FR2809734A1 - New human tetraspan protein, useful for identifying specific modulators, e.g. for treating or diagnosing neurodegeneration, also related nucleic acid - Google Patents
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Abstract
Description
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La présente invention a pour objet une protéine tétraspane humaine et ses fragments, notamment son domaine extracellulaire EC2, les acides nucléiques correspondants, les vecteurs contenant lesdits acides nucléiques, les anticorps dirigés contre ladite tétraspane ou ses fragments ainsi que les compositions pharmaceutiques comprenant ces précédents objets. La présente invention concerne encore l'utilisation de ladite tétraspane ou d'un agoniste de cette dernière notamment pour diminuer la migration des cellules tumorales. The subject of the present invention is a human tetraspane protein and its fragments, in particular its extracellular domain EC2, the corresponding nucleic acids, the vectors containing said nucleic acids, the antibodies directed against said tetraspane or its fragments as well as the pharmaceutical compositions comprising these preceding objects. . The present invention also relates to the use of said tetraspane or of an agonist of the latter in particular for reducing the migration of tumor cells.
La superfamille des tétraspanes (abréviation TM4SF) regroupe des glycoprotéines présentant des homologies structurales et de séquences. Ces tétraspanes présentent quatre domaines hydrophobes TM1 à TM4 (TM pour transmembrane) pouvant constituer des domaines transmembranaires permettant la formation de deux boucles extérieures, une de petite taille appelée EC1(EC pour extracellular) située à l'extrémité N-terminale et une de plus grande taille appelée EC2 située à l'extrémité Cterminale) (Maecker et al., 1997). Les plus fortes homologies entre les différents membres de la superfamille des tétraspanes sont confinées aux domaines transmembranaires. La plus grande diversité de séquence est trouvée au niveau des boucles extracellulaires et en particulier EC2. Cependant, quatre résidus cystéines sont conservés au niveau de EC2 : motif CCG localisé à environ 50 acides aminés après le domaine TM3, un résidu cystéine à environ 11acides aminés en amont de TM4, et un résidu cystéine fréquemment trouvé dans un motif PXSC (X pouvant être n'importe lequel des acides aminés) qui est placé indifféremment dans le domaine EC2. The tetraspanes superfamily (abbreviation TM4SF) groups together glycoproteins with structural and sequence homologies. These tetraspanes have four hydrophobic domains TM1 to TM4 (TM for transmembrane) which can constitute transmembrane domains allowing the formation of two outer loops, one of small size called EC1 (EC for extracellular) located at the N-terminal end and one more large size called EC2 located at the Cterminal end) (Maecker et al., 1997). The strongest homologies between the various members of the tetraspan superfamily are confined to the transmembrane domains. The greatest sequence diversity is found at the level of the extracellular loops and in particular EC2. However, four cysteine residues are conserved at the level of EC2: CCG motif located at approximately 50 amino acids after the TM3 domain, a cysteine residue at approximately 11 amino acids upstream of TM4, and a cysteine residue frequently found in a PXSC motif (X possibly be any of the amino acids) which is placed interchangeably in the EC2 domain.
La superfamille des tétraspanes contient une vingtaine de membres dont certains sont ubiquitaires (comme par exemple les molécules CD9, CD63, CD81 et CD82) (Oren et al., 1990 ; Boucheix et al., 1991 ; Metzelaar et al., 1991 ; Gil et al., 1992) ou d'expression plus restreinte (comme par exemple la molécule CD37 sur les lymphocytes B matures, la molécule CD53 sur les cellules lymphoïdes et méloïdes ou la neurospanine sur les cellules nerveuses) (Classon et al., 1989 ; Amiot, 1990 ; et Bixby, 1999). Les molécules de la superfamille des tétraspanes agiraient comme facilitateurs dans les interactions des molécules membranaires (Maecker et al., 1997). The tetraspans superfamily contains around twenty members, some of which are ubiquitous (such as, for example, the molecules CD9, CD63, CD81 and CD82) (Oren et al., 1990; Boucheix et al., 1991; Metzelaar et al., 1991; Gil et al., 1992) or of a more limited expression (such as, for example, the CD37 molecule on mature B lymphocytes, the CD53 molecule on lymphoid and meloid cells or neurospanin on nerve cells) (Classon et al., 1989; Amiot, 1990; and Bixby, 1999). The molecules of the tetraspan superfamily act as facilitators in the interactions of membrane molecules (Maecker et al., 1997).
De nombreuses molécules de la superfamille des tétraspanes ont été initialement identifiées comme des antigènes tumoraux comme les molécules TAPA-1/CD63 (Oren et al., 1990), Motility related protein-l/CD9 (Boucheix et al., 1991), L6 (Marken et al., Many molecules of the tetraspan superfamily were initially identified as tumor antigens such as TAPA-1 / CD63 (Oren et al., 1990), Motility related protein-1 / CD9 (Boucheix et al., 1991), L6 (Marken et al.,
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1992), Sarcoma Amplified Sequence (SAS) (Jankowski étal, 1994), TI-1 (Kallin et al., 1991) ou CO-029 (Szala et al., 1990). De manière remarquable, il apparaît que la diminution d'expression de certaines molécules de la superfamille des tétraspanes est associée à une augmentation des propriétés de migration des cellules tumorales (processus d'invasion tumorale ou métastase). Ce phénomène a été largement rapporté dans la littérature pour les molécules CD9 (Miyake et al., 1991), CD63 (Hotta et al., 1988 ; Azorsa et al., 1991), et CD82 (Adachi et al., 1996 ; White et al., 1998). De la même manière, la transfection de cellules tumorales avec les ADNc codant pour les molécules CD9 (Ikeyama et al., 1993), CD63 (Hotta et al., 1991 ; Kondoh et al., 1993 ; Radford et al., 1995 ; Radford et al., 1996) ou CD82 (Dong et al., 1995) induit une diminution de la mobilité et donc de l'agressivité de la tumeur. 1992), Sarcoma Amplified Sequence (SAS) (Jankowski et al, 1994), TI-1 (Kallin et al., 1991) or CO-029 (Szala et al., 1990). Remarkably, it appears that the decrease in expression of certain molecules of the tetraspan superfamily is associated with an increase in the migration properties of tumor cells (tumor invasion process or metastasis). This phenomenon has been widely reported in the literature for the molecules CD9 (Miyake et al., 1991), CD63 (Hotta et al., 1988; Azorsa et al., 1991), and CD82 (Adachi et al., 1996; White et al., 1998). In the same way, the transfection of tumor cells with the cDNAs coding for the molecules CD9 (Ikeyama et al., 1993), CD63 (Hotta et al., 1991; Kondoh et al., 1993; Radford et al., 1995; Radford et al., 1996) or CD82 (Dong et al., 1995) induces a decrease in the mobility and therefore the aggressiveness of the tumor.
Les molécules de la superfamille des tétraspanes jouent un rôle de corécepteur en formant des complexes oligomériques dont le rôle reste obscur. Parmi ces structures multimériques, citons l'interaction de la molécule CD19 avec les tétraspanes CD9/CD81/CD82 (Horvath et al., 1998). Les molécules du complexe majeur d'histocompatibilité de classe II forment des complexes oligomériques avec les tétraspanes CD37/CD53/CD81/CD82 (Angelisova et al., 1994) ou CD9/CD63/CD81/CD82 (Rubinstein et al., 1996). La molécule CD2 interagit avec la tétraspane CD53 et la molécule CD5 interagit avec la tétraspane CD9 (Toyo-oka et al., 1999). Les molécules CD81 et CD82 s'associent aux domaines intracellulaires des molécules CD4 et CD8 (Imai & Yoshie, 1993 ; Imai et al., 1995). The molecules of the tetraspan superfamily play a co-receptor role by forming oligomeric complexes whose role remains obscure. Among these multimeric structures, let us quote the interaction of the CD19 molecule with the tetaspanes CD9 / CD81 / CD82 (Horvath et al., 1998). The molecules of the major class II histocompatibility complex form oligomeric complexes with the tetaspanes CD37 / CD53 / CD81 / CD82 (Angelisova et al., 1994) or CD9 / CD63 / CD81 / CD82 (Rubinstein et al., 1996). The CD2 molecule interacts with tetraspane CD53 and the CD5 molecule interacts with tetraspane CD9 (Toyo-oka et al., 1999). The CD81 and CD82 molecules associate with the intracellular domains of the CD4 and CD8 molecules (Imai & Yoshie, 1993; Imai et al., 1995).
Les molécules de la superfamille des tétraspanes interagissent également avec les intégrines, principalement celles de la famille ss1 comme par exemple l'interaction de la molécule CD63 avec les intégrines [alpha]3ss1 (VLA-3) et [alpha]6ss1 (VLA-6), de la molécule CD9 avec les intégrines [alpha]4ss1 (VLA-4) et VLA-6, de la molécule CD 151 avec l'intégrine [alpha]5ss1 (Berdichevski et al., 1996 ; Rubinstein et al., 1994 ; Rubinstein et al., 1996 ; Mannion et al., 1996 ; Radford et al., 1996 ; Sincock et al., 1997) ou de la molécule NAG-2 avec [alpha]3ss1 et [alpha]6ss1 (Tachibana et al., 1997). Les molécules CD9 et CD63 ont également la propriété d'interagir avec la molécule LFA-1 ([alpha]1ss2). Le rôle des intégrines dans les mécanismes d'adhésion et de migration cellulaire ainsi que la capacité des molécules de la superfamille des tétraspanes à former des complexes The molecules of the tetraspanes superfamily also interact with the integrins, mainly those of the ss1 family, for example the interaction of the CD63 molecule with the integrins [alpha] 3ss1 (VLA-3) and [alpha] 6ss1 (VLA-6 ), of the molecule CD9 with the integrins [alpha] 4ss1 (VLA-4) and VLA-6, of the molecule CD 151 with the integrin [alpha] 5ss1 (Berdichevski et al., 1996; Rubinstein et al., 1994 ; Rubinstein et al., 1996; Mannion et al., 1996; Radford et al., 1996; Sincock et al., 1997) or of the molecule NAG-2 with [alpha] 3ss1 and [alpha] 6ss1 (Tachibana et al ., 1997). The CD9 and CD63 molecules also have the property of interacting with the LFA-1 molecule ([alpha] 1ss2). The role of integrins in cell adhesion and migration mechanisms as well as the capacity of molecules in the tetraspan superfamily to form complexes
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oligomériques avec les intégrines permettent de souligner le rôle de ces dernières dans les processus d'invasion tumorale. oligomers with integrins make it possible to emphasize the role of the latter in the processes of tumor invasion.
L'association des molécules de la superfamille des tétraspanes avec des molécules de costimulation exprimées par les cellules du système immunitaire a permis de mettre en évidence leur participation dans l'activation de certaines cellules immunes. The association of the molecules of the tetraspan superfamily with costimulation molecules expressed by the cells of the immune system has made it possible to demonstrate their participation in the activation of certain immune cells.
Une activation des molécules CD9 et CD82 à l'aide d'anticorps monoclonaux fournit un signal de costimulation aux lymphocytes T stimulés avec un anticorps anti-CD3 (Lebelbinay et al., 1995 ; Tai et al., 1996). Des anticorps anti-CD151 et anti-CD9 induisent une agrégation et une activation plaquettaire, respectivement (Slupsky et al., 1989 ; Griffith et al., 1991). L'activation cellulaire médiée par les molécules de la superfamille des tétraspanes est associée à la génération de seconds signaux impliqués dans la transduction du signal. Un anticorps anti-CD53 fournit un signal de costimulation à des lymphocytes B activés via le récepteur aux immunoglobulines (Rasmussen et al., 1994) ; ce signal d'activation est médié en partie par la protéine kinase C (Bosca & Lazo, 1994). Un anticorps anti-CD9 active la kinase p72syk (Ozaki et al., 1995) et la signalisation intracellulaire est associée à une GTP-binding protein (Seehafer & Shaw, 1991). Des expériences d'immunoprécipitation des molécules CD63 et CD53 montrent qu'elles sont associées à des phosphatases non identifiées (Carmo & Wright, 1995). Activation of the CD9 and CD82 molecules using monoclonal antibodies provides a costimulation signal to T lymphocytes stimulated with an anti-CD3 antibody (Lebelbinay et al., 1995; Tai et al., 1996). Anti-CD151 and anti-CD9 antibodies induce platelet aggregation and activation, respectively (Slupsky et al., 1989; Griffith et al., 1991). Cellular activation mediated by the molecules of the tetraspan superfamily is associated with the generation of second signals involved in signal transduction. An anti-CD53 antibody provides a costimulation signal to B cells activated via the immunoglobulin receptor (Rasmussen et al., 1994); this activation signal is mediated in part by protein kinase C (Bosca & Lazo, 1994). An anti-CD9 antibody activates the kinase p72syk (Ozaki et al., 1995) and intracellular signaling is associated with a GTP-binding protein (Seehafer & Shaw, 1991). Immunoprecipitation experiments on the CD63 and CD53 molecules show that they are associated with unidentified phosphatases (Carmo & Wright, 1995).
La molécule CD81a été identifiée comme un récepteur pour la molécule E2 du virus à l'hépatite C (Pileri et al., 1998 ; Flint et al., 1999). Des souris n'exprimant pas la molécule CD9 (CD9 knock-out) présentent une fertilité réduite consécutive à une altération des interactions spermatozoïde-ovule (Kaji étal, 2000). The CD81 molecule has been identified as a receptor for the hepatitis C virus E2 molecule (Pileri et al., 1998; Flint et al., 1999). Mice not expressing the CD9 molecule (CD9 knockout) exhibit reduced fertility following an alteration in sperm-egg interactions (Kaji et al, 2000).
La superfamille des tétraspanes s'est récemment développée par l'identification de sept nouveaux ADNc codant pour des molécules présentant les caractéristiques structurales de cette famille (Serru et al., 2000) ainsi que par le clonage chez le poulet d'une nouvelle molécule, appelée neurospanine (Perron et Bixby, 2000). The tetraspans superfamily has recently developed by the identification of seven new cDNAs coding for molecules presenting the structural characteristics of this family (Serru et al., 2000) as well as by the cloning in chicken of a new molecule, called neurospanin (Perron and Bixby, 2000).
Ainsi, il reste aujourd'hui un grand besoin d'isoler et d'identifier de nouvelles tétraspanes. De telles tétraspanes seraient en effet susceptibles d'avoir un rôle important pour moduler les interactions des molécules membranaires mais aussi dans le processus d'invasion tumorale. Il existe donc un besoin de nouvelles compositions pharmaceutiques utiles dans le traitement des maladies liées à l'altération de l'expression Thus, there remains today a great need to isolate and identify new tetraspanes. Such tetraspanes would indeed be likely to have an important role in modulating the interactions of membrane molecules but also in the process of tumor invasion. There is therefore a need for new pharmaceutical compositions useful in the treatment of diseases linked to alteration of expression
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des molécules de la superfamille des tétraspanes tout comme de nouveaux diagnostiques permettant de déceler ces maladies. Ceci est justement l'objet de la présente invention. molecules from the tetraspan superfamily as well as new diagnostics to detect these diseases. This is precisely the object of the present invention.
La présente invention a ainsi pour objet une nouvelle protéine tétraspane humaine isolée de séquence SEQ ID No. 2, l'un de ses fragments d'au moins 5 acides aminés ou l'une de ses protéines dérivées. The present invention thus relates to a new isolated human tetraspane protein of sequence SEQ ID No. 2, one of its fragments of at least 5 amino acids or one of its derived proteins.
Cette nouvelle tétraspane selon l'invention a été isolée de façon surprenante en se basant notamment sur une étiquette de séquence exprimée EST (EST pour Expressed Sequence Tag ) choisie parmi 1856102 EST de la banque db EST, disponible à l'adresse internet "www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/". This new tetraspane according to the invention was surprisingly isolated on the basis in particular of an expressed sequence label EST (EST for Expressed Sequence Tag) chosen from 1856102 EST from the bank db EST, available at the internet address "www. ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/ ".
De plus, comme il est démontré dans l'exemple 2 ci-après, l'expression de cette tétraspane n'est pas limitée aux neurones. Ainsi, il a été démontré que cette nouvelle tétéraspane était également exprimée notamment au niveau des cellules endothéliales et des lymphocytes T. In addition, as demonstrated in Example 2 below, the expression of this tetaspane is not limited to neurons. Thus, it has been demonstrated that this new teteraspane was also expressed in particular at the level of endothelial cells and T lymphocytes.
Par protéine , on entend désigner également les termes de peptide ou polypeptide, ces 3 termes étant utilisés indifféremment dans la présente description. The term “protein” is also intended to denote the terms of peptide or polypeptide, these 3 terms being used interchangeably in the present description.
Dans la présente description, en particulier dans les revendications, sauf mention particulière, on entendra désigner par tétraspane humaine la tétraspane humaine isolée de séquence SEQ ID No. 2. In the present description, in particular in the claims, unless specifically mentioned, the term “human tetraspane” will be understood to mean isolated human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2.
Par fragment de la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, on entend désigner dans la présente description tout fragment dont la séquence comprend au moins 5 acides aminés consécutifs de la séquence SEQ ID No. 2, de préférence 8,10, 15,20, 25,50 et 100 acides aminés consécutifs de la séquence SEQ ID No. 2. By fragment of human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, is meant in the present description any fragment whose sequence comprises at least 5 consecutive amino acids of the sequence SEQ ID No. 2, preferably 8, 10, 15, 20, 25.50 and 100 consecutive amino acids of the sequence SEQ ID No. 2.
Par protéine dérivé de la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2 , on entend désigner dans la présente description les protéines comprenant une séquence présentant un pourcentage d'identité après alignement optimal d'au moins 90 %, de préférence 95 %, et 99 % avec la séquence SEQ ID No. 2. By protein derived from human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, is meant in the present description the proteins comprising a sequence having a percentage of identity after optimal alignment of at least 90%, preferably 95%, and 99 % with the sequence SEQ ID No. 2.
Parmi lesdits fragments et lesdites protéines dérivées de la protéine de séquence SEQ ID No. 2, on préfère ceux capables d'exercer au moins partiellement une des activités des protéines tétraspanes telles que mentionnées ci-avant, ou de moduler au moins partiellement une des activités des protéines tétraspanes mentionnées ci-avant. Among said fragments and said proteins derived from the protein of sequence SEQ ID No. 2, preference is given to those capable of exercising at least partially one of the activities of the tetraspane proteins as mentioned above, or of modulating at least partially one of the activities tetraspane proteins mentioned above.
Parmi lesdits fragments et lesdites protéines dérivées de la protéine de séquence SEQ ID No. 2, on préfère de manière particulière ceux capables d'inhiber ou Among said fragments and said proteins derived from the protein of sequence SEQ ID No. 2, particular preference is given to those capable of inhibiting or
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d'augmenter au moins partiellement une des activités des protéines tétraspanes telles que mentionnées ci-avant, lesdits fragments et lesdites protéines dérivées pouvant ainsi être utilisés pour moduler, en particulier diminuer, l'activité biologique de la tétraspane. to at least partially increase one of the activities of the tetraspane proteins as mentioned above, said fragments and said derived proteins thus being able to be used to modulate, in particular decrease, the biological activity of tetraspane.
Ainsi, lesdites protéines dérivées pourront comprendre une ou plusieurs substitutions, de préférence conservatrices, délétions ou insertions, comparées à la protéine sauvage de séquence SEQ ID No. 2. Thus, said derived proteins may comprise one or more substitutions, preferably conservative, deletions or insertions, compared with the wild protein of sequence SEQ ID No. 2.
Par substitution conservatrice, on entend désigner toute substitution d'acide aminé n'induisant que peu ou pas d'effet sur la charge totale, la polarité ou l'hydrophobicité de la protéine de référence, ladite substitution permettant d'accroître ou de diminuer l'activité recherchée de la tétraspane. Cette activité recherchée pouvant être soit une activité agoniste ou soit antagoniste de la tétraspane. The term “conservative substitution” is intended to denote any amino acid substitution which has little or no effect on the total charge, the polarity or the hydrophobicity of the reference protein, said substitution making it possible to increase or decrease the activity sought for tetraspane. This sought-after activity can either be an agonist or an antagonist of tetraspane.
Par pourcentage d'identité entre deux séquences d'acide nucléique ou d'acides aminés au sens de la présente invention, on entend désigner un pourcentage de nucléotides ou de résidus d'acides aminés identiques entre les deux séquences à comparer, obtenu après le meilleur alignement, ce pourcentage étant purement statistique et les différences entre les deux séquences étant réparties au hasard et sur toute leur longueur. Les comparaisons de séquences entre deux séquences d'acides nucléiques ou d'acides aminés sont traditionnellement réalisées en comparant ces séquences après les avoir alignées de manière optimale, ladite comparaison étant réalisée par segment ou par fenêtre de comparaison pour identifier et comparer les régions locales de similarité de séquence. L'alignement optimal des séquences pour la comparaison peut être réalisé, outre manuellement, au moyen de l'algorithme d'homologie locale de Smith et Waterman (1981) [Ad. App. Math. 2 :482], moyen de l'algorithme d'homologie locale de Neddleman et Wunsch (1970) [J. Mol. Biol. By percentage of identity between two nucleic acid or amino acid sequences within the meaning of the present invention is intended to denote a percentage of nucleotides or identical amino acid residues between the two sequences to be compared, obtained after the best alignment, this percentage being purely statistical and the differences between the two sequences being distributed randomly and over their entire length. Sequence comparisons between two nucleic acid or amino acid sequences are traditionally carried out by comparing these sequences after having optimally aligned them, said comparison being carried out by segment or by comparison window to identify and compare the local regions of sequence similarity. The optimal alignment of the sequences for comparison can be achieved, besides manually, by means of the local homology algorithm of Smith and Waterman (1981) [Ad. App. Math. 2: 482], using the local homology algorithm of Neddleman and Wunsch (1970) [J. Mol. Biol.
48 :443], au moyen de la méthode de recherche de similarité de Pearson et Lipman (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 :2444], moyen de logiciels informatiques utilisant ces algorithmes (GAP, BESTFIT, FASTA et TFASTA dans le Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI, ou encore par les logiciels de comparaison BLAST N ou BLAST P). 48: 443], using the similarity search method of Pearson and Lipman (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 2444], using computer software using these algorithms (GAP, BESTFIT, FASTA and TFASTA in the Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI, or even by BLAST N comparison software or BLAST P).
Le pourcentage d'identité entre deux séquences d'acides nucléiques ou d'acides aminés est déterminé en comparant ces deux séquences alignées de manière optimale par fenêtre de comparaison dans laquelle la région de la séquence d'acide nucléique ou The percentage of identity between two nucleic acid or amino acid sequences is determined by comparing these two optimally aligned sequences per comparison window in which the region of the nucleic acid sequence or
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d'acides aminés à comparer peut comprendre des additions ou des délétions par rapport à la séquence de référence pour un alignement optimal entre ces deux séquences. Le pourcentage d'identité est calculé en déterminant le nombre de positions identiques pour lesquelles le nucléotide ou le résidu d'acide aminé est identique entre les deux séquences, en divisant ce nombre de positions identiques par le nombre total de positions dans la fenêtre de comparaison et en multipliant le résultat obtenu par 100 pour obtenir le pourcentage d'identité entre ces deux séquences. of amino acids to be compared can include additions or deletions with respect to the reference sequence for optimal alignment between these two sequences. The percentage of identity is calculated by determining the number of identical positions for which the nucleotide or the amino acid residue is identical between the two sequences, by dividing this number of identical positions by the total number of positions in the comparison window. and multiplying the result obtained by 100 to obtain the percentage of identity between these two sequences.
Par exemple, on pourra utiliser le programme BLAST, BLAST 2 séquences , disponible sur le site http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/, les paramètres utilisés étant ceux donnés par défaut (en particulier pour les paramètres open gap penaltie : 5, et extension gap penaltie : 2 ; la matrice choisie étant par exemple la matrice BLOSUM 62 proposée par le programme), le pourcentage d'identité entre les deux séquences à comparer étant calculé directement par le programme. For example, we could use the BLAST program, BLAST 2 sequences, available on the site http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/, the parameters used being those given by default (in particular for the open parameters gap penalty: 5, and extension gap penalty: 2; the chosen matrix being for example the BLOSUM 62 matrix proposed by the program), the percentage of identity between the two sequences to be compared being calculated directly by the program.
Parmi lesdits fragments de la protéine de séquence SEQ ID No. 2 selon l'invention, on préfère la protéine isolée de séquence SEQ ID No. 4 correspondant au domaine extracellulaire EC2 de la tétraspane humaine, ou une de ses protéines dérivées. Among said fragments of the protein of sequence SEQ ID No. 2 according to the invention, preferred is the isolated protein of sequence SEQ ID No. 4 corresponding to the EC2 extracellular domain of human tetraspane, or one of its proteins derived.
Parmi lesdits fragments de la protéine de séquence SEQ ID No. 2 selon l'invention, on préfère également la protéine isolée de séquence SEQ ID No. 6 correspondant au domaine extracellulaire EC2 de la tétraspane humaine flanqué de ses deux domaines transmembranaires TM3 et TM4, ou une de ses protéines dérivées. Among said fragments of the protein of sequence SEQ ID No. 2 according to the invention, preference is also given to the isolated protein of sequence SEQ ID No. 6 corresponding to the extracellular domain EC2 of human tetraspan flanked by its two transmembrane domains TM3 and TM4, or one of its derived proteins.
Par protéine dérivée de la protéine de séquence SEQ ID No. 4 ou de séquence SEQ ID No. 6, on entend désigner respectivement une protéine dont la séquence présente un pourcentage d'identité après alignement optimal d'au moins 90 %, de préférence 95 %, et 99 % avec la séquence SEQ ID No. 4 ou SEQ ID No. 6. The term “protein derived from the protein of sequence SEQ ID No. 4 or of sequence SEQ ID No. 6” is intended to denote respectively a protein whose sequence has a percentage of identity after optimal alignment of at least 90%, preferably 95 %, and 99% with the sequence SEQ ID No. 4 or SEQ ID No. 6.
De préférence, lesdites protéines dérivées de la protéine de séquence SEQ ID No. 4 et de séquence SEQ ID No. 6 sont capables d'exercer respectivement au moins partiellement une des activités des fragments de séquences SEQ ID No. 4 et SEQ ID No. 6 de la protéine tétraspane ou de moduler au moins partiellement une desdites activités, comme ci-avant mentionnées pour les fragments et protéines dérivées de la séquences SEQ ID No. 2. Preferably, said proteins derived from the protein of sequence SEQ ID No. 4 and of sequence SEQ ID No. 6 are capable of exercising at least partially, respectively, one of the activities of the fragments of sequences SEQ ID No. 4 and SEQ ID No. 6 of the tetraspane protein or at least partially modulating one of said activities, as mentioned above for the fragments and proteins derived from the sequence SEQ ID No. 2.
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Sous un autre aspect, l'invention comprend les acides nucléiques isolés dont la séquence code pour une protéine selon la présente invention, leur acide nucléique de séquence complémentaire ou la séquence de leur ARN correspondant. In another aspect, the invention includes isolated nucleic acids whose sequence codes for a protein according to the present invention, their nucleic acid of complementary sequence or the sequence of their corresponding RNA.
Par acide nucléique, séquence nucléique, séquence polynucléotidique ou polynucléotide, on entend un fragment d'ADN, mono brin ou double brins, ou d'ARN naturel, recombinant, ou de synthèse, comportant ou non des nucléotides non naturels, désignant un enchaînement précis de nucléotides, modifiés ou non, permettant de définir un fragment, un segment ou une région. The term “nucleic acid, nucleic sequence, polynucleotide sequence or polynucleotide” means a fragment of DNA, single-stranded or double-stranded, or of natural, recombinant or synthetic RNA, comprising or not non-natural nucleotides, designating a precise sequence nucleotides, modified or not, making it possible to define a fragment, a segment or a region.
L'invention comprend en particulier un acide nucléique selon l'invention, dont la séquence code pour la protéine de séquence SEQ ID No. 2 ou pour une de ses protéines dérivées. Un tel acide nucléique est par exemple et préférentiellement un acide nucléique de séquence SEQ ID No. 1. The invention comprises in particular a nucleic acid according to the invention, the sequence of which codes for the protein of sequence SEQ ID No. 2 or for one of its derived proteins. Such a nucleic acid is for example and preferably a nucleic acid of sequence SEQ ID No. 1.
L'invention comprend en particulier un acide nucléique selon l'invention, dont la séquence code pour la protéine de séquence SEQ ID No. 4 ou pour une de ses protéines dérivées. Un tel un acide nucléique est par exemple et préférentiellement un acide nucléique de séquence SEQ ID No. 3. The invention comprises in particular a nucleic acid according to the invention, the sequence of which codes for the protein of sequence SEQ ID No. 4 or for one of its derived proteins. Such a nucleic acid is for example and preferably a nucleic acid of sequence SEQ ID No. 3.
L'invention comprend en particulier un acide nucléique selon l'invention, dont la séquence code pour la protéine de séquence SEQ ID No. 6 ou pour une de ses protéines dérivées. Un tel un acide nucléique est par exemple et préférentiellement un acide nucléique de séquence SEQ ID No. 5. The invention comprises in particular a nucleic acid according to the invention, the sequence of which codes for the protein of sequence SEQ ID No. 6 or for one of its derived proteins. Such a nucleic acid is for example and preferably a nucleic acid of sequence SEQ ID No. 5.
L'invention est aussi relative aux acides nucléiques capables de s'hybrider avec l'une des séquences d'acides nucléiques selon la présente invention. The invention also relates to nucleic acids capable of hybridizing with one of the nucleic acid sequences according to the present invention.
Par acide nucléique capable de s'hybrider spécifiquement avec l'un des acides nucléiques selon l'invention, on entend désigner les acides nucléiques d'au moins 15 nucléotides, de préférence 18,20, 25 et 50 nucléotides capables de s'hybrider dans des conditions stringentes d'hybridation avec l'un desdits acides nucléiques selon l'invention, ces conditions étant bien connues de l'homme de l'art, telles que les conditions décrites notamment par Sambrook et al. (Molecular cloning, A laboratory Manual, Sec. Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, pages 11. 50 et 11.51, 1989). The term “nucleic acid capable of hybridizing specifically with one of the nucleic acids according to the invention” is intended to denote the nucleic acids of at least 15 nucleotides, preferably 18, 20, 25 and 50 nucleotides capable of hybridizing in stringent hybridization conditions with one of said nucleic acids according to the invention, these conditions being well known to those skilled in the art, such as the conditions described in particular by Sambrook et al. (Molecular cloning, A laboratory Manual, Sec. Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, pages 11. 50 and 11.51, 1989).
Parmi lesdites conditions stringentes, on préfère les conditions telles qu'elles assurent aux acides nucléiques qui s'hybrident spécifiquement avec l'un des acides Among said stringent conditions, preference is given to the conditions such as they provide for nucleic acids which specifically hybridize with one of the acids
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nucléiques selon l'invention, une séquence présentant au moins 90 %, de préférence, 95 % et 99 % d'identité après alignement avec la séquence complémentaire de l'un desdits acides nucléiques selon l'invention. nucleic acids according to the invention, a sequence having at least 90%, preferably 95% and 99% identity after alignment with the complementary sequence of one of said nucleic acids according to the invention.
Sous un autre aspect, l'invention comprend l'utilisation des acides nucléiques selon l'invention comme amorce, notamment pour l'amplification d'acide nucléique par une technique de polymérisation en chaîne à la polymérase (PCR ou méthode apparentée à la PCR) ou en tant que sonde pour la mise en évidence ou l'identification d'acide nucléique. In another aspect, the invention includes the use of the nucleic acids according to the invention as a primer, in particular for the amplification of nucleic acid by a polymerase chain polymerization technique (PCR or method related to PCR) or as a probe for the detection or identification of nucleic acid.
La présente invention concerne l'ensemble des sondes qui peuvent être déduites des acides nucléiques de l'invention, notamment des séquences capables d'hybrider avec elles, et qui peuvent permettre de mettre en évidence lesdits acides nucléiques de l'invention, en particulier de discriminer les séquences normales des séquences mutées. The present invention relates to all the probes which can be deduced from the nucleic acids of the invention, in particular sequences capable of hybridizing with them, and which can make it possible to demonstrate said nucleic acids of the invention, in particular of discriminate normal sequences from mutated sequences.
L'ensemble des sondes et amorces selon l'invention pourront être marquées par des méthodes bien connues de l'homme du métier, afin d'obtenir un signal détectable et/ou quantifiable. All of the probes and primers according to the invention can be labeled by methods well known to those skilled in the art, in order to obtain a detectable and / or quantifiable signal.
L'invention comprend en outre l'utilisation des acides nucléiques selon l'invention, comme oligonucléotides sens ou antisens. The invention further comprises the use of the nucleic acids according to the invention, as sense or antisense oligonucleotides.
Les acides nucléiques antisens pourront notamment être utilisés dans des traitements thérapeutiques dits antisens connus de l'homme du métier. Ils consistent principalement à combiner une séquence d'ARN naturellement produite avec une polynucléotide antisens qui s'hybride à cette dernière de façon à former un duplex. Ce duplex bloque ensuite le reste de la transcription ou interdit la traduction. The antisense nucleic acids may in particular be used in so-called antisense therapeutic treatments known to those skilled in the art. They mainly consist in combining a naturally produced RNA sequence with an antisense polynucleotide which hybridizes to the latter so as to form a duplex. This duplex then blocks the rest of the transcription or prohibits translation.
On peut également citer les oligonucléotides sens qui, par interaction avec des protéines impliquées dans la régulation de l'expression du produit correspondant, induiront soit une inhibition, soit une activation de cette expression, et être ainsi utilisés dans d'autres traitements thérapeutiques nécessitant la modulation de cette expression. Mention may also be made of sense oligonucleotides which, by interaction with proteins involved in the regulation of the expression of the corresponding product, will induce either an inhibition or an activation of this expression, and thus be used in other therapeutic treatments requiring the modulation of this expression.
Un autre objet de l'invention est un vecteur, de clonage et/ou d'expression, qui contient un acide nucléique selon l'invention, notamment un acide nucléique choisi parmi : Another object of the invention is a vector, for cloning and / or expression, which contains a nucleic acid according to the invention, in particular a nucleic acid chosen from:
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- un acide nucléique codant pour une tétraspane de séquence SEQ ID No. 2 ou pour une protéine dont la séquence présente un pourcentage d'identité après alignement optimal d'au moins 90 %, de préférence 95 %, et 99 % avec la séquence SEQ ID No. 2 ; - un acide nucléique de séquence SEQ ID No. 1 ; - un acide nucléique qui codant pour le domaine extracellulaire EC2 de séquence SEQ ID No. 4, ou pour une protéine dont la séquence présente un pourcentage d'identité après alignement optimal d'au moins 90 %, de préférence 95 %, et 99 % avec la séquence SEQ ID No. 4 ; - un acide nucléique de séquence SEQ ID No. 3 ; - un acide nucléique codant pour le domaine extracellulaire EC2 de la tétraspane humaine flanqué de ses deux domaines transmembranaires TM3 et TM4 de séquence SEQ ID No. 6, ou pour une protéine dont la séquence présente un pourcentage d'identité après alignement optimal d'au moins 90 %, de préférence 95 %, et 99 % avec la séquence SEQ ID No. 6 ; - un acide nucléique de séquence SEQ ID No. 5. a nucleic acid coding for a tetaspane of sequence SEQ ID No. 2 or for a protein whose sequence has a percentage of identity after optimal alignment of at least 90%, preferably 95%, and 99% with the sequence SEQ ID No. 2; - a nucleic acid of sequence SEQ ID No. 1; a nucleic acid which codes for the EC2 extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4, or for a protein whose sequence has a percentage of identity after optimal alignment of at least 90%, preferably 95%, and 99% with the sequence SEQ ID No. 4; - a nucleic acid of sequence SEQ ID No. 3; a nucleic acid coding for the EC2 extracellular domain of human tetraspane flanked by its two transmembrane domains TM3 and TM4 of sequence SEQ ID No. 6, or for a protein whose sequence has a percentage identity after optimal alignment of minus 90%, preferably 95%, and 99% with the sequence SEQ ID No. 6; - a nucleic acid of sequence SEQ ID No. 5.
Parmi les vecteurs selon l'invention, on préfère les vecteurs caractérisés en ce qu'ils comportent les éléments permettant l'expression desdites séquences dans une cellule hôte et éventuellement la sécrétion desdites séquences hors de la cellule hôte. Par vecteur d'expression , on entend aussi bien des vecteurs d'expression à réplication autonome du type plasmide que des systèmes destinés à assurer l'intégration dans les cellules, mais ces vecteurs d'expression pourront être également des vecteurs d'expression de type viral ou bien même, lorsque l'on souhaite réaliser par exemple de la thérapie génique, de l'ADN nu. Parmi les vecteurs viraux, on préfère ceux dérivés de l'adénovirus, du virus associé à l'adénovirus (AAV), de rétrovirus, des lentivirus, et de préférence les dérivés de HIV, des poxvirus, du virus de l'herpès pour l'expression en système eucaryote. Parmi les vecteurs non viraux, on préfère les polynucléotides nus tels que l'ADN nu ou l'ARN nu selon la technique développée par la société VICAL, les chromosomes artificiels de levure (YAC, yeast artificial chromosome) pour l'expression dans la levure, les chromosomes artificiels de souris (MAC, mouse artificial chromosome) pour l'expression dans les cellules murines et de manière préférée les chromosomes artificiels d'homme (HAC, human artificial chromosome) pour l'expression dans les cellules humaines. Among the vectors according to the invention, the vectors characterized in that they comprise the elements allowing the expression of said sequences in a host cell and optionally the secretion of said sequences out of the host cell are preferred. By expression vector is meant both expression vectors with autonomous replication of the plasmid type and systems intended to ensure integration into cells, but these expression vectors may also be expression vectors of the type viral or even, when it is desired to carry out, for example, gene therapy, naked DNA. Among the viral vectors, those derived from adenovirus, from virus associated with adenovirus (AAV), from retroviruses, from lentiviruses, and preferably derivatives from HIV, poxviruses, from herpesvirus are preferred. in eukaryotic system. Among the non-viral vectors, naked polynucleotides such as naked DNA or naked RNA are preferred according to the technique developed by the company VICAL, artificial yeast chromosomes (YAC) for expression in yeast. , mouse artificial chromosomes (MAC) for expression in murine cells and preferably human artificial chromosomes (HAC, human artificial chromosome) for expression in human cells.
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Une cellule qui contient un vecteur selon l'invention est aussi un objet de la présente invention. Ladite cellule est préférentiellement une cellule eucaryote ou procaryote et plus préférentiellement une cellule de mammifère. A cell which contains a vector according to the invention is also an object of the present invention. Said cell is preferably a eukaryotic or prokaryotic cell and more preferably a mammalian cell.
La cellule peut ainsi être choisie parmi les cellules bactériennes mais également parmi les cellules de levure, de même que parmi les cellules végétales et animales ; de préférence, l'hôte cellulaire est une cellule de mammifères, mais également une cellule d'insectes dans laquelle on peut utiliser des procédés mettant en oeuvre des baculovirus par exemple. Ces cellules peuvent être obtenues par l'introduction dans des cellules hôtes d'acide nucléique inséré dans un vecteur tel que défini ci-dessus, puis la mise en culture desdites cellules dans des conditions permettant l'expression de l'acide nucléique transfecté. The cell can thus be chosen from bacterial cells but also from yeast cells, as well as from plant and animal cells; preferably, the cell host is a mammalian cell, but also an insect cell in which methods using baculoviruses can be used, for example. These cells can be obtained by the introduction into host cells of nucleic acid inserted into a vector as defined above, then the cultivation of said cells under conditions allowing the expression of the transfected nucleic acid.
L'invention concerne encore un procédé de préparation d'une tétraspane, d'un de ses fragments ou d'une de ses protéines dérivées selon l'invention, qui comprend les étapes suivantes : a) la culture d'une cellule selon l'invention, notamment une cellule contenant une séquence d'ADN codant pour la tétraspane de séquence SEQ ID No. 2 ou pour son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou SEQ ID No. 6, dans un milieu de culture approprié à ladite cellule ; et b) la récupération de ladite tétraspane, dudit fragment ou de ladite protéine dérivée, notamment la tétraspane de séquence SEQ ID No. 2 ou son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou SEQ ID No. 6, à partir du milieu de culture et/ou de lysat desdites cellules cultivées. The invention also relates to a process for the preparation of a tetaspane, of a fragment thereof or of a derivative thereof according to the invention, which comprises the following steps: a) culturing a cell according to the invention, in particular a cell containing a DNA sequence coding for the tetraspan of sequence SEQ ID No. 2 or for its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or SEQ ID No. 6, in a culture medium suitable for said cell ; and b) recovering said tetraspane, said fragment or said derived protein, in particular the tetraspane of sequence SEQ ID No. 2 or its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or SEQ ID No. 6, from the medium of culture and / or lysate of said cultured cells.
Pour la mise en #uvre de ce procédé ladite cellule à l'étape a) est préférentiellement une cellule selon l'invention telle que définie ci-dessus. For the implementation of this process, said cell in step a) is preferably a cell according to the invention as defined above.
La tétraspane recombinante, ses fragments ou ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine SEQ ID No. 6 sont susceptibles d'être obtenus selon le procédé de préparation de l'invention et selon les techniques de production de protéines recombinantes connues de l'homme du métier. La présente invention concerne donc aussi la tétraspane, ses fragments ou ses protéines dérivées susceptibles d'être obtenus par la méthode ci-dessus présentée. Dans ce cas, l'acide nucléique utilisé est placé sous le contrôle de signaux permettant son expression dans un The recombinant tetraspane, its fragments or its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein SEQ ID No. 6 are capable of being obtained according to the preparation process of the invention and according to the techniques for producing recombinant proteins known to those skilled in the art. The present invention therefore also relates to tetraspane, its fragments or its derived proteins which can be obtained by the method presented above. In this case, the nucleic acid used is placed under the control of signals allowing its expression in a
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hôte cellulaire. Un système efficace de production de protéine recombinante nécessite de disposer d'un vecteur, par exemple d'origine plasmidique ou virale, et d'une cellule hôte compatible. Le vecteur doit comporter un promoteur, des signaux d'initiation et de terminaison de la traduction, ainsi que des régions appropriées de régulation de la transcription. Il doit pouvoir être maintenu de façon stable dans la cellule et peut éventuellement posséder des signaux particuliers spécifiant la sécrétion des protéines traduites. Ces différents signaux de contrôle sont choisis en fonction de l'hôte cellulaire utilisé. A cet effet, les acides nucléiques codant pour la tétraspane, ses fragments ou ses protéines dérivées peuvent être insérés dans des vecteurs à réplication autonome au sein de l'hôte choisi, ou des vecteurs intégratifs de l'hôte choisi. De tels vecteurs seront préparés selon les méthodes couramment utilisées par l'homme du métier, et les clones en résultant peuvent être introduits dans un hôte approprié par des méthodes standards telles par exemple la transfection par précipitation au phosphate de calcium, la lipofection, l'électroporation, le choc thermique. cell host. An efficient recombinant protein production system requires a vector, for example of plasmid or viral origin, and a compatible host cell. The vector must include a promoter, translation initiation and termination signals, as well as appropriate regions for transcription regulation. It must be able to be maintained in a stable manner in the cell and may possibly have particular signals specifying the secretion of the proteins translated. These different control signals are chosen according to the cellular host used. To this end, the nucleic acids coding for tetraspane, its fragments or its derived proteins can be inserted into vectors with autonomous replication within the chosen host, or vectors integrative of the chosen host. Such vectors will be prepared according to the methods commonly used by those skilled in the art, and the resulting clones can be introduced into an appropriate host by standard methods such as, for example, calcium phosphate precipitation transfection, lipofection, electroporation, thermal shock.
La tétraspane, ses fragments ou ses protéines dérivées selon l'invention obtenus comme indiqué ci-dessus, peuvent aussi bien se présenter sous forme glycosylée que non glycosylée et peuvent présenter ou non la structure tertiaire naturelle. Tetraspane, its fragments or its derived proteins according to the invention obtained as indicated above, can be both in glycosylated and non-glycosylated form and may or may not have the natural tertiary structure.
La tétraspane, ses fragments ou ses protéines dérivées selon l'invention peuvent être obtenus par synthèse chimique et peuvent ainsi comporter des acides aminés non naturels. De telles protéines sont également comprises dans l'invention. Tetraspane, its fragments or its proteins derived according to the invention can be obtained by chemical synthesis and can thus contain unnatural amino acids. Such proteins are also included in the invention.
Les procédés de purification de protéines recombinantes ou naturelles, telles que la tétraspane, ses fragments ou ses protéines dérivées selon la présente invention, sont connus de l'homme du métier. La tétraspane, ses fragments ou ses protéines dérivées selon l'invention, notamment recombinants, peuvent être purifiés à partir de lysats et extraits cellulaires, du surnageant du milieu de culture, par des méthodes utilisées individuellement ou en combinaison, telles que le fractionnement, les méthodes de chromatographie, les techniques d'immuno-affinité à l'aide d'anticorps mono- ou polyclonaux spécifiques, etc.. Une variante préférée consiste à produire une protéine recombinante fusionnée à une protéine porteuse (protéine chimère). L'avantage de ce système est qu'il permet une stabilisation et une diminution de la protéolyse du produit recombinant, une augmentation de la solubilité au cours de la renaturation in The methods for purifying recombinant or natural proteins, such as tetraspane, its fragments or its derived proteins according to the present invention, are known to those skilled in the art. Tetraspane, its fragments or its proteins derived according to the invention, in particular recombinant, can be purified from lysates and cell extracts, from the supernatant of the culture medium, by methods used individually or in combination, such as fractionation, chromatography methods, immunoaffinity techniques using specific mono- or polyclonal antibodies, etc. A preferred variant consists in producing a recombinant protein fused to a carrier protein (chimeric protein). The advantage of this system is that it allows stabilization and a decrease in the proteolysis of the recombinant product, an increase in the solubility during the renaturation in
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vitro et/ou une simplification de la purification lorsque le partenaire de fusion possède une affinité pour un ligand spécifique. in vitro and / or a simplification of the purification when the fusion partner has an affinity for a specific ligand.
Sous un autre aspect, la présente invention comprend les anticorps monoclonaux, polyclonaux, ou un de leurs fragments, dirigés spécifiquement contre la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment dirigés contre la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6. In another aspect, the present invention comprises monoclonal, polyclonal antibodies, or a fragment thereof, directed specifically against tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular directed against human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6.
De préférence, l'anticorps monoclonal, polyclonal ou l'un de leurs fragments, est caractérisé en ce qu'il est capable de se fixer spécifiquement sur un des épitopes ou déterminant de la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, notamment un épitope porté par un de ses domaines extracellulaires, tel que le domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4, ou porté par la protéine de séquence SEQ ID No. 6. Les déterminants épitopiques consistent habituellement en des groupes de molécules présentant des surfaces chimiquement actives telles que des acides aminés ou des chaînes latérales de sucres et ayant une structure tridimensionnelle spécifique et/ou une charge spécifique caractéristique. Preferably, the monoclonal, polyclonal antibody or one of their fragments, is characterized in that it is capable of binding specifically to one of the epitopes or determinant of human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, in particular a epitope carried by one of its extracellular domains, such as the extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4, or carried by the protein of sequence SEQ ID No. 6. The epitopic determinants usually consist of groups of molecules having chemically active surfaces such as amino acids or sugar side chains and having a specific three-dimensional structure and / or a characteristic specific charge.
Les anticorps monoclonaux pourront avantageusement être préparés à partir d'hybridomes selon la technique décrite, par exemple, par Kohler et Milstein en 1975 (Kôhler et Milstein. Nature, 256 : 1975). The monoclonal antibodies can advantageously be prepared from hybridomas according to the technique described, for example, by Kohler and Milstein in 1975 (Kohler and Milstein. Nature, 256: 1975).
Les anticorps polyclonaux pourront être préparés, par exemple par immunisation d'un animal, en particulier une souris ou un lapin, avec la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, associé à un adjuvant de la réponse immunitaire, puis purification des anticorps spécifiques contenus dans le sérum des animaux immunisés sur une colonne d'affinité sur laquelle a préalablement été fixée la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, ayant servi d'antigène. The polyclonal antibodies can be prepared, for example by immunization of an animal, in particular a mouse or a rabbit, with tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, associated with an adjuvant of the immune response, then purification of the specific antibodies contained in the serum of animals immunized on an affinity column on which tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention has previously been fixed, has served as an antigen.
Les anticorps de l'invention, ou leurs fragments pourront également être marqués par un marquage de type enzymatique, fluorescent ou radioactif. The antibodies of the invention, or their fragments, can also be labeled with an enzymatic, fluorescent or radioactive type of labeling.
Un tel anticorps pourrait non seulement être utile pour étudier et ainsi mieux connaître le rôle joué par la tétraspane humaine selon l'invention, en particulier au Such an antibody could not only be useful for studying and thus better understanding the role played by human tetraspane according to the invention, in particular in
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niveau des interactions des molécules membranaires ; mais également pour d'autres applications comme les applications thérapeutiques ou diagnostics, ou pour le ciblage de composés capables de moduler l'activité biologique de la tétraspane humaine de l'invention. level of interactions of membrane molecules; but also for other applications such as therapeutic or diagnostic applications, or for targeting compounds capable of modulating the biological activity of the human tetraspane of the invention.
Les fragments d'anticorps monoclonal ou polyclonal selon l'invention comprennent tout fragment dudit anticorps monoclonal capable de se fixer sur un épitope de la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention sur lequel se fixe l'anticorps monoclonal ou polyclonal dont ledit fragment est issu. Des exemples de tels fragments incluent en particulier des anticorps monoclonaux simple chaîne ou des fragments monovalents Fab ou Fab' et des fragments divalents tels que F (ab')2, possèdent la même spécificité de fixation que l'anticorps monoclonal ou polyclonal dont ils sont issus. Un fragment selon l'invention pourra également être un fragment Fv simple chaîne produit par des méthodes connues de l'homme de l'art et telles que décrites par exemple par Skerra et al. (Skerra et al. Science, 240 : 1988) et King et al. (King, et al. Biochemical J., 290 : 723- 729, 1991). The fragments of monoclonal or polyclonal antibody according to the invention comprise any fragment of said monoclonal antibody capable of binding to an epitope of tetaspane, one of its fragments or one of its derived proteins according to the invention on which fixes the monoclonal or polyclonal antibody from which said fragment is derived. Examples of such fragments include in particular single-chain monoclonal antibodies or monovalent fragments Fab or Fab 'and divalent fragments such as F (ab') 2, have the same binding specificity as the monoclonal or polyclonal antibody of which they are issues. A fragment according to the invention may also be a single chain Fv fragment produced by methods known to those skilled in the art and as described for example by Skerra et al. (Skerra et al. Science, 240: 1988) and King et al. (King, et al. Biochemical J., 290: 723-729, 1991).
Selon la présente invention, des fragments d'anticorps monoclonaux ou polyclonaux de l'invention peuvent être obtenus à partir des anticorps monoclonaux ou polyclonaux tels que décrits précédemment par des méthodes telles que la digestion par des enzymes, comme la pepsine ou la papaïne et/ou par clivage des ponts disulfures par réduction chimique. D'une autre manière, les fragments d'anticorps monoclonaux ou polyclonaux compris dans la présente invention peuvent être synthétisés par des synthétiseurs automatiques de peptides tels que ceux fournis par la société Applied Biosystems, etc., ou peuvent être préparés manuellement en utilisant des techniques connues de l'homme de l'art et telles que décrites par exemple par Geysen et al. According to the present invention, fragments of monoclonal or polyclonal antibodies of the invention can be obtained from the monoclonal or polyclonal antibodies as described above by methods such as digestion with enzymes, such as pepsin or papain and / or by cleavage of the disulfide bridges by chemical reduction. Alternatively, the monoclonal or polyclonal antibody fragments included in the present invention can be synthesized by automatic peptide synthesizers such as those provided by the company Applied Biosystems, etc., or can be prepared manually using techniques known to those skilled in the art and as described for example by Geysen et al.
(Geysen, et al. J. Immunol. Methods, 102 : 1978). (Geysen, et al. J. Immunol. Methods, 102: 1978).
En général, pour la préparation d'anticorps monoclonaux, polyclonaux ou leurs fragments, on pourra se référer aux techniques qui sont en particulier décrites dans le manuel Antibodies (Harlow et al., Antibodies : Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Publications pp. 726,1988) ou à la technique de préparation à partir d'hybridomes décrite par Kohler et Milstein en 1975. In general, for the preparation of monoclonal, polyclonal antibodies or their fragments, reference may be made to the techniques which are in particular described in the Antibodies manual (Harlow et al., Antibodies: Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Publications pp. 726, 1988) or to the technique of preparation from hybridomas described by Kohler and Milstein in 1975.
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Les anticorps monoclonaux ou polyclonaux selon l'invention pourront par exemple être purifiés sur une colonne d'affinité sur laquelle a préalablement été immobilisée la tétraspane humaine, un domaine extracellulaire de ladite tétraspane, ou l'un de ses fragments comportant l'épitope reconnu spécifiquement par lesdits anticorps monoclonaux ou polyclonaux selon l'invention. The monoclonal or polyclonal antibodies according to the invention may for example be purified on an affinity column on which human tetraspane has previously been immobilized, an extracellular domain of said tetraspane, or one of its fragments comprising the epitope specifically recognized by said monoclonal or polyclonal antibodies according to the invention.
L'invention comprend en outre un anticorps monoclonal ou un de ses fragments selon l'invention, caractérisé en ce qu'il est choisi parmi les anticorps humanisés, chimériques ou anti-idiotypes. The invention further comprises a monoclonal antibody or one of its fragments according to the invention, characterized in that it is chosen from humanized, chimeric or anti-idiotypic antibodies.
Les anticorps monoclonaux humanisés selon l'invention ou leurs fragments peuvent être préparés par des techniques connues de l'homme de l'art (Carter et al., PNAS 89 : 4285-4289,1992 ; Mountain, et al. Biotechnol. Genet. Eng. Rev., 10 :
1992). The humanized monoclonal antibodies according to the invention or their fragments can be prepared by techniques known to those skilled in the art (Carter et al., PNAS 89: 4285-4289,1992; Mountain, et al. Biotechnol. Genet. Eng. Rev., 10:
1992).
De tels anticorps monoclonaux humanisés selon l'invention sont préférés pour leur utilisation dans des méthodes thérapeutiques. Such humanized monoclonal antibodies according to the invention are preferred for their use in therapeutic methods.
Les anticorps monoclonaux ou leurs fragments de type chimérique selon l'invention peuvent être réalisés en utilisant les techniques de recombinaison génétique. The monoclonal antibodies or their chimeric type fragments according to the invention can be produced using the techniques of genetic recombination.
L'invention comprend également un anticorps monoclonal, polyclonal ou l'un de leurs fragments selon l'invention, caractérisé en ce qu'il est marqué. The invention also comprises a monoclonal, polyclonal antibody or one of their fragments according to the invention, characterized in that it is labeled.
Les anticorps monoclonaux ou polyclonaux selon l'invention ou leurs fragments peuvent également, selon l'invention, se présenter sous forme d'anticorps marqués afin d'obtenir un signal détectable et/ou quantifiable. The monoclonal or polyclonal antibodies according to the invention or their fragments can also, according to the invention, be in the form of labeled antibodies in order to obtain a detectable and / or quantifiable signal.
Les anticorps monoclonaux marqués selon l'invention ou leurs fragments incluent par exemple des anticorps dits immunoconjugués qui peuvent être conjugués par exemple avec des enzymes telles que la peroxydase, la phosphatase alkaline, la ss-Dgalactosidase, la glucose oxydase, la glucose amylase, l'anhydrase carbonique, l'acétylcholinestérase, le lysozyme, la malate déhydrogénase ou la glucose-6 phosphate déhydrogénase ou par une molécule comme la biotine, la digoxigénine ou la 5-bromodésoxyuridine. Des marqueurs fluorescents peuvent être également conjugués aux anticorps monoclonaux ou leurs fragments de l'invention et incluent notamment la fluorescéine et ses dérivés, la rhodamine et ses dérivés, la GFP (GFP pour Green Fluorescent Protéine), le dansyl, l'umbelliférone etc.. Dans de tels conjugués, les anticorps monoclonaux de l'invention ou leurs fragments peuvent être préparés par des The monoclonal antibodies labeled according to the invention or their fragments include, for example, so-called immunoconjugate antibodies which can be conjugated, for example, with enzymes such as peroxidase, alkaline phosphatase, ss-Dgalactosidase, glucose oxidase, glucose amylase, carbonic anhydrase, acetylcholinesterase, lysozyme, malate dehydrogenase or glucose-6 phosphate dehydrogenase or by a molecule such as biotin, digoxigenin or 5-bromodesoxyuridine. Fluorescent markers can also be conjugated to the monoclonal antibodies or their fragments of the invention and include in particular fluorescein and its derivatives, rhodamine and its derivatives, GFP (GFP for Green Fluorescent Protein), dansyl, umbelliferone etc. In such conjugates, the monoclonal antibodies of the invention or their fragments can be prepared by
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méthodes connues de l'homme de l'art. Ils peuvent être couplés aux enzymes ou aux marqueurs fluorescents directement ou par l'intermédiaire d'un groupe espaceur ou d'un groupe de liaisons tel qu'un polyaldéhyde, comme le glutaraldéhyde, l'acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA), l'acide diéthylènetriaminepentaacétique (DPTA), ou en présence d'agents de couplage tels que le périodate etc.. Les conjugués comportant des marqueurs de type fluorescéine peuvent être préparés par réaction avec un isothiocyanate. methods known to those skilled in the art. They can be coupled to enzymes or fluorescent markers directly or through a spacer group or a linking group such as a polyaldehyde, such as glutaraldehyde, ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), diethylenetriaminepentaacetic acid (DPTA), or in the presence of coupling agents such as periodate, etc. The conjugates comprising markers of the fluorescein type can be prepared by reaction with an isothiocyanate.
D'autres conjugués peuvent inclure également des marqueurs chimioluminescents tels que le luminol et les dioxétanes ou des marqueurs bioluminescents tels que la luciférase et la luciférine. Other conjugates can also include chemiluminescent markers such as luminol and dioxetanes or bioluminescent markers such as luciferase and luciferin.
Parmi les marqueurs pouvant être fixés sur l'anticorps monoclonal ou un de ses fragments selon l'invention, on préfère également les marqueurs radioactifs tels que 14C, 36Cl, 57Co, 58Co, 51Cr, 152 Eu, 59Fe,3H, 125I, 131I, 32P, 35S, 75SE et 99mTc qui peuvent être détectés par des moyens connus tels que par exemple le compteur gamma ou à scintillations ou par autoradiographie. Among the markers which can be attached to the monoclonal antibody or one of its fragments according to the invention, radioactive markers such as 14C, 36Cl, 57Co, 58Co, 51Cr, 152 Eu, 59Fe, 3H, 125I, 131I are also preferred. 32P, 35S, 75SE and 99mTc which can be detected by known means such as for example the gamma or scintillation counter or by autoradiography.
L'invention a aussi pour objet un agoniste ou un antagoniste permettant respectivement d'augmenter ou de diminuer l'activité de la tétraspane, d'un de ses fragments ou d'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment de la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, de son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou de la protéine de SEQ ID No. 6. The subject of the invention is also an agonist or an antagonist making it possible respectively to increase or decrease the activity of tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular tetraspane human with sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain with sequence SEQ ID No. 4 or the protein with SEQ ID No. 6.
L'invention concerne encore l'utilisation d'une tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, d'un anticorps selon l'invention, d'un agoniste selon l'invention ou d'un antagoniste selon l'invention pour, ou pour la préparation d'une composition destinée à, moduler les interactions des molécules membranaires et/ou pour réguler la réponse immunitaire. The invention also relates to the use of a tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, of an antibody according to the invention, of an agonist according to the invention or of an antagonist according to the invention for, or for the preparation of a composition intended to, modulate the interactions of membrane molecules and / or to regulate the immune response.
En effet, l'exemple 2 ci-après démontre une expression spécifique (par rapport aux autres cellules immunes) de cette nouvelle molécule au niveau des lymphocytes T. Indeed, Example 2 below demonstrates a specific expression (compared to the other immune cells) of this new molecule at the level of T lymphocytes.
Une utilisation particulièrement préférée est l'utilisation d'une protéine tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire A particularly preferred use is the use of a tetraspane protein, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain
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de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, ou d'un agoniste selon l'invention pour, ou pour la préparation d'une composition destinée à, diminuer, voire supprimer, la survie, la migration, la croissance ou la prolifération de cellules tumorales. of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, or of an agonist according to the invention for, or for the preparation of a composition intended to, decrease, or even suppress, survival, migration, the growth or proliferation of tumor cells.
En effet, il a été constaté que la protéine tétraspane selon la présente invention était exprimée au niveau des cellules endothéliales, qui sont impliquées dans le processus d'angiogénèse et particulièrement dans la néovascularisation tumorale. Indeed, it has been found that the tetraspane protein according to the present invention is expressed at the endothelial cells, which are involved in the angiogenesis process and particularly in tumor neovascularization.
Un autre objet essentiel de l'invention est une composition pharmaceutique caractérisée en ce qu'elle comprend au moins un composé choisi parmi les composés suivants : a) une protéine tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. Another essential object of the invention is a pharmaceutical composition characterized in that it comprises at least one compound chosen from the following compounds: a) a tetraspane protein, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No.
2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 2, its extracellular domain with sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No.
6; b) un acide nucléique selon l'invention ; c) un anticorps selon l'invention ; d) un agoniste selon l'invention ; e) un antagoniste selon l'invention ; f) un vecteur selon l'invention ; et g) une cellule selon l'invention. 6; b) a nucleic acid according to the invention; c) an antibody according to the invention; d) an agonist according to the invention; e) an antagonist according to the invention; f) a vector according to the invention; and g) a cell according to the invention.
Cette composition pharmaceutique peut notamment être utilisée pour la prévention ou le traitement de maladies neurodégénératives, pour la régulation du système immunitaire, pour la régulation de l'angiogénèse ou pour la réparation ou la régénération du tissu nerveux. This pharmaceutical composition can in particular be used for the prevention or treatment of neurodegenerative diseases, for the regulation of the immune system, for the regulation of angiogenesis or for the repair or regeneration of nervous tissue.
Préférentiellement, elle est utilisée pour la prévention ou le traitement du cancer. Preferably, it is used for the prevention or treatment of cancer.
Les compositions pharmaceutiques comprenant un vecteur selon l'invention pourront en particulier être utilisées pour le transfert d'acide nucléique codant pour une protéine tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, dans une cellule donnée in vivo dans le cadre d'un traitement d'une maladie neurodégénérative par thérapie génique. Cette nouvelle technologie dont le champ d'application est vaste, permet d'envisager le traitement de maladies neurodégénératives pour lesquelles les The pharmaceutical compositions comprising a vector according to the invention may in particular be used for the transfer of nucleic acid encoding a tetraspane protein, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular tetraspane human of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, in a given cell in vivo in the context of a treatment of a neurodegenerative disease by gene therapy . This new technology, the scope of which is vast, makes it possible to envisage the treatment of neurodegenerative diseases for which the
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alternatives thérapeutiques classiques sont peu efficaces voire inexistantes et concerne aussi bien les maladies génétiques qu'acquises. L'approche la plus pratiquée consiste à utiliser un véhicule viral pour introduire l'acide nucléique thérapeutique dans la cellule à traiter et, en particulier, rétroviral et adénoviral. En effet, les virus ont développé des mécanismes sophistiqués pour traverser les membranes cellulaires, échapper à la dégradation au niveau des lysosomes et faire pénétrer leur génome dans les noyaux afin d'assurer l'expression du gène thérapeutique. conventional therapeutic alternatives are ineffective or even non-existent and concern both genetic and acquired diseases. The most practiced approach consists in using a viral vehicle to introduce the therapeutic nucleic acid into the cell to be treated and, in particular, retroviral and adenoviral. In fact, viruses have developed sophisticated mechanisms to cross cell membranes, escape degradation at the level of lysosomes and make their genome penetrate into the nuclei in order to ensure the expression of the therapeutic gene.
De plus en plus de méthodes de transfert de gènes font appel à des vecteurs non viraux. D'autres méthodes de transfert de gènes peuvent être employées comme par exemple la délivrance de l'acide nucléique thérapeutique au moyen de vecteurs synthétiques, tels que les lipides cationiques qui interagissent spontanément avec l'acide nucléique pour former des complexes chargés positivement capables de fusionner avec les membranes cellulaires anioniques et faire pénétrer l'acide nucléique qu'ils transportent (voir par exemple Behr, Bioconjugate Chemistry (1994) 5:382). Enfin, une approche encore plus simple peut également être envisagée par administration directe d'ADN nu codant pour une protéine tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6. More and more gene transfer methods use non-viral vectors. Other methods of gene transfer can be employed such as for example the delivery of the therapeutic nucleic acid by means of synthetic vectors, such as the cationic lipids which interact spontaneously with the nucleic acid to form positively charged complexes capable of fusing with the anionic cell membranes and penetrate the nucleic acid they transport (see for example Behr, Bioconjugate Chemistry (1994) 5: 382). Finally, an even simpler approach can also be envisaged by direct administration of naked DNA coding for a tetraspane protein, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain with sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6.
De telles compositions pharmaceutiques comprenant un vecteur ou système de vecteurs, selon l'invention pourront également être utilisées pour le transfert d'acide nucléique codant pour une protéine tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, dans une cellule donnée ex vivo dans le cadre d'un traitement de maladie neurodégénérative, en particulier pour la réparation ou la régénération de neurones ou tissu neuronal, qui seront ensuite implantés ou réimplantés dans le patient à traiter (xénogreffe ou allogreffe). Such pharmaceutical compositions comprising a vector or vector system according to the invention may also be used for the transfer of nucleic acid coding for a tetraspane protein, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, in a given cell ex vivo as part of a treatment for neurodegenerative disease , in particular for the repair or regeneration of neurons or neuronal tissue, which will then be implanted or reimplanted in the patient to be treated (xenograft or allograft).
Une forme de réalisation préférée selon l'invention est une composition pharmaceutique pour la prévention ou le traitement des métastases, qui comprend au moins un composé choisi parmi les composés suivants : A preferred embodiment according to the invention is a pharmaceutical composition for the prevention or treatment of metastases, which comprises at least one compound chosen from the following compounds:
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a) une protéine tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. a) a tetraspane protein, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No.
2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 2, its extracellular domain with sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No.
6; b) un acide nucléique selon l'invention ; c) un agoniste selon l'invention ; d) un vecteur selon l'invention ; et e) une cellule selon l'invention. 6; b) a nucleic acid according to the invention; c) an agonist according to the invention; d) a vector according to the invention; and e) a cell according to the invention.
La quantité de composés comprise dans les compositions pharmaceutiques selon la présente invention et nécessaire pour une thérapie efficace dépendra de différents facteurs tels que le mode d'administration, la partie du corps ciblée, l'état physiologique du patient, de l'administration d'autres médicaments, des éventuels effets secondaires, etc.. Le dosage pour de telles préventions ou traitements thérapeutiques devra être réalisé de manière à optimiser sa sécurité et son efficacité. En général, des modèles animaux peuvent être utilisés pour déterminer les quantités efficaces des composés entrant dans les compositions pharmaceutiques selon la présente invention pour le traitement ou la prévention des pathologies particulières. Ces méthodes sont en particulier discutées dans les ouvrages tels que Gilman et al. (Goodman and Gilman's : The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8th Ed. Pergamon Press, 1990) et Remington's Pharmaceutical Sciences (17th ed., 1990) pour des méthodes d'administration telles que les méthodes par voie orale, intraveineuse, intrapéritonale, intramusculaire ou transdermique. Les excipients pharmaceutiquement acceptables incluent notamment l'eau, les solutions salines, les tampons ou tout autre composé décrit par exemple dans l'Index de Merck. The amount of compounds included in the pharmaceutical compositions according to the present invention and necessary for effective therapy will depend on various factors such as the mode of administration, the targeted part of the body, the physiological state of the patient, the administration of other drugs, possible side effects, etc. The dosage for such preventions or therapeutic treatments should be carried out in such a way as to optimize its safety and effectiveness. In general, animal models can be used to determine the effective amounts of the compounds entering into the pharmaceutical compositions according to the present invention for the treatment or the prevention of particular pathologies. These methods are in particular discussed in works such as Gilman et al. (Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8th Ed. Pergamon Press, 1990) and Remington's Pharmaceutical Sciences (17th ed., 1990) for administration methods such as oral, intravenous, intraperitoneal, intramuscular or transdermal. The pharmaceutically acceptable excipients include in particular water, saline solutions, buffers or any other compound described for example in the Merck Index.
L'invention concerne encore une trousse de diagnostic comprenant au moins : - un anticorps monoclonal, polyclonal selon l'invention ou un de leurs fragments ; ou - un acide nucléique selon l'invention permettant de réaliser une PCR afin de déterminer quantitativement et/ou qualitativement la présence ou non de la tétraspane. The invention also relates to a diagnostic kit comprising at least: - a monoclonal, polyclonal antibody according to the invention or one of their fragments; or - a nucleic acid according to the invention making it possible to carry out a PCR in order to quantitatively and / or qualitatively determine the presence or not of tetraspane.
Ainsi, entre également dans le cadre de l'invention, une trousse ou nécessaire de diagnostic comprenant un anticorps selon l'invention, notamment pour le dosage (dont la détection) ou l'identification de la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses Thus, also within the scope of the invention, a diagnostic kit or kit comprising an antibody according to the invention, in particular for the assay (including the detection) or the identification of tetraspane, one of its fragments or one of his
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protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, dans un échantillon biologique, de préférence in vitro. proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, in a biological sample, preferably in vitro.
En particulier, une trousse de diagnostic caractérisée en ce qu'elle comprend les éléments suivants : - un anticorps polyclonal, monoclonal ou un de leurs fragments selon l'invention, le cas échéant marqué ; - le cas échéant, un réactif pour la constitution du milieu propice à la réalisation de la réaction immunologique ; - le cas échéant, un réactif permettant la détection des complexes antigèneanticorps produits par la réaction immunologique, ce réactif pouvant également porter un marqueur, ou être susceptible d'être reconnu à son tour par un réactif marqué, plus particulièrement dans le cas où ledit anticorps monoclonal, polyclonal ou un de leurs fragments n'est pas marqué. In particular, a diagnostic kit characterized in that it comprises the following elements: - a polyclonal, monoclonal antibody or one of their fragments according to the invention, if appropriate labeled; - If necessary, a reagent for the constitution of the medium suitable for carrying out the immunological reaction; - where appropriate, a reagent allowing the detection of antigen-antibody complexes produced by the immunological reaction, this reagent can also carry a marker, or be capable of being recognized in turn by a labeled reagent, more particularly in the case where said antibody monoclonal, polyclonal or one of their fragments is not marked.
L'utilisation d'un anticorps monoclonal, polyclonal, ou un de leurs fragments pour le dosage ou l'identification in vitro d'une tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, dans un échantillon biologique est un autre objet de l'invention. The use of a monoclonal, polyclonal antibody, or a fragment thereof, for the assay or in vitro identification of a tetaspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular Another subject of the invention is human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6.
Les anticorps monoclonaux, polyclonaux ou leurs fragments selon l'invention, peuvent ainsi être utilisés pour l'identification ou la localisation, notamment tissulaire ou cellulaire, et/ou le dosage de tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, ladite utilisation étant comprise dans l'invention. The monoclonal, polyclonal antibodies or their fragments according to the invention can thus be used for the identification or the localization, in particular tissue or cell, and / or the assay of tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, said use being included in the invention.
Les anticorps monoclonaux, polyclonaux ou leurs fragments selon l'invention constituent également un moyen d'analyse de l'expression de la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, dans des échantillons biologiques (fluides ou sur des coupes de tissus spécifiques), par exemple par immunofluorescence, par marquage enzymatique, radioactif ou à l'or. Ils permettent notamment de mettre en évidence et de quantifier la présence spécifique normale ou The monoclonal, polyclonal antibodies or their fragments according to the invention also constitute a means of analysis of the expression of tetaspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in biological samples (fluids or on specific tissue sections), for example by immunofluorescence, by enzymatic, radioactive or gold labeling. They make it possible in particular to highlight and quantify the normal specific presence or
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anormale de protéine tétraspane selon l'invention dans les tissus ou prélèvements biologiques, ce qui les rend utiles pour l'identification et la localisation de protéine tétraspane selon l'invention, pour le diagnostic de pathologies liées à la présence anormale de protéine tétraspane selon l'invention mais également pour le suivi de l'évolution de méthodes de prévention ou de traitement de pathologie nécessitant ladite détection ou ledit dosage. abnormal tetraspane protein according to the invention in tissues or biological samples, which makes them useful for the identification and localization of tetraspane protein according to the invention, for the diagnosis of pathologies linked to the abnormal presence of tetraspane protein according to the invention. invention but also for monitoring the evolution of methods of prevention or treatment of pathology requiring said detection or said assay.
Plus généralement, les anticorps monoclonaux, polyclonaux ou leurs fragments selon l'invention peuvent être avantageusement mis en oeuvre dans toute situation où l'expression de tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, doit être observée de manière qualitative et/ou quantitative. More generally, the monoclonal, polyclonal antibodies or their fragments according to the invention can be advantageously used in any situation where the expression of tetaspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, must be observed qualitatively and / or quantitatively.
De préférence, l'échantillon biologique est constitué par un fluide biologique, tel que le sérum, le sang total, des cellules, un échantillon de tissu ou des biopsies d'origine humaine. Preferably, the biological sample consists of a biological fluid, such as serum, whole blood, cells, a tissue sample or biopsies of human origin.
Toute procédure ou test classique peut être mise en oeuvre pour réaliser une telle détection et/ou dosage. Ledit test peut être un test par compétition ou par sandwich, ou tout test connu de l'homme de l'art dépendant de la formation d'un complexe immun anticorps-antigène. Suivant les applications selon l'invention, l'anticorps monoclonal, polyclonal ou un de leurs fragments peut être immobilisé ou marqué. Cette immobilisation peut être réalisée sur de nombreux supports connus de l'homme de l'art. Any conventional procedure or test can be used to carry out such a detection and / or assay. Said test can be a competition or sandwich test, or any test known to those skilled in the art dependent on the formation of an antibody-antigen immune complex. Depending on the applications according to the invention, the monoclonal, polyclonal antibody or one of their fragments can be immobilized or labeled. This immobilization can be carried out on numerous supports known to those skilled in the art.
Ces supports peuvent notamment inclure le verre, le polystyrène, le polypropylène, le polyéthylène, le dextran, le nylon, ou des celluloses naturelles ou modifiées. Ces supports peuvent être soit solubles ou insolubles. These supports may in particular include glass, polystyrene, polypropylene, polyethylene, dextran, nylon, or natural or modified celluloses. These supports can be either soluble or insoluble.
A titre d'exemple, une méthode préférée met en jeu des processus immunoenzymatiques selon la technique ELISA, par immunofluorescence, ou radioimmunologique (RIA) ou équivalent. For example, a preferred method involves immunoenzymatic processes according to the ELISA technique, by immunofluorescence, or radioimmunological (RIA) or equivalent.
Ainsi, l'invention comprend également un procédé pour la détection et/ou le dosage de la tétraspane ou d'un domaine extracellulaire de la tétraspane selon l'invention dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : Thus, the invention also comprises a method for the detection and / or the determination of tetraspane or of an extracellular domain of tetraspane according to the invention in a biological sample, characterized in that it comprises the following steps:
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a) mise en contact de l'échantillon biologique (tissu ou fluide biologique) avec un anticorps monoclonal, polyclonal ou un de leurs fragments selon l'invention (dans des conditions permettant une réaction immunologique entre lesdits anticorps et ladite tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6 ; b) mise en évidence du complexe antigène-anticorps éventuellement formé. a) bringing the biological sample (tissue or biological fluid) into contact with a monoclonal, polyclonal antibody or one of their fragments according to the invention (under conditions allowing an immunological reaction between said antibodies and said tetaspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6; b) evidence of the antigen-antibody complex possibly formed.
L'invention comprend également l'utilisation d'un acide nucléique selon l'invention capable de s'hybrider avec une séquence d'ADN, et/ou d'ARN correspondant, du gène codant pour la tétraspane, l'un de ses fragments ou l'une de ses protéines dérivées selon l'invention, notamment la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2, son domaine extracellulaire de séquence SEQ ID No. 4 ou la protéine de SEQ ID No. 6, pour le dosage ou l'identification in vitro d'une telle séquence d'ADN, et/ou d'ARN correspondant, dans un échantillon biologique est aussi un mode de réalisation de l'invention. The invention also includes the use of a nucleic acid according to the invention capable of hybridizing with a DNA sequence, and / or corresponding RNA, of the gene coding for tetraspane, one of its fragments or one of its proteins derived according to the invention, in particular human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2, its extracellular domain of sequence SEQ ID No. 4 or the protein of SEQ ID No. 6, for the assay or The in vitro identification of such a DNA sequence, and / or of corresponding RNA, in a biological sample is also an embodiment of the invention.
Ces différentes utilisations pourront notamment permettre de pronostiquer la sévérité d'une tumeur. These different uses may in particular make it possible to predict the severity of a tumor.
Un objet de l'invention concerne encore un mammifère, excepté l'homme, notamment en tant que modèle animal, comprenant un acide nucléique ou une cellule transformée selon l'invention, notamment caractérisé en ce que l'un au moins des allèles du gène correspondant à l'homologue du gène codant pour la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2 dudit animal n'est pas fonctionnel ou est surexprimé. An object of the invention also relates to a mammal, except man, in particular as an animal model, comprising a nucleic acid or a transformed cell according to the invention, in particular characterized in that at least one of the alleles of the gene corresponding to the homolog of the gene coding for human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2 of said animal is not functional or is overexpressed.
Parmi les mammifères selon l'invention, on préférera des animaux tels que les souris, les rats ou les lapins, dont le gène correspondant à l'homologue du gène codant pour la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2 porté par l'un au moins des deux allèles dudit animal est muté de telle sorte que la protéine codée par un tel gène n'est pas exprimée ou n'est pas fonctionnelle. Among the mammals according to the invention, animals such as mice, rats or rabbits are preferred, whose gene corresponding to the homolog of the gene coding for human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2 carried by one at least of the two alleles of said animal is mutated such that the protein encoded by such a gene is not expressed or is not functional.
Parmi les modèles animaux plus particulièrement intéressants ici, on trouve notamment : - les animaux transgéniques présentant un déficit de la protéine homologue à la tétraspane humaine de séquence SEQ ID No. 2 d'un des composants du LSR. Ils sont obtenus par exemple par recombinaison homologue sur cellules souches embryonnaires, Among the animal models which are more particularly interesting here, there are in particular: - transgenic animals exhibiting a deficit of the protein homologous to human tetraspane of sequence SEQ ID No. 2 of one of the components of LSR. They are obtained for example by homologous recombination on embryonic stem cells,
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transfert de ces cellules souches à des embryons, sélection des chimères affectées au niveau des lignées reproductrices, et croissance desdites chimères ; - les souris transgéniques surexprimant ledit gène homologue. Les souris sont obtenues par transfection de copies multiples dudit gène sous contrôle d'un promoteur puissant de nature ubiquitaire, ou sélectifd'un type de tissu ; - les animaux (de préférence souris) transgéniques rendus déficients pour un desdits gènes portés par les deux allèles, par inactivation à l'aide du système LOXP/CRE recombinase ou de tout autre système d'inactivation de l'expression d'un gène à un âge précis de l'animal. transfer of these stem cells to embryos, selection of the affected chimeras in the reproductive lines, and growth of said chimeras; - transgenic mice overexpressing said homologous gene. The mice are obtained by transfection of multiple copies of said gene under the control of a powerful promoter of ubiquitous nature, or selective of a type of tissue; - transgenic animals (preferably mice) rendered deficient for one of said genes carried by the two alleles, by inactivation using the LOXP / CRE recombinase system or any other system for inactivation of the expression of a gene to a specific age of the animal.
Ainsi, un tel modèle animal pourra notamment servir à cribler des molécules pour la prévention ou le traitement de maladies neurodégénératives, pour la réparation ou la régénération du tissu nerveux, pour la prévention ou le traitement du cancer et préférentiellement pour la prévention ou le traitement des métastases. Thus, such an animal model could in particular be used to screen molecules for the prevention or treatment of neurodegenerative diseases, for the repair or regeneration of nervous tissue, for the prevention or treatment of cancer and preferably for the prevention or treatment of metastases.
D'autres caractéristiques et avantages de l'invention apparaissent dans la suite de la description avec les exemples et la figure dont la légende est donnée ci-après. Other characteristics and advantages of the invention appear in the following description with the examples and the figure, the legend of which is given below.
Légende de la figure Figure : Expression de la tétraspane au niveau des cellules endothéliales et des lymphocytes T
Electrophorèse en gel d'agarose à 1 % mettant en évidende l'expression de l'ARNm codant pour la neurospanine dans différents types de cellules humaines. Figure Figure: Expression of tetraspane in endothelial cells and T lymphocytes
1% agarose gel electrophoresis demonstrating the expression of mRNA encoding neurospanin in different types of human cells.
L'expression de l'ARNm codant pour la neurospanine a été analysée par RTPCR dans les lymphocytes T, les cellules LAK, les cellules endothéliales, les cellules B, les monocytes et les neutrophiles. Le contrôle d'intégrité et de qualité de l'ADNc utilisé dans les expériences a été évaluée en analysant l'expression de l'ARNm codant pour la GAPDH. The expression of neurospanin-coding mRNA was analyzed by RTPCR in T lymphocytes, LAK cells, endothelial cells, B cells, monocytes and neutrophils. The integrity and quality control of the cDNA used in the experiments was evaluated by analyzing the expression of the mRNA coding for GAPDH.
Exemple 1 : Clonage de l'ADNc codant pour la nouvelle tétraspane humaine
Dans le but d'identifier de nouvelles molécules exprimées sélectivement à la surface des cellules humaines, des séquences pouvant contenir un motif transmembranaire ont été recherchées dans les banques de données EST (Expressed Example 1: Cloning of the cDNA Coding for the New Human Tetraspane
In order to identify new molecules expressed selectively on the surface of human cells, sequences which may contain a transmembrane motif have been sought in EST databases (Expressed
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Sequence Tag) humaines et particulièrement dans la banque db EST, disponible à l'adresse internet "www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/". Cette banque contient 1856102 différents EST. Sequence Tag) human and particularly in the db EST bank, available at the internet address "www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/". This bank contains 1856102 different ESTs.
L'identification de séquences ESTs humaines codant pour des motifs transmembranaires potentiels a été réalisée à l'aide du logiciel TopPred 2 (logiciel de prédiction de protéines membranaires) qui est disponible sur internet (http://www.biokemi.su.se/TopPred2). The identification of human ESTs sequences coding for potential transmembrane motifs was carried out using TopPred 2 software (membrane protein prediction software) which is available on the internet (http://www.biokemi.su.se/ TopPred2).
Parmi les 3000 séquences obtenues présentant le plus haut score, l'EST #AA411274 a été sélectionné. La séquence nucléotidique disponible (http: //www.ncbi.nih.nlm.gov) présente un cadre de lecture ouvert de 109 acides aminés avant un codon stop. Son produit de traduction présente un motif transmembranaire (position 69-91). La séquence peptidique présente 50 % d'idendité avec une protéine appelée neurospanine dont la séquence a été clonée chez le poulet. La neurospanine est une molécule appartenant à la superfamille des tétraspanes. La séquence nucléotidique codante de l'EST #AA411274 présente 85 % d'identité avec la séquence de la neurospanine. Basé sur les caractéristiques structurales des tétraspanes, il apparaît que le domaine protéique 69-91 correspond au 4ème domaine transmembranaire (EC4) des tétraspanes. Among the 3000 sequences with the highest score, EST # AA411274 was selected. The available nucleotide sequence (http: //www.ncbi.nih.nlm.gov) presents an open reading frame of 109 amino acids before a stop codon. Its translation product has a transmembrane motif (position 69-91). The peptide sequence has 50% identity with a protein called neurospanin whose sequence has been cloned in chicken. Neurospanin is a molecule belonging to the tetraspan superfamily. The coding nucleotide sequence of EST # AA411274 has 85% identity with the neurospanin sequence. Based on the structural characteristics of tetraspanes, it appears that the protein domain 69-91 corresponds to the 4th transmembrane domain (EC4) of tetraspans.
Des homologues de la séquence #AA411274 ont ensuite été recherchés dans la banque de données EST humaines. Huit nouvelles séquences nucléotidiques ont ainsi été sélectionnées sur la base d'une homologie avec la séquence #AA411274 (clones #AA132131, AA132070, T85007, AA031888, R60397. 1, AA031808, AA329968 et AA324463). Les clones ont été obtenus auprès de Research Genetics (New York, NY). Homologues of the sequence # AA411274 were then searched for in the human EST database. Eight new nucleotide sequences were thus selected on the basis of homology with the sequence # AA411274 (clones # AA132131, AA132070, T85007, AA031888, R60397. 1, AA031808, AA329968 and AA324463). The clones were obtained from Research Genetics (New York, NY).
Les clones bactériens ont été sélectionnés à l'aide de l'antibiotique approprié. L'ADN plasmidique a été purifié à l'aide d'un kit commercial (Midiprep DNA extraction kit, Qiagen, Germany) et séquence en utilisant le kit ABI Prism BigDye Terminator DNA kit (Perkin Elmer Applied Biosystems, Warrington, UK) en suivant les recommandations du fournisseur. La séquence a été analysée avec un séquenceur automatique ABI Prism 377 (Perkin Elmer Applied Biosystems). Les séquences ont été analysées grâce au logiciel d'analyse de séquence Sequencher (Genecodes, Ann Arbor, MI). Après alignement des différentes séquences, un fragment d'ADN de 1345 paires de bases présentant un cadre ouvert de lecture de 747 nucléotides contenant un codon The bacterial clones were selected using the appropriate antibiotic. The plasmid DNA was purified using a commercial kit (Midiprep DNA extraction kit, Qiagen, Germany) and sequenced using the ABI Prism BigDye Terminator DNA kit (Perkin Elmer Applied Biosystems, Warrington, UK) following supplier recommendations. The sequence was analyzed with an ABI Prism 377 automatic sequencer (Perkin Elmer Applied Biosystems). The sequences were analyzed using Sequencher sequence analysis software (Genecodes, Ann Arbor, MI). After alignment of the different sequences, a DNA fragment of 1345 base pairs having an open reading frame of 747 nucleotides containing a codon
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d'initiation et un codon stop a été défini. Ce fragment a été amplifié par PCR à l'aide d'amorces spécifiques correspondant aux extrémités 5' et 3' de la séquence alignée. La séquence d'ADNc complète a été obtenue par une série de cycles d'amplification par PCR de l'extrémité 5' (5'RACE) l'aide de kits commerciaux. Les matrices d'ADN étaient de l'ADNc préparé à partir de moelle osseuse humaine (Marathon-Ready cDNA ; Clontech). La prédiction d'un peptide signal a été définie à l'aide d'un logiciel disponible sur le Web (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignaIP). initiation and a stop codon has been defined. This fragment was amplified by PCR using specific primers corresponding to the 5 'and 3' ends of the aligned sequence. The complete cDNA sequence was obtained by a series of PCR amplification cycles of the 5 'end (5'RACE) using commercial kits. The DNA templates were cDNA prepared from human bone marrow (Marathon-Ready cDNA; Clontech). The prediction of a signal peptide was defined using software available on the web (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignaIP).
Résultats
Par analyse des banques de données EST humaines disponibles, un clone d'ADNc (#AA411274) codant pour une molécule présentant un motif transmembranaire a été sélectionné. La séquence d'ADNc obtenue est longue de 1345 paires de bases, voir séquence SEQ No 1. La séquence protéique prédite contient 248 acides aminés et présente un poids moléculaire de 27,5 kDa et un point isoélectrique de 4. 4. présente 85 % d'homologie avec la neurospanine de poulet (appartenant à la superfamille des tétraspanes). Le codon d'initiation est à la position nt 281 et le codon stop est localisé au nucléotide nt 1015. Le produit de traduction présente : - 4 domaines transmembranaires prédits (TM1-4) localisés aux positions aal3- 36, aa50-73, aa83-107 et aa218-243 de la séquence SEQ ID No. 2 ; - 2 domaines extracellulaires prédits (EC1 et EC2) localisés aux positions aa37- 49 et aal08-217 de la séquence SEQ ID No. 2. Results
By analysis of the available human EST databases, a cDNA clone (# AA411274) coding for a molecule exhibiting a transmembrane motif was selected. The cDNA sequence obtained is 1345 base pairs long, see sequence SEQ No 1. The predicted protein sequence contains 248 amino acids and has a molecular weight of 27.5 kDa and an isoelectric point of 4. 4. has 85% homology with chicken neurospanin (belonging to the tetraspan superfamily). The initiation codon is at position nt 281 and the stop codon is located at nucleotide nt 1015. The translation product presents: - 4 predicted transmembrane domains (TM1-4) located at positions aal3- 36, aa50-73, aa83 -107 and aa218-243 of the sequence SEQ ID No. 2; - 2 predicted extracellular domains (EC1 and EC2) located at positions aa37-49 and aal08-217 of the sequence SEQ ID No. 2.
La plus grande diversité est contenue dans la boucle externe EC2 (62 % d'identité). The greatest diversity is contained in the external EC2 loop (62% identity).
Le peptide signal est en position aal-32 de la séquence SEQ ID No. 2. The signal peptide is in position aal-32 of the sequence SEQ ID No. 2.
Exemple 2 : Mise en évidence de l'expression de la tétraspane au niveau des cellules endothéliales et des lymphocytes T. EXAMPLE 2 Demonstration of the Expression of Tetraspane in Endothelial Cells and T Lymphocytes
L'expression de l'ARNm codant pour la neurospanine a été évaluée par RT-PCR dans les types cellulaires suivants : lymphocytes B, lymphocytes T, monocytes, neutrophiles, cellules T activées par de l'IL-2 (LAK ou Lymphokine Activcated Killer cells) et cellules endothéliales. Brièvement, les culots cellulaires sont repris dans un tampon d'extraction contenant de l'isothiocyanate de guanidium (Trizol ; Life The expression of the mRNA coding for neurospanin was evaluated by RT-PCR in the following cell types: B lymphocytes, T lymphocytes, monocytes, neutrophils, T cells activated by IL-2 (LAK or Lymphokine Activcated Killer cells) and endothelial cells. Briefly, the cell pellets are taken up in an extraction buffer containing guanidium isothiocyanate (Trizol; Life
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technologies) à raison de 1 ml pour 10 x 106 cellules. Après deux extractions au phénol/chloroforme/alcool isoamylique (25/24/1), les ARNs totaux sont précipités par ajout d'un volume égal d'isopropanol (18 heures à -20 C) puis collectés par centrifugation (13. 000 rpm, 30 min, 4 C). Le culot est rincé avec de l'éthanol 70 %. technologies) at a rate of 1 ml for 10 x 106 cells. After two extractions with phenol / chloroform / isoamyl alcohol (25/24/1), the total RNAs are precipitated by adding an equal volume of isopropanol (18 hours at -20 ° C.) and then collected by centrifugation (13,000 rpm) , 30 min, 4 C). The pellet is rinsed with 70% ethanol.
L'ARN total est resuspendu dans de l'eau contenant un inhibiteur de Rnase (RNAsin ; Promega, Madison, WI), dénaturé par chauffage (5 min à 65 C) puis quantifié par spectrophotométrie (#=260 nm). Les ADNs complémentaires (ADNc) sont synthétisés à l'aide d'un kit commercial (First strand cDNA synthesis, Amersham Pharmacia Biotech, Uppsala, Suède) sont rétrotranscrits. La transcription réverse (2 g d'ARN total) est réalisée dans le tampon Tris-HCl 10 mM pH 8,3 contenant 300 ug/ml d'amorce oligodT (5'-AACTGGAAGAATTCGCGGCCGCAGGAA(T)i8-3' : SEQ ID No. 7), 10 M de dithiothréitol (DTT), 5 mM des 4 nucléotides et 1 U/ml de réverse transcriptase recombinante. Le mélange réactionnel est incubé pendant 1 heure à 37 C et la réaction est stoppée par chauffage à 65 C pendant 5 minutes. Le mélange réactionnel pour la RT-PCR est le suivant : 1 l d'ADNc (correspondant à 25 ng d'ARN total), 25 pmoles d'amorce (5'-CGGGGCCTGCCTGCTGGCCATCGGCATC-3' : SEQ ID No. 8 et 5'CCCTGGTAGTGCTTGGTGAGCTCC-3' : SEQ ID No. 9), dNTP 200 M, MgCl2 1,5 mM, Tris-HCl 10 mM pH 8,3, KCI 50 mM et 0,4 unité de Taq polymérase (Perkin Elmer). Les conditions de PCR sont : 5 min à 95 C, 30 cycles : 1 min à 94 C, 1 min à 55 C et 1 min à 72 C, une extension finale de 5 min à 72 C. Les échantillons sont repris dans le tampon d'échantillon (bleu de bromophénol 0,25 %, sucrose 40 %) et analysés par électrophorèse en gel d'agarose 1 % contenant du bromure d'éthidium. Après migration, les échantillons sont visualisés par illumination du gel aux UV. L'intégrité de l'ARN est analysée en évaluant l'expression de l'ADNc codant pour la molécule actine p à l'aide des amorces suivantes : 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' : SEQ ID No. The total RNA is resuspended in water containing an Rnase inhibitor (RNAsin; Promega, Madison, WI), denatured by heating (5 min at 65 ° C.) then quantified by spectrophotometry (# = 260 nm). The complementary DNAs (cDNAs) are synthesized using a commercial kit (First strand cDNA synthesis, Amersham Pharmacia Biotech, Uppsala, Sweden) are retrotranscribed. Reverse transcription (2 g of total RNA) is carried out in 10 mM Tris-HCl buffer pH 8.3 containing 300 μg / ml of oligodT primer (5'-AACTGGAAGAATTCGCGGCCGCAGGAA (T) i8-3 ': SEQ ID No 7), 10 M dithiothreitol (DTT), 5 mM of the 4 nucleotides and 1 U / ml of recombinant reverse transcriptase. The reaction mixture is incubated for 1 hour at 37 ° C. and the reaction is stopped by heating at 65 ° C. for 5 minutes. The reaction mixture for RT-PCR is as follows: 1 l of cDNA (corresponding to 25 ng of total RNA), 25 pmol of primer (5'-CGGGGCCTGCCTGCTGGCCATCGGCATC-3 ': SEQ ID No. 8 and 5' CCCTGGTAGTGCTTGGTGAGCTCC-3 ': SEQ ID No. 9), dNTP 200 M, MgCl2 1.5 mM, Tris-HCl 10 mM pH 8.3, KCI 50 mM and 0.4 units of Taq polymerase (Perkin Elmer). The PCR conditions are: 5 min at 95 ° C., 30 cycles: 1 min at 94 ° C., 1 min at 55 ° C. and 1 min at 72 ° C., a final extension of 5 min at 72 ° C. The samples are taken up in the buffer sample (0.25% bromophenol blue, 40% sucrose) and analyzed by electrophoresis in 1% agarose gel containing ethidium bromide. After migration, the samples are visualized by UV illumination of the gel. The integrity of the RNA is analyzed by evaluating the expression of the cDNA encoding the actin p molecule using the following primers: 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3 ': SEQ ID No.
10 et 5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC-3' : SEQID No. 11. 10 and 5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC-3 ': SEQID No. 11.
La figure montre que la neurospanine est exprimée dans les types cellulaires suivants : lymphocytes T, cellules T activées par de l'IL-2 (LAK ou Lymphokine Activated Killer cells) et cellules endothéliales. The figure shows that neurospanin is expressed in the following cell types: T lymphocytes, T cells activated by IL-2 (LAK or Lymphokine Activated Killer cells) and endothelial cells.
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