EP3880165A1 - Use of an organometallic compound as a dna-demethylating agent - Google Patents
Use of an organometallic compound as a dna-demethylating agentInfo
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- EP3880165A1 EP3880165A1 EP19835442.5A EP19835442A EP3880165A1 EP 3880165 A1 EP3880165 A1 EP 3880165A1 EP 19835442 A EP19835442 A EP 19835442A EP 3880165 A1 EP3880165 A1 EP 3880165A1
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Definitions
- the present invention relates generally to the non-therapeutic use and the therapeutic use of compounds having a demethylating effect on DNA.
- the invention also relates to the therapeutic use of these iron-based organometallic complexes as a medicament, for example for the treatment of proliferative pathologies, in particular of cancers.
- Cancers are the second leading cause of death after cardiovascular disease in industrialized countries. Aside from direct DNA mutations of essential genes, the expansion of a cancer cell is frequently associated with epigenetic changes, that is, not directly encoded by the DNA sequence.
- epigenetics indeed includes a whole set of modifications responsible for the regulation of gene expression which can be transmitted during cell division and which do not involve any change in the DNA sequence (Flintoft, 2017). This term thus groups together various processes, such as DNA methylation, post-translational modifications of histones and expression of non-coding RNA.
- the regulation of gene expression is a phenomenon that influences most aspects of cell biology (embryogenesis, development, cell differentiation, as well as cell death) in multicellular organisms.
- Deregulation of epigenetic changes, both in their maintenance and in their coordination, is frequently observed for various pathologies, such as inflammation, obesity, neurodegenerative and cardiovascular diseases, as well as cancers. Consequently, the search for molecules capable of regulating these processes is of major interest.
- DNA methylation is an epigenetic process. It is the result of a methylation of cytosines to 5-methylcytosines in the CG dimers of DNA, in particular in the CpG islets. About 80% of these regions are methylated in the human genome.
- the DNA methyltransferase (DNMTs) enzymes catalyze the addition of a methyl group originating from the donor Sadenosylmethionine on the carbon 5 of a cytosine.
- DNMT1 which is an enzyme involved in the maintenance of epigenetic information (Leonhardt et al., 1992; Liu et al., 1998), takes as its model the half-methylated DNA strand during the replication while the enzymes DNMT3a and 3b can act on an unmethylated strand and therefore modify the epigenetic information (Okano et al., 1999).
- DNMT2 does not show DNA methyltransferase activity. DNA methylation leads to repression of gene expression (Bird, 2002).
- DNA demethylating agents also known by the English term “DNA hypomethylating agent”
- DNA hypomethylating agent is based on strategies leading to indirect demethylation of DNA, in particular via inhibition enzymes responsible for the methylation thereof, namely the DNMTs described above.
- tumor suppressor genes such as, for example, p16
- p16 certain tumor suppressor genes
- Inhibitors blocking DNA methyltransferase activity cause the hypomethylation of these tumor suppressor genes and thus have anticancer properties (Santini et al., 2001).
- the different demethylating agents of DNA can be classified according to their mode of action into five different categories: 1) non-methylatable nucleoside analogs (decitabine, azacytidine), 2) inhibitors of catalytic activity (procainamide), 3) inhibitors of S-adenosylmethionine hydrolase (caldribine), 4) inhibitors of expression of DNMTs (MG98) and 5) inhibitors of the interaction of DNMTSs with their partners (UP peptide ).
- Non-methylatable nucleoside analogs such as 5-azacytidine, Decitabine (DAC or 5-aza-2'-deoxycytidine), Zebularine (dZTP), 5-fluoro-2'- deoxycytidine (FdCyd), SGI-1 10 (modified decitabine) and CP-4200 (a derivative of 5-azacytidine) allow the capture of DNMTs on DNA having incorporated these analogs thus leading to their degradation.
- these non-methylatable nucleoside analogs such as 5-azacytidine, or 5-aza-2’-deoxycytidine, in addition to having significant side effects, generally show high toxicity and low stability.
- zebularin exhibits better stability (Zhou et al., 2002; Cheng et al., 2003) and lower toxicity (Cheng et al., 2004).
- the inhibitors of the enzymatic activity of DNMTs are synthetic compounds which have an affinity for regions of DNA rich in CpG thus blocking the activity of DNMT1. These molecules have several advantages over nucleotide analogs because their use is not limited to highly proliferative cells since they directly inhibit DNMTs without requiring their incorporation into DNA.
- DNMT synthesis such as antisense oligonucleotides and microRNAs (MG98) (Amato, 2007; Winquist et al., 2006) are based on the fact that hypermethylation is very often associated with an increase in l expression of DNMTs. Despite a strong enthusiasm for this strategy, at present, phase I or II clinical trials have revealed a lack of efficacy of these oligonucleotides.
- the inhibitors of the interaction of DNMTs with their partners relate to peptide molecules which are capable of disturbing the association of DNMTs with some of their protein partners necessary for their functioning.
- this approach therefore makes it possible to avoid (compared to the other modes of action mentioned above) the induction of a global hypomethylation which can be at the origin significant side effects.
- specific inhibition of the DNMT3A / ISGF3y complex has been shown to restore sensitivity to temozolomide and thus reduce tumor growth of glioblastomas (Cheray et al., 2013, 2014; Hervouet et al., 2010).
- complex 1 has the lowest DNA binding affinity among the three complexes tested, has no cleavage activity. DNA under UV-A or under green light.
- Document FR 1 463 870 describes the use of organometallic complexes for the dyeing of keratin materials.
- An object of the present invention is thus to propose new compounds which avoid, all or in part, the abovementioned drawbacks.
- the Applicant has thus focused on the development of new demethylating compounds capable of interacting with DNA.
- the Applicant has demonstrated that the compounds according to the invention had an antiproliferative action, in particular on cancer cells.
- the compounds according to the invention are non-cytotoxic and thus exhibit a cytostatic effect.
- the subject of the present invention is the non-therapeutic use, as DNA demethylation agent, of at least one organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups of general formula ( I) following: in which :
- Y are each independently of the others a CH group or a nitrogen atom (the two Y groups can be identical or different);
- Z denotes an oxygen atom, a sulfur atom or an NH group
- the dotted line represents a C-C bond at the point of attachment of the aromatic cycle of formula (II) to (VI) to the terpyridine groups of the organometallic compound of formula (I);
- X is a counterion
- the present invention also relates to an organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups, having a general formula (I) defined above for its use as a medicament.
- the present invention could be a pharmaceutical composition which could comprise, in a pharmaceutically acceptable carrier, at least one organometallic compound as defined above.
- a pharmaceutically acceptable carrier for the rest of the description, unless otherwise specified, the indication of a range of values “from X to Y” or between “X to Y”, in the present invention, is understood to mean as including the X and Y values.
- the present invention relates to the non-therapeutic use, as DNA demethylating agent, of at least one organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups of formula general (I) below:
- Z denotes an oxygen atom, a sulfur atom or an NH group
- the dotted line represents a C-C bond at the point of attachment of the aromatic cycle of formula (II) to (VI) to the terpyridine groups of the organometallic compound of formula (I);
- X is a counterion
- the terpyridine groups are ligands which are particularly suitable for the iron atom which make it possible to form a relatively stable organometallic compound and which would therefore be resistant even in a biological environment.
- the particular configuration of the terpyridine ligands gives remarkable rigidity to the organometallic compound according to the invention.
- the compounds of the invention may be in the form of salts, solvates and / or pharmaceutically acceptable prodrugs.
- the pro-drugs are variants of the compounds of the invention which can be transformed in vivo into compounds of general formula (I) according to the invention.
- the term “pharmaceutically acceptable salts or solvates” refers to salts or solvates which retain the desired biological activity as described above of the organometallic compounds of the invention and which expose to very little, even no unwanted toxicological effects.
- alkyl designates a linear or branched, saturated or unsaturated hydrocarbon radical, advantageously having from 1 to 12 carbon atoms, such as methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, tert-butyl, pentyle, neopentyle, n-hexyle, etc. Groups having from 1 to 6 atoms and in particular from 1 to 4 carbon atoms are preferred.
- R 1 to R 6 may correspond to a hydrogen atom.
- organometallic compound of formula (I) can correspond to the following formula (IX):
- R 1 , R 3 , R 4 , 6 6 may be identical and correspond to a hydrogen atom
- organometallic compound of formula (I) can correspond to the following formula (X):
- R 1 , R 3 , R 4 , R 6 are identical and correspond to a hydrogen atom
- organometallic compound of formula (I) can correspond to the following formula (XI):
- the two terpyridine groups of this compound AIM3 thus each carry a pyridine nucleus, the nitrogen atom making it possible to induce a nucleophilic effect.
- the counterion X is chosen from: Cl, Br, I, the hexafluorophosphate of formula PF 6 , preferably the counterion is PF 6 .
- the organometallic compound (s) are capable of causing direct demethylation of DNA.
- organometallic compounds of formula (I) according to the invention can in particular be used in order to form biotechnology tools, for example as sequencing reagents where demethylation of DNA is required.
- the compound or compounds of the invention can be used as a biotechnology tool, such as for example as a reagent for carrying out demethylation experiments in vitro on cells, generally tumor cells, originating from a sample taken from an animal. These experiments would make it possible, for example, to confirm the presence or not of DNA methylation phenomenon on certain genes, to block the cell proliferation of these cells and therefore to sensitize them to chemotherapy agents.
- "By animal” according to the invention means mammals, birds, fish, insects, etc., as well as humans.
- organometallic compound (s) of formula (I) according to the invention and in particular of the compounds AIM1 to AIM3 has previously been described in publications, such as the publication of EC Constable, AMW Cargill Thompson, Dalton Trans, 1992, 2947 -2950 for the compounds AIM1 and AIM3 and the publication by H. Krass, EA Plummer, JM Haider, PR Barker, NW Alcock, Z. Pikramenou, MJ, Hannon, DG Kurth, Angew. Chem. Int. Ed. 40 (2001) 3862-3865 for the compound AIM2.
- the terpyridine ligands required for the synthesis of the organometallic compounds according to the invention were prepared using the Krohnke reaction between 2-acetylpyridine and an appropriate aryl aldehyde compound in the presence of ammonia.
- the homoleptic complexes AIM1, AIM2 and AIM3 are obtained with a respective yield of 90, 69 and 83% by reacting the appropriate terpyridine ligand (2 equivalents) with FeCh in acetonitrile (scheme 1).
- the organometallic compound (s) of formula (I) according to the invention having a demethylating action of DNA can also represent an active substance for therapeutic purposes, as will be described below.
- the present invention thus relates to an organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups, having a general formula (I) as defined above for its use as a medicament.
- organometallic compound (s) of formula (I) for non-therapeutic use are included here for therapeutic use (namely for their use as a medicament).
- the organometallic compound (s) according to the invention can be used to treat diseases linked to cellular hyperproliferation, in particular cancers.
- the organometallic compound (s) according to the invention can be used to treat glioblastomas, promyelocytic leukemias, cancers of the prostate, ovaries, lungs, breasts, digestive tracts, in particular the liver, pancreas , head and neck, colon, non-Hodgkin's lymphoma or melanoma, etc.
- the compounds of the invention exhibit an antiproliferative effect with respect to tumor and healthy cells. These compounds cause an accumulation of cells in the G2 / M or G0 / G1 phase. Cell death can be observed but only after long treatments of minimum 96 hours. Thus, these compounds can be used to reduce tumor proliferation.
- organometallic compound (s) can be used to treat tumors resistant to other anticancer agents.
- organometallic compound (s) according to the invention could be used to treat other diseases linked to deregulation of epigenetic modifications, such as to treat inflammation, obesity, neurodegenerative diseases or cardiovascular diseases.
- the present invention may be intended to form a pharmaceutical composition
- a pharmaceutical composition comprising, in a pharmaceutically acceptable carrier, at least one organometallic compound of formula (I) as defined above.
- organometallic compound (s) of formula (I) for non-therapeutic use or for use as a medicament are included here for therapeutic use as a medicament.
- the term “pharmaceutically acceptable carrier” designates substances such as excipients, vehicles, adjuvants, buffers which are conventionally used, in combination with one or more active principles (here, the organometallic compound or compounds according to the invention), for the preparation of a medicament.
- active principles here, the organometallic compound or compounds according to the invention.
- the choice of such supports essentially depends on the route of administration envisaged.
- the pharmaceutically acceptable carrier is an excipient, a vehicle and / or an adjuvant chosen from the group consisting of pharmaceutically acceptable excipients, vehicles and / or adjuvants.
- a person skilled in the art may in particular advantageously refer to the fourth edition 2002 of the European Pharmacopoeia, or even to the edition USP 25-NF 20 of the American Pharmacopoeia (U. S. Pharmacopeia).
- the pharmaceutical composition can comprise one or more agents or vehicles chosen from dispersants, solubilizers, stabilizers, preservatives, etc.
- the pharmaceutical composition can be a human or veterinary pharmaceutical composition.
- the pharmaceutical composition may be in a liquid form, or, preferably, in a solid form.
- a solid pharmaceutical composition is preferred, for example in the form of tablets, capsules or capsules.
- a pharmaceutical composition is preferred in the form of an aqueous suspension.
- a pharmaceutical composition can thus be presented in a form for oral administration, by inhalation, parenteral or injection such as for example by intravenous, intramuscular, subcutaneous, trans-dermal, intra-arterial, etc.
- the oral forms are particularly preferred.
- the intravenous, intramuscular, subcutaneous, and inhalation routes are preferred.
- the compositions are generally in the form of liquid suspensions, which can be injected by means of syringes or infusions, for example.
- the compounds are generally dissolved in an acceptable support which comprises saline, physiological, isotonic, buffered solutions, etc., compatible with pharmaceutical use and known to those skilled in the art.
- Agents or vehicles which can be used in liquid and / or injectable formulations are in particular methylcellulose, hydroxymethylcellulose, carboxymethylcellulose, polysorbate 80, mannitol, gelatin, lactose, vegetable oils, acacia, etc.
- injection rate and / or the dose injected can be adapted by a person skilled in the art depending on the patient, the pathology concerned, the mode of administration, etc.
- the organometallic compound (s) according to the invention are administered in doses which can vary between 0.1 pg and 100 mg / kg of body weight, more generally between 0.01 and 10 mg / kg, typically between 0.1 and 10 mg / kg.
- doses which can vary between 0.1 pg and 100 mg / kg of body weight, more generally between 0.01 and 10 mg / kg, typically between 0.1 and 10 mg / kg.
- repeated injections can be made.
- prolonged and / or delayed release systems may be advantageous.
- solid pharmaceutical forms as pharmaceutical support can comprise, as vehicles, adjuvants or excipients, at least one diluting agent, a flavoring, a solubilizing agent, a lubricating agent. , a suspending agent, a disintegrating agent and an encapsulating agent, the identity and the function of these different classics being fully documented in the European Pharmacopoeia or in the Pharmacopoeia of the United States of America (USP).
- USP European Pharmacopoeia or in the Pharmacopoeia of the United States of America
- compositions in liquid form can also comprise water, optionally in admixture with propylene glycol or polyethylene glycol, and optionally also coloring agents, flavorings, stabilizers and thickening agents.
- the method comprises a step during which said patient is administered a therapeutically effective amount of a purified dry extract of the or organometallic compounds according to the invention, or alternatively of the pharmaceutical composition described above.
- treatment designates preventive, curative, palliative treatment, as well as the management of patients (reduction of suffering, improvement of lifespan, slowing down the progression of the disease , reduction of tumor growth, etc.).
- the treatment can also be carried out in combination with other chemical or physical agents or treatments (chemotherapy, radiotherapy, gene therapy, etc.) ⁇
- the treatments and drugs of the invention are particularly intended for humans.
- organometallic compound (s) according to the invention and / or the pharmaceutical composition may, for example, be used in the treatment of cancers in combination with an anticancer treatment using radiation, such as radiotherapy.
- organometallic compound (s) according to the invention and / or the pharmaceutical composition can for example be used in the treatment of cancers in combination with at least one other anticancer chemical agent, conditioned and administered in a combined, separate or sequential manner.
- the other anticancer chemical agent can for example be cisplatin, carboplatin, taxoter, taxol, tomoxifene, doxorubicin or 5-fluorouracil and is advantageously taxol, 5-fluorouracil or else tomoxifene or doxorubicin .
- the present invention thus makes it possible to inhibit in vivo, in vitro or ex vivo the proliferation of tumor cells, comprising bringing said tumor cells into contact with the pharmaceutical composition.
- the tumor cells can in particular be those of the pathologies specified above.
- FIG. 2 shows the evaluation of the demethylating power of the compounds AIM2 and AIM3 according to the invention in an in vitro system, (a) ELISA tests were carried out in order to measure the level of methylated cytosines present on a fragment of DNA after action of TET2 demethylase or AIM2 and AIM3 molecules; (b) the demethylating activity of AIM2 (2mM) and of the his-tagged-TET2 protein (10pg) was measured by an assay of the incorporation of radiolabelled methyl groups at the level of a biotynilized double stranded DNA previously methylated by the enzyme MSsI;
- FIG. 3 represents the evaluation of the overall demethylating power of the molecules AIM2 and AIM3 in U251 cells: an ELISA test was carried out in order to measure the level of methylated cytosines present in the DNA of untreated U251 cells versus treated for 1 or 4h with 2mM of 5aza-2-deoxycytidine, AIM2 or AIM3;
- FIG. 5 shows the evaluation of the overall demethylating power of the molecules AIM2 and AIM3 according to the invention on MDA-MB231 cells: a quantification by densitometry made it possible to obtain a quantitative value of the intensity of the bands present in the framed part of the gel (the calculation of the percentage of demethylation was calculated using the formula indicated);
- FIG. 6 shows the influence of the AIM2 molecule according to the invention on the proliferation of MCF-10A breast epithelial cells and MDA-MB231 and Hs578T mammary tumor cells: the cells were seeded, after 24 hours of culture the cells were treated for 48 hours with varying concentrations of the AIIM2 molecule; the determination of the number of adherent cells was carried out by staining with violet crystal and quantified by a measurement of the absorbance at 595 nm; the results correspond to the average of 4 independent experiments, the standard errors to the average (SEM) are indicated and the significance of the data was calculated by comparing the treated vs untreated cells (Student test);
- FIG. 7 shows the influence of the AIM3 molecule according to the invention on the proliferation of breast epithelial cells MCF-10A and mammary tumors
- MDA-MB231 and Hs578T the cells were seeded, after 24 h of culture the cells were treated for 48 h with variable concentrations of the molecule AIIM3; the determination of the number of adherent cells was carried out by staining with violet crystal and quantified by a measurement of the absorbance at 595 nm; the results correspond to the average of 4 independent experiments, the standard errors to the average (SEM) are indicated - the significance of the data was calculated by comparing the treated vs untreated cells (Student test);
- FIG. 8 is an analysis of the cell cycle of MCF-10A cells treated or not with 0.5 mM AIM2 or AIM3; the cells were seeded and treated with 0.5 mM AIM2 or AIM3 for 0, 16, 24, 48 and 72 h; after detachment the cells are fixed and permeabilized in a 70% cold ethanol solution; labeling with propidium iodide is then carried out in order to label the DNA and the fluorescence is quantified by flow cytometry;
- FIG. 9 shows an analysis of the number of cells treated or not with 2mM AIM2 or AIM3.
- the cells were seeded and treated with 2mM AIM2 or AIM3 for 0, 24, 48, 72, 96, 120, 144, 168 and 192h. After detachment, the cells are counted using a Malassez type counting cell.
- the medium of the NT or AIM2 or AIM3 cells is renewed every 72 hours.
- AIM2 (72) + NT or AIM3 (72) + NT the culture medium contains the indicated molecule only for 72 hours and after that it is replaced by a medium without molecules in order to test the reversibility of the effect;
- MDA-MB 231 treated with different concentrations of the AIM2 compound according to the invention and / or tamoxifen;
- FIG. 12 shows a set of graphs showing the sensitivity of different breast tumor lines to AIM2, AIM3 compounds, conventional chemotherapy agents and their combinations;
- FIG. 17 shows the inhibition of the proliferation of T47D R + doxo cells by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 48 and 72 hours of treatment;
- FIG. 18 shows the inhibition of the proliferation of glioblastoma cells U251 and U87 by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 72 hours of treatment;
- FIG. 19 shows the inhibition of the proliferation of T47D cells by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 48 hours of treatment;
- daughter solutions can precipitate at 4 ° C. It is thus necessary to incubate them at 37 ° C for 10 min before their use.
- the Applicant has carried out a molecular modeling of the demethylating capacity of the AIM3 compound according to the invention.
- the energy profile linked to the demethylation reaction was carried out using quantum chemistry calculations.
- a model system comprising a methylated cytosine and AIM3 was used.
- the geometries of the reagents and products have been optimized using the density functional theory "DFT" using wB97XD as the exchange-correlation functional and LANL2DZ as the orbital base.
- the transition state that is to say the maximum energy conformation
- the energy profile of the reaction in space connecting the reactants and the products via the transition state was also estimated by analyzing the energy variation according to a reaction coordinate, i.e. the distance between methyl and the peripheral nitrogen of AIM3.
- the effects of the solvent, water were taken into account using a model of the polarizable continuum "PCM”.
- All molecular modeling calculations were carried out using Gaussian 09 software version D01 and using standard molecular modeling techniques, in particular detailed in numerous works such as “Chris J. Cramer Essential of Computational Chemistry Wiley eds”.
- those skilled in the art can refer to the Gaussian 09 manual for a detailed illustration of the geometry optimization techniques that have been used.
- the cell-free experiments consist in incubating methylated DNA (Qiagen, France) at 37 ° C. for 1 h with either 2 mM of molecules AIM2 and AIM3, or with the recombinant TET2 protein which is a protein known for its demethylating role and serving as positive control or either with water (Ctrl).
- methylated DNA 500ng, ref # N4007 NEB, genomic DNA of HeLa cell hypermethylated in vitro by the enzyme M.Sssi
- methylated DNA 500ng, ref # N4007 NEB, genomic DNA of HeLa cell hypermethylated in vitro by the enzyme M.Sssi
- the DNA is then used to carry out a 5mC-ELISA test (Zymo Research) i.e. making it possible to measure the level of 5-methylcytosines (see below).
- the cells of U251 gliomas or T98G glioblastomas were seeded at 2.10 6 respectively. 24 h after seeding, the cells were treated for 1 or 4 h with the molecules AIM2 or AIM3 at a rate of 0, 2, 5, 10 mM. After the treatment, the culture medium is replaced by a medium without molecules and the cells are kept in culture for 48 hours. The cells are then mechanically detached with a scraper in order to carry out a total DNA extraction via the use of the QiaCube automaton (Qiagen) and the QIAamp DNA Mini QIAcube Kit (Qiagen), without modification with the instructions provided by Qiagen .
- QiaCube automaton Qiagen
- Qiagen QIAamp DNA Mini QIAcube Kit
- the DNA (100 ng) collected as indicated above is first denatured at 98 ° C for 5 min (use of the MyCycler BioRad thermocycler), before being deposited in the wells of the plate: 96 wells provided for this purpose (Kit 5mC-ELISA, Zymo) for 1 h of incubation at 37 ° C. The supernatant is then removed and the wells are washed 3 times with 200 ⁇ L of washing buffer (supplied by the kit). Then, 200 ⁇ L of washing buffer are incubated in each well for 30 min at 37 ° C.
- the revelation / quantification step of 5- methylcytosines is carried out with the incubation (1 h, 37 ° C) of the anti-5mC antibody provided by the kit (ref / A3001-30), diluted to 1/2000. After 3 washes (200 ml of washing buffer provided by the kit), the primary antibody is revealed following the incubation (1 h, 37 ° C) of the coupled secondary antibody HRP (D5325-3-30). Finally, after 3 washes (200 ml of washing buffer supplied by the kit), the ELISA is revealed by adding 100 ml of "HRP developer" (supplied by the kit). The ELISA plate is read at 405-450 nm (Victor plate reader, Perkin Elmer). In parallel, a standard range is carried out with methylated DNA whose percentage of 5 mC is known (range: 0, 5, 10, 25, 50, 75, 100%).
- TET2 (10pg) (positive control) was measured by an assay for the incorporation of methyl groups radiolabelled in a double-stranded DNA biotynilized and previously methylated by the enzyme M.SSsl.
- a 96-well plate is pretreated beforehand with 10 mg / ml of BSA (bovine serum albumin) for 30 min.
- BSA bovine serum albumin
- the magnetic beads (10 mg / ml, Dynal) are washed three times with the TENT2M buffer (20 mM Tris, pH 8.0, 2 mM EDTA, 0.01% Triton X-100, 2 M NaCl). The concentration of these beads is adjusted to 2.5 mg / ml with the TENT2M buffer and 1/10 of the volume with the non-radioactive form of AdoMet (100 mg / ml; Sigma).
- the methylation reaction (40 mI) contains 200 U of the enzyme M.Sssi (NEB # M0226) 125 nM DNA oligonucleotides, 200ng DNA, and 900 nM tritium- labeled AdoMet (Amersham Bioscience, 1 mCi / ml) in the reaction medium (50 mM Tris, pH 8.0, 5 mM EDTA, 10% glycerol, 10 mM 2-mercaptoethanol, 0.5 mM phenylmethylsulfonyl fluoride).
- the reactions are stopped by adding an equivalent volume of magnetic beads in suspension and gentle shaking for 15 min at room temperature.
- the magnetic beads are separated using a magnet and washed successively with 300, 200, 150, and 100 mI TENT1 M (10 mM Tris, pH 8.0, 1 mM EDTA, 0.005% Triton X-100, 1 M NaCI ).
- the magnetic beads are resuspended in 25 mI of TENT1 M in the presence of “putative demethylating agents” or with 100 ⁇ g of nuclear extract isolated using the kit, nuclear extract kit (Active Motif, # 40410).
- the magnetic beads are separated using a magnet and washed successively with 300, 200, 150, and 100 mI of TENT1 M (10 mM Tris, pH 8.0, 1 mM EDTA, 0.005% Triton X- 100, 1 M NaCl). Then the level of incorporated tritium is measured in a scintillation counter.
- the compound AIM2 exhibits a demethylating action of DNA.
- the molecules AIM2 and AIM3 exhibit demethylating power after 1 h and 4 h of incubation clearly greater than that of 5aza-2-deoxycytidine which is the known and commonly used demethylating agent, but which requires a incorporation into DNA.
- T98G glioblastoma cell line
- T98G cells The experiment carried out on T98G cells consisted in treating the latter for 1 h with different concentrations of the compound AIM3 according to the invention, namely 0; 2; 5 and 10 mM.
- the cells of the breast cancer line MDA-MB 231 are cultured in RPMI 1640 medium (Gibco) containing 2 mM L-Glutamine (Sigma), 0.1 mg / ml of gentamicin (Sigma) and 10% of fetal calf serum ( Sigma) decomplemented 30 minutes at 56 ° C. They are incubated at 37 ° C and 5% CO2.
- the powder is taken up at 100 mM in DMSO (Sigma). This stock solution is aliquoted (2 mL) and stored at -80 ° C.
- the powder (717.07 g / mol) is taken up at 1 mM in PBS (Fisher) containing
- the powder (719.06 g / mol) is taken up at 5 mM in PBS containing 20% ethanol. This stock solution is stored at 4 ° C.
- the cell layer is washed with 2mL of PBS, then trypsinized with 0.5mL of EDX 1X trypsin (Sigma) for 5 minutes at 37 ° C. The action of trypsin is then inhibited by the addition of 4 mL of culture medium.
- the cell suspension is finally centrifuged at 200 G for 5 minutes and the pellet stored at -20 ° C.
- the intensity of each strip is measured using the Quantity One software.
- the data presented in FIG. 5 confirm that, like 5-azacytidine, the treatment of MDA-MB231 cells with the molecules AIM2 and AIM3 makes it possible to reduce the overall percentage of methylation of the genome.
- EXAMPLE 8 Influence of the compounds AIM2 and AIM3 according to the invention on the proliferation of breast epithelial cells MCF-10A and mammary tumor MDA-MB231 and Hs578T (Fig. 6 and Fig. 71
- the cells are seeded according to the densities indicated above (Table 4). After 24 hours of culture, the culture medium is replaced by medium containing or not containing the molecules AIM2 or AIM3 at concentrations of 0.5; 1; 1.5; 2 and 2.5 mM in four copies for 48 hours. After these 48 hours of treatment, the culture medium is removed and the cells are washed with a 1 ⁇ PBS solution. They are then fixed in 100 ⁇ l of culture medium containing 4% of paraformaldehyde and incubated for 20 min at room temperature. The cells are then rinsed with a 1X PBS solution.
- the next step is to dissolve the purple crystal in order to obtain a colored solution which can be dosed.
- 100 ⁇ l of a 10% acetic acid solution is added, then the plates are incubated with shaking until the total solubilization of the Violet Crystal.
- An absorbance is then read at 595 nm using a plate reader (VICTOR).
- the concentration of the cells is presented in the table below.
- the results obtained indicate that treatment with 0.5 mM AIM2 and AIM3 induces a blockage of the cell cycle in G1 phase.
- the absence of cells in the subG1 phase indicates that these molecules do not exhibit cellular toxicity under these treatment conditions.
- the effect of these molecules on cell proliferation was also evaluated as a function of the treatment time and no longer of the dose of molecule used.
- the 2mM dose which is the one capable of causing DNA demethylation, was chosen.
- the cells are seeded in 60mm boxes at a rate of 4 ml / box on the 1st day at the concentration indicated in the table below.
- the organometallic complexes AIM2 and AIM3 at 2 mM or the solvent (0.04% ethanol) for the untreated cells are added to the culture medium.
- the treated and untreated cells are detached by the action of trypsin.
- the cells After inactivation of trypsin with culture medium containing 10% fetal calf serum, the cells are washed in PBS and counted after staining with Trypan Blue so as to count only the living cells (a fraction of 10 ml of the suspension is mixed with 10 ml of 0.4% Trypan blue (Thermo Scientific) The cells are counted using a Malassez counting cell (Marienfeld-Superior). at). Prior to treatment, the Al Ms molecules are preheated in a heating block (Thermo Scientific) at 37 ° C. with stirring for 10 minutes in order to guarantee total solubilization.
- a heating block Thermo Scientific
- the media are renewed every 72 hours with or without Al Ms.
- the molecules AIM2 and AIM3 have a cytostatic action in the different cell lines used (MCF-10A, MDA-MB231 and Hs578).
- a treatment with a dose of 2 mM inhibits the proliferation of healthy mammary epithelial cells (MCF10A), but also of breast cancer cells (MDA-MB231 and HS578T) (cf. curves square points compared to the untreated controls round).
- MDF10A healthy mammary epithelial cells
- MDA-MB231 and HS578T breast cancer cells
- a 72h treatment was also carried out with 2mM of molecule, followed by a change of medium without adding any molecule.
- MCF10A healthy mammary epithelial cells
- EXAMPLE 1 1 Sensitizing effect of compounds according to the invention vis-à-vis chemotherapy in mammary tumor cells (Fiq.10 and Fig.1 1)
- Breast cancer actually groups different subcategories based on the expression of 3 molecular markers: the estrogen receptor (ERa), the progesterone receptor (PR) and the transmembrane receptor belonging to the family of receptors for EGF (HER2). Some tumors are thus called triple negative, because they do not express any of the 3 molecular markers. This type of tumor poses many problems in their treatment because:
- One of the major challenges in the treatment of breast cancer consists in trying to re-sensitize triple negative breast tumors to chemotherapy agents.
- One of the aims is thus to restore the sensitivity of cells triple negative breast cancer, MDA-MB231, to a chemotherapy agent, tamoxifen.
- tamoxifen is a selective estrogen receptor (ERa) modulator, that is to say that it binds specifically to estrogen receptors, but without activating a signaling pathway.
- ERa selective estrogen receptor
- the resistance of MDA-MB231 cells to tamoxifen has been shown to be due to a lack of expression of ERa.
- Yoshida and his collaborators showed that the hypermethylation of 2 promoter regions (promoter A and B) upstream of the gene coding ERa is inversely correlated to the expression of ERa in MDA-MB231 cells.
- the Applicant has studied whether the compounds according to the invention make it possible to demethylate the ERa promoter in MDA-MB231 cells, in order to re-induce its expression, and to resensitize cells to tamoxifen.
- Chou-Talalay tests were carried out by determining the number of cells attached after treatments using the AIM2 compound and / or using tamoxifen.
- MDA-MB231 cells were seeded in a 96-well plate at a cell density of 8,000 cells / well in a volume of 100 ⁇ L / well.
- the experimental plate design is shown in Figure 10.
- Treatment with AIM2 is done for 24 hours, followed by 48 hours of treatment with tamoxifen.
- a marking with violet crystal is carried out in order to count the living cells.
- the protocol is as follows:
- the plate triplicates are averaged, and the results are expressed as a function of the untreated control which is set to 1 for each condition.
- MDA-MB231 cells which are ER negative, are insensitive to tamoxifen.
- a treatment with AIM2 induces a reduction in cell viability of the order of 50% from the lowest dose (2000 nM).
- Pretreatment with AIM2 followed by treatment with tamoxifen also induces a decrease in cell viability, which seems greater than in the presence of the molecule AIM2 only.
- the Applicant used the CompuSync software which is based on the Chou-Talalay method via the principle of effect median of the law of mass action.
- fa and fu correspond respectively to the fractions of cells affected and not affected by the treatments
- D and Dm correspond respectively to the dose used and the median dose
- m corresponds to the shape of the dose-response curve.
- the software then generates combination indices (Cl): - if the Cl at a given dose combination is less than 1, then there is a synergy of action between molecule A and molecule B
- the breast cancer cells, MCF-7, MDA-MB231 and Hs578T, as well as a line of normal breast cells, MCF10A were seeded at a density of 1 ⁇ 10 4 cells / well in a 96-well plate. well. After 24 hours of inoculation, the cells are brought into contact with 2mM of AIM2 / 3 for 1 hour followed by 50mM of 5-fluorouracil or 50ng / ml of doxorubicin for 24 or 48 hours. Following these treatments, the media are removed and 0.5 mg / mL of MTT is added to each well.
- the different cell lines are cultivated in an incubator at 37 ° C, 5% CC> 2 and 95% humidity according to the following nutrient media:
- the different culture media are alternately supplemented with 0.1 mg / mL of Gentamicin (Sigma G1272) and 1% of Penicillin-Steptomycin (Sigma P4333).
- the fetal calf serum (SVF) and the horse serum are decomplemented beforehand for 30 minutes at 56 ° C.
- the doxorubicin-resistant line T47D is cultured in the presence of 12.5 ng doxorubicin / ml in order to maintain the resistance. However, doxorubicin is not added to the culture medium during the pre-treatment phases and the proliferation test.
- the cells are seeded in 100 mm boxes (10 ml medium / box) for the Untreated conditions and in 150 mm boxes (20 ml medium / box) for the conditions treated according to the following quantities:
- the cells are then treated 24 hours after seeding with the molecules
- AIM2 or AIM3 at a concentration of 2 mM for 72 hours.
- the cells are detached with 1 mL (10 mm dishes) or 2 ml (150 mm dishes) of trypsin - EDTA 1X for 5 minutes at 37 ° C (15 minutes of incubation are necessary to detach the MCF10A cells).
- trypsin is then inhibited by 10 ml of culture medium and then the cell suspension is centrifuged at 200 G for 5 minutes.
- Each pellet is taken up in 10 ml of medium and then the cells are counted using a Mallasez cell.
- the cells are then seeded in 60 mm dishes (4 ml medium / dish) as follows and according to the experimental plan of Fig. 13:
- the cells After washing with 2 ml of PBS, the cells are detached with 1 ml of 1X trysin-EDTA at 37 ° C for 10 minutes (20 minutes for the MCF10A line).
- the tryspine is then inhibited by the addition of 4 ml of medium. Then the cells are pelletized at 200G for 5 minutes. The pellets are taken up in a precise volume of PBS depending on the size of the pellet.
- the cells are correctly separated by several round trips to the P200 and counted using a Mallasez cell.
- the different cell lines are cultivated in an incubator at 37 ° C, 5% CC> 2 and 95% humidity according to the following nutrient media:
- the different culture media are alternately supplemented with 0.1 mg / mL of Gentamicin (Sigma G1272) and 1% of Penicillin-Steptomycin (Sigma P4333).
- Fetal calf serum (SVF) and horse serum are decomplemented beforehand for 30 minutes at 56 ° C.
- the doxorubicin resistant line T47D is cultured in the presence of 12.5 ng doxorubicin / ml in order to maintain the resistance, however doxorubicin is not added to the culture medium during the proliferation test.
- Each cell line is seeded in 96-well plates (100 ml_ medium / well) according to the following conditions:
- Each treatment condition is performed in a tripicat as shown in Figure 15.
- the cells are treated with the molecules represented in FIG. 16 (AIM1, AIM2, AIM3 according to the invention and Ru as a comparative example) at 2 mM 24 h after seeding.
- the medium from each well is removed and then washing is carried out with 100 ⁇ l of PBS.
- the cells are then fixed with 100 ⁇ L of 4% paraformaldehyde for 20 minutes, followed by two washes with 500 ⁇ L of PBS.
- the percentage of adhered cells is demonstrated by staining with violet crystal.
- the wells are rinsed 3 times with distilled water and then properly dried by tapping on a sheet of absorbent paper.
- the plate is placed under stirring until the total solubilization of the violet crystal crystals (approximately 10 minutes).
- the absorbance is read using a plate reader at 595 nm (see Fig. 17 to 20).
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Abstract
The invention relates to the non-therapeutic use, as a DNA-demethylating agent, of at least one organometallic compound comprising an iron atom bound to two terpyridine groups. The invention also relates to an organometallic compound comprising an iron atom bound to two terpyridine groups, to be used as a drug.
Description
UTILISATION D’UN COMPOSE ORGANOMETALLIQUE EN TANT QU’AGENT DE DÉMÉTHYLATION USE OF AN ORGANOMETALLIC COMPOUND AS A DEMETHYLATION AGENT
DE L’ADN DNA
DOMAINE TECHNIQUE AUQUEL SE RAPPORTE L'INVENTION TECHNICAL FIELD TO WHICH THE INVENTION RELATES
La présente invention concerne de manière générale l’utilisation non- thérapeutique et l’utilisation thérapeutique de composés ayant un effet déméthylant de l’ADN. The present invention relates generally to the non-therapeutic use and the therapeutic use of compounds having a demethylating effect on DNA.
Elle concerne ainsi tout d’abord, l’utilisation non-thérapeutique en tant qu’agent de déméthylation de l’ADN de complexes organométalliques à base de fer pour former par exemple des outils de biotechnologie, tels que des réactifs de séquençage. It therefore relates, first of all, to the non-therapeutic use as an agent for demethylation of DNA of organometallic iron-based complexes to form, for example, biotechnology tools, such as sequencing reagents.
Puis, l’invention porte également sur l’utilisation thérapeutique de ces complexes organométalliques à base de fer en tant que médicament, par exemple pour le traitement de pathologies prolifératives, en particuliers de cancers. Then, the invention also relates to the therapeutic use of these iron-based organometallic complexes as a medicament, for example for the treatment of proliferative pathologies, in particular of cancers.
ARRIERE-PLAN TECHNOLOGIQUE TECHNOLOGICAL BACKGROUND
Les cancers sont la seconde cause de décès après les maladies cardiovasculaires dans les pays industrialisés. Hormis des mutations directes de l’ADN de gènes essentiels, l’expansion d’une cellule cancéreuse est fréquemment associée à des modifications épigénétiques, c’est-à-dire non directement codés par la séquence de l’ADN. Cancers are the second leading cause of death after cardiovascular disease in industrialized countries. Aside from direct DNA mutations of essential genes, the expansion of a cancer cell is frequently associated with epigenetic changes, that is, not directly encoded by the DNA sequence.
Le terme épigénétique regroupe en effet tout un ensemble de modifications responsables de la régulation de l'expression génique pouvant être transmises lors de la division cellulaire et qui n'impliquent aucun changement de la séquence d'ADN (Flintoft, 2017). Ce terme regroupe ainsi différents processus, tels que la méthylation de l’ADN, les modifications post-traductionnelles des histones et l’expression d’ARN non codant. The term epigenetics indeed includes a whole set of modifications responsible for the regulation of gene expression which can be transmitted during cell division and which do not involve any change in the DNA sequence (Flintoft, 2017). This term thus groups together various processes, such as DNA methylation, post-translational modifications of histones and expression of non-coding RNA.
La régulation de l'expression génique est un phénomène qui influence la plupart des aspects de la biologie cellulaire (l'embryogenèse, le développement, la différenciation cellulaire, ainsi que la mort cellulaire) dans les organismes multicellulaires. Une dérégulation des modifications épigénétiques, tant au niveau de leur maintien que dans leur coordination, est fréquemment observée pour diverses pathologies, telles que l’inflammation, l’obésité, les maladies neurodégénératives et cardiovasculaires, ainsi que les cancers. Par conséquent, la recherche de molécules capables de réguler ces processus présente un intérêt majeur. The regulation of gene expression is a phenomenon that influences most aspects of cell biology (embryogenesis, development, cell differentiation, as well as cell death) in multicellular organisms. Deregulation of epigenetic changes, both in their maintenance and in their coordination, is frequently observed for various pathologies, such as inflammation, obesity, neurodegenerative and cardiovascular diseases, as well as cancers. Consequently, the search for molecules capable of regulating these processes is of major interest.
En particulier, la méthylation de l’ADN est un processus épigénétique. Elle est le résultat d’une méthylation de cytosines en 5-méthylcytosines dans les dimères C-G de l’ADN, en particulier dans les îlots CpG. Environ 80 % de ces régions sont méthylées dans le génome humain. Les enzymes DNA méthyltransférases (DNMTs) catalysent l’addition d’un groupement méthyle provenant du donneur Sadénosylméthionine sur le
carbone 5 d’une cytosine. Parmi les DNA méthyltransférases, la DNMT1 qui est une enzyme impliquée dans le maintien de l’information épigénétique (Leonhardt et al., 1992 ; Liu et al., 1998), prend comme modèle le brin d’ADN hémi-méthylé lors de la réplication tandis que les enzymes DNMT3a et 3b peuvent agir sur un brin non méthylé et donc modifier l’information épigénétique (Okano et al., 1999). Par contre, la DNMT2 ne montre pas d’activité DNA méthyltransférase. La méthylation de l’ADN conduit à la répression de l’expression du gène (Bird, 2002). Il existe aussi une enzyme (peptidyl arginine deiminase 4) pouvant, en déiminant les résidus arginine de l’histone H3, interférer avec la méthylation (Cuthbert et al., 2004). In particular, DNA methylation is an epigenetic process. It is the result of a methylation of cytosines to 5-methylcytosines in the CG dimers of DNA, in particular in the CpG islets. About 80% of these regions are methylated in the human genome. The DNA methyltransferase (DNMTs) enzymes catalyze the addition of a methyl group originating from the donor Sadenosylmethionine on the carbon 5 of a cytosine. Among DNA methyltransferases, DNMT1 which is an enzyme involved in the maintenance of epigenetic information (Leonhardt et al., 1992; Liu et al., 1998), takes as its model the half-methylated DNA strand during the replication while the enzymes DNMT3a and 3b can act on an unmethylated strand and therefore modify the epigenetic information (Okano et al., 1999). On the other hand, DNMT2 does not show DNA methyltransferase activity. DNA methylation leads to repression of gene expression (Bird, 2002). There is also an enzyme (peptidyl arginine deiminase 4) which, by decreasing the arginine residues of histone H3, can interfere with methylation (Cuthbert et al., 2004).
Jusqu'à ce jour, le développement d'agents déméthylants de l’ADN (également connus sous le terme anglais « DNA hypomethylating agent ») est basé sur des stratégies conduisant à une déméthylation indirecte de l’ADN et ce notamment via l’inhibition des enzymes responsables de la méthylation de celui-ci, à savoir les DNMTs décrites ci- dessus. To date, the development of DNA demethylating agents (also known by the English term “DNA hypomethylating agent”) is based on strategies leading to indirect demethylation of DNA, in particular via inhibition enzymes responsible for the methylation thereof, namely the DNMTs described above.
Par exemple, pour de nombreux cancers, il a été démontré que certains gènes suppresseurs de tumeurs, comme par exemple p16, étaient hyperméthylés (Herman et al., 1995). La conséquence de cette hyperméthylation est l’inactivation de ce gène régulateur du cycle cellulaire. Il a été démontré que les inhibiteurs bloquant l’activité DNA méthyltransférase provoquent l’hypométhylation de ces gènes suppresseurs de tumeurs et possèdent ainsi des propriétés anticancéreuses (Santini et al., 2001 ). For example, for many cancers, certain tumor suppressor genes, such as, for example, p16, have been shown to be hypermethylated (Herman et al., 1995). The consequence of this hypermethylation is the inactivation of this gene regulating the cell cycle. Inhibitors blocking DNA methyltransferase activity cause the hypomethylation of these tumor suppressor genes and thus have anticancer properties (Santini et al., 2001).
A l’heure actuelle, les différents agents déméthylants de l’ADN peuvent être classés en fonction de leur mode d’action en cinq catégories différentes :1 ) les analogues nucléosidiques non méthylables (décitabine, azacytidine), 2) les inhibiteurs de l’activité catalytique (procainamide), 3) les inhibiteurs de la S-adénosylméthionine hydrolase (caldribine), 4) les inhibiteurs de l’expression des DNMTs (MG98) et 5) les inhibiteurs de l’interaction des DNMTSs avec leurs partenaires (UP peptide). At present, the different demethylating agents of DNA can be classified according to their mode of action into five different categories: 1) non-methylatable nucleoside analogs (decitabine, azacytidine), 2) inhibitors of catalytic activity (procainamide), 3) inhibitors of S-adenosylmethionine hydrolase (caldribine), 4) inhibitors of expression of DNMTs (MG98) and 5) inhibitors of the interaction of DNMTSs with their partners (UP peptide ).
1 ) Les analogues nucléosidiques non méthylables, tels que la 5-azacytidine, la Décitabine (DAC ou 5-aza-2’-déoxycytidine), la Zébularine (dZTP), le 5-fluoro-2’- deoxycytidine (FdCyd), le SGI-1 10 (Décitabine modifiée) et le CP-4200 (un dérivé de la 5- azacytidine) permettent la capture des DNMTs sur de l’ADN ayant incorporé ces analogues conduisant ainsi à leur dégradation. Cependant, ces analogues nucléosidiques non méthylables, comme la 5-azacytidine, ou la 5-aza-2’-déoxycytidine, en plus de présenter d’importants effets secondaires, montrent généralement une forte toxicité et une faible stabilité. La zébularine présente toutefois une meilleure stabilité (Zhou et al., 2002 ; Cheng et al., 2003) et une plus faible toxicité (Cheng et al., 2004). 1) Non-methylatable nucleoside analogs, such as 5-azacytidine, Decitabine (DAC or 5-aza-2'-deoxycytidine), Zebularine (dZTP), 5-fluoro-2'- deoxycytidine (FdCyd), SGI-1 10 (modified decitabine) and CP-4200 (a derivative of 5-azacytidine) allow the capture of DNMTs on DNA having incorporated these analogs thus leading to their degradation. However, these non-methylatable nucleoside analogs, such as 5-azacytidine, or 5-aza-2’-deoxycytidine, in addition to having significant side effects, generally show high toxicity and low stability. However, zebularin exhibits better stability (Zhou et al., 2002; Cheng et al., 2003) and lower toxicity (Cheng et al., 2004).
2) Les inhibiteurs de l’activité enzymatique des DNMTs (tels que RG108, procaïne, nanaomycine et le procainamide) sont des composés synthétiques qui ont une affinité pour les régions d’ADN riches en CpG bloquant ainsi l’activité des DNMT1. Ces
molécules présentent plusieurs avantages par rapport aux analogues nucléotidiques car leur utilisation n’est pas limitée aux cellules hautement prolifératives puisqu’elles inhibent directement les DNMTs sans nécessiter leur incorporation au sein de l’ADN. 2) The inhibitors of the enzymatic activity of DNMTs (such as RG108, procaine, nanaomycin and procainamide) are synthetic compounds which have an affinity for regions of DNA rich in CpG thus blocking the activity of DNMT1. These molecules have several advantages over nucleotide analogs because their use is not limited to highly proliferative cells since they directly inhibit DNMTs without requiring their incorporation into DNA.
3) Les inhibiteurs de la S-adénosylhomocystéine hydrolase entraînent quant à eux une baisse de S-adénosylméthionine qui est le donneur de méthyl permettant aux methyltransférases de catalyser la méthylation des cytosines de l’ADN (Cladribine, Fludarabine et Clofarabine) (Bonate et al., 2006; Jeha et al., 2004). 3) Inhibitors of S-adenosylhomocysteine hydrolase lead to a drop in S-adenosylmethionine which is the methyl donor allowing methyltransferases to catalyze the methylation of DNA cytosines (Cladribine, Fludarabine and Clofarabine) (Bonate et al ., 2006; Jeha et al., 2004).
4) Les inhibiteurs de la synthèse des DNMTs, tels que les oligonucléotides antisens et les microARNs (MG98) (Amato, 2007; Winquist et al., 2006) reposent sur le fait qu’une hyperméthylation est très souvent associée à une augmentation de l’expression des DNMTs. Malgré un important engouement pour cette stratégie, à l’heure actuelle, les essais cliniques de phase I ou II ont révélé un manque d’efficacité de ces oligonucléotides. 4) The inhibitors of DNMT synthesis, such as antisense oligonucleotides and microRNAs (MG98) (Amato, 2007; Winquist et al., 2006) are based on the fact that hypermethylation is very often associated with an increase in l expression of DNMTs. Despite a strong enthusiasm for this strategy, at present, phase I or II clinical trials have revealed a lack of efficacy of these oligonucleotides.
5) Les inhibiteurs de l’interaction des DNMTs avec leurs partenaires concernent des molécules peptidiques qui sont capables de perturber l’association des DNMTs avec certains de leurs partenaires protéiques nécessaires à leur fonctionnement. Comme les complexes protéiques formés avec les DNMTs peuvent varier en fonction des gènes cibles, cette approche permet donc d’éviter (par rapport aux autres modes d’action cités précédemment) l’induction d’une hypométhylation globale qui peut être à l’origine d’importants effets secondaires. Il a par exemple été démontré que l’inhibition spécifique du complexe DNMT3A/ISGF3y permet de rétablir une sensibilité au témozolomide et ainsi réduire la croissance tumorale de glioblastomes (Cheray et al., 2013, 2014; Hervouet et al., 2010). 5) The inhibitors of the interaction of DNMTs with their partners relate to peptide molecules which are capable of disturbing the association of DNMTs with some of their protein partners necessary for their functioning. As the protein complexes formed with DNMTs can vary depending on the target genes, this approach therefore makes it possible to avoid (compared to the other modes of action mentioned above) the induction of a global hypomethylation which can be at the origin significant side effects. For example, specific inhibition of the DNMT3A / ISGF3y complex has been shown to restore sensitivity to temozolomide and thus reduce tumor growth of glioblastomas (Cheray et al., 2013, 2014; Hervouet et al., 2010).
A ce jour, la recherche de molécules capables de moduler le niveau de méthylation de l’ADN est donc tournée uniquement vers les inhibiteurs des enzymes responsables de ce processus, à savoir les DNMTs. To date, the search for molecules capable of modulating the level of DNA methylation has therefore focused solely on inhibitors of the enzymes responsible for this process, namely DNMTs.
On connaît également de l’état de la technique, la publication de Zohreh Naseri ét al. 201 1 , Pergamon Press, qui divulgue des complexes organométalliques comprenant le ligand 4’-(2-thiényl)-2,2’,6’,2”-terpyridine. Un solvaté d’un complexe de fer correspondant (Fe(thioterpy)2(N03)2.MeOH) est décrit en tant que composé 3 dans la publication. Toutefois, d’après les résultats présentés dans cette publication, ce complexe de fer 3 a une activité négligleable envers les microorganismes testés, ne démontre pas d’effet cytotoxique sur les lignées de cellules de leucémie et de fibrosarcome testées (tableau 7), et son activité de piégeage des ions superoxydes n’est pas remarquable. Also known from the state of the art, the publication by Zohreh Naseri et al. 201 1, Pergamon Press, which discloses organometallic complexes comprising the ligand 4 '- (2-thienyl) -2,2', 6 ', 2 ”-terpyridine. A solvate of a corresponding iron complex (Fe (thioterpy) 2 (NO 3 ) 2 .MeOH) is described as compound 3 in the publication. However, according to the results presented in this publication, this iron 3 complex has negligible activity towards the microorganisms tested, does not demonstrate a cytotoxic effect on the leukemia and fibrosarcoma cell lines tested (Table 7), and its activity of trapping superoxide ions is not remarkable.
La publication de Uttara et al. 2012, Journal of Inorganic Biochemistry, décrit des complexes terpyridiniques de fer photocytotoxiques (complexes 1 , 1 a, 2, 2a, 3 et 3a). D’après les résultats biologiques fournis, le complexe 1 présente l’affinité de liaison à l’ADN la plus faible parmi les trois complexes testés, n’a aucune activité de clivage de
l’ADN sous UV-A ou sous lumière verte. The publication by Uttara et al. 2012, Journal of Inorganic Biochemistry, describes photocytotoxic terpyridine iron complexes (complexes 1, 1 a, 2, 2a, 3 and 3a). According to the biological results provided, complex 1 has the lowest DNA binding affinity among the three complexes tested, has no cleavage activity. DNA under UV-A or under green light.
Le document FR 1 463 870 décrit l’utilisation de complexes organométalliques pour la teinture des matières kératiniques. Document FR 1 463 870 describes the use of organometallic complexes for the dyeing of keratin materials.
Dans ce contexte, il existe un besoin dans l’état de la technique de développer de nouveaux agents déméthylants de l’ADN à des fins thérapeutiques et non- thérapeutiques. In this context, there is a need in the prior art to develop new DNA demethylating agents for therapeutic and non-therapeutic purposes.
Il existe en particulier un besoin dans l’état de la technique de développer des nouveaux agents déméthylants de l’ADN qui soient efficaces, qui possèdent de préférence des effets indésirables réduits ou moindres par rapport aux agents déméthylants de l’art antérieur (de préférence, faible cytotoxicité cellulaire), tout en étant faciles à mettre en oeuvre et en ayant avantageusement un prix de revient modéré. There is in particular a need in the prior art to develop new DNA demethylating agents which are effective, which preferably have reduced or lesser adverse effects compared to the demethylating agents of the prior art (preferably , low cell cytotoxicity), while being easy to implement and advantageously having a moderate cost price.
Un but de la présente invention est ainsi de proposer de nouveaux composés qui évitent, tout ou en partie, des inconvénients susmentionnés. OBJET DE L’INVENTION An object of the present invention is thus to propose new compounds which avoid, all or in part, the abovementioned drawbacks. OBJECT OF THE INVENTION
La Demanderesse s’est ainsi attachée au développement de nouveaux composés déméthylants capables d’interagir avec l’ADN. The Applicant has thus focused on the development of new demethylating compounds capable of interacting with DNA.
Elle a notamment mis au point une nouvelle classe d’agents déméthylants aptes à entraîner une déméthylation directe de l’ADN par de simples réactions chimiques et ce dans des systèmes acellulaires et cellulaires. In particular, it has developed a new class of demethylating agents capable of causing direct demethylation of DNA by simple chemical reactions in cell-free and cellular systems.
La Demanderesse a en effet démontré que certains composés organométalliques comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines permettaient une déméthylation directe de l’ADN. The Applicant has indeed demonstrated that certain organometallic compounds comprising an iron atom linked to two terpyridine groups allow direct demethylation of DNA.
Ces composés pouvaient notamment être utilisés que ce soit pour des applications non-thérapeutiques, par exemple, en tant que réactifs de réaction lorsque qu’une déméthylation de l’ADN est requise, soit pour des applications thérapeutiques. These compounds could in particular be used either for non-therapeutic applications, for example, as reaction reagents when DNA demethylation is required, or for therapeutic applications.
Dans ce cas, la Demanderesse a démontré que les composés selon l’invention présentaient une action antiproliférative notamment sur des cellules cancéreuses. En outre, comme le montre les essais expérimentaux ci-dessous (en particulier les exemples 9 et 10), les composés selon l’invention sont non cytotoxiques et présentent ainsi un effet cytostatique. In this case, the Applicant has demonstrated that the compounds according to the invention had an antiproliferative action, in particular on cancer cells. In addition, as shown by the experimental tests below (in particular examples 9 and 10), the compounds according to the invention are non-cytotoxic and thus exhibit a cytostatic effect.
A cet effet, la présente invention a pour objet l’utilisation non-thérapeutique, en tant qu’agent de déméthylation de l’ADN, d’au moins un composé organométallique comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines de formule générale (I) suivante :
dans laquelle : To this end, the subject of the present invention is the non-therapeutic use, as DNA demethylation agent, of at least one organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups of general formula ( I) following: in which :
R1 à R6, identiques ou différents sont choisis parmi : un atome d’hydrogène ; une chaîne alkyle linéaire ou ramifiée de formule CnHhn+i avec n = 1 à 12 ; un groupe COOH ; un groupe SO3H ; un groupe PO3H ; un cycle aromatique de formule (II) à (VI) ci-dessous: R 1 to R 6 , identical or different, are chosen from: a hydrogen atom; a linear or branched alkyl chain of formula C n Hh n + i with n = 1 to 12; a COOH group; an SO3H group; a PO3H group; an aromatic cycle of formula (II) to (VI) below:
(II) (III) (IV) (V) (VI) où (II) (III) (IV) (V) (VI) where
Y sont chacun indépendemment des autres un groupe CH ou un atome d’azote (les deux groupes Y peuvent être identiques ou différents); Y are each independently of the others a CH group or a nitrogen atom (the two Y groups can be identical or different);
R7 est choisi parmi un groupe OCYH2Y+I avec y = 1 à 10 ; SCWH2W+I avecw= 1 à 10;R 7 is chosen from a group OC Y H2 Y + I with y = 1 to 10; SC W H2 W + I with w = 1 to 10;
N(CmH2m+i)2 avec m= 1 à 6, COOH ; SO3H ou PO2H3 ; N (C m H2m + i) 2 with m = 1 to 6, COOH; SO3H or PO2H3;
Z désigne un atome d’oxygène, un atome de soufre ou un groupe NH ; Z denotes an oxygen atom, a sulfur atom or an NH group;
la ligne en pointillée représente une liaison C-C au niveau du point de rattachement du cycle aromatique de formule (II) à (VI) aux groupements terpyridines du composé organométallique de formule (I) ; the dotted line represents a C-C bond at the point of attachment of the aromatic cycle of formula (II) to (VI) to the terpyridine groups of the organometallic compound of formula (I);
X est un contre-ion. X is a counterion.
La présente invention a également pour objet un composé organométallique comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines, ayant une formule générale (I) définie ci-dessus pour son utilisation comme médicament. The present invention also relates to an organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups, having a general formula (I) defined above for its use as a medicament.
Enfin, la présente invention pourrait être une composition pharmaceutique qui pourrait comprendre, dans un support acceptable sur le plan pharmaceutique, au moins un composé organométallique tel que défini ci-dessus.
Pour le reste de la description, à moins qu’il n’en soit spécifié autrement, l’indication d’un intervalle de valeurs « de X à Y » ou entre « X à Y », dans la présente invention, s’entend comme incluant les valeurs X et Y. Finally, the present invention could be a pharmaceutical composition which could comprise, in a pharmaceutically acceptable carrier, at least one organometallic compound as defined above. For the rest of the description, unless otherwise specified, the indication of a range of values “from X to Y” or between “X to Y”, in the present invention, is understood to mean as including the X and Y values.
DESCRIPTION DETAILLEE D’UN EXEMPLE DE RÉALISATION DETAILED DESCRIPTION OF AN EXAMPLE OF IMPLEMENTATION
La description qui va suivre, donnée à titre d’exemples non limitatifs, fera bien comprendre en quoi consiste l’invention et comment elle peut être réalisée. The description which follows, given by way of nonlimiting examples, will make it clear what the invention consists of and how it can be carried out.
I. Utilisation non-thérapeutique du ou des composés de formule générale (I)I. Non-therapeutic use of the compound or compounds of general formula (I)
Tel que mentionné ci-dessus, la présente invention porte sur l’utilisation non- thérapeutique, en tant qu’agent de déméthylation de l’ADN, d’au moins un composé organométallique comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines de formule générale (I) suivante : As mentioned above, the present invention relates to the non-therapeutic use, as DNA demethylating agent, of at least one organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups of formula general (I) below:
dans laquelle : in which :
R1 à R6, identiques ou différents sont indépendemment choisis parmi : un atome d’hydrogène ; une chaîne alkyle linéaire ou ramifiée de formule CnHhn+i avec n = 1 à 12 ; un groupe COOH ; un groupe SO3H ; un groupe PO3H ; un cycle aromatique de formule (II) à (VI) ci-dessous: R 1 to R 6 , identical or different, are independently chosen from: a hydrogen atom; a linear or branched alkyl chain of formula C n Hh n + i with n = 1 to 12; a COOH group; an SO 3 H group; a PO 3 H group; an aromatic cycle of formula (II) to (VI) below:
(II) (III) (IV) (V) (VI) où
Y sont chacun indépendemment des autres un groupe CH ou un atome d’azote, à savoir les deux groupes Y peuvent être identiques ou différents ; (II) (III) (IV) (V) (VI) where Y are each independently of the others a CH group or a nitrogen atom, that is to say the two groups Y can be identical or different;
R7 est choisi parmi un groupe OCYH2Y+I avec y = 1 à 10 ; SCWH2W+I avecw= 1 à 10; N(CmH2m+i)2 avec m = 1 à 6, COOH ; SO3H ; PO2H3 ; R 7 is chosen from a group OC Y H2 Y + I with y = 1 to 10; SC W H2 W + I with w = 1 to 10; N (C m H2m + i) 2 with m = 1 to 6, COOH; SO3H; PO2H3;
Z désigne un atome d’oxygène, un atome de soufre ou un groupe NH ; Z denotes an oxygen atom, a sulfur atom or an NH group;
la ligne en pointillée représente une liaison C-C au niveau du point de rattachement du cycle aromatique de formule (II) à (VI) aux groupements terpyridines du composé organométallique de formule (I) ; the dotted line represents a C-C bond at the point of attachment of the aromatic cycle of formula (II) to (VI) to the terpyridine groups of the organometallic compound of formula (I);
X est un contre-ion. X is a counterion.
Selon l’invention, les groupes terpyridine sont des ligands particulièrement appropriés pour l’atome de fer qui permettent de former un composé organométallique relativement stable et qui serait, de ce fait, résistant même dans un environnement biologique. En outre, la configuration particulière des ligands terpyridine confère une rigidité remarquable au composé organométallique selon l’invention. According to the invention, the terpyridine groups are ligands which are particularly suitable for the iron atom which make it possible to form a relatively stable organometallic compound and which would therefore be resistant even in a biological environment. In addition, the particular configuration of the terpyridine ligands gives remarkable rigidity to the organometallic compound according to the invention.
Les composés de l'invention peuvent être sous forme de sels, solvatés et/ou de pro-drogues pharmaceutiquement acceptables. Les pro-drogues sont des variants des composés de l'invention qui peuvent être transformés in vivo en composés de formule générale (I) selon l'invention. The compounds of the invention may be in the form of salts, solvates and / or pharmaceutically acceptable prodrugs. The pro-drugs are variants of the compounds of the invention which can be transformed in vivo into compounds of general formula (I) according to the invention.
Selon l’invention, le terme « sels ou solvatés pharmaceutiquement acceptables » se réfère à des sels ou des solvatés qui conservent l’activité biologique désirée telle que décrite ci-dessus des composés organométalliques de l’invention et qui exposent à très peu, voire aucun effet toxicologique non désiré. According to the invention, the term “pharmaceutically acceptable salts or solvates” refers to salts or solvates which retain the desired biological activity as described above of the organometallic compounds of the invention and which expose to very little, even no unwanted toxicological effects.
Selon l'invention, le terme « alkyle » désigne un radical hydrocarboné linéaire ou ramifié, saturé ou insaturé, ayant avantageusement de 1 à 12 atomes de carbone, tel que méthyle, éthyle, propyle, isopropyle, butyle, isobutyle, tert-butyle, pentyle, néopentyle, n-hexyle, etc. Les groupes ayant de 1 à 6 atomes et en particulier de 1 à 4 atomes de carbone sont préférés. According to the invention, the term “alkyl” designates a linear or branched, saturated or unsaturated hydrocarbon radical, advantageously having from 1 to 12 carbon atoms, such as methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, tert-butyl, pentyle, neopentyle, n-hexyle, etc. Groups having from 1 to 6 atoms and in particular from 1 to 4 carbon atoms are preferred.
Selon un premier mode de réalisation préféré, R1 à R6 peuvent correspondent à un atome d’hydrogène. According to a first preferred embodiment, R 1 to R 6 may correspond to a hydrogen atom.
Selon ce mode, le composé organométallique de formule (I) peut répondre à la formule (IX) suivante : According to this mode, the organometallic compound of formula (I) can correspond to the following formula (IX):
Ce composé de formule (IX) sera nommé ci-après AIM1. This compound of formula (IX) will be named hereinafter AIM1.
Selon un deuxième mode de réalisation préféré, R1, R3, R4, 66 peuvent être identiques et correspondre à un atome d’hydrogène, et R2 et R5 peuvent être identiques et désigner un cycle aromatique de formule (II) tel que décrit ci-dessus avec Y=CH et correspondre ainsi à un benzène de formule (Vil) suivante : According to a second preferred embodiment, R 1 , R 3 , R 4 , 6 6 may be identical and correspond to a hydrogen atom, and R 2 and R 5 may be identical and denote an aromatic ring of formula (II) as described above with Y = CH and thus correspond to a benzene of the following formula (Vil):
(VII)(VII)
Selon ce mode, le composé organométallique de formule (I) peut répondre à la formule (X) suivante : According to this mode, the organometallic compound of formula (I) can correspond to the following formula (X):
Ce composé de formule (IX) sera nommé ci-après AIM2. This compound of formula (IX) will be named hereinafter AIM2.
Selon un troisième mode de réalisation préféré, R1, R3, R4, R6 sont identiques et correspondent à un atome d’hydrogène, et R2 et R5 sont identiques et désignent un cycle aromatique de formule (II) où un des Y=CH et l’autre Y= N et correspondent à un radical pyridine de formule (VIII) suivante :
où la ligne en pointillée représente une liaison C-C entre le carbone porté par le radical pyridine et le carbone porté par le groupe terpyridine du composé organométallique de formule (I). According to a third preferred embodiment, R 1 , R 3 , R 4 , R 6 are identical and correspond to a hydrogen atom, and R 2 and R 5 are identical and denote an aromatic ring of formula (II) where a Y = CH and the other Y = N and correspond to a pyridine radical of formula (VIII) below: where the dotted line represents a CC bond between the carbon carried by the pyridine radical and the carbon carried by the terpyridine group of the organometallic compound of formula (I).
Selon ce mode, le composé organométallique de formule (I) peut répondre à la formule (XI) suivante : According to this mode, the organometallic compound of formula (I) can correspond to the following formula (XI):
Ce composé de formule (IX) sera nommé ci-après AIM3. This compound of formula (IX) will be named hereinafter AIM3.
Les deux groupes terpyridines de ce composé AIM3 porte ainsi chacun un noyau pyridinique, l’atome d’azote permettant d’induire un effet nucléophile. The two terpyridine groups of this compound AIM3 thus each carry a pyridine nucleus, the nitrogen atom making it possible to induce a nucleophilic effect.
Selon un mode de réalisation de l’invention, le composé organométallique de formule (I) exclut le ou les composés où R1=R3=R4=R6=H et où R2=R5 est choisi parmi un cycle aromatique de formule (VI) dans lequel Z est un atome de soufre ou un cycle aromatique de formule (II) ou (III) avec Y=CH. According to one embodiment of the invention, the organometallic compound of formula (I) excludes the compound or compounds where R 1 = R 3 = R 4 = R 6 = H and where R 2 = R 5 is chosen from an aromatic ring of formula (VI) in which Z is a sulfur atom or an aromatic ring of formula (II) or (III) with Y = CH.
De préférence, le contre-ion X est choisi parmi : Cl , Br, I , l’hexafluorophosphate de formule PF6 , de préférence le contre-ion est le PF6 . Preferably, the counterion X is chosen from: Cl, Br, I, the hexafluorophosphate of formula PF 6 , preferably the counterion is PF 6 .
Avantageusement, le ou les composés organométalliques sont capables d’entraîner une déméthylation directe de l’ADN. Advantageously, the organometallic compound (s) are capable of causing direct demethylation of DNA.
Sans être lié par une quelconque théorie, il semblerait que la déméthylation de l’ADN serait due soit à une attaque nucléophile des 5-méthylcytosines (5mC) entraînant ainsi leur déamination, et/ou soit à une oxydation médiée par le fer qui permettrait une conversion des 5mC en 5-hydroxymethylcytosine (5hmC). Without being bound by any theory, it would seem that the demethylation of DNA is due either to a nucleophilic attack of 5-methylcytosines (5mC) thus causing their deamination, and / or to an oxidation mediated by iron which would allow a conversion of 5mC into 5-hydroxymethylcytosine (5hmC).
Ainsi, les composés organométalliques de formule (I) selon l’invention peuvent notamment être utilisés afin de former des outils de biotechnologie, par exemple en tant que réactifs de séquençage où une déméthylation de l’ADN est requise. Thus, the organometallic compounds of formula (I) according to the invention can in particular be used in order to form biotechnology tools, for example as sequencing reagents where demethylation of DNA is required.
A titre d’exemple, le ou les composés de l’invention peuvent être utilisés en tant qu’outil de biotechnologies, comme par exemple en tant que réactif pour effectuer des expériences de déméthylation in vitro sur de cellules, généralement tumorales, issues d’un prélèvement effectué chez un animal. Ces expériences permettraient par exemple de confirmer la présence ou non de phénomène de méthylation de l’ADN sur certains gènes, de bloquer la prolifération cellulaire de ces cellules et donc de les sensibiliser à des agents de chimiothérapie. « Par animal » selon l’invention, on entend les mammifères, les oiseaux, les poissons, les insectes, etc., ainsi que l’être humain. By way of example, the compound or compounds of the invention can be used as a biotechnology tool, such as for example as a reagent for carrying out demethylation experiments in vitro on cells, generally tumor cells, originating from a sample taken from an animal. These experiments would make it possible, for example, to confirm the presence or not of DNA methylation phenomenon on certain genes, to block the cell proliferation of these cells and therefore to sensitize them to chemotherapy agents. "By animal" according to the invention means mammals, birds, fish, insects, etc., as well as humans.
La synthèse du ou des composés organométalliques de formule (I) selon l’invention et en particulier des composés AIM1 à AIM3 a précédemment été décrite dans des publications, telles que la publication de E. C. Constable, A. M. W. Cargill Thompson, Dalton Trans, 1992, 2947-2950 pour les composés AIM1 et AIM3 et la publication de H. Krass, E.A. Plummer, J.M. Haider, P. R. Barker, N.W. Alcock, Z. Pikramenou, M.J., Hannon, D.G. Kurth, Angew. Chem. Int. Ed. 40 (2001 ) 3862-3865 pour le composé AIM2. The synthesis of the organometallic compound (s) of formula (I) according to the invention and in particular of the compounds AIM1 to AIM3 has previously been described in publications, such as the publication of EC Constable, AMW Cargill Thompson, Dalton Trans, 1992, 2947 -2950 for the compounds AIM1 and AIM3 and the publication by H. Krass, EA Plummer, JM Haider, PR Barker, NW Alcock, Z. Pikramenou, MJ, Hannon, DG Kurth, Angew. Chem. Int. Ed. 40 (2001) 3862-3865 for the compound AIM2.
En particulier, la synthèse du ou des composés selon l’invention peut s’effectuer selon le procédé décrit ci-dessous. In particular, the synthesis of the compound (s) according to the invention can be carried out according to the method described below.
Les ligands terpyridines requis pour la synthèse des composés organométalliques selon l’invention ont été préparés en utilisant la réaction de Krohnke entre la 2-acétylpyridine et un composé aryl aldéhyde approprié en présence d’ammoniac.
Par exemple, les complexes homoleptiques AIM1 , AIM2 et AIM3 sont obtenus avec un rendement respectif de 90, 69 et 83% en faisant réagir le ligand terpyridine approprié (2 équivalents) avec du FeCh dans de l’acétonitrile ( schéma 1). The terpyridine ligands required for the synthesis of the organometallic compounds according to the invention were prepared using the Krohnke reaction between 2-acetylpyridine and an appropriate aryl aldehyde compound in the presence of ammonia. For example, the homoleptic complexes AIM1, AIM2 and AIM3 are obtained with a respective yield of 90, 69 and 83% by reacting the appropriate terpyridine ligand (2 equivalents) with FeCh in acetonitrile (scheme 1).
Schéma 1 Diagram 1
En particulier, une solution comprenant FeCh (106 mg, 0,84 mmoles) et du méthanol (20 ml_) est additionnée à une solution comprenant le ligand terpyridine approprié (1 ,68 mmoles) et du méthanol (20 ml_). Le mélange est alors agité pendant 10 min. De l’éther éthylique (100 mL) est ensuite ajouté conduisant à un solide pourpre collecté par filtration, lavé à l’éther et séché sous vide. In particular, a solution comprising FeCh (106 mg, 0.84 mmol) and methanol (20 ml) is added to a solution comprising the appropriate terpyridine ligand (1.68 mmol) and methanol (20 ml). The mixture is then stirred for 10 min. Ethyl ether (100 mL) is then added leading to a purple solid collected by filtration, washed with ether and dried under vacuum.
AIM1. Rendement: 90%. RMN 1 H (200 MHz, CD3OD): d = 7.85 (d, J = 8.1 Hz, 4H), 7.49 (t, J = 8.2 Hz, 2H), 7.41 (d, J = 8.2 Hz, 4H), 6.68 (m, 4H), 5.90 (d, J = 3.8 Hz,AIM1. Yield: 90%. 1 H NMR (200 MHz, CD 3 OD): d = 7.85 (d, J = 8.1 Hz, 4H), 7.49 (t, J = 8.2 Hz, 2H), 7.41 (d, J = 8.2 Hz, 4H), 6.68 (m, 4H), 5.90 (d, J = 3.8 Hz,
8H) ppm. HRMS (ESI) calcd pour C3oH22FeN6Cl2 m/z = 261 .0627 [M - 2 Cl]2+. Trouvé: 261 .0683. 8H) ppm. HRMS (ESI) calcd for C 3 oH 2 2FeN 6 Cl2 m / z = 261 .0627 [M - 2 Cl] 2+ . Found: 261 .0683.
AIM2. Rendement: 69%. RMN 1 H (200 MHz, DMSO-d6 ) 9.70 (s, 4H), 9.09 (d, J=8.5 Hz, 4H), 8.57 (d, J=7.4 Hz, 2H), 8.05 (t, J = 7.4 Hz, 4H), 7.85 (t, J=7.2 Hz, 4H), 7.78 (t, J=7.0 Hz, 2H ,), 7.3 (d, J=5.1 Hz, 4H), 7.2 (t, J=6.3 Hz, 4H). HRMS (ESI) calcd pourAIM2. Yield: 69%. 1 H NMR (200 MHz, DMSO-d6) 9.70 (s, 4H), 9.09 (d, J = 8.5 Hz, 4H), 8.57 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 8.05 (t, J = 7.4 Hz , 4H), 7.85 (t, J = 7.2 Hz, 4H), 7.78 (t, J = 7.0 Hz, 2H,), 7.3 (d, J = 5.1 Hz, 4H), 7.2 (t, J = 6.3 Hz, 4H). HRMS (ESI) calcd for
C42H3oFeN6Cl2 m/z = 337.0936 [M - 2 Cl]2+. Trouvé: 337.0902. C42H 3 oFeN 6 Cl2 m / z = 337.0936 [M - 2 Cl] 2+ . Found: 337.0902.
AIM3. Rendement: 83%. RMN 1 H (200 MHz, CD3CN): d = 9.27 (s, 2H), 9.08 (d, J = 5.8 Hz, 2H), 8.65 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 8.38 (d, J = 5.8 Hz, 2H), 7.97 (dt, J = 6.7 Hz, 1 .2 Hz, 2H), 7.22-7.10 (m, 4H) ppm. HRMS (ESI) calcd pour C^HzsFeNsCh m/z = 338.0888 [M - 2 Cl]2+. Trouvé: 338.0906. AIM3. Yield: 83%. 1 H NMR (200 MHz, CD 3 CN): d = 9.27 (s, 2H), 9.08 (d, J = 5.8 Hz, 2H), 8.65 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 8.38 (d, J = 5.8 Hz, 2H), 7.97 (dt, J = 6.7 Hz, 1 .2 Hz, 2H), 7.22-7.10 (m, 4H) ppm. HRMS (ESI) calcd for C ^ HzsFeNsCh m / z = 338.0888 [M - 2 Cl] 2+ . Found: 338.0906.
I I . Utilisation thérapeutique du ou des composés de formule générale (I)I I. Therapeutic use of the compound (s) of general formula (I)
Comme cela a déjà été mentionné précédemment, le ou les composés organométalliques de formule (I) selon l’invention présentant une action déméthylante de l’ADN peuvent aussi représenter une substance active à des fins thérapeutiques, comme cela sera décrit ci-après.
La présente invention porte ainsi sur un composé organométallique comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines, ayant une formule générale (I) telle que définie ci-dessus pour son utilisation comme médicament. As already mentioned previously, the organometallic compound (s) of formula (I) according to the invention having a demethylating action of DNA can also represent an active substance for therapeutic purposes, as will be described below. The present invention thus relates to an organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups, having a general formula (I) as defined above for its use as a medicament.
Bien sûr les caractéristiques décrites ci-dessus pour le ou les composés organométalliques de formule (I) à usage non-thérapeutique sont reprises ici pour l’usage thérapeutique (à savoir pour leur utilisation en tant que médicament). Of course, the characteristics described above for the organometallic compound (s) of formula (I) for non-therapeutic use are included here for therapeutic use (namely for their use as a medicament).
En particulier, selon un mode de réalisation de l’invention, le composé organométallique de formule (I) exclut le ou les composés où R1=R3=R4=R6=H et où R2=R5 est choisi parmi un cycle aromatique de formule (V) ou (VI) dans lequel Z est un atome de soufre ou un cycle aromatique de formule (II) ou (III) avec Y=CH. In particular, according to one embodiment of the invention, the organometallic compound of formula (I) excludes the compound or compounds where R 1 = R 3 = R 4 = R 6 = H and where R 2 = R 5 is chosen from an aromatic ring of formula (V) or (VI) in which Z is a sulfur atom or an aromatic ring of formula (II) or (III) with Y = CH.
De préférence, le ou les composés organométalliques selon l’invention peuvent être utilisés afin de traiter des maladies liées à une hyperprolifération cellulaire, en particulier des cancers. Preferably, the organometallic compound (s) according to the invention can be used to treat diseases linked to cellular hyperproliferation, in particular cancers.
En particulier, le ou les composés organométalliques selon l’invention peuvent être utilisés pour traiter des glioblastomes, des leucémies promyélocytaires, des cancers de la prostate, des ovaires, des poumons, des seins, des voies digestives, en particulier du foie, du pancréas, de la tête et du cou, du colon, des lymphomes non-Hodgkiniens ou des mélanomes, etc. In particular, the organometallic compound (s) according to the invention can be used to treat glioblastomas, promyelocytic leukemias, cancers of the prostate, ovaries, lungs, breasts, digestive tracts, in particular the liver, pancreas , head and neck, colon, non-Hodgkin's lymphoma or melanoma, etc.
Les composés de l'invention présentent un effet antiprolifératif vis-à-vis de cellules tumorales et saines. Ces composés entraînent une accumulation des cellules en phase G2/M ou G0/G1. Une mort cellulaire peut être observée mais seulement après des traitements longs de minimum 96h. Ainsi ces composés peuvent être utilisés afin de réduire la prolifération tumorale. The compounds of the invention exhibit an antiproliferative effect with respect to tumor and healthy cells. These compounds cause an accumulation of cells in the G2 / M or G0 / G1 phase. Cell death can be observed but only after long treatments of minimum 96 hours. Thus, these compounds can be used to reduce tumor proliferation.
En outre, le ou les composés organométalliques peuvent être utilisés pour traiter des tumeurs résistantes à d’autres agents anticancéreux. In addition, the organometallic compound (s) can be used to treat tumors resistant to other anticancer agents.
De par la capacité déméthylante de ces composés, la Demanderesse a également découvert que le ou les composés organométalliques selon l’invention pouvaient être utilisés pour traiter d’autres maladies liées à une dérégulation des modifications épigénétiques, telles que pour traiter l’inflammation, l’obésité, les maladies neurodégénératives ou les maladies cardiovasculaires. Due to the demethylating capacity of these compounds, the Applicant has also discovered that the organometallic compound (s) according to the invention could be used to treat other diseases linked to deregulation of epigenetic modifications, such as to treat inflammation, obesity, neurodegenerative diseases or cardiovascular diseases.
Egalement, la présente invention pourra être destinée à former une composition pharmaceutique comprenant, dans un support acceptable sur le plan pharmaceutique, au moins un composé organométallique de formule (I) tel que défini ci-dessus. Also, the present invention may be intended to form a pharmaceutical composition comprising, in a pharmaceutically acceptable carrier, at least one organometallic compound of formula (I) as defined above.
Bien sûr les caractéristiques décrites ci-dessus pour le ou les composés organométalliques de formule (I) à usage non-thérapeutique ou pour l’utilisation en tant que médicament sont reprises ici pour l’usage thérapeutique en tant que médicament. Of course, the characteristics described above for the organometallic compound (s) of formula (I) for non-therapeutic use or for use as a medicament are included here for therapeutic use as a medicament.
Dans le contexte de l'invention, le terme « support acceptable sur le plan pharmaceutique » désigne des substances telles que les excipients, les véhicules, les
adjuvants, les tampons qui sont classiquement utilisés, en combinaison avec un ou des principes actifs (ici, le ou les composés organométalliques selon l’invention), pour la préparation d'un médicament. Le choix de tels supports dépend essentiellement de la voie d'administration envisagée. In the context of the invention, the term “pharmaceutically acceptable carrier” designates substances such as excipients, vehicles, adjuvants, buffers which are conventionally used, in combination with one or more active principles (here, the organometallic compound or compounds according to the invention), for the preparation of a medicament. The choice of such supports essentially depends on the route of administration envisaged.
En général, le support acceptable sur le plan pharmaceutique est un excipient, un véhicule et/ou un adjuvant choisi dans le groupe constitué par les excipients, les véhicules et/ou les adjuvants pharmaceutiquement acceptables. In general, the pharmaceutically acceptable carrier is an excipient, a vehicle and / or an adjuvant chosen from the group consisting of pharmaceutically acceptable excipients, vehicles and / or adjuvants.
Des techniques de préparation de compositions pharmaceutiques peuvent être aisément retrouvées par l'homme du métier, par exemple dans l'ouvrage Remmington's Pharmaceutical Sciences, Mid. Publis. Co, Easton, PA, USA. Techniques for preparing pharmaceutical compositions can be easily found by those skilled in the art, for example in the work Remmington's Pharmaceutical Sciences, Mid. Publish. Co, Easton, PA, USA.
Des adjuvants, des véhicules et des excipients physiologiquement acceptables sont aussi décrits dans l'ouvrage intitulé "Handbook of Pharmaceutical Excipients, seconde édition, American Pharmaceutical Association, 1994". Physiologically acceptable adjuvants, vehicles and excipients are also described in the book "Handbook of Pharmaceutical Excipients, Second Edition, American Pharmaceutical Association, 1994".
Pour formuler une composition pharmaceutique, l'homme du métier pourra avantageusement se référer à la dernière édition de la Pharmacopée Européenne ou de la Pharmacopée des Etats-Unis d'Amérique (USP). To formulate a pharmaceutical composition, a person skilled in the art can advantageously refer to the latest edition of the European Pharmacopoeia or the Pharmacopoeia of the United States of America (USP).
L'homme du métier pourra notamment avantageusement se référer à la quatrième édition 2002 de la Pharmacopée Européenne, ou encore à l'édition USP 25-NF 20 de la Pharmacopée Américaine (U. S. Pharmacopeia). A person skilled in the art may in particular advantageously refer to the fourth edition 2002 of the European Pharmacopoeia, or even to the edition USP 25-NF 20 of the American Pharmacopoeia (U. S. Pharmacopeia).
Ainsi, la composition pharmaceutique peut comprendre un ou plusieurs agents ou véhicules choisis parmi les dispersants, les solubilisants, les stabilisants, les conservateurs, etc. Thus, the pharmaceutical composition can comprise one or more agents or vehicles chosen from dispersants, solubilizers, stabilizers, preservatives, etc.
La composition pharmaceutique peut être une composition pharmaceutique humaine ou vétérinaire. The pharmaceutical composition can be a human or veterinary pharmaceutical composition.
La composition pharmaceutique peut se présenter sous une forme liquide, ou, de manière préférentielle, sous une forme solide. The pharmaceutical composition may be in a liquid form, or, preferably, in a solid form.
Pour une administration orale, on préférera une composition pharmaceutique solide, par exemple sous la forme de comprimés, de capsules ou de gélules. For oral administration, a solid pharmaceutical composition is preferred, for example in the form of tablets, capsules or capsules.
Sous la forme liquide, on préférera une composition pharmaceutique sous la forme d'une suspension aqueuse. In the liquid form, a pharmaceutical composition is preferred in the form of an aqueous suspension.
Une composition pharmaceutique peut ainsi se présenter sous une forme pour l'administration orale, par inhalation, parentérale ou injection comme par exemple par voie intraveineuse, intra-musculaire, sous-cutanée, trans-dermique, intra-artérielle, etc. A pharmaceutical composition can thus be presented in a form for oral administration, by inhalation, parenteral or injection such as for example by intravenous, intramuscular, subcutaneous, trans-dermal, intra-arterial, etc.
Selon un premier aspect, les formes orales sont particulièrement préférées. Selon un deuxième aspect, les voies intraveineuse, intramusculaire, sous- cutanée, et par inhalation sont préférées. According to a first aspect, the oral forms are particularly preferred. In a second aspect, the intravenous, intramuscular, subcutaneous, and inhalation routes are preferred.
A titre d’exemple, pour les injections, les compositions sont généralement sous forme de suspensions liquides, qui peuvent être injectées au moyen de seringues ou de
perfusions, par exemple. A cet égard, les composés sont généralement dissous dans un support acceptable qui comprend des solutions salines, physiologiques, isotoniques, tamponnées, etc., compatibles avec un usage pharmaceutique et connues de l'homme du métier. Des agents ou véhicules utilisables dans des formulations liquides et/ou injectables sont notamment la méthylcellulose, l'hydroxyméthylcellulose, la carboxyméthylcellulose, le polysorbate 80, le mannitol, la gélatine, le lactose, des huiles végétales, l'acacia, etc. For example, for injections, the compositions are generally in the form of liquid suspensions, which can be injected by means of syringes or infusions, for example. In this regard, the compounds are generally dissolved in an acceptable support which comprises saline, physiological, isotonic, buffered solutions, etc., compatible with pharmaceutical use and known to those skilled in the art. Agents or vehicles which can be used in liquid and / or injectable formulations are in particular methylcellulose, hydroxymethylcellulose, carboxymethylcellulose, polysorbate 80, mannitol, gelatin, lactose, vegetable oils, acacia, etc.
Il est entendu que le débit d'injection et/ou la dose injectée peuvent être adaptés par l'homme du métier en fonction du patient, de la pathologie concernée, du mode d'administration, etc. It is understood that the injection rate and / or the dose injected can be adapted by a person skilled in the art depending on the patient, the pathology concerned, the mode of administration, etc.
Typiquement, le ou les composés organométalliques selon l'invention sont administrés à des doses pouvant varier entre 0,1 pg et 100 mg/kg de poids corporel, plus généralement entre 0,01 et 10 mg/kg, typiquement entre 0,1 et 10 mg/kg. En outre, des injections répétées peuvent être réalisées. D'autre part, pour des traitements chroniques, des systèmes à libération prolongée et/ou retardée peuvent être avantageux. Typically, the organometallic compound (s) according to the invention are administered in doses which can vary between 0.1 pg and 100 mg / kg of body weight, more generally between 0.01 and 10 mg / kg, typically between 0.1 and 10 mg / kg. In addition, repeated injections can be made. On the other hand, for chronic treatments, prolonged and / or delayed release systems may be advantageous.
A titre d’exemple, pour une administration par voie orale, des formes pharmaceutiques solides en tant que support pharmaceutique peuvent comprendre, en tant que véhicules, adjuvants ou excipients, au moins un agent diluant, un arôme, un agent solubilisant, un agent lubrifiant, un agent de suspension, un agent désintégrant et un agent d'encapsulation, l'identité et la fonction de ces différents classiques étant documentés complètement dans la Pharmacopée Européenne ou dans la Pharmacopée des Etats-Unis d'Amérique, (USP). By way of example, for oral administration, solid pharmaceutical forms as pharmaceutical support can comprise, as vehicles, adjuvants or excipients, at least one diluting agent, a flavoring, a solubilizing agent, a lubricating agent. , a suspending agent, a disintegrating agent and an encapsulating agent, the identity and the function of these different classics being fully documented in the European Pharmacopoeia or in the Pharmacopoeia of the United States of America (USP).
De tels composés sont par exemple le carbonate de magnésium, le stéarate de magnésium, le talc, le lactose, la pectine, la dextrine, l'amidon, la gélatine, des matériaux cellulosiques, etc. Les compositions sous forme liquide peuvent comprendre également de l'eau, le cas échéant en mélange avec du propylèneglycol ou du polyéthylèneglycol, et éventuellement aussi des agents de coloration, des arômes, des stabilisants et des agents épaississants. Such compounds are, for example, magnesium carbonate, magnesium stearate, talc, lactose, pectin, dextrin, starch, gelatin, cellulose materials, etc. The compositions in liquid form can also comprise water, optionally in admixture with propylene glycol or polyethylene glycol, and optionally also coloring agents, flavorings, stabilizers and thickening agents.
Généralement, afin de traiter un patient d’une pathologie liée à une dérégulation des modifications épigénétiques (telle que le cancer), la méthode comprend une étape au cours de laquelle on administre audit patient, une quantité thérapeutiquement efficace d’un extrait sec purifié du ou des composés organométalliques selon l’invention, ou encore de la composition pharmaceutique décrite ci-dessus. Generally, in order to treat a patient with a pathology linked to a deregulation of epigenetic modifications (such as cancer), the method comprises a step during which said patient is administered a therapeutically effective amount of a purified dry extract of the or organometallic compounds according to the invention, or alternatively of the pharmaceutical composition described above.
Dans le contexte de l'invention, le terme « traitement » désigne le traitement préventif, curatif, palliatif, ainsi que la prise en charge des patients (réduction de la souffrance, amélioration de la durée de vie, ralentissement de la progression de la maladie, réduction de la croissance tumorale, etc.). Le traitement peut en outre être réalisé en combinaison avec d'autres agents ou traitements chimiques ou physiques
(chimiothérapie, radiothérapie, thérapie génique, etc.)· Les traitements et médicaments de l'invention sont tout particulièrement destinés aux humains. In the context of the invention, the term “treatment” designates preventive, curative, palliative treatment, as well as the management of patients (reduction of suffering, improvement of lifespan, slowing down the progression of the disease , reduction of tumor growth, etc.). The treatment can also be carried out in combination with other chemical or physical agents or treatments (chemotherapy, radiotherapy, gene therapy, etc.) · The treatments and drugs of the invention are particularly intended for humans.
Ainsi, le ou les composés organométalliques selon l’invention et/ou la composition pharmaceutique pourront par exemple être utilisés dans le traitement des cancers en combinaison avec un traitement anticancéreux mettant en oeuvre des rayonnements, tel que la radiothérapie. Thus, the organometallic compound (s) according to the invention and / or the pharmaceutical composition may, for example, be used in the treatment of cancers in combination with an anticancer treatment using radiation, such as radiotherapy.
Egalement, le ou les composés organométalliques selon l’invention et/ou la composition pharmaceutique pourront par exemple être utilisés dans le traitement des cancers en combinaison avec au moins un autre agent chimique anticancéreux, conditionné et administré de façon combinée, séparée ou séquentielle. Par exemple, il serait possible de prévoir un pré-traitement avec un composé selon l’invention, suivi d’un traitement avec un agent anticancéreux. Also, the organometallic compound (s) according to the invention and / or the pharmaceutical composition can for example be used in the treatment of cancers in combination with at least one other anticancer chemical agent, conditioned and administered in a combined, separate or sequential manner. For example, it would be possible to provide a pretreatment with a compound according to the invention, followed by treatment with an anticancer agent.
L’autre agent chimique anticancéreux peut être par exemple le cisplatine, le carboplatine, le taxotère, le taxol, le tomoxifène, la doxorubicine ou encore le 5- fluorouracile et est avantageusement le taxol, le 5-fluorouracile ou encore le tomoxifène ou la doxorubicine. The other anticancer chemical agent can for example be cisplatin, carboplatin, taxoter, taxol, tomoxifene, doxorubicin or 5-fluorouracil and is advantageously taxol, 5-fluorouracil or else tomoxifene or doxorubicin .
La Demanderesse a en effet mis en évidence de manière surprenante que les composés selon l’invention permettaient de sensibiliser des cellules cancéreuses à des agents anticancéreux, voire d’agir en synergie avec eux (exemples 1 1 et 12). The Applicant has in fact surprisingly demonstrated that the compounds according to the invention made it possible to sensitize cancer cells to anticancer agents, or even to act in synergy with them (examples 1 1 and 12).
La présente invention permet ainsi d’inhiber in vivo, in vitro ou ex vivo la prolifération de cellules tumorales, comprenant la mise en contact desdites cellules tumorales avec la composition pharmaceutique. Les cellules tumorales peuvent être notamment celles des pathologies spécifiées ci-dessus. The present invention thus makes it possible to inhibit in vivo, in vitro or ex vivo the proliferation of tumor cells, comprising bringing said tumor cells into contact with the pharmaceutical composition. The tumor cells can in particular be those of the pathologies specified above.
L'invention est en outre illustrée, sans pour autant être limitée, par les figures annexées et les exemples suivants où : The invention is further illustrated, without being limited, by the appended figures and the following examples where:
- la Figure 1 : représente le résultat d’une expérience de modélisation moléculaire de la capacité déméthylante du composé AIM3 selon l’invention ; - Figure 1: shows the result of an molecular modeling experiment of the demethylating capacity of the compound AIM3 according to the invention;
- la Figure 2 : représente l’évaluation du pouvoir déméthylant des composés AIM2 et AIM3 selon l’invention dans un système in vitro, (a) des tests ELISA ont été réalisés afin de mesurer le taux de cytosines méthylées présent sur un fragment d’ADN après action de la déméthylase TET2 ou des molécules AIM2 et AIM3 ; (b) l’activité déméthylante de AIM2 (2mM) et de la protéine his-tagged-TET2 (10pg) a été mesurée par un dosage de l’incorporation de groupements méthyle radiomarqués au niveau d’un ADN double brin biotynilé et préalablement méthylé par l’enzyme MSsI ; - Figure 2: shows the evaluation of the demethylating power of the compounds AIM2 and AIM3 according to the invention in an in vitro system, (a) ELISA tests were carried out in order to measure the level of methylated cytosines present on a fragment of DNA after action of TET2 demethylase or AIM2 and AIM3 molecules; (b) the demethylating activity of AIM2 (2mM) and of the his-tagged-TET2 protein (10pg) was measured by an assay of the incorporation of radiolabelled methyl groups at the level of a biotynilized double stranded DNA previously methylated by the enzyme MSsI;
- la Figure 3 : représente l’évaluation du pouvoir déméthylant global des molécules AIM2 et AIM3 dans les cellules U251 : un test ELISA a été réalisé afin de mesurer le taux de cytosines méthylées présent au niveau de l’ADN de cellules U251 non traitées versus traitées pendant 1 ou 4h avec 2mM de 5aza-2-déoxycytidine, AIM2 ou
AIM3 ; - Figure 3: represents the evaluation of the overall demethylating power of the molecules AIM2 and AIM3 in U251 cells: an ELISA test was carried out in order to measure the level of methylated cytosines present in the DNA of untreated U251 cells versus treated for 1 or 4h with 2mM of 5aza-2-deoxycytidine, AIM2 or AIM3;
- la Figure 4 : représente l’évaluation du pouvoir déméthylant global de la molécule AIM3 sur les cellules T98G et montre l’absence d’effet dose du pouvoir déméthylant de la molécule AIM3 suite à son incubation pendant 1 h (p=0.2578) ; - Figure 4: shows the evaluation of the overall demethylating power of the AIM3 molecule on T98G cells and shows the absence of a dose effect of the demethylating power of the AIM3 molecule following its incubation for 1 h (p = 0.2578);
- la Figure 5 : représente l’évaluation du pouvoir déméthylant global des molécules AIM2 et AIM3 selon l’invention sur les cellules MDA-MB231 : une quantification par densitométrie a permis d’obtenir une valeur quantitative de l’intensité des bandes présentent dans la partie encadrée du gel (le calcul du pourcentage de déméthylation a été calculé à l’aide de la formule indiquée) ; - Figure 5: shows the evaluation of the overall demethylating power of the molecules AIM2 and AIM3 according to the invention on MDA-MB231 cells: a quantification by densitometry made it possible to obtain a quantitative value of the intensity of the bands present in the framed part of the gel (the calculation of the percentage of demethylation was calculated using the formula indicated);
- la Figure 6 : représente l’influence de la molécule AIM2 selon l’invention sur la prolifération des cellules épithéliales mammaires MCF-10A et tumorales mammaires MDA-MB231 et Hs578T : les cellules ont été ensemencées, après 24h de culture les cellules ont été traitées pendant 48h avec des concentrations variables de la molécule AIIM2 ; la détermination du nombre de cellules adhérentes a été réalisée par une coloration au cristal violet et quantifiée par une mesure de l’absorbance à 595 nm ; les résultats correspondent à la moyenne de 4 expériences indépendantes, les erreurs standard à la moyenne (SEM) sont indiquées et la significativité des données a été calculée en comparant les cellules traitées vs non traitées (test de Student) ; - Figure 6: shows the influence of the AIM2 molecule according to the invention on the proliferation of MCF-10A breast epithelial cells and MDA-MB231 and Hs578T mammary tumor cells: the cells were seeded, after 24 hours of culture the cells were treated for 48 hours with varying concentrations of the AIIM2 molecule; the determination of the number of adherent cells was carried out by staining with violet crystal and quantified by a measurement of the absorbance at 595 nm; the results correspond to the average of 4 independent experiments, the standard errors to the average (SEM) are indicated and the significance of the data was calculated by comparing the treated vs untreated cells (Student test);
- la Figure 7 : représente l’influence de la molécule AIM3 selon l’invention sur la prolifération des cellules épithéliales mammaires MCF-10A et tumorales mammaires - Figure 7: shows the influence of the AIM3 molecule according to the invention on the proliferation of breast epithelial cells MCF-10A and mammary tumors
MDA-MB231 et Hs578T : les cellules ont été ensemencées, après 24h de culture les cellules ont été traitées pendant 48h avec des concentrations variables de la molécule AIIM3 ; la détermination du nombre de cellules adhérentes a été réalisée par une coloration au cristal violet et quantifiée par une mesure de l’absorbance à 595 nm ; les résultats correspondent à la moyenne de 4 expériences indépendantes, les erreurs standard à la moyenne (SEM) sont indiquées- la significacité des données a été calculée en comparant les cellules traitées vs non traitées (test de Student) ; MDA-MB231 and Hs578T: the cells were seeded, after 24 h of culture the cells were treated for 48 h with variable concentrations of the molecule AIIM3; the determination of the number of adherent cells was carried out by staining with violet crystal and quantified by a measurement of the absorbance at 595 nm; the results correspond to the average of 4 independent experiments, the standard errors to the average (SEM) are indicated - the significance of the data was calculated by comparing the treated vs untreated cells (Student test);
- la Figure 8 : est une analyse du cycle cellulaire des cellules MCF-10A traitées ou non avec 0,5mM de AIM2 ou AIM3 ; les cellules ont été ensemencées et traitées avec 0,5mM d’AIM2 ou de AIM3 pendant 0, 16, 24, 48 et 72h ; après détachement les cellules sont fixées et perméabilisées dans une solution d’éthanol froid à 70% ; un marquage à l’iodure de propidium est ensuite réalisé afin de marquer l’ADN et la fluorescence est quantifiée par cytométrie en flux ; - Figure 8: is an analysis of the cell cycle of MCF-10A cells treated or not with 0.5 mM AIM2 or AIM3; the cells were seeded and treated with 0.5 mM AIM2 or AIM3 for 0, 16, 24, 48 and 72 h; after detachment the cells are fixed and permeabilized in a 70% cold ethanol solution; labeling with propidium iodide is then carried out in order to label the DNA and the fluorescence is quantified by flow cytometry;
- la Figure 9 : représente une analyse du nombre de cellules traitées ou non avec 2mM de AIM2 ou AIM3. Les cellules ont été ensemencées et traitées avec 2mM d’AIM2 ou de AIM3 pendant 0, 24, 48, 72, 96, 120, 144, 168 et 192h. Après détachement les cellules sont dénombrées à l’aide d’une cellule de comptage de type Malassez. Le milieu des cellules NT ou AIM2 ou AIM3 est renouvelé toutes les 72h. Pour les cellules
AIM2(72)+NT ou AIM3(72)+NT le milieu de culture contient la molécule indiquée uniquement pendant 72h et après cela il est remplacé par un milieu sans molécule afin de tester la réversibilité de l’effet ; - Figure 9: shows an analysis of the number of cells treated or not with 2mM AIM2 or AIM3. The cells were seeded and treated with 2mM AIM2 or AIM3 for 0, 24, 48, 72, 96, 120, 144, 168 and 192h. After detachment, the cells are counted using a Malassez type counting cell. The medium of the NT or AIM2 or AIM3 cells is renewed every 72 hours. For cells AIM2 (72) + NT or AIM3 (72) + NT the culture medium contains the indicated molecule only for 72 hours and after that it is replaced by a medium without molecules in order to test the reversibility of the effect;
- la Figure 10 : correspond au plan expérimental de plaque de l’exemple 11 ; - la Figure 11 : est une représentation graphique de la viabilité cellulaire des - Figure 10: corresponds to the experimental plate design of Example 11; - Figure 11: is a graphic representation of the cell viability of
MDA-MB 231 traitées par différentes concentrations du composé AIM2 selon l’invention et/ou de tamoxifène ; MDA-MB 231 treated with different concentrations of the AIM2 compound according to the invention and / or tamoxifen;
- la Figure 12 : représente un ensemble de graphique montrant la sensibilité de différentes lignées de tumeurs mammaires face aux composés AIM2, AIM3, des agents de chimiothérapies classiques et leurs combinaisons ; - Figure 12: shows a set of graphs showing the sensitivity of different breast tumor lines to AIM2, AIM3 compounds, conventional chemotherapy agents and their combinations;
- la Figure 13 : représente le plan d’expérience de l’exemple 13 ; - Figure 13: shows the experiment plan of Example 13;
- la Figure 14 : représente l’inhibition de la prolifération par les molécules AIM2 et AIM3 qui est réversible dans certaines cellules ; de gauche à droite sont présentés les résultats concernant les cellules MDA-MB-231 (cellules cancéreuses mammaires triples négatives), MCF10A (cellules épithéliales mammaires saines) et T47R+Doxo (cellules cancéreuses mammaires résistantes à la doxorubicine) traitées avec AIM2 (panel du haut) ou AIM3 (panel du bas) pendant 72h de prétraitement puis réensemencées pour 72h supplémentaires ; les différentes conditions correspondent à : T= sans traitement préalable ni durant ces 72h ; AIM2/3+NT cellules prétraitées avec AIM2 ou AIM3 et ensuite sans traitement ; AIM2/3+AIM2/3 cellules prétraitées avec AIM2 ou AIM3 et ensuite remises en présence de AIM2 ou AIM3 pour 72h ; - Figure 14: shows the inhibition of proliferation by the molecules AIM2 and AIM3 which is reversible in certain cells; from left to right are presented the results for MDA-MB-231 (triple negative breast cancer cells), MCF10A (healthy breast epithelial cells) and T47R + Doxo (doxorubicin resistant breast cancer cells) treated with AIM2 (panel of top) or AIM3 (bottom panel) for 72 hours of pre-treatment then reseeded for an additional 72 hours; the different conditions correspond to: T = without prior treatment or during these 72 hours; AIM2 / 3 + NT cells pretreated with AIM2 or AIM3 and then without treatment; AIM2 / 3 + AIM2 / 3 cells pretreated with AIM2 or AIM3 and then returned in the presence of AIM2 or AIM3 for 72 hours;
- la Figure 15 : représente les conditions d’expérience de l’Exemple 14 ; - Figure 15: represents the experience conditions of Example 14;
- la Figure 16 : représente les molécules testées de l’Exemple 14 ; - Figure 16: represents the tested molecules of Example 14;
- la Figure 17 : représente l’inhibition de la prolifération des cellules T47D R+ doxo par les différentes molécules AIM1 , AIM2, AIM3 et Ru après 48 et 72h de traitement ; - Figure 17: shows the inhibition of the proliferation of T47D R + doxo cells by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 48 and 72 hours of treatment;
- la Figure 18 : représente l’inhibition de la prolifération des cellules de glioblastomes U251 et U87 par les différentes molécules AIM1 , AIM2, AIM3 et Ru après 72h de traitement ; - Figure 18: shows the inhibition of the proliferation of glioblastoma cells U251 and U87 by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 72 hours of treatment;
- la Figure 19 : représente l’inhibition de la prolifération des cellules T47D par les différentes molécules AIM1 , AIM2, AIM3 et Ru après 48h de traitement ; et - Figure 19: shows the inhibition of the proliferation of T47D cells by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 48 hours of treatment; and
- la Figure 20 : représente l’inhibition de la prolifération des cellules MDA- MB-231 par les différentes molécules AIM1 , AIM2, AIM3 et Ru après 48h de traitement.
III. EXEMPLES - Figure 20: shows the inhibition of proliferation of MDA-MB-231 cells by the different molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru after 48 hours of treatment. III. EXAMPLES
Afin de confirmer biologiquement ces données, une étude de l’influence des molécules AIM3 et AIM2 sur la méthylation de l’ADN a été réalisée dans des systèmes acellulaires et cellulaires. In order to biologically confirm these data, a study of the influence of the molecules AIM3 and AIM2 on DNA methylation was carried out in acellular and cellular systems.
EXEMPLE 1 : Solubilisation des composés AIM2 et AIM3 selon l’invention pour leur utilisation sur cellules EXAMPLE 1 Solubilization of the AIM2 and AIM3 compounds according to the invention for their use on cells
Pour les différents essais décrits ci-dessous, les composés AIM2 et AIM3 selon l’invention ont été préalablement solubilisés de la manière suivante (Tableau 1 ): For the various tests described below, the compounds AIM2 and AIM3 according to the invention were previously dissolved in the following manner (Table 1):
Tableau 1 Table 1
Pour le composé AIM2, les solutions filles peuvent précipiter à 4°C. Il est ainsi nécessaire de les incuber à 37°C pendant 10 min avant leur utilisation. For the AIM2 compound, daughter solutions can precipitate at 4 ° C. It is thus necessary to incubate them at 37 ° C for 10 min before their use.
EXEMPLE 2 : Modélisation moléculaire de la capacité déméthylante du composé AIM3 selon l’invention EXAMPLE 2 Molecular modeling of the demethylating capacity of the compound AIM3 according to the invention
Afin de démontrer l’action déméthylante des composés organométalliques selon l’invention, la Demanderesse a réalisé une modélisation moléculaire de la capacité déméthylante du composé AIM3 selon l’invention. In order to demonstrate the demethylating action of the organometallic compounds according to the invention, the Applicant has carried out a molecular modeling of the demethylating capacity of the AIM3 compound according to the invention.
A cet effet, le profil d’énergie lié à la réaction de déméthylation a été réalisé à l’aide des calculs de chimie quantique. Notamment un système modèle comprenant une cytosine méthylée et AIM3 a été utilisé. Les géométries des réactifs et des produits ont été optimisées à l’aide de la théorie de la fonctionnelle de la densité « DFT » en utilisant wB97XD comme fonctionnelle d’échange-corrélation et LANL2DZ comme base d’orbitales. For this purpose, the energy profile linked to the demethylation reaction was carried out using quantum chemistry calculations. In particular, a model system comprising a methylated cytosine and AIM3 was used. The geometries of the reagents and products have been optimized using the density functional theory "DFT" using wB97XD as the exchange-correlation functional and LANL2DZ as the orbital base.
Par la suite l’état de transition, c’est à dire la conformation d’énergie maximale, a été aussi optimisé ce qui a permis d’estimer la barrière énergétique qui doit être surmonté pour pouvoir compléter la réaction dans ce cas de déméthylation. Le profil énergétique de la réaction dans l’espace reliant les réactifs et les produits via l’état de transition a aussi été estimé en analysant la variation d’énergie selon une coordonnée de réaction, c’est à dire la distance entre le méthyl et l’azote périphérique de AIM3. Les effets du solvant, l’eau, ont été pris en compte à l’aide d’un modèle du continuum polarisable « PCM ».
Tous les calculs de modélisation moléculaire ont été réalisés via le logiciel Gaussian 09 version D01 et grâce aux techniques standards de modélisation moléculaire notamment détaillées dans des nombreux ouvrages comme par exemple « Chris J. Cramer Essential of Computational Chemistry Wiley eds ». De plus l’homme de métier pourra se référer au manuel de Gaussian 09 pour une illustration détaillée des techniques d’optimisation de géométrie qui ont été utilisées. Subsequently, the transition state, that is to say the maximum energy conformation, was also optimized, which made it possible to estimate the energy barrier which must be overcome in order to be able to complete the reaction in this case of demethylation. The energy profile of the reaction in space connecting the reactants and the products via the transition state was also estimated by analyzing the energy variation according to a reaction coordinate, i.e. the distance between methyl and the peripheral nitrogen of AIM3. The effects of the solvent, water, were taken into account using a model of the polarizable continuum "PCM". All molecular modeling calculations were carried out using Gaussian 09 software version D01 and using standard molecular modeling techniques, in particular detailed in numerous works such as “Chris J. Cramer Essential of Computational Chemistry Wiley eds”. In addition, those skilled in the art can refer to the Gaussian 09 manual for a detailed illustration of the geometry optimization techniques that have been used.
Comme le montre la FIG.1 , les résultats obtenus ont révélé que le composé AIM3 et les autres composés organométalliques de formule (I) pourraient entraîner une déméthylation directe de l’ADN via des réactions thermodynamiques favorables. As shown in FIG.1, the results obtained revealed that the compound AIM3 and the other organometallic compounds of formula (I) could cause direct demethylation of DNA via favorable thermodynamic reactions.
EXEMPLE 3 : Mesure du taux de 5-méthylacytosine (5mC) par ELISA (Fiq.2 (a)) EXAMPLE 3 Measurement of the level of 5-methylacytosine (5 mC) by ELISA (Fiq. 2 (a))
Test acellulaire : Acellular test:
Les expériences acellulaires consistent à incuber de l’ADN méthylé (Qiagen, France) à 37°C pendant 1 h avec soit 2mM de molécules AIM2 et AIM3, soit avec la protéine TET2 recombinante qui est une protéine connue pour son rôle déméthylant et servant de contrôle positif ou soit avec de l’eau (Ctrl). The cell-free experiments consist in incubating methylated DNA (Qiagen, France) at 37 ° C. for 1 h with either 2 mM of molecules AIM2 and AIM3, or with the recombinant TET2 protein which is a protein known for its demethylating role and serving as positive control or either with water (Ctrl).
En particulier, l’ADN méthylé (500ng, ref#N4007 NEB, ADN génomique de cellule HeLa hyperméthylée in vitro par l’enzyme M.Sssi) est incubé pendant 1 h at 37°C soit en présence d’eau (Ctrl), soit en présence de AIM2 (2 mM) ou AIM3 (2 mM), soit en présence de 10 pg de protéine his-tagged-TET2. In particular, methylated DNA (500ng, ref # N4007 NEB, genomic DNA of HeLa cell hypermethylated in vitro by the enzyme M.Sssi) is incubated for 1 h at 37 ° C either in the presence of water (Ctrl), either in the presence of AIM2 (2 mM) or AIM3 (2 mM), or in the presence of 10 μg of his-tagged-TET2 protein.
L’ADN est ensuite utilisé pour réaliser un test 5mC-ELISA (Zymo Research) i.e. permettant de mesurer le niveau de 5-méthylcytosines (voir ci-dessous). The DNA is then used to carry out a 5mC-ELISA test (Zymo Research) i.e. making it possible to measure the level of 5-methylcytosines (see below).
Test cellulaire : Cell test:
Les cellules de gliomes U251 ou de glioblastomes T98G ont été ensemencées à 2.106 respectivement. 24 h après l’ensemencement, les cellules ont été traitées pendant 1 ou 4h avec les molécules AIM2 ou AIM3 à raison de 0, 2, 5, 10 mM. Après le traitement le milieu de culture est remplacé par un milieu sans molécule et les cellules sont maintenues 48h en culture. Les cellules sont ensuite détachées mécaniquement avec un grattoir afin de réaliser une extraction d’ADN total via l'utilisation de l’automate QiaCube (Qiagen) et du kit QIAamp DNA Mini QIAcube Kit (Qiagen), sans modification avec les instructions fournies par Qiagen. The cells of U251 gliomas or T98G glioblastomas were seeded at 2.10 6 respectively. 24 h after seeding, the cells were treated for 1 or 4 h with the molecules AIM2 or AIM3 at a rate of 0, 2, 5, 10 mM. After the treatment, the culture medium is replaced by a medium without molecules and the cells are kept in culture for 48 hours. The cells are then mechanically detached with a scraper in order to carry out a total DNA extraction via the use of the QiaCube automaton (Qiagen) and the QIAamp DNA Mini QIAcube Kit (Qiagen), without modification with the instructions provided by Qiagen .
5mC-ELISA (Zymo Research) 5mC-ELISA (Zymo Research)
L’ADN (100ng) collecté comme indiqué ci-dessus est tout d’abord dénaturé à 98°C pendant 5min (utilisation du thermocycler MyCycler BioRad), avant d’être déposé dans les puits de la plaque : 96 puits prévus à cet effet (Kit 5mC-ELISA, Zymo) pour 1 h d’incubation à 37°C. Le surnageant est ensuite retiré et les puits sont lavés 3 fois avec 200 pL de tampon de lavage (fourni par le kit). Puis, 200 pL de tampon de lavage sont incubés dans chaque puits pour 30min à 37°C. L’étape de révélation/quantification des 5-
méthylcytosines est réalisée avec l’incubation (1 h, 37°C) de l’anticorps anti-5mC fourni par le kit (ref/A3001-30), dilué au 1/2000. Après 3 lavages (200 mI_ de tampon de lavage fourni par le kit), l’anticorps primaire est révélé suite à l’incubation (1 h, 37°C) de l’anticorps secondaire couplé HRP (D5325-3-30). Enfin, après 3 lavages (200 mI_ de tampon de lavage fourni par le kit), la révélation de l’ELISA est réalisée par ajout de 100 mI_ de « HRP developer » (fourni par le kit). La lecture de la plaque ELISA est réalisée à 405-450 nm (Victor plate reader, Perkin Elmer). En parallèle, une gamme étalon est réalisée avec de l’ADN méthylé dont le pourcentage de 5mC est connu (gamme : 0, 5, 10, 25, 50, 75, 100%). The DNA (100 ng) collected as indicated above is first denatured at 98 ° C for 5 min (use of the MyCycler BioRad thermocycler), before being deposited in the wells of the plate: 96 wells provided for this purpose (Kit 5mC-ELISA, Zymo) for 1 h of incubation at 37 ° C. The supernatant is then removed and the wells are washed 3 times with 200 μL of washing buffer (supplied by the kit). Then, 200 μL of washing buffer are incubated in each well for 30 min at 37 ° C. The revelation / quantification step of 5- methylcytosines is carried out with the incubation (1 h, 37 ° C) of the anti-5mC antibody provided by the kit (ref / A3001-30), diluted to 1/2000. After 3 washes (200 ml of washing buffer provided by the kit), the primary antibody is revealed following the incubation (1 h, 37 ° C) of the coupled secondary antibody HRP (D5325-3-30). Finally, after 3 washes (200 ml of washing buffer supplied by the kit), the ELISA is revealed by adding 100 ml of "HRP developer" (supplied by the kit). The ELISA plate is read at 405-450 nm (Victor plate reader, Perkin Elmer). In parallel, a standard range is carried out with methylated DNA whose percentage of 5 mC is known (range: 0, 5, 10, 25, 50, 75, 100%).
Comme le montre la Fig.2(a), la mesure du taux de méthylcytosines (test As shown in Fig. 2 (a), the measurement of the methylcytosine level (test
ELISA) présentes au niveau de la sonde d’ADN a permis de révéler une baisse significative des méthylcytosines après un traitement avec les molécules AIM3 et AIM2. ELISA) present at the DNA probe revealed a significant drop in methylcytosines after treatment with the molecules AIM3 and AIM2.
EXEMPLE 4 : Dosage des groupements méthyl radiomarqués (Fig. 2(b)) EXAMPLE 4 Determination of the radiolabelled methyl groups (Fig. 2 (b))
De plus, l’activité déméthylante de AIM2 (2mM) et de la protéine his-tagged- In addition, the demethylating activity of AIM2 (2mM) and the his-tagged protein-
TET2 (10pg) (témoin positif) a été mesurée par un dosage de l’incorporation de groupements méthyle radiomarqués au niveau d’un ADN double brin biotynilé et préalablement méthylé par l’enzyme M.SSsl. TET2 (10pg) (positive control) was measured by an assay for the incorporation of methyl groups radiolabelled in a double-stranded DNA biotynilized and previously methylated by the enzyme M.SSsl.
Protocole Protocol
Cette expérience DMB est réalisée comme décrit par Yokochi and Robertson This DMB experiment is carried out as described by Yokochi and Robertson
(2004). (2004).
Une plaque de 96 puits est préalablement pré-traitée avec 10 mg/ml de BSA (bovine sérum albumin) pendant 30 min. A 96-well plate is pretreated beforehand with 10 mg / ml of BSA (bovine serum albumin) for 30 min.
Les billes magnétiques (10 mg/ml, Dynal) sont lavées trois fois avec le tampon TENT2M (20 mM Tris, pH 8.0, 2 mM EDTA, 0.01 % Triton X-100, 2 M NaCI). La concentration de ces billes est ajustée à 2,5 mg/ml avec le tampon TENT2M et 1/10 du volume avec la forme non radioactive de AdoMet (100 mg/ml ; Sigma). The magnetic beads (10 mg / ml, Dynal) are washed three times with the TENT2M buffer (20 mM Tris, pH 8.0, 2 mM EDTA, 0.01% Triton X-100, 2 M NaCl). The concentration of these beads is adjusted to 2.5 mg / ml with the TENT2M buffer and 1/10 of the volume with the non-radioactive form of AdoMet (100 mg / ml; Sigma).
La réaction de méthylation (40 mI) contient 200 U de l’enzyme M.Sssi (NEB#M0226) 125 nM d’oligonucléotides d’ADN, 200ng d’ADN, and 900 nM tritium- labeled AdoMet (Amersham Bioscience, 1 mCi/ml) dans le milieu réactionnel (50 mM Tris, pH 8.0, 5 mM EDTA, 10% glycérol, 10 mM 2-mercaptoéthanol, 0,5 mM de fluorure de phénylméthylsulfonyle). The methylation reaction (40 mI) contains 200 U of the enzyme M.Sssi (NEB # M0226) 125 nM DNA oligonucleotides, 200ng DNA, and 900 nM tritium- labeled AdoMet (Amersham Bioscience, 1 mCi / ml) in the reaction medium (50 mM Tris, pH 8.0, 5 mM EDTA, 10% glycerol, 10 mM 2-mercaptoethanol, 0.5 mM phenylmethylsulfonyl fluoride).
Après une incubation de 30 min à 37 °C, les réactions sont stoppées par l’ajout d’un volume équivalent de billes magnétiques en suspension et une agitation douce pendant 15 min à température ambiante. Les billes magnétiques sont séparées à l’aide d’un aimant et lavées successivement avec 300, 200, 150, and 100 mI TENT1 M (10 mM Tris, pH 8.0, 1 mM EDTA, 0.005% Triton X-100, 1 M NaCI). Les billes magnétiques sont resuspendues dans 25 mI de TENT1 M en présence des“agents déméthylant putatifs” ou
avec 100 pg d’extrait nucléaire isolé à l’aide du kit, nuclear extract kit (Active Motif, # 40410). Après les incubations, les billes magnétiques sont séparées à l’aide d’un aimant et lavées successivement avec 300, 200, 150, and 100 mI de TENT1 M (10 mM Tris, pH 8.0, 1 mM EDTA, 0.005% Triton X-100, 1 M NaCI). Ensuite le taux de tritium incorporé est mesuré dans un compteur à scintillation. After an incubation of 30 min at 37 ° C, the reactions are stopped by adding an equivalent volume of magnetic beads in suspension and gentle shaking for 15 min at room temperature. The magnetic beads are separated using a magnet and washed successively with 300, 200, 150, and 100 mI TENT1 M (10 mM Tris, pH 8.0, 1 mM EDTA, 0.005% Triton X-100, 1 M NaCI ). The magnetic beads are resuspended in 25 mI of TENT1 M in the presence of “putative demethylating agents” or with 100 μg of nuclear extract isolated using the kit, nuclear extract kit (Active Motif, # 40410). After the incubations, the magnetic beads are separated using a magnet and washed successively with 300, 200, 150, and 100 mI of TENT1 M (10 mM Tris, pH 8.0, 1 mM EDTA, 0.005% Triton X- 100, 1 M NaCl). Then the level of incorporated tritium is measured in a scintillation counter.
Résultats (Fig.2(b)) Results (Fig. 2 (b))
Comme le montre la Fig.2(b), le composé AIM2 présente une action déméthylante de l’ADN. As shown in Fig. 2 (b), the compound AIM2 exhibits a demethylating action of DNA.
EXEMPLE 5 : Expérience sur des cellules du glioblastome U251 (Fiq.3) EXAMPLE 5 Experiment on U251 Glioblastoma Cells (Fiq.3)
Parallèlement, dans le but de vérifier le pouvoir déméthylant de ces molécules organométalliques selon l’invention, des expériences sur des cellules de glioblastome U251 ont été réalisées. In parallel, in order to verify the demethylating power of these organometallic molecules according to the invention, experiments on U251 glioblastoma cells were carried out.
Protocole Protocol
L’expérience réalisée sur les cellules U251 a consisté à traiter ces dernières pendant 1 ou 4h avec 2mM d’AIM2, AIM3 ou de 5aza-2-déoxycytidine qui est un agent déméthylant connu et couramment utilisé. The experiment carried out on U251 cells consisted in treating the latter for 1 or 4 hours with 2mM of AIM2, AIM3 or 5aza-2-deoxycytidine which is a known and commonly used demethylating agent.
A la suite des traitements, l’ADN a été extrait et soumis à un test ELISA afin de déterminer le taux de cytosines méthylées (protocole, voir EXEMPLE 3). Following the treatments, the DNA was extracted and subjected to an ELISA test in order to determine the level of methylated cytosines (protocol, see EXAMPLE 3).
Résultats : Results:
Comme indiqué sur la Figure 3, les molécules AIM2 et AIM3 présentent un pouvoir déméthylant après 1 h et 4h d’incubation nettement supérieur à celui de la 5aza-2- déoxycytidine qui est l’agent déméthylant connu et couramment utilisé, mais qui nécessite une incorporation au sein de l’ADN. As indicated in FIG. 3, the molecules AIM2 and AIM3 exhibit demethylating power after 1 h and 4 h of incubation clearly greater than that of 5aza-2-deoxycytidine which is the known and commonly used demethylating agent, but which requires a incorporation into DNA.
EXEMPLE 6 : Expérience sur une autre ligne cellulaire de glioblastome T98G (Fiq.4) EXAMPLE 6 Experiment on another cell line of glioblastoma T98G (Fiq.4)
Par ailleurs, l’action déméthylante de AIM3 a également été observée sur une autre lignée cellulaire de glioblastome, appelée T98G (Figure 4). Furthermore, the demethylating action of AIM3 has also been observed on another glioblastoma cell line, called T98G (Figure 4).
Protocole Protocol
L’expérience réalisée sur les cellules T98G a consisté à traiter ces dernières pendant 1 h avec différentes concentrations du composé AIM3 selon l’invention, à savoir 0 ; 2 ; 5 et 10 mM. The experiment carried out on T98G cells consisted in treating the latter for 1 h with different concentrations of the compound AIM3 according to the invention, namely 0; 2; 5 and 10 mM.
A la suite des traitements, l’ADN a été extrait et soumis à un test ELISA afin de déterminer le taux de cytosines méthylées (protocole, voir EXEMPLE 3). Following the treatments, the DNA was extracted and subjected to an ELISA test in order to determine the level of methylated cytosines (protocol, see EXAMPLE 3).
Résultats : Results:
Comme indiqué sur la Figure 4, dans ces cellules le pouvoir déméthylant de la molécule AIM3 est visible après 1 h de traitement à une concentration de 2mM. Néanmoins, une augmentation de la concentration de cette molécule (de l’ordre de 5 à
10 mM) n’augmente pas son pouvoir déméthylant. En effet, une dose de 2mM de AIM3 présente un effet déméthylant qui est similaire à celui d’une dose de 10 mM de AIM3. As indicated in FIG. 4, in these cells the demethylating power of the AIM3 molecule is visible after 1 h of treatment at a concentration of 2 mM. However, an increase in the concentration of this molecule (of the order of 5 to 10 mM) does not increase its demethylating power. Indeed, a 2mM dose of AIM3 has a demethylating effect which is similar to that of a 10 mM dose of AIM3.
EXEMPLE 7 : Expérience sur les cellules MDA-MB231 (Fiq.5) EXAMPLE 7 Experiment on MDA-MB231 cells (Fiq.5)
Une expérience de digestion enzymatique a également été réalisée afin de déterminer le pourcentage de déméthylation global induit par les molécules AIM2 et AIM3 selon l’invention. An enzymatic digestion experiment was also carried out in order to determine the percentage of overall demethylation induced by the molecules AIM2 and AIM3 according to the invention.
Protocole Protocol
1. Culture cellulaire 1. Cell culture
1.1. Conditions de culture et traitements 1.1. Culture conditions and treatments
Les cellules de la lignée cancéreuse mammaire MDA-MB 231 sont cultivées en milieu RPMI 1640 (Gibco) contenant 2mM de L-Glutamine (Sigma), 0,1 mg/mL de gentamicine (Sigma) et 10% de sérum de veau foetal (Sigma) décomplémenté 30 minutes à 56°C. Elles sont incubées à 37°C et à 5% de CO2. The cells of the breast cancer line MDA-MB 231 are cultured in RPMI 1640 medium (Gibco) containing 2 mM L-Glutamine (Sigma), 0.1 mg / ml of gentamicin (Sigma) and 10% of fetal calf serum ( Sigma) decomplemented 30 minutes at 56 ° C. They are incubated at 37 ° C and 5% CO2.
L’ensemencement s’effectue en boîtes de Pétri 6cm (4mL milieu/boîte) selon les conditions suivantes (tableau 2) : The seeding is carried out in 6 cm Petri dishes (4 ml medium / dish) according to the following conditions (Table 2):
Tableau 2 Table 2
1.2. Conditions de reprise des molécules 1.2. Conditions for taking up molecules
5aza2déoxycytidine (Sigma A3656) 5aza2deoxycytidine (Sigma A3656)
La poudre est reprise à 100 mM dans du DMSO (Sigma). Cette solution stock est aliquotée (2pL) et stockée à -80°C. The powder is taken up at 100 mM in DMSO (Sigma). This stock solution is aliquoted (2 mL) and stored at -80 ° C.
Les dilutions intermédiaires s’effectuent dans le milieu de culture. Intermediate dilutions are made in the culture medium.
AIM 2 AIM 2
La poudre (717,07 g/mol) est reprise à 1 mM dans du PBS (Fisher) contenant The powder (717.07 g / mol) is taken up at 1 mM in PBS (Fisher) containing
20% d’éthanol. Cette solution mère est stockée à 4°C. 20% ethanol. This stock solution is stored at 4 ° C.
Les dilutions intermédiaires s’effectuent dans du PBS.
AIM 3 Intermediate dilutions are made in PBS. AIM 3
La poudre (719,06 g/mol) est reprise à 5mM dans du PBS contenant 20% d’éthanol. Cette solution mère est stockée à 4°C. The powder (719.06 g / mol) is taken up at 5 mM in PBS containing 20% ethanol. This stock solution is stored at 4 ° C.
Les dilutions intermédiaires s’effectuent dans du PBS Intermediate dilutions are made in PBS
NB : Les solutions mères de AIM 2 et AIM3 précipitent à 4°C. Il suffit de les incuber 5 minutes à 37°C afin de les re-solubiliser. NB: Stock solutions of AIM 2 and AIM3 precipitate at 4 ° C. It is enough to incubate them for 5 minutes at 37 ° C. in order to re-solubilize them.
1.3. Procédure de récolte des cellules 1.3. Cell harvesting procedure
Le tapis cellulaire est lavé avec 2mL de PBS, puis trypsiné avec 0,5mL de trypsine EDTA 1X (Sigma) pendant 5 minutes à 37°C. L’action de la trypsine est ensuite inhibée par l’ajout de 4 mL de milieu de culture. The cell layer is washed with 2mL of PBS, then trypsinized with 0.5mL of EDX 1X trypsin (Sigma) for 5 minutes at 37 ° C. The action of trypsin is then inhibited by the addition of 4 mL of culture medium.
La suspension cellulaire est enfin centrifugée à 200 G pendant 5 minutes et le culot conservé à -20°C. The cell suspension is finally centrifuged at 200 G for 5 minutes and the pellet stored at -20 ° C.
1.4. Planning 1.4. Planning
Tableau 3 Table 3
2. Lyse et extraction de l’ADN 2. Lysis and extraction of DNA
2.1. Lyse cellulaire 2.1. Cell lysis
Chaque culot est repris dans 100pL de PBS, auxquels sont ajoutés dans l’ordre : Each pellet is taken up in 100 μl of PBS, to which are added in order:
100 pL eau 100 pL water
- 150 pL SDS 0,1 % - 150 pL SDS 0.1%
50 pL Protéinase K à 10mg/mL (Sigma) 50 pL Proteinase K 10mg / mL (Sigma)
La lyse s’effectue à 37°C toute la nuit.
2.2. Extraction de l’ADN Lysis takes place at 37 ° C overnight. 2.2. DNA extraction
Ajouter au lysat 2 volumes de phénol/chloroforme 5 : 1 Add 2 volumes of phenol / chloroform 5: 1 to the lysate
Vortexer 30 secondes Vortex 30 seconds
Centrifuger à 16 000 G pendant 5 minutes à température ambiante Centrifuge at 16,000 G for 5 minutes at room temperature
Récupérer la phase aqueuse (surnageant) Recover the aqueous phase (supernatant)
Ajouter 1 volume de chloroforme/isoamylalcool 23 : 1 Add 1 volume of 23: 1 chloroform / isoamylalcohol
Centrifuger à 16 000 G pendant 5 minutes à température ambiante Centrifuge at 16,000 G for 5 minutes at room temperature
Récupérer la phase aqueuse (surnageant) Recover the aqueous phase (supernatant)
Ajouter 1/10 du volume d’acétate de sodium 3M Add 1/10 of the volume of 3M sodium acetate
Puis 1 volume d’éthanol absolu froid Then 1 volume of cold absolute ethanol
Vortexer 10 secondes Vortex 10 seconds
Laisser précipiter une nuit à -20°C Leave to precipitate overnight at -20 ° C
Centrifuger à 12 000 G pendant 15 minutes à 4°C Centrifuge at 12,000 G for 15 minutes at 4 ° C
Laver le culot avec 500 pL d’éthanol 70% Wash the pellet with 500 μL of 70% ethanol
Centrifuger à 12 000 G pendant 5 minutes à 4°C Centrifuge at 12,000 G for 5 minutes at 4 ° C
Laisser sécher le culot (couvercle du tube ouvert) jusqu’à ce qu’il devienne translucide Let the base dry (open tube cover) until it becomes translucent
Dissoudre le culot dans de l’eau stérile (100 pL environ, volume à ajuster en fonction de la taille du culot obtenu) Dissolve the pellet in sterile water (approximately 100 pL, volume to be adjusted according to the size of the pellet obtained)
Doser l’ADN à 260 nm Dosing the DNA at 260 nm
Conserver l’ADN à -20°C Store DNA at -20 ° C
3. Digestions enzymatiques avec MSPI et Hpall (Fisher, ER0541 et ER051 1 ) 3. Enzymatic digestion with MSPI and Hpall (Fisher, ER0541 and ER051 1)
1 pg d’ADN de chaque condition est digéré avec MSPI et Hpall selon le protocole suivant : 1 pg of DNA from each condition is digested with MSPI and Hpall according to the following protocol:
2 pL Buffer TANGO 10X 2 pL Buffer TANGO 10X
1 pg ADN 1 pg DNA
Eau qsp 16 pL Water qs 16 pL
2 pL Hpall ou Mspl (=20 U) 2 pL Hpall or Mspl (= 20 U)
Incuber à 37°C toute la nuit, puis 20 minutes à 80 °C (inactivation enzymes) Incubate at 37 ° C overnight, then 20 minutes at 80 ° C (enzyme inactivation)
4. Migration de l’ADN digéré sur gel d’agarose 4. Migration of digested DNA on agarose gel
Ajouter 4pL de bleu de dépôt 6X à chaque volume de digestion (20pL) Add 4pL of 6X deposition blue to each digestion volume (20pL)
(Bleu dépôt 6X : 10mM TrisHCI pH 7,6, 60mM EDTA, 60% glycérol, 0,03% bromophénol bleu, 0,03% xylène cyanol FF) (6X blue deposit: 10mM TrisHCI pH 7.6, 60mM EDTA, 60% glycerol, 0.03% blue bromophenol, 0.03% xylene cyanol FF)
Faire migrer la totalité de chaque digestion sur un gel d’agarose 1 % + 2pL BET 10mg/mL à 90V pendant 40 minutes. Migrate all of each digestion on a 1% agarose gel + 2pL BET 10mg / mL at 90V for 40 minutes.
L’intensité de chaque bande est mesurée à l’aide du logiciel Quantity One. The intensity of each strip is measured using the Quantity One software.
Calcul % de déméthylation de l’ADN : (Hpall - Mspl)Traité x 100 / (Hpall - Mspl )NOP Traité
Résultats : Calculation% of DNA demethylation: (Hpall - Mspl) Treated x 100 / (Hpall - Mspl) N OP Treated Results:
Les données présentées figure 5 confirment que, comme la 5-azacytidine, le traitement de cellules MDA-MB231 avec les molécules AIM2 et AIM3 permet de réduire le pourcentage globale de méthylation du génome. The data presented in FIG. 5 confirm that, like 5-azacytidine, the treatment of MDA-MB231 cells with the molecules AIM2 and AIM3 makes it possible to reduce the overall percentage of methylation of the genome.
EXEMPLE 8 : Influence des composés AIM2 et AIM3 selon l’invention sur la prolifération des cellules épithéliales mammaires MCF-10A et tumorales mammaires MDA-MB231 et Hs578T (Fig.6 et Fig.71 EXAMPLE 8 Influence of the compounds AIM2 and AIM3 according to the invention on the proliferation of breast epithelial cells MCF-10A and mammary tumor MDA-MB231 and Hs578T (Fig. 6 and Fig. 71
Protocole cristal violet
Crystal violet protocol
Tableau 4 Table 4
Les cellules sont ensemencées selon les densités indiquées ci-dessus (Tableau 4). Après 24h de culture, le milieu de culture est remplacé par du milieu contenant ou non les molécules AIM2 ou AIM3 aux concentrations de 0,5 ; 1 ; 1 ,5 ; 2 et 2,5 mM en quatre exemplaires pendant 48h. Après ces 48h de traitement le milieu de culture est enlevé et les cellules sont lavées avec une solution de PBS 1X. Elles sont ensuite fixées dans 100pL de milieu de culture contenant 4% de paraformaldéhyde et incubées 20 min à température ambiante. Les cellules sont ensuite rincées avec une solution de PBS 1X. Puis elles sont colorées 30 min à l’aide de 100pL d’une solution de Cristal Violet 0,1 % (dilution au 1/5 dans H2O de la solution stock : 0.5% cristal violet 2% éthanol). Les cellules sont ensuite lavées 3 fois avec 100pL d’FhO. The cells are seeded according to the densities indicated above (Table 4). After 24 hours of culture, the culture medium is replaced by medium containing or not containing the molecules AIM2 or AIM3 at concentrations of 0.5; 1; 1.5; 2 and 2.5 mM in four copies for 48 hours. After these 48 hours of treatment, the culture medium is removed and the cells are washed with a 1 × PBS solution. They are then fixed in 100 μl of culture medium containing 4% of paraformaldehyde and incubated for 20 min at room temperature. The cells are then rinsed with a 1X PBS solution. Then they are colored for 30 min using 100 μl of a 0.1% crystal violet solution (dilution 1/5 in H2O of the stock solution: 0.5% crystal violet 2% ethanol). The cells are then washed 3 times with 100 μL of FhO.
L’étape suivante consiste à solubiliser le cristal violet afin d’obtenir une solution colorée qui pourra être dosée. Ainsi, 100pL d’une solution d’acide acétique à 10% est ajoutée, puis les plaques sont incubées sous agitation jusqu’à la solubilisation totale du Cristal Violet. Une lecture de l’absorbance est ensuite réalisée à 595 nm grâce à un lecteur de plaque (VICTOR). The next step is to dissolve the purple crystal in order to obtain a colored solution which can be dosed. Thus, 100 μl of a 10% acetic acid solution is added, then the plates are incubated with shaking until the total solubilization of the Violet Crystal. An absorbance is then read at 595 nm using a plate reader (VICTOR).
Résultats : Results:
Au niveau biologique, il a été déterminé que les molécules AIM2 et AIM3 présentaient une action antiproliférative sur des cellules épithéliales mammaires normales (MCF-10A) et sur des cellules tumorales mammaires (MDA-MB231 et Hs578T) (Figure 6 et 7). Ces résultats permettent de définir la concentration médiane inhibitrice (IC50) des molécules AIM2 (Figure 6) et AIM3 (Figure 7). L’IC50 de la molécule AIM2 dans les cellules MCF-10A est comprise entre 0,5 et 1 mM et dans les cellules MDA-MB231 entre 1 et 1 ,5mM ; l’IC50 de la molécule AIM3 dans les cellules MCF-10A est comprise entre 1 et 1 ,5mM et dans les cellules MDA-MB231 entre 1 ,5 et 2mM.
EXEMPLE 9 : Influence des composés AIM2 et AIM3 selon l’invention sur la prolifération des cellules épithéliales mammaires MCF-10A par cytométrie en flux (Fiq.8) : absence de toxicité cellulaire At the biological level, it was determined that the molecules AIM2 and AIM3 had an antiproliferative action on normal mammary epithelial cells (MCF-10A) and on mammary tumor cells (MDA-MB231 and Hs578T) (FIGS. 6 and 7). These results make it possible to define the median inhibitory concentration (IC50) of the molecules AIM2 (Figure 6) and AIM3 (Figure 7). The IC50 of the AIM2 molecule in MCF-10A cells is between 0.5 and 1 mM and in MDA-MB231 cells between 1 and 1.5 mM; the IC50 of the AIM3 molecule in MCF-10A cells is between 1 and 1.5 mM and in MDA-MB231 cells between 1.5 and 2 mM. EXAMPLE 9 Influence of the compounds AIM2 and AIM3 according to the invention on the proliferation of breast epithelial cells MCF-10A by flow cytometry (Fiq.8): absence of cellular toxicity
Dans le but de définir cette action antiproliférative, une étude du cycle cellulaire des cellules épithéliales mammaires MCF-10A par cytométrie en flux a également été réalisée (Figure 8). In order to define this antiproliferative action, a study of the cell cycle of MCF-10A mammary epithelial cells by flow cytometry was also carried out (Figure 8).
Protocole : cycle cellulaire Protocol: cell cycle
1. Ensemencer les cellules dans des boîtes 60mm. 1. Inoculate the cells in 60mm boxes.
La concentration des cellules est présentée dans le tableau en dessous. The concentration of the cells is presented in the table below.
Tableau 5 Table 5
2. Traiter les cellules selon le temps de traitement. 2. Treat cells according to treatment time.
3. Récupérer le milieu de chaque boîte dans un tube de 15ml. 3. Collect the medium from each box in a 15ml tube.
4. Laver les cellules avec 2mL de PBS. 4. Wash cells with 2mL PBS.
5. Récupérer le PBS dans le tube. 5. Collect the PBS in the tube.
6. Ajouter 1 mL de trypsine 1 c dans chaque boîte et les incuber dans l’incubateur pendant6. Add 1 mL of 1 c trypsin to each dish and incubate them in the incubator for
5 minutes pour les MDA-MB231 et les Hs578T, et 15 minutes pour les MCF-10A. 5 minutes for MDA-MB231 and Hs578T, and 15 minutes for MCF-10A.
7. Inhiber la trypsine avec le milieu et récupérer les cellules dans le tube. 7. Inhibit trypsin with the medium and recover the cells in the tube.
8. Bien re-suspendre les cellules et faire un comptage à l’aide d’un TC10™ Automated Cell Counter (Bio-Rad). 8. Resuspend the cells well and count using a TC10 ™ Automated Cell Counter (Bio-Rad).
9. Prendre 1x106 cellules dans un nouveau tube de 15ml, centrifuger à 500 G pendant 5 minutes. 9. Take 1x10 6 cells in a new 15ml tube, centrifuge at 500 G for 5 minutes.
10. Aspirer le surnageant et laver les cellules avec 2ml de PBS. 10. Aspirate the supernatant and wash the cells with 2ml of PBS.
1 1. Centrifuger à 500 G pendant 5 minutes. 1 1. Centrifuge at 500 G for 5 minutes.
12. Aspirer le surnageant, reprendre le culot dans 300mI de PBS et bien séparer les cellules avec une pipette 200mI. 12. Aspirate the supernatant, take up the pellet in 300 ml of PBS and separate the cells well with a 200 ml pipette.
13. Ajouter 700mI de l’éthanol absolu froide au goutte à goutte tout en vortexant dans le tube. 13. Add 700mI of cold absolute ethanol dropwise while vortexing in the tube.
14. Mettre les cellules dans le frigo à -20°C au moins 30 minutes pour assurer une perméabilisation et une fixation correcte. 14. Put the cells in the fridge at -20 ° C for at least 30 minutes to ensure permeabilization and correct fixation.
15. Prendre 500pL de cellules (5x105 cellules) de chaque suspension et centrifuger à15. Take 500 µL of cells (5x10 5 cells) from each suspension and centrifuge at
800G pendant 10 minutes. 800G for 10 minutes.
16. Aspirer délicatement le surnageant.
17. Reprendre chaque culot dans 500 mI de DNA stainning solution contenant 10mI de RNase A et 2mI d’iodure de propidium(IP,50 pg/ml). Les culots non marqués sont repris dans 500pL de PBS. 16. Gently aspirate the supernatant. 17. Resume each pellet in 500 mI of DNA stainning solution containing 10mI of RNase A and 2mI of propidium iodide (PI, 50 pg / ml). The unmarked pellets are taken up in 500 μl of PBS.
18. Incubation 10 minutes à l’obscurité. 18. 10 minute incubation in the dark.
19. Lecture au FACS. 19. Reading at FACS.
Résultats : Results:
Comme le montre la Fig.8, les résultats obtenus indiquent qu’un traitement avec 0,5 mM d’AIM2 et AIM3 induit un blocage du cycle cellulaire en phase G1. L’absence de cellules en phase subG1 indique que ces molécules ne présentent pas de toxicité cellulaire dans ces conditions de traitement. As shown in Fig. 8, the results obtained indicate that treatment with 0.5 mM AIM2 and AIM3 induces a blockage of the cell cycle in G1 phase. The absence of cells in the subG1 phase indicates that these molecules do not exhibit cellular toxicity under these treatment conditions.
EXEMPLE 10 : Influence sur la prolifération cellulaire (essai PARP clivée par Western
L’absence de mort cellulaire a été confirmée par des expériences au cours desquelles il a été vérifié l’absence de la protéine PARP clivée par western blot EXAMPLE 10 Influence on Cell Proliferation (PARP Test Cleaved by Western The absence of cell death has been confirmed by experiments in which the absence of the PARP protein cleaved by western blot has been verified.
L’effet de ces molécules sur la prolifération cellulaire a également été évalué en fonction du temps de traitement et non plus de la dose de molécule utilisée. La dose de 2mM, qui est celle capable d’entraîner une déméthylation de l’ADN, a été choisie. The effect of these molecules on cell proliferation was also evaluated as a function of the treatment time and no longer of the dose of molecule used. The 2mM dose, which is the one capable of causing DNA demethylation, was chosen.
Protocole : Protocol:
Les cellules sont ensemencées dans des boîtes de 60mm à raison de 4 mL/boîte le 1er jour à la concentration indiquée dans le tableau ci-dessous. The cells are seeded in 60mm boxes at a rate of 4 ml / box on the 1st day at the concentration indicated in the table below.
Tableau 6 Table 6
6 heures après leur ensemencement, les complexes organométalliques AIM2 et AIM3 à 2mM ou le solvant (0.04% d’éthanol) pour les cellules non traitées sont ajoutés dans le milieu de culture. A l’issue du temps de traitement choisi, 24, 48, 72, 96, 120, 144 heures, les cellules traitées et non traitées sont détachées par action de la trypsine. Après inactivation de la trypsine avec du milieu de culture contenant 10% de sérum de veau foetal, les cellules sont lavées dans du PBS et comptées après coloration au Bleu Trypan afin de ne compter que les cellules vivantes (une fraction de 10mI de la suspension est mélangée avec 10mI de bleu de Trypan à 0,4% (Thermo Scientific). Le comptage des cellules est effectué à l’aide d’une cellule de comptage Malassez (Marienfeld-Superior).
a). Préalablement au traitement, les molécules Al Ms sont préchauffées dans un bloc chauffant (Thermo Scientific) à 37°C sous agitation pendant 10 minutes afin de garantir une solubilisation totale. 6 hours after their seeding, the organometallic complexes AIM2 and AIM3 at 2 mM or the solvent (0.04% ethanol) for the untreated cells are added to the culture medium. At the end of the chosen treatment time, 24, 48, 72, 96, 120, 144 hours, the treated and untreated cells are detached by the action of trypsin. After inactivation of trypsin with culture medium containing 10% fetal calf serum, the cells are washed in PBS and counted after staining with Trypan Blue so as to count only the living cells (a fraction of 10 ml of the suspension is mixed with 10 ml of 0.4% Trypan blue (Thermo Scientific) The cells are counted using a Malassez counting cell (Marienfeld-Superior). at). Prior to treatment, the Al Ms molecules are preheated in a heating block (Thermo Scientific) at 37 ° C. with stirring for 10 minutes in order to guarantee total solubilization.
b). Pour les traitements supérieurs à 72 heures, les milieux sont renouvelés toutes les 72 heures avec ou sans Al Ms. b). For treatments longer than 72 hours, the media are renewed every 72 hours with or without Al Ms.
c). Dans le test de réversibilité de la prolifération (courbes rouges sur la figure), le traitement est arrêté après 72 heures et les milieux sont renouvelés sans ajout de molécules AIMs. vs). In the proliferation reversibility test (red curves in the figure), the treatment is stopped after 72 hours and the media are renewed without adding AIMs molecules.
Résultats : Results:
Ainsi, les molécules AIM2 et AIM3 présentent une action cytostatique dans les différentes lignées cellulaires utilisées (MCF-10A, MDA-MB231 et Hs578). Thus, the molecules AIM2 and AIM3 have a cytostatic action in the different cell lines used (MCF-10A, MDA-MB231 and Hs578).
Comme indiqué figure 9, un traitement avec une dose de 2 mM inhibe la prolifération des cellules épithéliales mammaires saines (MCF10A), mais également des cellules cancéreuses mammaires (MDA-MB231 et HS578T) (cf. courbes points carré par rapport aux contrôles non traités rond). Par contre, dans le but de déterminer la réversibilité de ces traitements, il a également été réalisé un traitement de 72h avec 2mM de molécule, suivi par un changement de milieu sans rajout de molécule. Dans cette expérience, il apparaît que le changement de milieu permet aux cellules de proliférer de nouveau et ce de manière beaucoup plus marquée concernant les cellules épithéliales mammaires saines (MCF10A). Ce résultat permet de conforter les observations précédentes démontrant la non-cytotoxicité de ces molécules et donc leur effet cytostatique. As indicated in FIG. 9, a treatment with a dose of 2 mM inhibits the proliferation of healthy mammary epithelial cells (MCF10A), but also of breast cancer cells (MDA-MB231 and HS578T) (cf. curves square points compared to the untreated controls round). On the other hand, in order to determine the reversibility of these treatments, a 72h treatment was also carried out with 2mM of molecule, followed by a change of medium without adding any molecule. In this experiment, it appears that the change in environment allows the cells to proliferate again and this in a much more marked manner concerning healthy mammary epithelial cells (MCF10A). This result confirms the previous observations demonstrating the non-cytotoxicity of these molecules and therefore their cytostatic effect.
EXEMPLE 1 1 : Effet sensibilisant des composés selon l’invention vis-à-vis de chimiothérapie dans des cellules tumorales mammaires (Fiq.10 et Fig.1 1 ) EXAMPLE 1 1: Sensitizing effect of compounds according to the invention vis-à-vis chemotherapy in mammary tumor cells (Fiq.10 and Fig.1 1)
Le cancer du sein regroupe en réalité différentes sous-catégories basées sur l'expression de 3 marqueurs moléculaire : le récepteur aux oestrogènes (ERa), le récepteur à la progestérone (PR) et le récepteur transmembranaire appartenant à la famille des récepteurs à l'EGF (HER2). Certaines tumeurs sont ainsi nommées triples négatives, car elles n'expriment aucun des 3 marqueurs moléculaires. Ce type de tumeur pose de nombreux problèmes dans leur traitement du fait : Breast cancer actually groups different subcategories based on the expression of 3 molecular markers: the estrogen receptor (ERa), the progesterone receptor (PR) and the transmembrane receptor belonging to the family of receptors for EGF (HER2). Some tumors are thus called triple negative, because they do not express any of the 3 molecular markers. This type of tumor poses many problems in their treatment because:
- de leur insensibilité aux agents de chimiothérapie couramment utilisés dans le traitement du cancer du sein - their insensitivity to chemotherapy agents commonly used in the treatment of breast cancer
- de l'absence de traitement ciblé pour ces tumeurs. - the lack of targeted treatment for these tumors.
Un des enjeux majeurs dans le traitement du cancer du sein consiste à tenter de re-sensibiliser des tumeurs mammaires triples négatives aux agents de chimiothérapie. Un des buts visés consiste ainsi à restaurer la sensibilité de cellules
cancéreuses mammaires triples négatives, les MDA-MB231 , à un agent de chimiothérapie, le tamoxifène. One of the major challenges in the treatment of breast cancer consists in trying to re-sensitize triple negative breast tumors to chemotherapy agents. One of the aims is thus to restore the sensitivity of cells triple negative breast cancer, MDA-MB231, to a chemotherapy agent, tamoxifen.
D'un point de vue mécanistique, le tamoxifène est un modulateur sélectif des récepteurs aux oestrogènes (ERa), c'est-à-dire qu'il se fixe spécifiquement sur les récepteurs aux oestrogènes, mais sans activer de voie de signalisation. La résistance des cellules MDA-MB231 face au tamoxifène a été montrée comme étant due à une absence d'expression d'ERa. En 2000, Yoshida et ses collaborateurs ont montré que l'hyperméthylation de 2 régions promotrices (promoteur A et B) en amont du gène codant ERa est inversement corrélée à l'expression d'ERa dans les cellules MDA-MB231. From a mechanistic point of view, tamoxifen is a selective estrogen receptor (ERa) modulator, that is to say that it binds specifically to estrogen receptors, but without activating a signaling pathway. The resistance of MDA-MB231 cells to tamoxifen has been shown to be due to a lack of expression of ERa. In 2000, Yoshida and his collaborators showed that the hypermethylation of 2 promoter regions (promoter A and B) upstream of the gene coding ERa is inversely correlated to the expression of ERa in MDA-MB231 cells.
De plus, un traitement à l'aide d'un agent déméthylant (la 5-azadésoxycytidine) a permis de ré-induire l'expression d'ERa dans les cellules MDA-MB231 (lien : the synergie inhibitory effect of 5-aza-2-deoxycytidine and tamoxifen on estrogen receptor alpha négative breast cancer œil Unes in vitro). In addition, treatment with a demethylating agent (5-azadesoxycytidine) made it possible to re-induce the expression of ERa in MDA-MB231 cells (link: the synergie inhibitory effect of 5-aza- 2-deoxycytidine and tamoxifen on estrogen receptor alpha negative breast cancer eye (in vitro).
Les résultats de l'utilisation sur cellules de la 5aza étant très prometteurs, des essais cliniques ont été réalisés pour le traitement de certaines leucémies associées à une hyperméthylation de gènes spécifiques. Bien que la survie globale des patients soit nettement améliorée, il n'en reste pas moins que l'utilisation de la 5-azadésoxycytidine soit associée à de lourds effets secondaires (neutropénie, thrombocytopénie, anémie, pyrexie), du fait de l'absence de spécificité de l'action de cette molécule. Une partie des travaux menés en cancérologie est ainsi de générer et d'étudier de nouveaux agents déméthylants présentant une spécificité d'action améliorée. As the results of the use on 5aza cells are very promising, clinical trials have been carried out for the treatment of certain leukemias associated with hypermethylation of specific genes. Although the overall survival of the patients is markedly improved, the fact remains that the use of 5-azadesoxycytidine is associated with serious side effects (neutropenia, thrombocytopenia, anemia, pyrexia), due to the absence specificity of the action of this molecule. Part of the work carried out in oncology is thus to generate and study new demethylating agents with improved specificity of action.
C'est dans ce contexte que les composés selon l’invention ont été développés dont le composé AIM2 qui présente comme le montre les essais ci-dessus une action déméthylante, à la fois in vitro et in cellulo. It is in this context that the compounds according to the invention have been developed, including the compound AIM2 which, as shown in the tests above, has a demethylating action, both in vitro and in cellulo.
Face à ce mode d'action, la Demanderesse a étudié si les composés selon l’invention permettaient de déméthyler le promoteur d'ERa dans les cellules MDA-MB231 , afin de réinduire son expression, et de resensibiliser les cellules au tamoxifène. Faced with this mode of action, the Applicant has studied whether the compounds according to the invention make it possible to demethylate the ERa promoter in MDA-MB231 cells, in order to re-induce its expression, and to resensitize cells to tamoxifen.
Dans un 1 er temps, la synergie d'action entre notre molécule AIM2 et le tamoxifène a été étudié. First, the synergy of action between our AIM2 molecule and tamoxifen was studied.
Des tests de Chou-Talalay ont été réalisés en déterminant le nombre de cellules attachées après traitements à l'aide du composé AIM2 et/ou à l'aide de tamoxifène. Chou-Talalay tests were carried out by determining the number of cells attached after treatments using the AIM2 compound and / or using tamoxifen.
Protocole : Expérience de synergisme AIM2/Tamoxifène Chou Talalav Protocol: AIM2 / Tamoxifen Chou Talalav synergism experiment
Pour cela, des cellules MDA-MB231 ont été ensemencées en plaque 96 puits à une densité cellulaire de 8 000 cellules/puits dans un volume de 100pL/puits. Le plan expérimental de plaque est présenté sur la figure 10.
Le traitement à AIM2 se fait pendant 24h, suivi de 48h de traitement au tamoxifène. A la fin des traitements, un marquage au cristal violet est réalisé afin de dénombrer les cellules vivantes. For this, MDA-MB231 cells were seeded in a 96-well plate at a cell density of 8,000 cells / well in a volume of 100 μL / well. The experimental plate design is shown in Figure 10. Treatment with AIM2 is done for 24 hours, followed by 48 hours of treatment with tamoxifen. At the end of the treatments, a marking with violet crystal is carried out in order to count the living cells.
Le protocole est le suivant : The protocol is as follows:
- aspirer les puits - vacuum wells
- laver les puits avec 100pL de PBS - wash the wells with 100pL of PBS
- ajouter 50 pL de cristal violet 0,1 % et laisser incuber 30 minutes à température ambiante - add 50 μL of 0.1% violet crystal and incubate for 30 minutes at room temperature
- rincer 3 fois à l'eau distillée - rinse 3 times with distilled water
- ajouter 100 pL d'acide acétique 10% par puits et laisser incuber sous agitation - add 100 μL of 10% acetic acid per well and incubate with shaking
10 minutes 10 minutes
- mesurer l'absorbance à 595 nm dans un VICTOR Multilabel Plate Reader (PerkinElmer). - measure the absorbance at 595 nm in a VICTOR Multilabel Plate Reader (PerkinElmer).
Les triplicats de plaque sont moyennés, et les résultats sont exprimés en fonction du contrôle non traité qui est fixé à 1 pour chaque condition. The plate triplicates are averaged, and the results are expressed as a function of the untreated control which is set to 1 for each condition.
Résultats : Results:
Les résultats montrent que les cellules MDA-MB231 , qui sont ER négatives, sont insensibles au tamoxifène. Un traitement avec AIM2 induit une diminution de la viabilité cellulaire de l’ordre de 50% dès la dose la plus faible (2 000 nM). Un prétraitement par AIM2 suivi d’un traitement au tamoxifène induit également une diminution de la viabilité cellulaire, qui semble plus importante qu’en présence de la molécule AIM2 uniquement. Afin de savoir si cette diminution de la viabilité cellulaire dans la condition AIM2+Tam s’explique par une synergie entre les 2 molécules, le Demanderesse a utilisé le logiciel CompuSync qui se base sur la méthode de Chou- Talalay via le principe d'effet médian de la loi d'action de masse. The results show that MDA-MB231 cells, which are ER negative, are insensitive to tamoxifen. A treatment with AIM2 induces a reduction in cell viability of the order of 50% from the lowest dose (2000 nM). Pretreatment with AIM2 followed by treatment with tamoxifen also induces a decrease in cell viability, which seems greater than in the presence of the molecule AIM2 only. In order to know whether this decrease in cell viability under the AIM2 + Tam condition is explained by a synergy between the 2 molecules, the Applicant used the CompuSync software which is based on the Chou-Talalay method via the principle of effect median of the law of mass action.
L'équation sur laquelle se base le logiciel est la suivante : fa/fu=l(D/Dm)Jm où : The equation on which the software is based is as follows: fa / fu = l (D / Dm) J m where:
fa et fu correspondent respectivement aux fractions de cellules affectées et non affectées par les traitements; fa and fu correspond respectively to the fractions of cells affected and not affected by the treatments;
D et Dm correspondent respectivement à la dose employée et la dose médiane D and Dm correspond respectively to the dose used and the median dose
(IC50) (IC50)
m correspond à la forme de la courbe dose-réponse. m corresponds to the shape of the dose-response curve.
Il suffit de rentrer dans le logiciel 3 jeux de données : You just need to enter the 3 datasets software:
- les valeurs correspondant à l'effet de la molécule A à la dose donnée - les valeurs correspondant à l'effet de la molécule B à la dose donnée - the values corresponding to the effect of molecule A at the given dose - the values corresponding to the effect of molecule B at the given dose
- les valeurs correspondant à l'effet de la molécule A et de la molécule B à la combinaison de doses données. - the values corresponding to the effect of molecule A and of molecule B at the combination of given doses.
Le logiciel génère alors des indices de combinaison (Cl) :
- si le Cl à une combinaison de dose donnée est inférieur à 1 , alors il y a synergie d'action entre la molécule A et la molécule B The software then generates combination indices (Cl): - if the Cl at a given dose combination is less than 1, then there is a synergy of action between molecule A and molecule B
- si le Cl à une combinaison de dose donnée est supérieur à 1 , alors il y a antagonisme entre la molécule A et la molécule B. - if the Cl at a given dose combination is greater than 1, then there is an antagonism between molecule A and molecule B.
Les résultats (exprimés sous la forme de combinaison index, ou Cl) sont présentés dans le tableau 7 ci-dessous : The results (expressed in the form of an index or Cl combination) are presented in Table 7 below:
Tableau 7 Table 7
Comme les résultats le montrent, toutes les combinaisons de doses (sauf la combinaison 10 000 nM de AIM2 et 750 nM de TAM) permettent d’observer une synergie (Cl<1 ) entre le tamoxifène et AIM2. As the results show, all the combinations of doses (except the combination of 10,000 nM of AIM2 and 750 nM of TAM) make it possible to observe a synergy (Cl <1) between tamoxifen and AIM2.
Ces résultats permettent donc de conclure qu’un pré-traitement à l’aide d’AIM2 permet de sensibiliser les cellules MDA-MB231 au tamoxifène, qui sont de base insensibles. EXEMPLE 12 : Test MTT (viabilité) pour démontrer l’effet des composés selon l’invention sur la sensibilité aux agents anticancéreux (Fiq.12) These results therefore make it possible to conclude that a pre-treatment using AIM2 makes it possible to sensitize the MDA-MB231 cells to tamoxifen, which are basic insensitive. EXAMPLE 12: MTT test (viability) to demonstrate the effect of the compounds according to the invention on the sensitivity to anticancer agents (Fiq.12)
Par la suite, sur la base de la resensibilisation des cellules MDA-MB231 au tamoxifène en présence d’AIM2, la Demanderesse a étudié si un traitement avec les composés AIM2 et AIM3 permettait d’augmenter la sensibilité de différentes lignées de tumeurs mammaires face à différents agents de chimiothérapie classiquement employés : le 5-fluorouracile et la doxorubicine. Subsequently, on the basis of the resensitization of MDA-MB231 cells to tamoxifen in the presence of AIM2, the Applicant studied whether a treatment with the compounds AIM2 and AIM3 made it possible to increase the sensitivity of different lines of mammary tumors in the face of different chemotherapy agents conventionally used: 5-fluorouracil and doxorubicin.
Protocole : Protocol:
Pour cela, les cellules cancéreuses mammaires, les MCF-7, MDA-MB231 et Hs578T, ainsi qu’une lignée de cellules mammaires normales, les MCF10A, ont été ensemencées à une densité de 1 x104 cellules/puits dans une plaque à 96 puits. Après 24h d’ensemencement, les cellules sont mises en contact avec 2mM d’AIM2/3 pendant 1 heure suivi de 50mM de 5-fluorouracile ou 50ng/mL de doxorubicine pendant 24 ou 48 heures. Suite à ces traitements, les milieux sont enlevés et 0.5mg/mL de MTT est ajouté dans chaque puits. Après 3 heures d’incubation à 37°C, 100pL de SDS 25% est ajouté dans chaque puits et les plaques sont incubées à 37 °C toute la nuit. L’absorbance est mesurée à 570nm. Les résultats présentés correspondent à la moyenne ± l’erreur
standard à la moyenne issue de trois expériences indépendantes. Les différences entre les cellules traitées à différents temps sont significatives pour un p<0,05. For this, the breast cancer cells, MCF-7, MDA-MB231 and Hs578T, as well as a line of normal breast cells, MCF10A, were seeded at a density of 1 × 10 4 cells / well in a 96-well plate. well. After 24 hours of inoculation, the cells are brought into contact with 2mM of AIM2 / 3 for 1 hour followed by 50mM of 5-fluorouracil or 50ng / ml of doxorubicin for 24 or 48 hours. Following these treatments, the media are removed and 0.5 mg / mL of MTT is added to each well. After 3 hours of incubation at 37 ° C, 100 µL of 25% SDS is added to each well and the plates are incubated at 37 ° C overnight. The absorbance is measured at 570nm. The results presented correspond to the mean ± the error standard to average from three independent experiments. The differences between the cells treated at different times are significant for a p <0.05.
Résultats : Results:
Les résultats montrent qu’un traitement de 24h à AIM2/3 n’a aucun effet significatif sur la viabilité, peu importe la lignée de cancer du sein pris en compte. Néanmoins, lorsque le traitement à AIM2/3 est suivi d’un traitement au 5Fu ou à la doxorubicine, la viabilité cellulaire diminue de manière significative, et ce dans toutes les lignées. Cet effet apparaît dès 24 heures de traitement, mais s’accentue encore plus lors des traitements de 48 heures. The results show that a 24h treatment with AIM2 / 3 has no significant effect on viability, regardless of the breast cancer line taken into account. However, when treatment with AIM2 / 3 is followed by treatment with 5Fu or doxorubicin, cell viability decreases significantly, in all lines. This effect appears after 24 hours of treatment, but is accentuated even more during 48-hour treatments.
Ces résultats suggèrent donc que les composés selon l’invention sensibilisent les cellules tumorales mammaires aux agents de chimiothérapie, indiquant une possible utilisation thérapeutique de ces molécules. These results therefore suggest that the compounds according to the invention sensitize breast tumor cells to chemotherapy agents, indicating a possible therapeutic use of these molecules.
EXEMPLE 13 : Test de prolifération à la suite d’un pré-traitement avec AIM2 ou AIM3 2uM 72h (Fig.13 et Fig.141 EXAMPLE 13 Proliferation test following a pre-treatment with AIM2 or AIM3 2 uM 72h (Fig. 13 and Fig. 141
Condition de culture : Culture condition:
Les différentes lignées cellulaires sont cultivées dans un incubateur à 37°C, 5% CC>2 et 95 % d’humidité selon les milieux nutritifs suivants : The different cell lines are cultivated in an incubator at 37 ° C, 5% CC> 2 and 95% humidity according to the following nutrient media:
Tableau 8 Table 8
Les différents milieux de culture sont supplémentés alternativement par 0,1 mg/mL de Gentamicine (Sigma G1272) et 1 % de Penicilline-Steptomycine (Sigma P4333). The different culture media are alternately supplemented with 0.1 mg / mL of Gentamicin (Sigma G1272) and 1% of Penicillin-Steptomycin (Sigma P4333).
Le sérum de veau foetal (SVF) et le sérum de cheval sont préalablement décomplémentés pendant 30 minutes à 56°C.
La lignée T47D résistante à la doxorubicine est cultivée en présence de 12,5 ng doxorubicine/mL afin de maintenir la résistance. Cependant, la doxorubicine n’est pas ajoutée au milieu de culture pendant les phases de pré-traitement et le test de prolifération. The fetal calf serum (SVF) and the horse serum are decomplemented beforehand for 30 minutes at 56 ° C. The doxorubicin-resistant line T47D is cultured in the presence of 12.5 ng doxorubicin / ml in order to maintain the resistance. However, doxorubicin is not added to the culture medium during the pre-treatment phases and the proliferation test.
Pré-traitement des lignées cellulaires Pre-treatment of cell lines
Les cellules sont ensemencées dans des boîtes 100 mm (10 mL milieu/boîte) pour les conditions NonTraitées et dans des boîtes 150 mm (20 mL milieu/ boîte) pour les conditions traitées selon les quantités suivantes : The cells are seeded in 100 mm boxes (10 ml medium / box) for the Untreated conditions and in 150 mm boxes (20 ml medium / box) for the conditions treated according to the following quantities:
Tableau 9 Table 9
Les cellules sont ensuite traitées 24h après ensemencement avec les molécules The cells are then treated 24 hours after seeding with the molecules
AIM2 ou AIM3 à une concentration de 2 mM pendant 72h. AIM2 or AIM3 at a concentration of 2 mM for 72 hours.
Ensemencement cellulaire suite au pré-traitement avec AIM Cell seeding following pre-treatment with AIM
Les cellules sont décollées avec 1 mL (boîtes 10 mm) ou 2mL (boîtes 150 mm) de trypsine - EDTA 1X pendant 5 minutes à 37°C (15 minutes d’incubation sont nécessaires pour décoller les cellules MCF10A). The cells are detached with 1 mL (10 mm dishes) or 2 ml (150 mm dishes) of trypsin - EDTA 1X for 5 minutes at 37 ° C (15 minutes of incubation are necessary to detach the MCF10A cells).
L’action de la trypsine est ensuite inhibée par 10 mL de milieu de culture puis la suspension cellulaire est centrifugée à 200G pendant 5 minutes. The action of trypsin is then inhibited by 10 ml of culture medium and then the cell suspension is centrifuged at 200 G for 5 minutes.
Chaque culot est repris dans 10 mL de milieu puis les cellules sont dénombrées à l’aide d’une cellule de Mallasez. Each pellet is taken up in 10 ml of medium and then the cells are counted using a Mallasez cell.
Les cellules sont ensuite ensemencées dans des boîtes 60 mm (4mL milieu/boîte) comme suit et selon le plan d’expérience de la Fig.13 :
The cells are then seeded in 60 mm dishes (4 ml medium / dish) as follows and according to the experimental plan of Fig. 13:
Tableau 10 Table 10
Dénombrement cellulaire Cell count
Chaque jour pendant 72h, 3 boîtes issues d’un type cellulaire et d’un traitement donné sont dénombrées. Each day for 72 hours, 3 boxes of a cell type and a given treatment are counted.
Après un lavage avec 2 mL de PBS, les cellules sont décollées avec 1 mL de trysine-EDTA 1X à 37°C pendant 10 minutes (20 minutes pour la lignée MCF10A). After washing with 2 ml of PBS, the cells are detached with 1 ml of 1X trysin-EDTA at 37 ° C for 10 minutes (20 minutes for the MCF10A line).
La tryspine est ensuite inhibée par l’ajout de 4 mL de milieu. Puis les cellules sont culotées à 200G pendant 5 minutes.
Les culots sont repris dans un volume précis de PBS dépendant de la taille du culot. The tryspine is then inhibited by the addition of 4 ml of medium. Then the cells are pelletized at 200G for 5 minutes. The pellets are taken up in a precise volume of PBS depending on the size of the pellet.
Les cellules sont correctement séparées par plusieurs allers-retours à la P200 et dénombrées à l’aide d’une cellule de Mallasez. The cells are correctly separated by several round trips to the P200 and counted using a Mallasez cell.
Comme le montre la Fig.14, les résultats obtenus indiquent que l'inhibition de prolifération observée suite au traitement avec AIM2 et AIM3 est réversible dans les cellules MCF10A et pas dans les cellules MDA-MB-231. Une réversibilité est également observée dans les cellules T47D R+doxo traitées avec AIM2 mais pas avec AIM3. EXEMPLE 14 : Etude de l’effet du traitement des molécules AIM1 , AIM2, AIM3 et Ru (Fiq.16) à 2uM sur différentes lignées cellulaires pendant 48h ou 72h As shown in Fig. 14, the results obtained indicate that the proliferation inhibition observed following treatment with AIM2 and AIM3 is reversible in MCF10A cells and not in MDA-MB-231 cells. Reversibility is also observed in T47D R + doxo cells treated with AIM2 but not with AIM3. EXAMPLE 14 Study of the effect of the processing of the molecules AIM1, AIM2, AIM3 and Ru (Fiq.16) at 2 μM on different cell lines for 48 h or 72 h
Condition de culture Culture condition
Les différentes lignées cellulaires sont cultivées dans un incubateur à 37°C, 5% CC>2 et 95 % d’humidité selon les milieux nutritifs suivants : The different cell lines are cultivated in an incubator at 37 ° C, 5% CC> 2 and 95% humidity according to the following nutrient media:
Tableau 11 Table 11
Les différents milieux de culture sont supplémentés alternativement par 0,1 mg/mL de Gentamicine (Sigma G1272) et 1 % de Penicilline-Steptomycine (Sigma P4333). The different culture media are alternately supplemented with 0.1 mg / mL of Gentamicin (Sigma G1272) and 1% of Penicillin-Steptomycin (Sigma P4333).
Le sérum de veau foetal (SVF) et le sérum de cheval (horse sérum en anglais) sont préalablement décomplémentés pendant 30 minutes à 56°C. Fetal calf serum (SVF) and horse serum are decomplemented beforehand for 30 minutes at 56 ° C.
La lignée T47D résistante à la doxorubicine est cultivée en présence de 12,5 ng doxorubicine/mL afin de maintenir la résistance, cependant la doxorubicine n’est pas ajoutée au milieu de culture pendant le test de prolifération.
Plan d’expériences The doxorubicin resistant line T47D is cultured in the presence of 12.5 ng doxorubicin / ml in order to maintain the resistance, however doxorubicin is not added to the culture medium during the proliferation test. Experiments plan
Chaque lignée cellulaire est ensemencée dans des plaques 96 puits (100mI_ milieu/puits) selon les conditions suivantes :
Each cell line is seeded in 96-well plates (100 ml_ medium / well) according to the following conditions:
Tableau 12 Table 12
Chaque condition de traitement est effectuée en tripicat comme indiqué sur la Figure 15. Each treatment condition is performed in a tripicat as shown in Figure 15.
Les cellules sont traitées avec les molécules représentées à la Figure 16 (AIM1 , AIM2, AIM3 selon l’invention et Ru en tant qu’exemple comparatif) à 2 mM 24h après l’ensemencement. The cells are treated with the molecules represented in FIG. 16 (AIM1, AIM2, AIM3 according to the invention and Ru as a comparative example) at 2 mM 24 h after seeding.
Après 48h ou 72h de traitement, le milieu de chaque puits est retiré puis un lavage est effectué avec 100 pL de PBS. After 48h or 72h of treatment, the medium from each well is removed and then washing is carried out with 100 μl of PBS.
Les cellules sont ensuite fixées avec 100 pL de paraformaldéhyde 4% pendant 20 minutes, suivi de deux lavages avec 500 pL de PBS. The cells are then fixed with 100 μL of 4% paraformaldehyde for 20 minutes, followed by two washes with 500 μL of PBS.
Essai au Cristal Violet Purple Crystal Essay
Le pourcentage de cellules adhérées est mis en évidence par une coloration au cristal violet. The percentage of adhered cells is demonstrated by staining with violet crystal.
100 pL de cristal violet à 0,1 % (dilution au 1/5 dans H20 de la solution stock : 0.5% cristal violet 2% éthanol filtré 0,22pM) est ajouté dans chaque puits. 100 μL of 0.1% violet crystal (dilution to 1/5 in H2O of the stock solution: 0.5% violet crystal 2% 0.22 μm filtered ethanol) is added to each well.
Après 30 minutes d’incubation à température ambiante, les puits sont rincés 3 fois avec de l’eau distillée puis correctement séchés par tapotement sur une feuille de papier absorbant. After 30 minutes of incubation at room temperature, the wells are rinsed 3 times with distilled water and then properly dried by tapping on a sheet of absorbent paper.
100pL d’acide acétique 10% est ensuite ajouté à chaque puits. 100 µL of 10% acetic acid is then added to each well.
La plaque est placée sous agitation jusqu'à la solubilisation totale des cristaux de cristal violet (environ 10 minutes). The plate is placed under stirring until the total solubilization of the violet crystal crystals (approximately 10 minutes).
La lecture de l’absorbance est effectuée à l’aide d’un lecteur de plaque à 595 nm (voir Fig.17 à 20). The absorbance is read using a plate reader at 595 nm (see Fig. 17 to 20).
Résultats Results
L’ensemble de ces résultats représentés aux Fig. 17 à 20, indique que les molécules AIM2 et AIM3 induisent une inhibition significative de la prolifération des différents types cellulaires testés. La molécule AIM1 est également capable d’entraîner une baisse de la prolifération cellulaire même si celle-ci est moins marquée que pour les molécules AIM2 et AIM3. Par contre, la molécule (exemple comparatif) appelée Ru (qui correspond à la molécule AIM2 dont le Fer a été remplacé par du ruthénium) n’entraîne pas d’inhibition de la prolifération dans les conditions testées.
All of these results shown in Figs. 17 to 20, indicates that the molecules AIM2 and AIM3 induce a significant inhibition of the proliferation of the different cell types tested. The AIM1 molecule is also capable of causing a decrease in cell proliferation even if it is less marked than for the AIM2 and AIM3 molecules. On the other hand, the molecule (comparative example) called Ru (which corresponds to the molecule AIM2 whose iron has been replaced by ruthenium) does not cause inhibition of proliferation under the conditions tested.
Claims
1. Utilisation non-thérapeutique, en tant qu’agent de déméthylation de l’ADN, d’au moins un composé organométallique comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines de formule générale (I) suivante : 1. Non-therapeutic use, as DNA demethylation agent, of at least one organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups of general formula (I) below:
dans laquelle : in which :
R1 à R6, identiques ou différents sont choisis parmi : un atome d’hydrogène ; une chaîne alkyle linéaire ou ramifiée de formule CnHhn+i avec n = 1 à 12 ; un groupe COOH ; un groupe SO3H ; un groupe PO3H ; un cycle aromatique de formule (II) à (VI) ci-dessous: R 1 to R 6 , identical or different, are chosen from: a hydrogen atom; a linear or branched alkyl chain of formula C n Hh n + i with n = 1 to 12; a COOH group; an SO3H group; a PO3H group; an aromatic cycle of formula (II) to (VI) below:
(II) (III) (IV) (V) (VI) où (II) (III) (IV) (V) (VI) where
Y sont chacun indépendemment des autres un groupe CH ou un atome d’azote; R7 est choisi parmi un groupe OCYH2Y+I avec y = 1 à 10 ; SCWH2W+I avecw= 1 à 10;Y are each independently of the others a CH group or a nitrogen atom; R 7 is chosen from a group OC Y H2 Y + I with y = 1 to 10; SC W H2 W + I with w = 1 to 10;
N(CmH2m+i)2 avec m= 1 à 6, COOH ; SO3H ou PO2H3 ; N (C m H2m + i) 2 with m = 1 to 6, COOH; SO3H or PO2H3;
Z désigne un atome d’oxygène, un atome de soufre ou un groupe NH ; Z denotes an oxygen atom, a sulfur atom or an NH group;
la ligne en pointillée représente une liaison C-C au niveau du point de rattachement du cycle aromatique de formule (II) à (VI) aux groupements terpyridines du composé organométallique de formule (I) ; the dotted line represents a C-C bond at the point of attachment of the aromatic cycle of formula (II) to (VI) to the terpyridine groups of the organometallic compound of formula (I);
X est un contre-ion. X is a counterion.
2. Utilisation non-thérapeutique selon la revendication 1 , dans laquelle R1 à R6 correspondent à un atome d’hydrogène.
2. Non-therapeutic use according to claim 1, in which R 1 to R 6 correspond to a hydrogen atom.
3. Utilisation non-thérapeutique selon la revendication 1 , dans laquelle R1, R3, R4, 66 sont identiques et correspondent à un atome d’hydrogène, et R2 et R5 sont identiques et désignent un benzène de formule (Vil) suivante:
3. Non-therapeutic use according to claim 1, in which R 1 , R 3 , R 4 , 6 6 are identical and correspond to a hydrogen atom, and R 2 and R 5 are identical and denote a benzene of formula ( Vil) following:
4. Utilisation non-thérapeutique selon la revendication 1 , dans laquelle R1, R3, R4, 66 sont identiques et correspondent à un atome d’hydrogène, et R2 et R5 sont identiques et désignent un radical pyridine de formule (VIII) suivante : 4. Non-therapeutic use according to claim 1, in which R 1 , R 3 , R 4 , 6 6 are identical and correspond to a hydrogen atom, and R 2 and R 5 are identical and denote a pyridine radical of formula (VIII) following:
(VIII)(VIII)
où la ligne en pointillée représente une liaison C-C entre le carbone porté par le radical pyridine et le carbone porté par le groupe terpyridine du composé organométallique de formule (I). where the dotted line represents a CC bond between the carbon carried by the pyridine radical and the carbon carried by the terpyridine group of the organometallic compound of formula (I).
5. Utilisation non-thérapeutique selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle le contre-ion X est choisi parmi : Cl , Br ou I 5. Non-therapeutic use according to any one of the preceding claims, in which the counterion X is chosen from: Cl, Br or I
6. Utilisation non-thérapeutique selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle ledit composé organométallique est capable d’entraîner une déméthylation directe de l’ADN. 6. Non-therapeutic use according to any one of the preceding claims, in which said organometallic compound is capable of causing direct demethylation of DNA.
7. Composé organométallique comprenant un atome de fer lié à deux groupes terpyridines, ayant une formule générale (I) définie selon l’une quelconque de revendications 1 à 6 pour son utilisation comme médicament. 7. Organometallic compound comprising an iron atom linked to two terpyridine groups, having a general formula (I) defined according to any one of claims 1 to 6 for its use as a medicament.
8. Composé organométallique selon la revendication 7, pour son utilisation dans le traitement des maladies liées à une hyperprolifération cellulaire. 8. Organometallic compound according to claim 7, for its use in the treatment of diseases linked to cellular hyperproliferation.
9. Composé organométallique selon la revendication 7 ou 8, pour son utilisation dans le traitement de cancers. 9. Organometallic compound according to claim 7 or 8, for its use in the treatment of cancers.
10. Composé organométallique l’une des revendications 7 à 9, pour son utilisation dans le traitement des glioblastomes, des leucémies promyélocytaires, des cancers de la prostate, des ovaires, des poumons, des seins, des voies digestives, en particulier du foie, du pancréas, de la tête et du cou, du colon, des lymphomes non- Hodgkiniens ou des mélanomes. 10. Organometallic compound one of claims 7 to 9, for its use in the treatment of glioblastomas, promyelocytic leukemias, cancers of the prostate, ovaries, lungs, breasts, digestive tracts, in particular the liver, pancreas, head and neck, colon, non-Hodgkin lymphoma or melanoma.
1 1. Composé organométallique selon l’une des revendications 7 à 10, pour son utilisation dans le traitement des tumeurs résistantes au cisplatine, le 5-fluorouracile, le tomoxifène ou encore la doxorubicine ou à d'autres composés anticancéreux.
1 1. Organometallic compound according to one of claims 7 to 10, for its use in the treatment of tumors resistant to cisplatin, 5-fluorouracil, tomoxifene or even doxorubicin or other anticancer compounds.
12. Composé organométallique selon la revendication 7 ou 8, pour son utilisation dans le traitement de l’inflammation, de l’obésité, de maladies neurodégénératives ou de maladies cardiovasculaires.
12. Organometallic compound according to claim 7 or 8, for its use in the treatment of inflammation, obesity, neurodegenerative diseases or cardiovascular diseases.
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