FI118010B - Actinomaduras xylanassekvenser och förfaranden för dess användning - Google Patents

Actinomaduras xylanassekvenser och förfaranden för dess användning Download PDF

Info

Publication number
FI118010B
FI118010B FI953639A FI953639A FI118010B FI 118010 B FI118010 B FI 118010B FI 953639 A FI953639 A FI 953639A FI 953639 A FI953639 A FI 953639A FI 118010 B FI118010 B FI 118010B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
gly
ala
asn
thr
ser
Prior art date
Application number
FI953639A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI953639A0 (sv
FI953639A (sv
Inventor
Raija Lantto
Jari Vehmaanperae
Arja Aino Maentylae
Richard Fagerstroem
Marja Paloheimo
Tarja Lahtinen
Paula Kristo
Pirkko Suominen
Original Assignee
Ab Enzymes Gmbh
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ab Enzymes Gmbh filed Critical Ab Enzymes Gmbh
Publication of FI953639A0 publication Critical patent/FI953639A0/sv
Publication of FI953639A publication Critical patent/FI953639A/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI118010B publication Critical patent/FI118010B/sv

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01008—Endo-1,4-beta-xylanase (3.2.1.8)
    • D—TEXTILES; PAPER
    • D21—PAPER-MAKING; PRODUCTION OF CELLULOSE
    • D21C—PRODUCTION OF CELLULOSE BY REMOVING NON-CELLULOSE SUBSTANCES FROM CELLULOSE-CONTAINING MATERIALS; REGENERATION OF PULPING LIQUORS; APPARATUS THEREFOR
    • D21C5/00—Other processes for obtaining cellulose, e.g. cooking cotton linters ; Processes characterised by the choice of cellulose-containing starting materials
    • D21C5/005—Treatment of cellulose-containing material with microorganisms or enzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2477—Hemicellulases not provided in a preceding group
    • C12N9/248—Xylanases
    • C12N9/2482—Endo-1,4-beta-xylanase (3.2.1.8)

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Paper (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Claims (28)

1. Ett isolerat DNA, kännetecknat av, att det kodar en aminosyresekvens for xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186), vilken sekvens innehäller en aminosyresekvens enligt figur 13 eller en aminosyresekvens, som tili minst 85 % är homolog med den nämnda aminosyresekvensen enligt figur 13, och som är xylanolytiskt aktiv.
2. Isolerat DNA enligt patentkrav 1, kännetecknat av, att den innehäller en nukleinsyresekvens enligt figur 13.
3. Ett isolerat DNA, kännetecknat av, att det kodar en aminosyresekvens för xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186), vilken sekvens innehäller en aminosyresekvens enligt figur 14 eller en aminosyresekvens, som tili minst 85 % är homolog med den nämnda aminosyresekvensen enligt figur 14, och som är xylanolytiskt aktiv.
4. Isolerat DNA enligt patentkrav 3, kännetecknat av, att den innehäller en nukleinsyresekvens enligt figur 14. « · · t
· · :***: 5. Ett isolerat DNA-fragment, kännetecknat av, att det härstammar frän en plasmid • 4 : pALK923 (DSM9322), pALK938 (DSM 9899), pALK939 (DSM 9900), pALK940 i Γ·1: (DSM 9901), pALK941 (DSM 9902) eller pALK1056 (DSM9903), som kodar 35 kDa j xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186). • · · * « · • 2 1
6. Ett isolerat DNA-fragment, kännetecknat av, att det härstammar frän en plasmid I’2·· PALK927 (DSM 9447) eller en plasmid pALK928 (DSM 9448), som kodar 50 kDa f II :xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186).
·« · · « • ♦ :***· 7. En rekombinantvector, kännetecknad av, att den innehäller en DNA-sekvens, « « 1 ; .·, som kodar en aminosyresekvens för xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186), * · · • 1 1 · · * · · • · · 2 • · 118010 vilken nämnda aminosyresekvensen innehäller en aminosyresekvens enligt figur 13 eller en aminosyresekvens, som tili minst 85 % är homolog med aminosyresekvensen enligt figur 13, och som är xylanolytiskt aktiv.
8. En rekombinantvektor, kännetecknad av, att den innehäller en DNA-sekvens, som kodar en aminosyresekvens för xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186), vilken nämnda aminosyresekvensen innehäller en aminosyresekvens enligt figur 14 eller | en aminosyresekvens, som tili minst 85 % är homolog med aminosyresekvensen enligt figur 14, och som är xylanolytiskt aktiv.
9. Rekombinantvektor enligt patentkrav 7, kännetecknad av, att den innehäller en DNA-sekvens, som kodar en aminosyresekvens enligt figur 13.
10. Rekombinantvektor enligt patentkrav 8, kännetecknad av, att den innehäller en DNA-sekvens, som kodar en aminosyresekvens enligt figur 14. 1 2 3
11. Rekombinantvektor enligt patentkrav 7, kännetecknad av, att den nämnda DNA-sekvensen är förenlig med figur 13.
12. Rekombinantvektor enligt patentkrav 8, kännetecknad av, att den nämnda DNA- ·1·1: sekvensen är förenlig med figur 14, • ♦ • ♦ · a · · ·♦· I1·1:
13. Rekombinantvektor enligt patentkrav 7, kännetecknad av, att den innehäller ett • · ; DNA-fragment ur en plasmid pALK923 (DSM9322), pALK938 (DSM 9899), pALK939 :T: (DSM 9900), PALK940 (DSM 9901), pALK941 (DSM 9902) eller pALK1056 (DSM9903), vilket kodar 3 5 kDa xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186). ·· • · • ·· • ·· ί,,.ί
14. Rekombinantvektor enligt patentkrav 8, kännetecknad av, att den innehäller ett sädant fragment ur en plasmid pALK927 (DSM 9447) eller en plasmid pALK928 (DSM .···, 9448), vilket kodar 50 kDa xylanas hos Actinomadura flexuosa (DSM 43186). «·· · 1 2 • · « 3 · • # • · · • 1· m 1 118010
15. Rekombinantvektor enligt nägot av patentkraven 7 tili 14, som innehäller en isolerad DNA-sekvens enligt nägot av patentkraven 1 tili 6, kännetecknad av, att den nämnda isolerade DNA-sekvensen funktionsdugligt kopplas tili en homolog xylanaspromotor eller tili en Trichoderma reesei 06/2/-promoter.
16. En rekombinantvärd, kännetecknad av, att nämnda värd är Trichoderma spp. och att den har transformerats med en rekombinantvektor enligt nägot av patentkraven 7 tili 15.
17. Rekombinantvärd enligt patentkrav 16, kännetecknad av, att den nämnda värden är Trichoderma reesei.
18. Ett odlingsmedium, kännetecknat av, att det innehäller i en kultur av en Trichoderma-rekombinantvärd utsöndrat 35kDa eller 50 kDa xylanasenzym, där rekombinantvärden erhällits genom transformation med en rekombinantvektor enligt nägot av patentkraven 7 tili 15. ,
19. Odlingsmediet enligt patentkrav 18, kännetecknat av, att den nämnda värden är T. reesei. • · · * * * • · · a j *|ϊ
20. Odlingsmediet enligt nägot av patentkraven 18 tili 19, kännetecknat av, att det ϊ^ϊ DNA som kodar aminosyresekvensen för 35 kDa eller 50 kDa xylanas är • · · • \ί funktionsdugligt kopplat tili en homolog xylanaspromotor eller tili en Trichoderma reesei % 9 ·.* j cbhl-promoter. ·♦* • · · • * ·
21. Ett enzympreparat, kännetecknat av, att det erhällits ur ett odlingsmedium ·* • *·· genom ultrafiltrering, torkning, indunstning, utfallning, immobilisering eller genom vilket ·»· som heist ”downstream”-behandlingsförfarande, varvid odlingsmediet innehäller 35 kDa »:»** eller 50 kDa xylanasenzym som utsöndrats i en kultur av en Trichoderma- .***; rekombinantvärd, vilken rekombinantvärd erhällits genom transformation med en « * * rekombinantvektor enligt nägot av patentkraven 7 tili 15. • · · ..... '; • · i · · • · * • * 118010 7 4
22. Enzympreparat enligt patentkrav 21, kännetecknat av, att den nämnda rekombinantvärden är T. reesei.
23. Enzympreparat enligt nägot av patentkraven 21 tili 22, kännetecknat av, att det DNA som kodar aminosyresekvensen för 35 kDa eller 50 kDa xylanas är funktionsdugligt kopplat tili en homolog xylanaspromotor eller tili en T. reesei cbhl-promotor.
24. Ett biologiskt blekningsförfarande, kännetecknat av, att man i massa tillför ett odlingsmedium som innehäller 35 kDa eller 50 kDa xylanasenzym, som utsöndrats i en j kultur av en Trichoderma-iekombinantvärd, vilken rekombinantvärd erhällits genom i transformation med en rekombinantvektor enligt nägot av patentkraven 7 tili 15.
25. Förfarande enligt patentkrav 24, kännetecknat av, att temperaturen är 50 tili 80 °C, fördelaktigt 70 °C.
26. Ett förfarande för kemisk behandling av växtbiomassa, kännetecknat av, att man vid förfarandet sammanför biomassan med ett odlingsmedium vid en temperatur högre än :*5*j 50 °C och vid ett pH-värde högre än 6,0 och nämnda odlingsmediet innehäller 35 kDa eller 50 kDa xylanasenzym, som utsöndrats i en kultur av en Trichoderma~ rekombinantvärd, vilken rekombinantvärd erhällits genom transformation med en :***: rekombinantvektor enligt nägot av patentkraven 7 tili 15, • » ·«· ··· • · * · '•mi ί
27. Ett biologiskt blekningsförfarande, kännetecknat av, att man i massa tillför ett odlingsmedium eller ett enzympreparat enligt nägot av patentkraven 18 tili 23. ·· • · • ··
28. Ett förfarande för kemisk behandling av växtbiomassa, kännetecknat av, att man ·;··· sammanför nämnda biomassa med ett odlingsmedium eller enzympreparat enligt nägot av ;***; patentkraven 18 tili 23 vid en temperatur högre än 50 °C, fördelaktigt vid en temperatur * · « : om 70 °C. * · · ···· • · • · · » · · * · i ' . 1
FI953639A 1994-07-29 1995-07-31 Actinomaduras xylanassekvenser och förfaranden för dess användning FI118010B (sv)

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US28200194A 1994-07-29 1994-07-29
US28200194 1994-07-29
US33241294A 1994-10-13 1994-10-13
US33241294 1994-10-31
US46881295 1995-06-06
US08/468,812 US5935836A (en) 1994-07-29 1995-06-06 Actinomadura xylanase sequences and methods of use

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI953639A0 FI953639A0 (sv) 1995-07-31
FI953639A FI953639A (sv) 1996-01-30
FI118010B true FI118010B (sv) 2007-05-31

Family

ID=27403266

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI953639A FI118010B (sv) 1994-07-29 1995-07-31 Actinomaduras xylanassekvenser och förfaranden för dess användning

Country Status (3)

Country Link
US (1) US5935836A (sv)
CA (1) CA2154945C (sv)
FI (1) FI118010B (sv)

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7816129B2 (en) 1994-07-29 2010-10-19 Ab Enzymes Gmbh Production and secretion of proteins of bacterial origin in filamentous fungi
US6300114B1 (en) 1994-07-29 2001-10-09 Rohm Enzyme Finland Oy Sequences of xylanase and xylanase expression vectors
US5922579A (en) * 1995-12-18 1999-07-13 Rohm Enzyme Finland Oy Xylanases and uses thereof
US6635464B1 (en) 1995-12-18 2003-10-21 Rohm Enzyme Finland Oy Xylanases, genes encoding them, and uses thereof
US6228629B1 (en) 1995-12-18 2001-05-08 Röhn Enzyme Finland OY Xylanases, genes encoding them, and uses thereof
US7320741B2 (en) 2001-01-18 2008-01-22 Iogen Bio-Products Corporation Method of xylanase treatment in a chlorine dioxide bleaching sequence
CN100346030C (zh) * 2002-03-06 2007-10-31 埃欧金生物制品公司 化学纸浆的木聚糖酶处理
US7504120B2 (en) * 2002-06-14 2009-03-17 Verenium Corporation Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them
US7348172B2 (en) * 2004-04-16 2008-03-25 Ab Enzymes Oy Method and DNA constructs for increasing the production level of carbohydrate degrading enzymes in filamentous fungi
US8043839B2 (en) * 2006-02-14 2011-10-25 Verenium Corporation Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them
EP2205744B1 (en) 2007-10-03 2015-01-14 BP Corporation North America Inc. Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them
WO2010020645A1 (en) * 2008-08-18 2010-02-25 Novozymes A/S Polypeptides having xylanase activity and polynucleotides encoding same
WO2010037388A1 (en) * 2008-09-30 2010-04-08 Vestas Wind System A/S Logical scheme for severe fault detection
AU2009330641A1 (en) 2008-12-22 2011-06-30 The Regents Of The University Of California Acidothermus celluloyticus xylanase
US9012186B2 (en) 2009-04-27 2015-04-21 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Hemicellulose-degrading enzymes

Family Cites Families (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE117020T1 (de) * 1985-08-29 1995-01-15 Genencor Int Expression von heterologen polypeptiden in filamentösen pilzen, verfahren zu deren herstellung und vektoren zu deren herstellung.
DK122686D0 (da) * 1986-03-17 1986-03-17 Novo Industri As Fremstilling af proteiner
US5298405A (en) * 1986-04-30 1994-03-29 Alko Limited Enzyme preparations with recombinantly-altered cellulose profiles and methods for their production
FR2604198B1 (fr) * 1986-09-22 1989-07-07 Du Pin Cellulose Procede de traitement d'une pate papetiere par une solution enzymatique.
WO1989001969A1 (en) * 1987-09-04 1989-03-09 Novo-Nordisk A/S Process for the production of protein products in aspergillus and promoters for use in aspergillus
FI81395B (fi) * 1988-03-14 1990-06-29 Cultor Oy Foerfarande foer blekning av cellulosamassa.
FR2629108A1 (fr) * 1988-03-22 1989-09-29 Du Pin Cellulose Procede de fabrication de papiers ou cartons a partir de fibres recyclees, traitees avec des enzymes
FI81394C (sv) * 1988-07-22 1993-07-20 Genencor Int Europ Förfarande för behandling av massa med enzymer
FI85041C (sv) * 1989-01-16 1992-02-25 Enso Gutzeit Oy Förfarande för att bringa pappersmassa på en pappersmaskins vira
US5179021A (en) * 1989-02-10 1993-01-12 Gil Inc. (Now Ici Canada Inc.) Pulp bleaching process comprising oxygen delignification and xylanase enzyme treatment
FI90888B (sv) * 1989-02-14 1993-12-31 Enso Gutzeit Oy Förfarande för blekning av cellulosamassa
FI86896B (fi) * 1989-05-04 1992-07-15 Enso Gutzeit Oy Foerfarande foer blekning av cellulosamassa.
WO1991002791A1 (en) * 1989-08-14 1991-03-07 Cultor Oy Enzymatic bleaching of pulp
DK420289D0 (da) * 1989-08-25 1989-08-25 Novo Nordisk As Fremgangsmaade til behandling af lignocellulosepulp
NZ235679A (en) * 1989-10-18 1993-01-27 Int Paper Co Bleaching lignocellulosic pulp using (a) treatment with xylanase and (b) one or more chemical bleaching stages
NZ239083A (en) * 1990-07-24 1993-08-26 Gist Brocades Nv Endo-xylanase-containing silage composition
GB9018426D0 (en) * 1990-08-22 1990-10-03 Sandoz Ltd Improvements in or relating to novel compounds
GB2249096A (en) * 1990-10-11 1992-04-29 Ciba Geigy Saccharomyces cerevisiae strains lacking carboxypeptidase yscY activity for expression of proteins at high yields
FI931193A0 (fi) * 1992-05-22 1993-03-17 Valtion Teknillinen Mannanasenzymer, gener som kodar foer dem och foerfaranden foer isoleringav generna samt foerfarande foer blekning av lignocellulosahaltig massa
JPH07508647A (ja) * 1992-06-17 1995-09-28 コモンウェルス・サイエンティフィック・アンド・インダストリアル・リサーチ・オーガニゼイション 組換えキシラナーゼ
NZ253280A (en) * 1992-06-17 1997-09-22 Univ Newcastle Recombinant truncated xylanases derived from anaerobic fungi
EP0728197A1 (en) * 1993-11-05 1996-08-28 Cornell Research Foundation, Inc. THERMOSTABLE XYLANASE FROM A $i(THERMOMONOSPORA FUSCA) GENE
US5437992A (en) * 1994-04-28 1995-08-01 Genencor International, Inc. Five thermostable xylanases from microtetraspora flexuosa for use in delignification and/or bleaching of pulp

Also Published As

Publication number Publication date
CA2154945A1 (en) 1996-01-30
CA2154945C (en) 2010-07-06
FI953639A0 (sv) 1995-07-31
FI953639A (sv) 1996-01-30
US5935836A (en) 1999-08-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2168344C (en) Thermostable xylanases
US5661021A (en) Mannanase enzymes, genes coding for them and a method for isolating the genes, as well as a process for bleaching of lignocellulosic pulp
FI118010B (sv) Actinomaduras xylanassekvenser och förfaranden för dess användning
CA2156048C (en) Alkali-tolerant xylanases
Lüthi et al. Cloning, sequence analysis, and expression in Escherichia coli of a gene coding for a beta-mannanase from the extremely thermophilic bacterium" Caldocellum saccharolyticum"
Chen et al. Release of lignin from kraft pulp by a hyperthermophilic xylanase from Thermatoga maritima
EP0876494B1 (en) Production and secretion of actinomycete xylanases in a filamentous trichoderma fungus
CA2136350C (en) Xylanases from trichoderma reesei and methods for their production
US5202249A (en) Xylanase for biobleaching
CA2563469A1 (en) Method and dna constructs for increasing the production level of carbohydrate degrading enzymes in filamentous fungi
JP3229006B2 (ja) 真菌由来のアセチルキシランエステラーゼのクローニング、発現および利用
WO1993024621A9 (en) Novel enzyme preparations and methods for their production
FI118009B (sv) Förfarande för användning av termostabilt xylanas
US5837515A (en) Enzyme preparations and methods for their production
WO2006104448A1 (en) Thermostable alkaline xylanase
US20060014247A1 (en) Method and DNA constructs for increasing the production level of carbohydrate degrading enzymes in filamentous fungi
US7816129B2 (en) Production and secretion of proteins of bacterial origin in filamentous fungi
JP2002345472A (ja) 新規ヘキセンウロニダーゼ、それをコードする遺伝子、およびそれらの使用
CA2240390C (en) Novel xylanases, genes encoding them, and uses thereof
FI118770B (sv) Förfarande och DNA-konstruktioner för att förbättra produktionsnivån av kolhydratspjälkande hyfsvampar
JP2001245665A (ja) アルカリ性キシラナーゼ及びその製造方法
EP0633932A1 (en) DELIGNIFYING PREPARATION EXHIBITING $g(a)-L-ARABINOFURANOSIDASE ACTIVITY, PRODUCTION AND APPLICATION THEREOF

Legal Events

Date Code Title Description
GB Transfer or assigment of application

Owner name: R!HM ENZYME FINLAND OY

PC Transfer of assignment of patent

Owner name: AB ENZYMES GMBH

Free format text: AB ENZYMES GMBH

FG Patent granted

Ref document number: 118010

Country of ref document: FI

MA Patent expired