DE19834584A1 - Vorrichtung zur magnetischen Aufreinigung von biologischen Materialien - Google Patents

Vorrichtung zur magnetischen Aufreinigung von biologischen Materialien

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Abstract

Die Erfindung betrifft eine Vorrichtung zur magnetischen Aufreinigung von biologischen Materialien. In Kombination mit Probengefäßen im Multiwell-Plattenformat kann die erfindungsgemäße Vorrichtung besonders gut zur automatisierten magnetischen Separation von biologischen Materialien verwendet werden.

Description

Die Erfindung betrifft eine Vorrichtung zur magnetischen Aufreinigung von biologischen Materialien. In Kombination mit Probengefäßen im Multiwell- Plattenformat kann die erfindungsgemäße Vorrichtung besonders gut zur automatisierten magnetischen Separation von biologischen Materialien verwendet werden.
Vorrichtungen die bei der magnetischen Aufreinigung von biologischen Materialien verwendet werden, sind auf dem Gebiet der Molekularbiologie, Biochemie und Biomedizin seit längerem bekannt und im Stand der Technik dokumentiert. Allen gemeinsam ist, daß magnetische Trägerpartikel, an die die biologischen Materialien gebunden sind, mittels eines Magneten aktiviert werden, wodurch eine Abscheidung aus der Flüssigkeit erzielt wird. Die Flüssigkeit wird aus den Probengefäßen entfernt und das abgeschiedene Material weiterbehandelt. unvollständiges Abscheiden der Magnetpartikel, Kontaminationsprobleme und schwache Magnetleistungen machen die bisher im Handel erhältlichen Vorrichtungen, insbesondere für den Einsatz in automatisierten Vorgängen, ungeeignet.
Der Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, die Aufreinigung von biologischen Materialien die an magnetische Partikel gebunden sind zu vereinfachen und die Probleme, die sich aus dem Stand der Technik ergeben, zu vermeiden.
Eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist die Vereinfachung der automatisierten magnetischen Aufreinigung von biologischen Materalien.
Zur Lösung dieser Aufgabe wird eine Vorrichtung bereitgestellt, welche eine Trägerplatte umfaßt in der eine Mehrzahl von Magnetstiften verankert ist, wobei die Trägerplatte durch eine oder zwei seitliche Führungen, welche bei zwei seitlichen Führungen bevorzugt an den entgegengesetzten Enden der Trägerplatte liegen, begrenzt ist und eine oder mehrere mechanische und/oder optische Markierung(en) in der Trägerplatte verankert ist/sind und die Trägerplatte kompatibel mit handelsüblichen Multiwell-Platten ist. Die seitliche(n) Führung(en) an der Trägerplatte erleichtert I erleichtern das wiederholte Abheben und Aufsetzen der Multiwell-Platte auf die Trägerplatte, die mechanische und/oder optische(n) Markierung(en) ermöglicht/ermöglichen das Aufsetzen der Multiwell-Platte auf der Trägerplatte in einer bestimmten Orientierung.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsformen der erfindungsgemäßen Vorrichtung besteht die Trägerplatte aus nicht magnetisierbarem Material, bevorzugt ist Kunststoff, Keramik oder Aluminium.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsformen der erfindungsgemäßen Vorrichtung sind die Magnetstifte so angeordnet, daß jeder Magnetstift von 4 Probengefäßen umgeben ist, bevorzugt sind 24 Magnetstifte, welche bevorzugt aus Seltenerd Eisen Mischungen, bevorzugt FeNdB Mischungen, bestehen.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsformen der erfindungsgemäßen Vorrichtung sind die Magnetstifte axial oder diametral angeordnet.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsformen der erfindungsgemäßen Vorrichtung besteht die seitliche Führung aus nicht-magnetisierbarem Material, wobei Kunststoff, Keramik und/oder Aluminium bevorzugt sind, bevorzugt ist die seitliche Führung fest mit der Trägerplatte verbunden.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsformen wird die erfindungsgemäße Vorrichtung zur Reinigung von biologischen Materialien in einer Multiwell-Platte verwendet, insbesondere zur Reinigung von Proteinen und/oder Nukleinsäuren, insbesondere DNA und/oder RNA.
Biologische Materialien im Sinne der vorliegenden Erfindung sind solche Materialien, die aus Viren und/oder prokaryotischem und/oder eukaryotischem Material erhalten werden können, z. B. Makromoleküle wie Nukleinsäuren, insbesondere DNA und/oder RNA, Proteine, Polysaccharide, Lipide etc.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsformen ist die erfindungsgemäße Vorrichtung Teil einer automatischen oder automatisierten Pipettiervorrichtung, bevorzugt ist der BioRobot 9600, 9604 oder dessen Folgemodelle oder ähnliche Modelle, bevorzugt in der Verwendung zur Reinigung von Proteinen und/oder Nukleinsäuren, insbesondere DNA und/oder RNA.
Fig. 1 zeigt den schematischen Aufbau einer besonders bevorzugten Ausführungsform der erfindungsgemäßen Vorrichtung. Die aus Kunststoff bestehende Trägerplatte (1) wird von den zwei seitlichen Führungsschienen (2) begrenzt. Trägerplatte und seitliche Führung sind fest miteinander verbunden. Diese Führung erleichtert das Aufsetzen und Abheben der Multiwell-Platten und verhindert die eventuelle Beschädigung der Magnetstifte. Als mechanische Markierung (4) der Trägerplatte wurde ein Metallstift so angebracht, daß die 96-well-Platte nur in einer Orientierung aufgesetzt werden kann. Somit wird eine Verwechslung der Proben vermieden. In der Trägerplatte sind 24 Magnetstifte (3) so verankert, daß jeweils 4 Probengefäße einer handelsüblichen 96-well-Platte, bevorzugt Firma QIAGEN "Round Well Block" Cat.No. 19576/1998 oder eine ähnliche Platte, um einen Magnetstift angeordnet sind. Die Magnetstifte sind aus NdFeB. Die Ausrichtung der Magnete erfolgt, je nach Bedarf, axial oder diametral.
In Fig. 2 wird der Effekt, den die unterschiedliche Ausrichtung der Magnete auf die Abscheidungsform der Magnetpartikel hat, skizziert.
Fig. 2a) demonstriert die axiale Ausrichtung der Magnete; d. h. das Magnetfeld ist senkrecht zur Trägerplatte ausgerichtet. Die Abscheidung der NdFeB-Partikel erfolgt an einer Stelle der, dem Magneten zugewandten, Probengefäßwand ab.
Fig. 2b) zeigt die diametrale Ausrichtung der Magnete; das Magnetfeld ist waagerecht zur Trägerplatte ausgerichtet. Die NdFeB-Partikel scheiden sich entlang der ganzen, dem Magneten zugewandten, Probengefäßwand ab.
In Fig. 3 wird die Verwendung der erfindungsgemäßen Vorrichtung mit dem BioRobot 9600 der Firma QIAGEN demonstriert. Der BioRobot besteht aus einer automatischen Pipettiervorrichtung und einer Arbeitsplatte. Auf dieser Arbeitsplatte kann die erfindungsgemäße Vorrichtung fixiert werden. Die Reinigung des Biomaterials erfolgt bevorzugt in einer 96-well-Platte. Das biologische Material wird an magnetischen NdFeB-Partikel gebunden und in Lösung suspendiert. Wird die 96-well-Platte auf die in Fig. 1 beschriebene Vorrichtung aufgesetzt, so werden die magnetisierten Biomoleküle abgeschieden und die überstehende Flüssigkeit kann automatisch abpipettiert werden.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung eignet sich gut zur Verwendung in allen automatisierten Pipettier-Systemen, die Multiwell-Platten als Probengefäße für die automatisierte Aufreinigung von biologischen Materialien wie Proteinen oder Nukleinsäuren verwenden, insbesondere zur Verwendung im BioRobot 9600, 9604 oder dessen Folgemodellen oder ähnlichen Modellen. Der BioRobot besteht aus einer automatischen, von einem Prozessor gesteuerten, Pipettiervorrichtung, welche in mindestens 2 (zwei) Richtungen, bevorzugt sind 3 (drei) Richtungen, relativ zu einer Arbeitsplatte bewegt werden kann. Auf der Arbeitsplatte kann die erfindungsgemäße Vorrichtung fixiert werden. Die Reinigung des biologischen Materials erfolgt bevorzugt in einer Multiwell-Platte, bevorzugt ist eine 96er oder 384er Platte. Die Biomoleküle werden bevorzugt an magnetische Partikel, bevorzugt NdFeB- Partikel, gebunden und in Lösung suspendiert. Wird die Multiwell-Platte auf die in Fig. 1 beschriebene Vorrichtung aufgesetzt, so wird das an magnetische Partikel gebundene biologische Material abgeschieden und die überstehende Flüssigkeit kann automatisch abpipettiert, und das biologische Material kann isoliert werden.
Ein weiterer Aspekt der vorliegenden Erfindung betrifft ein Verfahren, bevorzugt wie oben beschrieben, zur Reinigung von biologischem Material, wobei die erfindungsgemäße Vorrichtung auf einer automatischen Pipettierstation montiert ist, eine Mulitwell-Platte, in der sich an magnetische Partikel gebundenes biologisches Material befindet, in diese eingebracht wird, die überstehende Flüssigkeit abpipettiert, und das biologische Material anschließend isoliert wird.

Claims (14)

1. Vorrichtung, bestehend aus einer Trägerplatte in der eine Mehrzahl von Magnetstiften verankert sind, dadurch gekennzeichnet,
  • - daß die Trägerplatte durch mindestens eine seitliche Führung begrenzt ist und
  • - daß mindestens eine mechanische und/oder optische Markierung in der Trägerplatte verankert ist und
  • - daß die Trägerplatte kompatibel mit handelsüblichen Multiwell-Platten ist.
2. Vorrichtung nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß die Trägerplatte der Vorrichtung bevorzugt aus nicht magnetisierbarem Material besteht.
3. Vorrichtung nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, daß ein Magnetstift im Zentrum von 4 Probengefäßen angeordnet ist.
4. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet, daß mindestens 24 Magnetstifte in der Trägerplatte verankert sind.
5. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet, daß die Magnetstifte Seltenerd Eisen Magnete sind.
6. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 5, dadurch gekennzeichnet, daß die Magnetstifte FeNdB Magnete sind.
7. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 6 dadurch gekennzeichnet, daß die Ausrichtung der Magnete axial oder diametral erfolgt.
8. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 7 dadurch gekennzeichnet, daß die seitliche Führung aus nicht-magnetisierbarem Material besteht.
9. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 zur Verwendung bei der Reinigung von biologischen Materialien in einer Multiwell-Platte.
10. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 zur Verwendung bei der Reinigung von Nukleinsäuren und/oder Proteinen in einer Multiwell- Platte.
11. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 zur Verwendung bei der Reinigung von DNA und/oder RNA in einer Multiwell-Platte.
12. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 zur Verwendung, bei der automatisierten Reinigung von Nukleinsäuren.
13. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 zur Verwendung, bei der automatisierten Reinigung von DNA und/oder RNA.
14. Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 zur Verwendung auf einer automatisierten Pipettierplattform.
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