DE19936563A1 - Tumor Associated Antigen - Google Patents

Tumor Associated Antigen

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DE19936563A1
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Ulrich Koenig
Wolfgang Sommergruber
Thomas Woelfel
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Abstract

The invention relates to tumor-associated antigens, immunogenic peptides derived therefrom and the DNA molecules coding therefor as well as to their utilization in cancer immunotherapy.

Description

Die Erfindung bezieht sich auf die Immuntherapie von Tumorerkrankungen.The invention relates to the immunotherapy of Tumor diseases.

Das Immunsystem hat die Aufgabe, den Organismus vor einer Vielzahl verschiedener Mikroorganismen zu schützen bzw. diese aktiv zu bekämpfen. Die Bedeutung eines intakten Immunsystems zeigt sich vor allem bei vererbten oder erworbenen Immundefizienzen. Der Einsatz von prophylaktischen Vakzinprogrammen erwies sich in vielen Fällen als äußerst zielführende und erfolgreiche immunologische Intervention im Kampf gegen virale oder bakterielle Infektionserkrankungen. Weiters hat sich gezeigt, daß das Immunsystem auch an der Eliminierung von Tumorzellen maßgeblich beteiligt ist. Dabei spielt die Erkennung der tumorassoziierten Antigene (TAAs) durch Komponenten des Immunsystems eine wesentliche Rolle. Im weitesten Sinn kann jede (peptidische oder nicht peptidische) Komponente einer Tumorzelle, die von einem Element des Immunsystems erkannt und zur Stimulation einer immunologischen Antwort führt, als immunogenes Tumorantigen fungieren. Besondere Bedeutung kommt dabei jenen Tumorantigenen zu, die nicht nur eine immunologische Reaktion hervorrufen, sondern auch eine Abstoßung des Tumors bewirken. Die Identifizierung definierter Antigene, die solch eine immunologische Reaktion bewirken können, stellt einen wichtigen Schritt für die Entwicklung einer molekular definierten Tumorvakzine dar. Obwohl noch nicht ganz geklärt ist, welche Elemente des Immunsystems für eine Abstoßung des Tumors verantwortlich sind, besteht doch ein Konsens darüber, daß dabei CD8-exprimierende zytotoxische T-Lymphozyten (CTLs) eine Hauptrolle spielen (Coulie, 1997). Besonders bei jenen Tumorarten (z. B. Melanom und Nierenkarzinom), die eine relativ hohe Spontanremissionsrate aufweisen, konnte eine Korrelation zwischen klinischem Verlauf und dem vermehrten Auftreten von CD8+- und CD4+-T-Zellen festgestellt werden (Schendel et al., 1993; Mackensen et al., 1993; Halliday et al., 1995; Kawakami et al., 1995; Kawakami et al., 1996; Wang, 1997; Celluzzi und Falo, 1998). Dabei wurden spezifische CTL-Klone entweder aus tumorinfiltrierenden Lymphozyten (TIL) oder peripheren mononuklearen Blutzellen (PBMC) nach Kokultivierung mit meist autologen Tumorzellen und Zytokinstimulierung in vitro erhalten. Sowohl in Tiermodellen als auch in in vitro kultivierten humanen Zellkultursystemen konnte die T-Zell-Antwort gegen Tumorzellen durch Transfektion der Tumorzellen mit Zytokinen verstärkt werden (von Elsas et al., 1997; Gansbacher et al., 1990; Tepper et al., 1989; Fearon et al., 1990; Dranoff et al., 1993).The immune system's task is to protect the organism from a variety of different microorganisms or to actively combat them. The importance of an intact immune system is particularly evident in inherited or acquired immunodeficiencies. In many cases, the use of prophylactic vaccine programs has proven to be an extremely effective and successful immunological intervention in the fight against viral or bacterial infectious diseases. Furthermore, it has been shown that the immune system is also significantly involved in the elimination of tumor cells. The detection of tumor-associated antigens (TAAs) by components of the immune system plays an important role. In the broadest sense, any component (peptide or non-peptide) of a tumor cell that is recognized by an element of the immune system and that stimulates an immunological response can act as an immunogenic tumor antigen. Of particular importance are those tumor antigens that not only cause an immunological reaction, but also cause rejection of the tumor. The identification of defined antigens that can cause such an immunological reaction is an important step for the development of a molecularly defined tumor vaccine. Although it is not yet clear which elements of the immune system are responsible for rejection of the tumor, there is a consensus on this that CD8-expressing cytotoxic T lymphocytes (CTLs) play a major role (Coulie, 1997). Especially in those types of tumors (e.g. melanoma and kidney carcinoma) that have a relatively high spontaneous remission rate, a correlation between clinical course and the increased occurrence of CD8 + and CD4 + T cells was found (Schendel et al., 1993; Mackensen et al., 1993; Halliday et al., 1995; Kawakami et al., 1995; Kawakami et al., 1996; Wang, 1997; Celluzzi and Falo, 1998). Specific CTL clones were obtained either from tumor infiltrating lymphocytes (TIL) or peripheral mononuclear blood cells (PBMC) after cocultivation with mostly autologous tumor cells and cytokine stimulation in vitro. Both in animal models and in vitro cultivated human cell culture systems, the T cell response against tumor cells could be enhanced by transfecting the tumor cells with cytokines (by Elsas et al., 1997; Gansbacher et al., 1990; Tepper et al., 1989 ; Fearon et al., 1990; Dranoff et al., 1993).

Aufgrund der Korrelation zwischen Remission und Beteiligung von CD8+-T-Zellen ist die Identifizierung tumorassoziierter Antigene (TAA), die durch CD8-positive CTLs erkannt werden, ein erklärtes Hauptziel auf dem Weg zur Entwicklung einer Tumorvakzine (Pardoll, 1998; Robbins und Kawakami, 1996). Ob auch andere Zelltypen des Immunsystems wie z. B. CD4+-T-Helferzellen eine wesentliche Rolle spielen ist noch unklar; einige Studien mit MAGE-3/HLA-A1 Peptiden in Melanompatienten deuten darauf hin (Marchand et al., 1995; Boon et al., 1998). In den vergangenen Jahren ist eine Reihe von TAAs, die durch CTLs erkannt werden, identifiziert worden (Boon et al., 1994; von den Eynde und von der Bruggen, 1997).Because of the correlation between remission and involvement of CD8 + T cells, the identification of tumor-associated antigens (TAA), which are recognized by CD8-positive CTLs, is a declared main goal on the way to the development of a tumor vaccine (Pardoll, 1998; Robbins and Kawakami , 1996). Whether other cell types of the immune system such. B. CD4 + T helper cells play an important role is still unclear; some studies with MAGE-3 / HLA-A1 peptides in melanoma patients suggest this (Marchand et al., 1995; Boon et al., 1998). A number of TAAs recognized by CTLs have been identified in recent years (Boon et al., 1994; von den Eynde and von Bruggen, 1997).

T-Zellen erkennen Antigene als Peptidfragmente, die an Zelloberflächen von MHC-Molekülen ("major histocompatibility complex", im Menschen "HLA" = "human leukocyte antigen") präsentiert werden. Es gibt zwei Klassen von MHC-Molekülen: MHC-I Moleküle kommen auf den meisten Zellen mit Kern vor und präsentieren Peptide (üblicherweise 8-10-mere), die durch proteolytischen Abbau endogener Proteine entstehen (sog. Antigen-Verarbeitung, "antigen processing") Peptid : MHC-I Komplexe werden von CD8-positiven CTLs erkannt. MHC-II Moleküle kommen nur auf sog. "professionellen antigen-präsentierenden Zellen" (APC) vor, und präsentieren Peptide exogener Proteine, die im Zuge der Endocytose von APC aufgenommen und verarbeitet werden. Peptid : MHC-II Komplexe werden von CD4-Helfer-T- Zellen erkannt. Durch eine Interaktion zwischen T-Zellrezeptor und Peptid : MHC Komplex können verschiedene Effektormechanismen ausgelöst werden, die im Fall von CTLs zur Apoptose der Zielzelle führen. Das geschieht, wenn entweder der MHC (z. B. im Fall der Transplantatabstoßung), oder das Peptid (z. B. im Fall intrazellulärer Pathogene) als fremd erkannt wird. Allerdings erfüllen nicht alle präsentierten Peptide die strukturellen und funktionellen Anforderungen für eine effektive Interaktion mit T-Zellen (wie von Rammensee et al., 1995 und weiter unten beschrieben). T cells recognize antigens as peptide fragments that recognize Cell surfaces of MHC molecules ("major histocompatibility complex ", in humans" HLA "=" human leukocyte antigen "). There are two Classes of MHC molecules: MHC-I molecules are emerging most cells with nucleus before and present Peptides (usually 8-10-mers) that pass through proteolytic degradation of endogenous proteins arise (so-called antigen processing, "antigen processing") Peptide: MHC-I complexes are derived from CD8-positive CTLs recognized. MHC-II molecules only come on so-called "professional antigen presenting cells" (APC) and present peptides of exogenous proteins that are found in Recorded and processed by APC during endocytosis become. Peptide: MHC-II complexes are generated by CD4 helper T Cells detected. Through an interaction between T cell receptor and peptide: MHC complex can various effector mechanisms are triggered that lead to apoptosis of the target cell in the case of CTLs. The happens when either the MHC (e.g. in the case of Graft rejection), or the peptide (e.g. in the case intracellular pathogens) is recognized as foreign. However, not all peptides presented meet the structural and functional requirements for an effective interaction with T cells (as from Rammenee et al., 1995 and described below).  

Für den Einsatz von TAAs in einer Tumorvakzine sind grundsätzlich mehrere Applikationsformen möglich: Das Antigen kann entweder als rekombinantes Protein mit geeigneten Adjuvantien bzw. Trägersystemen, oder als für das Antigen kodierende cDNA in Plasmid- (DNA- Vakzine; Tighe et al., 1998), bzw. viralen Vektoren (Restifo, 1997) appliziert werden. Eine weitere Möglichkeit besteht im Einsatz von rekombinanten Bakterien (z. B. Listeria, Salmonella), die das humane Antigen rekombinant exprimieren und durch ihre zusätzlichen Komponenten eine adjuvative Wirkung haben (Paterson, 1996; Pardoll, 1998). In allen diesen Fällen ist eine Verarbeitung und Präsentation des Antigens durch sog. "professionelle antigen-präsentierende Zellen" (APC) notwendig. Eine weitere Möglichkeit ist der Einsatz synthetischer Peptide (Melief et al., 1996), die den korrespondierenden T-Zell-Epitopen des Antigens entsprechen und die entweder von außen auf die APC geladen (Buschle et al., 1997; Schmidt et al., 1997) oder von den APC aufgenommen und intrazellulär auf die MHC-I Moleküle transferiert werden. Die therapeutisch effizienteste Applikationsform für ein definiertes Antigen wird im allgemeinen in klinischen Studien bestimmt.For the use of TAAs in a tumor vaccine basically several application forms possible: Das Antigen can either be used as a recombinant protein suitable adjuvants or carrier systems, or as cDNA encoding the antigen in plasmid (DNA Vaccine; Tighe et al., 1998), or viral vectors (Restifo, 1997) can be applied. Another Possibility exists in the use of recombinant Bacteria (e.g. Listeria, Salmonella) that the human Recombinantly express and by their antigen additional components have an adjuvant effect (Paterson, 1996; Pardoll, 1998). In all of these cases is a processing and presentation of the antigen through so-called "professional antigen-presenting Cells "(APC) is necessary. Another possibility is the use of synthetic peptides (Melief et al., 1996), which corresponds to the corresponding T cell epitopes of the Antigen and correspond either to the outside APC loaded (Buschle et al., 1997; Schmidt et al., 1997) or recorded by the APC and intracellularly to which MHC-I molecules are transferred. The therapeutically most efficient form of application for a Antigen is generally defined in clinical Studies determined.

Zu den von den tumorspezifischen CTLs erkannten Antigenen bzw. deren Epitopen zählen Moleküle, die aus sämtlichen Proteinklassen stammen können (z. B. Transkriptionsfaktoren, Rezeptoren, Enzyme; zur Übersicht siehe Rammensee et al., 1995; Robbins und Kawakami, 1996). Diese Proteine müssen nicht notwendigerweise an der Zelloberfläche lokalisiert sein, wie dies bei der Erkennung durch Antikörper erforderlich ist. Um für die Erkennung durch CTLs als tumorspezifisches Antigen zu fungieren bzw. um für die Therapie eingesetzt zu werden, müssen die Proteine bestimmte Bedingungen erfüllen: erstens soll das Antigen hauptsächlich von Tumorzellen exprimiert werden und in sog. "kritischen" Normalgeweben nicht oder nur in geringerer Konzentration als in Tumoren vorkommen. Kritische Normalgewebe sind essentielle Gewebe; eine gegen sie gerichtete Immunreaktion könnte unter Umständen schwerwiegende, zum Teil lethale Folgen haben. Zweitens soll das Antigen nicht nur im Primärtumor, sondern auch in den Metastasen vorhanden sein. Des weiteren ist es im Hinblick auf eine breite klinische Anwendung des Antigens erstrebenswert, wenn es in mehreren Tumorarten in hoher Konzentration vorhanden ist. Eine weitere Vorbedingung für die Eignung eines TAA als wirksamer Bestandteil einer Vakzine ist das Vorhandensein von T-Zell-Epitopen in der Aminosäuresequenz des Antigens; vom TAA abgeleitete Peptide sollen zu einer in vitro/in vivo T-Zell Antwort führen ("immunogenes" Peptid). Ein weiteres Selektionskriterium für ein klinisch breit anwendbares immunogenes Peptid ist die Häufigkeit, mit der das Antigen in einer gegebenen Patientenpopulation anzutreffen ist.To those recognized by the tumor specific CTLs Antigens or their epitopes count molecules that can come from all protein classes (e.g. transcription factors, receptors, enzymes; for For an overview, see Rammenee et al., 1995; Robbins and Kawakami, 1996). These proteins don't have to necessarily located on the cell surface be like this with detection by antibodies  is required. In order for detection by CTLs as to act on tumor-specific antigen or for the The proteins have to be used in therapy meet certain conditions: first, that Antigen are mainly expressed by tumor cells and not or only in so-called "critical" normal tissues in a lower concentration than in tumors. Critical normal tissues are essential tissues; a immune response directed against them could be under Serious and sometimes fatal consequences to have. Secondly, the antigen should not only Primary tumor, but also present in the metastases his. Furthermore, it is broad clinical use of the antigen desirable if it in several types of tumors in high concentration is available. Another prerequisite for the Suitability of a TAA as an effective part of a Vaccine is the presence of T cell epitopes in the amino acid sequence of the antigen; derived from the TAA Peptides are said to result in an in vitro / in vivo T cell response lead ("immunogenic" peptide). Another one Selection criterion for a clinically widely applicable immunogenic peptide is the frequency with which the Antigen in a given patient population can be found.

Die immunogenen tumorassoziierten Antigene (TAAs), von denen größtenteils bereits gezeigt wurde, daß sie T-Zell Epitope besitzen, lassen sich in mehrere Kategorien einteilen, u. a. virale Proteine, mutierte Proteine, überexprimierte Proteine, durch chromosomale Translokation gebildete Fusionsproteine, Differenzierungsantigene, onkofötale Antigene (Van den Eynde und Brichard, 1995; von den Eynde und von der Bruggen, 1997).The immunogenic tumor associated antigens (TAAs) from most of whom have already been shown that they T cell epitopes can be divided into several Classify categories, u. a. viral proteins, mutated Proteins, overexpressed proteins, by chromosomal Fusion proteins formed translocation, Differentiation antigens, oncofetal antigens (Van den  Eynde and Brichard, 1995; from the Eynde and from the Bruggen, 1997).

Die Methoden zur Identifizierung und Charakterisierung von TAAs, die den Ausgangspunkt für die Entwicklung einer Tumorvakzine darstellen, beruhen einerseits auf dem Einsatz von in Patienten bereits induzierten CTLs (zelluläre Immunantwort) oder Antikörpern (humorale Immunantwort), oder basieren auf der Erstellung differenzieller Transkriptionsprofile zwischen Tumoren und Normalgeweben. Im ersten Fall, dem immunologischen Ansatz, werden Patienten-CTLs für ein Screening eukaryotischer Tumor-cDNA-Expressionsbibliotheken, die über MHC-I Moleküle die CTL-Epitope präsentieren, eingesetzt (Boon et al., 1994), während mittels hochaffiner Patienten-Antiseren prokaryotische-cDNA- Expressionsbibliotheken, direkt über eine Immunoblot- Analyse der einzelnen Plaques auf das Vorhandensein von TAAs untersucht werden (Sahin et al., 1995). Eine Kombination von CTL-Reaktivität und proteinchemischen Verfahren stellt die Isolierung von aus MHC-I isolierten Peptiden von Tumorzellen dar, die über Reaktivität mit Patienten-CTLs vorselektioniert wurden. Die Peptide werden aus dem MHC-I Komplex ausgewaschen und mit Hilfe der Massenspektrometrie identifiziert (Falk et al., 1991; Wölfel et al., 1994; Cox et al., 1994). Die Ansätze, welche CTLs zum Charakterisieren von Antigenen verwenden, sind aufgrund der erforderlichen Kultivierung und Aktivierung von CTLs mit einem erheblichen Aufwand verbunden bzw. nicht immer erfolgreich. The methods of identification and characterization of TAAs that are the starting point for development of a tumor vaccine are based on the one hand the use of CTLs already induced in patients (cellular immune response) or antibodies (humoral Immune response), or are based on the creation differential transcription profiles between tumors and normal tissues. In the first case, the immunological Approach, patient CTLs for screening eukaryotic tumor cDNA expression libraries, the present the CTL epitopes via MHC-I molecules, used (Boon et al., 1994), while by means high affinity patient antisera prokaryotic cDNA Expression libraries, directly via an immunoblot Analysis of the individual plaques for the presence of TAAs are examined (Sahin et al., 1995). A Combination of CTL reactivity and protein chemical Process represents the isolation of MHC-I isolated peptides from tumor cells that are over Reactivity with patient CTLs were preselected. The peptides are washed out of the MHC-I complex and identified using mass spectrometry (Falk et al., 1991; Wölfel et al., 1994; Cox et al., 1994). The approaches that characterize CTLs of antigens are due to the required cultivation and activation of CTLs associated with considerable effort or not always successful.  

Methoden zur Identifizierung von TAAs, welche auf dem Vergleich des Transkriptionsprofils von Normal- mit Tumorgewebe beruhen, sind vielfältig; dazu zählen die differenzielle Hybridisierung, die Erstellung von Subtraktions-cDNA-Banken ("representational difference analysis"; Hubank und Schatz, 1994; Diatchenko et al., 1996) und der Einsatz der DNA-Chip Technologie oder der SAGE-Methode (Velculescu et al., 1995). Im Gegensatz zur oben erwähnten immunologischen Methode mit Hilfe von Patienten-CTLs muß beim Einsatz von molekularbiologischen Methoden gezeigt werden, daß die damit gefundenen potentiellen Antigenkandidaten tumorspezifisch (tumorassoziiert) sind und tatsächlich T-Zell Epitope besitzen, die eine zytotoxische T-Zell Antwort auslösen können. In zumindest einem Fall (NY-ESO/LAGE-1) wurde ein Antigen sowohl durch die Verwendung von Patientenseren als auch durch RDA identifiziert (Chen et al., 1997; Lethe et al. 1998), außerdem wurden CTL-Epitope dieses Antigens und eine gleichzeitige spontane humorale und T-Zell Antwort in einem Patienten beschrieben (Jager et al., 1998).Methods for identifying TAAs based on the Comparison of the transcription profile of normal with Tumor tissues are diverse; these include the differential hybridization, the creation of Subtraction cDNA banks ("representational difference analysis "; Hubank and Schatz, 1994; Diatchenko et al., 1996) and the use of DNA chip technology or the SAGE method (Velculescu et al., 1995). In contrast to the immunological method mentioned above with the help of patient CTLs when using molecular biological methods are shown that the potential antigen candidates found therewith are tumor-specific (tumor-associated) and indeed T cell epitopes possess a cytotoxic T cell Can trigger response. In at least one case (NY-ESO / LAGE-1) was an antigen by both Use of patient sera as well as through RDA identified (Chen et al., 1997; Lethe et al. 1998), also CTL epitopes of this antigen and a simultaneous spontaneous humoral and T cell response in in one patient (Jager et al., 1998).

Aufgabe der vorliegenden Erfindung war es, ein neues tumorassoziiertes Antigen (TAA) bereitzustellen.The object of the present invention was to create a new one to provide tumor associated antigen (TAA).

Diese Aufgabe wurde gelöst, indem zunächst mittels RDA ("representational difference analysis") zwischen einer von einem Pankreas Carcinom Patienten abgeleiteten Zelllinie und einem Pool von 11 verschiedenen Normalgeweben eine cDNA-Substraktionsbibliothek hergestellt wurde. Zur Generierung der für die subtraktive Hybridisierung notwendigen cDNA-Fragmente von "tester" und "driver" wurde in Abweichung vom ursprünglichen Protokoll (Diatchenko et al., 1996) eine Mischung von 6 verschiedenen Restriktionsenzymen eingesetzt. Die Verwendung einer Mischung verschiedener Restriktionsenzyme, die 6 Basenpaare als Erkennungssequenz benötigen, hat gegenüber dem ursprünglichen Protokoll (Diatchenko et al., 1996) folgende Vorteile: a) durch Auswahl von jeweils zwei Restriktionsenzymen, deren Erkennungssequenzen durch 6-er Kombination der Basen A/T (z. B. Ssp I: AATATT)oder C/G (z. B. Nae I: GCCGGC) oder A/C/G/T (z. B. EcoR V: GATATC) dargestellt sind, werden sowohl GC- als auch AT-reiche Regionen eines Gens gleichermaßen geschnitten, wodurch eine homogene Repräsentanz der gesamten Genregion als Restriktionsfragmente ermöglicht wird; b) weiters ist es dadurch möglich, im statistischen Mittel größere cDNA-Fragmente des Kandidatengens zu erhalten (ca. 800 bp), was wiederum bei der nachfolgenden Analyse (Sequenzierung und Annotation) und der Klonierung der "full-size" cDNA von großem Vorteil ist. Im Originalprotokoll (Diatchenko et al., 1996) wurde ein nur 4-Basen erkennendes Restriktionsenzym (Rsa I) eingesetzt, das zu einer mittleren Fragmentlänge von 256 bp führt und spezifisch CG- oder AT-reiche Regionen nicht prozessieren kann. Um der durch die längeren Insert-cDNA-Fragmente veränderten Hybridisierungskinetik gerecht zu werden, wurde das PCR-Protokoll, wie im Beispiel 2, beschrieben geändert.This task was solved by first using RDA ("representational difference analysis") between one derived from a pancreatic carcinoma patient Cell line and a pool of 11 different Normal tissues a cDNA subtraction library was produced. To generate the for the subtractive hybridization necessary cDNA fragments of "tester" and "driver" was deviated from  original protocol (Diatchenko et al., 1996) a Mixture of 6 different restriction enzymes used. The use of a mixture of different Restriction enzymes, the 6 base pairs as Need recognition sequence compared to original protocol (Diatchenko et al., 1996) the following advantages: a) by choosing two each Restriction enzymes, the recognition sequences of which Combination of 6 bases A / T (e.g. Ssp I: AATATT) or C / G (e.g. Nae I: GCCGGC) or A / C / G / T (e.g. EcoR V: GATATC) are shown, both GC and Regions of a gene rich in AT equally cut, creating a homogeneous representation of the entire gene region as restriction fragments becomes; b) it is also possible in statistical mean larger cDNA fragments of the Obtain candidate gene (approximately 800 bp), which in turn in the subsequent analysis (sequencing and Annotation) and the cloning of the "full-size" cDNA from is a big advantage. In the original protocol (Diatchenko et al., 1996) was only a 4-base recognizing Restriction enzyme (Rsa I) used that leads to a average fragment length of 256 bp leads and specifically CG or AT-rich regions cannot process. Around by the longer insert cDNA fragments to meet changed hybridization kinetics, the PCR protocol was described as in Example 2 changed.

Zur Selektion der im Tumor überexprimierten Antigene wurden zunächst die erhaltenen cDNA-Klone vereinzelt und davon jeweils eine Glycerinstammkultur, eine Plasmidpräparation und eine das Insert darstellende Sammlung der PCR-Fragmente im 96-Loch-Plattenformat etabliert. Zunächst wurden 50 zufällig ausgewählte cDNA-Fragmente der 345 Klone der subtraktiven cDNA- Bibliothek des Pankreas Karzinoms zur Selektion der im Tumor überexprimierten Antigene sequenziert und mit in Datenbanken verfügbaren Sequenzen verglichen. Unter den dabei annotierten Genen befanden sich 12 unbekannte, zu denen ESTs ("expressed sequence tags")-Einträge in der Datenbank existierten. Ein Klon, R11, wies durch seine bevorzugte Präsenz in fötalen Geweben ein im Hinblick auf einen möglichen Einsatz als TAA geeignetes EST- Profil auf. Weitere Untersuchungen mittels semi­ quantitativer RT-PCR und Northern Blot Analyse bestätigten die bevorzugte Expression in verschiedenen Tumor- (Mamma-, Nierenzell- und Pankreaskarzinom) sowie immunprivilegierten Geweben (Testis, Plazenta und Nebenniere) und keine oder eine geringe Expression in Normalgeweben. Weiters ist aus den durch Northern Blot Experimente gewonnenen Daten zu schließen, daß das R11- Transkript eine Länge von ca. 7,5 kb hat und möglicherweise in der Nebenniere Splicevarianten oder homologe Gene existieren.For the selection of antigens overexpressed in the tumor the cDNA clones obtained were first separated and each one a glycerol stock culture, one Plasmid preparation and an insert  Collection of PCR fragments in 96-well plate format established. Initially, 50 were selected at random cDNA fragments of the 345 clones of the subtractive cDNA Library of pancreatic carcinoma for selection of im Tumor overexpressed antigens sequenced and with in Databases available sequences compared. Among the there were 12 unknown genes annotated which ESTs ("expressed sequence tags") entries in the Database existed. A clone, R11, indicated by its preferred presence in fetal tissues with a view suitable for use as a TAA EST Profile on. Further investigations using semi quantitative RT-PCR and Northern blot analysis confirmed the preferred expression in various Tumor (breast, kidney and pancreatic carcinoma) as well immune privileged tissues (testis, placenta and Adrenal gland) and little or no expression in Normal tissues. It is also from Northern Blot Experiments conclude that the R11 Transcript has a length of approximately 7.5 kb and possibly in the adrenal splice variants or homologous genes exist.

Die humane R11-cDNA wurde aus Testis kloniert, die erhaltene Sequenz ist in SEQ ID NO: 1 dargestellt. Die Sequenz von R11 zeigt sowohl auf Nukleotid- als auch auf Proteinebene keine Identität oder Homologie zu einem bekannten Gen. Die im Rahmen der vorliegenden Erfindung erhaltene R11-cDNA weist einen für 356 Aminosäuren kodierenden durchgehenden Leserahmen auf, von dem aufgrund der erhaltenen Ergebnisse anzunehmen ist, daß er den C-terminalen Abschnitt des vollständigen R11-Antigens repräsentiert. Die im Zuge der vorliegenden Erfindung klonierte R11-cDNA weist eine Länge von 514 bp auf, wobei das Vorhandensein eines PolyA-Schwanzes am 3'-Ende der Sequenz für die Vollständigkeit der cDNA in diesem Bereich spricht.The human R11 cDNA was cloned from Testis, which sequence obtained is shown in SEQ ID NO: 1. The Sequence of R11 points to both nucleotide and no identity or homology at the protein level a known gene. The under the present The R11 cDNA obtained by the invention has one for 356 Continuous reading frames encoding amino acids, from which to assume based on the results obtained is that it is the C-terminal portion of the represents complete R11 antigen. The in the course  of the present invention has cloned R11 cDNA a length of 514 bp, the presence of a polyA tail at the 3 'end of the sequence for the Completeness of the cDNA speaks in this area.

Aufgrund der im Rahmen vorliegenden Erfindung erhaltenen Daten kann nicht ausgeschlossen werden, daß 5' von der sequenzierten cDNA ein weiteres ATG vorliegt, das das Start-ATG darstellt; in diesem Fall kodiert die vorliegende cDNA für den C-terminalen Abschnitt von R11. Informationen über das 5'-Ende und eine gegebenenfalls weiter stromaufwärts liegende kodierende DNA-Sequenz können durch molekularbiologische Standardmethoden gewonnen werden, z. B. mittels 5'-RACE ("rapid amplification of cDNA ends"). Bei dieser Methode wird RNA, vorzugsweise mRNA, aus Zellen oder Geweben, in denen R11 transkribiert wird (z. B. Mamma-, Nierenzell- oder Pankreaskarzinomgewebe) revers transkribiert und anschließend mit einem Adaptor bekannter Sequenz ligiert. Eine PCR mit einem Adaptorprimer (bindet spezifisch an den Adaptor am 5'-Ende der cDNA) und einem R11-spezifischen Primer (z. B. SEQ ID NO: 25) erlaubt die Amplifikation entsprechender R11-Fragmente. Diese PCR-Produkte können, wie in Beispiel 6 beschrieben, nach Standardmethoden kloniert und, insbesondere durch DNA Sequenzierung, charakterisiert werden.Because of the present invention received data can not be excluded that Another ATG 5 'from the sequenced cDNA is present, which represents the start ATG; in this case encodes the present cDNA for the C-terminal Section of R11. Information about the 5 'end and a possibly further upstream coding DNA sequence can by standard molecular biological methods are obtained, e.g. B. using 5'-RACE ("rapid amplification of cDNA ends "). This method uses RNA, preferably mRNA, from cells or tissues in which R11 is transcribed (e.g. breast, kidney or Pancreatic carcinoma tissue) reverse transcribed and then with an adapter of known sequence ligated. A PCR with an adapter primer (binds specific to the adapter at the 5 'end of the cDNA) and an R11-specific primer (e.g. SEQ ID NO: 25) allows the amplification of corresponding R11 fragments. These PCR products can, as in Example 6 described, cloned using standard methods and, characterized in particular by DNA sequencing become.

Eine alternative Methode zur Charakterisierug des 5'-Endes ist das Screenen von cDNA-Bibliotheken durch Hybridisierung mit für R11 spezifischen DNA-Sonden oder die Analyse von cDNA-Expressions Bibliotheken mit Antiseren.An alternative method to characterize the 5'-end is the screening of cDNA libraries Hybridization with DNA probes specific for R11 or  the analysis of cDNA expression libraries with Antisera.

Führt das Screenen von cDNA-Bibliotheken aufgrund methodisch bedingter Beschränkungen, z. B. ineffiziente reverse Transkription, bedingt durch ausgeprägte Sekundärstrukturen der RNA, nicht zum gewünschten Ziel, können genomische Bibliotheken untersucht werden, indem z. B., wie beim Screenen von cDNA-Bibliotheken, durch Hybridisierung mit für R11 spezifischen DNA-Sonden Klone isoliert werden können, die die stromaufwärts vom erhaltenen 5'-Ende der cDNA liegende Sequenzinformation z. B. die Promotorregion von R11 enthalten.Performs screening of cDNA libraries based on methodological restrictions, e.g. B. inefficient reverse transcription due to pronounced Secondary structures of RNA, not to the desired goal, genomic libraries can be examined by e.g. B., as when screening cDNA libraries Hybridization with DNA probes specific for R11 Clones that can be isolated upstream from the sequence information obtained 5 'end of the cDNA e.g. B. contain the promoter region of R11.

Im Zuge der vollständigen Klonierung der R11-cDNA kann festgestellt werden, ob der im Bereich des vorliegenden cDNA-Abschnitts erhaltene offene Leserahmen eine Fortsetzung im 5'-Bereich aufweist und/oder ob alternative Leserahmen vorliegen.In the course of complete cloning of the R11 cDNA can to determine whether the in the area of the present cDNA section received an open reading frame Continues in the 5 'range and / or whether alternative reading frames are available.

Die im Rahmen der vorliegenden Erfindung isolierte cDNA weist die in SEQ ID NO: 1 angegebene Nukleotidsequenz auf; es ist anzunehmen (vgl. oben), daß sie für den C- terminalen Abschnitt des tumorassoziierten Antigens (TAA) der Bezeichnung R11 kodiert.The cDNA isolated in the context of the present invention has the nucleotide sequence given in SEQ ID NO: 1 on; it can be assumed (see above) that for the C- terminal portion of the tumor associated antigen (TAA) of the designation R11.

Ein von der isolierten CDNA exprimiertes Protein weist die in SEQ ID NO: 2 dargestellte Aminosäuresequenz auf. Die Erfindung betrifft somit in einem ersten Aspekt ein tumorassoziiertes Antigen der Bezeichnung R11, das die in SEQ ID NO: 2 angegebene Aminosäuresequenz aufweist. A protein expressed from the isolated CDNA has the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. The invention thus relates to a first aspect tumor-associated antigen of the designation R11, which the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 2.  

In einem weiteren Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein tumorassoziiertes Antigen der Bezeichnung R11, das die in SEQ ID NO: 2 angegebene Aminosäuresequenz als Teilsequenz enthält (dies trifft für den Fall zu, daß in 5'-Richtung eine Verlängerung des vorliegenden offenen Leserahmens vorliegt).In another aspect, the present concerns Invention of a tumor-associated antigen called R11, which is the one specified in SEQ ID NO: 2 Contains amino acid sequence as a partial sequence (this applies in the event that there is an extension in the 5 'direction of this open reading framework).

Bei dem Protein mit der in SEQ ID NO: 2 angegebenen Sequenz handelt es sich um ein Produkt, das von einem ca. 7,5 kb großen Transkripts translatiert ist, bzw. das von den Transkripten einer Größe von ca. 3,8 kb und 2,3 kb translatiert ist, das von Spleißvarianten des 7,5 kb Transkripts, wie sie im Gewebe der Nebenniere anzutreffen sind oder von Transkripten der dazu homologen Gene abgeleitet sind.For the protein with that specified in SEQ ID NO: 2 Sequence is a product made by one approx. 7.5 kb transcript is translated, or that of the transcripts with a size of approx. 3.8 kb and 2.3 kb is translated, that of splice variants of the 7.5 kb transcripts as found in the tissue of the adrenal gland can be found or from transcripts of the homologous genes are derived.

Die in SEQ ID NO: 2 dargestellte Aminosäuresequenz kann Abweichungen aufweisen, z. B. solche, die durch Austausch von Aminosäuren bedingt sind, sofern das R11-Derivat die für die Anwendung in einer Tumorvakzine erwünschten immunogenen Eigenschaften aufweist.The amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 can Have deviations, e.g. B. those by Exchange of amino acids are required, provided that R11 derivative which is for use in a tumor vaccine has desirable immunogenic properties.

Die natürliche Aminosäuresequenz von R11 kann gegebenenfalls modifiziert sein, indem einzelne Aminosäuren in einem R11 CTL-Epitop ausgetauscht werden, um, im Vergleich zum natürlichen R11 CTL- Epitop, eine Steigerung der Affinität von R11-Peptiden zu MHC-I-Molekülen und damit eine erhöhte Immunogenität und letztlich eine verstärkte Reaktivität gegenüber Tumoren zu bewirken. Modifikationen im Bereich der R11-Epitope können am R11-Gesamtprotein (dieses wird von den APCs zu den entsprechenden Peptiden prozessiert) bzw. an größeren R11-Proteinfragmenten oder an R11-Peptiden (vgl. unten) vorgenommen werden.The natural amino acid sequence of R11 can may be modified by individual Amino acids exchanged in an R11 CTL epitope be compared to the natural R11 CTL Epitope, an increase in the affinity of R11 peptides to MHC-I molecules and thus an increased immunogenicity and ultimately increased reactivity towards To cause tumors. Modifications in the area of R11 epitopes can be found on the total R11 protein (this is from the APCs to the corresponding peptides  processed) or on larger R11 protein fragments or on R11 peptides (see below).

In einem weiteren Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung immunogene Fragmente und Peptide, die von R11 abgeleitet sind. Letztere werden im folgenden als "R11-Peptide" bezeichnet. Eine erste Gruppe sind R11-Peptide, die eine humorale Immunantwort (Induktion von Antikörpern) auslösen. Derartige Peptide sind ausgewählte Abschnitte von R11 (mindestens 12 bis 15 Aminosäuren), die mittels sogenannter Vorhersage- Algorithmen ("prediction algorithms") wie z. B. dem "surface probability blot" (Emini et al., 1985), dem "hydrophobicity blot" (Kyte and Doolittle, 1982) und dem "antigenic index" (Jameson and Wolf, 1988) ermittelt werden können.In another aspect, the present concerns Invention of immunogenic fragments and peptides derived from R11 are derived. The latter are referred to below as Denoted "R11 peptides". A first group are R11 peptides that have a humoral immune response (induction of antibodies). Such peptides are selected sections of R11 (at least 12 to 15 amino acids), which are Algorithms ("prediction algorithms") such. B. the "Surface probability blot" (Emini et al., 1985), the "hydrophobicity blot" (Kyte and Doolittle, 1982) and the "antigenic index" (Jameson and Wolf, 1988) determined can be.

Miteingeschlossen sind auch all jene Peptide, die aus dem gegebenenfalls im Zuge der weiteren Klonierung erhaltenen N-terminalen Bereich von R11 abgeleitet sind.Also included are all those peptides that are made up of if necessary in the course of further cloning obtained N-terminal region are derived from R11.

Es ist bekannt, daß tumorassoziierte Antigene tumorspezifische Mutationen aufweisen können, die zu einer immunologischen Unterscheidung zwischen Tumor und Normalgewebe beitragen (Mandruzzato et al., 1997; Hogan et al., 1998; Gaudi et al., 1999; Wölfel et al., 1995). Um das Vorhandensein tumorspezifischer R11-Mutationen festzustellen, wird, zweckmäßig mit Hilfe von Sonden aus der erfindungsgemäßen, aus Testis isolierten cDNA, die R11-cDNA aus einem oder mehreren unterschiedlichen Tumoren kloniert und die erhaltenen Sequenzen mit Normalgewebs-R11-cDNA verglichen. Es ist zu erwarten, daß Tumor-R11-Peptide aus einem gegenüber Normalgewebs- R11 mutierten Sequenzabschnitt im Vergleich zu Normalgewebs-R11-Peptiden aus dem entsprechenden Abschnitt eine verstärkte Immunogenität aufweisen. Die vorliegende Erfindung betrifft somit in einem weiteren Aspekt R11-Peptide, abgeleitet von Bereichen eines tumorexprimierten R11, die tumorspezifische Mutationen aufweisen.It is known that tumor-associated antigens can have tumor-specific mutations that lead to an immunological distinction between tumor and Normal tissues (Mandruzzato et al., 1997; Hogan et al., 1998; Gaudi et al., 1999; Woelfel et al., 1995). The presence of tumor-specific R11 mutations is determined, expediently with the help of probes the cDNA according to the invention isolated from Testis, which R11 cDNA from one or more different Tumors cloned and the sequences obtained with Normal tissue R11 cDNA compared. It is expected that tumor R11 peptides from a normal tissue  R11 mutated sequence section compared to Normal tissue R11 peptides from the corresponding Section have increased immunogenicity. The The present invention thus relates to another Aspect R11 peptides derived from areas of a tumor-expressed R11, the tumor-specific mutations exhibit.

Bei der therapeutischen Anwendung werden R11-Peptide direkt oder in modifizierter Farm (z. B. an KLH "keyhole limpet hemocyanine" gekoppelt) verabreicht und die Bildung von Antikörpern mittels gängiger immunologischer Assays, z. B. mittels ELISA, bestimmt.In therapeutic use, R11 peptides directly or in a modified farm (e.g. to KLH "keyhole limpet hemocyanine" coupled) administered and the formation of antibodies using common immunological assays, e.g. B. determined by ELISA.

Weitere, im Rahmen der vorliegenden Erfindung bevorzugte, R11-Peptide sind diejenigen, die durch MHC-Moleküle präsentiert werden und eine zelluläre Immunantwort bewirken. Es gibt zwei Klassen von MHC-Molekülen, nämlich MHC-I-Moleküle, die von CD8-positiven CTLs und MHC-II-Moleküle, die von CD4-positiven T-Helferzellen erkannt werden.Further, within the scope of the present invention preferred, R11 peptides are those by MHC molecules are presented and a cellular one Effect immune response. There are two classes of MHC molecules, namely MHC-I molecules, that of CD8 positive CTLs and MHC-II molecules made by CD4-positive T helper cells are recognized.

Damit ein Peptid eine zelluläre Immunantwort auslöst, muß es an ein MHC-Molekül binden, wobei der zu behandelnde Patient das MHC-Molekül in seinem Repertoire aufweisen muß. Die Bestimmung des MHC-Subtyps des Patienten stellt somit, im Hinblick auf die Auslösung einer zellulären Immunantwort, eine der wesentlichen Voraussetzungen für die wirksame Anwendung eines Peptids an diesem Patienten dar.For a peptide to trigger a cellular immune response, it must bind to an MHC molecule, the to patient treating the MHC molecule in his repertoire must have. Determination of the MHC subtype of Patients thus poses, in terms of triggering a cellular immune response, one of the essential ones Requirements for the effective application of a Peptide on this patient.

Die Sequenz eines therapeutisch einzusetzenden R11-Peptids wird durch das jeweilige MHC-Molekül hinsichtlich Ankeraminosäuren und Länge vorgegeben. The sequence of a therapeutically used R11 peptide is by the respective MHC molecule given with regard to anchor amino acids and length.  

Definierte Ankerpositionen und Länge gewährleisten, daß ein Peptid in die Peptid-Bindungsfurche des jeweiligen MHC-Moleküls des Patienten paßt. Dies hat zur Folge, daß das Immunsystem stimuliert wird und eine zelluläre Immunreaktion erzeugt wird, die sich, im Falle der Verwendung eines von einem Tumorantigen abgeleiteten Peptids, gegen die Tumorzellen des Patienten richtet.Defined anchor positions and lengths ensure that a peptide in the peptide binding groove of each MHC molecule of the patient fits. As a consequence, that the immune system is stimulated and a cellular Immune response is generated, which, in the case of Use of one derived from a tumor antigen Peptide against the patient's tumor cells.

Immunogene R11-Peptide können nach bekannten Methoden identifiziert werden, eine der Grundlagen dafür ist die Beziehung zwischen MHC-Bindung und CTL-Induktion.Immunogenic R11 peptides can be made by known methods one of the foundations for this is the Relationship between MHC binding and CTL induction.

Da also die Sequenz immunogener Peptide aufgrund ihres Peptidbindungsmotivs vorherbestimmbar ist, können R11-Peptide, die CTL-Epitope darstellen, aufgrund der R11-Proteinsequenz identifiziert und synthetisiert werden. Dazu sind verschiedene Methoden geeignet, die zur Identifizierung von CTL-Epitopen von bekannten Protein-Antigenen verwendet wurden; z. B. die von Stauss et al., 1992, für die Identifizierung von T-Zell- Epitopen in humanem Papillomavirus beschriebene Methode.So since the sequence of immunogenic peptides due to their Peptide binding motif can be predetermined R11 peptides that represent CTL epitopes due to R11 protein sequence identified and synthesized become. Various methods are suitable for this for the identification of CTL epitopes from known ones Protein antigens have been used; e.g. B. from Stauss et al., 1992, for the identification of T cell Epitopes described in human papillomavirus Method.

Die allelspezifischen Anforderungen jedes MHC-I Allel- Produkts an ein Peptid, das an das MHC-Molekül bindet und von diesem präsentiert wird, wurden als Motiv zusammengefaßt (z. B. Falk et al., 1991). Bisher ist eine große Anzahl sowohl von MHC-Peptid-Motiven als auch von MHC-Liganden bekannt. Eine im Rahmen der vorliegenden Erfindung geeignete Methode zur Suche nach Epitopen eines bekannten Proteins, das in ein bestimmtes MHC-I-Molekül paßt, wurde in einem Übersichtsartikel von Rammensee et al., 1995, beschrieben. Sie umfaßt die folgenden Schritte: zunächst wird die Protein-Sequenz auf Abschnitte untersucht, die dem Anker-Motiv entsprechen, wobei gewisse Variationen hinsichtlich Peptidlänge und Ankerbesetzung möglich sind. Wenn z. B. ein Motiv ein 9-mer mit Ile oder Leu am Ende vorschreibt, können auch 10-mere mit einem entsprechenden C-Terminus in Betracht gezogen werden, ebenso Peptide mit anderen aliphatischen Resten, wie Val oder Met am C-Terminus. Auf diese Weise wird eine Reihe von Peptid-Kandidaten erhalten. Diese werden auf das Vorhandensein möglichst vieler Ankerreste, die sie gemeinsam mit bereits bekannten Liganden haben, untersucht und/oder daraufhin, ob sie für verschiedene MHC-Moleküle "bevorzugte" Reste haben (entsprechend der Tabelle von Rammensee et al., 1995). Um schwach bindende Peptide auszuschließen, werden zweckmäßig Bindungs-Assays durchgeführt. Wenn die Anforderungen an die Peptid- Bindung für bestimmte MHC-Molküle bekannt sind, können die Peptid-Kandidaten auch auf Nicht-Ankerreste untersucht werden, die sich negativ oder positiv auf die Bindung auswirken, oder die diese erst ermöglichen (Ruppert et al., 1993). Bei dieser Vorgangsweise ist jedoch in Betracht zu ziehen, daß das Peptid-Bindungs- Motiv für die Suche nach natürlichen Liganden nicht allein ausschlaggebend ist; auch andere Aspekte, z. B. die Enzymspezifität während der Antigenprozessierung, tragen - zusätzlich zur Spezifität der MHC-Bindung - zur Identität des Liganden bei. Eine Methode, die diese Aspekte berücksichtigt, und die im Rahmen der vorliegenden Erfindung zur Identifizierung von immunogenen R11-Peptiden geeignet ist, wurde u. a. von Kawakami et al., 1995, angewendet, um auf der Grundlage bekannter HLA-A*0201 Motive gp100 Epitope zu identifizieren.The allele-specific requirements of each MHC-I allele Product to a peptide that binds to the MHC molecule and presented by this were motif summarized (e.g. Falk et al., 1991). So far a large number of both MHC peptide motifs also known from MHC ligands. One under the suitable method for searching for the present invention Epitopes of a known protein that are in a specific MHC-I molecule, was in one Review article by Rammenee et al., 1995,  described. It includes the following steps: First, the protein sequence is divided into sections examined that correspond to the anchor motif, where certain variations in peptide length and Anchorage are possible. If e.g. B. a motif 9-mer with Ile or Leu at the end can also 10-mers with a corresponding C-terminus into consideration pulled, as well as peptides with others aliphatic residues such as Val or Met at the C-terminus. In this way, a number of peptide candidates receive. These are based on the existence if possible many anchor remains that they already share with have known ligands, examined and / or then whether they are for different MHC molecules have "preferred" residues (according to the table of Rammenee et al., 1995). To weakly binding peptides to rule out binding assays carried out. If the requirements for the peptide Binding for certain MHC molecules are known the peptide candidates also on non-anchor residues be examined that are negative or positive affect the bond or make it possible (Ruppert et al., 1993). With this procedure is however, to consider that the peptide binding Motive for the search for natural ligands not alone is decisive; other aspects, e.g. B. the enzyme specificity during antigen processing, wear - in addition to the specificity of the MHC binding - contribute to the identity of the ligand. A method of doing this Aspects taken into account, and those within the present invention for the identification of immunogenic R11 peptides is suitable, u. a. of  Kawakami et al., 1995, applied to based on known HLA-A * 0201 motifs gp100 epitopes too identify.

Die Peptide können auch im Hinblick auf ihre Bindungsfähigkeit an MHC-II-Moleküle ausgewählt werden. Das MHC-II-Bindungsmotiv, das sich über neun Aminosäuren erstreckt, weist einen höheren Grad an Degeneration in den Ankerpositionen auf als das MHC-I- Bindungsmotiv. Es wurden kürzlich, ausgehend von der Röntgenstrukturanalyse von MHC-II-Molekülen, Methoden entwickelt, die die genaue Analyse der MHC-II- Bindungsmotive, und ausgehend davon, Variationen der Peptidsequenz erlauben (Rammensee et al., 1995 und die dort zitierte Originalliteratur). Peptide, die an MHC-II-Moleküle binden, werden den CD4-T-Zellen typischerweise von dendritischen Zellen, Makrophagen oder B-Zellen präsentiert. Die CD4-T-Zellen wiederum aktivieren dann in der Folge direkt CTLs durch z. B. Cytokin-Ausschüttung und Verstärken die Effizienz der Antigen-Präsentation durch APC (dendritische Zellen, Makrophagen und B-Zellen).The peptides can also be used with regard to their Binding ability can be selected to MHC-II molecules. The MHC-II binding motif spanning nine Amino acids indicates a higher degree Degeneration in the anchor positions on as the MHC-I Tie motif. Recently, starting from the X-ray structure analysis of MHC-II molecules, methods developed the exact analysis of MHC-II Attachment motifs, and based on that, variations of Allow peptide sequence (Rammenee et al., 1995 and the original literature cited there). Peptides that participate MHC-II molecules bind to the CD4 T cells typically from dendritic cells, macrophages or B cells. The CD4 T cells in turn then activate CTLs directly by z. B. Cytokine release and enhance the efficiency of the Antigen presentation by APC (dendritic cells, Macrophages and B cells).

Seit kurzem sind Datenbanken und Vorhersage-Algorithmen verfügbar, die mit großer Verläßlichkeit die Vorhersage von Peptid-Epitopen erlauben, die an ein bestimmtes MHC-Molekül binden.Recently databases and prediction algorithms have been released available, the prediction with great reliability of peptide epitopes that are linked to a specific Bind MHC molecule.

Im Rahmen der vorliegenden Erfindung wurden, unter Verwendung des von Parker et al., 1994 und Rammensee et al., 1995 beschriebenen Algorithmus, für die wichtigsten HLA-Typen, insbesondere für HLA-A1, -A*0201, -A3, -B7, -B14 und -B*4403, Kandidaten-Peptide des C-terminalen Fragments von R11 identifiziert, von denen zu erwarten ist, daß sie an die entsprechenden HLA-Moleküle binden und daher immunogene CTL-Epitope darstellen; die ermittelten Peptide sind in Tabelle 1 aufgelistet. Auf ähnliche Weise können, gegebenenfalls unter Verwendung weiterer Algorithmen, die den unterschiedlichen Charakteristika der Peptide (Hydrophobizität, Ladung, Größe) bzw. Anforderungen an die Peptide, z. B. die 3D-Struktur des HLA-Moleküls, Rechnung tragen, weitere potentielle Peptid-Epitope ermittelt werden; dies gilt auch für Peptid-Epitope anderer HLA-Typen.Within the scope of the present invention, under Use of the method described by Parker et al., 1994 and Rammenee et al., 1995 described algorithm for which most important HLA types, especially for HLA-A1, -A * 0201, -A3, -B7, -B14 and -B * 4403, candidate peptides  of the C-terminal fragment of R11 identified by which is expected to match the appropriate HLA molecules bind and therefore immunogenic CTL epitopes represent; the peptides found are in Table 1 listed. Similarly, if necessary using other algorithms that the different characteristics of the peptides (Hydrophobicity, charge, size) or requirements the peptides, e.g. B. the 3D structure of the HLA molecule, Take into account further potential peptide epitopes be determined; this also applies to peptide epitopes other HLA types.

Nach Auswahl von R11-Peptid-Kandidaten mit Hilfe der angeführten Methoden wird deren MHC-Bindung mittels Peptidbindungs-Assays getestet. Als nächstes wird die Immunogenität der Peptide mit guten Bindungseigenschaften bestimmt (Stabilität der Peptid- MHC-Wechselwirkung korreliert in den meisten Fällen mit Immunogenität; von der Burg et al., 1996). Um die Immunogenität des ausgewählten Peptids oder Peptid- Äquivalents zu bestimmen, können Methoden, wie z. B. von Sette et al., 1994, beschrieben, in Kombination mit quantitativen MHC-Bindungs-Assays verwendet werden. Alternativ kann die Immunogenität des ausgewählten Peptids über in vitro CTL-Induktion mittels bekannter Methoden (wie weiter unten für ex vivo CTL-Induktion beschrieben) getestet werden. Das Prinzip der in mehreren Schritten durchgeführten Methode für die Auswahl von Peptiden, die zur Auslösung einer zellulären Immunantwort fähig sind, ist in der WO 97/30721, auf deren Offenbarung hiermit ausdrücklich Bezug genommen wird, beschrieben. Eine allgemeine Strategie zum Erhalt effizienter immunogener Peptide, die im Rahmen der vorliegenden Erfindung geeignet ist, wurde außerdem von Schweighoffer, 1997, beschrieben.After selecting R11 peptide candidates using the The methods mentioned are their MHC binding by means of Peptide binding assays tested. Next is the Immunogenicity of the peptides with good ones Binding properties determined (stability of the peptide MHC interaction correlates with in most cases Immunogenicity; von Burg et al., 1996). To the Immunogenicity of the selected peptide or peptide To determine equivalents, methods such. B. from Sette et al., 1994, in combination with quantitative MHC binding assays can be used. Alternatively, the immunogenicity of the selected one Peptide via known in vitro CTL induction Methods (as below for ex vivo CTL induction described) can be tested. The principle of in method for the Selection of peptides that trigger a is capable of cellular immune response WO 97/30721, the disclosure of which is hereby expressly stated Reference is described. A general one  Strategy for obtaining efficient immunogenic peptides, which is suitable in the context of the present invention, was also described by Schweighoffer, 1997.

Statt die Originalpeptide zu verwenden, die in die Bindungsfurche von MHC-I- oder MHC-II-Molekülen passen, also Peptide, die unverändert von R11 abgeleitet sind, können anhand der auf der Grundlage der Originalpeptidsequenz angegebenen Minimalanforderungen bezüglich Ankerpositionen und Länge Variationen vorgenommen werden, sofern durch diese Variationen die effektive Immunogenität des Peptids, die sich zusammensetzt aus seiner Bindungsaffinität an das MHC-Molekül und seiner Fähigkeit, T-Zell-Rezeptoren zu stimulieren, nicht nur nicht beeinträchtigt ist, sondern vorzugsweise verstärkt wird. In diesem Fall werden also künstliche Peptide oder Peptid-Äquivalente verwendet, die entsprechend den Anforderungen der Bindungsfähigkeit an ein MHC-Molekül entworfen sind.Instead of using the original peptides included in the Binding groove of MHC-I or MHC-II molecules fit, peptides derived from R11 unchanged, can be based on the Original peptide sequence specified minimum requirements variations in anchor positions and length be made, provided that through these variations effective immunogenicity of the peptide itself is made up of its affinity to the MHC molecule and its ability to target T cell receptors stimulate, not only is not impaired, but is preferably reinforced. In this case become artificial peptides or peptide equivalents used according to the requirements of Binding ability to an MHC molecule are designed.

Solchermaßen veränderte Peptide werden als "heteroclitische Peptide" bezeichnet. Sie können nach folgenden Methoden erhalten werden:
Zunächst werden die Epitope von MHC-I- bzw. MHC-II- Liganden bzw. deren Variation z. B. nach dem von Rammensee et al., 1995, beschriebenen Prinzip vorgenommen. Die Länge des Peptids entspricht im Falle seiner Abstimmung auf MHC-I Moleküle vorzugsweise einer Minimalsequenz von 8 bis 10 Aminosäuren mit den erforderlichen Ankeraminosäuren.
Peptides modified in this way are referred to as "heteroclitic peptides". They can be obtained using the following methods:
First, the epitopes of MHC-I or MHC-II ligands or their variation z. B. made according to the principle described by Rammenee et al., 1995. The length of the peptide in the case of its adaptation to MHC-I molecules preferably corresponds to a minimum sequence of 8 to 10 amino acids with the required anchor amino acids.

Gegebenenfalls kann das Peptid auch am C- und/oder am N-Terminus verlängert sein, sofern diese Verlängerung die Bindungsfähigkeit an das MHC-Molekül nicht beeinträchtigt bzw. das verlängerte Peptid auf die Minimalsequenz zellulär prozessiert werden kann.If necessary, the peptide can also on the C and / or on N-terminus can be extended if this extension  the ability to bind to the MHC molecule is not impaired or the extended peptide on the Minimal sequence can be processed cellularly.

Die modifizierten Peptide werden daraufhin auf ihre Erkennung durch TILs ("tumor-infiltrating lymphocytes"), auf CTL-Induktion sowie auf verstärkte MHC-Bindung und Immunogenität geprüft, wie von Parkhurst et al., 199, und Becker et al., 1997, beschrieben.The modified peptides are then applied to their Detection by TILs ("tumor infiltrating lymphocytes "), on CTL induction and on enhanced MHC binding and immunogenicity checked as by Parkhurst et al., 199, and Becker et al., 1997, described.

Eine weitere im Rahmen der vorliegenden Erfindung geeignete Methode zur Auffindung von Peptiden mit stärkerer Immunogenität als die der natürlichen R11-Peptide besteht im Screenen von Peptid-Bibliotheken mit CTLs, die die natürlich auf Tumoren vorkommenden R11-Peptide erkennen, wie von Blake et al., 1996, beschrieben; in diesem Zusammenhang wird die Verwendung kombinatorischer Peptid-Bibliotheken vorgeschlagen, um Moleküle zu entwerfen, welche von MHC-I-restringierten CTLs erkannte Tumorepitope nachahmen.Another within the scope of the present invention suitable method for finding peptides with stronger immunogenicity than that of natural ones R11 peptides consist of screening peptide libraries with CTLs that are naturally occurring on tumors Recognize R11 peptides as described by Blake et al., 1996, described; in this context the use combinatorial peptide libraries proposed to To design molecules that were restricted by MHC-I Imitating CTLs recognized tumor epitopes.

Das R11-Polypeptid der vorliegenden Erfindung oder davon abgeleitete immunogene Fragmente oder Peptide können rekombinant oder mittels Peptid-Synthese hergestellt werden, wie in der WO 96/10413 beschrieben, auf deren Offenbarung hiermit Bezug genommen wird. Für die rekombinante Herstellung wird das entsprechende DNA-Molekül nach Standardmethoden in einen Expressionsvektor eingefügt, in eine geeignete Wirtszelle transfiziert, der Wirt unter geeigneten Expressionsbedingungen kultiviert und das Protein gereinigt. Für die chemische Synthese von R11-Peptiden können herkömmliche Methoden verwendet werden, z. B. im Handel erhältliche automatische Peptid-Synthesizer.The R11 polypeptide of the present invention or immunogenic fragments or peptides derived therefrom can be recombinant or by means of peptide synthesis are produced as described in WO 96/10413, the disclosure of which is hereby incorporated by reference. For the recombinant production becomes the corresponding one DNA molecule into one using standard methods Expression vector inserted into an appropriate one Host cell transfected, the host under appropriate Expression conditions cultured and the protein cleaned. For the chemical synthesis of R11 peptides  conventional methods can be used, e.g. B. in Commercially available automatic peptide synthesizers.

Alternativ zu natürlichen R11-Peptiden oder heteroclitischen Peptiden können Substanzen, die solche Peptide vortäuschen, z. B. "Peptidomimetica" oder "retro- inverse-Peptide", verwendet werden. Zur Testung dieser Moleküle im Hinblick auf die therapeutische Verwendbarkeit in einer Tumorvakzine werden dieselben Methoden angewendet wie oben für die natürlichen R11-Peptide oder R11-Peptidäquivalente.Alternative to natural R11 peptides or heteroclitic peptides can be substances that such Pretend peptides, e.g. B. "Peptidomimetics" or "retro inverse peptides "can be used. To test these Molecules with a view to therapeutic Usability in a tumor vaccine will be the same Methods applied as above for the natural ones R11 peptides or R11 peptide equivalents.

Das TAA der Bezeichnung R11 gemäß der vorliegenden Erfindung und die davon abgeleiteten Proteinfragmente, Peptide bzw. Peptid-Äquivalente oder Peptidomimetika können in der Krebstherapie eingesetzt werden, z. B. um eine Immunantwort gegen Tumorzellen zu induzieren, die die entsprechenden Antigen-Determinanten exprimieren. Vorzugsweise werden sie für die Therapie von R11- positiven Tumoren verwendet, insbesondere beim Mamma-, Nierenzell- und Pankreaskarzinom.The TAA of the designation R11 according to the present Invention and the protein fragments derived from it Peptides or peptide equivalents or peptidomimetics can be used in cancer therapy, e.g. B. um to induce an immune response against tumor cells that express the corresponding antigen determinants. They are preferably used for the therapy of R11- positive tumors used, especially in the breast, Renal cell and pancreatic carcinoma.

Die Immunantwort in Form einer Induktion von CTLs kann in vivo oder ex vivo bewirkt werden.The immune response in the form of an induction of CTLs can can be effected in vivo or ex vivo.

Für die in vivo Induktion von CTLs wird eine pharmazeutische Zusammensetzung, enthaltend als wirksame Komponente das TAA R11 bzw. davon abgeleitete Fragmente oder Peptid(e), einem Patienten verabreicht, der an einer mit dem TAA assoziierten Tumorerkrankung leidet, wobei die Menge an TAA(Peptid) ausreichen muß, um eine wirksame CTL-Antwort auf den Antigen-tragenden Tumor zu erzielen. For the in vivo induction of CTLs a pharmaceutical composition containing as effective Component the TAA R11 or fragments derived from it or peptide (s) administered to a patient who is a tumor associated with TAA, the amount of TAA (peptide) must be sufficient to produce one effective CTL response to the antigen-bearing tumor achieve.  

Die Erfindung betrifft somit in einem weiteren Aspekt eine pharmazeutische Zusammensetzung für die parenterale, topische, orale oder lokale Verabreichung. Vorzugsweise dient die Zusammensetzung der parenteralen Verabreichung, z. B. für die subkutane, intradermale oder intramuskuläre Anwendung. Die R11-TAA/Peptide sind in einem pharmazeutisch annehmbaren, vorzugsweise wässerigen, Träger gelöst oder suspendiert. Die Zusammensetzung kann außerdem übliche Hilfsstoffe, wie Puffer, etc. enthalten. Die R11-TAA/Peptide können allein oder in Kombination mit Adjuvantien, z. B. inkomplettem Freunds Adjuvans, Saponinen, Aluminiumsalzen oder, in einer bevorzugten Ausführungsform, Polykationen wie Polyarginin oder Polylysin, verwendet werden. Die Peptide können auch an Komponenten, die die CTL-Induktion oder CTL-Aktivierung unterstützen, gebunden werden, z. B. an T-Helferpeptide, Lipide oder Liposomen, oder sie werden gemeinsam mit diesen Substanzen und/oder gemeinsam mit immunstimulierenden Substanzen, z. B. Zytokinen (IL-2, IFN-γ) verabreicht. Methoden und Formulierungen, die zur Herstellung und Verabreichung der erfindungsgemäßen pharmazeutischen Zusammensetzung geeignet sind, sind in der WO 95/04542 und WO 97/30721, auf deren Offenbarung hiermit Bezug genommen wird, beschrieben.The invention thus relates in a further aspect a pharmaceutical composition for the parenteral, topical, oral or local administration. The parenteral composition is preferably used Administration, e.g. B. for subcutaneous, intradermal or intramuscular use. The R11-TAA / peptides are in a pharmaceutically acceptable, preferably aqueous, carrier dissolved or suspended. The Composition can also include common excipients such as Buffers, etc. included. The R11-TAA / peptides can alone or in combination with adjuvants, e.g. B. incomplete friend's adjuvant, saponins, Aluminum salts or, in a preferred Embodiment, polycations such as polyarginine or Polylysine. The peptides can also Components that are CTL induction or CTL activation support, be bound, e.g. B. T helper peptides, Lipids or liposomes, or they are shared with these substances and / or together with immunostimulating substances, e.g. B. cytokines (IL-2, IFN-γ) administered. Methods and formulations used for Production and administration of the invention pharmaceutical composition are suitable are in WO 95/04542 and WO 97/30721, on their disclosure hereby referred to.

R11-Fragmente bzw. R11-Peptide können auch verwendet werden, um eine CTL-Antwort ex vivo auszulösen. Eine ex vivo CTL-Antwort auf einen Tumor, der R11 exprimiert, wird induziert, indem man die CTL-Vorläuferzellen zusammen mit APCs und R11-Peptiden bzw R11-Protein inkubiert. Dann läßt man die aktivierten CTLs expandieren, worauf sie dem Patienten wieder verabreicht werden. Alternativ können APCs mit R11-Peptiden beladen werden, was zu einer effizienten Aktivierung zellulärer Immunreaktionen gegen R11 positive Tumoren führen kann (Mayordomo et al., 1995; Zitvogel et al., 1996). Eine geeignete Methode um Peptide auf Zellen, z. B. dendritische Zellen, zu laden, wird in der WO 97/1919 geoffenbart.R11 fragments or R11 peptides can also be used to trigger a CTL response ex vivo. An ex vivo CTL response to a tumor expressing R11 is induced by looking at the CTL progenitor cells together with APCs and R11 peptides or R11 protein incubated. Then the activated CTLs are left expand, after which it is administered to the patient again  become. Alternatively, APCs can be loaded with R11 peptides become what leads to efficient cellular activation Immune responses to R11 positive tumors can result (Mayordomo et al., 1995; Zitvogel et al., 1996). A suitable method for peptides on cells, e.g. B. Charging dendritic cells is described in WO 97/1919 revealed.

In einer Ausführungsform der Erfindung wird eine Kombination mehrerer verschiedener R11-Peptide oder R11-Peptidäquivalente angewendet. In einer weiteren Ausführungsform werden R11-Peptide mit von anderen TAAs abgeleiteten Peptiden kombiniert. Die Auswahl von Peptiden für derartige Kombinationen wird im Einblick auf die Erfassung unterschiedlicher MHC-Typen getroffen, um eine möglichst breite Patientenpopulation abzudecken, und/oder sie wird auf ein möglichst breites Indikationsspektrum abgestellt, indem Peptide mehrerer unterschiedlicher Tumorantigene kombiniert werden. Die Anzahl der Peptide in einer pharmazeutischen Zusammensetzung kann über einen weiten Bereich schwanken, typischerweise enthält eine klinisch anwendbare Vakzine 1 bis 15, vorzugsweise 3 bis 10 verschiedene Peptide.In one embodiment of the invention, a Combination of several different R11 peptides or R11 peptide equivalents applied. In another Embodiment are R11 peptides with from other TAAs derived peptides combined. The selection of Peptides for such combinations will be examined encountered the detection of different MHC types, in order to cover the widest possible patient population, and / or it is as wide as possible Indication spectrum turned off by multiple peptides different tumor antigens can be combined. The Number of peptides in a pharmaceutical Composition can vary over a wide range fluctuate, typically includes one clinically applicable vaccine 1 to 15, preferably 3 to 10 different peptides.

Die erfindungsgemäßen Peptide können auch als diagnostische Reagentien eingesetzt werden.The peptides according to the invention can also be used as diagnostic reagents are used.

Beispielsweise können die Peptide dazu benutzt werden, um das Ansprechen eines Patienten auf die durch das immunogene Peptid hervorgerufene humorale oder zelluläre Immunantwort zu testen. Dadurch besteht die Möglichkeit, ein Behandlungsprotokoll zu verbessern. Beispielsweise kann in Abhängigkeit der Darreichungsform (Peptid, Gesamtprotein oder DNA-Vakzine) des TAA die Zunahme von Vorläufer T-Zellen in den PBLs, die eine Reaktivität gegen das definierte Peptidepitop aufweisen, untersucht werden (Robbins und Kawakami, 1996 sowie darin zitierte Referenzen). Außerdem können die Peptide oder das Gesamtprotein bzw. gegen das TAA gerichtete Antikörper dazu verwendet werden, um den Krankheitsverlauf eines R11-positiven Tumors zu charakterisieren (z. B. durch immunhistochemische Analysen von Primärtumor und Metastasen). Eine derartige Strategie hat sich schon mehrfach als erfolgreich erwiesen, z. B. der Nachweis des Östrogenrezeptors als Entscheidungsgrundlage zur Endokrintherapie bei Brustkrebs; c-erbB-2 als relevanter Marker bei Prognostik und Therapieverlauf bei Brustkrebs (Ravaioli et al., 1998; Revillion et al., 1998); PSMA ("prostate specific membrane antigen") als Marker für Epithelialzellen des Prostatakarzinoms im Serum bzw. durch Einsatz eines 111In-markierten monoklonalen Antikörpers gegen PSMA bei der Immunoscintigraphie auf Prostatakarzinom (Murphy et al., 1998 und inkludierte Referenzen); CEA ("carcinoembryonic antigen") als serologischer Marker für die Prognose und Verlauf bei Patienten des kolorektalen Karzinoms (Jessup und Loda, 1998).For example, the peptides can be used to test a patient's response to the humoral or cellular immune response elicited by the immunogenic peptide. This makes it possible to improve a treatment protocol. For example, depending on the dosage form (peptide, total protein or DNA vaccine) of the TAA, the increase in precursor T cells in the PBLs that are reactive to the defined peptide epitope can be investigated (Robbins and Kawakami, 1996 and references cited therein) . In addition, the peptides or the total protein or antibodies directed against the TAA can be used to characterize the course of the disease of an R11-positive tumor (eg by immunohistochemical analyzes of primary tumor and metastases). Such a strategy has proven successful several times, e.g. B. Detection of the estrogen receptor as a decision-making basis for endocrine therapy in breast cancer; c-erbB-2 as a relevant marker in the prognosis and course of therapy for breast cancer (Ravaioli et al., 1998; Revillion et al., 1998); PSMA ("prostate specific membrane antigen") as a marker for epithelial cells of prostate cancer in serum or by using a 111 In-labeled monoclonal antibody against PSMA in immunoscintigraphy for prostate cancer (Murphy et al., 1998 and included references); CEA ("carcinoembryonic antigen") as a serological marker for the prognosis and course in patients with colorectal cancer (Jessup and Loda, 1998).

Die vorliegende Erfindung betrifft in einem weiteren Aspekt isolierte DNA-Moleküle, kodierend für ein Protein mit den immunogenen Eigenschaften von R11 oder für Fragmente davon.The present invention relates in a further Aspect of isolated DNA molecules encoding a Protein with the immunogenic properties of R11 or for fragments of it.

In einem weiteren Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein isoliertes DNA-Molekül, das die in SEQ ID NO: 1 dargestellte Nukleotidsequenz aufweist bzw. ein Polynukleotid, das mit diesem DNA-Molekül unter stringenten Bedingungen hybridisiert.In another aspect, the present concerns Invention an isolated DNA molecule that the in SEQ ID NO: 1 nucleotide sequence shown or  a polynucleotide that interacts with this DNA molecule stringent conditions hybridized.

Unter "stringenten Bedingungen" wird z. B. verstanden:
Inkubation über Nacht bei 65°C-68°C mit 6 × SSC (1 × SSC = 150 mM NaCl, 15 mM Tri-Natriumcitrat), 5 × Denhardts Lösung, 0.2% SDS, 50 µg/ml Lachsspermien- DNA, daran anschließend Waschen zweimal 30 min mit 2 × SSC, 0.1% SDS bei 65°C, einmal 30 min mit 0.2 × SSC, 0.1% SDS bei 65°C und gegebenenfalls abschließendes Spülen mit 0.1 × SSC, 0.1% SDS bei 65°C.
Under "stringent conditions" z. B. understood:
Incubation overnight at 65 ° C-68 ° C with 6 × SSC (1 × SSC = 150 mM NaCl, 15 mM trisodium citrate), 5 × Denhardt's solution, 0.2% SDS, 50 µg / ml salmon sperm DNA, followed by Wash twice for 30 min with 2 × SSC, 0.1% SDS at 65 ° C, once for 30 min with 0.2 × SSC, 0.1% SDS at 65 ° C and if necessary, finally rinse with 0.1 × SSC, 0.1% SDS at 65 ° C.

In einem weiteren Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein isoliertes DNA-Molekül, das ein Polynukleotid der in SEQ ID NO: 1 dargestellten Sequenz als Teilsequenz enthält oder das ein Polynukleotid enthält, das mit einem Polynukleotid dieser Sequenz unter stringenten Bedingungen hybridisiert.In another aspect, the present concerns Invention of an isolated DNA molecule containing a Polynucleotide of the sequence shown in SEQ ID NO: 1 contains as a partial sequence or a polynucleotide contains that with a polynucleotide of this sequence hybridized under stringent conditions.

Die erfindungsgemäßen DNA-Moleküle bzw. Fragmente davon kodieren für (Poly)peptide der Bezeichung R11, bestehend aus oder enthaltend die in SEQ ID NO: 2 dargestellte Aminosäuresequenz, bzw. für davon abgeleitete Proteinfragmente oder Peptide; damit sind DNA-Moleküle mitumfaßt, die durch die Degeneration des genetischen Codes Abweichungen von der in SEQ ID NO: 1 dargestellten Sequenz aufweisen.The DNA molecules or fragments thereof according to the invention code for (poly) peptides with the designation R11, consisting of or containing those in SEQ ID NO: 2 amino acid sequence shown, or for thereof derived protein fragments or peptides; with that DNA molecules, which are caused by the degeneration of the genetic codes deviations from that in SEQ ID NO: 1 have shown sequence.

Die Erfindung betrifft auch DNA-Moleküle, die durch Mutation zu einem Austausch von Aminosäuren in der in SEQ ID NO: 2 dargestellten Proteinsequenz führen, sofern sie für ein R11-Derivat bzw. Fragmente oder Peptide mit den für die Anwendung als Tumorvakzine erwünschten immunogenen Eigenschaften kodieren.The invention also relates to DNA molecules that pass through Mutation in an exchange of amino acids in the SEQ ID NO: 2 lead protein sequence shown, if they are for an R11 derivative or fragments or  Peptides with those for use as tumor vaccines encode desired immunogenic properties.

Die R11-DNA-Moleküle der vorliegenden Erfindung oder die entsprechenden RNAs, die ebenfalls Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind, werden, wie die davon kodierten (Poly)Peptide, für die Immuntherapie von Krebserkrankungen eingesetzt.The R11 DNA molecules of the present invention or the corresponding RNAs, which are also the subject of present invention, like those thereof encoded (poly) peptides, for the immunotherapy of Cancer used.

In einer Ausführungsform der Erfindung werden DNA-Moleküle, kodierend für natürliche R11-Polypeptide verwendet. Alternativ zur natürlichen R11-cDNA bzw. Fragmenten davon können modifizierte Derivate verwendet werden. Diese umfassen Sequenzen mit Modifikationen, die für ein Protein(fragment) bzw. Peptide mit stärkerer Immunogenität kodieren, wobei für die Modifikationen auf DNA-Ebene dieselben Überlegungen gelten wie für die oben beschriebenen Peptide. Eine weitere Art der Modifikation ist die Aneinanderreihung zahlreicher Sequenzen, kodierend für immunologisch relevante Peptide, nach Art einer Perlenschnur ("string-of-beads"; Toes et al., 1997). Die Sequenzen können auch durch Anfügung von Hilfselementen modifiziert werden, z. B. Funktionen, die eine effizientere Abgabe und Prozessierung des Immunogens gewährleisten (Wu et al., 1995). Beispielsweise kann durch Anfügen einer Lokalisierungssequenz in das endoplasmatische Retikulum ("ER targetting sequence") die Prozessierung und damit die Präsentation und letztlich die Immunogenität des Antigens erhöht werden. In one embodiment of the invention DNA molecules coding for natural R11 polypeptides used. As an alternative to the natural R11 cDNA or Fragments thereof can use modified derivatives become. These include sequences with modifications, with a protein (fragment) or peptides encode stronger immunogenicity, whereby for the Modifications at the DNA level have the same considerations apply as for the peptides described above. A another type of modification is the stringing together numerous sequences coding for immunological relevant peptides, like a string of pearls ("string-of-beads"; Toes et al., 1997). The sequences can also be done by adding auxiliary elements be modified, e.g. B. Functions that a more efficient delivery and processing of the immunogen ensure (Wu et al., 1995). For example by adding a localization sequence to the endoplasmic reticulum ("ER targetting sequence") the processing and thus the presentation and ultimately the immunogenicity of the antigen can be increased.  

Die vorliegende Erfindung betrifft in einem weiteren Aspekt ein rekombinantes DNA-Molekül, das die R11-DNA enthält.The present invention relates in a further Aspect of a recombinant DNA molecule that contains the R11 DNA contains.

Die R11-DNA-Moleküle der vorliegenden Erfindung können, vorzugsweise in rekombinanter Form als Plasmide, direkt oder als Bestandteil eines rekombinanten Virus, oder Bakteriums verabreicht werden. Prinzipiell kann jede gentherapeutische Methode für die Immuntherapie von Krebs auf Basis von DNA ("DNA-Vakzine") auf R11-DNA angewendet werden, und zwar sowohl in vivo als auch ex vivo.The R11 DNA molecules of the present invention can preferably in recombinant form as plasmids, directly or as part of a recombinant virus, or Bacteria are administered. In principle, everyone can gene therapy method for the immunotherapy of Cancer based on DNA ("DNA vaccine") on R11 DNA applied, both in vivo and ex vivo.

Beispiele für die in vivo Verabreichung sind die direkte Injektion von "nackter" DNA, entweder intramuskulär oder mittels Gen-Pistole ("gene gun") von der sich gezeigt hat, daß sie zur Bildung von CTLs gegen Tumorantigene führt. Beispiele für rekombinante Organismen sind Vaccinia Virus, Adenovirus oder Listeria monocytogenes (eine Übersicht wurde von Coulie, 1997, gegeben). Desweiteren können synthetische Träger für Nukleinsäuren, wie kationische Lipide, Mikrosphären, Mikrokügelchen oder Liposomen für die in vivo Verabreichung von Nukleinsäure-Molekülen, kodierend für R11-Peptid verwendet werden. Ähnlich wie für Peptide können verschiedene Hilfsstoffe, die die Immunantwort verstärken, mitverabreicht werden, z. B. Zytokine, entweder in Form von Proteinen oder dafür kodierenden Plasmiden. Die Applikation kann gegebenenfalls mit physikalischen Methoden, z. B. Elektroporation, kombiniert werden. Examples of in vivo administration are direct injection of "naked" DNA, either intramuscularly or using a gene gun from who has shown that they are used to form CTLs against tumor antigens. Examples of recombinant Organisms are vaccinia virus, or adenovirus Listeria monocytogenes (an overview was provided by Coulie, 1997). Furthermore, synthetic Carriers for nucleic acids, such as cationic lipids, Microspheres, microspheres or liposomes for the in vivo administration of nucleic acid molecules, coding for R11 peptide can be used. Similar to For peptides, various excipients can be used Enhance immune response, be co-administered, e.g. B. Cytokines, either in the form of proteins or for them coding plasmids. The application can optionally using physical methods, e.g. B. Electroporation.  

Ein Beispiel für die ex vivo Verabreichung ist die Transfektion dendritischer Zellen, wie von Tuting, 1997, beschrieben, oder anderer APCs, die als zelluläre Krebsvakzine zur Anwendung kommen.An example of ex vivo administration is Transfection of dendritic cells, such as Tuting, 1997, or other APCs described as cellular Cancer vaccine are used.

Die vorliegende Erfindung betrifft somit in einem weiteren Aspekt die Verwendung von Zellen, die R11 exprimieren, entweder von sich aus oder, in gegebenenfalls modifizierter Farm, nach Transfektion mit der entsprechend kodierenden Sequenz, für die Herstellung einer Krebsvakzine.The present invention thus relates to one Another aspect is the use of cells that have R11 express, either on its own or, in possibly modified farm, after transfection with the corresponding coding sequence for which Production of a cancer vaccine.

Die Erfindung betrifft in einem weiteren Aspekt Antikörper gegen R11 bzw. Fragmente davon. Polyklonale Antikörper können in herkömmlicher Weise durch Immunisierung von Tieren, insbesondere Kaninchen, mittels Injektion des Antigens bzw. Fragmenten davon, und anschließender Reinigung des Immunglobulins erhalten werden.The invention relates in a further aspect Antibodies against R11 or fragments thereof. Polyclonal Antibodies can be carried out in a conventional manner Immunization of animals, especially rabbits, by injection of the antigen or fragments thereof, and subsequent purification of the immunoglobulin be preserved.

Monoklonale anti-R11-Antikörper können nach Standardprotokollen gemäß dem von Köhler und Milstein, 1975, beschriebenen Prinzip gewannen werden, indem Tiere, insbesondere Mäuse, immunisiert, anschließend antikörperproduzierende Zellen der immunisierten Tiere immortalisiert werden, z. B. durch Fusion mit Myelomzellen, und der Überstand der erhaltenen Hybridome mittels immunologischer Standard-Assays auf monoklonale anti-R11-Antikörper gescreent wird. Für den therapeutischen oder diagnostischen Einsatz im Menschen können diese tierischen Antikörper gegebenenfalls auf herkömmliche Weise chimerisiert (Neuberger et al., 1984, Boulianne et al., 1984) oder humanisiert (Riechmann et al., 1988, Graziano et al., 1995) werden.Anti-R11 monoclonal antibodies can be used Standard protocols according to those of Köhler and Milstein, 1975, principle can be obtained by Animals, especially mice, then immunized antibody-producing cells of the immunized animals be immortalized, e.g. B. by fusion with Myeloma cells, and the supernatant obtained Hybridomas using standard immunological assays anti-R11 monoclonal antibody is screened. For the therapeutic or diagnostic use in humans can, if necessary, on these animal antibodies chimerized in a conventional manner (Neuberger et al.,  1984, Boulianne et al., 1984) or humanized (Riechmann et al., 1988, Graziano et al., 1995).

Humane monoklonale anti-R11-Antikörper(fragmente) können auch von sog. "Phage Display Libraries" (Winter et al., 1994, Griffiths et al., 1994, Kruif et al., 1995, Mc Guiness et al., 1996) und mittels transgener Tiere (Brüggemann et al., 1996, Jakobovits et al., 1995) gewonnen werden.Human anti-R11 monoclonal antibodies (fragments) can also be obtained from so-called "phage display libraries" (winter et al., 1994, Griffiths et al., 1994, Kruif et al., 1995, Mc Guiness et al., 1996) and by means of transgener Animals (Brüggemann et al., 1996, Jakobovits et al., 1995).

Die erfindungsgemäßen anti-R11-Antikörper können in immunhistochemischen Analysen für diagnostische Zwecke eingesetzt werden.The anti-R11 antibodies according to the invention can be found in immunohistochemical analysis for diagnostic purposes be used.

In einem weiteren Aspekt betrifft die Erfindung die Verwendung von R11-spezifischen Antikörpern, um beliebige Substanzen selektiv zu bzw. in einen Tumor zu bringen, der R11 exprimiert. Beispiele für solche Substanzen sind zytotoxische Agentien oder radioaktive Nuklide, deren Wirkung darin besteht, den Tumor vorort zu schädigen. Aufgrund der tumorspezifischen Expression von R11 sind dabei keine oder nur geringe Nebenwirkungen zu erwarten. In einem weiteren Aspekt können mit Hilfe von R11-Antikörpern Substanzen zur Sichtbarmachung von Tumoren, die R11 exprimieren, herangezogen werden. Dies ist für die Diagnose und die Bewertung des Therapieverlaufs von Nutzen.In a further aspect, the invention relates to Use of R11-specific antibodies to selectively add any substances to or into a tumor bring that expresses R11. Examples of such Substances are cytotoxic or radioactive agents Nuclides, the effect of which is to localize the tumor to harm. Because of the tumor-specific expression of R11 are little or no Expected side effects. In another aspect can with the help of R11 antibodies substances for Visualization of tumors expressing R11 be used. This is for the diagnosis and the Evaluation of the course of therapy is useful.

Therapeutische und diagnostische Anwendungen von Antikörpern, die für anti-R11-Antikörper in Frage kommen, sind in der WO 95/33771 beschrieben.Therapeutic and diagnostic applications of Antibodies in question for anti-R11 antibodies come are described in WO 95/33771.

Das TAA der Bezeichnung R11 gemäß der vorliegenden Erfindung und die davon abgeleiteten Proteinfragmente, Peptide bzw. Peptid-Äquivalente oder Peptidomimetika können in der Krebstherapie eingesetzt werden, z. B. um eine Immunantwort gegen Tumorzellen zu induzieren, die die entsprechenden Antigen-Determinanten exprimieren. Vorzugsweise werden sie für die Therapie von R11- positiven Tumoren verwendet, insbesondere beim Mamma-, Nierenzell- und Pankreaskarzinom.The TAA of the designation R11 according to the present Invention and the protein fragments derived from it Peptides or peptide equivalents or peptidomimetics  can be used in cancer therapy, e.g. B. um to induce an immune response against tumor cells that express the corresponding antigen determinants. They are preferably used for the therapy of R11- positive tumors used, especially in the breast, Renal cell and pancreatic carcinoma.

FigurenübersichtFigure overview

Fig. 1 Transkription von R11 in Tumor- und Normalgeweben: Semiquantitative RT-PCR. Fig. 1 transcription of R11 in tumor and normal tissues: semiquantitative RT-PCR.

Fig. 2 Transkription von R11 in Tumorgeweben und Normalgeweben: Qualitative PCR. Fig. 2 Transcription of R11 in tumor tissues and normal tissues: Qualitative PCR.

Fig. 3 Northern Blot Analyse von R11 in Normalgeweben. Fig. 3 Northern Blot Analysis of R11 in normal tissues.

Fig. 4 Transkription von R11: Qualitative RT-PCR aus RNA von humanen Tumorzelllinien. Fig. 4 Transcription of R11: Qualitative RT-PCR from RNA from human tumor cell lines.

Fig. 5 Modifizierte Region des pCR3.1(+)Vektors. Fig. 5 Modified region of the pCR3.1 (+) vector.

Beispiel 1example 1 Zellkultur der von einem humanen Pankreaskarzinom abgeleiteten Zelllinie MZ.PC2 m7#1 B7.1#3 und Isolierung der poly A+ RNACell culture of the cell line MZ.PC2 m7 # 1 B7.1 # 3 derived from a human pancreatic carcinoma and isolation of the poly A + RNA

Die Zelllinie MZ.PC2 m7#1 B7.1#3 ist von einem humanen Pankreaskarzinom (MZ.PC2) abgeleitet; sie wurde wie folgt erhalten: Zunächst wurden die Tumorzellen einmal in der Maus passagiert und ein Klon für weitere Studien ausgewählt (MZ.PC 2m7#1). Dieser Klon wurde unter Standardbedingungen (Ausubel et al., 1994) mit einem eukaryontischen Vektor (pEE-BOS; Promotor stammt vom humanen EF-1alpha Gen, Selektionsmarker: Puromycin; Mizushima und Nagata, 1ß90), der die cDNA des humanen B7.1 Gens (Selvakumar et al., 1992) enthält, transfektiert. Ein Klon MZ-PC2 m7#1 B7.1#3 wurde ausgewählt und in T150 Zellkulturflaschen hochgezüchtet. Als Nährmedium diente RPMI 1640 (Gibco plus 4 g/L Glukose) mit 10% hitze-inaktiviertem, fötalem Kälberserum und 2 mN L-Glutamin. Alle 3 bis 4 Tage wurden die Zellen durch Trypsinisieren 1 : 5 zur Propagation gespalten. Nach Erreichen von etwa 80% Konfluenz wurden pro T150 Zellkulturflasche 4 ml einer Trypsinlösung (Angaben pro Liter: 8 g NaCl, 0,2 g KCl, 1,13 g Na2HPO4-wasserfrei, 0,2 g KH2PO4, 100 ml 2,5% Trypsinlösung, 1 g EDTA-Na-Salz; pH7,2-7,4) zum Ernten der Zellen eingesetzt. Insgesamt wurden 2 × 107 Zellen zur Isolierung der RNA nach dem Protokoll des Herstellers (RNeasy Minikit, QIAgen) eingesetzt. Ausgehend von ca. 100 µg total-RNA wurde für die Isolierung von polyA+ RNA mittels des Oligotex Kit (QIAgen) entsprechend dem Hersteller-Protokoll vergegangen. Im Anschluß daran wurde ausgehend von ca. 0,5 mg polyA+ RNA die cDNA Synthese nach Angaben des Herstellers (Clontech Marathon Protokoll) durchgeführt.The cell line MZ.PC2 m7 # 1 B7.1 # 3 is derived from human pancreatic carcinoma (MZ.PC2); it was obtained as follows: First, the tumor cells were passaged once in the mouse and a clone was selected for further studies (MZ.PC 2m7 # 1). This clone was developed under standard conditions (Ausubel et al., 1994) with a eukaryotic vector (pEE-BOS; promoter comes from the human EF-1alpha gene, selection marker: Puromycin; Mizushima and Nagata, 1ß90), which contains the cDNA of human B7.1 Gens (Selvakumar et al., 1992) contains, transfected. A clone MZ-PC2 m7 # 1 B7.1 # 3 was selected and grown up in T150 cell culture flasks. RPMI 1640 (Gibco plus 4 g / L glucose) with 10% heat-inactivated, fetal calf serum and 2 mN L-glutamine served as the nutrient medium. Every 3 to 4 days, the cells were cleaved by trypsinization 1: 5 for propagation. After approximately 80% confluence had been reached, 4 ml of a trypsin solution (data per liter: 8 g NaCl, 0.2 g KCl, 1.13 g Na 2 HPO 4 -hydrous, 0.2 g KH 2 PO 4 , 100 ml 2.5% trypsin solution, 1 g EDTA-Na salt; pH 7.2-7.4) were used to harvest the cells. A total of 2 × 10 7 cells were used to isolate the RNA according to the manufacturer's protocol (RNeasy Minikit, QIAgen). Starting from approx. 100 µg total RNA, the Oligotex Kit (QIAgen) was used to isolate polyA + RNA in accordance with the manufacturer's protocol. Subsequently, starting from approx. 0.5 mg polyA + RNA, the cDNA synthesis was carried out according to the manufacturer's instructions (Clontech Marathon protocol).

Beispiel 2Example 2 Repräsentative Differenzanalyse ("Representational Difference Analysis"; RDA) der Pankreaskarzinomzelllinie MZ.PC2 m7#1 B7.1#3 versus einem Pool von 11 NormalgewebenRepresentative Difference Analysis ("Representational Difference Analysis "; RDA) der Pancreatic carcinoma cell line MZ.PC2 m7 # 1 B7.1 # 3 versus a pool of 11 normal tissues

Ausgehend von ca. 0,5 µg poly-A(+) der Pankreastumorzelllinie MZ.PC2 m7#1 B7.1#3 und einem Pool aus 2,5 µg poly-A(+) RNA von 11 Normalgeweben (Clontech) Knochenmark, Herz, Niere, Leber, Lunge, Pankreas, Skelettmuskel, Milz, Thymus, Dünndarm und Magen wurde die RDA-Studie (Diatchenko et al.,; Hubank and Schatz,) unter Verwendung des PCR-select™ Kit (Clontech, Palo Alto) entsprechend dem Hersteller- Protokoll durchgeführt: dabei wurde die RNA der Pankreastumorzelllinie als "tester", die des Normalgewebepools als "driver" entsprechend dem Hersteller-Protokoll eingesetzt. Im Gegensatz zum ursprünglichen Protokoll wurde nach der Synthese von doppelsträngiger cDNA mittels oligo-dT die cDNA mit 6 Restriktionsenzymen: EcoRV, NaeI, NruI, ScaI (Promega), SspI, StuI (TaKaRa) in Promega Puffer A2 Stunden bei 37°C und nach Erhöhung der NaCl Konzentration auf 150 mM weitere 2 Stunden bei 37°C geschnitten. Der Einsatz dieser Mischung von 6 verschiedenen Restriktionsenzymen erlaubte die Generierung von ca. 800 bp langen cDNA-Fragmenten, die zur Repräsentativen Differenzanalyse zum Einsatz kamen.Starting from approx. 0.5 µg poly-A (+) the Pancreatic tumor cell line MZ.PC2 m7 # 1 B7.1 # 3 and one Pool of 2.5 µg poly-A (+) RNA from 11 normal tissues (Clontech) bone marrow, heart, kidney, liver, lungs, Pancreas, skeletal muscle, spleen, thymus, small intestine and The RDA study (Diatchenko et al.,; Hubank and Schatz,) using the PCR-select ™ kit (Clontech, Palo Alto) according to the manufacturer Protocol carried out: the RNA of the Pancreatic tumor cell line as "tester", the des Normal tissue pools as "driver" according to the Manufacturer protocol used. In contrast to original protocol was after the synthesis of double-stranded cDNA using oligo-dT with the cDNA 6 restriction enzymes: EcoRV, NaeI, NruI, ScaI (Promega), SspI, StuI (TaKaRa) in Promega buffer A2 Hours at 37 ° C and after increasing the NaCl Concentration on 150 mM for a further 2 hours at 37 ° C cut. The use of this mixture of 6 different restriction enzymes allowed Generation of approximately 800 bp long cDNA fragments were used for the representative difference analysis.

Gleiche Teile von "tester-cDNA" wurden entweder mit den Adaptoren A oder B ligiert und anschließend getrennt mit einem Überschuß an "driver-cDNA" bei 68°C hybridisiert. Danach wurden die beiden Ansätze vereinigt und einer zweiten Hybridisierung mit frischer denaturierter "driver-cDNA" unterworfen. Die angereicherten "tester"-spezifischen cDNAs wurden anschließend durch PCR mit für die Adaptoren A bzw. B spezifischen Primern des Kits mit 2 Minuten Elongationszeit bei 72°C exponentiell amplifiziert, 27 Zyklen (10" 94°C, 30" 66°C, 2' 72°C). Für eine weitere Anreicherung wurde ein Aliquot dieser Reaktion einer zweiten PCR mit spezifischen nach innen versetzten ("nested") Primern des Kits mit 2 Minuten Elongationszeit bei 72°C unterworfen, 10 Zyklen (10" 94°C, 30" 66°C, 2' 72°C). Das aus dieser Reaktion resultierende Produkt wurde in 3 verschiedene eigens modifizierte pCR3.1(+)-Vektoren (InVitrogen): Vektor (1.ORF), Vektor (2.ORF) und Vektor (3.ORF) (Fig. 5: CMV Cytomegalovirus; BGH Bovine Growth Hormone; ORF Open Reading Frame)
ligiert und anschließend in kompetente E. coli (OneShot™, Invitrogen) transformiert. Diese Vektoren ermöglichen die Expression in eukaryontischen Zellen in 3 unterschiedlichen Leserahmen.
Equal parts of "tester-cDNA" were ligated either with the adapters A or B and then hybridized separately with an excess of "driver-cDNA" at 68 ° C. The two approaches were then combined and subjected to a second hybridization with freshly denatured "driver cDNA". The enriched "tester" -specific cDNAs were then exponentially amplified by PCR with primers of the kit specific for the adapters A or B with a 2 minute elongation time at 72 ° C., 27 cycles (10 “94 ° C., 30“ 66 ° C., 2 '72 ° C). For further enrichment, an aliquot of this reaction was subjected to a second PCR with specific nested primers of the kit with an elongation time of 2 minutes at 72 ° C., 10 cycles (10 “94 ° C., 30“ 66 ° C., 2 '72 ° C). The product resulting from this reaction was converted into 3 different specially modified pCR3.1 (+) vectors (InVitrogen): vector (1.ORF), vector (2.ORF) and vector (3.ORF) ( FIG. 5: CMV Cytomegalovirus; BGH Bovine Growth Hormone; ORF Open Reading Frame)
ligated and then transformed into competent E. coli (OneShot ™, Invitrogen). These vectors enable expression in eukaryotic cells in 3 different reading frames.

Für die Konstruktion der 3 Vektoren wurde der pCR3.1(+)-Vektor (InVitrogen) mit NheI und HindIII (Promega) geschnitten und mit jeweils einem dsDNA Oligomer, das durch das Annealen von jeweils zwei ssDNA Oligomeren (SEQ ID NO: 3 und 4; Vektor ORF1) oder (SEQ ID NO: 5 und 6; Vektor ORF2) oder (SEQ ID NO: 7 und 8; Vektor ORF3) hergestellt wurde, nach Standardprotokollen ligiert (z. B. Ausubel et al., 1994; Sambrook et al. 1989). Die 3 Vektortypen besitzen ein Startcodon und eine Klonierungsstelle für die Expression in einem jeweils von den anderen beiden Vektoren unterschiedlichen Leserahmen. For the construction of the 3 vectors the pCR3.1 (+) - vector (InVitrogen) with NheI and HindIII (Promega) cut and each with a dsDNA Oligomer by annealing two ssDNA Oligomers (SEQ ID NO: 3 and 4; vector ORF1) or (SEQ ID NO: 5 and 6; Vector ORF2) or (SEQ ID NO: 7 and 8; Vector ORF3) was produced according to Standard protocols ligated (e.g. Ausubel et al., 1994; Sambrook et al. 1989). The 3 vector types have one Start codon and a cloning site for the Expression in one of the other two Vectors different reading frames.  

Die in drei Ansätzen (Vektor 1.ORF, 2.ORF und 3.ORF) durchgeführte Transformation von kompetenten E. coli (OneShot™, Invitrogen) mit der cDNA der subtraktiven cDNA-Bibliothek ergab etwa 9600 Klone. Diese wurden mittels PCR Analyse auf die Präsenz und Länge der Insert cDNA überprüft. Dabei wurde wie folgt vorgegangen: die 9600 Klone wurden in 96-Napf Blöcken in LB-Amp Medium für 48 h bei 37°C kultiviert. Anschließend wurden 5 µl Aliquots der E. coli Suspensionen in 500 µl TE Puffer für 10 Minuten auf 100°C erhitzt und 1,5 µl davon als Vorlage für eine PCR verwendet, bei der das Insert des Vektors mit flankierenden Primern (SEQ ID N0 : 9 und 10) amplifiziert wurde, 35 Zyklen (1' 99°C, 1' 55°C, 2' 72°C). Die PCR-Produkte wurden mittels Agarose-Gel-Elektrophorese und Ethidiumbromid-Färbung nachgewiesen. Die verbleibenden Bakterienkulturen wurden als Glycerinstammkulturen bei -80°C gelagert.The three approaches (vector 1.ORF, 2.ORF and 3.ORF) performed transformation of competent E. coli (OneShot ™, Invitrogen) with the cDNA of the subtractive cDNA library yielded approximately 9600 clones. These were by means of PCR analysis for the presence and length of the Insert cDNA checked. It was as follows proceeded: the 9600 clones were in 96-well blocks cultivated in LB-Amp medium for 48 h at 37 ° C. Then 5 ul aliquots of E. coli Suspensions in 500 µl TE buffer for 10 minutes Heated at 100 ° C and 1.5 µl of it as a template for a PCR used with the insert of the vector flanking primers (SEQ ID N0: 9 and 10) amplified was, 35 cycles (1 '99 ° C, 1' 55 ° C, 2 '72 ° C). The PCR products were analyzed using agarose gel electrophoresis and ethidium bromide staining. The remaining bacterial cultures were considered Glycerol stock cultures stored at -80 ° C.

Dadurch wurde eine cDNA-Subtraktionsbibliothek aus 350 Einzelklonen erhalten, die als E. coli Glycerin- Stammkulturen vorlagen und deren Insertlänge durch die Agarose-Gel-Elektrophorese bekannt war. Dabei konnte, wie erwartet, eine mittlere Länge der inserierten cDNA- Fragmente von ca. 800 bp nachgewiesen werden.This made a cDNA subtraction library 350 individual clones obtained as E. coli glycerol Stock cultures and their insert length by the Agarose gel electrophoresis was known. Could as expected, an average length of the inserted cDNA Fragments of approximately 800 bp can be detected.

Beispiel 3Example 3 DNA-Sequenzierung und Annotation von Klonen der subtraktiven cDNA-Bibliothek der Pankreastumorzelllinie MZ.PC2 m7#1 B7.1#3DNA sequencing and annotation of clones of the subtractive cDNA library of the pancreatic tumor cell line MZ.PC2 m7 # 1 B7.1 # 3

Die Plasmid-DNA von 50 aus der subtraktisen cDNA- Bibliothek willkürlich ausgewählten Klonen wurde entsprechend den Herstellerangaben (QIAgen) isoliert und nach der Sanger-Methode auf einem ABI-Prism Gerät sequenziert. Die so ermittelten Sequenzen wurden mittels BLAST-Search (National Center for Biotechnology Information) annotiert und EST-Datenbankvergleichen unterzogen. Das erlaubte die Identifizierung von 38 bekannten und 12 unbekannten Genen. Für letztere existierten lediglich EST-Einträge. Für die 12 unbekannten Gene wurde eine Abschätzung des Expressionsprofils vorgenommen: dabei wurde für alle in Datenbanken ESTs mit < 95% Identität (BLAST) zur experimentell ermittelten Sequenz das Ausgangsgewebe für die entsprechende cDNA-Bibliothek überprüft. Es wurde eine Unterteilung in i) kritische Normalgewebe, ii) foetale, "verzichtbare" und immunprivilegierte Gewebe und iii) Tumore und Tumorzelllinien vorgenommen. Auf der Basis dieses "virtuellen mRNA-Profils" wurden 4 Klone (R2, R8, R11 und R12) für eine weitere experimentelle Analyse ausgewählt.The plasmid DNA of 50 from the subtracted cDNA Library was selected clones arbitrarily isolated according to the manufacturer's instructions (QIAgen) and according to the Sanger method on an ABI-Prism device sequenced. The sequences determined in this way were using BLAST-Search (National Center for Biotechnology Information) annotated and EST database comparison subjected. This allowed the identification of 38 known and 12 unknown genes. For the latter only EST entries existed. For the 12th unknown genes has been estimated Expression profile made: for everyone in Databases ESTs with <95% identity (BLAST) for experimentally determined sequence the starting tissue checked for the corresponding cDNA library. It was divided into i) critical normal tissues, ii) fetal, "dispensable" and immune privileged Tissue and iii) tumors and tumor cell lines. On the basis of this "virtual mRNA profile" 4 Clones (R2, R8, R11 and R12) for another experimental analysis selected.

Beispiel 4Example 4 Transkriptionelle Analyse der Kandidaten-Klone in Tumor- und NormalgewebeTranscriptional analysis of the candidate clones in Tumor and normal tissues

Zwischen 2 und 5 µg total-RNA aus Tumor- oder Normalgeweben wurden mittels SuperScriptII (GibcoBRL) oder AMV-RT (Promega) entsprechend den Hersteller­ empfehlungen revers transkribiert. Für jede individuelle RNA Probe wurde ein zweiter Ansatz ohne reverse Transkriptase als Kontrolle für Kontamination durch chromosomale DNA durchgeführt. Qualität und Menge der cDNAs wurde durch PCR mit β-Actin spezifischen Primern (SEQ ID NO: 13 und 14) und GAPDH spezifischen Primern (SEQ ID NO: 15 und 16) nach 30 und 35 Zyklen (1-95°C, 1' 55°C, 1 72°C), überprüft. Die 4 Kandidatengene wurden analog mit jeweils spezifischen Primern analysiert. Die PCR-Produkte wurden mittels Agarose-Gel-Elektrophorese und Ethidiumbromid-Färbung nachgewiesen. Dabei zeigte ein Kandidat, der mit "R11" bezeichnet wurde, nach 35 Zyklen mit R11-spezifischen Primern (SEQ ID NO: 11 und 12) ein relativ spezifisches Tumor/Testis-Transkriptionsprofil; die semiquantitative RT-PCR von RNA aus Mammakarzinom, Lungen-Adenokarzinom, Lungen-Plattenepithelkarzinom, Nierenkarzinom, Kolonkarzinom, Herz, Lunge, Leber, Niere, Kolon, Milz und Testis ist in Fig. 1 dargestellt. Eine weitere qualitative PCR von cDNA aus Patientengewebe von 3 humanen Pankreastumoren mit denselben R11-spezifischen Primern (SEQ ID NO: 11 und 12) zeigte die Expression in humanen Pankreastumoren (Fig. 2). Weiters wurde eine zusätzliche qualitative PCR von cDNA aus verschiedenen Tumorzelllinien von humanen Lungen- (LC 6, 16), Gallenblase- (GB 1) und Pankreastumoren (PC 1, 2) sowie zwei Melanomen (Mel 2, 7) mit denselben R11- spezifischen Primern (SEQ ID N0 : 11 und 12) durchgeführt, die eine deutliche Expression in allen Tumorzelllinien (Fig. 4) zu erkennen gab. Bei dieser Analyse wurde nach dem Protokoll von Perkin Elmer (GeneAmp RNA PCR Kit, #N808-0017) vorgegangen (RT- Reaktion: (1 ×) 15'/42°C-5'/99°C-5'/4°C; PCR- Reaktion: (35 ×) 2'/95°C-1'/95°C-1'/60°C und (1 ×) 7'/72°C-4°C (Fig. 4). Wie oben beschrieben, wurden die PCR-Produkte mittels Agarose-Gel-Elektrophorese und Ethidiumbromid-Färbung nachgewiesen. Als Größenmarker kam ein 1kb Größenmarker von Gibco BRL zum Einsatz.Between 2 and 5 µg total RNA from tumor or normal tissues were reverse transcribed using SuperScriptII (GibcoBRL) or AMV-RT (Promega) according to the manufacturer's recommendations. For each individual RNA sample, a second approach without reverse transcriptase as a control for contamination by chromosomal DNA was carried out. The quality and amount of the cDNAs were determined by PCR with β-actin-specific primers (SEQ ID NO: 13 and 14) and GAPDH-specific primers (SEQ ID NO: 15 and 16) after 30 and 35 cycles (1-95 ° C, 1 ' 55 ° C, 1 72 ° C), checked. The 4 candidate genes were analyzed analogously with specific primers. The PCR products were detected by agarose gel electrophoresis and ethidium bromide staining. One candidate, designated "R11", showed a relatively specific tumor / testis transcription profile after 35 cycles with R11-specific primers (SEQ ID NO: 11 and 12); the semi-quantitative RT-PCR of RNA from breast cancer, lung adenocarcinoma, lung squamous cell carcinoma, kidney carcinoma, colon carcinoma, heart, lung, liver, kidney, colon, spleen and testis is shown in FIG. 1. Another qualitative PCR of cDNA from patient tissue from 3 human pancreatic tumors with the same R11-specific primers (SEQ ID NO: 11 and 12) showed the expression in human pancreatic tumors ( FIG. 2). Furthermore, an additional qualitative PCR of cDNA from different tumor cell lines of human lung (LC 6, 16), gall bladder (GB 1) and pancreatic tumors (PC 1, 2) as well as two melanomas (Mel 2, 7) with the same R11-specific were Primers (SEQ ID N0: 11 and 12) carried out, which gave a clear expression in all tumor cell lines ( Fig. 4). This analysis was carried out according to the protocol of Perkin Elmer (GeneAmp RNA PCR Kit, # N808-0017) (RT reaction: (1 ×) 15 '/ 42 ° C-5' / 99 ° C-5 '/ 4 ° C; PCR reaction: (35 ×) 2 '/ 95 ° C-1' / 95 ° C-1 '/ 60 ° C and (1 ×) 7' / 72 ° C-4 ° C ( Fig. 4) As described above, the PCR products were detected by agarose gel electrophoresis and ethidium bromide staining using a 1kb size marker from Gibco BRL.

Beispiel 5Example 5 Transkriptionsprofil von R11 in NormalgewebenR11 transcription profile in normal tissues

Für die Northern Blot Analyse wurden "Human Multiple Tissue Northern Blots" (Clontech, Palo Alto und Invitrogen) mit dem [α-32P]dCTP (NEN, Boston) markierten etwa 1000 bp langen R11 PCR Produkt bei 68° für 2 h hybridisiert. Die Visualisierung erfolgte durch Standard-Autoradiografie (Hyperfilm, Amersham). Fig. 3 zeigt das Ergebnis dieser Analyse: von 19 Normalgeweben (Pankreas, Nebennierenmark, Schilddrüse, Nebennierenrinde, Testis, Thymus, Dünndarm, Magen, Hirn, Herz, Skelettmuskel, Kolon, Milz, Niere, Leber, Plazenta, Lunge, Leukozyten). Für R11 zeigt sich in Plazenta, Nebennierenmark, Nebennierenrinde und in Testis ein prominentes Transkript von 7,5 kb Länge. Eine sehr schwache Bande von 7,5 kb kann auch im Hirn nachgewiesen werden. Da alle diese Normalgewebe einen immunprivilegierten Status aufweisen (Streilein, 1995), ist bei einer auf diesem Antigen beruhenden Immuntherapie eine Attacke durch CTL auszuschließen.For Northern blot analysis, "Human Multiple Tissue Northern Blots" (Clontech, Palo Alto and Invitrogen) were hybridized with the [α- 32 P] dCTP (NEN, Boston) labeled approximately 1000 bp R11 PCR product at 68 ° for 2 h . The visualization was carried out by standard autoradiography (Hyperfilm, Amersham). Fig. 3 shows the result of this analysis: from 19 normal tissues (pancreas, adrenal medulla, thyroid, adrenal cortex, testis, thymus, small intestine, stomach, brain, heart, skeletal muscle, colon, spleen, kidney, liver, placenta, lung, leukocytes). For R11, a prominent transcript of 7.5 kb in length is found in the placenta, adrenal medulla, adrenal cortex and in testis. A very weak band of 7.5 kb can also be detected in the brain. Since all of these normal tissues have an immune privileged status (Streilein, 1995), an attack by CTL can be ruled out in immunotherapy based on this antigen.

Weitere Transkripte von 3,8 kb und 2,3 kb, welche möglicherweise Spleißvarianten des 7,5 kb Transkripts darstellen oder von einem homologen Gen abgeleitet sind, wurden im Nebennierenmark und der Nebennierenrinde identifiziert (Fig. 3).Additional transcripts of 3.8 kb and 2.3 kb, which may represent splice variants of the 7.5 kb transcript or are derived from a homologous gene, were identified in the adrenal medulla and the adrenal cortex ( FIG. 3).

Beispiel 6Example 6 Klonierung der cDNA von R11Cloning of R11 cDNA

Zur Klonierung der humanen R11-cDNA wurde wie folgt vorgegangen: eine BLAST-Analyse ergab, daß zu der in Beispiel 3 durch Sequenzierung erhaltenen R11 "Originalsequenz" (796 bp) ein überlappendes Fragment AF038197 und eine Vielzahl von überlappenden ESTs, wie z. B. N42343, W69539, H82474, H51766, N28313, identifiziert werden konnten. Ausgehend von der Sequenz AF038197 wurde mit dem EstExtractor auf TigemNet (http: // gcg.tigem.it/cgi-bin/uniestass.pl) ein mit dem Klon R11 überlappendes Contig gefunden. Die Überlappung des Contigs und der 796 bp R11 "Originalsequenz" konnte durch PCR-Aplifikation mit einem R11 "Originalsequenz" spezifischen Primer und einem am Contig liegenden Primer (SEQ ID NO: 17 und 18) aus einer SuperScript™ Human Testis cDNA Library (GibcoBRL) und anschließender Sequenzierung verifiziert werden. Aus der SuperScript™ Human Testis cDNA Library konnten durch eine PCR mit einem R11 spezifischen Primer (SEQ ID NO: 19) und einem Vektor-spezifischen Primer (SEQ ID NO: 20) weitere zu R11 gehörende Fragmente unter Verwendung des Advantage cDNA PCR Kit (Clontech) und dem dort beschriebenen Standardprotokoll amplifiziert werden. Die Kenntnis dieser neuen Sequenzen ermöglichte wiederum PCR Ansätze mit R11 spezifischen Primern (SEQ ID NO: 21 und 22) und dem Vektor-spezifischen Primer (SEQ ID NO: 20). The cloning of the human R11 cDNA was carried out as follows proceeded: a BLAST analysis showed that to the in Example 3 R11 obtained by sequencing "Original Sequence" (796 bp) an overlapping fragment AF038197 and a variety of overlapping ESTs, such as e.g. B. N42343, W69539, H82474, H51766, N28313, could be identified. Starting from the sequence AF038197 was using the EstExtractor on TigemNet (http: // gcg.tigem.it/cgi-bin/uniestass.pl) one with the Clone R11 overlapping contig found. The overlap des Contigs and the 796 bp R11 "original sequence" by PCR aplification with an R11 "original sequence" specific primer and one on the contig Primer (SEQ ID NO: 17 and 18) from a SuperScript ™ Human Testis cDNA Library (GibcoBRL) and subsequent Sequencing to be verified. From the SuperScript ™ Human Testis cDNA Library could be analyzed by PCR an R11 specific primer (SEQ ID NO: 19) and one Vector-specific primers (SEQ ID NO: 20) further Fragments belonging to R11 using the Advantage cDNA PCR Kit (Clontech) and the one described there Standard protocol are amplified. The knowledge these new sequences in turn enabled PCR approaches with R11 specific primers (SEQ ID NO: 21 and 22) and the vector specific primer (SEQ ID NO: 20).  

Für die weiter Verlängerung der R11-cDNA wurde ein humane Testis Rapid-Screening cDNA Library panel (OriGene Technologies, Inc) mit für R11 spezifischen Primern (SEQ ID NO: 23 und 24) unter den vom Hersteller angegebenen Standard PCR-Bedingungen gescreent. Van den positiven Näpfchen wurde ein Aliquot als Template für eine PCR mit einem R11 spezifischen und einem für den Vektor spezifischen Primer (SEQ ID NO: 25 und 26) unter Verwendung des Advantage cDNA PCR Kit (Clontech) und dem dort beschriebenen Standardprotokoll amplifiziert. Für die Sequenzanalyse wurden Aliquote der PCR-Ansätze direkt in den pCR2.1-Vektor (Invitrogen) ligiert und anschließend in kompetente E. coli (OneShot™, Invitrogen) transformiert und, wie in Beispiel 3 beschrieben, sequenziert.A was used for the further extension of the R11 cDNA human testis rapid screening cDNA library panel (OriGene Technologies, Inc) with specific for R11 Primers (SEQ ID NO: 23 and 24) among those from the manufacturer the specified standard PCR conditions. Van den an aliquot was used as a template for positive cells a PCR with an R11 specific and one for the Vector specific primers (SEQ ID NO: 25 and 26) below Use of the Advantage cDNA PCR Kit (Clontech) and amplified the standard protocol described there. Aliquots of the PCR batches were used for the sequence analysis ligated directly into the pCR2.1 vector (Invitrogen) and then in competent E. coli (OneShot ™, Invitrogen) transformed and, as in Example 3 described, sequenced.

Der klonierte Bereich der R11-cDNA beträgt 5714 bp, wobei das Vorhandensein eines PolyA-Schwanzes am 3'-Ende der Sequenz für die Vollständigkeit der cDNA in diesem Bereich spricht. Ein durchgehender Leserahmen ist durch das Startkodon an Position 570 und das Stopkodon (TAA) an Position 1638 repräsentiert. Da zu diesem Gen keine Datenbankeintragungen von bekannten Genen existieren, kann über die Funktion keine Aussage getroffen werden. Eine Analyse des Proteinprofils (http: // www.expasy.ch/prosite/) ergab neben den zwei offensichtlichen Prolin-reichen Abschnitten (Position #128-141 und 330-351 in SEQ ID NO: 2), potentielle Motive für zwei N-Glykosylierungsstellen (104-107 und 250-253), eine Protein Kinase C Phosphorylierungsstelle (108-110), vier Casein Kinase II Phosphorylierungsstellen (99-102, 165-168, 198-201, 273-276), zwei N-Myristoylierungsstellen (21-26, 309-314) und eine Region mit Ähnlichkeit zum aktiven Zentrum von eukaryontischen und viralen Aspartat Proteinasen (16-27).The cloned region of the R11 cDNA is 5714 bp, the presence of a polyA tail on 3 'end of the sequence for completeness of the cDNA in this area speaks. A continuous reading frame is through the start codon at position 570 and that Stop codon (TAA) represented at position 1638. To this gene no database entries from known Genes exist, no statement can be made about the function to be hit. An analysis of the protein profile (http: // www.expasy.ch/prosite/) resulted in addition to the two obvious proline-rich sections (position # 128-141 and 330-351 in SEQ ID NO: 2), potential Motifs for two N-glycosylation sites (104-107 and 250-253), a protein kinase C phosphorylation site (108-110), four casein kinase II Phosphorylation sites (99-102, 165-168, 198-201,  273-276), two N-myristoylation sites (21-26, 309-314) and a region similar to the active one Center of eukaryotic and viral aspartate Proteinases (16-27).

Beispiel 7Example 7 Potentielle MHC-Bindungspeptide in der für den C-terminalen Teil von R11 kodierenden RegionPotential MHC binding peptides in the for C-terminal part of R11 coding region

Potentielle Peptid-Epitope innerhalb der kodierenden Region des C-terminalen Fragmentes von R11 gemäß (SEQ ID NO: 2) würden mittels den von Parker et. al., 1994 beschriebenen Algorithmen unter Zugrundelegung bekannter Motive (Rammensee et al. 1995) durchgeführt. Für die wichtigsten HLA-Typen, insbesondere für HLA-A1, -A*0201, -A3, -B7, -B14 und -B*4403, wurden 9-mer Kandidaten-Peptide identifiziert, von denen zu erwarten ist, daß sie an die entsprechenden HLA-Moleküle binden und daher immunogene CTL-Epitope darstellen; die ermittelten Peptide sind in Tab. 1 aufgelistet. Durch analoges Vorgehen können weitere potentielle Peptid- Epitope für andere HLA-Typen bzw. 8- und 10-mer Peptide ermittelt werden.Potential peptide epitopes within the coding Region of the C-terminal fragment of R11 according to (SEQ ID NO: 2) would be determined using the method described by Parker et. al., Algorithms described in 1994 on the basis known motifs (Rammenee et al. 1995). For the most important HLA types, especially for HLA-A1, -A * 0201, -A3, -B7, -B14 and -B * 4403, became 9-mer Candidate peptides identified from which to be expected is that they bind to the corresponding HLA molecules and therefore represent immunogenic CTL epitopes; the The peptides found are listed in Table 1. By analogous procedure can further potential peptide Epitopes for other HLA types or 8- and 10-mer peptides be determined.

Tabelle 1 Table 1

Immunogene Peptid-Kandidaten des C-terminalen Fragmentes von R11 (356 Aminosäuren) Immunogenic peptide candidates of the C-terminal fragment of R11 (356 amino acids)

Literaturliterature

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SEQUENZPROTOKOLL SEQUENCE LOG

Claims (19)

1. Tumorassoziiertes Antigen der Bezeichnung R11, dadurch gekennzeichnet, daß es die in SEQ ID NO: 2 definierte Aminosäuresequenz aufweist oder diese als Teilsequenz enthält.1. Tumor-associated antigen of the designation R11, characterized in that it has the amino acid sequence defined in SEQ ID NO: 2 or contains it as a partial sequence. 2. Immunogenes Proteinfragment oder Peptid, dadurch gekennzeichnet, daß es von dem in Anspruch 1 definierten tumorassoziierten Antigen abgeleitet ist.2. Immunogenic protein fragment or peptide, thereby characterized in that it is of that in claim 1 defined tumor-associated antigen is. 3. Immunogenes (Poly)peptid nach Anspruch 2, das eine humorale Immunantwort auslöst.3. Immunogenic (poly) peptide according to claim 2, which a triggers humoral immune response. 4. Immunogenes (Poly)peptid nach Anspruch 2, das bzw. dessen Abbauprodukte durch MHC-Moleküle präsentiert werden und eine zelluläre Immunantwort auslösen.4. Immunogenic (poly) peptide according to claim 2, which or its degradation products through MHC molecules are presented and a cellular immune response trigger. 5. Immunogenes Peptid nach Anspruch 4, ausgewählt aus der Gruppe von Peptiden gemäß SEQ ID NO: 27 bis 70.5. The immunogenic peptide of claim 4 selected from the group of peptides according to SEQ ID NO: 27 to 70. 6. Immunogenes (Poly)peptid nach einem der Ansprüche 1 bis 5 für die Immuntherapie von Krebserkrankungen in vivo oder ex vivo, wobei das (Poly)peptid eine Immunantwort gegen Tumorzellen des Patienten induziert, die R11 exprimieren.6. Immunogenic (poly) peptide according to one of the claims 1 to 5 for the immunotherapy of Cancers in vivo or ex vivo, where the (Poly) peptide has an immune response against tumor cells of the patient that express R11. 7. Pharmazeutische Zusammensetzung für die parenterale, topische, orale oder lokale Verabreichung, dadurch gekennzeichnet, daß sie als wirksame Komponente ein oder mehrere immunogene (Poly)peptide nach einem der Ansprüche 1 bis 5 enthält.7. Pharmaceutical composition for the parenteral, topical, oral or local Administration, characterized in that it is considered  active component one or more immunogenic (Poly) peptides according to one of claims 1 to 5 contains. 8. Pharmazeutische Zusammensetzung nach Anspruch 7, dadurch gekennzeichnet, daß sie verschiedene, von R11 abgeleitete immunogene Peptide enthält.8. Pharmaceutical composition according to claim 7, characterized in that they are different from Contains R11 derived immunogenic peptides. 9. Pharmazeutische Zusammensetzung nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, daß sie ein oder mehrere von R11 abgeleitete Peptide in Mischung mit von anderen tumorassoziierten Antigenen abgeleiteten Peptiden enthält.9. Pharmaceutical composition according to claim 8, characterized in that they have one or more peptides derived from R11 mixed with von other tumor-associated antigens Contains peptides. 10. Pharmazeutische Zusammensetzung nach Anspruch 7 oder 8, daß die Peptide an mindestens zwei verschiedene HLA-Typen binden.10. Pharmaceutical composition according to claim 7 or 8 that the peptides on at least two bind different HLA types. 11. Isoliertes DNA-Molekül, kodierend für ein Protein mit den immunogenen Eigenschaften des in Anspruch 1 definierten tumorassoziierten Antigens oder für Fragmente davon.11. Isolated DNA molecule coding for a protein with the immunogenic properties of in Claim 1 defined tumor-associated antigen or for fragments of it. 12. DNA-Molekül nach Anspruch 11, kodierend für ein immunogenes Polypeptid der Bezeichung R11, das die in SEQ ID NO: 2 enthaltene Aminosäuresequenz aufweist oder diese enthält, bzw. für davon abgeleitete Proteinfragmente oder Peptide.12. DNA molecule according to claim 11, coding for a immunogenic polypeptide of the designation R11, which the amino acid sequence contained in SEQ ID NO: 2 has or contains them, or for them derived protein fragments or peptides. 13. DNA-Molekül nach Anspruch 12, dadurch gekennzeichnet, daß es ein Polynukleotid mit der in SEQ ID NO: 1 dargestellten Sequenz ist oder diese Sequenz enthält oder daß es ein Polynukleotid ist oder dieses enthält, das mit einem Polynukleotid der in SEQ ID NO: 1 dargestellten Sequenz unter stringenten Bedingungen hybridisiert.13. DNA molecule according to claim 12, characterized characterized in that it is a polynucleotide with the sequence shown in SEQ ID NO: 1 is or contains this sequence or that it is a Polynucleotide is or contains this that with a polynucleotide that is shown in SEQ ID NO: 1  sequence shown under stringent Conditions hybridized. 14. Rekombinantes DNA-Molekül, enthaltend ein DNA- Molekül gemäß einem der Ansprüche 12 bis 13.14. Recombinant DNA molecule containing a DNA Molecule according to one of claims 12 to 13. 15. DNA-Molekül nach einem der Ansprüche 11 bis 14, für die Immuntherapie von Krebserkrankungen, wobei das von dem DNA-Molekül exprimierte R11 (Poly)peptid eine Immunantwort gegen Tumorzellen des Patienten induziert, die R11 exprimieren.15. DNA molecule according to one of claims 11 to 14, for cancer immunotherapy, where the R11 expressed by the DNA molecule (Poly) peptide has an immune response against tumor cells of the patient that express R11. 16. Verwendung von Zellen, die das in Anspruch 1 definierte Antigen exprimieren, für die Herstellung einer Krebsvakzine.16. Use of cells that in claim 1 express defined antigen for which Production of a cancer vaccine. 17. Antikörper gegen ein in einem der Anspüche 1 bis 5 definiertes (Poly)peptid.17. Antibodies against one of claims 1 to 5 defined (poly) peptide. 18. Antikörper nach Anspruch 17, dadurch gekennzeichnet, daß er monoklonal ist.18. Antibody according to claim 17, characterized characterized as being monoclonal. 19. Antikörper nach Anspruch 17 oder 18 für die Therapie und Diagnose von Krebserkrankungen, die mit der Expression von R11 assoziiert sind.19. Antibody according to claim 17 or 18 for the Therapy and diagnosis of cancer that are associated with the expression of R11.
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