ES2334539B1 - Utilizacion del enzima fosfopanteteina adeniltransferasa, implicado en la biosintesis del coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal,resistencia al estres salino/osmotico, incremento de lipidos de reserva y modificacion del contenido aminoacidico. - Google Patents
Utilizacion del enzima fosfopanteteina adeniltransferasa, implicado en la biosintesis del coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal,resistencia al estres salino/osmotico, incremento de lipidos de reserva y modificacion del contenido aminoacidico. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2334539B1 ES2334539B1 ES200801366A ES200801366A ES2334539B1 ES 2334539 B1 ES2334539 B1 ES 2334539B1 ES 200801366 A ES200801366 A ES 200801366A ES 200801366 A ES200801366 A ES 200801366A ES 2334539 B1 ES2334539 B1 ES 2334539B1
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- ppat
- seeds
- plants
- gene
- coa
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title claims abstract description 43
- 230000012010 growth Effects 0.000 title claims abstract description 42
- 230000008723 osmotic stress Effects 0.000 title claims description 16
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 title claims description 4
- RGJOEKWQDUBAIZ-IBOSZNHHSA-N CoASH Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 RGJOEKWQDUBAIZ-IBOSZNHHSA-N 0.000 title abstract description 79
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 title abstract description 27
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 title abstract description 27
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 title abstract description 21
- 230000006872 improvement Effects 0.000 title abstract description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 70
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims abstract description 44
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 claims abstract description 32
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 27
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 21
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 16
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 claims abstract description 16
- 230000008635 plant growth Effects 0.000 claims abstract description 11
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 101
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 claims description 76
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 claims description 25
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 claims description 25
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 claims description 25
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 claims description 25
- 102100037458 Dephospho-CoA kinase Human genes 0.000 claims description 23
- 108010049285 dephospho-CoA kinase Proteins 0.000 claims description 23
- 230000035882 stress Effects 0.000 claims description 22
- 101150085718 Ppat gene Proteins 0.000 claims description 18
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 16
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 15
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 12
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 claims description 12
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims description 12
- VKOBVWXKNCXXDE-UHFFFAOYSA-N icosanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O VKOBVWXKNCXXDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 claims description 9
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims description 9
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 7
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 7
- 235000013305 food Nutrition 0.000 claims description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 5
- 239000003921 oil Substances 0.000 claims description 5
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 claims description 5
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 230000007423 decrease Effects 0.000 claims description 4
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 claims description 4
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 claims description 4
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 claims description 4
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 claims description 3
- 239000003225 biodiesel Substances 0.000 claims description 3
- KQQKGWQCNNTQJW-UHFFFAOYSA-N linolenic acid Natural products CC=CCCC=CCC=CCCCCCCCC(O)=O KQQKGWQCNNTQJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 claims description 3
- 230000009105 vegetative growth Effects 0.000 claims description 3
- 230000017260 vegetative to reproductive phase transition of meristem Effects 0.000 claims 4
- OYHQOLUKZRVURQ-NTGFUMLPSA-N (9Z,12Z)-9,10,12,13-tetratritiooctadeca-9,12-dienoic acid Chemical compound C(CCCCCCC\C(=C(/C\C(=C(/CCCCC)\[3H])\[3H])\[3H])\[3H])(=O)O OYHQOLUKZRVURQ-NTGFUMLPSA-N 0.000 claims 2
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 claims 2
- DTOSIQBPPRVQHS-PDBXOOCHSA-N alpha-linolenic acid Chemical compound CC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCCCCC(O)=O DTOSIQBPPRVQHS-PDBXOOCHSA-N 0.000 claims 2
- 235000020661 alpha-linolenic acid Nutrition 0.000 claims 2
- 229960004488 linolenic acid Drugs 0.000 claims 2
- 235000021313 oleic acid Nutrition 0.000 claims 2
- 229940093530 coenzyme a Drugs 0.000 abstract description 80
- RGJOEKWQDUBAIZ-UHFFFAOYSA-N coenzime A Natural products OC1C(OP(O)(O)=O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)OC1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 RGJOEKWQDUBAIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 79
- 239000005516 coenzyme A Substances 0.000 abstract description 79
- KDTSHFARGAKYJN-UHFFFAOYSA-N dephosphocoenzyme A Natural products OC1C(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)OC1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 KDTSHFARGAKYJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 79
- 230000004048 modification Effects 0.000 abstract description 6
- 238000012986 modification Methods 0.000 abstract description 6
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N adenyl group Chemical group N1=CN=C2N=CNC2=C1N GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 3
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 abstract description 2
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 abstract description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 26
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 22
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 22
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 22
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 20
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 18
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 16
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 15
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 14
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 14
- 239000000047 product Substances 0.000 description 14
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 14
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 12
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 12
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 12
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 11
- GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N (D)-(+)-Pantothenic acid Chemical compound OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(O)=O GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 9
- 101100496603 Arabidopsis thaliana COAD gene Proteins 0.000 description 9
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 9
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 9
- 229940014662 pantothenate Drugs 0.000 description 9
- 235000019161 pantothenic acid Nutrition 0.000 description 9
- 239000011713 pantothenic acid Substances 0.000 description 9
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 9
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 8
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 8
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 8
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 8
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 8
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 8
- 241000894007 species Species 0.000 description 8
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- 108010047871 Phosphopantothenoyl-cysteine decarboxylase Proteins 0.000 description 7
- 241000219000 Populus Species 0.000 description 7
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 7
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 7
- XJLXINKUBYWONI-DQQFMEOOSA-N [[(2r,3r,4r,5r)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxy-4-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(2s,3r,4s,5s)-5-(3-carbamoylpyridin-1-ium-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphate Chemical compound NC(=O)C1=CC=C[N+]([C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@H](COP([O-])(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]3[C@H]([C@@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](O3)N3C4=NC=NC(N)=C4N=C3)O)O2)O)=C1 XJLXINKUBYWONI-DQQFMEOOSA-N 0.000 description 7
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 7
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 6
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 6
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 6
- 102100033809 Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase Human genes 0.000 description 6
- 241000218657 Picea Species 0.000 description 6
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 6
- 230000002786 root growth Effects 0.000 description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 6
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 5
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 5
- 101100450129 Caenorhabditis elegans hal-3 gene Proteins 0.000 description 5
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 5
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 5
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 5
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 5
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 5
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 5
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 5
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 5
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 4
- 235000001169 Brassica oleracea var oleracea Nutrition 0.000 description 4
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 4
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 4
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 4
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 235000003899 Brassica oleracea var acephala Nutrition 0.000 description 3
- 235000011301 Brassica oleracea var capitata Nutrition 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 3
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 3
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 3
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 3
- -1 Mg2 + Chemical compound 0.000 description 3
- 101710107870 Phosphopantothenate-cysteine ligase Proteins 0.000 description 3
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 3
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 3
- 230000009418 agronomic effect Effects 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 3
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 230000002015 leaf growth Effects 0.000 description 3
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 3
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 238000000034 method Methods 0.000 description 3
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 239000000419 plant extract Substances 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100031126 6-phosphogluconolactonase Human genes 0.000 description 2
- 108010029731 6-phosphogluconolactonase Proteins 0.000 description 2
- 230000002407 ATP formation Effects 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 2
- 101100450128 Arabidopsis thaliana HAL3B gene Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000011303 Brassica alboglabra Nutrition 0.000 description 2
- 235000011293 Brassica napus Nutrition 0.000 description 2
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 description 2
- 235000011302 Brassica oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010018962 Glucosephosphate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101710175625 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein Proteins 0.000 description 2
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 2
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 2
- 101100006984 Oryza sativa subsp. japonica Os07g0179400 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000195887 Physcomitrella patens Species 0.000 description 2
- 241000218595 Picea sitchensis Species 0.000 description 2
- 241000218976 Populus trichocarpa Species 0.000 description 2
- 241000208292 Solanaceae Species 0.000 description 2
- 235000002560 Solanum lycopersicum Nutrition 0.000 description 2
- 244000300264 Spinacia oleracea Species 0.000 description 2
- 235000009337 Spinacia oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 2
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 2
- 240000006365 Vitis vinifera Species 0.000 description 2
- 235000014787 Vitis vinifera Nutrition 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 230000001010 compromised effect Effects 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 235000002532 grape seed extract Nutrition 0.000 description 2
- FIKTURVKRGQNQD-UHFFFAOYSA-N icos-2-enoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC=CC(O)=O FIKTURVKRGQNQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- 229930027945 nicotinamide-adenine dinucleotide Natural products 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 238000000611 regression analysis Methods 0.000 description 2
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000013517 stratification Methods 0.000 description 2
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 2
- 230000004102 tricarboxylic acid cycle Effects 0.000 description 2
- XHFVGHPGDLDEQO-ZETCQYMHSA-N (R)-4'-phosphopantothenic acid Chemical compound OP(=O)(O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(O)=O XHFVGHPGDLDEQO-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- SXGZJKUKBWWHRA-UHFFFAOYSA-N 2-(N-morpholiniumyl)ethanesulfonate Chemical compound [O-]S(=O)(=O)CC[NH+]1CCOCC1 SXGZJKUKBWWHRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010030844 2-methylcitrate synthase Proteins 0.000 description 1
- KDTSHFARGAKYJN-IBOSZNHHSA-N 3'-dephospho-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 KDTSHFARGAKYJN-IBOSZNHHSA-N 0.000 description 1
- 102100030374 Actin, cytoplasmic 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 229920000856 Amylose Polymers 0.000 description 1
- 101000981492 Arabidopsis thaliana 4'-phosphopantetheine phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 101100450127 Arabidopsis thaliana HAL3A gene Proteins 0.000 description 1
- 101000981494 Arabidopsis thaliana Pantothenate kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- 108090000489 Carboxy-Lyases Proteins 0.000 description 1
- 241001674939 Caulanthus Species 0.000 description 1
- 108010071536 Citrate (Si)-synthase Proteins 0.000 description 1
- 102000006732 Citrate synthase Human genes 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 208000005156 Dehydration Diseases 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- OYHQOLUKZRVURQ-HZJYTTRNSA-N Linoleic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/CCCCCCCC(O)=O OYHQOLUKZRVURQ-HZJYTTRNSA-N 0.000 description 1
- 102000013460 Malate Dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108010026217 Malate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 240000008467 Oryza sativa Japonica Group Species 0.000 description 1
- 235000005043 Oryza sativa Japonica Group Nutrition 0.000 description 1
- 101100450130 Oryza sativa subsp. japonica HAL3 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010021592 Pantothenate kinase Proteins 0.000 description 1
- 102100024122 Pantothenate kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 108700023175 Phosphate acetyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 238000001190 Q-PCR Methods 0.000 description 1
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 101150106604 SIS2 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- 239000005708 Sodium hypochlorite Substances 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- CLJLWABDLPQTHL-UHFFFAOYSA-N TG(15:0/15:0/15:0) Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(OC(=O)CCCCCCCCCCCCCC)COC(=O)CCCCCCCCCCCCCC CLJLWABDLPQTHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 101710100170 Unknown protein Proteins 0.000 description 1
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 1
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 1
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 1
- 229940100228 acetyl coenzyme a Drugs 0.000 description 1
- LIPOUNRJVLNBCD-UHFFFAOYSA-N acetyl dihydrogen phosphate Chemical compound CC(=O)OP(O)(O)=O LIPOUNRJVLNBCD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000006154 adenylylation Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000037354 amino acid metabolism Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 239000007844 bleaching agent Substances 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012159 carrier gas Substances 0.000 description 1
- 230000005779 cell damage Effects 0.000 description 1
- 208000037887 cell injury Diseases 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 1
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003413 degradative effect Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J diphosphate(4-) Chemical compound [O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 235000011180 diphosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 230000024346 drought recovery Effects 0.000 description 1
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 1
- 230000006353 environmental stress Effects 0.000 description 1
- 238000007824 enzymatic assay Methods 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 235000019387 fatty acid methyl ester Nutrition 0.000 description 1
- 150000002185 fatty acyl-CoAs Chemical class 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000003167 genetic complementation Methods 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 229930195712 glutamate Natural products 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009643 growth defect Effects 0.000 description 1
- 230000009548 growth disturbance Effects 0.000 description 1
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000006195 histone acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000005213 imbibition Methods 0.000 description 1
- 238000007654 immersion Methods 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 235000021374 legumes Nutrition 0.000 description 1
- 208000013409 limited attention Diseases 0.000 description 1
- OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N linoleic acid Natural products CCCCC\C=C/C\C=C\CCCCCCCC(O)=O OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 229940049920 malate Drugs 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-L malate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)C(O)CC([O-])=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 230000004066 metabolic change Effects 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002889 oleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000000065 osmolyte Effects 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000019525 primary metabolic process Effects 0.000 description 1
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 230000008844 regulatory mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000002787 reinforcement Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000003938 response to stress Effects 0.000 description 1
- 230000024053 secondary metabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000008117 seed development Effects 0.000 description 1
- 238000005204 segregation Methods 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N sodium hypochlorite Chemical compound [Na+].Cl[O-] SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000009469 supplementation Effects 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DCXXMTOCNZCJGO-UHFFFAOYSA-N tristearoylglycerol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC)COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC DCXXMTOCNZCJGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012137 tryptone Substances 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
- XOOUIPVCVHRTMJ-UHFFFAOYSA-L zinc stearate Chemical compound [Zn+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O XOOUIPVCVHRTMJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- DTOSIQBPPRVQHS-UHFFFAOYSA-N α-Linolenic acid Chemical compound CCC=CCC=CCC=CCCCCCCCC(O)=O DTOSIQBPPRVQHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8273—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for drought, cold, salt resistance
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
- A01H5/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8247—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified lipid metabolism, e.g. seed oil composition
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8251—Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1241—Nucleotidyltransferases (2.7.7)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Physiology (AREA)
- Botany (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
Abstract
Utilización del enzima fosfopanteteina
adeniltransferasa, implicado en la biosíntesis del coenzima A, en la
mejora del crecimiento vegetal, resistencia al estrés
salino/
osmótico, incremento de lípidos de reserva y modificación del contenido aminoacídico.
osmótico, incremento de lípidos de reserva y modificación del contenido aminoacídico.
La presente invención se refiere a la
utilización del gen que codifica la fosfopanteteina adenil
transferasa (PPAT) como regulador de la biosíntesis de CoA para la
generación de nuevas variedades vegetales que presentan crecimiento
mejorado, resistencia al estrés osmótico y salino, aumento del
contenido en lípidos en sus semillas y composición aminoacídica
alterada. Concretamente la invención se refiere a la utilización de
este gen como regulador de la biosíntesis de CoA en plantas para
modificar el fenotipo de la planta, así como a las plantas obtenidas
genéticamente modificadas, cuyo crecimiento, resistencia a estrés
osmótico y salino y contenido en lípidos de sus semillas es mayor
que en las plantas sin modificar, y que presentan su composición
aminoacídica alterada.
Description
Utilización del enzima fosfopanteteina
adeniltransferasa, implicado en la biosíntesis del coenzima A, en la
mejora del crecimiento vegetal, resistencia al estrés
salino/osmótico, incremento de lípidos de reserva y modificación del
contenido aminoacídico.
La presente invención se refiere a la
utilización del gen que codifica la fosfopanteteina
adeniltransferasa (PPAT) como regulador de la biosíntesis de CoA
para la generación de nuevas variedades vegetales que presentan
crecimiento mejorado, resistencia al estrés osmótico y salino,
aumento de contenido en lípidos en sus semillas y composición
aminoacídica alterada. Concretamente, la invención se refiere tanto
a la utilización de este gen como regulador de la biosíntesis de CoA
como a las plantas obtenidas, genéticamente modificadas que
presentan su fenotipo modificado, cuyo crecimiento, resistencia a
estrés osmótico y salino y contenido en lípidos de sus semillas es
mayor que en las plantas sin modificar, y que presentan su
composición aminoacídica alterada.
La coenzima A (CoA) es un cofactor esencial en
numerosas rutas biosintéticas, degradativas y metabólicas
productoras de energía (Begley et al., 2001). La síntesis de
CoA, partiendo de pantotenato como precursor, se produce en cinco
etapas y se han clonado las correspondientes enzimas biosintéticas
tanto en procariotas como en eucariotas superiores (Begley et
al., 2001; Daugherty et al., 2002; Kupke et al.,
2003; Leonardi et al., 2005). La ruta universal para la
biosíntesis de CoA a partir de pantotenato está iniciada por la
fosforilación de este precursor para generar
4'-fosfopantotenato, que está catalizada por la
pantotenato kinasa (PK, CoaA). En organismos unicelulares y
sistemas animales, la velocidad de biosíntesis de CoA parece estar
regulada mediante inhibición por retroalimentación de PK.
Recientemente, se han caracterizado dos PK de plantas, concretamente
AtPANK1 y AtPANK2 en Arabidopsis y, como resultado, se
encontró que un doble mutante
pank1-1pank2-1 era letal para los
embriones (Tilton et al, 2006). La segunda etapa de la
biosíntesis de CoA supone la adición de cisteina a
4'-fosfopantotenato mediada por
4'-fosfo-N-pantotenoilcisteín
sintetasa (PPCS, CoaB). En la siguiente etapa, la
4'-fosfo-N-pantotenoilcisteín
descarboxilasa (PPCDC, CoaC) cataliza la generación de
4'-fosfopanteteina. Dos genes de
Arabidopsis, AtHAL3A y AtHAL3B, codifican para enzimas PPCDC
esenciales, y una inactivación combinada de ambos genes abortó la
embriogénesis en la fase globular temprana (Rubio et al.,
2006). La penúltima etapa en la ruta biosintética de CoA está
catalizada por la enzima 4'-fosfopanteteina
adeniltransferasa (PPAT, CoaD), que cataliza la adenilación
reversible de 4'-fosfopanteteina para formar
3'-desfosfo-CoA (dPCoA) y
pirofosfato (PPi) (véase más adelante la figura 5a). Finalmente, la
desfosfo-CoA kinasa (DPCK, CoaE) cataliza la última
etapa de la ruta biosintética de CoA, que supone la fosforilación
del grupo 3'-hidroxilo del resto del azúcar ribosa
de dPCoA para formar CoA y ADP.
Considerando el papel fundamental de CoA en el
metabolismo de las plantas, el análisis de mutantes con alteración
en la biosíntesis de CoA ha recibido una atención limitada (Rubio
et al., 2006; Tilton et al., 2006). Recientemente,
hemos notificado que un doble mutante HAL3A-1
HAL3B-1 era letal para los embriones, mientras que
las plántulas que eran nulas para HAL3A y heterocigóticas para HAL3B
(mutante aaBb hal3), presentaron un fenotipo dependiente de
sacarosa (Sac) para el establecimiento de las plántulas (Rubio
et al., 2006).
La presente solicitud de patente, se centra en
la siguiente etapa de la biosíntesis de CoA, que está catalizada
por la enzima PPAT. Los estudios en sistemas modelo de los
productos intermedios en la biosíntesis de CoA han mostrado que,
además del control de la síntesis al nivel de PK, la modulación
adicional del flujo a través de la ruta se produce en PPAT, ya que
tanto pantotenato como 4'-fosfopanteteina pueden
acumularse en la célula en condiciones limitantes para la
biosíntesis de CoA (Jackowski y Rock, 1984; Rock et al.,
2000). En seres humanos, ambas actividades PPAT y DPCK están
codificadas en un único gen que da lugar a una enzima bifuncional
denominada CoA sintasa (Daugherty et al., 2002). Por el
contrario, las plantas tienen diferentes enzimas monofuncionales
codificadas por genes distintos (Kupke et al., 2003).
Así, se ha identificado el producto génico PPAT
de Arabidopsis por su fuerte homología con el equivalente en seres
humanos en CoA sintasa, y se ha confirmado su actividad bioquímica
in vitro (Kupke et al., 2003).
Esta solicitud de patente presenta el análisis
de mutantes de ganancia de función y reducción de función en PPAT,
proporcionando una evidencia de su función sobre el crecimiento de
las plantas, la resistencia al estrés osmótico y el metabolismo de
los lípidos, llegando a la conclusión de que las plantas que
sobreexpresan PPAT, presentan crecimiento mejorado, resistencia al
estrés osmótico, aumento de contenido en lípidos en sus semilla y
composición aminoacídica modificada.
El objeto de la presente invención se refiere a
la utilización del gen que codifica la fosfopanteteina
adeniltransferasa (PPAT) de Arabidopsis thaliana (SEQ. ID.
NO:2) (Gen At2g18250) como regulador de la biosíntesis de CoA
plantas para modificar el fenotipo de la planta de manera que la
planta resultante presente crecimiento mejorado, resistencia al
estrés osmótico, aumento de contenido en lípidos en sus semillas y
composición aminoacídica alterada.
Otro objeto de la presente invención se refiere
al uso del gen que codifica la PPAT en especies de interés
agronómico e industrial como regulador de la biosíntesis de CoA en
plantas. Este uso conlleva la sobreexpresión de PPAT conduciendo a
la generación de plantas que presentan crecimiento y resistencia al
estrés osmótico mejorados así como mayor contenido en lípidos de
sus semillas y composición aminoacídica alterada en comparación con
plantas de tipo silvestre.
Como regulador se entiende el gen, y por tanto
la proteína (enzima) por él codificada que regula la ruta de
biosíntesis (o parte de la ruta que subyace) de CoA, cuya función
está relacionada con el crecimiento de las plantas, su resistencia
al estrés osmótico, el contenido en lípidos de sus semillas y el
metabolismo de aminoácidos.
Como gen que codifica la PPAT en especies de
interés agronómico e industrial se entiende tanto el gen PPAT como
secuencias homólogas de genes PPAT de otros organismos y con
función equivalente a la PPAT de Arabidopsis.
Entre estas especies de interés agronómico e
industrial se incluyen, aunque no de forma exclusiva: arroz, colza,
col, chopo, vid, tomate, patata, leguminosas, maíz, soja, algodón,
etc. Puesto que el gen que codifica la enzima PPAT está conservado
desde musgo hasta especies arbóreas (pícea, chopo) y desempeña una
función imprescindible en la célula vegetal, es razonable suponer
que está conservado en todas las especies vegetales. De hecho se
muestra en los alineamientos de la exposición detallada de un modo
de realización que el producto génico PPAT está presente en
aquellos genomas vegetales disponibles en bases de datos
públicas.
En la descripción de la invención, se realizan
estudios sobre la implicación del gen PPAT en el aumento o
disminución del crecimiento de las plantas, su resistencia al
estrés osmótico, el contenido en lípidos de sus semillas y la
alteración de su composición aminoacídica. Los experimentos se
realizan con la línea mutante ppat-1 que
muestra una reducción de un 90% en la expresión de PPAT, generada
por inserción de ADN-T en el gen PPAT (SEQ. ID. NO:
2) de Arabidopsis, así como con la línea de sobreexpresión
de PPAT OE, generada por transformación de plantas de tipo
silvestre con una copia adicional del gen que codifica la PPAT.
Otro objeto de la presente invención se refiere
a las plantas obtenidas, genéticamente modificadas, cuyo
crecimiento, resistencia a estrés osmótico y salino y contenido en
lípidos de sus semillas es mayor que en las plantas sin modificar, y
que presentan su composición aminoacídica modificada.
Otro objeto de la invención se refiere a las
semillas producidas por las plantas modificadas genéticamente, que
sobreexpresan PPAT, caracterizadas por presentar mayor contenido en
ácidos grasos en las semillas, que las semillas de plantas
silvestres.
Otro objeto de la invención se refiere al uso de
las semillas y plantas transgénicas, que sobreexpresan PPAT,
caracterizado porque los aceites vegetales obtenidos de las mismas
son para uso en alimentación o en la industria del biodiesel.
Otro objeto de la invención se refiere a las
semillas y plantas transgénicas, que sobreexpresan PPAT,
caracterizadas por presentar su composición aminoacídica
modificada.
Otro objeto de la invención se refiere al uso de
las semillas y plantas transgénicas, que sobreexpresan PPAT,
caracterizadas por presentar su composición aminoacídica modificada
en la industria alimenticia.
Figura 1. Caracterización molecular del mutante
ppat-1. (a) Esquema del gen PPAT (SEQ. ID.
NO: 2) y localización de la inserción de ADN-T. La
numeración comienza en el codón de iniciación de la traducción ATG.
Se indica el cebador del extremo izquierdo de ADN-T
(LBb1) que se utilizó para ubicar la inserción de
ADN-T. Los recuadros negros representan exones. (b)
Análisis de RT-qPCR de la expresión de PPAT en ARN
de tipo natural y de ppat-1 preparados a partir de
hojas en roseta de 3 semanas. Los datos son promedios \pm DE de
tres experimentos independientes. Se usó la expresión de
\beta-actina-8 para normalizar los
datos.
Figura 2. Fenotipo de crecimiento del mutante
ppat-1 y la complementación genética. (a)
Crecimiento de la línea de tipo natural (wt), ppat-1
y complementada (Comp) en medio complementado con sacarosa al 1%
(+Sac) o que carece de Sac (-Sac). (b) Cuantificación del
crecimiento de raíces. Los valores son promedios \pm DE (n=100).
(c, d) Crecimiento de plántulas y establecimiento de plantas wt,
ppat-1 y aaBb. La barra de escala
corresponde a 1 cm. Los valores en d son promedios \pm DE para
tres experimentos independientes (200 semillas cada uno). (e)
Crecimiento en suelo de la línea wt, ppat-1 y
complementada, y cuantificación del área de la hoja. Los valores
son promedios \pm DE (n=20). (f) Producción de semillas. Los
valores son promedios \pm DE (n=20).
Figura 3. Fenotipo de las líneas OE de PPAT. (a)
Se determinó la suma de los niveles de CoA y AcCoA en plántulas de
12 días a partir de líneas de tipo silvestre,
ppat-1 y OE de PPAT hechas crecer en medio
complementado con sacarosa al 1% (+Sac) o que carecen de Sac (-
Sac). Los valores son promedios \pm EE de dos experimentos
independientes. Los valores de las líneas OE representan los datos
de pooles de tres líneas independientes. (b, c) Aumento del
crecimiento de hojas en las líneas OE de PPAT en comparación con
las plantas de tipo silvestre. Cuantificación del área de la hoja y
fotografía de las plantas hechas crecer en el suelo durante 2
semanas. Los valores son promedios \pm EE (n=20).
* Indica P<0,01 (prueba de la t de Student) con respecto a wt. (d) Aumento del crecimiento reproductor de las líneas OE en comparación con las plantas wt. (e) Crecimiento de las líneas wt y OE en medio +Sac o -Sac. (f) Cuantificación tanto del crecimiento de raíces como del peso fresco para las líneas wt y OE en medio +Sac o -Sac. Se muestra una línea OE representativa en (d), (e) y (f).
* Indica P<0,01 (prueba de la t de Student) con respecto a wt. (d) Aumento del crecimiento reproductor de las líneas OE en comparación con las plantas wt. (e) Crecimiento de las líneas wt y OE en medio +Sac o -Sac. (f) Cuantificación tanto del crecimiento de raíces como del peso fresco para las líneas wt y OE en medio +Sac o -Sac. Se muestra una línea OE representativa en (d), (e) y (f).
Figura 4. Aumento de la resistencia tanto al
estrés salino como osmótico en las líneas OE en comparación con wt.
Las plántulas hechas crecer en medio que contenía sacarosa al 1% se
transfirieron a medio complementado con NaCl 75 mM (Na1), NaCl 125
mM (Na2), manitol 150 mM (M1) o manitol 250 mM (M2), en presencia o
ausencia de sacarosa exógena. Las plántulas control (C) se
transfirieron a medio que carecía de NaCl o manitol para medir el
crecimiento en ausencia de estrés. Se muestra una línea OE
representativa a partir de tres líneas independientes. (a)
Fotografía representativa tomada tras 11 días. Las barras de escala
corresponden a 4 cm. (b) Cuantificación del peso fresco (FW) tras
11 días. Los datos de las plántulas control corresponden al 50% de
los verdaderos valores. (c) Cuantificación del crecimiento de raíces
primarias tras 7 días. (d) Cuantificación del crecimiento de raíces
secundarias tras 11 días. Los valores son promedios \pm EE para
dos experimentos independientes (30 plántulas cada uno). (e)
Determinación del contenido en prolina en líneas wt y OE tras el
tratamiento con NaCl 125 mM durante 48 h.
Figura 5. Caracterización bioquímica de la
enzima PPAT en la reacción inversa. (a) Esquema de la reacción
reversible catalizada por PPAT. (b) Proteína de fusión
MBP-PPAT recombinante en extracto bruto de E.
coli (1) y tras la purificación mediante cromatografía de
afinidad (2). Se indica el peso molecular aparente de la proteína.
(c) Cinética enzimática de MBP-PPAT recombinante. Se
sometió a ensayo la enzima (40 nM) tal como se describe en los
procedimientos experimentales y se monitorizó la velocidad de
reducción de NADP en NADPH midiendo la absorbancia a una longitud
de onda de 340 nm. Se realizó el análisis de regresión de los datos
(R2=0,99) usando el software Microsoft Excel con el fin de calcular
la velocidad inicial (Vo) de la reacción a diferentes
concentraciones de sustrato. (d) Inhibición de la actividad de PPAT
por CoA(\Delta) y AcCoA(\sqbullet). Los valores
son promedios \pm DE para dos experimentos independientes. Se
realizó el análisis de regresión de los datos usando el software
Graph Pad 4.0.
Figura 6. Mediciones de ácidos grasos (AG) y
acilCoA. (a) Contenido total en AG en semillas secas de los
genotipos indicados. (b) Contenido en acilCoA en plántulas hechas
crecer en +Sac al 1% o -Sac a los 5 DAI. (c, e) Contenido total en
AG a los 0, 2 y 5 DAI de plántulas hechas crecer con +Sac al 1% o
-Sac, respectivamente (d, f) Contenido en ácido eicosaenoico a los
0, 2 y 5 DAI de plántulas hechas crecer con +Sac o -Sac,
respectivamente. Los valores son promedios \pm DE para 5
determinaciones separadas, expresados en una base de por
semilla/plántula; * indica P<0,03 (prueba de la t de Student) en
comparación con los datos de cada genotipo y wt en las mismas
condiciones de crecimiento.
Figura 7. Velocidad de crecimiento en suelo de
las líneas de tipo silvestre (wt), ppat-1,
complementadas (Comp) y de sobreexpresión (OE). Se llevó a cabo un
experimento en el tiempo para medir el número de hojas en roseta por
planta a los 2, 5 10, 12 y 15 días tras la transferencia al suelo
de plántulas de 5 días de los fenotipos indicados. Los valores son
promedio \pm SD (n=20). Se muestra una línea OE
representativa.
Figura 8. Mayor producción de semillas de las
líneas OE en comparación con el tipo silvestre. Los valores son
promedio \pm SD de dos experimentos independientes (n=20). Los
valores de las líneas OE representan datos de pool de tres líneas
independientes.
Figura 9. Mayor generación de raíces secundarias
en las líneas OE que las de tipo natural. Las plántulas crecidas en
medio con 1% de sacarosa fueron transferidas a un medio
suplementado con 125 nM de NaCII o 250 mM de manitol, en presencia o
ausencia de sucrosa exógena. Las plántulas control (C) fueron
transferidas a un medio carente de NaCl o manitol para medir el
crecimiento en ausencia de estrés. Fotografía representativa tomada
pasados 11 días. Las barras de escala corresponden a 4 cm. Se
muestra una línea OE representativa de tres líneas
independientes.
Figura 10. Contenido en Ácidos Grasos
principales a partir de las líneas de tipo silvestre Col,
ppat-1, complementadas (Comp) y de sobreexpresión
(OE). Los valores son promedio \pm DE para 5 determinaciones
separadas, expresados por semilla. El contenido de ácido oleico
(18:1), linoléico (18:2), linolénico (18:3) y eicosanoico (20:1)
fueron entre un 35-50% superior en las líneas OE que
en las de tipo silvestre.
Figura 11. Contenido en aminoácidos de plantas
silvestres Col (Col) y líneas de sobreexpresión (OE). La
determinación del contenido de aminoácidos (expresado en ng) se
realizó mediante HPLC/MS en extractos de 30 plántulas, las cuales
fueron crecidas en medio con 1% sacarosa (plus suc), sin sacarosa
(minus suc), con 1% sacarosa y 125 mM NaCl (plus suc, plus salt) o
bien sin sacarosa y 125 mM NaCl (minus suc plus salt).
Figura 12. Representación gráfica de la
modificación encontrada en los aminoácidos prolina (A) y glutamina
(B).
Tanto las bacterias como los organismos
eucariotas siguen una ruta universal de cinco etapas para
sintetizar CoA a partir de pantotenato. En las plantas, se ha
notificado que dobles mutaciones nulas que conducen a un bloqueo
completo de o bien la primera o bien la tercera etapa de la ruta
biosintética de CoA, es decir de las actividades de PK y PPCDC, son
letales para los embriones (Tilton et al., 2006; Rubio et
al., 2006).
Con el propósito de averiguar la función del gen
PPAT, la presente solicitud de patente lleva a cabo el estudio de
una mutación de reducción de función viable que afecta a la
penúltima etapa de la ruta biosintética de CoA, para estudiar su
impacto sobre el crecimiento de las plantas y la respuesta al
estrés. Así, se demuestra que la función de PPAT está relacionada
con el crecimiento de las plantas y la resistencia al estrés, y el
aumento de la biosíntesis de CoA a través de la sobreexpresión de
PPAT, condujo a plantas con mayor vigor y resistencia al estrés que
plantas de tipo silvestre. Por tanto, la presente invención amplía
el conocimiento existente sobre la biosíntesis de CoA en plantas y
su impacto sobre el crecimiento y la tolerancia al estrés.
El mutante ppat-1
estudiado por el presente documento muestra una alteración notable
en el crecimiento, que es evidente tanto en ausencia como en
presencia de sacarosa exógena. Sin embargo, se observó que la
expresión restante de PPAT es suficiente para el
establecimiento de las plántulas, aunque el crecimiento adicional se
vio alterado gravemente en comparación con las plantas de tipo
silvestre. Así mismo, durante el crecimiento fotoautótrofo, se
vieron alterados tanto el crecimiento vegetativo como reproductor
en ppat-1. Resulta probable que estos
fenotipos sean un reflejo del papel clave desempeñado por CoA en
una multitud de reacciones enzimáticas, tales como la oxidación de
los ácidos grasos, hidratos de carbono y aminoácidos, así como
muchas reacciones biosintéticas (Begley et al., 2001).
Así, con el fin de comprobar que, además del
papel bien conocido tanto en el metabolismo primario como en el
secundario, los efectos reguladores inesperados de CoA pueden ser
responsables en parte de esta alteración del crecimiento (por
ejemplo, efectos sobre la expresión génica a través de la modulación
de la acetilación de histonas mediante los niveles de AcCoA), se
complementaron los defectos de crecimiento de
ppat-1 con la introducción de una copia de
PPAT de tipo silvestre bajo el control del promotor 35S.
Aunque la mayor parte de las características de las líneas
complementadas fueron similares a las de tipo silvestre, el
contenido en ácidos grasos fue mayor que en las de tipo silvestre,
de alguna manera asemejándose a una línea de sobreexpresión
débil.
Por ello, se quiso comprobar si la introducción
de PPAT (SEQ. ID. NO:2) bajo el control de un promotor 35S del VMCo
pudiera conducir a niveles de expresión mayores de PPAT en ciertos
tejidos que los obtenidos a partir del promotor nativo.
La sobreexpresión de PPAT condujo a un
aumento del crecimiento vegetativo en comparación con el tipo
natural. Por tanto, durante el crecimiento fotoautótrofo en el
suelo, tanto el crecimiento vegetativo como el reproductor fueron
mayores en las líneas OE que en las plantas de tipo silvestre
(figura 3). De manera similar, tanto el crecimiento de raíces como
el peso fresco fueron mayores en las plántulas procedentes de las
líneas OE hechas crecer in vitro en ausencia de Sac.
El aumento de la biomasa de raíces se asocia
normalmente con un aumento de la tolerancia a la sequía (Park et
al., 2003; Verlues et al., 2006). Las líneas OE, que
mostraron mayor crecimiento de raíces que las de tipo natural en
condiciones sin estrés, también mostraron mayor crecimiento de
raíces primarias y secundarias que las plantas de tipo silvestre en
condiciones de estrés. Como resultado, se encontró una mejor
integración del crecimiento de las plantas con el estrés ambiental
en estas líneas OE.
Sin embargo, es difícil establecer la verdadera
magnitud de la implicación de CoA en la tolerancia osmótica. Por
tanto, además de evitar el estrés mediante el aumento de la biomasa
de raíces, podría conseguirse tolerancia al estrés a través tanto
de la acumulación de solutos compatibles como de diferentes cambios
metabólicos que evitan el daño celular provocado por la pérdida de
agua. En relación con este aspecto, la presente invención muestra
de manera interesante que, en condiciones de estrés osmótico, las
líneas OE sintetizan niveles de prolina 2 veces mayores que las de
tipo silvestre en medio carente de Sac exógena (figura 4e). Así
mismo se comprobó que la Sac exógena estimuló 2 veces la síntesis de
prolina en el tipo silvestre, mientras que tuvo un efecto moderado
sobre las líneas
OE.
OE.
Por tanto, la presente invención muestra que las
líneas OE parecen ser menos dependientes que las de tipo silvestre
de la complementación exógena de Sac para sintetizar prolina, hecho
que se considera ventajoso para soportar el estrés hídrico, ya que
se ven alterados la reducción de carbono y el transporte del floema
en estas condiciones (Wardlaw, 1967; Tully et al., 1979). La
prolina se sintetiza principalmente a través de una ruta derivada
del glutamato y, por tanto, la estructura principal del esqueleto
de carbono se deriva del ciclo del ácido cítrico. Las líneas OE de
PPAT de la presente invención tienen mayores niveles de CoA y AcCoA
que las de tipo silvestre, lo que podría aumentar la síntesis de
los diferentes productos intermedios del ciclo del ácido
cítrico.
Estudios en E. y mamíferos indican que
PPAT (SEQ. ID. NQ:1) cataliza una etapa reguladora secundaria en la
biosíntesis de CoA tras el punto regulador maestro de PK (Jackowski
y Rock, 1984; Rock et coli al., 2000; Rock et al.,
2003). En E. coli, se acumulan tanto pantotenato como
4'-fosfopanteteina en la célula en condiciones
limitantes para la biosíntesis de CoA (Jackowski et al.,
1984). El aumento del flujo de la ruta biosintética de CoA a través
de la introducción de una versión de PK que no responde a la
inhibición por CoA, condujo a una mayor acumulación de
4'-fosfopanteteina que de CoA, que ilustra que PPAT
es un segundo sitio para la regulación de la biosíntesis de CoA
tras PK (Rock et al., 2003). En mamíferos, se acumula la
4'-fosfopanteteina como el segundo metabolito más
abundante de la ruta de la CoA tras el pantotenato, lo que sugiere
que tanto PPAT como PK catalizan etapas limitantes de la velocidad
en la biosíntesis de CoA (Rock et al., 2000). La
sobreexpresión transitoria de PK1\beta suprimió la acumulación de
pantotenato y dio como resultado un aumento de al menos 10 veces de
los niveles de CoA intracelular, aunque también se midió una
acumulación de 3 veces de 4'-fosfopanteteina (Rock
et al., 2000). Estos resultados ilustran que se produce una
restricción de la velocidad de flujo tanto en las etapas
catalizadas por PK como por PPAT, aunque la regulación en la etapa
de PPAT parece ser secundaria a PK (Rock et al., 2000).
A los efectos de estudiar el efecto limitante de
PPAT en la producción de CoA, la presente invención comprobó que
las líneas de sobreexpresión de PPAT contenían un aumento de
los niveles de especies de CoA (figuras 3a y 6e), lo que indica que
PPAT limita la producción de CoA en plantas en un cierto grado.
Desgraciadamente, no pudo demostrarse directamente la actividad de
PPAT (SEQ. ID. NO:1) en plántulas u hojas de Arabidopsis ni
en extractos vegetales brutos ni tras la purificación parcial a
través de filtración en gel de Sephadex G-25 y
precipitación con sulfato de amonio (datos no mostrados). La
abundancia presumiblemente baja de las enzimas de la biosíntesis de
CoA podría explicar la no detección de actividad de PPAT en los
extractos de plantas. Por ejemplo, la actividad de una enzima de la
planta implicada en la biosíntesis del pantotenato sólo podía
detectarse en mitocondrias purificadas a actividades específicas de
0,5 nmol/min por mg de proteína (Ottenhof et al., 2004).
La presente invención lleva a cabo la
caracterización enzimática de la PPAT de Arabidopsis. Para
ello, se procedió a medir fácilmente la actividad de PPAT (SEQ. ID.
NO:1) utilizando proteína recombinante y proporcionar parámetros
cinéticos en el estado estacionario de la enzima (figura 5). La
Kcat para PPAT (3,4 s-1) fue comparable a la
notificada para PPAT de E. coli (3,3 s-1) y
la enzima hepática de cerdo bifuncional (7,7 s-1),
mientras que la Km de PPAT de Arabidopsis para dPCoA (37
\muM) fue notablemente mayor que en las enzimas de bacterias y
mamíferos (7 y 11 \muM, respectivamente) (Geerlof et al.,
1999; Aghajanian y Worrall, 2002).
Con el fin de evaluar la relevancia fisiológica
del CoA cobre la actividad de PPAt (SEQ. ID. NO:1), se procedió a
estimar la concentración de CoA libre en los diferentes tejidos de
la planta, en diferentes fases de desarrollo. Así, esta invención
presenta el efecto inhibidor de CoA (CI50= 38 \muM) sobre la
actividad de PPAT. Es difícil estimar con precisión la concentración
de CoA libre en los diferentes tejidos de la planta, en diferentes
fases de desarrollo (Tumaney et al., 2004). En las hojas de
espinaca, la concentración de AcCoA fuera del plastidio
(probablemente dominada por el conjunto citosólico) es del orden de
40-65 \muM (Tumaney et al., 2004). AcCoA
está presente en un gran exceso con respecto a CoA libre en las
semillas, pero en las hojas de espinaca o en las paredes de la
silicua verde, ambas especies de CoA están en el mismo orden de
magnitud (Tumaney et al., 2004; Gibon et al., 2002).
Además, la CI50 de CoA en la actividad de PPAT es muy próxima a la
Km para el sustrato dPCoA. Por tanto, parece razonable que CoA
tenga un efecto inhibidor sobre la actividad de PPAT en condiciones
fisiológicas que podría actuar como un mecanismo regulador por
retroalimentación negativa. De hecho, el CoA está estrechamente
unido a la enzima purificada de E. coli (Geerlof et
al., 1999), y se ha resuelto la estructura cristalina de PPAT
de E. coli complejada con dPCoA,
4'-fosfopanteteina o CoA (Izard y Geerlof, 1999;
Izard, 2002; Izard, 2003). El análisis de la estructura de PPAT:CoA
revela que CoA se une al sitio activo de una forma distinta a dPCoA
y 4'-fosfopanteteina (Izard, 2003). Estos
resultados confirman por tanto que, el CoA no es un sustrato para
PPAT y su unión a PPAT sugiere una regulación por retroalimentación
negativa sobre la actividad de PPAT, tal como ya se ha establecido
para PK
(Rock et al., 2003).
(Rock et al., 2003).
Para evaluar el papel regulador de PPAT en la
acumulación de ácidos grasos en las semillas, se estudió este
aspecto en los mutantes ppat-1 y PPAT
(O.E.). La mutación ppat-1 tuvo un efecto moderado
sobre la acumulación de AG en las semillas, mientras que la
sobreexpresión de PPAT dio como resultado un aumento del
35-50% de algunos AG con respecto al tipo natural
(figura 10). La alteración de la biosíntesis de CoA en el mutante
aaBb hal3 tampoco tuvo un efecto importante sobre la
acumulación de AG en las semillas (Rubio et al., 2006). Estos
resultados sugieren que la expresión residual de PPAT y
HAL3B a lo largo de la vida de la planta proporciona un
suministro de CoA suficiente para la biosíntesis de AG. Aunque no se
evito el establecimiento de las plántulas en
ppat-1, tal como se notificó para aaBb
hal3 (Rubio et al., 2006), se observó una alteración
grave del crecimiento temprano de las plántulas en comparación con
las plántulas de tipo natural (figura 2c). El catabolismo temprano
de los lípidos se detuvo en ppat-1 cuando el
medio se complementó con Sac exógena; mientras que en el medio que
carecía de sacarosa exógena, el mutante
ppat-1 no mostró tal fenotipo con alteración
drástica, aunque el uso de ácido eicosanoico fue más lento que en el
tipo natural (figura 6). El retraso en el consumo de AG en
ppat-1 podría atribuirse a la alteración de
la \beta-oxidación debido a la disminución de la
biosíntesis de CoA, tal como se sugirió anteriormente para otro
mutante de la ruta biosintética de CoA (Rubio et al., 2006).
Por el contrario, la presente invención demuestra que el retraso
inesperado en el consumo de AG observado en la línea OE sugiere que
el aumento de la biosíntesis de CoA puede conducir o bien a un uso
más eficaz de la sacarosa exógena como fuente de energía y/o a un
aumento de la sensibilidad a la inhibición relacionada con la
señalización de azúcares del catabolismo de los lípidos de
reserva.
Finalmente, el aumento de la producción de
semillas de las líneas OE de PPAT de Arabidopsis, junto con
la mayor acumulación de AG por semilla, demuestra que el refuerzo
de la biosíntesis de CoA constituye un enfoque para la obtención por
ingeniería genética de semillas de cultivo con mayor rendimiento de
aceite.
Así mismo, las plantas y semillas obtenidas a
partir de la invención presentan su composición aminoacídica
alterada (Figuras 11 y 12) con respecto a las plantas silvestres,
presentando gran utilidad en la industria de la alimentación
animal.
Así, en conclusión, es evidente el interés de la
presente invención en la producción mejorada de aceites vegetales
tanto para su uso en alimentación como de biodiesel.
Adicionalmente, el aumento del crecimiento vegetativo y reproductor,
así como la mejora concomitante en la resistencia al estrés
osmótico de las líneas OE de PPAT y la alteración de su
composición aminoacídica, hacen que la presente invención sea de
gran interés para la obtención por ingeniería genética de cosechas
con una mayor producción de biomasa y para ofrecer soluciones
sostenibles a largo plazo para el uso de los terrenos
agrícolas.
\vskip1.000000\baselineskip
Se identificó un alelo alterado por
ADN-T de PPAT en la colección de SALK
(http://signal.salk.edu/cgi-bin/
tadnexpress), correspondiente al número de reserva de donante SALK_093728 y designado como ppat-1 (figura 1 a). La inserción de ADN-T en ppat-1 se ubica en el segundo intrón, 652 nucleótidos en sentido 3' del codón de iniciación ATG. Se identificaron tres líneas de ADN-T adicionales en las proximidades de la unidad de transcripción de PPAT, pero no afectaron significativamente a la expresión del gen PPAT (datos no mostrados). El mutante ppat-1 mostró una reducción de un \sim90% en la expresión de PPAT en comparación con el tipo natural (figura 1b). El análisis por PCR cuantitativa en tiempo real (RT-qPCR) detectó sistemáticamente una expresión residual de un -10%, lo que sugiere que se produjo en cierto grado corte y empalme del intrón en el que se insertó el ADN-T.
tadnexpress), correspondiente al número de reserva de donante SALK_093728 y designado como ppat-1 (figura 1 a). La inserción de ADN-T en ppat-1 se ubica en el segundo intrón, 652 nucleótidos en sentido 3' del codón de iniciación ATG. Se identificaron tres líneas de ADN-T adicionales en las proximidades de la unidad de transcripción de PPAT, pero no afectaron significativamente a la expresión del gen PPAT (datos no mostrados). El mutante ppat-1 mostró una reducción de un \sim90% en la expresión de PPAT en comparación con el tipo natural (figura 1b). El análisis por PCR cuantitativa en tiempo real (RT-qPCR) detectó sistemáticamente una expresión residual de un -10%, lo que sugiere que se produjo en cierto grado corte y empalme del intrón en el que se insertó el ADN-T.
Se observó una grave alteración en el
crecimiento vegetativo para las plántulas de ppat-1
tanto en medio que carece de o complementado con Sac al 1% (figura
2a y 2b); no obstante, el fenotipo no tuvo una alteración tan grave
como la de las plántulas con aaBb hal3 en medio que carece de
sacarosa (Rubio et al., 2006) (figura 2c), y a diferencia de
la progenie con aaBb hal3, no se vio comprometido el establecimiento
de las plántulas en ppat-1 (figura 2d). El
mutante ppat-1 era viable pero el porcentaje
de supervivencia tras la transferencia de las plántulas germinadas
en placas de MS al suelo fue inferior al 30% (datos no mostrados).
El posterior crecimiento en el suelo y la producción de semillas de
plantas con ppat-1 se redujeron en
comparación con las plantas de tipo natural (figura 2e y 2f). En
general, se vio afectado el crecimiento reproductor en plantas con
ppat-1, ya que estaban presentes menos tallos
con inflorescencia por planta (véase más adelante la figura 3d).
Con el fin de verificar que los fenotipos observados eran una
consecuencia de la expresión alterada de PPAT, se generaron
líneas de complementación para ppat-1. Con
este fin, se puso ADNc de PPAT bajo el control del promotor
35S y se introdujo en ppat-1 mediante
Agrobacterium tumefaciens. Se seleccionaron los
transformantes primarios (T1) por su resistencia a la higromicina y
se obtuvo una población T3 homocigótica para el transgén. La
introducción de un alelo de PPAT de tipo natural complementó
los fenotipos descritos anteriormente (figura 2; véase más adelante
la figura 3d), lo que demostró que una mutación de reducción de
función en PPAT era responsable de estos fenotipos.
\vskip1.000000\baselineskip
Las plantas que sobreexpresan el gen que
codifica la PPCDC de AtHAL3A muestran una velocidad de crecimiento
más rápida y una tolerancia al estrés salino y osmótico mejorada
(Espinosa-Ruiz et al., 1999). La
sobreexpresión de HAL3 de Nicotiana tabacum también
aumenta la tolerancia al estrés salino y osmótico en células de
tabaco en cultivo (Yonamine et al., 2004). Estos resultados
sugieren que la regulación de la biosíntesis de CoA parece
desempeñar un papel importante en la integración del crecimiento de
las plantas y la resistencia al estrés. Para someter a prueba la
magnitud de esta hipótesis, se generaron líneas de sobreexpresión
(OE) de PPAT en una referencia de tipo silvestre. Se
seleccionaron tres líneas homocigóticas para el marcador de
selección en la generación T3 y se usaron para análisis
adicionales. Se determinó la cantidad combinada de CoA libre y
acetil-CoA usando el ensayo espectrofotométrico de
ciclación de enzimas descrito originariamente por Alfred y Guy
(1969) (figura 3a). Las líneas OE mostraron niveles
1,6-7 veces mayores en promedio de CoA libre +
acetil-CoA que los de tipo natural (figura 3a). Por
el contrario, el mutante ppat-1 mostró una
reducción de o bien un \sim60% o bien un \sim80% en comparación
con el tipo natural en medio +Sac o -Sac, respectivamente (figura
3a). Aunque se redujo el crecimiento de hojas en plantas
ppat-1 en comparación con las de tipo
silvestre (figura 2d), las líneas OE mostraron un aumento del
crecimiento de hojas (figura 3b y 3c). La velocidad de crecimiento,
estimada a partir del número de hojas en roseta por planta en un
periodo de tiempo, no se vio alterada significativamente en las
líneas OE (figura 7), aunque la producción de tallos florales fue 2
días más rápida en promedio en las líneas OE en comparación con las
de tipo natural (18\pm1 días en las líneas OE, 20\pm1 días en
wt). Adicionalmente, el crecimiento reproductor (figura 3d) y la
producción de semillas (figura 8) fueron significativamente mayores
en las líneas OE que en las de tipo natural. Las plántulas
procedentes de las líneas OE hechas crecer en medio que carece de
sacarosa mostraron tanto un peso fresco como un crecimiento de
raíces mayores que en las de tipo silvestre (figura 3e y 3f). Estas
diferencias se atenuaron cuando se hicieron crecer las plantas en
medio complementado con sacarosa (figura 3e y 3f).
Para someter a prueba la sensibilidad al estrés
salino y osmótico de las líneas OE, se transfirieron plántulas de 7
días hechas crecer en medio que contenían sacarosa al 1% a medio
complementado con o bien NaCl o bien manitol, ambos en ausencia o
presencia de sacarosa (figura 4). En comparación con las plantas de
tipo silvestre, las líneas OE mostraron un peso fresco y un
crecimiento de raíces primarias mayores en condiciones de estrés
salino y osmótico (figuras 4b y c). Teniendo en cuenta que en
ausencia de estrés, las líneas OE también mostraron un crecimiento
mayor que las de tipo natural, la inhibición del crecimiento
inducida por el aumento de la resistencia al estrés salino y
osmótico podría ser, al menos parcialmente, una consecuencia del
aumento del vigor observado en estas líneas. En estas condiciones
de baja disponibilidad de agua, se observó una drástica reducción en
el número y la longitud de las raíces secundarias en las plantas de
tipo natural (figura 4d; figura 9). Las líneas OE experimentaron
una reducción menos grave y la biomasa total de raíces fue
notablemente mayor que en las plantas de tipo silvestrel (figura 4d;
figura 9). Una explicación parcial del crecimiento mejorado con
estrés osmótico observado en las líneas OE podría ser un aumento de
la acumulación de osmolitos compatibles, tales como prolina. De
hecho, el ajuste osmótico debido a un aumento de la deposición de
prolina desempeña un papel importante en el mantenimiento del
alargamiento de las raíces a bajos potenciales hídricos (Voetberg y
Sharp, 1993). La figura 4e muestra que las líneas OE contenían
niveles de prolina aproximadamente dos veces mayores que las de
tipo silvestre en medio que carecía de complementación exógena de
Sac. Por el contrario, con la complementación del medio con Sac, el
contenido en prolina en ambos genotipos era alto y similar (figura
4e).
\vskip1.000000\baselineskip
Previamente, se ha sometido a ensayo la
actividad de PPAT de Arabidopsis añadiendo diferentes
combinaciones de enzimas recombinantes a una mezcla de reacción que
contenía pantotenato, ATP, Mg^{2+}, cisteína y DTT (Kupke et
al., 2003). Por ejemplo, una mezcla de CoaA, CoaB, CoaC y PPAT
pudo catalizar la síntesis de dPCoA. Cuando se omitió la CoaC del
ensayo, no se generó dPCoA, lo que indica que PPAT no acepta
4'-fosfopantotenoilcisteína como sustrato (producida
por la acción combinada de CoaA y CoaB). Sin embargo, no se han
investigado la cinética en estado estacionario ni la regulación
bioquímica para la enzima PPAT individual. PPAT cataliza la
transferencia reversible de un grupo adenilo desde
Mg^{2+}-ATP hasta
4'-fosfopanteteina para formar dPCoA y PPi (figura
5a). Por tanto, es posible someter a ensayo la actividad de PPAT en
sentido inverso usando hexokinasa y
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa
para acoplar la producción de ATP a la reducción de NADP (Geerlof
et al., 1999). Por tanto, usando MBP-PPAT
recombinante (figura 5b), se midió la velocidad inicial de la
reacción inversa a concentraciones variables del sustrato comercial
dPCoA (figura 5c). Se halló que los parámetros cinéticos para la
reacción inversa eran
K_{M(dPCoA)} = 37 \pm 2,1 \muM, K_{cat} = 3,4 \pm 0,2 s^{-1} y V_{max} = 0,34 \pm 0,02 \mumol min^{-1} mg^{-1} de proteína.
K_{M(dPCoA)} = 37 \pm 2,1 \muM, K_{cat} = 3,4 \pm 0,2 s^{-1} y V_{max} = 0,34 \pm 0,02 \mumol min^{-1} mg^{-1} de proteína.
El producto intermedio metabólico de CoA,
4'-fosfopanteteina, está presente en cantidades
significativas tanto en E. coli como en mamíferos, lo que
sugiere que PPAT cataliza una etapa limitante de la velocidad en la
ruta (Jackowski y Rock, 1984; Rock et al., 2000). Tales
enzimas están sometidas a menudo a regulación por retroalimentación
por subproductos de la ruta. Por tanto se examinó el efecto de CoA
y AcCoA sobre la actividad de PPAT (figura 5d). Aunque AcCoA casi no
tuvo efecto sobre la actividad de PPAT hasta 40 \muM, CoA tuvo
una CI_{50} = 38,6 \pm 1,9 \muM, que es próxima a la Km para
dPCoA.
\vskip1.000000\baselineskip
Se analizó el contenido en ácidos grasos (AG) en
semilla seca de líneas de tipo natural,
ppat-1, complementadas (Comp) y de
sobreexpresión (OE) (figura 6a). El contenido total en ácidos
grasos en ppat-1 pareció ser menor que en las
de tipo natural, aunque no fue estadísticamente significativo
(p<0,15). Por tanto, aunque el rendimiento de semilla por planta
fue menor para las plantas de ppat-1, se
produjo la deposición normal de aceite dentro de las semillas
individuales durante el desarrollo de las semillas. Se midió un
aumento estadísticamente significativo en el contenido total en
ácidos grasos tanto en las líneas complementadas (p<0,026) así
como en OE (p<0,012). Los perfiles individuales de los ácidos
grasos principales de semillas secas de Arabidopsis
mostraron que las líneas OE contenían entre un
35-50% más de AG, concretamente de ácido oleico,
linoleico, linolénico y eicosanoico, que las semillas de tipo
natural (figura 10). La medición del conjunto total de
acil-CoA se realizó a los 5 DAI tanto en medio que
carecía de cómo complementado con Sac tal como describieron Larson
y Graham (2001). De acuerdo con los resultados previos (Rubio et
al., 2006), la complementación con Sac condujo a la estimulación
de la biosíntesis de acil-CoA en comparación con
medio que carecía de Sac (figura 6b). Los niveles totales de
acil-CoA en ppat-1 fueron del
\sim68 y el 50% de los niveles en el tipo natural a los 5 DAI en
medio +Sac y -Sac, respectivamente. Por el contrario, las líneas OE
de PPAT contenían niveles \sim1,4 y 1,3 veces mayores de las
acil-CoA que las de tipo natural en medio +Sac y
-Sac, respectivamente. Estos cambios imitaron ampliamente los
observados para los niveles de CoA y AcCoA en plantas con más tiempo
en estas líneas (figura 3); lo que indica una relación entre la
disponibilidad de CoA libre y el tamaño del conjunto de
acil-CoA.
Se realizó un análisis en el tiempo del
contenido en AG de diferentes referencias genéticas a los 0, 2 y 5
cinco días tras la inhibición (DAI, days after imbibition)
en medio complementado con Sac (figura 6c). La complementación con
Sac condujo a un consumo más lento de estos lípidos de reserva
(Eastmond et al., 2000; Martin et al., 2002; Jennifer
et al., 2002) y este retraso aumentó notablemente tanto en
las líneas ppat-1 como en las OE a los 2 DAI,
cuando se detuvo el consumo de ácidos grasos (figura 6c). En
particular, el nivel del ácido graso específico de reserva
triacilglicerol, ácido eicosaenoico (20:1n9), disminuyó un \sim40%
en las plántulas de tipo natural a los 2 DAI, mientras que no se
observó casi reducción en las líneas de mutante
ppat-1 y OE (figura 6d). La acumulación de
20:1 n9 en las líneas ppat-1 y OE sugiere
que se detuvo el catabolismo temprano de ácidos grasos en estas
condiciones de germinación, a diferencia del intenso catabolismo
observado en wt. Sin embargo, 20:1 n9 se había consumido en su
mayor parte a los 5 DAI, lo que sugiere que sólo se comprometió en
estas líneas el uso temprano de los lípidos de reserva.
En medio que carecía de Sac exógena, se observó
un consumo más rápido de los AG en los diferentes genotipos (figura
6e y 6f). La grave alteración del catabolismo de los ácidos grasos
a los 2 DAI notificada anteriormente para las líneas
ppat-1 y OE no se observó en medio que
carecía de Sac exógena. Por tanto, el nivel de ácido eicosanoico
disminuyó un \sim60% en las plántulas de tipo silvestre a los 2
DAI, mientras que se observó una reducción de un \sim40% y un
\sim60% en las líneas de mutante ppat-1 y
OE, respectivamente (figura 6d).
\vskip1.000000\baselineskip
Se hicieron crecer plantas de Arabidopsis
thaliana rutinariamente en condiciones de invernadero en
macetas que contenían una mezcla de
vermiculita-tierra 1:3. Para el cultivo in
vitro, las semillas se esterilizaron en superficie mediante el
tratamiento con etanol al 70% durante 20 min, seguido por lejía
comercial (hipoclorito de sodio al 2,5%) que contenía Triton
X-100 al 0,05% durante 10 min, y finalmente cuatro
lavados con agua destilada estéril. Las semillas se sembraron en
placas con medio Murashige-Skoog (1962) (MS)
compuesto por sales basales de MS, ácido
2-[N-morfolino]etanosulfónico al 0,1%, agar
al 1% y un pH ajustado hasta 5,7 con KOH antes de esterilizarlas en
autoclave. Una vez establecido, se incluyó sacarosa al 1% en el
medio. Se llevó a cabo la estratificación de las semillas en la
oscuridad a 4ºC durante 3 días. Tras la estratificación (=0 DAI),
las placas se transfirieron a una cámara de crecimiento de entorno
controlado a 22ºC con un fotoperiodo de 16 h de luz, 8 h de
oscuridad a 80-100 \muE m^{-2} s^{-1}.
\vskip1.000000\baselineskip
Un grupo internacional conocido como AGI
(iniciativa para el genoma de Arabidopsis, Nature,
408:796-815) secuenció el genoma de la planta modelo
Arabidopsis thaliana. La disponibilidad de la secuencia
completa de este genoma permitió que se creasen diversos proyectos
para aclarar la función y el uso biotecnológico de los más de
25.000 genes identificados en esta planta modelo. En el caso de la
enzima PPAT (SEQ. ID. NO:1), la secuencia codificante corresponde al
gen At2g18250 (SEQ. ID. NO:2). Se amplificó por PCR la secuencia
codificante del ADNc de At2g18250 usando los siguientes pares de
cebadores: FCoaD,
5'-GGATCCATGGCAGCTCCGGAA
GATTC y RCoaD, 5'-GGATCCTCATGATGCTTTTTCTTCTG. Se clonó el producto de PCR en el vector de entrada pCR8/GW/TOPO (Invitrogen) y se recombinó mediante reacción de LR en el vector de destino pMDC32 (Curtis y Grossniklaus, 2003). Se transfirió el constructo pMDC32-35S:PPAT a Agrobacterium tumefaciens C58C1 (pGV2260; Deblaere et al., 1985) mediante electroporación y se usó para transformar plantas de tipo natural. Se usó el método de inmersión floral (Clough y Bent, 1998). Se hicieron crecer bacterias en la fase estacionaria en un cultivo de LB (10 g de triptona, 5 g de extracto de levadura y 5 g de NaCl por litro) complementado con 25 mg/ml de kanamicina. Se recuperaron las células mediante centrifugación y se resuspendieron en un medio de infiltración (sacarosa al 5% y Silwet L-77 al 0,05%). Se invirtieron plantas de Arabidopsis de cuatro semanas y se sumergieron en esta suspensión, tras lo cual se cubrieron con plástico para mantener la humedad. Tras 12-24 horas, se retiró la cubierta de plástico y se devolvieron las plantas al invernadero. Se recogieron las semillas de las plantas tratadas tras 3-5 semanas. Éstas se almacenaron durante 3-4 semanas, tras las que se realizó una selección de los transformantes que contenían ADN-T transferido por Agrobacterium. Se recogieron las semillas de las plantas transformadas y se cultivaron en placa sobre medio de selección con higromicina (20 \mug/ml) para identificar las plantas transgénicas T1. Se usaron para estudios adicionales las progenies T3 que eran homocigóticos para el marcador de selección.
GATTC y RCoaD, 5'-GGATCCTCATGATGCTTTTTCTTCTG. Se clonó el producto de PCR en el vector de entrada pCR8/GW/TOPO (Invitrogen) y se recombinó mediante reacción de LR en el vector de destino pMDC32 (Curtis y Grossniklaus, 2003). Se transfirió el constructo pMDC32-35S:PPAT a Agrobacterium tumefaciens C58C1 (pGV2260; Deblaere et al., 1985) mediante electroporación y se usó para transformar plantas de tipo natural. Se usó el método de inmersión floral (Clough y Bent, 1998). Se hicieron crecer bacterias en la fase estacionaria en un cultivo de LB (10 g de triptona, 5 g de extracto de levadura y 5 g de NaCl por litro) complementado con 25 mg/ml de kanamicina. Se recuperaron las células mediante centrifugación y se resuspendieron en un medio de infiltración (sacarosa al 5% y Silwet L-77 al 0,05%). Se invirtieron plantas de Arabidopsis de cuatro semanas y se sumergieron en esta suspensión, tras lo cual se cubrieron con plástico para mantener la humedad. Tras 12-24 horas, se retiró la cubierta de plástico y se devolvieron las plantas al invernadero. Se recogieron las semillas de las plantas tratadas tras 3-5 semanas. Éstas se almacenaron durante 3-4 semanas, tras las que se realizó una selección de los transformantes que contenían ADN-T transferido por Agrobacterium. Se recogieron las semillas de las plantas transformadas y se cultivaron en placa sobre medio de selección con higromicina (20 \mug/ml) para identificar las plantas transgénicas T1. Se usaron para estudios adicionales las progenies T3 que eran homocigóticos para el marcador de selección.
\vskip1.000000\baselineskip
Se identificó una línea (referencia Columbia)
que contenía una única inserción de ADN-T en
PPAT (At2g18250) a partir de la colección de
ADN-T de SALK (Alonso et al., 2003),
correspondiente al número de reserva de donante SALK_093728. Con el
fin de identificar individuos homocigóticos para la inserción de
ADN-T, se obtuvo el ADN genómico a partir de
plántulas resistentes a kanamicina (50 \mug/ml) y se sometió a
genotipado por PCR usando los siguientes cebadores:
5'-GGGAGTCTGTGATGGCCCAAT y
5'-CTTGACATAGGTCTCCACATTA. Como cebador del extremo
izquierdo de ADN-T del vector pROK2 se usó el
siguiente: 5'-GCCGATTTCGGAACCACCATC. La línea
mutante marcada con el ADN-T se retrocruzó una vez
con el tipo silvestre, se verificó mediante hibridación de
inmunotransferencia en gel de ADN y también mediante el análisis de
segregación del gen de resistencia a antibióticos codificado.
\vskip1.000000\baselineskip
Se amplificó la secuencia codificante del ADNc
de At2g18250 (obtenida a partir de ABRC, clon U61663) mediante PCR
usando los siguientes pares de cebadores: FCoaD,
5'-GGATCCATGGCAGCTCCGGAAGATTC y RCoaD,
5'-GGATCCTCATGATGCTTTTTCTTCTG. Se clonó el producto
de PCR en el vector de entrada pCR8/GW/TOPO (Invitrogen) y se
recombinó mediante reacción de LR en el vector de destino pMDC32
(Curtis y Grossniklaus, 2003). Se transfirió el constructo
pMDC32-35S:PPAT a Agrobacterium
tumefaciens C58C1 (pGV2260; Deblaere et al., 1985)
mediante electroporación y se usó para transformar plantas mutantes
ppat-1 (líneas complementadas) y de tipo
silvestre (líneas de sobreexpresión). Se recogieron las semillas de
las plantas transformadas y se sembraron en medio de selección con
higromicina (20 \mug/ml) para identificar las plantas transgénicas
T1. Se usaron para estudios adicionales las progenies T3 que eran
homocigóticas para el marcador de selección.
\newpage
Se clasificó el establecimiento de las plántulas
de las diferentes referencias genéticas como el porcentaje de
semillas que desarrollaron cotiledones expandidos verdes y el
primer par de verdaderas hojas. Se realizaron ensayos de tolerancia
al estrés salino y osmótico mediante la transferencia de plántulas
de 7 días hechas crecer en medio que contenía sacarosa a un medio
complementado con NaCl 75 mM, NaCl 125 mM, manitol 150 mM o manitol
250 mM, respectivamente. Las plántulas se hicieron crecer
verticalmente durante de 7 a 11 días y se exploraron periódicamente
las placas en un escáner de lecho plano para producir archivos de
imágenes adecuados para el análisis cuantitativo usando el software
NIH Image (ImageJ v1.37).
\vskip1.000000\baselineskip
El contenido en aminoácidos se determinó
mediante HPLC/EM en extractos vegetales preparados en etanol al 80%
a partir de plántulas que o bien eran simuladas o bien se trataron
con NaCl 125 mM durante 48 h. Se derivatizaron los aminoácidos
libres en los extractos hasta sus derivados de cloroformiato de
isobutilo tal como describe Husek (1991) y se analizaron mediante
CL-EM como sus fragmentos MS2.
\vskip1.000000\baselineskip
Se recogieron hojas en roseta y se congelaron en
nitrógeno líquido. Se extrajo el ARN total utilizando un Mini Kit
RNeasy Plant de Qiagen y se sometió a transcripción inversa 1
\mug de la disolución de ARN obtenida utilizando 0,1 \mug de
cebador de oligo(dT)_{15} y la transcriptasa inversa
de VLM-M (Roche), hasta obtener finalmente una
disolución de ADNc de 40 \mul. Se realizaron mediciones y
amplificaciones por RT-qPCR utilizando un sistema de
detección de secuencias ABI PRISM 7000
(Perkin-Elmer Applied Biosystems). Las secuencias de
los cebadores usados para las amplificaciones por PCR fueron las
siguientes: para PPAT, directo
5'-GGGAGTCTGTGATGGCCCAAT e inverso
5'-CTTGACATAGGT CTCCACATTA y para
\mu-actina-8 (At1g49420), directo
5'-AGTGGTCGTACAACCGGTATTGT e inverso
5'-GAGGATAGC ATGTGGAAGTGAGAA.
Se monitorizaron las amplificaciones por
RT-Q-PCR utilizando la cepa
fluorescente Eva-Green^{TM} (Biotium). Se llevó a
cabo la cuantificación relativa de los datos de expresión génica
utilizando el método 2^{\Delta\Delta CT} o de C_{T} comparativo
(Livak y Schmittgen 2001). Se normalizaron los niveles de expresión
utilizando los valores de CT obtenidos para el gen de la
\mu-actina-8. Se verificó adicionalmente la
presencia de un único producto de PCR mediante análisis de
disociación en todas las amplificaciones. Todas las cuantificaciones
se realizaron por triplicado en las muestras de ARN.
\vskip1.000000\baselineskip
Se sometió a ensayo la actividad de PPAT en el
sentido inverso utilizando hexocinasa y
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa
para acoplar la producción de ATP a la reducción de NADP (Geerlof
et al., 1999). La mezcla de ensayo contenía dPCoA 0,1 mM, PPi
2 mM, MgCl_{2} 2 mM, NADP^{+} 1 mM, glucosa 5 mM, DTT 1 mM, 4
unidades de hexocinasa y 1 unidad de
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa en
tampón Tris-HCl 50 mM, pH 8. Se obtuvo PPAT
recombinante como una proteína de fusión con la proteína de unión a
maltosa (MBP). Para este fin, se escindió la secuencia codificante
de PPAT del vector de entrada pCR8/GW/TOPO utilizando digestión con
BamHI y se clonó en pMalc2. Se indujo la expresión de
MBP-PPAT recombinante con IPTG 1 mM en células DH5a
de E. coli y se purificó la proteína de fusión mediante
cromatografía de afinidad con amilosa según las instrucciones del
fabricante (New England Biolabs).
Los ensayos enzimáticos se llevaron a cabo a
25ºC y se monitorizó el aumento de la absorbancia a 340 nm. Una
unidad de actividad corresponde a la formación de 1 \mumol de
producto/min usando un coeficiente de extinción para el NADPH de
6220 M^{-1} cm^{-1}. Se corrigieron las velocidades para la
reducción de la referencia de NADP.
\vskip1.000000\baselineskip
Se determinaron AcCoA y CoA básicamente tal como
se describe en Gibon et al., (2002) con modificaciones
minoritarias. Se redujeron a polvo muestras de tejido
(100-200 mg de FW) utilizando mortero y mano de
mortero y se extrajeron con (100-200 \mul) de
ácido tricloroacético al 16%. Tras la centrifugación, el
sobrenadante se llevó a pH 6-7 mediante la adición
de base Tris 2 M. Se determinó la suma de CoA y AcCoA utilizando el
ensayo espectrofotométrico de ciclación de enzimas descrito
originariamente por Allred y Guy (1969). Se colocaron alícuotas de
extracto de 20 \mul en una microplaca y se añadieron 150 \mul
de Tris/HCl pH 7,4 que contenía 0,25 \mumol de DTT y 12,5
\mumol de malato y se incubaron durante 10 min. A continuación, se
añadieron 80 \mul de una mezcla que contenía 0,25 \mumol de DTT,
0,2 \mumol de NAD^{+}, 0,6 pmol de fosfato de acetilo, 2,5
unidades de fosfotransacetilasa, 1,25 unidades de citrato sintasa y
3 unidades de malato deshidrogenasa en Tris 100 mM/HCI pH 7,4, se
incubó la mezcla de reacción a 25ºC durante 20 min y se leyó la
absorbancia a 340 nm. Con cada conjunto de determinaciones, se
incluyeron curvas de calibración utilizando patrones de CoA y AcCoA
(que oscilaban desde 0,5 hasta 10 pmol).
\vskip1.000000\baselineskip
Se extrajeron los lípidos de 20 semillas secas
por repetición y se transmetilaron en sus ésteres metílicos de
ácidos grasos (EMAG) junto con tripentadecanoína como un patrón
interno utilizando un procedimiento de 1 etapa (Browse et
al., 1986). Se disolvieron los EMAG en hexano y se inyectaron
alícuotas de 2 \muL para el análisis de CG-FID
utilizando una columna capilar BPX70 de 60 m x 0,25 mm de di. x 0,25
\mum de espesor de película (SGE) y un CG GC8000 Top de CE
Instruments (Thermoquest). Se realizó la inyección en una corriente
de gas portador de hidrógeno a 1,3 ml\cdotmin^{-1} (velocidad
lineal promedio de 35 cm\cdots^{-1}) a una razón de
fraccionamiento de 30:1. La temperatura se elevó tal como sigue:
110ºC isoterma 1 min; 7,5ºC\cdotmin 1 hasta 260ºC; se enfrió a
70ºC\cdotmin^{-1} hasta 110ºC; el tiempo total de análisis fue
de 23 min. Se identificaron los EMAG mediante su comparación con
una mezcla de 37 EMAG (Supelco). Se extrajeron cien plántulas por
repetición (aproximadamente 3 mg para las plántulas de 0 DAI, 20 mg
para las de 2 DAI y 30 mg para las de 5 DAI) para el análisis
cuantitativo de acil CoA mediante HPLC con detección por
fluorescencia de derivados de acil eteno CoA (Larson et
al., 2001; con modificaciones descritas por Larson et
al., 2002). Se utilizó la porción lipídica de los extractos de
acil CoA para las determinaciones de ácidos grasos tal como se
describió anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
Teniendo en cuenta que el gen que codifica la
enzima PPAT está conservado desde musgo hasta especies arbóreas
(pícea, chopo) y desempeña una función imprescindible en la célula
vegetal, para comprobar su conservación en las especies vegetales,
se llevaron a cabo alineamientos de la proteína PPAT de
Arabidopsis thaliana con algunas proteínas ortólogas (con
función equivalente) de otras especies vegetales.
Para ello, se llevó a cabo una búsqueda en las
base de datos públicas que presentan los genomas vegetales
disponibles.
La base de datos
http://www.ncbi.nlm.nih.gov incluye secuencias génicas y
productos génicos de vid, arroz, pícea, musgo, colza y col. Los
alineamientos de la proteína PPAT de Arabidopsis thaliana
obtenidos en esta base de datos permitió la identificación de los
siguientes genes o productos génicos con los porcentajes de
homología que se indican a continuación:
En vid (Vitis vinifera) se detectó la
proteína con número de acceso emb|CAO16378.1| y nombre
desconocido, que presenta una homología del 92% con PPAT de
Arabidopsis Thaliana.
En arroz (Oryza sativa Japonica Group),
se detectó un gen con número de identificación GENE ID: 4342557
Os07g0179400 | Os07g0179400, que presenta un 83% de homología
con PPAT de Arabidopsis Thaliana.
En Pícea (Picea sitchensis), se detectó
una proteína desconocida identificada como gb|ABK25768.1, con
homología del 86% frente a PPAT de Arabidopsis Thaliana.
En Musgo (Physcomitrella patens subsp.
patens), se identificó la proteína gb|EDQ82844.1 que presenta
homología del 86% con PPAT de Arabidopsis Thaliana.
En Colza (Brassica napus) se detectó
gi|95827801|gb|DW998276.1 que presenta homología del
85% con Arabidopsis Thaliana.
En Col (Brassica oleracea) se detectó
gi|150912248|gb|ES942706.1, con homología del 85%
frente a Arabidopsis Thaliana
La base de datos de especies de solanáceas
http://www.sgn.cornell.edu/ incluye secuencias génicas y
productos génicos de tomate y patata. Los alineamientos de la
proteína PPAT de Arabidopsis thaliana obtenidos en esta base
de datos permitó la identificación de los siguientes genes o
productos génicos con los porcentajes de homología que se indican a
continuación:
En tomate (Solanum lycopersicum) se
identificó tomato|TC155758, que presenta homología del 88%
con Arabidopsis Thaliana.
En patata (Solanum tuberosum) se
identificó SGN-U279993 que presenta
homología del 94% con Arabidopsis Thaliana.
Los alineamientos de la proteína PPAT de
Arabidopsis thaliana obtenidos en la base de datos del chopo
(http://genome.jgi-psf.org/Poptr1 1/Poptr1
1.home.html) permitó la identificación de los siguientes genes
o productos génicos con los porcentajes de homología que se indican
a continuación:
En chopo (Populus trichocarpa) se
identificó eugene3.00570163 que presenta homología del 80%
con Arabidopsis Thaliana.
Así, los resultados de estos alineamientos
corroboran la presencia del producto génico PPAT en los genomas
vegetales y por tanto su conservación en distintas especies
vegetales.
A continuación se muestran los alineamientos de
la proteína PPAT de Arabidopsis thaliana con algunas
proteínas ortólogas (con función equivalente) de otras especies
vegetales como: vid (Vitis vinifera), arroz (Oryza
sativa), pícea (Picea sitchensis), musgo
(Physcomitrella patens), colza (Brassica napus), col
silvestre (Brassica oleracea), tomate (Solanum
lycopersicum), patata (Solanum tuberosum), chopo
(Populus trichocarpa). Se llevó a cabo una búsqueda en la
base de datos http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ (la cual incluye
secuencias génicas y productos génicos de vid, arroz, pícea, musgo,
colza y col), la base de datos de especies de solanáceas
http://www.sgn.cornell.edu/ (la cual incluye secuencias
génicas y productos génicos de tomate y patata) y la base de datos
del chopo (http://genome.igi-psf.org/Poptr1
1/Poptr1 1.home.html). El gen que codifica las proteínas
ortólogas en estas especies vegetales está indicado en el
encabezamiento de cada uno de los alineamientos.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Aghajanian, S. and Worrall, D.M.
(2002). Identification and characterization of the gene
encoding the human phosphopantetheine adenylyltransferase and
dephospho-CoA kinase bifunctional enzyme (CoA
synthase). Biochem. J. 365, 13-18.
Allred, J.B. and Guy, D.G.
(1969). Determination of coenzyme A and acetyl CoA in tissue
extracts. Anal. Biochem. 29,
293-299.
Alonso, J.M., et al.,
(2003). Genome-wide insertional mutagenesis
of Arabidopsis thaliana. Science 301,
653-657.
Begley, T.P., Kinsland, C. and
Strauss, E. (2001). The biosynthesis of coenzyme A in
bacteria. Vitam. Horm. 61,
157-171.
Browse, J., McCourt, P.J. and
Somerville, C.R. (1986). Fatty acid composition of
leaf lipids determined after combined digestion and fatty acid
methyl ester formation from fresh tissue. Anal. Biochem.
152, 141-145.
Curtis, M.D. and Grossniklaus, U.
(2003). A gateway cloning vector set for
high-throughput functional analysis of genes in
planta. Plant Physiol 133,
462-469.
Daugherty, M., Polanuyer, B.,
Farrell, M., Scholle, M., Lykidis, A.,
Crecy-Lagard, V. and Osterman, A.
(2002). Complete reconstitution of the human coenzyme A
biosynthetic pathway via comparative genomics. J. Biol. Chem.
277, 21431-21439.
Deblaere, R., Bytebier, B., De
Greve, H., Deboeck, F., Schell, J., Van
Montagu, M. and Leemans, J. (1985). Efficient
octopine Ti plasmid-derived vectors for
Agrobacterium-mediated gene transfer to plants.
Nucleic Acids Res. 13, 4777-4788.
Eastmond, P.J., Germain, V.,
Lange, P.R., Bryce, J.H., Smith, S.M. and
Graham, I.A. (2000). Postgerminative growth and lipid
catabolism in oilseeds lacking the glyoxylate cycle. Proc. Natl.
Acad. Sci. U. S. A 97, 5669-5674.
Espinosa-Ruiz, A.,
Belles, J.M., Serrano, R. and
Culianez-Macia, F.A. (1999).
Arabidopsis thaliana AtHAL3: a flavoprotein related to salt
and osmotic tolerance and plant growth. Plant J. 20,
529-539.
Geerlof, A., Lewendon, A. and
Shaw, W.V. (1999). Purification and characterization
of phosphopantetheine adenylyltransferase from Escherichia coli.
J. Biol. Chem. 274, 27105-27111.
Gibon, Y., Vigeolas, H.,
Tiessen, A., Geigenberger, P. and Stitt, M.
(2002). Sensitive and high throughput metabolite assays for
inorganic pyrophosphate, ADPGIc, nucleotide phosphates, and
glycolytic intermediates based on a novel enzymic cycling system.
Plant J. 30, 221-235.
Husek, P. (1991). Amino acid
derivatization and analysis in five minutes. FEBS Lett.
280,354-356.
Izard, T. and Geerlof, A.
(1999). The crystal structure of a novel bacterial
adenylyltransferase reveals half of sites reactivity. EMBO J.
18, 2021-2030.
Izard, T. (2002). The crystal
structures of phosphopantetheine adenylyltransferase with bound
substrates reveal the enzyme's catalytic mechanism. J. Mol.
Biol. 315, 487-495.
Izard, T. (2003). A novel
adenylate binding site confers phosphopantetheine
adenylyltransferase interactions with coenzyme A. J.
Bacteriol. 185, 4074-4080.
Jackowski, S. and Rock, C.O.
(1984). Metabolism of 4'-phosphopantetheine
in Escherichia coli. J. Bacteriol. 158,
115-120.
Kupke, T.,
Hernandez-Acosta, P. and
Culianez-Macia, F.A. (2003).
4'-phosphopantetheine and coenzyme A biosynthesis in
plants. J. Biol. Chem. 278,
38229-38237.
Larson, T.R. and Graham, I.A.
(2001). Technical Advance: a novel technique for the
sensitive quantification of acyl CoA esters from plant tissues.
Plant J. 25, 115-125.
Larson, T.R., Edgell, T.,
Byrne, J., Dehesh, K. and Graham, I.A.
(2002). AcyI CoA profiles of transgenic plants that
accumulate medium-chain fatty acids indicate
inefficient storage lipid synthesis in developing oilseeds. Plant
J. 32, 519-527.
Leonardi, R., Zhang, Y.M.,
Rock, C.O. and Jackowski, S. (2005). Coenzyme
A: back in action. Prog. Lipid Res. 44,
125-153.
Livak, K.J. and Schmittgen, T.D.
(2001). Analysis of relative gene expression data using
real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta
C(T)) Method. Methods 25,
402-408.
Martin, T., Oswald, O. and
Graham, I.A. (2002). Arabidopsis seedling growth,
storage lipid mobilization, and photosynthetic gene expression are
regulated by carbon:nitrogen availability. Plant Physiol 128, 472-481.
Murashige, T. and Skoog, F.
(1962). A revised medium for rapid growth and bioassays with
tobacco tissue culture. Physiol. Plant. 15,
473-497.
Ottenhof, H.H., Ashurst, J.L.,
Whitney, H.M., Saldanha, S.A., Schmitzberger,
F., Gweon, H.S., Blundell, T.L., Abell, C. and
Smith, A.G. (2004). Organisation of the pantothenate
(vitamin B5) biosynthesis pathway in higher plants. Plant J.
37, 61-72.
Park, S., Li, J., Pittman,
J.K., Berkowitz, G.A., Yang, H., Undurraga, S.,
Morris, J., Hirschi, K.D. and Gaxiola, R.A.
(2005). Up-regulation of a H+-pyrophosphatase
(H+-PPase) as a strategy to engineer
drought-resistant crop plants. Proc. Natl. Acad.
Sci. U. S. A 102, 18830-18835.
Rock, C.O., Calder, R.B.,
Karim, M.A. and Jackowski, S. (2000).
Pantothenate kinase regulation of the intracellular concentration of
coenzyme A. J. Biol. Chem. 275,
1377-1383.
Rock, C.O., Park, H.W. and
Jackowski, S. (2003). Role of feedback regulation of
pantothenate kinase (CoaA) in control of coenzyme A levels in
Escherichia coli. J. Bacteriol. 185,
3410-3415.
Rubio, S., Larson, T.R.,
Gonzalez-Guzman, M., Alejandro, S.,
Graham, I.A., Serrano, R. and Rodriguez, P.L.
(2006). An Arabidopsis mutant impaired in coenzyme A
biosynthesis is sugar dependent for seedling establishment. Plant
Physiol 140, 830-843.
Tilton, G.B., Wedemeyer, W.J.,
Browse, J. and Ohlrogge, J. (2006). Plant
coenzyme A biosynthesis: characterization of two pantothenate
kinases from Arabidopsis. Plant Mol. Biol. 61,
629-642.
To, J.P., Reiter, W.D. and
Gibson, S.I. (2002). Mobilization of seed storage
lipid by Arabidopsis seedlings is retarded in the presence of
exogenous sugars. BMC. Plant Biol. 2, 4.
Tully, R.E., Hanson, A.D. and
Nelsen, C.E. (1979). Proline Accumulation in
Water-stressed Barley Leaves in Relation to
Translocation and the Nitrogen Budget. Plant Physiol 63, 518-523.
Tumaney, A.W., Ohlrogge, J.B. and
Pollard, M. (2004). Acetyl coenzyme A concentrations
in plant tissues. J. Plant Physiol 161,
485-488.
Verslues, P.E., Agarwal, M.,
Katiyar-Agarwal, S., Zhu, J. and
Zhu, J.K. (2006). Methods and concepts in quantifying
resistance to drought, salt and freezing, abiotic stresses that
affect plant water status. Plant J. 45,
523-539.
Voetberg, G.S. and Sharp, R.E.
(1991). Growth of the Maize Primary Root at Low Water
Potentials: III. Role of Increased Proline Deposition in Osmotic
Adjustment. Plant Physiol 96,
1125-1130.
Wardlaw, I.F. (1967). The effect
of water stress on translocation in relation to photosynthesis and
growth. I. Effect during grain development in wheat. Aust. J.
Biol. Sci. 20, 25-39.
Yonamine, I., Yoshida, K.,
Kido, K., Nakagawa, A., Nakayama, H. and
Shinmyo, A. (2004). Overexpression of NtHAL3 genes
confers increased levels of proline biosynthesis and the enhancement
of salt tolerance in cultured tobacco cells. J. Exp. Bot.
55, 387-395.
<110> Universidad Politécnica de Valencia
y Consejo Superior de Investigaciones Científicas
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Utilización del enzima
fosfopanteteina adeniltrasferasa, implicado en la biosíntesis del
coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal, resistencia al
estrés salino/osmótico, Incremento de lípidos de reserva y
modificación del contenido Aminoacídico.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> Referencia de la solicitud
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 176
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de aminoácidos de la
enzima PPAT
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 531
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de nucleótidos del ADNc de
PPAT
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (32)
1. Uso del gen que codifica la enzima PPAT en
especies vegetales como regulador de la síntesis de CoA.
2. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
reivindicación 1, donde dicho gen es homólogo al gen PPAT de A.
Thaliana.
3. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
reivindicaciones 1 y 2, caracterizado porque dicha
regulación se produce por ganancia de función del gen que codifica
la PPAT.
4. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
la reivindicación 3, caracterizado porque dicha ganancia de
función es por sobreexpresión de PPAT.
5. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
las reivindicaciones 1 a 4, caracterizado porque la
sobreexpresión es producida por inserción de una copia adicional
del gen PPAT en el genoma de la planta.
6. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
la reivindicación 5, caracterizado porque la copia adicional
del gen PPAT es insertada bajo el control de un promotor
constitutivo.
7. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
la reivindicación 6, caracterizado porque la copia adicional
del gen PPAT es insertada bajo el control del promotor constitutivo
35S del Virus del Mosaico de la Coliflor en el genoma de la
planta.
8. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
la reivindicaciones 1 a 7 caracterizado porque dicha
regulación implica un aumento en los niveles de síntesis de
CoA.
9. Uso del gen que codifica la enzima PPAT según
reivindicaciones 1 a 8 caracterizado porque dicha regulación
implica un aumento en los niveles de síntesis de CoA+ACoA de 1,6
veces superior a los niveles de CoA+ACoA en plantas silvestres.
10. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según reivindicaciones 1 a 9 caracterizado porque dicha
regulación implica un aumento en el crecimiento vegetativo y
reproductivo de las plantas, aumento de la producción de semillas,
disminución del tiempo de floración, mayor resistencia al estrés
osmótico y salino, aumento del contenido en ácidos grasos en las
semillas y composición aminoacídica modificada.
11. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según reivindicación 10 caracterizado porque dicha
regulación implica una disminución de dos días en el tiempo de
floración en comparación con plantas de tipo silvestre.
12. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según reivindicaciones 10 y 11 caracterizado porque dicha
regulación implica mayor resistencia al estrés osmótico y salino
debido a la acumulación de prolina.
13. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según reivindicación 12 caracterizado porque dicha
regulación implica una acumulación de prolina dos veces mayor que
los niveles de prolina en plantas silvestres.
14. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según reivindicaciones 10 a 13 caracterizado porque dicha
regulación implica que el aumento del contenido en ácidos grasos se
produzca en ácido oleico, ácido linoleico, ácido linolénico y ácido
eicosanoico.
15. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según reivindicaciones 10 a 14 caracterizado porque dicha
regulación implica que el contenido en ácidos grasos en las
semillas sea 35-50% superior que en las semillas de
plantas silvestres.
16. Uso del gen que codifica la enzima PPAT
según las reivindicaciones 1 a 15, para la obtención de plantas
transgénicas que presenten mayor crecimiento vegetativo y
reproductivo, mayor producción de semillas, disminución del tiempo
de floración, mayor resistencia al estrés osmótico y salino, aumento
del contenido en ácidos grasos en las semillas y composición
aminoacídica modificada.
17. Plantas modificadas genéticamente, según la
reivindicación 16, caracterizada por su ganancia de función
del gen PPAT para regular la síntesis de CoA.
18. Planta modificada genéticamente según
reivindicación 17 caracterizada porque la ganancia de
función del gen PPAT es producida por inserción de una copia
adicional del gen PPAT.
19. Planta modificada genéticamente según
reivindicaciones 17 y 18 caracterizada porque la inserción
de la copia adicional del gen PPAT se produce bajo el control de un
promotor constitutivo.
20. Planta modificada genéticamente según
reivindicaciones 17 a 19 caracterizada porque la inserción
de la copia adicional del gen PPAT se produce bajo el control del
promotor constitutivo 35S del Virus del Mosaico de la Coliflor.
21. Planta modificada genéticamente según
reivindicaciones 17 a 20 caracterizada por presentar mayor
crecimiento vegetativo y reproductivo, mayor producción de
semillas, disminución del tiempo de floración, mayor resistencia al
estrés osmótico y salino y mayor contenido en ácidos grasos en las
semillas, que las plantas silvestres, así como composición
aminoacídica modificada.
22. Semillas producidas por las plantas
modificadas genéticamente según reivindicaciones 17 a 21,
caracterizadas por presentar mayor contenido en ácidos
grasos en las semillas, que las semillas de plantas silvestres.
23. Semillas producidas por las plantas
modificadas genéticamente según reivindicaciones 17 a 22,
caracterizadas porque el aumento del contenido en ácidos
grasos se produce principalmente en ácido oleico, ácido linoleico,
ácido linolénico y ácido eicosanoico.
24. Semillas producidas por las plantas
modificadas genéticamente según reivindicaciones 17 a 23,
caracterizadas porque el contenido en ácidos grasos en las
semillas es 35-50% superior que en las semillas de
plantas silvestres.
25. Uso de las semillas y/o plantas transgénicas
según reivindicaciones 17 a 24 en la producción de aceites
vegetales.
26. Uso de las plantas según reivindicación 25
en la producción de aceites vegetales.
27. Uso de las semillas según reivindicación 25
en la producción de aceites vegetales.
28. Uso de las semillas y plantas transgénicas
según reivindicaciones 25 a 27 caracterizado porque dichos
aceites son para uso en alimentación.
29. Uso de las semillas y/o plantas transgénicas
según reivindicaciones 25 a 27 caracterizado porque dichos
aceites son para uso en la industria del biodiesel.
30. Uso de las semillas y/o plantas transgénicas
según reivindicaciones 17 a 24 en la industria de la alimentación
animal.
31. Uso de las semillas transgénicas según
reivindicación 30 en la industria de la alimentación animal.
32. Uso de las plantas transgénicas según
reivindicación 30 en la industria de la alimentación animal.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
ES200801366A ES2334539B1 (es) | 2008-05-12 | 2008-05-12 | Utilizacion del enzima fosfopanteteina adeniltransferasa, implicado en la biosintesis del coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal,resistencia al estres salino/osmotico, incremento de lipidos de reserva y modificacion del contenido aminoacidico. |
PCT/ES2009/000242 WO2009138535A1 (es) | 2008-05-12 | 2009-05-06 | Utilización del enzima fosfopanteteina adeniltransferasa, implicado en la biosíntesis del coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal, resistencia al estrés salino/osmótico, incremento de lípidos de reserva y modificación del contenido aminoacídico |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
ES200801366A ES2334539B1 (es) | 2008-05-12 | 2008-05-12 | Utilizacion del enzima fosfopanteteina adeniltransferasa, implicado en la biosintesis del coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal,resistencia al estres salino/osmotico, incremento de lipidos de reserva y modificacion del contenido aminoacidico. |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2334539A1 ES2334539A1 (es) | 2010-03-11 |
ES2334539B1 true ES2334539B1 (es) | 2011-02-02 |
Family
ID=41318386
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES200801366A Expired - Fee Related ES2334539B1 (es) | 2008-05-12 | 2008-05-12 | Utilizacion del enzima fosfopanteteina adeniltransferasa, implicado en la biosintesis del coenzima a, en la mejora del crecimiento vegetal,resistencia al estres salino/osmotico, incremento de lipidos de reserva y modificacion del contenido aminoacidico. |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
ES (1) | ES2334539B1 (es) |
WO (1) | WO2009138535A1 (es) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5876216B2 (ja) | 2010-04-09 | 2016-03-02 | 国立大学法人大阪大学 | ヤトロファ由来のnf−ybをコードするポリヌクレオチド及びその利用 |
JP6030281B2 (ja) | 2010-12-08 | 2016-11-24 | 住友電気工業株式会社 | ヤトロファ由来のppatをコードするポリヌクレオチド及びその利用 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2340998C (en) * | 2001-03-21 | 2012-01-03 | Saskatchewan Wheat Pool | Selective modification of plant fatty acids |
-
2008
- 2008-05-12 ES ES200801366A patent/ES2334539B1/es not_active Expired - Fee Related
-
2009
- 2009-05-06 WO PCT/ES2009/000242 patent/WO2009138535A1/es active Application Filing
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
KUPKE T. et al. 4'- Phosphopantetheine and coenzyme A biosynthesis in plants. The Journal of Biological Chemistry 2003 Vol. 278, páginas 38229-38237. Página 38237. * |
LEONARDI R. et al. Coenzyme A: Back in action. Progress in Lipid Research. Vol. 44, páginas 125-153. Página 138. * |
YONAMINE I. et al. Overexpression of NtHAL3 genes confers increased levels of proline biosynthesis and the enhancement of salt tolerance in cultured tobacco cells. Journal of Experimental Botany 2004. Vol. 55 (396), páginas 387-395. * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
ES2334539A1 (es) | 2010-03-11 |
WO2009138535A1 (es) | 2009-11-19 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Trovato et al. | Proline metabolism and its functions in development and stress tolerance | |
Ahmad et al. | Stress-induced expression of choline oxidase in potato plant chloroplasts confers enhanced tolerance to oxidative, salt, and drought stresses | |
Martin-Tanguy | Metabolism and function of polyamines in plants: recent development (new approaches) | |
Léon et al. | The AtNFS2 gene from Arabidopsis thaliana encodes a NifS-like plastidial cysteine desulphurase | |
Shockey et al. | Genome‐level and biochemical diversity of the acyl‐activating enzyme superfamily in plants | |
ES2542420T3 (es) | Desaturasas de ácidos grasos de hongos | |
Liu et al. | Enhanced seed oil content by overexpressing genes related to triacylglyceride synthesis | |
Wang et al. | A thioredoxin-dependent glutathione peroxidase (OsGPX5) is required for rice normal development and salt stress tolerance | |
Rubio et al. | The coenzyme a biosynthetic enzyme phosphopantetheine adenylyltransferase plays a crucial role in plant growth, salt/osmotic stress resistance, and seed lipid storage | |
BR112012019365A2 (pt) | método para aumentar a produção de biomassa, ácido nucleico, célula vegetal transgênica, planta transgênica e semente transgênica | |
ES2634795T3 (es) | Sorgo resistente a herbicidas inhibidores de acetil-CoA-carboxilasa | |
Chen et al. | The peanut (Arachis hypogaea L.) gene AhLPAT2 increases the lipid content of transgenic Arabidopsis seeds | |
Wang et al. | Characterization and molecular cloning of a serine hydroxymethyltransferase 1 (OsSHM1) in rice | |
JP2012523237A (ja) | 植物snf1関連タンパク質キナーゼ遺伝子 | |
Huai et al. | Genome-wide identification of peanut KCS genes reveals that AhKCS1 and AhKCS28 are involved in regulating VLCFA contents in seeds | |
Anwar et al. | Expression of Arabidopsis Ornithine Aminotransferase (AtOAT) encoded gene enhances multiple abiotic stress tolerances in wheat | |
Liu et al. | Identification and phenotypic characterization of ZEBRA LEAF16 encoding a β-Hydroxyacyl-ACP dehydratase in rice | |
US20110145948A1 (en) | Transgenic Plants Comprising as Transgene a Phosphatidate Cytidylyltransferase | |
Wu et al. | Sequence and expression divergence of the AOC gene family in soybean: insights into functional diversity for stress responses | |
Goto et al. | A single-nucleotide mutation in a gene encoding S-adenosylmethionine synthetase is associated with methionine over-accumulation phenotype in Arabidopsis thaliana | |
Hu et al. | Enhanced tolerance to herbicide of rice plants by over-expression of a glutathione S-transferase | |
Fouad et al. | Transplastomic expression of bacterial L-aspartate-α-decarboxylase enhances photosynthesis and biomass production in response to high temperature stress | |
Ibragimova et al. | Evaluation of salt tolerance of transgenic tobacco plants bearing the P5CS1 gene of Arabidopsis thaliana | |
Rubio et al. | An Arabidopsis mutant impaired in coenzyme A biosynthesis is sugar dependent for seedling establishment | |
US20030084472A1 (en) | Plant pyruvate dehydrogenase kinase gene |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
EC2A | Search report published |
Date of ref document: 20100311 Kind code of ref document: A1 |
|
FG2A | Definitive protection |
Ref document number: 2334539 Country of ref document: ES Kind code of ref document: B1 Effective date: 20110121 |
|
FD2A | Announcement of lapse in spain |
Effective date: 20180924 |