SK122002A3 - Novel antifungal agents and fungicides, method for the production thereof and their use - Google Patents
Novel antifungal agents and fungicides, method for the production thereof and their use Download PDFInfo
- Publication number
- SK122002A3 SK122002A3 SK12-2002A SK122002A SK122002A3 SK 122002 A3 SK122002 A3 SK 122002A3 SK 122002 A SK122002 A SK 122002A SK 122002 A3 SK122002 A3 SK 122002A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- yeast
- seq
- toxin
- polypeptide
- Prior art date
Links
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/10—Antimycotics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/37—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
- C07K14/39—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Mycology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Fodder In General (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
Description
ANTIMYKOTIKÁ A FUNGICÍDY, SPÔSOB ICH PRÍPRAVY A ICH POUŽITIEANTIMYCOTICS AND FUNGICIDES, METHOD OF PREPARATION AND USE
Oblasť technikyTechnical field
Tento vynález sa týka antimykotík a fungicídov, ktoré možno získať z kvasiniek, spôsobu ich prípravy a ich použitia.The present invention relates to antifungals and fungicides obtainable from yeast, to a process for their preparation and to their use.
Doterajší stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Selektívne antimykotiká majú veľký význam, pretože infekcie spôsobené hubami alebo kvasinkami u človeka sa v posledných rokoch veľmi rozšírili a v stále väčšej miere dochádza i k nežiaducej kontaminácii potravín a krmív. Obzvlášť vážne následky majú mykózy u imunosuprimovaných pacientov, ktorých bunkový a humorálny obranný systém sa musí udržiavať na nie celkom funkčnej úrovni (Anaissie, 1992; Meunier a kol., 1992; Wingard, 1995). Obzvlášť sú mykózami ohrozené HIV-1-infikované osoby (AIDS), ktoré v pokročilom štádiu choroby zomierajú veľmi často na oportunistické infekcie vyvolané humánno-patogénnymi plesňami a/alebo kvasinkami (Levy, 1993). Antimykotiká, ktoré sa používajú na terapiu týchto infekcií v súčasnej dobe (ako sú Amphotericin B, Fluconazol, Itraconazol, Ketoconazol), majú značné vedľajšie účinky, pretože rozrušujú štruktúrnu integritu eukaryotickej membrány cytoplazmy, a tým poškodzujú i infikovaný hostiteľský organizmus (Hector, 1993). Aplikácia bežných antimykotík vedie okrem toho už za krátky čas k rýchlemu nárastu fluconazolovej rezistencie, ktorá sa v humánnopatogénnych mikroorganizmoch rýchlo rozširuje a predstavuje tak stále väčší problém (Cameron a kol., 1993; Chavenet a kol., 1994; Maenza a kol., 1996; Pfaller a kol., 1994; Rex a kol., 1995; Troillet a kol., 1993). Je preto dôležité vyvinúť také antimykotiká, ktoré sa budú vyznačovať - podobne ako bakteriálne antibiotiká - vysokou selektivitou a tým, že budú napadať pokiaľ možno len huby a kvasinky patogénne pre človeka. Pretože však väčšina bunkových procesov je u vyšších organizmov riadená génovými produktmi, ktoré u eukaryotov vykazujú vysokú mieru funkčnej homológie, nepodarilo sa doterazSelective antifungals are of great importance because infections caused by fungi or yeasts in humans have become widespread in recent years, and there is an increasingly undesirable contamination of food and feed. Mycoses have particularly severe consequences in immunosuppressed patients whose cellular and humoral defense systems must be maintained at a not quite functional level (Anaissie, 1992; Meunier et al., 1992; Wingard, 1995). In particular, HIV-1-infected persons (AIDS), who in the advanced stage of the disease die very often from opportunistic infections caused by human pathogenic fungi and / or yeast, are particularly at risk for mycosis (Levy, 1993). The antimycotics that are currently used to treat these infections (such as Amphotericin B, Fluconazole, Itraconazole, Ketoconazole) have significant side effects because they disrupt the structural integrity of the eukaryotic membrane of the cytoplasm, thereby damaging even the infected host organism (Hector, 1993) . Furthermore, the application of conventional antifungal agents leads to a rapid increase in fluconazole resistance in a short time, which is rapidly expanding in human pathogenic microorganisms and is thus an increasing problem (Cameron et al., 1993; Chavenet et al., 1994; Maenza et al., 1996) Pfaller et al., 1994; Rex et al., 1995; Troillet et al., 1993). It is therefore important to develop antimycotics which, like bacterial antibiotics, are characterized by high selectivity and that they attack only fungi and yeasts pathogenic to humans. However, since most cellular processes in higher organisms are driven by gene products that exhibit a high degree of functional homology in eukaryotes, it has not been possible to date.
31854/H vyvinúť „špecifické antifungálne antibiotiká,, (Kurz, 1998; Komiyama a kol., 1998).31854 / H to develop "specific antifungal antibiotics" (Kurz, 1998; Komiyama et al., 1998).
Cieľovou oblasťou selektívnych antimykotík sú p-1,3-glukány bunkovej steny kvasiniek, ktoré sú nevyhnutné pre mechanickú a osmotickú stabilitu bunky, ktoré sa však u vyšších eukaryotov nevyskytujú, takže by bolo možné ich použiť ako „Achillovu pätu,, (pozn. prekl.: v origináli je Achillesverse, má byť asi Achillesferse) pri likvidácii patogénnych kvasiniek (Roemer a kol., 1994). Napriek tomu, že látky, ktoré selektívne napadajú štruktúru bunkových stien kvasiniek a húb, sú predmetom veľkého záujmu, neboli doteraz žiadne látky podobné antibiotikám na liečenie mykóz použité. Zatiaľ čo producenti bakteriálnych antibiotík sa objavili už začiatkom tohto storočia, podobné efekty u kvasiniek sa pozorovali až začiatkom šesťdesiatych rokov, kedy sa identifikovali a pozorovali tzv. „killer„-kvasinky (Bevan a Makower, 1963). Toxíny produkujúce „killer„-kmene pekárskych kvasníc Saccharomyces cerevisiae produkujú a vylučujú proteíny označené ako „killertoxíny,,, ktoré usmrcujú senzitívne kvasinky pri procese závislom od receptora (Rezeptor-abhängigen Prozess) (Bussey, 1991; Tipper a Schmitt, 1991). Schopnosť produkovať toxín spočíva u S. cerevisiae od infekcie vírusmi s dvojvláknovou RNA, ktoré sa podobajú reovírusu (Reovirus-ähnliche Dopplestrang-RNA-Viren), ktoré sú v cytoplazme kvasiniek stabilné a vo veľkom počte kópií tu pretrvávajú bez toho, aby eukaryotickú hostiteľskú bunku badateľným spôsobom poškodili (Tipper a Schmitt, 1991). U troch doteraz známych killer-toxínov (K1, K2, K28) z kvasiniek S. cerevisiae ide o neglykozylované α/β heterodiméry, ktoré sa prenášajú z infikovanej bunky ako vysokomolekulárne preprotoxíny a premenené na intracelulárnej sekrečnej ceste komplexnými modifikáciami na biologicky aktívne killer-proteíny (Hanes a kol., 1986; Dignard a kol., 1991; Schmitt a Tipper, 1995). Toxické pôsobenie toxínu zo S. cerevisiae spočíva buď v rozrušení celistvosti membrány (toxíny Κ1, K2) alebo (ako je to u killertoxínu K28) v pozastavení bunkového cyklu (Zellcyklus-Arrest) s cielenou inhibíciou syntézy DNA (Bussey, 1991; Schmitt a Compain, 1995; Schmitt a kol., 1996). Killer-toxíny tried K1, K2 a K28 sa síce vo svojom spôsobe účinku aThe target area of selective antifungal agents are yeast cell wall β-1,3-glucanes, which are essential for mechanical and osmotic cell stability, but which do not occur in higher eukaryotes, so that they could be used as an "Achilles heel". .: Achillesverse, supposed to be Achillesferse) in the control of pathogenic yeast (Roemer et al., 1994). Although substances that selectively attack the cell wall structure of yeast and fungi are of great interest, no antibiotics-like substances have been used to date to treat mycoses. While bacterial antibiotic producers appeared as early as this century, similar effects in yeast were not observed until the early 1960s, when so-called "yeasts" were identified and observed. Killer yeast (Bevan and Makower, 1963). Killer-producing toxins of baker's yeast Saccharomyces cerevisiae produce and secrete proteins designated as "killertoxins" that kill sensitive yeast in a receptor-dependent process (Rezeptor-abhängigen Prozess) (Bussey, 1991; Tipper and Schmitt, 1991). The ability to produce a toxin resides in S. cerevisiae from infection with reovirus-like double-stranded RNA viruses (Reovirus-ähnliche Dopplestrang-RNA-Viren), which are stable in yeast cytoplasm and persist in large numbers without the eukaryotic host they were noticeably damaged (Tipper and Schmitt, 1991). The three hitherto known killer toxins (K1, K2, K28) from yeast S. cerevisiae are non-glycosylated α / β heterodimers, which are transmitted from the infected cell as high-molecular preprotoxins and converted into intracellular secretory pathway by complex modifications to biologically active killer (Hanes et al., 1986; Dignard et al., 1991; Schmitt and Tipper, 1995). The toxic action of the S. cerevisiae toxin consists either in disrupting membrane integrity (toxins Κ1, K2) or (as in killertoxin K28) in cell cycle arrest (Zellcyclus-Arrest) with targeted inhibition of DNA synthesis (Bussey, 1991; Schmitt and Compain) , 1995; Schmitt et al., 1996). Killer toxins of classes K1, K2 and K28, although in their mode of action a
31854/H vo svojich fyzikálno-chemických vlastnostiach navzájom značne odlišujú, majú však spoločné úzke spektrum účinnosti a ďalej to, že usmrcujú prevažne senzitívne kvasinky úzko príbuzných druhov. Toto obmedzené spektrum účinnosti je dané tým, že doteraz charakterizované killer-toxíny z pekárskych kvasníc s rôznymi populáciami receptorov na úrovniach bunkovej steny kvasiniek a cytoplazmovej membrány musia reagovať navzájom, aby mohli usmrtiť senzitívne cieľové bunky. U primárnych toxínreceptorov bunkovej steny kvasiniek ide buď o veľmi rozvetvené β-Ι,θ-D-glukány alebo o vonkajšie manotriózové bočné reťazce manoproteínu bunkovej steny (Bussey, 1991; Schmitt a Radler, 1987, 1988).31854 / H in their physicochemical properties differ considerably from one another, but they share a narrow spectrum of activity in common and furthermore that they kill predominantly sensitive yeasts of closely related species. This limited spectrum of efficacy is due to the fact that the previously characterized baker's yeast killer toxins with different receptor populations at yeast cell wall and cytoplasmic membrane levels must react to each other in order to kill sensitive target cells. The primary yeast cell wall toxin receptors are either highly branched β-Ι, θ-D-glucans, or outer mannotriose cell wall mannoprotein side chains (Bussey, 1991; Schmitt and Radler, 1987, 1988).
Okrem vírusových proteíntoxínov kvasiniek S. cerevisiae, Hanseniaspora uvarum, Zygosaccharomyces bailii a Ustilago maydis boli opísané killer-kmene i v rodoch Debaromyces, Hansenula, Cryptococcus, Rhodotorula, Trichosporon, Pichia, Kluyveromyces, Torulopsis a Williopsis (McCracken a kol., 1994, Park a kol., 1996, Schmitt a Neuhausen, 1994; Walker a kol., 1995). Genetické základy tohto killer-javu však u týchto kvasiniek nespočívajú vo vírusových genómoch, ale buď v lineárnych DNA-plazmidoch alebo v chromozomálnych kvasinkových génoch (Schrunder a kol., 1994).In addition to the yeast viral protein toxins of S. cerevisiae, Hanseniaspora uvarum, Zygosaccharomyces bailii and Ustilago maydis, the killer strains have also been described in the genera Debaromyces, Hansenula, Cryptococcus, Rhodotorula, Pichia, Kluyveromyen and Parkis, Colis, Colis. et al., 1996, Schmitt and Neuhausen, 1994; Walker et al., 1995). However, the genetic basis of this killer phenomenon in these yeasts lies not in viral genomes, but either in linear DNA plasmids or in chromosomal yeast genes (Schrunder et al., 1994).
Intenzívne molekulárno-biologické výskumy rôznych killer-kvasiniek produkujúcich toxín preukázali, že sekrécia toxických proteínov (killer-toxíny) je u kvasiniek veľmi rozšírená a že pri vývoji selektívnych antimykotík predstavuje potenciál, ktorý nemožno prehliadnuť (Walker a kol., 1995, Hodgson a kol., 1995; Polonelli a kol., 1986; Schmitt a Neuhausen, 1994; Neuhausen a Schmitt, 1996; Schmitt a kol., 1997), doteraz však tieto proteíntoxíny neboli pripravené.Intensive molecular-biological studies of various toxin-producing killer-yeasts have shown that the secretion of toxic proteins (killer-toxins) in yeast is widespread and that it can be overlooked in the development of selective antifungals (Walker et al., 1995, Hodgson et al. , 1995; Polonelli et al., 1986; Schmitt and Neuhausen, 1994; Neuhausen and Schmitt, 1996; Schmitt et al., 1997), but to date these protein toxins have not been prepared.
Úlohou tohto vynálezu je preto príprava vhodných vysoko účinných proteíntoxínov s antimykotickými alebo fungicídnymi účinkami na ničenie kvasiniek a/alebo húb s patogénnym pôsobením na človeka alebo rastliny.It is therefore an object of the present invention to provide suitable highly potent protein toxins with antifungal or fungicidal effects on the control of yeast and / or fungi with a pathogenic effect on humans or plants.
31854/H31854 / H
Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION
Na ničenie kvasiniek a/alebo húb s patogénnym pôsobením na človeka alebo rastliny sa ako obzvlášť vhodné prekvapujúco ukázali toxíny produkované a secernované s vysokou účinnosťou, a to killer-toxín WICALTIN (rovnako proteíntoxín) z divokého kmeňa kvasiniek Williopsis californica kmeň 3/57 (DSM 12865) a víruskódovaný ZYGOCIN (rovnako proteíntoxín) z kvasiniek Zygosaccharomyces bailii (DSM 12864). Okrem toho týmito prostriedkami možno usmrtiť i obávané škodlivé kvasinky v potravinách a v krmivách. Oba tieto proteíntoxíny preto možno potenciálne použiť ako antimykotikum a/alebo fungicíd na likvidáciu infekcií vyvolaných kvasinkami a/alebo hubami, hlavne na likvidáciu mykóz. Tieto indikácie sa v tomto vynáleze overujú skúmaním spôsobu pôsobenia týchto látok. V rámci tohto vynálezu boli toxíngény vhodným spôsobom klonované a sekvencované a vypracoval sa tak postup génovo-technickej prípravy a expresie (Clberexpression) v kultúre preparátov WICALTIN a ZYGOCIN.Surprisingly, toxins produced and secreted with high efficiency, namely the killer-toxin WICALTIN (also proteintoxin) from the wild yeast strain Williopsis californica strain 3/57 (DSM), have been found to be particularly suitable for destroying yeasts and / or fungi with pathogenic effects on humans or plants. 12865) and virus-encoded ZYGOCIN (also protein toxin) from yeast Zygosaccharomyces bailii (DSM 12864). In addition, the detrimental harmful yeasts in food and feed can be killed by these agents. Both of these protein toxins can therefore potentially be used as an antifungal and / or fungicide for the control of yeast and / or fungal infections, in particular for the control of mycoses. These indications are verified in the present invention by investigating the mode of action of these agents. Within the scope of the present invention, the toxins have been appropriately cloned and sequenced, and a gene-preparation and expression procedure (Clberexpression) has been developed in the culture of WICALTIN and ZYGOCIN.
Predmetom tohto vynálezu sú teda proteíntoxíny, ktoré možno získať z Williopsis californica, hlavne z kmeňa DSM 12865 a Zygosaccharomyces bailii, hlavne z kmeňa DSM 12864. Oba tieto kmene boli podľa Budapeštianskej zmluvy dňa 9. júna 1999 uložené do Nemeckej zbierky mikroorganizmov a bunkových kultúr DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismem und Zellkulturen GmbH, 38124 Braunschweig, Mascheroder Weg 1b (www.dsmz.de).Accordingly, the present invention relates to protein toxins obtainable from Williopsis californica, in particular from strain DSM 12865 and Zygosaccharomyces bailii, in particular from strain DSM 12864. Both strains were deposited in the German Collection of Microorganisms and Cell Cultures DSMZ under the Budapest Treaty on 9 June 1999. -Deutsche Sammlung von Microorganism und Zellkulturen GmbH, 38124 Braunschweig, Mascheroder Weg 1b (www.dsmz.de).
V rámci tohto vynálezu secernovali hlavne kmene DSM 12864 a DSM 12865 biologicky vysoko účinné proteíntoxíny, ktoré vďaka širokému spektru ich účinnosti (pozri príklady 4 a 7) usmrcovali i mnohé humánno- a rastlinnopatogénne kvasinky a huby. Preto sa tento vynález týka i selektívnych antimykotík alebo fungicídov vtom zmysle, že u proteíntoxínov - a ďalej uvedených polypeptidov podľa tohto vynálezu a nimi kódovaných nukleových kyselín podľa tohto vynálezu, hlavne vo funkčnej jednotke toxíngénu - ide o potenciálne biofarmaká, ktoré na základe ich špecifického pôsobenia sprostredkovaného receptormi usmrcujú výhradne kvasinky a/alebo huby a preIn particular, strains DSM 12864 and DSM 12865 secreted biologically highly active protein toxins which, due to their broad spectrum of activity (see Examples 4 and 7), killed many human and plant pathogenic yeasts and fungi. Therefore, the present invention also relates to selective antifungals or fungicides in the sense that the protein toxins - and the polypeptides of the invention and the nucleic acids encoded by them of the invention, in particular in the functional unit of the toxin - mentioned below, are potential biopharmaceuticals which receptor-mediated agents kill exclusively yeast and / or fungi and pro
31854/H vyššie eukaryoty -a samozrejme pre ľudské a cicavčie bunky - a rovnako pre rastliny, hlavne pre kultúrne rastliny, sú celkom neškodné (pozri Pfeiffer a kol.,31854 / H higher eukaryotes - and of course for human and mammalian cells - as well as for plants, especially for crop plants, are quite harmless (see Pfeiffer et al.,
1988).1988).
Bolo možné selektívne usmrcovať nasledujúce humánno- a rastlinnopatogénne a rovnako apatogénne kvasinky a/alebo huby:It was possible to selectively kill the following human and plant-pathogenic as well as apatogenic yeasts and / or fungi:
ZYGOCIN-senzitívne druhy kvasiniek: Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida krusei, Candida glabrata, Candida vinii, Hanseniaspora uvarum, Kluyveromyces marxianus, Metschnikowia pulcherrima, Ustilago maydis, Debaromyces hansenii, Pichia anomala, Pichia jadinii, Pichia membranefaciens, Yarowia lipolytica a Zygosaccharomyces rouxii.ZYGOCIN-sensitive yeast species: Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida krusei, Candida glabrata, Candida vinii, Hanseniaspora uvarum, Kluyveromyces marxianus, Metschnikowia pulcherrima, Ustilago maydis, Debaromyichia nuclia, Pichosomyiaiaia, Pichosiaiaia, Pichia .
WICALTIN-senzitívne druhy kvasiniek: Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis, Debaromyces hansenii, Kluyveromyces lactis, Metschnikowia pulcherrima, Pichia anomala, Pichia jadinii, Saccharomyces cerevisiae, Sporthhx spec., Torulaspora delbrueckii, Torulaspora pretoriensis, Yarowia lipolytica a Zygosaccharomyces bailii.WICALTIN-sensitive yeast species: Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis, Debaromyces hansenii, Kluyveromyces lactis, Metschnikowia pulcherrima, Pichia anomala, Pichia jadinii, Saccharomyces cerevisiae, Sporthhysa sp.
Obzvlášť vysoká aktivita wicaltin-produkujúceho kmeňa DSM 12865 spočíva pravdepodobne vo výraznej sekrečnej účinnosti tohto kmeňa, ktorá je v porovnaní s inými kmeňmi rovnakého druhu kvasiniek podstatne vyššia. „Killer„-vlastnosť zigocin-produkujúceho kmeňa kvasiniek DSM 12864 spočíva v infekcii toxínkódujúcimi vírusmi s dvojvláknovou RNA (Mzb-dsRNA), ktoré sú stabilné, v cytoplazme pretrvávajú vo vysokom počte kópií a v príslušných kvasinkách (kmeň DSM 12864) vyvolávajú produkciu a sekréciu zygocinu (pozri Schmitt a Neuhausen, 1994). Ostatné kmene rovnakého druhu nevykazovali žiadnu produkciu toxínu, pretože v cytoplazme neobsahujú žiadne toxínkódujúce dsRNA-vírusy, takže sú fenotypovo klasifikované ako „Ne-killer„typy.The particularly high activity of the wicaltin-producing strain DSM 12865 is likely to be due to the pronounced secretory efficacy of this strain, which is significantly higher compared to other strains of the same yeast species. The "killer" -property of the zigocin-producing yeast strain DSM 12864 consists in infection with toxin-encoding double-stranded RNA viruses (Mzb-dsRNA) that are stable, persist in the cytoplasm in a high copy number and produce the appropriate yeast (DSM 12864in production strain) (See Schmitt and Neuhausen, 1994). Other strains of the same species showed no toxin production because they do not contain any toxin-coding dsRNA-viruses in the cytoplasm, so they are phenotypically classified as "non-killer" types.
Ďalším predmetom tohto vynálezu sú nukleové kyseliny kódujúce proteíntoxín - s aminokyselinovou sekvenciou podľa SEQ ID No 1 a No 2 a s glukanázovou aktivitou - alebo funkčné varianty týchto nukleových kyselín aA further object of the invention are nucleic acids encoding protein toxin - having the amino acid sequence of SEQ ID No 1 and No 2 and glucanase activity - or functional variants of these nucleic acids, and
31854/H ich časti minimálne s 8 nukleotidmi, hlavne minimálne s 15 alebo 20 nukleotidmi, obzvlášť minimálne so 100 nukleotidmi, predovšetkým minimálne s 300 nukleotidmi (ďalej sú uvádzané ako „nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu,,).31854 / H portions thereof of at least 8 nucleotides, in particular of at least 15 or 20 nucleotides, in particular of at least 100 nucleotides, in particular of at least 300 nucleotides (hereinafter referred to as "nucleic acids of the invention").
Kompletné nukleové kyseliny kódujú proteíntoxíny, ktoré vykazujú po intracelulárnom spracovaní a sekrécii veľkosť 309 aminokyselín a molekulovú hmotnosť 34 kDA (SEQ ID No 1), resp. 99 aminokyselín a molekulovú hmotnosť 10 kDA (SEQ ID No 2). Expresia tejto nukleovej kyseliny podľa SEQ ID No 1 v kvasinkách S. cerevisiae vedie k rekombinantnému WICALTINU, ktorý sa v supernatante kultúry kvasiniek secernuje ako glykozylovaný protein so signifikantnou p-1,3-D-glukanázovou aktivitou (pozri príklad 10). Ďalšie experimenty vykonané podľa tohto vynálezu potvrdili, že u nukleových kyselín podľa tohto vynálezu ide o nukleové kyseliny, ktoré v prípade SEQ ID No 1 kódujú proteíntoxín s glukanázovou aktivitou a v prípade SEQ ID No 2 kódujú in vivo pravdepodobne O-glykozylovaný proteíntoxín označovaný ako ZYGOCIN. Nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu možno získať z DSM 12865 (SEQ ID No 1) a z DSM 12864 (SEQ ID No 2).The complete nucleic acids encode protein toxins which, after intracellular processing and secretion, have a 309 amino acid size and a molecular weight of 34 kDA (SEQ ID No 1), respectively. 99 amino acids and a molecular weight of 10 kDA (SEQ ID No 2). Expression of this nucleic acid of SEQ ID No 1 in yeast S. cerevisiae results in recombinant WICALTIN, which is secreted in the yeast culture supernatant as a glycosylated protein with significant β-1,3-D-glucanase activity (see Example 10). Further experiments carried out according to the invention confirmed that the nucleic acids of the invention are nucleic acids which encode a protein toxin with glucanase activity in SEQ ID No 1 and, in the case of SEQ ID No 2, probably encode an O-glycosylated protein toxin referred to as ZYGOCIN in vivo. Nucleic acids of the invention can be obtained from DSM 12865 (SEQ ID No 1) and from DSM 12864 (SEQ ID No 2).
V jednej preferovanej forme vyhotovenia sú nukleovými kyselinami podľa tohto vynálezu DNA alebo RNA, predovšetkým dvojvláknová DNA, a hlavne DNA so sekvenciou nukleových kyselín podľa SEQ ID No 1 od pozície 1 do pozície 947 a podľa SEQ ID No 2 od pozície 1 do pozície 713. Obe tieto pozície určujú podľa tohto vynálezu začiatok a koniec kódujúcej oblasti, t.j. vždy prvú a poslednú aminokyselinu v príslušnom čítacom rámci (Leseraster).In one preferred embodiment, the nucleic acids of the invention are DNA or RNA, in particular double stranded DNA, and in particular DNA having the nucleic acid sequence of SEQ ID No 1 from position 1 to position 947 and according to SEQ ID No 2 from position 1 to position 713. Both of these positions determine, according to the invention, the beginning and the end of the coding region, i always the first and last amino acids in the respective reading frame (Leseraster).
Pojmom „funkčný variant,, sa chápe podľa tohto vynálezu nukleová kyselina, ktorá je funkčne príbuzná s nukleovými kyselinami podľa tohto vynálezu. Tak napríklad sú príbuznými nukleovými kyselinami nukleové kyseliny z rôznych kvasinkových buniek, resp. kmeňov a kultúr alebo alelické varianty. Tento vynález zahrňuje i varianty nukleových kyselín, ktoré môžu pochádzať z rôznych kvasiniek/kmeňov kvasiniek alebo iných pôvodcov infekcií ako sú dermatofyty a plesne (podľa DHS systému).By "functional variant" is meant according to the invention a nucleic acid that is functionally related to the nucleic acids of the invention. For example, related nucleic acids are nucleic acids from different yeast cells, respectively. strains and cultures or allelic variants. The present invention also encompasses nucleic acid variants that may be derived from various yeast / yeast strains or other infectious agents such as dermatophytes and fungi (according to the DHS system).
V ďalšom zmysle sa pod pojmom „varianty,, podľa tohto vynálezu chápuIn another sense, the term "variants" according to the invention is understood
31854/H nukleové kyseliny, ktoré vykazujú homológiu, hlavne identitu sekvencií z cca 60 %, radšej z cca 75 %, obzvlášť z cca 90 % a predovšetkým z cca 95 %.31854 / H nucleic acids which exhibit homology, in particular sequence identity of about 60%, preferably about 75%, especially about 90%, and especially about 95%.
Časti nukleových kyselín podľa tohto vynálezu sa môžu používať napríklad na prípravu jednotlivých epitopov, ako sondy pre identifikáciu ďalších funkčných variantov alebo ako antisense-nukleové kyseliny. Tak napríklad nukleová kyselina skladajúca sa minimálne z cca 8 nukleotidov je vhodná ako antisense-nukleová kyselina, nukleová kyselina skladajúca sa minimálne z cca 15 nukleotidov je vhodná ako primér pri PCR-postupe, nukleová kyselina skladajúca sa minimálne z cca 20 nukleotidov je vhodná na identifikáciu ďalších variantov a nukleová kyselina skladajúca sa minimálne z cca 100 nukleotidov je vhodná ako sonda.The nucleic acid portions of the invention can be used, for example, to prepare individual epitopes, as probes to identify additional functional variants, or as antisense nucleic acids. For example, a nucleic acid of at least about 8 nucleotides is suitable as an antisense nucleic acid, a nucleic acid of at least about 15 nucleotides is useful as a primer in a PCR procedure, a nucleic acid of at least about 20 nucleotides is suitable for identification other variants, and a nucleic acid consisting of at least about 100 nucleotides is suitable as a probe.
V ďalšej výhodnej forme vyhotovenia tohto vynálezu obsahuje nukleová kyselina podľa tohto vynálezu jednu alebo viacero nekódujúcich sekvencií a/alebo poly(A)-sekvenciu, jednu alebo viacero (pre intracelulárne pro-proteínspracovanie nevyhnutných) Kex2p-endopeptidázových rozlišujúcich sekvencií (Endopeptidase Erkennungssequenzen) a rovnako jedno alebo viacero potenciálnych N-glykozylačných miest. Nekódujúcimi sekvenciami sú riadiace sekvencie, ako sú promótor- alebo enhancer-sekvencie pre riadenú expresiu kódujúceho toxíngénu obsahujúceho nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu.In another preferred embodiment of the invention, the nucleic acid according to the invention comprises one or more non-coding sequences and / or a poly (A) sequence, one or more (necessary for intracellular protein processing) Kex2β-endopeptidase recognition sequences (Endopeptidase Erkennungssequenzen) and one or more potential N-glycosylation sites. Non-coding sequences are control sequences, such as promoter or enhancer sequences, for the controlled expression of a coding toxin comprising nucleic acids of the invention.
V ďalšej forme vyhotovenia je preto nukleová kyselina obsiahnutá vo vektore, prednostne v expresnom vektore alebo v génovo-terapeuticky účinnom vektore.Thus, in another embodiment, the nucleic acid is contained in a vector, preferably an expression vector or a gene-therapeutically effective vector.
Expresnými vektormi môžu byť napríklad v prípade nukleových kyselín podľa SEQ ID No 2 prokaryotické a/alebo eukaryotické expresné vektory, resp. v prípade nukleových kyselín podľa SEQ ID No 1 výhradne eukaryotické expresné vektory. Expresia toxínkódujúcich nukleových kyselín podľa SEQ ID No 1 v Escheríchia coli nie je možná, pretože príslušný heterologicky exprimovaný proteíntoxín je pre bakteriálne bunky toxický. Klonovanie WICALTIN-kódujúcich nukleových kyselín podľa SEQ ID No 1 v E. coli je možné len s plazmidmi, ktoré nenesú žiaden promótor (napr. pomocou derivátov plazmidu pBR322). Príkladom prokaryotického vektoru, ktorýFor example, the expression vectors for the nucleic acids of SEQ ID No 2 may be prokaryotic and / or eukaryotic expression vectors, respectively. in the case of the nucleic acids of SEQ ID No 1, exclusively eukaryotic expression vectors. Expression of the toxin-encoding nucleic acids of SEQ ID No 1 in Escherichia coli is not possible because the heterologously expressed protein toxin is toxic to bacterial cells. The cloning of the WICALTIN-encoding nucleic acids of SEQ ID No 1 in E. coli is only possible with plasmids that do not carry any promoter (e.g., using derivatives of plasmid pBR322). An example of a prokaryotic vector that
31854/H umožňuje heterologickú expresiu ZYGOCIN-kódujúcej nukleovej kyseliny podľa SEQ ID No 2, je komerčne dostupný vektor pGEX-4T-1, ktorý umožňuje vykonávať v E. coli expresiu glutatión-S-transferáza-ZYGOCIN-fúzneho proteínu. Ďalším vektorom pre expresiu ZYGOCINU v E. coli je napríklad T7 expresný vektor pGM10 (Martin, 1996), ktorý kóduje N-terminálnu Met-AlaHis6-časť (tag), čo umožňuje výhodné čistenie exprimovaného proteínu na stĺpci Ni2+-NTA. Ako eukaryotické expresné vektory pre expresiu v Saccharomyces cerevisiae sú vhodné napríklad vektory p426Met25 alebo p426GAL1 (Mumberg a kol., 1994, Nucl. Acids Res., 22, 5767), pre expresiu v bunkách hmyzu sú použiteľné napríklad Baculovirus-vektory ako sú EP-B10127839 alebo EP-B1-0549721 a pre expresiu v bunkách cicavcov možno použiť napríklad SV40-vektory, ktoré sú bežne dostupné.31854 / H allows heterologous expression of the ZYGOCIN-encoding nucleic acid of SEQ ID No 2, is a commercially available vector pGEX-4T-1 that allows the expression of glutathione-S-transferase-ZYGOCIN-fusion protein in E. coli. Another vector for the expression of ZYGOCIN in E. coli is, for example, the T7 expression vector pGM10 (Martin, 1996), which encodes an N-terminal Met-AlaHis6-tag (tag), allowing for convenient purification of the expressed protein on the Ni 2+ -NTA column. Suitable eukaryotic expression vectors for expression in Saccharomyces cerevisiae are, for example, vectors p426Met25 or p426GAL1 (Mumberg et al., 1994, Nucl. Acids Res., 22, 5767), for example, Baculovirus vectors such as EP- B10127839 or EP-B1-0549721 and for expression in mammalian cells, for example, SV40-vectors that are commercially available can be used.
Expresné vektory obsahujú všeobecné regulačné sekvencie vhodné i pre hostiteľskú bunku, ako sú napr. trp-promótor pre expresiu v E. coli (pozri napr. EP-B1-0154133), ADH-2-promótor pre expresiu v kvasinkách (Russel a kol., 1983, J. Biol. Chem., 2588, 2674), baculovirus-polyhedrín-promótor pre expresiu v bunkách hmyzu (pozri napríklad EP-B1-0127839) alebo starší SV40promótor alebo LTR-promótory napr. z MMTV (Mouse Mammary Tumour Virus, Lee a kol., 1981, Náture, 214, 228).Expression vectors contain general regulatory sequences suitable for the host cell, such as e.g. the trp promoter for expression in E. coli (see e.g. EP-B1-0154133), the ADH-2 promoter for expression in yeast (Russel et al., 1983, J. Biol. Chem., 2588, 2674), baculovirus a polyhedrin promoter for expression in insect cells (see for example EP-B1-0127839) or the older SV40 promoter or LTR promoters e.g. from MMTV (Mouse Mammary Tumor Virus, Lee et al., 1981, Nature, 214, 228).
Príkladom génovo-terapeuticky účinných vektorov sú vírusvektory, hlavne adenovírusvektory, najmä replikačno-deficientné adenovírusvektory alebo adenoasociované vírusvektory, napr. adenoasociovaný vírusvektor, ktorý sa skladá výhradne z dvoch vložených terminálnych opakujúcich sa sekvencii (Wiederholungssequenz) (ITR).Examples of gene-therapeutically effective vectors are virvectors, particularly adenovirus convectors, in particular replication-deficient adenovirus convectors or adeno-associated virus convectors, e.g. adeno-associated virusvector consisting exclusively of two inserted terminal repeat sequences (Wiederholungssequenz) (ITR).
Vhodné adenovírusvektory sú opísané napr. v prácach McGroy, W. J. a kol., 1988, Virol., 163, 614; Gluzman, Y. a kol., 1982, v publikácii „Eukaryotic Viral Vectors,, (Gluzman, Y. ed.) 187, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York; Chroboczek, J. a kol., 1992, Virol., 186, 280; Karlsson, S. a kol., 1986, EMBO J., 5, 2377 alebo vo WO 95/00655.Suitable adenovirus convectors are described e.g. in McGroy, W. J. et al., 1988, Virol., 163, 614; Gluzman, Y. et al., 1982, "Eukaryotic Viral Vectors" (Gluzman, Y. ed.) 187, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York; Chroboczek, J. et al., 1992, Virol., 186, 280; Karlsson, S. et al., 1986, EMBO J., 5, 2377 or in WO 95/00655.
Vhodné adenoasociované vírusvektory sú opísané napr. v prácach Muzyczka, N., 1992, Curr. Top. Microbiol. Immunol., 158, 97; WO 95/23867;Suitable adeno-associated virusvectors are described e.g. in Muzyczka, N., 1992, Curr. Top. Microbiol. Immunol., 158, 97; WO 95/23867;
31854/K31854 / K
Samulski, R.J., 1989, J. Virol., 63, 3822; WO 95/23867; Chiorini, J. A. a kol.,Samulski, R. J., 1989, J. Virol., 63, 3822; WO 95/23867; Chiorini, J. A. et al.,
1995, Human Gene Therapy, 6, 1531 alebo Kotin, R. M., 1994, Human Gene1995, Human Gene Therapy, 6, 1531 or Kotin, R. M., 1994, Human Gene
Therapy, 5, 793.Therapy, 5, 793.
Génovo-terapeuticky účinné vektory možno získať i tak, že sa nukleová kyselina podľa tohto vynálezu viaže do komplexu s lipozómami. Na to sú vhodné zmesi lipidov, ktoré sú opísané napr. v prácach Felgner, P. L. a kol., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413; Behr, J. P. a kol., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 6982; Felgner, J. H. a kol., 1994, J. Biol. Chem., 269, 2550 alebo Gao, X. a Huang, L., 1991, Biochim. Biophys. Acta, 1189, 195. Pri príprave týchto lipozómov sa DNA naviaže iónovo na povrch lipozómov, a to vtákom pomere, aby na povrchu zostal zachovaný kladný náboj a aby DNA bola s lipozómami úplne viazaná v komplexe.Gene-therapeutically effective vectors can also be obtained by binding a nucleic acid of the invention complexed with liposomes. Lipid mixtures which are described in e.g. in Felgner, P. L. et al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 7413; Behr, J. P. et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 6982; Felgner, J. H. et al., 1994, J. Biol. Chem., 269, 2550 or Gao, X. and Huang, L., 1991, Biochim. Biophys. Acta, 1189, 195. In the preparation of these liposomes, the DNA is bound ionically to the surface of the liposomes, in a bird ratio to maintain a positive charge on the surface and to fully bind the DNA to the liposomes in complex.
V ďalšej forme vyhotovenia sú nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu obsiahnuté vo vektore, prednostne v expresnom vektore na prípravu transgénnych rastlín. Vzhľadom k tomu, že opisované killer-toxíny WICALTIN a ZYGOCIN majú široké spektrum účinnosti a usmrcujú i fytopatogénne kvasinky a huby, možno získať také transgénne rastliny, ktoré sú odolné napr. proti infekcii vyvolávanej u kukurice patogénom Ustilago maydis. Podobné pokusy sa už vykonávali na rastlinách tabaku, ktoré po heterologickej expresii prirodzeného virálne kódovaného killertoxínu KP4 z U. maydis mali schopnosť secernovať príslušný proteíntoxín a získať tak špecifickú ochranu proti infekciám určitými fytopatogénnymi kmeňmi U. maydis (Park a kol., 1996; Kinal a kol., 1995; Bevan, 1984). Na základe komerčne dostupných transformačných systémov, založených na modifikovaných derivátoch prirodzených Ti-plazmidov z Agrobacterium tumefaciens, možno nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu, zastúpené i v toxíngénoch WCT a ZBT, naklonovať do tzv. dvojsmerných pBIvektorov (fa. CLONTECH) a použiť na získanie transgénnych rastlín. Príslušné toxíngény WCT a ZBT sa pritom vkladajú pod transkripčnou kontrolou silného promótora vírusu karfiolovej mozaiky (CaMV-P). Bližšie podrobnosti o výstavbe tohto konštruovaného vektoru sú schematicky uvedené v príklade 9.In another embodiment, the nucleic acids of the invention are contained in a vector, preferably an expression vector for the preparation of transgenic plants. Since the disclosed killer-toxins WICALTIN and ZYGOCIN have a broad spectrum of activity and also kill phytopathogenic yeasts and fungi, transgenic plants that are resistant to e.g. against infection caused by the pathogen Ustilago maydis in maize. Similar experiments have already been carried out on tobacco plants which, after heterologous expression of wild-type virally encoded killertoxin KP4 from U. maydis, have the ability to secrete the respective protein toxin and thus obtain specific protection against infections with certain phytopathogenic U. maydis strains (Park et al., 1996; Kinal et al. et al., 1995; Bevan, 1984). On the basis of commercially available transformation systems based on modified derivatives of natural Ti-plasmids from Agrobacterium tumefaciens, the nucleic acids of the present invention, also present in the WCT and ZBT toxins, can be cloned into the so-called. bi-directional pBIectors (CLONTECH) and used to obtain transgenic plants. The respective WCT and ZBT toxins are inserted under the transcriptional control of the strong cauliflower mosaic virus (CaMV-P) promoter. Further details on the construction of this engineered vector are shown schematically in Example 9.
Nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu možno napr. syntetizovaťThe nucleic acids of the invention may e.g. synthesize
31854/H chemicky s použitím sekvencii zo SEQ ID No 1 a No 2 alebo s použitím peptidových sekvencii zo SEQ ID No 1 a No 2 s využitím genetického kódu napr. fosfotriesterovou metódou (pozri napr. Uhlman, E. a Peyman, A., 1990, Chemical Reviews, 90, 543, č. 4). Ďalšou možnosťou získania nukleových kyselín podľa tohto vynálezu je izolácia z vhodnej génovej banky s použitím vhodnej sondy (pozri napr. Sambrook, J. a kol., 1989, Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 2. vyd., Cold Spring Harbor, New York). Ako sondy sú vhodné napr. jednovláknové fragmenty DNA s dĺžkou cca 100 až 1000 nukleotidov, hlavne s dĺžkou 200 až 500 nukleotidov, obzvlášť s dĺžkou cca 300 až 400 nukleotidov, ktorých sekvenciu možno odvodiť zo sekvencie nukleových kyselín podľa SEQ ID No 1 a No 2.31854 / H chemically using the sequences of SEQ ID No 1 and No 2 or using the peptide sequences of SEQ ID No 1 and No 2 using the genetic code e.g. by the phosphotriester method (see, e.g., Uhlman, E. and Peyman, A., 1990, Chemical Reviews, 90, 543, No. 4). Another possibility of obtaining nucleic acids of the invention is isolation from a suitable gene bank using a suitable probe (see, e.g., Sambrook, J. et al., 1989, Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor, New York) ). Suitable probes are e.g. single-stranded DNA fragments of about 100 to 1000 nucleotides in length, especially about 200 to 500 nucleotides in length, particularly about 300 to 400 nucleotides in length, the sequence of which may be derived from the nucleic acid sequence of SEQ ID No 1 and No 2.
Ďalším predmetom tohto vynálezu sú polypeptidy ako také s aminokyselinovou sekvenciou podľa SEQ ID No 1 a No 2 alebo ich funkčné varianty a ich časti minimálne so šiestimi aminokyselinami, hlavne minimálne s 12 aminokyselinami, obzvlášť minimálne so 65 aminokyselinami a predovšetkým s 309 aminokyselinami (SEQ ID No 1) a s 99 aminokyselinami (SEQ ID No 2) (ďalej sú uvádzané ako „polypeptidy podľa tohto vynálezu,,). Tak napr. môže polypeptid s dĺžkou cca 6-12, hlavne s dĺžkou cca 8 aminokyselín obsahovať epitop, ktorý slúži po naviazaní na nosič na prípravu špecifických poly- alebo monoklonálnych protilátok (pozri napr. US 5,656,435). Polypeptidy s dĺžkou minimálne cca 65 aminokyselín sa môžu použiť priamo i bez nosiča na prípravu poly- alebo monoklonálnych protilátok.A further object of the invention are polypeptides per se having the amino acid sequence according to SEQ ID No 1 and No 2 or functional variants thereof and portions thereof with at least six amino acids, in particular at least 12 amino acids, in particular at least 65 amino acids and in particular 309 amino acids. No. 1) and having 99 amino acids (SEQ ID No 2) (hereinafter referred to as "polypeptides of the invention"). So eg. For example, a polypeptide of about 6-12, in particular about 8 amino acids, may contain an epitope that serves, upon binding to a carrier, to produce specific poly- or monoclonal antibodies (see, e.g., US 5,656,435). Polypeptides of at least about 65 amino acids in length can be used directly or without a carrier to prepare poly- or monoclonal antibodies.
Pojmom „funkčný variant,, v zmysle tohto vynálezu sa chápu polypeptidy, ktoré sú príbuzné s peptídom podľa tohto vynálezu, t.j., že vykazujú glukanázovú aktivitu. Variantmi sa chápu i alelické varianty alebo polypeptidy, ktoré môžu pochádzať i z rôznych kvasiniek/kmeňov kvasiniek alebo iných pôvodcov infekcií, ako sú dermatofyty alebo plesne (podľa DHS-systému).The term "functional variant" within the meaning of the invention is understood to mean polypeptides that are related to the peptide of the invention, i.e., exhibit glucanase activity. Variants are also to be understood as allelic variants or polypeptides which may also originate from different yeast / yeast strains or other agents of infection, such as dermatophytes or fungi (according to the DHS system).
V ďalšom zmysle sa do tohto vynálezu zahrňujú i polypeptidy, ktoré vykazujú homológiu sekvencii, hlavne identitu sekvencii z cca 70 %, najme z cca 80 %, obzvlášť z cca 90 % a predovšetkým z cca 95 % s polypeptidom s aminokyselinovou sekvenciou podľa obr. 2. Ďalej sa sem radí i vyštiepenieIn another aspect, polypeptides that exhibit sequence homology, particularly about 70% identity, in particular about 80%, particularly about 90%, and especially about 95%, of the polypeptide having the amino acid sequence of FIG. 2. In addition, cleavage is also included
31854/H polypeptidu v rozsahu cca 1 - 60, hlavne 1 - 30, obzvlášť cca 1 - 15 a predovšetkým cca 1 - 5 aminokyselín. Tak napríklad môže chýbať prvá aminokyselina metionín bez toho, aby sa funkcia tohto polypeptidu podstatne zmenila. Okrem toho sem patria i fúzne proteíny, ktoré obsahujú vyššie uvedené polypeptidy podľa tohto vynálezu, pričom tieto fúzne proteíny už samotné majú funkciu glukanázy alebo túto špecifickú funkciu môžu získať až po odštiepení fúzneho podielu. Patria sem predovšetkým fúzne proteíny s podielom hlavne ne-humánnych sekvencii obsahujúcich cca 1 - 200, hlavne cca 1-150, obzvlášť cca 1 -100 a predovšetkým cca 1 - 50 aminokyselín. Ako príklady ne-humánnych peptidových sekvencii možno uviesť prokaryotické peptidové sekvencie, napr. z galaktozidázy z E. coli alebo tzv. histidínový reťazec (Histidin-Tag), napr. Met-Ala-His6-reťazec (Tag). Fúzny protein s tzv. histidínovým reťazcom je obzvlášť vhodný na čistenie exprimovaného proteínu na kolóne s kovovými iónmi, napr. s použitím stĺpca Ni2+-NTA. „NTA„ predstavuje chelátor, ktorým je n itri lotri octová kyselina (Qiagen GmbH, Hilden). Tento vynález zahrňuje i polypeptidy podľa tohto vynálezu, ktoré sú skryté ako pro-proteín alebo v najširšom zmysle ako Pre-drug.31854 / H polypeptide in the range of about 1 - 60, especially about 1 - 30, especially about 1 - 15, and especially about 1 - 5 amino acids. For example, the first amino acid methionine may be absent without substantially altering the function of the polypeptide. In addition, fusion proteins comprising the aforementioned polypeptides of the present invention are included, wherein the fusion proteins themselves already have a glucanase function or can only obtain this specific function after cleavage of the fusion moiety. In particular, these include fusion proteins having a proportion of mainly non-human sequences comprising about 1 - 200, especially about 1-150, especially about 1 - 100 and especially about 1 - 50 amino acids. Examples of non-human peptide sequences include prokaryotic peptide sequences, e.g. from galactosidase from E. coli or so-called. a histidine chain (Histidine-Tag), e.g. Met-Ala-His 6- chain (Tag). Fusion protein with so-called. the histidine chain is particularly suitable for purifying the expressed protein on a metal ion column, e.g. using a Ni 2+ -NTA column. "NTA" refers to a chelator which is nitrile acetic acid (Qiagen GmbH, Hilden). The invention also encompasses polypeptides of the invention that are hidden as a pro-protein or, in the broadest sense, as a Pre-drug.
Časti polypeptidov podľa tohto vynálezu predstavujú napr. epitopy, ktoré možno špecificky rozpoznať pomocou protilátok.Portions of the polypeptides of the invention are e.g. epitopes that can be specifically recognized by antibodies.
Polypeptidy podľa tohto vynálezu možno pripraviť napr. expresiou nukleových kyselín podľa tohto vynálezu vo vhodnom expresnom systéme s použitím prv opísaných metód, ktoré sú odborníkom známe. Ako hostiteľské bunky na prípravu správne spracovaných, a tým i biologicky aktívnych proteíntoxínov sú vhodné výhradne eukaryotické organizmy, hlavne klíčiace kvasinky (Sprosshefe) Saccharomyces cerevisiae a štiepne kvasinky (Spalthefe) Schizosaccharomyces pombe.Polypeptides of the invention may be prepared e.g. expressing the nucleic acids of the invention in a suitable expression system using the methods described above, which are known to those skilled in the art. Only eukaryotic organisms, particularly germinating yeast (Sprosshefe) of Saccharomyces cerevisiae and splitting yeast (Spalthefe) of Schizosaccharomyces pombe, are suitable as host cells for the preparation of properly processed and thus biologically active protein toxins.
Uvedené časti polypeptidu možno rovnako syntetizovať i pomocou klasickej syntézy peptidov (technika Merrifield). Tieto časti sú vhodné hlavne na získanie antisér, s ktorých pomocou možno preskúmať vhodné génexpresné banky tak, aby bolo možné získať ďalšie funkčné varianty polypeptidu podľa tohto vynálezu.Said portions of the polypeptide can also be synthesized by classical peptide synthesis (Merrifield technique). These portions are particularly suitable for obtaining antisera by means of which suitable gene expression banks can be examined in order to obtain other functional variants of the polypeptide of the invention.
31854/H31854 / H
Ďalší predmet tohto vynálezu sa preto vzťahuje k postupu prípravy polypeptidu podľa tohto vynálezu, pričom nukleová kyselina podľa tohto vynálezu sa vo vhodnej hostiteľskej bunke exprimuje a prípadne izoluje.Accordingly, a further aspect of the invention relates to a process for preparing a polypeptide of the invention, wherein the nucleic acid of the invention is expressed and optionally isolated in a suitable host cell.
Obzvlášť sa preferujú deliace sa kvasinky Schizosaccharomyces pombe, pretože tieto kvasinky vykazujú prirodzenú rezistenciu proti WICALTINU a ZYGOCINU a už sa niekoľkokrát úspešne použili na heterologickú expresiu cudzích proteínov (Giga-Hama a Kimagai, 1997, v publikácii „Foreign Gene Expresion in Fission Yeast (Expresia cudzích génov v deliacich sa kvasinkách): Schizosaccharomyces pombe,,, nakl. Springer). Ako je uvedené v príklade 11, môžu sa toxín-kódujúce nukleové kyseliny podľa SEQ ID No 1 a No 2 naklonovať napr. do S. pomôe-vektora pREP1 (Maundrell, 1990, J. Biol. Chem., 265, 10857-10864), v ktorom sú pod transkripčnou kontrolou tiamínregulovaného nmt1 promótora deliacich sa kvasiniek (nmt = no message with thiamine). Kvasinky transformované týmto vektorom exprimujú príslušný cudzorodý gén v závislosti od koncentrácie tiamínu v kultivačnom médiu kvasiniek. Týmto spôsobom je prípadne možno časovo oddeliť fázu rastu kvasiniek od fázy produkcie cudzorodého proteínu, takže principiálne možno vykonať i expresiu proteínov, ktoré sú pre kvasinky toxické. Aby bolo možné vykonávať súčasnú sekréciu, a tým podstatne uľahčiť čistenie heterologicky exprimovaných toxínov WICALTIN a ZYGOCIN v S. pombe, vykonali sme konštrukciu expresného/sekrečného vektora (vektor ρΤΖατ; pozri príklad 11), ktorý obsahuje sekrečný a procesný signál virálneho K28-pre-protoxíngénu (Schmitt a Tipper, 1995), a tým umožňuje účinnú sekréciu príslušného „inframe,, zaradeného cudzorodého proteínu.Particularly preferred are yeast dividing Schizosaccharomyces pombe because these yeasts exhibit natural resistance to WICALTIN and ZYGOCIN and have been successfully used several times for heterologous expression of foreign proteins (Giga-Hama and Kimagai, 1997, in the publication Foreign Gene Expression in Fission foreign genes in dividing yeasts: Schizosaccharomyces pombe, e.g. Springer). As shown in Example 11, the toxin-encoding nucleic acids of SEQ ID No 1 and No 2 can be cloned e.g. to S. a vector pREP1 (Maundrell, 1990, J. Biol. Chem., 265, 10857-10864) in which they are under transcriptional control of the thiamin-regulated nmt1 promoter of the dividing yeast (nmt = no message with thiamine). The yeast transformed with this vector expresses the respective foreign gene depending on the concentration of thiamine in the yeast culture medium. In this way, the yeast growth phase can optionally be separated in time from the foreign protein production phase, so that in principle the expression of proteins which are toxic to the yeast can also be carried out. In order to perform concomitant secretion, thereby substantially facilitating the purification of heterologously expressed toxins WICALTIN and ZYGOCIN in S. pom, we constructed an expression / secretion vector (ρΤΖατ vector; see Example 11) containing the secretion and process signal of viral K28-pre- protoxingen (Schmitt and Tipper, 1995), thereby allowing efficient secretion of the respective inframe of the included foreign protein.
Ďalší predmet tohto vynálezu sa vzťahuje i na protilátky, ktoré špecificky reagujú s polypeptidom podľa tohto vynálezu, pričom vyššie uvedené časti tohto polypeptidu sú buď samotné imunogénne alebo môže byť ich imunogenita vyvolaná alebo zvýšená naviazaním na vhodný nosič, ako je napr. bovínny sérový albumín.Another aspect of the invention also relates to antibodies that specifically react with a polypeptide of the invention, wherein the above portions of the polypeptide are either immunogenic alone or their immunogenicity can be induced or increased by binding to a suitable carrier, such as e.g. bovine serum albumin.
Tieto protilátky sú buď polyklonálne alebo monoklonálne. Ich príprava, ktorá je rovnako predmetom tohto vynálezu, sa vykonáva napr. podľaThese antibodies are either polyclonal or monoclonal. Their preparation, which is likewise an object of the present invention, is carried out e.g. by
31854/H všeobecne známych metód imunizáciou nejakého cicavca, ako je napríklad králik, polypeptidom alebo jeho vyššie uvedenou časťou podľa tohto vynálezu, prípadne za prítomnosti napr. Freundovho adjuvans a/alebo alumíniumhydroxidových gélov (pozri napr. Diamond, B. A. a kol., 1981, The New England Journal of Medicíne, 1344). Polyklonálne protilátky vzniknuté vo zvierati imunologickou reakciou možno nakoniec pomocou všeobecne známych metód ľahko izolovať z krvi a čistiť napríklad pomocou stĺpcovej chromatografie. Preferuje sa afinitné čistenie protilátok, pri ktorom sa napríklad príslušný antigén (WICALTIN alebo ZYGOCIN) kovalentne naviaže na všeobecne dostupnú CnBr-aktivovanú Sepharozovú matricu a použije sa na čistenie príslušných toxínšpecifických protilátok.31854 / H by well-known methods by immunizing a mammal, such as a rabbit, with a polypeptide or a portion thereof as described herein, optionally in the presence of e.g. Freund's adjuvant and / or aluminum hydroxide gels (see, e.g., Diamond, B.A. et al., 1981, The New England Journal of Medicine, 1344). Finally, polyclonal antibodies generated in an animal by an immunological reaction can be readily isolated from the blood by known methods and purified, for example, by column chromatography. Affinity purification of antibodies is preferred, wherein, for example, an appropriate antigen (WICALTIN or ZYGOCIN) is covalently bound to a generally available CnBr-activated Sepharose matrix and used to purify the respective toxin-specific antibodies.
Monoklonálne protilátky možno pripraviť napríklad podľa známej metódy, ktorú publikovali Winter a Miistein (Winter, G. a Milstein, C., 1991, Náture, 349, 293).Monoclonal antibodies can be prepared, for example, according to the known method of Winter and Miistein (Winter, G. and Milstein, C., 1991, Nature, 349, 293).
Ďalším predmetom tohto vynálezu je i liek, ktorý obsahuje nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu alebo polypeptidy podľa tohto vynálezu (samotné alebo v kombinácii) a prípadne vhodné prísady alebo pomocné látky a postup na prípravu tohto lieku na liečenie mykóz, ako sú povrchové, kutánne a subkutánne dermatomykózy, mykózy slizníc a systémové mykózy, a to hlavne Cand/'c/a-mykózy, pričom sa nukleová kyselina podľa tohto vynálezu alebo polypeptid podľa tohto vynálezu kombinujú s farmaceutický vhodnými prísadami a/alebo pomocnými látkami.A further object of the invention is also a medicament comprising the nucleic acids of the invention or polypeptides of the invention (alone or in combination) and optionally suitable additives or excipients and a process for the preparation of the medicament for the treatment of mycoses such as superficial, cutaneous and subcutaneous dermatomycoses, mucosal mycoses and systemic mycoses, in particular Cand / c-α-mycoses, wherein the nucleic acid of the invention or the polypeptide of the invention are combined with pharmaceutically acceptable excipients and / or excipients.
V príklade 12 je uvedené, že čistený toxín WICALTIN produkovaný kmeňom DSM 12865 má dokonca podstatne vyššiu toxicitu pre kvasinky ako porovnávané antimykotiká Clotrimazol a Miconazol, ktoré sa na liečenie mykóz často používajú.Example 12 shows that purified WICALTIN toxin produced by DSM 12865 strain has even significantly higher yeast toxicity than the compared antifungal agents Clotrimazole and Miconazole, which are often used to treat mycoses.
Preto sa tento vynález týka i liečiva vo vyššie uvedenom zmysle, ktorý obsahuje antimykotikum alebo proteíntoxín izolovaný z DSM 12864 a/alebo DSM 12865 a/alebo polypeptidy s antimykotickým účinkom podľa tohto vynálezu.Therefore, the present invention also relates to a medicament in the above sense comprising an antifungal or protein toxin isolated from DSM 12864 and / or DSM 12865 and / or polypeptides having antifungal activity according to the invention.
31854/H31854 / H
Pre génovo-terapeutické použitie u človeka je vhodný hlavne taký liek, ktorý obsahuje nukleovú kyselinu podľa tohto vynálezu v základnej forme (nackte Form) alebo vo forme niektorého z vyššie uvedených génovoterapeuticky účinných vektorov alebo vo forme komplexu s lipozómami.In particular, for gene therapy in humans, a drug comprising a nucleic acid of the present invention in a basic form (nackte Form) or in the form of one of the aforementioned gene therapeutically effective vectors or in the form of a complex with liposomes is suitable.
Ako vhodné prísady a/alebo pomocné látky možno použiť napr. fyziologický roztok kuchynskej soli, stabilizátory, proteínázové inhibítory, nukleázové inhibítory atď.Suitable additives and / or excipients can be used e.g. saline, stabilizers, proteinase inhibitors, nuclease inhibitors, etc.
Ďalším predmetom tohto vynálezu je diagnostický prostriedok obsahujúci nukleovú kyselinu podľa tohto vynálezu, polypeptid podľa tohto vynálezu alebo protilátky podľa tohto vynálezu a prípadne vhodné prísady a/alebo pomocné látky a postup prípravy tohto diagnostického prostriedku pre diagnózu mykóz, ako sú povrchové, kutánne a subkutánne dermatomykózy, mykózy slizníc a systémové mykózy, a to hlavne Cand/da-mykózy, pri ktorom sa nukleová kyselina podľa tohto vynálezu, polypeptid podľa tohto vynálezu alebo protilátky podľa tohto vynálezu kombinujú s vhodnými prísadami a/alebo pomocnými látkami.A further object of the invention is a diagnostic composition comprising a nucleic acid of the invention, a polypeptide of the invention or an antibody of the invention, and optionally suitable additives and / or excipients, and a process for preparing the diagnostic composition for diagnosis of mycoses such as superficial, cutaneous and subcutaneous dermatomycoses. , mucosal mycoses and systemic mycoses, in particular Cand / da-mycoses, in which the nucleic acid of the invention, the polypeptide of the invention or the antibodies of the invention are combined with suitable additives and / or excipients.
Tak je možné napríklad podľa tohto vynálezu s použitím nukleových kyselín podľa tohto vynálezu získať diagnostikum na základe polymerázovej reťazovej reakcie (PCR-diagnostika, napríklad podľa EP-0 200 362) alebo Northern a/alebo Southern Blot-analýzy, ako je bližšie opísané v príklade 13. Tieto testy sú založené na špecifickej hybridizácii nukleovej kyseliny podľa tohto vynálezu s komplementárnym protivláknom (Gegenstrang) spravidla zodpovedajúcej mRNA. Nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu sa môžu pritom modifikovať i spôsobom opísaným napríklad v EP 0 063 879. Pritom sa hlavne DNA-fragment podľa tohto vynálezu označí podľa známych metód vhodnými činidlami, ako je napríklad rádioaktívny a-P32-dATP alebo nerádioaktívny biotín a inkubuje sa s izolovanou RNA, spravidla naviazanou na vhodnej membráne napríklad z celulózy alebo nylonu. Pritom je výhodné izolovanú RNA pred hybridizáciou a naviazaním na membránu rozdeliť v závislosti od jej veľkosti napríklad pomocou elektroforézy na agarózovom géli. Pri rovnakom množstve sledovanej RNA z každej vzorky tkaniva je tak možné stanoviť množstvo mRNAThus, for example, according to the invention, using the nucleic acids of the invention, a polymerase chain reaction (PCR diagnostics, for example according to EP-0 200 362) or Northern and / or Southern Blot analysis can be obtained as described in more detail in the example. 13. These assays are based on the specific hybridization of a nucleic acid of the invention with a complementary counter-strand (Gegenstrang) as a rule corresponding to mRNA. The nucleic acids according to the invention can also be modified in the manner described, for example, in EP 0 063 879. In particular, the DNA fragment according to the invention is labeled according to known methods with suitable reagents such as radioactive aP 32 -dATP or non-radioactive biotin and incubated with isolated RNA, typically bound to a suitable membrane of, for example, cellulose or nylon. In this case, it is advantageous to separate the isolated RNA, depending on its size, for example by electrophoresis on an agarose gel, before hybridization and membrane binding. Thus, with the same amount of RNA of interest from each tissue sample, it is possible to determine the amount of mRNA
31854/H špecificky značené pomocou sondy.31854 / H specifically labeled with a probe.
Ďalšie diagnostikum obsahuje polypeptid podľa tohto vynálezu, resp. jeho vyššie uvedené imunogénne časti. Tento polypeptid, resp. jeho časti, viazané predovšetkým na pevnej fáze, napríklad na nitrocelulóze alebo nylone, je možné napríklad dať in vitro do styku s vyšetrovanou telesnou tekutinou, napríklad krvou, aby mohlo napríklad dôjsť k reakcii s protilátkou. Tento komplex protilátka-peptid sa môže potom dokázať napríklad pomocou značenej antihuman-lgG-protilátky alebo antihuman-IgM-protilátky. Pri tomto značení ide napríklad o enzým, ako je peroxidáza, ktorý katalyzuje farebnú reakciu. Prítomnosť a množstvo prítomných autoimunitných protilátok je tak možné ľahko a rýchlo preukázať pomocou farebnej reakcie.Another diagnostic comprises a polypeptide of the invention, respectively. the above immunogenic portions thereof. This polypeptide, respectively. for example, parts thereof bound primarily to the solid phase, for example nitrocellulose or nylon, can be contacted in vitro with the body fluid to be examined, for example blood, for example to react with the antibody. This antibody-peptide complex can then be detected using, for example, a labeled anti-human-IgG antibody or an anti-human-IgM antibody. This label is, for example, an enzyme such as peroxidase, which catalyzes the color reaction. Thus, the presence and amount of autoimmune antibodies present can be easily and rapidly detected by a color reaction.
Ďalšie diagnostikum obsahuje protilátky podľa tohto vynálezu ako také. Pomocou týchto protilátok možno napríklad ľahko a rýchlo vyšetrovať vzorky ľudského tkaniva na prítomnosť príslušného polypeptidu. V tomto prípade sa protilátky podľa tohto vynálezu značia napr. enzýmom, ako bolo opísané prv. Špecifický komplex protilátka-peptid je tak možno ľahko a rýchlo preukázať pomocou enzymatickej farebnej reakcie.Another diagnostic comprises the antibodies of the invention as such. With these antibodies, for example, human tissue samples can be easily and rapidly examined for the presence of the polypeptide of interest. In this case, the antibodies of the invention are labeled e.g. enzyme as described above. Thus, the specific antibody-peptide complex can be easily and rapidly detected by an enzymatic color reaction.
Ďalší predmet tohto vynálezu sa týka fungicídu, ktorý obsahuje nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu a/alebo polypeptidy podľa tohto vynálezu O'ednotlivo alebo v kombinácii) a prípadne vhodné prísady alebo pomocné látky a ďalej postupu prípravy fungicídu na ničenie škodlivých kvasiniek a škodlivých húb, pri ktorom sa kombinuje nukleová kyselina podľa tohto vynálezu alebo polypeptid podľa tohto vynálezu s poľnohospodársky prípustnými prísadami a/alebo pomocnými látkami.A further object of the invention relates to a fungicide comprising the nucleic acids of the invention and / or the polypeptides of the invention (individually or in combination) and optionally suitable additives or excipients and to a process for preparing a fungicide for controlling harmful yeasts and harmful fungi. which combines a nucleic acid of the invention or a polypeptide of the invention with agriculturally acceptable additives and / or excipients.
Ako bolo opísané prv, v jednej vyššie uvedenej forme vyhotovenia sa získala transgénna rastlina, ktorá exprimuje proteíntoxín podľa tohto vynálezu. Preto sa tento vynález týka i rastlinných buniek a rovnako transgénnej rastliny ako takej, ktoré obsahujú polypeptidy a/alebo proteíntoxíny podľa tohto vynálezu.As described above, in one of the above embodiments, a transgenic plant that expresses a protein toxin of the invention is obtained. Therefore, the present invention also relates to plant cells as well as to a transgenic plant as such comprising the polypeptides and / or protein toxins of the present invention.
Ďalší predmet tohto vynálezu sa týka testu identifikácie funkčnýchAnother object of the invention relates to a functional identification test
31854/H interaktorov, ako sú napr. inhibítory alebo stimulátory obsahujúce nukleovú kyselinu podľa tohto vynálezu, polypeptid podľa tohto vynálezu alebo protilátka podľa tohto vynálezu a prípadne vhodné prísady a/alebo pomocné látky.31854 / H interactors, such as e.g. inhibitors or stimulators comprising a nucleic acid of the invention, a polypeptide of the invention or an antibody of the invention, and optionally suitable excipients and / or excipients.
Vhodným testom identifikácie funkčných interaktorov, hlavne takých, ktoré v senzitívnej bunke kvasiniek reagujú s proteíntoxínom ZYGOCINOM podľa SEQ ID No 2, je napr. tzv. „Two-Hybrid System,, (Fields, S. a Sternglanz, R., 1994, Trends in Genetics, 10, 286). Pri tomto teste sa bunka, napr. bunka kvasiniek transformuje alebo transferuje s jedným alebo niekoľkými expresnými vektormi, exprimujúcimi fúzny proteín, ktorý obsahuje polypeptid podľa tohto vynálezu a DNA-väzbovú doménu známeho proteínu, napr. z Gal4 alebo LexA z E. coli a/alebo s vektormi, ktoré exprimujú fúzny proteín, ktorý obsahuje neznámy polypeptid a jednu transkripčno-aktivačnú doménu, napr. z Gal4, herpesvírusu VP16 alebo B42. Okrem toho obsahuje táto bunka reportérgén, napr. LacZ-gén z E. coli „Green (zelený) Fluorescence Proteín,, alebo kvasinkové gény biosyntézy aminokyselín (AS-Biosynthesegene der Hefe) His3 alebo Leu2, ktoré prostredníctvom regulačných sekvencii, ako sú napr. lexApromótor/operátor alebo tzv. „Upstream (vzostupná) Activation Sequence,, (UAS) kvasinku riadi. Neznámy polypeptid sa napr. kóduje DNA-fragmentom pochádzajúcim z génovej banky, napr. z humánnej génovej banky. V kvasinkách sa spravidla pripravuje pomocou opísaných expresných vektorov cDNA-génová banka, takže hneď potom možno test vykonať.A suitable assay for identifying functional interactions, particularly those that react with the protein toxin ZYGOCIN of SEQ ID No 2 in a sensitive yeast cell, e.g. called. The "Two-Hybrid System" (Fields, S. and Sternglanz, R., 1994, Trends in Genetics, 10, 286). In this assay, a cell, e.g. the yeast cell transforms or transfers with one or more expression vectors expressing a fusion protein comprising a polypeptide of the invention and a DNA-binding domain of a known protein, e.g. from Gal4 or LexA from E. coli and / or with vectors that express a fusion protein that contains an unknown polypeptide and one transcriptional activation domain, e.g. from Gal4, herpesvirus VP16 or B42. In addition, the cell contains a reporter gene, e.g. The LacZ gene from E. coli " Green Fluorescence Protein " or the yeast amino acid biosynthesis genes (AS-Biosynthesegene der Hefe) His3 or Leu2, which via regulatory sequences such as e.g. lexApromotor / operator or so-called. The upstream Activation Sequence (UAS) controls the yeast. An unknown polypeptide is e.g. encodes a DNA fragment derived from a gene bank, e.g. from a human gene bank. In yeast, a cDNA gene bank is typically prepared using the expression vectors described, so that the assay can be performed immediately thereafter.
Tak napríklad sa v kvasinkovom expresnom vektore klonujú nukleové kyseliny podľa tohto vynálezu vo funkčnej jednotke na nukleovú kyselinu kódujúcu LexA-DNA-väzbovú doménu, takže dochádza k expresii fúzneho proteínu z polypeptidu podľa tohto vynálezu a LexA-DNA-väzbové domény v transformovaných kvasinkách. V inom kvasinkovom expresnom vektore sa cDNA-fragmenty z cDNA-génovej banky vo funkčnej jednotke klonujú na nukleovú kyselinu kódujúcu Gal4-transkripčne-aktivačnú doménu, takže dochádza k expresii fúzneho proteínu z neznámeho polypeptidu a Gal4transkripčno-aktivačnej domény v transformovaných kvasinkách. Kvasinka transformovaná pomocou oboch týchto vektorov, napr. Leu2', obsahuje okremFor example, in a yeast expression vector, the nucleic acids of the invention are cloned in a functional unit into a nucleic acid encoding a LexA-DNA-binding domain such that the fusion protein from the polypeptide of the invention and the LexA-DNA-binding domain are expressed in transformed yeast. In another yeast expression vector, cDNA fragments from a cDNA gene bank in a functional unit are cloned into a nucleic acid encoding a Gal4-transcriptional-activating domain, so that the fusion protein from an unknown polypeptide and the Gal4-transcriptional-activating domain is expressed in transformed yeast. Yeast transformed with both of these vectors, e.g. Leu2 ', contains in addition to
31854/H toho nukleovú kyselinu kódujúcu Leu2, ktorá je riadená LexA-promótoroperátorom. V prípade funkčnej interakcie medzi polypeptidom podľa tohto vynálezu a neznámym polypeptidom sa viaže Gal4-transkripčno-aktivačná doména prostredníctvom LexA-DNA-väzbovej domény na LexA-promótoroperátor, ktorý sa aktivuje a exprimuje Leu2-gén. To má za následok, že kvasinky Leu2' môžu rásť na minimálnom médiu, ktoré neobsahuje žiaden leucín.31854 / H of that Leu2 encoding nucleic acid, which is under the control of the LexA promoter operator. In the case of a functional interaction between a polypeptide of the invention and an unknown polypeptide, the Gal4-transcriptional-activation domain binds via the LexA-DNA-binding domain to a LexA-promoter operator that activates and expresses the Leu2 gene. As a result, the Leu2 'yeast can grow on minimal medium containing no leucine.
Pri použití LacZ- resp. „Green Fluorescence Protein„-reportérgénu namiesto génu biosyntézy aminokyselín možno aktiváciu transkripcie dokázať tvorbou modro, resp. zeleno fluoreskujúcich kolónií. Mieru modrej, resp. zelenej fluorescencie možno ľahko kvantifikovať spektrofotometricky, napr. v prípade modrej farby pri 585 nm.When using LacZ- resp. The Green Fluorescence Protein of the " receptor-gene " instead of the amino acid biosynthesis gene, activation of transcription can be demonstrated by the formation of blue and blue cells respectively. green fluorescing colonies. Blue, respectively. green fluorescence can be easily quantified spectrophotometrically, e.g. in the case of blue at 585 nm.
Týmto spôsobom možno ľahko a rýchlo zisťovať v expresných génových bankách prítomnosť polypeptidov, ktoré reagujú s polypeptidom podľa tohto vynálezu. Potom možno nájdený nový polypeptid izolovať a ďalej charakterizovať.In this way, the presence of polypeptides that react with the polypeptide of the invention can be readily and rapidly detected in expression gene banks. The novel polypeptide can then be isolated and further characterized.
Ďalšou možnosťou použitia systému „Two-Hybrid System,, je ovplyvnenie interakcie medzi polypeptidom podľa tohto vynálezu a známym alebo neznámym polypeptidom pôsobením ďalších látok, ako sú napr. chemické zlúčeniny. Tento spôsob umožňuje i ľahké vyhľadávanie novej chemicky syntetizovateľnej účinnej látky, ktorú je možné použiť ako terapeutikum. Tento vynález preto nie je zameraný len na postup vyhľadávania polypeptidických interaktorov, ale sa vzťahuje i na postup vyhľadávania látok, ktoré môžu reagovať s vyššie uvedeným proteín-proteín-komplexom. Tieto peptidické a rovnako chemické interaktory sa označujú v zmysle tohto vynálezu ako funkčné interaktory, ktoré môžu mať inhibičné alebo stimulačné účinky.Another possibility of using the "Two-Hybrid System" is to influence the interaction between a polypeptide of the invention and a known or unknown polypeptide by the action of other substances, such as e.g. chemical compounds. This method also makes it possible to easily find a new chemically synthesized active substance which can be used as a therapeutic. Therefore, the present invention is not only directed to a procedure for screening for polypeptide interactions, but also to a procedure for screening for substances that may react with the above protein-protein complex. For the purposes of the present invention, these peptide and chemical interactions are referred to as functional interactions that may have inhibitory or stimulatory effects.
Ďalší predmet tohto vynálezu sa týka postupu prípravy proteíntoxínov zahrňujúceho kultiváciu a sekréciu proteíntoxínu v médiu, ktoré je syntetickým kultivačným médiom (BAVC-médium), chromatografické čistenie secernovaného toxínu, napr. pomocou ultrafiltrácie a katexovej chromatografie a/alebo afinitnej chromatografie na Laminarin-Sepharose a/alebo na :: I: í: > ' 'Another object of the present invention relates to a process for the preparation of protein toxins comprising culturing and secreting protein toxins in a medium that is a synthetic culture medium (BAVC-medium), chromatographic purification of a secreted toxin, e.g. by ultrafiltration and cation exchange chromatography and / or affinity chromatography on Laminarin-Sepharose and / or on:
31854/H31854 / H
Mannoprotein-Sepharose (pozri príklad 1 a dodatok k príkladom). V prípade WICALTINU produkovaného a secernovaného kmeňom DSM 12865 možno dosiahnuť ďalšie zvýšenie produkcie toxínu tak, že sa do média pridá rastlinný (a všeobecne dostupný) p-1,3-D-glukán laminarín na konečnú koncentráciu 1 %. Ako je uvedené v príklade 14, vedie prídavok laminarínu do kultivačného média k podnieteniu tvorby WICALTINU, ktorá je podľa Northern-anaiýzy vyvolaná indukciou transkripcie.Mannoprotein-Sepharose (see Example 1 and Example Supplement). For WICALTIN produced and secreted by DSM 12865 strain, further increase in toxin production can be achieved by adding plant (and generally available) β-1,3-D-glucan laminarin to a final concentration of 1%. As shown in Example 14, the addition of laminarin to the culture medium induces the formation of WICALTIN, which is induced by induction of transcription according to Northern analysis.
Na tvorbu toxínu ZYGOCINU secernovaného DSM 12864 možno používať syntetické B-médium (pozri Radler a kol., 1993)Synthetic B-medium can be used to generate ZYGOCIN toxin secreted by DSM 12864 (see Radler et al., 1993)
Ďalej uvedené príklady slúžia ako ilustrácia tohto vynálezu a neznamenajú nijaké obmedzenie tohto vynálezu len na tieto príklady.The following examples serve to illustrate the invention and do not limit the invention to these examples.
Príklady uskutočnenia vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Príklad 1Example 1
Izolácia, koncentrácia a čistenie anti-Canď/'ďa-toxínu WICALTIN zo supernatantu kultivačného roztoku killer-kvasiniek W. californica kmeň 3/57 (DSM 12865)Isolation, concentration and purification of WICALTIN anti-Can / D-toxin from supernatant of W. californica killer-yeast culture solution strain 3/57 (DSM 12865)
Killer-toxín WICALTIN secernovaný killer-kvasinkami l/V. californica 3/57 vykázal pri agarovom difúznom teste na agare s metylénovou modrou (Methylenblau-Agar) optimálne inhibičné pôsobenie na senzitívne kvasinky pri pH 4,7 a 20 °C. V syntetickom kvapalnom médiu vykazujú killer-kvasinky l/V californica 3/57 maximálnu produkciu toxínu pri kultivácii v BAVC-médiu (pH 4,7). Kvôli zvýšeniu tvorby toxínu sa killer-kvasinky najprv inkubovali za pretrepávania počas 24 hodín v 5 ml YEPD-médiu pri teplote 30 °C, potom boli kvantitatívne prevedené do 200 ml BAVC-média a znova sa kultivovali počas 48 hodín pri teplote 20 °C na trepačke (140 ot./min.). Štyri hlavné kultúry (Hauptkultur) sa zaočkovali predpestovanou kultúrou (Vorkultur) (1 %-né inokulum) vždy do 2,5 I BAVC-média (pH 4,7 v 5 I Erlenmeyerovej banke) a inkubovali počas 5 dní za mierneho trepania (60 ot./min.). Kvôli skoncentrovaniu secernovaného killer-toxínu sa bezbunkový supernatant priKiller-toxin WICALTIN secreted by killer-yeast l / V. californica 3/57 showed an optimal inhibitory effect on sensitive yeasts at pH 4.7 and 20 ° C in an methylene blue agar diffusion test (Methylenblau-Agar). In a synthetic liquid medium, killer-yeast 1 / V californica 3/57 exhibits maximum toxin production when cultured in BAVC-medium (pH 4.7). To increase toxin formation, the killer yeast was first incubated with shaking for 24 hours in 5 ml YEPD medium at 30 ° C, then quantitatively transferred to 200 ml BAVC medium and cultured again for 48 hours at 20 ° C to shaker (140 rpm). The four main cultures (Hauptkultur) were inoculated with a pre-cultured culture (Vorkultur) (1% inoculum) in 2.5 L of BAVC medium (pH 4.7 in a 5 L Erlenmeyer flask) and incubated for 5 days with gentle shaking (60). rpm.). To concentrate the secreted killer-toxin, a cell-free supernatant is added
31854/H teplote +4 °C a tlaku 1 bar 200-násobne zahustil ultrafiltráciou na membránach z polysulfónových kyselín („EasyFIow,, (fa. Sartorius); vylučovacia hranica (Ausschlussgrenze/10 kDA) na objem 50 ml. Kvôli odstráneniu nízkomolekulárnych zlúčenín a kvôli odstráneniu solí z takto získaného koncentrátu sa toxín dialyzoval cez noc pri 4 °C v dialyzačnej trubici (vylučovacia hranica 10-20 kDA) proti 5 mM citrát-fosfátovému pufru (pH 4,7). Kvôli uchovaniu koncentrátu toxínu sa dialyzovaný preparát sterilné prefiltroval cez membránu 0,2 pm a v dávkach po 1 ml sa zmrazil na -20 °C.31854 / H at a temperature of +4 ° C and a pressure of 1 bar, 200-fold concentrated by ultrafiltration on polysulfonic acid membranes ("EasyFIow" (Sartorius); exclusion limit (Ausschlussgrenze / 10 kDA) to 50 ml) to remove low molecular weight compounds. and to remove salts from the concentrate thus obtained, the toxin was dialyzed overnight at 4 ° C in a dialysis tube (exclusion threshold of 10-20 kDA) against 5 mM citrate-phosphate buffer (pH 4.7). filtered through a 0.2 µm membrane and frozen at -20 ° C in 1 ml portions.
Dôkaz a kalibrácia aktivity toxínu sa vykonali pri agarovom difúznom teste na agare s metylénovou modrou (MBA, pH 4,7) proti senzitívnym indikačným kvasinkám Saccharomyces cerevisiae 192.2d. Pritom sa z koncentrátu toxínu pripravili logaritmické zried’ovacie stupne v 0,1 M citrátfosfátovom pufre (pH 4,7) a pipetovalo sa vždy 100 μΙ do vopred pripravených otvorov (priemer otvoru 9 mm) v MBA-doske zaočkovanej senzitívnymi indikačnými kvasinkami (2 x 105 buniek/ ml). Po trojdennej inkubácii dosiek pri teplote 20 °C sa zmerali dobre viditeľné inhibičné dvorce (Hemmhof). Pritom sa preukázalo, že medzi priemerom inhibičného dvorca a logaritmom koncentrácie toxínu existuje lineárny vzťah. Priemeru inhibičného dvorca (korigovaného na priemer otvoru ) 20 mm sa priradila aktivita toxínu 1 x 104 jednotiek/ml.Detection and calibration of toxin activity was performed in a methylene blue (MBA, pH 4.7) agar diffusion assay against the sensitive indicator yeast Saccharomyces cerevisiae 192.2d. Logarithmic dilution steps were prepared from the toxin concentrate in 0.1 M citrate phosphate buffer (pH 4.7) and pipetted 100 μΙ into pre-prepared holes (9 mm hole diameter) in an MBA plate inoculated with sensitive indicator yeast (2). x 10 5 cells / ml). After three days incubation of the plates at 20 ° C, well visible inhibition wells (Hemmhof) were measured. It has been shown that there is a linear relationship between the mean inhibition court and the logarithm of the toxin concentration. The diameter of the inhibiting court (corrected for hole diameter) of 20 mm was assigned a toxin activity of 1 x 10 4 units / ml.
Čistenie koncentrovaného toxínu WICALTIN sa vykonávalo buď katexovou chromatografiou na Bioscale-S (FPLC) alebo afinitnou chromatografiou na epoxy-aktivovanej Sepharose-68-Matrix (Fa. Pharmacia), na ktorú sa vopred naviazal rastlinný β-Ι,β-D-glukán pustulán. Tento toxínový preparát, u ktorého sa týmto spôsobom preukázala špecifická aktivita zodpovedajúca 625-násobnému obohateniu (tabuľka 1), sa pri gélovej elektroforéze javil ako čistý a vykazoval po SDS-PAGE (v 10-22 %-nom gradientovom géli) len samostatné oddelené pásy pri cca 37 kDA, ktoré bolo možné preukázať ako modrou Coomassie-Blau (sfarbenie proteínu), tak i Schiffovým činidlom s kyselinou jodistou (Perjodsäure-Schifffs-Reagent-PAS; sfarbenie sacharidov). Pozitívne PAS-sfarbenie ukazuje na potenciálnu Nglykozyláciu anti-Canď/ďa-toxínu WICALTIN. Reakciou vyčisteného toxínuPurification of the concentrated WICALTIN toxin was carried out either by cation exchange chromatography on Bioscale-S (FPLC) or by affinity chromatography on epoxy-activated Sepharose-68-Matrix (Pharm. Pharmacia) to which the plant β-Ι, β-D-glucan pustulanin was pre-bound. . This toxin preparation, which showed a specific activity corresponding to a 625-fold enrichment in this way (Table 1), appeared to be pure in gel electrophoresis and showed separate discrete bands after SDS-PAGE (in a 10-22% gradient gel). at about 37 kDA, which was detectable by both blue Coomassie-Blau (protein staining) and Schiff's periodic acid reagent (Perjodsäure-Schifffs-Reagent-PAS; carbohydrate staining). Positive PAS staining indicates the potential Nglycosylation of the anti-Can / Da-toxin WICALTIN. Reaction of purified toxin
31854/H s endoglykázou-H bolo možné preukázať, že WICALTIN obsahuje Nglykozidicky viazanú sacharidickú časť s dĺžkou cca 3 kDA, ktorá vzhľadom k svojej veľkosti v kvasinkách rovnako ukazuje na jediné N-glykozylačné miesto v proteíntoxíne. Vzhľadom k tomu, že deglykozylovaný WICALTIN vykazuje podstatne zníženú toxicitu, je možné usúdiť, že sacharidická časť WICALTINU je zrejme pre naviazanie na senzitívnu cieľovú bunku nevyhnutná, t.j., že nepriamo ovplyvňuje biologickú aktivitu toxínu.31854 / H with endoglycase-H, WICALTIN has been shown to contain an approximately 3 kDA Nglycosidically linked carbohydrate moiety, which, due to its size in yeast, also points to a single N-glycosylation site in proteintoxin. Since deglycosylated WICALTIN exhibits substantially reduced toxicity, it can be concluded that the carbohydrate portion of WICALTIN appears to be necessary for binding to a sensitive target cell, i.e., it indirectly affects the biological activity of the toxin.
Tabuľka 1Table 1
Zahustenie toxínu WICALTIN zo supernatantu kultivačného média killerkvasiniek Williopsis californica (UF, ultrafiltrácia)Concentration of WICALTIN toxin from supernatant of Williopsis californica killer yeast culture medium (UF, ultrafiltration)
Príklad 2Example 2
Stanovenie NH2-terminálnej aminokyselinovej sekvencie preparátu WICALTIN a dôkaz enzymatickej β-1,3-glukonázovej aktivityDetermination of NH 2 -terminal amino acid sequence of WICALTIN and evidence of enzymatic β-1,3-gluconase activity
Sekvencovaním N-terminálnych aminokyselín vo vyčistenom killer-toxíne sa stanovilo prvých desať aminokyselín. Ako vyplýva z obr. 1, vykazuje Nkoniec preparátu WICALTIN signifikantnú homológiu s amino-koncom endo-β1,3-glukanázy kódovanej BGL2-génom z kvasiniek Saccharomyces cerevisiae.The first ten amino acids were determined by sequencing the N-terminal amino acids in the purified killer toxin. As can be seen from FIG. 1, the end of WICALTIN shows significant homology to the amino terminus of the endo-β1,3-glucanase encoded by the yeast Saccharomyces cerevisiae BGL2 gene.
31854/H31854 / H
Na základe tejto zistenej homológie preparátu WICALTIN a Bgl2 sa zisťovalo, či je v nečistenom koncentráte toxínu a rovnako v čistenom toxínovom preparáte preukázateľná glukanázová aktivita. Ako pri enzymatickom teste, pri ktorom sa použil ako substrát p-í,3-D-glukán laminarín, tak i pri fluorescenčnom teste, pri ktorom sa použil ako substrát 4metyl-umbelliferyl-p-D-glukozid (MUC), bolo možné u preparátov WICALTINU preukázať výraznú p-¥l,3-D-glukanázovú aktivitu; súbežne testovaný |>1,6-Dglukán pustulan sa pôsobením preparátu WICALTIN nehydrolyzoval.Based on this homology of WICALTIN and Bgl2, it was determined whether glucanase activity was detectable in the unpurified toxin concentrate as well as in the purified toxin preparation. Both in the enzymatic assay using β-1,3-D-glucan laminarin as substrate, and in the fluorescent assay using 4-methyl-umbelliferyl-β-D-glucoside (MUC) substrate, WICALTIN preparations were possible. demonstrate significant β-β 1,3-D-glucanase activity; concurrently tested?> 1,6-Duclucan pustulan was not hydrolyzed by WICALTIN.
Príklad 3Example 3
Miera prežitia kvasinkových buniek po pôsobení WICALTINU za prítomnosti a neprítomnosti glukánov bunkovej steny: kompetičné analýzySurvival rate of yeast cells after WICALTIN treatment in the presence and absence of cell wall glucans: competition analyzes
Senzitívne bunky kvasiniek kmeňa S. cerevisiae 192.2d, ktoré boli kultivované v kvapalnom médiu YEPD (pH 4,7) pri 20 °C za prítomnosti čisteného WICALTINU s aktivitou 1 x 105 E/ml, vykázali kinetiku usmrcovania uvedenú na obr. 2. Prídavkom rastlinného β-Ι,β-D-glukánu pustulanu bolo možné mieru prežitia kvasinkových buniek po pôsobení toxínu výrazne zvýšiť. Tento prídavok pri koncentráciách 10 mg/ml spôsobil úplné potlačenie toxicity preparátu WICALTIN. Na rozdiel od pustulanu nevykázal β-1,3-D-glukán laminarín schopnosť zvýšiť mieru prežitia toxínom upravovaných kvasinkových buniek (obr. 2).Yeast sensitive cells of strain S. cerevisiae 192.2d, which were cultured in liquid YEPD medium (pH 4.7) at 20 ° C in the presence of purified WICALTIN with an activity of 1 x 10 5 E / ml, showed the kinetics of killing shown in FIG. 2. By adding plant β-Ι, β-D-glucan to pustulan, the survival rate of yeast cells after toxin treatment could be significantly increased. This addition at concentrations of 10 mg / ml caused complete suppression of the toxicity of WICALTIN. In contrast to pustulan, β-1,3-D-glucan laminarin did not show the ability to increase the survival rate of toxin-modified yeast cells (Fig. 2).
Z uvedených poznatkov možno vyvodiť záver, že pôsobenie preparátu WICALTIN vyžaduje väzbu na β-1,6-D-glukány, ktoré fungujú ako primárne miesto väzby (Andockstelle) (receptory toxínu) na bunkovej stene kvasiniek. V súlade s tým sa dokázalo, že kvasinky s vyštiepením v chromozomálnom KRE1-génovom centre (Genlocus) majú toxínrezistentné správanie a po retransformácii s KRE1-nesúcim epizomálnym vektorom sú opäť toxínsenzitívne (obr. 3). V kre1-mutantoch spočíva rezistencia voči toxínu na podstatne zníženom obsahu p-1,6-D-glukánu, a tým podmieneným znížením väzby toxínu na povrch buniek kvasiniek, potrebnej pre letálny účinok.From the above, it can be concluded that the action of WICALTIN requires binding to β-1,6-D-glucans, which act as the primary binding site (Andockstelle) (toxin receptors) on the yeast cell wall. Accordingly, yeasts cleaved at the chromosomal KRE1-gene center (Genlocus) have been shown to have toxin-resistant behavior and, once retransformed with the KRE1-bearing episomal vector, are again toxinsensitive (Fig. 3). In cre1-mutants, the toxin resistance rests on a substantially reduced β-1,6-D-glucan content and thereby conditionally reduces the binding of the toxin to the yeast cell surface required for the lethal effect.
31854/H31854 / H
Príklad 4Example 4
Spektrum účinnosti a usmrcovania pôsobením WICALTINUSpectrum of efficacy and killing by WICALTIN
Pri agarovom difúznom teste preukázal čistený toxín WICALTIN z l/K califomica výraznú toxicitu voči kvasinkám uvedeným v tabuľke 2. S výnimkou troch kmeňov kvasiniek Candida crusei sa u J všetkých 22 sledovaných klinických izolátov od pacientov a rovnako u všetkých ostatných kontrolných kmeňov humánno-patogénnych druhov Candida preukázalo veľmi účinné ničenie pôsobením WICALTINU. U 14 toxínsenzitívnych druhov kvasiniek z celkom 10 rôznych rodov dokázal WICALTIN ako killer-toxín neobyčajné široké spektrum účinnosti.In the agar diffusion test, purified WICALTIN zl / K califomica toxin showed significant yeast toxicity listed in Table 2. Except for three Candida crusei yeast strains, all 22 clinical patient isolates studied as well as all other control strains of human pathogenic Candida species has shown very effective destruction by WICALTIN. In 14 toxin-sensitive yeast species from a total of 10 different genera, WICALTIN has shown an unusually broad spectrum of efficacy as a killer toxin.
Tabuľka 2Table 2
Spektrum účinnosti preparátu WICALTIN na patogénne a apatogénne kvasinky rôznych rodov. Všetky kmene sa skúšali pri agarovom difúznom teste (MBA; pH 4,7) proti čistenému preparátu WICALTIN. Aktivita aplikovaného toxínu bola vo všetkých prípadoch 1 x 106 E/ml. Kmeň C. tropicalis (pacient č. 541965) pochádzal z ústavu Inštitút fur Medizinisché Mikrobiológie und Hygiene z univerzitnej kliniky v Mainze).Spectrum of WICALTIN activity on pathogenic and apatogenic yeasts of different genera. All strains were tested in an agar diffusion assay (MBA; pH 4.7) against purified WICALTIN. The activity of the applied toxin was in all cases 1 x 10 6 E / ml. The strain of C. tropicalis (patient # 541965) was from the Institute of Fur Medizinisché Microbiology and Hygiene from the University Clinic of Mainz).
31854/H31854 / H
Príklad 5Example 5
Klonovanie, sekvencovanie a molekulárna charakterizácia WICALTINkódujúceho WCT-génu kvasiniek W. califomica kmeň 3/57 (DSM 12865)Cloning, sequencing and molecular characterization of the WICALTIN coding WCT gene of W. califomica strain 3/57 (DSM 12865)
Na základe N-terminálnej aminokyselinovej sekvencie preparátu WICALTIN sa pripravili špecifické DNA-oligonukleotidy, ktoré viedli k identifikácii a klonovaniu a rovnako k molekulárno-biologickej charakterizácii chromozomálne lokalizovaného toxíngénu WCT. DNA-sekvencia WCT (SEG IDBased on the N-terminal amino acid sequence of WICALTIN, specific DNA-oligonucleotides were prepared that led to identification and cloning as well as molecular-biological characterization of the chromosomally localized toxin of WCT. DNA sequence WCT (SEG ID
31854/H31854 / H
No 1) vykazuje jediný otvorený čítací rámec, ktorý kóduje potenciálne Nglykozylovaný proteín z 309 aminokyselín a s vypočítanou molekulovou hmotnosťou 34 017 Da.No 1) shows a single open reading frame that encodes a potentially N-glycosylated protein of 309 amino acids and with a calculated molecular weight of 34,017 Da.
Sledovanie účinnosti WCT-kódovaného killer-toxínu dokázalo, že v prípade preparátu WICALTIN ide o glykoproteín, ktorý jé pre kvasinky mimoriadne toxický, ktorého primárnym „cieľom (target)„; sú β-1,3-D-glukány, ktoré sá vyskytujú v bunkovej stene kvasiniek. Jeho selektívna toxicita voči kvasinkám a hubám spočíva vtom, že WICALTIN rozrušuje v senzitívnej cieľovej bunke štruktúru a/alebo integritu bunkovej steny, takže napadá kvasinky v ich najcitlivejšom mieste, a tým ich ničí.Monitoring the efficacy of WCT-encoded killer-toxin has shown that WICALTIN is a glycoprotein that is extremely toxic to yeast, whose primary "target"; are β-1,3-D-glucans that occur in the yeast cell wall. Its selective toxicity to yeasts and fungi lies in the fact that WICALTIN disrupts the structure and / or integrity of the cell wall in a sensitive target cell, thus attacking the yeast at their most sensitive site and thereby destroying it.
Príklad 6Example 6
Úprava a čistenie vírus-toxínu ZYGOCIN získaného zo supernatantu po kultivácii killer-kvasiniek Z. ba////kmeň 412 (DSM 12864)Treatment and purification of ZYGOCIN virus-toxin obtained from the supernatant after cultivation of Z. ba /// killer-yeast strain 412 (DSM 12864)
Z kvasiniek Z. bailii kmeň 412 sa zo supernatantu kultivačného média killer-kvasiniek metódou, ktorú opísali Radler a kol. (1993) izoloval víruskódovaný killer-toxín ZYGOCIN, ktorý sa ďalej zahustil ultrafiltráciou a potom sa čistil pomocou afinitnej chromatografie. Jednostupňové čistenie ZYGOCINU opísané v citovanej štúdii využíva prirodzenú afinitu toxínu k manoproteínom bunkovej steny senzitívnych kvasiniek. Podľa metódy, ktorú opísali Schmitt a Radler (1997) sa izolovaný a čiastočne vyčistený manoproteín zo S. cerevisiae kmeň 192.2d kovalentne naviazal na epoxyaktivovanú Sepharose-6B-matricu (Fa. Pharmacia) a použil pre FPLC čistenie toxínu pomocou stĺpcovej chromatografie. Podľa SDS-PAGE vykázal týmto spôsobom čistený biologicky vysoko aktívny ZYGOCIN oddelené proteínové pásy so zjavnou molekulovou hmotnosťou cca 10 kDa (obr. 4).From Z. bailii yeast strain 412, from the supernatant of the killer-yeast culture medium according to the method of Radler et al. (1993) isolated the virus-encoded killer-toxin ZYGOCIN, which was further concentrated by ultrafiltration and then purified by affinity chromatography. The single-step purification of ZYGOCIN described in the cited study utilizes the natural affinity of the toxin to sensitive yeast cell wall proteins. According to the method described by Schmitt and Radler (1997), isolated and partially purified mannoprotein from S. cerevisiae strain 192.2d was covalently coupled to an epoxyactivated Sepharose-6B-matrix (Pharmacia) and used for FPLC purification of the toxin by column chromatography. According to SDS-PAGE, the purified biologically highly active ZYGOCIN showed separate protein bands with an apparent molecular weight of about 10 kDa (FIG. 4).
Príklad 7Example 7
Spektrum účinnosti a usmrcovania pôsobením ZYGOCINUSpectrum of efficacy and killing by ZYGOCIN
31854/H31854 / H
Spektrum účinnosti virálného ZYGOCINU z kvasiniek Z. bailii 412 (DSM 12864), stanovené pri agarovom difúznom teste, zahrňuje patogénne a apatogénne rody kvasiniek, z ktorých Candida albicans a Sporothrix schenkii sa predpokladajú, že sú pôvodcami chorôb u človeka a zvierat a Ustilago maydis a Debaromyces hansenii za škodlivé kvasinky v poľnohospodárstve a potravinárstve (tab. 3).The spectrum of viral ZYGOCIN from yeast Z. bailii 412 (DSM 12864), determined in the agar diffusion test, includes the pathogenic and apatogenic yeast genera of which Candida albicans and Sporothrix schenkii are believed to be causative agents in humans and animals and Ustilago Debaromyces hansenii for harmful yeasts in agriculture and food (Table 3).
Tabuľka 3Table 3
Spektrum účinnosti ZYGOCINU voči patogénnym a apatogénnym kvasinkám rôznych rodov. Všetky kmene sa testovali pri agarovom difúznom teste (MBA, pH 4,5) na preparát ZYGOCIN s aktivitou 1 x 104 E/ml.Spectrum of ZYGOCIN activity against pathogenic and apatogenic yeasts of different genera. All strains were tested in an agar diffusion assay (MBA, pH 4.5) for ZYGOCIN preparation with an activity of 1 x 10 4 E / ml.
31854/H31854 / H
Príklad 8Example 8
Klonovanie a sekvencovanie ZYGOCIN-kódujúceho ZBT-génu (ZBT) kvasiniek Z. bailii kmeň 412 (DSM 12864) cDNA-syntéza toxínkódujúceho dvojvláknového RNA-genómu killerkvasiniek Z: bailii 412 sa vykonala podľa metódy, ktorú qpísal Schmitt s čistenou a metylortuťhydroxidom denaturovanou M-dsRNA ako matricou a s rôznymi hexanukleotidmi ako „primérmi,,. Po ligácii do EcoRI-restringovaného vektoru pUC18, transformácii v E. colia izolácii rekombinantného plazmidu bolo možné identifikovať a sekvencovať niekoľko cDNA-klonov. cDNA-sekvencia ZYGOCINOM kódovaného čítacieho rámca (SEQ ID No 2) obsahuje genetickú informáciu pre prvotný proteín (Vorläuferprotein) (Pro-Toxin) z 238 aminokyselín,. ktorý má v aminokyselinovej pozícii RR139 potenciálne Kex2endopeptidázové štiepne miesto. Pri in vivo vykonávanej - premene ProZYGOCINU v neskorom Golgiho štádiu (im späten Golgi-Stadium) sprostredkovanej Kex2 vzniká biologicky aktívny ZYGOCIN, ktorého molekulová hmotnosť (10 kDA; 99 aminokyselín) a N-terminálna aminokyselinová sekvencia súhlasia presne s hodnotami zodpovedajúcimi čistenému ZYGOCINU.Cloning and sequencing of the ZYGOCIN-encoding ZBT-gene (ZBT) of yeast Z. bailii strain 412 (DSM 12864) cDNA synthesis of the toxin-coding double-stranded RNA genome of the Z: bailii 412 yeast was performed according to the method of qroxymortortuted with purified and methyl dsRNA as a matrix and with various hexanucleotides as "primers". After ligation into the EcoRI-restricted pUC18 vector, transformation into E. colia by isolation of the recombinant plasmid, several cDNA clones could be identified and sequenced. The cDNA sequence of the ZYGOCIN encoded reading frame (SEQ ID No 2) contains genetic information for the protein (Vorlauferprotein) (Pro-Toxin) of 238 amino acids. which has a potential Kex2 endopeptidase cleavage site at amino acid position RR 139 . The in vivo conversion of ProZYGOCIN in late Golgi-mediated Kex2 mediated biologically active ZYGOCIN whose molecular weight (10 kDA; 99 amino acids) and the N-terminal amino acid sequence correspond exactly to the values corresponding to the purified ZYGOCIN.
Heterologická expresia ZBT-cDNA v kvasinkách S. cerevisiae viedla vzhľadom k toxicite ZYGOCINU k tomu, že transformované kvasinky boli usmrtené svojim vlastným toxínom. V budúcnosti bude heterologická expresia ZYGOCINU zameraná na toxínrezistentné deliace sa kvasinky Schizosaccharomyces pombe, pretože - ako už bolo uvedené v príklade vírusového K28-toxínu - sú tieto deliace sa kvasinky pre expresiu a sekréciu cudzorodých proteínov obzvlášť vhodné.The heterologous expression of ZBT-cDNA in S. cerevisiae yeast, due to the toxicity of ZYGOCIN, resulted in the transformed yeast being killed by its own toxin. In the future, heterologous expression of ZYGOCIN will be directed to the toxin resistant dividing yeast of Schizosaccharomyces pombe because, as already mentioned in the viral K28-toxin example, these dividing yeasts are particularly suitable for the expression and secretion of foreign proteins.
Príklad 9Example 9
Expresia toxíngénu WCT a ZBT v transgénnych rastlináchToxin toxin expression of WCT and ZBT in transgenic plants
31854/H31854 / H
Vzhľadom k tomu, že opísané killer-toxíny WICALTIN a ZYGOCIN majú široké spektrum účinnosti a usmrcujú i fytopatogénne kvasinky a huby, malo by byť možné pripraviť také transgénne rastliny, ktoré by boli odolné napr. proti infekcii kukurice zapríčinenej patogénom Ustilago maydis. Podobné pokusy sa už vykonali s rastlinami tabaku, ktoré pri heterologickej expresii prirodzeného vírusovo kódovaného killer-toxínu KP4 z U. maydis mali schopnosť secernovať príslušný killer-toxín, a tak získať špecifickú Ochranu proti infekciám vyvolaným určitými fytopatogénnymi kmeňmi U. maydis (Park a kol., 1996; Kinal a kol., 1995; Bevan, 1984). Na základe komerčne dostupných transformačných systémov založených na modifikovaných derivátoch prírodného Ti-plazmidu z Agrobacterium tumefaciens bolo možné klonované toxíngény WCT a ZBT naklonovať do tzv. dvojsmerných pBI-vektorov (Fa. Clontech) a použiť k získaniu transgénnych rastlín. Príslušné toxíngény WCT a ZBT boli pod transkripčnou kontrolou silného promótora vírusu karfiolovej mozaiky (CaMVP). Výstavba konštruovaných vektorov je schematicky znázornená na obr. 5.Since the described killer toxins WICALTIN and ZYGOCIN have a broad spectrum of activity and also kill phytopathogenic yeasts and fungi, it should be possible to prepare such transgenic plants that are resistant to e.g. against maize infection caused by the pathogen Ustilago maydis. Similar experiments have already been performed with tobacco plants which, when heterologously expressing the naturally virus-encoded killer toxin KP4 from U. maydis, had the ability to secrete the killer toxin in question and thereby obtain specific protection against infections caused by certain phytopathogenic U. maydis strains (Park et al. , 1996; Kinal et al., 1995; Bevan, 1984). Based on commercially available transformation systems based on modified derivatives of natural Ti-plasmid from Agrobacterium tumefaciens, it was possible to clone the cloned WCT and ZBT toxin genes into the so-called. bi-directional pBI vectors (Clontech) and used to obtain transgenic plants. The respective WCT and ZBT toxins were under the transcriptional control of the potent cauliflower mosaic virus (CaMVP) promoter. The construction of the constructed vectors is shown schematically in FIG. 5th
Príklad 10Example 10
Heterologická expresia WICALTIN-kódujúceho WCT-génu kvasiniek IV. califomica 3/57 (DSM 12865) v S. cerevisiaeHeterological expression of the WICALTIN-encoding WCT yeast gene IV. califomica 3/57 (DSM 12865) in S. cerevisiae
Kvôli heterologickej expresii WCT-génu v kvasinkách S. cerevisiae sa WICALTIN-kódujúci WCT-gén ako 930 bp EcoR/Smal-fragment naklonoval do všeobecne dostupného 2 μ vektoru pYX242. Výsledný vektor pSTH2 (obr. 6) obsahuje toxíngén pod transkripčnou kontrolou vlastného kvasinkového triózafosfát-izomeráza-promótoru (TPI) a umožňuje tak po transformácii v kvasinkách (S. cerevisiae) vykonať konštitutívnu expresiu WICALTINU. Gélová elektroforéza supernatantu kultivačného média dokázala u takto získaných kvasinkových transformantov, že rekombinantný WICALTIN sa secernuje do kultivačného média a vykazuje p-1,3-D-glukanázovú aktivitu (obr. 6) zodpovedajúcu homologickému WICALTINU (z „divokého,, kmeňa DSM 12865).Due to heterologous expression of the WCT gene in S. cerevisiae yeast, the WICALTIN-encoding WCT gene as a 930 bp EcoR / SmaI fragment was cloned into the generally available 2 μ vector of pYX242. The resulting pSTH2 vector (Fig. 6) contains the toxin under the transcriptional control of its own yeast triose phosphate isomerase promoter (TPI), thus allowing constitutive expression of WICALTIN after yeast transformation (S. cerevisiae). Gel electrophoresis of the culture medium supernatant in the yeast transformants thus obtained showed that recombinant WICALTIN secreted into the culture medium and showed β-1,3-D-glucanase activity (Fig. 6) corresponding to homologous WICALTIN (from "wild" strain DSM 12865) .
31854/H31854 / H
PríkladuExample
Pokusy s heterologickou expresiou WICALTINU a ZYGOCINU v deliacich sa kvasinkách Schizosaccharomyces pombeExperiments with heterologous expression of WICALTIN and ZYGOCIN in dividing yeast Schizosaccharomyces pombe
Vzhľadom k tomu, že deliace sa kvasinky ako vo forme intaktnej bunky, tak i ako sférôplast bez bunkovej steny sú voči WICALTINU a ZYGOCINU rezistentné, sú vhodné;ako hostiteľské bunky pre heterologickú expresiu týchto toxínov. Aby sa zaručilo, že tieto rekombinantné toxíny sa v deliacich sa kvasinkách nielen exprimujú, ale že sa dostanú i do intracelulárnej sekrečnej cesty, a tým sa secernujú do vonkajšieho kultivačného média, skonštruoval sa vektor (ρΤΖ/ατ, obr. 7), ktorý je nositeľom funkčného signálu pre sekréciu a spracovanie v S. pombe (S/P) a ktorý pochádza z cDNA virálneho K28preprotoxíngénu kvasiniek S. cerevisiae (pozri Schmitt, 1995; Schmitt a Tipper, 1995). Tento sekrečný a procesný signál zaisťuje, že sa vždy „in-frame„ zaradený cudzorodý proteín v deliacich sa kvasinkách importuje do dutiny (Lumen) endoplazmatického retikula, a tým sa dostane do sekrečnej cesty kvasiniek. Prostredníctvom Kex2p-štiepneho miesta na C-konci S/P oblasti sa odštiepi požadovaný cudzorodý proteín v neskorom Golgiho priestore v bunkách (in spätem Golgi-Kompartiment) pôsobením vlastnej kvasinkovej Kex2p-endopeptidázy od svojho intracelulárneho „transportného prostriedku (Transport-Vehikel,,) a môže sa nakoniec secernovať ako biologicky aktívny proteín (ZYGOCIN a/alebo WICALTIN) do vonkajšieho kultivačného média.Since the dividing yeast, both in the form of an intact cell and as a cell wall-free sphere, are resistant to WICALTIN and ZYGOCIN, they are suitable ; as host cells for heterologous expression of these toxins. To ensure that these recombinant toxins are not only expressed in dividing yeast, but also enter the intracellular secretory pathway and are secreted into the external culture medium, a vector (ρΤΖ / ατ, Fig. 7) was constructed which is carrier of a functional signal for S. pombe secretion and processing (S / P) and which is derived from the yeast S. cerevisiae viral K28 preprotoxin cDNA (see Schmitt, 1995; Schmitt and Tipper, 1995). This secretory and process signal ensures that the in-frame foreign protein in the dividing yeast is always imported into the lumen of the endoplasmic reticulum, and thus enters the yeast secretory pathway. Through the Kex2β-cleavage site at the C-terminus of the S / P region, the desired foreign protein in the late Golgi space in cells (in back Golgi-Compartiment) is cleaved by its own yeast Kex2β-endopeptidase from its intracellular "Transport-Vehicle". and can ultimately be secreted as a biologically active protein (ZYGOCIN and / or WICALTIN) into an external culture medium.
Príklad 12Example 12
Porovnanie biologickej aktivity čisteného WICALTINU a topických antimykotík Clotrimazol a MiconazolComparison of biological activity of purified WICALTIN and topical antifungal agents Clotrimazole and Miconazole
Vzhľadom k tomu, že čistený WICALTIN vykazuje široké spektrum účinnosti a účinne ničí i ľudské patogénne kvasinky a/alebo huby, má značný význam i ako potenciálne antimykotikum. Preto sa vykonali štúdie, pri ktorých sa WICALTIN porovnával s veľmi často používanými topickými antimykotikami Clotrimazol a Miconazol. Najprv sa testovalo toxické pôsobenie Clotrimazolu aSince purified WICALTIN exhibits a broad spectrum of activity and effectively kills even human pathogenic yeasts and / or fungi, it is also of great importance as a potential antifungal agent. Therefore, studies have been conducted comparing WICALTIN with the very commonly used topical antifungal agents Clotrimazole and Miconazole. The toxic action of Clotrimazole a was first tested
31854/H31854 / H
Miconazolu pri MBA-agarovom difúznom teste, pri ktorom sa ako indikátorové kvasinky použili Sporothríx spec. Pritom sa Clotrimazol rozpustil na koncentráciu 10 mg/ml v etanole (96 %); tento základný roztok sa zriedil redestilovanou vodou a použil vždy po 100 μΙ pri MBA-teste v koncentráciách od 0,1 do 10 mg/ml. Priemer inhibičného dvorca (Hemmhof) bol pri použitom množstve 10 - 50 μ9 Clotrimazolu medzi 12 a 32 mm. Z Miconazolu sa pripravil základný roztok 100 μρ/ηιΙ v DMSO (100 %), ktorý; sa pri MBA-teste sledoval rovnakým spôsobom ako u Clotrimazolu na biologickú aktivitu voči Sporothríx spec. Použitie 0,08-0,3 μ9 Miconazolu viedlo pri „Bioassay,, k inhibičným dvorcom s priemerom medzi 22 a 36 mm. Biologická aktivita 10 μς Clotrimazolu, resp. 0,08 g Miconazolu zodpovedala toxicite 2 g čisteného WICALTINU. Z porovnania týchto troch skúšaných zlúčenín vzťahujúceho sa na ich molekulové hmotnosti vyplýva, že WICALTIN už v koncentrácii 0,07 pmol vykazuje rovnakú aktivitu ako 0,2 pmol Miconazolu a 29 pmol Clotrimazolu; to znamená, že WICALTIN je ako antimykotikum vysoko účinný (obr. 8).Miconazole in an MBA-agar diffusion assay in which Sporothrix spec. Clotrimazole was dissolved to a concentration of 10 mg / ml in ethanol (96%); this stock solution was diluted with redistilled water and used at 100 μΙ in each case in the MBA test at concentrations ranging from 0.1 to 10 mg / ml. The diameter of the Inhibitory Court (Hemmhof) was between 12 and 32 mm, using an amount of 10 - 50 µ9 Clotrimazole. From Miconazole, a stock solution of 100 μρ / ηιΙ in DMSO (100%) was prepared which; in the MBA assay was followed in the same manner as Clotrimazole for biological activity against Sporothrix spec. The use of 0.08-0.3 μ9 of Miconazole resulted in inhibition wells with a diameter of between 22 and 36 mm at Bioassay. Biological activity of 10 μς Clotrimazole, resp. 0.08 g of Miconazole corresponded to the toxicity of 2 g of purified WICALTIN. A comparison of the three test compounds, based on their molecular weights, shows that WICALTIN already exhibits the same activity as 0.2 pmol of Miconazole and 29 pmol of Clotrimazole at a concentration of 0.07 pmol; this means that WICALTIN is highly effective as an antifungal agent (Fig. 8).
Príklad 13Example 13
Dôkaz WICALTIN-kódujúceho WCT-génu kvasiniek W. califomica 3/57 (DSM 12865) pomocou Southern-hybridizácie s génovo-špecifickou DNA-sondouDetection of the WICALTIN-coding WCT gene of W. califomica 3/57 (DSM 12865) by Southern hybridization with a gene-specific DNA probe
Ako dôkaz pre to, že nukleovú kyselinu podľa SEQ ID No 1 možno použiť na prípravu WICALTIN-špecifickej DNA-sondy pre nasledujúcu Southern-hybridizáciu, sa DIG-značená, 930 bp dlhá DNA-sonda použila ako dôkaz WCT-génu naklonovaného do vektoru pSTH1. Konštruovaný vektor pSTH1 predstavuje derivát všeobecne dostupného prokaryotického klonovacieho vektoru pBR322.As evidence that the nucleic acid of SEQ ID No 1 can be used to prepare a WICALTIN-specific DNA probe for subsequent Southern hybridization, a DIG-labeled, 930 bp long DNA probe was used as evidence of the WCT gene cloned into the pSTH1 vector . The engineered vector pSTH1 is a derivative of the generally available prokaryotic cloning vector pBR322.
Výsledky elektroforézy na agarózovom géli uvedené na obr. 9 a príslušné Southern-Blot-analýzy nepochybne preukázali, že WICALTINkódujúci WCT-gén možno pomocou sondy pripravenej z nukleových kyselín dokázať.The agarose gel electrophoresis results shown in FIG. 9 and the respective Southern-Blot analyzes undoubtedly demonstrated that the WICALTIN encoding WCT gene can be detected using a nucleic acid probe.
31854/H31854 / H
Príklad 14Example 14
Northern-Blot-analýza pre dôkaz transkripčnej indukcie WICALTIN-kódujúceho WCT-génu kvasiniek Williopsis califomica 3/57 (DSM 12865) pomocou β-1,3-DglukánuNorthern blot analysis to demonstrate transcriptional induction of the WICALTIN-coding WCT gene of Williopsis califomica 3/57 (DSM 12865) by β-1,3-Dglucan
Kvôli dokázaniu WCT-transkripcie indukovanej β-1,3-D-glukánom sa kultivoval kmeň kvasiniek DSM 12865 v 300 ml BAVC-médiu, resp. v BAVC- ? médiu s prídavkom 0,03 % prírodného β-1,3-D-glukánu laminarínu počas 48 hodín pri teplote 20 °C za mierneho trepania (60 ot./min.) a postupne sa v rôznych intervaloch použil na prípravu celkovej RNA. Všetky vzorky (10 ml) sa pred izoláciou RNA upravili na rovnaký počet buniek 1,8 x 108 buniek/ml a potom sa tieto vzorky elektroforeticky delili v denaturujúcich agarózaformaldehydových géloch. Ako vyplýva z obr. 10, bolo možné preukázať ako za neindukčných podmienok (BAVC-médium bez prídavku), tak i v laminarínom obohatenom BAVC-médiu, že WCT-transkript má veľkosť 1 100 báz. Bez prídavku glukánu sa dosiahla maximálna expresia WCT ku koncu fázy exponenciálneho rastu (po 19 hodinách); podstatne slabšie hybridizačné signály v stacionárnej fáze rastu ukazujú na zoslabenú transkripciu. Pri indukujúcich podmienkach kultivácie (za prítomnosti laminarínu) vykázal WCTtranskript po 10 hodinách podstatne vyššiu intenzitu ako v neindukujúcom kultivačnom médiu, z čoho vyplýva, že táto transkripcia WICALTINOM kódovaného WCT-génu sa môže vyvolať prídavkom β-1,3-D-glukánu.To demonstrate WCT-transcription induced by β-1,3-D-glucan, the yeast strain DSM 12865 was cultured in 300 ml of BAVC-medium, respectively. in BAVC-? medium with the addition of 0.03% natural β-1,3-D-glucan laminarin for 48 hours at 20 ° C with gentle shaking (60 rpm) and was successively used at various intervals to prepare total RNA. All samples (10 ml) were adjusted to an equal cell count of 1.8 x 10 8 cells / ml prior to RNA isolation and then electrophoretically resolved in denaturing agarose-formaldehyde gels. As can be seen from FIG. 10, both the non-induction conditions (BAVC-medium without addition) and the laminarin-enriched BAVC-medium could be shown to be 1,100 bases in the WCT transcript. Without the addition of glucan, maximal expression of WCT was achieved at the end of the exponential growth phase (after 19 hours); substantially weaker hybridization signals in the stationary phase of growth indicate attenuated transcription. Under inducing culture conditions (in the presence of laminarin), the WCT transcript showed significantly greater intensity after 10 hours than in the non-inducing culture medium, suggesting that this transcription of the WICALTIN-encoded WCT gene can be induced by the addition of β-1,3-D-glucan.
Dodatok k príkladom uskutočnenia vynálezuAddendum to the Examples
Médiá a roztoky použité v príkladoch:Media and solutions used in the examples:
a) BAVC-médium glukóza 50 g/la) BAVC medium glucose 50 g / l
D,L-jablčnan 20 g/l trinátriumcitrát 0,5 g/l (NH4)2SO4 D, L-malate 20 g / l trisodium citrate 0,5 g / l (NH 4 ) 2 SO 4
MgSO4 MgSO 4
1,5 g/l 1,0 mg/l1.5 g / l 1.0 mg / l
31854/H myoinozit 0,04 g/l základný roztok aminokyselín (10 x) 200 ml/l základný roztok stopových prvkov (100 x) 10 ml/l základný roztok vitamínov (100 x) 20 ml/l31854 / H myoinositis 0.04 g / l amino acid base solution (10 x) 200 ml / l trace element base (100 x) 10 ml / l vitamin base (100 x) 20 ml / l
b) základný roztok aminokyselín (10 x) alanín 0,75 g/l arginínmonohydrochlorid ‘ 3,5 g/l asparágová kyselina 0,5 g/l glutámová kyselina 3 g/l histidínmonohydrochlorid 0,2 g/l metionín 0,4 g/l serín 0,5 g/l treonín 2 g/l tryptofán 0,4 g/lb) amino acid stock solution (10x) alanine 0.75 g / l arginine monohydrochloride 3.5 g / l aspartic acid 0.5 g / l glutamic acid 3 g / l histidine monohydrochloride 0.2 g / l methionine 0.4 g / l serine 0.5 g / l threonine 2 g / l tryptophan 0.4 g / l
c) základný roztok stopových prvkov (100 x) boritá kyselina 200 mg/l(c) trace element stock (100 x) boric acid 200 mg / l
FeCI3.6 H2O 200 mg/lFeCl3.6 H2O 200 mg / l
ZnSO4.7 H2O 200 mg/lZnSO4.7 H2O 200 mg / l
AICI3 200 mg/lAlCl3 200 mg / L
CuSO4.5 H2O 100 mg/lCuSO4.5 H2O 100 mg / L
Na2MoO4.2 H2O 100 mg/lNa2MoO4.2 H2O 100 mg / L
LÍ2SO4 . H2O 100 mg/lLi2SO4. H 2 O 100 mg / L
KJ 100 mg/l hydrogénvínan draselný 2 g/lKJ 100 mg / l potassium hydrogen tartrate 2 g / l
d) základný roztok vitamínov (100 x)d) vitamin solution (100 x)
4-aminobenzoová kyselina 20 mg/l biotín 2 mg/l listová kyselina 2 mg/l nikotínová kyselina 100 mg/l pyridoxolhydrochlorid 100 mg/l4-aminobenzoic acid 20 mg / l biotin 2 mg / l folic acid 2 mg / l nicotinic acid 100 mg / l pyridoxol hydrochloride 100 mg / l
31854/H riboflavín tiamíniumdichlorid31854 / H riboflavin thiaminium dichloride
Ca-D-pantotenát mg/l 50 mg/l 100 mg/lCa-D-pantothenate mg / l 50 mg / l 100 mg / l
Biotín: bol rozpustený v roztoku 5 g KH2PO4 v 50 ml destilovanej vody.Biotin: was dissolved in a solution of 5 g KH2PO4 in 50 ml distilled water.
Listová kyselina: bola rozpustená v 50 ml destilovanej vody s prídavkom niekoľkých kvapiek zriedeného NaOH.>Folic acid: was dissolved in 50 ml of distilled water with the addition of a few drops of dilute NaOH.>
Riboflavín: bol rozpustený za zahrievania v 500 ml destilovanej vody s niekoľkými kvapkami HCI.Riboflavin: was dissolved with heating in 500 ml of distilled water with a few drops of HCl.
Ostatné vitamíny sú rozpustné v malom množstve destilovanej vody.Other vitamins are soluble in a small amount of distilled water.
Hodnota pH BAVC-média bola upravená prídavkom KOH na pH 4,7. Glukóza a základné roztoky boli sterilizované oddelene. Základné roztoky aminokyselín, vitamínov a stopových prvkov sa sterilizovali počas 20 minút prúdom pary pri 100 °C a potom sa pridalo BAVC-médium upravené v autokláve.The pH of the BAVC medium was adjusted to pH 4.7 by addition of KOH. Glucose and stock solutions were sterilized separately. Amino acid, vitamin, and trace element solutions were sterilized for 20 minutes with a steam stream at 100 ° C and then autoclaved BAVC-medium was added.
Vysvetlenie obrázkov na výkresoch a najdôležitejších sekvenciiExplanation of the drawings and the most important sequences
SEQ ID No 1: DNA- a odvodená aminokyselinová sekvencia WCT-kódovaného proteíntoxínu WICALTINU z kvasiniek Williopsis califomica kmeň 3/57.SEQ ID No 1: DNA- and deduced amino acid sequence of WCT-encoded protein toxin WICALTIN from yeast Williopsis califomica strain 3/57.
SEQ ID No 2: cDNA- a odvodená aminokyselinová sekvencia ZBT-kódovaného proteíntoxínu ZYGOCINU z kvasiniek Z. bailii.SEQ ID No 2: cDNA- and deduced amino acid sequence of ZBT-encoded protein toxin ZYGOCIN from yeast Z. bailii.
Obr. 1: N-terminálne aminokyselinové sekvencie W. califomica-iox\nu WICALTINU a endo-p-1,3-glukanázy Bgl2 z kvasiniek S. cerevisiae. Hrubo sú vytlačené jednotlivé odchýlky inak rovnakých čiastkových sekvencii (Bgl2psekvencie ako uvádzajú Klebl a Tanner, 1989).Fig. 1: N-terminal amino acid sequences of W. califomica-ioxin WICALTIN and endo-β-1,3-glucanase Bg12 from yeast S. cerevisiae. Individual deviations of otherwise identical sub-sequences are bold (Bg12 sequences as reported by Klebl and Tanner, 1989).
Obr. 2: Kinetika usmrcovania buniek senzitívnych kvasiniek S. cerevisiae 192.2 WICALTINOM za prítomnosti (2a) a neprítomnosti (2b) β-D-glukánu laminarínu (L) a pustulanu (P). Použitý toxín mal celkovú aktivitu 4,0 x 105 E/ml pri špecifickej aktivite 4,2 x 105 E/mg proteínu.Fig. 2: Kinetics of S. cerevisiae sensitive yeast 192.2 cells by WICALTIN in the presence (2a) and absence (2b) of laminarin-β-D-glucan (L) and pustulan (P). The toxin used had a total activity of 4.0 x 10 5 E / ml at a specific activity of 4.2 x 10 5 E / mg protein.
Obr. 3 (a, b, c, d): Agarový difúzny test ako dôkaz senzitivity/rezistencie vočiFig. 3 (a, b, c, d): Agar diffusion test as evidence of sensitivity / resistance
31854/H31854 / H
WICALTINU u Kre1+ a Kreľ kmeňov kvasiniek S. cerevisiae. Po transformáciiWICALTIN in Kre1 + and Kreel of yeast strains of S. cerevisiae. After transformation
WICALTIN-rezistentného kre1-nulmutantu S. cerevisiae SEY6210 [kre1] s KRE1- nesúcim vektorom pPGK [KRE1] sa opäť obnovila plná citlivosť vočiWICALTIN-resistant cre1-nullmutant of S. cerevisiae SEY6210 [kre1] with KRE1-carrying vector pPGK [KRE1] restored full sensitivity to
WICALTINU.WICALTIN.
Obr. 4: (A) Gélová elektroforéza (SDS-PAGE) ZYGOCINU produkovaného a secernovaného kvasinkami Z. bailii kmeň 412 (DSM 12864); po afinitne] chromatografii nä mahoproteín-Sepharose. (B) Agarový difúzny test ako dôkaz biologickej aktivity čisteného killer-toxínu ZYGOCINU.Fig. 4: (A) Gel electrophoresis (SDS-PAGE) of ZYGOCIN produced and secreted by yeast Z. bailii strain 412 (DSM 12864) ; after affinity chromatography on mahoprotein-Sepharose. (B) Agar diffusion assay as evidence of the biological activity of purified ZYGOCIN killer-toxin.
Obr. 5: Schéma štruktúry ZBT-, resp. WCT-nesúceho expresného vektoru na prípravu transgénnych rastlín.Fig. 5: Scheme structure of ZBT-, resp. WCT-bearing expression vector for the preparation of transgenic plants.
(Vysvetlivky: RB, LB: pravé a ľavé okrajové (right and left border) sekvencie prírodného Tl-plazmidu z Agrobacteríum tumefaciens', CaMV-P: 35S promótor vírusu karfiolovej mozaiky; NOS-P, NOS-T: transkripčný promótor a terminátor nopalínsyntázy; kanR: kanamycín-rezistentný gén zo Streptococcus pre selekciu vE coli; NPT-II: neomycín-fosfotransferázový gén ztranspozónu Tn5 pre selekciu v rastline).(Explanatory notes: RB, LB: right and left border of the natural T1 plasmid from Agrobacterium tumefaciens', CaMV-P: 35S cauliflower mosaic virus promoter; NOS-P, NOS-T: transcriptional promoter and nopaline synthase terminator kan R : kanamycin-resistant gene from Streptococcus for selection in E. coli; NPT-II: neomycin phosphotransferase gene from transpranone Tn5 for selection in plant).
Obr. 6:Fig. 6:
(A) Parciálna reštrikčná karta epizomálneho vektoru pSTH2 pre heterologickú expresiu WICALTIN-kódujúceho toxíngénu WCT v kvasinkách Saccharomyces cerevisiae. Vektor pSTH2 je konštruovaný plazmid vychádzajúci z komerčne dostupného 2μ Multi-Copy-vektoru pYX242, v ktorom je WCT-gén klonovaný z kmeňa DSM 12865 ako 930 bp EcoRI/Smal-fragment. Príslušný toxíngén podlieha transkripčnej kontrole vlastného kvasinkového TPI-promótoru a umožňuje tak po transformácii v S. cerevisiae intenzívnu a konštitutívnu expresiu WICALTINU.(A) Partial restriction card of the pSTH2 episomal vector for heterologous expression of WICALTIN-encoding toxin WCT in yeast Saccharomyces cerevisiae. The vector pSTH2 is a constructed plasmid based on the commercially available 2μ Multi-Copy vector pYX242, in which the WCT gene is cloned from the DSM 12865 strain as a 930 bp EcoRI / SmaI fragment. The respective toxin undergoes transcriptional control of its own yeast TPI-promoter, thus allowing intensive and constitutive expression of WICALTIN upon transformation in S. cerevisiae.
(B) Gélová elektroforéza (SDS-PAGE; 10 - 22,5 %-ný gradientový gél) koncentrovaného supernatantu kultivačného média S. cerevisiae po transformácii s konštruovaným WICALTIN-expresným vektorom pSTH2 (záznam/Spur/1). WICALTIN heterologicky exprimovaný v S. cerevisiae je označený šípkou.(B) Gel electrophoresis (SDS-PAGE; 10-22.5% gradient gel) of concentrated supernatant of S. cerevisiae culture medium after transformation with the constructed WICALTIN-expression vector pSTH2 (record / Spur / 1). WICALTIN heterologically expressed in S. cerevisiae is indicated by an arrow.
31854/H (C) Dôkaz extracelulárnej β-1,3-glukanázovej aktivity kvasiniek S. cerevisiae po transformácii s WICALTIN-exprimujúcim kvasinkovým vektorom pSTH2. Kvôli stanoveniu exo-β-1,3-glukanázovej aktivity boli kvasinkové kolónie kultivované na bezleucínovom SC-agare postriekané 0,04 %-ným 4-metylumbelliferyl^-Dglukozidom (MUG) v 50 mM nátriumacetátovom pufre (pH 5,2). Po inkubácii pri 37 °C počas 30 minút sa agarové dosky ožiarili UV-svetlom (vlnová dĺžka 254 nm). Glukanázová aktivita sa preukázala fluorescenciou na základe MUGhydrolýzy.31854 / H (C) Demonstration of extracellular β-1,3-glucanase activity of S. cerevisiae yeast after transformation with WICALTIN-expressing yeast vector pSTH2. To determine exo-β-1,3-glucanase activity, yeast colonies grown on leucine SC-agar were sprayed with 0.04% 4-methylumbelliferyl-4-glucoside (MUG) in 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.2). After incubation at 37 ° C for 30 minutes, the agar plates were irradiated with UV light (254 nm wavelength). Glucanase activity was demonstrated by fluorescence based on MUGhydrolysis.
(Vysvetlivky: 1 a 4, S. cerevisiae transformované vektorom (pEP-WCT), ktorý exprimuje WICALTIN-kódujúci WCT-gén za pôsobenia vlastného promótora; 2. kvasinky „divokého,, typu W. californica 3/57 (DSM 12865); 3. „divoké,, kvasinky W. californica 3/111; 5. S. cerevisiae po transformácii s WICALTINexprimujúcim vektorom pYX-WCT; 6. S. cerevisiae transformované so základným vektorom pYX242 (bez toxíngénu)).(Explanations: 1 and 4, S. cerevisiae transformed with a vector (pEP-WCT) that expresses the WICALTIN-encoding WCT gene under the action of its own promoter; 3. "wild" yeast W. californica 3/111; 5. S. cerevisiae after transformation with the WICALTINexpressing vector pYX-WCT; 6. S. cerevisiae transformed with the base vector pYX242 (non-toxin).
Obr. 7: Schéma štruktúry vektoru pTZ cdx pre heterologickú expresiu a sekréciu cudzorodých proteínov (hlavne WICALTINU a ZYGOCINU) v deliacich sa kvasinkách Schizosaccharomyces pombe.Fig. 7: Schematic structure of the pTZ cdx vector for heterologous expression and secretion of foreign proteins (especially WICALTIN and ZYGOCIN) in dividing yeast Schizosaccharomyces pombe.
(Vysvetlivky: Pnmt1, Tnmn, transkripčný promótor a terminátor nmt1 génu deliacich sa kvasiniek S. pombe regulovaný tiamínom; S/P sekrečná a procesná sekvencia virálneho K28-preprotoxínu pučiacich kvasiniek S. cerevisiae, ars1, autonómne sa replikujúce sekvencie z chromozómu 1 deliacich sa kvasiniek; Ieu2, leucín-2-markérový gén pre selekciu leucínprototrofných transformantov S. pombe).(Explanation: P nmt1 , T nm n, transcriptional promoter and terminator of the nmt1 gene of the dividing yeast S. pombe regulated by thiamine; S / P secretory and processing sequence of viral S. cerevisiae viral K28-preprotoxin, ars1, autonomously replicating chromosome sequence Ieu2, a leucine-2-marker gene for the selection of leucine prototrophic transformants (S. pombe).
Obr. 8: Porovnanie biologickej aktivity čisteného WICALTINU, Clotrimazolu a Miconazolu; uvedené molárne množstvá vyvolali pri „Bioassay„ (agarový difúzny test) voči senzitívnym indikačným kvasinkám Sporothrix spec. priemer inhibičného dvorca 12 mm.Fig. 8: Comparison of biological activity of purified WICALTIN, Clotrimazole and Miconazole; said molar amounts elicited in the "Bioassay" (agar diffusion test) against the sensitive indicator yeast Sporothrix spec. diameter of inhibition court 12 mm.
Obr. 9: Dôkaz WICALTIN-kódujúceho WCT-génu kvasiniek W. californica 3/57 (DSM 12865) klonovaného vpSTHI (derivát pBR322) vykonaný pomocou elektroforézy na agarózovom géli (A) a pomocou Southern-hybridizácie s DIG31854/H značenou WCT-sondou (B).Fig. 9: Detection of WICALTIN-coding WCT gene of W. californica 3/57 (DSM 12865) cloned in pSTHI (derivative of pBR322) by agarose gel electrophoresis (A) and Southern hybridization with WCT-labeled DIG31854 / H (B) ).
(Vysvetlivky: DIG-značený DNA-dĺžkový štandard II; záznam 1, pSTH1 restringovaný s EcoRI a Sa/I; záznam 2, DNA-markér „Smart-ladder,,).(Legend: DIG-labeled DNA-length standard II; record 1, pSTH1 restricted with EcoRI and Sa / I; record 2, DNA marker "Smart-ladder").
Obr. 10: Northern-analýza transkripčnej indukcie WICALTIN-kódujúceho WCTgénu kvasiniek W. califomica 3/57 (DSM 12865) za neindukujúcich podmienok kultivácie v BAVC-médiu (A) a za indukujúcich podmienok v BAVC-médiu s prídavkom 0,03 % láminarínu (B). Elektroforetické delenie dĺžkovej RNA izolovanej z kmeňa DSM 12865 sa vykonávalo v denaturujúcom agaróza/formaldehydovom géli pri konštantnom napätí (7 V/cm). RNA sa na nylonovej membráne hybridizovala proti WICALTIN-špecifickej DIG-značenej sonde (630 bp) a detekovala pomocou chemiluminiscencie.Fig. 10: Northern analysis of transcriptional induction of the WICALTIN-coding WCT gene of W. califomica 3/57 (DSM 12865) under non-inducing culture conditions in BAVC medium (A) and under inducing conditions in BAVC medium with an addition of 0.03% lamininarin (B) ). Electrophoretic separation of the length RNA isolated from the DSM 12865 strain was performed on a denaturing agarose / formaldehyde gel at a constant voltage (7 V / cm). RNA on the nylon membrane was hybridized against a WICALTIN-specific DIG-labeled probe (630 bp) and detected by chemiluminescence.
(Vysvetlivky: M, DIG-značený DNA-dĺžkový štandard I; záznamy 1-8 zodpovedajú dobám odberu vzoriek pre izoláciu celkovej RNA; záznam 1, 10 hod. záznam 2, 15 hod., záznam 3, 19 hod., záznam 4, 24 hod., záznam 5, 33 hod., záznam 6, 38 hod., záznam 7, 43 hod., záznam 8, 48 hod.).(Explanation: M, DIG-labeled DNA-length standard I; records 1-8 correspond to sampling times for total RNA isolation; record 1, 10 hr. Record 2, 15 hr, record 3, 7 hr, record 4, 24 hours, recording 5, 33 hours, recording 6, 38 hours, recording 7, 43 hours, recording 8, 48 hours).
Skratky použité v texteAbbreviations used in the text
WCT Williopsis Califomica ToxinWCT Williopsis Califomica Toxin
ZBT Zygosaccharomyces Bailii ToxinZBT Zygosaccharomyces Bailii Toxin
ZYGOCIN názov: toxín secernovanýz DSM 12864ZYGOCIN name: toxin secreted from DSM 12864
WICALTIN názov: toxín secernovaný z DSM 12865WICALTIN name: toxin secreted from DSM 12865
Ďalej uvedené mikroorganizmy použité podľa tohto vynálezu boli uložené do medzinárodne uznávanej Nemeckej zbierky mikroorganizmov a bunkových kultúr Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ), Maschenroder Weg 1b, 38124 Braunschweig, SRN, podľa požiadaviek Budapeštianskej zmluvy o medzinárodnom uznaní deponovania mikroorganizmov pre patentové účely (číslo uloženia, dátum uloženia).The following microorganisms used according to the invention were deposited in the internationally recognized German Collection of Microorganisms and Cell Cultures of the Deutsche Sammlung von Microorganisms and Zellkulturen GmbH (DSMZ), Maschenroder Weg 1b, 38124 Braunschweig, Germany, according to the requirements of the Budapest Treaty on International Recognition for (save number, save date).
Williopsis califomica kmeň 3/57 (DSM 12865)(09.06.1999)Williopsis califomica strain 3/57 (DSM 12865) (09/06/1999)
31854/H31854 / H
Zygosaccharomyces bailii kmeň 412 (DSM 12864)(09.06.1999).Zygosaccharomyces bailii strain 412 (DSM 12864) (09/06/1999).
31854/H31854 / H
Sekvenčný protokol· <110> Aventis Research & Technologies GmbH & Co KG <120> Antimykotiká a fungicídy, spôsob ich prípravy a ich použitie <130> 99F028 <140> 19930959.0 <14l> 1999-07-05 <160> 4 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 930 <212> DNA <213> Williopsis californica <220>Sequence protocol · <110> Aventis Research & Technologies GmbH & Co KG <120> Antimycotics and fungicides, process for their preparation and use <130> 99F028 <140> 19930959.0 <14l> 1999-07-05 <160> 4 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 930 <212> DNA <213> Williopsis californica <220>
<221> CDS <222> (1). . (930) <400> 1<221> CDS <222> (2). . (930) <400> 1
90 9590 95
31854/H31854 / H
3/3 /
31854/H si31854 / H si
<210> 2 <211> 309 <212> PRT <213> Williopsis californica <400> 2<210> 2 <211> 309 <212> PRT <213> Williopsis californica
31854/H31854 / H
<210> 3 <211> 717 <212> DNA <213> Zygosaccharomyces bailii <220><210> 3 <211> 718 <212> DNA <213> Zygosaccharomyces bailii <220>
<221> CDS <222> 1)..(717) <400> 3 atg aaa gca gcc caa ata tta aca gca agt ata gta agc tta ttg cca Met Lys Ala Ala Gin íle Leu Thr Ala Ser íle Val Ser Leu Leu Pro<221> CDS <222> 1) .. (717) <400> 3 atg aaa gca gcc caa ata tta aca gca agt ata gta agc tta ttg approx.
10 15 ata tat act agt get aga aac ata tta gac aga gaa tac aca gca aac íle Tyr Thr Ser Ala Arg Asn íle Leu Asp Arg Glu Tyr Thr Ala Asn10 15 ata tat act agt get aga aac tta gac aga gaa tac aca gca aac ile Tyr Thr Ser Ala Arg Asn ile Leu Asp Arg Glu Tyr Thr Ala Asn
25 30 gaa tta aaa act get ttt gga gat gaa gaa att ttt aca gat ttg acg25 30 gaa tta aaa act get ttt
Glu Leu Lys Thr Ala Phe Gly Asp Glu Glu íle Phe Thr Asp Leu ThrGlu Leu Lys Thr Gly Asp Glu Glu White Phe Thr Asp Leu Thr
144144
31854/H31854 / H
31854/H31854 / H
Iii íle Tyr Thr Ser Ala Arg Asn 20Iii il Tyr Thr Ser Ala Arg Asn 20
Glu Leu Lys Thr Ala Phe Gly 35Glu Leu Lys Thr Ala Phe Gly
Tyr His íle His Val Asn Val 50 55Tyr His White His Val Asn Val 50 55
Asn Leu Val Asn Phe Val Asp 65 70Asn Phu Val Asp 65 70
Arg Tyr íle Tyr Ala íle Phe 85Arg Tyr ile Tyr Ala ile Phe 85
Gly Leu íle Glu Tyr Leu Asn 100 íle íle Thr Gin Tyr Asn Val 115Gly Leu Clay Glu Tyr Leu Asn 100 Clay Thr Gin Tyr Asn Val 115
Asn Thr Thr Asp Gin Ala Arg 130 135Asn Thr Thr Asp Gin Ala Arg
Pro His Cys Ser Gly Asp Asn 145 150Pro His Cys Ser Gly Asp Asn 145,150
Leu Ala Tyr Asn Lys íle Asn 165Leu Ala Tyr Asn Lys White Asn 165
Tyr Val Val Gly Gin Cys His 180Tyr Val Val Gly Gin Cys His 180
Cys Ser Gly Ala Asp Arg Gin 195Cys Ser Gly Ala
Cys Gin Val Asn Gly Gly Val 210 215Cys Gin Val Asn
Thr Ala Ser íle Val Ser Leu Leu 10 15 íle Leu Asp Arg Glu Tyr Thr Ala 25 30Thr Ala Ser il Val Ser Leu Leu 10 15 il Leu Asp Arg Glu Tyr Thr Ala 25 30
Asp Glu Glu íle Phe Thr Asp Leu 40 45Asp Glu Glu White Phe Thr Asp Leu 40 45
Ser Gly Glu íle Asp Ser Tyr Tyr 60Ser Gly Glu White Asp Ser Tyr Tyr 60
Asn Ala Leu Ala Asn Lys Asp íle 75Asn Ala Leu
Thr Gin Gin Thr Asn Tyr Thr Glu 90 95Thr Gin Gin Thr Asn Tyr Thr Glu 90
His Tyr Asp Ser Glu Thr Cys Lys 105 110His Tyr Asp Ser Glu Thr Cys Lys
Asn Val Asp Thr Ser Asn Cys íle 120 125Asn Val Asp Thr Ser Asn Cys White 120 125
Leu Gin Arg Arg Gly Gly Trp Val 140Leu Gin Arg Arg
Leu Ala Asp Thr Ser Asp Cys Cys 155Leu Ala Asp Thr Ser Cys Cys 155
Pro Ser Ser Asn Leu Gin Ser Trp 170 175Pro Ser Ser Asn Leu Gin Ser Trp 170 175
Tyr íle Ser His Ala Asn Gly Lys 185 190Tyr ile Ser His Ala Asn Gly Lys 185,190
Gin Leu Ala Glu Asn Val Cys Asn 200 205Gin Leu Ala Glu Asn Val Cys Asn 200 205
Ser Ala Phe Ala Ser Ser Ser Ser 220Ser Ala Phe Ala Ser Ser Ser 220
Profor
Asnsame time
ThrThr
HisHis
Asnsame time
AspAsp
AspAsp
SerSer
Asnsame time
Asnsame time
160160
Asnsame time
Valwall
TrpTrp
AlaAla
31854/H31854 / H
Ý3Y3
His Pro Gly Ala Cys Met Ser Asp Val Gly Phe Cys Tyr Ala 225 230 235His Gly Ala Cys Met Ser
Claims (26)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19930959A DE19930959A1 (en) | 1999-07-05 | 1999-07-05 | New antimycotics and fungicides, process for their production and use |
PCT/EP2000/004972 WO2001002587A2 (en) | 1999-07-05 | 2000-05-31 | Novel antifungal agents and fungicides, method for the production thereof and their use |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK122002A3 true SK122002A3 (en) | 2002-05-09 |
Family
ID=7913696
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK12-2002A SK122002A3 (en) | 1999-07-05 | 2000-05-31 | Novel antifungal agents and fungicides, method for the production thereof and their use |
Country Status (17)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP1196608A2 (en) |
JP (1) | JP2003504030A (en) |
KR (1) | KR20020059581A (en) |
CN (1) | CN1361825A (en) |
AR (1) | AR029377A1 (en) |
AU (1) | AU5969400A (en) |
BR (1) | BR0012172A (en) |
CA (1) | CA2372935A1 (en) |
CZ (1) | CZ200249A3 (en) |
DE (1) | DE19930959A1 (en) |
HU (1) | HUP0201690A3 (en) |
IL (1) | IL147252A0 (en) |
NO (1) | NO20020003L (en) |
PL (1) | PL364765A1 (en) |
SK (1) | SK122002A3 (en) |
TR (1) | TR200200097T2 (en) |
WO (1) | WO2001002587A2 (en) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5467251B2 (en) * | 2008-08-12 | 2014-04-09 | 株式会社ソフィ | Method for quantifying β-1,3-1,6-glucan |
PT105331A (en) * | 2010-10-12 | 2012-04-12 | Cev Biotecnologia Das Plantas S A | PRESERVATIVE FOOD |
CN107164248B (en) * | 2017-03-16 | 2020-11-10 | 中国水产科学研究院南海水产研究所 | Yeast DD12-7 strain and application thereof |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
IL97020A (en) * | 1990-01-30 | 2000-12-06 | Mogen Int | Recombinant polynucleotides comprising a chitinase gene and a glucanase gene |
GB9115669D0 (en) * | 1991-07-19 | 1991-09-04 | Sandoz Ltd | Improvements in or relating to organic compounds |
WO1994020620A2 (en) * | 1993-03-03 | 1994-09-15 | Gist-Brocades N.V. | Cloning of the zymocin gene and use of zymocin in beverages |
-
1999
- 1999-07-05 DE DE19930959A patent/DE19930959A1/en not_active Withdrawn
-
2000
- 2000-05-31 TR TR2002/00097T patent/TR200200097T2/en unknown
- 2000-05-31 HU HU0201690A patent/HUP0201690A3/en unknown
- 2000-05-31 CA CA002372935A patent/CA2372935A1/en not_active Abandoned
- 2000-05-31 BR BR0012172-0A patent/BR0012172A/en not_active IP Right Cessation
- 2000-05-31 KR KR1020027000108A patent/KR20020059581A/en not_active Application Discontinuation
- 2000-05-31 CZ CZ200249A patent/CZ200249A3/en unknown
- 2000-05-31 CN CN00809677A patent/CN1361825A/en active Pending
- 2000-05-31 EP EP00945695A patent/EP1196608A2/en not_active Withdrawn
- 2000-05-31 IL IL14725200A patent/IL147252A0/en unknown
- 2000-05-31 PL PL00364765A patent/PL364765A1/en unknown
- 2000-05-31 JP JP2001508359A patent/JP2003504030A/en active Pending
- 2000-05-31 AU AU59694/00A patent/AU5969400A/en not_active Abandoned
- 2000-05-31 WO PCT/EP2000/004972 patent/WO2001002587A2/en not_active Application Discontinuation
- 2000-05-31 SK SK12-2002A patent/SK122002A3/en unknown
- 2000-07-03 AR ARP000103393A patent/AR029377A1/en unknown
-
2002
- 2002-01-02 NO NO20020003A patent/NO20020003L/en not_active Application Discontinuation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE19930959A1 (en) | 2001-01-25 |
IL147252A0 (en) | 2002-08-14 |
AU5969400A (en) | 2001-01-22 |
NO20020003D0 (en) | 2002-01-02 |
CZ200249A3 (en) | 2002-04-17 |
TR200200097T2 (en) | 2002-05-21 |
BR0012172A (en) | 2002-03-05 |
KR20020059581A (en) | 2002-07-13 |
WO2001002587A3 (en) | 2002-02-07 |
CA2372935A1 (en) | 2001-01-11 |
PL364765A1 (en) | 2004-12-13 |
HUP0201690A3 (en) | 2004-10-28 |
NO20020003L (en) | 2002-02-28 |
CN1361825A (en) | 2002-07-31 |
JP2003504030A (en) | 2003-02-04 |
AR029377A1 (en) | 2003-06-25 |
HUP0201690A2 (en) | 2002-09-28 |
EP1196608A2 (en) | 2002-04-17 |
WO2001002587A2 (en) | 2001-01-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US9333246B2 (en) | Compositions and methods to elicit immune responses against pathogenic organisms using yeast-based vaccines | |
JP4118340B2 (en) | Fungal antigen and method for producing the same | |
RU2559537C2 (en) | Hyr1 as target for active and passive immunisation against candida | |
IZGÜ et al. | Isolation and characterization of the K5-type yeast killer protein and its homology with an exo-β-1, 3-glucanase | |
EP1071767B1 (en) | Gene coding for heliomicine and use thereof | |
CA2124034C (en) | Gene coding for a protein regulating aureobasidin sensitivity | |
US5886151A (en) | Candida albicans integrin-like protein | |
US8563293B2 (en) | Bacteriocin based methods to control lactic acid bacterial growth | |
US20040072325A1 (en) | Transformation system of fungus belonging to the genus monascus | |
SK122002A3 (en) | Novel antifungal agents and fungicides, method for the production thereof and their use | |
JP6396330B2 (en) | Polypeptides against phytopathogenic fungi | |
JP2001510325A (en) | Chitinase substances and methods | |
CN110272908B (en) | Isaria farinosa Kill protection 4 gene, recombinant protein and application | |
US20040087771A1 (en) | Antimicrobial peptides of the family of defensins, polynucleotides encoding said peptides, transformed vectors and organisms containing them | |
Türel | Antimicrobial spectrum determination of the K5 type yeast killer protein and its kinetics of cell killing | |
WO2000005388A1 (en) | Genes of the dead box protein family, their expression products and use | |
Yerli | Determination of in vitro activity of Panomycocin against Botrytis cinerea | |
MXPA04012451A (en) | Improved trichoderma strains as biocontrol agents, method for obtaining the same and use thereof for controlling diseases caused by phytopathogen fungi. | |
Kepekçi | Antifungal spectrum determination of the K5 type yeast killer protein on fungi causing spoilage in citrus fruits | |
Yener | Determination of antimicrobial spectrum of K9 type yeast killer toxin and its cell killing activity | |
AU2016307152A1 (en) | A transgenic plant having resistance to a phyto-pathogenic fungus | |
CA2351017A1 (en) | Catfiiia candida albicans tfiiia gene (catfiiia) and the coded catfiiia protein | |
WO2000017344A1 (en) | RESPONSE REGULATOR $i(CaSSK1) | |
WO2002022825A9 (en) | The c. albicans tec1 gene (catec1) and the coded tec1p protein |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FB9A | Suspension of patent application procedure |