ES2929392T3 - Sistemas, procedimiento y medio legible por ordenador para clasificar una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito - Google Patents

Sistemas, procedimiento y medio legible por ordenador para clasificar una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito Download PDF

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Abstract

Un aspecto de la presente divulgación se relaciona con un sistema analizador automatizado para muestras biológicas que incluye un sistema de procesamiento de muestras y un controlador configurado para recibir una selección de uno de múltiples flujos de trabajo para determinar la presencia y/o concentración de un analito en una muestra biológica y el sistema analizador automatizado para llevar a cabo automáticamente el flujo de trabajo seleccionado utilizando el sistema de procesamiento de muestras y generar un resultado que clasifique la muestra biológica. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)

Description

DESCRIPCIÓN
Sistemas, procedimiento y medio legible por ordenador para clasificar una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito
Campo técnico
Esta divulgación se refiere a sistemas y procedimientos para clasificar una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito. En particular, se presentan sistemas y procedimientos para pruebas de confirmación de muestras biológicas.
Antecedentes
Actualmente, someter a prueba una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito se puede realizar por analizadores automatizados en muchas situaciones. En un ejemplo, la presencia del antígeno de superficie del VHB ("HBsAg"), que puede ser indicativa de una infección aguda o crónica por el virus de la hepatitis B ("VHB"), se puede detectar por un analizador automatizado (por ejemplo, en el transcurso de una prueba de cribado o de diagnóstico). En caso de un resultado positivo para una muestra biológica, se desea o requiere una prueba de confirmación de la muestra en muchas situaciones, por ejemplo, para reducir la probabilidad de resultados positivos falsos que pueden tener graves consecuencias para los pacientes, en particular, en el entorno del hemocribado.
Las pruebas de confirmación pueden ser un procedimiento engorroso, ya que pueden implicar un considerable número de etapas de preparación de muestras y selección de protocolos. Por una parte, se pueden justificar diferentes protocolos de pruebas de confirmación en diferentes situaciones. En algunos sistemas conocidos, un operario tiene que averiguar cómo configurar la prueba de confirmación en una situación particular, incluyendo los cálculos de las cantidades requeridas de volúmenes de muestra y de reactivo. Esto puede ser una tarea intelectualmente complicada. Además, la realización de las etapas de la prueba de confirmación puede implicar una pluralidad de etapas de preparación y pretratamiento de muestras que se tienen que realizar manualmente en algunos sistemas conocidos. Por último, un operario puede tener que interpretar los resultados de la prueba de confirmación en algunos sistemas conocidos.
Cada una de estas tareas, e incluso más su combinación, puede ser propensa a errores y requerir una considerable cantidad de recursos de laboratorio (en primer lugar y, ante todo, se puede necesitar una considerable cantidad de tiempo de trabajo del personal de laboratorio).
El documento US 6.306.616 B1 divulga un sistema para la detección mejorada de analitos y la capacidad de distinguirlos de sustancias de reactividad cruzada. Las muestras que dan una reacción positiva en una prueba de inmunoanálisis directa se tratan con un anticuerpo neutralizante que inhibe la reactividad del verdadero analito, pero no la sustancia interferente. Por tanto, las muestras que dan una reacción positiva en la prueba directa, pero una reacción disminuida en la prueba de confirmación, se marcan como que contienen el verdadero analito. Las muestras que dan una reacción positiva de magnitud aproximadamente equivalente tanto en la prueba directa como en la de confirmación se marcan como que contienen una sustancia interferente.
El documento US 2010/113285 A1 divulga un sistema analizador automatizado para muestras biológicas.
Sumario
En un primer aspecto general, la presente invención se refiere a un sistema analizador automatizado para muestras biológicas como se expone en la reivindicación 1.
En un segundo aspecto general, la presente invención divulga un procedimiento implementado por ordenador como se expone en la reivindicación 14. Se describen otros modos de realización en las reivindicaciones dependientes.
Se pueden implementar modos de realización particulares de la materia objeto de los primer y segundo aspectos generales para realizar una o más de las siguientes ventajas.
En primer lugar, las técnicas de la presente divulgación pueden reducir una carga de trabajo de un operario de un analizador automatizado por la automatización de diferentes aspectos de una prueba de confirmación de una muestra biológica en algunos ejemplos. En particular, algunos sistemas de la técnica anterior requieren etapas de decisión intelectualmente exigentes con respecto a cómo realizar una prueba de confirmación y etapas de preparación manuales engorrosas de las alícuotas de control y confirmación.
En segundo lugar, las técnicas de la presente divulgación pueden reducir un número de errores al realizar una prueba de confirmación en algunos ejemplos. Como se analiza anteriormente, algunas de las pruebas de confirmación de los sistemas de la técnica anterior incluyen etapas intelectual y manualmente complicadas que se van a llevar a cabo por operarios de los analizadores automatizados. Esto puede dar lugar a un considerable número de errores que pueden tener diferentes consecuencias que varían desde tener que repetir la prueba (lo que puede implicar la obtención de una nueva muestra) hasta los resultados falsos (lo que puede tener graves consecuencias para un paciente). Al proporcionar automatización y soporte en las decisiones automatizado, las técnicas de la presente divulgación pueden reducir una frecuencia/número de estos errores en algunas situaciones.
En tercer lugar, las técnicas de la presente divulgación pueden reducir una exposición del personal de laboratorio a sustancias o entornos de trabajo infecciosos. En algunos ejemplos, puede que un operario no tenga que manipular ninguna muestra en el procedimiento de realización de una prueba de confirmación al emplear las técnicas de la presente divulgación. Por ejemplo, en algunos ejemplos, una prueba de conformación sin interacción del usuario se puede llevar a cabo por el analizador automatizado. Además, la prueba de confirmación también se puede activar automáticamente en algunos ejemplos, lo que puede reducir además la exposición del operario a sustancias o entornos de trabajo infecciosos.
En cuarto lugar, en algunos ejemplos, se puede reducir el consumo de muestra en la prueba de confirmación. Esto, a su vez, puede significar que el volumen de muestra y de reactivo requerido para realizar una prueba de confirmación se puede reducir en algunas situaciones al usar las técnicas de la presente divulgación. Por ejemplo, un consumo de muestra de 50 |jl o menos puede ser suficiente para llevar a cabo una prueba de confirmación. Los volúmenes de reactivo y volúmenes de otras sustancias implicadas pueden ser, en consecuencia, bajos. Por tanto, la cantidad de sustancia corporal que se tiene que obtener de un paciente se puede reducir en algunas situaciones. En otros casos, trabajar con menores volúmenes de muestra puede evitar que se tenga que tomar una segunda muestra de un paciente para realizar la prueba de confirmación.
En quinto lugar, la automatización de la prueba de confirmación puede permitir modificaciones de protocolos de pruebas de confirmación que se realizan manualmente en algunos sistemas conocidos. Estos protocolos conocidos pueden incluir garantías (por ejemplo, pruebas repetidas de muestras) que se motivan, en parte, por el hecho de que el procedimiento ejecutado manualmente puede ser propenso a errores. Además, las etapas manuales en los protocolos conocidos pueden hacer que modificaciones particulares sean difíciles o imposibles de lograr. Los protocolos así modificados pueden ser más simples y, por tanto, más eficaces en términos de tiempo y recursos en algunos ejemplos (por ejemplo, se puede reducir un número de pruebas para determinar un índice de valor de corte). Sin embargo, se debe señalar que las pruebas de muestras biológicas, en particular, para enfermedades infecciosas, pueden estar sujetas a diferentes normativas en diferentes países. Por lo tanto, se pueden requerir protocolos y etapas de protocolo particulares por normativa.
En sexto lugar, el analizador automatizado puede incrementar la eficacia y/o el tiempo hasta el resultado del procedimiento de prueba en algunos ejemplos. Se puede comenzar automáticamente una prueba de confirmación cuando se descubre que una muestra es reactiva. De esta manera, el tiempo hasta el resultado se puede acortar en comparación con algunos sistemas conocidos.
En la presente divulgación, se usa una serie de términos de una manera particular:
Los términos 'automatizado'/'automáticamente' como se usa en la presente divulgación significan "sin interacción del usuario, excepto para operaciones que activan o detienen un procedimiento o etapa de un procedimiento particular, o que confirman que se ejecutará una etapa de un procedimiento particular". En otras palabras, un procesamiento automatizado/automático no significa que no exista en absoluto interacción del usuario (aunque este caso también está englobado por los términos 'automatizado'/'automáticamente'). Más bien, las posibles interacciones del usuario se limitan a comenzar/detener un procedimiento o una etapa de un procedimiento. Por ejemplo, en algunos ejemplos, un operario puede tener que confirmar que se llevará a cabo un flujo de trabajo particular de una prueba de confirmación, o que se llevará a cabo una etapa particular de una prueba de confirmación. El operario simplemente confirma/rechaza que se llevará a cabo un procedimiento, pero no toma parte en la ejecución real.
El término 'analizador automatizado' como se usa en el presente documento puede hacer referencia a cualquier clase de dispositivo técnico automatizado o semiautomatizado para su uso en trabajo de laboratorio, por ejemplo, en el área clínica, química, biológica, inmunológica o farmacéutica o similares, usado para realizar una prueba de confirmación en una muestra biológica in vitro.
En la presente divulgación, se analizarán analizadores automatizados para realizar pruebas de confirmación del virus de la hepatitis B ("VHB"). Esto significa que el analito es el antígeno de superficie del VHB ("HBsAg"). Sin embargo, las técnicas de la presente divulgación no se limitan a pruebas de confirmación de VHB. En otros ejemplos, los analizadores automatizados están configurados para realizar pruebas de confirmación para otras enfermedades o afecciones (siempre que las técnicas de la presente divulgación se puedan aplicar en la respectiva prueba de confirmación). Varias posibles implementaciones de un analizador automatizado se analizarán en los siguientes párrafos.
En general, un analizador automatizado puede comprender componentes para realizar la transferencia y dosificación de líquidos, homogeneización (mezcla) de líquidos, control de temperatura y mediciones de parámetros químicos o físicos. Por ejemplo, los dispositivos pueden incluir componentes de distribución de líquidos (por ejemplo, una pipeta electrónica o una válvula), un mezclador, un dispositivo atemperador, un batidor y/o un agitador.
En otros ejemplos, los analizadores automatizados pueden incluir un sistema de análisis o una celda de trabajo de un sistema de análisis o analizador. Por ejemplo, un analizador automatizado puede ser un analizador para analizar una propiedad mecánica, óptica, química o biológica de una muestra.
Los 'analizadores' no se localizan necesariamente en un laboratorio especializado. Más bien, el término también incluye analizadores independientes para llevar a cabo procedimientos analíticos, por ejemplo, en el área clínica, química, biológica, inmunológica o farmacéutica. Por ejemplo, un dispositivo de sobremesa en entornos de diagnóstico inmediato, tales como clínicas médicas o farmacias, o un dispositivo para uso doméstico también pueden ser analizadores automatizados de acuerdo con la presente divulgación.
'Analizadores' como se usa en el presente documento comprende una unidad de control o un controlador acoplado de forma funcional para controlar las operaciones del analizador. Además, el controlador se puede hacer funcionar para evaluar y/o procesar datos de análisis recabados, para controlar la carga, el almacenamiento y/o la descarga de muestras en y/o de uno cualquiera de los analizadores, para inicializar un análisis u operaciones de equipo informático o programa informático del sistema de análisis usado para preparar las muestras, tubos de muestra o reactivos para dicho análisis y similares.
Un analizador se puede hacer funcionar para determinar, por medio de diversos procedimientos químicos, biológicos, físicos, ópticos u otros procedimientos técnicos, un valor de parámetro de la muestra o un componente de la misma (por ejemplo, un índice de valor de corte para una muestra que incluye HBsAg como analito por medio de una señal óptica emitida a partir de la muestra).
Un analizador se puede hacer funcionar para medir dicho parámetro de la muestra o de al menos un analito y devolver el valor de medición obtenido. La lista de posibles resultados de análisis devueltos por el analizador comprende, sin limitación, concentraciones del analito en la muestra, un resultado digital (por ejemplo, sí o no, o positivo o negativo) que indica la existencia del analito en la muestra (correspondiente a una concentración por encima del nivel de detección), parámetros ópticos, imágenes, recuentos de células o partículas, secuencias de ADN o ARN, datos obtenidos de espectrometría de masas de proteínas o metabolitos y parámetros físicos, mecánicos, ópticos, eléctricos o químicos de diversos tipos.
Un analizador automatizado puede comprender unidades que ayuden con el pipeteo, la dosificación y la mezcla de muestras y/o reactivos. El analizador puede comprender una unidad de contención de reactivo para contener reactivos para realizar ensayos (en particular, para realizar una prueba de confirmación). Los reactivos se pueden disponer, por ejemplo, en forma de recipientes o casetes que contienen reactivos individuales o un grupo de reactivos, colocados en receptáculos o posiciones apropiados dentro de un compartimento de almacenamiento o transportador. Puede comprender una unidad de alimentación de material fungible. El analizador puede comprender un procedimiento y sistema de detección, estando optimizado su flujo de trabajo para determinados tipos de análisis.
En general, los ejemplos de dicho analizador son analizadores de bioquímica clínica, analizadores de química de coagulación, analizadores de inmunoquímica, analizadores de orina, analizadores de ácido nucleico, usados para detectar el resultado de reacciones químicas o biológicas o para monitorizar el avance de reacciones químicas o biológicas. En un ejemplo, el analizador se puede configurar para llevar a cabo inmunoanálisis (por ejemplo, inmunoanálisis basados en micropartículas).
En la presente divulgación, un 'analizador automatizado' o 'analizador' es parte de una unidad que es el 'sistema analizador automatizado'. En algunos ejemplos, el 'sistema analizador automatizado' puede consistir solo en el propio analizador automatizado. Sin embargo, en otros ejemplos, un 'sistema analizador automatizado' puede incluir adicionalmente otros componentes que se acoplan a y/o conectan en red con el analizador automatizado (por ejemplo, a través de una red de comunicación) y toman parte en la realización de las técnicas de la presente divulgación. Estos otros componentes pueden ser locales a y/o remotos del analizador automatizado en el que tiene lugar el procesamiento de muestras. Por ejemplo, un sistema de gestión de laboratorio u hospitalario se puede acoplar a o conectar en red con el analizador automatizado y controlar las funciones del analizador automatizado. En otros ejemplos, se puede conectar en red un dispositivo portátil o una estación de trabajo remota con el analizador automatizado para proporcionar control de funciones para el analizador automatizado. El sistema analizador automatizado también puede incluir múltiples analizadores automatizados distribuidos en algunos ejemplos para llevar a cabo las pruebas de la presente divulgación.
El término 'muestra biológica' o 'muestra' se refiere a material(es) que potencialmente puede(n) contener un analito de interés. La muestra se puede derivar de una fuente biológica, tal como un líquido fisiológico, incluyendo sangre completa, plasma, suero, saliva, líquido del cristalino ocular, líquido cefalorraquídeo, sudor, orina, heces, semen, leche, líquido ascítico, moco, líquido sinovial, líquido peritoneal, líquido amniótico, tejido, células o similares. La muestra biológica se puede pretratar antes de su uso. El pretratamiento puede implicar la centrifugación, filtración, dilución, concentración y/o separación de los componentes de muestra, incluyendo los analitos de interés, la inactivación de los componentes interferentes y la adición de reactivos.
Una muestra se puede usar directamente como se obtiene de la fuente o usar tras un pretratamiento para modificar el carácter de la muestra. En algunos modos de realización, un material biológico inicialmente sólido o semisólido se puede volver líquido disolviéndolo o suspendiéndolo con un medio líquido adecuado. En algunos ejemplos, se puede sospechar que la muestra contiene un determinado antígeno o ácido nucleico.
Una muestra se puede tratar antes de que se realicen las pruebas analíticas. La sangre extraída de un paciente, por ejemplo, se puede centrifugar para obtener suero o tratar con anticoagulantes para obtener plasma.
En la presente divulgación, se analizarán en detalle muestras derivadas de sangre (por ejemplo, muestra de suero o plasma) para su uso en una prueba de confirmación de VHB. Sin embargo, las técnicas de la presente divulgación no se limitan a muestras de sangre o muestras derivadas de sangre. En otros ejemplos, se pueden usar otras muestras biológicas para realizar pruebas de confirmación (siempre que las técnicas de la presente divulgación se puedan aplicar para detectar una presencia del respectivo analito).
El término 'analito' como se usa en la presente divulgación se refiere a una sustancia o constituyente que es de interés en un procedimiento analítico. En algunos ejemplos, un analito puede ser una proteína. Por ejemplo, un analito puede ser un patógeno (por ejemplo, un virus, una bacteria o un microorganismo) o un anticuerpo producido en reacción a una infección por un patógeno (por ejemplo, un virus, una bacteria o un microorganismo). En la presente divulgación, el antígeno de superficie del virus de la hepatitis B ("HBsAg") se describe como analito en la mayoría de los ejemplos. Sin embargo, las técnicas de la presente divulgación no se limitan al antígeno de superficie del virus de la hepatitis B como analito.
En otros ejemplos, otros analitos potencialmente presentes en las muestras biológicas se pueden usar como dianas en las pruebas de confirmación (siempre que las técnicas de la presente divulgación se puedan aplicar para procesar la respectiva muestra). Por ejemplo, en algunos ejemplos se pueden detectar analitos indicativos de otras enfermedades infecciosas distintas de hepatitis B, o analitos indicativos de otras afecciones distintas de enfermedades infecciosas.
La expresión 'presencia de un analito' se refiere a una medición cualitativa de un análisis (por ejemplo, que incluye una decisión binaria de que un analito está presente). La expresión 'concentración de un analito' se refiere a una medición cuantitativa (por ejemplo, que incluye la determinación de que un analito está presente en una determinada concentración).
El término 'agente' como se usa en la presente divulgación no se limita a situaciones donde el agente incluye solo una única sustancia (activa). Un 'agente' también puede incluir dos o más sustancias (activas). Además, un agente puede incluir un kit de sustancias preparadas para usarse en una pluralidad de etapas (que pueden tener lugar en paralelo, en serie, posteriormente y/o con otras etapas intercaladas).
En consecuencia, 'añadir un agente' puede incluir una pluralidad de subetapas que se pueden llevar a cabo en paralelo o en serie. Además, 'añadir un agente' cubre situaciones donde se llevan a cabo una pluralidad de etapas en sucesión directa, o se interrumpen por otras etapas (por ejemplo, etapas de incubación).
En un ejemplo, un agente puede incluir diversos tipos de reactivos que se requieran para llevar a cabo una prueba de diagnóstico analítica in vitro (por ejemplo, un ensayo de tipo sándwich). Por ejemplo, un agente puede incluir los reactivos que se requieren para determinar específicamente el analito, por ejemplo, compañeros de unión tales como anticuerpos que se unen específicamente al analito. Un grupo de estos compañeros de unión o anticuerpos específicos de analito se puede marcar para asegurarse de que el analito se pueda determinar por medio de una señal detectable y otro grupo de compañeros de unión o anticuerpos específicos de analito se puede fijar a una fase sólida, tal como a micropartículas.
Un agente también puede ser un agente de neutralización que pueda contener compañeros de unión específicos de analito en forma no marcada.
El término agente también cubre agentes de control que no contienen ningún compañero de unión o anticuerpo específico de analito (por ejemplo, suero humano que ha dado negativo para el analito o una solución tampón). En algunos ejemplos, un agente también incluye ingredientes adicionales para provocar un resultado particular (por ejemplo, partículas en fase sólida, tampones, sales, etc.).
El término 'nivel de dilución particular' como se describe en el presente documento engloba una situación donde no existe dilución (es decir, el nivel de dilución es cero).
El término 'dilución' (y, respectivamente, 'operación de dilución') no se limita a la adición de agentes de dilución (por ejemplo, tampones, suero normal) y cualquier otra sustancia (por ejemplo, sustancias químicas, anticuerpos, antígenos, compuestos antiinterferencia, conservantes, etc.) a una muestra. Como ejemplo, una etapa de dilución también puede hacer referencia a la adición de detergentes a las alícuotas de muestra que se requieren para liberar un analito de interés, normalmente seguido de un determinado tiempo de incubación antes de que se determine la presencia y/o concentración del analito.
Una 'unidad de control' o 'controlador' controla el sistema automatizado o semiautomatizado de manera que las etapas necesarias para los protocolos de procesamiento se realicen por el sistema automatizado. Eso significa que el controlador, por ejemplo, puede dar instrucciones al sistema automatizado para realizar determinadas etapas de pipeteo para mezclar la muestra biológica líquida con reactivos, o el controlador controla el sistema automatizado para incubar las mezclas de muestra durante un determinado tiempo, etc. La unidad de control puede recibir información de una unidad de gestión de datos con respecto a qué etapas se necesitan realizar con una determinada muestra. En algunos modos de realización, el controlador puede ser integral con la unidad de gestión de datos o se puede realizar por un equipo informático común. El controlador se puede realizar, por ejemplo, como un controlador lógico programable que ejecuta un programa legible por ordenador provisto de instrucciones para realizar operaciones de acuerdo con un plan de operación de procedimiento. El controlador se puede configurar, por ejemplo, para controlar una cualquiera o más de las siguientes operaciones: carga y/o desechado y/o lavado de cubetas y/o puntas de pipeta, movimiento y/o apertura de tubos de muestra y casetes de reactivo, pipeteo de muestras y/o reactivos, mezcla de muestras y/o reactivos, lavado de agujas o puntas de pipeteo, lavado de paletas de mezcla, control de una fuente de luz, por ejemplo, selección de la longitud de onda o similares. En particular, el controlador puede incluir un programador para ejecutar una secuencia de etapas dentro de un tiempo de ciclo predefinido. El controlador puede determinar además el orden de las muestras que se van a procesar de acuerdo con el tipo de ensayo, urgencia y similares.
El término 'red de comunicación' como se usa en el presente documento engloba cualquier tipo de red inalámbrica, tal como WIFI, GSM, UMTS u otra red digital inalámbrica, o una red basada en cable, tal como Ethernet o similares. En particular, la red de comunicación puede implementar el protocolo de Internet (IP). Por ejemplo, la red de comunicación comprende una combinación de redes basadas en cable e inalámbricas.
A menos que se especifique de otro modo, los términos 'aproximadamente' y 'sustancialmente' como se usa en el presente documento pueden hacer referencia a una desviación de /- 10 % del valor indicado. Si dos valores son 'sustancialmente' o 'aproximadamente' iguales, esto puede significar que los valores difieren como máximo en un 10 % (determinado a partir del valor más pequeño).
Descripción de los dibujos
La FIG. 1 incluye una ilustración esquemática de un sistema analizador automatizado para muestras biológicas de acuerdo con la presente divulgación.
La FIG. 2 incluye un diagrama de flujo de un flujo de trabajo de ejemplo de acuerdo con la presente divulgación.
La FIG. 3 incluye un diagrama de flujo de otro procedimiento de prueba de confirmación de ejemplo de acuerdo con la presente divulgación.
La FIG. 4 incluye un diagrama de flujo de un procedimiento de prueba de cribado o de diagnóstico y de prueba confirmación combinadas de ejemplo de acuerdo con la presente divulgación.
Descripción detallada
Los procedimientos y sistemas para clasificar una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito de acuerdo con la presente divulgación se analizarán posteriormente con más detalle.
En primer lugar, se analizará un sistema analizador automatizado de ejemplo en relación con la FIG. 1. Posteriormente, los aspectos de los flujos de trabajo que se pueden llevar a cabo por los sistemas analizadores automatizados de acuerdo con la presente divulgación, que pueden implicar una prueba de confirmación o una combinación de una prueba de diagnóstico o de cribado y una prueba de confirmación, se analizarán en relación con de la FIG. 2 a la FIG. 4.
Sistema analizador automatizado
La FIG. 1 ilustra un sistema analizador automatizado 1 de ejemplo de acuerdo con la presente divulgación.
Un operario 3 puede monitorizar y controlar el sistema analizador automatizado 1 por medio de una interfaz de usuario 4. En el ejemplo de la FIG. 1, la interfaz de usuario 4 es un monitor del sistema analizador automatizado 1. Sin embargo, la interfaz de usuario puede ser cualquier otro dispositivo adecuado para emitir información con respecto al estado del sistema analizador automatizado 1 y para permitir la entrada del usuario al sistema analizador automatizado. Por ejemplo, se puede proporcionar una interfaz de usuario en un dispositivo móvil o en un dispositivo remoto (por ejemplo, un ordenador portátil o un teléfono inteligente). Además o de forma alternativa, una interfaz de usuario necesariamente no es una interfaz gráfica de usuario en una pantalla, sino que también se puede proporcionar a través de otros canales (por ejemplo, el operario 3 puede introducir instrucciones a través de comandos de voz o gestos).
Además, el sistema analizador automatizado 1 incluye un sistema de procesamiento de muestras 2 configurado para llevar a cabo las etapas de procesamiento de muestras automatizadas de acuerdo con la presente divulgación. En un ejemplo, el sistema de procesamiento de muestras 2 se puede equipar con una o más unidades de distribución (por ejemplo, unidades de pipeteo, no mostradas en la FIG. 1) para tomar alícuotas de muestras, añadir diluyentes y reactivos y otras operaciones de manipulación de pretratamiento de muestras.
Además, el sistema de procesamiento de muestras 2 puede incluir una unidad de medición para detectar un parámetro de la muestra (por ejemplo, un fotómetro u otras unidades de medición ópticas). Además o de forma alternativa, el sistema analizador automatizado puede incluir cualquiera de los componentes analizados en la sección de sumario anterior.
En un ejemplo, el sistema analizador automatizado 1 está configurado para usar el sistema de procesamiento de muestras 2 para llevar a cabo la prueba de confirmación y una prueba de cribado o de diagnóstico en la muestra biológica. De acuerdo con los resultados de las pruebas, se puede clasificar una muestra biológica (por ejemplo, como 'reactiva' o 'no reactiva'). Antes de continuar con el análisis de los componentes del sistema analizador automatizado 1 de acuerdo con la presente divulgación, se dará posteriormente información preliminar con respecto a las pruebas de cribado o de diagnóstico.
Como se analiza anteriormente, el sistema analizador automatizado puede llevar a cabo pruebas in vitro en muestras biológicas para detectar la presencia y/o concentración de un analito particular (o de más de un analito).
En algunos ejemplos, las pruebas para determinar la presencia de un analito en una muestra biológica proporcionan un valor obtenido para un parámetro medible física o químicamente (por ejemplo, una señal de absorción o una señal de emisión). Estas pruebas de diagnóstico o de cribado pueden tener resultados continuos que se miden en una escala. Para decidir si un valor medido se clasifica como 'normal' (o 'negativo' o 'no reactivo') o como 'patológico' (o 'positivo' o 'reactivo'), se pueden definir criterios que separan el intervalo normal del intervalo patológico o anómalo.
En algunos ejemplos (en particular, en el campo de las enfermedades infecciosas) dichos criterios pueden incluir un umbral. Si el parámetro medido varía por debajo del umbral, una muestra se considera no reactiva o negativa. Si el parámetro medido varía por encima del umbral, una muestra se clasifica como reactiva o positiva. Un ejemplo de dicho umbral es el llamado "valor de corte", que es un punto divisorio en una escala de medición que se establece para los procedimientos de prueba para diferenciar entre valores positivos y negativos.
Dicho umbral se puede seleccionar de modo que la prueba todavía proporcione una alta sensibilidad predefinida (alta tasa de positivos verdaderos), pero, al mismo tiempo, también garantice una alta especificidad predefinida (alta tasa de negativos verdaderos) de modo que se eviten resultados positivos falsos y negativos falsos. Dependiendo del diseño de la prueba y para evitar resultados positivos falsos, el valor de corte se puede definir como un múltiplo de la señal de fondo o como un múltiplo del resultado de una muestra normal (negativa).
En algunos ejemplos, los resultados de las pruebas se proporcionan en forma de un "índice de valor de corte" (COI) que puede ser una proporción de una señal resultado obtenida para una muestra dividida por el valor de corte predefinido, lo que da como resultado una proporción muestra de señal/valor de corte.
En particular, en el diagnóstico de enfermedades infecciosas, se pueden elegir un valor de corte y un COI calculado de modo que se logren una alta sensibilidad y una alta especificidad de un ensayo, es decir, idealmente se tienen que detectar todos los positivos y entre esos positivos no debe existir ningún positivo falso, o al menos tan pocos positivos falsos como sea posible. En muchos casos, la sensibilidad y especificidad para la mayoría de las pruebas para enfermedades infecciosas altamente reguladas es de al menos un 98 % (por ejemplo, variando de un 98 a un 99,95 %).
Volviendo a la FIG. 1, el sistema analizador automatizado 1 se puede configurar para presentar dos o más flujos de trabajo 5 para pruebas de confirmación que se van a llevar a cabo por el sistema analizador automatizado en la interfaz de usuario 4, y recibir una selección de uno de los flujos de trabajo 5 que se van a llevar a cabo a través de la interfaz de usuario 4. El sistema analizador automatizado está configurado para ejecutar el flujo de trabajo seleccionado de la prueba de confirmación de manera automatizada. El flujo de trabajo se puede almacenar en el sistema analizador automatizado o recibir por el sistema analizador automatizado de manera adecuada (por ejemplo, como programa informático, equipo informático o una combinación de ambos). En un ejemplo, los flujos de trabajo se definen como parte de la configuración de fábrica del sistema analizador. En otros ejemplos, los flujos de trabajo se pueden proporcionar al sistema analizador después de la implementación del sistema analizador en el campo a través de una red de comunicación.
Posteriormente se darán aspectos adicionales con respecto a este procedimiento y la estructura de los flujos de trabajo (en particular, en relación con la FIG. 2).
En otros ejemplos, el sistema analizador automatizado se puede configurar para seleccionar automáticamente un flujo de trabajo para una prueba de confirmación (es decir, el operario no tiene que seleccionar el flujo de trabajo que se ejecutará). Los detalles con respecto a estos ejemplos también se analizarán a continuación (en particular, en relación con la FIG. 3).
Prueba de confirmación con selección de flujo de trabajo por el usuario
La FIG. 2 incluye un diagrama de flujo de un flujo de trabajo de ejemplo para una prueba de confirmación (una prueba de confirmación de VHB en el presente ejemplo) de acuerdo con la presente divulgación. Este flujo de trabajo se puede llevar a cabo por el sistema analizador automatizado de manera automatizada.
En el ejemplo de la FIG. 2 , una prueba de cribado o de diagnóstico de VHB puede haber arrojado un resultado positivo (reactivo) para una muestra biológica particular. Para confirmar este hallazgo, se pide una prueba de confirmación.
En el sistema de análisis automatizado de la presente divulgación, el operario puede seleccionar uno de múltiples flujos de trabajo proporcionados por el sistema de análisis automatizado para realizar la prueba de confirmación. En un ejemplo, como se muestra en la FIG. 1, la interfaz de usuario del sistema analizador automatizado puede presentar una selección (por ejemplo, una o más) de los múltiples flujos de trabajo o todos los múltiples flujos de trabajo (por ejemplo, que presenten las respectivas representaciones gráficas en la interfaz de usuario). La selección se recibe en el sistema analizador automatizado, que posteriormente solicita al sistema analizador automatizado que lleve a cabo automáticamente el flujo de trabajo seleccionado usando el sistema de procesamiento de muestras.
Como se representa en la FIG. 2 , cada uno de los múltiples flujos de trabajo define una pluralidad de etapas que se van a llevar a cabo por el sistema analizador automatizado. Cada flujo de trabajo se asigna a un valor o a un intervalo de valores del parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración de un analito en la muestra biológica. En la FIG. 2 , el flujo de trabajo se asigna a un intervalo de "COI bajo" (por ejemplo, el COI determinado para la muestra biológica es igual a o está por debajo de un (primer) umbral predeterminado). Los demás flujos de trabajo de los múltiples flujos de trabajo proporcionados por los sistemas analizadores automatizados se pueden asignar a otros intervalos de COI.
En un ejemplo, se puede asignar un segundo flujo de trabajo a un intervalo de COI alto (por ejemplo, el COI determinado para la muestra biológica está por encima de un (segundo) umbral predeterminado). Además, se pueden asignar uno o más terceros flujos de trabajo a un intervalo intermedio de COI (por ejemplo, el COI determinado para la muestra biológica está por encima del primer umbral y es igual a o está por debajo del segundo umbral).
Como se analiza anteriormente, el COI es solo un posible parámetro medido indicativo una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica. Aunque el COI se usará como parámetro en los ejemplos posteriores, las técnicas de la presente divulgación también se pueden emplear con otros parámetros indicativos de una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica. Por ejemplo, la presencia y/o concentración de un analito también se puede expresar en unidades de concentración (por ejemplo, mol/l o mg/l) o un porcentaje.
En el ejemplo de la FIG. 2 , un conjunto de flujos de trabajo para la prueba de confirmación se proporciona por el sistema analizador automatizado. En todavía otros ejemplos, los múltiples flujos de trabajo se pueden definir por un único flujo de trabajo parametrizado por uno o más parámetros. En estos ejemplos, la selección de uno de los múltiples flujos de trabajo incluye especificar los uno o más parámetros. Por ejemplo, un operario puede seleccionar un flujo de trabajo especificando un COI de la muestra biológica en algunos ejemplos. Por ejemplo, el COI determinado para la muestra biológica puede ser de 7,5, de modo que el operario puede introducir este valor en el sistema analizador automatizado.
Volviendo a la FIG. 2 , el sistema analizador automatizado puede recibir una selección del flujo de trabajo (en 101). En 103 y 104, el analizador automatizado prepara automáticamente al menos una primera y una segunda alícuota de muestra de una muestra biológica en consideración, siendo la primera alícuota de muestra una alícuota de confirmación y siendo la segunda alícuota de muestra una alícuota de control. El sistema analizador automatizado puede realizar todas las etapas necesarias de forma automatizada.
Manipulación de muestras antes de la medición
La preparación de alícuotas de muestra puede implicar la dilución de las alícuotas de confirmación y control a niveles de dilución particulares definidos en el respectivo flujo de trabajo. Como se analiza anteriormente, cada flujo de trabajo define un nivel de dilución predeterminado que usa el sistema analizador automatizado si se selecciona el respectivo flujo de trabajo. Los múltiples flujos de trabajo también pueden incluir uno o más flujos de trabajo para los que no exista dilución (es decir, el nivel de dilución sea cero). Sin embargo, uno o más flujos de trabajo siempre definen un nivel de dilución distinto de cero.
En modos de realización particulares, la etapa o etapas de dilución puede(n) incluir la adición de agentes de dilución (por ejemplo, tampones, suero normal) y otras sustancias (por ejemplo, sustancias químicas, anticuerpos, antígenos, compuestos antiinterferencia, conservantes, etc.) a una muestra.
Además, la etapa de dilución puede incluir una o más etapas de un procedimiento de pretratamiento antes de la determinación del analito (por ejemplo, añadir detergentes a las alícuotas de muestra requeridas para liberar un analito de interés).
En algunos ejemplos, los niveles de dilución particulares se definen en base al respectivo valor o el intervalo de valores del parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito al que se asigna el respectivo flujo de trabajo (por ejemplo, un valor de COI o intervalo de valores de COI a los que se asigna el flujo de trabajo). Por ejemplo, los niveles de dilución particulares incluyen al menos una menor dilución (por ejemplo, para un menor intervalo de COI), una dilución intermedia (por ejemplo, para un intervalo intermedio de COI) y una mayor dilución (por ejemplo, para un mayor intervalo de COI).
En un ejemplo en particular, pueden existir tres flujos de trabajo: un primer flujo de trabajo para un COI menor de 7,0, un segundo flujo de trabajo para un COI igual a o mayor de 7,0 y menor de 30 y un tercer flujo de trabajo para un COI igual a o mayor de 30. En este ejemplo, los flujos de trabajo para los COI de menos de 30 pueden definir un nivel de dilución de cero, mientras que el flujo de trabajo para un COI igual a o mayor de 30 puede definir un nivel de dilución distinto de cero.
La preparación de las alícuotas de control y confirmación puede incluir una o más etapas adicionales.
Por ejemplo, la preparación de la muestra de confirmación puede incluir añadir un agente de neutralización a la primera alícuota de muestra para preparar la alícuota de confirmación. El agente de neutralización se puede seleccionar para que reduzca un efecto de un agente para determinar la presencia de dicho analito. En un ejemplo, el agente de neutralización puede incluir anticuerpos no marcados que se seleccionan para unirse al analito, pero que no pueden producir una señal medible. Por ejemplo, en algunos ejemplos se puede emplear suero humano con una cantidad predefinida de anticuerpos anti-HBs (no marcados).
La preparación de las alícuotas de muestra puede incluir añadir un agente de control a la segunda alícuota de muestra para preparar la alícuota de control. En un ejemplo, el agente de control puede ser una sustancia que no cambie sustancialmente las características de la alícuota de control. El agente de control puede ser una solución tampón. Por ejemplo, el agente de control puede ser suero humano que haya dado negativo para anticuerpos anti-HBs y antígenos de superficie del virus de la hepatitis B (el propio analito).
En otros ejemplos, puede que no se requiera un agente de control en la alícuota de control. Por ejemplo, el sistema analizador automatizado se puede configurar para corregir una diferencia (por ejemplo, una diferencia de dilución y/o volumen) entre las alícuotas de control y confirmación en virtud de un algoritmo de corrección.
El orden de las etapas analizadas anteriormente para preparar la alícuota de control y la alícuota de confirmación es flexible hasta cierto punto. Por ejemplo, la etapa de dilución se puede realizar antes de la etapa de alicuotado, o las etapas de dilución se pueden realizar después de las etapas de alicuotado. En muchos ejemplos, las alícuotas se toman antes de las etapas de dilución.
Además o de forma alternativa, la preparación de las alícuotas de control y confirmación también puede incluir etapas adicionales a las etapas analizadas anteriormente antes y/o tras la operación de alicuotado (por ejemplo, etapas de incubación o etapas de adición de reactivos adicionales).
La preparación de la alícuota de confirmación y la alícuota de control puede suceder en paralelo en algunos ejemplos. En otros ejemplos, el analizador automatizado puede preparar las alícuotas secuencialmente.
Procedimiento de medición general para alícuotas de confirmación y control
En una etapa adicional (no mostrada en la FIG. 2), el sistema analizador automatizado añade cantidades predefinidas de uno o más agentes para determinar específicamente la presencia de dicho analito con respecto a la alícuota de confirmación y la alícuota de control. En un ejemplo, el sistema analizador automatizado añade uno o múltiples tipos de anticuerpos marcados configurados para unirse al analito en las respectivas alícuotas.
Después de que se hayan preparado la alícuota de control y la de confirmación y se hayan añadido los uno o más agentes para determinar específicamente la presencia de dicho analito, el analizador automatizado determina un parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (105). En algunos ejemplos, este parámetro es un COI. El orden de la operación de preparación y determinación también puede ser diferente en otros ejemplos (las respectivas etapas de preparación de muestras para una muestra particular naturalmente se tienen que completar antes de determinar el parámetro para esta muestra).
En un ejemplo, la adición de las cantidades predefinidas de uno o más agentes para determinar específicamente la presencia de dicho analito con respecto a la etapa de alícuota de confirmación y de alícuota de control y la etapa de determinación puede incluir el siguiente procedimiento.
Determinación de COI para muestras que incluyen el antígeno de superficie del virus de la hepatitis (HBsAg) como analito
El procedimiento comienza con la recepción de la alícuota de confirmación y la alícuota de control (que se pueden preparar como se analiza anteriormente).
El analito en este procedimiento de ejemplo es un antígeno de superficie del virus de la hepatitis (HBsAg), de modo que la etapa de determinación incluye llevar a cabo automáticamente un ensayo para HBsAg. El ensayo se puede basar en el formato de tipo sándwich que incluye dos incubaciones como sigue. En el transcurso del procedimiento, el analito se une entre anticuerpos anti-HBs biotinilados y anticuerpos anti-HBs marcados con un componente generador de señales (por ejemplo, complejo de rutenio: complejo tris(2,2'-bipiridil)rutenio(II) (Ru(bpy)32+) (es decir, un agente para determinar específicamente la presencia del analito). El agente de neutralización para la alícuota de confirmación incluye anticuerpos no marcados que compiten con los anticuerpos marcados. El agente de control para la alícuota de control puede ser un suero humano que haya dado negativo para anticuerpos anti-HBs y HBsAg o una solución tampón. Por tanto, en la alícuota de confirmación se formará un menor número de complejos de tipo sándwich que incluyen el marcador que en la muestra control (si la muestra biológica es positiva para el antígeno de superficie del virus de la hepatitis (HBsAg)).
El procedimiento incluye una primera etapa de incubación de una cantidad (por ejemplo, 50 |jl) de una muestra de suero o plasma humano preparada con los anticuerpos anti-HBs descritos anteriormente. Esta etapa de incubación forma inmunocomplejos de tipo sándwich con el analito HBsAg en la alícuota de control y una menor cantidad de inmunocomplejos de tipo sándwich en la alícuota de confirmación (en caso de que el HBsAg esté presente en la muestra biológica). En una segunda etapa de incubación, el analizador añade micropartículas recubiertas de estreptavidina y el complejo se une a la fase sólida por medio de interacción de biotina y estreptavidina.
La mezcla de reacción así preparada se aspira en una celda de medición del sistema de procesamiento de muestras donde las micropartículas se capturan magnéticamente sobre la superficie de un electrodo. A continuación, las sustancias no unidas se retiran añadiendo un reactivo apropiado (por ejemplo, una solución de tripropilamina tamponada).
En presencia de analito, el complejo de rutenio se une con puente a la fase sólida y emite luz a 620 nm después de la excitación en un electrodo de platino comprendido en una celda de medición del sistema de manipulación de muestras del analizador automatizado. La alícuota de confirmación emite una menor cantidad de luz debido al hecho de que no se incorpora una cantidad de HBsAg en los complejos emisores de luz. La salida de señal puede estar en unidades de luz arbitrarias. El controlador del analizador determina automáticamente los resultados por el programa informático al comparar la señal de electroquimioluminiscencia obtenida del producto de reacción de la muestra con la señal del valor de corte obtenido previamente por calibración. Se puede determinar un índice de valor de corte (COI) (como se analiza anteriormente) para la alícuota de control y la alícuota de confirmación.
Volviendo a la FIG. 2 , después de que el analizador automatizado haya determinado el parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (por ejemplo, un COI para ambas muestras), el analizador determina una relación de los parámetros determinados del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (106). En un ejemplo, esta etapa incluye calcular una proporción del parámetro determinado del analito en las alícuotas de confirmación y de control (por ejemplo, los valores de COI). En el ejemplo de la FIG. 2 , la proporción se calcula como "COI de la alícuota de confirmación" dividido por "COI de la alícuota de control".
En otros ejemplos, la relación se puede determinar de manera diferente. Por ejemplo, la proporción se podría invertir, o se podría usar otra relación en lugar de la proporción (por ejemplo, se podrían sustraer los parámetros determinados de las alícuotas de control y confirmación). Además, la determinación de la relación puede incluir una o más etapas de pre- o posprocesamiento de señales medidas por una unidad de detección del sistema de procesamiento de muestras del sistema analizador automatizado.
Una vez que se ha determinado la relación, el sistema analizador automatizado clasifica automáticamente la muestra biológica en una de una pluralidad de clases con respecto a la presencia del analito en base a la relación determinada.
En la fig. 2 , el analizador automatizado clasifica la muestra en una de dos clases: Una primera clase indica que la muestra biológica es reactiva (por ejemplo, se confirma un resultado de una prueba de diagnóstico o de cribado inicial). Una segunda clase indica que la muestra biológica no es reactiva (por ejemplo, no se confirma el resultado de una prueba de diagnóstico o de cribado inicial).
En el ejemplo de la FIG. 2 , la clasificación automática incluye determinar si la proporción de los COI es igual a o está por debajo o por encima de un umbral predeterminado. En el primer caso (el COI es igual a o está por debajo de dicho umbral), el sistema analizador automatizado clasifica la muestra biológica como reactiva (etapa 107). En este último caso (el COI está por encima de dicho umbral), el analizador automatizado clasifica la muestra biológica como no reactiva (etapa 108). Una menor proporción de los COI puede indicar que la muestra biológica, de hecho, incluye el analito diana, ya que la adición del agente de neutralización tiene un efecto sustancial sobre la intensidad de señal. Una mayor proporción de los COI puede indicar que la adición del agente de neutralización no tuvo ningún efecto sustancial y, a su vez, la muestra biológica puede no incluir el analito diana. En un ejemplo, la proporción umbral puede estar entre 0,5 y 0,7 (por ejemplo, aproximadamente 0,6).
En otros ejemplos, un criterio para la clasificación puede ser diferente. En estos casos, el respectivo umbral se puede ver influenciado por la manera en que se determina la relación de los parámetros indicativos de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control. Por ejemplo, si la proporción se determina de forma invertida en comparación con el flujo de trabajo de la FIG. 2 , la muestra se puede clasificar como confirmada si la proporción supera un umbral predeterminado. Si se sustraen los parámetros (por ejemplo, los COI) para determinar la relación, un valor de aproximadamente 0 puede ser el umbral entre una muestra confirmada y una no confirmada.
En la FIG. 2 solo se usa la proporción del COI para clasificar la muestra biológica. En otros ejemplos, se puede usar información adicional a la proporción (o cualquier otra relación entre los parámetros del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control). En un ejemplo, se puede usar el parámetro determinado indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y/o en la propia alícuota de control (por ejemplo, los valores de COI) para clasificar la muestra biológica. Por ejemplo, el analizador automatizado puede determinar si el COI (o cualquier otro parámetro adecuado) de la alícuota de control se encuentra por debajo o por encima de un umbral predeterminado.
Además o de forma alternativa, el sistema analizador automatizado puede clasificar la muestra biológica en más de dos clases (por ejemplo, tres clases, cuatro clases o más de cuatro clases).
Por ejemplo, el sistema analizador automatizado puede emplear además una o ambas de una tercera clase que indique que el resultado de prueba de la muestra biológica es inválido y de una cuarta clase que indique que el resultado de la prueba no se puede clasificar en una de las primera y segunda clases (por ejemplo, indeterminado).
En un ejemplo, el analizador automatizado determina i) si la proporción entre el parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control es igual a o está por debajo de un primer umbral o está por encima del primer umbral y ii) si el propio parámetro (por ejemplo, el COI) de la alícuota de control y/o la alícuota de confirmación es igual a o está por debajo de un segundo umbral o está por encima del segundo umbral.
Si la proporción es igual a o está por debajo del primer umbral y el parámetro de la alícuota de control es igual a o está por encima del segundo umbral, la muestra biológica se puede clasificar como reactiva.
Si la proporción es igual a o está por debajo del primer umbral y el parámetro de la alícuota de control está por debajo del segundo umbral, la muestra biológica se puede clasificar como indeterminada.
Si la proporción está por encima del primer umbral y el parámetro de la alícuota de control es igual a o está por encima del segundo umbral, la muestra biológica se puede clasificar como no reactiva.
Si la proporción está por encima del primer umbral y el parámetro de la alícuota de control está por debajo del segundo umbral, la muestra biológica se puede clasificar como no válida.
En el ejemplo, el sistema analizador automatizado puede clasificar la muestra biológica como sigue:
si la proporción "confirmación/control" x > 60 % y COI para la alícuota de control > 0,81 ^ negativa (no reactiva);
si la proporción "confirmación/control" x > 60 % y COI para el reactivo de control < 0,81 ^ no válida;
si la proporción "confirmación/control" x < 60 % y COI para el reactivo de control > 0,81 ^ positiva (reactiva);
si la proporción "confirmación/control" x < 60 % y COI para el reactivo de control < 0,81 ^ indeterminada.
Además de las variaciones y alternativas analizadas anteriormente, las técnicas para realizar automáticamente una prueba de confirmación también pueden incluir uno o más de los siguientes rasgos característicos:
En el ejemplo de la FIG. 2 se preparan una alícuota de control y una de confirmación. En otros ejemplos, un flujo de trabajo puede implicar la preparación de múltiples alícuotas de control y/o múltiples alícuotas de confirmación.
Además o de forma alternativa, el sistema analizador automatizado se puede configurar para llevar a cabo una o más pruebas adicionales para asegurar la validez de la prueba. En un ejemplo, se puede ejecutar una prueba de control positiva en paralelo a las pruebas en las alícuotas de confirmación y control descritas anteriormente.
Además, como se muestra en la FIG. 1 y se describe anteriormente, el operario puede seleccionar entre múltiples flujos de trabajo en algunos ejemplos. Esto puede significar que un operario selecciona un flujo de trabajo que no es perfectamente adecuado para la respectiva muestra biológica.
En un ejemplo, el controlador del sistema analizador automatizado se puede configurar para verificar si la selección de uno de los flujos de trabajo recibidos a través de la interfaz de usuario satisface uno o más criterios. En un ejemplo, los uno o más criterios pueden ser si el valor asignado o el intervalo de valores del parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica del flujo de trabajo seleccionado coincide con el parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito que se ha medido en la muestra biológica. Además, el controlador se puede configurar para emitir un mensaje de advertencia o error si el flujo de trabajo seleccionado recibido a través de la interfaz de usuario no satisface los uno o más criterios. Además o de forma alternativa, el controlador se puede configurar para prevenir que se lleven a cabo las etapas del flujo de trabajo seleccionado si el flujo de trabajo seleccionado recibido a través de la interfaz de usuario no satisface los uno o más criterios.
En un ejemplo, un criterio puede ser si el COI de la muestra biológica coincide con el intervalo de COI al que se asigna el flujo de trabajo seleccionado. Se puede emitir un mensaje de advertencia al usuario si este no es el caso (por ejemplo, "confirmación no válida", "valor de muestra demasiado alto", "valor de muestra demasiado bajo").
En resumen, el analizador automatizado realiza automáticamente etapas potencialmente propensas a errores anteriormente ejecutadas manualmente, lo que puede dar como resultado una dilución falsa de la muestra, errores de pipeteo y similares. Además, la clasificación de la muestra (y potencialmente otras etapas) anteriormente llevada a cabo por el operario está automatizada. Esto puede reducir un número de errores que se producen en el procedimiento y puede requerir una menor cantidad de tiempo del operario.
Además, la prueba puede consumir un menor volumen de una muestra biológica que las pruebas previas. El volumen total de la muestra requerida para llevar a cabo la prueba puede ser algo mayor que el volumen consumido en la prueba (por ejemplo, puede existir determinado volumen muerto que no se pueda usar en la prueba). Un menor consumo de muestra, a su vez, puede significar que los volúmenes de reactivo y de muestra se pueden reducir en algunas situaciones.
En algunos ejemplos, el consumo de una muestra biológica en la prueba de confirmación (es decir, el volumen usado en la prueba de confirmación) puede ser de menos de 120 pl, opcionalmente de menos de 50 pl.
En un modo de realización, el consumo de menos de 120 pl o de menos de 50 pl, respectivamente, se relaciona con el volumen de muestra biológica sumado contenido en las primera y segunda alícuotas de muestra. En algunas situaciones, para muestras positivas que tienen un índice de valor de corte < 7,0, pueden ser suficientes menos de 100 pl, para muestras positivas que tienen un índice de valor de corte > 7,0, pueden ser suficientes menos de 40 pl.
Prueba de confirmación con selección automatizada del flujo de trabajo
En los ejemplos descritos anteriormente, un operario selecciona uno de los múltiples flujos de trabajo. Posteriormente, se analizará una variante de las técnicas de la presente divulgación en la que el sistema analizador automatizado selecciona automáticamente el flujo de trabajo que se va a llevar a cabo en relación con la FIG. 3.
Como se puede ver, la técnica de la FIG. 3 incluye seleccionar un flujo de trabajo que se va a llevar a cabo por el analizador automatizado. En el ejemplo de la FIG. 3 , tres flujos de trabajo se proporcionan por el sistema analizador automatizado con diferentes niveles de dilución ("bajo", "medio" y "alto"). Los flujos de trabajo son los mismos que los flujos de trabajo analizados en relación con la FIG. 2 anterior. En particular, los flujos de trabajo incluyen las etapas de preparación de una alícuota de confirmación y control 103a-c, 104a-c, y las etapas de medición 105, de determinación de relación 106 y de clasificación 107, 108 realizadas automáticamente, como se explica anteriormente. Por tanto, todos los aspectos analizados en relación con la FIG. 2 con respecto a estas etapas también se pueden emplear en las técnicas donde el sistema analizador automatizado selecciona automáticamente el flujo de trabajo que se va a llevar a cabo.
Habiendo dicho esto, el análisis de la FIG. 3 se centrará en los aspectos adicionales y/o diferentes del procedimiento donde el sistema analizador automatizado selecciona automáticamente el flujo de trabajo que se va a llevar a cabo.
Como se puede ver, el procedimiento puede comenzar con una recepción de un pedido en cuanto a una medición de confirmación para una muestra reactiva conocida en el sistema analizador automatizado (etapa 109).
Posteriormente, el analizador automatizado usa el sistema de procesamiento de muestras para llevar a cabo una prueba inicial (en 110) en la muestra biológica para determinar una presencia y/o concentración del analito. Esta prueba puede ser un ensayo para HBsAg, como se analiza anteriormente, o cualquier otra prueba adecuada en la muestra biológica.
En el ejemplo de la FIG. 3, la prueba inicial arroja un valor de COI de la muestra biológica. En otros ejemplos, otros parámetros cuantitativos o cualitativos que indican una presencia y/o concentración del analito.
En otros ejemplos, se puede usar un parámetro que indique una presencia y/o concentración del analito en la muestra (por ejemplo, un COI) ya determinado (por ejemplo, en una prueba realizada previamente). En este caso, no es necesaria ninguna prueba inicial en la etapa 110 y el analizador automatizado puede usar el parámetro que indica una presencia y/o concentración del analito en la muestra ya obtenida en las etapas analizadas a continuación. Dependiendo del resultado de la prueba inicial (o un valor del parámetro ya determinado que indica una presencia y/o concentración), el analizador automatizado lleva a cabo una o más de las siguientes operaciones.
En un ejemplo, el sistema analizador automatizado puede iniciar la realización de la prueba de confirmación solo si la prueba inicial indica la presencia y/o una determinada concentración del analito en la muestra biológica. En el ejemplo de la FIG. 3 , el analizador automatizado solo inicia la prueba de confirmación si la prueba inicial arroja un COI que esté por encima de un primer umbral (COI > A). Si el COI es igual a o está por debajo del primer umbral (COI < A), el sistema analizador automatizado clasifica la muestra biológica como no reactiva (en 111). El sistema analizador automatizado puede emitir un mensaje correspondiente en una interfaz de usuario (por ejemplo, "no reactiva: no se realizó ninguna prueba de confirmación, insuficiente analito").
Además o de forma alternativa, el sistema analizador automatizado puede clasificar la muestra biológica que se va a analizar en base al parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica en una de una pluralidad de clases. La pluralidad de clases puede incluir al menos una primera clase para situaciones en las que el parámetro medido varía por debajo de un segundo umbral predefinido y una segunda clase para situaciones en las que el parámetro medido varía por encima de un tercer umbral predefinido (el segundo umbral y el tercer umbral pueden tener valores diferentes).
En el ejemplo de la FIG. 3 , el sistema analizador automatizado clasifica la muestra biológica en tres clases dependiendo del valor de COI determinado: Una primera clase si el COI está entre el primer umbral y un segundo umbral (A < COI < B - una clase de "COI bajo"), una segunda clase si el COI está entre el segundo umbral y un tercer umbral (B < COI < C-una clase de "COI medio") y una tercera clase si el COI está entre igual a o por encima del tercer umbral (C > COI - una clase de "COI alto").
En otros ejemplos, el analizador automatizado puede incluir un menor número de clases (por ejemplo, dos clases) o un mayor número de clases (por ejemplo, cuatro o más clases).
En base a la clase determinada, el sistema analizador automatizado selecciona automáticamente uno de los múltiples flujos de trabajo que se van a llevar a cabo. A continuación, el sistema analizador automatizado puede proceder a llevar a cabo el flujo de trabajo seleccionado como se analiza anteriormente.
Adicionalmente, el analizador automatizado se puede configurar además para presentar el flujo de trabajo seleccionado a un usuario (por ejemplo, en una interfaz de usuario del sistema analizador automatizado) y recibir una confirmación del usuario de que se llevará a cabo el flujo de trabajo seleccionado. En otros ejemplos, el procedimiento completo se lleva a cabo sin confirmación del usuario.
La automatización del procedimiento de selección del flujo de trabajo puede reducir además la carga intelectual del operario y reducir la tasa de error en algunos ejemplos.
Pruebas de diagnóstico/cribado y de confirmación combinadas
En los ejemplos descritos anteriormente en relación con la FIG. 2 y FIG. 3 , se han descrito diferentes aspectos de las pruebas de confirmación que se pueden realizar sobre una muestra biológica. En este caso, un diagnóstico o cribado anterior puede haber arrojado un resultado positivo para una muestra biológica. En algunos ejemplos adicionales, las técnicas de la presente divulgación pueden incluir la realización de la prueba de diagnóstico o de cribado inicial. Esto también puede suceder de forma automatizada. Esto se analizará posteriormente en relación con la FIG. 4.
Como se puede ver, el diagrama de flujo de ejemplo de la FIG. 4 incluye la secuencia de prueba de confirmación automatizada de la FIG. 3 en el lado derecho. Además, la técnica de la FlG. 4 incluye realizar automáticamente una prueba de cribado o de diagnóstico para determinar si una muestra biológica es positiva o reactiva (las etapas se muestran en el lado izquierdo de la FlG. 4).
El sistema analizador automatizado puede pedir automáticamente una prueba de confirmación. Esta prueba de confirmación puede implicar cualquiera de los aspectos analizados en el presente documento a este respecto (por ejemplo, puede incluir el uso de un flujo de trabajo seleccionado por el operario o un flujo de trabajo seleccionado automáticamente por el sistema analizador automatizado).
En un ejemplo, la prueba de cribado o de diagnóstico incluye una primera prueba en una alícuota de cribado de la muestra biológica y una prueba por duplicado en una o más de otras alícuotas de la muestra biológica (la prueba por duplicado puede incluir dos o más pruebas en dos o más alícuotas de la muestra biológica). Solo si la primera prueba y las pruebas por duplicado arrojan que la muestra biológica es reactiva, se pide la prueba de confirmación. En otros ejemplos, se puede usar un número diferente de pruebas y/o la prueba de confirmación se puede pedir en diferentes circunstancias.
En la prueba de cribado o de diagnóstico de ejemplo de la FIG. 4, en 112 se lleva a cabo una medición inicial (por ejemplo, que determine un COI de la muestra biológica). En un ejemplo, se puede emplear un ensayo para HBsAg automatizado (por ejemplo, el ensayo analizado anteriormente en relación con la FIG. 2).
Dependiendo del resultado de la medición inicial, la muestra biológica se clasifica como positiva o negativa 113. Por ejemplo, esto puede suceder en base a un COI de la muestra biológica, como se analiza anteriormente.
En caso de un resultado límite o positivo inicial, la medición se repite. En un ejemplo, la medición se repite por duplicado (etapa 115). El ensayo usado para la medición inicial se puede a usar de nuevo. Esta operación se puede activar automáticamente por el sistema analizador automatizado (con o sin confirmación del usuario).
La medición repetida puede estar seguida por otra etapa de clasificación (116). En caso de que ambas mediciones repetidas por duplicado sean negativas, la interpretación del resultado final se considera que es no reactiva (117). En este caso, no se tienen que realizar mediciones adicionales y el procedimiento de cribado se finaliza.
Si una o ambas de las mediciones repetidas muestran un resultado límite o positivo, la muestra se considera repetidamente reactiva, lo que activa un pedido de la prueba de confirmación automática de la muestra (109).
En un ejemplo, el analizador automatizado puede seleccionar 120 uno de los múltiples flujos de trabajo que se van a llevar a cabo en base a los resultados obtenidos en las pruebas previas (por ejemplo, la medición inicial 112 y/o la medición por duplicado 115).
Todos los resultados se pueden emitir en una interfaz de usuario del sistema analizador automatizado.
La combinación completamente automatizada de una prueba de cribado y de diagnóstico y una prueba de confirmación puede mejorar además la eficacia del sistema. En particular, se puede reducir el tiempo hasta el resultado, ya que la prueba de confirmación directamente se puede pedir y comenzar cuando la prueba de cribado o de diagnóstico sea positiva.
Implementación por ordenador
Se divulga y propone además un programa informático que incluye instrucciones ejecutables por ordenador para realizar el procedimiento de acuerdo con la presente invención en uno o más de los modos de realización incluidos en el presente documento cuando el programa se ejecuta en un ordenador o red de ordenadores. Específicamente, el programa informático se puede almacenar en un soporte de datos legible por ordenador. Por tanto, específicamente, una, más de una o incluso todas las etapas de procedimiento, como se divulga en el presente documento, se pueden realizar usando un ordenador o una red de ordenadores, preferentemente usando un programa informático.
Se divulga y propone además un producto de programa informático que tiene medios de código de programa para realizar el procedimiento de acuerdo con la presente invención en uno o más de los modos de realización incluidos en el presente documento cuando el programa se ejecuta en un ordenador o red de ordenadores. Específicamente, los medios de código de programa se pueden almacenar en un soporte de datos legible por ordenador.
Se divulga y propone además un soporte de datos que tiene una estructura de datos almacenada en el mismo, que, después de cargarse en un ordenador o red de ordenadores, tal como en una memoria de trabajo o memoria principal del ordenador o red de ordenadores, puede ejecutar el procedimiento de acuerdo con uno o más de los modos de realización divulgados en el presente documento.
Se divulga y propone además un producto de programa informático con medios de código de programa almacenados en un soporte legible por máquina para realizar el procedimiento de acuerdo con uno o más de los modos de realización divulgados en el presente documento, cuando el programa se ejecuta en un ordenador o red de ordenadores. Como se usa en el presente documento, un producto de programa informático se refiere al programa como un producto comercializable. El producto puede existir, en general, en un formato arbitrario, tal como en un formato impreso, o en un soporte de datos legible por ordenador. Específicamente, el producto de programa informático se puede distribuir sobre una red de datos.
Se divulga y propone además una señal de datos modulada que contiene instrucciones legibles por un sistema informático o red de ordenadores para realizar el procedimiento de acuerdo con uno o más de los modos de realización divulgados en el presente documento.
En referencia a los aspectos implementados por ordenador de la invención, una o más de las etapas de procedimiento o incluso todas las etapas de procedimiento del procedimiento de acuerdo con uno o más de los modos de realización divulgados en el presente documento se pueden realizar usando un ordenador o red de ordenadores. Por tanto, en general, se puede realizar cualquiera de las etapas de procedimiento, incluyendo la provisión y/o manipulación de datos usando un ordenador o red de ordenadores. En general, estas etapas de procedimiento pueden incluir cualquiera de las etapas de procedimiento, típicamente excepto por las etapas de procedimiento que requieran un trabajo manual, tales como proporcionar las muestras y/o determinados aspectos de realización de mediciones.
Se divulga y propone además un ordenador o red de ordenadores que comprende al menos un procesador, en el que el procesador está adaptado para realizar el procedimiento de acuerdo con uno de los modos de realización descritos en esta descripción.
Se divulga y propone además una estructura de datos cargable por ordenador que está adaptada para realizar el procedimiento de acuerdo con uno de los modos de realización descritos en esta descripción mientras la estructura de datos se ejecuta en un ordenador.
Se divulga y propone además un medio de almacenamiento, en el que una estructura de datos está almacenada en el medio de almacenamiento y en el que la estructura de datos está adaptada para realizar el procedimiento de acuerdo con uno de los modos de realización descritos en esta descripción después de haberse cargado en un almacenamiento principal y/o de trabajo de un ordenador o de una red de ordenadores.

Claims (15)

REIVINDICACIONES
1. Un sistema analizador automatizado (1) para muestras biológicas, que comprende:
un sistema de procesamiento de muestras (2);
un controlador configurado para:
- recibir una selección de uno de múltiples flujos de trabajo (5) para determinar una presencia y/o concentración de un analito en una muestra biológica (101);
- solicitar al sistema analizador automatizado que lleve a cabo automáticamente el flujo de trabajo seleccionado usando el sistema de procesamiento de muestras; y
- emitir un resultado que clasifica la muestra biológica; y
en el que cada uno de los múltiples flujos de trabajo se asigna a un valor o a un intervalo de valores de un parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito caracterizado por que cada uno de los múltiples flujos de trabajo define además una pluralidad de etapas que se van a llevar a cabo por el sistema analizador automatizado, incluyendo la pluralidad de etapas:
- preparar al menos una primera y una segunda alícuota de muestra de una muestra biológica con niveles de dilución particulares definidos en el respectivo flujo de trabajo, siendo la primera alícuota de muestra una alícuota de confirmación y siendo la segunda alícuota de muestra una alícuota de control (103; 104);
- añadir cantidades predefinidas de uno o más agentes para determinar específicamente la presencia de dicho analito con respecto a la alícuota de confirmación y la alícuota de control;
- determinar un parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (105);
- determinar una relación de los parámetros determinados del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (106); y
- en base a la relación determinada, clasificar la muestra biológica en una de una pluralidad de clases con respecto a la presencia del analito (107; 108),
en el que la alícuota de confirmación incluye un agente de neutralización para reducir un efecto de un agente para determinar la presencia del analito, y en el que la alícuota de control incluye una sustancia que no cambia sustancialmente las características de la segunda alícuota de muestra.
2. El sistema analizador automatizado de la reivindicación 1, que comprende además:
una interfaz de usuario; y
en el que el controlador está configurado además para:
presentar uno o más de los flujos de trabajo que se van a llevar a cabo en la interfaz de usuario (4); y recibir la selección de uno de los flujos de trabajo que se van a llevar a cabo a través de la interfaz de usuario.
3. El sistema analizador automatizado de la reivindicación 2, en el que el controlador está configurado para verificar si la selección de uno de los flujos de trabajo recibidos a través de la interfaz de usuario satisface uno o más criterios, opcionalmente en el que el controlador está configurado para emitir un mensaje de advertencia o error si el flujo de trabajo seleccionado recibido a través de la interfaz de usuario no satisface los uno o más criterios.
4. El sistema analizador automatizado de la reivindicación 1, en el que el controlador está configurado además para:
seleccionar automáticamente uno de los múltiples flujos de trabajo que se van a llevar a cabo por el sistema analizador automatizado.
5. El sistema analizador automatizado de la reivindicación 4, en el que el controlador está configurado además para:
recibir un parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito que se ha medido en la muestra biológica;
clasificar la muestra biológica que se va a analizar en base al parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica en una de una pluralidad de clases; y
seleccionar automáticamente uno de los múltiples flujos de trabajo que se van a llevar a cabo por el sistema analizador automatizado en base a la clasificación.
6. El sistema analizador automatizado de la reivindicación 5, en el que la pluralidad de clases incluye al menos una primera clase para situaciones donde el parámetro medido varía por debajo de un primer umbral predefinido y una segunda clase para situaciones donde el parámetro medido varía por encima de un segundo umbral predefinido, opcionalmente en el que el primer umbral y el segundo umbral tienen valores diferentes.
7. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que el controlador está configurado además para:
usar el sistema de procesamiento de muestras para medir el parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica usada para la selección del flujo de trabajo.
8. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que el controlador está configurado además para:
usar el sistema de procesamiento de muestras para llevar a cabo una prueba inicial (110; 112) en la muestra biológica para determinar una presencia del analito;
iniciar la realización de las operaciones definidas en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 solo si la prueba inicial indica la presencia del analito en la muestra biológica, en el que el controlador está configurado además para iniciar la realización de las operaciones definidas en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 automáticamente si la prueba inicial indica la presencia del analito en la muestra biológica, en el que la prueba inicial es una prueba de cribado o de diagnóstico y las operaciones definidas en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 son parte de una prueba de confirmación.
9. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes 1 a 8, en el que el parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la muestra biológica es un índice de valor de corte o una unidad de concentración, en el que cada flujo de trabajo se asocia a un intervalo de índices de valor de corte o unidades de concentración.
10. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en el que el analito es una proteína, opcionalmente, en el que el analito es un patógeno o un anticuerpo producido en reacción a una infección por un patógeno, además opcionalmente en el que el analito es indicativo de una infección por hepatitis.
11. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10, en el que la pluralidad de etapas de cada flujo de trabajo incluye además:
- añadir un agente de neutralización a la primera alícuota de muestra para preparar la alícuota de confirmación; - añadir un agente de control a la segunda alícuota de muestra para preparar la alícuota de control.
12. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, en el que la relación del parámetro determinado del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control incluye una proporción del parámetro determinado del analito en las alícuotas de confirmación y de control.
13. El sistema analizador automatizado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12, en el que la pluralidad de clases incluye al menos una primera clase que indica que el parámetro varía por debajo de un primer umbral, y una segunda clase que indica que el parámetro varía por encima de un segundo umbral.
14. Un procedimiento implementado por ordenador, que comprende:
- recibir una selección de uno de múltiples flujos de trabajo (5) para determinar una presencia y/o concentración de un analito en una muestra biológica (101);
- solicitar a un sistema analizador automatizado (1) que lleve a cabo automáticamente el flujo de trabajo seleccionado usando un sistema de procesamiento de muestras (2); y
- emitir un resultado que clasifica la muestra biológica;
en el que cada uno de los múltiples flujos de trabajo se ha asignado a un valor o intervalo de valores de un parámetro medido indicativo de una presencia y/o concentración del analito y define una pluralidad de etapas que se van a llevar a cabo por el sistema analizador automatizado, estando caracterizado el procedimiento implementado por ordenador por que la pluralidad de etapas incluye:
- preparar al menos una primera y una segunda alícuota de muestra de una muestra biológica con niveles de dilución particulares definidos en el respectivo flujo de trabajo, siendo la primera alícuota de muestra una alícuota de confirmación y siendo la segunda alícuota de muestra una alícuota de control (103; 104);
- añadir cantidades predefinidas de uno o más agentes para determinar específicamente la presencia de dicho analito con respecto a la alícuota de confirmación y la alícuota de control;
- determinar un parámetro indicativo de una presencia y/o concentración del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (105);
- determinar una relación de los parámetros determinados del analito en la alícuota de confirmación y en la alícuota de control (106); y
- en base a la relación determinada, clasificar la muestra biológica en una de una pluralidad de clases con respecto a la presencia del analito (107; 108),
en el que la alícuota de confirmación incluye un agente de neutralización para reducir un efecto de un agente para determinar la presencia del analito, y en el que la alícuota de control incluye una sustancia que no cambia sustancialmente las características de la segunda alícuota de muestra.
15. Un medio legible por ordenador que almacena instrucciones en el mismo que, al llevarse a cabo por un controlador de un sistema analizador automatizado, solicita al sistema analizador automatizado que lleve a cabo las etapas del procedimiento de la reivindicación 14.
ES18706519T 2017-03-01 2018-02-23 Sistemas, procedimiento y medio legible por ordenador para clasificar una muestra biológica con respecto a la presencia de un analito Active ES2929392T3 (es)

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