ES2207395B1 - Nuevos factores transcripcionales hsf y su utilizacion en plantas transgenicas. - Google Patents
Nuevos factores transcripcionales hsf y su utilizacion en plantas transgenicas.Info
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Abstract
Nuevos factores transcripcionales HSF y su utilización en plantas transgénicas. El objeto de la presente invención es un factor transcripcional denominado HaHSFA10, que ha sido clonado en nuestro laboratorio, y que se expresa específicamente en los embriones zigóticos de las semillas de girasol. Además HaHSFA10 es capaz de activar transcripcionalmente a promotores de genes sHSP (small Heat Shock Protein) expresados durante la embriogénesis en el girasol (Helianthus annuus). La estructura de los elementos en cis HSE(Heat Shock cis Elements) presentes en dichos promotores nos ha permitido definir requisitos para la activación transcripcional por HaHSFA10 y confirmar la presencia de HSFs (Heat Shock transcription Factors) funcionalmente equivalentes a HaHSFA10 en otras plantas como el tabaco (Nicoti ana tabacum). Esta información permite proponer el uso de HaHSFA10 (o de HSFs equivalentes) para alterar específicamente la expresión de los genes a los que regula cualquiera de estos factores (porejemplo las mencionadas sHSPs) en semillas de distintas especies de plantas transgénicas.
Description
Nuevos factores transcripcionales HSF y su
utilización en plantas transgénicas.
Agricultura. Herramienta biotecnológica para: 1.-
La obtención de plantas transgénicas de distintas especies que
expresen los genes regulados por HaHSFA10 (en el girasol), o
regulados por factores funcionalmente equivalentes a HaHSFA10 (en
otras plantas), bien a niveles mayores de lo normal (por
sobre-expresión de HaHSFA10), o que prolonguen
temporalmente o extiendan espacialmente su expresión (por expresión
ectópica de HaHSFA10 tras la germinación de las semillas). Los
genes regulados por HaHSFA10 en las plantas transgénicas incluirían
las sHSP embrionarias, cuya expresión en distintas especies
vegetales sin modificar ha sido correlacionada con distintas
propiedades de posible utilidad: por ejemplo, la conservación de su
capacidad de germinación y la tolerancia al estrés hídrico y
térmico antes y durante la germinación de las semillas. 2.-
Incrementar la transcripción de genes quiméricos con secuencias HSE
derivadas de los promotores regulados por HaHSFA10.
La expresión de los genes se controla
primariamente a nivel transcripcional mediante otros genes
reguladores -los factores transcripcionales (FT). Estos actúan como
activadores (FTA) o represores (FTR) de complejos multiprotéicos
que incluyen las polimerasas de RNA y otros componentes comunes de
la maquinaria transcripcional [ver por ejemplo las revisiones por
Kornberg, R. Trends Cell Biol 9,
M46-49.1999; y (en vegetales) por Singh, K. B.
Plant Physiol 118, 1111-1120. 1998;
Liu, L., White, M. J. y MacRae, T. H. Eur J Biochem
262, 247-257. 1999]. La clonación e
identificación de factores transcripcionales implicados, de forma
crítica y suficientemente específica, en la regulación de distintos
conjuntos de genes ha permitido alterar simultáneamente su
expresión en animales y plantas transgénicas. Para ello se han
utilizado dos estrategias conocidas respectivamente por "ganancia
de función" (En plantas transgénicas ver por ejemplo: Kasuga,
M., Liu, Q., Miura, S., Yamaguchi, S. K. & Shinozaki, K. Nat
Biotechnol 17, 287-91. 1999) y "pérdida
de función" (un ejemplo reciente de esto en plantas transgénicas
sería: Schmitz, G., Tillmann, E., Carriero, F., Fiore, C., Cellini,
F. y Theres, K. (2002) Proc Natl Acad Sci USA 99,
1064-1069. 2002). En la "ganancia de función",
la sobre-expresión (generalmente ectópica y
constitutiva) de un FTA, o alternativamente la reducción de la
expresión de un FTR, produce una mayor expresión de los genes
regulados por dicho factor. Esto provoca efectos fenotípicos
positivos dependientes de la función de dichos genes (que
consecuentemente también se incrementa). La "pérdida de
función" es una estrategia complementaria que provoca el efecto
opuesto reduciendo específicamente la expresión de un FTA (o
alternativamente incrementando la de un FTR). Las estrategias de
"pérdida de función" han tenido en general mayores problemas
técnicos derivados de la redundancia funcional de otros FTs
(Riechmann JL y Ratcliffe OJ Curr Opin Plant Biol 3,
423-434. 2000). En vegetales, las estrategias de
"ganancia de función" han producido efectos claros sobre la
tolerancia al calor de las plantas adultas (Prändl R, Hinderhofer
K, Eggers-Schumacher G y Schöffl F Mol Gen
Genet 258, 269- 78. 1998), al frío (Kim JC, Lee S H,
Cheong YH, Yoo CM, Lee SI, Chun HJ, Yun DJ, Hong JC, Lee SY, Lim CO
y Cho MJ. Plant J 25, 247-59. 2001); y
también frente a otros tipos de estrés (Kasuga, M., Liu, Q., Miura,
S., Yamaguchi, S. K. & Shinozaki, K. Nat Biotechnol
17, 287-91. 1999; Park, J. M., Park, C. J.,
Lee, S. B., Ham, B. K., Shin, R. & Paek, K. H. Plant Cell
13, 1035-46. 2001). La identificación de
factores transcripcionales críticos y específicos para la
regulación de genes implicados en cada uno de dichos procesos
posibilitó el éxito de dichas aproximaciones. Existen incluso
patentes previas que proponen el uso de FTs para la ganancia de
función en plantas transgénicas. Algunas de ellas también
contemplan la posible alteración de distintas características de la
semilla (por ejemplo US6160202, US6248937, WO9955840), incluyendo
la tolerancia a la falta de riego y al estrés osmótico (US6248937,
WO9955840). Dichas patentes son similares a nuestra solicitud
únicamente en procedimientos metodológicos de conocimiento usual, y
en la posible utilidad o finalidad general de las patentes: por
ejemplo en la construcción de los genes quiméricos, la producción de
plantas transgénicas de distintas especies, la descripción y
evaluación de las posibles características mejoradas, etc. La
diferencia esencial con esta solicitud es el uso de una nueva
herramienta biotecnológica: un FT completamente distinto, HaHSFA10,
que clonamos e identificamos mediante la evaluación funcional
incluida en la descripción, los ejemplos y las figuras adjuntas.
El trabajo de nuestro grupo ha contribuido a la
identificación de las sHSPs (small Heat Shock Proteins)
embrionarias de plantas como genes con posibles funciones
complementarias a las proteínas LEA (Late Embryogenesis
Abundant) en la tolerancia al estrés hídrico, tanto en semillas
como en tejidos vegetativos (citado recientemente en la revisión de
Hoekstra, F. A., Golovina, E. A. y Buitink, J. Trends Plant
Sci 6, 431-438. 2001). Observaciones de
nuestro laboratorio, y de otros grupos, permiten relacionar la
tolerancia a la desecación de las semillas y al vigor de germinación
con la expresión embrionaria de genes sHSP (ver por ej. Coca, M.
A., Almoguera, C. y Jordano, J. Plant Mol Biol 25,
479-492. 1994; Alamillo, J., Almoguera, C.,
Bartels, D. y Jordano, J. Plant Mol Biol 29,
1093-1099. 1995; Bettey, M. y
Finch-Savage, W. E. Seed Science Research
8, 347-355. 1998). Dichas observaciones
también están apoyadas por el efecto de genes mutantes en especies
modelo como Arabidopsis thaliana. Así, la tolerancia a la
desecación de las semillas y la expresión de las sHSPs se reduce en
algunos mutantes (por ej. abi3-6,
lec1-2, y fus3-3); mientras que
otros mutantes similares que no presentan efectos sobre la
expresión de sHSPs tienen una tolerancia normal (por ej.
abi3-1, lec2-1 y emb266; Wehmeyer,
N., y Vierling, E. Plant Physiol 122, 1099-108,
2000). El conocimiento de los factores transcripcionales implicados
específicamente en la activación del subconjunto de genes sHSP con
expresión embrionaria en plantas, permitiría su
sobre-expresión coordinada por "ganancia de
función"; lo que pudiera producir efectos beneficiosos mediados
por estas sHSPs: por ejemplo, sobre la tolerancia a aumentos
incontrolados de la temperatura y la humedad de las semillas antes
de la germinación. Este tipo de estrés es un problema importante en
la producción y almacenamiento de semillas, pues conduce a la
pérdida de su vigor de germinación.
Nuestro laboratorio ha identificado elementos en
cis implicados en la regulación embrionaria de genes sHSP de
girasol, e identificado algunas peculiaridades del mecanismo de su
activación transcripcional (ver por ejemplo: Almoguera, C.,
Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J
13, 437-46. 1998; Carranco, R., Almoguera,
C. y Jordano, J. Plant Physiol 121,
723-730. 1999; Rojas, A., Almoguera, C. y Jordano,
J. Plant J 20, 601-610. 1999; Rojas
A, Almoguera C, Carranco R, Scharf KD y Jordano J. Plant
Physiol 129, en prensa, 2002). Esto ha permitido
finalmente la donación de un FTA (que denominamos HaHSFA10)
implicado específicamente en la activación transcripcional en
semillas de promotores sHSP. HaHSFA10 es un FT muy peculiar
perteneciente a la familia de los HSFs (Heat Shock transcription
Factors). Los HSFs están generalmente implicados en la respuesta
transcripcional al estrés por aumento brusco de la temperatura
(choque térmico, o heat shock). Aunque se sabía que este
tipo de factores estaba implicado en la regulación de la expresión
de genes sHSP durante el desarrollo embrionario en semillas del
girasol y de otras plantas (ver por ejemplo, Coca, M. A.,
Almoguera, C., Thomas, T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol
31, 863-876. 1996; Prändl, R. y Schöffl, F.
Plant Mol Biol 31, 157-162. 1996;
Almoguera, C., Prieto-Dapena, P., y Jordano, J.
Plant J 13, 437-46. 1998), se
desconocía que los HSFs implicados tuvieran la suficiente
especificidad. Este es también el caso de ABl3, otra familia de FTs
implicada en la regulación de las sHSPs embrionarias (Wehmeyer, N.,
Hernández, L. D., Finkelstein, R. R. y Vierling, E. Plant
Physiol 112, 747-757.1996; Rojas, A.,
Almoguera, C. y Jordano, J. Plant J 20,
601-610. 1999; Wehmeyer, N. y Vierling, E. Plant
Physiol 122, 1099-1108. 2000); pero con
funciones pleiotrópicas muy diversas y no restringidas al
desarrollo embrionario (ver Wehmeyer, N., Hernández, L. D.,
Finkelstein, R. R. y Vierling, E. Plant Physiol 112,
747-757.1996, las referencias citadas por estos
autores; y la revisión por Rohde, A., Kurup, S. y Holdsworth, M.
Trends Plant Sci 5, 418-419. 2000). De
hecho HaHSFA10 es, en el momento de escribir esta solicitud, el
único ejemplo conocido en todos los organismos eucariotas (plantas,
hongos y animales) de un HSF expresado específicamente durante el
desarrollo embrionario: en su caso, en los embriones zigóticos de
las semillas del girasol. Los restantes HSFs descritos hasta el
momento tienen, bien una expresión muy generalizada en ausencia de
estrés térmico, o en el caso de algunos HSFs vegetales su expresión
es también generalizada pero inducible por choque térmico [ver por
ejemplo las revisiones: Morimoto, R. I. Genes Dev 12,
3788-3796. 1998 (para HSFs animales); Schöffl, F.,
Prändl, R. y Reindl, A. Plant Physiol 117,
1135-1141. 1998; Nover, L., Bharti, K., Dbring, P.,
Mishra, S. K., Ganguli, A. y Scharf, K. D. Cell Stress
Chaperones 6, 177-189. 2001 (para HSFs
vegetales); y otras referencias incluidas en estas revisiones].
Sólo uno de los HSFs animales, el HSF4 humano, tiene una cierta
especificidad de tejido; aunque su expresión no es específica de
embriones (Tanabe, M., Sasai, N., Nagata, K., Liu, X. D., Liu, P.
C., Thiele, D. J. y Nakai, A. J Biol Chem 274,
27845-27856. 1999). Por lo tanto, ningún resultado
antecedente permitía suponer que los HSFs implicados en la
regulación transcripcional de las sHSPs en semillas del girasol
tuvieran una especificidad embrionaria. Además de esta información
crucial sobre HaHSFA10 (incluida en el ejemplo 1 de esta
solicitud), mostramos que HaHSFA10 es capaz de activar
transcripcionalmente, en embriones de girasol, a dos promotores de
genes sHSP expresados durante la embriogénesis en el girasol:
Hahsp17.7G4 y Hahsp17.6G1; uno de los cuales
(Hahsp17.6G1) no es activable por choques térmicos
(Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J. J Biol Chem
272, 27470-27475. 1997) y hemos descrito
previamente su activación selectiva utilizando otros HSFs de tomate
(Rojas A, Almoguera C, Carranco C, Scharf KD y Jordano J. Plant
Physiol 129, en prensa. 2002). La estructura de los
elementos en cis HSE presentes en dichos promotores nos ha
permitido definir requisitos para la activación transcripcional por
HaHSFA10 y confirmar la presencia de HSFs (Heat Shock
transcription Factors) funcionalmente equivalentes a HaHSFA10
en otras plantas como el tabaco (Nicotiana tabacum). Esta
última información es vital para permitir el uso de estrategias de
ganancia de función usando HaHSFA10 en plantas transgénicas de
especies distintas al girasol (ver también el ejemplo 5).
Además de las referencias mencionadas
anteriormente, quisiéramos destacar los siguientes precedentes, que
sin anticipar el objeto de nuestra invención, creemos que refuerzan
la viabilidad de nuestra solicitud:
1.- (En relación con la ganancia de función
mediada por sHSPs). Recientemente se ha publicado que la
sobre-expresión constitutiva en plantas
transgénicas homólogas de una sola sHSP de Arabidopsis
thaliana (AtHSP17.6), usando un gen quimérico con secuencias
reguladoras del gen 35S CaMV, incrementa la tolerancia a la falta
de riego y al estrés osmótico durante la germinación de dichas
plantas. Este efecto es limitado (ver Sun, W., Bernard, C., van De
Cotte, B., Van Montagu, M., y Verbruggen, N. Plant J
27, 407-415. 2001); pero es concebible que
pudiera incrementarse usando un FT que incremente la expresión
simultánea de más de una sHSP. Debe tenerse en cuenta que con la
determinación de la secuencia genómica de Arabidopsis
thaliana se han identificado 13 genes sHSP distintos, y que
existen indicios de una multiplicidad similar en otras especies
vegetales (ver Scharf, K. D., Siddique, M., y Vierling, E. Cell
Stress Chaperones 6, 225-237. 2001).
Nuestra invención identifica a un FT utilizable para conseguir dicho
incremento simultáneo de expresión de sHSPs.
2.- Nuestra invención también contempla el uso,
en plantas transgénicas, de HaHSFA10 como FTA de genes quiméricos
con secuencias HSE derivadas de promotores regulados por dicho
factor. Un uso análogo ha sido demostrado anteriormente para otros
FTAs (por ejemplo REB, PBF y O2 de Oriza sativa) y otras
secuencias reguladoras (ver Yang, D., Wu, L., Hwang, Y. S., Chen,
L., y Huang, N. Proc Natl Acad Sci USA 98,
11438-11443. 2001); e incluso dicho uso ha sido
protegido por una patente (W00183792). Estos antecedentes apoyan la
viabilidad de nuestra propuesta alternativa sin anticiparla.
Tampoco nuestros estudios previos, mencionados más arriba en este
apartado, sobre los HSEs de Hahsp17.6G1G1 y de
Hahsp17.7G4G4 anticipan dicha propuesta; pues esta requiere
la clonación y verificación funcional de HaHSFA10 como el activador
de los mencionados genes.
El objeto de la presente invención es un factor
transcripcional activador, de tipo Heat Shock Factor (HSF),
denominado HaHSFA10 en girasol (la secuencia de nucleótidos, SEC.
ID. N°: 1, que codifica este factor está depositada en la base de
datos GenBank con el número de acceso AY099451), y cualquier
otro factor transcripcional activador de tipo Heat Shock
Factor, de girasol o cualquier otra planta, que se exprese
específicamente o restrinja su capacidad de activación
transcripcional en embriones de semillas en desarrollo. La
activación transcripcional de estos factores se realiza
preferentemente a través de elementos en cis de choque
térmico (HSE) "imperfectos", es decir con una estructura
semejante a los HSEs de los genes sHSP de girasol Hahsp17.6G1
y Hahsp 17.7G4.
Igualmente se incluyen en esta invención los
factores transcripcionales que presentan modificaciones (deleciones
o substituciones de aminoácidos, particularmente las substituciones
por los residuos excepcionales indicados en la Figura 1) y/o los
factores derivados de las modificaciones de estos HSFs, siempre que
mantengan la misma funcionalidad en cuanto a capacidad de
activación transcripcional mencionada anteriormente.
Estos factores transcripcionales son utilizados
para conseguir ganancia de función en plantas transgénicas mediante
su sobre-expresión con un gen quimérico, en
semillas y/o ectópica, constitutiva y/o inducible. Esta utilización
comprende los siguientes pasos:
- a)
- Construcción de un gen quimérico fusionando las secuencias HSF, especialmente HaHSFA10, a un promotor y a otras secuencias reguladoras apropiadas, según el tipo de sobre-expresión deseada.
- b)
- Introducción en la planta del gen quimérico (mediante transformación con Agrobacterium, biolística o electroporación)
- c)
- Evaluación de la expresión en las plantas transgénicas del HSF, y de la de los genes regulados por dicho HSF (especialmente las sHSP expresadas normalmente en las semillas).
La ganancia de función conseguida con la
utilización de estos factores transcripcionales pudiera mejorar
diversas propiedades de las semillas (su conservación, su capacidad
de germinación, su tolerancia al estrés) como consecuencia de la
sobre-expresión de los genes activados
transcripcionalmente por dichos factores HSF.
Estos HSFs serían, asimismo, utilizables para
potenciar la expresión en plantas transgénicas de otros genes
quiméricos que contengan elementos en cis HSE de genes
activados transcripcionalmente de forma natural por dichos HSFs, u
otros HSEs imperfectos (naturales o sintéticos). Dichos genes
quiméricos están fusionados a promotores que dirigen la expresión
de secuencias codificantes correspondientes a proteínas o péptidos
con utilidad, y de cualquier origen (biológicos: vegetal, animal,
etc.; o sintético).
Para conseguir ganancia de función y/o potenciar
la expresión de genes, también es posible utilizar factores HSF
quiméricos que incorporen parcialmente secuencias y características
del factor HaHSFA10 (naturales o mejoradas mediante diversas
modificaciones).
modificaciones).
Las plantas transgénicas (monocotiledóneas o
dicotiledóneas) de cualquier cosecha que incorporen los genes
quiméricos construidos y utilizados según se menciona anteriormente
en esta memoria constituyen otro objeto adicional de esta
invención.
Secuencia de amino ácidos de HaHSFA10 en, y cerca
de, la hélice alfa de reconocimiento del ADN (\alpha3). La
predicción de estructura secundaria (en el esquema superior) se
basa en la resuelta para el DBD del HSF de Kluyveromyces
lactis (KI, P22121, Harrison, C. J., Bohm, A. A., y Nelson, H.
C. Science 263, 224-227, 1994). Las
otras secuencias de HSFs incluyen el HSF2 de Homo sapiens
(Hs-2, Q03933), AtHSFA9 de Arabidopsis
thaliana (At-9, BAA97129) y dos ESTs de
Solanum tuberosum (St-EST, BG886969) y
Lycopersicon esculentum (Le-EST, AW930998).
Los símbolos y números de acceso de estas secuencias se indican,
entre paréntesis, en cada caso. Los amino ácidos invariantes se
marcan mediante cajas. El residuo excepcional de arginina presente
en posición 131 de HaHSFA10 y en la equivalente de los dos ESTs
vegetales se resalta en negrita, así como el residuo de ácido
aspártico que reemplaza a la glicina en la proteína de
Saccharomyces cerevisiae Skn7 (U00485). De forma similar
indicamos la substitución de un residuo conservado sin carga, en la
posición 114, por otro cargado positivamente (H o R) en Skn7 y los
HSFs de tipo A10. Los puntos gruesos en el extremo inferior resaltan
las posiciones de estas substituciones de amino ácidos (posiciones
numeradas respecto a la secuencia de HaHSFA10). Mediante análisis
filogenéticos (Neighbor-joining) de la
secuencia completa de los DBD de estos y otros HSFs vegetales de
clase A, hemos corroborado el agrupamiento de
St-EST, Le-EST y
Ha-A10 (valor bootstrap de la rama 0.985,
confirmado mediante 1000 repeticiones del algoritmo).
Panel superior: expresión de mRNAs durante la
embriogénesis zigótica y su desaparición al germinar las semillas.
El estado de desarrollo se indica como días tras la antesis (dpa) o
tras la imbibición (dpi). Panel inferior: ausencia de mRNAs en
órganos vegetativos en condiciones control (C) o de choque térmico
(HS). La acumulación marginal de mRNAs en respuesta al estrés
hídrico (DS) se detectó únicamente tras tiempos de autoradiografía
(72h) mucho más largos que los utilizados para los embriones y
germínulas (18h). Marcadores de peso molecular (MW): DNA marcado
del vector pBluescript (SK+) digerido con HpaII. La cantidad
y calidad de las muestras de RNA total usadas en los ensayos de
protección con Ribonucleasa A se verificó mediante electroforesis en
geles de agarosa al 1% (fotografías en la parte inferior de cada
panel). El esquema en la parte más inferior de esta figura muestra
el extremo 5' de las secuencias transcritas de HaHSFA10 (línea
sólida: UTR, caja: región codificante en la que la posición
prevista para el intrón conservado se indica con un triángulo
oscuro); y la ribosonda antisentido sin digerir (Sonda) usada en
estos ensayos (línea punteada). Las líneas más gruesas, en la parte
inferior, muestran la interpretación de la identidad de los
fragmentos de mRNA protegidos 1 y 2 (señalados con flechas en ambos
paneles). Las posiciones de nucleótidos en el mapa corresponden a
las de la SEC. ID. N°: 1. El signo de interrogación muestra un
posible sitio de iniciación alternativo del mRNA.
La inmuno-detección, mediante
ensayos Western, confirmó la acumulación de la proteína
HaHSFA10 durante la embriogénesis zigótica (a partir de 8 dpa) y en
semillas maduras (22 dpa, panel superior y datos no mostrados). Tras
la germinación detectamos niveles muy bajos de la proteína HaHSFA10
(señalada con una flecha), aunque sólo hasta los 5dpi y en
condiciones control (C). Los tratamientos de estrés por calor (H) o
déficit de agua (D) no re-indujeron la acumulación
de la proteína HaHSFA10 en órganos vegetativos, pues no se detectó
incluso forzando el tiempo de exposición de la autoradiografía
hasta los 30 min (ver el panel inferior). En este caso, como
control positivo incluimos la muestra de embriones de 12 dpa (E).
Marcadores de peso molecular, indicados en kD, a la izquierda. La
calidad y cantidad de las muestras se confirmó mediante tinción de
las proteínas totales con Ponceau-S (parte
superior, P), o mediante inmuno-detección usando
anticuerpos frente a HSC70 (parte inferior, 70).
Panel A (parte superior): Remplazamiento
funcional del gen HSF de levadura ScHsf1 por HaHSFA10. Se
depositaron sobre placas con medio YPD gotas, de un volumen de 3
\mul, con diluciones seriadas (en pasos de 1:10, a partir de
cultivos en fase logarítmica media) de las cepas de levadura RSY4
indicadas. Las placas se incubaron a las temperaturas indicadas a
la izquierda y se fotografiaron tras 4 días de cultivo. Parte
inferior (A): Ensayos de activación transcripcional en levadura
usando plásmidos con el gen delator de la
\beta-Galactosidasa y un promotor mínimo fusionado
a los HSEs naturales (WT) y mutantes (m) de los genes
Hahsp17.7G4 (G4HSE) y Hahsp17.6G1 (G1 HSE). Se
muestran los valores medios obtenidos en ensayos de la actividad
\beta-Galactosidasa usando la cepa RSY4 con
HaHSFA10 transformada con el plásmido indicado. En cada caso se
promediaron los valores (en duplicado) obtenidos con tres
transformantes independientes para cada plásmido. Los barras
muestran los errores estándar. Panel B: Activación en trans
del promotor de Hahsp17.6G1 usando el plásmido efector de
HaHSFA10 en embriones de girasol bombardeados con
micro-proyectiles. Las barras representan la
actividad del gen delator de \beta-Glucuronidasa
(GUS) normalizada con un control interno de luciferasa (LUC). En
estos experimentos usamos plásmidos delatores con genes quiméricos
descritos anteriormente (-1486::GUS y -1486(m)::GUS,
Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J. Plant Physiol
121, 723-730. 1999), que fueron bombardeados
con (+A10), o sin (-A10), el plásmido efector de HaHSFA10. Se
muestran los errores estándar de los valores promedio de actividad
(n>25).
El esquema de la parte superior (A) muestra el
contexto del promotor de los genes quiméricos usados en estos
experimentos. Dichos genes incluyen uno (WT) con los HSEs naturales
(-1132::GUS, Coca, M. A., Almoguera, C., Thomas, T. L. y Jordano,
J. Plant Mol Biol 31, 863-876. 1996);
y los HSEs mutantes descritos previamente: el
"casi-nulo" mutE (m), y el "perfecto"
mutP (P) [ver respectivamente: Almoguera, C.,
Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J
13, 437-46. 1998; y Rojas, A., Almoguera, C.
y Jordano, J. Plant J 20, 601-610.
1999]. Se subrayan los núcleos de las repeticiones de secuencias
consenso en los HSEs; y se indican con minúsculas las
substituciones de nucleótidos (en los mutantes). Los puntos y los
óvalos representan, respectivamente, las posiciones de contacto
críticas y las "mellas" en las secuencias consenso del HSE WT.
Panel B: Activación en trans, de los distintos genes
quiméricos, por el plásmido efector de HaHSFA10 en embriones de
girasol bombardeados con micro-proyectiles. Las
barras muestran las actividades medias de \beta–Glucuronidasa
(GUS) normalizadas con luciferasa (LUC, errores y tamaños de
muestra como en la Figura 5B). En cada caso se indica el gen
quimérico bombardeado con (+A10), o sin (-A10), el plásmido efector
de HaHSFA10. Se observa una activación en trans reducida con
el mutante P, que se resalta con sombreado más oscuro. Panel C:
Expresión de los genes quiméricos en plantas transgénicas de tabaco;
a la izquierda resultados que muestran que el mutante P no afecta a
la expresión en condiciones control (C) o tras choques de calor
(HS); a la derecha se ilustra la reducción de la actividad del gen
P (en comparación con WT) en embriones a los 28 dpa. En este caso el
efecto es estadísticamente significativo y similar al observado con
la activación por HaHSFA10 en embriones de girasol, lo que se
indica con el mismo sombreado usado en el panel B.
En cada caso se indica el gen quimérico
bombardeado con (+A10), o sin (-A10), el plásmido efector de
HaHSFA10. Se observa una activación significativa y similar de los
promotores de Hahsp17.7G4 (G4, en el
gen-1132::GUS, WT en la Figura 6B) y
Hahsp17.6G1 (G1, en el -1486::GUS, ver la Figura 5B). La
actividad de los genes quiméricos se representa y se normaliza como
se explica en las leyendas de las Figuras 4B y 5B. Tamaño de muestra
(n=10).
En la parte superior se muestra el mapa del
plásmido pSKHSFA10-F, del que derivan todos estos
genes, con las secuencias completas de cDNA de HaHSFA10 (ver
también la SEC. ID. N°: 1). Se indican las dianas de restricción
que flanquean las secuencias de HaHSFA10 usadas en la construcción
de los genes. En la parte inferior se muestran esquemas con las
cassettes de expresión correspondientes a los genes
quiméricos a1, a2 y a3. En cada caso se incluyen las respectivas
secuencias reguladoras 5'-flanqueantes (incluyendo
los promotores), 3'-flanqueantes (incluyendo los
terminadores). Se indican las dianas de restricción usadas para
ensamblar, en cada caso, el fragmento de ADN con las secuencias de
HaHSFA10 (sombreado). El resto de las secuencias de los vectores
binarios descrito en el texto de los ejemplos correspondientes no
se representa en esta Figura.
Esta secuencia se determinó mediante el
ensamblamiento de las correspondientes a dos clones de cDNA
(HaHSFA10-36 y HaHSFA10-38). Dichos
cDNAs tienen 5'-UTRs incompletos cuyos extremos se
indican mediante trazos verticales en la primera
(HaHSFA10-38) y segunda
(HaHSFA10-36) líneas de la secuencia. La flecha
indica la posición esperada para un intrón conservado presente en
las secuencias genómicas. Bajo la secuencia de nucleótidos se
muestra la traducción conceptual (in silico) de la proteína
HaHSFA10. El codón de terminación se indica en negrita. También se
indican los dominios putativos 15 identificados mediante
comparaciones de secuencia con otros HSFs: el DBD con la
substitución excepcional de un amino ácido (R, resaltado); el
dominio de oligomerización con las repeticiones solapantes de siete
residuos (HR-A/B) indicadas mediante pequeños
círculos y asteriscos; una posible señal de localización nuclear
bipartita (NLS); otras zona con repeticiones
carboxilo-terminal (HR-C); y
finalmente posibles motivos AHA (subrayados) con 20 residuos de
triptófano (w1-w3).
La realización práctica de esta invención,
representada con los ejemplos y figuras adjuntos, utiliza técnicas
convencionales de Biología Molecular, Microbiología, ADN
recombinante; y de producción de plantas transgénicas, que son de
uso común en laboratorios especializados en estos campos. Estas
técnicas están explicadas con suficiente detalle en la literatura
científica [ver por ejemplo: Sambrok J, Fritsch EF, y Maniatis T,
Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
laboratory Press, 2ª Edición. 1989; Glover DM, DNA Cloning,
IRL Press, 1985; Lindsey K., Plant Tissue Culture Manual,
Kluwer Academic Publishers. 1993; y Gelvin SB, Schilperoort RA,
Verma DPS, Plant Molecular Biology Manual, Kluwer Academic
Publishers. 1992]. Los términos técnicos usados en esta
solicitud (por ejemplo, cDNA, intrón, poly-A,
promotor, 5'-UTR, RLM-RACE, mRNA,
transgén, gen quimérico, gen delator -por reporter gene-,
gen ortólogo, promotor, vector, vector binario, plásmido efector,
expresión, transformación, sistema homólogo, sistema heterólogo,
secuencia nativa -por wild-type o WT- etc.)
son estándar y comprensibles sin ambigüedad por un experto en la
materia. Ejemplos de descripciones precisas de los mismos se
encuentran por ejemplo en WO0183792 (entre en las solicitudes de
patentes citadas anteriormente), además de explicaciones adicionales
que pueden encontrarse en la literatura científica citada en este y
otros apartados de nuestra solicitud. Para otros detalles más
específicos, se citan las referencias bibliográficas pertinentes en
el lugar correspondiente de esta solicitud.
El cDNA de HaHSFA10 ha sido donado en nuestro
laboratorio mediante una estrategia de híbrido sencillo
(one-hybrid) en Saccharomyces
cerivisiae (descrita de modo general por Li, J. J., y
Herskowitz, I. Science 262,
1870-1874. 1993). Los detalles del procedimiento de
donación son irrelevantes para nuestra invención, y serán descritos
con detalle en otra publicación una vez presentada esta solicitud.
Sin embargo, tanto el método de donación, como algunas
peculiaridades de HaHSFA10 observadas en su secuencia (SEC. ID. N°:
1 y Figura 1), son relevantes en tanto que esta información pudiera
utilizarse para obtener FTs homólogos de otras plantas con patrones
de expresión y características funcionales semejantes a las
determinadas para HaHSFA10. El cebo de ADN usado para la donación
de HaHSFA10 tiene una triple repetición directa de las secuencias
HSE proximales (desde la posición -89 a -57) del promotor
Hahsp17.7G4. La secuencia de nucleótidos de este promotor ha
sido descrita con anterioridad (Coca, M. A., Almoguera, C., Thomas,
T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol 31,
863-876. 1996). Dicho cebo se utilizó para donar
distintos FTs a partir de una genoteca de cDNAs preparada con
embriones de girasol a los 14 días tras la antesis. Este cebo se
eligió en base a observaciones preliminares que indicaban que
contenía sitios de unión para distintos FTs (HSFs y otros
diferentes); aunque se desconocía tanto la identidad de dichos
factores como su especificidad (ver Almoguera, C.,
Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J
13, 437-446. 1998, y las consideraciones
expuestas anteriormente en el apartado de "Estado de la
Técnica").
El nombre asignado al FT objeto de nuestra
invención, HaHSFA10, refleja las características y peculiaridades
estructurales deducidas de la determinación de su secuencia (SEC.
ID. N°: 1 y Figura 1 y 8). Debemos destacar la escasa conservación
de la secuencia de nucleótidos de todos los HSFs donados hasta el
momento, por lo que sólo son útiles las comparaciones de la
traducción a amino ácidos de la secuencia de nucleótidos del cDNA de
HaHSFA10 (SEC. ID. N°: 1). Incluso dichas comparaciones deben
limitarse a dos regiones de la secuencia de amino ácidos que
muestran una mayor conservación: el dominio de unión al ADN (DBD) y
el dominio de oligomerización (OD), presentes en todos los HSFs,
pues se trata de unos FTs que se unen al ADN como trímeros [ver por
ejemplo las revisiones: Morimoto, R. I. Genes Dev 12,
3788-3796. 1998 (para HSFs animales); Schöffl, F.,
Prändl, R. y Reindl, A. Plant Physiol 117,
1135-1141. 1998; Nover, L., Bharti, K., Döring, P.,
Mishra, S. K., Ganguli, A. y Scharf, K. D. Cell Stress
Chaperones 6, 177-189. 2001 (para HSFs
vegetales); y otras referencias incluidas en estas revisiones].
Dichas comparaciones permiten que los datos resumidos a
continuación (e ilustrados por la SEC. ID. N°: 1 y la Figura 1 y 8)
puedan utilizarse para identificar tentativamente en otras plantas
distintas al girasol otros HSFs con una estructura y funciones
similares a las de HaHSFA10 (es decir posibles genes ortólogos).
Sin embargo, las características funcionales de estos genes
ortólogos y sus patrones de expresión no pueden ser inferidas
exclusivamente de su secuencia. El conjunto de nuestras
observaciones sobre HaHSFA10 (SEC. ID. N°: 1 y Figuras
2-6) es lo que permite demostrar su utilidad, e
inferir una utilidad similar para posibles genes ortólogos de otras
especies vegetales (ver especialmente la explicación de los datos
ilustrados por la Figura 5C, que apoyan la existencia de al menos
un gen ortólogo a HaHSFA10 en plantas de Nicotiana
tabacum).
HaHSFA10 claramente muestra las características
de los HSF de plantas de clase A. En consecuencia, la secuencia de
aminoácidos obtenida muestra una inserción de 21 residuos entre las
repeticiones hidrofóbicas HR-A y
HR-B, presentes en el OD (ver Nover, L., Scharf, K.
D., Gagliardi, D., Vergne, P., Czarnecka, V. E., y Gurley, W. B.
Cell Stress Chaperones 1, 215-223.
1996). Sin embargo tanto el OD como el DBD de HaHSFA10 muestran una
clara divergencia con los respectivos dominios presentes en el resto
de HSFs de clase A clonados hasta el momento en vegetales (ver
Nover, L., Bharti, K., Döring, P., Mishra, S. K., Ganguli, A. y
Scharf, K. D. Cell Stress Chaperones 6,
177-189. 2001; y la Figura 1). Esto incluye
especialmente la presencia de un residuo de arginina que reemplaza
a una glicina conservada en todos los HSFs (animales y vegetales).
Este cambio ocurre en una posición que flanquea la hélice de
reconocimiento del ADN (\alpha3) en el DBD. Sólo hemos podido
encontrar en las bases de datos dos ESTs (Expressed Sequence
Tags), de Solanum tuberosum y Lycopersicon
esculentum, con secuencias parciales (cDNAs incompletos)
correspondientes a mRNAs que pudieran codificar HSFs con la misma
substitución (Figura 1). Se desconoce incluso si los mRNA
completos, correspondientes a dichos EST, existen y llegan a
traducirse a proteína; así como su patrón de expresión -salvo la
presencia respectiva de mRNAs incompletos en tubérculos y frutos- o
alguna característica funcional de dichos posibles HSFs. El único
ejemplo de un FT semejante a un HSF con una substitución de la
glicina invariante es SKN7, en la levadura Saccharomyces
cerevisiae (Morgan, B. A., Banks, G. R., Toone, W. M., Raitt,
D., Kuge, S., y Johnston, L. H. Embo J 16,
1035-1044. 1997; ver la Figura 1). Otra
característica que distingue a HaHSFA10 es el
re-emplazamiento por arginina de una tirosina
conservada en la mayoría de los HSFs vegetales de clase A (ver
Nover, L., Bharti, K., Döring, P., Mishra, S. K., Ganguli, A. y
Scharf, K. D. Cell Stress Chaperones 6,
177-189. 2001), lo que incluye a AtHSFA9, el HSF de
Arabidopsis thaliana que globalmente presenta una secuencia
de amino ácidos más semejante a HaHSFA10 (ver la R en la posición
114; Figura 1 y 8). Estas dos substituciones de amino ácidos, y los
resultados de otros análisis filogenéticos de la secuencia de
HaHSFA10 mencionados en la explicación de la Figura 1, nos permiten
concluir que HaHSFA10 y los dos ESTs mencionados anteriormente
representarían a un nuevo subgrupo de HSFs vegetales de clase A, al
que hemos denominado A10. Este subgrupo sería suficientemente
distinto del A9, y del resto de los subgrupos propuestos
anteriormente, para considerarlo aparte. En la SEC. ID. N°: 1
señalamos otras características estructurales poco usuales
deducidas de la secuencia de amino ácidos de HaHSFA10: Una región
ácida situada amino-terminalmente respecto al DBD
(los amino ácidos en las posiciones 7-66); y tres
motivos AHA (Aromatic Hydrophobic and Acidic) bastante
peculiares. Dichos motivos AHA son semejantes a los encontrados en
los dominios de activación de otros HSF vegetales de clase A (ver
Döring, P., Treuter, E., Kistner, C., Lyck, R., Chen, A., y Nover,
L. Plant Cell 12(2), 265-278, 2000;
Nover, L., Bharti, K., Döring, P., Mishra, S. K., Ganguli, A. y
Scharf, K. D. Cell Stress Chaperones 6,
177-189. 2001). Sin embargo HaHSFA10 difiere en el
número total de motivos AHA (tres), en sus secuencias, y en su
posición dentro de la molécula (particularmente en la presencia de
un motivo AHA en el extremo carboxilo).
Las siguientes observaciones adicionales
determinan que el FT HaHSFA10, caracterizado por las secuencias de
nucleótidos y de amino ácidos codificadas por su cDNA (SEC. ID. N°:
1, y otras comparaciones más detalladas en la Figura 1), posee las
propiedades adecuadas para los usos propuestos en esta solicitud.
De modo resumido, estas propiedades incluyen: 1.- La especificidad
embrionaria de la expresión de HaHSFA10, comprobada tanto a nivel
de mRNA (Figura 2) como de proteína (Figura 3), utilizando técnicas
con la suficiente sensibilidad. 2.- La capacidad de HaHSFA10 de
sustituir funcionalmente al HSF de Saccharomyces cerevisiae
(ScHSF1) y de activar a genes quiméricos con un promotor mínimo y
los HSEs naturales de los genes sHSP de girasol Hahsp17.7G4
y Hahsp17.6G1 (Figura 4A). 3.- Que HaHSFA10 es capaz de
activar transcripcionalmente a los promotores de Hahsp17.6G1
(Figura 4B) y de Hahsp17.7G4 (Figura 5B) en embriones de
girasol; siendo además el promotor de Hahsp17.6G1 específico
de embriones (Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J. J Biol
Chem 272, 27470-27475. 1997), y
selectivo para su activación transcripcional por otros HSFs
heterólogos de tomate (ver Rojas A, Almoguera C, Carranco C, Scharf
KD y Jordano J. Plant Physiol 129, en prensa, 2002).
4.- El efecto negativo de un HSE mutante (P, Figura 5A) sobre la
activación transcripcional en embriones de promotor
Hahsp17.7G4. Dicho efecto ha sido observado tanto con
HaHSFA10 en embriones de girasol (Figura 5B); como con otros HSFs
endógenos de plantas transgénicas de tabaco (Nicotiana
tabacum), en este caso específicamente en semillas y sin
afectar a la activación transcripcional por calor de dicho promotor
en tejidos vegetativos (Figura 5C). Esta última propiedad de
HaHSFA10 confirmaría: A.- La identificación de HaHSFA10 como un FTA
implicado en la activación embrionaria de los genes sHSP de girasol
Hahsp17.7G4 y Hahsp17.6G1 y de otros genes similares
en otras plantas. B.- La existencia de HSFs funcionalmente
equivalentes a HaHSFA10 en plantas distintas al girasol (en nuestro
ejemplo el tabaco); y por tanto la posibilidad de utilizar HaHSFA10
para estrategias de "ganancia de función" en dichas
plantas.
A modo de ejemplos demostrativos de la utilidad
de HaHSFA10, como herramienta biotecnológica para los usos
propuestos en esta solicitud, describimos con más detalle dichos
resultados experimentales y las figuras acompañantes
correspondientes.
Los patrones de acumulación de los ARN mensajeros
de HaHSFA10 se determinaron mediante la técnica de la protección
frente a la Ribonucleasa A (RNAsa A), descrita con detalle en
publicaciones anteriores de nuestro grupo [Almoguera C, Coca MA,
Jordano J. Plant Physiol. 107: 765-773, 1995;
Carranco, R., Almoguera, C., y Jordano, J. J Biol Chem
272, 27470-27475. 1997]. Esta técnica
combina una gran especificidad con una sensibilidad muy alta,
permitiendo la detección de mRNAs poco abundantes (1 pg mRNA, ver
por ejemplo Meisinger, C., y Grothe, C. Mol Biotechnol
5, 289-291.1996), y procedentes de un único
gen distinguible de otros muy homólogos (en un caso extremo de
genes que sólo se diferencian en un único nucleótido, ver
Almoguera, C., Shibata, D., Forrester, K., Martin, J., Arnheim, N.,
y Perucho, M. Cell 53, 549-554.
1988). Para estos experimentos usamos una colección de muestras de
RNA total purificadas a partir de embriones de girasol y de
distintos órganos de plantas cultivadas en condiciones control o
sometidas a diferentes condiciones de estrés. Estas mismas muestras
han sido usadas previamente para otros análisis de acumulación de
mRNAs durante la embriogénesis del girasol, y para estudiar
mediante protección frente a RNAsa A la respuesta al calor y la
desecación de otros genes de girasol. Por tanto, nuestros estudios
anteriores nos proporcionan controles positivos adecuados para la
expresión durante la embriogénesis y para el efecto de los distintos
tratamientos de estrés en plantas de girasol. Las referencias
bibliográficas correspondientes a dichos estudios también contienen
los detalles de los procedimientos experimentales usados para el
cultivo de las plantas, los distintos tratamientos y la purificación
de las muestras de ARN [Almoguera, C., Coca, M. A., y Jordano, J.
Plant J 4, 947-958. 1993; Coca, M. A.,
Almoguera, C., Thomas, T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol
31, 863-876. 1996; Carranco, R., Almoguera,
C., y Jordano, J. J Biol Chem 272,
27470-27475. 1997].
Para producir la sonda de RNA (ribosonda) usada
para detectar los ARNm de HaHSFA10, primero clonamos, como un
fragmento EcoRI-PstI, uno de sus cDNAs
(HSFA10-36) en el vector pBluescript SK+ (de
Stratagene). Así obtuvimos el plásmido
pSKHSFA10-36, a partir del cual preparamos un nuevo
plásmido pSKHSFA10-RI clonando de nuevo en
pBluescript SK+ el fragmento obtenido mediante digestión de
pSKHSFA10-36 con EcoRI. La orientación de
dicho fragmento es tal que tras linearizar
pSKHSFA10-RI con XhoI, la transcripción
in vitro (ver detalles en Carranco, R., Almoguera, C., y
Jordano, J. J Biol Chem 272,
27470-27475. 1997) con la RNA polimerasa de T3
produce la ribosonda de 507 nucleótidos usada en nuestros
experimentos. Esta ribosonda incluye las secuencias de la cadena
no-codificante de HaHSFA10, desde una posición
situada inmediatamente 3' de la posición prevista para el intrón,
hasta el extremo 5' del cDNA (ver el esquema en la parte inferior de
la Figura 2 y la SEC. ID. N°: 1). Con dicha sonda, tras hibridación
con las muestras de ARN y digestión con RNAsa A, esperábamos la
detección de un fragmento de ARN protegido de un tamaño de 395
nucleótidos. La detección de este fragmento (marcado con "1"
en la Figura 2) requiere la hibridación de la ribosonda con los
mRNAs de HaHSFA10 sin que ocurra ningún desapareamiento. Esto ha
permitido distinguir específicamente los patrones de acumulación de
los mRNAs de este gen. En la parte superior de la Figura 2 se
muestra que los mRNAs del gen HaHSFA10 se empiezan a acumular en
semillas en desarrollo, desde fases tempranas de la embriogénesis
zigótica; y que éstos desaparecen muy pronto tras la imbibición y
germinación de las semillas. Así, los mRNAs de HaHSFA10 se detectan
a partir de los 8 días tras la antesis (dpa), su acumulación se
incrementa hasta los 18 dpa y posteriormente empieza a disminuir.
Dichos mRNAs son apenas detectables a los 5 días tras la imbibición
(dpi); además son indetectables, en condiciones control, tanto en
germínulas de mayor edad (14 dpi), como en distintos órganos (tallos
y hojas) de plantas adultas (datos mostrados el panel inferior de la
Figura 2).
Puesto que tratamientos de estrés por calor
inducen la expresión de algunos HSF vegetales (ver los datos
revisados por Nover, L., Bharti, K., Döring, P., Mishra, S. K.,
Ganguli, A. y Scharf, K. D. Cell Stress Chaperones 6,
177-189. 2001), investigamos un posible
comportamiento semejante en el caso de HaHSFA10. Adicionalmente
estudiamos una posible respuesta al estrés hídrico, ya que la
expresión de los genes sHSP potencialmente regulados por HaHSFA10
se inducen durante la fase de desecación de la embriogénesis (ver
por ejemplo, Coca, M. A., Almoguera, C., Thomas, T. L. y Jordano,
J. Plant Mol Biol 31, 863-876. 1996;
Carranco, R., Almoguera, C., y Jordano, J. J Biol Chem
272, 27470-27475. 1997). Ninguna de dichas
condiciones de estrés indujo la acumulación de los mRNAs de HaHSFA10
tras la embriogénesis zigótica. Tan sólo detectamos niveles muy
bajos de mRNAs inducidos por el estrés hídrico en hojas y tallos,
para lo que necesitamos incrementar substancialmente el tiempo de
autoradiografía (ver los resultados mostrados en el panel inferior
de la Figura 2 y la leyenda correspondiente).
Nuestros experimentos de protección con RNAsa A
también detectaron al menos dos fragmentos adicionales de ARN
protegidos (marcados con "2" en la Figura 2). Dichos
fragmentos, de una tamaño aproximado de 350 nucleótidos, son
demasiado grandes para ser explicados por complementaridad de
secuencia completa (del 100%) con otro gen HSF; ya que tan sólo la
secuencia de nucleótidos de la región DBD se conserva, y usualmente
lo hace de forma escasa. Pensamos que las interpretaciones más
probables para dichos fragmentos podrían ser (ver el esquema
inferior en la Figura 2): 1.- La detección de mRNAs con el intrón
sin procesar (unspliced), en cuyo caso la ribosonda
protegería un fragmento de 361 nucleótidos desde la posición
esperada para el intrón; o, 2.- La detección de mRNAs con un extremo
5' más corto. En ambos casos la detección de distintos mRNAs,
aunque todos ellos procedentes del gen HaHSFA10, explicaría sus
idénticos y muy peculiares patrones de acumulación.
La acumulación de un mRNA no siempre conlleva su
traducción (síntesis) y acumulación de la proteína correspondiente,
que normalmente es la responsable de la función del gen en cuestión.
Por ello, hemos obtenido anticuerpos específicos frente a la
proteína HaHSFA10 y, con ellos, hemos analizado la expresión
(acumulación) de la dicha proteína durante la embriogénesis
zigótica del girasol y en plantas control, o sometidas a los
distintos tratamientos de estrés. El antígeno utilizado, para la
producción de los anticuerpos poli-clonales en
conejos, es una proteína recombinante expresada en células BL21 de
Escherichia coli a partir del plásmido
pRSET-HSFA10\DeltaBglII. Este plásmido contiene
las secuencias del cDNA de HaHSFA10 entre BglII (posición
683) y PstI (posición 1247), insertadas en el vector
pRSET-A (de Invitrogen). El antígeno se
purificó mediante cromatografía de afinidad por metal en columnas
TALON® (de Clontech, usando los procedimientos descritos por
este fabricante). Los anticuerpos obtenidos se purificaron, a
partir del suero completo, mediante adsorción sobre el antígeno
inmovilizado en membranas Immobilon™-P (de Millipore). Esto
se hizo esencialmente como se describe por Almoguera, C., Coca, M.
A., y Jordano, J. Plant J 4, 947-958
(1993). Para la inmunodetección utilizamos membranas de
Immobilon™-P y el sistema ECL+PIus™ (de Amersham
Biosciences). Los anticuerpos primarios purificados se usaron
con una dilución final de 1:4000 en hibridaciones a 4°C durante
unas 16h (ver también los detalles en Almoguera, C., Coca, M. A., y
Jordano, J. Plant J 4, 947-958, 1993).
Las incubaciones con los anticuerpos secundarios, diluidos 1:20000,
fueron durante 1 h a 25°C. Las autoradiografías se obtuvieron por
exposición durante 5 min de película BioMax MS (de Kodak).
Para las hibridaciones con los anticuerpos frente a HSC70 (de
StressGen Biotechnologies Corp., diluidos 1:2000), las
membranas se reciclaron usando los procedimientos y el kit
Re-Blot Plus (de Chemicon
International).
Los resultados de los experimentos de
inmunodetección (análisis Western) mostrados en la Figura 3
confirmaron la mayor parte de nuestras observaciones sobre la
acumulación de mRNA de HaHSFA10 (Figura 2): Así, detectamos la
proteína HaHSFA10 en embriones desde los 8 dpa y verificamos su
ausencia en tallos y hojas de planta en condiciones control y tras
los diferentes tratamientos de estrés. Tras la germinación, la
proteína HaHSFA10 persiste a un nivel bajo, pero (como en caso de
los mRNAs correspondientes) sólo hasta los 5 dpi. También apreciamos
algunas diferencias con los resultados de mRNA, ya que no
conseguimos detectar la acumulación de la proteína HaHSFA10 en
respuesta al estrés hídrico en tejidos vegetativos (comparar las
Figuras 2 y 3). La proteína HaHSFA10 detectada en embriones tiene
un peso molecular aparente de 53.7 kD. Este peso es mayor que el
predicho por la traducción de la secuencia de nucleótidos del cDNA
(43.9 kD); pero una discrepancia similar tiene precedentes en otros
HSFs (ver por ejemplo los datos revisados por Nover, L., Scharf, K.
D., Gagliardi, D., Vergne, P., Czarnecka, V. E., y Gurley, W. B.
Cell Stress Chaperones 1, 215-223.
1996).
De todos los resultados experimentales mostrados
en este ejemplo (ilustrado con las Figuras 2 y 3) concluimos que el
gen HaHSFA10 tiene un patrón de expresión excepcional para un HSF
(considerando todas las observaciones previas en sistemas animales
y vegetales resumidas en el apartado de Estado de la Técnica). La
detección de la proteína HaHSFA10, antes de (y durante) la fase de
desecación de la embriogénesis zigótica del girasol, indica
claramente que este factor podría estar implicado en funciones
especializadas; como la activación transcripcional durante el
desarrollo embrionario de genes sHSP, como Hahsp17.6 G1 y
Hahsp17.7 G4. Los resultados experimentales incluidos en los
ejemplos adicionales confirmarían funcionalmente esta hipótesis,
mostrando así la utilidad de nuestra invención. Aunque también
hemos sido incapaces de detectar la proteína HaHSFA10 en raíces, y
por tanto verificamos su ausencia en todos los órganos vegetativos
del girasol analizados en distintas condiciones, nuestros resultados
no excluyen la expresión de la proteína HaHSFA10 y las de otros
HSFs similares (del nuevo grupo propuesto A10) en otras situaciones
de desarrollo: por ejemplo en gametos, frutos. Se desconocen los
patrones de expresión de los HSFs similares identificados en base a
comparaciones de secuencia y análisis filogenéticos (Figura 1)
salvo la acumulación de sus mRNAs incompletos en frutos de tomate
(Le-EST, AW930998) o en tubérculos de patata
(St-EST, BG886969). No podemos descartar que en
otras especies vegetales la expresión de HSFs de tipo A10 muestre
una especificidad algo distinta de la de HaHSFA10. Así, además de
en semillas, dichos HSFs pudieran expresarse en otras condiciones
de desarrollo y órganos, como los tubérculos, donde también se ha
descrito la expresión de sHSPs en ausencia de estrés (ver Lubaretz,
O., y Zur Nieden, U. Planta 215,
220-228. 2002). Incluso en este caso, la
especialización de los HSFs de tipo A10 sería lo suficientemente
alta para los usos propuestos. La especificidad embrionaria de
HaHSFA10 ha facilitado la identificación de dicho FT en el sistema
de girasol. Las peculiaridades estructurales y otras
características, que distinguen funcionalmente a HaHSFA10 y que se
detallan en los siguientes ejemplos, permitirían la identificación
tentativa de otros HSFs semejantes que tendrían las mismas
utilidades.
En primer lugar hemos confirmado la integridad y
actividad transcripcional de la(s) proteína(s)
HaHSFA10 codificadas por las secuencias de nucleótidos del cDNA
ensamblado en la SEC. ID. N°: 1. Para ello construimos un vector de
expresión apropiado para levaduras que contiene la secuencia
codificante completa de HaHSFA10, desde el primer residuo de
metionina presente hasta la posición 1254 en el
3'-UTR. Este vector nos ha permitido el
re-emplazamiento funcional del único HSF de
Saccharomyces cerevisiae (ScHsf1) por HaHSFA10. La deleción
cromosómica del gen ScHsf1 es letal y no permite el crecimiento de
la levadura incluso a temperaturas normales (sin choque de calor);
sin embargo dicha cepa mutante es viable tras
re-introducir el gen ScHsf1 en un plásmido con el
marcador URA3 (ver el experimento control mostrado en la parte
superior de la Figura 4A y Boscheinen, O., Lyck, R., Queitsch, C.,
Treuter, E., Zimarino, V., y Scharf, K. D. Mol Gen Genet
255, 322-331. 1997). Hemos producido otra
cepa de levadura con HaHSFA10 como su único HSF (cepa
RSY4::HaHSFA10). Los resultados en la parte superior de la Figura
4A demuestran que a 28°C (e incluso a 35°C) dicha cepa tiene una
viabilidad comparable a la de la cepa original (con ScHsf1 en el
plásmido). En cambio, sólo la cepa con ScHsf1 es viable hasta los
37°C. Ambas cepas tuvieron además una tasa de duplicación similar
en medio líquido YPD a 28°C (aproximadamente de unas
2-2.5 horas, datos no mostrados en la Figura). Estos
resultados son comparables a los obtenidos en experimentos análogos
usando otros HSFs de clase A procedentes de Lycopersicon
peruvianum (Boscheinen, O., Lyck, R., Queitsch, C., Treuter,
E., Zimarino, V., y Scharf, K. D. Mol Gen Genet 255,
322-331. 1997).
También hemos usado la cepa RSY4::HaHSFA10 para
demostrar la capacidad de activación transcripcional de distintos
genes quiméricos por HaHSFA10, investigando además la dependencia
de dicha activación de la complejidad de los HSEs presentes en cada
caso. Dichos genes quiméricos contienen un gen delator (la
\beta-Galactosidasa), un promotor mínimo de
levaduras (Cyc1), y distintos HSE (con secuencias naturales,
o mutagenizadas) donados frente al promotor mínimo). Estos HSEs
proceden de dos genes sHSP de girasol expresados durante la
embriogénesis. En primer lugar, mostramos que HaHSFA10 es capaz de
activar a un gen quimérico a través las secuencias de los HSEs de
Hahsp17.7G4 (Figura 4A: panel inferior izquierdo, WT). Estas
secuencias comprenden dos regiones HSE (una proximal y otra distal
respecto al promotor) con su espaciado y repeticiones naturales.
Estos resultados confirman la capacidad de activación
transcripcional de HaHSFA10, a través los HSEs de
Hahsp17.7G4, sin la multimerización utilizada para donar
dicho FT mediante one-hybrid. El nivel de
activación obtenido se redujo considerablemente en una cepa con
otro gen quimérico con una versión mutante (no funcional) de dichos
HSEs (Figura 4A: panel inferior izquierdo, m). Destacamos, sin
embargo, que el nivel de activación residual de dicho gen quimérico
es mayor que el observado en experimentos similares con otros HSFs
vegetales y plásmidos con otros HSEs no funcionales (aproximadamente
1, ver Bharti, K., Schmidt, E., Lyck, R., Heerklotz, D., Bublak, D.,
y Scharf, K. D. Plant J 22, 355-365.
2000). Los HSEs de gen mutante "m" aún conservan un pequeño
número de núcleos de repeticiones con similitud a las secuencias
GAA y TTC, aunque espaciadas por otras secuencias sin esta similitud
(es decir con "mellas" o gaps entre los núcleos de
secuencia conservada; ver Almoguera, C.,
Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J
13, 437-46. 1998, y el esquema en la Figura
5A). Por lo tanto, estas observaciones nos sugirieron que HaHSFA10
pudiera unirse y activar eficientemente la transcripción a través
de otros HSEs naturales con una estructura similar. Esta hipótesis
se ha verificado con las observaciones realizadas utilizando genes
quiméricos análogos con secuencias HSE sin modificar (WT), o en su
versión mutante no funcional (m), procedentes del gen
Hahsp17.6G1. Dichas secuencias contienen un número menor de
repeticiones que en caso de Hahsp17.7G4, y los núcleos
repetidos ya están espaciados por "mellas" en la versión
natural sin modificar (Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J.
J Biol Chem 272, 27470-27475. 1997).
Así, mientras que el gen quimérico con la versión WT del HSE de
Hahsp17.6G1 se activó eficientemente por HaHSFA10, en el gen
con el HSE mutante no funcional (m), que conserva un único núcleo
de tipo GAA, la actividad residual se redujo hasta los niveles
usuales mencionados anteriormente (es decir 1, Figura 4A: panel
inferior derecho). Los resultados experimentales en este ejemplo
demuestran que el FT HaHSFA10, codificado por el cDNA
correspondiente a la SEC. ID. N°: 1, es capaz de sustituir
funcionalmente en levaduras a ScHsf1 (a temperaturas de crecimiento
<35°C) y de activar a genes quiméricos con los HSEs de
Hahsp17.6G1 o Hahsp17.7G4.
A continuación señalamos los detalles específicos
más relevantes de los procedimientos experimentales de este
apartado. Para la substitución de ScHsf1 por HaHSFA10 fue necesaria
la construcción de un plásmido (pSKHSFA10-F, ver su
mapa en la Figura 7 del apartado "otros ejemplos"), derivado
del vector pBluescript SK+ (de Stratagene), con las
secuencias ensambladas completas de HaHSFA10. Esto se hizo ligando
un fragmento de ADN de 120bp, con las secuencias desde el extremo
5' del cDNA hasta el sitio de StyI en la posición 122 de la
secuencia de nucleótidos SEC. ID. N°: 1, junto con resto de las
secuencias del cDNA HaHSFA10-36 clonadas en dicho
vector (en el plásmido pSKHaHSF-36). Las secuencias
del fragmento de 120 pb se clonaron por RLM-RACE
(usando materiales y procedimientos descritos por
Invitrogen, el fabricante de Kit GeneRacer™); y se
amplificaron por PCR usando los oligonucleótidos
HSFA10-RACE (posiciones 265-241 de
la cadena no codificante del cDNA) y TOPO-1
(5'-atcATATTCTCCTTCAAAAA-3'). El
vector de expresión para levaduras se construyó sustituyendo las
secuencias de LpHSFA2 [fragmento de ADN SalI-SacI en
un plásmido derivado de pAD5\Delta descrito previamente
(Boscheinen, O., Lyck, R., Queitsch, C., Treuter, E., Zimarino, V.,
y Scharf, K. D. Mol Gen Genet 255,
322-331. 1997)], por el fragmento correspondiente
con las secuencias de HaHSFA10 en pSKHSFA10-F. Para
sustituir ScHsf1 por HaHSFA10 en la estirpe de Saccharomyces
cerevisiae RSY4, dicha estirpe mutante, con ScHsf1 en un
plásmido URA3, se transformó con el plásmido
pAD5\Delta-HSFA10 (el vector de expresión de
HaHSFA10 para levaduras). El plásmido con ScHsf1 se eliminó
posteriormente tras cultivo durante 5 días en medio
SD-LEU seguido de plaqueo a baja densidad en medio
SD+FOA; finalmente comprobamos el contenido plasmídico de la
estirpe mediante PCR. Para los aspectos generales de este
procedimiento, ver la substitución de ScHsf1 por otros HSFs descrita
anteriormente con suficiente detalle por Boscheinen, O., Lyck, R.,
Queitsch, C., Treuter, E., Zimarino, V., y Scharf, K. D. Mol Gen
Genet 255, 322-331. (1997).
La estirpe Saccharomyces cerevisiae RSY4 y
los procedimientos para los ensayos de actividad
\beta-Galactosidasa también han sido descritos
anteriormente con suficiente detalle (Boscheinen, O., Lyck, R.,
Queitsch, C., Treuter, E., Zimarino, V., y Scharf, K. D. Mol Gen
Genet 255, 322-331. 1997). Los plásmidos
con el gen delator de \beta-Galactosidasa se
construyeron a partir del vector pZJ (Slater, M. R., y Craig, E. A.
Mol Cell Biol 7, 1906-1916.1987) y de
las respectivas secuencias HSE (WT, m) contenidas en otros genes
quiméricos (Hahsp17.7G4::GUS y Hahsp17.6G1::GUS) descritos
anteriormente (ver, respectivamente, Almoguera, C.,
Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J
13, 437-446. 1998, y Rojas A, Almoguera C,
Carranco C, Scharf KD y Jordano J. Plant Physiol 129,
en prensa, 2002). En resumen, cada HSE se amplifico por PCR a
partir de cada gen quimérico GUS. Tras digestión con SalI,
en las dianas de restricción introducidas en los extremos de los
fragmentos de ADN amplificados, cada fragmento se clonó en la diana
XhoI de pZJ. En cada caso se comprobó la secuencia, y
orientación respecto al promotor Cyc1 en pZJ, de cada
secuencia HSE amplificada. Los fragmentos de ADN así amplificados
tienen un tamaño de 88 bp (con los HSEs de Hahsp17.6G1), o de
107 bp (con HSEs de Hahsp17.7G4). Las parejas de
oligonucleótidos usadas para las amplificaciones por PCR fueron:
5'-TAATAATCCGTcGAcAAAAAAGC-3' y
5'-GGATATTGtCgACGTAGTAG-3' (en el
caso de los HSEs de Hahsp17.6G1); y
5'-CCACCTCAgTcgaCCTCTTTT-3', junto
con 5'-AAGAAGGGtcGAcTGAGTAAT-3' (en
el caso de los HSEs de Hahsp17.7G4). Se indican con letras
minúsculas las substituciones de nucleótidos realizadas para
introducir las dianas de SalI (para más detalles respecto a
las construcciones con secuencias HSE de Hahsp17.6G1, ver
también lo descrito por Rojas A, Almoguera C, Carranco C, Scharf KD
y Jordano J. Plant Physiol 129, en prensa, (2002).
Los resultados experimentales obtenidos en
levaduras con el gen quimérico que contiene el HSE natural de
Hahsp17.6G1 (Figura 4A, G1 HSE) sugirieron que el propio
promotor del gen Hahsp17.6G1 pudiera ser activado
transcripcionalmente por HaHSFA10 en embriones de girasol. Dicho
promotor confiere un patrón de expresión único (específico de
semillas y no inducible por calor) entre los genes sHSP vegetales;
una característica hipotéticamente relacionada con la peculiar
estructura de sus HSEs (Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J.
J Biol Chem 272, 27470-27475. 1997;
Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J. Plant Physiol
121, 723-730. 1999).
En este ejemplo mostramos (Figura 4B), mediante
expresión transitoria en embriones de girasol, que HaHSFA10,
expresado a partir de un plásmido efector apropiado, es capaz de
activar a un gen quimérico con el promotor de Hahsp17.6G1
(-1486::GUS); mientras que dicha activación no ocurre en otro gen
quimérico [-1486(m)::GUS] que difiere del anterior en tres
sustituciones críticas de nucleótidos en los HSEs.
De forma análoga al ejemplo anterior, en este
ejemplo mostramos que HaHSFA10 también es capaz de activar a un gen
quimérico con el promotor de Hahsp17.7G4 (del que derivaron
las secuencias HSE usadas para la clonación de HaHSFA10), y que
dicha activación también depende de nucleótidos críticos para la
unión de HSFs a los HSEs (Figuras 5A y 5B).
Los detalles metodológicos no descritos
previamente en la literatura científica, correspondientes a los
experimentos de los ejemplos 3 y 4, y las referencias bibliográficas
para procedimientos (o material) descrito anteriormente se incluyen
a continuación. En el caso del promotor de Hahsp17.6G1, ya
habíamos descrito los genes quiméricos GUS utilizados (Rojas A,
Almoguera C, Carranco C, Scharf KD y Jordano J. Plant Physiol
129, en prensa, 2002); y el efecto de las sustituciones en
los HSEs sobre su activación transcripcional por HSFs endógenos en
embriones de plantas transgénicas de tabaco [Carranco, R.,
Almoguera, C. y Jordano, J. Plant Physiol 121,
723-730. (1999); o incluso por HSFs heterólogos (de
tomate) en embriones de girasol (Rojas A, Almoguera C, Carranco C,
Scharf KD y Jordano J. Plant Physiol 129, en prensa,
2002)]. Los genes con el promotor de Hahsp17.7G4, las
condiciones experimentales para la expresión transitoria en
embriones de girasol, los procedimientos de normalización de la
actividad GUS con luciferasa, y el análisis estadístico de los
resultados han sido descritos con detalle por Rojas, A., Almoguera,
C. y Jordano, J. Plant J 20, 601-610
(1999). El plásmido efector utilizado en estos experimentos
(p35S::HSFA10) contiene la secuencia completa del cDNA de HaHSFA10
clonada tras el promotor y estimulador (enhancer) del gen
35S CaMV procedente del plásmido pBI221 (Jefferson, R.A. Plant
Molecular Biology Reporter 5: 387-405. 1987). El
plásmido p35S::HSFA10 se obtuvo sustituyendo, en pBI221, las
secuencias de gen GUS por las de HaHSFA10. Estas últimas se
purificaron como un fragmento de ADN de 1300pb, con extremos de
EcoRV y SacI, que se obtuvo por restricción del
plásmido pSKHSFA10-F (descrito anteriormente en esta
solicitud, ver la Figura 7 en "otros ejemplos"). Dicho
fragmento se ligó en pBI221, digerido a su vez con SmaI y
SacI.
Nuestros estudios previos de la activación
transcripcional de los genes sHSP de girasol habían determinado que
el gen Hahsp18.6G2 responde a choques de calor, pero en
cambio, y a diferencia de HaHsp17.7G4 y Hahsp17.6G1,
que Hahsp18.6G2 no se activa durante la embriogénesis
zigótica (ver Carranco, R., Almoguera, C. y Jordano, J. J Biol
Chem 272, 27470-27475. 1997). Los
promotores de HaHsp17.7G4 y HaHsp18.6G2 se asemejan en
la presencia de dos regiones HSE de tamaño y posición comparable
(I: proximal y II: distal, respecto al promotor); pero las regiones
HSE de Hahsp18.6G2 difieren en su mayor perfección (o ajuste
a la secuencia consenso repetida aGAA/TTCt), en el sentido de que
carecen de "mellas" o espaciamientos entre los núcleos (core
repeats) de las repeticiones conservadas en cada región (ver la
Figura 5A para los HSEs de Hahsp17.7G4). Por ello, en primer
lugar, y dado que HaHSFA10 es capaz de activar transcripcionalmente
en embriones de girasol al promotor de Hahsp17.7G4 a través
de sus HSEs (ver Figura 5B), decidimos estudiar como afecta a dicha
activación las mutaciones que hacen que dichos HSEs se
"perfeccionen" y se parezcan más a los de Hahsp18.6G2.
En el esquema de la Figura 5A presentamos la secuencia de dichas
mutaciones (P) realizadas en el mismo contexto que el resto de los
genes quiméricos con el promotor de Hahsp17.7G4 (Rojas, A.,
Almoguera, C. y Jordano, J. Plant J 20,
601-610. 1999). Los datos presentados en la parte
derecha de la Figura 5B muestran el efecto observado en este
sistema: una reducción estadísticamente significativa (F=9.82,
P=0.002) de la activación por HaHSFA10 del gen quimérico P
comparado con el WT. Dicha reducción se ve acompañada por un aumento
significativo (F=40.01, P=0.0001) de la actividad basal (es decir
sin HaHSFA10) del gen P, si ésta se compara con la de los genes WT
y m.
Estos resultados demuestran una característica
funcional novedosa y diferencial para HaHSFA10: que dicho FT es
capaz de activar a través de los HSEs naturales (WT) del gen
Hahsp17.7G4 de forma más eficiente que a través de su
versión mutante perfeccionada (P). En cambio otros HSFs se
comportan de la forma contraria, lo que explicaría el incremento de
la actividad basal dependiente de la integridad de los HSEs (debida
a la activación más eficiente de P por otros HSFs presentes en
embriones de girasol), o la similar actividad transcripcional
observada previamente en embriones de girasol con los mismos genes
quimérico WT y P, pero usando un HSF diferente: LpHSFA1 (ver Rojas,
A., Almoguera, C. y Jordano, J. Plant J 20,
601-610. 1999).
Adicionalmente mostramos en este ejemplo el
análisis, usando plantas transgénicas de tabaco, del efecto de la
versión mutante P de los HSEs sobre la regulación del gen quimérico
correspondiente durante el desarrollo embrionario y en respuesta a
los choques de calor (Figura 5C). El uso de dicho sistema
heterólogo es posible ya que previamente habíamos mostrado que con
él podemos reproducir fielmente la regulación transcripcional del
gen Hahsp17.7G4 en ambas condiciones (Coca, M. A.,
Almoguera, C., Thomas, T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol
31, 863-876. 1996; Almoguera, C.,
Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J
13, 437-46. 1998). Por tanto, estos estudios
de expresión estable son complementarios de los de expresión
transitoria utilizados en girasol (el sistema homólogo, Figura 5B),
y nos permiten además determinar las características funcionales de
los HSFs de tabaco implicados en la activación embrionaria del
promotor Hahsp17.7G4. Los resultados que se presentan en el
panel izquierdo de la Figura 5C demuestran que en comparación con
el gen quimérico WT, el gen mutante P no se vio afectado en su
respuesta a choques de calor en germínulas. Ambos genes muestran
niveles de actividad estadísticamente similares en condiciones
control (F=0.06, P=0.81) y tras la inducción por calor (F=0.002,
P=0.96). Sin embargo, durante el desarrollo embrionario observamos
una reducción significativa de la actividad del gen mutante P, que
además ocurre específicamente durante la fase de desecación (28
dpa, F=36.5, P=0.0001), pero no en etapas anteriores (16 dpa,
F=1.67, P=0.2). Por tanto, el efecto negativo del HSE mutante P en
las plantas transgénicas de tabaco es altamente específico y se
restringe a la fase de la embriogénesis zigótica donde se produce
la mayor activación transcripcional del promotor
Hahsp17.7G4. Además dicho efecto es similar, e incluso más
drástico, que el observado sobre la activación por HaHSFA10 de
dicho promotor usando el mismo gen quimérico en el sistema homólogo
de embriones de girasol (comparar las Figuras 5B y 5C). Estos
resultados nos permiten inferir que en las plantas de tabaco
existen HSFs con características funcionales análogas a las de
HaHSFA10 y que su implicación en la activación transcripcional del
promotor Hahsp17.7G4 se restringe a fases determinadas de la
embriogénesis; de acuerdo con el resto de las observaciones sobre
HaHSFA10 en el sistema homólogo de girasol. Dichos factores estarían
también implicados en la regulación embrionaria de genes sHSPs de
tabaco que probablemente tienen HSEs de estructura similar a los de
Hahsp17.7G4 y Hahsp17.6G1. Esta conclusión apoya que
HaHSFA10 pueda usarse para aproximaciones de "ganancia" de
función tanto en el sistema homólogo (girasol) como en plantas
transgénicas heterólogas: por ejemplo el tabaco u otras solanáceas;
y probablemente en cualquier monocotiledónea o dicotiledónea
transformable, ya que la expresión de genes sHSP en semillas
mediada por HSFs parece conservarse evolutivamente (según datos en
las referencias y revisiones citadas en el apartado de estado de la
técnica).
A continuación damos los detalles metodológicos
no descritos previamente en la literatura científica,
correspondientes a los experimentos con las plantas transgénicas de
tabaco incluidos en este ejemplo, y las referencias bibliográficas
para los procedimientos (o el material) descrito anteriormente. El
plásmido binario con el gen quimérico con el HSE mutante P se obtuvo
clonando en pBIN19 (Bevan, M. Nucl. Acids Res. 12,
8711-872. 1987; N° de acceso U09365) un fragmento
de ADN con dicho gen (con extremos de SalI y SacI).
Dicho fragmento lo obtuvimos por restricción del plásmido
SK-1132::GUS(mutP), que previamente hemos
descrito (Rojas, A., Almoguera, C. y Jordano, J. Plant J
20, 601-610. 1999). Los transformantes
primarios (T0), y la primera generación de plantas transgénicas
descendientes (T1), con los genes binarios tanto de
-1132(mutP)::GUS como de
\hbox{-1132(WT)::GUS}, se obtuvieron mediante los procedimientos descritos por Coca, M. A., Almoguera, C., Thomas, T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol 31, 863-876. (1996). Se analizaron en cada caso varias plantas transgénicas con un número similar (1-3) de eventos de integración del transgén. Para los ensayos de expresión durante el desarrollo embrionario se usaron plantas T0 y para los de la respuesta al calor sus descendientes (plantas T1). Los procedimientos para la determinación de la actividad fluorimétrica de la actividad GUS y para el análisis estadístico de los datos se describen en Almoguera, C., Prieto-Dapena, P., y Jordano, J. Plant J 13, 437-446. (1998). Los tratamientos de choque térmico fueron durante 2.5 h a 42°C, seguidos de 3h de recuperación a 25°C antes de las determinaciones de actividad GUS.
Algunos de los usos propuestos para HaHSFA10 en
esta solicitud requerirían su expresión ectópica (es decir fuera de
los embriones) o en sistemas heterólogos (distintos al girasol); y
que en estas condiciones HaHSFA10 sea capaz de activar
transcripcionalmente a los genes sHSP expresados normalmente en
embriones durante el desarrollo. Los datos mostrados en los
ejemplos experimentales anteriores muestran la capacidad de
activación transcripcional de HaHSFA10 a través de los HSEs
apropiados en un sistema heterólogo muy distante evolutivamente al
girasol (la levadura Saccharomyces cerevisiae, Ejemplo 2); y
sugieren la existencia de HSFs funcionalmente equivalentes (de tipo
A10) en especies vegetales distintas al girasol (tabaco en el
Ejemplo 5). Adicionalmente, en este ejemplo, mostramos la capacidad
de activación transcripcional de los promotores de
Hahsp17.6G1 y Hahsp17.7G4 por sobre expresión
ectópica de HaHSFA10 en hojas de girasol (Figura 6). Los genes
quiméricos con ambos promotores (con sus HSEs WT respectivos) se
activan con una eficiencia comparable en un órgano vegetativo en el
que no se expresa HaHSFA10 (ver las Figuras 2 y 3) ni se activan
transcripcionalmente ninguno de estos promotores en ausencia de
estrés (calor o desecación), o incluso tras tratamientos de estrés
(sólo en el caso de Hahsp17.6G1; ver Coca, M. A., Almoguera, C.,
Thomas, T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol 31,
863-876. 1996; Carranco, R., Almoguera, C. y
Jordano, J. J Biol Chem 272,
27470-27475. 1997; Carranco, R., Almoguera, C. y
Jordano, J. Plant Physiol 121,
723-730. 1999). Este ejemplo, junto con los
anteriores, confirmaría la posibilidad de usar HaHSFA10 para la
activación transcripcional ectópica (en hojas y otros órganos
vegetativos) de genes sHSP semejantes a Hahsp17.6G1 y
Hahsp17.7G4 en el girasol y otras plantas.
Las condiciones experimentales de la expresión
transitoria en hojas de girasol difieren de lo descrito
anteriormente en esta memoria para los experimentos análogos
realizados con embriones en los siguientes puntos: el material
vegetal utilizado son trozos cuadrangulares de 1 cm^{2} (del
primer par de hojas verdaderas, sin el nervio principal), que se
esterilizaron por lavados sucesivos con Etanol (70%, durante 1 min)
e hipoclorito sódico (2% + 1 gota de Triton X-100,
durante 30 min), seguido de varios aclarados con agua estéril.
Dichos trozos se cultivan (con la cara correspondiente al haz
dispuesta hacia arriba), 24h antes, y otras 24h tras el bombardeo
con micro-proyectiles, sobre medio sólido MS con
sacarosa (2%), y las hormonas 6-benzilaminopurina
(1 mg/ml) y 1-naftalenoacético (0.1 mg/ml). Las
condiciones para el bombardeo con el sistema Biolistic
PDS-1000 He (de Biorad) difieren
únicamente en el uso de membranas de ruptura de 900 psi (en vez de
1500 psi).
El ejemplo "Ea" representa la construcción
de distintos genes quiméricos que permiten la
sobre-expresión, constitutiva o regulada de
proteína(s) HaHSFA10 (y eventualmente de otros HSFs
funcionalmente equivalentes) en distintas plantas transgénicas (sus
esquemas se muestran en la Figura 7). Los ejemplos anteriores,
junto con los antecedentes mencionados en el Estado de la Técnica
(y en especial, Sun, W., Bernard, C., van De Cotte, B., Van Montagu,
M., y Verbruggen, N. Plant J 27,
407-415, 2001) indican que la consecuencia de
dichas manipulaciones experimentales sería la ganancia de función
consecuencia de la sobre-expresión (y/o expresión
ectópica) de los genes sHSP activados transcripcionalmente de forma
específica por dichos factores (esto último según los ejemplos
2-7). Ni la producción de plantas transgénicas de
distintas especies transformables, ni los procedimientos para la
verificación de la sobre-expresión de dichas sHSPs
y de sus efectos son en sí mismos novedosos o particularmente
cruciales para nuestra invención; existiendo descripciones
suficientemente detalladas de ejemplos análogos con demostrada
eficiencia en la literatura científica y en las bases de datos de
patentes. Igualmente podemos decir de la construcción de los genes
quiméricos, apartado en el que el único punto crucial (el objeto de
nuestra invención) es la inclusión del cDNA de HaHSFA10 (completo o
parcialmente modificado), o en su caso de otras secuencias que
codifiquen HSFs funcionalmente análogos y que por lo tanto pudieran
producir efectos similares sobre la expresión de genes sHSP
regulados por dichos factores. Por ello, aquí nos concentramos en
la descripción de los detalles críticos y de las modificaciones más
evidentes, cubriendo otros aspectos de conocimiento general con
algunas referencias bibliográficas pertinentes. El ejemplo
"Eb", contempla un uso complementario de HaHSFA10: la
activación de genes quiméricos "diana" con distintas
utilidades, utilizando para ello genes quiméricos "efectores"
como los usados en el ejemplo A.
En este ejemplo describimos, de forma no
excluyente, tres genes quiméricos construidos en nuestro
laboratorio y utilizables para ganancia de función por
sobre-expresión de HaHSFA10 en distintas plantas
transgénicas; concretamente (ver la Figura 7):
a1.- Gen para la
sobre-expresión "constitutiva" de HaHSFA10
utilizando el promotor y enhancer de 35S CaMV. Las
secuencias codificantes del gen GUS en el plásmido binario pBI101.1
(número de acceso de secuencia U12639), que además contiene un
terminador del gen nos, se sustituyeron por las del cDNA de
HaHSFA10 (ya clonado tras dicho promotor y enhancer en el
plásmido efector p35S::HaHSFA10, descrito en el ejemplo 4). Así, un
fragmento de ADN de 2168 pb con extremos romos SphI (por
tratamiento con la DNA polimerasa de T4) y SacI, purificado
a partir de p35S::HaHSFA10 se liga al fragmento de ADN de 12033 pb
obtenido por digestión con SmaI y SacI de
pBI101.1.
Este ejemplo es análogo a lo descrito para otros
genes quiméricos utilizados para la ganancia de función por
expresión ectópica el factor ABI4 (patente US6248937). La
sobre-expresión constitutiva de otros HSFs
vegetales, usando genes quiméricos semejantes a los descritos en
este apartado, no ha producido efectos negativos sobre el
crecimiento y desarrollo de las plantas transgénicas; y ha
permitido una ganancia de función (el aumento de la
termo-tolerancia) consecuencia de la activación
específica de los genes sHSP regulados por dichos factores (Prändl
R, Hinderhofer K, Eggers-Schumacher G y Schöffl F
Mol Gen Genet 258, 269-78. 1998;
Mishra SK et al. Genes & Development 16, en
prensa, 2002). Por tanto no es probable que la
sobre-expresión constitutiva de HaHSFA10 sea nociva
para las plantas transgénicas; aunque en los siguientes ejemplos se
presentan distintas soluciones alternativas para dicha
posibilidad.
a2.- Gen para la
sobre-expresión específica en semillas de
HaHSFA10. Usamos el promotor y secuencias reguladoras del gen de
girasol Hads10, contenidas en el vector de expresión
ds10EC1. Dichas secuencias inducen niveles de expresión muy
elevados en distintos tejidos embrionarios, y no la permiten en
tejidos vegetativos y otros órganos salvo una expresión residual en
el polen (Prieto-Dapena, P., Almoguera, C., Rojas,
A., y Jordano, J. Plant Molecular Biology 39,
615-627. 1999; y Patente PCT/ES99/00017). Este gen
se construye en dos pasos. Las secuencias utilizadas de HaHSFA10 se
obtienen, como un fragmento de ADN de 1258 pb, mediante doble
restricción con EcoRV y SmaI del plásmido
pSKHSFA10-F (descrito en el ejemplo 2). Dicho
fragmento se liga al vector de expresión ds10EC1 (descrito en
nuestra patente PCT/ES99/00017), que previamente se prepara
mediante restricción con EcoRI y relleno de los extremos con
klenow. Se verificó que la orientación del inserto de
HaHSFA10 respecto al promotor en ds10EC1 es correcta, obteniendo así
el plásmido intermedio pds10EC1::HaHSFA10. La versión binaria final
de este plásmido (pBIN19::ds10EC1::HaHSFA10) se obtuvo clonando en
el vector pBin19 (Bevan, M. Nucl. Acids Res. 12,
8711-872. 1987; N° de acceso U09365), que
previamente se digirió con ambos enzimas, el fragmento de ADN de
unas 5 Kb, obtenido por doble restricción con SalI y
SacI a partir del plásmido pds10EC1::HaHSFA10.
a3.- Gen para la
sobre-expresión de HaHSFA10 utilizando el promotor y
las secuencias reguladoras de Hahsp17.7G4 (contenidas en
el gen quimérico - 1132(\DeltaBglII)::GUS,
Almoguera C, Rojas A, y Jordano, J. Plant Phys 129,
313-341 (2002); o modificaciones de dichas
secuencias, por ejemplo según nuestra patente Española P9602746).
Con este transgen la proteína HaHSFA10 se produce a partir de un
promotor activado por ella (demostrado con el ejemplo 4), lo que
provocaría un lazo de retro-alimentación
(feedback) que amplifica esta activación y la cantidad final
de HaHSFA10. Además, y dado el patrón de expresión observado con el
gen -1132(\DeltaBglII)::GUS en plantas transgénicas
de tabaco, el nuevo transgen serviría no sólo para
sobre-expresar HaHSFA10 en semillas, sino también
ectópicamente y de forma inducible, por ácido abscísico (ABA), o
por calor, en tejidos vegetativos (ver también la expresión del gen
-1132::GUS, una fusión traduccional muy similar a
-1132(\DeltaBglII)::GUS que aunque se induce peor
por calor, lo hace bien en respuesta a ABA, Coca, M. A., Almoguera,
C., Thomas, T. L. y Jordano, J. Plant Mol Biol 31,
863-876. 1996). La expresión ectópica de la proteína
HaHSFA10 en respuesta a tratamientos de calor pudiera ser muy
ventajosa, ya que en estas condiciones no se expresa normalmente
HaHSFA10 (Figuras 2 y 3), y precisamente el aumento de temperatura
conduce a un deterioro del vigor de germinación (Bentsink, L.,
Alonso Blanco, C., Vreugdenhil, D., Tesnier, K., Groot, S. P., y
Koornneef, M. Plant Physiol 124,
1595-1604. 2000), lo que pudiera evitarse por
ganancia de función con HaHSFA10.
Una estrategia de expresión transgénica similar
ha sido utilizada con éxito para conseguir una mayor tolerancia al
frío y a la falta de riego en plantas que
sobre-expresan el factor DREB1A usando genes
quiméricos bajo el control del promotor del gen Atrd29A
(activado transcripcionalmente por dicho factor); eliminando así
inconvenientes derivados de la sobre-expresión
constitutiva de DREB1A con el promotor y enhancer 35S CaMV
(ver, Kasuga, M., Liu, Q., Miura, S., Yamaguchi, S. K. &
Shinozaki, K. Nat Biotechnol 17,
287-91. 1999). En nuestro caso la construcción del
transgen con las secuencias de HaHSFA10 y de Hahsp17.7G4 se
ha hecho de la forma siguiente: El fragmento de ADN del cDNA
HaHSFA10 con extremos de EcoRV y SacI (de 1300pb) se
obtiene a partir de pSKHSFA10-F (plásmido descrito
en el ejemplo 2); y se clona en un vector binario derivado de pBI
101.1 que contiene el gen quimérico
-1132(\DeltaBglII)::GUS::nos (descrito por Almoguera
C, Rojas A, y Jordano, J. Plant Phys 129,
313-341. 2002). Esto se hizo eliminando primero el
fragmento de ADN con las secuencias codificantes del gen GUS
(mediante doble restricción con SmaI y SacI), y
ligando después el fragmento anteriormente indicado (de 1300 pb)
con las secuencias de HaHSFA10.
Mediante los genes a2 y a3 intentamos producir
efectos fenotípicos por el HaHSFA10 acumulado durante la
embriogénesis, sin los inconvenientes de su expresión ectópica
continuada en tejidos vegetativos (no probables, pero posibles con
el gen a1). Como controles negativos usaremos plantas transgénicas
en las que el gen GUS se expresa utilizando los promotores y
secuencias reguladoras correspondientes. La expresión de los
transgenes puede verificarse y cuantificarse usando determinaciones
fluorimétricas (plantas GUS) y anticuerpos específicos disponibles
para la inmuno-detección en Westerns de
HaHSFA10. Los efectos fenotípicos de la
sobre-expresión sobre el crecimiento y la
apariencia general de las plantas transgénicas pueden determinarse
por procedimientos estándar. La viabilidad de germinación de las
semillas se determinaría sometiéndolas a pruebas de envejecimiento y
deterioro controlado, mediante tratamientos de humedad (85%) y
temperatura (40°C) elevadas; estudiando a continuación la
viabilidad de germinación (Bentsink, L., Alonso Blanco, C.,
Vreugdenhil, D., Tesnier, K., Groot, S. P., y Koornneef, M.
Plant Physiol 124, 1595-1604. 2000).
La tolerancia a la desecación de las semillas tras la germinación
se analizaría mediante otros procedimientos descritos previamente
(Sun, W., Bernard, C., van De Cotte, B., Van Montagu, M., y
Verbruggen, N. Plant J 27, 407-415,
2001).
Podrían obtenerse de forma análoga otros genes
quiméricos que contengan las secuencias del cDNA de HaHSFA10 (o de
otro HSF funcionalmente equivalente), y promotores y secuencias
reguladoras 5'-flanqueantes o
3'-flanqueantes (terminadores) procedentes de otros
genes. Esto no supone complicaciones técnicas adicionales a lo
descrito anteriormente, por lo que sería fácilmente realizables por
personas con conocimientos suficientes en el sector de la técnica
de la invención. Así por ejemplo, serían fácilmente concebibles
genes quiméricos con otros promotores constitutivos (de origen
viral o diferente) que muestren similar eficiencia y especificidad
a las de 35S CaMV en plantas transgénicas (como es el caso de lo
descrito por: Daraselia, N. D., Tarchevskaya, S., y Narita, J. O.
Plant Physiol 112, 727-733, 1996;
Maiti, I. B., Gowda, S., Kiernan, J., Ghosh, S. K., y Shepherd, R.
J. Transgenic Res 6, 143-156. 1997;
Medberry, S. L., y Olszewski, N. E. Plant J 3,
619-626. 1993; y M Ni, D Cui, J Einstein, S
Narasimhulu, CE Vergara, y SB Gelvin. Plant J 7,
661-676. 1995). También dichos genes quiméricos
pudieran derivar de otros vectores binarios distintos a pBIN19 (el
usado en todos nuestros ejemplos, número de acceso de secuencia
U09365). Igualmente, para conferir expresión específica de HaHSFA10
en semillas pudieran utilizarse otros promotores y secuencias
reguladoras de genes vegetales que codifican proteínas de reserva, u
otros productos expresados exclusivamente en semillas durante
diversas etapas del desarrollo (véanse por ejemplo las siguientes
referencias bibliográficas y patentes, así como otros documentos
citados en ellas: Thomas TL, en Plant Cell, vol 5, pp
1401-1410, 1993; Gatehouse JA, y Shirsat AH, en
Control of Plant Gene Expression, pp
357-375, CRC press, 1993; y las patentes USA
números: 5530192, 5530194 y 5420034). Adicionalmente, pudieran
utilizarse genes quiméricos con distintos promotores y secuencias
reguladoras que permitan la expresión inducible de HaHSFA10 en
plantas transgénicas, por ejemplo utilizando sistemas inducibles
por etanol, receptores de hormonas esteroides, u otros agentes.
Incluso dichos sistemas pueden combinarse con procedimientos para
la amplificación de los mRNAs inducidos mediante replicasas virales,
como por ejemplo los que se detallan en las siguientes referencias:
Gatz C, y Lenk I. Trends in Plant Science 3,
352-358. 1998; Martínez, A., Sparks, C., Hart, C.
A., Thompson, J., y Jepson, I. Plant J 19,
97-106. 1999; Zuo, J., Niu, Q. W., y Chua, N. H.
Plant J 24, 265-273. 2000; Mori, M.,
Fujihara, N., Mise, K., y Furusawa, I. Plant J 27,
79-86. 2001; y Frey, A. D., Rimann, M., Bailey, J.
E., Kallio, P. T., Thompson, C. J., y Fussenegger, M. Biotechnol
Bioeng 74, 154-163. 2001.
Otra posible variación evidente de nuestro
procedimiento sería la modificación (mutagénesis, deleción o
adición de residuos de amino ácidos o de nucleótidos) de las
secuencias de HaHSFA10 (según la SEC. ID. N°: 1 y la Figura 1); o
el uso análogo de otros HSFs funcionalmente equivalentes a HaHSFA10
(teniendo en cuenta las características de este último factor según
los datos en los ejemplos 1-6). Así en otros HSFs la
deleción de determinadas secuencias [por ejemplo repeticiones
hidrofóbicas carboxilo-terminales (HR_C) también
presentes en HaHSFA10: ver la SEC. ID. N°: 1] provoca su
trimerización, la unión eficiente al ADN, e incluso su activación
transcripcional en ausencia de calor (ver los datos revisados por
Morimoto, R. I. Genes Dev 12,
3788-3796. 1998; Schöffl, F., Prändl, R. y Reindl,
A. Plant Physiol 117, 1135-1141.
1998), o en ausencia de otros estímulos externos (Zhu, Z., y
Mivechi, N. F. J Cell Biochem 73,
56-69. 1999). Es más, la modificación de amino
ácidos concretos (incluso de un único residuo) en el DBD puede
producir HSFs mutantes que activen mejor la transcripción
específicamente y sin cambios en su unión al ADN (ver, Bulman, A.
L., Hubl, S. T., y Nelson, H. C. J Biol Chem 276,
40254-40262. 2001). Dichos precedentes hacen
concebible que el propio HaHSFA10 pudiera mejorar su capacidad de
activación transcripcional específica mediante modificaciones
análogas. Incluso otros HSFs distintos pudieran adquirir fácilmente
las características útiles de HaHSFA10, mediante pequeños cambios
de secuencia (por ejemplo con una, o dos, de las substituciones de
amino ácidos extraordinarias presentes en los HSF de tipo A10 y
señaladas en la Figura 1); o mediante la combinación, en nuevos HSF
quiméricos, de cualquiera de las secuencias y dominios descritos en
la SEC. ID. N°: 1, y en la Figura 1, con otros dominios y secuencias
procedentes de otros HSFs. Un ejemplo de esta última posibilidad se
ha demostrado recientemente con dos HSFs animales: ver Ahn, S. G.,
Liu, P. C., Klyachko, K., Morimoto, R. I., y Thiele, D. J. Genes
Dev 15, 2134-2145. (2001).
Los distintos genes quiméricos podrían ser
transformados eficientemente a otras plantas diferentes del tabaco
(el sistema modelo usado en el ejemplo 5) y de mayor importancia
económica; como por ejemplo el girasol, la soja, la colza, la
"canola", el maíz, el trigo, la cebada, el arroz, la
"casava", la judía, el cacahuete, etc. La transformación
genética de dichas plantas es posible y está documentada
suficientemente en la literatura científica: veáse por ejemplo
Lindsey K, Ed. (1993). [Plant Tissue Culture Manual. Kluwer
Academic Publishers]; y la revisión por Christou [Trends in
Plant Science. 1: 423-431, 1996]. Estas y otras
posibilidades adicionales también se contemplan y se documentan
suficientemente, por ejemplo, en las siguientes patentes
relacionadas con nuestra invención: US6248937, US6160202 y
WO0183792.
Los mismos genes quiméricos (y sus posibles
modificaciones) que permiten la sobre-expresión en
semillas (y/o ectópica) de HaHSFA10, y que se describen en el
ejemplo "Ea" (ver la Figura 7), pueden usarse para incrementar
la expresión de cualquier otro gen quimérico "diana" que
contenga secuencias HSE activables por HaHSFA10. Estos genes
quiméricos "diana" pueden introducirse en la plantas
transgénicas que sobre-expresan HaHSFA10 tanto por
transformación genética directa como mediante cruzamiento sexual con
otras plantas que los contengan. Las secuencias HSE en los genes
quiméricos "diana" pueden derivar de Hahsp17.6G1,
Hahsp17.7G4 o de cualquier otro gen sHSP (ver las
características estructurales apropiadas para la activación por
HaHSFA10 determinadas experimentalmente en el ejemplo 5). Los genes
quiméricos diana contendrían, además de un promotor activable por
HaHSFA10 a través de dichos HSEs, las secuencias que codifiquen un
producto (péptido o proteína, natural o sintético/a) con propiedades
útiles: como proteínas de reserva, enzimas de la biosíntesis de
lípidos, proteínas con actividad farmacológica etc. (ver nuestras
Solicitudes de Patentes Españolas 9602746 9701215, y
PCT/ES99/00017). En las plantas transgénicas donde se combinara la
sobre-expresión de HaHSFA10 con la presencia de
dichos genes quiméricos diana se producirían simultáneamente dos
efectos beneficiosos: la ganancia de función a consecuencia de la
activación de los genes sHSP nativos de la planta (los expresados
normalmente en semillas y activados por HSFs semejantes a
HsHSFA10); y una mayor producción de la proteína útil con la
potenciación de su efecto sobre la composición proteica o lipídica
de la semilla (consecuencia de la activación del gen quimérico
diana).
Los usos de HaHSFA10 contemplados en el ejemplo
"Eb" admitirían todas las variaciones descritas en una patente
previa (WO0183792). Dicha patente difiere de nuestra solicitud
únicamente en el uso de distintos FTs, y por tanto de diferentes
secuencias reguladoras (que en nuestro caso son HSEs peculiares)
incluidas en los genes quiméricos activados por dichos factores.
Para otros detalles técnicos de conocimiento general aplicables a
este uso de HaHSFA10 puede consultarse WO0183792 y un artículo
reciente relacionado con dicha patente (Yang, D., Wu, L., Hwang, Y.
S., Chen, L., y Huang, N. Proc Natl Acad Sci USA 98,
11438-11443, 2001).
<110> Consejo Superior de Investigaciones
Científicas
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Nuevos factores transcripciones HSF y
su utilización en plantas transgénicas
\vskip0.400000\baselineskip
<130> Factores transcripcionales HSF
\vskip0.400000\baselineskip
<140> PCT/ES03 / 00348
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
2003-07-10
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1434
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Helianthus annuus
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (61)..(1173)
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 371
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Helianthus annuus
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligo TOPO-1
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatcatattct ccttcaaaaa
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligo HSE G1a
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptaataatccg tcgacaaaaa agc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligo HSE G1b
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggatattgtc gacgtagtag
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligo HSE G4a
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccacctcagt cgacctcttt t
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligo HSE G4b
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagaagggtc gactgagtaa t
\hfill21
Claims (10)
1. El factor transcripcional activador, de tipo
Heat Shock Factor (HSF), denominado HaHSFA10 en girasol,
caracterizado porque está codificado por la traducción de la
secuencia de nucleótidos SEC. ID. N°: 1 depositada en la base de
datos GenBank con el número de acceso AY099451.
2. Factores transcripcionales activadores, de
tipo Heat Shock Factor (HSF), de girasol o de cualquier otra
planta, y particularmente HaHSFA10, caracterizado(s)
porque se expresa(n) específicamente o restringen su
capacidad de activación transcripcional en embriones de semillas en
desarrollo.
3. Factor transcripcional activador según las
reivindicaciones 1 y 2, caracterizado por su preferente
capacidad de activación transcripcional a través de elementos en
cis de choque térmico (HSE) "imperfectos", es decir con
una estructura semejante a los HSEs de los genes sHSP de girasol
Hahsp17.6G1 y Hahsp17.7G4.
4. Factor transcripcional activador según la
reivindicación 1 caracterizado adicionalmente por
modificaciones (deleciones o substituciones de aminoácidos,
particularmente las substituciones por los residuos excepcionales
indicados en la Figura 1); o factores derivados de las
modificaciones de estos HSFs, y particularmente de HaHSFA10, que
mantengan su funcionalidad en cuanto a capacidad de activación
transcripcional según las reivindicaciones 2 y 3.
5. Utilización de un factor transcripcional
activador según las reivindicaciones 1-4, para
ganancia de función en plantas transgénicas mediante su
sobre-expresión con un gen quimérico, en semillas
y/o ectópica, constitutiva y/o inducible. Dicha utilización
comprende los siguientes pasos:
- d)
- Construcción de un gen quimérico fusionando las secuencias HSF, especialmente HaHSFA10, a un promotor y a otras secuencias reguladoras apropiadas, según el tipo de sobre-expresión deseada.
- e)
- Introducción en la planta del gen quimérico (mediante transformación con Agrobacterium, biolística o electroporación)
- f)
- Evaluación de la expresión en las plantas transgénicas del HSF, y de la de los genes regulados por dicho HSF (especialmente las sHSP expresadas normalmente en las semillas).
6. Utilización de un factor transcripcional (HSF)
según la reivindicación 5, caracterizada porque la ganancia
de función conlleva efecto(s) sobre la conservación de las
semillas, su capacidad de germinación, y/o de su tolerancia al
estrés como consecuencia de la sobre-expresión de
los genes activados transcripcionalmente por dicho HSF.
7. Utilización de un factor transcripcional
activador según las reivindicaciones 1-4, para
potenciar la expresión en plantas transgénicas de otros genes
quiméricos que contengan elementos en cis HSE de genes
activados transcripcionalmente de forma natural por dicho factor, u
otros HSEs imperfectos (naturales o sintéticos) según se define en
la reivindicación
3.
3.
8. Utilización de un factor transcripcional
activador según la reivindicación 7 caracterizada porque los genes
quiméricos están fusionados a promotores que dirijan la expresión
de secuencias codificantes correspondientes a proteínas o péptidos
con utilidad (y de cualquier origen, biológico: vegetal, animal,
etc.; o sintético).
9. Utilización de un factor transcripcional
activador según las reivindicaciones 5-8,
caracterizados porque dichos factores son HSFs quiméricos
que incorporan parcialmente secuencias y características de HaHSFA10
(normales o mejoradas según la reivindicación 4).
10. Las plantas transgénicas (monocotiledóneas o
dicotiledóneas) de cualquier cosecha que incorporen los genes
quiméricos construidos según las reivindicaciones
5-9.
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