DE10028725A1 - Primary structure and nucleic acid of the human neutrophil antigen-2a, useful for antigen detection, e.g. diagnosis of various forms of neutropenia - Google Patents

Primary structure and nucleic acid of the human neutrophil antigen-2a, useful for antigen detection, e.g. diagnosis of various forms of neutropenia

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    • C07K14/70539MHC-molecules, e.g. HLA-molecules

Abstract

The primary structure of the human neutrophil antigen-2a (HNA-2a, previously known as NB-1), expressed on neutrophilic granulocytes, is new. Independent claims are also included for the following: (1) nucleic acid sequences for HNA-2a; and (2) the deduced amino acid sequence and applications of NHA-2a.

Description

Es ist bekannt, daß das HNA-2a (NB1)-Merkmal zur Bildung von Allo- und Autoantikörpern führen kann. Diese Antikörper können zu Erkrankungen wie der neonatalen Immunneutropenie, die transfusionsassoziierten akuten Lungeninsuffizienz, der Immunneutropenie nach Knochenmarktransplantation, der Medikament-induzierten Immunneutropenie sowie der Autoimmunneutropenie führen. Man weiß, daß es sich bei dem HNA-2a (NB1)-Antigen um ein auf einer Subpopulation der Granulozyten exprimiertes Glykoprotein handelt. Die dem Glykoprotein zugrundeliegende Nukleotid- und Aminosäuresequenz ist bisher nicht bekannt gewesen, weshalb die fragilen und nicht lagerbaren Granulozyten für die Antigen- und Antikörper-Diagnostik benutzt werden müssen. Hierzu sind die Granulozyten zunächst arbeits- und zeitaufwendig aus dem Blut von Patienten (Antigennachweis) bzw. ausgesuchter, gesunder Spender (Antikörpernachweis) zu isolieren. Erst dann können die notwendigen Untersuchungen für die Diagnostik der oben angeführten Erkrankungen durchgeführt werden. Dies hatte zur Folge, daß diese Untersuchungen nur von wenigen Speziallaboratorien durchgeführt werden, was wiederum Postversand notwendig macht, bzw. der Patient wegen der Instabilität der Granulozyten zur. Blutentnahme zum Speziallabor reisen muß.The HNA-2a (NB1) trait is known to produce allo- and autoantibodies can lead. These antibodies can cause diseases like the neonatal Immunneutropenia, the transfusion-associated acute lung insufficiency, the Immunoneutropenia after bone marrow transplantation, the drug-induced Immunneutropenia and autoimmune neutropenia. We know that it is HNA-2a (NB1) antigen by one expressed on a subpopulation of granulocytes Glycoprotein acts. The nucleotide and Amino acid sequence has not been known, which is why the fragile and not storable granulocytes must be used for antigen and antibody diagnostics. For this purpose, the granulocytes are initially laborious and time-consuming from the blood of patients (Antigen detection) or selected, healthy donor (antibody detection). Only then can the necessary examinations for the diagnosis of the above be carried out Diseases are carried out. As a result, these investigations only of few special laboratories are carried out, which in turn requires mailing makes, or the patient because of the instability of the granulocytes. Blood sampling for Special laboratory must travel.

Das Problem der Erfindung lag daher in der Aufklärung der kodierenden Nukleotidsequenz und der hieraus ableitbaren Aminosäuresequenz, um auf die Verwendung von humanen, Granulozyten verzichten zu können.The problem of the invention was therefore to elucidate the coding nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence to indicate the use of human, To be able to do without granulocytes.

Zur Lösung dieses Problems wurden zunächst Granulozyten aus dem Blut HNA-2a (NB1) tragender Individuen separiert und anschließend lysiert. Mittels Immunaffinitätschromatographie wurde das Antigen aus dem Granulozytenlysat isoliert. Nach Auftrennung in der SDS-Polyacrylamid-Gelelektropherese wurde das isolierte Antigen mittels Immunoblot unter Verwendung von mehreren Referenzantikörpern als HNA-2a (NB1)-Antigen bestätigt. Die N-terminale Aminosäuresequenz wurde durch Edman-Abbau ermittelt und Primer zur Aufklärung der cDNA-Sequenz konstruiert. Nach Isolierung von m- RNA aus Granulozyten HNA-2a (NB1)-positiver Individuen wurde die cDNA-Sequenz mittels RACE-PCR ("rapid amplification of cDNA ends polymerase chain reaction) ermittelt. Die aus der cDNA-Sequenz abgeleitete Aminosäuresequenz enthielt Aminosäuresequenzen von 3 Trypsinspaltprodukten des immunchromatographisch isolierten Antigens. Die gefundene Nukleinsäuresequenz wurde in COS- und CHO-Säugerzellen zur Expression gebracht. Das exprimierte Glykoprotein (Antigen) wurde von monoklonalen und humanen Antikörpern sowohl in der Durchflußzytometrie als auch in immunchemischen Methoden wie dem Immunoblot und der Immunpräzipitation erkannt. Somit ist nach derzeit gültigen wissenschaftlichen Maßstäben nachgewiesen, daß die von uns aufgeklärte Nukleinsäuresequenz für das bekannte HNA-2a- (NB1)-Antigen codiert. Nukleinsäuresequenz-Datenbanksuchen zeigten, daß der Anfangsteil der Nukleotidsequenz bereits im Rahmen des Human Genome Projekts sequenziert worden waren, ohne jedoch die Bedeutung der Nukleotidsequenz als kodierende Sequenz für das HNA-2a (NB1)-Antigen zu erkennen, was sich auch in den Protein-Datenbanksuchen bestätigte. Bei dem HNA-2a (NB 1)-Antigen handelte es sich somit um ein Glykoprotein der Granulozytenmembran mit bislang unbekannter Primärstruktur.To solve this problem, granulocytes from the blood HNA-2a (NB1) were first bearing individuals separated and then lysed. Means The antigen was isolated from the granulocyte lysate by immunoaffinity chromatography. After separation in the SDS polyacrylamide gel electropheresis, the isolated antigen by immunoblot using several reference antibodies as HNA-2a (NB1) antigen confirmed. The N-terminal amino acid sequence was determined by Edman degradation determined and primers constructed to elucidate the cDNA sequence. After isolation of m- RNA from granulocyte HNA-2a (NB1) positive individuals became the cDNA sequence determined by RACE-PCR ("rapid amplification of cDNA ends polymerase chain reaction). The amino acid sequence derived from the cDNA sequence contained amino acid sequences of 3 trypsin cleavage products of the immunochromatographically isolated antigen. The  Nucleic acid sequence found was used in COS and CHO mammalian cells for expression brought. The expressed glycoprotein (antigen) was from monoclonal and human Antibodies both in flow cytometry and in immunochemical methods such as the immunoblot and the immunoprecipitation. Thus, is currently valid scientific standards prove that the one we have enlightened Nucleic acid sequence encoded for the known HNA-2a (NB1) antigen. Nucleic acid sequence database searches showed that the initial part of the nucleotide sequence had already been sequenced as part of the Human Genome Project, but without the Importance of the nucleotide sequence as coding sequence for the HNA-2a (NB1) antigen recognize what was also confirmed in the protein database searches. In the HNA-2a (NB 1) antigen was thus a glycoprotein with the granulocyte membrane previously unknown primary structure.

Mit Hilfe der gewonnenen Nukleotidsequenz lassen sich einfache und sichere molekularbiologische Methoden, z. B. Polymerase-Ketten-Reaktionen, zur Antigenbestimmung entwickeln, die nur geringe Mengen lagerbare DNA und nicht fragile Granulozyten als Ausgangsmaterial erfordern. Die DNA-basierten Techniken erlauben im Gegensatz zu intakten Granulozyten auch einen Versand der Patientenblutproben. Weiterhin kann mit Hilfe der Rekombinationstechnologie das HNA-2a (NB1)-Antigen in großer Menge und ohne Verunreinigungen durch andere humane Glykoproteine hergestellt und in Antikörpernachweisverfahen, z. B. ELISA, eingesetzt werden.With the help of the nucleotide sequence obtained, simple and reliable molecular biological methods, e.g. B. polymerase chain reactions Develop antigen determination that uses only small amounts of storable DNA and is not fragile Require granulocytes as starting material. The DNA-based techniques allow in In contrast to intact granulocytes, the patient's blood samples are also sent. With the help of recombination technology, the HNA-2a (NB1) antigen in produced in large quantities and without contamination by other human glycoproteins and in antibody detection procedures, e.g. B. ELISA can be used.

Sowohl die DNA-basierten Antigentests als auch die Antikörpernachweisverfahren unter Verwendung rekombinanter Antigene lassen sich in Form von fertig konfektionierten Testkits als einfache diagnostische Verfahren für Laboratorien vermarkten. Die Aufklärung der HNA- 2a (NB 1)-Primärstruktur führt somit zu einer entscheidenden Vereinfachung seiner Antigen- und Antikörper-Diagnostik.Both the DNA-based antigen tests and the antibody detection methods below Recombinant antigens can be used in the form of ready-made test kits Market as simple diagnostic procedures for laboratories. The clarification of the HNA 2a (NB 1) primary structure thus leads to a decisive simplification of its antigen- and antibody diagnostics.

Die Ausführung der Testkits kann zum Beispiel analog zu den bereits im Handel befindlichen PCR-SSP-Testkits für die molekulare HLA-Antigenbestimmung erfolgen, wobei die Nukleotidsequenzen für die HLA-Primer durch HNA-2a (NB1)-Antigen-spezifische Primersequenzen zu ersetzen wären.The execution of the test kits can, for example, be analogous to those already on the market PCR-SSP test kits for molecular HLA antigen determination take place, the Nucleotide sequences for the HLA primers by HNA-2a (NB1) antigen-specific Primer sequences would have to be replaced.

Der Antikörpernachweistest könnte entsprechend einem ebenfalls bereits auf dem Markt befindlichen Testkit zum Nachweis antinukleärer Antikörper unter Verwendung rekombinat hergestellter Antigene konfiguriert werden. Hierzu könnte die rekombinate Herstellung des HNA-2a (NB1)-Antigens in größerem Stile ebenfalls im Baculovirus-Insektenzellen- Expressionssystem erfolgen. The antibody detection test could also correspond to one already on the market located test kit for the detection of antinuclear antibodies using recombinant prepared antigens can be configured. The recombinant production of the  HNA-2a (NB1) antigen in a larger style also in baculovirus insect cells Expression system take place.  

SEQUENZPROTOKOLL SEQUENCE LOG

Claims (2)

1. Die Erfindung bezieht sich auf das Gebiet der Immunhämatologie und betrifft die von uns aufgeklärte Primärstruktur des HNA-2a (ehemals NB1)-Antigens. Dieses Antigen wird auf neutrophilen Granulozyten exprimiert und wurde von seinem Erstbeschreiber "NB1" genannt. Nach der Revision der Nomenklatur für Granulozytenantigene wird es "HNA-2a" (human neutrophil antigen 2a) bezeichnet.1. The invention relates to the field of immune hematology and relates to that of us elucidated primary structure of the HNA-2a (formerly NB1) antigen. This antigen is on expressed neutrophil granulocytes and was named "NB1" by its first descriptor. After revision of the nomenclature for granulocyte antigens, it becomes "HNA-2a" (human neutrophil antigen 2a). 2. Für die von uns aufgeklärte Nukleotidsequenz, die davon abgeleitete Aminosäuresequenz und die sich hieraus ergebenden Nutzungsmöglichkeiten für das HNA-2a (NB1)-Antigen wird patentrechtlicher Schutz beantragt. Nutzungsmöglichkeiten stellen RNA- oder DNA-basierte- Verfahren zum Antigennachweis wie z. B. die Polymerase-Kettenreaktion mit, sequenzspezifischen Primern (PCR-SSP), die Hybridisierungsreaktionen mit sequenzspezifischen Oligonileotiden oder DNA-Sequenzierungsverfahren dar. Weitere Nutzungsmöglichkeiten ergeben sich aus der rekombinanten Herstellung des HNA-2a- Antigens zum Nachweis von HNA-2a-spezifischen Alloantikörpern.2. For the nucleotide sequence we have elucidated, the amino acid sequence and the resulting possible uses for the HNA-2a (NB1) antigen protection requested. Possible uses are RNA- or DNA-based- Antigen detection methods such as B. the polymerase chain reaction with, sequence-specific primers (PCR-SSP) that use hybridization reactions sequence-specific oligonileotides or DNA sequencing methods. Others Possible uses result from the recombinant production of HNA-2a Antigen for the detection of HNA-2a-specific alloantibodies.
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