DK2209920T3 - Ny detekteringsfremgangsmåde til cervix-hpv - Google Patents
Ny detekteringsfremgangsmåde til cervix-hpv Download PDFInfo
- Publication number
- DK2209920T3 DK2209920T3 DK07834656.6T DK07834656T DK2209920T3 DK 2209920 T3 DK2209920 T3 DK 2209920T3 DK 07834656 T DK07834656 T DK 07834656T DK 2209920 T3 DK2209920 T3 DK 2209920T3
- Authority
- DK
- Denmark
- Prior art keywords
- hrhpv
- primers
- dna
- hpv
- probes
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/708—Specific hybridization probes for papilloma
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Virology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (9)
1. Fremgangsmåde til detektering af tilstedeværelsen af én eller flere hrHPV-typer, udvalgt fra gruppen bestående af HPV-type 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 67 og 68, hvilken fremgangsmåde omfatter følgende trin: (a) tilvejebringelse af en prøve, der er mistænkt for at indeholde hrHPV’eme; (b) tilvejebringelse af en flerhed af forward- og backward-primere omfattende primerne fra Figur 1, (c) udførelse af en reaktion for at amplificere DNA afledt fra prøven ved anvendelsen af flerheden af primere; og (d) detektering af DNA-amplifikationsprodukter fra én eller af hrHPV’eme fra prøven, fortrinsvis hvor trin (d) udføres ved hybridisering af reaktionsprodukteme af DNA-amplifikationsreaktionen til en flerhed af hrHPV-prober.
2. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor samtlige forward- eller samtlige backward-primeme fra flerheden af primere omfatter et biotinmærke.
3. Fremgangsmåde ifølge krav 1 eller krav 2, hvor reaktionen for at amplificere DNA udføres under forhold med reduceret stringens.
4. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 1-3, hvor flerheden af hrHPV-prober omfatter probeme fra Figur 2, mere fortrinsvis, hvor probeme omfatter et DIG-mærke.
5. Fremgangsmåde til typebestemmelse af én eller flere hrHPV-typer, udvalgt fra gruppen bestående af HPV type 16,18, 31, 33, 35, 39,45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 67 og 68, hvilken fremgangsmåde omfatter følgende trin: (a) tilvej ebringelse af DNA-amplifikationsprodukter ved amplifikation af DNA fra E7-området af hrHPV ved anvendelse af en flerhed af forward- og backward-primere omfattende primerne fra Fig. 1; og (b) detektering af DNA-amplifikationsprodukter fra én eller flere af hrHPV-typeme ved hybridisering af amplifikationsprodukteme til mindst én hrHPV-probe, der i alt væsentligt er komplementær til DNA’et af mindst én men ikke samtlige hrHPV-typeme.
6. Fremgangsmåde ifølge krav 5, hvor samtlige forward- eller samtlige backward-primeme af flerheden af primere omfatter et biotinmærke.
7. Fremgangsmåde ifølge krav 5 eller 6, hvor den mindst ene probe i alt væsentligt er komplementær til DNA’et fra præcist én type af hrHPV, fortrinsvis hvor den mindst ene probe er udvalgt fra probeme fra enten Figur 2 eller Figur 3.
8. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 5-7, hvor detekteringen omfatter anvendelsen af en reverse line blot.
9. Flerhed af forward- og backward-primere der, når de anvendes samlet, er i stand til at anneale til et område i E7-området af en hvilken som helst af de hrHPV’er, der er udvalgt fra gruppen bestående af HPV type 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 67 og 68, hvor området er området mellem nukleotidpositioneme 622 og 847 af HPV 16 og det tilsvarende område af de andre hrHPV-typer, og, hvor hver af primerne i alt væsentligt er komplementær til E7-området af en undergruppe af hrHPV’eme, omfattende samtlige forward- og backward-primeme, som er opført i Figur 1.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/NL2007/050526 WO2009057993A1 (en) | 2007-11-01 | 2007-11-01 | NEW DETECTION METHOD FOR CERVICAL HPVs |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DK2209920T3 true DK2209920T3 (da) | 2016-08-15 |
Family
ID=38988345
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DK07834656.6T DK2209920T3 (da) | 2007-11-01 | 2007-11-01 | Ny detekteringsfremgangsmåde til cervix-hpv |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9435001B2 (da) |
EP (1) | EP2209920B1 (da) |
JP (1) | JP5595276B2 (da) |
AU (1) | AU2007360826B2 (da) |
CA (1) | CA2704151C (da) |
CY (1) | CY1117822T1 (da) |
DK (1) | DK2209920T3 (da) |
ES (1) | ES2584228T3 (da) |
HU (1) | HUE029729T2 (da) |
PT (1) | PT2209920T (da) |
SI (1) | SI2209920T1 (da) |
WO (1) | WO2009057993A1 (da) |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7601497B2 (en) | 2000-06-15 | 2009-10-13 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Detection of nucleic acids by target-specific hybrid capture method |
US7439016B1 (en) | 2000-06-15 | 2008-10-21 | Digene Corporation | Detection of nucleic acids by type-specific hybrid capture method |
WO2010062556A1 (en) | 2008-10-27 | 2010-06-03 | Qiagen Gaithersburg Inc. | Fast results hybrid capture assay and system |
CN102414327B (zh) | 2009-05-01 | 2015-04-08 | 奇亚根盖瑟斯堡股份有限公司 | 用于在样品中检测rna剪接形式的非靶向扩增方法 |
CA2773320C (en) | 2009-09-14 | 2018-02-20 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Compositions and methods for recovery of nucleic acids or proteins from tissue samples fixed in cytology media |
JP5876834B2 (ja) | 2010-01-04 | 2016-03-02 | キアジェン ゲイサーズバーグ インコーポレイテッド | 固定された組織サンプルからの核酸またはタンパク質の回収のための方法、組成物、およびキット |
US9689047B2 (en) | 2010-01-29 | 2017-06-27 | Qiagen Gaithersburg Inc. | Methods and compositions for sequence-specific purification and multiplex analysis of nucleic acids |
US9605303B2 (en) | 2010-01-29 | 2017-03-28 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Method of determining and confirming the presence of an HPV in a sample |
CN102822354B (zh) | 2010-02-16 | 2015-06-03 | 贝克顿·迪金森公司 | 用于检测人乳头瘤病毒(hpv)的密切相关的血清型的测定法 |
AU2011255638B2 (en) | 2010-05-19 | 2016-08-25 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Methods and compositions for sequence-specific purification and multiplex analysis of nucleic acids |
EP2576840B1 (en) | 2010-05-25 | 2018-10-17 | QIAGEN Gaithersburg, Inc. | Fast results hybrid capture assay and associated strategically-truncated probes |
AU2012204158B2 (en) * | 2011-01-07 | 2017-02-02 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Materials and method for genotyping and quantifying a high-risk human papillomavirus |
JP2014511182A (ja) | 2011-02-24 | 2014-05-15 | キアゲン ガイサーズバーグ アイエヌシー. | Hpv核酸を検出するための材料及び方法 |
CA2854165C (en) | 2011-11-03 | 2022-11-22 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Materials and method for immobilizing, isolating, and concentrating cells using carboxylated surfaces |
AU2013205122B2 (en) * | 2012-10-11 | 2016-11-10 | Gen-Probe Incorporated | Compositions and Methods for Detecting Human Papillomavirus Nucleic Acid |
RU2737619C1 (ru) * | 2019-12-27 | 2020-12-01 | Общество с ограниченной ответственностью "НекстБио" | Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления ДНК вируса папилломы человека 52 типа высокого канцерогенного риска в слизистой оболочке цервикального канала |
CN112195287B (zh) * | 2020-11-12 | 2022-03-01 | 武汉凯德维斯生物技术有限公司 | 一种用于人乳头瘤病毒hpv分型和整合检测的探针组及其试剂盒 |
CN112195281A (zh) * | 2020-11-12 | 2021-01-08 | 武汉凯德维斯生物技术有限公司 | 一种用于检测人乳头瘤病毒hpv56的探针及其试剂盒 |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
PT1012348E (pt) * | 1997-09-16 | 2002-11-29 | Innogenetics Nv | Deteccao do virus do papiloma humano por pcr e hibridacao reversa tipo-especifica |
JP2005500856A (ja) * | 2001-08-23 | 2005-01-13 | メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド | 多重フルオロフォアを使用する蛍光多重hpvpcrアッセイ |
PT1463839E (pt) * | 2002-01-07 | 2007-05-31 | Norchip As | Método para detectar arnm de um vírus do papiloma humano |
EP1403384A1 (en) * | 2002-09-26 | 2004-03-31 | Stichting Researchfonds Pathologie | Method for detecting and typing of cutaneous HPV and primers and probes for use therein |
SE0202897D0 (sv) | 2002-10-01 | 2002-10-01 | Quantovir Ab | Method and kit for quantitative and qualitative determination of human papillomavirus |
US20090233272A1 (en) * | 2003-12-23 | 2009-09-17 | Autogenomics, Inc. | Multiplexed Nucleic Acid Analysis with High Specificity |
ITMO20040126A1 (it) | 2004-05-21 | 2004-08-21 | Bioanalisi Ct Sud S N C Di Per | Sistema per la ricerca ed identificazione di agenti patogeni |
US8124334B2 (en) * | 2004-07-06 | 2012-02-28 | Enzo Biochem, Inc. | Selective detection of oncogenic HPV |
KR100633525B1 (ko) | 2004-10-04 | 2006-10-16 | 굿젠 주식회사 | 인체유두종바이러스의 프로브, 이를 포함하는올리고뉴클레오티드 마이크로어레이, 진단키트 및 이를이용한 유전자형 분석방법 |
JP5020825B2 (ja) * | 2004-12-08 | 2012-09-05 | ジェン−プローブ・インコーポレーテッド | 複数型のヒトパピローマウイルスに由来する核酸の検出 |
WO2006094238A2 (en) * | 2005-03-03 | 2006-09-08 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of adventitious viruses |
-
2007
- 2007-11-01 WO PCT/NL2007/050526 patent/WO2009057993A1/en active Application Filing
- 2007-11-01 AU AU2007360826A patent/AU2007360826B2/en not_active Ceased
- 2007-11-01 CA CA2704151A patent/CA2704151C/en active Active
- 2007-11-01 US US12/741,018 patent/US9435001B2/en active Active
- 2007-11-01 DK DK07834656.6T patent/DK2209920T3/da active
- 2007-11-01 ES ES07834656.6T patent/ES2584228T3/es active Active
- 2007-11-01 JP JP2010531974A patent/JP5595276B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-11-01 HU HUE07834656A patent/HUE029729T2/en unknown
- 2007-11-01 PT PT78346566T patent/PT2209920T/pt unknown
- 2007-11-01 EP EP07834656.6A patent/EP2209920B1/en active Active
- 2007-11-01 SI SI200731808A patent/SI2209920T1/sl unknown
-
2016
- 2016-07-25 CY CY20161100728T patent/CY1117822T1/el unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2009057993A1 (en) | 2009-05-07 |
ES2584228T3 (es) | 2016-09-26 |
US20100304362A1 (en) | 2010-12-02 |
JP2011502477A (ja) | 2011-01-27 |
CY1117822T1 (el) | 2017-05-17 |
HUE029729T2 (en) | 2017-03-28 |
US9435001B2 (en) | 2016-09-06 |
AU2007360826A1 (en) | 2009-05-07 |
PT2209920T (pt) | 2016-08-02 |
CA2704151A1 (en) | 2009-05-07 |
CA2704151C (en) | 2017-04-25 |
SI2209920T1 (sl) | 2016-10-28 |
EP2209920B1 (en) | 2016-05-04 |
AU2007360826B2 (en) | 2014-08-21 |
EP2209920A1 (en) | 2010-07-28 |
JP5595276B2 (ja) | 2014-09-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DK2209920T3 (da) | Ny detekteringsfremgangsmåde til cervix-hpv | |
US10988816B2 (en) | Compositions and methods for detecting human papillomavirus nucleic acid | |
CA2595390A1 (en) | Method for the detection of hpv and probes, primers and kits | |
CA2617978A1 (en) | In vitro diagnostic kit for identification of human papillomavirus in clinical samples | |
PL209415B1 (pl) | Mieszanina starterów do amplifikacji, jej zastosowanie, sposób wykrywania genotypów HPV i zestaw odczynników do wykrywania i typowania HPV | |
TWI757239B (zh) | 檢測hpv之方法、擴增混合物及套組 | |
AU2013205110B2 (en) | Compositions, Methods and Kits to Detect Herpes Simplex Virus Nucleic Acids | |
US20050260561A1 (en) | Method for detecting and typing of cutaneous hpv and primers and probes for use therein | |
EP2336369A1 (en) | Probes for genotyping low-risk-HPV | |
CA2906373A1 (en) | Detection of neisseria gonorrhoeaes | |
WO2010125420A1 (en) | A method for detection and identification of hpv16 variants using primers and probes |