DK2268810T3 - Fremgangsmåde til modifikation af målregion i værts-DNA og selekterbar markørkassette - Google Patents
Fremgangsmåde til modifikation af målregion i værts-DNA og selekterbar markørkassette Download PDFInfo
- Publication number
- DK2268810T3 DK2268810T3 DK09725848.7T DK09725848T DK2268810T3 DK 2268810 T3 DK2268810 T3 DK 2268810T3 DK 09725848 T DK09725848 T DK 09725848T DK 2268810 T3 DK2268810 T3 DK 2268810T3
- Authority
- DK
- Denmark
- Prior art keywords
- dna
- region
- host
- gene
- selectable marker
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1082—Preparation or screening gene libraries by chromosomal integration of polynucleotide sequences, HR-, site-specific-recombination, transposons, viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Virology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (9)
1. Fremgangsmåde til sletning af en målregion for sletning i et værts-DNA, under anvendelse af et donor-DNA: hvor donor-DNA'et omfatter regioner, som er homologe med en 5'-sideregion udenfor målregionen for sletning i værts-DNA'et, en 3'-sideregion udenfor målregionen for sletning i værts-DNA'et hhv. en første homolog rekombinationsregion indenfor målregionen for sletningen i værts-DNA'et, i denne rækkefølge, og yderligere omfattende et første selekterbart markørgen, en ekspressionsinducerende promotor og et andet selekterbart markørgen, som eksprimeres under styring af den ekspressionsinducerende promotor, imellem den region, som er homolog med 3'-sideregionen og den region, som er homolog med den første homologe rekombinationsregion; hvilken fremgangsmåde omfatter følgende trin: et første trin med gennemføring af homolog rekombination imellem donor-DNA'et og værts-DNA'et ved regionerne for 5'-sideregionen og den første homologe rekombinationsregion, for at udføre selektion af en vært integreret med donor-DNA'et baseret på ekspressionen af det første selekterbare markørgen; og et andet trin med udførelse af homolog rekombination, i værts-DNA'et, som er integreret med donor-DNA'et ved det første trin, imellem to regioner af 3'-sideregionen afledt af værts-DNA'et og 3'-sideregionen afledt af donor-DNA'et, at udføre selektion af en vært, hvis målregion er slettet, baseret på ekspression af det andet selekterbare markørgen under en ekspressionsinducerende tilstand for den ekspressionsinducerende promotor, hvor de selekterbare markørgener ikke forbliver i værts-DNA'et efter sletning.
2. Fremgangsmåde til udskiftning af en målregion for udskiftning i et værts-DNA under anvendelse af et donor-DNA: hvor donor-DNA'et omfatter regioner, som er homologe med en 5'-sideregionen udenfor målregionen for udskiftning i værts-DNA'et, en 3'-sideregion udenfor målregionen for udskiftning af værts-DNA'et, hhv. en første homolog rekombinationsregion indenfor målregionen for udskiftning i værts-DNA'et, i denne rækkefølge, omfattende en ønsket DNA-sekvens imellem den region, som er homolog med 5'-sideregionen og den region, som er homolog med 3'-sideregionen, og yderligere omfattende et første selekterbart markørgen, en ekspressionsinducerende promotor og et andet selekterbart markørgen, som eksprimeres understyring af den ekspressionsinducerende promotor, imellem den region, som er homolog med 3'-sideregionen og den region, som er homolog med den første homologe rekombinationsregion; hvilken fremgangsmåde omfatter følgende trin: et første trin med udførelse af homolog rekombination imellem donor-DNA'et og værts-DNA'et ved regionerne for 5'-sideregionen og den første homologe rekombinationsregion, for at udføre selektion af en vært integreret med donor-DNA'et baseret på ekspressionen af det første selekterbare markørgen; og et andet trin med udførelse af homolog rekombination, i værts-DNA'et, som er integreret med donor-DNA'et ved det første trin, imellem to regioner af 3'-sideregionen afledt af værts-DNA'et og 3'-sideregionen afledt af donor-DNA'et, at udføre selektion af en vært, hvis målregion er udskiftet med den ønskede DNA-sekvens, baseret på ekspression af det andet selekterbare markørgen under en ekspressionsinducerende tilstand for den ekspressionsinducerende promotor, hvor de selekterbare markørgener ikke forbliver i værts-DNA'et efter udskiftning.
3. Fremgangsmåde ifølge krav 1 eller 2, hvor, i det andet trin, værten, hvis målregion er slettet eller udskiftet, selekteres ved positiv selektion, baseret på ekspression af det andet selekterbare markørgen.
4. Fremgangsmåde ifølge ethvert af kravene 1 til 3, hvor det andet selekterbare markørgen er et gen, som koder for et protein, som inducerer død af en værtscelle.
5. Fremgangsmåde ifølge ethvert af kravene 1 til 4, hvor det andet selekterbare markørgen er chpA-gen.
6. Fremgangsmåde ifølge ethvert af kravene 1 til 5, hvor den ekspressionsinducerende promotor er en promotor, som inducerer ekspression af et nedstrømsgen under tilstedeværelsen af en ekspressionsinduktor.
7. Fremgangsmåde ifølge ethvert af kravene 1 til 6, hvor det første selekterbare markørgen er et medikamentresistens-gen.
8. Fremgangsmåde ifølge ethvert af kravene 1 til 7, hvor værten er Bacillus subtilis.
9. Fremgangsmåde til fremstilling afen værtscelle, (i) som omfatter sletning af en målregion for sletning i et værts-DNA ved anvendelse af fremgangsmåden ifølge ethvert af kravene 1 og 3 til 8; eller (ii) som omfatter udskiftning af en målregion for udskiftning i et værts-DNA ved anvendelse af fremgangsmåden ifølge ethvert af kravene 2 til 8.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2008076008 | 2008-03-24 | ||
| JP2009044193A JP5524492B2 (ja) | 2008-03-24 | 2009-02-26 | 宿主ｄｎａの改変方法および選択マーカーカセット |
| PCT/JP2009/056409 WO2009119862A2 (en) | 2008-03-24 | 2009-03-23 | Method of modifying target region in host dna and selectable marker cassette |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DK2268810T3 true DK2268810T3 (da) | 2016-06-06 |
Family
ID=40863423
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DK09725848.7T DK2268810T3 (da) | 2008-03-24 | 2009-03-23 | Fremgangsmåde til modifikation af målregion i værts-DNA og selekterbar markørkassette |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8852943B2 (da) |
| EP (1) | EP2268810B1 (da) |
| JP (1) | JP5524492B2 (da) |
| CN (1) | CN101978057B (da) |
| DK (1) | DK2268810T3 (da) |
| WO (1) | WO2009119862A2 (da) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2011074413A1 (ja) | 2009-12-14 | 2011-06-23 | 日本電気株式会社 | 画像生成装置、画像生成方法、画像生成プログラム |
| JP5740955B2 (ja) * | 2010-12-10 | 2015-07-01 | 三菱レイヨン株式会社 | ロドコッカス属細菌の形質転換のためのランダム遺伝子導入用ツール |
| CN103484471B (zh) * | 2013-09-30 | 2015-07-08 | 王悦 | 人表皮细胞生长因子核酸序列及大肠杆菌表达载体 |
| HUE051262T2 (hu) * | 2014-01-28 | 2021-03-01 | Lanzatech New Zealand Ltd | Módszer rekombináns mirkoorganizmus elõállítására |
| CN106497954A (zh) * | 2016-11-02 | 2017-03-15 | 南京福斯弗瑞生物科技有限公司 | 一种可诱导调控的标记蛋白表达框及其构建的重组载体与应用 |
| CN112029698A (zh) * | 2020-09-14 | 2020-12-04 | 南开大学 | 一种降解有机磷农药的工程菌及其构建方法 |
| CN112941088B (zh) * | 2021-02-04 | 2023-06-16 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所（中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心） | 与布氏杆菌毒力相关的基因及其在布氏杆菌毒力评价及制备弱毒布氏杆菌中的应用 |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP4721868B2 (ja) * | 2005-10-24 | 2011-07-13 | 花王株式会社 | 宿主ｄｎａの欠失対象領域の欠失方法 |
-
2009
- 2009-02-26 JP JP2009044193A patent/JP5524492B2/ja active Active
- 2009-03-23 DK DK09725848.7T patent/DK2268810T3/da active
- 2009-03-23 CN CN2009801103888A patent/CN101978057B/zh active Active
- 2009-03-23 US US12/933,766 patent/US8852943B2/en active Active
- 2009-03-23 WO PCT/JP2009/056409 patent/WO2009119862A2/en active Application Filing
- 2009-03-23 EP EP09725848.7A patent/EP2268810B1/en active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN101978057B (zh) | 2012-09-05 |
| CN101978057A (zh) | 2011-02-16 |
| JP2009254350A (ja) | 2009-11-05 |
| WO2009119862A3 (en) | 2009-12-10 |
| EP2268810B1 (en) | 2016-05-04 |
| US8852943B2 (en) | 2014-10-07 |
| JP5524492B2 (ja) | 2014-06-18 |
| US20130295676A2 (en) | 2013-11-07 |
| US20110275158A2 (en) | 2011-11-10 |
| EP2268810A2 (en) | 2011-01-05 |
| WO2009119862A2 (en) | 2009-10-01 |
| US20110014709A1 (en) | 2011-01-20 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DK2268810T3 (da) | Fremgangsmåde til modifikation af målregion i værts-DNA og selekterbar markørkassette | |
| US10415022B2 (en) | Trichoplusia ni piggyBac transposases with reduced integration activity | |
| JP2020517240A (ja) | ＣＲＩＳＰＲ−Ｃｐｆ１を使用する誘導性で調整可能な多重ヒト遺伝子制御 | |
| KR20210053228A (ko) | CRISPR/Cas12f1 시스템 효율화를 위한 엔지니어링 된 가이드 RNA 및 그 용도 | |
| CA2420328A1 (en) | Synthetic nucleic acid molecule compositions and methods of preparation | |
| US20060084136A1 (en) | Production of fusion proteins by cell-free protein synthesis | |
| Arakaki et al. | Comparative subcellular localization analysis of magnetosome proteins reveals a unique localization behavior of Mms6 protein onto magnetite crystals | |
| US20150376627A1 (en) | Inducible Expression System Transcription Modulators Comprising A Distributed Protein Transduction Domain And Methods For Using The Same | |
| Yunusova et al. | Evaluation of the OsTIR1 and AtAFB2 AID systems for genome architectural protein degradation in mammalian cells | |
| CA3129835A1 (en) | Crispr/cas fusion proteins and systems | |
| Tüncher et al. | The CCAAT-binding complex of eukaryotes: evolution of a second NLS in the HapB subunit of the filamentous fungus Aspergillus nidulans despite functional conservation at the molecular level between yeast, A. nidulans and human | |
| Valenčíková et al. | Clostridial DivIVA and MinD interact in the absence of MinJ | |
| US20210123065A1 (en) | Recombination systems for high-throughput chromosomal engineering of bacteria | |
| Buj et al. | A plasmid toolkit for cloning chimeric cDNAs encoding customized fusion proteins into any Gateway destination expression vector | |
| Gier et al. | Analysis of yeast killer toxin K1 precursor processing via site-directed mutagenesis: implications for toxicity and immunity | |
| Paz-Yepes et al. | Expression and mutational analysis of the glnB genomic region in the heterocyst-forming Cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 7120 | |
| JP4721868B2 (ja) | 宿主ｄｎａの欠失対象領域の欠失方法 | |
| Trachtmann et al. | Construction of chromosomally encoded lacZ and gfp reporter strains of Escherichia coli for the study of global regulation of metabolism | |
| Bano et al. | Heterogeneity in the spontaneous induction of the promoter of the ColE9 operon in Escherichia coli | |
| WO2003004599A2 (en) | Methods of making and using expression constructs for the expression of recombinant proteins | |
| Knipfer et al. | Development of an α-complementation system for mycobacterial promoter analysis | |
| Sanchez Garcia et al. | Functional mapping of the fission yeast DNA polymerase δ B-subunit Cdc1 by site-directed and random pentapeptide insertion mutagenesis | |
| EP4311858A1 (en) | Intein-based controllers | |
| US20230383267A1 (en) | Flp-TAL RECOMBINASES | |
| Wang et al. | CRISPR/Cas9 RNP-Mediated Gene Fusion to Assess Protein Quantification and Subcellular Localization in Fusarium oxysporum |