CZ2005428A3 - Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku - Google Patents

Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku Download PDF

Info

Publication number
CZ2005428A3
CZ2005428A3 CZ20050428A CZ2005428A CZ2005428A3 CZ 2005428 A3 CZ2005428 A3 CZ 2005428A3 CZ 20050428 A CZ20050428 A CZ 20050428A CZ 2005428 A CZ2005428 A CZ 2005428A CZ 2005428 A3 CZ2005428 A3 CZ 2005428A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
dna
translocation
composition
sperm
labeled
Prior art date
Application number
CZ20050428A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ300118B6 (cs
Inventor
Rubes@Jirí
Kubícková@Svatava
Vozdová@Miluse
Cernohorská@Halina
Original Assignee
Výzkumný ústav veterinárního lékarství, v.v.i.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Výzkumný ústav veterinárního lékarství, v.v.i. filed Critical Výzkumný ústav veterinárního lékarství, v.v.i.
Priority to CZ20050428A priority Critical patent/CZ300118B6/cs
Publication of CZ2005428A3 publication Critical patent/CZ2005428A3/cs
Publication of CZ300118B6 publication Critical patent/CZ300118B6/cs

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Resení se týká prostredku pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku, kdy jeho specifická smes fragmentu DNA detekuje ve spermiích úsek DNA specifický pro translokaci. Prostredek umoznuje presné, jednoduché a velmi rychlé stanovení kvality spermií, aby nedocházelo k prenosu nezádoucího genetického poskození na dalsí generaceskotu.

Description

Prostředek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býků
Oblast techniky
Vynález se týká prostředku pro stanovení translokace t(1;29) v chromozomech pohlavních buněk býků za použití fluorescenční in šitu hybridizace (FISH), umožňující odhalení cytogenetického poškození skotu.
Dosavadní stav techniky
U hospodářských zvířat byla popsána řada typů strukturálních a numerických poruch chromozomů, u skotu jsou nejčastější spojení v centromerách (centrické fúze), tzv. robertsonovské translokace. Jak název naznačuje, vznikají centrické fúze spojením dvou konců chromozomů za vzniku jednoho chromozomu. Nedochází k podstatné ztrátě genetického materiálu, je však redukován celkový počet chromozomů. Byla popsána řada typů centrických fúzí (souhrně viz. Fries R, Popescu P (1999) Cytogenetics and physical chromosome maps. ln: Fries R, Ruvinsky A, eds. The Genetics of Cattle. CABI, Oxon, pp 257-261). Z hlediska kontroly dědičnosti zdraví (KDZ) u skotu má význam zejména translokace t(1;29), ostatní translokace se vyskytují vzácně.
Robertsonovská translokace t(1;29) je dědičná chromozomální anomálie, vzniklá fúzí chromozomů 1 a 29. Heterozygotní zvířata přenášejí translokaci na 50 % svých potomků, a proto se může nežádoucně velmi rychle rozšířit v populaci. Tato translokace byla • · · · · · • · • 9 9 9 ·· 99·· • 9
9 9
9 99
9 9
9 9
9 9
9 9 99 popsána asi u 50 plemen skotu na celém světě. Četnost této odchylky se značně liší a je závislá na počtu vyšetřených zvířat v jednotlivých zemích. Pohybuje se nejčastěji od 0,1 do 20 %. Heterozygotní býci nositelé translokace t(1;29) jsou fenotypicky normální, sexuální chování není narušeno a jejich semeno nevykazuje kvalitativní ani kvantitativní změny. Schopnost oplození není ovlivněna. Hlavní problém vzniká u heterozygotních dcer býků - nositelů translokace. Ty produkují část nevyvážených pohlavních buněk (gamet), které dávají vznik embryím odumírajícím v počátečních stádiích vývoje, což způsobuje asi 5% redukci plodnosti (Dyrendahl, I. a Gustavsoon, I. Sexual functions, semen characteristics and fertility of bulíš carrying the 1/29 chromosome translocation. Hereditas 90: 281-289, 1979). Vzhledem k velkým ekonomickým ztrátám, které vznikají používáním býků s touto translokací v inseminaci, je v některých státech prováděna její eliminace (eradikace). V České republice jsou býčci, určeni pro plemenitbu, cytogeneticky vyšetřeni analýzou krve na základě vyhlášky č. 471/2000 Sb. O kontrole dědičnosti zdraví zvířat, kterou se provádějí některá ustanovení Zákona č. 154/2000 Sb., o šlechtění, plemenitbě a evidenci zvířat a o změně některých souvisejících zákonů (plemenářský zákon).^ Problém je, že okolo 50 % inseminačních dávek, používaných v České republice, je importováno, takže krev k vyšetření není dostupná. Kvalita semene pro inseminaci se ovšem sleduje i/dalších státech, takže se vlastně jedná o naléhavý celospolečenský problém. Aby bylo nyní možno ověřit, zda semeno je od býka, který je nositelem uvedené translokace, bylo doposud nutné čekat až na jeho první potomky, kteří pak mohli být cytogeneticky vyšetřeni a teprve potom případně vyloučeni z další plemenitby. To samozřejmě je finančně velmi nákladné, zdlouhavé a komplikované.
·· ··· · • · • · · ·
Podstata vynálezu
Uvedené nedostatky zcela odstraňuje prostředek pro chromozomální stanovení translokace t(1;29) ve spermiích býků, podle vynálezu, jehož podstata spočívá vtom, že 100 μΙ vodného roztoku prostředku obsahuje 5 až 50 mM Tris-HCI a dále 10 až 40 ng/μΙ fragmentů DNA o velikosti 100 až 500 bp, které se skládají z neznačených nukleotidů dATP, dCTP, dGTP, dTTP a fluoresceinem značeným dUTP, přičemž frekvence vloženého fluorescenčního nukleotidu je 1 značený nukleotid na 12 až 20 neznačených nukleotidů.
Prostředek podle vynálezu je dále charakterizován tak, že 100 μΙ vodného roztoku prostředku obsahuje 10 mM Tris-HCI a 20 ng/μΙ fragmentů DNA o velikosti 200 až 250 bp, které se skládají z neznačených nukleotidů dATP, dCTP, dGTP, dTTP a fluoresceinem značeným dUTP, přičemž frekvence vloženého fluorescenčního nukleotidu je 1 značený nukleotid na 15 neznačených nukleotidů.
Prostředek podle vynálezu se dále vyznačuje tím, že umožňuje přesnou detekci DNA specifickou pro chromozomální translokaci t(1 ;29), přičemž se specifická DNA nachází na translokovaném chromozomu v oblasti vymezené satelitní DNA IV a III.
Prostředek podle vynálezu umožňuje přesné a rychlé stanovení přítomnosti translokace t(1;29) vyšetřením spermií býků, přičemž vlastní provádění stanovení zahrnuje následující kroky: dekondenzaci chromatinu spermií pomocí DTT, FISH s detekční směsí a zjištění přítomnosti translokace (specifického signálu) pomocí fluorescenční mikroskopie. Prostředek podle vynálezu je založen na originálním
4444
4
4 4 4 •4 4444
4
4 4
4 4
4 4
4 4
4
4
4 4
444 zjištění původců vynálezu, že na translokovaném chromozomu t(1;29) se v oblasti ohraničené na jednom konci satelitní DNA IV a na opačném konci satelitní DNA III nachází sekvence DNA specifická pro translokaci t(1;29), která není fluorescenční in šitu hydridizací zjistitelná na normálních (netranslokovaných) chromozomech 1 a 29 ani na žádném z dalších normálních chromozomů.
Základním cílem předkládaného vynálezu bylo umožnit detekci translokace t(1;29) ve spermiích býků, protože dosavadní známé metody umožňovaly detekci této translokace pouze na chromozomech získaných kultivací z krve nebo tkání živých zvířat, což bylo zdlouhavé a často nemožné, protože býci nejsou k dispozici (např. jsou již odporaženi, chováni v zahraničí apod.). Prostředkem podle vynálezu, při kterém jsou vyšetřované spermie fixované na mikroskopickém skle a hybridizovány se specifickou fluorescenčně značenou DNA-sondou, se uvedeného cíle dosáhlo. V předkládaném vynálezu byla na translokovaném chromozomu t(1;29) původci vynálezu objevena specifická DNA charakteristická pro tuto translokaci. Ta byla využita pro konstrukci specifické DNA-sondy (činidla, detekční směsi) identifikující tuto translokaci metodou FISH. Prostředek podle vynálezu umožňuje rychlou detekci translokace t(1 ;29) v pohlavních buňkách, ale i v chromozomech a interfázních somatických buňkách skotu jakéhokoliv plemene bez ohledu na věk zvířete. FISH je hybridizace DNA buněk fixovaných na mikroskopickém podložním skle s fluorescenčně značenou komplementárním DNA (detekční směsí). Pokud se na DNA ve zkoumaném mikroskopickém preparátu nachází sekvence homologní detekční směsi DNA, je identifikována fluorescenčním signálem v místě hybridizace.
»· ···· • · • ··· • ·
Přípravu prostředku podle vynálezu lze rozdělit do několika kroků:
U savců se v krátkých nebarvitelných oblastech chromozomů (centromerách) nebo jejich blízkosti nachází tzv. satelitní DNA, která obsahuje tandemově uspořádaná opakování (repetice), ln šitu hybridizační studie u skotu prokázaly přítomnost různých satelitních DNA I až IV. Na chromozomu 1 je přítomna satelitní DNA I a III, není přítomna satelitní DNA IV. Na chromozomu 29 je přítomna satelitní DNA I a IV, není přítomna satelitní DNA III. Na translokovaném chromozomu t(1 ;29) satelitní DNA I chybí, jsou přítomny satelitní DNA III a IV. To dokumentuje skutečnost, že při vzniku translokace t(1;29) došlo k rozsáhlé chromozomální přestavbě v centromerických opakujících se (repetitivních) oblastech. Původci vynálezu bylo objeveno, že na translokovaném chromozomu t(1;29) se nachází specifická oblast, která není FISH detekovatelná na normálních chromozomech 1 ani 29, a umožňuje proto průkaz této translokace pomocí metody FISH.
Všechny molekulárně-genetické metody a operace genetické manipulace, pokud není dále původci uvedeno jinak, byly provedeny podle metody popsané v 1989 Molecular Cloning (Sambrook, J., Fritsch, E.F. a Maniatis, T., Cold Spring Haror Laboratory Press). Pokud byly použity komerční reagencie a soupravy, postupy byly provedeny podle přiložených instrukcí.
Kultivace chromozomů z krve a zpracování mikroskopických preparátů byly prováděny dle metod popsaných v Human
Chromosomes, manual of basic techniques (Ram S. Verma and Arvind
Babu, Pergamon Press, 1989).
Metody in šitu hybridizace, pokud není uvedeno jinak, byly provedeny původci podle metod popsaných v práci Trask B.J.: DNA sequence localization in metaphase and interphase celíš by fluorescence in šitu hybridization. Methods Cell Biol 35:3-35, 1991,
Prostředek podle vynálezu připravili jeho původci tak, že translokované chromozomy t(1;29) získali kultivací krve odebrané ze zvířete stranslokací t(1;29) pomocí standardní cytogenetické techniky. Jejich centomerické oblasti byly získány pomocí mikrodisekčního (mikropreparačního) zařízení (např. PALM® MicroLaser systém). Odebrané části chromozomu (20 kopií) byly centrifugací přeneseny do 20 pl 10 mM Tris-HCI, pH 8,8 a DNA byla pomnožena pomocí DOP PCR (polymerázová řetězová reakce s primery obsahujícími náhodně včleněné nukleotidy; primer je krátká sekvence DNA). Pět μΙ PCR produktu bylo analyzováno elektroforézou na 1,5% agarozovém gelu. Zbývající PCR produkt byl přečištěn od zbytků primerů a nakloňován (včleněn) do plazmidu množícím se v buňkách laboratorního kmene bakterií Escherichia coli. Rekombinantní(s včleněnou DNA) klony byly identifikovány podle bílé barvy kolonií. Přítomnost nakloňované DNA byla v rekombinantních klonech ověřena pomocí PCR.
Pozitivní klony byly vyhledány metodou DOT BLOT (tečkovou) hybridizaci na nylonovém filtru. Poté byly testovány pomocí FISH tak, že amplifikační produkty byly naznačeny v sekundární PCR přidáním 0,2 μΙ 1 mM fluorescenčního nukleotidu (Spectrum Orange-dUTP,VYSIS) do reakční směsi. Z jednotlivých naznačených amplifikačních produktů byl odebrán 1 μΙ a použit do FISH na chromozomech získaných z krve zvířete stranslokací t(1;29). Z rekombinantních plazmidů vykazujících «« · ·· ···· ·· ···· · ··· · · · · · · • · · · · · · ♦ ···
Ί ·······♦·· J *·.* ·!· *··* ί ·· ··· pozitivní FISH signál byla vyizolována DNA a byla zjištěna její sekvence. Na základě zjištěných sekvencí byly vybrány vhodné primery pro PCR. Tato dvojice primerů s označením t(1;29)S a t(1;29)A je uložena ve Sbírce patogenních mikroorganizmů, která je vedena ve Výzkumném ústavu veterinárního lékařství, ul. Hudcova 70, 612 32 Brno, Česká republika.
Prostředek podle vynálezu vykazoval specifický hybridizační signál pod centromerou t(1;29), který nebyl detekovatelný na normálních chromozomech 1 a 29 ani na žádném jiném chromozomu. Tento specifický signál, který byl viditelný v buňkách, jednoznačně prokazuje přítomnost translokace t(1;29) ve vyšetřovaném genetickém materiálu skotu.
Satelitní DNA
Pro amplifikaci různých satelitních DNA skotu byly použity primery připravené na základě informací z genové banky a literatury. Z krve zvířete bez translokace byla vyizolována DNA. Tato DNA (50 ng) byla použita do 50 pl PCR s primery vybranými pro zvolenou satelitní DNA. Část amplifikačních produktů (5μΙ) byla ověřena na 2% agarozovém gelu a 2 μΙ PCR produktu byly značeny ve 20 μΙ sekundární PCR za přidání 0,2 μΙ 1 mM fluorescenčního nukleotidu (Spectrum OrangedUTP.VYSIS). Z jednotlivých naznačených amplifikačních produktů byl odebrán 1 μΙ a použit jako DNA sonda do FISH na chromozomech získaných z krve zvířete stranslokací t(1;29) a chromozomech zvířete bez translokace. Ke stanovení vzájemné polohy satelitních různých DNA a DNA specifické pro translokaci t(1;29) na tomto chromozomu bylo použito dvoubarevné FISH, přičemž satelitní DNA byly značeny červeně
a t(1;29) specifické činidlo zeleně. Z výsledků hybridizace vyplynulo, že na translokovaném chromozomu t(1;29) chybí signál pro satelitní DNA I a další DNA leží v pořadí p-satelitní DNA IV - t(1;29)specifická DNA satelitní DNA III - q.
Dekondezace spermií
Vzorky spermií býků byly 3x promyty stejným objemem PBS (fyziologický roztok pH 7,4) obsahujícím 6 mM EDTA (etylendiamintetraoctová kyselina), resuspendovány do PBS obsahujícím 5 mM DTT (dithiothreitol) a inkubovány 20 min při teplotě 18 až 23 °C. Dekondenzované spermie byly 2x promyty PBS a fixovány ve fixativu. Pět μΙ suspenze bylo nakapáno na mikroskopické sklo a necháno uschnout při teplotě 18 až 23 °C.
ln sítu hybridizace
Jeden μΙ fluorescenčně značené DNA sondy byl přidán do hybridizačního roztoku. Mikroskopické preparáty byly denaturovány v 70% formamidu, 2xSSC (pH 7,0) při 72 °C 10 min u spermií a 2 min u chromozomů. Hybridizační roztok byl denaturován po dobu 10 min při 72 °C a nanesen na preparát pod krycí sklo. Preparáty byly hybridizovány 20 hodin při 37 °C. Po hybridizaci byla skla 2x promyta 5 min při 42 °C. Skla byla podbarvena DAPI (diamino-phenylindole dihydrochloride)) v montovacím mediu.
Pro lepší objasnění vynálezu jsou na přiložených obrázcích 1 až 5 uvedeny fotografie, které byly pořízeny při mikroskopickém sledování ·· · »· »··· ·· ···« • « · · ·· · · » · ·«· ··· · « ··· chromozomů spermatu skotu po použití prostředku podle vynálezu, aby se doložil jeho účinek.
Na obr. 1 světle zelená skvrna jasně zobrazuje průkaz translokace t(1;29) po použití specifického činidla na chromozomech zvířete s translokaci t(1;29): výrazný hybridizační signál se vyskytuje pouze na translokovaném chromozomu t(1;29).
Na obr. 2 je zobrazena detekce translokace t(1;29) po použití specifického činidla na spermiích zvířete s translokaci, kde světle červený hybridizační signál se vyskytuje asi v polovině spermií, což odpovídá statistické pravděpodobnosti výskytu této translokace ve spermiích.
Na obr. 3 je zobrazena hybridizace t(1;29) po použití specifického činidla na spermiích zvířete bez translokace t(1;29), kde se nevyskytuje žádný hybridizační signál.
Na obr. 4 je zobrazena společná hybridizace t(1;29) specifického činidla (zelený signál) a satelitní DNA III (červený signál) na chromozomech zvířete s translokaci t(1;29). Protože se obě DNA na chromozomu v tomto případě nacházejí na stejném místě, výsledkem je žlutý hybridizační signál.
Na obr. 5 je zobrazena společná hybridizace t(1;29) specifického činidla (zelený signál) a satelitní DNA IV (červený signál) na chromozomech zvířete s translokaci t(1 ;29).
• to toto·· to to • toto* • to ···
Na základě výše uvedených skutečností jasně vyplývá, že prostředek podle vynálezu umožňuje rychlé, přesné a jednoduché sledování kvality býčího spermatu s ohledem na případné genetické poškození dalších generací skotu při jeho plemenitbě.
V následujících příkladech provedení je prostředek podle vynálezu pouze podrobně doložen, aniž by byl příklady provedení jakkoliv omezován.
Příklady provedení
Příklad 1
Z krve zvířete sjiž prokázanou translokací t(1;29) je vyizolována DNA za využití běžně dostupné soupravy (např. QIAamp DNA blood mini kit QIAGEN). Z 200 pl krve se získá 100 μΙ DNA. Koncentrace izolované DNA je stanovena spektrofotometrem. Z této DNA je za využití specifických primerů t(1;29)S a t(1;29)A uložených ve Sbírce patogenních mikroorganizmů, vedené ve Výzkumném ústavu veterinárního lékařství, ul. Hudcova 70, 612 32 Brno, Česká republika, syntetizován amplifikační produkt pomocí PCR.
Na přípravu 100 μΙ prostředku podle vynálezu je použito:
μΙ 10x PCR pufr (200 mM Tris-HCI, pH 8,4, 500 mM KCI) μΙ 50 mM MgCI2 μΙ 10 mM dNTP μΙ primert(1;29)S μΙ primer t(1;29)A
100 ng DNA
U enzymu (LA polymerases mix TOP BIO), zbývající objem je doplněn vodou.
PCR probíhá za podmínek: počáteční denaturace 5 min při 95 °C, pak 30 cyklů: 1 min při 95 °C; 1 min při 56 °C; 2 min při 72 °C; závěrečné prodloužení 5 min při 72 °C.
Část připraveného amplifikačního produktu (5μΙ) je ověřena na 1% agarozovém gelu. Amplifikační produkt se přečistí pomocí soupravy (High PCR purification kit ROCHE) a spektrofotometricky je stanovena koncentrace DNA.
Značení detekčního prostředku podle vynálezu (hybridizační sondy):
500 ng přečištěné detekční směsi je denaturováno varem po dobu 5 minut s následným prudkým ochlazením na ledu po dobu 5 minut. Denaturovaná DNA v detekčním prostředku podle vynálezu je značena za použití dostupné soupravy (např. Prime-a-Gene Labeling System PROMEGA). Značící směs se připraví smícháním 500 ng denaturované DNA, 10 pl 5x značícího pufru, 2 μΙ BSA, 1,5 μΙ dATP, 1,5 μΙ dCTP, 1,5 μΙ dGTP, 0,15 μΙ dTTP, 0,4 μΙ Spectrum Green-dUTP nebo 0,4 μΙ Spectrum Red-dUTP, 2 μΙ enzymu a je doplněna vodou do objemu 50 μΙ. Značení probíhá při teplotě 26 °C po dobu 2 hodin. Značená detekční směs je přečištěna pomocí výše uvedené soupravy (např. Prime-a-Gene Labeling System PROMEGA), přičemž výsledný objem je asi 40 μΙ naznačeného detekčního prostředku podle vynálezu, které má na přiložených obrázcích 1, 4, 5 zelenou, na obr. 2 červenou barvu.
Dekondenzace spermií
Vzorek spermií (stačí 10 μΙ semene) je centrifugován 5 min. při 2000 rpm (otáčky/min). Odstředěný roztok je odstraněn a sediment 3x promyt stejným objemem PBS obsahujícím 6 mM EDTA. Odstředěný
·· • · • · • ·· • • · • · • · • · · · « • ·» • · • · ·**· •
• · • ·· ·· ·♦ ♦ ··
roztok se odstraní a sediment je rozpuštěn v 300 μΙ PBS obsahujícím 5 mM DTT a inkubován 20 min. při teplotě 18 až 23 °C. Po této dekondenzaci je vzorek zcentrifugován a sediment 2x promyt v 300 μΙ PBS a 2x ve fixačním roztoku (metanol : kyselina octová 3 : 1). Po posledním promytí je sediment rozpuštěn ve fixačním roztoku a fixovaná suspenze spermií je po 5 μΙ nakapána na mikroskopické sklo a nechána uschnout při teplotě 18 až 23 °C.
In šitu hybridizace
Jeden μΙ detekčního prostředku podle vynálezu se přidá do hybridizačního roztoku, 10 μΙ hybridizačního roztoku obsahuje 50% formamid, 2xSSC, 10% dextran sulphate a 1 μΙ vysycovací DNA (salmon sperm DNA,SIGMA). Nátěry spermií jsou denaturovány v 70% formamidu, 2xSSC (pH7,0) po dobu 10 min při 72 °C a dehydratovány ve vychlazené etanolové řadě po 2 min v 70%, 85% a 90% etanolu. Hybridizační roztok je denaturován 10 min při 72 °C a nanesen na vzorek pod krycí sklo 24x24 mm. Vzorky spermií jsou hybridizovány 20 hodin při 37 °C. Po hybridizaci se podložní skla s nátěry spermií 2x promyjí roztokem 2xSSC po dobu 5 min při 42 °C, 2x v 50% formamidu, 2xSSC 5 min při 42 °C a v2xSSC 5 min při 42 °C. Spermie jsou podbarveny pomocí flourescenčního barviva DAPI rozpuštěného v montovacím mediu (např. Vectechield, VECTOR LABORATORIES), 10 μΙ montovacího media s DAPI (0,05 pg/ml) je použito pod krycí sklo o velikosti 24x32 mm.
Vyšetření spermií
Podložní skla se spermiemi jsou vyšetřeny pomocí fluorescenčního mikroskopu s vhodnou sadou dvoupásmových fluorescenčních filtrů
DAPI/Texas Red nebo DAPI/FITC. Je detekován barevný signál ve spermiích, který se vyskytuje v přítomnosti translokace t(1;29). Protože většina pozitivních býků jsou heterozygotní nositelé, mají signál v přibližně 50-ti procentech spermií. Pro stanovení kvality spermatu stačí vyšetřit 20 až 30 spermií, neboť prostředek podle vynálezu poskytuje rychlé a přesné určení.
Průmyslová využitelnost
Prostředek podle vynálezu pro stanovení translokace t(1;29) ve spermiích býků umožňuje přesné, jednoduché a velmi rychlé sledování kvality hovězího spermatu, zamezující nežádoucí genetické poškození populace skotu v dalších generacích. Prostředek podle vynálezu je na bázi vodného roztoku Tris-HCI, fragmentů DNA o velikosti 100 až 500 bp obsahujících neznačené nukleotidy dATP, dCTP, dGTP, dTTP a fluoresceinem značený dUTP.
/fy x
00 0··0 00 0000
• 0 • 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 000
0
0
00 0 00 00 0 00 000
Seznam zkratek
bp páry bází (jednotka délky DNA)
dATP deoxyadenozin-trifosfát
dCTP deoxycytozin-trifosfát
dGTP deoxyguanozin-trifosfát
DNA kyselina deoxyribonukleová
EDTA ethylenediaminetetraacetic acid
dTTP deoxytymidin-trifosfát
dUTP deoxuridin-trifosfát
KCI chlorid draselný
MgCI2 chlorid hořečnatý
ng nanogram
SSC pufr obsahující citrát sodný a chlorid sodný
Tris-HCI trishydroxymethylaminomethan

Claims (5)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    ·· • · • · • ·· • ·« • · • · ···· • • • · • * • · ···· ··· ·· • ·· ·· ·· • ···
    1. Prostředek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býků, vyznačující se tím, že 100 μΙ vodného roztoku prostředku obsahuje 5 až 50 mM Tris-HCI a dále 10 až 40 ng/μΙ fragmentů DNA o velikosti 100 až 500 bp, které se skládají z neznačených nukleotidů dATP, dCTP, dGTP, dTTP a fluoresceinem značeným dUTP, přičemž frekvence vloženého fluorescenčního nukleotidu je 1 značený nukleotid na 12 až 20 neznačených nukleotidů.
  2. 2. Prostředek podle nároku 1, vyznačující se tím, že 100 μΙ vodného roztoku prostředku obsahuje 10 mM tris-HCI a 20 ng/μΙ fragmentů DNA o velikosti 200 až 250 bp, které se skládají z neznačených nukleotidů dATP, dCTP, dGTP, dTTP a fluoresceinem značeným dUTP, přičemž frekvence vloženého fluorescenčního nukleotidu je 1 značený nukleotid na 15 neznačených nukleotidů.
  3. 3. Prostředek podle nároku 1 se vyznačuje tím , že přesně detekuje DNA specifickou pro chromozomální translokaci t(1;29), přičemž se specifická DNA nachází na translokovaném chromozomu v oblasti vymezené satelitní DNA IV a III.
    ·· 9 99 8889 88 9999
  4. 8 9 99 8 9 8 9 8 9
  5. 9 9 9 8 9 9 9 8 898
    99 999 99 9 99 888
CZ20050428A 2005-07-01 2005-07-01 Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku CZ300118B6 (cs)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20050428A CZ300118B6 (cs) 2005-07-01 2005-07-01 Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20050428A CZ300118B6 (cs) 2005-07-01 2005-07-01 Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ2005428A3 true CZ2005428A3 (cs) 2007-02-07
CZ300118B6 CZ300118B6 (cs) 2009-02-11

Family

ID=37719081

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20050428A CZ300118B6 (cs) 2005-07-01 2005-07-01 Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku

Country Status (1)

Country Link
CZ (1) CZ300118B6 (cs)

Also Published As

Publication number Publication date
CZ300118B6 (cs) 2009-02-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2593021B2 (ja) ウシ胚の性の識別方法
US20240209422A1 (en) Hybridization compositions and methods using formamide
Bauer et al. Protamine mRNA as molecular marker for spermatozoa in semen stains
US9624542B2 (en) Telomere length measurement in formalin-fixed, paraffin embedded (FFPE) samples by quantitative PCR
Zhu et al. Identification of genome organization in the unusual allotetraploid form of Carassius auratus gibelio
US20240018590A1 (en) Hybridization compositions and methods
Piumi et al. Specific cytogenetic labeling of bovine spermatozoa bearing X or Y chromosomes using fluorescent in situ hybridization (FISH)
CN100554962C (zh) 基因组比较杂交
Phua et al. A PCR-based sex determination method for possible application in caprine gender selection by simultaneous amplification of the Sry and Aml-X genes
US20040038213A1 (en) Genotyping by in situ PCR amplification of a polynucleotide in a tissue biopsy
Abdel-Rahman et al. Polymorphism in BPM-15 gene and its association with litter size in Anglo-Nubian goat
Carneiro et al. Sexing single bovine blastomeres using TSPY gene amplification
JP2002345466A (ja) Dnaの増幅方法
CZ2005428A3 (cs) Prostredek pro stanovení chromozomální translokace t(1;29) ve spermiích býku
Scherthan Analysis of telomere dynamics in mouse spermatogenesis
EP1182265A1 (en) Method for determining genetic traits of improved breed animal embryos prior to implantation
Rychlik et al. The phenomenon of cell chimerism in goats
Pandulli-Alonso et al. Characterization of four hypervariable microsatellite loci in a nuptial gift-giving spider and its prospect for paternity analyses
JP2003310265A (ja) 核酸抽出法
ES2257139B1 (es) Metodo y kit para genotipificacion de la hla-drb basados en la pcr en tiempo real.
Bimenova et al. Reproductive function of cows with different genotypes for TNF α locus and estimation of sperm fertility by the DNA fragmentation method
RU2770204C1 (ru) Способ идентификации ДНК бактерии Ureaplasma diversum в сперме крупного рогатого скота методом ПЦР в режиме реального времени
JP2006238888A (ja) 牛胚の性判別用プライマーおよびそれを用いた牛の性判別方法
RU2732626C1 (ru) Система олигонуклеотидных праймеров и зонда для выявления ДНК Mycoplasma bovigenitalium
US5310649A (en) Method for detecting species and biovars of Brucella

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20160701