CN217922034U - 基底保持件、支承装置及系统 - Google Patents
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Abstract
本实用新型涉及一种基底保持件，包括构造成接纳基底的基部；覆盖件，其构造成与基部匹配地接合，该覆盖件限定由内侧壁形成的开口；以及限定表面的可移除插入件，该可移除插入件构造成接纳在覆盖件的开口内。可移除插入件包括衬垫；联接到衬垫的突起；以及至少两个插入凸片，该至少两个插入凸片从可移除插入件的相对侧延伸，每个插入凸片构造成与形成覆盖件的开口的内侧壁中的至少一个接合。另外，本实用新型还涉及一种支承装置及系统。
Description
技术领域
本实用新型涉及一种基底保持件。
背景技术
由于不同细胞内的不同分析物水平(例如基因和/或蛋白质表达)，被试组织内的细胞在细胞形态和/或功能方面存在差异。细胞在组织内的特定位置(例如，细胞相对于相邻细胞的位置或细胞相对于组织微环境的位置) 可能影响例如细胞的形态、分化、命运、活力、增殖、行为以及信号传导以及与组织中其它细胞的串扰。
之前已经使用如下技术研究空间异质性，这些技术仅提供完整组织或部分组织中少量分析物的数据，或提供单个细胞的大量分析物数据，但未能提供有关单个细胞在亲本生物样本(例如，组织样本)中的位置的信息。
此外，用于空间分析物数据的成像系统的分辨率和灵敏度本质上是可变的。除了成像设备的布置、各种类型的成像设备和图像采集软件之间的差异之外，这在很大程度上是由于成像系统部件的制造商的可变性。图像质量还受到用户执行的图像采集的改变的影响。当尝试对未知荧光强度的样本进行成像或由不同经验的用户对样本进行成像时，这个问题变得尤为明显。
此外，在实验室环境中，采用各种处理方案(protocol)来制备用于分析的样本。这些方案可以在试管中、在载物片上、或更普遍地在由基底支承的样本上进行。某些方案在稳定、受控的温度下执行，以确保样本和方案试剂的保真度。其它方案涉及温度循环和其它步骤，其中以受控方式调节样本的温度。为了在方案期间加热样本及其支承基底，可以使用热循环仪、加热板或其它加热装置。作为一个示例，热循环仪可以作为聚合酶链反应方案的一部分用于核酸扩增以及转录和逆转录分析序列。还可以在热循环仪和其它加热装置中对样本进行受控加热，以例如有助于限制性酶消化和快速诊断的温度敏感反应。
此外，可以将生物样本放置在紧固的支承件上以进行分析以识别或表征样本内的分析物，例如DNA、RNA或其它遗传物质。印制的引导物可帮助改善样本在坚固的支承件上的放置。
当前用于支承生物样本的方法和装置(例如，在空间分析和/或加热期间)通常缺乏便携性，不提供进入特定样本区域或孔的通路，和/或不提供用于防止样本区域或井孔之间的交叉污染的汽密密封。
实用新型内容
下面公开的实施例包括用于包括样本区域的基底的支承装置，以及培育设置在基底的样本区域上的样本的方法。本文描述的装置、系统和方法的一些实施例可以提供以下优点中的一个或多个。
首先，本文描述的一些实施例可以提供模块化设计，其为用户提供将一个或多个插入件装载到同一支承装置上的灵活性。在一些实施例中，插入件包括支承结构和包覆模制衬垫。一个或多个插入件可以包括一个或多个端口，该端口构造成向用户提供通向基底(例如，基底上的生物样本) 的直接通路。例如，支承装置的模块化设计可以为用户提供使用具有不同体积的多种端口的选项，同时仅需要使用一个支承装置。因此，用户可能能够将相同的支承装置用于需要不同体积的不同应用。
其次，本文所述的一些实施例可有助于在使用支承装置时将端口(例如，插入件)精确定位在基底(例如，载玻片)上。例如，一旦装载到支承装置上，插入件就可以移动到基底的任何部分或区段或直接在基底上方。在一些实施例中，插入件可以旋转约0度至约360度，以促进与基底的样本区域(例如，支承诸如生物样本的样本的区域)对齐。在一些实施例中，插入件可以放置在基底的表面上的不同位置中或直接上方，在支承装置的覆盖件的开口区段的边界内。在一些实施例中，插入件可以是包括可滑动衬垫的可滑动插入件，其为用户提供在一个或多个位置处接触基底的灵活性，而无需从支承装置移除插入件或无需在支承装置的覆盖件的开口区段内移动插入件本身。
第三，本文所述的一些实施例可容纳位于基底上任何位置的一个或多个样本(例如，生物样本)。例如，在一些实施例中，基底可以包括定位在基底上的不同位置处的两个样本，并且本文公开的支承装置的可移除和可运动插入件可以围绕两个样本中的每一个的至少一部分产生两种密封 (例如，汽密密封和/或液密密封)。在一些实施例中，支承装置可以形成试剂井孔(例如，通过将插入件的衬垫与样本的至少一部分对齐)，用于在用于处理一个或多个样本的测定中使用的测定试剂溶液。在一些实施例中，本文公开的支承装置有助于溶液(例如，测定试剂溶液)体积的优化。
第四，本文描述的一些实施例可以促进设置并减少用户在组装装置和基底时花费的时间。在一些实施例中，用户能够容易地将基底插入本文所述的装置中，而无需紧固多个部件。在一些实施例中，用户不使用任何工具来帮助将基底插入到装置中或帮助从装置中移除基底。例如，用户可能不需要使用任何类型的紧固件来组装支承装置，也不需要将基底固定到支承装置，从而提供更有效的支承样本(例如，生物样本)的方式。在其它示例中，本文公开的装置可替代地使用一个或多个紧固件来组装支承装置和/或将基底固定到支承装置。
第五，本文所述的一些实施例可提供当基底保持件处于闭合位置时在衬垫和基底之间形成的汽密密封、或液密密封、和/或气密密封。例如，插入件可以包括构造成形成汽密密封和/或气密密封的衬垫，其能够防止液体在一个或多个插入件或端口之间传输。汽密密封和/或气密密封还能够防止生物样本经由例如溶液或液体从第一样本区域泄漏到第二样本区域而发生交叉污染。此外，在衬垫和基底之间形成的汽密、液密和/或气密密封可以允许用户使用更少体积的试剂(例如，昂贵的试剂)，否则如果衬垫将不用于密封基底上的感兴趣区域(例如，样本区域)将需要。因此，包括本文所述的衬垫的插入件可以有利地降低使用本公开的支承装置进行测定的成本。
第六，本文描述的一些实施例可以最小化装载到支承装置上的基底上的剪切力。例如，加载的基底上的剪切力可以在紧密靠近支承装置的一个或多个铰链的基底的区段附近或处被最小化。剪切力的最小化可以防止对基底的损坏(例如，断开或开裂)。
第七，本文描述的一些实施例可以为基底表面提供一致且均匀的加热。均匀加热对于确保在由基底支承的样本上进行的制备反应按照既定的方案发生并实现期望的结果也是至关重要的。本文提供的装置可用于确保在样本制备和/或分析方案期间均匀且一致地控制基底和支承在基底表面上的任何样本和/或试剂的温度。在此类方案中，不均匀加热会导致样本制备的失败。
第八，本文所述的一些实施例可以通过用衬垫产生的汽密密封和/或气密密封来密封基底井孔(例如，包括样本区域或样本)来减少或防止在基底井孔中形成冷凝。如果在没有上盖的情况下加热基底，将基底(例如载玻片)加热到高于室温的温度会导致在封围的基底井孔的上表面上形成冷凝。冷凝会改变基底井孔中反应混合物的组分、抑制制备反应、和/或产生不可预知的结果。此外，即使当样本加热相对均匀时，接触样本的冷凝也可能会损害作为方案的部分的某些反应，或以其它方式影响发生的化学反应。在各种实施例中，所描述的装置提供基底的多个表面的加热(例如，在载物片盒或基底保持件中)，并且可以包括促进从加热元件到基底的热传递并且可以减少或防止在基底的某些区域(例如，在基底表面上的样本井孔或区域中)中形成冷凝的特征。
第九，本文描述的一些实施例可以提供减轻来自基底上不同位置的样本和/或试剂的交叉污染。例如，所描述的装置的衬垫可以提供离散的生物样本区段和从一个井孔到下一个井孔的蒸汽屏障。此外，衬垫可以阻止试剂溢出或从一个井孔流到下一个井孔。在一些实施例中，本文提供的装置包括锁定机构(例如锁定凸片)，当支承装置处于闭合位置时，该锁定机构有助于将衬垫固定就位。
第十，本文所述的一些实施例可用于在并非为这种基底设计的加热装置内支承基底，确保对基底进行充分且均匀的热传递。某些类型的热循环仪和加热装置专为诸如多井孔基底之类的特定类型的基底而构建。将诸如标准显微镜载物片之类的其它类型的基底装载到这种装置中可能会导致不均匀的基底加热。特别地，本公开的支承装置可用于适配设计成接受多井孔基底的热循环仪，使得作为样本制备方案的部分，其它类型的基底可以在热循环仪内被有效地加热。
第十一，本文所述的一些实施例可通过允许基底的表面直接接触加热装置(例如，热循环仪)的表面来向基底提供均匀的加热。即，在一些实施例中，不需要将额外的基底或外壳元件定位在热源和待加热的基底之间。此外，由于本公开的装置允许基底的表面直接接触加热装置(例如热循环仪)的表面，因此基底的温度可以更容易地由用户控制并且与使用不允许基底和加热装置之间的表面接触的装置(例如，热循环仪)相比，可以在更短的时间内加热到期望的温度。因此，基底上的样本(例如，生物样本) 可以以受控方式且均匀地加热。
第十二，本文描述的一些实施例可以承受高温范围(例如，范围高达 135℃或更高)。例如，本公开的装置可以经受高压釜中的蒸汽灭菌。因此，本公开的装置可以在使用之前和/或之后进行灭菌(例如，高压灭菌)。此外，用户可以选择对本公开的装置进行灭菌(例如，高压灭菌)并重新使用相同的装置来处理不同的样本(例如，生物样本)。
第十三，本文描述的一些实施例可以提供一种基底保持件，该基底保持件可以处于解锁状态，其中覆盖件放置在基部上方，并且可运动凸片搁置在不可运动凸片上，使得覆盖件和基部以间隙距离间隔开，并且衬垫的远侧表面与基底的表面间隔开。在一些实施例中，用户可以在将基底保持件置于可释放锁定状态之前有利地调整衬垫和/或可移除插入件的位置。因此，在一些实施例中，基底保持件的解锁状态解决了密封基底上的感兴趣的表面区段(例如，样本区域或表面是基底的其上设置样本的表面)的问题，而不会潜在地损坏在基底的表面上的样本(例如，通过用衬垫的表面从基底上移出样本的至少一部分)。
第十四，本文描述的一些实施例可以为用户提供调整可移除插入件在基底保持件的覆盖件的开口内的位置，和/或衬垫在可移除插入件的突起内的位置的能力，使得用户能够接近暴露在覆盖件的开口内的基底的增加的表面积(例如，暴露在覆盖件的开口内的基底面积的至少约50％)。因此，在一些实施例中，可移除插入件和衬垫的可滑动联接在基底的表面上的样本的数量和放置方面为用户提供了更大的自由度，当基底保持件处于可释放锁定状态时，基底表面可以被衬垫密封。
第十五，本文描述的一些实施例可以提供可运动凸片和不可运动凸片，它们的表面的至少一部分是成角度的表面，这可以有利于基底保持件的覆盖件和基部的接合。例如，在一些实施例中，当用户选择将基底保持件置于可释放锁定状态时，可运动凸片和不可运动凸片的成角度的表面可以允许用户将覆盖件卡扣配合到基部上，从而便于组装基底保持件和基底。
在一个方面，本公开涉及一种支承装置，包括：基底保持件，包括：限定开口的覆盖件；一个或多个可移除插入件，该一个或多个可移除插入件包括衬垫和突起，其中一个或多个可移除插入件的至少一部分构造成接纳在覆盖件的开口中，一个或多个可移除插入件限定插入件开口；以及基部，该基部构造成与覆盖件接合并接纳基底。
在另一个方面，本公开涉及一种支承装置，包括：基底保持件，包括：限定开口的覆盖件；限定第一插入件开口的第一可移除插入件，第一可移除插入件包括第一衬垫和第一突起；限定第二插入件开口的第二可移除插入件，第二可移除插入件包括第二衬垫和第二突起；以及基部，其构造成与覆盖件接合并接纳基底，其中，第一可移除插入件的至少一部分和第二可移除插入件的一部分构造成接纳在覆盖件的开口中。
在另一个方面，本公开涉及一种基底保持件，包括：限定开口的覆盖件；一个或多个可移除插入件，该一个或多个可移除插入件包括衬垫和突起，其中一个或多个可移除插入件的至少一部分构造成接纳在覆盖件的开口中，一个或多个可移除插入件限定插入件开口；以及基部，该基部构造成与覆盖件接合并接纳基底。
在另一个方面，本公开涉及一种基底保持件，包括：限定开口的覆盖件；限定第一插入件开口的第一可移除插入件，第一可移除插入件包括第一衬垫和第一突起；限定第二插入件开口的第二可移除插入件，第二可移除插入件包括第二衬垫和第二突起；以及基部，其构造成与覆盖件接合并接纳基底，其中，第一可移除插入件的至少一部分和第二可移除插入件的一部分构造成接纳在覆盖件的开口中。
在一些实施例中，覆盖件限定第一凹部。在一些实施例中，第一凹部限定构造成与突起接合的第一凹部开口。在一些实施例中，第一凹部开口的面积大于覆盖件的开口面积。在一些实施例中，覆盖件包括从覆盖件的表面延伸的一个或多个肋。在一些实施例中，第一可移除插入件或第二可移除插入件的至少一部分构造成与第一凹部接合。
在一些实施例中，当基部与覆盖件接合时，衬垫接触基底的表面。在一些实施例中，基底保持件包括第一可移除插入件和第二可移除插入件。在一些实施例中，第一插入件开口的面积大于第二插入件开口的面积。在一些实施例中，第一插入件开口的面积大约等于第二插入件开口的面积。在一些实施例中，基底保持件包括三个或更多个可移除插入件。在一些实施例中，当基部不与覆盖件接合时，突起的位置在开口内可调整或可滑动。
在一些实施例中，衬垫包括固定地联接到可移除插入件的表面的衬垫壁。在一些实施例中，衬垫包括从衬垫壁的表面延伸的凸缘。在一些实施例中，可移除插入件包括构造成接纳凸缘的第二凹部。在一些实施例中，凸缘在第二凹部内是可调整的或可滑动的。在一些实施例中，衬垫构造成当基底被基底保持件固定并且基部与覆盖件接合时，在衬垫和基底之间形成汽密密封。在一些实施例中，衬垫构造成当基底被基底保持件固定并且基部与覆盖件接合时，在衬垫和基底之间形成流体密封。
在一些实施例中，基底是载玻片。在一些实施例中，基底包括第一表面和第二表面，第一表面构造成用于接纳样本。在一些实施例中，基底的第二表面搁置在基底保持件的基部的一部分上。在一些实施例中，插入件开口小于覆盖件的开口。在一些实施例中，支承装置还包括基底。在一些实施例中，基底包括生物样本。在一些实施例中，衬垫构造成与生物样本的至少一部分对齐。
在另一个方面，本公开涉及一种方法，包括：将基底安装在支承装置的基部上，该支承装置包括：基底保持件，包括：限定开口的覆盖件；一个或多个可移除插入件，其包括衬垫和突起，其中一个或多个可移除插入件构造成接纳在开口中，一个或多个可移除插入件限定小于开口的插入件开口；和基部，其构造成与覆盖件接合并接纳基底；将一个或多个可移除插入件插入覆盖件的开口中；将一个或多个插入件放置在基底的表面上，同时将覆盖件放置在基部上；以及使覆盖件与基部接合以固定基底。
在另一个方面，本公开涉及一种方法，包括：包括：将基底安装在支承装置的基底保持件的基部上，该支承装置包括：基底保持件，包括：限定开口的覆盖件；一个或多个可移除插入件，该一个或多个可移除插入件包括衬垫和突起，一个或多个可移除插入件限定小于覆盖件的开口的插入件开口；和基部，其构造成与覆盖件接合并接纳基底；将一个或多个可移除插入件放置在基底的表面上；将覆盖件放置在一个或多个可移除插入件上方和基部上，使得一个或多个可移除插入件的至少一部分被接纳在覆盖件的开口中；以及使覆盖件与基部接合以固定基底。
在另一个方面，本公开涉及一种方法，包括：将基底安装在基底保持件的基部上，该基底保持件包括：限定开口的覆盖件；一个或多个可移除插入件，其包括衬垫和突起，其中一个或多个可移除插入件构造成接纳在开口中，一个或多个可移除插入件限定小于开口的插入件开口；和基部，其构造成与覆盖件接合并接纳基底；将一个或多个可移除插入件插入覆盖件的开口中；将一个或多个插入件放置在基底的表面上，同时将覆盖件放置在基部上；以及使覆盖件与基部接合以固定基底。
在另一个方面，本公开涉及一种方法，包括：将基底安装在基底保持件的基部上，该基底保持件包括：限定开口的覆盖件；一个或多个可移除插入件，该一个或多个可移除插入件包括衬垫和突起，一个或多个可移除插入件限定小于覆盖件的开口的插入件开口；和基部，其构造成与覆盖件接合并接纳基底；将一个或多个可移除插入件放置在基底的表面上；将覆盖件放置在一个或多个可移除插入件上方和基部上，使得一个或多个可移除插入件的至少一部分被接纳在覆盖件的开口中；以及使覆盖件与基部接合以固定基底。
在一些实施例中，该方法还包括当基部不与覆盖件接合时，在开口内调整或滑动突起。在一些实施例中，该方法还包括使凸缘与一个或多个可移除插入件的第二凹部接合，该凸缘从衬垫的衬垫壁的表面延伸。在一些实施例中，该方法还包括在第二凹部内调整或滑动凸缘。在一些实施例中，该方法还包括将可移除插入件的至少一部分与由覆盖件限定的第一凹部接合。在一些实施例中，该方法还包括当基部不与覆盖件接合时，在开口内调整或滑动突起。
在一些实施例中，支承装置还包括基底。在一些实施例中，基底包括生物样本。在一些实施例中，该方法还包括使衬垫与生物样本的至少一部分对齐。在一些实施例中，该方法还包括使生物样本与试剂接触。
在另一个方面，本公开涉及一种基底保持件，包括：构造成接纳基底的基部，该基部包括从其侧壁中的至少两个延伸的不可运动凸片；以及覆盖件，其构造成与基部匹配地接合，覆盖件限定开口，开口构造成接纳可移除插入件，覆盖件包括构造成与基部的不可运动凸片接合的可运动凸片，其中，每个可运动凸片包括第一接触表面和第二接触表面，其构造成与基部的相应的不可运动凸片接合，第一接触表面构造成与相应的不可运动凸片接合，使得覆盖件和基部在解锁状态下接合，并且其中，第二接触表面构造成与相应的不可运动凸片卡合，使得覆盖件与基部处于可释放锁定状态。
在一些实施例中，在覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，每个可运动凸片构造成弯曲以与不可运动凸片接合。在一些实施例中，在覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，每个可运动凸片构造成弯曲以与不可运动凸片接合。在一些实施例中，可运动凸片的第一接触表面构造成定位在相应的不可运动凸片的表面上。在一些实施例中，在解锁状态或可释放锁定状态下，覆盖件的周向边缘与基部的周向边缘基本对齐。在一些实施例中，覆盖件和基部的配合表面在解锁状态下由间隙间隔开。在一些实施例中，间隙在尺寸上构造成便于可移除插入件在解锁状态下在覆盖件的开口内的可运动调整。在一些实施例中，覆盖件和基部的配合表面在可释放锁定状态下直接接触。在一些实施例中，可运动凸片包括至少部分地由第一接触表面限定的槽口。在一些实施例中，不可运动凸片的第一接触表面包括成角度的表面。
在一些实施例中，基部包括从基部的侧壁延伸的一对引导部。在一些实施例中，每个引导部构造成接触可运动凸片的侧表面。在一些实施例中，可移除插入件包括衬垫和联接到衬垫的突起。在一些实施例中，衬垫构造成当基底被基底保持件固定并且覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，在衬垫和基底之间形成汽密密封。在一些实施例中，衬垫构造成当基底被基底保持件固定并且覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，在衬垫和基底之间形成流体密封。在一些实施例中，基底保持件包括第一可移除插入件和第二可移除插入件。在一些实施例中，第一可移除插入件限定第一插入件开口，该第一插入件开口的面积大于由第二可移除插入件限定的第二插入件开口的面积。在一些实施例中，第一插入件开口的面积大约等于第二插入件开口的面积。在一些实施例中，基底保持件包括三个或更多个可移除插入件。在一些实施例中，基底是载玻片。在一些实施例中，基底包括生物样本。在一些实施例中，衬垫构造成与生物样本的至少一部分对齐。在一些实施例中，覆盖件包括从覆盖件的表面延伸的一个或多个肋。在一些实施例中，插入件开口小于覆盖件的开口。在一些实施例中，第一和第二插入件开口比覆盖件的开口小。
在另一方面，本公开涉及一种支承装置，其包括本文所述的任何基底保持件。
在另一个方面，本公开涉及一种方法，包括：将基底安装在前述基底保持件的任一个的基部上，该基底保持件包括：构造成接纳基底的基部，该基部包括从其侧壁中的至少两个延伸的不可运动凸片；以及覆盖件，其构造成与基部匹配地接合，覆盖件限定开口，开口构造成接纳可移除插入件，覆盖件包括构造成与基部的不可运动凸片接合的可运动凸片；其中，每个可运动凸片包括第一接触表面和第二接触表面，其构造成与基部的相应的不可运动凸片接合，第一接触表面构造成与相应的不可运动凸片接合，使得覆盖件和基部在解锁状态下接合，并且其中，第二接触表面构造成与相应的不可运动凸片卡合，使得覆盖件与基部处于可释放锁定状态；将可移除插入件插入覆盖件的开口中；在将覆盖件放置于基部上时，使可运动凸片的第一接触面与不可运动凸片的表面接合，使得覆盖件与基部在解锁状态下接合；以及调整可移除插入件的位置。
在一些实施例中，该方法还包括使可运动凸片的第二接触表面与不可运动凸片的表面接合，使得覆盖件和基部在可释放锁定状态下接合。在一些实施例中，基底包括生物样本。在一些实施例中，调整可移除插入件的位置包括将可移除插入件与生物样本的至少一部分对齐。在一些实施例中，方法还包括使可运动凸片的第二接触表面与不可运动凸片的表面接合，使得覆盖件和基部在可释放锁定状态下接合。在一些实施例中，方法还包括使生物样本与试剂接触。在一些实施例中，在覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，每个可运动凸片构造成弯曲以与不可运动凸片接合。在一些实施例中，可运动凸片的第一接触表面构造成定位在相应的不可运动凸片的表面上。在一些实施例中，在解锁状态或可释放锁定状态下，覆盖件的周向边缘与基部的周向边缘基本对齐。在一些实施例中，覆盖件和基部的配合表面在解锁状态下由间隙间隔开。在一些实施例中，间隙在尺寸上构造成便于可移除插入件在解锁状态下在覆盖件的开口内的可运动调整。
在一些实施例中，覆盖件和基部的配合表面在可释放锁定状态下直接接触。在一些实施例中，可运动凸片包括至少部分地由第一接触表面限定的槽口。在一些实施例中，不可运动凸片的第一接触表面包括成角度的表面。在一些实施例中，基部包括从基部的侧壁延伸的一对引导部。在一些实施例中，每个引导部构造成接触可运动凸片的侧表面。在一些实施例中，可移除插入件包括衬垫和联接到衬垫的突起。在一些实施例中，衬垫构造成当基底被基底保持件固定并且覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，在衬垫和基底之间形成汽密密封。在一些实施例中，衬垫构造成当基底被基底保持件固定并且覆盖件和基部处于可释放锁定状态时，在衬垫和基底之间形成流体密封。
在一些实施例中，基底保持件包括第一可移除插入件和第二可移除插入件。在一些实施例中，第一可移除插入件限定第一插入件开口，该第一插入件开口的面积大于由第二可移除插入件限定的第二插入件开口的面积。在一些实施例中，第一插入件开口的面积大约等于第二插入件开口的面积。在一些实施例中，基底保持件包括三个或更多个可移除插入件。在一些实施例中，基底是载玻片。在一些实施例中，基底包括生物样本。在一些实施例中，衬垫构造成与生物样本的至少一部分对齐。在一些实施例中，覆盖件包括从覆盖件的表面延伸的一个或多个肋。在一些实施例中，插入件开口小于覆盖件的开口。
在另一个方面，本公开涉及一种基底保持件，包括：构造成接纳基底的基部；覆盖件，覆盖件构造成与基部匹配地接合，覆盖件限定由内侧壁形成的开口；以及限定表面的可移除插入件，该可移除插入件构造成接纳在覆盖件的开口内，该可移除插入件包括：衬垫；联接到衬垫的突起；以及至少两个插入凸片，至少两个插入凸片从可移除插入件的相对侧延伸，每个插入凸片构造成与形成覆盖件的开口的内侧壁中的至少一个接合。
在一些实施例中，每个插入凸片沿相同的平面方向延伸可移除插入件的表面。在一些实施例中，插入凸片构造成与覆盖件的内侧壁接合，使得可移除插入件的表面变得与覆盖件的表面基本齐平。在一些实施例中，覆盖件的内侧壁中的至少一个是倾斜的。在一些实施例中，插入凸片包括倾斜表面，该倾斜表面构造成与覆盖件的内侧壁中的至少一个接合。在一些实施例中，倾斜表面由与覆盖件的倾斜内侧壁的角度互补的角度限定。在一些实施例中，可移除插入件构造成卡扣配合在覆盖件的开口内。在一些实施例中，可移除插入件包括三个插入凸片。在一些实施例中，衬垫包括联接到可移除插入件的衬垫壁。在一些实施例中，衬垫包括从衬垫壁的表面延伸的凸缘。在一些实施例中，可移除插入件的突起包括构造成接纳凸缘的凹部。在一些实施例中，凸缘在凹部内是可调整的或可滑动的。在一些实施例中，可移除插入件的突起包括至少一个保持凸片，该保持凸片构造成与凸缘接合。在一些实施例中，当基部不与覆盖件接合时，突起的位置在开口内可调整或可滑动。
在一些实施例中，基部包括从其侧壁中的至少两个延伸的不可运动凸片，其中，覆盖件包括构造成与基部的不可运动凸片接合的可运动凸片，并且其中，每个可运动凸片包括第一接触表面和第二接触表面，其构造成与基部的相应的不可运动凸片接合，第一接触表面构造成与相应的不可运动凸片接合，使得覆盖件和基部在解锁状态下接合，并且其中，第二接触表面构造成与相应的不可运动凸片卡合，使得覆盖件与基部处于可释放锁定状态。
在又一方面，本公开涉及一种方法，包括：将覆盖件安装在前述基底保持件的任一个的基部上，该基底保持件包括：构造成接纳基底的基部；覆盖件，覆盖件构造成与基部匹配地接合，覆盖件限定由内侧壁形成的开口；以及限定表面的可移除插入件，该可移除插入件构造成接纳在覆盖件的开口内，该可移除插入件包括：衬垫；联接到衬垫的突起；以及至少两个插入凸片，至少两个插入凸片从可移除插入件的相对侧延伸，每个插入凸片构造成与形成覆盖件的开口的内侧壁中的至少一个接合；以及，将可移除插入件插入覆盖件的开口中。
在一些实施例中，该方法还包括在使至少两个插入凸片中的至少一个与覆盖件的开口的内侧壁中的至少一个接合之后，调整可移除插入件的位置。在一些实施例中，插入可移除插入件包括将至少两个插入凸片中的至少一个与覆盖件的开口的内侧壁中的至少一个接合。在一些实施例中，插入可移除插入件包括将可移除插入件卡扣配合到覆盖件的开口中。在一些实施例中，基底保持件还包括基底。在一些实施例中，基底包括生物样本。在一些实施例中，该方法还包括使可移除插入件与生物样本的至少一部分对齐。在一些实施例中，该方法还包括使生物样本与试剂接触。
在一些实施例中，每个插入凸片沿相同的平面方向延伸可移除插入件的表面。在一些实施例中，插入凸片构造成与覆盖件的内侧壁接合，使得可移除插入件的表面变得与覆盖件的表面基本齐平。在一些实施例中，覆盖件的内侧壁中的至少一个是倾斜的。在一些实施例中，插入凸片包括倾斜表面，该倾斜表面构造成与覆盖件的内侧壁中的至少一个接合。在一些实施例中，倾斜表面由与覆盖件的倾斜内侧壁的角度互补的角度限定。在一些实施例中，可移除插入件构造成卡扣配合在覆盖件的开口内。在一些实施例中，可移除插入件包括三个插入凸片。在一些实施例中，衬垫包括联接到可移除插入件的衬垫壁。在一些实施例中，衬垫包括从衬垫壁的表面延伸的凸缘。在一些实施例中，可移除插入件的突起包括构造成接纳凸缘的凹部。在一些实施例中，凸缘在凹部内是可调整的或可滑动的。在一些实施例中，可移除插入件的突起包括至少一个保持凸片，该保持凸片构造成与凸缘接合。在一些实施例中，当基部不与覆盖件接合时，突起的位置在开口内可调整或可滑动。在一些实施例中，基部包括从其侧壁中的至少两个延伸的不可运动凸片，其中，覆盖件包括构造成与基部的不可运动凸片接合的可运动凸片，并且其中，每个可运动凸片包括第一接触表面和第二接触表面，其构造成与基部的相应的不可运动凸片接合，第一接触表面构造成与相应的不可运动凸片接合，使得覆盖件和基部在解锁状态下接合，并且其中，第二接触表面构造成与相应的不可运动凸片卡合，使得覆盖件与基部处于可释放锁定状态。
在一方面，本公开包括套件，套件包括本公开的任何基底保持件，以及用于执行本文公开的任何方法的指令。
在一些实施例中，套件还包含一种或多种测定试剂。在一些实施例中，一种或多种测定试剂包括十二烷基硫酸钠(SDS)、蛋白酶K、胃蛋白酶、 N-月桂酰肌氨酸、核糖核酸酶及其钠盐中的一种或多种。在一些实施例中，套件还包括具有第一表面和第二表面的板，第一表面包括一个或多个平台，平台构造成接纳基底保持件，并且第二表面构造成由加热装置接纳。在一些实施例中，板由金属构成。在一些实施例中，还包括磁性分离器。
在一方面，本公开包括系统，该系统包括：a)本文公开的任何基底保持件，和b)包括生物样本的基底。在一些实施例中，系统还包含一种或多种测定试剂。在一些实施例中，一种或多种测定试剂包括十二烷基硫酸钠 (SDS)、蛋白酶K、胃蛋白酶、N-月桂酰肌氨酸、核糖核酸酶及其钠盐中的一种或多种。在一些实施例中，系统还包括加热装置。在一些实施例中，系统还包括具有第一表面和第二表面的板，第一表面包括一个或多个平台，平台构造成接纳基底保持件，并且第二表面构造成由加热装置接纳。在一些实施例中，板由金属构成。在一些实施例中，还包括磁性分离器。
互联网上可获得的和本说明书中提及的所有公开物、专利、专利申请以及信息以参见的方式全部并入本文中，该引用的程度就如同将特定且单独地指明每个单独的公开物、专利、专利申请或信息项目而以参见的方式纳入一样。如果以参见方式纳入的出版物、专利、专利申请和信息项目与说明书中包含的公开内容相矛盾，则说明书旨在取代和/或优先于任何此类矛盾材料。
在以范围描述值的情况下，应当理解，该描述包括对此类范围内所有可能的子范围以及落入此类范围内的特定数值的公开，无论是否明确陈述了特定数值或特定子范围。
术语“每个”在用于指代项目集合时，旨在标识集合中的单个项目，但不一定指集合中的每个项目，除非另有明确说明，或者除非使用上下文明确另有说明。
本文描述了本公开的特征的各种实施例。然而，应当理解的是，这些实施例仅作为示例提供，并且在不脱离本公开的范围的情况下，本领域技术人员可以想到多种变型、改变和替换。还应当理解的是，本文描述的特定实施例的各种替代方案也在本公开的范围内。
附图说明
以下附图示出了本公开的特征和优点的某些实施例。这些实施例不旨在以任何方式限制所附权利要求书的范围。在附图中，相似的附图标记指示相似的元件。
图1A是处于闭合位置的示例性支承装置的俯视立体图。
图1B是图1A的支承装置的仰视立体图。
图2是处于打开位置的示例性基底保持件的立体图。
图3A是示例性插入件的俯视立体图。
图3B是图3A的插入件的仰视立体图。
图4A是示例性插入件的俯视立体图。
图4B是图4A的插入件的仰视立体图。
图5A是示例性可滑动插入件的俯视立体图。
图5B是图5A的插入件的仰视立体图。
图6是示例性支承装置的分解立体图。
图7A-7D是示例性支承装置的仰视图，示出了定位在不同位置处的插入件。
图8A-8D是示例性支承装置的仰视图，示出了定位在不同位置处的插入件。
图9A-9D是示例性支承装置的仰视图，示出了定位在不同位置处的插入件。
图10示出了其中可以利用本公开的支承装置的示例工作流。
图11A是示例性插入件的立体图。
图11B是图11A的插入件的剖视图。
图12A是用于在支承装置中装载和固定基底和一个或多个插入件的示例方法的流程图。
图12B是用于在支承装置中装载和固定基底和一个或多个插入件的示例方法的流程图。
图13示出了描述夹层工艺的示例性示意图。
图14示出了处于闭合位置的示例性支承装置的俯视立体图。
图15是示例性支承装置的剖视图。
图16A是示例性可滑动插入件的俯视立体图。
图16B是图16A的示例性可滑动插入件的仰视立体图。
图16C是图16A的示例性可滑动插入件的分解俯视图。
图17A是图14的示例性支承装置处于解锁状态的侧视立体图。
图17B是图14的示例性支承装置处于解锁状态的剖视图。
图18A是图14的示例性支承装置处于锁定状态的侧视立体图。
图18B是图14的示例性支承装置处于锁定状态的剖视图。
图19A-19E示出了用于将基底和可滑动插入件装载和固定在示例性基底保持件中的示例性方法步骤。
具体实施方式
I.介绍
本公开描述了用于生物样本的空间分析的装置和方法。该部分描述了在本公开内容的后续部分中提及的某些通用术语、分析物、样本类型和制备步骤。
1.空间分析
组织和细胞可以从任何来源获得。例如，组织和细胞可以从单细胞或多细胞生物体(例如，哺乳动物)获得。从哺乳动物、例如人类获得的组织和细胞通常具有不同的分析物水平(例如基因和/或蛋白质表达)，这会导致细胞形态和/或功能的差异。细胞或细胞子集(例如，相邻细胞和/或非相邻细胞)在组织内的位置可以影响例如细胞的命运、行为、形态以及信号传导以及与组织中其它细胞的串扰。有关哺乳动物组织中不同细胞内分析物水平(基因和/或蛋白质表达)差异的信息还可以帮助医生选择或实施有效的治疗方法，并且可以允许研究人员基于检测到的组织中不同细胞内分析物水平的差异识别和阐明细胞形态和/或单细胞或多细胞生物体(例如，哺乳动物)中的细胞功能。哺乳动物组织中不同细胞内分析物水平的差异还可提供关于组织(例如，健康和患病组织)如何起作用和/或发展的信息。哺乳动物组织中不同细胞内分析物水平的差异还可以提供组织中疾病发病机理的不同机制和组织内治疗性处理的作用机制的信息。哺乳动物组织中不同细胞内分析物水平的差异还可提供关于药物抗性机制及其在哺乳动物组织中的发展的信息。多细胞生物(例如，哺乳动物)组织中不同细胞内分析物存在或不存在的差异可以提供关于耐药机制及其在多细胞生物组织中的发展的信息。
本文提供的支承装置可以与空间分析方法一起使用，该方法以高空间分辨率提供样本内各种各样的分析物的大量分析物水平和/或表达数据，例如，同时保持天然空间背景(context)。空间分析方法包括，例如，使用捕获探针，其包括空间条形码(例如，提供关于捕获探针在细胞或组织样本(例如，哺乳动物细胞或哺乳动物组织样本)内的位置相关的信息的核酸序列)和能够结合由细胞产生和/或存在于细胞中的分析物(例如，蛋白质和/或核酸)的捕获域。
分析物与捕获探针的结合可以使用多种不同的方法来检测，例如核酸测序、荧光团检测、核酸扩增、核酸连接检测和/或核酸切割产物检测。在一些实例中，检测用于将特定空间条形码与由细胞(例如哺乳动物细胞) 产生和/或存在于细胞中的特定分析物相关联。
捕获探针可以例如附连到表面，例如坚固的阵列、凸边(bead)或盖玻片。在一些示例中，捕获探针不附连到表面。在一些示例中，捕获探针可以被封装在、嵌入在可透化组合物(例如，本文所述的任何基底)的表面内或层叠在其表面上。例如，捕获探针可以封装或设置在可透化凸边(例如，凝胶凸边)内。在一些示例中，捕获探针可以被封装在、嵌入在基底(例如，本文所述的任何示例性基底，比如水凝胶或多孔膜)的表面内或层叠在其表面上。
在一些示例中，细胞或包括细胞的组织样本与附连到基底(例如基底的表面)的捕获探针接触，并且细胞或组织样本被透化以允许分析物从细胞中释放出来并与附连到基底的捕获探针结合。在一些示例中，可以使用多种方法，例如电泳、化学梯度、压力梯度、流体流动或磁场来将从细胞释放的分析物主动引导至附连到基底的捕获探针。
在PCT/US2019/065100中描述了支承装置的非限制性方面，其全部内容以参见的方式纳入本文并可在本文中以任何组合使用。本文描述了支承装置的其它非限制性方面。
(a)一般术语
(i)生物样本
本公开中描述的装置和方法可用于支承构造成接纳一种或多种生物样本的基底。如本文所使用的，“生物样本”是可从被试获得的用于使用多种技术中的任一种进行分析的样本，这些技术包括但不限于活检、手术和激光捕获显微术(LCM)，并且通常包括来自被试的细胞和/或其它生物材料。除了下面描述的被试，生物样本可以从非哺乳动物生物体(例如，植物、昆虫、蛛形纲动物、线虫(例如，秀丽隐杆线虫)、真菌、两栖动物或鱼(例如，斑马鱼))获得。生物样本可以从以下来源获得：诸如细菌之类的原核生物，例如大肠杆菌、葡萄球菌或肺炎支原体；古生菌；病毒，比如丙型肝炎病毒或人类免疫缺陷病毒；或类病毒。生物样本可以从真核生物获得，例如源自患者的类器官(PDO)或源自患者的异种移植物(PDX)。生物样本可以包括类器官，这是在体外产生的器官的微型化和简化版本，可在三个维度上示出逼真的显微解剖结构。类器官可以从组织的一种或多种细胞、胚胎干细胞和/或诱导多能干细胞产生，归因于它们的自我更新和分化能力，它们可以在三维培养中自我组织。在一些实施例中，类器官是脑类器官、肠类器官、胃类器官、舌类器官、甲状腺类器官、胸腺类器官、睾丸类器官、肝类器官、胰腺类器官、上皮类器官、肺类器官、肾脏类器官、原肠胚、心脏类器官或视网膜类器官。可以从中获得生物样本的被试可以是健康或无症状的个体、患有或疑似患有疾病(例如，癌症)或易患疾病的个体和/或需要治疗或疑似需要治疗的个体。
生物样本可以来自本文提及的被试或生物体的同质培养物或群体，或者来自例如群落或生态系统中的几种不同生物体的集合。
生物样本可以包括一种或多种患病细胞。患病细胞可以具有改变的代谢特性、基因表达、蛋白质表达和/或形态特征。疾病的示例包括炎症性疾病、代谢性疾病、神经系统疾病和癌症。癌细胞可以取自实体瘤、恶性血液病、细胞系，或作为循环肿瘤细胞获得。
生物样本还可以包括胎儿细胞。例如，可以执行诸如羊膜穿刺术之类的程序以从母体循环中获得胎儿细胞样本。胎儿细胞的序列可以用于识别多种遗传疾病中的任何一种，包括例如非整倍体，比如唐氏综合征、爱德华兹综合征和帕陶综合征。进一步地，胎儿细胞的细胞表面特征可以用于识别多种病症或疾病中的任何一种。
生物样本还可以包括免疫细胞。对包括基因组、蛋白质组和细胞表面特征的这些细胞的免疫组库的序列分析可以提供丰富的信息，以有助于了解免疫系统的状态和功能。作为示例，在自体干细胞移植后确定多发性骨髓瘤(MM)患者的微小残留病(MRD)状态(例如阴性或阳性)被认为是MM患者中的MRD的预测因子(参见，例如，美国专利申请公开第 2018/0156784号，其全部内容以参见的方式纳入本文)。
生物样本中免疫细胞的示例包括但不限于B细胞、T细胞(例如细胞毒性T细胞、自然杀伤T细胞、调节性T细胞和T辅助细胞)、自然杀伤细胞、细胞因子诱导的杀伤(CIK)细胞、诸如粒细胞(嗜碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞/超节段中性粒细胞)之类的髓细胞、单核细胞/ 巨噬细胞、肥大细胞、血小板/巨核细胞和树突细胞。
生物样本可以包括任何数量的大分子，例如细胞大分子和细胞器(例如，线粒体和细胞核)。生物样本可以是核酸样本和/或蛋白质样本。生物样本可以是碳水化合物样本或脂质样本。生物样本可以作为组织样本获得，比如组织切片、活检、核心活检、针吸物或细针吸物。样本可以是液体样本，比如血液样本、尿液样本或唾液样本。样本可以是皮肤样本、结肠样本、面颊拭子、组织学样本、组织病理学样本、血浆或血清样本、肿瘤样本、活细胞、培养细胞、临床样本例如全血制品或血液来源的制品、血细胞或培养的组织或细胞，包括细胞悬液。
无细胞生物样本可以包括细胞外多核苷酸。细胞外多核苷酸可以从身体样本中分离，例如血液、血浆、血清、尿液、唾液、黏膜排泄物、痰、粪便和眼泪。生物样本可以包括单一感兴趣的分析物，或多于一种感兴趣的分析物。
(ii)被试
如本文所使用的，术语“被试”是诸如哺乳动物(例如，人类或非人类猿)或禽类(例如，鸟类)之类的动物，或诸如植物之类的其它生物体。被试的示例包括但不限于哺乳动物，比如啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、豚鼠、有蹄类动物、马、绵羊、猪、山羊、牛、猫、狗、灵长类动物(即人类或非人类灵长类动物)；植物，比如拟南芥、玉米、高粱、燕麦、小麦、水稻、油菜或大豆；藻类，比如莱茵衣藻；线虫，比如秀丽隐杆线虫；昆虫，比如黑腹果蝇、蚊子、果蝇或蜜蜂；蛛形纲动物，比如蜘蛛；鱼，比如斑马鱼；爬行动物；两栖动物，比如青蛙或非洲爪蟾；盘基网柄菌；真菌，比如卡氏肺孢子菌、红鳍东方鲀、酵母、酿酒酵母或粟酒裂殖酵母；或恶性疟原虫。
(iii)基底附连
在一些实施例中，生物样本可以附连到基底。以下详细描述适用于该目的的基底的示例。生物样本的附连可以是不可逆的或可逆的，这取决于样本的性质和分析方法中的后续步骤。
在某些实施例中，通过将合适的聚合物涂层施加至基底并使样本与聚合物涂层接触，样本可以可逆地附连到基底。然后可以使用至少部分溶解聚合物涂层的有机溶剂将样本从基底分离。水凝胶是适用于此目的的聚合物的示例。
更一般地，在一些实施例中，基底可以用一种或多种物质涂覆或功能化以有助于样本与基底的附连。可以用于涂覆或功能化基底的合适物质包括但不限于凝集素、聚赖氨酸、抗体和多糖。
(iv)基底
对于使用基底的分析方法(例如，基于空间阵列的分析方法)，基底起到将捕获探针直接或间接附连至阵列特征的支承件的作用。此外，在一些实施例中，基底(例如，相同的基底或不同的基底)可以用于为生物样本，特别是例如薄组织切片提供支承。因此，如本文所使用的，“基底”是不溶于水性液体并且允许将生物样本、分析物、特征和/或捕获探针定位在基底上的支承件。
此外，本文所用的“基底”，并且当前面没有修饰语“化学”时，是指具有至少一个表面的构件，该表面通常起到为生物样本、分析物和/或可用于各种分析方法的任何其它化学和/或物理部分、试剂和结构提供物理支承的作用。基底可以由多种坚固的材料、凝胶基材料、胶体材料、半坚固的材料(例如，至少部分交联的材料)、完全或部分固化的材料以及经历相变或转变以提供物理支承的材料。可以用于本文所述的方法和装置中的基底的示例包括但不限于载物片(例如由各种玻璃形成的载物片、由各种聚合物形成的载物片)、水凝胶、层和/或薄膜、膜(例如、多孔膜)、晶片、板或它们的组合。在一些实施例中，如下文将进一步详细讨论的，基底能够可选地包括功能元件，比如凹部、突出结构、微流体元件(例如，通道、储存器、电极、阀、密封件)和各种标记。
1)基底属性
基底通常可以具有可以由本文公开的装置容纳的任何合适的形式或格式。例如，基底可以是平坦的、弯曲的，例如朝向生物样本(例如，组织样本)和基底之间发生相互作用的区段凸出地弯曲或凹入地弯曲。在一些实施例中，基底是平坦的，例如平面、芯片(chip)或载物片。基底可以在基底内包含一个或多个图案化表面(例如，通道、井孔、突起、脊部、草痕状(divot)等)。
基底可以是任何期望的形状。例如，基底典型地可以是薄的、平坦的形状(例如，正方形或矩形)。在一些实施例中，基底结构具有圆角(例如，为了增加安全性或坚固性)。在一些实施例中，基底结构具有一个或多个截角(例如，用于与载物片夹具或十字工作台一起使用)。在一些实施例中，当基底结构是平坦的时，基底结构可以是任何合适类型的具有平坦表面的支承件(例如，芯片或载物片，比如显微镜载物片)。
基底能够可选地包括各种结构，比如但不限于突起、脊部和通道。可以对基底进行微图案化以限制侧向扩散(例如，防止空间条形码重叠)。可以对用此类结构修改的基底进行修改，以允许分析物、特征(例如，凸边)或单独部位处的探针的关联。例如，其中用各种结构修改基底的部位可以是与其它部位连续的(例如，当装置处于闭合位置时，这些部位可以位于基底的被衬垫开口中的一个封围的区段内)或与其它部位不连续的(例如，当支承装置处于闭合位置时，第一部位可以位于基底的被第一衬垫开口封围的第一区段内，而第二部位可以位于基底的被第二衬垫封围的第二区段内)。
在一些实施例中，可以修改基底的表面，使得形成仅可以具有或容纳单个特征的离散部位。在一些实施例中，可以修改基底的表面，使得特征粘附到随机部位(例如，当支承装置处于闭合位置时，基底的由衬垫开口封围的区段内的随机部位)。
在一些实施例中，使用诸如(但不限于)冲压、微蚀刻或模制技术之类的技术来修改基底的表面以包含一个或多个井孔。在其中基底包括一个或多个井孔的一些实施例中，基底可以是凹面载物片或空腔载物片。例如，可以通过基底表面上的一个或多个浅的凹陷部形成井孔。在一些实施例中，当基底包括一个或多个井孔时，可以通过将盒(例如，包含一个或多个腔室的盒)附连到基底结构的表面来形成井孔。
在一些实施例中，基底的结构(例如，井孔或特征)可以各自承载不同的捕获探针。附连到每个结构的不同捕获探针可以根据结构在基底表面中或表面上的位置来识别。示例基底包括其中分离结构位于基底上的阵列，包括例如具有容纳特征的井孔的那些。
在基底被修改为包含一种或多种结构，包括但不限于井孔、突起、脊、特征或标记的一些实施例中，该结构可以包括物理地改变的部位。例如，用各种结构改性的基底可以包括物理特性，包括但不限于物理构造、磁力或压缩力、化学功能化部位、化学改变部位和/或静电改变部位。在基底被修改为包含各种结构，包括但不限于井孔、突起、脊、特征或标记的一些实施例中，该结构以图案施加。或者，结构可以随机分布。
基底(例如，或阵列上的凸边或特征)可以包括数万至数十万或数百万个单独的寡核苷酸分子(例如，至少约10,000、50,000、100,000、500,000、 1,000,000、10,000,000、100,000,000、1,000,000,000或10,000,000,000个寡核苷酸分子)。
在一些实施例中，基底包括在基底表面上的一个或多个标记，例如以提供用于将空间信息与感兴趣的分析物的表征相关联的指导。例如，可以用线网格标记基底(例如，以允许容易地估计在放大下看到的物体的尺寸和/或提供用于计数物体的参考区段)。在一些实施例中，可以在基底上包括基准标记。可以使用包括但不限于印制、喷砂和沉积在表面上的技术来制作此类标记。
多种不同的基底可用于上述目的。通常，基底可以是任何合适的支承材料，其可以被所公开的装置容纳。示例性基底包括但不限于玻璃、改性和/ 或功能化玻璃、水凝胶、薄膜、膜、塑料(包括例如丙烯酸树脂、聚苯乙烯、苯乙烯和其他材料的共聚物、聚丙烯、聚乙烯、聚丁烯、聚氨酯、特氟龙TM、环烯烃、聚酰亚胺等)、尼龙、陶瓷、树脂、日本瑞翁(Zeonor)、包括硅和改性硅的二氧化硅或二氧化硅基材料、碳、金属、无机玻璃、光纤束和聚合物，如聚苯乙烯、环烯烃共聚物(COC)、环烯烃聚合物(COP)、聚丙烯、聚乙烯聚碳酸酯或其组合。
在以上讨论的基底材料的示例中，聚苯乙烯是适合结合带负电荷的大分子的疏水材料，因为它通常含有很少的亲水基团。对于固定在载玻片上的核酸，通过增加玻璃表面的疏水性，可以增加核酸的固定化。这种增强可以允许相对更加紧密塞填的构成(例如，提供改进的特异性和分辨率)。
2)导电基底
在一些实施例中，基底可以是导电基底。如本文所述产生的导电基底 (例如，电泳相容阵列)可用于分析物的空间检测。
在一些实施例中，导电基底可以包括玻璃(例如，载玻片)，其已涂覆有物质或以其它方式修改以赋予玻璃导电特性。在一些实施例中，载玻片可以涂覆有导电涂层。在一些实施例中，导电涂层包括氧化锡(TO)或氧化铟锡(ITO)。在一些实施例中，导电涂层包括透明导电氧化物(TCO)。在一些实施例中，导电涂层包括掺铝氧化锌(AZO)。在一些实施例中，导电涂层包括掺氟氧化锡(FTO)。
在一些实施例中，可以在导电基底(例如，本文所述的任何导电基底) 上产生用寡核苷酸(例如，捕获探针)点样或印制的阵列。例如，本文所述的阵列可以与活性分析物捕获方法(例如，包括但不限于电泳捕获方法) 兼容。在一些实施例中，导电基底是多孔介质。可以用于采用活性分析物捕获的方法中的多孔介质的非限制性示例包括硝化纤维素或尼龙膜。在一些实施例中，可以用于本文所述的采用活性分析物捕获的方法中的多孔介质包括纸。在一些实施例中，寡核苷酸可以印制在纸基底上。在一些实施例中，印制的寡核苷酸可以与基底相互作用(例如，与纸的纤维相互作用)。在一些实施例中，印制的寡核苷酸可以共价地结合基底(例如，结合到纸的纤维)。在一些实施例中，分子前体溶液中的寡核苷酸可印制在导电基底(例如，纸)上。在一些实施例中，分子前体溶液可以聚合，从而在导电基底(例如，纸)上产生凝胶垫。在一些实施例中，分子前体溶液可以通过光聚合(例如，光固化)。在一些实施例中，可以将含有寡核苷酸(例如，条形码化的寡核苷酸，比如捕获探针)的凝胶珠印制在导电基底(例如，纸)上。在一些实施例中，印制的寡核苷酸可以共价附连到凝胶基质中。
3)涂层
在一些实施例中，基底的表面可以涂覆有细胞许可涂层，以允许活细胞的粘附。“细胞许可涂层”是允许或帮助细胞在基底上维持细胞活力(例如，保持存活)的涂层。例如，细胞许可涂层可以增强细胞附连、细胞生长和/或细胞分化，例如，细胞许可涂层可以向活细胞提供营养。细胞许可涂层可以包括生物材料和/或合成材料。细胞许可涂层的非限制性示例包括以一种或多种细胞外基质(ECM)成分(例如，蛋白多糖和纤维蛋白，比如胶原蛋白、弹性蛋白、纤连蛋白和层粘连蛋白)、聚赖氨酸、聚(L)- 鸟氨酸和/或生物相容性硅树脂(例如，
)为特征的涂层。例如，包括一种或多种细胞外基质成分的细胞许可涂层可以包括I型胶原蛋白、II型胶原蛋白、IV型胶原蛋白、弹性蛋白、纤维蛋白、层粘连蛋白和/或玻璃纤维蛋白。在一些实施例中，细胞许可涂层包括从 Engelbreth-Holm-Swarm(EHS)小鼠肉瘤中提取的溶解基底膜制剂(如
)。在一些实施例中，细胞许可涂层包括包括胶原蛋白。细胞许可涂层可用于在空间条码阵列上培养粘附细胞，或在与空间条码阵列接触时保持组织样本或切片的细胞活力。
在一些实施例中，基底涂覆有表面处理剂，比如聚(L)-赖氨酸。附加地或替代地，基底可以通过硅烷化处理，例如，用环氧硅烷、氨基硅烷和/或用聚丙烯酰胺处理。
在一些实施例中，对基底进行处理，以尽量减少或降低特征内部或之间的非特异性分析物混杂。例如，处理可以包括用对非特异性混杂形成物理屏障的水凝胶、薄膜和/或膜涂覆基底。可以使用任何合适的水凝胶。例如，可以使用根据美国专利第6,391,937号、第9,512,422号和第9,889,422 号以及美国专利申请公布第U.S.2017/0253918号和第U.S.2018/0052081号中提出的方法制备的水凝胶基质。上述每篇文献的全部内容均以参见的形式纳入本文。
处理可以包括添加具有反应性或能够被激活的官能团，使其在施加刺激后变得具有反应性(例如，光反应性官能团)。处理可以包括用具有一种或多种物理特性(例如，机械、电、磁和/或热)的聚合物进行处理，以尽量减少非特异性结合(例如，在某些位置激活基底以允许在这些位置进行分析物混杂)。
“可移除涂层”是指在应用释放剂后可从基底的表面移除的涂层。在一些实施例中，可移除涂层包括本文所述的水凝胶，例如，包括多肽基材料的水凝胶。具有多肽基材料的水凝胶的非限制性示例包括以蜘蛛丝和人类肌肉L型钙通道的跨膜段相结合为特征的合成肽基材料(例如，
)、一种含有重复的精氨酸-丙氨酸-天冬氨酸-丙氨酸序列(RADARADARADA)的两亲性16残基肽(例如，
)、EAK16(AEAEAKAKAEAEAKAK)、KLD12(KLDLKLDLKLDL)、以及PGMATRIXTM。
在一些实施例中，可移除涂层中的水凝胶是刺激反应性水凝胶。刺激反应性水凝胶可以在应用一个或多个外部触发器(例如，释放剂)时发生凝胶到溶液和/或凝胶到固体的转变。参见Willner的Acc.Chem.Res.(化学研究述评)50：657-658，2017，该文献全文以参见的方式纳入本文。刺激反应性水凝胶的非限制性示例包括热反应性水凝胶、pH反应性水凝胶、光反应性水凝胶、氧化还原反应性水凝胶、分析物反应性水凝胶或其组合。在一些实施例中，刺激反应性水凝胶可以是多刺激反应性水凝胶。
“释放剂”或“外部触发器”是指当释放剂应用于可移除涂层时，允许从基底移除可移除涂层的一种制剂。外部触发器或释放剂可以包括物理触发器，如热、磁、超声波、电化学和/或光刺激，以及化学触发器，比如 pH值、氧化还原反应、超分子复合物和/或生物催化驱动反应。例如，参见 Echeverria等人的Gels(2018)，4454：doi：10.3390/gels4020054，该文献全文以参见的方式纳入本文。“释放剂”或“外部触发器”的类型可以取决于可移除涂层的类型。例如，具有氧化还原反应水凝胶的可移除涂层可以在应用包括诸如二硫苏糖醇(DTT)之类的还原剂的释放剂时被移除。作为另一个示例，pH反应性水凝胶可以在施加改变pH值的释放剂时被移除。在一些实施例中，生物样本可以被限制在特定的区域或区段。例如，生物样本可以固定于载玻片以及位于生物样本上的腔室、衬垫或笼架，以充当生物样本存放在其中的容纳区域或框架。
序列ID编号：7 GGTGACTCTAGATAACCT
(v)捕获探针
“捕获探针”是指能够捕获(直接或间接)和/或标记生物样本中的分析物(例如，感兴趣的分析物)的任何分子。
在一些实施例中，捕获探针是核酸或多肽。在一些实施例中，捕获探针包括条形码(例如，空间条形码和/或唯一分子标识符(UMI)和捕获域)。
在一些实施例中，捕获探针可以包括劈裂域和/或功能域(例如，引物结合位点，比如用于下一代测序(NGS))。
2.附加的支承装置实施例
在一些实施例中，支承装置可以是用于加热基底的系统(例如，如 PCT/US2019/065100中所述的系统3102，其全文以参见的方式纳入本文) 的一部分，其还可以包括板。该板可以构造成由加热装置(例如，热循环器)接纳，并在加热装置和支承装置之间提供热传递。支承装置(例如 PCT/US2019/065100中所述的基底保持件3150)可以保持一个或多个基底 (比如一个或多个载玻片)，并且能够可移除地联接到板，以有助于热量从板传递至一个或多个基底。该支承装置可以包括底部构件和顶部构件。在一些实施例中，基底装置还可以包括载物片。在一些实施例中，支承装置可以包括定位在支承装置内部的衬垫。在一些实施例中，支承装置可以包括用于联接底部构件和顶部构件的接合机构(例如，螺钉)。
在一些实施例中，支承装置可以是单件式部件(例如，如 PCT/US2019/065100中所述的基底保持件4400)，其接纳衬垫和基底。在一些实施例中，支承装置可以包括一个或多个紧固件(比如 PCT/US2019/065100中所述的侧部安装的压力闭锁件4410)，用于基底的卡扣接合。在一些实施例中，支承装置还可以包括一个或多个凸片(例如，如PCT/US2019/065100中所述的第一凸片4412a和第二凸片4412b)，这些凸片构造成接合基底。支承装置可以包括限定多个孔的底表面，这些孔构造成与衬垫的多个孔对齐。
在一些实施例中，支承装置可以包括顶部部件和底部部件，它们经由从底部部件的侧壁延伸的一个或多个铰链(例如，如PCT/US2019/065100 中所述的铰链7360)连接。支承装置还可以包括从顶部部件的侧壁突出的一个或多个接合特征(例如，如PCT/US2019/06510中所述的第一槽口7358a 和第二槽口7358b)，这些特征构造成与从底部部件的侧壁突出的一个或多个凸片接合，从而使支承装置能够闭合。
II.支承装置
总体参照图1A-9D，示例性支承装置的实施例可以包括基底(例如，载玻片)和基底保持件。基底保持件可以包括覆盖件、基部和包括衬垫的插入件。在一些实施例中，插入件是可移除的、可调整的插入件，其构造成由覆盖件限定的开口接纳。在一些实施例中，插入件包括衬垫和突起(也可以称为支承件、框架等)。在一些实施例中，衬垫构造成接触基底的表面(例如，第一表面)。在一些实施例中，插入件的位置可以调整和/或在覆盖件的开口内和在基底的表面上滑动。本文所公开的支承装置可以通过提供可调整和/或可滑动的插入件来提供可由支承装置容纳的样本(定位在基底上)的数量、位置和尺寸方面的多功能性。在一些实施例中，插入件的衬垫可以通过调节插入件容易地与基底上的样本的至少一部分对齐。
在一些实施例中，覆盖件和基部通过一个或多个可断开铰链可移除地连接。在一些实施例中，基底保持件是使用注射模制技术制造的。在一些实施例中，插入件是使用注射模制技术制造的。用于制造本公开的支承装置的非限制性材料包括聚丙烯均聚物。在一些实施例中，基底保持件是一次性的。在一些实施例中，基底保持件是可重复使用的。一些实施例中，基底保持件是可重复使用的。例如，在一些实施例中，基底保持件可以在重新使用之前被清洗、消毒(例如，高压灭菌)和/或杀菌。
在一些实施例中，基底保持件接纳基底，比如载物片，例如载玻片。在一些实施例中，基底保持件包括附连机构，用于将基底联接和/或固定至基底保持件。覆盖件可以包括从覆盖件的表面基本上向上延伸的一个或多个肋。此外，基部可以构造成接纳基底。
在一些示例中，支承装置还可以包括至少一对锁定凸片，其中每个锁定凸片包括联接到覆盖件的第一侧壁的可运动凸片以及联接到基部的第一侧壁的不可运动凸片。在其它示例中，每个锁定凸片包括联接到基部的第一侧壁的可运动凸片，以及联接到覆盖件的第一侧壁的不可运动凸片。可运动凸片可以构造成与不可运动凸片接合，以将覆盖件可释放地固定到基部。在一些实施例中，这对锁定凸片的第一锁定凸片的长度大于这对锁定凸片的第二锁定凸片的长度。
在一些示例中，覆盖件和基部通过至少一个铰链可脱开地连接。在一些实施例中，铰链可以是可断开铰链。在一些实施例中，覆盖件和基部通过两个或多个铰链可枢转地连接在一起。在一些实施例中，至少一个铰链从覆盖件的第二侧壁延伸至基部的第二侧壁。例如，当基底保持件处于闭合位置时，覆盖件可以构造成与基部接合，以固定基底和插入件，包括在覆盖件与基部之间的衬垫。在一些实施例中，覆盖件和基部未连接或脱开。在一些实施例中，覆盖件和基部最初是连接的，随后通过一个或多个可断开铰链的断开而未连接。
此外，支承装置可以包括构造成接纳样本的基底(例如，载玻片)。
在一些实施例中，样本可以是生物样本。在一些实施例中，样本可以是本公开中其它地方限定的任何生物样本。该基底包括第一表面和第二表面。在一些示例中，基底的至少一个表面构造成接纳样本。在一些实施例中，基底包括一个或多个接收样本的样本区域。在一些示例中，样本区域接纳一个或多个样本。在一些实施例中，样本区域用标记标识，该标记提供识别基底上的样本位置的视觉标记(例如，参见图6的664)。
图1A和1B示出了处于闭合位置的示例性支承装置100。支承装置100 包括基底保持件101和基底110。具体地，图1示出了具有基部134和覆盖件136的基底保持件101。覆盖件136限定了盖开口121。当支承装置处于闭合位置时，盖开口121可以允许接近基底的样本区域(例如，组织载玻片)。在一些实施例中，盖开口121可以为用户提供通向基底(例如，基底上的样本区域)的通路，以例如当支承装置处于闭合位置时查看样本区域上的样本和/或将溶液直接递送到样本区域上的样本或基底的表面上。在一些实施例中，盖开口121可以被限定为使得当覆盖件136定位在基部134 上方时(例如，当支承装置100处于闭合位置时)至少部分地与基部开口重叠(例如，参见图2中的基部开口220)。
基部的尺寸定为接纳基底(例如，载物片)。在一些实施例中，基部 134和覆盖件136的尺寸和形状定为适应任何合适的基底和/或插入件。例如，在一些实施例中，基部134和覆盖件136可以具有矩形、圆形、正方形、三角形或任何其它合适的形状。基部134和覆盖件136可以具有第一对侧壁103和第二对侧壁105，其尺寸和形状定为容纳任何合适的基底和/ 或插入件。例如，在一些实施例中，基部134和覆盖件136的壁可以具有任何合适的尺寸(例如，长度、宽度、厚度等)以容纳任何合适的基底和/ 或插入件。如图1A和1B所示，基部134和覆盖件136具有基本上矩形的形状。
支承装置100可以包括一个或多个插入件172、173，其构造成接纳在盖开口121内。插入件172、173可以为用户提供端口或插入件开口尺寸的灵活性，这可能有利于有效地接近设置在基底的表面区段的任何给定部分上(例如，在一个或多个样本区域上或在样本区域之间的区段中)的样本。支承装置可以构造成包括单个插入件或多个插入件。图1A-1B的支承装置 100包括两个插入件172、173。在一些实施例中，支承装置100可以包括三个、四个、五个或更多个插入件。
插入件172、173可以限定允许接近基底(例如载物片)的开口，该基底可以在其表面上包括生物样本。在一些实施例中，每个插入件可限定一个或多个开口(例如，约1至2个、2至3个、3至4个或更多个开口)。在一些实施例中，由单个插入件限定的一个或多个开口可以为用户提供接近基底上样本的一个或多个密封部分的通路。插入件以及插入件开口可以根据需要形成为各种形状。插入件和插入件开口的非限制性示例形状可以包括多边形、诸如正方形、矩形、三角形、圆形，或任何其它合适的形状，比如不规则或圆形。
支承装置的一个或多个插入件172、173的尺寸可以定为适应任何样本区域。在一些实施例中，支承装置100包括具有相同形状和大小(例如，一个或多个尺寸)的彼此大约相等的多个插入件。在一些实施例中，支承装置100包括具有不同大小和形状的多个插入件。例如，在一些实施例中，第一插入件具有的大小和/或尺寸可以大于第二插入件的大小和/或尺寸。在一些实施例中，第一插入件具有的大小和/或尺寸可以小于第二插入件的大小和/或尺寸。在一些实施例中，支承装置100包括三个或更多个插入件，其大小和/或尺寸彼此大约相等。在一些实施例中，支承装置100包括三个或更多个插入件，其大小和/或尺寸彼此不相等。在一些实施例中，插入件和插入件的开口可以具有任何合适的大小和/或尺寸。
返回参照图1A和1B，支承装置100包括第一插入件172和第二插入件173，它们构造成被接纳在盖开口121内。第一插入件172限定第一插入件开口174，而第二插入件173限定第二插入件开口175。第一插入件开口 174和第二插入件开口175是方形的形状并且具有边长s1、s2。边长s2大于边长s1，因此，第二插入件开口175的面积大于第一插入件开口174的面积。在一些实施例中，边长s2比边长s1大至少约10％至约100％。在一些实施例中，边长s2比边长s1大至少约50％。在一些实施例中，边长s2 比边长s1大至少约10％至20％、约20％至30％、约30％至40％、约40％至50％、约50％至60％、约60％至70％、约70％至80％、约80％至90％或约90％至100％。在一些实施例中，第一插入件开口174和第二插入件开口175可以为用户提供通向基底(例如，基底上的样本区域)的通路，以例如当支承装置处于闭合位置时查看样本区域上的样本和/或将溶液直接递送到样本区域上的样本或基底的表面上。
在一些实施例中，插入件172、173可以为用户提供不同尺寸的端口，端口构造成提供通向各种尺寸的样本区域的通路，和/或提供通向一个或多个样本区域的各个部分的通路。例如，插入件开口(例如，参见开口174) 可以为用户提供相对于样本区域(例如，参见图7A-7D)大小等于或更小的端口或开口面积。在一些实施例中，较小的端口可能有利于有效地接近占据小于样本区域(例如，位于较大样本区域内的样本)的总表面积的表面积的样本(例如，占据至少约5％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％或50％至75％的样本)。在各种示例实施例中，插入件开口(例如，开口175)可以为用户提供相对于样本区域(例如，参见图 8A-8D)具有更大面积的端口或开口。在一些实施例中，较大的端口可能有利于有效地接近占据样本区域的总表面积的大约50％至100％(例如，占据至少约50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％或90％至100％) 的表面积的样本。
在一些实施例中，插入件包括构造成封闭和/或密封支承装置的基底(例如，载玻片)的表面上的区段的衬垫。在一些实施例中，衬垫可以具有正方形、圆形、矩形、三角形或任何其它合适的形状。在一些实施例中，本公开的衬垫具有任何合适的大小和/或尺寸以容纳任何数量的样本、一个或多个样本区域的任何区段、和/或基底表面的任何区段。
如图1A和1B所示，第一插入件172和第二插入件173各自包括衬垫 180，衬垫180分别形成围绕第一插入件开口174和第二插入件开口175的周边，并在第一插入件172和第二插入件173的顶表面176下方竖直地延伸。当支承装置100处于闭合构造时，衬垫180构造成接触基底110并形成密封件(例如，不透蒸气密封件、不透液密封件和/或不透气密封件)。在一些实施例中，衬垫180是包覆模制的衬垫。在一些实施例中，衬垫180 固定地联接到顶表面176。在一些实施例中，覆盖件136在衬垫180上施加压力，当基底保持件201处于闭合位置时，衬垫又在基底110上施加压力。
支承装置100可以包括一个或多个结构(例如肋)以限制装载的基底 (例如，放置在支承装置的基部中的基底)的移动和/或位置(例如，倾斜)，使得由一个或多个衬垫形成的密封件不会受到损害(例如，不会破裂)。一个或多个结构可以包括一个或多个肋(例如，参见图2中的多个肋218)，其构造成支承基底110并有助于确保保持衬垫180的密封。在一些实施例中，一个或多个结构可以包括附连凸片，其为基底提供支承并将基底固定到基部134。在一些实施例中，基部134限定有锥形壁，该锥形壁构造成将装载的基底压配合到基部134中。在一些实施例中，一个或多个结构可以由刚性件或橡胶制成。在一些实施例中，该结构是邻近基部134的侧壁的框架。
在一些实施例中，第一插入件172和第二插入件173以及衬垫180定位成使得当基底110设置在基底保持件101中并且基底保持件101处于闭合位置时，在衬垫180和基底110之间形成汽密密封。在一些实施例中，在衬垫180和基底110之间形成气密密封和/或液密密封。在一些实施例中，当覆盖件136处于闭合位置时，衬垫180构造成防止液体在一个或多个基底井孔(例如基底110的一个或多个样本区域)之间输送。
支承装置100可以包括一个或多个沿盖开口周边的凹部、引导部或导轨，其构造成接纳和/或支承一个或多个插入件。例如，在一些实施例中，插入件具有平坦的突起、向外延伸的边缘或构造成搁置在凹部、引导部或导轨上的突起。在一些实施例中，代替包括一个或多个凹部、引导部或导轨，支承装置具有盖开口，该盖开口具有构造成接纳和/或支承一个或多个插入件的成角度的边缘。在一些实施例中，凹部、引导部或导轨的尺寸被相应地确定以容纳任何合适的基底。例如，参照图1B，覆盖件136包括从凹部壁127延伸并限定覆盖件136的开口121的凹部123(在图2中最好被视为凹部223)。凹部壁127从底(内)表面132延伸并朝向在覆盖件136 的外表面。呈向外延伸的突起178形式的凹部接口结构可以包括在插入件 172、173中。突起178从第一插入件172和第二插入件173的所有四个侧部向外延伸。在一些实施例中，突起178可以从第一插入件172和第二插入件173的两侧向外延伸。突起178在支承装置100的相反方向上(例如，在相对于第一对侧壁103的正交方向上或在相对于第二对侧壁105的平行方向上)向外延伸，以与凹部壁127接合(例如，参见图2的227)和/或使第一插入件172和第二插入件173在大致平行于第一对侧壁103的方向上在凹部123上移动(例如，滑动)，如图1B中的箭头112所示。
在一些实施例中，当支承装置100处于闭合构造时(例如，当支承装置100被锁定时)，第一插入件172和第二插入件173不可滑动。在一些实施例中，第一插入件172和第二插入件173是可滑动的并且构造成当支承装置100处于未锁定构造时(例如，当覆盖件136放置在基部134上方但没有锁定机构还未接合时)，接合一个或多个凹部壁127。在一些实施例中，第一插入件172和第二插入件173是可滑动的，以使用户能够调整第一插入件172和第二插入件173相对于基底110的位置。在一些实施例中，将至多一个插入件装载到支承装置100上。在一些实施例中，将至少一个插入件装载到支承装置100上。在一些实施例中，将两个插入件装载到支承装置100上。
在一些实施例中，支承装置可以包括一个或多个便于覆盖件和基部接合的固定特征。在一些实施例中，支承装置可以包括至少一个、两个、三个、四个或更多个便于覆盖件和基部接合的固定特征。在一些实施例中，固定特征的尺寸定为适应支承装置的尺寸。在一些实施例中，当支承装置包括至少两个或更多个固定特征时，每个固定特征的尺寸可以彼此相等或可以彼此不同。在一些实施例中，一个或多个固定特征是能够使覆盖件与基部接合的磁体(例如，磁性闭合件)。在一些实施例中，一个或多个固定特征是能够使覆盖件与基部接合的互锁特征(例如，卡扣配合的连接器、压配合的连接器或其组合)。在一些实施例中，一个或多个固定特征是能够使覆盖件与基部接合的锁定凸片。在一些实施例中，可以使用允许基部与覆盖件可释放地接合的任何类型的紧固件，比如例如，磁力紧固件、卡扣配合件、钩环紧固件、按压式闭锁件、螺钉、压配合式连接件(例如，杠杆、夹子或夹持件)，或其任何组合。在一些实施例中，基底保持件还可以包括一个或多个弹簧加载的紧固件。
如图1A和1B所示，基底保持件101可以包括至少一对锁定凸片107，锁定凸片构造成用覆盖件136可释放地固定、闭合、锁定、紧固和/或接合基部134。每个锁定凸片107可以包括联接到覆盖件136的第一侧壁103 的可运动凸片106和联接到基部134的第一侧壁103的不可运动凸片108。在一些实施例中，可运动凸片106构造成与不可运动凸片108接合，以将覆盖件136可释放地固定到基部134。在替代示例中，可运动凸片106可联接到覆盖件136的第二侧壁105，不可运动凸片108可联接到基部134的第二侧壁105。在一些实施例中，一个或多个锁定凸片107可联接到第一侧壁 103中的一个或两个，和/或一个或多个锁定凸片107可联接到第二侧壁105 中的一个或两个。在一些实施例中，可运动凸片106和覆盖件136是一体连结的(例如，固定地附连)。在一些实施例中，不可运动凸片108和基部134是一体连结的。在一些示例中，基底保持件101可以包括多个锁定凸片107(例如，至少2、3、4或5对锁定凸片107)。在一些实施例中，基底保持件101包括一个锁定凸片。
基底保持件101可以包括锁定凸片158，该锁定凸片构造成用覆盖件 136可释放地固定、关闭、锁定、紧固和/或接合基部134。锁定凸片158 可以包括联接到覆盖件136的第一侧壁103的可运动凸片162和联接到基部134的第一侧壁103的不可运动凸片160。在一些实施例中，可运动凸片 160构造成与不可运动凸片162接合，以将覆盖件136可释放地固定到基部 134。在一些示例中，可运动凸片160可联接到覆盖件136的第二侧壁105，而不可运动凸片162可联接到基部134的第二侧壁105。在一些实施例中，一个或多个锁定凸片158可联接到第一侧壁103中的一个或两个，和/或一个或多个锁定凸片158可联接到第二侧壁105中的一个或两个。在一些实施例中，可运动凸片160和覆盖件136是一体连结的(例如，固定地附连的、一体式部件)。在一些实施例中，不可运动凸片162和基部134是一体连结的。在一些示例中，基底保持件101可以包括多个锁定凸片158(例如，至少2、3、4或5个锁定凸片158)。在一些实施例中，基底保持件 101包括一个锁定凸片158和一个锁定凸片107。在一些实施例中，基底保持件101包括一个锁定凸片158和一对锁定凸片107。在一些实施例中，基底保持件101包括一个锁定凸片158和三个锁定凸片107。在一些实施例中，基底保持件101包括一个锁定凸片158和四个锁定凸片107。
如图1A-1B所示，基底110的顶表面128的至少一部分通过第一插入件172和第二插入件173的第一插入件开口174和第二插入件开口175暴露。第一插入件开口174和第二插入件开口175由第一插入件开口174和第二插入件开口175的顶表面176限定。当支承装置100处于闭合位置时，第一插入件开口174和第二插入件开口175可以与基底的一个或多个样本区域对齐。
图2是处于打开位置的示例性基底保持件的立体图。基底保持件201 包括锁定凸片258，该锁定凸片包括具有长度lm的可运动凸片262和具有长度ln的不可运动凸片260。基底保持件201包括一对锁定凸片207，锁定凸片包括具有长度l’m的可运动凸片206和具有长度l’n的不可运动凸片 208。锁定凸片258的长度可以大于上述一对锁定凸片207的长度。可运动凸片260的长度lm可以大于可运动凸片206的长度l’m。在一些实施例中，可运动凸片260的长度lm可以比可运动凸片206的长度l’m长约40％。在一些实施例中，可运动凸片260的长度lm可以比可运动凸片206的长度l’m至少长约10％至约80％(例如，在约10％至20％、20％至30％、30％至40％、 40％至50％、50％至60％、60％至70％、或70％至80％之间)。不可运动凸片262的长度ln可以大于不可运动凸片208的长度l’n。在一些实施例中，不可运动凸片262的长度ln可以比不可运动凸片208的长度l’n长约40％。在一些实施例中，不可运动凸片260的长度ln可以比不可运动凸片208的长度l’n至少长约10％至约80％(例如，在约10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、或70％至80％之间)。
在一些实施例中，可运动凸片260的长度lm小于盖开口221的长度lo。在一些实施例中，可运动凸片260的长度lm可以比盖开口221的长度lo小约5％。在一些实施例中，可运动凸片260的长度lm可以比盖开口221的长度lo至少小约5％至约20％(例如，约5％至10％、10％至15％、15％至20％之间)。在一些实施例中，可运动凸片260的长度lm与盖开口221的长度lo对齐。当基底保持件201处于闭合位置时，可运动凸片260的长度lm可以帮助固定一个或多个插入件，包括它们的衬垫。在一些实施例中，可运动凸片260关于盖开口221的长度lo对中(例如，沿着盖开口221的长度 lo对中)。
覆盖件236和基部234通过一对铰链216可枢转地连接，铰链216从覆盖件和基部234的相对和邻接的第二侧壁205延伸。在一些实施例中，这对铰链可以是一对活动铰链。在一些实施例中，覆盖件和基部通过至少一个铰链可枢转地连接。在一些实施例中，一个或多个铰链可以从覆盖件的第二侧壁延伸到基部的第二侧壁。在一些实施例中，覆盖件和基部可以通过一个铰链可枢转地连接，该铰链的长度跨越它所延伸出来的一侧的长度的大约50％或更多。在一些实施例中，覆盖件和基部通过若干铰链可枢转地连接在一起。在一些实施例中，覆盖件和基部可以通过一个连接器(例如，铰链)或通过多于两个的连接器(例如，一对铰链)连接。在一些实施例中，至少一个连接器是可断开的连接器(例如，可断裂的铰链)，其允许在使用前使基部与覆盖件分离。
图2示出了处于打开位置的基底保持件201，该基底保持件的覆盖件 236处于延伸远离基部234的延伸、展开位置。在一些实施例中，如图2 所示，当覆盖件236相对于基部234呈约180°时，基底保持件201处于打开位置。在一些实施例中，当覆盖件236相对于基部234呈约10°至约170°的角度时，基底保持件201处于打开位置。
支承装置可以包括沿着盖开口周边的一个或多个凹部、引导部或导轨，它们由从覆盖件的表面延伸的壁限定。在一些实施例中，壁的尺寸定为容纳能够相应地支承基底(例如，能够为基底提供紧密配合、保持基底和/或防止其通过盖开口掉落)的任何合适的凹部、引导部或导轨。
仍然参照图2，覆盖件236限定开口221和凹部223。凹部223从凹部壁227大致正交地延伸。凹部壁227限定凹部开口225。凹部开口225的面积大于覆盖件236的开口221的面积。在一些实施例中，凹部开口比覆盖件236的开口221大至少约5％。在一些实施例中，凹部开口比覆盖件236 的开口221大至少约10％。在一些实施例中，凹部开口比覆盖件236的开口221大至少约1％至20％或更多(例如，在约1％至3％、3％至5％、5％至7％、7％至10％、10％至12％、12％至15％或15％至20％之间)。凹部开口225构造成与插入件的至少一个突起接合。在一些实施例中，凹部壁 227构造成接合插入件的突起的侧壁(例如，插入件的第一、第二、第三或第四侧384a-d、484a-d、584a-d)，从而帮助使插入件固定就位。
在一些实施例中，覆盖件236构造成接纳一个或多个插入件(例如，第一插入件172和第二插入件173)。
在一些实施例中，本公开的任何衬垫由热塑性聚合物构造，比如热塑性弹性体在一些实施例中，本公开的任何衬垫可移除地粘附到覆盖件236 的底表面232。在一些实施例中，本公开的任何衬垫与插入件的一部分共同模制，例如第一插入件172和第二插入件173。
在一些实施例中，本文所述的衬垫可以承受至少约10％的压缩变形(compression set)。在一些实施例中，本公开的衬垫可以承受约15％或更多的压缩变形。在一些实施例中，本公开的任何衬垫可以承受约1％、2％、 3％、4％、5％、6％、7％、8％、9％、10％、15％、20％、40％、60％、70％或更多的压缩变形。如本文所使用的，压缩变形表示为暴露在恒定压缩力下后原始试样厚度的百分比。在一些实施例中，本公开的任何衬垫可以承受导致衬垫高度hg变化约0.5毫米(mm)的压缩力。在一些实施例中，本公开的任何衬垫可以承受导致衬垫高度hg变化约0.1mm、0.2mm、0.3mm、 0.4mm、0.5mm、0.6mm、0.7mm、0.8mm、0.9mm、1mm或更多的压缩力。
可运动凸片260包括从基本上竖直的壁270延伸出来的顶部部分268，该壁270另外从覆盖件236延伸出来。当基底保持件201处于闭合位置时，竖直壁270与不可运动凸片262的主体(例如，其匹配部分)接合。顶部部分268远离可运动凸片260的主体向外延伸，以形成用户的抓握手柄。在一些实施例中，抓握手柄可有助于用户拉动或推动可运动凸片260(例如，在接合和/或脱离不可运动凸片262时)。顶部部分268远离可运动凸片260 的主体相对于平行于覆盖件236的底表面232的水平面以角度α向外延伸。在一些实施例中，角度α可以是约15度。在一些实施例中，角度α可以是至少约5度至约90度或更多(例如，在约5度至10度、10度至15度、15 度至20度、20度至25度、25度至30度、30度至35度、35度至40度、 40度至45度、45度至50度、50度至55度、55度至60度、60度至65 度、65度至70度、70度至75度、75度至80度、80度至85度、85度至 90度之间)。
第一高度hm包括可运动凸片260的顶部部分268和竖直壁270。第二高度hv包括可运动凸片260的竖直壁270。在一些实施例中，可运动凸片 260的第一高度hm可以比多个肋218的高度h高约5％。在一些实施例中，可运动凸片260的第一高度hm可以比多个肋218的高度h高约5％。在一些实施例中，可运动凸片260的第一高度hm可以比多个肋218的高度h至少高约5％至约20％(例如，在约5％至10％、10％至15％、15％至20％之间)。
在一些实施例中，可运动凸片260的第二高度hv可以约等于多个肋218 的高度h。在一些实施例中，可运动凸片260的第二高度hv可以比多个肋 218的高度h高约5％。在一些实施例中，可运动凸片260的第二高度hv可以比多个肋218的高度h至少高约5％至约20％(例如，在约5％至10％、 10％至15％、15％至20％之间)。
在一些实施例中，覆盖件236具有底表面232，多个肋218可以从底表面延伸。在图2所示的示例中，基底保持件201包括从底表面232垂直延伸或向外突出的多个肋218。在一些实施例中，插入件不与多个肋218接触 (即不邻接)。在一些实施例中，多个肋218勾勒出底表面232的区段(例如，尺寸设计成足以且构造成接纳一个或多个插入件的区段)。
多个肋218具有沿平行于第二侧壁205的方向延伸的宽度w。在一些实施例中，如图2所示，多个肋218可以具有相等的宽度w。在一些实施例中，多个肋218的宽度可以变化。肋218中的一个在基底保持件201的第一端211a附近离开底表面232基本上向上延伸。其余的肋218中在基底保持件201的第二端211b附近从底表面232垂直延伸。在一些实施例中，基底保持件201可包括多个肋(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个肋)。在一些实施例中，基底保持件201可以包括一个肋。在一些实施例中，基底保持件201可以不包括任何肋。在一些实施例中，基底保持件201可以包括一个或多个肋，这些肋从覆盖件的底表面232垂直延伸。
多个肋218具有从底表面232在基本向上的方向上延伸的高度h。在一些实施例中，如图2所示，多个肋218可以具有相等的高度h。在一些实施例中，可以提供高度h，使得当支承装置处于闭合位置时，多个肋218的顶部边缘与基底110接触。在一些实施例中，当支承装置处于闭合位置时，多个肋218通过与基底110的表面接触来固定基底110。在一些实施例中，当基底保持件101处于闭合位置时，基底110的第一表面228与多个肋218 中的至少一个接合。在一些实施例中，基底110的第一表面228包括样本区域。在一些实施例中，样本区域是基底的构造成接纳一个或多个样本的区段。在一些实施例中，基底110包括一个或多个样本区域。
图3A-3B是包括衬垫380的示例性插入件372的立体图。在一些实施例中，插入件372和衬垫380的尺寸和形状设计成适应任何合适的样本区域、样本、基底或一个或多个附加的相邻插入件。插入件372是模块化的支承结构，其构造成与本公开的支承装置结合使用并且与本文所述的任何其它插入件结合使用。例如，一个或多个插入件可以与本公开的支承装置结合使用。当支承装置100处于闭合或锁定构造时，插入件372可以为用户提供将衬垫(例如，连同插入件372一起)放置在基底的表面的任何期望部分上并产生密封基底井孔的能力。插入件372的顶表面376限定插入件开口374。插入件开口374是方形的形状。衬垫380围绕插入件开口374 的周边设置在插入件372的顶表面376下方。衬垫380具有四个衬垫壁309，衬垫壁309具有高度hg并且在插入件372的顶面376下方竖直延伸。衬垫壁309延伸远离底表面382并限定衬垫开口383，衬垫开口383是插入件开口374的延续部(例如，衬垫开口383的面积大约等于插入件开口374的面积)。在一些实施例中，衬垫壁309远离底表面382渐缩以形成面积小于插入件开口面积的衬垫开口。包括衬垫壁309的衬垫380和插入件372 可以彼此固定地附连(例如，通过包覆模制工艺)。当支承装置100处于闭合构造时，衬垫380构造成接触基底110并形成密封件(例如，不透蒸气密封件、不透液密封件和/或不透气密封件)。在一些实施例中，衬垫380 是包覆模制的衬垫。
插入件372可以具有由第一侧384a、第二侧384b、第三侧384c和第四侧384d限定的正方形形状。在一些实施例中，插入件372可以具有矩形形状(例如，每个第一侧和第二侧384a-b的长度可以大于每个第三侧和第四侧384c-d的长度)。在一些实施例中，插入件372可以具有进一步限定圆形插入件和衬垫开口的圆形形状。插入件372包括从插入件开口374的第一、第二、第三和第四侧384a-d向外延伸的突起378。在一些实施例中，突起378可以从插入件开口374的两侧向外延伸。突起378向外延伸，并且在使用时，在凹部123上行进/沿着凹部123的突起378可以定位在支承装置100的宽度方向上(例如，在相对于第一对侧壁103的正交方向上或在相对于第二对侧壁105的平行方向上)。突起378可以允许用户可选地使插入件372沿着凹部123/在凹部123上在平行于第一对侧壁103的方向上滑动，以便在锁定支承装置之前调整插入件372的放置。替代地，凹部 123可以接纳突起178，并且用户可以选择在插入件372放置之前不使它滑动。
现在参照图4A和4B，示出了包括衬垫480的示例性插入件473。在一些实施例中，插入件473和衬垫480的尺寸和形状设计成适应任何合适的样本区域、样本、基底或一个或多个附加的相邻插入件。在示例性实施例中，插入件473包括插入件开口475和衬垫480。在各种示例性实施例中，插入件473可包括如本文参考上文和参照图3A和3B描述的插入件372的一个或多个特征。插入件473在构造和功能上可以在若干方面与上面讨论的插入件372基本相似，但是可以包括插入件开口475和衬垫开口483，其所的面积大于插入件开口374和衬垫开口383的面积。在一些实施例中，插入件开口475的面积比插入件开口374的面积大至少约10％至约100％ (例如，在至少约10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、 50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％之间)。在一些实施例中，衬垫开口483的面积比衬垫开口383的面积大至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％之间)。
现在参照图5A和5B，示出了包括可滑动衬垫580的示例性可滑动插入件577。在一些实施例中，可滑动插入件577和可滑动衬垫580的尺寸和形状设计成适应任何合适的样本区域、样本、基底或一个或多个附加的相邻插入件。在示例性实施例中，可滑动插入件577包括插入件开口579和可滑动衬垫580。在各种示例性实施例中，可滑动插入件577可包括如本文参考上文和参照图3A、3B、4A和4B描述的插入件372和插入件473的一个或多个特征。可滑动插入件577在若干方面的构造和功能上可与上述插入件372和/或插入件473基本相似，但可包括框架594、凹部588和凸缘 586。
可滑动插入件577是方形的形状并且包括限定孔口592的框架594。孔口592提供通向由衬垫开口583提供的通路外部的基底的通路。框架594 在顶表面576上限定插入件开口579并在底表面582上限定凹部588。凹部 588构造成接纳在可滑动衬垫580的所有侧部上向外延伸的凸缘586。在使用时，凸缘586沿着凹部588行进并且为用户提供控制可滑动衬垫580的位置的灵活性突起586可以允许用户可选地使可滑动衬垫580沿着凹部588 在平行于或正交于第一对侧壁103的方向上滑动，以便在锁定支承装置之前调整可滑动插入件577的放置。替代地，凹部588可以接纳凸缘586，并且用户可以选择在可滑动插入件580放置之前不使它滑动。可滑动衬垫580 限定衬垫开口583并且包括四个衬垫壁309，衬垫壁309具有高度hg并且在可滑动插入件577的顶表面576下方竖直延伸。衬垫壁509远离底表面 582延伸并且限定衬垫开口583。插入件577包括从框架594的所有三个侧部向外延伸的突起578。
在一些实施例中，衬垫开口583的面积比插入件开口374的面积大至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、30％至 40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％之间)。在一些实施例中，衬垫开口583的面积比衬垫开口380 的面积大至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、 30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至 90％、90％至100％之间)。
在一些实施例中，衬垫开口583的面积比插入件开口374的面积小至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、30％至 40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％之间)。在一些实施例中，衬垫开口583的面积比衬垫开口380 的面积小至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、 30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至 90％、90％至100％之间)。
在一些实施例中，衬垫开口583的面积比插入件开口475的面积大至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、30％至 40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％之间)。在一些实施例中，衬垫开口583的面积比衬垫开口483 的面积大至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、 30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至 90％、90％至100％之间)。
在一些实施例中，衬垫开口583的面积比插入件开口475的面积小至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、30％至 40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％之间)。在一些实施例中，衬垫开口583的面积比衬垫开口483 的面积小至少约10％至约100％(例如，在至少约10％至20％、20％至30％、 30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至 90％、90％至100％之间)。
图11A和11B示出了示例性插入件11102。在一些实施例中，示例性插入件372和衬垫380的尺寸和形状设计成适应任何合适的样本区域、样本、基底或一个或多个附加的相邻插入件。在示例性实施例中，插入件11102 包括插入件开口579和可滑动衬垫580。在各种示例性实施例中，可滑动插入件11102可包括如本文参考上文和参照图3A、3B、4A、4B、5A和5B描述的插入件372、插入件473、可滑动插入件577的一个或多个特征。插入件11102在若干方面的构造和功能可与上述插入件372、插入件473和/ 或可滑动插入件577基本相似，但可包括第一、第二、第三和第四突出边缘11104a、11104b、11104c和11104d。
插入件11102的顶表面11076限定插入件开口11074。插入件11102 具有正方形形状，其具有第一侧11084a、第二侧11084b、第三侧11084c 和第四侧11084d。如图11A所示，在某些实施例中，第一、第二、第三和第四侧11084a-d分别包括突出边缘11104a-d。在一些实施例中，突出边缘 11104a-d构造成与凹部壁11106接合，如图11B所示，图11B是线11B-11B的横截面。凹部壁11106是成角度的并且构造成接合一个或多个突出边缘 11104a-d。在一些实施例中，突出边缘11104a-d以与凹部壁11106的角度互补的角度成角度。因此，在一些实施例中，插入件11102构造成卡合到基部的凹部中。
图6是包括基底保持件600和基底610的支承装置601的立体图。基底保持件601示出为具有从基部636分离的覆盖件634。一对铰链616可以是可断开的铰链。在一些实施例中，一对铰链616可选择性地、手动地间隔开，以允许用户将覆盖件636从基部634分离。在一些实施例中，这对铰链616可以包括可断开部分。在一些实施例中，可断开部分可以包括可断开网带。在一些实施例中，这对铰链616是不可逆地可断开的。例如，一旦断开，覆盖件636和基部634就不能经由这对铰链616附连。在一些实施例中，这对铰链616可以是可逆地可断开的。
参照图12A和12B，示出了将基底和一个或多个插入件装载和固定在支承装置中的两种示例方法。在一些实施例中，一个或多个插入件672可以定位在任何合适的方向和/或位置，使得由插入件672中的每一个限定的封闭区域(例如，插入件开口674)将一个或多个样本区域664包围在基底 610的第一表面628上或其一个或多个部分上。在一些实施例中，基底610 可以包括在其表面的一个或多个部分上的样本(例如，生物材料样本)。在一些实施例中，一个或多个插入件672定位成使得它们的一个或多个插入件开口674构造成与基底的表面上的样本或样本的部分对齐。在一些实施例中，样本(例如，生物材料样本)可以通过使用插入件672来识别。例如，在一些实施例中，插入件可以被标记(例如，用数字、字母和/或颜色)，并且用户可以将一个或多个标记的插入件与一个或多个特定样本配对，作为标记或识别一个或多个样本的一种方式。
参照图6、12A和12B，在一些实施例中，基部634构造成接纳基底610。在一些实施例中，如步骤12108所示，用户将基底610放置在基部634 中。如果基底保持件601处于闭合位置(例如，覆盖件636与基部634接合)，用户在将基底610放置在基部634中之前将覆盖件636从基部634 分离。一旦分离，用户就可以跟随箭头610的方向将基底614插入到基部 634中。接下来，如步骤12118(参见图12B)中所述，用户可以将插入件 672放置在插入的基底610的第一表面628上，例如，在箭头612的方向上。可选地，用户可以通过拾取插入件672并改变它们在第一表面628上的位置和/或在将覆盖件636与基部634接合之前根据需要旋转插入件672来调整插入件672的位置和/或方向，如步骤12120(参见图12B)中所述。一旦插入件672被放置在期望的位置和/或取向处，用户就可以将覆盖件636 放置在基部634的顶部上，使得插入件672由覆盖件636的开口621接纳，如步骤12122中所述(参见图12B)。在一些实施例中，将覆盖件636放置在基部634的顶部上可以帮助使基底610和插入件672保持就位。接着，如步骤12116(参见图12B)中所述，用户可以经由锁定凸片607和658使覆盖件636与基部634接合(例如卡合)，以将基底保持件601置于闭合位置。当基底保持件601处于闭合位置时，覆盖件636与基部634的接合可以帮助将基底610和包括衬垫680的插入件672固定就位。
在一些实施例中，如步骤12110(参见图12A)中所述，在将插入件 672放置在插入的基底610的第一表面628上之前，用户可以将插入件672 插入覆盖件636的开口621中。接下来，在一些实施例中，用户可以可选地在使覆盖件636与基部634接合之前，通过使突起678在接合凹部壁627 的同时沿凹部623滑动来调整插入件672的位置和/或取向，如步骤12112 (参见图12A)中所述。一旦插入件672的位置和/或取向被选择性地调整，就将覆盖件636(使插入件672插入盖开口中)放置在基部634上；因此，随着覆盖件636搁置在基部634上，插入件672接触插入的基底610(例如，已经插入基部634中的基底610)的第一表面628，如步骤12114(参见图 12A)中所述。其余步骤与上述步骤类似。例如，用户可以接着经由锁定凸片607和658使覆盖件636与基部634接合(例如，卡合)，以将基底保持件601置于闭合位置(参见步骤12116)。
在一些示例中，基底610的第二表面(例如，底表面)可以搁置在基底保持件601的基部634的顶部上。例如，基部634可以包括构造成将基底610保持在基部634内的唇部622。例如，基底610可以搁置在唇部622 上并保持在位。在一些实施例中，唇部622围绕基部634的周边延伸。在一些实施例中，基底可以固定到基底保持件的基部。在一示例中，基底610可以在箭头614的方向上放置在基部434中。基底610的第二表面可以放置成使得当支承装置600处于闭合位置时，它与唇部622接触，并且基底 610的第一表面628与多个肋618和衬垫624接触。在一些实施例中，基底 610可以在不使用工具的情况下装载到基部634中。基部634可以包括开口 620，该开口的尺寸设计成足以暴露基底610的一个或多个部分。在一些实施例中，开口620的尺寸设计成使基底610的第二表面的大部分被暴露而不被覆盖。在一些实施例中，开口620可以使基底610的第二表面能够与加热装置(例如，如PCT/US2019/065100中所述的板3110，其全部内容以参见的方式纳入本文)的表面接触。在一些实施例中，基底610的第一表面628包括样本区域664。在一些实施例中，基部634包括开口620，当基底610放置在基部634中时，该开口暴露基底610的第二表面的至少一部分。
在一些实施例中，基部634不限定开口(例如，参见图2中的基部开口220)，并且替代地，它包括平坦的实心表面底部。在一些实施例中，基部634包括与基部634的壁一体模制的内部底表面。在一些实施例中，内部底表面是平坦的或部分平坦的。在一些实施例中，内部底表面是弯曲的或部分弯曲的。在一些实施例中，内部底表面是光滑的。在一些实施例中，内部底表面是不平坦的。在一些实施例中，不平坦的内底表面包括从内部底表面垂直延伸的结构(例如，脊或突起)以帮助将装载的基底固定就位 (例如，以限制装载的基底的移动和/或位置)。在一些实施例中，不平坦的内部底表面涂有材料(例如，涂橡胶)以帮助将装载的基底固定就位(例如，以限制装载的基底的移动和/或位置)。在一些实施例中，结构(例如，脊或突起)和/或涂层在装载的基底的表面(或其一部分)和内部底表面之间提供增加的摩擦。
在一些实施例中，基部限定开口，并且支承装置还包括可移除覆盖件，该可移除覆盖件的形状和尺寸适于配合到基部开口中并覆盖基部开口(例如，以紧密配合的方式)。例如，在一些实施例中，可移除覆盖件可经由一个或多个连接器(例如，卡扣配合或压配合连接器)装配到基部开口中。在一些实施例中，可移除覆盖件可插入基部开口中以提供平坦、坚固的表面，以支承装载的基底。替代地，在一些实施例中，能够移除可移除覆盖件(在存在或不存在装载的基底的情况下)，以便更清楚地观察装载的基底(例如，用肉眼和/或使用光学显微镜装置观察装载的基底的表面上的生物样本)。
在一些实施例中，可运动凸片606和660可以具有C形结构。在一些实施例中，可运动凸片606和660由柔性材料构成，柔性材料使它们能够远离基底保持件的本体挠曲，以便分别接合不可运动凸片608和662。在一些实施例中，不可运动凸片608和662不能够挠曲。在一些实施例中，不可运动凸片608和662是刚性的，并且在接合可运动凸片606、660时不挠曲。
在一些实施例中，能够将支承装置的第一侧壁603和第二侧壁605的尺寸设计成适应任何合适尺寸的基底、插入件、凸片(锁定、可运动和/或不可运动凸片)或其任何组合。在一些实施例中，第一侧壁603可以测得约3英寸。在一些实施例中，第二侧壁605可以测得约1英寸。在一些实施例中，基底610可以具有任何合适的尺寸。在一些实施例中，基底610 可以测得约75毫米(mm)乘25mm。在一些实施例中，基底610可以测得约75毫米(mm)乘50mm。在一些实施例中，基底610可以测得约48 毫米(mm)乘28mm。在一些实施例中，基底610可以测得约46毫米(mm) 乘27mm。在一些实施例中，基底610是载玻片。
现在参照图7A、7B、7C和7D，示出了处于闭合位置的示例性支承装置700的底表面715的仰视图。在示例性实施例中，支承装置700包括插入件772，该插入件772包括衬垫780和衬垫开口783。参照图3A和3B，插入件772在若干方面在构造和功能上与上面讨论的插入件372基本相似。图7A、7B、7C和7D示出了当装载到支承装置700上时插入件772和衬垫 780的各种示例位置。例如，图7A、7B和7C示出了定位在第二样本区域 764b上方并与第二样本区域764b对齐的插入件772。图7A示出了具有衬垫780的插入件772，其定位在第二样本区域764b的边缘796上方。图7B 示出了具有衬垫780的插入件772，其定位在第二样本区域764b的稍稍偏离中心部分的下部上方。图7C示出了具有衬垫780的插入件772，其定位在第二样本区域764b的稍稍偏离中心部分的侧部上方。图7D示出了具有衬垫780的插入件772，其定位在第一样本区域764a的稍稍偏离中心部分的侧部上方。通过在将插入件772插入支承装置700之前顺时针或逆时针旋转插入件772，能够控制衬垫开口783的位置。
在一些实施例中，衬垫780可以在基底710的表面上以任何合适的方向和/或位置定位，使得其衬垫开口783可以提供通向基底710的表面的任何部分的通路。在一些实施例中，衬垫开口783的面积与样本区域的面积的至少约10％至约100％(例如，至少约10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％)重叠。在一些实施例中，衬垫开口783定位成远离第一侧壁 703的边缘约4毫米(mm)至约12mm(例如，至少约4mm至5mm、5 mm至6mm、6mm至7mm、7mm至8mm、8mm至9mm、9mm至10mm、 10mm至11mm、11mm至12mm或更多)。在一些实施例中，衬垫开口783 定位成远离第一侧壁705的边缘约6mm至约40mm(例如，至少约6mm 至10mm、10mm至15mm、15mm至20mm、20mm至25mm、25mm至30mm、 30mm至35mm、35mm至40mm或更多)。
在一些实施例中，衬垫780和衬垫开口783可以具有任何合适的形状或尺寸以容纳任何合适数量的样本、基底的表面上的样本区域的任何合适区域、基底710的表面的任何部分、或其任何组合。衬垫开口783为正方形的形状并且具有边长s1，基底710为矩形的形状并且具有边长x，并且支承装置700为矩形的形状并且具有边长为x’。在一些实施例中，边长s1为约8mm长(例如，至少约6mm至7mm、7mm至8mm、8mm至9mm或 9mm至10mm长)。在一些实施例中，衬垫开口783具有约64mm2的面积 (例如，约35mm2至50mm2、约50mm2至60mm2、约60mm2至70mm2、约70mm2至80mm2、约80mm2至90mm2，或约90mm2到100mm2的面积)。在一些实施例中，边长x为约76mm长(例如，至少约70mm至71mm、 71mm至72mm、72mm至73mm、73mm至74mm、74mm至75mm、75mm 至76mm、76mm至77mm、77mm至78mm、78mm至79mm或79mm 至80mm长)。在一些实施例中，边长x为约80mm长(例如，至少约75mm 至76mm、76mm至77mm、77mm至78mm、78mm至79mm、79mm至80mm、 80mm至81mm、81mm至82mm、82mm至83mm、83mm至84mm或 84mm至85mm长)。在一些实施例中，边长s1是边长x的约10％(例如，至少约5％至10％、10％至11％、11％至12％、12％至13％、13％至14％、或14％至15％)。在一些实施例中，边长s1是边长x’的约10％(例如，至少约5％至10％、10％至11％、11％至12％、12％至13％、13％至14％、或 14％至15％)。
现在参照图8A、8B、8C和8D，示出了处于闭合位置的示例性支承装置800的底表面815的仰视图。在示例性实施例中，支承装置800包括插入件873，该插入件772包括衬垫780和衬垫开口883。参照图4A和4B，插入件873在若干方面在构造和功能上与上面讨论的插入件473基本相似。图8A、8B、8C和8D示出了当装载到支承装置800上时插入件873和衬垫 880的各种示例位置。例如，图8A、8B和8C示出了定位在第二样本区域 764b上方并与第二样本区域864b对齐的插入件873。图8A示出了具有衬垫880的插入件873，其定位在第二样本区域864b的边缘896上方。图8B 示出了具有衬垫880的插入件873，其定位在第二样本区域864b的稍稍偏离中心部分的下部。图8C示出了具有衬垫880的插入件873，其定位在第二样本区域864b的稍稍偏离中心部分的侧部。图8D示出了具有衬垫880 的插入件873，其定位在第一样本区域864a的稍稍偏离中心部分的侧部上方。通过在将插入件873插入支承装置700之前顺时针或逆时针旋转插入件872，能够控制衬垫开口883的位置。
在一些实施例中，衬垫880可以在基底810的表面上以任何合适的方向和/或位置定位，使得其衬垫开口883可以提供通向基底810的表面的任何部分的通路。在一些实施例中，衬垫开口883的面积与样本区域的面积的至少约10％至约100％(例如，至少约10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％)重叠。在一些实施例中，衬垫开口883定位成远离第一侧壁 803的边缘约3mm至约12mm(例如，至少约3mm至4mm、约4mm至 5mm、5mm至6mm、6mm至7mm、7mm至8mm、8mm至9mm、9mm 至10mm、10mm至11mm、11mm至12mm或更多)。在一些实施例中，衬垫开口883定位成远离第一侧壁805的边缘约7mm至约40mm(例如，至少约7mm至10mm、10mm至15mm、15mm至20mm、20mm至25mm、 25mm至30mm、30mm至35mm、35mm至40mm或更多)。
在一些实施例中，衬垫880和衬垫开口883可以具有任何合适的形状或尺寸以容纳任何合适数量的样本、基底的表面上的样本区域的任何合适区域、基底810的表面的任何部分、或其任何组合。衬垫开口883为正方形的形状并且具有边长s2，基底810为矩形的形状并且具有边长x，并且支承装置800为矩形的形状并且具有边长为x’。在一些实施例中，边长s2为约14mm长(例如，至少约11mm至12mm、12mm至13mm、13mm至14mm、 14mm至15mm、15mm至16mm、16mm至17mm，或17mm至18mm长)。在一些实施例中，衬垫开口883具有约196mm2的面积(例如，约190mm2至200mm2、约200mm2至225mm2、约225mm2至250mm2、约250mm2至275mm2、约275mm2至300mm2，或约300mm2到325mm2的面积)。在一些实施例中，边长x为约76mm长(例如，至少约70mm至71mm、71mm 至72mm、72mm至73mm、73mm至74mm、74mm至75mm、75mm至76 mm、76mm至77mm、77mm至78mm、78mm至79mm或79mm至80 mm长)。在一些实施例中，边长x’为约80mm长(例如，至少约75mm 至76mm、76mm至77mm、77mm至78mm、78mm至79mm、79mm至80mm、80mm至81mm、81mm至82mm、82mm至83mm、83mm至84mm或 84mm至85mm长)。在一些实施例中，边长s2是边长x的约18％(例如，至少约16％至17％、17％至18％、18％至19％、19％至20％、20％至21％、或21％至22％)。在一些实施例中，边长s2是边长x’的约16％(例如，至少约14％至15％、15％至16％、16％至17％、17％至18％、18％至19％、或 19％至20％)。
现在参照图9A、9B、9C和9D，示出了处于闭合位置的示例性支承装置900的底表面915的仰视图。在示例性实施例中，支承装置900包括可滑动插入件977，该可滑动插入件772包括衬垫980和衬垫开口983。参照图5A和5B，可滑动插入件977在若干方面在构造和功能上与上面讨论的插入件577基本相似。图9A、9B、9C和9D示出了当装载到支承装置900 上时可滑动插入件977和衬垫980的各种示例位置。例如，可滑动插入件 977示出为定位在第一样本区域964a和第二样本区域964b上方并且在第一样本区域964a和第二样本区域964b之间。图9A示出了具有衬垫980的可滑动插入件977，其定位在第一样本区域964a和第二样本区域964b之间的区域上方。衬垫980的边缘的一部分被示为与第一样本区域964a的边缘996 重叠。凸缘986与凹部988接触，并示出为处于第一构造(例如，滑动到可滑动插入件977的右侧998)。图9B示出了具有衬垫980的可滑动插入件977，其定位在第二样本区域964b的一部分上方。凸缘986与凹部988 接触，并示出为处于第二构造(例如，滑动到可滑动插入件977的左侧999)。可滑动插入件977不需要旋转以便从第一构造(例如，滑动到可滑动插入件977的右侧998)切换到第二构造(例如，滑动到可滑动插入件977的左侧999)，因为凸缘986可以沿着凹部988滑动以调节衬垫980的位置。图 9C示出了具有衬垫980的可滑动插入件977，其定位在第二样本区域964b 的一部分上方。凸缘986与凹部988接触，并示出为处于第二构造(例如，滑动到可滑动插入件977的右侧998)。图9D示出了具有衬垫980的可滑动插入件977，其定位在第一样本区域964b的一部分上方。凸缘986与凹部988接触，并示出为处于第二构造(例如，滑动到可滑动插入件977的右侧998)。可滑动插入件977的位置可以通过将可滑动插入件977从支承装置900移除并将其重新插入到较佳位置(例如，在第一样本区域964a或第二样本区域964b上方)来调整。
在一些实施例中，衬垫980可以在基底910的表面上以任何合适的方向和/或位置定位，使得其衬垫开口983可以提供通向基底910的表面的任何部分的通路。在一些实施例中，衬垫开口983的面积与样本区域的面积的至少约10％至约100％(例如，至少约10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、 90％至100％)重叠。在一些实施例中，衬垫开口983定位成远离第一侧壁 903的边缘约4mm至约12mm(例如，至少约4mm至5mm、5mm至6mm、 6mm至7mm、7mm至8mm、8mm至9mm、9mm至10mm、10mm 至11mm、11mm至12mm或更多)。在一些实施例中，衬垫开口983定位成远离第一侧壁905的边缘约7mm至约40mm(例如，至少约7mm至 10mm、10mm至15mm、15mm至20mm、20mm至25mm、25mm至30mm、 30mm至35mm、35mm至40mm或更多)。
在一些实施例中，衬垫980可以在基底710的表面上以任何合适的方向和/或位置定位，使得其衬垫开口983可以提供通向基底910的表面的任何部分的通路。衬垫开口983为正方形的形状并且具有边长s3，基底910 为矩形的形状并且具有边长x，并且支承装置900为矩形的形状并且具有边长为x’。在一些实施例中，边长s3为约8mm长(例如，至少约6mm至7mm、 7mm至8mm、8mm至9mm或9mm至10mm长)。在一些实施例中，衬垫开口983具有约64mm2的面积(例如，约35mm2至50mm2、约50mm2至60mm2、约60mm2至70mm2、约70mm2至80mm2、约80mm2至90mm2，或约90mm2到100mm2的面积)。在一些实施例中，边长x为约76mm 长(例如，至少约70mm至71mm、71mm至72mm、72mm至73mm、73mm 至74mm、74mm至75mm、75mm 76mm、76mm至77mm、77mm至78mm、 78mm至79mm或79mm至80mm长)。在一些实施例中，边长x为约80mm长(例如，至少约75mm至76mm、76mm至77mm、77mm至78mm、 78mm至79mm、79mm至80mm、80mm 81mm、81mm至82mm、82mm 至83mm、83mm至84mm或84mm至85mm长)。在一些实施例中，边长s3是边长x的约10％(例如，至少约5％至10％、10％至11％、11％至 12％、12％至13％、13％至14％、或14％至15％)。在一些实施例中，边长 s3是边长x’的约10％(例如，至少约5％至10％、10％至11％、11％至12％、 12％至13％、13％至14％、或14％至15％)。
在一个方面，本公开包括一种使用本文所述的支承装置或基底保持件的方法。使用支承装置和基底保持件的示例方法在图12A和12B中示出。在一些实施例中，该方法包括将基底安装在支承装置的基底保持件的基部上。在一些实施例中，该方法包括将基底保持件的一个或多个可移除插入件定位在基底的表面上。例如，用户可以将样本放置在基底的第一表面上并且可以接触基底保持件的基部上的基底的第二表面。一个或多个可移除插入件可以定位在基底的第一表面上(例如，围绕样本)，以便在包含样本的样本区域周围提供液密和/或汽密密封。在一些实施例中，该方法包括将每个可移除插入件的至少一部分插入由基底保持件的覆盖件限定的开口中。在一些实施例中，该方法包括在使覆盖件与基部接合之前，将基底保持件的覆盖件放置在一个或多个可移除插入件上方和接收基底的基部上。在一些实施例中，该方法包括将覆盖件与基部接合以固定基底和一个或多个可移除插入件。
在一些实施例中，该方法包括当基部不与覆盖件接合时，在开口内调整或滑动突起。例如，用户可以在开口内调整或滑动突起，以便重新定位衬垫并在基底上的不同位置(例如，不同的样本区域)处产生密封(例如，液密和/或汽密密封)。
在一些实施例中，该方法包括使用可滑动插入件(例如，图5A和5B 中所示的可滑动插入件577)并且使可滑动插入件的凸缘与可滑动插入件的第二凹部接合。在一些实施例中，该方法包括在可滑动插入件的第二凹部内调整或滑动可滑动插入件的凸缘。例如，用户可以通过在第二凹部内滑动或调节可滑动插入件的凸缘来进一步重新定位衬垫，而不必滑动或调节整个插入件(例如，通过调节或滑动在覆盖件的开口内的插入件的突起)。在一些实施例中，与通过调整或滑动整个插入件所提供的范围相比，可滑动插入件可以提供在更小的范围内重新调整可滑动插入件的衬垫的优点。
在一些实施例中，该方法包括将每个可移除插入件的至少一部分与覆盖件的第一凹部和凹部壁接合。在一些实施例中，该方法包括当基部不与覆盖件接合时，在覆盖件的开口内调整或滑动插入件的突起。
支承装置在若干方面的结构和功能上可以与上述支承装置100、600、 700、800和900基本相似，但可以包括基底保持件101、201和601的一个或多个替代特征和/或者可以包括一个或多个替代插入件，而不是插入件 172、173、372、473、577、672、772、873、977和11102。例如，在一些实施例中，替代特征包括替代的可运动凸片，而不是可运动凸片106、160、 206、260、606和660，和/或替代的不可运动凸片，而不是不可运动凸片 108、162、206、262、608和662。
在一些实施例中，基底保持件可以具有一个或多个特征，其使得基底保持件能够被放置在解锁状态中，其中覆盖件搁置在基部上，使得覆盖件和基部的可接合、可配合部分间隔开间隙距离。例如，当基底保持件处于解锁状态时，覆盖件的一个或多个可运动凸片可以设置(例如，搁置)在基部的一个或多个相应的不可运动凸片上。这样的解锁状态构造可以允许用户操纵插入件在盖开口内的位置，同时覆盖件定位在基部上方而不接触基底。因此，解锁状态有利地允许用户在视觉上验证插入件已经定位在基底上方的期望位置，同时还最小化了对基底上的生物样本造成潜在损害的风险。
在一些实施例中，插入件可以具有一个或多个特征，其使得插入件能够与盖开口接合。例如，插入件可以包括一个或多个插入凸片，其可以接合覆盖件的开口的内侧壁中的至少一个。在一些实施例中，插入件可以具有一个或多个特征，其使得插入件的部分(例如，插入件的衬垫)能够在插入件开口内滑动。例如，插入件可包括保持凸片，其构造成与衬垫接合以帮助在其平移(例如，滑动)期间固定衬垫。插入件的这种可滑动构造可以允许用户操纵插入件在盖开口内的位置，并进一步操纵衬垫在插入件内的位置，从而使用户能够将衬垫定位在基底的任何期望位置上方。在一些实施例中，插入件可以在盖开口内在沿第一轴线的方向上移动，并且插入件内的衬垫可以在沿第二轴线的方向上移动，第二轴线通常正交于第一轴线，这使用户能够将衬垫沿两个不同的轴线定位在基底的期望位置上方。
图14-19E示出了示例性支承装置14000和15000，其包括示例性基底保持件14001、17001、18001和19001以及可移除插入件14108、16108和 19108。通常，任何支承装置都可以包括本文公开的基底保持件。具体参照图14，示出了包括基底保持件14001和基底14114的支承装置14000。在一些实施例中，基底保持件14001包括基部14110和覆盖件14112。在一些实施例中，基部14110构造成接纳基底14114。在一些实施例中，覆盖件 14112构造成与基部14110匹配地接合并且进一步限定开口14116。覆盖件 14112可以与基部14110匹配地接合，因为覆盖件14112和基部14110的形状和尺寸都定为构造成联接在一起的配合部件。在一些实施例中，基底保持件14001包括可移除插入件14108，其被示为插入在图14中的开口14116内。在一些实施例中，开口14116由一对第一内侧壁14120a和一对第二内侧壁14120b形成。在一些实施例中，可移除插入件14108构造成当基部 14110不与覆盖件14112接合时，沿着由第二内侧壁14120b限定的纵向轴线(即，y轴)在开口14116内移动(例如，平移)。在一些实施例中，覆盖件14112的表面包括一个或多个标记或特征(例如，为可移除插入件相对于基底或基底上的样本的平移提供引导)(未示出)。例如，覆盖件14112 的表面可以用网格线标记(例如，为可移除插入件已经平移的距离和/或可移除插入件的位置提供参考)。在一些实施例中，此类标记或特征可以使用以下技术制成：包括但不限于在覆盖件14112的表面或基底保持件的任何其它合适部分(例如，基部14110)上印制、蚀刻和/或模制。
在一些实施例中，基底保持件14001包括第一可移除插入件和第二可移除插入件(参见例如图1A-1B)。在一些实施例中，第一可移除插入件限定第一插入件开口，该第一插入件开口的面积大于由第二可移除插入件限定的第二插入件开口的面积。在一些实施例中，第一插入件开口的面积大约等于第二插入件开口的面积。在一些实施例中，基底保持件包括三个或更多个可移除插入件。
在一些实施例中，可移除插入件14108包括衬垫插入件14190，衬垫插入件14190构造成与突起14124联接(例如，可滑动联接)。在一些实施例中，衬垫插入件14190与突起14124可逆地联接。衬垫插入件14190包括衬垫14118。在一些实施例中，衬垫14118与可移除插入件14108或其部件(例如，与衬垫插入件14190)包覆模制，使得衬垫14118与可移除插入件14108或其部件(例如，与衬垫插入件14190)联接。在一些实施例中，衬垫14118与衬垫插入件14190固定地附连(例如，通过机械装置或固定装置)。在一些实施例中，衬垫14118与衬垫插入件14190可逆地附连(例如，可滑动地联接)。在一些实施例中例如，可移除插入件14108和衬垫 14118的尺寸和形状定为容纳任何合适的样本、基底的部分、基底上的样本区域、一个或多个相邻的插入件、或它们的组合。
图15是示例性支承装置15000的剖视图(其类似于示例性支承装置 14000，但示出了可移除插入件的替代定位)。在一些实施例中，可移除插入件15108构造成接纳在覆盖件15112的开口内。在一些实施例中，可移除插入件15108包括可释放地联接到衬垫插入件15190的突起15124。在一些实施例中，可移除插入件15108还包括从可移除插入件的相对侧延伸的至少第一插入凸片15126a和第二插入凸片15126b。在一些实施例中，每个插入凸片15126a和15126b使可移除插入件15108的表面15122沿同一平面方向延伸。在一些实施例中，每个插入凸片15126a和15126b构造成与形成覆盖件15112的开口的内侧壁15120中的至少一个接合，使得可移除插入件15108的表面15122变得与覆盖件15112的面15128基本齐平或平行。如图15所示，覆盖件15112的内侧壁15120(例如，第一内侧壁15120a 和第二内侧壁15120b)可以是倾斜的，并且第一插入凸片15126a和第二插入凸片15126b可以包括倾斜表面15130。在一些实施例中，倾斜表面15130 构造成与覆盖件15112的倾斜的内侧壁15120接合。在一些实施例中，倾斜表面15130由与覆盖件15112的倾斜内侧壁15120的角度互补的角度限定，这有助于两个表面的接合。如本文所用，“与另一角度互补的角度”和术语“互补角度”是指一个或多个角度之和约为90度。在一些实施例中，覆盖件15112的内侧壁15120的倾斜表面和第一插入凸片15126a和第二 15126b的成角度的表面15130使得可移除插入件15108能够卡扣配合在覆盖件15112的开口内。
如图15所示，覆盖件15112的内侧壁15120可以相对于由可移除插入件15108的底表面15134限定的侧向轴线(即，x轴)限定的角度15132 倾斜。在一些实施例中，角度15132范围从大约1度至大约80度(例如，至少大约1度至5度、5度至10度、10度至15度、15度至20度、20度至25度、25度至30度、30度至35度、35度至40度、40度至45度、45 度至50度、50度至55度、55度至60度、60度至65度、65度至70度、 70度度至71度、71度至72度、72度至73度、73度至74度、74度至75 度、75度至76度、76度至77度、77度至78度、78度至79度、79度至 80度80度至81度、81度至82度、82度至83度、83度至84度、84度至 85度、85度至86度、86度至87度、87度至88度、或88度至89度)。在一些实施例中，角度15132的范围从大约70度至大约75度。在一些实施例中，角度15132范围从大约75度至大约80度。在一些实施例中，角度15132的范围从大约80度至大约85度。在一些实施例中，角度15132 范围从大约85度至大约89度。
此外，第一插入凸片15126a和第二插入凸片15126b的倾斜表面15130 能够以相对于侧向轴线(即，x轴)和纵向轴线(即，y轴)限定的角度15136 倾斜。在一些实施例中，角度15136与角度15132互补。在一些实施例中，角度15136的范围从大约1度至大约45度(例如，至少大约1度至5度、 5度至10度、10度至15度、15度至20度、20度至25度、25度至30度、 30度至35度、35度至40度、40度至45度)。在一些实施例中，角度15136 的范围从大约1度至大约5度。在一些实施例中，角度15136的范围从大约5度至大约10度。在一些实施例中，角度15136的范围从大约5度至大约15度。在一些实施例中，角度15136的范围从大约5度至大约20度。在一些实施例中，角度15136的范围从大约15度至大约20度。在一些实施例中，角度15132与角度15136互补。在一些实施例中，角度15132和 15136之和约为90度。
图16A-16C分别示出了示例性可移除插入件16108的俯视立体图、仰视立体图和展开图。在一些实施例中，可移除插入件16108包括衬垫插入件16190和突起16124。
在一些实施例中，包括衬垫16118的衬垫插入件16190构造成与突起 16124联接(例如，可滑动联接)。当衬垫插入件16190与突起16124联接时，衬垫插入件16190可以是可移除插入件16108的最里面的部件。在一些实施例中，衬垫16118包括一个或多个衬垫壁16140，其固定地附连到衬垫插入件16190并还限定衬垫16118的周边。在一些实施例中，衬垫16118 包括四个衬垫壁16140。在一些实施例中，衬垫插入件16190包括凸缘 16142，该凸缘基本上是平坦的并且相对于由衬垫壁16140限定的周边向外突出或以大致垂直的方式突出。
在一些实施例中，突起16124是U形的并且具有一对相对的臂16138。在一些实施例中，突起16124包括多个部件。在一些实施例中，突起16124 包括框架16194。在一些实施例中，突起16124是与框架16194分离的部件。在一些实施例中，突起16124联接(例如，固定联接或可逆联接)到框架 16194。突起16124可以是基本上平坦的并且相对于由框架16194限定的周边向外突出或以大致垂直的方式突出。在一些实施例中，框架16194包括第一插入凸片16126a、第二插入凸片16126b和第三插入凸片16126c，它们能够使可移除插入件16108与覆盖件的开口接合(例如，卡扣配合)，如上文所讨论的(参见图15)。在一些实施例中，突起16124包括一对从臂16138向内延伸到开口16198中的保持凸片16146，如图16B所示。此外，突起16124的底面16134和框架16194的内侧壁16196能够一起限定凹部16144。凹部16144可以是U形的并且可以构造成在衬垫插入件16190 的组装期间引导衬垫插入件16190的凸缘16142，并且可选地，在使用期间，在突起16124内平移(例如，滑动)，以获得在基底上方的期望的定位。
在一些实施例中，衬垫插入件16190构造成在突起16124的凹部16144 内平移。衬垫插入件16190的凸缘16142可以构造成被突起16124的凹部 16144接纳，如图16B所示。凸缘16142可以在凹部16144内进行调整或滑动。在一些实施例中，当用户将凸缘16142插入凹部16144中并在凹部 16144内滑动时，该对保持凸片16146构造成与凸缘16142接合。因此，当用户调整衬垫16118在突起16124内的位置时，该对保持凸片16146可以有利地固定可移除插入件16108。
在操作中，用户可以通过将衬垫插入件16190与突起的臂16138对齐并随后将衬垫插入件16190在箭头16148的方向上插入突起16124中并将其推入突起16124中来组装可移除插入件16108，如图16C所示，使得凸缘16142能够以基本无摩擦的方式在凹部16144内自由线性滑动并完全插入。在一些实施例中，衬垫插入件16190和突起16124由摩擦减小材料构成，比如聚四氟乙烯(PTFE)或其它类似的摩擦减小材料。在一些实施例中，凸缘16142和凹部16144的接触表面包括摩擦减小材料或由摩擦减小材料构成，比如聚四氟乙烯(PTFE)或其它类似的摩擦减小材料。在一些实施例中，凸缘16142和凹部16144的接触表面涂覆有摩擦减小材料，比如聚四氟乙烯(PTFE)或其它类似的摩擦减小材料。在一些实施例中，凸缘16142和凹部16144的接触表面包括高温热塑性材料或由高温热塑性材料构成。示例性高温热塑性材料包括，例如，PPSU(聚苯砜)和有机硅弹性体。
一旦衬垫插入件16190与突起16124可释放地联接，用户就能够通过使衬垫插入件16190沿着由可移除插入件16108的底表面16134限定的侧向轴线(即，x轴)在突起16124内平移来调整衬垫插入件16190在突起 16124内的位置，如图16B所示。因此，在一些实施例中，可移除插入件的内部部件的移动方向通常正交于可移除插入件16108在基底保持件的覆盖件的开口中的移动方向。
图17A和17B示出了处于解锁状态的示例性基底保持件17001，其中基底保持件17001的覆盖件17112可以搁置在基部17110的顶部上，而没有锁定机构的接合，使得间隙17178存在于覆盖件17112和基部17110的配合表面之间，以允许用户在将覆盖件17112锁定在基部17110上方之前可视化基底保持件的覆盖部件在基底上方的位置。例如，在一些实施例中，覆盖件17112和基部17110的配合表面在解锁状态下由间隙17178间隔开。可以将间隙17178的尺寸定为使得当基底在解锁状态中装载在基底保持件 17001中时，衬垫17118不接触基底的表面。在一些实施例中，间隙17178 在尺寸上构造成便于可移除插入件在解锁状态下在覆盖件17112的开口内的可运动调整。在一些实施例中，间隙17178可为约0.25mm或更大。
基部17110可以可选地包括从侧壁17152突出的两个引导部17160。在一些实施例中，每个引导部17160联接到侧壁17152并且具有有着侧面 17164的基本矩形棱柱形状。在一些实施例中，引导部17160的侧面17164 构造成接触可运动凸片17154的侧面17162。在一些实施例中，在解锁状态下，引导部17160的侧面17164的至少一部分(例如，每个侧面17164的表面区域的至少约50％))接触可运动凸片17154的侧面17162。在一些实施例中，在锁定状态(参见图18A)，引导部17160的侧面17164的整个表面区域可以接触可运动凸片17154的侧表面17162。在一些实施例中，在锁定状态下，引导部17160的侧面17164的大部分表面积(例如，每个侧面17164的大约90％或更多的表面积)可以接触可运动凸片17154的侧面17162。在一些实施例中，覆盖件17112和基部17110的接合由引导部 17160引导，从而为用户提供有效方式以视觉和触觉对齐两个部件，以将基底保持件置于解锁状态或锁定状态。
在一些实施例中，基部17110包括从两个相对的侧壁17152延伸的不可运动凸片17150。在一些实施例中，基部17110包括从两个相对的侧壁 17152延伸的三个不可运动凸片17150。在一些实施例中，覆盖件17112包括可运动凸片17154，其构造成与基部17110的不可运动凸片17150接合。在一些实施例中，可运动凸片17154包括第一接触表面17156，其构造成与基部17110的相应不可运动凸片17150接合。在一些实施例中，第一接触表面17156构造成与相应的不可运动凸片17150接合，使得覆盖件17112 和基部17110在解锁状态下接合。在一些实施例中，可运动凸片17454的第一接触表面17156在解锁状态下构造成定位并搁置在相应的不可运动凸片17150的表面17158上，如图17B所示。
如图17B所示，可运动凸片17454的第一接触表面17156可以可选地包括成角度的表面，并且不可运动凸片17150的表面17158也可以可选地成角度。在一些实施例中，第一接触表面17156以角度17202倾斜，该角度17202相对于侧向轴线(即，x轴)和纵向轴线(即，y轴)限定，该侧向轴线由可运动凸片17454的第二接触表面17170限定，该纵向轴线正交于侧向轴线。在一些实施例中，角度17202的范围从大约1度至约80度(例如，至少大约1度至5度、5度至10度、10度至15度、15度至20度、20 度至25度、25度至30度、30度至35度、35度至40度、40度至45度、 45度至50度、50度至55度、55度至60度、60度至65度、65度至70 度、70度至75度或75度至80度)。
在一些实施例中，表面17158以角度17200倾斜，该角度17200相对于与侧向轴线(即，x轴)正交的纵向轴线(即，y轴)限定。在一些实施例中，角度17200的范围从大约1度至约80度(例如，至少大约1度至5 度、5度至10度、10度至15度、15度至20度、20度至25度、25度至 30度、30度至35度、35度至40度、40度至45度、45度至50度、50度至55度、55度至60度、60度至65度、65度至70度、70度至75度或75 度至80度)。
在一些实施例中，第一接触表面17156构造成在解锁状态下接合表面 17158并使覆盖件17112在基部17110上方保持对齐(例如，使得覆盖件 17112的周边边缘与基部17110的周边边缘齐平和/或基本对齐))。在一些实施例中，具有成角度的表面有利于第一接触表面17156和表面17158 的接合。此外，成角度的表面可以允许覆盖件17112在可释放锁定状态下容易地装配(例如，卡扣装配)到基部17110上，因为当将法向力施加到覆盖件表面时，第一接触表面抵靠彼此滑动。在一些实施例中，可运动凸片17154包括槽口17166，该槽口17166至少部分地由第一接触表面17156 限定。在一些实施例中，槽口17166具有大致矩形的U形，其宽度大约等于或大于不可运动凸片17150的宽度。在一些实施例中，不可运动凸片17150的尺寸可以定为紧密配合在槽口17166内。
图18A和18B示出了处于可释放锁定状态的示例性基底保持件18001，其中基底保持件18001的覆盖件18112可以搁置在基部18110的顶部上，并且锁定机构被接合，使得在覆盖件18112和基部18110的配合表面之间不存在间隙。如图所示，在可释放锁定状态下，覆盖件18112和基部18110 的配合表面可以直接接触。此外，在18A-B中的可释放锁定状态下，覆盖件18112的周向边缘可以与基部18110的周向边缘基本对齐。在一些实施例中，衬垫18118可以构造成当基底18114被基底保持件18001固定时，在衬垫18118和基底18114之间形成汽密密封和/或流体密封，并且覆盖件 18112和基部18110处于可释放锁定状态。
在一些实施例中，可运动凸片18154包括第二接触表面18170，第二接触表面18170构造成与基部18110的相应不可运动凸片18150接合，使得覆盖件18112和基部18110以可释放锁定状态接合。在一些实施例中，在覆盖件18112和基部18110处于可释放锁定状态时，每个可运动凸片18154 构造成弯曲以与不可运动凸片18150接合。在一些实施例中，当处于可释放锁定状态时，第二接触表面18170与不可运动凸片18150的表面18186 接合，如图18B所示。在一些实施例中，第二接触表面18170和表面18186 是平坦表面。
在一个方面，本公开包括一种使用本文所述的支承装置或基底保持件的方法。图19A-19E示出了用于组装支承装置19000的示例步骤。在一些实施例中，该方法包括通过将基底19114在箭头19174的方向上插入基部开口19172中，来将基底19114安装在基底保持件19001的基部19110上，如图19A所示。在一些实施例中，该方法包括将可移除插入件19108插入覆盖件19112的开口19116中。例如，用户可以将可移除插入件19108在箭头19176的方向上穿过覆盖件19112的下侧插入到开口19116中，如图 19B所示。在一些实施例中，将可移除插入件19108插入到开口19116中包括将插入凸片19126中的至少一个与覆盖件19112的开口19116的内侧壁19120中的至少一个接合。在一些实施例中，将可移除插入件19108插入件开口19116中包括将可移除插入件19108卡扣配合到覆盖件19112的开口19116中。
在一些实施例中，该方法包括在箭头19204的方向上将覆盖件19112 放置在基部19110上方，并且通过使可运动凸片19154的侧表面19162接触到每个引导部19160的侧表面19164，将覆盖件19112和基部19110对齐 (例如，使得覆盖件19112的周向边缘与基部19110的周向边缘齐平和/或基本对齐)，如图19C所示。在一些实施例中，该方法还包括使可运动凸片19154的第一接触表面19156与不可运动凸片19150的表面19158接合，使得覆盖件19112和基部19110在解锁状态下接合，如图19D所示。在一些实施例中，在解锁状态下将覆盖件19112与基部19110间隔开的间隙 19178可以允许用户调整可移除插入件19108在覆盖件19112的开口19116 内的位置，并调整包括衬垫的衬垫插入件19190在突起19124内的位置，而不使基底的表面与衬垫的表面接触。在一些实施例中，可移除插入件 19108与覆盖件19112可滑动地联接，使得可移除插入件19108能够沿着侧壁19120平移(如箭头19180所示)。类似地，在一些实施例中，衬垫与突起19124可滑动地联接，使得衬垫能够沿着突起19124的凹部(参见图 16B)平移(如标记19182所示)。
在一些实施例中，可移除插入件和垫圈的可滑动联接可有利地允许用户调整可移除插入件和/或垫圈的位置而不接触基底，这可避免潜在地损坏可能设置在基底的表面上的生物样本。在一些实施例中，方法包括将可移除插入件与设置在基底的表面上的生物样本的至少一部分对齐。例如，在一些实施例中，将可移除插入件与生物样本的至少一部分对齐，包括将垫圈的内边缘与生物样本的周边对齐和/或与基底上的感兴趣的区域(例如，样本区域)的周边对齐。在一些实施例中，将可移除插入件与生物样本的至少一部分对齐，包括定位可移除插入件，使得垫圈壁环绕生物样本或其一部分，例如，当基底保持件处于可释放锁定状态时。在一些实施例中，样本区域可以用标志物进行标记，该标志物为识别基底上的样本位置提供视觉标记(例如，见图19B的标志物19182)。
在一些实施例中，方法包括在箭头19184的方向上施加力，以将覆盖件19112卡扣配合到底部19110上，并将基底保持件19001置于可释放锁定状态，如图19E所示。在一些实施例中，通过使可运动凸片的第二接触表面19170与不可运动凸片19150的表面19186接合(参考图19C)使得覆盖件19112和基部19110在可释放锁定状态下接合，来使基底保持件置于可释放锁定状态。在一些实施例中，为了使第二接触表面19170与表面 19186脱离，并将基底保持件从可释放锁定状态变为解锁状态，用户可以远离基部的19110的侧壁19152弯曲并提起可运动凸片19154(如箭头19188 所示)，同时在相反方向上，例如，朝向侧壁19152(如箭头19190所示)，在不可运动凸片19150上施加力。
在某些实施例中，这里公开的是一种套件，其包括本公开的任何基底装置，其还包括基底保持件和一个或多个插入件，以及基底。在一些实施例中，该套件包括本文公开的任何基底保持件，本文公开的任何插入件，以及基底。在一些实施例中，该套件包括本文所述的任何基底保持件和本文所述的一个或多个插入件。在一些实施例中，该套件包括第一可移除插入件和第二可移除插入件(参见例如图1A-1B、图16A-16C)。在一些实施例中，第一可移除插入件限定第一插入件开口，该第一插入件开口的面积大于由第二可移除插入件限定的第二插入件开口的面积。在一些实施例中，第一插入件开口的面积大约等于第二插入件开口的面积。因此，在一些实施例中，本公开的套件使用户能够密封一个或多个样本，这些样本设置在基底上并具有不同的尺寸。在一些实施例中，该套件包括三个或更多个可移除插入件。
在一些实施例中，方法包括使用本文所述的支承装置或基底保持件对样本进行生物测定。在一些实施例中，样本是组织样本。在一些实施例中，样本是组织切片。在一些实施例中，将组织切片安装在基底上，例如，安装在载物片上。在一些实施例中，样本是新鲜冷冻组织或福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织。在一些实施例中，本文所述的支承装置用于支承可能包括生物样本(例如，冷冻组织或福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE) 组织)的基底。在一些实施例中，本文所述的支承装置可以在测定的各个阶段期间协助用户。例如，在一些实施例中，测定的各个阶段可以包括生物组织的染色(例如苏木精和/或伊红染色、抗体染色等)、样本的成像(例如显微镜成像，比如高分辨率显微镜成像)、样本的去交联、样本的脱色、测定的洗涤步骤、样本的消化或其任何组合。在一些实施例中，本文所述的支承装置或基底保持件可用于原位杂交测定。在一些实施例中，本文所述的支承装置或基底保持件可用于提取分析物(例如，核酸或蛋白质)。例如，本文所述的支承装置的插入件可以被调整和/或滑动，以便在测定的这些各个阶段期间容纳一个或多个生物样本。
在一些实施例中，本文公开的方法包括将设置在本文公开的任何基底的样本区域上的样本与一种或多种测定试剂溶液一起培育。在一些实施例中，该方法包括将基底安装在本文所公开的任何支承装置上。在一些实施例中，该方法还包括将基底和支承装置定位在加热装置(例如，实验室热板)上。在一些实施例中，该方法还包括启动加热设备，以将热量传递给样本(例如，经由基底的第二表面，该第二表面经由基底保持件的开口暴露)。
在一些实施例中，该方法可以包括将本文公开的任何插入件与支承装置一起使用。例如，该方法可以包括将一个或多个(例如，一个、两个、三个或四个)插入件插入到装载有基底(例如，载玻片)的支承装置的基部中，使得衬垫与基底的表面接触并产生密封(例如，汽密密封、液密密封和/或气密密封)。此外，该方法可包括通过在插入的插入件上方放置覆盖件以闭合支承装置并接合一个或多个锁定凸片以锁定支承装置(例如，将覆盖件固定到基部)，来锁定插入的插入件的位置(例如，插入到支承装置的基部中)。在一些实施例中，该方法可以包括通过使插入件的突起在凹部的导轨上滑动来调整插入件开口、衬垫开口或端口的位置，以及通过闭合和锁定支承装置(例如，从支承装置的打开位置切换到闭合和锁定位置)来锁定插入件的位置。在一些实施例中，该方法可以包括通过使可滑动插入件的凸缘在可滑动插入件的框架的凹部上滑动来调整插入件开口、衬垫开口或端口的位置，并通过闭合和锁定支承装置(例如，从支承装置的打开位置切换到闭合和锁定位置)来锁定可滑动插入件的位置。
图10示出了用于处理新鲜冷冻组织的示例性工作流和用于使用本文公开的支承装置处理FFPE组织的示例性工作流。在一些实施例中，新鲜冷冻组织工艺和FFPE组织工艺包括组织学、免疫染色和/或免疫组织化学步骤。例如，在一些实施例中，新鲜冷冻组织工艺和FFPE组织工艺开始于通过对样本进行切片并将样本(例如，如果样本是冷冻组织)固定在基底(例如，载玻片)上来制备样本(例如，生物样本)，如图10所示。在特定实施例中，该工艺开始于提供基底，基底具有安装在其上的切片的和固定的组织样本。替代地，在一些实施例中，样本被切片，安装在基底上，并从样本中去除石蜡(例如，如果样本已经固定并包埋在石蜡中)，如FFPE组织工艺中所示。在特定实施例中，新鲜冷冻组织工艺和FFPE组织工艺开始于提供其上安装有FFPE组织切片的基底。接下来，在一些实施例中，样本(设置在基底上)可以用苏木精和伊红(H&E)染色或通过使用本公开的支承装置进行去交联和/或免疫染色。例如，可以将包括样本的基底插入基底保持件中，并且由插入件的衬垫形成的密封件可以形成封闭样本的井孔。在一些实施例中，井孔可以容纳在样本的处理(例如，H&E染色、免疫染色等)中使用的一定体积的液体(例如，一种或多种试剂)。在一些实施例中，将包括样本的基底从支承装置中移除并成像。接下来，可以将包括样本的基底放回基底保持件中以进行下一阶段的处理。在用于处理新鲜冷冻组织的示例性工作流中，处理的下一阶段可以包括使用支承装置进行脱色、脱模、伊红染色或其任何组合。在用于处理FFPE组织的示例性工作流中，处理的下一阶段可以包括使用支承装置进行脱色、去交联、从基底卸下或其任何组合。用于处理FFPE组织的示例工作流还可以包括RNA模板连接(RTL)。
在用于新鲜冷冻组织和/或FFPE组织的示例工作流中，来自样本的分析物可以经由捕获探针(例如，空间条形码特征)进行分析物标记和/或捕获。
通常，对于基于空间阵列的方法，基底用作将捕获探针直接或间接附连到阵列的特征的支承件。“特征”是作为空间分析中使用的各种分子实体的支承件或存储库的实体。在一些实施例中，阵列中的一些或所有特征被功能化以用于分析物捕获。示例性基底在WO2020/176788和/或美国专利申请公开号2020/0277663的部分(II)(c)中进行了描述。阵列的示例特征和几何属性可在WO 2020/176788和/或美国专利申请公开号 2020/0277663的部分(II)(d)(i)、(II)(d)(iii)和(II)(d)(iv) 中找到。
通常，当生物样本与包括捕获探针的基底(例如，具有嵌入、点样、印制、制造在基底上的捕获探针的基底，或具有包括捕获探针的特征(例如凸边、井孔)接触时，可以捕获分析物和/或中间剂(或其部分)如本文所用，生物样本与基底的“接触”、“被接触”和/或“正接触”是指任何接触(例如，直接或间接)，使得捕获探针能够(例如，共价结合或非结合(例如杂交)与来自生物样本的分析物相互作用。可以主动(例如，使用电泳)或被动(例如，使用扩散)实现捕获。WO 2020/176788和/或美国专利申请公开号2020/0277663的部分(II)(e)中进一步描述了分析物捕获。
在一些情况下，可以通过将具有捕获探针(例如，空间条形码)的分子(例如，肽、脂质或核酸分子)附连和/或引入到生物样本(例如，引入到生物样本中的细胞)。在一些实施例中，将具有多个捕获探针(例如，多个空间条形码)的多个分子(例如，多个核酸分子)引入到生物样本(例如，引入生物样本中的多个细胞)用于空间分析。在一些实施例中，在将具有捕获探针的分子附连和/或引入到生物样本(例如，空间条形码特征) 之后，可以将生物样本物理分离(例如，解离)成单个细胞或细胞群以用于分析。在WO 2020/176788和/或美国专利申请公开号2020/0277663的部分(III)中描述了一些这种空间分析方法。
RTL的方法之前已经描述过。参见，例如，Credle等人，核酸研究 (Nucleic AcidsRes.)，2017年8月21日；45(14)：e128。通常，RTL 包括两个寡核苷酸与分析物(例如，RNA分子，比如mRNA分子)上的相邻序列的杂交。在一些情况下，寡核苷酸是DNA分子。在一些情况下，寡核苷酸中的一个在3’端处包括至少两个核糖核酸碱基和/或另一个寡核苷酸在5’端处包括磷酸化核苷酸。在一些情况下，两个寡核苷酸中的一个包括捕获域(例如，多聚(A)序列、非均聚序列)。在与分析物杂交后，连接酶(例如，SplintR连接酶)将两个寡核苷酸连接在一起，产生连接产物。在一些情况下，这两种寡核苷酸与彼此不相邻的序列杂交。例如，两种寡核苷酸的杂交会在杂交的寡核苷酸之间产生间隙。在一些情况下，聚合酶 (例如，DNA聚合酶)可以在连接之前使寡核苷酸之一延伸。
在连接后，连接产物从分析物中释放出来。在一些实施例中，连接的探针(例如连接产物)的释放包括使生物样本与包含透化剂和用于释放连接的探针(例如连接产物)的试剂的试剂介质接触，从而使生物样本透化并从分析物中释放连接的探针(例如连接产物)。在一些实施例中，用于释放连接的探针的试剂(例如，连接产物)包含核酸酶。在一些实施例中，核酸酶是核酸内切酶。在一些实施例中，核酸酶是核酸外切酶。在一些实施例中，核酸酶包括核糖核酸酶(RNase)。在一些实施例中，核糖核酸酶选自核糖核酸酶A、核糖核酸酶C、核糖核酸酶H或核糖核酸酶I。在一些实施例中，试剂介质还包括透化剂。在一些实施例中，释放还包括同时透化生物样本和从分析物释放捕获剂条形码域。在一些实施例中，透化剂还包括蛋白酶。在一些实施例中，蛋白酶选自胰蛋白酶、胃蛋白酶、弹性蛋白酶或蛋白酶K。在一些实施例中，试剂介质还包括去污剂。在一些实施例中，去污剂选自十二烷基硫酸钠(SDS)、肌氨酰、皂苷、特里同(Triton) X-100TM或吐温(Tween)-20TM。在一些实施例中，试剂介质包括小于5w/v％的选自十二烷基硫酸钠(SDS)和肌氨酰的去污剂。在一些实施例中，试剂介质包括至少5％w/v％的选自SDS和肌氨酰的去污剂。在一些实施例中，试剂介质不包括SDS或肌氨酰。在一些实施例中，试剂介质包括十二烷基硫酸钠(SDS)、蛋白酶K、胃蛋白酶、N-月桂酰肌氨酸、核糖核酸酶及其钠盐中的一种或多种。然后可以通过阵列上的捕获探针(例如，代替直接捕获分析物)捕获释放的连接产物，可选地扩增和测序，从而确定生物样本中分析物的位置和可选地丰度。
在空间信息分析期间，使用例如捕获探针，获得与分析物相关的捕获探针(例如，空间条形码)的序列信息，并且序列信息可用于提供关于在生物样本中的分析物的空间分布的信息。可以使用各种方法来获得空间信息。在一些实施例中，特定的捕获探针和它们捕获的分析物与基底上的特征阵列中的特定位置相关联。例如，在阵列制造之前，特定的捕获探针可以与特定的阵列位置相关联，并且可以将捕获探针的序列与特定的阵列位置信息一起存储(例如，在数据库中)，以便每个捕获探针唯一地映射到特定的阵列位置。
替代地，可以在制造期间将特定的捕获探针沉积在特征阵列中的预定位置，使得在每个位置处，仅存在一种类型的捕获探针，从而捕获探针与阵列的单个特征唯一相关联。必要时，可以对阵列进行解码，以便捕获探针与阵列特征位置唯一关联，并且可以如上所述存储该映射。
当在空间信息分析期间获得用于捕获探针和/或分析物的序列信息时，捕获探针和/或分析物的位置可以通过参考将每个捕获探针与阵列特征位置唯一关联的存储信息来确定。这样，特定的捕获探针和捕获的分析物与特征阵列中的特定位置相关联。每个阵列特征位置表示相对于阵列的坐标参考点(例如阵列位置、基准标记)的位置。因此，每个特征位置在阵列的坐标空间中都具有“地址”或位置。
在一些实施例中，“新鲜冷冻组织”和“FFPE组织”工艺都包括在脱色和脱模(“新鲜冷冻组织”工艺)或添加捕获探针(CP)(“FFPE组织”工艺)之后，通过使用本公开的支承装置用伊红对样本进行染色的可选步骤。接下来，在一些实施例中，在使样本经受逆转录、第二链cDNA 合成和cDNA文库制备之前，通过添加一种或多种合适的试剂(例如，核糖核酸酶、proK和/或肌氨酰)来使样本透化。
夹层工艺
在一些实施例中，在夹层工艺期间发生透化步骤。在一些实施例中，夹层工艺包括将第一基底(例如，本文所述的任何基底)与第二基底夹在一起，第二基底具有带有捕获探针的阵列。
(i)夹层工艺的高级概述
图13是描绘在包括生物样本的第一基底(例如，载物片13125上的组织切片13124)和包括空间条形码阵列的第二基底(例如，填充有空间条形码捕获探针13128)之间的示例性夹层工艺13000的示意图。在示例性夹层工艺期间，第一基底与第二基底对齐，使得生物样本的至少一部分与阵列的至少一部分对齐(例如，在夹层构造中对齐)。如图所示，载物片13126 位于载物片13125的上方位置。在一些实施例中，载物片13125可以定位在载物片13125上方。在一些实施例中，第一基底和第二基底对齐以保持在两个基底之间的间隙或分离距离13129。当第一基底和第二基底对齐时，一种或多种分析物从生物样本中释放出来并主动或被动地迁移到阵列以用于捕获。在一些实施例中，在生物样本和阵列的对齐部分与试剂介质13127 接触的同时发生迁移。释放的一种或多种分析物可以朝向捕获探针13128经由试剂介质13127主动或被动地横跨间隙13129迁移，并被捕获探针 13128捕获。
(ii)夹层装置/阵列对齐装置
在一些实施例中，在夹层工艺中使用阵列对齐装置。在一些实施例中，将第一基底和第二基底放置在阵列对齐装置中，该阵列对齐装置构造成对齐第一基底和第二基底(例如，生物样本和阵列)。在一些实施例中，阵列对齐装置包括分别接纳第一基底和第二基底的第一构件和第二构件。该装置可以包括连接到至少一个构件并对齐第一构件和第二构件的对齐机构。因此，阵列对齐装置可以有利地对齐第一基底和第二基底以及可能在第一基底和第二基底的表面上的任何样本、捕获探针(例如，条形码探针) 和/或透化试剂。在PCT专利申请公开第WO 2020/123320号中描述了示例装置和示例阵列对齐装置，该专利申请的全部内容以参见的方式纳入本文。其它示例阵列对齐装置在2021年6月10日提交的PCT专利申请公开号 WO 2021/252747和在2021年9月17日提交的PCT/US2021/050931中进行了描述，它们的全部内容以参见的方式纳入。
虽然本说明书包含许多具体实施方式的细节，但这些细节不应被解释为对任何技术或可能要求保护的内容的范围的限制，而是对可能特定于具体实施例的特征的描述。本说明书中在各单独的实施例的上下文中描述的某些特征还可部分地或全部地在单个实施例中组合地实施。相反地，在单个实施例的上下文中描述的各种特征还可在多个实施例中单独地或以任何合适的子组合实施。此外，虽然本文中可能将特征描述成以特定的组合作用和/或最初要求如此，但来自所要求保护的组合的一个或多个特征可在某些情形中从组合中被消除，且所要求保护的组合可涉及子组合或子组合的变化。
类似地，尽管在附图中以特定的次序描述操作，但这不应被理解为需要这些操作以所示的特定次序或以依次的顺序被执行或所有所示操作都要被执行以获得期望的结果。在某些情况中，多任务和并行加工可能是有利的。已描述了主题的特定实施例。其它实施例在权利要求书的范围内。
套件
在一些实施例中，本文还提供了套件，其包括本文所述的一个或多个基底保持件和用于执行本文公开的任何一种方法的指令。在一些情况下，该套件包括一种或多种测定试剂。在一些实施方案中，测定试剂包括本文别处描述的一种或多种试剂介质。例如，在一些实施例中，测定试剂包括透化剂。在一些实施例中，透化剂还包括蛋白酶。在一些实施例中，蛋白酶选自胰蛋白酶、胃蛋白酶、弹性蛋白酶或蛋白酶K。在一些实施例中，试剂介质还包括去污剂。在一些实施例中，去污剂选自十二烷基硫酸钠 (SDS)、肌氨酰、皂苷、特里同X-100TM或吐温-20TM。在一些实施例中，试剂介质包括小于5w/v％的选自十二烷基硫酸钠(SDS)和肌氨酰的去污剂。在一些实施例中，试剂介质包括至少5％w/v％的选自SDS和肌氨酰的去污剂。在一些实施例中，试剂介质不包括SDS或肌氨酰。在一些实施例中，试剂介质包括十二烷基硫酸钠(SDS)、蛋白酶K、胃蛋白酶、 N-月桂酰肌氨酸、核糖核酸酶及其钠盐中的一种或多种。
在一些情况下，该套件包括板。在一些实施例中，板具有第一表面和第二表面。在一些实施例中，第一表面包括一个或多个平台，平台构造成接纳基底保持件。在一些实施例中，平台是板的第一表面的升高的水平部分。在一些实施例中，第二表面构造成由加热装置(例如，热循环仪)接纳。在一些实施例中，板通常由导热材料形成以促进加热装置和基底保持件之间的热传递。在一些实施例中，板可以由金属构成，比如但不限于铝和/或不锈钢。在一些实施例中，该套件包括一个或多个磁性分离器。在一些实施例中，一个或多个磁性分离器可用于从悬浮液或生物样本中分离顺磁性和铁磁性颗粒。
系统
在一些实施例中，本文还提供了系统，系统包括一个或多个本文所述的基底保持件和包括生物样本的基底。在一些实施例中，系统还包含一种或多种测定试剂。在一些实施方案中，一种或多种测定试剂是本文别处描述的任何测定试剂。在一些实施例中，系统还包括加热装置。在一些实施例中，加热装置是热循环仪或循环变温加热器。在一些实施例中，加热装置是用于以离散的预编程步骤控制生物样本(例如，基底上的生物样本) 的温度的装置。在一些实施例中，加热装置使生物样本的温度升高和降低。在一些实施例中，加热装置用于经由聚合酶链式反应((PCR)扩增核酸片段(例如，DNA和/或RNA)。在一些实施例中，加热装置控制基底上的生物样本的温度，该基底装载在本文所述的任何基底保持件中。
其它实施例
应理解虽然本实用新型已结合其详述进行描述，但以上描述意在说明而不是限制本实用新型的范围，该范围由所附权利要求书的范围限定。
所公开的是可以用于所公开的方法、可以与所公开的方法结合、可以用于准备所公开的方法或为所公开的方法的产品的系统、设备(例如，装置)和方法。本文公开了这些和其它的系统、设备和方法，并且应当理解的是，这些系统、设备和方法的组合、子集、交互、分组等都被公开。即，虽然可能没有明确公开对这些系统、设备和方法的每一个单独和集体的组合和排列的具体参考，但这些每一个都在本文中被具体考虑和描述。例如，如果公开和讨论了具体的系统、设备或具体的方法，并且讨论了许多系统、设备或方法，那么除非特别指出相反的情况，否则这些系统、设备和方法的每一种组合和排列方式都是具体考虑的。同样，这些内容的任何子集或组合也被具体考虑并公开。
其它方面、优势和修改在所附权利要求书的范围内。
Claims (49)
1.一种基底保持件，包括：
基部，所述基部构造成接纳基底；
覆盖件，所述覆盖件构造成与所述基部匹配地接合，所述覆盖件限定由内侧壁形成的开口；以及
限定表面的可移除插入件，所述可移除插入件构造成接纳在所述覆盖件的所述开口内，所述可移除插入件包括：
衬垫；
联接到所述衬垫的突起；以及
至少两个插入凸片，所述至少两个插入凸片从所述可移除插入件的相对侧延伸，每个插入凸片构造成与形成所述覆盖件的所述开口的所述内侧壁中的至少一个接合。
2.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，每个插入凸片沿同一平面方向延伸所述可移除插入件的所述表面。
3.根据权利要求1或2所述的基底保持件，其特征在于，所述插入凸片构造成与所述覆盖件的所述内侧壁接合，使得所述可移除插入件的所述表面变得与所述覆盖件的表面基本齐平。
4.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，所述覆盖件的所述内侧壁中的所述至少一个是倾斜的。
5.根据权利要求4所述的基底保持件，其特征在于，所述插入凸片包括倾斜表面，所述倾斜表面构造成与所述覆盖件的所述内侧壁中的至少一个接合。
6.根据权利要求5所述的基底保持件，其特征在于，所述倾斜表面由与所述覆盖件的所述内侧壁的角度互补的角度限定。
7.根据权利要求5所述的基底保持件，其特征在于，所述倾斜表面由与所述覆盖件的所述倾斜的内侧壁的角度互补的角度限定。
8.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，所述可移除插入件构造成卡扣配合在所述覆盖件的所述开口内。
9.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，所述可移除插入件包括三个插入凸片。
10.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，所述衬垫包括联接到所述可移除插入件的衬垫壁。
11.根据权利要求10所述的基底保持件，其特征在于，所述衬垫包括从所述衬垫壁的表面延伸的凸缘。
12.根据权利要求11所述的基底保持件，其特征在于，所述可移除插入件的突起包括构造成接纳所述凸缘的凹部。
13.根据权利要求12所述的基底保持件，其特征在于，所述凸缘能在所述凹部内调整或滑动。
14.根据权利要求11所述的基底保持件，其特征在于，所述可移除插入件的所述突起包括至少一个保持凸片，所述至少一个保持凸片构造成与所述凸缘接合。
15.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，当所述基部不与所述覆盖件接合时，所述突起的位置能在所述开口内调整或滑动。
16.根据权利要求1所述的基底保持件，其特征在于，所述基部包括从其侧壁中的至少两个延伸的不可运动凸片，其中，所述覆盖件包括构造成与所述基部的所述不可运动凸片接合的可运动凸片，并且其中，每个可运动凸片包括第一接触表面和第二接触表面，所述第一接触表面和所述第二接触表面构造成与所述基部的相应的不可运动凸片接合，所述第一接触表面构造成与相应的不可运动凸片接合，使得所述覆盖件和所述基部在解锁状态下接合，并且其中，所述第二接触表面构造成与相应的不可运动凸片卡合，使得所述覆盖件与所述基部处于可释放锁定状态。
17.一种基底保持件，包括：
构造成接纳基底的基部，所述基部包括从其侧壁中的至少两个延伸的不可运动凸片；以及
覆盖件，所述覆盖件构造成与所述基部匹配地接合，所述覆盖件限定开口，所述开口构造成接纳可移除插入件，所述覆盖件包括构造成与所述基部的所述不可运动凸片接合的可运动凸片，
其中，每个可运动凸片包括第一接触表面和第二接触表面，所述第一接触表面和所述第二接触表面构造成与所述基部的相应的不可运动凸片接合，所述第一接触表面构造成与相应的不可运动凸片接合，使得所述覆盖件和所述基部在解锁状态下接合，并且其中，所述第二接触表面构造成与相应的不可运动凸片卡合，使得所述覆盖件与所述基部处于可释放锁定状态。
18.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，每个可运动凸片构造成在所述覆盖件和所述基部处于可释放锁定状态时弯曲以与每个不可运动凸片接合。
19.根据权利要求17或18所述的基底保持件，其特征在于，每个可运动凸片构造成在所述覆盖件和所述基部处于可释放锁定状态时弯曲以与所述不可运动凸片接合。
20.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，每个可运动凸片的所述第一接触表面构造成定位在相应的不可运动凸片的表面上。
21.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述可运动凸片的所述第一接触表面构造成定位在相应的不可运动凸片的表面上。
22.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，在所述解锁状态或所述可释放锁定状态下，所述覆盖件的周向边缘与所述基部的周向边缘基本对齐。
23.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述覆盖件和所述基部的配合表面在所述解锁状态下被间隙间隔开。
24.根据权利要求23所述的基底保持件，其特征在于，所述间隙在尺寸上构造成便于所述可移除插入件在所述解锁状态下在所述覆盖件的所述开口内的可运动调整。
25.根据权利要求23所述的基底保持件，其特征在于，所述覆盖件和所述基部的所述配合表面在所述可释放锁定状态下直接接触。
26.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述可运动凸片包括至少部分地由所述第一接触表面限定的槽口。
27.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述不可运动凸片的所述第一接触表面包括成角度的表面。
28.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述基部包括从所述基部的侧壁延伸的成对引导部。
29.根据权利要求28所述的基底保持件，其特征在于，每个引导部构造成接触可运动凸片的侧表面。
30.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述可移除插入件包括衬垫和联接到所述衬垫的突起。
31.根据权利要求30所述的基底保持件，其特征在于，所述衬垫构造成当所述基底被所述基底保持件固定并且所述覆盖件和所述基部处于所述可释放锁定状态时，在所述衬垫和所述基底之间形成汽密密封。
32.根据权利要求30所述的基底保持件，其特征在于，所述衬垫构造成当所述基底被所述基底保持件固定并且所述覆盖件和所述基部处于所述可释放锁定状态时，在所述衬垫和所述基底之间形成流体密封。
33.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述基底保持件包括第一可移除插入件和第二可移除插入件。
34.根据权利要求33所述的基底保持件，其特征在于，所述第一可移除插入件限定第一插入件开口，所述第一插入件开口的面积大于由所述第二可移除插入件限定的第二插入件开口的面积。
35.根据权利要求34所述的基底保持件，其特征在于，所述第一插入件开口的面积大约等于所述第二插入件开口的面积。
36.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述基底保持件包括三个或更多个可移除插入件。
37.根据权利要求30所述的基底保持件，其特征在于，所述基底是载玻片。
38.根据权利要求37所述的基底保持件，其特征在于，所述基底包括生物样本。
39.根据权利要求38所述的基底保持件，其特征在于，所述衬垫构造成与所述生物样本的至少一部分对齐。
40.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述覆盖件包括从所述覆盖件的表面延伸的一个或多个肋。
41.根据权利要求34所述的基底保持件，其特征在于，所述第一插入件开口和所述第二插入件开口小于所述覆盖件的所述开口。
42.根据权利要求17所述的基底保持件，其特征在于，所述插入件开口小于所述覆盖件的所述开口。
43.一种支承装置，其特征在于，所述支承装置包括根据权利要求1-42中任一项所述的基底保持件。
44.一种系统，包括：
a)根据权利要求1-43中任一项所述的基底保持件，以及
b)包括生物样本的基底。
45.根据权利要求44所述的系统，其特征在于，还包括一种或多种测定试剂。
46.根据权利要求44-45中任一项所述的系统，其特征在于，还包括加热装置。
47.根据权利要求46所述的系统，其特征在于，还包括具有第一表面和第二表面的板，所述第一表面包括一个或多个平台，所述一个或多个平台构造成接纳所述基底保持件，并且所述第二表面构造成由所述加热装置接纳。
48.根据权利要求47所述的系统，其特征在于，所述板由金属构成。
49.根据权利要求44-45中任一项所述的系统，其特征在于，还包括磁性分离器。
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