ES2935745T3 - Adenovirus oncolíticos modificados - Google Patents

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Sari Pesonen
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Vincenzo Cerullo
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Abstract

La invención se refiere a un adenovirus oncolítico competente en replicación modificado; una composición farmacéutica que comprende la misma; y un método para tratar el cáncer usando el mismo. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)

Description

DESCRIPCIÓN
Adenovirus oncolíticos modificados
Campo de la invención
La invención se refiere a un adenovirus oncolítico, competente para replicación modificado; a una composición farmacéutica que comprende el mismo; y a su uso en un método para tratar cáncer.
Antecedentes de la invención
La percepción del papel de virus oncolíticos en el tratamiento del cáncer ha cambiado drásticamente durante la última década, ya que la inmunoterapia y la estimulación del propio sistema inmunitario del paciente para fijar como diana y atacar el cáncer han ganado popularidad. A principios de siglo, los virus oncolíticos se percibían como agentes activos en el tratamiento del cáncer, actuando únicamente mediante su capacidad inherente para causar lisis de células tumorales mediante oncólisis. Recientemente, su uso como vacunas contra el cáncer ha ganado interés, y su capacidad para liberar antígenos tumorales de células cancerosas tras oncólisis para activar el sistema inmunitario se reconoce como una característica importante en el diseño de inmunoterapia final contra el cáncer. Los adenovirus son virus altamente inmunogénicos que a menudo se usan como vectores en diversos enfoques de vacunas contra enfermedades infecciosas. Es importante destacar que tienen una capacidad excepcional para cebar y estimular respuestas inmunitarias. Además, es probable que la presencia de un adenovirus oncolítico dentro de un tumor y la muerte celular inmunogénica que causa conformen el microentorno tumoral hostil hacia un estado más susceptible para que ocurra una inmunidad antitumoral clínicamente relevante, causando la expresión de inmunomoduladores de tipo TH1 tales como interferón gamma (IFNgamma). La infiltración de células inmunitarias en el tumor es una consecuencia frecuente del tratamiento con virus oncolíticos y, lo que es importante, algunos adenovirus inducen infiltración por linfocitos T CD8+ que son células efectoras fundamentales en la inmunidad contra el cáncer. Los adenovirus causan lisis inmunogénica de las células cancerosas, por lo que algunos antígenos tumorales, incluyendo neoantígenos únicos específicos del paciente, ocultos previamente al sistema inmunitario o no presentados en un contexto inmunogénico, se liberan en el entorno inmunogénico. Esta es la base de una respuesta inmunitaria específica de tumor causada por adenovirus oncolíticos.
Sin embargo, los tumores han desarrollado varios mecanismos inmunosupresores para contrarrestar las células inmunitarias del organismo. Las células inmunitarias expresan moléculas de superficie celular que regulan su activación y funciones efectoras, específicamente moléculas coestimuladoras y coinhibidoras. Las moléculas de retroalimentación negativa, es decir, moléculas de puntos de control, permiten autotolerancia en contextos fisiológicos normales pero, a menudo, las células tumorales las utilizan para causar supresión inmunitaria severa. Las rutas de puntos de control mejor caracterizadas son las rutas de proteína 4 de linfocitos T citotóxicos (CTLA-4) y de proteína 1 de muerte celular programada (PD-1/PD-L1). Debido a estos fuertes mecanismos inmunosupresores dentro del tumor, la respuesta inmunitaria antitumoral inducida por virus puede ser débil a menos que se fortalezca por el uso de transgenes inmunoestimuladores. El enfoque actual aborda el problema de la supresión inmunitaria en el sitio tumoral, ya que la presencia del adenovirus oncolítico altamente inmunogénico que codifica transgenes humanos inmunoestimuladores conforma el microentorno tumoral hacia un fenotipo "inflamado inmunitario" que es más susceptible a enfoques de inmunoterapia. Es importante destacar que el virus oncolítico del enfoque actual puede utilizarse en combinación con moduladores de puntos de control tales como moléculas anti-PD1, anti-PD-L1 o anti-CTLA-4 para contrarrestar el entorno tumoral inmunosupresor y causar una fuerte respuesta antiinmunitaria. Exposiciones de la invención
De acuerdo con un primer aspecto de la invención, se proporciona un adenovirus de tipo natural replicante y modificado de serotipo 5 que tiene actividad lítica en células cancerosas diana que comprende:
a) una deleción génica de E1A en donde la deleción es de pares de bases 923-946;
b) una sustitución quimérica 5/3 de una protuberancia de una proteína de fibra adenoviral en donde la protuberancia de Ad de serotipo 5 está reemplazada por la protuberancia de un Ad de serotipo 3;
c) una deleción génica de 14.7k en donde la deleción es de pares de bases 30446-30460 con respecto al adenovirus de tipo natural y en donde la secuencia GGA GGA GAT GAC TGA (SEQ ID NO: 1) eliminada por deleción está sustituida por GGA GGA GAC GAC TGA (SEQ ID NO: 2); y
d) una deleción génica de gp19k y una deleción génica de 7.1k en donde las deleciones son de pares de bases 28541-29211 con respecto al adenovirus de tipo natural.
En el adenovirus modificado mencionado anteriormente, los aminoácidos 923-946 se eliminan por deleción de la secuencia de Ad5 de tipo natural (wt). Esta deleción es una medida de seguridad ya que la proteína E1A viral no puede unirse a una molécula de retinoblastoma (Rb) y libera el factor de transcripción E2F de Rb para transcripción génica viral. Por tanto, el adenovirus se basa en la presencia de E2F libre en una célula hospedadora y puede replicar su genoma en células normales en división o en células cancerosas, donde E2F libre está disponible constantemente. Por tanto, la modificación es relativamente protectora de células que no están en división y está dirigida contra células en división o cancerosas.
Además, la sustitución quimérica 5/3, es decir, el reemplazo de la región de protuberancia de fibra adenoviral de serotipo 5 con la región de protuberancia de adenovirus de serotipo 3 permite que el virus eluda al receptor de Coxsackie-adenovirus (CAR) de receptor nativo de Ad5 y, en su lugar, use el receptor nativo de desmogleína 2 (DSG2) de Ad3 para internalización. DSG2 está presente en células cancerosas en abundancia. Por tanto, de nuevo, la modificación es relativamente protectora de células que no están en división y está dirigida contra células en división o cancerosas.
La infección adenoviral comienza con el reconocimiento de receptores de células hospedadoras mediante proteínas especializadas en la superficie viral, es decir, la proteína de fibra de adenovirus y, en particular, el dominio carboxiterminal globular de la proteína de fibra de adenovirus, denominado dominio de protuberancia carboxi-terminal. Por consiguiente, en el presente documento, la referencia a una protuberancia de una proteína de fibra adenoviral se refiere al dominio carboxi-terminal globular de la proteína de fibra de adenovirus.
Además, la deleción génica de 14.7k evita que las células infectadas mueran por citólisis inducida por TNFalfa y, por tanto, la deleción es ventajosa. Es importante destacar que los presentes inventores han observado que hay una superposición corta al comienzo del gen 14.7k y el gen RID beta (14.5k) corriente arriba y, por tanto, se realiza una modificación para permitir la deleción génica de 14.7k sin eliminar por deleción el último aminoácido y el codón de parada del gen RID beta. Específicamente, la secuencia de unión nativa se lee como GGAGGAGATGACTGATTAGGTA (SEQ ID NO: 3) siendo la secuencia subrayada la parte C-terminal del gen RID beta y siendo el resto la parte N-terminal del gen 14.7k. La traducción a aminoácidos se lee como parada G G D D (GGA GGA GAT GAC t Ga ; SEQ ID NO: 1) para el gen RID beta. Por tanto, para anular el ATG dentro del ORF del gen RID beta para que no haya una lectura incorrecta si se inserta un transgén dentro del sitio de deleción, y para asegurarse de que se mantiene la parte C-terminal del RID beta funcional, los presentes inventores han cambiado ligeramente la secuencia de RID beta: GGA GGA GAC GAC TGA (SEQ ID NO: 2). De este modo, la secuencia todavía se lee como parada G G D D, pero no contiene un ATG para cualquier lectura corriente abajo incorrecta que pueda interferir con la expresión del transgén.
Por último, gp19k es un gen que regula por disminución MHCI en la célula infectada, y es redundante para replicación, empaquetamiento, etc., de adenovirus y, por tanto, puede retirarse. Además, como es un gen inmunorregulador que usa el adenovirus para ocultarse del sistema inmunitario, es beneficioso eliminarlo por deleción. 7.1k es un gen relacionado con la degradación del receptor de TRAIL 2 e inhibe la apoptosis inducida por liberación de Ca2+ del retículo endoplásmico (RE). Sin embargo, como el codón de parada del gen 7.1k reside dentro del marco de lectura abierto de gp19k, no se añaden transgenes a este sitio eliminado por deleción.
En una realización preferente de la invención, dicho adenovirus está modificado además por la inserción de una molécula que codifica OX40L, de forma ideal OX40L humano, en la deleción génica de 14.7k. OX40L es un activador de linfocitos T y, por tanto, es ventajoso para el funcionamiento de la invención.
El gen OX40L tiene su propio codón de inicio (ATG) y cuando está insertado en la deleción génica de 14.7k es preferente añadir un emparejamiento de bases CC entre el codón de parada del gen RID beta y el codón de inicio de OX40L para optimizar la traducción (es decir, para generar la secuencia Kozak ACCATGG).
Lo más preferentemente, el OX40L humano está situado en la región E3B, reemplazando la deleción génica de 14.7K. El extremo 3' del gen RID beta y el extremo 5' del 14.7K están superpuestos en el adenovirus de tipo natural y, por tanto, la modificación de T/C explicada anteriormente se realizó en el extremo 3' de RID beta, para permitir la transcripción correcta del transgén.
En otra realización preferente de la invención, dicho adenovirus está modificado, además o alternativamente, por la inserción de CD40L, de forma ideal CD40L humano. El CD40L humano está insertado en la región tardía del virus, específicamente en la región tardía 3 (L3), de forma ideal, corriente abajo del gen 23K, o en la región L5, corriente abajo del gen Fiber. CD40L activa las células presentadoras de antígeno (APC) y, por tanto, es ventajoso para el funcionamiento de la invención.
Preferentemente, el transgén CD40L está situado inmediatamente después de la región codificante del gen 23K adenoviral, precediendo a su sitio de poliadenilación, o inmediatamente después del gen Fiber, precediendo a su sitio de poliadenilación. Habitualmente, pero no exclusivamente, no se realizan deleciones para alojar al gen y, por tanto, la expresión del transgén depende de la maquinaria de corte y empalme alternativa adenoviral y un sitio aceptor de corte y empalme (SAS) que precede al transgén (por ejemplo, SAS adaptado de los documentos de Patente US2006/0292682 A1 y WO2006/012393).
En otra realización preferente de la invención, dicho adenovirus está modificado además por la inserción de un sitio aceptor de corte y empalme (SAS) y/o una secuencia Kozak corriente arriba del transgén CD40L para ayudar a la transcripción de CD40L.
Alternativamente, y además lo más preferentemente, el transgén CD40L está insertado inmediatamente corriente abajo de OX40L usando:
A) un sitio de procesamiento 2A del virus de la fiebre aftosa (F2A) (por ejemplo, véase Ad5/3-D24-OX40L-F2A-CD40L, constructo C1 en las figuras) o
B) sitio de procesamiento 2A del tescovirus porcino-1 (P2A) (por ejemplo, véase Ad5/3-D24-OX40L-P2A-CD40L, constructo C3 en las figuras).
El sitio de procesamiento 2A está insertado entre los dos transgenes y, de forma ideal, ambos sitios de procesamiento 2A están precedidos por un sitio de escisión (por ejemplo, un sitio de escisión de furina: RKRR) y un conector SGSG para asegurar una escisión eficaz de los transgenes.
Los expertos en la materia entenderán que los sitios de procesamiento 2A son péptidos pequeños de "autoescisión" encontrados en picornavirus. Los ribosomas hospedadores saltan la síntesis del enlace peptídico glicil-prolilo en la parte C-terminal del péptido 2A, conduciendo a la escisión entre un péptido 2A y su péptido corriente abajo inmediato. Como resultado, el péptido corriente abajo escindido tiene prolina en su parte N-terminal, lo que significa que la proteína CD40L producida a partir de los constructos de virus descritos en el presente documento tiene una prolina en su parte N-terminal.
Por consiguiente, en una realización preferente de la invención, dicho adenovirus modificado incluye uno y más preferentemente dos transgenes: OX40L y CD40L. Además, habitualmente, pero no exclusivamente, dicho transgén CD40L está provisto casi inmediatamente o inmediatamente corriente abajo de dicho transgén OX40L o viceversa. El acoplamiento de receptores de linfocitos T por complejos antígeno-MHCI/II constituye la señal principal, señal 1, para la activación de linfocitos T indiferenciados. Sin embargo, la señal 1 no es suficiente para iniciar generación y mantenimiento productivos de linfocitos T efectores. La activación completa de linfocitos T CD8+ requiere señales adicionales dirigidas por moléculas coestimuladoras presentes en APC activadas o en linfocitos T auxiliares pero raramente en tumores. Las moléculas coestimuladoras que los presentes inventores han elegido para usar como transgenes en su invención, es decir, CD40L y OX40L, son miembros de la superfamilia de ligandos del factor de necrosis tumoral (TNF). La mayoría de ligandos de la superfamilia de TNF se expresan predominantemente en células implicadas en el sistema inmunitario, incluyendo linfocitos B, linfocitos T, linfocitos citolíticos naturales (NK), monocitos y DC.
El ligando OX40 (OX40L) y el ligando CD40 (CD40L) son proteínas transmembrana de tipo II que tienen un dominio extracelular relativamente largo y una región citoplasmática corta. El dominio extracelular (específicamente, el dominio de homología de TNF) presenta la especificidad de unión a receptor que es esencial para la funcionalidad del ligando. La mayoría de los ligandos de la superfamilia de TNF se expresan como homotrímeros en la superficie celular y son inactivos o poco activos como proteínas de fusión triméricas solubles. Por tanto, una forma soluble sin la región transmembrana no sería aplicable para el enfoque de los presentes inventores. Por tanto, en la presente invención, se utiliza el ADNc completo de cada transgén. De esta forma, los productos de transgén contienen todos los dominios que están presentes de forma natural en la proteína que se produce a partir de una célula, es decir, también un dominio transmembrana que dirige la proteína a la ruta secretora y la retiene en la membrana celular, así como los sitios de origen natural que causan escisión de la superficie celular por proteinasas.
Por consiguiente, en una realización preferente de la invención, se inserta una molécula que codifica la totalidad de al menos uno o cada transgén en dicho adenovirus, de forma ideal ADNc que codifica la totalidad de al menos uno o cada transgén.
En su mayoría, los enfoques que utilizan moléculas coestimuladoras como agente terapéutico para provocar/mejorar inmunidad antitumoral, usan anticuerpos agonistas monoclonales específicos para receptores de los ligandos de TNF, o formas solubles de los ligandos. Este enfoque requiere la administración sistémica de las moléculas terapéuticas. Por el contrario, el enfoque de los presentes inventores se asemeja a la situación natural dentro del organismo, donde los ligandos se presentan a sus receptores afines como proteínas ancladas a membrana producidas por la maquinaria celular de la célula cancerosa infectada.
Los linfocitos T CD4+ desempeñan un papel fundamental en el mantenimiento de una respuesta eficaz de linfocitos T CD8+ en infecciones virales persistentes. El nuevo constructo viral de la invención con transgén coestimulador o transgenes coestimuladores provoca inmunidad antiviral de tipo Th1 dentro del entorno tumoral. La presencia de antígenos tumorales en la superficie del virus y la liberación de otros antígenos tumorales en presencia de inflamación local, así como propagación determinante, conduce a la formación de clones de linfocitos T inmunitarios antitumorales. Para mantener la fase efectora de los linfocitos T citotóxicos CD8+, las moléculas coestimuladoras (concretamente, OX40L y CD40L) poseen características únicas que los presentes inventores quieren aplicar en el tratamiento de cáncer inmunosupresor.
Sorprendentemente, los datos de los presentes inventores indican que la adición de los transgenes inmunoestimuladores, OX40L humano y CD40L humano, en el locus 14.7K no compromete la eficacia oncolítica de los virus de la presente invención, en comparación con el virus de cadena principal Ad5/3D24 o un virus con un transgén inmunoestimulador, por ejemplo, GM-CSF humano, reemplazando los genes gp19K/7.1K eliminados por deleción. Esto es sorprendente porque los transgenes pueden influir profundamente en la replicación del virus debido al tamaño del transgén y los efectos directos del transgén en las células que están infectadas. Además, la deleción del gen 14.7K no está tan ampliamente estudiada como la deleción de genes gp19K/7.1K y, por tanto, podría tener consecuencias inesperadas para la maquinaria de replicación del virus, especialmente en el contexto de incorporación de transgenes en el sitio de deleción de 14.7K.
Los presentes inventores también muestran que el virus de la presente solicitud puede producir transgenes humanos funcionales desde el locus génico de 14.7K. Esto fue inesperado porque los presentes inventores usaron, en cierto modo inusualmente, un casete de transcripción con un sitio de procesamiento 2A viral entre los dos transgenes. Además, los presentes inventores muestran que el virus de la presente invención puede provocar una respuesta inmunitaria específica de MAGE-A3 y de NY-eSo -1.
Por consiguiente, en un aspecto adicional, la invención se refiere a una composición farmacéutica que comprende al menos un adenovirus competente para replicación y lítico de células diana de acuerdo con la invención y un vehículo adecuado.
OX40/OX40L
OX40L se expresa en APC activadas, incluyendo células dendríticas, linfocitos B y macrófagos. Se expresa en la superficie celular como un trímero que le permite unirse a tres moléculas de OX40. Se requiere activación de linfocitos T para la expresión de OX40, el receptor de OX40L, en linfocitos T CD8+ y CD4+. La inducción de OX40 ocurre en 24 horas y alcanza su punto máximo en 48-72 horas después de estimulación inicial de TCR, y dura generalmente 3-4 días. El nivel relativo de receptor de OX40 expresado en linfocitos T está influenciado en gran medida por el entorno local mediante contacto con células presentadoras de antígeno profesionales que expresan CD80 o CD86, o mediante un medio rico en TNFalfa o citoquinas inflamatorias similares. Además, normalmente, la expresión de OX40L se encuentra principalmente en el sitio de inflamación. Por tanto, los linfocitos T que expresan OX40 que se activan mediante señalización de TCR reciben coestimulación mediante OX40L en el sitio de inflamación. Esta especificidad de coestimulación mediante OX40 es análoga a una señal de peligro recibida de un entorno inflamatorio y, de ese modo, añade una capa de seguridad a su uso. Además, la expresión temporal de OX40 en la superficie de linfocitos T después del evento de cebado sugiere su importancia en proliferación tardía y supervivencia de linfocitos T efectores. Se sugiere que la activación de las moléculas antiapoptóticas BCL-2, BCL-xL y survivina en linfocitos T estimulados con OX40 es responsable del aumento de expansión clonal y de un grupo mayor de linfocitos T de memoria.
CD40/CD40L
Además de proporcionar señales coestimuladoras directamente a linfocitos T, también es atractivo promover la activación de las APC que probablemente presenten antígenos tumorales de forma cruzada, de modo que se logre in situ mayor expresión del ligando coestimulador. CD40 es fundamental para la función de linfocitos B y de las DC que lo expresan de forma constitutiva. El ligando CD40 (CD40L) está expresado principalmente en linfocitos auxiliares T activados. Se ha mostrado que el ligamiento de CD40 autoriza a las a Pc y permite que impulsen respuestas de CTL efectoras, en parte mediante inducción de la secreción de IL-12, y también mediante regulación por aumento de miembros de la familia B7 (CD80, CD86). La coestimulación de CD40/CD40L es importante para inducción de respuestas de linfocitos T antitumorales eficaces, y se ha mostrado que la incorporación de CD40L en vacunas basadas en células tumorales mejora significativamente las respuestas inmunitarias a tumores poco inmunogénicos en ratones, subrayando la importancia del efecto indirecto en la inmunidad adaptativa mediante APC en inmunidad antitumoral.
Además, en otra realización preferente de la invención, dicho adenovirus puede ser de cualquier tipo y especie de Adenoviridae, por ejemplo, no limitado a adenovirus humano pero lo más habitualmente es adenovirus humano. Lo más favorablemente, los adenovirus son capaces de replicarse y destruir células cancerosas mientras desvían la respuesta inmunitaria antiviral contra el tumor.
A partir de lo mencionado anteriormente, se desprende que el adenovirus modificado de la invención se ha modificado por ingeniería para estimular una respuesta inmunitaria contra cáncer y específicamente en un entorno tumoral donde, habitualmente, el sistema inmunitario se ve comprometido por los mecanismos evasivos empleados por las células cancerosas.
Además, o aún de forma alternativa, la invención se refiere a al menos un adenovirus modificado competente para replicación y lítico de células diana de acuerdo con la invención para uso para tratar cáncer.
Además, en el presente documento se describe el uso de al menos un adenovirus modificado competente para replicación y lítico de células diana de acuerdo con la invención en la preparación de un medicamento para tratar cáncer.
Lo más preferentemente, el cáncer mencionado en el presente documento incluye uno cualquiera o más de los siguientes cánceres: cáncer nasofaríngeo, cáncer sinovial, cáncer hepatocelular, cáncer renal, cáncer de tejidos conjuntivos, melanoma, cáncer de pulmón, cáncer intestinal, cáncer de colon, cáncer rectal, cáncer colorrectal, cáncer cerebral, cáncer de garganta, cáncer oral, cáncer de hígado, cáncer pancreático, coriocarcinoma, gastrinoma, feocromocitoma, prolactinoma, leucemia/linfoma de linfocitos T, neuroma, enfermedad de von Hippel-Lindau, síndrome de Zollinger-Ellison, cáncer suprarrenal, cáncer anal, cáncer de vías biliares, cáncer de vejiga, cáncer de uréter, oligodendroglioma, neuroblastoma, meningioma, tumor de médula espinal, cáncer óseo, osteocondroma, condrosarcoma, sarcoma de Ewing, cáncer de sitio primario desconocido, carcinoide, carcinoide de tracto gastrointestinal, fibrosarcoma, cáncer de mama, enfermedad de Paget, cáncer cervicouterino, cáncer de esófago, cáncer de vesícula biliar, cáncer de cabeza, cáncer ocular, cáncer de cuello, cáncer de riñón, tumor de Wilms, cáncer de hígado, sarcoma de Kaposi, cáncer de próstata, cáncer testicular, enfermedad de Hodgkin, linfoma no Hodgkin, cáncer de piel, mesotelioma, mieloma múltiple, cáncer de ovario, cáncer pancreático endocrino, glucagonoma, cáncer paratiroideo, cáncer de pene, cáncer de pituitaria, sarcoma de tejidos blandos, retinoblastoma, cáncer de intestino delgado, cáncer de estómago, cáncer de timo, cáncer de tiroides, cáncer trofoblástico, mola hidatídica, cáncer uterino, cáncer endometrial, cáncer de vagina, cáncer de vulva, neuroma del acústico, micosis fungoide, insulinoma, síndrome carcinoide, somatostatinoma, cáncer de encías, cáncer de corazón, cáncer de labios, cáncer de meninges, cáncer de boca, cáncer de nervios, cáncer de paladar, cáncer de glándula paratiroides, cáncer de peritoneo, cáncer de faringe, cáncer pleural, cáncer de glándulas salivales, cáncer de lengua y cáncer de amígdalas.
En el presente documento se describe el uso de un adenovirus modificado, optimizado para seguridad y supervivencia, como adyuvante activo en una terapia de tratamiento de cáncer que usa al menos uno y, de forma ideal, dos agentes inmunoestimuladores, es decir, OX40L y CD40L.
El adenovirus modificado actúa como adyuvante activo porque proporciona las señales de peligro requeridas para una respuesta inmunitaria óptima contra un péptido diana, pero también retiene su capacidad para producir oncólisis de las células cancerosas que infecta y replica su genoma. La destrucción celular oncolítica es inmunogénica por naturaleza, lo que causa cambios en el microentorno tumoral, que probablemente fortalezcan la respuesta inmunitaria a los péptidos/tumor.
En las reivindicaciones posteriores y en la descripción precedente de la invención, excepto cuando el contexto requiera lo contrario debido a lenguaje expreso o implicación necesaria, el término "comprende", o variaciones tales como "comprende" o "que comprende" se usa en un sentido inclusivo, es decir, para especificar la presencia de las características indicadas pero no para excluir la presencia o adición de características adicionales en diversas realizaciones de la invención.
A lo largo de la descripción y reivindicaciones de la presente memoria descriptiva, el singular incluye el plural a menos que el contexto requiera lo contrario. En particular, cuando se usa el artículo indefinido, debe entenderse que la memoria descriptiva contempla tanto el plural como el singular, a menos que el contexto requiera lo contrario. A continuación se describirá una realización de la presente invención a modo de ejemplo únicamente con referencia a lo siguiente, en donde:
Figura 1. Muestra un análisis de electroforesis en agarosa de las reacciones de ensamblaje de Gibson amplificadas por PCR de los fragmentos GA-OX40L/F2A/CD40L y GA-OX40L/P2A/CD40L. En el carril 1, una amplificación por PCR de los fragmentos ensamblados 1,2 y 3 que crea un fragmento GA-OX40L/F2A/CD40L de longitud completa con un tamaño de 3974 pb. En el carril 2, una amplificación por PCR de los fragmentos ensamblados 1, 2 y 3 que crea un fragmento GA-OX40L/P2A/CD40L de longitud completa con un tamaño de 3929 pb. En el carril 3, una amplificación por PCR del plásmido de virus de cadena principal pAd5/3D24 que amplifica un fragmento del tamaño de 3564 pb. Véase que en ambos carriles, 1 y 2, también puede observarse cierta amplificación de la cadena principal viral.
Figura 2. Muestra que la capacidad de la proteína OX40L producida por virus para unirse a su receptor OX40 se confirmó por citometría de flujo. Se usaron un anticuerpo de receptor OX40 (conejo) y un anticuerpo anti-conejo de cabra marcado con Alexa fluor 488 para unir la proteína OX40L expresada a partir de los virus en la superficie celular A549 infectada. Como controles negativos se usaron células no teñidas, células teñidas no infectadas y células teñidas infectadas con virus sin transgén. Los datos se presentan como A) histograma o B) como media de las frecuencias absolutas o proporcionales. MG = Media geométrica de células positivas para la marca de Alexa fluor 488, Frec. parental = proporción de células positivas para la marca de Alexa fluor 488, virus-Cont. = Ad5/3D24, un virus con una cadena principal idéntica y sin transgén, virus-OX40L = virus con OX40L solo como transgén, OX40L/CD40L.C1 y OX40L/CD40L.C3 = virus con OX40L y CD40L como transgenes. Figura 3. Muestra que OX40L capaz de unirse al receptor OX40 se expresa a partir de virus de transgén doble Ad5/3-D24-OX40L-CD40.C1 (C1 en la figura) y Ad5/3-D24-OX40L-CD40.C3 (C3 en la figura) así como a partir del virus que expresa solo el transgén OX40L (usado como control de expresión). Se usó ELISA sándwich funcional para la detección de la forma nativa de OX40L expresada a partir de los virus en el sobrenadante de células infectadas. El sobrenadante de células no infectadas se usó como control negativo. Las diluciones se representan para cada muestra en la figura.
Figura 4. Muestra la funcionalidad de OX40L expresado en virus determinada usando células HEK-293 que expresan el receptor OX40 con un sistema indicador de luciferasa. Se analizó la capacidad de un virus sin transgén (virus-Cont.), un virus solo con OX40L como transgén (virus-OX40L), virus con OX40L y CD40L como transgenes (OX40L/CD40L.C1 y OX40L/CD40L.C3) para desencadenar la actividad de luciferasa dependiente de interacción de OX40L/OX40. Se detectó una clara actividad de luciferasa con los virus que expresan OX40L, lo que indica que OX40L expresado a partir del genoma del virus es funcional.
Figura 5. Muestra las absorbancias medidas usando el ensayo de células Ramos Blue para determinar niveles de expresión de CD40L funcional. (A) CD40L se expresó a partir de los virus de transgén doble (OX40L/CD40L.C1 y OX40L/CD40L.C3) y como controles negativos se usaron virus sin transgén (virus cont.) u OX40L como un solo transgén (virus-OX40L), o células no infectadas (A549). (B) Mediciones de absorbancia para las células Ramos Blue tratadas con CD40L humano recombinante.
Figura 6. Muestra la frecuencia de linfocitos T en tumor tratado y contralateral, y sin tratar cuando se trata con virus oncolítico sin revestimiento peptídico (VALO-C1), virus onclolítico con revestimiento antigénico peptídico (PeptiCRAd) NYESO-1 o MAGE-A3 o péptido solo. El número de linfocitos T CD3+ (A), linfocitos T c D4+ (B) y linfocitos T CD8+ (C) se representa como células por gramo de tejido tumoral en cada grupo de tratamiento. Los tratamientos dieron como resultado frecuencias de linfocitos T más elevadas en todos los grupos en comparación con la simulación. Los números más elevados se observaron en tumores tratados con VALO-C1 o PeptiCRAd. Figura 7. Muestra la frecuencia de todas las células inmunitarias (células CD45+) en tumor tratado y contralateral, y sin tratar cuando se trata con virus oncolítico sin revestimiento peptídico (VALO-C1), virus oncolítico con revestimiento antigénico peptídico NYESO-1 o MAGE-A3 (PeptiCRAd) o péptido solo. Las frecuencias fueron similares en todos los grupos con un número algo menor en animales tratados de forma simulada.
Figura 8. Muestra que los tratamientos con VALO-C1 y PeptiCRAd disminuyen el porcentaje de linfocitos T reguladores de todos los TIL en tumores tratados.
Figura 9. Muestra que PeptiCRAd (que contiene virus que expresa OX40L y CD40L revestido con proteínas NY-ESO-1 y MAGE-A3) puede detener el crecimiento tumoral en un modelo de melanoma de ratón humanizado incluso si el tratamiento se inicia para tumores grandes y bien establecidos. Diseño experimental: se implantaron 2 x 106 células SK-MEL-2 por vía subcutánea (un tumor por animal) en el costado de ratones inmunodeficientes NOD/Shi-scid/IL-2RYnulo el día 1. El día 13, se inyectaron 5 x l 06 PBMC por vía intravenosa. El día 16, se inyectaron 5x104 células dendríticas plasmocitoides y mieloides por vía intratumoral. Los tratamientos de PeptiCRAd intratumoral a una dosis de 1 x 109 VP se administraron los días 16, 17, 18 (cebado), y el día 25 (refuerzo). La primera dosis de PeptiCRad se administró inmediatamente después de inyección de DC. Se siguió el crecimiento tumoral. Los animales se sacrificaron el día 32. PeptiCRAd = Ad5/3-D24-OX40L-CD40L, adenovirus oncolítico con deleción de 24 pb en E1A, una cápside quimérica de 5/3 y transgenes CD40L y OX40L expresados a partir del locus de 14.7K, revestidos con péptidos NY-eSo -1 y MAGE-A3; OX40L PeptiCRAd = Ad5/3-D24-OX40L, adenovirus oncolítico con deleción de 24 pb en E1A, una cápside quimérica de 5/3 y transgén OX40L expresado a partir del locus de 14.7K, revestido con péptidos NY-ESO-1 y MAGE-A3. Figura 10. Muestra que OX40L(solo)-PeptiCRAd aumentó el número de linfocitos T CD8+ específicos de MAGE-A3 en sangre periférica en comparación con animales tratados de forma simulada. Dos animales tratados con PeptiCRAd también mostraron mayor número de linfocitos T CD8+ específicos de MAGE-A3 en sangre. Se evaluaron linfocitos T anti-MAGE-A3 por citometría de flujo (análisis pentamérico) al final del estudio de crecimiento tumoral mencionado anteriormente el día 32.
Descripción específica
Materiales y métodos:
Creación de un adenovirus oncolítico que tiene una deleción génica de E1A de nucleótidos que codifican aminoácidos 923-946
La deleción de 24 pares de bases se introdujo en la secuencia de cadena principal de Ad5 usando un plásmido lanzadera dirigido a la región de E1A, método de clonación descrito en Kanerva et al., la deleción descrita primero en Fueyo et al.
Creación de un adenovirus oncolítico que tiene una sustitución quimérica 5/3 de una proteína de fibra adenoviral La protuberancia de serotipo 5 se reemplazó con la protuberancia de serotipo 3 usando un plásmido lanzadera con una región de fibra modificada para introducir la secuencia mediante recombinación homóloga en la cadena principal viral. Los métodos de clonación específicos se describen en Kanerva et al.
Creación de un adenovirus oncolítico que tiene una deleción génica de 14.7k de pares de bases 30448-30834 con respecto al adenovirus de tipo natural y en donde la secuencia GGA GGA GAT GAC TGA (SEQ ID NO: 1) está sustituida por GGA GGA GAC GAC t Ga (SEQ ID NO: 2) y creación de un adenovirus oncolítico que tiene una deleción génica de gp19ky una deleción génica de 7.1k de pares de bases 28541-29211 con respecto al adenovirus de tipo natural.
La deleción de 14.7K y la sustitución de GGA GGA GAJ GAC TGA (SEQ ID NO: 1) por GGA GGA GAC GAC TGA (SEQ ID NO: 2) (con la inserción del transgén OX40L en el lugar de 14.7K) y la deleción de genes gp19k/7.1k se introdujeron en un plásmido lanzadera (pShuttle-OX40L) por síntesis química. Basándose en una secuencia virtual diseñada en el programa Vector NTI, se diseñaron oligonucleótidos solapantes en GeneArt (Thermo Fisher Scientific), que comprendían conjuntamente la secuencia completa. La síntesis oligonucleotídica se consiguió por síntesis en fase sólida aplicando vidrio de poro controlado como material sólido. A continuación, los oligonucleótidos se liberaron a una fase líquida y se ensamblaron usando PCR en una estación de ensamblaje totalmente automatizada. La secuencia clonada por vía sintética se introdujo en un vector de clonación pMX, y se verificó por secuenciación.
Clonación de OX40L y CD40L en pAD5/3-D24 para obtener pAd5/3-D24-OX40L/F2A/CD40L y pAd5/3-D24-OX40L/P2A/CD40L
Para crear virus que contienen los genes OX40L y CD40L y uno del sitio de procesamiento 2A del virus de la fiebre aftosa (F2A) o sitio de procesamiento 2A del tescovirus porcino-1 (P2A) insertado entre los transgenes para procesamiento de traducción conjunta, se amplificaron 3 fragmentos para cada constructo por PCR.
Para constructos que contienen F2A, se amplificaron el fragmento 1 que contiene secuencia de OX40L y una parte del sitio de procesamiento F2A a partir de pShuttle-OX40L usando cebadores Gibson OX40L y F2A inverso OX40L (véase el listado de todos los cebadores usados en la tabla 1), se amplificaron el fragmento 2 que contiene una parte del sitio de procesamiento F2A y la secuencia completa de CD40L a partir de pShuttle-CD40L usando los cebadores F2A directo CD40L y F2A inverso CD40L.
Para constructos que contienen P2A, se amplificaron el fragmento 1 que contiene secuencia de OX40L y una parte del sitio de procesamiento P2A a partir de pShuttle-OX40L usando los cebadores Gibson OX40L y P2A inverso OX40L (véase el listado de todos los cebadores usados en la tabla 1), se amplificaron el fragmento 2 que contiene una parte del sitio de procesamiento de P2A y la secuencia completa de CD40L a partir de pShuttle-CD40L usando los cebadores P2A directo CD40L y P2A inverso CD40L.
Para constructos F2A y P2A, se amplificó el fragmento 3 que contiene secuencia genómica de adenovirus flanqueando el extremo 3' de CD40L a partir de pShuttle-OX40L usando los cebadores F2A directo extremo Adeno sin inserción y Gibson OX40L REV. Todas las reacciones de PCR se realizaron con ADN polimerasa Phusion High-Fidelity (Thermo Fisher, F530) de acuerdo con las instrucciones del fabricante seguido por tratamiento con Dpnl (NEB, R0176). Las reacciones se purificaron con Gel NucleoSpin® y kit de limpieza de pCr (MACHEREY-NAg El , 740609.50). A continuación, los fragmentos purificados se ensamblaron conjuntamente creando fragmentos GA-OX40L/F2A/CD40L y GA-OX40L/P2A/CD40L usando mezcla maestra de ensamblaje de Gibson (NEB, E2611) seguido por amplificación de PCR del fragmento ensamblado usando los cebadores Gibson OX40L DIR. y Gibson OX40L iNv . (véase la figura 1 para análisis en gel de agarosa de los fragmentos finales).
Para ensamblar GA-OX40L/F2A/CD40L o GA-OX40L/P2A/CD40L en la cadena principal viral, se digirió pAd5/3-D24 con Srfl (NEB, R0629L) y Barl (SibEnzyme®, E548) seguido por precipitación en etanol. La cadena principal viral pAd5/3-D24 digerida se ensambló con fragmentos de GA-OX40L/F2A/CD40L o de GA-OX40L/P2A/CD40L usando mezcla maestra de ensamblaje de Gibson (NEB, E2611) de acuerdo con las instrucciones del fabricante para generar pAd5/3-D24-OX40L/F2A/CD40L y pAd5/3-D24-OX40L/P2A/CD40L. Las reacciones de ensamblaje de Gibson se transformaron en E. coli competente para 5-alfa NEB® (NEB, C2987H) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Las colonias positivas se cribaron por PCR y los sucesos de recombinación correctos se confirmaron adicionalmente por secuenciación de los constructos.
Clonación de CD40L y OX40L en pAD5/3-D24 para obtener pAd5/3-D24-CD40L-OX40L
Para crear un fragmento que incluya CD40L (CD40L-GA) a clonar en la cadena principal viral de pAd5/3-D24 por reacción de recombinación homologa específica (nombre de marca Gibson Assembly, New England Biolabs), en primer lugar se ensamblaron tres productos de PCR conjuntamente con reacción de recombinación de ensamblaje de Gibson. Los fragmentos fusionados conjuntamente contenían las siguientes secuencias: Fragmento A que corresponde a nucleótidos 21376 a 22114 del plásmido pAd5/3-D24. Fragmento B que corresponde a nucleótidos 999 a 2623 del plásmido pShuttle-CD40L. Fragmento C que corresponde a nucleótidos 22820-27107 del plásmido pAd5/3-D24 (véase la tabla 1b-3b para el listado de cebadores y secuencias de cebador usados). Se realizaron reacciones de PCR con ADN polimerasa Phusion High-Fidelity (Thermo Fisher, F530) de acuerdo con las instrucciones del fabricante y las reacciones se purificaron con Gel NucleoSpin® y kit de limpieza de PCR (MACHEREY-NAGEL, 740609.50). A continuación, para crear CD40L-GA, los fragmentos de PCR purificados se ensamblaron conjuntamente por reacción de recombinación de ensamblaje de Gibson de acuerdo con las instrucciones del fabricante (mezcla maestra de ensamblaje de Gibson, NEB E2611). Después de recombinación homóloga, el fragmento de CD40L-GA recién creado se amplificó adicionalmente por PCR usando los cebadores AA y DD (para las secuencias de cebador, véanse las tablas 1b y 3b) usando ADN polimerasa Phusion High-Fidelity de acuerdo con las instrucciones del fabricante. El CD40L-GA amplificado por PCR se purificó en gel usando Gel NucleoSpin® y kit de limpieza de PCR. Para clonar CD40L-GA en la cadena principal viral, se digirió pAd5/3-D24 con Spel (n Eb , R0133S) y AsiSI (NEB, R0630S) seguido por precipitación en etanol. La cadena principal viral pAd5/3-D24 digerida se ensambló con fragmento de CD40L-GA usando mezcla maestra de ensamblaje de Gibson (NEB, E2611) de acuerdo con las instrucciones del fabricante para generar pAd5/3-D24-CD40L. La reacción de ensamblaje de Gibson se transformó en E. coli competente para 5-alfa NEB® (NEB, C2987H) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Las colonias positivas se cribaron por PCR y la recombinación correcta se confirmó adicionalmente por secuenciación de los constructos. Para crear el constructo final, es decir, virus que contiene genes CD40L y OX40L, se amplificó un fragmento que incluía OX40L (OX40L-GA) usando los siguientes cebadores: Gibson OX40L DIR. y Gibson OX40L INV. (que amplifican la región en pShuttle-OX40L que corresponde a nucleótidos 11 a 3287), véase la tabla 4b para secuencias de cebador. La reacción de PCR se realizó con ADN polimerasa Phusion High-Fidelity (Thermo Fisher, F530) de acuerdo con las instrucciones del fabricante y las reacciones se purificaron con Gel NucleoSpin® y kit de limpieza de PCR (MACHEREY-NAGEL, 740609.50). Para clonar OX40L-GA en la cadena principal viral, se digirió pAd5/3-D24-CD40L con Srfl (NEB, R0629L) y Barl (SibEnzyme®, E548) seguido por precipitación en etanol. La cadena principal viral pAd5/3-D24-CD40L digerida se ensambló con el fragmento OX40L-GA usando mezcla maestra de ensamblaje de Gibson (NEB, E2611) de acuerdo con las instrucciones del fabricante para generar pAd5/3-D24-CD40L-OX40L. La reacción de ensamblaje de Gibson se transformó en E. coli competente para 5-alfa n Eb® (NEB, C2987H) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Las colonias positivas se cribaron por PCR y la recombinación correcta se confirmó adicionalmente por secuenciación de los constructos.
Métodos para ensayo in vitro del adenovirus modificado con un transgén o con dos transgenes
Análisis de citometría de flujo para determinar la interacción de OX40L/OX40
Se realizó un análisis de citometría de flujo para verificar que el OX40L expresado a partir de los virus puede unirse a su receptor nativo, OX40 (Figura 2). Se sembraron células A549 humanas en una placa de 6 pocillos y se infectaron con los virus de transgén doble (Ad5/3-D24-OX40L-CD40L.C1 y Ad5/3-D24-OX40L-CD40L.C3, denominados OX40L/CD40L.C1 y OX40L/CD40L.C3), el virus con OX40L solo (Ad5/3-D24-OX40L, denominado virus-OX40L en las figuras) o un virus sin transgenes (Ad5/3-D24, denominado virus-cont.) con una multiplicidad de infección de 10 (es decir, 10 virus por célula).
Las células se recogieron 72 horas después de la infección, se hizo su recuento, y se sembraron 3 x 105 células por pocillo en una placa de 96 pocillos por duplicado. La placa se centrifugó a 400 g durante 5 minutos y se resuspendió en PBS. Esta etapa se repitió dos veces, y a continuación las células se suspendieron en una mezcla de anticuerpo de receptor de OX40 y anticuerpo anti-conejo de cabra Alexa fluor 488, se incubaron durante 30 minutos, se lavaron 3 veces y a continuación se desarrollaron en un citómetro de flujo BD Accuri para detectar la media geométrica de las células del complejo OX40L/OX40. Los datos se analizaron con el software FlowJo.
ELISA sándwich para verificar la interacción de OX40L/OX40
Para verificar además que el OX40L expresado a partir de los virus puede unirse a su receptor nativo, OX40, se realizó un Elisa sándwich funcional (Figura 3). Una placa de 96 pocillos se revistió con 2 ug/ml de receptor de OX40 en su forma nativa durante la noche y posteriormente se lavó 3 veces con Tween 20 al 0,05 % v/v en PBS. El sobrenadante de las células A549 infectadas con virus se añadió a los pocillos y la placa se incubó a 37 °C durante 1 hora, y posteriormente se lavó de nuevo 3 veces. Los pocillos se incubaron durante 1 hora con un anticuerpo anti-OX40L humano de ratón (dilución 1:1000 en PBS), se lavaron 3 veces, y se incubaron con un conjugado anti-ratón-HRP (dilución 1:1000 en PBS) durante 1 hora. Después de lavar las placas 3 veces, se añadieron 90 pl de sustrato de TMB y la placa se incubó en la oscuridad a temperatura ambiente durante 10 minutos. La HRP conjugada con el anticuerpo anti-ratón reacciona con el sustrato de TMB colorimétricamente, y se midió la intensidad del color a 450 nm espectrofotométricamente.
Ensayo de funcionalidad con OX40/NF-kB-línea celular recombinante HEK293
Para verificar que el OX40L producido por los virus (los virus de transgén único o los virus de transgén doble) es funcional y puede activar las señales corriente abajo cuando se une a su receptor, OX40, se realizó un ensayo de funcionalidad usando la línea 293 de células de riñón embrionario humano (HEK-293) que expresa OX40 de forma constitutiva (Figura 4).
El producto de OX40L se produce en el medio de cultivo de un cultivo celular A549 infectado con un virus que expresa el gen OX40L. Se recoge el medio y se añade a un cultivo de indicador de OX40/NF-KB-células HEK293 que expresan de forma constitutiva el receptor OX40. La unión de OX40L al receptor de OX40 desencadena una ruta de señalización intracelular que, mediante la activación de NF-kB, conduce a la expresión del gen indicador de luciferasa de luciérnaga. La actividad de luciferasa se mide usando el sistema de ensayo de luciferasa ONE-step y un luminómetro para determinar la bioluminiscencia relativa de una concentración conocida de patrón OX40L. A continuación, puede analizarse la concentración de OX40L de la muestra de virus basándose en las lecturas de luminiscencia y la curva patrón. Antes de poder determinar la concentración de OX40L, debe definirse una curva patrón para OX40L usando concentraciones conocidas de OX40L humano recombinante.
En resumen, se sembraron 1,5 x 104 células A549 en una placa de 96 pocillos en DMEM al 10 %. Al día siguiente, las células A549 se infectaron con una multiplicidad de infección de 10, es decir, 10 virus por célula, con el virus de transgén único (Ad5/3-D24-OX40L, denominado virus-OX40L en las figuras), los virus de transgén doble (Ad5/3-D24-OX40L-CD40L.C1 y Ad5/3-D24-OX40L-CD40L.C3, denominados OX40L/CD40L.C1 y OX40L/CD40L.C3) o un virus sin transgén (Ad5/3-D24, denominado virus-cont.) en DMEM al 2 %.
Algunos pocillos se dejaron sin infectar para usarlos como control negativo. Se centrifugaron las células a 500 g durante 5 minutos, 72 horas después de la infección, se desechó el medio y se añadieron 2 x 105 células OX40/NF-kB-HEK293 en 100 ul de MEM al 10 % sobre las células A549. Después de centrifugar a 400 g durante 1 minuto, las células se incubaron a 37 °C durante 6 horas antes de someter a lisis con un tampón de lisis y añadir 20 ul de cada lisado en una placa transparente de 96 pocillos. Después de añadir 100 ul del reactivo de luciferasa como sustrato, se leyó inmediatamente la luminiscencia en un luminómetro.
Ensayo de funcionalidad para el producto de transgén de CD40L
Para verificar que la proteína CD40L expresada a partir de los virus de transgén doble puede unirse a su receptor nativo CD40 y activar las señales de corriente abajo en las células que expresan CD40, se realizó un ensayo de funcionalidad basado en células Ramos Blue (Figura 5).
Ramos Blue es una línea celular de linfocitos B que expresa de forma estable un gen indicador de SEAP (fosfatasa alcalina embrionaria secretada) inducible por NF-kB. El producto de CD40L se produce en el medio de cultivo de un cultivo celular infectado con un virus PeptiCRAd que expresa el gen de CD40L. El medio se recoge y se añade a un cultivo de células Ramos Blue que expresan constitutivamente el receptor CD40. La unión de CD40L a CD40 desencadena una ruta de señalización intracelular que conduce a la secreción de SEAP que convierte un sustrato en azul y que puede medirse espectrofotométricamente a 620-655 nm. La concentración relativa del CD40L funcional se determina usando una curva patrón para CD40L humano recombinante.
En resumen, se sembraron células A549 humanas en una placa de 6 pocillos y se infectaron con los virus de transgén doble (OX40L/CD40L.C1 o OX40L/CD40L.C3), el virus solo con OX40L (virus-OX40L) como transgén o un virus sin transgenes (virus-Cont.) con una multiplicidad de infección de 10. El sobrenadante se recogió 72 horas después y se retiró cualquier célula y residuo celular por centrifugación a 500 g durante 5 minutos. Se preparó una serie de diluciones 2 veces a partir de los sobrenadantes y de la proteína CD40L recombinante con una concentración inicial de 100 ug/ml. Se añadieron 100 pl de cada sobrenadante a 4 x 105 células Ramos Blue en una placa de 96 pocillos (sembrado en placas en 100 pl) y la placa se incubó a 37 °C durante 18 horas. Después de incubación, las células sedimentaron por centrifugación a 400 g durante 5 minutos y se añadieron 40 pl del sobrenadante a una nueva placa de 96 pocillos. Se añadieron 160 pl del sustrato QUANTI-Blue, se incubó la placa durante 1 hora y el nivel de SEAP se determinó espectrofotométricamente.
Métodos para ensayo in vivo del adenovirus modificado con y sin revestimiento de antígeno peptídico
Se humanizaron ratones inmunodeficientes NOD/Shi-scid/IL-2RYnulo usando células madre hematopoyéticas (CD34+, HLA-B35+) aisladas de sangre de cordón umbilical humano. Se implantaron tumores de melanoma humano A375 por vía subcutánea (2x106 células por 100 ul) y los animales se distribuyeron aleatoriamente en grupos basándose en la tasa de humanización y el tamaño tumoral. Los animales se trataron con virus oncolítico sin revestimiento peptídico (VALO-C1) o virus oncolítico con revestimiento de antígeno peptídico (PeptiCRAd) (dosis de virus 1 x 108 para ambos grupos; también se sometió a ensayo una dosis subóptima de 1 x 107 para PeptiCRAd). Las vacunas peptídicas (0,12 o 30 ug) se administraron por vía intradérmica con Poli-IC como adyuvante.
Los tratamientos comenzaron 25 días después de la aleatorización (D0) con una dosis en bolo de ciclofosfamida (1 mg/ratón i.v.). Los tratamientos se administraron por vía intratumoral (simulado, virus y PeptiCRAd) o por vía intradérmica (control peptídico) los días 1, 2, 3 y 12. Se implantaron tumores secundarios en el costado contralateral dos días después del tercer tratamiento (día 5). No se administraron tratamientos para tumores secundarios.
Se analizaron células mononucleares de sangre periférica (PBMC) y linfocitos CD8+ infiltrantes tumorales (TIL) para detectar antígeno peptídico NY-ESO-1 y linfocitos T CD8+ específicos de MAGE por citometría de flujo con análisis dextramérico. Se evaluaron diferentes subconjuntos de células inmunitarias entre PBMC y TIL. El análisis de citometría de flujo se realizó en el citómetro de flujo Attune NxT (Life Technologies).
Inmunización de modelo de ratón de PBMC
Se injertaron 2.106 células tumorales SKMEL-2 (HLA-B35+) en el costado derecho (Día 0) a 35 ratones inmunodeficientes (NCG) NOD-Prkdcem26Cd52/IL-2RYem26Cd22/NjuCrl de ocho semanas de edad. El día 13, se inyectaron por vía intravenosa 5x106 células mononucleares de sangre periférica humana (PBMC) HLA-B35+ de dos donantes diferentes. Se iniciaron tratamientos intratumorales con cápside 5/3 formando complejo con NYESO-1 y MAGE-A3 y que contenía virus que expresa OX40L ("OX40L PeptiCRAd") o una cápside 5/3 formando complejo con NYESO-1 y MAGE-A3 que contenía virus que expresa OX40L y CD40L ("PeptiCRAd") el Día 16 con una dosis viral de 1 x 109 VP formando complejo con cada péptido. Simultáneamente con el primer tratamiento con PeptiCRAd, se inyectaron por vía intratumoral 50.000 células dendríticas plasmocitoides y mieloides autólogas. Los días 17 y 18 (cebado con el primer tratamiento) y 25 (refuerzo), los tumores se trataron con inyecciones intratumorales de PeptiCRAd sin adición de células dendríticas. El esquema de tratamiento se presenta en la figura 10. Se siguió el crecimiento tumoral. Los animales se sacrificaron el día 32. OX40L-PeptiCRAd y PeptiCRad contienen una deleción de 24 pb en E1A, una región de gp19k/7.1K eliminada por deleción, un transgén OX40L humano expresado a partir del locus de 14.7K y una fibra quimérica 5/3.
Resultados
Funcionalidad del OX40L expresado a partir de los virus
El análisis de citometría de flujo, así como el ELISA sándwich, indican que el producto de transgén OX40L expresado de los virus en la superficie celular de la célula infectada, así como desprendido en cierta medida de la superficie celular, puede unirse a su receptor OX40 (Figuras 2 y 3, respectivamente). Lo que es más importante, al analizar la funcionalidad del OX40L expresado a partir de los virus, se observó una clara activación del gen corriente abajo al utilizar células HEK-293 que expresan de manera estable el receptor OX40 (Figura 4). La unión de OX40L a OX40 desencadena una ruta de señalización intracelular en estas células que, mediante activación de NF-kB, conduce a la expresión del gen indicador de luciferasa de luciérnaga. Los niveles de bioluminiscencia obtenidos al usar células A549 infectadas con virus que expresan OX40L indican claramente que la proteína OX40L es funcional y activa la señalización corriente abajo cuando se une a OX40, en comparación con los niveles de bioluminiscencia obtenidos usando un virus sin transgén o controles celulares negativos.
Funcionalidad del CD40L expresado a partir de los virus que expresan OX40L/CD40L
Se observó una clara activación del gen corriente abajo al analizar la funcionalidad de CD40L utilizando células Ramos Blue que expresan de manera estable el receptor CD40 (Figura 5). La unión de CD40L a CD40 desencadena una ruta de señalización intracelular en estas células que, mediante la activación de NF-kB, conduce a la expresión del gen de SEAP. Los niveles de absorbancia obtenidos al usar las células A549 infectadas con virus que expresan CD40L indican claramente que la proteína CD40L es funcional y activa la señalización corriente abajo cuando se une a CD40, en comparación con los niveles de absorbancia obtenidos al usar virus sin CD40L como transgén o controles celulares negativos.
El virus oncolítico modificado con y sin antígeno superficial peptídico provoca una respuesta inmunitaria específica de péptido en un modelo de ratón humanizado
Todos los tratamientos activos (péptido solo, virus sin péptido [VALO-C1] y virus con péptido [PeptiCRAd]) aumentaron el número de células inmunitarias en tumores primarios en comparación con los animales tratados de forma simulada. Los animales tratados con VALO-C1 y PeptiCRAd-1 mostraron más linfocitos T (CD3, CD4, CD8) en tumores primarios en comparación con la vacuna peptídica o animales tratados de forma simulada después del tratamiento, mientras que el número total de células inmunitarias infiltrantes (CD45) fue similar en todos los grupos (Figuras 6 y 7, respectivamente).
Además, el número de linfocitos T reguladores (CD3+/CD4+/FoxP3+) fue menor en tumores primarios tratados con VALO-C1 y PeptiCRAd-1 en comparación con tumores primarios de animales tratados con vacuna peptídica o de forma simulada (Figura 8). Esto sugiere que el adenovirus inmunogénico administrado por vía intratumoral (virus VALO-C1 desnudo o PeptiCRAd-1) modula el microentorno tumoral al reducir la inmunosupresión local.
El adenovirus oncolítico con (PeptiCRAd) o sin (VALO-C1) antígeno peptídico es superior a la vacunación peptídica estándar para desencadenar respuestas sistémicas de linfocitos T c D8+ dirigidas a tumores e infiltración de TIL CD8+ en tumores distantes no tratados. Los datos sugieren que PeptiCRAd mejora la especificidad de fijación como diana tumoral de un virus oncolítico estándar.
PeptiCRAd provoca respuesta inmunitaria específica peptídica en un modelo de ratón de PBMC
Los tratamientos con PeptiCRAd formando complejo con NY-ESO-1 y MAGE-A3 dieron como resultado detención del crecimiento tumoral en un modelo de melanoma de ratón humanizado incluso cuando el tratamiento se inició para tumores grandes y bien establecidos (Figura 9). Los ratones tratados con OX40L-PeptiCRAd mostraron significativamente más linfocitos T CD8+ específicos de MAGE-A3 entre todos los linfocitos T CD8+ de las PBMC que los ratones tratados de forma simulada, lo que indica que el tratamiento con PeptiCRAd pudo provocar una respuesta específica peptídica en ratones humanizados (Figura 10).
Referencias
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Figure imgf000013_0001
 T l 1. r r fr m n A P R n A D24 m ml .
Figure imgf000014_0001
T l 2. r r fr m n B P R n h l- D4 L m ml .
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T l . r r fr m n P R n A -D24 m ml .
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Claims (17)

REIVINDICACIONES
1. Un adenovirus de tipo natural replicante modificado de serotipo 5 que tiene actividad lítica en células cancerosas diana que comprende:
a) una deleción génica de E1A en donde la deleción es de pares de bases 923-946;
b) una sustitución quimérica 5/3 de una protuberancia de una proteína de fibra adenoviral en donde la protuberancia de Ad de serotipo 5 está reemplazada por la protuberancia de un Ad de serotipo 3;
c) una deleción génica de 14.7k en donde la deleción es de pares de bases 30446-30460 con respecto al adenovirus de tipo natural y en donde la secuencia GGA GGA GAT GAC TGA eliminada por deleción está sustituida por g Ga GGA GAC GAC TGA; y
d) una deleción génica de gp19k y una deleción génica de 7.1k en donde las deleciones son de pares de bases 28541-29211 con respecto al adenovirus de tipo natural.
2. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 1 en donde dicho adenovirus está modificado además por la inserción de una molécula que codifica OX40L.
3. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 2 en donde dicho OX40L es OX40L humano.
4. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 2 o la reivindicación 3 en donde dicho OX40L está insertado en la región E3B, reemplazando la deleción génica de 14.7K.
5. El adenovirus modificado de acuerdo con cualquier reivindicación precedente en donde dicho adenovirus está modificado por la inserción de una molécula que codifica CD40L.
6. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 5 en donde dicho CD40L es CD40L humano.
7. El adenovirus modificado de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 5-6 en donde dicha molécula de CD40L está insertada inmediatamente corriente abajo de OX40L usando un sitio de procesamiento 2A.
8. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 7 en donde el sitio de procesamiento 2A está insertado entre los dos transgenes y el sitio de procesamiento 2A está precedido por un sitio de escisión y un conector SGSG para asegurar una escisión eficaz de los transgenes.
9. El adenovirus modificado de acuerdo con las reivindicaciones 7 u 8 en donde dicho sitio de procesamiento 2A es un sitio de procesamiento 2A del virus de la fiebre aftosa (F2A) o un sitio de procesamiento 2A del tescovirus porcino-1.
10. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 5 o la reivindicación 6 en donde dicha molécula de CD40L está insertada en la región tardía del virus, específicamente en la región tardía 3 (L3).
11. El adenovirus modificado de acuerdo con la reivindicación 10 en donde dicha molécula de CD40L está insertada corriente abajo del gen 23K que precede a su sitio de poliadenilación.
12. El adenovirus modificado de acuerdo con las reivindicaciones 10 u 11 en donde un sitio aceptor de corte y empalme y/o una secuencia Kozak están provistos o insertados corriente arriba de la molécula de CD40L.
13. El adenovirus modificado de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 2-12 en donde una molécula que codifica el ADNc completo de al menos uno o cada uno de OX40L y CD40L está insertada en dicho adenovirus.
14. Una composición farmacéutica que comprende al menos un adenovirus competente para replicación modificado y lítico de células diana de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-13 y un vehículo adecuado.
15. La composición farmacéutica de acuerdo con la reivindicación 14 en donde dicha composición está formulada para inyección intratumoral, intramuscular, intraarterial, intravenosa, intrapleural, intravesicular, intradérmica, intracavitaria o peritoneal, o para una administración oral.
16. Un adenovirus competente para replicación modificado y lítico de células diana de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-13 o composición farmacéutica de acuerdo con las reivindicaciones 14-15 para uso en el tratamiento de cáncer.
17. El adenonovirus o composición farmacéutica para uso de acuerdo con la reivindicación 16 en donde dicho cáncer se selecciona entre el listado que comprende o que consiste en: cáncer nasofaríngeo, cáncer sinovial, cáncer hepatocelular, cáncer renal, cáncer de tejidos conjuntivos, melanoma, cáncer de pulmón, cáncer intestinal, cáncer de colon, cáncer rectal, cáncer colorrectal, cáncer cerebral, cáncer de garganta, cáncer oral, cáncer de hígado, cáncer óseo, cáncer pancreático, coriocarcinoma, gastrinoma, feocromocitoma, prolactinoma, leucemia/linfoma de linfocitos T, neuroma, enfermedad de von Hippel-Lindau, síndrome de Zollinger-ENison, cáncer suprarrenal, cáncer anal, cáncer de vías biliares, cáncer de vejiga, cáncer de uréter, oligodendroglioma, neuroblastoma, meningioma, tumor de médula espinal, osteocondroma, condrosarcoma, sarcoma de Ewing, cáncer de sitio primario desconocido, carcinoide, carcinoide de tracto gastrointestinal, fibrosarcoma, cáncer de mama, enfermedad de Paget, cáncer cervicouterino, cáncer de esófago, cáncer de vesícula biliar, cáncer de cabeza, cáncer ocular, cáncer de cuello, cáncer de riñón, tumor de Wilms, cáncer de hígado, sarcoma de Kaposi, cáncer de próstata, cáncer testicular, enfermedad de Hodgkin, linfoma no Hodgkin, cáncer de piel, mesotelioma, mieloma múltiple, cáncer de ovario, cáncer pancreático endocrino, glucagonoma, cáncer paratiroideo, cáncer de pene, cáncer de pituitaria, sarcoma de tejidos blandos, retinoblastoma, cáncer de intestino delgado, cáncer de estómago, cáncer de timo, cáncer de tiroides, cáncer trofoblástico, mola hidatídica, cáncer uterino, cáncer endometrial, cáncer de vagina, cáncer de vulva, neuroma del acústico, micosis fungoide, insulinoma, síndrome carcinoide, somatostatinoma, cáncer de encías, cáncer de corazón, cáncer de labios, cáncer de meninges, cáncer de boca, cáncer de nervios, cáncer de paladar, cáncer de glándula paratiroides, cáncer de peritoneo, cáncer de faringe, cáncer pleural, cáncer de glándulas salivales, cáncer de lengua y cáncer de amígdalas.
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