EA037161B1 - Последовательности олигонуклеотидов для применения в конструировании путей - Google Patents
Последовательности олигонуклеотидов для применения в конструировании путей Download PDFInfo
- Publication number
- EA037161B1 EA037161B1 EA201791156A EA201791156A EA037161B1 EA 037161 B1 EA037161 B1 EA 037161B1 EA 201791156 A EA201791156 A EA 201791156A EA 201791156 A EA201791156 A EA 201791156A EA 037161 B1 EA037161 B1 EA 037161B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- gly
- lys
- leu
- asp
- thr
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
- C12N15/1137—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against enzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y503/00—Intramolecular oxidoreductases (5.3)
- C12Y503/01—Intramolecular oxidoreductases (5.3) interconverting aldoses and ketoses (5.3.1)
- C12Y503/01005—Xylose isomerase (5.3.1.5)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Virology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Abstract
Изобретение охватывает новые последовательности искусственных олигонуклеотидов, которые могут инициировать транскрипцию генов в различных условиях на высоком уровне. Кроме того, изобретение касается рекомбинантных фрагментов ДНК, включающих последовательности искусственных олигонуклеотидов, экспрессирующих плазмид, содержащих фрагменты рекомбинантной ДНК, и клеток-хозяев, трансформированных фрагментами рекомбинантной ДНК.
Description
| (54) | ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ДЛЯ ПРИМЕНЕНИЯ В КОНСТРУИРОВАНИИ ПУТЕЙ | |
| (31) 14195026.1 (32) 2014.11.26 (33) ЕР (43) 2017.09.29 (86) РСТ/ЕР2015/076715 (87) WO 2016/083180 2016.06.02 (71 )(73) Заявитель и патентовладелец: КЛАРИАНТ ИНТЕРНЭШНЛ ЛТД (СН) | (56) WO-A1-2010062597 WO-A1-2014035458 DE-A1-102012007491 WO-A2-2014080024 WO-A1-03095627 JP-A-2010136627 WO-A2-2010151866 | |
| (72) | Изобретатель: Драгович Здравко, Райзингер Кристоф, Диц Хайко (DE) | |
| (74) | Представитель: Бадаева Т.Н., Фелицына С.Б. (RU) |
(57) Изобретение охватывает новые последовательности искусственных олигонуклеотидов, которые могут инициировать транскрипцию генов в различных условиях на высоком уровне. Кроме того, изобретение касается рекомбинантных фрагментов ДНК, включающих последовательности искусственных олигонуклеотидов, экспрессирующих плазмид, содержащих фрагменты рекомбинантной ДНК, и клеток-хозяев, трансформированных фрагментами рекомбинантной ДНК.
037161 В1
037161 Bl
Настоящее изобретение охватывает новые последовательности искусственных олигонуклеотидов, которые могут инициировать транскрипцию генов в различных условиях на высоком уровне. Кроме того, изобретение касается рекомбинантных фрагментов ДНК, включающих последовательности искусственных олигонуклеотидов, экспрессирующих плазмид, содержащих рекомбинантные фрагменты ДНК, и клеток-хозяев, трансформированных рекомбинантными фрагментами ДНК.
Дрожжи Saccharomyces и в более узком смысле вида S. cerevisiae применяются уже тысячи лет для производства хлеба и алкогольных напитков типа саке, вина или пива. За весь этот длительный период промышленного применения дрожжи приспособились к технологическим условиям и могут переносить механические воздействия в биореакторах, ингибирующие вещества и продукты ферментации. Кроме того, они устойчивы к колебаниям температуры и могут сбраживать сахара при низких значениях pH, что сводит к минимуму риск загрязнения. Помимо этого, S. cerevisiae является ключевой лабораторной модельной системой и легко поддаются генетическим модификациям и вообще считаются безопасными имеют статус GRAS. Имеется широкий набор генетических инструментов для S. cerevisiae и хорошо изучены многие внутриклеточные процессы, как-то метаболизм, секреция, транспорт, сигнализация и другие пути, что способствует успешному конструированию дрожжей для разнообразного применения.
Введение мультиферментных путей требует особенно точного контроля за уровнем экспрессии генов, в особенности ключевых ферментов, которые могут быть гетерологичными или собственными, чтобы довести до максимума утилизацию субстрата и/или образование продуктов. При этом транскрипционный контроль имеет место на уровне последовательности олигонуклеотида - промотора, находящегося в вышерасположенном участке гена. Таким образом, сила и регуляция промотора являются критическими точками для метаболической инженерии.
Поскольку эндогенные промоторы обычно не полностью осуществляют необходимый непрерывный транскрипционный контроль и поэтому не доводят до максимума уровни транскрипции, достижимые внутри клетки, то решающим шагом при инженерии дрожжей является правильный выбор промотора.
В данной области известны различные типы промоторов.
Индуцибельные или дерепрессируемые промоторы обеспечивают высокий уровень транскрипционного контроля, но они зависят от индуктора или заданных технологических условий. Регулируемые промоторы лимитируются выработкой токсических белков или построением путей с токсическими промежуточными продуктами. Кроме того, известно, что большинство промоторов существующего уровня техники позволяют контролировать транскрипцию лишь одной конкретной группы генов.
Таким образом, промоторы, известные специалистам в данной области, всегда имеют определенные недостатки, которые серьезно ограничивают их использование лишь несколькими конкретными применениями.
Поэтому авторы настоящего изобретения поставили перед собой задачу разработать новые и улучшенные промоторы, обеспечивающие высокий уровень транскрипционного контроля для разнообразных генов, которые хорошо подходят для промышленного применения.
Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что эта задача может быть решена при помощи:
последовательности олигонуклеотида, характеризующегося тем, что он повышает скорость транскрипции РНК, типа фрагментов матричной РНК, кодирующих белки из группы, состоящей из ферментов, структурных белков, коферментов, переносчиков, антител, гормонов и регуляторов, типа фрагментов регуляторной РНК, типа фрагментов ферментативно активной РНК или типа фрагментов транспортной РНК, причем данная последовательность олигонуклеотида по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 1.
Номенклатура аминокислот, пептидов, нуклеотидов и нуклеиновых кислот в настоящей заявке соответствует рекомендациям IUPAC. Как правило, в этом документе аминокислоты именуются в соответствии с однобуквенным кодом.
Термин олигонуклеотид в настоящем изобретении следует понимать как одноцепочечную или двухцепочечную молекулу ДНК или РНК, содержащую от 2 до 1000 нуклеотидов, предпочтительно от 10 до 900 нуклеотидов, более предпочтительно от 50 до 850 нуклеотидов и наиболее предпочтительно от 100 до 820 нуклеотидов.
Термины ДНК и РНК хорошо известны специалистам в данной области. ДНК содержит дезоксирибозу, а РНК содержит рибозу (у дезоксирибозы нет гидроксильной группы, присоединенной к пентозному кольцу в положении 2'). Комплементарным основанием для аденина является не тимин, как в ДНК, а урацил, который является неметилированной формой тимина.
Олигонуклеотиды по настоящему изобретению имеют нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 82%, более предпочтительно по меньшей мере на 85%, особенно предпочтительно по меньшей мере на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере на 92%, еще предпочтительней по меньшей мере на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере на 98% и наиболее предпочтительно по меньшей мере на 99% идентична последовательности SEQ ID NO: 1.
- 1 037161
В особенно предпочтительном воплощении нуклеотидную последовательность выбирают из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO:
и SEQ ID NO: 7.
Олигонуклеотиды по настоящему изобретению повышают скорость транскрипции некоторых фрагментов РНК. При этом термин повышение скорости транскрипции следует понимать как повышение по сравнению с олигонуклеотидом с активностью промотора из существующего уровня техники. Повышение скорости транскрипции обычно определяется следующим образом:
ИТЦ rtls где RTLI - относительный уровень транскрипта в репортерной системе, контролируемой олигонуклеотидом по изобретению,
RTLS - относительный уровень транскрипта в репортерной системе, контролируемой олигонуклеотидом из существующего уровня техники.
При этом относительный уровень транскрипта измеряется как концентрация РНК в клеточном экстракте репортерной системы относительно концентрации РНК гена домашнего хозяйства в том же клеточном экстракте.
При этом RTLI и RTLS определяются с использованием одного и того же типа клеток-хозяев, где клетки-хозяева трансформируют по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим соответствующий олигонуклеотид, и клетки- хозяева культивируют в идентичных условиях существующего уровня техники, причем клетки-хозяева собирают в экспоненциальной фазе роста.
В предпочтительном воплощении скорость транскрипции повышается по меньшей мере в 2 раза при выращивании дрожжевых клеток-хозяев, предпочтительно S. cerevisiae, трансформированных по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим олигонуклеотид по настоящему изобретению, как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, галактозы, ксилозы, арабинозы, сахарозы, трегалозы, рафинозы, глицерина, этанола, ацетата и лактата. Повышение определяется следующим образом:
RTLIe RTLSe где RTLIe - относительный уровень транскрипта матричной РНК, кодирующей SEQ ID NO: 17, контролируемой олигонуклеотидом SEQ ID NO: I,
RTLSe - относительный уровень транскрипта матричной РНК, кодирующей SEQ ID NO: 17, контролируемой олигонуклеотидом SEQ ID NO: 9.
При этом относительный уровень транскрипта измеряется как концентрация матричной РНК, кодирующей SEQ ID NO: 17, в экстракте дрожжевых (S. cerevisiae) клеток относительно концентрации матричной РНК гена домашнего хозяйства, кодирующего актин в том же экстракте дрожжевых клеток.
При этом RTLIe и RTLSe определяются с использованием одного и того же типа дрожжевых клетокхозяев (S. cerevisiae), где дрожжевые клетки-хозяева трансформируют по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим соответствующий олигонуклеотид, и дрожжевые и клеткихозяева культивируют в идентичных условиях существующего уровня техники, причем дрожжевые клетки-хозяева собирают в экспоненциальной фазе роста.
В одном особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения скорость транскрипции гена в дрожжевых клетках-хозяевах, трансформированных по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим олигонуклеотид по настоящему изобретению, повышается по меньшей мере в 2 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 4 раза, особенно предпочтительно по меньшей мере в 6 раз и наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 раз при выращивании дрожжевых клеток-хозяев как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, галактозы, ксилозы, арабинозы, сахарозы, трегалозы, рафинозы, глицерина, этанола, ацетата и лактата.
В другом особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения скорость транскрипции гена в клетках-хозяевах повышается по меньшей мере в 2 раза, предпочтительно по меньшей мере в 4 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 6 раз, особенно предпочтительно по меньшей мере в 8 раз и наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 раз при выращивании клеток-хозяев как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, ксилозы, сахарозы, глицерина и этанола.
В еще одном особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения скорость транскрипции гена в клетках-хозяевах повышается по меньшей мере в 2 раза, предпочтительно по меньшей мере в 4 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 6 раз, особенно предпочтительно по меньшей мере в 8 раз и наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 раз при выращивании клеток-хозяев как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, глицерина, этанола и ксилозы.
- 2 037161
Другим преимуществом олигонуклеотидов по настоящему изобретению является то, что они повышают ферментативную активность ферментов, кодируемых РНК, контролируемой этими олигонуклеотидами. При этом термин степень повышения активности фермента следует понимать как повышение по сравнению с олигонуклеотидом с активностью промотора из существующего уровня техники. Степень повышения активности фермента обычно определяется следующим образом:
ЕА;
EAS где EAI - активность фермента в репортерной системе, контролируемой олигонуклеотидом по изобретению,
EAS - активность фермента в репортерной системе, контролируемой олигонуклеотидом из существующего уровня техники.
При этом активность фермента измеряется в виде количества субстрата, преобразованного за 1 минуту при заданном количестве клеточного экстракта, за вычетом фоновой активности репортерной системы.
При этом EAI и EAS определяются с использованием одного и того же типа клеток-хозяев, где клетки-хозяева трансформируют по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим соответствующий олигонуклеотид, и клетки-хозяева культивируют в идентичных условиях существующего уровня техники, причем клетки-хозяева собирают в экспоненциальной фазе роста.
В предпочтительном воплощении активность фермента повышается по меньшей мере в 2 раза при выращивании дрожжевых клеток-хозяев, предпочтительно S. cerevisiae, трансформированных по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим олигонуклеотид по настоящему изобретению, как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, галактозы, ксилозы, арабинозы, сахарозы, трегалозы, рафинозы, глицерина, этанола, ацетата и лактата.
Повышение определяется следующим образом:
ЕА1е EASe где EAIe - активность фермента у белка SEQ ID NO: 17, контролируемого олигонуклеотидом SEQ ID NO: 1, или его варианта с последовательностью, по меньшей мере на 80% идентичной SEQ ID NO: 1,
EASe - активность фермента у белка SEQ ID NO: 17, контролируемого олигонуклеотидом SEQ ID NO: 9.
При этом активность фермента измеряется в виде количества ксилозы, преобразованного за 1 мин при заданном количестве клеточного экстракта, за вычетом фоновой активности репортерной системы.
При этом EAIe и EASe определяются с использованием одного и того же типа клеток-хозяев (S. cerevisiae), где клетки-хозяева трансформируют по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим соответствующий олигонуклеотид, и клетки-хозяева культивируют в идентичных условиях существующего уровня техники, причем клетки-хозяева собирают в экспоненциальной фазе роста.
В одном особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения активность фермента в дрожжевых клетках-хозяевах, трансформированных по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим олигонуклеотид по настоящему изобретению, повышается по меньшей мере в 2 раза, предпочтительно по меньшей мере в 4 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 6 раз, особенно предпочтительно по меньшей мере в 8 раз и наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 раз при выращивании дрожжевых клеток-хозяев как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, галактозы, ксилозы, арабинозы, сахарозы, трегалозы, рафинозы, глицерина, этанола, ацетата и лактата.
В другом особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения активность фермента в клетках-хозяевах повышается по меньшей мере в 2 раза, предпочтительно по меньшей мере в 4 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 6 раз, особенно предпочтительно по меньшей мере в 8 раз и наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 раз при выращивании клеток-хозяев как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, ксилозы, сахарозы, глицерина и этанола.
В еще одном особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения активность фермента в клетках-хозяевах повышается по меньшей мере в 2 раза, предпочтительно по меньшей мере в 4 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 6 раз, особенно предпочтительно по меньшей мере в 8 раз и наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 раз при выращивании клеток-хозяев как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, глицерина, этанола и ксилозы.
В настоящем изобретении термин фрагмент регуляторной РНК (фрагмент рРНК) следует понимать как цепочку РНК, которая обладает способностью подавлять экспрессию гена будучи комплементарной к какой-то части мРНК или ДНК гена. Примером фрагментов рРНК является микроРНК
- 3 037161 (миРНК), которая действует посредством РНК-интерференции (RNAi), причем эффекторный комплекс миРНК с ферментами может расщеплять комплементарную мРНК, блокировать трансляцию мРНК или ускорять её деградацию. Сама мРНК тоже может содержать регуляторные элементы типа рибопереключателей в 5'-нетранслируемой области или 3'-нетранслируемой области; эти цис-регуляторные элементы регулируют активность этой мРНК. Нетранслируемые участки также могут содержать элементы, регулирующие другие гены.
В настоящем изобретении термин фрагмент ферментативно активной РНК следует понимать как РНК, которая входит в состав белкового комплекса, способного катализировать ферментативные реакции в клетке, типа рибосомной РНК или такой РНК, которая сама образует каталитически активный комплекс типа рибозима (фермента из рибонуклеиновой кислоты).
В настоящем изобретении термин фрагмент транспортной РНК (фрагмент тРНК) следует понимать как небольшую цепочку РНК примерно из 80 нуклеотидов, которая обладает способностью переносить определенную аминокислоту на растущую полипептидную цепь в рибосомальном сайте синтеза белка во время трансляции. Она содержит сайты для прикрепления аминокислот и антикодоновый участок для распознавания кодона, который связывается с определенной последовательностью на цепочке матричной РНК посредством водородных связей.
В настоящем изобретении термин фрагмент матричной РНК (фрагмент мРНК) следует понимать как небольшую цепочку РНК, которая обладает способностью переносить информацию о последовательности белка на рибосомы. Каждые три нуклеотида (кодон) соответствуют одной аминокислоте. В эукариотических клетках, как только предшественница мРНК (пре-мРНК) транскрибируется из ДНК, она преобразуется в зрелую мРНК. При этом из нее удаляются интроны - некодирующие участки пре-мРНК. Затем мРНК экспортируется из ядра в цитоплазму, где она связывается с рибосомами и подвергается трансляции в соответствующую белковую форму с помощью тРНК. В прокариотических клетках, которые не имеют ядра и цитоплазматических компартментов, мРНК может связываться с рибосомами в то время, когда она транскрибируется с ДНК. По прошествии определенного времени матричная РНК подвергается деградации на ее составные нуклеотиды под действием рибонуклеаз.
В настоящем изобретении термин структурные белки относится к таким белкам, которые придают неподвижность и жесткость биологическим компонентам, находящимся в жидком состоянии. Предпочтительные структурные белки выбирают из группы, состоящей из таких волокнистых белков, как коллаген, эластин и кератин; и таких глобулярных белков, как актин и тубулин. Другие белки, которые выполняют структурные функции и понимаются в качестве структурных белков в настоящем изобретении, - это моторные белки, как-то миозин, кинезин и динеин, которые способны генерировать механические силы.
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие структурные белки, выбирают из группы, состоящей из актина, эластина, филамина, коллагена, миозина, ламина.
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие коферменты, выбирают из числа фрагментов РНК, кодирующих полипептиды, которые подвергаются посттрансляционной модификации. Примерами являются триптофан-триптофилхинон (TTQ) и 4-метилиден-имидазол-5-он (MIO).
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие переносчики, выбирают из числа фрагментов РНК, кодирующих переносчики типа унипорта, симпорта и антипорта, протонные насосы, ионные каналы и аквапорины.
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие антитела, выбирают из числа фрагментов РНК, кодирующих IgA, IgD, IgE, EgG, IgM, IgY и IgW.
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие гормоны, выбирают из числа фрагментов РНК, кодирующих небольшие пептидные гормоны типа TRH и вазопрессина; инсулин; гормон роста; гликопротеидные гормоны, такие как лютеинизирующий гормон, фолликулостимулирующий гормон и тиреотропный гормон.
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие регуляторы, выбирают из числа фрагментов РНК, кодирующих рецепторы, факторы транскрипции, метаболические рецепторы, зрительные рецепторы, электрорецепторы, механические рецепторы и преобразователи сигналов.
Предпочтительные фрагменты РНК, кодирующие ферменты, выбирают из числа фрагментов РНК, кодирующих ферменты, модифицирующие углеводы. В настоящем изобретении термин модифицирующие углеводы ферменты следует понимать как охватывающий любые ферменты, способные модифицировать углеводы любого типа, как-то (но без ограничения) ферменты, расщепляющие углеводы, окисляющие углеводы, восстанавливающие углеводы, декарбоксилирующие углеводы, деацетилирующие углеводы, ацетилирующие углеводы, метилирующие углеводы, деметилирующие углеводы, аминирующие углеводы, фосфорилирующие углеводы, дефосфорилирующие углеводы, изомеризующие углеводы, эпимеризующие углеводы и дезаминирующие углеводы.
В одном особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения модифицирующие углеводы ферменты выбирают из группы, состоящей из классов EC 5.1.3, EC 5.3.1, EC 2.7.1, EC 2.2.1, EC 2.2.1 и EC 1.1.1, предпочтительно выбирают из группы, состоящей из EC 5.1.3.3, EC 5.3.1.5, EC 2.7.1.17, EC 2.2.1.2, EC 2.2.1.1 и EC 1.1.1.1. В другом особенно предпочтительном воплощении белок выбирают из
- 4 037161 группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-53.
В следующем предпочтительном воплощении настоящего изобретения у олигонуклеотидов настоящего изобретения от 1 до 80 нуклеотидов являются мутантными. В настоящем изобретении термин мутантный следует понимать как содержащий замену, делецию или вставку. Термин мутация следует понимать как замену, делецию или вставку. Замены классифицируются как транзиции, при которых пурин заменяется на пурин (A <-> G) или пиримидин на пиримидин (C <-> T), либо трансверсии, при которых пурин заменяется на пиримидин и наоборот (C/T <-> A/G). При вставке в олигонуклеотид добавляется один или несколько дополнительных нуклеотидов (A, C, T или G). Удаление одного или нескольких нуклеотидов из ДНК называется делецией.
В следующем воплощении настоящего изобретения предусмотрены рекомбинантные фрагменты ДНК, включающие олигонуклеотиды по настоящему изобретению.
Особенно предпочтительные рекомбинантные фрагменты ДНК по настоящему изобретению включают олигонуклеотиды, входящие в группу, состоящую из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6 и SEQ ID NO: 7, и фрагменты РНК, кодирующие белки, входящие в группу, состоящую из ферментов, структурных белков, коферментов, переносчиков, антител, гормонов и регуляторов. Также особенно предпочтительно, чтобы белок являлся ферментом, а фермент входил в группу, состоящую из классов EC 5.1.3, EC 5.3.1, EC 2.7.1, EC 2.2.1, EC 2.2.1 и EC 1.1.1, предпочтительно в группу, состоящую из EC 5.1.3.3, EC 5.3.1.5, EC 2.7.1.17, EC 2.2.1.2, EC 2.2.1.1 и EC 1.1.1.1. Другие особенно предпочтительные рекомбинантные фрагменты ДНК включают олигонуклеотиды, входящие в группу, состоящую из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6 и SEQ ID NO: 7, и фрагменты РНК, входящие в группу, состоящую из SEQ ID NO: 11-53.
В следующем воплощении настоящего изобретения предусмотрены экспрессирующие плазмиды, содержащие по меньшей мере один рекомбинантный фрагмент ДНК по настоящему изобретению.
Настоящим изобретением также предусмотрены клетки-хозяева, трансформированные по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим олигонуклеотид по настоящему изобретению. Клетки-хозяева по настоящему изобретению предпочтительно применяются для конструирования путей или для метаболического превращения содержащих ксилозу субстратов в предпочтительные метаболиты.
Рекомбинантные клетки-хозяева по настоящему изобретению предпочтительно выбирают из бактерий, дрожжевых или грибковых клеток. В особенно предпочтительном воплощении клетки-хозяева выбирают из группы, состоящей из Escherichia, Klebsiella, Pseudomonas, Lactobacillus, Bacillus, Streptomyces; Saccharomyces, Kluyveromyces, Schizosaccharomyces, Candida, Yarrowia, Komagataella, Pichia, Hansenula, Penicillium, Trichoderma, Hypocrea, Aspergillus, Cantharellu, Agraicus, Boletos, Pleurotus, Trametes, Phanerochaete, Myceliophthora, Chaetomium, Humicola, Chrysosporium, Talaromyces и Neurospora.
Особенно предпочтительно клетки-хозяева выбирают из группы, состоящей из Lactococcus lactis, Lactobacillus brevis, Bacillus subtilis, Bacillus megaterium, Bacillus lentus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus licheniformis, Pseudomonas fluorescence, Klebsiella planticola, Escherichia coli, Streptomyces lividans, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces bayanus, Saccharomyces uravum, Saccharomyces pastorianus, Saccharomyces kudriavzevii, Saccharomyces mikatae, Saccharomyces carlsbergensis, Schizosaccharomyces pombe, Kluyveromyces marxianus, Yarrowia lipolytica, Hansenula polymorpha, Pichia angusta, Komagataella pastoris, Pichia pastoris, Aspergillus niger, Aspergillus oryzae, Trichoderma reesei и Myceliophthora thermophila.
Рекомбинантные клетки-хозяева по настоящему изобретению могут содержать одну или несколько плазмид по настоящему изобретению.
Примеры и фигуры
Далее настоящее изобретение будет описано на примерах и фигурах. Примеры и фигуры приводятся только в иллюстративных целях и не ограничивают объем настоящего изобретения и формулы изобретения никоим образом.
Пример 1. Исследование роста - отбор штамма для скрининга.
Плазмидой, содержащей типичный олигонуклеотид для тестирования, трансформировали 5 различных штаммов клеток-хозяев.
Таблица 1. Перечень тестируемых клеток-хозяев
| Порядковый номер | Название | Происхождение |
| Штамм А | Ethanol Red® (серия 897/1, дата продукции: 01.05.08) | Fermentis, Франция |
| Штамм В | Simi White™ (партия: 02905340230601V) | Lallemand, Канада |
| Штамм С | Rhone 2226™ (партия: 025556551030Y9) |
- 5 037161
| Штамм D | CBS 7764 | Centraalbureau voor Schimmelcultures (Институт королевской академии искусств и наук Нидерландов - KNAW), Нидерланды |
| Штамм Е | CBS 6413 |
Плазмиду конструировали путем рекомбинационного клонирования в S. cerevisiae. Дрожжевые клетки трансформировали продуктами ПЦР, перекрывающимися друг с другом на 45 п.н. Фрагментами служили дрожжевой маркер (pUG6 с 87 по 1559 п.н.), маркер Е. coli и ori (pUG19 с 754 по 2534 п.н.), дрожжевой ori (хромосома IV S. cerevisiae S288C с 44978 по 449831 п.н. и хромосома II S. cerevisiae S288C с 63156 по 63454 п.н.) и функциональная часть (SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 54, хромосома XI S. cerevisiae S288C с 326407 по 326108 п.н.). При этом данные части были фланкированы рестрикционными сайтами SapI, SbfI, StuI и NotI, соответственно.
Дрожжевые штаммы подвергали трансформации повторно выделенной плазмидой высокоэффективным методом LiAc согласно Gietz и Schiestl.
Затем клетки-хозяева культивировали в 50 мл содержащего ксилозу субстрата (10 г/л дрожжевого экстракта, 20 г/л пептона, 20 г/л ксилозы + 200 мг/л G418) в аэробных условиях в качалочной колбе на 300 мл при 30°C и 250 об/мин. Результаты представлены на фиг. 1.
Для дальнейшего тестирования был выбран штамм В вследствие отличных показателей роста.
Пример 2. Исследование роста - сравнение различных плазмид, содержащих различные олигонуклеотиды.
Штамм В трансформировали 10 плазмидами. Плазмиды конструировали таким же образом, как описано в примере 1, и они содержали олигонуклеотиды SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9 и SEQ ID NO: 10, соответственно.
Штамм В трансформировали плазмидами, как описано в примере 1, и культивировали в таких же условиях. Результаты представлены на фиг. 2.
Клетки-хозяева, трансформированные плазмидами, содержащими олигонуклеотиды по настоящему изобретению (т.е. регулируемые SEQ ID NO: 1-7), проявляли значительно более высокие показатели роста, чем клетки-хозяева, трансформированные плазмидами, содержащими олигонуклеотиды из существующего уровня техники SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 8.
Пример 3. Уровень транскрипта - сравнение различных плазмид, содержащих различные олигонуклеотиды.
Дрожжевые штаммы, содержащие различные плазмиды, описанные в примере 2, культивировали в 100 мл субстрата, содержащего глюкозу, маннозу, этанол, глицерин или ксилозу (10 г/л дрожжевого экстракта, 20 г/л пептона, 20 г/л источника углерода + 200 мг/л G418) в качалочной колбе на 500 мл при 30°C и 250 об/мин. Собирали по 5 мл этих культур примерно при OD600 = 2, то есть центрифугировали, промывали водой и опять центрифугировали (два раза). После этого осадки культур хранили при -80°C.
Из клеток экстрагировали тотальную РНК с помощью набора RNeasy Mini Kit™, Qiagen Germany, в соответствии с инструкцией производителя. Затем 500 нг этой РНК подвергали трансляции в кДНК с помощью набора Thermo Script™ RT-PCR Kit, Life Technologies USA, в соответствии с инструкцией производителя. Проводили амплификацию продуктов ПЦР длиной в 225 и 236 п.н., используя iQ™ SYBR® Green Supermix и iQ™ iCycler, BioRad Germany, и рассчитывали концентрации мРНК АСТ1 и XylA, следуя информации производителя.
Относительные уровни транскрипта (концентрация РНК XylA, деленная на концентрацию РНК АСТ1) представлены на фиг. 3.
Таблица 2. Степень изменения уровня транскрипта XylA (разы) под контролем различных олигонуклеотидов по сравнению с уровнем транскрипта XylA под контролем SEQ ID NO: 9
| SEQID NO: 1 | SEQID NO: 2 | SEQID NO: 3 | SEQID NO: 4 | SEQID NO: 5 | SEQID NO: 6 | SEQID NO: 7 | |
| Глюкоза | 23,4 ±5,7 | 23,9 ±5,9 | 22,6 ±5,8 | 24,4 ±5,3 | 28,9 ±5,1 | 26,4 ± 6,6 | 22,3 ± 4,5 |
| Манноза | 25,3 ±6,5 | 27,6 ± 6,6 | 25,9 ±7,0 | 23,3 ±6,6 | 22,1 ±4,0 | 22,4 ± 6,7 | 26,2 ± 7,3 |
| Этанол | 4,6 ± 0,8 | 5,6 ± 1,1 | 3,9 ±0,7 | 3,9 ±0,8 | 4,5 ±0,6 | 4,7 ± 0,6 | 4,9 ± 1,1 |
| Глицерин | 8,3 ± 2,2 | 7,6 ±3,4 | 7,6 ±2.7 | 9,3 ± 2,7 | 6,6 ± 1,3 | 6,8 ±2,3 | 7,0 ±2,3 |
| Ксилоза | 6,8 ±3,3 | 6,6 ±5,3 | 5,8 ±3,2 | 8,4 ±4,1 | 7,1 ±4,6 | 7,7 ±4,5 | 7,9 ±4,4 |
Репортерная система под контролем олигонуклеотидов по настоящему изобретению проявляла повышение уровня транскрипта в 4-29 раз. Уровни транскрипта варьируют при различных условиях роста, но существенных отличий в отношении контроля между олигонуклеотидами SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 7 не отмечалось.
Пример 4. Активность фермента - сравнение различных плазмид, содержащих различные олигонуклеотиды.
Собирали по 50 мл культур, как указано в примере 3, примерно при OD600 = 2. После этого осадки культур хранили при -80°C. Кроме того, таким же образом обрабатывали культуру штамма В, несущего
- 6 037161 плазмиду, описанную в примере 2, но без функциональной части (пустая плазмида).
Оттаявшие осадки суспендировали в 400 мкл буфера (100 мМ трис, pH 7,5, 10 мМ MgCl2) и гомогенизировали. После лизиса клеток неочищенные экстракты разбавляли до общей концентрации белка в 1 мкг/мкл (измеряли методом Брэдфорда). Определение активности ксилозоизомеразы проводили в 100 мкл с 10% разбавленных неочищенных экстрактов, 0,25 мМ NADH, 3 ед./мл сорбитолдегидрогеназы и 500 мМ ксилозы. Кинетику реакции отслеживали фотометрически при 340 нм.
Измеренные активности фермента (за вычетом фоновой активности - пустая плазмида) представлены на фиг. 4.
Таблица 3. Степень изменения активности ксилозоизомеразы (разы) под контролем различных олигонуклеотидов по сравнению с активностью ксилозоизомеразы под контролем SEQ ID NO: 9
| SEQID NO: 1 | SEQID NO: 2 | SEQID NO: 3 | SEQID NO: 4 | SEQID NO: 5 | SEQID NO: 6 | SEQID NO: 7 | |
| Глюкоза | 22,5 ±3,6 | 23,7 ±3,4 | 24,8 ±3,5 | 24,9 ± 4,0 | 23,9 ±3,9 | 22,8 ±4,1 | 20,6 ±3,2 |
| Манноза | 20,4 ± 4,4 | 20,4 ± 4,5 | 18,6 ±5,4 | 18,9 ±4,5 | 19,7 ±4,7 | 19,7 ±5,3 | 18,6 ±4,2 |
| Этанол | 13,7 ±2,2 | 13,0 ±2,2 | 14,0 ±2,3 | 15,2 ±2,6 | 13,9 ±2,3 | 14,6 ±2,6 | 13,4 ±2,7 |
| Г лицерин | 14,8 ±4,2 | 14,3 ±3,8 | 16,9 ±4,8 | 15,5 ±4,3 | 15,4 ±4,3 | 16,5 ±4,6 | 15,3 ±4,2 |
| Ксилоза | 14,3 ±2,0 | 15,0 ±2,5 | 16,7 ±2,6 | 14,8 ±2,4 | 14,8 ±2,3 | 14,5 ±2,2 | 14,5 ±2,4 |
Репортерная система под контролем олигонуклеотидов по настоящему изобретению проявляла повышение активности фермента в 14-25 раз. Хотя активность фермента варьируется при различных условиях роста, но существенных отличий в отношении контроля между олигонуклеотидами SEQ ID NO: 1 SEQ ID NO: 7 не отмечалось.
Краткое описание фигур
На фиг. 1 представлены показатели роста 5 различных штаммов дрожжевых клеток (от A до E), которые были трансформированы плазмидой, содержащей ген, кодирующий SEQ ID NO: 17, регулируемый олигонуклеотидом из существующего уровня техники: SEQ ID NO: 10.
На фиг. 2 представлены показатели роста штамма В, трансформированного различными плазмидами, содержащими различные олигонуклеотиды (олигонуклеотиды из существующего уровня техники и олигонуклеотиды по настоящему изобретению).
На фиг. 3 представлено повышение в 4-29 раз уровня транскрипта в репортерной системе под контролем олигонуклеотидов по настоящему изобретению (SEQ ID NO: 1-7) по сравнению с олигонуклеотидами из существующего уровня техники SEQ ID NO 8, SEQ ID NO: 9 и SEQ ID NO: 10 на различных субстратах (глюкоза, манноза, этанол, глицерин и ксилоза).
На фиг. 4 представлено повышение в 14-25 раз активности фермента в репортерной системе под контролем олигонуклеотидов по настоящему изобретению (SEQ ID NO: 1-7) по сравнению с олигонуклеотидами из существующего уровня техники SEQ ID NO 8, SEQ ID NO: 9 и SEQ ID NO: 10 на различных субстратах (глюкоза, манноза, этанол, глицерин и ксилоза).
- 7 037161
Перечень последовательностей с описанием
SEQ ID NO: 1: синтетический олигонуклеотид, состоящий из комбинации SEQ ID
NO: 9 и SEQ ID NO: 8 ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac 180 cggagtcatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt 240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca 300 agagccgatt agtggaagcc acggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg 360 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac 420 aatttcgggc ccctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata 480 attttcagag gcaacaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc 540 ccaccatctt tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa 600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa aagtataaat agagacgata tatgccaata 660 cttcacaatg ttcgaatcta ttcttcattt gcagctattg taaaataata aaacatcaag 720 aacaaacaag ctcaacttgt cttttctaag aacaaagaat aaacacaaaa acaaaaagtt 780 tttttaattt taatcaaaaa 800
SEQ ID NO: 2: синтетический олигонуклеотид, соответствующий SEQ ID NO: 1 и содержащий следующие мутации: g315a, c322g, a623-, t679c ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac 180 cggagtcatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt 240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca 300 agagccgatt agtgaaagcc agggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg 360 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac 420 aatttcgggc ccctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata 480 attttcagag gcaacaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc 540 ccaccatctt tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa 600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa agtataaata gagacgatat atgccaatac 660 ttcacaatgt tcgaatccat tcttcatttg cagctattgt aaaataataa aacatcaaga 720 acaaacaagc tcaacttgtc ttttctaaga acaaagaata aacacaaaaa caaaaagttt 780 ttttaatttt aatcaaaaa 799
SEQ ID NO: 3: синтетический олигонуклеотид, соответствующий SEQ ID NO: 1 и содержащий следующие мутации: t549c, а622-, а623-, с661а, t679c
- 8 037161 ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac 180 cggagtcatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt 240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca 300 agagccgatt agtggaagcc acggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg 360 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac 420 aatttcgggc ccctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata 480 attttcagag gcaacaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc 540 ccaccatcct tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa 600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa gtataaatag agacgatata tgccaataat 660 tcacaatgtt cgaatccatt cttcatttgc agctattgta aaataataaa acatcaagaa 720 caaacaagct caacttgtct tttctaagaa caaagaataa acacaaaaac aaaaagtttt 780 tttaatttta atcaaaaa 798
SEQ ID NO: 4: синтетический олигонуклеотид, соответствующий SEQ ID NO: 1 и содержащий следующие мутации: с495а, g674a, t679c, a687g ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac 180 cggagtcatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt 240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca 300 agagccgatt agtggaagcc acggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg 360 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac 420 aatttcgggc ccctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata 480 attttcagag gcaaaaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc 540 ccaccatctt tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa 600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa aagtataaat agagacgata tatgccaata 660 cttcacaatg ttcaaatcca ttcttcgttt gcagctattg taaaataata aaacatcaag 720 aacaaacaag ctcaacttgt cttttctaag aacaaagaat aaacacaaaa acaaaaagtt 780 tttttaattt taatcaaaaa 800
SEQ ID NO: 5: синтетический олигонуклеотид, соответствующий SEQ ID NO: 1 и содержащий следующие мутации: а171-, c322g, c430t, c431t, c495a ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaacc 180
- 9 037161 ggagtcatta tatacgatac cgtccagggt aagacagtga tttctagctt ccactttttt 240 caatttcttt ttttcgttcc aaatggcgtc cacccgtaca tccggaatct gacggcacaa 300 gagccgatta gtggaagcca gggttacgtg attgcggttt ttttttccta cgtataacgc 360 tatgacggta gttgaatgtt aaaaacgaaa acagagatat tgaattgact cgtaggaaca 420 atttcgggtt cctgcgtgtt cttctgaggt tcatctttta catttgcttc tgctggataa 480 ttttcagagg caaaaaggaa aaattagatg gcaaaaagtc gtctttcaag gaaaaatccc 540 caccatcttt cgagatcccc tgtaacttat tggcaactga aagaatgaaa aggaggaaaa 600 tacaaaatat actagaactg aaaaaaaaaa agtataaata gagacgatat atgccaatac 660 ttcacaatgt tcgaatctat tcttcatttg cagctattgt aaaataataa aacatcaaga 720 acaaacaagc tcaacttgtc ttttctaaga acaaagaata aacacaaaaa caaaaagttt 780 ttttaatttt aatcaaaaa 799
SEQ ID NO: 6: синтетический олигонуклеотид, соответствующий SEQ ID NO: 1 и содержащий следующие мутации: с181а, c205t, c322g, t549c, a623-, t679c ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac 180 aggagtcatt atatacgata ccgttcaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt 240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca 300 agagccgatt agtggaagcc agggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg 360 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac 420 aatttcgggc ccctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata 480 attttcagag gcaacaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc 540 ccaccatcct tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa 600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa agtataaata gagacgatat atgccaatac 660 ttcacaatgt tcgaatccat tcttcatttg cagctattgt aaaataataa aacatcaaga 720 acaaacaagc tcaacttgtc ttttctaaga acaaagaata aacacaaaaa caaaaagttt 780 ttttaatttt aatcaaaaa 799
SEQ ID NO: 7: синтетический олигонуклеотид, соответствующий SEQ ID NO: 1 и содержащий следующие мутации: tl86a, c322g, c430t, c431t, a623-, t679c ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc 60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa 120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac 180 cggagacatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt 240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca 300 agagccgatt agtggaagcc agggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg 360
- 10 037161 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac 420 aatttcgggt tcctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata 480 attttcagag gcaacaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc 540 ccaccatctt tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa 600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa agtataaata gagacgatat atgccaatac 660 ttcacaatgt tcgaatccat tcttcatttg cagctattgt aaaataataa aacatcaaga 720 acaaacaagc tcaacttgtc ttttctaaga acaaagaata aacacaaaaa caaaaagttt 780 ttttaatttt aatcaaaaa 799
SEQ ID NO: 8: олигонуклеотид из Saccharomyces cerevisiae S288C, вышерасположенный участок PFK2
SEQ ID NO: 9: олигонуклеотид из Saccharomyces cerevisiae S288C, вышерасположенный участок HXT7
SEQ ID NO: 10: олигонуклеотид из Saccharomyces cerevisiae S288C, вышерасположенный участок PGK1
SEQ ID NO: И: белок с активностью альдозо-1-эпимеразы из Saccharomyces cerevisiae ECI 118, 1O4_6579
SEQ ID NO: 12: белок с активностью альдозо-1-эпимеразы из Saccharomyces cerevisiae ECI 119, 1F14_OO56
SEQ ID NO: 13: белок с активностью альдозо-1-эпимеразы из Saccharomyces cerevisiae S288C, YHR210C
SEQ ID NO: 14: белок с активностью альдозо-1-эпимеразы из Saccharomyces cerevisiae * Saccharomyces kudriavzevii VIN7, типа YHR210C
SEQ ID NO: 15: белок с активностью альдозо-1-эпимеразы из Saccharomyces cerevisiae AWRI796, типа YHR210C
SEQ ID NO: 16: белок с активностью альдозо-1-эпимеразы из Lactococcus lactis, XylM
SEQ ID NO: 17: белок с активностью ксилозоизомеразы из Eubacterium saburreum, XylA
SEQ ID NO: 18: белок с активностью ксилозоизомеразы из Piromyces sp. E2, XylA
SEQ ID NO: 19: белок с активностью ксилозоизомеразы из Orpinomyces sp. ukkl, XylA
SEQ ID NO: 20: белок с активностью ксилозоизомеразы из Clostridium phytofermentans, XylA
SEQ ID NO: 21: белок с активностью ксилозоизомеразы из Ruminococcus flavefaciens, XylA
- 11 037161
SEQ ID NO: 22: белок с активностью ксилозоизомеразы из Bacteroides uniformis,
XylA
SEQ ID NO: 23: белок с активностью ксилозоизомеразы из Clostridium cellulolyticum, XylA
SEQ ID NO: 24: белок с активностью ксилозоизомеразы из Thermotoga maritima, XylA
SEQ ID NO: 25: белок с активностью ксилозоизомеразы из Bacillus stearothermophilus, XylA
SEQ ID NO: 26: белок с активностью ксилозоизомеразы из Bacteroides stercoris, XylA
SEQ ID NO: 27: белок с активностью ксилозоизомеразы из Parabacteroides distasonis, XylA
SEQ ID NO: 28: белок с активностью ксилозоизомеразы из Prevotella ruminicola, XylA
SEQ ID NO: 29: белок с активностью ксилозоизомеразы из Agrobacterium tumefaciens, XylA
SEQ ID NO: 30: белок с активностью ксилозоизомеразы из Clostridium cellulovorans, XylA
SEQ ID NO: 31: белок с активностью ксилозоизомеразы из Burkholderia cenocepacia, XylA
SEQ ID NO: 32: белок с активностью ксилозоизомеразы из Lactococcus lactis, XylA
SEQ ID NO: 33: белок с активностью ксилозоизомеразы из Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus, XylA
SEQ ID NO: 34: белок с активностью ксилозоизомеразы из Reticulitermes speratus, XylA
SEQ ID NO: 35: белок с активностью ксилозоизомеразы из некультивированных бактерий из рубца коровы, последовательность № 2 в WO 2014/164392
SEQ ID NO: 36: белок с активностью ксилозоизомеразы из некультивированных бактерий из рубца коровы, последовательность № 1 в WO 2014/164392
SEQ ID NO: 37: белок с активностью ксилозоизомеразы из Lachnospiraceae bacterium ICM7, XylA
SEQ ID NO: 38: белок с активностью ксилозоизомеразы из Lachnospiraceae bacterium oral taxon 107, XylA
SEQ ID NO: 39: белок с активностью ксилозоизомеразы из Lachnospiraceae bacterium oral taxon 082, XylA
- 12 037161
SEQ ID NO: 40: белок с активностью ксилозоизомеразы из некультивированных бактерий, XYM1, см. Parachin N.S. and Gorwa-Grauslund M.F. Isolation of xylose isomerases by sequence- and function-based screening from a soil metagenome library. Biotechnol Biofuels
4(1), 9(2011)
SEQ ID NO: 41: белок с активностью ксилозоизомеразы из некультивированных бактерий, XYM2, см. Parachin N.S. and Gorwa-Grauslund M.F. Isolation of xylose isomerases by sequence- and function-based screening from a soil metagenome library. Biotechnol Biofuels 4(1), 9(2011)
SEQ ID NO: 42: белок с активностью ксилозоизомеразы из Thermus thermophilus, XylA
SEQ ID NO: 43: белок с активностью ксилозоизомеразы из Escherichia coli, XylA
SEQ ID NO: 44: белок с активностью ксилулокиназы из Saccharomyces cerevisiae S288C, XKS1
SEQ ID NO: 45: белок с активностью ксилулокиназы из Scheffersomyces (Pichia) stipites CBS 6054, XKS1
SEQ ID NO: 46: белок с активностью ксилулокиназы из Trichoderma reesei QM6a, TRIREDRAFT 123288
SEQ ID NO: 47: белок с активностью трансальдолазы из Saccharomyces cerevisiae S288C, TALI
SEQ ID NO: 48: белок с активностью трансальдолазы из Saccharomyces cerevisiae S288C, NQM1
SEQ ID NO: 49: белок с активностью трансальдолазы из Scheffersomyces (Pichia) stipites CBS 6054, TALI
SEQ ID NO: 50: белок с активностью транскетолазы из Saccharomyces cerevisiae S288C, TKL1
SEQ ID NO: 51: белок с активностью транскетолазы из Saccharomyces cerevisiae S288C, TKL2
SEQ ID NO: 52: белок с активностью транскетолазы из Scheffersomyces (Pichia) stipites CBS 6054, TKL1
SEQ ID NO: 53: белок с активностью алкогольдегидрогеназы из Saccharomyces cerevisiae S288C, ADH1
SEQ ID NO: 54: синтетическая последовательность ДНК, кодирующая SEQ ID NO: 17 atgaaggaat tcttcccagg tatttctcca gttaagttcg aaggtagaga ctctaagaac 60 ccattgtctt tcaagtacta cgacgctaag agagttatta tgggtaagac catggaagaa 120
- 13 037161 cacttgtctt tcgctatggc ttggtggcac aacttgtgtg cttgtggtgt tgacatgttc 180 ggtcaaggta ccgttgacaa gtctttcggt gaatcttctg gtaccatgga acacgctaga 240 gctaaggttg acgctggtat tgaattcatg aagaagttgg gtattaagta ctactgtttc 300 cacgacaccg acattgttcc agaagaccaa gaagacatta acgttaccaa cgctagattg 360 gacgaaatta ccgactacat tttggaaaag accaaggaca ccgacattaa gtgtttgtgg 420 accacctgta acatgttctc taacccaaga ttcatgaacg gtgctggttc ttctaactct 480 gctgacgttt tctgtttcgc tgctgctcaa gctaagaagg gtttggaaaa cgctgttaag 540 ttgggtgcta agggtttcgt tttctggggt ggtagagaag gttacgaaac cttgttgaac 600 accgacatga agttggaaga agaaaacatt gctaccttgt tcaccatgtg tagagactac 660 ggtagatcta ttggtttcat gggtgacttc tacattgaac caaagccaaa ggaaccaatg 720 aagcaccaat acgacttcga cgctgctacc gctattggtt tcttgagaaa gtacggtttg 780 gacaaggact tcaagttgaa cattgaagct aaccacgcta ccttggctgg tcacaccttc 840 caacacgaat tgagagtttg tgctgttaac ggtatgatgg gttctgttga cgctaaccaa 900 ggtgacacct tgttgggttg ggacaccgac caattcccaa ccaacgttta cgacaccacc 960 ttggctatgt acgaaatttt gaaggctggt ggtttgagag gtggtttgaa cttcgactct 1020 aagaacagaa gaccatctaa caccgctgac gacatgttct acggtttcat tgctggtatg 1080 gacaccttcg ctttgggttt gattaaggct gctgaaatta ttgaagacgg tagaattgac 1140 gacttcgtta aggaaagata cgcttcttac aactctggta ttggtaagaa gattagaaac 1200 agaaaggtta ccttgattga atgtgctgaa tacgctgcta agttgaagaa gccagaattg 1260 ccagaatctg gtagacaaga atacttggaa tctgttgtca acaacatttt gttcggtggt 1320 tctggttaa 1329
- 14 037161
Список последовательностей < 110> clariant International Ltd < 120> ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ДЛЯ ПРИМЕНЕНИЯ В КОНСТРУИРОВАНИИ
ПУТЕЙ <130> 2014DE617-WO-PCT < 160> 54 < 170> Patentin version 3.5 <210> 1 <211> 800 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 1
| ccattctctg | ctgctttgtt | gcatcgtatc atcgcccgtt | tcagccagtc | ccgcataccc | 60 |
| cctttgcaac | gttaacgtta | ccgctagcgt ttaccatctc | cacgctaaaa | ggaaaacgaa | 120 |
| gattaagata | aagttgggta | aaatccgggg taagaggcaa | gggggtagag | aaaaaaaaac | 180 |
| cggagtcatt | atatacgata | ccgtccaggg taagacagtg | atttctagct | tccacttttt | 240 |
| tcaatttctt | tttttcgttc | caaatggcgt ccacccgtac | atccggaatc | tgacggcaca | 300 |
| agagccgatt | agtggaagcc | acggttacgt gattgcggtt | tttttttcct | acgtataacg | 360 |
| ctatgacggt | agttgaatgt | taaaaacgaa aacagagata | ttgaattgac | tcgtaggaac | 420 |
| aatttcgggc | ccctgcgtgt | tcttctgagg ttcatctttt | acatttgctt | ctgctggata | 480 |
| attttcagag | gcaacaagga | aaaattagat ggcaaaaagt | cgtctttcaa | ggaaaaatcc | 540 |
| ccaccatctt | tcgagatccc | ctgtaactta ttggcaactg | aaagaatgaa | aaggaggaaa | 600 |
| atacaaaata | tactagaact | gaaaaaaaaa aagtataaat | agagacgata | tatgccaata | 660 |
| cttcacaatg | ttcgaatcta | ttcttcattt gcagctattg | taaaataata | aaacatcaag | 720 |
| aacaaacaag | ctcaacttgt | cttttctaag aacaaagaat | aaacacaaaa | acaaaaagtt | 780 |
| tttttaattt | taatcaaaaa | 800 |
<210> 2 <211> 799 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 2
| ccattctctg | ctgctttgtt | gcatcgtatc | atcgcccgtt | tcagccagtc | ccgcataccc | 60 |
| cctttgcaac | gttaacgtta | ccgctagcgt | ttaccatctc | cacgctaaaa | ggaaaacgaa | 120 |
| gattaagata | aagttgggta | aaatccgggg | taagaggcaa | gggggtagag | aaaaaaaaac | 180 |
| cggagtcatt | atatacgata | ccgtccaggg | taagacagtg | atttctagct | tccacttttt | 240 |
| tcaatttctt | tttttcgttc | caaatggcgt | ccacccgtac | atccggaatc | tgacggcaca | 300 |
| agagccgatt | agtgaaagcc | agggttacgt | gattgcggtt | tttttttcct | acgtataacg | 360 |
| ctatgacggt | agttgaatgt | taaaaacgaa | aacagagata | ttgaattgac | tcgtaggaac | 420 |
| aatttcgggc | ccctgcgtgt | tcttctgagg | ttcatctttt | acatttgctt | ctgctggata | 480 |
- 15 037161
| attttcagag gcaacaagga aaaattagat | ggcaaaaagt | cgtctttcaa ggaaaaatcc | 540 |
| ccaccatctt tcgagatccc ctgtaactta | ttggcaactg | aaagaatgaa aaggaggaaa | 600 |
| atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa | agtataaata | gagacgatat atgccaatac | 660 |
| ttcacaatgt tcgaatccat tcttcatttg | cagctattgt | aaaataataa aacatcaaga | 720 |
| acaaacaagc tcaacttgtc ttttctaaga | acaaagaata | aacacaaaaa caaaaagttt | 780 |
| ttttaatttt aatcaaaaa | 799 |
<210> 3 <211> 798 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 3 ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc60 cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa120 gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac180 cggagtcatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt240 tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca300 agagccgatt agtggaagcc acggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg360 ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac420 aatttcgggc ccctgcgtgt tcttctgagg ttcatctttt acatttgctt ctgctggata480 attttcagag gcaacaagga aaaattagat ggcaaaaagt cgtctttcaa ggaaaaatcc540 ccaccatcct tcgagatccc ctgtaactta ttggcaactg aaagaatgaa aaggaggaaa600 atacaaaata tactagaact gaaaaaaaaa gtataaatag agacgatata tgccaataat660 tcacaatgtt cgaatccatt cttcatttgc agctattgta aaataataaa acatcaagaa720 caaacaagct caacttgtct tttctaagaa caaagaataa acacaaaaac aaaaagtttt 780 tttaatttta atcaaaaa798 <210> 4 <211> 800 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 4 ccattctctg ctgctttgtt gcatcgtatc atcgcccgtt tcagccagtc ccgcataccc cctttgcaac gttaacgtta ccgctagcgt ttaccatctc cacgctaaaa ggaaaacgaa gattaagata aagttgggta aaatccgggg taagaggcaa gggggtagag aaaaaaaaac cggagtcatt atatacgata ccgtccaggg taagacagtg atttctagct tccacttttt tcaatttctt tttttcgttc caaatggcgt ccacccgtac atccggaatc tgacggcaca agagccgatt agtggaagcc acggttacgt gattgcggtt tttttttcct acgtataacg ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattgac tcgtaggaac
120
180
240
300
360
420
- 16 037161
| aatttcgggc | ccctgcgtgt tcttctgagg | ttcatctttt | acatttgctt | ctgctggata | 480 |
| attttcagag | gcaaaaagga aaaattagat | ggcaaaaagt | cgtctttcaa | ggaaaaatcc | 540 |
| ccaccatctt | tcgagatccc ctgtaactta | ttggcaactg | aaagaatgaa | aaggaggaaa | 600 |
| atacaaaata | tactagaact gaaaaaaaaa | aagtataaat | agagacgata | tatgccaata | 660 |
| cttcacaatg | ttcaaatcca ttcttcgttt | gcagctattg | taaaataata | aaacatcaag | 720 |
| aacaaacaag | ctcaacttgt cttttctaag | aacaaagaat | aaacacaaaa | acaaaaagtt | 780 |
| tttttaattt | taatcaaaaa | 800 |
<210> 5 <211> 799 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 5
| ccattctctg | ctgctttgtt | gcatcgtatc atcgcccgtt | tcagccagtc | ccgcataccc | 60 |
| cctttgcaac | gttaacgtta | ccgctagcgt ttaccatctc | cacgctaaaa | ggaaaacgaa | 120 |
| gattaagata | aagttgggta | aaatccgggg taagaggcaa | gggggtagag | aaaaaaaacc | 180 |
| ggagtcatta | tatacgatac | cgtccagggt aagacagtga | tttctagctt | ccactttttt | 240 |
| caatttcttt | ttttcgttcc | aaatggcgtc cacccgtaca | tccggaatct | gacggcacaa | 300 |
| gagccgatta | gtggaagcca | gggttacgtg attgcggttt | ttttttccta | cgtataacgc | 360 |
| tatgacggta | gttgaatgtt | aaaaacgaaa acagagatat | tgaattgact | cgtaggaaca | 420 |
| atttcgggtt | cctgcgtgtt | cttctgaggt tcatctttta | catttgcttc | tgctggataa | 480 |
| ttttcagagg | caaaaaggaa | aaattagatg gcaaaaagtc | gtctttcaag | gaaaaatccc | 540 |
| caccatcttt | cgagatcccc | tgtaacttat tggcaactga | aagaatgaaa | aggaggaaaa | 600 |
| tacaaaatat | actagaactg | aaaaaaaaaa agtataaata | gagacgatat | atgccaatac | 660 |
| ttcacaatgt | tcgaatctat | tcttcatttg cagctattgt | aaaataataa | aacatcaaga | 720 |
| acaaacaagc | tcaacttgtc | ttttctaaga acaaagaata | aacacaaaaa | caaaaagttt | 780 |
| ttttaatttt | aatcaaaaa | 799 |
<210> 6 <211> 799 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 6
| ccattctctg | ctgctttgtt gcatcgtatc | atcgcccgtt | tcagccagtc | ccgcataccc | 60 |
| cctttgcaac | gttaacgtta ccgctagcgt | ttaccatctc | cacgctaaaa | ggaaaacgaa | 120 |
| gattaagata | aagttgggta aaatccgggg | taagaggcaa | gggggtagag | aaaaaaaaac | 180 |
| aggagtcatt | atatacgata ccgttcaggg | taagacagtg | atttctagct | tccacttttt | 240 |
| tcaatttctt | tttttcgttc caaatggcgt | ccacccgtac | atccggaatc | tgacggcaca | 300 |
| agagccgatt | agtggaagcc agggttacgt | gattgcggtt | tttttttcct | acgtataacg | 360 |
| ctatgacggt | agttgaatgt taaaaacgaa | aacagagata | ttgaattgac | tcgtaggaac | 420 |
- 17 037161
| aatttcgggc | ccctgcgtgt tcttctgagg | ttcatctttt | acatttgctt | ctgctggata | 480 |
| attttcagag | gcaacaagga aaaattagat | ggcaaaaagt | cgtctttcaa | ggaaaaatcc | 540 |
| ccaccatcct | tcgagatccc ctgtaactta | ttggcaactg | aaagaatgaa | aaggaggaaa | 600 |
| atacaaaata | tactagaact gaaaaaaaaa | agtataaata | gagacgatat | atgccaatac | 660 |
| ttcacaatgt | tcgaatccat tcttcatttg | cagctattgt | aaaataataa | aacatcaaga | 720 |
| acaaacaagc | tcaacttgtc ttttctaaga | acaaagaata | aacacaaaaa | caaaaagttt | 780 |
| ttttaatttt | aatcaaaaa | 799 |
<210> 7 <211> 799 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 7
| ccattctctg | ctgctttgtt | gcatcgtatc atcgcccgtt | tcagccagtc | ccgcataccc | 60 |
| cctttgcaac | gttaacgtta | ccgctagcgt ttaccatctc | cacgctaaaa | ggaaaacgaa | 120 |
| gattaagata | aagttgggta | aaatccgggg taagaggcaa | gggggtagag | aaaaaaaaac | 180 |
| cggagacatt | atatacgata | ccgtccaggg taagacagtg | atttctagct | tccacttttt | 240 |
| tcaatttctt | tttttcgttc | caaatggcgt ccacccgtac | atccggaatc | tgacggcaca | 300 |
| agagccgatt | agtggaagcc | agggttacgt gattgcggtt | tttttttcct | acgtataacg | 360 |
| ctatgacggt | agttgaatgt | taaaaacgaa aacagagata | ttgaattgac | tcgtaggaac | 420 |
| aatttcgggt | tcctgcgtgt | tcttctgagg ttcatctttt | acatttgctt | ctgctggata | 480 |
| attttcagag | gcaacaagga | aaaattagat ggcaaaaagt | cgtctttcaa | ggaaaaatcc | 540 |
| ccaccatctt | tcgagatccc | ctgtaactta ttggcaactg | aaagaatgaa | aaggaggaaa | 600 |
| atacaaaata | tactagaact | gaaaaaaaaa agtataaata | gagacgatat | atgccaatac | 660 |
| ttcacaatgt | tcgaatccat | tcttcatttg cagctattgt | aaaataataa | aacatcaaga | 720 |
| acaaacaagc | tcaacttgtc | ttttctaaga acaaagaata | aacacaaaaa | caaaaagttt | 780 |
| ttttaatttt | aatcaaaaa | 799 |
<210> 8 <211> 409 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 8
| ccattctctg | ctgctttgtt | gcatcgtatc | atcgcccgtt | tcagccagtc | ccgcataccc | 60 |
| cctttgcaac | gttaacgtta | ccgctagcgt | ttaccatctc | cacgctaaaa | ggaaaacgaa | 120 |
| gattaagata | aagttgggta | aaatccgggg | taagaggcaa | gggggtagag | aaaaaaaaac | 180 |
| cggagtcatt | atatacgata | ccgtccaggg | taagacagtg | atttctagct | tccacttttt | 240 |
| tcaatttctt | tttttcgttc | caaatggcgt | ccacccgtac | atccggaatc | tgacggcaca | 300 |
| agagccgatt | agtggaagcc | acggttacgt | gattgcggtt | tttttttcct | acgtataacg | 360 |
- 18 037161
| ctatgacggt agttgaatgt taaaaacgaa aacagagata ttgaattga | 409 | |
| <210> 9 <211> 391 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 9 ctcgtaggaa caatttcggg cccctgcgtg ttcttctgag | gttcatcttt tacatttgct | 60 |
| tctgctggat aattttcaga ggcaacaagg aaaaattaga | tggcaaaaag tcgtctttca | 120 |
| aggaaaaatc cccaccatct ttcgagatcc cctgtaactt | attggcaact gaaagaatga | 180 |
| aaaggaggaa aatacaaaat atactagaac tgaaaaaaaa | aaagtataaa tagagacgat | 240 |
| atatgccaat acttcacaat gttcgaatct attcttcatt | tgcagctatt gtaaaataat | 300 |
| aaaacatcaa gaacaaacaa gctcaacttg tcttttctaa | gaacaaagaa taaacacaaa | 360 |
| aacaaaaagt ttttttaatt ttaatcaaaa a <210> 10 <211> 500 <212> ДНК <213> saccharomyces cerevisiae <400> 10 tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaaaaaac ccagacacgc | tcgacttcct gtcttcctat | 391 60 |
| tgattgcagc ttccaatttc gtcacacaac aaggtcctag | cgacggctca caggttttgt | 120 |
| aacaagcaat cgaaggttct ggaatggcgg gaaagggttt | agtaccacat gctatgatgc | 180 |
| ccactgtgat ctccagagca aagttcgttc gatcgtactg | ttactctctc tctttcaaac | 240 |
| agaattgtcc gaatcgtgtg acaacaacag cctgttctca | cacactcttt tcttctaacc | 300 |
| aagggggtgg tttagtttag tagaacctcg tgaaacttac | atttacatat atataaactt | 360 |
| gcataaattg gtcaatgcaa gaaatacata tttggtcttt | tctaattcgt agtttttcaa | 420 |
| gttcttagat gctttctttt tctctttttt acagatcatc | aaggaagtaa ttatctactt | 480 |
| tttacaacaa agacaagaaa <210> 11 <211> 342 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 11 Met Lys Asp Asn Gin Glu Asn His Asp Gin Lys | Pro Phe lie lie Leu | 500 |
| 15 10 Gly Asp Lys Asn Lys Phe Glu Ala Thr lie Ala | 15 Lys Val Gly Ala Thr | |
| 20 25 Leu Val Asp Leu Lys Val Asn Gly Gin ser Val | 30 Val Leu Gly Tyr Pro | |
| 35 40 Asp Val Lys Gly Tyr Leu Asn Asp Pro Gly Asn | 45 Leu Val Gly Ala Asn |
- 19 037161
55 60
| Vai 65 | Gly | Arg Tyr Ala Asn 70 | Arg | He | Tyr | Lys Gly 75 | Vai | Phe | Asn | Thr | Pro 80 |
| Asp | Gly | Ala His Gin Leu 85 | Thr | Vai | Asn | Asn cys 90 | Gly | Asn | Al a | Asn 95 | Hi s |
| ser | ser | lie ser cys Phe 100 | Asn | Arg | Lys 105 | Thr Phe | Vai | Al a | ser 110 | Pro | Val |
| G1 u | Asn | ser ser Arg Asp 115 | Vai | Tyr 120 | He | Ala Lys | Leu | Thr 12 5 | Leu | Leu | Asp |
| Asp | Hi s 130 | Thr Vai Pro Asn | Glu 135 | Phe | Pro | Gly Asp | Leu 140 | G1 u | Vai | Thr | Val |
| Thr 145 | Tyr | Thr Leu Asn Vai 150 | Ala | G1 u | Met | Thr Leu 155 | Asp | Leu | Asp | Tyr | Arg 160 |
| Al a | Hi s | Leu Vai Lys Gly 165 | Asp | Al a | Thr | Pro lie 170 | Asn | Met | Thr | Asn 175 | Hi s |
| Thr | Tyr | Phe Asn Leu Asn 180 | Lys | Thr | Arg 185 | Asn Glu | G1 U | ser | He 190 | He | Gly |
| Thr | G1 U | lie Asn lie cys 195 | ser | Asp 200 | Lys | ser Leu | G1 U | Vai 205 | Thr | G1 U | Gly |
| Al a | Leu 210 | lie Pro Thr Gly | Lys 215 | He | He | Lys Arg | Asp 220 | He | Al a | Thr | Phe |
| G1 n 225 | ser | Ala His Pro Thr 2 30 | Thr | Leu | Gly | ser Lys 235 | Al a | Pro | Vai | Tyr | Asp 240 |
| Phe | cys | Phe lie Vai Asp 245 | Ala | Asn | Lys | Asp Leu 250 | Arg | ser | Thr | Asp 255 | ser |
| Thr | ser | Vai Asn Lys Leu 260 | Vai | Pro | Vai 265 | Phe Lys | Al a | Tyr | Hi s 270 | Pro | G1 u |
| ser | Asn | lie Arg Leu Gin 275 | Vai | ser 280 | Thr | Thr Glu | Pro | Thr 285 | Vai | Hi s | Phe |
| Tyr | Thr 290 | Gly Asp ser Leu | Gly 295 | Gly | Lys | Phe Vai | Pro 300 | Arg | ser | Gly | Phe |
| Al a 305 | Vai | Glu Gin Gly Arg 310 | Tyr | He | Asp | Ala He 315 | Asn | Arg | ser | G1 U | T rp 320 |
| Arg | Asn | cys Vai Leu Leu 325 | Lys | Arg | Gly | Glu Vai 330 | Tyr | Thr | ser | Lys 335 | Thr |
- 20 037161
Gin Tyr cys Phe Lys Asn
340 <210> 12 <211> 359 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 12
Met Gly ser Lys Asn Thr Leu Leu Vai Phe His Leu Lys Gly Vai Lys 15 1015
Thr Asp Leu Ala Gly Ala Vai Asn Asp Tyr Glu Asn Arg Phe lie Thr 20 2530 lie Gly Ala Gly ser Lys Phe Glu Ala Thr lie Ala Asn Leu Gly Ala 35 4045
Thr Leu Vai Asp Leu Lys Vai Asn Gly Gin ser Vai Vai Leu Gly Tyr 50 5560 ser Arg Ala Glu Asp Tyr Asn ser Asp Gly Gly Asn Tyr lie Gly Ala 65 70 7580
Thr Vai Gly Arg Phe Ala Asn Arg lie Lys Glu Gly Leu Phe Thr Leu 85 9095
Gin Asp Gly Thr His Lys Leu Thr Vai Asp Asn cys Asp Asn Thr Asn
100 105110
His ser ser lie ser ser Phe His Vai Lys Lys Phe Leu Gly Pro Leu
115 120125 lie Glu Asn Pro ser Asp Glu lie Tyr Thr Ala Glu Phe Leu Leu Leu
130 135140
Asp Asp His ser lie Pro Asn Glu Phe Pro Gly Asp Leu Glu Vai lie
145 150 155160
Vai Lys Phe Thr Leu Asn lie Ala Glu Met ser Leu Lys Phe ser Tyr
165 170175
Gin Ala Gin Leu lie Asn Gly Glu Ala Thr Pro lie Asn Met Thr ser
180 185190
His Thr Tyr Phe Asn Leu Asn Lys Phe His Asn Glu Gin ser lie ser
195 200205
Gly Thr Glu Vai Arg Vai cys ser Thr Lys ser Leu Glu Vai ser Glu
210 215220
- 21 037161
Gly Ala Leu lie Pro Thr Gly Lys Vai lie Asp Arg Asp Vai Ala Thr
225 230 235240
Phe Asp ser Ala Gly Pro Thr Thr Leu Gly Gly Asp Gly Pro Thr Tyr
245 250255
Asp Tyr cys Phe lie ser Asp Glu Asn Lys Gly Leu Lys ser Pro Asp
260 265270 ser Arg ser Gin Asn Glu Leu Arg Pro Vai Leu Lys Ala Tyr His Pro
275 280285
Glu ser Lys lie Thr Leu Glu Vai ser Thr Thr Glu Pro ser Phe Vai
290 295300
Leu Tyr ser Gly Asp Asn Leu Phe Gly Lys Phe lie Pro Arg Gin Gly
305 310 315320
Phe cys Vai Glu Gin Gly Arg Tyr lie Asp Ala lie Asn Arg Asp Asp
325 330335
Trp Lys Asp cys Vai Leu Leu Lys Arg Gly Asp Vai Tyr Thr ser Glu
340 345350
Thr Gin Tyr Arg Phe Glu Asn
355 <210> 13 <211> 341 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 13
Met ser Asn Asn Lys Ala Gly Gly Glu Tyr Glu Vai lie Thr lie Gly 15 1015
Asp Ala Lys Lys Leu Gin Ala Thr lie ser Glu Leu Gly Ala Thr Leu 20 2530
Leu Asp Leu Lys Vai Asn Asn Glu ser lie Vai Leu Gly Tyr Pro Asp 35 4045 lie His Gly Tyr lie ser Asp Gly Tyr Asn Tyr lie Gly Ala Thr Vai 50 5560
Gly Arg Tyr Ala Asn Arg lie Tyr Lys Gly Met Phe ser Met Glu Asp 65 70 7580
Gly Pro His Gin Leu Thr Vai Asn Asn cys Gly Asn Thr Asn His ser 85 9095 ser lie ser ser Phe His Leu Lys Lys Tyr Lys Ala ser Lys Vai Gin
100 105110
- 22 037161
| Asn | Pro | Leu 115 | Asp | Asp | Leu | Tyr | Ile 120 | Val | G1 u | Phe | Thr | Leu 12 5 | Leu | Asp | Asp |
| Arg | Thr 130 | Leu | Pro | Asn | G1 u | Phe 135 | Pro | Gly | Asp | Leu | Al a 140 | Val | Asn | Leu | Lys |
| Tyr 145 | Thr | Leu | Asn | Val | Al a 150 | Asp | Met | Thr | Leu | Asp 155 | Leu | G1 u | Tyr | G1 u | Al a 160 |
| Lys | Leu | Val | ser | Gly 165 | G1 u | Ala | Thr | Pro | Ile 170 | Asn | Met | Thr | Asn | Hi s 175 | Thr |
| Tyr | Phe | Asn | Leu 180 | Asn | Lys | Thr | Met | Asp 185 | Lys | Lys | ser | Ile | ser 190 | Gly | Thr |
| G1 U | Val | Arg 195 | Leu | cys | ser | Asp | Lys 200 | ser | Leu | G1 U | Val | ser 205 | G1 u | Gly | Al a |
| Leu | Ile 210 | Pro | Thr | Gly | Lys | Ile 215 | Val | G1 n | Arg | Lys | Ile 220 | Al a | Thr | Phe | Asp |
| ser 225 | ser | Lys | Pro | Thr | Ile 2 30 | Leu | G1 n | Asp | Asp | Gly 235 | Pro | Ile | Tyr | Asp | Tyr 240 |
| Al a | Phe | Ile | Val | Asp 245 | G1 u | Asn | Lys | Asn | Leu 250 | Lys | Thr | Thr | Asp | ser 255 | Val |
| ser | Val | Asn | Lys 260 | Leu | Val | Pro | Al a | Phe 265 | Lys | Al a | Tyr | Hi s | Pro 270 | Al a | ser |
| Arg | Leu | ser 275 | Leu | G1 u | Val | ser | Thr 280 | Thr | G1 U | Pro | Thr | Val 285 | Leu | Phe | Tyr |
| Thr | Gly 290 | Asp | Asn | Leu | cys | Asp 295 | Gly | Phe | Thr | Pro | Arg 300 | ser | Gly | Phe | Al a |
| Val 305 | G1 u | G1 n | Gly | Arg | Tyr 310 | Val | Asp | Al a | Ile | Asn 315 | Arg | Asp | Gly | T rp | Arg 320 |
| Asp | cys | Val | Leu | Leu 325 | Arg | Arg | Gly | G1 u | Val 330 | Tyr | Thr | ser | Lys | Thr 335 | Arg |
Tyr Arg Phe Ala Val
340 <210> 14 <211> 360 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 14
- 23 037161
| Met 1 | ser Asn | Asp Gly 5 | Gin Gin | Lys | Lys | Leu 10 | Al a | Thr | He | Asp | Asn 15 | Lys | |||
| Leu | G1 u | Met | Thr | Asn | ser | Asn | Thr | G1 U | Asn | Lys | Tyr | Lys | Val | He | Thr |
| lie | Gly | Asp | 20 G1 u | Lys | Arg | Phe | G1 n | 25 Al a | Thr | He | Al a | Pro | 30 Leu | Gly | Al a |
| Thr | Leu | 35 Val | Asp | Leu | Lys | Val | 40 Asn | Asn | G1 n | ser | Val | 45 Val | G1 n | Gly | Tyr |
| ser | 50 Asn | Val | G1 n | Asp | Tyr | 55 Leu | Thr | Asp | Gly | Asn | 60 Met | Met | Gly | Al a | Thr |
| 65 Vai | Gly | Arg | Tyr | Al a | 70 Asn | Arg | He | Al a | Lys | 75 Gly | Val | Phe | ser | Leu | 80 G1 u |
| Asp | Gly | Pro | Hi s | 85 Lys | Leu | Thr | Val | Asn | 90 Asn | cys | Gly | Asn | Thr | 95 Asn | Hi s |
| ser | ser | He | 100 ser | ser | Leu | Asn | Leu | 105 Lys | G1 n | Tyr | Arg | Al a | 110 ser | Pro | Val |
| G1 u | Asn | 115 Pro | ser | Lys | Asp | Val | 120 Phe | Val | Val | G1 U | Phe | 12 5 Lys | Leu | Leu | Asp |
| Asp | 130 Hi s | Thr | G1 n | Pro | Asn | 135 Pro | Asn | G1 u | Phe | Pro | 140 Gly | Asp | Leu | G1 u | Val |
| 145 Thr | Val | Lys | Tyr | Thr | 150 Leu | Asn | Val | Al a | G1 u | 155 Met | Thr | Leu | Gly | Met | 160 Lys |
| Tyr | G1 n | Al a | G1 n | 165 Leu | Val | Arg | Gly | Asp | 170 Al a | Thr | Pro | He | Asn | 175 Met | Thr |
| Asn | Hi s | ser | 180 Tyr | Phe | Asn | Leu | Asn | 185 Lys | Thr | Lys | Asn | G1 U | 190 Lys | ser | He |
| ser | Gly | 195 Thr | G1 U | Val | Lys | Val | 200 cys | ser | Asn | Lys | ser | 205 Leu | G1 U | Val | Thr |
| G1 u | 210 Gly | Al a | Leu | Leu | Pro | 215 Thr | G1 u | Lys | He | He | 220 G1 u | Arg | Lys | He | Al a |
| 225 Thr | Phe | Asp | ser | Al a | 2 30 Lys | Pro | Thr | Val | Leu | 235 Hi s | Asp | Asp | Al a | Pro | 240 Val |
| Phe | Asp | cys | Thr | 245 Phe | He | He | Asp | Al a | 250 Asn | Lys | Asp | Leu | Hi s | 255 Thr | Thr |
| Asp | ser | Val | 260 ser | Val | Asn | Lys | Leu | 265 Val | Pro | Val | Phe | Lys | 270 Al a | Tyr | Hi s |
- 24 037161
| 275 | 280 | 285 |
| Pro Glu ser Arg lie Thr Phe 290 295 | Glu Vai ser Thr | Thr Glu Pro Thr Vai 300 |
| His Leu Tyr Thr Gly Asp Asn 305 310 | Leu cys Gly Lys 315 | Phe Thr Pro Arg ser 320 |
| Gly Phe Ala Vai Gin Gin Gly 325 | Arg Tyr Vai Asp 330 | Ala lie Asn His Asp 335 |
| Lys Trp Arg Asp cys Vai Leu 340 Glu Thr Gin Tyr Arg Phe Gly 355 | Leu Lys Arg Gly 345 He 360 | Glu Vai Tyr Thr ser 350 |
<210> 15 <211> 342 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 15
Met ser Asn ser Asn Gly Asp Asn Lys Tyr Gly Vai lie Thr lie Gly 15 1015
Asp Glu Lys Lys Phe Gin Ala Thr lie Ala Pro Leu Gly Ala Thr Leu 20 2530
Vai Asp Leu Lys Vai Asn Gly Gin ser Vai Vai Gin Gly Tyr ser Asn 35 4045
Vai Gin Asp Tyr Leu Thr Asp Gly Asn Met Met Gly Ala Thr Vai Gly 50 5560
Arg Tyr Ala Asn Arg lie Ala Lys Gly Vai Phe Ser Leu Asp Asp Gly 65 70 7580
Pro His Lys Leu Thr Vai Asn Asn cys Gly Asn Thr Asn His ser ser 85 9095 lie ser ser Leu Asn Leu Lys Gin Tyr Lys Ala ser Pro Vai Glu Asn
100 105110
Pro ser Lys Gly Vai Tyr Vai Vai Glu Phe Lys Leu Leu Asp Asp His
115 120125
Thr Gin Pro Asn Pro Asn Glu Phe Pro Gly Asp Leu Glu Vai Thr Vai
130 135140
Lys Tyr Thr Leu Asn Vai Ala Glu Met Thr Leu Asp Met Glu Tyr Gin
145 150 155160
- 25 037161
| Al a | G1 n | Leu | Vai | Arg 165 | Gly | Asp | Al a | Thr | Pro 170 | He | Asn | Met | Thr | Asn 175 | Hi s |
| ser | Tyr | Phe | Asn 180 | Leu | Asn | Lys | Vai | Lys 185 | ser | G1 U | Lys | ser | He 190 | Arg | Gly |
| Thr | G1 u | Vai 195 | Lys | Vai | cys | ser | Asn 200 | Lys | ser | Leu | G1 U | Vai 205 | Thr | G1 u | Gly |
| Al a | Leu 210 | Leu | Pro | Thr | Gly | Lys 215 | He | He | G1 u | Arg | Asn 220 | He | Al a | Thr | Phe |
| Asp 225 | ser | Thr | Lys | Pro | Thr 2 30 | Vai | Leu | Hi s | G1 u | Asp 235 | Thr | Pro | Vai | Phe | Asp 240 |
| cys | Thr | Phe | He | He 245 | Asp | Ala | Asn | Lys | Asp 250 | Leu | Lys | Thr | Thr | Asp 255 | ser |
| Vai | ser | Vai | Asn 260 | Lys | Leu | Vai | Pro | Vai 265 | Phe | Lys | Al a | Tyr | Hi s 270 | Pro | G1 u |
| ser | Hi s | He 275 | Lys | Phe | G1 u | Vai | ser 280 | Thr | Thr | G1 U | Pro | Thr 285 | Vai | Hi s | Leu |
| Tyr | Thr 290 | Gly | Asp | Asn | Leu | cys 295 | Gly | Lys | Phe | Vai | Pro 300 | Arg | ser | Gly | Phe |
| Al a 305 | Vai | G1 n | G1 n | Gly | Arg 310 | Tyr | Vai | Asp | Al a | He 315 | Asn | Arg | Asp | G1 U | T rp 320 |
| Arg | Gly | cys | Vai | Leu 325 | Leu | Lys | Arg | Gly | G1 u 330 | Vai | Tyr | Thr | ser | Lys 335 | Thr |
| G1 n | Tyr | Lys | Phe 340 | Asp | He |
| <210> <211> <212> <213> <400> Met Thr 1 | 16 334 Белок Lactococcus lact | i s | ||||||||||||
| 16 | ser | |||||||||||||
| Phe | Thr | He 5 | Lys | G1 u | ser | Leu 10 | Pro | Phe | Arg | Al a | Asp 15 | Lys | ||
| ser lie | Ser | Gin 20 | He | Thr | Leu | Ser | Asn 25 | Glu | Arg | Leu | Thr | He 30 | Vai | Vai |
| His Asp | Tyr 35 | Gly | Al a | Arg | Ala | Hi s 40 | G1 n | Leu | Leu | Thr | Pro 45 | Asp | Lys | Asn |
| Gly Thr | Phe | G1 u | Asn | He | Leu | Leu | ser | Lys | Asn | Asp | ser | G1 U | Thr | Tyr |
- 26 037161
55 60
| Al a 65 | Asn | Asp | Gly | Gly | Tyr 70 | Tyr | Gly | Val | He | cys 75 | Gly | Pro | Val | Al a | Gly 80 |
| Arg | He | ser | Gly | Al a 85 | Thr | Tyr | Asp | ser | Val 90 | ser | Leu | G1 u | Al a | Asn 95 | G1 u |
| Gly | Lys | Asn | Asn 100 | Leu | Hi s | ser | Gly | ser 105 | Hi s | Gly | T rp | G1 u | Arg 110 | G1 n | Phe |
| T rp | ser | Tyr 115 | G1 U | Thr | Phe | Glu | Thr 120 | Al a | ser | ser | Leu | Gly 12 5 | He | Lys | Leu |
| ser | Leu 130 | Arg | Asp | G1 u | G1 u | ser 135 | Gly | Phe | Pro | Gly | G1 n 140 | He | G1 П | Al a | G1 u |
| Vai 145 | Thr | Tyr | Lys | Leu | Thr 150 | Asp | Asn | Lys | Leu | G1 u 155 | Val | Thr | lie | ser | Gly 160 |
| Leu | ser | Vai | Thr | Asp 165 | Thr | Val | Phe | Asn | Pro 170 | Al a | T rp | Hi s | Pro | Tyr 175 | Phe |
| Asn | Leu | ser | Al a 180 | G1 u | Leu | ser | Thr | Thr 185 | Hi s | G1 u | Hi s | Phe | He 190 | G1 n | Al a |
| Asn | Vai | Asp 195 | Phe | Leu | Val | Glu | Thr 200 | Asn | G1 n | G1 u | Asn | He 205 | Pro | Thr | Gly |
| Arg | Leu 210 | Leu | Thr | Val | Asp | Asp 215 | ser | ser | Tyr | ser | He 220 | Lys | G1 U | ser | Val |
| ser 225 | He | Lys | Lys | Leu | Leu 2 30 | Lys | Asp | Asn | Pro | G1 u 235 | Gly | Leu | Asp | Asp | cys 240 |
| Phe | Vai | Phe | Asn | Pro 245 | Lys | Gly | Asp | Lys | ser 250 | Leu | Met | Leu | Tyr | Asp 255 | Pro |
| Leu | ser | Gly | Arg 260 | Lys | Leu | Val | Al a | G1 П 265 | Thr | Asp | Arg | G1 n | Al a 270 | Val | Val |
| He | Tyr | Thr 275 | Al a | Thr | Asn | Pro | G1 u 280 | He | G1 u | ser | Met | He 285 | Asn | Gly | Arg |
| Pro | Met 290 | ser | Lys | Asn | Arg | Gly 295 | He | Al a | He | Glu | Phe 300 | Gin | Glu | He | Pro |
| Asp 305 | Leu | Val | Hi s | Hi s | Pro 310 | Glu | T rp | Gly | Thr | He 315 | G1 u | Leu | Lys | Al a | Gly 320 |
| G1 n | Lys | Lys | Thr | Phe 325 | He | Thr | G1 U | Tyr | Leu 330 | Phe | Thr | Thr | Asn |
- 27 037161 <210> 17 <211> 442 <212> Белок <213> Eubacterium saburreum <400> 17
Met Lys Glu Phe Phe Pro Gly lie 1 5 ser Pro Vai Lys Phe Glu Gly Arg
15
Asp ser Lys Asn Pro Leu ser Phe 20
Lys Tyr Tyr Asp Ala Lys Arg Vai 25 30 lie Met Gly Lys Thr Met Glu Glu
40
His Leu ser Phe Ala Met Ala Trp 45
Trp His Asn Leu cys Ala cys Gly
55
Vai Asp Met Phe Gly Gin Gly Thr
Vai Asp Lys ser Phe Gly Glu ser 65 70 ser Gly Thr Met Glu His Ala Arg 75 80
Ala Lys Vai Asp Ala Gly lie Glu 85
Phe Met Lys Lys Leu Gly lie Lys
95
Tyr Tyr cys Phe His Asp Thr Asp
100 lie Vai Pro Glu Asp Gin Glu Asp
105 110 lie Asn Vai Thr Asn Ala Arg Leu
115 120
Asp Glu lie Thr Asp Tyr lie Leu 12 5
Glu Lys Thr Lys Asp Thr Asp lie
130 135
Lys cys Leu Trp Thr Thr cys Asn
140
Met Phe ser Asn Pro Arg Phe Met
145 150
Asn Gly Ala Gly ser ser Asn ser
155 160
Ala Asp Vai Phe cys Phe Ala Ala
165
Ala Gin Ala Lys Lys Gly Leu Glu
170 175
Asn Ala Vai Lys Leu Gly Ala Lys
180
Gly Phe Vai Phe Trp Gly Gly Arg
185 190
Glu Gly Tyr Glu Thr Leu Leu Asn
195 200
Thr Asp Met Lys Leu Glu Glu Glu 205
Asn lie Ala Thr Leu Phe Thr Met
210 215 cys Arg Asp Tyr Gly Arg ser lie 220
Gly Phe Met Gly Asp Phe Tyr lie
225 230
Glu Pro Lys Pro Lys Glu Pro Met
235 240
- 28 037161
Lys
Hi s
G1 n
Tyr
Asp 245
Phe
Asp
Al a
Al a
Thr
250
Al a
He
Gly
Phe
Leu
255
Arg
Lys
Tyr
Gly
Leu
260
Asp
Lys
Asp
Phe
Lys 265
Leu
Asn
He
G1 u
Al a 270
Asn
Hi s
Al a
Thr
Leu
275
Al a
Gly
Hi s
Thr
Phe
280
Gin
Hi s
Glu
Leu
Arg 285
Val cys
Al a
Val
Asn
290
Gly
Met
Met
Gly ser
295
Val
Asp
Al a
Asn
G1 n 300
Gly
Asp
Thr
Leu
Leu
305
Gly
T rp
Asp
Thr
Asp
310
Gin
Phe
Pro
Thr
Asn
315
Val
Tyr
Asp
Thr
Thr
320
Leu
Al a
Met
Tyr
G1 u 325
He
Leu
Lys
Al a
Gly 330
Gly
Leu
Arg
Gly
Gly 335
Leu
Asn
Phe
Asp ser
340
Lys
Asn
Arg
Arg
Pro
345 ser
Asn
Thr
Al a
Asp 350
Asp
Met
Phe
Tyr
Gly 355
Phe
He
Al a
Gly
Met
360
Asp
Thr
Phe
Al a
Leu
365
Gly
Leu
He
Lys
Al a 370
Al a
G1 u
He
He
Glu
375
Asp
Gly
Arg lie
Asp
380
Asp
Phe
Val
Lys
G1 U 385
Arg
Tyr
Al a ser
Tyr
390
Asn ser
Gly
He
Gly 395
Lys
Lys
He
Arg
Asn
400
Arg
Lys
Val
Thr
Leu
405
He
G1U cys
Al a
G1 u 410
Tyr
Al a
Al a
Lys
Leu
415
Lys
Lys
Pro
G1 U
Leu
420
Pro
G1 U ser
Gly
Arg 42 5
G1 П
G1 U
Tyr
Leu
G1 u
430 ser
Val
Val
Asn
Asn
435
He
Leu
Phe
Gly
Gly 440 ser
Gly <210>
<211>
<212>
<213>
437 Белок
Piromyces sp. E2 <400>
Met 1
Al a
Lys
G1 u
Tyr 5
Phe
Pro
G1 n
He
G1 n 10
Lys
He
Lys
Phe
G1 u 15
Gly
Lys
Asp ser
Lys 20
Asn
Pro
Leu
Al a
Phe 25
Hi s
Tyr
Tyr
Asp
Al a 30
G1 u
Lys
G1 u
Val
Met 35
Gly
Lys
Lys
Met
Lys 40
Asp
T rp
Leu
Arg
Phe 45
Al a
Met
Al a
- 29 037161
Trp Trp His Thr Leu cys Ala Glu Gly Ala Asp Gin Phe Gly Gly Gly 50 5560
Thr Lys ser Phe Pro Trp Asn Glu Gly Thr Asp Ala lie Glu lie Ala 65 70 7580
Lys Gin Lys Vai Asp Ala Gly Phe Glu lie Met Gin Lys Leu Gly lie 85 9095
Pro Tyr Tyr cys Phe His Asp Vai Asp Leu Vai ser Glu Gly Asn ser
100 105110 lie Glu Glu Tyr Glu ser Asn Leu Lys Ala Vai Vai Ala Tyr Leu Lys
115 120125
Glu Lys Gin Lys Glu Thr Gly lie Lys Leu Leu Trp ser Thr Ala Asn
130 135140
Vai Phe Gly His Lys Arg Tyr Met Asn Gly Ala ser Thr Asn Pro Asp
145 150 155160
Phe Asp Vai Vai Ala Arg Ala lie Vai Gin lie Lys Asn Ala lie Asp
165 170175
Ala Gly lie Glu Leu Gly Ala Glu Asn Tyr Vai Phe Trp Gly Gly Arg
180 185190
Glu Gly Tyr Met ser Leu Leu Asn Thr Asp Gin Lys Arg Glu Lys Glu
195 200205
His Met Ala Thr Met Leu Thr Met Ala Arg Asp Tyr Ala Arg ser Lys
210 215220
Gly Phe Lys Gly Thr Phe Leu lie Glu Pro Lys Pro Met Glu Pro Thr
225 230 235240
Lys His Gin Tyr Asp Vai Asp Thr Glu Thr Ala lie Gly Phe Leu Lys
245 250255
Ala His Asn Leu Asp Lys Asp Phe Lys Vai Asn lie Glu Vai Asn His
260 265270
Ala Thr Leu Ala Gly His Thr Phe Glu His Glu Leu Ala cys Ala Vai
275 280285
Asp Ala Gly Met Leu Gly ser lie Asp Ala Asn Arg Gly Asp Tyr Gin
290 295300
Asn Gly Trp Asp Thr Asp Gin Phe Pro lie Asp Gin Tyr Glu Leu Vai 305 310 315320
- 30 037161
Gin Ala Trp Met Glu lie lie Arg
325
Gly Gly Gly Phe Val Thr Gly Gly
330 335
Thr Asn Phe Asp Ala Lys Thr Arg
340
Arg Asn ser Thr Asp Leu Glu Asp 345 350 lie lie lie Ala His Val ser Gly
355 360
Met Asp Ala Met Ala Arg Ala Leu 365
Glu Asn Ala Ala Lys Leu Leu Gin
370 375
Glu ser Pro Tyr Thr Lys Met Lys
380
Lys Glu Arg Tyr Ala ser Phe Asp
385 390 ser Gly lie Gly Lys Asp Phe Glu
395 400
Asp Gly Lys Leu Thr Leu Glu Gin
405
Val Tyr Glu Tyr Gly Lys Lys Asn
410 415
Gly Glu Pro Lys Gin Thr ser Gly
420
Lys Gin Glu Leu Tyr Glu Ala lie 425 430
Val Ala Met Tyr Gin
435 <210> 19 <211> 437 <212> Белок <213> Orpinomyces sp. PC-2 <400> 19
Met Thr Lys Glu Tyr Phe Pro Thr 1 5 lie Gly Lys lie Arg Phe Glu Gly
15
Lys Asp ser Lys Asn Pro Met Ala 20
Phe His Tyr Tyr Asp Ala Glu Lys 25 30
Glu Val Met Gly Lys Lys Met Lys
40
Asp Trp Leu Arg Phe Ala Met Ala 45
Trp Trp His Thr Leu cys Ala Asp
55
Gly Ala Asp Gin Phe Gly Val Gly 60
Thr Lys ser Phe Pro Trp Asn Glu 65 70
Gly Thr Asp Pro lie Ala lie Ala 75 80
Lys Gin Lys Val Asp Ala Gly Phe 85
Glu lie Met Thr Lys Leu Gly lie
95
Glu His Tyr cys Phe His Asp Val
100
Asp Leu Val ser Glu Gly Asn ser
105 110 lie Glu Glu Tyr Glu ser Asn Leu
Lys Gin Val Val Ala Tyr Leu Lys
- 31 037161
115
120
5
G1 η
Lys
130
G1 η
G1 η
G1 u
Thr
Gly
135 lie
Lys
Leu
Leu
T rp 140 ser
Thr
Al a
Asn
Vai
145
Phe
Gly
Asn
Pro
Arg
150
Tyr
Met
Asn
Gly
Al a 155 ser
Thr
Asn
Pro
Asp
160
Phe
Asp
Vai
Vai
Al a 165
Arg
Ala
He
Vai
G1 n 170
He
Lys
Asn
Al a
Met
175
Asp
Al a
Gly
He
G1 u 180
Leu
Gly
Ala
G1 u
Asn
185
Tyr
Vai
Phe
T rp
Gly 190
Gly
Arg
G1 u
Gly
Tyr 195
Met ser
Leu
Leu
Asn
200
Thr
Asp
G1 n
Lys
Arg 205
G1 u
Lys
G1 U
Hi s
Met
210
Al a
Thr
Met
Leu
Thr
215
Met
Al a
Arg
Asp
Tyr 220
Al a
Arg ser
Lys
Gly
225
Phe
Lys
Gly
Thr
Phe 2 30
Leu
He
G1 U
Pro
Lys 235
Pro
Met
G1 U
Pro
Thr
240
Lys
Hi s
G1 n
Tyr
Asp 245
Vai
Asp
Thr
G1 u
Thr
250
Vai
He
Gly
Phe
Leu
255
Arg
Al a
Hi s
Asn
Leu
260
Asp
Lys
Asp
Phe
Lys 265
Vai
Asn
He
Glu
Vai
270
Asn
Hi s
Al a
Thr
Leu
275
Al a
Gly
Hi s
Thr
Phe
280
G1 u
Hi s
G1 u
Leu
Al a 285 cys
Al a
Vai
Asp
Al a 290
Gly
Met
Leu
Gly ser
295 lie
Asp
Al a
Asn
Arg
300
Gly
Asp
Tyr
G1 n
Asn
305
Gly
Trp
Asp
Thr
Asp 310
Gin
Phe
Pro
He
Asp 315
G1 П
Tyr
G1 U
Leu
Vai
320
G1 n
Al a
Trp
Met
G1 u 325 lie
He
Arg
Gly
Gly 330
Gly
Phe
Vai
Thr
Gly 335
Gly
Thr
Asn
Phe
Asp
340
Al a
Lys
Thr
Arg
Arg 345
Asn ser
Thr
Asp
Leu
350
G1 u
Asp
He
He
He
355
Al a
Hi s lie ser
Gly 360
Met
Asp
Al a
Met
Al a 365
Arg
Al a
Leu
G1 u
Asn
370
Al a
Al a
Lys
Leu
Leu
375
G1 n
G1 u ser
Pro
Tyr
380 cys
Asn
Met
Lys
Lys 385
G1 U
Arg
Tyr
Al a ser
390
Phe
Asp ser
Gly
He
395
Gly
Lys
Asp
Phe
G1 u 400
- 32 037161
Asp Gly Lys Leu Thr Leu Glu Gin Vai Tyr Glu Tyr Gly Lys Lys Asn
405 410 415
Gly Glu Pro Lys Vai Thr ser Gly Lys Gin Glu Leu Tyr Glu Ala lie
420 425 430
Vai Ala Met Tyr Gin
435 <210> 20 <211> 438 <212> Белок <213> clostrium phytofermentans <400> 20
Met Lys Asn Tyr Phe Pro Asn Vai 1 5
Pro Glu Vai Lys Tyr Glu Gly Pro
15
Asn ser Thr Asn Pro Phe Ala Phe
Lys Tyr Tyr Asp Ala Glu Arg lie 25 30
Vai Ala Gly Lys Thr Met Lys Glu
40
His cys Arg Phe Ala Leu ser Trp 45
Trp His Thr Leu cys Ala Gly Gly
55
Ala Asp Pro Phe Gly Vai Thr Thr 60
Met Asp Arg ser Tyr Gly Asn lie 65 70
Thr Asp Pro Met Glu Phe Ala Lys 75 80
Ala Lys Vai Asp Ala Gly Phe Glu 85
Leu Met Thr Lys Leu Gly lie Glu
95
Tyr Phe cys Phe His Asp Ala Asp
100 lie Ala Pro Glu Gly Glu Asn Phe
105 110
Glu Glu ser Lys Lys Asn Leu Phe
115 120
Vai lie Vai Asp Tyr lie Lys Glu 12 5
Lys Met Asp Gin Thr Gly lie Lys
130 135
Leu Leu Trp Gly Thr Ala Asn Asn
140
Phe Gly His Pro Arg Phe Met His
145 150
Gly Ala ser Thr ser cys Asn Ala
155 160
Asp Vai Phe Ala Tyr Ala Ala Ala
165
Lys lie Lys Asn Ala Leu Asp Ala
170 175
Thr lie Lys Leu Gly Gly Lys Gly
180
Tyr Vai Phe Trp Gly Gly Arg Glu
185 190
- 33 037161
| Gly | Tyr | G1 u 195 | Thr | Leu | Leu | Asn | Thr 200 | Asp | Leu | Gly | Leu | G1 u 205 | Leu | Asp | Asn |
| Met | Al a 210 | Arg | Leu | Met | Lys | Met 215 | Al a | Val | G1 u | Tyr | Gly 220 | Arg | Al a | Asn | Gly |
| Phe 225 | Asp | Gly | Asp | Phe | Tyr 2 30 | He | G1 u | Pro | Lys | Pro 235 | Lys | G1 u | Pro | Thr | Lys 240 |
| Hi s | G1 n | Tyr | Asp | Phe 245 | Asp | Thr | Al a | Thr | Val 250 | Leu | Gly | Phe | Leu | Arg 255 | Lys |
| Tyr | Gly | Leu | G1 u 260 | Lys | Asp | Phe | Lys | Met 265 | Asn | He | G1 U | Al a | Asn 270 | Hi s | Al a |
| Thr | Leu | Al a 275 | Gly | Hi s | Thr | Phe | G1 U 280 | Hi s | G1 U | Leu | Al a | Leu 285 | Al a | Arg | Val |
| Asn | Gly 290 | Val | Phe | Gly | ser | Val 295 | Asp | Al a | Asn | G1 n | Gly 300 | Asp | Pro | Asn | Leu |
| Gly 305 | T rp | Asp | Thr | Asp | G1 n 310 | Phe | Pro | Thr | Asp | Val 315 | Hi s | ser | Al a | Thr | Leu 320 |
| Al a | Met | Leu | G1 u | Val 325 | Leu | Lys | Al a | Gly | Gly 330 | Phe | Thr | Asn | Gly | Gly 335 | Leu |
| Asn | Phe | Asp | Al a 340 | Lys | Val | Arg | Arg | Gly 345 | ser | Phe | G1 u | Phe | Asp 350 | Asp | He |
| Al a | Tyr | Gly 355 | Tyr | He | Al a | Gly | Met 360 | Asp | Thr | Phe | Al a | Leu 365 | Gly | Leu | He |
| Lys | Al a 370 | Al a | G1 U | He | He | Glu 375 | Asp | Gly | Arg | He | Al a 380 | Lys | Phe | Val | G1 U |
| Asp 385 | Arg | Tyr | Al a | ser | Tyr 390 | Lys | Thr | Gly | He | Gly 395 | Lys | Al a | He | Val | Asp 400 |
| Gly | Thr | Thr | ser | Leu 405 | G1 u | Glu | Leu | G1 U | G1 П 410 | Tyr | Val | Leu | Thr | Hi s 415 | Asn |
| G1 U | Pro | Val | Met 420 | G1 n | ser | Gly | Arg | G1 П 42 5 | G1 u | Val | Leu | G1 u | ser 430 | He | Val |
Asn Asn lie Leu Phe Arg 435 <210> 21 <211> 438 <212> Белок <213> Rumi nococcus flavefaciens
- 34 037161 <400> 21
| Met 1 | G1 U | Phe | Phe | ser 5 | Asn | He | Gly | Lys | He 10 | G1 n | Tyr | G1 n | Gly | Pro 15 | Lys |
| ser | Thr | Asp | Pro 20 | Leu | ser | Phe | Lys | Tyr 25 | Tyr | Asn | Pro | G1 u | G1 u 30 | Vai | He |
| Asn | Gly | Lys 35 | Thr | Met | Arg | Glu | Hi s 40 | Leu | Lys | Phe | Al a | Leu 45 | ser | T rp | T rp |
| Hi s | Thr 50 | Met | Gly | Gly | Asp | Gly 55 | Thr | Asp | Met | Phe | Gly 60 | cys | Gly | Thr | Thr |
| Asp 65 | Lys | Thr | T rp | Gly | G1 n 70 | ser | Asp | Pro | Al a | Al a 75 | Arg | Al a | Lys | Al a | Lys 80 |
| Vai | Asp | Al a | Al a | Phe 85 | G1 U | He | Met | Asp | Lys 90 | Leu | ser | He | Asp | Tyr 95 | Tyr |
| cys | Phe | Hi s | Asp 100 | Arg | Asp | Leu | ser | Pro 105 | G1 u | Tyr | Gly | ser | Leu 110 | Lys | Al a |
| Thr | Asn | Asp 115 | G1 n | Leu | Asp | He | Vai 120 | Thr | Asp | Tyr | He | Lys 12 5 | G1 u | Lys | G1 n |
| Gly | Asp 130 | Lys | Phe | Lys | cys | Leu 135 | T rp | Gly | Thr | Al a | Lys 140 | cys | Phe | Asp | Hi s |
| Pro 145 | Arg | Phe | Met | Hi s | Gly 150 | Ala | Gly | Thr | ser | Pro 155 | ser | Al a | Asp | Vai | Phe 160 |
| Al a | Phe | ser | Al a | Al a 165 | G1 n | He | Lys | Lys | Al a 170 | Leu | G1 u | ser | Thr | Vai 175 | Lys |
| Leu | Gly | Gly | Asn 180 | Gly | Tyr | Vai | Phe | T rp 185 | Gly | Gly | Arg | G1 u | Gly 190 | Tyr | G1 U |
| Thr | Leu | Leu 195 | Asn | Thr | Asn | Met | Gly 200 | Leu | G1 u | Leu | Asp | Asn 205 | Met | Al a | Arg |
| Leu | Met 210 | Lys | Met | Al a | Vai | Glu 215 | Tyr | Gly | Arg | ser | He 220 | Gly | Phe | Lys | Gly |
| Asp 225 | Phe | Tyr | He | G1 u | Pro 2 30 | Lys | Pro | Lys | G1 u | Pro 235 | Thr | Lys | Hi s | G1 П | Tyr 240 |
| Asp | Phe | Asp | Thr | Al a 245 | Thr | Vai | Leu | Gly | Phe 250 | Leu | Arg | Lys | Tyr | Gly 255 | Leu |
| Asp | Lys | Asp | Phe 260 | Lys | Met | Asn | He | G1 U 265 | Al a | Asn | Hi s | Al a | Thr 270 | Leu | Al a |
- 35 037161
Gln His Thr Phe Gln His Glu Leu
275 280
Arg Val Ala Arg Asp Asn Gly Val 285
Phe Gly ser Ile Asp Ala Asn Gln
290 295
Gly Asp Val Leu Leu Gly Trp Asp
300
Thr Asp Gln Phe Pro Thr Asn Ile 305 310
Tyr Asp Thr Thr Met cys Met Tyr
315 320
Glu Val Ile Lys Ala Gly Gly Phe
325
Thr Asn Gly Gly Leu Asn Phe Asp
330 335
Ala Lys Ala Arg Arg Gly ser Phe
340
Thr Pro Glu Asp Ile Phe Tyr ser 345 350
Tyr Ile Ala Gly Met Asp Ala Phe
355 360
Ala Leu Gly Phe Arg Ala Ala Leu 365
Lys Leu Ile Glu Asp Gly Arg Ile
370 375
Asp Lys Phe Val Ala Asp Arg Tyr
380
Ala ser Trp Asn Thr Gly Ile Gly
385 390
Ala Asp Ile Ile Ala Gly Lys Ala
395 400
Asp Phe Ala ser Leu Glu Lys Tyr
405
Ala Leu Glu Lys Gly Glu Val Thr
410 415
Ala ser Leu ser ser Gly Arg Gln
420
Glu Met Leu Glu ser Ile Val Asn
425 430
Asn Val Leu Phe ser Leu
435 <210> 22 <211> 438 <212> Белок <213> Bacteroides uniformis <400> 22
Met Ala Thr Lys Glu Tyr Phe Pro 1 5
Gly lie Gly Lys Ile Lys Phe Glu
15
Gly Lys Glu ser Lys Asn Pro Met 20
Ala Phe Arg Tyr Tyr Asp Ala Asp 25 30
Lys Val Ile Met Gly Lys Lys Met
40 ser Glu Trp Leu Lys Phe Ala Met 45
Ala Trp Trp His Thr Leu cys Ala
55
Glu Gly Gly Asp Gln Phe Gly Gly 60
Gly Thr Lys Lys Phe Pro Trp Asn
Gly Glu Ala Asp Lys Val Gln Ala
- 36 037161
70 75 80
| Al a | Lys | Asn | Lys | Met 85 | Asp | Ala | Gly | Phe | G1 u 90 | Phe | Met | G1 n | Lys | Met 95 | Gly |
| He | G1 U | Tyr | Tyr 100 | cys | Phe | His | Asp | Val 105 | Asp | Leu | cys | G1 U | G1 U 110 | Al a | G1 u |
| Thr | He | Glu 115 | Glu | Tyr | Glu | Ala | Asn 120 | Leu | Lys | Glu | He | Val 12 5 | Al a | Tyr | Al a |
| Lys | G1 n 130 | Lys | G1 n | Al a | G1 u | Thr 135 | Gly | He | Lys | Leu | Leu 140 | T rp | Gly | Thr | Al a |
| Asn 145 | Val | Phe | Gly | Hi s | Al a 150 | Arg | Tyr | Met | Asn | Gly 155 | Al a | Al a | Thr | Asn | Pro 160 |
| Asp | Phe | Asp | Val | Val 165 | Al a | Arg | Al a | Al a | He 170 | G1 n | He | Lys | Asn | Al a 175 | He |
| Asp | Al a | Thr | He 180 | G1 u | Leu | Gly | Gly | ser 185 | Asn | Tyr | Val | Phe | T rp 190 | Gly | Gly |
| Arg | G1 u | Gly 195 | Tyr | Met | ser | Leu | Leu 200 | Asn | Thr | Asp | G1 n | Lys 205 | Arg | G1 u | Lys |
| G1 u | Hi s 210 | Leu | Al a | G1 П | Met | Leu 215 | Thr | He | Al a | Arg | Asp 220 | Tyr | Al a | Arg | Al a |
| Arg 225 | Gly | Phe | Lys | Gly | Thr 2 30 | Phe | Leu | He | G1 u | Pro 235 | Lys | Pro | Met | G1 u | Pro 240 |
| Thr | Lys | Hi s | G1 П | Tyr 245 | Asp | Val | Asp | Thr | G1 u 250 | Thr | Val | He | Gly | Phe 255 | Leu |
| Lys | Al a | Hi s | Asn 260 | Leu | Asp | Lys | Asp | Phe 265 | Lys | Val | Asn | He | G1 U 270 | Val | Asn |
| Hi s | Al a | Thr 275 | Leu | Al a | Gly | His | Thr 280 | Phe | Glu | Hi s | Glu | Leu 285 | Al a | Val | Al a |
| val | Asp 290 | Asn | Gly | Met | Leu | Gly 295 | ser | He | Asp | Al a | Asn 300 | Arg | Gly | Asp | Tyr |
| G1 n 305 | Asn | Gly | T rp | Asp | Thr 310 | Asp | G1 n | Phe | Pro | He 315 | Asp | Asn | Phe | G1 u | Leu 320 |
| Thr | G1 n | Al a | Met | Met 325 | G1 n | He | He | Arg | Asn 330 | Gly | Gly | Phe | Gly | Asn 335 | Gly |
| Gly | Thr | Asn | Phe 340 | Asp | Al a | Lys | Thr | Arg 345 | Arg | Asn | ser | Thr | Asp 350 | Leu | G1 u |
- 37 037161
Asp lie Phe lie Ala His lie Ala Gly Met Asp Vai Met Ala Arg Ala
355 360365
Leu Glu ser Ala Ala Lys Leu Leu Glu Glu ser Pro Tyr Lys Lys Met
370 375380
Leu Ala Asp Arg Tyr Ala ser Phe Asp ser Gly Lys Gly Lys Glu Phe
385 390 395400
Glu Asp Gly Lys Leu Thr Leu Glu Asp Leu Vai Ala Tyr Ala Lys Ala
405 410415
Asn Gly Glu Pro Lys Gin Thr ser Gly Lys Gin Glu Leu Tyr Glu Ala
420 425430 lie Vai Asn Met Tyr cys 435 <210> 23 <211> 439 <212> Белок <213> Clostridium cellulolyticum <400> 23
Met ser Glu Vai Phe ser Gly lie 1 5 ser Asn lie Lys Phe Glu Gly ser
15
Gly ser Asp Asn Pro Leu Ala Phe 20
Lys Tyr Tyr Asp Pro Lys Ala Vai 25 30 lie Gly Gly Lys Thr Met Glu Glu
40
His Leu Arg Phe Ala Vai Ala Tyr 45
Trp His Thr Phe Ala Ala Pro Gly
55
Ala Asp Met Phe Gly Ala Gly ser 60
Tyr Vai Arg Pro Trp Asn Thr Met 65 70 ser Asp Pro Leu Glu lie Ala Lys
80
Tyr Lys Vai Glu Ala Asn Phe Glu 85
Phe lie Glu Lys Leu Gly Ala Pro
95
Phe Phe Ala Phe His Asp Arg Asp
100 lie Ala Pro Glu Gly Asp Thr Leu
105 110
Ala Glu Thr Asn Lys Asn Leu Asp
115 120
Thr lie Vai ser Vai lie Lys Asp 12 5
Arg Met Lys ser ser Pro Vai Lys
130 135
Leu Leu Trp Gly Thr Thr Asn Ala
140
- 38 037161
Phe
145
Gly
Asn
Pro
Arg
Phe
150
Met
Hi s
Gly
Al a ser
155
Thr ser
Pro
Asn
Al a 160
Asp
He
Phe
Al a
Tyr 165
Al a
Ala
Al a
G1 n
Val
170
Lys
Lys
Al a
Met
G1 u 175
He
Thr
Lys
G1 u
Leu
180
Gly
Gly
Glu
Asn
Tyr 185
Val
Phe
T rp
Gly
Gly 190
Arg
G1 u
Gly
Tyr
G1 u 195
Thr
Leu
Leu
Asn
Thr
200
Asp
Met
Lys
Leu
G1 u 205
Leu
Asp
Asn
Leu
Al a 210
Arg
Phe
Leu
Lys
Met
215
Al a
Val
Asp
Tyr
Al a 220
Lys
G1 u
He
Gly
Phe
225
Asp
Gly
G1 П
Phe
Leu 2 30
He
G1 U
Pro
Lys
Pro
235
Lys
G1 U
Pro
Thr
Lys 240
Hi s
G1 n
Tyr
Asp
Phe
245
Asp
Thr
Al a
Thr
Val
250
He
Gly
Phe
Leu
Lys 255
Thr
Tyr
Gly
Leu
Asp 260
Pro
Tyr
Phe
Lys
Met
265
Asn
He
G1 U
Al a
Asn
270
Hi s
Al a
Thr
Leu
Al a 275
Gly
Hi s
Thr
Phe
G1 n 280
Hi s
G1 u
Leu
Al a
Met
285 cys
Arg
He
Asn
Asp 290
Met
Leu
Gly ser
He
295
Asp
Al a
Asn
G1 n
Gly 300
Asp
Val
Met
Leu
Gly 305
T rp
Asp
Thr
Asp
G1 n 310
Phe
Pro
Thr
Asn
Leu
315
Tyr
Asp
Al a
Thr
Leu
320
Al a
Met
Val
G1 u
Val
325
Leu
Lys
Al a
Gly
Gly 330
Leu
Lys
Lys
Gly
Gly 335
Leu
Asn
Phe
Asp ser
340
Lys
Val
Arg
Arg
Gly 345 ser
Phe
Glu
Pro ser
350
Asp
Leu
Phe
Tyr
Gly 355
Hi s
He
Al a
Gly
Met
360
Asp
Thr
Phe
Al a
Lys 365
Gly
Leu
He
He
Al a 370
Asn
Lys
He
Val
Glu
375
Asp
Gly
Lys
Phe
Asp
380
Al a
Phe
Val
Al a
Asp 385
Arg
Tyr ser ser
Tyr
390
Thr
Asn
Gly
He
Gly 395
Lys
Asp
He
Val
G1 u 400
Gly
Lys
Val
Gly
Phe
405
Lys
Glu
Leu
G1 u
G1 n 410
Tyr
Al a
Leu
Thr
Al a 415
Lys
He
G1 П
Asn
Lys ser
Gly
Arg
G1 П
G1 U
Met
Leu
G1 U
Al a
Leu
Leu
Asn
- 39 037161
420
425 430
Gin Tyr lie Leu Glu Thr Lys
435 <210> 24 <211> 444 <212> Белок <213> Thermotoga maritima <400> 24
Met Ala Glu Phe Phe Pro Glu lie
5
Pro Lys lie Gin Phe Glu Gly Lys
15
Glu ser Thr Asn Pro Leu Ala Phe
Arg Phe Tyr Asp Pro Asn Glu Vai 25 30 lie Asp Gly Lys Pro Leu Lys Asp
40
His Leu Lys Phe ser Vai Ala Phe 45
Trp His Thr Phe Vai Asn Glu Gly
55
Arg Asp Pro Phe Gly Asp Pro Thr 60
Ala Glu Arg Pro Trp Asn Arg Phe 65 70 ser Asp Pro Met Asp Lys Ala Phe 75 80
Ala Arg Vai Asp Ala Leu Phe Glu 85
Phe cys Glu Lys Leu Asn lie Glu
95
Tyr Phe cys Phe His Asp Arg Asp
100 lie Ala Pro Glu Gly Lys Thr Leu
105 110
Arg Glu Thr Asn Lys lie Leu Asp
115 120
Lys Vai Vai Glu Arg lie Lys Glu 12 5
Arg Met Lys Asp ser Asn Vai Lys
130 135
Leu Leu Trp Gly Thr Ala Asn Leu
140
Phe ser His Pro Arg Tyr Met His
145 150
Gly Ala Ala Thr Thr cys ser Ala
155 160
Asp Vai Phe Ala Tyr Ala Ala Ala
165
Gin Vai Lys Lys Ala Leu Glu lie
170 175
Thr Lys Glu Leu Gly Gly Glu Gly
180
Tyr Vai Phe Trp Gly Gly Arg Glu 185 190
Gly Tyr Glu Thr Leu Leu Asn Thr
195 200
Asp Leu Gly Leu Glu Leu Glu Asn 205
Leu Ala Arg Phe Leu Arg Met Ala
210 215
Vai Glu Tyr Ala Lys Lys lie Gly
220
- 40 037161
| Phe Thr Gly 225 | G1 n | Phe | Leu 2 30 | He | G1 u | Pro | Lys | Pro 235 | Lys G1u | Pro Thr | Lys 240 | ||||
| Hi s | G1 n | Tyr | Asp | Phe 245 | Asp | Vai | Al a | Thr | Al a 250 | Tyr | Al a | Phe | Leu | Lys 255 | Asn |
| Hi s | Gly | Leu | Asp 260 | G1 u | Tyr | Phe | Lys | Phe 265 | Asn | He | G1 u | Al a | Asn 270 | Hi s | Al a |
| Thr | Leu | Al a 275 | Gly | Hi s | Thr | Phe | G1 П 280 | Hi s | G1 U | Leu | Arg | Met 285 | Al a | Arg | He |
| Leu | Gly 290 | Lys | Leu | Gly | ser | He 295 | Asp | Al a | Asn | G1 n | Gly 300 | Asp | Leu | Leu | Leu |
| Gly 305 | T rp | Asp | Thr | Asp | G1 n 310 | Phe | Pro | Thr | Asn | He 315 | Tyr | Asp | Thr | Thr | Leu 320 |
| Al a | Met | Tyr | G1 u | Vai 325 | He | Lys | Al a | Gly | Gly 330 | Phe | Thr | Lys | Gly | Gly 335 | Leu |
| Asn | Phe | Asp | Al a 340 | Lys | Vai | Arg | Arg | Al a 345 | ser | Tyr | Lys | Vai | G1 u 350 | Asp | Leu |
| Phe | He | Gly 355 | Hi s | He | Al a | Gly | Met 360 | Asp | Thr | Phe | Al a | Leu 365 | Gly | Phe | Lys |
| He | Al a 370 | Tyr | Lys | Leu | Al a | Lys 375 | Asp | Gly | Vai | Phe | Asp 380 | Lys | Phe | He | G1 U |
| G1 u 385 | Lys | Tyr | Arg | ser | Phe 390 | Lys | G1 U | Gly | He | Gly 395 | Lys | G1 U | He | Vai | G1 U 400 |
| Gly | Lys | Thr | Asp | Phe 405 | G1 u | Lys | Leu | G1 U | G1 U 410 | Tyr | He | lie | Asp | Lys 415 | G1 U |
| Asp lie Asn ser <210> : <211> <212> 1 <213> 1 <400> : | Glu Leu 420 Tyr lie 435 25 441 Белок Bacillus 25 | Pro ser Gly Lys Gin 42 5 Vai Lys Thr lie Ala 440 stearothermophilus | G1 u G1 U | Tyr Leu | Leu Arg | G1 u | ser 430 | Leu | Leu | ||||||
| Met 1 | Pro | Tyr | Phe | Asp 5 | Asn | He | ser | Thr | He 10 | Al a | Tyr | G1 u | Gly | Pro 15 | Al a |
| ser | Lys | Asn | Pro | Leu | Al a | Phe | Lys | Phe | Tyr | Asn | Pro | G1 U | G1 u | Lys | Vai |
- 41 037161
25 30
Gly
Asp
Lys 35
Thr
Met
G1 u
Glu
Hi s 40
Leu
Arg
Phe ser
Val 45
Al a
Tyr
T rp
Hi s
Thr 50
Phe
Thr
Gly
Asp
Gly 55 ser
Asp
Pro
Phe
Gly 60
Al a
Gly
Asn
Met
He
Arg
Pro
T rp
Asn
Lys 70
Tyr ser
Gly
Met
Asp 75
Leu
Al a
Lys
Al a
Arg 80
Val
G1 u
Al a
Al a
Phe 85
G1 u
Phe
Phe
G1 u
Lys 90
Leu
Asn
He
Pro
Phe 95
Phe cys
Phe
Hi s
Asp
100
Val
Asp
He
Al a
Pro
105
G1 u
Gly
G1 U
Thr
Leu
110
Lys
G1 u
Thr
Tyr
Lys 115
Asn
Leu
Asp
He
He
120
Val
Asp
Met
He
G1 u
5
G1 U
Tyr
Met
Lys
Thr
130 ser
Lys
Thr
Lys
Leu
135
Leu
T rp
Asn
Thr
Al a 140
Asn
Leu
Phe
Thr
Hi s 145
Pro
Arg
Phe
Val
Hi s 150
Gly
Al a
Al a
Thr ser
155 cys
Asn
Al a
Asp
Val
160
Phe
Al a
Tyr
Al a
Al a 165
Al a
Lys
Val
Lys
Lys 170
Gly
Leu
G1 u
He
Al a 175
Lys
Arg
Leu
Gly
Al a 180
G1 U
Asn
Tyr
Val
Phe
185
T rp
Gly
Gly
Arg
G1 u 190
Gly
Tyr
G1 U
Thr
Leu
195
Leu
Asn
Thr
Asp
Met
200
Lys
Leu
G1 u
Leu
Asp 205
Asn
Leu
Al a
Arg
Phe
210
Leu
Hi s
Met
Al a
Val
215
Asp
Tyr
Al a
Lys
G1 u 220
He
Gly
Phe
Asp
Gly
225
G1 n
Phe
Leu
He
G1 u
30
Pro
Lys
Pro
Lys
G1 u 235
Pro
Thr
Lys
Hi s
G1 n 240
Tyr
Asp
Phe
Asp
Val
245
Al a
Thr
Al a
Leu
Al a 250
Phe
Leu
G1 n
Thr
Tyr
255
Gly
Leu
Lys
Asp
Tyr
260
Phe
Lys
Phe
Asn lie
265
G1 u
Al a
Asn
Hi s
Al a 270
Thr
Leu
Al a
Gly
Hi s
275
Thr
Phe
G1 u
His
G1 u 280
Leu
Arg
Val
Al a
Arg 285
He
Hi s
Gly
Met
Leu
290
Gly ser
Val
Asp
Ala 295
Asn
G1 n
Gly
Asp
Met
300
Leu
Leu
Gly
T rp
- 42 037161
Asp Thr Asp Glu Phe Pro Thr Asp
305 310
Leu Tyr ser Thr Thr Leu Ala Met
315 320
Tyr Glu Ile Leu Lys Asn Gly Gly
325
Leu Gly Arg Gly Gly Leu Asn Phe
330 335
Asp Ala Lys Val Arg Arg Gly ser
340
Phe Glu Pro Glu Asp Leu Phe Tyr
345 350
Ala His Ile Ala Gly Met Asp ser
355 360
Phe Ala Val Gly Leu Lys Val Ala
365
His Arg Leu Ile Glu Asp Arg Val
370 375
Phe Asp Glu Phe Ile Glu Glu Arg
380
Tyr Lys ser Tyr Thr Glu Gly Ile
385 390
Gly Arg Glu Ile Val Glu Gly Thr
395 400
Ala Asp Phe His Lys Leu Glu Ala
405
His Ala Leu Gln Leu Gly Glu Ile
410 415
Gln Asn Gln ser Gly Arg Gln Glu
420
Arg Leu Lys Thr Leu Leu Asn Gln
425 430
Tyr Leu Leu Glu Val cys Ala Ala
435 440 <210> 26 <211> 438 <212> Белок <213> Bacteroides stercoris <400> 26
Met Ala Thr Lys Glu Tyr Phe Pro 1 5
Arg
Gly Ile Gly Lys Ile Lys Phe Glu
15
Gly Lys Glu ser Lys Asn Pro Met 20
Ala Phe Arg Tyr Tyr Asp Ala Glu 25 30
Lys Val Ile Met Gly Lys Lys Met
40
Lys Asp Trp Leu Lys Phe ser Met 45
Ala Trp Trp His Thr Leu cys Ala
55
Glu Gly Gly Asp Gln Phe Gly Gly 60
Gly Thr Lys His Phe Pro Trp Asn 65 70
Gly Asp Ala Asp Lys Leu Gln Ala 75 80
Ala Lys Asn Lys Met Asp Ala Gly 85
Phe Glu Phe Met Gln Lys Met Gly
95
- 43 037161
| lie Glu Tyr Tyr | cys | Phe | His | Asp Val 105 | Asp | Leu | cys | Asp Glu 110 | Al a | Asp | |||||
| 100 | |||||||||||||||
| Thr | He | G1 U | G1 u | Tyr | G1 u | Ala | Asn | Leu | Lys | Al a | He | Val | Al a | Tyr | Al a |
| Lys | G1 n | 115 Lys | G1 n | G1 U | G1 u | Thr | 120 Gly | He | Lys | Leu | Leu | 12 5 T rp | Gly | Thr | Al a |
| Asn | 130 Val | Phe | Gly | Hi s | Al a | 135 Arg | Tyr | Met | Asn | Gly | 140 Al a | Al a | Thr | Asn | Pro |
| 145 Asp | Phe | Asp | Val | Val | 150 Al a | Arg | Al a | Al a | Val | 155 G1 n | He | Lys | Asn | Al a | 160 He |
| Asp | Al a | Thr | He | 165 G1 u | Leu | Gly | Gly | ser | 170 Asn | Tyr | Val | Phe | T rp | 175 Gly | Gly |
| Arg | G1 u | Gly | 180 Tyr | Met | ser | Leu | Leu | 185 Asn | Thr | Asp | G1 n | Lys | 190 Arg | G1 u | Lys |
| G1 u | Hi s | 195 Leu | Al a | G1 n | Met | Leu | 200 Thr | He | Al a | Arg | Asp | 205 Tyr | Al a | Arg | Al a |
| Arg | 210 Gly | Phe | Lys | Gly | Thr | 215 Phe | Leu | He | G1 u | Pro | 220 Lys | Pro | Met | G1 u | Pro |
| 225 Thr | Lys | Hi s | G1 n | Tyr | 2 30 Asp | Ala | Asp | Thr | G1 u | 235 Thr | Val | Val | Gly | Phe | 240 Leu |
| Lys | Al a | Hi s | Gly | 245 Leu | Asp | Lys | Asp | Phe | 250 Lys | Val | Asn | He | G1 U | 255 Val | Asn |
| Hi s | Al a | Thr | 260 Leu | Al a | Gly | His | Thr | 265 Phe | G1 U | Hi s | G1 u | Leu | 270 Al a | Val | Al a |
| Val | Asp | 275 Asn | Gly | Met | Leu | Gly | 280 ser | He | Asp | Al a | Asn | 285 Arg | Gly | Asp | Tyr |
| G1 n | 290 Asn | Gly | T rp | Asp | Thr | 295 Asp | G1 n | Phe | Pro | He | 300 Asp | Asn | Tyr | G1 u | Leu |
| 305 Thr | G1 n | Al a | Met | Met | 310 G1 n | He | He | Arg | Asn | 315 Gly | Gly | Phe | Gly | Asp | 320 Gly |
| Gly | Thr | Asn | Phe | 325 Asp | Al a | Lys | Thr | Arg | 330 Arg | Asn | ser | Thr | Asp | 335 Leu | G1 u |
| Asp | He | Phe | 340 He | Al a | Hi s | lie | Al a | 345 Gly | Met | Asp | Val | Met | 350 Al a | Arg | Al a |
| Leu | G1 U | 355 ser | Al a | Al a | Lys | Leu | 360 Leu | G1 u | G1 U | ser | Pro | 365 Tyr | Lys | Lys | Met |
- 44 037161
| 370 | 375 | 380 |
| Leu Ala Asp Arg Tyr 385 | Ala ser 390 | Phe Asp ser Gly Lys Gly Lys Glu Phe 395 400 |
| Glu Glu Gly Lys Leu 405 | Thr Leu | Glu Asp Vai Vai Ala Tyr Ala Lys Ala 410 415 |
| Asn Gly Glu Pro Lys 420 | Gin Thr | ser Gly Lys Gin Glu Leu Tyr Glu Ala 425 430 |
lie Vai Asn Met Tyr cys 435 <210> 27 <211> 442 <212> Белок <213> Parabacteroides distasonis <400> 27
Met ser Tyr Phe Lys Gly Glu Lys Glu Phe Phe Pro Gly lie Gly Gin 15 1015 lie Gin Phe Glu Gly Arg Glu ser Lys Asn Pro Leu Ala Phe His Tyr 20 2530
Tyr Asp Ala Asp Lys Vai Vai Met Gly Lys Thr Leu Lys Asp His Leu 35 4045
Arg Phe Ala Met Ala Tyr Trp His Thr Leu cys Ala Glu Gly Gly Asp 50 5560
Gin Phe Gly Gly Gly Thr Lys Thr Phe Pro Trp Asn Asp ser Thr Asp 65 70 7580
Ala lie Thr Arg Ala Lys Tyr Lys Met Asp Ala Ala Phe Glu Phe Met 85 9095
Thr Lys cys Asn lie Pro Tyr Tyr cys Phe His Asp Vai Asp Vai Vai
100 105110
Asp Glu Ala Pro Thr Leu Gly Glu Phe Glu Lys Arg Leu Gin Thr Met
115 120125
Vai Glu His Ala Lys Glu His Gin Ala Ala Thr Gly Lys Lys Leu Leu
130 135140
Trp ser Thr Ala Asn Vai Phe Gly His Lys Arg Tyr Met Asn Gly Ala
145 150 155160
Ala Thr Asn Pro Tyr Phe Pro Thr Vai Ala cys Ala Gly Thr Gin lie
165 170175
- 45 037161
| Lys Asn Ala lie | Asp | Al a | cys | He | Ala Leu Gly Gly Glu Asn | Tyr | Val | ||||||||
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Phe | T rp | Gly 195 | Gly | Arg | G1 u | Gly | Tyr 200 | Met | ser | Leu | Leu | Asn 205 | Thr | Asn | Met |
| Lys | Arg 210 | G1 u | Lys | Asp | Hi s | Leu 215 | Al a | Met | Met | Leu | Thr 220 | Met | Al a | Arg | Asp |
| Tyr 225 | Gly | Arg | Lys | Asn | Gly 230 | Phe | Lys | Gly | Thr | Phe 235 | Leu | He | G1 u | Pro | Lys 240 |
| Pro | Met | G1 u | Pro | Thr 245 | Lys | His | G1 П | Tyr | Asp 250 | Val | Asp | ser | G1 u | Thr 255 | Val |
| He | Gly | Phe | Leu 260 | Arg | Hi s | Tyr | Gly | Leu 265 | Asp | Lys | Asp | Phe | Al a 270 | Leu | Asn |
| He | G1 U | Val 275 | Asn | Hi s | Al a | Thr | Leu 280 | Al a | Gly | Hi s | Thr | Phe 285 | G1 u | Hi s | G1 u |
| Leu | G1 П 290 | Al a | Al a | Al a | Asp | Ala 295 | Gly | Met | Leu | cys | ser 300 | He | Asp | Al a | Asn |
| Arg 305 | Gly | Asp | Tyr | G1 n | Asn 310 | Gly | T rp | Asp | Thr | Asp 315 | G1 n | Phe | Pro | Met | Asp 320 |
| He | Tyr | G1 u | Leu | Al a 325 | G1 n | Ala | T rp | Leu | Val 330 | He | Leu | G1 u | Gly | Gly 335 | Gly |
| Leu | Thr | Thr | Gly 340 | Gly | Thr | Asn | Phe | Asp 345 | Al a | Lys | Thr | Arg | Arg 350 | Asn | ser |
| Thr | Asp | Leu 355 | G1 u | Asp | He | Phe | He 360 | Al a | Hi s | lie | Gly | Gly 365 | Met | Asp | Al a |
| Phe | Al a 370 | Arg | Al a | Leu | Met | He 375 | Al a | Al a | Asp | He | Leu 380 | G1 u | Asn | ser | Asp |
| Tyr 385 | Arg | Lys | Met | Arg | Al a 390 | Glu | Arg | Tyr | Al a | ser 395 | Phe | Asp | Al a | Gly | G1 u 400 |
| Gly | Lys | Al a | Phe | G1 u 405 | Asp | Gly | Lys | Leu | Thr 410 | Leu | G1 u | Asp | Leu | Arg 415 | Thr |
| He Leu | Al a Tyr | Leu G1 u 435 | Arg 420 Met | Asp He | Gly Val | Glu Asn | Pro Leu 440 | Lys 42 5 Hi s | G1 n He | He | ser | Gly | Lys 430 | G1 n | G1 u |
- 46 037161 <210> 28 <211> 439 <212> Белок <213> Prevote'll a ruminicola <400> 28
Met Ala Lys Glu Tyr Phe Pro Phe 1 5
Thr Gly Lys lie Pro Phe Glu Gly
15
Lys Asp ser Lys Asn Vai Met Ala 20
Phe His Tyr Tyr Glu Pro Glu Lys 25 30
Vai Vai Met Gly Lys Lys Met Lys
40
Asp Trp Leu Lys Phe Ala Met Ala 45
Trp Trp His Thr Leu Gly Gly Ala
55 ser Ala Asp Gin Phe Gly Gly Gin 60
Thr Arg ser Tyr Glu Trp Asp Lys 65 70
Ala Ala Asp Ala Vai Gin Arg Ala 75 80
Lys Asp Lys Met Asp Ala Gly Phe 85
Glu lie Met Asp Lys Leu Gly lie
95
Glu Tyr Phe cys Phe His Asp Vai
100
Asp Leu Vai Glu Glu Gly Glu Thr
105 110 lie Ala Glu Tyr Glu Arg Arg Met
115 120
Lys Glu lie Thr Asp Tyr Ala Leu 12 5
Vai Lys Met Lys Glu Tyr Pro Asn
130 135 lie Lys Leu Leu Trp Gly Thr Ala
140
Asn Vai Phe Gly Asn Lys Arg Tyr
145 150
Ala Asn Gly Ala ser Thr Asn Pro
155 160
Asp Phe Asp Vai Vai Ala Arg Ala
165 lie Vai Gin lie Lys Asn Ala lie
170 175
Asp Ala Thr lie Lys Leu Gly Gly
180
Thr Asn Tyr Vai Phe Trp Gly Gly
185 190
Arg Glu Gly Tyr Met ser Leu Leu
195 200
Asn Thr Asp Gin Lys Arg Glu Lys 205
Glu His Met Ala Thr Met Leu Thr
210 215
Met Ala Arg Asp Tyr Ala Arg Ala
220
Lys Gly Phe Lys Gly Thr Phe Leu 225 230 lie Glu Pro Lys Pro Met Glu Pro
235 240 ser Lys His Gin Tyr Asp Vai Asp
245
Thr Glu Thr Vai cys Gly Phe Leu
250 255
- 47 037161
Arg Ala His Gly
260
Leu Asp Lys Asp
Phe Lys Vai Asn 265 lie Glu Vai Asn
270
His Ala Thr Leu
275
Ala Gly His Thr
280
Phe Glu His Glu
Leu Ala cys Ala 285
Vai Asp Asn Gly
290
Met Leu Gly ser
295 lie Asp Ala Asn
300
Arg Gly Asp Ala
Gin Asn Gly Trp 305
Asp Thr Asp Gin
310
Phe Pro lie Asp
315
Asn Phe Glu Leu
320
Thr Gin Ala Met
Leu Glu lie lie 325
Arg Asn Gly Gly
330
Leu Gly Asn Gly
335
Gly Thr Asn Phe
340
Asp Ala Lys lie
Arg Arg Asn ser 345
Thr Asp Leu Glu
350
Asp Leu Phe lie
355
Ala His lie ser
360
Gly Met Asp Ala
Met Ala Arg Ala 365
Leu Met Asn Ala
370
Ala Ala lie Leu
375
Glu Glu Ser Glu
380
Leu Pro Lys Met
Lys Lys Glu Arg 385
Tyr Ala ser Phe
390
Asp Asn Gly lie
395
Gly Lys Asp Phe
400
Glu Asp Gly Lys
Leu Thr Leu Glu 405
Gin Ala Tyr Glu
410
Tyr Gly Lys Lys
415
Vai Glu Glu Pro
420
Lys Gin Thr ser
Gly Lys Gin Glu 42 5
Lys Tyr Glu Thr
430
Thr Vai Ala Leu
435
Tyr cys Lys <210> 29 <211> 436 <212> Белок <213> Agrobacte <400> 29
Met ser Thr Gly 1
Phe Phe Gly Asp 5 lie Thr Lys lie 10
Lys Tyr Glu Gly
Pro Asp ser Thr
Asn Pro Leu Ala
Phe Arg His Tyr 25
Asn Pro Asp Glu 30
He Vai Ala Gly
Lys Arg Met Glu 40
Asp His Leu Arg
Phe Ala Vai Ala 45
- 48 037161
| Tyr Trp His 50 | Thr | Phe | Thr | Trp Pro 55 | Gly | Gly | Asp Pro 60 | Phe | Gly | Gly | G1 n | ||||
| Thr 65 | Phe | Gin | Arg | Pro | T rp 70 | Phe | Glu | Asp | Thr | Met 75 | Gin | Al a | Al a | Lys | Leu 80 |
| Lys | Al a | Asp | Val | Al a 85 | Phe | Glu | Phe | Phe | ser 90 | Leu | Leu | Gly | ser | Pro 95 | Phe |
| Tyr | cys | Phe | Hi s 100 | Asp | Al a | Asp | Val | Arg 105 | Pro | G1 u | Gly | Lys | Asn 110 | Phe | Al a |
| G1 U | Asn | Thr 115 | Lys | Asn | Leu | Asn | G1 u 120 | He | Val | Asp | Tyr | Phe 12 5 | Al a | G1 u | Lys |
| G1 П | Al a 130 | G1 n | Thr | Gly | Val | Lys 135 | Leu | Leu | T rp | Gly | Thr 140 | Al a | Asn | Leu | Phe |
| Ser 145 | Asn | Arg | Arg | Phe | Met 150 | ser | Gly | Al a | Al a | Thr 155 | Asn | Pro | Asp | Pro | Asp 160 |
| Vai | Phe | Al a | Phe | ser 165 | Al a | Ala | Thr | Val | Lys 170 | Thr | Cys | Leu | Asp | Al a 175 | Thr |
| Lys | Lys | Leu | Gly 180 | Gly | Al a | Asn | Tyr | Val 185 | Leu | T rp | Gly | Gly | Arg 190 | G1 u | Gly |
| Tyr | G1 U | Thr 195 | Leu | Leu | Asn | Thr | Asp 200 | Leu | ser | Arg | G1 U | Leu 205 | Asp | G1 n | Met |
| Gly | Arg 210 | Phe | Leu | Asn | Leu | Val 215 | Val | G1 u | Tyr | Lys | Tyr 220 | Lys | He | Gly | Phe |
| G1 U 225 | Gly | Thr | He | Leu | He 230 | Glu | Pro | Lys | Pro | G1 П 235 | G1 U | Pro | Thr | Lys | Hi s 240 |
| G1 n | Tyr | Asp | Tyr | Asp 245 | Val | Ala | Thr | Val | Tyr 250 | Al a | Phe | Leu | G1 n | Lys 255 | Asn |
| Gly | Leu | G1 u | Lys 260 | G1 u | Val | Lys | Val | Asn 265 | He | G1 u | G1 n | Gly | Hi s 270 | Al a | He |
| Leu | Al a | Gly 275 | Hi s | ser | Phe | Glu | Hi s 280 | G1 u | Leu | Al a | Leu | Al a 285 | Asn | Al a | Phe |
| Gly | He 290 | Phe | Gly | ser | He | Asp 295 | Met | Asn | Arg | Asn | Asp 300 | Tyr | G1 n | ser | Gly |
| T rp 305 | Asp | Thr | Asp | G1 n | Phe 310 | Pro | Asn | Asn | Val | Pro 315 | G1 u | Met | Al a | Leu | Al a 320 |
| Tyr | Tyr | Hi s | Val | Leu | Al a | Gly | Gly | Gly | Phe | Lys | Asn | Gly | Gly | Thr | Asn |
- 49 037161
325 330335
Phe Asp Ala Lys Leu Arg Arg Gin ser Leu Asp Pro Gin Asp Leu Leu
340 345350 lie Gly His lie Gly Gly Met Asp cys cys Ala Arg Gly Leu Lys Ala
355 360365
Ala Ala Lys Met lie Glu Asp Gly Ala Leu ser Lys Pro Leu ser Glu
370 375380
Arg Tyr Ala Lys Trp Asp ser Ala Glu Ala Gin Lys Met Leu Arg Gly
385 390 395400
Glu Leu Lys Leu Asp Asp lie Ala Ala Leu Val Glu Arg Glu Asp lie
405 410415
Asn Pro Glu Pro Lys ser Gly Arg Gin Glu Tyr Leu Glu Asn Val Val
420 425430
Asn Arg Tyr Val
435 <210> 30 <211> 439 <212> Белок <213> Clostridium cellulovorans <400> 30
| Met Arg 1 | Glu Tyr | Phe 5 | Al a | Asn Val | Pro | Lys 10 | He | Lys | Tyr | G1 u | Gly 15 | Lys |
| Asp ser | Lys Asn 20 | Pro | Leu | Ala Phe | Lys 25 | Tyr | Tyr | Asn | Pro | Asp 30 | G1 U | Val |
| Val Gly | Gly Lys 35 | Thr | Met | Lys G1u 40 | Hi s | Leu | Arg | Phe | Thr 45 | Leu | ser | Tyr |
| Trp His 50 | Thr Leu | Thr | Gly | Ala Gly 55 | ser | Asp | Pro | Phe 60 | Gly | Val | Gly | Thr |
| Met Leu 65 | Arg Pro | T rp | Asp 70 | cys Ala | G1 u | Asp | G1 U 75 | Met | G1 u | Leu | Al a | Lys 80 |
| Met Arg | Met Glu | Al a 85 | Asn | Phe Glu | Leu | Met 90 | Asp | Lys | Leu | Gly | He 95 | G1 u |
| Tyr Phe | Ala Phe 100 | Hi s | Asp | Arg Asp | He 105 | Al a | Pro | G1 U | Gly | Lys 110 | Thr | Leu |
| Ala Asp | Thr Asn 115 | G1 u | Lys | Leu Asp 120 | G1 u | He | Val | Al a | Tyr 12 5 | cys | Lys | G1 u |
- 50 037161
Leu Met Gln Lys His Gly Lys Lys Leu Leu Trp Gly Thr Ala Asn Met
130 135140
Phe Gly Asn Pro Arg Phe Val His Gly Ala Ala Thr Thr cys Asn Ala
145 150 155160
Asp Val Phe Ala Tyr Ala Ala Ala Gln Thr Lys Lys Ala Met Asp Val
165 170175
Thr Lys Glu Leu Gly Gly Glu Asn Tyr Val Phe Trp Gly Gly Arg Glu
180 185190
Gly Tyr Glu Thr Leu Leu Asn Thr Asp Leu Gly Leu Glu Gln Asp Asn
195 200205
Leu Ala Arg Phe Phe Gln Met Ala Val Asp Tyr Ala Lys Lys Ile Gly
210 215220
Phe Thr Gly Gln Phe Leu Ile Glu Pro Lys Pro Lys Glu Pro Thr Lys 225 230 235240
His Gln Tyr Asp Phe Asp Val Ala Thr Val Leu Gly Phe Leu Arg Lys
245 250255
Tyr Asn Leu Glu Lys Tyr Phe Lys Met Asn Ile Glu Ala Asn His Ala
260 265270
Thr Leu Ala Gln His Thr Phe Gln His Glu Val Ala Val Ala Arg Val
275 280285
Asn Gly Val Leu Gly ser Leu Asp Val Asn Gln Gly Asp Pro Asn Leu
290 295300
Gly Trp Asp Thr Asp Gln Phe Pro Thr Asn Ile Tyr Asp Ala Thr Met
305 310 315320
Val Met Tyr Glu Val Leu Lys Asn Gly Gly Ile Ala Pro Gly Gly Leu
325 330335
Asn Phe Asp Ala Lys Thr Arg Arg Ala ser Phe Glu Pro Glu Asp Leu
340 345350
Phe Leu ser Tyr Ile Ala Gly Met Asp Thr Met Ala Lys Gly Leu Arg
355 360365
Val Ala Tyr ser Leu Leu Asp Asp Ala Val Leu Glu Asn Asn Thr ser
370 375380
Glu Arg Tyr Lys Thr Phe ser Glu Gly Ile Gly Lys Asp Ile Val Glu
385 390 395400
- 51 037161
| Gly | Lys | Vai | Asp | Phe 405 | G1 u | ser Leu Glu | Lys Tyr Ala 410 | Leu | Glu Asn 415 | ser | ||||
| Vai | He | ser | Asn 420 | Lys | ser | Gly Arg | G1 n 42 5 | G1 u | Tyr | Leu | G1 u | ser 430 | Vai | Vai |
| Asn | G1 n | Tyr 435 | He | Phe | Asn | Asp |
<210> 31 <211> 440 <212> Белок <213> Burkholderia cenocepacia <400> 31
Met ser Tyr Phe Glu His lie Pro Ala lie Arg Tyr Glu Gly Pro Gin
1015 ser Asp Asn Pro Leu Ala Tyr His His Tyr Asp Pro Asp Lys Arg Vai 20 2530
Leu Gly Lys Thr Leu Ala Glu His Leu Arg lie Ala Vai cys Tyr Trp 35 4045
His Thr Phe Vai Trp Pro Gly His Asp lie Phe Gly Gin Gly Ala Phe 50 5560
Gin Arg Pro Trp Gin Gin Pro Gly Asp Ala Leu Glu Arg Ala Arg Gin 65 70 7580
Lys Ala Asp Ala Ala Phe Glu Phe Phe Thr Lys Leu Gly Thr Pro Phe 85 9095
Tyr Thr Phe His Asp Thr Asp Vai Ala Pro Glu Gly Asp ser Leu Arg
100 105110
Asp Tyr Ala Ala Asn Phe Ala Arg Met Vai Asp Tyr Leu Gly Glu Arg
115 120125
Gin Gin Ala ser Gly Vai Arg Leu Leu Trp Gly Thr Ala Asn Leu Phe
130 135140 ser His Pro Arg Phe Ala Ala Gly Ala Ala Thr Asn Pro Asn Pro Asp
145 150 155160
Vai Phe Ala Trp Ala Ala Thr Gin Vai cys His Ala Leu Asp Ala Thr
165 170175
His Arg Leu Gly Gly Glu Asn Tyr Vai Leu Trp Gly Gly Arg Glu Gly
180 185190
Tyr Glu Thr Leu Leu Asn Thr Asp Leu Lys Arg Glu Arg Asp Gin Phe
195 200205
- 52 037161
| Al a | Arg 210 | Phe | Leu | ser | Met | Val 215 | Val | G1 u | Hi s | Lys | Hi s 220 | Arg | He | Gly | Phe |
| Lys 225 | Gly | Al a | Leu | Leu | He 2 30 | Glu | Pro | Lys | Pro | G1 П 235 | G1 u | Pro | Thr | Lys | Hi s 240 |
| G1 n | Tyr | Asp | Tyr | Asp 245 | Val | Ala | Thr | Val | Hi s 250 | Gly | Phe | Leu | Val | G1 П 255 | Tyr |
| Gly | Leu | G1 n | Asn 260 | G1 u | He | Arg | Val | Asn 265 | He | G1 U | Al a | Asn | Hi s 270 | Al a | Thr |
| Leu | Al a | Gly 275 | Hi s | ser | Phe | His | Hi s 280 | G1 u | He | Al a | Asn | Al a 285 | Phe | Al a | Leu |
| Gly | Val 290 | Phe | Gly | ser | Val | Asp 295 | Al a | Asn | Arg | Gly | Asp 300 | Pro | G1 n | Asn | Gly |
| T rp 305 | Asp | Thr | Asp | G1 n | Phe 310 | Pro | Asn | ser | Val | G1 u 315 | G1 u | Leu | Thr | Leu | Al a 320 |
| Phe | Tyr | G1 u | He | Leu 325 | Arg | His | Gly | Gly | Phe 330 | Thr | Thr | Gly | Gly | Met 335 | Asn |
| Phe | Asp | Al a | Lys 340 | Val | Arg | Arg | G1 n | ser 345 | He | Asp | Pro | G1 u | Asp 350 | Leu | Phe |
| Tyr | Gly | Hi s 355 | Val | Gly | Al a | He | Asp 360 | Val | Leu | Al a | Leu | Al a 365 | Leu | G1 u | Arg |
| Al a | Al a 370 | Val | Leu | Val | G1 u | Asn 375 | Asp | Arg | Leu | Asp | Al a 380 | Leu | Arg | Arg | G1 n |
| Arg 385 | Tyr | Al a | G1 n | T rp | Asp 390 | Asp | Al a | Phe | Gly | Arg 395 | Lys | He | Leu | ser | Gly 400 |
| Gly | Tyr | Thr | Leu | G1 u 405 | ser | Leu | Al a | Al a | Asp 410 | Al a | Leu | Al a | Arg | Gly 415 | Val |
| Asn | Pro | Arg | Hi s 420 | Al a | ser | Gly | Al a | G1 n 42 5 | G1 u | Arg | Leu | G1 u | Asn 430 | He | Val |
| Asn | G1 n | Al a 435 | He | Tyr | Gly | Leu | Arg 440 |
<210> 32 <211> 439 <212> Белок <213> Lactococcus lactis <400> 32
- 53 037161
Met 1
Al a
Tyr
Phe
Asn 5
Asp
He
Al a
Pro
He
Lys
Tyr
G1 u
Gly
Thr 15
Lys
Thr
Lys
Asn
Met 20
Phe
Al a
Phe
Arg
Hi s 25
Tyr
Asn
Pro
G1 u
G1 u 30
Vai
Vai
Al a
Gly
Lys 35
Thr
Met
G1 u
Glu
G1 n 40
Leu
Hi s
Phe
Al a
Leu 45
Al a
Phe
T rp
Hi s
Thr 50
He
Thr
Met
Asp
Gly 55 ser
Asp
Pro
Phe
Gly 60
Gly
Al a
Thr
Met
G1 u 65
Arg
Pro
T rp
Asp
Leu 70
Glu
Gly
Gly ser
G1 u
Leu
Asp
Arg
Al a
Hi s 80
Arg
Arg
Vai
Asp
Al a 85
Phe
Phe
G1 u
He
Al a 90
G1 U
Lys
Leu
Gly
Vai 95
Lys
Tyr
Tyr cys
Phe
100
Hi s
Asp
He
Asp
He
105
Al a
Pro
Thr
Gly
Asn
110 ser
Leu
Lys
G1 u
Phe
115
Tyr
Al a
Asn
Leu
Asp
120
G1 u
He
Thr
Asp
Hi s
5
Leu
Leu
G1 u
Lys
G1 n 130
Lys
Al a
Thr
Gly
He
135
Lys
Leu
Leu
T rp
Asn
140
Thr
Al a
Asn
Met
Phe
145 ser
Asn
Pro
Arg
Tyr 150
Met
Asn
Gly
Vai ser
155
Thr ser
Asn
Arg
Al a 160
G1 u
Vai
Phe
Al a
Tyr 165
Gly
Ala
Al a
G1 n
Vai
170
Lys
Lys
Gly
Leu
G1 u 175
Leu ser
Lys
Lys
Leu
180
Gly
Gly
Glu
Asn
Tyr 185
Vai
Phe
T rp
Gly
Gly 190
Arg
Glu
Gly
Tyr
G1 u 195 ser
Leu
Leu
Asn
Thr
200
Asp
Met
Gly
Leu
G1 u 205
Met
Asp
Hi s
Met
Al a 210
Lys
Phe
Phe
Hi s
Leu
215
Al a
He
Asp
Tyr
Al a 220
Lys ser
He
Asn
Hi s
225
Leu
Pro
He
Phe
Leu 2 30
He
G1 U
Pro
Lys
Pro
235
Lys
G1 U
Pro
Met
Thr
240
Hi s
G1 n
Tyr
Asp
Phe
245
Asp ser
Al a
Thr
Al a 250
Leu
Al a
Phe
Leu
G1 n 255
Lys
Tyr
Asp
Leu
Asp 260
Lys
Tyr
Phe
Lys
Leu
265
Asn
Leu
G1 u
Thr
Asn
270
Hi s
Al a
T rp
Leu
Al a
Gly
Hi s
Thr
Phe
G1 u
Hi s
G1 u
Leu
Asn
Thr
Al a
Arg
Thr
- 54 037161
275 280285
Phe Asn Ala Leu Gly ser lie Asp Ala Asn Gin Gly Asn Tyr Leu Leu
290 295300
Gly Trp Asp Thr Asp Glu Phe Pro Thr Leu Vai lie Asp lie Thr Leu
305 310 315320
Ala Met His Gin lie Leu Leu Asn Gly Gly Leu Gly Lys Gly Gly lie
325 330335
Asn Phe Asp Ala Lys Vai Arg Arg Thr ser Phe Lys Ala Glu Asp Leu
340 345350 lie Leu Ala His lie Ala Gly Met Asp Thr Tyr Ala Arg Ala Leu Lys
355 360365
Gly Ala Ala Ala lie lie Glu Asp Lys Phe Leu ser Asp lie Vai Asp
370 375380
Glu Arg Tyr ser ser Tyr Arg Asn Thr Glu Vai Gly Gin ser lie Glu
385 390 395400
Asn Gly Thr Ala Thr Phe Glu ser Leu Ala Ala Phe Ala Leu Glu Tyr
405 410415
Gly Asp Asp lie Glu Leu Asp ser Asn His Leu Glu Tyr lie Lys ser
420 425430
Vai Leu Asn Asp Tyr Leu Vai
435 <210> 33 <211> 438 <212> Белок <213> Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus <400> 33
Met Glu Tyr Phe Lys Asn Vai Pro 1 5
Gin lie Lys Tyr Glu Gly Pro Lys
15 ser Asn Asn Pro Tyr Ala Phe Lys 20
Phe Tyr Asn Pro Asp Glu lie lie 25 30
Asp Gly Lys Pro Leu Lys Glu His
40
Leu Arg Phe ser Vai Ala Tyr Trp 45
His Thr Phe Thr Ala Asn Gly Thr
55
Asp Pro Phe Gly Ala Pro Thr Met 60
Gin Arg Pro Trp Asp His Phe Thr 65 70
Asp Pro Met Asp lie Ala Lys Ala 75 80
- 55 037161
Arg Vai Glu Ala Ala Phe Glu Leu Phe Glu Lys Leu Asp Vai Pro Phe 85 9095
Phe cys Phe His Asp Arg Asp lie Ala Pro Glu Gly Glu Thr Leu Arg
100 105110
Glu Thr Asn Lys Asn Leu Asp Thr lie Vai Ala Met lie Lys Asp Tyr
115 120125
Leu Lys Thr ser Lys Thr Lys Vai Leu Trp Gly Thr Ala Asn Leu Phe
130 135140 ser Asn Pro Arg Phe Vai His Gly Ala Ala Thr ser cys Asn Ala Asp
145 150 155160
Vai Phe Ala Tyr Ala Ala Ala Gin Vai Lys Lys Ala Leu Glu lie Thr
165 170175
Lys Glu Leu Gly Gly Gin Asn Tyr Vai Phe Trp Gly Gly Arg Glu Gly
180 185190
Tyr Glu Thr Leu Leu Asn Thr Asp Met Glu Leu Glu Leu Asp Asn Leu
195 200205
Ala Arg Phe Leu His Met Ala Vai Glu Tyr Ala Gin Glu lie Gly Phe
210 215220
Glu Gly Gin Phe Leu lie Glu Pro Lys Pro Lys Glu Pro Thr Lys His
225 230 235240
Gin Tyr Asp Phe Asp Ala Ala ser Vai His Ala Phe Leu Lys Lys Tyr
245 250255
Asp Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Leu Asn lie Glu Ala Asn His Ala Thr
260 265270
Leu Ala Gly His Asp Phe Gin His Glu Leu Arg Tyr Ala Arg lie Asn
275 280285
Asn Met Leu Gly ser lie Asp Ala Asn Met Gly Asp Met Leu Leu Gly
290 295300
Trp Asp Thr Asp Gin Tyr Pro Thr Asp lie Arg Met Thr Thr Leu Ala 305 310 315320
Met Tyr Glu Vai lie Lys Met Gly Gly Phe Asn Lys Gly Gly Leu Asn
325 330335
Phe Asp Ala Lys Vai Arg Arg Ala ser Phe Glu Pro Glu Asp Leu Phe
340 345350
- 56 037161
Leu
Gly
Hi s 355
He
Al a
Gly
Met
Asp
360
Al a
Phe
Al a
Lys
Gly 365
Phe
Lys
Val
Al a
Tyr 370
Lys
Leu
Val
Lys
Asp 375
Gly
Val
Phe
Asp
Arg
380
Phe
He
G1 U
G1 U
Arg 385
Tyr
Lys ser
Tyr
Arg 390
Glu
Gly lie
Gly
Al a 395
G1 U
He
Val ser
Gly 400
Lys
Al a
Asn
Phe
Lys 405
Thr
Leu
G1 u
G1 u
Tyr
410
Al a
Leu
Asn
Asn
Pro
415
Lys
He
G1 U
Asn
Lys 420 ser
Gly
Lys
G1 П
G1 u
5
Leu
Leu
G1 U ser
He 430
Leu
Asn
G1 n
Tyr
Leu
435
Phe ser
G1 u <210> 34 <211> 439 <212> Белок <213> Reticulitermes speratus <400> 34
Met ser Gin lie Phe Lys Asp lie Pro Val 1510 lie Lys Tyr Glu Gly Pro 15
Ala ser
Lys Asn Pro Leu ser Phe Lys Tyr Tyr Asp Ala Asn Lys Val
2530 lie Asp Gly Lys Pro Met Lys Glu His Leu Arg Tyr Ala Met Ala Trp 35 4045
Trp His Asn Leu cys Ala Thr Gly Gin Asp Met Phe Gly Pro Gly Thr 50 5560
Ala Asp Lys ser Phe Gly ser Lys Thr Val Gly Thr Met Glu His Ala 65 70 7580
His Ala Lys Val Asp Ala Gly Phe Glu Phe Met ser Lys Leu Gly Val 85 9095
Glu Tyr Phe cys Phe His Asp Ala Asp Leu Val Pro Glu Ala Asp Thr
100 105110
Leu ser Glu Thr Asn Lys Arg Leu Asp Glu lie Ala Glu His lie Val
115 120125
Ala Lys Gin Lys Ala Thr Gly lie Lys cys Leu Trp Gly Thr Ala Asn
130 135140
Leu Phe ser Asn Pro Arg Phe Leu Asn Gly ser Gly ser ser Asn ser
145 150 155160
- 57 037161
| Ala Asp | Val | Tyr | Al a 165 | Tyr | Ala | Ala Ala | Gin He 170 | Lys | Lys | Al a | Leu 175 | Asp |
| Leu Thr | Val | Lys 180 | Phe | Gly | Gly | Val Gly 185 | Tyr Val | Phe | T rp | Gly 190 | Gly | Arg |
| Glu Gly | Tyr 195 | G1 u | Thr | Leu | Leu | Asn Thr 200 | Asp Val | Lys | Phe 205 | G1 u | G1 n | G1 u |
| Asn lie 210 | Al a | Asn | Leu | Met | His 215 | Leu Ala | Val Thr | Tyr 220 | Gly | Arg | ser | He |
| Gly Phe 225 | Lys | Gly | Asp | Phe 2 30 | Tyr | He Glu | Pro Lys 235 | Pro | Lys | G1 u | Pro | Thr 240 |
| Lys His | G1 П | Tyr | Asp 245 | Phe | Asp | Ala Ala | Thr Thr 250 | He | Gly | Phe | He 255 | Arg |
| Gin Tyr | Gly | Leu 260 | Glu | Lys | Asp | Phe Lys 265 | Leu Asn | He | Glu | Al a 270 | Asn | Hi s |
| Ala Thr | Leu 275 | Al a | Gly | Hi s | Thr | Phe Gin 280 | His Asp | Leu | Arg 285 | He | ser | Al a |
| lie Asn 290 | Gly | Met | Leu | Gly | ser 295 | Val Asp | Ala Asn | Thr 300 | Gly | Asp | Pro | Leu |
| Leu Gly 305 | T rp | Asp | Thr | Asp 310 | Glu | Phe Pro | Tyr ser 315 | Val | Tyr | Asp | Thr | Thr 320 |
| Leu Ala | Met | Tyr | G1 u 325 | He | He | Lys Ala | Gly Gly 330 | Leu | Thr | Gly | Gly 335 | Leu |
| Asn Phe | Asp | ser 340 | Lys | Val | Arg | Arg Pro 345 | ser Tyr | Thr | Hi s | G1 U 350 | Asp | Leu |
| Phe Tyr | Gly 355 | Phe | He | Leu | Gly | Met Asp 360 | ser Phe | Al a | Leu 365 | Gly | Leu | He |
| Lys Ala 370 | Lys | Al a | Leu | He | Ala 375 | Asp Gly | Arg Leu | Asp 380 | ser | Phe | Val | Lys |
| Asp Arg 385 | Tyr | Al a | ser | Tyr 390 | Gly | ser Gly | He Gly 395 | Al a | Lys | He | Arg | Asp 400 |
| His ser | Al a | Thr | Leu 405 | G1 u | Glu | Leu Ala | Ala Tyr 410 | Al a | Leu | Al a | Lys 415 | Asp |
| Thr Val | Al a | Leu 420 | Pro | Gly | ser | Gly Arg 42 5 | Gin Glu | Tyr | Leu | G1 u 430 | ser | He |
- 58 037161 lie Asn Gin lie Leu Phe Gin
435 <210> 35 <211> 438 <212> Белок <213> uncultured bacteria from <400> 35
Met ser Glu lie Phe Ala Asn lie 1 5 cow rumen
Pro Val lie Pro Tyr Glu Gly Pro
15
Gin ser Lys Asn Pro Leu Ala Phe 20
Lys Phe Tyr Asp Ala Asp Lys Val 25 30 lie Leu Gly Lys Lys Met ser Glu
40
His Leu Pro Phe Ala Met Ala Trp 45
Trp His Asn Leu cys Ala Gly Gly
55
Thr Asp Met Phe Gly Arg Asp Thr 60
Ala Asp Lys ser Phe Gly Ala Glu 65 70
Lys Gly Thr Met Ala His Ala Arg 75 80
Ala Lys Val Asp Ala Gly Phe Glu 85
Phe Met Lys Lys Val Gly Val Lys
95
Tyr Phe cys Phe His Asp Val Asp
100
Leu Val Pro Glu Ala Asp Asp lie
105 110
Lys Glu Thr Asn Arg Arg Leu Asp
115 120
Glu lie ser Asp Tyr lie Leu Glu 12 5
Lys Met Lys Gly Thr Asp lie Lys
130 135 cys Leu Trp Gly Thr Ala Asn Met
140
Phe Gly Asn Pro Arg Tyr Met Asn
145 150
Gly Ala Gly ser Thr Asn ser Ala
155 160
Asp Val Phe cys Phe Ala Ala Ala
165
Gin lie Lys Lys Ala Leu Asp Leu
170 175
Thr Val Lys Leu Gly Gly Arg Gly
180
Tyr Val Phe Trp Gly Gly Arg Glu
185 190
Gly Tyr Glu Thr Leu Leu Asn Thr
195 200
Asp Met Lys Phe Glu Gin Glu Asn 205 lie Ala Arg Leu Met His Leu Ala
210 215
Val Asp Tyr Gly Arg ser lie Gly
220
Phe Thr Gly Asp Phe Tyr lie Glu
Pro Lys Pro Lys Glu Pro Met Lys
- 59 037161
225 230 235240
His Gln Tyr Asp Phe Asp Ala Ala Thr Ala Ile Gly Phe Leu Arg Gln
245 250255
Tyr Gly Leu Asp Lys Asp Phe Lys Met Asn Ile Glu Ala Asn His Ala
260 265270
Thr Leu Ala Gly His Thr Phe Gln His Asp Leu Arg Ile ser Ala Ile
275 280285
Asn Gly Met Leu Gly ser Ile Asp Ala Asn Gln Gly Asp Leu Leu Leu
290 295300
Gly Trp Asp Thr Asp Glu Phe Pro Phe Asn Val Tyr Glu Ala Thr Leu
305 310 315320 cys Met Tyr Glu Val Leu Lys Ala Gly Gly Leu Thr Gly Gly Phe Asn
325 330335
Phe Asp ser Lys Thr Arg Arg Pro ser Tyr Thr Leu Glu Asp Met Phe
340 345350
His Ala Tyr Ile Leu Gly Met Asp Thr Phe Ala Leu Gly Leu Ile Lys
355 360365
Ala Ala Ala Leu Ile Glu Asp Gly Arg Leu Asp Gln Phe Val Ala Asp
370 375380
Arg Tyr Ala ser Tyr Lys Thr Gly Ile Gly Ala Lys Ile Arg ser Gly
385 390 395400
Glu Thr Thr Leu Ala Glu Leu Ala Ala Tyr Ala Asp Lys Leu Gly Ala
405 410415
Pro Ala Leu Pro ser ser Gly Arg Gln Glu Tyr Leu Glu ser Ile Val
420 425430
Asn ser Ile Leu Phe Gly
435 <210> 36 <211> 438 <212> Белок <213> некультивированные бактерии из коровьего рубца <400> 36
Met Ala Glu Ile Phe Lys Gly Ile Pro Glu Ile Arg Tyr Glu Gly Pro 15 10 15
Asn ser Thr Asn Pro Leu ser Phe Lys Tyr Tyr Asp Pro Asp Lys Val 20 25 30
- 60 037161
| lie | Leu | Gly 35 | Lys | Pro | Met | Lys | G1 u 40 | Hi s | Leu | Pro | Phe | Al a 45 | Met | Al a | T rp |
| T rp | Hi s 50 | Asn | Leu | Gly | Al a | Ala 55 | Gly | Thr | Asp | Met | Phe 60 | Gly | Arg | Asp | Thr |
| Al a 65 | Asp | Lys | ser | Phe | Gly 70 | Ala | G1 U | Lys | Gly | Thr 75 | Met | G1 u | Hi s | Al a | Lys 80 |
| Al a | Lys | Val | Asp | Al a 85 | Gly | Phe | G1 U | Phe | Met 90 | Lys | Lys | Leu | Gly | He 95 | Arg |
| Tyr | Phe | cys | Phe 100 | Hi s | Asp | Val | Asp | Leu 105 | Val | Pro | G1 U | Al a | Asp 110 | Asp | He |
| Lys | Val | Thr 115 | Asn | Al a | Arg | Leu | Asp 120 | G1 u | He | ser | Asp | Tyr 12 5 | He | Leu | G1 U |
| Lys | Met 130 | Lys | Gly | Thr | Asp | He 135 | Lys | cys | Leu | T rp | Gly 140 | Thr | Al a | Asn | Met |
| Phe 145 | ser | Asn | Pro | Arg | Phe 150 | Met | Asn | Gly | Al a | Gly 155 | ser | Thr | Asn | ser | Al a 160 |
| Asp | Val | Phe | cys | Phe 165 | Al a | Ala | Al a | G1 П | Val 170 | Lys | Lys | Al a | Leu | Asp 175 | He |
| Thr | val | Lys | Leu 180 | Gly | Gly | Lys | Gly | Tyr 185 | Val | Phe | T rp | Gly | Gly 190 | Arg | G1 u |
| Gly | Tyr | G1 U 195 | Thr | Leu | Leu | Asn | Thr 200 | Asp | Val | Lys | Phe | G1 u 205 | G1 n | G1 u | Asn |
| He | Al a 210 | Lys | Leu | Met | Hi s | Leu 215 | Al a | Val | Asp | Tyr | Gly 220 | Arg | ser | He | Gly |
| Phe 225 | Lys | Gly | Asp | Phe | Phe 2 30 | He | G1 u | Pro | Lys | Pro 235 | Lys | G1 u | Pro | Met | Lys 240 |
| Hi s | G1 П | Tyr | Asp | Phe 245 | Asp | Ala | Al a | Thr | Al a 250 | He | Gly | Phe | Val | Arg 255 | G1 n |
| Tyr | Gly | Leu | Asp 260 | Lys | Asp | Phe | Lys | Met 265 | Asn | He | G1 U | Al a | Asn 270 | Hi s | Al a |
| Thr | Leu | Al a 275 | Gly | Hi s | Thr | Phe | G1 П 280 | Hi s | G1 U | Leu | Arg | lie 285 | ser | Al a | lie |
| Asn | Gly 290 | Met | Leu | Gly | Ser | He 295 | Asp | Al a | Asn | Gin | Gly 300 | Asp | Met | Leu | Leu |
- 61 037161
Gly Trp Asp Thr Asp Glu Phe Pro Phe Asn Vai Tyr Asp Thr Thr Leu
305 310 315320 cys Met Tyr Glu Vai Leu Lys Asn Gly Gly lie Pro Gly Gly Phe Asn
325 330335
Phe Asp Ala Lys Asn Arg Arg Pro ser Tyr Thr Ala Glu Asp Met Phe
340 345350
Tyr Gly Phe lie Leu Gly Met Asp ser Phe Ala Leu Gly Leu lie Lys
355 360365
Ala Ala Lys Leu lie Glu Asp Gly Arg lie Asp Lys Phe Vai Glu Glu
370 375380
Arg Tyr Ala ser Tyr Lys Asp Gly lie Gly Lys Lys lie Arg Asp Gly
385 390 395400
Glu Thr Thr Leu Ala Glu Leu Ala Ala Tyr Ala Asp Gin Leu Gly Ala
405 410415
Pro Lys Leu Pro Gly ser Gly Arg Gin Glu Asp Leu Glu ser Vai Phe
420 425430
Asn Gin Vai Leu Phe Gly 435 <210> 37 <211> 442 <212> Белок <213> Lachnospiraceae bacterium <400> 37
| Met 1 | Lys | G1 U | Phe | Phe 5 | Pro ser | lie ser | Pro 10 | He | Lys | Phe | G1 u | Gly 15 | ser |
| G1 U | ser | Lys | Asn 20 | Pro | Leu ser | Phe Lys 25 | Tyr | Tyr | Asp | Al a | Lys 30 | Arg | Vai |
| He | Met | Gly 35 | Lys | Thr | Met Glu | Glu His 40 | Leu | ser | Phe | Al a 45 | Met | Al a | T rp |
| T rp | Hi s 50 | Asn | Leu | cys | Ala ser 55 | Gly Vai | Asp | Met | Phe 60 | Gly | G1 n | Gly | Thr |
| Al a 65 | Asp | Lys | Gly | Phe | Gly Glu 70 | Asn Leu | Gly | Thr 75 | Met | G1 u | Hi s | Al a | Lys 80 |
| Al a | Lys | Vai | Asp | Al a 85 | Gly He | Glu Phe | Met 90 | Gin | Lys | Leu | Gly | He 95 | Lys |
| Tyr | Tyr | cys | Phe 100 | Hi s | Asp Thr | Asp lie 105 | Vai | Pro | G1 U | Asp | G1 n 110 | G1 u | Asp |
- 62 037161 lie Asn Vai Thr Asn Ala Arg Leu Asp Glu lie Thr Asp Tyr lie Leu
115 120125
Glu Lys Thr Lys Gly Thr Asp lie Lys cys Leu Trp Ala Thr cys Asn
130 135140
Met Phe ser Asn Pro Arg Phe Met Asn Gly Ala Gly ser ser Asn ser
145 150 155160
Ala Asp Vai Phe cys Phe Ala Ala Ala Gin Ala Lys Lys Gly Leu Glu
165 170175
Asn Ala Vai Lys Leu Gly Ala Lys Gly Phe Vai Phe Trp Gly Gly Arg
180 185190
Glu Gly Tyr Glu Thr Leu Leu Asn Thr Asp Met Lys Leu Glu Glu Glu
195 200205
Asn lie Ala Thr Leu Phe Thr Met cys Arg Asp Tyr Gly Arg ser lie
210 215220
Gly Phe Lys Gly Asp Phe Tyr lie Glu Pro Lys Pro Lys Glu Pro Met
225 230 235240
Lys His Gin Tyr Asp Phe Asp Ala Ala Thr Ala lie Gly Phe Leu Arg
245 250255
Lys Tyr Gly Leu Asp Lys Asp Phe Lys Met Asn lie Glu Ala Asn His
260 265270
Ala Thr Leu Ala Gly His Thr Phe Gin His Glu Leu Arg Vai ser Ala
275 280285 lie Asn Gly Met Leu Gly ser Vai Asp Ala Asn Gin Gly Asp Thr Leu 290 295300
Leu Gly Trp Asp Thr Asp Gin Phe Pro Thr Asn Vai Tyr Asp Thr Thr
305 310 315320
Leu Ala Met Tyr Glu lie Leu Lys Ala Gly Gly Leu ser Gly Gly Leu
325 330335
Asn Phe Asp ser Lys Asn Arg Arg Pro ser Asn Thr Ala Glu Asp Met
340 345350
Phe Tyr Gly Phe lie Ala Gly Met Asp Thr Phe Ala Leu Gly Leu lie
355 360365
Lys Ala Ala Gin lie lie Glu Asp Gly Arg lie Asp Glu Phe Vai Lys
370 375380
- 63 037161
Glu Arg Tyr ser ser Tyr Asn ser Gly lie Gly Glu Lys lie Arg Asn
385 390 395400
Arg ser Val Thr Leu Val Glu cys Ala Glu Tyr Ala Leu Lys Met Lys
405 410415
Lys Pro Glu Leu Pro Glu ser Gly Arg Gin Glu Tyr Leu Glu Thr Val
420 425430
Val Asn Asn lie Phe Phe Asn ser Lys Leu
435440 <210> 38 <211> 442 <212> Белок <213> Lachnospiraceae bacterium <400> 38
Met Lys Glu Phe Phe Pro Gly lie 1 5 ser Pro Val Lys Phe Glu Gly ser
15
Glu ser Lys Asn Pro Leu ser Phe 20
Lys Tyr Tyr Asp Ala Lys Arg Val 25 30 lie Met Gly Lys Thr Met Glu Glu
40
His Leu ser Phe Ala Met Ala Trp 45
Trp His Asn Leu cys Ala ser Gly
55
Val Asp Met Phe Gly Gin Gly Thr
Ala Asp Lys Gly Phe Gly Glu ser 65 70 ser Gly Thr Met Gly His Ala Lys
80
Ala Lys Val Asp Ala Gly lie Glu 85
Phe Met Lys Lys Leu Gly lie Lys
95
Tyr Tyr cys Phe His Asp Thr Asp
100 lie Val Pro Glu Asp Gin Glu Asp
105 110 lie Asn Val Thr Asn Ala Arg Leu
115 120
Asp Glu lie Thr Asp Tyr lie Leu 12 5
Glu Lys Thr Lys Gly ser Asp lie
130 135
Lys cys Leu Trp Thr Thr cys Asn
140
Met Phe Gly Asn Pro Arg Phe Met
145 150
Asn Gly Ala Gly ser ser Asn ser
155 160
Ala Asp Val Phe cys Phe Ala Ala
165
Ala Gin Ala Lys Lys Gly Leu Glu
170 175
Asn Ala Val Lys Leu Gly Ala Lys
Gly Phe Val Phe Trp Gly Gly Arg
- 64 037161
180
185
190
G1 u
Gly
Tyr 195
G1 u
Thr
Leu
Leu
Asn
200
Thr
Asp
Met
Lys
Leu
205
G1 u
G1 u
G1 U
Asn
He
210
Al a
Thr
Leu
Phe
Thr
215
Met cys
Arg
Asp
Tyr 220
Gly
Arg ser
He
Gly
225
Phe
Lys
Gly
Asp
Phe
30
Tyr
He
G1 U
Pro
Lys 235
Pro
Lys
G1 U
Pro
Met
240
Lys
Hi s
G1 n
Tyr
Asp 245
Phe
Asp
Al a
Al a
Thr
250
Al a
He
Gly
Phe
Leu
255
Arg
Lys
Tyr
Gly
Leu
260
Asp
Lys
Asp
Phe
Lys 265
Leu
Asn
He
G1 U
Al a 270
Asn
Hi s
Al a
Thr
Leu
275
Al a
Gly
Hi s
Thr
Phe
280
G1 n
Hi s
G1 u
Leu
Arg 285
Vai ser
Al a
He
Asn
290
Gly
Met
Leu
Gly ser
295
Vai
Asp
Al a
Asn
G1 n 300
Gly
Asp
Thr
Leu
Leu
305
Gly
T rp
Asp
Thr
Asp
310
Gin
Phe
Pro
Thr
Asn
315
He
Tyr
Asp
Thr
Thr
320
Phe
Al a
Met
Tyr
G1 u 325
He
Leu
Lys
Al a
Gly 330
Gly
Leu ser
Gly
Gly 335
Leu
Asn
Phe
Asp ser
340
Lys
Asn
Arg
Arg
Pro
345 ser
Asn
Thr
Al a
G1 u 350
Asp
Met
Phe
Tyr
Gly 355
Phe
He
Al a
Gly
Met
360
Asp
Thr
Phe
Al a
Leu
365
Gly
Leu
He
Lys
Al a 370
Al a
G1 n
He
He
Glu
375
Asp
Gly
Arg lie
Asp
380
G1 u
Phe
He
Lys
G1 u 385
Arg
Tyr ser ser
Tyr
390 ser
Thr
Gly
He
Gly 395
G1 U
Lys lie
Arg
Asn
400
Lys ser
Vai
Thr
Leu
405
G1 u
Glu cys
Al a
G1 u 410
Tyr
Al a
Al a
Lys
Leu
415
Lys
Lys
Pro
G1 U
Leu
420
Pro
G1 U ser
Gly
Arg 425
G1 П
G1 U
Tyr
Leu
G1 u
430
Thr
Vai
Vai
Asn
Asn
435
He
Leu
Phe
Asn ser
440
Lys
Leu <210> 39 <211> 439
- 65 037161 <212> Белок <213> Lachnospiraceae bacterium <400> 39
Met Lys Glu Phe Phe Pro Gly Ile 1 5 ser Pro Val Lys Phe Glu Gly Lys
15
Asp ser Lys Asn Pro Leu ser Phe 20
Lys Tyr Tyr Asp Ala Lys Arg Val 25 30
Ile Met Gly Lys Thr Met Glu Glu
40
His Leu ser Phe Ala Met Ala Trp 45
Trp His Asn Leu cys Ala cys Gly
55
Val Asp Met Phe Gly Gln Gly Thr
Ile Asp Lys ser Phe Gly Ala Leu 65 70
Pro Gly Thr Met Glu His Ala Lys
80
Ala Lys Val Asp Ala Gly Ile Glu 85
Phe Met Gln Lys Leu Gly Ile Lys
95
Tyr Tyr cys Phe His Asp Thr Asp
100
Ile Val Pro Glu Asp Gln Glu Asp
105 110
Ile Asn Val Thr Asn Ala Arg Leu
115 120
Asp Glu Ile Thr Asp Tyr Ile Leu 12 5
Glu Lys Thr Lys Gly Thr Asp Ile
130 135
Lys cys Leu Trp Thr Thr cys Asn
140
Met Phe ser Asn Pro Arg Phe Met
145 150
Asn Gly Ala Gly ser ser Asn ser
155 160
Ala Asp Val Phe cys Phe Ala Ala
165
Ala Gln Ala Lys Lys Gly Leu Glu
170 175
Asn Ala Val Lys Leu Gly Ala Lys
180
Gly Phe Val Phe Trp Gly Gly Arg
185 190
Glu Gly Tyr Glu Thr Leu Leu Asn
195 200
Thr Asp Met Lys Leu Glu Glu Glu 205
Asn Ile Ala Thr Leu Phe Thr Met
210 215 cys Arg Asp Tyr Gly Arg ser Ile 220
Gly Phe Met Gly Asp Phe Tyr Ile
225 230
Glu Pro Lys Pro Lys Glu Pro Met
235 240
Lys His Gln Tyr Asp Phe Asp Ala
245
Ala Thr Ala Ile Gly Phe Leu Arg
250 255
- 66 037161
Lys Tyr Gly Leu Glu Lys Asp Phe Lys Met Asn lie Glu Ala Asn His
260 265270
Ala Thr Leu Ala Gly His Thr Phe Gin His Glu Leu Arg Val cys Ala
275 280285
Val Asn Gly Met lie Gly ser Val Asp Ala Asn Gin Gly Asp Thr Leu
290 295300
Leu Gly Trp Asp Thr Asp Gin Phe Pro Thr Asn Val Tyr Asp Thr Thr
305 310 315320
Leu Ala Met Tyr Glu lie Leu Lys Ala Gly Gly Leu Arg Gly Gly Leu
325 330335
Asn Phe Asp ser Lys Asn Arg Arg Pro ser Asn Thr Ala Asp Asp Met
340 345350
Phe Tyr Gly Phe lie Ala Gly Met Asp Ala Phe Ala Leu Gly Leu lie
355 360365
Lys Ala Ala Glu lie lie Glu Asp Gly Arg lie Asp Glu Phe Val Lys
370 375380
Glu Arg Tyr ser ser Tyr Asn ser Gly lie Gly Glu Lys lie Arg Asn
385 390 395400
Arg Ala Val Thr Leu Val Glu cys Ala Glu Tyr Ala Ala Lys Leu Lys
405 410415
Lys Pro Glu Leu Pro Asp ser Gly Lys Gin Glu Tyr Leu Glu ser Val
420 425430
Val Asn Asn lie Leu Phe Gly
435 <210> 40 <211> 443 <212> Белок <213> некультивированная бактерия <400> 40
| Met ser Val 1 | Val | Leu Gly Asp Lys 5 | G1 U | Tyr 10 | Phe | Pro | Gly | Val | Gly 15 | Lys |
| lie Ala Tyr | G1 u 20 | Gly Pro Glu ser | Asp 25 | Asn | Pro | Leu | ser | Phe 30 | Lys | T rp |
| Tyr Asp Glu 35 | Asn | Arg Val Val Ala 40 | Gly | Lys | Thr | Leu | Lys 45 | Asp | Hi s | Phe |
| Lys Phe Ala | Val | cys Tyr Trp His | Thr | Phe | cys | Gly | Al a | Gly | Hi s | Asp |
55 60
- 67 037161 ser 65
Phe
Gly
Pro
Gly
Pro 70
Phe
Val
Phe
Pro
T rp 75
Gly
Al a
Gly ser
Asp 80
Al a
Leu ser
Arg
Al a 85
Lys
Met
Lys
Al a
Asp 90
Al a
Al a
Phe
G1 u
Phe 95
He
Thr
Lys
Leu
Gly 100
Val
Pro
Tyr
Tyr cys 105
Phe
Hi s
Asp
He
Asp 110
Leu
He
G1 u
G1 u
Gly 115 ser ser
Arg
Ala
G1 u 120
Thr
Al a
Lys
Arg
Val
5
Met
Asp
He
Val
G1 u 130
Tyr
Al a
Lys
G1 n
Lys 135
G1 n
Al a
Al a ser
Gly 140
Val
Lys
Leu
Leu
T rp 145
Gly
Thr
Al a
Asn
Leu
150
Phe ser
Asn
Pro
Arg 155
Tyr
He
Asn
Gly
Al a 160 ser
Thr
Asn
Pro
Asp 165
Phe
Ala
Val
Val
Al a 170
Hi s
Al a
Gly
Al a
G1 n 175
Leu
Lys
Asp
Al a
Leu
180
Asp
Al a
Thr
He
Al a 185
Leu
Gly
Gly
G1 U
Asn
190
Tyr
Val
Phe
T rp
Gly 195
Gly
Arg
G1 u
Gly
Tyr 200
Met ser
Pro
Leu
Asn
205
Thr
Asp
Met
Lys
Arg 210
G1 u
Val
G1 u
Arg
Phe 215
Al a
Arg
Phe
Leu
Thr
220
Met
Al a
Arg
Asp
Tyr
225
Al a
Arg
Gly
G1 n
Gly 2 30
Phe
Lys
Gly
Val
Phe
235
Phe
He
G1 U
Pro
Lys 240
Pro
Met
G1 U
Pro ser
245
Lys
His
G1 n
Tyr
Asp 250
Phe
Asp cys
Al a
Thr
255
Val
He
Gly
Phe
Leu
260
Arg
G1 n
Tyr
Gly
Leu
265
Asp
Lys
Asp
Phe
Lys 270
Leu
Asn
He
G1 U
Thr
275
Asn
Hi s
Al a
Thr
Leu
280
Al a
Gly
Hi s
Thr
Met
285
G1 u
Hi s
G1 u
Met
G1 n 290
Val
Al a
Al a
Asp
Ala 295
Gly
Met
Leu
Gly ser
300
He
Asp
Al a
Asn
Arg 305
Gly
Asp
Tyr
G1 n
Asn
310
Ala
T rp
Asp
Thr
Asp 315
G1 n
Phe
Pro
Asn
Asn
320
He
Asn
G1 U
Thr
Thr
325
G1 U
Met
Met
Leu
Val
330
Leu
Leu
Arg ser
Gly 335
Gly
- 68 037161
Phe Gin Gly Gly Gly Val Asn Phe Asp Ala Lys Arg Arg Arg Asn ser
340 345350
Thr Asp Pro Asn Asp Thr Phe His Gly His lie Gly Gly Met Asp Thr
355 360365
Phe Ala Arg ser Leu lie lie Ala Gly Asp lie Leu Glu Lys ser Pro
370 375380 lie Glu Lys Met Arg Lys Glu Arg Tyr Ala ser Phe Asp Ala Gly Lys
385 390 395400
Gly Ala Glu Phe Glu Ala Gly Lys Leu ser Leu Val Gin Leu Ala Glu
405 410415
Leu Gly Asn Lys Gly Gly Glu Pro Thr Gin Lys ser Gly Arg Gin Glu
420 425430
Leu Tyr Glu Asn lie Met Asn Arg Trp lie Arg
435440 <210> 41 <211> 442 <212> Белок <213> некультивированная бактерия <400> 41
Met Lys Leu Thr Val Gly Asp Lys Glu Tyr Phe Lys Gly lie Lys Pro 15 1015 lie Lys Phe Glu Gly Lys Asp ser Asp Asn Pro Leu Ala Phe Lys Tyr 20 2530
Tyr Asn Pro ser Gin Lys Val Gly Lys Lys Thr Met Glu Glu His Phe 35 4045
Arg Phe Ala lie Ala Tyr Trp His Thr Phe cys Gly Thr Gly Gly Asp 50 5560
Pro Phe Gly Pro Gly Thr Lys Thr Phe Pro Trp Leu Gin Asn ser Asp 65 70 7580
Ala Val Gin Arg Ala Tyr Asp Lys Met Asp Ala Ala Phe Glu Phe lie 85 9095
Thr Lys lie Gly Ala Pro Phe Tyr cys Phe His Asp Tyr Asp Leu Val
100 105110
Asp Glu Gly Pro Thr Leu Lys Glu ser Glu ser Arg Leu Gin Lys Val
115 120125
Val Asp Tyr Ala Lys Lys Lys Gin Lys Ala ser Gly Val Lys Leu Leu
- 69 037161
130 135 140
| T rp 145 | Gly Thr | Al a | Asn | Leu 150 | Phe | ser His | Pro Arg Tyr 155 | Met | Asn | Gly | Al a 160 |
| Al a | Thr Asn | Pro | Asp 165 | Phe | Asp | Vai Vai | cys Tyr Ala 170 | Al a | ser | G1 n 175 | Vai |
| Lys | Asn Ala | Leu 180 | Asp | Al a | Thr | He Ala 185 | Leu Gly Gly | Al a | Asn 190 | Tyr | Vai |
| Phe | Trp Gly 195 | Gly | Arg | G1 u | Gly | Tyr Met 200 | ser Leu Leu | Asn 205 | Thr | Asn | Met |
| Lys | Arg Glu 210 | G1 n | G1 u | Hi s | Met 215 | Ala Lys | Phe Leu His 220 | Met | Al a | Lys | Asp |
| Tyr 225 | Ala Arg | Al a | Asn | Gly 2 30 | Phe | Lys Gly | Thr Phe Phe 235 | He | G1 u | Pro | Lys 240 |
| Pro | Met Glu | Pro | ser 245 | Lys | His | Gin Tyr | Asp Phe Asp 250 | ser | Al a | Thr 255 | Vai |
| He | Gly Phe | Leu 260 | Arg | G1 П | Phe | Asp Leu 265 | Leu Gly Asp | Phe | Lys 2 70 | Leu | Asn |
| He | Glu Vai 275 | Asn | Hi s | Al a | Thr | Leu Ala 280 | His His Thr | Phe 285 | G1 n | Hi s | G1 u |
| Leu | Gin Vai 290 | Al a | Al a | Asp | Ala 295 | Gly Ala | Leu Gly ser 300 | He | Asp | Al a | Asn |
| Arg 305 | Gly Asp | Tyr | G1 n | Asn 310 | Gly | Trp Asp | Thr Asp Gin 315 | Phe | Pro | Asn | Asn 320 |
| Leu | Tyr Glu | Leu | Al a 325 | G1 u | ser | Met Leu | Vai lie Leu 330 | G1 u | Al a | Gly 335 | Gly |
| Phe | Lys ser | Gly 340 | Gly | Vai | Asn | Phe Asp 345 | Ala Lys Thr | Arg | Arg 350 | Asn | ser |
| Thr | Asp Leu 355 | Vai | Asp | lie | Phe | His Ala 360 | His He Gly | Gly 365 | Met | Asp | Thr |
| Phe | Ala Arg 370 | ser | Leu | Leu | He 375 | Al a G1n | Ala Vai Leu 380 | Asp | Asn | Gly | G1 u |
| Tyr 385 | Thr Lys | He | Arg | Lys 390 | Asp | Arg Tyr | ser ser Phe 395 | Asp | ser | Gly | Lys 400 |
| Gly | Lys G1n | Phe | Asp 405 | G1 n | Gly | Lys Leu | ser Leu Glu 410 | Asp | Leu | Arg 415 | Asn |
- 70 037161
Leu Ala His Lys Ala Gly Glu Pro
420
Lys Gin Leu ser Gly Lys Gin Glu 425 430
Tyr lie Glu Asn Leu lie ser Arg
435 440
Phe He <210> 42 <211> 387 <212> Белок <213> Thermus thermophilus <400> 42
Met Tyr Glu Pro Lys Pro Glu His 1 5
Arg Phe Thr Phe Gly Leu Trp Thr
15
Val Gly Asn Val Gly Arg Asp Pro 20
Phe Gly Asp Ala Val Arg Glu Arg 25 30
Leu Asp Pro Val Tyr Val Val His
40
Lys Leu Ala Glu Leu Gly Ala Tyr 45
Gly Val Asn Leu His Asp Glu Asp
55
Leu lie Pro Arg Gly Thr Pro Pro 60
Gin Glu Arg Asp Gin lie Val Arg 65 70
Arg Phe Lys Lys Ala Leu Asp Glu 75 80
Thr Gly Leu Lys Val Pro Met Val 85
Thr Ala Asn Leu Phe ser Asp Pro
95
Ala Phe Lys Asp Gly Ala Phe Thr
100 ser Pro Asp Pro Trp Val Arg Ala
105 110
Tyr Ala Leu Arg Lys ser Leu Glu
115 120
Thr Met Asp Leu Gly Ala Glu Leu 12 5
Gly Ala Glu lie Tyr Val Val Trp
130 135
Pro Gly Arg Glu Gly Ala Glu Val
140
Glu Ala Thr Gly Lys Ala Arg Lys
145 150
Val Trp Asp Trp Val Arg Glu Ala
155 160
Leu Asn Phe Met Ala Ala Tyr Ala
165
Glu Asp Gin Gly Tyr Gly Tyr Arg
170 175
Phe Ala Leu Glu Pro Lys Pro Asn
180
Glu Pro Arg Gly Asp lie Tyr Phe
185 190
Ala Thr Val Gly ser Met Leu Ala
195 200
Phe lie His Thr Leu Asp Arg Pro
205
- 71 037161
Glu Arg Phe Gly Leu Asn Pro Glu
210 215
Phe Ala His Glu Thr Met Ala Gly
220
Leu Asn Phe Vai His Ala Vai Ala 225 230
Gin Ala Leu Asp Ala Gly Lys Leu
235 240
Phe His lie Asp Leu Asn Asp Gin
245
Arg Met ser Arg Phe Asp Gin Asp
250 255
Leu Arg Phe Gly ser Glu Asn Leu
260
Lys Ala Ala Phe Phe Leu Val Asp 265 270
Leu Leu Glu ser ser Gly Tyr Gin
275 280
Gly Pro Arg His Phe Asp Ala His 285
Ala Leu Arg Thr Glu Asp Glu Glu
290 295
Gly Val Trp Ala Phe Ala Arg Gly
300 cys Met Arg Thr Tyr Leu lie Leu
305 310
Lys Glu Arg Ala Glu Ala Phe Arg
315 320
Glu Asp Pro Glu Vai Lys Glu Leu
325
Leu Ala Ala Tyr Tyr Gin Glu Asp
330 335
Pro Ala Ala Leu Ala Leu Leu Gly
340
Pro Tyr ser Arg Glu Lys Ala Glu
345 350
Ala Leu Lys Arg Ala Glu Leu Pro
355 360
Leu Glu Ala Lys Arg Arg Arg Gly 365
Tyr Ala Leu Glu Arg Leu Asp Gin
370 375
Leu Ala Val Glu Tyr Leu Leu Gly
380
Vai Arg Gly 385 <210> 43 <211> 440 <212> Белок <213> Escherichia coli <400> 43
Met Gin Ala Tyr Phe Asp Gin Leu
5
Asp Arg Val Arg Tyr Glu Gly ser
15
Lys ser ser Asn Pro Leu Ala Phe 20
Arg His Tyr Asn Pro Asp Glu Leu 25 30
Val Leu Gly Lys Arg Met Glu Glu
40
His Leu Arg Phe Ala Ala cys Tyr 45
Trp His Thr Phe cys Trp Asn Gly
55
Ala Asp Met Phe Gly Val Gly Ala 60
- 72 037161
Phe 65
Asn
Arg
Pro
T rp
G1 n 70
Gin
Pro
Gly
G1 U
Al a 75
Leu
Al a
Leu
Al a
Lys 80
Arg
Lys
Al a
Asp
Vai 85
Al a
Phe
G1 u
Phe
Phe 90
Hi s
Lys
Leu
Hi s
Vai 95
Pro
Phe
Tyr cys
Phe
100
Hi s
Asp
Vai
Asp
Vai
105 ser
Pro
G1 u
Gly
Al a 110 ser
Leu
Lys
G1 u
Tyr 115
He
Asn
Asn
Phe
Al a 120
G1 n
Met
Vai
Asp
Vai
5
Leu
Al a
Gly
Lys
G1 n 130
G1 u
G1 u ser
Gly
Vai
135
Lys
Leu
Leu
T rp
Gly 140
Thr
Al a
Asn cys
Phe
145
Thr
Asn
Pro
Arg
Tyr 150
Gly
Al a
Gly
Al a
Al a 155
Thr
Asn
Pro
Asp
Pro
160
G1 U
Vai
Phe ser
T rp 165
Al a
Ala
Thr
G1 n
Vai
170
Vai
Thr
Al a
Met
G1 u 175
Al a
Thr
Hi s
Lys
Leu
180
Gly
Gly
Glu
Asn
Tyr 185
Vai
Leu
T rp
Gly
Gly 190
Arg
G1 U
Gly
Tyr
G1 u 195
Thr
Leu
Leu
Asn
Thr
200
Asp
Leu
Arg
G1 n
G1 u 205
Arg
G1 u
G1 n
Leu
Gly 210
Arg
Phe
Met
G1 n
Met
215
Vai
Vai
G1 u
Hi s
Lys 220
Hi s
Lys
He
Gly
Phe
225
G1 П
Gly
Thr
Leu
Leu 2 30
He
G1 U
Pro
Lys
Pro
235
G1 П
G1 U
Pro
Thr
Lys 240
Hi s
G1 n
Tyr
Asp
Tyr
245
Asp
Ala
Al a
Thr
Vai
250
Tyr
Gly
Phe
Leu
Lys 255
G1 n
Phe
Gly
Leu
G1 u 260
Lys
G1 u
He
Lys
Leu
265
Asn
He
G1 U
Al a
Asn
270
Hi s
Al a
Thr
Leu
Al a 275
Gly
Hi s ser
Phe
Hi s 280
Hi s
Glu
He
Al a
Thr
285
Al a
He
Al a
Leu
Gly 290
Leu
Phe
Gly ser
Vai
295
Asp
Al a
Asn
Arg
Gly 300
Asp
Al a
G1 n
Leu
Gly 305
T rp
Asp
Thr
Asp
G1 n 310
Phe
Pro
Asn ser
Vai
315
G1 u
G1 u
Asn
Al a
Leu
320
Vai
Met
Tyr
G1 u
He
325
Leu
Lys
Al a
Gly
Gly 330
Phe
Thr
Thr
Gly
Gly 335
Leu
- 73 037161
Asn Phe Asp Ala Lys Val Arg Arg Gin ser Thr Asp Lys Tyr Asp Leu
340 345350
Phe Tyr Gly His lie Gly Ala Met Asp Thr Met Ala Leu Ala Leu Lys
355 360365 lie Ala Ala Arg Met lie Glu Asp Gly Glu Leu Asp Lys Arg lie Ala
370 375380
Gin Arg Tyr ser Gly Trp Asn ser Glu Leu Gly Gin Gin lie Leu Lys 385 390 395400
Gly Gin Met ser Leu Ala Asp Leu Ala Lys Tyr Ala Gin Glu His His
405 410415
Leu ser Pro Val His Gin ser Gly Arg Gin Glu Gin Leu Glu Asn Leu
420 425430
Val Asn His Tyr Leu Phe Asp Lys
435440 <210> 44 <211> 600 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 44
Met Leu cys ser Val lie Gin Arg Gin Thr Arg Glu Val ser Asn Thr
1015
Met ser Leu Asp ser Tyr Tyr Leu Gly Phe Asp Leu ser Thr Gin Gin 20 2530
Leu Lys cys Leu Ala lie Asn Gin Asp Leu Lys lie Val His ser Glu 35 4045
Thr Val Glu Phe Glu Lys Asp Leu Pro His Tyr His Thr Lys Lys Gly 50 5560
Val Tyr lie His Gly Asp Thr lie Glu cys Pro Val Ala Met Trp Leu 65 70 7580
Glu Ala Leu Asp Leu Val Leu ser Lys Tyr Arg Glu Ala Lys Phe Pro 85 9095
Leu Asn Lys Val Met Ala Val ser Gly ser cys Gin Gin His Gly ser
100 105110
Val Tyr Trp ser ser Gin Ala Glu ser Leu Leu Glu Gin Leu Asn Lys
115 120125
Lys Pro Glu Lys Asp Leu Leu His Tyr Val ser ser Val Ala Phe Ala
- 74 037161
130 135140
Arg Gin Thr Ala Pro Asn Trp Gin Asp His ser Thr Ala Lys Gin cys
145 150 155160
Gin Glu Phe Glu Glu cys lie Gly Gly Pro Glu Lys Met Ala Gin Leu
165 170175
Thr Gly ser Arg Ala His Phe Arg Phe Thr Gly Pro Gin lie Leu Lys
180 185190 lie Ala Gin Leu Glu Pro Glu Ala Tyr Glu Lys Thr Lys Thr lie ser
195 200205
Leu Val ser Asn Phe Leu Thr ser lie Leu Val Gly His Leu Val Glu
210 215220
Leu Glu Glu Ala Asp Ala cys Gly Met Asn Leu Tyr Asp lie Arg Glu
225 230 235240
Arg Lys Phe ser Asp Glu Leu Leu His Leu lie Asp ser ser ser Lys
245 250255
Asp Lys Thr lie Arg Gin Lys Leu Met Arg Ala Pro Met Lys Asn Leu
260 265270 lie Ala Gly Thr lie cys Lys Tyr Phe lie Glu Lys Tyr Gly Phe Asn
275 280285
Thr Asn cys Lys Val ser Pro Met Thr Gly Asp Asn Leu Ala Thr lie
290 295300 cys ser Leu Pro Leu Arg Lys Asn Asp Val Leu Val ser Leu Gly Thr
305 310 315320 ser Thr Thr Val Leu Leu Val Thr Asp Lys Tyr His Pro ser Pro Asn
325 330335
Tyr His Leu Phe lie His Pro Thr Leu Pro Asn His Tyr Met Gly Met
340 345350 lie cys Tyr cys Asn Gly ser Leu Ala Arg Glu Arg lie Arg Asp Glu
355 360365
Leu Asn Lys Glu Arg Glu Asn Asn Tyr Glu Lys Thr Asn Asp Trp Thr
370 375380
Leu Phe Asn Gin Ala Val Leu Asp Asp ser Glu ser ser Glu Asn Glu
385 390 395400
Leu Gly Val Tyr Phe Pro Leu Gly Glu lie Val Pro ser Val Lys Ala
405 410415
- 75 037161
| lie Asn | Lys Arg 420 | Val | He | Phe | Asn | Pro 42 5 | Lys Thr | Gly Met | lie 430 | G1 U | Arg | ||||
| G1 u | Val | Al a 435 | Lys | Phe | Lys | Asp | Lys 440 | Arg | Hi s | Asp | Al a | Lys 445 | Asn | He | Val |
| G1 u | ser 450 | G1 n | Al a | Leu | ser | cys 455 | Arg | Val | Arg | He | ser 460 | Pro | Leu | Leu | ser |
| Asp 465 | ser | Asn | Al a | ser | ser 470 | Gin | G1 n | Arg | Leu | Asn 475 | G1 u | Asp | Thr | He | Val 480 |
| Lys | Phe | Asp | Tyr | Asp 485 | G1 u | ser | Pro | Leu | Arg 490 | Asp | Tyr | Leu | Asn | Lys 495 | Arg |
| Pro | G1 u | Arg | Thr 500 | Phe | Phe | Val | Gly | Gly 505 | Al a | ser | Lys | Asn | Asp 510 | Al a | He |
| Val | Lys | Lys 515 | Phe | Al a | G1 n | Val | He 520 | Gly | Al a | Thr | Lys | Gly 525 | Asn | Phe | Arg |
| Leu | G1 U 530 | Thr | Pro | Asn | ser | cys 535 | Al a | Leu | Gly | Gly | cys 540 | Tyr | Lys | Al a | Met |
| T rp 545 | ser | Leu | Leu | Tyr | Asp 550 | ser | Asn | Lys | He | Al a 555 | Val | Pro | Phe | Asp | Lys 560 |
| Phe | Leu | Asn | Asp | Asn 565 | Phe | Pro | T rp | Hi s | Val 570 | Met | G1 u | ser | lie | ser 575 | Asp |
| Val Asp ser Glu <210> <211> <212> <213> <400> | Asn Glu Asn Trp 580 Leu Glu Lys Thr 595 45 62 3 Белок Pi chi a stipitis 45 | Asp Leu | Arg He 600 | Tyr 585 | Asn | ser | Lys | He | Val 590 | Pro | Leu | ||||
| Met 1 | Thr | Thr | Thr | Pro 5 | Phe | Asp | Al a | Pro | Asp 10 | Lys | Leu | Phe | Leu | Gly 15 | Phe |
| Asp | Leu | ser | Thr 20 | G1 n | G1 n | Leu | Lys | He 25 | He | Val | Thr | Asp | G1 u 30 | Asn | Leu |
| Al a | Al a | Leu 35 | Lys | Thr | Tyr | Asn | Val 40 | G1 u | Phe | Asp | ser | He 45 | Asn | ser | ser |
- 76 037161
Val Gin Lys Gly Val lie Ala lie Asn Asp Glu lie ser Lys Gly Ala 55 60
He
He ser
Pro
Val
Tyr 70
Met
T rp
Leu
Asp
Al a 75
Leu
Asp
Hi s
Val
Phe 80
G1 u
Asp
Met
Lys
Lys 85
Asp
Gly
Phe
Pro
Phe 90
Asn
Lys
Val
Val
Gly 95
He ser
Gly ser cys 100
G1 n
G1 n
His
Gly ser
105
Val
Tyr
T rp ser
Arg 110
Thr
Al a
G1 u
Lys
Val
115
Leu ser
G1 u
Leu
Asp
120
Al a
G1 u ser ser
Leu
5 ser ser
G1 n
Met
Arg
130 ser
Al a
Phe
Thr
Phe
135
Lys
Hi s
Al a
Pro
Asn
140
T rp
G1 n
Asp
Hi s ser
145
Thr
Gly
Lys
G1 u
Leu
150
Glu
G1 U
Phe
G1 u
Arg 155
Val
He
Gly
Al a
Asp
160
Al a
Leu
Al a
Asp
He
165 ser
Gly ser
Arg
Al a 170
Hi s
Tyr
Arg
Phe
Thr
175
Gly
Leu
G1 n
He
Arg 180
Lys
Leu ser
Thr
Arg 185
Phe
Lys
Pro
G1 u
Lys 190
Tyr
Asn
Arg
Thr
Al a 195
Arg
He ser
Leu
Val
200 ser ser
Phe
Val
Al a 205 ser
Val
Leu
Leu
Gly 210
Arg
He
Thr ser
He
215
G1 u
G1 U
Al a
Asp
Al a 220 cys
Gly
Met
Asn
Leu
225
Tyr
Asp
He
G1 U
Lys 2 30
Arg
G1 U
Phe
Asn
G1 u 235
G1 u
Leu
Leu
Al a
He
240
Al a
Al a
Gly
Val
Hi s 245
Pro
Glu
Leu
Asp
Gly 250
Val
G1 u
G1 n
Asp
Gly
255
G1 u
He
Tyr
Arg
Al a 260
Gly lie
Asn
G1 u
Leu
265
Lys
Arg
Lys
Leu
Gly 270
Pro
Val
Lys
Pro
He
275
Thr
Tyr
G1 u ser
G1 u 280
Gly
Asp
He
Al a ser
285
Tyr
Phe
Val
Thr
Arg 290
Tyr
Gly
Phe
Asn
Pro
295
Asp cys
Lys
He
Tyr
300 ser
Phe
Thr
Gly
Asp 305
Asn
Leu
Al a
Thr
He
310
He ser
Leu
Pro
Leu
315
Al a
Pro
Asn
Asp
Al a 320
Leu
He ser
Leu
Gly
Thr ser
Thr
Thr
Val
Leu
He
He
Thr
Lys
Asn
- 77 037161
| 325 | 330 | 335 | |
| Tyr | Ala Pro ser ser Gln Tyr His 340 | Leu Phe Lys 345 | His Pro Thr Met Pro 350 |
| Asp | His Tyr Met Gly Met Ile cys | Tyr cys Asn | Gly ser Leu Ala Arg |
355
360
365
G1 u
Lys 370
Val
Arg
Asp
G1 u
Val
375
Asn
G1 u
Lys
Phe
Asn
380
Val
G1 u
Asp
Lys
Lys 385 ser
T rp
Asp
Lys
Phe
390
Asn
G1 U lie
Leu
Asp 395
Lys ser
Thr
Asp
Phe
400
Asn
Asn
Lys
Leu
Gly 405
Ile
Tyr
Phe
Pro
Leu
410
Gly
G1 u
Ile
Val
Pro
415
Asn
Al a
Al a
Al a
G1 n
420
Ile
Lys
Arg ser
Val
5
Leu
Asn ser
Lys
Asn
430
G1 u
Ile
Val
Asp
Val
435
G1 u
Leu
Gly
Asp
Lys 440
Asn
T rp
G1 n
Pro
G1 u 445
Asp
Asp
Val ser ser
450
Ile
Val
G1 u ser
Gln
455
Thr
Leu ser cys
Arg 460
Leu
Arg
Thr
Gly
Pro
465
Met
Leu ser
Lys ser
470
Gly
Asp ser ser
Al a 475 ser ser ser
Al a ser
480
Pro
G1 n
Pro
G1 u
Gly 485
Asp
Gly
Thr
Asp
Leu
490
Hi s
Lys
Val
Tyr
G1 n 495
Asp
Leu
Val
Lys
Lys 500
Phe
Gly
Asp
Leu
Tyr 505
Thr
Asp
Gly
Lys
Lys 510
G1 n
Thr
Phe
G1 u ser
515
Leu
Thr
Al a
Arg
Pro
520
Asn
Arg cys
Tyr
Tyr
525
Val
Gly
Gly
Al a ser
530
Asn
Asn
Gly ser
Ile
535
Ile
Arg
Lys
Met
Gly 540 ser
Ile
Leu
Al a
Pro
545
Val
Asn
Gly
Asn
Tyr 550
Lys
Val
Asp
Ile
Pro
555
Asn
Al a cys
Al a
Leu
560
Gly
Gly
Al a
Tyr
Lys
565
Al a ser
T rp ser
Tyr
570
G1 u cys
G1 u
Al a
Lys
575
Lys
Glu
T rp
Ile
Gly 580
Tyr
Asp
Gln
Tyr
Ile
585
Asn
Arg
Leu
Phe
Glu
590
Val ser
Asp
G1 u
Met
595
Asn ser
Phe
Glu
Val
600
Lys
Asp
Lys
T rp
Leu
605
G1 u
Tyr
Al a
- 78 037161
Asn Gly Val Gly
610
Met Leu Ala
615
Lys
Met
G1 U ser
G1 u 620
Leu
Lys
Hi s <210>
<211>
<212>
<213>
575 Белок Hypocrea jecorina <400>
Met 1 ser
G1 u
G1 u
Lys 5
Gly
Pro
Leu
Tyr
Leu 10
Gly
Phe
Asp
Leu ser 15
Thr
G1 n
G1 n
Leu
Lys 20
Al a
He
Val
Val
Asn 25 ser
Asn
Leu
Lys ser 30
He
Al a
G1 u
Al a
Lys 35
Val
Asp
Phe
Asp
G1 n 40
Asp
Phe
Gly
Pro
G1 n 45
Tyr
Gly
He
G1 n
Lys 50
Gly
Val
Hi s
Val
Arg 55
G1 u ser
Thr
Gly
G1 u 60
Val
Phe
Al a
Pro
Val 65
Al a
Leu
T rp
Leu
G1 u 70 ser
Leu
Asp
Leu
Val 75
Leu ser
Arg
Leu ser 80
Lys
Al a
Met
Hi s
Pro 85
Leu
Pro
Met ser
Arg 90
He
Arg
Gly
Val ser 95
Gly ser
Gly
G1 n
G1 n 100
Hi s
Gly
Ala
Val
Phe
105
T rp
Asn
Al a ser
Al a 110
G1 u
G1 u
Leu
Leu
Gly 115
Gly
Leu
Asp
Ala
Al a 120
Lys
Gly ser
Leu
Val
5
G1 u
G1 n
Leu
Arg
Gly 130
Al a
Leu
Al a
Hi s
Glu
135
Phe
Al a
Pro
Asn
T rp 140
G1 n
Asp
Hi s ser
Thr
145
G1 n
G1 u
G1 U
Leu
Val
150
Ala
Phe
Asp
Al a
G1 u 155
Leu
Gly
Asp
Arg
G1 u 160
Lys
Leu
Al a
G1 u
Val
165
Thr
Gly ser
Gly
Al a 170
Hi s
Hi s
Arg
Phe
Thr
175
Gly
Leu
G1 n
He
Met
180
Arg
He
Arg
Arg
Val
185
Leu
Pro
G1 П
Val
Tyr 190
Al a
Asn
Al a
Lys
Arg 195
He ser
Leu
Val ser
200 ser
T rp
Leu
Al a ser
205
Val
Leu
Met
Gly ser
210
He
Al a
Pro
Leu
Asp 215
Val ser
Asp
Val cys
220
Gly
Met
Asn
Leu
- 79 037161
Trp Asp lie Pro Asn Gin Ala Trp ser Glu Lys
225 230 235
Leu Leu Ala Leu ser
240
Gly
Gly
Gly
Gly
Leu
245
Asp
Gly
Al a
Al a
Asn
250
Leu
Arg
Arg
Lys
Leu
255
Gly
G1 U
Pro
Arg
Met
260
Asp
Gly
Gly
Gly ser
265
Met
Gly ser
He ser
270
Arg
Tyr
Tyr
Val ser
275
Lys
Tyr
Gly
Phe ser
280
Pro
G1 u cys
G1 n
He
285
Thr
Pro
Phe
Thr
Gly 290
Asp
Asn
Pro
Al a
Thr
295
He
Leu
Al a
Leu
Pro
300
Leu
Arg
Pro
Leu
Asp 305
Al a
He
Val ser
Leu
310
Gly
Thr ser
Thr
Thr
315
Phe
Leu
Met
Asn
Thr
320
Pro
Al a
Tyr
Lys
Pro
325
Asp
Gly ser
Tyr
Hi s 330
Phe
Phe
Asn
Hi s
Pro
335
Thr
Thr
Pro
Gly
Asn
340
Tyr
Met
Phe
Met
Leu
345 cys
Tyr
Lys
Asn
Gly 350
Gly
Leu
Al a
Arg
G1 u
355
Lys
Val
Arg
Asp
Thr
360
Leu
Pro
Lys
Pro
G1 u 365
Gly
Gly
Al a
Thr
Gly 370
T rp
G1 u
Thr
Phe
Asn
375
G1 u
Al a
He
Met
Al a 380
Thr
Lys
Pro
Leu
Gly 385 lie
G1 u ser
Asp
Gly 390
Asp
Arg
Al a
Lys
Leu
395
Gly
Leu
Tyr
Phe
Tyr
400
Leu
Arg
G1 u
Thr
Val
405
Pro
Asn
He
Arg
Al a 410
Gly
Thr
T rp
Arg
Phe
415
Thr cys
Arg
G1 n
Asp
420
Gly ser
Asp
Leu
G1 n
5
G1 u
Al a
Arg
G1 u
Al a 430
T rp
Pro
Lys
G1 u
Al a 435
Asp
Al a
Arg
Ala
He
440
Val
G1 u ser
G1 n
Al a 445
Leu ser
Met
Arg
Leu
450
Arg ser
G1 n
Lys
Leu
455
Val
Hi s ser
Pro
Arg 460
Asp
Gly
Leu
Pro
Al a 465
G1 n
Pro
Arg
Arg
He
470
Tyr
Val
Val
Gly
Gly 475
Gly ser
Leu
Asn
Pro
480
Al a lie
Thr
Arg
Val
485
Leu
Gly
G1 u
Val
Leu
490
Gly
Gly
Al a
Asp
Gly 495
Val
Tyr
Lys
Leu
Asp
Val
Gly
Gly
Asn
Al a cys
Al a
Leu
Gly
Gly
Al a
Tyr
- 80 037161
| 500 | 505 | 510 | |
| Lys Ala Leu 515 | Trp Ala Leu | Glu Arg Lys Asp 520 | Gly Glu Thr Phe Asp Asp 525 |
| Leu lie Gly 530 | Gly Arg Trp | Thr Glu Glu Gly 535 | ser lie Asp Lys Val Asp 540 |
| Val Gly Tyr 545 | Arg Glu Gly 550 | Thr Tyr Glu Arg | Tyr Gly Lys Val Leu Gly 555 560 |
| Ala Phe Glu | Glu Met Glu 565 | Arg Arg Leu Leu 570 | Ala Glu Glu Glu His 575 |
<210> 47 <211> 335 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 47
Met ser Glu Pro Ala Gin Lys Lys Gin Lys Val Ala Asn Asn ser Leu 15 1015
Glu Gin Leu Lys Ala ser Gly Thr Val Val Val Ala Asp Thr Gly Asp 20 2530
Phe Gly ser lie Ala Lys Phe Gin Pro Gin Asp ser Thr Thr Asn Pro 35 4045 ser Leu lie Leu Ala Ala Ala Lys Gin Pro Thr Tyr Ala Lys Leu lie 50 5560
Asp Val Ala Val Glu Tyr Gly Lys Lys His Gly Lys Thr Thr Glu Glu 65 70 7580
Gin Val Glu Asn Ala Val Asp Arg Leu Leu Val Glu Phe Gly Lys Glu 85 9095 lie Leu Lys lie Val Pro Gly Arg Val ser Thr Glu Val Asp Ala Arg
100 105110
Leu ser Phe Asp Thr Gin Ala Thr lie Glu Lys Ala Arg His lie lie
115 120125
Lys Leu Phe Glu Gin Glu Gly Val ser Lys Glu Arg Val Leu lie Lys
130 135140 lie Ala ser Thr Trp Glu Gly lie Gin Ala Ala Lys Glu Leu Glu Glu
145 150 155160
Lys Asp Gly lie His cys Asn Leu Thr Leu Leu Phe ser Phe Val Gin
165 170175
- 81 037161
Al a Val Al a cys Al a G1 u Al a G1 n Val
180 185
Thr Leu lie ser Pro Phe Val
190
Gly Arg lie Leu Asp Trp Tyr Lys ser
195 200 ser Thr Gly Lys Asp Tyr Lys 205
Gly Glu Ala Asp Pro Gly Val lie ser
210 215
Val Lys Lys lie Tyr Asn Tyr
220
Tyr Lys Lys Tyr Gly Tyr Lys Thr lie 225 230
Val Met Gly Ala ser Phe Arg
235 240 ser Thr Asp Glu lie Lys Asn Leu Ala 245
Gly Val Asp Tyr Leu Thr lie
250 255 ser Pro Ala Leu Leu Asp Lys Leu Met
260 265
Asn ser Thr Glu Pro Phe Pro
270
Arg Val Leu Asp Pro Val ser Ala Lys
275 280
Lys Glu Ala Gly Asp Lys lie
285 ser Tyr lie ser Asp Glu ser Lys Phe
290 295
Arg Phe Asp Leu Asn Glu Asp
300
Ala Met Ala Thr Glu Lys Leu ser Glu 305 310
Gly lie Arg Lys Phe ser Ala
315 320
Asp lie Val Thr Leu Phe Asp Leu lie
325
Glu Lys Lys Val Thr Ala
330 335 <210> 48 <211> 333 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 48
Met ser Glu Pro ser Glu Lys Lys Gin 1 5
Lys Val Ala Thr ser ser Leu
15
Glu Gin Leu Lys Lys Ala Gly Thr His
25
Val Val Ala Asp ser Gly Asp
Phe Glu Ala lie ser Lys Tyr Glu Pro
40
Gin Asp ser Thr Thr Asn Pro 45 ser Leu lie Leu Ala Ala ser Lys Leu
55
Glu Lys Tyr Ala Arg Phe lie 60
Asp Ala Ala Val Glu Tyr Gly Arg Lys 65 70
His Gly Lys Thr Asp His Glu
80
Lys lie Glu Asn Ala Met Asp Lys lie
Leu Val Glu Phe Gly Thr Gin
- 82 037161
95 lie Leu Lys Vai Vai Pro Gly Arg
100
Vai ser Thr Glu Vai Asp Ala Arg
105 110
Leu ser Phe Asp Lys Lys Ala Thr
115 120
Vai Lys Lys Ala Leu His lie lie 12 5
Lys Leu Tyr Lys Asp Ala Gly Vai
130 135
Pro Lys Glu Arg Vai Leu lie Lys
140 lie Ala ser Thr Trp Glu Gly lie
145 150
Gin Ala Ala Arg Glu Leu Glu Vai
155 160
Lys His Gly lie His cys Asn Met
165
Thr Leu Leu Phe ser Phe Thr Gin
170 175
Ala Vai Ala cys Ala Glu Ala Asn
180
Vai Thr Leu lie ser Pro Phe Vai
185 190
Gly Arg lie Met Asp Phe Tyr Lys
195 200
Ala Leu ser Gly Lys Asp Tyr Thr 205
Ala Glu Thr Asp Pro Gly Vai Leu
210 215 ser Vai Lys Lys lie Tyr ser Tyr 220
Tyr Lys Arg His Gly Tyr Ala Thr 225 230
Glu Vai Met Ala Ala ser Phe Arg
235 240
Asn Leu Asp Glu Leu Lys Ala Leu
245
Ala Gly lie Asp Asn Met Thr Leu
250 255
Pro Leu Asn Leu Leu Glu Gin Leu
260
Tyr Glu ser Thr Asp Pro lie Glu 265 270
Asn Lys Leu Asn ser Glu ser Ala
275 280
Lys Glu Glu Gly Vai Glu Lys Vai
285 ser Phe lie Asn Asp Glu Pro His
290 295
Phe Arg Tyr Vai Leu Asn Glu Asp
300
Gin Met Ala Thr Glu Lys Leu ser
305 310
Asp Gly lie Arg Lys Phe ser Ala
315 320
Asp lie Glu Ala Leu Tyr Lys Leu 325
Vai G1u G1u Lys Met
330 <210> 49 <211> 323 <212> Белок <213> scheffersomyces stipitis <400> 49
- 83 037161
Met 1 ser ser
Asn ser 5
Leu
Glu
G1 П
Leu
Lys 10
Al a
Thr
Gly
Thr
Vai 15
He
Vai
Thr
Asp
Thr 20
Gly
G1 u
Phe
Asp ser 25
He
Al a
Lys
Tyr
Thr 30
Pro
G1 n
Asp
Al a
Thr 35
Thr
Asn
Pro ser
Leu 40
He
Leu
Al a
Al a
Al a 45
Lys
Lys
Pro
G1 u
Tyr 50
Al a
Lys
Vai
He
Asp 55
Vai
Al a
He
G1 U
Tyr 60
Al a
Lys
Asp
Lys
Gly 65 ser ser
Lys
Lys
G1 u 70
Lys
Al a
G1 u
He
Al a 75
Leu
Asp
Arg
Leu
Leu 80 lie
G1 u
Phe
Gly
Lys 85
Asn
He
Leu
Al a
He
Vai
Pro
Gly
Arg
Vai 95 ser
Thr
G1 u
Vai
Asp
100
Al a
Arg
Leu ser
Phe
105
Asp
Lys
G1 u
Al a
Thr
110
He
Lys
Lys
Al a
Leu
115
G1 u
Leu
He
Ala
Leu
120
Tyr
G1 u ser
G1 n
Gly 12 5
He ser
Lys
Asp
Arg
130
He
Leu
He
Lys
He
135
Al a ser
Thr
Trp
G1 u 140
Gly
He
G1 П
Al a
Al a 145
Arg
G1 u
Leu
G1 U
Al a 150
Lys
Hi s
Gly
He
Hi s 155 cys
Asn
Leu
Thr
Leu
160
Leu
Phe ser
Phe
Vai
165
G1 n
Ala
Vai
Al a cys 170
Al a
G1 u
Al a
Lys
Vai
175
Thr
Leu
He ser
Pro
180
Phe
Vai
Gly
Arg
He
185
Leu
Asp
T rp
Tyr
Lys 190
Al a ser
Thr
Gly
Lys 195
Thr
Tyr
G1 u
Gly
Asp 200
G1 u
Asp
Pro
Gly
Vai
205
He ser
Vai
Arg
Al a 210
He
Tyr
Asn
Tyr
Tyr 215
Lys
Lys
Tyr
Gly
Tyr 220
Lys
Thr
He
Vai
Met
225
Gly
Al a ser
Phe
Arg 2 30
Asn
Thr
Gly
G1 u
He
235
Lys
Al a
Leu
Al a
Gly 240 cys
Asp
Tyr
Leu
Thr
245
Vai
Ala
Pro
Lys
Leu
250
Leu
Glu
Glu
Leu
Leu
255
Asn ser
Thr
G1 u
Pro
260
Vai
Pro
Gin
Vai
Leu
265
Asp
Al a
Al a ser
Al a 270 ser
Al a
- 84 037161
Thr Asp Val Glu Lys Val ser Tyr
275 280
Val Asp Asp Glu Ala Thr Phe Arg
285
Tyr Leu Phe Asn Glu Asp Ala Met
290 295
Ala Thr Glu Lys Leu Ala Gin Gly
300 lie Arg Ala Phe Gly Lys Asp Ala
305 310
Val Thr Leu Leu Glu Gin Leu Glu
315 320
Ala Arg Phe <210> 50 <211> 680 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 50
Met Thr Gin Phe Thr Asp lie Asp 1 5
Lys Leu Ala Val ser Thr lie Arg
15 lie Leu Ala Val Asp Thr Val ser 20
Lys Ala Asn ser Gly His Pro Gly 25 30
Ala Pro Leu Gly Met Ala Pro Ala
40
Ala His Val Leu Trp ser Gin Met 45
Arg Met Asn Pro Thr Asn Pro Asp
55
Trp lie Asn Arg Asp Arg Phe Val 60
Leu ser Asn Gly His Ala Val Ala 65 70
Leu Leu Tyr ser Met Leu His Leu 75 80
Thr Gly Tyr Asp Leu ser lie Glu 85
Asp Leu Lys Gin Phe Arg Gin Leu
95
Gly ser Arg Thr Pro Gly His Pro
100
Glu Phe Glu Leu Pro Gly Val Glu
105 110
Val Thr Thr Gly Pro Leu Gly Gin
115 120
Gly lie ser Asn Ala Val Gly Met 12 5
Ala Met Ala Gin Ala Asn Leu Ala
130 135
Ala Thr Tyr Asn Lys Pro Gly Phe
140
Thr Leu ser Asp Asn Tyr Thr Tyr
145 150
Val Phe Leu Gly Asp Gly cys Leu
155 160
Gin Glu Gly lie ser ser Glu Ala
165 ser ser Leu Ala Gly His Leu Lys
170 175
Leu Gly Asn Leu lie Ala lie Tyr
180
Asp Asp Asn Lys lie Thr lie Asp 185 190
- 85 037161
Gly Ala Thr ser lie ser Phe Asp Glu Asp Val Ala Lys Arg Tyr Glu
195 200205
Ala Tyr Gly Trp Glu Val Leu Tyr Val Glu Asn Gly Asn Glu Asp Leu
210 215220
Ala Gly lie Ala Lys Ala lie Ala Gin Ala Lys Leu ser Lys Asp Lys 225 230 235240
Pro Thr Leu lie Lys Met Thr Thr Thr lie Gly Tyr Gly ser Leu His
245 250255
Ala Gly ser His ser Val His Gly Ala Pro Leu Lys Ala Asp Asp Val
260 265270
Lys Gin Leu Lys ser Lys Phe Gly Phe Asn Pro Asp Lys ser Phe Val
275 280285
Val Pro Gin Glu Val Tyr Asp His Tyr Gin Lys Thr lie Leu Lys Pro
290 295300
Gly Val Glu Ala Asn Asn Lys Trp Asn Lys Leu Phe ser Glu Tyr Gin
305 310 315320
Lys Lys Phe Pro Glu Leu Gly Ala Glu Leu Ala Arg Arg Leu ser Gly
325 330335
Gin Leu Pro Ala Asn Trp Glu ser Lys Leu Pro Thr Tyr Thr Ala Lys
340 345350
Asp ser Ala Val Ala Thr Arg Lys Leu ser Glu Thr Val Leu Glu Asp
355 360365
Val Tyr Asn Gin Leu Pro Glu Leu lie Gly Gly ser Ala Asp Leu Thr
370 375380
Pro ser Asn Leu Thr Arg Trp Lys Glu Ala Leu Asp Phe Gin Pro Pro
385 390 395400 ser ser Gly ser Gly Asn Tyr ser Gly Arg Tyr lie Arg Tyr Gly lie
405 410415
Arg Glu His Ala Met Gly Ala lie Met Asn Gly lie ser Ala Phe Gly
420 425430
Ala Asn Tyr Lys Pro Tyr Gly Gly Thr Phe Leu Asn Phe Val ser Tyr
435 440445
Ala Ala Gly Ala Val Arg Leu ser Ala Leu ser Gly His Pro Val lie
450 455460
- 86 037161
| T rp 465 | Val | Al a | Thr | Hi s | Asp 470 | ser | He | Gly | Val | Gly 475 | G1 u | Asp | Gly | Pro | Thr 480 |
| Hi s | G1 n | Pro | He | G1 u 485 | Thr | Leu | Al a | Hi s | Phe 490 | Arg | ser | Leu | Pro | Asn 495 | He |
| G1 n | Val | T rp | Arg 500 | Pro | Al a | Asp | Gly | Asn 505 | G1 u | Val | ser | Al a | Al a 510 | Tyr | Lys |
| Asn | ser | Leu 515 | G1 u | ser | Lys | His | Thr 520 | Pro | ser | He | He | Al a 525 | Leu | ser | Arg |
| G1 n | Asn 530 | Leu | Pro | G1 n | Leu | Glu 535 | Gly | ser | ser | He | G1 U 540 | ser | Al a | ser | Lys |
| Gly 545 | Gly | Tyr | Val | Leu | G1 n 550 | Asp | Val | Al a | Asn | Pro 555 | Asp | He | He | Leu | Val 560 |
| Al a | Thr | Gly | ser | G1 u 565 | Val | ser | Leu | ser | Val 570 | G1 u | Al a | Al a | Lys | Thr 575 | Leu |
| Al a | Al a | Lys | Asn 580 | He | Lys | Ala | Arg | Val 585 | Val | ser | Leu | Pro | Asp 590 | Phe | Phe |
| Thr | Phe | Asp 595 | Lys | G1 П | Pro | Leu | G1 u 600 | Tyr | Arg | Leu | ser | Val 605 | Leu | Pro | Asp |
| Asn | Val 610 | Pro | He | Met | ser | Val 615 | G1 u | Val | Leu | Al a | Thr 620 | Thr | cys | T rp | Gly |
| Lys 62 5 | Tyr | Al a | Hi s | G1 n | ser 630 | Phe | Gly | He | Asp | Arg 635 | Phe | Gly | Al a | ser | Gly 640 |
| Lys | Al a | Pro | G1 u | Val 645 | Phe | Lys | Phe | Phe | Gly 650 | Phe | Thr | Pro | G1 u | Gly 655 | Val |
| Al a | G1 u | Arg | Al a 660 | G1 n | Lys | Thr | He | Al a 665 | Phe | Tyr | Lys | Gly | Asp 670 | Lys | Leu |
| He | ser | Pro 675 | Leu | Lys | Lys | Ala | Phe 680 | ||||||||
| <210> <211> ι <212> 1 <213> I | 51 581 Белок saccharomyces cerevisiae | ||||||||||||||
| <400> | 51 | ||||||||||||||
| Met 1 | Al a | G1 n | Phe | ser 5 | Asp | He | Asp | Lys | Leu 10 | Al a | Val | ser | Thr | Leu 15 | Arg |
| Leu | Leu | ser | Val | Asp | G1 n | Val | G1 U | ser | Al a | G1 n | ser | Gly | Hi s | Pro | Gly |
- 87 037161
Al a
Pro
Leu 35
Gly
Leu
Al a
Pro
Val 40
Al a
Hi s
Val
He
Phe 45
Lys
G1 n
Leu
Arg cys 50
Asn
Pro
Asn
Asn
Glu 55
Hi s
T rp
He
Asn
Arg 60
Asp
Arg
Phe
Val
Leu 65 ser
Asn
Gly
Hi s ser 70 cys
Al a
Leu
Leu
Tyr 75 ser
Met
Leu
Hi s
Leu 80
Leu
Gly
Tyr
Asp
Tyr 85 ser
He
G1 U
Asp
Leu 90
Arg
G1 П
Phe
Arg
G1 n 95
Val
Asn ser
Arg
Thr
100
Pro
Gly
His
Pro
G1 u 105
Phe
Hi s ser
Al a
Gly 110
Val
G1 u
He
Thr ser
115
Gly
Pro
Leu
Gly
G1 n 120
Gly
He ser
Asn
Al a
5
Val
Gly
Met
Al a
He
130
Al a
G1 n
Al a
Asn
Phe
135
Al a
Al a
Thr
Tyr
Asn
140
G1 u
Asp
Gly
Phe
Pro
145
He ser
Asp ser
Tyr 150
Thr
Phe
Al a
He
Val
155
Gly
Asp
Gly cys
Leu
160
G1 П
G1 U
Gly
Val ser
165 ser
Glu
Thr ser ser
170
Leu
Al a
Gly
Hi s
Leu
175
G1 n
Leu
Gly
Asn
Leu
180
He
Thr
Phe
Tyr
Asp 185 ser
Asn ser
He ser
190
He
Asp
Gly
Lys
Thr
195 ser
Tyr ser
Phe
Asp 200
G1 u
Asp
Val
Leu
Lys 205
Arg
Tyr
G1 u
Al a
Tyr 210
Gly
T rp
Glu
Val
Met
215
Glu
Val
Asp
Lys
Gly 220
Asp
Asp
Asp
Met
G1 u 225 ser
He ser ser
Al a 2 30
Leu
G1 U
Lys
Al a
Lys 235
Leu ser
Lys
Asp
Lys 240
Pro
Thr
He
He
Lys 245
Val
Thr
Thr
Thr
He
250
Gly
Phe
Gly ser
Leu
255
G1 n
| Gin Gly Thr Ala | Gly Val | His | Gly | ser Ala 265 | Leu | Lys Ala Asp 270 | Asp | Val | |||||||
| 260 | |||||||||||||||
| Lys | G1 n | Leu | Lys | Lys | Arg | T rp | Gly | Phe | Asp | Pro | Asn | Lys | ser | Phe | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Val | Pro | G1 n | G1 U | Val | Tyr | Asp | Tyr | Tyr | Lys | Lys | Thr | Val | Val | G1 u | Pro |
290
295
300
- 88 037161
Gly 305
Gl η
Lys
Leu
Asn
Gl u 310
Glu
T rp
Asp
Arg
Met
315
Phe
Gl u
Gl u
Tyr
Lys 320
Thr
Lys
Phe
Pro
Gl u 325
Lys
Gly
Lys
Gl u
Leu
330
Gl n
Arg
Arg
Leu
Asn
335
Gly
Gl u
Leu
Pro
Gl u 340
Gly
T rp
Glu
Lys
Hi s 345
Leu
Pro
Lys
Phe
Thr
350
Pro
Asp
Asp
Asp
Al a 355
Leu
Al a
Thr
Arg
Lys 360
Thr ser
Gl n
Gl n
Val
365
Leu
Thr
Asn
Met
Val
370
Gl n
Vai
Leu
Pro
Glu
375
Leu
He
Gly
Gly ser
380
Al a
Asp
Leu
Thr
Pro
385 ser
Asn
Leu
Thr
Arg 390
T rp
Gl u
Gly
Al a
Val
395
Asp
Phe
Gl n
Pro
Pro
400 lie
Thr
Gl n
Leu
Gly 405
Asn
Tyr
Al a
Gly
Arg 410
Tyr lie
Arg
Tyr
Gly 415
Vai
Arg
Gl U
Hi s
Gly 420
Met
Gly
Ala
He
Met
5
Asn
Gly lie ser
Al a 430
Phe
Gly
Al a
Asn
Tyr
435
Lys
Pro
Tyr
Gly
Gly 440
Thr
Phe
Leu
Asn
Phe
445
Vai ser
Tyr
Al a
Al a 450
Gly
Al a
Vai
Arg
Leu
455
Al a
Al a
Leu ser
Gly 460
Asn
Pro
Vai
He
T rp 465
Vai
Al a
Thr
Hi s
Asp 470 ser
He
Gly
Leu
Gly 475
Gl U
Asp
Gly
Pro
Thr
480
Hi s
Gl n
Pro
He
Gl u 485
Thr
Leu
Al a
Hi s
Leu
490
Arg
Al a
He
Pro
Asn
495
Met
Hi s
Val
T rp
Arg 500
Pro
Al a
Asp
Gly
Asn
505
Gl u
Thr ser
Al a
Al a 510
Tyr
Tyr ser
Al a
He
515
Lys ser
Gly
Arg
Thr
520
Pro ser
Val
Val
Al a 525
Leu ser
Arg
Gl n
Asn
530
Leu
Pro
Gl n
Leu
Glu
535
Hi s ser ser
Phe
Gl u 540
Lys
Al a
Leu
Lys
Gly 545
Gly
Tyr
Val lie
Hi s 550
Asp
Val
Gl u
Asn
Pro
555
Asp
He
He
Leu
Val
560 ser
Thr
Gly ser
Glu
565
Val ser
He ser
He
570
Asp
Al a
Al a
Lys
Lys
575
Leu
- 89 037161
| Tyr Asp | Thr | Lys 580 | Lys | He | Lys | Al a | Arg 585 | Vai | Vai | ser | Leu | Pro 590 | Asp | Phe | |
| Туг | Thr | Phe 595 | Asp | Arg | Gin | Ser | Glu 600 | Glu | Tyr | Arg | Phe | Ser 605 | Vai | Leu | Pro |
| Asp | Gly 610 | Vai | Pro | He | Met | ser 615 | Phe | G1 u | Vai | Leu | Al a 620 | Thr | ser | ser | T rp |
| Gly 62 5 | Lys | Tyr | Al a | Hi s | G1 n 630 | ser | Phe | Gly | Leu | Asp 635 | G1 u | Phe | Gly | Arg | ser 640 |
| Gly | Lys | Gly | Pro | G1 u 645 | He | Tyr | Lys | Leu | Phe 650 | Asp | Phe | Thr | Al a | Asp 655 | Gly |
| Vai Al a Leu Leu <210> <211> । <212> 1 <213> <400> | ser Arg Ala Glu 660 ser Pro Met Gly 675 52 577 Белок Pi chi a stipitis 52 | Lys Arg | Thr Al a 680 | He 665 Phe | Asn | Tyr | Tyr | Lys | Gly 670 | Lys | G1 n | ||||
| Met 1 | ser | ser | Vai | Asp 5 | G1 П | Lys | Al a | He | ser 10 | Thr | He | Arg | Leu | Leu 15 | Al a |
| Vai | Asp | Al a | Vai 20 | Al a | Al a | Al a | Asn | ser 25 | Gly | Hi s | Pro | Gly | Al a 30 | Pro | Leu |
| Gly | Leu | Al a 35 | Pro | Al a | Al a | His | Al a 40 | Vai | Phe | Lys | Lys | Met 45 | Arg | Phe | Asn |
| Pro | Lys 50 | Asp | Thr | Lys | T rp | He 55 | Asn | Arg | Asp | Arg | Phe 60 | Vai | Leu | ser | Asn |
| Gly 65 | Hi s | Al a | cys | Al a | Leu 70 | Leu | Tyr | ser | Met | Leu 75 | Vai | Leu | Tyr | Gly | Tyr 80 |
| Asp | Leu | Thr | Vai | G1 u 85 | Asp | Leu | Lys | Lys | Phe 90 | Arg | G1 n | Leu | Gly | ser 95 | Lys |
| Thr | Pro | Gly | Hi s 100 | Pro | G1 U | Asn | Thr | Asp 105 | Vai | Pro | Gly | Al a | G1 u 110 | Vai | Thr |
| Thr | Gly | Pro 115 | Leu | Gly | G1 П | Gly | He 120 | cys | Asn | Gly | Vai | Gly 12 5 | He | Al a | Leu |
| Al a | G1 n | Al a | G1 n | Phe | Al a | Al a | Thr | Tyr | Asn | Lys | Pro | Asp | Phe | Pro | He |
- 90 037161
130 135140 ser Asp ser Tyr Thr Tyr Val Phe Leu Gly Asp Gly cys Leu Met Glu
145 150 155160
Gly Val ser ser Glu Ala ser ser Leu Ala Gly His Leu Gin Leu Gly
165 170175
Asn Leu lie Ala Phe Trp Asp Asp Asn Lys lie ser lie Asp Gly ser
180 185190
Thr Glu Val Ala Phe Thr Glu Asp Val lie Ala Arg Tyr Lys ser Tyr
195 200205
Gly Trp His lie Val Glu Val ser Asp Ala Asp Thr Asp lie Thr Ala
210 215220 lie Ala Ala Ala lie Asp Glu Ala Lys Lys Val Thr Asn Lys Pro Thr
225 230 235240
Leu Val Arg Leu Thr Thr Thr lie Gly Phe Gly ser Leu Ala Gin Gly
245 250255
Thr His Gly Val His Gly Ala Pro Leu Lys Ala Asp Asp lie Lys Gin
260 265270
Leu Lys Thr Lys Trp Gly Phe Asn Pro Glu Glu ser Phe Ala Val Pro
275 280285
Ala Glu Val Thr Ala ser Tyr Asn Glu His Val Ala Glu Asn Gin Lys
290 295300 lie Gin Gin Gin Trp Asn Glu Leu Phe Ala Ala Tyr Lys Gin Lys Tyr
305 310 315320
Pro Glu Leu Gly Ala Glu Leu Gin Arg Arg Leu Asp Gly Lys Leu Pro
325 330335
Glu Asn Trp Asp Lys Ala Leu Pro Val Tyr Thr Pro Ala Asp Ala Ala
340 345350
Val Ala Thr Arg Lys Leu ser Glu lie Val Leu ser Lys lie lie Pro
355 360365
Glu Val Pro Glu lie lie Gly Gly ser Ala Asp Leu Thr Pro ser Asn
370 375380
Leu Thr Lys Ala Lys Gly Thr Val Asp Phe Gin Pro Ala Ala Thr Gly
385 390 395400
Leu Gly Asp Tyr ser Gly Arg Tyr lie Arg Tyr Gly Val Arg Glu His
405 410415
- 91 037161
Al a
Met
Gly
Al a 420
Ile
Met
Asn
Gly
Ile
5
Al a
Al a
Phe
Gly
Al a 430
Asn
Tyr
Lys
Asn
Tyr
435
Gly
Gly
Thr
Phe
Leu
440
Asn
Phe
Val ser
Tyr
445
Al a
Al a
Gly
Al a
Val
450
Arg
Leu ser
Al a
Leu
455 ser
G1 u
Phe
Pro
Ile
460
Thr
T rp
Val
Al a
Thr
465
Hi s
Asp ser
Ile
Gly 470
Leu
Gly
G1 u
Asp
Gly 475
Pro
Thr
Hi s
G1 n
Pro
480
Ile
G1 u
Thr
Leu
Al a 485
Hi s
Phe
Arg
Al a
Thr
490
Pro
Asn
Ile ser
Val
495
T rp
Arg
Pro
Al a
Asp
500
Gly
Asn
Glu
Thr ser
505
Al a
Al a
Tyr
Lys ser
510
Al a
Ile
G1 U ser
Thr
515
Hi s
Thr
Pro
His
Ile
520
Leu
Al a
Leu
Thr
Arg 525
G1 n
Asn
Leu
Pro
G1 n 530
Leu
G1 u
Gly ser ser
535
Ile
G1 u
Lys
Al a ser
540
Lys
Gly
Gly
Tyr
Thr
545
Leu
Val
G1 n
G1 n
Asp 550
Lys
Al a
Asp
Ile
Ile
555
Ile
Val
Al a
Thr
Gly 560 ser
G1 U
Val ser
Leu
565
Al a
Val
Asp
Al a
Leu
570
Lys
Val
Leu
G1 u
Gly 575
G1 n
Gly
Ile
Lys
Al a 580
Gly
Val
Val ser
Leu
585
Pro
Asp
G1 n
Leu
Thr
590
Phe
Asp
Lys
G1 n ser
595
G1 u
G1 U
Tyr
Lys
Leu
600 ser
Val
Leu
Pro
Asp 605
Gly
Val
Pro
Ile
Leu
610 ser
Val
G1 u
Val
Met
615 ser
Thr
Phe
Gly
T rp 620 ser
Lys
Tyr ser
Hi s
5
G1 n
G1 n
Phe
Gly
Leu
630
Asn
Arg
Phe
Gly
Al a 635 ser
Gly
Lys
Al a
Pro
640
G1 u
Ile
Phe
Lys
Leu
645
Phe
Glu
Phe
Thr
Pro
650
G1 u
Gly
Val
Al a
G1 u 655
Arg
Al a
Al a
Lys
Thr
660
Val
Al a
Phe
Tyr
Lys 665
Gly
Lys
Asp
Val
Val
670 ser
Pro
Leu Arg ser Ala Phe
675
- 92 037161 <210> 53 <211> 348 <212> Белок <213> saccharomyces cerevisiae <400> 53
Met ser lie Pro Glu Thr Gin Lys 1 5
Gly Val lie Phe Tyr Glu ser His
15
Gly Lys Leu Glu Tyr Lys Asp lie 20
Pro Val Pro Lys Pro Lys Ala Asn 25 30
Glu Leu Leu lie Asn Val Lys Tyr
40 ser Gly Val cys His Thr Asp Leu 45
His Ala Trp His Gly Asp Trp Pro
55
Leu Pro Val Lys Leu Pro Leu Val 60
Gly Gly His Glu Gly Ala Gly Val 65 70
Val Val Gly Met Gly Glu Asn Val
80
Lys Gly Trp Lys lie Gly Asp Tyr 85
Ala Gly lie Lys Trp Leu Asn Gly
95 ser cys Met Ala cys Glu Tyr cys
100
Glu Leu Gly Asn Glu ser Asn cys
105 110
Pro His Ala Asp Leu ser Gly Tyr
115 120
Thr His Asp Gly ser Phe Gin Gin 12 5
Tyr Ala Thr Ala Asp Ala Val Gin
130 135
Ala Ala His lie Pro Gin Gly Thr
140
Asp Leu Ala Gin Val Ala Pro lie
145 150
Leu cys Ala Gly lie Thr Val Tyr
155 160
Lys Ala Leu Lys ser Ala Asn Leu
165
Met Ala Gly His Trp Val Ala lie
170 175 ser Gly Ala Ala Gly Gly Leu Gly
180 ser Leu Ala Val Gin Tyr Ala Lys
185 190
Ala Met Gly Tyr Arg Val Leu Gly
195 200 lie Asp Gly Gly Glu Gly Lys Glu
205
Glu Leu Phe Arg ser lie Gly Gly
210 215
Glu Val Phe lie Asp Phe Thr Lys
220
Glu Lys Asp lie Val Gly Ala Val
225 230
Leu Lys Ala Thr Asp Gly Gly Ala
235 240
His Gly Val lie Asn Val ser Val ser Glu Ala Ala lie Glu Ala ser
- 93 037161
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Arg | Tyr | Val 260 | Arg | Al a | Asn | Gly | Thr 265 | Thr | Val | Leu | Val | Gly 270 | Met | Pro |
| Al a | Gly | Al a 275 | Lys | Cys | Cys | Ser | Asp 280 | Val | Phe | Asn | Gin | Val 285 | Val | Lys | ser |
| He | ser 290 | He | Val | Gly | ser | Tyr 295 | Val | Gly | Asn | Arg | Al a 300 | Asp | Thr | Arg | G1 u |
| Al a 305 | Leu | Asp | Phe | Phe | Al a 310 | Arg | Gly | Leu | Val | Lys 315 | ser | Pro | He | Lys | Val 320 |
| Val | Gly | Leu | ser | Thr 325 | Leu | Pro | G1 u | He | Tyr 330 | G1 u | Lys | Met | G1 U | Lys 335 | Gly |
| G1 n | He | Val | Gly 340 | Arg | Tyr | Val | Val | Asp 345 | Thr | ser | Lys |
<210> 54 <211> 1329 <212> ДНК <213> Eubacterium saburreum <400> 54
| atgaaggaat | tcttcccagg | tatttctcca | gttaagttcg | aaggtagaga | ctctaagaac | 60 |
| ccattgtctt | tcaagtacta | cgacgctaag | agagttatta | tgggtaagac | catggaagaa | 120 |
| cacttgtctt | tcgctatggc | ttggtggcac | aacttgtgtg | cttgtggtgt | tgacatgttc | 180 |
| ggtcaaggta | ccgttgacaa | gtctttcggt | gaatcttctg | gtaccatgga | acacgctaga | 240 |
| gctaaggttg | acgctggtat | tgaattcatg | aagaagttgg | gtattaagta | ctactgtttc | 300 |
| cacgacaccg | acattgttcc | agaagaccaa | gaagacatta | acgttaccaa | cgctagattg | 360 |
| gacgaaatta | ccgactacat | tttggaaaag | accaaggaca | ccgacattaa | gtgtttgtgg | 420 |
| accacctgta | acatgttctc | taacccaaga | ttcatgaacg | gtgctggttc | ttctaactct | 480 |
| gctgacgttt | tctgtttcgc | tgctgctcaa | gctaagaagg | gtttggaaaa | cgctgttaag | 540 |
| ttgggtgcta | agggtttcgt | tttctggggt | ggtagagaag | gttacgaaac | cttgttgaac | 600 |
| accgacatga | agttggaaga | agaaaacatt | gctaccttgt | tcaccatgtg | tagagactac | 660 |
| ggtagatcta | ttggtttcat | gggtgacttc | tacattgaac | caaagccaaa | ggaaccaatg | 720 |
| aagcaccaat | acgacttcga | cgctgctacc | gctattggtt | tcttgagaaa | gtacggtttg | 780 |
| gacaaggact | tcaagttgaa | cattgaagct | aaccacgcta | ccttggctgg | tcacaccttc | 840 |
| caacacgaat | tgagagtttg | tgctgttaac | ggtatgatgg | gttctgttga | cgctaaccaa | 900 |
| ggtgacacct | tgttgggttg | ggacaccgac | caattcccaa | ccaacgttta | cgacaccacc | 960 |
| ttggctatgt | acgaaatttt | gaaggctggt | ggtttgagag | gtggtttgaa | cttcgactct | 1020 |
| aagaacagaa gacaccttcg | gaccatctaa ctttgggttt | caccgctgac gattaaggct | gacatgttct gctgaaatta | acggtttcat ttgaagacgg | tgctggtatg tagaattgac | 1080 1140 |
| gacttcgtta | aggaaagata | cgcttcttac | aactctggta | ttggtaagaa | gattagaaac | 1200 |
| agaaaggtta | ccttgattga | atgtgctgaa | tacgctgcta | agttgaagaa | gccagaattg | 1260 |
| ccagaatctg | gtagacaaga | atacttggaa | tctgttgtca | acaacatttt | gttcggtggt | 1320 |
tctggttaa 1329
- 94 037161
Claims (11)
1. Последовательность олигонуклеотида, обладающего активностью промотора и характеризующегося тем, что он повышает скорость транскрипции РНК типа фрагмента матричной РНК, кодирующего белок, выбранный из группы, состоящей из ферментов, структурных белков, коферментов, переносчиков, антител, гормонов и регуляторов, типа фрагмента регуляторной РНК, типа фрагмента ферментативно активной РНК или типа фрагмента транспортной РНК, причем последовательность данного олигонуклеотида по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 1.
2. Последовательность олигонуклеотида по п.1, где последовательность данного олигонуклеотида по меньшей мере на 85% идентична последовательности SEQ ID NO: 1.
3. Последовательность олигонуклеотида по п.1 или 2, при этом скорость транскрипции фрагмента РНК в дрожжевых клетках-хозяевах повышается по меньшей мере в 2 раза при выращивании дрожжевых клеток-хозяев, трансформированных по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим этот олигонуклеотид, как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, галактозы, ксилозы, арабинозы, сахарозы, трегалозы, рафинозы, глицерина, этанола, ацетата и лактата.
4. Последовательность олигонуклеотида по п.1 или 2, при этом активность фермента, кодируемого фрагментом РНК, контролируемым этим олигонуклеотидом в дрожжевых клетках-хозяевах, повышается по меньшей мере в 2 раза при выращивании дрожжевых клеток-хозяев, трансформированных по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК, включающим этот олигонуклеотид, как минимум на двух субстратах, выбранных из группы, состоящей из глюкозы, маннозы, фруктозы, галактозы, ксилозы, арабинозы, сахарозы, трегалозы, рафинозы, глицерина, этанола, ацетата и лактата.
5. Последовательность олигонуклеотида по любому из предыдущих пунктов, при этом фермент является модифицирующим углеводы ферментом.
6. Последовательность олигонуклеотида по любому из предыдущих пунктов, при этом фермент является модифицирующим углеводы ферментом, выбранным из группы, состоящей из EC 5.1.3, EC 5.3.1, EC 2.7.1, EC 2.2.1, EC 2.2.1 и EC 1.1.1.
7. Последовательность олигонуклеотида по любому из предыдущих пунктов, при этом белок выбран из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-53.
8. Последовательность олигонуклеотида по любому из предыдущих пунктов, при этом от 1 до 80 нуклеотидов подверглись замене, делеции или вставке.
9. Рекомбинантный фрагмент ДНК, включающий последовательность олигонуклеотида по любому из пп.1-8.
10. Экспрессионная плазмида, содержащая по меньшей мере один рекомбинантный фрагмент ДНК по п.9.
11. Клетка-хозяин, трансформированная по меньшей мере одним рекомбинантным фрагментом ДНК по п.9 либо трансформированная по меньшей мере одной экспрессионной плазмидой по п.10.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP14195026.1A EP3026116B1 (en) | 2014-11-26 | 2014-11-26 | Oligonucleotide sequence for use in pathway engineering |
| PCT/EP2015/076715 WO2016083180A1 (en) | 2014-11-26 | 2015-11-16 | Oligonucleotide sequence for use in pathway engineering |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EA201791156A1 EA201791156A1 (ru) | 2017-09-29 |
| EA037161B1 true EA037161B1 (ru) | 2021-02-12 |
Family
ID=52000679
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| EA201791156A EA037161B1 (ru) | 2014-11-26 | 2015-11-16 | Последовательности олигонуклеотидов для применения в конструировании путей |
Country Status (17)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US10400244B2 (ru) |
| EP (1) | EP3026116B1 (ru) |
| CN (1) | CN108064291B (ru) |
| AR (1) | AR102762A1 (ru) |
| AU (1) | AU2015352801B2 (ru) |
| BR (1) | BR112017011182B1 (ru) |
| CA (1) | CA2967751C (ru) |
| DK (1) | DK3026116T3 (ru) |
| EA (1) | EA037161B1 (ru) |
| ES (1) | ES2626804T3 (ru) |
| HR (1) | HRP20170884T1 (ru) |
| HU (1) | HUE032941T2 (ru) |
| MY (1) | MY176630A (ru) |
| PL (1) | PL3026116T3 (ru) |
| RS (1) | RS56018B1 (ru) |
| SI (1) | SI3026116T1 (ru) |
| WO (1) | WO2016083180A1 (ru) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20210017526A1 (en) * | 2018-03-27 | 2021-01-21 | Basf Se | Xylose metabolizing yeast |
| DK3690052T3 (da) * | 2019-01-29 | 2023-06-19 | Clariant Produkte Deutschland Gmbh | Kimær promotor til anvendelse i metabolsk manipulation |
| US20210062178A1 (en) * | 2019-06-21 | 2021-03-04 | The Regents Of The University Of California | Novel xylose isomerase gene and polypeptide and uses thereof |
Citations (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2003095627A1 (en) * | 2002-05-08 | 2003-11-20 | Forskarpatent I Syd Ab | A modified yeast consuming l-arabinose |
| WO2010062597A1 (en) * | 2008-10-27 | 2010-06-03 | Butamax™ Advanced Biofuels LLC | Carbon pathway optimized production hosts for the production of isobutanol |
| JP2010136627A (ja) * | 2008-12-09 | 2010-06-24 | Nippon Oil Corp | 酵母にガラクトースを利用させる方法 |
| WO2010151866A2 (en) * | 2009-06-26 | 2010-12-29 | Archer Daniels Midland Company | Improvement of ethanol yield and reduction of biomass accumulation in the recombinant strain of saccharomyces cerevisiae overexpressing atp degrading the enzymes |
| DE102012007491A1 (de) * | 2012-04-11 | 2013-10-17 | Evonik Industries Ag | Neue Enzyme |
| WO2014035458A1 (en) * | 2012-08-29 | 2014-03-06 | Mascoma Corporation | Expression of enzymes in yeast for lignocellulose derived oligomer cbp |
| WO2014080024A2 (en) * | 2012-11-23 | 2014-05-30 | Dsm Ip Assets B.V. | Itaconic acid and itaconate methylester production |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7504493B2 (en) * | 1997-01-23 | 2009-03-17 | The John Hopkins University | Characterization of the yeast transcriptome |
| CN102060930B (zh) * | 2010-11-30 | 2013-05-29 | 上海交通大学 | hHscFv-Rcr功能蛋白及转基因烟草的制备方法 |
| US8669076B1 (en) | 2013-03-11 | 2014-03-11 | E I Du Pont De Nemours And Company | Cow rumen xylose isomerases active in yeast cells |
-
2014
- 2014-11-26 RS RS20170511A patent/RS56018B1/sr unknown
- 2014-11-26 EP EP14195026.1A patent/EP3026116B1/en active Active
- 2014-11-26 DK DK14195026.1T patent/DK3026116T3/en active
- 2014-11-26 PL PL14195026T patent/PL3026116T3/pl unknown
- 2014-11-26 ES ES14195026.1T patent/ES2626804T3/es active Active
- 2014-11-26 HU HUE14195026A patent/HUE032941T2/en unknown
- 2014-11-26 SI SI201430240T patent/SI3026116T1/sl unknown
-
2015
- 2015-11-16 EA EA201791156A patent/EA037161B1/ru unknown
- 2015-11-16 CN CN201580064337.1A patent/CN108064291B/zh active Active
- 2015-11-16 MY MYPI2017000774A patent/MY176630A/en unknown
- 2015-11-16 AU AU2015352801A patent/AU2015352801B2/en not_active Ceased
- 2015-11-16 WO PCT/EP2015/076715 patent/WO2016083180A1/en active Application Filing
- 2015-11-16 US US15/529,577 patent/US10400244B2/en active Active
- 2015-11-16 CA CA2967751A patent/CA2967751C/en active Active
- 2015-11-16 BR BR112017011182-9A patent/BR112017011182B1/pt active IP Right Grant
- 2015-11-24 AR ARP150103828A patent/AR102762A1/es unknown
-
2017
- 2017-06-09 HR HRP20170884TT patent/HRP20170884T1/hr unknown
Patent Citations (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2003095627A1 (en) * | 2002-05-08 | 2003-11-20 | Forskarpatent I Syd Ab | A modified yeast consuming l-arabinose |
| WO2010062597A1 (en) * | 2008-10-27 | 2010-06-03 | Butamax™ Advanced Biofuels LLC | Carbon pathway optimized production hosts for the production of isobutanol |
| JP2010136627A (ja) * | 2008-12-09 | 2010-06-24 | Nippon Oil Corp | 酵母にガラクトースを利用させる方法 |
| WO2010151866A2 (en) * | 2009-06-26 | 2010-12-29 | Archer Daniels Midland Company | Improvement of ethanol yield and reduction of biomass accumulation in the recombinant strain of saccharomyces cerevisiae overexpressing atp degrading the enzymes |
| DE102012007491A1 (de) * | 2012-04-11 | 2013-10-17 | Evonik Industries Ag | Neue Enzyme |
| WO2014035458A1 (en) * | 2012-08-29 | 2014-03-06 | Mascoma Corporation | Expression of enzymes in yeast for lignocellulose derived oligomer cbp |
| WO2014080024A2 (en) * | 2012-11-23 | 2014-05-30 | Dsm Ip Assets B.V. | Itaconic acid and itaconate methylester production |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| SI3026116T1 (sl) | 2017-10-30 |
| EP3026116B1 (en) | 2017-03-15 |
| HRP20170884T1 (hr) | 2017-09-08 |
| RS56018B1 (sr) | 2017-09-29 |
| HUE032941T2 (en) | 2017-11-28 |
| PL3026116T3 (pl) | 2017-09-29 |
| BR112017011182B1 (pt) | 2024-02-15 |
| CA2967751A1 (en) | 2016-06-02 |
| BR112017011182A2 (pt) | 2018-02-06 |
| CN108064291A (zh) | 2018-05-22 |
| MY176630A (en) | 2020-08-19 |
| US10400244B2 (en) | 2019-09-03 |
| ES2626804T3 (es) | 2017-07-26 |
| US20170314029A1 (en) | 2017-11-02 |
| AR102762A1 (es) | 2017-03-22 |
| EA201791156A1 (ru) | 2017-09-29 |
| DK3026116T3 (en) | 2017-06-06 |
| BR112017011182A8 (pt) | 2022-08-30 |
| AU2015352801A1 (en) | 2017-05-25 |
| WO2016083180A1 (en) | 2016-06-02 |
| AU2015352801B2 (en) | 2018-11-01 |
| CN108064291B (zh) | 2022-01-11 |
| EP3026116A1 (en) | 2016-06-01 |
| CA2967751C (en) | 2020-08-11 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN106687576B (zh) | 用于提高乙醇生产的改变的宿主细胞途径 | |
| US8778652B2 (en) | Pentose fermentation by a recombinant microorganism | |
| EP2977382A2 (en) | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same | |
| EP2576804B1 (en) | Pentose fermentation by a recombinant microorganism | |
| AU2013348272A1 (en) | Pentose fermentation by a recombinant microorganism | |
| US20130295631A1 (en) | Combinatorial design of highly efficient heterologous pathways | |
| WO2008155665A2 (en) | Method for enhancing cellobiose utilization | |
| EA037161B1 (ru) | Последовательности олигонуклеотидов для применения в конструировании путей | |
| US9732338B2 (en) | Promoter and use thereof | |
| CN111757931A (zh) | 变体g6p g7p葡糖淀粉酶组合物及方法 | |
| EP3690052B1 (en) | Chimeric promoter for use in metabolic engineering | |
| JP2015012852A (ja) | 微細藻類バイオマスを原料とするバイオ燃料の製造方法 | |
| WO2020023890A1 (en) | Increased alcohol production from yeast producing an increased amount of active crz1 protein | |
| CN113272438A (zh) | 重组酵母和使用其的乙醇的制造方法 |