FR2633310A1 - Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques - Google Patents

Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques Download PDF

Info

Publication number
FR2633310A1
FR2633310A1 FR8808536A FR8808536A FR2633310A1 FR 2633310 A1 FR2633310 A1 FR 2633310A1 FR 8808536 A FR8808536 A FR 8808536A FR 8808536 A FR8808536 A FR 8808536A FR 2633310 A1 FR2633310 A1 FR 2633310A1
Authority
FR
France
Prior art keywords
racks
tank
samples
rack
robot
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
FR8808536A
Other languages
English (en)
Inventor
Daniel Larzul
Jean-Luc Guesdon
Jean-Pierre Gerlier
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institut Pasteur de Lille
Original Assignee
Institut Pasteur de Lille
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institut Pasteur de Lille filed Critical Institut Pasteur de Lille
Priority to FR8808536A priority Critical patent/FR2633310A1/fr
Publication of FR2633310A1 publication Critical patent/FR2633310A1/fr
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L7/00Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
    • B01L7/52Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
    • B01L7/525Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples with physical movement of samples between temperature zones
    • B01L7/5255Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples with physical movement of samples between temperature zones by moving sample containers
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L7/00Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
    • B01L7/52Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/0099Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor comprising robots or similar manipulators
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/00584Control arrangements for automatic analysers
    • G01N2035/0097Control arrangements for automatic analysers monitoring reactions as a function of time

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Clinical Laboratory Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Robotics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

Appareil d'exécution automatique répétée d'un cycle thermique en plusieurs étapes successives de traitement d'une pluralité d'échantillons biologiques. L'appareil comporte : - un premier bloc calorifugé 1, - une pluralité de cuves thermostatiques indépendantes 5, 6, 7 ménagées dans ce bloc calorifugé 1, - une pluralité de portoirs 11 de support d'une pluralité de tubes contenant les échantillons, chaque portoir étant destiné à être immergé successivement dans les cuves thermostatiques, - un robot 4 de transfert successif des portoirs 11, - un dispositif de régulation électronique de la température de chaque cuve 5, 6, 7, - un ordinateur de commande du robot et du dispositif de régulation électronique. Application au traitement thermique cyclique répété d'échantillons biologiques, et notamment à l'amplification enzymatique in vitro de séquences d'acides nucléiques.

Description

La présente invention est relative à un appareil d'exécution automatique répétée d'un cycle thermique en plusieurs étapes successives pour le traitementd'unepluralité d'éohantillons biologiques, notamment pour l'amplification en- zymatique in vitro de séquences d'acides nucléiques.
Un procédé décrit par SAIKI et al. (cf. SCIENCE, vol. 230, pages 1350-1354, 20 décembre 1985) vise à amplifier au moins une séquence spécifique d'acides nucléiques ou d'un mélange de ceux-ci en utilisant des amorces (primers), des nucléotides triphosphates et un agent de polymérisation, tel que l'ADN polymérase. Cette méthode d'amplification enzymatique in vitro est connue sous le nom de technique PCR (Polymerase Chain Reaction) et est très utile notamment pour effectuer des tests chimiques très importants, tels que le diagnostic prénatal de l'anémie à hématies falciformes ou le diagnostic du virus du SIDA. Dans ces cas, 1'ADN amplifié par PCR est détecté à l'aide d'une sonde nucléique complémentaire des séquences d'ADN amplifiées.
De façon plus précise, cette technique consiste à amplifier spécifiquement un fragment d'ADN double brin à l'aide de l'enzyme ADN polymérase, permettant sa synthèse (cf. la figure 1 annexée à cette description,qui illustre schématiquement deux cycles d'amplification). Pour cela, il est nécessaire d'ajouter au milieu réactionnel deux oligonucléotides (P1 et P2) spécifiques d'une partie du fragment d'ADN à amplifier. Les deux oligonucléotides sont complémentaires des brins opposés : P1 est complémentaire du brin (+) et P2 est complémentaire du brin (-). Chaque oligonucléotide, une fois hybridé avec son brin complémentaire, servira d'amorce (ou primer) à 1'ADN polymérase pour réaliser l'élongation (extension) du brin d'ADN en utilisant le brin hybridé à l'oligonucléotide comme matrice à copier.Ainsi, le primer P1 hybridé au brin (+) permettra la synthèse d'un brin (-) complémentaire.
Le primer P2 hydridé au brin (-) permettra la synthèse ^*'un brin (+) complémentaire. Cette suite de réactions représente un cycle d'amplification qe l'on peut résumer er. trois étapes
* une dénaturation à 92-1000C, permettant une sépara-
tion physique de tous les brins d'ADN complémentaires,
* une hybridation des primers à une température qui leur
est spécifique, soit de 37 à 650C,
* une élongation du brin d'ADN par 1'ADN polymérase à sa
température optimale de fonctionnement, soit de 70 à
80"C pour la Taq polymérase (ADN polymérase thermoré
sistante extraite à partir de Thermus aquaticus).
I1 est important de noter que chaque brin d'ADN néosynthétisé peut servir de matrice à l'ADN polymérase lors du cycle suivant. I1 en résulte une amplification exponentielle de la quantité de fragment considérée, suivant la formule Y = (1 + X)n , où Y est le facteur total d'amplification, n le nombre total de cycles d'amplification et X la moyenne sur n cycles de l'efficacité par cycle d'amplification, tel que si la quantité d'ADN à amplifier est égale à A, la quantité d'ADN après n cycles d'amplification est égale à A(l+X)n.
Un appareil décrit dans la Demande EP-A2-0 236 069 (CETUS) est basé sur cette technique, qu'il vise à automatiser sous contrôle d'un ordinateur, puisque son exécution manuelle est très longue (2 à 5 heures) et fastidieuse.
L'appareil CETUS permet de soumettre de façon cyclique (jusqu'à 100 cycles environ) un nombre donné d'échantillons biologiques à amplifier du type évoqué plus haut (notamment contenus dans un lot de 48 tubes d'essai de 0,5 ml chacun) aux différentes températures définissant les trois phases précitées (dénaturation/hybr.idation/ élongation). La température de chaque étape et le temps d'incubation des échantillons à chaque température sont déterminés par l'expérimentateur.
Les échantillons sont placés dans un récepteur fixe à l'intérieur duquel circule-un liquide thermorégulé.
Un transfert d'énergie thermique se fera alors entre ce liquide circulant et l'échantillon biologique. Deux exemples sont proposés dans la Demande de Brevet CETUS précitée pour la réalisation technique de cet appareil
i) le récepteur est en relation avec une pompe à effet
Peltier (chauffage et refroidissement), elle-même
en relation avec un réservoir,
ii) le récepteur est en relation, par l'intermédiaire
d'un système de valves automatiques, avec deux ré
servoirs contenant un liquide thermorégulé.
Toutefois, l'appareil CETUS présente un certain nombre de limitations
1) Le lot d'échantillons étant immobile, c'est un
liquide thermorégulé qui permettra d'atteindre la
température souhaitée pour les échantillons. Ce
liquide, à une température donnée, circule d'un
réservoir de stockage ou d'une pompe à effet Peltier
jusqu'au récepteur portant les échantillons. La cir
culation ayant lieu dans des conduits non-thermorégu
lés, la température du liquide est modifiée et ne
correspond plus à la température initiale au départ
du réservoir ou de la pompe.
2) Le transfert thermique entre le liquide thermorégulé
et l'échantillon biologique doit se faire à travers
trois barrières physiques : la paroi du récepteur des
tubes, une fine pellicule d'air et la paroi du tube
contenant l'échantillon. Il en résulte une inertie
thermique et des pertes thermiques importantes.
3) Le remplacement d'un liquide à une température(Tl)par
un liquide à une autre température (T2 ,avec iT1-T23
pouvant atteindre 600C) demande un temps non négli
geable,qui augmente encore l'inertie du système.
4) La température réelle de l'échantillon est inconnue.
5) Cet appareil permet de traiter automatiquement un
nombre donné (48 tubes de 0,5 ml) dréchantillons (un
lot d'échantillons) dans des conditions précises de
températures. Cependant , les échantillons d'un lot
seront tous traités de manière identique, c'est-à
dire dans les mêmes conditions de température, de
temps à chaque température et de nombre total de
cycles. En d'autres termes, tous les
sont solidaires et traités de manière identique.
6) Le traitement automatique d'un second lot d'échanil
lons à la suite du premier lot est impossible.
7) L'immobilité totale des échantillons ne permet pas de
déplacer un lot entier d'échantillons, ou une partie
de lot, pour le présenter à un appareil de mesure ou de
modification de l'échantillon.
Ces limitations ont les conséquences suivantes
A) Les pertes thermiques (limitations 1 et 2) inhérentes à la conception même de l'appareil CETUS, ont des conséquences graves au niveau de la thermorégulation duliquide.
Cette perte de contrôle de la température du liquide circulant a des conséquences évidentes sur la température réelle atteinte par l'échantillon. La température programmée sur l'appareil est celle du réservoir de stockage (ou de la pompe à effet Peltier) du liquide et non la température réelle créée autour du tube contenant l'échantillon.
Ce problème peut avoir de graves conséquences pour l'amplification PCR en particulier pour la température permettant lthybridation des primers qui doit être déterminée avec précision (expérimentalement ou par le calcul).
B) L'inertie thermique (limitations 2 et 3) va à l'encontre d'un changement rapide de température souhaité pour l'amplification PCR.
C) Le fait de ne pas connaitre la température réelle de l'échantillon (limitation 4) est particulièrement problématique avec un système ayant une inertie thermique et des pertes thermiques importantes. Notamment,les données publiées dans la littérature scientifique et technique ne sont pas direc- tement utilisables: les températures publiées sont en effet les températures réelles. De plus, sans la connaissance de la température réelle, il est impossible de comparer les résultats de différentes expériences.
D) Le traitement strictement identique de tous les échantillons (limitation 5), ainsi que l'impossibilité de traiter automatiquement plusieurs lots d'échantillons (limitation 6) ont des conséquences très graves pour l'amplification par PCR. En effet, l'application essentielle.
de l'amplification PCR se situe dans le domaine du diagnostic. Dans la grande majorité des cas (maladies infectieuses) il est indispensable de connaître la concentration (en séquences d'ADN) du pathogène à détecter. Cette concentration est en effet directement liée, d'une part, au pouvoir infectieux du prélèvement biologique et, d'autre part, à la gravité et au stade d'avancement de la maladie. Malheureusement, une telle quantification (la détermination de la concentration en séquences d'ADN spécifique) est très délicate après amplification spécifique des séquences à détecter. Cette difficulté est liée à deux facteurs - la complexité des courbes d'amplification qui atteignent
un plateau, - le fait que ces courbes soient différentes en fonction
de la concentration initiale en fragment à amplifier.
La seule s o 1 u t i o n permettant une quantification précise, sur 40 cycles par exemple, est de suivre la cinétique d'accumulation du fragment amplifié. En d'autres termes, il faudrait connaître pour chaque échantillon la concentration de fragment amplifié après 4, 8, 12, 16, 20, 24, 28, 32, 36 et 40 cycles.
Or, i 1 e s t parfaitement impossible de suivre automatiquement une telle cinétique avec l'appareil CETUS puisque les 48 échantillons d'un lot sont traités dans des conditions identiques et qu'un seul lot peut être traité automatiquement. I1 en résulte que le traitement automatique des échantillons par cet appareil ne permet pas de faire une quantification,qui est très souvent indispensable.
E) Les tubes contenant les échantillons ne peuvent pas être déplacés pour les présenter à un appareil de mesure ou de modification de l'échantillon (limitation 7).
En fait, au cours ou en fin d'amplification, il peut être intéressant de connaître certains paramètres, comme par exemple - la densité optique à 260 nm , permettant de calculer la
concentration de 1'ADN, donc d'avoir une idée du taux
d'amplification instantané; - le pH , permettant de réajuster celui-ci à la valeur
optimale pour 1'ADN polymérase.
De plus, il peut être utile d'effectuer certaines modifications sur l'échantillon avant ou après l'amplification
PCR, par exemple - amplification de séquences d'ARN (VIH responsable du
SIDA) : une première étape consiste à copier le brin
d'ARN en un brin d'ADN complémentaire à l'aide d'une
réverse transcriptase,pour ajouter ensuite dans l'échan
tillon les éléments nécessaires pour l'amplification PCR - amplification PCR + amplification par la RNA.polymérase
des bactériophages T7 ou SP6 : après une amplification
PCR, une seconde amplification peut être faite en uti
lisant une autre enzyme (RNA polymérase) et d'autres réac
tifs (nucléotides triphosphate) qu'il faut ajouter dans le
milieu réactionnel; - amplification PCR + hybridation en milieu liquide : après
amplification PCR, une (ou plusieurs) sonde nucléique spé
clfique(s) du fragment amplifié est(sont) ajoutée(s) au milieu
réactionnel 11 'échantillon est alors incubé à une tem
pérature permettant i'hybridation de la sonde.
La présente invention a donc pour but de pourvoir à un appareil d'exécution automatique de séquences d'acides nucléiques qui répond mieux aux nécessités de la pratique que les appareils visant au même but antérieurement connus, notamment en ce que - les pertes thermiques entre le lieu de chauffage (refroi
dissement) et le lieu d'utilisation (environnement des
tubes) n'existent pas puisque le chauffage et l'utili
sation se font dans le même lieu. Ainsi, la température
programmée par l'utilisateur sera réellement celle de
l'environnement des tubes.Les tubes contenant les échan
tillons trempent directement dans un bain à huile thermo
régulé, limitant ainsi les barrières physiques, entre
l'huile et l'échantillon, à la seule paroi du tube (cf.limita
tion précitée 2).Un robot déplace ui portoir de 48 tubes de
1,5 ml (par exemple) entre les différents bains à huile.
Le temps nécessaire pour changer de bain est compris
entre 3 et 5 secondes, rendant négligeables les varia
tions de température de l'échantillon pendant le dépla
cement, - la température réelle de l'échantillon sera mesurée par
une sonde positionnée directement dans un tube. Cepen
dant, cette sonde ne sera disponible qu'en option sur
l'appareil objet de la présente invention, - le point fort de cet appareil est de permettre une quan
tification en suivant la cinétique d'accumulation du
fragment amplifié.Contrairement à l'appareil CETUS, les
différents échantillons d'un même lot peuvent être traités
dans différentes conditions d'amplitication, c'est-à-dire en
particulier avec un nombre de cyclesdifférent.Il suffit pour
cela d'utiliser un portoir de tubes composé de plusieurs
éléments indépendants, le robot pouvant arrêter l'ampli
fication pour un seul élément alors que les éléments
restant continuent les cycles d'amplification. Le suivi
automatique de la cinétique peut également se faire par
traitement successif de plusieurs lots d'échantillons
le premier lot subissant 4 cycles, le second 8 cycles,
etc..., - le robot peut présenter un lot ou une partie de lot à un
appareil de mesure ou de modiication de l'échantillon.
De façon plus précise, la présente invention a pour objet un appareil d'exécution automatique répétée d'un cycle thermique en plusieurs étapes successives pour le traitement d'une pluralité d'échantillons biologiques,-ca- ractérisé en ce qu'il comporte - un premier bloc calorifugé, - une pluralité de cuves. thermostatiques indépendantes ménagées dans ce bloc calorifugé, qui sont équipées chacune d'un élément chauffant, - une pluralité de portoirs de support d'une pluralité de tubes contenant les échantillons précités, chaque portoir étant équipé de pieds d'appui et d'oreilles de préhension et étant destiné à être immergé successivement dans la pluralité de cuves thermostatiques précitées, - un robot de transfert successif des portoirs, équipés des tubes d'échantillons, d'une cuve thermostatique à la suivante, lequel robot comporte un bras de manoeuvre équipé d'une pince de préhension de chaque portoir par l'intermédiaire de ses oreilles précitées, - un dispositif de régulation électronique de la température de chaque cuve, - un ordinateur de commande du robot et du dispositif de régulation électronique des températures des cuves en fonction du cycle thermique précité, les températures des cuves et le temps d'incubation dans chaque cuve ainsi que l'ordre de transfert des différents portoirs et le nombre de cycles auxquels sont soumis les échantillons de chaque portoir étant pilotés par cet ordinateur.
L'appareil selon l'invention est avantageusement applicable à l'exécution de la technique PCR décrite plus haut, à savoir de l'amplification enzymatique in.vitro de séquences d'acides nucléiques. En outre, les cuves thermostatiques peuvent être constituées, soit par des cuves remplies chacune d'un fluide échangeur de chaleur,définissant un bain thermostatique et coopérant avec un dispositif d'agitation pour homogéniser la température du bain correspondant, soit par des cuves thermostatiques simples sans fluide échangeur de chaleur.
L'appareil selon l'invention peut être avantageusement équipé d'un deuxième bloc calorifugé comportant au moins une cuve réfrigérée à 40C et destinée à stocker les portoirs avant et/ou après traitement thermique complet des échantillons correspondants.
Sel on une variante avantageuse de cette disposition, le bloc réfrigéré est remplacé par un simple plateau de stockage.
La hauteur des premier et deuxième blocs calorifugés est fonction de celle des portoirs,qui peuvent y être disposés superposés.
En outre, une sonde thermique peut être solidaire de la pince du robot et coopère avec un tube témoin de chaque portoir.
Outre les dispositions qui précèdent, l'invention comprend encore d'autres dispositions, qui ressortiront de la description qui va suivre.
L'invention sera mieux comprise à l'aide du complément de description qui va suivre, qui se refère aux dessins annexés dans lesquels
- la figure 1 est une illustration schématique de deux cycles d'amplification enzymatique de séquences d'acides nucléiques selon la technique PCR,déjà décrite plus haut,
- la figure 2 est une vue en perspective de l'appareil selon l'invention,
- la figure 3 est une vue de dessus de l'appareil de figure 2 représenté sur un plan de travail,
- la figure 4 est une vue du portoir utilisé dans l'appareil conforme à l'invention, qui y est représenté développé à plat.
I1 doit être bien entendu, toutefois, que ces dessins et les parties descriptives correspondantes, sont
v donnés uniquement à titre d'illustration de l'objet de l'invention, dont ils ne constituent en aucune manière une limitation.
L'appareil automatique selon l'invention se compose de quatre parties principales - un bloc thermostaté 1, - un robot 4, - un bloc réfrigéré 3, - un ordinateur de commande piloté par son logiciel.
Le bloc thermostaté 1 qui est calorifugé, se compose de trois bains thermostatiques 5, 6 et 7 à huile équipés chacun d'un dispositif de chauffage/régulation de température réglable individuellement dans la plage température ambiance - 1000C.
Chaque bain est donc constitué d'une cuve remplie d'un fluide échangeur de chaleur, d'un élément chauffant, d'une sonde de mesure de température et d'un système d'agitation qui permet d'homogénéiser la températeure du fluide.
Une mousse en matière plastique assure l'isolation thermique entre cuves et limite les déperditions calorifiques vers l'extérieur.
Un dispositif de régulation électronique de température de chaque cuve est intégré dans un boîtier de commande 2. La fixation des points de consigne et l'affi- chage des températures réelles sont obtenues, soit grâce à un boîtier de commande indépendant , soit grâce à l'ordinateur de commande.
Le robot 4, qui est d'un type connu en soi, comporte un bras de manoeuvre 8 équipé d'une pince comprenant deux doigts de préhension 10.
I1 assure le transfert des portoirs il contenant les tubes d'échantillons (20 à 100 tubes par portoir) d'un bain thermostaté à l'autre.
Une sonde thermique 20, solidaire de la pince permet de connaître la température dans un tube témoin du portoir 11.
Sa pince a été adaptée pour que l'opération de préhension du portoir se fasse à l'ouverture, comme il est précisé plus loin.
Le bloc réfrigéré 3 est analogue au bloc ther mostatic:-ie, 1 mais ne comporte qu'une seule grande cuve 9 réfrigérée à 40C et destinée à recevoir les portoirs neufs et les portoirs après traitement, en bloquant toute réaction biologique.
Cette cuve est plus profonde que celles qui sont utilisées dans le bloc thermostatique, car elle peut contenir des portoirs superposés sur deux étages.
La source de froid est obtenue grâce à un groupe frigorifique de type connu ou une cellule à effet Peltier de type connu.
Le bloc réfrigéré peut être remplacé par un simple plateau de stockage.
L'ordinateur de commande utilisé est un microordinateur de type connu.
Le logiciel de commande gère le fonctionnement complet de l'automate, il permet notamment - l'affichage et la mise en place des points de consigne
des températures de chaque bain thermostatique, - l'affichage de la température réelle de chaque bain, - la programmation du temps de présence d'un portoir dans
une cuve, - la fixation du nombre de cycles thermiques pour un por
toir, - la détermination de l'ordre de passage,dans les différents
bains, de chaque portoir, - le fonctionnement continu, sans intervention manuelle,pour
le nombre de portoirs qui a été fourni à l'automate, - la programmation d'un arrêt momentané du fonctionnement
de l'automate pour réaliser une opération manuelle (parexemple
ajout de réactif ou prélèvement pour analyse).
Chaque portoir 11, montré en détail à la figure 4, comporte une plaque perforée 12 comportant 49 (7 X 7) orifices 13,dont 48 orifices sont.destinés à recevoir les tubes contenant des échantillons de séquences d'acides nucléiques à soumettre à l'amplification enzymatique PCR par passage successif, à l'aide du robot 4 et sous contrôle de l'ordinateur 30 (associé à une imprimante 40 et à un écran 50), dans les trois cuves thermostatiques 5 à 7 dans lesquelles ont respectivement lieu les étapes de dénaturation,hybridation et élongation décrites plus haut.
Dans le 49-ème orifice, 13a, qui se trouve en position centrale dans la plaque 12, est disposé un tube témoin destiné à recevoir, le cas échéant, la sonde thermique 20 précitée solidaire de la pince 9 du robot.
Le portoir 11 comporte des pieds (ou pattes) 14 qui sont illustrées en pointillé à l'état développé à la figure 4 et qui sont perpendiculaires au plan de cette figure et dirigés vers le bas. Ces pieds 14 sont équipés de, tétons de centrage 15 permettant un positionnement précis du portoir dans chaque cuve ou sur le couvercle (non représenté et qui est décrit ci-après) d'un portoir inférieur en tenant compte du fait que la profondeur de la cuve 3 est telle qu'elle permet de gerber les portoirs.
Deux oreilles de préhension 18, perpendiculaires au plan de la figure 4 et dirigées en sens opposé aux pattes 14, à savoir vers le haut, permettent aux doigts 10 de la pince du robot de transférer les portoirs d'une cuve à l'autre. A cet effet, chaque oreille 18 comporte deux orifices 21 dans lesquels sont introduits deux ergots portés par chaque doigt 10.
La plaque 12, ainsi que les pattes 14, peuvent comporter des évidements d'allègement, tels que ceux indiqués par les références numériques 16 et 17.
Les orifices 19 sont destinés à recevoir les tétons de centrage 15 d'un portoir supérieur lorsque deux portoirs sont superposés dans la cuve 3.
Chaque plaque 12 est destinée à coopérer avec un couvercle, qui n'a pas été représenté car il est constitué par une plaque identique à la plaque 12, sauf le fait qu'il est dépourvu de pattes et d'oreilles. Ce couvercle est appliqué sur les tubes placés dans la plaque 12 et est maintenu pressé contre les bouchons des tubes à l'aide de quatre languettes 22 portées par les deux côtés de la plaque 12 sur lesquels sont ménagées les oreilles de préhension 18 et repliées vers l'intérieur de la plaque 12 parallèlement à celle-ci. De cette manière est assuré le positionnement rigoureux des tubes contenant les échantillons à amplifier, évitant ainsi qu'ils remontent sous l'effet de la poussée d'Archimède lorsqu'ils sont immergés dans un bain thermostatique ou que les bouchons des tubes s'ouvrent sous l'effet de la pression de l'échantillon.
I1 va de soi que la configuration générale du portoir de la figure 4 est susceptible d'être adaptée à différents types de tubes à essai pour échantillons.
De plus, il est possible d'utiliser une pluralité de portoirs de dimensions réduites, chacun pourvu de ses propres pattes de positionnement et de ses propres oreilles de préhension et que l'on peut imaginer obtenir à partir de la plaque 12 en subdivisant celle-ci en plaques élémentaires.
Ceci permet de faire suivre aux échantillons de certains portoirs élémentaires juxtaposables un processus différent de celui des autres portoirs élémentaires.
L'appareil automatique dont on vient de décrire les composants assure donc le transfert des portoirs de tubes d'échantillons dans trois bains thermostatés à température réglable pour qu'ils puissent y subir de façon répétée le traitement thermique cyclique en trois étapes successives.
Cet appareil est donc parfaitement adapté à la technique d'amplification PCR et permet,d'une part,de résoudre les problèmes essentiels posés par l'appareil CETUS décrit plus haut et, d'autre part, d'assurer un traitement automatique d'un nombre élevé d'échantillons, notamment 25 à 300 tubes de 1,5 m; environ et plus de 500 tubes de 0,5 ml.
La température des bains, le temps d'incubation dans les bains, l'ordre de passage des différents portoirs et le nombre de cycles d'amplification sont programmables.
En particulier, les températures des bains peuvent évoluer automatiquement pendant une expérience et le changement de cuve peut être non seulement programmé dans le temps, mais aussi en fonction de la température d'échantillon grâce à la sonde thermique de mesure de température associée à chaque portoir.
Une zone de stockage (bloc réfrigéré) permet de placer les portoirs avant et après passage dans les cuves thermostatiques, et assure un fonctionnement automatique sans intervention humaine pour 3 à 5 portoirs.
Ainsi que cela ressort de ce qui précède, l'invention le se limite nullement à ceux de ses modes de réalisation et d'application qui viennent d'être décrits de façon plus explicite ; elle en embrasse, au contraire, toutes les variantes qui peuvent venir à l'esprit du technicien en la matière, sans s'écarter du cadre, ni de la portée, de la présente invention. En particulier, il y a lieu de noter que les domaines d'application de l'appareil selon l'invention sont en général constitués par tous ceux où il est nécessaire d'avoir une température constante (et éventuellement réglable suivant les besoins) pendant un temps donné. I1 s'agit donc essentiellement des réactions enzymatiques et des techniques d'hybridation ADN/ADN,
ARN/ARN, et ADN/ARN et en général de toutes les techniques dans lesquelles une pluralité d'échantillons biologiques doit être soumise de façon répétée à un cycle thermique en plusieurs étapes successives, la technique PCR visée dans la description qui précède n'étant donc pas limitative.

Claims (8)

REVENDICATIONS
1.- Appareil d'exécution automatique répétée d'un cycle thermique comprenant plusieurs étapes successives pour le traitement d'une pluralité d'échantillons biologiques, caractérisé. en ce qu'il comporte - un premier bloc calorifugé (1), - une pluralité de cuves thermostatiques indépendantes
(5, 6, 7) ménagées dans ce bloc calorifugé (1), qui sont
équipées chacune d'un élément chauffant, - une pluralité de portoirs (11) de support d'une pluralité
de tubes contenant les échantillons précités, chaque por
toir (11) étant équipé de piedsd'appui (14) et d'oreilles
de préhension (18) et étant destiné à être immergé succes
sivement dans la pluralité de cuves thermostatiques pré
citées (5, 6, 7), - un robot (4) de transfert successif des portoirs (11),
équipés des tubes d'échantillons,d'une cuve thermostatique
à la suivante,lequel robot (4) comporte un bras de manoeuvre
(8) équipé d'une pince (10-10) de préhension de chaque
portoir (11) par l'intermédiaire de ses oreilles préci
tées (18), - un dispositif de régulation électronique de la tempé
rature de chaque cuve (5, 6, 7), - un ordinateur de commande du robot et du dispositif de
régulation électronique des températures des cuves en
fonction du cycle thermique précité, les températures des
cuves et le temps d'incubation dans chaque cuve ainsi que
l'ordre de transfert des différents portoirs et le nombre
de cycles auxquels sont soumis les échantillons de chaque
portoir étant pilotés par cet ordinateur
2.- Appareil selon la revendication 1, caractérisé
en ce qu'il est équipé d'un deuxième bloc calorifugé (3)
comportant au moins une cuve (9) réfrigérée à 40C et destinée
à stocker les portoirs (11) avant et/ou après traitement
thermique complet des échantillons correspondants.
3.- Appareil selon la revendication 1, caractérisé en ce qu'il est équipé d'un plateau de stockage des portoirs.
4.- Appareil selon la revendication 2, caractérisé en ce que la cuve réfrigrée (3) présente une hauteur double de celle de la cuve thermostatée (1) pour y gerber plusieurs portoirs (11) avant et/ou après traitement thermique des échantillons.
5.- Appareil selon l'une quelconque des revendications 1, 2 ou 4, caractérisé en ce qu'au moins un portoir se compose de plusieurs portoirs élémentaires indépendants juxtaposables.
6.- Appareil selon l'une quelconque des revendications 1 ou 5, caractérisé en ce qu'une sonde thermique (20) est solidaire de la pince du robot (4) et coopère avec un tube témoin de chaque portoir (11).
7.- Appareil selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, caractérisé en ce que le premier bloc calorifugé (1) comporte trois cuves thermostatiques (5, 6, 7) et le cycle thermique correspond à l'exécution de l'amplification enzymatique in vitro de séquences d'acides nucléiques
8.- Appareil selon l'une quelconque des revendications I ou 7, caractérisé en ce que les cuves (5, 6, 7) du premier bloc calorifugé (1) sont remplies d'un fluide échangeur de chaleur définissant un bain thermostatique et sont équipées, en outre, d'un dispositif d'agitation permettant d'homogéneiser la température de la cuve correspondante.
FR8808536A 1988-06-24 1988-06-24 Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques Pending FR2633310A1 (fr)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR8808536A FR2633310A1 (fr) 1988-06-24 1988-06-24 Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR8808536A FR2633310A1 (fr) 1988-06-24 1988-06-24 Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques

Publications (1)

Publication Number Publication Date
FR2633310A1 true FR2633310A1 (fr) 1989-12-29

Family

ID=9367704

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FR8808536A Pending FR2633310A1 (fr) 1988-06-24 1988-06-24 Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques

Country Status (1)

Country Link
FR (1) FR2633310A1 (fr)

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1993025912A2 (fr) * 1992-06-09 1993-12-23 Medical Research Council Preparation automatique d'acides nucleiques
WO1997022882A1 (fr) * 1995-12-18 1997-06-26 Alan Norman Hale Appareil et procede de traitement d'echantillons
WO2001096559A2 (fr) * 2000-06-15 2001-12-20 Board Of Regents The University Of Texas System Acides nucleiques pouvant etre regules et actifs du point de vue catalytique
JP2002116122A (ja) * 2000-08-22 2002-04-19 Leica Microsystems Nussloch Gmbh 被検物処理装置
WO2002077614A2 (fr) * 2001-03-23 2002-10-03 Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. Appareil destine a l'automatisation d'etudes cinetiques de reactions chimiques
EP1251164A1 (fr) * 2001-04-20 2002-10-23 KENDRO Laboratory Products GmbH Dispositif réglable de réception des objets, en particulier pour une armoire de climatisation
WO2014041217A1 (fr) * 2012-09-11 2014-03-20 Universidad Complutense De Madrid Dispositif et procédé automatisé de cyclage thermique pour des matériaux odontologiques

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB1205752A (en) * 1966-07-23 1970-09-16 Baird & Tatlock Ltd Receptacle support
EP0122772A1 (fr) * 1983-04-15 1984-10-24 Science and Technology Agency, Minister's Secretariat, Director of Finance Division Manipulateur chimique
JPS60247167A (ja) * 1984-05-23 1985-12-06 Seiko Instr & Electronics Ltd ケミカルマニピユレ−タ

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB1205752A (en) * 1966-07-23 1970-09-16 Baird & Tatlock Ltd Receptacle support
EP0122772A1 (fr) * 1983-04-15 1984-10-24 Science and Technology Agency, Minister's Secretariat, Director of Finance Division Manipulateur chimique
JPS60247167A (ja) * 1984-05-23 1985-12-06 Seiko Instr & Electronics Ltd ケミカルマニピユレ−タ

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JOURNAL OF PHYSICS. E. SCIENTIFIC INSTRUMENTS, vol. 18, no. 11, novembre 1985, pages 891-896, The Institute of Physics, Bristol, GB; J.HUDDLESTON: "The use of small robots for laboratory manipulations" *
PATENT ABSTRACTS OF JAPAN, vol. 10, no. 119 (P-453)[2176], 6 mai 1986; & JP-A-60 247 167 (SEIKO DENSHI KOGYO K.K.) 06-12-1985 *
TRAC: TRENDS IN ANALYTICAL CHEMISTRY, vol. 4, no. 2, février 1985, pages 32-40, Elsevier Science Publishers B.V., Amsterdam, NL; G.D.OWENS et al.: "Comparison of approaches to robotics in the laboratory" *

Cited By (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1993025912A2 (fr) * 1992-06-09 1993-12-23 Medical Research Council Preparation automatique d'acides nucleiques
WO1993025912A3 (fr) * 1992-06-09 1994-03-17 Medical Res Council Preparation automatique d'acides nucleiques
WO1997022882A1 (fr) * 1995-12-18 1997-06-26 Alan Norman Hale Appareil et procede de traitement d'echantillons
WO2001096559A2 (fr) * 2000-06-15 2001-12-20 Board Of Regents The University Of Texas System Acides nucleiques pouvant etre regules et actifs du point de vue catalytique
WO2001096559A3 (fr) * 2000-06-15 2003-07-10 Univ Texas Acides nucleiques pouvant etre regules et actifs du point de vue catalytique
JP2002116122A (ja) * 2000-08-22 2002-04-19 Leica Microsystems Nussloch Gmbh 被検物処理装置
WO2002077614A2 (fr) * 2001-03-23 2002-10-03 Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. Appareil destine a l'automatisation d'etudes cinetiques de reactions chimiques
WO2002077614A3 (fr) * 2001-03-23 2003-03-27 Ortho Mcneil Pharm Inc Appareil destine a l'automatisation d'etudes cinetiques de reactions chimiques
US7045288B2 (en) 2001-03-23 2006-05-16 Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc Apparatus for the automation of chemical reaction kinetics studies
EP1251164A1 (fr) * 2001-04-20 2002-10-23 KENDRO Laboratory Products GmbH Dispositif réglable de réception des objets, en particulier pour une armoire de climatisation
WO2014041217A1 (fr) * 2012-09-11 2014-03-20 Universidad Complutense De Madrid Dispositif et procédé automatisé de cyclage thermique pour des matériaux odontologiques

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7346503B2 (ja) 自動インキュベーションのためのシステム、方法、および装置
US10226772B2 (en) Combined thermal devices for thermal cycling
US5720923A (en) Nucleic acid amplification reaction apparatus
JP6797205B2 (ja) 試料分析及び処理のための急速熱サイクル
JP4758891B2 (ja) 微小流体デバイス上の加熱、冷却および熱サイクリングのためのシステムおよび方法
RU2385940C1 (ru) Способ определения нуклеиновых кислот методом полимеразно-цепной реакции в режиме реального времени и устройство для его осуществления
EP2061866B1 (fr) Thermocycleur rapide
US20170114380A1 (en) Systems and methods for the amplification of dna
US20140371083A1 (en) Systems, apparatus and methods for biochemical analysis
JP2009525032A (ja) サーモサイクラーおよびサンプルポート
FR2633310A1 (fr) Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique en plusieurs etapes successives, notamment pour l'amplification enzymatique de sequences d'acides nucleiques
FR2672231A1 (fr) Appareil d'execution automatique repetee d'un cycle thermique, notamment pour l'amplification du nombre d'une sequence definie d'acide nucleique.
WO2017213589A1 (fr) Cyclage thermique rapide pour analyses et traitement d'échantillons
US20090275034A1 (en) Temperature control system
FR2796863A1 (fr) Procede et dispositif permettant de realiser en flux continu un protocole de traitement thermique sur une substance
WO2014113663A1 (fr) Réaction en chaîne de la polymérase en ligne