ES2321680B1 - Restauracion de las moleculas hla de clase i mediante terapia genica empleando vectores adenovirales portando el gen de la beta 2-microglobulina. - Google Patents

Restauracion de las moleculas hla de clase i mediante terapia genica empleando vectores adenovirales portando el gen de la beta 2-microglobulina. Download PDF

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Abstract

Restauración de las moléculas HLA de clase I mediante terapia génica empleando vectores adenovirales portando el gen de la \beta2-microglobulina.
La invención se relaciona con la recuperación de la capacidad de presentación antigénica de tumores in vivo mediante la restauración de la expresión de moléculas HLA de clase I empleando para ello vectores adenovirales. La misma será realizada en aquellos tumores totalmente negativos para la expresión de moléculas HLA de clase I debido a alteraciones en la \beta2-microglobulina, implicando el diagnóstico previo de la alteración presente en el tumor.

Description

Restauración de las moléculas HLA de clase I mediante terapia génica empleando vectores adenovirales portando el gen de la \beta2-microglobulina.
Sector de la técnica
La presente invención se refiere a la generación de vacunas adenovirales que restauren la expresión de moléculas HLA de clase I en tumores generando un incremento de la capacidad de presentación antigénica de la célula tumoral.
Estado de la técnica Antígenos tumorales y la inmunovigilancia
La presencia de antígenos específicos de tumor fue en principio demostrada sometiendo a los animales a fuerte dosis de carcinógenos químicos (Prehn, R.T., and J.M. Main. 1957. "Immunity to methylcholantreno-induced sarcomas". J Natl Cancer Inst 18:769), a virus oncogénicos (Klein, E and G. Klein. 1964. "Antigenic properties of lymphomas induced by Moloney agent". J. Natl Inst. 32: 547) o a radiación ultravioleta (Kripke, MI. 1974 "Antigenicity o murine skin tumors induced by ultraviolet light". J. Natl Cancer Inst. 53:1333-1336). Estos y otros múltiples estudios permitieron a Burnet generar la hipótesis de que el sistema inmune reconoce y elimina tumores en desarrollo basado en el reconocimiento de neoantígenos generados en el proceso de la transformación maligna (Burnet, F.M. 1970. "The concept of immunological surveillance". Prog. Exp. Tumor Res. 13:1-27).
Dada la existencia de los antígenos tumorales capaces de ser reconocidos por el sistema inmune, una parte de las investigaciones en los últimos años en el cáncer, han estado enfocadas a conocer los mecanismos que conducen al sistema inmune a evadir el reconocimiento tumoral o a adquirir una tolerancia progresiva durante su desarrollo.
Los componentes efectores del sistema inmune están implicados en la respuesta inmunológica desarrollada frente al cáncer, siendo los mas destacado la respuesta citotóxica celular llevada por linfocitos T citotóxicos (CTLs) y células NK. Esta respuesta efectora va a ser generada en la medida que se produzca el reconocimiento inmunológico de las células tumorales llevado a cabo por los linfocitos T. Este proceso está condicionado a la expresión de moléculas HLA de clase I por parte de la célula tumoral. La función principal de estas moléculas es la presentación de pequeños péptidos, producto de la degradación de proteínas del interior celular, a los linfocitos T en contexto de su receptor (TCR). La habilidad de los linfocitos T para reconocer epitopos peptídicos derivados del citoplasma, proteínas nucleares, antígenos tumorales en el contexto de las moléculas HLA de clase I, permite el reconocimiento por parte del sistema inmune de alteraciones celulares provocadas por el proceso maligno y la consecuente respuesta efectora.
El hecho de que las moléculas del MHC desempeñan un papel esencial en el reconocimiento de los antígenos proteicos por las células T, (Doherty, P.,C., M.B. Dunlop, C.R. Parish, and R.M. Zinkernagel. 1976. "Inflamatory process in murine lymphocytic choriomeningitis is maximal in H-2K or H-2D compatible interactions". J. Immunology. 117:187-190) llevó a muchos laboratorios a realizar un enorme esfuerzo para aclarar la estructura de estas moléculas y el fenómeno de la presentación antigénica.
Existen dos grandes vías de procesamiento y presentación antigénica; una usada para la presentación de moléculas extracelulares y moléculas asociadas a membranas de la célula y otra para la presentación de péptidos generados a partir de la degradación de macromoléculas presentes en el citosol celular (vía endógena). La primera vía descrita genera péptidos que son presentados mediante las moléculas MHC de clase II a linfocitos T CD4+. La segunda vía genera péptidos para ser presentados por moléculas pertenecientes al MHC de clase I que son reconocidos por linfocitos T CD8+. Ambos tipo de moléculas, están localizadas en el complejo mayor de histocompatibilidad, ubicados en el brazo corto del cromosoma 6 (6p21.3) (Breuning, M.,H., E.M. van den Berg-Loonen, L.F. Bernini, J.B. Bijlsma, E. van Loghem, P. Meera Khan, L.E. Nijenhuis. 1977 "Localization of HLA on short arm of chromosome 6". Hum Genet 37:131-139) constituido por un conjunto de cerca de 200 genes de los cuales aproximadamente 40 codifican para los antígenos HLA. Las moléculas HLA de clase I presentan péptidos derivados de proteínas citosólicas, sintetizadas en el interior celular, para su reconocimiento por linfocitos T CD8, el antígeno es procesado por la vía denominada endógena o biosintética. El ensamble de las moléculas HLA de clase I es un proceso de naturaleza secuencial, en un orden cronológico específico lo cual permite un reporte continuo del contenido celular a los CTLs.
La respuesta específica de linfocitos T citotóxicos (CTLs) juega un papel predominante en el control del crecimiento tumoral, la misma ha sido observada en ausencia de respuesta clínica. La aparición de variantes menos antigénicas así como interferencias con el proceso de presentación antigénica puede afectar la capacidad de las células tumorales para ser dianas de CTLs al modular la sensibilidad de las células tumorales a los CTLs, como a la disminución de su actividad citotóxica.
Desde el último cuarto del siglo pasado es ampliamente conocido el hecho de que las células tumorales pueden perder la expresión de moléculas HLA de clase I por una gran variedad de mecanismos, durante la progresión tumoral (Festenstein, H. 1987. "The biological consequences of altered MHC expression on tumours". Br Med Bull. 43:217-227).
Su estudio retomó interés nuevamente en el inicio de la década de los 90, cuando fue puesto de manifiesto el papel de los antígenos de clase I del MHC en el reconocimiento de las células tumorales por CTLs (Crowley, N.,J., T.L. Darrow, M.A. Quinn-Allen, H.F. Sigler. 1991. "MHC-restricted recognition of autologous melanoma by tumor-specific cytotoxic T cells". Evidence for restriction by a dominant HLA-A allele. J Immunol 146:1692-1699) y la implicación de estas células efectoras en el establecimiento de la inmunoterapia específica de células T en el tratamiento del cáncer (Boon, T, P.G. Coulie, B. Van den Eynde. 1997. "Tumor antigens recognized by T cells". Immunol Today 18:267-268).
Los estudios iniciales de las moléculas HLA fueron difíciles de realizar, por la carencia de los reactivos adecuados. El desarrollo de la metodología de hibridomas y anticuerpos monoclonales conjuntamente con el advenimiento de las técnicas inmunohistoquímicas ayudó a caracterizar mejor estas alteraciones al poder analizar su expresión en tejidos criopreservados. El uso de anticuerpos que reconocían determinantes monomórficos, locus específicos y alelo específico en secciones criopresevadas de tumores permitió la identificación de distintos fenotipos de expresión alterada de moléculas HLA de clase I (Garrido, F., F. Ruiz-Cabello, T. Cabrera, J.J. Perez-Villar, M. Lopez-Botet, M. Duggan-Keen, P.L. Stern. 1997. "Implications for immunosurveillance of altered HLA class I phenotypes in human tumors". Immunol Today 18:89-95), (Ferrone, S., and F.M. Marincola. 1995. "Loss of HLA class I antigen by melanoma cells: Molecular mechanisms, functional significance and clinical relevance". Immunol Today 16: 487-494).
Estos estudios permitieron la clasificación de las alteraciones de las moléculas HLA clase I encontradas comúnmente en tejidos y líneas celulares tumorales, en fenotipos HLA alterados siendo los descritos hasta ahora el fenotipo I (pérdida total de expresión de antígenos HLA de clase I); fenotipo II (pérdida de haplotipo) fenotipo III (pérdida de expresión del locus); fenotipo IV (pérdida de expresión de alelos individuales). Algunos tumores pueden presentar fenotipos complejos que consisten en la combinación de uno o varios de los mecanismos antes mencionados (Fenotipo V) (Garrido, F., F. Ruiz-Cabello, T. Cabrera, J.J. Perez-Villar, M. Lopez-Botet, M. Duggan-Keen, P.L. Stern. 1997. "Implications for immunosurveillance of altered HLA class I phenotypes in human tumors". Immunol Today 18:89-95). Recientemente han sido descritos dos fenotipos nuevos: el fenotipo VI, en el que la célula tumoral es resistente a la acción del IFN-\gamma y el fenotipo VII caracterizado por baja regulación de moléculas HLA de clase I y expresión de moléculas HLA no clásicas (Fig. 1).
Los mecanismos moleculares generadores de los fenotipos alterados de las moléculas HLA de clase I son diversos, probablemente como consecuencia de la inestabilidad genética característica del proceso tumoral.
Las células tumorales exhiben frecuentemente pérdida total de expresión de los antígenos HLA de clase I (Fenotipo I) (12-40%), siendo encontrada en un 15% de melanomas, 12% de carcinoma laringeo, 14% de carcinomas colorectales, 40% de carcinomas de vejiga y un 25% de cáncer de mama (Garrido, F., T. Cabrera, A. Concha, S. Glew, F. Ruiz-Cabello, P.L. Stern. 1993. "Natural history of HLA expression during tumour development". Immunol Today 14: 491-499), (Garrido, F et al. 1995. "HLA class I antigens in human tumors". Adv Cancer Research, 67:155-95) siendo rápidamente detectada en la mayoría de los tumores mediante técnicas inmunohistoquímicas.
La ausencia total de expresión de moléculas HLA de clase I o Fenotipo I, puede estar asociado con defectos en la síntesis de la molécula \beta2-microglobulina, baja regulación de las proteínas LMP (low molecular weight protein) y/o TAP, (Chen, H.,L., D. Gabrilovich, R. Tampe, K.,R., Girgis, S., Nadaf, D., Carbone. 1996. "A functionally defective allele of TAP-1 results in loss of MHC class I antigen presentation in a human lung cancer". Nat Genet. 13: 210-213); pérdida de factores de transcripción y metilación de los genes HLA de clase I, lo que implica que todas las moléculas que participan en las distintas etapas de su biosíntesis son dianas probables para la generación de variantes tumorales HLA negativas como mecanismo de escape durante la tumorogénesis (Sette, A., R. Chesnut, J. Fikes. 2001. "HLA expression in cancer: implications for T cell-based immunotherapy". Immunogenetic 53:255-263); (Tait, B.,D. 2000. "HLA class I expression on human cancer cells: implications for effective immunotherapy". Hum Immunol 61:158-165). La ausencia total de expresión es observada en tumores con defectos de naturaleza transcripcional (reversibles tras tratamientos de citoquinas) que conllevan a la baja regulación de los componentes involucrados en el procesamiento antigénico (TAP1, TAP2, LMP2, LMP7), observados en líneas celulares tumorales de pulmón, próstata, y carcinomas renales. (Restifo N.P., F Esquivel, Y. Kawakami, J.W. Yewedell, J.J. Mule, S.A. Rosenberg, J.R. Bennink. 1993. "Identification of human cancers deficient in antigen processing". J Exp Med 177:265-272).
Uno de los mecanismos responsables mas claramente implicados, lo constituyen las mutaciones en el gen de la \beta2-microglobulina. Las mismas han sido descritas en cáncer de colón, en carcinoma de pulmón y en melanoma maligno metastásico (Bicknell D., C.,A., Rowan, WF Bodmer. 1994. Beta 2-microglobulin gene mutations: a study of established colorectal cell lines and fresh tumor. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91:4751); (Benitez R., D. Godelaine, M.A. Lopez-Nevot, F. Brasseur, P. Jimenez, M. Marchand, M.R. Oliva, N. van Baren, T. Cabrera, G. Andry, G. Landry, F. Ruiz-Cabello, T. Boon, and Garrido F. 1998. ``Mutations of the \beta2microglobulin gene result in a lack of HLA class I molecules on melanoma cells of two patients immunized with MAGE peptides. Tissue Antigens. 52: 520-529).
Las alteraciones moleculares descritas para este gen, van desde mutaciones puntuales (cambios en el patrón de lectura y la introducción prematura de codones de terminación) hasta deleciones, que afectan a ambas copias del mismo (Ruiz-Cabello, F., T. Cabrera, M.A. Lopez-Nevot, Garrido F. 2002. Impaired surface antigen presentation in tumors: implications for T cell-based immunotherapy''. Seminars in Cancer Biology. 12:15-24).
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Lo mas importante a destacar de esta alteración es su naturaleza de carácter irreversible a sustancias inmunomoduladoras como el IFN-\gamma, no siendo posible la recuperación de la expresión de las moléculas HLA de clase I en la superficie celular tras tratamientos con estas sustancias.
En estos casos, la restauración de la expresión de las moléculas HLA de clase I solo puede realizarse mediante la restauración de la copia normal de la \beta2-microglobulina.
En cuanto a los demás fenotipos HLA alterados, la pérdida de haplotipo(Fenotipo II) es probablemente el mecanismo mas frecuente que origina alteraciones HLA de clase I. Está ampliamente descrito en cáncer cervical con una frecuencia del 50% (Koopman, L.A., W.E. Corver, A.R. van der Slik, M.J. Giphart, G.J. Fleuren. 2000. "Multiple genetic alterations cause frequent and heterogeneous human histocompatibility leukocyte antigen class I loss in cervical cancer". J Exp Med 191:961-76), así como en melanoma y en páncreas (Marincola, F.M., P Shananuab, R. Alexander, J.R. Gnarra, R. Turetskaya, S.A Nedospasov, T.B. Simonis, J.K, Taubenberger, J. Yannelli, A. Mixon, N.P. Restifo, M. Herlyn and S.A. Rosernberg. 1994. "Loss of HLA haplotype and B locus down regulation in melanoma cell lines". J Immunol 153:1225-1237); (Torres, M.J., F. Ruiz-Cabello, A Skoudy, G Berrozpe, P Jiménez, A Serrano, FX Real, F Garrido. 1996. "Loss of an HLA haplotype in pancreas cancer tissue and its corresponding tumor derived cell line". Tissue Antigens. 47, 372-381). Esta alteración es el resultado de la pérdida de material genético, específicamente en el brazo corto del cromosoma 6 (6p), que da origen a la pérdida de heterozigocidad o LOH. La pérdida de material genético es debida a defectos en la segregación de los cromosomas en la división celular ocasionando pérdidas genéticamente variables e irreversibles de la region 6p21 (de Nooij-van Dalen, A.G., V.H. van Buuren-van Seggelen, P.H. Lohman, M. Giphart-Gassler. 1998 "Chromosome loss with concomitant duplication and recombination both contribute most to loss of heterozygosity in vitro" Genes Chromosomes Cancer 21:30-38); (Jimenez, P., Cantón, J., Collado, A., Cabrera, T., Serrano, A., Real, L.M., García, A., Ruiz- Cabello, F., Garrido F. 1999. "Chromosome loss is the most frequent mechanism contributing to HLA haplotype loss in human tumors". Int J Cancer. 83:91.
La pérdida de expresión selectiva de moléculas HLA de clase I puede ocurrir también al nivel molecular de un solo locus (Fenotipo III). Este fenotipo ha sido identificado en tejidos de cáncer colorectal, gástrico, y carcinomas de laringe mediante el empleo de anticuerpos locus específicos (López-Nevot M.A., F. Esteban, A. Ferron, F. Ruiz-Cabello, F. Garrido. 1989. "HLA class I expression on human primary tumors and autologous metastases: demostration of selective losses of HLA antigens on colorectal, gastric and laryngeal carcinomas". Br. J Cancer 59: 221-226). La baja regulación del locus HLA-B es frecuentemente reversible in vitro por incubación de las líneas celulares con IFN-\gamma, siendo el mecanismo molecular responsable aun no bien conocido. (Soong TW and K.M, Hui. 1992. "Locus specific transcriptional control of HLA genes". J Immunol. 149:2008-2020.
Una de las alteraciones más comunes es la pérdida específica de alelos HLA de clase I (Fenotipo IV). Entre los mecanismos descritos responsables de estas alteraciones se encuentran recombinación somática dentro del antígeno, mutaciones sin sentido, mutaciones que causan splicing aberrante del pre-mRNA, deleciones e inserciones (Serrano, A., C.S. Brady, P. Jimenez, M.F. Duggan-Keen, R. Méndez, P. Stern, F. Garrido, F. Ruiz-Cabello. 2000. "A mutations determining the loss of HLA-A2 antigen expression in a cervical carcinoma reveals novel splicing of human MHC class I classical transcripts both in tumoral and normal cells". Immunogenetics 51:1047-1052). Con excepción del Fenotipo III que es de naturaleza transcripcional, las demás alteraciones solo pueden recuperarse introduciendo la copia normal del gen alterado.
Importancia Biológica de las moléculas HLA de clase I y sus alteraciones en tumores Implicaciones en la Inmunoterapia
La generación de una respuesta inmune efectiva requiere un complejo número de eventos que involucran tanto el brazo humoral como el brazo celular de la respuesta inmune. Tal como hemos descrito anteriormente, la pérdida de los antígenos HLA de clase I en células tumorales impide el reconocimiento por parte de los CTLs. En el caso de las pérdidas alélicas, este tipo de alteración permite que el tumor escape del reconocimiento antigénico debido a una respuesta inmunodominante restringida por una sola molécula HLA de clase I y a su vez inhibir la respuesta de las células NK (Sette A, R Chesnut., J Fikes. 2001. "HLA expression in cancer: implications for T cell-based immunotherapy". Immunogenetic 53:255-63).
Varias estrategias han sido empleadas para incrementar la respuesta inmune contra las células tumorales de melanoma. En un principio se demostró que era posible generar una reactividad inmune específica mediante la inyección de células tumorales conjuntamente con bacterias o virus. Posteriormente, la identificación de péptidos provenientes de diferentes tumores humanos ha provisto las bases para la inmunoterapia activa antígeno específica y ha facilitado el diseño de nuevos esquemas de inmunoterapia (Renkvist, N., C. Castelli, P.F. Robbins, G. Parmiani. 2001. "A listing of human tumor antigens recognized by T cells". Cancer Immunol Immunother 50:3-15). La inmunoterapia activa tiene su fundamento en que los antígenos asociados a tumores pueden ser reconocidos por el sistema inmune de manera que al ser inyectados en pacientes con cáncer serian capaces de inducir una respuesta efectora tumor-específica, que pueda lograr la destrucción del cáncer, bien por la generación de una respuesta inmunológica o por la re-estimulación de la ya existente hacia el antígeno, mediante la generación o inducción de una expansión y/o activación clonal de células T y B.
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Algunos de los métodos utilizados para el tratamiento del cáncer se basan en péptidos tumorales reconocidos de manera específica por las células T. Sin embargo en ensayos clínicos en pacientes con melanoma, la falta de respuesta al tratamiento con péptidos MAGE se correlaciona con la presencia de mutaciones en el gen de la \beta2-microglobulina y la pérdida de moléculas HLA de clase I en la superficie de la célula tumoral (Benitez R., D. Godelaine, M.A. Lopez-Nevot, F. Brasseur, P. Jimenez, M. Marchand, M.R. Oliva, N. van Baren, T. Cabrera, G. Andry, G. Landry, F. Ruiz-Cabello, T. Boon, and Garrido F. 1998. ``Mutations of the \beta2microglobulin gene result in a lack of HLA class I molecules on melanoma cells of two patients immunized with MAGE peptides. Tissue Antigens. 52: 520-29). La ausencia de expresión o la baja regulación de antígenos HLA de clase I en las células tumorales puede llevar a la ausencia de un respuesta clínica de esta inmunoterapia con péptidos.
El éxito en el establecimiento de la inmunoterapia como tratamiento del cáncer requiere la comprensión de las relaciones establecidas entre el sistema inmune y el tumor en sus distintas etapas de transformación, invasión y generación de metástasis (Pardoll D. 2003. "Does the immune system see tumor as foreign or self". Annu. Rev Immunol. 21:807-39).
Hasta el momento, las vacunas de melanomas son las que han recibido más atención. Entre las vacunas que se utilizan en ensayos clínicos podemos encontrar: lisados celulares íntegros (Melacine) Sosman, JA, V.K. Sondak. 2003. "Melacine: an allogeneic melanoma tumor cell lysate vaccine". Expert Review of Vaccines 2:353-68), células de melanoma autólogas tratadas con haptenos (M-Vax) (Berd D. 2002. "M-Vax: an autologous, hapten-modified vaccine for human cancer". Expert opin Biol Ther 2:335-42), y células alogénicas irradiadas (CancerVax) (Morton DL, LJ Foshag, DS Hoon, JA Nizze, E Famatiga, LA Wanek, C Chang, DG Davtyan, RK Gupta, R Elashoff, et al. 1992. "Prolongation of survival in metastatic melanoma after active specific immunotherapy with a new polyvalente melanoma vaccine". Ann Surg. 216:463-82).
No obstante, en numerosos protocolos llevados a cabo en inmunoterapia con gran número de pacientes, la respuesta obtenida al tratamiento ha sido aproximadamente de apenas de un 3%. (Rosenberg, S., Yang, J.C., and Restifo, N.P. 2004 Cancer immunotherapy: moving beyond current vaccines. Nat Med. 10: 909-915).
Este resultado puede ser debido a la generación de mecanismos de escape al sistema inmune generados por el tumor. (Marincola, F.,M., E. Jaffee, D. Hicklin, S. Ferrone. 2000. "Escape of Human Solid Tumors from T-Cell Recognition: Molecular Mechanisms and Functional Significance". Advances in Immunology 74:181-273).
Dentro de estos mecanismos de escape se encuentran las alteraciones HLA de clase I. Estas alteraciones se han clasificado de acuerdo al grado de reversibilidad dada la repercusión que pueden tener en las opciones de tratamiento incluida la inmunoterapia. En el caso de las alteraciones reversibles, con trastornos en la transcripción, estas pueden ser revertidas administrando citocinas tales como los interferones. En el caso de alteraciones HLA de clase I generadas a partir de daños estructurales, éstas solo pueden ser restauradas mediante la corrección del daño genético y solamente, ser recuperadas mediante la restitución del gen salvaje que codifica las moléculas HLA. Por todo ello, los métodos de terapia génica podrían aplicarse en el complejo tratamiento del cáncer incrementando las opciones de tratamiento en la inmunoterapia.
En este sentido, hace ya tiempo que se esta intentando restaurar la expresión normal de proteínas HLA de clase I en diferentes células tumorales. Los primeros hallazgos se presentaron en los años 80 y se hicieron en los primeros modelos murinos en los que se habían descrito defectos en el MHC. La primera descripción de una pérdida de una especificidad privada H-2Kk se produjo en el linfoma Gardener, derivado de un ratón C3H (Garrido F and Festenstein. Further evidence for depression of H-2 and Ia-like specificities of foreign haplotypes in mouse tumour cell lines. Nature, 1976, 261:705-07).
En líneas celulares humanas resultados similares fueron encontrados en líneas celulares negativas para la expresión de molecular HLA de clase I producto de una alteración de las dos copias del gen de la \beta2-microglobulina. Al transfectar con este gen las células tumorales recobraban la capacidad de presentar peptidos antigénicos y de ser reconocidos de manera especifica por linfocitos T citotóxicos (Paschen A, R.M. Méndez, P. Jiménez, A. Sucker, F. Ruiz-Cabello, M. Song, F. Garrido, D. Schadendorf. Int J Cancer. 103:759-67). Estos ensayos han sido realizados in vitro con plásmidos, que tienen el incoveniente de ser bastante inespecíficos para la terapia génica dirigida al tumor y son menos eficientes que los vectores virales.
En esta invención el objeto es diseñar una vacuna que pueda ser empleada especificamente en tumores humanos, estudiando previamente las alteraciones de los genes HLA presentes en el tumor, ya que la pérdida de estas moléculas compromete la inmunogenicidad y sensibilidad de la célula tumoral frente al sistema inmune. El objetivo principal de esta invención es la restauración de la capacidad antigénica en tumores con pérdida total de moléculas HLA de clase I debida a mutaciones en la \beta2-microglobulina, mediante la restitución de este gen a través del uso de vectores adenovirales portadores del gen de la \beta2-microglobulina.
Los vectores virales son sistemas biológicos derivados de virus desarrollados naturalmente capaces de transferir su material genético a las células huésped. Muchos virus, incluyendo retrovirus, adenovirus, herpes simple (HSV), lentivirus y pox virus han sido modificados para eliminar su toxicidad y mantener su alta capacidad de transferir genes.
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Las células eucarióticas pueden, bajo condiciones optimas, tomar DNA exógeno, parte del cual comienza a localizarse en el núcleo. Este proceso es, sin embargo, generalmente insuficiente para la terapia génica, dirigida al tumor. Los adenovirus son candidatos atractivos para las aplicaciones en la terapia génica, siendo como vectores seguros y ademas de que pueden realizarse purificaciones con altas dosis o altos títulos de virus recombinantes purificados, los cuales pueden infectar eficientemente un amplio rango de células in vitro e in vivo (Curiel DT. et al. 1996. "Gene therapy approaches for inherited and acquired lung diseases". Am J Respir Cell Mol Biol. 14:1-18). El adenovirus es un virus con DNA de doble cadena, que contiene un genoma de 36 kb que consta de genes que codifican proteínas reguladoras tempranas y proteínas estructurales tardías (Dobbelstein, M. 2004. "Replication adenoviruses in cancer therapy". Curr Top Microbiol Immunol.; 273:291-334).
A la primera generación de adenovirus recombinantes se le quita la región reguladora temprana El, cuya función, normalmente, es activar otros genes virales. Esto inhabilita al virus para replicarse. Generalmente también se elimina la región E3, para obtener espacio para el inserto (Trapnell BC, Gorziglia. 1994. M Gene therapy using adenoviral vectors. Curr Opin Biotechnol., 5(6):617-625).
Esta ingenieria conlleva el reemplazar la parte codificante de las proteínas estructurales del genoma viral con genes marcadores (ej. \beta-gal, GFP) o genes terapéuticos de cDNA. El virus no se integra dentro del cromosoma, sino que permanece como un episoma en el núcleo. Se ha creado una segunda y tercera generación de adenovirus. En estos vectores, se eliminan más proteínas codificadas por la región que tiene la secuencia E4 (y posiblemente la E2), para reducir la expresión de las proteínas virales. Los adenovirus humanos se han usado para la transferencia génica en humanos in vivo en células nasales y pulmonares (CFTR cDNA), células endoteliales, de riñón, de corazón, de hígado, del sistema nervioso central, de músculo, hematopoyéticas y cancerosas. (Puumalainen AM et al., 1998. Beta-galactosidase gene transfer to human malignant glioma in vivo using replication-deficient retroviruses and adenoviruses. Hum Gene Ther. 9:1769-74).
Breve descripción de las figuras
Figura 1. Fenotipos alterados de expresión de las moléculas HLA de clase I descritos en tumores. Una célula normal expresa 6 alelos diferentes de las moléculas HLA de clase I. En los procesos de transformación tumoral, estas moléculas pueden desaparecer. Según este patrón se han descrito 7 fenotipos diferentes. El fenotipo I corresponde a la pérdida total de expresión en la superficie celular de las moléculas HLA de clase I. El fenotipo II se caracteriza por la pérdida de expresión de un haplotipo HLA de clase I. El fenotipo III consiste en la pérdida de un locus (A, B o C). En el fenotipo IV se pierde solamente un alelo HLA de clase I. El fenotipo V o compuesto se caracteriza por la combinación de dos fenotipos. El fenotipo VI es la ausencia de incremento de las moléculas HLA de clase por resistencia al IFN gamma. El fenotipo VII consiste en la baja regulación de moleculas HLA de clase I y la sobre expresión de moléculas no clásicas (HLA-G o HLA-E).
Figura 2. Esquema del vector adenoviral (AdCMV b2m) construido mediante el sistema Cre-lox. El vector adenoviral AdCMVb2m fue generado mediante el sistema Cre-lox, portando la secuencia del gen de la b2 microglobulina indispensable para la expresión de moléculas HLA de clase I. Con este virus se infectó la línea celular de melanoma E-109. Esta línea posee una ausencia total de expresión de las moléculas HLA de clase I debido a mutaciones en el gen de la \beta2 microglobulina. La línea celular recuperó la expresión de moléculas HLA de clase I a las 48 horas. El máximo nivel de expresión se obtuvo a las 96. Esta expresión se mantuvo hasta el noveno día, decreciendo lentamente hasta el día 12 y siendo negativa el día 17.
Descripción detallada de la invención
La identificación de las alteraciones HLA de clase I será realizada en el tumor del paciente, empleando técnicas previamente estandarizadas que permitiran evaluar rápidamente y de manera sistemática, la expresión de las moléculas HLA en la célula tumoral. En primer lugar se utilizarán anticuerpos monoclonales (técnica de inmuhistoquímica) en tejidos criopreservados.
La metodología molecular es desarrollada en varios pasos:
Obtención del RNA/DNA
El análisis se realizará sobre células tumorales. El RNA celular total se obtendrá con Ultraspec (Biotex Laboratories, Houston, Texas), siendo posteriormente utilizado para los estudios de expresión mediante la síntesis de cDNA. Esta se realizará con Kit Reverse Transcription System (Promega) y mRNA (2 \mug) La reacción es incubada en un termociclador a 42ºC durante 60 minutos y a 95ºC durante 5 minutos, amplificándose posteriormente por RT-PCR usando primeros específicos para la \beta2-micrglobulina humana. El DNA genómico del tumor y de los linfocitos sanguíneos se aislará utilizando extracción con fenol y proteinasa K y precipitación salina. El DNA se amplificarán por PCR utilizando primers específicos que incluyen la región codificante del gen de la \beta2-microglobulina.
Construcción de vectores adenovirales recombinantes
Como ejemplo del procedimiento estandar de generación de adenovirus se describe la producción del Ad-CMV \beta2-microglobulina, bajo el control del promotor de CMV y empleando el sistema de recombinación Cre-lox (Hardy, S., M. Kitamura, T. Harris-Stansil, Y. Dai, and M. L. Phipps. 1997. "Construction of adenovirus vectors through Cre-lox recombination". J Virol 71:1842-49). Para la donación del gen de la \beta2-microglobulina el RNA celular total se obtuvo con el método de Ultraspec (Biotecx Laboratories, TX, USA) de PBLs humanos normales positivos para la expresión de moléculas HLA clase I. A partir de 2 \mug se realizó la técnica de transcripción inversa reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR) utilizando un termociclador (MJ research) para obtener y amplificar el ADN complementario de la \beta-2 microglobulina. El ARN total fue transcrito (60 minutos a 42ºC) con 400 unidades de M-MuLV transcriptasa reversa (Promega) en un volumen final de 20 \mul. Después de desnaturalizar la transcriptasa reversa (95ºC 1 minuto), el ADN complementario se diluyo a un cuarta con agua pentadestilada y 2 \mul de esta solución fueron empleados para la amplificación de la (32-microglobulina, con primers específicos diseñados para el cDNA de este gen y que tenían incorporados los sitios de restricción de las enzimas de restricción HindIII y Bam HI. (Primer Fw: 5'-aagcttgccaccatgtctcgctccgtggccttag-3', Primer Bw: 5'-ggatcctgcggcatcttcaaacctccatg-3'). 40 \mul del producto de PCR fueron separados mediante electroforesis en un gel de agarosa al 1,5% (p/v) teñido con bromuro de etidio. La banda obtenida se visualizó con una lámpara de luz ultravioleta, se comprobó su tamaño, se cortó y extrajo del gel, y el producto de la PCR se purificó mediante el kit de purificación de DNA, GENECLEAN (Q.BIO gene). El fragmento de 415 pares de bases correspondiente al cDNA de la \beta-2 microglobulina (Secuencia I) se clonó en el plásmido pCR4-TOPO (TOPO TA cloning Kit), directamente a partir de la PCR purificada según las indicaciones del KIT. Con el resultado de dicha ligación se transformaron bacterias competentes E. coli DH5\alpha-T1 (Invitrogen, Carlsbad), las bacterias transformadas se seleccionaron por su crecimiento en placas de Petri con medio LB con ampicilina, ya que el vector contiene un gen de resistencia a este antibiótico. Se extrajo el DNA plasmídico de las bacterias positivas mediante la técnica de MiniPrep (Qiagen, Alemania) para, posteriormente, digerir 2 \mug de dicho plásmido con las enzimas HindIII y BamHI (Roche Diagnostics) y separar por electroforesis el resultado de dicha digestión en un gel de agarosa al 1,5% para comprobarla presencia del inserto. Los plásmidos con el fragmento de 415 pares de bases esperado se secuenciaron para descartar errores en la amplificación en un secuenciador automático ABIPRISM 310 (Perkin Elmer, Foster, CA, USA), utilizando el kit de secuenciación Dye RhodamineTerminator Cycle Sequencing Kit (Perkin Elmer) coincidiendo con lo reportado en la bibliografia. Una vez comprobada la presencia del inserto adecuado, con 2 \mug de dicho plásmido se realizó una digestión con las enzimas de restricción HindIII y BamHI (RocheDiagnostics), el producto de la digestión se analizó en un gel de agarosa al 1,5%, la banda conteniendo el fragmento con el cDNA de h\beta-2 microglobulina se purificó con el Kit de purificación de DNA Ultrafree-DA (Amicon-Milipore). El cDNA obtenido se subclonó por debajo de la secuencia del promotor de CMV y por encima de la señal de poli-A en el plásmido pAdlox que contiene la señal de empaquetamiento del adenovirus (\Psi5) y el sitio loxP. Para ello, el plásmido pAdLox, fue previamente digerido con las enzima HindIII y BamHI, (Roche Diagnostics), cuyos sitios de corte se encuentran presentes en las posiciones 1163 y 1193 del vector pAdlox y tratado con fosfatasa alcalina (Roche Diagnogtics), mediante una ligación de extremos cohesivos a temperatura ambiente durante 5 minutos con la T4 DNA ligasa y el Kit de ligación de Invitrogen. Con el resultado se transformaron bacterias competentes E. coli DH5\alpha-T1 (Clontech, Palo Alto, CA, USA) se seleccionaron las resistentes a ampicilina y se purificó el DNA plasmídico de colonias seleccionadas siguiendo las técnicas descritas anteriormente. Se realizó un screening mediante una nueva digestión con las enzimas de restricción HindIII y BamHI (Roche Diagnostics) y el producto se separo en un gel de agarosa al 1,5% para comprobar la presencia y orientación del inserto (cDNA de \beta2-microglobulina humana).
El adenovirus recombinante Ad CMV b2-microglobulina, se generó por cotransfección de pAdloxb2m y \Psi5 (DNA adenoviral defectuoso en El-E3) en la línea celular que expresa 293 la recombinasa Cre (CRE8). La línea celular selectiva CRE8 tiene un cassette de expresión conducido por la actividad de la \beta-actina dando lugar al gen de la recombinasa Cre con una señal N-terminal de localización nuclear establemente integrada en las células 293 (células de riñón embrionario humano transformadas con El adenoviral) Qian, C., M. Idoate, R. Bilbao, B. Sangro, 0. Bruna, J. Vazquez, and J. Prieto. 1997. "Gene transfer and therapy with adenoviral vector in rats with diethylnitrosamine-induced hepatocellular carcinoma". Hum Gene Ther 8:349-58).
La recombinasa Cre cataliza la recombinación del sitio loxP que generó AdCMV-b2 microglobulina. Las células CRE8 se cotransfectaron con CaPO4 con el pAdlox/b2-microglobulina previamente digerido con la enzima SfiI y el ADN viral procedente del \Psi5.
Pasados 10 días, el lisado de las células cotransfectadas se usó para infectar las células CRE8 llevando a cabo varios pases, con el objeto de eliminar la contaminación con el virus \Psi5 que no se haya recombinado. El lisado celular del último pase se clonó por dilución límite en placas de 96 pocillo en monocapas de células 293 para obtener una sola partícula viral. Para ello se empleará el método de dilución límite, utilizando el pocillo donde se observe una única placa lítica por la acción del virus en las células 293. Esta única partícula será expandida en estas mismas células hasta un total de 20-40 placas (15 cm de diámetro) para amplificar el AdCMVb2 microglobulina correspondiente. El DNA viral empaquetado se preparará como se describe en Hardy et al., 1997. (Hardy, S., M. Kitamura, T. Harris-Stansil, Y. Dai, and M. L. Phipps.1997. "Construction of adenovirus vectors through Cre-lox recombination". J Virol 71:1842-49).
Brevemente, una vez seleccionado el pocillo con un único virus, se expandirán en células 293. La purificación del virus se realizará por ultracentrifugación en gradiente doble de cloruro de cesio (Qian, C., M. Idoate, R. Bilbao, B. Sangro, O. Bruna, J. Vazquez, and J. Prieto. 1997. "Gene transfer and therapy with adenoviral vector in rats with diethylnitrosamine-induced hepatocellular carcinoma". Hum Gene Ther 8:349-58).
Los virus purificados se dializarán en 10 mM Tris/1 mM MgCl2 y se almacenarán a -80ºC hasta su uso en experimentos de transfección. Los adenovirus empleados para terapia serán elaborados con todos los requerimientos de bioseguridad establecidos. El adenovirus que contiene los genes control humanizados GFP bajo el control del promotor de CMV (AdCMVhGFP), así como pAdloxGFP, se producirán como vectores control.
El medicamento derivado de la presente invención se destina al tratamiento de un cáncer en los mamíferos, más particularmente en el hombre. Puede permitir el tratamiento de tumores secundarios que son unas complicaciones frecuentes presentadas en numerosos tipos de cáncer y para las que actualmente no existe una terapia satisfactoria. El medicamento puede administrarse por inyección directa en el lugar del tumor mediante seguimiento ecográfico. De una forma general, la administración puede producirse en una dosis única o repetida, uno o varia veces después de un determinado intervalo de tiempo.
Según una forma de realización preferida de la invención, el medicamento comprenderá, además una cantidad terapéuticamente eficaz de dicho vector viral, un soporte aceptable desde un punto de vista farmacéutico. Puede asimismo comprender un vehículo, un diluyente o un adyuvante aceptable desde un punto de vista farmacéutico y presentarse en forma líquida o liofilizada.
Ejemplos Tratamiento de las líneas celulares con alteraciones en la \beta2-microglobulina con el AdCMV\beta2-microglobulina
Se han realizado ensayos in vitro en líneas celulares tumorales previamente estudiadas en nuestro laboratorio en las que se conoce con precisión el tipo alteración HLA que presentan. Varios ejemplos de las mismas están constituidos por: las líneas celulares E-038, (Benítez R, y cols., Tissue Antigens, 52:520, 1998) y E-109 (UKRV-me12) (Paschen et al, Int. J. Cáncer, 103:759, 2003) que presentan pérdida total de moléculas HLA de clase I (fenotipo I) debido a mutaciones y a LOH de la \beta2microglobulina. Estas líneas celulares se transfectaron con el gen salvaje de la \beta2m recuperándose la expresión de las moléculas HLA de clase I en las mismas (Fig. 2).
Procedimiento
Las líneas celulares tumorales provenientes de diferentes estirpes celulares, son previamente sembradas en placas de 6 pocillos a una confluencia de un 70-80%. Las líneas fueron infectadas a una MOI de 100 (100 partículas virales por célula), en medio RPMI o Dulbeco al 2% de suero fetal. Tras 48 horas de infección las células fueron levantadas mediante lavado con PBS-EDTA y se analizó la expresión de la \beta2-microglobulina u otra molécula HLA de clase I en la superficie celular mediante el uso de anticuerpos monoclonales específicos para esta molécula y para la expresión de HLA de clase I tales como el GRH-1 y el W6/32 respectivamente. Se realizará mediante la técnica de inmunofluorescencia indirecta y citometría de flujo empleando un amplio panel de AcMos contra antígenos HLA de clase I. Para estudiar la expresión de los alelos será imprescindible conocer con anterioridad el tipaje HLA de clase I.
Un resultado positivo es representado en la figura 2 donde la célula de melanoma UKRV-mel 1 inicialmente negativa para la expresión de moléculas HLA de clase I, pasa a expresar estas moléculas tras 48 horas manteniendo la expresión de las mismas hasta 12 días tras ser infectado con el virus Ad CMV \beta2-microglobulina.
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<110> FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN BIOSANITARIA DE ANDALUCÍA ORIENTAL - ALEJANDRO OTERO
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GARRIDO, FEDERICO
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<120> RESTAURACIÓN DE LAS MOLÉCULAS HLA DE CLASE I MEDIANTE TERAPIA GÉNICA EMPLEANDO VECTORES ADENOVIRALES
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<130> HLA clase I
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<140> 200701222/7
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<150> 200701222/7
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<151> 2007-04-26
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<160> 4
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<170> PatentIn version 3.3
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<210> 1
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Claims (5)

1. Construcción génica recombinante para estimular la respuesta antitumoral citotóxica que consiste en un sistema de expresión el cual incluye un vector viral portador de una secuencia polinucleotídica que codifica el gen de la \beta2-microglobulina, caracterizado porque el vector viral es un adenoviruso un virus adeno-asociado y porque la secuencia polinucleotídica presenta al menos un 85% de homología con la secuencia SEQ ID NO 1.
2. Construcción génica recombinante para estimular la respuesta antitumoral citotóxica según la reivindicación 1, caracterizado porque la secuencia polinucleotídica presenta al menos un 90% de homología con la secuencia SEQ ID NO 1.
3. Construcción génica recombinante para estimular la respuesta antitumoral citotóxica según la reivindicaciones 1 y 2, caracterizado porque la secuencia polinucleotídica presenta al menos un 95% de homología con la secuencia SEQ ID NO 1.
4. Construcción génica recombinante para estimular la respuesta antitumoral citotóxica según la reivindicaciones 1-3, caracterizado porque la secuencia polinucleotídica es la SEQ ID NO 1.
5. Uso de la construcción génica recombinante según las reivindicaciones 1-4 para la preparación de una vacuna antitumoral que consiste en una cantidad terapéuticamente efectiva de dicha construcción génica recombinante y un soporte farmacéuticamente aceptable.
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