EA040607B1 - Молекула биспецифического антитела - Google Patents

Молекула биспецифического антитела Download PDF

Info

Publication number
EA040607B1
EA040607B1 EA201400709 EA040607B1 EA 040607 B1 EA040607 B1 EA 040607B1 EA 201400709 EA201400709 EA 201400709 EA 040607 B1 EA040607 B1 EA 040607B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
ser
domain
antibody
thr
gly
Prior art date
Application number
EA201400709
Other languages
English (en)
Inventor
Гундрам Янг
Михаэл Дурбен
Лудгер Гросс-Ховест
Original Assignee
Синиммун Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Синиммун Гмбх filed Critical Синиммун Гмбх
Publication of EA040607B1 publication Critical patent/EA040607B1/ru

Links

Description

Область техники
Настоящее изобретение относится к молекуле биспецифического антитела, а также к способу ее продуцирования, применения и молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей молекулу биспецифического антитела. В частности, изобретение предусматривает получение молекулы антитела, способной к опосредованию ограниченной клеткой-мишенью активации иммунных клеток.
Уровень техники
Моноклональные антитела к комплексу антиген-специфического Т-клеточного рецептора (TCR) и CD3 способны эффективно активировать Т-клетки. Однако данная активация требует мультимеризации антитела через его Fc-фрагмент на поверхности клеток, экспрессирующих Fc-рецепторы, что часто также обеспечивает дополнительные сигналы активации Т-клеток (Davis, L., Vida, R. and Lipsky, P.E., Regulation of human T lymphocyte mitogenesis by antibodies to CD3, J. Immunol. (1986), 137:3758-3767).
Биспецифические антитела, которые распознают как антиген на клетках-мишенях (например, FLT3 или CD19 на лейкозных клетках, CSPG4-антиген на клетках меланомы или EGFR на клетках глиобластомы), так и комплекс антиген-специфического Т-клеточного рецептора и CD3 (TCR/CD3-комплекс), подобным образом способны активировать Т-клетки (Jung, G., Ledbetter, J.A., Muller-Eberhard, H.J., Induction of cytotoxicity in resting human T lymphocytes bound to tumor cells by antibody heteroconjugates, Proc. Natl. Acad. Sci., USA (1987), 84:4611-4615; Jung, G., Eberhard, H.J., An in-vitro model for tumor immunotherapy with antibody heteroconjugates, Immunol. Today (1988), 9:257-260; Jung, G., Brandl, M., Eisner, W., Fraunberger, P., Reifenberger, G., Schlegel, U., Wiestler, O.D., Reulen, H.J., Wilmanns, W. Local immunotherapy of glioma patients with a combination of 2 bispecific antibody fragments and resting autologous lymphocytes: evidence for in situ T-cell activation and therapeutic efficacy, Int. J Cancer. (2001), 91:225-30) и в дополнение к этому фокусировать активированные клетки на клетке-мишени (Staerz, U.D., Kanagawa, О., and Bevan, M.J., Hybrid antibodies can target sites for attack by T cells, Nature (1985), 314:628-631; Perez, P., Hoffman, R.W., Shaw, S., Bluestone, J.A., and Segal, D.M. Specific targeting of cytotoxic T cells by anti-T3 linked to anti-target cell antibody, Nature (1985), 316:354-356; Jung, G., Honsik, C.J., Reisfeld, R.A. and Muller-Eberhard, H.J. Activation of human peripheral blood mononuclear cells by anti-T3: killing of tumor target cells coated with anti-target-anti-T3 conjugates, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 83:4479-4483, 1986). В результате происходит опосредованный Т-клеткой лизис опухолевых клеток. Антитела, агонистические к костимулирующей Т-клетку молекуле, такой как CD28, усиливают активацию Т-клетки, опосредованную анtu-CD3. Такие костимулирующие антитела особенно эффективны, если они также сформированы в биспецифическом формате (Grosse-Hovest, L., Hartlapp, I., Marwan, W., Brem, G., Rammensee, H.G., and Jung, G., A recombinant bispecific single-chain antibody induces targeted, supra-agonistic CD28-stimulation and tumor cell killing, Eur. J. Immunol. (2003), 33:1334-1340). В любом случае мы считаем безусловным требованием для терапевтического применения биспецифических антител, характеризующихся специфичностью в отношении CD3, чтобы связывание с Fc-рецепторами было исключено (Jung, G., Eberhard, H.J., An in-vitro model for tumor immunotherapy with antibody heteroconjugates, Immunol. Today (1988), 9:257-260; Jung, G., Freimann, U., Von Marshall, Z., Reisfeld, R.A., Wilmanns, W., Target cell-induced T cell activation with bi- and trispecific antibody fragments, Eur. J. Immunol. (1991), 21:2431-2435). Такое связывание с Fcрецепторами привело бы к активизации Т-клеток in vivo, что случается независимо от связывания с антигеном-мишенью в любом месте, где могут находиться экспрессирующие Fc-рецептор клетки, например, внутри всей гематопоэтической, лимфатической и ретикулоэндотелиальной системы. Исходя из опыта подобная активация Т-клеток ведет к системной активации Т-клеток, сопровождаемой синдромом выброса цитокинов - весьма неблагоприятной побочной реакции при терапевтическом применении цитокинов или антител, активирующих Т-клетки (Rosenberg, S.A., Lotze, M.T., Yang, J.C., Aebersold, P.M., Linehan, W.M., Seipp, C.A., and White, D.E., Experience with the use of high-dose interleukin-2 in the treatment of 652 cancer patients, Ann. Surg. (1989), 210:474-484; Tibben, J.G., Boerman, O.C., Massuger, L.F., Schijf, C.P., Claessens, R.A., and Corstens, F.H., Pharmacokinetics, biodistribution and biological effects of intravenously administered bispecific monoclonal antibody OC/TR F(ab')2 in ovarian carcinoma patients, Int. J. Cancer (1996), 66:477-483; Kroesen, B.J., Buter, J., Sleijfer, D.T., Janssen, R.A., van der Graaf, W.T., The, Т.Н., de, L.L., Mulder, N.H., Phase I study of intravenously applied bispecific antibody in renal cell cancer patients receiving subcutaneous interleukin 2, Br. J. Cancer (1994), 70:652-661). Таким образом, целью при форматировании биспецифических антител CD3 должно быть предотвращение Fc-опосредованной системной активации Т-клеток и обеспечение за счет этого возможности ограниченной активации клеток-мишеней, которая зависит исключительно от связывания части-мишени биспецифического антитела с соответствующим антигеном-мишенью (Jung, G., Eberhard, H.J., An in-vitro model for tumor immunotherapy with antibody heteroconjugates, Immunol. Today (1988), 9:257-260; Jung, G., Freimann, U., Von Marshall, Z., Reisfeld, R.A., Wilmanns, W., Target cell-induced T cell activation with bi- and trispecific antibody fragments, Eur. J. Immunol. (1991), 21:2431-2435). Из сказанного выше следует, что при выборе антигена-мишени необходимо максимально возможно следить за экспрессией, ограниченной патогенными клетками. За счет этого активация непатогенными клетками с сопутствующим выбросом цитокинов удерживается на максимально возможном низком уровне.
Подобные соображения распространяются на случаи конструирования биспецифических антител,
- 1 040607 содержащих агонистические эффекторные антитела, связывающиеся с триггерными рецепторами на иммунных клетках, отличных от Т-клеток, такими как CD16, экспрессирующимися на NK-клетках. Так или иначе Fc-опосредованное связывание антител с Fc-рецепторами следует избегать, следуя доводам, приведенным выше относительно Т-клеток.
Биспецифическое антитело, клиническая разработка которого наиболее продвинулась сегодня, представляет собой Blinatumomab (Micromet, Inc., Роквил, Мэриленд, США) - биспецифическое одноцепочечное антитело с CD19χCD3-специфичностью, обладающее замечательной терапевтической активностью против клеток лимфомы и лейкемии (Bargou, R. et al., Tumor regression in cancer patients by very low doses of a T cell-engaging antibody, Science (2008), 321:974-977; Topp, M.S. et al., Targeted therapy with the T-cell-engaging antibody blinatumomab of chemotherapy-refractory minimal residual disease in B-lineage acute lymphoblastic leukemia patients results in high response rate and prolonged leukemia-free survival, J. Clin. Oncol. (2011), 29:2493-2498).
Поскольку одноцепочечный формат не содержит какой-либо участок Fc-части, это антитело представляет собой клетку-мишень, ограниченную в истолкованном выше смысле, т.е. оно активирует Т-клетки лишь в присутствии клеток-мишеней, экспрессирующих CD19 (Brischwein, K. et al., Strictly target cell-dependent activation of T cells by bispecific single-chain antibody constructs of the BiTE class, J. Immunother. (2007), 30:798-807).
Однако CD19 также экспрессируется на нормальных В-клетках таким образом, что несмотря на ограниченность клетки-мишени после терапевтического применения происходит системный выброс цитокинов, вызывающий значительную цитотоксичность уже при суточных дозах около 100 мкг (Bargou, R., et al., Tumor regression in cancer patients by very low doses of a T cell-engaging antibody, Science (2008), 321:974-977; Topp, M.S. et al., Targeted therapy with the T-cell-engaging antibody blinatumomab of chemotherapy-refractory minimal residual disease in B-lineage acute lymphoblastic leukemia patients results in high response rate and prolonged leukemia-free survival, J. Clin. Oncol. (2011), 29:2493-2498).
Более того, одноцепочечный формат имеет такие недостатки, как (i) молекулярная масса около 50 кДа относительно низка и связана с коротким периодом полураспада сыворотки;
(ii) антитела этого формата легко агрегируют; и (iii) их трудно получать обычной ферментацией (Grosse-Hovest, L., Hartlapp, I., Marwan, W., Brem, G., Rammensee, H.G., Jung, G., A recombinant bispecific single-chain antibody induces targeted, supra-agonistic CD28-stimulation and tumor cell killing, Eur. J. Immunol. (2003), 33:1334-1340; Grosse-Hovest, L. et al., Cloned transgenic farm animals produce a bispecific antibody for T cell-mediated tumor cell killing, Proc. Natl. Acad. Sci., USA (2004), 101:6858-6863).
Таким образом, целью настоящего изобретения является получение молекулы биспецифического антитела, которая преодолевала бы по меньшей мере некоторые из вышеуказанных недостатков и которую можно было бы широко применять в терапии, помимо прочих, для строго ограничиваемой клеткоймишенью активации иммунных клеток, как было описано выше.
Краткое описание изобретения
Первым аспектом настоящего изобретения является рекомбинантная молекула биспецифического антитела. Рекомбинантная молекула биспецифического антитела состоит из Fab-фрагмента, одноцепочечного Fv-фрагмента и СН2-домена иммуноглобулина. Fab-фрагмент включает первый сайт связывания первого антигена. Одноцепочечный Fv-фрагмент включает второй сайт связывания второго антигена. Fab-фрагмент и одноцепочечный Fv-фрагмент сопряжены друг с другом через СН2-домен. В типовых вариантах реализации происходит замена остатков цистеина, образующих дисульфидные связи между тяжелыми цепями (С226 и С229 в иммуноглобулинах (IgG) человека).
Вторым аспектом настоящего изобретения является тетрамерная молекула антитела. Тетрамерная молекула антитела содержит димер молекулы антитела по первому аспекту. Димер в целом определяется связью между остатками цистеина двух молекул антитела по первому аспекту, а именно между цистеинами в шарнирной области. Такими остатками цистеина обычно являются сохранившиеся аминокислоты (С226 и С229 в иммуноглобулинах IgG человека).
Третьим аспектом настоящего изобретения является рекомбинантная молекула биспецифического антитела. Рекомбинантная молекула биспецифического антитела включает Fab-фрагмент, содержащий первый сайт связывания первого антигена, одноцепочечный Fv-фрагмент, содержащий второй сайт связывания второго антигена, СН2-домен иммуноглобулина и СН3-домен иммуноглобулина. Fab-фрагмент и одноцепочечный Fv-фрагмент связаны через СН2-домен/СН3-домен. По меньшей мере один аминокислотный остаток СН2-домена, способный опосредствовать связывание с Fc-рецепторами, отсутствует или мутирован. В типовых вариантах осуществления этого аспекта происходит замена по меньшей мере одного из остатков цистеина, формирующих межцепочечные дисульфидные связи (С226 и С229 в IgG-антителах человека). В некоторых вариантах реализации такие молекулы могут содержать дополнительные модификации в области СН3, которые предотвращают димеризацию с гомотипическими СН3-доменами.
Четвертым аспектом настоящего изобретения является тетрамерная молекула антитела. Тетрамер
- 2 040607 ная молекула антитела состоит из димера рекомбинантной молекулы биспецифического антитела по третьему аспекту. Димер, как правило, определяется связью между сохранившимися цистеинами в шарнирной области (С226 и С229 в IgG-антителах человека).
Пятым аспектом настоящего изобретения является еще одна рекомбинантная молекула биспецифического антитела. Эта молекула антитела включает Fab-фрагмент, содержащий первый сайт связывания первого антигена, одноцепочечный Fv-фрагмент, содержащий второй сайт связывания второго антигена, СН2-домен иммуноглобулина и СН3-домен иммуноглобулина. Fab-фрагмент и одноцепочечный Fv-фрагмент сопряжены друг с другом через СН2-домен и СН3-домен. По меньшей мере один остаток цистеина этой молекулы антитела, способный формировать дисульфидный мостик димеризации, отсутствует или мутирован.
Шестым аспектом настоящего изобретения является молекула нуклеиновой кислоты. Молекула нуклеиновой кислоты кодирует молекулу антитела по одному из первого, второго, третьего, четвертого или пятого аспектов.
Седьмым аспектом настоящего изобретения является фармацевтическая композиция. Фармацевтическая композиция включает молекулу антитела по одному из первого, второго, третьего, четвертого и пятого аспектов.
Восьмым аспектом настоящего изобретения является способ лечения болезни. Способ включает применение молекулы антитела по одному из первого, второго, третьего, четвертого и пятого аспектов. В целом молекулу антитела вводят пациенту, нуждающемуся в этом.
Девятым аспектом настоящего изобретения является клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по шестому аспекту.
Десятым аспектом настоящего изобретения является способ продуцирования молекулы антитела по одному из первого, второго, третьего, четвертого или пятого аспектов. Способ включает экспрессию нуклеиновой кислоты, кодирующей молекулу антитела, в условиях, допускающих экспрессию молекулы нуклеиновой кислоты.
Эти аспекты изобретения будут более полно раскрыты с учетом представленного ниже описания, чертежей и неограничивающих примеров.
Краткое описание чертежей
На фиг. 1 схематично изображены варианты реализации молекул биспецифического антитела согласно изобретению.
На фиг. 1А изображена бивалентная молекула, включающая Fab-фрагмент, СН2-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. Молекула антитела имеет главную цепь, в которой СН2-домен своим N-концом сопряжен с Chi- и VH-доменами тяжелой цепи Fab-фрагмента, а С-концом - с одноцепочечным Fv-фрагментом (формат bsFc-1/2).
На фиг. 1В изображена двухвалентная молекула антитела с главной цепью, в которой СН2-домен сопряжен с легкой цепью Fab-фрагмента, т.е. главная цепь которой содержит VL- и CL-домен, шарнирную область, СН2-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент.
На фиг. 1С показана бивалентная молекула антитела, в которой главная цепь включает VL- и Сн1-домен, шарнирную область, СН2-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. Вторая цепь с более низкой массой включает VH- и CL-домен. Таким образом, Fab-фрагмент молекулы антитела на фиг. 1С не является классическим (имеющим естественное происхождение), в котором вариабельная область легкой и тяжелой цепей сцеплена с соответствующей константной областью (соответственно Cl и Сн1), a представляет собой гибридный Fab-фрагмент, в котором вариабельная область сцеплена с константной областью противоположной цепи, т.е. Vн-домен сцеплен с CL-доменом, a VL-домен сцеплен с Сн1-доменом.
На фиг. 1D изображена бивалентная молекула антитела, в главной цепи которой СН2-домен связан с Cl- и Vн-доменом. Вторая цепь более низкой массы включает VL- и Сн1-домен. Таким образом, молекула антитела на фиг. 1D содержит гибридный Fab-фрагмент (включающий первый сайт связывания), который также содержится в молекуле на фиг. 1С.
На фиг. 1E изображена бивалентная молекула антитела с конфигурацией как на фиг. 1А, в которой аминокислоты в СН2-домене и/или шарнирная область модифицированы (обозначено X, как показано на фиг. 1O, формат bsFcko-1/2). Подобным образом, такие модификации могут быть включены в молекулы, изображенные на фиг. 1B-1D. В молекулах, изображенных на фиг. Ία-IE, происходит замена остатков цистеина, формирующих межцепочечные дисульфидные связи (С226 и С229 в антителах IgG человека), для предотвращения образования димеров (·).
На фиг. 1F в качестве иллюстрации изображен вариант реализации с тетравалентной молекулой, которая является димером конфигурации, изображенной на фиг. 1А. Подобная молекула может быть также продуцирована в конфигурациях Fab, изображенных на фиг. 1B-1D с модификациями и без модификаций Fc, изображенных на фиг. 1E. Перечень этих модификаций приведен на фиг. 1P.
На фиг. 1G в качестве иллюстрации изображен вариант реализации с тетравалентной молекулой, которая является димером конфигурации, включающей Fab-фрагмент, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. Аминокислоты в СН2-домене и в шарнирной области модифицированы (X), как резюмировано в таблице на фиг. 1P. Две главные цепи антитела включают VH- и Сн1-домен, шарнирную
- 3 040607 область, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент (формат bsFcko-1). Подобные молекулы также могут быть построены в конфигурациях Fab, изображенных на фиг. Ία-IE. Во всех этих молекулах димеры определяются остатками цистеина в шарнирной области (С226 и С229 в антителах IgG человека).
На фиг. 1H изображена тетравалентная молекула, являющаяся димером конфигурации, включающей Fab-фрагмент, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. В пределах Fab-фрагмента две главные цепи антитела включают VH- и CL-домен.
На фиг. 1I показано тетравалентное антитело с общей структурой, как на фиг. 1G. В отличие от варианта реализации по фиг. 1G, у этого антитела только одна из двух основных цепей содержит аминокислоты в СН2-домене и шарнирной области, которые были модифицированы (обозначено X).
На фиг. 1J изображена тетравалентная молекула, две основные цепи которой включают VL- и CL-домен, шарнирную область, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент.
На фиг. 1K изображена тетравалентная молекула с двумя структурно отличающимися Fab-фрагментами. Первая главная цепь антитела включает VL- и CL-домен, шарнирную область, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. Вторая главная цепь антитела включает VH- и Сн1-домен, шарнирную область, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент.
На фиг. 1L изображена тетравалентная молекула, являющаяся димером конфигурации, включающей Fab-фрагмент, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. В структуре Fab-фрагмента две главные цепи антитела включают VL- и Сн1-домен.
На фиг. 1М изображена еще одна тетравалентная молекула с двумя структурно отличающимися Fab-фрагментами. Первая главная цепь антитела включает VL- и Сн1-домен, шарнирную область, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. Вторая главная цепь антитела включает VH- и CL-домен, шарнирную область, СН2-домен, СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент.
На фиг. 1N в качестве иллюстрации изображен вариант реализации бивалентной молекулы, включающей Fab-фрагмент, СН2- и СН3-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. Молекула антитела имеет главную цепь, в которой СН2-домен своим N-концом сопряжен с Сн1- и VH-доменами тяжелой цепи Fab-фрагмента, а своим С-концом - с СН3-доменом, который своим С-концом сопряжен с одноцепочечным Fv-фрагментом. Такая молекула также может быть построена в Fab-конфигурациях, изображенных на фиг. 1A-1D, и может содержать модификации Fc в шарнирной области и СН2-области (X), как изображено на фиг. 1E и 1O. Дополнительно они могут содержать модификации в СН3-домене, которые предотвращают димеризацию этого домена и могут влиять на связывание с неонатальным Fc-рецептором (FcRn). Примеры остатков, которые участвуют в димеризации и, следовательно, могут быть модифицированы делецией или мутацией, включают Т366, L368, F405, Y407 и K409 (см. Dall'Aqua et al., Contribution of domain interface residues to the stability of antibody CH3 domain homodimers, Biochemistry (1998), vol. 37, issue 26, p. 9266-9273). Другие контактирующие остатки поверхности сопряжения СН3-домена, которые могут быть подвергнуты модификации, включают Q347, Y349, Т350, L351, L368, K370, K392, Т394, Р395, V397, L398, d399, F405, Y407 и K409 (см. S. Miller, Protein-Protein Recognition and the Association of Immunoglobulin Constant Domains, J. Mol. Biol. (1990), vol. 216, p. 965-973; и J. Deisenhofer Crystallographic refinement and atomic models of a human Fc fragment and its complex with fragment В of protein A from Staphylococcus aureus at 2.9- and 2.8-A resolution, Biochemistry (1981), vol. 20, p. 2361-2370); а также, поскольку речь идет о связывании неонатального Fc-рецептора, например, следующие остатки аминокислот СН2-домена: Т250, М252, S254, Т256, Т307 Н310; и СН3-домена: Е380 М428, Н433, N434, Н435 (см. обзор Roopenian & Akilesh; FcRn: the neonatal Fc receptor comes of age, Nature Reviews Immunology (2007), vol. 7, p. 715-725). Во всех этих молекулах, относящихся к изобретению, происходит замена остатков цистеина, образующих межцепочечные дисульфидные связи (С226 и С229 в антителах IgG человека), для предотвращения формирования димеров (·).
Дополнительные иллюстративные варианты реализации, не изображенные на фиг. 1A-1N, включают молекулы, в которых, по сравнению с изображенными вариантами реализации, одноцепочечный Fv-фрагмент на С-конце, скорее, может иметь VL-VH-, нежели VH-VL-ориентацию, означая, что VL-домен сцеплен с соответствующей константной областью.
На фиг. 1O дан перечень иллюстративных модификаций, которые могут быть внесены в варианты бивалентного антитела, изображенные на фиг. 1A-1D и 1N, с получением Fc-дефицитных производных, как представлено в качестве примера на фиг. 1E. Модификации идентичны показанным на фиг. 1P, за исключением сохранившихся цистеинов (С226 и С229 в антителах IgG человека). Нумерация аминокислот соответствует нумерации Кабата (индекс ЕС), wt=последовательность дикого типа IgG1 человека; А1=нокаут; Glycan=Δ1-нокаут с делецией сахаридных фрагментов =297; Δ2-5 последующие варианты нокаута после Δ1; - = аминокислота была подвергнута делеции.
На фиг. 1P дан перечень возможных модификаций, используемых для продуцирования тетравалентной молекулы, изображенной на фиг. 1F-1M. Нумерация аминокислот соответствует нумерации Кабата (индекс ЕС), wt=последовательность дикого типа IgG1 человека; Δ1=нокаут; Glycan=Δ1-нокаут с делецией сахаридных фрагментов =297; Δ2-5 последующие варианты нокаута после Δ1; - = аминокислота
- 4 040607 была подвергнута делеции.
На фиг. 2А-2С схематически изображена процедура клонирования при генерации оптимизированной тяжелой (главной) цепи для антител, изображенных на фиг. 1, в виде бивалентных или тетравалентных биспецифических антител с модифицированными Fc-частями с ослабленной ADCC.
i) Изображен первоначальный вектор на каркасе плазмиды pcDNA3 (Invitrogen; промотор CMV и сигнал терминации бычьего гормона роста удалены). Эта плазмида содержит тяжелую цепь D1-изотипа Ig человека с регуляторными элементами локуса тяжелой цепи иммуноглобулина.
ii) Показана замена элемента VDJ (вариабельной области тяжелой цепи) или VJ (вариабельной области легкой цепи) через сайт рестрикционной эндонуклеазы AatII и ClaI.
iii) Показана простая замена (через сайты рестрикции MluI и SpeI) полной тяжелой цепи D1-изотипа Ig человека на кодирующую последовательность для scFv-фрагмента и на элемент ДНК с подвергнутым делеции СН3-доменом и модифицированными шарнирной областью и СН2-доменом с получением в результате тяжелой цепи бивалентного специфического антитела. Для некоторых вариантов антител, в частности, изображенных на фиг. 1D, CH1-домен может быть заменен CL-доменом.
iv) Замена модифицированного фрагмента CH1-H-CH2 (через сайты рестрикции MluI и BspEI) на элемент CH1-H-CH2-CH3 с модифицированными шарнирной областью и СН2-доменом формирует в результате тяжелую цепь тетравалентного биспецифического антитела, как показано в секции v). В случае дополнительной или как таковой замены цистеинов в позиции С226 и С229 результатом станет образование молекул бивалентных специфических антител, как показано на фиг. 1N.
v) Замена фрагмента scFv (через сайты рестрикции BspEI и SpeI) на фрагмент scFv со специфичностью любого другого антигена или другой VH- и VL-ориентацией.
Замены iv) и v) могут быть объединены.
На фиг. 2В и 2С подробно показаны области, смежные со вставленными VDJ-CH1 и scFv-элементами соответственно.
На фиг. 2D и 2F изображено схематическое представление процедуры клонирования для генерации легкой цепи моноспецифических антител человека.
i) Родительский вектор на каркасе плазмиды pCR-Script (Stratagene; промотор lacZ и сигнал терминации удалены) содержит VJ-область и С-область k-гена человека совместно с регуляторными элементами локуса легкой цепи иммуноглобулина.
ii) Замена элемента VJ (вариабельной области легкой цепи) или элемента VDJ (вариабельной области тяжелой цепи) через рестрикционные эндонуклеазы XhoI и SpeI.
iii) Замена элемента CL (константной легкой цепи) через рестрикционные эндонуклеазы PmlI и BsmBI.
На фиг. 2Е и 2F подробно показаны области, смежные со вставленными элементами VJ и CL.
На схемах прямоугольниками обозначены экзоны, кружками - энхансерные элементы, тонкими линиями - UT-области и последовательности интронов;
L1 и L2 - лидерные последовательности, кодируемые двумя различными экзонами (также показаны на фиг. 2В и 2Е);
V - вариабельные области;
D - область диверсификации;
J - области сопряжения;
CH1, CH2, СН3, CL - экзоны константных тяжелых и легких цепей;
Н - шарнирный участок;
sc Fv - одноцепочечный Fv-фрагмент;
X=модификации аминокислот.
NotI, AatII, ClaI, MluI, BspEI, SpeI, XhoI, KpnI, XhoI, SpeI, PmlI, BsmBI, SaiI - рестрикционные эндонуклеазы, используемые для клонирования;
AmpR и NeoR обозначают области кодирования устойчивости к ампициллину и неомицину соответственно.
Сайты расщепления для секреторных сигнальных пептидов обозначены как |; границы между экзонами и нитронами обозначены как [,].
На фиг. 3А изображена ограниченная клеткой-мишенью активация Т-клетки (включение 3Н-тимидина) двумя биспецифическими антителами разного формата, имеющими специфичность FLT3xCD3, в соответствии с настоящим изобретением. На клетках используются антитела, которые не включают (не закрашенные символы) и которые включают (закрашенные символы) ELT3/CD19-положительные REH-клетки.
о, ·: бивалентная молекула антитела, как изображено на фиг. 1А, включающая последовательность Glycan, как изображено на фиг. 1E и 1O (формат bsFcko-l/2), Fab-фрагмент с сайтом связывания FLT3, фрагмент scFv с сайтом связывания CD3.
□, : тетравалентная молекула антитела, как изображено на фиг. 1G, с последовательностью D1, как изображено на фиг. 1P (формат bsFcko-1).
Fab2-фрагмент с сайтом связывания FLT3, scFv-фрагмент с сайтом связывания CD3.
*: интактное моноспецифическое анти-CD3 антитело без клеток-мишеней.
- 5 040607
В отсутствие клетки-мишени интактные моноспецифические CD3-антитела эффективно активируют Т-клетки в зависимости от Fc/FcR, тогда как биспецифические антитела неэффективны. Это показывает, что в биспецифическом формате изобретения связывание Fc/FcR фактически полностью отсутствует.
На фиг. 3В изображена ограниченная клеткой-мишенью активация Т-клетки (выброс TNF) различными бивалентными специфическими антителами согласно изобретению, используемыми на клетках, не включающих (не закрашенные символы) и включающих (закрашенные символы) FLT3/CD19-положительные REH-клетки.
о, ·: бивалентная молекула антитела, как изображено на фиг. 1А, включающая последовательность Glycan, как изображено на фиг. 1E и фиг. 1O, Fab-фрагмент с сайтом связывания FLT3, scFv-фрагмент с сайтом связывания CD3;
◊, ♦: бивалентная молекула антитела, как изображено на фиг. 1E, включающая последовательность Glycan, как изображено на фиг. 1O, Fab-фрагмент с сайтом связывания CD 19, scFv-фрагмент с сайтом связывания TCR;
V,V: бивалентная молекула антитела, как изображено на фиг. 1E, включающая последовательность Glycan, как изображено на фиг. 1O, Fab-фрагмент с сайтом связывания CSPG4, scFv-фрагмент с сайтом связывания CD3.
Хондроитинсульфата протеогликан CSPG4 является антигеном-мишенью клеток меланомы и не экспрессируется на REH-клетках.
На фиг. 4A, 4B изображен специфический лизис REH-клеток, экспрессирующих FLT3/CD19 (А), и SKMel63-клеток, экспрессирующих CSPG (В), соответственно посредством биспецифических антител согласно изобретению и активированных CD8-положительных Т-клеток-киллеров в 4-часовом тестировании на выделение 51хрома.
• : FLT3xCD3, формат bsFcko-1/2, как изображено на фиг. 1E;
: FLT3xCD3, формат bsFcko-1, как изображено на фиг. 1G;
▼ : CSPG4xCD3, формат bsFcko-1/2, как изображено на фиг. 1E;
♦ : CD19xTCR, формат bsFcko-l/2, как изображено на фиг. 1E.
На фиг. 5A, 5B показано сравнение антител FLT3xCD3 одинаковой специфичности в трех разных форматах: биспецифическом одноцепочечном формате (bs-scFv), формате bsFcko-1/2, как изображено на фиг. 1E, и формате bsFcko-1, как изображено на фиг. 1G.
А: определение агрегации (в процентах) фильтрацией в геле. Агрегаты мигрируют близко к объему пустот и составляют 43, 0 и 2% соответственно для bs-scFv, bsFcko-1/2 и bsFcko-1. Сделано заключение, что образование агрегатов значительно более выражено, если антитело экспрессируется как bs-scFv, а не как bsFcko-1/2 или bsFcko-1.
В: скорость продуцирования после трансфекции генов антитела в продуцируемые клетки и очистки аффинной хроматографией. Как можно видеть, образование агрегатов значительно снижено для двух форматов Fcko согласно изобретению, а скорости продуцирования существенно выше, чем при биспецифическом одноцепочечном формате (bs-scFv).
На фиг. 6А изображены последовательности иллюстративных легких цепей, которые могут быть включены в антитело согласно изобретению. Соответствующие пептидные цепи соответствуют зрелому белку без соответствующей лидерной пептидной последовательности. Последовательности имеют N-концевую вариабельную область, обозначенную жирным шрифтом, и С-концевую константную область, обозначенную курсивом. Определяющие комплементарность области (CDR) вариабельной области выделены подчеркиванием.
На фиг. 6В изображены последовательности иллюстративных главных цепей, которые в данном случае также могут быть названы тяжелыми цепями, которые могут быть включены в антитело согласно изобретению. Данная главная цепь для формата bsFc-1/2 (фиг. 1E) включает VH-домен, Сн1-домен, шарнирную область, модифицированный СН2-домен, VL-домен и VH-домен фрагмента scFv. В примере последовательности 21) (SEQ ID NO: 26) главная цепь содержит СН3-домен, как изображено в примере на фиг. 1G-1M (формат bsFcko-1).
VH-домены обозначены жирным шрифтом, Сн1-домены - обычным, а шарнирная область, СН2- и СН3-домены - обычным шрифтом с подчеркиванием. Главная цепь также включает VL-домен, который обозначен жирным курсивом, и VH-домен (жирным шрифтом) scFv-фрагмента. VH- и VL-домены сопряжены друг с другом посредством линкера, который обозначен подчеркнутым курсивом. Определяющие комплементарность области (CDR) соответствующих VL- и VH-доменов подчеркнуты. СН2-домен и фрагмент scFv сопряжены друг с другом через малый линкер (GQPSG), обозначенный курсивом.
Подробное описание
Настоящее изобретение относится к рекомбинантной молекуле биспецифического антитела. Эта молекула антитела сформирована из элементов, входящих в нативные, т.е. имеющие естественное происхождение, иммуноглобулины, а именно из доменов тяжелых и легких цепей иммуноглобулина.
Термин антитело в целом относится к белковой молекуле связывания, выполняющей функции на
- 6 040607 подобие иммуноглобулинов. Типичными примерами антитела являются иммуноглобулины, а также их производные или функциональные фрагменты, сохраняющие специфичность связывания. Способы продуцирования антител известны на существующем уровне техники. Термин антитело включает также иммуноглобулины (Ig) различных классов (т.е. IgA, IgG, IgM, IgD и IgE) и подклассов (таких как IgG1, IgG2 и т.д.). Иллюстративными примерами антител являются Fab-фрагменты, F(ab')2, Fv-фрагменты, одноцепочечные Fv-фрагменты (scFv), димерные антитела или доменные антитела (Holt L.J. et al., Trends Biotechnol., 21(11), 2003, 484-490). Доменные антитела могут представлять собой однодоменные антитела, антитела с одиночным вариабельным доменом или одиночный вариабельный домен иммуноглобулина, имеющий только один вариабельный домен, который может быть VH или VL, специфически связывающий антиген или эпитоп независимо от других V-областей или доменов. Такой одиночный вариабельный домен иммуноглобулина может включать не только выделенный полипептид одиночного вариабельного домена антитела, но и полипептид больших размеров, содержащий или состоящий из одного или более мономеров полипептидной последовательности одиночного вариабельного домена антитела. Таким образом, под определение термина антитело попадают такие формы, как химерные, одноцепочечные и гуманизированные антитела.
Молекула антитела согласно изобретению может нести один или более доменов, содержащих последовательность, которая по меньшей мере примерно на 60%, по меньшей мере примерно на 70%, по меньшей мере примерно на 75%, по меньшей мере примерно на 80%, по меньшей мере примерно на 85%, по меньшей мере примерно на 90%, по меньшей мере примерно на 92%, по меньшей мере примерно на 95%, по меньшей мере примерно на 96%, по меньшей мере примерно на 97%, по меньшей мере примерно на 98% или по меньшей мере примерно на 99% идентична последовательности с соответствующим имеющим естественное происхождение доменом иммуноглобулина М, иммуноглобулина G, иммуноглобулина А, иммуноглобулина D или иммуноглобулина Е. В этом отношении следует отметить, что термин примерно или приблизительно, используемые в данном тексте, обозначают отклонение от названных величин или диапазонов значений в пределах 20%, например в пределах 10% или в пределах 5%.
Следовательно, главная цепь (более длинная полипептидная цепь) молекулы антитела по изобретению может включать или состоять из доменов с указанной выше идентичностью последовательности с соответствующим доменом мю-тяжелой цепи иммуноглобулина, гамма-тяжелой цепи иммуноглобулина, альфа-тяжелой цепи иммуноглобулина, дельта-тяжелой цепи иммуноглобулина или эпсилон-тяжелой цепи иммуноглобулина. Кроме того, молекула антитела по изобретению может включать или состоять из доменов с вышеуказанной идентичностью последовательностей с соответствующим доменом лямбдалегкой цепи иммуноглобулина или каппа-легкой цепи иммуноглобулина. В некоторых вариантах реализации полные домены тяжелой цепи молекулы антитела по изобретению по меньшей мере примерно на 60%, по меньшей мере примерно на 70%, по меньшей мере примерно на 75%, по меньшей мере примерно на 80%, по меньшей мере примерно на 85%, по меньшей мере примерно на 90%, по меньшей мере примерно на 92%, по меньшей мере примерно на 95%, по меньшей мере примерно на 97%, по меньшей мере примерно на 98% или по меньшей мере примерно на 99% идентичны последовательностям соответствующих областей мю-тяжелой цепи иммуноглобулина, гамма-тяжелой цепи иммуноглобулина (таких, как тяжелые цепи гамма-1, гамма-2, гамма-3 или гамма-4), альфа-тяжелой цепи иммуноглобулина (таких, как тяжелые цепи альфа-1 или альфа-2), дельта-тяжелой цепи иммуноглобулина или эпсилон-тяжелой цепи иммуноглобулина. В некоторых вариантах реализации все домены легкой цепи, присутствующие в молекуле антитела по изобретению, по меньшей мере примерно на 60 %, по меньшей мере примерно на 70%, по меньшей мере примерно на 75%, по меньшей мере примерно на 80%, по меньшей мере примерно на 85%, по меньшей мере примерно на 90%, по меньшей мере примерно на 92%, по меньшей мере примерно на 95%, по меньшей мере примерно на 97%, по меньшей мере примерно на 98% или по меньшей мере примерно на 99% идентичны последовательностям соответствующих областей лямбда-легкой цепи иммуноглобулина (таких, как легкие цепи лямбда-1, лямбда-2, лямбда-3 или лямбда-4) или каппалегкой цепи иммуноглобулина.
Процент (%) идентичности последовательности в отношении аминокислотных последовательностей, раскрытых в настоящем документе, определяется как процентное содержание аминокислотных остатков в кандидатной последовательности, попарно идентичных аминокислотным остаткам в эталонной последовательности, т.е. молекулы антитела по настоящему изобретению, после выравнивания последовательностей и внесения при необходимости гэпов для достижения максимального процента идентичности последовательностей без учета каких-либо консервативных замен в качестве части идентичности последовательностей. Выравнивание с целью определения процента идентичности аминокислотной последовательности может быть выполнена различными известными из уровня техники способами, например, с использованием коммерчески доступного программного обеспечения, такого как BLAST, ALIGN или Megalign (DNASTAR). Специалисты в данной области техники могут задавать необходимые параметры для измерительного выравнивания, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания сравниваемых последовательностей по всей длине сравниваемых последовательностей. Это же справедливо в отношении раскрытых в настоящем документе последовательностям нуклеотидов.
- 7 040607
Термин вариабельный относится к доменам иммуноглобулина, проявляющим вариабельность в своей структуре и участвующим в определении специфичности и аффинности конкретного антитела (т.е. к вариабельному(ым) домену(ам)). Вариабельность имеет неравномерное распределение в пределах вариабельных доменов антител; она концентрируется в субдоменах каждой вариабельной области тяжелых и легких цепей. Такие субдомены называют гипервариабельными участками, HVR или HV, или определяющими комплементарность областями (CDR). Более консервативные (т.е. негипервариабельные) части вариабельных доменов называют каркасными участками (FR). Каждый из вариабельных доменов тяжелых и легких цепей естественного происхождения включает четыре каркасных участка FR, как правило, β-образной слоистой конфигурации, которые присоединены тремя гипервариабельными участками, которые образуют петли, соединяющие и в некоторых случаях образующие часть β-слоистой структуры. Гипервариабельные участки в каждой цепи удерживаются вместе в непосредственной близости от участка FR и, вместе с гипервариабельными участками другой цепи вносят свой вклад в формирование сайта связывания антигена (см. Kabat и др. ниже). В основном иммуноглобулины естественного происхождения включают шесть CDR (см. ниже): три в VH (H1, Н2, Н3) и три в VL (L1, L2, L3). В иммуноглобулинах естественного происхождения Н3 и L3 проявляют наибольшую диверсификацию из шести CDR, а Н3, в частности, как полагают, играет уникальную роль в придании иммуноглобулинам узконаправленной специфичности. Константные домены не вовлечены непосредственно в связывание антигена, но проявляют разнообразные эффекторные функции, такие как, например, антителозависимая, клеточноопосредованная цитотоксичность и активация комплемента.
Соответствующие иммуноглобулиновые мю-тяжелая цепь, гамма-тяжелая цепь, альфа-тяжелая цепь, дельта-тяжелая цепь, эпсилон-тяжелая цепь, лямбда-легкая цепь или каппа-легкая цепь могут быть любого биологического вида, например, от млекопитающих, включая грызунов, до земноводных, например, подкласса Lissamphibia, куда входят лягушки, жабы, саламандры и тритоны, или беспозвоночных. Неограничительными примерами млекопитающих служат крыса, мышь, кролик, морская свинка, белка, хомяк, еж, утконос, американская пищуха, броненосец, собака, лемур, козел, свинья, корова, опоссум, лошадь, летучая мышь, сурок, орангутан, макак-резус, шерстистая обезьяна, макака, шимпанзе, тамарин (saguinus oedipus), мартышка или человек.
Термин иммуноглобулин относится к гликопротеину, который включает по меньшей мере две тяжелые (Н) цепи и две легкие (L) цепи, соединенные дисульфидными связями, или к его антигенсвязывающей части. Каждая тяжелая цепь имеет вариабельную область тяжелой цепи (аббревиатура VH) и константную область тяжелой цепи. В некоторых вариантах реализации константная область тяжелой цепи включает три домена: CH1, CH2 и CH3. Каждая легкая цепь имеет вариабельную область легкой цепи (аббревиатура VL) и константную область легкой цепи. Константная область легкой цепи включает один домен CL. Области VH и VL могут быть также разделены на участки гипервариабельности, называемые определяющими комплементарность областями (CDR), которые чередуются с более консервативными участками, называемыми каркасными областями (FR). CDR содержат большинство остатков, ответственных за специфическое взаимодействие антитела с антигеном. Каждая VH и VL имеет три CDR и четыре FR, расположенные от амино-конца до карбоксильного конца в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. Вариабельные области тяжелых и легких цепей содержат домен связывания, который взаимодействует с эпитопом антигена.
Каждая легкая цепь иммуноглобулина включает N-концевой вариабельный (V) домен (VL) и константный (С) домен. Каждая тяжелая цепь включает N-концевой V-домен (VH), три или четыре С-домена (СН) и шарнирную область. Подобным образом, молекула антитела согласно настоящему изобретению содержит эти домены и области (даже при том, что один сайт связывания молекулы биспецифического антитела образован только одноцепочечным Fv-фрагментом).
Используемый здесь иммуноглобулин обычно представляет собой тетрамерный гликозилированный белок, образованный из двух легких (L) цепей приблизительно по 25 кДа каждая и двух тяжелых (Н) цепей приблизительно по 50 кДа каждая. Иммуноглобулины могут содержать две разновидности легкой цепи, называемые лямбда и каппа. В зависимости от аминокислотной последовательности в константном домене тяжелых цепей иммуноглобулины могут быть отнесены к пяти основным классам: A, D, Е, G и М, некоторые из которых могут быть далее разделены на подклассы (изотипы), например IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. Иммуноглобулин IgM состоит из 5 основных гетеротетрамерных единиц в сочетании с дополнительным полипептидом, называемым J-цепью, и содержит 10 сайтов связывания антигенов, в то время как иммуноглобулины IgA содержат от 2 до 5 из базовых 4-цепочечных элементов, способных полимеризироваться с образованием многовалентных структур в сочетании с J-цепью. В случае IgG молекулярная масса 4-цепочечного элемента в целом составляет приблизительно 150000 дальтон. Термин аминокислота или аминокислотный остаток относится к α- или β-аминокарбоновой кислоте.
Термины аминокислота или аминокислотный остаток, применяемые в отношении белка или пептида, обычно относятся к α-аминокарбоновой кислоте, известной в области техники как аминокислота, выбранная из группы, состоящей из следующего: L-аланин (Ala или А); L-аргинин (Arg или R); L-аспарагин (Asn или N); L-аспарагиновая-кислота (Asp или D); L-цистеин (Cys или С); L-глутамин (Gln
- 8 040607 или Q); L-глутаминовая кислота (Glu или Е); L-глицин (Gly или G); L-гистидин (His или Н); L-изолейцин (ILE или I); L-лейцин (Leu или L); L-лизин (Lys или K); L-метионин (Met или М); L-фенилаланин (Phe или F); L-пролин (Pro или Р); L-серин (Ser или S); L-треонин (Thr или Т); L-триптофан (Trp или W); L-тирозин (Tyr или Y) и L-валин (Val или V), хотя при необходимости могут быть использованы модифицированные, синтетические или редкие аминокислоты, такие как, например, таурин, орнитин, селеноцистеин, гомоцистин, гидроксипролин, тиопролин, йодотирозин, 3-нитротирозин, цитруллин, канаванин, 5-гидрокситриптофан, карнозин, циклолейцин, 3,4-дигидроксифенилаланин, N-ацетилцистеин, пролинол, аллилглицин или ацетидин-2-карбоновая кислота. В целом аминокислоты могут быть сгруппированы по наличию неполярной боковой цепи (например, Ala, Cys, ELE, Leu, Met, Phe, Pro, Val); отрицательно заряженной боковой цепи (например, Asp, Glu); положительно заряженной боковой цепи (например, Arg, His, Lys); или незаряженной полярной боковой цепи (например, Asn, Cys, Gln, Gly, His, Met, Phe, Ser, Thr, Trp и Tyr).
Термин эпитоп, также известный как антигенная детерминанта, относится к части антигена, с которой специфично связывается антитело или Т-клеточный рецептор, образуя комплекс. Из этого следует, что термин эпитоп включает в себя любую молекулу или белковую детерминанту, способную к специфическому связыванию с иммуноглобулином или Т-клеточным рецептором. Сайт(ы) связывания (паратоп) описываемой здесь молекулы антитела может(могут) специфично связаться/взаимодействовать с конформационными или непрерывными эпитопами с уникальной мишенной структурой. Эпитопные детерминанты обычно состоят из химически активных поверхностных группировок молекул, таких как аминокислоты или сахаридные боковые цепи, и, как правило, имеют специфические трехмерные структурные характеристики, а также специфические характеристики заряда. В некоторых вариантах реализации детерминанты эпитопов содержат химически активные поверхностные группировки молекул, такие как аминокислоты, сахаридные боковые цепи, фосфорил или сульфонил, а в определенных вариантах реализации они могут иметь специфические трехмерные структурные характеристики и/или специфические характеристики заряда. Что касается полипептидных антигенов, конформационный или прерывистый эпитоп характеризуется наличием двух или больше дискретных аминокислотных остатков, выделенных из первичной последовательности, которые, однако, собираются в последовательную структуру на поверхности молекулы, когда полипептид складывается в нативный белок/антиген (Sela, M., Science (1969), 166, 1365-1374; Laver, W.G. et al., Cell (1990), 61, 553-556). Два или более дискретных аминокислотных остатков, входящих в эпитоп, могут располагаться на отдельных участках одной или более полипептидных цепей. Эти остатки объединяются на поверхности молекулы, когда полипептидная(ые) цепь(и) складывает(ют)ся в трехмерную структуру со сборкой эпитопа. Напротив, непрерывный или линейный эпитоп состоит из двух или более дискретных аминокислотных остатков, которые присутствуют на одиночном линейном сегменте полипептидной цепи. В качестве иллюстративного примера контекстно-зависимый CD3-эпитоп является примером конформации указанного эпитопа. Такой контекстнозависимый эпитоп, локализованный на эпсилон-цепи CD3, может правильно развить свою конформацию, только если он встроен в остальную часть эпсилон-цепи и удерживается в правильном положении путем гетеродимеризации эпсилон-цепи с гамма- или дельта-цепью CD3. В противоположность этому контекстно-независимый CD3-эпитоп может быть N-концевым полипептидом из 1-27 аминокислотных остатков или его функциональным фрагментом в эпсилон-цепи CD3.
В целом по своей природе эпитопы могут быть линейными или прерывистыми. Таким образом, используемый здесь термин конформационный эпитоп относится к прерывистому эпитопу, образовавшемуся за счет пространственной взаимосвязи аминокислот в антигене, отличному от неразрывного ряда аминокислот. Кроме того, термин эпитоп включает в себя антигенную детерминанту гаптена, которая известна как небольшая молекула, способная выступать в роли антигена, проявляя один или более иммунологически распознаваемых эпитопов после связывания с веществом большего размера, таким как молекула большего размера, например белком.
Считается, что антитело или молекула/фрагмент антитела специфично связывается с антигеном при распознавании своего антигена-мишени в сложной смеси белков и/или макромолекул. Считается, что антитела связываются с одним и тем же эпитопом, если антитела взаимно конкурируют за то, чтобы только одно антитело могло связаться с эпитопом в данный момент времени, т.е. одно антитело предотвращает связывание или модулирующее воздействие другого.
В данном контексте термин специфический или специфически распознающий, также используемый как направленный на, в соответствии с настоящим изобретением означает, что молекула антитела способна специфично взаимодействовать и/или связываться по меньшей мере с двумя, например по меньшей мере с тремя или по меньшей мере с четырьмя, аминокислотами эпитопа, но по существу не связывается с другим эпитопом или антигеном. Пример такого связывания может быть приведен в качестве специфичности согласно принципу замок-ключ. Считается, что специфичность связывания реализуется специфическими мотивами в аминокислотной последовательности области связывания антитела и антитело и эпитоп или антиген связываются друг с другом в результате их первичной, вторичной или третичной структуры, а также в результате вторичных модификаций указанной структуры. Специфическое взаимодействие специфического эпитопа/сайта взаимодействия антигена со своим специфическим
- 9 040607 эпитопом/антигеном может также дать в результате простое связывание указанного сайта с антигеном. Более того, в качестве альтернативы специфическое взаимодействие сайта взаимодействия антигена со своим специфическим эпитопом/антигеном может привести к инициированию сигнала, например, вследствие индуцирования изменения конформации антигена или олигомеризации антигена.
Как правило, связывание считают специфичным, когда аффинность связывания превышает 10-6 М. В частности, связывание считают специфическим при аффинности связывания приблизительно от 10-8 до 10-11 М (KD), или приблизительно от 10-9 до 10-11 М, или еще выше. Таким образом, молекулы антитела с аффинностью первого сайта связывания и/или второго сайта связывания в пикомолярном диапазоне (при KD 10-12 М) также включены в настоящее изобретение. В случае необходимости неспецифическое связывание сайта связывания может быть ослаблено без оказания существенного воздействия на специфическое связывание изменением условий связывания.
В некоторых вариантах реализации антиген, с которым связывается антитело, согласно изобретению является антигеном, входящим в состав внеклеточного матрикса, или поверхностно-клеточным антигеном. В некоторых вариантах реализации антиген, с которым связывается антитело, согласно изобретению представляет собой опухоль-ассоциированный антиген. Следует понимать, что такой опухольассоциированный антиген может быть включен во внеклеточный матрикс или представлять собой поверхностно-клеточный антиген.
Термин внеклеточный матрикс относится к тканевой области многоклеточного животного, включая человека, которая находится в межклеточном пространстве, т.е. между клетками соответствующей ткани. Внеклеточный матрикс представляет собой большей частью сеть белков, таких как фибриллярные и нефибриллярные коллагены или эластин, гликопротеинов, таких как ламинин или фибронектин, протеогликанов, таких как хондроитин сульфат или кератан сульфат, и полисахаридов, таких как гиалуроновая кислота. Среди прочего, внеклеточный матрикс служит для разделения между собой различных тканей или для регулирования межклеточной связи. В некоторых вариантах реализации опухольассоциированный антиген может экспрессироваться частично или исключительно во внеклеточном матриксе опухоли.
Используемый здесь термин поверхностно-клеточный антиген относится к молекуле, которая проявляется на поверхности клетки. Обычно такая молекула расположена в или на плазматической мембране клетки таким образом, что по меньшей мере часть этой молекулы остается доступной из окружающей среды, т.е. снаружи клетки. Соответствующая молекула состоит из или включает в себя аминокислотные и/или сахаридные фрагменты. Примером, иллюстрирующим поверхностно-клеточную молекулу, расположенную в плазматической мембране, является трансмембранный белок, который в своей трехмерной конформации имеет области гидрофильности и гидрофобности. Одна или более гидрофобных областей обеспечивают поверхностно-клеточной молекуле возможность встраивания или инсерции в гидрофобную плазматическую мембрану клетки, в то время как гидрофильные области белка проходят по каждой стороне плазматической мембраны в цитоплазму и внеклеточное пространство соответственно. Примеры поверхностно-клеточной молекулы, расположенной на плазматической мембране, включают, но без ограничения, белок с посттрансляционно модифицированным остатком цистеина, несущим пальмитоильную группу, белок, модифицированный на С-концевом остатке цистеина, несущем фарнезильную группу, или белок, модифицированный на С-конце, несущем гликозилфосфатидилинозитоловый (GPI) якорь. Эти группы способствуют ковалентному присоединению белков к наружной поверхности плазматической мембраны, где они остаются доступными для распознавания внеклеточными молекулами, такими как антитела. Примеры поверхностно-клеточных антигенов включают в себя молекулу рецептора клеточной поверхности, такого как сопряженный с G-белком рецептор (например, адренергетический рецептор β), рецептор тирозинкиназы (такой как EGFR, EGFRvIII, Her2/neu, Her2/c-neu, PDGFRa, ILR-1, TNFR, CD30, CD33 или GMCSFR), мембранный рецептор с соответствующей активностью тирозинкиназы (такой, как IL6R или LEFR) или мембранный рецептор с активностью Ser/Thr-киназы (такой, как TGFbR), которые приведены лишь в качестве нескольких примеров.
Примеры опухоль-ассоциированного антигена, входящего в состав внеклеточного матрикса, включают, но без ограничения, протеогликан, такой как ассоциированный с меланомой хондроитинсульфатпротеогликан (CSPG4) или CD44v6, включая муцин, такой как Muc-1, или мембраносвязанный фермент, такой как карбоангидраза IX (CAIX). Примерами таких антигенов являются тенасцин и фибробластактивирующий протеин (FAP).
Используемый здесь термин выделенная молекула антитела относится к молекуле антитела, которая была идентифицирована и выделена и/или восстановлена из компонента своей природной среды. Примесями ее естественной среды являются вещества, которые могут препятствовать применению антитела в диагностике или терапии и которые могут включать ферменты, гормоны и другие белковые или небелковые растворенные вещества. В некоторых вариантах реализации молекулу антитела очищают более чем до 95% по массе антитела, например более чем до 99%, что определяется методом Лоури. В некоторых вариантах реализации молекулу антитела очищают до степени, достаточной для получения по меньшей мере 15 остатков N-концевой или внутренней аминокислотной последовательности с использо
- 10 040607 ванием секвенатора с вращающимся стаканом. В некоторых вариантах реализации антитело очищают до уровня гомогенности методом SDS-PAGE в восстанавливающих или невосстанавливающих условиях с применением окрашивания Кумасси синим или предпочтительно серебром. В некоторых вариантах реализации выделенная молекула антитела может находиться внутри рекомбинантных клеток при отсутствии одного или более компонентов естественной среды антитела. Обычно выделенное антитело получают по меньшей мере одной стадией очистки.
Используемые здесь термины VH и VL относятся соответственно к вариабельному домену тяжелой цепи и вариабельному домену легкой цепи иммуноглобулина. Вариабельная область легкой или тяжелой цепи иммуноглобулина состоит из каркасной области, прерываемой тремя гипервариабельными участками. Таким образом, термин гипервариабельный участок относится к аминокислотным остаткам антитела, ответственным за связывание антигена. Гипервариабельный участок включает аминокислотные остатки из определяющей комплементарность области или CDR. В вариабельную часть иммуноглобулина входят по три CDR (или CDR-области) тяжелой и легкой цепей. Таким образом, используемый здесь термин CDR относится ко всем трем CDR тяжелой цепи (CDRH1, CDRH2 и CDRH3), или всем трем CDR легкой цепи (CDRL1, CDRL2 и CDRL3), или же при необходимости ко всем CDR как тяжелой, так и легкой цепей. Три CDR составляют характер связывания вариабельной области легкой цепи, а другие три составляют характер связывания вариабельной области тяжелой цепи. CDR определяют специфичность молекулы иммуноглобулина в отношении антигена и разделены аминокислотными последовательностями, которые включают несущие или каркасные области. Четкие границы и протяженность CDR определяются различными классификационными и номенклатурными системами. Структура и укладка белка антитела могут означать, что другие остатки рассматриваются как часть антигенсвязывающей области, что будет ясно специалисту в данной области техники. CDR формируют большинство контактных остатков для связывания иммуноглобулина с антигеном или эпитопом.
CDR3, как правило, представляет собой самый большой источник молекулярного разнообразия в пределах сайта связывания антитела. Н3, например, может быть коротким, как два аминокислотных остатка, или длиннее, чем 26 аминокислот. Структура субъединиц и трехмерные конфигурации иммуноглобулинов разных классов хорошо известны из уровня техники. Обзор структуры антитела см. в Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, eds. Harlow et al., 1988. Специалисту в данной области техники будет ясно, что каждая структура субъединицы, например структура СН, VH, CL, VL, CDR, FR, содержит активные фрагменты, например, часть субъединицы VH, VL или CDR связывается с антигеном, т.е. антигенсвязывающим фрагментом, или, например, часть субъединицы СН, которая связывается и/или активирует, например, Fc-рецептор и/или комплемент. Как правило, CDR относятся к нумерации CDR по Кабату, как представлено в Sequences of Proteins of Immunological Interest, US Department of Health and Human Services (1991), eds. Kabat et al. Другим стандартом характеризации сайта связывания антигена является характеризация через гипервариабельные петли, как описано Чотиа. См., например, Chothia et al. (1992, J. Mol. Biol., 227:799-817); и Tomlinson et al. (1995), EMBO, J. 14:4628-4638. Еще одним стандартом является определение по AbM, используемое в программном обеспечении по моделированию антител AbM Oxford Molecular. В целом см., например, Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains, Antibody Engineering Lab Manual (ed.: Duebel, S. and Kontermann, R., SpringerVerlag, Heidelberg). Варианты реализации, описанные с использованием классификации CDR Кабата, альтернативно могут быть осуществлены с использованием подобных взаимоотношений касательно гипервариабельных петель по Чотиа или определенных по AbM петель.
Остатки каркасной области или FR представляют собой остатки вариабельного домена, отличного от гипервариабельного домена. Последовательности каркасных областей разных легких или тяжелых цепей являются относительно постоянными в пределах одного вида. Таким образом, каркасная область человека представляет собой каркасную область, которая по существу идентична (около 85% или более, как правило 90-95% или более) каркасной области иммуноглобулина человека естественного происхождения. Каркасная область антитела, т.е. комбинированные каркасные области составляющих легкой и тяжелой цепей, служит для позиционирования и выравнивания CDR. CDR изначально ответственны за связывание с эпитопом антигена.
Термины Fab и Fab-область, Fab-часть или Fab-фрагмент следует понимать, как определяющие полипептид, который включает домен VH, CH1, VL и CL иммуноглобулина. Fab может относиться к этой области отдельно или этой области в контексте молекулы антитела согласно изобретению, а также всей длине иммуноглобулина или фрагменту иммуноглобулина. Как правило, Fab-область содержит всю легкую цепь антитела. Fab-область может быть определена как плечо молекулы иммуноглобулина. Она содержит эпитопсвязывающую часть этого Ig. Fab-область иммуноглобулина естественного происхождения может быть получена в виде протеолитического фрагмента путем расщепления папаином. F(ab')2-часть представляет собой протеолитический фрагмент расщепленного пепсином иммуноглобулина. Fab'-часть является продуктом восстановления дисульфидных связей F(ab')2-части. Используемые здесь термины Fab, Fab-область, Fab-часть и Fab-фрагмент также могут включать шарнирную область, определяющую С-концевое плечо антитела (см. выше). Эта шарнирная область соответствует шарнирной области, находящейся на С-конце Абдомена по всей длине иммуноглобулина, в которой
- 11 040607 плечи молекулы антитела могут быть взяты для образования Y. Термин шарнирная участок используют в данной области техники, поскольку иммуноглобулин в этой области имеет некоторую гибкость.
Fv или Fv-фрагмент состоит только из VL и VH доменов одиночного плеча иммуноглобулина. Таким образом, Fv представляет собой минимальный фрагмент антитела, содержащий полный сайт распознавания и связывания антигена. Двухцепочечный Fv-фрагмент состоит из димера из одного вариабельного домена тяжелой и одного вариабельного домена легкой цепей, находящихся в прочной нековалентной связи. Разновидность одноцепочечного Fv (scFv) включает VH- и VL-домен иммуноглобулина, причем эти домены присутствуют в одной полипептидной цепи, в которой они ковалентно связаны друг с другом с помощью гибкого пептидного линкера. Как правило, в scFv-фрагменте вариабельные домены легкой и тяжелой цепей связаны в димерную структуру, аналогичную таковой в разновидности двухцепочечного Fv-. В одноцепочечных scFv-фрагментах возможно, чтобы вариабельный домен легкой цепи находился на N-конце одиночной полипептидной цепи, после которого следует линкер и вариабельный домен тяжелой цепи, находящийся на С-конце полипептидной цепи, или наоборот, чтобы вариабельный домен тяжелой цепи находился на N-конце, а вариабельный домен легкой цепи - на С-конце, между которыми находился бы пептидный линкер. Пептидный линкер может представлять собой любой известный из области техники гибкий линкер, например, составленный из остатков глицина и серина. Кроме того, возможно дополнительно стабилизировать ассоциацию между доменами VH и VL путем введения дисульфидных связей в консервативные каркасные области (см. Reiter et al., Stabilization of the Fv fragments in recombinant immunotoxins by disulfide bonds engineered into conserved framework regions, Biochemistry, 1994, 33, 6551-5459). Такие scFv-фрагменты также известны как стабилизированные дисульфидными связями scFv-фрагменты (ds-scFv).
Используемый здесь термин Fc-область или Fc-фрагмент обозначает С-концевую область тяжелой цепи иммуноглобулина, включающую Fc-области с нативной последовательностью и вариантные Fc-области. Fc-часть опосредует эффекторную функцию антител, например активацию системы комплемента и несущих Fc-рецептор иммунных эффекторных клеток, таких как NK-клетки. В молекулах IgG человека Fc-область генерируется расщеплением папаином на N-конце у Cys226. Хотя границы Fc-области тяжелой цепи иммуноглобулина могут варьироваться, Fc-область тяжелой цепи IgG человека обычно имеет протяжение от аминокислотного остатка в положении Cys226, или от Pro230, до ее карбоксильного конца. С-концевой лизин (остаток 447 по номенклатуре ЕС) Fc-области может быть удален, например, при продуцировании или очистке молекулы антитела или посредством рекомбинантной инженерии нуклеиновой кислоты, кодирующей тяжелую цепь молекулы антитела. Следовательно, композиция интактных антител может включать популяции антител со всеми удаленными остатками K447, популяции антител без удаленных остатков K447 и популяции со смесью антител с и без остатков K447. Fc-области с нативной последовательностью, пригодные для антител в соответствии с изобретением, включают иммуноглобулины млекопитающих, например, человека или мыши, IgG1, IgG2 (IgG2A, IgG2B), IgG3 и IgG4. Fc-область содержит два или три константных домена в зависимости от класса антитела. В вариантах реализации, где иммуноглобулином является IgG, Fc-область включает домены CH2 и CH3.
Молекула антитела по настоящему изобретению имеет две цепи: более короткую цепь, которая в некоторых вариантах реализации может быть легкой цепью, и главную цепь, которая в некоторых вариантах реализации также может быть названа тяжелой цепью. Молекула антитела обычно представляет собой димер из этих двух цепей. Основываясь на доменах, включенных в молекулу антитела, согласно изобретению может быть взята молекула антитела, которая имеет Fab-фрагмент, в целом включающий шарнирную области, CH2-домен и одноцепочечный Fv-фрагмент. В некоторых вариантах реализации молекула антитела также включает СН3-домен, в целом расположенный на С-конце CH2-домена. В некоторых вариантах реализации расположение доменов антитела согласно изобретению соответствует расположению доменов в иммуноглобулине. В качестве двух примеров более короткая цепь молекулы антитела по изобретению может иметь VL-домен на N-конце и CL-домен на С-конце более короткой цепи, а главная цепь может иметь VH-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. В некоторых вариантах реализации более короткая цепь может иметь VL-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. В некоторых вариантах реализации более короткая цепь может иметь VH-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце более короткой цепи. В некоторых вариантах реализации более короткая цепь может иметь VH-домен на N-конце и CL-домен на С-конце более короткой цепи. В некоторых вариантах реализации главная цепь может иметь VL-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. В некоторых вариантах реализации главная цепь может иметь VH-домен на N-конце и CL-домен на С-конце. В некоторых вариантах реализации главная цепь может иметь VL-домен на N-конце и CL-домен на С-конце.
Более короткая цепь антитела может быть связана с главной цепью антитела посредством одной, двух или трех дисульфидных связей. Соответствующая дисульфидная связь может образовывать мостик между С-концевым остатком цистеина меньшей цепи и остатком цистеина в пределах шарнирной области главной цепи антитела.
В молекуле антитела по изобретению С-концевая область главной цепи может быть определена одноцепочечным Fv-фрагментом. В некоторых вариантах реализации С-конец главной цепи может быть
- 12 040607 определен VH-доменом scFv-фрагмента. В некоторых вариантах реализации С-конец главной цепи может быть определен VL-доменом scFv-фрагмента. Соответственно в некоторых вариантах реализации scFv-фрагмент может быть сопряжен с СН2-доменом или с СН3-доменом, если он присутствует, главной цепи через VH-домен, например N-конец VH-домена. В некоторых вариантах реализации scFv-фрагмент может быть сопряжен с СН2-доменом или с СН3-доменом, если он присутствует, главной цепи через VL-домен, например через N-конец VL-домена. В некоторых вариантах реализации СН2-домен молекулы антитела или СН3-домен, если он присутствует, связан с scFv-фрагментом через вариабельный домен легкой цепи (VL-домен) scFv-фрагмента. В некоторых вариантах реализации СН2-домен связан с scFv-фрагментом через вариабельный домен тяжелой цепи (VH-домен) scFv-фрагмента.
Fab-фрагмент молекулы антитела по изобретению в некоторых вариантах реализации связан с СН2-доменом через домен тяжелой цепи Fab-фрагмента. Соответственно главная цепь антитела может иметь домен тяжелой цепи, такой как CH1-домен (см. выше), сопряженный с СН2-доменом. Как сказано выше, соответствующий CH1-домен может быть сопряжен с СН2-доменом через шарнирную область. Соответствующий домен тяжелой цепи Fab-фрагмента в некоторых вариантах реализации может находиться на N-конце полипептидной цепи главной цепи антитела. В некоторых вариантах реализации Fab-фрагмент молекулы антитела по изобретению связан с СН2-доменом через домен легкой цепи Fab-фрагмента. Соответственно главная цепь молекулы антитела может иметь домен легкой цепи, такой как CL-домен, сопряженный с СН2-доменом. И вновь соответствующий CL-домен может быть сопряжен с СН2-доменом через шарнирную область. В некоторых вариантах реализации соответствующий домен легкой цепи Fab-фрагмента может находиться на N-конце полипептидной цепи главной цепи молекулы антитела. Для предотвращения димеризации молекул в бивалентных вариантах реализации (фиг. 1А-1Е и 1N) остатки цистеина в шарнирной области, обеспечивающие межцепочечные дисульфидные связи, могут быть заменены. В тетравалентных вариантах реализации (фиг. 1F-1M) эти остатки цистеина сохранены. В этих вариантах реализации молекула антитела, соответственно, может быть взята для определения димера бивалентной димерной молекулы антитела, как описано выше, и каждая главная цепь и каждая более короткая цепь могут быть выбраны индивидуально. Например, первая из более коротких цепей может иметь VH-домен на N-конце и CL-домен на С-конце. Первая главная цепь может иметь VL-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. Далее первая главная цепь может иметь СН2- и СН3-домен, а также С-концевой scFv-фрагмент. scFv-фрагмент может быть сопряжен с СН3-доменом через VL-домен. Вторая из более коротких цепей может иметь VH-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. Вторая главная цепь может иметь VL-домен на N-конце и CL-домен на С-конце. Вторая главная цепь может также иметь СН2- и СН3-домен, а также С-концевой scFv-фрагмент. scFv-фрагмент может быть сопряжен с СН3-доменом через VL-домен.
Соответствующая тетрамерная молекула антитела может быть образована из двух димерных молекул антитела, связанных между собой одной или более, например двумя, дисульфидными связями. Такая дисульфидная связь может сформировать мостик между остатком цистеина главной цепи первой димерной молекулы антитела и остатком цистеина главной цепи второй димерной молекулы антитела. Как правило, соответствующие остатки цистеина расположены в пределах шарнирной области соответствующей главной цепи каждой димерной молекулы антитела. В некоторых вариантах реализации одна или обе из двух главных цепей, т.е. главная цепь первой димерной молекулы и главная цепь второй димерной молекулы тетрамерной молекулы антитела, имеют остаток цистеина в позиции 226 последовательности и/или в позиции 229 последовательности одной из соответствующих шарнирных областей в соответствии с нумерацией Кабата (индекс ЕС). В одном варианте реализации дисульфидная связь между шарнирной областью первой главной цепи и шарнирной областью второй главной цепи определяется по меньшей мере одним остатком цистеина в позиции 226 последовательности и остатком цистеина в позиции 229 последовательности одной из шарнирных областей в соответствии с нумерацией Кабата (индекс ЕС). В некоторых вариантах реализации тетрамерная молекула антитела может иметь одну или более дисульфидных связей между шарнирными областями двух главных цепей димерных молекул антитела и одну дисульфидную связь между шарнирными областями двух главных цепей димерных молекул антитела. В некоторых вариантах реализации две димерные молекулы антитела тетрамерной молекулы антитела по изобретению могут быть связаны дисульфидной связью, определяемой остатком цистеина, входящим в СН2-домен главной цепи первой димерной молекулы антитела, и остатком цистеина, входящим в СН2-домен главной цепи второй димерной молекулы антитела.
В качестве еще одного примера первая из более коротких цепей может иметь VL-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. Первая главная цепь может иметь VH-домен на N-конце и CL-домен, связанный с ней на С-конце. Кроме того, первая главная цепь может иметь СН2- и СН3-домен, а также С-концевой scFv-фрагмент. scFv-фрагмент может быть сопряжен с СН3-доменом через VH-домен. Вторая из более коротких цепей может иметь VL-домен на N-конце и CL-домен на С-конце. Вторая главная цепь может иметь VH-домен на N-конце и CH1-домен на С-конце. Вторая главная цепь может иметь также СН2- и СН3-домены, а также С-терминальный scFv-фрагмент. scFv-фрагмент может быть сопряжен с СН3-доменом через VH-домен.
Биспецифическая или бифункциональная молекула антитела представляет собой молекулу ан
- 13 040607 титела, которая имеет два разных эпитоп/антигенсвязывающих сайта и, соответственно, обладает специфичностью связывания с двумя разными эпитопами-мишенями. Эти два эпитопа могут быть эпитопами одного и того же антигена или разных антигенов. В отличие от этого бивалентное антитело может иметь сайты связывания идентичной антигенной специфичности.
Биспецифическое антитело может представлять собой молекулу антитела, которая связывается с одним антигеном или эпитопом на одном из двух или более плеч связывания, определяемых первой парой тяжелой и легкой цепей или главной и более короткой/меньшей цепей (см. выше), и связывается с другим антигеном или эпитопом на втором плече, определяемом второй парой тяжелой и легкой или главной и меньшей цепей. Такой вариант реализации биспецифического антитела имеет два антигенсвязывающих плеча, отличающихся как специфичностью, так и последовательностями CDR. Как правило, биспецифическое антитело является моновалентным для каждого антигена, с которым оно связывается. Биспецифическое антитело представляет собой гибридную молекулу антитела, которая может иметь первую область связывания, определяемую первой вариабельной областью легкой цепи и первой вариабельной областью тяжелой цепи, и вторую область связывания, определяемую второй вариабельной областью легкой цепи и второй вариабельной областью тяжелой цепи. В некоторых вариантах реализации одна из этих областей связывания может быть определена парой тяжелой/легкой цепей. Как разъяснено выше, в контексте настоящего изобретения молекула биспецифического антитела имеет первый сайт связывания, определяемый вариабельными областями главной цепи и меньшей цепи, и второй (другой) сайт связывания, определяемый вариабельной областью scFv-фрагмента, включенного в главную цепь молекулы антитела.
Способы получения молекулы биспецифического антитела известны из уровня техники; ими являются, например, химическая конъюгация двух различных моноклональных антител или также, например, химическая конъюгация двух фрагментов антитела, например двух Fab-фрагментов. В качестве альтернативы молекулы биспецифического антитела получают рекомбинантным способом. Традиционно рекомбинантное получение биспецифических антител основано на коэкспрессии двух пар Н-цепь-L-цепь иммуноглобулина, где две Н-цепи обладают различной специфичностью связывания. Вследствие случайного подбора Н- и L-цепей получают потенциальную смесь из десяти различных структур антитела, из которых только одно имеет желаемую специфичность связывания. Альтернативный подход включает слияние вариабельных доменов, характеризующихся желаемой специфичностью связывания, с константной областью тяжелой цепи, включающей по меньшей мере часть шарнирной области, СН2- и СН3-области. В одном варианте реализации CH1-область, содержащая сайт, требуемый для связывания легкой цепи, присутствует по меньшей мере в одном из слияний. ДНК, кодирующую эти слияния, и при необходимости L-цепь подвергают инсерции в отдельные векторы экспрессии и затем котрансфицируют в подходящий организм-хозяин. При этом существует возможность инсерции кодирующих последовательностей для двух или всех трех цепей в один вектор экспрессии.
Молекула биспецифического антитела согласно изобретению может действовать в отношении каждой мишени как моноклональное антитело (MAb). В некоторых вариантах реализации антитело может быть химерным, гуманизированным или полностью человеческим.
В целом антитело с двойной специфичностью, которое может быть, например, иммуноглобулином полной длины или конструктом со свойствами связывания наподобие иммуноглобулина, следует понимать, как такое, которое имеет два плеча связывания, в частности плечи, характеризуемые парой HC/LC, каждая из которых может связывать два разных антигена или эпитопа (см. публикацию РСТ WO 02/02773). Соответственно связывающий белок с двойной специфичностью имеет два идентичных антигенсвязывающих плеча с идентичной специфичностью и идентичными CDR-последовательностями, и является бивалентным для каждого антигена, с которым он связывается.
Т-клеточный рецептор (TCR) представляет собой конкретный рецептор на клеточной поверхности Т-клеток, т.е. Т-лимфоцитов. In vivo Т-клеточный рецептор существует в виде комплекса из нескольких белков. В целом Т-клеточный рецептор имеет две отдельные пептидные цепи, как правило альфа- и бета-цепи Т-клеточного рецептора (цепи TCRa и TCRe), у некоторых Т-клеток имеется Т-клеточный рецептор с гамма- и дельта-цепями (TCRy и TCRδ). Другими белками в комплексе являются белки CD3: гетеродимеры CD3εγ и CD3εδ и, самое главное, гомодимер CD3Z, который имеет в общей сложности шесть ITAM-мотивов. ITAM-мотивы на CD3Z могут быть фосфорилированы посредством Lck и, в свою очередь, привлечь ZAP-70. Lck и/или ZAP-70 также может фосфорилировать тирозины на многих других молекулах, особенно CD28, LAT и SLP-76, что обеспечивает агрегацию сигнальных комплексов вокруг этих белков.
Молекула антитела согласно изобретению включает легкую цепь с VL-доменом и CL-доменом. Кроме того, молекула антитела включает главную цепь, которая включает VH-домен, CH1-домен и шарнирную область. VH-домен расположен на N-конце главной цепи, при этом VH-домен связан с CHi-доменом напрямую или через связывающий пептид, обычно состоящий из 20 или менее, в том числе 10 или менее, аминокислотных остатков. Шарнирная область связана с С-концом CH1-домена. Таким образом, часть молекулы антитела, которая определена смежным расположением VL-, CL-, VH- и CH1-домена, а
- 14 040607 также шарнирной области, может быть взята для определения Fab-фрагмента и, следовательно, называется именно так. Как и в иммуноглобулине естественного происхождения, конъюгация VH- и VL-домена друг с другом определяет один антигенсвязывающий сайт. Следовательно, Fab-фрагмент антитела по изобретению содержит сайт связывания с первым антигеном. В соответствующей молекуле антитела легкая цепь связана с главной цепью дисульфидной связью. В некоторых вариантах реализации молекула антитела согласно изобретению представляет собой димер, который включает две главных цепи и две легких цепи, как описано выше (также см. ниже).
В некоторых вариантах реализации последовательность рекомбинантной молекулы биспецифического антитела, согласно изобретению, можно сопоставить с последовательностью IgG1, поскольку последовательность молекулы антитела по изобретению имеет определенную степень сходства с последовательностью IgG1, как дополнительно показано ниже. По сравнению с аминокислотной последовательностью IgG1 по Кабату и др. (1991, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., United States Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda) главная цепь молекулы антитела по изобретению в некоторых вариантах реализации включает VH-домен в позициях аминокислоты 1-117, CH1-домен в позициях 118-215, шарнирную область в позициях 216-230 и CH2-домен в позициях 231-340.
В этих вариантах реализации в соответствии с аминокислотной последовательностью главной цепи антитела согласно изобретению Fab-фрагмент, состоящий из VH-домена, CH1-домена и шарнирной области, обычно охватывает аминокислоты 1-230. В составе этого Fab-фрагмента VH-домен обычно определен аминокислотами 1-118, CH1-домен определен аминокислотами 119-216, а шарнирная область определена аминокислотами 217-231 согласно нумерации Кабата. Цепь антитела с последовательностью SEQ ID NO: 6 может служить примером соответствующего варианта реализации. В некоторых вариантах реализации молекула антитела согласно изобретению в позициях 342 и далее главной цепи имеет химерную последовательность, составленную из VH-домена и VH-домена. В некоторых вариантах реализации VH-домен расположен так, что он определяет С-концевой домен этой химерной последовательности. В некоторых вариантах реализации антитело по изобретению, в отличие от аминокислотной последовательности IgG1 по Кабату и др., имеет СН3-домен в позициях 342-447, после которого следует химерная последовательность, составленная из VH-домена и С-концевого VH-домена. В таких вариантах реализации, где СН3-домен включен в состав антитела, согласно изобретению этот СН3-домен определен аминокислотами 342-448 в соответствии с аминокислотной последовательностью главной цепи молекулы антитела. Химерная последовательность, составленная из VH-домена и VL-домена, которые в этих вариантах реализации могут быть С-концевыми (см. выше), в этих реализациях находится в позициях 449 и далее аминокислотной последовательности главной цепи молекулы антитела.
Молекула биспецифического антитела по изобретению может иметь два сайта связывания любой желаемой специфичности. В некоторых вариантах реализации один из сайтов связывания способен к связыванию опухоль-ассоциированного антигена. В некоторых вариантах реализации сайт связывания, включенный в состав Fab-фрагмента, представляет собой сайт связывания, который специфичен в отношении поверхностного опухоль-ассоциированного антигена. В некоторых вариантах реализации сайт связывания, включенный в состав одноцепочечного Fv-фрагмента, представляет собой сайт связывания, который специфичен в отношении опухоль-ассоциированного антигена, такого как поверхностный опухоль-ассоциированный антиген.
Используемый здесь термин поверхностный опухоль-ассоциированный антиген относится к антигену, который присутствует или может присутствовать на поверхности, расположенной на или внутри опухолевых клеток. Эти антигены могут присутствовать на поверхности клетки с внеклеточной частью, которая зачастую скомбинирована с трансмембранной и цитоплазматической частью молекулы. Эти антигены в некоторых вариантах реализации могут быть презентированы только опухолевыми клетками, а не нормальными, т.е. неопухолевыми клетками. Опухолевые антигены могут экспрессироваться исключительно на опухолевых клетках или могут выражать опухоль-специфическую мутацию по сравнению с неопухолевыми клетками. В таком варианте реализации соответствующий антиген может называться опухоль-специфическим антигеном. Некоторые антигены презентируются как опухолевыми, так и неопухолевыми клетками, которые могут называться опухоль-ассоциированными антигенами. Эти опухоль-ассоциированные антигены могут сверхэкспрессироваться на опухолевых клетках по сравнению с неопухолевыми клетками или быть доступными для связывания антителом в опухолевых клетках в силу менее компактной структуры опухолевой ткани по сравнению с неопухолевой тканью. В некоторых вариантах реализации поверхностный опухоль-ассоциированный антиген расположен на сосудистой сети опухоли.
Примерами, иллюстрирующими поверхностный опухоль-ассоциированный антиген, являются CD10, CD19, CD20, CD22, Cd33, Fms-подобная тирозинкиназа 3 (FLT-3, CD135), хондроитинсульфатпротеогликан 4 (CSPG4, ассоциированный с меланомой хондроитинсульфатпротеогликан), рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), Her2/neu, Her3, IGFR, CD133, IL3R, фибробласт-активирующий белок (FAP), CDCP1, Derlinl, тенасцин, frizzled 1-10, сосудистые антигены VEGFR2 (KDR/FLK1), VEGFR3 (FLT4, CD309), PDGFR-α (CD140a), PDGFR-β (CD140b) эндоглин, CLEC14, Tem1-8 и Tie2. Еще одни примеры могут включать в себя А33, САМРАТН-1 (CDw52), карциноэмбриональный антиген
- 15 040607 (СЕА), карбоангидраза IX (MN/CA IX), CD21, CD25, CD30, CD34, CD37, CD44v6, CD45, CD133, de2-7 EGFR, EGFRvIII, EpCAM, Ep-CAM, фолатсвязывающий протеин, G250, Fms-подобная тирозинкиназа 3 (FLT-3, CD135), c-Kit (CD117), CSF1R (CD115), HLA-DR, IGFR, IL-2-рецептор, IL3R, MCSP (ассоциированный с меланомой поверхностно-клеточный хондроитинсульфатпротеогликан), Muc-1, простатаспецифический мембранный антиген (PSMA), антиген стволовой клетки простаты (PSCA), простатаспецифический антиген (PSA) и TAG-72. Примерами антигенов, экспрессирующихся на внеклеточном матриксе опухолей, являются тенасцин и фибробласт-активирующий белок (FAP).
В некоторых вариантах реализации один из сайтов связывания молекулы антитела по изобретению способен к связыванию молекулы специфического Т-клеточного рецептора и/или молекулы специфического рецептора естественной клетки-киллера (NK-клетки). Специфический Т-клеточный рецептор представляет собой так называемый Т-клеточный рецептор (TCR), который обеспечивает Т-клетке возможность связывания с эпитопом/антигеном и, при наличии дополнительных сигналов, активации эпитопом/антигеном и отклика на эпитоп/антиген, при этом указанный эпитоп/антиген презентируется другой клеткой, называемой антиген-презентирующей клеткой или АРС. Известно, что Т-клеточный рецептор имеет сходство с Fab-фрагментом иммуноглобулина естественного происхождения. В целом он является моновалентным, охватывает α- и β-цепи, а в некоторых вариантах реализации он охватывает γ- и δ-цепи (см. выше). Соответственно в некоторых вариантах реализации TCR представляет собой TCR (альфа/бета), а в некоторых вариантах реализации он представляет собой TCR (гамма/дельта). Т-клеточный рецептор образует комплекс с Т-клеточным корецептором CD3. CD3 представляет собой комплекс белка, и он составлен из четырех различных цепей. У млекопитающих этот комплекс состоит из CD3γ-цепи, CD3δ-цепи и двух CD3ε-цепей. Эти цепи ассоциируются с молекулой, известной как Т-клеточный рецептор (TCR) и ζ-цепью для генерирования сигнала активации в Т-лимфоцитах. Таким образом, в некоторых вариантах реализации специфический Т-клеточный рецептор представляет собой Т-клеточный корецептор CD3. В некоторых вариантах реализации специфическим Т-клеточным рецептором является CD28, белок, также экспрессирующийся на Т-клетках. CD28 может обеспечить костимулирующие сигналы, необходимые для активации Т-клеток. CD28 выполняет важные функции в пролиферации и выживании Т-клеток, выработке цитокинов и развитии Т-хелпера типа 2. Еще одним примером специфического Т-клеточного рецептора является CD134, называемый также Ох40. CD134/OX40 экспрессируется через 24-72 ч после активации и может быть взят для определения вторичной костимулирующей молекулы. Другим примером Т-клеточного рецептора является 4-1ВВ, способный связываться с 4-1ВВ-лигандом на антиген-презентирующих клетках (АРС), посредством чего генерируется костимулирующий сигнал для Т-клетки. Другим примером рецептора, присутствующего преимущественно на Т-клетках, является CD5, который также находится на В-клетках на низких уровнях. Еще одним примером рецептора, модифицирующего функции Т-клеток, является CD95, известный также как Fas-рецептор, который опосредует апоптотический сигналинг Fas-лигандом, экспрессирующимся на поверхности других клеток. Было сообщено, что CD95 модулирует TCR/CD3-активируемые пути сигналинга в покоящихся Т-лимфоцитах.
Примером молекулы специфического NK-клеточного рецептора является CD16, низкоаффинный Fc-рецептор и NKG2D. Примером молекулы рецептора, которая презентируется на поверхности как Т-клеток, так и естественных клеток-киллеров (NK-клеток), является CD2 и другие члены CD2-суперсемейства. CD2 может действовать как костимулирующая молекула на Т- и NK-клетках.
В некоторых вариантах реализации первый сайт связывания молекулы антитела связывает поверхностный опухоль-ассоциированный антиген, а второй сайт связывания связывает молекулу специфического Т-клеточного рецептора и/или молекулу специфического рецептора естественной клетки-киллера (NK). В некоторых вариантах реализации первый сайт связывания молекулы антитела связывает один из следующих: А33, САМРАТН-1 (CDw52), карциноэмбриональный антиген (СЕА), карбоангидраза IX (MN/CA IX), CD10, CD19, CD20, CD21, CD22, CD25, CD30, CD33, CD34, CD37, CD44v6, CD45, CD133, CDCP1, Her3, хондроитинсульфатпротеогликан 4 (CSPG4, ассоциированный с меланомой хондроитинсульфатпротеогликан), CLEC14, Derlin1, рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), de2-7 EGFR, EGFRvIII, EpCAM, эндоглин, ЕР-CAM, фибробласт-активирующий белок (FAP), фолатсвязывающий белок, G250, Fms-подобная тирозинкиназа 3 (FLT-3, CD135), c-Kit (CD117), CSF1R (CD115), frizzled 1-10, Her2/neu, HLA-DR, IGFR, рецептор IL-2, IL3R, MCSP (ассоциированный с меланомой поверхностноклеточный хондроитинсульфатпротеогликан), Muc-1, простата-специфический мембранный антиген (PSMA), антиген стволовой клетки простаты (PSCA), простата-специфический антиген (PSA), TAG-72, тенасцин, Tem1-8, Tie2 и VEGFR2 (KDR/FLK1), VEGFR3 (FLT4, CD309), PDGFR-α (CD140a), PDGFR-β (CD140b), a второй сайт связывания связывает молекулу специфического Т-клеточного рецептора и/или молекулу специфического рецептора естественной клетки-киллера (NK). В некоторых вариантах реализации первый сайт связывания молекулы антитела связывает поверхностный опухоль-ассоциированный антиген, а второй сайт связывания связывает один из CD3, Т-клеточный рецептор (TCR), CD28, CD16, NKG2D, Ох40, 4-1ВВ, CD2, CD5 и CD95.
В некоторых вариантах реализации первый сайт связывания молекулы антитела связывает молекулу специфического Т-клеточного рецептора и/или молекулу специфического рецептора естественной
- 16 040607 клетки-киллера (NK), а второй сайт связывания связывает поверхностный опухоль-ассоциированный антиген. В некоторых вариантах реализации первый сайт связывания антитела связывает молекулу специфического Т-клеточного рецептора и/или молекулу специфического рецептора естественной клеткикиллера (NK), а второй сайт связывания связывает один из следующих: А33, САМРАТН-1 (CDw52), карциноэмбриональный антиген (СЕА), карбоангидраза IX (MN/CA IX), CD10, CD19, CD20, CD21, CD22, CD25, CD30, CD33, CD34, Cd37, CD44v6, CD45, CD133, CdCPI, Her3, хондроитинсульфатпротеогликан 4 (CSPG4, ассоциированный с меланомой хондроитинсульфатпротеогликан), CLEC14, Derlinl, рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), de2-7 EGFR, EGFRvIII, EpCAM, эндоглин, ЕР-CAM, фибробластактивирующий белок (FAP), фолатсвязывающий белок, G250, Fms-подобная тирозинкиназа 3 (FLT-3, CD135), frizzled 1-10, Her2/neu, HLA-DR, IGFR, рецептор IL-2, IL3R, MCSP (ассоциированный с меланомой поверхностно-клеточный хондроитинсульфатпротеогликан), Muc-1, простата-специфический мембранный антиген (PSMA), простата-специфический антиген (PSA), TAG-72, тенасцин, Tem1-8, Tie2 и VEGFR. В некоторых вариантах реализации первый сайт связывания антитела связывает один из следующих: CD3, Т-клеточный рецептор (TCR), CD28, CD16, NKG2D, Ох40, 4-1ВВ, CD2, CD5 и CD95, а второй сайт связывания связывает поверхностный опухоль-ассоциированный антиген.
Термин гликозилирование означает присоединение олигосахаридов (углеводов, содержащих два или больше простых сахаров, связанных вместе, например от двух до двенадцати простых сахаров, связанных вместе) к гликопротеину. Боковые цепи олигосахаридов обычно связаны с каркасом гликопротеина посредством N- или О-связей. Олигосахариды антител, раскрытых здесь, в целом присоединены к СН2-домену Fc-области в виде N-сцепленные олигосахаридов. N-сцепленное гликозилирование относится к присоединению углеводного фрагмента к аспарагиновому остатку в гликопротеиновой цепи. Специалисту в данной области техники будет ясно, что, например, СН2-домены каждого из мышиных IgG1, IgG2a, IgG2b и IgG3 и человеческих IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA и IgD имеют один сайт для N-сцепленного гликозилирования в остатке 297.
Последовательности доменов или областей, включенных в молекулу антитела, согласно изобретению могут представлять собой последовательности любых разновидностей. Тем не менее в зависимости от последующего применения молекулы антитела, в некоторых вариантах реализации может быть желательно внесение изменений, предотвращающих нежелательные побочные эффекты, вызываемые антителом. Применение интактных нечеловеческих антител в лечении болезней или расстройств у человека несет с собой потенциальную иммуногенность со всеми хорошо известными последствиями, что означает, что иммунная система пациента может распознать нечеловеческое интактное антитело как чужеродное и выработать нейтрализирующую реакцию. Это особенно очевидно при многократном введении нечеловеческого антитела пациенту-человеку. В течение многих лет для решения этих задач были разработаны различные методики, которые в целом включают снижение содержания нечеловеческих аминокислотных последовательностей в интактном антителе, сохраняя при этом относительную простоту получения нечеловеческих антител от иммунизированных животных, например мыши, крысы или кролика. Для достижения этих целей было выработано два общих подхода. Первый - это химерные антитела, которые в целом имеют нечеловеческий (а, например, относящийся к грызуну, такому как мышь) вариабельный домен, сцепленный с константной областью человека. В силу того что антигенсвязывающий сайт антитела определяется остатками внутри вариабельных доменов, химерное антитело сохраняет свою аффинность к антигену, но приобретает эффекторные функции константной области человека и, следовательно, способно выполнять эффекторные функции, как описано выше. Химерные антитела обычно получают, используя методы рекомбинантных ДНК. ДНК, кодирующую антитела (например, кДНК), выделяют и секвенируют с использованием стандартных процедур (например, с использованием олигонуклеотидных зондов, способных специфично связываться с генами, кодирующими Н- и L-цепи антитела по изобретению). Гибридомные клетки служат типичным источником такой ДНК. После выделения ДНК помещают в векторы экспрессии, которые затем трансфицируют в клетки-хозяева, такие как Е.coli, COS-клетки, СНО-клетки или клетки миеломы, которые без этого не продуцируют белок иммуноглобулина для синтеза антитела. ДНК может быть модифицирована путем замены кодирующей последовательности для L- и Н-цепей человека соответствующими нечеловеческими Н- и L-константными областями, например мышиными (см., например, Morrison, PNAS (1984), 81, 6851).
Второй подход включает генерирование гуманизированных антител, при которой не принадлежащее человеку содержимое антитела уменьшают за счет гуманизации вариабельных доменов. Распространение получили две методики гуманизации. Первая заключается в гуманизации путем трансплантации CDR. CDR определяют петли (см. выше), при этом антигенсвязывающая специфичность антитела главным образом определяется топографией и химическими характеристиками поверхности его CDR. Эти особенности, в свою очередь, определяются конформацией индивидуальных CDR, относительным расположением CDR, а также природой и расположением боковых цепей остатков, содержащих CDR. Значительное снижение иммуногенности может быть достигнуто за счет трансплантации CDR только нечеловеческих, например мышиных (донорских) антител на человеческий каркас (акцепторный каркас) и константные области (см. Jones et al. (1986), Nature, 321, 522-525; Verhoeyen M. et al. (1988), Science, 239, 1534-1536). Однако сама по себе трансплантация CDR может не обеспечить полное сохранение антиген
- 17 040607 связывающих свойств и часто оказывается, что некоторые каркасные остатки (иногда называемые обратными мутациями) донорского антитела должны быть сохранены в гуманизированной молекуле, если необходимо восстановить значительный уровень антиген-связывающей аффинности (см. Queen С. et al. (1989), PNAS, 86, 10,029-10,033; Со, М. et al. (1991), Nature, 351, 501-502). В этом случае из базы данных выбирают человеческие вариабельные домены, демонстрирующие наибольшую гомологию последовательностей относительно нечеловеческого донорского антитела, для формирования человеческого каркаса (FR). FR человека выбирают как из общетипичных, так и из индивидуальных человеческих антител. Где это необходимо, ключевые остатки из донорского антитела заменяют в человеческом акцепторном каркасе, чтобы сохранить CDR-конформации, при этом для помощи при идентификации таких структурно важных остатков может быть применено компьютерное моделирование антитела. См., например, WO 99/48523.
В качестве альтернативы гуманизация может быть достигнута способом маскировки. Статистический анализ уникальных человеческих и мышиных вариабельных доменов тяжелой и легкой цепей иммуноглобулина показал, что точные шаблоны подвергнутых воздействию остатков отличаются у человеческих и мышиных антител и наиболее индивидуальные позиции на поверхности являются более предпочтительными по сравнению с малым числом разных остатков (см. Padlan E.A. et al. (1991), Mol. Immunol., 28, 489-498; и Pedersen J.T. et al. (1994), J. Mol. Biol., 235; 959-973). Следовательно, можно снизить иммуногенность нечеловеческого Fv путем замены подвергнутых воздействию остатков в его каркасных областях, отличающиеся от тех, которые обычно находятся в антителах человека. Поскольку антигенность белка может быть связана с поверхностной доступностью, замены поверхностных остатков может быть достаточно, чтобы сделать вариабельный домен грызуна невидимым для иммунной системы человека (см. также Mark G.E. et al. (1994) в Handbook of Experimental Pharmacology, vol. 113: The pharmacology of monoclonal Antibodies, Springer-Verlag, p. 105-134). Эту процедуру гуманизации называют маскировкой, поскольку при ней изменяют только поверхность антитела, а опорные остатки остаются нетронутыми.
Молекула антитела по изобретению может быть получена с использованием любой известной и широко применяемой системы экспрессии и рекомбинантной технологии культивирования клеток, например экспрессии в бактериях-хозяевах (прокариотических системах) или эукариотических системах, таких как дрожжи, грибы, клетки насекомых или клетки млекопитающих. Молекула антитела по настоящему изобретению может быть получена в трансгенных организмах, таких как коза, растение или трансгенная мышь XENOMOUSE, сконструированных путем инжиниринга породы мыши, которая имеет крупные фрагменты локусов иммуноглобулина человека и является дефицитной в отношении продуцирования антитела мыши. Антитело также может быть получено путем химического синтеза.
Как правило, для рекомбинантного получения молекулы антитела по изобретению полинуклеотид, кодирующий антитело, выделяют и подвергают инсерции в реплицирующийся вектор, такой как плазмида, для последующего клонирования (амплификации) или экспрессии. Примером, иллюстрирующим подходящую систему экспрессии, является система глутаматсинтетазы (например, продаваемая Lonza Biologies), при этом клетка-хозяин представляет собой, например, СНО или NS0. Полинуклеотид, кодирующий антитело, легко выделяют и секвенируют с использованием традиционных процедур. Векторы, которые могут быть использованы, включают в себя плазмиду, вирус, фаг, транспозоны, минихромосомы, среди которых типичным вариантом реализации являются плазмиды. В целом такие векторы дополнительно включают сигнальную последовательность, ориджин репликации, один или более маркерных генов, энхансерный элемент, промотор и последовательности терминации транскрипции, функционально сцепленные с полинуклеотидом легкой и/или тяжелой цепей, способствуя экспрессии. Полинуклеотиды, кодирующие легкую и тяжелую цепи, могут быть подвергнуты инсерции в отдельные векторы и трансфицированы в одну и ту же клетку-хозяина, или при необходимости тяжелая цепь и легкая цепь могут быть подвергнуты инсерции в один и тот же вектор для трансфекции в клетку-хозяин. Обе цепи, например, могут быть скомпонованы под контролем бицистронного оперона и экспрессироваться, чтобы дать в результате функциональную и корректно сложенную молекулу антитела, как описано в Skerra, A. (1994) Use of the tetracycline promoter for the tightly regulated production of a murine antibody fragment in Escherichia coli, Gene, 151, 131-135; или Skerra, A. (1994), A general vector, pASK84, for cloning, bacterial production, and single-step purification of antibody Fab fragments, Gene, 141, 79-8. Таким образом, в соответствии с одним из аспектов настоящего изобретения представлен способ конструирования вектора, кодирующего легкую и/или тяжелую цепи антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по изобретению, причем способ включает инсерцию в вектор полинуклеотида, кодирующего легкую цепь и/или тяжелую цепь молекулы антитела по изобретению.
При использовании рекомбинантных методик молекула антитела может быть получена внутриклеточно в периплазматическом пространстве или секретирована непосредственно в среду (см. также Skerra, 1994, выше). Если антитело получено внутриклеточно, на первом этапе дебрис в виде частиц, или клетки-хозяева, или лизированные фрагменты удаляют, например, центрифугированием или ультрафильтрацией. В публикации Carter et al., Bio/Technology, 10:163-167 (1992) описана процедура выделения антител, секретированных в периплазматическое пространство Е.coli. Антитело также может быть получено в
- 18 040607 любой окислительной среде. Такая окислительная среда может быть получена периплазмой грамотрицательных бактерий, таких как Е.coli, во внеклеточной среде грамположительных бактерий, или в полости эндоплазматического ретикулума эукариотических клеток (включая клетки животных, такие как клетки насекомых или млекопитающих), и обычно способствует образованию структурных дисульфидных связей. Однако также возможно получение молекулы антитела по изобретению в цитозоли клетки-хозяина, такой как Е.coli. В таком случае полипептид может быть получен или напрямую в растворимом и сложенном состоянии или восстановлен в форме телец включения с последующей ренатурацией in vitro. Еще одним вариантом является использование специфических штаммов-хозяев, имеющих окислительную внутриклеточную среду, которая, таким образом, может способствовать формированию дисульфидных связей в цитозоли (Venturi M., Seifert С., Hunte С. (2002), High level production of functional antibody Fab fragments in an oxidizing bacterial cytoplasm, J. Mol. Biol., 315, 1-8).
Молекула антитела, продуцированная клетками, может быть очищена любым традиционным способом очистки, например гидроксилапатитовой хроматографией, гель-электрофорезом, диализом и аффинной хроматографией, которая является одной предпочтительной методикой очистки. Молекулы антител могут быть очищены аффинной очисткой белками/лигандами, специфично и обратимо связывающими константные домены, такие как CH1 или CL. Примерами таких белков являются иммуноглобулинсвязывающие бактериальные белки, такие как белок А, белок G, Белок A/G или белок L, причем связывание белка L ограничено молекулами антител, которые содержат легкие каппа-цепи. Альтернативным способом очистки антител с легкими k-цепями является использование нагруженных гранулами антител к каппа (KappaSelect). Пригодность белка А в качестве аффинного лиганда зависит от разновидности и изотипа любого Fc-домена иммуноглобулина, присутствующего в антителе. Белок А может использоваться для очистки антител (Lindmark et al., J. Immunol. Meth., 62:1-13 (1983)). Белок G рекомендуется для всех мышиных изотипов и для γ3 человека (Guss et al., EMBO J., 5:15671575 (1986)). Выбор способа очистки, используемого для конкретной молекулы антитела согласно изобретению, находится в компетенции специалиста в данной области техники.
Также можно снабдить одну из цепей молекулы антитела по изобретению аффинным маркером. Такие аффинные маркеры, как Strep-tag® или Strep-tag® II (Schmidt, T.G.M. et al. (1996), J. Mol. Biol., 255, 753-766), myc-tag, FLAG™-tag, His6-tag или HA-tag, обеспечивают легкое распознавание, а также простую очистку рекомбинантной молекулы антитела.
Термины мутировавший/мутированный, мутант/мутантный и мутация/мутирование, используемые в отношении нуклеиновой кислоты или полипептида, обозначают замену, делецию или инсерцию одного или более нуклеотидов или аминокислот соответственно по сравнению с нуклеиновой кислотой или полипептидом естественного происхождения, т.е. эталонной последовательностью, которая может быть взята для определения дикого типа.
В этом отношении следует понимать, что термин позиция, используемый в контексте данного изобретения, подразумевает позицию аминокислоты в представленной здесь аминокислотной последовательности. Такая позиция может быть обозначена относительно сходной нативной последовательности, например последовательности домена или цепи IgG естественного происхождения. Используемый здесь термин соответствующий также включает то, что такая позиция не обязательна или определяется не только количеством предшествующих нуклеотидов/аминокислот. Таким образом, позиция заданной аминокислоты согласно настоящему изобретению, которая может быть заменена, может меняться вследствие делеции или добавления аминокислот в любом месте в цепи антитела.
Следовательно, в контексте изобретения под соответствующей позицией следует понимать то, что аминокислоты могут отличаться по обозначенному номеру, однако, все еще имея подобные соседние аминокислоты. Указанные аминокислоты, которые могут быть заменены, удалены или добавлены, также охвачены термином соответствующая позиция. Чтобы определить, соответствует ли аминокислотный остаток в заданной аминокислотной последовательности определенной позиции в аминокислотной последовательности домена или цепи иммуноглобулина естественного происхождения, специалист может использовать средства и способы, которые широко известны в данной области техники, например выравнивание вручную или с использованием таких компьютерных программ, как BLAST2.0, что расшифровывается, как средство поиска основного локального выравнивания, или ClustalW, или любой другой программы, которая пригодна для генерирования выравниваний последовательностей.
В некоторых вариантах реализации под заменой (или замещением) подразумевается консервативная замена. В целом консервативными заменами являются следующие замены, перечисленные в соответствии с аминокислотами, подлежащими мутации, за каждым из которых следует одна или более замен, которые можно принять за консервативные: Ala^Gly, Ser, Val; Arg^Lys; Asn^Gln, His; Asp^Glu; Cys^Ser; Gln^Asn; Glu^Asp; Gly^Ala; His^Arg, Asn, Gln; Ile^Leu, Val; Leu^Ile, Val; Lys^Arg, Gln, Glu; Met^Leu, Tyr, Ile; Phe^Met, Leu, Tyr; Ser^Thr; Thr^Ser; Trp^Tyr; Tyr^Trp, Phe; Val^Ile, Leu. Другие замены также допустимы и могут быть определены эмпирически или по известным консервативным или неконсервативным заменам. В качестве еще одной ориентировки приведены следующие восемь групп, каждая из которых содержит аминокислоты, которые, как правило, могут быть взяты для опреде
- 19 040607 ления консервативных замен между собой:
1) аланин (Ala), глицин (Gly);
2) аспарагиновая кислота (Asp), глутаминовая кислота (Glu);
3) аспарагин (Asn), глютамин (Gln);
4) аргинин (Arg), лизин (Lys);
5) изолейцин (Ile), лейцин (Leu), метионин (Met), валин (Val);
6) фенилаланин (Phe), тирозин (Tyr), триптофан (Trp);
7) серии (Ser), треонин (Thr); и
8) цистеин (Cys), метионин (Met).
Если такие замены приводят к изменению биологической активности, то могут быть внесены более существенные изменения, такие как перечисленные ниже или дополнительно описанные ниже в отношении классов аминокислот, после чего продукты скринируют на желаемую характеристику. Примерами таких более существенных изменений являются Ala^Leu, Ile; Arg^Gln; Asn^Asp, Lys, Arg, His; Asp^Asn; Cys^Ala; Gln^Glu; Glu^Gln; His^Lys; Ile^Met, Ala, Phe; Leu^Ala, Met, норлейцин; Lys^Asn; Met^Phe; Phe^Val, Ile, Ala; Trp^Phe; Tyr^Thr, Ser; Val^Met, Phe, Ala.
В некоторых вариантах реализации молекула антитела согласно изобретению включает один или более аминокислотных остатков, в том числе два, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать, двенадцать, тринадцать, четырнадцать, пятнадцать, шестнадцать, семнадцать или восемнадцать аминокислотных остатков, которые мутированы для предотвращения димеризации через остатки цистеина или для модуляции Fc-функции. В некоторых из этих вариантов реализации мутированными являются один или более аминокислотных остатков СН2-домена и/или шарнирной области, способных опосредствовать связывание с Fc-рецепторами. При наличии один или более аминокислотных остатков, способных опосредствовать связывание с Fc-рецепторами, могут представлять собой аминокислотный остаток, способный активировать антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) или комплемент-опосредованную цитотоксичность (CDC). В некоторых вариантах реализации соответствующий аминокислотный остаток, способный к опосредованию связывания с Fc-рецепторами, заменен другой аминокислотой в целом при сравнении данной последовательности с последовательностью соответствующего домена иммуноглобулина естественного происхождения, такого как IgG. В некоторых вариантах реализации такой аминокислотный остаток, способный опосредовать связывания с Fc-рецепторами, подвергают делеции в целом относительно последовательности соответствующего домена естественного происхождения в иммуноглобулине, таком как IgG. Однако в других вариантах реализации изобретения, когда молекула биспецифического антитела состоит из Fab-фрагмента, одноцепочечного Fv-фрагмента и СН2-домена иммуноглобулина, в объем изобретения входит введение мутаций в СН2-домен человеческого γ1, что оптимизирует антителозависимую цитотоксичность (ADCC).
Такие мутации описаны, например, в международных патентных заявках WO 2011/076922 и WO 2011/089211.
В некоторых вариантах реализации один или более мутировавших, например замещенных или подвергнутых делеции, аминокислотных остатков представляют собой аминокислоту, расположенную в одной из позиций 226, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 265, 297, 327 и 330. Здесь также нумерация используемых аминокислот соответствует позициям в последовательности согласно нумерации Кабата (индекс ЕС). Соответствующая делеция аминокислоты может представлять собой, например, делецию аминокислоты 228, в целом пролина в IgG, делецию аминокислоты 229, в целом цистеина в IgG, делецию аминокислоты 230, в целом пролина в IgG, делецию аминокислоты 231, в целом аланина в IgG, делецию аминокислоты 232, в целом пролина в IgG, делецию аминокислоты 233, в целом глутаминовой кислоты в IgG, делецию аминокислоты 234, в целом лейцина в IgG, делецию аминокислоты 235, в целом лейцина в IgG, делецию аминокислоты 236, в целом глицина в IgG, делецию аминокислоты 237, в целом глицина в IgG, делецию аминокислоты 238, в целом пролина в IgG, и делецию аминокислоты 265, в целом аспарагиновой кислоты в IgG. Соответствующая замена аминокислоты может представлять собой, например, замену аминокислоты 226, в целом цистенина в IgG, замену аминокислоты 228, в целом пролина в IgG, замену аминокислоты 229, в целом цистеина в IgG, замену аминокислоты 230, в целом пролина в IgG, замену аминокислоты 231, в целом аланина в IgG, замену аминокислоты 232, в целом пролина в IgG, замену аминокислоты 233, в целом глутаминовой кислоты в IgG, замену аминокислоты 234, в целом лейцина в IgG, замену аминокислоты 235, в целом лейцина в IgG, замену аминокислоты 265, в целом аспарагиновой кислоты в IgG, замену аминокислоты 297, в целом аспарагина в IgG, замену аминокислоты 327, в целом аланина в IgG, и замену аминокислоты 330, в целом аланина в IgG. Соответствующей заменой может быть одна из следующих замен: Cys226®Ser, Cys229®Ser, Glu233®Pro, Leu234®Val, Leu235®Ala, Asp265®Gly, Asn297®Gln, Ala327®Gln, Ala327®Gly и Ala330®Ser. Как можно понять из приведенного выше, в некоторых вариантах реализации один или два остатка цистеина в позициях 226 и 229 в шарнирной области заменяются на другую аминокислоту, например, остатком серина. Таким образом, может быть предотвращено образование дисульфидной связи с другой главной цепью. Кроме того, а также, как описано ниже, делеция и/или замена (мутация) выбранных аминокис
- 20 040607 лотных остатков в СН2-домене, который способен опосредовать связывание с Fc-рецепторами, могут обусловить снижение или потерю молекулой антитела по изобретению активности в части антителозависимой клеточно-опосредованной цитотоксичности и фиксации комплемента.
Другой тип аминокислотного варианта антитела изменяет исходный профиль гликозилирования (при наличии такового) молекулы антитела. Под изменением понимается делеция из антитела одного или более присутствующих в нем углеводных фрагментов и/или добавление к нему одного или более сайтов гликозилирования, отсутствующих в антителе. Гликозилирование антител обычно осуществляется N- или О-сцеплением. N-сцепление относится к присоединению углеводного фрагмента к боковой цепи аспарагинового остатка. Трипептидные последовательности аспарагин-Х-серин и аспарагин-Х-треонин, где X - любая аминокислота, кроме пролина, являются последовательностями распознавания для ферментативного прикрепления углеводного фрагмента к боковой цепи аспарагина. Таким образом, наличие любой из этих трипептидных последовательностей в полипептиде формирует потенциальный сайт гликозилирования. О-сцепленное гликозилирование относится к присоединению одного из сахаров N-ацетилгалактозамина, галактозы или ксилозы к гидроксиламинокислоте, чаще всего к серину или треонину, хотя также может быть использован 5-гидроксипролин или 5-гидроксилизин. Добавление сайтов гликозилирования к антителу легко осуществляется путем изменения аминокислотной последовательности таким образом, чтобы она содержала одну или более из описанных выше трипептидных последовательностей (для N-сцепленных сайтов гликозилирования). Это изменение также может быть осуществлено путем добавления одного или более остатков серина или треонина к последовательности исходного антитела или путем замены ими (для О-сцепленных сайтов гликозилирования).
В контексте данного изобретения в некоторых вариантах реализации часть главной цепи молекулы антитела по изобретению, представляющая Fc-область иммуноглобулина, обычно инертна или оказывает по меньшей мере по существу низкое воздействие в отношении связывания с Fc-рецепторами. Как уже сказано, это достигается путем делеции и/или замены (мутации) по меньшей мере одного из выбранных аминокислотных остатков в СН2-домене, способных опосредовать связывание с Fc-рецептором. Здесь такие молекулы антител также называются Fc-аттенуированными или Fcko-молекулами антитела. Таким образом, часть цепи антитела по изобретению, которое может быть взято для представления части Fc-фрагмента, т.е. СН2-домен и при наличии СН3-домен, может составлять каркас без обеспечения конкретной биологической функции, например эффекторной функции. Однако в настоящем изобретении было выявлено, что этот каркас способен обеспечивать значительные преимущества в части очистки, эффективности продуцирования и/или стабильности молекул антитела по изобретению по сравнению с известными молекулами антител (см. примеры).
В некоторых вариантах реализации распознавание и, соответственно, связывание этой части, соответствующей Fc-фрагменту, с конкретным Fc-рецептором приблизительно в 2 раза, приблизительно в 5 раз, приблизительно в 8 раз, приблизительно в 10 раз, приблизительно в 12 раз, приблизительно в 15 раз, приблизительно в 20 раз или более ниже, чем у Fc-области иммуноглобулина естественного происхождения. В некоторых вариантах реализации эта часть, соответствующая Fc-фрагменту, полностью лишена способности связывания с Fc-рецепторами. Связывание антитела с Fc-рецепторами, включая определение константы диссоциации, может быть легко определено специалистом с применением стандартных методик, таких как поверхностный плазмонный резонанс, с использованием, например, измерений с помощью Biacore™. Подобным образом, может быть использован любой другой способ измерения биомолекулярного связывания, который может быть основан, например, на средствах спектроскопии, фотохимии, фотометрии или радиологии. Примерами соответствующих способов обнаружения являются флуоресцентная корреляционная спектроскопия, фотохимическое поперечное сшивание и применение, соответственно, фотоактивных или радиоактивных меток. Некоторые из этих способов могут включать методики дополнительного разделения, такие как электрофорез или ВЭЖХ.
При необходимости для этой цели может быть осуществлена замена или делеция аминокислотных остатков, как объяснено выше. Подходящие мутации могут быть взяты, например, из Armour et al. (Eur. J. Immunol. (1999), 29, 2613-2624). Другие подходящие позиции для мутаций до последовательности цепи антитела могут быть взяты из данных кристаллической структуры, опубликованных в отношении комплекса между FcyRIII и Fc-фрагментом IgG1 человека (Sondermann et al., Nature (2000), 406, 267-273). В дополнение к описанному выше измерению аффинности для оценки уровня Fc-аттенуации или потери аффинности также возможна функциональная оценка способности (ее отсутствия) опосредствовать связывание с Fc-рецептором. В случае молекул антитела, которые связывают CD3 в качестве одной мишени, можно, например, оценить связывание через митогенность молекул таких CD3-связывающих антител на клетках. Митогенность опосредуется связыванием антител CD3 с Fc-рецепторами на А-клетках, таких как моноциты. Если молекула антитела по изобретению, которая имеет один сайт связывания для CD3, не проявляет никакого митогенного эффекта, в то время как родительское моноклональное анти-CD3 антитело, которое имеет функциональную Fc-часть, индуцирует интенсивный митоз в Т-клетках, становится ясно, что в силу отсутствия митоза молекула антитела по изобретению не обладает способностью к Fc-связыванию и, следовательно, может рассматриваться как молекула Fc-нокаута. Примеры, иллюст
- 21 040607 рирующие способ оценки анти-CD3-опосредованной митогенности, описаны в Davis, Vida & Lipsky (J. Immunol. (1986), 137, 3758); и Ceuppens, J.L., van Vaeck, F. (см. J. Immunol. (1987), 139, 4067 или Cell. Immunol. (1989), 118, 136). Другие иллюстрирующие примеры оценки митогенности антитела были описаны в Rosenthal-Allieri et al. (Rosenthal-Allieri M.A., Ticcioni M., Deckert M., Breittmeyer J.P., Rochet N., Rouleaux M., Senik A., Bemerd A., Cell Immunol., 1995, 163(1):88-95); и Grosse-Hovest et al. (Grosse-Hovest L., Hartlapp I., Marwan W., Brem G., Rammensee H-G, and Jung G., Eur. J. Immunol. (2003), may, 33(5):1334-1340). В дополнение к этому отсутствие Fc-связывания может быть оценено по способности молекулы антитела согласно изобретению опосредовать одну или более известных эффекторных функций Fc-части.
Как отмечено выше, замены или делеции остатков цистеина могут быть выполнены для введения или удаления одной или более дисульфидных связей, в том числе для введения или удаления потенциальной или ранее существовавшей дисульфидной связи. За счет этого можно управлять связью между главной цепью и более легкой/более короткой цепью молекулы антитела по изобретению, в том числе устанавливать, усиливать или удалять эту связь. Путем введения или удаления одного или более остатков цистеина может быть введен или удален дисульфидный мостик. В качестве иллюстративного примера, тетрамерная молекула антитела по настоящему изобретению имеет одну или более дисульфидных связей, соединяющих две димерные молекулы антитела. Одна такая дисульфидная связь обычно образована цистеином в главной цепи первой димерной молекулы антитела и цистеином в шарнирной области второй димерной молекулы антитела. В этом отношении в некоторых вариантах реализации антитело по изобретению может включать аминокислотную замену нативного остатка цистеина в позициях 226 и/или 229 относительно последовательности IgG человека в соответствии с нумерацией Кабата (индекс Е) другим аминокислотным остатком.
Замены или делеции таких аминокислотных остатков, как остатки аргинина, аспарагина, серина, треонина или тирозина, также могут выполняться для модификации профиля гликолизирования антитела. В качестве иллюстративного примера молекула IgG имеет одиночный N-сцепленный биантенарный углевод в Asn297 СН2-домена. Для IgG как сывороточного, так и полученного ex vivo в гибридомах или сконструированных путем инжиниринга клетках, IgG являются гетерогенными относительно присоединенного к Asn-297 углевода. В случае с IgG человека, основной олигосахарид обычно состоит из GlcNAc2Man3GlcNAc при отличающихся номерах внешних остатков.
Известно, что, кроме связывания антигенов/эпитопов, иммуноглобулин имеет другие эффекторные функции, биологические активности, связанные к Fc-областью (Fc-областью с нативной последовательностью или вариантной Fc-областью с аминокислотной последовательностью) иммуноглобулина, и изменяется в зависимости от изотипа иммуноглобулина. Примерами эффекторных функций антитела являются Clq-связывание и комплементзависимая цитотоксичность (CDC); связывание Fc-рецептора; антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность (ADCC); фагоцитоз; даун-регуляция поверхностно-клеточных рецепторов (например, В-клеточных рецепторов) и активация В-клеток. Осуществление антителом эффекторных функций в целом включает задействование эффекторных клеток. Некоторые эффекторные функции иммуноглобулина опосредствуются Fc-рецепторами (FcR), которые связывают Fc-область антитела. FcR определяются их специфичностью к изотипам иммуноглобулина; Fc-рецепторы для антител IgG называются FcyR, для IgE - FcεR, для IgA - FcaR и т.д. Любая из этих эффекторных функций (или потеря этих эффекторных функций), таких как CDC или ADCC, может быть использована для оценки того, отсутствует ли у молекулы антитела по изобретению способность Fc-связывания.
В данном контексте следует отметить, что термин Fc-рецептор или FcR обозначает рецептор, в целом белок, способный связываться с Fc-областью антитела. Fc-рецепторы расположены на поверхности определенных клеток иммунной системы организма, например естественных клеток-киллеров, макрофагов, нейтрофилов и тучных клеток. In vivo Fc-рецепторы связываются с иммуноглобулинами, иммобилизованными на инфицированных клетках или присутствующими на инвазивных патогенах. Их активность стимулирует фагоцитарные или цитотоксические клетки для уничтожение микробов или инфицированных клеток за счет антитело-опосредованного фагоцитоза или антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности. Некоторые вирусы, такие как флавивирусы, используют Fc-рецепторы при инфицировании клеток за счет механизма, известного как антителозависимое усиление инфекции. Обзор рецепторов FcR был сделан в Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9:457-92 (1991); Capel et al., Immunomethods, 4:25-34 (1994); и de Haas et al., J. Lab. Clin. Med., 126:330-41 (1995).
Комплементзависимая цитотоксичность или CDC относится к лизису клетки-мишени в присутствии комплемента. Активация пути классического комплемента инициируется путем связывания первого компонента (Clq) системы комплемента с антителами (соответствующего подкласса), связанными со своим распознанным антигеном. Для оценки активации комплемента может быть выполнен CDC-анализ, например, как описано в Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods, 202:163 (1997).
Термин система комплемента используется в данной области техники для обозначения ряда мелких белков, называемых факторами комплемента, присутствующих в крови, которые в целом циркулируют в виде неактивных предшественников (пробелков). Термин относится к способности этой неизменной и неадаптивной системы комплементировать способность антител и фагоцитов для очистки орга
- 22 040607 низма от патогенов, таких как бактерии, а также от комплексов антиген-антитело. Примером факторов комплемента является комплекс С1, включающий C1q и две сериновые протеазы - C1r и C1s. Комплекс С1 представляет собой компонент пути CDC. C1q представляет собой шестивалентную молекулу с молекулярной массой примерно 460000 и структурой, похожей на букет тюльпанов, в котором шесть коллагеновых стеблей соединены с шестью сферическими областями, представляющими собой головку. Для активации каскада комплемента необходимо, чтобы C1q связывался по меньшей мере с двумя молекулами из IgG1, IgG2 или IgG3.
Термин антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность или ADCC относится к форме цитотоксичности, при которой секретированные Ig, связанные с Fc-рецепторами (FcR), присутствующими на определенных цитотоксических клетках, таких как естественные клетки-киллеры (NK), нейтрофилы и макрофаги, обеспечивают специфическое связывание этих цитотоксических эффекторных клеток с антиген-несущей клеткой-мишенью для последующего киллинга этой клетки-мишени цитотоксинами. Антитела заряжают цитотоксические клетки и требуются для киллинга клетки-мишени посредством этого механизма. Первичные клетки для опосредования ADCC, NK-клетки, экспрессируют только FcyRIII, тогда как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIII. Экспрессия FcR на гематопоэтических клетках обобщена в табл. 3 на странице 464 в публикации Ravetch, Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9:457-92 (1991). Для оценки активности ADCC интересующей молекулы может быть проведен анализ ADCC in vitro, как описано в патентах US 5500362 или 5821337. Эффекторные клетки, пригодные для таких анализов, включают, но без ограничения, периферические мононуклеарные клетки крови (РВМС) и естественные клетки-киллеры (NK). В некоторых вариантах реализации ADCC-активность интересующей молекулы может быть оценена in vivo, например, на модели животного, как описано в Clynes et al., PNAS, USA, 95:652-656 (1998).
Некоторые эффекторные функции антитела опосредуются Fc-рецепторами (FcR), которые связывают Fc-область антитела. FcR определяются специфичностью к изотипам иммуноглобулина; Fc-рецепторы для антител IgG называются FcyR, для IgE - FcεR, для IgA - FcaR и т.д. Было выделено три подкласса FcyR: FcyRI (CD64), FcyRII (CD32) и FcyRIII (CD16).
Переходя далее к нуклеиновым кислотам, согласно изобретению молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая одну или более цепей антитела, согласно изобретению может представлять собой любую нуклеиновую кислоту в любой возможной конфигурации, например однонитевой, двунитевой или их комбинацию. В нуклеиновые кислоты входят, например, молекулы ДНК, молекулы РНК, аналоги ДНК или РНК, генерируемые с использованием аналогов нуклеотидов или с использованием химии нуклеиновых кислот, молекулы закрытой нуклеиновой кислоты (ЗНК) и молекулы белковых нуклеиновых кислот (БНК). ДНК или РНК могут иметь геномное или синтетическое происхождение и могут быть одноили двунитевыми. Такая нуклеиновая кислота может представлять собой, например, мРНК, кРНК, синтетическую РНК, геномную ДНК, кДНК, синтетическую ДНК, сополимер ДНК и РНК, олигонуклеотиды и т.д. Соответствующая нуклеиновая кислота, кроме того, может содержать ненатуральные аналоги нуклеотидов и/или быть связана с аффинным маркером или меткой.
В некоторых вариантах реализации последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую цепь, такую как главную цепь и/или меньшую цепь, антитела по изобретению, включают в вектор, например плазмиду. Когда необходима замена или делеция в цепи антитела, по сравнению с доменом или областью антитела естественного происхождения, в качестве исходной точки мутагенеза может быть использована кодирующая последовательность соответствующего нативного/ой домена/области, например, входящего/ей в последовательность иммуноглобулина. Для осуществления мутагенеза выбранных аминокислотных позиций в распоряжении специалиста имеются различные стандартные методики сайтнаправленного мутагенеза. Общеупотребимой методикой является включение мутаций посредством ПЦР (полимеразной цепной реакции) с использованием смесей синтетических олигонуклеотидов, несущих дегенеративный состав оснований, в заданные позиции последовательности. Например, использование кодона NNK или NNS (где N=аденин, гуанин, цитозин или тимин; K=гуанин или тимин; S=аденин или цитозин) обеспечивает возможность включения всех 20 аминокислот плюс амбер стоп-кодон во время мутагенеза, тогда как кодон VVS ограничивает количество возможных включаемых аминокислот до 12, поскольку он предотвращает включение аминокислот Cys, Ile, Leu, Met, Phe, Trp, Tyr, Val в выбранную позицию последовательности полипептида; использование кодона NMS (где М=аденин или цитозин), например, ограничивает количество возможных аминокислот до 11 в выбранной позиции в последовательности, поскольку он предотвращает включение аминокислот Arg, Cys, Gly, Ile, Leu, Met, Phe, Trp, Val в выбранную позицию последовательности. В этой связи следует отметить, что кодоны для других аминокислот, отличных от обычных 20 аминокислот естественного происхождения, такие как селеноцистеин или пирролизин, также могут быть включены в нуклеиновую кислоту молекулы антитела. Как описано в Wang, L. et al. (2001), Science, 292, 498-500; или Wang, L. and Schultz, P.G. (2002), Chem. Comm., 1, 1-11 также представляется возможным использование искусственных кодонов, таких как UAG, обычно распознаваемых в качестве стоп-кодонов, для инсерции других нестандартных аминокислот, например о-метил-Ь-тирозина или р-аминофенилаланина.
- 23 040607
Другим вариантом включения мутаций в выбранный сегмент последовательности является применение нуклеотидных структурных блоков с пониженной специфичностью пар оснований, например инозина, 8-окса-2'-дезоксигуанозина или 6-(2-деокси-в-О-рибофуранозил)-3,4-дигидро-8Н-пиримин-до-1,2оксазин-7-она (Zaccolo et al. (1996), J. Mol. Biol., 255, 589-603). Еще одним возможным вариантом является так называемый триплет-мутагенез. В этом способе для включения в кодирующую последовательность используют смеси различных нуклеотидных триплетов, каждый из которых кодирует одну аминокислоту (Virnekas В., et al., 1994, Nucleic. Acids. Res., 22, 5600-5607).
Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая цепь, такую как главная цепь и/или меньшая цепь, антитела по изобретению, может экспрессироваться с использованием любой подходящей системы экспрессии, например, в соответствующей клетке-хозяине или в бесклеточной системе. Полученная молекула антитела обогащается за счет отбора и/или выделения.
Как было разъяснено выше, молекула антитела согласно изобретению может быть нацелена на любые необходимые эпитопы/антигены-мишени. В зависимости от выбранных эпитопов/антигенов антитело может быть пригодным в лечении или профилактике заболевания. Следовательно, в некоторых вариантах реализации антитело по изобретению может быть применено в способах лечения и/или профилактики медицинского состояния, такого как расстройство или заболевание. В вариантах реализации, в которых одно из антител, включенных в биспецифичную молекулу, способно активировать иммунные клетки FcR-зависимым образом, может быть особенно полезно выбрать молекулу антитела, имеющую Fc-соответствующую часть, демонстрирующую пониженное связывание с Fc-рецепторами. За счет этого может быть предупреждена нежелательная иммунная активация, опосредованная FcR-связыванием. В некоторых вариантах реализации заболевание, подлежащее лечению или профилактике, может представлять собой пролиферативное заболевание. Примеры пролиферативного заболевания включают, но без ограничения, злокачественные поражения гемопоэтической системы, такие как острый и хронический миеломный и лимфатический лейкозы, а также лимфомы или солидные опухоли. Примеры солидных опухолей включают, но без ограничения, опухоли желудочно-кишечного тракта, костей, легких, почек, простаты, молочной железы, головного мозга, яичника, матки, яичка, мезенхимальных тканей и кожи, например меланома.
В изобретении также представлена фармацевтическая композиция, включающая молекулу антитела согласно изобретению и необязательно фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
Молекула антитела согласно изобретению может быть введена любым парентеральным или непарентеральным (энтеральным) путем, который является терапевтически эффективным в отношении белковых лекарственных средств. Способы парентерального применения включают, например, внутрикожные, подкожные, внутримышечные, интратрахеальные, интраназальные, интравитреальные или внутривенные инъекции и инфузии, например, в форме растворов для инъекции, растворов для инфузии или тинктур, а также введение и ингаляции аэрозолей, например, в форме аэрозольных смесей, распыляемых растворов или порошков. Обзор способов доставки лекарственного средства в легкие, т.е. путем ингаляции аэрозоля (который также может быть применен при интраназальном введении) или интратрахеального введения, представлен, например, в J.S. Patton et al., The lungs as a portal of entry for systemic drug delivery, Proc. Amer. Thoracic Soc., 2004, vol. 1, p. 338-344. К непарентеральным способам доставки относятся, например, пероральное применение, например, в форме пилюль, таблеток, капсул, растворов или суспензий или ректальное применение, например, в форме суппозиториев. Введение молекул антитела по изобретению может осуществляться системно или местно в составах, содержащих любые общепринятые нетоксичные фармакологически приемлемые вспомогательные вещества или носители, добавки и наполнители по мере необходимости.
В одном варианте реализации настоящего изобретения фармацевтическую композицию вводят парентерально млекопитающему и, в частности, человеку. Соответствующие способы введения включают, но без ограничения, например, внутрикожные, подкожные, внутримышечные, интратрахеальные или внутривенные инъекции и инфузии, например, в форме растворов для инъекции, растворов для инфузии или тинктур, а также введение и ингаляции аэрозолей, например, в форме аэрозольных смесей, распыляемых растворов или порошков. В случаях соединений с относительно коротким временем полужизни в сыворотке наиболее удобной может быть комбинация внутривенной и подкожной инфузии и/или инъекции. Фармацевтическая композиция может представлять собой водный раствор, эмульсию типа масло в воде или эмульсию типа вода в масле.
В этом отношении следует отметить, что для трансдермальной доставки молекулы антитела, описанного здесь, также могут быть применены способы трансдермальной доставки, например ионтофорез, сонофорез или доставка с микроигольным усилением, как описано в Meidan V.M., Michniak B.B., 2004, Am. J. Ther., 11(4):312-316. Непарентеральные способы доставки представляют собой, например, пероральное применение, например, в форме пилюль, таблеток, капсул, растворов или суспензий или ректальное применение, например, в форме суппозиториев. Введение молекул антитела по изобретению может осуществляться системно или местно в составах, содержащих разнообразные традиционные нетоксичные фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества или носители, добавки и наполнители по мере необходимости.
- 24 040607
Дозировка применяемой молекулы антитела может варьироваться в широких пределах в зависимости для достижения желаемого профилактического или терапевтического ответа. Это будет зависеть, например, от аффинности молекулы антитела к выбранной мишени, а также от периода полужизни комплекса между молекулой антитела и лигандом in vivo. Кроме того, оптимальная дозировка будет зависеть от биораспределения молекулы антитела или ее конъюгата, способа введения, тяжести заболевания/расстройства, подвергаемого лечению, а также медицинского состояния пациента. Например, при местном нанесении в форме мази может быть использована высокая концентрация молекулы антитела. Однако при необходимости молекула антитела также может быть представлена в составе с замедленным высвобождением, например липосомных дисперсиях или полимерных микросферах на основе гидрогеля, например PolyActive™ или OctoDEX™ (см. Bos et al., Business Briefing: Pharmatech, 2003, 1-6). Другими доступными составами с замедленным высвобождением являются, например, полимеры на основе PLGA (PR pharmaceuticals), гидрогели на основе PLA-PEG (Medincell) и полимеры на основе PEA (Medivas).
Таким образом, молекулы антител по настоящему изобретению могут быть включены в композиции с использованием фармацевтически приемлемых ингредиентов и известных способов приготовления (Gennaro, A.L., Gennaro, A.R. (2000), Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20th ed., Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, PA). Для приготовления фармацевтических композиций могут быть применены фармацевтически инертные неорганические или органические вспомогательные вещества. Для приготовления, например, пилюль, порошков, желатиновых капсул или суппозиториев может быть использована лактоза, тальк, стеариновая кислота и ее соли, жиры, воски, твердые или жидкие полиолы, натуральные и гидрогенизированные масла.
Подходящими вспомогательными веществами для получения растворов, суспензий, эмульсий, аэрозольных смесей или порошков для разведения в растворах или аэрозольных смесях перед применением являются вода, спирты, глицерин, полиолы и подходящие их смеси, а также растительные масла.
Фармацевтическая композиция может также включать такие добавки, как, например, наполнители, связующие, увлажнители, глиданты, стабилизаторы, консерванты, эмульгаторы и, кроме того, растворители, или солюбилизаторы, или агенты для достижения депонирующего эффекта. Последние предназначены для того, чтобы белки слияния могли быть включены в системы медленного или замедленного высвобождения или системы направленной доставки, такие как липосомы и микрокапсулы.
Составы могут быть подвергнуты стерилизации многочисленными способами, включая фильтрацию через удерживающий бактерии фильтр, или путем включения стерилизирующих агентов в форме стерильных твердых композиций, которые могут быть растворены или диспергированы в стерилизованной воде или другой стерилизованной среде непосредственно перед применением.
В медицине существует множество возможных вариантов применения молекулы антитела в соответствии с настоящим изобретением. В дополнение к ее применению в диагностике in vitro или доставке лекарственного средства может быть получена молекула антитела по изобретению, которая связывает, например, ткань- или опухоль-специфические клеточно-поверхностные молекулы.
Далее приведены неограничительные примеры, иллюстрирующие изобретение.
Пример 1.
Генерировали биспецифичную бивалентную Fc-аттенуированную молекулу, также обозначаемую, как молекула формата bsFcko-1/2, с опухолевой X CD3 специфичностью, как схематично изображено на фиг. 1E. Вносили модификации аминокислот шарнирной области и Сн2-домена, как показано на фиг. 1О. Генерировали биспецифические Fc-аттенуированные тетравалентные молекулы, также обозначаемые, как молекулы формата bsFcko-1, с опухолевой X CD3 специфичностью, как схематично изображено на фиг. 1G. Вносили модификации аминокислот шарнирной области и Сн2-домена, как показано на фиг. 1P.
Клонирование и амплификацию плазмид осуществляли, используя Escherichia coli DH5a (Invitrogen, Карлсруэ, Германия). Построение соответствующих векторов отображено на фиг. 2.
Котрансфекцию векторов экспрессии, кодирующих главную и меньшую цепи, которые также могут называться тяжелой и легкой цепями, с обозначенной специфичностью выполняли в клетках плазмоцитомы Sp2/0, полученных от American Type Culture Collection (ATCC, Манассас, штат Виргиния). Структура соответствующих векторов изображена на фиг. 2 (см. также пример 2 ниже). Клетки культивировали в средах EMDM с добавлением 10% фетальной телячьей сыворотки (PAN-Biotech, Айденбах, Германия), 1% пенициллина и стрептомицина (Lonza, Базель, Швейцария). Стабильные трансфектанты отбирали путем добавления 1 мг/мл G418 (Invitrogen, Карлсруэ, Германия).
Биспецифические антитела очищали от супернатантов культур стабильно трансфицированных клеток путем аффинной хроматографии, используя белок А для формата Fcko-1 и KappaSelect для формата bsFcko-1/2 (обе среды для хроматографии были получены от GE Healthcare, Мюнхен, Германия).
Пример 2.
В векторе экспрессии V-области иммуноглобулина объединяли с желаемыми константными С-областями. Указанная здесь процедура клонирования обеспечивает возможность включения полных V-областей Ig и их экспрессии в лимфоидных клетках без каких-либо изменений их аминокислотной последовательности. С этой целью нуклеотидную последовательность VDJ- и VJ-фрагмента моноспеци
- 25 040607 фического антитела использовали для конструирования пар праймеров (С-С, D-D'; табл. 1). Реамплифицированные фрагменты ДНК V-сегментов расщепляли (VJ - напрямую, a VDJ - после реамплификации с парой праймеров Е-Е', табл. 1) с помощью соответствующих нуклеаз рестрикции (резюмировано в табл. 1), а затем лигировали в векторы экспрессии. В качестве альтернативы V-домены синтезировали как фрагменты ДНК в GeneArt, Регенсбург, Германия. Этот способ использовали для кодирования генов для V-областей антитела, направленного на EGFR (клон K225). Векторы (фиг. 2) содержат гены тяжелой и легкой константной области человека. Таким образом, инсерция амплифицированных и расщепленных V-сегментов восстанавливает исходную геномную организацию генов Ig в векторах без изменения какой-либо аминокислоты в V-областях.
Исходный вектор для тяжелой цепи содержит тяжелую цепь изотипа γ1 человеческого Ig (фиг. 2А). Сайты рестрикции вводили в требуемых позициях в интронах для замещения AatII-ClaI-фрагмента на VDJ-фрагмент тяжелой цепи моноклональных антител 4G8 (анти-FLT3), BV10 (анти-FLT3), 4G7 (анти-CD19), С225 (анти-EGFR) и 9.2.27 (анти-CSPG4) или любого другого моноклонального антитела. Область, релевантная для клонирования VDJ-фрагмента, показана увеличенной на фиг. 2В. Фрагмент, подлежащий замещению, содержит части первого интрона с сайтом рестрикции AatII, второй экзон лидерной последовательности, VDJ-область и часть интрона тяжелой цепи с сайтом рестрикции ClaI. Для замены всех экзонов константной области тяжелой цепи человеческого γ1 сайты рестрикции вводили в заданные позиции в интроне тяжелой цепи (MluI) и в поли А-области тяжелой цепи 5'-UTR (рА-область; SpeI), как показано на фиг. 2А и 2С.
Кроме того, после конструирования векторов экспрессии возможно замещение всей константной области изотипа γ1 человеческого Ig (фрагмент MluI-SpeI; см фиг. 2А) или на константные области всех других изотипов антитела или на Fc-части с оптимизированной или пониженной эффекторной функцией. В случае антител, оптимизированных для запуска ADCC, аминокислотные замены вводили в СН2-домен константной области человеческого γ1, как показано в международных патентных заявках WO 2011/076922 и WO 2011/089211. Для получения биспецифических антител, показанных на фиг. 1A-1N, можно выполнить инсерцию MluI- и SpeI-фланкированных фрагментов ДНК, содержащих экзоны, кодирующие дикий тип, или модифицированные константные области тяжелой цепи Ig. Подлежащий замещению фрагмент MluI-SpeI показан увеличенным на фиг. 2С. Чтобы дополнить биспецифическое антитело специфичностью ко второму антигену, можно включить scFv-фрагменты с ориентацией VH-VL или Vl-Vh через сайты ферментов рестрикции BspEI и SpeI, что также показано на фиг. 2А. Область, релевантная для клонирования scFv-фрагмента в ориентации VL-VH, показана увеличенной на фиг. 2С. ScFv-фрагменты со специфичностью к CD3 (гуманизированный клон UCHT1; ориентация Vl-Vh), CD28 (клон 9.3; ориентация Vl-Vh), TCRa/β (клон ВМА031; ориентация Vh-Vl) получали путем ПЦР с олигонуклеотидами F и F', перечисленными в табл. 2. В качестве альтернативы их синтезировали как фрагменты ДНК в Gene Art, Регенсбург, Германии. Этот способ применяли для генов, кодирующих антитела, направленные на CD16 (клон 3G8; ориентация Vl-Vh). Фрагмент ДНК scFv-фрагментов в ориентации Vh-Vl и Vl-Vh соответственно расщепляли подходящими рестрикционными нуклеазами (резюмированы в табл. 2) и затем лигировали в вектор экспрессии.
Исходный вектор для легкой цепи содержит VJ-область легкой цепи и С-область κ-гена человека (фиг. 2D). В требуемые места (XhoI и SpeI) вводили сайты рестрикции для замены фрагмента XhoI-SpeI легкой цепи на соответствующий VJ-фрагмент легкой цепи моноклональных антител 4G8 (анти-FLT3), BV10 (анти-FLT3), 4G7 (анти-CD19), K225 (анти-EGFR) или 9.2.27 (анти-CSPG4) или любого другого моноклонального антитела. Область, смежная с фрагментом, подлежащим замещению, показана на фиг. 2Е. Эта область содержит части второго экзона лидерной последовательности, сайт рестрикции (XhoI), подходящий для слияния с сохранением рамки считывания, VJ-область и части интрона каппацепи с сайтом рестрикции SpeI. Для замены константной области легкой цепи (CL) сайты рестрикции вводили в требуемые места (PmlI и BsmBI). Область, смежная с фрагментом, подлежащим замещению, показана увеличенной на фиг. 2F. Эта область содержит части интрона каппа-цепи, подходящий сайт рестрикции (PmII), CL-область и части полиА-области (пА-области) каппа-цепи области 3'-UTR с сайтом рестрикции (BsmBI).
- 26 040607
Таблица 1
Олигонуклеотиды, используемые для амплификации VDJ- и VJ-сегментов для инсерции в векторы экспрессии
Олигонуклеотиды, используемые для VDJ-сегмента тяжёлой цепи
С 4G7-H-for 5’-etc ttc аса ggt gtc etc tet gag gtc cag etg cag cag tet gga cct g-3’ (SEQ ID NO: 27)
С’ 4G7-H-rev 5’-ggg aga agg tag gac tea cct gag gag act gtg aga gtg gtg cct tgg ccc cag tag tc-3’ (SEQ ID NO: 28)
С 9.2.27-H-for 5’-tet tea cag gtg tcc tet ccc agg tga age tgc age aat etg gac etg agc-3’ (SEQ ID NO: 29)
С’ 9.2.27-H-rev 5’-aat ggg aga agg tag gac tea cct gag gag acg gtg acc gtg gtc cct tgg-3’ (SEQ ID NO: 30)
с 4G8-H-for 5’-tet ett cac agg tgt cct etc tea ggt cca act gca gca gcc tgg ggc tga gc-3’ (SEQ ID NO: 31)
С’ 4G8-H-rev 5’-gag aag gta gga etc acc tga gga gac tgt gag agt ggt gcc ttg gcc cca g-3’ (SEQ ID NO: 32)
с BVlO-H-for 5’-aga cgt cca etc tgt ett tet ett cac agg tgt cct etc cca ggt gca get gaa gca gtc-3’(SEQID NO: 33)
С’ BVlO-H-rev 5’-gag aag gta gga etc acc tga gga gac ggt gac tga ggt tec ttg acc c-3’ (SEQ ID NO: 34)
Е universal for (Aatll) 5’-aga cgt cca etc tgt ett tet ett cac agg tgt cct etc c-3’ (SEQ ID NO: 35)
E’ universal rev (Clal) 5’-tat ega ttt aga atg gga gaa ggt agg act cac-3’ (SEQ ID NO: 36)
Олигонуклеотиды, используемые для VJ-сегмента лёгкой цепи
D 4G7-L-for (Xhol) 5’-act ega gga gat att gtg atg act cag get gca ccc tet ata c-3’ (SEQ ID NO: 37)
D 4G7-L-rev (Spel) 5’-aac tag tac tta cgt ttc age tec age ttg gtc cca gca ccg aac gtg-3’ (SEQ ID NO: 38)
D 9.2.27-L-for (Xhol) 5’-tet ega gga gac ate gag etc act cag tet cca get tet ttg-3’ (SEQ ID NO: 39)
D 9.2.27-L-rev (Spel) 5’-aac tag tac tta cgt ttg ate tec age ttg gtg ccc cct cca aag g-3’ (SEQ ID NO: 40)
D 4G8-L-for (Xhol) 5’-act ega gga gat att gtg eta act cag tet cca gcc acc ctg-3’ (SEQ ID NO: 41)
D 9 4G8-L-rev (Spel) 5’-tac tag tac tta cgt ttt att tec age ttg gtc ccc cct cc-3’ (SEQ ID NO: 42)
D BVlO-L-for (Xhol) 5’-act ega gga gac att gtg atg аса cag tet cca tec tec c-3’ (SEQ ID NO: 43)
D 9 BVlO-L-rev (Spel) 5’-act agt act tac gtt tea get cca get tgg tec cag cac ega acg tg-3’ (SEQ ID NO: 44)
Сайты рестрикции выделены жирным шрифтом и обозначены буквами в круглых скобках.
- 27 040607
Таблица 2
Олигонуклеотиды, используемые для амплификации scFv-сегментов для инсерции в векторы экспрессии
Олигонуклеотиды, используемые для scFv-сегмента
F UCHTl-for (BspEI) 5’- ate egg aga tat cca gat gac cca gtc ccc gag etc cct g-3’ (SEQ ID NO: 45)
F’ UCHTl-rev (Spel) 5’- tac tag tta tea ega gga gac ggt gac cag ggt tcc ttg acc cca-3’ (SEQ ID NO: 46)
F BMA031-for (BspEI) 5’- ate egg aga agt gca get gca gca gtc egg ccc tga gct-3’ (SEQ ID NO: 47)
F’ BMA031-rev (Spel) 5’- tac tag tta tea ett cag ttc cag ett ggt gee age gee gaa ggt-3’ (SEQ ID NO: 48)
F 9.3-for (BspEI) 5’-ate egg aga cat tgt get gac cca gtc ccc tgc etc cct gg-3’ (SEQ ID NO: 49)
F’ 9.3-rev (Spel) 5’- tac tag tta tea aga get cac agt cac tgt ggt gee etg gee cca -3’ (SEQ ID NO: 50)
Сайты рестрикции выделены жирным шрифтом и обозначены буквами в круглых скобках.
Таким образом, были получены молекулы биспецифического антитела с FLT3xCD3 (4G8xUCHT1, BV10xUCHT1), FLT3xTCRa/e (4G8xBMA031, BV10xBMA031), FLT3xCD28 (4G8x9.3, BV10x9.3), FLT3xCD16 (4G8x3G8, BV10x3G8), CD19xCD3 (4G7xUCHT1), CD19xTCRa/e (4G7xBMA031), CD19xCD28 (4G7x9.3), CD19xCD16 (4G7x3G8), CSPG4xCD3 (9.2.27xUCHT1), CSPG4xTCRD/D (9.2.27xBMA031), CSPG4xCD28 (9.2.27x9.3), CSPG4xCD16 (9.2.27x3G8), EGFRxCD3 (C225xUCHT1), EGFRxTCRa/β (C225xBMA031), EGFRxCD28 (C225x9.3), EGFRxCD16 (C225x3G8) в качестве тетравалентного bsFc-KO-1 и бивалентного bsFc-KO-1/2. Последовательности соответствующих цепей изображены как SEQ ID NO: 1-SEQ ID NO: 26 и представлены на фиг. 6.
Котрансфекция векторов экспрессии, кодирующих химерные тяжелую и легкую цепи (IgG1/k) или модифицированные тяжелые цепи в не-Ig-продуцирующую линию миеломной клетки Sp2/0 давала устойчивые трансфектомы, секретирующие биспецифические моноклональные антитела, способные специфично связываться с целевым антигеном. Функциональные характеристики этих молекул антител проиллюстрированы в следующих экспериментах с использованием молекул биспецифических антител FLT3xCD3, CD19xTCRa/e и CSPGxCD3.
Пример 3.
Определяли активацию Т-клеток двумя форматами антител из примера 1, форматом bsFcko-1/2 и bsFcko-1, с и без позитивных REH-клеток FLT3/CD19. Данные приведены на фиг. 3. Используемые молекулы биспецифического антитела имели сайт связывания FLT3 (первый сайт связывания) клона 4G8 и сайт связывания CD3 (второй сайт связывания) клона UCHT1. Молекула bsFcko-1/2-формата была составлена из цепей SEQ ID NO: 1 и SEQ ID NO: 6, а молекула bsFcko-1-формата состояла из цепей SEQ ID NO: 1 и SEQ ID NO: 26. Молекула биспецифического антитела, связывающая CSPG4 и CD3, имела bsFcko-1/2-формат и состояла из цепей SEQ ID NO: 3 и SEQ ID NO: 18. Дополнительно использовали молекулу биспецифического антитела в формате bsFcko-1/2, связывающую CD19 и TCRa/β, которая состояла из цепей SEQ ID NO: 4 и SEQ ID NO: 15.
A) Из периферической крови здоровых доноров получали мононуклеарные клетки человека (РВМС) и отделяли с использованием центрифугирования в градиенте плотности. РВМС переносили в 96-луночные планшеты (100000 на лунку). Далее добавляли облученные FLT3/CD19-позитивные REH-клетки (50000 на лунку) или среду, в завершение чего добавляли антитела в показанных концентрациях (фиг. 3А). Через 24 ч клетки инкубировали с использованием 3Н тимидина (0,5 μCi/лунка). Еще через 24 ч клетки наносили на стекловолоконные фильтры, используя коллектор клеток. Далее с помощью сцинтилляционного счетчика определяли радиоактивность.
B) Гепаринизированную цельную кровь (50 мкл/лунка) инкубировали в 96-луночных планшетах с и без FLT3/CD19-позитивных REH-клеток (50000/лунку) и с антителами в концентрациях, указанных на фиг. 3В. Через 24 ч концентрацию TNF в супернатанте определяли посредством ELISA.
REH-клетки (Deutsche Sammlung fur Mikroorganismen und Zellkulturen, DSMZ, Брауншвейг, Германия) и РВМС-клетки культивировали в среде RPMI 1640 с добавлением 10% фетальной телячьей сыво
- 28 040607 ротки (PAN-Biotech, Айденбах, Германия), 1% пенициллина и стрептомицина (Lonza, Базель, Швейцария).
Пример 4.
Определяли лизис REH-клеток, экспрессирующих FLT3/CD19 (фиг. 4А), и SKMe163-клеток, экспрессирующих CSPG (фиг. 4В), биспецифическими антителами и активированными клетками-киллерами CD8+T.
Мононуклеарные клетки человека (РВМС) в течение трех дней стимулировали посредством моноспецифического CD3-антитела UCHT1 (10 нг/мл). Затем активированные клетки CD8+T отделяли позитивной селекцией, используя магнитную сортировку клеток. Эти клетки добавляли к FLT3/CD19-позитивным REH-клеткам, маркированным 51Cr (фиг. 4А), или к CSPG4-позитивным клеткам SKMe163 (фиг. 4В) и инкубировали с антителами в указанных концентрациях. Через 4 ч клеточные супернатанты собирали на планшетах сцинтилляции и определяли радиоактивность в сцинтилляционном счетчике.
Специфический лизис в процентах при заданных экспериментальных условиях оценивали следующим образом: cpm(exp)-cpm(bg)/cpm(100)-cpm(bg), где cpm(bg) соответствует выходу хрома без антитела и эффекторных клеток, а cpm(100) соответствует выходу хрома после инкубации клеток-мишеней с детергентом.
Клетки SKMe163 были получены от Dr. В. Guckel, Klinik fur Gynakologie, University of Tubingen, Германия.
Пример 5.
Скорость агрегации и продуцирования антител FLT3xCD3 (сайт связывания FLT: клон 4G8, сайт связывания CD3: клон UCHT1) идентичной специфичности сравнивали между тремя разными форматами: биспецифичного одноцепочечного формата (bs-scFv), bsFcko-1/2-формата и bsFcko-1-формата. Молекула антитела bsFcko-1/2-формата состояла из цепей SEQ ID NO: 1 и SEQ ID NO: 6, а молекула антитела bsFcko-1-формата состояла из цепей SEQ ID NO: 1 и SEQ ID NO: 26.
Биспецифические одноцепочечные молекулы очищали афинной хроматографией, используя белок L.
Выполняли фильтрацию в геле, используя колонку Superdex 200 РС3.2/30 и SMARTSystem (GEHealthcare, Мюнхен, Германия). Стандартными белками были каталаза (232 кДа, из бычьей печени), альдолаза (158 кДа, из мышц кролика), альбумин (67 кДа, из бычьей сыворотки) и рибонуклеаза А (13,7 кДа, из бычьей поджелудочной железы). Результаты представлены на фиг. 5А. Из данных на фиг. 5А следует, что образование агрегатов значительно более выражено, если антитело экспрессируется, как bs-scFv (скорость агрегации 43%), а не как bsFcko-1/2 (агрегация не обнаружена) или bsFcko-1 (скорость агрегации 2%), т.е. молекулы биспецифического антитела по настоящему изобретению остаются мономерными молекулами и по существу не стремятся к агрегации.
Для сравнения скоростей продуцирования в клетки Sp2/0 вводили гены, кодирующие биспецифические молекулы со специфичностью к 4G8 (анти-FLT3) и UCHT1 (анти-CD3) в указанных форматах, и антитела очищали, используя аффинную хроматографию. Количество антитела, очищенного от супернатантов клонов, выбранное для максимального продуцирования, изображено на фиг. 5В. Концентрации антител определяли оптической спектроскопией, принимая оптическую плотность в 1,4 при 280 нм за концентрацию антитела 1 мг/мл. Скорости продуцирования для молекул антитела bsFcko-1/2 и bsFcko-1 по изобретению были значительно выше соответствующих значений для соответствующей молекулы bs-scFv.
Специалист в данной области техники легко поймет, что настоящее изобретение хорошо адаптировано для решения задач и достижения указанных конечных целей и преимуществ, указанных в настоящем документе. Кроме того, специалисту в данной области техники будет понятно, что в раскрытое здесь изобретение могут быть внесены различные замены и модификации без отступления от объема и сущности изобретения. Композиции, способы, процедуры, способы лечения, молекулы и специфические соединения, описанные здесь, представляют собой некоторые варианты реализации, приведены в качестве примера и не ограничивают объем правовой охраны изобретения. Изменения и другие варианты применения будут ясны специалисту в данной области техники, и они входят в рамки сущности изобретения и определены формулой изобретения. Перечень или ссылки на опубликованные ранее документы, сделанные в настоящем описании, не являются подтверждением того, что этот документ является частью уровня техники или обычными общеизвестными знаниями.
Изобретение, иллюстративно описанное здесь, подходящим образом может быть осуществлено на практике в отсутствие любого элемента или элементов, ограничения или ограничений, не раскрытых здесь конкретно. Соответственно, например, термины содержащий, включающий, содержащий в себе и т.д. имеют расширительный и неограничительный смысл. Кроме того, использованные здесь термины и выражения применены как описательные, но не ограничительные, и не должны толковаться как исключающие возможность эквивалентов представленных и описанных признаков, при этом различные модификации допустимы в объеме формулы заявленного изобретения. Таким образом, следует понимать, что несмотря на то что настоящее изобретение информационно раскрыто на основе конкретных вариантов реализации и необязательных признаков, специалистам в данной области техники может быть понятна модификация и вариация реализованных в нем изобретений и такие модификации и вариации
- 29 040607 входят в объем данного изобретения.
Здесь дано широкое и общее описание изобретения. Любая более узкая производная и соподчиненная составляющая общего раскрытия также является частью изобретения. Это относится и к общему описанию изобретения при некотором условии или отрицательном признаке, исключающем какой-либо объект изобретения из общего вне зависимости от присутствия такого исключения в описании.
Другие варианты реализации входят в рамки представленной ниже формулы изобретения. В дополнение к этому там, где описанные признаки или аспекты изобретения относятся к группе Маркуша, специалистам в данной области будет понятно, что данное изобретение также имеет отношение к какомулибо отдельному компоненту или подгруппе компонентов группы Маркуша.
Перечень последовательностей <110> Synimmune GbmH <120> МОЛЕКУЛА БИСПЕЦИФИЧЕСКОГО АНТИТЕЛА <130> SYN14309PCT <150> US 61/577,327 <151> 2011-12-19 <160> 50 <170> Patentin, версия 3.5 <210> 1 <211> 214 <212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> последовательность легкой цепи, анти-ПТЗ химерная легкая цепь (клон
4G8) < 400> 1
Asp lie Val 1 Leu Thr 5 Gin Ser Pro Ala Thr Leu 10 Ser Val Thr Pro 15
Gly Asp Ser Val Ser Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gin Ser lie Ser
20 25 30
Asn Asn Leu His Trp Tyr Gin Gin Lys Ser His Glu Ser Pro Arg
35 40 45
Leu Leu lie Lys Tyr Ala Ser Gin Ser lie Ser Gly lie Pro Ser
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Ser lie
65 70 75
Asn Ser Val Glu Thr Glu Asp Phe Gly Val Tyr Phe Cys Gin Gin
80 85 90
Ser Asn Thr Trp Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu
95 100 105
lie Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe lie Phe Pro Pro
110 115 120
Ser Asp Glu Gin Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val cys Leu
125 130 135
Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gin Trp Lys Val
140 145 150
Asp Asn Ala Leu Gin Ser Gly Asn Ser Gin Glu Ser Val Thr Glu
155 160 165
Gin Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr
170 175 180
Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu
185 190 195
Val Thr His Gin Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn
200 205 210
- 30 040607
Arg Gly Glu Cys < 210> 2 < 211> 220 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> последовательность легкой цепи, анти-РИЗ химерная легкая цепь (клон BV10) < 400> 2
Asp lie Vai Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser 10 Leu Ser Vai Ser Ala 15
1 5
Gly Glu Lys Vai Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gin Ser Leu Leu
20 25 30
Asn Ser Gly Asn Gin Lys Asn Tyr Met Ala Trp Tyr Gin Gin Lys
35 40 45
Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu He Tyr Gly Ala Ser Thr Arg
50 55 60
Glu Ser Gly Vai Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr
65 70 75
Asp Phe Thr Leu Thr He Ser Ser Vai Gin Ala Glu Asp Leu Ala
80 85 90
Vai Tyr Tyr Cys Gin Asn Asp His Ser Tyr Pro Leu Thr Phe Gly
95 100 105
Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg Thr Vai Ala Ala Pro Ser
110 115 120
Vai Phe He Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gin Leu Lys Ser Gly Thr
125 130 135
Ala Ser Vai Vai Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
140 145 150
Lys Vai Gin Trp Lys Vai Asp Asn Ala Leu Gin Ser Gly Asn Ser
155 160 165
Gin Glu Ser Vai Thr Glu Gin Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser
170 175 180
Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His
185 190 195
Lys Vai Tyr Ala Cys Glu Vai Thr His Gin Gly Leu Ser Ser Pro
- 31 040607
200 205 210
Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 215 220 <210> 3 <211> 218 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> последовательность легкой цепи, aHTM-CSPG4 химерная легкая цепь (клон 9.2.27) <400> 3
Asp He Glu Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu
1 5 10 15
Gly Gln Arg Ala Thr He Ser Cys Arg Ala Ser Glu Ser Val Asp
20 25 30
Ser Tyr Gly Asn Ser Phe Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
35 40 45
Gln Pro Pro Lys Leu Leu He Tyr Leu Ala Ser Asn Leu Glu Ser
50 55 60
Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Arg Thr Asp Phe
65 70 75
Thr Leu Thr He Asp Pro Val Glu Ala Asp Asp Ala Ala Thr Tyr
80 85 90
Tyr Cys Gln Gln Asn Asn Glu Asp Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly
95 100 105
Thr Lys Leu Glu He Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe
110 115 120
He Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser
125 130 135
Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val
140 145 150
Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
155 160 165
Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
170 175 180
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val
185 190 195
Tyr Ala cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr
200 205 210
Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
215
<210> 4 <211> 219 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> последовательность легкой цепи, анти-С019 химерная легкая цепь (клон
- 32 040607
4G7) <400> 4
Asp lie Vai Met Thr 1 5
Glu Ser Vai Ser lie 20
Asn Gly Asn Thr Tyr 35
Pro Gin Leu Leu Ile 50
Asp Arg Phe Ser Gly 65
Ser Arg Vai Glu Ala 85
Leu Glu Tyr Pro Phe 100
Arg Thr Vai Ala Ala 115
Gin Leu Lys Ser Gly 130
Tyr Pro Arg Glu Ala 145
Ser Gly Asn Ser Gin 165
Thr Tyr Ser Leu Ser 180
Lys His Lys Vai Tyr 195
Pro Vai Thr Lys Ser 210
Gin Ala Ala Pro Ser lie 10
Ser Cys Arg Ser Ser Lys 25
Leu Tyr Trp Phe Leu Gin 40
Tyr Arg Met Ser Asn Leu 55
Ser Gly Ser Gly Thr Ala 70 75
Glu Asp Vai Gly Vai Tyr 90
Thr Phe Gly Ala Gly Thr 105
Pro Ser Vai Phe lie Phe 120
Thr Ala Ser Vai Vai Cys 135
Lys Vai Gin Trp Lys Vai 150 155
Glu Ser Vai Thr Glu Gin 170
Ser Thr Leu Thr Leu Ser 185
Ala Cys Glu Vai Thr His 200
Phe Asn Arg Gly Glu Cys 215
Pro Vai Thr Pro Gly 15
Ser Leu Leu Asn Ser 30
Arg Pro Gly Gin Ser 45
Ala Ser Gly Vai Pro 60
Phe Thr Leu Arg lie 80
Tyr Cys Met Gin His 95
Lys Leu Glu Leu Lys 110
Pro Pro Ser Asp Glu 125
Leu Leu Asn Asn Phe 140
Asp Asn Ala Leu Gin 160
Asp Ser Lys Asp Ser 175
Lys Ala Asp Tyr Glu 190
Gin Gly Leu Ser Ser 205 < 210> 5 < 211> 214 < 212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
< 223> последовательность легкой цепи, анти-EGFR химерная легкая цепь
- 33 040607
(клон C225)
<400> 5
Asp He Leu Leu Thr Gin Ser Pro Vai He Leu Ser Vai Ser Pro
1 5 10 15
Gly Glu Arg Vai Ser Phe Ser cys Arg Ala Ser Gin Ser He Gly
20 25 30
Thr Asn He His Trp Tyr Gin Gin Arg Thr Asn Gly Ser Pro Arg
35 40 45
Leu Leu He Lys Tyr Ala Ser Glu Ser He Ser Gly He Pro Ser
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Ser He
65 70 75
Asn Ser Vai Glu Ser Glu Asp He Ala Asp Tyr Tyr Cys Gin Gin
80 85 90
Asn Asn Asn Trp Pro Thr Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu
95 100 105
Leu Lys Arg Thr Vai Ala Ala Pro Ser Vai Phe He Phe Pro Pro
110 115 120
Ser Asp Glu Gin Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Vai Vai Cys Leu
125 130 135
Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Vai Gin Trp Lys Vai
140 145 150
Asp Asn Ala Leu Gin Ser Gly Asn Ser Gin Glu Ser Vai Thr Glu
155 160 165
Gin Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr
170 175 180
Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Vai Tyr Ala cys Glu
185 190 195
Vai Thr His Gin Gly Leu Ser Ser Pro Vai Thr Lys Ser Phe Asn
200 205 210
Arg Gly
Glu
Cys <210> 6 <211> 589 <212> PRT <213> Искусственная последовательность
- 34 040607 <220>
<223> последовательность тяжелой цепи/главной цепи, FLT3 х CD3; bsFcko-1/2 [N концевая aHTH-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон 4G8) и Сконцевая CD3 одноцепочечная (клон UCHT1, VL-VH)] цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> б
Gin Vai Gin Leu Gin Gin Pro Gly Ala Glu Leu Vai Lys Pro Gly
1 5 10 15
Ala Ser Leu Lys Leu Ser 20 Cys Lys Ser Ser Gly 25 Tyr Thr Phe Thr 30
Ser Tyr Trp Met His Trp 35 Vai Arg Gin Arg Pro 40 Gly His Gly Leu 45
Glu Trp He Gly Glu He 50 Asp Pro Ser Asp Ser 55 Tyr Lys Asp Tyr 60
Asn Gin Lys Phe Lys Asp 65 Lys Ala Thr Leu Thr 70 Vai Asp Arg Ser 75
Ser Asn Thr Ala Tyr Met 80 His Leu Ser Ser Leu 85 Thr Ser Asp Asp 90
Ser Ala Vai Tyr Tyr Cys 95 Ala Arg Ala He Thr 100 Thr Thr Pro Phe 105
Asp Phe Trp Gly Gin Gly 110 Thr Thr Leu Thr Vai 115 Ser Ser Ala Ser 120
Thr Lys Gly Pro Ser Vai 125 Phe Pro Leu Ala Pro 130 Ser Ser Lys Ser 135
Thr Ser Gly Gly Thr Ala 140 Ala Leu Gly Cys Leu 145 Vai Lys Asp Tyr 150
Phe Pro Glu Pro Vai Thr 155 Vai Ser Trp Asn Ser 160 Gly Ala Leu Thr 165
Ser Gly Vai His Thr Phe 170 Pro Ala Vai Leu Gin 175 Ser Ser Gly Leu 180
Tyr Ser Leu Ser Ser Vai 185 Vai Thr Vai Pro Ser 190 Ser Ser Leu Gly 195
Thr Gin Thr Tyr lie Cys 200 Asn Vai Asn His Lys 205 Pro Ser Asn Thr 210
Lys Vai Asp Lys Lys Vai 215 Glu Pro Lys Ser Cys 220 Asp Lys Thr His 225
Thr Ser Pro Pro Ser Pro 230 Ala Pro Pro Vai Ala 235 Gly Pro Ser Vai 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys 245 Pro Lys Asp Thr Leu 250 Met He Ser Arg 255
Thr Pro Glu Vai Thr Cys 260 Vai Vai Vai Gly Vai 265 Ser His Glu Asp 270
Pro Glu Vai Lys Phe Asn 275 Trp Tyr Vai Asp Gly 280 Vai Glu Vai His 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro 290 Arg Glu Glu Gin Tyr 295 Gin Ser Thr Tyr 300
Arg Vai Vai Ser Vai Leu 305 Thr Vai Leu His Gin 310 Asp Trp Leu Asn 315
Gly Lys Glu Tyr Lys Cys 320 Lys Vai Ser Asn Lys 325 Gin Leu Pro Ser 330
Pro He. Glu Lys Thr He 335 Ser Lys Ala Lys Gly 340 Gin Pro Ser Gly 345
- 35 040607
Asp He Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Vai 360
350 355
Gly Asp Arg Vai Thr He 365 Thr Cys Arg Ala 370 Ser Gin Asp lie Arg 375
Asn Tyr Leu Asn Trp Tyr 380 Gin Gin Lys Pro 385 Gly Lys Ala Pro Lys 390
Leu Leu lie Tyr Tyr Thr 395 Ser Arg Leu Glu 400 Ser Gly Vai Pro Ser 405
Arg Phe Ser Gly Ser Gly 410 Ser Gly Thr Asp 415 Tyr Thr Leu Thr He 420
Ser Ser Leu Gin Pro Glu 425 Asp Phe Ala Thr 430 Tyr Tyr Cys Gin Gin 435
Gly Asn Thr Leu Pro Trp 440 Thr Phe Gly Gin 445 Gly Thr Lys Vai Glu 450
He Lys Gly Gly Gly Gly 455 Ser Gly Gly Gly 460 Gly Ser Gly Gly Gly 465
Gly Ser Glu Vai Gin Leu 470 Vai Glu Ser Gly 475 Gly Gly Leu Vai Gin 480
Pro Gly Gly Ser Leu Arg 485 Leu Ser Cys Ala 490 Ala Ser Gly Tyr Ser 495
Phe Thr Gly Tyr Thr Met 500 Asn Trp Vai Arg 505 Gin Ala Pro Gly Lys 510
Gly Leu Glu Trp Vai Ala 515 Leu He Asn Pro 520 Tyr Lys Gly Vai Ser 525
Thr Tyr Asn Gin Lys Phe 530 Lys Asp Arg Phe 535 Thr He Ser Vai Asp 540
Lys Ser Lys Asn Thr Ala 545 Tyr Leu Gin Met 550 Asn Ser Leu Arg Ala 555
Glu Asp Thr Ala Vai Tyr 560 Tyr Cys Ala Arg 565 Ser Gly Tyr Tyr Gly 570
Asp Ser Thr Vai Asp Trp Tyr Phe 575 Ser Ser Asp Vai Trp Gly 580 Gin Gly Thr Leu Vai 585
<210> 7 <211> 594 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <22Θ>
< 223> FLT3 x CD3; bsFcko-1/2 [N-концевая aHTH-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон BV10) и С-концевая CD3 одноцепочечная (клон UCHT1, VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы < 400> 7
Gin Vai Gin Leu Lys Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Gin Pro Ser Gin
10 15
Ser Leu Ser He Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 20 25 30
- 36 040607
Gly Leu His Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 4045
Gly Vai lie Trp Ser Gly Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Ala Ala Phe lie 50 5560
Ser Arg Leu Ser lie Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe 65 70 7580
Lys Met Asn Ser Leu Gin Ala Asp Asp Thr Ala lie Tyr Tyr Cys Ala 85 9095
Arg Lys Gly Gly lie Tyr Tyr Ala Asn His Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
100 105110
Trp Gly Gin Gly Thr Ser Vai Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly
115 120125
Pro Ser Vai Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly
130 135140
Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai
145 150 155160
Thr Vai Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe
165 170175
Pro Ala Vai Leu Gin Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai
180 185190
Thr Vai Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr lie Cys Asn Vai
195 200205
Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys
210 215220
Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai 225 230 235240
Ala Gly Pro Ser Vai Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu
245 250255
- 37 040607
Met lie Ser Arg Thr Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser
260 265270
His Glu Asp Pro Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu
275 280285
Vai His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr
290 295300
Tyr Arg Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn
305 310 315320
Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro
325 330335
He Glu Lys Thr He Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp lie
340 345350
Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Vai Gly Asp Arg
355 360365
Vai Thr lie Thr Cys Arg Ala Ser Gin Asp lie Arg Asn Tyr Leu Asn
370 375380
Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie Tyr Tyr
385 390 395400
Thr Ser Arg Leu Glu Ser Gly Vai Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly 405 410415
Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp
420 425430
Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Gly Asn Thr Leu Pro Trp Thr Phe
435 440445
Gly Gin Gly Thr Lys Vai Glu He Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
450 455460
- 38 040607
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly
465 470 475480
Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala
485 490495
Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr Thr Met Asn Trp Vai Arg Gin Ala
500 505510
Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Vai Ala Leu lie Asn Pro Tyr Lys Gly
515 520525
Vai Ser Thr Tyr Asn Gin Lys Phe Lys Asp Arg Phe Thr lie Ser Vai
530 535540
Asp Lys Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Ala
545 550 555560
Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Ser Gly Tyr Tyr Gly Asp
565 570575
Ser Asp Trp Tyr Phe Asp Vai Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai
580 585590
Ser Ser <210> 8 <211> 585 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FLT3 x TCR альфа/бета; bsFcko-1/2 [N-концевая aHTH-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон 4G8) и С-концевая TCR альфа/бета одноцепочечная (клон ВМА031; VH-VL)], цепь гликан-ковариант-полумолекулы <400> 8
Gin Vai 1 Gin Leu Gin Gin Pro Gly Ala Glu Leu Vai Lys Pro Gly Ala
5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Lys Ser Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
- 39 040607
Trp Met His Trp Vai Arg Gin Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp lie
35 40 45
Gly Glu lie Asp Pro Ser Asp Ser Tyr Lys Asp Tyr Asn Gin Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Vai Asp Arg Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met His Leu Ser Ser Leu Thr Ser Asp Asp Ser Ala Vai Tyr Tyr cys
85 90 95
Ala Arg Ala lie Thr Thr Thr Pro Phe Asp Phe Trp Gly Gin Gly Thr
100 105 110
Thr Leu Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Vai Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai Thr Vai Ser Trp Asn
145 150 155 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe Pro Ala Vai Leu Gin
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai Thr Vai Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr lie Cys Asn Vai Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys Ser cys Asp Lys Thr
210 215 220
His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai Ala Gly Pro Ser Vai
225 230 235 240
- 40 040607
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys 245
Asp Thr Leu Met lie Ser Arg Thr
250 255
Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai
260
Gly Vai Ser His Glu Asp Pro Glu
265 270
Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp
275 280
Gly Vai Glu Vai His Asn Ala Lys
285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr
290 295
Gin Ser Thr Tyr Arg Vai Vai Ser 300
Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp 305 310
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
315 320
Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu
325
Pro Ser Pro lie Glu Lys Thr lie
330 335
Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser 340
Gly Glu Vai Gin Leu Gin Gin Ser
345 350
Gly Pro Glu Leu Vai Lys Pro Gly
355 360
Ala Ser Vai Lys Met Ser Cys Lys 365
Ala Ser Gly Tyr Lys Phe Thr Ser
370 375
Tyr Vai Met His Trp Vai Lys Gin 380
Lys Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp 385 390 lie Gly Tyr lie Asn Pro Tyr Asn
395 400
Asp Vai Thr Lys Tyr Asn Glu Lys 405
Phe Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr
410 415
Ser Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala 420
Tyr Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr
425 430
Ser Glu Asp Ser Ala Vai His Tyr
435 440
Cys Ala Arg Gly Ser Tyr Tyr Asp 445
Tyr Asp Gly Phe Vai Tyr Gly Gin
450 455
Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
460
- 41 040607
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin
465 470 475480
He Vai Leu Thr Gin Ser Pro Ala He Met Ser Ala Ser Pro Gly Glu 485 490495
Lys Vai Thr Met Thr Cys Ser Ala Thr Ser Ser Vai Ser Tyr Met His
500 505510
Trp Tyr Gin Gin Lys Ser Gly Thr Ser Pro Lys Arg Trp He Tyr Asp
515 520525
Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly
530 535540
Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr lie Ser Ser Met Glu Ala Glu Asp
545 550 555560
Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr Phe
565 570575
Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
580585 <210> 9 <211> 590 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> FLT3 x TCR альфа/бета; bsFcko-1/2 [N-концевая aHTM-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон BV10) и С-концевая TCR альфа/бета одноцепочечная (клон ВМА031; VH-VL)], цепь гликан-ковариант-полумолекулы
<400> 9
Gin Vai 1 Gin Leu Lys Gin Ser Gly Pro Gly Leu 5 10 Vai Gin Pro Ser Gin 15
Ser Leu Ser He 20 Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe 25 Ser Leu Thr Asn Tyr 30
- 42 040607
Gly Leu His 35 Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly 40 Lys Gly Leu Glu 45 Trp Leu
Gly Vai 50 He Trp Ser Gly Gly 55 Ser Thr Asp Tyr Asn 60 Ala Ala Phe He
Ser Arg 65 Leu Ser He Ser Lys 70 Asp Asn Ser Lys Ser 75 Gin Vai Phe Phe 80
Lys Met Asn Ser Leu Gin Ala 85 Asp Asp Thr 90 Ala He Tyr Tyr Cys 95 Ala
Arg Lys Gly Gly 100 He Tyr Tyr Ala Asn His 105 Tyr Tyr Ala Met 110 Asp Tyr
Trp Gly Gin 115 Gly Thr Ser Vai Thr Vai Ser 120 Ser Ala Ser Thr 125 Lys Gly
Pro Ser 130 Vai Phe Pro Leu Ala 135 Pro Ser Ser Lys Ser 140 Thr Ser Gly Gly
Thr Ala 145 Ala Leu Gly Cys Leu 150 Vai Lys Asp Tyr Phe 155 Pro Glu Pro Vai 160
Thr Vai Ser Trp Asn Ser Gly 165 Ala Leu Thr 170 Ser Gly Vai His Thr 175 Phe
Pro Ala Vai Leu 180 Gin Ser Ser Gly Leu Tyr 185 Ser Leu Ser Ser 190 Vai Vai
Thr Vai Pro 195 Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gin 200 Thr Tyr He Cys 205 Asn Vai
Asn His 210 Lys Pro Ser Asn Thr 215 Lys Vai Asp Lys Lys 220 Vai Glu Pro Lys
Ser Cys 225 Asp Lys Thr His Thr 230 Ser Pro Pro Ser Pro 235 Ala Pro Pro Vai 240
- 43 040607
Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 245
Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu
250 255
Met lie Ser Arg Thr Pro Glu Val
260
Thr Cys Val Val Val Gly Val Ser
265 270
His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe
275 280
Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu
285
Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro
290 295
Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr
300
Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 305 310
Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn
315 320
Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val 325
Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro
330 335 lie Glu Lys Thr lie Ser Lys Ala 340
Lys Gly Gin Pro Ser Gly Glu Val
345 350
Gin Leu Gin Gin Ser Gly Pro Glu
355 360
Leu Val Lys Pro Gly Ala Ser Val
365
Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly
370 375
Tyr Lys Phe Thr Ser Tyr Val Met 380
His Trp Val Lys Gin Lys Pro Gly
385 390
Gin Gly Leu Glu Trp lie Gly Tyr
395 400 lie Asn Pro Tyr Asn Asp Val Thr 405
Lys Tyr Asn Glu Lys Phe Lys Gly
410 415
Lys Ala Thr Leu Thr Ser Asp Lys 420
Ser Ser Ser Thr Ala Tyr Met Glu
425 430
Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp
435 440
Ser Ala Val His Tyr Cys Ala Arg 445
Gly Ser Tyr Tyr Asp Tyr Asp Gly
450 455
Phe Val Tyr Gly Gin Gly Thr Leu 460
- 44 040607
Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
465 470 475480
Gly Gly Gly Ser Gin Ue Vai Leu Thr Gin Ser Pro Ala Ue Met Ser
485 490495
Ala Ser Pro Gly Glu Lys Vai Thr Met Thr Cys Ser Ala Thr Ser Ser
500 505510
Vai Ser Tyr Met His Trp Tyr Gin Gin Lys Ser Gly Thr Ser Pro Lys
515 520525
Arg Trp lie Tyr Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Vai Pro Ala Arg
530 535540
Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr lie Ser Ser
545 550 555560
Met Glu Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Trp Ser Ser
565 570575
Asn Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
580 585590 <210> 10 <211> 592 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> FLT3 x CD28; bsFcko-1/2 [N-концевая aHTM-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон 4G8) и С-концевая CD28 одноцепочечная (клон 9.3;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 10
Gin Vai Gin Leu Gin Gin Pro Gly Ala Glu Leu Vai Lys Pro Gly Ala
10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Lys Ser Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 20 25 30
- 45 040607
Trp Met His Trp Val Arg Gln Arg Pro Gly His Gly Leu 45 Glu Trp He
35 40
Gly Glu He 50 Asp Pro Ser Asp Ser Tyr Lys 55 Asp Tyr 60 Asn Gln Lys Phe
Lys 65 Asp Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Arg 70 Ser Ser 75 Asn Thr Ala Tyr 80
Met His Leu Ser Ser Leu Thr Ser Asp Asp 85 90 Ser Ala Val Tyr Tyr 95 Cys
Ala Arg Ala He Thr Thr Thr Pro Phe Asp 100 105 Phe Trp Gly Gln Gly 110 Thr
Thr Leu Thr 115 Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys 120 Gly Pro Ser 125 Val Phe Pro
Leu Ala Pro 130 Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly 135 Gly Thr 140 Ala Ala Leu Gly
Cys 145 Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro 150 Val Thr 155 Val Ser Trp Asn 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr 165 170 Phe Pro Ala Val Leu 175 Gln
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val 180 185 Val Thr Val Pro Ser 190 Ser
Ser Leu Gly 195 Thr Gln Thr Tyr lie Cys Asn 200 Val Asn His 205 Lys Pro Ser
Asn Thr Lys 210 Val Asp Lys Lys Val Glu Pro 215 Lys Ser 220 Cys Asp Lys Thr
His 225 Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro 230 Val Ala 235 Gly Pro Ser Val 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr 245 250 Leu Met He Ser Arg 255 Thr
- 46 040607
Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser His Glu Asp Pro Glu
260 265270
Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His Asn Ala Lys
275 280285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg Vai Vai Ser
290 295300
Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
305 310 315320
Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro lie Glu Lys Thr lie
325 330335
Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp lie Glu Leu Thr Gin Ser
340 345350
Pro Ala Ser Leu Ala Vai Ser Leu Gly Gin Arg Ala Thr lie Ser Cys
355 360365
Arg Ala Ser Glu Ser Vai Glu Tyr Tyr Vai Thr Ser Leu Met Gin Trp
370 375380
Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu lie Phe Ala Ala
385 390 395400
Ser Asn Vai Glu Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
405 410415
Gly Thr Asn Phe Ser Leu Asn He His Pro Vai Asp Glu Asp Asp Vai
420 425430
Ala Met Tyr Phe Cys Gin Gin Ser Arg Lys Vai Pro Tyr Thr Phe Gly
435 440445
Gly Gly Thr Lys Leu Glu He Lys Arg Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
450 455460
- 47 040607
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin Vai Lys Leu Gin Gin Ser Gly
465 470 475480
Pro Gly Leu Vai Thr Pro Ser Gin Ser Leu Ser He Thr Cys Thr Vai
485 490495
Ser Gly Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Gly Vai His Trp Vai Arg Gin Ser
500 505510
Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Leu Gly Vai He Trp Ala Gly Gly Gly
515 520525
Thr Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met Ser Arg Lys Ser He Ser Lys Asp
530 535540
Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gin Ala Asp
545 550 555560
Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Asp Lys Gly Tyr Ser Tyr Tyr
565 570575
Tyr Ser Met Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Thr Vai Thr Vai Ser Ser 580 585590 <210> 11 <211> 597 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> FLT3 x CD28; bsFcko-1/2 [N-концевая 3hth-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон BV10) и С-концевая CD28 одноцепочечная (клон 9.3,
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 11
Gin Vai Gin Leu Lys Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Gin Pro Ser Gin 15 1015
Ser Leu Ser He Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 20 2530
Gly Leu His Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 4045
- 48 040607
Gly Vai He Trp Ser Gly Gly Ser Thr
55
Asp Tyr Asn Ala Ala Phe He 60
Ser Arg Leu Ser lie Ser Lys Asp Asn 65 70
Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe
80
Lys Met Asn Ser Leu Gin Ala Asp Asp 85
Thr Ala He Tyr Tyr Cys Ala 90 95
Arg Lys Gly Gly He Tyr Tyr Ala Asn
100 105
His Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
110
Trp Gly Gin Gly Thr Ser Vai Thr Vai
115 120
Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly 125
Pro Ser Vai Phe Pro Leu Ala Pro Ser
130 135
Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly
140
Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Vai Lys 145 150
Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai
155 160
Thr Vai Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu 165
Thr Ser Gly Vai His Thr Phe
170 175
Pro Ala Vai Leu Gin Ser Ser Gly Leu
180 185
Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai 190
Thr Vai Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr
195 200
Gin Thr Tyr He Cys Asn Vai 205
Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Vai
210 215
Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys 220
Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Ser Pro 225 230
Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai
235 240
Ala Gly Pro Ser Vai Phe Leu Phe Pro 245
Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu
250 255
Met He Ser Arg Thr Pro Glu Vai Thr
Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser
- 49 040607
260
265 270
His Glu Asp Pro Glu Vai Lys Phe
275 280
Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu
285
Vai His Asn Ala Lys Thr Lys Pro
290 295
Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr
300
Tyr Arg Vai Vai Ser Vai Leu Thr 305 310
Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn
315 320
Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Vai
325
Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro
330 335
He Glu Lys Thr lie Ser Lys Ala 340
Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp He 345 350
Glu Leu Thr Gin Ser Pro Ala Ser
355 360
Leu Ala Vai Ser Leu Gly Gin Arg
365
Ala Thr He Ser Cys Arg Ala Ser
370 375
Glu Ser Vai Glu Tyr Tyr Vai Thr 380
Ser Leu Met Gin Trp Tyr Gin Gin
385 390
Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu
395 400
Leu He Phe Ala Ala Ser Asn Vai 405
Glu Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe
410 415
Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asn
420
Phe Ser Leu Asn He His Pro Vai
425 430
Asp Glu Asp Asp Vai Ala Met Tyr
435 440
Phe Cys Gin Gin Ser Arg Lys Vai 445
Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr
450 455
Lys Leu Glu He Lys Arg Gly Gly 460
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 465 470
Gly Gly Gly Gly Ser Gin Vai Lys
475 480
- 50 040607
Leu Gin Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Thr Pro Ser Gin Ser Leu Ser 485 490495
He Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Gly Vai His
500 505510
Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Leu Gly Vai He 515 520525
Trp Ala Gly Gly Gly Thr Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met Ser Arg Lys
530 535540
Ser lie Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Leu Lys Met Asn
545 550 555560
Ser Leu Gin Ala Asp Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Asp Lys
565 570575
Gly Tyr Ser Tyr Tyr Tyr Ser Met Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Thr
580 585590
Vai Thr Vai Ser Ser 595 <210> 12 <211> 589 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> FLT3 x CD16; bsFcko-1/2 [N-концевая aHTH-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон 4G8) и С-концевая CD16 одноцепочечная (клон 3G8;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 12
Gin Vai Gin Leu 1 Gin Gin 5 Pro Gly Ala Glu Leu 10 Vai Lys Pro Gly 15 Ala
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Lys Ser Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Vai Arg Gin Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp He
- 51 040607
4045
Gly Glu He Asp Pro Ser Asp Ser Tyr Lys Asp Tyr Asn Gin Lys Phe 50 5560
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Vai Asp Arg Ser Ser Asn Thr Ala Tyr 65 70 7580
Met His Leu Ser Ser Leu Thr Ser Asp Asp Ser Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Arg Ala lie Thr Thr Thr Pro Phe Asp Phe Trp Gly Gin Gly Thr
100 105110
Thr Leu Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Vai Phe Pro 115 120125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135140
Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai Thr Vai Ser Trp Asn
145 150 155160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe Pro Ala Vai Leu Gin
165 170175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai Thr Vai Pro Ser Ser
180 185190
Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr He Cys Asn Vai Asn His Lys Pro Ser
195 200205
Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr
210 215220
His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai Ala Gly Pro Ser Vai
225 230 235240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met He Ser Arg Thr
245 250255
- 52 040607
Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser His Glu Asp 270 Pro Glu
260 265
Vai Lys Phe Asn Trp 275 Tyr Vai Asp Gly Vai 280 Glu Vai His 285 Asn Ala Lys
Thr Lys 290 Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser 295 Thr Tyr Arg 300 Vai Vai Ser
Vai Leu 305 Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu 310 Asn Gly 315 Lys Glu Tyr Lys 320
Cys Lys Vai Ser Asn 325 Lys Gin Leu Pro Ser 330 Pro lie Glu Lys Thr 335 He
Ser Lys Ala Lys Gly 340 Gin Pro Ser Gly Asp 345 He Vai Leu Thr 350 Gin Ser
Pro Ala Ser Leu Ala 355 Vai Ser Leu Gly Gin 360 Arg Ala Thr 365 He Ser Cys
Lys Ala 370 Ser Gin Ser Vai Asp Phe Asp Gly 375 Asp Ser 380 Phe Met Asn Trp
Tyr Gin 385 Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys 390 Leu Leu 395 He Tyr Thr Thr 400
Ser Asn Leu Glu Ser 405 Gly He Pro Ala Arg 410 Phe Ser Ala Ser Gly 415 Ser
Gly Thr Asp Phe Thr 420 Leu Asn He His Pro 425 Vai Glu Glu Glu 430 Asp Thr
Ala Thr Tyr Tyr Cys 435 Gin Gin Ser Asn Glu 440 Asp Pro Tyr 445 Thr Phe Gly
Gly Gly 450 Thr Lys Leu Glu lie Lys Gly Gly 455 Gly Gly 460 Ser Gly Gly Gly
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin Vai Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro
- 53 040607
465 470 475480
Gly lie Leu Gin Pro Ser Gin Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser
485 490495
Gly Phe Ser Leu Arg Thr Ser Gly Met Gly Val Gly Trp lie Arg Gin
500 505510
Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala His lie Trp Trp Asp Asp
515 520525
Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr lie Ser Lys
530 535540
Asp Thr Ser Ser Asn Gin Val Phe Leu Lys lie Ala Ser Val Asp Thr
545 550 555560
Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gin lie Asn Pro Ala Trp Phe 565 570575
Ala Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 580585 <210> 13 <211> 594 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> FLT3 x CD16; bsFcko-1/2 [N-концевая aHTH-FLT3 химерная тяжелая цепь (клон BV10) и С-концевая CD16 одноцепочечная (клон 3G8;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы < 400> 13
Gin 1 Val Gin Leu Lys 5 Gin Ser Gly Pro Gly 10 Leu Val Gin Pro Ser 15 Gin
Ser Leu Ser lie 20 Thr cys Thr Val Ser 25 Gly Phe Ser Leu Thr 30 Asn Tyr
Gly Leu His 35 Trp Val Arg Gin Ser 40 Pro Gly Lys Gly Leu 45 Glu Trp Leu
Gly Val lie Trp Ser Gly Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Ala Ala Phe lie
- 54 040607
55
Ser Arg Leu Ser lie Ser Lys 65 70
Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe 75 80
Lys Met Asn Ser Leu Gin Ala 85
Asp Asp Thr Ala lie Tyr Tyr Cys Ala 90 95
Arg Lys Gly Gly lie Tyr Tyr 100
Ala Asn His Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
105 110
Trp Gly Gin Gly Thr Ser Vai 115
Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly 120 125
Pro Ser Vai Phe Pro Leu Ala
130 135
Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly
140
Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu
145 150
Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai
155 160
Thr Vai Ser Trp Asn Ser Gly
165
Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe
170 175
Pro Ala Vai Leu Gin Ser Ser
180
Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai
185 190
Thr Vai Pro Ser Ser Ser Leu
195
Gly Thr Gin Thr Tyr lie Cys Asn Vai 200 205
Asn His Lys Pro Ser Asn Thr
210 215
Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys 220
Ser Cys Asp Lys Thr His Thr
225 230
Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai
235 240
Ala Gly Pro Ser Vai Phe Leu
245
Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu
250 255
Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu 260
Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser
265 270
- 55 040607
His Glu Asp 275 Pro Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr 280 Vai Asp Gly 285 Vai Glu
Vai His Asn 290 Ala Lys Thr Lys 295 Pro Arg Glu Glu Gin 300 Tyr Gin Ser Thr
Tyr 305 Arg Vai Vai Ser Vai 310 Leu Thr Vai Leu His 315 Gin Asp Trp Leu Asn 320
Gly Lys Glu Tyr Lys 325 Cys Lys Vai Ser Asn Lys 330 Gin Leu Pro Ser 335 Pro
Ue Glu Lys Thr 340 Ue Ser Lys Ala Lys Gly Gin 345 Pro Ser Gly 350 Asp Ue
Vai Leu Thr 355 Gin Ser Pro Ala Ser Leu Ala Vai 360 Ser Leu Gly 365 Gin Arg
Ala Thr lie 370 Ser cys Lys Ala 375 Ser Gin Ser Vai Asp 380 Phe Asp Gly Asp
Ser 385 Phe Met Asn Trp Tyr 390 Gin Gin Lys Pro Gly 395 Gin Pro Pro Lys Leu 400
Leu lie Tyr Thr Thr 405 Ser Asn Leu Glu Ser Gly 410 Ue Pro Ala Arg 415 Phe
Ser Ala Ser Gly 420 Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu 425 Asn lie His 430 Pro Vai
Glu Glu Glu 435 Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin 440 Gin Ser Asn 445 Glu Asp
Pro Tyr Thr 450 Phe Gly Gly Gly 455 Thr Lys Leu Glu Ue 460 Lys Gly Gly Gly
Gly 465 Ser Gly Gly Gly Gly 470 Ser Gly Gly Gly Gly 475 Ser Gin Vai Thr Leu 480
Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ue Leu Gin Pro Ser Gin Thr Leu Ser Leu
- 56 040607
485 490495
Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Arg Thr Ser Gly Met Gly Vai 500 505510
Gly Trp He Arg Gin Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala His
515 520525
He Trp Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser Arg
530 535540
Leu Thr He Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gin Vai Phe Leu Lys lie
545 550 555560
Ala Ser Vai Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gin lie
565 570575
Asn Pro Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai
580 585590
Ser Ser <210> 14 <211> 592 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> CD19 x CD3, bsFcko-1/2 [N-концевая анти-С019 химерная тяжелая цепь (клон 4G7) и С-концевая анти-СОЗ одноцепочечная (клон
UCHT1; VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 14
Glu Vai Gin 1 Leu Gin 5 Gin Ser Gly Pro Glu 10 Leu He Lys Pro Gly 15 Ala
Ser Vai Lys Met Ser cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Vai Met His Trp Vai Lys Gin Lys Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp He
35 40 45
- 57 040607
Gly Tyr He Asn Pro Tyr Asn Asp Gly Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe 50 5560
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ser Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr 65 70 7580
Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Arg Gly Thr Tyr Tyr Tyr Gly Ser Arg Vai Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105110
Gin Gly Thr Thr Leu Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120125
Vai Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135140
Ala Leu Gly Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai Thr Vai
145 150 155160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe Pro Ala
165 170175
Vai Leu Gin Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai Thr Vai
180 185190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr lie Cys Asn Vai Asn His
195 200205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys Ser Cys
210 215220
Asp Lys Thr His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai Ala Gly
225 230 235240
Pro Ser Vai Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met lie
245 250255
Ser Arg Thr Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser His Glu
260 265270
- 58 040607
Asp Pro Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His
275 280285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg
290 295300
Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315320
Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro He Glu
325 330335
Lys Thr He Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp He Gin Met
340 345350
Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Vai Gly Asp Arg Vai Thr
355 360365
He Thr Cys Arg Ala Ser Gin Asp He Arg Asn Tyr Leu Asn Trp Tyr
370 375380
Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu He Tyr Tyr Thr Ser
385 390 395400
Arg Leu Glu Ser Gly Vai Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly 405 410415
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr He Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala 420 425430
Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Gly Asn Thr Leu Pro Trp Thr Phe Gly Gin
435 440445
Gly Thr Lys Vai Glu He Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
450 455460
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly
465 470 475480
- 59 040607
Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly 485 490495
Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr Thr Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly
500 505510
Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Leu He Asn Pro Tyr Lys Gly Val Ser
515 520525
Thr Tyr Asn Gln Lys Phe Lys Asp Arg Phe Thr lie Ser Val Asp Lys
530 535540
Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp
545 550 555560
Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Ser Gly Tyr Tyr Gly Asp Ser Asp 565 570575
Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
580 585590 <210> 15 <211> 588 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CD19 x TCR альфа/бета, bsFcko-1/2 [N-концевая анти-С019 химерная тяжелая цепь (клон 4G7) и С-концевая анти-TCR альфа/бета одноцепочечная (клон гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 15
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala
Val Met His Trp Val Lys Gln Lys 3540
Gly Tyr He Asn Pro Tyr Asn Asp
5055
BMA031; VH-VL)]: цепь
Pro Glu Leu He Lys Pro Gly Ala 10 15
Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 25 30
Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp He 45
Gly Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe 60
- 60 040607
Lys 65
Gly
Lys
Ala
Thr
Leu 70
Thr
Ser
Asp
Lys
Ser 75
Ser
Ser
Thr
Ala
Tyr 80
Met
Glu
Leu
Ser
Ser 85
Leu
Thr
Ser
Glu
Asp 90
Ser
Ala
Vai
Tyr
Tyr 95 cys
Ala
Arg
Gly
Thr 100
Tyr
Tyr
Tyr
Gly
Ser
105
Arg
Vai
Phe
Asp
Tyr 110
Trp
Gly
Gin
Gly
Thr 115
Thr
Leu
Thr
Vai
Ser
120
Ser
Ala
Ser
Thr
Lys
125
Gly
Pro
Ser
Vai
Phe
130
Pro
Leu
Ala
Pro
Ser
135
Ser
Lys
Ser
Thr
Ser
140
Gly
Gly
Thr
Ala
Ala 145
Leu
Gly
Cys
Leu
Vai 150
Lys
Asp
Tyr
Phe
Pro
155
Glu
Pro
Vai
Thr
Vai 160
Ser
Trp
Asn
Ser
Gly 165
Ala
Leu
Thr
Ser
Gly 170
Vai
His
Thr
Phe
Pro 175
Ala
Vai
Leu
Gin
Ser
180
Ser
Gly
Leu
Tyr
Ser
185
Leu
Ser
Ser
Vai
Vai 190
Thr
Vai
Pro
Ser
Ser
195
Ser
Leu
Gly
Thr
Gin
200
Thr
Tyr
He cys
Asn
205
Vai
Asn
His
Lys
Pro
210
Ser
Asn
Thr
Lys
Vai 215
Asp
Lys
Lys
Vai
Glu 220
Pro
Lys
Ser
Cys
Asp 225
Lys
Thr
His
Thr
Ser
230
Pro
Pro
Ser
Pro
Ala
235
Pro
Pro
Vai
Ala
Gly 240
Pro
Ser
Vai
Phe
Leu
245
Phe
Pro
Pro
Lys
Pro
250
Lys
Asp
Thr
Leu
Met
255
He
Ser
Arg
Thr
Pro
260
Glu
Vai
Thr cys
Vai
265
Vai
Vai
Gly
Vai
Ser
270
His
Glu
- 61 040607
Asp Pro Glu Vai Lys Phe Asn Trp
275 280
Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His
285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
290 295
Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg 300
Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu
305 310
His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn
325
Lys Gin Leu Pro Ser Pro He Glu
330 335
Lys Thr He Ser Lys Ala Lys Gly 340
Gin Pro Ser Gly Glu Vai Gin Leu 345 350
Gin Gin Ser Gly Pro Glu Leu Vai
355 360
Lys Pro Gly Ala Ser Vai Lys Met
365
Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Lys
370 375
Phe Thr Ser Tyr Vai Met His Trp 380
Vai Lys Gin Lys Pro Gly Gin Gly
385 390
Leu Glu Trp He Gly Tyr lie Asn
395 400
Pro Tyr Asn Asp Vai Thr Lys Tyr 405
Asn Glu Lys Phe Lys Gly Lys Ala
410 415
Thr Leu Thr Ser Asp Lys Ser Ser 420
Ser Thr Ala Tyr Met Glu Leu Ser 425 430
Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala
435 440
Vai His Tyr Cys Ala Arg Gly Ser 445
Tyr Tyr Asp Tyr Asp Gly Phe Vai
450 455
Tyr Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr
460
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
465 470
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
475 480
Gly Ser Gin He Vai Leu Thr Gin
485
Ser Pro Ala He Met Ser Ala Ser
490 495
- 62 040607
Pro Gly Glu Lys Vai Thr Met Thr Cys Ser Ala Thr Ser Ser Vai Ser
500 505510
Tyr Met His Trp Tyr Gin Gin Lys Ser Gly Thr Ser Pro Lys Arg Trp
515 520525
He Tyr Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser
530 535540
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr He Ser Ser Met Glu
545 550 555560
Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Trp Ser Ser Asn Pro
565 570575
Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys 580585 <210> 16 <211> 595 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> CD19 x CD28; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-С019 химерная тяжелая цепь (клон 4G7) и С-концевая CD28 одноцепочечная (клон 9.3;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы < 400> 16
Glu 1 Vai Gin Leu Gin 5 Gin Ser Gly Pro Glu 10 Leu He Lys Pro Gly 15 Ala
Ser Vai Lys Met 20 Ser cys Lys Ala Ser 25 Gly Tyr Thr Phe Thr 30 Ser Tyr
Vai Met His 35 Trp Vai Lys Gin Lys 40 Pro Gly Gin Gly Leu 45 Glu Trp He
Gly Tyr 50 He Asn Pro Tyr Asn 55 Asp Gly Thr Lys Tyr 60 Asn Glu Lys Phe
- 63 040607
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ser Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr 65 70 7580
Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Arg Gly Thr Tyr Tyr Tyr Gly Ser Arg Vai Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105110
Gin Gly Thr Thr Leu Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser 115 120125
Vai Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135140
Ala Leu Gly Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai Thr Vai
145 150 155160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe Pro Ala
165 170175
Vai Leu Gin Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai Thr Vai
180 185190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr lie Cys Asn Vai Asn His
195 200205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys Ser Cys
210 215220
Asp Lys Thr His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai Ala Gly
225 230 235240
Pro Ser Vai Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met lie
245 250255
Ser Arg Thr Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser His Glu
260 265270
Asp Pro Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His
275 280285
- 64 040607
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg
290 295300
Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315320
Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro He Glu
325 330335
Lys Thr He Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp He Glu Leu
340 345350
Thr Gin Ser Pro Ala Ser Leu Ala Vai Ser Leu Gly Gin Arg Ala Thr
355 360365
He Ser Cys Arg Ala Ser Glu Ser Vai Glu Tyr Tyr Vai Thr Ser Leu
370 375380
Met Gin Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu He
385 390 395400
Phe Ala Ala Ser Asn Vai Glu Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser Gly 405 410415
Ser Gly Ser Gly Thr Asn Phe Ser Leu Asn lie His Pro Vai Asp Glu 420 425430
Asp Asp Vai Ala Met Tyr Phe Cys Gin Gin Ser Arg Lys Vai Pro Tyr
435 440445
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu He Lys Arg Gly Gly Gly Gly
450 455460
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin Vai Lys Leu Gin
465 470 475480
Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Thr Pro Ser Gin Ser Leu Ser He Thr
485 490495
- 65 040607
Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Gly Vai His Trp Vai
500 505510
Arg Gin Ser Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Leu Gly Vai He Trp Ala
515 520525
Gly Gly Gly Thr Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met Ser Arg Lys Ser lie
530 535540
Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu
545 550 555560
Gin Ala Asp Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Asp Lys Gly Tyr
565 570575
Ser Tyr Tyr Tyr Ser Met Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Thr Vai Thr
580 585590
Vai Ser Ser
595 <210> 17 <211> 592 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> CD19 x CD16; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-С019 химерная тяжелая цепь (клон 4G7) и С-концевая CD16 одноцепочечная (клон 3G8;
VL-VH)], цепи гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 17
Glu Vai Gin Leu Gin Gin Ser Gly Pro Glu Leu lie Lys Pro Gly Ala
1015
Ser Vai Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 20 2530
Vai Met His Trp Vai Lys Gin Lys Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp lie 35 4045
Gly Tyr lie Asn Pro Tyr Asn Asp Gly Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe 50 5560
- 66 040607
Lys 65
Gly
Lys
Ala
Thr
Leu 70
Thr
Ser
Asp
Lys
Ser 75
Ser
Ser
Thr
Ala
Tyr 80
Met
Glu
Leu
Ser
Ser 85
Leu
Thr
Ser
Glu
Asp 90
Ser
Ala
Vai
Tyr
Tyr 95
Cys
Ala
Arg
Gly
Thr
100
Tyr
Tyr
Tyr
Gly
Ser 105
Arg
Vai
Phe
Asp
Tyr 110
Trp
Gly
Gin
Gly
Thr
115
Thr
Leu
Thr
Vai
Ser
120
Ser
Ala
Ser
Thr
Lys 125
Gly
Pro
Ser
Vai
Phe 130
Pro
Leu
Ala
Pro
Ser
135
Ser
Lys
Ser
Thr
Ser
140
Gly
Gly
Thr
Ala
Ala 145
Leu
Gly
Cys
Leu
Vai
150
Lys
Asp
Tyr
Phe
Pro
155
Glu
Pro
Vai
Thr
Vai 160
Ser
Trp
Asn
Ser
Gly 165
Ala
Leu
Thr
Ser
Gly 170
Vai
His
Thr
Phe
Pro
175
Ala
Vai
Leu
Gin
Ser
180
Ser
Gly
Leu
Tyr
Ser
185
Leu
Ser
Ser
Vai
Vai 190
Thr
Vai
Pro
Ser
Ser
195
Ser
Leu
Gly
Thr
Gin
200
Thr
Tyr
He cys
Asn 205
Vai
Asn
His
Lys
Pro
210
Ser
Asn
Thr
Lys
Vai 215
Asp
Lys
Lys
Vai
Glu 220
Pro
Lys
Ser
Cys
Asp 225
Lys
Thr
His
Thr
Ser
230
Pro
Pro
Ser
Pro
Ala
235
Pro
Pro
Vai
Ala
Gly 240
Pro
Ser
Vai
Phe
Leu 245
Phe
Pro
Pro
Lys
Pro 250
Lys
Asp
Thr
Leu
Met
255
He
Ser
Arg
Thr
Pro 260
Glu
Vai
Thr
Cys
Vai
265
Vai
Vai
Gly
Vai
Ser
270
His
Glu
- 67 040607
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg
290 295300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro lie Glu
325 330335
Lys Thr lie Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp lie Val Leu
340 345350
Thr Gin Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly Gin Arg Ala Thr
355 360365 lie Ser Cys Lys Ala Ser Gin Ser Val Asp Phe Asp Gly Asp Ser Phe
370 375380
Met Asn Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu lie 385 390 395400
Tyr Thr Thr Ser Asn Leu Glu Ser Gly lie Pro Ala Arg Phe Ser Ala 405 410415
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn lie His Pro Val Glu Glu 420 425430
Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Ser Asn Glu Asp Pro Tyr 435 440445
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu lie Lys Gly Gly Gly Gly Ser
450 455460
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin Val Thr Leu Lys Glu
465 470 475480
Ser Gly Pro Gly lie Leu Gin Pro Ser Gin Thr Leu Ser Leu Thr Cys 485 490495
- 68 040607
Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Arg Thr Ser Gly Met Gly Vai Gly Trp
500 505510
He Arg Gin Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala His He Trp
515 520525
Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr
530 535540
He Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gin Vai Phe Leu Lys He Ala Ser
545 550 555560
Vai Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gin He Asn Pro
565 570575
Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser 580 585590 <210> 18 <211> 592 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CSPG4 x CD3, bsFcko-1/2 [N-концевая aHTM-CSPG4 химерная тяжелая цепь (клон 9.2.27) и С-концевая анти-СОЗ одноцепочечная (клон UCHT1; VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант полумолекулы <400> 18
Gin Vai Lys Leu Gin Gin Ser Gly
5
Pro Glu Leu Vai Lys Pro Gly Ala 10 15
Ser Vai Lys lie Ser Cys Lys Ala 20
Ser Gly Tyr Ala Phe Ser Arg Ser 25 30
Trp Met Asn Trp Vai Lys Gin Arg 35 40
Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp lie 45
Gly Arg lie Tyr Pro Gly Asp Gly
55
Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe 60
- 69 040607
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser 75 Ser Ser Thr Ala Tyr 80
65 70
Met Gln Val Ser Ser Leu 85 Thr Ser Val Asp Ser 90 Ala Val Tyr Phe 95 Cys
Ala Arg Gly Asn Thr Val 100 Val Val Pro Tyr Thr 105 Met Asp Tyr 110 Trp Gly
Gln Gly Thr Thr Val Thr 115 Val Ser 120 Ser Ala Ser Thr Lys 125 Gly Pro Ser
Val Phe 130 Pro Leu Ala Pro Ser Ser 135 Lys Ser Thr Ser 140 Gly Gly Thr Ala
Ala Leu 145 Gly Cys Leu Val 150 Lys Asp Tyr Phe Pro 155 Glu Pro Val Thr Val 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala 165 Leu Thr Ser Gly Val 170 His Thr Phe Pro 175 Ala
Val Leu Gln Ser Ser Gly 180 Leu Tyr Ser Leu Ser 185 Ser Val Val 190 Thr Val
Pro Ser Ser Ser Leu Gly 195 Thr Gln 200 Thr Tyr He Cys Asn 205 Val Asn His
Lys Pro 210 Ser Asn Thr Lys Val Asp 215 Lys Lys Val Glu 220 Pro Lys Ser cys
Asp Lys 225 Thr His Thr Ser 230 Pro Pro Ser Pro Ala 235 Pro Pro Val Ala Gly 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe 245 Pro Pro Lys Pro Lys 250 Asp Thr Leu Met 255 He
Ser Arg Thr Pro Glu Val 260 Thr Cys Val Val Val 265 Gly Val Ser 270 His Glu
Asp Pro Glu Val Lys Phe 275 Asn Trp 280 Tyr Val Asp Gly Val 285 Glu Val His
- 70 040607
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg
290 295300
Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315320
Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro Ue Glu
325 330335
Lys Thr lie Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp Ue Gin Met
340 345350
Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Vai Gly Asp Arg Vai Thr
355 360365 lie Thr Cys Arg Ala Ser Gin Asp lie Arg Asn Tyr Leu Asn Trp Tyr
370 375380
Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie Tyr Tyr Thr Ser
385 390 395400
Arg Leu Glu Ser Gly Vai Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
405 410415
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala
420 425430
Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Gly Asn Thr Leu Pro Trp Thr Phe Gly Gin
435 440445
Gly Thr Lys Vai Glu Ue Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
450 455460
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly
465 470 475480
Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly 485 490495
- 71 040607
Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr Thr Met 500
Asn Trp Vai Arg Gin Ala Pro Gly 505 510
Lys Gly Leu Glu Trp Vai Ala Leu
515 520
He Asn Pro Tyr Lys Gly Vai Ser
525
Thr Tyr Asn Gin Lys Phe Lys Asp
530 535
Arg Phe Thr He Ser Vai Asp Lys 540
Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin 545 550
Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp
555 560
Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg 565
Ser Gly Tyr Tyr Gly Asp Ser Asp
570 575
Trp Tyr Phe Asp Vai Trp Gly Gin 580
Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser 585 590 <210> 19 <211> 588 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CSPG4 x TCR альфа/бета, bsFcko-1/2 [N-концевая aHTH-CSPG4 химерная тяжелая цепь (клон 9.2 альфа/бета одноцепочечная (клон гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 19
Gin Vai Lys Leu Gin Gin Ser Gly 1 5
27) и С-концевая анти-TCR BMA031; VH-VL)], цепи
Pro Glu Leu Vai Lys Pro Gly Ala 10 15
Ser Vai Lys He Ser Cys Lys Ala 20
Ser Gly Tyr Ala Phe Ser Arg Ser 25 30
Trp Met Asn Trp Vai Lys Gin Arg 35 40
Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp He 45
Gly Arg He Tyr Pro Gly Asp Gly
55
Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala 65 70
Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr 75 80
- 72 040607
Met Gin Vai Ser Ser Leu Thr Ser Vai Asp Ser Ala Vai Tyr Phe Cys 85 9095
Ala Arg Gly Asn Thr Vai Vai Vai Pro Tyr Thr Met Asp Tyr Trp Gly
100 105110
Gin Gly Thr Thr Vai Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120125
Vai Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135140
Ala Leu Gly Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai Thr Vai
145 150 155160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe Pro Ala
165 170175
Vai Leu Gin Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai Thr Vai
180 185190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr He Cys Asn Vai Asn His 195 200205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys Ser Cys
210 215220
Asp Lys Thr His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai Ala Gly
225 230 235240
Pro Ser Vai Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met He
245 250255
Ser Arg Thr Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser His Glu
260 265270
Asp Pro Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His 275 280285
- 73 040607
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
290 295
Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg 300
Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu
305 310
His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn
325
Lys Gin Leu Pro Ser Pro lie Glu
330 335
Lys Thr He Ser Lys Ala Lys Gly 340
Gin Pro Ser Gly Glu Vai Gin Leu
345 350
Gin Gin Ser Gly Pro Glu Leu Vai
355 360
Lys Pro Gly Ala Ser Vai Lys Met
365
Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Lys
370 375
Phe Thr Ser Tyr Vai Met His Trp 380
Vai Lys Gin Lys Pro Gly Gin Gly 385 390
Leu Glu Trp lie Gly Tyr lie Asn
395 400
Pro Tyr Asn Asp Vai Thr Lys Tyr 405
Asn Glu Lys Phe Lys Gly Lys Ala
410 415
Thr Leu Thr Ser Asp Lys Ser Ser 420
Ser Thr Ala Tyr Met Glu Leu Ser 425 430
Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala
435 440
Vai His Tyr Cys Ala Arg Gly Ser 445
Tyr Tyr Asp Tyr Asp Gly Phe Vai
450 455
Tyr Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr 460
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
465 470
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
475 480
Gly Ser Gin He Vai Leu Thr Gin
485
Ser Pro Ala He Met Ser Ala Ser
490 495
Pro Gly Glu Lys Vai Thr Met Thr 500
Cys Ser Ala Thr Ser Ser Vai Ser 505 510
- 74 040607
Tyr Met His Trp Tyr Gin Gin Lys Ser Gly Thr Ser Pro Lys Arg Trp 515 520525 lie Tyr Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser
530 535540
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr lie Ser Ser Met Glu
545 550 555560
Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Trp Ser Ser Asn Pro 565 570575
Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys 580585 <210> 20 <211> 595 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> CSPG4 x CD28; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-СБРС4 химерная тяжелая цепь (клон 9.2.27) и С-концевая CD28 одноцепочечная (клон 9.3; VL-VH)], цепь гликан-ко-вариантполумолекулы <400> 20
Gin Vai Lys Leu Gin Gin Ser Gly Pro Glu Leu Vai Lys Pro Gly Ala 15 1015
Ser Vai Lys lie Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ser Arg Ser 20 2530
Trp Met Asn Trp Vai Lys Gin Arg Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp lie 35 4045
Gly Arg lie Tyr Pro Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe
5560
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr 65 70 7580
- 75 040607
Met Gin Vai Ser Ser 85 Leu Thr Ser Vai Asp Ser Ala 90 Vai Tyr Phe 95 cys
Ala Arg Gly Asn Thr 100 Vai Vai Vai Pro Tyr Thr Met 105 Asp Tyr 110 Trp Gly
Gin Gly Thr Thr Vai 115 Thr Vai Ser 120 Ser Ala Ser Thr Lys 125 Gly Pro Ser
Vai Phe Pro Leu Ala 130 Pro Ser 135 Ser Lys Ser Thr Ser 140 Gly Gly Thr Ala
Ala 145 Leu Gly Cys Leu Vai 150 Lys Asp Tyr Phe Pro Glu 155 Pro Vai Thr Vai 160
Ser Trp Asn Ser Gly 165 Ala Leu Thr Ser Gly Vai His 170 Thr Phe Pro 175 Ala
Vai Leu Gin Ser Ser 180 Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser 185 Vai Vai 190 Thr Vai
Pro Ser Ser Ser Leu 195 Gly Thr Gin 200 Thr Tyr He Cys Asn 205 Vai Asn His
Lys Pro Ser Asn Thr 210 Lys Vai 215 Asp Lys Lys Vai Glu 220 Pro Lys Ser cys
Asp 225 Lys Thr His Thr Ser 230 Pro Pro Ser Pro Ala Pro 235 Pro Vai Ala Gly 240
Pro Ser Vai Phe Leu 245 Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp 250 Thr Leu Met 255 He
Ser Arg Thr Pro Glu 260 Vai Thr cys Vai Vai Vai Gly 265 Vai Ser 270 His Glu
Asp Pro Glu Vai Lys 275 Phe Asn Trp 280 Tyr Vai Asp Gly Vai 285 Glu Vai His
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg
- 76 040607
290 295300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro Ile Glu
325 330335
Lys Thr lie Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp lie Glu Leu 340 345350
Thr Gin Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly Gin Arg Ala Thr
355 360365 lie Ser Cys Arg Ala Ser Glu Ser Val Glu Tyr Tyr Val Thr Ser Leu
370 375380
Met Gin Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu lie
385 390 395400
Phe Ala Ala Ser Asn Val Glu Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly 405 410415
Ser Gly Ser Gly Thr Asn Phe Ser Leu Asn lie His Pro Val Asp Glu 420 425430
Asp Asp Val Ala Met Tyr Phe Cys Gin Gin Ser Arg Lys Val Pro Tyr
435 440445
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu lie Lys Arg Gly Gly Gly Gly
450 455460
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin Val Lys Leu Gin
465 470 475480
Gin Ser Gly Pro Gly Leu Val Thr Pro Ser Gin Ser Leu Ser lie Thr 485 490495
Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Gly Val His Trp Val 500 505510
- 77 040607
Arg Gin Ser Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Leu Gly Vai lie Trp Ala
515 520525
Gly Gly Gly Thr Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met Ser Arg Lys Ser lie
530 535540
Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu
545 550 555560
Gin Ala Asp Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Asp Lys Gly Tyr
565 570575
Ser Tyr Tyr Tyr Ser Met Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Thr Vai Thr
580 585590
Vai Ser Ser
595 <210> 21 <211> 592 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> CSPG4 x CD16; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-С5Р64 химерная тяжелая цепь (клон 9.2.27) и С-концевая CD16 одноцепочечная (клон 3G8; VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 21
Gin Vai Lys Leu Gin Gin Ser Gly Pro Glu Leu Vai Lys Pro Gly Ala 15 1015
Ser Vai Lys lie Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ser Arg Ser 20 2530
Trp Met Asn Trp Vai Lys Gin Arg Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Ue 35 4045
Gly Arg lie Tyr Pro Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe
5560
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
- 78 040607
Met
Gin
Vai
Ser
Ser 85
Leu
Thr
Ser
Vai
Asp 90
Ser
Ala
Vai
Tyr
Phe 95
Cys
Ala
Arg
Gly
Asn 100
Thr
Vai
Vai
Vai
Pro
105
Tyr
Thr
Met
Asp
Tyr 110
Trp
Gly
Gin
Gly
Thr 115
Thr
Vai
Thr
Vai
Ser
120
Ser
Ala
Ser
Thr
Lys 125
Gly
Pro
Ser
Vai
Phe 130
Pro
Leu
Ala
Pro
Ser
135
Ser
Lys
Ser
Thr
Ser
140
Gly Gly
Thr
Ala
Ala 145
Leu
Gly
Cys
Leu
Vai
150
Lys
Asp
Tyr
Phe
Pro
155
Glu
Pro
Vai
Thr
Vai 160
Ser
Trp
Asn
Ser
Gly 165
Ala
Leu
Thr
Ser
Gly 170
Vai
His
Thr
Phe
Pro
175
Ala
Vai
Leu
Gin
Ser
180
Ser
Gly
Leu
Tyr
Ser
185
Leu
Ser
Ser
Vai
Vai 190
Thr
Vai
Pro
Ser
Ser
195
Ser
Leu
Gly
Thr
Gin 200
Thr
Tyr
He
Cys
Asn 205
Vai
Asn
His
Lys
Pro 210
Ser
Asn
Thr
Lys
Vai 215
Asp
Lys
Lys
Vai
Glu 220
Pro
Lys
Ser
Cys
Asp
225
Lys
Thr
His
Thr
Ser
230
Pro
Pro
Ser
Pro
Ala
235
Pro
Pro
Vai
Ala
Gly 240
Pro
Ser
Vai
Phe
Leu 245
Phe
Pro
Pro
Lys
Pro 250
Lys
Asp
Thr
Leu
Met 255
He
Ser
Arg
Thr
Pro
260
Glu
Vai
Thr
Cys
Vai
265
Vai
Vai
Gly
Vai
Ser
270
His
Glu
Asp
Pro
Glu
275
Vai
Lys
Phe
Asn
Trp 280
Tyr
Vai
Asp
Gly
Vai 285
Glu
Vai
His
- 79 040607
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
290 295
Glu Gin Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg 300
Vai Vai Ser Vai Leu Thr Vai Leu
305 310
His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys
315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Vai Ser Asn 325
Lys Gin Leu Pro Ser Pro He Glu
330 335
Lys Thr He Ser Lys Ala Lys Gly
340
Gin Pro Ser Gly Asp He Vai Leu 345 350
Thr Gin Ser Pro Ala Ser Leu Ala
355 360
Vai Ser Leu Gly Gin Arg Ala Thr
365
He Ser Cys Lys Ala Ser Gin Ser
370 375
Vai Asp Phe Asp Gly Asp Ser Phe 380
Met Asn Trp Tyr Gin Gin Lys Pro
385 390
Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu lie
395 400
Tyr Thr Thr Ser Asn Leu Glu Ser 405
Gly He Pro Ala Arg Phe Ser Ala
410 415
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 420
Leu Asn lie His Pro Vai Glu Glu
425 430
Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys
435 440
Gin Gin Ser Asn Glu Asp Pro Tyr 445
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu
450 455
Glu lie Lys Gly Gly Gly Gly Ser 460
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 465 470
Gly Ser Gin Vai Thr Leu Lys Glu
475 480
Ser Gly Pro Gly He Leu Gin Pro
485
Ser Gin Thr Leu Ser Leu Thr Cys
490 495
Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Arg
Thr Ser Gly Met Gly Vai Gly Trp
- 80 040607
500 505510
He Arg Gin Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala His He Trp
515 520525
Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr
530 535540
He Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gin Vai Phe Leu Lys He Ala Ser
545 550 555560
Vai Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gin He Asn Pro
565 570575
Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
580 585590 <210> 22 <211> 590 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> EGFR x CD3; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-EGFR химерная тяжелая цепь (клон С225) и С-концевая CD3 одноцепочечная (клон UCHT1;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы < 400> 22
Gin Vai Gin Leu Lys Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Gin Pro Ser Gin 15 1015
Ser Leu Ser lie Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 20 2530
Gly Vai His Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 4045
Gly Vai lie Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr Pro Phe Thr
5560
Ser Arg Leu Ser lie Asn Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe 65 70 7580
- 81 040607
Lys
Met
Asn
Ser
Leu 85
Gln
Ser
Asn
Asp
Thr 90
Ala
He
Tyr
Tyr
Cys 95
Ala
Arg
Ala
Leu
Thr
100
Tyr
Tyr
Asp
Tyr
Glu
105
Phe
Ala
Tyr
Trp
Gly 110
Gln
Gly
Thr
Leu
Val 115
Thr
Val
Ser
Ser
Ala 120
Ser
Thr
Lys
Gly
Pro
125
Ser
Val
Phe
Pro
Leu
130
Ala
Pro
Ser
Ser
Lys 135
Ser
Thr
Ser
Gly Gly
140
Thr
Ala
Ala
Leu
Gly 145
Cys
Leu
Val
Lys
Asp 150
Tyr
Phe
Pro
Glu
Pro
155
Val
Thr
Val
Ser
Trp 160
Asn
Ser
Gly
Ala
Leu 165
Thr
Ser
Gly
Val
His
170
Thr
Phe
Pro
Ala
Val 175
Leu
Gln
Ser
Ser
Gly 180
Leu
Tyr
Ser
Leu
Ser
185
Ser
Val
Val
Thr
Val 190
Pro
Ser
Ser
Ser
Leu 195
Gly
Thr
Gln
Thr
Tyr 200
He cys
Asn
Val
Asn 205
His
Lys
Pro
Ser
Asn 210
Thr
Lys
Val
Asp
Lys 215
Lys
Val
Glu
Pro
Lys 220
Ser
Cys
Asp
Lys
Thr
225
His
Thr
Ser
Pro
Pro
230
Ser
Pro
Ala
Pro
Pro
235
Val
Ala
Gly
Pro
Ser
240
Val
Phe
Leu
Phe
Pro
245
Pro
Lys
Pro
Lys
Asp
250
Thr
Leu
Met
He
Ser
255
Arg
Thr
Pro
Glu
Val 260
Thr
Cys
Val
Val
Val
265
Gly
Val
Ser
His
Glu 270
Asp
Pro
Glu
Val
Lys 275
Phe
Asn
Trp
Tyr
Val 280
Asp
Gly
Val
Glu
Val 285
His
Asn
Ala
Lys
Thr
Lys
Pro
Arg
Glu
Glu
Gln
Tyr
Gln
Ser
Thr
Tyr
Arg
Val
Val
- 82 040607
290 295300
Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315320
Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro He Glu Lys Thr
325 330335
He Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp He Gin Met Thr Gin
340 345350
Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Vai Gly Asp Arg Vai Thr He Thr
355 360365
Cys Arg Ala Ser Gin Asp He Arg Asn Tyr Leu Asn Trp Tyr Gin Gin
370 375380
Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie Tyr Tyr Thr Ser Arg Leu
385 390 395400
Glu Ser Gly Vai Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp 405 410415
Tyr Thr Leu Thr He Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr 420 425430
Tyr Cys Gin Gin Gly Asn Thr Leu Pro Trp Thr Phe Gly Gin Gly Thr
435 440445
Lys Vai Glu lie Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
450 455460
Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai
465 470 475480
Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Tyr Ser 485 490495
Phe Thr Gly Tyr Thr Met Asn Trp Vai Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly
500 505510
- 83 040607
Leu Glu Trp 515 Vai Ala Leu lie Asn 520 Pro Tyr Lys Gly Vai Ser Thr Tyr 525
Asn Gin Lys Phe Lys Asp Arg Phe Thr He Ser Vai Asp Lys Ser Lys
530 535 540
Asn Thr Ala Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala
545 550 555 560
Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Ser Gly Tyr Tyr Gly Asp Ser Asp Trp Tyr
565 570 575
Phe Asp Vai Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
580 585 590
<210> 23 <211> 586 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> EGFR x TCR альфа/бета; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-EGFR химерная тяжелая цепь (клон С225) и С-концевая TCR альфа/бета одноцепочечная (клон ВМА031; VH-VL)], цепь гликан-ковариант-полумолекулы <400> 23
Gin Vai Gin Leu Lys Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Gin Pro Ser Gin 15 1015
Ser Leu Ser He Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 20 2530
Gly Vai His Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 4045
Gly Vai lie Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr Pro Phe Thr 50 5560
Ser Arg Leu Ser He Asn Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe 65 70 7580
- 84 040607
Lys
Met
Asn
Ser
Leu 85
Gin
Ser
Asn
Asp
Thr 90
Ala
He
Tyr
Tyr cys 95
Ala
Arg
Ala
Leu
Thr
100
Tyr
Tyr
Asp
Tyr
Glu 105
Phe
Ala
Tyr
Trp
Gly 110
Gin
Gly
Thr
Leu
Vai 115
Thr
Vai
Ser
Ser
Ala 120
Ser
Thr
Lys
Gly
Pro
125
Ser
Vai
Phe
Pro
Leu
130
Ala
Pro
Ser
Ser
Lys 135
Ser
Thr
Ser
Gly
Gly 140
Thr
Ala
Ala
Leu
Gly 145
Cys
Leu
Vai
Lys
Asp 150
Tyr
Phe
Pro
Glu
Pro
155
Vai
Thr
Vai
Ser
Trp 160
Asn
Ser
Gly
Ala
Leu
165
Thr
Ser
Gly
Vai
His 170
Thr
Phe
Pro
Ala
Vai 175
Leu
Gin
Ser
Ser
Gly 180
Leu
Tyr
Ser
Leu
Ser
185
Ser
Vai
Vai
Thr
Vai 190
Pro
Ser
Ser
Ser
Leu
195
Gly
Thr
Gin
Thr
Tyr 200
He
Cys
Asn
Vai
Asn
205
His
Lys
Pro
Ser
Asn 210
Thr
Lys
Vai
Asp
Lys 215
Lys
Vai
Glu
Pro
Lys 220
Ser
Cys
Asp
Lys
Thr 225
His
Thr
Ser
Pro
Pro 230
Ser
Pro
Ala
Pro
Pro
235
Vai
Ala
Gly
Pro
Ser
240
Vai
Phe
Leu
Phe
Pro
245
Pro
Lys
Pro
Lys
Asp 250
Thr
Leu
Met
He
Ser
255
Arg
Thr
Pro
Glu
Vai 260
Thr
Cys
Vai
Vai
Vai 265
Gly
Vai
Ser
His
Glu
270
Asp
Pro
Glu
Vai
Lys 275
Phe
Asn
Trp
Tyr
Vai 280
Asp
Gly
Vai
Glu
Vai
285
His
Asn
Ala
- 85 040607
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin
290 295
Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg Val Val 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gin
305 310
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gin
325
Leu Pro Ser Pro lie Glu Lys Thr
330 335 lie Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro 340
Ser Gly Glu Val Gin Leu Gin Gin 345 350
Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro
355 360
Gly Ala Ser Val Lys Met Ser Cys 365
Lys Ala Ser Gly Tyr Lys Phe Thr
370 375
Ser Tyr Val Met His Trp Val Lys 380
Gin Lys Pro Gly Gin Gly Leu Glu 385 390
Trp lie Gly Tyr lie Asn Pro Tyr
395 400
Asn Asp Val Thr Lys Tyr Asn Glu 405
Lys Phe Lys Gly Lys Ala Thr Leu
410 415
Thr Ser Asp Lys Ser Ser Ser Thr
420
Ala Tyr Met Glu Leu Ser Ser Leu 425 430
Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val His
435 440
Tyr Cys Ala Arg Gly Ser Tyr Tyr 445
Asp Tyr Asp Gly Phe Val Tyr Gly
450 455
Gin Gly Thr Leu Val Thr Val Ser 460
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 465 470
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
475 480
Gin Ile Val Leu Thr Gin Ser Pro 485
Ala lie Met Ser Ala Ser Pro Gly
490 495
Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Ser
500
Ala Thr Ser Ser Val Ser Tyr Met 505 510
- 86 040607
His Trp Tyr Gin Gin Lys Ser Gly Thr Ser Pro Lys Arg Trp lie Tyr
515 520525
Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser
530 535540
Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr lie Ser Ser Met Glu Ala Glu
545 550 555560
Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr 565 570575
Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
580585 <210> 24 <211> 593 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> EGFR x CD28; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-EGFR химерная тяжелая цепь (клон С225) и С-концевая CD28 одноцепочечная (клон 9.3;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы < 400> 24
Gin Vai Gin Leu Lys Gin Ser Gly Pro Gly Leu Vai Gin Pro Ser Gin
1015
Ser Leu Ser lie Thr Cys Thr Vai Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 20 2530
Gly Vai His Trp Vai Arg Gin Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 4045
Gly Vai lie Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr Pro Phe Thr
5560
Ser Arg Leu Ser lie Asn Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe 65 70 7580
- 87 040607
Lys Met Asn Ser Leu Gin Ser Asn 85
Asp Thr Ala He Tyr Tyr Cys Ala 90 95
Arg Ala Leu Thr Tyr Tyr Asp Tyr 100
Glu Phe Ala Tyr Trp Gly Gin Gly 105 110
Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser Ala
115 120
Ser Thr Lys Gly Pro Ser Vai Phe 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser
130 . 135
Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu 140
Gly Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe 145 150
Pro Glu Pro Vai Thr Vai Ser Trp
155 160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly 165
Vai His Thr Phe Pro Ala Vai Leu
170 175
Gin Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu 180
Ser Ser Vai Vai Thr Vai Pro Ser
185 190
Ser Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr
195 200 lie Cys Asn Vai Asn His Lys Pro 205
Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys
210 215
Vai Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys 220
Thr His Thr Ser Pro Pro Ser Pro
225 230
Ala Pro Pro Vai Ala Gly Pro Ser
235 240
Vai Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro 245
Lys Asp Thr Leu Met He Ser Arg
250 255
Thr Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai
260
Vai Gly Vai Ser His Glu Asp Pro
265 270
Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai
275 280
Asp Gly Vai Glu Vai His Asn Ala 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin
290 295
Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg Vai Vai 300
- 88 040607
Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315320
Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin Leu Pro Ser Pro He Glu Lys Thr
325 330335
He Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Ser Gly Asp He Glu Leu Thr Gin
340 345350
Ser Pro Ala Ser Leu Ala Vai Ser Leu Gly Gin Arg Ala Thr He Ser
355 360365
Cys Arg Ala Ser Glu Ser Vai Glu Tyr Tyr Vai Thr Ser Leu Met Gin
370 375380
Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu He Phe Ala
385 390 395400
Ala Ser Asn Vai Glu Ser Gly Vai Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly
405 410415
Ser Gly Thr Asn Phe Ser Leu Asn lie His Pro Vai Asp Glu Asp Asp 420 425430
Vai Ala Met Tyr Phe Cys Gin Gin Ser Arg Lys Vai Pro Tyr Thr Phe
435 440445
Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu lie Lys Arg Gly Gly Gly Gly Ser Gly
450 455460
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gin Vai Lys Leu Gin Gin Ser
465 470 475480
Gly Pro Gly Leu Vai Thr Pro Ser Gin Ser Leu Ser He Thr Cys Thr
485 490495
Vai Ser Gly Phe Ser Leu Ser Asp Tyr Gly Vai His Trp Vai Arg Gin
500 505510
- 89 040607
Ser Pro Gly 515 Gin Gly Leu Glu Trp Leu Gly Vai He Trp Ala Gly Gly
520 525
Gly Thr 530 Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met Ser Arg 535 Lys Ser He Ser Lys 540
Asp Asn 545 Ser Lys Ser Gin 550 Vai Phe Leu Lys Met 555 Asn Ser Leu Gin Ala 560
Asp Asp Thr Ala Vai Tyr 565 Tyr Cys Ala Arg Asp 570 Lys Gly Tyr Ser Tyr 575
Tyr Tyr Ser Met 580 Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr 585 Thr Vai Thr Vai Ser 590
Ser <210> 25 <211> 590 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> EGFR x CD16; bsFcko-1/2 [N-концевая анти-EGFR химерная тяжелая цепь (клон С225) и С-концевая CD16 одноцепочечная (клон 3G8;
VL-VH)], цепь гликан-ко-вариант-полумолекулы <400> 25
Gin Vai Gin Leu Lys Gin Ser Gly 1 5
Pro Gly Leu Vai Gin Pro Ser Gin
15
Ser Leu Ser lie Thr Cys Thr Vai 20
Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 25 30
Gly Vai His Trp Vai Arg Gin Ser
40
Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 45
Gly Vai He Trp Ser Gly Gly Asn
55
Thr Asp Tyr Asn Thr Pro Phe Thr 60
Ser Arg Leu Ser lie Asn Lys Asp 65 70
Asn Ser Lys Ser Gin Vai Phe Phe 75 80
- 90 040607
Lys Met Asn Ser Leu Gin Ser Asn Asp Thr Ala Ue Tyr Tyr Cys Ala 85 9095
Arg Ala Leu Thr Tyr Tyr Asp Tyr Glu Phe Ala Tyr Trp Gly Gin Gly
100 105110
Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Vai Phe
115 120125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
130 135140
Gly Cys Leu Vai Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Vai Thr Vai Ser Trp
145 150 155160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Vai His Thr Phe Pro Ala Vai Leu 165 170175
Gin Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Vai Vai Thr Vai Pro Ser
180 185190
Ser Ser Leu Gly Thr Gin Thr Tyr lie Cys Asn Vai Asn His Lys Pro
195 200205
Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys Vai Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys
210 215220
Thr His Thr Ser Pro Pro Ser Pro Ala Pro Pro Vai Ala Gly Pro Ser
225 230 235240
Vai Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met lie Ser Arg
245 250255
Thr Pro Glu Vai Thr Cys Vai Vai Vai Gly Vai Ser His Glu Asp Pro
260 265270
Glu Vai Lys Phe Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His Asn Ala
275 280285
- 91 040607
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin
290 295
Tyr Gin Ser Thr Tyr Arg Vai Vai 300
Ser Vai Leu Thr Vai Leu His Gin
305 310
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
315 320
Lys Cys Lys Vai Ser Asn Lys Gin
325
Leu Pro Ser Pro lie Glu Lys Thr
330 335
He Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro
340
Ser Gly Asp He Vai Leu Thr Gin
345 350
Ser Pro Ala Ser Leu Ala Vai Ser
355 360
Leu Gly Gin Arg Ala Thr He Ser
365
Cys Lys Ala Ser Gin Ser Vai Asp
370 375
Phe Asp Gly Asp Ser Phe Met Asn 380
Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin 385 390
Pro Pro Lys Leu Leu lie Tyr Thr
395 400
Thr Ser Asn Leu Glu Ser Gly He 405
Pro Ala Arg Phe Ser Ala Ser Gly
410 415
Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn 420 lie His Pro Vai Glu Glu Glu Asp 425 430
Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin
435 440
Ser Asn Glu Asp Pro Tyr Thr Phe 445
Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu He
450 455
Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 460
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
465 470
Gin Vai Thr Leu Lys Glu Ser Gly
475 480
Pro Gly lie Leu Gin Pro Ser Gin 485
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe
490 495
Ser Gly Phe Ser Leu Arg Thr Ser
500
Gly Met Gly Vai Gly Trp He Arg 505 510
- 92 040607
Gin Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala His lie Trp Trp Asp
515 520525
Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr lie Ser
530 535540
Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gin Val Phe Leu Lys lie Ala Ser Val Asp
545 550 555560
Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gin lie Asn Pro Ala Trp
565 570575
Phe Ala Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
580 585590 <210> 26 <211> 693 < 212> БЕЛОК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> последовательность тяжелой цепи/главной цепи, FLT3 х CD3; bsFcko-1 [N концевая aHTH-FLT3 химерная тяжелая цепь и С-концевая СОЗ одноцепочечная (клон UCHT1; VL-VH)]: цепь ко-вариант(полной) молекулы, которая включает СНЗ-домен, не гликомутант < 400> 26
Gin 1 Val Gin Leu Gin 5 Gin Pro Gly Ala Glu 10 Leu Val Lys Pro Gly 15
Ala Ser Leu Lys Leu 20 Ser Cys Lys Ser Ser 25 Gly Tyr Thr Phe Thr 30
Ser Tyr Trp Met His 35 Trp Val Arg Gin Arg 40 Pro Gly His Gly Leu 45
Glu Trp lie Gly Glu 50 lie Asp Pro Ser Asp 55 Ser Tyr Lys Asp Tyr 60
Asn Gin Lys Phe Lys 65 Asp Lys Ala Thr Leu 70 Thr Val Asp Arg Ser 75
Ser Asn Thr Ala Tyr 80 Met His Leu Ser Ser 85 Leu Thr Ser Asp Asp 90
Ser Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Ala lie Thr Thr Thr Pro Phe
- 93 040607
100 105
Asp Phe Trp Gly Gin 110 Gly Thr Thr Leu Thr 115 Vai Ser Ser Ala Ser 120
Thr Lys Gly Pro Ser 125 Vai Phe Pro Leu Ala 130 Pro Ser Ser Lys Ser 135
Thr Ser Gly Gly Thr 140 Ala Ala Leu Gly Cys 145 Leu Vai Lys Asp Tyr 150
Phe Pro Glu Pro Vai 155 Thr Vai Ser Trp Asn 160 Ser Gly Ala Leu Thr 165
Ser Gly Vai His Thr 170 Phe Pro Ala Vai Leu 175 Gin Ser Ser Gly Leu 180
Tyr Ser Leu Ser Ser 185 Vai Vai Thr Vai Pro 190 Ser Ser Ser Leu Gly 195
Thr Gin Thr Tyr lie 200 cys Asn Vai Asn His 205 Lys Pro Ser Asn Thr 210
Lys Vai Asp Lys Lys 215 Vai Glu Pro Lys Ser 220 Cys Asp Lys Thr His 225
Thr Cys Pro Pro Cys 230 Pro Ala Pro Pro Vai 235 Ala Gly Pro Ser Vai 240
Phe Leu Phe Pro Pro 245 Lys Pro Lys Asp Thr 250 Leu Met lie Ser Arg 255
Thr Pro Glu Vai Thr 260 cys Vai Vai Vai Gly 265 Vai Ser His Glu Asp 270
Pro Glu Vai Lys Phe 275 Asn Trp Tyr Vai Asp Gly 280 Vai Glu Vai His 285
Asn Ala Lys Thr Lys 290 Pro Arg Glu Glu Gin 295 Tyr Asn Ser Thr Tyr 300
Arg Vai Vai Ser Vai 305 Leu Thr Vai Leu His 310 Gin Asp Trp Leu Asn 315
Gly Lys Glu Tyr Lys 320 cys Lys Vai Ser Asn 325 Lys Gin Leu Pro Ser 330
Pro lie Glu Lys Thr 335 lie Ser Lys Ala Lys 340 Gly Gin Pro Arg Glu 345
Pro Gin Vai Tyr Thr 350 Leu Pro Pro Ser Arg Asp 355 Glu Leu Thr Lys 360
Asn Gin Vai Ser Leu Thr Cys Leu Vai Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
- 94 040607
365 370 375
Asp He Ala Vai Glu 380 Trp Glu Ser Asn Gly 385 Gin Pro Glu Asn Asn 390
Туг Lys Thr Thr Pro 395 Pro Vai Leu Asp Ser 400 Asp Gly Ser Phe Phe 405
Leu Tyr Ser Lys Leu 410 Thr Vai Asp Lys Ser 415 Arg Trp Gin Gin Gly 420
Asn Vai Phe Ser Cys 425 Ser Vai Met His Glu 430 Ala Leu His Asn His 435
Tyr Thr Gin Lys Ser 440 Leu Ser Leu Ser Pro 445 Gly Lys Ser Gly Asp 450
He Gin Met Thr Gin 455 Ser Pro Ser Ser Leu 460 Ser Ala Ser Vai Gly 465
Asp Arg Vai Thr He 470 Thr Cys Arg Ala Ser 475 Gin Asp He Arg Asn 480
Tyr Leu Asn Trp Tyr 485 Gin Gin Lys Pro Gly 490 Lys Ala Pro Lys Leu 495
Leu He Tyr Tyr Thr 500 Ser Arg Leu Glu Ser 505 Gly Vai Pro Ser Arg 510
Phe Ser Gly Ser Gly 515 Ser Gly Thr Asp Tyr 520 Thr Leu Thr He Ser 525
Ser Leu Gin Pro Glu 530 Asp Phe Ala Thr Tyr 535 Tyr Cys Gin Gin Gly 540
Asn Thr Leu Pro Trp 545 Thr Phe Gly Gin Gly 550 Thr Lys Vai Glu He 555
Lys Gly Gly Gly Gly 560 Ser Gly Gly Gly Gly 565 Ser Gly Gly Gly Gly 570
Ser Glu Vai Gin Leu 575 Vai Glu Ser Gly Gly 580 Gly Leu Vai Gin Pro 585
Gly Gly Ser Leu Arg 590 Leu Ser Cys Ala Ala 595 Ser Gly Tyr Ser Phe 600
Thr Gly Tyr Thr Met 605 Asn Trp Vai Arg Gin 610 Ala Pro Gly Lys Gly 615
Leu Glu Trp Vai Ala 620 Leu He Asn Pro Tyr 625 Lys Gly Vai Ser Thr 630
Tyr Asn Gin Lys Phe Lys Asp Arg Phe Thr He Ser Vai Asp Lys
- 95 040607
635 640645
Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu
650 655660
Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Arg Ser Gly Tyr Tyr Gly Asp
665 670675
Ser Asp Trp Tyr Phe Asp Vai Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr
680 685690
Vai Ser Ser <210> 27 <211> 49 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для VDJ-сегмента тц <400> 27 ctcttcacag gtgtcctctc tgaggtccag ctgcagcagt ctggacctg 49 <210> 28 <211> 59 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для УОЗ-сегмента тц <400> 28 gggagaaggt aggactcacc tgaggagact gtgagagtgg tgccttggcc ccagtagtc 59 <210> 29 <211> 51 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для УОЗ-сегмента тц <400> 29 tcttcacagg tgtcctctcc caggtgaagc tgcagcaatc tggacctgag c 51 <210> 30 <211> 51 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность
- 96 040607 <220>
<223> олигонуклеотид для VDD-сегмента тц <400> 30 aatgggagaa ggtaggactc acctgaggag acggtgaccg tggtcccttg g < 210> 31 < 211> 53 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VD3-сегмента тц < 400> 31 tctcttcaca ggtgtcctct ctcaggtcca actgcagcag cctggggctg age 53 < 210> 32 < 211> 52 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VD3-сегмента тц < 400> 32 gagaaggtag gactcacctg aggagaetgt gagagtggtg ccttggcccc ag 52 < 210> 33 < 211> 60 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VD3-сегмента тц < 400> 33 agacgtccac tctgtctttc tcttcacagg tgtcctctcc caggtgcagc tgaagcagtc 60 < 210> 34 < 211> 49 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VDJ-сегмента тц < 400> 34
- 97 040607 gagaaggtag gactcacctg aggagacggt gactgaggtt ccttgaccc < 210> 35 < 211> 40 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность < 220>
< 223> олигонуклеотид для VD3-сегмента тц < 400> 35 agacgtccac tctgtctttc tcttcacagg tgtcctctcc 40 < 210> 36 < 211> 40 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VD3-cerMeHTa тц < 400> 36 agacgtccac tctgtctttc tcttcacagg tgtcctctcc 40 < 210> 37 < 211> 43 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VD-сегмента лц < 400> 37 actcgaggag atattgtgat gactcaggct gcaccctcta tac 43 < 210> 38 < 211> 48 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для V3-сегмента лц < 400> 38 aactagtact tacgtttcag ctccagcttg gtcccagcac cgaacgtg 48 <210> 39 <211> 42 <212> ДНК
- 98 040607 <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для VJ-сегмента лц <400> 39 tctcgaggag acatcgagct cactcagtct ccagcttctt tg < 210> 40 < 211> 46 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность < 220>
< 223> олигонуклеотид для VD-сегмента лц < 400> 40 aactagtact tacgtttgat ctccagcttg gtgccccctc caaagg 46 < 210> 41 < 211> 42 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VJ-сегмента лц < 400> 41 actcgaggag atattgtgct aactcagtct ccagccaccc tg 42 < 210> 42 < 211> 41 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
< 223> олигонуклеотид для VJ-сегмента лц < 400> 42 tactagtact tacgttttat ttccagcttg gtcccccctc c 41 < 210> 43 < 211> 40 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность < 220>
< 223> олигонуклеотид для VJ-сегмента лц < 400> 43
- 99 040607 actcgaggag acattgtgat gacacagtct ccatcctccc 40 <210> 44 <211> 47 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для VJ-сегмента лц <400> 44 actagtactt acgtttcagc tccagcttgg tcccagcacc gaacgtg 47 <210> 45 <211> 40 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для scFv-сегмента <400> 45 atccggagat atccagatga cccagtcccc gagctccctg 40 <210> 46 <211> 45 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для scFv-сегмента <400> 46 tactagttat cacgaggaga cggtgaccag ggttccttga cccca 45 <210> 47 <211> 39 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> олигонуклеотид для scFv-сегмента <400> 47 atccggagaa gtgcagctgc agcagtccgg ccctgagct 39 <210> 48 <211> 45 <212> ДНК
- 100 -

Claims (3)

  1. < 213> Искусственная последовательность <220>
    < 223> олигонуклеотид для scFv-сегмента < 400> 48 tactagttat cacttcagtt ccagcttggt gccagcgccg aaggt 45 < 210> 49 < 211> 41 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
    < 223> олигонуклеотид для scFv-сегмента < 400> 49 atccggagac attgtgctga cccagtcccc tgcctccctg g 41 < 210> 50 < 211> 45 < 212> ДНК < 213> Искусственная последовательность <220>
    < 223> олигонуклеотид для scFv-сегмента < 400> 50 tactagttat caagagctca cagtcactgt ggtgccctgg cccca 45
    ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Рекомбинантная молекула биспецифического антитела, характеризующаяся тем, что включает Fab-фрагмент, содержащий первый сайт связывания первого антигена, одноцепочечный Fv-фрагмент, содержащий второй сайт связывания для второго антигена, и СН2-домен иммуноглобулина IgG1, при этом Fab-фрагмент и одноцепочечный Fv-фрагмент связаны через СН2-домен, причем по меньшей мере три аминокислотных остатка СН2-домена, обладающие способностью обеспечивать связывание с Fc-рецепторами, удалены или мутированы путем замены на другую аминокислоту, тем самым ослабляя связывание СН2-домена к Fc-рецепторам, причем по меньшей мере три аминокислотных остатка СН2-домена состоят из положения последовательности 233 и по меньшей мере двух аминокислот, выбранных из группы, состоящей из положения последовательности 228, 230, 231, 232, 234, 235, 236, 237, 238, 265, 297, 327 и 330 (нумерация положений последовательностей в соответствии с номенклатурой ЕС), где, кроме того, аминокислотные остатки в положениях 226 и 229 удалены или мутированы посредством замены на другую аминокислоту, где либо первый сайт связывания, либо второй сайт связывания связывается с антигеном, ассоциированным с опухолью, и где первый сайт связывания или второй сайт связывания связывается с молекулой специфического рецептора Т-клетки или NK-клетки.
  2. 2. Молекула антитела по п.1, характеризующаяся тем, что ассоциированный с опухолью антиген выбран из группы, включающей CD10, CD19, CD20, CD21, CD22, CD25, CD30, CD33, CD34, CD37, CD44v6, CD45, CDw52, Fms-подобной тирозинкиназы 3 (FLT-3, CD135), c-Kit (протеин-рецепторной тирозинкиназы, продукт гена KIT) (CD117), CSF1R (CD115), CD133, PDGFR-α (CD140a), PDGFR-β (CD140b), хондроитинсульфат протеогликана 4 (CSPG4, меланома-ассоциированный хондроитинсульфат протеогликана), Muc-1, EGFR, de2-7-EGFR, EGFRvIII, фолатсвязывающий белок, Her2/neu, Her3, PSMA, PSCA, PSA, TAG-72, HLA-DR, IGFR, CD133, IL3R, белок, активирующий фибробласты (FAP), карбоангидраза IX (MN/CA IX), карциноэмбриональный антиген (СЕА), ЕрСАМ, CDCP1, Derlin1, тенасцин, Frizzled 1-10, сосудистые антигены VEGFR2 (KDR/FLK1), VEGFR3 (FLT4, CD309), эндоглин, CLEC14, Tem1-8 и Tie2; и/или либо первый сайт связывания, либо второй сайт связывания связывает молекулу специфического рецептора Т-клеток или NK-клеток, которая является одной из нижеуказанных: CD3, TCR (рецептор Т-клеток), CD28, CD16, NKG2D, Ox40, 4-1BB, CD2, CD5 и CD95, при этом TCR представляет собой TCR (альфа/бета) или TCR (гамма/дельта).
  3. 3. Молекула антитела по п.1 или 2, в которой Fab-фрагмент связан с СН2-доменом через CH1- и VH-домены тяжелой цепи Fab-фрагмента или через CL- и VL-домены легкой цепи Fab-фрагмента,
    - 101 -
EA201400709 2011-12-19 2012-11-12 Молекула биспецифического антитела EA040607B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US61/577,327 2011-12-19

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA040607B1 true EA040607B1 (ru) 2022-07-05

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6441079B2 (ja) 二重特異性抗体分子
US20180208657A1 (en) Recombinant antibody molecule and its use for target cell restricted t cell activation
JP6893939B2 (ja) Psma結合抗体及びその使用
WO2020260329A1 (en) Fusion of an antibody binding cea and 4-1bbl
TW202030204A (zh) 靶向腫瘤之超促效cd28抗原結合分子
US20220056141A1 (en) Improved Anti-FLT3 Antigen Binding Proteins
TW202219065A (zh) 免疫活化 Fc 域結合分子
US20230192795A1 (en) Immunoconjugates
CA3176579A1 (en) Antibodies binding to cd3
TW202019473A (zh) 抗steap1抗原結合蛋白
EP3623383A1 (en) Improved bispecific flt3xcd3 antigen binding proteins
WO2022253867A1 (en) Agonistic cd28 antigen binding molecules targeting epcam
JP7495409B2 (ja) 改善された抗flt3抗原結合タンパク質
EA040607B1 (ru) Молекула биспецифического антитела
US20230348630A1 (en) Antibodies binding bcma and cd3 and uses thereof
JP2024501653A (ja) ヒト及びサルcd3と結合する抗体及びその使用