ES2241487B2 - Procedimiento para la sintesis de nucleosidos mediante la utilizacion de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. - Google Patents
Procedimiento para la sintesis de nucleosidos mediante la utilizacion de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes.Info
- Publication number
- ES2241487B2 ES2241487B2 ES200400817A ES200400817A ES2241487B2 ES 2241487 B2 ES2241487 B2 ES 2241487B2 ES 200400817 A ES200400817 A ES 200400817A ES 200400817 A ES200400817 A ES 200400817A ES 2241487 B2 ES2241487 B2 ES 2241487B2
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- synthesis
- nucleosides
- strains
- starts
- deoxyuridine
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title claims abstract description 65
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title claims abstract description 64
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 32
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 30
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims abstract description 48
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 37
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 claims abstract description 36
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 claims abstract description 18
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 claims abstract description 18
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 claims abstract description 9
- 241000194104 Bacillus psychrosaccharolyticus Species 0.000 claims abstract description 8
- 241000493790 Photobacterium leiognathi Species 0.000 claims abstract description 7
- 241000588672 Psychrobacter immobilis Species 0.000 claims abstract description 6
- 241000607565 Photobacterium phosphoreum Species 0.000 claims abstract description 5
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Natural products O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 claims abstract 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 claims abstract 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 claims description 24
- MXHRCPNRJAMMIM-SHYZEUOFSA-N 2'-deoxyuridine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 MXHRCPNRJAMMIM-SHYZEUOFSA-N 0.000 claims description 18
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 claims description 18
- MXHRCPNRJAMMIM-UHFFFAOYSA-N desoxyuridine Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 MXHRCPNRJAMMIM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 claims description 12
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 claims description 12
- OLXZPDWKRNYJJZ-UHFFFAOYSA-N 5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(CO)O1 OLXZPDWKRNYJJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 claims description 9
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 claims description 9
- 239000005549 deoxyribonucleoside Substances 0.000 claims description 7
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 7
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 claims description 6
- 102100036286 Purine nucleoside phosphorylase Human genes 0.000 claims description 6
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 108010009099 nucleoside phosphorylase Proteins 0.000 claims description 6
- BTOTXLJHDSNXMW-POYBYMJQSA-N 2,3-dideoxyuridine Chemical compound O1[C@H](CO)CC[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 BTOTXLJHDSNXMW-POYBYMJQSA-N 0.000 claims description 5
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- OQRXBXNATIHDQO-UHFFFAOYSA-N 6-chloropyridine-3,4-diamine Chemical compound NC1=CN=C(Cl)C=C1N OQRXBXNATIHDQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 claims description 4
- GLVAUDGFNGKCSF-UHFFFAOYSA-N mercaptopurine Chemical compound S=C1NC=NC2=C1NC=N2 GLVAUDGFNGKCSF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229960001428 mercaptopurine Drugs 0.000 claims description 3
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 claims description 3
- WVXRAFOPTSTNLL-NKWVEPMBSA-N 2',3'-dideoxyadenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1CC[C@@H](CO)O1 WVXRAFOPTSTNLL-NKWVEPMBSA-N 0.000 claims description 2
- NKGPJODWTZCHGF-KQYNXXCUSA-N 6-thioinosinic acid Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(S)=C2N=C1 NKGPJODWTZCHGF-KQYNXXCUSA-N 0.000 claims description 2
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- -1 uracil nucleoside Chemical class 0.000 claims description 2
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 239000002718 pyrimidine nucleoside Substances 0.000 abstract description 4
- 239000002212 purine nucleoside Substances 0.000 abstract description 3
- 150000003852 triazoles Chemical class 0.000 abstract description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 abstract 1
- 238000007086 side reaction Methods 0.000 abstract 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 16
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 16
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 16
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 9
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical group C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 6
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 6
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 5
- HBOMLICNUCNMMY-XLPZGREQSA-N zidovudine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](N=[N+]=[N-])C1 HBOMLICNUCNMMY-XLPZGREQSA-N 0.000 description 5
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 4
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 4
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 3
- 241000488494 Bacillus psychrosaccharolyticus ATCC 23296 Species 0.000 description 3
- 230000036983 biotransformation Effects 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 3
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 3
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 3
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 3
- 229960002555 zidovudine Drugs 0.000 description 3
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000193385 Geobacillus stearothermophilus Species 0.000 description 2
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 102000009097 Phosphorylases Human genes 0.000 description 2
- 108010073135 Phosphorylases Proteins 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- MKUXAQIIEYXACX-UHFFFAOYSA-N aciclovir Chemical compound N1C(N)=NC(=O)C2=C1N(COCCO)C=N2 MKUXAQIIEYXACX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 235000010633 broth Nutrition 0.000 description 2
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 2
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 2
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 2
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 229940083251 peripheral vasodilators purine derivative Drugs 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000010517 secondary reaction Methods 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710169336 5'-deoxyadenosine deaminase Proteins 0.000 description 1
- ZFTBZKVVGZNMJR-UHFFFAOYSA-N 5-chlorouracil Chemical compound ClC1=CNC(=O)NC1=O ZFTBZKVVGZNMJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MSSXOMSJDRHRMC-UHFFFAOYSA-N 9H-purine-2,6-diamine Chemical compound NC1=NC(N)=C2NC=NC2=N1 MSSXOMSJDRHRMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150046889 ADORA3 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000055025 Adenosine deaminases Human genes 0.000 description 1
- 108050000203 Adenosine receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000009346 Adenosine receptors Human genes 0.000 description 1
- 241000607525 Aeromonas salmonicida Species 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 241000590031 Alteromonas Species 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000019838 Blood disease Diseases 0.000 description 1
- QAGYKUNXZHXKMR-UHFFFAOYSA-N CPD000469186 Natural products CC1=C(O)C=CC=C1C(=O)NC(C(O)CN1C(CC2CCCCC2C1)C(=O)NC(C)(C)C)CSC1=CC=CC=C1 QAGYKUNXZHXKMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N Crotonoside Natural products C1=NC2=C(N)NC(=O)N=C2N1[C@H]1O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N 0.000 description 1
- NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N D-guanosine Natural products C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1C1OC(CO)C(O)C1O NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000672609 Escherichia coli BL21 Species 0.000 description 1
- 241000131747 Exiguobacterium acetylicum Species 0.000 description 1
- GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N Fluorouracil Chemical compound FC1=CNC(=O)NC1=O GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 1
- 241000713340 Human immunodeficiency virus 2 Species 0.000 description 1
- 208000023105 Huntington disease Diseases 0.000 description 1
- XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N IDUR Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 description 1
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 1
- 241001134654 Lactobacillus leichmannii Species 0.000 description 1
- 102000008109 Mixed Function Oxygenases Human genes 0.000 description 1
- 108010074633 Mixed Function Oxygenases Proteins 0.000 description 1
- 108700019961 Neoplasm Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000048850 Neoplasm Genes Human genes 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010033645 Pancreatitis Diseases 0.000 description 1
- 241000588701 Pectobacterium carotovorum Species 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000607568 Photobacterium Species 0.000 description 1
- 241001517016 Photobacterium damselae Species 0.000 description 1
- 241000881813 Pluralibacter gergoviae Species 0.000 description 1
- 241000590028 Pseudoalteromonas haloplanktis Species 0.000 description 1
- 102000030764 Purine-nucleoside phosphorylase Human genes 0.000 description 1
- 108700006317 Purine-nucleoside phosphorylases Proteins 0.000 description 1
- IWUCXVSUMQZMFG-AFCXAGJDSA-N Ribavirin Chemical compound N1=C(C(=O)N)N=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 IWUCXVSUMQZMFG-AFCXAGJDSA-N 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 108090000787 Subtilisin Proteins 0.000 description 1
- 208000003734 Supraventricular Tachycardia Diseases 0.000 description 1
- 208000001871 Tachycardia Diseases 0.000 description 1
- 241000607594 Vibrio alginolyticus Species 0.000 description 1
- 241000607334 Vibrio mediterranei Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- WWXBHTZSYYGCSG-UHFFFAOYSA-N [4-(carbamoylamino)phenyl]arsonic acid Chemical compound NC(=O)NC1=CC=C([As](O)(O)=O)C=C1 WWXBHTZSYYGCSG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004150 aciclovir Drugs 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 1
- 230000003281 allosteric effect Effects 0.000 description 1
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 1
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940024171 alpha-amylase Drugs 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000002259 anti human immunodeficiency virus agent Substances 0.000 description 1
- 229940124411 anti-hiv antiviral agent Drugs 0.000 description 1
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000798 anti-retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 231100001015 blood dyscrasias Toxicity 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 229960002949 fluorouracil Drugs 0.000 description 1
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 239000003168 generic drug Substances 0.000 description 1
- 102000045442 glycosyltransferase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108700014210 glycosyltransferase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 229940029575 guanosine Drugs 0.000 description 1
- 208000014951 hematologic disease Diseases 0.000 description 1
- 208000018706 hematopoietic system disease Diseases 0.000 description 1
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 239000006225 natural substrate Substances 0.000 description 1
- QAGYKUNXZHXKMR-HKWSIXNMSA-N nelfinavir Chemical compound CC1=C(O)C=CC=C1C(=O)N[C@H]([C@H](O)CN1[C@@H](C[C@@H]2CCCC[C@@H]2C1)C(=O)NC(C)(C)C)CSC1=CC=CC=C1 QAGYKUNXZHXKMR-HKWSIXNMSA-N 0.000 description 1
- 229960000884 nelfinavir Drugs 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 1
- 229940127073 nucleoside analogue Drugs 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 description 1
- 208000027232 peripheral nervous system disease Diseases 0.000 description 1
- 208000033808 peripheral neuropathy Diseases 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 description 1
- 239000012429 reaction media Substances 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 239000000018 receptor agonist Substances 0.000 description 1
- 229940044601 receptor agonist Drugs 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 229940064914 retrovir Drugs 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 229960000329 ribavirin Drugs 0.000 description 1
- HZCAHMRRMINHDJ-DBRKOABJSA-N ribavirin Natural products O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1N=CN=C1 HZCAHMRRMINHDJ-DBRKOABJSA-N 0.000 description 1
- 239000003419 rna directed dna polymerase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 230000006794 tachycardia Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 229940107931 zovirax Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/26—Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
- C12P19/28—N-glycosides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/26—Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
- C12P19/28—N-glycosides
- C12P19/38—Nucleosides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/26—Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
- C12P19/28—N-glycosides
- C12P19/38—Nucleosides
- C12P19/40—Nucleosides having a condensed ring system containing a six-membered ring having two nitrogen atoms in the same ring, e.g. purine nucleosides
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Procedimiento para la síntesis de nucleósidos mediante la utilización de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. La presente invención se refiere a la síntesis de nucleósidos purínicos, nucleósidos pirimidínicos derivados de 5''-fluoruracilo y 5''-clorouracilo o triazoles, por intercambio de bases, mediante la utilización de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. La reacción ocurre partiendo de nucleósidos de uracilo, en un solo paso, a menor temperatura que la utilizada hasta ahora, no observándose reacciones secundarias de degradación del nucleósido formado. Los microorganismos seleccionados son Bacillus psychrosaccharolyticus; Bacillus subtilis ssp. niger; Photobacterium leiognathi; Photobacterium phosphoreum; Psychrobacter immobilis.
Description
Procedimiento para la síntesis de nucleósidos
mediante la utilización de microorganismos psicrotrofos o
psicrotolerantes.
La presente invención, según se expresa en esta
memoria descriptiva, se refiere a la utilización de microorganismos
psicrotrofos en la síntesis de nucleósidos por intercambio de
bases. El proceso es válido para la obtención de nucleósidos
naturales, o no naturales, con buenos rendimientos y
enantioselectividades. Estos compuestos tienen interés como
medicamentos genéricos de actividad antiretroviral, antitumoral o
para la terapia antisentido. Derivados de estos nucleósidos
obtenidos mediante modificaciones simples se pueden utilizar en la
inhibición de la difusión facilitada de nucleósidos naturales para
el tratamiento de ciertas leucemias, agonistas de receptores
A_{1}, A_{2A}, A_{2B}, A_{3}, antiinflamatorios, enfermedad
de Huntington, taquicardias, etc. Su aplicación es en el campo de
la Industria Farmacéutica y en la Industria Veterinaria.
Los análogos de nucleósidos naturales presentan
muchas aplicaciones en terapéutica. Entre ellas, las más
contrastadas son el tratamiento de enfermedades de origen viral
(Dimoglo A.S.; Gorbachov M.Y.; Lesnik T.I.; Saragoglu M.; Yildirich
I.- Current Medicinal Chemistry 1977, 4,
23-34) y el tratamiento de diversas neoplasias
(Sanders P.P.; Kutan R.; Lay M.M.; Robins R.K.- Mol.
Pharmacol. 1983, 23, 534-538).
A partir de 1985 - cuando se descubre que el AZT
(3'-azido-3'-desoxitimina)
inhibe la replicación de los virus HIV-1 y
HIV-2 in vitro - han sido innumerables las
moléculas análogas diseñadas para combatir el SIDA, donde los
2',3'-didesoxinucleósidos constituyen la principal
arma terapéutica contra este tipo de virus. Sin embargo, los
efectos tóxicos colaterales: discrasias sanguíneas, pancreatitis,
neuropatías periféricas, así como la aparición de resistencias a
estos fármacos (AZT, ddl y ddC) siguen siendo los mayores
inconvenientes de este tipo de tratamientos. Esto se está intentado
solventar con el diseño de nuevos agentes potenciales
anti-HIV de estructura nucleosídica.
La importancia económica y social de este tipo de
fármacos es bien patente. Para ello solo hay que recordar las
enfermedades contra las cuales se utilizan – cáncer, SIDA, herpes,
etc. – y los elevados precios de estos fármacos. Su principal
consumo está ligado a la Farmacia Hospitalaria y a los centros de
atención de enfermos de SIDA por lo cual su montante real en ventas
no se refleja en su justa medida en las tablas de fármacos más
vendidos en las Oficinas de Farmacia. Otros ejemplos de este tipo de
fármacos, muy empleados en estos centros son la Zidovudina
(ZDV(Retrovir)), Nelfinavir (Virazep, AG1343), Aziclovir
(Zovirax), (Ruiz Camps I. Inhibidores de transcriptasa inversa,
El farmacéutico de Hospitales. Informe 8 nº 89 1999) etc.
En estos casos la actividad terapéutica se
encuentra relacionada con la alteración del proceso de síntesis de
ADN o de ARN.
No obstante, existen otras dianas farmacológicas
frente a las que son activos los nucleósidos de síntesis. Entre
ellas citaremos:
- 1)
- Inhibición de la difusión facilitada de nucleósidos naturales. Esta metodología se utiliza en el tratamiento de ciertas leucemias humanas. Buolamwimi J.K.- Current Medicinal Chem. 1997, 4, 35-66). Las estructuras son del tipo:
\vskip1.000000\baselineskip
que pueden obtenerse fácilmente a
partir de
adenosina.
- 2)
- Agonistas de receptores A_{1}, A_{2A}, A_{2B}, A_{3} de adenosina, de estructura general (Muller C.E.-Current Medicinal Chem. 2000, 7,1269-1288):
Estos compuestos son inhibidores de adenosina
kinasa o inhibidores alostéricos de los receptores de adenosina.
Por ello tienen aplicación en el tratamiento de la taquicardia
supraventricular, enfermedad de Huntington, etc.
- 3)
- Nucleósidos activos en el tratamiento de los procesos inflamatorios. Estos nucleósidos tienen como estructura general:
que también puede obtenerse
fácilmente a partir de adenosina. Estos nucleósidos se obtienen
oxidando los ribonudeósidos convencionales con monooxigenasas
(Mahamoudian M.-Biocatalysis & Biotransformations 2000, 18,
105-118).
- 4)
- Formación de triples hélices de ADN que permiten obtener nucleósidos antisentido con una extensa secuencia de reconocimiento (Fox K.R.-Current Medicinal Chem. 2000, 7, 17-37; Ganesh K.N.; Rajeev K.G.; Pallan P.S.; Rana V.S.; Barawkar D.A.; Kumar V.A.-Nucleoside & Nucleotides 1997, 16, 12-71; Bijapur J.; Keppler M.D.; Bergquist S.; Brown T.; Fox K.R.-Nucleic Acids Research 1999, 27, 1802-1807; Mercola D; Cohen J.S. Cancer Gene Therapy 1995, 2, 47-53).
- 5)
- Estos compuestos poseen estructuras del tipo:
Ejemplos significativos lo constituyen el
aciclovir y la tiazofurina:
Todo ello justifica por qué en los últimos años,
se han realizado innumerables esfuerzos para lograr la síntesis a
gran escala de nudeósidos con actividad biológica. Éstas se pueden
dividir en dos grandes grupos:
A.- Síntesis químicas
B.- Síntesis
quimio-enzimáticas
La síntesis químicas escalables y generalizables
a todo tipo de nucleósido, parten del azúcar o de un análogo
funcionalizado en C-1 con un grupo saliente que
reacciona con el heterociclo previamente formado. Aunque se han
desarrollado muchos métodos de síntesis, en especial en el caso de
los derivados purínicos, la compleja estructura de estas moléculas,
su inestabilidad, y su polifuncionalidad hacen que se requiera un
elevado número de pasos de síntesis para su preparación, incluidos
los de protección y desprotección de grupos funcionales reactivos.
Además, es difícil el control de la configuración anomérica y la
formación regioespecífica de la unión glicosídica
C-N cuando existen varios posibles grupos
nucleofílicos en las bases (Paf S. and Nair V.; Biotechnol.
Letters, 1997, 19, 349; Wong C.H., Halcomb R.L.,
Ichikawa Y. and Kajimoto T. Angew. Chem. Int. Ed. Engl.,
1995, 34, 511).
Por ello, las síntesis químicas conducen a una
mezcla de compuestos isómeros, donde la separación del producto
buscado puede ser tediosa y complicada obteniéndose rendimientos de
bajos a moderados en producto final lo cual reduce la rentabilidad
económica del proceso.
La síntesis de nucleósidos catalizada por enzimas
puede ser una alternativa a las llevadas a cabo por métodos
químicos ya que no se requieren grupos protectores y usualmente
transcurren con alta regio - y estereoespecificidad (Wong C.H.
Whitesides G.M-., Enzymes in organic synthetic chemistry,
Elsevier Science Ltd., Oxford, Cap.1 (1994); Hanrahan J.R.,
Hutchinson D.W.; J. Biotechnol.1992, 23, 193.) lo cual
simplifica los procesos de separación del producto final de los
productos secundarios de reacción. La alta eficiencia catalítica de
las enzimas y su moderada especificidad por substrato en procesos
in vitro permiten que las reacciones se lleven a cabo sobre
análogos de substratos naturales, utilizando tanto disolventes
orgánicos hidrófilos como hidrofóbicos.
La aplicación de las enzimas libres a la síntesis
de nucleósidos ha sido revisada en dos recientes trabajos de
Ferrero y Gotor (Ferrero M.; Gotor V.-Monatsh Chem 2000,
131, 585-616; Idem.- Chemical Rev.
2000, 100, 4319-4347). Entre ellas hay que
citar las enzimas que catalizan la formación de uniones
glicosídicas por transferencia del azúcar de una base donadora a una
base aceptora (glicosiltransferasas y nucleósidofosforilasas).
Estas enzimas son específicas de
2'-desoxiribosa y son abundantes en especies del
género Lactobacillus como L. leichmanii (Carson D. A.
y Wasson D.B.- Biochem. Biophys. Res. Comm. 1989, 155,
829-839; Stoecker J.D., Poirot A.F., Smith R.M.,
Parks R.E., Ealick S.E., Takabayashi K., Erion M.D.,
Biochemistry 1997, 36 11749) y L. helveticus.
(Krenitsky T., Koszalka G,. Tuttle J., J. Biochemistry. 1981,
20, 3615-3618). Hay dos subclases de enzimas
según sea su mecanismo de acción.
Donde B1 y B2 son dos bases distintas.
Catalizan la transferencia de bases solamente
entre purinas
dRib-Pur(1) +
Pur(2) \Leftrightarrow d Rib-Pur(2)
+ Pur(1)
Catalizan la transformación entre purinas y/o
pirimidinas
i) dRib-Pur(1) +
Pur(2) \Leftrightarrow d Rib-Pur(2)
+ Pur(1)
ii) dRib-Pur + Pyr
\Leftrightarrow d Rib-Pyr + Pur
iii) dRib-Pyr(1) +
Pyr(2) \Leftrightarrow d Rib-Pyr +
Pyr(2)
d Rib =
2'-desoxi-D-ribosa
Pur- = base púrica
Pyr = base pirimidínica
Estas enzimas catalizan la fosforólisis
reversible de ribo o desoxiribonucleósidos con la formación de
ribosa o
2'-desoxiribosa-1-fosfato,
y la base correspondiente. Se conocen purín (EC 2.4.2.1) y
pirimidín (EC 2.4.2.2, EC2.4.2.3 y EC 2.4.2.4)
nucleósidofosforilasas (Burns Ch L., Clair M.H., Frick L.Y.; Spector
Th., Averett D.R., English L.M., Holmes T.H., Krenitsky T.,
Koszalka G.W., J. Med. Chem. 1993, 36,
378-384; Shirae H., Yokozeki K., Uchiyama M.,
Kubota, K. Agric. Biol. Chem.1988, 52,
1777-1783; Lewkowicz E.S.; Martínez N.; Rogert
M.C.; Porro S.; Iribarren A.M.- Biotcehnol.Lett. 2000,
23, 1277-1280), que pueden ser de origen
bacteriano o de tejidos de mamíferos.
Las nucleósido fosforilasas de mamíferos no
aceptan adenosina pero sí inosina, uridina y guanosina como
sustrato (Hanrahan J.R., Hutchinson D.W.; J. Biotechnol.
1992, 23, 193-198). Por el contrario, las
enzimas bacterianas aceptan a los tres nucleósidos purínicos
(Shirae H., Yokozeki K., Uchiyama M., Kubota, K. Agric. Biol.
Chem. 1988, 52, 1777-1783) o a
nucleósidos pirimidínicos como uridina Shirae, H., Yokozeki, K. y
Kubota, K. Agric. Biol. Chem. 1988, 52,
1499-1505). Esto, unido al rápido crecimiento de las
bacterias productoras de estas enzimas y a la sencillez que
presenta su fermentación, hace que sean estas últimas enzimas las
más utilizadas. Como microorganismos productores de estas enzimas
tenemos: Brevibacterium acetylicum ATCC 954 (Nori, N.,
Watanabe, M., Sungawa, K., Uehara, K. y Mikami, Y.
J.Bacteriol. 1991, 17, 121-131),
Erwinia carotovora AJ 2992 (Feng L., Yoshiharu 1., Kimura A.
Applied Environm. Microbiol. 1990, 56,
3830-3834), Bacillus stearothermophilus JTS
859 (Wielgus-Kutrowska B., Kyulikowska E.,
Wierzchowski J., Bzowska A., Shugar D., Eur. J. Biochem.
1997, 243, 408.), E. coli BL21(Rogert M.C.,
Trelles A. J., Porro S., Lewkowicz E. S., Iribarren A.M.
Biocatalysis and Biotransformations. 2002, 20,
347-351), Enterobacter gergoviae CECT 875
(Trelles A. J.; Fernández M.; Lewkowicz E.S.; Iribarren A.M.;
Sinisterra J.V.-Tetrahedron Asymmetry 2003, 44,
2605-2609) etc., que se han empleado en la síntesis
de diversos nucleósidos con actividad antiviral. En este grupo
también hay que citar la nucleósido fosforilasa de Klebsiella
sp(Utagawa T., Morisawa H., Yoshinaga F., Yamazaki A.,
Mitsugi K., Hirose Y., Agric. Blol. Chem., 1985, 49,
1053) que acepta como substratos tanto a nucleósidos pirimidínicos
como purínicos cuando la célula ha sido cultivada en un medio donde
la adenosina era la única fuente de carbono y nitrógeno.
Donde | B^{1}: pirimidina | E_{1}: pirimidín nucleósído fosforilasa |
B^{2}: purina | E_{2}: purín nucleósido fosforilasa | |
o bien | B^{1}: purina | E_{1}: purín nucleósido fosforilasa |
B^{2}: pirimidina | E_{2}: pirimidín nucleósido fosforilasa |
X = H, OH
En la Bibliografía existen trabajos científicos
en los que se emplean diversos microorganismos en estos procesos.
Entre ellos se destacan E. coli y Bacillus
stearothermophilus. en forma de pastas húmedas de células
(Utagawa, T. Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic.
1999, 6, 215-222; Erion, M.D., Takabayashi,
K., Smith, H.B., Kessi, J., Wagner, S., Hönger, S., Shamen, S. L.,
Ealick, S. E. Biochemistry 1997, 6,
11725-11734; Erion, M.D., Stoeckler, J.D., Guida,
W.C., Walter, R.L. Ealick, S.E.- Biochemistry. 1997,
36, 11735-11748).
Entre las principales limitaciones del empleo de
microorganismos mesófilos en esta síntesis destaca la
descomposición de los nucleósidos 6-aminupurínicos
por la adenosin deaminasa (Rogert M.C., Trelles J.A., Porro S.,
Lewkowicz E.S., Iribarren A.M. Bíocatalysis and
Biotransformations. 2002, 20, 347-351).
Esta reacción secundaria puede ser reducida, pero no eliminada,
trabajando a T < 60ºC (Utagawa, T. Journal of Molecular
Catalysis B: Enzymatic. 1999, 6,
215-222: Yokozeki K.; Tsuji T., J. Mol. Catal. B:
Enzymatic, 2000, 10, 207-213). Otra
limitación es la fuerte dependencia de la estructura del azúcar que
limita su aplicación para obtener con un mismo microorganismo
diversos nucleósidos con distintos anillos de azúcar.
Los microorganismos empleados en esta invención
han sido microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes lo que nos
ha permitido bajar la temperatura de reacción. Ninguno de estos
microorganismos se ha descrito previamente como productor de este
tipo de enzimas. Las enzimas de estos microorganismos pueden
trabajar a menores temperaturas que las de los organismos mesófilos
convencionales. Los microorganismos son activos desde 15ºC a 30ºC
(Feller G.; Gerday C.- Cell Mol, Life Science 1997,
53, 830-841). Se han descrito solo algunas
enzimas hidrolíticas obtenidas a partir de estos microorganismos,
fundamentalmente bacterias antárticas. Entre estas podemos citar
la: \alpha-amilasa de Alteromonas
haloplanctis (Feller G.; Zekhnini Z.;
Lummotte-Brasseur J.; Gerday C. Eur. J.
Biochem. 1977, 244, 186-191), la
subtilisina de Bacillus TA 39 (Feller G.; Payan F.; Theys F., Quian
M.; Haser R. And Gerday C. Alteromonas haloplanctics A23
Eur.J. Biochem. 1994, 222, 441-447) o
la (\beta-lactamasa de Psychrobacter
immobilis (Feller G.; Zekhnini Z.;
Lummotte-Brasseur J.; Gerday C. Eur. J.
Biochem. 1977, 244, 186-191). Estas
enzimas presentan un elevado valor de Km por lo que son poco
específicas de substrato.
Procedimiento para la síntesis de nucleósidos
mediante la utilización de microorganismos psicrotrofos o
psicrotolerantes.
En la presente invención se describe por primera
vez el empleo de una serie de microorganismos en la síntesis de
nucleósidos por intercambio de bases. La reacción permite la
obtención en un solo paso de nucleósidos derivados de
6-mercapto purina, purinas,
2,6-diaminopurina u otros derivados de purina
funcionalizadas en 2 y 6, a partir de nucleósidos como uridina,
timidina, 2'-deoxiuridina y
2',3'-dideoxiuridina. Asimismo se han obtenido
nucleósidos pirimidínicos derivados de
5-fluoruracilo, 5-clorouracilo,
timina, etc. y con otras estructuras como triazoles como es el caso
de la ribavirina.
La principal ventaja consiste en que la reacción
ocurre a temperaturas menores de 60ºC, que es la usada
tradicionalmente, por lo que no hay formación de hipoxantina o
derivados a partir de nucleósidos de 6-aminopurina
lo que constituye la principal reacción parásita que disminuye el
rendimiento de la reacción.
Los microorganismos empleados en esta invención
son: Aeromonas salmonicida ssp achromogenes (CECT 895);
Bacillus psychrosaccharolyticus (CECT 4074); Bacillus
subtilis ssp. niger (CECT 4071); Photobacterium damselae
(CECT 626); Photobacterium leiognathi (CECT 4191);
Photobacterium phosphoreum (CECT 4192); Psychrobacter
immobilis (CECT 4492); Vibrio alginolyticus (CECT 436) y
Vibrio mediterranei (CECT 415). Las cepas se encuentran
depositadas en al Colección Española de Cultivos Tipo (CECT,
Universidad de Valencia (Burjassot), Valencia. España).
El medio de fermentación empleado para el cultivo
de estos microorganismos fue el siguiente: extracto de carne,
extracto de levadura y NaCl en agua desionizada; el pH se ajustó a
7.
Los cultivos pueden crecer en cualquier
recipiente apropiado, que podría ser típicamente en un medio sólido
de placas Petri o en medios líquidos en matraces de vidrio tipo
erlenmeyer. Los cultivos se pueden realizar en un intervalo de
temperaturas de 15 a 40ºC, ventajosamente de 15 a 30ºC y
típicamente de 25 a 30ºC. Los cultivos líquidos se llevaron a cabo
con agitación orbital a 100-350 r.p.m. y típicamente
a 200-250 r.p.m.
Las reacciones catalizadas por estos
microorganismos se llevaron a cabo con las células recogidas
después de haber alcanzado su periodo estacionario de crecimiento.
El medio se centrifugó y se separaron las células que se lavaron
con un tampón adecuado y se volvieron a recentrifugar. Las células
limpias se mezclan con tampón adecuado y los reactivos
correspondientes, en distintas relaciones molares. El seguimiento de
la reacción se puede hacer mediante diversas técnicas como
cromatografía de capa fina (TLC) o cromatografía de alta presión
(HPLC).
La estereoquímica de los productos de reacción se
puede determinar por Resonancia Magnética Nuclear (RMN) o
Dispersión óptica rotatoria (DOR).
De acuerdo con esto, la presente invención
proporciona un procedimiento para obtener nucleósidos naturales o
no a partir de otros nucleósidos más baratos empleando células
enteras de microorganismos que se describen aquí por primera vez
con este fin.
Los siguientes ejemplos ilustran la presente
invención pero no son limitativos de su alcance, el cual viene
definido exclusivamente por la nota reivindicativa.
Medio de cultivo sólido: Los
microorganismos se crecieron en placas Petri, un medio compuesto
por 1% (plv) extracto de carne, 0.5% (plv) extracto de levadura y
0.5% (plv) NaCI y agar bacteriológico 2% (p/v), en agua desionizada
ajustando el pH a 7 con KOH.
Medio de cultivo líquido: Los
microorganismos se crecieron hasta saturación en erlenmeyers de 250
ml conteniendo 50 ml de un medio de cultivo compuesto por 1% (plv)
extracto de carne, 0.5% (plv) extracto de levadura y 0.5% (plv)
NaCl en agua desionizada ajustando el pH a 7 con KOH.
Los microorganismos se cultivaron inicialmente en
medio sólido. Cuando el cultivo estuvo bien crecido, se raspó la
superficie del medio sólido para proporcionar suficientes células
como inóculo de los matraces en el paso siguiente.
Los microorganismos se cultivaron en matraces
Erlenmeyer de 250 ml, que contenían 50 ml de medio de cultivo. La
incubación se realizó a 28ºC en una bandeja con agitación orbital a
una velocidad de 200 r.p.m. Los caldos de cultivo fueron recogidos
a 24 hrs.
Las reacciones se llevaron acabo a temperaturas
entre 50 y 70ºC en matraces de vidrio con agitación orbital
constante de 200 r.p.m. El tiempo de reacción varió entre 30 min 21
hrs, según la síntesis a realizar. El caldo de cultivo se
centrifugó a 4.000 r.p.m. y a 4ºC durante 15 min. El líquido
sobrenadante se desechó y la pasta de células se lavó con tampón
fosfato 30 mM (pH=7) y se recentrifugó en las mismas condiciones
que antes. El lavado se repitió otra vez más.
El análisis del transcurso de la reacción se
llevó a cabo por TLC (Cl_{3}CH/metanol 80:20 (v/v)) o por
HPLC.
La pasta de células se mezcló con 10 ml de tampón
fosfato 10 mM (pH=7). La reacción se lleva acabo a 57ºC, empleando
células de Bacillus psychrosaccharolyticus. Las
concentraciones de 2'-deoxiuridina y de adenina
fueron iguales a 0,5 mM. El volumen de reacción se ajustó a 50 ml.
Transcurrida una hora, se separa los microorganismos del medio de
reacción centrifugando a 10.000 r.p.m. durante 20 min. a 4ºC. La
reacción se siguió por HPLC.
El análisis por HPLC se llevó a cabo usando una
columna INTERSIL ODS2 5 \mum (15 cm x 0.46 cm) (Tecnokroma S.A.
España). La longitud de onda fue de 260 nm y la temperatura de la
columna fue de 35ºC. La fase móvil fue HAcO/NaAcO (pH=5.8)/MeOH
(95/5 v/v); Flujo 0.87 ml/min, Presión de 1,800 \pm 15 psi. Los
tiempos de retención (min) fueron: 2'deoxiuridina= 5.56; Adenina =
6.42; Hipoxantina =3.65; 2'-deoxyadenosine =
28.5.
La conversión obtenida fue de un 71% con una
productividad de 32 x 10^{-5} mM/(hr x 10^{6} cel).
La síntesis se llevó a cabo en las mismas
condiciones que en el ejemplo 1, pero empleando células de
Psychrobacter immobilis.
La conversión obtenida fue de un 66% con una
productividad de 23 x 10^{-5} mM/(hr x 10^{6} cel).
La síntesis se llevó a cabo en las mismas
condiciones que en el ejemplo 1, pero empleando ahora una
concentración de 2'-deoxiuridina de 15 mM y de
adenina de 5 mM.
La conversión obtenida fue de un 28% con una
productividad de 0.18 x 10^{-5} mM/(hr x 10^{6} células)
La síntesis se llevó a cabo en las mismas
condiciones que en el ejemplo 1, pero empleando células de
Photobacterium phosphoreum. Las concentraciones de uridina
fueron de 5 mM y la de adenina 0,5 mM.
La conversión obtenida fue de un 47% con una
productividad de 46 x 10^{-5} mM/(hr x 10^{6} cel).
La síntesis se llevó a cabo en las mismas
condiciones que en el ejemplo 4, pero empleando células de
Photobacterium leiognathi.
La conversión obtenida fue de un 66% con una
productividad de 47 x 10^{-5} mM/(hr x 10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Photobacterium leiognathi.
La conversión obtenida fue de un 70% con una
productividad de 32 x 10^{-5} mM/(hr x 10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacíllus subtilis ssp níger.
La conversión obtenida fue de un 68% al cabo de 3
hrs de reacción, con una productividad de 28 x 10^{-5} mM/(hr x
10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacillus subtilis ssp níger.
La conversión obtenida fue de un 38% al cabo de
21 hrs de reacción, con una productividad de 1.2 x 10^{-5} mM/(hr
x 10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacillus subtilis ssp níger.
La conversión obtenida fue de un 45% al cabo de 3
hrs de reacción, con una productividad de 12 x 10^{-5} mM/(hr x
10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacillus subtilis ssp níger.
La conversión obtenida fue de un 36% al cabo de 3
hrs de reacción, con una productividad de 7 x 10^{-5} mM/(hr x
10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacillus subtilis ssp níger.
La conversión obtenida fue de un 18% al cabo de 3
hrs de reacción, con una productividad de 5 x 10^{-5} mM/(hr x
10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacillus psychrosaccharolyticus.
La conversión obtenida fue de un 5% al cabo de 1
hr de reacción, con una productividad de 3,2 x 10^{-5} mM/(hr x
10^{6} cel).
La síntesis se realizó en las condiciones
descritas para el ejemplo 1, pero empleando las células de
Bacillus psychrosaccharolyticus.
La conversión obtenida fue de un 10% al cabo de 3
hrs de reacción, con una productividad de 7 x 10^{-5} mM/(hr x
10^{6} cel).
Claims (16)
1. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos
en un único paso por intercambio de bases que comprende:
- a)
- un nucleósido de uracilo como producto de partida
- b)
- un microorganismo psicrotolerante o psicrotrofo productor de nucleósido fosforilasas o 2'-desoxirribosiltransferasas como agente catalizador
- c)
- una temperatura de reacción entre 45 y 60ºC con una escasa formación de hipoxantina como producto secundario de la reacción por descomposición de nucleósidos de 6-aminopurina.
2. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicación 1, caracterizado porque la temperatura
de reacción es de 57ºC.
3. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones anteriores, caracterizado porque se
emplean las células enteras de los microorganismos utilizados.
4. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones anteriores, caracterizado porque se
parte de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiadenosina utilizando cepas de Bacillus
psychrosaccharolyticus.
5. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones anteriores, caracterizado porque se
parte de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiadenosina utilizando cepas de
Psychrobacter immobilis.
6. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque se parte
de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiadenosina utilizando cepas de Bacillus
subtilis ssp niger.
7. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque se parte
de uridina y se obtiene adenosina utilizando cepas de
Photobacterium phosphoreum.
8. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque se parte
de uridina y se obtiene adenosina utilizando cepas de
Photobacterium leiognathi.
9. Procedimiento para la síntesis de nucleósidos,
según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque se parte
de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiadenosina utilizando cepas de
Photobacterium leiognathi.
10. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de 2',3'-dideoxiuridina y se obtiene
2',3'-dideoxiadenosina utilizando cepas de
Bacillus subtilis ssp niger.
11. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de 2',3'-dideoxiuridina y se obtiene
2',3'-dideoxiribonucleósido de purina utilizando
cepas de Bacillus subtilis ssp niger.
12. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de uridina y se obtiene ribonucleósido de
3-carboxamido-1,2,4-triazol
utilizando cepas de Bacillus subtilis ssp niger.
13. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de uridina y se obtiene ribonucleósido de
6-mercaptopurina utilizando cepas de Bacillus
subtilis ssp niger.
14. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiribonucleósido de
6-mercaptopurina utilizando cepas de Bacillus
subtilis ssp niger.
15. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiribonucleósido de
5'-fluoruracilo utilizando cepas de Bacillus
psychrosaccharolyticus.
16. Procedimiento para la síntesis de
nucleósidos, según reivindicaciones 1 a 3, caracterizado
porque se parte de 2'-deoxiuridina y se obtiene
2'-deoxiribonucleósido de
5'-clorouracilo utilizando cepas de Bacillus
psychrosaccharolyticus.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
ES200400817A ES2241487B2 (es) | 2004-04-02 | 2004-04-02 | Procedimiento para la sintesis de nucleosidos mediante la utilizacion de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. |
PCT/ES2005/000166 WO2005116232A1 (es) | 2004-04-02 | 2005-03-30 | Procedimiento para la síntesis de nucleósidos mediante la utilización de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
ES200400817A ES2241487B2 (es) | 2004-04-02 | 2004-04-02 | Procedimiento para la sintesis de nucleosidos mediante la utilizacion de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2241487A1 ES2241487A1 (es) | 2005-10-16 |
ES2241487B2 true ES2241487B2 (es) | 2006-06-01 |
Family
ID=35151190
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES200400817A Expired - Fee Related ES2241487B2 (es) | 2004-04-02 | 2004-04-02 | Procedimiento para la sintesis de nucleosidos mediante la utilizacion de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
ES (1) | ES2241487B2 (es) |
WO (1) | WO2005116232A1 (es) |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS57146593A (en) * | 1981-03-09 | 1982-09-10 | Ajinomoto Co Inc | Preparation of ribofuranosyltriazole derivative |
US4614719A (en) * | 1982-04-30 | 1986-09-30 | Yamasa Shoyu Kabushiki Kaisha | Process for producing ribavirin |
-
2004
- 2004-04-02 ES ES200400817A patent/ES2241487B2/es not_active Expired - Fee Related
-
2005
- 2005-03-30 WO PCT/ES2005/000166 patent/WO2005116232A1/es active Application Filing
Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
CAVICCHIOLI, R. et al. Low-temperature extremophiles and their applications. Current Opinion in Biotechnology, 2002, Vol. 13 (3), páginas 253-261. * |
LEWKOWICZ, E.S. et al. An improved microbial synthesis of purine nucleosides. Biotechnology Letters, 2000, Vol. 22, páginas 1277-1280. * |
RAMANA, K.V. et al. Biotechnological application of psycrophiles and their habitat to low-temperature. Journal of Scientific and Industrial Research, 2000, Vol. 59, páginas 87-101. * |
RUSSEL, N.J. Toward a molecular understanding of cold activity of enzimes from psycrophiles. Extremophiles, 2000, Vol. 4, páginas 83-90. * |
TRELLES, J.A. et al. Purine nucleoside synthesis from uridine using immobilised Enterobacter gergoviae CECT 875 whole cells. Tetrahedron Letters, 2003, Vol. 44 (12), páginas 2605-2609. * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
ES2241487A1 (es) | 2005-10-16 |
WO2005116232A1 (es) | 2005-12-08 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Mikhailopulo et al. | New trends in nucleoside biotechnology | |
Parks Jr et al. | 16 Purine Nucleoside Phosphorylase | |
ES2582216T3 (es) | Combinación de biocatalizadores termoestables para la síntesis de nucleósidos | |
Utagawa | Enzymatic preparation of nucleoside antibiotics | |
ES2281082T3 (es) | Procedimiento para producir ester nucleosido-5'-fosfato. | |
Barai et al. | A universal biocatalyst for the preparation of base‐and sugar‐modified nucleosides via an enzymatic transglycosylation | |
Cohen | Sponges, cancer chemotherapy, and cellular aging | |
Bresnick | Feedback inhibition of aspartate transcarbamylase in liver and in hepatoma | |
Secrist III et al. | Gene therapy of cancer: activation of nucleoside prodrugs with E. coli purine nucleoside phosphorylase | |
Prasad et al. | Nucleoside synthesis mediated by glycosyl transferring enzymes | |
CN108018252B (zh) | 一种中间体2’-脱氧鸟苷的制备方法 | |
Su et al. | The crystallographic structure of a human dihydropteridine reductase NADH binary complex expressed in Escherichia coli by a cDNA constructed from its rat homologue. | |
Thomson et al. | The nucleic acid metabolism of animal cells in vitro: III. Factors influencing nucleotide biosynthesis | |
ES2241487B2 (es) | Procedimiento para la sintesis de nucleosidos mediante la utilizacion de microorganismos psicrotrofos o psicrotolerantes. | |
Taverna-Porro et al. | Chemoenzymatic preparation of nucleosides from furanoses | |
WO2024040628A1 (zh) | 酶催化合成嘌呤核苷的方法及组合物 | |
Cass | 9-β-D-arabinofuranosyladenine (AraA) | |
Lewkowicz et al. | An improved microbial synthesis of purine nucleosides | |
CN106834176B (zh) | 一种核苷磷酸化酶、编码基因及其高产菌株和应用 | |
Mieczkowski et al. | Potential and perspectives of cyclonucleosides | |
Spadari et al. | Molecular basis for the antiviral and anticancer activities of unnatural L-β-nucleosides | |
JP4066121B2 (ja) | グアノシン類及びその中間体の製造方法 | |
JP4058663B2 (ja) | リボース1−リン酸類及びヌクレオシド化合物の製造方法 | |
RU2664472C1 (ru) | Гидройодная соль 7-метил-2'-дезоксигуанозина в качестве субстрата для получения 2'-дезоксинуклеозидов методом ферментативного трансгликозилирования | |
Gupta et al. | Adenosine deaminase in nucleoside synthesis. A review |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
EC2A | Search report published |
Date of ref document: 20051016 Kind code of ref document: A1 |
|
FG2A | Definitive protection |
Ref document number: 2241487B2 Country of ref document: ES |
|
FD2A | Announcement of lapse in spain |
Effective date: 20240426 |