CZ20004569A3 - Způsob přípravy expresního vektoru k produkci terapeutických proteinů v transgenních zvířatech - Google Patents

Způsob přípravy expresního vektoru k produkci terapeutických proteinů v transgenních zvířatech Download PDF

Info

Publication number
CZ20004569A3
CZ20004569A3 CZ20004569A CZ20004569A CZ20004569A3 CZ 20004569 A3 CZ20004569 A3 CZ 20004569A3 CZ 20004569 A CZ20004569 A CZ 20004569A CZ 20004569 A CZ20004569 A CZ 20004569A CZ 20004569 A3 CZ20004569 A3 CZ 20004569A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
gene
vector
erythropoietin
expression
expression vector
Prior art date
Application number
CZ20004569A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ293226B6 (cs
Inventor
Tomá© Mgr. Miku©
Petr Rndr. Csc. Malý
Original Assignee
Biopharm Výzkumný Ústav Biofarmacie A Veterinárníc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biopharm Výzkumný Ústav Biofarmacie A Veterinárníc filed Critical Biopharm Výzkumný Ústav Biofarmacie A Veterinárníc
Priority to CZ20004569A priority Critical patent/CZ293226B6/cs
Priority to DE60139300T priority patent/DE60139300D1/de
Priority to EP01128498A priority patent/EP1217072B1/en
Priority to AT01128498T priority patent/ATE437231T1/de
Publication of CZ20004569A3 publication Critical patent/CZ20004569A3/cs
Publication of CZ293226B6 publication Critical patent/CZ293226B6/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/8509Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/505Erythropoietin [EPO]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2207/00Modified animals
    • A01K2207/15Humanized animals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/05Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00Animals characterised by species
    • A01K2227/10Mammal
    • A01K2227/105Murine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/01Animal expressing industrially exogenous proteins

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Description

Způsob přípravy expresního vektoru k produkci terapeutických proteinů v transgenních zvířatech
Oblast techniky
Vynález se týká způsobu přípravy expresních vektorů využitelných k produkci terapeutických proteinů v mléčné žláze transgenních zvířat. Zejména vektorů konstruovaných pomocí takové modifikace nukleotidové sekvence, při které je cíleně instalováno restrikční místo v oblasti translačního konsenzu Kozákové mezi nukleotidy -9 až +4. Zavedení nového restrikčního místa v tomto místě genu umožňuje definované a univerzální propojení 5'koncového úseku regulačního genu řídícím genovou expresi zvoleného strukturního genu kódujícího primární aminokyselinovou (AK) strukturu terapeutického proteinu.
Dosavadní stav techniky
Transgenní protein - erythropoetin
S mezidruhovým přenosem genů se otevřela cesta k izolaci terapeuticky významných lidských proteinů z organizmů, do jejichž genomu byla vpravena funkční lidská deoxyribonukleová kyselina (DNA) nesoucí genetickou informaci. Transkribce přeneseného řetězce DNA s lidským genem vede k syntéze cizorodé „messenger“ ribonukleové kyseliny (mRNA), která je následnou translací přepsána do původní struktury lidského proteinu. Takové proteiny, které nacházejí využití v medicíně, bylo možné dříve získávat jen nákladnou izolací z lidského materiálu. Nyní je lze izolovat ze zvířecích produktů ve větším množství. Tímto způsobem je možné kromě proteinů lidského původu s původními vlastnostmi vytvářet genovou manipulací nové výhodnější varianty takových proteinů s výhodnějšími terapeutickými vlastnostmi, či menšími vedlejšími účinky jako např. „humanizované“ protilátky, což jsou hybridní imunoglogulinové proteiny, jejichž variabilní část zvířecího původu je propojena s konstantní částí lidského imunoglobulinů.
• · 0 0 0·· · · · · • · · · · · · 0
00 0 Φ00000
000 ·· 00··
000 00 ··· 0000 ·· ,0 0
Jedním z řady lidských proteinů, které začaly být produkovány v savčích tkáňových kulturách in vitro a nebo izolovány ze zvířecích produktů in vivo, je lidský glykoprotein erythropoetin (EPO). Je to kyselý glykoprotein s molekulovou hmotností přibližně 34 Kda a vyskytuje se ve formách : α, β,γ, které se vzájemně liší formou glykosylace a jejich asialovými formami, ve kterých je odstraněna koncová cukerná složka. (Dordal,
M. S, Wang, F.F. Goldwasser, E. (1985) The role of carbohydrate in erythropoietin action. Endocrinology, 116:2293-9; Goldwasser, E. Kung, C.K. Eliason, J. (1974) The role ofsialic acid in erythropoietin action. J. Biol. Chem, 249:4202-6; Goto, M. Murakami, A. Akai, K. Kawanishi, G. Ueda, M. Chiba, H. Sasaki, R. (1989) Characterization and use of monoclonal antibodies directed against human erythropoietin that recognize different antigenic determinants. Blood, 74:1415-23;
Lukowsky, W.A. Painter, R.H. (1972) Studies on the role ofsialic acid in the physical and biological properties of erythropoietin. Can. J. Biochem, 50:909-17; Miyake, T Kung, C.K. Goldwasser, E. (1977) Purification of human erythropoietin. J. Biol. Chem, 252:5558-64; Takeuchi, M. Inoue,
N. Strickland, T.W. Kubota, M. Wada, M. Shimizu, R. Hoshi, S. Kozutsumi, H. Takasaki, S. Kobata, A. (1989) Relationship between sugar chain structure and biological activity of recombinant human erythropoietin produced in Chinese hamster ovary cells. Proč. Nati.
Acad. Sci. USA, 86:7819-22; Takeuchi, M. Takasaki, S. Shimada, M. Kobata, A. (1990) Role of sugar chains in the in vitro biological activity of human erythropoietin produced in recombinant Chinese hamster ovary cells. J. Biol. Chem, 265:12127-30; Tsuda, E. Kawanishi, G. Ueda, M. Masuda, S. Sasaki, R. (1990) The role of carbohydrate in recombinant human erythropoietin. Eur. J. Biochem, 188:405-11).
Erythropoetin je schopen stimulovat přeměnu primitivních zárodečných buněk v kostní dřeni na proerythroblasty, které postupně dozrávají, syntetizují hemoglobin a jsou uvolňovány do krevního oběhu jako červené krvinky.(Erslev, A. (1953) Humoral regulation ofred cell production. Blood, 8:349-357).
• ·
Erythropoetin je v plazmě přítomen ve velmi nízkých koncentracích. Přesto je tato normální nízká koncentrace dostatečná ke stimulaci náhrady červených krvinek podléhajících fyziologickému rozpadu.
(Fried, W. (1972) The liver as a source of extrarenal erythropoietin production. Blood, 40:671-7; Jacobson, L.O. Goldwasser, E. Plzak, L.F. Fried, W. (1957) Studies on erythropoiesis Part IV. Reticulocyte response of hypophysectomized and polycythemic rodents to erythropoietin. Proč. Soc. Exp. Biol. Med, 94:243-249; Zanjani, E.D. Ascensao, J.L. McGlave, P.B. Banisadre, M. Ash, P.C. (1981) Studies on the liver to kidney switch of erythropoietin production. J. Clin. Invest, 67:1183-1188). Množství erythropoetinu se zvětšuje při nedostatku kyslíku v případě, že je snížen přenos kyslíku červenými krvinkami, jako odpověď na stress hypoxické tkáně (Beru, N. McDonald, J. Lacombe, C. Goldwasser, E. (1986) Expression ofthe erythropoietin gene. Mol. Cell. Biol, 6:2571-5; Bondurant, M.C. Koury, M.J. (1986) Anemia induces accumulation of erythropoietin mPNA in the kidney and liver. Mol. Cell. Biol, 6:2731-3; Lacombe, C. Da Silva, J.L. Bruneval, P. Fournier, J.G. Wendling, F. Casadevall, N. Camilleri, J.P. Bariety, J. Varet, B. Tambourin, P (1988) Peritubular celíš are the site of erythropoietin synthesis in the murine hypoxic kidney. Clin. Invest, 81: 620-623;
Zanjani, E.D. Peterson, E.N. Gordon, A.S. Wasserman, L.P. (1974) Erythropoietin production in the fetus: role ofthe kidney and matemal anemia J. Lab. Clin. Med, 83:281-7; ShusterSJ, et al. 1987). Díky svým účinkům je erythropoetin vhodným prostředkem pro diagnostiku a léčbu krevních poruch charakterizovaných defektní tvorbou červených krvinek. Nukleotidová sekvence lidského erythropoetinu byla získána a publikována autory (Jacobs, K. Shoemaker, C. Pudersdorf, P. Neill, S.D. Kaufman, P.J. Mufson, A. Seehra, J. (1985) Isolation and characterization ofgenomic and cDNA dones ofhuman erythropoietin. Nátuře, 313:806-10; Lin, F.K. Suggs, S. Lin, C.H. Browne, J.K. Smalling, P. Egrie, J.C. Chen, K.K. Fox, G.M. Martin, F. Stabinsky, Z. (1985) Cloning and expression of the human erythropoietin gene. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 82:7580-4). Biologicky aktivní erythropoetin byl v • · · · · · · ···· • · · ····· • · · · ······ ··· · · · · · · ··· ·· ··· ···· ·· ·· podmínkách in vitro nejprve připraven na stabilně transfekovaných jaterních buňkách afrického kočkodana (Green Monkey) (Jacobs, K. Shoemaker, C. Rudersdorf, R. Neill, S.D. Kaufman, R.J. Mufson, A. Seehra, J. (1985) Isolation and characterization ofgenomic and cDNA dones of human erythropoietin. Nátuře, 313:806-10) a vaječníkových buňkách čínského křečka (CHO) (Lin, F.K. Suggs, S. Lin, C.H. Browne, J.K. Smalling, R. Egrie, J.C. Chen, K.K. Fox, G.M. Martin, F. Stabinsky, Z. (1985) Cloning and expression ofthe human erythropoietin gene. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 82:7580-4). Později byl izolován i z dalších savčích systémů jako transformovaných lidských fetáních jaterních buněk (Browne, J.K. Cohen, A.M. Egrie, J.C. Lai, P.H. Lin, F.K. Strickland, T. Watson, E. Stebbing, N. (1986) Erythropoietin: gene cloning, protein structure, and biological properties. Cold. Spring. Harb. Symp. Quant. Biol, 1:693-702), v B-lymfoblastoidních buňkách (Yanagi, H. Yoshima, T. Ogawa, I. Okamoto, M. (1989) Recombinant human erythropoietin DNA produced by Namalwa cells. DNA, 8:419-27), Buněk melanomu (Keay, L. Walsh, J.M. Buchholz, R.M. Terando, J.M. (1990) Production of recombinant human erythropoietin in Bowes melanoma cells in suspension culture. Appl. Microbiol. Biotechnol, 34:198-202) a jaterních buňkách křečka (Brody VC etal.1988; Dube, S. Fisher, J.W. Powell, J.S. (1988) Glycosylation at specific sites of erythropoietin is essential for biosynthesis, secretion, and biological function. J. Biol. Chem, 263:17516-21; Powell, J.S. Berkner, K.L. Lebo, P.V. Adamson, J.W. (1986) Human erythropoietin gene: high level expression in stably transfected mammalian cells and chromosome localization. Proč. Natí. Acad. Sci. USA, 83:6465-9; Tsuda, E. Goto, M. Murakami, A. Akai, K. Ueda, M. Kawanishi, G. Takahashi, N. Sasaki, P. Chiba, H. Ishihara, H. (1988) Comparative structural study ofN-linked oligosaccharides of urinary and recombinant erythropoietins. Biochemistry, 27:5646-54). Pokud je gen pro erythropoetin vpraven do buněk bezobratlých nebo prokaryontních organizmů, tak jako hmyzích buněk (Quelle, F.W. Caslake, L.F. Burkert, P.E. Wojchowski, D.M. (1989) High-level expression and purification of a recombinant human erythropoietin • · · • · • · · « · · produced using a baculovirus vector. Blood, 74:652-7), bakterií (íeeHuang, S. (1984) Cloning and expression ofhuman erythropoietin cDNA in Escherichia coli. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 81:2708-12), nebo kvasinek (Elliott, S. Giffín, J. Suggs, S. Lau, E.P. Banks, A.R. (1989) Secretion of glycosylated human erythropoietin from yeast directed by the alpha-factor leader region. Gene, 79:167-80), postrádá cukerné struktury, které jsou v nativním stavu přítomné na lidském hormonu izolovaného ze savčích transfekovaných buněk.Většina studií využívá k expresi genu pro erythropoetin transfekované ovariální buňky čínského křečka (CHO) (Browne, J.K. Cohen, A.M. Egrie, J.C. Lai, P.H. Lin, F.K. Strickland, T. Watson, E. Stebbing, N. (1986) Erythropoietin: gene cloning, protein structure, and biological properties. Cold. Spring. Harb. Symp. Quant. Biol, 1:693-702; Davis, J.M. Arakawa, T. Strickland, T.W. Yphantis, D.A. (1987) Characterization of recombinant human erythropoietin produced in Chinese hamster ovary cells. Biochemistry, 26:2633-8; Delorme, E. Lorenzini, T. Giffín, J. Martin, F. Jacobsen, F. Boone, T. Elliott, S. (1992) Role of glycosylation on the secretion and biological activity of erythropoietin. Biochemistry, 31:9871-6; Recny, M.A. Scoble, H.A. Kim, Y. (1987) Structural characterization of natural human urinary and recombinant DNA-derived erythropoietin. Identification of des-arginine 166 erythropoietin. J. Biol. Chem, 262:17156-63; Sasaki, H. Bothner, B. Dell, A. Fukuda, M. (1987) Carbohydrate structure of erythropoietin expressed in Chinese hamster ovary cells by a human erythropoietin cDNA J. Biol. Chem, 262:12059-76; Sasaki, H. Ochi, N. Dell, A. Fukuda, M. (1988) Site-specific glycosylation ofhuman recombinant erythropoietin: analysis of glycopeptides orpeptides at each glycosylation site by fast atom bombardment mass spectrometry. Biochemistry, 27:8618-26; Takeuchi, M. Inoue, N. Strickland, T.W. Kubota, M. Wada, M. Shimizu, R. Hoshi, S. Kozutsumi, H. Takasaki, S. Kobata, A. (1989) Relationship between sugar chain structure and biological activity of recombinant human erythropoietin produced in Chinese hamster ovary cells. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 86:781922).V buňkách CHO je exprimovaný rekombinantní erythropoetin glykosylován podobně jako v lidských buňkách, proto jsou CHO buňky využívány k produkci erythropoetinu použitelného ve farmacii (Browne, J.K. Cohen, A.M. Egrie, J.C. Lai, P.H. Lin, F.K. Strickland, T. Watson, E. Stebbing, N. (1986) Erythropoietin: gene cloning, protein structure, and biological properties. Cold. Spring. Harb. Symp. Quant. Biol, 1:693-702; Egrie, J.C. Browne, J. Lai, P. Lin, F.K. (1985) Characterization of recombinant monkey and human erythropoietin Prog. Clin. Biol. Res, 191:339-50). Hlavní nevýhoda současného způsobu přípravy erythropoetinu spočívá v obecně vysoké finanční i pracovní náročnosti práce s tkáňovými kulturami, která se pak odráží ve výsledné vysoké ceně rekombinantního erythropoetinu. Z hlediska požadavků na výši produkce je erythropoetin produkovaný v mléčné žláze myši a králíka vhodným modelovým proteinem pro ověření námi navrhované strategie pro přípravu a testování funkce genových konstruktů. Jelikož ke stimulaci přeměny primitivních zárodečných buněk v kostní dřeni na proerythroblasty nejsou zapotřebí relativně vysoké dávky lidského erythropoetinu, je v tomto konkrétním případě a v případě dalších podobně účinných stimulačních faktorů transgenní králík nejen optimálním testovacím, ale současně i cílovým produkčním organizmem.
Přenos DNA
Pro přenos cizorodé DNA do savčích buněk a následné produkci transgenních zvířat se nejčastěji využívá metoda mikroinjekce geneticky manipulované DNA do samčího prvojádra oplozeného oocytu (Brínster, R.L. Chen, H.Y. Trumbauer, M.E. Avarbock, M.R. (1980) Translation of globin messenger RNA by the mouše ovum. Nátuře, 283:499-501; Brehm, G. Brenic, H.M. Goodman, R.C. Selden, F. Kraublish, H. (1985) Production of transgenic mice, rabbits and pigs by microinjection into pronuclei Zuchthygiene, 20: 251-252; Costantini, F. Lacy, E. (1982)
Gene transfer into the mouše germ-line. J. Cell. Physiol. Suppl, 1:21926; Gordon, J.W. Ruddle, F.H. (1981) Integration and stable germ line transmission of genes injected into mouše pronuclei. Science, 214:12446 ·· · · • · 4 4 4 4
4 4 4 4
4 4 · · « • · · · · · · · « · ··
6; Hogan, B. Constantini, Lacy Ε (1986) Manipulating the mouše embryo, laboratory manual. N.Y. Cold Spring Harbor Laboratory), nebo se k přenosu využije takový přístup, kdy se nejprve oplozené savčí oocyty zbaví jádra (tzv. enukleace oocytů) a pak se do nich vpraví buněčné jádro přenosem z normálních nebo geneticky manipulovaných savčích buněčných linií, a to zejména pluripotentních embryonálních kmenových (ES) buněk nebo terminálně diferencovaných, avšak reprogramovatelných jader fibroblastoidního původu (metoda nukleární transplantace, součást tzv. klonování) (McGrath, J. Solter, D. (1983) Nuclear transplantation in the mouše embryo by microsurgery and cell fusion. Science, 220:1300-2; McGrath, J. Solter, D. (1983) Nuclear transplantation in mouše embryos. J. Exp. Zool, 228:355-62; McGrath, J. Solter, D. (1984) Maternal Thp lethalityin the mouše is a nuclear, not cytoplasmic, defect. Nátuře, 308:550-1; McGrath, J. Solter, D. (1984) Completion of mouše embryogenesis requires both the maternal and paternal genomes. Cell, 37:179-83; Surani, M.A. Bartoň, S.C. (1983) Development of gynogenetic eggs in the mouše: implications for parthenogenetic embryos. Science, 222:1034-6; Surani, M.A. Bartoň,
S.C. Norris, M.L. (1984) Development of reconstituted mouše eggs suggests imprinting of the genome during gametogenesis. Nátuře, 308:548-50). Při použití obou způsobů je přenesena exogenní DNA do buněčného jádra, kde je jadernými reparativními mechanismy náhodně zabudována do hostitelského genomu. Tímto způsobem není možné kontrolovat místo integrace v genomu hostitele ani počet vnesených kopií zvoleného genu. Výhodou metody využívající nukleární transplantace je možnost identifikovat a genomově charakterizovat klon vhodný k přípravě transgenního zvířete již při in vitro kultivaci transfektovaných buněk. Tím odpadne časová ztráta vzniklá nutnou generační dobou potřebnou k vyhledání pozitivních transgenních jedinců běžně získaných mikroinjikační technikou.To vede k zefektivnění přípravy transgenního zvířete, neboť odpadne rozsáhlé testování mnoha narozených jedinců.
Dokonalejší alternativou vpravování exogenní DNA do genomu hostitele je využití cíleného vpravení genomového fragmentu využitím homologní rekombinace mezi genovým lokusem genomu savčí embryonální kmenové buňky (nebo savčího fibroblastu) a cizorodou rekombinantní DNA ve formě vektoru. Jadernými enzymy navozená rekombinace vede k zacílení mutace do genomu s kontrolou místa integrace a počtu vložených kopií. (Doetschman, T. Gregg, R.G. Maeda, N. Hooper, M.L. Melton, D.W. Thompson, S. Smithies, O. (1987) Targetted correction of a mutant HPRT gene in mouše embryonic stem celíš Nátuře, 330:576-8; Mansour, S.L. (1990) Gene targeting in murine embryonic stem celíš: introduction ofspecific alterations into the mammaiian genome. Genet. Anai. Tech. Appi, 7:219-27; Robertson, E.J. (1991) Using embryonic stem celis to introduce mutations into the mouše germ line. Biol. Reprod, 44:238-45). Tímto přístupem lze cíleně směrovat transgen nebo kontrolované vpravovat mutaci pro ztrátu funkce endogenu, tzv. „gene knock-out„.
Konstrukce expresních vektorů pro produkci proteinů v mléčné žláze
Klíčovým krokem při přípravě geneticky manipulovaných zvířat je sestrojení expresního vektoru pocházejícího z bakteriální plasmidové DNA, ke které se připojí požadovaný savčí gen, určený k produkci terapeutického proteinu. K navození genomové exprese jsou připojeny ke kódujícím sekvencím manipulovaného genu další sekvence DNA pocházející ze savčích genů specificky exprimovaných v dané tkáni. Výsledný expresní vektor je tak velice komplexní molekula DNA, kde jsou propojeny jednotlivé části rozdílného původu v jeden funkční celek. Způsob, jakým se vyjádří strukturní gen, závisí na vzájemných interakcích s okolím místa integrace v genomu příjemce a na funkčnosti připojených společně přenesených regulačních sekvencích.
Pro produkci cizorodých transgenních proteinů s terapeutickým využitím v humánní medicíně je vhodným orgánem mléčná žláza savců. Z tohoto důvodu se zájem soustředil na studium regulačních oblastí genů, které kódují důležité mléčné proteiny, jako jsou pLactoglobulin, aLactalbumin pCasein a kyselý protein mléčné syrovátky (WAP). Regulační sekvence těchto genů jsou používané ke konstrukci expresních vektorů, k řízení produkce cizorodých genů v mléčné žláze zvířat. Pro přípravu transgenního zvířete je používán obvykle gen, jehož produkt v mléce daného druhu zvířete tvoří hlavní proteinovou složku a současně je v organizmu zvířete produkován specificky pouze v mléčné žláze. (Devinoy, E. Hubert, C. Jolivet, G. Thépot, D. Clergue, N. Desaleux, M. Dion, M. Servely, J.L. Houdebine, L.M. (1988) Recent data on structure ofrabbit milk protein genes and on the mechanism ofthe hormonal control of their expression . Reprod. Nutr. Develop, 28:1145-64; Hennighausen, L.G. Sippel, A.E. (1982) Characterization and cloning of the mRNAs specific for the iactating mouše mammary gland. Eur. J. Biochem, 125:131-41; Hobbs, A.A. Richards, D.A. Kessler, D.J. Rosen, J.M. (1982) Complex hormonal regulation ofrat casein gene expression. J. Biol. Chem. 257:3598-605). Výběr regulační oblasti genu pro mléčný protein, která bude využita v konstrukci expresního vektoru, se tak obvykle řídí typem cílového produkčního zvířete. Dominantním proteinem produkovaným specificky v mléčné žláze myši a králíka a dalších hlodavců je (WAP) ( Campbell, S.M. Rosen, J.M. Hennighausen,
L.G. Střech-Jurk, U. Sippel, A.E. (1984) Comparison ofthe whey acidic protein genes ofthe rat and mouše. Nucleic. Acids. Res, 12:8685-97. Grabowski, H. Le Bars, D. Chene, N. Attal, J. Maliénou-N'Gassa, R. Puissant, C. Houdebine, L.M. (1991) Rabbit whey acidic protein concentration in milk, sérum, mammary gland extract and culture medium. J. Dairy Sci. 74: 4143-54; Hennighausen, L.G. Sippel, A.E. Hobbs, A. A. Rosen, J.M. (1982) Comparative sequence analysis ofthe mRNAs coding for mouše and rat whey protein. Nucleic Acids Res. 10:3733-44; Piletz, J.E. Heinlen, M. Ganschow, R.E. (1981) Biochem ical characterization of a novel whey protein from murine milk. Biol. Chem, 256:11509-16). Regulační sekvence tohoto genu jsou proto vhodné pro přípravu expresních vektorů kontrolujících produkci proteinů v mléčné » ·« · • · » · • · žláze těchto zvířat ( Kolb, A.F. Gunzburg, W.H. Albang, R. Brém, G. Erfle, V. Salmons, B. (1994) Negative regulátory element in the mammary specific whey acidic protein promotér. Cell. Biochem. 56:24561). V současné době již byla úspěšně klonována celá řada genů do různých expresních vektorů s promotorovými sekvencemi mléčných proteinů včetně vektorů, kde jsou využity regulační sekvence z WAP genu (Andres, A.C. Shoenenberger, C.A. Groner, B. Hennighausen, L. LeMeur, M. Gerlinger, P. (1987) Ha -ras oncogene expression directed by a milk protein gene promotér: tissue specificity, hormonal regulation and tumor induction in transgenic mice. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 84:1299-1303;; Devinoy, E. Thépot, D. Stinnakre, M.G. Fontaine,M. L. Grabowski, H. Puissant, C. Pavirani, A. Houdebine, L.M. (1994) High level production of human growth hormone in the milk of transgenic mice: the upstream region ofthe rabbit whey acidic protein (WAP) gene targets transgene expression to the mammary gland. Transgenic. Res, 3:79- 89; Gordon, K. Lee, E. Vitale, J.A. Smith, A.E. Westphal, H. Hennighausen, L. (1992) Production of human tissue plasminogen activator in transgenic mouše milk Biotechnology, 24:425-8; Gunzburg, W.H. Salmons, B. Zimmermann, B. Muller, M. Erfle, V. Brém, G. (1991)
A mammary -specific promotér directs expression of growth hormone not only to the mammary gland, but also to Bergman glia celíš in transgenic mice. Mol. Endocrinol, 5:123-33; Limonta, J. Pedraza, A. Rodriguez, A. Freyre, F.M. Barral, A.M. Castro, F.O. Lleonart, R. Gracia, C.A, Gavilondo, J.V, de la Fuente, J. (1995) Production of active anti-CD6 mouse/human chimeric antibodies in the milk of transgenic mice. Immunotechnology, 1:107-13; Limonta, J.M. Castro, F.O. Martinez, R. Puentes, P. Ramos, B. Aguilar, A. Lleonart, R.L. de la Fuente, J. (1995) Transgenic rabbits as bioreactors for the production of human growth hormone. J. Biotechnol, 40:49-58; Pittius C. W. Heninghausen, L. Lee, E. Westphal, H. Nichols, E. Vitale, J. Gordon, K. (1988) A milk protein gene promotér directs the expression of human tissue plasminogen activator cDNA to the mammary gland in transgenic mice. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 85: 5874-8; Reddy, V.B. Vitale, J.A. Wei, C. Montaya -Zavala, M.
• * ··< 9 9
Štice, S.L. Balise, J. Robi, J.M. (1991) Expression ofHuman Growth Hormone in the milk oftransgenic mice. Animal Biotechnology, 2:15-29; Thepot. D. Devinoy, E. Fontaine, M.L. Stinnakre, M.G. Massound, M. Kann, G. Houdebine, L.M. (1995) Rabbit wheyacidic protein gene upstream region Controls high -level expression ofbovine growth hormone in the mammary giand of transgenic mice. Mol. Reprod. Dev, 42: 261-7; Tomasetto, C. Wolf, C. Rio, M.C. Mehtali, M. LeMeur, M. Gerlinger, P. Chambon, P. Lathe, R. (1989) Brest Cancer Protein PS2 Synthesis in Mammary Giand of Transgenic Mice and secretion into Milk. Mol. Endocrinol, 89:1579-84; Velander, W.H. Page, R.L. Morcol, T. Russeíl, C.G. Canseco, R. Young, J.M. Drohan, W.N. Gwazdauskas,
F.C. Wilkins, T.D. Johnson, J.L. (1992) Expression ofhuman protein C in the milk of transgenic mice and pigs. Ann. Ν. Y. Acad. Sci, 665:391-403; Yu, S.H. Deen, K.C. Lee, E. Hennighausen, L. Sweet, R.W. Rosenberg,
M. Westphal, H. (1989) Functional human CD4 protein produced in milk of transgenic mice. Mol. Biol. Med, 6:255-61) Hlavní významné sekvenční motivy účastnící se v procesu regulace transkribce byly lokalizovány v oblasti do vzdálenosti 6,3kb od startovního kodonu ATG (Devinoy, E. Malienou -N'Gassa, R. Thepot, D. Puissant, C. Houdebine, L.M. (1991) Hormone responsive elements within the upstream sequences of the rabbit whey acidic protein (WAP)gene direct chloramphenicol acetyl transferase (CAT) reportér gene expression in transfected rabbit mammary celis Mol. Cell. Endocrinol. 81:185-93). Podobným způsobem, s využitím stejných regulačních oblastí, byly konstruovány i vektory k zajištění exprese strukturního genu pro hEPO. (Aguirre, A. Castro-Palomino, N. De la Fuente, J. Castro, F.O. (1998) Expression ofhuman erythropoietin and ofthe endogenous WAP gene in the mammary giand of transgenic rabbits during gestation and lactation. Transgenic. Res, 4:311-7; Massoud, M. Attal, J. Thepot, D. Pointu, H. Stinnakre, M.G. Theron, M.C. Lopez, C. Houdebine, L.M. (1996) The deleterious effects ofhuman erythropoietin gene driven by the rabbits whey acidic protein gene promotér in transgenic rabbits. Reprod. Nutr. Dev, 36, 555-63; Rodriguez, A. Castro, F.O. Aguilar, A. Ramos, B. Del
0 000 0 0Λ 99 99
0 · 0 0 0 0 9 9 9 9 · 0 0 0 0 0 0 • 00 0 000000
000 00 0000
000 00 0000000 00 00
Barco, D. G. Lleonart, R. De la Fuente, J. (1995) Expression ofactive human erythropoietin in mammary gland oflactating transgenic mice and rabbits. Biol. Res, 28:141- 53). Ukazuje se, že v řadě případů fungují regulační oblasti stejně dobře a někdy i lépe v organizmu živočišného druhu odlišného původu, než z kterého pochází gen pro mléčný protein. Důvodem je především skutečnost, že důležitou roli z hlediska kvantity a specifity produkce proteinu hraje počet integrovaných kopií a transkribční aktivita chromatinu v místě integrace. Významnou roli hrají i další regulační sekvence v intronech a ve 3'koncové oblasti (Dále, T.C. Krnacik, M.J. Schmidhauser, C. Yang,C.L-Q. Bissell, M.J. Rosen, J.M. (1992) High- level Expression of the rat Whey acidic protein gene is mediated by elements in the promotér and 3'untranslated region. Mol. And Cell. Biol. 12: 905-914) a také ve větší vzdálenosti proti proudu od ATG (Bischoff, R. Degryse, E. Perraund, F. Dalemans, W. Ali-Hadji, D. Thepot, D. Devinoy, E. Houdebine, L.M. Pavirani, A., (1992) A 17.6 kbp region located upstream of the rabbit WAP gene directs high level expression of a functional human proteinvariant in mose milk. FEBS Letí, 6:265- 8). Tyto regulační sekvence mohou významně ovlivnit jak úroveň exprese, tak pozměnit její tkáňovou specifitu. Introny však mají vliv na expresi genu i v případě, že regulační sekvence neobsahují, jelikož expresní vektory tvořené genomovými sekvencemi genů s introny mají obyčejně vyšší hladiny exprese, než je tomu u vektorů konstruovaných na základě genů přepsaných pomocí reverzní transkribce z mRNA (cDNA) (Brinster, R.L. Allen, J.M. Behringer, R.R. Gelinas, R.E. Palmiter, R.D. (1988) Introns increase transcriptional efficiency in transgenic mice. Proč. Nati. Acad. Sci. US A, 85:836-40; Choi, T. Huang, M. Gorman, C. Jaenisch, R. (1991) A generic intron increases gene expression in transgenic mice. Mol. Cell. Biol, 11:3070-4; Palmiter, R.D. Sandgren,
E.P. Avarbock, M.R. Allen, D.D. Brinster, R.L. (1991) Heterologous introns can enhance expression of transgenes in mice. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 88:478-82). Na druhou stranu mohou introny pocházející z genu hEPO obsahovat regulační elementy s negativním regulačním účinkem (silencery), které mohou transkribční aktivitu genů tlumit.
• ·♦ • ♦ ·· ·· ·· • ·· · · « · · · • · · · · · · • · · ······ • · · · · · · · ·* ······· ·· ··
Výsledky různých autorů přinášejí celou řadu poznatků, ze kterých nelze v současné době vyvodit jednoznačné závěry. Ukazuje se, že oblast promotoru do vzdálenosti 6,3-kb proti proudu od ATG obsahuje hlavní regulační elementy, které jsou schopné vzájemně s regulačními sekvencemi intronů a 3'nepřekládané oblasti WAP genu zabezpečit vysokou a tkáňově specifickou expresi. Pokud je však strukturní oblast WAP genu nahrazena strukturní genomovou částí, nebo (cDNA) jiného genu, dochází obyčejně ke snížení exprese, která je do značné míry závislá na transkribční aktivitě chromatinu v okolí místa integrace a na počtu kopií transgenu v genomu. Často také dochází ke změně tkáňové specifity vedoucí k nežádoucí (ektopické) expresi přeneseného genu i v dalších tkáních mimo mléčnou žlázu. Tak může cizorodý protein negativně ovlivnit zdravotní stav zvířete (Massoud, M. Attal, J. Thepot, D. Pointu, H. Stinnakre, M.G. Theron, M.C. Lopez, C. Houdebine, L.M. (1996) The deleterious effects of human erythropoietin gene driven by the rabbits whey acidic protein gene promotér in transgenic rabbits. Reprod. Nutr. Dev, 36, 555-63.) Základním požadavkem na expresní vektory, které jsou používány ke genovým manipulacím u vývojově vyšších organizmů, je vedle výše produkce požadovaného proteinu také zacílení exprese genu určeného pro produkci požadovaného proteinu do dané tkáně hostitelského zvířete. Společným znakem vektorů, které využívají promotorové sekvence králičího genu pro WAP k řízení exprese genu pro lidský erythropoetin, je, že strukturní gen pro erythropoetin ve formě genomové DNA nebo cDNA sekvence je vklonován do místa mezi kódující sekvence strukturního genu WAP. Výhodou je, že není nijak narušena regulační funkce 5'koncové oblasti genu WAP a že introny řídícího genu se mohou podílet na kontrole genové exprese. Profil exprese lidského erytropoetinu v mléčné žláze králíka by měl odpovídat přirozené expresi genu pro WAP.
Značnou nevýhodou většiny takových vektorů je skutečnost, že při spojení genů dochází k produkci fúzního proteinu. Nelze předem odhadnout, jaký vliv mohou mít aminokyseliny části WAP na aktivitu lidského erytropoetinu a jaký vliv by měly na aktivitu erythropoetinu • · · 9 • ·
9
9 ·
• * • · • ·· technologické postupy zaměřené na jejich odstranění. Těmto komplikacím lze předejít způsobem podle vynálezu pro konstrukci hybridních vektorů pro přípravu transgenních zvířat využitím zabudování restrikčního motivu pro místa Notl a Ncol do sekvenčního konsenzu Kozákové. Z těchto důvodu jsou tyto vektory dále vyvíjeny a jsou současně hledány a připojovány další sekvenční motivy a možnosti propojení genových částí, jak bylo navrženo i původci tohoto vynálezu, které mohou ovlivnit transkribční a translační aktivitu vnesené DNA v genomu hostitele a její překlad do RNA.
Konsensus Kozákové pro translační iniciační místo
Model pro mechanismus regulace translace u eukaryot, tzv. „scanning mechanism for initiation of translation“, byl navržen Marylin Kozákovou před více než 20 lety (Kozák, M. Shatkin, A.J. (1978) Identification of features in 5' terminál fragments from retrovirus mRNA which are important forribosome binding. Cell,13:201-12; Kozák, M. Shatkin, A.J. (1979) Characterization of translational initiation regions from eukaryotic messenger RNAs. Methods. Enzymol, 60:360-75). Tento model předpokládá, že malá podjednotka eukaryotického ribosomu (40S), která nese RNA s navázaným methioninem (Met-RNA), se nejprve váže k 5’konci metylací upravené messenger RNA, a poté migruje po RNA molekule až po dosažení úvodního „favorizovaného“ kodonu AUG (triplet adenin -uráčil -thymin), kdy se migrace zastaví a zahájí se vlastní proces translace. Tento model postuluje nutnost dvou základních faktorů pro výběr favorizovaného prvního AUG, a to jednak pozici v blízkosti 5’konce RNA a dále kontext, tedy informační obsah sekvencí v blízkosti startovního AUG. Důkaz „pravidla pro první AUG“ byl demonstrován Kozákovou v roce1987, kdy analýzou sekvencí v okolí startovního AUG u 699 RNA různých obratlovců dokázala, že „pravidlo pro první AUG“ platí pro 90-95% testovovaných typů RNA a kdy poprvé představila nukleotidový sled GCCGCCA/GCCAUGG za sekvenční konsesnsus pro iniciaci translace u vyšších eukaryot (Kozák, M. (1987) At least six nucleotides preceding the AUG initiator codon enhance translation in • · 4 · • · mammalian cells. J. Mol. Biol, 196:947-50) (viz Příloha 1). V dalších experimentech s použitím místně-směrované mutageneze na modelu genu pro preproinsulin vnášeným do opičích CV-1 buněk ledvin transformovaných mutantním virem SV-40 (COS) buněk ukázala Kozáková význam pozic G+4 a dalších nukleotidů v sekvenčním konsensu v pozicích -1 až -6 (Kozák, M. (1986) Bifunctional messenger RNAs in eukaryotes. Cell, 47:481-3; Kozák, M. (1986) Influences of mRNA secondary structure on initiation by eukaryotic ribosomes. Proč. Nati. Acad. Sel. USA, 83:2850-4; Kozák, M. (1987) At least six nucleotides preceding the AUG initiator codon enhance translation in mammalian cells. J. Mol. Biol, 196:947-50; Kozák, M. (1980) Influence of mRNA secondary structure on binding and migration of40S ribosomal subunits. Cell, 19:79-90). Důležitost purinu v pozici -3 byla vedle cílené mutageneze potvrzena objevem typu thalassemie, u které změna v sekvenci z CACCAUG na CCCCAUG drasticky potlačuje iniciaci translace a-globinu ( Morlé, F. Lopez, B. Henni, T. Godet, J. (1985) alpha-Thalassaemia associated with the deletion oftwo nucleotides at position -2 and -3 preceding the AUG codon. EMBO J, 4:1245-50). Purin v pozici -3 (obvykle A) je nejkonzervativnějším nukleotidem u všech eukaryotických RNA včetně obratlovců, a dále u hub (Paluh, J.L. Orbách, M.J. Legerton, T.L. Yanofsky, C. (1988) The cross-pathway control gene of Neurospora crassa, cpc-1, eneodes a protein similarto GCN4 ofyeast and the DNA-binding domain of the oneogene v-jun-eneoded protein. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 85:3728-32.) a rostlin ( Heidecker, G. Messing, J. (1987) A method for cloning full-length cDNA in plasmid vectors. Methods. Enzymol, 154: 28-41). Cílená mutace v pozici -3 ovlivňuje translaci více než bodová mutace kteréhokoli jiného nukleotidu v sekvenčním konsensu (Kozák, M. (1986) Influences ofmRNA secondary structure on initiation by eukaryotic ribosomes. Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 83:2850-4). Dalšími studiemi bylo zjištěno, že je-li přítomen adenin v pozici -3, mají již pozice dalších nukleotidů jen vedlejší vliv na účinnost iniciace translace, avšak v nepřítomnosti purinu v pozici -3 je pro účinnou translaci kritická přítomnost guaninu G+4 a « ·« · «« ·· • · · · • · · · • 9 9 9
9 9 9
99 zvyšuje se úloha nukleotidů v dalších pozicích, zejména v pozicích -6 a -9 (Kozák, M. (1987) At least six nucleotides preceding the AUG initiator codon enhance translation in mammaiian cells. J. Mol. Biol, 196:947-50). Z praktických důvodů navrhla autorka rozlišovat iniciační kodon na silný a slabý dle pozic -3 a +4 ( Kozák, M. (1989) Context effects and inefficient initiation at non-AUG codons in eucaryotic cell-free translation systems. Mol. Cell. Biol, 9:5073-80; Kozák, M. (1989) Circumstances and mechanisms ofinhibition of translation by secondary structure in eucaryotic mRNAs. Mol. Cell. Biol, 9:5134-42). Z těchto důvodů je výhodné připravit expresní vektor propojením 5'koncových regulačních sekvencí se strukturním genem v oblasti startovního kodonu adeninthymin-guanin (ATG), jak se povedlo původcům tohoto vynálezu .
Podstata vynálezu
Některé uvedené nevýhody dosavadního stavu, týkající se způsobů konstrukce expresních vektorů a způsobů přípravy rekombinantního erythropoetinu, odstraňuje způsob přípravy expresních vektorů k produkci terapeutických proteinů v transgenních zvířatech podle vynálezu, jehož podstata spočívá v tom, že ke spojení genového úseku zahrnujícího regulační oblast promotoru s genovým úsekem, který zahrnuje strukturní části genu kódujícího požadovaný protein, využívá sekvenční motiv pro restrikční endonukleázu Not I nebo Ncol. Ten je vytvořený modifikací původního translačního konsenzu Kozákové v oblasti mezi nukleotidy -9 až +4 za vzniku hybridního rekombinantního expresního vektoru k produkci terapeutických proteinů.
Podstata vynálezu dále spočívá v tom, že ke spojení vybraných genových úseků je modifikován translační konsenzus Kozákové genů pro králičí kyselý protein mléčné syrovátky a lidský erythropoetin vložením sekvenčního motivu pro restrikční endonukleázu, zejména Not I v oblasti mezi nukleotidy -9 až +4, za vzniku expresního vektoru • ··· • · · · · · · · • · · · ···©·· © · · · © ···· ©·· ·© ··· ···· ·© ·· prWhEBS-BNX k produkci lidského erythropoetinu v mléčné žláze transgenních organizmů.
Dále podstata vynálezu spočívá v primární nukleotidové struktuře DNA vektoru prWhEBS-BNX, připravené způsobem podle vynálezu, a všech dalších vektorů, které jsou modifikací odvozeny od tohoto původního vektoru prWhEBS-BNX.
Rovněž eukaryontní buňky nesoucí ve svém genomu nukleotidovou primární strukturu hybridních genů pocházejících z expresních vektorů, které jsou připraveny způsobem podle vynálezu, jsou také podstatou vynálezu.
Podstatou vynálezu jsou také transgenní organizmy, nesoucí ve svém genomu nukleotidovou primární strukturu hybridních genů pocházejících z expresních vektorů, připravených způsobem podle vynálezu.
Způsob přípravy expresních vektorů podle vynálezu využívá skutečnost, že motiv kódující aminokyselinu methionin je univerzálním tripletem pro všechny eukaryotické geny a dále, že pro sekvenční motiv Kozákové je známý tzv. optimalizovaný sekvenční konsensus pro nejúčinnější translační účinnost. Tyto skutečnosti daly vzniknout myšlence, že by bylo možné připravit univerzálně použitelnou sekvenci blízkou optimální variantě s uměle instalovanými restrikčními místy, vhodnými ke klonování expresních vektorů. V takových expresních vektorech by bylo možné propojovat promotorové regulační sekvence přímo s prvním ATG tripletem zvoleného genu.
Z hlediska použitelnosti restrikčních míst pro klonování delších fragmentů jsou konstrukčně zajímavá pouze taková, která se vyskytují v hostitelské genomové DNA pouze vzácně. Jedním z takových enzymů je Ncol, který rozeznává 6ti místné restrikční místo CCATGG, nacházející se také v optimalizované variantě konsensu Kozákové.
• ··«
99 99
9 9 9 9
9 9 9 9
9 9 9 9 9 • · · · 9
999 99 99
Další, ještě výhodnější z hlediska klonování, je restrikční místo Not I (GCGGCCGC, viz Příloha 1), které se zřídka vyskytuje v savčím genomu, a to s průměrnou frekvencí výskytu 1: 106 párů baží. Po zavedení tohoto restrikčního motivu do konsensu Kozákové dojde k minimální modifikaci optimalizovaného konsensu, která podstatně nesníží translační účinnost při syntéze produktu.
Způsob podle vynálezu nápaditě využívá sekvenční motiv Kozákové k cílené modifikaci primární nukleotidové sekvence DNA vedoucí k instalaci restrikčního místa pro Notl nebo Ncol unikátně, nebyl dosud využit a vede k přípravě univerzálního vektoru regulujícího produkci proteinů do mléčné žlázy savce s významně zjednodušenou možností výměny strukturního genu pro produkci zvoleného proteinu. Způsob podle vynálezu tak umožňuje rychlejší přípravu expresního vektoru k produkci řady terapeutických proteinů, což povede k širokému využití v praxi a zkrácení doby nutné pro vývoj expresních vektorů.
Následující příklady provedení slouží lepšímu porozumění vynálezu, aniž by ho však omezovaly.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Subklonovártí 5'oblast genu rWAP z DASHII fágů genomové knihovny do plazmidů prW5'BS-KE
Králičí WAP gen s přilehlými regulačními oblastmi byl izolován z DASH II fágů genomové králičí knihovny.
Na genomové DNA izolované z králičí svaloviny obvyklým způsobem (Sambrook, J. Fritsch, E.F. Maniatis , T. (1989) Molecular cloning :laboratory manual -2nd ed. Cold. Spring. Harbor. Laboratory Press.) byla připravena pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) reakce sonda WAP 2ex/3ex 587 bp dlouhá (viz příloha 2 a 4). Tento fragment ····
4· • · • ·· *·· «· #8 • · · · • · · · • » ·> 8 • · · · * * 4 4
DNA je komplementární se sekvencí genu pro králičí WAP v oblasti mezi počátkem druhého exonu a koncem třetího exonu strukturního genu. V PCR byly použity nukleotidové sekvence primerů. 5’CGG GAT CCT CAT GTG CCC CGA GCC CAG CTC TT3’ z počátku druhého exonu genu WAP jako forward primer a
5’CGG GAT CCG GGT TCC AGA TAG CGC ATG GCG AC3’ z konce třetího exonu WAP jako reverzní primer. Oba primery byly opatřeny na 5'konci restrikčním místem pro BamHI restrikční endonukleázu. Amplifikovaný fragment byl izolován z gelu , štěpen restrikční endonukleázou BamHI a ligací vklonován do vektoru pBluescript II KS+ (pBS). Schopnost klonovaného DNA fragmentu WAP genu specificky hybridizovat s králičím WAP lokusem byla ověřována Southernovou hybridizací (viz Příloha 5). Genomová DNA byla štěpena třemi dvojicemi restrikčních enzymů a poté frakciována na 0,7% m/v agarózovém gelu, blotována a fixována na nylonový filtr. Hybridizací s označeným DNA fragmentem WAP genu se podařilo detekovat celkem tři fragmenty Xhol-Xhol 4,8kb, Xhol-Sacl 3,1 kb a Xhol-Kpnl 2,6kb .
Ověřená sonda byla využita k vyhledávání fágových klonů nesoucích úseky WAP genu. Z ploten o průměru 150mm byly otisknuty plaky na nylonové membrány a za standartních podmínek kultivovány v hybridizačním roztoku. Takto se podařilo identifikovat a izolovat fágový klon nesoucí úplný strukturní gen pro WAP s přilehlými 10 kb dlouhou 5' a 4,8 dlouhou 3'koncovými sekvencemi (viz příloha 6).
Po restrikční analýze λ Fága DASH II obsahujícího kompletní sekvenci králičího WAP genu s jeho přilehlými regulačními sekvencemi byl pomocí restriktáz EcoRI a Kpnl izolován na 0,5% m/v agaróze 10kb dlouhý 5'koncový fragment a ligací vklonován do vektoru pBS Výsledný vektor získal označení prW5'BS-KE (viz Příloha 7).
···· • · 4 40 • ··
0· * 4 • · • 9 • · <44 ···· • 4 R*
4 · · • 4 · · • 4 4 9 4
9 4 · ·· 44
Příklad 2
Subklonování strukturní části hEPO genu z FIXU fágů genomové knihovny do plazmidů phEBS-HB
Lidský strukturní gen pro erythropoetin (EPO) byl izolován z FIX II fágů genomové lidské knihovny.
Na genomové DNA izolované ze vzorku lidské krve obvyklým způsobem (Sambrook, J. Fritsch, E.F. Maniatis , T. (1989) Molecular cloning: laboratory manual -2nd ed. Cold. Spring. Harbor. Laboratory Press.) byla připravena pomocí PCR reakce sonda EPO 2ex/3ex 3343 bp dlouhá. Tento fragment DNA je komplementární se sekvencí lidského EPO genu v oblasti mezi počátkem druhého exonu a koncem třetího exonu strukturního genu (viz Příloha 4).
V PCR byly použity nukleotidové sekvence primerů.
(5’TGT GAC AGC CGA GTC CTG CAG AGG3’z počátku druhého exonu EPO genu jako forward primer a 5’CAA GCT GCA GTG TTC AGC ACA GCC3’ z konce třetího exonu EPO jako reverzní primer.
Oba primery byly opatřeny na 5'konci restrikčním místem pro Pst I restrikční endonukleázu. Amplifikovaný fragment byl izolován z gelu , štěpen restrikční endonukleázou Pstl a ligací vklonován do vektoru pBS Schopnost klonovaného EPO fragmentu specificky hybridizovat s lidským EPO lokusem byla ověřována na Southern blotech (viz Příloha 5). Genomová DNA byla štěpena třemi dvojicemi restrikčních enzymů a poté frakciována na 0,7 %m/v agarozovém gelu, blotována na nylonový filtr a hybridizována s radioaktivně značenou sondou. Podařilo se detekovat celkem tři fragmenty BamHI- HindiII, Sací- Smál a Pstl. Ověřená sonda byla využita k vyhledávání fágových klonů nesoucích úseky EPO genu. Z ploten o průměru 150mm byly otisknuty plaky na nylonové membrány a za standartních podmínek kultivovány v hybridizačním roztoku. Takto se podařilo identifikovat a izolovat fágový klon nesoucí úplný strukturní gen pro EPO (viz Příloha 6).
Po restrikční analýze λ Fága FIX II obsahujícího kompletní sekvenci lidského EPO genu s jeho přilehlými regulačními sekvencemi byl pomocí
restriktáz BamHI a Hindi11 izolován na 0,5% m/v agaróze 5,2 kb dlouhý fragment obsahující kompletní sekvenci lidského EPO genu s jeho přilehlými regulačními sekvencemi a ligací vklonován do vektoru pBS Výsledný vektor získal označení phEBS-HB (viz Příloha 7).
Příklad 3
Instalování Notl restrikčního místa do translačního konsenzu Kozákové rWAP a hEPO genů.
Zvolená strategie při konstrukci hybridního genomového úseku mezi rWAP a hEPO je založena na cílené instalaci restrikčního místa v motivu pro translační konsenzus Kozákové v blízkosti startovního kodonu ATG. Tato cílená změna bází je možná s využitím techniky PCR s koncově modifikovanými primery, které jsou na svém 3'konci komplementární s cílovou sekvencí genu a na 5'konci nesou instalované restrikční místo. Pomocí dvojice primerů je k jednomu z nich (komplementárnímu k translačnímu konsenzu Kozákové) připojena sekvence s motivem pro restrikční endonukleázu Notl. Pomocí PCR je generována oblast proti proudu od ATG genu rWAP s modifikovaným translačním konsenzem Kozákové. Stejným přístupem zrcadlově je připravena modifikovaná oblast hEPO genu po proudu od ATG. Obě části jsou následně spojeny přes modifikovaný translační konsenzus a propojeny se zbývajícími částmi rWAP promotoru a hEPO kódující oblastí genu v požadovaný hybridní gen pro cílenou expresi v buňkách mléčné žlázy.
Restrikční analýzou bylo ověřeno, že Notl restrikční místo v oblasti použitých genomových úseků EPO a WAP není přítomno. Je tedy vhodným místem ke konstrukci četných rekombinantních vektorů WAP/EPO.
Postup instalace Notl do sekvence Kozákové ve WAP genu vedl přes vytvoření umělého fragmentu WAP genu pomocí PCR s následujícími primery:
rW-824 (5' CCA ggA AgC TgC gAg gAg CtC TgT gCC TgA 3') rW-26Notl (5' CgC ATg gCg gCC gCT ggT Agg CTg gTg gTg 3')
• · ·
Upravený fragment EPO genu s Notl místem v sekvenci Kozákové byl vytvořen pomocí PCR s touto dvojicí primerů: hE+1Notl ( 5' AAg AAt gCg gCC gCC ATg ggg gTg CaC ggT gAg Tac TCg 3') hE+998 ( 5' CAA gTC gCA gTg TTC AgC ACA gCC 3')
Oba amplifikované fragmenty byly izolovány z gelu, restrikčně testovány a upraveny k ligaci: WAP fragment byl štěpen Notl a Sací enzymy, EPO fragment byl štěpen dvojicí Notl a Kpnl. Notl- modifikovaný EPO fragment byl vklonován do hostitelského pracovního vektoru pBS za vytvoření vektoru phEPOBS-KN (viz Příloha 8). Do téhož hostitelského vektoru byl rovněž subklonován modifikovaný WAP fragment a konstrukt byl označen jako vektor prWAPBS-NS (viz příloha 8).
Příklad 4
Klonování a propojení fragmentů rWAP a hEPO genů s instalovaným Notl restrikčním místem.
Do vektoru phEPOBS-KN byl instalován PCR-generovaný Notlmodifikovaný fragment rWAP genu, a to přes nově vytvořené Notl místo v Kozak-sekvenci EPO a přes Sací místo v polylinkeru vektoru. Vektor dostal označení prWAPhEPOBS-KNS (viz Příloha 9). Vzniklý WAP/EPO fúzní fragment Sacl-(Notl)-Kpnl o velikosti 1070 bp se stal základem k vytvoření cílového hybridního konstruktu.
Vektor prWBS-KE, nesoucí subklonovanou 5'- nepřepisovanou regulační část králičího WAP genu, byl linearizován pomocí Kpnl enzymu v místě383 od ATG startu a následně ligován s 1070 bp dlouhým Kpnl-(Notl)Kpnl spojovacím fragmentem izolovaným z prWAPhEPOBS-KNS. Fúze těchto fragmentů vytvořila vektor prWhEPOBS-KNKE o velikosti 14 kb. Vektor phEBS-HB, nesoucí celou kódující část lidského EPO genu, byl linearizován pomocí Kpnl enzymu v místě +687 od ATG startu a následně ligován s 1070 bp dlouhým Kpn-(Notl)-Kpnl spojovacím fragmentem izolovaným z prWAPhEPOBS-KNS. Fúze těchto fragmentů vytvořila vektor prWAPhEBS-KNKB o velikosti 9 kb. Z tohoto vektoru byl následně vyštěpen 4,8 bp dlouhý Notl-BamHI fragment obsahující • · ·· ·· • · · · · • · · · · « · · · · · kompletní strukturní gen pro hEPO s instalovaným Notl místem v sekvenci Kozákové a tento fragment byl vložen do hostitelského vektoru pBS za vzniku phEBS-BN. Do Xbal místa tohoto konstruktu byl poté vpraven 8 kb velký Xbal-Xbal fragment izolovaný z prWhEPOBSKNKE vektoru. Výsledný řekombinantní konstrukt, nazvaný prWhEBSBNX (viz Příloha 10), byl restrikčně testován a částečně sekvenován (viz Příloha 11). Velikost celého vektoru je 16 kb a hybridní rWAP-hEPO gen je možné izolovat z vektoru štěpením s EcoRI a Hindlll enzymy.
Identifikace transgenních myší
Pro identifikaci transgenních myší byl testován systém primerů, využívaný již dříve k přípravě sond, jejichž specifita byla ověřena hybridizací s lidskou genomovou DNA. Bylo ověřeno, že testované primery na negativní myší DNA neumožňují při PCR amplifikaci žádnému fragmentu.
Průmyslová využitelnost
Modifikace translačního konsenzu Kozákové genu rWAP způsobem podle vynálezu je využitelná ke snadné konstrukci expresních vektorů určených k produkci transgenních proteinů. Vektor prWhEBS-BNX připravený popsaným způsobem podle vynálezu je možné použít k expresi EPO ve vhodných transfekovaných eukaryotických buňkách a nebo v mléčné žláze transgenních organizmů.
• · • © • · • ·
Objasnění příloh
Příloha č.1
Primární nukleotidová struktura translačního konsenzu Kozákové genů pro rWAP a hEPO a jejich propojení pomocí modifikace Notl translačního konsenzu kozákové.
Příloha č.2
Příprava sond vhodných k identifikaci fágových klonů nesoucích část primární nukleotidové struktury genu pro rWAP. Sondy byly připraveny pomocí PCR reakce s použitím primerů (podtržené úseky primární sekvence).
Příloha č.3
Příprava sond vhodných k identifikaci fágových klonů nesoucích část primární nukleotidové struktury genu pro hEPO. Sondy byly připraveny pomocí PCR reakce s použitím primerů (podtržené úseky primární sekvence).
Příloha č.4
Elektroforetické zobrazení amplifikace sond použitých k vyhledání fágových klonů nesoucích primární nukleotidovou strukturu genů pro rWAP a hEPO.
Příloha č. 5
Ověření schopnosti amplfikovaných sond hybridizovat za stringentních podmínek s restrikčně upravenou genomovou DNA vázanou na nylonové membráně pomocí metody Southern blot.
Příloha č. 6
Restrikční mapy izolovaných fágových klonů nesoucích primární nukleotidové struktury genů pro rWAP a pro hEPO, s vyznačením strukturní části genů zobrazující introny a exony (vyznačené široké úseky jsou exony, tenčí úseky jsou introny) a vyznačenými nejdůležitějšími restrikčními místy.
Přílohy č.7 ažč.10
Zjednodušená schémata zobrazující postup restrikčních štěpení fragmentů pocházejících z izolovaných fágových klonů rWAP a hEPOa vektoru pBS a konstrukce finálního expresního vektoru prWhEBS-BNX pomocí modifikace translačního konsenzu Kozákové, vnesením restrikčního místa Notl.
Příloha č.11
Primární nukleotidové struktura kódující oblasti expresního vektoru

Claims (5)

PATENTOV'E Ν Ά R Ο Κ Υ
1. Způsob přípravy expresního vektoru k produkci terapeutických proteinů vyznačující se tím, že ke spojení genového úseku zahrnujícího regulační oblast promotoru s genovým úsekem zahrnujícím strukturní části genu kódujícího požadovaný protein využívá sekvenční motiv pro restrikční endonukleázu Not I nebo Ncol vytvořený modifikací původního translačního konsenzu Kozákové v oblasti mezi nukleotidy -9 až +4 za vzniku hybridního rekombinantního expresního vektoru k produkci terapeutických proteinů.
2. Způsob přípravy expresního vektoru podle nároku 1, v y z n a č u j í c í se t í m, že ke spojení vybraných genových úseků je modifikován translační konsenzus Kozákové genů pro králičí kyselý protein mléčné syrovátky a lidský erythropoetin vložením sekvenčního motivu pro restrikční endonukleázu zejména Not I v oblasti mezi nukleotidy -9 až +4 za vzniku expresního vektoru prWhEBS-BNX k produkci lidského erythropoetinu v mléčné žláze transgenních organizmů.
3. Primární nukleotidová struktura DNA vektoru prWhEBS-BNX, připravená podle nároku 1 a 2, a všech dalších vektorů, které jsou modifikací odvozeny od tohoto původního vektoru prWhEBS-BNX.
4. Eukaryontní buňky nesoucí ve svém genomu nukleotidovou primární strukturu hybridních genů pocházejících z expresních vektorů, připravených způsobem podle nároku 1 a 2.
5. Transgenní organizmy nesoucí ve svém genomu nukleotidovou primární strukturu hybridních genů pocházejících z expresních vektorů, připravených způsobem podle nároku 1 a 2.
Příloha č.1
Translační konsenzus Kozákové v genech pro rWAP a hEPO a modifikovaný translační konsenzus v hybridním genu rWAP-hEPO ' s motivem pro restrikční enzym Notl.
TACCA C -9 c -6 -3 +1 +4 C ATG CGC -WAP T G C C A C GGCCAG G c G C G G A G ATG GGG -EPO ----- G C c G C C G/A C c atg g---Optimalizovaný translační konsenzus Kozákové TACCA G C G G C C G C c atg ggg -Translační konsenzus WAP-EPO s modifikací Notl
CZ20004569A 2000-12-07 2000-12-07 Způsob přípravy DNA expresního vektoru, DNA vektor, eukaryontní buňka a transgenní organismus CZ293226B6 (cs)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20004569A CZ293226B6 (cs) 2000-12-07 2000-12-07 Způsob přípravy DNA expresního vektoru, DNA vektor, eukaryontní buňka a transgenní organismus
DE60139300T DE60139300D1 (de) 2000-12-07 2001-12-07 Verfahren für die Herstellung eines Expressionsvektors zur Produktion von therapeutischen Proteinen in transgenen Tieren
EP01128498A EP1217072B1 (en) 2000-12-07 2001-12-07 Method for the preparation of an expression vector for the production of therapeutic proteins in transgenic animals
AT01128498T ATE437231T1 (de) 2000-12-07 2001-12-07 Verfahren für die herstellung eines expressionsvektors zur produktion von therapeutischen proteinen in transgenen tieren

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20004569A CZ293226B6 (cs) 2000-12-07 2000-12-07 Způsob přípravy DNA expresního vektoru, DNA vektor, eukaryontní buňka a transgenní organismus

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20004569A3 true CZ20004569A3 (cs) 2002-07-17
CZ293226B6 CZ293226B6 (cs) 2004-03-17

Family

ID=5472752

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20004569A CZ293226B6 (cs) 2000-12-07 2000-12-07 Způsob přípravy DNA expresního vektoru, DNA vektor, eukaryontní buňka a transgenní organismus

Country Status (4)

Country Link
EP (1) EP1217072B1 (cs)
AT (1) ATE437231T1 (cs)
CZ (1) CZ293226B6 (cs)
DE (1) DE60139300D1 (cs)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3020273B1 (en) * 2014-11-17 2018-07-04 Competence Centre on Health Technologies A method of producing biotechnological drugs using transgenic bovine animals

Also Published As

Publication number Publication date
EP1217072A3 (en) 2002-08-28
EP1217072B1 (en) 2009-07-22
ATE437231T1 (de) 2009-08-15
CZ293226B6 (cs) 2004-03-17
DE60139300D1 (de) 2009-09-03
EP1217072A2 (en) 2002-06-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6377095B2 (ja) 鳥の導入遺伝子についてのマグナム特異的プロモーターを含むベクター
US7378086B2 (en) Retroviral vector having an ovalbumin promoter
CN102660581A (zh) 转基因禽类的生产
US20130131317A1 (en) Expression of secreted human alpha-fetoprotein in transgenic animals
CN110177878B (zh) 转基因动物和生物生产方法
CN1980571A (zh) 禽类及禽蛋中表达的外源蛋白质
US7511126B2 (en) Position-independent and tissue specific expression of a transgene in milk of transgenic animals
EP1217072B1 (en) Method for the preparation of an expression vector for the production of therapeutic proteins in transgenic animals
AU769622B2 (en) Tissue specific synthesis of protein in eggs of transgenic hens
HK40005869B (zh) 转基因动物和生物生产方法
NZ503901A (en) Transgenic avians containing replication-defective retroviral vectors and methods for tissue specific synthesis of protein in eggs laid by the avian or female progeny thereof.
HK1121342A (en) Expression of secreted human alpha-fetoprotein in transgenic animals

Legal Events

Date Code Title Description
MK4A Patent expired

Effective date: 20201207