CZ200249A3 - Antimycotics and fungicidal agents, process of their preparation and use - Google Patents

Antimycotics and fungicidal agents, process of their preparation and use Download PDF

Info

Publication number
CZ200249A3
CZ200249A3 CZ200249A CZ200249A CZ200249A3 CZ 200249 A3 CZ200249 A3 CZ 200249A3 CZ 200249 A CZ200249 A CZ 200249A CZ 200249 A CZ200249 A CZ 200249A CZ 200249 A3 CZ200249 A3 CZ 200249A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
nucleic acid
yeast
seq
polypeptide
toxin
Prior art date
Application number
CZ200249A
Other languages
Czech (cs)
Inventor
Klaus Rahfeldt
Simone Theisen
Frank Weiler
Manfred Schmitt
Original Assignee
Aventis Research & Technologies Gmbh & Co. Kg
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Aventis Research & Technologies Gmbh & Co. Kg filed Critical Aventis Research & Technologies Gmbh & Co. Kg
Publication of CZ200249A3 publication Critical patent/CZ200249A3/en

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/10Antimycotics
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/37Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
    • C07K14/39Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Fodder In General (AREA)
  • Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)

Abstract

The invention relates to the preparation of protein toxins from yeasts so-called killer yeasts using genetic technology in order to control human pathogenic and plant pathogenic yeasts and/or fungi, whereby these are selectively destroyed. The high specificity enables the protein toxins to be used as an antifungal agent and/or fungicide. In addition, protein toxins of this type can be used for protecting plants.

Description

Antimykotika a fungicidy, způsob jejich přípravy a jejich použitíAntimycotics and fungicides, their preparation and their use

Oblast technikyTechnical field

Tento vynález se týká antimykotik a fungicidů, které je možno získat z kvasinek, způsobu jejich přípravy a jejich použití.The present invention relates to antimycotics and fungicides obtainable from yeast, to a process for their preparation and to their use.

Dosavadní stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION

Selektivní antimykotika mají velký význam, poněvadž infekce způsobované houbami nebo kvasinkami u člověka se v posledních letech velmi rozšířily a ve stále větší míře dochází i k nežádoucí kontaminaci potravin a krmiv. Obzvláště závažné následky mají mykózy u imunosuprimovaných pacientů, jejichž buněčný a humorální obranný systém musí být udržován na ne zcela funkční úrovni [Anaissie, 1992; Meunier a spol., 1992; Vingard, 1995]. Obzvláště jsou mykózami ohroženy HIV-1-infikované osoby (AIDS), které v pokročilém stadiu choroby umírají velmi často na oportunistické infekce vyvolané humánně-patogenními plísněmi a/nebo kvasinkamiSelective antifungals are of great importance since infections caused by fungi or yeast in humans have become widespread in recent years and, to a greater extent, undesirable contamination of food and feed. Mycoses have particularly severe consequences in immunosuppressed patients whose cellular and humoral defense systems must be maintained at a not fully functional level [Anaissie, 1992; Meunier et al., 1992; Vingard, 1995]. In particular, HIV-1-infected persons (AIDS), who, in the advanced stage of the disease, die very often from opportunistic infections caused by human pathogenic fungi and / or yeast, are at particular risk of mycosis.

Λ [Levý, 1993]. Antimykotika, která se používají pro terapii těchto infekcí v současné době (jako jsou Amphotericin B, Fluconazol, Itraconazol, Ketoconazol), mají značné vedlejší ' účinky, poněvadž rozrušují strukturní integritu eukaryotické membrány cytoplasmy a tím poškozují i infikovaný hostitelský organismus [Hector, 1993]. Aplikace běžných antimykotik vede kromě toho již za krátký čas k rychlému nárůstu fluconazolové resístence, která se v humánně-patogenních mikroorganis• «· ♦ · · · « · · ··· • · · » · » ' »· • ······* 9 9 99 · 9 ··· · · · · · » mech rychle rozšiřuje a představuje tak stále větší problém [Cameron a spol., 1993; Chavenet a spol., 1994; Maenza a spol., 1996; Pfaller a spol., 1994; Rex a spol., 1995; Troillet a spol., 1993]. Je proto důležité vyvinout taková antimykotika, která se budou vyznačovat - podobně jako bakteriální antibiotika - vysokou selektivitou a tím, že budou napadat pokud možno pouze houby a kvasinky patogenní pro člověka. Poněvadž však většina buněčných procesů je u vyšších organismů řízena genovými produkty kteréΛ [Left, 1993]. The antimycotics currently used for the therapy of these infections (such as Amphotericin B, Fluconazole, Itraconazole, Ketoconazole) have significant side effects because they disrupt the structural integrity of the eukaryotic membrane of the cytoplasm and thereby damage the infected host organism [Hector, 1993] . In addition, the application of conventional antifungals leads to a rapid increase in fluconazole resistance in a short period of time, which in human pathogenic microorganisms is rapidly increasing. The moss expands rapidly, posing an increasing problem [Cameron et al., 1993; Chavenet et al., 1994; Maenza et al., 1996; Pfaller et al., 1994; Rex et al., 1995; Troillet et al., 1993]. It is therefore important to develop antimycotics which, like bacterial antibiotics, are characterized by a high selectivity and that, as far as possible, they attack only fungi and yeasts pathogenic to humans. However, since most cellular processes in higher organisms are controlled by gene products that

Λ u eukaryotů vykazují vysokou míru funkční homologie, nepodařilo se dosud vyvinout specifická antifungální antibiotika [Kurz, 1998; Komiyama a spol., 1998].They exhibit a high degree of functional homology in eukaryotes, and specific antifungal antibiotics have not yet been developed [Kurz, 1998; Komiyama et al., 1998].

Cílovou oblastí selektivních antimykotik jsou β-l,3-glukany buněčné stěny kvasinek, které jsou nezbytné pro mechanickou a osmotickou stabilitu buňky, které se však u vyšších eukaryontů nevyskytují, takže by bylo možno je použít jako Achillovu patu (pozn. překl.: v orig. je Achillesverse, má být asi Achillesf erse) při likvidaci patogenních kvasinek [Roemer a spol., 1994], Přes to, že látky, které selektivně napadají strukturu buněčných stěn kvasinek a hub, jsou předmětem velkého zájmu, nebyly dosud žádné látky podobné antibiotikům pro léčbu mykos použity. Zatímco producenti bakteriálních antibiotik byli objeveni již počátkem tohoto století, podobné efekty u kvasinek byly pozorovány až teprve počátkem šedesátých let, kdy byly identifikovány a pozorovány tzv. killer-kvasinky [Bevan and Makower, 1963]. Toxiny produkující killer-kmeny ‘ pekařského droždí Saccharomyces cerevisiae produkují a vylučují proteiny označené jako killertoxiny, které usmrcují senzitivní kvasinky při procesu závislém na receptoru (Rezeptor-abhángigen Prozess) [Bussey, 1991; Tipper a Schmitt, 1991]. Schopnost produkovat toxin spočívá • · • · · · · · w ··«« ···· · · · · * « « ····*·· · · - · « , u S.cerevisiae na infekci viry s dvouvláknovou RNA, které se podobají reoviru (Reovirus-áhnliche Dopplestrang-RNA-Viren), které jsou v cytoplasmě kvasinek stabilní a ve velkém počtu kopiíí zde přetrvávají, aniž by eukaryotickou hostitelskou buňku znatelným způsobem poškodily [Tipper a Schmitt, 1991]. U třech dosud známých killer-toxinů (ΚΙ, K2, K28) z kvasinek S.cerevisiae jde o neglykosylované α/β heterodimery, které jsou přenášeny z infikované buňky jako vysokomolekulární preprotoxiny a přeměněny na intracelulární sekreční cestě komplexními modifikacemi na biologicky aktivní killer-proteiny [Hanes a spol., 1986; Dignard a spol., 1991; Schmitt a Tipper, 1995]. Toxické působení toxinu ze S.cerevisiae spočívá, buď v rozrušení celistvosti membrány (toxiny ΚΙ, K2) nebo (jako je tomu u killer-toxinu K28) v pozastavení buněčného cyklu (Zellcyklus-Arrest) s cílenou inhibici syntézy DNA [Bussey, 1991; Schmitt a Compain, 1995; Schmitt a spol., 1996]. Killer-toxiny tříd ΚΙ, K2 a K28 se sice ve svém způsobu účinku a ve svých fyzikálně-chemických vlastnostech navzájem značně liší, mají však společné úzké spektrum účinnosti a dále to, že usmrcují převážně senzitivní kvasinky úzce příbuzných druhů. Toto omezené spektrum účinnosti je dáno tím, že dosud charakterizované killer-toxiny z pekařského droždí s různými populacemi receptorů na úrovních buněčné stěny kvasinek a cytoplasmové membrány musí reagovat navzájem, aby mohly usmrtit senzitivní cílové buňky. U primárních toxinreceptorů buněčné stěny kvasinek jde buď o velmi rozvětvené β-Ι,ό-D-glukany nebo o vnější mannotriosové postranní řetězce mannoproteinu buněčné stěny [Bussey, 1991; Schmitt a Radler 1987, 1988].The target area of selective antifungal agents are β-1,3-glucans of the yeast cell wall, which are essential for the mechanical and osmotic stability of the cell, but which do not occur in higher eukaryotes, so that they could be used as Achilles' heel. Achillesverse is likely to be involved in the eradication of pathogenic yeasts [Roemer et al., 1994]. Despite the fact that substances that selectively attack the cell wall structure of yeasts and fungi are of great interest, no similar substances have so far antibiotics used to treat mycoses. While bacterial antibiotic producers were discovered earlier this century, similar effects in yeast were only observed in the early 1960s when killer yeasts were identified and observed [Bevan and Makower, 1963]. Saccharomyces cerevisiae killer-strain-producing toxins produce and secrete proteins designated as killertoxins, which kill sensitive yeast in a receptor-dependent process (Rezeptor-abhángigen Prozess) [Bussey, 1991; Tipper and Schmitt, 1991]. The ability to produce a toxin rests in S. cerevisiae for infection with double-stranded viruses in S. cerevisiae. Reovirus-like RNAs (Reovirus-ähnliche Dopplestrang-RNA-Viren), which are stable in the yeast cytoplasm and persist in a large number of copies there, without appreciably damaging the eukaryotic host cell [Tipper and Schmitt, 1991]. Three known killer toxins (ΚΙ, K2, K28) from yeast S. cerevisiae are non-glycosylated α / β heterodimers, which are transferred from the infected cell as high-molecular preprotoxins and converted into intracellular secretory pathway by complex modifications to biologically active killer-proteins [Hanes et al., 1986; Dignard et al., 1991; Schmitt and Tipper, 1995]. The toxic action of the S. cerevisiae toxin consists either in disrupting membrane integrity (toxins ΚΙ, K2) or (as in killer toxin K28) in cell cycle arrest (Zellcycle-Arrest) with a targeted inhibition of DNA synthesis [Bussey, 1991; Schmitt and Compain, 1995; Schmitt et al., 1996]. Although killer toxins of classes ΚΙ, K2 and K28 differ greatly in their mode of action and in their physicochemical properties, they share a common narrow spectrum of activity and furthermore that they kill predominantly sensitive yeasts of closely related species. This limited spectrum of efficacy is due to the fact that the previously characterized baker's yeast killer toxins with different receptor populations at yeast cell wall and cytoplasmic membrane levels must interact with each other in order to kill sensitive target cells. The primary yeast cell wall toxin receptors are either highly branched β-Ι, ό-D-glucans or outer mannotriose sidewalls of the cell wall mannoprotein [Bussey, 1991; Schmitt and Radler 1987, 1988].

Kromě virálních proteintoxinů kvasinek S.cerevisiae, Hanseniaspora uvarum, Zygosaccaromyces bailii a Ustilago maydis byly popsány killer-kmeny i v rodech Debaromyces, Hansenula, Cryptococcus, Rhodotorula, Trichosporon, Ptchia, Kluyveromyces, Torulopsis a WHliopsis [McCracken a spol., 1994; Park a spol., 1996; Schmitt a Neuhausen, 1994; Valker a spol., 1995]. Genetické základy tohoto killer-jevu však u těchto kvasinek nespočívají ve virálních genomech, nýbrž buď v lineárních DNA-plasmidech nebo v chromosomálních kvasinkových genech [Schrůnder a spol., 1994].In addition to the viral protein toxins of yeast S. cerevisiae, Hanseniaspora uvarum, Zygosaccaromyces bailii and Ustilago maydis, killer strains have also been described in the genera Debaromyces, Hansenula, Cryptococcus, Rhodotorula, Trichosporon, Ptchia, Kluyveromyli and Torulisis, Torulops, Torulops. Park et al., 1996; Schmitt and Neuhausen, 1994; Valker et al., 1995]. However, the genetic basis of this killer phenomenon in these yeasts lies not in viral genomes, but either in linear DNA plasmids or in chromosomal yeast genes [Schrůnder et al., 1994].

Intenzivní molekulárně-biologické výzkumy různých killer-kvasinek produkujících toxin prokázaly, že sekrece toxických proteinů (killer-toxiny) je u kvasinek velmi rozšířena a že při vývoji selektivních antimykotik představuje potenciál, který nelze přehlédnout [Valker a spol., 1995; Hodgson a spol., 1995; Polonelli a spol., 1986; Schmitt a Neuhausen, 1994; Neuhausen a Schmitt, 1996; Schmitt a spol., 1997], doposud však tyto proteintoxiny nebyly připraveny.Intensive molecular-biological studies of various toxin-producing killer-yeasts have shown that the secretion of toxic proteins (killer-toxins) is widespread in yeast and that it can be overlooked in the development of selective antifungals [Valker et al., 1995; Hodgson et al., 1995; Polonelli et al., 1986; Schmitt and Neuhausen, 1994; Neuhausen and Schmitt, 1996; Schmitt et al., 1997], however, these protein toxins have not been prepared.

Úkolem tohoto vynálezu je proto příprava vhodných vysoce účinných proteintoxinů s antimykotickými nebo fungicidními účinky pro ničení kvasinek a/nebo hub s patogenním působením na člověka nebo rostliny.SUMMARY OF THE INVENTION It is therefore an object of the present invention to provide suitable highly potent protein toxins with antifungal or fungicidal effects for destroying yeast and / or fungi with a pathogenic effect on humans or plants.

Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION

Pro ničení kvasinek a/nebo hub s patogenním působením na člověka nebo rostliny se jako obzvláště vhodné překvapivě ukázaly toxiny produkované a secernované s vysokou účinností, a to killer-toxin VICALTIN (rovněž proteintoxin) z divokého kmene kvasinek Williopsis californica kmen 3/57 (DSM 12865) a viruskódovaný ZYGOCIN (rovněž proteintoxin) z kvasinek Zygosaccharomyces baílii (DSM 12864). Kromě toho bylo těmito prostředky možno usmrtit i obávané škodlivé kvasinky v potravinách a v krmivech. Oba tyto proteintoxiny je proto možno potenciálně použit jako antimykotikum a/nebo fungicid pro likvidaci infekci vyvolaných kvasinkami a/nebo houbami, zejména pro likvidaci mykóz. Tyto indikace jsou v tomto vynálezu ověřovány zkoumáním způsobu působení těchto látek. V rámci tohoto vynálezu byly toxingeny vhodným způsobem klonovány a sekvencovány a byl tak vypracován postup i genově-technické přípravy a exprese (Úberexpression) v kultuře preparátů VICALTIN a ZYGOCIN.Surprisingly, toxins produced and secreted with high efficiency, namely the killer-toxin VICALTIN (also proteintoxin) from the wild yeast strain Williopsis californica strain 3/57 (DSM), have proved to be particularly suitable for destroying yeasts and / or fungi with pathogenic effects on humans or plants. 12865) and virus-encoded ZYGOCIN (also proteintoxin) from yeast Zygosaccharomyces bailia (DSM 12864). In addition, the feared harmful yeasts in food and feed have been killed by these means. Both of these protein toxins can therefore potentially be used as an antifungal and / or fungicide for the control of yeast and / or fungal infections, in particular for the control of mycoses. These indications are verified in the present invention by investigating the mode of action of these agents. Within the scope of the present invention, the toxins have been appropriately cloned and sequenced, and thus a process for both gene-engineering and expression (removal) has been developed in the culture of VICALTIN and ZYGOCIN.

·«· «

Předmětem tohoto vynálezu jsou tudíž proteintoxiny, které je možno získat z Williopsis californica, zejména z kmene DSM 12865 a Zygosaccharomyces bailii, zejména z kmene DSM 12864. Oba tyto kmeny byly podle Budapešťské smlouvy dne 9.června 1999 uloženy do Německé sbírky mikroorganismů a buněčných kultur DSMZ - Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH, 38124 Braunschweig, Mascheroder Veg lb (www.dsmz.de).Accordingly, the present invention provides protein toxins obtainable from Williopsis californica, in particular from strain DSM 12865 and Zygosaccharomyces bailii, in particular from strain DSM 12864. Both strains were deposited in the German Collection of Microorganisms and Cell Cultures under the Budapest Treaty on 9 June 1999. DSMZ - Deutsche Sammlung von Microorganismen und Zellkulturen GmbH, 38124 Braunschweig, Mascheroder Veg lb (www.dsmz.de).

V rámci tohoto vynálezu secernovaly zejména kmeny DSM 12864 a DSM 12865 biologicky vysoce účinné proteintoxiny, které díky širokému spektru jejich účinnosti (viz příklady 4 a 7) usmrcovaly i četné humánně- a rostlinně-patogenní kvasinky a houby. Proto se tento vynález týká i selektivních antimykotik nebo fungicidů v tom smyslu, že u proteintoxinů - a dále uvedených polypeptidů podle tohoto vynálezu a jimi < kódovaných nukleových kyselin podle tohoto vynálezu, zejména ve funkční jednotce toxingenu - jde o potenciální bíofarma* ka, která na základě jejich specifického působení zprostředkovaného receptory usmrcuji výhradně kvasinky a/nebo houby a pro vyšší eukaryoty - a samozřejmě pro lidské a savčí • · buňky - a rovněž pro rostliny, zejména pro kulturní rostliny, jsou zcela neškodné [viz Pfeiffer a spol., 1988].In particular, strains DSM 12864 and DSM 12865 secreted biologically highly active protein toxins, which, due to their broad spectrum of activity (see Examples 4 and 7), also killed numerous human and plant pathogenic yeasts and fungi. Therefore, the present invention also relates to selective antifungals or fungicides in the sense that the protein toxins - and the polypeptides of the invention and the nucleic acids encoded by them of the invention, in particular in the toxigen functional unit, - are potential biopharmaceuticals which due to their specific receptor-mediated action, they only kill yeasts and / or fungi and are completely harmless to higher eukaryotes - and, of course, to human and mammalian cells - and also to plants, especially to crop plants [see Pfeiffer et al., 1988] .

Bylo možno selektivně usmrcovat následující humánněa rostlinně-patogenní a rovněž apatogenní kvasinky a/nebo houby:The following human and plant-pathogenic as well as apatogenic yeasts and / or fungi were selectively killed:

Zygocin-senzitivní druhy kvasinek: Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida krusei, Candída glabrata, Candida vinii, Hanseniaspora uvarum, Kluyveromyces marxianus,Zygocin-sensitive yeast species: Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida krusei, Candida glabrata, Candida vinii, Hanseniaspora uvarum, Kluyveromyces marxianus,

Metschnikowia pulcherrima, Ustilago maydis, Debaromyces * hansenii, Pichia anomala, Pichia jadinii, Pichia membranefaciens, Yarowia lipolytica a Zygosaccharomyces rouxii.Metschnikowia pulcherrima, Ustilago maydis, Debaromyces hansenii, Pichia anomala, Pichia jadinii, Pichia membranefaciens, Yarowia lipolytica and Zygosaccharomyces rouxii.

Vicaltin-senzitivní druhy kvasinek: Candida albicans,Vicaltin-sensitive yeast species: Candida albicans,

Candida glabrata, Candida tropicalis, Debaromyces hansenii, Kluyveromyces lactis, Metschnikowia pulcherrima, Pichia anomala, Pichia jadinii, Saccharomyces cerevisiae, Sporthrix spec., Torulaspora delbrueckii, Torulaspora pretoriensis, Yarowia lipolytice a Zygosaccharomyces bailii.Candida glabrata, Candida tropicalis, Debaromyces hansenii, Kluyveromyces lactis, Metschnikowia pulcherrima, Pichia anomala, Pichia jadinii, Saccharomyces cerevisiae, Sporthrix spec.

Obzvláště vysoká aktivita wicaltin-produkujícího kmene DSM 12865 spočívá pravděpodobně ve výrazné sekreční účinnosti tohoto kmene, která je v porovnání s jinými kmeny stejného druhu kvasinek podstatně vyšší. Killer-vlastnost zygocin-produkujícího kmene kvasinek DSM 12864 spočívá v infekci toxinkódujícími viry s dvouvláknovou RNA i (M^^-dsRNA), které jsou stabilní, v cytoplasmě přetrvávají ve vysokém počtu kopií a v příslušných kvasinkách (kmen DSM , 12864) vyvolávají produkci a sekreci zygocinu [viz Schmitt a Neuhausen, 1994]. Ostatní kmeny stejného druhu nevykazovaly žádnou produkci toxinů, poněvadž v cytoplazmě neobsahují žádné toxinkódující dsRNA-viry, takže jsou • · ·The particularly high activity of the wicaltin-producing strain DSM 12865 is likely to be due to the pronounced secretory efficacy of this strain, which is significantly higher than other strains of the same yeast species. The killer-property of the zygocin-producing yeast strain DSM 12864 is due to infection with toxin-coding double-stranded RNA i (M ^^ - dsRNA) viruses that are stable, persist in the cytoplasm in high copy numbers and induce production in the respective yeast (DSM strain, 12864). and zygocin secretion [see Schmitt and Neuhausen, 1994]. Other strains of the same species showed no toxin production since they do not contain any toxin-coding dsRNA viruses in the cytoplasm, so they are

9 rf 9 9 · · · fenotypově klasifikovány jako Ne-Killer- typy.9 r f 9 9 · · · phenotypically classified as non-Killer types.

Dalším předmětem tohoto vynálezu jsou nukleové kyseliny kódující proteintoxin - s aminokyselinovou sekvencí podle SEQ ID No 1 a No 2 a s glukanasovou aktivitou - nebo funkční varianty těchto nukleových kyselin a jejich části minimálně s 8 nukleotidy, zejména minimálně s 15 nebo 20 nukleotidy, obzvláště minimálně se 100 nukleotidy, především minimálně s 300 nukleotidy (dále jsou uváděny jako nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu).Another object of the present invention are proteintoxin-encoding nucleic acids - having the amino acid sequence of SEQ ID No 1 and No 2 and glucanase activity - or functional variants of these nucleic acids and portions thereof with at least 8 nucleotides, in particular at least 15 or 20 nucleotides, 100 nucleotides, preferably at least 300 nucleotides (hereinafter referred to as nucleic acids of the invention).

Kompletní nukleové kyseliny kódují proteintoxiny, které vykazují po intracelulárním zpracování a sekreci velikost 309 aminokyselin a molekulovou hmotnost 34 kDa (SEQ ID No 1), resp. 99 aminokyselin a molekulovou hmotnost 10 kDa (SEQ ID No 2). Exprese této nukleové kyseliny podle SEQ ID No 1 v kvasinkách S.cerevisiae vede k rekombinantnímu VICALTINU, který se v supernatantu kultury kvasinek secernuje jako glykosylovaný protein se signifikantní β-l,3-D-glukanasovou aktivitou [viz příklad 10]. Další experimenty provedené podle tohoto vynálezu potvrdily, že u nukleových kyselin podle tohoto vynálezu jde o nukleové kyseliny, které v případě SEQ ID No 1 kódují proteintoxin s glukanasovou aktivitou a v případě SEQ ID No 2 kódují in vivo pravděpodobně O-glykosylovaný proteintoxin označovaný jako ZYGOCIN.Complete nucleic acids encode protein toxins which, after intracellular processing and secretion, have a 309 amino acid size and a molecular weight of 34 kDa (SEQ ID No 1), respectively. 99 amino acids and a molecular weight of 10 kDa (SEQ ID No 2). Expression of this nucleic acid according to SEQ ID No 1 in yeast S. cerevisiae results in recombinant VICALTIN, which is secreted in the yeast culture supernatant as a glycosylated protein with significant β-1,3-D-glucanase activity [see Example 10]. Further experiments carried out according to the invention confirmed that the nucleic acids of the invention are nucleic acids which encode a proteintoxin with glucanase activity in SEQ ID No 1 and, in the case of SEQ ID No 2, probably encode an O-glycosylated proteintoxin referred to as ZYGOCIN .

Nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu je možno získat z DSM 12865 (SEQ ID No 1) a z DSM 12864 (SEQ ID No 2).Nucleic acids of the invention can be obtained from DSM 12865 (SEQ ID No 1) and from DSM 12864 (SEQ ID No 2).

V jedné preferované formě provedení jsou nukleovými kyselinami podle tohoto vynálezu DNA nebo RNA, především dvouvláknová DNA, a zejména DNA se sekvencí nukleových kyselin podle SEQ ID No 1 od pozice 1 do pozice 947 a podle SEQ ID No 2 od pozice 1 do pozice 713. Obě tyto pozice ur• « ··»·»·· · · < · * 9 * · 9 · · · ··· • » 9 · · · · 9 · 9 · 9 9 9 čují podle tohoto vynálezu začátek a konec kódující oblasti, tj. vždy první a poslední aminokyselinu v příslušném čtecím rámci (Leseraster).In one preferred embodiment, the nucleic acids of the invention are DNA or RNA, in particular double stranded DNA, and in particular DNA having the nucleic acid sequence according to SEQ ID No 1 from position 1 to position 947 and according to SEQ ID No 2 from position 1 to position 713. Both of these positions determine the beginning and end of the coding according to the present invention. region, i.e. always the first and last amino acids in the respective reading frame (Leseraster).

Pojmem funkční varianta se rozumí podle tohoto vynálezu nukleová kyselina, která je funkčně příbuzná s nukleovými kyselinami podle tohoto vynálezu. Tak na příklad j sou příbuznými nukleovými kyselinami nukleové kyseliny z různých kvasinkových buněk resp. kmenů a kultur f nebo alelické varianty. Tento vynález zahrnuje i varianty nukleových kyselin, které mohou pocházet z různých kvasi« nek/kmenů kvasinek nebo jiných původců infekcí jako jsou dermatofyty a plísně (podle DHS systému).As used herein, a functional variant is a nucleic acid that is functionally related to the nucleic acids of the invention. For example, related nucleic acids are nucleic acids from different yeast cells, respectively. strains and cultures of f or allelic variants. The present invention also encompasses nucleic acid variants that can be derived from various yeast / yeast strains or other pathogens such as dermatophytes and fungi (according to the DHS system).

V dalším smyslu se pod pojmen varianty podle tohoto vynálezu rozumějí nukleové kyseliny, které vykazují homologii, zejména identitu sekvencí z cca 60%, raději z cca 75 %, obzvláště z cca 90 % a především z cca 95 %.In another sense, variants of the invention are nucleic acids that exhibit homology, in particular sequence identity of about 60%, preferably about 75%, especially about 90%, and especially about 95%.

Části nukleových kyselin podle tohoto vynálezu se mohou používat např. pro přípravu jednotlivých epitopů, jako sondy pro identifikaci dalších funkčních variant nebo jako antisense-nukleové kyseliny. Tak na příklad nukleová kyselina skládající se minimálně z cca 8 nukleotidů je vhodná jako antisense-nukleová kyselina, nukleová kyselina skládající se minimálně z cca 15 nukleotidů je vhodná jako primér při PCR-postupu, nukleová kyselina skládající se minimálně z cca 20 nukleotidů je vhodná pro identifikaci dalších variant a nukleová kyselina skládající se minimálně z cca 100 nukleotidů je vhodná jako sonda.The nucleic acid portions of the invention can be used, for example, to prepare individual epitopes, as probes to identify other functional variants, or as antisense nucleic acids. For example, a nucleic acid of at least about 8 nucleotides is suitable as an antisense nucleic acid, a nucleic acid of at least about 15 nucleotides is suitable as a primer in a PCR procedure, a nucleic acid of at least about 20 nucleotides is suitable for identifying additional variants and a nucleic acid consisting of at least about 100 nucleotides is suitable as a probe.

V další výhodné formě provedení tohoto vynálezu obsahuje nukleová kyselina podle tohoto vynálezu jednu nebo • ♦ 4 *· « ·· ·· • · 9 ♦ · * * ···« • · · · « · 4 » » v • ······· · · < « · · • · I ··· · · * •· * ·· »·· ·· ···· více nekódujících sekvencí a/nebo póly(A)-sekvenci, jednu nebo více (pro intracelulární pro-protein-zpracování nezbytných) Kex2p-endopeptidasových rozlišujících sekvencí (Endopeptidase Erkennungssequenzen) a rovněž jedno nebo více potenciálních N-glykosylačních míst. Nekódujícími sekvencemi jsou řídící sekvence, jako jsou promotor- nebo enhancer- sekvence pro řízenou expresi kódujícího toxingenu obsahujícího nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu.In a further preferred embodiment of the invention, the nucleic acid according to the invention comprises one or more of 9 in the sequence of the invention. Multiple non-coding sequences and / or poles (A) - sequence, one or more (-). for intracellular pro-protein processing of the necessary Kex2β-endopeptidase recognition sequences (Endopeptidase Erkennungssequenzen) as well as one or more potential N-glycosylation sites. The non-coding sequences are control sequences, such as a promoter or enhancer sequence, for the controlled expression of a coding toxingen comprising the nucleic acids of the invention.

/ V další formě provedení je proto nukleová kyselina obsažena ve vektoru, přednostně v expresním vektoru nebo * v genově-terapeuticky účinném vektoru.Therefore, in another embodiment, the nucleic acid is contained in a vector, preferably an expression vector or a gene-therapeutically effective vector.

Expresními vektory mohou být např. v případě nukleových kyselin podle SEQ ID No 2 prokaryotické a/nebo eukaryotické expresní vektory resp. v případě nukleových kyselin podle SEQ ID No 1 výhradně eukaryotické expresní vektory. Exprese toxinkódujících nukleových kyselin podle SEQ ID No 1 v Escherichia coli není možná, poněvadž příslušný heterologicky exprimovaný proteintoxin je pro bakteriální buňky toxický. Klonování VITCALTIN-kódujících nukleových kyselin podle SEQ ID No 1 v E. coli je možné pouze s plasmidy, které nenesou žádný promotor (např. pomocí derivátů plasmidů pBR322). Příkladem prokaryotického vektoru, který umožňuje heterologickou expresi ZYGOCIN-kódující nukleové kyseliny podle SEQ ID No 2 je komerčně dostupný vektor pGEX-4T-l, který umožňuje provádět v E.coli expresi glutathion-S-transferasa-ZYGOCIN-fúzního proteinu. Dalším vektorem pro r expresi ZYGOCINU v E.coli je např. T7 expresní vektor pGMÍO (Martin, 1996) , který kóduje N-terminální Met-Ala-His6-část • (tag), což umožňuje výhodné čištění exprimovaného proteinu na sloupci Ni -NTA. Jako eukaryotické expresní vektory pro expresi v Saccharomyces cerevisiae jsou vhodné např. vektory • * · • · • · • ······« · ·· · · ··· · · « ··· • · · ·· · · · «» ···· p426Met25 nebo p426GALl [Mumberg a spol., (1994) Nucl. Acids Res., 22, 5767], pro expresi v buňkách hmyzu jsou použitelné např. Baculovirus-vektory jako jsou EP-B1-0127839 nebo EP-B1-0549721 a pro expresi v buňkách savců lze použít např. SV40-vektory, které jsou běžně dostupné.For example, in the case of the nucleic acids of SEQ ID No 2, the expression vectors may be prokaryotic and / or eukaryotic expression vectors, respectively. in the case of the nucleic acids of SEQ ID No 1, exclusively eukaryotic expression vectors. Expression of the toxin-encoding nucleic acids of SEQ ID No 1 in Escherichia coli is not possible because the heterologically expressed protein toxin is toxic to bacterial cells. Cloning of the VITCALTIN-encoding nucleic acids of SEQ ID No 1 in E. coli is only possible with plasmids that carry no promoter (eg, by using plasmid derivatives pBR322). An example of a prokaryotic vector that allows heterologous expression of the ZYGOCIN-encoding nucleic acid of SEQ ID No 2 is the commercially available vector pGEX-4T-1, which allows glutathione-S-transferase-ZYGOCIN-fusion protein to be expressed in E. coli. Another vector for the r expression of ZYGOCIN in E. coli is, for example, the T7 expression vector pGM10 (Martin, 1996), which encodes the N-terminal Met-Ala-His6-tag (tag), allowing convenient purification of the expressed protein on the Ni- NTA. Suitable eukaryotic expression vectors for expression in Saccharomyces cerevisiae are, for example, vectors such as <RTIgt; vectors. </RTI> P426Met25 or p426GAL1 [Mumberg et al., (1994) Nucl. Acids Res., 22, 5767], for expression in insect cells, for example, Baculovirus vectors such as EP-B1-0127839 or EP-B1-0549721 are useful, and for expression in mammalian cells, for example, SV40-vectors that are commercially available.

Expresní vektory obsahuj i obecně regulační sekvence vhodné i pro hostitelskou buňku, jako jsou např. trp-promotor pro expresi v E.coli (viz např. EP-B1-0154133), Λ ADH-2-promotor pro expresi v kvasinkách [Russel a spol.Expression vectors also generally contain regulatory sequences suitable for the host cell, such as e.g. the trp promoter for expression in E. coli (see, e.g., EP-B1-0154133), the ADH-2 Λ promoter for expression in yeast [Russel spol.

(1983). J.Biol.Chem 2588, 2674], baculovirus-polyhedrin-* promotor pro expresi v buňkách hmyzu (viz například(1983). J.Biol.Chem 2588, 2674], baculovirus-polyhedrin- * promoter for expression in insect cells (see, for example,

EP-B1-0127839) nebo starší SV40-promotor nebo LTR-promotory např. z MMTV (Mouše Mammary Tumour Virus; Lee a spol., (1981) Nátuře, 214, 228).EP-B1-0127839) or the older SV40-promoter or LTR-promoters eg from MMTV (Mammary Tumor Virus; Lee et al., (1981) Nature, 214, 228).

Příkladem genově-terapeuticky účinných vektorů jsou virusvektory, zejména adenovirusvektory, obzvláště replikačně-deficientní adenovirusvektory, nebo adenoasociované virusvektory, např. adenoasociovaný virusvektor, který se skládá výhradně ze dvou vložených terminálních opakujících se sekvencí (Viederholungssequenz) (ITR).Examples of gene-therapeutically effective vectors are virusvectors, in particular adenovirusvectors, in particular replication-deficient adenovirusvectors, or adeno-associated virusvectors, e.g. an adeno-associated virusvector, which consists exclusively of two inserted terminal repeat sequences (ITRs).

Vhodné adenovirusvektory j sou popsány např. v pracích McGroy, V.J. a spol. (1988) Virol. 163, 614; Gluzman, Y. a spol. (1982) v publikaci Eukaryotic Viral Vectors (Gluzman, Y. ed.) 187, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York; Chroboczek, J. a spol. (1992) Virol. 186, * 280; Karlsson, S. a spol. (1986) EMBO J., 5, 2377 nebo veSuitable adenoviral vectors are described, for example, in McGroy, V.J. et al. (1988) Virol. 163, 614; Gluzman, Y. et al. (1982) in Eukaryotic Viral Vectors (Gluzman, Y. ed.) 187, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York; Chroboczek, J. et al. (1992) Virol. 186, 280; Karlsson, S. et al. (1986) EMBO J., 5, 2377;

V095/00655.WO95 / 00655.

Vhodné adenoasociované virusvektory jsou popsány např. v pracích Muzyczka, N. (1992) Curr. Top. Microbiol. Immunol.Suitable adeno-associated virus vectors are described, for example, in Muzyczka, N. (1992) Curr. Top. Microbiol. Immunol.

· 44 • · · · · · » • · · · · · < · · 444 · 4 · 4 · 4 · 4

158, 97; VO95/23867; Samulski, R.J. (1989) J. Virol., 63, 3822; VO95/23867; Chiorini, J.A. a spol. (1995) Human Gene Therapy 6, 1531 nebo Kotin, R.M. (1994) Human Gene Therapy 5, 793.158, 97; WO95 / 23867; Samulski, R.J. (1989) J. Virol., 63, 3822; WO95 / 23867; Chiorini, J.A. et al. (1995) Human Gene Therapy 6, 1531 or Kotin, R.M. (1994) Human Gene Therapy 5,793.

Genově-terapeuticky účinné vektory je možno získat i tak, že se nukleová kyselina podle tohoto vynálezu váže do komplexu s liposomy. K tomu jsou vhodné směsi lipidů, které jsou popsány např. v pracích Felgner, P.L. a spol., (1987) Proč. Nati. Acad. Sci USA 84, 7413; Behr, J.P. a spol.Gene-therapeutically effective vectors can also be obtained by binding a nucleic acid of the invention complexed with liposomes. Lipid mixtures suitable for this purpose are described, for example, in Felgner, P.L. et al., (1987) Proc. Nati. Acad. Sci. USA 84, 7413; Behr, J.P. et al.

(1989) Proč. Nati. Acad. Sci USA 86, 6982; Felgner J.H. a spol. (1994) J. Biol. Chem. 269, 2550 nebo Gao, X. a Huang, L. (1991) Biochim. Biophys. Acta 1189, 195. Při přípravě těchto liposomů se DNA naváže iontově na povrch liposomů, a to v takovém poměru, aby na povrchu zůstal zachován kladný náboj a aby DNA byla s liposomy úplně vázána v komplexu.(1989) Proc. Nati. Acad. Sci USA 86, 6982; Felgner J.H. et al. (1994) J. Biol. Chem. 269, 2550 or Gao, X. and Huang, L. (1991) Biochim. Biophys. Acta 1189, 195. In the preparation of these liposomes, DNA binds ionically to the surface of the liposomes in such a proportion that a positive charge is maintained on the surface and that the DNA is completely complexed with the liposomes.

V další formě provedení jsou nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu obsaženy ve vektoru, přednostně v expresním vektoru pro přípravu transgenních rostlin. Vzhledem k tomu, že popisované killer-toxiny VICALTIN a ZYGOCIN mají široké spektrum účinnosti a usmrcují i fytopatogenní kvasinky a houby, je možno získat takové transgenní rostliny, které j sou odolné např. proti infekci vyvolávané u kukuřice patogenem Ustilago maydis. Podobné pokusy byly již prováděny na rostlinách tabáku, které po heterologické expresi přirozeného virálně kódovaného killertoxinu KP4 z U.maydis měly schopnost secernovat příslušný proteintoxin a získat tak specifickou ochranu proti infekcím určitými fytopatogenními kmeny U.maydis (Park a spol., 1996; Kinal a spol., 1995; Bevan, 1984). Na základě komerčně dostupných transformačních systémů, založených na modifikovaných derivátech přirozených ··· ·· · ·« · · · · · · · · · *··»In another embodiment, the nucleic acids of the invention are contained in a vector, preferably an expression vector for the preparation of transgenic plants. Since the described killer-toxins VICALTIN and ZYGOCIN have a broad spectrum of activity and also kill phytopathogenic yeasts and fungi, it is possible to obtain such transgenic plants which are resistant, for example, to infection caused by maize by the pathogen Ustilago maydis. Similar experiments have already been carried out on tobacco plants which, after heterologous expression of naturally virally encoded killertoxin KP4 from U.maydis, have the ability to secrete the respective protein toxin and thereby obtain specific protection against infections with certain phytopathogenic U.maydis strains (Park et al., 1996; et al., 1995; Bevan, 1984). Based on commercially available transformation systems based on modified natural derivatives.

- ···· · · · · » ·- ···· · · · ·

Ti-plasmidů z Agrobacterium tumefaciens, je možno nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu zastoupené i v toxingenech WCT a ZBT nakloňovat do tzv. dvousměrných pBI-vektorů (fa. CLONTECH) a použít pro získání transgenních rostlin. Příslušné toxingeny WCT a ZBT se přitom vkládají pod transkripční kontrolou silného promotoru viru květákové mosaiky (CaMV-P). Bližší podrobnosti o výstavbě tohoto konstruovaného vektoru jsou schematicky uvedeny v příkladu 9.The thi plasmids from Agrobacterium tumefaciens can be cloned into the so-called bi-directional pBI vectors (CLONTECH) and used to obtain transgenic plants. The respective WCT and ZBT toxins are introduced under the transcriptional control of the potent cauliflower mosaic virus promoter (CaMV-P). Further details of the construction of this engineered vector are shown schematically in Example 9.

λ Nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu je možno např.The nucleic acids of the invention may be e.g.

syntetizovat chemicky s použitím sekvencí ze SEQ ID No 1 ’ a No 2 nebo s použitím peptidových sekvencí ze SEQ ID No a No 2 s využitím genetického kódu např. fosfotriesterovou metodou (viz např. Uhlman, E. a Peyman, A. (1990) Chemical Reviews, 90, 543, No.4). Další možností pro získání nukleových kyselin podle tohoto vynálezu je izolace z vhodné genové banky s použitím vhodné sondy (viz např. Sambrook, J. a spol. (1989) Molecular Cloning. A laboratory manual, 2. vyd., Cold Spring Harbor, New York). Jako sondy jsou vhodné např. jednovláknové fragmenty DNA o délce cca 100 až 1000 nukleotidů, zejména o délce 200 až 500 nukleotidů, obzvláště o délce cca 300 až 400 nukleotidů, jejichž sekvenci je možno odvodit ze sekvence nukleových kyselin podle SEQ ID No 1 a No 2.synthesized chemically using the sequences of SEQ ID No 1 'and No 2 or using the peptide sequences of SEQ ID No and No 2 using the genetic code, eg, by the phosphotriester method (see, eg, Uhlman, E. and Peyman, A. (1990) Chemical Reviews, 90,543, No.4). Another possibility for obtaining nucleic acids of the invention is isolation from a suitable gene bank using a suitable probe (see, e.g., Sambrook, J. et al. (1989) Molecular Cloning. A laboratory manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor, New. York). Suitable probes are, for example, single-stranded DNA fragments of about 100 to 1000 nucleotides in length, in particular 200 to 500 nucleotides in length, in particular about 300 to 400 nucleotides in length, the sequence of which can be derived from the nucleic acid sequence of SEQ ID No 1 and No 2.

Dalším předmětem tohoto vynálezu jsou polypeptidy jako takové s aminokyselinovou sekvencí podle SEQ ID No 1 a No nebo jejich funkční varianty a jejich části minimálně se • šesti aminokyselinami, zejména minimálně s 12 aminokyselinami, obzvláště minimálně s 65 aminokyselinami a především ' s 309 aminokyselinami (SEQ ID No 1) a s 99 aminokyselinami (SEQ ID No 2) (dále jsou uváděny jako polypeptidy podle tohoto vynálezu). Tak např. může polypeptid o délce ccaA further object of the invention are polypeptides per se having the amino acid sequence according to SEQ ID No 1 and No or functional variants thereof and portions thereof with at least six amino acids, in particular at least 12 amino acids, in particular at least 65 amino acids and especially 309 amino acids (SEQ. ID No 1) and having 99 amino acids (SEQ ID No 2) (hereinafter referred to as polypeptides of the invention). For example, a polypeptide with a length of approx

6-12, zejména o délce cca 8 aminokyselin obsahovat epitop, který slouží po navázání na nosič k přípravě specifických póly- nebo monoklonálních protilátek (viz např. US 5,656,435). Polypeptidy o délce minimálně ca 65 aminokyselin mohou být použity přímo i bez nosiče k přípravě póly- nebo monoklonálních protilátek.6-12, in particular about 8 amino acids in length, contain an epitope which, upon binding to a carrier, serves to prepare specific pole or monoclonal antibodies (see, eg, US 5,656,435). Polypeptides of at least about 65 amino acids in length can be used directly or without a carrier to prepare polys or monoclonal antibodies.

Pojmem funkční varianta ve smyslu tohoto vynálezu se rozumí polypeptidy, které jsou příbuzné s peptidem podle , tohoto vynálezu, t.zn., že vykazují glukanasovou aktivitu.The term functional variant within the meaning of the present invention is understood to mean polypeptides that are related to the peptide of the present invention, i.e., exhibit glucanase activity.

Variantami se rozumí i alelické varianty nebo polypeptidy,Variants include allelic variants or polypeptides,

- které mohou pocházet i z různých kvasinek / kmenů kvasinek nebo jiných původců infekcí, jako jsou dermatofyty nebo plísně (podle DHS-systému).- which may also originate from different yeast / yeast strains or other agents of infections such as dermatophytes or fungi (according to the DHS system).

V dalším smyslu se do tohoto vynálezu zahrnují i polypeptidy, které vykazují homologii sekvencí, zejména identitu sekvencí z cca 70 %, zejména z cca 80%, obzvláště z cca 90 % a především z cca 95 % s polypeptidem s aminokyselinovou sekvencí podle obr. 2. Dále se sem řadí i vyštěpení polypeptidu v rozsahu cca 1-60, zejména 1-30, obzvláště cca 1 - 15 a především cca 1-5 aminokyselin. Tak na příklad může chybět první aminokyselina methionin, aniž by se funkce tohoto polypeptidu podstatně změnila. Kromě toho sem patří i fúzní proteiny, které obsahují výšeuvedené polypeptidy podle tohoto vynálezu, přičemž tyto fúzní proteiny již samy mají funkci glukanasy nebo tuto specifickou funkci mohou získat až po odštěpení fúzního podílu. Patří sem především • fúzní proteiny s podílem zejména ne-humánních sekvencí obsahujících cca 1 - 200, zejména cca 1 - 150, obzvláště cca • 1 - 100 a především cca 1-50 aminokyselin. Jako příklady ne-humánních peptidových sekvencí je možno uvést prokaryotické peptidové sekvence, např. z galaktosidasy z E.coli • · · ♦ · · ·· · · ··· · · · · ·«· • ······· · · ·· · · *· * · · · · * · · « nebo tzv. histidinový řetězec (Histidin-Tag), např.In a further aspect, polypeptides which exhibit sequence homology, in particular sequence identity of about 70%, especially about 80%, especially about 90%, and especially about 95% with the polypeptide having the amino acid sequence of Figure 2, are also included in the invention. Also included are cleavage of the polypeptide in the range of about 1-60, especially 1-30, especially about 1-15, and especially about 1-5 amino acids. For example, the first amino acid methionine may be absent without substantially altering the function of the polypeptide. In addition, fusion proteins comprising the above-described polypeptides of the present invention are included, wherein the fusion proteins themselves already have a glucanase function or can only obtain this specific function after cleavage of the fusion moiety. These include, in particular, fusion proteins having a proportion of particularly non-human sequences comprising about 1 - 200, especially about 1 - 150, especially about 1 - 100 and especially about 1-50 amino acids. Examples of non-human peptide sequences include prokaryotic peptide sequences, eg, from E.coli galactosidase, such as galactosidase from E. coli. Or a so-called histidine-tag, e.g.

Met-Ala-Hisg-řetězec (Tag). Fúzní protein s tzv. histidinovým řetězcem je obzvláště vhodný pro čištění exprlinovaného proteinu na koloně s kovovými ionty, např. s použitím o .Met-Ala-Hisg-chain (Tag). A fusion protein with a so-called histidine chain is particularly suitable for purifying the expressed protein on a metal ion column, e.g. using o.

sloupce Ni -NTA. NTA představuje chelátor, kterým je nitrilotrioctová kyselina (Qiagen GmbH, Hilden). Tento vynález zahrnuje i polypeptidy podle tohoto vynálezu, které jsou skryté jako pro-protein nebo v nej širším smyslu jako Pre-drug.Ni-NTA columns. NTA is a chelator which is nitrilotriacetic acid (Qiagen GmbH, Hilden). The invention also encompasses polypeptides of the invention that are hidden as a pro-protein or, in the broadest sense, as a Pre-drug.

Části polypeptidů podle tohoto vynálezu představují např. epitopy, které je možno specificky rozeznat pomocí protilátek.Portions of the polypeptides of the invention are, for example, epitopes that can be specifically recognized by antibodies.

Polypeptidy podle tohoto vynálezu je možno připravit např. expresí nukleových kyselin podle tohoto vynálezu ve vhodném expresním systému s použitím dříve popsaných metod, které jsou odborníkům známy. Jako hostitelské buňky pro přípravu správně zpracovaných a tím i biologicky aktivních proteintoxinů jsou vhodné výhradně eukaryotické organismy, zejména pučící kvasinky (Sprosshefe) Saccharomyces cerevisiae a štěpné kvasinky (Spalthefe) Schizosaccharomyces pombe.Polypeptides of the invention may be prepared, for example, by expressing the nucleic acids of the invention in a suitable expression system using methods previously described known to those skilled in the art. Only eukaryotic organisms, in particular budding yeast (Sprosshefe) of Saccharomyces cerevisiae and fission yeast (Spalthefe) of Schizosaccharomyces pombe, are suitable as host cells for the preparation of correctly processed and thus biologically active protein toxins.

Uvedené části polypeptidů je možno rovněž syntetizovat i pomocí klasické syntézy peptidů (technika Merrifield). Tyto části jsou vhodné zejména pro získání antisér, s jejichž pomocí je možno prozkoumávat vhodné genexpresní banky tak, aby bylo možno získat další funkční varianty polypeptidů podle tohoto vynálezu.These portions of the polypeptides can also be synthesized by classical peptide synthesis (Merrifield technique). These portions are particularly useful for obtaining antisera by which suitable genexpression banks can be screened to obtain additional functional variants of the polypeptides of the invention.

Další předmět tohoto vynálezu se proto vztahuje na postup pro přípravu polypeptidů podle tohoto vynálezu, přičemž ··· ·· · ·* ·· • · * · · · · ···« ···· · · · · · · • ······· · 9 9 9 9 · • · · 9 9 9 9 9 9 • 9 9 9 9 9 9 9 · 9 9 9 9 9 nukleová kyselina podle tohoto vynálezu se ve vhodné hostitelské buňce exprimuje a případně izoluje.Therefore, a further object of the present invention relates to a process for preparing the polypeptides of the present invention, wherein the polypeptide of the present invention is: 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 The nucleic acid of the invention is expressed and optionally isolated in a suitable host cell.

Obzvláště preferovány jsou dělící se kvasinky Schizosaccharomyces pombe, poněvadž tyto kvasinky vykazují přirozenou resistenci proti VICALTINU a ZYGOCINU a byly již několikrát úspěšně použity pro heterologickou expresi cizích proteinů [Giga-Hama a Kumagai (1997) v publikaci Foreign Gene Expresion in Fission Yeast (Exprese cizích genů v dělících se kvasinkách): Schizosaccharomyces pombe, nakl. Springer]. Jak je uvedeno v příkladu 11, mohou být toxin-kódující nukleové· kyseliny podle SEQ ID No 1 a No 2 nakloňovány např. do S. pombe-vektoru pREPl [Maundrell (1990), J. Biol. Chem. 265:10857-10864], v němž jsou pod transkripční kontrolou thiamin-regulovaného nmtl promotoru dělících se kvasinek [nmt = no message with thíamine]. Kvasinky transformované tímto vektorem exprimují příslušný cizorodý gen v závislosti na koncentraci thiaminu v kultivačním mediu kvasinek. Tímto způsobem je případně možno časově oddělit fázi růstu kvasinek od fáze produkce cizorodého proteinu, takže je principiálně možno provést i expresi proteinů, které jsou pro kvasinky toxické. Aby bylo možno provádět současnou sekreci a tím podstatně usnadnit čištění heterologicky exprimovaných toxinů VICALTIN a ZYGOCIN v S.pombe, provedli jsme konstrukci expresního/ /sekrečního vektoru [vektor ρΤΖατ; viz příklad 11], který obsahuje sekreční a procesní signál virálního K28-preprotoxingenu [Schmitt a Tipper, 1995] a tím umožňuje účinnou sekreci příslušného in-frame zařazeného cizorodého proteinu.Particularly preferred are yeast dividing Schizosaccharomyces pombe, since these yeasts exhibit natural resistance to VICALTIN and ZYGOCIN and have been successfully used several times for heterologous expression of foreign proteins [Giga-Hama and Kumagai (1997) in Foreign Gene Expression in Fission Yeast genes in dividing yeast): Schizosaccharomyces pombe, nakl. Springer]. As shown in Example 11, the toxin-encoding nucleic acids of SEQ ID No 1 and No 2 can be cloned into, e.g., the S. pombe-vector pREP1 [Maundrell (1990), J. Biol. Chem. 265: 10857-10864], in which they are under transcriptional control of the thiamine-regulated nmt1 promoter of dividing yeast [nmt = no message with thiamine]. The yeast transformed with this vector expresses the respective foreign gene depending on the concentration of thiamine in the yeast culture medium. In this way, the yeast growth phase may optionally be temporally separated from the foreign protein production phase, so that in principle the expression of proteins which are toxic to the yeast can also be expressed. In order to perform simultaneous secretion and thereby substantially facilitate the purification of heterologously expressed toxins VICALTIN and ZYGOCIN in S.pombe, we constructed an expression / / secretion vector [vector ρΤΖατ; see Example 11], which contains the secretion and process signal of viral K28-preprotoxingene [Schmitt and Tipper, 1995], thereby allowing efficient secretion of the respective in-frame inserted foreign protein.

Další předmět tohoto vynálezu se vztahuje i na protilátky, které specificky reagují s polypeptidem podle tohotoAnother aspect of the invention also relates to antibodies that specifically react with a polypeptide of the invention

-16·«· · · · ·· · · vynálezu, přičemž výšeuvedené části tohoto polypeptidu jsou buď samy imunogenní nebo může být jejich imunogenita vyvolána nebo zvýšena navázáním na vhodný nosič, jako je např. bovinní sérový albumin.The above-mentioned portions of the polypeptide are either immunogenic themselves or their immunogenicity can be induced or increased by binding to a suitable carrier, such as bovine serum albumin.

Tyto protilátky jsou buď polyklonální nebo monoklonální. Jejich příprava, která je rovněž předmětem tohoto vynálezu, se provádí např. podle všeobecně známých metod imunizací nějakého savce, jako je na příklad králík, polypeptidem nebo jeho výšeuvedenou částí podle tohoto vynálezu, případně za přítomnosti např. Freundova adjuvantu a/nebo aluminiumhydroxidových gelů (viz např. Diamond, B.A. a spol. (1981)These antibodies are either polyclonal or monoclonal. Their preparation, which is also an object of the invention, is carried out, for example, according to well-known methods by immunizing a mammal, such as a rabbit, with a polypeptide or a portion thereof as described herein, optionally in the presence of e.g. Freund's adjuvant and / or aluminum hydroxide gels. see, eg, Diamond, BA et al (1981)

The New England Journal of Medicíně, 1344). Polyklonální protilátky vzniklé ve zvířeti imunologickou reakcí je možno nakonec pomocí obecně známých metod snadno izolovat z krve a čistit např. pomocí sloupcové chromatografie. Preferováno je afinitní čištění protilátek, při němž se např. příslušný antigen (VICALTIN nebo ZYGOCIN) kovalentně naváže na všeobecně dostupnou CnBr-aktivovanou Sepharosovou matrici a použije se pro čištění příslušných toxinspecifických protilátek.The New England Journal of Medicine, 1344). Finally, polyclonal antibodies produced in an animal by an immunological reaction can be readily isolated from the blood by means of generally known methods and purified, for example, by column chromatography. Affinity purification of antibodies is preferred, wherein, for example, an appropriate antigen (VICALTIN or ZYGOCIN) is covalently bound to a generally available CnBr-activated Sepharose matrix and used to purify the respective toxin-specific antibodies.

Monoklonální protilátky je možno připravit např. podle známé metody kterou publikovali Vinter a Milstein (Vinter, G. a Milstein, C. (1991) Nátuře, 349, 293).Monoclonal antibodies can be prepared, for example, according to the known method of Vinter and Milstein (Vinter, G. and Milstein, C. (1991) Nature, 349, 293).

Dalším předmětem tohoto vynálezu je i léčivo, které obsahuje nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu nebo polypeptidy podle tohoto vynálezu (samotné nebo v kombinaci) a případně vhodné přísady nebo pomocné látky a postup pro přípravu tohoto léčiva pro léčbu mykóz, jako jsou povrchové, kutánní a subkutánní dermatomykózy, mykózy sliznic a systémové mykózy, a to zejména Candida-mykózy,A further object of the invention is also a medicament comprising the nucleic acids of the invention or the polypeptides of the invention (alone or in combination) and optionally suitable additives or excipients and a process for preparing the medicament for the treatment of mycoses such as superficial, cutaneous and subcutaneous dermatomycoses, mucosal mycoses and systemic mycoses, in particular Candida mycoses,

-17přičemž se nukleová kyselina podle tohoto vynálezu nebo polypeptid podle tohoto vynálezu kombinují s farmaceuticky vhodnými přísadami a/nebo pomocnými látkami.Wherein the nucleic acid of the invention or polypeptide of the invention is combined with pharmaceutically acceptable excipients and / or excipients.

V příkladu 12 je uvedeno, že čištěný toxin VICALTIN produkovaný kmenem DSM 12865 má dokonce podstatně vyšší toxicitu pro kvasinky než srovnávaná antimykotika Clotrimazol a Miconazol, která se pro léčbu mykóz často používají.Example 12 states that the purified VICALTIN toxin produced by the DSM 12865 strain has even significantly higher yeast toxicity than the compared antifungal agents Clotrimazole and Miconazole, which are often used to treat mycoses.

Proto se tento vynález týká i léčiva ve výše uvedeném smyslu, které obsahuje antimykotikum nebo proteintoxin izolovaný z DSM 12864 a/nebo DSM 12865 a/nebo polypeptidy s antimykotickým účinkem podle tohoto vynálezu.Accordingly, the present invention also relates to a medicament as defined above comprising an antifungal or protein toxin isolated from DSM 12864 and / or DSM 12865 and / or polypeptides having antifungal activity according to the invention.

Pro genově-terapeutické použití u člověka je vhodné zejména takové léčivo, které obsahuje nukleovou kyselinu podle tohoto vynálezu v základní formě (nackte Form) nebo ve formě některého z výšeuvedených genově-terapeuticky účinných vektorů nebo ve formě komplexu s liposomy.Particularly suitable for gene-therapeutic use in humans is a medicament which comprises the nucleic acid of the present invention in its basic form (nackte Form) or in the form of one of the aforementioned gene-therapeutically effective vectors or in the form of a complex with liposomes.

Jako vhodné přísady a/nebo pomocné látky je možno použít např. fyziologický roztok kuchyňské soli, stabilizátory, proteinasové inhibitory, nukleasové inhibitory atd.Suitable additives and / or excipients are, for example, saline, stabilizers, proteinase inhibitors, nuclease inhibitors, etc.

Dalším předmětem tohoto vynálezu je diagnostický prostředek obsahující nukleovou kyselinu podle tohoto vynálezu, polypeptid podle tohoto vynálezu nebo protilátky podle tohoto vynálezu a případně vhodné přísady a/nebo pomocné látky a postup přípravy tohoto diagnostického prostředku pro diagnózu mykóz, jako jsou povrchové, kutánní a subkutánní dermatomykózy, mykózy sliznic a systémové mykózy, a to zejméma Candida-mykózy, při němž se nukleová kyselina podle tohoto vynálezu, polypeptid podle tohoto • · • · • · vynálezu nebo protilátky podle tohoto vynálezu kombinují s vhodnými přísadami a/nebo pomocnými látkami.The invention further provides a diagnostic composition comprising a nucleic acid of the invention, a polypeptide of the invention or an antibody of the invention, and optionally suitable additives and / or excipients, and a process for preparing the diagnostic composition for diagnosing mycoses such as superficial, cutaneous and subcutaneous dermatomycoses. mucosal mycoses and systemic mycoses, in particular Candida mycosis, wherein the nucleic acid of the invention, the polypeptide of the invention or the antibodies of the invention are combined with suitable excipients and / or excipients.

Tak je možno na příklad podle tohoto vynálezu s použitím nukleových kyselin podle tohoto vynálezu získat diagnostikům na základě polymerasové řetězové reakce (PCR-diagnostika, např. podle EP-0200362), nebo Northern a/nebo Southern Blot-analýzy, jak je blíže popsáno v příkladu 13. Tyto testy jsou založeny na specifické hybridizaci nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu s komplementárním protivláknem (Gegenstrang) zpravidla odpovídající mRNA. Nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu mohou být přitom modifikovány i způsobem popsaným např. v EP0063879. Přitom se zejména DNA-fragment podle tohoto vynálezu označí podle známých metod vhodnými činidly, jako je např. radioaktivní a-PJ -dATP nebo neradioaktivní biotin a inkubuje se s izolovanou RNA, zpravidla navázanou na vhodné membráně např. z celulózy nebo nylonu.-Přitom je výhodné izolovanou RNA před hybridizaci a navázáním na membránu rozdělit v závislosti na její velikosti např. pomocí elektroforézy na agarosovém gelu. Při stejném množství sledované RNA z každého vzorku tkáně je tak možno stanovit množství mRNA specificky značené pomocí sondy.Thus, for example, according to the invention, using the nucleic acids of the invention, one can obtain diagnostics based on polymerase chain reaction (PCR-diagnostics, e.g. according to EP-0200362), or Northern and / or Southern Blot analysis, as described in more detail in Example 13. These assays are based on the specific hybridization of a nucleic acid of the invention with a complementary counter strand (Gegenstrang) typically corresponding to mRNA. The nucleic acids according to the invention can also be modified in the manner described, for example, in EP0063879. In particular, this DNA fragment according to the invention labeled by known methods with suitable reagents such as e.g. aP J radioactive or non-radioactive biotin -dATP and incubated with isolated RNA, generally attached to a suitable membrane, e.g. cellulose or nylonu.-It is it is preferred to separate the isolated RNA prior to hybridization and membrane binding, depending on its size, for example by agarose gel electrophoresis. Thus, with the same amount of RNA of interest from each tissue sample, the amount of mRNA specifically labeled with the probe can be determined.

Další diagnostikům obsahuje polypeptid podle tohoto vynálezu resp. jeho výšeuvedené imunogenní části. Tento polypeptid resp. jeho části, vázané především na pevné fázi, např. na nitrocelulóze nebo nylonu, je možno např. dát in vitro do styku s vyšetřovanou tělesnou tekutinou, např. krví, aby mohlo např. dojít k reakci s protilátkou. Tento komplex protilátka-peptid může být potom prokázán např. pomocí značené antihuman-IgG-protilátky nebo antihuman-Igří-protilátky. Při tomto značení se jedná např. o enzym, jakoFor further diagnosis, the polypeptide of the invention and the invention comprise, respectively. immunogenic portions thereof. This polypeptide, respectively. For example, portions thereof bound primarily to a solid phase, such as nitrocellulose or nylon, may be contacted in vitro with the body fluid to be examined, such as blood, for example, to react with the antibody. This antibody-peptide complex can then be detected, for example, with a labeled anti-human-IgG-antibody or anti-human-IgI-antibody. This labeling is, for example, an enzyme such as

je peroxidasa, který katalýzuje barevnou reakci. Přítomnost a množství přítomných autoimunitních protilátek je tak možno snadno a rychle prokázat pomocí barevné reakce.is a peroxidase that catalyses the color reaction. Thus, the presence and amount of autoimmune antibodies present can be easily and rapidly detected by a color reaction.

Další diagnostikům obsahuje protilátky podle tohoto vynálezu jako takové. Pomocí těchto protilátek je možno např. snadno a rychle vyšetřovat vzorky lidské tkáně na přítomnost příslušného polypeptidu. V tomto případě se protilátky podle tohoto vynálezu značí např. enzymem, jak bylo popsáno dříve. Specifický komplex protilátka-peptid je tak možno snadno a rychle prokázat pomocí enzymatické barevné reakce.Other diagnostics include the antibodies of the invention as such. With these antibodies, for example, human tissue samples can be easily and rapidly examined for the presence of the polypeptide of interest. In this case, the antibodies of the invention are labeled with, for example, an enzyme as described previously. Thus, the specific antibody-peptide complex can be detected easily and rapidly by an enzymatic color reaction.

Další předmět tohoto vynálezu se týká fungicidu, který obsahuje nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu a/nebo polypeptidy podle tohoto vynálezu (jednotlivě nebo v kombinaci) a případně vhodné přísady nebo pomocné látky a dále postupu přípravy fungicidu pro ničení škodlivých kvasinek a škodlivých hub, při němž se kombinuje nukleová kyselina podle tohoto vynálezu nebo polypeptid podle tohoto vynálezu se zemědělsky přípustnými přísadami a/nebo pomocnými látkami.A further object of the invention relates to a fungicide comprising the nucleic acids of the invention and / or the polypeptides of the invention (singly or in combination) and optionally a suitable additive or excipient and a process for preparing a fungicide for controlling harmful yeasts and harmful fungi combining a nucleic acid of the invention or a polypeptide of the invention with agriculturally acceptable ingredients and / or excipients.

Jak bylo popsáno dříve, byla v jedné výše uvedené formě provedení získána transgenní rostlina, která exprimuje proteintoxin podle tohoto vynálezu. Proto se tento vynález týká i rostlinných buněk a rovněž transgenní rostliny jako takové, které obsahují polypeptidy a/nebo proteintoxiny podle tohoto vynálezu.As described previously, in one of the above embodiments, a transgenic plant that expresses a protein toxin of the invention was obtained. Therefore, the present invention also relates to plant cells as well as transgenic plants as such which comprise the polypeptides and / or protein toxins of the invention.

Další předmět tohoto vynálezu se týká testu pro identifikaci funkčních interaktorů, jako jsou např. inhibitory nebo stimulátory obsahující nukleovou kyselinu podle tohoto vynálezu, polypeptid podle tohoto vynálezu nebo protilátku podle tohoto vynálezu a případně vhodné přísady a/nebo pomocné látky.A further object of the invention relates to an assay for identifying functional interactions, such as inhibitors or stimulators comprising a nucleic acid of the invention, a polypeptide of the invention or an antibody of the invention, and optionally suitable additives and / or excipients.

Vhodným testem pro identifikaci funkčních interaktorů, zejména takových, které v senzitivní buňce kvasinek reagují s proteintoxinem ZYGOCINEM podle SED ID No 2 je např. tzv. Two-Hybrid System (Fields, S. a Sternglanz, R. (1994) Trends in Genetics, 10, 286). Při tomto testu se buňka, např. buňka kvasinek transformuje nebo transferuje s jedním nebo několika expresními vektory, exprimujícími fúzní protein, který obsahuje polypeptid podle tohoto vynálezu a DNA-vaznou doménu známého proteinu, např. z Gal4 nebo LexA z E.coli a/nebo s vektory, které exprimuji fúzní protein, který obsahuje neznámý polypeptid a jednu transkripčně-aktivační doménu, např. z Gal4, herpesviru VP16 nebo B42. Kromě toho obsahuje tato buňka reportergen, např. LacZ-gen z E.coli, Green (zelený) Fluorescence Protein nebo kvasinkové geny biosyntézy aminokyselin (AS-Biosynthesegene der Hefe) His3 nebo Leu2, které prostřednictvím regulačních sekvencí, jako jsou např. IexA-promotor/operátor nebo tzv. Upstream (vzestupná) Activation Sequence (UAS) kvasinku řídí. Neznámý polypeptid se např. kóduje DNA-fragmentem pocházejícím z genové banky, např z humánní genové banky. V kvasinkách se zpravidla připravuje pomocí popsaných expresních vektorů cDNA-genová banka, takže ihned potom je možno test provést.A suitable test for the identification of functional interactions, especially those that react with protein toxin ZYGOCIN according to SED ID No 2 in a sensitive yeast cell, is the so-called Two-Hybrid System (Fields, S. and Sternglanz, R. (1994) Trends in Genetics, 10, 286). In this assay, a cell, eg, a yeast cell, is transformed or transferred with one or more expression vectors expressing a fusion protein comprising a polypeptide of the invention and a DNA-binding domain of a known protein, eg, from Gal4 or LexA from E.coli and / or with vectors that express a fusion protein that contains an unknown polypeptide and one transcriptional-activation domain, e.g., from Gal4, herpesvirus VP16 or B42. In addition, the cell contains a reportergen, e.g., the LacZ gene from E. coli, Green Fluorescence Protein or yeast amino acid biosynthesis genes (AS-Biosynthesegene der Hefe) His3 or Leu2, which, through regulatory sequences such as IexA- the promoter / operator or the so-called Upstream Activation Sequence (UAS) controls the yeast. For example, an unknown polypeptide is encoded by a DNA fragment derived from a gene bank, such as a human gene bank. In yeast, a cDNA gene bank is typically prepared using the expression vectors described, so that the assay can be performed immediately thereafter.

Tak na příklad se v kvasinkovém expresním vektoru klonují nukleové kyseliny podle tohoto vynálezu ve funkční jednotce na nukleovou kyselinu kódující LexA-DNA-vaznou doménu, takže dochází k expresi fúzního proteinu z polypeptidu podle tohoto vynálezu a LexA-DNA-vazné domény v trans• · · • · · · · · · ···· • · » · ·· · ·« « • ······· · » · · · · • · · · · · · · · *· · ·· ··· ·· ···· formovaných kvasinkách. V jiném kvasinkovém expresním vektoru se cDNA-fragmenty z cDNA-genové banky ve funkční jednotce klonují na nukleovou kyselinu kódující Gal4-transkripčně-aktivační doménu, takže dochází k expresi fúzního proteinu z neznámého polypeptidu a Gal4-transkripčně-aktivační domény v transformovaných kvasinkách. Kvasinka transformovaná pomocí obou těchto vektorů, např. Leu2’, obsahuje kromě toho nukleovou kyselinu kódující Leu2, která je řízena LexA-promotor-operátorem. V případě funkční interakce mezi polypeptidem podle tohoto vynálezu a neznámým polypeptidem se váže Gal4-transkripčně-aktivační doména prostřednictvím LexA-DNA-vazné domény na LexA-promotor-operátor, který se aktivuje a exprimuje Leu2-gen. To má za následek, že kvasinky Leu2’ mohou růst na minimálním mediu, které neobsahuje žádný leucin.For example, in a yeast expression vector, the nucleic acids of the invention are cloned in a functional unit into a nucleic acid encoding a LexA-DNA-binding domain, such that the fusion protein from the polypeptide of the invention and the LexA-DNA-binding domain are expressed in the trans. • • · «« «« «« «« «* * * * * * * * * * * * * * * ··· ·· ···· formed yeast. In another yeast expression vector, cDNA fragments from a cDNA gene bank in a functional unit are cloned into a nucleic acid encoding a Gal4-transcriptional-activation domain, so that a fusion protein from an unknown polypeptide and the Gal4-transcriptional-activation domain is expressed in transformed yeast. The yeast transformed with both of these vectors, e.g. Leu2 ', also contains a nucleic acid encoding Leu2, which is under the control of the LexA-promoter-operator. In the case of a functional interaction between a polypeptide of the invention and an unknown polypeptide, the Gal4-transcriptional-activation domain binds through the LexA-DNA-binding domain to a LexA-promoter-operator that activates and expresses the Leu2-gene. As a result, the Leu2 yeast can grow on minimal medium containing no leucine.

Při použití LacZ- resp. Green Fluorescence Protein” -reportergenu namísto genu biosyntézy aminokyselin je možno aktivaci transkripce prokázat tvorbou modře, resp. zeleně fluoreskujících kolonií. Míru modré resp. zelené fluorescence je možno snadno kvantifikovat spektrofotometricky např. v případě modré barvy při 585 nm.When using LacZ- resp. Green Fluorescence Protein ”-reportergen instead of the amino acid biosynthesis gene can be shown by activation of transcription in blue, resp. green fluorescing colonies. Peace blue respectively. green fluorescence can be easily quantified spectrophotometrically, for example in the case of a blue color at 585 nm.

Tímto způsobem je možno snadno a rychle zjišťovat v expresních genových bankách přítomnost polypeptidů, které reagují s polypeptidem podle tohoto vynálezu. Potom je možno nalezený nový polypeptid izolovat a dále charakterizovat.In this way, the presence of polypeptides that react with a polypeptide of the invention can be readily and rapidly detected in expression gene banks. The novel polypeptide can then be isolated and further characterized.

Další možností použití systému Two-Hybrid System je ovlivnění interakce mezi polypeptidem podle tohoto vynálezu a známým nebo neznámým polypeptidem působením dalších látek, jako jsou např. chemické sloučeniny. Tento způsob umožňuje i snadné vyhledávání nové chemicky syntetizovatelné účinné látky, kterou je možno použít jako terapeutika. Tento vynález proto není zaměřen pouze na postup pro vyhledávání polypeptidických interaktorů, nýbrž se vztahuje i na postup vyhledávání látek, které mohou reagovat s výšeuvedeným protein-protein-komplexem. Tyto peptidické a rovněž chemické interaktory jsou označovány ve smyslu tohoto vynálezu jako funkční interaktory, které mohou mít inhibiční nebo stimulační účinky.Another possibility of using the Two-Hybrid System is to influence the interaction between a polypeptide of the invention and a known or unknown polypeptide by the action of other agents, such as chemical compounds. This method also makes it possible to easily find a new chemically synthesizable active substance which can be used as therapeutics. Therefore, the present invention is directed not only to a procedure for screening for polypeptide interactions but also to a process for screening for substances that may react with the above-mentioned protein-protein complex. These peptide and chemical interactions are referred to within the meaning of the invention as functional interactions that may have inhibitory or stimulatory effects.

Další předmět tohoto vynálezu se týká postupu pro přípravu proteintoxinů zahrnujícího kultivaci a sekreci proteintoxinů v mediu, které je syntetickým kultivačním mediem (BAVC-medium), chromatografické čištění secernovaného toxinu, např. pomocí ultrafiltrace a katexové chromatografie a/nebo afinitní chromatografie na Laminarin-Sepharose a/nebo na Mannoprotein-Sepharose [viz příklad 1 a dodatek k příkladům]. V případě VICALTINU produkovaného a secernovaného kmenem DSM 12865 je možno dosáhnout dalšího zvýšení produkce toxinu tím, že se do media přidá rostlinný (a všeobecně dostupný) β-l,3-D-glukan laminarin na konečnou koncentraci 1 %. Jak je uvedeno v příkladu 14, vede přídavek laminarinu do kultivačního media k podnícení tvorby VICALTINU, která je podle Northern-analýzy vyvolána indukcí transkripce.Another object of the present invention relates to a process for the preparation of protein toxins comprising culturing and secreting protein toxins in a medium that is a synthetic culture medium (BAVC-medium), chromatographic purification of a secreted toxin, eg by ultrafiltration and cation exchange chromatography and / or Laminarin-Sepharose affinity chromatography and / or Mannoprotein-Sepharose [see Example 1 and Appendix to Examples]. In the case of VICALTIN produced and secreted by DSM 12865 strain, further increase in toxin production can be achieved by adding vegetable (and generally available) β-1,3-D-glucan laminarin to a final concentration of 1%. As shown in Example 14, the addition of laminarin to the culture medium stimulates the formation of VICALTIN, which is induced by induction of transcription according to Northern analysis.

Pro tvorbu toxinu ZYGOCINU secernovaného DSM 12864 je možno používat syntetické B-medium [viz Radler a spol.,Synthetic B-medium can be used to form ZYGOCIN secreted DSM 12864 [see Radler et al.

1993] .1993].

Dále uvedené příklady slouží pro ilustraci tohoto vynálezu a neznamenaj í žádné omezení tohoto vynálezu pouze na tyto příklady.The examples below serve to illustrate the invention and do not limit the invention to these examples.

•« · • ·• «·

Příklady provedení vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

Příklad 1Example 1

Izolace, koncentrace a čištění anti-Candida-toxinu VICALTIN ze supernatantu kultivačního roztoku killer-kvasinek H7. californica kmen 3/57 Q)SM 12865)Isolation, concentration and purification of anti-Candida toxin VICALTIN from the killer-yeast H 7 culture supernatant. californica strain 3/57 Q) SM 12865)

Killer-toxin VICALTIN secernovaný killer-kvasinkami W. californica 3/57 vykázal při agarovém difuzním testu na agaru s methylenovou modří (Methylenblau-Agar) optimální inhibiční působení na senzitivní kvasinky při pH 4,7 a 20 °C. V syntetickém kapalném mediu vykazují killer-kvasinky W. californica 3/51 maximální produkci toxinu při kultivaci v BAVC-mediu (pH 4,7). Pro zvýšení tvorby toxinu byly killer-kvasinky nejprve inkubovány za protřepávání po dobu 24 hodin v 5 ml YEPD-media při teplotě 30 °C a potom byly kvantitativně převedeny do 200 ml BAVC-media a znovu byly kultivovány po dobu 48 hodin při teplotě 20 °C na třepačce (140 ot./min.). Čtyři hlavní kultury (Hauptkultur) byly zaočkovány předpěstovanou kulturou (Vorkultur) (l%ní inokulum) vždy do 2,5 1 BAVC-media (pH 4,7 v 5 1 Erlenmeyerově baňce) a inkubovány po dobu 5 dnů za mírného třepání (60 ot./min.). Pro zkoncentrování secernovaného killer-toxinu byl bezbuněčný supernatant při teplotě +4 °C a tlaku 1 bar 200-násobně zahuštěn ultrafiltrací na membránách z polysulfonových kyselin (EasyFlow [fa.Sartorius]; vylučovací mez /Ausschlussgrenze/ 10 kDa) na objem 50 ml.Killer-toxin VICALTIN secreted by W. californica 3/57 killer-yeast showed an optimal inhibitory effect on sensitive yeast at pH 4.7 and 20 ° C in an methylene blue agar diffusion test (Methylenblau-Agar). In synthetic liquid medium, killer-yeast W. californica 3/51 show maximum toxin production when cultured in BAVC-medium (pH 4.7). To increase toxin production, the killer yeast was first incubated with shaking for 24 hours in 5 ml YEPD-medium at 30 ° C and then quantitatively transferred to 200 ml BAVC-medium and cultured again for 48 hours at 20 ° C on the shaker (140 rpm). The four main cultures (Hauptkultur) were inoculated with a pre-cultured culture (Vorkultur) (1% inoculum) in 2.5 L of BAVC-medium (pH 4.7 in a 5 L Erlenmeyer flask) and incubated for 5 days with gentle shaking (60 rpm). To concentrate the secreted killer-toxin, the cell-free supernatant at +4 ° C and 1 bar pressure was 200-fold concentrated by ultrafiltration on polysulfonic acid membranes (EasyFlow [fa.Sartorius]; exclusion limit / Ausschlussgrenze / 10 kDa) to a volume of 50 ml.

Pro odstranění nízkomolekulárních sloučenin a pro odstranění solí z takto získaného koncentrátu byl toxin dialyzován přes noc při 4 °C v dialyzační trubici (vylučovací mez 10-20 kDa) proti 5 mM citrát-fosfátovému pufru (pH 4,7). Pro uchování ·· « * koncentrátu toxinu byl dialyzovaný preparát sterilně zfiltrován přes membránu 0,2 pm a v dávkách po 1 ml byl zmrazen na -20 °C.To remove low molecular weight compounds and to remove salts from the concentrate thus obtained, the toxin was dialyzed overnight at 4 ° C in a dialysis tube (exclusion limit 10-20 kDa) against 5 mM citrate-phosphate buffer (pH 4.7). To store the toxin concentrate, the dialyzed preparation was sterile filtered through a 0.2 µm membrane and frozen in portions of 1 ml at -20 ° C.

Důkaz a kalibrace aktivity toxinu byly provedeny při agarovém difuzním testu na agaru s methylenovou modří (MBA;Detection and calibration of toxin activity was performed in a methylene blue agar diffusion test (MBA;

i pH 4,7) proti senzitivním indikačním kvasinkám Saccharomyces cerevzsiae 192.2d. Přitom byly z koncentrátu toxinu připraveny logaritmické zřeďovací stupně v 0,1 M citrát-fosfátovém pufru (pH 4,7) a bylo pipetováno vždy 100 pl do předem vyseknutých otvorů (průměr otvoru 9 mm) v MBA-desce zaočkované senzitivními indikačními kvasinkami (2x10$ buněk/ml). Po třídenní inkubaci desek při teplotě 20 °C byly změřeny dobře viditelné inhibiční dvorce (Hemmhof). Přitom se prokázalo, že mezi průměrem inhibičního dvorce a logaritmem koncentrace toxinu existuje lineární vztah. Průměru inhibičního dvorce (korigovanému na průměr otvoru) 20 mm byla uzančně přiřazena aktivita toxinu 1 x 10^ jednotek/ml.i pH 4.7) against the sensitive indicator yeast Saccharomyces cerevzsiae 192.2d. Logarithmic dilution steps in 0.1 M citrate-phosphate buffer (pH 4.7) were prepared from the toxin concentrate and 100 µl each was pipetted into pre-punched holes (9 mm hole diameter) in an MBA plate inoculated with sensitive indicator yeast (2x10 6). $ cells / ml). After three days incubation of the plates at 20 ° C, well visible inhibition wells (Hemmhof) were measured. It has been shown that there is a linear relationship between the inhibition court diameter and the logarithm of the toxin concentration. To the diameter of the inhibition court (corrected for hole diameter) of 20 mm, toxin activity was 1 x 10 6 units / ml.

Čištění koncentrovaného toxinu VITCALTIN bylo prováděno buď katexovou chromatografií na Bioscale-S (FPLC) nebo afinitní chromatografií na epoxy-aktivované Sepharose-68-Matrix (Fa. Pharmacia), na kterou byl předem navázán rostlinný β-l,6-D-glukan pustulan. Tento toxinový preparát, u něhož byla tímto způsobem prokázána specifická aktivita odpovídající 625-násobnému obohacení (Tabulka 1) se při gelové elektroforéze jevil jako čistý a vykazoval po SDS-PAGE (v 10-22%ním gradientovém gelu) pouze samostatné oddělené pásy při cca 37 kDa, které bylo možno prokázat jak modří Coomassie-Blau (zbarvení proteinu) tak i Schiffovým činidlem s jodistou kyselinou (Perjodsáure-Schiffs-Reagent - PAS; zbarvení sacharidů). Pozitivní PAS-zbarvení ukazuje na potenciální N-glykosylaci arzti-Candida-toxinu VITCALTIN.Purification of concentrated VITCALTIN toxin was performed either by cation exchange chromatography on Bioscale-S (FPLC) or by affinity chromatography on epoxy-activated Sepharose-68-Matrix (Pharmacia) to which the plant β-1,6-D-glucan pustulan was pre-bound . This toxin preparation, which showed a specific activity corresponding to the 625-fold enrichment (Table 1), appeared to be pure in gel electrophoresis and showed only separate discrete bands after SDS-PAGE (in a 10-22% gradient gel) at ca. 37 kDa, which was detected by both Coomassie-Blau blue (protein staining) and Schiff's periodic acid reagent (Perjodsáure-Schiffs-Reagent - PAS; carbohydrate staining). Positive PAS staining indicates potential N-glycosylation of arzti-Candida toxin VITCALTIN.

»* · ·· · *· »» • » · · 4 4 · · · · · • · · » · 4 · 4 w 4 *·*··»· · · * β « • · * 4 4« » · » ·« · ·« · «4 -9 ·»>44 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 · »» «4 - 9» »4

Reakcí vyčištěného toxinu s endoglykasou-H bylo možno prokázat, že VITCALTIN obsahuje N-glykosidicky vázanou sacharidickou část o délce cca 3 kDa, která vzhledem ke své velikosti v kvasinkách rovněž ukazuje na jediné N-glykosylační místo v proteintoxinu. Vzhledem k tomu, že deglykosylovaný VITCALTIN vykazuje podstatně sníženou toxicitu, je možno soudit, že sacharidická část VITCALTINU je zřejmě pro navázání na senzitivní cílovou buňku nezbytná, t.zn., že nepřímo ovlivňuje biologickou aktivitu toxinu.Reaction of the purified toxin with endoglycases-H revealed that VITCALTIN contains an N-glycosidically linked carbohydrate moiety of about 3 kDa, which, due to its size in yeast, also points to a single N-glycosylation site in proteintoxin. Since deglycosylated VITCALTIN exhibits substantially reduced toxicity, it can be concluded that the saccharide portion of VITCALTIN appears to be necessary for binding to a sensitive target cell, i.e., it indirectly affects the biological activity of the toxin.

Tabulka 1:Table 1:

Zahuštění toxinu VITCALTIN ze supernatantu kultivačního media killer-kvasinek Williopsis californica [UF, ultrafiltrace]Concentration of VITCALTIN toxin from supernatant of killer-yeast culture medium Williopsis californica [UF, ultrafiltration]

Preparát Preparation Objem [ml] Volume [ml] Celk.protein [mg] Celk.protein [mg] Celková aktivita toxinu [Ε] , Total toxin activity [Ε], Specifická aktivita toxinu [E/mg] Specific activity toxin [E / mg] Aktivitní výtěžek [%] Activity yield [%] Faktor vyčištění (Reini- gungsf.) Factor cleanup (Reini- gungsf.) Supernatant kultiv. media Culture supernatant. media 10000 10000 24600 24600 7,9x105 7,9x10 5 3,2x10 3,2x10 100 100 ALIGN! 1 1 UF-retentát UF-retentate 50 50 162 162 6,3x105 6,3x10 5 3,9x103 3,9x10 3 80 80 122 122 Ivofil.dialyzát Ivofil.dialyzát 25 25 45,8 45.8 3,1x105 3,1x10 5 6,8x103 6,8x10 3 39 39 213 213 Bioscale S (katex) Bioscale S (cation exchanger) 64 64 1,28 1,28 2,5x104 2,5x10 4 2,0x104 2,0x10 4 3,2 3.2 625 625

Příklad 2Example 2

Stanovení NH2-terminální aminokyselinové sekvence preparátu VICALTIN a důkaz enzymatické β-1,3-glukonasové aktivityDetermination of NH 2 -terminal amino acid sequence of VICALTIN and evidence of enzymatic β-1,3-gluconase activity

Sekvencováním N-terminálních aminokyselin ve vyčištěném killer-toxinu bylo stanoveno prvních deset aminokyselin. Jak vyplývá» z obr. 1, vykazuje N-konec preparátu VICALTIN signifikantní homologii s amino-koncem endo-β-Ι,3-glukanasy kódované RG£2-genem z kvasinekThe first ten amino acids were determined by sequencing the N-terminal amino acids in the purified killer toxin. As shown in Fig. 1, the N-terminus of VICALTIN exhibits significant homology to the amino-terminus of the endo-β-β-glucanase encoded by the yeast RG-2 gene.

Saccharomyces cerevisiae.Saccharomyces cerevisiae.

Na základě této zjištěné homologie preparátu VICALTIN a BgI2 bylo zjišťováno, zda je v nečištěném koncentrátu toxinu a rovněž v čištěném toxinovém preparátu prokazatelná glukanasová aktivita. Jak při enzymatickém testu, při němž byl použit jako substrát β-1,3-D-glukan laminarin, tak i při fluorescenčním testu, při němž byl použit jako substrátBased on this homology of VICALTIN and BgI2, it was determined whether glucanase activity was detectable in the unpurified toxin concentrate as well as in the purified toxin preparation. Both in the enzymatic test using β-1,3-D-glucan laminarin as well as in the fluorescent test using substrate

4-methyl-umbelliferyl-p-D-glukosid (MUC), bylo možno u preparátů VICALTINU prokázat výraznou β-1,3-D-glukanasovou aktivitu; souběžně testovaný β-1,6-D-glukan pustulan se působením preparátu VICALTIN nehydrolyzoval.4-methyl-umbelliferyl-β-D-glucoside (MUC), VICALTIN preparations showed significant β-1,3-D-glucanase activity; concomitantly tested β-1,6-D-glucan pustulan was not hydrolyzed by VICALTIN.

Příklad 3Example 3

Míra přežití kvasinkových buněk po působení VICALTINU za přítomnosti a nepřítomnosti glukanů buněčné stěny: kompetiční analýzySurvival rate of yeast cells after treatment with VICALTIN in the presence and absence of cell wall glucan: competition analysis

Senzitivní buňky kvasinek kmene 5. cerevisiae 192.2d, které byly kultivovány v kapalném mediu YEPD (pH 4,7) při 20 °C za přítomnosti čištěného VICALTINU o aktivitě lx 10$ E/ml, vykázaly kinetiku usmrcování uvedenou v obr. 2. Přídavkem rostlinného β-1,6-D-glukanu pustulanu bylo možno míru přežití kvasinkových buněk po působení toxinu výrazně zvýšit. Tento přídavek při koncentracích 10 mg/ml způsobil úplné potlačení toxicity preparátu VICALTIN. Na rozdíl od pustulanu nevykázal β-1,3-D-glukan laminarin schopnost zvýšit míru přežití toxinem upravovaných kvasinkových buněk (obr.2).Sensitive yeast cells of strain 5. cerevisiae 192.2d, which were cultured in liquid medium YEPD (pH 4.7) at 20 ° C in the presence of purified VICALTIN with an activity of 1x10 $ E / ml, showed killing kinetics as shown in Fig. 2. of plant β-1,6-D-glucan of pustulan, the survival rate of yeast cells after toxin treatment could be significantly increased. This addition at concentrations of 10 mg / ml caused complete suppression of the toxicity of VICALTIN. Unlike pustulan, β-1,3-D-glucan laminarin did not show the ability to increase the survival rate of toxin-modified yeast cells (Figure 2).

Z uvedených poznatků je možno vyvodit závěr, že působení preparátu VICALTIN vyžaduje vazbu na β-1,6-ϋ^1η27 kaný, které fungují jako primární místo vazby (Andockstelle) (receptory toxinu) na buněčné stěně kvasinek. V souladu s tím bylo prokázáno, že kvasinky s vyštěpením v chromosomálním - genovém centru (Genlocus) mají toxinrezistentní chování a po retransformaci s KRE1-nesoucím episomálním vektorem jsou opět toxinsenzitivní (obr. 3).It can be concluded that the action of VICALTIN requires binding to β-1,6-ϋ ^ 1η27 forged, which acts as the primary binding site (Andockstelle) (toxin receptors) on the yeast cell wall. Accordingly, yeasts cleaved at the chromosomal gene center (Genlocus) have been shown to have toxinresistant behavior and, once retransformed with the KRE1-bearing episomal vector, are again toxinsensitive (Fig. 3).

V kreí-mutantech spočívá rezistence vůči toxinu na podstatně sníženém obsahu β-l,6-D-glukanu a tím podmíněným snížením vazby toxinu na povrch buněk kvasinek, potřebné k letálnímu účinku.In Kre-mutants, the toxin resistance relies on a substantially reduced β-1,6-D-glucan content and thereby conditionally reduces the binding of the toxin to the yeast cell surface required for the lethal effect.

Příklad 4Example 4

Spektrum účinnosti a usmrcování působením VICALTINUSpectrum of efficacy and killing by VICALTIN

Při agarovém difuzním testu prokázal čištěný toxin VICALTIN z W. californica výraznou toxicitu vůči kvasinkám uvedeným v tabulce 2. S výjimkou tří kmenů kvasinek Candžda crusei bylo u všech 22 sledovaných klinickcých izolátů od pacientů a rovněž u všech ostatních kontrolních kmenů humánně-patogenních druhů Candida prokázáno velice účinné ničení působením VICALTINU. U 14 toxinsenzitivních druhů kvasinek z celkem 10 různých rodů prokázal VICALTIN jako killer-toxin neobyčejně, široké spektrum účinnosti.In the agar diffusion test, purified W. californica VICALTIN toxin showed significant yeast toxicity shown in Table 2. Except for three Candida crusei strains, all 22 clinical patient isolates studied as well as all other control strains of human pathogenic Candida species were demonstrated very effective destruction by VICALTIN. In 14 toxinsensitive yeast species from a total of 10 different genera, VICALTIN has shown an extremely wide spectrum of efficacy as a killer-toxin.

·· ··· ·· · ····· ··· ·· · ···

Tabulka 2:Table 2:

Spektrum účinnosti preparátu VICALTIN na patogenní a apatogenní kvasinky různých rodu. Všechny kmeny byly zkoušeny při agarovém difuzmm testu (MBA; pH 4,7) proti čištěnému preparátu VICALTIN. Aktivita aplikovaného toxinu byla ve všech případech 1 x 10^ E/ml. Kmen C. tropicalis (pacient č. 541965) pocházel z ústavu Institut fůr Medizinische Mikrobiologie und Hygiene z univerzitní kliniky v Mainzu.The spectrum of activity of VICALTIN on pathogenic and apatogenic yeasts of different genera. All strains were tested in an agar diffusion assay (MBA; pH 4.7) against purified VICALTIN. The activity of the applied toxin was in all cases 1 x 10 µE / ml. The strain C. tropicalis (patient no. 541965) came from the Institute of Forces of Medizinische Microbiologie und Hygiene from the University Clinic in Mainz.

Kmen kvasinek Yeast strain Fenotyp Phenotype Průměr inhibičního dvorce [mm] Diameter of inhibition court [mm] Candída albicans ATCC 10231 Candida albicans ATCC 10231 S WITH 11 11 C. glabrata NCYC 388 C. glabrata NCYC 388 S WITH 12 12 C. krusei 185 C. krusei R R 0 0 C. tropicalis pacient č.541965 C. tropicalis patient no.541965 S WITH 11 11 Debaromyces hansenii 233 Debaromyces hansenii 233 S WITH 16 16 Hanseniaspora uvarum ATCC 64295 Hanseniaspora uvarum ATCC 64295 R R 0 0 Hasegawaea japonica var.Versatilis 191 Hasegawaea japonica var.Versatilis 191 R R 0 0 Kluyveromyces lactis CBS 2359/152 Kluyveromyces lactis CBS 2359/152 S WITH 22 22nd K. marxianus C 8,1 K. marxianus C 8.1 R R 0 0 Metchnikowia pulcherrima K/3I B6 Metchnikowia pulcherrima K / 3I B6 S WITH 8 8 Pichia anomala 245 Pichia anomala S WITH 17 17 P. farinosa 258 P. farinosa R R 0 0 P. jardinii 258 P. jardinii R R 0 0 P. kluyveri ATCC 64301 P. klyveri ATCC 64301 R R 0 0 P. membranaefaciens NCYC 333 P. membranaefaciens NCYC 333 R R 0 0 Saccharomyces cerevisiae 192.2d Saccharomyces cerevisiae 192.2d S WITH 30 30 381 381 S WITH 23 23 ATCC 42017 (K1 -superkiller) ATCC 42017 (K1) S WITH 19 19 Dec NCYC 738 <K2-killer) NCYC 738 (Killer) S WITH 14 14 452 (=NCYC 1006) 452 (NCYC 1006) S WITH 16 16 Saccharomyces ludwigii 240 Saccharomyces ludwigii 240 R R 0 0 Schizosaccharomyces pombe CBS 1042 Schizosaccharomyces pombe CBS 1042 R R 0 0 Sporothríx spec. 1129 Sporothríx spec. 1129 S WITH 11 11 Torulospora delbrueckii 208 Torulospora delbrueckii 208 S WITH 18 18 T. pretoriensis 186 T. pretoriensis S WITH 10 10 Yarrowia lipolytica 271 Yarrowia lipolytica S WITH 8 8 Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii S WITH 23 23

• · * · · · « · · · ··· · · · · · · · ·• · * · · · · · ··· · · · · · · · · ·

Příklad 5Example 5

Klonování, sekvencování a molekulární charakterizaceCloning, sequencing and molecular characterization

VICALTIN-kódujícího VCT-genu kvasinek V. californica kmen 3/57 (DSM 12865)VICALTIN-encoding VCT yeast V. californica strain 3/57 (DSM 12865)

Na základě N-terminální aminokyselinové sekvence preparátu VICALTIN byly připraveny specifické DNA-oligonukleotidy, které vedly k identifikaci a klonování a rovněž k molekulárně-biologické charakterizaci chromosomálně lokalizovaného toxingenu WCT. DNA-sekvence WCT (SEQ ID No.l) vykazuje jediný otevřený čtecí rámec, který kóduje potenciálně N-glykosylovaný protein ze 309 aminokyselin a s vypočtenu molekulovou hmotností 34 017 Da.Based on the N-terminal amino acid sequence of VICALTIN, specific DNA-oligonucleotides were prepared which led to identification and cloning as well as molecular-biological characterization of the chromosomally localized toxin of WCT. The WCT DNA sequence (SEQ ID No. 1) shows a single open reading frame that encodes a potentially N-glycosylated protein of 309 amino acids and a calculated molecular weight of 34,017 Da.

Sledování účinnosti WCT-kódovaného killer-toxinu prokázalo, že v případě preparátu VICALTIN jde o glykoprotein, který je pró kvasinky mimořádně toxický, jehož primárním cílem (target) jsou β-1,3-D-glukany, které se vyskytují v buněčné stěně kvasinek. Jeho selektivní toxicita vůči kvasinkám a houbám spočívá v tom, že VICALTIN rozrušuje v senzitivní cílové buňce strukturu a/nebo integritu buněčné stěny, takže napadá kvasinky v jejich nejcitlivějším místě a tím je ničí.Monitoring of the efficacy of WCT-coded killer-toxin has shown that VICALTIN is an extremely toxic yeast to the yeast, the primary target of which is the β-1,3-D-glucans found in the yeast cell wall . Its selective toxicity to yeasts and fungi is that VICALTIN disrupts the structure and / or integrity of the cell wall in a sensitive target cell, thus attacking the yeast at its most sensitive site and thereby destroying it.

Příklad 6Example 6

Úprava a čištění virus-toxinu ZYGOCINU získaného ze supernatantu po kultivaci killer-kvasinek Z. baÍlii kmen 412 (DSM 12864)Treatment and purification of the ZYGOCIN virus-toxin obtained from the supernatant after cultivation of killer-yeast Z. billium strain 412 (DSM 12864)

Z kvasinek Z. bailii kmen 412 byl ze supernatantu kultivačního media killer-kvasinek metodou kterou popsali • · · ·· · ·· ·· ··· ···· · · · ·Of the Z. bailii yeast strain 412 was from the supernatant of the killer-yeast culture medium according to the method described by the method described above.

• · · · · · · · ·· ····• · · · · · · · · · ·

Radler a spol. (1993) izolován virus-kódovaný killer-toxin ZYGOCIN, který byl dále zahuštěn ultrafiltrací a potom byl čištěn pomocí afinitní chromatografie. Jednostupňové čištění ZYGOCINU popsané v citované studii využívá přirozené afinity toxinu k mannoproteinům buněčné stěny senzitivních kvasinek. Podle metody kterou popsali Schmitt a Radler (1997) byl izolovaný a částečně vyčištěný mannoprotein ze S.cerevžsiae kmen 192.2d kovalentně navázán na epoxyaktivovanou Sepharose-6B-matrici (Fa. Pharmacia) a použit pro FPLC čištění toxinu pomocí sloupcové chromatografie. Podle SDS-PAGE vykázal tímto způsobem čištěný, biologicky vysoce aktivní ZYGOCIN oddělené proteinové pásy se zjevnou molekulovou hmotností cca 10 kDa (obr. 4).Radler et al. (1993) isolated the virus-encoded killer-toxin ZYGOCIN, which was further concentrated by ultrafiltration and then purified by affinity chromatography. The one-step purification of ZYGOCIN described in the cited study utilizes the natural affinity of the toxin to the cell wall mannoproteins of sensitive yeast. According to the method of Schmitt and Radler (1997), isolated and partially purified mannoprotein from S. cerevysia strain 192.2d was covalently bound to an epoxyactivated Sepharose-6B-matrix (Pharmacia) and used for FPLC toxin purification by column chromatography. According to SDS-PAGE, this purified, biologically highly active ZYGOCIN showed separate protein bands with an apparent molecular weight of about 10 kDa (Fig. 4).

Příklad 7Example 7

Spektrum účinnosti a a usmrcování působením ZYGOCINUSpectrum of efficacy and killing by ZYGOCIN

Spektrum účinnosti virálního ZYGOCINU z kvasinek Z. bailii 412 (DSM 12864), stanovené při agarovém difuzním testu zahrnuje patogenní a apatogenní rody kvasinek, z nichž jsou Candida albicans a Sporothrix schenkii obávané jako původci chorob u člověka a zvířat a Ustilago maydis a Debaromyces hansenii jako škodlivé kvasinky v zemědělství a potravinářství (tab.3) • · · ·· · ·· ·· ··· · · · · ···· • ······· · · ·· · · • · · · * · é · · · · · · ·The activity spectrum of viral ZYGOCIN from yeast Z. bailii 412 (DSM 12864), determined in the agar diffusion test, includes pathogenic and apatogenic yeast genera of which Candida albicans and Sporothrix schenkii are feared as causative agents in humans and animals and Ustilago maydis and Debaromyces hansenii as harmful yeasts in agriculture and food industry (tab.3) · · ····· · · ····· · · ····· · · · · ··· * · É · · · · · · ·

Tabulka 3:Table 3:

Spektrum účinnosti ZYGOCINU vůči patogenním a apatogenním kvasinkám různých rodů. Všechny kmeny byly testovány při agarovém difuzním testu (MBA; pH 4,5) na preparát ZYGOCIN s aktivitou 1 x 10^ E/ml.Spectrum of ZYGOCIN activity against pathogenic and apatogenic yeasts of different genera. All strains were tested in an agar diffusion assay (MBA; pH 4.5) for ZYGOCIN preparation with an activity of 1 x 10 &lt; 6 &gt; E / ml.

ZYGOCIN-senzitivní kvasinky ZYGOCIN-sensitive yeast Relativní stupeň senzitivity Relative degree of sensitivity Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae ++ ++ Candida albicans Candida albicans + + Candida krusei Candida krusei ++ ++ Candida glabrata Candida glabrata ++ ++ Candida vinii Candida vinii + + Hanseniaspora uvarum Hanseniaspora uvarum ++ ++ Kluyveromyces marxianus Kluyveromyces marxianus + + Metchnikowia pulcherrima Metchnikowia pulcherrima + + Ustilago maydis Ustilago maydis ++ ++ Debaromyces hansenii Debaromyces hansenii ++ ++ Pichia anomala Pichia anomala ++ ++ Pichia jadinii Pichia jadinii + + Pichia membranefaciens Pichia membranefaciens + + Yarrowia lipolytica Yarrowia lipolytica + + Zygosaccharomyces rouxii Zygosaccharomyces rouxii ++ ++

Příklad 8Example 8

Klonování a sekvencování ZYGOCIN-kódujícíhoCloning and sequencing of ZYGOCIN-coding

ZBT-gemi (ZBT) kvasinek Z.bailÍi kmen 412 (DSM 12864) cDNA-syntéza toxinkódujícího dvouvláknového RNA-genomu killer-kvasinek Z.bailÍi 412 byla provedena podle metody kterou popsal Schmitt s čištěnou a methylrtuťhydroxidem denaturovanou M-dsRNA jako matricí a s různými hexanukleotidy jako priméry. Po ligaci do EcoRI-restringovaného vektoru pUC18, transformaci v E.coli a izolaci rekombinantního plasmidu bylo možno identifikovat a sekvencovat několik • ····· · · ··· · · ···· cDNA-klonů. cDNA-sekvence ZYGOCINEM kódovaného čtecího rámce (SEQ ID No.2) obsahuje genetickou informaci pro prvotní protein (Vorláuferprotein) (Pro-Toxin) z 238 aminokyselin, který má v aminokyselinové pozici RR potenciální Kex2-endopeptidasové štěpné místo. Při in vivo prováděné přeměně Pro-ZYGOCINU v pozdním Golgiho stadiu (im spáten Golgi-Stadium) zprostředkované Kex2 vzniká biologicky aktivní ZYGOCIN, jehož molekulová hmotnost (10 kDA; 99 aminokyselin) a N-terminální aminokyselinová sekvence souhlasí přesně s hodnotami odpovídajícími čištěnému ZYGOCINU.ZBT-gemi (ZBT) yeast Z.bailIi strain 412 (DSM 12864) cDNA-synthesis of the toxin-coding double-stranded RNA genome of the z.bailIi 412 was performed according to the method described by Schmitt with purified and methylmercuryhydroxide denatured M-dsRNA as a matrix and with various hexanucleotides as primers. After ligation into the EcoRI-restricted pUC18 vector, transformation into E. coli, and isolation of the recombinant plasmid, several cDNA-clones could be identified and sequenced. The cDNA sequence of the ZYGOCIN encoded reading frame (SEQ ID No.2) contains genetic information for the protein (Vorlauferprotein) (Pro-Toxin) of 238 amino acids having a potential Kex2-endopeptidase cleavage site at the amino acid position of RR. In vivo Kex2-mediated conversion of Pro-ZYGOCIN in the late Golgi stage results in biologically active ZYGOCIN whose molecular weight (10 kDA; 99 amino acids) and the N-terminal amino acid sequence correspond exactly to the values corresponding to the purified ZYGOCIN.

Heterologická exprese ZUT-cDNA v kvasinkách S. cerevisiae vedla vzhledem k toxicitě ZYGOCINU k tomu, že transformované kvasinky byly usmrceny svým vlastním toxinem. V budoucnosti bude heterologická exprese ZYGOCINU zaměřena na toxinrezistentní dělící se kvasinky Schizosaccharomyces pombe, poněvadž - jak bylo již uvedeno na příkladu virálního K28-toxinu - jsou tyto dělící se kvasinky pro expresi a sekreci cizorodých proteinů obzvláště vhodné.The heterologous expression of ZUT-cDNA in yeast S. cerevisiae, due to the toxicity of ZYGOCIN, resulted in the transformed yeast being killed by its own toxin. In the future, heterologous expression of ZYGOCIN will be directed to the toxin resistant dividing yeast Schizosaccharomyces pombe, since - as already mentioned by the viral K28-toxin example - these dividing yeast are particularly suitable for the expression and secretion of foreign proteins.

Příklad 9Example 9

Exprese toxingenu WCT a ZBT v transgenních rostlináchToxin expression of WCT and ZBT in transgenic plants

Vzhledem k tomu, že popsané killer-toxiny VICALTIN a ZYGOCIN mají široké spektrum účinnosti a usmrcuji i fytopatogenní kvasinky a houby, mělo by být možno připravit takové transgenní rostliny, které by byly odolné např. proti infekci kukuřice způsobované patogenem Ustilago maydis. Podobné pokusy byly již provedeny s rostlinami tabáku, které při heterologické expresi přirozeného virálně kódovaného killer-toxinu KP4 z U. maydis měly schopnost secernovatSince the described killer toxins VICALTIN and ZYGOCIN have a broad spectrum of activity and also kill phytopathogenic yeasts and fungi, it should be possible to prepare such transgenic plants which are resistant, for example, to maize infection caused by the pathogen Ustilago maydis. Similar experiments have already been performed with tobacco plants which have the ability to secrete upon heterologous expression of the naturally virally encoded killer toxin KP4 from U. maydis.

Μ · « * · ·· · · ··· · · · · · · · • ······· · · · · · · ·· · · · ··· ·· ···» příslušný killer-toxin a tak získat specifickou ochranu proti infekcím vyvolaným určitými fytopatogenními kmeny U. maydis (Park a spol., 1996; Kinal a spol., 1995; Bevan,Příslušný «« příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný k příslušný příslušný příslušný příslušný příslušný toxin and thus obtain specific protection against infections caused by certain phytopathogenic U. maydis strains (Park et al., 1996; Kinal et al., 1995; Bevan,

1984). Na základě komerčně dostupných transformačních systémů založených na modifikovaných derivátech přírodního Ti-plasmidu z Agrobacterium tumefaciens bylo možno klonované toxingeny WCT a ZBT nakloňovat do tzv. dvousměrných pBI-vektorů (Fa. Clontech)' a použít pro získání transgenních rostlin. Příslušné toxingeny WCT a ZBT byly pod transkripční kontrolou silného promotoru viru květákové mozaiky (CaMV-P). Výstavba konstruovaných vektorů je schematicky znázorněna v obr. 5.1984). Based on commercially available transformation systems based on modified derivatives of natural Ti-plasmid from Agrobacterium tumefaciens, cloned WCT and ZBT toxingenes could be cloned into so-called bi-directional pBI vectors (Clontech) and used to obtain transgenic plants. The respective WCT and ZBT toxingenes were under transcriptional control of the potent cauliflower mosaic virus (CaMV-P) promoter. The construction of the constructed vectors is shown schematically in FIG. 5.

Příklad 10Example 10

Heterologická exprese VICALTIN-kódujícího WCT-genu kvasinek W. californica 3/57 (DSM 12865) v S .cerevisiaeHeterological expression of the VICALTIN-coding WCT gene of W. californica 3/57 (DSM 12865) in S. cerevisiae

Pro heterologickou expresi WCT-genu v kvasinkách S. cerevisiae byl VICALTIN-kódující WCT-gen jako 930 bp EcoR/Smal-fragment nakloňován do všeobecně dostupného 2 μ vektoru pYX242. Výsledný vektor pSTH2 (obr. 6) obsahuje toxingen pod transkripční kontrolou vlastního kvasinkového triosa-fosfát-isomerasa-promotoru (ΤΡΓ) a umožňuje tak po transformaci v kvasinkách (S.cerevisiae) provést konstitutivní expresi VITCALTINU. Gelová elektroforéza supernatantu kultivačního media prokázala u takto získaných kvasinkových transformantů, že rekombinantní VITCALTIN se secernuje do kultivačního media a vykazuje β-l,3-D-glukanasovou aktivitu (obr.6) odpovídající homologickému VITCALTINU (z divokého kmene DSM 12865).For heterologous expression of the WCT gene in S. cerevisiae yeast, the VICALTIN-encoding WCT gene as a 930 bp EcoR / SmaI fragment was cloned into the generally available 2 μ vector of pYX242. The resulting pSTH2 vector (Fig. 6) contains toxin under the transcriptional control of its own yeast triose phosphate isomerase promoter (ΤΡΓ), thus allowing the constitutive expression of VITCALTIN to be performed after transformation in yeast (S. cerevisiae). The gel electrophoresis of the culture medium supernatant in the yeast transformants thus obtained showed that recombinant VITCALTIN secreted into the culture medium and showed β-1,3-D-glucanase activity (Fig. 6) corresponding to homologous VITCALTIN (from wild strain DSM 12865).

·»· «· · »· «« » » * · ♦ · · ···<»♦ *........

Příklad 11Example 11

Pokusy s heterologickou expresí VITCALTINU a ZYGOCINU v dělících se kvasinkách Schizosaccharomyces pombeExperiments with heterologous expression of VITCALTIN and ZYGOCIN in dividing yeast Schizosaccharomyces pombe

Vzhledem k tomu, že dělící se kvasinky jak ve formě intaktní buňky tak i jako sféroplast bez buněčné stěny jsou vůči VITCALTINU a ZYGOCINU rezistentní, jsou vhodné jako hostitelské buňky pro heterologickou expresi těchto toxinů. Aby bylo zaručeno, že tyto rekombinantní toxiny se v dělících se kvasinkách nejenom exprimuji, ale že se dostávají i do intracelulární sekreční cesty a tím se secernuji do vnějšího akultivačního media, byl zkonstruován vektor (ρΤΖ/ατ; obr.7), který je nositelem funkčního signálu pro sekreci a zpracování v S.pombe (S/P), a který pochází z cDNA virálního K28-preprotoxingenu kvasinek S.cerevisiae [viz Schmitt, 1995; Schmitt a Tipper, 1995]. Tento sekreční a procesní signál zajišťuje, že se vždy in-frame zařazený cizorodý protein v dělicích se kvasinkách importuje do dutiny (Lumen) endoplaámatického retikula a tím se dostane do sekreční cesty kvasinek. Prostřednictvím Kex2p-štěpného místa na C-konci S/P oblasti se odštěpí požadovaný cizorodý protein v pozdním Golgiho prostoru v buňkách (in spátem Golgi-Kompartiment) působením vlastní kvasinkové Kex2p-endopeptidasy od svého intracelulárního transportního prostředku (Transport-Vehikel) a může být nakonec secernován jako biologicky aktivní protein (ZYGOCIN a/nebo VITCALTIN) do vnějšího kultivačního media.Since the dividing yeast, both in the form of an intact cell and as a cell wall spheroplast, are resistant to VITCALTIN and ZYGOCIN, they are suitable as host cells for heterologous expression of these toxins. To ensure that these recombinant toxins are not only expressed in dividing yeast, but also enter the intracellular secretory pathway and are secreted into the external accultivation medium, a vector (ρΤΖ / ατ; Figure 7) has been constructed to carry a functional signal for secretion and processing in S.pombe (S / P), which originates from the cDNA of the viral K28-preprotoxin of yeast S. cerevisiae [see Schmitt, 1995; Schmitt and Tipper, 1995]. This secretion and process signal ensures that the always in-frame foreign protein in the yeast divider is imported into the lumen of the endoplasmic reticulum and thus enters the yeast secretory pathway. Through the Kex2p-cleavage site at the C-terminus of the S / P region, the desired foreign protein in the late Golgi space in the cells (in the Golgi-Compartiment) is cleaved by its own yeast Kex2p-endopeptidase from its intracellular transporter (Transport-Vehikel). finally secreted as a biologically active protein (ZYGOCIN and / or VITCALTIN) into the external culture medium.

Příklad 12Example 12

Srovnání biologické aktivity čištěného VITCALTINU a topických antimykotik Clotrimazol a Miconazol • · · • · »· * • *4 • · · · e · · · · ·Comparison of biological activity of purified VITCALTIN and topical antifungal agents Clotrimazole and Miconazole 4

Vzhledem k tomu, že čištěný VITCALTIN vykazuje široké spektrum účinnosti a účinně ničí i lidské patogenní kvasinky a/nebo houby, má značný význam i jako potenciální antimykotikum. Proto byly provedeny studie, při nichž byl VITCALTIN srovnáván s velmi často používanými topickými antimykotiky Clotrimazol a Miconazol. Nejprve bylo testováno toxické působení Clotrimazolu a Miconazolu při MBA-agarovém difúzním testu, při němž byly jako indikátorové kvasinky použity Sporothrix spec. Přitom byl Clotrimazol rozpuštěn na koncentraci 10 mg/ml v ethanolu (96%); tento základní roztok byl zředěn redestilovanou vodou a použit vždy po 100 μΐ při MBA-testu v koncentracích od 0,1 do 10 mg/ml. Průměr inhibičního dvorce (Hemmhof) byl při použitém množství 10Since purified VITCALTIN exhibits a broad spectrum of activity and effectively kills even human pathogenic yeast and / or fungi, it is also of great importance as a potential antifungal agent. Therefore, studies have been conducted comparing VITCALTIN with the very commonly used topical antifungal agents Clotrimazole and Miconazole. Initially, the toxic effects of Clotrimazole and Miconazole were tested in the MBA-agar diffusion test using Sporothrix spec. Clotrimazole was dissolved to a concentration of 10 mg / ml in ethanol (96%); this stock solution was diluted with redistilled water and used at 100 μΐ each in an MBA test at concentrations ranging from 0.1 to 10 mg / ml. The diameter of the inhibition court (Hemmhof) was 10 at the amount used

- 50 pg Clotrimazolu mezi 12 a 32 mm. Z Miconazolu byl připraven základní roztok 100 pg/ml v DMSO (100%), který byl při MBA-testu sledován stejným způsobem jako u Clotrimazolu na biologickou aktivitu vůči Sporothrix spec. Použití 0,08- 50 µg Clotrimazole between 12 and 32 mm. A 100 µg / ml stock solution in DMSO (100%) was prepared from Miconazole and monitored in the same way as Clotrimazole for biological activity against Sporothrix spec. Use 0,08

- 0,3 pg Miconazolu vedlo při Bioassay k inhibičním dvorcům o průměru mezi 22 a 36 mm. Biologická aktivita 10 pg Clotrimazolu resp. 0,08 g Miconazolu odpovídala toxicitě 2 g čištěného VICALTINU. Z porovnání těchto tří zkoušených sloučenin vztaženého na jejich molekulové hmotnosti vyplývá, že VICALTIN již v koncentraci 0,07 pmol vykazuje stejnou aktivitu jako 0,2 pmol Miconazolu a 29 pmol Clotrimaziolu; to znamená, že VICALTIN je jako antimykotikum vysoce účinný (obr. 8) .- 0.3 µg of Miconazole resulted in Bioassay inhibition yards with a diameter of between 22 and 36 mm. Biological activity of 10 pg of Clotrimazole resp. 0.08 g of Miconazole corresponded to the toxicity of 2 g of purified VICALTIN. Comparison of the three test compounds, based on their molecular weight, shows that VICALTIN already exhibits the same activity as 0.2 pmol of Miconazole and 29 pmol of Clotrimaziol at a concentration of 0.07 pmol; that is, VICALTIN is highly effective as an antifungal agent (Fig. 8).

Příklad 13Example 13

Důkaz VICALTIN-kódujídího UCT-genu kvasinek W. californica 3/57 (DSM 12865) pomocí Southern-hybridizace s genově-specifickou DNA-sondou • · 9 • · *Detection of the VICALTIN-encoding UCT gene of W. californica 3/57 (DSM 12865) by Southern hybridization with a gene-specific DNA probe

Pro důkaz toho, že nukleovou kyselinu podle SEQ ID No.l je možno použít pro přípravu VICALTIN-specifické DNA-sondy pro následující Southern-hybridizaci, byla DIG-značená, 930 bp dlouhá DNA-sonda použita pro důkaz HLT-genu nakloňovaného do vektoru pSTHl. Konstruovaný vektor pSTHl představuje derivát obecně dostupného prokaryotického klonovacího vektoru pBR322.To demonstrate that the nucleic acid of SEQ ID No. 1 can be used to prepare a VICALTIN-specific DNA probe for subsequent Southern hybridization, a DIG-labeled, 930 bp long DNA probe was used to detect the HLT gene cloned into the vector pSTHl. The engineered vector pSTH1 is a derivative of the generally available prokaryotic cloning vector pBR322.

Výsledky elektroforézy na agarosovém gelu uvedené v obr 9 a příslušné Southern-Blot-analýzy nepochybně prokázaly, že VICALTIN-kódující WCT-gen je možno pomocí sondy připravené z nukleových kyselin prokázat.The results of the agarose gel electrophoresis shown in FIG. 9 and the corresponding Southern-Blot analysis undoubtedly demonstrated that the VICALTIN-encoding WCT gene could be detected using a nucleic acid probe.

Příklad 14Example 14

Northern-Blot-analýza pro důkaz transkripční indukce VICALTIN-kódujícího UCT-genu kvasinek Williopsis californica 3/57 (DSM 12865) pomocí β-1,3-D-glukanuNorthern blot analysis to demonstrate transcriptional induction of the VICALTIN-coding UCT gene of Williopsis californica 3/57 (DSM 12865) with β-1,3-D-glucan

Pro důkaz WCT-transkripce indukované β-1,3-D-glukanem byl kultivován kmen kvasinek DSM 12865 ve 300 ml BAVC-media resp. v BAVC-mediu s přídavkem 0,03% přírodního β-l,3-Dglukanu laminarinu po dobu 48 hodin při teplotě 20 °C za mírného třepání (60 ot./min.) a postupně byl v různých intervalech použit pro přípravu celkové RNA. Všechny vzorky (10 ml) byly před izolací RNA upraveny na stejný počet buněkTo demonstrate WCT-transcription induced by β-1,3-D-glucan, the yeast strain DSM 12865 was cultured in 300 ml of BAVC-medium, respectively. in BAVC-medium containing 0.03% natural β-1,3-D-glucan laminarin for 48 hours at 20 ° C with gentle shaking (60 rpm) and was gradually used at various intervals to prepare total RNA . All samples (10 ml) were adjusted to the same number of cells before RNA isolation

QQ

1,8 x 10 buněk/ml a potom byly tyto vzorky elektroforeticky děleny v denaturujících agarosa-formaldehydových gelech. Jak vyplývá z obr. 10, bylo možno prokázat jak za neindukčních podmínek (BAVC-medium bez přídavku) tak i v laminarinem obohaceném BAVC-mediu, že UCT-transkript má velikost 1 100 bází. Bez přídavku glukanu bylo dosaženo maximální exprese • ·1.8 x 10 cells / ml and then these samples were electrophoretically separated in denaturing agarose-formaldehyde gels. As shown in FIG. 10, both the non-induction conditions (BAVC medium without addition) and the laminarin-enriched BAVC medium showed that the UCT transcript was 1,100 bases in size. Maximum glucose expression was achieved without the addition of glucan • ·

WCT ke konci fáze exponenciálního růstu (po 19 hodinách); podstatně slabší hybridizační signály ve stacionární fázi růstu ukazují na zeslabenou transkripci. Při indukujících podmínkách kultivace (za přítomnosti laminarinu) vykázal HUT-transkript po 10 hodinách podstatně vyšší intenzitu než v neindukujícím kultivačním mediu, z čehož vyplývá, že tato transkripce VICALTINEM kódovaného WCT-genu může být vyvolána přídavkem β-l,3-D-glukanu.WCT towards the end of the exponential growth phase (after 19 hours); substantially weaker hybridization signals in the stationary phase of growth indicate attenuated transcription. Under inducing culture conditions (in the presence of laminarin), the HUT transcript showed significantly greater intensity after 10 hours than in the non-inducing culture medium, suggesting that this transcription of the VICALTIN encoded WCT gene could be induced by the addition of β-1,3-D-glucan .

Dodatek k příkladům provedení vynálezuAddendum to the Examples

Media a roztoky použité v příkladech:Media and solutions used in the examples:

a) BAVC-mediuma) BAVC medium

glukosa glucose 50 g/1 50 g / l D,L-j ablečnan D, L-jectate 20 g/1 20 g / l trinatriumcitrát trinatriumcitrát 0,5 g/1 0.5 g / l (nh4)2so4 (nh 4 ) 2 Sat 4 1,5 g/1 1.5 g / l MgS04 MgS0 4 1,0 mg/l 1.0 mg / l myoinosit myoinosit 0,04 g/1 0.04 g / l základní roztok aminokyselin (lOx) amino acid stock solution (10x) 200 ml/1 200 ml / l základní roztok stopových prvků (lOOx) trace element basic solution (100x) 10 ml/1 10 ml / l základní roztok vitaminů (lOOx) Vitamin Essential Solution (100x) 20 ml/1 20 ml / l

b) základní roztok aminokyselin (lOx) b) amino acid base solution (10x) alanin alanine 0,75 g/1 0.75 g / l argininmonohydrochlorid arginine monohydrochloride 3,5 g/1 3.5 g / l asparagová kyselina aspartic acid 0,5 g/1 0.5 g / l glutamová kyselina glutamic acid 3 g/1 3 g / l histidinmonohydrochlorid histidine monohydrochloride 0,2 g/1 0.2 g / l

• · · «· · • · · ♦ · · · • · · · · * · • ······· · · • · · · · · • · · ·» «· ·· * * * * * * * * * * * · · * * * * · * * * * * *

methionin serin threonin tryptofan methionine serine threonine tryptophan 0,4 g/l 0,5 g/l 2 g/l 0,4 g/l 0.4 g / l 0.5 g / l 2 g / l 0.4 g / l c) základní roztok stopových prvků c) trace element basic solution (lOOx) (100x) boritá kyselina boric acid 200 mg/1 200 mg / l FeCl3.6 H20FeCl 3 .6 H 2 0 200 mg/1 200 mg / l ZnS04.7 H20ZnSO 4 .7 H 2 0 200 mg/1 200 mg / l aici3 aici 3 200 mg/1 200 mg / l CuSO4.5 H20CuSO 4 .5 H 2 0 100 mg/1 100 mg / l Na2Mo04.2 H20Na 2 Mo0 4 .2 H 2 0 100 mg/1 100 mg / l 2so4.h2oli 2 Sat 4 .h 2 o 100 mg/1 100 mg / l KJ KJ 100 mg/1 100 mg / l hydrogenvinan draselný potassium hydrogen tartrate 2 g/l 2 g / l

d) základní roztok vitaminů (lOOx)d) vitamin solution (100x)

4-aminobenzoová kyselina 4-Aminobenzoic acid 20 20 May mg/1 mg / l biotin biotin 2 2 mg/1 mg / l listová kyselina folic acid 2 2 mg/1 mg / l nikotinová kyselina nicotinic acid 100 100 ALIGN! mg/1 mg / l pyridoxolhydrochlorid pyridoxol hydrochloride 100 100 ALIGN! mg/1 mg / l riboflavin riboflavin 50 50 mg/1 mg / l thiaminiumdichlorid thiaminium dichloride 50 50 mg/1 mg / l Ca-D-pant othenát Ca-D-hinge othenate 100 100 ALIGN! mg/1 mg / l

Biotin: byl rozpuštěn v roztoku 5 g KH2PO4 v 50 ml destilované vody ··· «· · ·· ·· • » · ♦ · · · · ·· • ······· · · ·· · • · · · · ··· ·· ····Biotin: was dissolved in a solution of 5 g KH 2 PO 4 in 50 ml distilled water · · · ot 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 • · · · · ··· ·· ····

Listová kyselina: byla rozpuštěna v 50 ml destilované vody s přídavkem několika kapek zředěného NaOH.Folic acid: was dissolved in 50 ml of distilled water with the addition of a few drops of dilute NaOH.

Riboflavin: byl rozpuštěn za zahřívání v 500 ml destilované vody s několika kapkami HCI.Riboflavin: was dissolved with heating in 500 ml of distilled water with a few drops of HCl.

Ostatní vitaminy jsou rozpustné v malém množství destilované vody.Other vitamins are soluble in a small amount of distilled water.

Hodnota pH BAVC-media byla upravena přídavkem KOH na pH 4,7. Glukosa a základní roztoky byly sterilovány odděleně. Základní roztoky aminokyselin, vitaminů a stopových prvků byly sterilovány po dobu 20 minut proudem páry při 100 °C a potom bylo přidáno BAVC-medium upravené v autokloávu.The pH of the BAVC-medium was adjusted to pH 4.7 by addition of KOH. Glucose and stock solutions were sterilized separately. Amino acid, vitamin, and trace element solutions were sterilized for 20 minutes with a steam stream at 100 ° C and then autoclaved BAVC-medium was added.

Vysvětlení obrázků na výkresech a nejdůležitějších sekvencíExplanation of the drawings and the most important sequences

SEQ ID No.l: DNA- a odvozená aminokyselinová sekvenceSEQ ID No. 1: DNA- and deduced amino acid sequence

WCT-kódovaného proteintoxinů VICALTINU z kvasinek Williopsis californica kmen 3/57.WCT-encoded protein toxins VICALTIN from yeast Williopsis californica strain 3/57.

SEQ ID No.2: cDNA- a odvozená aminokyselinová sekvence ZBT-kódovaného proteintoxinů ZYGOCINU z kvasinek Z.bailii .SEQ ID No.2: cDNA- and deduced amino acid sequence of ZBT-encoded ZYGOCIN protein toxins from yeast Z.bailii.

Obr.l: N-terminální aminokyselinové sekvence W.Fig. 1: N-terminal amino acid sequences of W.

californica-toxinu VICALTINU a endo-β-1,3-glukanasy BgI2 z kvasinek S. cerevisiae. Tučně jsou vytištěny jednotlivé odchylky jinak stejných dílčích sekvencí (BgI2p- sekvence jak uvádějí Klebl a Tanner, 1989).californica-toxin VICALTIN and endo-β-1,3-glucanase BgI2 from yeast S. cerevisiae. Individual deviations of otherwise identical sub-sequences are printed in bold (BgI2p-sequences as reported by Klebl and Tanner, 1989).

Obr.2: Kinetika usmrcování buněk senzitivních kvasinek S.cerevisiae 192.2 VICALTINEM za přítomnosti (2a)Figure 2: Kinetics of S.cerevisiae sensitive yeast cells 192.2 by VICALTIN in the presence of (2a)

a nepřítomnosti (2b) β-D-glukanu laminarinu (L) a pustulanu (P). Použitý toxin měl celkovou aktivitu 4,0 x 10$ E/ml při specifické aktivitě 4,2 x 105 E/mg proteinu.and the absence (2b) of laminarin (L) and pustulan (P) β-D-glucan. The toxin used had a total activity of 4.0 x 10 5 E / ml at a specific activity of 4.2 x 10 5 E / mg protein.

Obr. 3 (a,b,c,d): Agarový difuzní test pro důkaz senzitivity/rezistence vůči VICALTINU u Krel+ a Krel- kmenů kvasinek S.cerevisiae. Po transformaci VICALTIN-rezistentního kreř-nulmutantu S.cerevisiae SEY6210[ krel} s KRE1- nesoucím vektorem pPGK[KR£7] byla opět obnovena plná citlivost vůči VICALTINU.Giant. 3 (a, b, c, d): Agar diffusion test for the detection of sensitivity / resistance to WICALTIN in Krel Krel + and - strains of the yeast S. cerevisiae. After transformation of the VICALTIN-resistant Cre-null mutant S. cerevisiae SEY6210 [krel} with the KRE1-carrying vector pPGK [KR £7], full sensitivity to VICALTIN was restored.

Obr. 4: (A) Gelová elektroforéza (SDS-PAGE) ZYGOCINU produkovaného a secernovaného kvasinkami Z. bailii kmen 412 (DSM 12864) po afinitní chromatografií na mannoprotein-Sepharose. (B) Agarový difúzní test pro důkaz biologické aktivity čištěného killer-toxinu ZYGOCINU.Giant. 4: (A) Gel electrophoresis (SDS-PAGE) of ZYGOCIN produced and secreted by yeast Z. bailii strain 412 (DSM 12864) after affinity chromatography on mannoprotein-Sepharose. (B) An agar diffusion assay to demonstrate the biological activity of purified ZYGOCIN killer-toxin.

Obr. 5: Schéma struktury ZBT- resp. WCT-nesouciho expresního vektoru pro přípravu transgenních rostlin.Giant. 5: Scheme structure ZBT- resp. WCT-bearing expression vector for the preparation of transgenic plants.

[Vysvětlivky: RB, LB: pravé a levé okrajové (right and left border) sekvence přírodního TI-plasmidů z Agrobacterium tumefaciens; CaMV-P: 35S promotor viru květákové mozaiky; NOS-P, NOS-T: transkripční promotor a terminátor nopalinsynthasy; kan : kanamycm-rezistentní gen ze Streptococcus pro selekci v E. coli; NPT-II:[Explanation: RB, LB: right and left border sequences of natural TI plasmids from Agrobacterium tumefaciens; CaMV-P: Cauliflower Mosaic Virus 35S promoter; NOS-P, NOS-T: nopaline synthase transcriptional promoter and terminator; kan: kanamycm-resistant Streptococcus gene for selection in E. coli; NPT-II:

neomycin-fosfotransferasový gen z transposonu Tn5 pro selekci v rostlině].neomycin phosphotransferase gene from transposon Tn5 for selection in plant].

Obr. 6:Giant. 6:

(A) Parciální restrikčni karta episomálního vektoru pSTH2 pro heterologickou expresi VICALTIN-kódujícího toxingenu WUT v kvasinkách Saccaromyces cerevisiae. Vektor pSTH2 je konstruovaný plasmid vycházející z komerčně(A) Partial restriction card of the episomal vector pSTH2 for heterologous expression of VICALTIN-encoding WUT toxin in yeast Saccaromyces cerevisiae. The vector pSTH2 is a commercially engineered plasmid

dostupného 2μ Multi-Copy-vektoru pYX242, ve kterém je WCT-gen klonován z kmene DSM 12865 jako 930 bp EcoRI/Smál-fragment.of the available 2μ Multi-Copy pYX242 vector, in which the WCT gene is cloned from the DSM 12865 strain as a 930 bp EcoRI / SmaI fragment.

Příslušný toxingen podléhá transkripční kontrole vlastního kvasinkového TPI-promotoru a umožňuje tak po transformaci v S.cerevisiae intenzivní a konstitutivní expresi VICALTINU.The respective toxin undergoes transcriptional control of its own yeast TPI promoter, thus allowing intensive and constitutive expression of VICALTIN upon transformation in S. cerevisiae.

(B) Gelová elektroforéza (SDS-PAGE; 10 - 22,5%ní gradientový gel) koncentrovaného supernatantu kultivačního media(B) Gel electrophoresis (SDS-PAGE; 10-22.5% gradient gel) of concentrated culture medium supernatant

S.cerevisiae po transformaci s konstruovanýmS. cerevisiae after transformation with engineered

VICALTIN-expresním vektorem pSTH2 (záznam /Spur/ 1).VICALTIN-expression vector pSTH2 (record / Spur / 1).

VICALTIN heterologicky exprimovaný v S. cerevisiae je označen šipkou.VICALTIN heterologously expressed in S. cerevisiae is indicated by an arrow.

(C) Důkaz extracelulární β-1,3-glukanasové aktivity kvasinek S.cerevisiae po transformaci s VICALTIN-exprimujícím kvasinkovým vektorem pSTH2. Pro stanovení exo-β-Ι,3-glukanasové aktivity byly kvasinkové kolonie kultivované na bezleucinovém SC-agaru postříkány 0,04%ním 4-methylumbelliferyl^-D-glukosidem (MUG) v 50 mM natriumacetátovém pufru (pH 5,2). Po inkubaci při 37 °C po dobu 30 minut byly agarové desky ozářeny UV-světlem (vlnová délka 254 nm). Glukanasová aktivita byla prokázána fluorescencí na základě MUG-hydrolýzy.(C) Detection of extracellular β-1,3-glucanase activity of S. cerevisiae yeast after transformation with VICALTIN-expressing yeast vector pSTH2. To determine exo-β-β-glucanase activity, yeast colonies grown on non-leucine SC-agar were sprayed with 0.04% 4-methylumbelliferyl-4-D-glucoside (MUG) in 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.2). After incubation at 37 ° C for 30 minutes, the agar plates were irradiated with UV light (254 nm wavelength). Glucanase activity was demonstrated by fluorescence based on MUG-hydrolysis.

[Vysvětlivky: 1 a 4, S.cerevisiae transformované vektorem (pEP-VCT), který exprimuje VICALTIN-kódující UCT-gen za působení vlastního promotoru; 2, kvasinky divokého typu W. californica 3/57 (DSM 12865); 3. divoké kvasinky W. californica 3/111; 5, S. cerevisiae po transformaci s VICALTIN-exprimujícím vektorem pYX-VCT; 6, S.cerevisiae transformované se základním vektorem pYX242 (bez toxingenu)].[Explanations: 1 and 4, S. cerevisiae transformed with a vector (pEP-VCT) that expresses the VICALTIN-encoding UCT gene under the action of its own promoter; 2, wild-type W. californica 3/57 yeast (DSM 12865); 3. wild yeast W. californica 3/111; 5, S. cerevisiae after transformation with the VICALTIN-expressing vector pYX-VCT; 6, S. cerevisiae transformed with base vector pYX242 (no toxingen)].

Obr.7: Schéma struktury vektoru pTZ α/τ pro heterologickou expresi a sekreci cizorodých proteinů (zejména VICALTINU a ZYGOCINU) v dělících se kvasinkách Schizosaccaromyces pombe.Figure 7: Schematic structure of the vector pTZ α / τ for heterologous expression and secretion of foreign proteins (especially VICALTIN and ZYGOCIN) in dividing yeast Schizosaccaromyces pombe.

[Vysvětlivky: , Tnnrti, transkripční promotor a terminátor nmtl genu dělících se kvasinek S. pombe regulovaný thiaminem; S/P sekreční a procesní sekvence virálního K28-preprotoxinu pučících kvasinek S.cerevisiae·, arsl, automomně se replikující sekvence z chromosomu 1 dělících se kvasinek; leu2, leucin-2-markerový gen pro selekci leucin-prototrofních transformantů S.pombe].[Explanation: T nnrt i, transcriptional promoter and terminator of the nmt1 gene of the dividing yeast S. pombe regulated by thiamine; S / P secretory and process sequences of viral K28-preprotoxin of budding yeast S. cerevisiae, arsl, auto-replicating sequences from chromosome 1 of dividing yeast; leu2, a leucine-2-marker gene for the selection of leucine-prototrophic transformants S.pombe].

Obr 8: porovnání biologické aktivity čištěného VICALTINU, Clotrimazolu a Miconazolu; uvedená molární množství vyvolala při Bioassay (agarový difuzní test) vůči senzitivním indikačním kvasinkám Sporothrix spec. průměr inhibičního dvorce 12 mm.Figure 8: comparison of biological activity of purified VICALTIN, Clotrimazole and Miconazole; said molar amounts elicited in the Bioassay (agar diffusion test) against the sensitive indicator yeast Sporothrix spec. diameter of inhibition court 12 mm.

Obr. 9: Důkaz VICALTIN-kódujícího WCT-genu kvasinekGiant. 9: Detection of the VICALTIN-coding WCT-yeast gene

W. californica 3/57 (DSM 12865) klonovaného v pSTHl (derivát pBR322) provedený pomocí elektroforézy na agarosovém gelu (A) a pomocí Southern-hybridizace s DIG-značenou WCT-sondou (B) .W. californica 3/57 (DSM 12865) cloned in pSTH1 (derivative of pBR322) by agarose gel electrophoresis (A) and Southern hybridization with a DIG-labeled WCT probe (B).

[Vysvětlivky: DIG-značený DNA-délkový standard II;[Legend: DIG-labeled DNA-length standard II;

záznam 1, pSTHl restringovaný s .EcoRI a Sa/I; záznam 2, DNA-marker Smart-ladder]Entry 1, pSTH1 restricted with EcoRI and Sa / I; record 2, DNA-marker Smart-ladder]

Obr. 10: Northern-analýza transkripční indukceGiant. 10: Northern analysis of transcriptional induction

VICALTIN-kódujícího WCT-genu kvasinek W. californica 3/57 (DSM 12865) za neindukujících podmínek kultivace v BAVC-mediu (A) a za indukujících podmínek v BAVC-mediu ·* · ·· 4 ·· ·· • · · ···· ···· • · · · · · · · 9 φ • ······· · · · I · φ ·· · · 4 ··» ·· ···· s přídavkem 0,03% laminarinu (B). Elektroforetické dělení celkové RNA izolované z kmene DSM 12865 bylo prováděno v denaturujícím agarosa/formaldehydovém gelu při konstantním napětí (7V/cm). RNA byla na nylonové membráně hybridizována proti VICALTIN-specifické DIG-značené sondě (630 bp) a detekována pomocí chemiluminiscence.VICALTIN-coding WCT gene of W. californica 3/57 (DSM 12865) under non-inducing culture conditions in BAVC-medium (A) and under inducing conditions in BAVC-medium 9 · 9 · I · 4 · 4 · Add 0.03 % laminarin (B). Electrophoretic separation of total RNA isolated from strain DSM 12865 was performed in denaturing agarose / formaldehyde gel at a constant voltage (7V / cm). RNA was hybridized on a nylon membrane against a VICALTIN-specific DIG-labeled probe (630 bp) and detected by chemiluminescence.

[Vysvětlivky: M, DIG-značený DNA-délkový standard I; záznamy 1-8 odpovídají dobám*odběru vzorků pro izolaci celkové RNA; záznam 1, 10 h, záznam 2, 15 h, záznam 3, 19 h, záznam 4, h, záznam 5, 33 h, záznam 6, 38 h, záznam 7, 43 h, záznam 8, 48 h.[Legend: M, DIG-labeled DNA-length standard I; records 1-8 correspond to sampling times * for total RNA isolation; 1, 10 h, 2, 15 h, 3, 19 h, 4, h, 5, 33 h, 6, 38 h, 7, 43 h, 8, 48 h.

Zkratky použité v textuAbbreviations used in the text

VCT Villiopsis Californica ToxinVCT Villiopsis Californica Toxin

ZBT Zygosaccharomyces Bailii ToxinZBT Zygosaccharomyces Bailii Toxin

ZYGOCIN název; toxin secernovaný z DSM 12864ZYGOCIN name; toxin secreted from DSM 12864

VICATIN název; toxin secernovaný z DSM 12865VICATIN name; toxin secreted from DSM 12865

Dále uvedené mikroorganismy použité podle tohoto vynálezu byly uloženy do mezinárodně uznávané Německé sbírky mikroorganismů a buněčných kultur Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ), Maschenroder Veg lb, 38124 Braunschweig, SRN, podle požadavků Budapešťské smlouvy o mezinárodním uznání deponování mikroorganismů pro patentové účely (číslo uložení, datum uložení):The following microorganisms used according to the present invention were deposited in the internationally recognized German Collection of Microorganisms and Cell Cultures of the Deutsche Sammlung von Microorganisms and Zellkulturen GmbH (DSMZ), Maschenroder Veg lb, 38124 Braunschweig, Germany, according to the Budapest Treaty on International Recognition (number of deposit, date of deposit):

Wi lliopsis californica kmen 3/57 (DSM 12865) (09.06.1999) Zygosaccharomyces bailii kmen 412 (DSM 12864) (09.06.1999)Wi lliopsis californica strain 3/57 (DSM 12865) (09/06/1999) Zygosaccharomyces bailii strain 412 (DSM 12864) (09/06/1999)

Claims (26)

1. Proteintoxiny získatelné z Milliopsis californica a/nebo Zygosaccharomyces bažIii.Proteintoxins obtainable from Milliopsis californica and / or Zygosaccharomyces bažii. 2. Proteintoxiny podle nároku 1, získatelné z DSM 12864 a/nebo DSM 12865.Protein toxins according to claim 1, obtainable from DSM 12864 and / or DSM 12865. 3. Proteintoxiny podle nároku 1 a 2, vyznačující se tím, že mají antimykotické a/nebo fungicidní účinky.Proteintoxins according to claims 1 and 2, characterized in that they have antifungal and / or fungicidal effects. 4. Proteintoxin podle některého z nároků 1 až 3 s glukanasovou aktivitou.Proteintoxin according to any one of claims 1 to 3 with glucanase activity. 5. Proteintoxin podle nároku 4, vyznačující se tím, že se váže na β-l,6-D-glukan a vykazuje β-l,3-D-glukanasovou aktivitu a/nebo β-l,3-D-glukanosyltransferasovou aktivitu.Proteintoxin according to claim 4, characterized in that it binds to β-1,6-D-glucan and exhibits β-1,3-D-glucanase activity and / or β-1,3-D-glucanosyltransferase activity. 6. Nukleová kyselina kódující glukanasu a/nebo proteintoxin podle některého z nároků 1. až 5 s aminokyselinovou sekvencí podle SEQ ID No 1 nebo SEQ ID No 2 nebo její funkční varianta a její části minimálně s 8 nukleotidy, přičemž SEQ ID No 1 nebo SEQ ID No· 2 je součástí tohoto nároku.A nucleic acid encoding a glucanase and / or a protein toxin according to any one of claims 1 to 5 having an amino acid sequence according to SEQ ID No 1 or SEQ ID No 2 or a functional variant thereof and portions thereof with at least 8 nucleotides, wherein SEQ ID No 1 or SEQ ID No · 2 is part of this claim. 7. Nukleová kyselina podle nároku 6, vyznačující se tím, že tato nukleová kyselina je DNA nebo RNA, přednostně dvouvláknová DNA.Nucleic acid according to claim 6, characterized in that the nucleic acid is DNA or RNA, preferably double-stranded DNA. * · · * · « · · • · · · · · ·· • · · ·· · · · ······· · · · · ·* · «· • · · · · 8. Nukleová kyselina podle nároku 6 nebo 7, vyznačující se tím, že tato nukleová kyselina je DNA s aminokyselinovou sekvencí podle SEQ ID No 1 s pozicí bází 1 až 951 nebo SEQ ID No 2 s pozicí bází 1 až 717, přičemž SEQ ID No 1 nebo SEQ ID No 2 je součástí tohoto nároku.Nucleic acid according to claim 6 or 7, characterized in that the nucleic acid is a DNA having the amino acid sequence according to SEQ ID No 1 having a base position 1 to 951 or SEQ ID No 2 having a base position 1 to 717, wherein SEQ ID No 1 or SEQ ID No 2 is part of this claim. 9. Nukleová kyselina podle nároku 8, vyznačující se tím, že tato nukleová kyselina obsahuje jednu nebo více regulačních oblastí, jako je promotor, enhancer, terminátor a/nebo 3’-terminální PolyA-sekvenci a/nebo Kex2p-endopeptidasové štěpné místo nezbytné pro intracelulární zpracování pro-toxinu a/nebo jedno nebo několik potenciálních N-glykosylačních míst.Nucleic acid according to claim 8, characterized in that the nucleic acid comprises one or more regulatory regions, such as a promoter, enhancer, terminator and / or 3'-terminal PolyA-sequence and / or a Kex2β-endopeptidase cleavage site necessary for intracellular processing of the pro-toxin and / or one or more potential N-glycosylation sites. 10. Nukleová kyselina podle některého z nároků 8 až 9, získatelná z DSM 12864 a/nebo DSM 12865.Nucleic acid according to any one of claims 8 to 9, obtainable from DSM 12864 and / or DSM 12865. 11. Nukleová kyselina podle některého z nároků 6 až 10, vyznačující se tím, že tato nukleová kyselina je obsažena ve vektoru, přednostně v expresním vektoru nebo v genově-terapeuticky účinném vektoru.Nucleic acid according to one of Claims 6 to 10, characterized in that the nucleic acid is contained in a vector, preferably in an expression vector or in a gene-therapeutically active vector. 12. Způsob přípravy nukleové kyseliny podle některého z nároků 6 až 10, vyznačující se tím, že tato nukleová kyselina je syntetizována chemicky nebo je izolována pomocí sondy z genové banky.A method for preparing a nucleic acid according to any one of claims 6 to 10, characterized in that the nucleic acid is synthesized chemically or isolated by a probe from a gene bank. 13. Polypeptid s aminokyselinovou sekvencí podle SEQ ID No 1 nebo SEQ ID No 2 nebo jeho funkční varianta a jeho části minimálně se šesti aminokyselinami.13. A polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID No 1 or SEQ ID No 2, or a functional variant thereof, and portions thereof with at least six amino acids. 14. Způsob přípravy polypeptidu podle nároků 1 až 5 a 13, vyznačující se tím, že se nukleová kyselina podle některého z- nároků 6 až 11 exprimuje ve vhodné hostitelské buňce.A method for preparing a polypeptide according to claims 1 to 5 and 13, characterized in that the nucleic acid according to any one of claims 6 to 11 is expressed in a suitable host cell. 15. Protilátka proti peptidu podle některého z nároků 1 až 5 a 13 .The anti-peptide antibody of any one of claims 1 to 5 and 13. 16. Způsob přípravy protilátky podle nároku 15, vyznačující se tím, že se savec imunizuje polypeptidem podle nároku 7 a případně vzniklá protilátka se izoluj e.16. A method for producing an antibody according to claim 15, wherein the mammal is immunized with the polypeptide of claim 7 and the optionally formed antibody is isolated. 17. Léčivo obsahující nukleovou kyselinu podle některého z nároků 6 až 10 nebo polypeptid podle některého z nároků 1 až 5 a 13 nebo protilátku podle nároku 15 a případně farmaceuticky přípustné přísady nebo pomocné látky.A medicament comprising the nucleic acid of any one of claims 6 to 10 or the polypeptide of any one of claims 1 to 5 and 13 or the antibody of claim 15, and optionally pharmaceutically acceptable excipients or excipients. 18. Způsob přípravy léčiva pro léčení mykóz jako jsou povrchové, kutánní a subkutánní dermatomykózy, mykózy sliznic a systémové mykózy, zejména Candida-mykózy, vyznačující se tím, že nukleová kyselina podle některého z nároků 6 až 10 nebo polypeptid podle některého z nároků 1 až 5 a 13 nebo protilátka podle nároku 15 se kombinuje s farmaceuticky přípustnou přísadou nebo pomocnou látkou.Method for the preparation of a medicament for the treatment of mycoses such as superficial, cutaneous and subcutaneous dermatomycosis, mucosal mycosis and systemic mycosis, in particular Candida mycosis, characterized in that the nucleic acid according to any one of claims 6 to 10 or the polypeptide according to any one of claims 1 to 5 and 13 or the antibody of claim 15 is combined with a pharmaceutically acceptable excipient or excipient. 19. Diagnostikům obsahující nukleovou kyselinu podle některého z nároků 6 až 10 nebo polypeptid podle některého z nároků 1 až 5 a 13 nebo protilátku podle nároku 15 a případně vhodné přísady a/nebo pomocné látky.Diagnostics comprising a nucleic acid according to any one of claims 6 to 10 or a polypeptide according to any one of claims 1 to 5 and 13 or an antibody according to claim 15 and optionally suitable additives and / or excipients. 20. Způsob přípravy diagnostika pro diagnózu mykóz, jako • · » · · · 9 • ··· · * · « • · · · · · • · · · · · · • · · « · · · ···· jsou povrchové, kutánní a subkutánní dermatomykózy, mykózy sliznic a systémové mykózy,· zejména Candida-mykózy, vyznačující se tím, že nukleová kyselina podle některého z nároků 6 až 10 nebo polypeptid podle některého z nároků 1 až 5 a 13 nebo protilátka podle nároku 15 se kombinuje s farmaceuticky přípustným nosičem.20. A method of preparing a diagnosis for the diagnosis of mycoses, such as the mycosis, such as 9; superficial, cutaneous and subcutaneous dermatomycosis, mucosal mycosis and systemic mycosis, in particular Candida mycosis, characterized in that the nucleic acid according to any one of claims 6 to 10 or the polypeptide according to any one of claims 1 to 5 and 13 or the antibody according to claim 15 combined with a pharmaceutically acceptable carrier. 21. Test pro identifikaci funkčních interaktorů obsahujících nukleovou kyselinu podle některého z nároků 6 až 10 nebo polypeptid podle některého z nároků 1 až 5 a 13 nebo protilátku podle nároku 15 a případně vhodné přísady a/nebo pomocné látky.An assay for identifying functional interactions comprising the nucleic acid of any one of claims 6 to 10 or the polypeptide of any one of claims 1 to 5 and 13 or the antibody of claim 15 and optionally suitable excipients and / or excipients. 22. Použití nukleové kyseliny podle některého z nároků 6 až 10 nebo polypeptidu podle některého z nároků 1 až 5 a 13 pro identifikaci funkčních interaktorů.Use of a nucleic acid according to any one of claims 6 to 10 or a polypeptide according to any one of claims 1 to 5 and 13 for identifying functional interactions. 23. Použití nukleové kyseliny podle některého z nároků 6 ažUse of a nucleic acid according to any one of claims 6 to 23 10 pro vyhledávání variant, vyznačující se tím, že se genová banka prohledává touto nukleovou kyselinou a nalezená varianta se izoluj e.10 for variant searches, characterized in that the gene bank is searched by the nucleic acid and the variant found is isolated. 24. Použití polypeptidu podle některého z nároků 1 až 5 a 13 k ničení škodlivých kvasinek a hub v potravinách a v krmivech.Use of the polypeptide of any one of claims 1 to 5 and 13 for controlling harmful yeasts and fungi in food and feed. 25. Způsob kultivace DSM 12864 a DSM 12865, vyznačující se tím, že se tento postup provádí v syntetickém B- a/nebo BAVC-mediu.25. A method of culturing DSM 12864 and DSM 12865, wherein the process is carried out in synthetic B- and / or BAVC-medium. 26. Použití nukleových kyselin podle některého z nároků 6 ažUse of nucleic acids according to any one of claims 6 to 26 11 pro přípravu transgenních rostlin a rostlinných buněk.11 for the preparation of transgenic plants and plant cells.
CZ200249A 1999-07-05 2000-05-31 Antimycotics and fungicidal agents, process of their preparation and use CZ200249A3 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19930959A DE19930959A1 (en) 1999-07-05 1999-07-05 New antimycotics and fungicides, process for their production and use

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ200249A3 true CZ200249A3 (en) 2002-04-17

Family

ID=7913696

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ200249A CZ200249A3 (en) 1999-07-05 2000-05-31 Antimycotics and fungicidal agents, process of their preparation and use

Country Status (17)

Country Link
EP (1) EP1196608A2 (en)
JP (1) JP2003504030A (en)
KR (1) KR20020059581A (en)
CN (1) CN1361825A (en)
AR (1) AR029377A1 (en)
AU (1) AU5969400A (en)
BR (1) BR0012172A (en)
CA (1) CA2372935A1 (en)
CZ (1) CZ200249A3 (en)
DE (1) DE19930959A1 (en)
HU (1) HUP0201690A3 (en)
IL (1) IL147252A0 (en)
NO (1) NO20020003L (en)
PL (1) PL364765A1 (en)
SK (1) SK122002A3 (en)
TR (1) TR200200097T2 (en)
WO (1) WO2001002587A2 (en)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP5467251B2 (en) * 2008-08-12 2014-04-09 株式会社ソフィ Method for quantifying β-1,3-1,6-glucan
PT105331A (en) * 2010-10-12 2012-04-12 Cev Biotecnologia Das Plantas S A PRESERVATIVE FOOD
CN107164248B (en) * 2017-03-16 2020-11-10 中国水产科学研究院南海水产研究所 Yeast DD12-7 strain and application thereof

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
IL97020A (en) * 1990-01-30 2000-12-06 Mogen Int Recombinant polynucleotides comprising a chitinase gene and a glucanase gene
GB9115669D0 (en) * 1991-07-19 1991-09-04 Sandoz Ltd Improvements in or relating to organic compounds
JPH07506729A (en) * 1993-03-03 1995-07-27 ギスト ブロカデス ナムローゼ フェンノートシャップ Cloning of the zymosin gene and use of zymosin in beverages

Also Published As

Publication number Publication date
EP1196608A2 (en) 2002-04-17
PL364765A1 (en) 2004-12-13
AR029377A1 (en) 2003-06-25
KR20020059581A (en) 2002-07-13
NO20020003D0 (en) 2002-01-02
DE19930959A1 (en) 2001-01-25
AU5969400A (en) 2001-01-22
HUP0201690A3 (en) 2004-10-28
BR0012172A (en) 2002-03-05
TR200200097T2 (en) 2002-05-21
SK122002A3 (en) 2002-05-09
JP2003504030A (en) 2003-02-04
NO20020003L (en) 2002-02-28
CN1361825A (en) 2002-07-31
WO2001002587A3 (en) 2002-02-07
HUP0201690A2 (en) 2002-09-28
IL147252A0 (en) 2002-08-14
WO2001002587A2 (en) 2001-01-11
CA2372935A1 (en) 2001-01-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Wessels Developmental regulation of fungal cell wall formation
Meyer A small protein that fights fungi: AFP as a new promising antifungal agent of biotechnological value
Rocha et al. Aspergillus fumigatus MADS-box transcription factor rlmA is required for regulation of the cell wall integrity and virulence
Pozo et al. Functional analysis of tvsp1, a serine protease-encoding gene in the biocontrol agent Trichoderma virens
Urban et al. The moonlighting protein Tsa1p is implicated in oxidative stress response and in cell wall biogenesis in Candida albicans
US9333246B2 (en) Compositions and methods to elicit immune responses against pathogenic organisms using yeast-based vaccines
DE69738525T2 (en) MUSHROOM ANTIGEN AND METHOD FOR THE PRODUCTION THEREOF
US7241613B1 (en) Identification of Candida cell surface proteins and their uses
Lou et al. CmpacC regulates mycoparasitism, oxalate degradation and antifungal activity in the mycoparasitic fungus C oniothyrium minitans
Buyuksirit et al. Antimicrobial agents produced by yeasts
Li et al. A new non-hydrophobic cell wall protein (CWP10) of Metarhizium anisopliae enhances conidial hydrophobicity when expressed in Beauveria bassiana
Meinhardt et al. Yeast killer toxins: Fundamentals and applications
JP2004511756A (en) Antifungal compounds and uses
CZ200249A3 (en) Antimycotics and fungicidal agents, process of their preparation and use
JP6396330B2 (en) Polypeptides against phytopathogenic fungi
Martín-Urdiroz et al. Differential toxicity of antifungal protein AFP against mutants of Fusarium oxysporum
Sentandreu et al. Cloning and characterization of CSP37, a novel gene encoding a putative membrane protein of Candida albicans
McCabe et al. Molecular basis of symptom expression by the Cryphonectria hypovirus
KR101526054B1 (en) Use of the CnKTR3 gene encoding a mannoslytransferase for treating mycoses by Cryptococcus neoformans
Höfs Identification of Candidalysin: a Candida albicans peptide toxin involved in epithelial damage
Türel Antimicrobial spectrum determination of the K5 type yeast killer protein and its kinetics of cell killing
Alturki Genetic and Molecular Studies on some Killer Yeasts
WO2000005388A1 (en) Genes of the dead box protein family, their expression products and use
KR20220100270A (en) Identification method of antifungal agent using target gene atrR and target protein AtrR for treatment of Aspergillosis
WO2001075115A1 (en) Gene 763 of phytopathogenic fungus magnaporthe grisea and use thereof for identifying fungicidal compounds