FI95146B - A method for producing the anti-rejection protein PP15 or an immunogenic portion thereof - Google Patents

A method for producing the anti-rejection protein PP15 or an immunogenic portion thereof Download PDF

Info

Publication number
FI95146B
FI95146B FI891249A FI891249A FI95146B FI 95146 B FI95146 B FI 95146B FI 891249 A FI891249 A FI 891249A FI 891249 A FI891249 A FI 891249A FI 95146 B FI95146 B FI 95146B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
cdna
ecori
protein
placental
dna
Prior art date
Application number
FI891249A
Other languages
Finnish (fi)
Swedish (sv)
Other versions
FI95146C (en
FI891249A0 (en
FI891249A (en
Inventor
Ulrich Grundmann
Karl-Josef Abel
Eugen Amann
Original Assignee
Behringwerke Ag
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Behringwerke Ag filed Critical Behringwerke Ag
Publication of FI891249A0 publication Critical patent/FI891249A0/en
Publication of FI891249A publication Critical patent/FI891249A/en
Application granted granted Critical
Publication of FI95146B publication Critical patent/FI95146B/en
Publication of FI95146C publication Critical patent/FI95146C/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4715Pregnancy proteins, e.g. placenta proteins, alpha-feto-protein, pregnancy specific beta glycoprotein
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/06Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Pregnancy & Childbirth (AREA)
  • Gynecology & Obstetrics (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Reproductive Health (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Transplantation (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

The cDNA coding for PP15 is described. This cDNA can be used to prepare PP15 in pro- or eukaryotic cells. <IMAGE>

Description

95146 *95146 *

Menetelmä hylkimistä vastustavan proteiinin PP15 tai sen immunogeenisen osan valmistamiseksiA method for producing the anti-rejection protein PP15 or an immunogenic portion thereof

Keksintö koskee menetelmää hylkimistä vastustavan 5 proteiinin PP15 tai sen immunogeenisen osan valmistamiseksi. Immuunisuppressiivisesti eli hylkimistä vastustavana toimiva proteiini PP15 on kuvattu seuraavin parametrein patenttijulkaisussa DE-A 2 952 792 (US-A 4 348 316): a) hiilihydraattimäärä 3,35 ± 0,9 %, joka koostuu 10 heksooseista 2,8 ± 0,5 %, heksoosiamiineista 0,3 ± 0,2 %, fukoosista 0,05 ± 0,05 % ja neuramiinihaposta 0,20 ± 0,15 %, b) sedimentaatiokerroin SMw0 2,9 ± 0,2 S, c) ultrasentrifugissa määritelty molekyylipaino 30 15 700 ± 3 200 (dimeeri), d) ekstinktiokerroin E,,»1 * (280 nm) 14,2 ± 1,0 ja e) elektroforeettinen liikkuvuus albumiinin alueella samoin kuin f) isoelektrinen piste 4,4 ± 0,1, C t f.The invention relates to a method for producing the anti-rejection protein PP15 or an immunogenic part thereof. The immunosuppressive protein PP15 is described by the following parameters in DE-A 2 952 792 (US-A 4 348 316): a) a carbohydrate content of 3.35 ± 0.9% consisting of 10 hexoses of 2.8 ± 0.5 %, 0,3 ± 0,2% for hexose amines, 0,05 ± 0,05% for fucose and 0,20 ± 0,15% for neuraminic acid, b) sedimentation factor SMw0 2,9 ± 0,2 S, c) molecular weight determined in an ultracentrifuge 30 15 700 ± 3 200 (dimer), d) extinction coefficient E ,, »1 * (280 nm) 14.2 ± 1.0 and e) electrophoretic mobility in the albumin region as well as f) isoelectric point 4.4 ± 0.1 , C t f.

20 g) aminohappokoostumuksella Jäännöksiä 100 Variaatio-jäännöstä kerroin20 g) with amino acid composition Residues 100 Variation residue factor

Aminohappo kohti (mol %) (%)_ . Lysiini 4,74 3,30 • 25 Histidiini 3,81 5,43Per amino acid (mol%) (%) _. Lysine 4.74 3.30 • 25 Histidine 3.81 5.43

Arginiini 1,62 3,43Arginine 1.62 3.43

Asparagiinihappo 13,39 5,08Aspartic acid 13.39 5.08

Treoniini 3,85 5,35Threonine 3.85 5.35

Seriini 6,38 2,81 . 30 Glutamiinihappo 13,43 5,32Serine 6.38 2.81. 30 Glutamic acid 13.43 5.32

Proliini 4,35 14,25Proline 4.35 14.25

Glysiini 6,87 2,13Glycine 6.87 2.13

Alaniini 6,51 8,26Alanine 6.51 8.26

Kystiini 1/2 2,48 4,55 35 Väliini 2,29 15,67 2 95146Cystine 1/2 2.48 4.55 35 Intermediate 2.29 15.67 2 95146

Metioniini 2,87 10,86Methionine 2.87 10.86

Isoleusiini 8,39 8,18Isoleucine 8.39 8.18

Leusiini 8,18 6,72Leucine 8.18 6.72

Tyrosiini 2,09 8,49 5 Fenyylialaniini 6,27 2,27Tyrosine 2.09 8.49 5 Phenylalanine 6.27 2.27

Tryptofaani 2,51 6,81Tryptophan 2.51 6.81

Molekyylipainon määritys SDS-polyakryyliamidigee-lielektroforeesin avulla antoi molekyylipainoksi noin 10 15 000 d (monomeeri).Determination of molecular weight by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis gave a molecular weight of about 10 to 15,000 d (monomer).

Tämän proteiinin geenitekninen valmistus on erit täin toivottavaa koska se on hylkimistä vastustavien ominaisuukseensa takia tullut terapeuttisen ja diagnostisen kiinnostuksen kohteeksi. Keksintö koskee siten menetelmää 15 PP15:n valmistamiseksi geeniteknisesti. Kuvataan myös tähän vaadittavaa mRNA:ta, siitä saatua cDNA:ta, tämän cDNA-:n kokonaan tai osittain sisältävät DNA-rakenteet ja vektorit, sellaisella DNA:11a transformoidut solut, näistä soluista ekspressoituvan polypeptidin ja sen käytön lääke-20 aineena. Lisäksi esitetään PP15:n aminohapposekvenssi samoin kuin aminohapposekvenssin osasekvenssi, sen avulla saadut spesifiset vasta-aineet, vasta-aineista valmistetut diagnostiset reagenssit ja vasta-ainepylväät samoin kuin pylväiden avulla saatu polypeptidi. Keksinnön eräs lisä-• 25 muodostelma koskee diagnostisia reagensseja, jotka sisäl tävät kokonaan tai osittain PP15:tä koodaavan tai sen komplementaarisen DNA:n tai RNA:n ja diagnostisia menetelmiä, joilla tutkitaan kehonnesteitä ja kudoksia näiden diagnostisten reagenssien avulla. Keksinnön muita näkökohtia va-. . 30 laistaan lähemmin seuraavassa tai määritetään patenttivaa- " timuksissa.Genetic engineering of this protein is highly desirable as it has become of therapeutic and diagnostic interest due to its anti-rejection properties. The invention thus relates to a method for the genetic engineering of PP15. Also described are the mRNA required therein, cDNA derived therefrom, DNA structures and vectors containing all or part of this cDNA, cells transformed with such DNA, a polypeptide expressed from these cells, and its use as a drug. In addition, the amino acid sequence of PP15 as well as the amino acid sequence subsequence, specific antibodies obtained therefrom, diagnostic reagents prepared from antibodies and antibody columns as well as the polypeptide obtained by the columns are shown. A further embodiment of the invention relates to diagnostic reagents comprising, in whole or in part, DNA or RNA encoding or complementary to PP15, and to diagnostic methods for examining body fluids and tissues with these diagnostic reagents. Other aspects of the invention . 30 are further specified in the following or defined in the claims.

Ensin yritettiin spesifisten PP15:tä vastaan suunnattujen vasta-aineiden avulla kaupallisesti saatavissa olevassa cDNA-ekspressoitumispankissa, joka on ihmisen 35 kypsän istukan mRNA:sta (Fa. Genofit, Heidelberg), osoit-First, specific antibodies against PP15 were attempted in a commercially available cDNA expression library of human 35 mature placental mRNA (Genofit, Heidelberg).

IIII

95146 3 taa klooneja, jotka ekspressoivat PP15:tä. Koska oli tunnettua, että PP15 vaikuttaa hylkimistä vastustavasti, niin muodoin spesifiset vasta-aineet olivat vain huonosti, jos ylipäänsä lainkaan valmistettavissa, valmistettiin spesi-5 fisiä vasta-aineita osapeptidejä vastaan.95146 3 clones expressing PP15. Since PP15 was known to be anti-rejection, thus specific antibodies were poorly, if at all, specific antibodies against subpeptides were prepared.

Sen vuoksi hajotettiin proteiini PP15 spesifisiin fragmentteihin leikkaamalla bromisyaanilla, trypsiinillä tai proteinaasi V8:lla, jotka fragmentit sekvenssoitiin myöhemmin. Saatiin seuraavat fragmentit:Therefore, the protein PP15 was digested into specific fragments by cleavage with bromocyanin, trypsin or proteinase V8, which fragments were subsequently sequenced. The following fragments were obtained:

10 (A) MVVGQLKADEDPIMGFHQMF10 (A) MVVGQLKADEDPIMGFHQMF

(B) FRLALHNFG(B) FRLALHNFG

(C) VSVYAEAAER(C) VSVYAEAAER

(D) L S S L P F Q K I Q (H)(D) L S S L P F Q K I Q (H)

(E) FDNDRTQLGAIYIDAS-LT-E(E) FDNDRTQLGAIYIDAS-LT-E

15 (F) LLKNINDAWT15 (F) LLKNINDAWT

Peptidit A, B ja C syntetisoitiin yleisesti tunnettujen menetelmien avulla ja tuotettiin spesifisiä vasta-aineita kaneissa tavallisten menetelmien mukaan. Yllä mainitussa cDNA-ekspressoitumispankissa, joka sisälsi >1 x 106 20 rekombinoitunutta Lambda gtll-kloonia, ei onnistuttu paikallistamaan positiivisia klooneja. Peptidi A:ta ja B:tä vastaan suunnatut vasta-aineet saostivat tällöin kontrol-likokeessa PP15:n, kun taas vasta-aineet peptidi C:tä vastaan eivät reagoineet. Kuten myöhemmin tuli ilmi, peptidi • 25 C ei myöskään sisälly seuraavaksi cDNA-sekvenssistä joh dettuun PP15-proteiinisekvenssiin, joten se täytyy todennäköisesti rinnastaa PP15:n seuralaisproteiiniin.Peptides A, B and C were synthesized by well-known methods and specific antibodies were produced in rabbits according to standard methods. The above-mentioned cDNA expression bank containing> 1 x 10 6 recombinant Lambda gt11 clones failed to locate positive clones. Antibodies directed against Peptide A and B then precipitated PP15 in the control experiment, whereas antibodies against Peptide C did not react. As it later emerged, peptide • 25 C is also not subsequently included in the PP15 protein sequence derived from the cDNA sequence, so it is likely to need to be assimilated to the PP15 companion protein.

Sen jälkeen valittiin PP15-oligopeptidi A:ta koo-daavista oligonukleotideistä PP15-oligonukleotidi-103 30The oligonucleotides encoding PP15 oligopeptide A were then selected from PP15 oligonucleotide 103.

5'ATGGTGGTGG GCCAGCTGAA GGCTGATGAG GACCCC, vastaavasti oligopeptidi E:stä PP15-oligonukleotidi-140 35 5'TTTGACAATG ACCGGACCCA GCTGGGCGCC ATCTACATTG ATGC5'ATGGTGGTGG GCCAGCTGAA GGCTGATGAG GACCCC, respectively oligopeptide E from PP15 oligonucleotide-140 35 5'TTTGACAATG ACCGGACCCA GCTGGGCGCC ATCTACATTG ATGC

4 95146 ja oligopeptidi F:stä 64-kertaisesti degeneroitunut PP15-oligonukleotidi-1394,95146 and 64-fold degenerate PP15 oligonucleotide-139 from oligopeptide F.

5'AAAAATATTAATGATGCCTGGAC 5 G C C C C5'AAAAATATTAATGATGCCTGGAC 5 G C C C C

AA

R. Lathen [J. Mol. Biol. (1985) 183, 1 - 12] tilastollisten tietojen perusteella.R. Lathen [J. Mol. Biol. (1985) 183, 1-12] on the basis of statistical data.

10 Näiden oligonukleotidikoettimien avulla tehtiin cDNA-pankille, joka oli valmistettu ihmisen kypsän istukan mRNA:sta, screening. Ensin eristettiin istukasta mRNA ja siitä valmistettiin cDNA. Tämä varustettiin EcoRI-päillä ja ligoitiin faagivektori Lambda gtl0:n EcoRI-leikkauskoh-15 tiin. Osoitettiin 2 kloonia (PP15-24 ja PP15-28), joissa oli PPl5:n koko cDNA. DNA:n sekvenssointi tapahtui sinänsä tunnetuilla menetelmillä; PP15:n täydellinen cDNA-sekvens-si (koodaava juoste) esitetään taulukossa 1. cDNA on 894 emäsparia (bp) pitkä, sillä on 5'-päässä 99 emäsparin ei-20 translatoitu sekvenssi, sillä on 381 emäsparin avoin luku-kehys ja jättää 3'-päässä 414 emäsparia, kahdeksan emäspo-ly (A):ta mukaanlukien, translatoimatta.These oligonucleotide probes were screened onto a cDNA library prepared from mature human placental mRNA. First, mRNA was isolated from the placenta and cDNA was prepared. This was provided with EcoRI ends and ligated into the EcoRI cleavage site of the phage vector Lambda gt10. 2 clones (PP15-24 and PP15-28) with the entire cDNA of PP15 were identified. DNA sequencing was performed by methods known per se; The complete cDNA sequence (coding strand) of PP15 is shown in Table 1. The cDNA is 894 bp in length, has a 99 bp untranslated sequence at the 5 'end, has an open reading frame of 381 bp, and leaves At the 3 'end, 414 base pairs, including eight base poly (A), without translation.

Taulukossa 1 ovat nukleotidikoetinkohdat allevii-. vaarnalla merkitty, lisäksi aminohapposekvenssi on merkit- • 25 ty.Table 1 lists the nucleotide probe sites below. dashed, in addition, the amino acid sequence is marked.

Keksinnön mukaisesti voidaan koodaavaa cDNA:ta käyttää sopivan ekspressoitumissysteemin avulla ekspres-soimaan PP15:tä. Isännän valinnalla voidaan vielä vaikuttaa PP15:n modifiointiin. Niinpä bakteereissa ei tapahdu 30 glykosylaatiota ja hiivasoluissa tapahtuu toisenlainen glykosylaatio kuin korkeammissa eukaryoottisissa soluissa.According to the invention, the encoding cDNA can be used to express PP15 by a suitable expression system. The choice of host can further influence the modification of PP15. Thus, there is no glycosylation in bacteria and different glycosylation occurs in yeast cells than in higher eukaryotic cells.

Kun tiedetään PP15:n aminohapposekvenssi, on mahdollista valmistaa tavanomaisilla tai geeniteknisillä menetelmillä aminohappo-osasekvenssejä, jotka voivat toimia il 5 95146 TAULUKKO 1 10 30 50 GGAAGGGACAGTCGGCCGCAGACCGCGCTGGGTTGCCGCTGCCGCTGCCGCCATCGTGCC 70 90 110Knowing the amino acid sequence of PP15, it is possible to prepare amino acid subsequences that can function by conventional or genetic engineering methods. 5 95146 TABLE 1 10 30 50 GGAAGGGACAGTCGGCCGCAGACCGCGCTGGGTTGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCTGCCGCCGC

5 AGCCCCTCGGGTCTCCGTGAGGCCGGGTGACGCTCCAGAATGGGAGACAAGCCAATTTGG5 AGCCCCTCGGGTCTCCGTGAGGCCGGGTGACGCTCCAGAATGGGAGACAAGCCAATTTGG

M G D K P I WM G D K P I W

130 150 170130 150 170

GAGCAGATTGGATCCAGCTTCATTCAACATTACTACCAGTTATTTGATAATGATAGAACCGAGCAGATTGGATCCAGCTTCATTCAACATTACTACCAGTTATTTGATAATGATAGAACC

EQIGSSFIQHYYQLFDNDRTEQIGSSFIQHYYQLFDNDRT

10 190 210 23010 190 210 230

CAACTAGGCGCAATTTACATTGACGCGTCATGCCTTACGTGGGAAGGACAACAGTTCCAGCAACTAGGCGCAATTTACATTGACGCGTCATGCCTTACGTGGGAAGGACAACAGTTCCAG

QLGAIYIDASCLTWEGQQFQQLGAIYIDASCLTWEGQQFQ

250 270 290 GGGAAAGCTGCCATTGTGGAGAAGTTGTCTAGCCTTCCGTTCCAGAAAATTCAGCACAGC 15250 270 290 GGGAAAGCTGCCATTGTGGAGAAGTTGTCTAGCCTTCCGTTCCAGAAAATTCAGCACAGC 15

GKAAIVEKLSSLPFQKIQHSGKAAIVEKLSSLPFQKIQHS

310 330 350310 330 350

ATCACCGCGCAGGACCATCAGCCCACTCCAGATAGCTGCATCATCAGCATGGTTGTGGGCATCACCGCGCAGGACCATCAGCCCACTCCAGATAGCTGCATCATCAGCATGGTTGTGGGC

I TAQDHQPTPDSCI I SMVVGI TAQDHQPTPDSCI I SMVVG

20 370 390 41020,370,390,410

CAGCTTAAGGCGGATGAAGACCCCATCATGGGGTTCCACCAGATGTTCCTATTAAAGAACCAGCTTAAGGCGGATGAAGACCCCATCATGGGGTTCCACCAGATGTTCCTATTAAAGAAC

QLKADEDPIMGFHQMFL'LKNQLKADEDPIMGFHQMFL'LKN

430 450 470430 450 470

ATCAACGATGCTTGGGTTTGCACCAATGACATGTTCAGGCTCGCCCTGCACAACTTTGGCATCAACGATGCTTGGGTTTGCACCAATGACATGTTCAGGCTCGCCCTGCACAACTTTGGC

25 INDAWVCTNDMFRLALHNFG25 INDAWVCTNDMFRLALHNFG

490 510 530 TGACCTCCTCTCAGCTAGGCACTCACGCTGTTTCCTCCTCCCTCCTCTTCCCAATACTAT 550 570 590 TCCCACTCCTCCAGATGCTCCAAATATCATGCACAAATGAGCAGGGCCGCGGTGGGAGTG 610 630 650 on GGCGCAGTGCGCTGCTGCCACTGAGGTGTTGTGCATGATGTTTGGATGCTAGACTAGTTG 670 690 710 CATCTGACGGGAGAAGTTTGTGTTGTACCAGCGCATGCCTTGGAAAGACTTAAGTAATGC 730 750 770 AAAAGGTTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTACTGACAAGTTGCTCTAGTAA 790 810 830 C C CAAAGAAGTGAAGGAGAAAGCAGCTGC CT CAC CGC CCAGACATTGATTTGTTCAGATG 850 870 890TGACCTCCTCTCAGCTAGGCACTCACGCTGTTTCCTCCTCCCTCCTCTTCCCAATACTAT 490 510 530 550 570 590 610 630 650 TCCCACTCCTCCAGATGCTCCAAATATCATGCACAAATGAGCAGGGCCGCGGTGGGAGTG is GGCGCAGTGCGCTGCTGCCACTGAGGTGTTGTGCATGATGTTTGGATGCTAGACTAGTTG CATCTGACGGGAGAAGTTTGTGTTGTACCAGCGCATGCCTTGGAAAGACTTAAGTAATGC 670 690 710 730 750 770 790 810 830 AAAAGGTTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTACTGACAAGTTGCTCTAGTAA C C CAAAGAAGTGAAGGAGAAAGCAGCTGC CAC CGC CT CCAGACATTGATTTGTTCAGATG 850 870 890

35 TTTCAATGCCTCATGATACAATAAAACCACAAAAATTTTCTTAACAAAAAAAAA35 TTTCAATGCCTCATGATACAATAAAACCACAAAAATTTTCTTAACAAAAAAAAA

95146 6 antigeeneinä polyklonaalisten tai monoklonaalisten vasta-aineiden valmistuksessa. Sellaiset vasta-aineet ovat käyttökelpoiset sekä diagnostisiin tarkoituksiin että myös vasta-ainepylväiden valmistamiseen, jonka avulla PP15 voi-5 daan erottaa liuoksista, jotka sisältävät sitä muiden proteiinien rinnalla.95146 6 as antigens in the manufacture of polyclonal or monoclonal antibodies. Such antibodies are useful both for diagnostic purposes and for the preparation of antibody columns that allow PP15 to be separated from solutions containing it alongside other proteins.

cDNA:n tai sen osien avulla voidaan myös yksinkertaisella tavalla eristää geenipankista PP15:tä koodaava genominen klooni, jonka avulla ei ainoastaan ekspressoi-10 tuminen eukaryoottisissa soluissa helpotu, vaan myös muita diagnostisia lausuntoja voidaan antaa.The cDNA or portions thereof can also be used to isolate a genomic clone encoding PP15 from a gene bank in a simple manner, which not only facilitates expression in eukaryotic cells, but also allows other diagnostic statements to be made.

Keksintöä on lisäksi määritetty patenttivaatimuksissa ja esitetty edelleen seuraavissa esimerkeissä.The invention is further defined in the claims and further illustrated in the following examples.

Mikäli tekstissä ei ole selitetty, käytetään seu-15 raavia lyhenteitä.If not explained in the text, the following abbreviations are used.

EDTA = natriummetyleenidiamiinitetra-asetaatti SDS = natriumdodekyylisulfaatti DTT - ditiotreitoli BSA - naudan seerumin albumiinia 20 Esimerkki 1 RNA:n eristys ihmisen istukasta RNA saatiin kypsästä ihmisen istukasta [Chirgwin et ai. mukaan, Biochemistry 18 (1979) 5294 - 5299]. Noin 10 g . istukkakudosta murskattiin nestemäisessä typessä, suspen- • 25 doitiin 80 ml:aan 4 M guanidiiniumtiosyanaattia, jossa oli 0,1 M merkaptaanietanolia, ja käsiteltiin 90 sek. 20 000 rpm homogenisaattorissa (Ultraturrax). Lysaattia sentrifu-goitiin 15 min. 7 000 rpm (Sorvall-GSA -roottori) ja su-pernatantti saostettiin 2 ml:11a 1 M etikkahappoa ja 60 30 ml:11a abs. etanolia -20 °C:ssa yön yli. Kun nukleiinihap-po oli sedimentoitu 6 000 rpm:ssä ja -10 °C:ssa 10 min., se liuotettiin täydellisesti 40 ml:aan 7,5 M guanidiinium-hydrokloridia (pH 7,0) ja saostettiin seoksella, jossa oli 1 ίηΐ 1 M etikkahappoa ja 20 ml abs. etanolia. DNA:n erot-35 tamiseksi toistettiin seostaminen toisen kerran puolillaEDTA = sodium methylenediamine tetraacetate SDS = sodium dodecyl sulfate DTT - dithiothreitol BSA - bovine serum albumin 20 Example 1 Isolation of RNA from human placenta RNA was obtained from mature human placenta [Chirgwin et al. according to Biochemistry 18 (1979) 5294-5299]. About 10 g. the placental tissue was crushed in liquid nitrogen, suspended in 80 ml of 4 M guanidinium thiocyanate with 0.1 M mercaptan ethanol and treated for 90 sec. 20,000 rpm in a homogenizer (Ultraturrax). The lysate was centrifuged for 15 min. 7,000 rpm (Sorvall-GSA rotor) and supernatant were precipitated with 2 ml of 1 M acetic acid and 60 with 30 ml of abs. ethanol at -20 ° C overnight. After the nucleic acid was sedimented at 6,000 rpm and -10 ° C for 10 min, it was completely dissolved in 40 ml of 7.5 M guanidinium hydrochloride (pH 7.0) and precipitated with a mixture of 1 μM. 1 M acetic acid and 20 ml abs. ethanol. To separate the DNA, the doping was repeated a second time

IIII

7 95146 tilavuuksilla. RNA liuotettiin 12 ml:aan H20, saostettiin seoksella, jossa oli 1,2 ml 4 M kaliumasetaattia ja 24 ml abs. etanolia, sedimentoitiin ja liuotettiin lopuksi 10 mitään H2o (1 ml kudosgrammaa kohti).With 7 95146 volumes. RNA was dissolved in 12 mL of H 2 O, precipitated with a mixture of 1.2 mL of 4 M potassium acetate and 24 mL of abs. ethanol, was sedimented and finally dissolved in 10 H2O (1 ml per gram of tissue).

5 Esimerkki 25 Example 2

PolWAI -pitoisen istukka-mRNA: n valmistus Istukka-RNA erotettiin poly (A)-pitoisen mRNA:n valmistamiseksi oligo(dT)-selluloosakromatografiällä [Aviv ja Leder, Proc. Natl. Acad. Sei. USA 69 (1973) 1408 - 1412] 10 2 ml:n Pasteur-pipetissä LiCl:ssa. Noin 5 mg istukka-RNA:- ta erotettiin puskuri l:ssä (500 mM LiCl, 20 mM Tris, pH 7,5, 1 mM EDTA, 0,1 % SDS) pylväässä. Poly(A)+-RNA sitoutui oligo(dT)-selluloosaan, ja poly(A)'-RNA taas voitiin eluoida. Puskurilla 2 suoritetun pesuvaiheen jälkeen (100 15 mM LiCl, 20 mM Tris, pH 7,5, 1 mM EDTA, 0,1 % SDS), eluoi-tiin poly (A) +-RNA (istukka-mRNA) puskurilla 3 (5 mM Tris, pH 7,5, 1 mM EDTA, 0,05 % SDS) pylväästä.Preparation of PolWAI-Contained Placental MRNA Placental RNA was separated to prepare poly (A) -containing mRNA by oligo (dT) -cellulose chromatography [Aviv and Leder, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 69 (1973) 1408-1412] 10 in a 2 ml Pasteur pipette in LiCl. Approximately 5 mg of placental RNA was separated on a buffer 1 (500 mM LiCl, 20 mM Tris, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.1% SDS) column. Poly (A) + RNA bound to oligo (dT) cellulose, and poly (A) 'RNA could again be eluted. After a washing step with buffer 2 (100 15 mM LiCl, 20 mM Tris, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.1% SDS), poly (A) + RNA (placental mRNA) was eluted with buffer 3 (5 mM Tris, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.05% SDS) column.

Lisäpuhdistusta varten laitettiin poly(A)+-RNA puskuri l:een ja kromatografoitiin uudelleen oligo(dT)-sel-20 luloosalla.For further purification, poly (A) + RNA was placed in buffer 1 and rechromatographed with oligo (dT) -selulose.

Istukka poly(A)+-RNA:n saanto tämän toisen puhdis-tusvaiheen jälkeen oli noin 4 % RNA:n aloitusmäärästä. Esimerkki 3 i cDNA:n synteesi ihmisen istukan (istukka-cDNAI ia ’ 25 kaksiiuosteisesta cDNA:sta fdsDNA)The yield of placental poly (A) + RNA after this second purification step was about 4% of the starting amount of RNA. Example 3 Synthesis of i cDNA from human placenta (placenta cDNAI and 25 double solution cDNA fdsDNA)

Poly (A)-pitoisen istukka-mRNA: n koskemattomuus tutkittiin ennen cDNA-synteesiä 1,5 % agaroosigeeIissä.The integrity of the poly (A) -containing placental mRNA was examined before cDNA synthesis on a 1.5% agarose gel.

Sen jälkeen 4 μg istukka-mRNA:ta liuotettiin 65,5 Ml:aan H20:ta, denaturoitiin 10 min. 70 °C:ssa ja jäähdy-30 tettiin jäissä.Thereafter, 4 μg of placental mRNA was dissolved in 65.5 ml of H 2 O, denatured for 10 min. At 70 ° C and cooled on ice.

cDNA-synteesi tapahtui 100 μ1:η annoksena, kun oli lisätty 20 μΐ RT,-puskuria (250 mM Tris, pH 8,2, 42 °C:ssa, 250 mM KCl, 30 mM MgCl2), 2,5 μΐ 20 mM:sta dNTP:tä (tämä tarkoittaa kaikki neljä deoksinukleosiditrifosfaattia), 35 1 μΐ oligo(dT):tä 1 μg/ml:sta, 1 μΐ 1 M DTT:tä, 2 μΐ RNA- 8 95146 t asia (Boehringer Mannheim) ja 8 μΐ käänteistranskriptaasia (24 U/μΙ, Boehringer Mannheim) 90 min. 42 °C:ssa. Kaksi-juosteinen cDNA (dsDNA) syntetisoitiin Gublerin ja Hoff-mannin mukaan [Gene 25 (1983) 263 - 269]. Synteesi tapah-5 tui heti cDNA-synteesin jälkeen lisäämällä 305,5 μΐ H20, 80 μΐ RT2-puskuria (100 mM Tr is, pH 7,5, 25 mM MgCl2, 500 mM KC1, 50 mM DTT, 250 μg/ml BSA), 2 μΐ RNaasi H (2 U/ml), 2,5 μΐ E. coli DNA-ligaasia (5 ϋ/μΐ), 5 μΐ 15 mM B-NAD ja 5 μΐ DNA-polymeraasi I (5 ϋ/μΐ) ja inkuboimalla 5 h 15 10 °C:ssa. Reaktio lopetettiin kuumainaktivoinnilla (70 eC, 30 min.).cDNA synthesis was performed at a dose of 100 μl with the addition of 20 μΐ RT, buffer (250 mM Tris, pH 8.2, at 42 ° C, 250 mM KCl, 30 mM MgCl 2), 2.5 μΐ 20 mM dNTP (this means all four deoxynucleoside triphosphates), 35 1 μΐ oligo (dT) per 1 μg / ml, 1 μΐ 1 M DTT, 2 μΐ RNA- 8 95146 t case (Boehringer Mannheim) and 8 μΐ reverse transcriptase (24 U / μΙ, Boehringer Mannheim) 90 min. At 42 ° C. Double-stranded cDNA (dsDNA) was synthesized according to Gubler and Hoffmann [Gene 25 (1983) 263-269]. The synthesis took place immediately after cDNA synthesis by adding 305.5 μΐ H 2 O, 80 μΐ RT2 buffer (100 mM Tr is, pH 7.5, 25 mM MgCl 2, 500 mM KCl, 50 mM DTT, 250 μg / ml BSA ), 2 μΐ RNase H (2 U / ml), 2.5 μΐ E. coli DNA ligase (5 ϋ / μΐ), 5 μΐ 15 mM B-NAD and 5 μΐ DNA polymerase I (5 ϋ / μΐ) and incubating for 5 h at 10 ° C. The reaction was quenched by heat inactivation (70 eC, 30 min).

Reaktioseosta inkuboitiin vielä 30 min. 37 °C:ssa sen jälkeen, kun oli lisätty 55 μΐ 250 μM:sta dNTP, 55 μΐ 10 mM Tris (pH 7,5), 10 mM MgCl2, 10 μg/ml BSA, 3 μΐ T4 15 DNA-polymeraasi I (l ϋ/μΐ), 2 μΐ RNaasi H (2 ϋ/μΐ) ja 2 μΐ RNaasi A (2 μg/ml), jotta taattaisiin synteesin täydellisyys toiseen DNA-juosteeseen ("Repair Reaction").The reaction mixture was incubated for another 30 min. At 37 ° C after addition of 55 μΐ of 250 μM dNTP, 55 μΐ of 10 mM Tris (pH 7.5), 10 mM MgCl 2, 10 μg / ml BSA, 3 μΐ of T4 DNA polymerase I ( l ϋ / μΐ), 2 μΐ RNase H (2 ϋ / μΐ) and 2 μΐ RNase A (2 μg / ml) to ensure the completeness of the synthesis for the second strand of DNA ("Repair Reaction").

Esimerkki 4Example 4

EcoRI-linkkereiden liaaatio dsDNA:hän ia linkkerei-20 den avaaminenLigation of EcoRI linkers with dsDNA and opening of linkers

Istukka-cDNA-pankin perustamiseksi varustettiin dsDNA EcoRI-päillä, jotta ne voitaisiin ligatoida faagi-vektori λ gtl0:n EcoRI-leikkauskohtiin [T. Maniatis et ai. (1982), Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold 25 Spring Harbor]. Tämän lisäksi dsDNATo establish a placental cDNA library, dsDNAs were provided with EcoRI ends to be ligated to the EcoRI cleavage sites of the phage vector λ gt10 [T. Maniatis et al. (1982), Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold 25 Spring Harbor]. In addition to this, dsDNA

a) käsiteltiin EcoRI-metylaasilla, dsDNA:n sisäisten EcoRI-leikkauskohtien suojaamiseksi, b) varustettiin EcoRI-linkkerillä, jotka c) sen jälkeen leikattiin EcoRI:11a.a) treated with EcoRI methylase to protect the internal EcoRI cleavage sites of the dsDNA, b) provided with an EcoRI linker, which c) were then cleaved with EcoRI.

30 a) : dsDNA:n metylaasireaktio tapahtui suoraan "Repair Reactionin" yhteydessä, kun oli lisätty 25 μΐ 500 mM EDTA (pH 8,0), 60 μΐ metylaasipuskuria (100 mM NaOAc, pH 5,2, 2 mg S-adenosyyli-L-metioniini) ja 2 μΐ EcoRI-metylaasia 35 (20 U/μΙ) inkuboimalla 37 °C:ssa 30 min.30 a): The methylase reaction of dsDNA occurred directly in the "Repair Reaction" with the addition of 25 μΐ 500 mM EDTA (pH 8.0), 60 μΐ methylase buffer (100 mM NaOAc, pH 5.2, 2 mg S-adenosyl). L-methionine) and 2 μΐ EcoRI methylase 35 (20 U / μΙ) by incubation at 37 ° C for 30 min.

il 9 95146 4il 9 95146 4

Reaktioseos uutettiin fenolilla ja dsDNA seostettiin 60 Ml:lla 4 M NaOAc ja 1300 μΐ etanolia. dsDNA pestiin kaksi kertaa 70 %:lla etanolilla, ravistettiin yhden kerran eetterin kanssa ja kuivattiin.The reaction mixture was extracted with phenol and the dsDNA was mixed with 60 Ml of 4 M NaOAc and 1300 μΐ ethanol. The dsDNA was washed twice with 70% ethanol, shaken once with ether and dried.

5 b) :5 b):

EcoRI-metyloitu dsDNA liuotettiin 88 μΐ:aan H20 ja kun oli lisätty 10 μΐ ligaasipuskuria (500 mM Tris, pH 7,4, 100 mM MgCl2, 100 mM DTT, 10 mM spermidiini, 10 mMEcoRI-methylated dsDNA was dissolved in 88 μΐ H 2 O and after the addition of 10 μΐ ligase buffer (500 mM Tris, pH 7.4, 100 mM MgCl 2, 100 mM DTT, 10 mM spermidine, 10 mM

ATP, 1 mg/ml BSA), 1 μΐ T4 DNA-ligaasia (10 U/μΙ) 1 μ1:η 10 kanssa EcoRI-linkkeriä (0,5 μg/μl, pGGAATTCC tai pAGAATTCT) ligatoitiin yön yli 15 eC:ssa.ATP, 1 mg / ml BSA), 1 μΐ T4 DNA ligase (10 U / μΙ) with 1 μl η 10 of EcoRI linker (0.5 μg / μl, pGGAATTCC or pAGAATTCT) was ligated overnight at 15 eC.

c) :c):

Ligaatioseoksen tilavuus tehtiin 120 μΐ^εί 6 μ1:11β H20, 12 μ1:1ΐ3 10 x EcoRI-puskuria ja 2 μ1:1ΐΆ 15 EcoRIa (120 U/μΙ). EcoRI-pilkkominen tapahtui 2 h 37 °C:ssa.The volume of the ligation mixture was made of 120 μΐ ^ εί 6 μ1: 11β H 2 O, 12 μ1: 1ΐ3 10 x EcoRI buffer and 2 μ1: 1ΐΆ 15 EcoRI (120 U / μΙ). EcoRI digestion occurred for 2 h at 37 ° C.

Esimerkki 5Example 5

Ei-sitoutuneen linkkerin erotus kaliumasetaatti- aradientilla ia dsDNA;n koon selektio 20 Kaiken ei-sitoutuneen EcoRI-linkkerin erottamiseksi dsDNA:sta EcoRI-reaktioseos laitettiin kokonaisuudessaan kaliumasetaattigradienttiin (5 - 20 % KOAc, 1 mM EDTA, 1 μΐ/ml etidiumbromidi) ja sentrifugoitiin 3 h 50 000 rpm ja 20 °C:ssa (Beckman SW 65 -roottori).Separation of unbound linker by potassium acetate gradient and size selection of dsDNA To separate all unbound EcoRI linker from dsDNA, the entire EcoRI reaction mixture was placed in a potassium acetate gradient (5-20% KOAc, 1 mM EDTA, 1 μ mM / ml ethidium). centrifuged for 3 h at 50,000 rpm and 20 ° C (Beckman SW 65 rotor).

:* 25 Gradientti fraktioitiin alhaalta niin, että ensim mäiset viisi fraktiota olivat 500 μΐ ja kaikki loput 100 μΐ. Fraktiot saostettiin 0,01 tilavuudella akryyliamidia (2 mg/ml) ja 2,5 tilavuudella etanolia, pestiin yhden kerran 70 %:lla etanolilla, kuivattiin ja liuotettiin 5 μΐ:-30 aan H20:ta.: * 25 The gradient was fractionated from below so that the first five fractions were 500 μΐ and all the remaining 100 μΐ. Fractions were precipitated with 0.01 volume of acrylamide (2 mg / ml) and 2.5 volumes of ethanol, washed once with 70% ethanol, dried and dissolved in 5 μΐ -30 H 2 O.

• dsDNA:n koon määritystä varten analysoitiin 1 μΐ jokaista fraktiota l,5-%:isessa agaroosigeelissä. Lisäksi määritettiin dsDNA:n määrä 1 μl:sta jokaisesta fraktiosta.• To determine the size of dsDNA, 1 μΐ of each fraction was analyzed on a 1.5% agarose gel. In addition, the amount of dsDNA from 1 μl of each fraction was determined.

ίο 95146ίο 95146

Fraktiot, joiden dsDNA oli 500 emäsparia, yhdistettiin ja näyte konsentroitiin siten, että loppukonsentraa-tio oli 27 pg/ml.Fractions with a dsDNA of 500 bp were pooled and the sample was concentrated to a final concentration of 27 pg / ml.

Esimerkki 6 5 dsDNA:n siirtäminen faaaivektoriin λ atlO 1a "in vitro pakkaus" -reaktio dsDNA:n siirtämisen faagivektorin λ gtlO EcoRI-leikkauskohtaan (Vector Cloning Systems, San Diego, CA) tapahtui 4 μ1:η ligaatioseoksessa: 2 μΐ dsDNA, 1 μΐ gtlO x 10 EcoRI (1 pg/ml), 0,4 μΐ ligaasipuskuria, 0,5 μΐ H20, 0,1 μΐ T4 DNA-ligaasia. Seosta inkuboitiin 4 h 15 °C:ssa.Example 6 Transfer of dsDNA to phage vector λ atlO 1a "in vitro packaging" reaction Transfer of dsDNA to the EcoRI junction of the phage vector λ gtlO (Vector Cloning Systems, San Diego, CA) occurred in a 4 μl: η ligation mixture: 2 μΐ dsDNA, 1 μΐ gt10 x 10 EcoRI (1 pg / ml), 0.4 μΐ ligase buffer, 0.5 μΐ H 2 O, 0.1 μΐ T4 DNA ligase. The mixture was incubated for 4 h at 15 ° C.

Istukka-cDNA-pankin perustaminen faagivektoriin λ gtlO tapahtui ligaasiseoksen "in vitro pakkaus" -reaktiolla E. coli NS 428 ja NS 433 λ-lysogeenisen solu-uut-15 teen kanssa 2 h huoneen lämpötilassa (Vector Cloning Systems, San Diego, CA; Enquist ja Sternberg, Methods in En-zymology 68, (1979), 281 - 298). Reaktio pysäytettiin 500 pl:lla suspensioalustaa (SM: 0,1 M NaCl, 8 mM MgS04, 50 mM Tris, pH 7,5, 0,1 % gelatiini) ja 2 pisaralla kloroformia.The establishment of a placental cDNA library in the phage vector λ gt10 was accomplished by in vitro packaging of the ligase mixture with E. coli NS 428 and NS 433 λ-lysogenic cell extract at 15 h at room temperature (Vector Cloning Systems, San Diego, CA; Enquist and Sternberg, Methods in Enzymology 68, (1979), 281-298). The reaction was quenched with 500 of suspension medium (SM: 0.1 M NaCl, 8 mM MgSO 4, 50 mM Tris, pH 7.5, 0.1% gelatin) and 2 drops of chloroform.

20 Esimerkki 720 Example 7

Istukka-cDNA-pankin tiitterin määritys ia analysointiDetermination and analysis of placental cDNA library titer

Istukka-cDNA-pankin pesäkkeitä muodostavien yksiköiden (PFU) lukumäärä määritettiin E. coli K 12 -kannan ' 25 C600 HFL kompetenttien solujen avulla: arvo oli 1 x 106 PFU:ta.The number of colony-forming units (PFUs) in the placental cDNA library was determined using E. coli K 12 strain '25 C600 HFL competent cells: a value of 1 x 106 PFU.

Esimerkki 8Example 8

Ollaonukleotidikoettimet istukka-cDNA-pankin seulontaa varten 30 Oligonukleotidikoettimet (PP15-oligonukleotidi 103 : ja -140) ja oligonukleotidipooli (PP15-oligonukleotidipoo- li 139) syntetisoitiin istukka-cDNA-pankin analyysiä varten. Niiden sekvenssit johdettiin PP15:n kolmen bromisyaa-nifragmentin aminohapposekvenssistä.Oligonucleotide Probes for Placental CDNA Bank Screening Oligonucleotide probes (PP15 oligonucleotide 103: and -140) and an oligonucleotide pool (PP15 oligonucleotide pool 139) were synthesized for analysis of a placental cDNA library. Their sequences were derived from the amino acid sequence of the three bromocyanine fragments of PP15.

li il 95146li il 95146

Koettimien rakentaminen ja käyttö seurasi olennaisesti R. Lathen, edellä sääntöjä.The construction and use of probes essentially followed R. Lathen, above the rules.

Oligonukleotidisekvenssit leimattiin T4-polynukleo-tidikinaasilla (γ-32Ρ)ΑΤΡ:η läsnä ollessa 5'päähän (käy-5 tettiin 60 μ0ΐ/40 μ1:η reaktioseosta). Koettimilla oli spesifinen aktiivisuus 1 x 10* Bq/μΐ tai 1,5 x 106 Bq/pmol.Oligonucleotide sequences were labeled with T4 polynucleotide kinase (γ-32Ρ) in the presence of ΑΤΡ: η at the 5 'end (60 μ0ΐ / 40 μ1: η reaction mixture was used). The probes had a specific activity of 1 x 10 * Bq / μΐ or 1.5 x 106 Bq / pmol.

Esimerkki 9Example 9

Istukka-cDNA:n seulonta spesifisellä oliaonukleoti- aillä 10 1 x 106 PFU:ta istukka-cDNA-pankkia tutkittiin yhdessä oligonukleotidikoettimien 103, 140 ja 139 kanssa.Screening for placental cDNA with specific oligonucleotides 10 l of 106 PFU of placental cDNA libraries were examined in conjunction with oligonucleotide probes 103, 140 and 139.

Tätä varten maljättiin 3 x 104 PFU:ta E. coli K 12 -kanta C 600 HFL:n kanssa pehmytagariin 13,5 cm:n petrimaljoille ja inkuboitiin 6 h 37 °C:ssa. Tähän ajankohtaan mennessä 15 ei vielä esiintynyt konfluenttia lyysiä. Maljoja inkuboitiin yön yli jääkaapissa ja faagit siirrettiin nitrosellu-loosasuodattimille (Schleicher & Schiill, BA 85, Ref.-Nr.To this end, 3 x 10 4 PFU of E. coli K 12 strain C 600 HFL were plated on soft agar in 13.5 cm petri dishes and incubated for 6 h at 37 ° C. By this time, 15 had no confluent lysis. The plates were incubated overnight in a refrigerator and the phages were transferred to nitrocellulose filters (Schleicher & Schiill, BA 85, Ref.-No.

401 124) (kaksoiskappaleet). Nitroselluloosasuodatin ja petrimaljat merkittiin injektiokanyylillä, jotta mahdol-20 listettaisiin positiivisten plakkien myöhempi rinnastaminen. Petrimaljat varastoitiin nitroselluloosasuodattimen prosessoinnin aikana kylmähuoneeseen. Nitroselluloosasuo-dattimilla oleva DNA denaturoitiin laittamalla suodatin 5 minuutiksi 1,5 M NaCl:lla, 0,5 M NaOHilla kastetun suoda- « • 25 tinpaperin (Whatman-M3) päälle. Seuraavaksi suodattimet renaturoitiin samalla lailla 1,5 M NaCl:lla, 0,5 M Tris:-llä, pH 8,0, ja pestiin 2 x SSPErllä (0,36 M NaCl, 16 mM NaOH, 20 mM NaH2P04, 2mM EDTA). Suodattimet kuivattiin sitten 2 h 80 °C:ssa tyhjiössä. Suodattimia pestiin 4 h 65 30 °C:ssa 3 X SSC:ssä, 0,1 % SDS:ssä (20 X SSC - 3 M NaCl, 0,3 M Na-sitraatti) ja esihybridisoitiin 4 h 65 °C:ssa [esihybridisaatioliuos: 0,6 M NaCl, 0,06 M Tris, pH 8,3, 6 mM EDTA, 0,2 % ei-ioninen synteettinen sakkaroosipoly-meeri ( Ficoll) , 0,2 % polyvinyylipyrrolidoni 40, 0,2 % 35 BSA, 0,1 % SDS, 50 μg/ml denaturoitu sillin sperma -DNA].401 124) (duplicates). The nitrocellulose filter and petri dishes were labeled with an injection cannula to allow subsequent alignment of positive plaques. Petri dishes were stored in a cold room during nitrocellulose filter processing. DNA on nitrocellulose filters was denatured by placing the filter on filter paper (Whatman-M3) dipped in 1.5 M NaCl, 0.5 M NaOH for 5 minutes. The filters were then similarly renatured with 1.5 M NaCl, 0.5 M Tris, pH 8.0, and washed with 2x SSPE (0.36 M NaCl, 16 mM NaOH, 20 mM NaH 2 PO 4, 2 mM EDTA). . The filters were then dried at 80 ° C under vacuum for 2 h. The filters were washed for 4 h at 65 ° C in 3 X SSC, 0.1% SDS (20 X SSC - 3 M NaCl, 0.3 M Na citrate) and prehybridized for 4 h at 65 ° C [ prehybridization solution: 0.6 M NaCl, 0.06 M Tris, pH 8.3, 6 mM EDTA, 0.2% non-ionic synthetic sucrose polymer (Ficoll), 0.2% polyvinylpyrrolidone 40, 0.2% 35 BSA, 0.1% SDS, 50 μg / ml denatured herring semen DNA].

12 9514612 95146

Suodattimia inkuboitiin yön yli dekantterilaseissa tai kiinnipoltetuissa polyetyleenifoolioissa kevyesti ravistellen hybridisaatioliuoksessa, johon oli lisätty 100 000 - 200 000 Bq leimattua oligonukleotidiä/ml hybridisaatio-5 liuosta (kuin esihybridisaatioliuos, kuitenkin ilman sillin sperman DNA:ta). Hybridisaatiolämpötila oli 46 °C oli-gonukleotidikoettimelle 139 ja 52 °C muille koettimille. Nitroselluloosasuodattimet pestiin 6 x SCCtssä, 0,05 M natriumpyrofosfaatissa tunnin ajan huoneen lämpötilassa ja 10 lisätunti kulloisessakin hybridisaatiolämpötilassa. Suodattimet kuivattiin ja autoradiografoitiin yön yli. Rönt-genfilmillä olevat signaalit, jotka esiintyivät molemmissa kaksoiskappaleissa, paikallistettiin petrimaljoilla ja alue (n. 50 plakkia) levitettiin läpi pasteur-pipetin le-15 veällä päällä ja faagit suspendoitiin uudelleen l ml:aan SM-puskuria. Positiivisia faageja eriteltiin toisistaan kolmen kierroksen avulla, kunnes oli vain yksi ainoa positiivinen klooni.Filters were incubated overnight in beakers or fired polyethylene foils with gentle shaking in hybridization solution supplemented with 100,000 to 200,000 Bq of labeled oligonucleotide / ml of hybridization-5 solution (like prehybridization solution, but without herring sperm DNA). The hybridization temperature was 46 ° C for the oligonucleotide probe 139 and 52 ° C for the other probes. The nitrocellulose filters were washed 6 x SCC, 0.05 M sodium pyrophosphate for one hour at room temperature and an additional 10 hours at each hybridization temperature. The filters were dried and autoradiographed overnight. The signals on the X-ray film that appeared in both duplicates were localized in petri dishes and the area (ca. 50 plaques) was spread through a Pasteur pipette with water on top and the phages resuspended in 1 ml SM buffer. Positive phages were separated by three rounds until there was only one positive clone.

1 x 106 PFU:ta istukka-cDNA-pankkia tutkittiin kolme 20 kertaa. Vasta kolmannella etsimisellä identifioitiin 2 signaalia kaksoiskappalesuodattimella. Molemmissa klooneissa PP15-24 ja PP15-28 oli PP15:n koko cDNA.1 x 106 PFU placental cDNA libraries were examined three to 20 times. Only the third search identified 2 signals with a duplicate filter. Both clones PP15-24 and PP15-28 had the entire cDNA for PP15.

Oligonukleotidisekvenssien 103, 139 ja 140 vertailu ilmoitetun PP15-sekvenssin kanssa on koottu taulukkoon 2.A comparison of oligonucleotide sequences 103, 139 and 140 with the reported PP15 sequence is summarized in Table 2.

· » - · 11 13 95146 TAULUKKO 2 PP15-sekvenssi versus PP15-oligonukleotidi 103 5 301 ATCACCGCGCAGGACCATCAGCCCACTCCAGATAGCTGCATCATCAGCAT 350 1 ................................................AT 2 • · · · · 351 GGTTGTGGGCCAGCTTAAGGCGGATGAAGACCCCATCATGGGGTTCCACC ^00 3 GGTGGTGGGCCAGCTGAAGGCTGATGAGGACCCC................ 36 10 PP15-sekvenssi versus PP15-oligonukleotidi 139 • ♦ · · « 401 AGATGTTCCTATTAAAGAACATCAACGATGCTTGGGTTTGCACCAATGAC 450 15 1 ..............AAGAACATCAACGATGCCTGGAC............. 23 PP15-sekvenssi versus PP15-oligonukleotidi 140 • · · · ♦ 151 TACTACCAGTTATTTGATAATGATAGAACCCAACTAGGCGCAATTTACAT 200 20 1 ............TTTGACAATGACCGGACCCAGCTGGGCGCCATCTACAT 38 • · · · · 201 TGACGCGTCATGCCTTACGTOGGAAGGACAACAGTTCCAGGGGAAAGCTG 250 39 TGATGC............................................ 44 : 25 Esimerkki 10 DNA-sekvenssianalwsi· »- · 11 13 95146 TABLE 2 PP15 Sequence versus PP15 Oligonucleotide 103 5 301 ATCACCGCGCAGGACCATCAGCCCACTCCAGATAGCTGCATCATCAGCAT 350 1 ............................ .................... AT 2 • · · · · 351 GGTTGTGGGCCAGCTTAAGGCGGATGAAGACCCCATCATGGGGTTCCACC ^ 00 3 GGTGGTGGGCCAGCTGAAGGCTGATGAGGACCCC ................ 36 10 PP15 Sequence versus PP15 Oligonucleotide 139 • ♦ · · «401 AGATGTTCCTATTAAAGAACATCAACGATGCTTGGGTTTGCACCAATGAC 450 15 1 .............. AAGAACATCAACGATGCCTGGAC ............. 23 PP15- sequence versus PP15 oligonucleotide 140 • · · · ♦ 151 TACTACCAGTTATTTGATAATGATAGAACCCAACTAGGCGCAATTTACAT 200 20 1 ............ TTTGACAATGACCGGACCCAGCTGGGCGCCATCTACAT 38 • · · · · 201G TGACGCGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG .................................. 44: 25 Example 10 DNA sequence analysis

Faagiklooneja PP15-24 ja PP15-18 monistettiin ja niiden DNA uutettiin kummassakin tapauksessa. Vastaava EcoRI-fragmentti eristettiin ja ligatoitiin Bluescript M13 30 -vektorin (Stratagene, San Diego, CA, USA) EcoRI-kohtaan entsymaattisen dideoksimenetelmän avulla Sangerin mukaan restriktioanalyysiä ja sekvenssianalyysiä varten. Sekvenssi osoittaa avoimen lukukehyksen, ja koodaa proteiinia, jolla on enintään 127 aminohappoa. PP15:llä on laskettu 14 95146 molekyylipaino 14 478 d (metioniini mukaanlukien), mikä on yhtäpitävä alussa mainitun patenttijulkaisun DE-A 2 952 729 arvon kanssa.Phage clones PP15-24 and PP15-18 were amplified and their DNA extracted in each case. The corresponding EcoRI fragment was isolated and ligated into the EcoRI site of the Bluescript M13 30 vector (Stratagene, San Diego, CA, USA) by the enzymatic dideoxy method according to Sanger for restriction analysis and sequence analysis. The sequence indicates an open reading frame, and encodes a protein of up to 127 amino acids. PP15 has a calculated molecular weight of 14,475,146 (including methionine), which is in line with the value of DE-A 2,952,729 mentioned at the beginning.

Esimerkki 11 5 Hylkimistä vastustavan proteiinin PP15 ekspressoi- tuminenExample 11 Expression of anti-rejection protein PP15

Vektoria pTrc99A [E. Amann et ai. (1988) Gene 69, 301 - 315] käytettiin ei-yhteenliittyneen, kypsän PP15 proteiinin ekspressoitumiseen E. colissa. PP15-cDNA:n DNA-10 sekvenssi aloituskodonin kohdalla on:Vector pTrc99A [E. Amann et al. (1988) Gene 69, 301-315] was used to express non-fused, mature PP15 protein in E. coli. The DNA-10 sequence of the PP15 cDNA at the start codon is:

Met Gly Asp 5' ... CGCTCCAGA ATG GGA GAC ...3' 15 Koska ATG:ssä ei ole Ncol-kohtaa, DNA:ta ei voida kloonata suoraan pTrc99A-ekspressoitumisvektoriin. Ncol-kohta saadaan kuitenkin kahden emäksenvaihdon avulla PP15-sekvens-sissä: 5' GAATGG 3' mutageneesin kautta 5' CCATGG 3'. Toinen aminohappo (Gly) ei vahingoitu tämän muutoksen aikana, 20 koska PP15:n rakennesekvenssin toinen kodoni alkaa G:llä. Mutageneesiä varten eristettiin PP15-cDNA:n PP15-28-kloo-nin 902 emäsparia suuri EcoRI-fragmentti ja ligatoitiin samalla lailla EcoRI:11a pilkottuun ja defosforyloituun mutageneesivektoriin pMa5-8 (kuvio). Saadulle plasmidille • · :: 25 pMa5-8-PP15 (jolla oli oikea PP15 EcoRI-insertin suuntaMet Gly Asp 5 '... CGCTCCAGA ATG GGA GAC ... 3' 15 Because there is no NcoI site in ATG, DNA cannot be cloned directly into the pTrc99A expression vector. However, the NcoI site is obtained by two base exchanges in the PP15 sequence: 5 'GAATGG 3' through mutagenesis 5 'CCATGG 3'. The second amino acid (Gly) was not damaged during this change, because the second codon of the structural sequence of PP15 begins with G. For mutagenesis, a 902 bp EcoRI fragment of clone PP15-28 of the PP15 cDNA was isolated and similarly ligated into the EcoRI digested and dephosphorylated mutagenesis vector pMa5-8 (Figure). For the resulting plasmid • · :: 25 pMa5-8-PP15 (with the correct orientation of the PP15 EcoRI insert

Fl-aloituskohtaan nähden) tehtiin sitten "gapped duplex"-mutageneesi [Kramer et ai. (1984) Nucl. Acids. Res. 12, 9441 - 9456], jolloin käytettiin seuraavaa oligodeoksinuk-leotidiä: 30 : 1 5' GGCTTGTCTCCCATGGTGGAGCGTCAC 3'Relative to the F1 start site) was then subjected to gapped duplex mutagenesis [Kramer et al. (1984) Nucl. Acids. Res. 12, 9441-9456] using the following oligodeoxynucleotide: 30: 1 5 'GGCTTGTCTCCCATGGTGGAGCGTCAC 3'

Klooni, joka sisälsi toivotun mutaation, identifioitiin restriktioanalyysillä ja merkittiin pMc5-8-NcoI.A clone containing the desired mutation was identified by restriction analysis and labeled pMc5-8-NcoI.

35 Tältä plasmidilta eristettiin 798 emäsparia suuri Ncol-35 A 798 bp large NcoI was isolated from this plasmid.

IIII

is 95146 4is 95146 4

EcoRI -fragmentti ja ligatoitiin vastaavasti pilkottuun pTrc99A-vektoriin. Saatu plasmidi pTrc99A-PP15 käsittää 4918 emäsparia ja ekspressoi ei-yhteenliittynyttä, n. 15 kD suurta PP15 proteiinia trc-promoottorin induktion jäl-5 keen.EcoRI fragment and ligated into the digested pTrc99A vector, respectively. The resulting plasmid pTrc99A-PP15 comprises 4918 base pairs and expresses a non-fused, approximately 15 kD large PP15 protein after induction of the trc promoter.

Claims (1)

16 95146 Patenttivaatimus Menetelmä hylkimistä vastustavan proteiinin PP15 tai sen immunogeenisen osan valmistamiseksi, t u n -5 n e t t u siitä, että taulukon 1 mukaista PP15:tä koodaa-va cDNA viedään prokaryoottiseen ekspressiosysteemiin ja saatetaan siellä tavanomaisiin menetelmiin ekspressoitu-maan. 10 Förfarande för framställning av det immunsuppressi-va proteinet PP15 eller en immunogen del av detta, 15 kännetecknat därav, att cDNA som kodar för PP15 enligt tabell 1 införs i ett prokaryotiskt expres-sionssystem och bringas där medelst konventionella metoder till expression. « II 95146 Xbal—I Hindlll—ι Pst I—I Sail—ι BamHI-i .... Smaln ^-3803 3500 Xmir Λ(- 3000~-#;:ί / Λ W -ί':; 1 Pmac 5-8 r -™ 3803 \ —1000 2500 ^|^>^____^ // 1500 2000 Plasmidin pMAC5-8 (= pMA5-8 ja pMC5-8) kartta Fl-ORI: Faagi fl:n replikaation aloituskohta, ORI: ColEl-Typ:n replikaation aloituskohta, CAT: Klooriamfenikoliasetyylitransferaasia koodaava alue AMP: β-laktamaasia koodava alue pMA5-8:lla on amber-mutaatio CAT:ssa (A asemassa 3409) ja pMCT-8:llä amber-mutaatio AMP:ssä (C asemassa 2238).16 95146 Patenttivaatimus Menetelmä hylkimistä vastustavan proteini PP15 tai sen immunogenes osan valmistamiseksi, t u n -5 n e t u siitä, et taulukon 1 mukaista PP15: tä koodaa-va cDNA, if it is not expressed in the prokaryotic system. Process for the preparation of the immunosuppressive protein PP15 or an immunogenic portion thereof, characterized in that cDNA encoding PP15 of Table 1 is inserted into a prokaryotic expression system and expressed there by conventional methods. «II 95146 Xbal — I Hindlll — ι Pst I — I Sail — ι BamHI-i .... Smaln ^ -3803 3500 Xmir Λ (- 3000 ~ - #;: ί / Λ W -ί ':; 1 Pmac 5 -8 r - ™ 3803 \ —1000 2500 ^ | ^> ^ ____ ^ // 1500 2000 Plasmidine pMAC5-8 (= pMA5-8 yes pMC5-8) mapped Fl-ORI: Faagi fl: n replication aloitus cohta, ORI: ColEl -Type: n Replication aloituskohta, CAT: Chloramphenicoliasetyylitransferaasia koodaava alue AMP: β-lactamaasia koodava alue pMA5-8: lla on amber mutatio CAT: ssa (A ash mass 3409) and pMCT-8: llä amber-mutaatio AMP breathing mass 2238).
FI891249A 1988-03-18 1989-03-16 A process for producing the immunosuppressive protein PP15 or an immunogenic portion thereof FI95146C (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE3809119 1988-03-18
DE3809119A DE3809119A1 (en) 1988-03-18 1988-03-18 GENETICALLY PRODUCED PROTEIN PP 15

Publications (4)

Publication Number Publication Date
FI891249A0 FI891249A0 (en) 1989-03-16
FI891249A FI891249A (en) 1989-09-19
FI95146B true FI95146B (en) 1995-09-15
FI95146C FI95146C (en) 1995-12-27

Family

ID=6350091

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI891249A FI95146C (en) 1988-03-18 1989-03-16 A process for producing the immunosuppressive protein PP15 or an immunogenic portion thereof

Country Status (11)

Country Link
EP (1) EP0333134B1 (en)
JP (2) JPH029370A (en)
KR (1) KR890014739A (en)
AT (1) ATE141104T1 (en)
AU (1) AU616248B2 (en)
DE (2) DE3809119A1 (en)
DK (1) DK131989A (en)
ES (1) ES2090019T3 (en)
FI (1) FI95146C (en)
GR (1) GR3020755T3 (en)
PT (1) PT90031B (en)

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE2952792A1 (en) * 1979-12-31 1981-07-02 Behringwerke Ag, 3550 Marburg NEW PROTEIN (PP (DOWN ARROW) 15 (DOWN ARROW)) WITH IMMUNE SUPPRESSIVE EFFECT

Also Published As

Publication number Publication date
JPH029370A (en) 1990-01-12
DK131989A (en) 1989-09-19
ES2090019T3 (en) 1996-10-16
AU3143189A (en) 1989-09-21
PT90031B (en) 1994-05-31
ATE141104T1 (en) 1996-08-15
DK131989D0 (en) 1989-03-17
DE3809119A1 (en) 1989-10-05
PT90031A (en) 1989-11-10
FI95146C (en) 1995-12-27
GR3020755T3 (en) 1996-11-30
EP0333134A3 (en) 1990-06-06
EP0333134B1 (en) 1996-08-07
FI891249A0 (en) 1989-03-16
AU616248B2 (en) 1991-10-24
JPH09131188A (en) 1997-05-20
FI891249A (en) 1989-09-19
EP0333134A2 (en) 1989-09-20
KR890014739A (en) 1989-10-25
DE58909708D1 (en) 1996-09-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Kalfayan et al. α-Tubulin genes of Drosophila
Reilly et al. cDNA cloning and immunolocalization of a Na (+)-H+ exchanger in LLC-PK1 renal epithelial cells
EP0205579A1 (en) Methods and compositions useful in the diagnosis and treatment of autoimmune diseases.
Than et al. Cloning and sequence analysis of cDNAs encoding human placental tissue protein 17 (PP17) variants
EP0580672B1 (en) SYNTHETIC CDw52(CAMPATH-1) PEPTIDE ANTIGEN
JPH01165386A (en) Preparation of coagulation-resistant protein pp4 by genetic engineering
US5840832A (en) Transcription factor regulating MHC expression, CDNA and genomic clones encoding same and retroviral expression constructs thereof
FI95146B (en) A method for producing the anti-rejection protein PP15 or an immunogenic portion thereof
DK172677B1 (en) Monoclonal Antibodies to an Interferon Induced Protein, Method of Preparation, Hybridoma Cell Lines
JP2002543761A (en) Tuberculosis antigens and methods of use therefor
Roebber et al. 739 Isolation and characterization of allergen Amb a VII from short ragweed pollen
KR960001820B1 (en) Method for producing minactivin
US7217692B2 (en) Complex of a human FOXC2 protein and a FOXC2-interacting protein
US5830684A (en) Native type II GAP, methods for purifying various GAPs and uses of GAPs to diagnose cancer
US5202419A (en) Anticoagulative protein pp4-x
WO1994029448A1 (en) Dna and protein coded for thereby
US5317094A (en) Protein PP 15 preprared by genetic manipulation
EP0506377B1 (en) Calmodulin binding protein
US5320950A (en) DNA encoding anticoagulative protein PP4-X, and its preparation and use
US6368790B1 (en) cDNA encoding P2P proteins and use of P2P cDNA derived antibodies and antisense reagents in determining the proliferative potential of normal, abnormal, and cancer cells in animals and humans
WO2004052927A1 (en) A baldness related gene and the polypeptide encoded thereby, and uses thereof
JP2001500019A (en) Granulocyte chemoattractant protein 2 mutant
CA2006535A1 (en) Cdna coding for placenta protein 11 (pp11), the isolation and use thereof
Bass et al. 740 Isolation and translation of messenger RNA from white oak pollen and inflorescences
Ghosh et al. 737 c-DNA cloning of Amb V allergens from ragweed pollens

Legal Events

Date Code Title Description
BB Publication of examined application
MM Patent lapsed
MM Patent lapsed

Owner name: BEHRINGWERKE AKTIENGESELLSCHAFT