FR3139820A1 - Molécule hybride comprenant un fragment Fc d’anticorps et au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, et ses utilisations - Google Patents

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Eve Combes
Jennifer Lambour
Christian Jorgensen
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Universite de Montpellier I
Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale INSERM
Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier CHUM
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
Universite de Montpellier
Universite Toulouse III Paul Sabatier
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Abstract

L’invention concerne une molécule hybride comprenant au moins un fragment Fc d’anticorps lié de façon covalente à au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, les utilisations d’une telle molécule hybride, ainsi que son procédé de production. (pas de figure)

Description

Molécule hybride comprenant un fragment Fc d’anticorps et au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, et ses utilisations
La présente invention concerne une molécule hybride comprenant au moins un fragment Fc d’anticorps lié de façon covalente à au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, les utilisations d’une telle molécule hybride, ainsi que son procédé de production. Ledit récepteur lymphocytaire auto-réactif est un récepteur membranaire à la surface d’un lymphocyte B (BCR) ou à la surface d’un lymphocyte T (TCR).
Contexte de l’invention
Les vascularites auto-immunes sont des maladies rares caractérisées par une inflammation de la paroi des petits vaisseaux de l’organisme, notamment liées à la production d’auto-anticorps par l’organisme et/ou de cytokines pro-inflammatoires secrétées par les lymphocytes T.
Lesdits auto-anticorps sont notamment dirigés contre certains globules blancs : les polynucléaires neutrophiles et peuvent donc parfois être parfois nommés ANCA (anticorps anti-cytoplasme des polynucléaires neutrophiles).
Ces auto-anticorps sont bien souvent utilisés pour établir le diagnostic des vascularites auto-immunes et leur rôle dans la pathogénèse de la maladie a été étudié (e.g. Bruner BF, Vista ES, Wynn DM, Harley JB, James JA. Anti-neutrophil cytoplasmic antibodies target sequential functional proteinase 3 epitopes in the sera of patients with Wegener’s granulomatosis. Clin Exp Immunol. 2010 Nov;162(2):262-70. doi: 10.1111/j.1365-2249.2010.04251.x. PMID: 21077276; PMCID: PMC2996593 ; ou encore Van Der Geld YM, Simpelaar A, Van Der Zee R, Tervaert JW, Stegeman CA, Limburg PC, Kallenberg CG. Antineutrophil cytoplasmic antibodies to proteinase 3 in Wegener's granulomatosis: epitope analysis using synthetic peptides. Kidney Int. 2001 Jan;59(1):147-59. doi: 10.1046/j.1523-1755.2001.00475.x. PMID: 11135067). Ces auto-anticorps représentent donc une cible thérapeutique de choix.
Les cibles antigéniques de ces auto-anticorps impliqués dans les vascularites auto-immunes ont été caractérisées et peuvent être retrouvées dans la base de données IEDB, Immune Epitope DataBase and analysis resource, http://www.iedb.org/home_v3.php. Lesdits auto-anticorps sont notamment dirigés spécifiquement contre la protéinase 3 (PR3), ou spécifiquement contre la myélopéroxidase (MPO) ou contre la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1 (« small nuclear ribonucleoprotein »).
Les vascularites auto-immunes (ou « vascularites ANCA-positives » ou vascularites associées aux ANCA) regroupent principalement trois maladies : la granulomatose avec polyangéite (parfois appelée maladie de Wegener), la granulomatose éosinophilique avec polyangéite (parfois appelée syndrome de Churg et Strauss) et la micropolyangéite. La granulomatose avec polyangéite est caractérisée par une nécrose inflammatoire des vaisseaux de petit et moyen calibre (capillaires, veinules et artérioles) qui entraîne une ischémie tissulaire. La granulomatose éosinophilique avec polyangéite est définie comme une vascularite systémique des petits vaisseaux qui est aussi caractérisée aussi de l'asthme, une éosinophilie sanguine et tissulaire, et la micropolyangéite est définie comme une vascularite inflammatoire nécrosante systémique qui touche principalement les vaisseaux de petit calibre de multiples organes (petites artères, artérioles, capillaires, veinules).
A ce jour il n’existe pas de traitement spécifique de ces vascularites auto-immunes. Les traitements consistent généralement en l'administration de corticoïdes, voire des médicaments immunosuppresseurs, qui peuvent provoquer des effets secondaires graves. Des anticorps anti-CD20 peuvent également être utilisés, mais ces derniers ne sont pas spécifiques des lymphocytes B à l’origine des anticorps auto-réactifs et sont sans effet sur les lymphocytes T auto-réactifs.
Un objet de la présente invention est ainsi de fournir un traitement plus ciblé des vascularites auto-immunes. En ciblant les cellules B à l’origine des anticorps auto-réactifs (auto-anticorps) associés aux vascularites auto-immunes, et/ou les lymphocytes T auto-réactifs sources de cytokines pro-inflammatoires, la présente invention vise ainsi à fournir un traitement plus spécifique.
La présente invention repose sur les recherches des Inventeurs montrant qu’il est possible de cibler les récepteurs lymphocytaires auto-réactifs qui reconnaissent les peptides du soi impliqués dans le développement d’une vascularite auto-immune. Plus particulièrement, la présente invention repose sur les recherches des Inventeurs montrant qu’il est possible de cibler les clones lymphocytaires B exprimant les récepteurs lymphocytaires impliqués dans une vascularite auto-immune et/ou les lymphocytes T auto-réactifs (par liaison d’un peptide du soi impliqué dans le développement d’une vascularite auto-immune au TCR), et de les éliminer à l’aide d’une molécule hybride comprenant (i) au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune et (ii) un fragment Fc d’immunoglobuline humaine. Ces molécules hybrides cibleront spécifiquement les clones lymphocytaires B exprimant des auto-anticorps responsables d’une vascularite auto-immune et/ou les lymphocytes T auto-réactifs (à l’aide dudit peptide, qui est reconnu par lesdits récepteurs B et/ou T exprimés par lesdits lymphocytes B et/ou T) qui seront ensuite éliminés, après fixation du fragment Fc sur les récepteurs Fc, par des macrophages (via phagocytose) et/ou des cellules NK (via cytotoxicité à médiation cellulaire dépendante des anticorps - ADCC), et/ou par activation de la cascade du complément.
En ciblant les clones lymphocytaires B exprimant des auto-anticorps responsables d’une vascularite auto-immune et les cellules qui se différencient en plasmocytes qui sécrètent eux-mêmes lesdits auto-anticorps et/ou les lymphocytes T auto-réactifs sources de cytokines pro-inflammatoires, les molécules hybrides de l’invention visent ainsi à faire disparaître ces auto-anticorps « pathogènes » de l’organisme des patients.
Molécule hybride selon l’invention
Dans un premier aspect, l’invention concerne une molécule hybride comprenant au moins un fragment Fc d’anticorps lié de façon covalente à au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, au moins un espaceur étant optionnellement présent entre ledit fragment Fc et ledit peptide. Le schéma d’une telle construction est présenté en .
Selon l’invention, une « molécule hybride » s’entend d’une molécule ayant au moins deux composants de nature différente, en l’espèce le fragment Fc d’anticorps et ledit peptide.
Selon l’invention, un « fragment Fc » d’anticorps s’entend de la région constante d'une immunoglobuline à l'exclusion du premier domaine de région constante d'immunoglobuline (i.e. CH1-CL). Ainsi le fragment Fc fait référence à un homodimère, chaque monomère comprenant les deux derniers domaines constants des IgA, IgD, IgG (i.e. CH2 et CH3), ou les trois derniers domaines constants des IgE et IgM (i.e. CH2, CH3 et CH4).
Selon l’invention, l’expression « lié de façon covalente » s’entend d’une liaison covalente, c’est-à-dire une liaison chimique dans laquelle deux atomes se partagent deux électrons. Ladite liaison covalente peut être polaire ou non-polaire.
Selon l’invention, un « espaceur » est un agent de liaison qui permet de lier de façon covalente un fragment Fc d’anticorps audit peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, tout en éloignant ledit fragment Fc dudit peptide (diminuant ainsi un éventuel encombrement stérique). Il peut s’agir de toute molécule, et notamment d’un peptide ou d’un polypeptide. De manière préférée, l’espaceur ne modifie pas les propriétés physico-chimiques de la molécule hybride.
La présence d’au moins un espaceur est avantageuse : elle permet de faciliter l’accessibilité indépendante des deux partenaires de la molécule hybride (le fragment Fc est plus facilement accessible pour se lier aux récepteurs Fc, de même que ledit peptide est plus facilement accessible pour se lier aux lymphocytes auto-réactifs), et/ou de stabiliser la molécule hybride, et/ou augmenter la solubilité de la molécule hybride.
Selon un mode de réalisation, la molécule hybride selon l’invention peut comprendre un ou plusieurs espaceurs. De préférence, la molécule hybride comprend un ou deux espaceurs. Selon un mode de réalisation, lorsqu’au moins un espaceur est présent dans ladite molécule hybride de l’invention, ledit fragment Fc est lié de façon covalente à un espaceur, ledit espaceur étant lui-même lié de façon covalente audit peptide. Selon un autre mode de réalisation, lorsqu’au moins deux espaceurs sont présents dans ladite molécule hybride de l’invention, ledit fragment Fc est lié de façon covalente à un premier espaceur, ledit premier espaceur étant lui-même lié de façon covalente à un deuxième espaceur et le deuxième espaceur est lui-même lié de façon covalente audit peptide. La liaison entre le fragment Fc et le peptide peut donc être directe, ou bien indirecte en présence d’espaceurs.
Selon un mode de réalisation, la molécule hybride selon l’invention peut comprendre au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune. Cela signifie que le fragment Fc peut être lié à un ou deux peptides. En effet, le fragment Fc comprend deux monomères, et le fragment Fc peut ainsi être lié de façon covalente à un peptide sur un seul des deux monomères, ou bien le fragment Fc peut être lié de façon covalente à un peptide sur chaque monomère. De préférence, lorsque deux peptides sont liés sur le fragment Fc, les deux peptides sont identiques.
Selon un mode de réalisation, ledit espaceur est un polymère contenant un ou plusieurs motifs de répétition contenant le groupe éther. Selon un mode de réalisation particulier, ledit espaceur est le polyéthylène glycol de formule PEG-n, dans laquelle n représente un nombre entier compris entre 1 et 100, préférentiellement entre 1 et 10, et notamment 1, 2, 3, 4 ou 8. Selon l’invention ledit polyéthylène glycol peut être fonctionnalisé, par exemple avec un groupement amine (PEG-n-amine tel que PEG-NH2). Selon l’invention « un nombre entier compris entre 1 et 100 » représente toutes les valeurs entières comprises entre 1 et 100, i.e. ; 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 et 100.
L’expression « récepteur lymphocytaire auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un récepteur à la surface d’un lymphocyte T et/ou d’un lymphocyte B qui reconnait un peptide du soi impliquant l’activation des cellules conduisant à la vascularite auto-immune par une production inappropriée d’auto-anticorps ou de cytokines pro-inflammatoires. Plus particulièrement, ledit récepteur lymphocytaire est un récepteur de lymphocyte B (BCR) et/ou un récepteur d’un lymphocyte T (TCR). La liaison du peptide au BCR et/ou au TCR est ainsi impliqué dans le développement d’une vascularite auto-immune. Par exemple, et selon un mode de réalisation, le peptide du soi impliqué peut comprendre tout ou partie de la protéinase 3. et/ou un « auto-anticorps responsable d’une vascularite auto-immune » s’entend d’un « auto-anticorps anti-cytoplasme des polynucléaires neutrophiles (ACPN ou ANCA en anglais). Typiquement, la fixation de ces ACPN à leur cible conduit à l’activation des neutrophiles avec augmentation de l’adhésion à l’endothélium vasculaire, production de radicaux libres de l’oxygène et libération d’enzymes à l’origine des dommages tissulaires.
L’expression « lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un lymphocyte exprimant à sa surface un récepteur qui reconnait un peptide du soi impliquant l’activation des cellules conduisant à la vascularite auto-immune par une production inappropriée d’auto-anticorps ou de cytokines pro-inflammatoires. De préférence, il s’agit d’un lymphocyte T et/ou d’un lymphocyte B.
Selon un mode de réalisation préféré, un auto-anticorps selon l’invention s’entend d’un auto-anticorps dirigé contre la protéinase 3 (anti-PR3), un auto-anticorps dirigé contre la myélopéroxidase (anti-MPO) et/ou un auto-anticorps dirigé contre la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1 (anti-SmD1). De préférence, les auto-anticorps sont des auto-anticorps anti-cytoplasme des polynucléaires neutrophiles tels que des anti-PR3 (c-ANCA pour cytoplasmique-ANCA) ou des anti-MPO (p-ANCA pour périnucléaire-ANCA).
L’expression « vascularite auto-immune » s’entend plus particulièrement d’une inflammation nécrosante des petits vaisseaux, avec peu ou pas de dépôts de complexes immuns, et la présence fréquente d’anticorps circulants dirigés contre la protéinase 3 (PR3) et/ou contre la myélopéroxidase (anti-MPO) et/ou contre la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1 anti-SmD1).
Selon un mode de réalisation, l’expression « peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un peptide comprenant tout ou partie de la séquence polypeptidique de la protéinase 3, tout ou partie de la séquence polypeptidique de la myélopéroxidase et/ou tout ou partie de la séquence polypeptidique de la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1.
Selon un mode de réalisation, l’expression « peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un peptide comprenant tout ou partie de la séquence polypeptidique de la protéinase 3. De préférence, ladite séquence polypeptidique de la protéinase 3 est représentée par la SEQ ID NO : 28.
Selon un mode de réalisation, l’expression « peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un peptide comprenant tout ou partie de la séquence polypeptidique de la myélopéroxidase. De préférence, ladite séquence polypeptidique de la myélopéroxidase est représentée par SEQ ID NO : 29.
Selon un mode de réalisation, l’expression « peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un peptide comprenant tout ou partie de la séquence polypeptidique de la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1. De préférence, ladite séquence polypeptidique de ladite SmD1est représentée par SEQ ID NO : 30.
Selon un mode de réalisation, un « peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune » s’entend d’un peptide reconnu par un auto-anticorps dirigé contre la protéinase 3, contre la myélopéroxidase et/ou contre la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1. De tels peptides peuvent être obtenus à partir de fragments de la protéinase, de la myélopéroxidase et/ou de la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1, que ces fragments soient naturels, recombinants ou de synthèse. De tels peptides peuvent également être directement synthétisés. Les acides aminés constituant le peptide peuvent être de série L ou D, de préférence de série L. Un peptide selon l’invention se lie à un auto-anticorps dirigé contre la protéinase 3, contre la myélopéroxidase et/ou contre la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1, et la liaison entre ledit peptide et l’auto-anticorps peut par exemple être vérifiée à l’aide d’un test ELISA. Voir également, par exemple, Csernok, E., Moosig, F. Current and emerging techniques for ANCA detection in vasculitis.Nat Rev Rheumatol 10, 494–501 (2014). https://doi.org/10.1038/nrrheum.2014.78.
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit peptide comprend tout ou partie de la séquence polypeptidique de la protéinase 3, tout ou partie de la séquence polypeptidique de la myélopéroxidase et/ou tout ou partie de la séquence polypeptidique de la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1, et ladite protéinase 3, myélopéroxidase et/ou SmD1 est issue de mammifère et est de préférence d’origine humaine.
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, le peptide a une taille d’au moins 2 acides aminés consécutifs, 3 acides aminés consécutifs, 4 acides aminés consécutifs, de préférence au moins 5 acides aminés consécutifs. Selon un mode de réalisation, ledit peptide a une taille comprise entre 5 et 70 acides aminés. Selon l’invention, « entre 5 et 70 » s’entend de toutes les valeurs : 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70. Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, le peptide a une taille comprise en 5 et 15 acides aminés consécutifs, de préférence entre 5 et 10.
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, le peptide est linéaire.
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, le peptide peut être modifié de façon à améliorer sa réactivité vis-à-vis des auto-anticorps. A titre d’exemple, les peptides peuvent être cyclisés, les peptides peuvent être de type rétro (les acides aminés de série L sont enchainés selon une séquence inverse de celle du peptide à reproduire), ou de type rétro-inverso (les acides aminés sont de type D au lieu de la série naturelle L et sont enchainés selon une séquence inverse de celle du peptide à reproduire). Selon un mode de réalisation encore plus particulier, dans ladite molécule hybride selon l’invention, la fonction carboxyle (COOH) terminale dudit peptide est remplacée par une fonction carboxamide (CONH2).
Selon un autre mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, le peptide peut être modifié de façon à faciliter sa synthèse et/ou améliorer sa stabilité, par exemple par alkylation. Selon un mode de réalisation encore plus particulier, dans ladite molécule hybride selon l’invention, la fonction amine (NH2) terminale dudit peptide est acétylée.
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, les fonctions amine et carboxyle du peptide peuvent être sous forme du sel correspondant à l’acide ou à la base.
Selon un mode de réalisation encore plus particulier, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit peptide est choisi dans le groupe constitué par : SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO : 5, SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, SEQ ID NO : 9, SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, SEQ ID NO : 16, SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, SEQ ID NO : 20, SEQ ID NO : 21, SEQ ID NO : 22, SEQ ID NO : 23, SEQ ID NO : 31, SEQ ID NO : 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO : 34, SEQ ID NO : 35, SEQ ID NO : 36, SEQ ID NO : 37, SEQ ID NO : 38, SEQ ID NO : 39, SEQ ID NO : 40, SEQ ID NO : 41, SEQ ID NO : 42, SEQ ID NO : 43, SEQ ID NO : 44, SEQ ID NO : 45, SEQ ID NO : 46, SEQ ID NO : 47, SEQ ID NO : 48, SEQ ID NO : 49, SEQ ID NO : 50 et SEQ ID NO : 51.
Selon un mode de réalisation encore plus particulier, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit peptide est choisi dans le groupe constitué par : SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO : 5, SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, SEQ ID NO : 9, SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, SEQ ID NO : 16, SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, SEQ ID NO : 20, SEQ ID NO : 21, SEQ ID NO : 22, SEQ ID NO : 23, SEQ ID NO : 31, SEQ ID NO : 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO : 34 et SEQ ID NO : 35 (PR3).
Selon un mode de réalisation encore plus particulier, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit peptide est choisi dans le groupe constitué par : SEQ ID NO : 36 et SEQ ID NO : 37 (SmD1).
Selon un mode de réalisation encore plus particulier, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit peptide est choisi dans le groupe constitué par : SEQ ID NO : 38, SEQ ID NO : 39, SEQ ID NO : 40, SEQ ID NO : 41, SEQ ID NO : 42, SEQ ID NO : 43, SEQ ID NO : 44, SEQ ID NO : 45, SEQ ID NO : 46, SEQ ID NO : 47, SEQ ID NO : 48, SEQ ID NO : 49, SEQ ID NO : 50 et SEQ ID NO : 51 (MPO).
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit fragment Fc est un fragment Fc humain, notamment d’IgG, plus particulièrement d’IgG1. L’IgG1 peut correspondre à n’importe quel variant allotypique par exemple G1m3 ou nG1m17. A titre d’exemple, le fragment Fc d’IgG1 est représenté par SEQ ID NO : 24, SEQ ID NO : 25(Fc+Qtag) ou SEQ ID NO : 26 (Fc+Qtag bis).
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit fragment Fc est de type sauvage ou muté. La ou les mutations peuvent viser à augmenter la demi-vie plasmatique, la diminuer, modifier les fonctions effectrices du fragment Fc. Selon un mode de réalisation encore plus particulier, ledit fragment Fc muté comprend au moins les mutations suivantes :
- L234A et L235A (LALA), ou
- L234A, L235A et P329G (LALAPG), ou
- G236A, S239D et I332E (GASDIE), ou
- G236A, S239D, A330L et I332E (GASDALIE), ou
- S239D, H268F, S324T et I332E (SDHFSTIE ou SDH),
la numérotation étant indiquée dans la séquence d’une IgG1 humaine selon l’index EU. De telles mutations sont notamment décrites dans l’article Bruhns and Jönsson, Immunol Rev. 2015 Nov;268(1):25-51. De préférence, lorsque la molécule hybride est utilisée en thérapie, ledit fragment Fc muté comprend au moins les mutations GASDIE, GASDALIE, ou SDH.
Selon un mode de réalisation, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit fragment Fc présente un taux de fucosylation compris entre 0% à 100% des formes glycosylées. Selon l’invention « entre 0% et 100% » représente toutes les valeurs entières comprises entre 0 et 100, i.e ; 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 et 100%. Une faible fucosylation du fragment Fc provoque une forte réponse ADCC. C’est pourquoi selon un mode de réalisation particulier, ledit fragment Fc présente un taux de fucosylation compris entre 0% à 60% des formes glycosylées, notamment 50%, 40%, 30%, 20%, 10% ou 0%. Selon l’invention, le taux de fucosylation est défini comme la proportion moyenne de fucose portée par le fragment Fc, par rapport à la quantité maximale de fucose que peut porter un fragment Fc.
Le fragment Fc et le peptide ont chacun des extrémités N- et C-terminale. Le fragment Fc peut donc être lié via son extrémité N- ou C-terminale à l’extrémité N- ou C-terminale du peptide. Selon un mode de réalisation préféré, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ladite liaison covalente se situe entre l’extrémité C-terminale dudit fragment Fc et l’extrémité N-terminale dudit peptide, ou entre l’extrémité N-terminale dudit fragment Fc et l’extrémité N-terminale dudit peptide. Selon un mode de réalisation, lorsqu’un espaceur est présent, l’espaceur peut être lié au fragment Fc via son extrémité N- ou C-terminale. Selon un autre mode de réalisation, lorsque deux espaceurs sont présents, le premier espaceur peut être lié au fragment Fc via son extrémité N- ou C-terminale et le deuxième espaceur peut être lié au peptide via son extrémité N- ou C-terminale, notamment N-terminale. Alternativement, ladite liaison covalente entre ledit fragment Fc et ledit peptide (éventuellement en présence d’un ou plusieurs espaceurs) peut être créée sur tout ou partie du fragment Fc. Selon l’invention « tout ou partie du fragment Fc » signifie que différents acides aminés constituant le fragment Fc peuvent être impliqués dans une liaison covalente avec ledit peptide.
Selon un mode de réalisation préféré, lorsqu’au moins un espaceur est présent dans ladite molécule hybride de l’invention, celui-ci permet de lier le fragment Fc à un azoture ou à un alcyne qui sera lui-même impliqué dans la liaison covalente avec ledit peptide. Selon un mode de réalisation, lorsqu’au moins un espaceur est présent dans ladite molécule hybride de l’invention, celui-ci peut également permettre de lier le peptide à un alcyne ou à un azoture qui sera lui-même impliqué dans la liaison covalente avec le fragment Fc. Selon un mode de réalisation préféré, la molécule hybride selon l’invention comprend au moins deux espaceurs : un premier espaceur qui permet de lier le fragment Fc à un azoture ou à un alcyne et un deuxième espaceur qui permet de lier le peptide à un azoture (lorsque le fragment Fc est lié à un alcyne) ou à un alcyne (lorsque le fragment Fc est lié à un azoture).
Selon un mode de réalisation selon l’invention, dans ladite molécule hybride selon l’invention, ledit fragment Fc :
- est couplé à au moins un azoture ou à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, ou
- est lié à au moins un espaceur qui est lui-même couplé à un azoture ou à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO,
et ledit peptide est :
- soit couplé à un azoture ou à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO,
- soit lié à un espaceur qui est lui-même couplé à un azoture ou à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO,
la liaison covalente entre ledit fragment Fc et ledit peptide, éventuellement en présence d’un ou plusieurs espaceurs, étant créée entre l‘azoture et l’alcyne.
Selon un mode de réalisation selon l’invention, dans ladite molécule hybride selon l’invention,
- le fragment Fc est couplé à au moins un azoture et ledit peptide est couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, ou
- le fragment Fc est couplé à au moins un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est couplé à un azoture,
la liaison covalente entre ledit fragment Fc et ledit peptide étant créée entre l‘azoture et l’alcyne.
Selon un mode de réalisation selon l’invention, dans ladite molécule hybride selon l’invention :
- le fragment Fc est couplé à au moins un azoture et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ou
- le fragment Fc est couplé à au moins un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un azoture ou
- le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un azoture, et ledit peptide est couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ou
- le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est couplé à un azoture ou
- le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un azoture, et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ou
- le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un azoture,
la liaison covalente entre ledit fragment Fc et ledit peptide, en présence d’un ou plusieurs espaceurs, étant créée entre l’azoture et l’alcyne.
Selon l’invention, la création de la liaison covalente entre l’azoture et l’alcyne correspond à une étape dite de « chimie-click », la partie N3de l’azoture réagissant avec un alcyne. L’azoture s’entend des sels de l'acide azothydrique HN3, ou des azotures organiques dans lesquels un des atomes d'azote est lié de façon covalente avec un atome de carbone d'un composé organique (par exemple l’azoture de méthyle CH3N3). Préférentiellement l’azoture est représenté par la formule N3. L’alcyne s’entend des molécules ayant pour formule générale CnH2n-2, et qui sont caractérisées par la présence d’au moins une triple liaison. Préférentiellement l’alcyne est un cyclooctyne, encore plus préférentiellement le dibenzocyclooctyne (DBCO).
Le fragment Fc, ledit peptide et éventuellement le(s)dit(s) espaceur(s), sont couplés à l’alcyne ou à l’azoture par toute technique de couplage moléculaire classiquement utilisée (telle qu’une conjugaison). Toute technique peut également être utilisée pour lier de façon covalente le fragment Fc à l’espaceur et/ou le peptide à l’espaceur.
Plus particulièrement, une technique de conjugaison s’entend d’une conjugaison enzymatique ou d’une conjugaison chimique. Une conjugaison enzymatique s’entend par exemple d’une conjugaison à l’aide d’une transglutaminase qui catalyse la formation de liaisons covalentes entre des groupes amines libres et des résidus de glutamine ou de lysine ou encore à l’aide d’une transpeptidase telle que la sortase. Pour de plus amples informations concernant la conjugaison enzymatique, voir par exemple la demande de brevet US20160361434 ou US20170313787, ou encore la publication Ohtsuka et al., Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry Volume 64, 2000 - Issue 12, Comparison of Substrate Specificities of Transglutaminases Using Synthetic Peptides as Acyl donors. Le substrat de la transglutaminase est par exemple un peptide comportant un résidu glutamyl (un Qtag), tel que représenté par SEQ ID NO : 27 (LLQG). Une conjugaison chimique s’entend par exemple d’une liaison covalente entre une cystéine isolée ou participant à un pont disulfure après réduction de celui-ci et par exemple un maléimide. Un exemple d’une telle conjugaison est représenté en . Dans cet exemple, le fragment Fc comprend un peptide Qtag et ledit fragment Fc est lié à un espaceur (lui-même couplé à un azoture), grâce à l’action de la transglutaminase qui va créer une liaison covalente entre le résidu glutamyl du Qtag et le groupe NH2porté par l’espaceur PEGn.
Selon l’invention, le terme « couplé » ou « couplage moléculaire » s’entend de l’établissement d’une liaison covalente, ainsi le fragment Fc et/ou le peptide et/ou l’espaceur est lié de façon covalente à un alcyne ou un azoture. Le terme « lié » s’entend également d’une liaison covalente. Ainsi, à titre d’exemple, l’expression « le fragment Fc est couplé à un azoture et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un alcycne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO » peut également se lire « le fragment Fc est lié de façon covalente à un azoture et ledit peptide est lié de façon covalente à un espaceur, ledit espaceur étant lui-même lié de façon covalente à un alcycne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ».
Utilisation des molécules hybrides selon l’invention
Dans un second aspect, la présente invention concerne également une molécule hybride telle que définie précédemment, pour son utilisation comme médicament.
Plus particulièrement, selon l’invention, lesdites molécules hybrides sont destinées à cibler et à lyser dans l’organisme des patients, par ADCC et/ou phagocytose et/ou activation du complément, toutes les cellules exprimant des récepteurs lymphocytaires auto-réactifs dans le cadre d’une vascularite auto-immune : à savoir les cellules B (lymphocytes) exprimant à leur surface les BCR reconnaissant au moins un des peptides de l’invention (auto-anticorps responsables d’une vascularite auto-immune, se liant à au moins un peptide selon l’invention) et les lymphocytes T exprimant à leur surface les TCR reconnaissant au moins un des peptides selon l’invention. En effet, la molécule hybride selon l’invention se lie à ces cellules grâce au peptide : il s’agit de la cible épitopique dudit récepteur lymphocytaire auto-réactif. La molécule hybride selon l’invention se lie aussi aux cellules permettant de détruire les lymphocytes B et/ou T exprimant à leur surface les récepteurs lymphocytaires auto-réactifs impliqués dans une vascularite auto-immune grâce à son fragment Fc, ligand naturel des récepteurs Fc (par exemple Fc-gamma récepteur (FcγR) si le fragment Fc est issu d’une IgG), présents notamment à la surface des macrophages mais aussi des cellules NK (“Natural Killers“).
Selon un mode de réalisation particulier, l’invention concerne une molécule hybride, telle que définie précédemment, pour son utilisation dans le traitement d’une vascularite auto-immune, en particulier la granulomatose avec polyangéite, la granulomatose éosinophilique avec polyangéite et la micropolyangéite. Selon un mode de réalisation préféré, l’invention concerne une molécule hybride, telle que définie précédemment, pour son utilisation dans le traitement d’une granulomatose avec polyangéite.
Selon un mode de réalisation particulier, l’invention concerne une molécule hybride telle que défini précédemment et comprenant un peptide choisi dans le groupe constitué par : SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO : 5, SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, SEQ ID NO : 9, SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, SEQ ID NO : 16, SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, SEQ ID NO : 20, SEQ ID NO : 21, SEQ ID NO : 22, SEQ ID NO : 23, SEQ ID NO : 31, SEQ ID NO : 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO : 34, SEQ ID NO : 35, SEQ ID NO : 36, SEQ ID NO : 37, SEQ ID NO : 38, SEQ ID NO : 39, SEQ ID NO : 40, SEQ ID NO : 41, SEQ ID NO : 42, SEQ ID NO : 43, SEQ ID NO : 44, SEQ ID NO : 45, SEQ ID NO : 46, SEQ ID NO : 47, SEQ ID NO : 48, SEQ ID NO : 49, SEQ ID NO : 50 et SEQ ID NO : 51, pour son utilisation dans le traitement d’une vascularite auto-immune, de préférence la granulomatose avec polyangéite.
Selon un mode de réalisation, l’invention concerne également une composition pharmaceutique comprenant une molécule hybride selon l’une quelconque des revendications précédentes, en combinaison avec un véhicule pharmaceutiquement acceptable.
Selon l’invention « un véhicule pharmaceutiquement acceptable » s’entend de toute formulation rendant la composition apte à être administrée à un patient, sous n’importe quelle forme galénique.
La présente invention concerne également une méthode de traitement d’une vascularite auto-immune, en particulier la granulomatose avec polyangéite, comprenant l’administration d’une quantité thérapeutiquement efficace d’une molécule hybride selon l’invention.
L’invention concerne également l’utilisation d’une molécule hybride selon l’invention pour la préparation d’un médicament destiné au traitement d’une vascularite auto-immune, en particulier la granulomatose avec polyangéite.
Selon un autre mode de réalisation, la molécule hybride selon l’invention peut être couplée à au moins un radioisotope ou à au moins un fluorochrome, tels que A488 ou A647. De telles molécules peuvent avantageusement être utilisées comme outils moléculaires traceurs.
Selon un autre mode de réalisation, l’invention concerne ainsi l’utilisationin vitroouex vivod’une molécule hybride comprenant au moins un fragment Fc d’anticorps lié de façon covalente à au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, au moins un espaceur étant optionnellement présent entre ledit fragment Fc et ledit peptide, comme outil moléculaire. De telles constructions peuvent notamment être utilisées pour analyser la fixation des molécules hybrides aux auto-anticorps et aux récepteurs Fc des macrophages et des cellules NK, ainsi que pour analyser la réactivité des macrophages et des cellules NK à la fixation des hybrides suivie du pontage de ceux-ci par les auto-anticorps…. Les radioisotopes et/ou fluorochromes sont de préférence couplés sur le fragment Fc, encore plus particulièrement au niveau du Qtag (si présent) ou au niveau des lysines.
Procédé de production des molécules hybrides selon l’invention
Dans un autre aspect, l’invention concerne également un procédé permettant d’obtenir une molécule hybride telle que définie précédemment.
Selon un mode de réalisation, l’invention concerne ainsi un procédé de production d’une molécule hybride telle que définie précédemment, comprenant les étapes suivantes :
- (i) obtention d’un azoture couplé à un fragment Fc ou obtention d’un alcyne couplé à un fragment Fc,
- (ii) obtention d’un alcyne couplé à un peptide ou obtention d’un azoture couplé à un peptide,
- (iii) réalisation de la liaison covalente entre l’azoture et l’alcyne,
- l’étape (i) pouvant être réalisée avant ou après l’étape (ii), ou bien de façon concomitante.
Selon un mode de réalisation, l’invention concerne ainsi un procédé de production d’une molécule hybride telle que définie précédemment, comprenant les étapes suivantes :
- (i) couplage d’au moins un azoture et d’un fragment Fc, éventuellement en présence d’au moins un espaceur, ou couplage d’au moins un alcyne et d’au moins un fragment Fc, éventuellement en présence d’un espaceur,
- (ii) couplage d’un alcyne et d’un peptide, éventuellement en présence d’un espaceur, ou couplage d’un azoture et d’un peptide, éventuellement en présence d’un espaceur,
- (iii) réalisation de la liaison covalente entre l’azoture et l’alcyne,
- l’étape (i) pouvant être réalisée avant ou après l’étape (ii), ou bien de façon concomitante.
Selon un autre mode de réalisation, l’invention concerne ainsi un procédé de production d’une molécule hybride telle que définie précédemment, comprenant les étapes suivantes :
- (i) couplage d’au moins un azoture sur chaque monomère du fragment Fc, éventuellement en présence d’au moins un espaceur, ou couplage d’au moins un alcyne sur chaque monomère du fragment Fc, éventuellement en présence d’un espaceur,
- (ii) couplage d’un alcyne et d’un peptide, éventuellement en présence d’un espaceur, ou couplage d’un azoture et d’un peptide, éventuellement en présence d’un espaceur,
- (iii) réalisation de la ou les liaison(s) covalente(s) entre l’azoture et l’alcyne,
- l’étape (i) pouvant être réalisée avant ou après l’étape (ii), ou bien de façon concomitante.
Selon un mode de réalisation, les molécules hybrides selon l’invention peuvent également être obtenues par des méthodes de bioproduction et codées par un ADN recombinant codant le peptide selon l’invention et le fragment Fc, ledit peptide et ledit fragment Fc étant optionnellement séparés par un linker polypeptidique. Dans un tel cas, le peptide de la molécule hybride est non-modifié (e.g. non cyclisé, non rétro, non rétro-inverso), et peut-être orienté N-terminal ou C-terminal. Le peptide peut être en C-terminal ou en N-terminal du fragment Fc, l’ADNc incluant sa séquence codante nucléotidique en amont ou en aval de l’ADNc du Fc.
Les séquences de l’invention sont représentées dans le Tableau 1 ci-après.
Numéro de la séquence / Nom de la séquence le cas échéant Séquence
SEQ ID NO : 1 VVLGAHNV
SEQ ID NO : 2 VLGAHNVR
SEQ ID NO : 3 LGAHNVRT
SEQ ID NO : 4 GAHNVRTQ
SEQ ID NO : 5 PHSRPYMA
SEQ ID NO : 6 QPHSRPYM
SEQ ID NO : 7 HSRPYMAS
SEQ ID NO : 8 FLNNYDAE
SEQ ID NO : 9 CFGDSGGP
SEQ ID NO : 10 MAHRPPSP
SEQ ID NO : 11 AHRPPSPA
SEQ ID NO : 12 HRPPSPAL
SEQ ID NO : 13 AQPHSRPY
SEQ ID NO : 14 PGSHFCGG
SEQ ID NO : 15 PVPHGTQC
SEQ ID NO : 16 FCRPHNI
SEQ ID NO : 17 PRRKAGI
SEQ ID NO : 18 ATVQLPQ
SEQ ID NO : 19 QLPQQDQ
SEQ ID NO : 20 PVPHGTQ
SEQ ID NO : 21 QPHSRPY
SEQ ID NO : 22 RVGAHDP
SEQ ID NO : 23 IDSFVIW
SEQ ID NO : 24 / Fragment Fc APELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO : 25/ Fragment Fc + Qtag LLQGARSDATHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO : 26/ Fragment Fc + Qtag bis AHGHGHGLLQGARSDATHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO : 27 / (Exemple de Qtag) LLQG
SEQ ID NO : 28 / Séquence de la PR3 MAHRPPSPALASVLLALLLSGAARAAEIVGGHEAQPHSRPYMASLQMRGNPGSHFCGGTLIHPSFVLTAAHCLRDIPQRLVNVVLGAHNVRTQEPTQQHFSVAQVFLNNYDAENKLNDVLLIQLSSPA N LSASVATVQLPQQDQPVPHGTQCLAMGWGRVGAHDPPAQVLQEL N VTVVTFFCRPHNICTFVPRRKAGICFGDSGGPLICDGIIQGIDSFVIWGCATRLFPDFFTRVALYVDWIRSTLRRVEAKGRP
SEQ ID NO : 29 / Séquence de la MPO MGVPFFSSLRCMVDLGPCWAGGLTAEMKLLLALAGLLAILATPQPSEGAAPAVLGEVDTSLVLSSMEEAKQLVDKAYKERRESIKQRLRSGSASPMELLSYFKQPVAATRTAVRAADYLHVALDLLERKLRSLWRRPFNVTDVLTPAQLNVLSKSSGCAYQDVGVTCPEQDKYRTITGMCNNRRSPTLGASNRAFVRWLPAEYEDGFSLPYGWTPGVKRNGFPVALARAVSNEIVRFPTDQLTPDQERSLMFMQWGQLLDHDLDFTPEPAARASFVTGVNCETSCVQQPPCFPLKIPPNDPRIKNQADCIPFFRSCPACPGSNITIRNQINALTSFVDASMVYGSEEPLARNLRNMSNQLGLLAVNQRFQDNGRALLPFDNLHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSSEMPELTSMHTLLLREHNRLATELKSLNPRWDGERLYQEARKIVGAMVQIITYRDYLPLVLGPTAMRKYLPTYRSYNDSVDPRIANVFTNAFRYGHTLIQPFMFRLDNRYQPMEPNPRVPLSRVFFASWRVVLEGGIDPILRGLMATPAKLNRQNQIAVDEIRERLFEQVMRIGLDLPALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLPQPETVGQLGTVLRNLKLARKLMEQYGTPNNIDIWMGGVSEPLKRKGRVGPLLACIIGTQFRKLRDGDRFWWENEGVFSMQQRQALAQISLPRIICDNTGITTVSKNNIFMS NSYPRDFVNCSTLPALNLASWREAS
SEQ ID NO : 30 / Séquence de la SmD1 MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSI RGNNIRYFILPDSLPLDTLLVDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR
SEQ ID NO : 31 AHCLRDIPQRLVNV
SEQ ID NO : 32 HGTQCLAMGWGRVGAH
SEQ ID NO : 33 NICTFVPRRKAGIC
SEQ ID NO : 34 SRPYMA
SEQ ID NO : 35 ATRLFPDFFTRVALY
SEQ ID NO : 36 VEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR
SEQ ID NO : 37 VAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR
SEQ ID NO : 38 MPELTSMHTLLLREH
SEQ ID NO : 39 PILRGLMATPAKLNR
SEQ ID NO : 40 DHGLPGYNAWR
SEQ ID NO : 41 FPTDQLTPDQER
SEQ ID NO : 42 IANVFTNAFR
SEQ ID NO : 43 IGLDLPALNMQR
SEQ ID NO : 44 IPCFLAGDTR
SEQ ID NO : 45 LFEQVMR
SEQ ID NO : 46 NNIFMSNTYPR
SEQ ID NO : 47 RKIVGAMVQIITY
SEQ ID NO : 48 RSPTLGASNR
SEQ ID NO : 49 VFFASWR
SEQ ID NO : 50 VVLEGGIDPILR
SEQ ID NO : 51 RKIVGAMVQIITYRD
[Tableau 1]. Tableau récapitulatif des séquences de l’invention
D’autres caractéristiques, détails et avantages de l’invention apparaîtront à la lecture des Figures annexées et des exemples qui illustrent l’invention et ne visent en aucun cas à la limiter.
Brève description des Figures Fig. 1
représente le schéma d’un exemple de molécule hybride selon l’invention.
Un espaceur (qui est optionnel) est représenté entre le fragment Fc d’anticorps et le peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune (dénommé « peptide selon l’invention »).
Fig. 2
représente un lymphocyte B exprimant à sa surface des BCR/auto-anticorps transmembranaires liés à une molécule hybride selon l’invention, ladite molécule hybride étant elle-même liée par le fragment Fc à une cellule NK.
La cellule NK va ainsi pouvoir détruire le lymphocyte B par ADCC. Plus spécifiquement, cette figure montre une cellule B (ou lymphocyte B) qui exprime à sa surface un BCR (l’auto-anticorps ANCA) qui interagit spécifiquement avec le peptide selon l’invention porté par la molécule hybride. L’engagement du fragment Fc porté par la même molécule hybride au FcγRIIIa (CD16a) exprimé à la surface d’une cellule NK va activer l’ADCC et induire la destruction spécifique du lymphocyte B « ANCA positif » (qui exprime un ANCA). (ADCC, Antibody-Dependent Cell Cytotoxicity; BCR, B-Cell Receptor; FcγR, Fc-gamma Receptor; NK cell, Natural Killer cell).
Nb : une représentation similaire pourrait être réalisée en remplaçant le lymphocyte B par un lymphocyte T, et le BCR par un TCR (T-Cell Receptor).
Fig. 3
représente un lymphocyte B exprimant à sa surface des BCR transmembranaires liés à une molécule hybride selon l’invention, ladite molécule hybride étant elle-même liée par le fragment Fc à un macrophage.
Le macrophage va ainsi pouvoir détruire le lymphocyte B par phagocytose. Plus spécifiquement, cette Figure montre des cellules B (ou lymphocytes B) qui expriment à leur surface un BCR (l’auto-anticorps ANCA) et qui interagissent spécifiquement avec des peptides selon l’invention portés par les molécules hybrides. L’engagement des fragments Fc portés par ces mêmes molécules hybrides à différents FcγRs exprimés à la surface d’un macrophage va activer l’ADCP, c’est-à-dire la phagocytose, et induire la destruction spécifique des lymphocytes B « ANCA positifs ». (ADCP, Antibody-Dependent Cellular Phagocytosis; BCR, B-Cell Receptor; FcγR, Fc-gamma Receptor).
Nb : une représentation similaire pourrait être réalisée en remplaçant le lymphocyte B par un lymphocyte T, et le BCR par un TCR (T-Cell Receptor).
Fig. 4
représente un procédé de fabrication d’une molécule hybride selon l’invention, comprenant le schéma de dérivation et de conjugaison des fragments Fc.
Exemples
Exemple 1 :Exemple de production d’une molécule hybride selon l’invention
La molécule hybride ici décrite comprend la construction suivante : un fragment Fc lié de façon covalente à au moins un espaceur PEGn, lui-même couplé à un azoture, ledit azoture étant lié de façon covalente à un alcyne, qui est lui-même couplé à un espaceur PEGn lié à un peptide selon l’invention. Une telle molécule peut se lire : Fc-PEGn-N3-DBCO-PEGn-peptide. Les deux PEGn peuvent être identiques ou bien différents (par exemple le premier PEGn est PEG3et le deuxième PEGn est PEG2).
1. Synthèse d’un NH2-PEGn-N3(i.e. un espaceur couplé à un azoture à une extrémité et possédant une fonction amine libre à une autre extrémité).
2. Mise en présence du NH2-PEGn-N3, avec un fragment Fc possédant un Qtag, et une transglutaminase, de préférence pendant 16h à 37°C. Cette étape dite « de dérivation » est par exemple réalisée avec 20 fois plus de moles de NH2-PEGn-N3que de moles de fragment Fc. La transglutaminase est utilisée, par exemple à hauteur de 15U/µmol par Qtag présent (sur un ou sur les deux monomères). Eventuellement un dessalage peut être réalisé pour retirer l’excédent d’espaceur non lié au fragment Fc à l’issue de l’étape. Un Fc-PEGn-N3est ainsi obtenu. Si le fragment Fc comporte 2Qtag (un porté sur chaque monomère), alors le fragment Fc peut porter deux PEGn-N3.
3. Synthèse d’un Cys-PEGn-peptide (i.e. un espaceur lié à un peptide à une extrémité et possédant une cystéine libre à une autre extrémité). Un alcyne, par exemple un DBCO est ensuite couplé au Cys-PEGn-peptide au niveau de la cystéine, et un DBCO-PEGn-peptide est ainsi obtenu.
4. Réalisation du « click » : couplage entre le N3et le DBCO. Le DBCO-PEGn-peptide est mis en présence du Fc-PEGn-N3avec, de préférence, 10 fois plus de moles de DBCO-PEGn-peptide que de moles de Fc-PEGn-N3. La réaction du click se déroule notamment à température ambiante et est presque complète au bout de 4h.
5. Obtention de la molécule hybride : Fc-PEGn-N3-DBCO-PEGn-peptide. Ce mode de réalisation est illustré en .
De façon similaire un Fc-PEGn-DBCO et un N3-PEGn-peptide peuvent être obtenus, puis couplés pour obtenir Fc-PEGn-DBCO-N3-PEGn-peptide.
De façon similaire un Fc-PEGn-DBCO et un N3-peptide peuvent être obtenus, ou un Fc-PEGn-N3et un DBCO-peptide, puis couplés pour obtenir respectivement Fc-PEGn-DBCO-N3-peptide ou Fc-PEGn-N3-DBCO-peptide.
Exemple 2 :Réactivité de sérums de patients atteints de vascularites auto-immunes vis-à-vis des molécules hybrides selon l’invention
Les sérums utilisés sont des sérums de patients atteints de vascularite auto-immune, plus particulièrement de granulomatose avec polyangéite, qui contiennent des auto-anticorps spécifiques.
Des puits de plaque de microtitration ELISA ont été revêtus par adsorption passive à l’aide de 100 µL d’une solution contenant soit un peptide choisi parmi SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO : 5, SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, SEQ ID NO : 9, SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, SEQ ID NO : 16, SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, SEQ ID NO : 20, SEQ ID NO : 21, SEQ ID NO : 22, SEQ ID NO : 23, SEQ ID NO : 31, SEQ ID NO : 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO : 34, SEQ ID NO : 35, SEQ ID NO : 36, SEQ ID NO : 37, SEQ ID NO : 38, SEQ ID NO : 39, SEQ ID NO : 40, SEQ ID NO : 41, SEQ ID NO : 42, SEQ ID NO : 43, SEQ ID NO : 44, SEQ ID NO : 45, SEQ ID NO : 46, SEQ ID NO : 47, SEQ ID NO : 48, SEQ ID NO : 49, SEQ ID NO : 50 et SEQ ID NO : 51, soit une molécule hybride selon l’invention, dont le fragment Fc est sauvage (WT) ou le fragment Fc comprend la mutation GASDIE. Une telle molécule hybride est par exemple « FcWT-PEG-SEQ ID NO : 1-23/31-51 », « FcLALAPG-PEG-SEQ ID NO : 1-23/31-51 » ou « FcGASDIE-PEG-SEQ ID NO : 1-23/31-51 ». « FcWT-PEG-SEQ ID NO : 1-23/31-51 » représente un fragment Fc de type sauvage qui est lié à au moins un espaceur PEGn qui est lui-même couplé à un azoture lié de façon covalente à un cyclooctyne DBCO couplé à un espaceur PEGn qui est lui-même lié à un peptide représenté par l’une quelconque des SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO : 23 ou SEQ ID NO : 31 à SEQ ID NO : 51, « FcWT-LALAPG-SEQ ID NO : 1-23/31-51 » représente un fragment Fc comprenant les mutations L234A, L235A et P329G qui est lié à au moins un espaceur PEGn qui est lui-même couplé à un azoture lié de façon covalente à un cyclooctyne DBCO couplé à un espaceur PEGn qui est lui-même lié à un peptide représenté par l’une quelconque des SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO : 23 ou SEQ ID NO : 31 à SEQ ID NO : 51, et « FcGASDIE-PEG-SEQ ID NO : 1-23/31-51 » représente un fragment Fc comprenant les mutations G236A, S239D et I332E, qui est lié à au moins un espaceur PEGn qui est lui-même couplé à un azoture lié de façon covalente à un cyclooctyne DBCO couplé à un espaceur PEGn qui est lui-même lié à un peptide représenté par l’une quelconque des SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO : 23 ou SEQ ID NO : 31 à SEQ ID NO : 51. Dans les constructions, n représente un nombre entre 1 et 10 lorsqu’un espaceur PEGn est utilisé, de préférence 1, 2, 3, 4 ou 8.
Ces solutions ont été utilisées chacune à la concentration de 5 µg/mL en tampon PBS (Phosphate Buffered Saline) et incubées pendant une nuit à 4°C. Les peptides choisis et les molécules hybrides construites avec lesdits peptides synthétisés en séquence aléatoire (scramble) ont été utilisés à la même concentration comme contrôles négatifs. Après lavage en PBS Tween 0.05% les puits ont ensuite été saturés par du lait à 5%, pendant 1h à température ambiante. Après lavages, les sérums ont été incubés en dilution sérielle en tampon PBS + lait 5% pendant 1h à température ambiante. Après lavages, la réactivité des sérums a été détectée à l’aide d’un anticorps de détection anti-Fab d’IgG humaines couplé HRP dilué au 1/2500 en tampon PBS 5% lait incubé également 1h à température ambiante. Après lavage, la présence d’auto-anticorps reconnus par la molécule hybride est révélée par ajout de TMB et arrêt de la réaction enzymatique par ajout d’H2SO4 et une lecture au spectrophotomètre à 450nm.
Les résultats sont exprimés en ΔDO (Delta-Densité Optique), correspondant à la DO obtenue avec un hybride peptide scramble ou avec la molécule hybride construite avec ledit peptide.
Les résultats montrent une réactivité dose-dépendante des sérums sur les peptides vis-à-vis des molécules hybrides. Ils montrent qu’inclus dans les différents hybrides, les peptides restent parfaitement réactifs aux sérums comprenant les auto-anticorps.
Exemple 3 :Cinétique de fixation des molécules hybrides sur macrophages, à température physiologique
Des macrophages humains, différenciésin vitroen présence de M-CSF (100 ng/mL) à partir de monocytes CD14+ isolés du sang périphérique d’un sujet sain ont été incubés à 500.000 cellules/puits, en présence de molécules hybrides à 5 µg/Ml. Les molécules hybrides sont par exemple celles décrites dans l’Exemple 2.
Les molécules hybrides sont incubées pendant 2h, 8h 16h, 24h et 48h à 37°C. La fixation des molécules hybrides à la surface des macrophages est mise en évidence et quantifiée par cytofluorimétrie (FACS Canto II) après incubation des macrophages avec un anticorps anti-Fc couplé au FITC, utilisé 1/1000.
« NM » et « ANTI FC » représentent respectivement le puits contenant les macrophages incubés sans anticorps ou avec l’anticorps anti-Fc seul. « Wt », « LALAPG » et « GASDIE » représentent respectivement le puits contenant la molécule hybride avec le fragment Fc sauvage ou avec la mutation LALAPG ou avec la mutation GASDIE.
Les résultats montrent que les molécules hybrides à la température physiologique de 37°C, se fixent à la membrane des macrophages. Ces résultats montrent également que la fixation de l’hybride comprenant un fragment Fc comprenant la mutation GASDIE est supérieure à celle de la forme sauvage.
Exemple 4 :Phagocytose induite par l’hybride Fc-WT ou l’hybride Fc-GASDIE lorsqu’on arme les lymphocytes B via leurs FcγRIIb (CD32b) en présence des sérums
Des lymphocytes B humains fraîchement purifiés à partir de sang périphérique de donneurs sains par tri magnétique CD19+, ont été marqués au PKH-67 vert (Paul Karl Horan / marqueur lipidique fluorescent) puis incubés avec des sérums de patients atteints de vascularite auto-immune à une concentration de 5 μg/mL durant 30min à 37°C. Par la suite, les cellules ont été lavées puis mises en présence de l’hybride selon l’invention comprenant un fragment Fc sauvage (Wt) ou comprenant les mutations GASDIE. Les molécules hybrides sont par exemple celles décrites dans l’Exemple 2. Les cellules ont été mises en présence des hybrides à 10 μg/mL durant 30 min à 37°C. Après lavage, les cellules ont été mises au contact des macrophages (marqués PKH-26 rouge), à raison de 1 lymphocyte B pour 1 macrophage, durant 2h à 37°C. Les cellules ont ensuite été décollées puis analysées par cytométrie en flux. Les cellules présentant la double fluorescence (PKH-67 vert/PKH-26 rouge) correspondent aux macrophages qui ont phagocyté des lymphocytes. Les différentes populations cellulaires sont exprimées en pourcentage de la population cellulaire totale : pourcentage de phagocytose et pourcentage de lymphocytes B.
Les résultats obtenus confirment que l’activité de phagocytose est majorée en présence des hybrides (augmentation de la phagocytose associée à une diminution de la population de lymphocytes B). En effet, une augmentation significative du pourcentage de phagocytose, toujours associée à une diminution significative de la population de lymphocytes B, a été observée lorsque les lymphocytes B étaient recouverts de l’hybride.
Exemple 5 :Stabilité de la fixation des Fc-GASDIE A488 et des hybrides Fc-GASDIE peptide, sur des cellules NK après 30min, 24h et 48h, à température physiologique
Les cellules NK ont été incubées 30min, 24h ou 48h à 37°C en présence de FcGASDIE-N3-DBCO-A488 (un fragment Fc comprenant les mutations G236A, S239D et I332E qui est lié à au moins un espaceur PEGn qui est lui-même couplé à un azoture lié de façon covalente à un DBCO, la molécule étant marquée avec le fluorochrome A488) ou de FcGASDIE-N3-DBCO-PEG3-peptide-lysineA488 (un fragment Fc comprenant les mutations G236A, S239D et I332E qui est lié à au moins un espaceur PEGn qui est lui-même couplé à un azoture lié de façon covalente à un DBCO qui est couplé à espaceur PEGn lié à un peptide selon l’invention (représentée par l’une quelconque des SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO : 23 ou SEQ ID NO : 31 à SEQ ID NO : 51) la molécule étant marquée avec le fluorochrome A488 qui est liée à la molécule via une lysine). La fixation de ces 2 sondes fluorescentes aux cellules NK a été analysée par cytofluorimétrie. Dans les constructions, n représente un nombre entre 1 et 10 lorsqu’un espaceur PEGn est utilisé, de préférence 1, 2, 3, 4 ou 8.
Les résultats sont présentés à 30 minutes, à 24 heures et à 48 heures suivants. NM représente les cellules NK non marquées, sans anticorps.

Claims (8)

  1. Molécule hybride comprenant au moins un fragment Fc d’anticorps lié de façon covalente à au moins un peptide se liant à un lymphocyte auto-réactif impliqué dans une vascularite auto-immune, au moins un espaceur étant optionnellement présent entre ledit fragment Fc et ledit peptide, et dans laquelle ledit peptide comprend tout ou partie de la séquence polypeptidique de la protéinase 3, tout ou partie de la séquence polypeptidique de la myélopéroxidase et/ou tout ou partie de la séquence polypeptidique de la petite ribonucléoprotéine nucléaire SmD1.
  2. Molécule hybride selon la revendication précédente, dans laquelle la séquence est d’origine humaine.
  3. Molécule hybride selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle ledit espaceur est un polymère contenant un ou plusieurs motifs de répétition contenant le groupe éther, ledit espaceur étant de préférence le polyéthylène glycol de formule PEGn, dans laquelle n représente un nombre entier compris entre 1 et 100, préférentiellement entre 1 et 10 et notamment 1, 2, 3, 4 ou 8.
  4. Molécule hybride selon l’une quelconque des revendications 1-2, dans laquelle ledit peptide est choisi dans le groupe constitué par : SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO : 5, SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, SEQ ID NO : 9, SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, SEQ ID NO : 16, SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, SEQ ID NO : 20, SEQ ID NO : 21, SEQ ID NO : 22, SEQ ID NO : 23, SEQ ID NO : 31, SEQ ID NO : 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO : 34, SEQ ID NO : 35, SEQ ID NO : 36, SEQ ID NO : 37, SEQ ID NO : 38, SEQ ID NO : 39, SEQ ID NO : 40, SEQ ID NO : 41, SEQ ID NO : 42, SEQ ID NO : 43, SEQ ID NO : 44, SEQ ID NO : 45, SEQ ID NO : 46, SEQ ID NO : 47, SEQ ID NO : 48, SEQ ID NO : 49, SEQ ID NO : 50 et SEQ ID NO : 51.
  5. Molécule hybride selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle ledit fragment Fc est un fragment Fc humain, notamment d’IgG, plus particulièrement d’IgG1.
  6. Molécule hybride selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle ledit fragment Fc est de type sauvage ou muté, ledit fragment Fc muté comprenant de préférence au moins les mutations suivantes :
    - L234A et L235A, ou
    - L234A, L235A et P329G, ou
    - G236A, S239D et I332E, ou
    - G236A, S239D, A330L et I332E, ou
    - S239D, H268F, S324T et I332E,
    la numérotation étant indiquée dans la séquence d’une IgG1 humaine selon l’index EU.
  7. Molécule hybride selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle :
    - le fragment Fc est couplé à au moins un azoture et ledit peptide est couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, ou
    - le fragment Fc est couplé à au moins un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est couplé à un azoture, ou
    - le fragment Fc est couplé à au moins un azoture et ledit peptide est lié à un espaceur lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ou
    - le fragment Fc est couplé à au moins un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est lié à un espaceur lui-même couplé à un azoture ou
    - le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un azoture, et ledit peptide est couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ou
    - le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est couplé à un azoture ou
    - le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un azoture, et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO ou
    - le fragment Fc est lié à au moins un espaceur, lui-même couplé à un alcyne, tel qu’un cyclooctyne, et en particulier le DBCO, et ledit peptide est lié à un espaceur, lui-même couplé à un azoture,
    la liaison covalente entre ledit fragment Fc et ledit peptide, éventuellement en présence d’un ou plusieurs espaceurs, étant créée entre l’azoture et l’alcyne.
  8. Molécule hybride selon l’une quelconque des revendications précédentes, pour son utilisation comme médicament, notamment pour son utilisation dans le traitement d’une vascularite auto-immune, en particulier une granulomatose avec polyangéite.
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