ES2925909T3 - Dispositivo de recogida de muestras - Google Patents

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ES2925909T3 ES16804650T ES16804650T ES2925909T3 ES 2925909 T3 ES2925909 T3 ES 2925909T3 ES 16804650 T ES16804650 T ES 16804650T ES 16804650 T ES16804650 T ES 16804650T ES 2925909 T3 ES2925909 T3 ES 2925909T3
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Jacob Paul Hendrickx
Michael Sylvester Botzet
Nathan D Lakey
Anthony D Favello
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Orion Genomics LLC
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Abstract

Un dispositivo de muestreo que tiene una parte inferior con un recipiente de muestra. Una tapa está unida de forma móvil con la parte inferior e incluye un borde cortante configurado para cortar una hoja. Cuando la tapa se une a la parte inferior con una hoja en medio, se deposita una muestra de hoja en el recipiente de muestra de la parte inferior. La tapa incluye un respiradero en comunicación fluida con el recipiente de muestra de manera que la muestra de hoja se seca. Una etiqueta separable puede extenderse desde la parte inferior. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)

Description

DESCRIPCIÓN
Dispositivo de recogida de muestras
Antecedentes de la invención
Los dispositivos y procesos para la toma de muestras de material biológico, tales como muestras vegetales, pueden ser complejos y costosos. Para correlacionar los resultados de las pruebas con precisión, muchos sistemas utilizan costosos y complejos métodos de rastreo GPS basados en ordenadores, que incluyen lectura de código de barras, rastreo GPS, y/o muestreo electrónico, y en consecuencia requieren de personal altamente capacitado, que puede no estar disponibles en todas las regiones.
El documento US 2007/269341 A1 desvela un sistema de preparación de muestras para el análisis microbiológico y/o de otros analitos.
El documento US 2006/057738 A1 desvela dispositivos y métodos y kits para aislar componentes subcelulares. Breve sumario de la invención
De acuerdo con el primer aspecto de la presente invención, se proporciona un dispositivo de muestreo que comprende:
una porción inferior que comprende un recipiente de muestra y un paso de espacio muerto adyacente al recipiente de muestra;
una tapa unida de forma móvil con la porción inferior y que comprende un borde cortante configurado para cortar una hoja, de tal forma que cuando la tapa se une a la porción inferior con una hoja en el medio, una muestra de hoja se deposita en el recipiente de muestra de la porción inferior, comprendiendo también la tapa una abertura de espacio muerto configurada para recibir una primera pipeta,
en donde la tapa se une de forma móvil a la porción inferior mediante un poste lateral que se extiende fuera de la porción inferior, en donde la abertura de espacio muerto está abierta al paso de espacio muerto, en donde el paso de espacio muerto se extiende a través del poste lateral, y en donde la tapa incluye un eje configurado para cooperar con el poste lateral, y en donde la tapa incluye un orificio de ventilación en comunicación fluida con el recipiente de muestra de tal forma que la muestra de hoja se seca durante el transporte del dispositivo de muestreo, estando el orificio de ventilación configurado para recibir una segunda pipeta.
De acuerdo con un segundo aspecto de la presente invención, se proporciona un método para tomar muestras de una hoja de una planta usando un sistema del dispositivo de muestreo, comprendiendo el método:
obtener una pluralidad de dispositivos de muestreo del primer aspecto anterior de la presente invención; disponer la pluralidad de dispositivos de muestreo en primera y segunda matrices de dispositivos de muestreo; colocar la pluralidad de dispositivos de muestreo adyacentes a una matriz de pipetas, comprendiendo la matriz de pipetas una primera pluralidad de pipetas y una segunda pluralidad de pipetas dispuestas en filas alternas; mover la matriz de pipetas de tal forma que la primera pluralidad de pipetas se mueva hacia los orificios de ventilación de la primera matriz de dispositivos de muestreo y la segunda pluralidad de pipetas descienda hacia las aberturas de espacio muerto de la primera matriz de dispositivos de muestreo;
extraer fluido de los orificios de ventilación de la primera matriz de dispositivos de muestreo utilizando la primera pluralidad de pipetas;
mover la matriz de pipetas de tal forma que la primera pluralidad de pipetas se mueva hacia las aberturas de espacio muerto de la segunda matriz de dispositivos de muestreo y la segunda pluralidad de pipetas descienda hacia los orificios de ventilación de la segunda matriz de dispositivos de muestreo;
extraer fluido de los orificios de ventilación de la segunda matriz de dispositivos de muestreo utilizando la segunda pluralidad de pipetas.
Los aspectos adicionales de la invención se exponen en las reivindicaciones dependientes,
La muestra puede ser una muestra biológica, tal como materia vegetal, y más específicamente, una hoja, y el dispositivo de muestreo puede construirse específicamente solo para su uso con materia vegetal, tal como una hoja. Por ejemplo, un poste de corte de la tapa se puede construir a partir de un polímero que no sería adecuado para otros materiales biológicos (por ejemplo, piel, grasa) al no tener un borde cortante lo suficientemente afilado. El orificio de ventilación en la tapa puede usarse para secar muestras de materia vegetal después de su adquisición y proporciona un canal para agregar líquido de prueba durante el procesamiento. Un orificio de ventilación de este tipo puede ser incompatible con otros tipos de materia biológica, tal como tejido animal, porque no impediría la entrada de bacterias y otras materias.
En muchas realizaciones, la porción inferior puede incluir al menos un recipiente de muestra parcialmente cilíndrico.
En muchas realizaciones, la porción inferior puede incluir al menos un recipiente de muestra parcialmente redondo. En muchas realizaciones, la porción inferior puede incluir al menos un recipiente de muestra de forma parcialmente ovalada.
En muchas realizaciones, la tapa puede incluir un poste de corte alargado que se extiende dentro del recipiente de muestra.
En muchas realizaciones, el poste de corte alargado se puede configurar para inmovilizar la muestra de hoja en una porción inferior del recipiente de muestra.
En muchas realizaciones, la porción inferior y la tapa se pueden configurar para cortar solo el borde de una hoja. En muchas realizaciones, la porción inferior puede incluir una pared limitadora de profundidad para limitar la entrada de la porción inferior sobre una hoja.
En muchas realizaciones, el orificio de ventilación está adaptado para actuar como un conducto de carga para un fluido de preparación de muestras.
Breve descripción de los dibujos
Las realizaciones del dispositivo y método de acuerdo con la presente invención se describirán, solo a modo de ejemplo, con referencia a los dibujos adjuntos. Aunque los dispositivos de muestreo ilustrados en las Figuras 1A-5B, 6 y 7A-8, en la forma precisa ilustrada, no están de acuerdo con la invención reivindicada, los mismos y su descripción asociada representan antecedentes técnicos que son útiles para comprender el dispositivo de muestreo y el método de la presente invención. En los dibujos:
Las Figuras 1A-1C muestran, respectivamente, vistas en perspectiva, superior y lateral de un dispositivo de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada).
La Figura 2A muestra una vista en sección transversal parcial de un dispositivo de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada).
La Figura 2B muestra una muestra obtenida mediante el uso de un dispositivo de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada).
La Figura 3 muestra una pluralidad de dispositivos de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada). Las Figuras 4A, 4B y 4Cmuestran, respectivamente, vistas en perspectiva, superior y lateral de un dispositivo de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada).
La Figura 5A muestra una vista en sección transversal parcial de un dispositivo de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada).
La Figura 5B muestra una muestra obtenida mediante el uso de un dispositivo de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada).
Las Figuras 5C-5F muestran vistas en sección transversal y superior de un dispositivo de muestreo, de acuerdo con muchas realizaciones de la invención.
La Figura 5G muestra una vista superior de una matriz de dispositivos de muestreo, de acuerdo con muchas realizaciones de la invención.
La Figura 6 muestra una pluralidad de dispositivos de muestreo (no de acuerdo con la invención reivindicada). Las Figuras 7A, 7B, 7C y 8 representan métodos para usar un dispositivo de muestreo (los dispositivos de muestreo ilustrados en estas Figuras no están de acuerdo con la presente invención)
Las Figuras 9A-9C muestran un método para procesar una matriz de dispositivos de muestreo, de acuerdo con muchas realizaciones de la invención.
Descripción detallada de la invención
A continuación se describen ejemplos específicos con referencia a las Figuras proporcionadas. Sin embargo, estos ejemplos no son exclusivos ni exhaustivos para proporcionar una divulgación clara y concisa. Por tanto, debe entenderse que los ejemplos no se limitan a la combinación particular de elementos, y los elementos específicos de los ejemplos se pueden combinar con los elementos de otros ejemplos. De forma adicional, cada ejemplo no representa una combinación mínima de elementos y, por ende, se pueden eliminar elementos específicos de los ejemplos.
Las Figuras 1A-1C muestran, respectivamente, vistas en perspectiva, superior y lateral de un dispositivo de muestreo 100. El dispositivo de muestreo 100 puede construirse a partir de un polímero, por ejemplo, polipropileno (PP), acrilonitrilo butadieno estireno (ABS) o polietileno de alta densidad (HDPE). El dispositivo de muestreo 100 incluye una porción inferior 102, que está configurada para incluir una superficie interior que define un recipiente de muestra. En este ejemplo, la superficie interior está definida por una pared cilíndrica 104 que conduce a una superficie inferior 106. Sin embargo, son posibles otras formas.
El exterior de la porción inferior 102 es cilindrico e incluye una sección media 108 que tiene un diámetro relativamente reducido, que se puede usar para retener el dispositivo de muestreo en herramientas y accesorios. Un reborde intermedio 110 y un reborde inferior 112 flanquean la sección media 108, y una sección cilíndrica 114 conduce hacia arriba desde el reborde intermedio 110.
Una etiqueta alargada 116 se extiende en voladizo desde la porción inferior 102, sin embargo, la etiqueta alargada 116 puede extenderse desde cualquier porción del dispositivo de muestreo 100. La etiqueta se puede fabricar con un material rígido (por ejemplo, HDPE estabilizado por UV, PP estabilizado por UV, o cloruro de polivinilo (PVC)), de tal forma que la etiqueta pueda soportar su propio peso y el del resto del dispositivo de muestreo sin deformarse. La etiqueta alargada 116 puede llevar una variedad de información, tal como un número de matriz e identificación del producto, en forma de códigos de barras, letras impresas y/o identificadores electrónicos (por ejemplo, chip de identificación por radiofrecuencia (RFID)). Cualquier porción del dispositivo de muestreo 100 del que se desprenda la etiqueta alargada 116, incluyendo porciones no desprendidas de la etiqueta alargada 116, puede incluir una identificación (por ejemplo, un código de barras) que correlacione la etiqueta desprendida con el dispositivo de muestreo restante y, por lo tanto, correlacione la etiqueta desprendida con cualquier muestra que contenga. Una porción proximal 118 de la etiqueta 116 incluye una abertura circular de forma que la etiqueta 116 se ajuste y quede soportada por la sección cilíndrica 114 mientras se apoya en el reborde intermedio 110 de la porción inferior 102. La porción proximal 118 incluye también secciones adelgazadas 120 que preferiblemente se fracturan al aplicar fuerza a la etiqueta alargada 116. La porción inferior 102 se puede moldear alrededor de la etiqueta alargada 116 para reducir ventajosamente las etapas de producción y el coste.
El dispositivo de muestreo 100 incluye también una tapa 122 que tiene un poste de corte alargado 124 dimensionado para encajar dentro de la pared cilíndrica 104 de la porción inferior 102. Puede haber poca o ninguna holgura entre el poste de corte alargado 124 y la pared cilíndrica 104, de tal forma que el poste de corte alargado 124 encaje firmemente dentro de la pared cilíndrica 104. El poste de corte alargado 124 se puede ranurar como se muestra para reducir la fricción durante la inserción. De forma adicional, el poste de corte alargado 124 puede incluir bordes cortantes angulares 126 configurados para cortar material, tal como una muestra vegetal (por ejemplo, hojas, corteza, tallo, flores, raíces, etc.). El poste de corte alargado 124 puede tener una longitud tal que cualquier materia vegetal cortada por los bordes cortantes quede físicamente atrapada entre el poste de corte alargado y la superficie inferior 106 de la porción inferior 102. La tapa 122 es ventilada de forma fluida por un paso 128 que se extiende a través del poste de corte alargado 124. Si bien se muestra un poste de corte alargado de forma circular 124 y una pared cilíndrica 104 para su uso con el dispositivo de muestreo 100, otras formas son posibles, incluyendo, por ejemplo, total o al menos parcialmente circular u ovalada (tal como una forma de D), rectangular, poligonal y semicircular.
Una correa 130 se extiende desde la tapa 122 hasta una porción circular 132 que se conecta a la sección cilíndrica 114 de la porción inferior 118. La correa 130 puede tener muescas para doblarse preferiblemente en un cierto lugar a lo largo de su longitud.
La Figura 2A muestra una vista en sección transversal parcial del dispositivo muestreo 100, con la tapa 122 ajustada en la porción inferior 102. Como se muestra, la tapa 122 se ha ajustado doblando y/o fracturando la correa 130 y ajustando el poste de corte alargado 124 y la pared cilíndrica 104. Como resultado, la porción inferior 102 sostiene de forma segura la tapa 122, y cualquier materia que haya sido cortada por la tapa 122 durante este proceso queda retenida físicamente entre el extremo del poste de corte alargado 124 y la superficie inferior 106. La materia cortada resultante formará una galleta circular como se muestra en la Figura 2B, que quedará asegurada contra su movimiento por el poste de corte alargado 124. Durante el transporte, una muestra de materia vegetal puede secarse hasta el punto de volverse quebradiza. Por tanto, retener la muestra mediante el poste de corte alargado 124 puede ayudar a evitar que la frágil muestra se desprenda y dañe fácilmente. Especialmente, la superficie inferior 106 permanece en comunicación fluida con el entorno exterior a través del paso 128 que atraviesa la tapa 122. Por ende, cualquier materia biológica almacenada dentro del dispositivo de muestreo 100 puede hidratarse o deshidratarse mediante el paso de fluidos a través del paso 128.
La Figura 3 muestra una pluralidad de dispositivos de muestreo 134 dispuestos en un formato de lado a lado. En este punto, las etiquetas 116 están formadas como una tira y configuradas para desprenderse a la fuerza unas de otras, por ejemplo, aplicando fuerza a los limites perforados, con muescas o adelgazados presentes entre cada etiqueta 116. Las tapas 122 y las porciones inferiores 102 de cada etiqueta, no se unen, sin embargo, a las tapas adyacentes 122 ni a las porciones inferiores 102. Por ende, el desprendimiento de una etiqueta particular 116 da como resultado la adquisición de un dispositivo de muestreo individual 134.
Las Figuras 4A, 4B y 4C muestran, respectivamente, vistas en perspectiva, superior y lateral de otro ejemplo de un dispositivo de muestreo 200, que comparte muchas de las características generales del dispositivo de muestreo 100 que se muestra en la Figura 1A. Sin embargo, en este punto, el dispositivo de muestreo 200 incluye una porción inferior 202 que tiene un recipiente interior con una sección transversal semicircular "en forma de D", en lugar de la sección transversal del dispositivo de muestreo 100 que se muestra en la Figura 1A.
El dispositivo de muestreo 200 incluye una tapa 204 que incluye un poste de corte alargado 206 que tiene un borde cortante de sección transversal en forma de D complementario. Puede haber poca o ninguna holgura entre el poste de corte alargado 206 y el recipiente interior de la porción inferior 202, de tal forma que el poste de corte alargado 206 encaje firmemente en su interior. El poste de corte alargado 206 incluye un paso interior 208 que ventila de forma fluida la tapa 204 y la porción inferior 202.
Una etiqueta alargada 210 se extiende en voladizo desde la porción inferior 202. La etiqueta se puede fabricar con un material rígido (por ejemplo, polímero rígido), de tal forma que la etiqueta pueda soportar su propio peso y el del resto del dispositivo de muestreo sin deformarse. La etiqueta alargada 202 puede llevar una variedad de información, tal como un número de matriz e identificación del producto, en forma de códigos de barras, letras impresas y/o identificadores electrónicos (por ejemplo, chip de identificación por radiofrecuencia (RFID)). Cualquier porción del dispositivo de muestreo 200 del que se desprenda la etiqueta alargada 210, incluyendo las porciones no desprendidas de la etiqueta alargada 210, puede incluir una identificación (por ejemplo, un código de barras) que correlacione la etiqueta desprendida con el dispositivo de muestreo restante y, por lo tanto, correlacione la etiqueta desprendida con cualquier muestra que contenga. Una porción proximal 212 de la etiqueta alargada 210 se asegura a una porción de la tapa 204, sin embargo, la porción proximal 212 puede asegurarse a cualquier porción del dispositivo de muestreo. La porción proximal 212 incluye también secciones adelgazadas 214 que preferiblemente se fracturan al aplicar fuerza a la etiqueta alargada 210. La tapa 204 se puede moldear alrededor de la etiqueta alargada 210 para reducir ventajosamente las etapas de producción y el coste.
La Figura 5A muestra una vista en sección transversal parcial del dispositivo muestreo 200, con la tapa 204 ajustada en la porción inferior 202. Como se muestra, la tapa 204 se ha encajado deslizando la tapa hacia abajo en la porción inferior 202. Un poste lateral 216 coopera con un paso dentro de la porción inferior 202 para servir como una guía de desplazamiento para esta operación. Como resultado, la porción inferior 202 sostiene de forma segura la tapa 204, y cualquier materia que haya sido cortada por la tapa 202 durante este proceso queda retenida físicamente entre el extremo del poste de corte alargado 206 y la parte inferior del recipiente dentro de la porción inferior 202. La materia cortada resultante formará una galleta en forma de D como se muestra en la Figura 5b , que quedará asegurada contra su movimiento por el poste de corte alargado 206. Durante el transporte, una muestra de materia vegetal puede secarse hasta el punto de volverse quebradiza. Por tanto, retener la muestra mediante el poste de corte alargado 206 puede ayudar a evitar que la frágil muestra se desprenda y dañe fácilmente. Especialmente, la porción inferior 202 permanece en comunicación fluida con el entorno exterior a través del paso 208 que atraviesa la tapa 204. Por ende, cualquier materia biológica almacenada dentro del dispositivo de muestreo 200 puede hidratarse o deshidratarse mediante el paso de fluidos a través del paso interior 208.
Una ventaja particular del dispositivo de muestreo 200 es la capacidad de retirar muestras de un borde de un material biológico, tal como una hoja. Esto evita la necesidad de cortar o rasgar el material biológico o desmontar el dispositivo de muestreo para recuperar una muestra que se tomó en una porción central de una hoja, por ejemplo. Una pared limitadora de profundidad 218 mostrada en la Figura 5A, evita que la entrada del dispositivo de muestreo sobresalga más allá de un borde de una hoja. Una característica limitadora de profundidad de este tipo no se limita al uso con el dispositivo de muestreo 200 que se muestra en la Figura 5A, y puede utilizarse, por ejemplo, con el dispositivo de muestreo 200 que se muestra en la Figura 1A. Si bien se muestra un poste de corte alargado en forma de D parcialmente circular/ovalado 206 y el recipiente correspondiente de la porción inferior 202 para su uso con el dispositivo de muestreo 200, otras formas son posibles, incluyendo triangular, completamente ovalada, rectangular, poligonal y circular.
Las Figuras 5C-5F muestran vistas de una construcción del dispositivo de muestreo 230 de acuerdo con la presente invención, que comparte muchas de las mismas características del dispositivo de muestreo que se muestra en las Figuras 4A-4C. Por ende, muchos de los mismos números de referencia se describen anteriormente y no se repiten aquí por razones de brevedad. En este punto, una diferencia es que un poste lateral 232 se extiende desde la porción inferior 202. El poste lateral 232 coopera con un eje 234 de la tapa 204. La tapa 204 incluye una abertura de espacio muerto 236 que está abierta a un paso de espacio muerto 238 que se extiende a través del poste lateral 232. La abertura de espacio muerto 236 está dimensionada para permitir que una pipeta pase al paso de espacio muerto 238. Debido a que solo hay un recipiente de muestra por dispositivo de muestreo 230, solo los pasos interiores 208 contienen muestras, mientras que las aberturas de espacio muerto 236 sirven como pasos al espacio muerto. Esto es para proporcionar compatibilidad con una máquina de manipulación de líquidos estándar, que proporciona una pipeta fija para cada ubicación de pocillo estándar. Si las aberturas de espacio muerto 236 no estuvieran presentes, las pipetas de lo contrario chocarían debido a la huella general del dispositivo de muestreo 232, que es mayor que la distancia entre dos pocillos de una microplaca estándar.
Las vistas superiores mostradas en las Figuras 5E y 5F muestran dimensiones de ejemplo para el dispositivo de muestreo 230. En este punto, la dimensión de ejemplo de centro a centro entre el paso interior 208 y la abertura de espacio muerto 236 es de 9 mm (0,354 pulgadas). Además, el ancho del dispositivo de muestreo 230 es de 8,75 mm (0,344 pulgadas), que es menor que la separación de 9 mm que es estándar en el formato de microtitulación y que permite la disposición de una pluralidad de dispositivos de recogida de muestras en una matriz de lado a lado con un formato de 9 mm; y la longitud es de 17,5 mm (0,689 pulgadas), que es menor que los 18 mm (o dos veces la separación de 9 mm que es estándar en el formato de microtitulación) y que permite la disposición de una pluralidad de dispositivos de recogida de muestras en una matriz de lado a lado con un formato de 2 x 9 mm; y, por ende, el paso interior 208 y la abertura de espacio muerto 236 del dispositivo de muestreo estarán situados a 9 mm de distancia en la dirección X o Y de cualquier dispositivo de muestreo contiguo. Estas dimensiones se basan en la compatibilidad con las dimensiones estándar de las microplacas de acuerdo con las normas ANSI/SLAS 1-2004 a ANSI/SLAS 4-2004. Por ende, 2, 4, 8, 12, 16, 24, 32 o idealmente 48 dispositivos de muestreo 230 pueden disponerse en una matriz como se muestra en la Figura 5G usando una bandeja especializada 240, de tal forma que cada paso interior 208 y cada abertura 236 se colocan en las ubicaciones teóricas de los pocillos de una microplaca estándar de 96 pocillos y, por lo tanto, están dispuestos para ser compatibles con los aparatos de manipulación robótica de líquidos comercialmente disponibles configurados para microplacas estándar. La bandeja 240 incluye porciones curvas 242 para encajar extremos curvos de los dispositivos de muestreo 230, así como un lado truncado 244 que se alinea con los extremos planos de los dispositivos de muestreo 230. De esta forma, se pueden disponer dos bandejas 240 una cerca de la otra de tal forma que el mismo dispositivo de pipeteo multicanal pueda acceder a ambas matrices para transferir muestras de forma eficaz a una segunda placa de formato de microtitulación y, en algunas realizaciones, las dos bandejas pueden estar una al lado de la otra para comprender, por ejemplo, 96 dispositivos de muestreo 230, como se comentará adicionalmente más adelante.
Las matrices útiles de la invención se disponen a una distancia predeterminada. Una separación útil de ejemplo entre los dispositivos de recogida de muestras en una matriz es el cociente de 9 mm y X donde X es un número entero, u opcionalmente el producto de 9 mm y X donde X es un número entero. Por lo tanto, una matriz útil incluiría una separación de centro a centro de los dispositivos de recogida de muestras de 1,125 mm (9 mm/8), 2,25 mm (9 mm/4), 4,5 mm (9 mm/2), 9 mm (9 mm/1), 18 mm (9 mm x 2), 27 mm (9 mm x 3), 36 mm (9 mm x 4), y 45 mm (9 mm x 5) y más (9 mm x X). El número de los dispositivos de recogida de muestras puede ser tan solo dos, cuatro, 8, 12, 16, 24, 36, 48, 96, 384, 768 y hasta 1.536 o más. Una matriz ordenada de dispositivos de recogida de muestras puede ser unidimensional, donde los dispositivos están dispuestos en una fila con una separación uniforme de centro a centro, y donde una pipeta multicanal unidimensional puede acceder simultáneamente a dos o más muestras en la fila. Opcionalmente, una matriz ordenada útil de dispositivos de recogida de muestras en la invención puede ser bidimensional, donde los dispositivos están dispuestos en filas y columnas con una separación uniforme de centro a centro en las filas y columnas, y donde una pipeta multicanal unidimensional puede acceder simultáneamente a dos o más muestras en una fila o columna determinada, u opcional donde una pipeta multicanal bidimensional puede acceder simultáneamente a múltiples muestras en más de una fila y más de una columna. Una realización de la invención es cuando los dispositivos de recogida de muestras tienen la misma separación de centro a centro en las filas que es diferente de la separación de centro a centro en las columnas. Por ejemplo, la separación de centro a centro en las filas se establece en 9 mm y en las columnas se establece en 18 mm. Otra realización de la invención es cuando los dispositivos de recogida de muestras tienen la misma separación de centro a centro en las filas que es la misma que la separación de centro a centro en las columnas. Por ejemplo, la separación de centro a centro en las filas y en las columnas se establece en 9 mm.
La Figura 6 muestra una pluralidad de dispositivos de muestreo 220 dispuestos en un formato de lado a lado. En este punto, las etiquetas 210 están formadas como una tira y configuradas para desprenderse a la fuerza unas de otras, por ejemplo, aplicando fuerza a los limites perforados, con muescas o adelgazados presentes entre cada etiqueta 210. Las tapas 204 y las porciones inferiores 202 de unión a cada etiqueta, no se unen, sin embargo, a las tapas adyacentes 204 ni a las porciones inferiores 204. Por ende, el desprendimiento de una etiqueta particular 210 da como resultado la adquisición de un dispositivo de muestreo individual 200.
Las Figuras 7A a 7C representan el contenido de un kit de dispositivo de muestreo y el método para usar un dispositivo de muestreo. El contenido de un kit se puede proporcionar dentro de una caja de envío, una bolsa de envío de muestras, una bolsa de decantación sellada y una pluralidad de dispositivos de muestreo, que, por ejemplo, puede tomar la forma de cualquiera de los dispositivos de muestreo y combinaciones de los mismos desvelados en el presente documento. La cantidad de dispositivos de muestreo puede variar dependiendo de las necesidades de un usuario, generalmente se proporciona al menos un dispositivo de muestreo. La bolsa de envío de muestras de hojas está configurada para contener muestras de hojas y la bolsa desecante sellada.
En la Figura 7B, el usuario desprende una etiqueta rígida de la pluralidad de etiquetas de la tira provista en el kit. El dispositivo de muestreo resultante se aplica después a una hoja como se muestra, cerrando la tapa del dispositivo de muestreo sobre la porción inferior, con una porción de la hoja colocada en el medio. La acción resultante hace que una muestra de la hoja sea depositada e inmovilizada de forma segura dentro del dispositivo de muestreo. La etiqueta del dispositivo de muestreo se desprende y se fija a la planta directamente o indirectamente al recipiente que contiene la planta de la que se tomó la muestra. Por tanto, la muestra dentro del dispositivo de muestreo se puede rastrear hasta la planta etiquetada o el recipiente de planta, porque el dispositivo de muestreo incluye una identificación coincidente o vinculada. Este proceso se puede repetir para plantas adicionales hasta que todos los dispositivos de muestreo dentro del kit de la Figura 7A se carguen con material de muestra.
En la Figura 7C, los dispositivos de muestreo se colocan dentro de la bolsa de envío de muestras junto con un desecante activado, que deshidrata las muestras durante el envío a través de los orificios de ventilación proporcionados dentro de los dispositivos de muestreo. Después, la bolsa de envío cagada se coloca dentro de una caja de envío proporcionada dentro del kit y se envía a una instalación de prueba de muestras.
En la Figura 8, se recibe la caja de envío junto con su contenido de la bolsa de envío cagada con al menos un dispositivo de muestreo y se retira el dispositivo de muestreo. Los dispositivos de muestreo y su contenido pueden rehidratarse después con una solución (por ejemplo, un tampón de lisis de tejido vegetal) mediante un aparato de carga 800 a través de los orificios de ventilación de los dispositivos de muestreo, por tanto, evitando la necesidad de abrir los dispositivos de muestreo para probar su contenido. Por ejemplo, los reactivos (por ejemplo, una solución alcalina que incluye, entre otros, NaOH) para extraer ácidos nucleicos o proteínas se pueden agregar a través de los orificios de ventilación de los dispositivos de muestreo. Se pueden encontrar protocolos de ejemplo para la extracción de ácidos nucleicos en, por ejemplo, Protocolos Actuales en Biología Molecular (Ausubel et al., eds., 1994-1999). Un ensayo (que incluye, entre otros, la secuenciación de ácidos nucleicos, reacción en cadena de la polimerasa, etc.) se puede realizar después para cada muestra y los resultados de cada ensayo se pueden correlacionar con plantas particulares correlacionando el código de identificación de cada dispositivo de muestreo con la etiqueta restante dejada en el lugar de la cosecha.
Las Figuras 9A-9C muestran las etapas de un método para usar el dispositivo de muestreo 230 de las Figuras 5C-5F. Como se ha observado anteriormente, cada paso interior 208 y cada abertura 236 se colocan en las ubicaciones teóricas de los pocillos de una microplaca estándar de 96 pocillos y, por lo tanto, están dispuestos para ser compatibles con los aparatos de manipulación robótica de líquidos comercialmente disponibles configurados para microplacas estándar. Sin embargo, debido a que solo hay un recipiente de muestra por dispositivo de muestreo 230, solo los pasos interiores (orificios de ventilación) 208 contienen muestras, mientras que las aberturas 236 sirven como pasos al espacio muerto. Esta disposición proporciona compatibilidad con una máquina de manipulación de líquidos estándar, que proporciona una pipeta para cada ubicación de pocillo estándar. Si las aberturas 236 no estuvieran presentes, las pipetas de lo contrario chocarían debido a la longitud del dispositivo de muestreo 230.
En la Figura 9A, los dispositivos de muestreo 230 se disponen en una primera matriz 300 y en una segunda matriz 302, con cada matriz aquí conteniendo 48 dispositivos de muestreo 230 como se muestra en la Figura 5G. Los dispositivos de muestreo 230 de cada matriz están dispuestos de forma idéntica, pero las matrices son especulares entre sí de tal forma que los orificios de ventilación de cada dispositivo de muestreo 230 de la primera matriz 300 se colocan en el lado izquierdo, mientras que los orificios de ventilación de cada dispositivo de muestreo 230 de la segunda matriz 302 se colocan en el lado derecho. La primera y segunda matrices se colocan adyacentes a una matriz de pipetas 306, que tiene una matriz estándar de 96 pipetas, en este caso se muestra en filas alternas de pipetas A y B. La matriz de pipetas 306 puede ser parte de un aparato de manipulación de líquidos comercialmente disponible, tal como el IntelliQube® de Douglas Scientific. El movimiento relativo de la matriz de pipetas 306 y de la primera y segunda matrices de dispositivos de muestreo se puede lograr mediante sistemas robóticos, como se conoce en la técnica, o en algunos casos derivado semiautomáticamente mediante el uso de accesorios de sujeción de dispositivos de muestreo deslizantes que utilizan portaobjetos y una matriz de pipetas limitada al movimiento vertical automatizado.
En la Figura 9B, la matriz de pipetas 306 se mueve de tal forma que cada pipeta se coloca en un paso de espacio muerto u orificio de ventilación de los dispositivos de muestreo de la primera matriz 300. En este punto, las filas A de pipetas se colocan en comunicación fluida con los orificios de ventilación y, por tanto, en comunicación fluida con la porción del recipiente de muestra de los dispositivos de muestreo que contienen muestras de hojas y que se han cargado previamente con fluido, mientras que las filas B de pipetas se colocan en los pasos de espacio muerto. A continuación, se puede extraer líquido de las filas A de pipetas. En algunos casos, solo la primera matriz 300, o una porción menor de la misma, de dispositivos de muestreo está presente y, por ende, solo se utilizará la mitad o menos de la mitad de la matriz de pipetas 306.
En la Figura 9C, la matriz de pipetas 306 se mueve de tal forma que cada pipeta se coloca en un paso de espacio muerto u orificio de ventilación de los dispositivos de muestreo de la segunda matriz 302. En este punto, debido a la disposición de imagen especular de la primera matriz 300 y la segunda matriz 302, las filas B de pipetas se colocan en comunicación fluida con los orificios de ventilación y, por tanto, en comunicación con la porción del recipiente de muestra de los dispositivos de muestreo que contienen muestras de hojas y que se han cargado previamente con fluido, mientras que las fijas A de pipetas, que ya se utilizaron para la primera matriz 300, se colocan en los pasos de espacio muerto. A continuación, se puede extraer líquido de las filas B de pipetas. De esta forma, se pueden procesar 96 muestras de 96 recipientes de muestra.
Debe interpretarse que el uso de los términos "un" y "uno/a", y "el/la" y los referentes similares en el contexto de descripción de la invención (especialmente en el contexto de las siguientes reivindicaciones) cubren tanto el singular como el plural, salvo que se indique lo contrario en el presente documento o el contexto lo contradiga claramente. Los términos "que comprende(n)", "que tiene(n)", "que incluye(n)", y "que contiene(n)" deben interpretarse como términos abiertos (es decir, significa ''que incluye(n), pero no se limita(n) a,'') a menos que se indique lo contrario. El término "conectado/a" debe interpretarse como parcial o totalmente contenido dentro, unido/a a, o fijado/a, incluso si hay algo interviniendo. La enumeración de intervalos de valores en el presente documento tiene la intención de servir simplemente como un método abreviado para referirse individualmente a cada valor separado que se encuentra dentro del intervalo, a menos que se indique lo contrario en el presente documento, y cada valor por separado se incorpora a la memoria descriptiva como si se mencionara individualmente en el presente documento.
Todos los métodos descritos en el presente documento pueden realizarse en cualquier orden adecuado salvo que se indique lo contrario en el presente documento o que de otro modo el contexto lo contradiga claramente. El uso de cualquiera y todos los ejemplos o lenguaje de ejemplo (por ejemplo, "de tal forma que") proporcionados en el presente documento, tiene la intención de simplemente ilustrar mejor las realizaciones de la invención y no plantea una limitación en el alcance de la invención a menos que se reivindique lo contrario. Debería interpretarse que ningún lenguaje de la memoria descriptiva indica cualquier elemento no reivindicado como esencial para la práctica de la invención.

Claims (13)

REIVINDICACIONES
1. Un dispositivo muestreo (230) que comprende:
una porción inferior (202) que comprende un recipiente de muestra y un paso de espacio muerto (238) adyacente al recipiente de muestra;
una tapa (204) unida de forma móvil con la porción inferior (202) y que comprende un borde cortante configurado para cortar una hoja, de tal forma que cuando la tapa (204) se une a la porción inferior (202) con una hoja en el medio, una muestra de hoja se deposita en el recipiente de muestra de la porción inferior, comprendiendo también la tapa (204) una abertura de espacio muerto (236) configurada para recibir una primera pipeta, en donde la tapa (204) se une de forma móvil a la porción inferior mediante un poste lateral (232) que se extiende fuera de la porción inferior, en donde la abertura de espacio muerto está abierta al paso de espacio muerto, en donde el paso de espacio muerto se extiende a través del poste lateral (232), y en donde la tapa (204) incluye un eje (234) configurado para cooperar con el poste lateral (232), y en donde la tapa (204) incluye un orificio de ventilación (208) en comunicación fluida con el recipiente de muestra de tal forma que la muestra de hoja se seca durante el transporte del dispositivo de muestreo (230), estando el orificio de ventilación (208) configurado para recibir una segunda pipeta.
2. El dispositivo de muestreo de la reivindicación 1, en donde la abertura de espacio muerto (236) y el orificio de ventilación (208) están separados 9 mm.
3. El dispositivo de muestreo la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en donde el dispositivo de muestreo (230) está configurado para estar dispuesto en una matriz (300, 302) de dispositivos de muestreo configurados de forma similar (230).
4. El dispositivo de muestreo de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde la porción inferior (202) comprende al menos un recipiente de muestra de forma parcialmente ovalada.
5. El dispositivo de muestreo de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde el paso de espacio muerto (238) está al menos parcialmente formado dentro del poste lateral (232).
6. El dispositivo de muestreo de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde la tapa (204) comprende un poste de corte alargado (206) que se extiende dentro del recipiente de muestra, en donde el poste de corte alargado está configurado para inmovilizar la muestra de hoja en una porción inferior del recipiente de muestra, y en donde la porción inferior comprende una pared limitadora de profundidad para limitar la entrada de la porción inferior sobre una hoja.
7. El dispositivo de muestreo de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, que comprende además una etiqueta rígida que se extiende en voladizo, opcionalmente, en donde la etiqueta rígida se extiende desde la porción inferior del recipiente de muestra o una porción superior del recipiente de muestra, y se puede desprender del mismo.
8. El dispositivo de muestreo de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en donde el orificio de ventilación (208) está configurado para actuar como un conducto de carga para un fluido de preparación de muestras.
9. Un método para tomar muestras de una hoja de una planta usando un sistema del dispositivo de muestreo, comprendiendo el método:
obtener una pluralidad de dispositivos de muestreo (230) de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores; disponer la pluralidad de dispositivos de muestreo (230) en primera y segunda matrices de dispositivos de muestreo (300, 302);
colocar la pluralidad de dispositivos de muestreo adyacentes a una matriz (306) de pipetas, comprendiendo la matriz de pipetas una primera pluralidad de pipetas y una segunda pluralidad de pipetas dispuestas en filas alternas;
mover la matriz de pipetas de tal forma que la primera pluralidad de pipetas se mueva hacia los orificios de ventilación de la primera matriz de dispositivos de muestreo y la segunda pluralidad de pipetas descienda hacia las aberturas de espacio muerto de la primera matriz de dispositivos de muestreo;
extraer fluido de los orificios de ventilación de la primera matriz de dispositivos de muestreo utilizando la primera pluralidad de pipetas;
mover la matriz de pipetas de tal forma que la primera pluralidad de pipetas se mueva hacia las aberturas de espacio muerto (236) de la segunda matriz de dispositivos de muestreo y la segunda pluralidad de pipetas descienda hacia los orificios de ventilación (208) de la segunda matriz de dispositivos de muestreo;
extraer fluido de los orificios de ventilación de la segunda matriz de dispositivos de muestreo utilizando la segunda pluralidad de pipetas.
10. El método de la reivindicación 9, en donde la pluralidad de dispositivos de muestreo (230) dispuestos en una matriz de dispositivos de muestreo (300, 302) se colocan donde la distancia entre la abertura de espacio muerto (236) y el orificio de ventilación (208) de un primer dispositivo de muestreo es la misma que la distancia entre el orificio de ventilación de un primer dispositivo de muestreo y el orificio de ventilación de un segundo dispositivo de muestreo en la matriz.
11. El método de la reivindicación 9 o 10, en donde la distancia entre la abertura de espacio muerto (236) y el orificio de ventilación (208) de un primer dispositivo de muestreo (230) es de 9 mm y la distancia entre el orificio de ventilación de un primer dispositivo de muestreo en la matriz y el orificio de ventilación de un segundo dispositivo de muestreo en la matriz es también de 9 mm.
12. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11, en donde la primera y segunda matrices de dispositivos de muestreo están dispuestas para que sean accesibles por el mismo dispositivo de manipulación de líquidos, en donde la primera matriz de dispositivos de muestreo (300) se apoya directamente en la segunda matriz de dispositivos de muestreo (302), y en donde la segunda matriz de dispositivos de muestreo está dispuesta como una imagen especular de la primera matriz de dispositivos de muestreo.
13. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 9 a 12, en donde la pluralidad de dispositivos de muestreo (230) comprende 96 dispositivos de muestreo.
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