EP1549958A2 - Maldi-matrix - Google Patents

Maldi-matrix

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Publication number
EP1549958A2
EP1549958A2 EP03793665A EP03793665A EP1549958A2 EP 1549958 A2 EP1549958 A2 EP 1549958A2 EP 03793665 A EP03793665 A EP 03793665A EP 03793665 A EP03793665 A EP 03793665A EP 1549958 A2 EP1549958 A2 EP 1549958A2
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
acid
amine
matrix
matrices
group
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP03793665A
Other languages
German (de)
French (fr)
Inventor
Bernd Stahl
Günther Boehm
Marko Mank
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Nutricia NV
Original Assignee
Nutricia NV
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Filing date
Publication date
Application filed by Nutricia NV filed Critical Nutricia NV
Publication of EP1549958A2 publication Critical patent/EP1549958A2/en
Withdrawn legal-status Critical Current

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    • HELECTRICITY
    • H01ELECTRIC ELEMENTS
    • H01JELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
    • H01J49/00Particle spectrometers or separator tubes
    • H01J49/02Details
    • H01J49/10Ion sources; Ion guns
    • H01J49/16Ion sources; Ion guns using surface ionisation, e.g. field-, thermionic- or photo-emission
    • H01J49/161Ion sources; Ion guns using surface ionisation, e.g. field-, thermionic- or photo-emission using photoionisation, e.g. by laser
    • H01J49/164Laser desorption/ionisation, e.g. matrix-assisted laser desorption/ionisation [MALDI]
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • GPHYSICS
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    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • G01N33/6851Methods of protein analysis involving laser desorption ionisation mass spectrometry
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10TTECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
    • Y10T436/00Chemistry: analytical and immunological testing
    • Y10T436/10Composition for standardization, calibration, simulation, stabilization, preparation or preservation; processes of use in preparation for chemical testing

Definitions

  • the invention relates to matrices for ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry comprising a salt of an amine reacting as a proton acceptor and an organic substance reacting as a proton donor, either the amine or the organic substance absorbing UV light, and the use of such matrices ,
  • UV-MALDI-MS The analysis principle of UV-MALDI-MS is based on matrix-assisted laser desorption and ionization of molecules, including biomolecules from a cocrystallization from an analyte and a UV light-absorbing matrix substance. Such UV light-absorbing substances are also simply called MALDI matrix.
  • Typical MALDI matrices are, for example, 2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB), ⁇ -cyano-4-hydroxycinnamic acid (CHCA) and trans-3,5-dimethoxy-4-hydroxycinnamic acid (sinapic acid).
  • DVB 2,5-dihydroxybenzoic acid
  • CHCA ⁇ -cyano-4-hydroxycinnamic acid
  • sinapic acid trans-3,5-dimethoxy-4-hydroxycinnamic acid
  • the UV-MALDI-MS is mainly used for mass spectrometric analysis of molecules or biomolecules, e.g. carbohydrates, proteins, peptides, Nucleotides and lipids including their corresponding conjugates such as glycoproteins, lipoproteins etc. It is also possible to directly characterize whole cells and microorganisms using MALDI-MS analysis.
  • MALDI-MS analysis for example, to Alomirah HF, Alli I, Konishi Y..Applications of mass spectrometry to food proteins and peptides, J. Chromatogr. A. 2000 Sep 29; 893 (1): 1-21. Review; Kussmann M, Roepstorff P.
  • enzymes on the MALDI targets or the MALDI sample carriers in order to carry out modifications to the molecules to be examined and to demonstrate them by mass spectrometry.
  • a solution of enzyme, analyte / substrate and a neutral conventional MALDI matrix such as ATT is applied directly to the MALDI target.
  • the enzymatic reaction taking place is then stopped by drying and cocrystallization of the batch.
  • the analysis of the reaction products using MALDI can then be carried out as usual after the actual enzymatic reaction.
  • an acidic matrix such as DHB can also be added to the reaction mixture at the end of an enzymatic reaction.
  • Ionic liquids from an amine salt of an organic acid have also been proposed as matrices for MALDI-MS, see D. W. Armstrong et al, Anal. Chem. 2001, 73, 3679-3686 ,. These are amine salts of various cinnamic acid derivatives or from aminoquinoline and CHCA (Kolli VSK, Orlando R, Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10: 923-926).
  • the object of the present invention is to provide improved matrices for UV-MALDI-MS with which more error-free and reproducible analysis values can be obtained, in particular the combination of the pure mass spectrometric analysis with the additional knowledge from enzymatic reactions / modifications with the possibility of monitoring should be given.
  • This object is achieved by the matrices according to the teaching of claims 1 to 4 and by the use of these matrices in the form of an ionic liquid according to the teaching of the use claims.
  • the invention relates to new matrices, namely those which are ionic liquids and are therefore liquid at room temperature.
  • These matrices are composed of a salt of an amine reacting as a proton acceptor and an organic substance reacting as a proton donor, either the amine or the organic substance absorbing UV light.
  • the C 1 -C 8 -alkyl radicals mentioned can thus have 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 8 C atoms, the C 1 -C 3 -alkyl radicals in the primary amines 1, 2, 3, 4, 5 , 6, 7, 8, 9, 10 or 1 1 carbon atoms.
  • the amines used according to the invention thus include the following:
  • the iso radicals listed above include all possible isomers.
  • the organic substance is 2,5-dihydroxybenzoic acid and the isomers (especially 2,6-dihydroxybenzoic acid) thereof, 2-hydroxy-5-methoxy-benzoic acid and the isomers thereof, picolinic acid, 3-hydroxypicolinic acid, nicotinic acid , 5-chloro-2-mercaptobenzothiazole, 6-aza-2-thiothymine,
  • the new matrices preferably include
  • the new matrices are obtainable by reacting a proton accepting amine described above with an organic reacting proton donor in a molar ratio of 0.5: 1 to 1: 0.5 and preferably in a molar ratio by for example, these two reactants are brought into contact with one another. If only one of the reactants is liquid, then the solid reactant can be added to the liquid reactant and vice versa. In the case of two liquid reactants, these can be combined. However, the two reactants are preferably brought into contact with one another in a solvent which is removed after the reaction, preferably by stripping off the solvent, in particular in vacuo. If liquid reaction products are obtained in this reaction or after removal of the solvent at room temperature, then they are ionic liquids or matrices according to the invention.
  • the invention further relates to the use of the new matrices and known matrices in the form of ionic liquids from one Salt from an amine reacting as a proton acceptor and from cinnamic acid. or a cinnamic acid derivative, the amine being one on whose N atom one, two or three methyl, ethyl, n-propyl, iso-propyl, n-butyl, iso-butyl radical (E), which may be substituted by an OH group and / or a phenyl radical is / are pyridine or 3-aminoquinoline, as a medium for carrying out reactions with (bio) polymers and for Monitoring of these reactions and for analysis of the resulting reaction products by means of the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry.
  • E iso-butyl radical
  • the new matrices and the known matrices are referred to as matrices according to the invention in the context of the present documents.
  • Another advantage of using ionic liquids as a matrix is that the matrix / analyte mixture does not have to be dry. This leads to a time saving in the preparation of the preparation.
  • the matrices according to the invention can be used without problems in already existing UV-MALDI mass spectrometers which are equipped, for example, with N 2 lasers.
  • enzymatic cleavages of peptides / proteins by means of proteases eg trypsin, chymotrypsin, pepsin, aminopeptidase, carboxypeptidase
  • proteases eg trypsin, chymotrypsin, pepsin, aminopeptidase, carboxypeptidase
  • glycoconjugates eg: fucosidases, sialidases, galactosidases, hexosaminidases, and pectinases
  • lipids triglycerides, phospholipids, glycolipids
  • nucleic acids DNA, RNA
  • synthesis reactions in the MALDI matrix can also be monitored using transferases such as transglycosidases.
  • Analytes with a high concentration can be directly prepared and measured undiluted.
  • simultaneous detection of different analytes with little variance depending on the desorption site is possible. This also applies to analytes of different substance classes with possibly different physico-chemical properties.
  • pH of the matrices according to the invention is closer to the physiological values of non-covalent complexes and acid-labile molecules, such analytes can also be measured.
  • ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry can also be carried out using electrophoresis techniques (such as FFE, PAGE or CE techniques), if necessary using sample application robots, or using (micro) preparation
  • the matrices according to the invention can be produced by adding an amine reacting as a proton acceptor in an equimolar amount to an organic substance reacting as a proton donor, with either the amine or the organic substance absorbing UV light.
  • the reaction is carried out at room temperature.
  • An ionic liquid or a liquid salt is obtained which is generally highly vacuum stable and can be used as a UV-MALDI matrix.
  • the solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes).
  • the final volume of the DHB-Bu obtained was approximately 200 ⁇ l.
  • MSA 5-methoxysalicylic acid
  • Bu butylamine
  • Working up was carried out in accordance with Example 1. Approx. 200 ⁇ l of MSA-butylamine (MSA-Bu) were obtained.
  • the solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no volume reduction (about 30 minutes).
  • the final volume of the ATT-Bu obtained was approximately 200 ⁇ l.
  • THAP 2 ', 4', 6'-trihydroxyacetophenone monohydra
  • the ionic matrices obtained can each be diluted with a solvent, for example pure ethanol in a ratio of 1: 1 V / V, and are then readily pipettable
  • a matrix analyte preparation can be prepared according to the following general procedure:
  • liquid ionic matrix A undiluted or 1: 1 (v / v) in EtOH or solvent B
  • analyte C in a suitable solvent D on a MALDl sample plate (stainless steel target).
  • the preparation can be carried out as under 1., but after prior desalting of the analyte by incubation in a 1: 1 (v / v)
  • the MALDI sample plate with the premixed sample is transferred directly to the MALDI high vacuum. Then the MALDI MS analysis is carried out.
  • ionic liquids described here and in particular the following can be used as matrix A: butylamine-CHCA, butylamine-DHB, butylamine-MA, butylamine-DHBS and triethylamine-sinapic acid.
  • solvent B acetone, acetonitrile, methanol (MetOH), ethanol (EtOH), butanol, isopropanol, chloroform and H 2 O.
  • the analyte C can be of the following substance classes:
  • carbohydrates e.g. mono-, di-, tri-, oligo- and polysaccharides, homopolymeric and heteropolymeric composition
  • Atoms that are not volatile in a high vacuum e.g. alkali, alkaline earth metals (such as Na, K, Ca, Mg), metals (such as Fe, Zn, Sn, Cu, Cr, etc.).
  • the solution can e.g. acidified with 0.1-5% TFA, acetic acid or formic acid.
  • the solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes).
  • the final volume of the 2,6-DHB-Bu obtained was about 200 ⁇ l.
  • the solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes).
  • the final volume of the DHB-HMIM obtained was approximately 200 ⁇ l.
  • the solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes).
  • the final volume of the 3-aminoquinoline triflate obtained was approximately 200 ⁇ l.
  • the 3-aminoquinoline and thus the amine or the proton acceptor is the compound which is able to absorb UV light, while in the other examples the amine is not able to do this, but rather as a proton donor functioning organic substance that absorbs UV light.
  • reaction of (bio) polymers and in particular enzymatic reactions can be carried out.
  • the matrix also serves as a medium or as a “reaction container”. The course of the reaction can then be followed directly and continuously by mass spectroscopy.
  • the preparation can be carried out as follows (general procedure):
  • Example 7 Those listed in Example 7 can be used as matrix A.
  • enzyme B hydrolases, isomerases, lyases, transferases, oxidoreductases and ligases.
  • solvent / buffer C H 2 0, carbonate buffer, ammonium acetate buffer, Tris buffer or another suitable and MS compatible buffer system or solvent.
  • the enzyme / substrate ratio in the finished matrix-enzyme substrate solution is 1: 1 to 1: 300 (w / w) or more.
  • the MALDI-MS spectra are recorded e.g. after 0, 5, 10, 20, 30, 60 and 120 minutes. If necessary, the MS analysis can also be extended to a few days after the mixture has been prepared
  • the matrices described above can be used in combined LC-MALDI-MS or in electrophoresis-MALDI-MS methods (PAGE, CE, FFE).
  • a combination with (micro) preparation / separation techniques, in particular ⁇ TAS, GYROS ® and Lab-on-Chip ® is also possible

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Abstract

The invention relates to matrixes for ultraviolet matrix-assisted laser desorption-ionisation mass spectrometry made of the salt of an amine which reacts as a proton acceptor and an organic substance which reacts as a proton donator. Either the amine or the organic substance absorbs UV light. Said matrixes are characterised in that they represent an ionic liquid at room temperature and in that the amine is selected from the group which is made up of 3-aminoquinoline, pyridine, a primary amine whose N-Atom is bound to a phenyl radical or a straight or branched, saturated C1-C11-alkyl radical which can be substituted by an OH-group, a secondary and tertiary amine whose N-Atoms are bound to two or three radicals which can be the same or different and represent a straight or branched, saturated C1-C8-alkyl radical which can be substituted by an OH-group and a phenyl radical, imidazole and the C and/or N-alkylated imidazole derivatives and also characterised in that the organic substance is selected from the group which is made up of 2,5-dihydroxybenzoic acid and the isomers thereof, 2-hydroxy-5-methoxy-benzoic acid and the isomers thereof, picolinic-acid, 3-hydroxypicolinic acid, nicotinic acid, 5-chloro-2-mercapto-benzo-thiazole, 6-aza-2-thiothymine, 2',4',6'-trihydroxyacetophenone-monohydrate, 2',6'-di-hydroxyaceto-phenone, 9H-pyridol[3,4-b]indole, dithranole, trans-3-indolacrylic acid, osazones, ferulic acid, 2,5-dihydroxyacetophenone, 1-nitrocarbazole, 7-amino-4-methylcumarine, 2-(p-hdroxyphenylazo)-benzoic acid, 8-aminopyrene-2,3,4-trissulfonic acid, 2-[2E-3-(4-tert-butylphenyl)-2-methylprop-2-enylidene]malonitril (DCTB), 4-methoxy-3-hydroxycinnamic acid and 3,4-dihydroxycinnamic acid. Said liquid matrixes enable reproducible, error-free analysis values to be obtained. The combination of pure mass spectrometric analysis with additional knowledge of enzymatic reactions/modifications with the possible monitoring is also described.

Description

MALDI-Matrix MALDI matrix
BESCHREIBUNGDESCRIPTION
Die Erfindung betrifft Matrizes für die Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/Ionisations-Massenspektrometrie aus einem Salz eines als Protonenakzeptor reagierenden Amins und einer als Protonendonator reagierenden organischen Substanz, wobei entweder das Amin oder die organische Substanz UV-Licht absorbiert, und die Verwendung derartiger Matrizes.The invention relates to matrices for ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry comprising a salt of an amine reacting as a proton acceptor and an organic substance reacting as a proton donor, either the amine or the organic substance absorbing UV light, and the use of such matrices ,
Die Ultraviolett-Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/lonisations-Massen- spektrometrie wird im allgemeinen abgekürzt als UV-MALDI-MS.Ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry is generally abbreviated as UV-MALDI-MS.
Das Analysenprinzip der UV-MALDI-MS basiert auf einer Matrixunterstützten Laserdesorption und Ionisierung von Molekülen einschließlich Biomolekülen aus einer Kokristallisation aus einem Analyt und einer UV-Licht-absorbierenden Matrixsubstanz. Derartige UV-Licht- absorbierenden Substanzen werden vereinfacht auch MALDI-Matrix genannt.The analysis principle of UV-MALDI-MS is based on matrix-assisted laser desorption and ionization of molecules, including biomolecules from a cocrystallization from an analyte and a UV light-absorbing matrix substance. Such UV light-absorbing substances are also simply called MALDI matrix.
Übliche MALDI-Matrizes sind beispielsweise 2,5-Dihydroxybenzoesäure (DHB), α-Cyano-4-Hydroxyzimtsäure (CHCA) und trans-3,5-Dimethoxy-4- Hydroxyzimtsäure (Sinapinsäure).Typical MALDI matrices are, for example, 2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB), α-cyano-4-hydroxycinnamic acid (CHCA) and trans-3,5-dimethoxy-4-hydroxycinnamic acid (sinapic acid).
Die Kokristallisation von Analyt und Matrix wird beispielsweise erreicht, indem man üblicherweise wässrige Lösungen der genannten UV-Licht- absorbierenden Matrixsubstanzen und des Analyten auf einem Metallprobenträger mischt und trocknet. Die aus der festen Phase der Kokristallisation erzeugten Ionen werden anschließend mit massenspektrometrischen Analysatoren, die beispielsweise auf dem TOF-, Quadrupol-, lonenfallen- oder FTICR-Prinzip oder auf einer Kombination dieser Techniken basieren, nachgewiesen.The cocrystallization of analyte and matrix is achieved, for example, by usually mixing and drying aqueous solutions of the aforementioned UV light-absorbing matrix substances and the analyte on a metal sample carrier. The ions generated from the solid phase of the cocrystallization are then detected using mass spectrometric analyzers, which are based, for example, on the TOF, quadrupole, ion trap or FTICR principle or on a combination of these techniques.
Die UV-MALDI-MS wird vorwiegend eingesetzt zu massenspektrometrischen Analysen von Molekülen bzw. von Biomolekülen, beispielsweise Kohlenhydraten, Proteinen, Peptiden, Nukleotiden und Lipiden einschließlich deren entsprechender Konjugate wie Glycoproteine, Lipoproteine etc. Auch die direkte Charakterisierung ganzer Zellen und Mikroorganismen mittels MALDI-MS-Analyse ist möglich. Diesbezüglich wird beispielsweise verwiesen auf Alomirah HF, Alli I, Konishi Y..Applications of mass spectrometry to food proteins and peptides, J. Chromatogr. A. 2000 Sep 29;893(1 ):1-21. Review; Kussmann M, Roepstorff P. Sample preparation techniques for peptides and proteins analyzed by MALDI-MS, Methods Mol. Biol. 2000;146:405-24; Bonk T., Humney A., MALDI-TOF-MS analysis of Protein and DNA, Neuroscientist, 2001 , 27(5), 465-72.The UV-MALDI-MS is mainly used for mass spectrometric analysis of molecules or biomolecules, e.g. carbohydrates, proteins, peptides, Nucleotides and lipids including their corresponding conjugates such as glycoproteins, lipoproteins etc. It is also possible to directly characterize whole cells and microorganisms using MALDI-MS analysis. In this regard, reference is made, for example, to Alomirah HF, Alli I, Konishi Y..Applications of mass spectrometry to food proteins and peptides, J. Chromatogr. A. 2000 Sep 29; 893 (1): 1-21. Review; Kussmann M, Roepstorff P. Sample preparation techniques for peptides and proteins analyzed by MALDI-MS, Methods Mol. Biol. 2000; 146: 405-24; Bonk T., Humney A., MALDI-TOF-MS analysis of Protein and DNA, Neuroscientist, 2001, 27 (5), 465-72.
Die MALDI-MS verfügt über viele Vorteile. Dazu zähit die hohe Empfindlichkeit der Analyse (Femto - bis Attomolbereich bei Isolaten), eine hohe Toleranz gegenüber Verunreinigungen und verschiedenen Puffersubstanzen, die einfache Probenpräparation („Dried Droplet- Verfahren") und die Einbindung des MALDI-MS-Prinzips in Hochdurchsatzanalysen.The MALDI-MS has many advantages. This includes the high sensitivity of the analysis (femto - to attomol range for isolates), a high tolerance to impurities and various buffer substances, the simple sample preparation ("Dried Droplet method") and the integration of the MALDI-MS principle in high-throughput analyzes.
Desweiteren ist es möglich, Enzyme auf den MALDI-Targets bzw. den MALDI-Probenträgern einzusetzen, um Modifikationen an den zu untersuchenden Molekülen durchzuführen und diese massenspektrometrisch nachzuweisen. Dazu wird eine Lösung aus Enzym, Analyt/Substrat und einer neutralen herkömmlichen MALDI-Matrix wie ATT direkt auf das MALDI-Target appliziert. Die ablaufende enzymatische Reaktion wird anschließend durch Trocknen und Kokristallisation des Ansatzes gestoppt. Die Analyse der Reaktionsprodukte mittels MALDI kann dann nach der eigentlichen enzymatischen Reaktion wie üblich durchgeführt werden Alternativ kann auch eine saure Matrix wie etwa DHB zur Beendigung einer enzymatischen Reaktion nachträglich zum Reaktionsansatz zugegeben werden.Furthermore, it is possible to use enzymes on the MALDI targets or the MALDI sample carriers in order to carry out modifications to the molecules to be examined and to demonstrate them by mass spectrometry. For this purpose, a solution of enzyme, analyte / substrate and a neutral conventional MALDI matrix such as ATT is applied directly to the MALDI target. The enzymatic reaction taking place is then stopped by drying and cocrystallization of the batch. The analysis of the reaction products using MALDI can then be carried out as usual after the actual enzymatic reaction. Alternatively, an acidic matrix such as DHB can also be added to the reaction mixture at the end of an enzymatic reaction.
Ein wesentlicher Nachteil der MALDI-MS-Analyse mit einer festen Matrix oder einer festen Analytpräparation ist allerdings die oft hohe Varianz der Signalintensitäten des Analyten bei der Desorption von unterschiedlichen Stellen der gleichen Präparation bzw. des gleichen Präparates. Diese Varianz beruht einerseits darauf, dass die Analytmoleküle über die Oberfläche der getrockneten Präparation unterschiedlich verteilt sind. Andererseits ist die Ursache dafür in dem unterschiedlichen Einbau verschiedener Substanzklassen in das Kristallgitter der getrockneten Kokristallisation von Analyt/Probe und Matrix zu sehen. Es sind nun bereits verschiedene Präparationsverfahren vorgeschlagen worden, um homogenere Kristallisationen zu erreichen. Dazu zählt beispielsweise die Dünnschichtpräparation (Vorm O., Roepstorf, P., Mann M., Anal, Chem., 64, 1992, 1879-1884), die Präparation auf dünnen Schichten von Matrixkristallen, die als Kristallisationskeime dienen, die Anwendung von Nitrozellulosezusätzen sowie Fucose und das Lösen üblicher MALDI- Matrizes wie DHB oder CHCA in Glycerin (Sze ET, Chan TW, Wang G. Formulation of matrix Solutions for use in matrix-assisted laser desorption/ionization of biomolecules. J. Am. Soc. Mass. Spectrom. 1998 Feb;9(2): 166-74). Diese optimierten Verfahren lösen jedoch immer nur Probleme aus Teilbereichen der MALDl-MS-Analytik.A major disadvantage of MALDI-MS analysis with a fixed matrix or a fixed analyte preparation is, however, the often high variance of the signal intensities of the analyte when desorbing different ones Make the same preparation or the same preparation. This variance is based on the one hand on the fact that the analyte molecules are distributed differently over the surface of the dried preparation. On the other hand, the reason for this can be seen in the different incorporation of different substance classes into the crystal lattice of the dried cocrystallization of analyte / sample and matrix. Various preparation methods have now been proposed in order to achieve more homogeneous crystallizations. These include, for example, thin-film preparation (Vorm O., Roepstorf, P., Mann M., Anal, Chem., 64, 1992, 1879-1884), the preparation on thin layers of matrix crystals, which serve as crystallization nuclei, the use of nitrocellulose additives as well as fucose and the dissolution of conventional MALDI matrices such as DHB or CHCA in glycerol (Sze ET, Chan TW, Wang G. Formulation of matrix Solutions for use in matrix-assisted laser desorption / ionization of biomolecules. J. Am. Soc. Mass. Spectrom. 1998 Feb; 9 (2): 166-74). However, these optimized methods only ever solve problems from sub-areas of MALDI MS analysis.
Es sind auch schon ionische Flüssigkeiten aus einem Aminsalz einer organischen Säure als Matrizes für die MALDI-MS vorgeschlagen worden, man vergleiche D. W. Armstrong et al, Anal. Chem. 2001 , 73, 3679- 3686,. Dabei handelt es sich um Aminsalze verschiedener Zimtsäurederivate bzw. aus Aminochinolin und CHCA (Kolli VSK, Orlando R, Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10:923-926).Ionic liquids from an amine salt of an organic acid have also been proposed as matrices for MALDI-MS, see D. W. Armstrong et al, Anal. Chem. 2001, 73, 3679-3686 ,. These are amine salts of various cinnamic acid derivatives or from aminoquinoline and CHCA (Kolli VSK, Orlando R, Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10: 923-926).
Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es, verbesserte Matrizes für die UV-MALDI-MS bereitzustellen, mit denen fehlerfreiere und reproduzierbarere Analysenwerte erhalten werden können, wobei insbesondere die Verknüpfung der reinen massenspektrometrischen Analyse mit den zusätzlichen Erkenntnissen aus enzymatischen Reaktionen/Modifikationen mit der Möglichkeit eines Monitoring gegeben sein soll. Gelöst wird diese Aufgabe durch die Matrizes gemäß der Lehre der Ansprüche 1 bis 4 sowie durch die Verwendung dieser Matrizes in Form einer ionischen Flüssigkeit nach der Lehre der Verwendungsansprüche.The object of the present invention is to provide improved matrices for UV-MALDI-MS with which more error-free and reproducible analysis values can be obtained, in particular the combination of the pure mass spectrometric analysis with the additional knowledge from enzymatic reactions / modifications with the possibility of monitoring should be given. This object is achieved by the matrices according to the teaching of claims 1 to 4 and by the use of these matrices in the form of an ionic liquid according to the teaching of the use claims.
Gegenstand der Erfindung sind neue Matrizes, und zwar solche, die ionische Flüssigkeiten darstellen und somit bei Raumtemperatur flüssig sind. Diese Matrizes sind aufgebaut aus einem Salz eines als Protonenakzeptor reagierenden Amins und einer als Protonendonator reagierenden organischen Substanz, wobei entweder das Amin oder die organische- Substanz UV-Licht absorbiert. Bei dem Amin handelt es sich um 3-Aminochinolin, um Pyridin, um ein primäres Amin, an dessen N- Atom ein Phenylrest oder ein gerader oder verzweigter, gesättigter Ci-C-n-Alkylrest, der durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann, gebunden ist, um ein tertiäres oder sekundäres Amin, an dessen N-Atom zwei oder drei Reste gebunden sind, die gleich oder verschieden sein können und bei denen es sich um einen geraden oder verzweigten, gesättigten Cι-C8-Alkylrest, der durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann, und einen Phenylrest handelt, um Imidazol und um die C- und/oder N-alkylierten imidazolderivaten.The invention relates to new matrices, namely those which are ionic liquids and are therefore liquid at room temperature. These matrices are composed of a salt of an amine reacting as a proton acceptor and an organic substance reacting as a proton donor, either the amine or the organic substance absorbing UV light. The amine is 3-aminoquinoline, pyridine, a primary amine, to the N atom of which a phenyl radical or a straight or branched, saturated Ci-Cn-alkyl radical, which can be substituted by an OH group, is bonded is a tertiary or secondary amine, to the N atom of which two or three radicals are bonded, which may be the same or different and which are a straight or branched, saturated C 1 -C 8 -alkyl radical which is formed by an OH Group may be substituted, and a phenyl radical is imidazole and the C- and / or N-alkylated imidazole derivatives.
Die genannten Cι-C8-Alkylreste können somit 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7 oder 8 C- Atome besitzen, wobei die C-i-Cn-Alkytreste bei den primären Aminen 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 oder 1 1 C-Atome besitzen können.The C 1 -C 8 -alkyl radicals mentioned can thus have 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 8 C atoms, the C 1 -C 3 -alkyl radicals in the primary amines 1, 2, 3, 4, 5 , 6, 7, 8, 9, 10 or 1 1 carbon atoms.
Zu den erfindungsgemäß eingesetzten Aminen zählen somit folgende:The amines used according to the invention thus include the following:
• ein primäres Amin, an dessen N-Atom ein Methyl-, Ethyl-, n-Propyl-, iso-Propyl-, n-Butyl-, iso-Butyl-, n-Pentyl-, iso-Pentyl-, n-Hexyl-, iso-Hexyl-, n-Heptyl-, iso-Heptyl-, n-Octyl-, iso-Octyl-, n-Nonyl-, iso-Nonyl-, n-Decyl, iso-Decyl-, n-Undedcyl- oder iso-Undecyl-Rest, der durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann, oder ein Phenylrest gebunden ist.• a primary amine, on the N atom of which is methyl, ethyl, n-propyl, iso-propyl, n-butyl, iso-butyl, n-pentyl, iso-pentyl, n-hexyl -, iso-hexyl, n-heptyl, iso-heptyl, n-octyl, iso-octyl, n-nonyl, iso-nonyl, n-decyl, iso-decyl, n-undedcyl or iso-undecyl radical, which may be substituted by an OH group, or a phenyl radical is bonded.
• ein sekundäres oder tertiäres Amin, an dessen N-Atom zwei oder drei Reste gebunden sind, die gleich oder verschieden sein können und die ausgewählt sind aus der Gruppe bestehend aus Methyl-, Ethyl-, n-Propyl-, iso-Propyl-, n-Butyl-, iso-Butyl-, n-Pentyl-, iso-Pentyl-, n-Hexyl-, iso-Hexyl-, n-Heptyl-, iso-Heptyl-, n-Octyl- und iso-Octyl-Resten, die durch eine OH-Gruppe substituiert sein können, und einem Phenylrest.A secondary or tertiary amine, to the N atom of which two or three radicals are bonded, which may be the same or different, and which are selected from the group consisting of methyl, ethyl, n-propyl, iso-propyl, n-butyl, iso-butyl, n-pentyl, iso-pentyl, n-hexyl, iso -Hexyl, n-heptyl, iso-heptyl, n-octyl and iso-octyl residues, which can be substituted by an OH group, and a phenyl residue.
• 3-Amino-chinolin, Pyridin, Imidazol und die C- und/oder N-alkylierten Imidazolderivate, wobei die Alkylreste gleich oder verschieden sein können und insbesondere 1 , 2, 3, 4, 5 oder 6 C-Atom besitzen.• 3-amino-quinoline, pyridine, imidazole and the C- and / or N-alkylated imidazole derivatives, where the alkyl radicals can be the same or different and in particular have 1, 2, 3, 4, 5 or 6 carbon atoms.
Die oben aufgeführten iso-Reste umfassen alle möglichen Isomere.The iso radicals listed above include all possible isomers.
** I Bei der organischen Substanz handelt es sich um 2,5-Dihydroxybenzoesäure sowie den Isomeren (insbesondere 2,6-Dihydroxybenzesäure) davon, 2-Hydroxy-5-methoxy-benzoesäure sowie den Isomeren davon, Picolinsäure, 3-Hydroxypicolinsäure, Nikotinsäure, 5-Chloro-2-mercaptobenzothiazol, 6-Aza-2-thiothymin,** I The organic substance is 2,5-dihydroxybenzoic acid and the isomers (especially 2,6-dihydroxybenzoic acid) thereof, 2-hydroxy-5-methoxy-benzoic acid and the isomers thereof, picolinic acid, 3-hydroxypicolinic acid, nicotinic acid , 5-chloro-2-mercaptobenzothiazole, 6-aza-2-thiothymine,
15 Trifluormethansolfonat, 2I,4',6'-Trihydroxyacetophenon-Monohydrat, 2', 6'- Dihydroxyacetophenon, 9H-Pyridol[3,4-b]indol, Dithranol, trans-3- Indolacrylsäure, Osazone, Ferulasäure, 2,5-Dihydroxyacetophenon, 1 -Nitrocarbazol, 7-Amino-4-methylcumarin, 2-(p-Hdroxyphenylazo)- benzoesäure, 8-Aminopyrene-2,3,4-trissulfonsäure, 2-[2E-3-(4-tert-15 trifluoromethanesol fonate, 2 I , 4 ', 6'-trihydroxyacetophenone monohydrate, 2', 6'-dihydroxyacetophenone, 9H-pyridol [3,4-b] indole, dithranol, trans-3-indolacrylic acid, Osazone, ferulic acid, 2, 5-dihydroxyacetophenone, 1 -nitrocarbazole, 7-amino-4-methylcoumarin, 2- (p-hydroxyphenylazo) benzoic acid, 8-aminopyrene-2,3,4-trissulfonic acid, 2- [2E-3- (4-tert-
20 butylphenyl)-2-methylprop-2-enylidene]malonitril (DCTB), 4-Methoxy- 3-hydroxyzimtsäure und 3,4-Dihydroxyzimtsäure. Neben den bei den einzelnen organischen Substanzen aufgeführten Isomeren können auch Isomere und insbesondere Stellungsisomere der anderen organischen Substanzen eingesetzt werden, sofern sie in der Lage sind, mit einem20 butylphenyl) -2-methylprop-2-enylidenes] malonitrile (DCTB), 4-methoxy-3-hydroxycinnamic acid and 3,4-dihydroxycinnamic acid. In addition to the isomers listed for the individual organic substances, isomers and, in particular, positional isomers of the other organic substances can also be used, provided that they are able to use a
25 Amin eine ionische Flüssigkeit zu bilden, worauf nachstehend noch näher eingegangen wird. Es werden somit solche Matπzes beansprucht, die bei Raumtemperatur als ionische Flüssigkeit vorliegen. Diese ionische Flüssigkeit wird aufgrund einer Säure Base Reaktion erzeugt aus einem genannten Amin mit der Funktion eines Protonenakzeptors und einer25 amine to form an ionic liquid, which will be discussed in more detail below. Thus, those materials are claimed that are present as an ionic liquid at room temperature. This ionic liquid is generated due to an acid-base reaction from an amine with the function of a proton acceptor and a
30 genannten organischen Substanz mit der Funktion eines Protonendonators. Bei dem Amin handelt es sich vorzugsweise um Anilin, Ethanolamin, Ethylamin. n-Butylamin, N,N-Diethylamin, N,N-Diethylanilin, N,N- Diethylmethylamin, N,N-Dimethylamin, Triethylamin, Tri-n-propylamin, Tri-n-butylamin, 3-Aminochinolin und Pyridin.30 mentioned organic substance with the function of a proton donor. The amine is preferably aniline, ethanolamine, ethylamine. n-butylamine, N, N-diethylamine, N, N-diethylaniline, N, N-diethylmethylamine, N, N-dimethylamine, triethylamine, tri-n-propylamine, tri-n-butylamine, 3-aminoquinoline and pyridine.
Zu den neuen Matrizes gehören vorzugsweiseThe new matrices preferably include
2,5-Dihydroxybenzoesäure-Butylamin und 2-Hydroxy-5-methoxy-j benzoesäure-Butylamin.2,5-dihydroxybenzoic acid-butylamine and 2-hydroxy-5-methoxy-benzoic acid j-butylamine.
Die neuen Matrizes sind dadurch erhältlich, dass ein als Protonenakzeptor reagierendes, oben beschriebenes Amin mit einer als Protonendonator reagierenden organischen, oben beschriebenen Substanz in einem Molverhältnis von 0,5 : 1 bis 1 : 0,5 und vorzugsweise im molaren Verhältnis umgesetzt wird, indem beispielsweise diese beiden Reaktanden miteinander in Kontakt gebracht werden. Ist nur einer der Reaktanden flüssig, dann kann der feste Reaktand zu dem flüssigen Reaktanden hinzugegeben werden und vice versa. Im Falle von zwei flüssigen Reaktanden können diese zusammengegeben werden. Vorzugsweise werden die beiden Reaktanden jedoch in einem Lösungsmittel miteinander in Kontakt gebracht, das nach der Umsetzung entfernt wird, vorzugsweise durch Abziehen des Lösungsmittels, insbesondere im Vakuum. Werden bei dieser Umsetzung bzw. nach dem Entfernen des Lösungsmittels bei Raumtemperatur flüssige Reaktionsprodukte erhalten, dann handelt es sich um erfindungsgemäße ionische Flüssigkeiten bzw. Matπzes.The new matrices are obtainable by reacting a proton accepting amine described above with an organic reacting proton donor in a molar ratio of 0.5: 1 to 1: 0.5 and preferably in a molar ratio by for example, these two reactants are brought into contact with one another. If only one of the reactants is liquid, then the solid reactant can be added to the liquid reactant and vice versa. In the case of two liquid reactants, these can be combined. However, the two reactants are preferably brought into contact with one another in a solvent which is removed after the reaction, preferably by stripping off the solvent, in particular in vacuo. If liquid reaction products are obtained in this reaction or after removal of the solvent at room temperature, then they are ionic liquids or matrices according to the invention.
Es ist somit ohne weiteres durch einen einfachen Versuch feststellbar, ob aus einem hier beschriebenen, als Protonenakzeptor dienenden Amin und einer hier beschriebenen organischen, als Protonendonator dienenden Substanz bei Raumtemperatur eine ionische Flüssigkeit herstellbar ist. Ist dies der Fall, handelt es sich um eine erfindungsgemäße Matrix.It is thus readily ascertainable by a simple experiment whether an ionic liquid can be prepared from an amine described here as a proton acceptor and an organic substance described here as a proton donor at room temperature. If this is the case, it is a matrix according to the invention.
Gegenstand der Erfindung ist ferner die Verwendung der neuen Matrizes sowie bekannter Matrizes in Form von ionischen Flüssigkeiten aus einem Salz aus einem als Protonenakzeptor reagierenden Amin und von Zimtsäure . oder einem Zimtsäurederivat, wobei es sich bei dem Amin um eine solches, an dessen N-Atom ein, zwei oder drei Methyl-, Ethyl-, n-Propyl-, iso-Propyl-, n-Butyl-, iso-Butyl- Rest(e), der/die durch eine OH- Gruppe substituiert sein kann/können, und/oder ein Phenylrest gebunden ist/sind, um Pyridin oder um 3-Aminochinolin handelt, als Medium zur Durchführung von Reaktionen mit (Bio)Polymeren und zur Überwachung dieser Reaktionen sowie zur Analyse der dabei entstehenden Reaktionsprodukte mittels der Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/lonisations-Massenspektrometrie.The invention further relates to the use of the new matrices and known matrices in the form of ionic liquids from one Salt from an amine reacting as a proton acceptor and from cinnamic acid. or a cinnamic acid derivative, the amine being one on whose N atom one, two or three methyl, ethyl, n-propyl, iso-propyl, n-butyl, iso-butyl radical (E), which may be substituted by an OH group and / or a phenyl radical is / are pyridine or 3-aminoquinoline, as a medium for carrying out reactions with (bio) polymers and for Monitoring of these reactions and for analysis of the resulting reaction products by means of the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry.
Diese bekannten flüssigen Matrizes sind beschrieben an dem bereits oben genannten Ort, nämlich von D. W. Armstrong et al in Anal. Chem. 2001 , 73, 3679-3686.These known liquid matrices are described at the location already mentioned, namely by D. W. Armstrong et al in Anal. Chem. 2001, 73, 3679-3686.
Die neuen Matrizes und die bekannten Matπzes werden im Rahmen der vorliegenden Unterlagen als erfindungsgemäße Matrizes bezeichnet.The new matrices and the known matrices are referred to as matrices according to the invention in the context of the present documents.
Da die erfindungsgemäße Matrix flüssig ist, liegt eine homogene Verteilung des Analyten in dieser Matrix vor. Daher treten die oben geschilderten Probleme mit den festen Matrizes nicht auf. So findet beispielsweise keine Segregation verschiedener Analytkomponenten an verschiedenen Punkten der Präparation statt. Daher kann eine UV- MALDI-MS mit einer flüssigen Matrix auch für Zwecke einer quantitativen Analyse eingesetzt werden, die bisher nur in wenigen Ausnahmefällen möglich war, beispielsweise durch den Einsatz isotopenmarkierter interner Standards.Since the matrix according to the invention is liquid, there is a homogeneous distribution of the analyte in this matrix. Therefore, the problems with the fixed matrices described above do not occur. For example, there is no segregation of different analyte components at different points in the preparation. Therefore, a UV-MALDI-MS with a liquid matrix can also be used for the purposes of a quantitative analysis that was previously only possible in a few exceptional cases, for example through the use of isotope-marked internal standards.
Ein weiterer Vorteil des Einsatzes von ionischen Flüssigkeiten als Matrix besteht darin, dass das Matrix/Analytgemisch nicht trocken sein muss. Dies führt zu einer Zeitersparnis bei der Herstellung der Präparation.Another advantage of using ionic liquids as a matrix is that the matrix / analyte mixture does not have to be dry. This leads to a time saving in the preparation of the preparation.
Allerdings ist es auch möglich, die erfindungsgemäßen Matrizes bzw. die erfindungsgemäßen ionischen Flüssigkeiten zusammen mit einem Lösungsmittel wie beispielsweise Ethanol, Isopropanol sowie langkettigeren Alkoholen und Acetonitril, Dimethylformamid, Dimethylsulfoxid und Tetra hydrofu ran zum Einsatz zu bringen, um die Viskosität der ionischen Matrix zu verringern und besser handhabbar, beispielsweise pipettierbar zu machen. Weiterhin kann durch den Einsatz der genannten Lösungsmittel die Solubilisierung der Analyten in der Matrix verbessert werden.However, it is also possible to use the matrices according to the invention or the ionic liquids according to the invention together with a solvent such as ethanol, isopropanol and long-chain alcohols and acetonitrile, dimethylformamide, dimethyl sulfoxide and tetrahydrofuran can be used in order to reduce the viscosity of the ionic matrix and make it easier to handle, for example by pipetting. Furthermore, the solubilization of the analytes in the matrix can be improved by using the solvents mentioned.
Die erfindungsgemäßen Matrizes können problemlos in bereits existierenden UV-MALDI-Massenspektrometern eingesetzt werden, die beispielsweise mit N2-Lasem ausgerüstet sind.The matrices according to the invention can be used without problems in already existing UV-MALDI mass spectrometers which are equipped, for example, with N 2 lasers.
Mit einer flüssigen Matrix ist zudem die Analyse eines breiten Spektrums von Molekülen möglich. Dazu zählen technische Polymere und Biopolymere wie Kohlenhydrate, z. B. Oligosaccharide, Proteine, Peptide, Lipide, Nukleinsäuren, Sekundärmetabolite, Pharmaka und deren Konjugate, beipielsweise Glyko- sowie Lipokonjugate und auch sekundäre Pflanzenmetabolite (z.B. Flavonoide inklusive Procyanidine etc.).With a liquid matrix, it is also possible to analyze a wide range of molecules. These include technical polymers and biopolymers such as carbohydrates, e.g. B. oligosaccharides, proteins, peptides, lipids, nucleic acids, secondary metabolites, pharmaceuticals and their conjugates, for example glyco- and lipoconjugates and also secondary plant metabolites (e.g. flavonoids including procyanidins etc.).
Mit den erfindungsgemäßen Matrizes ist es zudem möglich, Reaktionsabläufe und Reaktionsverläufe einschließlich Kinetiken zu untersuchen, ohne die Reaktion zu einem willkürlichen Zeitpunkt stoppen zu müssen. Dies gilt vorzugsweise für Reaktionen, die durch Enzyme, insbesondere Glycosidasen, Proteasen, Nukleasen, Lipasen oder Lyasen, katalysiert werden. So können insbesondere enzymatische Spaltungen von Peptiden/Proteinen mittels Proteasen (z.B. Trypsin, Chymotrypsin, Pepsin, Aminopeptidase, Carboxypeptidase) sowie Spaltungen von Kohlenhydraten und Glycoconjugaten mittels Glycosidasen (z.B.: Fucosidasen, Sialidasen, Galactosidasen, Hexosaminidasen, Pectinasen, Lyasen) und darüber hinaus Spaltungen von Lipiden (Triglyceriden, Phospholipide, Glycolipide) und Nukleinsäuren (DNA, RNA) untersucht werden. Ferner können auch Synthesereaktionen in der MALDI-Matrix mittels Transferasen wie etwa Transglycosidasen verfolgt werden. Analyte mit hoher Konzentration können unverdünnt direkt präpariert und vermessen werden. Zudem ist eine simultane Detektion von unterschiedlichen Analyten mit geringer vom Desorptionsort abhängiger Varianz möglich. Dies gilt auch für Analyte unterschiedlicher Substanzklassen mit unter Umständen unterschiedlichen physiko- chemischen Eigenschaften.With the matrices according to the invention, it is also possible to examine reaction sequences and reaction curves, including kinetics, without having to stop the reaction at an arbitrary point in time. This preferably applies to reactions which are catalyzed by enzymes, in particular glycosidases, proteases, nucleases, lipases or lyases. In particular, enzymatic cleavages of peptides / proteins by means of proteases (eg trypsin, chymotrypsin, pepsin, aminopeptidase, carboxypeptidase) as well as cleavages of carbohydrates and glycoconjugates by means of glycosidases (eg: fucosidases, sialidases, galactosidases, hexosaminidases, and pectinases) of lipids (triglycerides, phospholipids, glycolipids) and nucleic acids (DNA, RNA) are examined. Furthermore, synthesis reactions in the MALDI matrix can also be monitored using transferases such as transglycosidases. Analytes with a high concentration can be directly prepared and measured undiluted. In addition, simultaneous detection of different analytes with little variance depending on the desorption site is possible. This also applies to analytes of different substance classes with possibly different physico-chemical properties.
Der Einsatz einer flüssigen Matrix ermöglicht auch die Analyse labiler Analyte. Es wird dabei davon ausgegangen, ohne an diese Erklärung gebunden zu sein, dass die Desorption von einer flüssigen Matrix schonender verläuft, da der Analyt nicht aus dem Kristallgitter sondern aus einer Flüssigkeit in die Gasphase übergeht.The use of a liquid matrix also enables the analysis of labile analytes. It is assumed, without being bound to this explanation, that the desorption from a liquid matrix proceeds more gently, since the analyte does not pass from the crystal lattice but from a liquid into the gas phase.
Bedingt dadurch, dass der pH-Wert der erfindungsgemäßen Matrizes näher an physiologischen Werten von nicht-kovalenten Komplexen und säurelabilen Molekülen liegt, können auch derartige Analyten vermessen werden.Due to the fact that the pH of the matrices according to the invention is closer to the physiological values of non-covalent complexes and acid-labile molecules, such analytes can also be measured.
Darüberhinaus ermöglichen die flüssigen Matrices auch eine Kopplung von analytischen und präparativen chromatographischen Methoden wie der HPLC, GPC, HPAEC mit der MALDI-MS. So können etwa im Atmospheric Pressure MALDI-Modus die Matrix und das Säuleneluat in bzw. vor der Quelle gemischt werden. Bei offline MALDI-Analyse können geeignete Probenapplikationsroboter Säuleneluate parallel mit flüssiger Matrix auf Targets applizieren, um so kontinuierlich, unter „Abbildung" einer hohen chromatographischen Trennung, eine verbesserte Analyse zu gewährleisten.In addition, the liquid matrices also enable the coupling of analytical and preparative chromatographic methods such as HPLC, GPC, HPAEC with the MALDI-MS. In the Atmospheric Pressure MALDI mode, for example, the matrix and the column eluate can be mixed in or before the source. With offline MALDI analysis, suitable sample application robots can apply column eluates in parallel with a liquid matrix to targets, in order to guarantee an improved analysis continuously under "mapping" of a high chromatographic separation.
Die Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/lonisations- Massenspektrometrie kann neben LC auch mit Elektrophoresetechniken (wie FFE-, PAGE- oder CE-Techniken ), ggf. unter Einsatz von Probenapplikationsrobotern, oder mit (mikro)Präparations-In addition to LC, ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry can also be carried out using electrophoresis techniques (such as FFE, PAGE or CE techniques), if necessary using sample application robots, or using (micro) preparation
/Separationstechniken, insbesondere μTAS, GYROS® und Lab-on-Chip® kombiniert/gekoppelt werden. Gegenstand der Erfindung ist zudem ein Verfahren gemäß der Lehre der Verfahrensansprüche./ Separation techniques, in particular μTAS, GYROS ® and Lab-on-Chip ® can be combined / coupled. The invention also relates to a method according to the teaching of the method claims.
Die Erfindung wird im folgenden anhand bevorzugte Ausführungsformen erläuternder Beispiele näher beschrieben. Prinzipiell sind die erfindungsgemäßen Matrizes dadurch herstellbar, das ein als Protonenakzeptor reagierendes Amin in äquimolarer Menge zu einer als Protonendonator reagierenden organischen Substanz, wobei entweder das Amin oder die organische Substanz UV-Licht absorbiert, hinzugegeben wird. Die Umsetzung wird bei Raumtemperatur durchgeführt. Es wird eine ionische Flüssigkeit bzw. ein flüssiges Salz erhalten, das im allgemeinen hochvakuumstabil ist und als UV-MALDI- Matrix eingesetzt werden kann.The invention is described in more detail below on the basis of preferred exemplary embodiments. In principle, the matrices according to the invention can be produced by adding an amine reacting as a proton acceptor in an equimolar amount to an organic substance reacting as a proton donor, with either the amine or the organic substance absorbing UV light. The reaction is carried out at room temperature. An ionic liquid or a liquid salt is obtained which is generally highly vacuum stable and can be used as a UV-MALDI matrix.
Beispiel 1example 1
Herstellung von 2,5-Dihydroxybenzoesäure-Butylamin (DHB-Bu):Production of 2,5-dihydroxybenzoic acid-butylamine (DHB-Bu):
308,4 mg 2,5-Dihydroxybenzoesäure (DHB) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 198,4 μl Butylamin (Bu) hinzugegeben.308.4 mg of 2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 198.4 ul of butylamine (Bu) was added.
Das Lösungsmittel wurde bei ca. 40 °C sowie ca. 43 mbar abgezogen, bis keine Volumenreduktion mehr erfolgte (ca. 30 min). Das Endvolumen des erhaltenen DHB-Bu betrug etwa 200 μl.The solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes). The final volume of the DHB-Bu obtained was approximately 200 μl.
Beispiel 2Example 2
Herstellung von 5-Methoxysalicylsäure-Butylamin (MSA-Bu):Preparation of 5-methoxysalicylic acid butylamine (MSA-Bu):
336,4 mg 5-Methoxysalicylsäure (MSA; wird auch als 2-Hydroxy-5- methoxybenzoesäure bezeichnet) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dazu wurden 198,4 μl Butylamin (Bu) hinzugegeben. Die Aufarbeitung erfolgte entsprechend Beispiel 1. Es wurden ca. 200 μl MSA-Butylamin (MSA-Bu) erhalten.336.4 mg of 5-methoxysalicylic acid (MSA; also referred to as 2-hydroxy-5-methoxybenzoic acid) was dissolved in 10 ml of ethanol. 198.4 μl of butylamine (Bu) were added. Working up was carried out in accordance with Example 1. Approx. 200 μl of MSA-butylamine (MSA-Bu) were obtained.
Durch Vermischen von Butylamin-DHB mit Butylamin-MSA (10 : 1) (v/v) kann Butylamin-DHBS hergestellt werden. Beispiel 3By mixing butylamine DHB with butylamine MA (10: 1) (v / v) butylamine DHBS can be produced. Example 3
Herstellung α-Cyano-4-hydroxyzimtsäure-Butylamin (CHCA-Bu):Preparation of α-cyano-4-hydroxycinnamic acid butylamine (CHCA-Bu):
378,4 mg α-Cyano-4-hydroxyzimtsäure (CHCA) wurden in 10 ml Methanol gelöst. Dann wurden 198,4 μl Butylamin (Bu) hinzugegeben. Die Aufarbeitung erfolgte entsprechend Beispiel 1. Es wurden 200 μl • α-Cyano-4-hydroxyzimtsäure-ButyIamin (CHCA-Bu) erhalten.378.4 mg of α-cyano-4-hydroxycinnamic acid (CHCA) was dissolved in 10 ml of methanol. Then 198.4 ul of butylamine (Bu) was added. Working up was carried out in accordance with Example 1. 200 μl • α-cyano-4-hydroxycinnamic acid butylamine (CHCA-Bu) were obtained.
Beispiel 4Example 4
Herstellung Sinapinsäure-Triethylamin:Production of sinapic acid triethylamine:
378,4 mg Sinapinsäure (trans-3,5-Dimethoxy-4-hydroxy-zimtsäure) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 278,4 μl Triethylamin hinzugegeben. Die Aufarbeitung erfolgte entsprechend Beispiel 1. Es wurden 200 μl Sinapinsäure-Triethylamin erhalten.378.4 mg of sinapic acid (trans-3,5-dimethoxy-4-hydroxy-cinnamic acid) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 278.4 ul triethylamine were added. Working up was carried out in accordance with Example 1. 200 μl of sinapic acid triethylamine were obtained.
Beispiel 5Example 5
Herstellung von 6-Aza-2-Thiothymin-Butylamin (ATT-Bu):Preparation of 6-aza-2-thiothymine-butylamine (ATT-Bu):
286,4 mg 6-Aza-2-Thiothymin (ATT) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 198,4 μl Butylamin (Bu) hinzugegeben.286.4 mg of 6-aza-2-thiothymine (ATT) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 198.4 ul of butylamine (Bu) was added.
Das Lösungsmittel wurde bei ca. 40 °C sowie ca. 43 mbar abgezogen, bis keine Volumenreduktion mehr erfolgte (ca. 30 min.). Das Endvolumen des erhaltenen ATT-Bu betrug etwa 200 μl.The solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no volume reduction (about 30 minutes). The final volume of the ATT-Bu obtained was approximately 200 μl.
Beispiel 6Example 6
Herstellung von 2',4',6,-Trihydroxyacetophenon-Monohydrat-Butylamin (THAP-Butylamin):Preparation of 2 ', 4', 6 , -Trihydroxyacetophenone Monohydrate-Butylamine (THAP-Butylamine):
372,4 mg 2',4',6'-Trihydroxyacetophenon-Monohydra (THAP) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 198,4 μl Butylamin (Bu) hinzugegeben. Das Lösungsmittel wurde bei ca. 40 °C sowie ca. 43 mbar abgezogen, bis keine Volumenreduktion mehr erfolgte (ca. 30 min.). Das Endvolumen des erhaltenen THAP-Bu betrug etwa 200 μl.372.4 mg of 2 ', 4', 6'-trihydroxyacetophenone monohydra (THAP) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 198.4 ul of butylamine (Bu) was added. The solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no volume reduction (about 30 minutes). The final volume of the THAP-Bu obtained was approximately 200 μl.
Zur Verringerung der Viskosität der erhaltenen ionischen Matrizes können diese jeweils mit einem Lösungsmittel, beispielsweise reinem Ethanol im Verhältnis 1 : 1 V/V verdünnt werden und sind dann gut pipettierbarTo reduce the viscosity of the ionic matrices obtained, they can each be diluted with a solvent, for example pure ethanol in a ratio of 1: 1 V / V, and are then readily pipettable
Beispiel 7Example 7
Die Herstellung einer Matrix-Analytpräparation kann nach folgender allgemeinen Arbeitsweise erfolgen:A matrix analyte preparation can be prepared according to the following general procedure:
1 . 1 μl flüssige ionische Matrix A (unverdünnt oder 1 :1 (v/v) in EtOH oder Lösungsmittel B) werden mit 1 μl Analyt C in einem geeignetem Lösungsmittel D auf einer MALDl-Probenplatte (Stainless Steel Target) vermischt.1 . 1 μl of liquid ionic matrix A (undiluted or 1: 1 (v / v) in EtOH or solvent B) are mixed with 1 μl of analyte C in a suitable solvent D on a MALDl sample plate (stainless steel target).
2. Alternativ kann die Präparation wie unter 1. erfolgen, jedoch nach vorheriger Entsalzung des Analyten durch Inkubation in einer 1 : 1 (v/v)2. Alternatively, the preparation can be carried out as under 1., but after prior desalting of the analyte by incubation in a 1: 1 (v / v)
Verdünnung mit einem . Crown-Ether bzw. mit Ionenaustauschern.Dilution with a. Crown ether or with ion exchangers.
3. Die MALDl-Probenplatte mit der vorgemischten Probe wird direkt in das MALDl-Hochvakuum transferiert. Dann erfolgt die Durchführung der MALDI MS Analyse.3. The MALDI sample plate with the premixed sample is transferred directly to the MALDI high vacuum. Then the MALDI MS analysis is carried out.
Als Matrix A können alle hier beschriebenen ionischen Flüssigkeiten und insbesondere folgende eingesetzt werden: Butylamin-CHCA, Butylamin- DHB, Butylamin-MSA, Butylamin-DHBS und Triethylamin-Sinapinsäure.All ionic liquids described here and in particular the following can be used as matrix A: butylamine-CHCA, butylamine-DHB, butylamine-MA, butylamine-DHBS and triethylamine-sinapic acid.
Als Lösungsmittel B können folgende eingesetzt werden: Aceton, Acetonitril, Methanol (MetOH), Ethanol (EtOH), Butanol, Isopropanol, Chloroform und H2O.The following can be used as solvent B: acetone, acetonitrile, methanol (MetOH), ethanol (EtOH), butanol, isopropanol, chloroform and H 2 O.
Bei dem Analyt C kann es sich um folgende Substanzklassen handeln:The analyte C can be of the following substance classes:
1. Technische Polymeren (z.B. PEG, Polyacrylamide, PE),1.Technical polymers (e.g. PEG, polyacrylamides, PE),
2. Kohlenhydraten (z.B. Mono-, Di-, Tri-, Oligo- und Polysaccharide, homopolymerer und heteropolymerer Zusammensetzung),2. carbohydrates (e.g. mono-, di-, tri-, oligo- and polysaccharides, homopolymeric and heteropolymeric composition),
3. Proteine und Peptide,3. proteins and peptides,
4. Lipide,4. lipids,
5. Konjugate obiger Analyte, 6. Mono-, Di, -Tri-, Oligo- und Polynucleotide,5. conjugates of the above analytes, 6. mono-, di, -tri-, oligo- and polynucleotides,
7. sekundäre Pflanzenmetabolite ( Phenolische Substanzen, Flavonoide etc.),7. secondary plant metabolites (phenolic substances, flavonoids etc.),
8. Atome die im Hochvakuum nicht flüchtig sind (z.B. Alkali-, Erdalkalimetalle (wie Na, K, Ca, Mg), Metalle (wie Fe, Zn, Sn, Cu, Cr, etc.).8. Atoms that are not volatile in a high vacuum (e.g. alkali, alkaline earth metals (such as Na, K, Ca, Mg), metals (such as Fe, Zn, Sn, Cu, Cr, etc.).
Als Lösungsmitte! D können folgende dienen:As a solution! D can serve the following:
Wässrige oder angesäuerte Lösung von 10-80 % MetOH, EtOH, H2O, Aceton, Acetonitril, Isopropanol, Butanol, Chloroform, DMSO, DMF, Glycerin und THF.Aqueous or acidified solution of 10-80% MetOH, EtOH, H 2 O, acetone, acetonitrile, isopropanol, butanol, chloroform, DMSO, DMF, glycerin and THF.
Die Lösung kann z.B. mit 0,1-5% TFA, Essigsäure oder Ameisensäure angesäuert werden.The solution can e.g. acidified with 0.1-5% TFA, acetic acid or formic acid.
Beispiel 8Example 8
Herstellung von 2,6-Dihydroxybenzoesäure-Butylamin (2,6-DHB-Bu):Preparation of 2,6-dihydroxybenzoic acid butylamine (2,6-DHB-Bu):
308,4 mg 2,6-Dihydroxybenzoesäure (DHB) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 198,4 μl Butylamin (Bu) hinzugegeben.308.4 mg of 2,6-dihydroxybenzoic acid (DHB) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 198.4 ul of butylamine (Bu) was added.
Das Lösungsmittel wurde bei ca. 40 °C sowie ca. 43 mbar abgezogen, bis keine Volumenreduktion mehr erfolgte (ca. 30 min). Das Endvolumen des erhaltenen 2,6-DHB-Bu betrug etwa 200 μl.The solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes). The final volume of the 2,6-DHB-Bu obtained was about 200 μl.
Beispiel 9Example 9
Herstellung von 2,5-Dihydroxybenzoesäure-1 -HexyI-3-MethyIimidazol (DHB-HMIM): 308,4 mg 2,5-Dihydroxybenzoesäure (DHB) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 371 ,4 mg 1-Hexyl-3-Methylimidazol (Bu) hinzugegeben.Preparation of 2,5-Dihydroxybenzoic Acid-1-HexyI-3-Methylimidazole (DHB-HMIM): 308.4 mg of 2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 371.4 mg of 1-hexyl-3-methylimidazole (Bu) was added.
Das Lösungsmittel wurde bei ca. 40 °C sowie ca. 43 mbar abgezogen, bis keine Volumenreduktion mehr erfolgte (ca. 30 min). Das Endvolumen des erhaltenen DHB-HMIM betrug etwa 200 μl.The solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes). The final volume of the DHB-HMIM obtained was approximately 200 μl.
Beispiel 10Example 10
Herstellung von 3-Aminochinolin-Triflat (AC-Triflat):Production of 3-aminoquinoline triflate (AC triflate):
288,4 mg 3-Aminochinolin (AC) wurden in 10 ml Ethanol gelöst. Dann wurden 298,2 mg Trifluormethansulfonat hinzugegeben.288.4 mg of 3-aminoquinoline (AC) was dissolved in 10 ml of ethanol. Then 298.2 mg of trifluoromethanesulfonate was added.
Das Lösungsmittel wurde bei ca. 40 °C sowie ca. 43 mbar abgezogen, bis keine Volumenreduktion mehr erfolgte (ca. 30 min). Das Endvolumen des erhaltenen 3-Aminochinolin-Triflat betrug etwa 200 μl.The solvent was drawn off at about 40 ° C. and about 43 mbar until there was no further reduction in volume (about 30 minutes). The final volume of the 3-aminoquinoline triflate obtained was approximately 200 μl.
Bei dieser Matrix stellt das 3-Aminochinolin und somit das Amin bzw. der Protonenakzeptor diejenige Verbindung dar, welche in der Lage ist, UV- Licht zu absorbieren, während bei den anderen Beispielen das Amin dazu nicht in der Lage ist, sondern die als Protonendonator fungierende organische Substanz das UV-Licht absorbiert.In this matrix, the 3-aminoquinoline and thus the amine or the proton acceptor is the compound which is able to absorb UV light, while in the other examples the amine is not able to do this, but rather as a proton donor functioning organic substance that absorbs UV light.
Beispiel 1 1Example 1 1
In den oben beschriebenen Matrizes können Reaktionen von (Bio)Polymeren und insbesondere enzymatische Reaktionen durchgeführt werden. Die Matrix dient dabei zusätzlich als Medium bzw. als „Reaktions-Container". Die Reaktionsverläufe können dann unmittelbar und kontinuierlich massenspektroskopisch verfolgt werden.In the matrices described above, reactions of (bio) polymers and in particular enzymatic reactions can be carried out. The matrix also serves as a medium or as a “reaction container”. The course of the reaction can then be followed directly and continuously by mass spectroscopy.
Für die Herstellung der entsprechenden Präparationen kann man wie folgt vorgehen (allgemeine Arbeitsweise):The preparation can be carried out as follows (general procedure):
0,5μl flüssige ionische Matrix A (unverdünnt oder 1 :1 (v/v) werden in EtOH oder einem anderem geeigneten Lösungsmittel) mit 0,5 μl eines Enzyms B_(ca. 1 μg/μl) in einem geeigneten Lösungsmittel/Puffer C sowie mit 0,5 μl eines Substrats D (ca. 1 μg/μl ) in einem geeigneten Lösungsmittel/Puffer auf einer MALDl-Probenplatte homogen vermischt. Danach erfolgt ein direkter Transfer der MALDl-Probenplatte mit dem vorgemischten enzymatischen Ansatz in der ionischen flüssigen MALDI- Matrix in das MALDI-Hochvakuum.0.5μl liquid ionic matrix A (undiluted or 1: 1 (v / v) in EtOH or another suitable solvent) with 0.5 μl one Enzyme B_ (approx. 1 μg / μl) in a suitable solvent / buffer C and homogeneously mixed with 0.5 μl of a substrate D (approx. 1 μg / μl) in a suitable solvent / buffer on a MALDl sample plate. This is followed by a direct transfer of the MALDI sample plate with the premixed enzymatic batch in the ionic liquid MALDI matrix into the MALDI high vacuum.
Als Matrix A können diejenigen eingesetzt werden, die im Beispiel 7 aufgeführt sind.Those listed in Example 7 can be used as matrix A.
Als Enzym B können folgende Enzymklassen Verwendung finden: Hydrolasen, Isomerasen, Lyasen, Transferasen, Oxidoreduktasen und Ligasen.The following enzyme classes can be used as enzyme B: hydrolases, isomerases, lyases, transferases, oxidoreductases and ligases.
Als Lösungsmittel/Puffer C sind folgende einsetzbar.: H20, Carbonatpuffer, Ammoniumacetatpuffer, Tris-Puffer oder ein anderes geeignetes und MS kompatibles Puffersystem oder Lösungsmittel.The following can be used as solvent / buffer C: H 2 0, carbonate buffer, ammonium acetate buffer, Tris buffer or another suitable and MS compatible buffer system or solvent.
Das Enzym/Substratverhältnis in der fertigen Matrix-Enzym- Substratlösung beträgt dabei 1 :1 bis 1 :300 (w/w) oder mehr.The enzyme / substrate ratio in the finished matrix-enzyme substrate solution is 1: 1 to 1: 300 (w / w) or more.
Anwendunqsbeispiele:Application Examples:
• Desialisierung eines Trisaccharides aus humaner Milch: 0,5μl Sialidase aus Clostridium Perfringens 1 μg/μl (ca. 0, 1 U/μl) in 25mM• Desialization of a trisaccharide from human milk: 0.5 μl sialidase from Clostridium Perfringens 1 μg / μl (approx. 0.1 U / μl) in 25 mM
NH4-Acetatpuffer bei pH 5.0) mit 0,5μl Sialyllactose 1 μg/μl in H2O und mit 0,5μl DHB-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS Hochvakuum transferieren.Mix NH 4 acetate buffer at pH 5.0) with 0.5 μl sialyl lactose 1 μg / μl in H 2 O and with 0.5 μl DHB-Bu (1: 1 in EtOH) on a MALDl sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
• Defucosylierung eines Pentasaccharides aus humaner Milch: 0,5μl - Fucosidase aus Rinderniere 1 μg/μl (ca. 2mU/μl) in 25mM NH -• Defucosylation of a pentasaccharide from human milk: 0.5μl - fucosidase from bovine kidney 1 μg / μl (approx. 2mU / μl) in 25mM NH -
Acetatpuffer bei pH 5.0) mit 0,5μl LNFP 1 μg/μl in H2O und mit 0,5μl DHB-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS Hochvakuum transferieren. • Deglykosilierung eines Glykoproteins: 0,5μl PNGase F aus Flavobactenum Meningosepticum, rekombinant 1 μg/μl (ca. 0,5U/μl) in 20mM Tris-Puffer pH 7.5 mit 0,5μl RNAse B 1 μg/μl in H2O und mit 1 μl CHCA-Bu oder DHB-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS Hochvakuum transferrieren.Mix acetate buffer at pH 5.0) with 0.5μl LNFP 1 μg / μl in H 2 O and with 0.5μl DHB-Bu (1: 1 in EtOH) on a MALDl sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum. Deglycosylation of a glycoprotein: 0.5μl PNGase F from Flavobactenum Meningosepticum, recombinant 1 μg / μl (approx. 0.5U / μl) in 20mM Tris buffer pH 7.5 with 0.5μl RNAse B 1 μg / μl in H 2 O and Mix with 1 μl CHCA-Bu or DHB-Bu (1: 1 in EtOH) on a MALDl sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
• Enzym. Hydrolyse von humanem Casein: 0,5μl Trypsin mit TPCK aus bovinem Pancreas 0,01-1 μg/μl (ca. 0,074 -7,4 U/μl) mit 0,5μl ß- casein 1 μg/μl in Imidazolpuffer 12,5mM pH 7.6 und mit 1 μl CHCA-Bu (1 : 1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI- MS Hochvakuum transferieren.• enzyme. Hydrolysis of human casein: 0.5μl trypsin with TPCK from bovine pancreas 0.01-1 μg / μl (approx. 0.074 -7.4 U / μl) with 0.5μl ß-casein 1 μg / μl in imidazole buffer 12.5mM Mix pH 7.6 and with 1 μl CHCA-Bu (1: 1 in EtOH) on a MALDl sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
• Carboxypeptidasenverdau zur Sequenzanalyse eines Peptides: 0,5μl Carboxypeptidase aus Saccharomyces Cerevisiae (CPY) 0,2μg/μl (ca. 20mU/μl) mit 0,5μl Peptid 0, 1-1 μg/μl in 60mM Diammoniumhydrogencitratpuffer pH 5 und mit 1 μl CHCA-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS• Carboxypeptidase digestion for sequence analysis of a peptide: 0.5μl carboxypeptidase from Saccharomyces Cerevisiae (CPY) 0.2μg / μl (approx. 20mU / μl) with 0.5μl peptide 0, 1-1 μg / μl in 60mM diammonium hydrogen citrate buffer pH 5 and with 1 Mix μl CHCA-Bu (1: 1 in EtOH) on MALDl sample plate and directly into MALDI-MS
Hochvakuum transferieren.Transfer high vacuum.
• Aminopeptidasenverdau zur Sequenzanalyse eines Peptides: 0,5μl Aminopeptidase aus Aeromonas Protolytica 0,2μg/μl (ca. 20mU/μl) mit 0,5μl Peptid 0, 1-1 μg/μl in Tricinpuffer pH 8 +ZnCI2 und mit 1 μl CHCA-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS Hochvakuum transferieren.• Aminopeptidase digestion for sequence analysis of a peptide: 0.5μl aminopeptidase from Aeromonas Protolytica 0.2μg / μl (approx. 20mU / μl) with 0.5μl peptide 0.1-1.1 μg / μl in tricine buffer pH 8 + ZnCI 2 and with 1 μl Mix CHCA-Bu (1: 1 in EtOH) on MALDI sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
• Dephosphorylierung eines Phosphoglykopeptides: 0,5μl saure Phosphatase aus Kartoffeln 0,01-1 μg/μl (ca. 0,02 -2 U/μl) mit 0,5μl ß- casein 1 μg/μl in 25mM NH4-Acetatpuffer bei pH 5 und mit 1 μl CHCA- Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins• Dephosphorylation of a phosphoglycopeptide: 0.5μl acid phosphatase from potatoes 0.01-1 μg / μl (approx. 0.02 -2 U / μl) with 0.5μl ß-casein 1 μg / μl in 25mM NH 4 acetate buffer Mix pH 5 and with 1 μl CHCA-Bu (1: 1 in EtOH) on MALDl sample plate and add directly to
MALDI-MS Hochvakuum transferieren.Transfer MALDI-MS high vacuum.
• Dephosphorylierung eines Phospholipids: 0,5μl Phospholipase A2 aus Honigbienengift 0,01 μg/μl (ca. 10mU/μl) mit Phosphatidylcholin- diheptadecanoyl 1 μg/μl in MetOH/ CHCI3 (2:1 ) und mit 1 μl DHB-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI- MS Hochvakuum transferieren.• Dephosphorylation of a phospholipid: 0.5μl phospholipase A 2 from honeybee venom 0.01 μg / μl (approx. 10mU / μl) with phosphatidylcholine-diheptadecanoyl 1 μg / μl in MetOH / CHCI 3 (2: 1) and with 1 μl DHB- Bu Mix (1: 1 in EtOH) on the MALDI sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
• Deglykosilierung eines Glykolipids/Gangliosids: 0,5μl Ceramidglykanase aus Marobdella Decora 1 μg/μl (ca. 10 mU/μl) in 20mM Tris-Puffer pH 7.0 mit bovinem Gangliosid GM1 1 μg/μl in H2O und mit 1 μl CHCA-Bu oder DHB-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl- Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS Hochvakuum transferieren.Deglycosylation of a glycolipid / ganglioside: 0.5μl ceramide glycanase from Marobdella Decora 1 μg / μl (approx. 10 mU / μl) in 20mM Tris buffer pH 7.0 with bovine ganglioside GM1 1 μg / μl in H 2 O and with 1 μl CHCA -Bu or DHB-Bu (1: 1 in EtOH) mix on MALDI sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
• Sequenzierung eines Oligonucleotides: 0,5μl Phosphodiesterase I aus Crotalus Adamanteus Gift ca. 1 mU/μl in 20mM Tris-Puffer pH• Sequencing of an oligonucleotide: 0.5μl phosphodiesterase I from Crotalus Adamanteus Gift approx. 1 mU / μl in 20mM Tris buffer pH
8.0 mit 0,5μl Oligonucleotid in H2O 1 μg/μl und mit 1 μl CHCA-Bu (1 :1 in EtOH) auf MALDl-Probenplatte mischen und direkt ins MALDI-MS Hochvakuum transferieren.Mix 8.0 with 0.5μl oligonucleotide in H 2 O 1 μg / μl and with 1 μl CHCA-Bu (1: 1 in EtOH) on a MALDl sample plate and transfer directly to the MALDI-MS high vacuum.
Die Aufnahme der MALDI-MS-Spektren erfolgt z.B. nach 0, 5, 10, 20, 30, 60 und 120 Minuten. Die MS-Analyse kann, wenn nötig, auch bis auf einige Tage nach Ansatz der Mischung ausgedehnt werdenThe MALDI-MS spectra are recorded e.g. after 0, 5, 10, 20, 30, 60 and 120 minutes. If necessary, the MS analysis can also be extended to a few days after the mixture has been prepared
Auf die oben beschriebene Weise ist z.B. auch ein einfaches Screening von Substraten oder Reaktionsprodukten möglich. So können beispielsweise mehrere hundert verschiedene Substrate mit einem Enzym auf nur einer Proben-Platte inkubiert werden. Dazu sind nur geringste Mengen Enzym und Substrat (0,5 μl bei beispielsweise 1 μg/μl) erforderlich. Über die massenspektrometrische Analyse können beispielsweise Kinetiken im Vakuum verfolgt werden. Diese Anwendung birgt . unter Ausnutzung bereits bestehender automatischer Messprogramme ein sehr hohes Potential bezüglich Automatisierung und Kostenersparnis.In the manner described above, simple screening of substrates or reaction products is also possible, for example. For example, several hundred different substrates can be incubated with an enzyme on just one sample plate. Only the smallest amounts of enzyme and substrate (0.5 μl at 1 μg / μl, for example) are required. For example, mass spectrometric analysis can be used to track kinetics in a vacuum. This application hides . using existing automatic measurement programs, a very high potential with regard to automation and cost savings.
Dies gilt beispielsweise im Falle des Einsatzes von Sialidase zur Desialisierung von Sialyllactose in DHB-Bu und im Falle des Einsatzes von PNGaseF zur Deglykosilierung von Glycopeptiden/-Proteinen in DHB- Bu. Weiterhin können die oben beschriebenen Matrizes in kombinierten LC- MALDI-MS oder in Elektrophorese-MALDl-MS Verfahren (PAGE, CE, FFE) eingesetzt werden. Auch eine Kombination mit (mikro)Präparations- /Separationstechniken, insbesondere μTAS, GYROS® und Lab-on-Chip®, ist möglich This applies, for example, when using sialidase to desialize sialyllactose in DHB-Bu and when using PNGaseF to deglycosylate glycopeptides / proteins in DHB-Bu. Furthermore, the matrices described above can be used in combined LC-MALDI-MS or in electrophoresis-MALDI-MS methods (PAGE, CE, FFE). A combination with (micro) preparation / separation techniques, in particular μTAS, GYROS ® and Lab-on-Chip ® , is also possible

Claims

PATENTANSPRÜCHE
1. Matrizes für die Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorpti ns- /lonisations-Massenspektrometrie aus einem Salz eines als Protonenakzeptor reagierenden Amins und einer als Protonendonator reagierenden organischen Substanz, wobei entweder das Amin oder die organische Substanz UV-Licht absorbiert, dadurch gekennzeichnet, dass die Matrizes bei Raumtemperatur eine ionische Flüssigkeit darstellen, dass das Amin ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus 3-Aminochinolin, Pyridin, einem primären Amin, an dessen N-Atom ein Phenylrest oder ein gerader oder verzweigter, gesättigter Ci-Cn-Alkyl- rest, der durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann, gebunden ist, einem sekundären und tertiären Amin, an dessen N-Atom zwei oder drei Reste gebunden sind, die gleich oder verschieden sein können und bei denen es sich um einen geraden oder verzweigten, gesättigten Cι-C8-Alkylrest, der durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann, und einen Phenylrest, handelt, Imidazol und den C- und/oder N-alkylierten1. Matrices for the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry of a salt of an amine reacting as a proton acceptor and an organic substance reacting as a proton donor, wherein either the amine or the organic substance absorbs UV light, characterized in that the Matrices at room temperature represent an ionic liquid, that the amine is selected from the group consisting of 3-aminoquinoline, pyridine, a primary amine, on the N atom of which a phenyl radical or a straight or branched, saturated Ci-Cn-alkyl radical, which can be substituted by an OH group, is bound, a secondary and tertiary amine, to the N atom of which two or three radicals are bound, which may be the same or different, and which are a straight or branched, saturated C 1 -C 8 alkyl radical, which may be substituted by an OH group, and a phenyl radical, imidazole and the C- un d / or N-alkylated
Imidazolderivaten und dass die organische Substanz ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus 2,5-Dihydroxybenzoesäure sowie den Isomeren davon, 2-Hydroxy-5-methoxy-benzoesäure sowie den Isomeren davon, Picolinsäure, 3-Hydroxypicolin-säure, Nikotinsäure, 5-Chloro-Imidazole derivatives and that the organic substance is selected from the group consisting of 2,5-dihydroxybenzoic acid and the isomers thereof, 2-hydroxy-5-methoxy-benzoic acid and the isomers thereof, picolinic acid, 3-hydroxypicolinic acid, nicotinic acid, 5-chloro -
2-mercaptobenzo-thiazol, 6-Aza-2-thiothymin, 2',4',6,-Trihydroxyaceto- phenon-Monohydrat, 2',6'-Di-hydroxyaceto-phenon, 9H-Pyridol[3,4-b]- indol, Dithranol, trans-3-lndolacrylsäure, Osazone, Ferulasäure, 2,5-Dihyd.roxyacetophenon, 1-Nitrocarbazol, 7-Amino-4-methylcumarin, 2-(p-Hdroxyphenylazo)-benzoesäure, 8-Aminopyrene-2,3,4-trissulfon- säure, 2-[2E-3-(4-tert-butylphenyl)-2-methylprop-2-enylidene]malonitril (DCTB), 4-Methoxy-3-hydroxyzimtsäure, Trifluormethansulfonat und 3,4-Dihydroxy-zimtsäure.2-mercaptobenzo-thiazole, 6-aza-2-thiothymine, 2 ', 4', 6 , -Trihydroxyaceto-phenon monohydrate, 2 ', 6'-Di-hydroxyaceto-phenone, 9H-pyridol [3,4-b ] - indole, dithranol, trans-3-indolacrylic acid, osazone, ferulic acid, 2,5-dihyd . roxyacetophenone, 1-nitrocarbazole, 7-amino-4-methylcoumarin, 2- (p-hydroxyphenylazo) benzoic acid, 8-aminopyrene-2,3,4-trissulfonic acid, 2- [2E-3- (4-tert- butylphenyl) -2-methylprop-2-enylidene] malononitrile (DCTB), 4-methoxy-3-hydroxycinnamic acid, trifluoromethanesulfonate and 3,4-dihydroxycinnamic acid.
2. Matrizes nach Anspruch 1 , dadurch gekennzeichnet, dass . es sich bei dem Amin um Anilin, Ethanolamin, Ethylamin. n-Butylamin,2. Matrices according to claim 1, characterized in that. the amine is aniline, ethanolamine, ethylamine. n-butylamine,
N,N-Diethylamin, N,N-Diethylanilin, N,N-Diethylmethylamin, N,N- Dimethylamin, Triethylamin, Tri-n-propylamin, Tri-n-butylamin, 3-Aminochinolin und Pyridin handelt.N, N-diethylamine, N, N-diethylaniline, N, N-diethylmethylamine, N, N-dimethylamine, triethylamine, tri-n-propylamine, tri-n-butylamine, 3-aminoquinoline and pyridine.
3. Matrizes nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei den Matrizes um 2,5-Dihydroxybenzoesäure-Butylamin oder 2-Hydroxy-5-methoxybenzoesäure-Butylamin handelt.3. Matrices according to claim 1 or 2, characterized in that the matrices are 2,5-dihydroxybenzoic acid butylamine or 2-hydroxy-5-methoxybenzoic acid butylamine.
4. Matrizes nach einem der vorhergehenden Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass sie mit einem Lösungsmittel versetzt sind.4. Matrices according to one of the preceding claims, characterized in that they are mixed with a solvent.
5. Verwendung der ionische Flüssigkeiten darstellenden Matrizes nach einem der vorhergehenden Ansprüche bei der Ultraviolett Matrixunterstützten Laserdesorptions-/lonisations-Massenspektrometrie und insbesondere zur quantitativen oder qualitativen Ultraviolett Matrix- unterstützten Laserdesorptions-/lonisations-Massenspektrometrie.5. Use of the matrices representing ionic liquids according to one of the preceding claims in the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry and in particular for quantitative or qualitative ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry.
6. Verwendung der ionische Flüssigkeiten darstellenden Matrizes nach einem der vorhergehenden Ansprüche 1 bis 4 und von bei Raumtemperatur flüssigen, ionische Flüssigkeiten darstellenden Matrizes aus einem Salz aus einem als Protonenakzeptor reagierenden Amin und von Zimtsäure oder einem Zimtsäurederivat, wobei es sich bei dem Amin um eine solches, an dessen N-Atom ein, zwei oder drei Methyl-, Ethyl-, n-Propyl-, iso-Propyl-, n-Butyl-, iso-Butyl- Rest(e), der/die durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann/können, und/oder ein Phenylrest gebunden ist/sind, um 3-Aminochinolin und um Pyridin handelt, als Medium zur Durchführung von Reaktionen mit (Bio)Polymeren und zur Überwachung dieser Reaktionen sowie zur Analyse der dabei entstehenden Reaktionsprodukte mittels der Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/lonisations-Mas- senspektrometrie.6. Use of the matrices representing ionic liquids according to one of the preceding claims 1 to 4 and of matrices representing ionic liquids which are liquid at room temperature and which comprise a salt of an amine reacting as a proton acceptor and cinnamic acid or a cinnamic acid derivative, the amine being a such, on the N atom of which one, two or three methyl, ethyl, n-propyl, iso-propyl, n-butyl, iso-butyl radical (s) are formed by an OH group may be substituted, and / or a phenyl radical is / are 3-aminoquinoline and pyridine, as a medium for carrying out reactions with (Bio) polymers and for monitoring these reactions as well as for analyzing the resulting reaction products using ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry.
7. Verwendung nach Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet, dass die Reaktionen durch Enzyme, insbesondere durch Glycosidasen, Proteasen, Nukleasen, Lipasen oder Lyasen, katalysiert werden, und es sich bei den (Bio)Polymeren um Peptide, Proteinen, Kohlenhydrate, Lipide, Nukleinsäuren, Sekundärmetabolite und/oder Pharmaka sowie deren Konjugate handelt.7. Use according to claim 6, characterized in that the reactions are catalyzed by enzymes, in particular by glycosidases, proteases, nucleases, lipases or lyases, and the (bio) polymers are peptides, proteins, carbohydrates, lipids, nucleic acids , Secondary metabolites and / or pharmaceuticals and their conjugates.
8. Verwendung nach einem der Ansprüche 5 bis 7, dadurch gekennzeichnet, dass die Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/lonisations- Massenspektrometrie mit analytischer oder präparativer Flüssigchromatographie, insbesondere HPLC, GPC und HPAEC, Elektrophorese-Techniken, insbesondere CE, CEC, PAGE und FFE, oder (mikro) Präparations-/Separationstechniken, insbesondere μTAS, GYROS® und Lab-on-Chip®, kombiniert wird.8. Use according to one of claims 5 to 7, characterized in that the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry with analytical or preparative liquid chromatography, in particular HPLC, GPC and HPAEC, electrophoresis techniques, in particular CE, CEC, PAGE and FFE, or (micro) preparation / separation techniques, in particular μTAS, GYROS ® and Lab-on-Chip ® , is combined.
9. Verfahren zur Durchführung von Reaktionen mit (Bio)Polymeren und zur Überwachung dieser Reaktionen sowie zur Analyse der dabei entstehenden Reäktionsprodukte, wobei diese Reaktionen insbesondere durch Enzyme, vorzugsweise Glycosidasen, Proteasen, Nukleasen, Lipasen oder Lyasen, katalysiert werden, dadurch gekennzeichnet, dass diese Reaktionen in einer eine ionische Flüssigkeit darstellenden Matrix nach einem der Ansprüche 1 bis 4 oder in einer eine ionische Flüssigkeit darstellenden Matrix aus einem Salz aus einem als Protonenakzeptor reagierenden Amin und aus Zimtsäure oder einem Zimt- säurederivat, wobei es sich bei dem Amin um eine solches, an dessen9. A process for carrying out reactions with (bio) polymers and for monitoring these reactions and for analyzing the resulting reaction products, these reactions being catalyzed in particular by enzymes, preferably glycosidases, proteases, nucleases, lipases or lyases, characterized in that these reactions in a matrix representing an ionic liquid according to one of claims 1 to 4 or in a matrix representing an ionic liquid consisting of a salt of an amine reacting as a proton acceptor and of cinnamic acid or a cinnamic acid derivative, the amine being a such, at whose
N-Atom ein, zwei oder drei Methyl-, Ethyl-, n-Propyl-, iso-Propyl-, n-Butyl-, iso-Butyl- Rest(e), der/die durch eine OH-Gruppe substituiert sein kann/können, und/oder ein Phenylrest gebunden ist/sind, um 3- Aminochinolin oder um Pyridin handelt, durchgeführt und mittels der Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/Ionisations-Mas- senspektrometrie überwacht werden.N atom one, two or three methyl, ethyl, n-propyl, iso-propyl, n-butyl, iso-butyl radical (s) which are substituted by an OH group be / can, and / or a phenyl radical is / are bound, is 3-aminoquinoline or pyridine, and is monitored by means of the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry.
10. Verfahren nach Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, dass die Ultraviolett Matrix-unterstützte Laserdesorptions-/lonisations-Mas- senspektrometrie mit analytischer oder präparativer Flüssigchromatographie, insbesondere HPLC, GPC und HPAEC, Elektrophorese- Techniken, insbeswondere CE, CEC, PAGE und FFE, oder10. The method according to claim 9, characterized in that the ultraviolet matrix-assisted laser desorption / ionization mass spectrometry with analytical or preparative liquid chromatography, in particular HPLC, GPC and HPAEC, electrophoresis techniques, in particular CE, CEC, PAGE and FFE, or
(mikro)Präparations-/Separationstechniken, insbesondere μTAS, GYROS® und Lab-on-Chip®, kombiniert wird. (Micro) preparation / separation techniques, in particular μTAS, GYROS ® and Lab-on-Chip ® , is combined.
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