CZ346799A3 - Chimérické proteiny jako flt3 ligandy - Google Patents

Chimérické proteiny jako flt3 ligandy Download PDF

Info

Publication number
CZ346799A3
CZ346799A3 CZ19993467A CZ346799A CZ346799A3 CZ 346799 A3 CZ346799 A3 CZ 346799A3 CZ 19993467 A CZ19993467 A CZ 19993467A CZ 346799 A CZ346799 A CZ 346799A CZ 346799 A3 CZ346799 A3 CZ 346799A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
seq
cells
sequence
protein
hematopoietic
Prior art date
Application number
CZ19993467A
Other languages
English (en)
Inventor
Dennis A. Bennet
Nicholas R. Staten
Christopher S. Bauer
John P. Mckearn
Original Assignee
G. D. Searle & Co. Corporate Patentdepartment
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by G. D. Searle & Co. Corporate Patentdepartment filed Critical G. D. Searle & Co. Corporate Patentdepartment
Priority to CZ19993467A priority Critical patent/CZ346799A3/cs
Publication of CZ346799A3 publication Critical patent/CZ346799A3/cs

Links

Abstract

Nové chimérické proteiny nebo též proteiny multifunkčmch - agonistů hematopoietických receptorů obsahujících flt3 agonistu, DNA, které kódují proteinymultifunkčmch agonistů hematopoietických receptorů, způsoby přípravy proteinů multifúnkčních agonistů hematopoietických receptorů a způsoby použití proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů. ·

Description

Přihláška je částenou pokračovácí přihláškou 08/837,026 podanou 11. dubna 1997, čímž je zde zahrnuta odkazem.
Oblast techniky ’ / .......
> · Vynález se týká chimérických proteinů nebo multi-funkčních agonistů hematopoietických > receptorů, zahrnujících agonistů lidského flt3. Tyto chimérické proteiny si ponechávají jednu, nebo více aktivit nativních flt3 ligandů a zároveň jednu, nebo více aktivit druhé ze složek chimérického · proteinu. Chimérické proteiny mohou též vykazovat zvýšené hematopoietické buňky stimulující aktivity,' nebo aktivity, které nepozorujeme u flt3 ligandu a dalšího faktoru, jsouli· podávány současně. Chimérické proteiny mohou rovněž vykazovat výhodnější profil aktivity, cóž může zahrnovat redukci nežádoucích biologických účinků spojených s nativním flt3 ligandem a/nebo může vykazovat výhodnější fyzikální vlastnosti, což může zahrnovat zvýšenou . rozpustnost, stabilitu a účinnost správného znovusvinutí. '
Dosavadní stav techniky ‘ L
Kolonie stimulující faktory, které stimulují diferenciaci a/nebo proliferaci buněk kostní dřeně vyvolávají mnoho zájmu pro jejich terapeutický potenciál obnovovat snížené hladiny hémátopoietických buněk pocházejících z kmenových buněk. Kolonie stimulující faktory v lidském i myším systému byly identifikovány a rozlišeny podle svých aktivit. Například granulocytový-CSF (G-CSF) a makrofágový-CSF (M-CSF) stimulují in-vitro tvorbu kolonií neutrofilních granulocytů a makrofágů, zatímco GM-CSF a interleukin-3 (IL-3) mají širší aktivity a stimulují tvorbu kolonií makrofágů, neutrofilních a eosinofilních granulocytů. Jisté faktory jako
IV jsou flt3 ligandy jsou schopné působit převážně na kmenové buňky.
s Tyrosinkinasové receptory jsou receptory růstových faktorů regulujících proliferaci a diferenciaci mnoha typů buněk. Jisté tyrosinkinasové receptory mají funkci i systému krvetvorby. Flt3 (Roseate et al., Oncogene, 6:1641-1650, 1991) a flk-2 (Matthews et al., Cell, 65:1143-1152, 1991) jsou formy tyrosinkinasových receptorů příbuzných c-fins a c-kit receptorů. Receptory flk-2 a flt3 jsou si podobné svou aminokyselinovou sekvencí a liší se dvěma aminokyselinovými zbytky v extracelulámí doméně a také v 31 aminokyselinovém segmentu umístěném blízko Ckonce.
* -·.·< ' ' Ftl3 ligand je hematopoietický růstový faktor, který má schopnost regulovat růst a diferenciaci hematopoietických prekurzorových a kmenových buněk. Pro svou schopnost podporovat růst a proliferaci prekurzorových buněk mají agonisté ftl3 receptoru potenciální terapeutické použití při léčbě poruch krvetvorby jako je aplastická anemie a myelodisplastické syndromy. Navíc budou agonisté flt3 receptoru použitelní pro obnovu hematopoietických buněk k normálním množstvím v těch případech, kdy byl počet těchto buněk snížen z důvodu nemoci, nebo terapeutického zásahu jako je radiace nebo chemoterapie.
WO 94/28391 uveřejňuje proteinové sekvence nativních ftl3 ligandů a cDNA sekvence ·; kódující ftl3 ligandy, metody exprese flt3 ligandů v hostitelských buňkách transfekovaných cDNA a metody léčby pacientů s poruchami krvetvorby pomocí ftl3 ligandů.
US patent číslo 5,554,512 je zaměřen na lidský flt3 ligand jako izolovaný protein, DNA kódující flt3 ligand, hostitelské buňky transfekované cDNA kódující flt3 ligand a metody léčby pacientů pomocí flt3 ligandů.
WO 94/26891 uvádí savčí flt3 ligandy, včetně isolátu který obsahuje insert s 29 aminokyselinami nebo jeho fragmenty.
Lidský systém krvetvorby (hematopoese) je schopen nahradit různé typy bílých krvinek (včetně neutrofilů, makrofágů a basofílů (žímých buněk), červených krvinek (erytrocytů) a buněk podílejících se na tvorbě sraženiny (megakaryocytů/destiček). Odhaduje se, že hematopoietický systém průměrného savce je schopen vyprodukovat řádově asi 4,5 x 1011 granulocytů a erytrocytů každý rok, což je ekvivalentní celkové hmotnosti těla (Dexter et al., BioEssays, 2:154-158, 1985).
US patent 4,999,291 uveřejňuje DNA a metody pro přípravu G-CSF, které jsou zde uvedeny ve formě úplného odkazu.
US patent 4,810,643 se týká DNA a metod přípravy G-CSF a varianty G-CSF se substitucí Ser za Cys.
Kuga et al. (Biochem. + Biophys. Res. Comm. 159:103-111, 1988) připravil sérii variant fe G-CSF částečně ukazující vztah struktury a funkce. Kuga et al. zjistil, že vnitřní a C-terminální delece ruší aktivitu, zatímco N-terminální delece až do 11 aminokyselin a aminokyselinové substituce na pozicích 1, 2, a 3 byly aktivní.
Watanabe et al. (Anal. Biochem. 195: 38-44, 1991) zkonstruoval pro studium jeho vazby na receptor variantu G-CSF, kde 1 a 3 aminokyselina byla zaměněna za tyrosin kvůli radiojodaci proteinu. Watanabe et al. zjistil, že Tyr1, Tyr3 varianta G-CSF byla aktivní..
• ·
Erythropoietin je přirozeně se vyskytující glykoproteinový hormon jehož molekulová hmotnost byla nejprve stanovena na 39 000 daltonů (T. Miyaki et al., J. Biol. Chem. 252:55585564 (1977)). Hotový hormon je 166 aminokyselin dlouhý a „preprotein“ tohoto hormonu s jeho vedoucím peptidem je 193 aminokyselin dlouhý (F. Lin, U.S. patent č. 4,703,008). Hotový hormon má molekulovou hmotnost, vypočítanou z jeho aminokyselinové sekvence, 18 399 daltonů (K. Jakobs et al., Nátuře 313:806-810 (1985); J.K. Browne et al., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 5:1693-702 (1986)).
První mutantní erythropoietiny (tj. analoga erythropoietinu), připravené aminokyselinovými substitucemi a delecemi, vykazovaly sníženou nebo nezměněnou aktivitu. Jak bylo popsáno v U.S. patentu č. 4,703,008, nahrazení tyrosinového zbytku na pozici 15, 40, a 145 fenylalaninovými zbytky, nahrazení cysteinových zbytků na pozici 7 histidinem, substituce prolinu na pozici 2 asparaginem, delecě zbytků 2-6, delece zbytků 163-166, delece zbytků 27-55 nezpůsobila nárůst biologické aktivity. Nahrazení Cys7 za Hys7 zruší biologickou aktivitu. Serie mutantních erythropoietinů s jednou aminokyselinovou substitucí asparaginových zbytků 24, 38, nebo 83 vykazovala několikanásobně sníženou aktivitu (substituce na pozici 24) nebo rychlou intracelulárrií degradaci a zdánlivou nepřítomnost sekrece (substituce zbytků 38 nebo 183). Eliminace O-glykosylačního místa, šeřinu 126, vede k rychlé degradaci nebo ztrátě sekrece analoga erythropoietinu (S. Dube et al., J. Biol. Chem. 33: 17516-17521 (1988)). Tito autoři shrnuli své poznatky tak, že glykosylační místa na zbytcích 38, 83, a 126 jsou nezbytná pro správnou sekreci, a že glykosylační místa na zbytcích 24 a 38 mohou být zapojena do biologické aktivity hotového erythropoietinu.
Deglykosylovaný erythropoietin je plně aktivní v in vitro stanovení (M. S. Dorsdal et al., Endokrinology 116:2293-2299 (1985); U.S. patent č. 4,703, 008; E. Tsunda et al., Eur. J. Biochem. 266:20434-20439 (1991). Ačkoliv je glykosylace erythropoietinu široce přijímána jako faktor hrající klíčovou úlohu při in vivo aktivitě hormonu (P. H. Lowy et al., Nátuře 185:102-105 (1960); E. Goldwasser a C. K. H. Kung, Ann. N. Y. Acad. Science 149:49-53 (1968); W. A. Lukowsky a R. H. Painter, Can. J. Biochem. :9é9-917 (1972); D. W. Briggs et al., Amer. J. Phys. 201:1385-1388 (1974); J. C. Schooley, Exp. Hematol. 13:994-998; N. Imai et al., Eur. J. Biochem. 1994: 454-462 (1990); M. S. Dordal et al., Endokrinology 116: 2293-2299 (1985); E. Tsunda et al. , Eur. J. Biochem. 188: 405-411 (1990); U.S. patent č. 4,703,008; J. K. Brown et aí, Cold Spring Harbor Symposia on Quant. Biol. 51:693-702 (1986); a K. Yamaguchi et al., J. Biol. Chem. 266: 20434-20439 (1991). Ztráta in vivo biologické aktivity deglykosylovaných analog erythropoietinu je připisována rychlému clearens deglykosylovaného hormonu z oběhu testovaných zvířat. Tento názor je podpořen přímým srovnáním poločasu glykosylováného a deglykosylováného erythropoietinu v plasmě (J. C. Spivak a B. B. Hoyans, Blood 73: 90-99 (1989), a Μ. N. Fukuda, et al., Blood 73: 84-89 (1989).
Oligonukleotidem řízená mutagenese erythropoietinových glykosylačních míst účinně prověřila funkci giykosylace, ale dosud neposkytla návod na efektivní strategii pro signifikantní
Ž vylepšení charakteristik hormonu pro terapeutické aplikace.
Série mutantů erythropoietinu s jednou aminokyselinovou substitucí nebo delecí se týká aminokyselinových zbytků 15, 24, 49, 76, 78, 83, 143, 145, 160, 162, 163, 164, 165, a 166. V v
těchto mutantech jsou pozměněny karboxykonec, glykosylační místa a tyrosinové zbytky μ , erythropoietinu. Mutantní formy byly podávány pokusným zvířatům a přitom byly sledovány , hladiny hemoglobinu, hematokritu a retikulocytů (EP č. 0409113). Zatímco mnoho z těchto mutantních forem si zachovalo biologickou aktivitu in vivo, žádný nevykazoval signifikantní nárůst v jejich schopnosti zvyšovat hladiny hemoglobinu, hematokritu nebo retikulocýtů (přímých prekursorů erythrocytů) v porovnání s nativním erythropoietinem.
Jiná sada mutantů byla zkonstruována pro ověření funkce zbytků 99-199 (doména 1) a zbytků 111-129 (doména 2) (Y. Chem et al., Eur. J. Biochem. 202:225-230 (1991)). Mutanti v doméně 1 jsou rychle degradováni a inaktivní při in vitro stanovení, zatímco mutanti v doméně 2 si přinejlepším zachovávají svou in vitro aktivitu. Tito mutanti také vykazují nezvýšenou in vivo biologickou aktivitu v porovnání s divokým typem lidského erythropoietinu. Autoři shrnuli, že zbytky 99-199 hrají kritickou úlohu ve struktuře erythropoietinu.
Molekula lidského erythropoietinu obsahuje dva disulfidické můstky, jeden spojuje cysteinové zbytky na pozicích 7 a 161 a druhý spojuje cysteiny na pozicích 29 a 33 (P. El. Lai et al., J. Biol. Chem. 261:3116-3121 (1986)). Pro zjištění funkce disulfidických můstků spojujících ( cysteiny na pozicích 29 a 33 lidského erythropoietinu byla použita oligonukleotidem řízená mutagenese. Cystein na pozici 33 byl zaměněn za prolinový zbytek, který simuloval strukturu myšího erithropoietinu v tomto zbytku. Vzniklý mutant měl silně sníženou in vitro aktivitu. Ztráta aktivity byla tak prudká, že autoři vyvodili, že disulfidický můstek mezi zbytky 29 a 33 je ( esenciální pro funkci erythropoietinu (F. K. Lin, Molecular and Cellular Aspects of Erythropoietin and Erythropoiesis, str. 23-26, ed. I. N. Rich, Springer-Verlag, Berlin (1987)).
U. S. patent č. 4,703,008 autora Lin, F-K. (zde uvedený jako patent „008“) spekuluje o širokém spektru modifikací EPO, včetně inzerčních, delečních a substitučních analog EPO. Patent „008“ nenaznačuje, že by některá z navrhovaných modifikací měla zvýšenou biologickou aktivitu, ačkoliv bylo zjištěno, že delece glykosylačních míst může zvýšit aktivitu EPO produkovaného v ' t . , . . , '' i ' si, . ’ *· kvasnicích (viz „008“ patent, oddíl 37, řádek 25-28). Patent „008“ rovněž spekuluje o tom, že analoga EPO, které měli jeden, nebo více tyrosinových zbytků nahrazeno fenylalaninem mohou vykazovat zvýšenou, nebo sníženou afinitu k receptoru.
Australská patentová přihláška č. AU-A-59145/90 autorů Fibi, M et al. rovněž diskutuje velký počet modifikovaných EPO proteinů (EPO muteinů). Byly zkoumány záměny aminokyselin 10-55, 70-85 a 130-166 EPO. Zvláště připojení kladně nabitých aminokyselin na karboxykonec .znamenalo zvýšení biologické aktivity EPO.
U.S. patent č. 4,835,260 autora Shomaker, C. B. diskutuje modifikované EPO proteiny s aminokyselinovými substitucemi methioninu na pozicích 54 a asparaginu na pozici 38. Tyto EPO muteiny mají patrně zvýšenou stabilitu, ale nevykazují zvýšenou biologickou aktivitu v porovnání s divokým typem EPO.
WO 91/05867 uveřejnil analoga lidského erythropoietinu majících zvýšený počet míst pro připojení cukrů ve srovnán s lidským erythropoietinem, jsou to EPO (Asn69), EPO (Asn125, Ser127), EPO (Thr125), a EPO (Pro124, Thr125).
WO 94/24160 uveřejňuje mutanty erythropoietinu, které mají zvýšené aktivity, zvláště u aminokyselinových substitucí na pozicích 20, 49, 73,140,143,146,147 a 154.
WO 94/25055 uveřejňuje analoga erythropoietinu včetně EPO (X33, Cys139, des-Arg166) a EPO (Cys139, des-Arg166).
• Faktory kmenových buněk mají schopnost stimulovat růst raných stadií hematopoietických buněk, které jsou schopné dospívat na erythroid, megakaryocyt, granulocyt, lymfocyt a makrofágy. Působení faktory kmenových buněk na savce vede k nárůstu hladin hematopoietických myeloidních i lymfoidmch buněk.
EP 0423980 uvádí ve známost nové polypeptidy odvozené od faktoru kmenových buněk (SCF) zahrnující SCF1 148, SCF1157, SCF1'160, SCF1161, SCF1'162, SCF1'164, SCF1165, SCF1'183, SCF1'185, SCF1188, SCF1189, SCF1220, SCF1248.
U.S. 4,877,729 a U.S. 4,959,455 uveřejňuje proteinové a cDNA sekvence lidského IL-3 a giboního IL-3. Uvedený hIL-3 má ve své proteinové sekvenci na pozici 8 serin spíše než-li prolin.
Mezinárodní patentová přihláška (PCT) WO 88/00598 uvádí ve známost analoga lidského a giboního IL-3. HL-3 obsahuje záměnu Ser8 ->Pro8. Byl také učiněn návrh na záměnu Cys za Ser, tedy zrušení disulfidického můstku a záměny jedné nebo více aminokyselin v glykosylačpích místech.
·· · ··· • · • · · ·
U.S. 4,810,643 zveřejňuje fuzní protein zahrnující GM-CSF a IL-3, který má zvýšenou biologickou aktivitu v porovnání s GM-CSF a IL-3 samotnými. Rovněž zveřejňuje neglykosylovaný analog GM-CSF jako, složky multifunkčního agonisty hematopoietických receptorů.
WO 92/04455 uveřejňuje fuzní protein složený z IL-3 spojeného s lymfokinem zvoleným ze skupiny obsahující IL-3, IL-6, IL-7, IL-9, IL-11, EPO a G-CSF. .
WO 95/21197 a WO 95/21254 uveřejňují fuzní proteiny schopné širokého spektra hematopoietických účinků.
GB 2,285,446 se týká c-mpl ligandu (thrombopoietinu) a různých forem thrombopoietinu, o kterých bylo zjištěno, že mají vliv na replikaci, diferenciaci a maturaci megakaryocytů a prekurzorů megakaryocytů, které mohou být použity pro léčbu thrombocytopenie.
EP 675,201 AI se týká c-mpl ligandu, megakaryocytového růstového a vývojového faktoru (MGDF), alelických variant c-mpl ligandu a c-mpl ligandu připojeného k ve vodě rozpustným polymerům jako je polyethylenglykol.
WO 95/21920 uvádí myší a lidský c-mpl ligand a jejich polypetidové fragmenty. Tyto proteiny jsou vhodné pro in-vivo a ex-vivo terapii pro stimulaci výroby destiček.
Podstata vynálezu
Vynález se týká rekombinantních chimérických proteinů zahrnujících flt3 agonistu a další faktor. Tímto dalším faktorem může být, bez omezení tímto výčtem, kolonie stimulující faktor fy (CSF), cytokin, lymfokin, interleukin, hematopoietický růstový faktor, kterým může být GMCSF, c-mpl ligand (také označovaný TPO nebo MGDF), M-CSF, erythropoietin (EPO), IL-1, IL' 4, IL-2, IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, LIF, flt3 ligand, lidský růstový hormon, růstový faktor B-buněk, diferenciační faktor B-buněk, diferenciační faktor ' eosinofilů, faktor kmenových buněk (SCF) také známý jako Steel faktor, nebo c-kit ligand, i- růstový faktor kmenových buněk (SCGH) (Hiraoka, A. et al. Proč. Nati. Acad. Sci USA
94:7577-7582, 1997) a buňkami stromatu produkovaný faktor-1 (SDF-1) (Bleul, C.C. et al., J. EXP. Med 184:1101-1109, 1996), (zde společně označované jako „hematopoietické růstové faktory“. Chimemí proteiny mohou být také spolupodávány nebo následně podávány spolu s jedním nebo více dalších faktorů zahrnujících kolonie stimulujících faktor, cytokin, lymfokin, interleukin, hematopoietický růstový faktor, kterým může být GM-CSF, c-mpl ligand (také * označovaný TPO nebo MGDF), M-CSF, erythropoietin (EPO), IL-1, IL-4, IL-2, IL-3, IL-5, IL6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, LIF, flt3 ligand, lidský růstový hormon, í ' , í
i. .
•f '. ' . ' ► · ·· • · 1 ' · · 1 ► · · · · I • « »· ·· růstový faktor B-buněk, diferenciační faktor B-buněk, diferenciační faktor eosinofilů, faktor kmenových buněk (SGF) také známý jako Steel faktor, nebo c-kit ligand, růstový faktor kmenových bůněk (SCGH) (Hiraoka, A. et al. Proč. Nati. Acad. SciUSA 94:7577-7582, 1997) a buňkami stromatu produkovaný faktor-1 (SDF-1) (Bleul, C.C. et al., J. EXP. Med 184:11011109, 1996), (zde společně označované jako „hematopoietické růstové faktory“. Tyto společně podávané.směsi mohou mít obvyklou aktivitu obou peptidů, nebo dále mohou mít biologickou a íyziologickou aktivitu vyšší než prostý součet účinků agonisty G-CSF receptoru a druhého hematopoietického růstového faktoru samotných. Chimérické proteiny mohou rovněž vykazovat zvýšenou aktivitu, nebo aktivitu odlišnou než je očekávána od přítomnosti £Lt3 ligandu, nebo i druhého koloriie stimulujícího faktoru. Chimérické proteiny mohou rovněž mít zlepšený profil aktivit, což může zahrnovat redukci nežádoucích biologických aktivit spojených s nativním lidským fit 3.
Výnález se týká multiíunkčních agonistů hematopoietických receptorů, nebo též chimérických proteinůvytvořených kovalentním spojením polypeptidů, z nichž každý může ' působit na jiný specifický buněčný receptor iniciující vzájemně se doplňující biologické aktivity. Hematopoese vyžaduje komplexní série buněčných událostí, při kterých kmenové buňky generují kontinuálně velké populace dospívajících buněk ve všech hlavních liniích. Existuje nejméně 20 v současnosti známých regulátorů hematopoietické proliferační aktivity. Většina těchto proliferačních regulátorů může stimulovat pouze jeden typ tvorby kolonií in vitro, přesný způsob stimulace tvorby kolonií každým z regulátorů je dosti rozdílný. Neexistují dva regulátory stimulující tvorbu kolonií přesně stejným způsobem, vyhodnoceno podle počtu kolonií, nebo což · ř je důležitější, podle linií a způsobu maturace buněk, které tvoří vznikající kolonie. Proliferační . odpovědi mohou být snadno analyzovány jednoduchých in vitro kultivačních systémech. Mohou být stanoveny tři v podstatě nezávislé parametry: rozdíly v počtu kolonií, rozdíly v počtu buněk a
- rozdíly v liniích buněk. Na prekurzorové buňky mohou působit dva nebo více faktorů, indukce i* tvorby velkého počtu prekurzorových buněk vede k větším koloniím. Dva nebo více faktorů mohou způsobit expansi prekurzorových buněk vzniklých proliferací, buď proto, že různé podskupiny prekurzorových buněk reagují exklusivně na jeden faktor, nebo proto, že některé prekurzorové buňky vyžadují stimulaci dvěma nebo více faktory. Aktivace dalších receptorů buňky za použití dvou, nebo více faktorů pravděpodobně zvyšuje mitotický signál, což je Ϊ ’ r· .. · · způsobeno splýváním na počátky rozdílných signálních drah do společné dráhy, která vstupuje do jádra · (Metcalf, Nátuře 339: 27, 1989). Další mechanismy mohou být vysvětleny sinergií.
. Například je-li jedna signální dráha limitována nutností aktivace svého meziproduktu, který je ' 1 * .· J ’ ' t • · součástí další signální dráhy spouštěné druhým faktorem, pak tato situlace může vést k super áditivní odpovědi. V některých případech může aktivace jednoho typu receptorů vést k indukci zvýšené exprese jiných receptorů (Metcalf, Blood 82:3515-3523, 1993). Dva nebo více faktorů mohou vést k odlišnému typu buněčných linií, než by způsobil jeden faktor. Použití multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů může mít potenciální klinické výhody plynoucí z proliferační odpovědi, kterou není dosažitelná při použití jediného faktoru.
Receptory hematopoietických a ostatních růstových faktorů mohou být zařazeny do dvou rodin příbuzných proteinů: (1) tyrosinkinasové receptory, zahrnující epidermální růstový faktor, M-CSF (Sherr, Blood 75:1, 1990) a SCF (Yarden et al., EMBO J. 6:3341, 1987): a (2) hematopoietické receptory neobsahující tyrosinkynasovou doménu, ale vykazující obvykle homologii ve své extracelulámí doméně (Bazan, PNAS USA 87: 6934-6938, 1990). V této druhé skupině jsou erithropoietin (EPO) (D'Andrea et al., Cell 57:277, 1989), GM-CSF (Gearing et al., EMBO J. 8:3667, 1989), IL-3 (Kitamura et al., Cell 66: 1165, 1991), G-CSF (Fukunata et al., J. Biol. Chem. 265: 14008-15, 1990), IL-4 (Harada et al., PNAS USA 87:857, 1990), IL-5 (Takali et al., EMBO J. 9:4367, 1990), IL-6 (Yamasaki et al., Science 241: 825,1988)*IL-7 (Goodwin et al., Cell 60: 941-951, 1990), LIF (Gearing et al., EMBO J. 10: 2839, 1991) a IL-2 (Cosman et al., Mol-Immunol. 23:935-94, 1986). Většina později zmíněných receptorů existuje ve vysokoaťinitní formě jako heterodimery. Po vazbě ligandu dochází k asociaci specifického α-řetězce s nejméně jedním dalším receptorovým řetězcem (β-řetězec, γ-řetězec). Mnoho z těchto faktorů sdílí společnou receptorovou podjednotku. α-řetězec pro GM-CSF, IL-3 a IL-5 sdílí společný β' řetězec (Kitamura et al., Cell, 66:1165, 1991), Takaki et al., EMBO J. 10,2833-8, 1991) a receptorové komplexy pro IL-6, LIF a IL-11 sdílí také společný β-řetězec (gpl30)(Taga et al., Cell 58:573-81, 1989; Gearing et al., Sciece 255:1443-7, 1992). Receptorové komplexy IL-2, IL♦ 4, IL-7, IL-9 a IL-15 sdílí společný γ-řetězec (Kondo et al., Science 265:1874, 1993; Russell et al., Science 266: 1042-1045, 1993; Noguchi et al., Science 262: 1877, 1993; Giri et al., EMBO J. 13:2822-2830,1994).
Použití vícenásobně působících hematopoietických faktorů může mít také potenciální • -výhodu ve snížených nárocích na faktory produkující buňky a systém jejich indukce. Existují-li limitace ve schopnosti buněk produkovat faktor, pak snížením požadovaných koncentrací každého z faktorů a jejich použitím v kombinaci může dojít ke snížení nároků na faktoryprodukující buňky. Použití vícenásobně působícího hematopoietického faktoru může snížit množství faktorů, které by byly potřebné a pravděpodobně snížit případné nežádoucí vedlejší účinky.
)·.
* · • · • · ·
Nové látky podle vynálezu jsou representovány vzorcem vybraným ze skupiny obsahující:
R1-L1-R2, R2-L1-R1, R1-R2, R2-R1, i kde Ri je flt3 agonista a R2 je hematopoietický růstový faktor. S výhodou je R2 hematopoietický růstový faktor s rozdílnou, ale komplementární aktivitou ve srovnání s R]. Komplementární aktivitou se myslí aktivita, která zvyšuje, nebo mění odpověď druhého buněčného modulátoru. Polypeptid Ri je připojen buď přímo, nebo přes spojovníkový segment k polýpeptidu R2. Termín „přímo“ se týká multifunkěních agonistů hematopoietických receptorů, ve kterém jsou poíypeptidy spojeny bez peptidového. Li tedy představuje chemickou vazbu, nebo polypeptidový segment, ke kterému jsou oba Ri i R2 připojeny , za zachování čtecího rámce, a Li je obvykle polypeptid, ke kterému jsou Ri a R2 připojeny amidiěkými vazbami spojujícími karboxy konec Ri š aminokoncem Li a karboxy konec Li aminokoncem R2. Připojeny za zachování čtecího rámce znamená, že zde nedochází k terminaci translace, nebo přerušení mezi čtecími rámci DNA kódujícími Rja R2.
Neomezující výčet dalších růstových faktorů, tedy kolonie stimulujících faktorů (CSF) zahrnuje cytokiny, lymfokiny, interleukiny, hematopoietickými růstovými faktory, které mohou být připojeny k Ri mohou být GM-CSF, c-mpl ligand (také označovaný TPO nebo,MGDF), MCSF, erythropoieťin (EPO), IL-l, IL-4, IL-2,1L-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8,1L-9, IL-10, IL-11, IL12, IL-13, IL-15, LIF, flt3 ligand, lidský růstový hormon, růstový faktor B-bunčk, difeřenciační faktor B-buněk, difeřenciační faktor eosinofilů, faktor kmenových buněk (SCF) také známý jako Steel faktor, nebo c-kit ligand. Tento vynález rovněž zahrnuje použití modifikovaných Ri nebo R2, . nebo mutovaných, nebo modifikovaných DNA sekvencí kódujících tyto Rj nebo R2 molekuly. Jako „varianty c-mpl ligandu“ ze označujeme molekuly c-mpl ligandu, které obsahují aminokyselinové substituce a/nebo jsou části c-mpl ligandu deletovány, jak jé to uvedeno v U.S.
1.' patentové přihlášce č. 08/383,035, stejně tak jako další známé varianty. „Varianty G-CSF“ jsou , definovány jako molekuly G-CSF, které obsahují aminokyselinové substituce a/nebo jsou části GCSF deletovány, jak je to uvedeno zde, stejně tak jako další známé varianty. S výhodou je R2 GČSF, GM-CSF, c-mpl ligand nebo EPO.
, ; Spojovací skupinou (Li) je obecně polypeptid od 1 do 500 aminokyselin délky.
Spojovníky spojují dvě molekuly jsou s výhodou zkonstruovány tak, aby (1) umožnit oběma molekulám svinovat se a působit navzájem nezávisle, (2) neměly sklon formovat se do uspořádané L sekundární struktury, která může interferovat s funkčními doménami obou proteinů, (3) měla '. minimální hydrofobní charakter, který by mohl interferovat s funkčními doménami proteinů a (4) zajišťovali sterickou separaci Ri a R2 tak, že Ri a R2 mohou interagovat současně s • · · ·· . ·· • · · • · · ··· ··· • · • · · · odpovídajícími receptory na jediné buňce. Obvykle zahrnují povrchové amino kyseliny v ohebném regionu proteinů Gly, Asn a Ser. Zdá se, že jakákoli kombinace aminokyselinových sekvencí obsahujících Gly, Asn, a Ser by mohla splnit výše zmíněná kriteria pro spojovníkovou sekvenci. V spojovníkové sekvenci mohou být také použity další neutrální aminokyseliny jako jsou Thr a Ala. V aminokyselinových sekvencích spojovníků mohou být rovněž zahrnuty další aminokyseliny pro začlenění unikátních restrikčních míst do spojovníkových sekvencí, aby byla' umožněná konstrukce multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů.
Výhodnými spojovníky Li podle vynálezu jsou sekvence zvolené ze skupiny vzorců obsahující:
(GlySer) (SEQ ID Č:l), (Gly4Ser)n (SEQ ID Č:2), (Gly5Ser)n (SEQ ID Č:3), (Gl/Ser) (SEQ ID Č:4), nebo (AlaGIySer) (SEQ ID Č:5), kde n kladné celé číslo (společně zde nazývány „GlySer“ spojovníky).
Příkladem vysoce flexibilního spojovníku je na glycin a serin bohatý spacerový region nacházející se uvnitř plil proteinu vláknitých bakteriofágů , například bakteriofága M 13 nebo fd (Schaller et al., PNAS USA 72: 737-741, 1975). Tento region se chová jako dlouhý ohebný spacer mezi dvěma doménami plil povrchového proteinu. Spacerová oblast se skládá . z aminokyselinové sekvence:
GlyGlyGlySer GlyGlyGlySer GlyGlyGlySerGlu GlyGlyGlySerGlu GlyGlyGlySerGlu
GlyGlyGlySerGlu GlyGlyGlySer GlyGlyGlySer (SEQ ID Č:6). . ;
Vynález rovněž zahrnuje spojovníky, ve kterých je začleněna rozpoznávací sekvence pro endopeptidasu. Takové štěpící místo může být využito pro oddělení jednotlivých komponent multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů, aby mohlo být zjištěno zda jsou správně svinuty a aktivní in-vitro. Příklady různých endopeptidas jsou, kromě jiných, plasmin, enterokinasa, kallikrein, urokinasa, tkáňový aktivátor plasminogenu, clostripain, chymosin, kolagenasa, Russelova proteasa z hadího jedu, postprolinový štěpící enzym, V8 proteasa, thrombin a faktor Xa.
Peptidové spojovníkové segmenty z pantových oblastí těžkých řetězců imunoglobulinů IgG, IgA, IgM, IgD nebo IgE zajišťují správný úhel mezi připojenými polypeptidy. Zvláště výhodné jsou takové pantové oblasti, kde byly cysteiny nahrazeny šeřiny. Výhodnými spojovníky podle vynálezu jsou sekvence odvozené od myšího IgG gama 2b pantového regionu, kde byly cysteiny zaměněny za šeřiny (Bell et al., U.S. patent 4,936,233). Tyto spojovníky mohou rovněž obsahovat štěpící místo endopeptidasy. Příklady takových spojovníků zahrnují následující sekvence:
• ·· * ·· ·· • · · ··« · · ·· · ··· · · ··· · • · · · · · · ··· ··· • · · · · · ·· ·· ······· ·· ··
IleSerGluProSerGlyProIleSerThrlleAsnProSerProProSerLysGluSerHisLysSerPro (SEQ ID Č:7) a
IleGluGlyArglleSerGluProSerGlyProIleSerThrlleAsnProSerProProSerLysGluSerHisLysSerPro (SEQ ID Č:8) (společně zde nazývané ,JgG2b“ spojovníky).
Vynález však není omezen formou, velikostí, nebo počtem spojovníkových použitých sekvencí a je vyžadováno pouze, aby spojovník funkčně neinterferoval při svinování a funkci jednotlivých molekul multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů.
Hematopoietické růstové faktory mohou být charakterizovány svou schopností stimulovat tvorbu kolonií lidských hematopoietických prekurzorových buněk. Kolonie mohou být tvořeny erythroidy, granulocyty, megakaryocyty, granulocytické makrofágy a jejich směsi. Mnoho hematopoietických růstových faktorů projevuje schopnost obnovovat funkci kostní dřeně a populace buněk periferní krve na terapeuticky prospěšné úrovně ve studiích prováděných nejprve na primátech a posléze na lidech. Mnoho ze všech těchto biologických aktivit hematopoietických růstových faktorů zahrnuje přenos signálu a vysokoafínitm vazbu na receptor. Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou vykazovat výhodné vlastnosti jako je podobná, nebo větší biologická aktivita ve srovnání s jediným faktorem, nebo mají vyšší poločas života, nebo snížené nežádoucí vedlejší účinky, nebo kombinace těchto vlastností.
Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů, kteří mají menší, nebo žádnou aktivitu agonisty mohou být výhodní jako antagonisté, jako antigeny pro produkci protilátek použitelných v imunologii, nebo imunoterapii, jako genetické sondy, nebo jako meziprodukty použitelné pro konstrukci jiných výhodných hIL-3 muteinů.
Vynález také zahrnuje DNA sekvence, které kódují proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů, DNA sekvence, které jsou svou podstatou podobné a mají v podstatě stejnou funkci a DNA sekvence, které liší od DNA kódující multifunkční agonisty hematopoietických receptorů podle vynálezu jen vlivem degenerace genetického kódu. Vynález také zahrnuje oligonukleotidové intermediáty používané pro konstrukci mutantních DNA a polypeptidy kódované těmito oligonukleotidy.
Techniky genetického inženýrství nyní standardně používané (U. S. patent 4,935,233 a Sambrook et al., „Molecular cloning A laboratory manual“, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989) mohou být použity pro konstrukci DNA sekvencí kódujících flt3 ligand, EPO, G-CSF, GM-CSF, další hematopoietické růstové faktory a chimérické proteiny podle vynálezu. Jednou z těchto metod je kazetová mutagenese (Wells et al., Gene 34:315-323, 1985), při které je část »·· · ·· ·· ·· » · · · » · · · ·· · ··· 9 · ·· ·· kódující sekvence v plasmidu nahrazena syntetickými oligonukleotidy, které kódují žádané aminokyselinové substituce v části genu mezi dvěma restrikčními místy. Páry komplementárních syntetických oligonukleotidů kódujících žádaný gen, mohou být spárovány. DNA sekvence oligonukleotidů budou kódovat sekvence aminokyselin žádaného genu s výjimkou substitucí a/nebo delecí sekvence.
Plasmidová DNA může být štěpena restrikčními endonukleasami, poté spojeny se spárovanými oligonukleotidy. Směs po ligaci může být poté použita pro transformaci kompetentních bakteriálních buněk, jako např. E. coli kmeme JMI01 resistentním k příslušnému antibiotiku. Určitá kolonie může být přenesena, -kultivována a plasmidová DNA může být podrobena restrikční analýze a/nebo DNA sekvenaci, aby mohly být identifikovány plasmidy s žádoucími geny.
Klonování DNA sekvencí nových multiíunkčních hematopoietických agonistů, kde alespoň v jedné z nich je obsažena sekvence dalšího hematopoietického růstového faktoru může být spojeno s použitím dalšího vektoru. Případně může být jeden gen klonován přímo do vektoru obsahujícího druhý gen. Mohou být použity spojovníky a adaptory pro spojem. DNA sekvencí, stejně jako nahrazení ztracených sekvencí, v případě, že se v místě našeho zájmu nachází restrikční místo. Genetický materiál (DNA) kódující jeden polypeptid je tedy vložen do vhodného expresního vektoru, který je použit pro transformaci bakterií, kvasinek, hmyzích buněk, nebo savčích buněk. Transformovaný organismus je kultivován a protein izolován standardními technikami. Vzniklý produkt je tedy novým proteinem, který obsahuje hematopoietický růstový faktor připojený spojovníkovým regionem k druhému kolonie stimulujícímu faktoru.
Dalším aspektem vynálezu je získání plasmidových DNA vektorů použitelných pro expresi těchto nových multiíunkčních agonistů hematopoietických receptorů. Tyto vektory obsahují nové DNA sekvence popsané výše, které kódují nové polypeptidy podle vynálezu. Příslušné vektory, které mohou transformovat mikroorganismy schopné exprimovat multifunkční agonisty hematopoietických receptorů, zahrnují expresní vektory obsahující nukleotidové sekvence kódující multifunkční agonisty hematopoietických receptorů připojené k transkripčním a translačním regulačním sekvencím, které jsou zvoleny podle použité hostitelské buňky.
Vektory s inkorporovánými modifikovanými sekvencemi, jak jsou popsány jsou součástí vynálezu a jsou vhodné pro produkci polypetidů multiíunkčních agonistů hematopoietických receptorů. Vektory používané v těchto metodách také obsahují vybrané regulační sekvence v účinném asociaci s DNA kódujícími sekvencemi podle vynálezu, a které jsou schopny řídit jejich replikaci a expresi ve zvolené hostitelské buňce.
·'· ·· fc et ··. *· • 9 · 9 9 9 9 9 · · · 9
9 9 9 9 9 · · · • 9 9 9 t · 9 999 999
9 9 9 9 9 9
9999 99 9999999 99 99
Dalším aspektem vynálezu je poskytnout způsob pro produkci nových multifunkčních agoňistů hematopoietických receptorů. Metody podle vynálezu zahrnují kultivaci vhodných buněk, nebo buněčných linií, které byly transformovány vektorem obsahujícím DNA sekvence kódující expresi nových multifunkčních agoňistů hematopoietických receptorů. Vhodnými buňkami, nebo buněčnými liniemi mohou být bakteriální buňky. Například jsou jako hostitelské buňky v biotechnologii dobře známé různé kmeny E. coli. Příklady takových kmenů zahrnují kmeny E. coli JM101 (Yanish-Perron et. al. Gene 33: 103-119, 1985) a MON105 (Obukovicz et al., Applied Environmental Microbiology 58: 1511-1523, 1992). Ve vynálezu je zahrnuta také exprese proteinů multifunkčních agoňistů hematopoietických receptorů využívající chromosomální expresní vektory pro E. coli založené na bakteriofágu Mu (Weinberg et al., Gene 126: 25-33, 1993). Mohou být použity také různé kmeny B. subtilis. Jako hostitelské buňky jsou dostupné rovněž různé kmeny kvasinek známé odborníkům v oboru a použitelné pro expresi polypeptidů podle vynálezu. Jsou-li exprimovány v cytoplasmě E. coli mohou být geny kódující multifunkčníagonisty hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou také konstruovány tak, že k 5' konci kodonů genu jsou přidány kodoňy Meť2-Ala’1 nebo Met1 na N-konci proteinu. Nkonec proteinů syntesovaných v cytoplasmě E. coli prodělává post-třanslační procesing pomocí methionin aminopeptidasy (Ben Bassat et al., J. Bac. 169: 751-757, 1987) a snad i dalších peptidas tak, že po expresi je methionin odštěpen s N-konce proteinu. Multifiinkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou zahrnovat < polypeptidy multifunkčních agoňistů hematopoietických receptorů mající Meť1-Ala'1 nebo Meť2-Ala1 na svém N-konci. Tito mutanti multifunkčních agoňistů hematopoietických receptorů mohou být také exprimováni v E. coli po připojení sekrečního signálního peptidu k N-konci. Tento signální peptid je odštěpen z . polypeptidů v průběhu procesu sekrece.
Pro použití ve vynálezu jsou vhodné rovněž savčí buňky, například vaječné buňky čínského křečka (CHO). Nejdůležitějšími metodami pro expresi cizích genů v savčích buňkách jsou popsány v publikaci Kaufman, R. J., 1987 Genetics Engineering, Principles and Methods, Vol. 9, J.K. Setlow, editor, Plenům Press, New York. Byl zkonstruován expresní vektor i!.
obsahující silný promotor schopný funkce v savčích buňkách řídící transkripci kódující oblasti eukaryotického sekrečního signálního peptidu, který je translačně spojen s kódující oblastí multifunkčních agoňistů hematopoietických receptorů. Například mohou být použity plasmidy jako pcDNA I/Neo, pRc/RSV, a pRc/VMC (získané od Invitrogen Corp., San Diego, Kalifornie). Kódující oblast eukaryotického sekrečního signálního peptidu může pocházet z jiného sekrečního savčího proteinu (Bayně, M. L. et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 84: 2638-2642; 1987). Po ' ' ’ i - . . ' • ·
konstrukci vektoru obsahujícího gen je vektorová DNA transfekována do savčí buňky. Těmito buňkami mohou být například COS7, HeLa, BHK, CHO, nebo myší L linie. Buňky mohou být kultivovány například v DMEM mediu (JRH Scientific). Polypeptid sekretovaný do média může být získán standardními biochemickými přístupy, které nastupují po přechodné expresi trvající 2472 hodin po transfekci buněk, nebo po získání stabilní buněčné linie po selekci na resistenci k antibiotiku. Selekce vhodných hostitelských savčích buněk a metody pro transformaci, kultivaci, amplifikaci, screening a produkci produktu a purifikaci jsou známy. Viz např. Gethig and Sambrook, Nátuře, 293: 620-625, 1981), nebo případně, Kaufinan et al., Mol. Cell. Biol., 5(7): 1750-1759, 1985) nebo Howley et al., U.S. patent č. 4,419,446. Další vhodnou buněčnou linií je opičí COS-1 buněčná linie. Podobně je vhodná savčí buněčná linie CV-1.
Je-li to žádoucí mohou být jako hostitelské buňky ve způsobech podle vynálezu použity buňky hmyzí. Viz. např. Miller et al., Genetic Engineering, 8: 277-298 (Plenům Press 1986) zde citované reference. Navíc jsou hlavní metody pro expresy cizích genů ve hmyzích buňkách pomocí baculovirového vektoru jsou popsány v: Summers, M. D. a Smith, G. E., 1987, A manual of methods for Baculovirus vectors and insect cell culture procedures, Texas Agriculture Experiment Station Bulletin No. 1555. Expresní vektor obsahuje Baculovirový přenosový vektor, ve kterém silný Baculovirový promotor (jako je polyhedronový promotor) řídí transkripci kódující oblasti eukariotického sekrečního signálního peptidu, který je translačně spojen s kódující oblastí multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů. Například může být použit plasmid jako pVL1392 (získaný z Invitrogen Corp., San Diego, Kalifornie). Po konstrukci vektoru nesoucího gen kódující polypeptid multifunkčního agonisty hematopoietických receptorů jsou dva mikrogramy této DNA kotransfekovány s jedním mikrogramem Baculovirové DNA (viz Summers & Smith, 1987) do hmyzích buněk, kmene SF9. Čistý rekombinantní Baculovirus nesoucí multifunkční agonisty hematopoietických receptorů je používán pro infikování buněčné kultury, například v Excell 401 sérum neobsahujícím médiu (JHR Biosciences, Lenexa, Kansas). Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů sekretovaní do média mohou být získám standardními biochemickými přístupy. Supematanty pocházející z savčích, nebo hmyzích buněk exprimujících proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů mohou být nejprve zakoncentrovány pomocí některé z komerčně dostupných zahušťovacích jednotek.
Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro léčbu nemocí provázených poklesem hladin myeloidních, erythroidních, lymfoidních, nebo megakaryocytových buněk hematopoietického systému, nebo kombinací poklesu hladin více různých z těchto buněk. Navíc mohou být použity pro aktivaci dozrávání myeloidních a/nebo • · ι< ······· ··· ·· A ····· · ···· ·· ··· ···· ·· ·· lymfoidních buněk. Mezi stavy citlivými k léčbě polypeptidy podle vynálezu je leukopenie, redukce počtu cirkulujících leukocytů (bílých krvinek) v periferní krvi. Leukopenie může být způsobena působením různých virů, nebo radiace. Je často vedlejším efektem různých forem protirakovinné terapie, například působení chemoterapeutických léků, ozáření a infekce, nebo krvácení. Léčba leukopenie těmito multifunkčními agonisty hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou vyloučit nežádoucí vedlejší účinky způsobované v současnosti dostupnými léky. Multiíunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro léčbu neuropenie a například pro léčbu takových stavů jako je aplastická anemie, cyklická neuropenie, idiopathická neuropenie, Chediak-Higashi syndrom, systémový lupus erythematosus (SLE), « leukemie, myelodysplastického syndromu a myelofibrosy.
Multiíunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro léčbu a prevenci thrombocytopenie. V současné době je jediným způsobem léčby thrombocytopenie transfuze krevních destiček, která je drahá a přináší sebou významné riziko infekce (HIV, HBV) a aloimunizace. Multiíunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou zmírnit nebo zcela odstranit potřebu transfuze krevních destiček. Některé případy thrombocytopenie mohou mít příčinu v genetickém defektu např. Fanconiho anemie, Wiscott-Aldrich syndrom nebo May Hegglik syndrom. Získaná thrombocytopenie může mít příčinu v auto- nebo allo- protilátkách jako např. Imunní thrombocytopenie purpura, systémová lupus erythromatosis, hemolytická anemie, nebo imunitní neslučitelnost mezi matkou a plodem. Do thrombocytopenie mohou navíc vyústit i splenomegalitida, roztroušená intravaskulámí koagulace, thrombotická thrombocytopenická purpura, infekce nebo umělé náhrady srdeční stěny. Některé thrombocytopenie mohou mít příčinu také v chemoterapii a/nebo ozáření jako terapii rakoviny. Thrombocytopenie může být způsobena také invazí karcinomu do kostní dřeně, lymfomem, leukémií nebo fibrózou.
Multiíunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné * pro mobilizaci hematopoietických prekurzorových a kmenových buněk v periferní krvi. V periferní krvi produkované prekursorové buňky jsou výhodné pro zlepšení stavu pacientů po autologní transplantaci kostní dřeně. Bylo prokázáno, že hematopoietické růstové faktory zahrnující G-CSF a GM-CSF zvyšují počet cirkulujících prekursorových a kmenových buněk v periferní krvi. Tak byla zjednodušena procedura získávání periferních kmenových buněk a byla dramaticky snížena cena procedury snížením počtu potřebných odběrů. Multiíunkční agonisté hematopoietických receptorů mohou být výhodné pro mobilizaci kmenových buněk a dalšího zvýšení eficience transplantace periferních kmenových buněk.
i'
Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro ex-vivo zvyšování počtu hematopoietických prekurzorových a kmenových buněk. Kolonie stimulující faktory (CSF), jako jsou hIL-3 mohou být podávány samostatně, společně s dalšími CSF, nebo v kombinaci s transplantací kostní dřeně následující po vysokých dávkách chemoterapeutik při léčbě neutropenie a thrombocytopenie, které jsou často následkem takové léčby. Období neutropenie a thrombocytopenie však nemůže být zcela eliminována. Myeloidm linie, které zahrnují monocyty (makrofágy), granulocyty (včetně neutrofílů) a megakaryocyty a jsou kritické pro prevenci infekcí a krvácení, které mohou ohrožovat život. Neutropenie a thrombocytopenie mohou být také následkem nemoci, genetických poruch, léků, toxinů, ozáření a mnoha terapeutických zásahů jako je konvenční onkologická terapie.
Pro léčbu této skupiny pacientů je používána transplantace kostní dřeně. S použitím kostní dřeně pro rekonstituci vyrovnání hematopoietického systému a je však spojeno několik problémů: 1) počet kmenových buněk v kostní dřeni, slezině, nebo periferní krvi je omezený, 2) vzájemná reakce štěpu a příjemce, 3) odvržení štěpu a 4) možná kontaminace nádorovými buňkami. Kmenové buňky tvoří velmi malé procento jaderných buněk v kostní dřeni, slezině a periferní krvi. Je jasné, že existuje závislost na dávce, a že vyšší počet kmenových buněk zvýší hematopoietickou obnovu. In-vitro expanse kmenových buněk může tedy zlepšit obnovu krvetvorby a zvýšit pacientovu šanci na přežití. Pro transplantaci kostní dřeně je používána kostní dřeň od alogenního dárce. Vzájemná reakce příjemce a štěpu a odmítnutí štěpu však omezuje použití transplantace kostní dřeně dokonce i od sourozeneckého dárce se shodnými HLA. Alternativou k alogenní transplantaci kostní dřeně jsou autologní transplantace. Při autologní transplantaci kostní dřeně je část pacientovi vlastní kostní dřeně odebrána před myeloblativní terapií např. vysokými dávkami chemoterapeutik, a poté je transplantována zpět pacientovi. Autologní transplantace eliminuje riziko vzájemné reakce příjemce a štěpu a odmítnutí štěpu. Autologní transplantace kosím dřeň však stále způsobuje problémy vyplývající s omezeného počtu kmenových buněk v kostní dřeni a možné kontaminaci tumorovými buňkami. Omezený počet kmenových buněk může být překonán pomocí ex-vivo expanse kmenových buněk. Kmenové buňky mohou být navíc specificky izolovány, na základě přítomnosti specifických povrchových antigenů jako je CD34+ a tak snížena možnost kontaminace dřeňového štěpu tumorovými buňkami.
Následující patenty obsahují další detaily týkající se separace kmenových buněk CD34+ buněk, kultivace těchto buněk s hematopoietickými faktory, použití buněk pro léčbu pacientů s poruchami krvetvorby a použití hematopoietických faktorů pro expansi buněk a genovou terapii.
• · • ·
5,. 061, 620 se týká směsí obsahujících lidské hematopoietické kmenové buňky získané separací kmenových buněk z určených buněk.
Dokument 5, 199, 942 popisuje metodu pro autologní transplantaci hematopoietických buněk zahrnující: (1) získávání hematopoietických prekurzorových buněk od pacienta; (2) ex-vivo expanse buněk pomocí faktorů zvolených ze skupiny obsahující IL-3, flt3 ligand, c-kit ligand, GM-CSF, IL-1, GM-CSF/IL-3 chimérický protein a jejich kombinace; (3) podávání buněčných preparátů pacientovi.
Dokument 5, 240, 856 se týká separace buněk, která zahrnuje přístroj pro automatické řízem procesu separace buněk.
WO 91/16116 popisuje zařízení a metody pro selektivní isolaci a separaci cílových buněk ze směsi buněk.
WO 91/18972 popisuje způsoby pro in-vitro kultivaci kostní dřeně inkubací suspenze buněk kostní dřeně v bioreaktoru z dutých vláken.
WO 92/18615 se týká procesu pro uchovávání a expansi buněk kostní dřeně v kultiačním médiu obsahujícím specifické směsi cytokinů pro použití při transplantaci.
WO 93/08268 popisuje způsoby pro selektivní expansi kmenových buněk, zahrnující kroky (a) separace CD34+ kmenových buněk od jiných buněk a (b) inkubace izolovaných buněk v selektivním médiu, takže kmenové buňky jsou selektivně pomnoženy.
WO 93/18136 popisuje proces pro in-vitro podporu savčích buněk získaných z periferní krve.
WO 93/18648 se týká směsi obsahující lidské neutrofilní prekursorové buňky s vysokým ^«Ί-^ηι myeloblastů a promyeloblastů pro léčbu genetické, nebo získané neutropenie.
» WO 94/08039 popisuje metodu pro obohacení lidských hematopoietických kmenových ouněk selekcí buněk, které exprimují c-kit protein.
WO 94/11493 popisuje populaci kmenových buněk exprimující CD34+ a malých co do velikosti, které jsou izolovány pomocí metod průtokové cytometrie.
WO 94/27698 se týká metody kombinující imunoafínitní separaci a kontinuální průtokovou centrifiigaci pro selektivní separaci heterogenní populace jaderných buněk z heterogenní směsi buněk.
WO 94/25848 popisuje separační zařízení pro získávám a manipulaci s cílovými buňkami.
• · « · • · · · • · · · ··· ···
Dlouhodobá kultivace vysoce obohacených CD34+ prekursorových hematopoietických buněk z buněk kostní dřeně v kulturách obsahujících IL-la, IL-3, IL-6 nebo GM-CSF je diskutována v Brant et al., J. Clin. Invest. 86:932-941, 1990).
Jedním z aspektů vynálezu je, že poskytuje způsoby pro selektivní ex-vivo expansi kmenových buněk. Termín „kmenové buňky“ označuje totipotentní hematopoietické kmenové buňky stejně jako rané prekursorové buňky , které mohou být izolovány z kostní dřeně, sleziny, nebo periferní krve. Termín „expanse“ označuje diferenciaci a proliferaci buněk. Vynález poskytuje způsoby pro selektivní ex-vivo expansi kmenových buněk, zahrnující kroky: (a) separaci kmenových buněk od jiných buněk, (b) kultivaci těchto separovaných buněk ze selektivního média, které obsahuje protein či proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů a (c ) sklízení těchto kmenových buněk. Kmenové buňky, stejně jako prekurzorové buňky, které jsou předurčeny, aby se vyvinuly v neutrofily, erythrocyty, destičky apod. mohou být rozlišeny od ostatních buněk na základě přítomnosti, nebo nepřítomnosti určitých antigenů prekursorových buněk, jako je CD34+, které jsou přítomny na povrchu těchto buněk a/nebo na základě morfologických charakteristik. Fenotyp charakterizující vysoce obohacenou frakci lidských kmenových buněk je typický přítomností CD34+, Thy-1+ a lin-, ale je třeba zdůraznit, že vynález není omezen pouze na expansi takové populace kmenových buněk. CD34+ obohacená frakce kmenových buněk může být separována velkým počtem známých metod, včetně afinitních kolon nebo částic, magnetických částic, nebo průtokové cytometrie využívající protilátky proti povrchovým antigenům jako jsou CD34+. Dále mohou být pro obohacení hematopoietických ' prekurzorů použity fyzikální separační metody jako je protisměrná elutriace. CD34+ prekursory jsou heterogenní a mohou být rozděleny na několik subpopulací charakterizovaných přítomností, -nebo absencí ko-exprese různých linií příbuzných buněčných povrchových molekul. Nejnezralejší prekursorové buňky neexprimují žádnou ze známých linií souvisejících markérů, jako je HLA-DR nebo CD38, ale mohou exprimovat CD90 (thy-1). Pro selektivní isolaci hematopoietických prekursorů mohou být použity také další povrchové antigeny jako jsou CD33, CD38, CD41, CD71, HLA-DR nebo c-kit. Oddělené buňky mohou být inkubovány ve zvoleném médiu v kultivační láhvi, sterilním sáčku, nebo v dutých vláknech. Pro expansi zvolených buněk mohou být použity různé kolonie stimulující faktory. Příklady takových faktorů použitelných pro ex-vivo expansi kostní dřeně jsou, c-kit ligand, IL-3, G-CSF, GM-CSF, IL-1, IL-6, IL-11, flt3 ligand, nebo jejich kombinace. Proliferace kmenových buněk může být monitorována sčítáním počtu kmenových buněk a dalších buněk, standardními technikami (např. hemacytometr, CFU, LTCIC), nebo pomocí průtokové cytometrie před a po inkubaci.
Bylo popsáno několik metod pro ex-vivo expansi kmenových buněk využívajících kolonie stimulující faktory včetně c-kit ligandu (Brandt et al., Blood 83: 1507-1514 (1994), McKenna et al., Blood 86: 3413-3420 (1995), IL-3 (Brandt et al., Blood 83: 1507-1514 (1994), Sáto et al., Blood 82: 3600-3609 (1993)), G-CSF (Sáto et al., Blood 82: 3600-3609 (1993), IL-1 (Muench et al., Blood 81: 3463-3473 (1993), IL-6 (Sáto et al., Blood 82: 3600-3609, (1993), IL-11 (Lemoli et al., Exp. Hem. 21: 1668-1672, (1993), Sáto et al., Blood 82: 3600-3609, (1993), flt3 ligand ( McKenna et al., Blood 86: 3413-3420 (1995) a/nebo jejich kombinace (Brandt et al„ Blood 83: 1507-1514 (1994), Hayloch et al., Blood 80: 1405-1412 (1992), Koller et al., Biotechnology 11: 358-363 (1993), Lemoli et al., Exp. Hem. 21: 1668-1672, (1993), McKenna et al., Blood 86: 3413-3420 (1995), Muench et al., Blood 81: 3463-3473 (1993), Patchen et al., Biotherapy 7: 1326 (1994), Sáto et al., Blood 82: 3600-3609, (1993), Smith et al., Exp. Hem. 21: 870-877 (1993), Steen et al., Exp. Hem. 21: 1379-1386 (1993)). Mezi jednotlivými kolonie stimulujícími faktory byl jako jeden z nejúčinnějších pro expanzi CD34+ buněk periferní krve označen hIL-3 (Sáto et al., Blood 82: 3600-3609, (1993), Kobayashi et al., Blood 73: 1836-1841 (1989)). Bylo však ukázáno, že kterýkoli jediný faktor není tak účinný jako kombinace více faktorů. Vynález poskytuje způsob pro ex-vivo expansi, která využívá multifunkční agonisty hematopoietických receptorů, které jsou účinnější, než jediný samotný faktor.
Dalším aspektem vynálezu je poskytnutí způsobů pro uchovávání a/nébo expansi hematopoietických prekursorových buněk, které zahrnují inokulaci buněk do kultivační nádoby, která obsahuje kultivační médium, které bylo upraveno působením buněčné linie buněk stromatu jako jsou např HS-5 (WO 96/02662, Roecklein a Torok-Strob, Blood 85: 997-1105, 1995), které bylo doplněno o multifunkční agonisty hematopoietických receptorů podle vynálezu.
Dalším zamýšleným terapeutickým použitím růstových faktorů je ίη-vitro aktivace hematopoietických prekursorových a kmenových buněk pro účely genové terapie. Vzhledem k
Č dlouhému času života hematopoietických prekursorových buněk a distribuci jejich dceřiných 4 buněk do celého těla jsou hematopoietické prekursorové buňky dobrým kandidátem pro ex-vivo genovou transfekci. Máme-li žádaný gen inkorporovaný do genomu hematopoietické prekursorové, nebo kmenové buňky potřebujeme stimulovat buněčné dělení a replikaci DNA.
Buněčný cyklus hematopoietické kmenové buňky má velmi nízkou frekvenci, což znamená, že růstové faktory mohou být výhodné k vyvolání transdukce genu a tak zvýšit klinické vyhlídky genové terapie. Potenciálními aplikacemi genové terapie (review Crystal, Science 270: 404-410 (1995)) zahrnuje 1) léčbu mnoha vrozených metabolických poruch a imunodeficiencí (Kay a Woo,
- Trends Genet. 10: 253-257 (1994)), 2) neurologických poruch (Friedmann, Trends Genet. 10:
• ·
Ofi · · · ·· - * - * ······ ♦······ ·· ··
210-214 (1994)), 3) rakoviny (Culver a Blaese, Trends Genet. 10: 174-178 (1994)) a 4) infekčních chorob (Gilboa and Smith, Trends Genet. 10: 139-144 (1994)).
Existuje mnoho způsobů, známých odborníkům, pro vnášení genetického materiálu do hostitelských buněk. Byl vyvinut velký počet vektorů virových i nevirových pro přenos terapeutických genů do primárních buněk. Na virech založené vektory zahrnují 1) replikačně deficientní rekombinantm retro virus (Boris-Lawrie a Temin, Curr. Opin. Genet. Dev. 3: 102-109 (1993), Boris-Lawrie a Temin, Annal. New York Acad. Sci. 716: 59-71 (1994), Miller, Current Top. Microbiol. Immunol. 158: 1-24 (1992)) a replikačně deficientní rekombinantní adenovirus r(Berkner, BioTechniques 6: 616-629 (1988), Berkner, Current Top. Microbiol. Immunol. 158: 39-66 (1992), Brody a Crystal, Annal. New York Acad. Sci. 716: 90-103 (1994)). Nevirové vektory zahrnující komplexy proteinů a DNA (Cristiano et al., PNAS USA. 90: 2122-2126 (1993(, Curriel et al., PNAS USA 88: 8850-8854 (1991), Curriel, Annal. New York Acad. Sci. 716: 36-58 (1994)), elektroporace a na liposomech založený přenos nanř pomocí kationických liposomů (Farhood et al., Annal. New York Acad. Sci. 716: 23-35 (1994)).
Vynález poskytuje zlepšení existujících metod expanse hematopoietických buněk, do kterých může být vložen nový genetický materiál, v takovém případě poskytuje způsoby využití multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů, které mají zvýšenou biologickou aktivitu včetně aktivit nepozorovaných u žádného jednotlivého kolonie stimulujícího faktoru.
Mnoho léků může způsobit supresi kostní dřeně, nebo hematopoietické deficience. Příklady takových léků jsou AZT, DDI, alkylační činidla a antimetabolity používané v | chemoterapii, antibiotika jako jsou chloramfenikol, penicilín, gancyclovir, daunomycin a sulfonamidy, fenothiazony, trankvilizery jako je meprobamat, analgetika jako je aminopyrin a dipyron, anti-konvulsanty jako je fenytoin nebo karbamazepin, antithyroidika jako je propylthiouracil a methimazol a diuretika. Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro prevenci, nebo léčbu suprese kostní dřeně, nebo deficiencí krvetvorby, které se často objevují u pacientů léčených těmito léky.
Hematopoietické deficience se často mohou objevovat jako důsledek virové, mikrobiální, nebo parasitické infekce a jako důsledek léčby ledvinových chorob, nebo selhání ledvin, např. dialysy, Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro léčbu takovýchto hematopoietických deficiencí.
Různé imunodeficience např. deficience v T a/nebo B lymfocytech, nebo poruchy imunity, např. revmatická arthritida mohou být rovněž prospěšně ovlivněny léčbou pomocí multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů podle vynálezu. Imunodeficience mohou být výsledkem
·· · • · virových infekcí např. HTLVI, HTLVII, HTLVIII, silného vystavení radiaci, terapie rakoviny, nebo důsledkem dalších lékařských zákroků. Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být rovněž využity, sami, nebo v kombinaci s dalšími kolonie stimulujícími faktory pro léčbu dalších deficiencí krevních buněk, včetně thrombocytopenie (nedostatečnost krevních destiček), nebo anemie. Dalšími použitími těchto nových polypeptidů je in vivo a ex vivo léčba pacientů v rekonvalescenci po transplantaci kostní dřeně a při vývoji monoklonálních a polyklonálních protilátek generovaných standardními metodami pro diagnostiku, nebo terapeutické použití.
Dalším aspektem vynálezu jsou způsoby a terapeutické směsi pro léčbu stavů uvedených výše. Takové směsi obsahují terapeuticky efektivní množství jednoho, nebo více multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů podle vynálezu ve směsi s terapeuticky přijatelným nosičem. Tato směs může být podávána buď parenterálně, intravenózně, nebo subkutálně. Je-li podávána, pak je tato terapeutická směs podle vynálezu ve formě neobsahující pyrogeny, parenterálně přijatelném vodném roztoku. Příprava takové parenterálně přijatelného roztoku proteinu majícího vhodné pH, isotonického, stabilního a podobně je v techonologii známá. Léčba hematopoietické deficience může zahrnovat podávání farmaceutických směsí obsahující multifunkční agonisty hematopoietických receptorů pacientům. Multifunkční agonisté hematopoietických receptorů podle vynálezu mohou být výhodné pro aktivaci a amplifikaci hematopoietických prekursorových buněk léčbou těchto buněk in vitro proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů podle vynálezu před podáním buněk pacientovi.
Dávkovači režim zahrnutý ve způsobu léčby výše popsaných stavů bude stanoven s ohledem na názor lékaře, protože účinek léků může být modifikován řadou faktorů např. stavem, tělesnou váhou, pohlavím a výživou pacienta, závažností případné infekce, dobou podání a dalšími klinickými faktory. Obecně může být denní režim podávání v rozsahu od 0,2 - 150 pg/kg C multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů na kilogram tělesné váhy. Dávkování bude také přispůsobeno aktivitě daného proteinu multifunkčního agonisty hematopoietických receptorů a je třeba poznamenat že, mohou nastat situlace, kdy je odůvodněné i dávkování menší než 0,1 pg a vyšší než 1 mg na kilogram tělesné váhy za den. Navíc existují specifické okolnosti, kdy dávkování multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů mohou být stanoveny vyšší, nebo nižší, než v rozmezí 0,2 -150 pg na kilogram tělesné váhy. To zahrnuje spolupodávání s dalšími hematopoietickými růstovými faktory, nebo IL-3 variantami, nebo růstovými faktory; spolupodávání s chemoterapeutickými léky a/nebo ozářením; používáním glykosylovaných proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů; a různých pacienta se týkajících ·· ·« » · · • · • · • · ···· ·· • · • · ·« · ·· ·· • · · · » · · ·
Λ ··· ··· • · • · · » problémů zmíněných výše v tomto oddílu. Jak je poznamenáno výše mohou zahrnovat terapeutické způsoby a směsi spolupodávání dalších hematopoietických růstových faktorů. Neomezující výčet dalších případných hematopoietických růstových faktorů, kolonie stimulujících faktorů (CSF), cytokinů, lymfokinů a interleukinů pro současné nebo sekvenční podávání spolu s chimérickými proteiny podle vynálezu zahrnují GM-CSF, G-CSF, G-CSF Ser17, c-mpl ligand (také označovaný TPO nebo MGDF), M-CSF, erythropoietin (EPO), IL-1, IL-4, IL-2, IL-3, varianty IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, IL-16, LIF, růstový faktor B-buněk, diferenciační faktor B-buněk, diferenciační faktor eosinofilů, faktor kmenových buněk (SCF) také známý jako Steel faktor, nebo c-kit ligand, SCSF, SDF-1, nebo jejich kombinace. „hIL-3 varianta“ je definována jako hIL-3 molekula, která obsahuje aminokyselinové substituce, nebo části hIL-3 deletovány, jak bylo uvedeno v WO 94/12638, WO 94/12639 a WO 95/00646, stejně jako další známé varianty. Výše uvedené dávkování bude přizpůsobeno, aby byl kompenzován obsah dalších složek v terapeutických směsích. Vývoj léčby pacientů může být sledován periodickým stanovováním hematopoietického profilu např. porovnáním počtu buněk a podobně.
Stanovení aktivity chimérických proteinů
Biologická aktivita proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů podle vynálezu může být stanovena na základě syntesy DNA ve faktor dependentních buněčných linií, nebo počítáním vytvořených kolonu v in-vitro stanovení buněk kostní dřeně. Chimérické proteiny mohou být stanoveny pomocí mnoha in-vitro a in-vivo modelů známých odborníkům. Neomezující výčet takových stanovém zahrnuje:
Methylcelulosové stanovení
Toto stanovení odráží schopnost kolonie stimulujících faktorů stimulovat normální buňky kostní dřeně k produkci odlišných typů hematopoietických kolonií in vitro (Bradley et al., Aust. Exp Biol. Sci. 44: 287-300, 1966), Pluznik et al., J. Cell Comp. Physio 66: 319-324, 1965).
Metody
Přibližně 30 ml čerstvé, normální, aspirátu zdravé kostní dřeně je získáno od osob po jejich informovaném souhlasu. Za sterilních podmínek jsou vzorky zředěny 1:5 roztokem IX PBS (#14040.059 Life Technologies, Gaithesburg, MD.) v 50 ml kónických zkumavkách (#25339-50 ·· ·· • · · · • · · • · · · • · · ···· «· ·· • · · · • « · « ··· ··· • « ·· ··
Corning, Corning MD). Pod zředěné vzorky je podvrstven Ficoll (Histopaque 1077 Sigma H8889) a vzorky jsou zcentrifugovány při 300 x g 30 min. Vrstva jednojademých buněk je odděleny dvakrát promyta v IX PBS a jednou v 1% BSA PBS (CellPro Co., Bothel, WA). Mononukleáry jsou spočteny a CD34+ buňky jsou odděleny pomocí Ceprate LC (CD34) Kit (CellPro Co., Bothel, WA) kolony. Tato frakcionace je prováděna jelikož všechny prekurzorové a kmenové buňky kostní dřeně nesou CD34 povrchový antigen.
Kultury byly připraveny v trojím provedení ve finálním objemu 1,0 ml v 35x10 mm petriho miskách (Nunc č. 174926). Kultivační médium bylo získáno z Terry Fox Laboratoří (HCC-4230 <· médium, Terry Fox Labs, Vancouver, B.C., Kanada) do kultivačního média je přidán i erythropoietin (Amgen, Thousand Oaks, CA.). Na jednu misku bylo přidáno 3000-10000 CD34+ bunčk. Je přidán rekombinantní IL-3, purifikovaný ze savčích buněk, nebo E. coli, a proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů v kondiciovaném médiu od transfekovaných savčích buněk, nebo purifikovaných z kondiciovaného média od transfekováných savčích buněk, nebo E. coli, v finální koncentraci od 0,001 nM do 10 nM.
Rekombinantní hIL-3, GM-CSF, c-mpl ligand a- multifunkční agonisté hematopoietických receptorů jsou vlastní výroby. G-CSF (Neupogen) byl získán od Amgen (Thousand Oaks Calf.).
Kultury byly resuspendovány pomocí 3 ml stříkačky po 1 ml na misku. Kontrolní (slepý pokus) kultury neobsahovaly žádné stimulační faktory. Kultury pro pozitivní kontrolu obsahovaly kondiciované médium (PHA stimulované lidské buňky: Terry Fox Lab. H2400). Kultury jsou inkubovány při 37°C, 5% CO2 ve zvlhčeném vzduchu. Hematopoietické kolonie, které jsou definovány jako větší než 50 buněk byly spočítány v den nejvyšší odpovědi (po 10-11 dnech) pomocí Nikon fázově inverzního mikroskopu s 40x objektivem. Skupiny buněk obsahující méně než 50 buněk byly označeny jako klastry. Alternativně mohou být kolonie identifikovány přenesením kolonií na sklíčko a barveny, nebo mohou být sklizeny resuspendovány a stočeny na C cytospinové sklíčko pro barvení.
Stanovení růstových faktorů pomocí krve z lidské pupeční šňůry
Buňky kostní dřeně jsou tradičně používány pro in vitro stanovém aktivity hematopoietických kolonie stimulujících faktorů (CSF). Lidská kostní dřeň však není vždy dostupná a navíc existuje významná variabilita mezi jednotlivými dárci. Krev z pupeční šňůry je s kostní dření srovnatelná jako zdroj hematopoietických a prekurzorových buněk (Broxmeyer et al., PNAS USA 89: 4109-113, 1992; Mayani et al., Blood 81: 3252-3258, 1993). Na rozdíl od kostní dřeně je však krev z pupeční šňůry mnohem snadněji a pravidelněji dostupná. Existuje zde rovněž • · • · · · · ·
možnost redukovat variabilitu stanovení smíšením buněk čerstvě získaných od několika dárců, nebo vytvořením banky zmražených buněk pro tento účel. Modifikováním kultivačních podmínek a/nebo analyzováním specifických znaků linií je možné specificky stanovovat granulocytové í makrofágové kolonie (CFU-GM), aktivitu megakaiyocytového CSF, nebo aktivitu buněk s vysokým potenciálem tvorby kolonií (HPP-CFC).
Metody
Mononukleámí buňky (MNC) byly izolovány z krve z pupeční šňůry v průběhu 24 hodin od odběru pomocí standardního hustotního gradientu (1,077 g/ml Histopaque). MNC z krve pupeční ř šňůry byly dále obohaceny o kmenové buňky a prekurzory pomocí několika postupů zahrnující imunomagnetickou selekci CD 14-, CD34+ buněk; získání SBA-CD34+ frakce pomocí láhve pokryté speciální vrstvou od Aplied Imune Science (Santa Clara, CA); a CD34+ selekce pomocí
CellPro (Bothell, WA) avidinové kolony. Ke stanovení jsou použity buď čerstvě izolované nebo zmražené CD34+ obohacené frakce. Kultury ve dvojím provedení pro každé ředění vzorku (koncentrace od 1 pM do 1204 pM) jsou připraveny s 1 x 104 buňkami v 1 ml 0,9% methylcelulosu obsahujícího média bez dalších růstových faktorů (Methocult H4230 od Stem Cell Technologies, Vancouver, BC.). V některých experimentech byl použit místo Methocult H4230 použit Methocult H4330 obsahující erythropoietin (EPO), nebo byl přidán faktor kmenových buněk (SCF), 50 ng/ml (Biosource International, Camarillo, CA). Po 7-9 denní kultivaci byly kolonie obsahující více než 30 buněk spočítány. Abychom dodrželi objektivitu vyhodnocení byly jednotlivá stanovém vyhodnocována na slepo.
AML proliferační stanovení biaktivního lidského interleukinu-3
Faktor-dependentní buněčná linie AML 193 byla získána od American Type Culture C
Collection (ATCC, Rockville, MD). Tato buněčná linie pocházející od pacienta s akutní myeloidní leukémií, je buněčná linie dependentní na růstovém faktoru, která vykazuje zvýšený růst v médiu doplněném o GM-CSF (Lange, B. et al., Blood 70: 192, 1987; Valtieri, M., et al., J. Immunol. 138: 4042, 1987). Byla použita varianta této buněčné linie AML 193 1.3, která byla adaptována na dlouhodobý růst v IL-3 vymytím růstových faktorů a ponecháním buněk bez růstových faktorů po 24 hodin. Buňky jsou poté přemístěny na 24 jamkovou destičku lxl 05 buněk/jamku v médiu obsahujícím 100 U/ml IL-3. Trvá přibližně 2 měsíce než jsou buňky začnou v přítomnosti IL-3 rychle růst. Tyto buňky jsou uchovávány stejně jako AML 193 1.3 tedy v tkáňové kultuře doplněné lidským IL-3 (viz níže)'.
• · ··· · · ···· ·· ·· · · · ······ · · · · · · ·
Buňky AML 193 1.3 byly 6 krát promyty studeným vyváženým Hanksovým solným roztokem (HBSS, Gipco, Grand Island, NY) centrifugací buněčné suspenze při 250 x g po 10 minut následované dekantací supematantu. Pelet buněk je resuspendován v HBSS a procedura je opakována dokud není uskutečněno šest promývacích cyklů. Buňky promyté šestkrát pomocí tohoto postupu jsou resuspendovány v médiu pro tkáňovou kulturu na hustotu pohybující se od 2 x 105 do 5 x 105 živých buněk na ml. Toto médium je připraveno doplněním Iscove modifikovaného Dulbecco media (IMDM, Hazelton, Lenexa, KS) o albumin, transferin, lipidy a 2-merkaptoethanol. Hovězí albumin (Boehringer Mannheim, Indianopolis, IN) je přidán v koncentraci 500 pg/ml; lidský transferin (Boehringer Mannheim, Indianopolis, IN) v koncentraci “ 100 pg/ml; lipid ze sóji (Boehringer Mannheim, Indianopolis, IN) při 50 pg/ml; a 2merkaptoethanol (Sigma, St. Louis, MG) je přidán v koncentraci 5 x 10'5 M.
Série ředění lidského interleukinu-3, nebo chimérických proteinů multifiinkčních agonistů hematopoietických receptorů jsou připraveny ve třech provedeních v médiu pro tkáňové kultury7 doplněném, jak je uvedeno výše, na 96 jamkových destičkách Costar 3596 pro tkáňové kultury.
Každá jamka obsahovala 50 μΐ média obsahujícího interleukin-3, nebo chimérického proteinu multifunkčního agonisty hematopoietických receptorů dokud není série ředění úplná. Kontrolní jamky obsahovaly samotné médium pro tkáňové kultury (negativní kontrola). AML 193 1.3 buněčná suspenze popsaná výše je přidána do každé jamky odpipetováním 50μ1 (2,5 x 104 buněk) do každé jamky. Destičky s tkáňovými kulturami jsou inkubovány při 37°C, 5% CO2 v zvlhčeném vzduchu tři dny. Třetí den je přidáno 0,5 pCi 3H-thymidinu (2 Ci/mM, New England Nuclear,
Boston, MA) v 50 μΐ média pro tkáňové kultury. Kultury jsou inkubovány při 37°C, 5% CO2 v zvlhčeném vzduchu 18-24 hodin. Buněčná DNA je sklizena na smotek skleněných vláken (Pharmacia LKB, Gaithersburg, MD) pomocí systému pro sklízení buněk TOMTEC (TOMTEC,
Orange, CT), které využívají cyklus promytí vodou následovaný promytím 70% ethanolem.
Filtrační smotky jsou ponechány k vysušení na vzduchu a poté umístěny do vzorkových sáčků, do I kterých je přidána scintilační kapalina (Scintiverse II, Fisher Scientific, St. Louis, MO, nebo BetaPlate Scintilační kapalina, Pharmacia LKB, Gaithersburg, MD).
Beta emise z jednotlivých jamek s tkáňovými kulturami je změřena LKB BetaPlate 1205 scintilační počítač (Pharmacia LKB, Gaithersburg, MD) a data jsou vyjádřena jako impulzy do buněk začleněného H3-thymidinu za minutu v každé z jamek s tkáňovou kulturou. Aktivita lidského interleukinu-3 nebo proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů je kvantifikována měřením proliferace buněk (začlenění H3-thymidinu) indukovaném zvyšujícími se koncentracemi interleukinu-3, nebo proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů. Obvykle se koncentrace při tomto stanovení pohybovala od 0,05 pM do 105 pM. Aktivita byla určena změřením dávky interleukinu-3 nebo proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů, které způsobí 50% maximální proliferace (ECso= 0,5 x (maximální mezi třemi provedeními průměrný počet impulsů do buněk začleněného H3-thymidinu za minutu v jedné jamce u všech testovaných koncentrací interleukinu-3 - pozadí (průměrný počet impulsů do buněk začleněného H3-thymidinu za minutu v jedné jamce u kultur bez interleukinu-3)). Tato hodnota EC50 je rovněž ekvivalentní 1 jednotce bioaktivity. Každé stanovení je prováděno s nativním interleukinem-3 jako referenčním standardem, takže může být stanovena relativní velikost aktivity.
Obvykle byly proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů testovány v koncentracích od 2000 pM do 0,06 pM kdy v řadě ředění byla vždy sousední koncentrace dvakrát zředěnější.
Aktivita každého vzorku byla stanovena jako koncentrace, která způsobila 50% maximální odpovědi, kdy při stanovém této hodnoty byl použit pro proložení dat čtyř parametrový matematický model. Bylo pozorováno, že horní plato (maximální odpověď) pro vzorek a standard, se kterým byl porovnáván se neliší. Výpočet relativní aktivity pro každý vzorek byl tedy proveden ze stanovení EC50 pro vzorek a standard jak jsou uvedeny výše. AML 193.1.3 buňky proliferací reagovaly na hIL-3, hGM-CSF a hG-CSF.
TF1 c-mpl ligand dependentní proliferační stanovení
C-mpl ligand proliferační aktivita může být stanovena pomocí subklonu pluripotentní lidské buněčné linie TF1 (Kitamura et al., J. Cell Physiol 140: 323-334. (1989)). TF1 buňky jsou udržovány v hIL-3 (100 U/ml). Pro získání sub-klonu reagujícího na c-mpl ligand jsou buňky udržovány v přechodovém médiu obsahujícím 10% supematant z BHK buněk trasfekováných genem exprimujícím 1-153 formu c-mpl ligandu (pMON26448). Většina buněk zahyne, ale část přežije. Po zředění klonů je vyselektován k c-mpl citlivý klon a tyto buňky jsou rozděleny do přechodového média na hustotu 0,3 x 106 buněk/ml den před zahájením stanovení. Přechodové médium pro tyto buňky má následující složení: RPMI 1640 (Gipco), 10% FBS (Harlan, Lot #91206), 10% c-mpl ligand supematant z transťekováných BHK buněk, 1 mM pyruvát sodný (Gipco), 2 mM glutamin (Gipco), a 100 pg/ml penicilin-streptomycin (Gipco). Další den jsou buňky sklizeny a dvakrát promyty v RPMI, nebo IMDM médiu a nakonec promyty v ALT, nebo médiu pro stanovení. ALT médium obsahuje: IMDM (Gibco), 500 pg/ml lidského sérového albuminu, 100 pg/ml lidského transferům, 50 pg/ml sójového lipidu, 4 x 10-8M beta27
9 9 9
¢. do o o o 3 o 3 0 a ooo.
O O O O 09
O o o 0 o o o
O 5 O o o
O O O 0 90 0
C 9 O
000 000 a o <5 3 O O merkaptoethanol a 2 ml A9909 (Sigma, roztok antibiotik) na 1000 ml ALT. Buňky jsou zředěny v médiu pro stanovení na finální koncentraci 0,25 x 106 buněk/ml na 96 jamkové destičce s.malým odparem (Costar) a finální objem 50 μΐ. Supematanty (kondiciovaná média( od transfekovaných klonů jsou přidány v objemu ·50 μΐ ve dvojím provedení vzorků v koncetraci 50% a dále vždy v trojnásobném zředění až do konečného zředění 1,8%.. Trojí provedení sady ředění IL-3 varianty pMON13288 začínající na 1 ng/ml a ředěné , třikrát po-koncentraci 0,0014 ng/ml je použita jako pozitivní kontrola. Destičky jsou inkubovány při 5% CO2 a 37°C.; Šestý den kultivace je na destičky aplikován puls 0,5 Ci 3H / jamku (NEN) v objemu 20 μΐ/jamku a ponechány inkubovat
A při 5% CO2 a 37°C po čtyři hodiny. Destičky jsou sklizeny a proměřeny na Betaplate čítači.
MUTZ-2 buněčné proliferační stanovení *
Buněčná linie jako je MUTZ-2, což je lidská linie myeloidních buněk (German Collection of Microorganism and Cell Cultures, DSM ACC 271), může být použita pro stanovení buněčné proliferační aktivity agonistů flt3 receptorů. Kultury MUTZ-2 jsou udržovány v přítomnosti rekombinantního nativního flt3 ligandu (20-100 ng/ml) v růstovém médiu. Devatenáct hodin před zahájením stanovení jsou MUTZ-2 buňky třikrát promyty IMDM médiem (Gipco) a resupendovány v samotném IMDM médiu v koncentraci 0,5-0,7 x 106 buněk/ml a inkubovány při 37°C a 5% CO2 takže hladový v nepřítomnosti flt3 ligandu. V den stanovení jsou standardy a agonisté flt3 receptorů naředěny na koncentraci dvakrát vyšší než je žádaná finální koncentrace ve sterilním médiu pro tkáňové kultury určené pro stanovení na 96 jamkové destičce. Agonisté flt3 receptorů a standardy jsou testovány třikrát vedle sebe. Je vneseno 50 μΐ média pro stanovení do každé jamky kromě řádku A. Do řádku A je přidáno 75 μΐ agonisty flt3 receptorů nebo standardů | ' a poté je z řádku A odebráno vždy 25 μΐ je provedena série ředění (1:3) ha celém zbytku destičky (řádky B až G). Řádek H zůstává a obsahuje pouze médium jako kontrolu. Hladovějící MUTZ-2
X , buňky jsou dvakrát promyty v IMDM médiu a resuspendovány v 50 μΐ média pro stanovení. Do každé jamky je přidáno 50 μΐ suspeze buněk tak, aby výsledná koncentrace byla 0,25 x 10 . buněk/ml. Destičky pro stanovení obsahující buňky jsou inkubovány při 37°C a 5% CO2 44 hodin.
Na každou jamku je pak aplikován puls 1 μ(Ζν)ηηύαχ triciovaného thymidinu v objemu 20 μΐ na čtyři hodiny. Poté jsou destičky sklizeny a vyhodnoceny.
Další in vitro na buňkách založené proliferační stanovení
Další in vitro na buňkách založené proliferační stanovém, známá odborníkům, mohou být rovněž vhodná pro stanovém aktivity chimérických proteinů multifunkčních agonistů • · ·· · · · · · · · » · · · · · · · · · · · • * · · · · · · · · · · · ········
J-ϋ · · · · · · · ···· ·· «···»·· ·* «· hematopoietických receptorů a to v závislosti na různých faktorech podobně jako bylo popsáno pro AML 193.1.3 buněčnou proliferační stanovení. Následují příklady dalších použitelných stanovení.
TF1 proliferační stanovení: TF1 je pluripotentní lidská buněčná linie (Kitamura et al., J. Cell Physiol 140: 323-334. (1989)), které jsou citlivé k hIL-3.
32D proliferační stanovení: 32D je myší IL-3 dependentní buněčná linie, která není citlivá k lidskému IL-3, aleje citlivá k lidskému G-CSF, který není druhově specifický.
Baf/3 proliferační stanovení: Baf/3 je myší IL-3 dependentní buněčná linie, která není citlivá k lidskému IL-3, lidskému flt3 ligandu, nebo lidskému c-mpl ligandu, ale je citlivá k lidskému G-CSF, který není druhově specifický.
TI 165 proliferační stanovení: TI 165 buňky jsou IL-6 dependentní myší buněčná linie (Nordan et al., 1986), která je citlivá k IL-6 a IL-11.
Na lidské sraženině plasmy založené meg-CSF stanovém': Využívá ke stanovém tvorbu klonů megakaryocytů (Mazur et al., 1981).
Transfekované buněčné linie:
Buněčné linie jako je myší Baf73 buněčná linie mohou být transfekovány, receptory hematopoietických růstových faktorů, jako je lidský G-CSF receptor, nebo lidský c-mpl receptor, které tato buňky normálně neobsahují. Tyto transfekované buněčné linie mohou být použity ke stanovení aktivity ligandu, pro který je receptor transfekovaný do buněčné linie určen.
Jednou takovou transfekovanou buněčnou linií je Baf/3 buněčná linie byla připravena klonováním cDNA kódující c-mpl z knihovny připravené z c-mpl citlivé buněčné linie a kolonované do mnohonásobného klonovacího místa plasmidu pcDNA3 (Invitrogen, San Diego Ca.). Baf/3 buňky byly transfekovány plasmidem pomocí elektroporace. Buňky byly selektovány v přítomnosti G418 v přítomnosti myšího IL-3 ve Wehi kondiciovaném médiu. Klony byly připraveny omezeným zředěním.
Podobným způsobem může být do Baf/3 buněčné linie transfekován i lidský G-CSF receptor a tato může být použita pro stanovení bioaktivity chimérických proteinů multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů.
Analýza proliferační aktivity c-mpl ligandu Metody « ·
1. Proliferační stanovení s použitím kostní dřeně
a. Purifikace CD34+ buněk:
Odebraná kostní dřeň (15-20) ml byla získaná od normálních alogenních dárců po informovaném souhlasu. Buňky byly zředěny 1:3 fosfátovým pufrem s chloridem sodným (PBS, Gibco-BRL), 30 ml bylo navrstveno nad 15 ml Histopaque-1077 (Sigma) a centrifugováno 30 minut při 300 RCF. Vrstva mononukleárů byla odebrána a promyta PBS. CD34+ buňky byly z připravených mononukleárů získány pomocí afinitm kolony podle instrukcí výrobce (CellPro, lne., Bothell WA). Po purifikaci byla čistota CD34+ buněk průměrně 70% jak bylo stanoveno pomocí průtokové cytometrie s využitím anti CD34 monoklonální protilátky konjugované s fluoresceinem a antiCD38 konjugované s fykoerythrinem (Becton Dickinson, San Jose CA).
Buňky byly resuspendovány v hustotě 40000 buněk na ml v X-vivo 10 médiu (BioWhittaker, Walkersville, MD) a jeden ml suspeze byl vyset na 12 jamkové destičky pro tkáňové kultury (Costar). Do některých jamek byl přidán růstový faktor hIL-3 v množství 100 ng/ml (pMON5873). hIL-3 varianty byly použity v množství 10 ng/ml až 100 ng/ml. Byly testována kondiciovaná média pocházející od BHK buněk transfekovaných plasmidem kódujícím c-mpl ligand, nebo chimérické proteiny multifunkčních agonistů hematopoietických receptorů po přídavku 100 μΐ supematantu od těchto buněk do 1 ml kultur (asi 10% zředění). Buňky byly inkubovány při 37°C 8-14 dnů v 5% CO2 ve vlhkém inkubátoru,
b. Sklizeň buněk a analysa:
I Na konci doby kultivace byl stanoven celkový počet buněk pro každé podmínky. Pro fluorescenční analýzu a určení ploidity byly buňky promyty v megakaryocytovém pufru (MK pufr, 13,6 mM citrát sodný, 1 mM theofylin, 2,2 pm PGE1, 11 mM glukosa, 3% hmotn./obj. BSA, v PBS, pH 7,4) (Tomer et al., Blood 70: 1735-1742, 1987) resuspendovány v 500 μΐ MK pufru obsahujícího anti-CD41 a FITC protilátky (1:200, AMAC, Westbrook, ME) a promyty v MK 9 pufru obsahujícího 0,5% Tween 20 (Fisher, Fair Lawn NJ) 20 min. na ledu následně fixovány v
0,5% Tween-20 a 1% paraformaldehydu (Fisher Chemical) 30 minut a poté inkubovány v propidium jodidu (Calbiochem, La Jolla, Ca) (50 pg/ml) s RNAsou (400 U/ml) v 55% v/v MK pufru (200 mOsm) 1-2 hodiny na ledu. Buňky byly analyzovány na FACScan, nebo Vantage průtokovém cytometru (Becton Dickinson, San Jose, CA). Zelená fluorescence (CD41a-FITC) byla oddělena a zárověň byl sledován lineární a log signál červené fluorescence (PI) pro stanovení ploidity DNA. Pro všechny buňky bylo stanoveno procento buněk, které obsahují CD41+. Analýza dat byla provedena pomocí software LYSIS (Becton Dickinson, San Jose, CA). Procento
buněk exprimujících CD41 antigen bylo zjištěno pomocí průtokové cytometrie (Percent). Absolutní počet (Abs) CD41+ buněk/ml byl vypočítán jako: (Abs)=(Počet buněk)* (procento)/100.
Stanovém megakaryocytů pomocí fibrinové sraženiny
CD34+ obohacená frakce buněk byla izolována, jak bylo popsáno výše. Buňky byly rozsuspendovány na hustotu 25 000 buněk/ml s, nebo bez cytokinu(cytokinů) v médiu obsahujícího bazické Iscoves IMDM médium doplněné o 0,3% BSA, 0,4 mg/ml apo-transferinu, 6,67 μΜ FeCl2, 25 pg/ml CaCl2, 25 pg/ml L-asparaginu, 500 pg/ml e-amino-n-kapronová kyselina a penicilin/streptomycin. Před vysetím na 35 mm destičky byl přidán thrombin (0,25 jednotek/ml) pro iniciaci tvorby sraženiny. Buňky byly inkubovány při 37°C 13 dnů v 5% CO2 ve vlhkém inkubátoru.
Na konci doby kultivace byly destičky fixovány směsí methanoF.aceton (1:3), vysušeny na vzduchu a před barvením uchovávány při -200°C. Bylo použito peroxidasové imunochemické barvení (Zymed, Histostain-SP. San Francisco, CA) využívající směs primárních monoklonálních protilátek obsahujících anti-CD41a, CD42 a CD61. Kolonie byly po barvení spočteny a klasifikovány jako negativní, CFU-MK (malé kolonie, 1-2 ohniska a méně než přibližně 25 buněk), BFU-MK (velké, mnoho-ohniskové kolonie s >25 buňkami), nebo směsné kolonie (směs pozitivních a negativních buněk).
Příklady provedení vynálezu
Příklady 1 a 2
Konstrukce expresních vektorů pMÓN32364 a pMON32377 obsahujících DNA sekvence kódující multiíunkční agonisty receptorů zahrnující IL-3 (15-125) variantu připojenou přes IgG2b spojovník k flt-3 (1-134) ligandu, respektive IL-3 (15-125) variantu připojenou přes IgG2b spojovník k flt-3 (1-134) ligandu. Plasmidy pMON32364 a pMON32377 byly připraveny klonováním pomocí gelu purifikovaného NcoI/HindlII DNA fragmentu pocházejícího s pMON30237 SEQ ID Č.: 53 a pMON30238 SEQ ID Č.: 54 obsahujícího flt-3 (1-134) ligand a flt-3 (1-139) do vektorové DNA pMON30311 (derivátu pMON13058-WO 95/21254) štěpené AflIII/HindlII a upravené pomocí SAP s použitím standardních ligačních podmínek. Ligační směs byla použita k transformaci kompetentních DH5a buněk (Gibco BRL cat #18265-017) podle postupu doporučeného výrobcem a vektorová DNA byly izolována z ampicilin resistentních ··· · · ···· • · · · · · · «····· • · · · · · · «··· ·· «······ ·· ·· kolonií. DNA sekvence získaných genů (SEQ ID Č.: 21 respektive SEQ ID Č.: 22) byly stanoveny automatickým fluorescenčním DNA sekvencováním na ABI 373/377 DNA sekvenátoru (Perkin Elmer ABI) a Sequencher (Gene Codes) software. Výsledné vektory pMON32364 a pMON32377 kódují proteiny SEQ ID Č.: 42 respektive SEQ ID Č.: 43.
Příklady 3 a 4
Konstrukce expresních vektorů pMON30247 a pMON30246 obsahujících DNA sekvence kódující multifiinkčm agonisty receptorů zahrnující IL-3 (15-125) variantu připojenou přes IgG2b spojovník k flt-3 (1-134) ligandu, respektive IL-3 (15-125) variantu připojenou přes GlySer spojovník k flt-3 (1-134) ligandu. Plasmidy pMON30246 a pMON30247 byly připraveny klonováním pomocí gelu purifikovaného NcoI/AflIII DNA fragmentu pocházejícího, s pMON30244 (GlySer spojovník) SEQ ID Č.: 65 a pMON30245 (IgG2b spojovník) SEQ ID Č.: 66 do vektorové DNA pMON30237 štěpené Ncol (která obsahuje hFlt3L 1-34) jak je popsáno v příkladech 1 a 2. DNA sekvence získaných genů SEQ ID Č.: 13 respektive SEQ ID Č.: 14 kódují proteiny SEQ ID Č.: 42 respektive SEQ ID Č.: 43.
Příklady 5 a 6
Konstrukce expresních vektorů pMON30249 a pMON30248 obsahujících DNA sekvence kódující multifiinkční agonisty receptorů zahrnující IL-3 (15-125) variantu připojenou přes IgG2b spojovník k flt-3 (1-139) ligandu, respektive IL-3 (15-125) variantu připojenou přes GlySer spojovník k flt-3 (1-139) ligandu. Plasmidy pMON30248 a pMON30249 byly připraveny klonováním pomocí gelu purifikovaného NcoI/AflIII DNA restrikčního fragmentu pocházejícího s pMON30244 (GlySer spojovník) respektive pMON30245 (IgG2b spojovník) do vektorové DNA pMON30238 štěpené Ncol (která obsahuje hFlt3L 1-39) jak je popsáno v příkladech 1 a 2. DNA
Γ „ .
sekvence získaných genů SEQ ID Č.: 15 respektive SEQ ID C.: 16 kódují proteiny SEQ ID C.: va 36 respektive SEQ ID Č.: 37.
Příklady 7 a 8
Konstrukce expresních vektorů pM0N32392 a pMON32393 obsahujících DNA sekvence kódující multifiinkční agonisty receptorů zahrnující flt3 (1-134) ligand připojený přes IgG2b spojovník k IL-3 (15-125) variantě respektive flt3 (1-134) ligand připojený přes IgG2b spojovník k IL-3 (15-125) variantě. Plasmidy pMON32392 a pMON32393 byly připraveny pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR). Jako templát pro PCR reakci byla použita plasmidová • · · · · ···· · · ·· · · ·
DNA pMON30237 a pMON30238 a jako primery páry N-term SEQ ID Č.: 29/134rev SEQ ID Č.: 30 respektive N-term SEQ ID Č.: 29/139rev SEQ ID Č.: 31 aby bylo na C-konec ve čtecím rámci vloženo restrikční místo SnaBI. PCR reakční směs byla sestavena standardním způsobem pomocí Invitrogen PCR Optomizer kitu (Invitrogen). Podmínky amplifikačního cyklu byly následující: sedm cyklů 95°C jedna minuta, 65°C dvě minuty, 72°C 2 a 1/2 minuty následovaných jedním cyklem 94°C jedna minuta, 70°C dvě minuty, 72°C 2 a 1/2 minuty. Produkt PCR reakce byl purifikován pomocí Wizard PCR Purification kitu (Promega), a eluován 50 μΐ dH2O. 20 μΐ
i. každého z purifiko váných PCR produktů bylo štěpeno 50 μΐ reakční směsi s 10 U Ncol a 10 U
SnaBI 90 minut při 37°C. Jeden pg vektoru pMON26431 (derivát pMON13061 - WO 95/21254) bylo štepeno 7,5 U Ncol a 7,5 U SnaBI v 20 μΐ reakční směsi 90 minut při 37°C a následně byla přidána 1 U krabí alkalické fosfatasy. Reakční směs byla inkubována dalších 10 minut při 37°C a oba inzerty a vektor byly purifikovány na gelu, jak bylo popsáno výše. Ligační čas a teplota byly modifikovány na inkubaci 3 hodiny při 16°C, následovanou 2 hodinami za pokojové teploty. Transformace a ověření DNA sekvence byly provedeny jak bylo popsáno v příkladech 1 a 2. DNA sekvence získaných genů SEQ ID Č.: 23 respektive SEQ ID Č.: 24 kódují proteiny SEQ ID Č.: 44 respektive SEQ ID Č.: 45.
Příklad 9
Konstrukce expresního vektoru pMON30328 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifiinkčního agonistů receptorů zahrnujícího flt3 (1-134) ligand připojený přes IgG2b spojovník k agonistovi G-CSF receptorů. Plasmid pMON30328 byl připraven subklonováním na gelu purifikovaného NcoI/HindlII restrikčního fragmentu z pMON30237 do plasmidu pMON30309 (derivátu pMON13149 - WO 95/21254) rozštěpeného AfHII/HindlII (obsahujícího f G-CSF/IgG2b-AflIII/HindIII), jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu
SEQ ID Č.: 50 kóduje protein SEQ ID Č.: 60.
Příklad 10
Konstrukce expresního vektoru pMON30329 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifiinkčního agonistů receptorů zahrnujícího agonistů G-CSF receptorů připojený přes IgG2b spojovník k flt3 (1-139) ligandu. Plasmid pMON30329 byl připraven subklonováním na gelu purifikovaného NcoI/HindlII restrikčního fragmentu z pMON30238 do plasmidu pMON30309 rozštěpeného AťlIII/HindlII (obsahujícího G-CSF/IgG2b-AflIII/HindIII), jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 17 kóduje protein SEQ ID Č.: 38.
• ·
Příklad 11
Konstrukce expresního vektoru pMON32175 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifunkčního agonistu receptorů zahrnujícího flt3 (1-139) ligand připojený přes IgG2b spojovník k agonistovi G-CSF receptorů. Plasmid pMON32175 byl připraven subklonováním na gelu purifikovaného NcoI/SnaBI restrikčního fragmentu z pMON32393 do plasmidu pMON26430 (derivátu pMON13060 - WO 95/21254) rozštěpeného NcoI/SnaBI, jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 19 kóduje protein SEQ ID Č.: 40.
Příklad 12
Konstrukce expresního vektoru pMON32191 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifunkčního agonistu receptorů zahrnujícího £Lt3 (1-139) ligand připojený přes IgG2b spojovník k agonistovi G-CSF receptorů. Plasmid pMON32175 byl připraven subklonováním na gelu purifikovaného NcoI/SnaBI restrikčního fragmentu z pMON32393 SEQ ID Č.: 58 do plasmidu pMON31123 rozštěpeného NcoI/SnaBI (který obsahuje GlySer/G-CSF seskupení), jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 20 kóduje protein SEQ IDČ.:41.
Příklad 13
Konstrukce expresního vektoru pMON35767 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifunkčního agonistu receptorů zahrnujícího flt3 (1-139) ligand připojený přes IgG2b spojovník k agonistovi G-CSF receptorů. Plasmid pMON35767 byl připraven subklonováním na gelu purifikovaného NcoI/HindlII restrikčního fragmentu z pMON32191 SEQ ID Č.: 20 do expresního vektoru pMON3934, který je derivátem pMON3359. pMON3359 je na pUC18
Γ založený vektor obsahující savčí expresní kazetu. Kazeta zahrnuje herpes simplex virový promotor IE110 (-800 až +120) následovaný modifikovaným IL-3 signálním peptidovou sekvencí a SV40 polyadenilačním signálem (poly-A), který byl subklonován do pUC18 polyspojovníku (viz Hippenmeyer et al., Bio/Technology, 1993, pp. 1037-1041). DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 20 kóduje protein SEQ ID Č.: 41.
• ·
Příklad 14
Konstrukce expresního vektoru pMON32173 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifunkčního agonistů receptorů zahrnujícího flt3 (1-139) ligand připojený přes IgG2b spojovník k flt3 (1-139) ligandu. Plasmid pMON32173 byl připraven subklonováním na gelu purifikovaného -130 kbp NcoI/SacI restrikčního fragmentu z pMON32342 SEQ ID Č.: 52 a -290 kbp SacI/SnaBI restrikčního fragmentu z pMON32393 do plasmidu pMON30329 rozštěpeného NcoI/SnaBI, jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 18 kóduje protein SEQ ID Č.: 39.
Příklad 15
Konstrukce expresního vektoru pMON45419 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifunkčního agonistů receptorů zahrnujícího c-mpl (1-153) ligand připojený přes IgG2b spojovník k flt3 (1-139) ligandu. Plasmid pMON45419 byl připraven subklonováním NcoI/SnaBI restrikčního fragmentu z pMON26474 (derivátu pMON26472 - WO 95/21254) do plasmidu pMON32173 SEQ ID Č.: 56 rozštěpeného NcoI/SnaBI, jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 25 kóduje protein SEQ ID Č.: 46.
Příklad 16
Konstrukce expresního vektoru pMON45420 obsahujícího DNA sekvenci kódující multifunkčního agonistů receptorů zahrnujícího flt3 (1-139) ligand připojený přes IgG2b spojovník k c-mpl (1-153) ligandu. Plasmid pMON45420 (derivát pMON26471 - WO 95/21254) byl připraven subklonováním NcoI/SnaBI restrikčního fragmentu z pMON32191 do plasmidu pMON26473 rozštěpeného NcoI/SnaBI, jak je popsáno v příkladu 1 a 2. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 26 kóduje protein SEQ ID Č.: 47.
Příklad 17
Konstrukce plasmidu pMON46408, který kóduje multifunkčního agonistů hematopoietických receptorů obsahujícího EPO připojený přes GlySer spojovník k flt3 (1-139) ligandu.
Plasmid pMON46408 byl zkonstruován pomocí dvou krokové klonovací procedury . Nejprve byl zkonstruován meziproduktový plasmid pMON46406. Tento plasmid kóduje lidskou EPO sekvenci připojenou k GlySer spojovníkové sekvenci obsahující restrikční místa AflIII a HindlII. Následující tři DNA fragmenty byly ligo vány za vzniku plasmidu pMON46406:
• ·
1. 480 pb Ncol/Stul fragment kódující EPO vyjma 6 koncových aminokyselin.
2. Zpárované oligonukleotidy epostu-xma.seq SEQ ID Č.: 32 a epostu.ma.rev SÉQ ID Č.: 33, které obsahují Stul-Xmal fragment kódující 6 terminálních aminokyselin EPO a část GlySer polypeptidové spojovníkové sekvence.
3. 3 052 bp Ncol/Xmal vektorový fragment plasmidu pMON13180
Ligační směs byla použita pro transformaci kompetentních MON105 buněk a transformanti byly selektováni na LB Amp miskách. Kolonie byly odebrány a analyzovány sekvenací DNA, aby byl identifikován správný klon. Tento klon byl označen pMON46406.
Pro přípravu pMON46408 byl plasmid pMON46406 štěpen AflITI a HindlII a fragment vektoru byl purifikován. Fragment byl ligován s 423 bp NcoI/HindlII fragmentem plasmidu pMON32342 SEQ ID Č.: 52, který kóduje flt-3 (1-139) ligand. Ligační směs byla použita pro transformaci kompetentních MON105 buněk a transformanti byly selektováni na LB Amp miskách. Kolonie byly odebrány a analyzovány sekvenací DNA, aby byl identifikován správný klon. Tento klon byl označen pMON46408. DNA sekvence získaného genu SEQ ID Č.: 28 kóduje protein SEQ ID Č.: 49.
Příklad 18 φ Stanovém bioaktivity vybraných chimemích proteinů
Vybrané chimérické proteiny podle vynálezu byly zkoumány pomocí BaG buněčné linie transfekované flt3/flk2 receptorem (BaG/flt3), aby byla stanovena £lt3 ligandová bioaktivita.
C
Tabulka 1 BaG/flt3 stanovení pMON30249
PMON32173 pMON32392
PMON32393
PMON32364 pMON32377
Srovnatelný se samotným nativním flt3 ligandem Srovnatelný se samotným nativním flt3 ligandem Srovnatelný se samotným nativním flt3 ligandem Srovnatelný se samotným nativním flt3 ligandem Srovnatelný se samotným nativním flt3 ligandem Srovnatelný se samotným nativním flt3 ligandem
Další detaily týkající se rekombinantních DNA metod, které mohou být použity pro vytvoření variant, jejich expresi v bakteriích, savčích buňkách, nebo hmyzích buňkách, purifikaci a znovusbalení žádaných proteinů a stanoveních bioaktivity těchto proteinů mohou být nalezeny v WO 95/00646, WO 94/12639, WO 94/12638, WO 95/20976, WO 95/21197, WO 95/20977, WO 95/21254, a US 08/383,035, jejichž úplné odkazy jsou zde uvedeny.
Další detaily známé odborníkům mohou být nalezeny v T. Maniatis, et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1982 a tam uvedených odkazech, začleněných zde jako odkazy; a v J. Sambrook, et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, druhé vydání Cold Spring Harbor Laboratory, 1989 a tam uvedených odkazech, začleněných zde jako odkazy. Metody purifikace proteinů, odborníkům známé, jsou detailně popsány v Methods in Enzymology, Vol. 182, Guide to Protein Purification zpracovaný Murrayem Deutscher, Academie Press, San Diego, CA (1990).
Všechny odkazy, patenty, nebo přihlášky zde uvedené jsou zde začleněny ve své úplnosti.
Různé další příklady v duchu a rozsahu vynálezu budou odborníkovi v oboru zřejmé po přečtení tohoto textu. Je zřejmé, že všechny takové další příklady jsou zahmúty v rozsahu vynálezu a připojených nároků.
SEZNAM SEKVENCI (1) OBECNÉ INFORMACE (i) PŘIHLAŠOVATEL: G. D. Searle Corporate, Oddělení pro patenty (ii) NÁZEV VYNÁLEZU: Chimérické proteiny jako Flt3 ligandy (iii) POČET SEKVENCÍ: 65 (iv) ADRESA PRO KORESPONDENCI:
(A) ADRESÁT: G. D. Searle Corporate Patent Department (B) ULICE: P.O. Box 55110 (C) MĚSTO: Chicago (D) STÁT: IL (E) ZEMÉ: USA (F) ZIP: 60680 (v) POČÍTAČOVĚ ZPRACOVATELNÁ FORMA:
(A) TYP MÉDIA: Disketa (B) POČÍTAČ: IBM Kompaktibilní (C) OPERAČNÍ SYSTÉM: DOS (D) SOFTWARE: FastSEQ pro Windows Verse 2.0 (vi) SOUČASNÉ ÚDAJE O PŘIHLÁŠCE:
(A) ČÍSLO PŘIHLÁŠKY:
(B) DATUM PODÁNÍ: 10-DUBEN-1998 (C) KLASIFIKACE:
(vii) PŘEDBĚŽNÉ ÚDAJE O PŘIHLÁŠCE:
(A) ČÍSLO PŘIHLÁŠKY: 08/837,026 (B) DATUM PODÁNÍ: ll-DUBEN-1997 (viii) ZÁSTUPCE/ÚDAJE O AGENTOVI:
(A) JMÉNO: Bennett, Dennis A (B) REGISTRAČNÍ ČÍSLO: 34,547 (C) REFERENCE/JEDNACÍ ČÍSLO: C-3018/1/PCT (ix) TELEKOMUNIKAČNÍ INFORMACE:
(A) TELEFON: 314-737-6986 (B) TELEFAX: 314-737-6972 (C) TELEX:
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:l:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 4 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: peptid (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:l:
Gly Gly Gly Ser 1 • · (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 2:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 5 aminokyselin ' (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) TYP MOLEKULY: peptid
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 2:
Gly 1 Gly Gly Gly Ser 5
!* (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 3:
( (i) POPIS SEKVENCE: (A) DÉLKA: 6 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) TYP MOLEKULY: peptid
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 3:
Gly 1 Gly Gly Gly Gly Ser 5
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 4:
(i) POPIS SEKVENCE: (A) DÉLKA: 2 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární -
(ii) TYP MOLEKULY: peptid
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 4:
Gly 1 Ser
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 5:
r i (i) POPIS SEKVENCE: (A) DÉLKA: 3 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) TYP MOLEKULY: peptid
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:5:
Ala 1 Gly Ser
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:6:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 36 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová ··· ··· (C) POČET ŘEŤEZCÓ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: peptid (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:6:
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Glu Gly Gly Gly
1 5 10 15
Ser Glu Gly Gly Gly Ser Glu 'Gly Gly Gly Ser Glu Gly Gly Gly Ser
20 25 30
Gly Gly Gly Ser 35 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:7: t
£ (i) POPIS (A) (B) (C) (D) SEKVENCE: DÉLKA: 24 aminokyselin TYP: aminokyselinová POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová TOPOLOGIE: lineární
(ii) TYP MOLEKULY: peptid
(xi) D/ODTC OrVUPMCr. ΤΠ ň . Π · £ í. j. kj ijuiv v υίΊ'νυ « kj j. i_z i ·
Ile Ser Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro
1 5 10 15
Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:8:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 28 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: peptid (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:8:
Ile 1 Pro Glu Gly Arg Ile 5 Ser Ser Lys Glu Glu Pro Ser Ser Gly Pro Ser Ile Pro Ser Thr Ile Asn 15
His 10 Lys
Ser Pro Pro
20 25
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:9:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 349 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:9:
Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe
1 5 10 15
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
·· ·· ·· • · · ··
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr He Asn
145 150 155 160
Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Thr
165 170 175
Pro Leu Gly Pro Ala Ser Ser Leu Pro Gin Ser Phe Leu Leu Lys Ser
180 185 190
Leu Glu Gin Val Arg Lys Ile Gin Gly Asp Gly Ala Ala Leu Gin Glu
190 200 205
Lys Leu Cys Ala Thr Tyr Lys Leu Cys His Pro Glu Glu Leu Val Leu
210 215 220
Leu Gly His Ser Leu Gly Ile Pro Trp Ala Pro Leu Ser Ser Cys Pro
225 230 235 240
Ser Gin Ala Leu Gin Leu Ala Gly Cys Leu Ser Gin Leu His Ser Gly
245 250 255
Leu Phe Leu Tyr Gin Gly Leu Leu Gin Ala Leu Glu Gly Ile Ser Pro
260 265 270
Glu Leu Gly Pro Thr Leu Asp Thr Leu Gin Leu Asp Val Ala Asp Phe
275 280 285
Ala Thr Thr Ile Trp Gin Gin Met Glu Glu Leu Gly Met Ala Pro Ala
290 295 300
Leu Gin Pro. .. Thr Gin Gly Ala Met Pro Ala Phe Ala Ser Ala Phe Gin
305 310 315 320
Arg Arg Ala Gly Gly Val Leu Val Ala Ser His Leu Gin Ser Phe Leu
325 330 335
Glu Val Ser Tyr Arg Val Leu Arg His Leu Ala Gin Pro
340 345
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:10:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1047 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:10:
GCCACCCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCCTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCATGGATC
ACTCGCCAGA 420 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC' CTCAACCCTG
TACGTAGAGG 4 80 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC
CCGTCTCCTC 540 CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TCTCCAAACA TGGCTACACC ATTGGGCCCT
«· ··
41 * • ·*· • · « · * · « > ·· ··· ·
GCCAGCTCCC TGCCCCAGAG 600 CTTCCTGCTC AAGTCTTTAG AGCAAGTGAG AAAGATCCAG
GGCGATGGCG CAGCGCTCCA 660 GGAGAAGCTG TGTGCCACCT ACAAGCTGTG CCACCCCGAG
GAGCTGGTGC TGCTCGGACA 720 CTCTCTGGGC ATCCCCTGGG CTCCCCTGAG CTCCTGCCCC
AGCCAGGCCC TGCAGCTGGC 780 AGGCTGCTTG AGCCAACTCC ATAGCGGCCT TTTCCTCTAC
CAGGGGCTCC TGCAGGCCCT 840 GGAAGGGATA TCCCCCGAGT TGGGTCCCAC CTTGGACACA
CTGCAGCTGG ACGTCGCCGA 900 CTTTGCCACC ACCATCTGGC AGCAGATGGA AGAACTGGGA
ATGGCCCCTG CCCTGCAGCC 960 CACCCAGGGT GCCATGCCGG CCTTCGCCTC TGCTTTCCAG
CGCCGGGCAG GAGGGGTCCT GGTTGCTAGC CATCTGCAGA GCTTCCTGGA GGTGTCGTAC
1020
CGCGTTCTAC GCCACCTTGC GCAGCCC
1047 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:ll:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 349 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:ll:
Ala Thr Pro Leu Gly Pro Ala Ser Ser Leu Pro Gin Ser Phe Leu Leu
1 5 10 15
Lys Ser Leu Glu Gin Val Arg Lys Ile Gin Gly Asp Gly Ala Ala Leu
20 25 30
Gin Glu Lys Leu Cys Ala Thr Tyr Lys Leu Cys His Pro Glu Glu Leu
35 40 45
Val Leu Leu Gly His Ser Leu Gly Ile Pro Trp Ala Pro Leu Ser Ser
50 55 60
Cys Pro Ser Gin Ala Leu Gin Leu Ala Gly Cys Leu Ser Gin Leu His
65 70 75 80
Ser Gly Leu Phe Leu Tyr Gin Gly Leu Leu Gin Aia Leu Glu Gly Ile
85 90 95
Ser Pro Glu Leu Gly Pro Thr Leu Asp Thr Leu Gin Leu Asp Val Ala
100 105 110
Asp Phe Ala Thr Thr Ile Trp Gin Gin Met Glu Glu Leu Gly Met Ala
115 120 125
Pro Ala Leu Gin Pro Thr Gin Gly Ala Met Pro Ala Phe Ala Ser Ala
130' 135 140
Phe Gin Arg Arg Ala Gly Gly Val Leu Val Ala Ser His Leu Gin Ser
145 150 155 '160
Phe Leu Glu Val Ser Tyr Arg Val Leu Arg His Leu Ala Gin Pro Tyr
165 170 175
Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser
180 185 190
Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn
195 200 205
Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp
210 215 220
Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr
225 230 235 240
Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly
245 250 255
Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr
260 265 270
Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu
·· • · · · , · · · • · · · • · · ···· ·· • ·· ·· · · • · • » w · ··· ·<« · «· ·» • · · · • · · · • ··· ·*« • · «· ··
275 280 285
Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu
290 295 300
Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu
305 310 315 320
Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg
325 330 335
Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
340 345
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:12:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1047 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:12:
GCTACACCAT 60 CAAGTGAGAA 120 TGGGCCCTGC CAGCTCCCTG CCCCAGAGCT TCCTGCTCAA GTCTTTAGAG
AGATCCAGGG CGATGGCGCA GCGCTCCAGG AGAAGCTGTG TGCCACCTAC
AAGCTGTGCC 180 ACCCCGAGGA GCTGGTGCTG CTCGGACACT CTCTGGGCAT CCCCTGGGCT
CCCCTGAGCT 240 CCTGCCCCAG CCAGGCCCTG CAGCTGGCAG GCTGCTTGAG CCAACTCCAT
AGCGGCCTTT 300 TCCTCTACCA 1 GGGGCTCCTG CAGGCCCTGG AAGGGATATC CCCCGAGTTG
GGTCCCACCT 360 TGGACACACT GCAGCTGGAC GTCGCCGACT TTGCCACCAC CATCTGGCAG
CAGATGGAAG 420 AACTGGGAAT GGCCCCTGCC CTGCAGCCCA CCCAGGGTGC CATGCCGGCC
TTCGCCTCTG 480 CTTTCCAGCG CCGGGCAGGA GGGGTCCTGG TTGCTAGCCA TCTGCAGAGC
TTCCTGGAGG 540 TGTCGTACCG CGTTCTACGC CACCTTGCGC AGCCCTACGT AGAGGGCGGT
GGAGGCTCCC 600 CGGGTGAACC GTCTGGTCCA ATCTCTACTA TCAACCCGTC TCCTCCGTCT
AAAGAATCTC 660 ATAAATCTCC AAACATGGCT ACCCAGGACT GCTCCTTCCA ACACAGCCCC
ATCTCCTCCG 720 ACTTCGCTGT CAAAATCCGT GAGCTGTCTG ACTACCTGCT TCAAGATTAC
CCAGTCACCG 780 TGGCCTCCAA CCTGCAGGAC GAGGAGCTCT GCGGGGGCCT CTGGCGGCTG
GTCCTGGCAC 840 AGCGCTGGAT GGAGČGGCTC AAGACTGTCG CTGGGTCCAA GATGCAAGGC
TTGCTGGAGC 900 GCGTGAACAC GGAGATACAC TTTGTCACCA AATGTGCCTT TCAGCCCCCC
CCCAGCTGTC 960 TTCGCTTCGT CCAGACCAAC ATCTCCCGCC. TCCTGCAGGA GACCTCCGAG
CAGCTGGTGG 1020 CAGTGTCAGC 1047 CGCTGAAGCC CCGACTCCTC CTGGATCACT AACCCTG CGCCAGAACT TCTCCCGGTG CCTGGAGCTG
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:13:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 798 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:13:
ř'
-
43 - • :· • · <· >· · '· 't
GCTAACTGCT 60 CTATAATGAT CGATGAAATT- ATACATCACT TAAAGAGACC ACCTGCACCT
TTGCTGGACC 120 ‘ CGAACAACCT CAATGACGAA GACGTCTCTA TCCTGATGGA CCGAAACCTT
CGACTTCCAA 180 ' ’· ACCTGGAGAG CTTCGTAAGG GCTGTCAAGA ACTTAGAAAA TGCATCAGGT
ATTGAGGCAA 240 TTCTTCGTAA TCTCCAACCA TGTCTGCCCT CTGCCACGGC CGCACCCTCT
CGACATCCAA 300 TCATCATCAA GGCAGGTGAC TGGCAAGAAT TCCGGGAAAA ACTGACGTTC
TATCTGGTTA 360 CCCTTGAGCA AGCGCAGGAA CAACAGTACG TAGAGGGCGG TGGAGGCTCC
CCGGGTGGTG 420 GTTCTGGCGG CGGCTCCAAC ATGGCCACCC AGGACTGCTC CTTCCAACAC
AGCCCCATCT CCTCCGACTT CGCTGTCAAA ATCCGTGAGC TGTCTGACTA CCTGCTTCAA
480 ' . -.-.0 1 “ A, ’
GATTACCCAG 540 TCACCGTGGC CTCCAACCTG CAGGACGAGG . s. AGCTCTGCGG ' *· -.i GGCGCTCTGG
CGGCTGGTCC 600 TGGCACAGCG CTGGATGGAG CGGCTCAAGA CTGTCGCTGG GTCCAAGATG
CAAGGCTTGC 660 TGGAGCGCGT GAACACGGAG ATACACTTTG TCACCAAATG TGCCTTTCAG
CCCCCCCCCA 720 GCTGTCTTCG CTTCGTCCAG ACCAACATCT CCCGCCTCCT GCAGGAGACC
TCCGAGCAGC 780 GAGCTGCAGT 798 TGGTGGCGCT GTCAGCCC GAAGCCCTGG ATCACTCGCC AGAACTTCTC CCGGTGCCTG
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:14:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 843 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:14:
GCTAACTGCT 60 TTGCTGGACC 120 CTATAATGAT CGATGAAATT ATACATCACT TAAAGAGACC ACCTGCACCT
CGAACAACCT CAATGACGAA GACGTCTCTA TCCTGATGGA CCGAAACCTT
CGACTTCCAA 180 ACCTGGAGAG CTTCGTAAGG GCTGTCAAGA ACTTAGAAAA TGCATCAGGT
ATTGAGGCAA 240 TTCTTCGTAA TCTCCAACCA TGTCTGCCCT CTGCCACGGC CGCACCCTCT
CGACATCCAA 300 TCATCATCAA GGCAGGTGAC TGGCAAGAAT TCCGGGAAAA ACTGACGTTC
TATCTGGTTA 360 CCCTTGAGCA AGCGCAGGAA CAACAGTACG TAGAGGGCGG TGGAGGCTCC
CCGGGTGAAC 420 CGTCTGGTCC AATCTCTACT ATCAACCCGT CTCCTCCGTC TAAAGAATCT
CATAAATCTC 480 CAAACATGGC CACCCAGGAC TGCTCCTTCC AACACAGCCC CATCTCCTCC
GACTTCGCTG 540 TCAAAATCCG TGAGCTGTCT GACTACCTGC TTCAAGATTA CCCAGTCACC
GTGGCCTCCA 600 ACCTGCAGGA CGAGGAGCTC TGCGGGGCGC TCTGGCGGCT GGTCCTGGCA
CAGCGCTGGA 660 TGGAGCGGCT CAAGACTGTC GCTGGGTCCA AGATGCAAGG CTT.GCTGGAG
CGCGTGAACA 720 CGGAGATACA CTTTGTCACC AAATGTGCCT TTCAGCCCCC CCCCAGCTGT
CTTCGCTTCG TCCAGÁCCAA CATCTCCCGC CTCCTGCAGG AGACCTCCGA GCAGCTGGTG
φ · · · « · ·· ··
780
GCGCTGAAGC CCTGGATCAC TCGCCAGAAC TTCTCCCGGT GCCTGGAGCT GCAGTGTCAG
840
CCC
843 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:15:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 813 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:15:
GCTAACTGCT CTATAATGAT CGATGAAATT ATACATCACT TAAAGAGACC ACCTGCACCT
60 TTGCTGGACC CGAACAACCT CAATGACGAA GACGTCTCTA TCCTGATGGA CCGAAACCTT
120 CGACTTCCAA ACCTGGAGAG CTTCGTAAGG GCTGTCAAGA ACTTAGAAAA TGCATCAGGT
180 ATTGAGGCAA TTCTTCGTAA TCTCCAACCA TGTCTGCCCT CTGCCACGGC CGCACCCTCT
240 CGACATCCAA TCATCATCAA GGCAGGTGAC TGGCAAGAAT TCCGGGAAAA ACTGACGTTC
300 TATCTGGTTA CCCTTGAGCA AGCGCAGGAA CAACAGTACG TAGAGGGCGG TGGAGGCTCC
360 CCGGGTGGTG GTTCTGGCGG CGGCTCCAAC ATGGCCACCC AGGACTGCTC CTTCCAACAC
420 AGCCCCATCT CCTCCGACTT CGCTGTCAAA ATCCGTGAGC TGTCTGACTA CCTGCTTCAA
480 GATTACCCAG TCACCGTGGC CTCCAACCTG CAGGACGAGG AGCTCTGCGG GGCGCTCTGG
540 CGGCTGGTCC TGGCACAGCG CTGGATGGAG CGGCTCAAGA CTGTCGCTGG GTCCAAGATG
600 CAAGGCTTGC TGGAGCGCGT GAACACGGAG ATACACTTTG TCACCAAATG TGCCTTTCAG
660 CCCCCCCCCA GCTGTCTTCG CTTCGTCCAG ACCAACATCT CCCGCCTCCT GCAGGAGACC
720 TCCGAGCAGC TGGTGGCGCT GAAGCCCTGG ATCACTCGCC AGAACTTCTC CCGGTGCCTG
780 GAGCTGCAGT GTCAGCCCGA CTCCTČAACC CTG
813 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:16: (i) POPIS SEKVENCE: (A) DÉLKA: 858 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:16:
GCTAACTGCT 60 TTGCTGGACC CTATAATGAT CGATGAAATT ATACATCACT TAAAGAGACC ACCTGCACCT
CGAACAACCT CAATGACGAA GACGTCTCTA TCCTGATGGA CCGAAACCTT
120 CGACTTCCAA ACCTGGAGAG CTTCGTAAGG GCTGTCAAGA ACTTAGAAAA TGCATCAGGT
180 ATTGAGGCAA TTCTTCGTAA TCTCCAACCA TGTCTGCCCT CTGCCACGGC CGCACCCTCT
240 CGACATCCAA TCATCATCAA GGCAGGTGAC TGGCAAGAAT TCCGGGAAAA ACTGACGTTC
300 TATCTGGTTA CCCTTGAGCA AGCGCAGGAA CAACAGTACG TAGAGGGCGG TGGAGGCTCC
v » 45 , o o e 0 © o 7 3 . 3 0 » » ·# 5 3 »3 O O O 7 Ί» O >3 O O 0,3 Ο 7 05703
$ 360 CCGGGTGAAC CGTCTGGTCC AATCTCTACT ATCAACCCGT CTCCTCCGTC TAAAGAATCT
1 420 CATAAATCTC CAAACATGGC CACCCAGGAC TGCTCCTTCC AACACAGCCC CATCTCCTCC
480 L 1 J.
r GACTTCGCTG TCAAAATCCG TGAGCTGTCT GACTACCTGC TTCAAGATTA CCCAGTCACC
ř p ‘ 54 0 .-•v
R GTGGCCTCCA ACCTGCAGGA CGAGGAGCTC TGCGGGGCGC TCTGGCGGCT GGTCCTGGCA
600 ..* ? A 7
i... CAGCGCTGGA TGGAGCGGCT CAAGACTGTC GCTGGGTCCA AGATGCAAGG CTTGCTGGAG
660 A-VCil'
CGCGTGAACA CGGAGATACA CTTTGTCACC AAATGTGCCT TTCAGCČCCC CCCCAGCTGT
720 — 7 : iL*C . v .
CTTCGCTTCG TCCAGACCAA CATCTCCCGC CTCCTGCAGG AGACCTCCGA GCAGCTGGTG
780 ,-,//-· I .
GCGCTGAAGC CCTGGATCAC TCGCCAGAAC TTCTCCCGGT GCCTGGAGCT GCAGTGTCAG
840 CCCGACTCCT CAACCCTG * , *·
λ 858 ID Č:17: ' r.'·
(2) INFORMACE PRO SEQ
(i) POPIS SEKVENCE:
- (A) DÉLKA: 1047 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) POČET ŘEŤEZCU: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:17
GCTACACCAT 60 TGGGCCCTGC CAGCTCCCTG CCCCAGAGCT TCCTGCTCAA GTCTTTAGAG
li- CAAGTGAGAA AGATCCAGGG CGATGGCGCA GCGCTCCAGG AGAAGCTGTG TGCCACCTAC
120 AAGCTGTGCC ACCCCGAGGA GCTGGTGCTG CTCGGACACT CTCTGGGCAT CCCCTGGGCT
180 CCCCTGAGCT 240 CCTGCCCCAG CCAGGCCCTG CAGCTGGCAG GCTGCTTGAG CCAACTCCAT
AGCGGCCTTT TCCTCTACCA GGGGCTCCTG CAGGCCCTGG AAGGGATATC CCCCGAGTTG
300 GGTCCCACCT TGGACACACT GCAGCTGGAC GTCGCCGACT TTGCCACCAC CATCTGGCAG
360 CAGATGGAAG 420 AACTGGGAAT GGCCCCTGCC CTGCAGCCCA CCCAGGGTGC CATGCCGGCC
TTCGCCTCTG CTTTCCAGCG CCGGGCAGGA GGGGTCCTGG TTGCTAGCCA TCTGCAGAGC
480 TTCCTGGAGG 540 TGTCGTACCG CGTTCTACGC CACCTTGCGC AGCCCTACGT AGAGGGCGGT
:: r GGAGGCTCCC 600 CGGGTGAACC GTCTGGTCCA ATCTCTACTA TCAACCCGTC TCCTCCGTCT
- AAAGAATCTC 660 ATAAATCTCC AAACATGGCC ACCCAGGACT GCTCCTTCCA ACACAGCCCC
ATCTCCTCCG ACTTCGCTGT CAAAATCCGT GAGCTGTCTG ACTACCTGCT TCAAGATTAC
L 720 CCAGTCACCG 780 TGGCCTCCAA CCTGCAGGAC GAGGAGCTCT GCGGGGGCCT CTGGCGGCTG
GTCCTGGCAC 840 AGCGCTGGAT GGAGCGGCTC AAGACTGTCG CTGGGTCCAA GATGCAAGGC
TTGCTGGAGC 900 GCGTGAACAC GGAGATACAC TTTGTCACCA AATGTGCCTT TCAGCCCCCC
CCCAGCTGTC 960 TTCGCTTCGT CCAGACCAAC ATCTCCCGCC TCCTGCAGGA GACCTCCGAG
CAGCTGGTGG 1020 CGCTGAAGCC CTGGATCACT CGCCAGAACT TCTCCCGGTG CCTGGAGCTG
CAGTGTCAGC CCGACTCCTC AACCCTG ·;
1047
Γ:
í
L r<iL.
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:18:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 942 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:18:
GCCACTCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCTTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
ACTCGCCAGA 420 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
TACGTAGAGG 480 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC
CCGTCTCCTC 540 CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TCTCCAAACA TGGCTACCCA GGACTGCTCC
TTCCAACACA 600 GCCCCATCTC CTCCGACTTC GCTGTCAAAA TCCGTGAGCT GTCTGACTAC
CTGCTTCAAG 660 ATTACCCAGT CACCGTGGCC TCCAACCTGC AGGACGAGGA GCTCTGCGGG
GGCCTCTGGC 720 GGCTGGTCCT GGCACAGCGC TGGATGGAGC GGCTCAAGAC TGTCGCTGGG
TCCAAGATGC 780 AAGGCTTGCT GGAGCGCGTG AACACGGAGA TACACTTTGT CACCAAATGT
GCCTTTCAGC 840 CCCCCCCCAG CTGTCTTCGC TTCGTCCAGA CCAACATCTC CCGCCTCCTG
CAGGAGACCT CCGAGCAGCT GGTGGCGCTG AAGCCCTGGA 900 CGGTGCCTGG AGCTGCAGTG TCAGCCCGAC TCCTCAACCC 942 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:19: (i) POPIS SEKVENCE: (A) DÉLKA: 1047 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:19: TCACTCGCCA TG GAACTTCTCC
GCCACCCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCCTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG .CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCATGGATC
ACTCGCCAGA ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
I • ·
47 • · · • · « · • · • · · · ♦ · • · · • · ·
420
TACGTAGAGG 480 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC
CCGTCTCCTC 540 CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TCTCCAAACA TGGCTACACC ATTAGGCCCT
GCCAGCTCCC 600 TGCCCCAGAG CTTCCTGCTC AAGTGCTTAG AGCAAGTGAG GAAGATCCAG
GGCGATGGCG 660 CAGCGCTCCA GGAGAAGCTG TGTGCCACCT ACAAGCTGTG CCACCCCGAG
GAGCTGGTGC 720 TGCTCGGACA CTCTCTGGGC ATCCCCTGGG CTCCCCTGAG CTCCTGCCCC
AGCCAGGCCC 780 TGCAGCTGGC AGGCTGCTTG AGCCAACTCC ATAGCGGCCT TTTCCTCTAC
CAGGGGCTCC 840 TGCAGGCCCT GGAAGGGATA TCCCCCGAGT TGGGTCCCAC CTTGGACACA
CTGCAGCTGG 900 ACGTCGCCGA CTTTGCCACC ACCATCTGGC AGCAGATGGA AGAACTGGGA
ATGGCCCCTG 960 CCCTGCAGCC CACCCAGGGT GCCATGCCGG CCTTCGCCTC TGCTTTCCAG
CGCCGGGCAG 1020 GAGGGGTCCT GGTTGCTAGC CATCTGCAGA GCTTCCTGGA GGTGTCGTAC
CGCGTTTTAC GCCACCTTGC GCAGCCC
1047 (2) INFORMACE PRO SEO ID Č:20:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1003 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ:. jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi)POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:20:
GGCCACTCAG 60 CCGTGAGCTG 120 GACTGCTCTT TTCAACACAG CCCCATCTCC TCCGACTTCG CTGTCAAAAT
TCTGACTACC TGCTTCAAGA TTACCCAGTC ACCGTGGCCT CCAACCTGCA
GGACGAGGAG 180 CTCTGCGGGG GCCTCTGGCG GCTGGTCCTG GCACAGCGCT GGATGGAGCG
» GCTCAAGACT 240 GTCGCTGGGT CCAAGATGCA AGGCTTGCTG GAGCGCGTGA ACACGGAGAT
-4. ACACTTTGTC 300 ACCAAATGTG CCTTTCAGCC CCCCCCCAGC TGTCTTCGCT TCGTCCAGAC
CAACATCTCC 360 CGCCTCCTGC AGGAGACCT CGAGCAGCTG GTGGCGCTGA AGCCCTGGAT
r CACTCGCCAG 420 AACTTCTCCC GGTGCCTGGA GCTGCAGTGT CAGCCCGACT CCTCAACCCT
GTACGTAGAG 480 GGCGGTGGAG GCTCCCCGGG TGGTGGTTCT GGCGGCGGCT CCAACATGGC
TACACCATTG 540 GGCCCTGCCA GCTCCCTGCC CCAGAGCTTC CTGCTCAAGT CTTTAGAGCA
AGTGAGAAAG 600 ATCCAGGGCG ATGGCGCAGC GCTCCAGGAG AAGCTGTGTG CCACCTACAA
GCTGTGCCAC 660 CCCGAGGAGC TGGTGCTGCT CGGACACTCT iCTGGGCATCC CCTGGGCTCC
CCTGAGCTCC 720 TGCCCCAGCC AGGCCCTGCA GCTGGCAGGC TGCTTGAGCC AACTCCATAG
CGGCCTTTTC 780 CTCTACCAGG GGCTCCTGCA GGCCCTGGAA GGGATATCCC CCGAGTTGGG
TCCCACCTTG 840 GACACACTGC AGCTGGACGT CGCCGACTTT GCCACCACCA TCTGGCAGCA
GATGGAAGAA 900 CTGGGAATGG CCCCTGCCCT GCAGCCCACC CAGGGTGCCA TGCCGGCCTT
CGCCTCTGCT TTCCAGCGCC GGGCAGGAGG GGTCCTGGTT GCTAGCCATC TGCAGAGCTT
960
CCTGGAGGTG TCGTACCGCG TTCTACGCCA CCTTGCGCAG CCG 1003 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:21:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 843 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:21:
GCTAACTGCT 60 TTGCTGGACC 120 CTATAATGAT CGATGAAATT ATACATCACT TAAAGAGACC ACCTAACCCT
CGAACAACCT CAATTCTGAA GACATGGATA TCCTGATGGA ACGAAACCTT
CGAACTCCAA 180 ACCTGCTCGC ATTCGTAAGG GCTGTCAAGC ACTTAGAAAA TGCATCAGGT
ATTGAGGCAA 240 TTCTTCGTAA TCTCCAACCA TGTCTGCCCT CTGCCACGGC CGCACCCTCT
CGACATCCAA 300 TCATCATCAA GGCAGGTGAC TGGCAAGAAT TCCGGGAAAA ACTGACGTTC
TATCTGGTTA 360 CCCTTGAGCA AGCGCAGGAA CAACAGTACG TAGAGGGCGG TGGAGGCTCC
CCGGGTGAAC 420 CGTCTGGTCC AATCTCTACT ATCAACCCGT CTCCTCCGTC TAAAGAATCT
CATAAATCTC 480 CAAACATGGC GACTCAGGAC TGTTCTTTCC AACACAGCCC CATCTCCTCC
GACTTCGCTG 540 TCAAAATCCG TGAGCTGTCT GACTACCTGC TTCAAGATTA CCCAGTCACC
GTGGCCTCCA 600 ACCTGCAGGA CGAGGAGCTC TGCGGGGGCC TCTGGCGGCT GGTCCTGGCA
CAGCGCTGGA 660 TGGAGCGGCT CAAGACTGTC GCTGGGTCCA AGATGCAAGG CTTGCTGGAG
CGCGTGAACA 720 CGGAGATACA CTTTGTCACC AAATGTGCCT TTCAGCCCCC CCCCAGCTGT
CTTCGCTTCG 780 TCCAGACCAA CATCTCCCGC CTCCTGCAGG AGACCTCCGA GCAGCTGGTG
GCGCTGAAGC CCTGGATCAC TCGCCAGAAC TTCTCCCGGT GCCTGGAGCT GCAGTGTCAG
840
CCC
843 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 22:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 858 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:22:
GCTAACTGCT 60 TTGCTGGACC CTATAATGAT CGATGAAATT ATACATCACT TAAAGAGACC ACCTAACCCT
CGAACAACCT CAATTCTGAA GACATGGATA TCCTGATGGA ACGAAACCTT
120 CGAACTCCAA ACCTGCTCGC ATTCGTAAGG GCTGTCAAGC ACTTAGAAAA TGCATCAGGT
180 ATTGAGGCAA TTCTTCGTAA TCTCCAACCA TGTCTGCCCT CTGCCACGGC CGCACCCTCT
240 CGACATCCAA TCATCATCAA GGCAGGTGAC TGGCAAGAAT TCCGGGAAAA ACTGACGTTC
300 TATCTGGTTA CCCTTGAGCA AGCGCAGGAA CAACAGTACG TAGAGGGCGG TGGAGGCTCC
·'· • · 4 • · « • · «
I · · · · ·
360
CCGGGTGAAC 420 CGTCTGGTCC AATCTCTACT ATCAACCCGT CTCCTCCGTC TAAAGAATCT
CATAAATCTC 480 CAAACATGGC AACCCAGGAC TGCTCTTTTC AACACAGCCC CATCTCCTCC
GACTTCGCTG 540 TCAAAATCCG TGAGCTGTCT GACTACCTGC TTCAAGATTA CCCAGTCACC
GTGGCCTCCA 600 ACCTGCAGGA CGAGGAGCTC TGCGGGGGCC TCTGGCGGCT GGTCCTGGCA
CAGCGCTGGA 660 TGGAGCGGCT CAAGACTGTC GCTGGGTCCA AGATGCAAGG CTTGCTGGAG
CGCGTGAACA 720 CGGAGATACA CTTTGTCACC AAATGTGCCT TTCAGCCCCC CCCCAGCTGT
CTTCGCTTCG 780 TCCAGACCAA CATCTCCCGC CTCCTGCAGG AGACCTCCGA GCAGCTGGTG
GCGCTGAAGC 840 CCCGACTCCT CCTGGATCAC CAACCCTG TCGCCAGAAC TTCTCCCGGT GCCTGGAGCT GCAGTGTCAG
858 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:23:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 843 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE:. SEQ ID Č:23:
GCCACTCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCCTT CCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA Gccctggatc
ACTCGCCAGA 420 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCTACGT AGAGGGCGGT
GGAGGCTCCC 480 CGGGTGAACC GTCTGGTCCA ATCTCTACTA TCAACCCGTC TCCTCCGTCT
AAAGAATCTC 5.40 ATAAATCTCC AAACATGGCT AACTGCTCTA TAATGATCGA TGAAATTATA
CATCACTTAA 600 AGAGACCACC TAACCCTTTG CTGGACCCGA ACAACCTCAA TTCTGAAGAC
ATGGATATCC 660 TGATGGAACG AAACCTTCGA ACTCCAAACC TGCTCGCATT CGTAAGGGCT
GTCAAGCACT 720 TAGAAAATGC ATCAGGTATT GAGGCAATTC TTCGTAATCT CCAACCATGT
CTGCCCTCTG 780 CCACGGCCGC' ACCCTCTCGA CATCCAATCA TCATCAAGGC AGGTGACTGG
CAAGAATTCC GGGAAAAACT GACGTTCTAT CTGGTTACCC TTGAGCAAGC GCAGGAACAA
840
CAG
843 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:24:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 858 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina • · έ»·
Š• · · · · · · · · · ·· · · · ········ jU · · · · · · · (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:24:
GCCACCCAGG 60 ACTGCTCCTT CCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CGTGAGCTGT 120 CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
ACTCGCCAGA 420 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
TACGTAGAGG 480 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC
CCGTCTCCTC 540 CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TCTCCAAACA TGGCTAACTG CTCTATAATG
ATCGATGAAA 600 TTATACATCA CTTAAAGAGA CCACCTAACC CTTTGCTGGA CCCGAACAAC
CTCAATTCTG 660 AAGACATGGA TATCCTGATG GAACGAAACC TTCGAACTCC AAACCTGCTC
GCATTCGTAA 720 GGGCTGTCAA GCACTTAGAA AATGCATCAG GTATTGAGGC AATTCTTCGT
AATCTCCAAC 780 CATGTCTGCC CTCTGCCACG GCCGCACCCT CTCGACATCC AATCATCATC
AAGGCAGGTG ACTGGCAAGA ATTCCGGGAA AAACTGACGT 840' CAAGCGCAGG AACAACAG 858 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:25: (i) POPIS SEKVENCE: (A) DÉLKA: 939 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:25: TCTATCTGGT TACCCTTGAG
GCCACTCAGG 60 ACTGCTCTTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CGTGAGCTGT 120 CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
ACTCGCCAGA 420 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
TACGTAGAGG 480 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GGTGGTTCTG GCGGCGGCTC CAACATGGCG
TCTCCGGCGC 540 CGCCTGCTTG TGACCTCCGA GTCCTCAGTA AACTGCTTCG TGACTCCCAT
GTCCTTCACA GCAGACTGAG CCAGTGCCCA GAGGTTCACC CTTTGCCTAC ACCTGTCCTG
• ·
51 • · • · · • * • · • · ·· · ·· ·· ·» • · · · · · · ♦ · • · · * ♦ · · « · · * ·' · · · · · « • · · · ·
600 CTGCCTGCTG TGGACTTTAG CTTGGGAGAA TGGAAAACCC AGATGGAGGA GACCAAGGCA
660 CAGGACATTC TGGGAGCAGT GACCCTTCTG CTGGAGGGAG TGATGGCAGC ACGGGGACAA
720 CTGGGACCCA CTTGCCTCTC ATCCCTCCTG GGGCAGCTTT CTGGACAGGT CCGTCTCCTC
780 CTTGGGGCCC TGCAGAGCCT CCTTGGAACC CAGCTTCCTC CACAGGGCAG GACCACAGCT
840 CACAAGGATC CCAATGCCAT CTTCCTGAGC TTCCAACACC TGCTCCGAGG AAAGGTGCGT .. .
900 TTCCTGATGC TTGTAGGAGG GTCCACCCTC TGCGTCAGG 939 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 26: (i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 996 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: i SEQ ID Č:26:
GCGTCCCCAG 60 CATGTCCTTC CTCCACCTGC TTGTGACCTC CGAGTCCTCA GTAAACTGCT TCGTGACTCC
ACAGCAGACT GAGCCAGTGC CCAGAGGTTC ACCCTTTGCC TACACCTGTC
120
CTGCTGCCTG CTGTGGACTT TAGCTTGGGA GAATGGAAAA CCCAGATGGA GGAGACCAAG
180 GCACAGGACA 240 TTCTGGGAGC AGTGACCCTT CTGCTGGAGG GAGTGATGGC AGCACGGGGA
CAACTGGGAC 300 CCACTTGCCT CTCATCCCTC CTGGGGCAGC TTTCTGGACA GGTCCGTCTC
CTCCTTGGGG 360 CCCTGCAGAG CCTCCTTGGA ACCCAGCTTC CTCCACAGGG CAGGACCACA
GCTCACAAGG ATCCCAATGC CATCTTCCTG AGCTTCCAAC ACCTGCTCCG AGGAAAGGTG
420 CGTTTCCTGA 480 TGCTTGTAGG AGGGTCCACC CTCTGCGTCA GGGAATTCCA TGCATACGTA
GAGGGCGGTG GAGGCTCCCC GGGTGAACCG TCTGGTCCAA TCTCTACTAT CAACCCGTCT
540
CCTCCGTCTA AAGAATCTCA TAAATCTCCA AACATGGCTA CCCAGGACTG CTCCTTCCAA
600 CACAGCCCCA TCTCCTCCGA CTTCGCTGTC AAAATCCGTG AGCTGTCTGA CTACCTGCTT
0 660 CAAGATTACC 720 CAGTCACCGT GGCCTCCAAC CTGCAGGACG AGGAGCTCTG 1 CGGGGGCCTC
o TGGCGGCTGG TCCTGGCACA GCGCTGGATG GAGCGGCTCA AGACTGTCGC TGGGTCCAAG
780 J ATGCAAGGCT 840 TGCTGGAGCG CGTGAACACG GAGATACACT TTGTCACCAA ATGTGCCTTT
CAGCCCCCCC 900 CCAGCTGTCT TCGCTTCGTC CAGACCAACA TCTCCCGCCT CCTGCAGGAG
ACCTCCGAGC 960 AGCTGGTGGC GCTGAAGCCC TGGATCACTC GCCAGAACTT CTCCCGGTGC
CTGGAGCTGC AGTGTCAGCC CGACTCCTCA ACCCTG
996 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:27:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1020 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina ·· ·· · ·· ·· ·· » · · 9 ·· · · · · · · • 9 · · · · · · · ♦ · · Λ · · · ······ • · · « · · « ··· ·» «····«· ·· ·* (C) POČET RETEZCU: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:27:
GCCACTCAGG ACTGCTCTTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC 60
CGTGAGCTGT CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG 120
GACGAGGAGC TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG. CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG 180
CTCAAGACTG TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA 240
CACTTTGTCA CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC 300
AACATCTCCC GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC 360
ACTCGCCAGA ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG 420
TACGTAGAGG GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC 480
CCGTCTCCTC CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TČTCCAAACA TGGCCCCACC ACGCCTCATC 540 .
TGTGACAGCC GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA AGGAGGCCGA GAATATCACG 600
ACGGGCTGTG CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT 660
AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC 720
CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG GGCCAGGCCC TGTTGGTCAA CTCTTCCCAG 780
CCGTGGGAGC CCCTGCAGCT GCATGTGGAT AAAGCCGTCA GTGGCCTTCG CAGCCTCACC 840
ACTCTGCTTC GGGCTCTGCG AGCCCAGAAG GAAGCCATCT CCCCTCCAGA TGCGGCCTCA 900
GCTGCTCCAC TCCGAACAAT CACTGCTGAC ACTTTCCGCA AACTCTTCCG AGTCTACTCC 960
AATTTCCTCC GGGGAAAGCT GAAGCTGTAC ACAGGGGAGG CCTGCAGGAC AGGGGACAGA 1020 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:28:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 975 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEÍEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:28:
GCCCCACCAC 60 GAGGCCGAGA GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA GGTACCTCTT GGAGGCCAAG
ATATCACGAC GGGCTGTGCT GAACACTGCA GCTTGAATGA GAATATCACT
120 GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC
180 GTAGAAGTCT 240 TTGGTCAACT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG
CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT
300 GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG GCTCTGCGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC
360 CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA
fef r
• · » * ·.
• · · • ·· · ·· • ·
·. · · »
420
CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC 480
TGCAGGACAG GGGACAGATA CGTAGAGGGC GGTGGAGGCT CCCCGGGTGG TGGTTCTGGC 540
GGCGGCTCCA ACATGGCCAC TCAGGACTGC TCTTTTCAAC ACAGCCCCAT CTCCTCCGAC 600
TTCGCTGTCA AAATCCGTGA GCTGTCTGAC TACCTGCTTC AAGATTACCC AGTCACCGTG 660
GCCTCCAACC TGCAGGACGA GGAGCTCTGC GGGGGCCTCT GGCGGCTGGT CCTGGCACAG 720
CGCTGGATGG AGCGGCTCAA GACTGTCGCT GGGTCCAAGA TGCAAGGCTT GCTGGAGCGC 780
GTGAACACGG AGATACACTT TGTCACCAAA TGTGCCTTTC AGCCCCCCCC CAGCTGTCTT 840
CGCTTCGTCC AGACCAACAT CTCCCGCCTC CTGCAGGAGA CCTCCGAGCA GCTGGTGGCG 900
CTGAAGCCCT GGATCACTCG CCAGAACTTC TCCCGGTGCC TGGAGCTGCA GTGTCAGCCC 960 ·
GACTCCTCAA CCCTG
975 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:29:
(1) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 28 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:29:
GTAGTCCATG GCCACCCAGG ACTGCTCC (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:30:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 31 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ:. jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:30:
GCATTACGTA GGGCTGACAC TGCAGCTCCA G 31 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:31:
(1) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 31 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:31:
GCATTACGTA CAGGGTTGAG GAGTCGGGCT G 31 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:32:
SČ jí
54.
3
3 >
30 3
3
3
3 >
Ϊ > 5 1 3 ΐ 3 »
> 3‘ e 33 3 3 ti 3 3
J
O *
3 3 ► »3
3 a 3
Ti
Φ » 3 ť>
(1) POPIS SEKVENCE: ' .
(A) DÉLKA: 4 4 párů baží . . .«, (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová . m,;r Li · , , (D) TOPOLOGIE: lineární '·.
' '.· . ·.;··.·?. řr, (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:32: C5 ,
CCTGCAGGAC AGGGGACAGA TACGTAGAGG GCGGTGGAGG CTCC
... __________ ________ .... . - .
(2) INFORMACE'PRO SEQ ID Č:33: > n-TVis (1) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 48 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA ' X.« b < : : Lv·.: I y (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID C:33: 11
-. -.3Γ ' ; í-u A.·
CCGGGGAGCC TCCACCGCCC TCTACGTATC TGTCCCCTGT CCTGCAGG :
8 .;· (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:34:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 266 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 34:
Zf
Ala 1 Asn ' Cys Ser Ile 5 Met Ile Asp Glu Ile 10 Ile His His Leu Lys 15 Arg
Pro Pro Ala Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Asp Glu Asp Val
20 25 30
Ser Ile Leu Met Asp Arg Asn Leu Arg Leu Pro Asn Leu Glu Ser Phe
35 40 45
Val Arg Ala Val Lys Asn Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile
50 55 60
Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser
65 70 75 80
Arg His Pro Ile Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu
85 90 95
Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Aia Gin Glu Gin Gin
100 105 110
Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Ser Asn Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser
130 135 140
Ser Asp Phe Ala Val Lys Ile Ařg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin
145 150 155 160
Asp Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys
165 170 175
Gly Ala Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu
180 i 190
Lys Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn
195 200 205
Thr Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser
• * ·
210 215 220
Cys Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr
225 230 235 240
Ser Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe
245 250 255
Ser Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro
260 265
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:35:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 281 aminokyselinovás (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:35:
Ala Asn Cys Ser Ile Met Ile Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg
1 5 10 15
Pro Pro Ala Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Asp Glu Asp Val
20 25 30
Ser Ile Leu Met Asp Arg Asn Leu Arg Leu Pro Asn Leu Glu Ser Phe
35 40 45
Val Arg Ala Val Lys Asn Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile
50 55 60
Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr. Ala Ala Pro Ser
65 70 75 80
Arg His Pro Ile Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu
85 90 95
Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
100 105 110
Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile
115 120 125
Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro
130 135 140
Asn Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser
145 150 155 160
Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp
165 170 175
Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly
180 185 190
Ala Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys
195 200 205
Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr
210 215 220
Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys
225 230 235 240
Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser
2.4 5 250 255
Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser
260 265 270
Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro
275 280
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:36:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 271 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný • · • · * « · 4 (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 36:
Ala Asn Cys Ser Ile Met Ile Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg
1 5 10 15
Pro Pro Ala Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Asp Glu Asp Val
20 25 30
Ser Ile Leu Met Asp Arg Asn Leu Arg Leu Pro Asn Leu Glu Ser Phe
35 40 45
Val Arg Ala Val Lys Asn Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile
50 55 60
Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser
65 70 75 80
Arg His Pro Ile Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu
85 90 95
Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
100 105 110
Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Ser Asn Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser
130 135 140
Ser Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin
145 150 155 160
Asp Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys
165 170 175
Gly Ala Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu
180 185 190
Lys Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn
195 200 205
Thr Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser
210 215 220
Cys Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr
225 230 235 240
Ser Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe
245 250 255
Ser Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
260 265 270 (2) INFORMACE PRO SEQ· ID Č:37:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 286 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová
(C) POČET ŘEŤEZCÓ: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE : lineární
(u: ) TYP MOLEKULY: žádný
(xi: ) POPIS SEKVENCE : SEQ ID Č:37:
Ala Asn Cys Ser Ile Met Ile Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg
1 5 10 15
Pro Pro Ala Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Asp Glu Asp Val
20 25 30
Ser Ile Leu Met Asp Arg Asn Leu Arg Leu Pro Asn Leu Glu Ser Phe
35 40 45
Val Arg Ala Val Lys Asn Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile
50 55 60
Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser
65 70 75 80
Arg His Pro Ile Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu
85 90 95
Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
100 105 110
Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile
115 120 125 ffcv ř
Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro
130 135 140
Asn Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser
145 150 155 160
Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp
165 170 175
Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly
180 185 190
Ala Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys
195 200 205
Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr
210 215 220
Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys
225 230 235 240
Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser
245 250 255
Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser
260 265 270
Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
275 280 285
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:38:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 349 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii: ) TYP MOLEKULY: : žádný
(xí: ) POPIS SEKVENCE : SEQ ID Č:38:
Ala Thr Pro Leu Gly Pro Ala Ser Ser Leu Pro Gin Ser Phe Leu Leu
1 5 10 15
Lys Ser Leu Glu Gin Val Arg Lys Ile Gin Gly Asp Gly Ala Ala Leu
20 25 30
Gin Glu Lys Leu Cys Ala Thr Tyr Lys Leu Cys His Pro Glu Glu Leu
35 40 45
Val Leu Leu Gly His Ser Leu Gly Ile Pro Trp Ala Pro Leu Ser Ser
50 55 60
Cys Pro Ser Gin Ala Leu Gin Leu Ala Gly Cys Leu Ser Gin Leu His
65 70 75 80
Ser Gly Leu Phe Leu Tyr Gin Gly Leu Leu Gin Ala Leu Glu Gly Ile
85 90 95
Ser Pro Glu Leu Gly Pro Thr Leu Asp Thr Leu Gin Leu Asp Val Ala
100 105 110
Asp Phe Ala Thr Thr Ile Trp Gin Gin Met Glu Glu Leu Gly Met Ala
115 120 125
Pro Ala Leu Gin Pro Thr Gin Gly Ala Met Pro Ala Phe Ala Ser Ala
130 135 140
Phe Gin Arg Arg Ala Gly Gly Val Leu Val Ala Ser His Leu Gin Ser
145 150 155 160
Phe Leu Glu Val Ser Tyr Arg Val Leu Arg His Leu Ala Gin Pro Tyr
165 170 175
Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser
180 185 190
Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn
195 200 205
Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp
210 215 220
Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr
225 230 235 240
Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly
245 250 255
·· ·· ·· • · · · ♦· • · · · · • · · · · · · ·
Leu Val Ile Trp Ala His 290 Arg Leu 260 Gly Ser Val Lys Thr Leu Met Lys Ala Gin Arg Trp Met 265 Leu Leu Glu Glu Arg Leu Lys Thr Glu Leu
Arg Val 285 270 Asn Thr
Gin Cys 295 Gly 280 Ala
275 Phe Val Phe Gin Pro
Pro 300 Pro Ser Cys
Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu
305 310 315 320
Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg
325 330 335
Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
340 345
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Čt 39:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 314 aminokyseliny
(B) TYP: aminokyselinová
(C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE : lineární
(ii) i TYP MOLEKULY: žádný
(xi; i POPIS SEKVENCE : SEQ ID Č:39:
Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe
1 5 10 15
Ala Val Lys-Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 s 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn
145 150 155 160
Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Thr
165 170 175
Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe Ala Val
180 185 190
Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro Val Thr
195 200 205
Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu Trp Arg
210 215 220
Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val Ala Gly
225 230 235 240
Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile His Phe
245 250 255
Vai Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg Phe Val
2 60 265 270
Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser. Glu Gin Leu Val
275 280 285
Ala Leu Lys Pro. Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys Leu Glu
290 295 300
Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
305 310
• · · · · • · ··· ··# (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:40:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 349 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:40:
Ala 1 Thr Gin Asp Cys 5 Ser Phe Gin His Ser 10 Pro Ile Ser Ser Asp 15 Phe
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cvs J Ala Phe Gin Pzro Pro Pro Ser Cys Leu A.rg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn
145 150 155 160
Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Thr
165 170 175
Pro Leu Gly Pro Ala Ser Ser Leu Pro Gin Ser Phe Leu Leu Lys Cys
180 185 190
Leu Glu Gin Val Arg Lys Ile Gin Gly Asp Gly Ala Ala Leu Gin Glu
195 200 205
Lys Leu Cys Ala Thr Tyr Lys Leu Cys His Pro Glu Glu Leu Val Leu
210 215 220
Leu Gly His Ser Leu Gly Ile Pro Trp Ala Pro Leu Ser Ser Cys Pro
225 230 235 240
Ser Gin Ala Leu Gin Leu Ala Gly Cys Leu Ser Gin Leu His Ser Gly
245 250 255
Leu Phe Leu Tyr Gin Gly Leu Leu Gin Ala Leu Glu Gly Ile Ser Pro
260 265 270
Glu Leu Gly Pro Thr Leu Asp Thr Leu Gin Leu Asp Val Ala Asp Phe
275 280 285
Ala Thr · Thr Ile Trp Gin Gin Met Glu Glu Leu Gly Met Ala Pro Ala
290 295 300
Leu Gin Pro Thr Gin Gly Ala Met Pro Ala Phe Ala Ser Ala Phe Gin
305 310 315 320
Arg Arg Ala Gly Gly Val Leu Val Ala Ser His Leu Gin Ser Phe Leu
325 330 335
Glu Val Ser Tyr Arg Val Leu Arg His Leu Ala Gin Pro
340 345
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:41:
‘T, i (i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 334 aminokyselin
Γ $
II, ··· · ·· ·« • · ·> * • · (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:41:
Ala 1 Thr Gin Asp Cys 5 Ser Phe Gin His Ser 10 Pro Ile Ser Ser Asp 15 Phe
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp· ?Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
'50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leů Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
85 ’ 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 1 ΟΛ X 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Asn Met Ala
145 150 155 160
Thr Pro Leu Gly Pro Ala Ser Ser Leu Pro Gin Ser Phe Leu Leu Lys
165 170 175
Ser Leu Glu Gin Val Arg Lys Ile Gin Gly Asp Gly Ala Ala Leu Gin
180 185 190
Glu Lys Leu Cys Ala Thr Tyr Lys Leu Cys His Pro Glu Glu Leu Val
195 200 205
Leu Leu Gly His Ser Leu Gly Ile Pro Trp Ala Pro Leu Ser Ser Cys
210 215 220
Pro Ser Gin Ala Leu Gin Leu Ala Gly Cys Leu Ser Gin Leu His Ser
225 230 235 240
Gly Leu Phe Leu Tyr Gin Gly Leu Leu Gin Ala Leu Glu Gly Ile Ser
245 250 255
pro Glu Leu Gly Pro Thr Leu Asp Thr Leu Gin Leu Asp Val Ala Asp
260 265 270
Phe Ala Thr Thr Ile Trp Gin Gin Met Glu Glu Leu Gly Met Ala Pro
275 280 285
Ala Leu Gin Pro Thr Gin Gly Ala Met Pro Ala Phe Ala Ser Ala Phe
290 295 300
Gin Arg Arg Ala Gly Gly Val Leu Val Ala Ser His Leu Gin Ser Phe
305 310 315 320
Leu Glu Val Ser Tyr Arg Val Leu Arg His Leu Aia Gin Pro
325 330
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:42:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 281 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE:'SEQ ID Č:42:
Ala Asn Cys Ser Ile Met Ile Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg ··
·· ·· * · « · • · · ·
1 5 10 15
Pro Pro Asn Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Ser Glu Asp Met
20 25 30
Asp Ile Leu Met Glu Arg Asn Leu Arg Thr Pro Asn Leu Leu Ala Phe
35 40 45
Val Arg Ala Val Lys His Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile
50 55 60
Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser
65 70 75 80
Arg His Pro Ile. Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu
85 90 95
Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
100 105 110
Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile
115 120 125
Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro
130 135 140
Asn Met. Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser
145 150 155 160
Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp
165 170 175
Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly
180 185 190
Gly Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys
195 200 205
Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly : Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr
210 215 220
Glu Ile His Phe Val Thr Lys cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys
225 230 235 240
Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser
245 250 255
Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser
260 265 270
Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro
275 280
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:43:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 286 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:43:
Ala Asn Cys Ser Ile Met Ile Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg
1 5 10 15
Pro Pro Asn Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Ser Glu Asp Met
20 25 30
Asp Ile Leu Met Glu Arg Asn Leu Arg Thr Pro Asn Leu Leu Ala Phe
35 40 45
Val Arg Ala Val Lys His Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile
50 55 60
Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser
65 70 75 80
Arg His Pro Ile Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu
85 , 90 95
Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
100 105 110
Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile
115 120 125
Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro
130 135 140
·* ·· » · · « ♦ · « ···· ·· ·* ·· » · · 1
I · · <
··♦ ··« • <
·* «·
Asn Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser
.145 150 155 160
Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp
165 170 175
Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly
180 185 190
Gly Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys
195 200 205
Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr
210 215 220
Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys
225 230 235 240
Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser
245 250 255
Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser
260 265 270
Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
275 280 285
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:44:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 281 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:44:
Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe
1 5 10 1.5
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro
130 135 140
Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser
145 150 155 160
Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Asn Cys Ser Ile Met Ile
165 170 175
Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg Pro Pro Asn Pro Leu Leu Asp
180 185 190
Pro Asn Asn Leu Asn Ser Glu Asp Met Asp Ile Leu Met Glu Arg Asn
195 200 205
Leu Arg Thr Pro Asn Leu Leu Ala Phe Val Arg Ala Val . Lys His Leu
210 215 220
Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile Leu Arg Asn Leu Gin Pro Cys
225 230 235 240
Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser Arg His Pro Ile Ile Ile Lys
245 250 255
Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu Lys Leu Thr Phe Tyr Leu Val
260 265 270
Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
k· r
·« • · « ···· ·· • · • · • · ·
«* * ·· ·· ·· ·· « · · · · · • · · · · · • « « ··· ··· • · · · ··· ··<€ ·· ·.· 'P
J
275 280 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 45:
(i) POPIS SEKVENCE:
(Á) DÉLKA: 286 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 45:
Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe
1 5 10 15
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr T.vq ***. j ~ Ρνς '-'J — Ala Phe Gin Pro Pro' Pro Ser Cys Leu Arg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn
145 150 155 160
Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Asn
165 170 175
Cys Ser Ile Met Ile Asp Glu Ile Ile His His Leu Lys Arg Pro Pro
180 185 190
Asn Pro Leu Leu Asp Pro Asn Asn Leu Asn Ser Glu Asp Met Asp Ile
195 200 205
Leu Met Glu Arg Asn Leu Arg Thr Pro Asn Leu Leu Ala Phe Val Arg
210 215 220
Ala Val Lys His Leu Glu Asn Ala Ser Gly Ile Glu Ala Ile Leu Arg
225 230 235 240
Asn Leu Gin Pro Cys Leu Pro Ser Ala Thr Ala Ala Pro Ser Arg His
245 250 255
Pro Ile Ile Ile Lys Ala Gly Asp Trp Gin Glu Phe Arg Glu Lys Leu
260 265 270
Thr Phe Tyr Leu Val Thr Leu Glu Gin Ala Gin Glu Gin Gin
275 280 285
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:46:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 313 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:46:
Ala 1 Thr Gin Asp Cys 5 Ser Phe Gin His Ser 10 Pro Ile Ser Ser Asp 15 Phe
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
• ·
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Asn Met Ala
145 150 155 160
Ser Pro Ala Pro Pro Ala Cys Asp Leu Arg Val Leu Ser Lys Leu Leu
165 170 175
Arg Asp Ser His Val Leu His Ser Arg Leu Ser Gin Cys Pro Glu Val
180 185 190
His Pro Leu Pro Thr Pro Val Leu Leu Pro Ala Val Asp Phe Ser Leu
195 200 205
Gly Glu Trp Lys Thr Gin Met Glu Glu Thr Lys Ala Gin Asp Ile Leu
210 215 220
Gly Ala Val Thr Leu Leu Leu Glu Gly Val Met Ala Ala Arg Gly Gin
225 230 235 240
Leu Gly Pro Thr Cys Leu Ser Ser Leu Leu Gly Gin Leu Ser Gly Gin
245 250 255
Val Arg Leu Leu Leu Gly Ala Leu Gin Ser Leu Leu Gly Thr Gin Leu
260 265 270
Pro Pro Gin Gly Arg Thr Thr Ala His Lys Asp Pro Asn Ala Ile Phe
275 280 285
Leu Ser Phe Gin His Leu Leu Arg Gly Lys Val Arg Phe Leu Met Leu
290 295 300
Val Gly Gly Ser Thr Leu Cys Val Arg
305 310
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:47:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: : 332 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselinová
(C) POČET RETEZCU: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) TYP MOLEKULY: žádný
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:47:
Ala Ser. Pro Ala Pro Pro Ala Cys Asp Leu Arg Val Leu Ser Lys Leu
1 5 10 15
Leu Arg Asp Ser His Val Leu His Ser Arg Leu Ser Gin Cys Pro Glu
20 25 30
Val His Pro Leu Pro Thr Pro Val Leu Leu Pro Ala Val Asp Phe Ser
35 40 45
Leu Gly Glu Trp Lys Thr Gin Met Glu Glu Thr Lys Ala Gin Asp Ile
50 55 60
Leu Gly Ala Val Thr Leu Leu Leu Glu Gly Val Met Ala Ala Arg Gly
65 70 75 80
Gin Leu Gly Pro Thr Cys Leu Ser Ser Leu Leu Gly Gin Leu Ser Gly
85 90 95
Gin Val Arg Leu Leu Leu Gly Ala Leu Gin Ser Leu Leu Gly Thr Gin
100 105 110
Leu Pro Pro Gin Gly Arg Thr Thr Ala His Lys Asp Pro Asn Ala Ile
115 120 125
Phe Leu Ser Phe Gin His Leu Leu Arg Gly Lys Val Arg Phe Leu Met
130 135 140
Leu Val Gly Gly Ser Thr Leu Cys Val Arg Glu Phe His Ala Tyr Val
145 150 155 160
Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr
165 170 175
Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met
180 185 190
Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe
195 200 205
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
210 215 220
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Giy Gly Leu
225 230 235 240
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
245 250 255
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
260 265 270
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
275 280 285
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
290 OQR 300
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
305 310 315 320
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu
325 330 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:48:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 340 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová.
(C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE : lineární
(ii: ) TYP MOLEKULY: žádný
(xí: ) POPIS SEKVENCE : SEQ ID Č:48:
Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe
1 5 10 15
Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro
20 25 30
Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu
35 40 45
Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val
50 55 60
Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile
65 70 75 80
His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg
85 90 95
Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin
100 105 110
Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys
115 120 125
Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro Asp Ser Ser Thr Leu Tyr Val Glu Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn
145 150 155 160
Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Pro
165 170 175
Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu
180 185 190
i
Q i;
fe.
Ala Lys Glu 195 Ala Glu Asn Ile Thr 200
Leu Asn 210 Glu Asn Ile Thr Val 215 Pro
Trp 225 Lys Arg Met Glu Val 230 Gly Gin
Leu Ala Leu Leu Ser 245 Glu Ala Val
Asn Ser Ser Gin 260 Pro Trp Glu Pro
Val Ser Gly. 275 Leu Arg Ser Leu Thr 280
Gin Lys 290 Glu Ala Ile Ser Pro 295 Pro
Arg 305 Thr Ile Thr Ala Asp 310 Thr Phe
Asn Thr Phe Gly Leu Asp Arg Arg 340 Gly 325 Lys Leu Lys
Thr Gly Cys Ala Glu 205 His Cys Ser
Asp Thr Lys Val 220 Asn Phe Tyr Ala
Gin Ala Val 235 Glu Val Trp Gin Gly 240
Leu Arg 250 Gly Gin Ala Leu Leu 255 Val
Leu 2 65 Gin Leu His Val Asp 270 Lys Ala
Thr Leu Leu Arg Ala 285 Leu Arg Ala
Asp Ala Ala Ser 300 Ala Ala Pro Leu
Arg Lys Leu 315 Phe Arg Val Tyr Ser 320
Leu Tyr 330 Thr Gly Glu Ala Cys 335 Arg
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 49:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 325 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ:. jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:49:
Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu
1 5 10 15
Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His
20 25 30
Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe
35 40 45
Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu val Trp
50 55 60
Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu
65 70 75 80
Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp
85 90 95
Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
100 105 110
Arg Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
115 120 125
Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val
130 135 140
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
145 150 155 160
Cys Arg Thr Gly Asp Arg Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly
165 170 175
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Asn Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe
180 185 190
Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu
195 200 205
Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu
210 215 220
Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin
225 230 235 240
Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly
245 250 255
Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala
k i• · · · • · ·
67 9 9 9 9999 ·· • · · • • 9 9 9
260 265 270
Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser
275 280 • 285
Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp
290 295 300
Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro
305 310 315 320
Asp Ser Ser Thr Leu
• · · · » · · · » » · · • ·· · 9 9 • · e ♦ · ·
325 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:50:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1032 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární ‘Λ
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:50:
GCTACACCAT 60 CAAGTGAGAA 120 TGGGCCCTGC CAGCTCCCTG CCCCAGAGCT TCCTGCTCAA GTCTTTAGAG
AGATCCAGGG CGATGGCGCA GCGCTCCAGG AGAAGCTGTG TGCCACCTAC
AAGCTGTGCC 180 ACCCCGAGGA GCTGGTGCTG CTCGGACAC-T CTC-TGGGCAT CCCCTGGGCT
CCCCTGAGCT 240 CCTGCCCCAG CCAGGCCCTG CAGCTGGCAG GCTGCTTGAG CCAACTCCAT
AGCGGCCTTT 300 TCCTCTACCA GGGGCTCCTG CAGGCCCTGG AAGGGATATC CCCCGAGTTG
GGTCCCACCT 360 TGGACACACT GCAGCTGGAC GTCGCCGACT TTGCCACCAC CATCTGGCAG
CAGATGGAAG 420 AACTGGGAAT GGCCCCTGCC CTGCAGCCCA CCCAGGGTGC CATGCCGGCC
TTCGCCTCTG 480 CTTTCCAGCG CCGGGCAGGA GGGGTCCTGG TTGCTAGCCA TCTGCAGAGC
TTCCTGGAGG 540 TGTCGTACCG CGTTCTACGC CACCTTGCGC AGCCCTACGT AGAGGGCGGT
GGAGGCTCCC 600 CGGGTGAACC GTCTGGTCCA ATCTCTACTA TCAACCCGTC TCCTCCGTCT
AAAGAATCTC 660 ATAAATCTCC AAACATGGCC ACCCAGGACT GCTCCTTCCA ACACAGCCCC
ATCTCCTCCG 720 ACTTCGCTGT CAAAATCCGT GAGCTGTCTG ACTACCTGCT TCAAGATTAC
CCAGTCACCG 780 TGGCCTCCAA CCTGCAGGAC GAGGAGCTCT GCGGGGGCCT CTGGCGGCTG
GTCCTGGCAC 84 0 AGCGCTGGAT GGAGCGGCTC AAGACTGTCG CTGGGTCCAA GATGCAAGGC
ŤTGCTGGAGC 900 GCGTGAACAC GGAGATACAC TTTGTCACCA AATGTGCCTT TCAGCCCCCC
CCCAGCTGTC 960 TTCGCTTCGT CCAGACCAAC ATCTCCCGCC TCCTGCAGGA GACCTCCGAG
CAGCTGGTGG 1020 CGCTGAAGCC CTGGATCACT CGCCAGAACT TCTCCCGGTG CCTGGAGCTG
CAGTGTCAGCCC
1032 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:51:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1005 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:51 • · • ·
68 • · · • · · « · · · • ·
ATGGCCACTC 60 AGGACTGCTC TTTTCAACAC AGCCCCATCT CCTCCGACTT CGCTGTCAAA
ATCCGTGAGC 120 TGTCTGACTA CCTGCTTCAA GATTACCCAG TCACCGTGGC CTCCAACCTG
CAGGACGAGG 180 AGCTCTGCGG GGGCCTCTGG CGGCTGGTCC TGGCACAGCG CTGGATGGAG
CGGCTCAAGA 240 CTGTCGCTGG GTCCAAGATG CAAGGCTTGC TGGAGCGCGT GAACACGGAG
ATACACTTTG 300 TCACCAAATG TGCCTTTCAG CCCCCCCCCA GCTGTCTTCG CTTCGTCCAG
ACCAACATCT 360 CCCGCCTCCT GCAGGAGACC TCCGAGCAGC TGGTGGCGCT GAAGCCCTGG
ATCACTCGCC 420 AGAACTTCTC CCGGTGCCTG GAGCTGCAGT GTCAGCCCGA CTCCTCAACC
CTGTACGTAG 480 AGGGCGGTGG AGGCTCCCCG GGTGGTGGTT CTGGCGGCGG CTCCAACATG
GCTACACCAT 540 TGGGCCCTGC CAGCTCCCTG CCCCAGAGCT TCCTGCTCAA GTCTTTAGAG
CAAGTGAGAA 600 AGATCČAGGG CGATGGCGCA GCGCTCCAGG AGAAGCTGTG TGCCACCTAC
AAGCTGTGCC 660 ACCCCGAGGA GCTGGTGCTG CTCGGACACT CTCTGGGCAT CCCCTGGGCT
CCCCTGAGCT 720 CCTGCCCCAG CCAGGCCCTG CAGCTGGCAG GCTGCTTGAG CCAACTCCAT
AGCGGCCTTT 780 TCCTCTACCA GGGGCTCCTG CAGGCCCTGG AAGGGATATC CCCCGAGTTG
GGTCCCACCT 840 TGGACACACT GCAGCTGGAC GTCGCCGACT TTGCCACCAC CATCTGGCAG
CAGATGGAAG 900 AACTGGGAAT GGCCCCTGCC CTGCAGCCCA CCCAGGGTGC CATGCCGGCC
TTCGCCTCTG CTTTCCAGCG 960 TTCCTGGAGG TGTCGTACCG 1005 (2) INFORMACE PRO SEQ (i) POPIS SEKVENCE: CCGGGCAGGA CGTTCTACGC ID Č:52: GGGGTCCTGG CACCTTGCGC TTGCTAGCCA AGCCG TCTGCAGAGC
(A) DÉLKA: 420 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi)POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:52:
GCCACTCAGG ACTGCTCTTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC 60
CGTGAGCTGT CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG 120
GACGAGGAGC TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG 180
CTCAAGACTG TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA 240
CACTTTGTCA CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC 300
AACATCTCCC GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC 360
ACTCGCCAGA ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG 420 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 53:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 405 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina ·· ·· • · 4 • · 4 (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:53:
GCCACCCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCCTT CCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGC GCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 ' CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
P AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
i ACTCGCCAGA 405 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCC
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:54:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 420 párů baží (B) TYP: nukleová kyselině (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:54:
GCCACCCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCCTT CCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG. CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
ACTCGCCAGA ACTTCTCCCG 420 (2) INFORMACE PRO SEQ GTGCCTGGAG ID Č:55: CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 420 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:55:
GCCACTCAGG 60 CGTGAGCTGT ACTGCTCTTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
120 GACGAGGAGC TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
180 CTCAAGACTG TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
240 CACTTTGTCA CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
300 AACATCTCCC GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
• · • *
360
ACTCGCCAGA ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG ř. 420
ú. (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:56:
t
e;
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 942 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: . lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:56:
GCCACTCAGG 60 CGTGAGCTGT ACTGCTCTTT TCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
120
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240 TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300- CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
ACTCGCCAGA ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
420 TACGTAGAGG 480 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC
CCGTCTCCTC 540 CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TCTCCAAACA TGGCTACCCA GGACTGCTCC
TTCCAACACA GCCCCATCTC CTCCGACTTC GCTGTCAAAA TCCGTGAGCT GTCTGACTAC
600 -
CTGCTTCAAG ATTACCCAGT CACCGTGGCC TCCAACCTGC AGGACGAGGA GCTCTGCGGG
660 GGCCTCTGGC 720 GGCTGGTCCT GGCACAGCGC TGGATGGAGC GGCTCAAGAC TGTCGCTGGG
TCCAAGATGC AAGGCTTGCT GGAGCGCGTG AACACGGAGA TACACTTTGT CACCAAATGT
780 GCCTTTCAGC 840 CCCCCCCCAG CTGTCTTCGC TTCGTCCAGA CCAACATCTC CCGCCTCCTG
CAGGAGACCT CCGAGCAGCT GGTGGCGCTG AAGCCCTGGA TCACTCGCCA GAACTTCTCC
900 CGGTGCCTGG AGCTGCAGTG TCAGCCCGAC TCCTCAACCC TG
942 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:57:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1003 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:57:
GGCCACTCAG GACTGCTCTT TTCAACACAG CCCCATCTCC TCCGACTTCG CTGTCAAAAT 60
CCGTGAGCTG TCTGACTACC TGCTTCAAGA TTACCCAGTC ACCGTGGCCT CCAACCTGCA 120
GGACGAGGAG CTCTGCGGGG GCCTCTGGCG GCTGGTCCTG GCACAGCGCT GGATGGAGCG 180
GCTCAAGACT 240 GTCGCTGGGT CCAAGATGCA AGGCTTGCTG GAGCGCGTGA ACACGGAGAT
ACACTTTGTC 300 ACCAAATGTG CCTTTCAGCC CCCCCCCAGC TGTCTTCGCT TCGTCCAGAC
CAACATCTCC 360 CGCCTCCTGC AGGAGACCTC CGAGCAGCTG GTGGCGCTGA AGCCCTGGAT
CACTCGCCAG 420 AACTTCTCCC GGTGCCTGGA GCTGCAGTGT CAGCCCGACT CCTCAACCCT
GTACGTAGAG 480 GGCGGTGGAG GCTCCCCGGG TGGTGGTTCT GGCGGCGGCT CCAACATGGC
TACACCATTG 540 GGCCCTGCCA GCTCCCTGCC CCAGAGCTTC CTGCTCAAGT CTTTAGAGCA
AGTGAGAAAG 600 ATCCAGGGCG ATGGCGCAGC GCTCCAGGAG AAGCTGTGTG CCACCTACAA
GCTGTGCCAC 660 CCCGAGGAGC TGGTGCTGCT CGGACACTCT CTGGGCATCC CCTGGGCTCC
CCTGAGCTCC 720 TGCCCCAGCC AGGCCCTGCA GCTGGCAGGC TGCTTGAGCC AACTCCATAG
CGGCCTTTTC 780 CTCTACCAGG GGCTCCTGCA GGCCCTGGAA GGGATATCCC CCGAGTTGGG
TCCCACCTTG 840 GACACACTGC AGCTGGACGT CGCCGACTTT GCCACCACCA TCTGGCAGCA
GATGGAAGAA 900 - CTGGGAATGG CCCCTGCCCT GCAGCCCACC CAGGGTGCCA TGCCGGCCTT
CGCCTCTGCT 960 TTCCAGCGCC GGGCAGGAGG GGTCCTGGTT GC T AGCk_rt.i'G TGCAGAGCTT
CCTGGAGGTG 1003 TCGTACCGCG TTCTACGCCA CCTTGCGCAG CCG
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:58:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 858 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SĚQ ID Č:58:
GCCACCCAGG 60 CGTGAGCTGT 120 ACTGCTCCTT CCAACACAGC CCCATCTCCT CCGACTTCGC TGTCAAAATC
CTGACTACCT GCTTCAAGAT TACCCAGTCA CCGTGGCCTC CAACCTGCAG
GACGAGGAGC 180 TCTGCGGGGG CCTCTGGCGG CTGGTCCTGG CACAGCGCTG GATGGAGCGG
CTCAAGACTG 240. TCGCTGGGTC CAAGATGCAA GGCTTGCTGG AGCGCGTGAA CACGGAGATA
CACTTTGTCA 300 CCAAATGTGC CTTTCAGCCC CCCCCCAGCT GTCTTCGCTT CGTCCAGACC
AACATCTCCC 360 GCCTCCTGCA GGAGACCTCC GAGCAGCTGG TGGCGCTGAA GCCCTGGATC
ACTCGCCAGA 420 ACTTCTCCCG GTGCCTGGAG CTGCAGTGTC AGCCCGACTC CTCAACCCTG
TACGTAGAGG 480 GCGGTGGAGG CTCCCCGGGT GAACCGTCTG GTCCAATCTC TACTATCAAC
CCGTCTCCTC 540 CGTCTAAAGA ATCTCATAAA TCTCCAAACA TGGCTAACTG CTCTATAATG
ATCGATGAAA 600 TTATACATCA CTTAAAGAGA CCACCTAACC CTTTGCTGGA CCCGAACAAC
CTCAATTCTG 660 AAGACATGGA TATCCTGATG GAACGAAACC TTCGAACTCC AAACCTGCTC
GCATTCGTAA 720 GGGCTGTCAA GCACTTAGAA AATGCATCAG GTATTGAGGC AATTCTTCGT
AATCTCCAAC 780 CATGTCTGČC CTCTGCCACG GCCGCACCCT CTCGACATCC AATCATCATC
AAGGCAGGTG ACTGGCAAGA ATTCCGGGAA AAACTGACGT TCTATCTGGT TACCCTTGAG
840
CAAGCGCAGG AACAACAG
858 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:59:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 402 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C ) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:59:
ATGGCTCCAA 60 TGACTCAGAC TACTTCTCTT AAGACTTCTT GGGTTAACTG
ATCGATGAAA TTATAACACA CTTAAAGCAG CCACCTTTGC CTTTGCTGGA
120 CTCAATGGGG AAGACCAAGA CATTCTGATG GAAAATAACC TTCGAAGGCC
180 GCATTCAACA 240 GGGCTGTCAA GAGTTTACAG AATGCATCAG CAATTGAGAG
AATCTCCTGC 300 CATGTCTGCC CCTGGCCACG GCCGCACCCA CGCGACATCC
AAGGACGGTG ACTGGAATGA ATTCCGTCGT AAACTGACCT TCTATCTGAA
360 AACGCGCAGG 402 CTCAACAGAC CACTCTGTCG CTAGCGATCT TT
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č: 60:
CTCTAACATG
CTTCAACAAC
AAACCTGGAG
CATTCTTAAA
AATCCATATC
AACCTTGGAG (i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 344 aminokyseliny (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:60:
Ala Thr Pro Leu Gly Pro Ala Ser Ser Leu Pro Gin Ser Phe Leu Leu
1 5 10 15
Lys Ser Leu Glu Gin Val Arg Lys Ile Gin Gly Asp Gly Ala Ala Leu
20 25 30
Gin Glu Lys Leu Cys Ala Thr Tyr Lys Leu Cys His Pro Glu Glu Leu
35 40 45
Val Leu Leu Gly His Ser Leu Gly Ile Pro Trp Ala Pro Leu Ser Ser
50 55 60
Cys Pro Ser Gin Ala Leu Gin Leu Ala Gly Cys Leu Ser Gin Leu His
65 70 75 80
Ser Gly Leu Phe Leu Tyr Gin Gly Leu Leu Gin Ala Leu Glu Gly Ile
85 90 95
Ser Pro Glu Leu Gly Pro Thr Leu Asp Thr Leu Gin Leu Asp Val Ala
100 105 110
Asp Phe Ala Thr Thr Ile Trp Gin Gin Met Glu Glu Leu Gly Met Ala
115 120 125
Pro Ala Leu Gin Pro Thr Gin Gly Ala Met Pro Ala Phe Ala Ser Ala
130 135 140
Phe Gin Arg Arg Ala Gly Gly Val Leu Val Ala Ser His Leu Gin Ser
145 150 155 160
Phe Leu Glu Val Ser Tyr Arg Val Leu Arg His Leu Ala Gin Pro Tyr
165 170 175
Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu Pro Ser Gly Pro Ile Ser
··
9 ♦ · • · · · • · 9 9 ·
£ 180 185 190
s Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu Ser His Lys Ser Pro Asn
< 195 200 205
I Met Ala Thr Gin Asp Cys Ser Phe Gin His Ser Pro Ile Ser Ser Asp
i 210 215 220
ř Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr
225 230 235 240
Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp Glu Glu Leu Cys Gly Gly
í~-·· 245 250 255
Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr
b- 260 265 270
Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu
L· 275 280 285
Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu
* ζ-'ν 290 295 300
ΐ S Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu
í 305 310 315 320
? Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg
32.5 330 335
? Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro
340
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:61:
I (i) POPIS SEKVENCE:
L (A) DÉLKA: 133 aminokyseliny
(B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:61:
Pro 1 Met Thr Gin Thr 5 Thr Ser Leu Lys Thr 10 Ser Trp Val Asn Cys 15 Ser
Asn Met Ile Asp Glu Ile Ile Thr His Leu Lys Gin Pro Pro Leu Pro
20 25 30
Leu Leu Asp Phe Asn Asn Leu Asn Gly Glu Asp Gin Asp Ile Leu Met
35 40 45
Glu Asn Asn Leu Arg Arg Pro Asn Leu Glu Ala Phe Asn Arg Ala Val
50 55 60
Lys Ser Leu Gin Asn Ala Ser Ala Ile Glu Ser Ile Leu Lys Asn Leu
65 70- 75 80
Leu Pro Cys Leu Pro Leu Ala Thr Ala Ala Pro Thr Arg His Pro Ile
85 90 95
His Ile Lys Asp Gly Asp Trp Asn Gly Ile Phe Arg Arg Lys Leu Thr
100 105 110
Phe Tyr Leu Lys Thr Leu Glu Asn Ala Gin Ala Gin Gin Thr Thr Leu
115 120 125
Ser Leu Ala Ile Phe 130 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:62:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 287 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: žádný <k.
v /3¾
TS
74 • • ·* ·« • · · * • * * • • · • · • • •
• · • · » · ·· · • * · * « ·
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:62:
Pro Met Thr Gin Thr Thr Ser Leu Lys 1 5 Thr Ser 10 Trp Val Asn Cys 15 Ser
Asn Met Ile Asp Glu Ile Ile Thr His 20 25 Leu Lys Gin Pro Pro 30 Leu Pro
Leu Leu Asp Phe Asn Asn Leu Asn Gly 35 40 Glu Asp Gin Asp 45 Ile Leu Met
Glu Asn Asn Leu Arg Arg Pro Asn Leu 50 55 Glu Ala Phe 60 Asn Arg Ala Val
Lys Ser Leu Gin Asn Ala Ser Ala Ile 65 70 Glu Ser 75 Ile Leu Lys Asn Leu 80
Leu Pro Cys Leu Pro Leu Ala Thr Ala 85 Ala Pro 90 Thr Arg His Pro 95 Ile
His Ile Lys Asp Gly Asp Trp Asn Gly 100 105 Ile Phe Arg Arg Lys 110 Leu Thr
Phe Tyr Leu Lys Thr Leu Glu Asn Ala 115 120 Gin Ala Gin Gin 125 Thr Thr Leu
Ser Leu Ala Ile Phe Tyr Val Glu Gly 130 135 Gly Gly Gly 140 Ser Pro Gly Gly
Gly Ser Gly Gly Gly Ser Asn Met Ala 145 150 Thr Gin 155 Asp Cys Ser Phe Gin 160
His Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe Ala 165 Val Lys 170 Ile Arg Glu Leu 175 Ser
Asp Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro Val 180 185 Thr Val Ala Ser Asn 190 Leu Gin
Asp Glu Glu Leu Cys Gly Ala Leu Trp 195 200 Arg Leu Val Leu 205 Ala Gin Arg
Trp Met Glu Arg Leu Lys Thr Val Ala 210 215 Gly Ser Lys 220 Met Gin Gly Leu
Leu Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile His 225 230 Phe Val 235 Thr Lys Cys Ala Phe 240
Gin Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg Phe 245 Val Gin 250 Thr Asn Ile Ser 255 Arg
Leu Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin Leu 260 265 Val Ala Leu Lys Pro 270 Trp Ile
Thr Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys Leu 275 280 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:63: Glu Leu Gin Cys 285 Gin Pro
·’ · · • · · ·· · ··· (i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 302 aminokyselin (B) TYP: aminokyselinová
(C) POČET ŘEČEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární -
(ii) TYP MOLEKULY: žádný
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:63:
Pro Met Thr Gin Thr Thr Ser Leu Lys Thr Ser Trp Val Asn Cys Ser
1 5 10 15
Asn Met Ile Asp Glu Ile Ile Thr His Leu Lys Gin Pro Pro Leu Pro
,20 25 30
Leu Leu Asp Phe Asn Asn Leu Asn Gly Glu Asp Gin Asp Ile Leu Met
35 40 45
Glu Asn Asn Leu Arg Arg Pro Asn Leu Glu Ala Phe Asn Arg Ala Val
50 55 60
Lys Ser Leu Gin Asn Ala Ser Ala Ile Glu Ser Ile Leu Lys Asn Leu
65 . 70 75 80
Leu Pro Cys Leu Pro Leu Ala Thr Ala Ala Pro Thr Arg His Pro Ile
85 90 95
His Ile Lys Asp Gly Asp Trp Asn Gly Ile Phe Arg Arg Lys Leu Thr
100 105 110
Phe Tyr Leu Lys 115 Thr Leu Glu Asn Ala Gin Ala Gin Gin Thr Thr Leu
120 125
Ser Leu Ala Ile Phe Tyr Val Glu Gly Gly Gly Gly Ser Pro Gly Glu
130 135 140
Pro Ser Gly Pro Ile Ser Thr Ile Asn Pro Ser Pro Pro Ser Lys Glu
145 150 155 160
Ser His Lys Ser Pro Asn Met Ala Thr Glh Asp Cys Ser Phe Gin His
165 170 175
Ser Pro Ile Ser Ser Asp Phe Ala Val Lys Ile Arg Glu Leu Ser Asp
180 185 -190
Tyr Leu Leu Gin Asp Tyr Pro Val Thr Val Ala Ser Asn Leu Gin Asp
195 200 205
Glu Glu Leu Cys Gly Ala Leu Trp Arg Leu Val Leu Ala Gin Arg Trp
210 215 220
Met Glu Arg Leu Lys Thr Val Ala Gly Ser Lys Met Gin Gly Leu Leu
225 230 235 240
Glu Arg Val Asn Thr Glu Ile His Phe Val Thr Lys Cys Ala Phe Gin
245 250 255
Pro Pro Pro Ser Cys Leu Arg Phe Val Gin Thr Asn Ile Ser Arg Leu
260 265 270
Leu Gin Glu Thr Ser Glu Gin Leu Val Ala Leu Lys Pro Trp Ile Thr
275 280 285
Arg Gin Asn Phe Ser Arg Cys Leu Glu Leu Gin Cys Gin Pro
290 295 300
(2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:64:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 407 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č:64:
CCATGGCTAA CTGCTCTATA ATGATCGATG AAATTATACA TCACTTAAAG AGACCACCTG 60
CACCTTTGCT GGACCCGAAC AACCTCAATG ACGAAGACGT CTCTATCCTG ATGGATCGAA 120
ACCTTCGACT TCCAAACCTG GAGAGCTTCG TAAGGGCTGT CAAGAACTTA GAAAATGCAT 180
CAGGTATTGA GGCAATTCTT CGTAATCTCC AACCATGTCT GCCCTCTGCC ACGGCCGCAC 240
CCTCTCGACA TCCAATCATC ATCAAGGCAG GTGACTGGCA AGAATTCCGG GAAAAACTGA 300 CGTTCTATCT GGTTACCCTT GAGCAAGCGC AGGAACAACA GTACGTAGAG GGCGGTGGAG 360
GCTCCCCGGG TGGTGGTTCT GGCGGCGGCT CCAACATGTA AGGTACC
407 (2) INFORMACE PRO SEQ ID Č:65:
(i) POPIS SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 452 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) POČET ŘEŤEZCÚ: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA
• ·
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID Č: 65:
CCATGGCTAA 60 CACCTTTGCT CTGCTCTATA ATGATCGATG AAATTATACA TCACTTAAAG AGACCACCTG
GGACCCGAAC AACCTCAATG ACGAAGACGT CTCTATCCTG ATGGATCGAA
120 ACCTTCGACT TCCAAACCTG GAGAGCTTCG TAAGGGCTGT CAAGAACTTA GAAAATGCAT
180 CAGGTATTGA GGCAATTCTT CGTAATCTCC AACCATGTCT GCCCTCTGCC ACGGCCGCAC
240 CCTCTCGACA TCCAATCATC ATCAAGGCAG GTGACTGGCA AGAATTCCGG GAAAAACTGA
300 CGTTCTATCT GGTTACCCTT GAGCAAGCGC AGGAACAACA GTACGTAGAG GGCGGTGGAG
360 GCTCCCCGGG TGAACCGTCT GGTCCAATCT CTACTATCAA CCCGTCTCCT CCGTCTAAAG
420
AATCTCATAA ATCTCCAAAC ATGTAAGGTA CC

Claims (39)

1. Chimérický protein obsahující flt3 agonistů.
fe.
&
r
2. Chimérický protein obsahující polypeptid vzorce zvoleného ze skupiny vzorcůsestávající z: Ri-L- R2, R2-L- Ri, R,- R2, R2-R1, Met-Ala-Rj-L- R2, Met-Ala-R2-L- Rj, Met-Ala-Ri-R2, MetAla-Rr Ri, Met -Ri-L- R2, Met-R2-L- Ri, Met -Rr R2, Met-R2-Ri, Ala-Ri-L- R2, Ala-Rz-L- Rb Ala-Ri-Rž, Ala-Rí-Ri;
kde Ri je flt3 ligand;
R2 je hematopoietický růstový faktor a L je spojovník schopný spojovat Ri a R2.
3. Chimérický protein podle nároku 2, kde hematopoietický růstový faktor je zvolen ze skupiny sestávající se z:
GM-CSF, G-CSF, G-CSF Serl7, c-mpl ligand, M-CSF, EPO, IL-1, IL-4, IL-2, IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, IL-16, LIF, flt3 ligand, růstový faktor Bbuněk, diferenciační faktor B-buněk, diferenciační faktor eosinofilů, SCSF, SDF-1 a SCF.
4. Chimérický protein podle nároku 3, kde hematopoietický růstový faktor je zvolen ze skupiny sestávající z: G-CSF, G-CSF Ser17.
5. Chimérický protein podle nároku 4, kde hematopoietický růstový faktor je zvolen ze skupiny sestávající z:
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 9;
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 11;
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 38;
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 40; a proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 41.
6. Chimérický protein podle nároku 3, kde hematopoietický růstový faktor je GM-CSF.
7. Chimérický protein podle nároku 3, kde hematopoietický růstový faktor je EPO.
'
8. Chimérický protein podle nároku 7 vybraný ze skupiny sestávající z:
í ř
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 48; a proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 49.
9. Chimérický protein podle nároku 3, kde hematopoietický růstový faktor je flt3 ligand.
10. Chimérický protein podle nároku 9, mající sekvenci SEQ ID Č.: 39.
11. Chimérický protein podle nároku 3, kde hematopoietický růstový faktor je c-mpl ligand.
12. Chimérický protein podle nároku 11, vybraný ze skupiny sestávající z:
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 46; a proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 47.
13. Chimérický protein podle nároku 3, kde hematopoietický růstový faktor je IL-3 ligand.
14. Chimérický protein podle nároku 13 vybraný ze skupiny sestávající z:
proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 62; a proteinu majícího sekvenci SEQ ID Č.: 63.
15. Farmaceutická směs obsahující chimérické proteiny podle nároků 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, nebo 14 a farmaceuticky přijatelný nosič.
16. Farmaceutická směs obsahující chimérické proteiny podle nároků 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, nebo 14 a hematopoietický růstový faktor a farmaceuticky přijatelný nosič.
17. Farmaceutická směs podle nároku 16, kde hematopoietický růstový faktor je zvolen ze skupiny sestávající z:
GM-CSF, G-CSF, G-CSF Ser 17, c-mpl ligand, M-CSF, EPO, IL-1, IL-4, IL-2, IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, IL-16, LIF, £Lt3 ligand, růstový faktor Bbuněk, diferenciační faktor B-buněk, diferenciačm faktor eosinofilů, SCSF, SDF-1 a SCF.
18. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 1.
9 9 9
999 999
99 ·« • · 9 9
19. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 2.
20. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 3.
21. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 4.
22. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 5.
23. Molekula nukleové kyseliny podle nároku 22 zvolené ze skupiny sestávající z: DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 10;
DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 12;
DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 17;
DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 19; a
DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 20.
24. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 6.
25. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 7.
26. Molekula nukleové kyseliny podle nároku 25 zvolené ze skupiny sestávající z: DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 27; a
DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 28.
27. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 9.
28. Molekula nukleové kyseliny podle nároku 27 mající DNA sekvenci SEQ ID Č.: 18.
29. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 11.
30. Molekula nukleové kyseliny podle nároku 29 zvolené ze skupiny sestávající z: DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 25; a
DNA sekvence mající sekvenci SEQ ID Č.: 26.
·· ·· ř ί t80 • · · ·
31. Molekula nukleové kyseliny kódující chimérický protein podle nároku 13.
32. Způsob výroby chimérických proteinů zahrnující: kultivaci hostitelských buněk transferovaných nebo transformovaných replikovatelným vektorem za vhodných podmínek výživy, kde vektor obsahuje molekuly nukleových kyselin podle nároků 18,19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, nebo 31 tak, že umožňuje expresi chimérických proteinů a jejich získání.
33. Způsob zvýšení výroby hematopoietických buněk v organismu savců využívající podávání farmaceuticky účinného množství chimérického proteinu podle nároků 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11,12,13,14.
34. Způsob zvýšení výroby hematopoietických buněk v organismu savců využívající podávání farmaceuticky účinného množství směsi podle nároku 15.
35. Způsob zvýšení výroby hematopoietických buněk v organismu savců využívající podávání farmaceuticky účinného množství směsi podle nároku 16.
36. Způsob zvýšení výroby hematopoietických buněk v organismu savců využívající podávání farmaceuticky účinného množství směsi podle nároku 17.
v í1·
In
37. Způsob ex-vivo expansi kmenových buněk zahrnující následující kroky:
(a) kultivaci kmenových buněk ve zvoleném růstovém médiu obsahujícím chimérické proteiny podle nároků 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9,10,11, 12,13 a 14; a (b) sklízení kultivovaných kmenových buněk.
38. Způsob zvýšení výroby hematopoietických buněk v organismu savců využívající podávání farmaceuticky efektivního množství expandovaných kmenových buněk podle nároku 37.
39. Způsob genové terapie lidí, zahrnující kroky:
(a) odebrání kmenových buněk pacientovi, nebo dárci (b) kultivace kmenových buněk ve zvoleném růstovém médiu obsahujícím chimérické proteiny podle nároků 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11,12,13a 14; .
í 1 ·· ·· » · · ι • · 4 ·· · · ·· ·· ·· » · · · » · · · ··· .··· ·· (c) transdukce DNA do kultivovaných buněk;
(d) sklízení transdukováných buněk; a (e) transplantace transdukovaných buněk pacientovi.
CZ19993467A 1998-04-10 1998-04-10 Chimérické proteiny jako flt3 ligandy CZ346799A3 (cs)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ19993467A CZ346799A3 (cs) 1998-04-10 1998-04-10 Chimérické proteiny jako flt3 ligandy

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ19993467A CZ346799A3 (cs) 1998-04-10 1998-04-10 Chimérické proteiny jako flt3 ligandy

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ346799A3 true CZ346799A3 (cs) 2000-03-15

Family

ID=5466790

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ19993467A CZ346799A3 (cs) 1998-04-10 1998-04-10 Chimérické proteiny jako flt3 ligandy

Country Status (1)

Country Link
CZ (1) CZ346799A3 (cs)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JPH10502801A (ja) 多重変異il−3造血機能性融合タンパク質
JPH09508625A (ja) インターロイキン−3変異体とコロニー刺激因子との併用投与
CA2268023A1 (en) Circularly permuted polypeptides as novel stem cell factor receptor agonists
US6436387B1 (en) Methods of ex-vivo expansion of hematopoietic cells using multivariant IL-3 hematopoiesis chimera proteins
US6660257B1 (en) Circular permuteins of flt3 ligand
AU725547B2 (en) Multi-functional chimeric hematopoietic receptor agonists
US6730303B1 (en) Fused G-CSF and IL-3 proteins and uses thereof
KR100456212B1 (ko) 다기능성조혈수용체아고니스트
WO1997012985A9 (en) Multi-functional hematopoietic receptor agonists
US20070081979A1 (en) Multi-functional chimeric hematopoietic receptor agonists
AU751498B2 (en) flt3 ligand chimeric proteins
CA2182474A1 (en) Co-administration of interleukin-3 mutant polypeptides with csf&#39;s for multi-lineage hematopoietic cell production
AU722759B2 (en) Novel C-MPL receptor agonists
US6413509B1 (en) Methods of ex-vivo expansion of hematopoietic cells using interleukin-3 mutant polypeptides with other hematopoietic growth factors
CZ346799A3 (cs) Chimérické proteiny jako flt3 ligandy
AU703627B2 (en) Interleuken-3 (IL-3) receptor agonists
US20050059149A1 (en) Methods of ex-vivo expansion of hematopoeitic cells using multivariant IL-3 hematopoiesis chimera proteins
MXPA99003877A (en) Multi-functional chimeric hematopoietic receptor agonists

Legal Events

Date Code Title Description
PD00 Pending as of 2000-06-30 in czech republic