ES2621413T3 - Uso de tubulina acetilada como un biomarcador de la respuesta de fármacos a furazanobencimidazoles - Google Patents
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- A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
- A61K31/4164—1,3-Diazoles
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Abstract
Uso de tubulina acetilada como un biomarcador para predecir la respuesta a un compuesto, en el que el compuesto es un compuesto de fórmula general I,**Fórmula** en donde R representa fenilo, tienilo o piridinilo, en donde fenilo está opcionalmente sustituido con uno o dos sustituyentes seleccionados independientemente entre alquilo, halo-alquilo inferior, hidroxi-alquilo inferior, alcoxi inferior-alquilo inferior, aciloxi-alquilo inferior, fenilo, hidroxi, alcoxi inferior, hidroxi-alcoxi inferior, alcoxi inferior-alcoxi inferior, fenil-alcoxi inferior, alquil inferior-carboniloxi, amino, monoalquilamino, dialquilamino, alcoxi inferior-carbonilamino, alquil inferior-carbonilamino, amino sustituido, en donde los dos sustituyentes en nitrógeno forman, junto con el nitrógeno, heterociclilo, alquil inferior-carbonilo, carboxi, alcoxi inferior-carbonilo, ciano, halógeno y nitro; y en donde dos sustituyentes adyacentes son metilendioxi; y en donde piridinilo está opcionalmente sustituido con alcoxi inferior, amino o halógeno; X representa un grupo C>=Y, en donde Y representa oxígeno o nitrógeno sustituido con hidroxi o alcoxi inferior; R1 representa hidrógeno, alquil inferior-carbonilo, hidroxi-alquilo inferior o ciano-alquilo inferior; R2, R3 y R6 representan hidrógeno; R4 y R5, independientemente uno de otro, representan hidrógeno, alquilo inferior o alcoxi inferior; o R4 y R5 juntos representan metilendioxi; y derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos, en donde los derivados farmacéuticamente aceptables se seleccionan del grupo que consiste en una sal, solvato, éster o una amida hidrolizable in vivo de dicho compuesto, sal de tal éster o amida hidrolizable in vivo, y polimorfo de dicho compuesto, o en donde R representa fenilo o piridinilo, en donde fenilo está opcionalmente sustituido con uno o dos sustituyentes seleccionados independientemente entre alquilo, halo-alquilo inferior, hidroxi-alquilo inferior, alcoxi inferior-alquilo inferior, aciloxi-alquilo inferior, fenilo, hidroxi, alcoxi inferior, hidroxi-alcoxi inferior, alcoxi inferior-alcoxi inferior, fenil-alcoxi inferior, alquil inferior-carboniloxi, amino, monoalquilamino, dialquilamino, alcoxi inferior-carbonilamino, alquil inferior-carbonilamino, amino sustituido, en donde los dos sustituyentes en nitrógeno forman junto con el nitrógeno un heterociclilo, alquil inferior-carbonilo, carboxi, alcoxi inferior-carbonilo, formilo, ciano, halógeno y nitro; y en donde dos sustituyentes adyacentes son metilendioxi; y en donde piridinilo está opcionalmente sustituido con alcoxi inferior, amino o halógeno; X representa oxígeno; R1 representa hidrógeno, alquil inferior-carbonilo, hidroxi-alquilo inferior o ciano-alquilo inferior; R2, R3 y R6 representan hidrógeno; R4 y R5, independientemente uno de otro, representan hidrógeno, alquilo inferior o alcoxi inferior; o R4 y R5 juntos representan metilendioxi; y derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos, en donde los derivados farmacéuticamente aceptables se seleccionan del grupo que consiste en una sal, solvato, éster o amida hidrolizable in vivo de dicho compuesto, sal de tal éster o amida hidrolizable in vivo, y polimorfo de dicho compuesto, y en donde el prefijo inferior designa un radical que tiene hasta e incluye un máximo de 7, especialmente hasta e incluye un máximo de 4 átomos de carbono, y en el que la respuesta es de una enfermedad en un sujeto, y el biomarcador tubulina acetilada se mide ex vivo en una muestra o muestras tomadas del cuerpo humano o animal, preferiblemente tomadas del cuerpo humano.
Description
de escala blanca representa 10 micrómetros. Se muestran imágenes representativas de los fenotipos de
microtúbulos observados. Figura 5: Muestra una combinación de tratamiento con BAL27862 y agentes convencionales que fijan como objetivo microtúbulos. Microtúbulos de células mitóticas o detenidas G2/M de NSCLC A549 fueron teñidos después del tratamiento durante los tiempos indicados más adelante. Se utilizaron BAL27862 50 Nm, vinblastina 50 nM, colchicina 50 nM y paclitaxel 25 nM. La barra de escala blanca representa 10 micrómetros.
Fig. 5A: Tratamiento con vinblastina durante 24 horas; Fig. 5B: Tratamiento con vinblastina durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862; Fig. 5C: Tratamiento con BAL27862 durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales vinblastina; Fig. 5D: Tratamiento con colchicina durante 24 horas; Fig. 5E: Tratamiento con colchicina durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862; Fig. 5F: Tratamiento con BAL27862 durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales colchicina; Fig. 5G: Tratamiento con paclitaxel durante 24 horas; Fig. 5H: Tratamiento con paclitaxel durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862; Fig. 5I: Tratamiento con BAL27862 durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales paclitaxel. Figura 6: Muestra una combinación de tratamiento con BAL27862 y nocodazol. Microtúbulos de células mitóticas o
detenidas G2/M de NSCLC A549 fueron teñidos después del tratamiento durante los tiempos indicados más adelante. Se utilizaron BAL27862 25 nM y nocodazol a las concentraciones indicadas a continuación. La barra de escala blanca representa 10 micrómetros.
Figo. 6A: Tratamiento con control durante 24 horas; Figo. 6B: Tratamiento con BAL27862 25 nM durante 24 horas; Figo. 6C: Tratamiento con nocodazol 50 nM durante 24 horas; Figo. 6D: Tratamiento con nocodazol 100 nM durante 24 horas; Figo. 6E: Tratamiento con nocodazol 150 nM durante 24 horas; Figo. 6F: Tratamiento con nocodazol 200 nM durante 24 horas; Fig. 6G: Tratamiento con nocodazol 50 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862 25 nM; Fig. 6H: Tratamiento con nocodazol 100 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862 25 nM; Fig. 6I: Tratamiento con nocodazol 150 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862 25 nM; Fig. 6J: Tratamiento con nocodazol 200 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales BAL27862 25 nM; Fig. 6K: Tratamiento con BAL27862 25 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales nocodazol 50 nM; Fig. 6L: Tratamiento con BAL27862 25 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales nocodazol 100 nM; Fig. 6M: Tratamiento con BAL27862 25 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales nocodazol 150 nM; Fig. 6N: Tratamiento con BAL27862 25 nM durante 24 horas incluyendo las 4 horas finales nocodazol 200 nM; Figura 7: Muestra las líneas de células tumorales que han sido seleccionados en cuanto a la resistencia a BAL27862
a través de cultivo in vitro en presencia del compuesto. Sobre la base de determinaciones de CI50 (para la proliferación: A549, SKOV3, H460) o CE50 (para la muerte celular: Jurkat), factores de resistencia de BAL27862 frente a líneas parentales fueron: A549 (3,0 veces); SKOV3 (7,6 veces -resistente a 1 línea); Jurkat (22,5 veces), H460 (5,3 veces) (véase la Tabla 1). Extractos de proteínas de células enteras se han preparado a partir de líneas parentales y resistentes y se han analizado por inmunotransferencia para la expresión de tubulina acetilada. Las concentraciones de actina se incluyeron como control de carga.
Figura 8: Muestra que concentraciones incrementadas de proteínas tubulina acetilada se mantienen en líneas tumorales SKOV3 durante el desarrollo de la resistencia. Se seleccionaron líneas de células tumorales SKOV3 para la resistencia a BAL27862 a través de cultivo in vitro en presencia de BAL27862 para aumentar los períodos de tiempo. Sobre la base de determinaciones de CI50, los factores de resistencia de BAL27862 frente a líneas
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parentales fueron: SKOV3 resistente 1 (7,6 veces), SKOV3 resistente 2 (11,6 veces) (véase la Tabla 1). Extractos de proteínas de células enteras se prepararon a partir de líneas parentales y resistentes y se analizaron por inmunotransferencia para la expresión de tubulina acetilada. Las concentraciones de actina actúan como un control de la carga.
Figura 9: Muestra la secuencia de proteínas de la cadena de tubulina alfa-1C [Homo sapiens] (SEQ. ID. No.1) Figura 10: Muestra la secuencia de proteínas de la cadena de tubulina alfa-3C/D [Homo sapiens] (SEQ. ID. No.2)
Figura 11: Muestra la secuencia de proteínas de la cadena de tubulina alfa-4A [Homo sapiens] (SEQ ID No. 3)
Figura 12: Muestra la secuencia de proteínas de la isoforma 1 de la cadena de tubulina alfa-8 [Homo sapiens] (SEQ ID No. 4) Figura 13: Muestra la secuencia de proteínas de la cadena de tubulina beta [Homo sapiens] (SEQ ID No. 5) Figura 14: Muestra la secuencia de proteínas de la isoforma 1 de la cadena de tubulina beta-3 [Homo sapiens] (SEQ
ID No. 6).
Descripción Detallada
Compuestos de fórmula I Los compuestos utilizados en la invención están representados por la fórmula general I:
en donde R representa fenilo, tienilo o piridinilo en donde fenilo está opcionalmente sustituido con uno o dos sustituyentes seleccionados independientemente entre
alquilo, halo-alquilo inferior, hidroxi-alquilo inferior, alcoxi inferior-alquilo inferior, aciloxi-alquilo inferior, fenilo, hidroxi, alcoxi inferior, hidroxi-alcoxi inferior, alcoxi inferior-alcoxi inferior, fenil-alcoxi inferior, alquil inferior-carboniloxi, amino, monoalquilamino, dialquilamino, alcoxi inferior-carbonilamino, alquil inferior-carbonilamino, amino sustituido, en donde los dos sustituyentes en nitrógeno forman, junto con el nitrógeno, heterociclilo, alquil inferior-carbonilo, carboxi, alcoxi inferior-carbonilo, ciano, halógeno y nitro; y en donde dos sustituyentes adyacentes son metilendioxi;
y en donde piridinilo está opcionalmente sustituido con alcoxi inferior, amino o halógeno; X representa un grupo C=Y, en donde Y representa oxígeno o nitrógeno sustituido con hidroxi o alcoxi inferior; R1 representa hidrógeno, alquil inferior-carbonilo, hidroxi-alquilo inferior o ciano-alquilo inferior; R2, R3 y R6 representan hidrógeno; R4 y R5, independientemente uno de otro, representan hidrógeno, alquilo inferior o alcoxi inferior;
- o R4 y R5 juntos representan metilendioxi;
y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos, en donde los derivados farmacéuticamente aceptables se seleccionan del grupo que consiste en una sal, solvato, éster o amida hidrolizable in vivo de dicho compuesto, sal de tal éster o amida hidrolizable in vivo, y polimorfo de dicho compuesto;
- o en donde R representa fenilo o piridinilo, en donde fenilo está opcionalmente sustituido con uno o dos sustituyentes seleccionados independientemente entre
alquilo, halo-alquilo inferior, hidroxi-alquilo inferior, alcoxi inferior-alquilo inferior, aciloxi-alquilo inferior, fenilo, hidroxi,
en donde R, Y y R1 se definen como sigue:
- R
- Y R1
- imagen11
- O H
- imagen12
- NOH H
- imagen13
- NOMe H
- imagen14
- O H
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- NOH H
- imagen16
- NOH H
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- NOMe H
- imagen18
- O H
- imagen19
- NOH H
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- NOMe H
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- O H
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- NOH H
- R
- Y R1
- imagen23
- NOMe H
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- NOMe H
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- O H
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- NOH H
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- NOMe H
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- O H
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- NOH H
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- NOMe H
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- NOMe H
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- O H
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- O Ac
- R
- Y R1
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- O H
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- O H
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- O H
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- O CH2CH2CN
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- O CH2CH2CN
- imagen41
- O H
- imagen42
- O H
- imagen43
- O CH2CH2CH2OH
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- O H
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- O CH2CH2CN
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- O H
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- O CH2CH2CN
- imagen48
- O CH2CH2CN
- R
- Y R1
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- O CH2CH2CN
- imagen50
- O H
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- O CH2CH2CN
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- Y R1
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- O CH2CH2CN
- imagen69
- O H
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- O H
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- O CH2CH2CN
o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente. Aún en una realización preferida, el compuesto de fórmula general I se selecciona del grupo que consiste en: 4-(1-fenoximetil-1H-bencimidazol-2-il)-furazan-3-ilamina, 4-[1-(4-fluorofenoximetil)-1H-bencimidazol-2-il]-furazan-3-ilamina, 4-[1-(3,4-dimetilfenoximetil)-1H-bencimidazol-2-il]-furazan-3-il-N-(2-cianoetil)-amina y compuestos representados por la fórmula:
en donde R y R1 son como se definen a continuación
- R
- R1
- imagen73
- H
- imagen74
- H
- imagen75
- H
- imagen76
- H
- imagen77
- H
- imagen78
- CH2CH2CN
- imagen79
- CH2CH2CN
- imagen80
- CH2CH2CN
- imagen81
- H
- imagen82
- H
- R
- R1
- imagen83
- H
- imagen84
- H
- imagen85
- H
- imagen86
- H
- imagen87
- H
- imagen88
- H
- imagen89
- CH2CH2CN
- imagen90
- CH2CH2CH2OH
- imagen91
- H
- imagen92
- H
y derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente. En aún otra realización preferida, el compuesto de fórmula general I es:
en donde R, R4 y R5 son como se definen a continuación
- R
- R4 R5
- imagen94
- Me Me
- imagen95
- Me Me
- imagen96
- Me Me
- imagen97
- Me Me
- imagen98
- Me Me
- imagen99
- OMe OMe
- imagen100
- OMe OMe
- imagen101
- OMe OMe
- imagen102
- OMe OMe
- imagen103
- OMe OMe
o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente. Más preferiblemente, el compuesto es un compuesto de fórmula general I
en donde R representa fenilo o piridinilo, en donde fenilo está opcionalmente sustituido con uno o dos sustituyentes seleccionados independientemente de
5 alquilo inferior, alcoxi inferior, amino, acetilamino, halógeno y nitro; y en donde piridinilo está opcionalmente sustituido con amino o halógeno; X representa un grupo C=O; R1 representa hidrógeno o ciano-alquilo inferior; R2, R3, R4, R5 y R6 representan hidrógeno;
10 y derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente,
y en donde el prefijo inferior designa un radical que tiene hasta e incluye un máximo de 7, especialmente hasta e incluye un máximo de 4 átomos de carbono. De manera especialmente preferida, el compuesto está representado por la siguiente fórmula
15 en donde R, Y y R1 se definen como sigue:
- R
- Y R1
- imagen106
- O H
- imagen107
- O CH2CH2CN
- imagen108
- O H
- imagen109
- O CH2CH2CN
o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente. De manera más especialmente preferida, el compuesto está representado por la siguiente fórmula
en donde R, Y y R1 se definen como sigue:
- R
- Y R1
- imagen110
- O CH2CH2CN
- imagen111
- O H
- imagen112
- O CH2CH2CN
- o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente. De manera particularmente preferida, el compuesto es
- o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos tal como se definen anteriormente.
El término derivado o derivados en la frase "derivado farmacéuticamente aceptable" o "derivados farmacéuticamente
10 aceptables" de los compuestos de fórmula general I se refiere a sales, solvatos y complejos de los mismos y a solvatos y complejos de sales de los mismos, así como a pro-fármacos tal como se define en esta memoria, y polimorfos y también sales de pro-fármacos de los mismos. En una realización más preferida, se refiere a sales y pro-fármacos, así como a sales de profármacos de los mismos.
Las sales son preferiblemente sales por adición de ácidos. Las sales se forman, preferiblemente con ácidos
15 orgánicos o inorgánicos, a partir de compuestos de fórmula (I) con un átomo de nitrógeno de carácter básico, especialmente las sales farmacéuticamente aceptables. Ácidos inorgánicos adecuados son, por ejemplo, ácidos halogenados tales como ácido clorhídrico, ácido sulfúrico o ácido fosfórico. Ácidos orgánicos adecuados son, por ejemplo, los ácidos carboxílico, fosfónico, sulfónico o sulfámico, por ejemplo, ácido acético, ácido propiónico, ácido
En una realización especialmente preferida, el compuesto de fórmula general I está en forma de un pro-fármaco que tiene la siguiente fórmula
En una realización más especialmente preferida, el compuesto es una sal preferiblemente una sal hidrocloruro, lo más preferiblemente una sal dihidrocloruro, de un compuesto de la siguiente fórmula
El metabolito farmacéuticamente activo in vivo en este caso es BAL27862.
10 Estos pro-fármacos se pueden preparar mediante procedimientos que son conocidos per se, en particular, un procedimiento en el que un compuesto de fórmula (II)
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se prestan fácilmente, es decir, sin reacciones secundarias no deseadas, a la separación, típicamente por solvólisis, reducción, fotólisis o también por actividad enzimática, por ejemplo bajo condiciones análogas a las condiciones fisiológicas, y que no están presentes en los productos finales. El especialista conoce, o puede establecer fácilmente, qué grupos protectores son adecuados con las reacciones mencionadas anteriormente en esta memoria y de aquí en adelante.
La protección de grupos funcionales de este tipo mediante tales grupos protectores, los propios grupos protectores, y sus reacciones de separación se describen, por ejemplo, en libros de referencia estándares para la síntesis de péptidos y en libros especiales sobre grupos protectores tales como
J. F. W. McOmie, "Protective Groups in Organic Chemistry", Plenum Press, Londres y Nueva York 1973, en "Methoden der organischen Chemie" (Methods of organic chemistry), Houben-Weyl, 4ª edición, Volumen 15/l, Georg Thieme Verlag, Stuttgart 1974, y en T. W. Greene, G. M. Wuts "Protective Groups in Organic Synthesis", Wiley, Nueva York, 2006.
Enfermedad
Los compuestos de fórmula general I han demostrado detener la proliferación celular e inducir la muerte celular, por ejemplo por apoptosis.
La desregulación de la proliferación celular, o la falta de una muerte celular apropiada, tiene una amplia gama de implicaciones clínicas. Un cierto número de enfermedades asociadas con una desregulación de este tipo implican hiperproliferación, inflamación, remodelación y reparación de tejidos. Indicaciones familiares en esta categoría incluyen cánceres, restenosis, hiperplasia neointimal, angiogénesis, endometriosis, trastornos linfoproliferativos, patologías relacionadas con el trasplante (rechazo del injerto), poliposis, pérdida de la función neural en el caso de remodelación de tejidos y similares.
El cáncer se asocia con tasas de proliferación celular y muerte celular anormales. Dado que la apoptosis es inhibida
o retrasada en la mayoría de los tipos de enfermedades proliferativas, neoplásicas, la inducción de la apoptosis es una opción para el tratamiento del cáncer, especialmente en tipos de cáncer que muestran resistencia a la quimioterapia clásica, la radiación y la inmunoterapia (Apoptosis and Cancer Chemotherapy, Hickman y Dive, comps., Blackwell Publishing, 1999). También en enfermedades y patologías autoinmunes y relacionadas con el trasplante se puede utilizar compuestos que inducen la apoptosis para restablecer los procesos de muerte celular normal y, por lo tanto, pueden erradicar los síntomas y podrían curar las enfermedades. Otras aplicaciones de compuestos que inducen la apoptosis pueden ser la restenosis, es decir, la acumulación de células de la musculatura lisa vascular en las paredes de las arterias, y en infecciones persistentes provocadas por un fallo de erradicar células infectadas por bacterias y virus. Además, la apoptosis puede ser inducida o restablecida en células epiteliales, en células endoteliales, en las células de la musculatura y en otras que han perdido contacto con la matriz extracelular.
Un compuesto de acuerdo con la fórmula general I o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos se puede usar para el tratamiento profiláctico o especialmente terapéutico del cuerpo humano, en particular para el tratamiento de una enfermedad neoplásica, enfermedad autoinmune, patología relacionada con el trasplante y/o enfermedad degenerativa. Ejemplos de tales enfermedades neoplásicas incluyen, pero no se limitan a neoplasias epiteliales, neoplasias de células escamosas, neoplasias de células basales, papilomas de células de transición y carcinomas, adenomas y adenocarcinomas, neoplasias anexiales y fanera, neoplasias mucoepidermoides, neoplasias quísticas, neoplasias mucinosas y serosas, neoplasias ducales, lobulares y medulares, neoplasias de células acinares, neoplasias epiteliales complejas, neoplasias gonadales especializadas, paragangliomas y tumores del glomus, nevus y melanomas, tumores de tejido blando y sarcomas, neoplasias fibromatosas, neoplasias mixomatosas, neoplasias lipomatosas, neoplasias miomatosas, neoplasias mixtas complejas y estromales, neoplasias fibroepiteliales, neoplasias tipo sinoviales, neoplasias mesoteliales, neoplasias de células germinales, neoplasias trofoblásticas, mesonefromas, tumores de los vasos sanguíneos, tumores de los vasos linfáticos, neoplasias óseas y condromatosas, tumores de células gigantes, tumores óseos misceláneos, tumores odontogénicos, gliomas, neoplasias neuroepiteliomatosas, meningiomas, tumores de la vaina nerviosa, tumores de células granulares y sarcomas de las partes blandas alveolares, linfomas de Hodgkin y no Hodgkin, otras neoplasias linforreticulares, tumores de células plasmáticas, tumores de mastocitos, enfermedades inmunoproliferativas, leucemias, trastornos mieloproliferativos misceláneos, trastornos linfoproliferativos y síndromes mielodisplásicos.
Los compuestos de fórmula I general o derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos se pueden utilizar para tratar enfermedades autoinmunes. Ejemplos de tales enfermedades autoinmunes incluyen, pero no se limitan a lupus eritematoso cutáneo sistémico, discoide o subagudo, artritis reumatoide, síndrome antifosfolípido, CREST, esclerosis sistémica progresiva, enfermedad mixta del tejido conjuntivo (síndrome de Sharp), síndrome de Reiter, artritis juvenil, enfermedad de aglutinina fría, crioglobulinemia mixta esencial, fiebre reumática, espondilitis anquilosante, poliartritis crónica, miastenia grave, esclerosis múltiple, polineuropatía desmielinizante inflamatoria crónica, síndrome de Guillan-Barre, dermatomiositis/polimiositis, anemia hemolítica autoinmune, púrpura trompocitopénica, neutropenia, diabetes mellitus tipo I, tiroiditis (incluida la enfermedad de Hashimoto y de Grave), enfermedad de Addison, síndrome poliglandular, pénfigo (vulgar, foliáceo, sebáceo y vegetante), penfigoide
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ampolloso y cicatricial, penfigoide gestacional, epidermólisis ampollosa adquirida, enfermedad de IgA lineal, liquen escleroso y atrófico, enfermedad de Duhring, psoriasis vulgar, guttata, psoriasis pustular generalizada y pustular localizada, vitiligo, alopecia areata, cirrosis biliar primaria, hepatitis autoinmune, todas las formas de glomerulonefritis, hemorragia pulmonar (síndrome de Goodpasture), nefropatía por IgA, anemia perniciosa y gastritis autoinmune, enfermedades inflamatorias del intestino (incluyendo colitis ulcerosa y enfermedad de Crohn), enfermedad de Behcet, enfermedad celiaca-bebedero, uveítis autoinmune, miocarditis autoinmune, orquitis granulomatosa, aspermatogénesis sin orquitis, fibrosis pulmonar idiopática y secundaria, enfermedades inflamatorias con una posibilidad de patogénesis autoinmune tal como pioderma gangrenoso, liquen ruber, sarcoidosis (incluyendo Lofgren y de tipo cutánea/subcutánea), granuloma anular, reacción inmunológica alérgica tipo I y tipo IV, asma bronquial, polinosis, dermatitis atópica, de contacto y por el aire, vasculitis de grandes vasos (arteritis de células gigantes y de Takayasu), vasculitis de vasos de tamaño mediano (poliarteritis nodosa, enfermedad de Kawasaki), vasculitis de vasos pequeños (granulomatosis de Wegener, síndrome de Churg Strauss, polangiitis microscópica, púrpura de Henoch Schoenlein, vasculitis crioglobulinémica esencial, angiitis cutánea leucoclástica), síndromes de hipersensibilidad, necrólisis epidérmica tóxica (síndrome de Stevens-Johnson, eritema multiforme), enfermedades debidas a los efectos secundarios de los fármacos, todas las formas de efectos cutáneos, específicos para órganos y sistémicos debidos al tipo I-vu (clasificación de Coombs) formas inmunológicas de reacción, patologías relacionadas con el trasplante tales como enfermedad de injerto aguda y crónica frente a huésped e injerto frente a huésped, que implican todos los órganos (piel, corazón, riñón, médula ósea, ojo, hígado, bazo, pulmón, músculo, sistema nervioso central y periférico, tejido conjuntivo, hueso, vasos sanguíneos y linfáticos, sistema genito-urinario, oídos, cartílago , sistema linfático primario y secundario incluyendo médula ósea, ganglios linfáticos, timo, tracto gastrointestinal, incluyendo oro-faringe, esófago, estómago, intestino delgado, colon y recto, incluidas partes de los órganos anteriormente mencionados hasta la concentración y subestructuras de células individuales, p. ej., células madre).
De manera particularmente preferible, la enfermedad es una enfermedad neoplásica o autoinmune. En una realización especialmente preferida, la enfermedad es cáncer.
Ejemplos de cánceres en términos de los órganos y partes del cuerpo afectadas incluyen, pero no se limitan al cáncer de mama, cuello uterino, ovario, colon, recto, (incluyendo colon y recto es decir, cáncer colorrectal), pulmón (incluyendo cáncer de pulmón de células pequeñas cáncer, cáncer de pulmón de células no pequeñas, cáncer de pulmón de células grandes y mesotelioma), hueso, sistema endocrino, glándula adrenal, timo, hígado, estómago, intestino (incluyendo el cáncer gástrico), páncreas, médula ósea, tumores malignos hematológicos, (tales como linfoma, leucemia, mieloma o tumores malignos linfoides), vejiga, tracto urinario, riñones, piel, tiroides, cerebro, cabeza, cuello, próstata y testículos. Preferiblemente, el cáncer se selecciona del grupo que consiste en cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer cervical, cáncer de ovario, cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de páncreas, cáncer de hígado, cáncer de cerebro, cáncer neuroendocrino, cáncer de pulmón, cáncer de riñón, tumores malignos hematológicos, melanoma, leucemia de células T y sarcomas. De manera más especialmente preferida, el cáncer se selecciona del grupo que consiste en cáncer de mama, cáncer cervical, cáncer de ovario, leucemia de células T y cáncer de pulmón. En una realización especialmente preferida, el cáncer se selecciona del grupo que consiste en cáncer de pulmón, cáncer de ovario y leucemia de células T.
Muestras
La medición de la concentración de tubulina acetilada se puede realizar in vitro, en una muestra de tejido biológico derivada del sujeto. La muestra puede ser cualquier material biológico separado del cuerpo tal como, por ejemplo, tejido normal, tejido tumoral, líneas celulares, sangre entera, suero, plasma, líquido cefalorraquídeo, líquido linfático, células tumorales circulantes, lisado celular, lisado tisular, orina y aspirados. Preferiblemente, la muestra se deriva de tejido normal, tejido tumoral o células tumorales circulantes. Más preferiblemente, la muestra se deriva de tejido tumoral o células tumorales circulantes. En una realización particularmente preferida, la muestra se deriva de tejido tumoral. Por ejemplo, la concentración de tubulina acetilada se puede medir en una muestra de tejido tumoral reciente, congelada o fijada en formalina/embebida en parafina.
La muestra se pre-obtiene del sujeto antes de que la muestra sea sometida a las etapas del método que implican medir la concentración del biomarcador. Los métodos para la separación de la muestra son bien conocidos en la técnica, y puede ser separada, por ejemplo, del sujeto por biopsia, por ejemplo, mediante biopsia por punción, biopsia de núcleo o biopsia con aguja fina de aspiración, biopsia endoscópica o biopsia superficial. La sangre puede ser recogida por punción venosa y puede ser procesada adicionalmente de acuerdo con técnicas estándares. Las células tumorales circulantes también pueden obtenerse a partir de sangre sobre la base de, por ejemplo, el tamaño
(p. ej., ISET -Aislamiento por Tamaño de las Células Tumorales del Epitelio) o el enriquecimiento celular inmunomagnético (p. ej., Cellsearch®, Veridex, Raritan, NJ).
Comparación de la muestra
El sujeto puede ser humano o animal. Preferiblemente, el sujeto es humano.
El biomarcador tubulina acetilada se mide ex vivo en una muestra o muestras tomadas del cuerpo humano o animal, tomada preferentemente del cuerpo humano. La muestra o muestras se pre-obtienen del cuerpo humano o animal,
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