ES2530292A1 - Gene construction and methods to detect antifungal and antitumor compounds (Machine-translation by Google Translate, not legally binding) - Google Patents
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Abstract
Description
Construcción génica y métodos para detectar compuestos antifúngicos y antitumorales Gene construction and methods to detect antifungal and antitumor compounds
Sector de la Técnica La presente invención se encuadra en el sector de la industria farmacéutica biotecnológica y, más concretamente, en programas de cribado farmacológico para búsqueda de compuestos con actividad antifúngica o modificadora de la señalización mediada por MAPKs (Mitogen Activated Protein Kinases). Technical Sector The present invention falls within the pharmaceutical industry sector biotechnology and, more specifically, in pharmacological screening programs to search for compounds with antifungal or signal modifying activity mediated by MAPKs (Mitogen Activated Protein Kinases).
Estado de la técnica: La epidemiología de la infección fúngica invasiva (IFI) ha cambiado en los últimos 20 años, por lo que hoy día las micosis se consideran enfermedades emergentes. Su incidencia ha aumentado significativamente y la población de riesgo se ha extendido incluyendo a pacientes con diferentes enfermedades de base tales como los que padecen un cáncer hematológico, los ingresados en unidades de cuidados intensivos, los trasplantados de órgano sólido o aquellos que reciben altas dosis de corticosteroides u otros inmunosupresores (GarcíaVidal et aL, 2013. Pathogenesis of invasive fungal infections. Curr. Opino Infect. Dis. 26, 270-276). Además, este aumento se ha observado también en otras poblaciones de pacientes mucho más numerosas como son los que sufren enfermedad pulmonar obstructiva crónica. También es relevante el hecho de que la etiología de las micosis invasivas está cambiando. Además de Gandida a/bicans y Aspergíllus fumigatus, se están identificando como agentes causales de IFI otras especies como Gandida g/abrata, Aspergíllus terreus, Tríchosporon asahíi, Fusarium spp, Scedosporium spp, Mucora/es y dematiaceos. Todas estas especies emergentes tienen la característica común de ser mucho más resistentes a los antifúngicos que G. a/bicans y A. fumigatus, lo que aumenta la mortalidad ya de por sí elevada. State of the art: The epidemiology of invasive fungal infection (IFI) has changed in the last 20 years, so mycoses are considered emerging diseases today. Its incidence has increased significantly and the population at risk has expanded to include patients with different underlying diseases such as those suffering from hematological cancer, those admitted to intensive care units, solid organ transplant recipients or those receiving high doses of corticosteroids or other immunosuppressants (GarcíaVidal et aL, 2013. Pathogenesis of invasive fungal infections. Curr. Opino Infect. Dis. 26, 270-276). Furthermore, this increase has also been observed in other much larger patient populations such as those with chronic obstructive pulmonary disease. Also relevant is the fact that the etiology of invasive fungal infections is changing. In addition to Gandida a / bicans and Aspergíllus fumigatus, other species such as Gandida g / abrata, Aspergíllus terreus, Tríchosporon asahíi, Fusarium spp, Scedosporium spp, Mucora / es and dematiaceos are being identified as causative agents of IFI. All these emerging species have the common characteristic of being much more resistant to antifungals than G. a / bicans and A. fumigatus, which increases already high mortality.
El número actual de antifúngicos efectivos es relativamente reducido y, contrariamente a lo que se podía esperar por analogía con lo que ocurre en el caso de los fármacos antibacterianos que actúan sobre la pared celular, sólo se ha comercializado hasta el momento un tipo de compuestos antifúngicos que actúan sobre esta diana, inhibiendo la síntesis de ~-glucano: las equinocandinas (Drew et al., 2013. Recent advances in the treatment of lifethreatening, invasive fungal infections. Expert. Opino Pharmacother. 14, 23612374). Una de las razones de la escasez de fármacos antifúngicos de este tipo probablemente sea el limitado número de procedimientos de rastreo específicos dirigidos a esta diana, frente a la estrategia clásica de buscar inhibidores del crecimiento fúngico de una forma general. Se han propuesto algunas metodologías enfocadas a la búsqueda de antifúngicos que específicamente actúen sobre la pared celular, como son la búsqueda de compuestos inhibidores de GTPasas fúngicas que regulan el proceso de mantenimiento de la integridad de la pared celular (EP0892854B1), compuestos que puedan inhibir manosil-transferasas (N u O-glicosilaciones), que son enzimas ausentes en células de mamíferos y esenciales para el mantenimiento de la pared celular fúngica (US6153376A), o bien inhibidores específicos del producto de genes relacionados con esta estructura y que son esenciales para la viabilidad fúngica como CaKRE5, CaALR1 o CaCdc24 (W00068420A2). Se han propuesto también estrategias orientadas a la valoración de la expresión de genes indicadores de la actividad de la vía de la glucán-sintasa, como son los genes SKM1, YPS3, YKL 161C (MLP1), MET10, etc. (W02004057033A1). Asimismo, se ha propuesto una metodología para identificar compuestos que alteren la pared celular mediante la valoración de la expresión del promotor de uno de estos genes, MLP1, en virtud de que su expresión está regulada por la ruta de integridad de la pared celular (CWI, Cel/ Wal/ Integrity) de forma dependiente del factor de transcripción Rlm1, de manera que cuando se induce la ruta, consecuencia de una alteración significativa de la pared celular, este es el gen cuya expresión más se induce. La fusión de dicho promotor al gen de resistencia al antibiótico nurseotricina permite detectar la inducción de la ruta en función de la resistencia de la levadura a dicho antibiótico (ES2303452B1). The current number of effective antifungals is relatively small and, contrary to what could be expected by analogy with what happens in the case of antibacterial drugs that act on the cell wall, only one type of antifungal compound has been marketed so far. that act on this target, inhibiting the synthesis of ~ -glucan: echinocandins (Drew et al., 2013. Recent advances in the treatment of lifethreatening, invasive fungal infections. Expert. Opino Pharmacother. 14, 23612374). One of the reasons for the shortage of antifungal drugs of this type is probably the limited number of specific screening procedures directed at this target, as opposed to the classic strategy of searching for inhibitors of fungal growth in a general way. Some methodologies focused on the search for antifungals that specifically act on the cell wall have been proposed, such as the search for compounds that inhibit fungal GTPases that regulate the process of maintaining the integrity of the cell wall (EP0892854B1), compounds that can inhibit mannosyl transferases (N or O-glycosylations), which are absent enzymes in mammalian cells and essential for the maintenance of the fungal cell wall (US6153376A), or specific inhibitors of the product of genes related to this structure and which are essential for fungal viability such as CaKRE5, CaALR1 or CaCdc24 (W00068420A2). Strategies aimed at evaluating the expression of genes that indicate activity of the glucan synthase pathway have also been proposed, such as the SKM1, YPS3, YKL 161C (MLP1), MET10 genes, etc. (W02004057033A1). Likewise, a methodology has been proposed to identify compounds that alter the cell wall by evaluating the expression of the promoter of one of these genes, MLP1, since its expression is regulated by the cell wall integrity pathway (CWI). , Cel / Wal / Integrity) dependent on the Rlm1 transcription factor, so that when the pathway is induced, as a consequence of a significant alteration of the cell wall, this is the gene whose expression is most induced. The fusion of said promoter to the antibiotic resistance gene nurseotricin allows to detect the induction of the route based on the resistance of the yeast to said antibiotic (ES2303452B1).
Otra de las razones que podrían explicar el bajo número de inhibidores de la biogénesis de la pared celular fúngica identificados hasta el momento, podría ser precisamente la existencia del eficaz mecanismo de salvamento inducido por la ruta CWI ante condiciones que hacen peligrar a esta estructura. Another reason that could explain the low number of inhibitors of fungal cell wall biogenesis identified so far, could be precisely the existence of the effective rescue mechanism induced by the CWI pathway under conditions that endanger this structure.
Todo tipo de células, desde las procarióticas más elementales hasta las eucarióticas más complejas, utilizan rutas de transducción de señales para reconocer el ambiente que las rodea y adaptarse a él, así como para comunicarse con otras células. De especial relevancia en organismos eucariotas son las rutas en las que intervienen MAPKs (Mitogen Activated Protein Kinases). Estas proteín quinasas regulan procesos esenciales como son la expresión génica o la traducción, estabilidad y localización de proteínas. No es de extrañar, por tanto, que las MAPKs jueguen un papel esencial en procesos como la embriogénesis, la proliferación y diferenciación celular, la apoptosis, la respuesta a estrés, la movilidad celular, la homeostasis metabólica, la inmunidad o la función cardiaca, o que las anormalidades en señalización por MAPKs se asocien con enfermedades humanas como la obesidad, diabetes, desórdenes neurodegenerativos, artritis reumatoide o cáncer (Kim and Choi, 2010. Pathological roles of MAPK signaling pathways in human diseases. Biochim. Biophys. Acta. 1802, 396-405). All types of cells, from the most basic prokaryotes to the most complex eukaryotes, use signal transduction pathways to recognize and adapt to the environment around them, as well as to communicate with other cells. Of particular relevance in eukaryotic organisms are the routes in which MAPKs (Mitogen Activated Protein Kinases) intervene. These protein kinases regulate essential processes such as gene expression or protein translation, stability and localization. It is not surprising, therefore, that MAPKs play an essential role in processes such as embryogenesis, cell proliferation and differentiation, apoptosis, stress response, cell mobility, metabolic homeostasis, immunity or cardiac function, or that MAPK signaling abnormalities are associated with human diseases such as obesity, diabetes, neurodegenerative disorders, rheumatoid arthritis, or cancer (Kim and Choi, 2010. Pathological roles of MAPK signaling pathways in human diseases. Biochim. Biophys. Acta. 1802 , 396-405).
Estas rutas, conservadas evolutivamente en eucariotas, comparten una cascada de tres proteín quinasas: una MAPK quinasa quinasa (MKKK o MEKK), una MAPK kinasa (MKK o MEK) y la propia MAPK, que se fosforilan y activan sucesivamente en condiciones de estimulación. Una vez activadas, las MAPKs fosforilan a su vez a proteínas efectoras, por ejemplo, factores de transcripción, regulando de esta manera la expresión génica (Yang et al., 2013. MAP kinase signalling cascad es and transcriptional regulation. Gene 513, 113). These pathways, evolutionarily conserved in eukaryotes, share a cascade of three protein kinases: a MAPK kinase kinase (MKKK or MEKK), a MAPK kinase (MKK or MEK), and MAPK itself, which are successively phosphorylated and activated under stimulating conditions. Once activated, MAPKs in turn phosphorylate effector proteins, eg, transcription factors, thereby regulating gene expression (Yang et al., 2013. MAP kinase signaling cascad es and transcriptional regulation. Gene 513, 113) .
En la levadura Saccharomyces cerevisiae, un organismo unicelular eucariótico, operan 5 MAPKs: Fus3, Kss1, Hog1, 8mk1 y 81t2, que definen 5 rutas que regulan el apareamiento, el crecimiento filamentoso, la respuesta a condiciones de estrés osmótico, la formación de las esporas y la integridad celular, respectivamente (Chen and Thorner, 2007. Function and regulation in MAPK signaling pathways: Lessons learned from the yeast Saccharomyces cerevisiae. Biochim. Biophys. Acta. 1773, 1311-1340). En respuesta a una agresión a la pared celular de S. cerevisiae, una estructura esencial que la protege y da forma, se produce la estimulación de la ruta mediada por la MAPK Slt2, denominada ruta de integridad de la pared celular (CWI; revisado por Levin en 2005 -Levin, O.E., 2005. Cell wall integrity signaling in Saccharomyces cerevisiae. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 69, 262-291-). La activación de esta ruta dispara un mecanismo compensatorio dirigido a mantener la estabilidad de la pared celular mediante una remodelación de la misma, fundamentalmente a través de un cambio en el patrón de expresión génica, y con ello asegurar la viabilidad celular frente a dicha agresión. La MAPK SIt2 es activada por las MAPKKs redundantes Mkk1 y Mkk2 quienes a su vez son activadas por la MAPKKK Bck1. Bck1 recibe el estímulo de la proteína kinasa C Pkc1 , a su vez activada por la GTPasa Rh01 en respuesta a la señal detectada por los mecanosensores de membrana Mid2 y Wsc1,2,3. Una vez activada, SIt2 fosforila y activa al factor de transcripción Rlm1, que promueve un incremento en la transcripción de una serie de genes, entre ellos YKL 161G (MLP1), GRH1, GWP1, SL T2 o RLM1. Por otro lado, la pared celular no está presente en células de mamíferos, mientras que esta ruta también está conservada en hongos patógenos, como Gandida albicans (Navarro-Garcia, F. et al., 2001. Signal transduction pathways and cell-wall construction in Gandida albicans. Med. Mycol. 39 Supp/1, 87-100), Aspergillus fumiga tus (May, G.S et al., 2005. Mitogen activated protein kinases of Aspergillus fumiga tus. Med.Mycol. 43 Suppl 1, S83-S86) o Gryptococcus neoformans (Kozubowski, L. et al., 2009. Signalling pathways in the pathogenesis of Gryptococcus. Cell Microbiol. 11, 370-380). In the yeast Saccharomyces cerevisiae, a eukaryotic unicellular organism, 5 MAPKs operate: Fus3, Kss1, Hog1, 8mk1 and 81t2, which define 5 routes that regulate mating, filamentous growth, the response to conditions of osmotic stress, the formation of spores and cellular integrity, respectively (Chen and Thorner, 2007. Function and regulation in MAPK signaling pathways: Lessons learned from the yeast Saccharomyces cerevisiae. Biochim. Biophys. Acta. 1773, 1311-1340). In response to an attack on the S. cerevisiae cell wall, an essential structure that protects and shapes it, stimulation of the MAPK Slt2-mediated pathway occurs, called the cell wall integrity pathway (CWI; reviewed by Levin in 2005 -Levin, OE, 2005. Cell wall integrity signaling in Saccharomyces cerevisiae. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 69, 262-291-). Activation of this pathway triggers a compensatory mechanism aimed at maintaining the stability of the cell wall by remodeling it, fundamentally through a change in the pattern of gene expression, and thereby ensure cell viability against such aggression. The SIK2 MAPK is activated by the redundant MAPKKs Mkk1 and Mkk2, which in turn are activated by the MAPKKK Bck1. Bck1 is stimulated by protein kinase C Pkc1, which in turn is activated by GTPase Rh01 in response to the signal detected by the Mid2 and Wsc1,2,3 membrane mechosensors. Once activated, SIt2 phosphorylates and activates the transcription factor Rlm1, which promotes an increase in transcription of a series of genes, including YKL 161G (MLP1), GRH1, GWP1, SL T2 or RLM1. On the other hand, the cell wall is not present in mammalian cells, while this pathway is also conserved in pathogenic fungi, such as Gandida albicans (Navarro-Garcia, F. et al., 2001. Signal transduction pathways and cell-wall construction in Gandida albicans. Med. Mycol. 39 Supp / 1, 87-100), Aspergillus fumigates tus (May, GS et al., 2005. Mitogen activated protein kinases of Aspergillus fumigates. Med.Mycol. 43 Suppl 1, S83- S86) or Gryptococcus neoformans (Kozubowski, L. et al., 2009. Signaling pathways in the pathogenesis of Gryptococcus. Cell Microbiol. 11, 370-380).
En conclusión, es necesario desarrollar nuevos sistemas de búsqueda y estrategias terapéuticas para solventar estos problemas. En esa línea de actuaciones se incluye la invención aquí presentada, que se orienta a la utilización de cepas hipersensibles para el rastreo farmacológico de compuestos que específicamente dañen la pared celular fúngica, o inhiban el mecanismo compensatorio controlado por la ruta CWI. In conclusion, it is necessary to develop new search systems and therapeutic strategies to solve these problems. In this line of action is included the invention presented here, which is oriented to the use of hypersensitive strains for pharmacological screening of compounds that specifically damage the fungal cell wall, or inhibit the compensatory mechanism controlled by the CWI pathway.
Construcción génica y métodos para detectar compuestos antifúngicos y antitumorales. Gene construction and methods to detect antifungal and antitumor compounds.
Para obtener un sistema con el que rastrear nuevos fármacos con efecto potencialmente antifúngico, en la presente invención se ha realizado una construcción génica que incluye el gen MKK1 de Saccharomyces cerevisiae modificado mediante una mutación que da lugar a un cambio en el aminoácido 386 de la proteína, de manera que la serina de la secuencia silvestre está sustituida por una prolina, lo que da lugar a una forma hiperactiva del gen (MKK1S386P); en la construcción génica, además, dicho gen está precedido por una secuencia promotora inducible por el factor de transcripción Rlm1 de la ruta CWI y también se incluye una secuencia de terminación de la transcripción. In order to obtain a system with which to screen new drugs with a potentially antifungal effect, in the present invention a gene construct has been made that includes the Saccharomyces cerevisiae MKK1 gene modified by a mutation that results in a change in amino acid 386 of the protein , so that the serine of the wild sequence is replaced by a proline, which gives rise to an overactive form of the gene (MKK1S386P); in the gene construction, furthermore, said gene is preceded by a promoter sequence inducible by the transcription factor Rlm1 of the CWI pathway and a transcription termination sequence is also included.
En la presente invención, por "secuencia promotora" se entiende la región de una molécula de ADN a la que se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripción y por "secuencia de terminación de la transcripción" se entiende la secuencia de ADN localizada en el extremo de la porción transcrita, y que causa que la ARN polimerasa termine la transcripción. In the present invention, "promoter sequence" means the region of a DNA molecule to which RNA polymerase binds to initiate transcription, and "transcription termination sequence" means the DNA sequence located in the end of the transcribed portion, and which causes RNA polymerase to terminate transcription.
Un aspecto de la presente invención se refiere a una construcción génica que comprende los siguientes componentes, en el orden que se indica en la dirección de transcripción de 5' a 3': -la secuencia promotora de un gen inducible por el factor de transcripción Rlm1 de la ruta de integridad celular (CWI) de Saccharomyces cerevisiae, -una secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1 de Saccharomyces cerevisiae con una mutación que produce la modificación del aminoácido S386 por P386 en dicha proteína, denominada Mkk1s386P, según se describe en SEQ ID NO: 3, y -una secuencia de terminación de la transcripción. En esta construcción génica la distancia entre el extremo 3' de la secuencia promotora y el extremo 5' de la secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1 S386P es menor o igual a 18 nucleótidos y la distancia entre el extremo 3' de la secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1s386P y el extremo 5' de la secuencia de terminación es menor o igual a 18 nucleótidos. De hecho, en la unión entre dos de los componentes de la construcción pueden quedar, por ejemplo, nucleótidos de secuencias diana de enzimas de restricción insertadas en la secuencia de uno o varios componentes para facilitar la unión de los distintos componentes de la construcción, o bien otras secuencias de nucleótidos, siempre que no alteren la funcionalidad de la construcción. One aspect of the present invention relates to a gene construct comprising the following components, in the order indicated in the 5 'to 3' direction of transcription: -the promoter sequence of a gene inducible by the transcription factor Rlm1 of the cellular integrity pathway (CWI) of Saccharomyces cerevisiae, -an ONA sequence whose expression gives rise to the Mkk1 protein of Saccharomyces cerevisiae with a mutation that produces the modification of amino acid S386 by P386 in said protein, named Mkk1s386P, according to described in SEQ ID NO: 3, and -a transcription termination sequence. In this gene construct the distance between the 3 'end of the promoter sequence and the 5' end of the ONA sequence whose expression gives rise to the Mkk1 S386P protein is less than or equal to 18 nucleotides and the distance between the 3 'end of the ONA sequence whose expression gives rise to the Mkk1s386P protein and the 5 'end of the termination sequence is less than or equal to 18 nucleotides. In fact, at the junction between two of the components of the construct, for example, nucleotides of target sequences of restriction enzymes can be inserted into the sequence of one or more components to facilitate the union of the different components of the construct, or or other nucleotide sequences, provided they do not alter the functionality of the construct.
En una realización preferida, la secuencia promotora pertenece al gen YKL161C (MLP1) , que se describe en SEQ ID NO:1. Por otro lado, como secuencia de terminación de la transcripción, una realización preferida incluye la secuencia de terminación ADHt, descrita en SEQ ID NO:4. La realización más preferida de la invención, caracterizada por SEQ ID NO: 13, incluye pYKL161C y ADHt. In a preferred embodiment, the promoter sequence belongs to the YKL161C (MLP1) gene, which is described in SEQ ID NO: 1. On the other hand, as the transcription termination sequence, a preferred embodiment includes the ADHt termination sequence, described in SEQ ID NO: 4. The most preferred embodiment of the invention, characterized by SEQ ID NO: 13, includes pYKL161C and ADHt.
La sobreexpresión del alelo de MKK1s386P que codifica una versión hiperactiva de esta MAPKK es letal para la célula. Se ha elaborado una construcción génica que da lugar a un circuito genético de retroalimentación positiva que conduce a una elevada amplificación de la señal que se transmite a través de la ruta CWI de la levadura S. cerevisiae y resulta en letalidad para las células. Overexpression of the MKK1s386P allele encoding an overactive version of this MAPKK is cell-lethal. A gene construct has been developed that results in a positive feedback loop that leads to high signal amplification that is transmitted through the CWI pathway of S. cerevisiae yeast and results in lethality for cells.
La construcción génica objeto de esta invención conduce a una amplificación continua de la señal transmitida por la MAPK SIt2 a través del factor de transcripción Rlm1. El esquema que incluye una realización preferida de la invención es: pYKL 161C-MKK1s386P-ADHt, y por tanto comprende los siguientes componentes: The gene construction object of this invention leads to a continuous amplification of the signal transmitted by MAPK SIt2 through the transcription factor Rlm1. The scheme that includes a preferred embodiment of the invention is: pYKL 161C-MKK1s386P-ADHt, and therefore comprises the following components:
pYKL 161C-promotor del gen YKL 161C (MLP1), caracterizado por SEO ID NO: 1, que presenta una elevada inducción transcripcional en respuesta a daño en pared y a estímulos que activan la ruta CWI. pYKL 161C-promoter of the YKL 161C gene (MLP1), characterized by SEO ID NO: 1, which has a high transcriptional induction in response to wall damage and stimuli that activate the CWI pathway.
MKK1s386P_ caracterizado por SEO ID NO: 2; alelo de MKK1 que codifica una versión hiperactiva de esta MAPKK, cuya sobreexpresión es letal para la célula. MKK1s386P_ characterized by SEO ID NO: 2; MKK1 allele encoding a hyperactive version of this MAPKK, whose overexpression is lethal to the cell.
ADHt-región de terminación transcripcional del gen ADH1, caracterizada por SEO ID NO: 4. ADHt-transcriptional termination region of the ADH1 gene, characterized by SEO ID NO: 4.
Otro aspecto de la invención se refiere a vectores en los que se han insertado las posibles construcciones de la invención. Estos vectores, posteriormente, pueden utilizarse para transformar células de S. cerevísíae. Además, las construcciones de la invención pueden integrarse directamente en el genoma de una cepa de S. cerevísíae. Another aspect of the invention relates to vectors into which the possible constructions of the invention have been inserted. These vectors can subsequently be used to transform S. cerevísíae cells. Furthermore, the constructs of the invention can be directly integrated into the genome of a strain of S. cerevísíae.
La invención también incluye a la cepa de S. cerevísíae depositada con fecha 26 de septiembre de 2014 en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT), ubicada en el Parque Científico de la Universidad de Valencia, 46980 Paterna (Valencia), con número de acceso CECT13115 que, internamente, recibe la referencia yEA 1 . The invention also includes the S. cerevísíae strain deposited on September 26, 2014 in the Spanish Type Culture Collection (CECT), located in the Scientific Park of the University of Valencia, 46980 Paterna (Valencia), with number of access CECT13115 which, internally, receives the reference yEA 1.
Tal y como se indica en la figura 1, en una célula que incluye la construcción génica de la invención, se genera un circuito de amplificación, de retroalimentación positiva, y la estimulación de la ruta supone la activación de la cascada de quinasas hasta Slt2, la fosforilación y activación de Rlm1, la inducción del promotor YKL 161C y la expresión del alelo hiperactivo correspondiente. Su expresión conduce a una mayor activación de Slt2, por tanto de Rlm1, y por tanto una mayor expresión de YKL 161C, generándose un bucle de activación que se retroalimenta positiva y continuadamente mientras se mantenga el estímulo. E"o con "eva una gran amplificación de la señal y, por tanto, una respuesta celular excesiva, lo que conduce a la muerte de la célula a bajas concentraciones de cualquier agente que altere la pared de S. ce re vísía e. Por tanto, la construcción génica de la invención confiere a las células que la portan una hipersensibilidad a los estímulos que activan la ruta CWI. As indicated in Figure 1, in a cell that includes the gene construct of the invention, an amplification circuit is generated, with positive feedback, and the stimulation of the path involves the activation of the kinase cascade to Slt2, Rlm1 phosphorylation and activation, induction of the YKL 161C promoter, and expression of the corresponding overactive allele. Its expression leads to a greater activation of Slt2, therefore of Rlm1, and therefore a greater expression of YKL 161C, generating an activation loop that is positively and continuously fed back while the stimulus is maintained. E "o con" eva a large signal amplification and, therefore, an excessive cellular response, which leads to the death of the cell at low concentrations of any agent that alters the wall of S. ce re vísía e. Therefore, the gene construction of the invention gives the cells that carry it a hypersensitivity to the stimuli that activate the CWI pathway.
Esta invención tiene aplicaciones como sistema biosensor de estímulos externos. Las cepas que incluyen la construcción génica pueden utilizarse para detectar con más facilidad estímulos débiles que activen naturalmente la ruta CWI, debido a su mayor sensibilidad. This invention has applications as a biosensor system for external stimuli. Strains that include the gene construct can be used to more easily detect weak stimuli that naturally activate the CWI pathway, due to their increased sensitivity.
La capacidad biosensora de las cepas fúngicas con la construcción génica que da lugar al circuito amplificador de señal permite su utilización como herramienta de cribado farmacológico para la identificación de diferentes tipos de fármacos: The biosensing capacity of fungal strains with the gene construction that gives rise to the signal amplifier circuit allows their use as a pharmacological screening tool for the identification of different types of drugs:
i) Por una parte, para la búsqueda de antifúngicos. Con una cepa de levadura que incluya la construcción génica de la invención, que da lugar al circuito de amplificación en la ruta CWI, podemos rastrear 2 tipos de compuestos con actividad antifúngica de una manera muy sencilla y sensible: i) On the one hand, for the search for antifungals. With a yeast strain that includes the gene construct of the invention, which gives rise to the amplification circuit in the CWI pathway, we can trace 2 types of compounds with antifungal activity in a very simple and sensitive way:
(A) compuestos que alteran procesos de la pared celular o dañan directamente dicha estructura. Estos compuestos provocan la muerte celular al estimular el circuito de amplificación de la ruta CWI, lo que se detecta mediante sistemas de rastreo HTS (Hígh fhroughpuf screening). La cepa que contiene la construcción génica es hipersensible al daño en la pared, debido al efecto amplificador de la señal, por lo que puede permitir descubrir compuestos que, siendo activos sobre esa diana, estén en baja concentración o tengan una potencia reducida en la muestra a ensayar (productos naturales o de síntesis (A) compounds that alter cell wall processes or directly damage said structure. These compounds cause cell death by stimulating the amplification circuit of the CWI path, which is detected by HTS (Hígh fhroughpuf screening) systems. The strain that contains the gene construct is hypersensitive to damage to the wall, due to the amplifying effect of the signal, so it can allow the discovery of compounds that, being active on that target, are in low concentration or have a reduced potency in the sample to be tested (natural or synthetic products
química), por lo que no podrían ser detectados directamente como inhibidores chemistry), so they could not be directly detected as inhibitors
del crecimiento fúngico en una cepa silvestre de S. cerevisiae. of fungal growth in a wild strain of S. cerevisiae.
(B) compuestos que inhiben a componentes de la ruta CWI y, por tanto, al mecanismo compensatorio que se dispara en condiciones de daño en la pared celular y que permite mantener la integridad de esta estructura esencial. Este segundo tipo de compuestos podría potenciar la acción de otros antifúngicos que actúen directamente sobre la pared celular en terapias combinadas. Estos compuestos se identifican por su capacidad de evitar la muerte celular de las cepas fúngicas que incluyen las construcciones génicas de la invención en condiciones de activación del circuito de amplificación por algún estímulo conocido de la ruta CWI. El hecho de que su forma de identificación en el rastreo sea por recuperación de la viabilidad celular, favorece el aislamiento de compuestos con poca toxicidad per se sobre la célula eucariótica. (B) compounds that inhibit components of the CWI pathway and, therefore, the compensatory mechanism that is triggered under conditions of damage to the cell wall and that allows the integrity of this essential structure to be maintained. This second type of compound could enhance the action of other antifungals that act directly on the cell wall in combined therapies. These compounds are identified by their ability to prevent cell death of fungal strains that include the gene constructs of the invention under conditions of activation of the amplification circuit by some known stimulus of the CWI pathway. The fact that its identification form in the screening is by recovery of cell viability, favors the isolation of compounds with little toxicity per se on the eukaryotic cell.
ii) Por otra parte, este bioensayo se puede utilizar en el rastreo farmacológico para la búsqueda de antitumorales. ii) On the other hand, this bioassay can be used in pharmacological screening to search for antitumor drugs.
Hay que tener en cuenta que tanto las proteínas que operan en las rutas mediadas por MAPKs en la levadura S. cerevisiae, como los mecanismos de activación, las interacciones moleculares que determinan el reconocimiento y la especificidad de sustratos o la localización subcelular de los componentes, son muy parecidos a los del resto de organismos eucarióticos, incluyendo los de eucariotas superiores. De hecho, esta conservación estructural y funcional ha hecho posible el uso de S. cerevisiae como modelo experimental de célula eucariótica para la clonación o caracterización de genes humanos que codifican proteínas de señalización. Por tanto, los posibles compuestos que se obtendrían en un cribado con el segundo bioensayo anteriormente descrito (B) como inhibidores de los componentes de la ruta CWI son, potencialmente, inhibidores de rutas de MAPKs similares en células de mamífero. Dado que, en este caso, la diana no es específica de hongos, los compuestos seleccionados pueden tener efecto antitumoral ya que estas rutas de MAPKs son esenciales en la proliferación celular de células eucarióticas superiores, jugando un papel fundamental en algunos procesos anca lógicos. It should be borne in mind that both the proteins that operate on the MAPKs-mediated pathways in S. cerevisiae yeast, as well as the activation mechanisms, the molecular interactions that determine the recognition and specificity of substrates, or the subcellular location of the components, they are very similar to those of other eukaryotic organisms, including those of higher eukaryotes. In fact, this structural and functional conservation has made possible the use of S. cerevisiae as an eukaryotic cell experimental model for the cloning or characterization of human genes that encode signaling proteins. Therefore, the possible compounds that would be obtained in a screening with the second bioassay previously described (B) as inhibitors of the components of the CWI pathway are, potentially, inhibitors of similar MAPKs pathways in mammalian cells. Given that, in this case, the target is not fungus-specific, the selected compounds may have an antitumor effect since these MAPKs routes are essential in the cellular proliferation of higher eukaryotic cells, playing a fundamental role in some logical ancal processes.
El desarrollo de bioensayos utilizando este sistema, ya sea mediante el uso de la construcción génica o mediante el uso de los vectores y/o células que la contienen, tiene una serie de ventajas destacables, como es su fácil adaptabilidad a la tecnologla de alto rendimiento (HTS), ya que admite formatos de alta densidad, presenta un sistema de detección muy fácil (medida de crecimiento por espectrometría, frente a otros sistemas basados en genes reporteros que implican medida de actividad enzimática), rapidez en la obtención de resultados, bajo coste (permite el uso de medios de cultivo sencillos no definidos, sin requerimientos nutritivos específicos), etc. Una innovación importante de este sistema es la combinación de una elevada sensibilidad de las levaduras que portan la construcción génica de la invención con una gran selectividad de acción. The development of bioassays using this system, either by using the gene construct or by using the vectors and / or cells that contain it, has a number of notable advantages, such as its easy adaptability to high-performance technology. (HTS), since it supports high-density formats, presents a very easy detection system (growth measurement by spectrometry, compared to other systems based on reporter genes that involve measurement of enzyme activity), speed in obtaining results, low cost (allows the use of simple undefined culture media, without specific nutritional requirements), etc. An important innovation of this system is the combination of a high sensitivity of the yeasts that carry the gene construction of the invention with a high selectivity of action.
Otro aspecto de la invención se refiere a un kit para la detección de compuestos antifúngicos y/o antitumorales que incluye las construcciones génicas, los vectores y/o las células eucariotas de la invención. Another aspect of the invention relates to a kit for the detection of antifungal and / or antitumor compounds that includes the gene constructs, the vectors and / or the eukaryotic cells of the invention.
En conclusión, las cepas de levaduras que incluyen esta construcción génica constituyen un sistema sencillo, fácil de manipular, sensible, específico, seguro y muy económico de búsqueda de compuestos tanto que alteren la pared fúngica como que modifiquen la señalización a través de rutas de MAPKs, y por tanto con potencial actividad antifúngica o antitumoral. In conclusion, the yeast strains that include this gene construct constitute a simple, easy to manipulate, sensitive, specific, safe and very economical system for searching for compounds that both alter the fungal wall and modify the signaling through MAPK pathways. , and therefore with potential antifungal or antitumor activity.
Figura 1: Esquema ilustrativo de la forma de operar del circuito genético de amplificación y retroalimentación de la ruta CWI mediada por la MAPK SIt2 en la levadura S. cerevisiae. Se muestran los distintos componentes que Figure 1: Illustrative diagram of the way of operating the genetic amplification and feedback circuit of the CWI pathway mediated by MAPK SIt2 in the yeast S. cerevisiae. The different components that
participan en esta ruta de respuesta a estrés sobre la pared celular y la participate in this stress response pathway on the cell wall and the
composición de la construcción génica de la invención. composition of the gene construct of the invention.
Figura 2: Ensayos de sensibilidad en medio líquido de la cepa yEA 1 Y las isogénicas silvestre BY4741 y mutante Y00993 (sIt211), frente a rojo Congo (representado como "RC"), un compuesto alterante de la pared celular, utilizando un método de microdilución. Figure 2: Liquid medium sensitivity assays of the yEA 1 strain and the wild-type isogenic BY4741 and mutant Y00993 (sIt211), against Congo red (represented as "RC"), a cell wall disrupting compound, using a method of microdilution.
Figura 3: Ensayos de recuperación de la viabilidad en medio líquido en presencia de rojo Congo de la cepa yEA1 y las isogénicas silvestre BY4741 y mutante sIt211, tras la adición de cercosporamida (representada como "C"), un agente que inhibe la señalización a través de la ruta CWI, utilizando un método de microdilución. Figure 3: Viability recovery tests in liquid medium in the presence of Congo red from the yEA1 strain and the wild isogenic BY4741 and mutant sIt211, after the addition of cercosporamide (represented as "C"), an agent that inhibits signaling to through the CWI route, using a microdilution method.
La presente invención se ilustra adicionalmente mediante los siguientes ejemplos, los cuales no pretenden ser limitativos de su alcance. The present invention is further illustrated by the following examples, which are not intended to be limiting in scope.
Para construir el plásmido pEA 1 con la cassette de amplificación de la señal de la ruta CWI, se amplificaron por separado y mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) los tres módulos que incluye la construcción génica de la invención (los sitios de corte de las correspondientes enzimas de restricción se indican mediante subrayado): To construct the plasmid pEA 1 with the CWI pathway signal amplification cassette, the three modules that include the gene construction of the invention (the sites of the invention) were separately amplified by means of the polymerase chain reaction (PCR). section of the corresponding restriction enzymes are indicated by underlining):
Región promotora del gen YKL 161e, utilizando los oligonucleótidos cebadores MLP1 PR5 (CCCCGGAATTCGGGCCCACAACAAGAACGT GGGCGATAC), caracterizado por SEO ID NO: 5, que introduce puntos de corte EcoRI y PspOMI; Y MLP1PR3 (CCCCCTCGAGCATTTAATTG TGAATCTTTCTTCG), caracterizado por SEO ID NO: 6, que introduce Promoter region of the YKL 161e gene, using the primer oligonucleotides MLP1 PR5 (CCCCGGAATTCGGGCCCACAACAAGAACGT GGGCGATAC), characterized by SEO ID NO: 5, which introduces EcoRI and PspOMI cutpoints; AND MLP1PR3 (CCCCCTCGAGCATTTAATTG TGAATCTTTCTTCG), characterized by SEO ID NO: 6, which introduces
un punto Xhol. Como molde se utilizó DNA genómico de la cepa S288C a point Xhol. Genomic DNA from strain S288C was used as template
de S. cerevisiae. S. cerevisiae.
- --
- Amplificación de la versión hiperactiva del gen MKK1s386P. Se utilizaron los oligonucleótidos cebadores MKK1-5 (CCCGTCGACTCGAGATGG CTTCACTGTTCAGACC), caracterizado por SEO ID NO: 7, que introduce sitios de corte Sall-Xhol al comienzo de la secuencia amplificada y el oligonucleótido MKK1-3 (CCCGTCGACTT AATCTTTC CAGCACTTCC), caracterizado por SEO ID NO:8, que introduce un sitio Sall al final de la secuencia amplificada. Como molde se utilizó el plásmido pNV7W-MKK1s386P (Watanabe, Y. et al. 1995. Yeast RLM1 encodes a serum response factor-like protein that may function downstream of the Mpk1 (Slt2) mitogen-activated protein kinase pathway. Mol. Cell Biol. 15,5740-5749). Amplification of the hyperactive version of the MKK1s386P gene. Primer oligonucleotides MKK1-5 (CCCGTCGACTCGAGATGG CTTCACTGTTCAGACC), characterized by SEO ID NO: 7, introducing Sall-Xhol cleavage sites at the beginning of the amplified sequence, and MKK1-3 oligonucleotide (CCCGTCGACTT AATCTTTC CAGCACTTCC), characterized by ID NO: 8, which introduces a Sall site at the end of the amplified sequence. The plasmid pNV7W-MKK1s386P (Watanabe, Y. et al. 1995. Yeast RLM1 encodes a serum response factor-like protein that may function downstream of the Mpk1 (Slt2) mitogen-activated protein kinase pathway was used as a template. Mol. Cell Biol .15,5740-5749).
- --
- Amplificación de la región terminadora del gen ADH1, con los oligonucleótidos ADHT5 (CCCCGGATCCGTCGACCCTGAGT AAA T AA GCG), caracterizado por SEO ID NO: 9, que introduce sitios de corte BamHI-Sall, y ADHT3B (CCCCCGGATCCCGGTGGTGGTCAA T AAG), caracterizado por SEO ID NO: 10, que introduce un sitio de corte BamHI. Como molde se utilizó DNA genómico de la cepa S288C de S. Amplification of the terminator region of the ADH1 gene, with the oligonucleotides ADHT5 (CCCCGGATCCGTCGACCCTGAGT AAA T AA GCG), characterized by SEO ID NO: 9, which introduces BamHI-Sall cleavage sites, and ADHT3B (CCCCCGGATCCCGGTGGTGGTCAA T AAG), characterized NO: 10, which introduces a BamHI cut site. Genomic DNA from S strain S288C was used as template.
cerevisiae. cerevisiae.
A continuación, la construcción génica se ensambló subclonando en tándem los tres módulos indicados anteriormente, siguiendo la secuencia EcoRIpYKL161 C-Xhol-MKK1s386P-Sa/l-ADHt-BamHI , y se introdujeron como un fragmento génico en el vector de integración M4366 HO-hisG-URA3-hisG-polyHO (Voth et al. 2001. Yeast vectors for integration at the HO locus. Nucleic Acids Res. 29, E59) (número de acceso AF324729) entre los sitios EcoRI y BamH1, generándose el plásmido pEA1. Next, the gene construct was assembled by tandem subcloning the three modules indicated above, following the sequence EcoRIpYKL161 C-Xhol-MKK1s386P-Sa / l-ADHt-BamHI, and introduced as a gene fragment into the integration vector M4366 HO- hisG-URA3-hisG-polyHO (Voth et al. 2001. Yeast vectors for integration at the HO locus. Nucleic Acids Res. 29, E59) (accession number AF324729) between the EcoRI and BamH1 sites, generating the plasmid pEA1.
Ejemplo 2: Construcción de la cepa recombinante yEA1 de S. cerevisiae Para construir la cepa recombinante yEA 1 de S. cerevisiae, se integró la construcción génica pYKL161C-MKK1s386P-ADHt en el genoma de la cepa silvestre BY4741 (colección EUROSCARF) mediante su transformación con el fragmento Notl-Notl procedente del plásmido pEA 1, dirigiéndose por tanto la integración al locus HO de dicha cepa. Para la transformación, se siguió el método del acetato de litio seleccionando los transformantes en medio carente de uracilo. Se confirmó su integración en el locus HO mediante ensayos de amplificación por PCR, utilizándose los oligonucleótidos 5'CTGATATGTCTGAGG-3', caracterizado por SEQ ID NO: 11, que hibrida en el gen HO, y 5'-CATTGGAAATTAGGGC'-3, caracterizado por SEO ID NO: 12, que hibrida en la secuencia de la región promotora del gen YKL 161C. Tras la verificación de su integración correcta, se forzó la pérdida del marcador de selección URA3, presente en la cassette de integración, mediante el cultivo en presencia de ácido 5-fluoroorótico, que resulta tóxico para aquellas células portadoras del gen URA3, obteniéndose la cepa yEA 1. Example 2: Construction of the recombinant S. cerevisiae strain yEA1 To construct the recombinant S. cerevisiae strain yEA 1, the gene construct pYKL161C-MKK1s386P-ADHt was integrated into the genome of the wild BY4741 strain (EUROSCARF collection) by transformation with the Notl-Notl fragment from the plasmid pEA 1, thus directing the integration to the HO locus of said strain. For transformation, the lithium acetate method was followed by selecting transformants in uracil-free medium. Its integration in the HO locus was confirmed by means of PCR amplification assays, using the 5'CTGATATGTCTGAGG-3 'oligonucleotides, characterized by SEQ ID NO: 11, which hybridizes in the HO gene, and 5'-CATTGGAAATTAGGG''3, characterized by SEO ID NO: 12, which hybridizes in the sequence of the promoter region of the YKL 161C gene. After verifying its correct integration, the loss of the URA3 selection marker, present in the integration cassette, was forced by cultivation in the presence of 5-fluoroorotic acid, which is toxic to those cells carrying the URA3 gene, obtaining the strain yEA 1.
Ejemplo 3: Ensayo de la cepa yEA1 frente a agentes alterantes de la pared celular. Example 3: Assay of the yEA1 strain against cell wall disrupting agents.
A modo de ejemplo de la aplicabilidad de este sistema en la búsqueda de antifúngicos alterantes de la pared celular fúngica, se muestra la inhibición del crecimiento que provoca el rojo Congo, una sustancia que se une a la quitina de la pared celular e interfiere con la estabilidad de la pared celular de la levadura. Los ensayos se realizaron en la cepa yEA 1, en comparación con la cepa silvestre BY 47 41 y con una cepa mutante slt2fJ isogénica (la cepa Y00993 de EUROSCARF). El ensayo se realizó mediante el cultivo de un preinóculo de cada cepa de levadura en medio YPO (Yeast Extract-Peptone-Dextrose, medio común de crecimiento de hongos) hasta una concentración de 2 x 107 células (equivalente a una 00600 entre 0,8 y 1,2), desde el cual se diluyó el cultivo hasta una DO estimada 0,01, inoculándose 75 1-11 de esta suspensión en cada pocillo de una placa multipocillo (96 pocillos), que contenía 75 1-11 de medio fresco YPO en cada pocillo, al que se añadió rojo Congo en una concentración comprendida entre 0,0029 y 1,5 I-Ig/ml, tal y como se indica en la Figura 2. Las placas multipocillo se incubaron a 24°C durante 24 horas, valorándose el crecimiento de las tres cepas utilizadas en un lector de placas como absorbancia a 600nM. En el gráfico de la Figura 2, se muestra el comportamiento en este ensayo de las tres cepas, con el crecimiento representado en ordenadas y las concentraciones de rojo Congo utilizadas en el eje de abscisas. Se puede observar cómo la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI) de este compuesto sobre la cepa yEA 1 que incluye la construcción génica de la invención es menor que sobre la cepa silvestre BY 4741 e, incluso, que sobre la cepa delecionada en el gen SL T2. Ello indica la elevada sensibilidad de la cepa yEA 1, que porta la construcción génica aquí descrita. As an example of the applicability of this system in the search for antifungals in the fungal cell wall, the inhibition of growth caused by Congo red, a substance that binds to chitin in the cell wall and interferes with yeast cell wall stability. The tests were performed on the yEA 1 strain, compared to the wild BY 47 41 strain and to an isogenic slt2fJ mutant strain (EUROSCARF strain Y00993). The assay was performed by cultivating a preinoculum of each yeast strain in YPO medium (Yeast Extract-Peptone-Dextrose, common fungal growth medium) to a concentration of 2 x 107 cells (equivalent to 00600 between 0.8 and 1,2), from which the culture was diluted to an estimated OD 0.01, 75 1-11 of this suspension being inoculated in each well of a multi-well plate (96 wells), containing 75 1-11 of fresh medium YPO in each well, to which Congo red was added in a concentration between 0.0029 and 1.5 I-Ig / ml, as indicated in Figure 2. The multi-well plates were incubated at 24 ° C for 24 hours, assessing the growth of the three strains used in a plate reader as absorbance at 600nM. The graph in Figure 2 shows the behavior in this test of the three strains, with the growth represented in ordinates and the concentrations of Congo red used in the abscissa axis. It can be seen how the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) of this compound on the yEA 1 strain that includes the gene construct of the invention is lower than on the wild BY 4741 strain and, even, on the SL T2 gene-deleted strain . This indicates the high sensitivity of the yEA 1 strain, which carries the gene construct described here.
Ejemplo 4: Ensayo de la cepa yEA1 frente a agentes inhibidores de la señalización a través de la ruta CWI. A modo de ejemplo de la aplicabilidad de este sistema en la búsqueda de compuestos inhibidores de la ruta CWI de hongos, se muestra un ensayo de recuperación del crecimiento por cercosporamida. La cercosporamida es un inhibidor comercial de la protein kinasa Pkc1, componente esencial en la señalización a través de la ruta CWI. El ensayo se realizó igual que en el ejemplo 3, con la excepción de que se añadió una concentración fija de O,025¡.Jg/ml de rojo Congo a todos los pocillos para inducir el circuito genético de retroalimentación positiva a que da lugar la construcción génica de la invención y concentraciones variables de cercosporamida, en un rango que no resulta tóxico para la cepa silvestre (entre 2,5 y 40¡.Jg/ml); se utilizaron, además, las mismas tres cepas que en el ejemplo Example 4: Assay of the yEA1 strain against signaling inhibiting agents through the CWI pathway. As an example of the applicability of this system in the search for fungal CWI pathway inhibitor compounds, a cercosporamide growth recovery assay is shown. Cercosporamide is a commercial inhibitor of protein kinase Pkc1, an essential component in signaling through the CWI pathway. The assay was performed the same as in Example 3, with the exception that a fixed concentration of 0.025 µg / ml Congo red was added to all wells to induce the positive feedback loop resulting in Gene construction of the invention and variable concentrations of cercosporamide, in a range that is not toxic to the wild strain (between 2.5 and 40 µg / ml); In addition, the same three strains were used as in the example
3. En el gráfico de la Figura 3 se muestra, en ordenadas, el crecimiento en estas condiciones de las tres cepas ensayadas, tras 24 horas de incubación a 24°C, frente a las concentraciones de cercosporamida utilizadas, en el eje de abscisas. Se observa la recuperación del crecimiento que provocó la cercosporamida en la cepa yEA 1 a partir de una concentración de 20¡.Jg/ml, mientras que la cepa mutante slt2LJ isogénica no creció a ninguna de las concentraciones ensayadas. 3. The graph of Figure 3 shows, in ordinates, the growth under these conditions of the three strains tested, after 24 hours of incubation at 24 ° C, against the concentrations of cercosporamide used, on the abscissa axis. Recovery of the growth caused by cercosporamide in the yEA 1 strain is observed from a concentration of 20 µJg / ml, while the isogenic slt2LJ mutant strain did not grow at any of the concentrations tested.
Texto libre de la lista de secuencias Free text of the sequence list
El texto libre utilizado en la lista de secuencias se corresponde en español a The free text used in the sequence list corresponds in Spanish to
las siguientes características: the following characteristics:
Secuencia artificial de AON; cebador basado en YKL 161C de Saccharomyces cerevisiae. AON artificial sequence; primer based on YKL 161C from Saccharomyces cerevisiae.
Nucleótidos del 6 al 11: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Nucleotides 6-11: restriction enzyme recognition site
EcoRI. EcoRI.
Nucleótidos del 12 al 17: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Nucleotides 12-17: restriction enzyme recognition site
PspOMI. PspOMI.
Secuencia artificial de AON; cebador basado en YKL 161C de Saccharomyces cerevisiae. Nucleótidos del 5 al1 O: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Xhol AON artificial sequence; primer based on YKL 161C from Saccharomyces cerevisiae. Nucleotides from 5 to 1 O: Xhol restriction enzyme recognition site
Secuencia artificial de AON; cebador basado en MKK1 de Saccharomyces cerevisiae Nucleótidos del 4 al 9: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Sall. Nucleótidos del9 a114: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Xhol AON artificial sequence; Saccharomyces cerevisiae MKK1-based primer Nucleotides 4-9: restriction enzyme recognition site Sall. Nucleotides del9 to114: Xhol restriction enzyme recognition site
Secuencia artificial de AON; cebador basado en MKK1 de Saccharomyces cerevisiae. Nucleótidos del 4 al 9: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Sall. AON artificial sequence; Saccharomyces MKK1-based primer cerevisiae. Nucleotides 4-9: Sall restriction enzyme recognition site.
Secuencia artificial de AON; cebador basado en ADH1 de Saccharomyces cerevisiae. AON artificial sequence; Saccharomyces cerevisiae ADH1-based primer.
Nucleótidos del 5 al 10: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Nucleotides 5-10: restriction enzyme recognition site
BamHI. BamHI.
Nucleótidos del 11 al 16: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Nucleotides 11-16: restriction enzyme recognition site
Sall. Sall.
Secuencia artificial de ADN; cebador basado en AOH1 de Saccharomyces cerevisiae. Artificial DNA sequence; Saccharomyces cerevisiae AOH1-based primer.
Nucleótidos del 6 al 11: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Nucleotides 6-11: restriction enzyme recognition site
BamHI. BamHI.
Cebador basado en el gen HO de Saccharomyces cerevisiae. Primer based on the HO gene of Saccharomyces cerevisiae.
Cebador basado en la región promotora del gen YKL 161 C de Saccharomyces cerevisiae. Primer based on the promoter region of the YKL 161 C gene of Saccharomyces cerevisiae.
Secuencias artificial de ADN; construcción génica que comprende la región promotora del gen YKL161C, el gen MKK1s386P y la región de terminación del gen AOH1 de Saccharomyces cerevisiae. Nucleótidos del 1 al 6: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Artificial DNA sequences; Gene construct comprising the promoter region of the YKL161C gene, the MKK1s386P gene and the termination region of the AOH1 gene from Saccharomyces cerevisiae. Nucleotides 1-6: restriction enzyme recognition site
EcoRI. EcoRI.
Nucleótidos del 7 al 12: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Nucleotides 7-12: restriction enzyme recognition site
PspOMI. Nucleótidos del13 al 1204: promotor del gen YKL 161C de S. cerevisiae. Nucleótidos del 1205 al 1210: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Xhol. Nucleótidos del 1211 al 2737: gen MKK1s386P de S. cerevisiae. Nucleótidos del 2738 al 2743: sitio de reconocimiento de la enzima de restricción Sall. Nucleótidos del 2744 al 2938: región de terminación del gen AOH1 de S. cerevisiae. PspOMI. Nucleotides 13 to 1204: promoter of the YKL 161C gene from S. cerevisiae. Nucleotides 1205 to 1210: recognition site of the enzyme Xhol constraint. Nucleotides 1211 to 2737: MKK1s386P gene from S. cerevisiae. Nucleotides 2738 to 2743: recognition site of the enzyme Sall constraint. Nucleotides 2744 to 2938: termination region of the AOH1 gene of S. cerevisiae.
Claims (13)
- 1. one.
- Construcción génica que comprende los siguientes componentes, en el orden que se indica en la dirección de transcripción de 5' a 3': -la secuencia promotora de un gen inducible por el factor de transcripción Rlm1 de la ruta de integridad celular (CWI) de Saeeharomyees eerevisiae, -una secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1 de Saeeharomyees eerevisiae con una mutación que produce la modificación del aminoácido S386 por P386 en dicha proteína, según se describe en SEO ID NO: 3 y denominada Mkk1s386P, y -una secuencia de terminación de la transcripción; en la que la distancia entre el extremo 3' de la secuencia promotora y el extremo 5' de la secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1 S386P es menor o igual a 18 nucleótidos y la distancia entre el extremo 3' de la secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1 S386P y el extremo 5' de la secuencia de terminación es menor o igual a 18 nucleótidos. Gene construct comprising the following components, in the order indicated in the 5 'to 3' direction of transcription: -the promoter sequence of a gene inducible by the transcription factor Rlm1 of the cellular integrity pathway (CWI) of Saeeharomyees eerevisiae, -a sequence of ONA whose expression gives rise to the Mkk1 protein of Saeeharomyees eerevisiae with a mutation that produces the modification of amino acid S386 by P386 in said protein, as described in SEO ID NO: 3 and called Mkk1s386P, and - a transcription termination sequence; in which the distance between the 3 'end of the promoter sequence and the 5' end of the ONA sequence whose expression gives rise to the Mkk1 S386P protein is less than or equal to 18 nucleotides and the distance between the 3 'end of the ONA sequence whose expression gives rise to the Mkk1 S386P protein and the 5 'end of the termination sequence is less than or equal to 18 nucleotides.
- 2. 2.
- Construcción génica en la que la secuencia de ONA cuya expresión da lugar a la proteína Mkk1s386P es el polinucleótido que se describe en SEO ID NO: 2, denominado MKK1s386P. A gene construct in which the ONA sequence whose expression gives rise to the Mkk1s386P protein is the polynucleotide described in SEO ID NO: 2, called MKK1s386P.
- 4. Four.
- Construcción génica según cualquiera de las reivindicaciones 1-3 en la que la secuencia de terminación de la transcripción es la secuencia de terminación de gen ADH1 de Saeeharomyees eerevisiae, caracterizada por SEO ID NO: 4. Gene construct according to any of claims 1-3 in which the transcription termination sequence is the Saeeharomyees eerevisiae ADH1 gene termination sequence, characterized by SEO ID NO: 4.
- 5. 5.
- Construcción génica caracterizada por SEO ID NO: 13. Gene construct characterized by SEO ID NO: 13.
- 6. 6.
- Vector que contiene cualquiera de las construcciones definidas en las Vector that contains any of the constructions defined in the
- 7. 7.
- Célula de S. cerevisiae que contiene el vector definido en la reivindicación 6. S. cerevisiae cell containing the vector defined in claim 6.
- 8. 8.
- Célula recombinante de S. cerevisiae que incluye en su genoma cualquiera de las construcciones definidas en las reivindicaciones 1-5. Recombinant S. cerevisiae cell that includes in its genome any of the constructions defined in claims 1-5.
- 9. 9.
- Cepa de S. cerevisiae depositada en la Colección de Cultivos Tipo (CECT) con el número de acceso CECT13115. S. cerevisiae strain deposited in the Type Culture Collection (CECT) with the accession number CECT13115.
- 10. 10.
- Método para detectar compuestos antifúngicos que alteran la pared celular fúngica que incluye los siguientes pasos: a) inocular una cantidad suficiente de una cepa de S. cerevisiae según se define en cualquiera de las reivindicaciones 7-9 en medio de cultivo que contiene, en sucesivos tubos, microtubos o pocillos, concentraciones crecientes de los productos que se desea evaluar; b) incubar el medio de cultivo inoculado del paso a); c) determinar el crecimiento de la cepa inoculada en el paso a); d) seleccionar elllos productols incluidols en el medio de cultivo del paso a) en el que se detecte menor crecimiento de la cepa de S. cerevisiae definida en las reivindicaciones 7-9 con respecto a una cepa silvestre utilizada como control. Method to detect antifungal compounds that alter the cell wall fungal that includes the following steps: a) inoculate a sufficient amount of a S. cerevisiae strain as defined in any of claims 7-9 in culture medium that contains, in successive tubes, microtubes or wells, concentrations crescents of the products to be evaluated; b) incubating the inoculated culture medium from step a); c) determining the growth of the strain inoculated in step a); d) select the products included in the culture medium from step a) in the one that detects less growth of the S. cerevisiae strain defined in the Claims 7-9 with respect to a wild strain used as a control.
- 11. eleven.
- Método para detectar compuestos antitumorales o antifúngicos inhibidores de la señalización a través de la ruta CWI que incluye los siguientes pasos: a) inocular una cantidad suficiente de una cepa de S. cerevisiae según se define en cualquiera de las reivindicaciones 7-9 en medio de cultivo que contiene un compuesto que estimula la ruta CWI y, en sucesivos tubos, microtubos o pocillos, concentraciones crecientes de los productos que se desea evaluar; b) incubar el medio de cultivo inoculado del paso a); c) determinar el crecimiento de la cepa inoculada en el paso a); Method for detecting inhibitory antitumor or antifungal compounds signaling through the CWI route that includes the following steps: a) inoculate a sufficient amount of a S. cerevisiae strain as defined in any of claims 7-9 in culture medium that contains a compound that stimulates the CWI path and, in successive tubes, microtubes or wells, increasing concentrations of the products being you want to evaluate; b) incubating the inoculated culture medium from step a); c) determining the growth of the strain inoculated in step a);
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