ES2294804T3 - Antibioticos sinteticos. - Google Patents
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Abstract
LAS COMPOSICIONES DE LA PRESENTE INVENCION ESTAN DESTINADAS A INHIBIR LA PROLIFERACION DE MICROORGANISMOS, ESPECIALMENTE HONGOS. DICHAS COMPOSICIONES ESTAN COMPUESTAS DE ANTIBIOTICOS SINTETIZADOS QUIMICAMENTE QUE COMPRENDEN CIERTOS ACIDOS AMINADOS. SE DESCRIBEN TAMBIEN UNOS PROCEDIMIENTOS DE IDENTIFICACION DE COMPOSICIONES DE ANTIBIOTICOS ESPECIFICOS PROCEDENTES DE BIBLIOTECAS QUE COMPRENDEN DICHAS COMPOSICIONES, ASI COMO PROCEDIMIENTOS DE PREVENCION DE LA PROLIFERACION MICROBIANA EN LAS PLANTAS Y EN LOS ANIMALES.
Description
Antibióticos sintéticos.
La invención se refiere a composiciones químicas
sintéticas y a procedimientos de ensayo de dichas composiciones
para determinar qué composiciones inhiben el crecimiento fúngico.
Las composiciones de la invención pueden utilizarse para prevenir,
limitar o de otra manera tratar los daños fúngicos a los cultivos
agrícolas y hortícolas, particularmente a semillas y productos
agrícolas, incluyendo plantas maduras, tales como árboles. Ciertas
composiciones y procedimientos de la invención pueden utilizarse
para tratar enfermedades fúngicas no vegetales, tales como las de
animales, incluyendo el ser humano. Las composiciones de la
invención resultan especialmente útiles en el caso de condiciones
que propician el desarrollo de enfermedad fúngica y en las que el
control del crecimiento fúngico se consigue preferentemente con
composiciones que no son tóxicas para las células no fúngicas.
Un problema común en la agricultura es la
reducción del rendimiento y la pérdida de la cosecha causada por
microorganismos patogénicos de las plantas. Por ejemplo, en Texas,
las enfermedades del arroz, soja y algodón causadas por
microorganismos patogénicos de plantas se estima que redujeron las
producción del Estado en 15%, 13% y 27% en 1992, respectivamente.
Además de las pérdidas de cultivos extensivos, también se producen
pérdidas por enfermedad en plantas hortícolas y plantas silvícolas.
La contaminación por hongos posterior a la recolección también
puede conducir a la reducción del rendimiento y de los valores
posteriores a la recolección del producto vegetal. Entre las
estrategias actuales para el control de enfermedades se incluyen la
plantación de cultivares resistentes y la utilización pesticidas y
fungicidas conocidos.
Por desgracia, muchos de los compuestos químicos
antifúngicos más efectivos muestran una persistencia no deseable en
el medio ambiente. En otros casos, dichos compuestos químicos
presentan una especificidad reducida para el organismo diana. En el
caso de que resulten afectados organismos no diana por dichos
compuestos químicos de especificidad reducida, no resulta
infrecuente observar actividad biológica no deseada, incluyendo
toxicidad humana (teratogenicidad, mutagenicidad, carcinogenicidad,
etc.). La preocupación pública sobre la utilización de productos
químicos externos en el medio ambiente proporciona un potente
incentivo para el desarrollo de procedimientos alternativos de
control de los hongos.
Entre las infecciones fúngicas agrícolas se
incluyen enfermedades tanto vasculares como no vasculares. En el
caso de las enfermedades no vasculares, pueden producirse
condiciones tales como la peste de los semilleros y la podredumbre
de las raíces. La peste de los semilleros (un síntomas de ataque
patogénico del tejido de las semillas, por ejemplo de ataque
fúngico) se produce como resultado del daño a las semillas y raíces
de las plántulas durante la germinación, antes o después de la
emergencia del suelo. Las semillas que experimentan peste de los
semilleros no consiguen germinar, se ablandan, se encogen y
finalmente se desintegran. La podredumbre de las raíces
postemergencia debida a la infección por patógenos del tejido de la
planta también es responsable de grandes reducciones de viabilidad
de las plantas cultivadas.
Se ha intentado controlar la peste de los
semilleros y la podredumbre de las raíces mediante la cría de
plantas resistentes, con éxito variable. Sin embargo, no se han
desarrollado cultivares completamente resistentes y las
enfermedades microbianas siguen siendo una causa importante de
pérdida de cosecha. Esta pérdida resulta especialmente evidente en
los ambientes de crecimiento húmedos, o donde se planta
repetidamente en las mismas parcelas. Algunas prácticas culturales
mejoradas, aunque de algún valor, de manera similar no consiguen
proporcionar una mejora suficiente.
Por ejemplo, los plátanos (familia
Musaceae) son el fruto tropical más importante del mundo, con
una producción anual superior a 62 millones de toneladas (si se
incluye el plátano macho). Para el crecimiento adecuado de estas
hierbas perennes de gran tamaño, se requiere una humedad elevada
constante y temperatura tropical (16ºC a 35ºC). Estas mismas
condiciones también resultan altamente conducentes a enfermedades
importantes, tales como la enfermedad de
banana-panama, enfermedad Sigatoka, raya negra de la
hoja/Sigatoka negra, enfermedad Moko, enfermedad de la cabeza negra
y virus del cogollo racemoso del plátano. La enfermedad Panama está
causada por Fusarium oxysporum f.sp. cubense (razas
1, 2 y 4). La raya negra de la hoja/Sigatoka negra está causada por
Mycosphaerella fijiensis. La enfermedad Moko está causada por
Pseudomonas solanacearum.
El control biológico de las enfermedades
fúngicas en plantas ha sido investigado con anterioridad. Ver, por
ejemplo, las patentes US nº 4.942.032 y nº 4.906.611. Estas patentes
dan a conocer la producción y utilización de un producto
antifúngico de origen natural ("AFP") producido a partir de
especies de Pediococcus para el control de enfermedades
posteriores a la cosecha, incluyendo la podredumbre causada por
Mucor, moho gris y moho azul en fruta. La patente US nº
5.244.680 da a conocer la utilización de diversas especies de
Cryptococcus para prevenir el deterioro posterior a la
cosecha de la fruta. La patente US nº 5.049.379 da a conocer la
utilización de un fungicida aislado a partir de Bacillus
cereus, o la utilización del organismo mismo para controlar la
infección de determinadas legumbres por Phytophthora
megasperma f. sp. medicaginis y Phytophthora
megasperma f. sp. glycinea. La utilización de agonistas
microbianas para inhibir el crecimiento de hongos patogénicos, sin
embargo, presenta severas limitaciones. Los efectos antagonistas
del agente de control dependen del establecimiento y control del
agente en el nicho ecológico particular en el que se encuentra el
patógeno. Dicho establecimiento puede verse afectado por factores
tanto abióticos como bióticos y el posterior crecimiento del
microorganismo antagonista que, a su vez, afecta a la producción
del agente antifúngico.
Otras investigaciones se han centrado en el
aislamiento de compuestos antifúngicos de origen natural procedentes
de especies de Pseudomonas. Un aislado de
Pseudomonas, L-22-64 y de la
levadura F-43-31 es capaz de
controlar el moho azul de las manzanas (W.J. Janisiewicz,
Phytopathology 78:194-198, 1988). Se ha identificado
el agente antifúngico como pirrolnitrina (W.J. Janisiewicz y J.
Poitmann, Phytophatology 78:1697-1700, 1988). Entre
otros ejemplos de compuestos producidos naturalmente que presentan
actividad antifúngica se incluyen: fenacina, floroglucinol y
pioluteorina. En muchos casos, el componente activo de los agentes
antifúngicos naturales no ha sido identificado ni caracterizado por
completo. Debido a que muchos de estos agentes antifúngicos
producidos naturalmente se encuentran pobremente caracterizados en
el mejor de los casos, se desconoce cuál es el nivel de
persistencia y de toxicidad de estos compuestos en el medio
ambiente. Además, el hecho de que estos compuestos sean producidos
por microbios en el medio ambiente sugiere que podrían presentar un
espectro limitado de actividad antimicrobiana.
Existen péptidos que son efectores de una
diversidad de procesos fisiológicos y pueden actuar como
antimicrobianos inhibiendo el crecimiento de hongos y de otras
células microbianas. Se han aislado de semillas de rábano varios
péptidos antifúngicos ricos en cisteínas. Estos péptidos, con
longitudes comprendidas entre 23 y 30 aminoácidos, presentan
diversas actividades antifúngicas contra Alternaria brasicola,
Botrytis cinerea, Fusarium culmorum, Pyricularia oryzae, Fusarium
oxysporum y Verticillium dahliae (Terras et al.,
FEBS Letters 316:233, 1993; Terras et al., J. Biol. Chem.
267:15301, 1992). Los péptidos ricos en cisteínas también han sido
aislados a partir de semillas de Mirabilis jalapa. Estos
péptidos presentan actividad antifúngica contra Alternaria
brassicola, Ascochyta pisi, Botrytis cinerea, Cercospora beticola,
Colletotrichum lindemuthianum, Fusarium culmorum, Fusarium
oxysporum, Nectria haematocca, Phoma betea, Pyrenophora
tritici-repentis, Pyricularia oryzae, Rhizoctonia
solani, Verticillium dahliae y Venturia inaequalis. Los
péptidos también inhibieron el crecimiento de varias bacterias
Gram-positivas (B.P.A. Cammue, J. of Biol. Chem.
267:2228, 1992). Se han aislado otros péptidos ricos en cisteínas
de las semillas de Amaranthus caudatus (W.F. Broekaert et
al., Biochemistry 31:4308, 1992). Sin embargo, el contenido de
cisteínas de estos péptidos si se producen sintéticamente
probablemente resultará en la polimerización del monómero péptido en
agregados de dos o más monómeros. Estos agregados presentan una
actividad antifúngica desconocida. De esta manera, la formación de
agregados puede resultar en niveles variables de actividad y de
especificidad.
Se han caracterizado con mayor detalle otros
péptidos antifúngicos de origen natural. Se ha aislado un derivado
de un dipéptido ("nitropeptina") con actividad inhibidora del
crecimiento contra Pyricularia oryzae. El dipéptido se
purificó a partir de Streptomyces xanthochromogenus (K. Ohba
et al., The Journal of Antibiotics
40:709-713, 1986). Se cree que la nitropeptina es un
inhibidor competitivo del metabolismo del ácido glutámico durante
la síntesis de proteínas. Como tal, no resulta probable que sea un
antimicrobiano efectivo en condiciones de crecimiento ricas en
nutrientes o en organismos con capacidades de biosíntesis de ácido
glutámico. También se ha demostrado que un decapéptido cíclico
derivado naturalmente, la caloficina, muestra propiedades
antimicrobianas (S.S. Moon, J. Org. Chem. 57:1097, 1992). Se
descubrió que el péptido contenía varios aminoácidos modificados,
incluyendo un residuo ácido D-aspártico y un residuo
N-metil-asparagina y un residuo
ácido graso [ácido
(2R,3R,4S)-3-amino-2-hidroxi-4-metilpalmítico].
Sin embargo, los péptidos cíclicos son difíciles de sintetizar con
pureza elevada y/o a tasas de recuperación elevadas debido a la
química de la ciclización. Además, los péptidos antifúngicos de
Bacillus subtilis se ha demostrado que controlan la
podredumbre parda en melocotones (C.G. Guelderner et al.,
Journal of Agricultural and Food Chemistry
36:366-370, 1988). Los péptidos de origen natural,
tales como la nisina, así como los ácidos antibióticos de origen
natural, tales como el ácido propiónico, se han utilizado en la
conservación de alimentos. Sin embargo, se desconoce generalmente
el nivel de estabilidad ambiental y las toxicidades de dichos
compuestos de origen natural. Además, en el caso de que dichos
agentes antifúngicos se deriven de fuentes naturales, únicamente
uno de los dos estereoisómeros demuestra típicamente la actividad
antifúngica deseada.
La utilización de productos antifúngicos
naturales aislados en cantidad comercial a partir de microorganismos
resulta de utilidad limitada debido en gran parte a problemas de
purificación. Resulta necesario el cultivo celular a gran escala
del microorganismo productor del agente antifúngico para la
purificación del agente antifúngico. En muchos casos, el aislado
cultural responsable de la producción del agente antifúngico no es
un aislado de fácil cultivo por lotes o resulta totalmente imposible
cultivarlo por lotes (por ejemplo los patógenos obligados). Además,
con frecuencia se requieren estrategias complicadas de purificación
para purificar el producto activo hasta un nivel razonable de
homogeneidad. Una desventaja sustancial de la utilización de
agentes antifúngicos derivados naturalmente es el potencial de
copurificación de productos secundarios microbianos no deseados,
especialmente productos secundarios que resultan indeseablemente
tóxicos. En muchos casos, estos factores conducen a elevados costes
de producción y provocan que el aislamiento a gran escala de
productos antifúngicos a partir de aislados naturales no resulta
práctico. Las purificaciones pueden resultar todavía más difíciles
en el caso de que resulten posibles las mezclas racemizadas en las
que únicamente un estereoisómero es activo, o en el caso de que
resulten posibles los enlaces disulfuro entre monómeros péptido.
La búsqueda de productos antimicrobianos para la
utilización agrícola ha ido atrasada respecto a la búsqueda de
dichos productos para la medicina humana. Por ejemplo, los péptidos
sintéticos han emergido como herramientas de investigación útiles
en el desarrollo de vacunas en investigación biomédica (Pinilla, C.
et al., Vaccines 92:25, 1992). Dichos péptidos se han
utilizado para resolver detalles de las interacciones
antígeno-anticuerpo (Lerner, R.A., Nature 299:592,
1982), para mapear productos proteicos de genes específicos
cerebrales (Gramsch, C. et al., Neurochem. 40:1220, 1983) y
para preparar análogos óptimos de péptidos biológicamente activos
(Cull, M.G. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:865, 1992;
Furka, A. et al., Int. J. Pept. Protein Res. 37:487, 1991) y
en ensayos de microdilución para el desarrollo de nuevos péptidos
antimicrobianos (contra S. aureus, P. aeruginosa,
C. albicans) (Houghten et al., 1991; Houghten et
al., 1992a).
La patente US nº 5.245.535, incorporada a la
presente memoria como referencia, da a conocer la utilización de
péptidos y derivados de péptido para potenciar los efectos de los
antibióticos utilizados en terapias antimicrobianas estándares. Los
péptidos utilizados presentaban una longitud comprendida entre 14 y
50 residuos, eran de naturaleza necesariamente anfifílica y se
predice que presentan características de formación de canales
iónicos. Se sugiere que estos péptidos podrían funcionar
desestabilizando las membranas celulares. Los péptidos dados a
conocer están compuestos de secuencias tetraméricas de motivos
definidos. El motivo incluye dos residuos hidrofóbicos contiguos y
por lo menos un residuo básico, mientras que el residuo restante
puede ser básico o neutro. Los residuos hidrofóbicos deben ser
contiguos. Aunque se han determinado los modos de acción de
determinados péptidos (ver, por ejemplo, Fiedler et al.,
1982; Isono y Suzuki, 1979), típicamente no se han determinado los
mecanismos que explican el modo de acción y especificidad de dichos
péptidos. En los casos en los que dichos estudios se han llevado a
cabo en la investigación fúngica, los estudios iniciales para
determinar el modo de acción antifúngica de los péptidos implicaban
un examen físico de los micelos y de las células para determinar si
los péptidos podían perturbar las funciones membranales responsables
del equilibrio osmótico, tal como se ha observado en otros péptidos
(Zasloff, M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
84:5449-5453, 1987). Entre otros modos potenciales
de acción podrían incluirse interrupciones de la síntesis o del
metabolismo macromolecular.
La patente US nº 5.126.257 da a conocer el
aislamiento y la utilización de un péptido de origen natural
derivado de extractos de leucocitos polimorfonucleares humanos
lisados. El agente activo elimina bacterias
Gram-positivas y Gram-negativas.
Sin embargo, se desconoce su actividad contra los hongos. La patente
US nº 4.725.576 da a conocer la utilización de péptidos para
combatir las infecciones fúngicas. Los péptidos contienen por lo
menos 14% de histidina. Se dan a conocer específicamente hexámeros
de histidina que controlan las infecciones por Candida
albicans y Streptococcus mutans.
Unos procedimientos desarrollados recientemente
permiten la preparación de bibliotecas combinatoriales de péptidos
sintéticos ("SPCL") compuestos de mezclas equimolares de
péptidos libres que pueden utilizarse en procedimientos in
vitro para determinar la bioactividad (Furka, A. et al.,
Int. J. Pept. Protein Res. 37:487, 1991; Houghten, R.A. et
al., Nature 354:84, 1991; Houghten, R.A. et al.,
BioTechniques 13:412, 1992). Las bibliotecas pueden estar
constituidos por estereoisómeros D o L de aminoácido o combinaciones
de aminoácidos L y D y/o aminoácidos de origen no natural. También
se conocen otros procedimientos para sintetizar péptidos de
secuencia definida. De manera similar, se conocen procedimientos
preparativos de gran escala. También se conocen determinados
procedimientos recombinantes de producción de péptidos (ver, por
ejemplo, la patente US nº 4.935.351). La publicación de solicitud
de patente PCT número WO9608264 da a conocer la utilización de
bibliotecas para identificar compuestos huérfanos útiles como
inhibidores del crecimiento fúngico. Sin embargo, dicho documento
no da a conocer las secuencias 32 a 47.
Las composiciones actuales para el control de
las infecciones por patógeno fúngico presentan una utilidad
limitada debido a su especificidad reducida, toxicidad humana y
persistencia en el medio ambiente. A pesar de lo anterior, debido a
la incapacidad de controlar suficientemente el crecimiento fúngico
por resistencia reproductiva y prácticas culturales, resulta
necesario encontrar agentes antifúngicos que no presenten dichas
características no deseables. La utilización de microbios para
controlar el crecimiento de los hongos en el medio ambiente resulta
difícil. La utilización de productos antifúngicos naturales en
cantidades comerciales a partir de microorganismos también presenta
una utilidad limitada debido en gran parte a problemas de
purificación, especialmente en el caso de que resulte necesario
purificar mezclas racemizadas. Además, la búsqueda de agentes
antifúngicos producidos naturalmente es un procedimiento que
requiere mucho tiempo y con una probabilidad de éxito muy reducida.
Incluso en el caso de que se localicen dichos péptidos de origen
natural, la síntesis del péptido puede resultar problemática (por
ejemplo formación de disulfuros, requisitos elevados de histidina,
etc.). Resultan necesarios procedimientos y composiciones que
proporcionen un medio para sintetizar y someter a ensayo con
facilidad composiciones antifúngicas que no adolezcan de las mismas
limitaciones que los péptidos de origen natural.
La presente invención supera las desventajas de
los fungicidas conocidos con anterioridad en los que las
composiciones de la invención son especies definidas químicamente
que se sintetizan y se purifican con facilidad. No dependen de la
estabilidad genética ni de las propiedades de crecimiento de los
microorganismos para la producción de los mismos. El tratamiento
antimicrobiano que utiliza las composiciones y los procedimientos de
la invención no requiere poner en contacto un producto agrícola con
microbios vivos, impredecibles. Además, los procedimientos y
composiciones de la presente invención proporcionan una serie de
diferentes compuestos antibióticos que se ha demostrado que
presentan una efectividad particular en el tratamiento de
enfermedades fúngicas de plantas y animales.
\newpage
Las composiciones de la invención resultan
efectivas en el control de las infecciones por patógeno fúngico
aunque demuestran un elevado grado de especificidad para los hongos
diana, toxicidad reducida y persistencia controlada en el medio
ambiente. Mediante la utilización de los procedimientos de la
invención resulta posible producir agentes antifúngicos en un
periodo de tiempo mucho más corto y con una probabilidad de éxito
considerablemente superior que el cribado de aislado naturales para
dicha actividad. Debido a que los procedimientos de la invención
pueden controlar la naturaleza química de los agentes antifúngicos
producidos de esta manera, la síntesis y la purificación de los
péptidos resulta mucho menos problemática (por ejemplo se elimina la
cisteína).
Las composiciones de la presente invención
comprenden péptidos de estructura química y características
conocidas. La utilización de D-aminoácidos
incrementa la estabilidad de algunos de estos compuestos al ser
insensibles a las rutas comunes de degradación biológica que
degradan los péptidos de L-aminoácidos. Por ejemplo,
los péptidos de L-aminoácidos pueden estabilizarse
mediante la adición de D-aminoácidos en uno o ambos
extremos del péptido. Sin embargo, se encuentran disponibles rutas
bioquímicas que degradarán incluso los D-aminoácidos
en estos péptidos, de manera que la persistencia medioambiental de
largo plazo no es un problema. Evidentemente, en el caso de que las
composiciones de la invención actúen con rapidez o no requieran
estabilización, los L-aminoácidos o mezclas de
L-aminoácidos y D-aminoácidos,
pueden resultar útiles. Al contrario que los agentes antifúngicos
que únicamente funcionan como uno u otro estereoisómero, las
composiciones de la invención funcionan bien en forma de uno u otro
estereoisómero o en forma de una composición estereoisomérica
mixta.
La investigación que llevó a la presente
invención evaluó los SPCL para actividad contra patógenos fúngicos,
incluyendo patógenos de plantas, así como de animales. La biblioteca
se encontraba compuesta de 52.128.400 péptidos de seis residuos,
estando compuesto cada péptido de D-aminoácidos y
presentando extremos N-terminales no acetilados y
extremos C-terminales amidados. Se utilizó un
procedimiento iterativo para identificar las secuencias de péptido
activo con un amplio espectro de actividad antifúngica. El
procedimiento utilizó una biblioteca de hexapéptidos en los que los
dos primeros aminoácidos en cada cadena de péptido se encontraban
individual y específicamente definidos y estando los últimos cuatro
aminoácidos constituidos por mezclas equimolares de 20 aminoácidos.
Se evaluaron cuatrocientas (400)(20^{2}) mezclas diferentes de
péptidos, consistiendo cada una de 130.321 (19^{4})(se eliminó la
cisteína) hexámeros individuales. En dicha mezcla de péptidos, la
concentración final de cada péptido era de 9,38 ng/ml, en una mezcla
compuesta de 1,5 mg (mezcla de péptidos)/ml de solución. En dicho
perfil de mezcla se supuso que un péptido medio presentaba un peso
molecular de 785. Esta concentración era suficiente para permitir
el ensayo de bioactividad. Posteriormente, se construyeron y se
sometieron a ensayo péptidos que contenían aminoácidos D tanto como
L.
La invención da a conocer composiciones de
péptidos que pueden controlar patógenos fúngicos, principalmente
los de plantas. Las composiciones de la invención comprenden una
mezcla de péptidos derivados de aminoácidos que presentan una
longitud de seis residuos. Entre otras composiciones de la invención
se incluyen composiciones de péptidos sustancialmente homogéneas
útiles como agentes antimicrobianos. Entre las composiciones
adicionales de interés de la invención se incluyen composiciones de
péptidos formuladas para la utilización, tales como las contenidas
en microesferas.
Los péptidos de la invención pueden construirse
utilizando una diversidad de precursores aminoácidos. Evidentemente
los péptidos pueden ser composiciones homogéneas que contienen
únicamente aminoácidos D, L o cíclicos (no racémicos). La
estructura química de dichos aminoácidos (término que se utiliza en
la presente memoria para incluir iminoácidos), con independencia de
la configuración estereoisomérica, puede basarse en la de los
diecinueve o veinte aminoácidos de origen natural: alanina (Ala;
A), arginina (Arg; R), asparagina (Asn; N), aspartato (Asp; D),
glutamina (Gln; Q), glutamato (Glu; E), glicina (Gly; G), histidina
(His; H), isoleucina (Ile; I), leucina (Leu; L), lisina (Lys; K),
metionina (Met; M), prolina (Pro; P), fenilalanina (Phe; F), serina
(Ser; S), treonina (Thr; T), triptófano (Trp; W), tirosina (Tyr; Y)
y valina (Val; V). Se excluyó la cisteína (Cys; C) para evitar
problemas por enlaces disulfuro en los productos. Las composiciones
de la invención también pueden ser no homogéneos, conteniendo por
ejemplo aminoácidos tanto D como L y/o aminoácidos cíclicos. Las
composiciones de péptido también pueden contener aminoácidos
diferentes de los aminoácidos de origen natural, tales como la
norleucina, etc.
Más específicamente, las composiciones de la
invención serán una de entre el grupo de péptidos dados a conocer
en las secuencias ID nº 32 a 47. Estas secuencias, y las secuencias
ID nº 1 a 31, indicadas a título comparativo, establecen un número
de composiciones químicas precisas que se ha demostrado que
presentan actividad antifúngica contra un espectro de hongos. En
determinados casos, los péptidos de secuencias ID nº 1 a 47
presentarán secuencias completamente definidas.
En otros casos, la secuencia del péptido
antifúngico se encontrará definida para únicamente algunos de los
residuos aminoácidos C-terminales, dejando los
residuos aminoácidos restantes definidos como proporciones
equimolares. De esta manera, en cada alícuota de la SPCL que
contiene un nº de ID de secuencia dado que contiene un residuo
variable; los residuos variables se encontrarán uniformemente
representados cada uno de ellos en cantidades equimolares por uno
de entre diecinueve aminoácidos de origen natural diferentes en una
u otra de las formas estereoisoméricas. Sin embargo, los residuos
variables pueden definirse rápidamente utilizando los
procedimientos de la invención para determinar los péptidos más
efectivos para el control del crecimiento fúngico.
De esta manera, puede apreciarse en los Ejemplos
siguientes que la secuencia C-terminal "FRXXXX"
(Sec ID nº 1) mostró actividad antifúngica para un amplio espectro
de hongos. Para facilitar la referencia, los péptidos en la
presente memoria se escriben rutinariamente en una dirección
C-terminal a N-terminal para
designar la secuencia de síntesis. Sin embargo, es utilizada en el
listado de secuencias la manera convencional
N-terminal a C-terminal de informar
las secuencias de aminoácidos. Por lo tanto, esta composición
relativamente variable, puede describirse como una composición
antibiótica de la invención, aunque resulta probable que no todos
los componentes de la composición de péptidos mixtos posea
actividad antibiótica. En la siguiente ronda de identificación de
composiciones de péptidos antibióticos basada en la composición
parental "FRXXXX" (sec ID nº 1) de actividad antibiótica
conocida, las composiciones de péptido "FRLXXXX" (sec ID nº 9)
se descubrió que mostraban una actividad antibiótica significativa.
De manera similar a la composición parental de "FRXXXX" (sec ID
nº 1), la composición de péptido "FRLXXXX" (sec ID nº 9)
presenta una serie equimolar mixta de péptidos que representa los
mismos diecinueve residuos aminoácidos, algunos de los cuales puede
presentar actividad antibiótica, y otros de los cuales podrían no
presentar dicha actividad antibiótica. Globalmente, sin embargo, la
composición de péptido "FRLXXX" (sec ID nº 9) es ella misma
una composición antibiótica de la invención. Este procedimiento
puede llevarse a cabo hasta el punto en el que se producen y se
someten a ensayo péptidos completamente definidos mediante los
procedimientos de la invención para su actividad antibiótica. En
estos casos, tal como se consiguió, por ejemplo, para "FRLHF"
(sec ID nº 31), todos los residuos aminoácidos en un péptido de seis
residuos serán conocidos.
Sin embargo, no resulta necesario que una
composición peptídica de actividad antibiótica demostrable que se
encuentre completamente definida respecto a cada residuo. De hecho,
en determinados casos, especialmente en el caso de que se utilicen
composiciones péptidos de la invención para tratar una serie de
enfermedades fúngicas, cada una con un agente causativo diferente,
resultan preferidas las composiciones péptido mixtas. Éste
probablemente es el caso si se desea tratar una enfermedad fúngica
con concentraciones inferiores de numerosos antibióticos, y no una
concentración más elevada de una sola composición química. En otros
casos, en los que, por ejemplo, debido al coste incrementado del
ensayo o la producción de un antibiótico péptido completamente
definido resulta prohibitivo, pueden resultar preferidas las
composiciones de péptidos mixtas de la invención que presentan uno
o más residuos aminoácidos variables. De esta manera, se han
derivado las composiciones antibióticas que comprenden una mezcla
equimolar de péptidos producidos en una biblioteca combinatorial de
péptidos sintéticos utilizando los procedimientos de la invención,
y se ha demostrado que presentan actividad antibiótica deseable.
Estas composiciones relativamente variables son específicamente las
basadas en la secuencia de uno de los péptidos de las SEC. ID nº 1
a 24.
Las composiciones antibióticas de la invención
también pueden comprender un portador. El portador es uno adecuado
para la utilización en la aplicación de las composiciones
antibióticas sobre plantas. En cualquier caso, el portador
seleccionado debe ser un portador cuyas características químicas y/o
físicas no interfieran significativamente con la actividad
antibiótica de la composición péptido. Es conocido, por ejemplo, que
determinados portadores microesfera pueden utilizarse con
efectividad con composiciones proteináceas con el fin de administrar
estas composiciones en un sitio de actividad preferido, tal como
sobre una superficie tópica de una planta. También pueden
utilizarse como portadores para las composiciones péptido de la
invención, soluciones salinas, tampones y solventes
farmacéuticamente aceptables y similares.
Las composiciones antibióticas están
constituidas esencialmente por uno de los péptidos de las sec. ID nº
32 a 47 no presentan residuos variables. Estas composiciones se ha
demostrado que inhiben el crecimiento de células fúngicas de hongos
seleccionados de entre el grupo de hongos patogénicos constituido
por especies de Fusarium, Rhizoctonia, Ceratocystis, Pythium,
Mycosphaerella y Candida.
De manera similar, se describen procedimientos
para inhibir el crecimiento de células fúngicas que comprenden
poner en contacto la célula fúngica con una composición antibiótica
que comprende por lo menos uno de los péptidos de entre las SEC. ID
nº 1 a 31 a título comparativo. Utilizando las técnicas de la
invención, se han sometido a ensayo hongos patogénicos
seleccionados, algunos patógenos de plantas y otros patógenos de
animales. Por lo tanto, los procedimientos de la invención se ha
demostrado específicamente que resultan efectivos cuando la célula
fúngica es una célula fúngica seleccionada de entre el grupo de
hongos constituido por especies de Fusarium, Rhizoctonia,
Ceratocystis, Pythium, Mycosphaerella y Candida.
Los procedimientos de la invención pueden
aplicarse a células fúngicas que son las de un patógeno de una
planta. En determinados casos preferidos, la parte u órgano vegetal
que se trata es una semilla de un organismo vegetal susceptible. En
otros, los procedimientos de la invención se aplican a células
fúngicas de un patógeno de un animal, tal como un ser humano.
También se describe un procedimiento para la
selección de composiciones antibióticas. El procedimiento comprende
en primer lugar crear una biblioteca combinatorial de péptidos
sintéticos tal como se describe en la presente memoria. A
continuación, tal como se describe adicionalmente en detalle en la
presente memoria, se lleva a cabo una etapa de puesta en contacto
de una batería de células fúngicas con alícuotas de la biblioteca
combinatorial de péptidos sintéticos, representando cada una de las
alícuotas una mezcla equimolar de péptidos en los que por lo menos
los dos residuos aminoácidos C-terminales son
conocidos y siendo los residuos comunes para cada péptido. Tras
dejar transcurrir un periodo apropiado para el crecimiento, se lleva
a cabo una etapa siguiente en la que se mide el crecimiento de la
batería de células fúngicas en comparación con células de control no
tratadas. Finalmente, se realiza una determinación de cual de las
alícuotas reduce en mayor grado el crecimiento de las células
fúngicas en la batería de las mismas.
Evidentemente puede llevarse a cabo el mismo
procedimiento en el que cada una de las alícuotas representa una
mezcla equimolar de péptidos en la que son conocidos por lo menos
tres, cuatro, cinco o más residuos aminoácidos
C-terminales (dependiendo de la longitud total del
último péptido en la SPCL). Típicamente, dichas alícuotas
crecientemente definidas se someten a ensayo secuencialmente con el
fin de seleccionar los mejores péptidos candidatos con éxito para
ser sometidos a ensayo. De esta manera, una etapa adicional del
procedimiento implica utilizar la determinación de qué alícuotas
reducen el crecimiento de las células fúngicas globalmente en dicha
batería de células fúngicas, con el fin de seleccionar qué alícuotas
someter a ensayo a continuación de entre una biblioteca
combinatorial de péptidos sintéticos, en la que es conocido por lo
menos un residuo aminoácido C-terminal
adicional.
También se da a conocer un procedimiento de
tratamiento de enfermedades fúngicas. El procedimiento comprende,
en primer lugar, crear una biblioteca combinatorial de péptidos
sintéticos y poner en contacto alícuotas de la misma con una célula
de un hongo que se cree que es el agente causativo de la enfermedad.
A continuación, se lleva a cabo un procedimiento de selección de
los alícuotas de la biblioteca combinatorial de péptidos sintéticos
que más reducen el crecimiento de la célula fúngica. Finalmente, la
enfermedad se trata en un organismo vegetal susceptible a la
enfermedad mediante la aplicación de la alícuota procedente de la
biblioteca combinatorial de péptidos sintéticos, que más reduce el
crecimiento de las células de agente causativo. La etapa de
tratamiento puede comprender la aplicación tópica en el organismo
susceptible, tal como pulverizaciones, nieblas, polvos y similares
en el caso de plantas.
Los expertos en la materia apreciarán que los
péptidos de la invención, tras la selección de los mismos pueden
modificarse para que contengan sustituciones de aminoácidos
funcionalmente equivalentes y conservar todavía características
antifúngicas iguales o similares. Kyte y Doolittle (1982) han
comentado de manera general la importancia del índice hidropático
de aminoácidos en la provisión de función biológica a una proteína.
Estos investigadores y otros han descubierto que determinados
aminoácidos pueden sustituirse por otros aminoácidos que presentan
un índice o puntuación hidropática similar y conservar todavía una
actividad biológica similar, si no idéntica. Tal como se muestra en
la Tabla I posteriormente, se asigna a los aminoácidos un índice
hidropático basándose en sus características de hidrofobicidad y de
carga. Se cree que el carácter hidropático relativo del aminoácido
determina la estructura secundaria de la proteína resultante, que a
su vez define la interacción de la proteína con la molécula
sustrato. De manera similar, en péptidos en los que la estructura
secundaria de los mismos no es un aspecto principal de la
interacción del péptido, la posición dentro del péptido y la
característica del residuo aminoácido determinan las interacciones
que presenta el péptido en un sistema biológico. Se propone que la
equivalencia funcional biológica puede mantenerse típicamente en el
caso de que se intercambien aminoácidos con una diferencia no
superior a +/-1 a 2 en el valor del índice, y más preferentemente
igual o inferior a una diferencia de +/- 1.
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\newpage
De esta manera, por ejemplo, la leucina, que
presenta un índice hidropático de +4,5, puede sustituirse por
valina (+4.2) o leucina (+3,8) y todavía obtener una proteína que
presenta una actividad biológica similar. Alternativamente, en el
otro extremo de la escala, puede sustituirse la lisina (-3,9) por
arginina (-4,5), y de esta manera sucesivamente.
De acuerdo con lo expuesto anteriormente, dichas
sustituciones de aminoácidos se basan generalmente en la similitud
relativa de los sustituyentes grupo R, por ejemplo en términos de
tamaño, carácter electrofílico, carga y similares. En general,
aunque éstas no son las únicas de dichas sustituciones, las
sustituciones preferidas que adoptan diversas de las
características anteriores en consideración incluyen las
siguientes:
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\vskip1.000000\baselineskip
Las composiciones péptido homogéneas se
encuentran compuestas principalmente de una sola especie péptido
activa de una secuencia bien definida. Pueden coexistir cantidades
menores (inferiores a 20% en moles) de impurezas con el péptido en
estas composiciones con la condición de que no interfieran en las
propiedades inhibidoras del crecimiento del compuesto activo.
Para los fines de la presente invención, la
expresión "ingrediente activo" se refiere al péptido que
presenta la capacidad de inhibir el crecimiento de microorganismos
diana. Entre los microorganismos diana se incluyen, aunque sin
limitarse a ellos, los hongos que causan podredumbre de las raíces,
peste de los semilleros, infecciones sistémicas, enfermedades
vasculares e infecciones de determinadas áreas superficiales de las
plantas. El microorganismo diana también puede incluir patógenos de
animales y del ser humano, tales como infecciones por levadura,
comunes en determinados estados de enfermedad del ser humano.
La presente invención proporciona además un
procedimiento para la inhibición del crecimiento microbiano en
plantas con las composiciones péptidos de la invención. Las
infecciones fúngicas pueden prevenirse en diversas etapas del
desarrollo del cultivo, incluyendo: la protección de semillas y
plántulas, el crecimiento de plántulas y plantas, la protección de
productos recolectados y el almacenamiento de productos. El
procedimiento comprende recubrir una parte u órgano de la planta
con las composiciones péptidos de la invención en una mezcla de
recubrimiento que comprende un portador no interfiriente y una
cantidad efectiva de la composición antimicrobiana.
Alternativamente, la composición antimicrobiana puede mezclarse con
un portador líquido no interfiriente y en contacto con semillas,
plántulas, plantas o productos recolectados o puede introducirse
sistémicamente en plantas.
Los procedimientos de construcción de péptidos
de secuencias definidas o por lo menos parcialmente definidas,
péptidos que después pueden seleccionarse para actividad biológica
son conocidos (patentes US nº 4.833.092, nº 5.182.366, nº
5.010.175, y Geysen, Proc. Ntl. Acad. Sci. USA
81:3998-4002). Estos procedimientos se incorporan
específicamente a la presente invención en el grado en que
proporcionan procedimientos alternativos adecuados para sintetizar
dichos péptidos. Las técnicas que se ha descubierto en la presente
invención que resultan adecuadas para sintetizar las composiciones
péptidos de la invención son generalmente las de Houghten et
al., Biotechniques 4:522-524, 1986, y Houghten,
Proc. Ntl. Acad. Sci. USA 82:5131-5135, 1985; ambas
referencias se incorporan a la presente invención en el grado en
que proporcionan materiales y métodos suplementarios.
Se utilizó química de Fmoc
(9-fluorenilmetoxicarbonilo) en la producción de las
bibliotecas de péptidos. Este enfoque se utilizó con la totalidad
de los péptidos de la invención, comprendiesen análogos D o L. A
menos que se indique lo contrario, los péptidos específicos que se
describen adicionalmente en la presente memoria comprenden
secuencias de D-análogo. El grupo Fmoc protege los
grupos N-alfa-amino de los derivados
aminoácidos y pueden eliminarse con una base, tal como piperidina,
mientras que los grupos funcionales de cadena lateral se encuentran
protegidos con grupos protectores sensibles a ácidos. El primer
aminoácido se añade a un línker sensible a ácidos unido a una
resina de poliestireno. Se añaden sucesivamente aminoácidos a
través de un ciclo de eliminación de Fmoc con piperidina al
20-25% en DMF:NMP (9:1; el NMP se añade para ayudar
a solvatar la resina, que mejora la eliminación del Fmoc), lavado
de la resina 6X con DMF, y adición del próximo aminoácido protegido
con Fmoc junto con un agente de acoplamiento apropiado, tal como
PyBOP (hexafluorofosfato de
benzotriazol-1-il-oxi-trix-pirrolidino-fosfonio,
el análogo no carcinogénico de BOP), HBTU (hexafluorofosfato de
2-(1H-benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tetra-metiluronio),
DCCI (N,N'-diciclohexilcarbodiimida) junto con una
base, tal como N-metilmorfolina o
diisopropiletilamina y HOBT
(N-hidroxilbenzotriazol), que reduce la racemización
durante el acoplamiento. Para péptidos pequeños (<10
aminoácidos), habitualmente resulta suficiente una sola etapa de
acoplamiento, con un exceso de 3 a 8 aminoácidos, dependiente de
los equipos de síntesis de péptidos utilizados, junto con un exceso
similar de cada uno de los compuestos químicos indicados
anteriormente.
Para péptidos largos o complicados, los
reactivos indicados anteriormente pueden eliminarse tras dejar
transcurrir el acoplamiento 20 a 45 minutos, momento en el que, en
lugar de lavar la resina con DMF y eliminar el Fmoc para el
siguiente ciclo de aminoácidos, se añade una cantidad adicional de
aminoácidos, agente de acoplamiento, base y HOBT con el fin de
mejorar la eficiencia de acoplamiento por etapas. Típicamente se
observa una eficiencia de acoplamiento de 99% o más durante las
primeras pocas etapas de un péptido medio, mientras que las
eficiencias de acoplamiento pueden ser mucho menores a medida que
las cadenas de péptidos se alargan y adquieren una estructura
terciaria significativa. El acoplamiento doble puede mejorar
significativamente el rendimiento y pureza globales del producto
crudo. Se observa una mejora todavía mayor si las cadenas de
péptidos que no consiguen añadir el aminoácido apropiado reciben
una "caperuza" mediante acetilación, que termina estas cadenas.
Este último procedimiento evita la síntesis de péptidos
prácticamente perfectos, que pueden no haber incorporado un solo
aminoácido, y de péptidos largos, que presentan problemas de
purificación debido a la similitud de secuencia con el péptido de
longitud completa deseado (se utilizó el acoplamiento doble para
garantizar un nivel elevado de eficiencia de acoplamiento; se
utilizó un exceso 5X de aminoácido, PyBOP y HOBT con un exceso 10X
de NMM).
La purificación de bibliotecas de péptidos puede
llevarse a cabo de dos maneras; para la identificación en una etapa
(iteraciones únicas), la purificación puede llevarse a cabo mediante
HPLC, en la que se carga la mezcla de péptidos en agua/TFA al 0,1%
y tras un ciclo de lavado corto en agua/TFA al 0,1%, se eluye con un
gradiente escalonado de acetonitrilo (ACN al 60%/TFA al 0,1%) en
agua/TFA al 0,1%. Alternativamente, para el descubrimiento inicial
de fármacos, en la que puede haber 400 muestras, puede utilizarse un
robot de extracción en fase sólida para eluir los péptidos,
utilizando una estrategia similar a la descrita anteriormente (se
realizó una purificación en HPLC en una columna C-18
de Vydac, 5 \mum de tamaño de poro, 10 x 250 mm).
Existen procedimientos para determinar la
toxicidad de nuevos compuestos para potenciales microorganismos
diana. Por ejemplo, puede realizarse el seguimiento del crecimiento
de cultivos puros de un microorganismo de ensayo en un lector de
microplacas. También pueden determinarse las tasas de crecimiento de
cultivos tras la adición de compuestos de ensayo a los medios de
crecimiento. En el caso de que una tasa de crecimiento sea más
lenta tras la adición de un compuesto de ensayo al medio de
crecimiento, se afirma que el compuesto es un agente antimicrobiano
(W.F. Broekaert et al., FEMS Microbiology Letters 69:55,
1990).
La clave para la identificación exitosa de
péptidos ha sido el ensayo cuantitativo para la medición del
crecimiento microbiano. La identificación de secuencias de péptido
a partir de SPCL, que inhiban el crecimiento de patógenos vegetales
presentes en el suelo se llevó a cabo utilizando un ensayo de
crecimiento en microplacas. Los volúmenes de cultivo y las
densidades de inóculo de esporas o de fragmentos de micelios se
optimizó para el crecimiento en microplacas de Fusarium
oxysporum f. lycopersici, Pythium ultimum,
Ceratocystis fagacerum, Rhizoctonia solani y Mycosphaerella
fijiensis. El peso seco de estos organismos es directamente
proporcional a la densidad óptica del cultivo. De esta manera,
pueden determinarse las tasas de crecimiento mediante la medición
de incrementos de densidad óptica de un cultivo líquido en
diferentes tiempos. Se determinaron las tasas de crecimiento en
presencia y en ausencia de composiciones añadidas, tales como SPCL.
En el caso de que se inhiba el crecimiento en la presencia de estos
compuestos, los compuestos se considera que presentan propiedades
antimicrobianas. De manera similar, se han llevado a cabo ensayos de
microplaca con los microorganismos Erwinia carotovora subsp.
carotovors y con Pseudomonas solanacearum.
Puede someterse a ensayo virtualmente cualquier
compuesto soluble para su capacidad de inhibir el crecimiento
microbiano en dicho ensayo, preferentemente se criban SPCL o
péptidos de esta manera. Puede cribarse con este ensayo cualquier
microorganismo que pueda cultivarse en cultivo líquido. Aunque los
microorganismos específicamente indicados anteriormente resultan
preferidos en la presente invención, también pueden estudiarse
patógenos vegetales, tales como Aspergillus flavus, A. higer, A.
terreus, Chaetomium globosum, Monilinia fructicola, Penicilium
oxalicum u otras especies de Mycosphaerella. Durante el
cribado inicial de la biblioteca de aminoácidos, y tal como se
describe en los ejemplos adicionales posteriormente, se
identificaron varias mezclas de péptidos que presentaban fuerte
actividad de inhibición del crecimiento contra los patógenos
diana.
Cuando una mezcla, tal como una SPCL, presentaba
actividad antimicrobiana, se identificaron las especies péptidos
responsable de dicha actividad mediante síntesis de componentes de
la mezcla seguido de un nuevo ensayo. Tras el cribado inicial de
mezclas de péptidos que definían las dos primeras posiciones en la
SPCL, las mezclas que mostraban la actividad de inhibición del
crecimiento más elevada se sometieron a series sucesivas de
evaluaciones. En la siguiente ronda de evaluación, se sintetizaron
las primeras tres posiciones de la secuencia hexamérica. A
continuación, la resina XXX se dividió en 19 partes iguales, seguido
de la adición de un aminoácido, O_{3}. A este procedimiento
siguió el acoplamiento de O_{1} y O_{2} definidos anteriormente.
De esta manera, se prepararon 20 mezclas de péptidos. En cada
grupo, se definieron los primeros tres residuos y los últimos tres
residuos eran aleatorios. A continuación, se sometió a ensayo cada
grupo en el ensayo de bioactividad tal como se ha descrito
anteriormente. Tras este procedimiento, se definió un aminoácido
adicional en cada nivel de evaluación hasta determinar cada
secuencia con fuertes propiedades de inhibición del crecimiento.
Este procedimiento permite la definición completa de secuencias
útiles como inhibidores de crecimiento de microorganismos diana
procedentes de bibliotecas SPCL.
Debido a que las posiciones se encuentran
definidas, la mezcla de péptidos puede mostrar una potencia más
elevada o IC_{50} (concentración inicial de inhibidor para la
inhibición del 50% del crecimiento) más baja para la batería
completa de microorganismos sometidos a ensayo que la mezcla menos
definida anterior. Sin embargo, éste no es un requisito estricto en
la presente invención debido a que dos péptidos pueden presentar
efectos sinérgicos de inhibición del crecimiento y la separación de
los mismos puede dejar péptidos purificados con menor actividad
antimicrobiana. Alternativamente, un péptido puede presentar un
efecto sinérgico de inhibición del crecimiento con otro compuesto.
Debido a que existen estos motivos, así como otros motivos en la
actualidad desconocidos, el inventor decidió no limitar la
selección de péptidos a únicamente los que mostraban valores de
IC_{50} crecientemente más bajos para cada organismo de ensayo en
cada ronda de síntesis.
Por el contrario, se realizaron selecciones que
proporcionaban generalmente la IC_{50} más baja para el mayor
número de organismos de ensayo. De esta manera, este enfoque es
diferente de los diseños experimentales específicos para un
microorganismo, que maximizan la actividad antimicrobiana de una
mezcla de péptidos frente a una sola especie de microorganismo. Por
este motivo, tal como se observará en los Ejemplos posteriormente,
cuando se añade un residuo aminoácido invariante adicional y la
mezcla de péptidos resultante se somete a ensayo nuevamente frente
a la misma batería de organismos de ensayo, la IC_{50} puede
haberse reducido o no, debido a que se refiere a una sola especie
de microorganismo, debido a que es la actividad inhibidora más
amplia que resulta inicialmente preferida. Evidentemente, tras
seleccionar una colección de péptidos basándose en el espectro más
amplio de organismos de ensayo, pueden llevarse a cabo mejoras de
los organismos diana específicos.
También puede utilizarse un ensayo de protección
de plantas para evaluar el control biológico frente a hongos que
causan peste de los semilleros y podredumbre de las raíces. Las
composiciones de la invención se estabilizan tal como se describe
en la presente memoria (microencapsulación, sustitución de
D-aminoácidos o adición de caperuza terminal) y
después se aplican en el suelo en contacto con la planta o se
utilizan para recubrir la planta, semilla, producto o similar. Se
introduce un reto para la planta, semilla o producto constituido
por un inóculo del microorganismo causante de enfermedad. El inóculo
puede ponerse en contacto con la planta o añadirse al suelo
residente de la planta. Alternativamente, el inóculo puede
inyectarse en el sistema vascular de la planta, particularmente
cuando se están tratando enfermedades vasculares tales como las
causadas por Ceratocystis. A continuación, se realiza un
seguimiento del crecimiento de la planta con el fin de determinar
si se produce una reducción estadísticamente significativa de los
síntomas, tales como los observados cuando se produce peste de los
semilleros o podredumbre de las raíces. Una cantidad efectiva de la
composición es la cantidad que resulta en una reducción
significativa en los síntomas visibles de la enfermedad de la
planta.
Crecimiento de cultivos. Se mantuvieron
rutinariamente en cuñas de ágar de patata-dextrosa
(PDA), cultivos de Fusarium oxysporum f.sp.
lycoperici raza 1 (RM-1)
[FOLRM-1]; Rhizoctonia solani (cepa
TM-101, anastomosis grupo -1)
[RS-101]; Pythium ultimum (cepa LB1, algodón)
[PULB1]; y Ceratocystis fagacearum (cepa BAN 102)
[CFBAN102]. Con el fin de obtener microconidios del aislado de
Fusarium oxysporum f.sp. lycoperici, se transfirió
una parte reducida de un cultivo en crecimiento activo de una placa
PDA a 50 ml de medio de sales minerales, tal como describen
Esposito y Fletcher (Esposito, R. et al., Arch. Biochem.
Biophys. 93:369-376, 1961). El cultivo se incubó
bajo agitación (125 rpm) a 25ºC. Tras 96 horas, la suspensión
fúngica constituida por micelios y microconidios se filtraron dos
veces a través de ocho capas de estopilla estéril para obtener una
suspensión microconidial. A continuación, se calibró la suspensión
microconidial con un hemocitómetro. Se obtuvieron esporas de C.
fagacearum haciendo crecer el cultivo en placas PDA a 25ºC
durante siete días. Las placas se lavaron a continuación con caldo
de patata-dextrosa (PDB), se filtraron dos veces a
través de ocho capas de estopilla estéril, y la suspensión se
calibró con un hemocitómetro. Se ajustaron microconidios de
Fusarium y esporas de Ceratocystis a
1-5 x 10^{7}/ml y se almacenaron en una solución
al 50% de glicerol a -80ºC hasta la utilización. Para obtener
fragmentos miceliares de Rhizoctonia, se inoculó un solo
esclerotio en 50 ml de PDB y se incubó a 25ºC bajo agitación (125
rpm) durante 5 días. El cultivo miceliar se fragmentó utilizando un
homogeneizador de tejidos con un paso de 0,15 mm entre el tubo y el
pistón. El procedimiento se llevó a cabo en hielo para evitar el
calentamiento de la muestra. La suspensión de fragmentos miceliares
se calibró con un hemocitómetro. Con el fin de obtener oosporas de
Pythium, se utilizó un tapón de PDA del hongo para inocular
25 ml de caldo V-8-colesterol
(Ayers, W.A. et al., Phytopathology
65:1094-1100, 1975) dispensado en una placa Petri y
se incubó estáticamente. Tras 10 días, se retiró la malla miceliar,
se lavó dos veces en agua estéril, y se maceró en agua estéril
utilizando un homogeneizador de tejidos tal como se ha descrito
anteriormente. El homogenado se filtró dos veces a través de ocho
capas de estopilla y las suspensiones de oosporas se calibraron con
un hemocitómetro. Se sometieron a ensayo inóculos fúngicos para la
ausencia de bacteria contaminantes antes de su utilización.
Ensayo de microplacas para la inhibición del
crecimiento. Con el fin de determinar los efectos de inhibición
de las mezclas de péptidos de ensayo, se determinó el crecimiento de
los aislados fúngicos en presencia de las mismas. Se identificaron
los efectos de inhibición de los aislados fúngicos preparando series
de dilución seriada de dos veces de una suspensión acuosa de las
mezclas de péptidos en PDB en un volumen final de 50 ml en una
microplaca de 96 pocillos estériles de fondo plano. A continuación,
se añadió el inóculo fúngico en PDB a cada uno de los pocillos. Se
añadieron cincuenta microlitros de una suspensión que contenía
6-8 X 10^{4} microconidios de Fusarium/ml
a la mezcla de péptidos o péptidos individuales para obtener una
concentración final de 3-4 X 10^{3}
microconidios/pocillo. Se ajustaron los fragmentos de
Rhizoctonia a 6 X 10^{4}/ml y se añadieron 50 ml de la
suspensión a la serie de dilución de los péptidos. Las oosporas de
Pythium se ajustaron a 1 X 10^{5}/ml y se añadieron 50 ml
de la suspensión a la serie de dilución de los péptidos. Se
añadieron cincuenta microlitros de una suspensión que contenía
6-8 X 10^{4} esporas de Ceratocystis/ml a
la mezcla de péptidos o péptidos individuales para obtener un
volumen final de 100 ml/pocillo y 3-4 X 10^{3}
esporas/pocillo. Se cultivaron esporas de Mycosphaerella
fijiensis en peptona de harina de soja-dextrosa
a pH 6,7. Sin embargo, se consiguió un crecimiento mejor en el
intervalo de pH de entre 5,0 y 5,5.
La concentración final de la mezcla de péptidos
por pocillo en la serie de dilución seriada de dos veces era de
2.500-1.25 mg/ml o 1.250-0.625
mg/ml, dependiendo de la concentración inicial de la mezcla que se
somete a ensayo. Todas las placas se incubaron estáticamente a
25ºC. Cada placa incluía tres pocillos que se asignaron a los
blancos, y 9 pocillos que realizaban el seguimiento del crecimiento
de los aislados fúngicos en ausencia de ningún péptido. Previamente
a la lectura, las placas se agitaron suavemente para suspender
cualquier parte sedimentada del cultivo. Se realizaron lecturas a
las 0, 24, 48 y 70 horas posteriores a la incoulación. Se realizó
el seguimiento del crecimiento mediante la obtención de lecturas de
densidad óptica (DO) a 595 nm utilizando un lector de precisión de
microplacas Emax (Molecular Devices Corp., Menlo Park, CA) unido a
la impresora de inyección Think-Jet de
Hewlett-Packard. Se calcularon las IC_{50}
(concentración necesaria para inhibir el 50% del crecimiento) para
los péptidos basándose en el análisis de regresión lineal de los
datos de crecimiento. Los datos utilizados para calcular la
IC_{50} de cada mezcla es una sola lectura a cada concentración
de cada mezcla de péptidos debido a la reducida cantidad de muestra
disponible para el ensayo. Los análisis se llevaron a cabo por
duplicado o por triplicado.
Se llevaron a cabo tres rondas de ensayo
utilizando mezclas de péptidos definidas sucesivamente derivadas de
la SPCL indicada anteriormente (una biblioteca D). Mediante la
utilización de las técnicas de cultivo indicadas de manera general
anteriormente, se sometieron a ensayo células de los hongos
patogénicos Ceratocystis fagacerum, Rhizoctonia solani,
Fusarium oxysporum y Pythium ultimum frente a baterías de
péptidos, tal como se ha descrito anteriormente.
La IC_{50} (mg/ml) calculada en cada caso es
la concentración de la composición de péptido de ensayo que inhibe
el crecimiento hasta el 50% del obtenido sin adición de péptido al
medio de cultivo. Los cálculos de IC_{50} se basaron en el
análisis de regresión lineal de los datos. En determinados casos,
los valores de IC_{50} se recogieron y se informaron como tres
valores independientes de tres determinaciones separadas.
Los datos para cada uno de los cuatro patógenos
fúngicos se proporcionan en tablas posteriormente. En cada tabla,
se someten a ensayo alícuotas definidas sucesivamente de la SPCL. En
algunos casos, la batería de péptidos sometida a ensayo en primer
lugar era la definida de manera general como O_{1}O_{2}XXXX. En
otros casos, la primera batería ensayada era
O_{1}O_{2}O_{3}XXX (Ceratocystis). En cualquiera de los
casos, la siguiente ronda de péptidos sometidos a ensayo se
encuentra definido por un residuo fijo adicional. Se muestra para
cada composición de péptidos sometida a ensayo el nº de ID de
secuencia.
La composición de péptidos sombreada en cada
caso es la composición de péptidos utilizada para definir la
fracción de la SPCL de la ronda siguiente que se sometió a ensayo. A
continuación, haciendo referencia a la Tabla IV, puede observarse
que FRXXXX (sec ID nº 1) proporcionó una concentración
significativamente inhibidora a 557 mg/ml al someterla a ensayo
contra Rhizoctonia solani. De esta manera, se sometieron a
ensayo péptidos con FRXXXX en la segunda ronda. En la segunda ronda
puede observarse que los péptidos de fórmula general FRLXXX (sec ID
nº 9) demostraron una actividad de inhibición significativa en tres
experimentos separados de 42, 119 y 94 mg/ml. Posteriormente,
basándose en las indicaciones relativas al interés particular que
muestran los péptidos FRLXXX (sec ID nº 9), se sometió a ensayo una
diversidad de dichos péptidos y se demostró en tres rondas
separadas que una de dichas composiciones de péptido, FRLKXX (sec ID
nº 14), presentaba actividad preferida contra Rhizoctonia.
Se aplicaron análisis en cada uno de los cuatro grupos fúngicos
separados sometidos a ensayo.
También puede apreciarse mediante comparación de
las Tablas (III-VI) que resumen los cuatro hongos
sometidos a ensayo, que resultó posible utilizar los procedimientos
de la invención para seleccionar composiciones de péptidos con una
amplia gama de características antifúngicas. En cada Tabla y para
cada ronda sucesiva de ensayo, las composiciones de péptidos se
disponen de arriba abajo en orden creciente de valores de IC_{50}.
Las composiciones de péptidos situadas en primer lugar en cada
columna se descubrió que eran las más inhibidoras (IC_{50} más
baja) para cada hongo seleccionado. También puede apreciarse que, en
baterías sucesivas de péptidos ensayados, las composiciones
alternativas de péptidos proporcionaron resultados adecuadamente
inhibidores. Éstos se indican en cajas sombreadas en cada tabla.
Debe recordarse que no todas las composiciones de péptidos
sometidas a ensayo se encuentran representadas en las tablas,
posteriormente. Únicamente se tabulan las que mostraron valores
significativos de IC_{50}. Se llevaron a cabo ensayos adicionales
para elucidar la secuencia completa de cada composición antibiótica
de péptidos. Estos péptidos se muestran en las Tablas
VII-XII, posteriormente.
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También se sometieron a ensayo composiciones de
péptidos completamente definidas frente a la batería de hongos. Se
adoptó un enfoque similar al descrito en el Ejemplo IV
anteriormente. Las composiciones de péptidos era tripéptidos,
tetrapéptidos o pentapéptidos seleccionados basándose en los
cribados iniciales llevados a cabo en el Ejemplo IV anteriormente y
sometidos a ensayo a título comparativo.
Nuevamente, se utilizó el análisis de regresión
lineal para generar los datos tabulados. Para el ensayo de
tripéptidos, los datos representados se basan en lecturas realizadas
a las 72 horas para cada hongo, excepto para Pythium. Para
Pythium, los datos se recogieron a las 48 horas. Para los
datos de tetrapéptidos, la totalidad de los datos se recogieron a
las 94 horas, excepto para los datos de Ceratocystis. Para
los datos de pentapéptidos, la totalidad de los datos se recogieron
a las 72 horas. En cada unas de las Tablas VII-IX,
"cc" es el coeficiente de correlación y "n" es el número
de datos utilizado en el cálculo. En el caso de que se someta a
ensayo un análogo D frente a un análogo L, la designación "D-"
o "L-" precede a la secuencia del péptido.
En el caso del ensayo de los pentapéptidos,
haciendo referencia a la Tabla IX puede observarse que se sometieron
a ensayo tanto el isómero D como el isómero L. En la mayoría de los
hongos sometidos a ensayo, las composiciones de péptidos que
estaban compuestas de D-aminoácidos eran inhibidoras
a concentraciones sustancialmente inferiores que el análogo de
L-aminoácido. Sin embargo, inesperadamente se ha
descubierto que en determinados casos (Ceratocystis), los
análogos D y L eran de actividad inhibidora sustancialmente
similar.
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Se mantuvo rutinariamente un cultivo de
Mycosphaerella fijiensis var difformis ATCC
36054 en cuñas de ágar peptona de harina de
soja-dextrosa. Con el fin de obtener fragmentos
miceliares de Mycosphaerella, se inoculó una parte del
cultivo miceliar de una cuña en 50 ml de caldo de peptona de harina
de soja-dextrona (SDB) (ajustada a pH 5,0 con ácido
acético) y se incubó a 28ºC bajo agitación (125 rpm) durante 6
días.
El cultivo miceliar se fragmentó utilizando un
homogeneizador de tejidos con un paso de 0,15 mm entre el tubo y el
pistón. El procedimiento se llevó a cabo en hielo para evitar el
calentamiento de la muestra. La suspensión de fragmentos miceliares
se calibró con un hemocitómetro. Los fragmentos miceliares de
Mycosphaerella se ajustaron a 1 X 10^{6} mg/ml en 1X SDB.
Todas las placas se incubaron estáticamente a
28ºC. Cada placa incluía tres pocillos que se asignaron a blancos y
9 pocillos que realizaron el seguimiento del crecimiento del hongo
en ausencia de cualquier péptido. Antes de las lecturas, las placas
se agitaron suavemente para suspender la parte sedimentada del
cultivo. Se realizaron lecturas en las 0, 24, 48, 72, 96, 120 y 144
horas posteriores a la inoculación. Se realizó el seguimiento del
crecimiento mediante la obtención de lecturas de densidad óptica
(DO) a 595 nm utilizando un lector de precisión de microplacas Emax
(Molecular Devices Corp., Menlo Park, CA) acoplado a una impresora
de inyección Think-Jet de
Hewlett-Packard. Los cálculos de IC_{50} se basan
en el análisis de regresión lineal de los datos de crecimiento. Los
datos utilizados para calcular la IC_{50} de cada mezcla son de
tres lecturas a cada concentración para cada mezcla de
péptidos.
Se cultivaron cultivos de Mycosphaerella
fijiensis var. difformis ATCC 36054 en presencia o en
ausencia del análogo péptido de D-aminoácidos de
FRLHF (sec. ID nº 31) en peptona de harina de
soja-dextrosa a pH 6,7 (los intervalos de pH de
entre 5,0 y 5,5 promueven mejor el crecimiento). Se obtuvo una
IC_{50} (mg/ml) calculada del péptido D-FRLHF
(sec ID nº 31) de 10,5 \pm 2,60 como la media de tres evaluaciones
réplicas. Los valores se basan en lecturas a las 141 horas del
crecimiento en comparación con controles sin adición de péptido. Se
obtuvo un valor calculado de IC_{50} de 57 \pm 0,0 como la media
de tres evaluaciones réplicas para el péptido
L-FRLHF (sec ID nº 31).
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Se cultivó Candida albicans cepa BG1 en
ágar de soja tríptica (Difco) a 25ºC para obtener clamidosporas. Se
preparó una suspensión del cultivo en caldo de soja tríptica (TSB) y
se ajustó a una densidad óptica de 0,10 a 600 nm. Se determinó el
recuento de clamidosporas utilizando un hemocitómetro. El péptido o
mezcla de péptidos se diluyó seriadamente tal como se ha descrito
anteriormente con la excepción de que se utilizó TSB en lugar de
PDB. Se añadieron cincuenta microlitros de la suspensión de
clamidosporas a la suspensión de péptidos para obtener una
concentración final de clamidosporas de 1 X 10^{6} por pocillo. La
concentración final del péptido o mezcla de péptidos por pocillo en
la serie de dilución seriada de dos veces en un volumen final de 50
ml, en una microplaca de 96 pocillos estériles de fondo plano, era
de 2.500-1.255 mg/ml o de 1.250/0,625 mg/ml,
dependiendo de la concentración inicial del péptido o mezcla de
péptidos sometido a ensayo.
Las placas de microtitulación se incubaron a
37ºC en un agitador de plataforma giratoria a 200 rpm. Cada placa
incluía tres pocillos que se asignaron a blancos y 9 pocillos que
realizaron el seguimiento del crecimiento del aislado fúngico en
ausencia de ningún péptido.
Antes de las lecturas, las placas se agitaron
suavemente para suspender cualquier parte sedimentada del cultivo.
Se realizaron las lecturas a las 0 h y cada hora durante las 8 horas
posteriores. Se realizó el seguimiento mediante la obtención de
lecturas de densidad óptica (DO) a 595 nm utilizando un lector de
precisión de microplacas Emax (Molecular Devices Corp., Menlo Park,
CA) acoplado a una impresora de inyección Think-Jet
de Hewlett Packard. Se calculó la IC_{50} de los péptidos
utilizando análisis de regresión lineal para los datos de
crecimiento.
Correlación de peso seco de los micelos y
densidad óptica. Los aislados fúngicos se inocularon tal como se ha
descrito anteriormente en ausencia de cualquier compuesto inhibidor.
Las lecturas de DO se realizaron a lo largo de un periodo de 96
horas con treinta pocillos muestreados en cada uno de los periodos
de tiempo. Las muestras se recogieron por filtración (10/filtro) a
través de filtros de vidrio pesados previamente (0,45 micras) Los
filtros se secaron en un horno de vacío a 70ºC hasta peso constante
y se restó el peso de la tara del peso del filtro con muestra para
determinar el peso seco de la masa de micelios.
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Se llevaron a cabo estudios similares en
levaduras. Los datos informados en la Tabla XII se basan en el
análisis de regresión logarítmica de los datos. Los datos se basan
en lecturas a las 6 horas de cultivos incubados a 37ºC.
A continuación, haciendo referencia a la Tabla
XII, puede apreciarse que determinadas composiciones de péptido
variable de la invención se sometieron a ensayo contra la levadura
Candida albicans. Además, se sometieron a ensayo
determinados péptidos completamente definidos de la invención que
comprendían tres y cuatro residuos. En el caso de que se someta a
ensayo un análogo L en lugar de un análogo D, la designación
"L-" precede a la secuencia del péptido.
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En determinados casos, puede resultar más
deseable llevar a cabo los ensayos de inhibición directamente en
determinados organismos huésped susceptibles, de manera que dichos
microorganismos no puedan crecer independientemente del organismo
huésped, o de manera que el crecimiento independiente del
microorganismo respecto al huésped resulte problemático de otra
manera. Por ejemplo, el mildiú pulverulento de las rosas está
causado por el parásito obligado Sphaerothecia pannosa f.sp.
rosae. En estos casos, resultará necesario someter a ensayo
la inhibición por el péptido o mezcla de péptidos en las plantas
huésped infectadas.
En otros casos, puede resultar deseable someter
a ensayo la efectividad de las composiciones de péptidos de la
invención directamente en el producto cosechado, tal como fruta.
Janisiewicz et al., 1991, describen un ensayo posterior a la
cosecha para el control del moho azul y el moho gris de manzanas y
peras mediante tratamiento por inmersión con pirrolnitrina, que es
ejemplificativo (ver el artículo por los mismos autores en Plant
Disease 75:490-494, 1991). Los patógenos de interés
se aíslan y se conservan tal como se ha descrito anteriormente.
Se recolectan manzanas Golden Delicious y se
mantienen con un régimen de pulverización mínimo. La fruta puede
almacenarse a 1º \pm 1ºC y 95 \pm 2% de humedad relativa (HR)
durante por lo menos 2 meses antes de la utilización. La fruta
utilizada en los ensayos se selecciona para uniformidad de tamaño y
de madurez. De manera similar, se recolectan peras Bosc y se
almacenan bajo las mismas condiciones y se utilizan dentro de los 2
meses posteriores a la recolección. Se somete a ensayo la firmeza de
las manzanas y peras antes de inocularlas con hongos, y deben
presentar una firmeza de aproximadamente 11 (manzanas) y 14 (peras)
libras de fuerza según se determina mediante ensayos de presión de
Effegi.
Se daña la fruta mediante tres procedimientos.
Se infringen daños de corte cortando una incisión de 3 mm cuadrados
y 3 mm de profundidad con un instrumento afilado y retirando el
tejido. Se realizan dos de estos daños separados aproximadamente 2
cm en cada fruta. Se infringen daños por punción con dos clavos de
6,1 mm de diámetro separados 2 cm y sobresalientes 4 mm de un
bloque de madera. Se infringen daños de "amoratamiento"
apretando dos cabezas de tornillo (de 1 cm de diámetro) contra la
superficie de la fruta hasta una profundidad de 2 a 3 mm, rompiendo
la piel de la fruta. Las cabezas de tornillo se montan en un bloque
de madera separadas 2 cm. Se infringen todos los daños
aproximadamente a mitad de la línea entre el cáliz y el final del
tallo.
Las frutas se sumergen en suspensiones que
contienen el organismo de ensayo solo o mezclado con diversas
concentraciones de la composición de péptidos que deben someterse a
ensayo. Las manzanas o peras dañadas (dos daños por fruto) se
sumergen en las suspensiones durante 2 minutos con agitación
ocasional. A continuación, la fruta se coloca en
paquetes-bandeja de poliestireno para fruta con la
cara dañada orientada hacia arriba en cajas de fruta de 1 bushel
con revestimiento de polietileno. Se coloca la fruta de cada
tratamiento en bandejas separadas en cajas separadas. Se utilizan
cinco frutos por tratamiento, y cada tratamiento se repite tres
veces. Las cajas se almacenan en bloques aleatorizados.
Se almacena un grupo de frutas tratado de la
manera indicada anteriormente, a 24ºC y 95 \pm 2% de HR durante 7
días, y el otro grupo se almacena a 2ºC durante 30 días. El
almacenamiento a 24ºC se ha diseñado para mantener o para
establecer condiciones óptimas para el desarrollo de las
enfermedades fúngicas, y se seleccionan las duraciones de los
periodos de almacenamiento para que resulte posible medir los daños
antes de que se pudran por completo los frutos. Al final del
periodo de almacenamiento, se miden los diámetros de los daños en
dirección perpendicular al eje que conecta los dos daños.
Se llevaron a cabo estudios de fitotoxicidad
mediante el seguimiento del crecimiento de la lenteja de agua
(Lemna minor) y la germinación de la semilla del arroz
(Oryzae sativa). Los ensayos de fitotoxicidad con lenteja de
agua común son simples, sensibles y eficientes para el coste. Se
cultivó L. minor axénico en matraces utilizando medio de
Bowker, tal como describe Caux (Caux, P.Y. et al.,
Environmental Toxicology and Chemistry 7:671-676,
1988). Se obtuvo una población clonal mediante multiplicación
vegetativa de un inóculo que era una sola fronda. Se añadieron los
péptidos individuales al medio de ensayo, y se realizó el
seguimiento de las plantas para el incremento de biomasa y de
disfunción fotosintética (Caux, P.Y. et al., Environmental
Toxicology and Chemistry 7:671-676, 1988) durante un
periodo de 14 días. El arroz es un cultivo económicamente
importante y es una especie recomendada para el ensayo de toxicidad
(Wang, W., Environmental Toxicology and Chemistry
10:1173-1177, 1991). Las condiciones para el ensayo
son las descritas por Wang (Wang, W., Environmental Toxicology and
Chemistry 10:1173-1177, 1991). Para evaluar la
potencial genotoxicidad, los péptidos de interés se evaluaron
utilizando el ensayo de Salmonella/microsomas (Maron, D.M. y
B.N. Ames, Mutat. Res.:173-215, 1983) y el ensayo
microscreen de inducción de profago (Rossman, T.G. et al.,
Environ. Mutagen. 6:59-69, 1984). La actividad
hemolítica se evaluó mediante el procedimiento de Zasloff (Zasloff,
M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:5449-5453,
1987).
Puede llevarse a cabo una diversidad de
modificaciones a los péptidos con la condición de que se conserve
la actividad antimicrobiana. Algunas modificaciones pueden
utilizarse para incrementar la potencia antimicrobiana intrínseca
del péptido. Otras modificaciones pueden facilitar la manipulación
del péptido. Entre los grupos funcionales del péptido que
típicamente pueden modificarse se incluyen hidroxilo, amino,
guanidinio, carboxilo, amida, fenol, anillos imidazol o
sulfhidrilo. Entre las reacciones típicas de estos grupos se
incluyen, aunque sin limitarse a ellos, la acetilación de grupos
hidroxilo por haluros de alquilo. Los grupos carboxilo pueden
esterificarse, amidarse o reducirse a alcoholes. Las carbodiimidas u
otros catalizadores pueden utilizarse para catalizar la amidación
de los grupos carboxilo. Los grupos amida de la asparagina o de la
glutamina pueden desaminarse bajo condiciones ácidas o básicas. Las
reacciones de acilación, alquilación, arilación o amidación se
producen con facilidad con grupos amino, tal como el grupo amino
primario del péptido o el grupo amino de los residuos lisina. El
grupo fenólico de la tirosina puede halogenarse o nitratarse. Entre
los ejemplos en los que podría reducirse la solubilidad de un
péptido se incluyen acilar residuos de lisina cargados o acetilar
los grupos carboxilo de los ácidos aspártico y glutámico. Los
péptidos pueden conjugarse con moléculas portadores solubles o
insolubles para modificar sus propiedades de solubilidad según
resulte necesario, y para incrementar las concentraciones locales
de los péptidos en las áreas diana de los mismos. Las composiciones
de péptidos de la invención también pueden inyectarse en el sistema
vascular de una planta. Entre los ejemplos de moléculas portadores
solubles se incluyen polímeros de polietilenglicol y
polivinilpirrolidona. Entre los ejemplos de polímeros insolubles se
incluyen arena u otros silicatos o poliestireno, celulosa o
similares. Los péptidos también pueden microencapsularse para
incrementar su estabilidad durante la aplicación en semillas, suelo
o plantas. Típicamente se utilizan microesferas de poliéster para
encapsular y estabilizar los péptidos.
Se lleva a cabo la síntesis a gran escala (hasta
60 kg) de péptidos en solución o en fase sólida tras la selección
de composiciones particulares de péptidos para la utilización
masiva. Esta síntesis requiere una selección cuidadosa de grupos
protectores y procedimientos de condensación. Todos los materiales
de partida y reactivos pueden obtenerse con buena pureza a partir
de suministradores químicos, tales como Sigma Chemical Co. O Aldrich
Chemical Co. La racemización de los bloques de construcción
aminoácidos bajo condiciones de acoplamiento puede suprimirse en
gran medida o eliminarse mediante la utilización de reactivos de
nueva generación, es decir HOBt, HOAt, HBTU o HATU. Incluso la
metodología en fase sólida en la actualidad se encuentra
convenientemente desarrollada para preparar péptidos farmacéuticos
en múltiples de 1 a 10 kg/año.
Síntesis a gran escala de péptidos en
solución. La síntesis en fase sólida permite la fácil
planificación con respecto a la estrategia de protección de grupos,
selección de fragmentos y procedimientos de acoplamiento de
fragmentos para minimizar la racemización. Los intermediarios en
ocasiones pueden aislarse simplemente mediante técnicas de
cristalización, que pueden eliminar la necesidad de purificación
mediante cromatografía de columna y por lo tanto mejorar el
potencial de escalado. La calidad de los fragmentos producidos
simultáneamente puede controlarse con facilidad en cada etapa.
Síntesis de péptidos en fase sólida a gran
escala. El coste de los polímeros más avanzados de la síntesis
en fase sólida habitualmente es elevado. Algunos de los soportes no
se encuentran disponible en masa. Sin embargo, las propiedades de
los mismos desempeñan un papel importante en la accesibilidad del
péptido anclado y en la liberación del péptido de la resina en una
forma completamente protegida, desprotegida o modificada. La
transición de la escala de laboratorio a la de fabricación de la
síntesis de péptidos en fase sólida (SPSS) resulta claramente
ventajosa debido al hecho de que el procedimiento sintético entero
podría automatizarse con facilidad, y podría realizarse el
seguimiento y la optimización de la eficiencia de las etapas
sintéticas. Los procesos activadores a escala productiva son bien
conocidos y ambientalmente inocuos. Además, SPSS permite la
recuperación directa y el reciclado del exceso de bloques de
construcción aminoácidos a partir de los filtrados de los residuos
a escala productiva.
Las referencias siguientes se incorporan
específicamente como referencia a la presente invención:
Boris Group, "Production of
large-scale peptides in solution", Biochem. Soc.
Trans. 18(6):1299-306; Christian Birr,
"The transition to solid-phase production of
pharmaceutical peptides", Biochem. Soc. Trans.
18(6):1313-16, y Paul
Lloyd-Williams, Fernando Albericio y Ernest Giralt,
"Convergent solid-phase peptide synthesis",
Tetrahedron 49(48):11065-11133. En el caso
de que deban intentarse síntesis a gran escala de las composiciones
de péptidos de la invención, deben seguirse los procedimientos y
materiales citados en dichas referencias.
Evidentemente, en el caso de que se haya
determinado que un péptido de L-aminoácidos resulta
suficientemente inhibidor (con o sin estabilización), puede
resultar posible utilizar expresión de ADN recombinante siguiendo
técnicas bien conocidas por los expertos en la materia para producir
dichos péptidos en cantidades de gran escala. En el caso de que se
produzcan péptidos recombinantes y se desee la estabilidad de dichos
péptidos, el péptido puede protegerse del ataque en ambos extremos
uniendo covalentemente D-aminoácidos a uno o a ambos
extremos utilizando técnicas conocidos por los expertos en la
materia de la química de los péptidos.
También se da a conocer un procedimiento para
proteger las semillas. El procedimiento de recubrimiento de
semillas con un compuesto antimicrobiano es bien conocido por los
expertos en la materia. Cualquier procedimiento convencional que no
destruye el ingrediente activo resulta adecuado para los fines de la
presente invención. Un procedimiento fácil y preferido consiste en
suspender o disolver el ingrediente activo en metilcelulosa acuosa
al 1,0-1,5%. Se añaden las semillas que deben
protegerse a la suspensión y se mezclan vigorosamente con la misma
para recubrir la superficie de las semillas con la suspensión. A
continuación se secan las semillas. Las semillas se encuentran
protegidas de las infecciones fúngicas tras la germinación debido a
que el material de recubrimiento sitúa el ingrediente activo en
posición inmediatamente contigua a las semillas.
Se determinan las concentraciones efectivas del
ingrediente activo mediante la mezcla de cantidades diversas del
ingrediente activo en la mezcla de recubrimiento líquida y
recubriendo lotes de semillas. A continuación, se plantan las
semillas en el suelo y se retan con microorganismos causantes de
enfermedad. Se determina la tasa de germinación de las semillas y
se determina una concentración mínima de ingrediente activo cuando
rinde tasas de germinación estadísticamente mejoradas. También
pueden determinarse tasas de supervivencia de las plántulas y de la
planta en general. Pueden utilizarse concentraciones más elevadas
del agente antimicrobiano si se demuestra que incrementan la
supervivencia de las plántulas o plantas o si incrementan los
rendimientos de plantas.
Pueden utilizarse otros procedimientos para
controlar las infecciones fúngicas agrícolas. Los microorganismos
pueden ponerse en contacto directamente con una cantidad efectiva de
una composición de ingrediente activo de la presente invención,
típicamente disuelta en el portador apropiado. Son conocidos de la
técnica ejemplos de portadores apropiados y pueden comprender
tampón fosfato o solución salina tamponada con fosfato a pH
fisiológico.
El tratamiento de las semillas por medio de la
aplicación de materiales químicos, biológicos o una combinación de
los mismos, sobre las semillas con el fin de protegerlas frente al
ataque por patógenos e insectos presentes en el suelo, típicamente
puede llevarse a cabo utilizando dos procedimientos de aplicación
comunes:
(1) Recubrimiento comercial por las compañías
de semillas. Los tratadores comerciales normalmente crean una
suspensión del material de péptidos en agua y aplican la suspensión
en forma de pulverización sobre las semillas. A continuación, secan
las semillas y las embolsan para su comercialización.
(2) También puede utilizarse un procedimiento de
caja de tolva. El cultivador aplica el material de péptidos antes
del plantado. El material se rocía en forma de polvos secos sobre la
parte superior de la caja de tolva. Típicamente se introduce la
mitad de las semillas en la caja de tolva, la mitad del fungicida,
después el resto de las semillas y finalmente el resto de
fungicida.
\vskip1.000000\baselineskip
Las siguientes referencias proporcionan detalles
de procedimientos adicionales a los establecidos en la presente
memoria, y por ello están incorporados específicamente a
continuación:
Caux, P. Y., P. Weinberger, y D.
B. Carlisle. 1988. A physiological study of the
effects of triton surfactants on Lemna minor L. Environmental
Toxicology and Chemistry 7:671-676.
Cull, MV. G., J. F. Miller, y P.
J. Schatz. 1992. Screening for receptor ligands using
large libraries of peptides linked to the C terminus of the lac
repressor. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:
1865-1869.
Fiedler, H. P., R. Kurth, J.
Langharig, J. Delzer, y H. Zahner. 1982.
Nikomycins: microbial inhibitors of chitin synthase. J. Chem.
Technol. Biotechnol. 32:271-280.
Furka, A., F. Sebastyen, M.
Asgedom, y G. Dibo. 1991. General method for
rapid synthesis of multicomponent peptide mixtures. Int. J.
Pept. Protein Res. 37:487-493.
Gramsch, C., T. Meo, G.
Riethmuller, y A. Herz. 1983. Binding
characteristics of a monoclonal b-endorphin
antibody recognizing the N-terminus of opioid
peptides. J. Neurochem. 40:1220-1226.
Houghten, R. A., C. Pinilla, S. E.
Blondelle, J. R. Appel, C. T. Dooley, y J. H.
Cuervo. 1991. Generation and use of synthetic peptide
combinatorial libraries for basic research and drug discovery.
Nature 354:84-86.
Houghten, R. A., J. R. Appel, S.
E. Blondelle, J. H. Cuervo, C. T. Dooley, y C.
Pinilla. 1992. The use of synthetic peptide
combination libraries for the identification of bioactive peptides.
BioTechniques 13:412-421.
Houghten, R.A., Blondelle, S.E.,
Cuervo, J.H., en Innovations and Perspectives in Solid Phase
Synthesis. Canterbury; Epton, R., Ed., Solid Phase Conference
Coordination, Ltd.: Canterbury, 1992.
Isono, K. and S. Suzuki.
1979. The polyoxins: pyrimidine nucleoside peptide
antibiotics inhibiting fungal cell wall biosynthesis.
Heterocycles 13:333-351.
Lerner, R. A. 1982. tapping the
immunological repertoire to produce antibodies of predetermined
specificity. Nature 299:592-596.
Maron, D. M., y B. N. Ames.
1983. Revised methods for the Salmonella mutagenicity test.
Mutat. Res.: 173-215.
Pinilla, C., J.R. Appel, and R. A.
Houghten. 1992. Synthetic peptide combinatorial
libraries: the screening of tens of millions of peptides for basic
research and drug discovery. in Vaccines 92; Brown, F.,
Chanock, R.M., Ginsberg,
H.S., Lerner, R.A., Eds. Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 1992 página 25 y
siguientes.
Rossman, T. G., M. Molina, y L. W.
Meyer. 1984. the genetic toxicology of metal
compounds. I. Induction of lambda prophage in E. coli WP2,
Environ. Mutagen. 6:59-69.
Wang, W. 1991. Ammonia toxicity to
macrophytes (common duckweeds and rice) using static and renewal
methods. Environmental Toxicology and Chemistry
10:1173-1177.
Zasloff, M. 1987. Magainins, a
class of antimicrobial peptides from Xenopus skin: Isolation,
characterization of two active forms, and partial cDNA sequence of
precursor. Proc. Natl. Acad. Sci. USA
84:5449-5453.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: David L. Edwards
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 7 Inwood Oaks
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: San Antonio
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Texas
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: USA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): 78248
\vskip0.500000\baselineskip
- (G)
- TELÉFONO: (210) 691-2868
\vskip0.500000\baselineskip
- (H)
- FAX: (210) 697-9942
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Antibióticos sintéticos
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 47
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn emisión nº 1.0, versión nº 1.25 (EPO)
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Phe His}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Lys Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 4
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Gln Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 5
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 5
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Met}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 6
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa His Met}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 7
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Lys Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 8
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 9
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Ile Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 11
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Phe Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 12
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Trp Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 13
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Xaa Met Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 14
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 15
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Arg Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 16
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa His Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 17
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Thr Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 18
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Phe Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 19
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Ser Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 20
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Ile Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 21
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Leu Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 22
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Ala Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 23
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Trp Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 24
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Met Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 25
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 26
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 27
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Trp Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 28
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 29
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 30
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Trp Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 31
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe His Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 32
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 34
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 35
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 36
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 37
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 38
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 39
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 7 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe His Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 40
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 7 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile His Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 41
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Arg Leu Lys Phe His}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 42
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 43
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 43:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 44
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 44:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 45
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.500000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 45:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 46
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.500000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Phe Lys Leu Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID nº 47
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.500000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Trp Phe Lys Leu Arg Phe}
Claims (10)
1. Antibiótico que comprende por lo menos uno de
los péptidos de las SEC. ID nº 32 a 47.
2. Antibiótico según la reivindicación 1, en el
que por lo menos uno de los aminoácidos que comprende dicho péptido
es un estereoisómero D.
3. Antibiótico según la reivindicación 1, que
comprende además un portador.
4. Antibiótico según la reivindicación 3, en el
que dicho portador comprende además una microesfera.
5. Antibiótico según la reivindicación 1, capaz
de inhibir el crecimiento de un hongo.
6. Antibiótico según la reivindicación 5, en el
que dicho hongo se selecciona de entre Fusarium, Rhizoctonia,
Ceratocystis, Pythium, Mycosphaerella y Candida.
7. Procedimiento para inhibir el crecimiento de
una célula fúngica en una planta, que comprende poner en contacto
dicha célula con por lo menos uno de los péptidos de las SEC. ID nº
32 a 47, en el que dicha célula fúngica es un patógeno de una
planta.
8. Procedimiento según la reivindicación 7, en
el que dicha célula fúngica se selecciona de entre Fusarium,
Rhizoctonia, Ceratocystis, Pythium, Mycosphaerella y
Candida.
9. Procedimiento según la reivindicación 7, en
el que dicha planta es una semilla.
10. Procedimiento según la reivindicación 7, en
el que dicha planta es un cuerpo fructífero.
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5767373A (en) * | 1994-06-16 | 1998-06-16 | Novartis Finance Corporation | Manipulation of protoporphyrinogen oxidase enzyme activity in eukaryotic organisms |
US5885782A (en) * | 1994-09-13 | 1999-03-23 | Nce Pharmaceuticals, Inc. | Synthetic antibiotics |
US7129052B1 (en) * | 2000-07-12 | 2006-10-31 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Peptides and their utility in modulation of behavior of cells expressing α3β1 integrins |
US20100210745A1 (en) * | 2002-09-09 | 2010-08-19 | Reactive Surfaces, Ltd. | Molecular Healing of Polymeric Materials, Coatings, Plastics, Elastomers, Composites, Laminates, Adhesives, and Sealants by Active Enzymes |
US20090238811A1 (en) * | 2002-09-09 | 2009-09-24 | Mcdaniel C Steven | Enzymatic Antimicrobial and Antifouling Coatings and Polymeric Materials |
US20110070376A1 (en) * | 2002-09-09 | 2011-03-24 | Reactive Surfaces, Ltd. | Anti-fouling Paints & Coatings |
US20040109853A1 (en) * | 2002-09-09 | 2004-06-10 | Reactive Surfaces, Ltd. | Biological active coating components, coatings, and coated surfaces |
US20100233146A1 (en) * | 2002-09-09 | 2010-09-16 | Reactive Surfaces, Ltd. | Coatings and Surface Treatments Having Active Enzymes and Peptides |
US20050058689A1 (en) * | 2003-07-03 | 2005-03-17 | Reactive Surfaces, Ltd. | Antifungal paints and coatings |
US8618066B1 (en) | 2003-07-03 | 2013-12-31 | Reactive Surfaces, Ltd., Llp | Coating compositions having peptidic antimicrobial additives and antimicrobial additives of other configurations |
US20060286006A1 (en) * | 2005-06-21 | 2006-12-21 | Mcdaniel C S | Method and apparatus for the treatment of fluid waste streams |
US9925398B2 (en) | 2008-04-23 | 2018-03-27 | Novacell Technology Inc. | Angiogenic peptide |
US8388904B1 (en) | 2008-12-22 | 2013-03-05 | Reactive Surfaces, Ltd., Llp | Equipment decontamination system and method |
US10412962B2 (en) | 2015-11-25 | 2019-09-17 | North Carolina Agricultural And Technical State University | Antifungal compositions and methods of use thereof |
Family Cites Families (16)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4324683A (en) * | 1975-08-20 | 1982-04-13 | Damon Corporation | Encapsulation of labile biological material |
NZ215865A (en) * | 1985-04-22 | 1988-10-28 | Commw Serum Lab Commission | Method of determining the active site of a receptor-binding analogue |
US5093120A (en) * | 1987-08-12 | 1992-03-03 | Mycogen Corporation | Novel isolates of Bacillus thuringiensis having activity against nematodes |
US4948734A (en) * | 1987-08-12 | 1990-08-14 | Mycogen Corporation | Novel isolates of bacillus thuringiensis having activity against nematodes |
US5521153A (en) * | 1987-10-02 | 1996-05-28 | Ciba-Geigy Corporation | Synergistic antifungal protein and compositions containing same |
US5290914A (en) * | 1988-04-28 | 1994-03-01 | Mycogen Corporation | Hybrid diphtheria-B.t. pesticidal toxins |
US5010175A (en) * | 1988-05-02 | 1991-04-23 | The Regents Of The University Of California | General method for producing and selecting peptides with specific properties |
US5182366A (en) * | 1990-05-15 | 1993-01-26 | Huebner Verena D | Controlled synthesis of peptide mixtures using mixed resins |
CA2090860C (en) * | 1990-11-21 | 2003-09-16 | Richard A. Houghten | Synthesis of equimolar multiple oligomer mixtures, especially of oligopeptide mixtures |
WO1994008010A1 (en) * | 1992-09-28 | 1994-04-14 | Monsanto Company | Method of controlling plant pathogenic fungi |
US5440016A (en) * | 1993-06-18 | 1995-08-08 | Torrey Pines Institute For Molecular Studies | Peptides of the formula (KFmoc) ZZZ and their uses |
WO1995004754A1 (en) * | 1993-08-04 | 1995-02-16 | Zeneca Limited | Antimicrobial proteins |
US5750357A (en) * | 1994-05-18 | 1998-05-12 | Microquest Diagnostics, Inc. | Method of rapid analyte detection |
US5602097A (en) * | 1994-09-13 | 1997-02-11 | Ceres Technologies, Inc. | Synthetic antibiotics |
US5616315A (en) * | 1994-10-13 | 1997-04-01 | Gillette Canada Inc. | Particles including degradable material and anti-microbial agent |
JPH08136179A (ja) * | 1994-11-04 | 1996-05-31 | Zexel Corp | 積層型熱交換器 |
-
1996
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1997
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