HU222186B1 - Cold resistant pyruvate ortophosphate dikinase, the dna coding it, the recombinante vector containing the dna, and the transformed plants - Google Patents
Cold resistant pyruvate ortophosphate dikinase, the dna coding it, the recombinante vector containing the dna, and the transformed plants Download PDFInfo
- Publication number
- HU222186B1 HU222186B1 HU9600790A HU9600790A HU222186B1 HU 222186 B1 HU222186 B1 HU 222186B1 HU 9600790 A HU9600790 A HU 9600790A HU 9600790 A HU9600790 A HU 9600790A HU 222186 B1 HU222186 B1 HU 222186B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- amino acid
- leu
- gly
- ppdk
- ser
- Prior art date
Links
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
Abstract
A találmány tárgya új polipeptid, melynek hidegtűrő piruvát-,ortofoszfát-dikináz („PPDK")-aktivitása van, továbbá a polipeptidetkódoló klónozott DNS, valamint a DNS-t tartalmazó rekombináns vektor,amely alkalmas növények hidegtűrővé tételére. A találmány tárgyátképezik továbbá a találmány szerinti DNS-sel transzformált növényekis. ŕFIELD OF THE INVENTION The present invention relates to a novel polypeptide having a cold tolerant pyruvate, orthophosphate dicinase ("PPDK") activity, and a cloned DNA encoding the polypeptide, as well as a recombinant vector containing DNA, which is suitable for rendering plants cold-resistant. ált
Description
A találmány tárgya egy új polipeptid, melynek hidegtűrő piruvát-, ortofoszfát-dikináz- (továbbiakban: „PPDK”) aktivitása van, továbbá a polipeptidet kódoló klónozott DNS, valamint a DNS-t tartalmazó rekombináns vektor, amely alkalmas növények hidegtűrővé tételére. A találmány tárgyát képezik továbbá a találmány szerinti DNSsel transzformált növények is.The present invention relates to a novel polypeptide having cold-tolerant pyruvate, orthophosphate dinicase ("PPDK") activity, a cloned DNA encoding the polypeptide, and a recombinant vector containing DNA suitable for rendering plants cold-tolerant. The invention also relates to plants transformed with the DNA of the invention.
A találmány szerinti megoldás előnyösen alkalmazható hidegtűrő transzgenikus növények előállítására.The present invention is advantageously applicable to the production of cold tolerant transgenic plants.
Erős fény, magas hőmérséklet, illetve alacsony CO2-koncentráció esetén a C4-növények fotoszintetizáló képessége igen jó. Alacsony hőmérsékleten azonban ezen képességük nagymértékben csökken, kivéve azon növényeket, melyek alkalmazkodtak az alacsony hőmérsékleten fennálló körülményekhez. Noha a PPDK (EC 2.7.9.1, mely ATP, piruvát és ortofoszfát átalakulását katalizálja AMP-vé, foszfoenol-piruváttá, valamint pirofoszfáttá) egyike a C4-reakcióút legfontosabb enzimjeinek, aktivitása nem elég nagy a levélszövetben folyó fotoszintézis többi lépésének sebességéhez viszonyítva, így egyike azoknak az enzimeknek, melyek meghatározzák a CO2-megkötés sebességét a C4-fotoszintézisben. Az enzim felfedezésével egyidejűleg kimutatták továbbá, hogy az enzim hidegérzékeny. A kukorica-PPDK esetében az enzim aktivitásának 11,7 °C-nál inflexiós pontja van. Ez a hőmérséklet egybeesik a kukorica növekedésének hőmérsékleti határával. Ezek alapján feltételezhető, hogy a PPDK hidegérzékenysége egyike azoknak az okoknak, melyek csökkentik a C4-növények fotoszintézisének sebességét alacsony hőmérsékleten. A PPDK hidegtűrésének fokozásával tehát a kukorica növekedésének hőmérsékleti határát csökkenteni lehet. A Flaveria brownii egy, a Compositae családba tartozó növény, melyet a C3/C4 köztes típusba sorolnak, és ismert, hogy a belőle származó PPDK nem inaktiválódik számottevően alacsony hőmérsékleten, azaz 0 °C-on való inkubálás hatására. [Bumell JN: „A comparative study of the cold sensitivity of pyruvate, Pi dikinase in Flaveria species.” Plánt Cell Physiol. 31, 295-297 (1991)].Under strong light, high temperature and low CO 2 concentration, the photosynthetic capacity of C 4 plants is very good. However, at low temperatures, this ability is greatly reduced, except for plants that have adapted to low temperatures. Although the PPDK (EC 2.7.9.1, which ATP, pyruvate and transformation orthophosphate catalyzes AMP, phosphoenol pyruvate and pyrophosphate) one relative to the most important enzymes, the activity of the C 4 -reakcióút other force is not sufficiently large current in leaf tissue photosynthesis rate of, Thus, it is one of the enzymes that determine the rate of CO 2 uptake in C 4 photosynthesis. Simultaneously with the discovery of the enzyme, it has also been shown that the enzyme is cold sensitive. In maize PPDK, the enzyme activity has an inflection point at 11.7 ° C. This temperature coincides with the temperature limit for maize growth. On this basis, it is assumed that one of the PPDK cold sensitivity of the reasons that reduce herbs C4 photosynthesis rate at a low temperature. Thus, by increasing the cold tolerance of PPDK, the temperature limit for maize growth can be lowered. Flaveria brownii is a plant belonging to the Compositae family, which is classified as intermediate C3 / C4 and it is known that PPDK derived from it is not inactivated by incubation at significantly low temperature, i.e. 0 ° C. [Bumell JN: "A Comparative Study of the Cold Sensitivity of Pyruvate, Pi Dikinase in Flaveria Species." Plant Cell Physiol. 31: 295-297 (1991)].
Azáltal, hogy klónozzuk a hidegtűrő Flaveria brownii PPDK-génjét, és egy növényt transzformálunk vele, várható, hogy a növénynek hidegtűrést kölcsönözhetünk.By cloning the PPDK gene of the cold tolerant Flaveria browniei and transforming it with a plant, it is expected that the plant will be conferred cold tolerance.
A fentiek értelmében a találmány szerinti megoldás egyik célja egy új hidegtűrő PPDK-aktivitással bíró polipeptid, az ezt kódoló klónozott DNS, és a DNS-t tartalmazó rekombináns vektor előállítása, mely vektor alkalmas növények hidegtűrővé tételére. A találmány szerinti megoldás másik célja olyan növények előállítása, melyeket a találmány szerinti DNS-sel transzformáltunk.Accordingly, one object of the present invention is to provide a novel polypeptide having cold-tolerant PPDK activity, a cloned DNA encoding it, and a recombinant vector containing DNA useful for rendering plants cold-tolerant. Another object of the present invention is to provide plants that have been transformed with the DNA of the invention.
Kiterjedt kutatásokat folytattunk annak érdekében, hogy sikeresen klónozzuk a teljes PPDK-gént, meghatározzuk nukleotidszekvenciáját és a benne kódolt aminosavszekvenciát, valamint hogy azonosítsuk a hidegtűrésért felelős régiót a PPDK-génben, a találmány szerinti megoldás megvalósítása útján.Extensive research has been conducted to successfully clone the entire PPDK gene, determine its nucleotide sequence and the amino acid sequence encoded therein, and identify the region responsible for the cold tolerance in the PPDK gene by carrying out the present invention.
A találmány tárgyát képezi tehát egy hidegtűrő PPDK-aktivitással rendelkező polipeptid, melynek aminosavszekvenciája megegyezik az (1) vagy (2) polipeptid C-terminálisától számított régiójának 1/6 régiójáéval, azzal a különbséggel, hogy legalább egy aminosavoldalláncot az említett 1/6 régióban egy másik aminosav-oldallánc helyettesít, ahol:Accordingly, the present invention provides a polypeptide having cold-tolerant PPDK activity having an amino acid sequence equal to 1/6 of the C-terminal region of polypeptide (1) or (2), with the exception that at least one amino acid residue in said 1/6 region is substituted by another amino acid residue, where:
(1) egy PPDK, amelynek aminosavsorrendje megegyezik a szekvencialistában 1-4. azonosító számon megadott aminosavszekvenciákkal, valamint (2) egy polipeptid, melynek aminosavsorrendje nem kevesebb mint 50%-os homológiát mutat az (1) szerinti aminosavsorrenddel, és melynek hidegtűrő PPDK-aktivitása van.(1) a PPDK having the same amino acid sequence in SEQ ID NO: 1-4. and (2) a polypeptide having at least 50% amino acid sequence homology to the amino acid sequence of (1) and having cold-tolerant PPDK activity.
A találmány tárgyát képezi továbbá egy klónozott DNS, amely a találmány szerinti hidegtűrő PPDK-aktivitással rendelkező polipeptidet kódolja. A találmány tárgyát képezi továbbá a találmány szerinti DNS-t tartalmazó rekombináns vektor, amely alkalmas egy hidegtűrő PPDK-aktivitással rendelkező polipeptid expresszáltatására megfelelő gazdaszervezetben. A találmány tárgyát képezik továbbá a találmány szerinti DNS-sel transzformált növények.The invention further provides a cloned DNA encoding a polypeptide having cold-tolerant PPDK activity of the invention. The present invention further provides a recombinant vector comprising the DNA of the invention which is capable of expressing a polypeptide having cold tolerant PPDK activity in a suitable host. The invention also relates to plants transformed with the DNA of the invention.
A találmány szerinti megoldás kidolgozása során egy hidegtűrő PPDK-t kódoló gént klónoztunk és szekvenáltunk. Azonosítottuk továbbá a gén hidegstabilitásért felelős régióját. Az elmondottak értelmében, amennyiben egy növényt, melynek PPDK-ja hidegérzékeny, transzformálunk a találmány szerinti génnel, a hidegérzékeny PPDK-t tartalmazó növény hidegtűrő PPDK-t tartalmazóvá változtatható. Továbbá amennyiben a fent említett hidegtűrésért felelős régióval helyettesítjük a hidegérzékeny PPDK megfelelő régióját, a hidegérzékeny PPDK-t hidegtűrő PPDK-vá változtathatjuk. Ezáltal a növény olyan hideg éghajlatú vidéken is termeszthető lesz, melyen eddig nem volt termeszthető. Várható tehát, hogy a találmány szerinti megoldás nagymértékben hozzá fog járulni a mezőgazdaság fejlődéséhez.In the development of the present invention, a gene encoding a cold tolerant PPDK was cloned and sequenced. We also identified the region responsible for the cold stability of the gene. As stated above, when a plant having a cold-sensitive PPDK is transformed with a gene of the invention, the plant containing the cold-sensitive PPDK can be transformed into a cold-tolerant PPDK. Further, by replacing the corresponding region of the cold-sensitive PPDK with the aforementioned cold-tolerant region, the cold-sensitive PPDK can be converted to a cold-tolerant PPDK. This will allow the plant to be cultivated in a cold climate where it has not been possible to grow. It is therefore expected that the present invention will greatly contribute to the development of agriculture.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a leíráshoz csatolt ábrákat.BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS The accompanying drawings are briefly described below.
Az 1. ábrán egy expressziós vektor konstrukciójának sematikus rajza látható. A vektor a találmány szerinti PPDK-gén egy megvalósítási módját tartalmazza.Figure 1 is a schematic diagram of the construction of an expression vector. The vector comprises an embodiment of the PPDK gene of the invention.
A 2. ábra az enzimaktivitás időbeli változását mutatja a Flaveria brownii, Flaveria bidentis és a kukorica-PPDK-k 0 °C-on történő inkubálása során. Mindhárom enzim expresszi ója Escherichia coliban történt.Figure 2 shows the time course of enzyme activity during incubation of Flaveria brown, Flaveria bidentis and maize PPDK at 0 ° C. All three enzymes were expressed in Escherichia coli.
A 3. ábrán egy expressziós vektor konstrukciójának sematikus rajza látható, mely vektor a találmány szerinti PPDK-gén egy megvalósítási módját tartalmazza.Figure 3 is a schematic diagram of the construction of an expression vector comprising an embodiment of the PPDK gene of the invention.
A találmány szerinti megoldás kidolgozása során a hidegtűrő Flaveria brownii PPDK-t klónoztuk, meghatároztuk a nukleotidszekvenciáját, valamint az általa kódolt származtatott aminosavszekvenciát. A nukleotidés az aminosavszekvenciát a szekvencialistában 5. azonosító számon megadott szekvencia mutatja. Amint azt a következő példákban részletesen leírjuk, ezt a szekvenciát a következő lépésekben határoztuk meg: teljesIn the development of the present invention, the cold-tolerant Flaveria brown PPDK was cloned, its nucleotide sequence and the derived amino acid sequence encoded. The nucleotide sequence is shown in SEQ ID NO: 5 in the amino acid sequence. As described in detail in the following examples, this sequence was determined by the following steps: complete
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
RNS-extrakció Flaveria brownii-levelekből; cDNSkönyvtár készítése a hagyományos módszerrel; plakkhibridizáció olyan próbával, mely a Flaveria brownii PPDK-gén, illetve a kukorica-PPDK-gén kimutatására készült, mely gének nagyfokú homológiát mutatnak egymással; a pozitív kiónok szelektálása és klónozása; a gén szekvenálása didezoximódszerrel. A szekvencia nagyfokú homológiát mutat az ugyanahhoz a nemzetséghez tartozó Flaveria bidentisből származó PPDKgénnel, és viszonylag nagymértékben homológ a kukorica-PPDK génjével. Továbbá az N-terminális régió és a közbülső régiók származtatott aminosavszekvenciái teljesen megegyeznek a Flaveria brownii PPDK megfelelő szekvenciájával, mely enzimet közvetlen ezen növény zöld leveléből izoláltunk. Nyilvánvaló tehát, hogy a klónozott gén a Flaveria brownii PPDKgénje. A Flaveria brownii PPDK-génjét plakkhibridizáció segítségével szekvenáltuk, melyhez a kukorica cDNS-ét használtuk próbaként; a pozitív kiónokat tovább klónoztuk; a gént a didezoximódszerrel szekvenáltuk.RNA extraction from leaves of Flaveria brown; cDNA library construction using the conventional method; plaque hybridization with a probe designed to detect the Flaveria brownii PPDK gene and the maize PPDK gene, which show a high degree of homology to each other; selection and cloning of positive clones; sequencing of the gene by the dideoxy method. The sequence has a high degree of homology to the PPDK gene from Flaveria bidentis of the same genus and is relatively homologous to the maize PPDK gene. Furthermore, the derived amino acid sequences of the N-terminal region and the intermediate regions are identical to the corresponding sequence of Flaveria brown PPDK, an enzyme isolated directly from the green leaf of this plant. It is therefore obvious that the cloned gene is the PPDK gene of Flaveria brownii. The PPDK gene of Flaveria brown was sequenced by plaque hybridization using maize cDNA as a probe; positive clones were further cloned; the gene was sequenced by the dideoxy method.
Az 5. azonosító számon megadott aminosavszekvencia új, 40 aminosavban különbözik az ugyanahhoz a nemzetséghez tartozó Flaveria bidentis PPDK aminosavszekvenciájától, és körülbelül 180 aminosavban a kukorica-PPDK aminosavszekvenciájától. Annak ellenére tehát, hogy a Flaveria brownii PPDK 5. azonosító számon megadott aminosavszekvenciája nagyfokú homológiát mutat az ugyanahhoz a nemzetséghez tartozó Flaveria bidentis PPDK aminosavszekvenciájával, a Flaveria bidentis PPDK hidegérzékeny, míg a Flaveria brownii PPDK hidegtűrő. így tehát egy kis aminosavszekvenciabeli eltérés a két enzim tulajdonságainak jelentős különbségét okozza. A találmány tárgyát képezi az aminosavszekvenciát kódoló klónozott PPDKgén. Mint fent említettük, ez az aminosavszekvencia új, és jelentős sajátsága a hidegtűrés. A találmány szerinti gén nem kizárólag az 5. azonosító számon megadott nukleotidszekvencia által kódolt gén, hanem minden olyan találmány szerinti gén, melynek nukleotidszekvenciája ezt az aminosavszekvenciát kódolja.The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5 is a new 40 amino acid sequence different from the Flaveria bidentis PPDK amino acid sequence of the same genus and about 180 amino acids from the maize PPDK amino acid sequence. Thus, although the amino acid sequence of Flaveria brown PPDK under ID No. 5 has a high degree of homology to the same genus Flaveria bidentis PPDK, Flaveria bidentis PPDK is cold-sensitive and Flaveria brown PPDK is cold-sensitive. Thus, a small difference in the amino acid sequence causes a significant difference in the properties of the two enzymes. The present invention relates to a cloned PPDK gene encoding an amino acid sequence. As mentioned above, this amino acid sequence is novel and has a significant property of cold tolerance. The gene of the invention is not only the gene encoded by the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 5, but any gene of the invention having the nucleotide sequence encoding this amino acid sequence.
Megpróbáltuk azonosítani az 5. azonosító számon megadott Flaveria brownii PPDK-gén hidegtűrésért felelős régióját. Tehát, amint azt az alábbi példák részletesen leírják, a Flaveria brownii PPDK-gént három, körülbelül azonos méretű régióra hasítottuk restrikciós enzimekkel; mindegyik régiót kicseréltük a kukoricaPPDK-gén megfelelő régiójával, így kiméra PPDKgéneket kaptunk; meghatároztuk, hogy a kapott kimérek által kódolt PPDK-k hidegtűrők-e vagy sem. Ennek eredményeképpen megbizonyosodtunk róla, hogy a hidegtűrést okozó régió a Flaveria brownii PPDK-gén utolsó 1/3 régiójában található. A továbbiakban ezt az utolsó 1/3 régiót restrikciós enzimekkel további két, körülbelül azonos méretű régióra hasítottuk, és hasonló módszerrel meghatároztuk, hogy a kettő közül melyik felelős a hidegtűrésért. Eredményként azt kaptuk, hogy a hidegtűrésért felelős peptidszakaszt az 5. azonosító számon megadott Flaveria brownii PPDK-gén ATroI-hasítóhelyétől 3’-irányba eső régió kódolja. így tehát azt kaptuk, hogy a hidegtűrésért felelős funkció a 832-es aminosav (arginin) és a 955-ös aminosav (valin) közötti aminosavszekvencián belül lokalizálható, mely az 5. azonosító számon megadott aminosavszekvencia részét képezi. (A 832-es és a 955-ös aminosavak közötti aminosavszekvenciát a következőkben esetenként „hidegtűrésért felelős szekvenciának” fogjuk nevezni.) így tehát bebizonyítottuk, hogy a PPDK hidegtűréssel kapcsolatba hozható régiója a teljes gén C-terminálistól számított 1/6 régiójában helyezkedik el. Másfelől a szekvenciafelsorolásban az 1. azonosító számon a Flaveria bidentis PPDK-t kódoló gén nukleotidszekvenciáját és az általa kódolt származtatott aminosavszekvenciát adtuk meg, míg a 2. azonosító számon a kukorica-PPDK-t kódoló gén nukleotidszekvenciáját és az általa kódolt származtatott aminosavszekvenciát [Journal of Biochemistry 263, 11 080-11 083 (1988)]. A 3. azonosító számon a Bacteriodes symbiosus baktériumból származó PPDK-t kódoló gén nukleotidszekvenciáját és az általa kódolt származtatott aminosavszekvenciát adtuk meg [Biochemistry 29, 10 757-10 765 (1988)]. A 4. azonosító számon az Entamoeba histolytica baktériumból származó PPDK-t kódoló gén nukleotidszekvenciáját és az általa kódolt származtatott aminosavszekvenciát adtuk meg [Molecular Parasitology 62, 153-156 (1993)]. Amint azt fent leírtuk, a találmány szerinti megoldás megvalósítása során bebizonyítottuk, hogy a PPDK hidegtűréssel kapcsolatba hozható régiója a teljes régió C-terminálistól számított 1/6 régiójában található, így tehát lehetségessé vált hidegtűrő PPDK előállítása azáltal, hogy az 1., 2., 3. vagy 4. azonosító számon felsorolt aminosavszekvenciák C-terminálistól számított 1/6 régiójában kicserélünk legalább egy aminosavat. A „hidegtűrő” kifejezés a leírásban használt értelemben azt jelenti, hogy 0 °C-on való 20 perces inkubálás során az enzim aktivitása nem csökken az eredeti aktivitás 60%-a alá.An attempt was made to identify the region of the cold tolerance region of the Flaveria brownii PPDK gene set forth in SEQ ID NO: 5. Thus, as detailed in the examples below, the Flaveria brown PPDK gene was cleaved into three regions of approximately the same size by restriction enzymes; each region was replaced with the corresponding region of the maize PPDK gene to obtain chimeric PPDK genes; it was determined whether the PPDKs encoded by the resulting chimeras were cold tolerant or not. As a result, we confirmed that the cold tolerance region is located in the last 1/3 region of the Flaveria brownii PPDK gene. Further, this last 1/3 region was cleaved with restriction enzymes into two more regions of approximately the same size, and similarly determined which of the two was responsible for cold tolerance. As a result, the cold tolerance peptide region was found to be encoded by a region 3 'to the ATroI site of the Flaveria brown PPDK gene set forth in SEQ ID NO: 5. Thus, it has been found that the cold tolerance function can be localized within the amino acid sequence between amino acid 832 (arginine) and amino acid 955 (valine), which is part of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5. (The amino acid sequence between amino acids 832 and 955 will hereinafter be referred to as the "cold tolerance sequence".) Thus, it has been demonstrated that the cold tolerance region of the PPDK is located 1/6 of the entire gene from the C-terminus. On the other hand, SEQ ID NO: 1 is the nucleotide sequence of the gene encoding Flaveria bidentis PPDK and the derived amino acid sequence encoded by it, and SEQ ID NO: 2 is the nucleotide sequence of the maize PPDK coding sequence and the amino acid sequence of Biochemistry 263: 118080-1183 (1988)]. 3 is the nucleotide sequence of the gene encoding PPDK from Bacteriodes symbiosus and the derived amino acid sequence encoded by it (Biochemistry 29: 10757-10765 (1988)). 4 is the nucleotide sequence of the gene encoding PPDK from Entamoeba histolytica and the derived amino acid sequence encoded by it (Molecular Parasitology 62: 153-156 (1993)). As described above, it has been demonstrated in the practice of the present invention that the cold-tolerant region of the PPDK is located in 1/6 of the entire region from the C-terminus, thus making it possible to produce cold-tolerant PPDK by At least one amino acid change in the 1/6 region of the amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 3 or 4 from the C-terminus. The term "cold tolerant" as used herein, means that, after incubation at 0 ° C for 20 minutes, the activity of the enzyme does not fall below 60% of its original activity.
Amint azt fent említettük, mivel az 5. azonosító számon megadott aminosavszekvencia 832-es arginin aminosavtól a 955-ös valin aminosavig terjedő régiója határozza meg a hidegtűrést, a hidegérzékeny PPDK-k, melyek aminosavszekvenciáját az 1 -4-ig terjedő azonosító számon adtunk meg, átalakíthatok hidegtűrő PPDKvá azáltal, hogy a hidegérzékeny PPDK-k megfelelő régióit az 5. azonosító számon megadott aminosavszekvencia 832-es arginin aminosavtól a 955-ös valinig terjedő régiójával helyettesítjük. Ez a felismerés igen nagy jelentőségű, mivel ezt felhasználva bármely kívánt hidegérzékeny PPDK átalakítható hidegtűrő PPDK-vá. PPDK-t nem csupán a szerint a módszer szerint tehetünk hidegtűrővé, melyet az alábbi példákban írtunk le, melyekben a Flaveria brownii PPDK hidegtűrésért felelős szekvenciájával helyettesítettük a hidegérzékeny PPDK megfelelő régióját kiméra gént készítve, hiszen egy növény hidegérzékeny PPDK-ját azáltal is hidegtűrővé tehetjük, hogy a PPDK-gén megfelelő régióját irányított mutagenezissel megváltoztatjuk úgy, hogy az a Flaveria brownii PPDK hidegtűrésért felelős szekvenciájával azonos legyen. Ezért a találmány tárgyát képezi bármely PPDK-aktivitással rendelkező polipeptidet kó3As mentioned above, since the region of amino acid sequence SEQ ID NO: 5 from arginine 832 to valine 955 determines cold tolerance, cold-sensitive PPDKs whose amino acid sequence is set to SEQ ID NO: 1-4 , can be converted to cold-tolerant PPDK by replacing the corresponding regions of the cold-sensitive PPDK with the arginine 832 to valine 955 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5. This recognition is very important as it can be used to convert any desired cold-sensitive PPDK to cold-tolerant PPDK. Not only can PPDK be made cold-tolerant by the method described in the examples below, in which the corresponding region of cold-sensitive PPDK was replaced by the cold-tolerant sequence of Flaveria brownii PPDK to produce a chimeric gene, by altering the appropriate region of the PPDK gene by directed mutagenesis so that it is identical to the PPDK cold tolerance sequence of Flaveria brown. Therefore, the invention provides any polypeptide having PPDK activity
HU 222 186 Β1 dőlő olyan DNS, amely a fent leírt hidegstabilitásért felelős szekvenciát tartalmazza. Különösen az a PPDK, melyben az 1. azonosító számon megadott aminosavszekvencia 869-es aminosavát prolinra cseréltük, és az a PPDK, melyben az 1. azonosító számon megadott aminosavszekvencia 885-ös aminosavát leucinre és a 952-es aminosavát valinra cseréltük, bizonyultak hidegtűrőknek.Leaning DNA is the DNA containing the cold stability sequence described above. In particular, the PPDK in which the 869 amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 was replaced with proline, and the PPDK in which the 885 amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 was replaced with leucine and 952 amino acid by valine, were found to be cold.
Nemcsak azoknak a PPDK-knak kölcsönözhetünk hidegtűrést, melyeknek szekvenciáját az 1 - 4. azonosító számon adtuk meg, hanem mindazoknak, melyek nem kevesebb mint 50%-os homológiát mutatnak az 1-4. azonosító számon megadott szekvenciákkal. Előnyösen, a hidegtűrővé teendő PPDK-t kódoló gén nukleotidszekvenciája nem kevesebb mint 48,5%-os homológiát mutat a Flaveria brownii PPDK-génjével, előnyösebben nem kevesebb mint 90%-osat.Not only PPDKs having the sequence set forth in SEQ ID NOs 1-4 can be borrowed, but all those having at least 50% homology to the one shown in Figures 1-4. SEQ ID NO. Preferably, the cold-tolerant PPDK encoding gene has a nucleotide sequence of at least 48.5% homology to the Flaveria brown PPDK gene, more preferably at least 90%.
A technika állása szerint jól ismert, hogy vannak esetek, amikor egy fiziológiailag aktív peptid fiziológiai aktivitása megmarad még akkor is, ha a peptid aminosavszekvenciája kismértékben módosul, azaz ha az aminosavszekvencia egy vagy két aminosavát helyettesítik, vagy kiejtik, vagy akkor is, ha egy vagy két aminosavat betoldanak a szekvenciába. Ezért a találmány tárgyát képezik azok a polipeptidek, melyek aminosavszekvenciája lényegében megegyezik az 5. azonosító számon megadottal, azzal a különbséggel, hogy olyan módosításokat tartalmaznak, melyek mellett a hidegtűrő PPDK-aktivitás megmarad. így tehát a találmány tárgyát képezik azon polipeptidek, melyek aminosavszekvenciája lényegében megegyezik az 5. azonosító számon megadottal, azzal a különbséggel, hogy egy vagy több aminosav be van toldva, ki van ejtve vagy ki van cserélve, és hidegtűrő PPDK-aktivitásuk van. Hasonlóképpen, a találmány tárgyát képezik azok a DNS-ek, melyeknek nukleotidszekvenciája lényegében megegyezik az 5. azonosító számon megadottal, azzal a különbséggel, hogy egy vagy több nukleotid be van toldva, ki van ejtve vagy ki van cserélve, és hidegtűrő PPDKaktivitással rendelkező polipeptidet kódolnak.It is well known in the art that there are cases in which the physiological activity of a physiologically active peptide is retained even if the amino acid sequence of the peptide is slightly modified, i.e., when one or two amino acids of the amino acid sequence are replaced or deleted, or two amino acids are inserted into the sequence. Therefore, the present invention provides polypeptides having substantially the same amino acid sequence as set forth in SEQ ID NO: 5, except that they contain modifications that retain cold-tolerant PPDK activity. Thus, the present invention provides polypeptides having substantially the same amino acid sequence as set forth in SEQ ID NO: 5, with the exception that one or more amino acids are inserted, deleted or replaced and have cold-tolerant PPDK activity. Similarly, the invention relates to DNAs having a nucleotide sequence substantially identical to that set forth in SEQ ID NO: 5, except that one or more nucleotides are inserted, deleted or replaced and encode a polypeptide having cold-tolerant PPD activity. .
A DNS-szekvencia módosítása és ezáltal aminosavak betoldása, kiejtése vagy cseréje az általa kódolt aminosavszekvenciában helyspecifikus mutagenezissel érhető el, amely eljárás a technika állása szerint jól ismert. [Pl. Nucleic Acid Research, 10, No. 20, 6487-6500 (1982)]. A leírásban használt értelemben az „egy vagy több aminosav” azon aminosavak számát jelenti, melyeket irányított mutagenezissel betoldani, kiejteni vagy helyettesíteni lehet.Modification of the DNA sequence and thereby insertion, deletion or replacement of amino acids in the amino acid sequence encoded by it is accomplished by site-specific mutagenesis, which is well known in the art. [E.g. Nucleic Acid Research, 10, No. 20, 6487-6500 (1982)]. As used herein, "one or more amino acids" refers to the number of amino acids that can be inserted, deleted or substituted by directed mutagenesis.
Helyspecifikus mutagenezist például szintetikus láncindító oligonukleotidok alkalmazásával lehet végezni, melyek egy egyes szálú fág-DNS-sel - a kívánt mutáció kivételével - komplementerek, amint azt az alábbiakban leírjuk. A fenti szintetikus oligonukleotidot láncindítóként használva a fág egy komplementer láncot készít, és az így nyert kettős szálú DNS-sel gazda-baktériumsejteket transzformálunk. A transzformált baktérium-sejtkultúrát agarlemezen szélesztjük, ahol egy-egy sejtből, amelyik a fágot tartalmazza, plakk keletkezik. Elméletileg a telepek 50%-a tartalmaz olyan fágot, amelyikben mutációt hordozó egyes szálú DNS van, és a maradék 50%-uk olyat, melyben az eredeti szekvencia van. Az így nyert plakkokat aztán kinázzal kezelt szintetikus próbával való hibridizációnak vetjük alá olyan hőmérsékleten, ahol a próba hibridizál az olyan DNS-sel, melynek a szekvenciája azonos a kívánt mutációt hordozó DNS-sel, de nem hibridizál az eredeti DNS-szekvenciával, amely nem teljesen komplementer a próbával. Ezután a hibridizációt mutató plakkokat táptalajba oltjuk, növesztjük, és a DNS-t begyűjtjük.Site-specific mutagenesis can be accomplished, for example, using synthetic primer oligonucleotides which are complementary to single-stranded phage DNA, except for the desired mutation, as described below. Using the above synthetic oligonucleotide as a primer, the phage produces a complementary strand and the resulting double-stranded DNA is transformed into host bacterial cells. The transformed bacterial cell culture is plated on an agar plate where plaque is formed from each cell containing the phage. Theoretically, 50% of the colonies contain a phage containing single-stranded DNA carrying the mutation, and the remaining 50% contains the original sequence. The plaques thus obtained are then subjected to hybridization with a kinase-treated synthetic probe at a temperature where the probe hybridizes with DNA having the same sequence as the DNA carrying the desired mutation but not hybridizing with the original DNA sequence. complementary to the test. The hybridization plaques are then inoculated into culture medium, grown and the DNA is harvested.
Aminosavak helyettesítésére, kiejtésére vagy betoldására úgy, hogy az enzim aktivitása ne vesszen el, a fent említett helyspecifikus mutagenezisen kívül más módszerek is léteznek, ilyen például a gén valamilyen mutagénnel való kezelése, illetve az, amikor a gént szelektíven hasítjuk, egy kiválasztott nukleotidot eltávolítunk, kiejtünk vagy helyettesítünk, majd a gént összeligáljuk.In addition to site-directed mutagenesis, other methods exist to replace, delete, or insert amino acids without losing enzyme activity, such as treating the gene with a mutagen or removing a selected nucleotide by selectively cleaving the gene, pronounce or replace and then ligate the gene.
Azáltal, hogy egy növényt a Flaveria brownii PPDK-génjével transzformálunk, vagy egy olyan DNSsel, amely egy, a hidegtűrésért felelős szekvenciát tartalmazó, PPDK-aktivitású polipeptidet kódol, hidegtűrő növényt nyerhetünk. Előnyösen például többek között az alábbi növényeket transzformálhatjuk: kukorica, cukornád, köles, takarmányozásra alkalmas fűfélék és cirok.By transforming a plant with the PPDK gene of Flaveria brown or with a DNA encoding a polypeptide with PPDK activity containing the cold tolerance sequence, a cold tolerant plant can be obtained. Preferably, for example, the following plants may be transformed: maize, sugar cane, millet, forage grasses and sorghum.
Már léteznek módszerek növények transzformálására, és az Agrobacterium tumefacienst hasznosító módszer különösen jól alkalmazható. A növények transzformálására szolgáló azon módszer, amely az Agrobacterium tumefacienst hasznosítja, jól ismert a technika állása szerint. Ezzel a módszerrel mind a kétszikűek (például 4-330234-es számú közrebocsátott japán szabadalmi bejelentés), mind pedig az egyszikűek (WO 94/00977) transzformálhatok. Másik lehetőség, hogy a DNS-t bejuttathatjuk a növény protoplasztjaiba elektroporációval vagy hasonló, a technika állása szerint jól ismert módszerrel. A transzformálást úgy is elvégezhetjük továbbá, hogy a DNS-t volfrámrészecskékhez vagy hasonlókhoz kötjük, és a részecskéket beültetjük a növény csíráiba. Az alábbiakban leírt példákban konkrétan ismertetni fogjuk az említett transzformálási eljárásokat.Methods for transforming plants already exist, and the method utilizing Agrobacterium tumefaciens is particularly applicable. A method for transforming plants using Agrobacterium tumefaciens is well known in the art. With this method, both dicotyledons (e.g., Japanese Patent Application Laid-Open No. 4-330234) and monocotyledons (WO 94/00977) can be transformed. Alternatively, the DNA may be introduced into the plant's protoplasts by electroporation or a similar method well known in the art. The transformation can also be accomplished by binding the DNA to tungsten particles or the like and implanting the particles in the germ of the plant. The following examples will specifically describe the transformation methods mentioned.
A találmány szerinti megoldást az alábbi példák segítségével konkrétabban is ismertetjük, anélkül azonban, hogy igényünket az ismertetettekre korlátoznánk.The invention is further illustrated by the following examples, but is not to be construed as limiting.
1. példaExample 1
A Flaveria brownii PPDK-gén klónozása és szekvenálása (1) A cDNS-könyvtár elkészítése és a teljes hosszúságú cDNS klónozása.Cloning and sequencing of the Flaveria brown PPDK gene (1) Construction of a cDNA library and full-length cDNA cloning.
(i) A cDNS-könyvtár elkészítése(i) Construction of the cDNA library
A Flaveria brownii zöld leveleiből (60 g) teljes RNS-izolátumot készítettünk a guanidin-hidroklorid/fenol módszerrel. Ezzel a módszerrel 26,5 mg RNS-t nyertünk lítiummal való kicsapás után. Ezután 118,9 pg poli(A)+RNS-t nyertünk az RNS 13,2 mg-jából a hagyományos módszer szerint „01igo(dT)-Cellulose Type 7” oszlopot használva (kereskedelmi forgalomban kaphatóTotal RNA isolates from green leaves of Flaveria brown (60 g) were prepared by the guanidine hydrochloride / phenol method. By this method, 26.5 mg of RNA was obtained after precipitation with lithium. Subsequently, 118.9 µg of poly (A) + RNA was obtained from 13.2 mg of RNA by a conventional method using a "01igo (dT) -Cellulose Type 7" column (commercially available).
HU 222 186 Β1 a Pharmacia cégtől). A cDNS-könyvtár készítéséhez a „TimeSaver cDNA Synthesis” reagenskészletet (kereskedelmi forgalomban kapható a Pharmacia cégtől), a Lambda-ZAPII-vektort (kereskedelmi forgalomban kapható a STRATAGENE cégtől) és a XgtlO cDNS klónozórendszer (kereskedelmi forgalomban kapható az AMERSHAM cégtől) fág-DNS csomagoló reagensét használtuk. Egy EcoRI/NotI kapcsoló oligonukleotidot alkalmazva olyan cDNS-könyvtárt készítettünk, amelyben a DNS-fragmenseket a Lambda-ZAPU-vektor EcoRI-hasítóhelyére inszertáltuk. Az elkészített cDNSkönyvtár mérete 415 000 pfú (plakk-képző egység) volt. Gazdasejtekként XLl-Blue-sejteket használtunk.HU 222 186 Β1 from Pharmacia). The cDNA library was prepared using the TimeSaver cDNA Synthesis kit (commercially available from Pharmacia), the Lambda-ZAPII vector (commercially available from STRATAGENE) and the Xgt10 cDNA cloning system (commercially available from AMERSHAM). DNA packaging reagent was used. Using an EcoRI / NotI linker oligonucleotide, a cDNA library was constructed in which the DNA fragments were inserted into the EcoRI site of the Lambda-ZAPU vector. The size of the prepared cDNA library was 415,000 pfu (plaque forming unit). XL1-Blue cells were used as host cells.
(ii) Hibridizációs próba előállítása(ii) Preparation of hybridization assay
Egy, a F. brownii RNS-éből származó DNS-fragmenst amplifikáltunk reverz transzkripciós PCR-rel (polimeráz-láncreakcióval), melyhez a következő láncindítókat használtuk: az 5’-GACGGCTAAAAAGAGGGT szekvenciájú láncindítót (ezt a Flaveria bidentis és a kukorica nagy homológiát mutató PPDK-régiói alapján terveztük) és a TATCGAGAAACCTTCTATAC szekvenciájú R-láncindítót, amely a Flaveria bidentis PPDK-gén komplementer szála szekvenciájának egy részlete. Az amplifíkált DNS-fragmenst pCRII-vektorba inszertáltuk (kereskedelmi forgalomban kapható az INVITROGEN cégtől). Az így kapott vektort templátként használva, és a fenti láncindítókat alkalmazva a DNS-t amplifikáltuk, és a PCR-terméket elektroforézisnek vetettük alá, majd a DNS-t visszanyertük a gélből „SUPREC-01”-et (kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől) használva. Ezzel a művelettel egy 428 bp hosszú DNS-fragmenst kaptunk, amely az érett fehérje N-terminálisától 3’-irányban számított 24. bp-ral kezdődik. Ezt a fragmenst 32P-izotóppal jelöltük, „Multiprime DNA” jelölőrendszer (kereskedelmi forgalomban kapható az AMERSHAM cégtől) segítségével, ezzel elkészítve a próbát.A DNA fragment from F. browniei RNA was amplified by reverse transcription PCR (polymerase chain reaction) using the following primers: 5'-GACGGCTAAAAAGAGGGT sequence primer (this is Flaveria bidentis bigD and maize). and the R-primer of the sequence TATCGAGAAACCTTCTATAC, which is a part of the complementary strand sequence of the Flaveria bidentis PPDK gene. The amplified DNA fragment was inserted into pCRII vector (commercially available from INVITROGEN). Using the resulting vector as a template and using the above primers, the DNA was amplified and the PCR product electrophoresed, and the DNA was recovered from the gel "SUPREC-01" (commercially available from TAKARA SHUZO) ). This operation yielded a 428 bp DNA fragment starting 24 bp 3 'to the N-terminus of the mature protein. This fragment was labeled with 32 P isotopes using a "Multiprime DNA" labeling system (commercially available from AMERSHAM) to prepare the probe.
(iii) A Flaveria brownii teljes hosszúságú cDNS-ének klónozása(iii) Cloning of the full length cDNA of Flaveria brown
A cDNS-könyvtárt plakkhibridizációval szkríneltük, a fenti DNS-fragmenst próbaként használva. Hibridizációs szűrőként „Hybond N+” (kereskedelmi forgalomban kapható az AMERSHAM cégtől) szolgált, a hibridizációt 5 χ Denhalt-oldatot tartalmazó 6 χ SSC-pufferben végeztük, 0,1% SDS és 100 pg/ml denaturált lazachereDNS jelenlétében 65 °C-on egy éjszakán át. A mosás 0,1% SDS-t tartalmazó 2xSSC-vel történt szobahőmérsékleten 5 percig; 0,1% SDS-t tartalmazó 2xSSC-vel szobahőmérsékleten 90 percig, majd 0,1% SDS-t tartalmazó 1 χ SSC-vel 68 °C-on 90 percig. Ezek során 28 független pozitív kiónt nyertünk. Ezekből 21 erős jelet mutató plakkot kiválasztottunk, és újra szkríneltük. Az újabb szkrinelést ugyanúgy végeztük, ment az elsőt, azzal a különbséggel, hogy a második mosás ideje 60 perc volt. Eredményképpen 6 klónból nyertünk egyetlen fágtól származó független pozitív plakkokat. Az inszertált DNS-fragmensek méretét ellenőrzendő PCR-t végeztünk a fent leírt R-láncindítót, „M13PrimerM4”-láncindítót (GTTTTCCCAGTCACGAC, kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől) és „M13PrimerRV”-láncindítót (CAGGAAACAGCTATGAC, kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől) használva, miközben a fág templátként szolgált. Eredményképpen két olyan kiónt kaptunk, amely tartalmazta a teljes hosszúságú DNS-t. Ezután in vivő kihasítással az inszertált DNS-fragmenseket pBluescriptIISK(-)-plazmidvektorba szubklónoztuk (kereskedelmi forgalomban kapható a STRATAGENE cégtől). A klónozással nyert rekombináns plazmidokat p411-nek és p631-nek neveztük el.The cDNA library was screened by plaque hybridization using the above DNA fragment as a probe. The hybridization filter was "Hybond N + " (commercially available from AMERSHAM), hybridization was carried out in 6 χ SSC buffer containing 5 χ of Denhalt solution in the presence of 0.1% SDS and 100 pg / ml of denatured salmonhere DNA at 65 ° C. overnight. Wash was performed with 2xSSC containing 0.1% SDS for 5 minutes at room temperature; With 2xSSC containing 0.1% SDS at room temperature for 90 minutes and then with 1χ SSC containing 0.1% SDS at 68 ° C for 90 minutes. 28 independent positive clones were obtained. From these, 21 plaques showing a strong signal were selected and screened again. The new screening was done in the same way as the first one, except that the second wash was 60 minutes. As a result, independent positive plaques from a single phage were obtained from 6 clones. The size of the inserted DNA fragments was checked by PCR using the R-primer described above, the "M13PrimerM4" primer (GTTTTCCCAGTCACGAC, commercially available from TAKARA SHUZO) and the "M13PrimerRV" commercially available from CAGGGACACAG ) while the phage served as a temple. As a result, two clones containing full-length DNA were obtained. The inserted DNA fragments were then subcloned into the plasmid vector pBluescript IISK (-) (commercially available from STRATAGENE) by in vivo cleavage. The recombinant plasmids obtained by cloning were named p411 and p631.
A fent leírt PCR elvégzése során kiderült, hogy a fent leírt módon elkészített könyvtár elegendően hosszú inszerteket tartalmazott, és így alkalmasnak bizonyult cDNS-szkrínelésre. így tehát a Flaveria brownii mRNSének izolálására célszerű a fent leírt módszert alkalmazni és egyszerre nagy mennyiségű mRNS-t nyerni azáltal, hogy egyszerre nagy mennyiségű RNS-sel dolgozunk, amint azt fent leírtuk.The PCR described above revealed that the library prepared as described above contained sufficiently long inserts and was thus suitable for cDNA screening. Thus, for the isolation of Flaveria brown mRNA, it is desirable to employ the method described above and simultaneously obtain large amounts of mRNA by simultaneously working with large amounts of RNA as described above.
Továbbá, mivel a fent leírt cDNS-könyvtár számos elegendően hosszú inszertet tartalmaz, a teljes hosszúságú cDNS szűrése könnyen kivitelezhető volt azáltal, hogy elkészítettünk egy próbát egy olyan láncindító segítségével, amelyik egy, a kívánt fehérje génjének processziós régiója közvetlen szomszédságában elhelyezkedő régióval hibridizál.Furthermore, since the cDNA library described above contains a number of sufficiently long inserts, full-length cDNA screening was readily accomplished by constructing a probe using a primer that hybridizes to a region immediately adjacent to the processing region of the desired protein gene.
(2) A cDNS teljes nukleotidszekvenciájának meghatározása és a származtatott aminosavszekvenciával való összehasonlítása(2) Determination of the complete nucleotide sequence of the cDNA and comparison with the derived amino acid sequence
Annak érdekében, hogy meghatározzuk a p631 inszertált cDNS-fragmensének teljes nukleotidszekvenciáját, deléciós mutánsokat készítettünk. A deléciós mutánsokat a „Deletion Kit fór Kilo-Sequence” (deléciós reagenskészlet hosszú fragmensek szekvenálásához, kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől) segítségével készítettük el. Azonban az exonukleáz-III katalizálta reakciót megállítottuk azáltal, hogy a reakcióelegyet átvittük „Mung Beán” nukleázpufferbe, melyet 65 °C-on tartottunk. A nukleotidszekvencia meghatározását egy, a „Qiagen Plasmid Mini” reagenskészlettel (kereskedelmi forgalomban kapható a Diagen cégtől) tisztított plazmiddal, „Taq DyeDeoxy Terminator Cycle” szekvenáló reagenskészlettel (kereskedelmi forgalomban kapható az ABI cégtől) és egy „Applied Biosystems 373A” DNS-szekvenáló készülékkel (kereskedelmi forgalomban kapható az ABI cégtől) végeztük. Mindkét láncot megszekvenáltuk egyes részeik kivételével. A meghatározott nukleotidszekvencia alapján meghatároztuk az aminosavszekvenciát. A meghatározott nukleotidszekvenciát és az aminosavszekvenciát az 5. azonosító számon adtuk meg a szekvencialistában.In order to determine the complete nucleotide sequence of the inserted cDNA fragment of p631, deletion mutants were constructed. Deletion mutants were prepared using the "Deletion Kit for Kilo-Sequence" (commercially available from TAKARA SHUZO for sequencing of long fragments). However, the exonuclease-III catalyzed reaction was stopped by transferring the reaction mixture into "Mung Bean" nuclease buffer which was kept at 65 ° C. Nucleotide sequence determination was performed with a plasmid purified with the "Qiagen Plasmid Mini" reagent kit (commercially available from Diagen), the Taq DyeDeoxy Terminator Cycle sequencing kit (commercially available from ABI), and an Applied Biosystems 373A DNA. (commercially available from ABI). Both chains were sequenced except for some of their chains. Based on the determined nucleotide sequence, the amino acid sequence was determined. The determined nucleotide sequence and the amino acid sequence are set forth in SEQ ID NO: 5.
Meg kell jegyeznünk, hogy az izolált cDNS szekvenálásához készített deléciós kiónok elkészítésénél fontos volt előre felmelegíteni a „Mung Beán” nukleázpuffert 65 °C-ra, mivel a reakciót nem lehetett pusztán azáltal megállítani, hogy a reakcióelegyet a ,Mung Beán” nukleázpufferbe vittük át. Továbbá, mivel a vektor és az inszert határától a kb. 600-900 bp-ig terjedő szekvenciát nem tudtuk meghatározni azáltal, hogy az inszertből csupán az 5’-vég felől ejtettünk ki egy sza1It should be noted that in preparing deletion clones for sequencing the isolated cDNA, it was important to preheat the "Mung Bean" nuclease buffer to 65 ° C, because the reaction could not be stopped simply by transferring the reaction mixture to the "Mung Bean" nuclease buffer. Furthermore, since the boundary between the vector and the insert is approx. The 600-900 bp sequence could not be determined by deleting a sequence from the insert only at the 5'-end.
HU 222 186 Bl kaszt, szükséges volt mind a két vég felől végrehajtani a deléciót.EN 222 186 Bl, it was necessary to carry out the deletion from both ends.
Másfelől, közvetlenül Flaveria browniüxA PPDK-t tisztítottunk, és meghatároztuk az N-terminális régiója, a C-terminális régiója, és a közbülső régiók aminosavszekvenciáját. A PPDK-t a következőképpen tisztítottuk. A zöld leveleket elhomogenizáltuk háromszoros térfogatú feltárópufferben. Centrifugálás után ammónium-szulfátot adtunk a felülúszóhoz 30%-os telítettségig, majd a kicsapódott fehérjéket eltávolítottuk. További ammónium-szulfátot adtunk az oldathoz 70%-os telítettségig, majd a kicsapódott fehérjéket visszanyertük. Az így visszanyert fehérjéket Sephadex G25 (kereskedelmi forgalomban kapható a Pharmacia cégtől) oszlopra vittük fel, hogy a sókat eltávolítsuk. A kapott mintát DEAE-Sepharose (kereskedelmi forgalomban kapható a Pharmacia cégtől) oszlopra vittük fel, és a megkötött fehérjéket 5O-től 400 mM-ig növekvő KCl-gradienssel eluáltuk. A PPDK-aktivitást mutató frakciókat egyesítettük, és 70%-os telítettségig ammónium-szulfátot adtunk az oldathoz, majd sómentesítettük G25-ön. A kapott mintát hidroxi-apatit-oszlopon tisztítottuk tovább. A megkötött fehérjéket foszfátpufferrel eluáltuk, 10 mM-tól 40 mMig növekvő foszfátgradienssel. A PPDK-aktivitást mutató frakciókat egyesítettük, és 70%-os telítettségig ammónium-szulfátot adtunk az oldathoz, majd sómentesítettük G25-ön. A kapott mintát SDS-PAGE-nek (poliakrilamid-gélelektroforézis) vetettük alá, és a PPDK sávját kivágtuk a gélből. A fehérjét elektroelúcióval nyertük vissza. Ezen eljárás során kb. 5-10 nmol tisztított PPDK-mintát nyertünk. Az így tisztított PPDK egyetlen sávot mutatott SDS-PAGE-vel vizsgálva.On the other hand, the Flaveria brownowxA PPDK was purified directly and the amino acid sequence of the N-terminal region, the C-terminal region and the intermediate regions were determined. The PPDK was purified as follows. The green leaves were homogenized in triple volume digestion buffer. After centrifugation, ammonium sulfate was added to the supernatant to 30% saturation, and the precipitated proteins were removed. Additional ammonium sulfate was added to the solution up to 70% saturation, and the precipitated proteins were recovered. The recovered proteins were loaded on a Sephadex G25 (commercially available from Pharmacia) column to remove salts. The resulting sample was loaded on a DEAE-Sepharose (commercially available from Pharmacia) column and the bound proteins were eluted with an increasing KCl gradient from 50 to 400 mM. Fractions showing PPDK activity were pooled and ammonium sulfate was added to the solution to 70% saturation and desalted with G25. The resulting sample was further purified on a hydroxyapatite column. Bound proteins were eluted with phosphate buffer with an increasing phosphate gradient from 10 mM to 40 mM. Fractions showing PPDK activity were pooled and ammonium sulfate was added to the solution to 70% saturation and desalted with G25. The resulting sample was subjected to SDS-PAGE (polyacrylamide gel electrophoresis) and the PPDK band was excised from the gel. The protein was recovered by electroelution. During this procedure, approx. 5-10 nmol of purified PPDK sample was obtained. The PPDK thus purified showed a single band as analyzed by SDS-PAGE.
Ezután az így nyert tisztított PPDK N-terminális régiója, a C-terminális régiója és a közbülső régiói aminosavszekvenciáit határoztuk meg. Az N-terminális régió aminosavszekvenciájának a meghatározása úgy történt, hogy a fehérjét egy PVDF-membránra vittük át, majd egy gázfázisú aminosavszekvenáló berendezéssel meghatároztuk a szekvenciát. A C-terminális régió aminosavszekvenciáját úgy határoztuk meg, hogy a tisztított PPDK-t karboxi-peptidáz-Y-nal emésztettük, és az aminosavszekvenciát a felszabadított aminosavak aránya és az emésztési idő közötti összefüggésből határoztuk meg. A közbülső régiók aminosavszekvenciáját a fehérje proteázzal való emésztése során keletkező peptidek N-terminális aminosavszekvenciáinak a meghatározása útján határoztuk meg. Ezen módszer részletei az alábbiak. Először, éppen úgy, mint az N-terminális régió aminosavszekvenciájának a meghatározása során, a Flaveria brownii zöld leveleiből részlegesen tisztított PPDK-t állítottunk elő, majd alávetettük közönséges SDS-PAGE-nek. A gélt Coomassie Brilliant Blue R250-nel megfestettük, és a PPDK sávját kivágtuk. A kivágott gélt ekvilibráló pufferben (125 mM TrisHC1 pH 6,8, 1 mM EDTA, 0,1% SDS) ekvilibráltuk, majd újra SDS-poliakrilamidgélre vittük föl és megfuttattuk. Ez úgy történt, hogy egy fedő oldatot (125 mM Tris-HCl pH 6,8, 1 mM EDTA, 0,1% SDS, 0,01% BPB, 20% glicerin) és egy enzimoldatot (125 mM TrisHCl pH 6,8, 1 mM EDTA, 0,1% SDS, 0,01% BPB,The amino acid sequences of the N-terminal region, the C-terminal region and the intermediate regions of the thus obtained purified PPDK were then determined. The amino acid sequence of the N-terminal region was determined by transferring the protein to a PVDF membrane and determining the sequence using a gas phase amino acid sequencer. The amino acid sequence of the C-terminal region was determined by digesting the purified PPDK with carboxypeptidase-Y and the amino acid sequence was determined from the relationship between the ratio of liberated amino acids and the digestion time. The amino acid sequence of the intermediate regions was determined by determining the N-terminal amino acid sequences of the peptides produced by proteinase digestion. The details of this method are as follows. First, just as in the determination of the amino acid sequence of the N-terminal region, PPDK partially purified from the green leaves of Flaveria brown was prepared and then subjected to standard SDS-PAGE. The gel was stained with Coomassie Brilliant Blue R250 and the PPDK band was excised. The excised gel was equilibrated in equilibration buffer (125 mM TrisHCl pH 6.8, 1 mM EDTA, 0.1% SDS) and resuspended in SDS-polyacrylamide gel and run. This was done by adding a cover solution (125 mM Tris-HCl pH 6.8, 1 mM EDTA, 0.1% SDS, 0.01% BPB, 20% glycerol) and an enzyme solution (125 mM TrisHCl pH 6.8). , 1 mM EDTA, 0.1% SDS, 0.01% BPB,
10% glicerin, lizin-endopeptidáz 1-5 pg vagy V8 proteáz 0,01-0,1 pg) adtunk a gélhez az ekvilibrált géllel együtt. Miután egy ideig elektroforetizáltunk, a koncentrált gélben elvégeztük a fehérjék emésztését (az elektromos feszültséget kikapcsoltuk, és a gélt 45 percig állni hagytuk). Ezután újrakezdtük az elektroforézist, majd az elválasztott fehérjéket átvittük PVDFmembránra ugyanúgy, mint az N-terminális szekvencia meghatározása során, majd az emésztéssel nyert ffagmensek aminosavszekvenciáját N-terminálisaiktól kiindulva meghatároztuk a gázfázisú aminosavszekvenáló berendezés segítségével.10% glycerol, lysine endopeptidase 1-5 pg or V8 protease 0.01-0.1 pg) was added to the gel along with the equilibrated gel. After being electrophoresed for a while, the concentrated gel was digested (the voltage was turned off and the gel was left to stand for 45 minutes). The electrophoresis was then resumed, and the separated proteins were transferred to a PVDF membrane as in the determination of the N-terminal sequence, and the amino acid sequence of the digested fragments from their N-terminus was determined using a gas-phase amino acid sequencer.
Az N-terminális régió, a C-terminális régió és a közbülső régiók meghatározott szekvenciái a következők: N-terminális szekvencia: Asn Pro Val Ser Pro Pro Val (72-78)Specific sequences for the N-terminal region, the C-terminal region, and the intermediate regions are as follows: N-terminal sequence: Asn Pro Val Ser Pro Pro Val (72-78)
C-terminális szekvencia: Leu - Alá Alá * - Val Val (948-955)C-terminal sequence: Leu - Alá Alá * - Val Val (948-955)
Közbülső szekvencia (1): Lys Leu Tyr Glu Phe Leu ValIntermediate sequence (1): Lys Leu Tyr Glu Phe Leu Val
Asn Alá Gin Gly - Asp Val Val Alá (349-365) Közbülső szekvencia (2): Gin Leu Leu Alá Pro ProAsn Alá Gin Gly - Asp Val Val Alá (349-365) Intermediate sequence (2): Gin Leu Leu Alá Pro Pro
Alá Met Ser Asn Alá Leu - Thr (592-605) Közbülső szekvencia (3): Leu Thr Alá Asp Thr GlyAlá Met Ser Asn Alá Leu - Thr (592-605) Intermediate sequence (3): Leu Thr Alá Asp Thr Gly
Met Ser Lys Asp Glu Ile Tyr Ser Arg Ile Glu (721-738)Met Ser Lys Asp Glu Ile Tyr Ser Arg Ile Glu (721-738)
Közbülső szekvencia (4): Alá---Ser Phe Gly ThrIntermediate Sequence (4): Al --- Ser Phe Gly Thr
Asn Asp Leu Cys Gin Met Val Phe Gly - Ser (844-862).Asn Asp Leu Cys Gin Met Val Phe Gly - Ser (844-862).
A fent leírt aminosavszekvenciákban olyan glutamint jelent, amit a használt analizátorral nem lehetett kimutatni, és azt jelenti, hogy az analízis eredménye bizonytalan. A zárójelbe tett számok az 5. azonosító számon megadott aminosavszekvencia megfelelő régiói aminosavsorszámait mutatják. Noha a közbülső szekvencia (2) és (4) különböznek az 5. azonosító számon megadott aminosavszekvenciától, azt gondoljuk, hogy ez az aminosavszekvenátor hibájának tudható be. Amint az jól ismert, aminosavszekvenáló berendezések jelentős gyakorisággal követnek el hibákat, míg a DNS-szekvenáló berendezések lényegében nem hibáznak.In the amino acid sequences described above, it means glutamine that could not be detected by the analyzer used, and means that the result of the analysis is uncertain. The numbers in parentheses represent the amino acid sequences of the corresponding regions of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5. Although the intermediate sequence (2) and (4) differ from the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5, it is believed that this is due to an error in the amino acid sequencer. As is well known in the art, amino acid sequencing equipment makes a lot of mistakes, while DNA sequencing equipment does not make mistakes.
Mivel az 5. azonosító számon bemutatott aminosavszekvencia jó egyezést mutat a részleges aminosavszekvenciákkal, amiket közvetlenül a fent leírt tisztított PPDK-ból határoztunk meg, megerősítést nyert, hogy az 5. azonosító számon bemutatott aminosavszekvencia a PPDK aminosavszekvenciája. Az 5. azonosító számon bemutatott aminosavszekvenciát összehasonlítottuk a Flaveria bidentis és a kukorica ismert PPDK-inak aminosavszekvenciáival. Eredményként azt kaptuk, hogy a Flaveria bidentis esetében 40, a kukorica esetében kb. 180 aminosav a különbség az érett fehérjének megfelelő régióban. Továbbá a fent leírt eredmények alapján úgy gondoljuk, hogy az 5. azonosító számon bemutatott aminosavszekvenciában az 1-től a 71. aminosavig terjedő aminosavszekvencia nem létezik az érett fehérjében, hanem csupán egy, a membránokon való átjutásra szolgáló tranzitpeptidszakasz, amely a membránokon való átjutás után lehasad. A Flaveria brownii és a Flaveria bidentis érett fehérjéinek aminosavszekvenciái közötti különbségeket mutatja be az 1. táblázat.Because the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 shows good agreement with the partial amino acid sequences determined directly from the purified PPDK described above, it is confirmed that the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 is the amino acid sequence of PPDK. The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5 was compared with the amino acid sequences of known PPDKs in Flaveria bidentis and maize. As a result, it was found that Flaveria bidentis had 40 and maize ca. 180 amino acids are the difference in the region corresponding to the mature protein. Furthermore, based on the results described above, it is believed that the amino acid sequence 1 to 71 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 does not exist in the mature protein, but only a transit peptide region that passes through the membranes. cleaved. Table 1 shows the differences in amino acid sequences between the mature proteins of Flaveria brown and Flaveria bidentis.
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
1. táblázatTable 1
2. példaExample 2
A Flaveria brownii PPDK termeltetése E. coliban és a hidegtűrés méréseCultivation of Flaveria brown PPDK in E. coli and measurement of cold tolerance
Annak érdekében, hogy megerősítsük, hogy a Flaveria brownii fent leírt módon izolált cDNS-éből egy hidegtűrő enzim ténylegesen termelődik, E. coliban expresszáltattunk a következőképpen :In order to confirm that a cold-tolerant enzyme was indeed produced from the cDNA of Flaveria brown isolated as described above, it was expressed as E. coli as follows:
A DNS-ben az alább leírt módon restrikciós helyeket építettünk ki annak érdekében, hogy eltávolíthassuk a tranzitpeptidet, és hogy a DNS-t expressziós vektorba ligálhassuk: tehát a p631-plazmidot Sacl-gyel emésztettük, majd újra ciklizáltuk, és így a p631Sac-plazmidot kaptuk (amely megegyezik a p631-gyel, azzal a különbséggel, hogy a óacl-hely 3’-irányba eső régióját kiejtettük). PCR-t végeztünk a p631 Sac-plazmidot templátként használva. Ehhez a következő két láncindítót alkalmaztuk: egyrészt az EcoRV-hasítóhelyet tartalmazó 4. láncindítót (szekvenciája GATATCAATCCGGTGTCTCCTCC), melyet a processziós régió szomszédságában levő szekvencia alapján készítettünk el, másrészt az M13RV-láncindítót (kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől), amely komplementer a vektor szekvenciájával. Az amplifikált fragmenst a pCRII-vektorba klónoztuk. Az N-terminális fragmenst tartalmazó régiót EcoRV és Sacl restrikciós enzimekkel kivágtuk. Három DNS-fragmenst ligáltunk, melyek a következők voltak: az így kivágott DNS-fragmens, a p631-ből származó Sacl/HindlU fragmens (amely a PPDK cDNS-ének a maradék régióját tartalmazza), valamint egy fragmens, amit úgy nyertünk, hogy a pKK233-2-plazmidot /Vcol-enzimmel emésztettük, a végeket Klenow-fragmenssel tompává tettük, majd a fragmenst megemésztettük /fmdIII-mal (1. ábra). Az így kapott plazmiddal transzformáltuk az E. coli MV1184-törzset, és az így kapott törzset használtuk expressziós kísérleteinkhez, 1 ml-es kultúrát felhígítottunk 9 ml, 50 mg/ml ampicillint tartalmazó friss LB-táptalajjal, és a kapott kultúrát 3 órán keresztül 37 °C-on rázattuk. Ezután IPTG-t adtunk hozzá a koncentrációját 5 mM-ra állítva be, majd újabb 3 órán ke7Restriction sites were constructed in the DNA as described below to remove the transit peptide and to ligate the DNA into an expression vector: thus, plasmid p631 was digested with SacI and then recycled to give plasmid p631Sac. (which is identical to p631, except that the 3 'region of the ohacl site was pronounced). PCR was performed using plasmid p631 Sac as a template. For this, two primers were used: one, the EcoRV cleavage site primer 4 (sequence GATATCAATCCGGTGTCTCCTCC), based on the sequence adjacent to the process region, and the M13RV primer commercially available from commercially available T vector sequence. The amplified fragment was cloned into the pCRII vector. The region containing the N-terminal fragment was excised with EcoRV and SacI. Three DNA fragments were ligated: the DNA fragment thus excised, the Sac6 / HindIII fragment from p631 (containing the remaining region of the PPDK cDNA), and a fragment obtained by Plasmid pKK233-2 was digested with / Vcol, the ends blunted with Klenow fragment and digested with / fmdIII (Figure 1). The plasmid thus obtained was transformed into E. coli MV1184 and the resulting strain was used for our expression experiments, 1 ml of culture was diluted with 9 ml of fresh LB medium containing 50 mg / ml ampicillin and the resulting culture was maintained for 3 hours. And shaken. IPTG was then added to a concentration of 5 mM, followed by another
HU 222 186 Bi resztül folytattuk a tenyésztést. A sejteket centrifugálással gyűjtöttük össze. A sejteket 0,5 ml feltáró pufferben (50 mM HEPES-KOH pH 7,5, 10 mM MgSO4, 1 mM EDTA, 5 mM DTT) felszuszpendáltuk, majd lizozimot adtunk hozzá végső koncentrációját kb. 0,5 mg/ml-re ál- 5 Irtva be. A szuszpenziót állni hagytuk jégben 5 percig, majd ultrahanggal tártuk fel a sejteket egy „Model UCD-130T” szonikálóberendezés (kereskedelmi forgalomban kapható a COSMOBIO cégtől) segítségével, másodperces adagokban, összesen 5 percig, ezzel 10 felszabadítva az enzimet. A kapott szuszpenziót mikrocentrifúgával 10 percig centrifugáltuk, majd a felülúszót egy Sephadex G25-ös oszlopra vittük fel, melyet előzőleg oszloppufferrel (50 mM HEPES-KOH pH 7,0, mM MgSO4, 2 mM EDTA, 10 mM DTT) ekvilibráltunk, hogy eltávolítsuk a kis molekulatömegű anyagokat. A kapott oldatot 25 °C-on legalább 30 percig állni hagytuk, ezzel biztosítva, hogy tetramer képződjék, melyet aztán felhasználtunk az aktivitás méréséhez.We continued to breed bi. Cells were harvested by centrifugation. The cells were resuspended in 0.5 ml of breaking buffer (50 mM HEPES-KOH pH 7.5, 10 mM MgSO 4, 1 mM EDTA, 5 mM DTT), and then lysozyme was added to a final concentration of approx. To 0.5 mg / ml. The suspension was allowed to stand on ice for 5 minutes and sonicated using a Model UCD-130T sonicator (commercially available from COSMOBIO) for a total of 5 minutes in total, liberating the enzyme. The resulting suspension is centrifuged for 10 minutes in a microcentrifuge and the supernatant was applied to a Sephadex G25 column equilibrated in column buffer (50 mM HEPES-KOH, pH 7.0, mM MgSO4, 2 mM EDTA, 10 mM DTT) to remove low molecular weight materials. The resulting solution was allowed to stand at 25 ° C for at least 30 minutes to ensure that a tetramer was formed, which was then used to measure activity.
Az E. coli sejtekben termelt, a Flaveria brownii, a Flaveria bidentis,, valamint a kukorica cDNS-éből származó PPDK-k SDS-PAGE segítségével vizsgálva lényegében ugyanazt a mozgékonyságot mutatták, mint a növényekből származó enzimek. Noha az érett enzimek megfelelő cDNS-ek ismeretében várt molekulasúlyai kb. ugyanazok, az SDS-PAGE-n tapasztalt látszólagos molekulasúlyok lényegesen különböznek. Bebizonyítottuk, hogy ez az aminosav-összetételben mutatkozó különbségeknek köszönhető, és nem annak, hogy a fehérje deléciót szenved, vagy egyéb transzláció utáni módosításoknak, mint például cukorláncok fehérjéhez való kötődése. Az E. coliban termelt minden egyes PPDK hidegtűrése megegyezett az egyes növényekből származó megfelelő enzim hidegtűrésével. így tehát a Flaveria brownii PPDK hidegtűréséhez nem szükséges semmilyen, a növényre specifikus kiegészítő faktor vagy transzláció utáni átalakítás, ezért azt várjuk, hogy a cDNS-t kukoricába juttatva és expresszáltatva hideg15 tűrő PPDK-t termeltethetünk. A 2. ábra mutatja az enzim 0 °C-on való inkubálásának időtartama és relatív PPDK-aktivitása közötti összefüggést.PPDKs derived from Flaveria brown, Flaveria bidentis, and maize cDNAs produced in E. coli cells by SDS-PAGE showed essentially the same motility as plant-derived enzymes. Although the expected molecular weights of the mature enzymes, knowing the appropriate cDNAs, are approx. the same apparent molecular weights observed on SDS-PAGE differ significantly. We have shown that this is due to differences in amino acid composition and not to protein deletion or other post-translational modifications, such as binding of sugar chains to protein. The cold tolerance of each PPDK produced in E. coli was the same as that of the corresponding enzyme from each plant. Thus, the cold tolerance of Flaveria brown PPDK does not require any plant-specific additional factor or post-translational transformation, and it is expected that the cDNA can be introduced and expressed in maize to produce cold 15 tolerant PPDK. Figure 2 shows the relationship between the duration of the enzyme incubation at 0 ° C and the relative PPDK activity.
A fent leírt eljárás arra szolgál, hogy E. coliban aktív PPDK-t termelhessünk. Az eljárás során a cDNS-t, 20 melyből a tranzitpeptidet kódoló régiót eltávolítottuk, expressziós vektorba inszertáltuk. Ezért fontos volt pontosan illeszteni a hasítandó helyeket a növényekből származó enzim N-terminálisának megfelelő helyekkel.The method described above serves to produce active PPDK in E. coli. In this method, the cDNA from which the transit peptide coding region was removed was inserted into an expression vector. It was therefore important to precisely align the sites to be cleaved with those corresponding to the N-terminus of the plant-derived enzyme.
Részletesebben kifejtve, miközben kísérletet tettünk a Flaveria brownii cDNS-ének expresszálására, a 45 kukoricából és a Flaveria bidentisből származó PPDKk expressziója síkénél járt úgy, hogy mindkét esetben a kukoricából származó hasítóhelyet használtuk. így a Flaveria brownii cDNS-ének expresszálása során is, először - a 2. láncindítót használva - ezen a helyen ha- 50 sítottuk el a DNS-t, és a cDNS-t tartalmazó expressziós vektor elkészítése után megkíséreltük expresszálni a cDNS-t. PPDK azonban egyáltalán nem termelődött. Ezután a levelekből származó enzim N-terminális régiójának szekvenciája alapján egy expressziós vektort készítettünk a 3. láncindító segítségével, melyben az inszertált cDNS egy olyan további szekvenciát is tartalmaz, amely az N-terminális irányban 7 aminosavval meghosszabbított enzimet kódol. Ezt az expressziós vektort felhasználva expressziót végeztünk. Ennek ered- 60 ményeképpen PPDK termelődött. Azonban, még ezzel az expressziós vektorral dolgozva is, a keletkezett enzim mennyisége kicsi volt, így a kinyert enzimmennyiség nem volt elegendő ahhoz, hogy megmérjük az aktivitását. így egy újabb expressziós vektort készítettünk a 4. láncindító segítségével, melyben az inszertált cDNS még egy további szekvenciát is tartalmaz, amely az N-terminális irányban 1 aminosavval meghosszabbított enzimet kódol. Ezt az expressziós vektort felhasználva expressziót végeztünk. Ennek eredményeképpen nagy mennyiségű PPDK termelődött, amely hidegtűrő55 nek bizonyult. A 2. és a 3. láncindító nukleotidszekvenciái a következők voltak:More specifically, while an attempt was made to express Flaveria brown cDNA, the expression of PPDKs from 45 maize and Flaveria bidentis was at a level using the maize site in both cases. Thus, during expression of Flaveria brown cDNA, DNA was first cleaved at this site using primer 2, and an attempt was made to express the cDNA after constructing the expression vector containing the cDNA. However, PPDK was not produced at all. Subsequently, an expression vector was constructed based on the sequence of the N-terminal region of the leaf-derived enzyme using primer 3, in which the inserted cDNA also contains an additional sequence encoding an enzyme extended by N-terminal amino acids. Expression was made using this expression vector. As a result, 60 PPDKs were produced. However, even with this expression vector, the amount of enzyme produced was small, so that the amount of enzyme recovered was not sufficient to measure its activity. Thus, another expression vector was constructed using primer 4, in which the inserted cDNA also contains an additional sequence encoding an N-terminally-extended enzyme. Expression was made using this expression vector. As a result, a large amount of PPDK was produced, which proved to be cold tolerant55. The nucleotide sequences of primers 2 and 3 were as follows:
2. láncindító: CGGTGTCTCCTCCGGATATCACGGCTAAAAAGAGPrimer 2: CGGTGTCTCCTCCGGATATCACGGCTAAAAAGAG
3. láncindító: TTGATATCCCGGTTGTCTCCTCCGGTAPrimer 3: TTGATATCCCGGTTGTCTCCTCCGGTA
HU 222 186 Β1HU 222 186 Β1
3. példaExample 3
A hidegtűrésért felelős régió azonosítása aIdentification of the cold tolerance region a
Flaveria brownii PPDK-génben (1) A Flaveria browniíből és Flaveria bidentisbol előállított kiméraFlaveria browniei in the PPDK gene (1) Chimeras produced from Flaveria brownie and Flaveria bidentis
Az expressziós vektorokat önmagában ismert módon rekombináltuk restrikciós enzimek alkalmazásával. Ez úgy történt, hogy a pKK-brownii EcoRAIHindlll fragmensét kicseréltük a pKK-bidentis megfelelő fragmensével (utóbbi plazmidot úgy kaptuk, hogy a Flaveria bidentis cDNS-ét inszertáltuk a pKK 223-2-be, éppúgy, mint ez a pKK-brownii elkészítésénél történt), és így a pKK-ΟΙ 1-plazmidot kaptuk. Másfelől, a pKK-bidentis EcoRl/Hindül fragmensét kicseréltük a pKK-brownii megfelelő fragmensével, és így a pKK-100-plazmidot kaptuk. Hasonlóképpen kicseréltük az Ndel/Hindlll fragmenseket is, és így a pKK-001- és a pKK-110-plazmidokat kaptuk. Továbbá, a pKK-110 Xhol/Hindlll fragmensét kicserélve a ρΚΚ,-bidentis megfelelő fragmensével, a ρΚΚ-1101-et kaptuk, a pKK-bidentis Xhol/Hindlll fragmensét a p¥AZ-brownii megfelelő fragmensével kicserélve pedig a pKK-1110-et. Az Xhol/Hindlll fragmenseket PCR-rel összekapcsoltuk (összekapcsoló vagy „linking” PCR-módszer), annak érdekében, hogy további, pontosabb rekombinációt hajthassunk végre rajtuk. Elkészítettük az Xhol/Hindlll fragmens a browniiban és a bidentisben közös nukleotidszekvenciájával komplementer láncindítót, a „link-F”láncindítót: GCAGAGATGATGTTGGCAAG, és a „link-R”láncindítót: CTTGCCAACATCATCTCTGC. A brownii vagy a bidentis pBluescriptSK(-)-vektorba klónozott Xhol/Hindlll fragmensét templátként használva, valamint a „link-F”/RV vagy az M4/„link-R” láncindító-kombinációkat alkalmazva végrehajtottuk az első PCR-t. A kapott fragmenseket (összesen 4 típus) gélből való kivágással tisztítottuk. A brownii első felét kódoló fragmens és a bidentis második felét kódoló fragmens keverékét, vagy a bidentis első felét kódoló fragmens és a brownii második felét kódoló fragmens keverékét templátként használva, az M4/RV láncindítók segítségével egy második PCR-t hajtottunk végre. Az amplifikált összekapcsolt fragmenseket Xhol-gyel és Hindlll-mal megemésztettük, és a kapott fragmenseket kicseréltük a pKK-bidentis megfelelő régiójával, ilyenformán a pKKlinkOl-et és a pKK-linklO-et kapva. Újabb pár kiméra gént készítettünk az összekapcsoló PCR-rekombinációs helye és a //zWIII-hasítóhely közötti Psíl-helyet kihasználva. Ez úgy történt, hogy a pKK-linklO Xhol/Pstl fragmensét és a pKK-bidentis Pstl/HindWl fragmensét inszertáltuk a pKK-bidentis Xhol/Hindlll helyére, eredményül a pKKlinklOl-et kapva. Hasonlóképpen, a pKK-bidentis Xhol/Pstl fragmensét és a pKK-brownii Pstl/Hindlll fragmensét inszertáltuk a pKK-bidentis Xhol/Hindlll helyére, eredményül a pKK-linkl 10-et kapva.Expression vectors were recombined in a manner known per se using restriction enzymes. This was done by replacing the EcoRAIHindIII fragment of pKK with the corresponding fragment of pKK-bidentis (the latter plasmid was obtained by inserting the Flaveria bidentis cDNA into pKK 223-2, as was the case with pKK-brown). ) to give plasmid pKK-ΟΙ 1. On the other hand, the Eco RI / HindIII fragment of pKK-bidentis was replaced with the corresponding fragment of pKK-brown to give plasmid pKK-100. Similarly, the NdeI / HindIII fragments were exchanged to give plasmids pKK-001 and pKK-110. Furthermore, the Xhol / Hindlll fragment of pKK-110 was replaced with the corresponding fragment ρΚΚ, -bidentis, and the κΚΚ-1101 fragment of pKK-bidentis was replaced by the corresponding fragment of p ap AZ-Brown, pKK-1110. . The Xhol / HindIII fragments were linked by PCR (linker or "linking" PCR method) to allow further, more accurate recombination. A primer complementary to the common nucleotide sequence of the Xhol / HindIII fragment in brown and bidentis, the linker F-linker: GCAGAGATGATGTTGGCAAG, and the linker-R primer: CTTGCCAACATCATCTCTGC. The first PCR was performed using the Xhol / HindIII fragment cloned into the brown or bidentis pBluescriptSK (-) vector and using the link-F / RV or M4 / link-R primer combinations. The resulting fragments (4 types in total) were purified by gel excision. A second PCR was performed using M4 / RV primers as a template using a mixture of the first half of Brownian fragment and the second half of bidentis fragment, or a mixture of the first half of bidentis fragment and the second half of Brownian fragment. The amplified linked fragments were digested with XhoI and HindIII and the resulting fragments were replaced with the corresponding region of pKK-bidentis, thereby obtaining pKKlinkO1 and pKK-link10. Another pair of chimeric genes were constructed utilizing the PsIII site between the recombinant PCR recombination site and the / zWIII site. This was done by inserting the XhoI / PstI fragment of pKK-linklO and the PstI / HindIII fragment of pKK-bidentis into the XhoI / HindIII site of pKK-bidentis, resulting in pKKlink10. Similarly, the XhoI / PstI fragment of pKK-bidentis and the PstI / HindIII fragment of pKK-brown were inserted into the XhoI / HindIII site of pKK-bidentis, resulting in pKK-linkl10.
A 40 hely, ahol a Flaveria bidentis és a Flaveria brownii érett PPDK-fehérjéinek aminosavai különböznek, főként az N- és a C-terminális régióban található, és nem sok van belőlük a középső régióban, azaz az aktív helyen. A cDNS-eket három régióra osztottuk tehát, az első, középső és hátsó régiókra, kihasználva az £coRI és az Ndél helyeket, melyek mindkét génben közönségesen előfordulnak, és ezeket a fragmenseket egymással kölcsönösen többféleképpen kicserélve kiméra géneket készítettünk. Ezen kiméra géneket ellenőrizve meghatároztuk a hidegtűrésért felelős régiót. Eredményül azt kaptuk, hogy a fehérje hidegtűrésre tesz szert, ha tartalmazza a Flaveria brownii cDNS-ének hátsó 1/3 régióját. Ezzel szemben ha a fehérje a Flaveria bidentis hátsó 1/3 régióját tartalmazta, hidegérzékeny volt. Ezután a hátsó 1/3 régiót Xhől restrikciós enzimmel két régióra hasítottuk, és a fragmenseket sorra kicseréltük a pKK-bidentis megfelelő régióival, majd ellenőriztük a hidegtűrést. Az eredmény az volt, hogy az Xhol helytől 3’-irányba eső régió (azaz a C-terminálistól számított 1/6 régió) volt szükséges, és egyben elégséges a hidegtűrés biztosításához. Ezután egy, a hátsó 1/6 régiót (a 7 aminosavhelyettesítést tartalmazó Xhol/Hindlll fragmens) tartalmazó kiméra gént készítettünk összekapcsoló PCR-módszerrel, majd az amplifikált gént pKK-bidentisbe építtettük be, amelynek azután megmértük a hidegtűrését. Olyan eredményt is kaptunk, mely szerint a pKK-link 10-ben kódolt kiméra enzim, melynek a leginkább hátsó régiója 4 helyettesítést tartalmazott, hidegtűrőnek bizonyult, míg a pKKlinkO 1-ben kódolt, a hátsó régió előző felét, és ebben három helyettesítést tartalmazó enzim hidegérzékeny volt. Ezután a hátsó régión rekombinációt hajtottunk végre a Pstl restrikciós enzim segítségével, így génenként két aminosavhelyettesítést tartalmazó kiméra géneket készítettünk, és az így kapott gének hidegtűrését ellenőriztük. így tehát elfogadhatjuk, hogy két vagy több régió is összefüggésben van a hidegtűréssel.The 40 sites where the amino acid residues of the mature PPDK proteins of Flaveria bidentis and Flaveria brown differ are mainly located in the N- and C-terminal regions, and not much in the central region, i.e. the active site. The cDNAs were thus divided into three regions, the first, middle, and back regions utilizing the κ coRI and the Nde sites which are commonly found in both genes, and the chimeric genes were mutually interchanged. By checking these chimeric genes, the region responsible for cold tolerance was determined. As a result, the protein was found to have cold tolerance if it contained the back 1/3 region of Flaveria brown cDNA. In contrast, if the protein contained the back 1/3 region of Flaveria bidentis, it was cold sensitive. The posterior 1/3 region was then cleaved into XIII by restriction enzyme and the fragments were sequentially replaced with the corresponding regions of pKK-bidentis and the cold tolerance checked. The result was that a region 3 'to the Xhol site (i.e., 1/6 region from the C-terminal) was necessary and sufficient to provide cold tolerance. Then, a chimeric gene containing the back 1/6 region (the Xhol / HindIII fragment containing the 7 amino acid substitutions) was prepared by linkage PCR, and the amplified gene was inserted into pKK bidentis, which was then measured for cold tolerance. We also found that the chimeric enzyme encoded in pKK-link 10 with the most back region containing 4 substitutions proved to be cold-tolerant, while the pKKlinkO 1 encoded enzyme containing the upstream half of the back region with three substitutions he was cold sensitive. Subsequently, recombination in the posterior region was performed with the restriction enzyme Pstl to produce chimeric genes with two amino acid substitutions per gene and to check the cold tolerance of the resulting genes. Thus, it can be accepted that two or more regions are associated with cold tolerance.
(2) A kukoricából és a Flaveria browniífoól készült kiméra(2) Chimera of maize and Flaveria browniifo
A PPDK-F-láncindítót (CTCACTGTTCGAAGAGAAGC) és az AWel-helyet tartalmazó m/Vűfel-láncindítót (CATATGCTCTGTCCGGCATAATC, komplementer lánc), valamint a kukorica-PPDK cDNS-ét mint templátot felhasználva PCR-t hajtottunk végre, és az amplifikált fragmenst a pCRII-vektorba klónoztuk. Ezt a fragmenst kivágtuk a pCRlI-ből, Sad-gyel és Ndélgyel. Ezt a fragmenst, a pKK-PPDK Sacl/Smal fragmensét (vektorfragmens) és egy fragmenst - melyet úgy nyertünk, hogy a Flaveria brownii PPDK-jának cDNS-ét megemésztettük, a végeit Klenow-fragmenssel tompává tettük, majd M/el-gyel megemésztettük - három fragmensösszekötő reakcióval összeláncoltuk (3. ábra), és így a pKK-mz/bro/AWe)-t kaptuk. A PPDK-F-láncindítóval, az mATíoI-láncindítóval (CTCGAGGGATCTCAATCATTG, komplementer lánc) és a kukorica-PPDK-val mint templáttal PCR-t végeztünk. Az így kapott fragmenst pCRII-be klónoztuk, és az inszertet 5ac/-gyel és Xhol-gyel kivágtuk a pCRIIből. A kivágott fragmenst a pKK-mz/bro/We) SaclXhol fragmensével (vektorfragmens) összeligáltuk a pKK-mz/bro(A7zo)-t kapva ezzel.PCR using the PPDK-F primer (CTCACTGTTCGAAGAGAAGC) and the m / V helper primer containing the AWel site (CATATGCTCTGTCCGGCATAATC), as well as the maize PPDK cDNA as a template, was performed using PCR to amplify, vector. This fragment was excised from pCR11, Sad and Neel. This fragment, the Sacl / Smal fragment of pKK-PPDK (vector fragment), and a fragment obtained by digestion of the cDNA of Flaveria brown PPDK were blunt-ended and then digested with M / I. - linked by three fragment coupling reactions (Figure 3) to give pKK-mz / bro / AWe). PCR was performed with the PPDK-F primer, the mATIII primer (CTCGAGGGATCTCAATCATTG, complementary strand) and maize PPDK as template. The resulting fragment was cloned into pCRII and the insert was excised from pCRII with 5ac and XhoI. The excised fragment was ligated with the SaclXhol fragment (vector fragment) of pKK-mz / bro / We) to give pKK-mz / bro (A750).
Az a kiméra enzim, amelyik a kukorica-PPDK-ban a brownii PPDK C-terminális 1/3 régióját (az Ndel/Hindlll fragmenst) tartalmazta, valamint az a kiméra enzim, amelyik a kukorica-PPDK-ban a brownii PPDK C-terminálisThe chimeric enzyme containing the C-terminal 1/3 region of the Brown PPDK in maize PPDK (the NdeI / HindIII fragment) and the chimeric enzyme containing the C-terminal brown PPDK in maize PPDK
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
1/6 régióját (az Xhol/HindlII fragmenst) tartalmazta, egyaránt a brownii PPDK-val azonos mértékű hidegtűrést mutatott. így, mivel a kukorica-PPDK-t, melynek aminosavszekvenciája jelentősen eltér a F. brownii PPDK-étól, hidegtűrővé tehetjük, úgy gondoljuk, hogy különböző növények PPDK-it szintén hidegtűrővé tehetjük a hátsó 1/3 régió vagy a C-terminális 1/6 régió beépítése útján. Mivel az így elkészített kukorica/F. brownii kiméra PPDK eredeti formájában tartalmazza a kukoricaPPDK tranzitpeptidjét, ezért ha egy transzformált növény nem tudná transzportálni a Flaveria brownii tranzitpeptidjét tartalmazó, hidegtűrő PPDK-t a kloroplasztjaiba, a problémát úgy hidalhatjuk át, hogy ezt a kiméra gént juttatjuk a F. browniiból származó gén helyére.It contained 1/6 regions (the Xhol / HindIII fragment) and showed the same degree of cold tolerance as Brown PPDK. Thus, since maize PPDK, whose amino acid sequence is significantly different from that of F. brownney PPDK, can be made cold-tolerant, it is believed that PPDKs of various plants can also be made cold-tolerant by the back 1/3 region or the C-terminal 1 / 6 regions. Because the maize so prepared / F. Brownian chimeric PPDK contains the maizePPDK transit peptide in its original form, so if a transformed plant would not be able to transport cold tolerant PPDK containing the Flaveria brannii transit peptide to its chloroplasts, the problem could be overcome by transferring this chimeric gene to F. .
(3) Pontmutáns kiónok(3) Point mutant clone
A pKK-brownii Xhol/HindlII fragmensének aminosavait egyenként kicseréltük brownii típusúról bidentis típusúra. Hasonlóképpen, a pKK-bidentis Xhol/HindlII fragmensének aminosavait is kicseréltük egyenként bidentis típusúról brownii típusúra. A mutációkat úgy hoztuk létre, hogy a F. brownii és a F. bidentis PPDK-cDNSeinek Xhol/Hindlll ffagmenseit pBluescriptIISK(-)vektorba klónoztuk, majd a nukleotidokat Kunkel módszere szerint helyettesítettük a „Megalabef’-reagenskészlet (kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől) és a „Mutan-K”-reagenskészlet (kereskedelmi forgalomban kapható a TAKARA SHUZO cégtől) alkalmazásával. A mutációk elkészítéséhez használt láncindítók szekvenciáit a 2. táblázat tartalmazza. Miután a mutált nukleotidszekvencia helyességéről DNS-szekvenáló berendezés segítségével megbizonyosodtunk, ezeket a fragmenseket a pKK-bidentis Xhol/Hindlll helyére inszertáltuk.The amino acids of the XhoI / HindIII fragment of pKK-brown were individually changed from brown to bidentis. Similarly, the amino acids of the XhoI / HindIII fragment of pKK-bidentis were changed from bidentis to brown. Mutations were generated by cloning the XhoI / HindIII phage fragments of the F. Browniani and F. bidentis PPDK cDNAs into pBluescriptIISK (-) and replacing the nucleotides by the Kunkel method using the commercially available T ) and the Mutan-K reagent kit (commercially available from TAKARA SHUZO). The sequences of the primers used to generate the mutations are listed in Table 2. Once the mutated nucleotide sequence was confirmed by DNA sequencing, these fragments were inserted into the XhoI / HindIII site of pKK-bidentis.
2. táblázatTable 2
A pontmutáns kiónok elkészítéséhez használt láncindítókThe primers used to make point mutant clones
Az enzimek mindegyike, amelyben egy aminosavat kicseréltünk úgy, hogy a pKK-1110 Xhol/HindlII régiójában kicseréltünk egy, a F. browniiban és a F. bidentisben eltérő aminosavat a megfelelő bidentis típusúra, hidegtűrést mutatott. Ezért úgy gondoljuk, hogy egyszerre több helyettesítés kell a hidegtűréshez, mivel a hidegtűrés nem szűnt meg csupán egy aminosavat megváltoztatva. Ezután olyan enzimeket készítettünk, melyekben egy aminosavat kicseréltünk úgy, hogy a pKKbidentis Xhol/HindlII régiójában egy, a F. browniiban és a F. bidentisben eltérő aminosavat a megfelelő brownii típusúval helyettesítettünk, és leellenőriztük, hogy az enzimek hidegtűróek-e. Ezért 0 °C-on való 20 perces inkubálás után megmértük az enzimaktivitást. Ennek során a 869Gln-»Pro mutáns bizonyult hidegtűrőnek (a hidegben való inkubálás után az eredeti aktivitás 60-70%-a maradt meg). A 885Ile-»Leu és a 952Ile—>Val mutánsok esetében az alacsony hőmérséklet hatására történő aktivitáscsökkenés valamivel mérséklődött. Ezeket az eredményeket, valamint az (1) pont szerinti, pKK-linkllO kiméra enzimmel kapcsolatos eredményeket figyelembe véve feltételezhetjük, hogy a hidegtűrés eléréséhez ezen mutációk együttes megléte szükséges. Ezekből az eredményekből azt a következtetést vontuk le, hogy három aminosav, a 869Pro, 885Leu és a 952Val függ össze a hidegtűréssel. Azonban ezen, a brownii hidegtűrésével összefüggő aminosavak között vannak olyanok, nevezetesen a 869Pro és a 885Leu, amelyek brownii típusúak a kukorica-PPDK-ban is. Ezért a hidegtűrés nem szükségszerűen azzal érhető el, hogy ezek az aminosavak brownii típusúak, de úgy gondoljuk, hogy ezen aminosavak teljes hidegtűrést biztosítanak a brownitbbl vagy a bidentisből származó PPDK aminosavszekvenciájában. Ezért, azokban az esetekben, amikor más fajból származó PPDK-nak szándékozunk hidegtűrést kölcsönözni, amelynek aminosavszekvenciája jelentősen eltér a browniiétől és a bidentisélol, jobb, ha nem pontmutációkat végzünk, hanem kiméra gént készítünk, melybe egy hidegtűrésért felelős régiót építünk be úgy, mint a kukorica-PPDK esetében.Each of the enzymes in which an amino acid was replaced by substituting an XIII / HindIII region of pKK-1110 for the corresponding bidentis type, differing in F. brownney and F. bidentis, exhibited cold tolerance. Therefore, it is believed that several substitutions are needed at one time for cold tolerance, since cold tolerance is not abolished by changing only one amino acid. Subsequently, enzymes were prepared by replacing an amino acid by substituting the corresponding brown type in the XhoI / HindIII region of pKKbidentis with the corresponding brown type and checking that the enzymes were cold-tolerant. Therefore, the enzyme activity was measured after incubation at 0 ° C for 20 minutes. In this process, the 869Gln-Pro mutant proved to be cold tolerant (60-70% of the original activity was retained after incubation in cold). In the case of 885Ile- »Leu and 952Ile-> Val mutants, the decrease in activity at low temperature was slightly reduced. In view of these results and the results relating to the pKK-linkllO chimeric enzyme according to (1), it is believed that coexistence of these mutations is required to achieve cold tolerance. From these results, it was concluded that three amino acids, 869Pro, 885Leu and 952Val, are related to cold tolerance. However, there are some of these amino acid residues associated with Brownian cold tolerance, namely 869Pro and 885Leu, which are also of the brown PPDK type. Therefore, cold tolerance is not necessarily achieved because these amino acids are of the brown type, but it is believed that these amino acids provide complete cold tolerance in the amino acid sequence of brownitb or bidentis derived PPDK. Therefore, in cases where we intend to confer cold tolerance to PPDK from other species whose amino acid sequence is significantly different from Brownian and bidentate, it is preferable not to make point mutations but to construct a chimeric gene incorporating the region responsible for cold tolerance. maize PPDK.
4. példaExample 4
Kukorica transzformálása Flaveria browniiTransformation of maize by Flaveria brownii
PPDK-génnelPPDK gene
Gordon-Kamm W. J. és munkatársai [The Plánt Cell 2, 603-618, (1990)], vagy Köziéi M. G. és munkatársai [Bio/Technology 11, 194-200 (1993)] módszerével összhangban arany- vagy volfrámrészecskéket borítunk be pKK-órownú'val, és a beborított részecskéket kukorica éretlen embrióiba vagy szuszpendált tenyésztett sejtekbe ültetjük be. Az így kezelt sejtek közül kiválasztjuk a transzformáltakat, a transzformált sejtekből nyert kalluszokból tenyészetet hozunk létre a hagyományos módszer szerint, majd a szövetekből regeneráljuk a növényt. A transzformálás elvégzésére nem csupán a részecskeágyú-módszer szolgálhat, hanem az alkalmazható módszerek közül szóba jöhet az elektroporáció [Rhodes C. A. és munkatársai, Science 240, 204-207, (1988)], PEG-módszer [Armstrong C. L. és munkatár10In accordance with the method of Gordon-Kamm WJ et al. (The Plant Cell 2: 603-618 (1990)) or Kohl MG et al. (Bio / Technology 11: 194-200 (1993)), gold or tungsten particles are coated with pKK clock. and the overlaid particles are implanted into immature maize embryos or suspended cultured cells. The transformed cells are selected from the transformed cells, the calli obtained from the transformed cells are cultured according to the conventional method, and the tissue is regenerated from the tissues. Not only the particle gun method, but also the electroporation method (Rhodes C.A. et al., Science 240: 204-207 (1988)), the PEG method (Armstrong C.L. et al.
HU 222 186 Bl sai, Plánt Cell Reports 9. 335-339, (1990)], szövetelektroporációs módszer (D’Halluin K. és munkatársai The Plánt Cell 4, 1495-1505, (1992)], Agrobacterium módszer [Hiei Y. és Komari T. WO 9400977] és hasonlók. Az így kapott növényekből magokat nyerünk 5 és csíráztatunk, hogy növényeket termeszthessünk.Plant Cell Reports 9: 335-339 (1990)], tissue electroporation method (D'Halluin K. et al., The Plant Cell 4, 1495-1505 (1992)), Agrobacterium method [Hiei Y. and Komari T. WO 9400977], and the like., The plants thus obtained are seeded and germinated to produce plants.
A növények leveleiből PPDK-t izolálunk, és leellenőrizzük a hidegtűrő mivoltát. A transzformált és a nem transzformált növények esetén is ellenőrizzük a hőmérséklet fotoszintézisre gyakorolt hatását. A transzformá- 10 ció stabilitásáról azáltal győződünk meg, hogy olyan kukoricanövényeket szaporítunk, melyeknek alacsony hőmérsékleten sok generáción keresztül gyors a fotoszintézisük, és mérjük a fotoszintézis sebességét különböző hőmérsékleteken, valamint a növényekből izolált PPDK-k hidegtűrését.PPDK was isolated from plant leaves and tested for cold tolerance. For both transformed and untransformed plants, the effect of temperature on photosynthesis is monitored. Transformation stability is assured by propagating maize plants that undergo rapid photosynthesis for many generations at low temperatures and measuring the rate of photosynthesis at various temperatures and the cold tolerance of PPDKs isolated from plants.
5. példaExample 5
Flaveria bidentis transzformálása Flaveria browniiTransformation of Flaveria bidentis into Flaveria brown
PPDK-génnelPPDK gene
Az Agrobacterium tumefaciens ártalmatlanított Tiplazmidjába egy, a szekvencialistában 5. sorszámon bemutatott teljes hosszúságú cDNS-t tartalmazó intermedier vektort és egy riportergént építünk be. Ezt elvégezhetjük a Draper és munkatársai által szerkesztett [„Plánt Genetic Transformation and Gene Expression - a laboratory manual”, szerk.: Draper, Blacwell Scientific Publications (ISBN 0-632-02172-1)] laboratóriumi kézikönyvben leírt módszerrel. Más esetben a Flaveria bidentis levélszövetét vagy kalluszát fertőzzük a fent említett Agrobacterium tumefacienssel. Ezt úgy végezhetjük el, hogy a szövetet vagy a kalluszt együtt tenyésztjük Agrobacterium tumefaciensseA. A fertőzött sejteket hatóanyag-rezisztencia alapján szelektáljuk. A kiválasztott kalluszokból teljes növényeket regenerálunk önmagában ismert eljárás szerint. Az így nyert növényekből kapott magokat kicsíráztatjuk, és növényeket nevelünk belőlük. Az így nyert növények le15 veiéiből PPDK-t izolálunk, és ellenőrizzük hidegtűrő mivoltát. A transzformált és a nem transzformált növények esetén egyaránt megvizsgáljuk a hőmérséklet hatását a fotoszintézis sebességére. A transzformáció stabilitásáról azáltal győződünk meg, hogy azokat a kukorica20 növényeket szaporítjuk, amelyeknek alacsony hőmérsékleten is gyors a fotoszintézisük sok generáción keresztül, miközben mérjük a fotoszintézis sebességét különböző hőmérsékleteken, valamint a növényekből izolált PPDK-k hidegtűrését.An intermediate vector containing the full-length cDNA shown in SEQ ID NO: 5 and a reporter gene were inserted into the disrupted Tipplasmid of Agrobacterium tumefaciens. This can be accomplished using the method described in Draper et al., "Laboratory Manual for Genetic Transformation and Gene Expression - A Laboratory Manual," ed. Draper, Blacwell Scientific Publications (ISBN 0-632-02172-1). Alternatively, the leaf tissue or callus of Flaveria bidentis is infected with the aforementioned Agrobacterium tumefaciens. This can be done by co-culturing the tissue or callus with Agrobacterium tumefaciensse. Infected cells are selected for drug resistance. From the selected calli, whole plants are regenerated according to a method known per se. Seeds obtained from the plants thus obtained are germinated and plants grown therefrom. PPDK was isolated from le15 cells of the resulting plants and tested for cold tolerance. For both transformed and untransformed plants, the effect of temperature on the rate of photosynthesis is investigated. Transformation stability is assured by propagating maize 20 plants that undergo rapid photosynthesis at low temperatures for many generations, while measuring the rate of photosynthesis at various temperatures and the cold tolerance of PPDKs isolated from plants.
SZEKVENCIALISTASEQUENCE LIST
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 1:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 2915LENGTH: 2915
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 1:
CGATCTCCTT CTGCTATTGC TGATATCTCA ATTTCACAGG TGAAGAAGG ATG ATG AGT 5 8 Me t Me t Ser 1CGATCTCCTT CTGCTATTGC TGATATCTCA ATTTCACAGG TGAAGAAGG ATG ATG AGT 5 8 Me t Me t Ser 1
HU 222 186 BIHU 222 186 BI
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 Β1HU 222 186 Β1
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
950950
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 2:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 2880LENGTH: 2880
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 2:
CGGCGCAGTA GGGGATCGGA AGG ATG GCG GCA TCG GTT TCC AGG GCC ATC TGC 5 3CGGCGCAGTA GGGGATCGGA AGG ATG GCG GCA TCG GTT TCC AGG GCC ATC TGC 5 3
Met Alá Alá Ser Val Ser Arg Alá Ile CysMet Alá Alá Ser Val Ser Arg Alá Ile Cys
5 105 10
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 Β1HU 222 186 Β1
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 BIHU 222 186 BI
940 945940 945
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 3:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 2610LENGTH: 2610
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 3:
GAATTCTCAA TCCTTTGCTC ATCGCAGCAT ATCAATGTTA ACACATAAAC TTTAGGAGGA 60 AGAAAACTT ATG GCA AAA TGG GTT TAT AAG TTC GAA GAA GGC AAT GCA TCT 11 1GAATTCTCAA TCCTTTGCTC ATCGCAGCAT ATCAATGTTA ACACATAAAC TTTAGGAGGA 60 AGAAAACTT ATG GCA AAA TGG GTT TAT AAG TTC GAA GAA GGC AAT GCA TCT 11 1
Met Alá Lys Trp Val Tyr Lys Phe Glu Glu Gly Asn Alá Ser 1 5 10Met Alá Lys Trp Val Tyr Lys Phe Glu Glu Gly Asn Alá Ser 1 5 10
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
275 280 285275 280 285
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 Β1HU 222 186 Β1
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
24152415
24632463
25112511
25592559
26092609
GG
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI :DETAILS OF SEQ ID NO: 4:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 2722LENGTH: 2722
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 4:
GAACTATTTA AGGAATTTGT AAGAATTTAG AGTTCATTCA GATAATA ATG CAA AGA Met Gin ArgGAACTATTTA AGGAATTTGT AAGAATTTAG AGTTCATTCA GATAATA ATG CAA AG Gin Arg
26102610
104104
152152
200200
248248
296296
344344
392392
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 BIHU 222 186 BI
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
Glu Asn 885Glu Asn 885
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:DETAILS OF SEQ ID NO: 5: SEQUENCE FEATURES:
HOSSZA: 3180LENGTH: 3180
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 5:
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 BIHU 222 186 BI
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
HU 222 186 Β1HU 222 186 Β1
ValWith
955955
ATATTATTTT GGTTTCATCC TTATTGTAAT GGTGAAAATG AACGATGTTT AAACAAAACA 3116 ACCCATTATA TTTTGGTTTG GTATGCAATA ATCTACTTTT CAAACAAAAA AAAAAAAAAA 3176 AAAA 3180ATATTATTTT GGTTTCATCC TTATTGTAAT GGTGAAAATG AACGATGTTT AAACAAAACA 3116 ACCCATTATA TTTTGGTTTG GTATGCAATA ATCTACTTTT CAAACAAAAA AAAAAAAAAA 3176 AAAA 3180
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 6:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 18LENGTH: 18
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 6:
GACGGCTAAA AAGAGGGT 18GACGGCTAAA AAGAGGGT 18
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 7:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI :CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 7:
TATCGAGAAA CCTTCTATAC 20TATCGAGAAA CCTTCTATAC 20
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 8:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 17LENGTH: 17
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 8:
GTTTTCCCAG TCACGAC 17GTTTTCCCAG TCACGAC 17
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 9:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 17LENGTH: 17
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 9:
CAGGAAACAG CTATGAC 17CAGGAAACAG CTATGAC 17
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 10:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 23LENGTH: 23
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 10:
GATATCAATC CGGTGTCTCC TCC 23GATATCAATC CGGTGTCTCC TCC 23
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:All. SEQ ID NO:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 134LENGTH: 134
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:All. DESCRIPTION OF SEQ ID NO:
CGGTGTCTCC TCCGGATATC ACGGCTAAAA AGAG 34CGGTGTCTCC TCCGGATATC ACGGCTAAAA AGAG 34
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 12:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 27LENGTH: 27
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 12:
TTGATATCCC GGTTGTCTCC TCCGGTA 27TTGATATCCC GGTTGTCTCC TCCGGTA 27
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 13:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 13:
GCAGAGATGA TGTTGGCAAG 20GCAGAGATGA TGTTGGCAAG 20
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 14:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 14:
CTTGCCAACA TCATCTCTGC 20CTTGCCAACA TCATCTCTGC 20
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 15:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 15:
CTCACTGTTC GAAGAGAAGC 20CTCACTGTTC GAAGAGAAGC 20
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 16:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 23LENGTH: 23
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 16:
CATATGCTCT GTCCGGCATA ATC 23CATATGCTCT GTCCGGCATA ATC 23
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 17:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 21LENGTH: 21
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 17:
CTCGAGGGAT CTCAATCATT G 21CTCGAGGGAT CTCAATCATT G 21
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:DETAILS OF SEQ ID NO: 18 SEQUENCE FEATURES:
HOSSZA: 18LENGTH: 18
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
HU 222 186 Β1HU 222 186 Β1
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 18:
GCAATCTCTT CAGCAATC 1 8GCAATCTCTT CAGCAATC 1 8
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI :DETAILS OF SEQ ID NO: 19:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 19:
GCTTCTTTTC CAATCTCATC 20GCTTCTTTTC CAATCTCATC 20
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 20:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 18LENGTH: 18
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 20:
CGAAAAGAAA TCGGCTTC 18CGAAAAGAAA TCGGCTTC 18
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 21:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 24LENGTH: 24
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 21:
GAAAGATAAA TCTGCAAAAA CTTG 24GAAAGATAAA TCTGCAAAAA CTTG 24
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 22:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 19LENGTH: 19
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 22:
GCCTTGAGCA AGATAAATC 19GCCTTGAGCA AGATAAATC 19
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 23:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 21LENGTH: 21
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 23:
TTCTGGTCAA TAACCTCAAT G 21TTCTGGTCAA TAACCTCAAT G 21
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 24:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI :CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 24:
GCTTAAACAA TGACTTGTGC 20GCTTAAACAA TGACTTGTGC 20
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 25:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 22LENGTH: 22
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 25:
CCAATCTCAT CAGCTATTAA AG 22CCAATCTCAT CAGCTATTAA AG 22
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 26:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 26:
GCTTCTTTTG CAATCTCTTC 20GCTTCTTTTG CAATCTCTTC 20
HU 222 186 BlHU 222 186 Bl
A 27. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 27:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 18LENGTH: 18
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 27. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 27:
CGAAAAGAAC TCAGCTTC 1 8CGAAAAGAAC TCAGCTTC 1 8
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 28:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 23LENGTH: 23
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 28:
CAAGATAAAT CGGCAAAAAC TTG 2 3CAAGATAAAT CGGCAAAAAC TTG 2 3
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 29:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI :CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 23LENGTH: 23
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 29:
GAATGCCTTG AGAAAGATAA ATC 2 3GAATGCCTTG AGAAAGATAA ATC 2 3
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI :DETAILS OF SEQ ID NO: 30:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 24LENGTH: 24
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 30:
CTTTCTGGTC AAGAACCTCA AATG 24CTTTCTGGTC AAGAACCTCA AATG 24
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:DETAILS OF SEQ ID NO: 31:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
HOSSZA: 20LENGTH: 20
TÍPUSA: nukleinsavTYPE: nucleic acid
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 31:
GCTTAAACAA CGACTTGTGC 20GCTTAAACAA CGACTTGTGC 20
Claims (10)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP19778094 | 1994-07-29 | ||
PCT/JP1994/002022 WO1995015385A1 (en) | 1993-12-03 | 1994-12-01 | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, dna coding for the same, and recombinant vector and transformed plant both containing said dna |
PCT/JP1995/001040 WO1996004369A1 (en) | 1994-07-29 | 1995-05-30 | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, dna coding for the polypeptide, recombinant vector containing the dna, and transformed plant |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9600790D0 HU9600790D0 (en) | 1996-05-28 |
HUT76103A HUT76103A (en) | 1997-06-30 |
HU222186B1 true HU222186B1 (en) | 2003-08-28 |
Family
ID=28456114
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9600790A HU222186B1 (en) | 1994-07-29 | 1995-05-30 | Cold resistant pyruvate ortophosphate dikinase, the dna coding it, the recombinante vector containing the dna, and the transformed plants |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
HU (1) | HU222186B1 (en) |
-
1995
- 1995-05-30 HU HU9600790A patent/HU222186B1/en not_active IP Right Cessation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
HUT76103A (en) | 1997-06-30 |
HU9600790D0 (en) | 1996-05-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20050009165A1 (en) | Raffinose synthase gene, method for producing raffinose, and transgenic plant | |
US20110098180A1 (en) | Herbicide-Resistant Plants, And Polynucleotides And Methods For Providing Same | |
KR19990029084A (en) | Mutated 5-enolpyrubilishkimate-3-phosphate synthase, genes encoding the protein, and transformed plants containing the gene | |
KR20010005581A (en) | Plants with modified growth | |
WO1998029542A1 (en) | Floral organ-specific genes and promoter sequences thereof | |
US20080254536A1 (en) | Method of elevating photosynthesis speed of plant by improving pyruvate phosphate dikinase | |
Landschütze et al. | Mitochondrial citrate synthase from potato: predominant expression in mature leaves and young flower buds | |
NZ314034A (en) | Method of producing d-glucosyl d-glucosides (trehalose) in plant cells in the presence of a trehalase inhibitor | |
GB2360521A (en) | Genetic modification of starch in plants | |
EP1321525A2 (en) | Fruit ripening-related genes | |
WO1994028146A2 (en) | Dna sequences and plasmids for the preparation of sugar beet with changed sucrose concentration | |
AU697450B2 (en) | Processes for inhibiting and for inducing flower formation in plants | |
EP1559787A1 (en) | Cold-resistant pyruvate phosphate dikinase. | |
AU735864B2 (en) | Raffinose synthase gene, method for producing raffinose, and transgenic plant | |
US5569831A (en) | Transgenic tomato plants with altered polygalacturonase isoforms | |
RU2136748C1 (en) | Polypeptide showing activity of cold-resistant pyruvate-orthophosphate dikinase (variants), cloned dna encoding polypeptide, recombinant vector and method of plant transformation | |
HU222186B1 (en) | Cold resistant pyruvate ortophosphate dikinase, the dna coding it, the recombinante vector containing the dna, and the transformed plants | |
US7250277B2 (en) | Soybean raffinose synthase and a method for producing raffinose | |
CN111788216B (en) | Agent for controlling formation of salt vesicle cell and plant body into which the agent is introduced | |
EP0701617A1 (en) | Dna sequences and plasmids for the preparation of sugar beet with changed sucrose concentration | |
AU696436B2 (en) | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, DNA coding for the same, and recombinant vector and transformed plant both containing said DNA | |
JPH10512451A (en) | Deoxyribonucleic acid encoding glutathione S-transferase and use thereof | |
HUT76355A (en) | Plant gene-expression vector family based on dna fragments regulating alfalfa h3 histon gene variant (ms h3g1) | |
MXPA96001212A (en) | Polipeptido that has activity of piruvato ortofosfato dicinasa stable in cold, dna that codifies for the same and recombinant vector and transformed plants that contain the | |
JPH11123080A (en) | Gene for raffinose synthetase, production of raffinose and transformed plant |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HFG4 | Patent granted, date of granting |
Effective date: 20030624 |
|
MM4A | Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees |