CN1954076A - 产生精细化学品的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及在生物(如微生物、非人动物或植物)中产生甲硫氨酸的方法。本发明还涉及核酸分子、多肽、核酸构建体、载体、反义分子、抗体、宿主细胞、植物组织、繁殖材料、收获的材料、植物、微生物以及农业组合物及其用途。

Description

产生精细化学品的方法
本发明涉及在生物(如微生物、非人动物或植物)中产生甲硫氨酸的方法。本发明还涉及核酸分子、多肽、核酸构建体、载体、反义分子、抗体、宿主细胞、植物组织、繁殖材料、收获的材料、植物、微生物以及农业组合物及其用途。
氨基酸用于许多工业分支中,包括食品、动物饲料、化妆品、制药和化学工业。如D、L-甲硫氨酸、L-赖氨酸或L-苏氨酸的氨基酸用于动物饲料工业。必需氨基酸:缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸对人类和大量家畜物种尤其重要。甘氨酸、L-甲硫氨酸和色氨酸都用于制药工业。谷氨酰胺、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、组氨酸、精氨酸、脯氨酸、丝氨酸和丙氨酸用于制药和化妆品工业。苏氨酸、色氨酸和D、L-甲硫氨酸是广泛使用的饲料添加剂(Leuchtenberger,W.(1996)Amino acids-technical production and use,Rehm等(编)Biotechnology第6卷,14a章,VCH Weinheim中的466-502页)。另外,氨基酸作为合成氨基酸和蛋白质,如N-乙酰半胱氨酸、S-羧甲基-L-半胱氨酸、(S)-5-羟色氨酸和Ullmann′s Encyclopedia ofIndustrial Chemistry,A2卷,57-97页,VCH Weinheim,1985中所述的其他物质的合成前体适用于化学工业。
现在每年产生超过一百万吨氨基酸,其市场价值超过25亿美元。它们现在通过四种竞争的方法产生:从蛋白质水解物中提取,例如L-半胱氨酸、L-亮氨酸或L-酪氨酸;化学合成,例如D、L-甲硫氨酸;在酶或细胞反应器中从化学前体转化,例如L-苯丙氨酸;和以工业规模通过培养细菌发酵产生,所述细菌已经发展产生并分泌大量的所需目的分子。特别适用于该目的的生物为用于产生例如L-赖氨酸或L-谷氨酸的谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)。其他通过发酵产生的氨基酸为例如L-苏氨酸、L-色氨酸、L-天冬氨酸和L-苯丙氨酸。
天然氨基酸在能够产生它们的生物(如细菌)中的生物合成已被充分表征,细菌氨基酸生物合成及其调节可参阅Umbarger,H.E.(1978)Ann.Rev.Biochem.47:533-606。
已知通过发酵棒杆菌菌株特别是谷氨酸棒杆菌产生氨基酸。由于它们非常重要,所以其产生方法一直在不断的改进。方法的改进可以涉及关于发酵的技术方面的措施,例如搅拌和氧供应;或关于营养培养基组合物的技术方面的措施,例如发酵时的糖浓度;或涉及产物的检查,例如通过离子交换层析;或涉及微生物本身的内在性能特性。来自其他属的细菌如大肠杆菌或芽孢杆菌也用于产生氨基酸。已经通过菌株选择发展了从含硫精细化学品产生一类所需化合物的大量突变株。就特定分子的产生而言,通过诱变、选择和突变体选择提高所述微生物的性能特性。还发展了产生甲硫氨酸的方法。以这种方式得到例如对抗代谢物(如甲硫氨酸的类似物α-甲基甲硫氨酸、乙基硫氨酸、正亮氨酸、N-乙酰基正亮氨酸、S-三氟甲基同型半胱氨酸、2-氨基-5-heprenoitic酸、硒代甲硫氨酸、甲硫氨酸、丁胱亚磺酰亚胺(sulfoximine)、methoxine、1-氨基环戊烷羧酸)有抗性或为具有调节重要性的代谢物缺陷型并产生含硫精细化学品(如L-甲硫氨酸)的菌株。然而,这些发展来产生甲硫氨酸的方法的缺点为其产量太低不能经济的开发,因此它们现在仍不能与化学合成竞争。
Zeh(Plant Physiol.,127卷,2001:792-802)描述了通过已知的反义技术抑制苏氨酸合酶来提高马铃薯植物中的甲硫氨酸含量。这引起降低的苏氨酸合酶活性而植物中的苏氨酸含量没有降低。该技术非常复杂,酶活性必须以高度分化的方式进行抑制,否则将发生氨基酸营养缺陷,且植物将停止生长。
US5,589,616教导了通过在双子叶植物中过表达单子叶植物的储存蛋白从而在植物中产生较多数量的氨基酸。WO96/38574、WO97/07665、WO97/28247、US4,886,878、US5,082,993和US5,670,635遵循了这一方法。这意味着在全部前述知识产权中,在植物中表达了不同的蛋白质或多肽。所述蛋白质或多肽应作为氨基酸池发挥作用。提高氨基酸(如赖氨酸)的其他方法述于WO95/15392、WO96/38574、WO89/11789或WO93/19190。在这种情况下氨基酸生物合成途径中的特异酶(如二氢吡啶二羧酸合酶)是失调的。这引起不同植物中赖氨酸产量的提高。提高植物中氨基酸水平的其他方法公开于EP-A-0 271 408。EP-A-0 271 408教导了诱变植物并随后用氨基酸生物合成途径中某些酶的抑制剂进行选择。
数年来,已通过扩增单个氨基酸生物合成基因并考查对氨基酸产生的影响将重组DNA技术的方法用于改进产生L-氨基酸的棒杆菌菌株。
如前述,必需氨基酸对人类和很多哺乳动物如家畜是必要的。L-甲硫氨酸作为甲基基团供体对例如胆碱、肌酸、肾上腺素、碱基和RNA和DNA、组氨酸的生物合成、在形成S-腺苷甲硫氨酸后的转甲基作用或作为巯基供体对半胱氨酸的形成都非常重要。另外,L-甲硫氨酸表现出对抑郁症的积极作用。
改进粮食和动物饲料的品质是食品和饲料工业的重要任务。这是必要的,因为例如植物中存在的某些氨基酸对于哺乳动物的需求而言十分有限。由于其他氨基酸突然成为限制因素,食品中大大超过特定浓度的氨基酸对食品的利用没有其他积极作用,因此对粮食和动物饲料的品质而言特别有利的是尽可能平衡的氨基酸谱。只能通过添加在这些条件下成为限制因素的其他氨基酸进一步提高品质。靶向添加合成产品形式的受限氨基酸必须极其小心的进行,以避免氨基酸失衡。例如,添加必需氨基酸刺激蛋白质消化,尤其可能引起第二种或第三种受限氨基酸不足的情况。在喂养实验(例如酪蛋白喂养实验)中,额外提供酪蛋白中有限的甲硫氨酸表现出肝中的脂肪变性,所述脂肪变性只能通过额外添加色氨酸来减轻。
因此为保证食品和动物饲料的高品质,有必要以适合生物的平衡方式添加多种氨基酸。
本发明的目的之一是开发合成L-甲硫氨酸的廉价方法。L-甲硫氨酸与赖氨酸或苏氨酸一起取决于生物,两种氨基酸之一常是限制性的。
现在发现通过提供本文所述的本发明方法和权利要求书中所表征的实施方案实现了该目的。
因此,在第一个实施方案中,本发明涉及产生精细化学品的方法,其中精细化学品为甲硫氨酸。因此,本发明中所使用的术语“精细化学品”涉及“甲硫氨酸”。另外,本文中使用的术语“精细化学品”还涉及含有甲硫氨酸的精细化学品。
在一个实施方案中,术语“精细化学品”指L-甲硫氨酸。在说明书全篇中术语“精细化学品”指游离形式或与蛋白质结合的L-甲硫氨酸、其盐、酯或酰胺。在优选的实施方案中,术语“精细化学品”指游离形式或盐或与蛋白质结合的L-甲硫氨酸。
因此本发明涉及产生甲硫氨酸的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)在非人生物中减少或缺失如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:20、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283中所述蛋白质所表现出的生物活性,和
(b)在允许在所述生物中产生甲硫氨酸的条件下培养该生物。
有利的是,产生该精细化学品的方法引起该精细化学品的增强产生。术语“增强的”或“提高”指与如下定义的参考比较,精细化学品的产生至少提高10%、20%、30%、40%、或50%,优选至少60%、70%、80%、90%或100%,更优选150%、200%、300%、400%或500%,所述比较是指与没有如前述对本发明蛋白质的生物活性进行修饰的生物相比较。
优选该方法还包括从生物和/或用于培养或维持所述生物的培养基中回收生物合成的精细化学品的步骤。
术语“回收”指以不同纯度分离精细化学品,这一方面指收获含有该精细化学品的生物材料不进一步纯化,另一方面精细化学品的纯度在5%和100%纯度之间,优选纯度在10%和95%范围内,更优选纯度在20%、30%、40%或50%和60%、70%、80%或90%之间。
令人吃惊的是,在拟南芥中转基因减少或缺失本发明蛋白质的表达赋予转化植物提高的精细化学品含量。
对本发明而言,术语“生物”在本文中都应理解为涉及非人生物,具体涉及动物或植物(整个生物或其细胞)或微生物。另外,术语“动物”在本文中都应理解为涉及非人动物。
就本发明而言,如果减少或缺失蛋白质或多肽的从头产生活性或生物活性引起精细化学品的提高,则其具有“SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283中所述蛋白质的活性或优选生物活性”。这意味着减少或缺失其生物活性(例如酶活性)与精细化学品的产生具有某种相关性。在本说明书全篇中,减少或缺失这类前述蛋白质或多肽或编码这类蛋白质或多肽的核酸分子或序列的生物活性是指其生物活性(如酶活性)与SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283中所述蛋白质的生物活性相比减少至少10%,优选20%、30%、40%或50%,特别优选60%70%或80%,最特别优选90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。在本说明书全篇中,缺失SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283中所述蛋白质的生物活性是指活性的完全丧失。减少或缺失生物活性引起精细化学品提高至少10%、20%、30%、40%、50%、100%、150%或200%,优选至少250%或300%,特别优选至少350%或400%,最特别优选至少500%或600%或更多。
术语“减少”、“降低”或“缺失”涉及生物、生物部分(如组织、种子、根、叶、花等)或细胞中相应的性质的改变。在“性质的改变”中,应当理解基因产物的活性、表达水平或数量或代谢物的含量是在特定体积中或特定蛋白质数量中相对于相应体积或蛋白质数量的对照、参考或野生型而有所改变。当减少、降低或缺失涉及基因产物活性的减少、降低或缺失时,优选减少、降低或缺失了体积中的全部活性,并且不依赖于基因产物的数量或基因产物的比活性或者两者是否减少、降低或缺失,也不依赖于编码基因产物的核酸序列或基因的数量、稳定性或翻译效率或是否减少、降低或缺失。
术语“减少”、“降低”或“缺失”包括所述性质只在本发明研究对象的部分有所变化,例如修饰可见于细胞区室(如细胞器),或植物部分(如组织、种子、根、叶、花等)中,但是如果检测整个研究对象(即完整的细胞或植株),则检测不到。优选“减少”、“降低”或“缺失”见于细胞,因此术语“活性的减少、降低或缺失”或“代谢物含量的减少、降低或缺失”涉及与野生型细胞相比,细胞中的减少、降低或缺失。另外,术语“减少”、“降低”或“缺失”包括所述特性只在本发明方法所使用生物的不同生长期中的变化,例如减少、降低或缺失只在种子生长或开花时发生。此外,术语包括例如由于使用的RNAi未稳定整合在生物基因组中并因此只有瞬时效应的转录减少、降低或缺失。
因此,术语“减少”、“降低”或“缺失”是指酶或其他蛋白质或调节RNA的比活性以及化合物或代谢物(例如本发明的多肽、核酸分子或高纯度化学物或编码RNA或DNA)的数量在单位体积内减少、降低或缺失。
术语“野生型”、“对照”或“参考”可互换使用并可以是细胞或生物的一部分(如细胞器或组织)或生物,尤其是未经根据本发明的方法修饰或处理的微生物或植物。相应地,作为野生型、对照或参考的细胞或生物的一部分(如细胞器或组织)或生物(尤其是微生物或植物)要与细胞、生物或其局部尽可能地吻合,且除本发明方法结果外的任何其他性质与本发明的研究对象尽可能一致。因此,野生型、对照或参考的处理要一致或尽可能一致,即只有不影响测试性质的质量的条件或性质才可不同。
优选地,任何比较要在类似条件下进行。术语“类似条件”是指要比较的实验之间的所有条件,例如培养或生长条件,实验条件(例如缓冲液组成、温度、底物、病原菌株、浓度等)保持一致。
“参考”、“对照”或“野生型”优选未根据本文所述本发明方法修饰或处理并且其他任何性质与本发明研究对象尽可能相似的对象,如细胞器、细胞、组织、生物,尤其是植物或微生物。参考、对照或野生型在基因组、转录组、蛋白质组或代谢组方面与本发明的研究对象尽可能相似。优选地,术语“参考”“对照”或“野生型”细胞器、细胞、组织或生物(尤其是植物或微生物)涉及与本发明细胞器、细胞、组织或生物(尤其是植物或微生物)在遗传上几乎一致的细胞器、细胞、组织或生物(尤其是植物或微生物),优选95%,更优选98%,甚至更优选99.00%,尤其特别优选99.10%、99.30%、99.50%、99.70%、99.90%、99.99%、99.999%或更高的同一性。最优选“参考”、“对照”或“野生型”是与本发明方法使用的生物、细胞或细胞器遗传上一致的对象,如细胞器、细胞、组织或生物,除非核酸分子及它们编码的基因产物根据本发明的方法有所改变。
优选的,参考、对照或野生型只在由例如本发明核酸分子水平减少、降低或缺失或本发明多肽的比活性减少、降低或缺失引起的本发明多肽或RNA的细胞活性方面与本发明的对象有区别,例如通过或在蛋白质或RNA的表达水平或活性上是指它的生物活性和/或其生化或遗传原因。
术语“表达”是指基因转录为结构RNA(rRNA、tRNA、miRNA)或信使RNA(mRNA)和后者随后翻译为蛋白质。实验上可通过例如Northern、qRT PCR、转录连缀反应(transcriptional run-on assays)或Western印迹和其他免疫实验检测表达。作为表达减少、降低或缺失的结果是指作为基因转录减少、降低或缺失的结果,出现相关的表型特征,例如增强的或提高的精细化学品产生。
因此,优选参考对象为本发明方法的起始对象。优选在例如标准化和规范化总RNA、DNA或蛋白质或活性或参考基因(如看家基因如泛素)的表达量后比较参考和本发明研究对象。
本发明多肽的修饰可通过一系列的机制直接或间接影响氨基酸的产量、产生和/或产生效率。例如,可以减少、降低或缺失本发明多肽的分子数量或比活性或本发明核酸分子的表达数量。然而,也可以例如通过修饰基因的调节,或减少或降低mRNA或本发明核酸分子编码的基因产物的稳定性来减少、降低或缺失在生物中天然存在的基因的表达。
这同样类似地适用于将本发明核酸分子的表达或其基因产物与其他活性(如氨基酸生物合成途径的酶)处理的组合的减少、降低或缺失。
根据本发明的提高、降低或调节可是组成型的,例如由于稳定的永久转基因表达,或由于编码本发明核酸分子的相应内源基因的稳定突变,或由于表达的调控或赋予本发明多肽表达的基因行为的调控,也可以是或瞬时的,例如由于瞬时转化或例如在转化了带有诱导型启动子控制下的本发明双链RNA核酸分子、反义核酸分子、核酶等的诱导型构建体并加入诱导物(如四环素或如下文所述的)后瞬时活化启动子,或短暂加入调节剂(如拮抗剂或诱导物)。
与对照、参考或野生型相比,活性数量的减少、降低或缺失优选为至少10%,优选至少30%或至少60%,特别优选至少70%、80%、85%、90%或更多,尤其特别优选至少95%,更优选至少99%或更多。最优选活性数量减少、降低或缺失100%。
本发明的核酸分子所编码多肽或本发明多肽的比活性可如实施例中所述测试。具体而言,所述蛋白质在细胞(如植物细胞或微生物)中表达的减少、降低或缺失及与对照相比精细化学品水平的提高的检测是容易测试的,并可根据实施例的描述实施。
术语“减少”、“降低”或“缺失”包括由对生物使用化学化合物引起的所述“减少”、“降低”或“缺失”。
因此,在下文中术语“减少”、“降低”或“缺失”还包含术语“减低”、“消耗”、“缩小”或“下降”。通过精细化学品的提高显示活性的降低或减少。在本文中,细胞(优选组织,更优选生物如植物或微生物或其局部)中的精细化学品数量提高3%或更多,特别优选10%或更多,非常特别优选多于30%或更多并最优选70%或更多,例如100%、300%或500%或更多。精细化学品可以以游离形式和/或与蛋白质或多肽或其混合物结合包含在生物中,或者可以有利地排出。
具有本发明方法中所使用蛋白质的生物活性的蛋白质优选具有本文所述多肽的结构,具体为SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示的多肽或如本文所述的其功能性同系物,或者由本文表征的核酸分子或本发明的核酸分子编码并具有上述活性,例如由SEQ ID NO:1、SEQID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示的核酸分子或其本文所述的功能性同系物编码。
就本发明而言,术语“L-甲硫氨酸”或“甲硫氨酸”还包括相应的盐,如盐酸甲硫氨酸或硫酸甲硫氨酸。优选的,术语甲硫氨酸旨在包括术语L-甲硫氨酸。
由于本发明的方法所使用的蛋白质并由本发明的核酸分子所编码的蛋白质的生物活性可能产生氨基酸组合物。取决于本发明方法所使用生物的选择(例如微生物或植物),可以产生多种氨基酸的组合物或混合物。
术语“表达”是指有编码意义的基因片段或基因的转录和/或翻译。通常产生的产物是mRNA或者蛋白质。然而,表达产物也可包括功能性RNA如反义链、tRNA、snRNA、rRNA、dsRNA、siRNA、miRNA、核酶等。表达可以是整体的、局部的或瞬时的,例如局限于某些细胞类型、组织、器官或时期。
在一个实施方案中,本发明的方法包括一个或多个以下步骤:
a)去稳定蛋白质,所述蛋白质使本发明核酸分子编码的蛋白质或本发明多肽(例如具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ IDNO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ IDNO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ IDNO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ IDNO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ IDNO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ IDNO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ IDNO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ IDNO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ IDNO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ IDNO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ IDNO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ IDNO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述引起本文所述精细化学品活性提高的蛋白质生物活性的多肽)的表达减少、降低或缺失;或
b)去稳定mRNA,所述mRNA使本发明核酸分子编码的蛋白质(例如具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ IDNO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ IDNO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ IDNO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ IDNO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ IDNO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ IDNO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ IDNO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ IDNO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ IDNO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ IDNO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ IDNO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ IDNO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ IDNO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ IDNO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的多肽)或编码引起本文所述精细化学品活性提高的本发明多肽的mRNA的表达减少、降低或缺失;
c)提高蛋白质或RNA的生物活性,例如提高阻抑物的生物活性,所述阻抑物使本发明核酸分子编码的蛋白质或引起本文所述精细化学品活性提高的的本发明多肽(例如具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ IDNO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ IDNO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ IDNO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ IDNO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ IDNO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ IDNO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ IDNO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的多肽)的表达减少、降低或缺失,或提高本发明多肽的抑制调节;或
d)通过向生物或其局部添加一种或多种外源阻抑因子例如化合物(如抑制剂)提高蛋白质或RNA的生物活性,例如提高阻抑物的生物活性,所述阻抑物使本发明核酸分子编码的蛋白质或引起本文所述精细化学品活性提高的的本发明多肽(例如具有如SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ IDNO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ IDNO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ IDNO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ IDNO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ IDNO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ IDNO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ IDNO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的多肽)的表达减少、降低或缺失,或提高本发明多肽的抑制调节;或
e)减少、降低或缺失基因拷贝数,例如减少、降低或缺失编码激活剂的基因的拷贝数,所述激活剂使编码由本发明核酸分子编码的多肽或具有提高本文所述精细化学品活性的本发明多肽(例如具有如SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ IDNO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ IDNO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ IDNO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ IDNO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ IDNO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ IDNO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ IDNO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ IDNO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ IDNO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ IDNO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ IDNO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ IDNO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ IDNO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ IDNO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的多肽)的核酸分子的表达提高;或
f)通过添加例如反义分子或RNAi或提高负表达元件的活性来减少、降低或缺失编码本发明多肽(例如具有本发明方法使用的蛋白质生物活性的多肽,如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ IDNO:111、SEQ ID NO:113、SEO ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ IDNO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ IDNO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ IDNO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ IDNO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ IDNO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ IDNO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ IDNO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ IDNO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ IDNO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ IDNO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述的蛋白质)的内源基因表达。这可通过例如以反义方向表达本发明核酸或其部分或通过表达发卡RNAi构建体或同时表达本发明核酸的有义和反义RNA来完成。细节在下文说明书或实施例中描述;或
g)提高引起本发明核酸分子生物活性或本发明蛋白质(例如如SEQID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ IDNO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ IDNO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ IDNO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ IDNO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ IDNO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ IDNO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ IDNO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ IDNO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ IDNO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ IDNO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ IDNO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ IDNO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ IDNO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ IDNO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ IDNO:435或SEQ ID NO:441所述的蛋白质)的生物活性显性负调控表型的蛋白质或RNA的生物活性。这可有利地通过例如表达编码蛋白质的核酸完成,所述蛋白质失去其生物活性,或者与另一蛋白质以多聚体复合物形式结合从而降低或缺失所述复合物的活性,或者例如作为转录因子与DNA结合从而降低或缺失翻译蛋白质的活性;或
h)表达抗体或适体,其与本发明核酸分子或本发明蛋白质(例如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ IDNO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ IDNO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ IDNO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ IDNO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ IDNO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述的蛋白质)结合,从而减少、降低或缺失其生物活性;和/或
i)以减少、降低或缺失编码本发明蛋白质的核酸分子或该蛋白质本身的表达或活性的方式调控生物生长条件。这可通过例如调控光和/或营养条件来实现,其调控本发明基因或蛋白质的表达。
优选地,所述mRNA是一种本发明的核酸分子和/或使得本发明核酸分子编码的蛋白质或具有本文提到的本发明多肽的生物活性的多肽表达减少、降低或缺失的蛋白质,例如在降低所编码多肽的表达或活性后赋予精细化学品产量的提高或具有有本发明蛋白质生物活性的多肽的生物活性。
通常,生物的细胞或生物区室中mRNA、多核苷酸或核酸分子的数量与其编码蛋白质的数量相关,并因此与所述体积中编码蛋白质的总体活性相关。所述关联并非总是线性的,体积中的活性取决于分子的稳定性、分子的降解或激活或抑制辅助因子的存在。另外,产物或离析物对酶的抑制是众所周知的。
可以通过多种途径减少、降低或缺失上文提到的本发明核酸分子编码的蛋白质和/或多肽的活性。例如,通过减少或降低基因产物数量减少或降低在生物或其局部(如细胞中)的活性,例如通过将天然启动子突变为较低的活性减少或降低表达率或减少或降低表达的mRNA的稳定性而减少或降低翻译率,和/或减少或降低基因产物的稳定性而提高降解的蛋白质。另外,可以以降低反应速率或改变(减少、降低或缺失)底物亲和力的方式影响酶或通道或载体、转录因子以及类似的活性蛋白质的活性或转换。突变本发明多肽(如酶)催化中心可调整酶的转换率,例如必须氨基酸的敲除可引起酶活性的降低或完全丢失,或调节子结合位点的缺失可降低负调节,如反馈抑制(底物浓度也提高时的底物抑制)。可降低本发明的酶的比活性以降低转换率或降低辅助因子的结合。减少编码mRNA或蛋白质的稳定性也可以降低基因产物的活性。活性的减少也属于术语“减少、降低或缺失的活性”的范围。此外,有利地顺式减少活性(例如突变启动子,包括其他顺式调节元件或基因的转录的或编码的部分),可以反式实现抑制,例如通过干扰表达的多个阶段(如转录、翻译或蛋白质或蛋白质复合体本身的活性)的反式因子,如嵌合体转录因子、核酶、反义RNA、dsRNA或显性负调控蛋白质模型。
在上述本发明方法中,优选通过减少、降低或缺失至少一个核酸分子的表达实现本发明蛋白质所表现出的生物活性的减少、降低或缺失,其中核酸分子选自:
a)编码SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ IDNO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ IDNO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ IDNO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ IDNO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ IDNO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ IDNO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ IDNO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ IDNO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ IDNO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ IDNO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ IDNO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ IDNO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ IDNO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ IDNO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ IDNO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ IDNO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ IDNO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ IDNO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽的核酸分子;
b)含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ IDNO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ IDNO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ IDNO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ IDNO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ IDNO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ IDNO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ IDNO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ IDNO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ IDNO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ IDNO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ IDNO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ IDNO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ IDNO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ IDNO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ IDNO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ IDNO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ IDNO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示核酸分子的核酸分子;
c)核酸分子,其所含的核酸序列可由于遗传密码简并性而从序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ IDNO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ IDNO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ IDNO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ IDNO:435或SEQ ID NO:441所述的多肽序列推导而来;
d)编码多肽的核酸分子,所述多肽与(a)到(c)的核酸分子编码的多肽的氨基酸序列有至少50%的同一性,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ IDNO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ IDNO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ IDNO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ IDNO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ IDNO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ IDNO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ IDNO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ IDNO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ IDNO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ IDNO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ IDNO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ IDNO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ IDNO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ IDNO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ IDNO:441所述蛋白质所表现的生物活性;
e)含有如下多核苷酸的核酸分子,所述多核苷酸通过使用SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:145、SEQ ID NO:221、SEQ ID NO:222、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:436或SEQ ID NO:437所述引物扩增cDNA文库或基因组文库获得,并具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ IDNO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ IDNO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ IDNO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ IDNO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ IDNO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ IDNO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ IDNO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ IDNO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ IDNO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ IDNO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ IDNO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;;
f)编码多肽的核酸分子,所述多肽借助针对由(a)到(d或e)的核酸分子之一所编码多肽的单克隆或多克隆抗体分离,并具有SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ IDNO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ IDNO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ IDNO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ IDNO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ IDNO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ IDNO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ IDNO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ IDNO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ IDNO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ IDNO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ IDNO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ IDNO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ IDNO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ IDNO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
g)编码多肽的核酸分子,所述多肽含有SEQ ID NO:33或SEQ ID NO:34所示共有序列,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ IDNO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ IDNO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ IDNO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ IDNO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ IDNO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ IDNO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ IDNO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
h)编码多肽的核酸分子,所述多肽具有SEQ ID NO:2、SEQID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ IDNO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ IDNO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ IDNO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ IDNO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ IDNO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ IDNO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ IDNO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ IDNO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ IDNO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ IDNO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ IDNO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ IDNO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ IDNO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ IDNO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ IDNO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ IDNO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
i)可以通过在严格杂交条件下以探针或探针片段筛选适当的核酸文库而获得的核酸分子,并且该核酸分子编码的多肽具有本发明蛋白质所表现的生物活性,其中所述探针含有(a)到(b)核酸分子之一的序列,或所述探针片段具有(a)到(c)所表征核酸分子的至少15nt,优选20nt、30nt、50nt、100nt、200nt或500nt核酸分子;
或者含有上述核酸分子互补序列的核酸分子。
此外,可以修饰前述核酸序列的调节从而降低基因表达。可以如上所述通过技术人员已知的所有方法实现该减少、降低或缺失(在本说明书全篇中减少、降低、缺失、失活或下调作为同义词使用),优选通过双链RNA干扰(dsRNAi)、引入反义核酸、核酶、与核酶组合的反义核酸、编码共阻抑制子的核酸、编码显性负调控蛋白质的核酸、靶向所述基因或RNA或蛋白质的DNA或蛋白质结合因子、诱导RNA降解的病毒核酸和表达体系、用于诱导所述基因同源重组的体系、所述基因的突变或上述的组合。
通常,生物或其局部,尤其是植物细胞、植物或植物组织或其部分或微生物中基因产物的活性可通过降低所述生物或其局部中特定编码mRNA或相应的蛋白质的数量来降低。“蛋白质或mRNA的数量”理解为生物、组织、细胞或细胞区室中多肽或mRNA分子的分子数。蛋白质数量的“降低”是指与野生型、对照或参考相比,所述蛋白质在生物、组织、细胞或细胞区室或其部分中分子数量的定量降低,例如通过下述方法之一降低。
在本文中,失活是指在生物或细胞中(如在植物或植物细胞中)不再能检测到编码的多肽的酶或生物活性。就本发明而言,下调(=减少)是指与未处理生物的活性相比,编码的多肽的酶或生物活性部分地或基本完全地减少。这可通过不同的细胞生物学机制来实现。在本文中,活性可在整个生物中,或对于多细胞生物在生物的局部中,对于植物在例如组织(如种子、叶、根或其他部分)中下调。在本文中,与对照、参考或野生型相比酶活性或生物活性至少降低10%,有利地至少20%,优选至少30%,特别优选至少40%、50%或60%,非常特别优选至少70%、80%、90%或更多。最优选活性的减少、降低或缺失达到100%。
本发明包括多种降低本发明核酸编码蛋白质的量、表达、活性或功能的策略。本领域技术人员会认识到可使用一系列不同的方法以需要的方式影响蛋白质的数量、活性或功能。
术语“生物活性”是指本发明蛋白质的生物功能。与术语“生物活性”不同,术语“活性”是指通过本发明方法产生的化合物产量的提高。术语“生物活性”优选指在生物、组织、细胞或细胞区室中多肽或蛋白质的酶功能、运载体或携带者功能、DNA包装功能、热休克蛋白功能、重组蛋白功能或调节功能。合适的底物为低分子量化合物以及蛋白质的蛋白质相互作用配偶体。术语生物功能的“减少”是指例如在其他相同条件下(例如培养条件、植物年龄等),与未经该方法处理的同属同种野生型相比,(例如通过本文下述方法之一)在生物、组织、细胞或细胞区室中定量降低蛋白质对至少一种底物的结合能力或结合强度。减少还可理解为对底物特异性的修饰,所述底物特异性可通过例如kcat/Km值来表示。在本文中,与未处理生物相比有利的功能减少至少为10%、有利的为至少20%、优选至少30%、特别优选至少40%、50%或60%,极其优选至少70%、80%、90%或95%。特别有利的实施方案是功能的失活。可以通过技术人员熟悉的方法(例如通过酵母双杂交系统)鉴定蛋白质的结合配偶体。
修饰(即降低)可由内源或外源因素引起。例如,可以通过向植物培养基、营养物、植物土壤或植物自身中添加化合物(如拮抗剂)而引起生物或其局部中活性的降低。
在一个实施方案中,通过降低本发明多肽的内源水平来实现精细化学品的提高。因此,在本发明的一个实施方案中,本发明涉及一种方法,其中降低了编码本发明多核苷酸或核酸分子的基因的基因拷贝数。此外,可通过例如改变多肽的转录或翻译调节降低本发明多肽的内源水平。
本发明方法的另一个实施方案是减少或缺失本发明方法所使用蛋白质表现的生物活性的方法,其中通过包含选自以下步骤的方法实现所述减少或缺失:
(a)引入编码核糖核酸序列的核酸分子,所述核糖核酸序列能够形成双链核糖核酸分子,其中所述双链核糖核酸分子的有义链与下述核酸分子至少30%同源,所述核酸分子赋予表达或编码具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ IDNO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ IDNO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ IDNO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ IDNO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ IDNO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ IDNO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ IDNO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ IDNO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ IDNO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ IDNO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ IDNO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ IDNO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ IDNO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ IDNO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ IDNO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ IDNO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质,或者含有与赋予表达具有SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ IDNO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ IDNO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ IDNO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ IDNO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ IDNO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ IDNO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ IDNO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ IDNO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ IDNO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ IDNO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ IDNO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ IDNO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ IDNO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ IDNO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质的核酸分子具有至少50%同源性的核酸分子的至少17、18、19、20、21、22、23、24或25个碱基对的片段;
(b)引入反义核酸分子,其中该反义核酸分子与编码具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ IDNO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ IDNO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ IDNO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ IDNO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ IDNO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ IDNO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ IDNO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ IDNO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ IDNO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ IDNO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ IDNO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质或赋予表达具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质的核酸分子的反义核酸分子具有至少30%的同源性,或者引入的反义核酸分子含有核酸分子的至少17、18、19、20、21、22、23、24或25个碱基对的片段,所述核酸分子与赋予表达具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ IDNO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ IDNO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ IDNO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ IDNO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ IDNO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ IDNO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ IDNO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ IDNO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ IDNO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ IDNO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ IDNO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ IDNO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ IDNO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ IDNO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ IDNO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ IDNO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ IDNO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ IDNO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ IDNO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质的核酸分子的反义核酸分子具有至少50%的同源性;
(c)引入特异性切割核酸分子的核酶,所述核酸分子赋予表达具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ IDNO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ IDNO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ IDNO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ IDNO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ IDNO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ IDNO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ IDNO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ IDNO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ IDNO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ IDNO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ IDNO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质;
(d)引入(b)中所表征的反义核酸分子和(c)中所表征的核酶;
(e)引入赋予SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ IDNO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ IDNO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ IDNO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ IDNO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ IDNO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ IDNO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ IDNO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ IDNO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ IDNO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ IDNO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ IDNO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ IDNO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ IDNO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ IDNO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ IDNO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ IDNO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ IDNO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ IDNO:434或SEQ ID NO:440所述核酸分子表达的有义核酸分子,或引入编码多肽或其部分(不需要编码功能蛋白)的核酸分子,所述多肽或其部分与本发明方法所使用的核酸分子所编码多肽的氨基酸序列具有至少50%的同源性,并具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ IDNO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ IDNO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ IDNO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ IDNO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ IDNO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ IDNO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ IDNO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ IDNO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ IDNO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ IDNO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ IDNO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ IDNO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ IDNO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ IDNO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ IDNO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ IDNO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ IDNO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ IDNO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的诱导共抑制具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的内源蛋白质的生物活性;
(f)引入核酸分子,其赋予表达具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质的显性负调控突变体,即通过表达引起显性负调控突变体蛋白质的所述序列来减少、降低或缺失本发明方法所使用的蛋白质的生物活性,从而提高精细化学品的产生;
(g)引入编码因子的核酸分子,所述因子与赋予表达具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ IDNO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ IDNO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ IDNO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ IDNO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ IDNO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ IDNO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ IDNO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ IDNO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ IDNO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ IDNO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ IDNO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质的核酸分子结合;
(h)引入降低RNA分子的病毒核酸分子,所述RNA分子赋予表达具有本发明方法所使用蛋白质,特别是SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质;
(i)引入能与内源基因重组的核酸构建体,所述内源基因赋予表达具有本发明方法所使用蛋白质,特别是SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质;
(j)引入内源基因的非沉默突变,所述内源基因赋予表达具有本发明方法所使用蛋白质,特别是SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质;
(k)从本发明方法所使用生物的随机诱变种群中选择核酸序列的非沉默突变,所述核酸序列编码具有本发明方法所使用蛋白质,特别是SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ IDNO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ IDNO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ IDNO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ IDNO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ IDNO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ IDNO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ IDNO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ IDNO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ IDNO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ IDNO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ IDNO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ IDNO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ IDNO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质生物活性的蛋白质;和/或
(l)引入赋予表达(a)到(k)中任一项所表征核酸分子的表达构建体。
如技术人员所公知,可以从上文(a)到(j)中所述核酸序列开始,分离所述核酸序列的5’和/或3’区并根据上文提到的(a)到(j)的不同方法步骤将所述5’和/或3’序列用于减少、降低或缺失本发明方法所使用的核酸序列。优选使用小于1000bp、900bp、800bp或700bp,特别优选小于600bp、500bp、400bp、300bp、200bp或100bp的所述核酸序列5’和/或3’区。
上述减少或缺失本发明蛋白质所表现的生物活性的步骤方法引起精细化学品产生的降低。
优选通过减少编码本发明方法蛋白质的基因实现活性或功能的减少。
本发明其他优选的降低本发明方法所使用蛋白质生物活性的实施方案可以使用以下方法实现所述活性的降低:
a)引入双链RNA核酸序列(dsRNA)或表达盒或多于一个表达盒,并确保表达盒的表达;
b)引入反义核酸序列或表达盒,并确保后者的表达;包括针对基因(即基因组DNA序列)或基因转录物(即RNA序列)(包括5’和3’非翻译区)的反义核酸序列的方法;还包括α-端基异构核酸序列;
c)引入与核酶组合的反义核酸序列或确保前者表达的表达盒;
d)引入用于诱导共抑制的有义核酸序列或确保前者表达的表达盒;
e)引入编码显性负调控蛋白质的核酸序列或表达盒,并确保后者的表达;
f)引入针对基因、RNA或蛋白质的DNA、RNA或蛋白质结合因子或表达盒,并确保后者的表达;
g)引入引起RNA降解的病毒核酸序列或确保前者表达的表达盒;
h)引入诱导内源基因同源重组的构建体,例如用于产生敲除突变体的构建体;
i)向内源基因引入突变以产生功能缺失(例如产生终止密码子、读框移位等);和/或
j)根据所谓的tilling方法在随机诱变种群中鉴定非沉默突变,如终止密码子的产生、读框移位、倒位等。
这些方法中的每一种都可以为本发明目的引起表达、活性或功能的降低。也可以组合使用。其他的方法为本领域技术人员所公知,并可包括妨碍或阻止蛋白质的加工、蛋白质或其mRNA的转运、抑制核糖体附着、抑制RNA剪接、诱导降解RNA的酶和/或抑制翻译的延伸和终止。
以下为个别优选方法的概述:
A)引入双链RNA核酸序列(dsRNA)
通过双链RNA调节基因的方法(双链RNA干扰;dsRNAi)在动物、酵母、真菌及植物生物体(例如Neurospora、斑马鱼、果蝇、小鼠、涡虫、人、锥虫、牵牛花或拟南芥)中已有多次描述(例如Matzke MA等(2000)Plant Mol Biol 43:401-415;Fire A等(1998)Nature 391:806-811;WO99/32619;WO99/53050;WO00/68374;WO00/44914;WO00/44895;WO00/49035;WO00/63364)。另外,RNAi还被例如Tchurikov等[J.Biol.Chem.,2000,275(34):26523-26529]证明是在细菌(例如大肠杆菌)中抑制基因表达的有利工具。Fire等将RNAi现象命名为RNA干扰。在以上谈及的参考文献中清楚地描述了其过程及方法。有效的基因抑制也可在瞬时表达情况下或瞬时表达后(例如,作为生物转化的结果)显示(SchweizerP等(2000)Plant J 2000 24:895-903)。dsRNAi方法是基于同时导入基因转录物的互补链及其对应链引起所述基因表达的高效抑制。所产生的表型与相应的敲除突变体非常相似(Waterhouse PM等(1998)Proc Natl AcadSci USA 95:13959-64)。
Tuschl等(Gens Dev.,1999,13(24):3191-3197)显示RNAi方法的效率是双链体长度、3’端突出长度和这些突出中的序列的函数。基于Tuschl等的工作并假定所强调的原则在不同物种间是保守的,则可给予本领域技术人员如下的指导:
·为了得到好的结果,应该避开所使用核酸序列的5’和3’非翻译区以及靠近起始密码子的区域,因为这些区域富含调节蛋白质结合位点,RNAi序列和这些调节蛋白质之间的相互作用可能引起不需要的相互作用;
·在植物中,所使用核酸序列的5’和3’非翻译区以及靠近起始密码子的区域(优选在起始密码子上游50到100nt)可得到好的结果,因此不应该避开;
·优选选择所使用的mRNA AUG起始密码子下游50到100nt(=核苷酸或碱基)的区域;
·只有来自外显子的dsRNA(=双链RNA)序列可用于本方法,因为来自内含子的序列没有效果;
·该区域中的G/C含量应该大于30%并小于70%,最好在50%左右;
·靶mRNA可能的二级结构对RNAi方法的效果重要性较低。
已证实dsRNAi方法对降低SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ IDNO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ IDNO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ IDNO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ IDNO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ IDNO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ IDNO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ IDNO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ IDNO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ IDNO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ IDNO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ IDNO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ IDNO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ IDNO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ IDNO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ IDNO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440的核酸序列和/或其同系物表达特别有效并有利。特别如WO99/32619中所述,dsRNAi方法明显优于传统的反义方法。
本发明因此还涉及当引入生物中,有利的为引入植物中时(或其衍生的细胞、组织、器官或种子),引起通过SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440中核酸序列和/或其同系物表达降低而改变代谢活性的双链RNA分子(dsRNA分子)。在用于降低SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440之一或其同系物的核酸序列编码的蛋白质表达的双链RNA分子中,
i)两条RNA链之一与至少部分核酸序列基本相同,且
ii)另一条RNA链与互补链的至少部分核酸序列基本相同。
术语“基本相同”指与靶序列相比,dsRNA序列也可具有插入、缺失及个别点突变,但仍引起表达的有效降低。优选地,抑制性dsRNA“有义链”与本发明核酸序列的至少部分节段之间(在本发明优选的实施方案中包括其内源5’和3’非翻译区)或“反义链”与核酸序列的互补链之间如以上定义的同源性达到至少30%,优选至少40%、50%、60%、70%或80%,极其优选至少90%,最优选100%。部分节段的长度达到至少10个碱基,优选至少17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个碱基,特别优选至少40、50、60、70、80或90个碱基,极其优选至少100、200、300或400个碱基,最优选至少500、600、700、800、900个或更多碱基或至少1000或2000个或更多碱基。在本发明的另一优选的实施方案中,部分节段的长度达到17、18、19、20、21、22、23、24、25、26或27个碱基,优选20、21、22、23、24或25个碱基。优选这些短序列在动物和植物中。优选为200至800碱基间的较长序列优选在非哺乳动物中,优选在无脊椎动物、酵母、真菌或细菌中,但在植物中亦可用。在生物体中长双链RNA被例如是双链特异Rnase III酶的Dicer蛋白质加工为许多siRNA(=小/短干扰RNA)。另外,“基本相同的”dsRNA也可定义为能与部分贮存蛋白基因转录物杂交的核酸序列(例如在400mMNaCl,40mM PIPES pH6.4,1mM EDTA于50℃或70℃进行12至16小时)。
dsRNA可由一条或多条聚合的核苷酸链组成。此外,可存在对糖-磷酸主链及核苷这两者的修饰。例如,天然RNA的磷酸二酯键可以它们包含至少一个氮或硫杂原子的方式进行修饰。碱基可以例如将腺苷脱氨酶的活性进行限制的方式进行修饰。这些及进一步修饰在下文用于稳定反义RNA的方法中有所描述。
dsRNA可通过酶制备,或完全或部分通过化学合成产生。可以通过例如使用大肠杆菌核糖核酸酶III(RNaseIII)部分消化长dsRNA而有效的产生可有效介导RNA干涉的长至30bp的短dsRNA(Yang,D.,等(2002)Proc.Nati.Acad.Sci.USA 99,9942.)。
双链dsRNA结构可自单一的、自动互补RNA链起始或自两个互补的RNA链起始进行形成。在单一的、自动互补链的情况时,有义及反义序列可通过连接序列(接头)进行连接并形成例如发夹结构。优选地,连接序列可为内含子,所述内含子在合成dsRNA后被剪切掉。编码dsRNA的核酸序列可包含额外元件例如转录终止信号或多聚腺苷酸化信号。如果dsRNA的两条链在细胞或植物中进行组合,这可以多种方式发生:
a)用包含两种表达盒的载体转化细胞或植物(有利的为植物);
b)用两个载体共转染细胞或生物(有利的为植物),所述两个载体的一个包含带有有义链的表达盒而另一个包含带有反义链的表达盒;
c)在用包含带有“反义”链的表达盒的载体转化细胞或生物后,用包含带有“有义”链的表达盒的载体超转化细胞或生物(有利的为植物);
d)杂交两个生物(有利的为植物),所述生物中的每个用载体进行转化,所述载体的一个包含带有有义链的表达盒而另一个包含带有反义链的表达盒;
e)引入包含两个启动子的构建体,所述启动子引起需要的序列从两个方向转录;和/或
f)用经过设计的的病毒转染细胞或生物(有利的为植物),所述病毒能够产生需要的dsRNA分子。
RNA复合物的形成可以起始于细胞外或细胞内。如果dsRNA在靶细胞或生物外合成,它可以通过注射、显微注射、电穿孔法、高速粒子、通过激光束或通过化合物(DEAE-葡聚糖、磷酸钙、脂质体)介导引入生物或生物细胞,或者在动物的情况下也可以把细菌如(经改造以表达双链RNAi)的大肠杆菌喂给动物。
如WO99/53050中所示,dsRNA还可通过经由“接头”连接“有义”和“反义”链(例如内含子)而包含发卡结构。优选自身互补的dsRNA结构,因为它们仅需要表达构建体且总是包含等摩尔比的互补链。
使用下文所述的方法,优选将编码dsRNA“反义”或“有义”链或dsRNA自身互补链的表达盒插入到载体中并稳定(例如用选择标记)插入到植物基因组中,以确保dsRNA的持续表达。也可以类似的使用细菌或病毒载体进行瞬时表达。
可以用使每个细胞至少一个拷贝的量将dsRNA引入。较大量(例如,每个细胞至少5、10、100、500或1000个拷贝)可引起更有效的降低。
如已描述的,对于引起表达的有效降低,dsRNA与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ IDNO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ IDNO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ IDNO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ IDNO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ IDNO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ IDNO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ IDNO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ IDNO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ IDNO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ IDNO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ IDNO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ IDNO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ IDNO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ IDNO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ IDNO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ IDNO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ IDNO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ IDNO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ IDNO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440或其同系物之一的核酸序列的基因转录物之间并非必须100%的序列同一性。因此,有利的是该方法能够承受作为遗传突变、多态性或进化趋异的结果存在的序列偏差。因此,例如产生自一种生物体中SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440或其同系物之一序列的dsRNA,可用于抑制另一生物体中相应的表达。
由于来源于多种生物(例如植物)的SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ IDNO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ IDNO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ IDNO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ IDNO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ IDNO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ IDNO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ IDNO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ IDNO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ IDNO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ IDNO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ IDNO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ IDNO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ IDNO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEO ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ IDNO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ IDNO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ IDNO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ IDNO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ IDNO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440之间高度的序列同源性,可得出结论这些蛋白质在例如其他植物中可能是高度保守的,很可能来源于SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ IDNO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ IDNO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ IDNO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ IDNO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ IDNO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ IDNO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ IDNO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ IDNO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ IDNO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ IDNO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ IDNO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ IDNO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ IDNO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ IDNO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示公开序列之一或其同系物的dsRNA的表达在其他植物物种中也可能具有有利的作用。
dsRNA可在体内或体外合成。为此,可将编码dsRNA的DNA序列导入到表达盒中,所述表达盒在至少一个基因控制元件(例如启动子、增强子、沉默子、剪接供体或受体、多腺苷酸化信号)控制下。适当的有益构建体在下文中有所描述。多腺苷酸化不是必需的,也一定要有用于起始翻译的元件。
dsRNA可用化学或酶法合成。为此,可用细胞RNA聚合酶或噬菌体RNA聚合酶(例如T3、T7或SP6 RNA聚合酶)。用于RNA体外表达的合适方法已有描述(WO97/32016、US5,593,874、US5,698,425、US5,712,135、US5,789,214、US5,804,693)。体外通过化学或酶法合成的dsRNA在导入到细胞、组织或生物体前,可例如进行提取、沉淀、电泳、层析或这些方法的组合,从而自反应混合物中完全或部分分离。dsRNA可直接导入到细胞中或通过细胞外应用(例如导入到细胞间隙)。在本发明的一个实施方案中,RNAi方法只引起基因功能的部分缺失,因此使技术人员能够研究在目的生物中起作用的基因量并微调本发明的方法。在另一优选的实施方案中它引起功能的完全丧失并因此提高精细化学品的生产。此外它使本领域技术人员能够研究基因的多重功能。
然而,植物优选用引起dsRNA表达的表达构建体进行稳定转化。适当的方法在下文中有所描述。
B)引入反义核酸序列
可广泛使用对通过“反义”技术阻止mRNA的积累从而抑制特定蛋白质的方法,这些方法已有大量描述,包括用于植物的方法(Sheehy等(1988)Proc Natl Acad Sci USA 85:8805-8809;US4,801,340;Mol JN等(1990)FEBS Lett 268(2):427-430)。反义核酸分子与编码欲抑制的靶蛋白的细胞mRNA和/或基因组DNA杂交或结合,所述杂交或结合抑制了靶蛋白的转录和/或翻译。在传统方式中通过稳定双链体的形成,或对于基因组DNA通过反义核酸分子与基因组DNA双链体的结合发生杂交,所述反义核酸分子与基因组DNA双链体的结合为通过在DNA螺旋的大沟的特异相互作用。
“反义”核酸分子包含与编码蛋白质的“有义”核酸分子至少部分互补的核苷酸序列,例如与双链cDNA分子编码链互补或与编码mRNA序列互补。因此,反义核酸分子可通过氢键与有义核酸分子结合。反义核酸分子可与给予本发明多肽表达的核酸分子整个编码链互补,或只与其部分互补。因此,反义核酸分子可与本发明核酸分子的核苷酸序列的编码链的“编码区”反义。有利的,非编码区为编码区上和/下游50bp、100bp、200bp、或300bp,优选400bp、500bp、600bp、700bp、800bp、900bp或1000bp的区域。术语“编码区”指含有翻译成氨基酸残基的密码子的核苷酸序列区。此外,反义核酸分子与核苷酸序列编码区侧翼的mRNA的“非编码区”反义。术语“非编码区”指编码区两侧不翻译成氨基酸的5’和3’序列(即也称为5’和3’非翻译区)。
给定编码本发明多肽的编码链序列,例如具有上述活性(例如具有本文公开蛋白质生物活性的多肽的活性)可根据Watson和Crick碱基配对原则设计本发明反义核酸分子。
例如,反义寡核苷酸可以与所述mRNA翻译起始位点周围的区域互补。反义寡核苷酸的长度可以为例如约5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、100或200个核苷酸。
应用Watson-Crick碱基配对原则,可从编码蛋白质的核酸序列(例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ IDNO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ IDNO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ IDNO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ IDNO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ IDNO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ IDNO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ IDNO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ IDNO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ IDNO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ IDNO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ IDNO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ IDNO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ IDNO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ IDNO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ IDNO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ IDNO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ IDNO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ IDNO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ IDNO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ IDNO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示的核酸序列,或其同源物、类似物、旁系同源物、直系同源物)推导出适于降低该蛋白质活性的反义核酸序列。反义核酸序列可与所述蛋白质的所有转录mRNA互补,其可限于编码区或可只由一个寡核苷酸组成,所述寡核苷酸与mRNA的编码或非编码序列的部分互补。因此,寡核苷酸可例如与包含用于所述蛋白质翻译起始的核酸区互补。反义核酸序列长度可有利的为例如5、10、15、20、25、30、35、40、45或50个核苷酸,但也可更长并包含至少100、200、500、1000、2000或5000个核苷酸。特别优选的长度为15和30个核苷酸之间,例如15、20、25或30个核苷酸。反义核酸序列可用技术人员已知的方法进行重组表达或通过化学或酶法进行合成。例如,可以使用天然存在的核苷酸或多种修饰核苷酸化学合成反义核酸分子(如反义寡核苷酸),所述修饰核苷酸设计用于提高分子的生物稳定性或提高反义和有义核酸间形成的双链体的物理稳定性,例如可以使用硫代磷酸衍生物和吖啶取代的核苷酸。可以使用的物质实例为硫代磷酸衍生物和吖啶取代的核苷酸,例如5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、4-乙酰胞嘧啶、5-(羧基羟基甲基)尿嘧啶、5-羧基甲基氨基甲基-2-硫尿苷、5-羧基甲基氨基甲基尿嘧啶、双氢尿嘧啶、β-D-半乳糖基queosine、次黄苷、N6-异戊烯腺嘌呤、1-甲基鸟嘌呤、1-甲基次黄苷、2,2-二甲基鸟嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、N6-腺嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、5-甲基氨基甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨基甲基-2-硫尿嘧啶、β-D-甘露糖基queosine、5’-甲氧基羧基甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、2-甲硫基-N6-异戊烯腺嘌呤、尿嘧啶-5-氧基乙酸、假尿嘧啶、queosine、2-硫代胞嘧啶、5-甲基-2-硫脲嘧啶、2-硫脲嘧啶、4-硫脲嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧乙酸甲基酯、尿嘧啶-5-氧乙酸、5-甲基-2-硫脲嘧啶、3-(3-氨基-3-N-2-羧基丙基)尿嘧啶及2,6-二氨基嘌呤。另外,可以使用以反义方向(即从插入核酸转录产生的RNA将为目的靶核酸的反义方向,下文有具体描述)将核酸亚克隆到其中的表达载体来生物产生反义核酸。
在另一优选的实施方案中,由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ IDNO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ IDNO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ IDNO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ IDNO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ IDNO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ IDNO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ IDNO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ IDNO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ IDNO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ IDNO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ IDNO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ IDNO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ IDNO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ IDNO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ IDNO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ IDNO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441或其同源物、类似物、旁系同源物和直系同源物序列之一编码的蛋白质的表达可通过这样的核酸序列进行抑制,以至降低基因的转录,所述核酸序列与基因调节区(例如启动子和/或增强子)互补并与其中的DNA双螺旋形成三螺旋结构。这类方法已有所描述(Helene C(1991)Anticancer Drug Res 6(6):569-84;Helene C等(1992)Ann NY Acad Sci 660:27-36;Maher LJ(1992)Bioassays14(12):807-815)。
在另一实施方案中,反义核酸分子可为α-端基异构核酸。此种α-端基异构核酸分子与互补RNA形成特异双链杂交体,与常规β-核酸相反,其中的两条链互相平行(Gautier C等(1987)Nucleic Acids Res 15:6625-6641)。反义核酸分子也可进一步包含2’-O-甲基核糖核苷酸(Inoue等(1987)Nucleic Acids Res 15:6131-6148)或嵌合RNA-DNA类似物(Inoue等(1987)FEBS Lett 215:327-330)。
本发明反义核酸分子通常被给予细胞或原位产生,从而它们与细胞内编码多肽的mRNA和/或基因组DNA杂交或结合,从而例如通过抑制转录和/或翻译抑制该蛋白质的表达,所述多肽具有本发明蛋白质生物活性并引起上述精细化学品提高的活性。
本发明的反义分子还包括这样的核酸分子,其含有与编码本发明天然存在多肽(例如序列列表中所示或依据本文所述方法鉴定的多肽序列)的核酸序列的调节区(例如其启动子和/或增强子)互补(例如形成阻止靶细胞中基因转录的三螺旋结构)的核酸序列。一般见Helene C(1991)Anticancer Drug Res6(6):569-84;Helene C等(1992)Ann NY AcadSci660:27-36;Maher LJ(1992)Bioassays 14(12):807-815。
C)引入与核酶组合的反义核酸序列
以上描述的反义策略可有益地与核酶方法组合。催化性RNA分子或核酶可适合于任何靶RNA并在特异位点切割磷酸二酯主链,以此功能性失活靶DNA(Tanner NK(1999)FEMS Microbiol Rev 23(3):257-275)。因此核酶自身没有被修饰,但能以类似的方式进一步切割靶RNA分子,因此它获得了酶的特性。核酶序列整合到反义RNA中赋予这些反义RNA酶样RNA切割特性并因此增强了它们在失活靶RNA中的效率。适当的核酶“反义”RNA分子的制备及应用描述于例如Haseloff等(1988)Nature334:585-591。
此外本发明反义核酸分子还可是核酶。“核酶”是指具有核酸酶活性的催化性RNA分子,其能够切割与其具有互补区的单链核酸(如mRNA)。核酶(例如Haselhoff和Gerlach,1988,Nature 334:585-591中描述的锤头状核酶)可用于催化性切割编码本发明多肽的mRNA转录物以抑制所述mRNA的翻译。核酶技术可提高反义策略的效率。表达用于降低某些蛋白质的核酶的方法在(EP0 291 533、EP0 321 201、EP0 360 257)中进行了描述。对在植物细胞中表达核酶也有所描述(Steinecke P等(1992)EMBO J11(4):1525-1530;de Feyter R等(1996)Mol Gen Genet.250(3):329-338)。适当的靶序列及核酶可例如通过“Steinecke P,《Ribozymes,Methods in Cell Biology 50》,Galbraith等编,Academic出版社,Inc(1995),第449-460页”描述的,计算核酶RNA及靶RNA的二级结构,及通过它们的相互作用(Bayley CC等(1992)Plant Mol Biol.18(2):353-361;Lloyd AM及Davis RW等(1994)Mol Gen Genet.242(6):653-657)确定。例如,可构建四膜虫L-19IVS RNA衍生物,所述四膜虫L-19IVSRNA衍生物具有欲进行抑制的蛋白质mRNA的互补区。(也参见US4,987,071及US5,116,742)。备选地,此类核酶也可用筛选方法自各种核酶文库进行鉴定(Bartel D和Szostak JW(1993)Science 261:1411-1418)。
D)引入用于诱导共抑制的(有义)核酸序列
核酸序列有义方向的表达可导致相应的同源性内源基因的共抑制。与内源基因有同源性的有义RNA的表达可降低或实质上消除内源基因的表达,该作用方式与以下描述的反义方法相似:Jorgensen等(1996)Plant MolBiol31(5):957-973;Goring等(1991)Proc Natl Acad Sci USA 88:1770-1774;Smith等(1990)Mol Gen Genet 224:447-481;Napoli等(1990)Plant Cell 2:279-289;Van der Krol等(1990)Plant Cell 2:291-99。在本文中,导入的构建体可完全或只部分代表欲进行降低的同源性基因。应用于植物的此种技术描述于例如Napoli等(1990)The Plant Cell 2:279-289及US5,034,323中。
另外,上述共抑制策略可以有利地与RNAi方法组合,如Brummell等,2003,Plant J.33,793-800页所述。
E)引入编码显性负调控蛋白质的核酸序列
也可通过表达所述蛋白质的显性负调控变体而有效的降低蛋白质的功能或活性。本领域技术人员熟悉通过共表达其显性负调控形式的方法降低蛋白质功能或活性的方法(Lagna G和Hemmati-Brivanlou A(1998)Cur-rent Topics in Developmental Biology 36:75-98;Perlmutter RM和Alberola-lla J(1996)Current Opinion in Immunology8(2):285-90;Sheppard D(1994)American Journal of Respiratory Cell & MolecularBiology11(1):1-6;Herskowitz I(1987)Nature 329(6136):219-22)。
可通过例如在SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ IDNO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ IDNO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ IDNO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ IDNO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ IDNO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ IDNO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ IDNO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ IDNO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ IDNO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ IDNO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ IDNO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ IDNO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ IDNO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ IDNO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ IDNO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ IDNO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ IDNO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ IDNO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441之一或其同源物编码的蛋白质中改变氨基酸来产生显性负调控变体。该改变可由例如计算机辅助的比较(“比对”)来决定。优选在核酸序列水平上进行产生显性负调控变体的突变。可以通过例如使用合适的寡核苷酸引物的PCR介导的体外诱变来进行相应的突变,通过所述PCR引入需要的突变。为此,使用本领域技术人员熟悉的方法。例如,“LA PCR体外诱变试剂盒”(Takara Shuzo,Kyoto)可用于该目的。本领域技术人员公知可通过删除或改变功能性结构域(例如TF)或其他可以结合但不激活的信号组分来降低蛋白质活性。
F)引入针对基因、RNA或蛋白质的DNA结合因子或蛋白质结合因子
也可以用特异DNA结合因子(例如用锌指转录因子类型的因子)来降低本发明SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ IDNO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ IDNO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ IDNO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ IDNO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ IDNO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ IDNO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ IDNO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ IDNO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440之一或其同源物编码的基因的表达。这些因子与内源性靶基因的基因组序列(优选调节区的序列)退火,并且引起内源基因的抑制。此种方法的应用使的可以不经重组操作而降低内源基因的表达。制备相关因子的这类方法描述于Dreier B等(2001)J Biol Chem 276(31):29466-78;Dreier B等(2000)J Mol Biol 303(4):489-502;Beerli RR等(2000)Proc Natl Acad Sci USA 97(4):1495-1500;Beerli RR等(2000)J Biol Chem 275(42):32617-32627;Segal DJ和Barbas CF 3rd(2000)Curr Opin Chem Biol4(1):34-39;Kang JS和Kim JS(2000)J Biol Chem 275(12):8742-8748;Beerli RR等(1998)Proc Natl Acad Sci USA 95(25):14628-14633;Kim JS等(1997)Proc Natl Acad Sci USA 94(8):3616-3620;Klug A(1999)J Mol Biol 293(2)215-218;Tsai SY等(1998)Adv Drug Deliv Rev 30(1-3):23-31;Mapp AK等(2000)Proc Natl Acad Sci USA 97(8):3930-3935;SharrocksAD等(1997)Int J Biochem Cell Biol 29(12)1371-1387;Zhang L等(2000)J Biol Chem 275(43):33850-33860。该技术在植物中应用的实例在WO01/52620,Ordiz MI等(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,Vol.99,Issue20,13290-13295,2002)或Guan等,(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,Vol.99,Issue 20,13296-13301,2002)中有所描述。
此类因子可用基因的任何部分选择。优选地,该片段位于启动子区。然而,对于基因抑制,也可位于编码外显子或内含子的区域。对于技术人员通过数据库搜索从Genbank中获得相关的片段或起始自Genbank中基因不存在的cDNA,通过从基因组文库筛选相应的基因组克隆来获得。
还可以首先在靶作物中鉴定由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ IDNO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ IDNO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ IDNO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ IDNO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ IDNO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ IDNO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ IDNO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ IDNO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ IDNO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ IDNO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ IDNO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ IDNO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ IDNO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ IDNO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ IDNO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ IDNO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ IDNO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ IDNO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440之一或其同源物编码的序列,然后找到启动子并使用上述因子降低表达。
技术人员熟悉为此所需的方法。
此外,引细胞的因子还可是其自身可抑制靶蛋白质的那些。蛋白质结合因子可为例如适体(Famulok M和Mayer G(1999)Curr Top MicrobiolImmunol 243:123-36)或抗原或抗体片段或单链抗体。获得这些因子的方式已有所描述并是技术人员公知的。例如,利用细胞质scFv抗体在经遗传修饰的烟草植物中调节植物色素A蛋白质的活性(Owen M等(1992)Biotechnology(NY)10(7):790-794;Franken E等(1997)Curr OpinBiotechnol8(4):411-416;Whitelam(1996)Trend Plant Sci1:286-272)。
基因表达也可通过适当的低分子量合成化合物(例如聚酰胺类)进行抑制(Dervan PB和Bürli RW(1999)Current Opinion in Chemical Biology3:688-693;Gottesfeld JM等(2000)Gene Expr 9(1-2):77-91)。这些寡聚物由3-(二甲氨基)丙胺、N-甲基-3-羟基吡咯、N-甲基咪唑及N-甲基吡咯组成并且以它们在大沟中序列特异性的结合并抑制位于其中的基因序列表达的方式可适于双链DNA的任何部分。适当的方法已描述于Bremer RE等(2001)Bioorg Med Chem.9(8):2093-103;Ansari AZ等(2001)Chem Biol.8(6):583-92;Gottesfeld JM等(2001)J Mol Biol.309(3):615-29:Wurtz NR等(2001)Org Lett3(8)1201-3;Wang CC等(2001)Bioorg Med Chem 9(3):653-7;Urbach AR和Dervan PB(2001)Proc Natl Acad Sci USA 98(8):4343-8;Chiang SY等(2000)J Biol Chem.275(32):24246-54。
G)引入引起RNA降解的病毒核酸序列及表达构建体
也可借助于病毒表达系统(扩增子),通过诱导生物(优选为植物)降解特异RNA来有效产生失活或下调(Angell,SM等(1999)Plant J.20(3):357-362)。借助于病毒载体,通过也称为“VIGS”(病毒诱导的基因沉默)的此类系统将与欲进行抑制的转录物同源的核酸序列导入植物中。然后可能通过植物抗病毒的防御机制停止转录。适当的技术及方法描述于Ratcliff F等(2001)Plant J 25(2):237-45;Fagard M和VaucheretH(2000)Plant Mol Biol 43(2-3):285-93;Anandalakshmi R等(1998)Proc Natl Acad Sci USA 95(22):13079-84;Ruiz MT(1998)Plant Cell10(6):937-46。
H)导入用于诱导内源基因的同源重组(例如用于产生敲除突变体)的构建体
为产生具有降低活性的同源重组生物体,使用例如包含至少部分内源基因的核酸构建体,所述内源基因通过以功能性降低或完全无效的方式缺失、添加或替代至少一个核苷酸进行修饰。修饰也可影响基因的调节元件(例如启动子)以至编码序列保持不变,但不发生表达(转录和/或翻译)或表达降低。
关于常规的同源重组,经修饰区的5’及3’端侧翼为长度足以用于重组的其它核酸序列。原则上,长度在几百个碱基至几千个碱基的范围内(Thomas KR和Capecchi MR(1987)Cell51:503;Strepp等(1998)Proc Natl Acad Sci USA 95(8):4368-4373)。对于同源重组,以下文中描述的方法用重组构建体转化宿主生物体(例如植物),并且用例如抗生素或杀草剂抗性选择成功重组的克隆。使用共转化技术,可以接着通过杂交有利的重新除去对抗生素或杀草剂的抗性。植物中高效同源重组系统的实例已在Nat.Biotechnol.2002 Oct;20(10):1030-4,Terada R等:Efficient genetargeting by homologous recombination in rice中公开。
同源重组在高等真核生物(特别是植物)中是相对稀有发生的事件。随机整合到宿主基因组中占主要方面。去除经随机整合序列并因此富集正确同源重组细胞克隆的可能性在于如US6,110,736中描述的用序列特异重组系统,通过所述同源重组系统可缺失非特异整合序列,这有助于选择通过同源重组进行成功整合的事件。可应用多种序列特异重组系统,可提及的实例为噬菌体P1的Cre/lox系统、酵母的FLP/FRT系统、噬菌体Mu的Gin重组酶、来自大肠杆菌(E.coli)的Pin重组酶及质粒pSR1的R/RS系统。优选的为噬菌体P1 Cre/lox和酵母FLP/FRT系统。FLP/FRT及cre/lox重组酶系统已在植物系统中进行应用(Odell等(1990)MolGen Genet 223:369-378)。
I)向内源基因引入用于产生功能丢失的突变(例如产生终止密码、读框移位等)
用于降低活性的其它适当方法为将无义突变导入到内源基因中,例如通过将RNA/DNA寡核苷酸导入到植物中(Zhu等(2000)Nat Biotechnol18(5):555-558)及例如借助于T-DNA诱变(Koncz等(1992)Plant MolBiol20(5):963-976)及ENU(N-乙基-N-亚硝基脲)诱变或同源重组(Hohn B和Puchta(1999)H Proc Natl Acad Sci USA 96:8321-8323)产生敲除突变体。点突变也可通过DNA-RNA杂交体(Cole-Strauss等(1999)Nucl Acids Res 27(5):1323-1330;Kmiec(1999)Gene TherapyAmerican Scientist 87(3):240-247)产生,所述DNA-RNA杂交体也已知为嵌合修复术(chimeraplasty)。突变位点可以是特异性靶向的或随机选择的。如果随机产生突变,例如通过转座子标记或化学诱变,技术人员能够在本发明的核酸中特异性富集选择的突变事件。
如B)到I)项中所描述的核酸序列通过细胞或生物的转化/转染在细胞或生物中表达,或者例如如A)项所公开的,通过已知方法引入细胞或生物体中。
在本发明方法的另一个实施方案中,使用其中一种上述基因或一种上述核酸按如下方式突变的植物,即突变使得编码的基因产物的活性与未突变蛋白质相比更多地受到细胞因子的影响。这种突变可以引起生物代谢活性的改变,从而引起精细化学品的较高产生。这种较高生产力的原因可能是由于酶活性调节机制(如底物抑制或反馈调节)的改变。在本发明方法的另一个实施方案中,在以下条件下培养生物,即减少或抑制了本发明核酸的表达,引起本发明精细化学品的增强产生。
由于单独或与其他基因组合减少或缺失了赋予本发明核酸分子或本发明多肽(例如以下提到的核酸构建体)表达的基因,不仅可以提高通往终产物的生物合成通量,还可以在生物中提高、修饰或从头产生有利的、优选为新的代谢物组合物,例如有利的氨基酸组合物,所述氨基酸组合物含有(从营养生理学角度的)较高含量的生理限制的氨基酸,例如与本发明所述组合物或生物或其局部提供的较高数量的对动物和人类的营养和健康具有正影响的代谢物或较低数量的对动物和人类营养和健康具有负影响的代谢物组合的甲硫氨酸或赖氨酸。同样的,可以提高输入或输出营养物或代谢物所需的其他基因(细胞生物合成氨基酸所需的氨基酸或其前体)的数目或活性,以提高细胞或相应储存区室中必要或相关前体、辅助因子或中间产物的浓度。由于本发明多肽减少、降低或缺失的活性或由于减少或降低的本发明核酸序列数和/或生物合成氨基酸相关的其他基因的调整(例如通过提高合成前体的酶的活性或通过破坏氨基酸分解相关的一个或多个基因的活性),可以在宿主生物如植物或微生物中提高氨基酸的产率和/或产生效率。
通过影响代谢,从而在本发明方法中可能产生其他有利的含硫化合物,所述含硫化合物含有至少一个共价结合的硫原子。除了甲硫氨酸以外,这些化合物的实例为同型半胱氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、半胱氨酸、有利地为甲硫氨酸和S-腺苷甲硫氨酸。
因此,在一个实施方案中,本发明的方法涉及含有以下的方法:
a)提供非人生物,优选微生物、非人动物、植物细胞、植物组织或植物;
b)减少、降低或删除具有本发明蛋白质的生物活性或由本发明核酸分子编码的和如下所述的蛋白质在生物(优选微生物、非人动物、植物细胞、植物组织或植物)中的活性,所述蛋白质例如具有上述活性,例如赋予精细化学品提高;
c)在允许精细化学品在生物中(优选微生物、非人动物、植物细胞、植物组织或植物)产生的条件下培养生物(优选微生物、非人动物、植物细胞、植物组织或植物);和
d)必要时,回收(任选的分离)游离的和/或结合的甲硫氨酸和任选的由生物、微生物、非人动物、植物或动物细胞、植物或动物组织或植物合成的其他游离的和/或结合的氨基酸。
在下述的条件下有利地生长生物(具体为微生物、非人动物、植物或动物细胞、植物或动物组织或植物),所述条件下不仅可以回收,必要时还可分离游离或结合甲硫氨酸或游离和结合甲硫氨酸,但作为选择,还可能产生、回收和必要时分离其他游离的或/和结合的氨基酸,特别是甲硫氨酸。Galili等,Transgenic Res.,200,9,2,137-144描述了异源表达用于氨基酸合成的细菌基因赋予游离和与蛋白质结合的氨基酸提高。
经前述的减少、降低或删除后(如前面定义还包括在生物中产生活性,即从头活性),例如在引入和表达本发明方法中所述RNAi分子、反义分子或核酶后,培养并随后收获本发明的生物,有利的为微生物、非人动物、植物、植物或动物组织或植物或动物细胞。
原则上能够合成精细化学品和适合抑制、减少或删除重组基因的所有生物都是适合本发明和本发明目的使用的核酸分子、核酸构建体和载体(均见下文)的生物或宿主生物(转基因生物)。可能提到的实例为转基因植物、其细胞或原生质体、转基因微生物(如真菌、细菌、酵母、藻类或硅藻)、其细胞或原生质体。优选的生物为能天然合成大量精细化学品的生物,如真菌、酵母或植物。原则上说,转基因动物如秀丽隐杆线虫(Caenorhabditiselegans)也适于作为宿主生物。
当转基因生物为微生物如真核生物如真菌、藻类、硅藻或酵母时,特别是选自毛壳菌科(Chaetomiaceae)、笄霉科(Choanephoraceae)、隐球酵母科(Cryptococcaceae)、小克银汉霉科(Cunninghamellaceae)、Demetiaceae、从梗孢科(Moniliaceae)、Mortierellaceae、毛霉科(Mucoraceae)、腐霉科(Pythiaceae)、酵母科(Saccharomycetaceae),水霉科(Saprolegniaceae)、裂殖酵母属(Schizosaccharomycetaceae)、Sodariaceae、掷孢酵母科(Sporobolomycetaceae)、瘤座孢科(Tuberculariaceae)、Adelotheciaceae、甲藻纲(Dinophyceae)、牛毛藓科(Ditrichaceae)或绿枝藻纲(Prasinophyceae)的真菌、藻类、硅藻或酵母,或原核生物,如细菌或蓝藻、特别是放线菌科(Actinomycetaceae)、芽胞杆菌科(Bacillaceae)、短杆菌科(Brevibacteriaceae)、棒杆菌科(Corynebacteriaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriacae)、Gordoniaceae、诺卡氏菌科(Nocardiaceae)、微球菌科(Micrococcaceae)、分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)、假单胞菌科(Pseudomonaceae)、根瘤菌科(Rhizobiaceae)或链霉菌科(Streptomycetaceae)时,在固体或液体培养基上培养该生物,所述培养基为技术人员所公知并适于该生物。在生长期过后可以收获生物。随后可以将微生物和回收的(必要时分离的)氨基酸进行直接进入食品或动物饲料或用于其他应用的加工,例如根据本文特别引入为参考的EP-B-0 533 039和EP-A-0 615 693所公开的内容进行。可以通过提取和沉淀或通过离子交换器或技术人员已知和下文所述的其他方法以常规的方式纯化发酵液或发酵产物。这些不同检查方法的产物为氨基酸或仍含有发酵液和不同数量的细胞组分的氨基酸组合物,有利的发酵液和细胞组分白重量范围在0到99%,优选重量低于80%,特别优选重量低于50%。
优选的微生物选自毛壳菌科,例如毛壳菌(Chaetomium)属,例如Chaetomium fimeti;笄霉科,例如布拉霉属(Blakeslea)、笄霉属(Choanephora),例如三孢布拉霉(Blakeslea trispora)、瓜笄霉(Choanephora cucurbitarum)或漏斗笄霉(Choanephora infundibulifera var.cucurbitarum);隐球酵母科,例如假丝酵母属(Candida)、隐球菌属(Cryptococcus)、赤酵母属(Rhodotorula)、球拟酵母属(Torulopsis),例如白假丝酵母、Candida albomarginata、南极洲假丝酵母(CandidaAntarctica)、Candida bacarum、茂物假丝酵母(Candida bogoriensis)、博伊丁假丝酵母(Candida boidinii)、Candida bovina、布伦假丝酵母(Candidabrumptii)、可可假丝酵母(Candida cacaoi)、Candida cariosilignicola、链状假丝酵母(Candida catenulata)、Candida chalmersii、Candida ciferrii、Candida cylindracea、Candida edax、Candida ernobii、著明假丝酵母(Candida famata)、弗里斯假丝酵母(Candida freyschussii)、弗里德假丝酵母(Candida friedrichii)、光滑假丝酵母(Candida glabrata)、季也蒙假丝酵母(Candida guilliermondii)、Candida haemulonii、土生假丝酵母(Candida humicola)、Candida inconspicua、极大假丝酵母(Candidaingens)、间型假丝酵母(Candida intermedia)、乳酒假丝酵母(Candidakefyr)、克鲁斯假丝酵母(Candida krusei)、Candida lactiscondensi、郎比可假丝酵母(Candida lambica)、溶脂假丝酵母(Candida lipolytica)、葡萄牙假丝酵母(Candida lusitaniae)、马其顿假丝酵母(Candidamacedoniensis)、Candida magnoliae、Candida membranaefaciens、肠系膜假丝酵母(Candida mesenterica)、Candida multigemmis、假丝酵母(Candida mycoderma)、Candida nemodendra、Candida nitratophila、Candida norvegensis、Candida norvegica、近平滑假丝酵母(Candidaparapsilosis)、Candida pelliculosa、Candida peltata、Candida pini、假热带假丝酵母(Candida pseudotropicalis)、Candida pulcherrima、Candidapunicea、Candida pustula、Candida ravautii、Candida reukaufii、皱褶假丝酵母(Candida rugosa)、Candida sake、Candida silvicola、Candidasolani、Candida sp.、Candida spandovensis、Candida succiphila、热带假丝酵母(Candida tropicalis)、Candida utilis、Candida valida、Candidaversatilis、酸酒假丝酵母(Candida vini)、涎沫假丝酵母(Candidazeylanoides)、潜白隐球酵母(Cryptococcus albidus)、Cryptococcuscurvatus、黄隐球酵母(Cryptococcus flavus)、Cryptococcus humicola、Cryptococcus hungaricus、枸杞隐球酵母(Cryptococcus kuetzingii)、罗伦隐球酵母(Cryptococcus laurentii)、瘦弱隐球酵母(Cryptococcus macerans)、新型隐球酵母(Cryptococcus neoformans)、土隐球酵母(Cryptococcusterreus)、指甲隐球酵母(Cryptococcus uniguttulatus)、Rhodotorulaacheniorum、Rhodotorula bacarum、Rhodotorula bogoriensis、黄红类酵母菌(Rhodotorula flava)、胶红类酵母菌(Rhodotorula glutinis)、Rhodotorula macerans、小红酵母(Rhodotorula minuta)、胶红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)、果蝇红酵母(Rhodotorula pilimanae)、Rhodotorula pustula、深红酵母菌(Rhodotorula rubra)、Rhodotorulatokyoensis、球拟酵母(Torulopsis colliculosa)、枣椰球拟酵母(Torulopsisdattila)或新型球拟酵母菌(Torulopsis neoformans);小克银汉霉科(Cunninghamellaceae),例如小克银汉霉属(Cunninghamella),例如短刺小克银汉霉(Cunninghamella blakesleana)、刺孢小克银汉霉科(Cunninghamella echinulata)、Cunninghamella echinulata var.elegans、雅致小克银汉霉科(Cunninghamella elegans)或Cunninghamellahomothallica;暗梗胞科(Demetiaceae),例如支链孢属(Alternaria)、双极霉属(Bipolaris)、尾孢属(Cercospora)、横节霉菌属(Chalara)、分支孢子菌属(Cladosporium)、弯孢(霉)属(Curvularia)、Exophilia、Helicosporium、长蠕孢属(Helminthosporium)、Orbimyces、瓶霉属(Philalophora)、Pithomyces、Spilocaea、根串珠霉属(Thielaviopsis)、万吉拉菌属(Wangiella),例如近缘弯孢霉(Curvularia affinis)、Curvulariaclavata、Curvularia fallax、不等弯孢霉(Curvularia inaequalis)、Curvularia indica、月状弯孢霉(Curvularia lunata)、苍白弯孢霉(Curvularia pallescens)、疣状弯孢霉(Curvularia verruculosa)或Helminothosporium sp.;丛梗孢科(Moniliaceae),例如线虫捕捉菌属(Arthrobotrys)、曲霉(Aspergillus)、表皮癣菌属(Epidermophyton)、地丝菌属(Geotrichum)、胶枝霉属(Gliocladium)、组织胞浆菌属(Histoplasma)、小孢子菌属(Microsporum)、念珠菌属(Monilia)、珠头霉属(Oedocephalum)、Oidium、青霉菌(Penicillium)、木霉属(Trichoderma)、发癣菌(Trichophyton)、Thrichoteclum、轮枝孢属(Verticillium),例如棘孢曲霉(Aspergillus aculeatus)、Aspergillus albus、洋葱曲霉(Aspergillus alliaceus)、糙孢曲霉(Aspergillus asperescens)、泡盛曲霉(Aspergillus awamori)、亮白曲霉(Aspergillus candidus)、碳黑曲霉(Aspergillus carbonarius)、肉色曲霉(Aspergillus carneus)、谢瓦曲霉(Aspergillus chevalieri)、Aspergillus chevalieri var.intermedius、棒曲霉(Aspergillus clavatus)、无花果曲霉(Aspergillus ficuum)、黄柄曲霉(Aspergillus flavipes)、黄曲霉(Aspergillus flavus)、臭曲霉(Aspergillusfoetidus)、烟曲霉(Aspergillus fumigatus)、巨大曲霉(Aspergillusgiganteus)、Aspergillus humicola、Aspergillus intermedius、日本曲霉(Aspergillus japonicus)、构巢曲霉(Aspergillus nidulans)、黑曲霉(Aspergillus niger)、雪白曲霉(Aspergillus niveus)、赭曲霉(Aspergillusochraceus)、米曲霉(Aspergillus oryzae)、孔曲霉(Aspergillus ostianus)、寄生曲霉(Aspergillus parasiticus)、Aspergillus parasiticus var.globosus、青霉状曲霉(Aspergillus penicillioides)、海藻曲霉(Aspergillus phoenicis)、皱褶曲霉(Aspergillus rugulosus)、菌黑曲霉(Aspergillus sclerotiorum)、Aspergillus sojae var.gymnosardae、聚多曲霉(Aspergillus sydowi)、溜曲霉(Aspergillus tamarii)、土曲霉(Aspergillus terreus)、栖土曲霉(Aspergillusterricola)、Aspergillus toxicarius、爪甲曲霉(Aspergillus unguis)、焦曲霉(Aspergillus ustus)、杂色曲霉(Aspergillus versicolor)、Aspergillusvitricolae、温特曲霉(Aspergillus wentii)、阿达青霉菌(Penicilliumadametzi)、白色青霉(Penicillium albicans)、Penicillium arabicum、Penicillium arenicola、Penicillium argillaceum、Penicillium arvense、Penicillium asperosporum、Penicillium aurantiogriseum、榛色青霉(Penicillium avellaneum)、巴恩青霉(Penicillium baarnense)、杆孢青霉(Penicillium bacillisporum)、Penicillium brasilianum、短密青霉(Penicillium brevicompactum)、沙门柏干酪青霉菌(Penicilliumcamemberti)、Penicillium canadense、变灰青霉(Penicillium canescens)、Penicillium caperatum、胶囊青霉(Penicillium capsulatum)、酪生青霉(Penicillium caseicolum)、产黄青霉(Penicillium chrysogenum)、Penicillium citreonigrum、桔青霉(Penicillium citrinum)、棒形青霉(Penicillium claviforme)、普通青霉(Penicillium commune)、顶青霉(Penicillium corylophilum)、丛花青霉(Penicillium corymbiferum)、皮落青霉(Penicillium crustosum)、圆弧青霉(Penicillium cyclopium)、齿孢青霉(Penicillium daleae)、斜卧青霉(Penicillium decumbens)、Penicilliumdierckxii、指状青霉(Penicillium digitatum)、Penicillium digitatum var.latum、散枝青霉(Penicillium divaricatum)、异型青霉(Penicilliumdiversum)、杜壳青霉(Penicillium duclauxii)、Penicillium echinosporum、扩展青霉(Penicillium expansum)、瘿青霉(Penicillium fellutanum)、常现青霉(Penicillium frequentans)、Penicillium funiculosum、平滑青霉(Penicillium glabrum)、唐菖蒲青霉(Penicillium gladioli)、Penicilliumgriseofulvum、多毛青霉(Penicillium hirsutum)、Penicillium hispanicum、岛青霉(Penicillium islandicum)、意大利青霉(Penicillium italicum)、Penicillium italicum var.avellaneum、Penicillium janczewskii、微紫青霉(Penicillium janthinellum)、Penicillium japonicum、Penicillitumlavendulum、薄青霉(Penicillium lilacinum)、铅色青霉(Penicilliumlividum)、马顿青霉(Penicillium martensii)、Penicillium megasporum、米舒青霉(Penicillium miczynskii)、Penicillium nalgiovense、黑青霉(Penicillium nigricans)、特异青霉(Pencillium notatum)、赭绿青霉(Penicilliam ochrochloron)、Penicillium odoratum、草酸青霉(Penicillilumoxalicum)、Penicillium paraherquei、展青霉(Penicillium patulum)、嗜松青霉(Penicillium pinophilum)、鱼肝油青霉(Penicillium piscarium)、Penicillium pseudostromaticum、软毛青霉(Penicillium puberulum)、产紫青霉(Penicillium purpurogenum)、皱绒青霉(Penicillium raciborskii)、娄地青霉(Penicillium roqueforti)、刺圆孢青霉(Penicillium rotundum)、红色青霉(Penicillium rubrum)、Penicillium sacculum、筒青霉(Penicilliumsimplicissimum)、Penicillium sp.、小刺青霉(Penicillium spinulosum)、歧皱青霉(Penicillium steckii)、葡枝青霉(Penicillium stoloniferum)、Penicillium striatisporum、条孢青霉(Penicillium striatum)、缓生青霉(Penicillium tardum)、托姆青霉(Penicillium thomii)、不整青霉(Penicillium turbatum)、变幻青霉(Penicillium variabile)、蠕形青霉(Penicillium vermiculatum)、Penicillium vermoesenii、Penicilliumverrucosum、Penicillium verrucosum var.corymbiferum、Penicilliumverrucosum var.cyclopium、疣孢青霉(Penicillium verruculosum)、葡萄酒色青霉(Penicillium vinaceum)、Penicillium violaceum、鲜绿青霉(Penicillium viridicatum)、Penicillium vulpinum、Trichoderma hamatum、Trichoderma harzianum、康宁木霉(Trichoderma koningii)、Trichodermalongibrachiatum、Trichoderma polysporum、Trichoderma reesei、Trichoderma virens或绿色木霉(Trichoderma viride);被孢霉科(Mortierellaceae)例如被孢霉属(Mortierella)例如深黄被孢霉(Mortierellaisabellina)、多头被孢霉(Mortierella polycephala)、拉曼被孢霉(Mortierellaramanniana)、葡酒色被孢霉(Mortierella vinacea)或Mortierella zonata;毛霉科(Mucoraceae)例如Actinomucor、毛霉(Mucor)、Phycomyces、根霉(Rhizopus)、Zygorhynchus例如Mucor amphibiorum、Mucorcircinelloides f.circinelloides、卷枝毛霉灰蓝变种(Mucor circinelloides var.griseocyanus)、黄色毛霉(Mucor flavus)、Mucor fuscus、灰蓝毛霉(Mucorgriseocyanus)、异孢毛霉(Mucor heterosporus)、冻土毛霉(Mucorhiemalis)、Mucor hiemalis f.hiemalis、不等孢毛霉(Mucorinaequisporus)、Mucor indicus、爪哇毛霉(Mucor javanicus)、大毛霉(Mucor mucedo)、粘毛霉(Mucor mucilaginous)、梨形毛霉(Mucorpirlformis)、浆孢毛霉(Mucor plasmaticus)、密丛毛霉(Mucor plumbeus)、总状毛霉(Mucor racemosus)、Mucor racemosus f.racemosus、Mucorracemosus f.sphaerosporus、鲁毛霉(Mucor rouxianus)、Mucor rouxii、Mucor sinensis、毛霉属(Mucor sp.)、刺囊毛霉(Mucor spinosus)、Mucortuberculisporus、Mucor variisporus、Mucor variosporus、大囊毛霉(Mucorwosnessenskii)、布拉克须霉(Phycomyces blakesleeanus)、Rhizopusachlamydosporus、少根根霉(Rhizopus arrhizus)、华根霉(Rhizopuschinensis)、Rhizopus delemar、台湾根霉(Rhizopus formosensis)、日本根霉(Rhizopus japonicus)、爪哇根霉(Rhizopus javanicus)、小孢根霉(Rhizopus microsporus)、小孢根霉华变种(Rhizopus microsporus var.chinensis)、小孢根霉小孢变种(Rhizopus microsporus var.oligosporus)、Rhizopus microsporus var.rhizopodiformis、黑根霉(Rhizopus nigricans)、雪白根霉(Rhizopus niveus)、少孢根霉(Rhizopus oligosporus)、稻根霉(Rhizopus oryzae)、Rhizopus pygmaeus、Rhiaopus rhizopodiformis、Rhizopus semarangensis、Rhizopus sontii、葡萄枝根霉(Rhizopusstolonifer)、Rhizopus thermosus、东条根霉(Rhizopus tonkinensis)、Rhizopus tritici或Rhizopus usamii;腐霉科,例如腐霉(Phytium)属、疫霉属(Phytophthora)例如德巴利腐霉(Pythium debaryanum)、间型腐霉(Pythium intermedium)、畸雌腐霉(Pythium irregulare)、大雄腐霉(Pythium megalacanthum)、侧雄腐霉(Pythium paroecandrum)、Pythiumsylvaticum、终极腐霉(Pythium ultimum)、恶疫霉(Phytophthoracactorum)、樟疫霉(Phytophthora cinnamomi)、柑桔生疫霉(Phytophthora citricola)、柑桔褐腐疫霉(Phytophthora citrophthora)、隐地疫霉(Phytophthora cryptogea)、德雷疫霉(Phytophthora drechsleri)、红腐疫霉(Phytophthora eryhroseptica)、侧生疫霉(Phytophthoralateralis)、大雄疫霉(Phytophthora megasperma)、烟草疫霉(Phytophthora nicotianae)、烟草疫霉寄生变种(Phytophthora nicotianaevar.parasitica)、棕榈疫霉(Phytophthora palmivora)、寄生疫霉(Phytophthora parasitica)或丁香疫霉(Phytophthora syringae)种;酵母科(Saccharomycetaceae)例如汉森氏酵母属(Hansenula)、毕赤酵母属(Pichia)、酵母(Saccharomyces)、类酵母属(Saccharomycodes)、Yarrowia例如异常汉逊酵母(Hansenula anomala)、加州汉逊酵母(Hansenula californica)、加拿大汉逊酵母(Hansenula canadensis)、碎囊汉逊酵母(Hansenula capsulata)、西弗汉逊酵母(Hansenulaciferrii)、葡糖酶汉逊酵母(Hansenula glucozyma)、亨利汉逊酵母(Hansenula henricii)、Hansenula holstii、小汉逊酵母(Hansenulaminuta)、不发酵汉逊酵母(Hansenula nonfermentans)、Hansenulaphilodendri、多形汉森氏酵母(Hansenula polymorpha)、土星汉逊酵母(Hansenula saturnus)、亚膜汉逊酵母(Hansenula subpelliculosa)、魏氏汉逊酵母(Hansenula wickerhamii)、温奇汉逊酵母(Hansenulawingei)、嗜酒毕赤酵母(Pichia alcoholophila)、Pichia angusta、异常毕赤酵母(Pichia anomala)、二孢毕赤酵母(Pichia bispora)、伯顿毕赤酵母(Pichia burtonii)、加拿大毕赤酵母(Pichia canadensis)、荚膜毕赤酵母(Pichia capsulata)、卡氏毕赤酵母(Pichia carsonii)、聚纤维二糖毕赤酵母(Pichia cellobiosa)、西弗毕赤酵母(Pichia ciferrii)、粉状毕赤酵母(Pichia farinosa)、发酵毕赤酵母(Pichia fermentans)、芬兰毕赤酵母(Pichia finlandica)、葡糖酿酶毕赤酵母(Pichia glucozyma)、季氏毕赤氏酵母(Pichia guilliermondii)、甲虫毕赤酵母(Pichia haplophila)、Pichia henricii、Pichia holstii、Pichia jadinii、Pichia lindnerii、膜醭毕赤酵母(Pichia membranaefaciens)、甲醇毕赤酵母(Pichia methanolica)、微小毕赤酵母微小变种(Pichia minuta var.minuta)、微小毕赤酵母非发酵变种(Pichia minuta var.nonfermentans)、挪威毕赤酵母(Pichianorvegensis)、奥默毕赤酵母(Pichia ohmeri)、巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)、Pichia philodendri、Pichia pini、多形毕赤酵母(Pichiapolymorpha)、栎毕赤酵母(Pichia quercuum)、罗丹毕赤酵母(Pichiarhodanensis)、Pichia sargentensis、树干毕赤酵母(pichia stipitis)、斯地毕赤酵母(Pichia strasburgensis)、亚膜毕赤酵母(Pichia subpelliculosa)、帽孢毕赤酵母(Pichia toletana)、喜海藻糖毕赤酵母(Pichia trehalophila)、Pichia vini、木糖毕赤酵母(Pichia xylosa)、醋酵母(Saccharomycesaceti)、拜耳酵母(Saccharomyces bailii)、葡萄酒酵母(Saccharomycesbayanus)、二孢酵母(Saccharomyces bisporus)、好望角(Saccharomycescapensis)、卡尔酵母(Saccharomyces carlsbergensis)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、酿酒酵母椭圆变种(Saccharomycescerevisiae var.ellipsoideus)、薛瓦酵母(Saccharomyces chevalieri)、德氏酵母(Saccharomyces delbrueckii)、糖化酵母(Saccharomycesdiastaticus)、Saccharomyces drosophilarum、雅致酵母(Saccharomyceselegans)、椭圆酵母(Saccharomyces ellipsoideus)、发酵酵母(Saccharomyces fermentati)、弗罗棱酵母(Saccharomyces florentinus)、脆壁酵母(Saccharomyces fragilis)、异质酵母(Saccharomycesheterogenicus)、橄榄油酵母(Saccharomyces hienipiensis)、荷兰啤酒酵母(Saccharomyces inusitatus)、意大利酵母(Saccharomyces italicus)、克鲁弗酵母(Saccharomyces kluyveri)、克鲁斯酵母(Saccharomyces krusei)、乳酸酵母(Saccharomyces lactis)、马克斯酵母(Saccharomycesmarxianus)、微椭圆酵母(Saccharomyces microellipsoides)、山地酵母(Saccharomyces montanus)、诺地酵母(Saccharomyces norbensis)、橄榄酵母(Saccharomyces oleaceus)、奇异酵母(Saccharomyces paradoxus)、Saccharomyces pastorianus、普地酵母(Saccharomyces pretoriensis)、罗斯酵母(Saccharomyces rosei)、鲁氏酵母(Saccharomyces rouxii)、葡萄汁酵母(Saccharomyces uvarum)、路德类酵母(Saccharomycodesludwigii)、解脂亚罗酵母(Yarrowia lipolytica);水霉科,例如水霉属(Saprolegnia)例如水霉(Saprolegnia ferax);裂殖酵母属,例如裂殖酵母属(Schizosaccharomyces)例如日本裂殖酵母日本变种(Schizosaccharomyces japonicus var.japonicus)、日本裂殖酵母易变变种(Schizosaccharomyces japonicus var.versatilis)、解苹果酸裂殖酵母(Schizosaccharomyces malidevorans)、八孢裂殖酵母(Schizosaccharomycesoctosporus)、粟酒裂殖酵母解苹果酸变种(Schizosaccharomyces pombe var.malidevorans)或粟酒裂殖酵母粟酒变种(Schizosaccharomyces pombe var.pombe);Sodariaceae例如脉孢菌(Neurospora)、Sordaria例如Neurospora africana、粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)、间型脉孢菌(Neurospora intermedia)、好食脉孢菌(Neurospora sitophila)、四孢脉孢菌(Neurospora tetrasperma、Sordaria fimicola或Sordaria macrospora;瘤座孢科(Tuberculariaceae),例如多腔菌属(Epicoccum)、镰孢属(Fusarium)、多腔菌属(Myrothecium)、Sphacelia、Starkeyomyces、瘤座孢属(Tubercularia),例如锐顶镰孢(Fusarium acuminatum)、花腐镰孢(Fusarium anthophilum)、水生镰孢(Fusarium aquaeductuum)、间型水生镰孢(Fusarium aquaeductuum var.medium、燕麦镰孢(Fusariumavenaceum)、Fusarium buharicum、Fusarium camptoceras、Fusariumcerealis、Fusarium chlamydosporum、细长镰孢(Fusarium ciliatum)、Fusarium coccophilum、深蓝镰孢(Fusarium coeruleum)、同色镰孢(Fusarium concolor)、Fusarium crookwellense、大刀镰孢(Fusariumculmorum)、双孢镰孢(Fusarium dimerum)、杂色镰孢(Fusariumdiversisporum)、木贼镰孢(Fusarium equiseti)、Fusarium equiseti var.bullatum、Fusarium eumartii、Fusarium flocciferum、Fusariumfujikuroi、禾本科镰孢(Fusarium graminearum)、禾赤镰孢(Fusariumgraminum)、异孢镰孢(Fusarium heterosporum)、Fusarium incarnatum、Fusarium inflexum、爪哇镰孢(Fusarium javanicum)、砖红镰孢(Fusariumlateritium)、Fusarium lateritium var.majus、Fusarium longipes、Fusarium melanochlorum、节状镰孢(Fusarium merismoides)、Fusariummerismoides var.chlamydosporale、串珠镰孢(Fusarium moniliforme)、串珠镰孢花腐变种(Fusarium moniliforme var.anthophilum)、串珠镰孢亚粘团变种(Fusarium moniliforme var.subglutinans)、雪腐镰孢(Fusariumnivale)、Fusarium,nivale var.majus、尖镰孢(Fusarium oxysporum)、Fusarium oxysporum f.sp.aechmeae、Fusarium oxysporum f.sp.cepae、Fusarium oxysporum f.sp.conglutinans、Fusarium oxysporum f.sp.cucumerinum、Fusarium oxysporum f.sp.cyclaminis、Fusariumoxysporum f.sp.dianthi、Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici、Fusariumoxysporum f.sp.melonis、Fusarium oxysporum f.sp.passiflorae、Fusarium oxysporum f.sp.pisi、Fusarium oxysporum f.sp.tracheiphilum、Fusarium oxysporum f.sp.tuberosi、Fusarium oxysporum f.sp.tulipae、Fusarium oxysporum f.sp.vasinfectum、Fusarium pallidoroseum、早熟禾镰孢(Fusarium poae)、Fusarium proliferatum、Fusarium proliferatum var.minus、芳香镰孢(Fusarium redolens、Fusarium redolens f.sp.dianthi、Fusarium reticulatum、粉红镰孢(Fusarium roseum)、Fusarium saccharivar.elongatum、接骨木镰孢(Fusarium sambucinum)、Fusariumsambucinum var.coeruleum、半裸镰孢(Fusarium semitectum)、Fusariumsemitectum var.majus、腐皮镰孢(Fusarium solani)、Fusarium solani f.sp.pisi、拟分枝孢镰孢(Fusarium sporotrichioides)、Fusarium sporotrichioidesvar.minus、Fusarium sublunatum、Fusarium succisae、Fusariumsulphureum、Fusarium tabacinum、三隔镰孢(Fusarium tricinctum)、Fusarium udum、Fusarium ventricosum、Fusarium verticillioides、Fusarium xylarioides或Fusarium zonatum;掷孢酵母科(Sporobolomycetaceae),例如布勒弹孢酵母属(Bullera)、掷孢酵母属(Sporobolomyces)、Itersonilia,例如不对称掷孢酵母(Sporobolomycesholsaticus)、香气掷孢酵母(Sporobolomyces odorus)、Sporobolomycespuniceus、赭色掷孢酵母(Sporobolomyces salmonicolor)、独特掷孢酵母(Sporobolomyces singularis)或Sporobolomyces tsugae;Adelotheciaceae例如Physcomitrella patens;甲藻纲(Dinophyceae),例如Cryptheeodinium、褐指藻属(Phaeodactylum),例如Crypthecodiniumcohnii或三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum);牛毛藓科,例如角齿藓属(ceratodon)、丛毛藓属(Pleuridium)、高地藓属(Astomiopsis)、牛毛藓属(Ditrichum)、Philibertiella、Ceratodon、对叶藓属(Distichium)、Skottsbergia例如Ceratodon antarcticus、角齿藓(Ceratodon purpureus)、Ceratodon purpureus ssp.convolutes或Ceratodon purpureus ssp.stenocarpus;绿枝藻纲,例如肾藻属(Nephroselmis)、Prasinococcus、Scherffelia、Tetraselmis、Mantoniella、Ostreococcus,例如绿肾藻(Nephroselmis olivacea)、Prasinococcus capsulatus、Scherffelia dubia、Tetraselmis chui、Tetraselmis suecica、Mantoniella squamata或Ostreococcus tauri;放线菌科(Actinomycetaceae),例如放线菌属(Actinomyces)、Actinobaculum、隐秘杆菌属(Arcanobacterium)、Mobiluncus例如Actinomyces bernardiae、牛型放线菌(Actinomycesbovis)、Actinomyces bowdenii、Actinomyces canis、Actinomycescardiffensis、Actinomyces catuli、Actinomyces coleocanis、Actinomycesdenticolens、Actinomyces europaeus、Actinomyces funkei、Actinomycesgeorgiae、Actinomyces gerencseriae、Actinomyces hordeovulneris、Actinomyces howellii、Actinomyces humiferus、Actinomyceshyovaginalis、Actinomyces israelii、Actinomyces marimammalium、Actinomyces meyeri、Actinomyces naeslundii、Actinomyces nasicola、Actinomyces neuii subsp.anitratus、Actinomyces neuii subsp.neuii、龋齿放线菌(Actinomyces odontolyticus)、Actinomyces oricola、Actinomycespyogenes、Actinomyces radicidentis、Actinomyces radingae、Actinomycesslackii、Actinomyces suimastitidis、Actinomyces suis、Actinomycesturicensis、Actinomyces urogenitalis、Actinomyces vaccimaxillae、Actinomyces viscosus、Actinobaculum schaalii、Actinobaculum suis、Actinobaculum urinale、Arcanobacterium bernardiae、Arcanobacteriumhaemolyticum、Arcanobacterium hippocoleae、Arcanobacterium phocae、Arcanobacterium pluranimalium、Arcanobacterium pyogenes、Mobiluncuscurtisii subsp.curtisii、Mobiluncus curtisii subsp.holmesii或Mobiluncusmulieris;芽孢杆菌科(Bacillaceae)例如Amphibacillus、Anoxybacillus、芽孢杆菌属(Bacillus)、Exiguobacterium、Gracilibacillus、Holobacillus、Saccharococcus、Salibacillus、Virgibacillus例如Amphibacillusfermentum、Amphibacillus tropicrs、Amphibacillus xylanus、Anoxybacillus flavithermus、Anoxybacillus gonensis、Anoxybacilluspushchinoensis、酸热芽孢杆菌属(Bacillus acidocaldarius)、酸土环脂芽孢杆菌属(Bacillus acidoterrestris)、Bacillus aeolius、Bacillusagaradhaerens、土壤芽孢杆菌(Bacillus agri)、嗜碱芽孢杆菌(Bacillusalcalophilus)、Bacillus alginolyticus、蜂房芽孢杆菌(Bacillus alvei)、淀粉液化芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillusamylolyticus)、解硫胺素芽孢杆菌(Bacillus aneurinolyticus)、Bacillusaquimaris、Bacillus arseniciselenatis、Bacillus atrophaeus、Bacillusazotofixans、Bacillus azotoformans、栗褐芽孢杆菌(Bacillus badius)、Bacillus barbaricus、Bacillus benzoevorans、Bacillus borstelensis、短芽孢杆菌(Bacillus brevis)、Bacillus carboniphilus、中饱芽孢杆菌(Bacilluscentrosporus)、蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)、Bacillus chitinolyticus、Bacillus chondroitinus、Bacillus choshinensis、环状芽孢杆菌(Bacilluscirculans)、Bacillus clarkii、Bacillus clausii、凝结芽孢杆菌(Bacilluscoagulans)、Bacillus cohnii、Bacillus curdlanolyicus、Bacilluscycloheptanicus、Bacillus decolorationis、Bacillus dipsosauri、Bacillusedaphicus、Bacillus ehimensis、Bacillus endophyticus、苛求芽孢杆菌(Bacillus fastidiosus)、坚强中饱芽孢杆菌(Bacillus firmus)、弯曲芽孢杆菌(Bacillus flexus)、Bacillus formosus、Bacillus fumarioli、Bacillusfuniculus、梭形芽孢杆菌(Bacdlus fusiformis)、球形芽孢杆菌梭形杆菌亚种(Bacillus sphaericus subsp.Fusiformis)、嗜乳糖芽孢杆菌(Bacdlusgalactophilus)、园孢芽孢杆菌(Bacillus globisporus)、园孢芽孢杆菌海生亚种(Bacillus globisporus subsp.Marimus)、Bacillus glucanolyticus、Bacillus gordonae、Bacillus halmapalus、Bacillus haloalkaliphilus、Bacillus halodenitrificans、Bacillus halodurans、嗜盐芽孢杆菌(Bacillushalophilus)、Bacillus horikoshii、Bacillus horti、Bacillus infernos、异常芽孢杆菌(Bacillus insolitus)、Bacillus jeotgali、Bacillus kaustophilus、Bacillus kobensis、Bacillus krulwichiae、左乳酸芽孢杆菌(Bacilluslaevolacticus)、幼虫芽孢杆菌(Bacillus larvae)、侧孢芽孢杆菌(Bacilluslaterosporus)、Bacillus lautus、乳病芽孢杆菌(Bacillus lentimorbus)、迟缓芽孢杆菌(Bacillus lentus)、蓟样芽孢杆菌(Bacillus lichemiformis)、Bacillus luciferensis、侵麻芽孢杆菌(Bacillus macerans)、马阔里芽孢杆菌(Bacillus macquariensis)、Bacillus marinus、Bacillus marisflavi、Bacillusmarismortui、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)、甲烷芽孢杆菌(Bacillus methanolicus)、Bacillus migulanus、Bacillus mojavensis、胶质芽孢杆菌(Bacillus mucilaginosus)、蕈状芽孢杆菌(Bacillus mycoides)、Bacillus naganoensis、Bacillus nealsonii、Bacillus neidei、Bacillusniacini、Bacillus okuhidensis、Bacillus oleronius、Bacillus pabulli、Bacillus pallidus、Bacillus pantothenticus、Bacillus parabrevis、巴氏芽孢杆菌(Bacillus pasteurii)、Bacillus peoriae、多粘芽孢杆菌(Bacilluspolymyxa)、日本甲虫芽孢杆菌(Bacillus popilliae)、Bacilluspseudalcaliphilus、Bacillus pseudofirmus、Bacillus pseudomycoides、Bacillus psychrodurans、嗜冷芽孢杆菌(Bacillus psychrophilus)、冷糖分解芽孢杆菌(Bacillus psychrosaccharolyticus)、Bacillus psychrotolerans、尘埃芽孢杆菌(Bacillus pulvifaciens)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)、Bacillus pycnus、Bacillus reuszeri、Bacillus salexigens、Bacillusschlegelii、Bacillus selenitireducens、Bacillus silvestris、简单芽孢杆菌(Bacillus simplex)、Bacillus siralis、Bacillus smithii、Bacillussonorensis、球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)、Bacillussporothermodurans、嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillus stearothermophilus)、Bacillus subterraneus、枯草杆菌spizizenii亚种(Bacillus subtilis subsp.Spizizenii)、枯草杆菌枯草亚种(Bacillus subtilis subsp.Subtilis)、Bacillusthermantarcticus、Bacillus thermoaerophilus、Bacillusthermoamylovorans、Bacillus thermoantarcticus、Bacillusthermocatenulatus、Bacillus thermocloacae、Bacillusthermodenitrificans、Bacillus thermoglucosidasius、Bacillusthermoleovorans、Bacillus thermoruber、Bacillus thermosphaericus、解硫胺素芽孢杆菌(Bacillus thiaminolyticus)、苏云金芽孢杆菌(Bacillusthuringiensis)、Bacillus tusciae、Bacillus validus、Bacillus vallismortis、Bacillus vedderi、Bacillus vulcani、Bacillus weihenstephanensis、Exiguobacterium acetylicum、Exiguobacterium antarcticum、Exiguobacterium aurantiacum、Exiguobacterium undae、Gracilibacillusdipsosauri、Gracilibacillus halotolerans、Halobacillus haliphilus、Halobacillus karajensis、Halobacillus litoralis、Halobacliius salinus、Halobacliius trueperi、Saccharococcus caldoxylosilyticus、Saccharococcusthermophilus、Salibacillus marismortui、Salibacillus salexigens、Virgibacillus carmonensis、Virgibacillus marismortui、Virgibacillusnecropolis、Virgibacillus pantothenticus、Virgibacillus picturae、Virgibacillus proomii或Virgibacillus salexigens、短杆菌科(Brevibacteriaceae),例如短杆菌属(Brevibacterium),例如乙酰短杆菌(Brevibacterium acetylicum)、Brevibacterium albidum、产安短杆菌(Brevibacterium ammoniagenes)、Brevibacterium avium、Brevibacteriumcasei、Brevibacterium citreum、叉开短杆菌(Brevibacteriumdivaricatum)、Brevibacterium epidermidis、Brevibacterium fermentans、Brevibacterium frigoritolerans、Brevibacterium halotolerans、蛾短杆菌(Brevibacterium imperiale)、未完短杆菌(Brevibacterium incertum)、Brevibacterium iodinum、扩展短杆菌(Brevibacterium linens)、Brevibacterium liquefaciens、Brevibacterium lutescens、Brevibacteriumluteum、Brevibacterium lyticum、Brevibacterium mcbrellneri、Brevibacterium otitidis、Brevibacterium oxydans、Brevibacteriumpaucivorans、Brevibacterium protophormiae、Brevibacterium pusillum、Brevibacterium saperdae、停滞短杆菌(Brevibacterium stationis)、Brevibacterium testaceum或Brevibacterium vitaeruminis;棒杆菌科(Corynebacteriaceae),例如棒杆菌属(Corynebacterium)例如Corynebacterium accolens、Corynebacterium afermentans subsp.afermentans、Corynebacterium afermentans subsp.lipophilum、Corynebacterium ammoniagenes、Corynebacterium amycolatum、Cotynebacterium appendicis、Corynebacterium aquilae、Corynebacteriumargentoratense、Corynebacterium atypicum、Corynebacteriumaurimucosum、Corynebacterium auris、Corynebacterium auriscanis、菜棒杆菌(Corynebacterium betae)、Corynebacterium beticola、牛棒杆菌(Corynebacterium bovis)、美棒杆菌(Corynebacterium callunae)、Corynebacterium camporealensis、Corynebacterium capitovis、Corynebacterium casei、Corynebacterium confusum、Cotynebacteriumcoyleae、Corynebacterium cystitidis、Corynebacterium durum、Corynebacterium efficiens、马棒杆菌(Corynebacterium equi)、Corynebacterium falsenii、缠绕棒杆菌(Corynebacterium fascians)、Corynebacterium felinum、萎蔫棒杆菌(Corynebacterium flaccumfaciens)、Corynebacterium flavescens、Corynebacterium freneyi、Corynebacteriumglaucum、Corynebacterium glucuronolyticum、Corynebacteriumglutamicum、霍氏棒杆菌(Corynebacterium hoagii)、Corynebacteriumilicis、Corynebacterium imitans、诡谲棒杆菌(Corynebacteriuminsidiosum)、伊朗棒杆菌(Corynebacterium iranicum)、Corynebacteriumjeikeium、Corynebacterium kroppenstedtii、库氏棒杆菌(Corynebacteriumkutscheri)、百合棒杆菌(Corynebacterium lilium)、Corynebacteriumliophiloflavum、Corynebacterium macginleyi、Corynebacteriummastitidis、Corynebacterium matruchotii、密执安棒杆菌(Corynebacteriummichiganense)、Corynebacterium michiganense subsp.tessellarius、Corynebacterium minutissimum、Corynebacterium mooreparkense、Corynebacterium mucifaciens、类真菌棒杆菌(Corynebacteriummycetoides)、尼布拉斯加棒杆菌(Corynebacterium nebraskense)、奥氏棒杆菌(Corynebacterium oortii)、稍变棒杆菌(Corynebacteriumpaurometabolum)、海棒杆菌(Corynebacterium phocae)、Corynebacteriumpilosum、猩猩木棒杆菌(Corynebacterium poinsettiae)、Corynebacteriumpropinquum、Corynebacterium pseudodiphtheriticum、假结核棒杆菌(Corynebacterium pseudotuberculosis)、牛化脓棒杆菌(Corynebacteriumpyogenes)、拉氏棒杆菌(Corynebacterium rathayi、兔肾棒杆菌(Corynebacterium renale)、Corynebacterium riegelii、Corynebacteriumseminale、马铃薯环腐病棒杆菌(Corynebacterium sepedonicum)、Corynebacterium simulans、Corynebacterium singulare、Corynebacteriumsphenisci、Corynebacterium spheniscorum、纹带棒杆菌(Corynebacteriumstriatum)、Corynebacterium suicordis、Corynebacterium sundsvallense、Corynebacterium terpenotabidum、Corynebacterium testudinoris、Corynebacterium thomssenii、小麦棒杆菌(Corynebacterium tritici)、溃疡棒杆菌(Corynebacterium ulcerans)、Corynebacterium urealyticum、Corynebacterium variabile、Corynebacterium vitaeruminis或干燥棒杆菌(Corynebacterium xerosis);肠杆菌科,例如Alterococcus、Arsenophonus、Brenneria、Buchnera、Budvicia、Buttiauxella、鞘杆菌属(Calymmatobacterium)、Cedecea、柠檬酸杆菌(Citrobacter)、爱德华氏菌属(Edwardsiella)、肠杆菌属(Enterobacter)、欧文氏菌属(Erwinia)、埃希氏菌属(Escherichia)、Ewingella、哈夫尼菌属(Hafnia)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、Kluyvera、Leclercia、Leminorella、Moellerella、摩根氏菌属(Morganella)、Obesumbacterium、Pantoea、果胶杆菌属(Pectobacterium)、Photorhabdus、邻单胞菌属(Plesiomonas)、Pragia、变形菌属(Proteus)、普罗威登斯菌属(Providencia)、Rahnella、Saccharobacter、沙门氏菌属(Salmonella)、志贺氏杆菌属(Shigella)、沙雷氏菌属(Serratia)、Sodalis、Tatumella、Trabulsiella、Wigglesworthia、Xenorhabdus,耶尔森菌属(Yersinia)和Yokenella例如Arsenophonus nasoniae、Brenneriaalni、Brenneria nigrifluens、Brenneria quercina、Brenneriarubrifaciens、Brenneria salicis、Budvicia aquatica、Buttiauxella agrestis、Buttiauxella brennerae、Buttiauxella ferragutiae、Buttiauxella gaviniae、Buttiauxella izardii、Buttiauxella noackiae、Buttiauxella warmboldiae、Cedecea davisae、Cedecea lapagei、Cedecea neteri、无丙二酸柠檬酸菌(Citrobacter amalonaticus)、异型柠檬酸菌(Citrobacter diversus)、弗氏柠檬酸菌(Citrobacter freundii)、Citrobacter genomospecies、Citrobactergillenii、间型柠檬酸菌(Citrobacter intermedium)、柯氏柠檬酸菌(Citrobacter koseri)、Citrobacter murliniae、柠檬酸菌种(Citrobactersp.)、保科爱德华菌(Edwardsiella hoshinae)、Edwardsiella ictaluri、迟钝爱德华菌(Edwardsiella tarda)、Erwinia alni、解淀粉欧文氏菌(Erwiniaamylovora)、Erwinia ananatis、Erwinia aphidicola、Erwinia billingiae、灭仙人掌欧文氏菌(Erwinia cacticida)、生癌欧文氏菌(Erwiniacancerogena)、大仙人掌欧文氏菌(Erwinia carnegieana)、胡萝卜软腐欧文氏菌黑腐亚种(Erwinia carotovora subsp.atroseptica)、胡萝卜软腐欧文氏菌亚种(Erwinia carotovora subsp.betavasculorum)、胡萝卜软腐欧文氏菌气味亚种(Erwinia carotovora subsp.odorifera)、胡萝卜软腐欧文氏菌wasabiae亚种(Erwinia carotovora subsp.wasabiae)、菊欧文氏菌(Erwinia chrysanthemi)、杓兰欧文氏菌(Erwinia cypripedii)、溶解欧文氏菌(Erwinia dissolvens)、草生欧文氏菌(Erwinia herbicola)、野梧桐欧文氏菌(Erwinia mallotivora)、鸡血藤欧文氏菌(Erwinia milletiae)、流黑欧文氏菌(Erwinia nigrifluens)、超压欧文氏菌(Erwinianimipressuralis)、粉红欧文氏菌(Erwinia persicina)、Erwinia psidii、Erwinia pyrifoliae、栎欧文氏菌(Erwinia quercina)、大黄欧文氏菌(Erwinia rhapontici)、生红欧文氏菌(Erwinia rubrifaciens)、柳欧文氏菌(Erwinia salicis)、斯氏欧文氏菌(Erwinia stewartii)、嗜气管欧文氏菌(Erwinia tracheiphila)、嗜夏孢欧文氏菌(Erwinia uredovora)、非脱羧埃希氏菌(Escherichia adecarboxylata)、Escherichia anindolica、金黄色埃希氏菌(Escherichia aurescens)、螳螂埃希氏菌(Escherichia blattae)、大肠杆菌(Escherichia coli)、大肠埃希氏菌共生变种(Escherichia coli var.communior)、可突变丈肠杆菌(Escherichia coli-mutabile)、福氏埃希氏菌(Escherichia fergusonii)、黑氏埃希氏菌(Escherichia hermannii)、埃希氏菌种(Escherichia sp.)、伤口埃希氏菌(Escherichia vulneris)、Ewingella americana、蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)、产气克雷伯氏菌(Klebsiella aerogenes)、Klebsiella edwardsii subsp.atlantae、解鸟氨酸克雷伯氏菌(Klebsiella ornithinolytica)、催产克雷伯氏菌(Klebsiellaoxytoca)、植物克雷伯氏菌(Klebsiella planticola)、肺炎杆菌(Klebsiellapneumoniae)、肺炎克雷伯氏菌肺炎亚种(Klebdella pneumoniae subsp.pneumoniae)、克雷伯氏菌种(Klebsiella sp.)、土生克雷伯氏菌(Klebsiellaterrigena)、特氏克雷伯氏菌(Klebsiella trevisanii)、Kluyvera ascorbata、Kluyvera citrophila、Kluyvera cochleae、Kluyvera cryocrescens、Kluyverageorgiana、Kluyvera noncitrophila、Klryvera sp.、Leclerciaadecarboxylata、Leminorella grimontii、Leminorella richardii、Moellerellawisconsensis、Morganella morganii、Morganella morganii subsp.morganii、Morganella morganii subsp.sibonii、Obesumbaterium proteus、Pantoea agglomerans、Pantoea ananatis、柠檬泛菌(Pantoea citrea)、Pantoea dispersa、Pantoea punctata、Pantoea stewartii subsp.stewartii、Pantoea terrea、Pectobacterium atrosepticum、Pectobacterium carotovorumsubsp.atrosepticum、Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum、Pectobacterium chrysanthemi、Pectobacterium cypripedii、Photorhabdusasymbiotica、Photorhabdus luminescens、Photorhabdus luminescens subsp.akhurstii、Photorhabdus luminescens subsp.laumondii、Photorhabdusluminescens subsp.luminescens、Photorhabdus sp.、Photorhabdustemperata、类志贺邻单胞菌(Plesiomonas shigelloides)、Pragia fontium、Proteus hauseri、Proteus ichthyosmius、无恒变形菌(Proteus inconstans)、奇异变形菌(Proteus mirabilis)、摩氏变形菌(Proteus morganii)、Proteusmyxofaciens、Proteus penneri、雷氏变形菌(Proteus rettgeri)、Proteusshigelloides、普通变形杆菌(Proteus vulgaris)、Providencia alcalifaciens、Providencia friedericiana、Providencia heimbachae、Providencia rettgeri、Providencia rustigianii、Providencia stuartii、Rahnella aquatilis、奥博尼沙门氏菌(Salmonella abony)、亚利桑那沙门氏菌(Salmonella arizonae)、邦戈尔沙门氏菌(salmonella bongori)、猪霍乱沙门氏菌亚利桑那亚种(Salmonella choleraesuis subsp.arizonae)、猪霍乱沙门氏菌邦戈尔亚种(Salmonella choleraesuis subsp.bongori)、猪霍乱沙门氏菌猪霍乱亚种(Salmonella choleraesuis subsp.cholereasuis)、猪霍乱沙门氏菌双亚利桑那亚种(Salmonella choleraesuis subsp.diarizonae)、猪霍乱沙门氏菌豪斯顿亚种(Salmonella choleraesuis subsp.houtenae)、猪霍乱沙门氏菌英迪加亚种(Salmonella choleraesuis subsp.indica)、猪霍乱沙门氏菌萨拉姆亚种(Salmonella choleraesuis subsp.salamae)、达累斯萨拉姆沙门氏菌(Salmonella daressalaam)、肠道沙门氏菌豪斯顿亚种(Salmonellaenterica subsp.houtenae)、肠道沙门氏菌萨拉姆亚种(Salmonella entericasubsp.salamae)、肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis)、鸡沙门氏菌(Salmonella gallinarum)、海德堡沙门氏菌(Salmonella heidelberg)、巴拿马沙门氏菌(Salmonella panama)、森夫顿堡沙门氏菌(Salmonellasenftenberg)、鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)、嗜虫沙雷菌(Serratia entomophila)、无花果沙雷菌(Serratia ficaria)、居泉沙雷菌(Serratia fonticola)、格式沙雷菌(Serratia grimesii)、液化沙雷菌(Serratia liquefaciens)、粘质沙雷菌(Serratia marcescens)、粘质沙雷菌粘质亚种(Serratia marcescens subsp.marcescens)、海红氏沙雷菌(Serratia marinorubra)、气味沙雷菌(Serratia odorifera)、普利茅斯沙雷菌(Serratia plymouthensis)、普城沙雷菌(Serratia plymuthica)、变形斑沙雷菌(Serratia proteamaculans)、变形斑沙雷菌解奎宁亚种(Serratiaproteamaculans subsp.quinovora)、解奎宁沙雷菌(Serratia quinivorans)或悬钩子沙雷菌(Serratia rubidaea)、鲍氏志贺氏菌(Shigella boydii)、弗氏志贺氏菌(Shigella flexneri)、副痢疾志贺氏菌(Shigellaparadysenteriae)、索氏志贺氏菌(Shigella sonnei)、Tatumella ptyseos、Xenorhabdus beddingii、Xenorhabdus bovienii、Xenorhabdusluminescens、Xenorhabdus nematophila、Xenorhabdus nematophila subsp.beddingii、Xenorhabdus nematophila subsp.bovienii、Xenorhabdusnematophila subsp.poinarii或Xenorhabdus poinarii;Gordoniaceae例如Gordonia、Skermania例如Gordonia aichiensis、Gordoniaalkanivorans、Gordonia amarae、Gordonia amicalis、Gordoniabronchialis,Gordonia desulfuricans、Gordonia hirsuta、Gordoniahydrophobica、Gordonia namibiensis、Gordonia nitida、Gordoniaparaffinivorans、Gordonia polyisoprenivorans、Gordonia rhizosphera、Gordonia rubripertincta、Gordonia sihwensis、Gordonia sinesedis、Gordonia sputi、Gordonia terrae或Gordonia westfalica;微球菌科(Micrococcaceae),例如微球菌属(Micrococcus)、节杆菌属(Arthrobacter)、Kocuria、Nesterenkonia、Renibacterium、罗氏菌属(Rothia)、Stomatococcus,例如活波微球菌(Micrococcus agilis)、Micrococcus antarcticus、Micrococcus halobius、Micrococcus kristinae、藤黄微球菌(Micrococcus luteus)、Micrococcus lylae、Micrococcusnishinomiyaensis、玫瑰色微球菌(Micrococcus roseus)、Micrococcussedentarius、变异微球菌(Micrococcus varians)、Arthrobacter agilis、Arthrobacter albus、Arthrobacter atrocyaneus、金黄节杆菌(Arthrobacteraurescens)、Arthrobacter chlorophenolicus、柠檬节杆菌(Arthrobactercitreus)、Arthrobacter creatinolyticus、成晶节杆菌(Arthrobactercrystallopoietes)、Arthrobacter cumminsii、肠肿节杆菌(Arthrobacterduodecadis)、微黄色节杆菌(Arthrobacter flavescens)、Arthrobacterflavus、Arthrobacter gandavensis、球形节杆菌(Arthrobacterglobiformis)、Arthrobacter histidinolovorans、Arthrobacter ilicis、Arthrobacter koreensis、Arthrobacter luteolus、Arthrobactermethylotrophus、Arthrobacter mysorens、Arthrobacter nasiphocae、Arthrobacter nicotianae、Arthrobacter nicotinovorans、氧化节杆菌(Arthrobacter oxydans)、滋养节杆菌(Arthrobacter pascens)、Arthrobacterpicolinophiilus、多色节杆菌(Arthrobacter polychromogenes)、Arthrobacterprotophormiae、Arthrobacter psychrolactophilus、Arthrobacterradiotolerans、Arthrobacter ramosus、Arthrobacter rhombi、Arthrobacterroseus、Arthrobacter siderocapsulatus、简单节杆菌(Arthrobactersimplex)、Arthrobacter sulfonivorans、Arthrobacter sulfureus、需七节杆菌(Arthrobacter terregens)、肿胀节杆菌(Arthrobacter tumescens)、Arthrobacter uratoxydans、产脲节杆菌(Arthrobacter ureafaciens)、Arthrobacter rvariabilis、Arthrobacter viscosus、Arthrobacter woluwensis、Kocuria erythromyxa、Kocuria kristinae、Kocuria palustris、Kocuriapolaris、Kocuria rhizophila、Kocuria rosea、Kocuria varians、Nesterenkonia halobia、Nesterenkonia lacusekhoensis、Renibacteriumsalmoninarum、Rothia amarae、Rothia dentocariosa、Rothiamucilaginosa、Rothia,nasimurium或Stomatococcus mucilaginosus;分枝杆菌科(Mycobacteriaceae),例如分枝杆菌属(Mycobacterium),例如非洲分枝杆菌(Mycobacterum africanum)、Mycobacterium agri、Mycobacterium aichiense、Mycobacterium alvei、Mycobacteriumasiaticum、Mycobacterium aurum、Mycobacterium austroafricanum、Mycobacterium bohemicum、Mycobacterium botniense、Mycobacteriumbrumae、龟分枝杆菌脓肿亚种(Mycobacterium chelonae subsp.abscessus)、Mycobacterium chitae、Mycobacterium chlorophenolicum、Mycobacterium chubuense、Mycobacterium confluentis、Mycobacteriumcookii、迪氏分枝杆菌(Mycobacterium diernhoferi)、Mycobacteriumdoricum、Mycobacterium duvalii、Mycobacterium fallax、Mycobacteriumfarcinogenes、转黄分枝杆菌(Mycobacterium flavescens)、Mycobacteriumfrederiksbergense、Mycobacterium gadium、Mycobacterium gilvum、戈氏分枝杆菌(Mycobacterium gordonae)、Mycobacterium hassiacum、Mycobacterium hiberniae、Mycobacterium hodleri、Mycobacteriumholsaticum、Mycobacterium komossense、Mycobacterium lacus、Mycobacterium madagascariense、Mycobacterium mageritense、Mycobacterium montefiorense、Mycobacterium moriokaense、Mycobacterium murale、Mycobacterium neoaurum、无色分枝杆菌(Mycobacterium nonchromogenicum)、Mycobacterium obuense、Mycobacterium palustre、Mycobacterium parafortuitum、Mycobacteriumperegrinum、草分枝杆菌(Mycobacterium phlei)、Mycobacteriumpinnipedii、Mycobacterium poriferae、Mycobacterium pulveris、Mycobacterium rhodesiae、Mycobacterium shottsii、Mycobacteriumsphagni、地分枝杆菌(Mycobacterium terrae)、Mycobacteriumthermoresistibile、Mycobacterium tokaiense、次要分枝杆菌(Mycobacterium triviale)、Mycobacterium tusciae或Mycobacteriumvanbaalenii;Nocardiaceae,例如诺卡氏菌科(Nocardia)、红球菌属(Rhodococcus),例如Nocardia abscessus、非洲诺卡氏菌(Nocardiaafricana)、Nocardia amarae、星状诺卡氏菌(Nocardia acteroides)、Nocardia autotrophica、Nocardia beijingensis、巴西诺卡氏菌(Nocardiabrasiliensis)、Nocardia brevicatena、Nocardia caishijiensis、石灰囊诺卡氏菌(Nocardia calcarea)、Nocardia carnea、纤维素诺卡氏菌(Nocardiacellulans)、Nocardia cerradoensis、空腔诺卡氏菌(Nocardia coeliaca)、Nocardia corynebacterioides、Nocardia crassostreae、Nocardiacammidelens、Nocardia cyriacigeorgica、鼻疽诺卡氏菌(Nocardiafarcinica)、Nocardia flavorosea、Nocardia fluminea、小球诺卡氏菌(Nocardia globerula)、Nocardia hydrocarbonoxydans、Nocardia ignorata、Nocardia mediterranei、Nocardia nova、Nocardia orientalis、Nocardiaotitidis-caviarum、Nocardia otitidiscaviarum、Nocardia paucivorans、嗜石油诺卡氏菌(Nocardia petroleophila)、Nocardia pinensis、Nocardiapseudobrasiliensis、Nocardia pseudovaccinii、Nocardia puris、Nocardiarestricta、粗糙诺卡氏菌(Nocardia rugosa)、Nocardia salmonicida、Nocardia saturnea、Nocardia seriolae、Nocardia soli、Nocardiasulphurea、南非诺卡氏菌(Nocardia transvalensis)、均一诺卡氏菌(Nocardia uniformis)、越桔诺卡氏菌(Nocardia vaccinii)、Nocardiaveterana或Nocardia vinacea;假单胞菌科(Pseudomonaceae),例如氮单胞菌属(Azomonas)、固氮菌属(Azotobacter)、Cellvibrio、Chryseomonas、Flaviomonas、Lampropedia、Mesophilobacter、Morococcus、Oligella、假单胞菌属(Pseudomonas)、Rhizobacter、Rugamonas、Serpens、Thermoleophilum、Xylophilus,例如敏捷氮单胞菌(Azomonas agilis)、标记氮单胞菌(Azomonas insignis)、巨胞氮单胞菌(Azomonasmacrocytogenes)、敏捷固氮菌(Azotobacter agilis)、Azotobacter agilis subsp.armeniae、Azotobacter armeniacus、释氏固氮菌(Azotobacterbeijerinckii)、褐球固氮菌(Azotobacter chroococcum)、印度固氮菌(Azotobacter indicum)、巨胞固氮菌(Azotobacter macrocytogenes)、Azotobacter miscellum、黑色固氮菌黑色亚种(Azotobacter nigricans subsp.nigricans)、雀稗固氮菌(Azotobacter paspali)、Azotobacter salinestris、固氮菌属(Azotobacter sp.)、维湟德固氮菌(Azotobacter vinelandii)、Flavimonas oryzihabitans、Mesophilobacter marinus、Oligella urethralis、食酸假单胞菌(Pseudomonas acidovorans)、铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa)、Pseudomonas agarici、产碱假单胞菌(Pseudomonasalcaligenes)、嗜氨基假单胞菌(Pseudomonas aminovorans)、Pseudomonasamygdali、须亡草假单胞菌(Pseudomonas andropogonis)、Pseudomonasanguilliseptica、Pseudomonas antarctica、Pseudomonas antimicrobica、Pseudomonas antimycetica、适合假单胞菌(Pseudomonas aptata)、小团假单胞菌(Pseudomonas arvilla)、铁角蕨假单胞菌(Pseudomonas asplenii)、大西洋假单胞菌(Pseudomonas atlantica)、致黑假单胞菌(Pseudomonasatrofaciens)、致金色假单胞菌(Pseudomonas aureofaciens)、燕麦假单胞菌(Pseudomonas avellanae)、Pseudomonas azelaica、固氮假单胞菌(Pseudomonas azotocolligans)、Pseudomonas balearica、巴氏假单胞菌(Pseudomonas barkeri)、Pseudomonas bathycetes、释氏假单胞菌(Pseudomonas beijerinckii)、Pseudomonas brassicacearum、Pseudomonasbrenneri、Pseudomonas butanovora、Pseudomonas carboxydoflava、Pseudomonas carboxydohydrogena、Pseudomonas carboxydovorans、Pseudomonas carrageenovora、麝香石竹假单胞菌(Pseudomonascaryophylli)、洋葱假单胞菌(Pseudomonas cepacia)、Pseudomonaschloritidismutans、绿叶假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)、菊苣假单胞菌(Pseudomonas cichorii)、香茅醇假单胞菌(Pseudomonascitronellolis)、Pseudomonas cocovenenans、Pseudomonas compransoris、Pseudomonas congelans、晕斑假单胞菌(Pseudomonas coronafaciens)、Pseudomonas corrugata、德阿昆哈假单胞菌(Pseudomonas dacunhae)、德氏假单胞菌(Pseudomonas delafieldii)、翠雀假单胞菌(Pseudomonasdelphinii)、脱氮假单胞菌(Pseudomonas denitrificans)、解韧带假单胞菌(Pseudomonas desmolytica)、缺陷假单胞菌(Pseudomonas diminuta)、Pseudomonas doudoroffii、Pseudomonas echinoides、伸长假单胞菌(Pseudomonas elongata)、Pseudomonas extorquens、Pseudomonasextremorientalis、敏捷假单胞菌(Pseudomonas facilis)、Pseudomonasficuserectae、黄假单胞菌(Pseudomonas flava)、Pseudomonas flavescens、荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)、Pseudomonas fragi、Pseudomonas frederiksbergensis、Pseudomonas fulgida、Pseudomonasfuscovaginae、Pseudomonas gazotropha、唐菖蒲假单胞菌(Pseudomonasgladioli)、Pseudomonas glathei、Pseudomonas glumae、Pseudomonasgraminis、Pseudomonas halophila、向日葵假单胞菌(Pseudomonashelianthi)、Pseudomonas huttiensis、Pseudomonashydrogenothermophila、Pseudomonas hydrogenovora、Pseudomonasindica、产靛假单胞菌(Pseudomonas indigofera)、碘假单胞菌(Pseudomonas iodinum)、Pseudomonas kilonensis、流泪假单胞菌(Pseudomonas lachrymans)、猝倒假单胞菌(Pseudomonas lapsa)、勒氏假单胞菌(Pseudomonas lemoignei)、Pseudomonas lemonnieri、Pseudomonaslundensis、Pseudomonas luteola、嗜麦芽假单胞菌(Pseudomonasmaltophilia)、假单胞菌(Pseudomonas marginalis)、划界假单胞菌(Pseudomonas marginata)、Pseudomonas marina、Pseudomonas meliae、门多萨假单胞菌(Pseudomonas mendocina)、Pseudomonas mesophilica、Pseudomonas mixta、Pseudomonas monteilii、死李假单胞菌(Pseudomonasmorsprunorum)、多食假单胞菌(Pseudomonas multivorans)、漂游假单胞菌(Pseudomonas natriegens)、Pseudomonas nautica、Pseudomonasnitroreducens、食油假单胞菌(Pseudomonas oleovorans)、Pseudomonasoryzihabitans、卵状假单胞菌(Pseudomonas ovalis)、Pseudomonasoxalaticus、帕氏假单胞菌(Pseudomonas palleronii)、Pseudomonaspaucimobilis、栖菜豆假单胞菌(Pseudomonas phaseolicola)、Pseudomonasphenazinium、Pseudomonas pickettii、Pseudomonas pisi、Pseudomonasplantarii、Pseudomonas plecoglossicida、Pseudomonas poae、报春假单胞菌(Pseudomonas primulae)、Pseudomonas proteolytica、类产碱假单胞菌(Pseudomonas pseudoalcaligenes)、Pseudomonas pseudoalcaligenes subsp.konjaci、类产碱假单胞菌类产碱亚种(Pseudomonas pseudoalcaligenessubsp.pseudoalcaligenes)、Pseudomonas pseudoflava、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、Pseudomonas putida var.naraensis、腐败假单胞菌(Pseudomonas putrefaciens)、Pseudomonas pyrrocinia、Pseudomonasradiora、食爬虫假单胞菌(Pseudomonas reptilivora)、Pseudomonasrhodesiae、Pseudomonas rhodos、核黄素假单胞菌(Pseudomonasriboflavina)、Pseudomonas rubescens、Pseudomonas rubrisubalbicans、吕氏假单胞菌(Pseudomonas ruhlandii)、嗜糖假单胞菌(Pseudomonassaccharophila)、萨氏假单胞菌(Pseudomonas savastanoi)、Pseudomonassavastanoi pvar.glycinea、萨氏假单胞菌栖菜豆变种(Pseudomonassavastanoi pvar.Phaseolicola)、青枯假单胞菌(Pseudomonassolanacearum、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、Pseudomonas spinosa、Pseudomonas stanieri、施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)、丁香假单胞菌(Pseudomonas syrlngae)、丁香假单胞菌适合变种(Pseudomonassyringae pvar.Aptata)、丁香假单胞菌致黑变种(Pseudomonas syringaepvar.Atrofaciens)、丁香假单胞菌晕斑病变种(Pseudomonas syringae pvar.Coronafaciens)、丁香假单胞菌翠雀变种(Pseudomonas syringae pvar.Delphinii)、丁香假单胞菌大豆变种(Pseudomonas syringae pvar.Glycinea)、丁香假单胞菌向日葵变种(Pseudomonas syringae pvar.Helianthi)、丁香假单胞菌流泪变种(Pseudomonas syringae pvar.Lachrymans)、丁香假单胞菌猝倒变种(Pseudomonas syringae pvar.Lapsa)、丁香假单胞菌死李变种(Pseudomonas syringae pvar.Morsprunorum)、丁香假单胞菌栖菜豆变种(Pseudomonas syringae pvar.Phaseolicola)、丁香假单胞菌报春变种(Pseudomonas syringae pvar.Primulae)、丁香假单胞菌丁香变种(Pseudomonas syringae pvar.Syringae)、丁香假单胞菌烟草变种(Pseudomonas syringae pvar.Tabaci)、丁香假单胞菌番茄变种(Pseudomonas syringae pvar.Tomato)、丁香假单胞菌大豆变种(Pseudomonas syringae subsp.glycinea)、丁香假单胞菌萨氏变种(Pseudomonas syringae subsp.savastanoi)、丁香假单胞菌丁香变种(Pseudomonas syringae subsp.syringae)、Pseudomonas syzygii、烟草假单胞菌(Pseudomonas tabaci)、Pseudomonas taeniospiralis、睾丸酮假单胞菌(Pseudomonas testosteroni)、Pseudomonas thermocarboxydovorans、Pseudomonas thermotolerans、Pseudomonas thivervalensis、番茄假单胞菌(Pseudomonas tomato)、Pseudomonas trivialis、Pseudomonas veronii、泡囊假单胞菌(Pseudomonas vesicularis)、绿黄假单胞菌(Pseudomonasviridiflava)、Pseudomonas viscogena、伍氏假单胞菌(Pseudomonaswoodsii)、Rhizobacter dauci、Rhizobacter daucus或Xylophilusampelinus;根瘤菌科(Rhizobiaceae)例如土壤杆菌属(Agrobacterium)、嗜碳杆菌属(Carbophilus)、Chelatobacter、剑菌属(Ensifer)、根瘤菌属(Rhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)例如亚特兰土壤杆菌属(Agrobacterium atlanticum)、Agrobacterium ferrugineum、解明胶土壤杆菌属(Agrobacterium gelatinovorum)、Agrobacterium larrymoorei、Agrobacterium meteori、放射形土壤杆菌属(Agrobacterium radiobacter)、毛根土壤杆菌属(Agrobacterium rhizogenes)、悬钩子土壤杆菌(Agrobacterium rubi)、星斑土壤杆菌(Agrobacterium stellulatum)、根瘤土壤杆菌(Agrobacterium tumefaciens)、Agrobacterium vitis、Carbophiluscarboxidus、Chelatobacter heintzii、剑菌(Ensifer adhaerens)、Ensiferarboris、费氏剑菌属(Ensifer fredii)、Ensifer kostiensis、鸡眼草剑菌属(Ensifer kummerowiae)、Ensifer medicae、苜蓿剑菌属(Ensifermeliloti)、萨赫尔剑菌属(Ensifer saheli)、Ensifer terangae、新疆剑菌属(Ensifer xinjiangensis)、鹰嘴豆根瘤菌(Rhizobium ciceri)、埃特里根瘤菌(Rhizobirm etli)、费氏根瘤菌(Rhizobium fredii)、山羊豆根瘤菌(Rhizobium galegae)、Rhizobium gallicum、Rhizobium giardinii、海南根瘤菌(Rhizobium hainanense)、华癸根瘤菌(Rhizobium huakuii)、胡特根瘤菌(Rhizobium huautlense)、木兰根瘤菌(Rhizobium indigoferae)、日本根瘤菌属(Rhizobium japonicum)、豌豆根瘤菌(Rhizobiumleguminosarum)、黄土根瘤菌(Rhizobium loessense)、百脉根根瘤菌(Rhizobium loti)、羽扁豆根瘤菌(Rhizobium lupini)、地中海根瘤菌属(Rhiizobium mediterraneum)、苜蓿根瘤菌(Rhizobium meliloti)、蒙古根瘤菌(Rhizobium mongolense)、菜豆根瘤菌(Rhizobium phaseoli)、放射形根瘤菌(Rhizobium radiobacter)、发根根瘤菌(Rhizobiumrhizogenes)、Rhizobium rubi、Rhizobium sullae、天山根瘤菌(Rhizobiumtianshanense)、三叶草根瘤菌(Rhizobium trifolii)、热带根瘤菌(Rhizobium tropici)、Rhizobium undicola、Rhizobium vitis、Sinorhizobium adhaerens、Sinorhizobium arboris、费氏中华根瘤菌属(Sinorhizobium fredii)、Sinorhizobium kostiense、鸡眼草中华根瘤菌(Sinorhizobium kummerowiae)、Sinorhizobium medicae、苜蓿根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)、莫雷兰中华根瘤菌(Sinorhizobium morelense)、萨赫尔中华根瘤菌(Sinorhizobium saheli)或新疆中华根瘤菌(Sinorhizobium xinjiangense);Streptomycetaceae例如Kitasatosprora、链霉菌属(Streptomyces)、Streptoverticillium,例如阿孙链霉菌(Streptomyces abikoensis)、阿布拉链霉菌(Streptomycesaburaviensis)、不产色链霉菌不产色亚种(Streptomyces achromogenessubsp.achromogenes)、Streptomyces achromogenes subsp.rubradiris、Streptomyces acidiscabies、吖啶霉素链霉菌(Streptomyces acrimycini)、Streptomyces aculeolatus、Streptomyces afghaniensis、丙氨菌素链霉菌(Streptomyces alanosinicus)、白五链霉菌(Streptomyces albaduncus)、Streptomyces albiaxialis、Streptomyces albidochromogenes、微白黄链霉菌(Streptomyces albidoflavus)、白网链霉菌(Streptomyces albireticuli)、生白链霉菌(Streptomyces albofaciens)、白黄链霉菌(Streptomyces alboflavus)、白线灰链霉菌(Streptomyces albogriseolus)、白长链霉菌(Streptomycesalbolongus)、白黑链霉菌(Streptomyces alboniger)、白刺链霉菌(Streptomyces albospinus)、白刺链霉菌白刺亚种(Streptomycesalbosporeus subsp.albosporeus)、Streptomyces albosporeus subsp.labilomyceticus、Streptomyces alboverticillatus、白酒红链霉菌(Streptomyces albovinaceus)、Streptomyces alboviridis、Streptomycesalbulus、Streptomyces albus subsp.albus、Streptomyces albus subsp.pathocidicus、Streptomyces almquistii、异硫链霉菌(Streptomycesalthioticus)、天草链霉菌(Streptomyces amakusaensis)、生二素链霉菌(Streptomyces ambofaciens)、嗜氨基链霉菌(Streptomyces aminophilus)、Streptomyces anandii、花青蓝链霉菌(Streptomyces anthocyanicus)、抗生链霉菌(Streptomyces antibioticus)、抗霉菌素链霉菌(Streptomycesantimycoticus)、Streptomyces anulatus、阿拉伯链霉菌(Streptomycesarabicus)、艰难链霉菌(Streptomyces ardus)、砂场链霉菌(Streptomycesarenae)、银样链霉菌(Streptomyces argenteolus)、Streptomycesarmeniacus、Streptomyces asiaticus、Streptomyces asterosporus、暗黑链霉菌(Streptomyces atratus)、Streptomyces atroaurantiacus、暗黑橄榄链霉菌(Streptomyces atroolivaceus)、暗黑微绿链霉菌(Streptomyces atrovirens)、橙色链霉菌(Streptomyces aurantiacus)、橙灰链霉菌(Streptomycesaurantiogriseus)、金色辐旋链霉菌(Streptomyces aureocirculatus)、金霉素链霉菌(Streptomyces aureofaciens)、金色真丝链霉菌(Streptomycesaureorectus)、Streptomyces aureoversilis、金色轮丝链霉菌(Streptotomycesaureoverticillatus)、金色链霉菌(Streptomyces aureus)、Streptomycesavellaneus、Streptomyces avermectinius、Streptomyces avermitilis、阿维丁(Streptomyces avidinii)、Streptomyces azaticus、远青链霉菌(Streptomycesazureus)、巴恩链霉菌(Streptomyces baarnensis)、Streptomyces bacillaris、栗褐链霉菌(Streptomyces badius)、巴尔达齐链霉菌(Streptomycesbaldaccii)、Streptomyces bambergiensis、Streptomyces beijiangensis、美丽链霉菌(Streptomyces bellus)、比基尼链霉菌(Streptomyces bikiniensis)、双轮丝链霉菌(Streptomyces biverticillatus)、稻瘟霉素链霉菌(Streptomycesblastmyceticus)、布鲁链霉菌(Streptomyces bluensis)、包比利链霉菌(Streptomyces bobili)、波卓链霉菌(Streptomyces bottropensis)、巴西链霉菌(Streptomyces brasiliensis)、Streptomyces bungoensis、Streptomyces cacaoisubsp.asoensis、可可链霉菌可可亚种(Streptomyces cacaoi subsp.cacaoi)、天青链霉菌(Streptomyces caelestis)、青蓝链霉菌(Streptomycescaeruleus)、加利福尼亚链霉菌(Streptomyces californicus)、秃裸链霉菌(Streptomyces calvus)、黄雀链霉菌(Streptomyces canaries)、纯白链霉菌(Streptomyces candidus)、灰白链霉菌(Streptomyces canescens)、Streptomyces cangkringensis、Streptomyces caniferus、暗灰链霉菌(Streptomyces canus)、Streptomyces capillispiralis、上开岛链霉菌(Streptomyces capoamus)、Streptomyces carpaticus、Streptomycescarpinensis、小串链霉菌(Streptomyces catenulae)、Streptomycescayiscabies、卡伍尔链霉菌卡伍尔亚种(Streptomyces cavourensis subsp.cavourensis)、Streptomyces cavourensis subsp.washingtonensis、制胞链霉菌(Streptomyces cellostaticus)、纤维黄链霉菌(Streptomyces celluloflavus)、Streptomyces  cellulolyticus、Streptomyces cellulosae、Streptomyceschampavatii、Streptomyces chartreuses、恰塔努加链霉菌(Streptomyceschattanoogensis)、干叶链霉菌(Streptomyces chibaensis)、Streptomyceschrestomyceticus、Streptomyces chromofuscus、浅金链霉菌(Streptomyceschryseus)、金羊毛链霉菌金羊毛亚种(Streptomyces chrysomallus subsp.chrysomallus)、Streptomyces chrysomallus subsp.fumigatus、Streptomycesdnereorectus、烬灰红链霉菌烬灰红亚种(Streptomyces cinereoruber subsp.cinereoruber)、烬灰红链霉菌发酵果糖亚种(Streptomyces cinereorubersubsp.fructofermentans)、Streptomyces cinereospinus、Streptomycescinereus、烬灰产色链霉菌(Streptomyces cinerochromogenes、朱红链霉菌(Streptomyces cinnabarinus)、肉桂地链霉菌(Streptomycescinnamonensis、Streptomyces cinnamoneus、Streptomyces cinnamoneussubsp.albosporus、Streptomyces cinnamoneus subsp.cinnamoneus、Streptomyces cinnamoneus subsp.lanosus、Streptomyces cinnamoneus、Streptomyces cinnamoneus subsp.lanosus、Streptomyces cinnamoneussubsp.sparsus、卷须链霉菌(Streptomyces cirratus)、Streptomycesciscaucasicus、柠檬荧光链霉菌(Streptomyces citreofluorescens)、钉斑链霉菌(Streptomyces clavifer)、Streptomyces clavuligerus、Streptomycescochleatus、浅天青链霉菌(Streptomyces coelescens)、Streptomycescoelicoflavus、天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)、Streptomycescoeruleoflavus、浅蓝褐链霉菌(Streptomyces coeruleofuscus)、Streptomycescoeruleoprunus、Streptomyces coeruleorubidus、浅天蓝链霉菌(Streptomyces coerulescens)、五一链霉菌(Streptomyces collinus)、Streptomyces colombiensis、黄麻链霉菌(Streptomyces corchorusii)、Streptomyces costaricanus、乳脂色链霉菌(Streptomyces cremeus)、Streptomyces crystallinus、古腊科链霉菌(Streptomyces curacoi)、Streptomyces cuspidosporus、蓝微褐链霉菌(Streptomycescyaneofuscatus)、蓝色链霉菌(Streptomyces cyaneus)、Streptomycescyanoalbus、Streptomyces cystargineus、达格斯坦链霉菌(Streptomycesdaghestanicus)、淀粉梅链霉菌(Streptomyces diastaticus subsp.Ardesiacus)、淀粉酶亚种链霉菌(Streptomyces diastaticus subsp.Diastaticus)、淀粉酶产色链霉菌(Streptomyces diastatochromogenes)、Streptomyces distallicus、Streptomyces djakartensis、达勒姆链霉菌(Streptomyces durhamensis)、多利链霉菌(Streptomyces echinatus)、Streptomyces echinoruber、Streptomyces ederensis、爱媛链霉菌(Streptomyces ehimensis)、内(涂)链霉菌(Streptomyces endus)、treptomyces enissocaesilis、Streptomyces erumpens、红霉素链霉菌(Streptomyces erythraeus)、Streptomyces erythrogriseus、杀霉菌链霉菌(Streptomyces eurocidicus)、Streptomyces europaeiscabiei、淡温链霉菌(Streptomyces eurythermus)、脱叶链霉菌(Streptomyces exfoliates)、苦胆链霉菌(Streptomyces felleus)、热诚链霉菌(Streptomyces fervens)、热诚链霉菌热诚并种(Streptomyces fervens subsp.fervens)、Streptomyces fervenssubsp.melrosporus、丝状链霉菌(Streptomyces filamentosus)、菲律宾链霉菌(Streptomyces filipinensis)、镶也链霉菌(Streptomyces fimbriatus)、粪生链霉菌(Streptomyces fimicarius)、芬莱链霉菌(Streptomyces finlayi)、浅黄链霉菌(Streptomyces flaveolus)、Streptomyces flaveus、Streptomycesflavidofuscus、微黄线链霉菌(Streptomyces flavidovirens)、Streptomycesflaviscleroticus、Streptomyces flavofungini、Streptomyces flavofuscus、Streptomyces flavogriseus、黄桃链霉菌(Streptomyces flavopersicus)、黄色三素链霉菌(Streptomyces flavotricini)、变色黄链霉菌(Streptomycesflavovariabilis)、黄微绿链霉菌(Streptomyces flavovirens)、黄绿链霉菌(Streptomyces flavoviridis)、困片链霉菌(Streptomyces flocculus)、佛罗里达链霉菌(Streptomyces foridae)、荧光链霉菌(Streptomyces fluorescens)、弗氏链霉菌(Streptomyces fradiae)、脆弱链霉菌(Streptomyces fragilis)、极暗黄链霉菌(Streptomyces fulvissimus)、Streptomyces fulvorobeus、烟薰链霉菌(Streptomyces fumanus)、Streptomyces fumigatiscleroticus、鲜黄链霉菌(Streptomyces galbus)、加利利链霉菌(Streptomyces galilaeus)、Streptomyces gancidicus、加德那链霉菌(Streptomyces gardneri)、胶样链霉菌(Streptomyces gelaticus)、Streptomyces geysiriensis、Streptomycesghanaensis、Streptomyces gibsonii、淡青链霉菌(Streptomycesglaucescens)、青孢链霉菌(Streptomyces glaucosporus)、青色链霉菌(Streptomyces glaucus)、球孢链霉菌(Streptomyces globisporus subsp.caucasicus)、Streptomyces globisporus subsp.flavofuscus、球孢链霉菌球孢亚种(Streptomyces globisporus subsp.globisporus)、浑圆链霉菌(Streptomyces globosus)、Streptomyces glomeratus、球团橙色链霉菌(Streptomyces glomeroaurantiacus)、Streptomyces gobitricini、五色链霉菌(Streptomyces goshikiensis)、古日娄链霉菌(Streptomyces gougerotii)、禾粟链霉菌(Streptomyces graminearus)、禾生链霉菌(Streptomycesgraminofaciens)、灰霉素链霉菌(Streptomyces griseinus)、灰橙色链霉菌(Streptomyces griseoaurantiacus)、灰暗褐链霉菌(Streptomycesgriseobrunneus)、灰肉色链霉菌(Streptomyces griseocarneus)、灰色产色链霉菌(Streptomyces griseochromogenes)、灰黄链霉菌(Streptomycesgriseoflavus)、灰褐链霉菌(Streptomyces griseofuscus)、灰肉红链霉菌(Streptomyces griseoincarnatus)、浅灰白链霉菌(Streptomycesgriseoloalbus)、Streptomyces griseolosporeus、浅灰链霉菌(Streptomycesgriseolus)、灰藤黄链霉菌(Streptomyces griseoluteus)、灰色霉素链霉菌(Streptomyces griseomycini)、灰平链霉菌(Streptomyces griseoplanus)、灰浅红链霉菌(Streptomyces griseorubens)、灰红链霉菌(Streptomycesgriseoruber)、灰锈赤链链霉菌(Streptomyces griseorubiginosus)、Streptomyces griseosporeus、灰草黄链霉菌(Streptomycesgriseostramineus)、灰色轮丝链霉菌(Streptomyces griseoverticillatus)、灰绿链霉菌(Streptomyces griseoviridis)、灰色链霉菌(Streptomyces griseus subsp.alpha)、Streptomyces griseus subsp.cretosus、灰色链霉菌灰色亚种(Streptomyces griseus subsp.griseus)、Streptomyces griseus subsp.solvifaciens、八大岛链霉菌(Streptomyces hachijoensis)、郝斯泰德链霉菌(Streptomyces halstedii)、夏威夷链霉菌(Streptomyces hawaiiensis)、Streptomyces heliomycini、淡蜡黄链霉菌(Streptomyces helvaticus)、Streptomyces herbaricolor、广岛链霉菌(Streptomyces hiroshimensis)、蓬刺链霉菌(Streptomyces hirsutus)、湿链霉菌(Streptomyces humidus)、Streptomyces humiferus、Streptomyces hydrogenans、吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus subsp.angustmyceticus)、Streptomyceshygroscopicus subsp.decoyicus、Streptomyces hygroscopicus subsp.glebosus、吸水链霉菌吸水亚种(Streptomyces hygroscopicus subsp.hygroscopicus)、Streptomyces hygroscopicus subsp.ossamyceticus、绿青链霉菌(Streptomyces iakyrus)、Streptomyces indiaensis、生靛链霉菌(Streptomyces indigoferus)、Streptomyces indonesiensis、中间型链霉菌(Streptomyces intermedius)、Streptomyces inusitatus、Streptomycesipomoeae、紫花链霉菌(Streptomyces janthinus)、Streptomyces javensis、卡那霉素链霉菌(Streptomyces kanamyceticus)、卡什米尔链霉菌(Streptomyces kashmirensis)、春日链霉菌(Streptomyces kasugaensis)、Streptomyces katrae、肯塔基链霉菌(Streptomyces kentuckensis)、Streptomyces kifunensis、岸和田链霉菌(Streptomyces kishiwadensis)、Streptomyces kunmingensis、库尔萨诺夫链霉菌(Streptomyceskurssanovii)、Streptomyces labedae、Streptomyces laceyi、Streptomycesladakanum、羊毛链霉菌(Streptomyces lanatus)、砖红链霉菌(Streptomyceslateritius)、Streptomyces laurentii、淡紫灰叶链霉菌(Streptomyceslavendofoliae)、Streptomyces lavendulae subsp.grasserius、淡紫灰叶链霉菌淡紫灰叶亚种(Streptomyces lavendulae subsp.lavendulae)、Streptomyceslavenduligriseus、Streptomyces lavendulocolor、Streptomyces levis、Streptomyces libani subsp.libani、Streptomyces libani subsp.rufus、Streptomyces lienomycini、丁香链霉菌(Streptomyces lilacinus)、淤泥链霉菌(Streptomyces limosus)、林肯链霉菌(Streptomyces lincolnensis)、利波曼链霉菌(Streptomyces lipmanii)、石蕊杀菌素链霉菌(Streptomyceslitmocidini)、Streptomyces lomondensis、黄色长孢链霉菌(Streptomyceslongisporoflavus)、红色长孢链霉菌(Streptomyces longispororuber)、灰色长孢链霉菌(Streptomyces longisporus)、Streptomyces longwoodensis、鲁萨链霉菌(Streptomyces lucensis)、Streptomyces luridiscabiei、苍黄链霉菌(Streptomyces luridus)、葡萄牙链霉菌(Streptomyces,lusitanus)、Streptomyces luteireticuli、藤黄灰链霉菌(Streptomyces luteogriseus)、Streptomyces luteosporeus、藤黄轮丝链霉菌(Streptomycesluteoverticillatus)、利嘉链霉菌(Streptomyces lydicus)、青大孢链霉菌(Streptomyces macrosporus)、孔雀石褐链霉菌(Streptomycesmalachitofuscus)、Streptomyces malachitospinus、Streptomycesmalaysiensis、马书链霉菌(Streptomyces mashuensis)、堆孢链霉菌(Streptomyces massasporeus)、Streptomyces matensis、锦葵色链霉菌(Streptomyces mauvecolor)、中杀菌素链霉菌(Streptomyces mediocidicus)、梅玖兰链霉菌(Streptomyces mediolani)、巨孢链霉菌(Streptomycesmegasporus)、产黑链霉菌(Streptomyces melanogenes)、生黑链霉菌(Streptomyces melanosporofaciens)、Streptomyces mexicanus、密执安链霉菌(Streptomyces michiganensis)、细黄链霉菌(Streptomyces microflavus)、Streptomyces minutiscleroticus、奇异链霉菌(Streptomyces mirabilis)、三畸链霉菌(Streptomyces misakiensis)、米修链链霉菌(Streptomycesmisionensis)、茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)、Streptomycesmonomycini、师岗链霉菌(Streptomyces morookaensis)、鼠灰链霉菌(Streptomyces murinus)、易变链霉菌(Streptomyces mutabilis)、Streptomyces mutomycini、长西链霉菌(Streptomyces naganishii)、那波链霉菌(Streptomyces narbonensis)、纳士维尔链霉菌(Streptomycesnashvillensis)、纺缍链霉菌(Streptomyces netropsis)、箭矢川链链霉菌(Streptomyces neyagawaensis)、黑色链霉菌(Streptomyces niger)、变黑链霉菌(Streptomyces nigrescens)、生黑链霉菌(Streptomyces nigrifaciens)、硝孢链霉菌(Streptomyces nitrosporeus)、Streptomyces niveiciscabiei、雪白红链霉菌(Streptomyces niveoruber)、雪白链霉菌(Streptomyces niveus)、诺博链霉菌(Streptomyces noboritoensis)、结节链霉菌(Streptomyces nodosus)、诺加链霉菌(Streptomyces nogalater)、野尻链霉菌(Streptomyces nojiriensis)、诺尔斯氏链霉菌(Streptomyces noursei)、新凯撒链霉菌(Streptomycesnovaecaesareae)、Streptomyces ochraceiscleroticus、土咪链霉菌(Streptomyces odorifer)、Streptomyces olivaceiscleroticus、似橄榄绿链霉菌(Streptomyces olivaceoviridis)、橄榄色链霉菌(Streptomyces olivaceus)、橄榄色链霉菌(Streptomyces olivochromogenes)、Streptomyces olivomycini、橄榄网状链霉菌(Streptomyces olivoreticuli)、Streptomyces olivoreticulisubsp.cellulophilus、橄榄网状链霉菌橄榄网状亚种(Streptomycesolivoreticuli subsp.olivoreticuli)、橄榄轮丝链霉菌(Streptomycesolivoverticillatus)、橄链霉菌(Streptomyces olivoviridis)、大宫链霉菌(Streptomyces omiyaensis)、奥里诺科链霉菌(Streptomyces orinoci)、密旋链霉菌(Streptomyces pactum)、Streptomyces paracochleatus、Streptomycesparadoxus、Streptomyces parvisporogenes、Streptomyces parvulus、小链霉菌(Streptomyces parvus)、波赛链霉菌(Streptomyces peucetius)、暗色产色链霉菌(Streptomyces phaeochromogenes)、生暗链霉菌(Streptomycesphaeofaciens)、暗绛红链霉菌(Streptomyces phaeopurpureus)、暗绿链霉菌(Streptomyces phaeoviridis)、streptomyces phosalacineus、多毛链霉菌(Streptomyces pilosus)、普拉特链霉菌(Streptomyces platensis)、褶皱链霉菌(Streptomyces plicatus)、浅多色链霉菌(Streptomyces pluricolorescens)、多产色链霉菌(Streptomyces polychromogenes)、Streptomyces poonensis、早期链霉菌(Streptomyces praecox)、葱绿多毛链霉菌(Streptomycesprasinopilosus)、Streptomyces prasinosporus、葱绿链霉菌(Streptomycesprasinus)、李色链霉菌(Streptomyces prunicolor)、沙链霉菌链霉菌(Streptomyces psammoticus)、Streptomyces pseudoechinosporeus、假浅灰链霉菌(Streptomyces pseudogriseolus)、Streptomyces pseudovenezuelae、粉末链霉菌(Streptomyces pulveraceus)、石榴链霉菌(Streptomycespuniceus)、Streptomyces puniciscabiei、绛红褐链霉菌(Streptomycespurpeofuscus)、浅绛红链霉菌(Streptomyces purpurascens)、Streptomycespurpureus、Streptomyces purpurogeneiscleroticus、穗产色链霉菌(Streptomyces racemochromogenes)、枚链霉菌(Streptomyces rameus)、小枚链霉菌(Streptomyces ramulosus)、Streptomyces rangoonensis、累西菲链霉菌(Streptomyces recifensis)、直轮丝链霉菌(Streptomycesrectiverticillatus)、直丝紫色链霉菌(Streptomyces rectiviolaceus)、Streptomyces regensis、拒霉素链霉菌(Streptomyces resistomycificus)、Streptomyces reticuliscabiei、Streptomyces rhizosphaericus、龟裂链霉菌(Streptomyces rimosus subsp.paromomycinus)、龟裂链霉菌龟裂亚种(Streptomyces rimosus subsp.rimosus、利尻链霉菌(Streptomycesrishiriensis)、娄彻氏链霉菌(Streptomyces rochei)、Streptomycesroseiscleroticus、玫瑰淀粉酶链霉菌(Streptomyces roseodiastaticus)、玫瑰黄链霉菌(Streptomyces roseoflavus)、玫瑰暗黄链霉菌(Streptomycesroseofulvus)、玫瑰丁香链霉菌(Streptomyces roseolilacinus)、浅玫瑰链霉菌(Streptomyces roseolus)、玫瑰孢链霉菌(Streptomyces roseosporus)、玫瑰轮丝链霉菌(Streptomyces roseoverticillatus)、玫瑰紫链霉菌(Streptomyces roseoviolaceus)、玫瑰绿链霉菌(Streptomyces roseoviridis)、Streptomyces rubber、锈赤蜡黄链霉菌(Streptomyces rubiginosohelvolus)、锈赤链霉菌(Streptomyces rubiginosus)、红灰链霉菌(Streptomycesrubrogriseus)、鲁特杰斯链霉菌(Streptomyces rutgersensis subsp.castelarensis)、鲁链霉菌鲁链霉菌亚种(Streptomyces rutgersens subsp.rutgersensis)、Streptomyces salmonis、桑普逊链霉菌(Streptomycessampsonii)、Streptomyces sanglieri、Streptomyces sannanensis、札幌链霉菌(Streptomyces sapporonensis)、疮痂病链霉菌(Streptomyces scabiei)、Streptomyces sclerotialus、Streptomyces scopiformis、Streptomycesseoulensis、Streptomyces septatus、Streptomyces setae、西唐氏链霉菌(Streptomyces setonii)、焦土链霉菌(Streptomyces showdoensis)、仙台链霉菌(Streptomyces sindenensis)、盐屋链霉菌(Streptomyces sioyaensi)s、索马里链霉菌(Streptomyces somaliensis)、稀产链霉菌(Streptomycessparsogenes)、壮观链霉菌(Streptomyces spectabilis)、Streptomycesspeibonae、Streptomyces speleomycini、浑球链霉菌(Streptomycesspheroids)、Streptomyces spinoverrucosus、螺旋链霉菌(Streptomycesspiralis)、螺旋轮丝链霉菌(Streptomyces spiroverticillatus)、Streptomycesspitsbergensis、Streptomyces sporocinereus、Streptomyces sporoclivatus、Streptomyces spororaveus、Streptomyces sporoverrucosus、Streptomycesstelliscabiei、Streptomyces stramineus、亚赤红链霉菌(Streptomycessubrutilus)、Streptomyces sulfonofaciens、硫黄链链霉菌(Streptomycessulphurous)、丁香苷链霉菌(Streptomyces syringium)、田无链霉菌(Streptomyces tanashiensis)、公牛链霉菌(Streptomyces tauricus)、唐德链霉菌(Streptomyces tendae)、白蚁链霉菌(Streptomyces termitum)、Streptomyces thermoalcalitolerans、Streptomyces thermoautotrophicus、Streptomyces thermocarboxydovorans、Streptomyces thermocarboxydus、Streptomyces thermocoprophilus、Streptomyces thermodiastaticus、Streptomyces thermogriseus、Streptomyces thermolineatus、热硝化链霉菌(Streptomyces thermonitrificans)、Streptomyces thermospinosisporus、热紫链霉菌(Streptomyces thermoviolaceus subsp.apingens)、热紫链霉菌热紫亚种(Streptomyces thermoviolaceus subsp.thermoviolaceus)、热普通链霉菌(Streptomyces thermovulgaris)、硫藤黄链霉菌(Streptomyces thioluteus)、Streptomyces torulosus、毒三素链霉菌(Streptomyces toxytricini)、三色链霉菌(Streptomyces tricolor)、杀结核菌链霉菌(Streptomyces tubercidicus)、保护链霉菌(Streptomyces tuirus)、Streptomyces turgidiscabies、赫褐链霉菌(Streptomyces umbrinus)、变异链霉菌(Streptomyces variabilis)、Streptomyces variegates、华沙链霉菌(Streptomyces varsoviensis)、Streptomyces vastus、委内瑞拉链霉菌(Streptomyces venezuelae)、酒红链霉菌(Streptomyces vinaceus)、Streptomyces vinaceusdrappus、Streptomycesviolaceochromogenes、紫边链霉菌(Streptomyces violaceolatus)、Streptomyces violaceorectus、紫红链霉菌(Streptomyces violaceoruber)、Streptomyces violaceorubidus、紫色链霉菌(Streptomyces violaceus)、Streptomyces violaceusniger、略紫链霉菌(Streptomyces violarus)、浅紫链霉菌(Streptomyces violascens)、Streptomyces violatus、Streptomycesviolens、Streptomyces virens、Streptomyces virginiae、绿黄链链霉菌(Streptomyces viridiflavus)、绿紫链霉菌(Streptomyces viridiviolaceus)、Streptomyces viridobrunneus、绿色产色链霉菌(Streptomycesviridochromogenes)、绿色淀粉酶链霉菌(Streptomyces viridodiastaticus)、Streptomyces viridosporus、Streptomyces vitaminophileus、Streptomycesvitaminophilus、威德摩尔链霉菌(Streptomyces wedmorensis)、Streptomyces werraensis、Streptomyces willmorei、黄质产色链霉菌(Streptomyces xanthochromogenes)、杀黄菌素链霉菌(Streptomycesxanthocidicus)、黄链霉菌(Streptomyces xantholiticus)、黄暗色链霉菌(Streptomyces xanthophaeus)、Streptomyces yatensis、Streptomycesyervanensis、Streptomyces yogyakartensis、横须贺链霉菌(Streptomycesyokosukanensis)、Streptomyces yunnanensis、沙阿霉素链霉菌(Streptomyces zaomyceticus)、Streptoverticillium abikoense、Streptoverticillium albireticuli、Streptoverticillium alboverticillatum、Streptoverticillium album、Streptoverticillium ardum、Streptoverticilliumaureoversale、Streptoverticillium aureoversile、Streptoverticilliumbaldaccii、Streptoverticillium biverticillatum、Streptoverticilliumblastmyceticum、Streptoverticillium cinnamoneum subsp.albosporum、肉桂色链霉菌白孢亚种(Streptomyces cinnamoneus subsp.albosporus)、Streptoverticillium cinnamoneum subsp.cinnamoneum、Streptoverticilliumcinnamoneum subsp.lanosum、Streptoverticillium cinnamoneum subsp.sparsum、Streptoverticillium distallicum、Streptoverticillium ehimense、Streptoverticillium eurocidicum、Streptoverticillium fervens subsp.fervens、Streptoverticillium fervens subsp.melrosporus、Streptoverticilliumflayopersicum、Streptoverticillium griseocarneum、Streptoverticilliumgriseoverticillatum、Streptoverticillium hachijoense、Streptoverticilliumhiroshimense、Streptoverticillium kashmirense、Streptoverticilliumkentuckense、Streptoverticillium kishiwadense、Streptoverticilliumladakanum、Streptoverticillium lavenduligriseum、Streptoverticilliumlilacinum、Streptoverticillium luteoverticillatum、Streptoverticilliummashuense、Streptoverticillium mobaraense、Streptoverticilliummorookaense、Streptoverticillium netropsis、Streptoverticilliumolivomycini、Streptomyces olivomycini、Streptoverticillium olivoreticulisubsp.cellulophilum、Streptoverticillium olivoreticuli subsp.olivoreticuli、Streptoverticillium olivoreticulum、Streptoverticillium olivoreticulum subsp.cellulophilum、Streptoverticillium olivoverticillatum、Streptoverticilliumorinoci、Streptoverticillium parvisporogenes、Streptoverticilliumparvisporogenum、Streptoverticillium rectiverticillatum、Streptoverticilliumreticulum subsp.protomycicum、Streptoverticillium roseoverticillatum、Streptoverticillium salmonis、Streptoverticillium sapporonense、Streptoverticillium septatum、Streptoverticillium syringium、Streptoverticillium thioluteum、Streptoverticillium verticillium subsp.quantum、Streptoverticillium verticillium subsp.tsukushiense或Streptoverticillium viridoflavum.
特别优选的菌株为选自芽孢杆菌科(Bacillaceae)、短杆菌科(Brevibacteriaceae)、棒杆菌科(corynebacteriaceae)、Nocardiaceae、合枝杆菌科(Mycobacteriaceae)、Streptomycetaceae、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)例如环状芽孢杆菌(bacillus circulans)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、Brevibacteriumalbidum、Brevibacterium album、Brevibacterium cerinum、Brevibacterium flavum、Brevibacterium glutamigenes、Brevibacteriumiodinum、Brevibacterium ketoglutamicum、Brevibacteriumlactofermentum、扩展短杆菌(Brevibacterium linens)、Brevibacteriumroseum、Brevibacterium saccharolyticum、短杆菌属(Brevibacteriumsp.)、乙酰乙酸棒杆菌(Corynebacterium acetoacidophilum)、Corynebacterium acetoglutamicum、Corynebacterium ammoniagenes、Corynebacterium glutamicum(=Micrococcus glutamicum)、栖糖密棒杆菌(corynebacterium melassecola)、棒杆菌属(Corynebacterium sp.)、Nocardia rhodochrous(Rhodococcus rhodochrous)、红厚合板杆菌(Mycobacterium rhodochrous)、变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)和大肠杆菌(Escherichia coli)尤其是大肠杆菌K12的菌株。
另外,特别优选的菌株为选自隐球酵母科(Cryptococcaceae)、酵母科(Saccharomycetaceae)、Schizosaccharomycetacease例如假丝酵母属(Candida)、汉森氏酵母属(Hansenula)、毕赤酵母属(Pichia)、酵母(Saccharomyces)和裂殖酵母属(Schizosaccharomyces)的菌株,优选的菌株选自Rhodotorula rubra、Rhodotorula glutinis、Rhodotorula graminis、Yarrowia lipolytica、Sporobolomyces salmonicolor、Sporobolomycesshibatanus、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、Candida boidinii、Candida bombicola、Candida cylindracea、Candida parapsilosis、Candidarugosa、Candida tropicalis、甲醇毕赤酵母(Pichia methanolica)和巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)。所有上述宿主生物也可用作本发明核酸序列的来源生物。隐球酵母科、酵母科、Schizosaccharomycetacease例如假丝酵母属、汉森氏酵母属、毕赤酵母属、酵母和裂殖酵母属为优选的来源生物。
对于该情况转基因宿主生物为非人动物如Caenorhaditis elegans或植物、植物组织或植物细胞,如选自以下科的植物:漆树科(Anacardiaceae)、紫菀科(Asteraceae)、伞形科(Apiaceae)、桦木科(Betulaceae)、紫草科(Boraginaceae)、芸苔科(Brassicaceae)、凤梨科(Bromeliaceae)、番木瓜科(Caricaceae)、大麻科(Cannabaceae)、旋花科(Convolvulaceae)、藜科(Chenopodiaceae)、葫芦科(Cucurbitaceae)、茱萸科(Elaeagnaceae)、杜鹃花科(Ericaceae)、大戟科(Euphorbiaceae)、蝶形花科(Fabaceae)、牛儿苗科(Geraniaceae)、禾本科(Gramineae)、胡桃科(Juglandaceae)、樟科(Lauraceae)、豆科(Leguminosae)、亚麻科(Linaceae)或多年生草本、饲料作物、蔬菜、观赏植物和拟南芥(Arabidopsis thaliana)。在固体培养基上培养这些植物,或作为细胞在技术人员已知且适合该生物的液体培养基中培养。此外,可以在土壤等中培养这些植物。在生长期后可以收获生物。随后可以将植物或植物细胞或回收的(必要时分离的)氨基酸进行直接进入食品或动物饲料或用于其他应用的加工,例如根据本文特别引入为参考的EP-B-0 533 039和EP-A-0 615 693所公开的内容进行。可以通过提取和沉淀或通过离子交换器或技术人员已知和下文所述的其他方法以常规的方式纯化收获的材料。这些不同检查方法的产物为含有目的氨基酸或氨基酸组合物(其仍含有不同数量的植物部分和/或细胞组分)的植物或植物材料,有利的植物部分和/或细胞组分重量范围在0到99%,优选重量低于80%,特别优选重量低于50%。
漆树科(Anacardiaceae)例如黄莲木属(Pistacia)、芒果属(Mangifera)、腰果属(Anacardium)例如阿月浑子(Pistacia vera)[pistachios、Pistazie]、芒果(Mangifer indica)[芒果]或腰果(Anacardiumoccidentale)[腰果];菊科(Asteraceae)例如金盏花属(Calendula)、红蓝花属(Carthamus)、矢车菊属(Centaure)、菊苣属(Cichorium)、莱蓟属(Cynara)、向日葵属、莴苣属(Lactuca)、Locusta、万寿菊属(Tagetes)、缬草属(Valeriana)例如金盏花(Calendula officinalis)[金盏花]、红花(Carthamus tinctorius)[红花]、矢车菊(Centaureacyanus)[矢车菊]、菊苣(cichorium intybus)[blue daisy]、洋蓟(Cynara scolymus)[朝鲜蓟]、向日葵、莴苣(Lactuca sativa)、Lactuca crispa、Lactuca esculenta、LactucascariolaL.ssp.saliva、Lactucascariola L.var.integrata、Lactuca scariolaL.var.integrifolia、Lacfuca sativa subsp.romana、Locusta communis、Valeriana locusta[莴苣]、香叶万寿菊(Tageteslucida)、万寿菊(Tageteserecta)或Tagetes tenuifolia[Marigold];伞形科例如Daucus如Daucuscarota[carrot];桦木科(Betulaceae)例如榛属(Corylus)如Corylusavellana或Coryluscolurna[hazelnut];紫草科(Boraginaceae)例如Borago如Borago officinalis[borage];芸苔科(Brassicaceae)例如芸苔(Brassica)、Melanosinapis、白芥属(Sinapis)、拟南芥(Arabadopsis)如欧洲油菜、芜青[canola、oilseed rape、turnip rape]、野欧白芥(Sinapisarvensis)Brassica芥莱(juncea)、Brassicajuncea var.juncea、皱叶芥菜(Brassicajuncea var.crispifolia)、大叶芥莱(Brassica junceavar.foliosa)、黑芥菜、Brassica sinapioides、Melanosinapis communis[mustard]、甘蓝[fodder beet]或拟南芥;凤梨科(Bromeliaceae)例如凤梨属(Anana)、Bromelia如凤梨(Anana comosus)、Ananas ananas或Bromelia comosa[pineapple];番瓜科(Caricaceae)例如番瓜属(Carica)如番木瓜;大麻科(Cannabaceae)(例如大麻属,如大麻)旋花科(Convolvulaceae)例如番薯属(Ipomea)、旋花属(Convolvulus)如Ipomoeabattus、Ipomoea pandurata、Convolvulus batatas、Convolvulustiliaceus、Ipomoea fastigiata、Ipomoea tiliacea、三裂叶薯或Convolvulus panduratus[sweet potato、Man of the Earth、wildpotato]、藜科(Chenopodiaceae)例如甜菜属,即甜菜(Beta vulgaris)、Beta vulgaris var.altissima、Beta vulgaris var.Vulgaris、Beta maritima、Beta vulgaris var.perennis、Beta vulgaris var.conditiva或Beta vulgaris var.esculenta[sugar beet];葫芦科(Cucurbitaceae)例如南瓜属,如笋瓜、灰子南瓜、西葫芦或南瓜;胡颓子科(Elaeagnaceae)例如胡颓子属(Elaeagnus)如油橄榄(Olea europaea)[橄榄];杜鹃花科(Ericaceae)例如山月桂属(Kalmia)如宽叶山月桂(Kalmialatifolia)、狭叶山月桂(Kalmiaangustifolia)、Kalmia小叶山月桂(microphylla)、Kalmia polifolia、Kalmiaoccidentalis、Cistus chamaerhodendros或Kalmia lucida[Americanlaurel、broad-leafed laurel、calico bush、spoon wood、sheep laurel、alpine laurel、bog laurel、western bog-laurel、swamp-laurel];大戟科(Euphorbiaceae)例如木薯属(Manihot)、Janipha、麻风树属(Jatropha)、蓖麻属(Ricinus)如Manihot utilissima、Janipha manihot、Jatrophamanihot.、Manihot aipil、Manihot dulcis、Manihot manihot、Manihotmelanobasis、Manihot esculenta[manihot、arrowroot、tapioca、cassava]或蓖麻[castor bean、Castor Oil Bush、Castor Oil Plant、PalmaChristi、Wonder Tree];蝶形花科例如豌豆属(Pisum)、合欢属(Albizia)、Cathormion、Feuillea、音加属(Inga)、Pithecolobium、金合欢属(Acacia)、含羞草属(Mimosa)、Medicajo、大豆属(Glycine)、镰扁豆属(Dolichos)、菜豆属(Phaseolus)、Soja如豌豆、饲料豌豆(Pisumarvense)、Pisum humile[pea]、Albizia berteriana、合欢(Albiziajulibrissin)、阔英合欢(Albizia lebbeck)、Acacia berteriana、Acacialittralis、Albizia berteriana、Albizzia berteriana、Cathormionbefteriana、Feuillea berteriana、lnga fragrans、Pithecellobiumberterianum、Pithecellobium fragrans、Pithecellobium berterianum、Pseudalbizzia berteriana、Acacia julibrissin、Acacia nemu、Albizianemu、Feuilleea julibrissin、Mimosa julibrissin、Mimosa speciosa、Sericanrda julibrissin、Acacia lebbeck、Acacia macrophylla、阔英合欢(Albizia lebbek)、Feuilleea lebbeck、Mimosa lebbeck、Mimosa speciosa[bastard logwood、silk tree、East Indian Walnut]、紫苜蓿、野苜蓿、杂交苜蓿、大豆(Glycine max)Dolichos soja、宽叶蔓豆(Glycinegracilis)、Glycine hispida、Phaseolus max、Soja hispida或Soja max[soybean];
牛儿苗科(Geraniaceae),例如天竺葵属(Pelargonium)、椰子属(Cocos)、Oleum如椰子、茶子天竺葵或Oleum cocois[椰子];禾本科(Gramineae)例如甘蔗属(Saccharum)如甘蔗(Saccharum officinarum);胡桃科(Juglandaceae)例如胡桃属(Juglans)、Wallia如胡桃(Juglans regia)、台湾胡桃(Juglans ailanthifolia)、山核桃(Juglans sieboldiana)、灰核桃(Juglans cinerea)、Wallia cinerea、Juglans bixbyi、加州黑核桃(Juglanscalifonica)、印度黑核桃(Juglans hindsii)、Juglans intermedia、Juglansjamaicensis、大核桃(Juglans major)、小果黑核(Juglans microcarpa)、黑核桃(Juglans nigra)或Wallia nigra[walnut、black walnut、commonwalnut、persian walnut、white walnut、butternut、black walnut];樟科(Lauraceae)例如鳄梨属(Persea)、月桂(Laurus)如月桂(Laurusnobilis)[bay、laurel、bay laurel、sweetbay]、鳄梨(Persea Americana)、鳄梨、食物鳄梨(Persea gratissima)或Persea persea[鳄梨];豆科(Leguminosae)例如落花生属(Arachis)如落花生[花生];亚麻科(Linaceae)例如亚麻属(Linum)、Adenolinum如亚麻、Linum humile、奥地利亚麻、苍白胡麻、窄叶亚麻、泻亚麻、金黄亚麻、大花亚麻、Adenolinumgrandiflorum、刘易斯亚麻、那旁亚麻、宿根亚麻、Linum perenne var.lewisii、Linum pratense或Linum tfigynum[亚麻、亚麻籽];千屈菜科(Lythrarieae)例如石榴属(Punica)如石榴;锦葵科(Malvaceae)例如棉属(Gossypium)如陆地棉、树棉、海岛棉、草棉或瑟伯氏棉[棉花];芭蕉科(Musaceae)例如芭蕉属(Musa)如香蕉、小果野蕉、粉芭蕉、Musa spp.[香蕉];柳叶菜科(Onagraceae)例如Camissonia、月见草属(Oenothera)如Oeyiothera biennis或Camissonia brevipes[报春花、月见草];棕榈科(Palmae)例如油棕属(Elacis)如油棕;罂粟科(Papaveraceae)例如罂粟属(Papaver)如鬼罂粟、虞美人、Papaver dubium[罂粟、东洋罂粟(orientalpoppy)、角罂粟(corn poppy)、蓟罂粟(field poppy)、shirley poppies、蓟罂粟(field poppy)、长荚罂粟(long-headed poppy)、long-pod poppy];胡麻科(Pedaliaceae)例如胡麻属(Sesamum)如胡麻[芝麻];胡椒科(Piperaceae)例如胡椒属(Piper)、Artanthe、草胡椒属(Peperomia)、Steffensia如Piperaduncum、Piper amalago、狭叶胡椒、Piper auritum、萎叶、毕澄茄、长胡椒、胡椒、Piper retrofiactusn、Artanthe adunca、Artantheelongata、Peperomia elongata、Piper elongatum、Steffensia elongata.[辣椒(Cayenne pepper)、wild pepper];Poaceae例如大麦属(Hordeum)、黑麦属(Secale)、燕麦属(Avena)、高梁属(Sorghum)、须芒草属(Andropogon)、绒毛草属(Holcus)、黍属(Panicum)、稻属(Oryza)、玉蜀黍属(Zea mays)、小麦属(Triticum)如大麦、芒颖大麦草、海滨大麦、野芒大麦草、栽培二棱大麦、Hordeum aegiceras、Hordeum hexastichon.、栽培四棱大麦、Hordeum irregulare、大麦(Hordeum sativum)、野芒大麦草[大麦、珍珠麦、狐尾大麦(foxtail barley)、wall barley、meadowbarley]、黑麦(Secale cereale)、燕麦、野燕麦、比赞燕麦、Avena fatuavar.sativa、杂种燕麦[燕麦]、两色蜀黍、石茅高梁、甜高梁、蜀黍、Andropogon drummondii、Holcus bicolor、Holcus sorghum、Sorghumaethiopicum、Sorghum arundinaceum、卡佛尔高梁、垂穗高梁草、Sorghum dochna、Sorghum drummondii、硬高梁草、Sorghumguineense、Sorghum lanceolatum、多脉高梁草、甜高梁、Sorghumsubglabrescens、Sorghum verticilliflorum、蜀黍、石茅高梁、Sorghummiliaceum millet、Panicum militaceum[Sorghum、millet]、稻、Oryzalatifolia[rice]、玉蜀黍[玉米]、普通小麦、硬粒小麦、圆柱小麦、Triticum hybemum、玛卡小麦、普通小麦[小麦、面包小麦、普通小麦]、山龙眼科(Proteaceae)例如澳洲坚果属(Macadamia)如全缘叶澳洲坚果(Macadamia intergrifolia)[macadamia];茜草科(Rubiaceae)例如咖啡属(Coffea)如Cofea spp.、小果咖啡、中果咖啡或大果咖啡;玄参科(Scrophulariaceae)例如毛蕊花属(Verbascum)如毛瓣毛蕊花(Verbascumblattaria)、东方毛蕊花(Verbascum chaixii)、Verbascum densiflorum、Verbascum lagurus、Verbascum longifolium、剪秋罗毛蕊花(Verbascumlychnitis)、Verbascum nigrum、奥林匹克毛蕊花(Verbascumolympicum)、Verbascufn phlomoides、紫毛蕊花(Verbascumphoeniceum)、毛蕊花(Verbascum pulverulentuin或Verbascum thapsus)[毛蕊花(mullein)、white moth mullein、nettle-leaved mullein、dense-flowered mullein、silver mullein、long-leaved mullein、白色毛蕊花(white mullein)、黑色毛蕊花(dark mullein)、希腊毛蕊花(greekmullein)、橙色毛蕊花(orange mullein)、紫色毛蕊花(purple mullein)、灰色毛蕊花(hoary mullein)、大毛蕊花(great mullein)];茄科(Solanaceae)例如辣椒属(Capsicum)、烟草属(Nicotiana)、茄属(Solanum)、番茄属(Lycopersicon)如辣椒、辣椒(Capsicum annuum)var.glabriusculum、小米辣[胡椒]、辣椒[paprika]、烟草、花烟草(Nicotiana alata)、Nicotianaattenuata、光烟草(Nicotiana glauca)、Nicotiana langsdorffii、Nicotianaobtusifolia、Nicotiana quadrivalvis、波叶烟草(Nicotiana repanda)、黄花烟草(Nicotiana rustica)、林生烟草(Nicotiana sylvestris)、马铃薯、茄、番茄、Lycopersicon lycopersicum.、Lycopersicon pyriforme、红茄或番茄;梧桐科(Sterculiaceae)例如可可树属(Theobroma)如可可树(Theobroma cacao);山茶科(Theaceae)例如山茶属(Camellia)如茶。所有上述宿主生物也可用作本发明核酸序列的来源生物。
特别优选的植物为选自玉米、Soja、芸苔、小麦、大麦、黑小麦、稻、亚麻子、向日葵、马铃薯和拟南芥的植物。
就如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ IDNO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ IDNO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ IDNO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ IDNO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ IDNO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ IDNO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ IDNO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ IDNO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核酸序列、含有所述核酸序列的核酸构建体或转化了所述核酸序列或所述核酸构建体的生物(=转基因生物)而言,“转基因”指由基因操作方法引起的所有构建体,优选其中
a)如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ IDNO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ IDNO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ IDNO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ IDNO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ IDNO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ IDNO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ IDNO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ IDNO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核酸序列或其衍生物,或
b)如与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ IDNO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ IDNO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ IDNO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ IDNO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ IDNO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ IDNO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ IDNO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ IDNO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核酸序列或其衍生物有效连接的遗传调节元件,例如启动子,或
c)(a)和(b)
在其天然遗传环境中不存在或通过基因操作的方法进行了修饰。修饰可以是例如一个或多个核苷酸根的替代、添加、缺失、倒置或插入。“天然遗传环境”是指在起始生物中的天然染色体位点或存在于基因组文库中。就基因组文库而言,核酸序列的天然遗传环境优选至少部分维持不变。环境与核酸序列至少在一侧相连并至少拥有50bp序列长度,优选至少500bp,特别优选至少1000bp,尤其特别优选至少5000bp。
然而,转基因还意味着本发明核酸位于它们在生物基因组中的天然位置上,但是序列与天然序列相比被修饰和/或天然序列的调节序列被修饰。优选地,转基因/重组还理解为本发明方法中使用的核酸转录在基因组的非天然位置发生,也就是说核酸的表达是同源的,或优选异源的。该表达可是瞬时的,或是稳定整合进基因组的序列。
因此本发明的核酸序列或本发明的核酸构建体用于产生转基因植物的用途也是本发明的课题。
必要时,可以分离本发明的生物,特别是微生物、植物或动物细胞、植物或动物组织或植物中合成的精细化学品。取决于精细化学品的用途,如下文描述的,可以通过纯化有利地得到不同的纯度。
在本发明的一个有利的实施方案中,生物为由所表达的本发明核酸分子修饰的活性有利地修饰了氨基酸含量的植物形式。由于例如用于单胃动物的植物的营养价值经常受限于几种必需氨基酸如赖氨酸、苏氨酸或甲硫氨酸,因此这对植物育种者是很重要的。因此在减少、降低或删除本发明的蛋白质的生物活性或减少或降低本发明的核酸分子或多肽的表达之后,在营养培养基或土壤上培养产生的转基因植物并随后进行收获。植物或其局部(如叶、根、花和/或茎)和/或其他如下所述的可收获材料可以作为食品或动物饲料直接使用或者进行其他加工。仍然可以通过提取和沉淀或通过离子交换器和其他本领域技术人员已知的和下文所述的方法进一步纯化氨基酸。适合于多种应用和由这些不同加工方法得到的产物为例如氨基酸或含有不同数量的其他植物组分的氨基酸组合物,所述其他组分有利的为以重量计从0到99%或更多,优选以重量计低于90%,特别优选以重量计低于80%。植物还可以有利地不进行其他加工而直接使用,如作为饲料或用于提取。
本发明的另一个实施方案是例如通过用化学品、辐射或UV光通过随机诱变或以提高精细化学品产生的方式定向诱变来修饰宿主生物编码的本发明核酸分子的方法。本发明的这一实施方案就本发明而言应视为转基因。
上述方法还可以产生化学纯的氨基酸或氨基酸组合物。为此,以已知的方式从本发明的生物(如微生物、非人动物或植物)和/或培养生物的培养基中分离氨基酸或氨基酸组合物。这些化学纯的氨基酸或氨基酸组合物对于食品工业、化妆品工业或制药工业中的应用是有利的。
因此,植物组分(及优选其他杂质)含量应尽可能低,得到的前述氨基酸应尽量为纯净形式。在这些应用中,植物组分的含量有利的为小于10%,优选1%,更优选0.1%,非常特别优选0.01%或更低。
因此,本发明产生的精细化学品纯度至少以重量计0.1%,优选纯度以重量计高于1%,更优选纯度以重量计为10%,甚至更优选纯度以重量计高于50、60、70或80%,甚至更优选纯度以重量计高于90%,最优选以重量计为95%,以重量计99%或更高。
在本文中,与野生型、对照或参考相比,本发明细胞中精细化学品的数量可以根据本发明方法提高至少1.1的因数,优选1.5、2或5的因数,特别优选10或30的因数,非常特别优选50的因数。优选的,所述提高可见于生物的组织中,更优选可见于生物本身或其可收获的部分中。
原则上讲,可以通过本发明的方法以两种方法增加所产生的氨基酸。可以有利的提高游离氨基酸(特别是甲硫氨酸)库、和/或蛋白质结合的甲硫氨酸的含量。通过本发明的方法在转基因生物中提高游离氨基酸库以分离纯甲硫氨酸可能是有利的。Galili等(Transgenic Res.2000)显示了通过非反馈敏感型天冬氨酸激酶增强的苏氨酸合成不仅引起游离苏氨酸的提高,还引起结合蛋白质的苏氨酸的提高。在本发明的另一优选的实施方案中,减少、降低或删除本发明的核酸序列或蛋白质的表达和蛋白质或多肽(作为生物中所需氨基酸如甲硫氨酸、赖氨酸或苏氨酸的库)转化的组合可用于产生精细化学品(参阅US5,589,616、WO96/38574、WO97/07665、WO97/28247、US4,886,878、US5,082,993和US5,670,635)。
在优选的实施方案中,根据本发明产生甲硫氨酸或苏氨酸并在必要时进行分离。根据本发明的方法产生其他氨基酸(如赖氨酸和氨基酸混合物)是有利的。
对于微生物发酵而言,前述氨基酸可以积累在培养基和/或细胞中。如果将微生物用于本发明的方法,可以在培养后处理发酵液。取决于需要,可以通过分离方法如离心、过滤、超滤、倾析或这些方法的组合从发酵液中去除一些或全部的生物质,或者也可以将生物质留在发酵液中。随后可以借助已知方法(如旋转蒸发器、薄层蒸发器、降膜式蒸发器),通过反渗透或纳米过滤减少或浓缩发酵液。随后可以通过冻干、喷雾干燥、喷雾选粒或其他方法处理浓缩的发酵液。
为纯化氨基酸,可以使用适当的树脂对去除了生物量的含有产物的发酵液进行层析,所述树脂如离子交换树脂,如阴离子或阳离子交换树脂、疏水树脂或亲水树脂例如环氧树脂、聚氨基甲酸乙酯树脂或聚丙烯酰胺树脂,或根据化合物的分子量分离的树脂,如聚氯乙稀同聚物树脂或组合树脂,如与多烯乙醚或二乙烯乙二醇交联的丙烯酸多聚体如Carbopol_、Pemulen_和Noveon_,其中全部或一些目的产物或杂质保留在层析树脂中。必要的话,可以使用相同或其它层析树脂重复这些层板步骤。技术人员熟悉适当层析树脂的选择以及它们最有效的用途。纯化的产物可以通过过滤式超滤浓缩并在确保产物最大稳定性的温度下储藏。优选通过使用本领域技术人员已知的离子交换层析纯化氨基酸。
可以通过本领域现有技术确定所分离化合物的身份和纯度。它们包括高效液相层析(HPLC)、分光方法、质谱(MS)、染色法、薄层层析法、NIRS、酶测定或微生物测定。这些分析方法汇编于:Patek等(1994)Appl.Environ.Microbiol.60:133-140;Malakhova等(1996)Biotekhnologiya 1127-32;和Schmidt等(1998)Bioprocess Engineer.19:67-70.《Ulmann′sEncyclopedia of Industrial Chemistry》(1996)Bd.A27,VCH Weinheim,89-90页,521-540页,540-547页,559-566页,575-581页和581-587页;Michal,G(1999)《Biochemical Pathways:An Atlas of Biochemistry andMolecular Biology》,John Wiley and Sons;Fallon,A.等(1987)《Applications of HPLC in Biochemistry in:Laboratory Techniques inBiochemistry and Molecular Biology》,卷17。
如上文所述,在本发明中通过减少、降低或缺失表达至少一个核酸分子来实现本发明蛋白质所表现生物活性的减少、降低或缺失,其中所述核酸分子选自:
a)编码(优选为至少成熟形式的)如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述的多肽的核酸分子;
b)含有(优选为至少成熟形式的)如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核酸分子的核酸分子;
c)含有由于遗传密码的简并性可以从SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述多肽序列得到的核酸序列,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质所表现的生物活性的核酸分子;
d)编码多肽的核酸分子,所述多肽与(a)到(c)的核酸分子所编码多肽的氨基酸序列具有至少50%的同一性,并具有SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质所表现的生物活性;
e)含有下述多核苷酸序列的核酸分子,所述多核苷酸通过用SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:145、SEQ ID NO:221、SEQ ID NO:222、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:436或SEQ ID NO:437所述引物扩增cDNA文库或基因组文库得到,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质表现出的生物活性;
f)编码多肽的核酸分子,所述多肽通过在(a)到(d)(优选(a)到(b)或(c))的核酸分子所编码多肽的氨基酸序列中替代、删除和/或添加一个或多个氨基酸得到,并编码具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ IDNO:283所述蛋白质所表现生物活性的多肽;
g)编码多肽的片段或表位的核酸分子,所述多肽由(a)到(e)(优选(a)到(b)或(c))的核酸分子编码,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质所表现的生物活性;
h)编码借助单克隆或多克隆抗体分离的多肽并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质所表现生物活性的核酸分子,其中单克隆或多克隆抗体针对由(a)到(e)(优选(a)到(b)或(c))的核酸分子编码的多肽;
i)编码多肽的核酸分子,所述多肽具有SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150、SEQ ID NO:223、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:225、SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:246、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:273、SEQ ID NO:274、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277、SEQ ID NO:278、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:281、SEQ ID NO:438、SEQ ID NO:439或SEQ ID NO:442所示共有序列,并具有SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质表现出的生物活性;
j)编码具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441蛋白质表现出的生物活性的多肽的核酸分子;和;
k)可以通过在严格杂交条件下用探针筛选适当的核酸文库得到并编码具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质表现生物活性多肽的核酸分子,所述探针含有(a)或(b)核酸分子之一的序列,或其片段具有(a)到(c)中所表征核酸分子的至少15nt、优选20nt、30nt、50nt、100nt、200nt或500nt。
或含有上述核酸分子互补序列的核酸分子。
在一个实施方案中,方法中使用的核酸分子通过至少一个或多个核苷酸区别于如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ IDNO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ IDNO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ IDNO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ IDNO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ IDNO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ IDNO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ IDNO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ IDNO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的序列或不由如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ IDNO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ IDNO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ IDNO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ IDNO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ IDNO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ IDNO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ IDNO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ IDNO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ IDNO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ IDNO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ IDNO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ IDNO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ IDNO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ IDNO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ IDNO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ IDNO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ IDNO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ IDNO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ IDNO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ IDNO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的序列所组成。在一个实施方案中,本发明的核酸分子与如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述序列的同一性小于100%、99.999%、99.99%、99.9%或99%。在另一个实施方案中,核酸分子不由如SEQ ID NO:1、SEQID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的序列组成。
除非另有说明,术语“多核苷酸”、“核酸”和“核酸分子”在本发明上下文中可互换使用。除非另有说明,术语“肽”、“多肽”和“蛋白质”在本发明上下文中可互换使用。术语“序列”可涉及多核苷酸、核酸、核酸分子、肽、多肽和蛋白质,取决于使用术语“序列”的语境。本文所用术语“基因”、“多核苷酸”、“核酸序列”、“核苷酸序列”或“核酸分子”是指任意长度多聚体形式的核苷酸,包括核糖核酸或脱氧核糖核酸。术语只涉及分子的一级结构。
因此,本文使用的术语“基因”、“多核苷酸”、“核酸序列”、“核苷酸序列”或“核酸分子”包括双链和单链DNA及RNA。其还包括已知类型的修饰,例如甲基化、“加帽”、用类似物替代一个或多个天然存在的核苷酸。优选本发明的DNA或RNA序列含有编码本文定义多肽的编码序列。
“编码序列”是指当置于合适调节序列控制下时转录为mRNA和/或翻译为多肽的核苷酸序列。编码序列的边界由5’末端的翻译起始密码子和3,末端的翻译终止密码子决定。编码序列可包括(但不限于)mRNA、cDNA、重组核苷酸序列或基因组DNA,其中在某些环境下还可存在内含子。
本发明的方法中有利地提高了具有如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ IDNO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ IDNO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ IDNO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ IDNO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ IDNO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ IDNO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ IDNO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ IDNO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ IDNO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ IDNO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ IDNO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ IDNO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ IDNO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ IDNO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ IDNO:440所述序列的核酸分子、得自如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ IDNO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ IDNO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ IDNO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ IDNO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ IDNO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ IDNO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ IDNO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ IDNO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ IDNO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ IDNO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ IDNO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ IDNO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ IDNO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ IDNO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ IDNO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ IDNO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述氨基酸序列
(本发明的方法中有利地减少、降低或缺失了)具有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ IDNO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ IDNO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ IDNO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ IDNO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ IDNO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ IDNO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:1O4、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ IDNO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ IDNO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ IDNO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ IDNO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ IDNO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ IDNO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ IDNO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ IDNO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ IDNO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ IDNO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ IDNO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ IDNO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ IDNO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示序列的核酸分子、得自SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ IDNO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ IDNO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ IDNO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ IDNO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ IDNO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ IDNO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ IDNO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示氨基酸序列的核酸分子或其编码具有本发明蛋白质的酶活性或生物活性的多肽或在减少、降低或缺失其表达或活性后赋予精细化学品提高的衍生物或同源物。以减少、降低或缺失其活性的方式将这些序列单独或与其他氨基酸合成相关序列组合克隆进核酸构建体中。这些核酸构建体使本发明方法中产生的精细化学品得以优化合成。
有利于本发明方法并编码具有本发明蛋白质所表现的生物活性和/或赋予精细化学品提高的多肽的核酸分子可以从普遍开放的数据库中确定。在本文中必须特别提到的是普遍的基因数据库,如EMBL数据库(StoesserG.等,Nucleic Acids Res 2001,卷29,17-21)、GenBank数据库(Benson D.A.等,Nucleic Acids Res 2000,卷28,15-18)或PIR数据库(Barker W.C.等,Nucleic Acids Res.1999,卷27,39-43)。还可以使用生物特异性基因数据库确定有利的序列,酵母有利的为例如SGD数据库(cherry J.M.等,Nucleic Acids Res.1998,卷26,73-80)或MIPS数据库(Mewes H.W.等,Nucleic Acids Res.1999,卷27,44-48),大肠杆菌为GenProtEC(http://web.bham.ac.uk/bcm4ght6/res.html)数据库,拟南芥为TAIR数据库(Huala,E.等,Nucleic Acids Res.2001卷29(1),102-5)或MIPS数据库。
本发明方法中使用的核酸分子为分离的核酸序列形式,编码具有本发明蛋白质(其通过减少、降低或删除其活性促使精细化学品提高)生物活性的多肽。方法中用于在转基因生物中产生精细化学品的核酸序列有利地来源于真核生物,但也可以来源于原核生物或古细菌,因此它可以来自例如微生物、动物或植物。
为在方法中使用的转基因生物中提高核酸序列的导入和序列的减少、降低或删除,将核酸序列按照生物活性或核酸序列表达水平或所述序列编码的多肽或蛋白质水平减少、降低或删除的方式整合进核酸构建体和/或载体中。除了本文所述的本发明方法中使用的序列以外,核酸构建体或载体还可额外存在其他核酸序列并一起导入生物中,所述核酸序列有利地为生物合成本发明方法产生的氨基酸基因。然而,这些额外的序列也可以通过其他单独的核酸构建体或载体导入生物中。
使用本文提到的克隆载体和转化方法,如出版和引用于《PlantMolecular Biology and Biotechnology》(CRC Press,Boca Raton,Florida),第6/7章,71-119页,(1993);F.F.White,《Transgenic Plants)》,第1卷,Engineering and Utilization中的“Vectors for Gene Transfer inHigher Plants”,Kung和R.Wu编,Academic Press,1993,15-38;B.Jenes等,《Transgenic Plants》,第1卷,Engineering and Utilization,Techniques for Gene Transfer Kung和R.Wu编,Academic Press(1993),128-143;Potrykus,Annu.Rev.Plant.Physiol.Plant Molec.Biol.42(1991),205-225))的载体和转化方法及下文引用的其他方法,核酸可以广泛应用于生物(特别是原核生物或真核微生物或植物)的重组修饰中,因此它们成为本发明方法所产生的氨基酸更好和更有效的生产者。可以通过操作的直接效应或通过该操作的间接效应引起氨基酸或来自它们的产物(如修饰的蛋白质)提高的生产或生产效率。
在一个实施方案中,本发明的核酸分子来源于植物,如选自Aceraceae、漆树科、伞形科、菊科、芸苔科、Cactaceae、葫芦科、大戟科、蝶形花科、锦葵科、Nymphaeaceae、罂粟科、Rosaceae、Salicaceae、茄科、Arecaceae、凤梨科、Cyperaceae、Iridaceae、Liliaceae、Orchidaceae、Gentianaceae、Labiaceae、Magnoliaceae、Ranunculaceae、Carifolaceae、茜草科、玄参科、Caryophyllaceae、杜鹃花科、Polygonaceae、Violaceae、Juncaceae或Poaceae的植物并优选来源于选自伞形科、Asteraceae、Brassicaceae、Cucurbitaceae、蝶形花科、Papaveraceae、Rosaceae、Solanaceae、Liliaceae或Poaceae的植物。优选为作物植物和本文在上文中作为宿主植物提到的植物如上文提到的科和属,例如优选物种腰果(Anacardium occidentale)、金盏菊(Calendula officinalis)、红花(Carthamus tinctorius)、菊苣(Cichorium intybus)、洋蓟(Cynara Scolymus)、向日葵、Tagetes lucida,Tagetes erecta,Tagetes tenuifolia;Daucus carota;Corylus avellana、Coryluscolurna、Borago offcinalis;欧洲油菜、芜青(Brassica rapa ssp.)、野欧白芥(Sinapis arvensis)、芥菜(Brassica juncea)、芥菜变种(Brassica juncea var.juncea)、皱叶芥菜(Brassica juncea var.crispifolia)、大叶芥菜(Brassicajuncea var.foliosa)、黑芥菜(Brassica nigra)、Brassica sinapioides、Melanosinapis communis、甘蓝(Brassica oleracea)、拟南芥、凤梨(Ananascomosus)、Ananas ananas、Bromelia comosa、番木瓜(Carica papaya)、大麻(Cannabis sative)、甘薯(Ipomoea batatus)、甘薯属(Ipomoea)pandurata、旋花属(Convolvulus)batatas、Convolvulus tiliaceus、Ipomoea fastigiata、Ipomoea tiliacea、三裂叶薯(Ipomoea triloba)、Convolvulus panduratus、甜菜(Beta vulgaris)、Beta vulgaris var.altissima、Beta vulgaris var.vulgaris、沿海甜菜(Beta maritime)、Beta vulgaris var.perennis、Beta vulgaris var.conditiva、Beta vulgaris var.esculenta、笋瓜(Cucurbita maxima)、灰子南瓜(Cucurbita mixta)、西葫芦(Cucurbita pepo)、磅瓜(Cucurbita moschata)、Olea europaea、Manihot utilissima、Janipha manihot、Jatropha manihot.、Manihot aipil、Manihot dulcis、Manihot manihot、Manihotmelanobasis、Manihotesculenta、蓖麻(Ricinus communis)、豌豆(Pisum sativum)、Pisumarvense、Pisum humile、紫苜蓿(Medicago sativa)、野苜蓿(Medicago falcata)、杂交苜蓿(medicago varia)、大豆(Glycine max Dolichos soja)、宽叶蔓豆(Glycine gracilis)、大豆(Glycine hispida)、Phaseolus max、Soja hispida、Soja max、椰子(Cocos nucifera)、茶子天竺葵(Pelargoniumgrossularioides)、Oleum cocoas、Laurus nobilis、鳄梨(Persea Americana)、落花生(Arachis hypogaea)、亚麻、Linum humile、奥地利亚麻(Linumaustriacum)、苍白胡麻(Linum bienne)、窄叶亚麻(Linum angustifolium)、泻亚麻(Linum catharticum)、金黄亚麻(Linum flavum)、大花亚麻(Linumgrandiflorum)、Adenolinum grandiflorum、刘易斯亚麻(Linum lewisii)、那旁亚麻(Linum narbonense)、宿根亚麻(Linum perenne)、Linum perenne var.lewisii、Linum pratense、Linum trigynum、石榴(Punica granatum)、陆地棉(Gossypium hirsutum)、树棉(GOssypium arboreum)、海岛棉(Gossypiumbarbadense)、草棉(Gossypium herbaceum)、瑟伯氏棉(Gossypium thurberi)、香蕉(Musa nana)、小果野蕉(Musa acuminata)、粉芭蕉(Musa paradisiacal)、Musa spp.、油棕(Elaeis guineensis)、鬼罂粟(Papaver orienle)、虞美人(Papaver rhoeas)、Papaver dubium、胡麻(Sesamum indicum)、Piperaduncum、Piper amalago、狭叶胡椒(Piper angustifolium)、Piper auritum、萎叶(Piper betle)、毕澄茄(Piper cubeba)、长胡椒(Piper longum)、胡椒(Pipernigrum)、Piper retrofractum、Artanthe adunca、Artanthe elongata、Peperomiaelongata、Piper elongatum、Steffensia elongata、大麦(Hordeum vulgare)、芒颖大麦草(Hordeum jubatum)、海滨大麦(Hordeum murinum)、野芒大麦草(Hordeum secalinum)、栽培二棱大麦(Hordeum distichon)、Hordeumaegiceras、Hordeum hexastichon.、栽培四棱大麦(Hordeum hexastichum)、Hordeum irregulare、大麦(Hordeum sativum)、野芒大麦草、燕麦(Avenasativa)、野燕麦(Avena fatua)、比赞燕麦(Avena byzantina)、Avena fatua var.sativa、杂种燕麦(Avena hybrida)、两色蜀黍(Sorghum bicolor)、石茅高梁(Sorghum halepense)、甜高梁(Sorghum saccharatum)、蜀黍(Sorghumvulgare)、Andropopogon drummondii、Holcus bicolor、Holcus sorghum、Sorghum aethiopicum、Sorghum arundinaceum、卡佛尔高梁(Sorghumcaffrorum)、垂穗高梁草(Sorghum cernuum)、Sorghum dochna、Sorghumdrummondii、硬高梁草(Sorghum durra)、Sorghum guineense、Sorghumlanceolatum、多脉高梁草(Sorghum nervosum)、甜高梁、Sorghumsubglabrescens、Sorghum verticilliflorum、蜀黍、石茅高梁(Holcushalepensis)、Sorghum miliaceum millet、Panicum militaceum、玉蜀黍、普通小麦(Triticum aestivum)、硬粒小麦(Triticum durum)、圆柱小麦(Triticumturgidum)、Triticum hybemum、玛卡小麦(Triticum macha)、普通小麦(Triticum sativum)、Cofea spp.、小果咖啡(Coffea arabica)、中果咖啡(Coffeacanephora)、大果咖啡(Coffea liberica)、辣椒(Capsicum annuum)、Capsicumannuum var.glabriusculum、小米辣(Capsicum frutescens)、辣椒、烟草(Nicotiana tabacum)、马铃著(Solanum tuberosum)、茄(Solanummelongena)、番茄(Lycopersicon esculentum)、Lycopersicon lycopersicum.、Lycopersicon pyriforme、红茄(Solanum integrifolium)、番茄(Solanumlycopersicum)、可可树(Theobroma cacao)或茶(Camellia sinensis)。
在一个实施方案中,用于在微生物中产生精细化学品的核酸分子序列有利地来源于上文的宿主生物中提到的微生物,如真菌,如曲霉属、青霉属或麦角菌属或来源于酵母如毕赤酵母属、球拟酵母属、汉森酵母属、裂殖酵母属、假丝酵母属、红酵母属或酵母属,特别优选有利地来源于酵母科的酵母,如有利的酵母属和特别有利的酿酒酵母属和种。技术人员了解产生精细化学品的其他合适来源,所述精细化学品还存在有用的核酸分子来源。它们一般包括所有原核生物或真核生物细胞,优选单细胞微生物,如真菌,如麦角菌属或曲霉属或革兰式阳性菌,如芽孢杆菌属、棒杆菌属、微球菌属、短杆菌属、红球菌属、诺卡氏菌属、Caseobacter或节杆菌属或革兰氏阴性菌,例如大肠杆菌属、黄杆菌属或沙门氏菌属,或酵母如红酵母属、汉森氏酵母属或假丝酵母属。
本发明方法中特别有利地选择的生产菌株为选自以下的微生物:放线菌科、芽孢杆菌科、短杆菌科、棒杆菌科、肠杆菌科、Gordoniaceae、微球菌科、分枝杆菌科、诺卡氏菌科、假单胞菌科、根瘤菌科、链霉菌科、毛壳菌科、笄霉科、隐球酵母科、小克银汉霉科、Demetiaceae、从梗孢科、Mortierellaceae、毛霉科、腐霉科、酵母科、水霉科、裂殖酵母亚科、Sodariaceae、掷孢酵母科、瘤座孢科、Adelotheciaceae、甲藻纲、牛毛藓科和绿枝藻纲或属以及异常汉森酵母、Candida utilis、Claviceps purpurea、环状芽孢杆菌、枯草杆菌、芽孢杆菌属、Brevibacterium albidum、Brevibacterium album、Brevibacterium cerinum、黄色短杆菌、Brevibacterium glutamigenes、碘短杆菌、Brevibacterium ketoglutamicum、Brevibacterium lactofermentum、扩展短杆菌、Brevibacterium roseum、解糖短杆菌、短杆菌属、Corynebacterium acetoacidophilum、Corynebacterium acetoglutamicum、Corynebacterium ammoniagenes、谷氨酸棒杆菌(=Micrococcus glutamicum)、Corynebacterium melassecola、棒杆菌属或大肠杆菌,特别是大肠杆菌K12及其所述菌株。所有上述生物基本上也可用作宿主生物。
然而,还可以使用人工序列,所述人工序列优选与可见于生物中的核酸序列有一个或多个碱基的差别,或与可见于生物中的多肽序列有一个或多个氨基酸分子的差别,并介导具有上述活性(如具有本发明蛋白质的生物活性或在减少、降低或缺失其表达或活性后赋予精细化学品提高)的多肽。
本发明方法中使用的核酸序列在适当时可以含有可整合进DNA或RNA的合成的非天然的或修饰的核苷酸碱基。所述合成的非天然的或修饰的碱基可以例如在细胞外或在细胞内提高核酸分子的稳定性。本发明的核酸分子可以含有与前述相同的修饰。
本文上下文中使用的术语“核酸分子”还可包含位于编码基因区3’和5’端的非翻译序列,例如编码区5’端上游的至少500个、优选200个、特别优选100个核苷酸和编码基因区3’端下游的至少100个、优选50个、特别优选20个核苷酸。通常有利的是仅选择编码区用于克隆和表达的目的。在例如RNAi或反义技术事件中,也可以有利地利用5’和/或3’区。
优选地,本发明方法中使用的核酸分子或本发明的核酸分子为分离的核酸分子。
“分离的”多核苷酸或核酸分子从核酸分子与天然来源中存在的其他多核苷酸或核酸分子相分离。分离的核酸分子可以是几kb的染色体片段,或优选为只含有基因编码区的分子。因此,本发明的分离核酸分子可以含有5’和3’相邻的染色体区或其他相邻染色体区,但优选不合有核酸分子所来源的生物基因组或染色体内含物中核酸分子序列两侧天然存在的那些序列(例如与编码核酸分子5’和3’UTR的区域相邻的序列)。在多种实施方案中,本发明方法中使用的分离的核酸分子可含有核酸所来源细胞的基因组DNA中核酸分子两侧天然存在的小于约5kb、4kb、3kb、2kb、1kb、0.5kb或0.1kb的核苷酸序列。
可使用标准分子生物学技术以及本文提供的序列信息分离方法中使用的核酸分子,例如具有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ IDNO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ IDNO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ IDNO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ IDNO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ IDNO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ IDNO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ IDNO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ IDNO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ IDNO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ IDNO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ IDNO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ IDNO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ IDNO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ IDNO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ IDNO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ IDNO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ IDNO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440核苷酸序列的核酸分子。还可以借助比较算法鉴定例如DNA或氨基酸水平的同源序列或同源保守序列区。前者可在标准杂交技术(例如Sambrook等,《MolecularCloning:A Laboratory Manual.》第2版,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY,1989中所述的)中作为探针用于分离本方法中其他有用的核酸序列。另外,可以通过聚合酶链式反应分离包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440的完整序列的核酸分子或其部分,其中使用基于所述序列或其部分的寡核苷酸引物。例如含有完整序列或其部分的核酸分子可以通过使用基于该序列产生的寡核苷酸引物的聚合酶链式反应分离。例如,可从细胞中分离mRNA(例如通过Chirgwin等(1979)Biochemistry 18:5294-5299的硫氰酸胍提取方法)并通过反转录酶(例如从Gibco/BRL、Bethesda、MD获得的Moloney MLV反转录酶,或可从SeikagakuAmerica,Inc.、St.Petersburg,FL获得的AMV反转录酶)产生cDNA。聚合酶链式反应扩增使用的合成寡核苷酸引物可以基于本文所述的序列产生(如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440中所示的序列或来自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ IDNO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ IDNO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的序列)。可以使用这些引物例如从cDNA文库或从基因组文库中扩增核酸序列,并鉴定可用于本发明方法并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质的生物活性的核酸分子。有利地使用如SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ IDNO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:145、SEQ ID NO:221、SEQ ID NO:222、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:436或SEQ ID NO:437所述的引物(见图1)。
表1:优选引物:
引物名称  SEQ IDNO: 序列  Length_F/R
 at2g25320_f  58  ATGAAGCAAAGCTCATCGGAG  21
 at3g07610_f  59  ATGGATTCTGTGGAGGAAGAAG  22
 at3g15600_f  60  ATGGGTATGTGGCTGTTATTTC  22
 at2g25320_r  61  TCATTCTTTTGTGTAGTCTTC  21
 at3g07610_r  62  CTACATCTTCTCCATTTCTAATC  23
 at3g15600_r  63  TTAAACATTCTTCTTTGTCTTTTTC  23
 At1g14490_f  144  ATGGAAACCGTCGGGCGTCCACGT  24
 At1g14490_r  145  TCAGTACGGCGATGGAGCTTTG  22
 At1g30570_f  221  ATGTCGAAGCTGAGGAAAAAG  21
 At1g30570_r  222  CTAAGCCGAATTGTGAAGAG  20
 At2g21290_f  244  ATGGCGGCGATGCAGTGGTGCG  22
 At2g21290_r  245  TCAGATGAGCTTGAAAGGAAGAGG  24
 At3g14230_f  436  ATGTGTGGAGGAGCTATAATC  21
 At3g14230_r  437  TCAAAAGTCTCCTTCCAGCATG  22
另外,可以通过与本发明的多肽(特别是与SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ IDNO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ IDNO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ IDNO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ IDNO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ IDNO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ IDNO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ IDNO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示的序列)进行蛋白质序列比对鉴定多种生物中的保守区域,从中可以得出保守区域和简并引物。这些本发明多肽的保守区域特别具有SEQ IDNO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150、SEQ ID NO:223、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:225、SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:246、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:273、SEQ ID NO:274、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277、SEQ ID NO:278、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:281、SEQ ID NO:438、SEQ ID NO:439或SEQ ID NO:442所示的序列。然后可以使用简并引物通过PCR扩增新的编码区片段,所述片段编码具有前述活性(如在减少、降低或删除各个核酸序列或由所述序列编码的具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质的表达或活性后赋予精细化学品增加)的蛋白质或来源于其他生物的本发明多肽的其他功能性同系物。
然后可以使用这些片段作为杂交探针分离完整基因序列。作为备选,可以通过RACE-PCR方法分离遗漏的5’和3’序列。可以使用cDNA或作为代替的基因组DNA作为模板,使用合适的寡核苷酸引物按照标准PCR扩增技术扩增本发明的核酸分子。由此扩增的核酸分子可以克隆进合适的载体并通过DNA序列分析的方法描述其特征。可以通过标准合成方法(例如自动DNA合成仪)产生相应于方法中使用的核酸分子之一的寡核苷酸。
有利于本发明方法的核酸分子可以基于它们与本文公开的核酸分子的同源性进行分离,所述分离使用该序列或其部分作为杂交探针,在严格杂交条件下按照标准杂交技术进行。在本文中可以使用例如与前述核酸分子(特别是含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440核苷酸序列的核酸分子)在严格条件下杂交,且长度为至少15、20、25、30、35、40、50、60或更多核苷酸,优选至少15、20或25个核苷酸的分离的核酸分子。也可以使用具有30、50、100、250或更多核苷酸的核酸分子。
术语“同源性”指各核酸分子或编码的蛋白质在功能和/或结构上是等效的。与前文所述核酸分子同源并为所述核酸分子的衍生物的核酸分子是例如存在相同生物功能的修饰的所述核酸分子的变体,特别是编码具有相同或基本相同的生物功能的蛋白质的变体。它们可以是天然存在的变体,如来源于其他植物变种或物种体的序列,或是突变序列。这些突变体可以是天然存在的或是通过诱变技术得到的。等位变体可以是天然存在的等位变体以及合成产生或遗传改造的变体。例如,可以通过测试所述多肽与抗体的结合或基于计算机预测来鉴定结构等效物。结构等效物具有相似的免疫学特性,例如含有相似的表位。
“杂交”指这些核酸分子在常规杂交条件下杂交,优选在严格条件下(例如Sambrook《Molecular Cloning;A Laboratory Manual》,第二版,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY(1989)或《Current Protocols in Molecular Biology》,John Wiley & Sons,N.Y.(1989),6.3.1-6.3.6.中所述的严格条件)杂交。
根据本发明,本发明核酸的DNA及RNA分子可以作为探针使用。另外,可以作为鉴定功能同系物的模板进行Northern印迹测定和Southern印迹测定。Nouthern印迹测定有利的提供关于表达的基因产物的其他信息:例如表达图式、加工步骤(如剪接和加帽)的发生等。Southern印迹测定提供关于编码本发明核酸分子的基因的染色体定位和组织的额外信息。
严格杂交条件优选的非限制性实例为在约45℃下,6×氯化钠/柠檬酸钠(=SSC)中杂交,随后在50到60℃,例如50℃、55℃或60℃下在0.2×SSC、0.1%SDS中进行一次或多次洗涤步骤。技术人员清楚这些杂交条件作为核酸类型的函数而变化,并(例如当存在有机溶剂时)与缓冲液的温度和浓度有关。“标准杂交条件”下的温度作为核酸类型的函数而变化,例如在0.1×、0.5×、1×、2×、3×、4×或5×SSC浓度的水性缓冲液中(pH7.2)介于42℃和58℃之间,优选在45℃和50℃之间。当前述缓冲液中存在有机溶剂(例如50%甲酰胺)时,标准条件下的温度约为40℃、42℃或45℃。DNA:DNA杂合体的杂交条件优选为例如0.1×SSC和20℃、25℃、30℃、35℃、40℃或45℃,优选30℃和45℃之间。DNA:RNA杂合体的杂交条件优选为例如0.1×SSC和30℃、35℃、40℃、45℃、50℃或55℃,优选45℃和55℃之间。前文提到的杂交温度以例如在无甲酰胺时长度约100bp(=碱基对)且G+C含量为50%的核酸确定。借助于如前述的教科书或以下教科书,技术人员了解如何确定所需杂交条件:Sambrook等,《Molecular Cloning》,Cold Spring Harbor Laboratory,1989;Hames and Higgins编1985,《Nucleic Acids Hybridization:A PracticalApproach》,IRL Press at Oxford University Press,Oxford;Brown编1991,《Essential Molecular Biology:A Practical Approach》,IRL Press atOxford University Press,Oxford。
这些严格杂交条件之一的其他实例是在65℃,4×SSC中杂交,随后在65℃在0.1×SSC中洗涤一小时。另外的代表性严格杂交条件为在50%甲酰胺中、42℃下4×SSC。另外,洗涤步骤的条件可以从由低严格条件(约2×SSC、50℃)和高严格条件(约0.2×SSC、50℃,优选65℃)(20×SSC:0.3M柠檬酸钠、3M氯化钠、pH7.0)限定的条件范围内选出。另外,洗涤步骤的温度可以从低严格条件的室温(约22℃)提高到高严格条件的约65℃。盐浓度和温度两个参数可以同时变化,或两个参数中的一个保持恒定而只有另一个变化。也可以在杂交中使用变性剂,例如甲酰胺或SDS。存在50%甲酰胺时,优选在42℃进行杂交。相关因素如i)处理的长度、ii)盐条件、iii)洗涤剂条件、iv)竞争DNA、v)温度和vi)探针的选择可以逐一组合,因此本文不可能提到所有的可能性。
DNA杂交(Southern印迹测定)和洗涤步骤的其他一些实例如下所示:
(1)杂交条件可选自例如以下的条件:
a)4×SSC、65℃,
b)6×SSC、45℃,
c)6×SSC、100mg/ml变性的鱼精DNA片段、68℃,
d)6×SSC、0.5%SDS、100mg/ml变性的鲑精DNA、68℃,
e)6×SSC、0.5%SDS、100mg/ml变性的鲑精DNA片段、42℃,
f)50%甲酰胺、4×SSC、42℃,
g)50%(体积/体积)甲酰胺、0.1%牛血清白蛋白、0.1%聚糖体、0.1%聚乙烯吡咯烷酮、50mM磷酸钠缓冲液(pH6.5)、750mM氯化钠、75mM柠檬酸钠、42℃,
h)2×或4×SSC、50℃(低严格条件),或
i)30到40%甲酰胺、2×或4×SSC、42℃(低严格条件)
(2)洗涤条件可选自例如以下的条件:
a)0.015M氯化钠/0.0015M柠檬酸钠/0.1%SDS、50℃,
b)0.1×SSC、65℃,
c)0.1×SSC、0.5%SDS、68℃,
d)0.1×SSC、0.5%SDS、50%甲酰胺、42℃,
e)0.2×SSC、0.1%SDS、42℃,
f)2×SSC、65℃(低严格条件)。
g)0.2×SSC、0.1%SDS、60℃(中度高严格条件),或
h)0.1×SSC、0.1%SDS、60℃(中度高严格条件),或
i)0.2×SSC、0.1%SDS、65℃(高严格条件),或
h)0.1×SSC、0.1%SDS、65℃(高严格条件)
来自其他生物的具有前述生物活性(即赋予精细化学品增加)的多肽可以由其他DNA序列编码,所述DNA序列在宽松杂交条件下与SEQ IDNO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示序列杂交,并编码表达具有本发明蛋白质其他生物活性的肽。
另外,一些应用只能在低严格杂交条件下进行,对于杂交的特异性没有影响。例如可以用本发明的核酸分子进行探测总DNA的Southern印迹分析,并在低严格(55℃在2×SSC、0.1%SDS中)下洗涤。杂交分析可以揭示只有编码本发明的多肽的基因才有的简单模式(例如具有本文所述的增加精细化学品的活性和/或还具有本发明蛋白质的生物活性)。这类低严格杂交条件的另一实例为4×SSC,50℃或使用30%到40%甲酰胺在42℃杂交。这些分子含有本发明的多肽的片段、类似物或衍生物,并通过例如单独或组合的氨基酸和/或核苷酸缺失、插入、替代、添加和/或重组或任何本领域已知的其他修饰而区别于前述氨基酸序列或其编码核苷酸序列。然而,优选使用高严格杂交条件。
应该有利地与至少5、10、15、20、25、30、35或40bp,有利地至少50、60、70或80bp,优选至少90、100或110bp的片段进行杂交。最优选至少15、20、25或30bp的片段。同样优选与长度至少100bp或200bp、极优选至少400bp的片段杂交。在特别优选的实施方案中,应在前述条件下与完整核酸序列进行杂交。
术语“片段”、“序列片段”或“序列部分”指所述原始序列的截短序列。截短序列(核酸或蛋白质序列)的长度可大泛围变化;最小长度为足以提供长度至少15、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30bp的序列或序列片段的序列,所述序列或序列片段与本发明的核酸分子(例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ IDNO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示序列)的片段具有至少90、91、92、93、94、95、96、97、98或99%同一性、优选100%同一性。所述截短序列的长度如所述可在从15bp到2kb或更大的范围内广泛变化,有利地,序列最小长度为15、20、25、30、35或40bp,而最大长度不重要。可以使用100、200、300、400、500或更多碱基对的片段。在一些应用中,最大长度通常不显著大于提供本发明核酸序列的完整基因功能所需的长度。这些序列可以通过如RNAi或反义技术有利地用于抑制、减少、降低或缺失本发明核酸分子和/或蛋白质的生物活性。为了减少、降低或缺失本发明核酸序列和/或本发明蛋白质的生物活性,还可以使用所公开序列的启动子区。技术人员了解如何克隆所述启动子区。
一般地,截短氨基酸序列长度范围从约5个到约310个氨基酸。然而更一般地,序列长度最大为约250个氨基酸,优选最大为约200个或约100个氨基酸。通常需要选择至少约10个、12个或15个氨基酸,最大为约20个或25个氨基酸的序列。
术语“表位”涉及抗原内特异性的免疫反应位点,也称为抗原决定簇。这些表位可以是多聚体组合物中单体的线阵(如蛋白质中的氨基酸),或者由更复杂的二级或三级结构组成或包含更复杂的二级或三级结构。技术人员会认识到免疫原(即能够激发免疫应答的物质)是抗原;然而,一些抗原如半抗原不是免疫原但可以通过偶联载体分子产生免疫原性。术语“抗原”包括可以针对其产生抗体和/或抗体针对其特异免疫反应的物质。
在一个实施方案中,本发明涉及多肽的表位,所述多肽为本发明多肽。
术语“一个或若干个氨基酸”涉及至少一个氨基酸,但不超过会导致同源性低于50%同一性的氨基酸数目。同一性优选高于70%或80%,更优选85%、90%、91%、92%、93%、94%或95%,甚至更优选96%、97%、98%或99%的同一性。
另外,本发明的核酸分子包括与前述核酸分子或其部分的核苷酸序列互补的核酸分子。与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核苷酸序列之一互补的核酸分子是指这些分子:它与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述核苷酸序列之一充分互补,从而可以与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核苷酸序列之一杂交并形成稳定的双链体。优选在严格杂交条件下进行杂交。然而,本文公开序列之一的互补体优选是其根据技术人员熟知的核酸分子碱基配对而互补的序列。例如,碱基A和G分别与碱基T和U或C碱基配对,反之亦然。碱基的修饰能影响碱基配对配偶体。
本发明的核酸分子含有如下核苷酸序列:与SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核苷酸序列或其部分同源性至少约30%、35%、40%或45%、优选至少约50%、55%、60%或65%、更优选至少约70%、80%或90%、甚至更优选至少约95%、97%、98%、99%或更高,并/或具有本发明蛋白质生物活性,或编码所述蛋白质的核酸分子。本发明的核酸分子含有如下的核苷酸序列:(优选在如本文定义的严格条件下)与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述核苷酸序列之一或其部分杂交,并编码具有前述活性(如减少或缺失其活性后赋予甲硫氨酸提高)并任选的具有本发明蛋白质的生物活性的蛋白质。
另外,本发明的核酸分子可以只含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440序列之一的编码区的一部分,例如可以作为探针或引物使用的片段或编码本发明核酸分子或多肽生物活性部分的片段,或编码本发明核酸分子或多肽非活性部分的片段,即具有前述活性,例如在其表达或活性降低时赋予精细化学品增加。从本发明蛋白质编码基因的克隆中鉴定的核苷酸序列可以产生探针和引物,所述探针和引物用于从其他细胞类型或生物中鉴定和/或克隆其同系物。探针/引物一般含有基本纯化的寡核苷酸。寡核苷酸一般含有在严格条件下与前述(例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440)序列之一有义链的至少约12个、15个、优选约20个或25个、更优选40个、50个或70个连续核苷酸杂交的核苷酸序列区域、序列(例如前述SEQ ID NO:1、SEQID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEO ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEO ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEO ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440)之一的反义序列或其天然存在的突变体。可以如实施例中所示在PCR反应中使用基于本发明核苷酸的引物克隆本发明多肽的同系物,例如本发明实施例中描述的引物。与本发明序列同源的所述核酸分子或本发明核酸分子本身可以用于减少、降低或缺失本发明核酸分子和/或蛋白质的生物活性。
引物集可互换。本领域技术人员了解在例如全长克隆或局部序列中组合所述引物产生所需的产物。基于本发明核酸分子序列的探针可以用于检测编码相同或同源蛋白质的转录物或基因组序列。探针还可以含有附着其上的标记基团,例如标记基团可以是放射性同位素、荧光化合物、酶或酶辅因子。这些探针可以作为基因组标记物测试试剂盒的一部分用于鉴定表达或不表达本发明多肽的细胞,如通过测量细胞样品中编码核酸分子的水平,例如检测mRNA水平或确定含有本发明多肽序列的基因组基因是否已突变或缺失。
本发明的核酸分子编码多肽或其部分,所述多肽或其部分包括与SEQID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的氨基酸序列充分同源,使得该蛋白或其部分保留参与产生精细化学品产生的能力,特别是包括化合物,例如通过代谢、降解或运出不需要的化学化合物与减少、降低和/或缺失精细化学品相关,从而在如上述或实施例所述减少或缺失其活性后提高精细化学品产生的本发明蛋白质。
本文使用的术语“充分同源”指具有如下氨基酸序列的蛋白质或其部分,所述氨基酸序列包含与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ IDNO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ IDNO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ IDNO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ IDNO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ IDNO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ IDNO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ IDNO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ IDNO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ IDNO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ IDNO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ IDNO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ IDNO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述氨基酸序列最小数目相同或等价的氨基酸残基。上述氨基酸序列的部分长度至少为3、5、10、20、30、40、50或更多氨基酸。由于遗传密码的简并性可从所述多肽序列得到的核酸序列可根据本文公开的内容用于抑制、降低或缺失本发明多肽或核酸分子的生物活性。
在一个实施方案中,本发明的核酸分子含有编码本发明蛋白质一部分的核酸。该蛋白质与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEO ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述完整氨基酸序列同源性至少为约30%、35%、45%或50%、优选至少约55%、60%、65%或70%、更优选至少约75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%或94%并最优选至少约95%、97%、98%、99%或更高,并具有前述活性,例如优选赋予精细化学品增加。
本发明核酸分子编码的蛋白质的部分优选以这样的方式具有生物活性,即通过减少、降低或缺失其生物活性提高产生精细化学品的生产力。
本文提到的术语“生物活性部分”旨在包含通过引入所述核酸序列或其部分赋予增加精细化学品产生的部分,例如结构域/基序。
本发明还涉及用于本发明方法并作为遗传密码简并性的结果可从SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述多肽序列得到,从而编码本发明多肽(特别通过减少、降低或缺失其生物活性引起生物中精细化学品提高的多肽)的核酸分子。有利地,本发明的核酸分子含有(或在其他实施方案中具有)编码蛋白质的核苷酸序列,所述蛋白质含有(或在其他实施方案中具有)SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示序列并与所述氨基酸序列存在至少一个或多个氨基酸的差异。
另外,本领域技术人员会认识到,种群内可能存在引起氨基酸序列改变的DNA序列多态性。编码本发明多肽或含有本发明核酸分子的基因中的这些遗传多态性可以由于天然变异在种群的个体中存在。
本文使用的术语“基因”和“重组基因”指下述核酸分子:其含有编码本发明多肽的开放读码框,或含有本发明核酸分子(优选编码本发明多肽),或含有来自用于产生精细化学品的作物植物或微生物的本发明核酸分子(具体编码本发明多肽),或含有来自用于产生精细化学品的作物植物或微生物的本发明核酸分子。这些天然变异一般引起本发明方法使用的基因的核苷酸序列中1-5%的改变。在编码本发明多肽或含有本发明核酸分子的基因中,由天然变异引起且在减少、降低或删除其生物活性的情况下不改变所述功能性活性的任一和全部这样的核苷酸变异及其引起的的氨基酸多态性旨在包含于本发明范围内。
相应于本发明核酸分子的天然变体同系物的核酸分子(也可以是cDNA)可以基于它们与该核酸分子的同源性,使用本发明的核酸分子或其部分作为杂交探针,在严格杂交条件下按照标准杂交技术进行分离。
因此,在另一实施方案中,本发明的核酸分子长度至少为15、20、25或30个核苷酸。优选地,它在严格条件下与本发明的核酸分子(例如含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEO ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEO ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的序列)杂交。该核酸分子优选长度至少为20、30、50、100、250或更多核苷酸。
术语“在严格条件下杂交”如前文定义。在一个实施方案中,术语“在严格条件下杂交”旨在描述使彼此至少30%、40%、50%或65%相同的核苷酸序列一般仍保持互相杂交的杂交和洗涤条件。优选的,该条件使至少约70%、更优选至少约75%或80%、甚至更优选至少约85%、90%或95%或更一致的序列一般仍保持彼此杂交。
优选地,在严格条件下与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:31的序列杂交的本发明核酸分子相应于天然存在的本发明核酸分子。本文使用的“天然存在”的核酸分子指具有自然界中存在的核苷酸序列(例如编码天然蛋白质)的RNA或DNA分子。优选地,该核酸分子编码具有前述活性(例如在减少、降低或删除其表达或其活性后赋予精细化学品增加或具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质的活性)的天然蛋白质。
技术人员还应理解,除了可以存在于种群中的本发明核酸或蛋白质序列的天然存在的变体以外,可以通过突变在编码本发明多肽的核酸分子的核苷酸序列中引入变化,从而引起本发明所编码多肽的氨基酸序列改变,从而改变多肽功能能力(即优选降减少、降低或删除所述活性)。例如,例如可以在本发明核酸分子或本发明方法所使用的核酸分子的序列(例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEO ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440)中产生导致“必需”氨基酸残基处的氨基酸替换的核苷酸替换。“必需”氨基酸残基是如果在本发明多肽之一的野生型序列中改变后则引起所述多肽活性改变的残基,而“非必需”氨基酸残基是蛋白质的活性(如作为酶的活性)不需要的氨基酸残基。改变“必需”残基引起本发明多肽活性的减少、降低或缺失。优选以减少、降低或缺失活性的方式改变本发明多肽的氨基酸,即优选改变必需氨基酸和/或较多的非必需氨基酸,从而减少活性,如上述在降低本发明多肽的表达或活性后引起生物中精细化学品的提高。然而,较不优选其他氨基酸残基(例如在具有所述活性的结构域中不保守或仅半保守的氨基酸残基),所述残基可能不是活性必需的,因此有可能适合在不改变所述活性的条件下发生改变。
另外,本领域技术人员了解,生物间的密码子选择可能是不同的。因此,可能需要使本发明核酸分子的密码子选择适应于表达多核苷酸或多肽的生物的选择,从而更可能减少本发明核酸分子或编码的多肽的表达。
因此,本发明涉及编码具有前述活性(例如在生物或其局部中赋予精细化学品含量增加)的多肽的核酸分子,所述多肽含有对所述活性非必需的氨基酸残基的变化。这些多肽的氨基酸序列与SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所含的序列不同,但不保留了本文所述的生物活性并从而使精细化学品产生。该核酸分子可以含有编码多肽的核苷酸序列,其中多肽含有与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的氨基酸序列至少约50%相同的氨基酸序列,并在降低其表达或其生物功能后能够参与增加精细化学品的产生。优选地,该核酸分子编码的蛋白质与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEO ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的序列至少约60%、70%或80%相同,更优选与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的序列之一至少约85%相同,甚至更优选与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的序列至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%同源,并最优选与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEO ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的序列至少约96%、97%、98%或99%相同。
为测定两个氨基酸序列(如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEO ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441)或两个核酸分子(如序列SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440)的同源性百分比(=同一性),以最佳比较(例如为产生蛋白质或核酸与另一蛋白质或核酸的最佳比较,可以在蛋白质或核酸的序列中插入缺口)将一个序列写在另一个下方。如果一个序列中的位置被与另一序列相应位置上相同的氨基酸残基或核酸分子占据时,两分子在该位置上是同源的(即本文中使用的相应于氨基酸或核酸“同一性”的氨基酸或核酸“同源性”)。两序列的序列同源性百分比是序列间共享的相同位置数目的函数(即%同源性=相同位置的数目/位置总数×100)。因此术语“同源性”和“同一性”在本说明书中应理解为同义词。
为了测定两个或多个氨基酸或两个或多个核苷酸序列的同源性百分比(=同一性),已经发展了若干种电脑软件程序。可以用例如fasta软件计算两个或多个序列的同源性,fasta现已应用到fasta 3版本(W.R.Pearson和D.J.Lipman(1988),Improved Tools for Biological SequenceComparison.PNAS 85:2444-2448;W.R.Pearson(1990)Rapid andSensitive Sequence Comparison with FASTP and FASTA,Methods inEnzymology 183:63-98;W.R.Pearson和D.J.Lipman(1988)ImprovedTools for Biological Sequence Comparison.PNAS 85:2444-2448;W.R.Pearson(1990);Rapid and Sensitive Sequence Comparison with FASTPand FASTAMethods in Enzymology 183:63-98)。另一个可用于计算不同序列的同源性的程序是Biomax pedant软件(Biomax,Munich,FederalRepublic of Germany)中包含的标准blast程序。由于blast并不总是包含对象和查询的完整序列,有时可能会导致次最佳结果。尽管如此,由于该程序十分有效,可以将其用于大量序列的比较。对于这样的序列比较一般使用以下设置:
-p程序名[字符串];-d数据库[字符串];默认=nr;-i查询文件[输入文件];默认=stdin;-e期望值(E)[实数];默认=10.0;-m比对查看选项:0=配对;1=锚定查询显示同一性;2=锚定查询非同一性;3=平锚定查询,显示同一性;4=flat锚定查询,非同一性;5=锚定查询非同一性和平末端;6=平锚定查询,非同一性和平末端;7=XML Blast输出;8=列表;9带注解行的列表[整数];默认=0;-o BLAST报告输出文件[输出文件]任选的;默认=stdout;-F过滤查询序列(blastn为DUST,其他为SEG)[字符串];默认=T;-G创建缺口代价(零调用默认行为)[整数];默认=0;-E创建缺口代价(零调用默认行为)[整数];默认=0;-X X缺口比对减少值(比特)(零调用默认行为);blastn 30,megablast 20,tblastx 0,其他15[整数];默认=0;-I在deflines中显示GI′s[T/F];默认=F;-q核苷酸错配罚分(只用于blastn)[整数];默认=-3;-r核苷酸匹配奖分(只用于blastn)[整数];默认=1;-v显示(V)的单行描述的数据库序列数[整数];默认=500;-b显示(B)比对的数据库序列数[整数];默认=250;-f延伸命中阈值,如果为0则默认;blastp 11,blastn 0,blastx 12,tblastn 13;tblastx 13,megablast 0[整数];默认=0;-g实施缺口比对(tblastx不可用)[T/F];默认=T;-Q查询使用的遗传密码[整数];默认=1;-D DB遗传密码(只用于tblast[nx])[整数];默认=1;-a使用的处理器数目[整数];默认=1;-O SeqAlign文件[输出文件]任选的;-J Believe the query defline [T/F];默认=F;-M矩阵[字符串];默认=BLOSUM62;-W字长,如果为0则默认(blastn 11,megablast 28,其他3)[整数];默认=0;-z数据库有效长度(对于真实长度使用0)[Real];默认=0;-K保持区命中数(默认关闭,如果使用,推荐值为100)[整数];默认=0;-P多重命中为0,单命中为1[整数];默认=0;-Y检索空间有效长度(对于真实长度使用0)[实数];默认=0;-S针对数据库搜索的查询链(用于blast[nx]和tblastx);3为两条都是,1为上方,2为下方[整数];默认=3;-T产生HTML输出[T/F];默认=F;-l限制性搜索数据库以列表GI′s[字符串]任选的;-U对FASTA序列使用小写过滤[T/F]任选的;默认=F;-y X非缺口延伸减少比特值(0.0调用默认行为);blastn 20,megablast 10,所有其他7[实数];默认=0.0;-Z X最终缺口比对减少比特值(0.0调用默认行为);blastn/megablast50,tblastx 0,所有其他25[整数];默认=0;-R PSI-TBLASTN检验点文件[File In]任选的;-n MegaBlast搜索[T/F];默认=F;-L查询序列定位[字符串]任选的;-A多重命中窗口大小,如果为0默认值为(blastn/megablast 0,所有其他40[整数];默认=0;-w移码罚分(blastx为OOF算法)[整数];默认=0;-t tblastn中允许连接HSPs的最大内含子长度(0中断连接)[整数];默认=0
使用Needleman及Wunsch或Smith及Waterman算法得到高质量结果。因此优选基于所述算法的程序。可以使用程序PleUp(J.Mol.Evolution.,25,351-360,1987,Higgins等,CABIOS,5 1989:151-153)或优选的程序Gap和BestFit得到有利的序列比较,它们分别基于Needleman及Wunsh的算法(J.Mol.Biol.48;443-453(1970))和Smith及Waterman(Adv.Appl.Math.2;482-489(1981))的算法。两个程序都是GCG软件包(Genetics Computer Group,575 Science DriVe,Madison,Wisconsin,USA 53711(1991);Altschul等(1997)Nucleic Acids Res.25:3389参照以下)的一部分。因此优选在完整序列范围上使用Gap程序完成测定序列同源性百分比的计算。核酸序列的比较使用了以下标准调整:缺口权重:50、长度权重:3、平均匹配:10.000、平均错配:0.000。
例如在核酸水平与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283序列具有80%同源性的序列应理解为:在使用前述参数设置的前述Gap程序算法与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283序列比较时,具有80%同源性的序列。
两个多肽之间的同源性应理解为指通过借助GAP(Wisconsin PackageVersion 10.0,University of Wisconsin,Genetics Computer Group(GCG),Madison,USA)程序算法的比较计算出的完整序列长度情况下的氨基酸序列同一性,设置为以下参数:缺口权重:8;长度权重:2;平均匹配:2,912;平均错配:-2,003。
例如在蛋白质水平与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283具有80%同源性的序列应理解为:使用前述参数设置的前述程序算法与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ IDNO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283序列比较时,具有80%同源性。
本发明SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述多肽序列之一通过替换、插入或缺失得到的功能等效物与本发明SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽之一具有至少为30%、35%、40%、45%或50%,优选至少55%、60%、65%或70%,优选至少80%,特别优选至少85%、90%、91%、92%、93%或94%,极其优选至少95%、97%、98%或99%的同源性,并以与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽(优选酿酒酵母、大肠杆菌或拟南芥的多肽)基本相同的性质为特征。
本发明SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述核酸序列之一通过替换、插入或缺失得到的功能等效物与本发明SEQID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEO ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽之一具有至少为30%、35%、40%、45%或50%,优选至少55%、60%、65%或70%,优选至少80%,特别优选至少85%、90%、91%、92%、93%或94%,极其优选至少95%、97%、98%或99%的同源性,并编码与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NQ:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEO ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEO ID NO:176、SEO ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NQ:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ 1D NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽具有基本相同特性的多肽。
功能等效物“基本相同的特性”首先应理解为功能等效物具有上文提到的活性,例如在降低所述功能等效物在生物如微生物、植物或植物或动物组织、植物、或动物细胞或其部分中的蛋白数量、活性或功能的同时,增加精细化学品的量。
可以通过向本发明核酸分子的核苷酸序列(特别是SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441)中引入一个或多个核苷酸的替换、添加或缺失,并因而向编码的多肽中引入一个或多个氨基酸替换、添加或缺失而产生编码SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NQ:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441蛋白质序列的同系物的核酸分子。可以通过标准技术(如位点定向诱变和PCR介导的诱变)向例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440的编码序列中引入突变。
优选地,在一个或多个预测的非必需或优选必需氨基酸残基处进行非保守性氨基酸替换并从而减少、降低或删除各自的蛋白质表达。“保守性氨基酸替换”是用具有相似侧链的氨基酸残基取代氨基酸残基的替换。本领域已经定义了具有相似侧链的氨基酸残基家族。这些家族包括具有碱性侧链的氨基酸(例如赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、具有酸性侧链的氨基酸(例如门冬氨酸、谷氨酸)、具有不带电荷的极性侧链的氨基酸(例如甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、具有非极性侧链的氨基酸(例如丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、具有β分支侧链的氨基酸(例如苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和具有芳香侧链的氨基酸(例如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。
因此,本发明多肽中预测的非必需或必需氨基酸残基优选被来自另一侧链家族的氨基酸取代。另外,在另一实施方案中,可以如通过饱和诱变在全部或部分的本发明多肽或本发明方法所使用多肽的编码序列中随机引入突变,可以筛选所得突变体的本文所述的活性以鉴定缺失或降低了生物活性(例如赋予精细化学品含量提高)的突变体。
对SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440的序列之一进行诱变后,可以重组表达编码的蛋白质并可以使用如本文所述的测定法(见实施例)测定多肽的活性。
通过Gap搜索在以下数据库条目中发现了本发明方法所使用核酸分子与以下数据库条目最高的同源性。
 Hit     最佳同系物     %同一
 At2g25320     At2g25330     35
 At3g07610     NP_172659     33
 at3g15600RefSeq AccessionNM_112428.1) NP_178820.1 83
 At1g14490(RefSeq AccessionNM_101316) SPTREMBL_Q9LTA2 69
 At1g30570(RefSeq AccessionNM_102794) SPTREMBL_Q7XTT9 53
At2g21290     bn43069381     85
 (RefSeq AccessionNM_127701)
 At3g14230(RefSeq AccessionNM_80251) REMTREMBL_CAD88898 98
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O:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441序列的核酸序列的同系物还包括与所示核苷酸序列或前述衍生核酸序列或其同系物、衍生物或类似物之一或它们的部分具有至少约30%、35%、40%、或45%同源性,优选至少50%、60%或70%,更优选至少90%、91%、92%、93%、94%或95%,甚至更优选至少95%、97%、98%或99%或更高的同源性的等位变体。等位变体具体包括可以通过从所示序列(优选从SEQ或从衍生的核酸序列)通过缺失、插入或替换核苷酸得到的功能变体,然而意图在于有利地缺失或降低合成得到的蛋白质的酶活性或生物活性。
在本发明的一个实施方案中,核酸分子含有SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEO ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440任一所示的序列。优选核酸分子尽可能少的含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440任一序列中未显示的其他核苷酸。在一个实施方案中,核酸分子含有少于500、400、300、200、100、90、80、70、60、50或40个其他核苷酸。在另一个实施方案中,核酸分子含有少于30、20或10个其他核苷酸。在一个实施方案中,本发明方法所使用的核酸分子与SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示序列相同。
还优选本发明的核酸分子编码含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列的多肽。在一个实施方案中,核酸分子编码少于150、130、100、80、60、50、40或30个其他氨基酸。在另一个实施方案中,编码的多肽含有少于20、15、10、9、8、7、6或5个其他氨基酸。在本发明方法使用的另一个实施方案中,编码的多肽与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列相同。
在一个实施方案中,核酸分子编码含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列的多肽并含有少于100个其他核苷酸。在另一个实施方案中,核酸分子含有少于30个其他核苷酸。在一个实施方案中,核酸分子与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEO ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列的编码序列相同。
仍具有本发明多肽上述活性(即赋予精细化学品提高或具有本发明蛋白质的生物活性)的多肽(=蛋白质)(即其活性基本降低的多肽)是与野生型生物活性或酶活性相比的至少10%或20%,优选30%或40%,特别优选50%或60%,极其优选具有80%或90%或更高的多肽,有利地,活性与在相同条件下表达的SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质的活性相比基本降低。
SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEO ID NO:314、SEO ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440或SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEO ID NO:407、SEQ ID NO:4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:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的衍生序列的同系物还应理解为指含有非编码区(如UTR、终止子、增强子或启动子变体)的衍生物。可以通过一个或多个核苷酸替换、插入和/或缺失修饰所述核苷酸序列的上游启动子,而优选干扰启动子、开放读码框(=ORF)或远离ORF的3’调节区(如终止子或其他3’调节区)的功能性或活性。还可以通过修饰其序列或其调节降低启动子的活性,或用活性更低的启动子(甚至是异源生物的启动子)将其完全取代。合适的启动子是本领域技术人员众所周知的,并在下文有所提及。存在如通过修饰反式作用因子(即能与启动子结合并影响其活性的天然或人工转录因子)的活性调控本发明基因启动子的其他方法。此外,还可以通过修饰与目的启动子的调控有关的上游信号组件(如受体或激酶)来影响目的启动子。
在另一个实施方案中,本发明的方法包括以下步骤:
(a)选择表达本发明多肽的生物或其局部;
(b)诱变选择的生物或其局部;
(c)将诱变生物或其局部中所述多肽的活性或表达水平与选择的生物或其局部中所述多肽的活性或表达水平进行比较;
(d)选择诱变生物或其局部,所述诱变生物或其局部与选择的生物(a)或其局部相比含有降低活性或表达水平的所述多肽;
(e)任选地,生长和栽培该生物或其局部;并
(f)回收(和任选地分离)选择的突变生物或其局部所产生的游离或结合的本发明化合物。
与所述对照或选择的生物或其局部相比,该生物或其局部根据本文所述本发明方法产生提高的游离和/或与蛋白质结合的甲硫氨酸水平。
有利地,选择根据本发明诱变的生物。根据本发明,诱变是生物基因组中遗传信息的任何变化,即不是由于正常分离或遗传重组过程引起的生物核酸(优选DNA)的任何结构或组成的变化。这些突变可以自发出现,或者可以通过下文所述的诱变剂诱导。这些变化可以随机诱导或选择性诱导。在两种情况下都修饰了生物的遗传信息。一般这会引起细胞内或生物内相关基因的基因产物活性减少或抑制的情形。
对于特异诱变或所谓的位点定向诱变的情况,突变了特定的基因,因此抑制、减少、降低或删除了其活性和/或所编码基因产物的活性。在随机诱变中,随意突变了一个或多个基因,并抑制、减少、降低或删除(优选降低或删除)了其活性和/或其基因产物的活性。
就诱变大生物群体而言,可以用DNA种群或DNA文库转化这样的群体,所述DNA种群或DNA文库可用于抑制生物中尽可能多的基因,优选全部基因。采用此方法,通过整合有利的鉴定了的DNA片段,可以统计学地诱变生物的几乎所有基因。然后技术人员可以容易地鉴定敲除事件。植物的诱变优选EMS、T-DNA和/或转座子诱变。
对于随机诱变的情况,用诱变剂处理大量生物。所述试剂的量和处理的强度按照统计学上几乎使每个基因突变的方式来选择。随机诱变和方法和各自的试剂是技术人员熟知的。这些方法公开于例如A.M.van Harten[(1998),《Mutation breeding:theory and practical applications》,Cambridge University Press,Cambridge,UK]、E Friedberg,G WaIker,WSiede[(1995),《DNA Repair and Mutagenesis》,Blackwell Publishing],或K.Sankaranarayanan,J.M.Gentile,L.R.Ferguson [(2000)《Protocols inMutagenesis》,Elsevier Health Sciences]。技术人员了解生物的细胞中自发突变率非常低,多种化学、物理或生物试剂可供诱变生物使用。这些试剂称为诱变因素或诱变剂。如上文所述,三种不同种类的诱变因素(化学、物理或生物试剂)可供使用。
化学诱变因素有不同类型,可以通过其作用模式来区分。例如碱基类似物,如5-溴尿嘧啶、2-氨基嘌呤。其他化学诱变因素与DNA相互作用,如硫酸、亚硝酸、羟胺,或其它烷化剂,如单功能剂(如甲磺酸乙酯(=EMS)、硫酸二甲酯、甲磺酸甲酯)、双功能剂(如二氯乙基硫醚、丝裂霉素、亚硝基胍-二烷基亚硝酸、N-亚硝基胍衍生物、N-烷基-N-硝基-N-亚硝基胍)、ntercalating染料,如吖啶、溴乙啶。
物理诱变因素例如电离照射(X光)、UV照射。可以使用不同类型的照射,它们是强诱变因素。可以区分两个主要类型的照射:a)非电离照射(如UV光)或电离照射(如X光)。生物诱变因素例如转座元件,如IS元件(如IS100)、转座子(如Tn5、Tn10、Tn903、Tn916或Tn1000)或噬菌体,如Muamplac、P1、T5、λ噬菌体等。将此噬菌体DNA引入适当的微生物的方法为技术人员所熟知(参阅《Microbiology》,第三版,Davis编,B.D.,Dulbecco,R.,Eisen,H.N.和Ginsberg,H.S.,Harper InternationalEdition,1980)。转座子诱变的常用方法是在基因或附近(例如启动子或终止子区)插入转座元件,从而引起基因功能的丧失。将转座子定位在生物基因组内的方法为本领域技术人员所熟知。对于植物中的转座子诱变,玉米转座子系统激活子-解离(Ac/Ds)和增强子-抑制子增变株(En/Spm)是本领域技术人员已知的,但也可以类似的使用其他转座子系统。可以通过可供植物转化使用的不同标准技术将转座子引入植物基因组。植物中另一种类型的诱变包括T-DNA诱变,即将T-DNA序列随机整合进植物基因组[Feldmann,K.A.(1991)T-DNA insertion mutagenesis in Arabidopsis:Mutational spectrum.Plant J.1,71-82]。随后可以通过PCR或其他高通量技术搜寻目的基因发生突变的事件[Krysan等,(1999)T_DNA as aninsertional mutagen in Arabidopsis,Plant Ce1l,11,2283-2290]。
本领域技术人员熟知产生本发明核酸序列或所编码蛋白质的生物活性减少、降低或缺失的微生物的方法。对于革兰氏阳性菌如短杆菌、棒杆菌、红球菌或芽孢杆菌,可以如Schafer等[Gene 1994,Jul.22,145(1):69-73]所述将IS元件用于所述目的。诱变细菌的方法为技术人员所熟知。
另一种非常有效的方法是借助转座子(=Tn)在细菌基因组中引入突变。转座子具有一些使其可用作诱变工具的普遍特性。这些特性在自然界普遍存在,例如他们可见于染色体、质粒和噬菌体上。转座子在基因组中的转座是rec依赖性的,一般频率为10-4-10-7。转座子具有所的编码转座酶和其末端的反向末端重复。此外,它们在基因组中的整合需要近似于随机的最小靶序列特异性。像质粒一样,它们经常赋予抗生素抗性。作为优点,它们产生极性突变。彼此不同的三种转座子为a)保守型转座子:转位时不提高拷贝数;b)复制型转座子:转座子在转位时复制,形成两个拷贝和c)缀合转座子:转座子编码Tra功能,切除并转移到另一宿主。如技术人员所知,已经开发了便于将转座元件引入多种革兰氏阴性和革兰氏阳性菌的方法。因此可以将转座元件引入几乎每种细菌的基因组中。它们进行某种随机插入,从而引起插入突变。由于细菌物种平均具有约3000个基因,可以很容易的饱和染色体。此外,转座子提供随后可用于鉴定和克隆突变基因的分子标签。与基因组学结合,转座子是突变不同基因的有效方法。如上文所述,有多种不同的将转座子引入细菌的方法。其选择取决于靶细菌的性质。例如可以借助温度敏感型复制子、引入不相容质粒的所谓碰撞质粒、缺少供体细胞或噬菌体以反式提供的必要的复制蛋白,从而在宿主生物中不能复制的转移质粒将转座子引入细菌基因组。一般熟知的转座子为Tn5、Tn10、Tn903、Tn916、Tn1000等。
其他方法如借助病毒如噬菌体如P1、P22、T2、T3、T5、T7、Muamplac、Mu、Mu1、MuX、miniMu、λ、λplac或插入元件如IS3、IS100、IS900等引入突变。同样随机诱变整个细菌基因组。突变体很容易鉴定。
破坏本发明的核酸序列从而减少、降低或缺失所编码蛋白质的生物活性的另一种方法可以通过用改变的本发明核酸序列进行同源重组实现。由此可以通过一个或多个点突变、删除或倒位改变本发明的核酸序列,但仍编码本发明的功能性蛋白质或非功能性蛋白质。在本发明的另一个实施方案中,(通过如删除、截短、倒位或点突变)改变了编码本发明蛋白质的基因的一个或多个调节区(如启动子、阻抑子或诱导物),从而调控相应基因的表达,即减少、降低或缺失。
优选使用化学或生物方法诱变生物。优选的化学方法是用N-甲基-N-硝基亚硝基胍诱变。
其他生物方法由Spee等(Nucleic Acids Research,卷21,No.3,1993:777-778)公开。Spee等教导了使用dITP随机诱变的PCR方法。Spee等描述的该方法由Rellos等(Protein Expr.Purif.,5,1994:270-277)进一步改进。Stemmer(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,卷91,1994:10747-10751)描述了使用体外重组技术进行分子诱变。Moore等(Nature Biotechnology卷14,1996:458-467)描述了组合PCR和重组方法以提高酯酶对对-硝基苄酯的酶活性。Greener等在Methods in Molecular Biology(卷57,1996:375-385)中描述了诱变酶的另一途径。Greener等使用特异性大肠杆菌菌株XL1-Red产生具有提高的抗生素抗性的大肠杆菌突变体。
在一个实施方案中,本发明的蛋白质或本文所表征的核酸分子来源于真核或原核生物,如非人动物、植物、微生物(如真菌、酵母、藻类、硅藻或细菌)。可有利地用于本发明方法的核酸来源于植物,如芸苔科特别是芥属、Melanosinapis、白芥属或拟南芥并特别有利的来自拟南芥物种。此外,可有利地用于本发明方法的核酸序列来源于植物如玉米、soja、芸苔、小麦、大麦、黑小麦、稻、亚麻子、向日葵或马铃薯。序列SEQ ID NO:2以Genebank登录号At2g25320(RefSeq Accession NM_128089)保藏,序列SEQ ID NO:8以Genebank登录号At3g07610(RefSeq AccessionNP_187418)保藏,序列SEQ ID NO:20以Genebank登录号At3g15600(RefSeq Accession NM_112428.1)保藏,序列SEQ ID NO:65以Genebank登录号At1gl4490(RefSeq Accession NM_01316)保藏,序列SEQ ID NO:152以Genebank登录号At1g30570(RefSeq Accession NM_102794)保藏,序列SEQ ID NO:229以Genebank登录号At2g21290(RefSeq AccessionNM_127701)保藏,序列SEQ ID NO:283以Genebank登录号At3g14230(RefSeq Accession NM_108251)保藏。
在本发明的另一个优选的实施方案中,可用于本发明方法的核酸来源于肠杆菌科,如来自上文所述的Echerichia属、沙门氏菌属、克雷伯氏菌属,如大肠杆菌物种。
因此,在一个实施方案中,本发明涉及含有选自以下核酸分子的分离的核酸分子:
a)编码含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽的多肽的核酸分子;
b)含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多核苷酸的核酸分子:
c)核酸分子,其所合的核酸序列可由于遗传密码简并性而从(b)所述多肽序列得到,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质表现出的生物活性;
d)编码多肽的核酸分子,所述多肽与(a)或(c)的核酸分子编码的多肽的氨基酸序列有至少50%的同一性,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质表现出的生物活性;
e)含有多核苷酸的核酸分子,所述多核苷酸通过使用SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:145、SEQ ID NO:221、SEQ ID NO:222、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:436或SEQ ID NO:437所述引物扩增cDNA文库或基因组文库获得;
f)编码多肽的核酸分子,所述多肽借助针对由(a)到(c)的核酸分子之一所编码多肽的单克隆或多克隆抗体分离,并具有SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
g)编码多肽的核酸分子,所述多肽含有SEQ ID NO:33或SEQ ID NO:34所示共有序列,并具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
h)编码多肽的核酸分子,所述多肽具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
i)可以通过在严格杂交条件下以探针或探针片段筛选适当的核酸文库而获得的核酸分子,并且该核酸分子编码的多肽具有本发明蛋白质所表现的生物活性,其中所述探针含有(a)到(c)核酸分子之一的序列,或所述探针片段具有(a)到(i)所表征核酸分子的至少15nt,优选20nt、30nt、50nt、100nt、200nt或500nt,并编码具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性的多肽;
或所述核酸含有与上述核酸分子互补的序列。其中,(a)到(j)的核酸分子与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述序列有至少一个或多个核苷酸的差异和/或编码与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质序列具有至少一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个或更多氨基酸差异的蛋白质。在另一实施方案中,SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的核酸分子不由如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述的序列组成。在另一个实施方案中,本发明核酸分子与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述核酸序列至少30%相同,且与如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述序列小于100%相同,优选小于99.999%、99.99%或99.9%相同,更优选小于99%、98%、97%、96%或95%相同。
优选的,核酸分子不编码SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ IDNO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ IDNO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ IDNO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ IDNO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ IDNO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ IDNO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ IDNO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ IDNO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ IDNO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ IDNO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ IDNO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述多肽。在另一个实施方案中,SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述核酸分子不编码SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质。即SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质序列不由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:1 19、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ IDNO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ IDNO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ IDNO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ IDNO:435或SEQ ID NO:441所述序列组成。在另一个实施方案中,本发明蛋白质与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质序列至少30%相同,且与如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ IDNO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ IDNO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ IDNO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ IDNO:435或SEQ ID NO:441所述序列小于100%相同,优选小于99.999%、99.99%或99.9%相同,更优选小于99%、98%、97%、96%或95%相同。
将本方法所使用的核酸序列有利地引入核酸构建体(优选表达盒)中,所述核酸构建体允许该核酸分子在生物(有利地为植物或微生物)中减少、降低等。
因此,本发明还涉及含有与一个或多个调节元件或信号有效连接的本发明核酸分子或其片段的核酸构建体,优选表达构建体。
如本文所述,核酸构建体还可以含有引入生物或细胞中的其他基因。将调节基因(如诱导物、阻抑物或酶基因)引入宿主生物并在其中表达是可能并且有利的,所述酶由于其酶活性而调节生物合成途径中的一个或多个基因。这些基因可以是异源来源或是同源来源的。另外,可以有利的存在其他生物合成基因,或者这些基因可以定位于一个或多个其他核酸构建体上。作为生物合成基因有利地使用的基因为氨基酸代谢、糖酵解、三羧酸代谢的基因或其组合。
如本文所述,调节序列或因子可以优选对所引入基因的基因表达具有正作用,从而使其提高。因此,可以通过使用强转录信号(如启动子和/或增强子)有利地在转录水平增强调节元件。然而,另外还可以通过例如提高mRNA稳定性增强翻译。另一方面,减少、降低或缺失了本发明核酸分子和基因产物以提高精细化学品的生产力。
原则上讲,核酸构建体可以含有本文所述的调节序列和与减少表达本发明核酸分子相关的和另一方面与表达构建体中额外基因相关的其他序列。因此,本发明的核酸构建体可以作为表达盒使用并因而可以直接用其引入植物,或者可以将它们引入载体。因此,一个实施方案的核酸构建体是含有微生物启动子或微生物终止子或两者皆有的表达盒。在另一个实施方案中,表达盒含有植物启动子或植物终止子或两者皆有。
因此,在一个实施方案中,本发明的方法包括以下步骤:
(a)引入含有本发明核酸分子的核酸构建体,其编码本发明多肽;或
(b)引入包含调节序列或因子的核酸分子,其表达在细胞或生物或其局部(优选植物、植物细胞或微生物)中降低表达本发明的多肽;和
(c)通过(a)或(b)中提到的核酸构建体或核酸分子,在细胞或生物中抑制
本发明核酸编码的多肽。
引入并表达核酸构建体后,有利地培养并随后收获转基因生物或细胞。转基因生物或细胞可以是原核或真核生物,如微生物、非人动物和植物,例如植物或动物细胞、植物或动物组织、优选作物植物或其局部。
为将核酸分子(例如RNAi、反义核酸序列或诱变核酸序列)引入(例如作为表达盒的一部分)核酸构建体(其引起个别基因减少的活性和/或表达)中,有利地以技术人员已知的方式将编码基因片段或非翻译区进行扩增和连接反应。优选遵循与Pfu DNA聚合酶或Pfu/Taq DNA聚合酶混合物类似地操作。根据待扩增的序列选择引物。应以使扩增物包含从起始到终止密码子的编码序列的方式来恰当地选择引物。其他可能性包括5’或3’非翻译区或启动子区。扩增后,恰当地分析扩增物。例如,分析可以考虑质量和数量,并在通过凝胶电泳分离后进行。随后可以遵循标准方法(例如Qiagen)纯化扩增物。纯化扩增物的等分试样可用于随后的克隆步骤。技术人员通常了解适当的克隆载体[Cloning Vectors(Pouwels P.H.等编辑,Elsevier,Amsterdam-New York-Oxford,1985,ISBN 0 444 904018)]。
它们具体包括能够在易于处理的克隆系统(例如细菌酵母或基于昆虫细胞(例如杆状病毒表达)的系统)中复制的载体,即特别是保证在大肠杆菌中有效克隆和可能稳定转化植物的载体。必需提到的载体特别为适合于T-DNA介导的转化的多种二元和共整合载体系统。这些载体系统通常表征为其至少含有农杆菌介导的转化所需的病毒基因和T-DNA边界序列。
一般而言,载体系统优选还含有其他顺式调节区(如启动子和终止子)和/或用以鉴定适当的转化生物的选择标记物。对于共整合载体系统,病毒基因和T-DNA序列位于同一载体上,而二元载体基于至少两个载体,其中之一携带病毒基因,不携带T-DNA,而第二个携带T-DNA,不携带病毒基因。基于这一事实,最后提到的载体相对较小,易于操作并能够在大肠杆菌和农杆菌中复制。这些二元载体包括来自pBIB-HYG、pPZP、pBecks、pGreen系列的载体。根据本发明优选使用的为Bin19、pBI101、pBinAR、pGPTV和pCAMBIA。Hellens等,Trends in Plant Science(2000)5,446-451给出了二元载体及其用途的概述。
为制备载体,首选使用限制性核酸内切酶将载体线性化,然后以适当的方式用酶修饰。随后纯化载体,一部分用于克隆步骤。在克隆步骤中,使用连接酶将酶切的和必要时纯化的扩增物和同样制备的载体片段克隆到一起。在本文中,特定的核酸构建体或载体或质粒构建体可以具有一个或多个编码基因片段。这些构建体中的编码基因片段优选与调节序列有效连接。调节序列具体包括植物序列如前述启动子和终止子。可以在选择条件下有利地在微生物特别是大肠杆菌和/或根瘤农杆菌中稳定地增殖构建体并使异源DNA能够转移到植物或其他微生物中。根据一个具体的实施方案,构建体基于二元载体(二元载体概述:Hellens等,2000)。通常它们含有用于在微生物(如大肠杆菌和根瘤农杆菌)中增殖的原核调节序列(如复制起点)和选择标记物。载体还可以含有用于将DNA转移到植物基因组中的农杆菌T-DNA序列或用于转移到其他真核细胞(如酵母菌属)中的其他真核调节序列或用于转移到其他原核细胞(如棒杆菌属或芽孢杆菌属)中的其他原核调节序列。为了转化植物至少必需含有约25碱基对的总农杆菌T-DNA序列的右侧边界序列。本发明的植物转化载体构建体通常含有右边和左边边界区域的T-DNA序列,所述区域含有位点特异性作用酶的恰当的识别位点,这些酶反之由一些病毒基因编码。
适当的宿主生物为技术人员众所周知。有利的生物为本申请上文所述。它们具体包括真核生物或真细菌,例如原核生物或古细菌。有利的宿主生物为选自以下的微生物:放线菌科、芽胞杆菌科、短杆菌科、棒杆菌科,、肠杆菌科、Gordoniaceae、微球菌科、分枝杆菌科、诺卡(氏)菌科、假单胞菌科、根瘤菌科或链霉菌科、毛壳菌科、笄霉科笄霉科、隐球酵母科、小克银汉霉科、暗梗胞科(Demetiaceae),丛梗孢科(Moniliaceae),被孢霉科(Mortierellaceae)、毛霉科、腐霉科、酵母科、水霉科、裂殖酵母属、Sodariaceae、Sporobolomycetaceae、Tuberculariaceae、Adelotheciaceae、Dinophyceae、牛毛藓科和绿枝藻纲。优选单细胞微生物例如真菌、细菌或原生动物,例如真菌如麦角菌属或曲霉属,或革兰氏阳性菌如杆菌属、棒杆菌属、微球菌属、短杆菌属、红球菌属、诺卡氏菌属、Caseobacter或节杆菌属,或革兰氏阴性菌如大肠杆菌属、黄杆菌属或沙门氏菌属,或酵母如红酵母属、汉逊氏酵母属、毕赤酵母属、Yerrowia、酵母属、裂殖酵母属或假丝酵母属。
本发明方法特别有利地选择的宿主生物为选自包括以下属和种的微生物:异常汉森酵母、Candida utilis、Claviceps purpurea、环状芽孢杆菌、枯草杆菌、芽孢杆菌属、Brevibacterium albidum、Brevibacterium album、Brevibacterium cerinum、黄色短杆菌、Brevibacterium glutamigenes、碘短杆菌、Brevibacterium ketoglutamicum、Brevibacteriumlactofermentum、扩展短杆菌、Brevibacterium roseum、解糖短杆菌、短杆菌属、Corynebacterium acetoacidophilum、Corynebacteriumacetoglutamicum、Corynebacterium ammoniagenes、谷氨酸棒杆菌(=Micrococcus glutamicum)、Corynebacterium melassecola、棒杆菌属或大肠杆菌,特别是大肠杆菌K12及其所述菌株。
根据本发明有利地优选根瘤农杆菌属或植物宿主生物。优选的植物选自以下科:Aceraceae、漆树科、伞形科、菊科、伞形科、桦木科、紫草科、芸苔科、凤梨科、仙人掌科、Caricaceae、石竹科(Caryophyllaceae),大麻科(Cannabaceae),旋花科(Convolvulaceae),藜科(Chenopodiaceae),胡颓子科(Elaeagnaceae)、龙儿苗科(Geraniaceae),禾本科(Gramineae),胡桃科(Juglandaceae),樟科(Lauraceae),豆科(Leguminosae),亚麻科(Linaceae),葫芦科(Cucurbitaceae),萍草科(Cyperaceae),大戟科(Euphorbiaceae),豆科(蝶形花科),锦葵科(Malvaceae),睡莲科(Nymphaeaceae)、罂粟科(Papaveraceae)、蔷薇科(Rosaceae)、杨柳科(Salicaceae)、茄科(Solanaceae)、Arecaceae、鸢尾科(Iridaceae)、百合科(Liliaceae)、兰科(Orchidaceae)、龙胆科(Gentianaceae)、Labiaceae、木兰科(Magnoliaceae)、毛莨科(Ranunculaceae)、Carifolaceae、茜草科(Rubiaceae)、玄参科(Scrophulariaceae)、杜鹃花科(Ericaceae)、蓼科(Polygonaceae)、堇菜科(Violaceae)、灯心草科(Juncaceae)、Poaceae科、多年生草本、饲料作物、蔬菜和观赏植物。
特别优选选自以下科的植物:伞形科、菊科(Asteraceae)、芸苔科(Brassicaceae)、葫芦科(Cucurbitaceae)、豆科(蝶形花科)、罂粟科(Papaveraceae)、蔷薇科(Rosaceae)、茄科(Solanaceae)、百合科(Liliaceae)Poaceae科。特别有利的为具体的作物植物。因此,优选有利的植物属于花生(peanut)、oilseed rape、芸苔(canola)、向日葵(Sunflower)、红花(safflower)、橄榄(olive)、芝麻(sesame)、榛子(hazelnut)、almond、酪梨(avocado)、bay、pumpkin/squash、亚麻子(linseed)、大豆(soya)、pistachio、琉璃苣(borage)、玉米(maize)、小麦、黑麦、燕麦、高梁(sorghum)和millet、黑小麦、稻、大麦、木薯、马铃薯、甜菜、fodderbeet、茄子和多年生草本及饲料植物、油椰、蔬菜(芸苔、root vegetables,tuber vegetables,pod vegetables,fruiting vegetables,onion vegetables,leafy vegetables and stem vegetables)荞麦(buckwheat)、Jerusalemartichoke、蚕豆(broad bean)、vetches、扁豆(lentil)、dwarf bean、羽扇豆(lupin)、三叶草(clover)和苜蓿属。其他优选的植物由上文描述。
为将本发明的核酸分子或本发明方法所使用的核酸分子(例如RNAi、反义核酸序列或诱变核酸序列)引入植物中,已经证明首先将其转化到中间宿主(如细菌或单细胞真核生物细胞)是有利的。已经证明转化大肠杆菌在本文中是恰当的,转化可以以本身已知的方式进,例如通过热激或电穿孔的方法。因此,可以分析转化大肠杆菌菌落的克隆率。这可借助PCR进行。可以借助通过将菌落的等分试样进行所述PCR来定义的菌落数确认质粒构建体的同一性和完整性。对于该目的,通常使用来自载体序列的通用引物,例如可以将正向引物安排在起始ATG上游,反向引物安排在编码基因片段的终止密码子下游。通过电泳分离扩增物并评估其数量和质量。
随后将(任选地确认的)核酸构建体用由于转化植物或其他宿主,如其他真核细胞或其他原核细胞。为此首先需要从中间宿主获得构建体。例如,可以通过类似于传统质粒分离的方法从细菌宿主中得到构建体(如质粒)。
植物中的基因沉默可以有利地通过瞬时转化技术实现,即核酸优选不整合进植物基因组。瞬时植物转化的合适系统包括基于农杆菌的系统和基于植物病毒的系统。基于病毒的瞬时系统及其在植物基因沉默中的用途描述于Lu等,Methods 2003,30(4)296-303。农杆菌用于在植物中瞬时表达核酸的用途描述由Fuentes等,2003在Biotechnol Appl Biochem.2003年10月21日online:doi:10.1042/BA20030192)中。
已知转化植物的大量方法。根据本发明,稳定整合异源DNA到植物基因组中是有利的,因此已证明T-DNA-介导的转化特别合适。该目的首先需要用含有本发明核酸分子的基因片段或相应的质粒构建体转化适当的载体,特别是农杆菌。这可以本身已知的方式进行。例如,可以通过电穿孔或热激的方法将根据上文详细描述所产生的所述本发明核酸构建体或所述表达构建体或所述质粒构建体转化进感受态农杆菌中。原则上讲,必须区别形成共整合载体的一方面和用二元载体转化的另一方面。在第一个方案中,含有本发明编码基因片段或核酸分子的构建体不具有T-DNA序列,而通过在农杆菌中与带有T-DNA的构建体异源重组形成共整合载体或构建体。T-DNA以Ti或Ri质粒的形式存在于农杆菌中,在所述质粒中外源DNA合适地取代了癌基因。如果使用二元载体,可以通过细菌缀合或直接转移将它们转移到农杆菌中。这些农杆菌有利地已含有携带病毒基因的载体(现在称为辅助Ti(Ri)质粒)。
另外稳定转化质体是有利的,因为质体在多数作物中是母系遗传的,这减少或消除了通过花粉的转基因外流危险。一般通过Klaus等,2004(Nature Biotechnology 22(2),225-229)中图示展示的方法完成叶绿体基因组的转化方法。
简言之,将待转化的序列和与叶绿体基因组同源的侧翼序列之间的选择标记基因一起克隆。这些同源侧翼序列指导位点特异性整合至原质体系中。已经描述了许多不同植物物种的质体转化,概述可得自Bock等(2001)Transgenic plastids in basic research and plant biotechnology.J Mol Biol.2001 Sep 21;312(3):425-38或Maiiga,P(2003)Progress towardscommercialization of plastid transformation technology.Trends Biotechnol.21,20-28(2003)。最近已经报导了无标记质体转化体形式的其他生物技术进展,所述转化体可通过瞬时共合体标记基因产生(Klaus等,2004,Nature Biotechnology 22(2),225-229)。
如果植物或植物细胞将与T-DNA一起转化,还可以便利地与核酸构建体或本发明的载体一起使用一个或多个标记,借助标记可以分离或选择转化的生物,如农杆菌或转化的植物细胞。这些标记基因使得可以通过一系列不同方法鉴定本发明核酸分子的成功转化,所述方法例如借助荧光、发光或人眼可见波长范围内的光视觉鉴定、通过对除草剂或抗生素的抗性、通过已知为营养标记(辅助营养缺陷型标记)或抗营养标记、通过酶分析或通过植物激素。可能提到的这些标记的实例为GFP(=绿色荧光蛋白)、荧光素/荧光素酶系统、β-半乳糖苷酶及其有色底物(如X-Gal)、除草剂抗性(如咪唑啉酮、草甘磷、膦丝菌素或磺酰脲)、抗生素抗性(如博来霉素、潮霉素、链霉素、卡那霉素、四环素、氯霉素、氨苄青霉素、庆大霉素、遗传霉素(G418)、大观霉素或杀稻瘟素)、仅举数例营养标记(如利用甘露糖或木糖)或抗营养标记(如2-脱氧葡萄糖抗性)。此处仅列出了一小部分可能的标记。技术人员对这些标记非常熟悉。优选取决于生物和选择方法使用不同的标记。
一般需要T-DNA在植物核酸构建体编码基因片段侧翼的一侧或两侧。这在使用根瘤农杆菌或毛根农杆菌转化时特别有用。本发明优选的方法是借助根瘤农杆菌的转化。然而,生物射弹方法也可以有利地用于引入本发明方法的序列,还可以使用PEG方法引入。可以以本身已知的方式培养转化的农杆菌,从而可供便利地转化植物。以惯例的方式生长或提供用于转化的植物或植物部分。随后使转化的农杆菌作用于植物或植物部分,直至达到足够的转染率。可以以不同形式使农杆菌作用于植物。例如,可以使用形态发生的植物细胞或组织的培养物。转移T-DNA之后,细菌一般被抗生素清楚,并诱导植物组织再生。这具体通过使用适当的植物激素以起始诱导愈伤组织形成并随后启动新枝发育来完成。
外源基因向植物基因组的转移称为转化。为此,使用所述用于转化及从植物组织或植物细胞再生植株的方法进行瞬时或稳定转化。为此,可以例如使农杆菌作用于植物种子或用农杆菌接种植物分生组织。根据本发明,已经证明使转化农杆菌的悬浊液作用于完整植物或至少花原基是特别便利的。随后继续生长植物直至获得所处理植物的种子(Clough和Bent,PlantJ.(1998)16,735-743)。为选择转化的植物,一般将转化得到的植物材料置于选择条件下,以从未转化的植物中区分出转化植物。例如,可以播种以前述方式收获的种子并在初始生长期后通过喷撒置于适当的选择条件。另外的可能性包括(必要时在灭菌后)使用适当的选择试剂在琼脂平板上生长种子,以使只有转化的种子能成长为植株。其他有利的(特别为植物的)转化方法为技术人员公知并在下文有所描述。
其他有利和合适的方法为通过聚(乙二醇)诱导的DNA摄取的原生质体转化、使用基因炮的“生物射弹”方法(指如微粒轰击的方法)、电穿孔、在DNA溶液中孵育干胚、微注射和农杆菌介导的基因转移。所述方法描述于例如B.Jenes等,《Transgenic Plants》,第一卷,Engineering andUtilization,S.D.Kung和R.Wu编,Academic Press(1993)128-143的Techniques for Gene Transfer和Potrykus Annu.Rev.Plant Physio.PlantMolec.Biol.42(1991)205-225。用于表达的核酸或构建体优选克隆进适合转化根瘤农杆菌的载体中,例如pBin19(Bevan等,Nucl.Acids Res.12(1984)8711)。随后转化了这一载体的农杆菌可用于按已知方式转化植物特别是作物植物,如烟草植物,例如将捣碎的叶片或切碎的叶片浸泡在农杆菌溶液中,随后在合适的培养基中培养。依靠根瘤农杆菌的植物转化由例如Hofgen和Willmitzer在Nucl.Acid Res.(1988)16,9877中描述,或此外公知于E.F.White,《Transgenic Plants》,第1卷,Engineering andUtilization,S.D.Kung和R.Wu编,Academic Press,1993,15-38页的“Vectors for Gene Transfer in Higher Plants”。
可以将前述核酸分子与其他基因组合在一起克隆进本发明的核酸构建体或载体中,或者通过向宿主细胞(有利地为植物细胞或微生物)中转化若干核酸构建体或载体(包括质粒)引入不同的基因。
除了SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ IDNO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ IDNO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ IDNO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ IDNO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ IDNO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ IDNO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ IDNO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ IDNO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ IDNO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ IDNO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述序列或其衍生物以外,可以有利地在生物中额外表达和/或突变其他基因。特别有利地,在生物(如植物或微生物)中额外表达至少一个氨基酸(例如L-赖氨酸、L-苏氨酸和/或L-甲硫氨酸)生物合成途径的其他基因。还可以有利地修饰天然基因的调控,以使基因和/或其基因产物不再置于生物中存在的调节机制下。这引起增加合成所需氨基酸,例如,反馈调节不再以相同程度存在或完全不存在。另外还可以有利地将SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440序列(其生物活性降低)与普遍支持或增强靶生物生长或产量的基因组合,例如引起微生物较快的生长率的基因或产生胁迫、病原体或除草剂抗性植物的基因。
因此,在本发明的另一实施方案中培养了自发过表达编码下述蛋白质的至少一个核酸或一个基因的微生物,所述蛋白质选自以下基因产物:天冬氨酸激酶(lysC)、天冬氨酸半醛脱氢酶(asd)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、3-磷酸甘油醛脱氢酶(gap)、3-磷酸甘油酸酯激酶(pgk)、丙酮酸羧化酶(pyc)、磷酸丙糖异构酶(tpi)、同型丝氨酸O-乙酰转移酶(metA)、胱硫醚γ合酶(metB)、胱硫醚γ裂解酶(metC)、胱硫醚β裂解酶、甲硫氨酸合酶(metH)、丝氨酸羟甲基转移酶(glyA)、O-乙酰同型丝氨酸硫化氢解酶(metY)、甲叉四氢叶酸酯还原酶(metF)、磷酸丝氨酸氨基转移酶(serC)、磷酸丝氨酸磷酸化酶(serB)、磷酸丝氨酸磷酸化酶(cysE)、胱氨酸合酶(cysK)、同型丝氨酸脱氢酶(hom)和S-腺苷甲硫氨酸合酶(metX)。
可以与本方法所使用序列和/或前述生物合成基因组合表达的其他有利的核酸序列为WO 01/20009中所描述的ATP/ADP易位体序列。该ATP/ADP易位体引起提高合成必需氨基酸赖氨酸和/或甲硫氨酸。
在本发明方法的另一有利的实施方案中,本方法所使用的生物自发突变了至少一个前述基因或一个前述核酸,以使与未突变蛋白质相比,相应蛋白质的活性受代谢物影响的程度较小或完全不受影响(特别是没有减少根据本发明产生的精细化学品,例如氨基酸),或提高了其酶活性。除了减少、降低或缺失本发明核酸序列的活性以外,基因表达的这种活性提高引起精细化学品产生的提高。较低影响指与起始生物相比,酶活性的调控减少至少10%,有利地至少20、30或40%,特别有利地至少50、60或70%,从而与起始生物相比该酶的活性得到了如这些数字所述的提高。酶活性的提高指与起始生物相比,提高至少10%、有利地至少20、30或40%,特别有利地至少50、70或70%的酶活性。这引起提高的精细化学品产量。
在本发明方法的其他有利的实施方案中,所述方法所使用的生物是同时弱化了至少一个以下基因(特别是通过减少相应基因的表达率)的生物,所述基因为:同型丝氨酸激酶(thrB)、苏氨酸脱水酶(ilvA)、苏氨酸合酶(thrC)、内消旋二胺基庚二酸D-脱氢酶(ddh)、磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶(pck)、葡萄糖-6-磷酸6-异构酶(pgi)、丙酮酸氧化酶(poxB)、dihydrodipicolinate合酶(dapA)、丙酮酸氧化酶(dapB)和二氨基甲基吡啶脱羧酶(lysA)或苏氨酸降解蛋白的基因。
在本发明方法的另一个实施方案中,本发明方法所使用的生物以部分降低或完全阻断相应蛋白质酶活性的方式自发突变了至少一个前述核酸或前述基因。酶活性的减少指与起始生物相比降低至少10%、有利地至少20、30或40%、特别有利地至少50、60或70%、优选更多的酶活性。
如果旨在用若干构建体或载体转化宿主细胞(特别是植物细胞),则在后续转化中必须去除先前转化的标记或采用其他标记。可以通过技术人员熟悉的方法如下文所述从宿主细胞特别是植物细胞中去除标记。具体地,没有标记(特别是没有抗生素抗性)的植物是本发明特别优选的实施方案。
在本发明方法中,本发明方法所使用的核酸分子有利地与一个或多个调节信号连接以提高基因表达(例如如使用RNAi或反义)。这些调节序列旨在特异性表达基因或基因片段。取决于宿主生物(如植物或微生物),这可以指例如基因或基因片段只在诱导后表达和/或过表达,或为组成型表达和/或过表达。这些调节序列是、例如诱导物或阻抑物与其结合从而使其调节核酸表达的序列。除了这些新调节序列以外,或作为这些序列的替代,这些序列的天然调节仍可以存在于实际结构基因之前,并在适当时经遗传修饰,以关闭天然调节并提高基因表达。然而,适于作为表达盒(=表达构建体=基因构建体)的本发明核酸构建体还可以在结构上进行简化,也就是说在核酸序列或其衍生物之前不插入额外的调节信号,并且没有去除天然启动子及其调节。取而代之的以使调节不再发生和/或提高基因表达的方式突变了天然调节序列。还可以以局部序列(=带有部分本发明核酸序列的启动子)的形式将这些修饰的启动子单独引入到天然基因之前以提高活性。此外,基因构建体还可以有利地含有一个或多个与启动子有效连接的已知增强子序列,它们使核酸序列的表达提高。还可以在DNA序列的3’端插入额外的有利序列,例如其他调节元件或终止子。
编码本发明蛋白质的核酸分子和编码其他多肽的核酸分子可以存在于一个核酸构建体或载体中或者存在于若干个中。有利地,在核酸构建体或载体中只存在本发明核酸分子或其编码基因的一个拷贝。可以在宿主生物中共同表达若干个载体或核酸构建体或载体。本发明的核酸分子或核酸构建体或载体可以插入载体并以游离形式存在于细胞中。如果优选稳定转化,则使用在数个世代中稳定复制或插入基因组中的载体。对于植物而言,可能发生质体基因组整合或尤其可能是核基因组整合。对于在宿主生物中插入多于一个基因,待表达的基因共同存在于一个基因构建体中,例如前述承载多个基因的载体。
基因表达率的调节序列一般位于本发明核酸分子编码序列或其他编码基因片段的上游(5’)、其间和/或下游(3’)。它们具体控制转录和/或翻译和/或转录物的稳定性。表达水平取决于与其他细胞调节系统的衔接,如细胞的蛋白质生物合成和降解系统。
调节序列包括转录和翻译调节序列或信号,例如位于上游(5’)的序列(具体关系到调节转录或翻译起始,如启动子或起始密码子)和位于下游(3’)的序列(具体关系到调节转录或翻译终止和转录物的稳定性,如多腺苷酸化信号或终止密码子)。除了转录的非编码区(如内含子)以外,调节序列还可以存在于转录的编码区(例如剪接位点)中。
细胞中调节本发明核酸的表达并可以使用的启动子原则上是所有能够在目的生物(如微生物或植物)中刺激核酸分子或刺激额外基因转录的启动子,取决于使用所述启动子应达到的目的。在这些生物中具有功能的合适的启动子是众所周知的。它们可以是组成型或诱导型启动子的形式。合适的启动子促使多细胞真核生物中的发育和/或组织特异性表达,因此在植物中可以有利地使用叶、根、花、种子、气孔、块茎、或果实特异性的启动子。
在微生物中表达本发明核酸分子的有利的调节序列存在于例如有利地用于革兰式阴性细菌中的cos、tac、rha、trp、tet、trp-tet、lpp、lac、lpp-lac、lacIq-、T7、T5、T3、gal、trc、ara、SP6、λ-PR或λ-PL启动子中。其他有利的调节序列存在于例如革兰式阳性细菌启动子amy、dnaK、xylS和SPO2、酵母或真菌启动子ADC1、MFa、AC、P-60、CYC1、GAPDH、TEF、rp28、ADH中。特别有利的启动子是组成型、组织或区室特异性和诱导型启动子。“启动子”在本文中一般应理解为核酸分子中介导核酸分子的编码序列片段表达的调节序列。启动子一般位于编码序列片段上游。然而,一些调节序列(例如表达增强元件,如增强子)也可以位于下游或甚至是转录区中。
原则上讲,天然启动子可以与其调节序列(如上文提及的那些)一起用于新方法。还可以有利地额外或单独使用合成启动子,特别是当它们如WO 99/16890中所述介导种子特异性表达时。
表达本方法所使用的核酸分子可能需要单独或组合的其他基因或核酸。可以通过同时转化若干个独立的适当核酸构建体(即表达构建体)或优选地通过在一个构建体上组合若干表达盒来引入多个赋予有利基因抑制或表达的核酸分子(取决于应达到的目的)。还可以转化若干载体,每次逐步向受者生物中引入若干个表达盒。
如上文所述,应有利地通过所引入生物合成基因3’端(终止密码子之后)的合适的终止子来终止引入(除本发明基因外)基因的转录。可用于该目的的终止子为例如OCS1终止子、nos3终止子或35S终止子。同启动子的情况相同,每个基因应使用不同的终止子序列。可用于微生物中的终止子为例如fimA终止子、txn终止子或trp终止子。这些终止子可以是rho-依赖型或rho非依赖型。
可有利地在核酸构建体中使用不同的植物启动子例如USP、LegB4、DC3启动子或来自荷兰芹的泛素启动子或其他本文提到的启动子和不同的终止子。其他有用的植物启动子为例如玉米泛素启动子、ScBV(Sugarcaine bacilliform病毒)启动子、大麦Ipt2或Ipt1基因的启动子(WO95/15389和WO 95/23230)或如W099/16890中所述的启动子(大麦大麦醇溶蛋白基因、水稻谷蛋白基因、稻水稻素基因、稻谷醇溶蛋白基因、小麦醇溶蛋白基因、白谷蛋白基因、玉米醇溶蛋白基因、燕麦谷蛋白基因、高梁kasirin基因和裸麦醇溶蛋白基因的启动子)。
由于重复序列基序可能引起重组事件或沉默或(在植物中)T-DNA不稳定,因此为保证与其他生物合成基因组合的本发明方法所使用核酸分子稳定整合至转基因植物中多个世代,本方法中使用的每个编码区应在其自身(优选独有)的启动子的控制下表达。
以以下方式有利地构建核酸构建体:启动子之后为适当的切割位点(用于插入待表达的核酸),优选为多聚接头,适当时之后是位于多聚接头之后的终止子。适当时,这一顺序可以重复若干次从而在一个构建体中组合若干个基因并因此可以引入到转基因植物中以被表达。该顺序有利地重复多至三次。为进行表达,通过合适的切割位点(如启动子后的多聚接头)插入核酸序列。如上文所述,每个核酸序列具有其自身的启动子并在必要时具有其自身的终止子是有利的。然而,如果宿主或靶生物中可以进行多顺反子转录,还可以在一个启动子后(和适当时一个终止子前)插入若干核酸序列。在本文中,核酸构建体中的插入位点或所插入核酸分子的顺序不是决定性的,也就是说核酸分子可以对表达没有显著影响地插入盒中第一个或最后一个位点。然而,还可以在构建体中仅使用一个启动子类型。但是如所述,这可能引起不希望的重组事件或沉默效应。
因此,在优选的实施方案中,本发明的核酸构建体在植物中赋予本发明核酸分子(以及任选的其他基因)表达,并含有一个或多个植物调节元件。所述本发明核酸构建体有利地包含植物启动子或植物终止子或植物启动子和植物终止子。
“植物”启动子含有在植物细胞中介导编码序列片段表达的调节元件。因此,植物启动子不需要为植物来源的,而是可以来源于病毒或微生物,特别是例如来自攻击植物细胞的病毒。
植物启动子还可以来源于植物细胞,例如来自如本文所述转化了核酸构建体或载体的植物。这还可以应用于其他“植物”调节信号,例如“植物”终止子。
适合于植物表达的核酸构建体优选含有能够在植物细胞中控制基因表达的调节序列,这些调节序列有效连接以使每个序列可以实现其功能。因此,该核酸构建体还可以含有转录终止子。转录终止的实例为多腺苷酸化信号。优选的多腺苷酸化信号为源于根瘤农杆菌T-DNA的序列,例如已知为Ti-质粒pTiACH5的章鱼碱合酶的基因3(Gielen等,1984,EMBO J.3:835)或其功能等效物,但是所有其他在植物中有功能活性的终止子也是合适的。
适于植物表达的核酸构建体优选还含有其他有效连接的调节元件,如翻译增强子,例如含有提高蛋白质/RNA比率的烟草花叶病毒5’-非翻译前导序列的超驱动序列(Gallie等,1987,Nucl.Acids Research 15:8693-8711)。
为在植物中表达,核酸分子必须如上文所述与使基因在正确的时间点和细胞或组织特异性的方式的合适的启动子有效连接,或含有所述启动子。有用的启动子为组成型启动子(Benfey等,(1989)EMBO J.8:2195-2202),例如来源于植物病毒的启动子,如35S CAMV(Franck等,Cell 21(1980)285-294)、19SCaMV)参阅US 5352605和WO 84/02913)、34S FMV(Sanger等,Plant.Mol.Biol.,14,1990:433-443)、荷兰芹泛素启动子或植物启动子,如U.S.专利No.4,962,028中所述的核酮糖二磷酸羧化酶-加氯酶小亚基的启动子或植物启动子PRP1(Ward等,Plant.Mol.Biol.22(1993))、SSU、PGEL1、OCS(Leisner(1988)Proc Natl Acad Sci USA 85(5):2553-2557)、lib4、usp、mas(Comai(1990)Plant Mol Biol 15(3):373-381)、STLS1、ScBV(Schenk(1999)Plant Mol Biol 39(6):1221-1230)、B33、SAD1或SAD2(亚麻启动子,Jain等,Crop Science,39(6),1999:1696-1701)或nos(Shaw等(1984)Nucleic Acids Res.12(20):7831-7846)。本发明的蛋白质在植物中稳定的组成型表达可能是有利的。然而,如果由于代谢操作可能引起植物生长延迟,而使收获前的后期表达是有益的,则诱导型表达本发明蛋白质是有利的。
还可以如上文所述通过化学诱导型启动子促进植物基因的表达(参阅Gatz 1997,Annu.Rev.Plant Physiol.Plant Mol.Biol.,48:89-108的综述)。当需要以时间特异性的方式表达基因时,化学诱导型启动子尤其合适。这些启动子的实例为水杨酸诱导的启动子(WO 95/19443)和脱落酸诱导的启动子(EP 335 528)、四环素诱导的启动子(Gatz等(1992)Plant J.2,397-404)、环己醇或乙醇诱导的启动子(WO 93/21334)或本文所述的其他启动子。
其他合适的启动子为与生物或非生物胁迫条件反应的启动子,例如病原体诱导的PRP1基因启动子(Ward等,Plant.Mol.Biol.22(1993)361-366)、番茄热诱导的hsp80启动子(US 5,187,267)、马铃薯冷诱导的α淀粉酶启动子(WO 96/12814)或创伤诱导的pinII启动子(EP-A-0 375091)或本文所述的其他启动子。
优选的启动子具体为在生物合成精细化学品的组织和器官中、种子细胞(如胚乳细胞和发育的胚细胞)中使基因表达的启动子。合适的启动子为油菜的油菜籽蛋白启动子(US 5,608,152)、蚕豆的USP启动子(Baeumlein等,Mol Gen Genet,1991,225(3):459-67)、拟南芥的油质蛋白启动子(WO 98/45461)、菜豆的菜豆蛋白启动子(US 5,504,200)、芸苔的Bce4启动子(WO 91/13980)、大豆的arc5启动子、胡萝卜的DcG3启动子或豆球蛋白B4启动子(LeB4;Baeumlein等,1992,Plant Journal,2(2):233-9)和在单子叶植物(如玉米、大麦、小麦、黑麦、稻等)中引起种子特异性表达的启动子。有利的种子特异性启动子为蔗糖结合蛋白质启动子(WO 00/26388)、菜豆蛋白启动子和油菜籽蛋白启动子。必需考虑的启动子为大麦中Ipt2或Ipt1基因的启动子(WO95/15389和WO 95/23230)和如W099/16890中所述的启动子(大麦大麦醇溶蛋白基因、水稻谷蛋白基因、稻水稻素基因、稻谷醇溶蛋白基因、小麦醇溶蛋白基因、白谷蛋白基因、玉米醇溶蛋白基因、燕麦谷蛋白基因、高梁kasirin基因和裸麦醇溶蛋白基因的启动子)。其他合适的启动子为Amy32b、Amy6-6和Aleurain(US 5,677,474)、Bce4(oilseed rape)(US 5,530,149)、大豆球蛋白(大豆,EP 571 741)、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(大豆,JP 06/62870)、ADR12-2(大豆,WO 98/08962)、异柠檬酸酶(oilseed rape,US 5,689,040)或α-淀粉酶(大麦,EP 781 849)。其他可供在植物中表达基因使用的启动子为如DE-A19644478中所述的叶特异型启动子或如豌豆petE启动子的光调节启动子。
其他合适的植物启动子为细胞质FBPase启动子或马铃薯ST-LSI启动子(Stockhaus等,EMBO J.8,1989,2445-245)、大豆磷核糖基焦磷酸氨基转移酶启动子(gene bank登录号U87999)、或EP-A-249 676中所述的结节特异性启动子。
其他特别适合的启动子为引起质体特异性表达的启动子。合适的启动子如WO 95/16783和WO 97/06250中描述的病毒RNA聚合酶启动子和WO 99/46394中描述的拟南芥clpP启动子。
除了前述的若干病毒和细菌启动子以外,用于在尽可能多的组织中(特别是还在叶中)强表达异源序列的其他启动子优选为肌动蛋白或泛素基因植物启动子,如稻肌动蛋白1启动子。组成型植物启动子的其他实例为甜菜V-ATPase启动子(WO 01/14572)。合成组成型启动子的实例为超级启动子(WO 95/14098)和来自G-框的启动子(WO 94/12015)。适当时,还可以另外使用化学诱导型启动子,参考EP-A 388186、EP-A 335528、WO97/06268。
本发明的另一实施方案为适于在微生物或优选植物中表达的核酸构建体,其赋予dsRNA分子、反义核酸分子、核酶、病毒核酸分子或本发明方法中使用的核酸分子表达。
如上文所述,优选的使用植物具体为可以以适当的方式转化的植物。包括单子叶和双子叶植物。必须具体提到的植物为农业用途的植物(如谷类和草),例如小麦属物种(Triticum spp.)、玉蜀黍、大麦(Hordeumvulgare)、燕麦(oats)、黑麦(Secale cereale)、稻(Oryza sativa)、Pennisetumglaucum、两色蜀黍(Sorghum bicolor)、黑小麦(Triticale)、Agrostis spp.、Cenchrus ciliaris、Dactylis glomerata、Festuca arundinacea、黑麦草属(Lolium spp.)、苜蓿属(Medicago spp.)和甘蔗属(Saccharum spp.)、legumes和油料作物例如芥菜(Brassica juncea)、欧洲油菜(Brassicanapus)、大豆(Glycine max)、落花生(Arachis hypogaea)、美洲棉(Gossypium hirsutum)、Cicer arietinum、向日葵(Helianthus annuus)、Lens culinaris、亚麻籽(Linum usitatissimum)、Sinapis alba、Trifoliumrepens和Vicia narbonensis,蔬菜和水果例如香蕉(bananas)、葡萄(grapes)、番茄(Lycopersicon esculentum)、芦笋(asparagus)、卷心菜(cabbage)、西瓜(watermelons)、猕猴桃(kiwi fruit)、马铃薯(Solanumtuberosum)、甜菜(Beta vulgaris)、木薯(cassava)和菊苣(chicory),树例如咖啡(Coffea species)、柑桔(Citrus spp.)、桉树(Eucalyptus spp.)、云杉属(Picea spp.),松属(Pinus spp.)和杨属(Populus spp.),药用植物和树和花。
本发明的一个实施方案还涉及产生载体的方法,所述载体含有向载体中插入的本文所表征的核酸分子、本发明的核酸分子或本发明的表达盒。例如,可以如本文就构建体的描述或如下文经转化或转染或如实施例中所示将载体引入细胞(如微生物或植物细胞)中。可以瞬时或稳定转染宿主或靶细胞,然而优选稳定转染。
本发明的载体优选为适合在植物中减少、降低或缺失本发明多肽的载体。该方法还可以包括一个或多个将调节序列(特别是介导在生物如微生物或植物中减少、降低或缺失的信号)整合至载体中的步骤。
因此,本发明还涉及载体,所述载体含有本文所表征的核酸分子或本发明的核酸分子,其作为适合植物表达的核酸构建体的一部分。
本发明有利的载体含有编码本发明蛋白质的核酸分子、本发明方法所使用的核酸分子或如上所述适合在微生物或植物中表达的核酸构建体,所述构建体含有单独或与其他基因(如精细化学品生物合成或调节基因,如与上文所述的基因)组合的所使用核酸分子。根据本发明,术语“载体”是指能够转运其所连接的另一核酸的核酸分子。一种类型的载体是“质粒”,是指可以连接额外DNA片段的环状双链DNA环。另一种类型的载体是病毒载体,额外的DNA片段可以被连接进病毒基因组。某些载体能够在其引入的宿主细胞中自主复制(例如具有细菌复制起始点的细菌载体)。其他优选的载体在被引入宿主细胞后完全或部分整合在宿主细胞基因组中,并因此随着宿主基因组一起复制。此外,某些载体可以指导与其有效连接的基因的表达。在本文中,“表达载体”即指这些载体。如上文所述,它们能够自主复制或可以被部分或完全整合到宿主基因组中。通常适合于DNA重组技术中的表达载体常为质粒形式。由于质粒是最常用的载体形式,本说明书中“质粒”和“载体”可互换使用。然而,本发明意图包括发挥类似功能的其他形式的表达载体,例如病毒载体。该术语另外还包括技术人员已知的其他载体,如噬菌体、病毒(如SV40、CMV、TMV)、转座子、IS元件、噬粒、噬菌粒、粘粒和线性或环状DNA。
有利地用于本方法的重组表达载体以适合抑制本发明核酸分子和/或同时在宿主细胞中表达与本发明核酸分子一起的额外基因的形式含有本发明核酸分子或本发明的核酸构建体。因此,该重组表达载体含有一个或多个基于用于表达的宿主细胞而选择的并与待表达的核酸序列有效连接的调节信号。
在重组表达载体中,“有效连接”指目的核酸分子以可能表达该基因的方式与调节信号连接:它们以使两个序列实现指定的预计功能的方式彼此连接(例如在体外转录/翻译体系或当载体引入宿主细胞时在宿主细胞中)。
术语“调节序列”旨在包括启动子、增强子以及其他表达控制元件(例如多腺苷酸化信号)。这些调节序列在例如Goeddel,《Gene ExpressionTechnology:Methods in Enzymology185》,Academic Press,San Diego,CA(1990)及Gruber和Crosby,《Methods in Plant Molecular Biology andBiotechnology》,Glick和Thompson编,第7章,89-108,CRC Press:BocaRaton,Florida,包括其参考文献中有所描述。调节序列包括指导核苷酸序列在多种类型宿主细胞中组成型表达的序列,以及只在特定宿主细胞中和特定条件下指导核苷酸序列表达的序列。本领域技术人员会理解,表达载体的设计基于这些因素,如待转化宿主细胞的选择、需要的多肽表达水平等。上文中描述了优选的调节序列选择,例如启动子、终止子、增强子等。术语调节序列应考虑为包含在术语调节信号内。上文描述了若干有利的调节序列,特别是启动子和终止子。描述为有利于适合表达的核酸构建体的调节序列一般也适用于载体。
可以特别设计所使用的重组表达载体,以在原核和/或真核细胞中表达本方法所使用的核酸分子。由于载体构建的中间步骤经常出于简单性考虑在微生物中进行,因此这是有利的。例如,本发明基因和其他基因可使用WO 98/01572中所述转化方法和载体在细菌细胞、昆虫细胞(使用杆状病毒表达载体)、酵母和其他真菌细胞(见Romanos,1992,Yeast 8:423-488;van den Hondel,(1991),《More Gene Manipulations in Fungi》,J.W.Bennet&L.L.Lasure,编,396-428页Academic Press:San Diego;和vanden Hondel,C.A.M.J.J.(1991),《Applied Molecular Genetics of Fungi,Peberdy》,J.F.编1-28页Cambridge University Press:Cambridge),藻类(Falciatore等,1999,Marine Biotechnology 1(3):239-251)中表达,优选在多细胞植物细胞(参阅Schmidt,R.和Willmitzer,L.,(1988)Plant CellRep.583-586;《Plant Molecular Biology and Biotechnology》,C Press,BocaRaton,Florida,6/7章,71-119页(1993);F.F.White,《Transgenic Plants》,第1卷,“Engineering and Utilization”,Kung和R.Wu编,Academic Press(1993),128-43;Potrykus,Annu.Rev.Plant Physiol.Plant Molec.Biol.42(1991),205-225及其引用的参考文献)中表达。合适的宿主细胞在Goeddel,《Gene Expression Technology:Methods in Enzymology 185》,Academic Press:San Diego,CA(1990)中有进一步的讨论。另外,重组表达载体的序列可以体外转录和翻译,例如使用T7启动子调节序列和T7聚合酶。
大多数情况下,可以使用含有控制表达融合蛋白或非融合蛋白的组成型或诱导型启动子的载体在原核生物中表达蛋白质。典型的融合蛋白表达载体为pGEX(Pharmacia Biotech Inc;Smith,D.B.和Johnson,K.S.(1988)Gene 67:31-40)、pMAL(New England Biolabs,Beverly,MA)和含有与重组靶蛋白融合的谷胱甘肽S-转移酶(GST)、麦芽糖-E-结合蛋白质和A蛋白的pRIT5(Pharmacia,Piscataway,NJ)等。合适的诱导型非融合蛋白大肠杆菌表达载体的实例为pTrc(Amann等,(1988)Gene 69:301-315)和pET11d载体[Studier等,《Gene Expression Technology:Methods inEnzymology 185》,Academic Press,San Diego,California(1990)60-89]。pTrc载体的靶基因表达基于通过宿主RNA聚合酶转录杂合的trp-lac融合启动子。从pET 11d载体表达靶基因基于由共表达的病毒RNA聚合酶(T7gn1)介导的T7-gn10-lac融合启动子转录。该病毒聚合酶由宿主菌株BL21(DE3)或HMS174(DE3)在lacUV5启动子转录控制下从携带有T7 gn1基因的定居λ原噬菌体提供。
适合原核生物的其他载体为技术人员所公知,这些载体例如大肠杆菌中的pLG338、pACYC184、pBR系列(如pBR322)、pUC系列(如pUC18或pUC19)、M113mp系列、pKC30、pRep4、pHS1、pHS2、pPLc236、pMBL24、pLG200、pUR290、pIN-III113-B1、λgt11或pBdCl;链霉菌中的pIJ101、pIJ364、pIJ702或pIJ361;芽孢杆菌中的pUB110、pC194或pBD214;棒杆菌中的pSA77或pAJ667。
在另一实施方案中,表达载体为酵母表达载体。用于酿酒酵母的表达载体的实例包括pYeDesaturasec1(Baldari,等,(1987)Embo J.6:229-234)、pMFa(Kurjan和Herskowitz,(1982)Cell 30:933-943)、pJRY88(Schultz等,(1987)Gene 54:113-123)和pYES2(Invitrogen Corporation,San Diego,CA)。适用于其他真菌(如丝状真菌)的载体构建方法包括vanden Hondel,(C.A.M.J.J.&Punt,P.J.((1991),J.F.Peberdy编,1-28页,Cambridge University Press:Cambridge或《More Gene Manipulations inFungi》,J.W.Bennet和L.L.Lasure编,396-428页:Academic Press:SanDiego)详细描述的那些。其他适合的酵母载体的实例为2μM、pAG-1、Yep6、Yep13或pEMBLYe23。
可能作为实例提到的其他载体例如真菌中的pALS1、pIL2或pBB116或植物中的pLGV23、pGHlac+、pBIN19、pAK2004或pDH51。
另外,可以使用杆状病毒表达载体在昆虫细胞中表达核酸序列。可用于在培养的昆虫细胞中表达蛋白质的杆状病毒载体包括pAc系列(Smith等,(1983)Mol.Cell Biol.3:2156-2165)和pVL系列(Lucklow和Summers(1989)Virology 170:31-39)。
前述载体只是可能合适的载体的简单概括。其他质粒为本领域技术人员所熟知并在例如《Cloning Vectors》(Pouwels P.H.等编,Elsevier,Amsterdam-New York-Oxford,1985 ISBN 10444904018)中有所描述。适合原核和真核细胞的其他表达系统可参阅Sambrook,J.,Fritsch,E.F.和Maniatis,T.,《Molecular Cloning:A Laboratory Manual》,第二版,ColdSpring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor,NY,1989的第16和17章。
因此,本发明的一个实施方案涉及含有本发明核酸分子或本发明核酸构建体的载体。所述载体适用于在生物(优选植物)中减少、降低或缺失本发明多肽。有利地,本发明核酸分子与用于在原核或真核,或原核和真核宿主中表达的调节序列有效连接。此外,适用于同源重组的载体也包括在本发明范围内。
因此,本发明的一个实施方案涉及稳定或瞬时转化了本发明载体或本发明核酸分子或本发明核酸构建体的宿主细胞。所述宿主细胞可以是微生物、非人动物细胞或植物细胞。
取决于宿主生物,以技术人员熟悉的方式培养或生长本发明方法所使用的生物。一般在0℃和100℃(优选10℃和60℃)之间的温度下,在流动供氧时在含有碳源(常为糖的形式)、氮源(常为有机氮源的形式,如酵母提取物,或盐的形式,如硫酸铵)、微量元素(如铁盐、锰盐、镁盐)以及适当时的维生素的液体培养基中培养微生物。对于微生物是厌氧菌的情况,培养基不通氧。液体营养培养基的pH值可以保持恒定(也就是说在培养过程中调节)或反之。可以批式培养、半批式培养或连续培养生物。营养物可以在发酵的开始提供或半持续或持续补充。
可以通过技术人员熟悉的方法从生物中分离产生的氨基酸。例如通过萃取、盐沉淀和/或离子交换层析等。为此可以先破坏生物。本发明的方法可以批式、半批式或连续进行。已知的培养和分离技术可见于Chmiel[Bioprozeβtechnik 1,《Einführung in die Bioverfahrenstechnik》(GustavFischer Verlag,Stuttgart,1991)]、Demain等(Industrial Microbiology andBiotechnology,第二版,ASM Press,Washington,D.C.,1999,ISBN1-55581-128-0)的教科书或Storhas[《Bioreaktoren und periphereEinrichtungen》(Vieweg Verlag,Braunschweig/Wiesbaden,1994)]的教科书。
在一个实施方案中,本发明涉及由本发明核酸分子编码的多肽,所述多肽优选在提高其表达或活性后赋予生物或细胞精细化学品含量提高。
本发明还涉及产生本发明多肽的方法,所述多肽在本发明宿主细胞(优选微生物、非人动物细胞或转基因植物细胞)中表达。
在一个实施方案中,产生多肽的方法所使用的核酸分子来自微生物,优选来自原核或原生动物细胞,并以真核生物作为宿主细胞。例如,在一个实施方案中,用来自原核或真菌或藻类或另一微生物(但不是来自植物)的核酸分子在植物细胞或植物中产生该多肽。
技术人员了解,尽管具有同一编码序列,在不同生物中表达的蛋白质和DNA在许多方面和特性上存在差异,例如甲基化、降解或翻译后修饰,如糖基化、磷酸化、乙酰化、十四烷酰化、ADP核糖基化、法尼基化、羧化、硫酸化、泛素化等。优选地,相应蛋白质的细胞表达控制在控制内源蛋白质或另一真核蛋白质的活性和表达的控制机制上相应地存在差异。原核或真核生物表达蛋白质的一个主要差异是糖基化的数量。例如在大肠杆菌中没有糖基化蛋白质。酵母中表达的蛋白质在糖基化蛋白质中具有高甘露糖含量,而在植物中糖基化模式是复杂的。
优选通过重组DNA技术产生本发明的多肽。例如,将编码蛋白质的核酸分子克隆进载体(如上文所述),将载体引入宿主细胞中(如上文所述)并在宿主细胞中表达所述多肽。然后可以通过适当的纯化方案使用标准蛋白质纯化技术从细胞中分离所述多肽。除了重组表达以外,可以使用标准肽合成技术化学合成本发明的多肽或肽。此外,可以从细胞(例如内皮细胞)中分离具有本发明蛋白质生物活性的天然多肽,例如使用如下文所述的本发明抗体,特别是抗本发明蛋白质的抗体,所述抗体可以通过标准技术,利用本发明多肽或其片段(即本发明多肽)产生。
在一个实施方案中,本发明涉及具有本发明蛋白质所表现出的生物活性的多肽。在一个实施方案中,所述多肽具有与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列有一个或多个氨基酸差异的本发明蛋白质所表现出的生物活性。在另一实施方案中,所述本发明多肽不由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列组成。在另一实施方案中,所述本发明多肽与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441小于100%、99.999%、99.99%、99.9%或99%相同。
在一个实施方案中,本发明涉及具有本发明核酸分子编码的或可通过本发明方法获得的氨基酸序列的多肽。优选所述多肽赋予上述活性,具体的,多肽在降低细胞活性(例如通过降低多肽的表达或比活性)后赋予细胞或生物或其局部中精细化学品的提高。在一个实施方案中,所述多肽与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列有一个或多个氨基酸差异。优选本发明多肽的序列与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列有不多于80%或70%的氨基酸,优选不多于60%或50%,更优选不多于40%或30%,甚至更优选不多于20%或10%的差异。在一个实施方案中,多肽与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述序列多于5、6、7、8或9个氨基酸,优选多于10、15、20、25或30个氨基酸,甚至更优选多于40、50或60氨基酸的差异。在另一实施方案中,所述本发明多肽不由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEO ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、 SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述的序列组成。在另一实施方案中,所述本发明多肽少于100%、99,999%、99,99%、99,9%或99%相同。在一个实施方案中,本发明多肽来源于非植物细胞(特别是微生物)并在植物细胞中表达。
本申请中使用的术语“蛋白质”和“多肽”可互换。“多肽”涉及氨基酸聚合物(氨基酸序列),并不涉及分子的特定长度。因此肽和寡肽包含于多肽的定义中。该术语还涉及或包括多肽的翻译后修饰,例如糖基化、乙酰化、磷酸化等。定义所包括例如天然存在或非天然存在的含有一个或多个氨基酸类似物(包括例如非天然氨基酸等)的多肽、具有替换键(Substituted linkage)以及本领域已知的其他修饰(包括天然或非天然发生的修饰)的多肽。
多肽优选为分离的。“分离的”或“纯化的”多肽或核酸分子或其生物活性部分基本不合有通过重组DNA技术产生时的细胞物质或化学合成时的化学前体或其他化学物质。
“基本不含有细胞物质”的术语包括本发明多肽的制剂,其中多肽从天然或重组产生它的细胞的细胞组分中分离。在一个实施方案中,“基本不含有细胞物质”一语包括含有低于约30%(干重)“污染蛋白质”的制剂,更优选低于约20%的“污染蛋白质”、还更优选低于约10%的“污染蛋白质”、并最优选低于约5%的“污染蛋白质”。术语“污染蛋白质“涉及不是本发明多肽的多肽。重组产生本发明多肽或其生物活性部分时,还优选基本不含有培养基,即培养基小于蛋白质制剂总体积的20%、更优选小于10%、并最优选小于5%。“基本不含有化学前体或其他化学物质”的术语包括制剂,其中本发明多肽从蛋白质合成中相关的化学前体或其他化学物质中分离。术语“基本不含有化学前体或其他化学物质”包括含有低于30%(干重)的化学前体或与本发明蛋白质不同的其他蛋白质或化学品,优选低于20%的化学前体或其他蛋白质或化学品、还更优选低于10%的化学前体或其他蛋白质或化学品、并最优选低于5%的化学前体或与本发明蛋白质不同的其他蛋白质或化学品。在优选的实施方案中,分离的蛋白质或其生物活性部分没有来源于产生本发明多肽的同一生物的污染蛋白质。一般通过重组技术产生这些蛋白质。
本发明多肽能够参与本发明的方法。多肽或其部分优选含有与SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述氨基酸序列充分同源的氨基酸序列,从而该蛋白质或其部分保持了赋予本发明活性的能力,即通过降低其生物活性提高生物中的精细化学品含量。蛋白质部分优选为本文所述的生物活性部分。优选地,本发明方法所使用多肽具有与SEQ ID NO:2、SEQID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示相同的氨基酸序列。
另外,该多肽可以具有由以下性质核苷酸序列编码的氨基酸序列,该核苷酸序列与本发明的核酸分子的核苷酸序列杂交(优选在如本文所述的严格条件下杂交)。因此,该多肽具有由核苷酸序列编码的氨基酸序列,所述氨基酸序列与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEO ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述氨基酸序列之一同源性至少为约35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%或70%,优选至少约75%、80%、85%或90%,并更优选至少约91%、92%、93%、94%或95%,甚至更优选至少约96%、97%、98%、99%或更高。本发明优选的多肽优选具有至少一种本发明的活性和本文所述的活性。本发明优选的多肽包含如前述(优选在严格条件下)与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440的核苷酸序列杂交的核苷酸序列或其同源物所编码的氨基酸序列。
因此如本文详细描述的,本发明的多肽由于天然变异或诱变可在氨基酸序列上与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ IDNO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ IDNO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ IDNO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ IDNO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ IDNO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ IDNO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ IDNO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ IDNO:435或SEQ ID NO:441不同。因此,该多肽含有与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441的完整氨基酸序列同源性至少为约35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%或70%,优选至少约75%、80%、85%或90%,并更优选至少约91%、92%、93%、94%或95%,甚至更优选至少约96%、97%、98%、99%或更高的氨基酸序列。
为比较氨基酸序列,可以使用如上文所述的同一算法或核酸序列。使用Needleman及Wunsch或Smith及Waterman算法得到高质量结果。因此优选基于所述算法的程序。可以使用程序PleUp(J.Mol.Evolutuon.,25,351-360,1987,Higgins等,CABIOS,5 1989:151-153)或优选的程序Gap和BestFit有利地比较序列,它们分别基于Needleman及Wunsh的算法(J.Mol.Biol.48;443-453(1970))和Smith及Waterman(Adv.Appl.Math.2;482-489(1981))的算法。两个程序都是GCG软件包(Genetics ComputerGroup,575 Science Drive,Madison,Wisconsin,USA 53711(1991);Altschul等(1997)Nucleic Acids Res.25:3389参照以下)的一部分。因此优选在完整序列范围上使用Gap程序完成测定序列同源性百分比的计算。核酸序列的比较使用了以下标准调整:缺口权重:8、长度权重:8、平均匹配:2.912、平均错配:-2.003。
本发明多肽的生物活性部分包括含有以下氨基酸序列的肽,所述氨基酸序列来自本发明多肽的氨基酸序列,例如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ IDNO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ IDNO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ IDNO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ IDNO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ IDNO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ IDNO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ IDNO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ IDNO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ IDNO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ IDNO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ IDNO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ IDNO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示的氨基酸序列或其同源蛋白质的氨基酸序列,所述肽包括的氨基酸少于全长的具有本发明蛋白质或本发明多肽生物活性的蛋白质或本文所述的与具有本发明蛋白质或本发明多肽生物活性的蛋白质同源的全长蛋白质,并表现至少一种引起精细化学品提高的本发明多肽的活性。一般的,生物(或免疫)活性部分(即多肽)例如长度为5、10、15、20、30、35、36、37、38、39、40、50、100或更多氨基酸的多肽含有具有至少一种本发明多肽的活性或表位的结构域或基序。此外,可以通过重组技术制备其中缺失了多肽其他区域的其他生物活性部分,并评估一种或多种本文所述的活性。
引起本发明多肽降低本文所述生物活性的任何诱变策略都是指非限制性的,这些策略的变化是本领域技术人员显而易见的。使用这些策略并结合本文公开的机制,可以利用本发明的核酸分子和多肽产生表达突变本发明核酸分子和/或多肽分子的植物或其部分,以提高所需化合物(例如精细化学品)的得率、产量和/或产生效率。该所需化合物可以是植物的任何天然产物,包括生物合成途径的终产物和天然存在的代谢途径的中间产物以及不存在于所述细胞的代谢中,但由本发明所述细胞产生的分子。
本发明还提供嵌合或融合蛋白。
本文中使用“嵌合蛋白”或“融合蛋白”包含与不给予上述活性(特别是当其表达或活性降低时)不给予细胞或生物或其部分精细化学品含量提高的多肽有效连接的多肽,例如不赋予本发明蛋白质的生物活性。
在一个实施方案中,蛋白质(=多肽)具有通过降低其生物活性提高生物中精细化学品含量的活性。所述蛋白质是指具有与本发明多肽或本发明方法使用的多肽相对应的氨基酸序列的多肽,优选具有与如SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述多肽相对应的氨基酸序列,其中“非本发明蛋白质”是指含有与本发明多肽基本上不同源的蛋白质相对应氨基酸序列的多肽,优选与具有本发明蛋白质生物学活性的多肽基本上不同源的多肽,例如不给予文中所述活性并来自于相同或不同生物的蛋白质。
在融合蛋白中,术语“有效连接”旨在指本发明的多肽和“其他多肽”或其部分彼此相互融合,使得两个序列都发挥对所使用序列期望的预期功能。可将“其他多肽”融合在本发明的多肽的N端或C端。例如,在一个实施方案中,融合蛋白为GST-LMRP融合蛋白,其中本发明的多肽的序列与GST序列的C端融合。这样的融合蛋白可简化本发明重组的多肽的纯化。
在另一实施方案中,融合蛋白为N端含有异源信号序列的本发明多肽。在某些宿主细胞(例如哺乳动物宿主细胞)中,可通过使用异源信号序列来提高本发明的其生物活性降低的蛋白质的表达和/或分泌。这类序列为例如定向序列。如上文已述,靶向序列对基因产物靶向特异细胞区室是必须的(可参阅Kermode,Crit.Rev.Plant Sci.15,4(1996)285-423的综述及其引用的参考文献),所述区室例如液泡、细胞核、所有类型的质体(如造粉体、叶绿体、色质体)、胞外空间、线粒体、内质网、油粒、过氧化物酶体、酵解酶体和植物细胞中的其他区室或胞外。本文必须提到的序列特别为本身已知的信号肽或转运肽编码序列。例如质体转运肽编码序列使表达产物靶向植物细胞的质体中。还已知真核生物的靶向序列和较少量的原核生物的靶向序列可有利地与本发明核酸分子有效连接以得到在所述区室之一或胞外表达。
优选通过标准重组DNA技术产生本发明的嵌合或融合蛋白。例如,编码差异多肽序列的DNA片段根据常规技术框内连接在一起,例如通过使用平末端或粘末端用于连接、限制性内切酶消化以产生合适的末端、适当补平粘性末端、碱性磷酸酶处理以防止非预期的连接和酶连接。可通过常规技术包括自动化DNA合成仪合成融合基因。此外,可使用锚定引物进行基因片段的PCR扩增,这产生两个相连基因片段之间可连续退火并再扩增以产生嵌合基因序列的互补突出端(见例如《Current Protocols inMolecular Biology》,Ausubel等编,John Wiley & Sons:1992)。此外,市售许多已经编码融合部分(例如GST多肽)的表达载体。可将本发明核酸分子克隆进这样的表达载体从而将融合部分与编码的蛋白质框内连接。
此外,可使用合适的计算机程序执行本发明蛋白质的折叠模拟和结构基序的计算机重新设计(Olszewski,Proteins 25(1996),286-299;Hoffman,Comput.Appl.Biosci.11(1995),675-679)。可使用蛋白质折叠的计算机模拟进行详细的肽和蛋白质模型的构象和能量分析(Monge,J.Mol.Biol.247(1995),995-1012;Renouf,Adv.Exp.Med.Biol.376(1995),37-45)。可使用合适的程序通过计算机协助搜寻互补肽序列来鉴定本发明多肽或本发明方法中使用的多肽与其底物或结合因子或其他相互作用蛋白质之间的相互作用位点(Fassina,Immunomethods(1994),114-120)。其他用于涉及蛋白质和肽的合适计算机系统描述于现有技术,例如在Berry,Biochem.Soc.Trans.22(1994),1033-1036;Wodak,Ann.N.Y.Acad.Sci.501(1987),1-13;Pabo,Biochemistry 25(1986),5987-5991中。上述计算机分析获得的结果可用于例如制备本发明蛋白质或其片段的肽模拟物(peptidomimetics)。该蛋白质天然氨基酸序列的拟肽类似物可以非常有效地模拟亲本蛋白质(Benkirane,J.Biol.Chem.271(1996),33218-33224)。例如,将容易获得的非手性Q氨基酸残基整合进本发明蛋白质或其片段中导致酰胺键被脂肪族链的聚亚甲基单元取代,从而提供构建肽模拟物的方便策略(Banerjee,Biopolymers 39(1996),769-777)。
其他系统中的小肽激素强效模拟肽类似物描述于现有技术(Zhang,Biochem.Biophys.Res.Commun.224(1996),327-331)。也可通过经由连续的酰胺羟基化合成肽模拟物组合文库并检测产生的化合物(例如它们的结合和免疫性质)来鉴定本发明蛋白质合适的肽模拟物。制备肽模拟物组合文库的方法及其用途描述于现有领域,例如在Ostresh,Methods inEnzymology 267(1996),220-234和Dorner,Bioorg.Med.Chem.4(1996),709-715中有所描述。
此外,可使用本发明蛋白质的三维和/或晶体结构以设计本发明蛋白质生物活性的肽模拟物抑制子(Rose,Biochemistry 35(1996),12933-12944;Rutenber,Bioorg.Med.Chem.4(1996),1545-1558)。
此外,可使用本发明蛋白质的三维和/或晶体结构和本发明多肽与其底物或结合因子相互作用位点的鉴定来设计结合或转换活性被调节的突变体。例如,可调节本发明多肽的活性中心和调节参与催化反应中的氨基酸残基以提高或降低底物结合以灭活多肽。活性中心和催化反应相关氨基酸的鉴定促进筛选具有提高活性的突变体。
SEQ ID NO:2所述的序列在登录号At2g25320下描述为假设蛋白质,其与泛素特异蛋白酶12有弱同源性。然而,尚未实验证明以登录号At2g25320公开的蛋白质的活性。SEQ ID NO:8所述蛋白质以登录号At3g07610保藏在Genebank中。该蛋白质包含与转录因子jumonji结构域类似的蛋白质结构域。SEQ ID NO:20所述并以登录号At3g15600保藏在Genebank中的蛋白质与En/Spm样转座蛋白类似。该蛋白质的功能和活性未知。SEQ ID NO:65所述并以登录号At1g14490保藏在Genebank中的蛋白质可能为DNA结合蛋白质。登录号At1g30570(SEQ ID NO:152)为假定的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。SEQ ID NO:229所述并以登录号At2g21290保藏在Genebank中的蛋白质具有未知功能。此外,SEQ ID NO:283所述并以登录号At3g14230保藏在Genebank中的蛋白质为转录因子EREBP样蛋白质。
本发明的一个实施方案还涉及特异结合本发明多肽或部分(即该蛋白质特异片段或表位)的抗体。
可使用本发明的抗体在任意生物(优选植物)中鉴定并分离在文中所述植物中制备的本发明的多肽和编码基因。这类抗体还可在适当的宿主生物中表达从而通过与本发明基因的蛋白质产物结合引起例如对它们生物活性的立体影响而减少本发明基因的生物活性。这些抗体可是单克隆抗体、多克隆抗体或合成抗体以及抗体片段,如Fab、Fv或scFv片段等。单克隆抗体可通过最初描述于K_hler和Milstein,Nature 256(1975),495,以及Galfr6,Meth.Enzymol.73(1981),3,的技术制备,其包括小鼠骨髓瘤细胞与源自免疫的哺乳动物的脾细胞的融合。
此外,前述肽的抗体或其片段可通过使用例如Harlow和Lane“Antibodies,A Laboratory Manual”,CSH Press,Cold Spring Harbor,1988中所述的方法获得。可使用该抗体进行本发明蛋白质的免疫沉淀和免疫定位和监测该蛋白质(例如在重组生物中)的合成,以及鉴定与本发明蛋白质相互作用的化合物。例如可使用BlAcore系统中使用的表面等离振子共振提高噬菌体抗体选择效率,产生亲和力剧增的结合本发明蛋白质表位的噬菌体抗体单一文库(Schier,Human Antibodies Hybridomas 7(1996),97-105;Malmborg,J.Immunol.Methods 183(1995),7-13)。在许多情况下,抗体与抗原的结合现象与其他的配体/抗配体结合是相等的。
本发明的另一实施方案还涉及产生转基因宿主或宿主细胞(例如真核或原核宿主或宿主细胞,优选转基因微生物、转基因植物细胞或转基因植物组织或转基因植物)的方法,其包括向植物、植物细胞或植物组织中导入本发明核酸构建体、本发明载体或本发明核酸分子。
本发明的另一实施方案还涉及瞬时产生宿主或宿主细胞(例如真核或原核细胞,优选转基因微生物、转基因植物细胞或转基因植物组织或转基因植物)的方法,其包括向植物、植物细胞或植物组织中导入本发明核酸构建体、本发明载体或文中描述包含在核酸构建体中的核酸分子或本发明核酸分子,其中导入的核酸分子、核酸构建体和/或载体不整合进宿主或宿主细胞的基因组中。因此在宿主繁殖中,就导入的核酸分子、核酸构建体和/或载体而言转化体是不稳定的。
在本发明方法中,如果转基因生物为植物形式,则还可理解为生长来产生氨基酸的植物细胞、植物组织、植物器官例如根、新枝、茎、花、块根或叶,或整株植物。
生长应理解为例如在营养培养基上培养转基因植物细胞、植物组织或植物器官,或在基质上(例如溶液培养物、盆栽培养物)或土地上培养整株植物。
在本方法的另一有利实施方案中,可在单细胞的植物细胞(例如藻类)——见Falciatore等,1999,Marine Biotechnology 1(3):239-251及其中引文——或高等植物的植物细胞(例如种子植物例如作物)中表达核酸分子。植物表达载体的实例包括文中详述的或Becker,D.[(1992)Plant Mol.Biol.20:1195-1197]和Bevan,M.W.[(1984),Nucl.Acids Res.12:8711-8721;Vectors for Gene Transfer in Higher Plants;in:Transgenic Plants,卷1,Engineering and Utilization,Kung和R.Wu编,Academic Press,1993,pp.15-38]中的那些。二元载体及其用途的综述见Hellens,R.[(2000),Trends in Plant Science,卷5 No.10,446-451。
可通过常规转化或转染技术将载体DNA引入原核或真核细胞。术语“转化”和“转染”包括结合和转导,并如本发明文中所用旨在包含多种用于向宿主细胞中引入外源核酸分子(例如DNA)的现有方法,包括磷酸钙共沉淀或氯化钙共沉淀、DEAE-葡聚糖介导的转染、PEG介导的转染、脂质转染法、天然感受态、化学方法介导的转移、电穿孔法或粒子轰击。用于转化宿主细胞包括植物细胞的适当方法可见于Sambrook等(《Molecular Cloning:A Laboratory Manual.》,第2版,Cold SpringHarbor Laboratory,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold SpringHarbor,NY,1989)以及其他实验室手册如《Methods in Molecular Biology》,1995,卷44,Agrobacterium protocols,Gartland和Davey编,HumanaPress,Totowa,New Jersey。
使用所述用于转化及从植物组织或植物细胞再生植株的方法瞬时或稳定转化植物。合适的方法为通过聚乙二醇诱导的DNA摄取的原生质体转化、使用生物射弹的“生物射弹”方法——也称为微粒轰击的方法、电穿孔、在DNA溶液中孵育干胚、微注射和农杆菌介导的基因转移。上述方法描述于例如B.Jenes等,《Transgenic Plants》,第一卷,Engineering andUtilization,S.D.Kung和R.Wu编,Academic Press(1993)128-143的Techniques for Gene Transfer和Potrykus Annu.Rev.Plant Physio.PlantMolec.Biol.42(1991)205-225。用于表达的核酸或构建体优选克隆进适合转化根瘤农杆菌的载体中,例如pBinl9(Bevan等,Nucl.Acids Res.12(1984)8711)。随后转化了这一载体的农杆菌可用于按已知方式转化植物特别是作物植物,如烟草植物,例如将捣碎的叶片或切碎的叶片浸泡在农杆菌溶液中,随后在合适的培养基中培养。依靠根瘤农杆菌的植物转化由例如Hofgen和Willmitzer在Nucl.Acid Res.(1988)16,9877中描述,或此外公知于F.F.White,《Transgenic Plants》,第1卷,Engineering andUtilization,S.D.Kung和R.Wu编,Academic Press,1993,15-38页的“Vectors for Gene Transfer in Higher Plants”。
为选择根据本发明成功转移至宿主细胞的本发明核酸分子、载体或核酸构建体,使用上文已详细描述的标记基因是有利的。已知在核酸分子稳定或瞬时整合进植物细胞时,只有少数细胞摄取外源DNA并需要时整合进其基因组(如果需要的话),这取决于使用的表达载体和使用的转染技术。为鉴定和选择这些整合体,通常将编码可选择标记(如上文所述,例如抗生素抗性)的基因与目的基因一起引入宿主细胞。植物中优选的选择标记包括赋予对除草剂如草甘磷或草丁膦的抗性的标记。其他合适的标记为例如编码糖或氨基酸(如β-半乳糖苷酶、ura3或ilv2)生物合成途径相关基因的标记。编码如荧光素酶、gfp或其他荧光基因的标记同样是合适的。这些标记和上文提到的标记可以用于突变体,在所述突变体中这些基因由于例如通过常规方法被缺失而没有功能。另外,编码可选择标记的核酸分子可以与编码本发明多肽或本方法所使用多肽的核酸分子在同一载体中引入宿主生物或者在单独的载体中引入。可以例如通过选择鉴定稳定转染了所引入核酸的细胞(例如整合了可选择标记的细胞存活而其他细胞死亡)。
由于一旦核酸成功引入转基因宿主细胞就不再需要或不希望有标记基因(通常特别是对抗生素和除草剂抗性的基因),本发明引入核酸的方法有利地使用能够去除或切除这些标记基因的技术。一个这样的方法已知为共转化。共转化方法同时使用两个载体进行转化,一个承载本发明的核酸,第二个承载标记基因。大部分的转化体接受和在植物情况下含有(最高达40%转化体和更高)全部两个载体。随后可以通过杂交从转化植物中去除标记基因。在另一方法中,标记基因整合进转座子中,并与所需核酸用于转化(已知的Ac/Ds)技术。在某些情况下(约10%),转座子在成功发生转化后跳出宿主细胞基因组并丢失。在另外一些情况下,转座子跳跃到不同的位置。在这些情况下,必须通过杂交消除标记基因。在微生物学中发展了使检测这些事件成为可能或更容易的方法。另一有利的方法依赖于已知的重组系统,其优越性为可以省却杂交消除。该类型已知最好的系统为已知的Cre/lox系统。Cre1是去除位于loxP序列之间序列的重组酶。如果标记基因整合到loxP序列之间,它在成功转化后通过表达重组酶被去除。其他重组系统为HIN/HX、FLP/FRT和REP/STB系统(Tribble瞪,J.Biol.Chem.,275,2000:22255-22267;Velmurugan瞪,J.Cell Biol.,149,2000:553-566)。可以将本发明的核酸序列位点特异性整合进植物基因组中。这些方法自然也可以用于微生物如酵母、真菌和细菌。
转化了本发明表达载体的农杆菌同样可以已知方式(例如捣磨碎的叶片或切碎的叶片浸泡在农杆菌溶液中,随后在合适的培养基中培养)用于植物转化,如试验植物,如拟南芥或作物植物,如谷类、玉米、燕麦、黑麦、大麦、小麦、大豆、稻、棉花、甜菜、芸苔、向日葵、亚麻、大麻、马铃薯、烟草、番茄、turnip rape、辣椒、油菜、树薯、木薯、葛、万寿菊、苜蓿、莴苣以及各种树木、坚果和藤本物种,特别是含油作物植物,如大豆、花生、蓖麻油植物、向日葵、玉米、棉花、亚麻、油菜、椰子、棕榈、红花或可可豆。
除了转化(必须再生为完整植物的)体细胞以外,还可以转化植物分生组织细胞(特别是发育为配子)的细胞。在该情况下,转化的配子遵循天然植物发育产生转基因植物。因此,例如用农杆菌处理拟南芥的种子,并从某些部分转化,并从而为转基因的发育的植物获得种子(Feldman,KA和Marks MD(1987).Mol Gen Genet 208:274-289;Feldmann K(1992).CKoncz,N-H Chua和J Shell编,《Methods in Arabidopsis Research》中WordScientific,Singapore,274-289页)。替代方法基于重复去除花序和用转化的农杆菌在盒中孵育切除位点(Chang(1994).Plant J.5:551-558;Katavic(1994).Mol Gen Genet,245:363-370)。然而,特别有效的方法为真空渗透方法及其改进的方法,如“花浸入”方法。在真空渗透拟南芥的情况下,用农杆菌悬浊液处理低压下的完整植物(Bechthold,N(1993).C R AcadSci Paris Life Sci,316:1194-1199),而在“花浸入”方法的情况中,发育的花组织与表面活性剂处理的农杆菌悬浊液一起短时孵育(Clough,SJ undBent,AF(1998).The Plant J.16,735-743)。某些部分的转基因种子在两种情况中都可以收获,通过在前述选择条件下培育,将这些种子从非转基因种子中区分。
经遗传修饰的植物细胞可以通过本领域技术人员已知的所有方法再生。适当的方法可见于前述S.D.Kung和R.Wu,Potrykus或Hofgen和Willmitzer的文献。
因此,本发明还涉及含有本发明核酸构建体、本发明核酸分子或本发明载体的植物细胞。
因此,本发明涉及任何作为本发明部分而被表征的核酸所转基因的细胞,所述核酸例如赋予细胞或生物或其部分中精细化学品增加的核酸,例如本发明的核酸分子、本发明的核酸构建体、本发明的反义分子、本发明的载体或编码本发明多肽例如编码具有本发明蛋白质生物活性多肽的核酸分子。由于上述活性,细胞或生物中的精细化学品含量提高。例如,由于调控或操纵,细胞活性提高,例如由于细胞或生物或其部分中本发明研究对象的表达降低或比活性降低。
当通过非天然的合成的“人工”方法(如诱变)进行修饰后,天然存在的表达盒——例如天然存在的本发明蛋白质启动子与相应编码本发明蛋白质的基因的组合——成为转基因表达盒。这些方法已被描述(US 5,565,350;WO 00/15815;也见上文)。
另外,还可以转化植物细胞、植物组织或植物从而(过)表达其他酶和蛋白质,所述酶和蛋白质的表达支持增加精细化学品。
本发明中使用的术语“转基因植物”涉及转基因植物的后代,例如T1、T2、T3和后续植物世代或BC1、BC2、BC3和后续植物世代。因此,本发明的转基因植物可栽培并自交或与其他个体杂交以获得更多的本发明转基因植物。转基因植物还可通过繁殖转基因植物细胞来获得。本发明还涉及可来自本发明转基因植物种群的转基因植物材料。该材料包括植物细胞和它们所有表型中的某些组织、器官和植物部分,例如种子、叶、花药、纤维、块茎、根、根毛、茎、胚、愈伤组织、子叶、叶柄、收获的材料、植物组织、繁殖组织和来自真实的转基因植物并/或可用于产生转基因植物的细胞培养物。
任何根据本发明获得的转化植物可用于传统的育种方案中或体外植物繁殖中以产生更多的具有相同特性的转化植物和/或可用于向相同或相关物种的变种中引入相同特性。这样的植物也是本发明的部分。从转化植物获得的种子遗传上也包含相同的特性并属于本发明。如前所述,本发明原则上适用于任何植物和作物,所述植物和作物可以本领域技术人员已知的任何转化方法转化。
在特别优选的实施方案中,本发明的生物、宿主细胞、植物细胞、植物、微生物或植物组织为转基因的。
因此,本发明另一方面涉及转化了至少一种本发明的核酸分子、核酸构建体或载体的转基因生物及细胞、细胞培养物、组织、部分(例如植物生物、植物组织的叶、根等)或来自这些生物或完整植物的繁殖材料。术语“重组(宿主)”和“转基因(宿主)”在上下文中可互换使用。当然这些术语不仅涉及所述的宿主生物或靶细胞,而且涉及这些生物或细胞的后代或潜在后代。由于突变或环境影响在连续世代中可能形成某些修饰,这些后代不一定与亲本细胞完全相同,但仍包含在本文使用的术语中。
用于本发明方法或作为宿主的适当生物为所有能够合成精细化学品的真核或原核生物。作为宿主使用的生物为微生物(例如细菌、真菌、酵母或藻类)、非人类动物或植物(例如双子叶或单子叶植物)。
原则上,所有的植物可用作宿主生物,特别是上述作为来源生物体的植物。优选的转基因植物为例如选自槭树科(Aceraceae)、漆树科(Anacardiaceae)、Apiaceae、菊科(Asteraceae)、芸苔科(Brassicaceae)、仙人掌科(Cactaceae)、葫芦科(Cucurbitaceae)、大戟科(Euphorbiaceae)、豆科(Fabaceae)、锦葵科(Malvaceae)、睡莲科(Nymphaeaceae)、罂粟科(Papaveraceae)、蔷薇科(Rosaceae)、杨柳科(Salicaceae)、茄科(Solanaceae)、Arecaceae、凤梨科(Bromeliaceae)、萍草科(Cyperaceae)、鸢尾科(Iridaceae)、百合科(Liliaceae)、兰科(Orchidaceae)、龙胆科(Gentianaceae)、Labiaceae、木兰科(Magnoliaceae)、毛茛科(Ranunculaceae)、Carifolaceae、茜草科(Rubiaceae)、玄参科(Scrophulariaceae)、石竹科(Caryophyllaceae)、杜鹃花科(Ericaceae)、蓼科(Polygonaceae)、堇菜科(Violaceae)、灯心草科(Juncaceae)或Poaceae科的且优选来自于选自Apiaceae、菊科(Asteraceae)、芸苔科(Brassicaceae)、葫芦科(Cucurbitaceae)、豆科(Fabaceae)、罂粟科(Papaveraceae)、蔷薇科(Rosaceae)、茄科(Solanaceae)、百合科(Liliaceae)或Poaceae科的植物。作物植物优选有利的选自花生(peanut)、oilseed rape、芸苔(canola)、向日葵(sunflower)、红花(safflower)、橄榄(olive)、芝麻(sesame)、榛子(hazelnut)、almond、酪梨(avocado)、bay、pumpkin/squash、亚麻子(linseed)、大豆(soya)、pistachio、琉璃苣(borage)、玉米(maize)、小麦、黑麦、燕麦、高梁(sorghum)和黍(millet)、黑小麦、稻、大麦、木薯、马铃薯、甜菜、茄子、苜蓿和多年生草本及饲料植物、油椰、蔬菜(芸苔、root vegetables、tuber vegetables、pod vegetables、fruiting vegetables、onion vegetables、leafy vegetables和stem vegetables)、荞麦(buckwheat)、Jerusalem artichoke、蚕豆(broadbean)、vetches、扁豆(lentil)、dwarf bean、羽扇豆(lupin)、三叶草(clover)和苜蓿属的植物,提到的只是其中一部分。
优选的植物细胞、植物器官、植物组织或植物部分来源于下面来源生物所提到的植物科,优选来自上述植物属,更优选来自上述植物种。
本发明方法中含有合成的精细化学品的转基因植物可直接推向市场,而不需要分离合成的化合物。在本发明方法中,植物应理解为所有植物部分、植物器官,例如叶、茎、根、块根或种子或繁殖材料或收获材料或完整植株。在本文中,种子包括种子的所有部分,例如种皮、表皮细胞、种子细胞、胚乳或胚胎组织。然而,本发明方法中产生的精细化学品还可从植物中以游离化合物或与植物其他组分结合的形式分离。通过该方法产生的精细化学品可通过从生物生长的培养物中或田间收集生物而收集。这可通过植物部分(优选植物种子、植物果实、植物块根等)的表达、研磨和/或抽提、盐沉淀和/或离子交换层析来实现。
在另一实施方案中,本发明涉及产生微生物的方法,包括将本发明核酸构建体或本发明载体或本发明核酸分子导入微生物或其部分。
在另一实施方案中,本发明还涉及包含本发明核酸分子、本发明核酸构建体或本发明载体的转基因微生物。适合的微生物本文之前在来源生物中已有所描述,优选的特别为上述适于产生精细化学品的菌株。
因此,本发明还涉及分离本发明方法产生的精细化学品的方法。
借此,可以分离以重量计高于50%,有利的高于60%,优选高于70%,特别优选高于80%,极其优选高于90%的产生的精细化学品。如果合适,随后可将产生的精细化学品进一步纯化,如果需要,与其他活性成分(如维生素、氨基酸、碳水化合物、抗生素等)混合,且如果合适可进行配制。
在本发明的方法中得到的氨基酸作为其它有价值产品的合成起始材料是合适的。例如,它们可以彼此组合或单独使用来生产药物、食物、动物饲料或化妆品。因此,本发明涉及生产药物、食物、动物饲料、营养品或化妆品的方法,所述方法含有本发明方法的步骤,包括分离产生的氨基酸组合物或产生的甲硫氨酸,并在需要时用可药用载体配制产品或将产品配制成可用于农业的形式。本发明的另一实施方案为本发明方法产生的氨基酸或转基因生物在动物饲料、食物、药物、食品添加剂、化妆品或药物中的用途。本发明另一实施方案为组合物,所述组合物含有本发明蛋白质、本发明核酸分子、本发明多肽、本发明核酸构建体或载体、本发明拮抗剂、本发明抗体和任选的可农业用的载体。
原则上可使用所有的微生物(特别是上述来源生物之下的那些)作为宿主生物。有利地在本发明方法中使用转基因微生物,例如真菌,例如麦角菌属或曲霉或革兰式阳性菌,如芽孢杆菌属、棒杆菌属、微球菌属、红球菌属、诺卡氏菌属、Caseobacter或节杆菌属或革兰氏阴性菌,例如黄杆菌属或沙门氏菌属,或酵母如红酵母属、汉森氏酵母属或假丝酵母属。特别有利的生物选自棒杆菌属、短杆菌属、大肠杆菌属、芽孢杆菌属、红酵母属、汉森氏酵母属、假丝酵母属、麦角菌属或黄杆菌属。特别有利地在本发明方法中使用的微生物选自异常汉逊酵母、Candida utilis,麦角菌Claviceps purpurea、环状芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、芽孢杆菌属、Brevibacterium albidum、Brevibacterium album、Brevibacteriumcerinum、黄色短杆菌(Brevibacterium flavum)、Brevibacteriumglutamigenes、碘短杆菌(Brevibacterium iodinum)、Brevibacteriumketoglutamicum、Brevibacterium lactofermentum、扩展短杆菌(Brevibacterium linens)、Brevibacterium roseum、解糖短杆菌(Brevibacterium saccharolyticum)、Brevibacterium sp.、Corynebacterium acetoacidophilum、Corynebacterium acetoglutamicum、Corynebacterium ammoniagenes、谷氨酸棒杆菌(Corynebacteriumglutamicum)(=Micrococcus glutamicum)、Corynebacterium melassecola、Corynebacterium sp.或大肠杆菌,特别是大肠杆菌K12及其所述菌株。
当宿主生物为微生物时,本发明的方法有利地在0℃和95℃之间,优选10℃和85℃之间,特别优选在15℃和75℃之间,极其优选在15℃和45℃之间完成。其间pH有利地保持在pH4至12之间,优选在pH6至9之间,特别优选在pH7至8之间。可批式、半批式或持续进行本发明方法。已知的培养方法概述可见于Chmiel(《Bioprozeβtechnik 1.Einführung in die Bioverfahrenstechnik》(Gustav Fischer Verlag,Stuttgart,1991))的教科书中或Storhas(《Bioreaktoren und periphereEinrichtungen》(Vieweg Verlag,Braunschweig/Wiesbaden,1994))的教科书中。将使用的培养基必须以适当的方式满足各自菌株的需要。用于多种微生物的培养基说明出现在American Society for Bacteriology(Washington D.C.,USA,1981)的《Manual of Methods for GeneralBacteriology》手册中。这些可用于本发明的培养基如上所述,通常包含一种或更多碳源、氮源、无机盐、维生素和/或微量元素。优选的碳源为糖,例如单糖、二糖或多糖。非常好碳源的实例为葡萄糖、果糖、甘露糖、半乳糖、核酸糖、山梨糖、核酮糖乳糖、麦芽糖、蔗糖、棉子糖、淀粉或纤维素。还可通过复合化合物(例如糖蜜或其他糖精炼的副产品)向培养基中添加糖,。其他可能的碳源为油脂,例如大豆油、向日葵油、花生油和/或椰子脂肪,脂肪酸,如软脂酸、硬脂酸、和/或亚油酸,醇和/或多元醇,例如甘油、甲醇和/或乙醇和/或有机酸,例如乙酸和/或乳酸。氮源通常为有机或无机氮化合物或包含这些化合物的材料。氮源的实例包括液态的或气态形式的氨水或铵盐,例如硫酸铵、氯化铵、磷酸铵、碳酸铵或硝酸铵、硝酸盐、尿素、氨基酸或复合氮源,例如玉米浆、大豆粉、大豆蛋白质、酵母提取物、肉膏及其他。氮源可单独或以混合物使用。培养基中可存在的无机盐化合物包括钙、镁、钠、钴、钼、钾、锰、锌、铜和铁的氯化物、磷酸或硫酸盐。为了制备含硫精细化学品,特别是精细化学品,可以使用无机含硫化合物例如硫酸盐、亚硫酸盐、连二亚硫酸盐、连四硫酸盐、硫代硫酸盐、硫化物或其他有机硫化合物(例如硫醇和巯基化合物)作为硫源。可以使用磷酸、磷酸二氢钾或磷酸氢二钾或相应含钠盐作为磷源。可向培养基中添加螯合剂以保持溶液中的金属离子。特别合适的螯合剂包括二羟苯酚(dihydroxyphenols)(例如邻苯二酚)或原苯酸(protocatechuate)或有机酸(例如柠檬酸)。本发明使用的用于培养微生物的发酵培养基通常还包括其他生长因子,例如维生素或生长促进因子,包括例如生物素、核黄素、硫胺、叶酸、烟酸、泛酸和维生素B6。生长因子和盐通常来自复合培养基成分,例如酵母提取物、糖蜜、玉米浆等。此外可向培养基中添加合适的前体。培养基混合物的确切成分非常依赖于具体的实验并为每个特定的案例单独选择。关于培养基最佳化的信息可见教科书《AppliedMicrobiol.Physiology,A Practical Approach》(P.M.Rhodes编,P.F.Stanbury,IRL Press(1997)53-73页,ISBN 0 19 963577 3)。生长培养基还可从商业供应商(例如Standard 1(Merck)或BHI(Brain heart infusion,DIFCO)等处)买到。所有的培养基成分可通过加热(1.5巴及121℃持续20min)或灭菌过滤来灭菌。成分可一起或单独(如果需要)灭菌。所有的培养基成分可在培养起始时存在或任选的持续或分批添加。培养基的温度通常在15℃和45℃之间,优选25℃到40℃,并可在实验中保持恒定或变化。培养基的pH应在5到8.5范围内,优选7左右。在培养中可通过添加酸性化合物(例如磷酸或硫酸)控制培养的pH。可使用消泡剂(例如脂肪酸聚乙二醇酯)控制泡沫。可通过向培养基中添加合适的,具有选择效应的物质(例如抗生素)来保持质粒的稳定性。需氧条件通过向培养物中引入氧气或含氧气体混合物(例如流通的空气)来保持。培养物的温度通常从20℃到45℃并优选从25℃到40℃。培养持续到目的产物以最大量形成。这个目标通常在10小时到160小时内实现。用该种途径得到的发酵液含有精细化学品,特别是例如氨基酸,如L-甲硫氨酸、L-苏氨酸和/或L-赖氨酸,通常干物质含量占重量的7.5到25%。糖限制发酵至少在结束时,特别是大于至少30%发酵时间时是格外有利的。这意味着发酵培养基中可利用糖的浓度在这段时间内保持在或降低至≥0到3g/l。然后将发酵液进一步处理。根据要求,生物菌体可整体或部分地通过分离方法(例如离心、过滤、倾析)或这些方法的组合从发酵液中移出或完全留在其中。然后可通过已知方法,例如在旋转式蒸发器、薄膜蒸发器、降膜式蒸发器帮助下通过逆向渗透或微过滤(nanofiltration)增稠或浓缩。然后通过冷冻干燥、喷雾干燥、喷雾粒化或通过其他方法建立浓缩的发酵液。
然而,还可能进一步纯化产生的氨基酸。为此,在目的产物和杂质部分或全部停留于层析树脂的情况下,将包含产物的组分在合适的树脂上层析。如果需要,可使用相同或不同层析树脂重复这些层析步骤。技术人员熟悉合适层析树脂的选择及它们的最有效用途。纯化的产物可通过过滤或超滤浓缩,并保存在产物稳定性最好的温度下。
可通过现有技术确定分离的化合物的身份和纯度。这些方法包括高效液相层析(HPLC)、分光镜方法、质谱(MS)、染色法、薄层层析、NIRS、酶测定或微生物测定。这些分析法概述于Patek等人(1994)Appl.Environ.Microbiol.60:133-140;Malakhova等人(1996)Biotekhnologiya 11 27-32;和Schmidt等人(1998)Bioprocess Engineer.19:67-70.Ulmann′sEncyclopedia of Industrial Chemistry(1996)卷A27,VCH:Weinheim,89-90页,521-540页,540-547页,559-566页,575-581页和581-587页;Michal,G(1999)《Biochemical Pathways:An Atlas of Biochemistry andMolecular Biology)》,John Wiley和Sons;Fallon,A.等人(1987)Applications of HPLC in Biochemistry in:Laboratory Techniques inBiochemistry and Molecular Biology,卷17。
在另一方面,本发明还涉及可收获部分和本发明转基因植物的繁殖材料,其或者包含表达本发明核酸分子的转基因植物细胞,或者包含表现出本发明多肽减少、降低或缺失的细胞活性的细胞,例如所述蛋白质降低的表达水平或更高的活性。
可收获部分一般可为植物的任何可用部分,例如花、花粉、苗、块茎、叶、茎、果实、种子、根等。繁殖材料包括例如种子、果实、切枝、苗、块茎、根状茎等。可收获部分或繁殖材料优选种子、果实、苗或块茎。
本发明还涉及本发明转基因生物和细胞、细胞培养物、来自它们的部分例如如上所述转基因植物生物的根、叶等、以及如上所述转基因繁殖材料例如种子或果实等用于产生食物或饲料、药物或精细化学品的用途。
因此在另一实施方案中,本发明涉及核酸分子、生物(例如微生物、植物、植物细胞或植物组织)、载体或本发明多肽用于制造精细化学品的用途。在本发明含义中,精细化学品为在细胞、组织和/或植物中产生的例如脂肪酸、类胡萝卜素、类异戊二烯、维生素、脂质、蜡酯、(多)糖和/或多聚羟基脂肪酸酯,和/或其代谢产物特别是类固醇激素、胆固醇、前列腺素、三酰甘油、胆汁酸和/或酮体。大量机制影响脂肪酸、类胡萝卜素、类异戊二烯、维生素、脂质、蜡酯、(多)糖和/或多聚羟基脂肪酸酯,和/或其代谢产物特别是类固醇激素、胆固醇、三酰甘油、前列腺素、胆汁酸和/或酮体或其他上述结合这类改变蛋白质的精细化学品的产量、产生和/或产生效率。在植物情况下,通过例如增加许多产物的底物(例如细胞中脂肪酸、类胡萝卜素、类异戊二烯、维生素、脂质、蜡酯、(多)糖和/或多聚羟基脂肪酸酯,和/或其代谢产物特别是前列腺素、类固醇激素、胆固醇、三酰甘油、胆汁酸和/或酮体)乙酰辅酶A的表达,可能增加产生的所述化合物的数量从而允许收集和纯化的大幅简化或植物情况下更有效的划分。此外,一个或更多所述代谢产物、辅助因子、前体分子和适当生物合成途径的中间化合物数量的增加可能是必需的。因此,通过增加与重要营养素例如碳源(即糖)、氮源(即氨基酸、铵盐)、磷酸盐和硫相关的传递蛋白的数量和/或活性,可能由于移除了任何生物合成方法上的营养素供给限制而改善乙酰辅酶A及其上述代谢产物的产生。具体的,可能增加所述化合物(例如脂肪酸、类胡萝卜素、类异戊二烯、维生素、蜡酯、脂质、(多)糖和/或多聚羟基脂肪酸酯,和/或其代谢产物特别是类固醇激素、胆固醇、前列腺素、三酰甘油、胆汁酸和/或酮体分子)在植物中的产量、产生和/或产生效率。
另外优选的是药物或精细化学品在宿主生物中的重组产生,其中宿主生物用一个上述核酸构建体转化,所述上述核酸构建体包含一个或多个编码目的精细化学品或催化目的精细化学品生物合成的结构基因,培养转化的宿主细胞并从培养基中分离目的化学品。该方法可广泛应用于精细化学品,例如酶、维生素、氨基酸、糖、脂肪酸和天然及合成调味料、香料和染料或包含它们的混合物。特别优选另外产生其他氨基酸、生育酚和生育三烯酚以及类胡萝卜素或包含所述化合物的混合物。培养转化的宿主生物并通过本领域技术人员已知的方法将产物从宿主生物或培养基中再生,或将生物自身作为食物或饲料添加剂。药物(例如抗体或疫苗)的产生描述于Hood EE,Jilka JM.Curr Opin Biotechnol.1999 Aug;10(4):382-6;MaJK,Vine ND.Curr Top Microbiol Immunol.1999;236:275-92。
本发明的另一实施方案为双链RNA分子(dsRNA),其中所述双链RNA分子的有义链与本发明核酸分子或编码下述蛋白质的核酸分子有至少30%、35%、40%、45%、50%、55%或60%,优选65%、70%、75%或80%,更优选85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的同源性,所述蛋白质赋予具有本发明蛋白质生物活性或含有下述片段的蛋白质表达,所述片段为下述核酸分子的至少40、50、60、70、80或90碱基对,特别优选至少100、200、300或400碱基对,最优选至少500、600、700、800、900或更多碱基对或至少1000或2000碱基对的片段,所述核酸分子与赋予具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子或本发明的核酸分子有至少50%、60%、70%、80%或90%,优选100%的同源性。在本发明另一个优选的实施方案中,编码的序列或其部分片段总计17、18、19、20、21、22、23、24、25、26或27个碱基,优选20、21、22、23、24或25个碱基,其中序列同源性与上述同源性类似。
在本发明优选的实施方案中,双链RNA的有义和反义链共价结合或通过弱化学键(例如氢键)彼此结合,且反义链与有义链基本互补。
而本发明另一实施方案为反义核酸分子,其中该反义核酸分子与下述核酸分子有至少30%的同源性:与编码由本发明核酸分子编码的蛋白质的核酸分子反义的核酸分子;或本发明的核酸分子;或编码本发明蛋白质并赋予具有下述蛋白质生物活性的蛋白质表达,所述蛋白质具有本发明蛋白质的生物活性;包含下述核酸分子至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45或50,特别优选至少60、70、80或90碱基对,非常特别优选至少100、200、300或400碱基对,最优选至少500、600、700、800、900或更多碱基对或至少整个序列的片段的反义核酸分子,所述核酸分子与下述核酸分子的反义核酸分子或本发明核酸分子本身或编码本发明蛋白质的核酸分子有至少50%、60%、70%、80%或90%,优选100%的同源性,所述核酸分子赋予具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质表达。
本发明的另一实施方案为核酶,其特异切割赋予具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子,或编码由本发明核酸分子编码的蛋白质的核酸分子,或本发明核酸分子自身。
本发明的另一实施方案为抗体,其与蛋白质特异结合从而抑制该蛋白质,所述蛋白质由下述核酸分子编码,所述核酸分子为赋予具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子,或编码由本发明核酸分子编码的蛋白质的核酸分子,或本发明核酸分子自身。
本发明的另一实施方案为病毒核酸分子,其降低RNA分子(其赋予具有本发明蛋白质生物活性的蛋白质表达)或核酸分子(其编码由本发明核酸分子编码的蛋白质)或本发明核酸分子或本发明蛋白质的显性失活突变体或编码这类显性失活突变体的核酸分子。
在一个实施方案中,本发明涉及鉴定赋予生物(如微生物、非人动物或植物)细胞中精细化合物产生增加的基因产物的方法,其包括下面的步骤:
(a)将样品(例如细胞、组织、植物或微生物或包含编码在减少、降低或缺失其表达后给予精细化学品增加的基因产物的候选基因的核酸文库)的核酸分子与本发明核酸分子接触(例如杂交);
(b)鉴定与本发明核酸分子特别是SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ IDNO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ IDNO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ IDNO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ IDNO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ IDNO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ IDNO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ IDNO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ IDNO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ IDNO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ IDNO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ IDNO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ IDNO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ IDNO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271,、SEQ IDNO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ IDNO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ IDNO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ IDNO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ IDNO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ IDNO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ IDNO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ IDNO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ IDNO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ IDNO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ IDNO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ IDNO:440中所示的核酸分子在松弛严格条件下杂交的核酸分子,并任选地,分离全长cDNA克隆或完整基因组克隆;
(c)将候选核酸分子引入适合产生精细化学品的宿主细胞,优选植物细胞或微生物;
(d)在宿主细胞中减少或缺失经鉴定的核酸分子的表达;
(e)测定宿主细胞中精细化学品的水平;并
(f)鉴定核酸分子及其基因产物,其减少或缺失的表达使得表达后宿主细胞中精细化学品的水平与野生型相比增加。
松弛杂交条件为:标准杂交操作后,可在低到中度严格条件下进行洗涤步骤,相对于例如60℃-68℃使用0.1%SDS的严格洗涤条件,通常使用40°-55℃和有0.1%SDS的2xSSC和0.2xSSC的盐条件的洗涤条件。其他严格杂交条件实例可见于上列参考文献。通常洗涤步骤以增加的严格度和长度重复,直到检测到有用的信号噪声比并依赖于许多因素,如靶标(例如其纯度、GC含量、大小等)、探针(例如其长度、是RNA或DNA探针)、盐条件、洗涤或杂交温度、洗涤或杂交时间等。
在另一实施方案中,本发明涉及鉴定赋予细胞中精细化学品产生增加的基因产物的方法,其包括下列步骤:
(a)鉴定生物的核酸分子;所述生物可能包含编码降低或缺失其表达后赋予精细化学品增加的基因产物的候选基因,增加为至少20%,优选25%,更优选30%,更特别优选35%、40%或50%,更特别优选60%、70%或80%,最优选90%或95%或鉴定的核酸分子与本发明核酸分子更加同源,例如通过在数据库中进行同源性搜索;
(b)在宿主细胞中减少或缺失鉴定的核酸分子的表达;
(c)测定宿主细胞中的精细化学品水平;并
(d)鉴定核酸分子及其基因产物,该基因产物的表达减少或缺失后给予宿主细胞中精细化学品水平与野生型相比增加。
然后可使用鉴定的核酸分子以与本发明核酸分子同样的方法产生精细化学品。因此,在一个实施方案中,本发明涉及生产精细化学品的方法,包括(a)根据前述步骤(a)到(d)鉴定核酸分子并从生物中回收游离的或结合的本发明化合物,该生物与野生型相比分离的核酸分子编码多肽具有降低的细胞活性。
另外,在一个实施方案中,本发明涉及鉴定刺激所述植物中精细化学品产生的化合物的方法,其包括:
a)将表达本发明多肽或其mRNA的细胞与候选化合物在细胞培养条件下接触;
b)测定所述多肽或所述mRNA表达的减少、降低或缺失;
c)比较表达水平与无所述候选化合物时产生的标准反应;
由此,比标准减少、降低或缺失的表达说明该化合物刺激精细化学品的产生。
此外,在一个实施方案中,本发明涉及筛选本发明多肽(例如降低细胞活性后赋予生物或其部分中精细化学品增加的多肽)活性的拮抗剂的方法,其包括:
a.将表达本发明多肽的细胞、组织、植物或微生物与候选化合物或包含多种化合物的样品在允许本发明多肽表达的条件下接触;
b.测定细胞、组织、植物或微生物或培养或保持细胞、组织、植物或微生物的培养基中的精细化学品水平或多肽表达水平;并
c.通过将测量的精细化学品水平或多肽表达水平与无所述候选化合物或包含所述多种化合物的样品时测量的精细化学品或多肽表达水平标准比较来鉴定拮抗剂;由此比标准提高的精细化学品水平说明该化合物或包含所述多种化合物的样品为激动剂,且比标准降低的水平说明该化合物或包含所述多种化合物的样品为拮抗剂。
又一本发明实施方案涉及鉴定赋予植物、非人动物或微生物中精细化学品产生增加的化合物的方法,其包括以下步骤:
a.在适当条件下培养或保持植物或动物细胞或其组织或微生物,这些植物或动物细胞或其组织或微生物表达本发明多肽或编码所述多肽的多核苷酸以及能够同多肽相互作用的读出系统,所述适当条件在化合物或包含多种化合物的样品存在下允许所述该系统与多肽相互作用,并在允许抑制所述读出系统和本发明蛋白质的条件下能够提高应答化合物与所述多肽结合的可检测信号;和
b.通过检测所述读出系统产生信号的存在或不存在或降低或提高来鉴定化合物是否为有效的拮抗剂。
所述化合物可以是化学合成的或微生物产生的和/或包含于来自例如植物、动物或微生物(如病原体)的样品(如细胞提取物)中。此外,所述化合物可能是本领域已知的,但迄今尚不了解其能够抑制或活化本发明多肽。反应混合物可以是不含细胞的提取物或者可以含有细胞或组织培养物。本发明方法合适的设置为本领域技术人员已知,并例如一般描述于Alberts等,《Molecular Biology of the Cell》,第三版(1994),特别是17章。该化合物可以例如加入反应混合物、培养基中、注射进细胞中或喷撒到植物上。
如果在本发明方法中鉴定了含有混合物的样品,则可以从鉴定为含有能够活化或提高生物或其局部中精细化学品含量的化合物的原始样品中分离化合物,或者可以进一步细分原始样品(例如如果含有多种不同化合物)以减少每个样品中不同物质的数量,并重复原始样品的细分方法。取决于样品的复杂性,可以进行上文所述步骤若干次,优选直至本发明方法所鉴定的样品只含有有限的几种或只含有一种物质。优选所述样品含有化学和/或物理特性类似的物质,并最优选所述物质是同一的。优选地,以适合植物育种或植物细胞或组织培养应用的形式进一步制备上文所述方法鉴定的化合物或其衍生物。
可根据本发明方法测试和鉴定的化合物可以是表达文库(例如cDNA表达文库)、肽、蛋白质、核酸、抗体、小有机化合物、激素、肽模拟物、PNA等(Milner,Nature Medicine 1(1995),879-880;Hupp,Cell 83(1995),237-245;Gibbs,Cell 79(1994),193-198及其引用的参考文献)。所述化合物还可以是已知抑制剂或激活剂的功能型衍生物或类似物。制备化学衍生物和类似物的方法为本领域技术人员所熟知,并描述于例如Beilstein,《Handbook of Organic Chemistry》,Springer edition New York Inc.,175Fifth Avenue,New York,N.Y.10010 U.S.A.and Organic Synthesis,Wiley,New York,USA。另外,可以根据本领域已知的方法测试所述衍生物和类似物的效果。另外,可以(例如根据上文所述方法)使用合适衍生物和类似物的肽模拟物和/或计算机辅助设计。本发明方法中使用的细胞或组织优选为上文实施方案中描述的本发明宿主细胞、植物或植物组织。
因此,本发明另一个实施方案中涉及根据本发明鉴定激动剂的方法得到或鉴定的化合物,所述化合物为本发明多肽的激动剂。
因此,在一个实施方案中,本发明另外涉及通过鉴定本发明化合物的方法所鉴定的化合物。
所述化合物为例如本发明多肽的同系物。可以通过诱变(如定点突变)或截短本发明多肽产生本发明多肽的同系物。本文使用的术语“同系物”指蛋白质的变体形式,所述变体发挥本发明多肽活性拮抗剂的作用。所述蛋白质的拮抗剂可以丧失本发明多肽的生物活性。具体的所述拮抗剂赋予本发明多肽表达水平降低并从而在生物或其局部中表达该拮抗剂赋予生物或其局部中游离和/或结合的本发明化合物提高。
在一个实施方案中,本发明涉及特异性识别本发明化合物或拮抗剂的抗体。
本发明还涉及含有至少一个前述核酸分子、载体、蛋白质、抗体或本发明化合物和任选的适当方法的诊断组合物。
本发明的诊断组合物适用于从细胞中分离mRNA和在杂交条件下用含有前述核酸探针的探针接触所得到的mRNA、检测与探针杂交mRNA的存在,并藉此检测细胞中蛋白质的表达。检测本发明蛋白质存在的其他方法包括本领域所熟知的免疫技术,例如酶联免疫吸附测定。另外,还可以使用本发明的核酸分子作为植物育种中的分子标记或引物。检测的适当方法为本领域技术人员所熟知,例如杂交测定的缓冲液和溶液(如前述的溶液和缓冲液)以及如Sambrook等描述的Southern、Western、Northern等印迹的方法是公知的。
在另一实施方案中,本发明涉及含有核酸分子、载体、宿主细胞、多肽、反义核酸、抗体、植物细胞、植物或植物组织、可收获部分、繁殖材料和/或根据本发明方法鉴定的化合物和/或拮抗剂的试剂盒。
本发明试剂盒的化合物可以(任选地与缓冲液和/或溶液一起或在缓冲液和/溶液中)包装在容器(如瓶)中。适当时,可以在同一个容器中包装一个或多个所述组分。除此以外(或另选的),一个或多个所述组分可以吸收到固体支持物(如消化纤维素膜滤膜、玻璃平板、芯片或尼龙膜或微孔板的孔)中。该试剂盒可以用于任何本文描述的方法和实施方案,例如产生宿主细胞、转基因植物、药物组合物、检测同源序列、鉴定拮抗剂或激动剂,作为食品或饲料或作为其添加剂、作为植物处理的补充物等。
另外,试剂盒可以包含该试剂盒用于任何所述实施方案的用途的说明书,特别是用于产生具有提高的游离的或结合的本发明化合物含量的生物或其局部的用途。
在一个实施方案中,所述试剂盒含有编码一个或多个前述蛋白质的其他核酸分子和/或抗体、载体、宿主细胞、反义核酸、植物细胞或植物组织或植物。
在另一实施方案中,本发明涉及产生农业组合物的方法,所述农业组合物提供本发明核酸分子、载体或多肽或含有鉴定所述化合物或拮抗剂的本发明方法的步骤,并以可用于植物农业组合物的形式制造本发明的核酸分子、载体或多肽或拮抗剂或根据本发明方法或过程鉴定或可应用于本发明对象的化合物。
在另一实施方案中,本发明涉及产生支持“精细化学品”的植物培养组合物的方法,其包括本发明方法的步骤并以可用于如农业组合物的形式制造鉴定的化合物。
“可用于农业的组合物”应理解为这些组合物符合规定杀菌剂、植物营养、除草剂等含量的法律。优选这样的组合物对受保护的植物和食用其的动物(包括人类)无任何损害。
本发明还与涉及其他用途和方法相关的实施方案。本文所述的核酸分子、多肽、蛋白质同系物、融合蛋白、引物、载体、宿主细胞可用于一个或多个以下方法:鉴定如前述可用于精细化学品产生的植物和相关生物;基因组作图;鉴定和定位目的序列;进化研究;确定功能所需区域;调控活性。
本发明的核酸分子、本发明载体或本发明核酸构建体还可以用于产生对氨基酸产生生物合成途径的抑制剂具有抗性的生物。具体的,减少、降低或缺失本发明多肽可能针对除草剂保护植物,所述除草剂阻断所述植物中的氨基酸(特别是甲硫氨酸)合成。
因此,本发明的核酸分子具有多种用途。首先,它们可用于鉴定生物或其近亲。此外,它们还可用于鉴定微生物或植物混和种群中其存在或其近亲。通过在严格条件下用跨越本发明基因独有区域的探针探查从单一或混和植物种群的培养物中提取的基因组DNA,可以确定是否使用了本发明或是否存在生物或其近亲。
另外,本发明的核酸分子可以与亲缘物种的序列充分同源,从而这些核酸分子可以在构建亲缘生物基因组作图中或关联作图中作为标记。另外,对应于本发明核酸或其同源物的基因组区的天然变异可能引起本发明蛋白质和它们同源物的活性变异并因此引起精细化学品生产的天然变化。因此,天然变异最终还以活性更弱的等位变体的形式存在,所述变体已引起精细化学品生产的相对提高。可鉴定本发明核酸的不同变体并用于提高精细化学品的标记辅助的育种,所述不同变体对应于不同的精细化学品生产能力。
因此,本发明涉及为产生精细化学品培育植物的方法,其包括:
(a)选择能够通过减少、降低或缺失本发明多肽表达而产生精细化学品的第一植物变种;
(b)将产生一定水平的精细化学品的能力与本发明基因的表达水平或基因组结构相关联;
(c)将产生精细化学品的能力具有显著差异的第一植物变种与第二植物变种杂交;并
(d)通过分析本发明基因的表达或基因组结构鉴定具有过量产生精细化学品的能力的子代变种。
本发明核酸分子还可以用于进化和蛋白质结构研究。可以通过比较本发明的序列与来自其他生物的编码类似酶的序列来评估生物间的进化亲缘关系。类似地,这样的比较可以评估序列中的哪些区域是保守的,哪些则不是,这可以帮助确定酶的功能所必需的蛋白质区域。这一类型的确定对蛋白质工程研究是有价值的,并可能给出关于蛋白质可以承受何种诱变而不丧失功能的提示。
因此,本发明的核酸分子可以用于鉴定在表达减少、降低或缺失后赋予精细化学品增加的其他核酸分子。
另外,本发明的核酸分子或赋予本发明多肽表达(优选含有本发明核酸分子)的基因片段可以用于标记辅助的育种或精细化学品衍生性状的联合作图。
因此,本发明的核酸、本发明的多肽、本发明的核酸构建体、本发明的生物、宿主细胞、微生物、植物、植物组织、植物细胞或其部分、本发明的载体、用本发明方法鉴定的拮抗剂、用本发明方法鉴定的核酸分子可以用于产生精细化学品或与一种或多种氨基酸(如苏氨酸、丙氨酸、高丝氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、缬氨酸、天冬酰胺、苯丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸和/或色氨酸)组合的精细化学品。
这些及其他实施方案是公开的,并包括于本发明的说明书和实施例中。可以使用如电子设备从公共图书馆中检索到关于根据应用任何本发明的方法、用途和化合物之一的其他文献。例如可以利用在互联网上提供的公共数据库“Medline”,例如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/medline.html。其他数据库和地址如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/、http://www.infobiogen.fr/、http://www.fmi.ch/biology/research-tools.html、http://www.tigr.org/为本领域技术人员已知,并可以使用例如http://www.lycos.com获得。Berks,TIBTECH 12(1994),352-364中给出了用于回溯检索和最新文献通报的生物技术专利信息的概述和专利信息相关资源的调查。
本发明通过以下实施例进行说明。本实施例展示了旨在不限制本发明对象的基本发明。本专利申请中引用的参考文献、专利申请、专利和出版专利申请的全部内容在本文中引入作为参考文献。
实施例
实施例1:在大肠杆菌中克隆SEQ ID NO:1
使用已知的良好建立的方法(参阅如Sambrook,J.等(1989)《Molecular Cloning:A Laboratory Manual》Cold Spring HarborLaboratory Press或Ausubel,F.M.等(1994)″Current Protocols in Mole-cular Biology″,John Wiley & Sons),将SEQ ID NO:1克隆进质粒pBR322(Sutcliffe,J.G.(1979)Proc.Natl Acad.Sci.USA,75:3737-3741);pACYC177(Change & Cohen(1978)J.Bacteriol.134:1141-1156);pBS系列质粒(pBSSK+,pBSSK-及其他;Stratagene,LaJolla,USA)或粘粒如SuperCos1(Stratagene,LaJolla,USA)或Lorist6(Gibson,T.J.Rosenthal,A.,和Waterson,R.H.(1987)Gene 53:283-286)以在大肠杆菌中表达。
除非特别说明,实施例中均使用Sambrook等人,Molecular Cloning:A laboratory manual,Cold Spring Harbor 1989,Cold Spring HarborLaboratory Press中描述的标准方法。
实施例2:DNA测序和计算机功能分析
通过标准方法,特别是使用ABI377测序仪的链测定方法测序DNA(参阅如Fleischman,R.D.等(1995)″Whole-genome Random Sequencing andAssembly of Haemophilus Influenzae Rd.,Science 269;496-512)。
实施例3:体内诱变
可以通过将质粒DNA(或其他载体DNA)转入不能保持其遗传信息完整性的大肠杆菌(如大肠杆菌XL-1 red)或其他微生物(如芽孢杆菌属或酵母,如酿酒酵母)来实施谷氨酸棒杆菌体内诱变,以产生氨基酸。通常,增变株在DNA修复系统的基因中含有突变(如mutHLS、mutD、mutT等;比较可见Rupp,W.D.,(1996),DNA repair mechanisms in Escherichiacoli and Salmonella,2277-2294页,ASM:Washington)。本领域技术人员了解这些菌株。这些菌株的使用在例如Greener,A.和Callahan,M.,1994,Strategies 7:32-34中有所说明。
实施例4:大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌间的DNA转移
一些棒杆菌和短杆菌物种含有自主复制(参阅如Martin,J.F.等(1987)Biotechnology 5:137-146的综述)的内源性质粒(如pHM1519或pBL1)。大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌的穿梭载体可以使用加入了谷氨酸棒杆菌的复制起点或来自谷氨酸棒杆菌的适当标记的标准大肠杆菌载体(Sambrook,J.等,(1989),《Molecular Cloning:A Laboratory Manual》,Cold SpringHarbor Laboratory Press或Ausubel,F.M.等(1994)《Current Protocols inMolecular Biology》,John Wiley & Sons)来便利地构建。这些复制起点优选取自从棒杆菌和短杆菌物种中分离的内源性质粒。特别作为这些物种的转化标记使用的基因为卡那霉素抗性(如来源于Tn5或Tn-903转座子的)或氯霉素抗性(Winnacker,E.L.(1987)《From Genes toClones-Introduction to Gene Technology》,VCH,Weinheim)基因。文献中有制备多种在大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌中复制并可用于多种目的(包括过表达基因或下调基因)的穿梭载体的实例(参阅如Yoshihama,M.等(1985)J.Bacteriol.162:591-597,Martin,J.F.等,(1987)Biotechnology,5:137-146和Eikmanns,B.J.等(1992)Gene 102:93-98)。在棒杆菌中复制的适当载体为例如pZ1(Menkel等,Appl.Environ.Microbiol.,64,1989:549-554)、pEkEx1(Eikmanns等,Gene 102,1991:93-98)或pHS2-1(Sonnen等,Gene 107,1991:69-74)。这些载体基于隐蔽性质粒pHM1519、pBL1或pGA1。还可以同样方式使用其他质粒载体如基于pCG4(US 4,489,160)、pNG2(Serwold-Davis等,FEMS Microbiol.Lett.,66,1990:119-124)或pAG1(US 5,158,891)的质粒。
使用标准技术可以将目的基因克隆到前述穿梭载体之一并将这些杂合载体引入谷氨酸棒杆菌菌株中。可以通过原生质体转化(Kastsumata,R.等,(1984)J.Bacteriol.159,306-311)、电穿孔(Liebl,E.等,(1989)FEMSMicrobiol.Letters,53:399-303)和使用特定载体的情况下的接合(例如Sch_fer,A.,等(1990)J.Bacteriol.172:1663-1666中所述)来实现谷氨酸棒杆菌转化。类似地,可以通过(使用本领域已知的标准技术)制备来自谷氨酸棒杆菌的质粒DNA并将其转化进大肠杆菌而将谷氨酸棒杆菌的穿梭载体转移到大肠杆菌。可以使用标准方法实施这一转化步骤,但优选使用Mcr-缺陷型大肠杆菌菌株,如NM522(Gough & Murray(1983)J.Mol.Biol.166:1-19)。
如果转化的序列需要有利地整合进棒杆菌基因组,对于这一目的也存在技术人员已知的标准技术。对于该目的使用的实例为用于复制和扩增hom-thrB操纵子的如Remscheid等(Appl.Environ.Microbiol.,60,1994:126-132)所述的质粒载体。在该方法中,将完整基因克隆到能在宿主(如大肠杆菌)中复制但在谷氨酸棒杆菌中不复制的质粒载体中。合适的载体为例如pSUP301(Simon等,Bio/Technology 1,1983:784-791)、pKIBmob或pK19mob(Sch_fer等,Gene 145,1994:69-73)、pGEM-T(PromegaCorp.,Madison,WI,USA)、pCR2.1-TOPO(Schuman,J.Biol.Chem.,269,1994:32678-32684,US 5,487,993)、pCR_Blunt(Invitrogen,Groningen,theNetherlands)或pEM1(Schrumpf等,J.Bacteriol.,173,1991:4510-4516)。
另一向靶基因引入突变的方法由Schafer等[Gene.1994 Jul22;145(1):69-73]公开。Schafer等教导了来自大肠杆菌质粒pK18和pK19的小型可运动多功能克隆载体用于在谷氨酸棒状杆菌染色体中选择确定的删除。
实施例5:测定突变体/转基因蛋白质的表达
观察转化宿主细胞中突变的或转基因蛋白质活性基于蛋白质以修饰的方式和因此例如低于野生型蛋白质的量表达这一事实。测定突变或转基因基因转录数量(可供翻译基因产物的mRNA数量的标志)的合适方法为进行Northern印迹(参阅如Ausubel等,(1988)《Current Protocols inMolecular Biology》,Wiley:New York),其中与可检测的标记(通常为放射性或化学发光标记)一起提供了以与目的基因结合的方式设计的引物,从而当提取生物培养物的总RNA、在胶中分离、应用于稳定基质并与该探针孵育时,探针的结合和结合数量标明该基因mRNA的存在和数量。另一方法为定量PCR。该信息检测基因转录的数量。可以用本领域已知的多种方法(如Bormann,E.R.等,(1992)Mol.Microbiol.6:317-326中所述)从谷氨酸棒杆菌中分离总细胞RNA。
可以使用标准技术如Western印迹测定从该mRNA翻译的蛋白质的存在或相对量(参阅如Ausubel等(1988)″Current Protocols in MolecularBiology″,Wiley,New York)。在这一方法中,提取总细胞蛋白质,通过凝胶电泳分离,转移到基质如硝酸纤维素并与探针(如与所需蛋白质特异性结合的抗体)孵育。这一探针通常直接或间接与容易检测的化学发光或比色标记一起提供。标记的存在和观察到的数量表明细胞中目的突变蛋白质的存在和数量。然而,也已知其他方法。
实施例6:培养遗传修饰的谷氨酸棒杆菌:培养基和培养条件
在合成或天然培养基中培养遗传修饰的棒杆菌。棒杆菌的多种不同培养基是已知的,并可广泛获得(Lieb等(1989)Appl.Microbiol.Biotechnol.32:205-210;von der Osten等(1998)Biotechnology Letters 11:11-16;Patent DE 4 120 867;Liebl(1992)《The Procaryotes》,卷II中的″TheGenus Corynebacterium″Balows,A.,等,Ed.Springer-Verlag)。
可根据本发明使用的所述培养基通常由一种或多种碳源、氮源、无机盐、维生素和微量元素组成。优选的碳源为糖,如单糖、双糖或多糖。非常好的碳源为葡萄糖、果糖、甘露糖、半乳糖、核糖、山梨糖、核酮糖、乳糖、麦芽糖、蔗糖、棉子糖、淀粉或纤维素。还可以通过复合化合物(如糖蜜)或其他糖精练的副产品将糖加入培养基中。还可以有利地加入多种碳源的混合物。其他可能的碳源为醇和/或有机酸(如甲醇、乙醇、乙酸或乳酸)。氮源通常为有机或无机氮化合物或含有所述化合物的物质。氮源的实例包括氨气、氨水或铵盐(如NH4Cl或(NH4)2SO4、NH4OH、硝酸盐)、尿素、氨基酸或复合氮源(如玉米浆、大豆粉、大豆蛋白、酵母提取物、肉提取物等)。可以有利地使用前述氮源的混合物。
培养基中可以含有的无机盐化合物包括钙、镁、钠、钴、钼、钾、锰、锌、铜和铁的氯化物、磷酸盐或硫酸盐。可以在培养基中加入螯合剂以保存溶液中的金属离子。合适的螯合剂具体包括二羟苯酚(如邻苯二酚或原苯酸)或有机酸(如柠檬酸)。培养基通常还含有其他生长因子如维生素或生长促进剂(包括例如生物素、核黄素、硫胺、叶酸、烟酸、panthothenate和吡哆醇)。生长因子和盐常来自复合培养基组分(如酵母提取物、糖蜜、玉米浆等)。培养基中使用化合物的准确组成在很大程度上取决于具体的实验,并对每一具体情况单独确定。优化培养基的信息可见于教科书《AppliedMicrobiol.Physiology,A Practical Approach》(P.M.Rhodes,P.F.Stanbury编,IRL Press(1997)S.53-73,ISBN 0 19 963577 3)。还可以从供应商获得生长培养基,例如Standard 1(Merck)或BHI(Brain heart infusion,DIFCO)等。
所有培养基组分通过加热(1.5bar,121℃下20分钟)或过滤灭菌进行灭菌。可以一起或必要时分别灭菌组分。所有培养基组分可以在培养起始时存在或按所需持续或批量加入。
对每一实验分别定义培养条件。温度一般在15℃和45℃之间并可以保持恒定或可以在实验过程中改变。培养基的pH应该在5到8.5的范围内(优选7.0左右),并可通过向培养基中加入缓冲液来保持。对于这一目的的缓冲液的实例为磷酸氢二钾缓冲液。合成缓冲液(如MOPS、HEPES、ACES等)可以作为代替使用或同时使用。可以通过加入如NaOH或NH4OH在培养期中保持培养物pH值恒定。如果使用复合培养基组分(如酵母提取物),则较少需要额外的缓冲液,因为许多复合化合物具有高缓冲能力。使用发酵罐培养微生物时,还可以使用气态氨调节pH。
孵育期通常在从数小时到几天的范围内。以发酵液中积累最大量产物的方式选择这一时间期。公开的生长实验可以在多种容器中进行,例如微孔板、玻璃管、玻璃瓶或各种尺寸的玻璃或金属发酵罐。为筛选大量克隆,应该在微孔板、玻璃管或摇瓶(简单瓶或挡板瓶)中培养微生物。优选使用装入10%(基于体积)所需生长培养基的100ml摇瓶。应该在定轨摇床(振幅25mm)上以从100rpm到300rpm范围内的速率摇晃瓶。可以通过维持潮湿空气来减少蒸发损失,或者可以对蒸发损失进行数学修正。
如果检测遗传修饰的克隆,测试中还应包括含有无插入的基本质粒的对照克隆或未修饰的对照克隆。如果表达转基因序列,测试中也应有利地包括对照克隆。使用在30℃孵育的琼脂平板(如CM平板)(10g/l葡萄糖、2.5g/l NaCl、2g/l尿素10g/l聚胨、5g/l酵母提取物、5g/l肉提取物、22g/l琼脂,用2M NaOH调至pH值6.8)上培养的细胞有利地将培养基孵育至OD600为0.5到1.5。通过引入来自CM平板的谷氨酸棒杆菌细胞的盐溶液或通过加入该细菌的液体预培养物孵育培养基。
实施例7:体外分析转化序列所编码蛋白质的功能
酶的活性和动力学参数的测定为本领域所熟知。测定特定修饰酶活性的实验必须适合野生型的比活性,这是技术人员完全能够做到的。酶的总论和关于结构、动力学、原则、方法、应用和鉴定多种酶活性的实例的具体细节的概述可见于例如以下文献:Dixon,M.和Webb,E.C:(1979)《Enzymes》,Longmans,London;Fersht(1985)《Enzyme Structure andMechanism》,Freeman,New York;Walsh(1979)《Enzymatic ReactionMechanisms》,Freeman,San Francisco;Price,N.C.,Stevens,L.(1982)《Fundamentals of Enzymology》,Oxford Univ.Press:Oxford;Boyer,P.D编(1983)The Enzymes,第三版.Academic Press,New York;Bisswanger,H.(1994)Enzymkinetik,2第二版VCH,Weinheim(ISBN3527300325);Bergmeyer,H.U.,Bergmeyer,J.,Graβl,M.编1983-1986)《Methods of Enzymatic Analysis》,第三版,I-XII卷,Verlag Chemie:Weinheim;和Ullmann的《Encyclopedia of Industrial Chemistry》(1987)A9卷,″Enzymes″,VCH,Weinheim,352-363页。
实施例8:分析核酸分子对产生氨基酸的影响
可以通过在适当条件(如上文所述)下培养修饰的微生物并分析培养基和/或细胞组分氨基酸产生的提高来测定谷氨酸棒杆菌中遗传修饰对氨基酸产生的影响。这些分析技术为技术人员所熟知,并包括光谱学、薄层层析、多种类型的染色方法、酶和微生物方法和分析型层析(如高效液相层析)(参阅如Ullman,《Encyclopedia of Industrial Chemistry》,A2卷,89-90和443-613页,VCH:Weinheim(1985);Fallon,A.,等(1987)《Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology》17卷中的″Applications of HPLC in Biochemistry″;Rehm等(1993)《Biotechnology》,3卷,III章:″Product recovery and purification″,469-714,VCH:Weinheim;Belter,P.A.等(1988)《Bioseparations:downstream processing for Biotechnology》,John Wiley and Sons;Kennedy,J.F.和Cabral,J.M.S.(1992)《Recovery processes for biologicalMaterials》,John Wiley and Sons;Shaeiwitz,J.A.和Henry,J.D.(1988)《Ullmann′s Encyclopedia of Industrial Chemistry》B3卷;11章,1-27页中的“Biochemical Separations”,VCH:Weinheim;和Dechow,F.J.(1989)《Separation and purification techniques in biotechnology》,NoyesPublications)。
除了测定发酵终产物以外,也可以分析产生所述化合物所使用的代谢途径中的其他组分(如中间产物和副产物),以测定生物的总生产率、化合物的得率和/或产生效率。分析方法包括测定培养基中营养素的量(例如糖、碳水化合物、氮源、磷酸盐和其他离子)、测定生物质组成和生长、分析生物合成途径正常代谢物的产生和测定发酵期间产生的气体。这些标准方法描述于《Applied Microbial Physiology;A Practical Approach》,P.M.Rhodes和P.F.Stanbury编IRL Ptess,103-129页;131-163页和165-192页(ISBN:0199635773)及其引用的参考文献。
实施例9:纯化氨基酸
可以通过多种本领域已知的方法从细胞或从前述培养物的上清液中回收氨基酸。例如,首先回收培养物上清液。为此,通过慢速离心从培养物中收获细胞。一般通过标准技术(如机械力或超声处理)破坏或裂解细胞。通过离心去除细胞碎片,上清液部分(适当时与培养物上清液一起)用于进一步纯化氨基酸。然而,如果氨基酸在上清液中以足够高的浓度存在,也可以单独处理上清液。这种情况下,可以例如通过提取和/或盐沉淀或通过离子交换层析进一步纯化氨基酸或氨基酸混合物。
如果必要且需要,可以继续进行用适当树脂的其他层析步骤,其中样品中的氨基酸而不是污染物留在层析树脂上,或者污染物而不是含有产品(氨基酸)的样品留在树脂上。必要时,可以使用同样的或其他层析树脂重复这些层析步骤。技术人员熟悉合适层析树脂的选择和针对待纯化的特定分子的最高效使用。可以通过过滤或超滤浓缩纯化的产物并保存于保证产物最大稳定性的温度。不限于以上纯化方法的多种纯化方法为本领域公知。它们描述于例如Bailey,J.E.&Ollis,D.F.Biochemical EngineeringFundamentals,McGraw-Hill:New York(1986)。
可以通过本领域标准技术测定分离的氨基酸的身份和纯度。它们包括高效液相层析(HPLC)、分光镜方法、质谱(MS)、染色方法、薄层层析、NIRS、酶测定法或微生物测定法。这些分析方法汇编于Patek等(1994)Appl.Environ.Microbiol.60:133-140;Malakhova等(1996)Biotekhnologiya 11:27-32;和Schmidt等(1998)Bioprocess Engineer.19:67-70.Ulmann的《Encyclopedia of Industrial Chemistry》(1996)A27卷,VCH:Weinheim,89-90页、521-540页、540-547页、559-566页、575-581页和581-587页;Michal,G(1999)《Biochemical Pathways:An Atlas ofBiochemistry and Molecular Biology》,John Wiley and Sons;Fallon,A.等(1987)《Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology》,17卷中的“Applications of HPLC in Biochemistry”。
实施例10  通过失活或下调基因设计拟南芥植物
基于修饰的pPZP二元载体主链(含有用于细菌选择的卡那霉素基因Hajukiewicz,P.等,1994,Plant Mol.Biol.,25:989-994)和由mas2’1’和mas271f启动子(Velten等,1984,EMBO J.3,2723-2730;Mengiste,Amedeo和Paszkowski,1997,Plant J.,12,945-948)驱动的选择标记bar基因(DeBlock等,1987,EMBO J.6,2513-2518)构建了二元敲除载体。
其他可用于插入诱变的二元载体为pBIN19、pBI101、pBinAR或pGPTV。二元载体及其特性的综述见Hellens等,2000,Trends in plantScience,5:446-451 和GuerineauF.,Mullineaux P.,1993,Planttransformation and expression vectors in plant molecular biology,LABFAX Series,(Croy R.R.D.编)121-127页  Bios Scientific Publishers,Oxford。
农杆菌的转化
使用热激或电穿孔方案将质粒转化进根瘤农杆菌(GV3101pMP90;Koncz和Schell,1986,Mol.Gen.Genet.204:383-396)。转化的菌落在YEP培养基上培养并通过各自的抗生素(Rif/Gent/Km)在28℃选择2天。用这些农杆菌培养物进行植物转化。
按照标准条件(Bechtold,N.,Ellis,J.,Pelletier,G.1993.In plantaAgrobacterium mediated gene transfer by infiltration of Arabidopsisthaliana plants.R.Acad.Sci.Paris.316:1194-1199;Bent,A.F.,Clough,J.C.,1998;Floral dip:a simplified method for Agrobacterium-mediatedtransformation of Arabidopsis thaliana,PLANT J.16:735-743)培养和转化C24生态型拟南芥。
使用其各自的抗性基因选择转化的植物(F1)。对于BASTA_抗性,幼苗用0.02%的BASTA_以2到3天的间隔喷洒四次,使转化的植物结籽。将50-100株苗(F2)再次进行标记选择,对于BASTA_抗性,在幼苗期连续4天喷洒0.1%的BASTA_。选择单抗性位点分离(抗性苗比敏感苗约为3∶1)的植物进行进一步分析。再使这些株系中的三株抗性苗(F2)结籽并通过使其种子(F3)在含有选择试剂(BASTA_,15mg/L草铵膦(ammonium glufosinate),Pestanal,Riedel de Haen,Seelze,德国)的琼脂培养基上体外萌发来测试其纯合性。显示接近100%抗性子代(F3)的F2株系认为是纯合的,并用于功能性分析。
实施例11:用于生物统计学分析的植物栽培
为了生物统计学分析转基因植物,后者在特定的栽培设备中均一地生长。为此,GS-90基质作为培养料混合物被置入装盆机器(Laible SystemGmbH,Singen,Germany)中并装入盆中。此后,将35盆组合在一个盘中并用Previcur处理。处理时,25ml Previcur注入10l自来水中。这样的数量足够处理大约200盆。将盆置于Previcur溶液中且另外的上部灌溉使用不含Previcur的自来水。它们在四天之内使用。
播种时,将曾储藏在冰箱(-20℃)中的种子用牙签从Eppendorf管中移出并转移进装有培养料的盆中。全部大约5到12个种子被投放进盆的中部。
播种后,将带有盆的盘子用匹配的塑料盖覆盖并置于成层室在4℃暗中四天。湿度为大约90%。成层后,实验植物以16小时光照8小时黑暗的节奏在20℃,大气湿度60%且CO2浓度大约400ppm下生长22到23天。使用的光源为来自Osram的Powerstar HQI-T 250W/D日光灯,它产生具有大约220μE/m2/s-1光强的集合了太阳层析的光线。
在转基因抗性植物到达14天龄时间苗。在盆中间生长最好的植物被认为是靶标植物。所有剩余的植物使用金属镊子小心移除并丢弃。
在植物生长期间,它们获得使用蒸馏水的上部灌溉(浇至培养料上)和浇至放置沟槽的底部灌溉。当植物达到23天龄时收集。
实施例12:转基因植物的代谢分析
根据本发明鉴定的对上述代谢物含量的修饰,根据下述步骤鉴定。
a)样品的取样和保存
取样直接在人工气候室中进行。使用小的实验室剪刀剪切植物,用实验室天平快速称量,移至预冷的提取管中并置于用液氮冷却的铝架上。如果需要,可将提取管保存在-80℃冰箱中。剪切植物和将其冷冻在液氮中之间消耗的时间总计不要多于10到20秒。
b)冻干法
在实验中,注意将植物保存在深度冷冻状态(温度<-40℃)或冷冻干燥直到第一次接触溶剂。
带有盛放植物样品的提取管的铝架被放置在预冷(-40℃)的冻干设备中。主要干燥状态中的起始温度为-35℃且压强为0.120mbar。在干燥状态中,参数依照压强和温度程序变化。12小时后的最终温度为+30℃且最终压强为0.001到0.004mbar。关闭真空泵和制冷机后,用空气(通过干燥管干燥)或氩气充满系统。
c)提取
低压冻干器被充满后立刻将装有低压冻干植物材料的提取管转移至5ml的ASE设备(Accelerated Solvent Extractor ASE 200 with SolventController and AutoASE software(DIONEX))提取柱上。
ASE设备(Accelerated Solvent Extractor ASE 200 with SolventController and AutoASE software(DIONEX))的24个样品位置充满植物样品,包括一些用于测试质量控制的样品。
极性物质提取用10ml甲醇/水(80/20,体积/体积)在T=70℃且p=140bar下5分钟加热状态,一分钟静止提取。更亲脂的物质提取用大约10ml甲醇/二氯甲烷(40/60,体积/体积)在T=70℃且p=140bar下5分钟加热状态,一分钟静止提取。将两种溶剂混合物提取至相同的玻璃管中(离心管,50ml,装有螺旋帽和ASE(DIONEX)pierceable septum)。
用内标处理溶液:核糖醇、L-甘氨酸-2,2-d2、L-丙氨酸-2,3,3,3-d4、甲硫氨酸-甲基-d3和α-甲基吡喃葡萄糖苷和methyl nonadecanoate、十三酸甲酯、十五酸甲酯、二十九酸甲酯。
用8ml水处理完全提取物。丢弃植物样品固体残余和提取管。
摇动提取物然后在至少1400g离心5到10分钟以加速相分离。移出1ml上清甲醇/水相(“极性相”,无色)用于进一步的GC分析,再移出1ml用于LC分析。丢弃剩余的甲醇/水相。移出0.5ml有机相(“脂质相”,深绿色)用于进一步GC分析,再移出0.5ml用于LC分析。所有移出的部分使用IR Dancer红外真空脱水器(Hettich)脱水至干燥。脱水步骤中的最高温度不超过40℃。装置中的压强不小于10mbar。
d)处理脂质相用于LC/MS或LC/MS/MS分析
已经脱水至干的脂质提取物被流动相吸收。使用剃度洗脱进行HPLC。
已经脱水至干的极性提取物被流动相吸收。使用剃度洗脱进行HPLC。
e)衍生化脂质相用于GC/MS分析
为了transmethanolysis,向脱水过的提取物中添加140μl氯仿、37μl盐酸(37%重量的HCl溶于水)、320μl甲醇和20μl甲苯的混合物。将管封紧并在100℃振荡加热2小时。然后将溶液脱水至干。残留物完全干燥。
碳基的甲氧胺化通过与甲氧胺盐酸盐(5mg/ml吡啶100μl 60℃持续1.5小时)在封紧的管中反应进行。根据时间标准加入20μl奇数直链脂肪酸溶液(从7到25碳原子脂肪酸每种0.3mg/mL和27、29和31碳原子脂肪酸每种0.6mg/mL在3/7(体积/体积)吡啶/甲苯中的溶液)。最后,仍在封紧的管中60℃ 30分钟进行100μl N-甲基-N-(三甲基硅烷基)-2,2,2-三氟乙酰胺(MSTFA)的衍生化。注射进GC之前的最终体积为220μl。
f)分析多种植物样品
样品按照每组20个植物样品的独立组(也称为序列)测量。在筛选实验中,每个序列分析20个不同的转基因株系,而在确认实验中,每个序列包含每种转基因株系的至少三个重复加上至少5个野生型植物作为对照。根据植物确定的鲜重调节每种分析物的峰区(标准化区)。通过进一步对对照标准化计算比值。在筛选实验中,该对照为根据给定分析物基于相应序列中所有植物的所有标准化区计算的中位数。在确认实验中,比值通过用标准化区除以同一序列野生型对照组相应数据的均值计算。获得的数值被称为ratio by对照,它们可在序列之间比较并指明分析物在突变体中浓度与对照组中相对差异多少,所述对照组为野生型对照(确认实验)或(筛选)给定序列的其他突变体。之前完成了合适的对照以证明载体和转化自身对植物代谢组分没有显著影响。因此与对照组相比期望的改变毫无疑问是由突变引起的。
作为另一种选择,可通过HPLC分离在乙醇提取物中如Geigenberger等人(Plant Cell & Environ,19,1996:43-55)所述有利地探测氨基酸。
不同植物分析的结果可见下面的表2。
表2:本发明化合物的分析结果
seqID 登录 代谢产物   与WT的最小和最大比值 方法
 1  At2g25320 甲硫氨酸 1,11-2,02  LC
 7  At3g07610 甲硫氨酸 1,49-2,77  LC
 17  At3g15600 甲硫氨酸 1,08-1,77  LC
 64  At1g14490 甲硫氨酸 1,01-1,83  LC
 151  At1g30570 甲硫氨酸 1,06-2,13  GC
 228  At2g21290 甲硫氨酸 1,14-1,35  LC
 282  At3g14230 甲硫氨酸 1,22-2,19  LC
第1列显示被敲除基因的seqID,第2列显示各自的Genebank登录号。第3列显示分析的氨基酸。第4列显示转基因植物和野生型之间分析的氨基酸比例。第5列指出分析方法。
独立重复分析时证明所有的结果是显著的。
分析选出的代谢变化的株系
由于预选了单插入位点和纯合抗性标记的的株系,T-DNA整合过程中单基因的破坏(或突变)预计会导致代谢表型。选择表现一致表型的株系进行分子分析。
使用标准程序(Qiagen,Hilden,德国的旋转柱或AmershamBiosciences,Freiburg,德国的Nucleon Phytopure试剂盒)从约100mg来源于这些株系的叶组织中纯化基因组DNA。使用两种不同方法扩增T-DNA的插入侧。根据Spertini D,Baliveau C.和Bellemare G.,1999,Biotechniques,27,308-314的衔接头PCR方法,分别使用T-DNA特异性引物LBl(5′-TGACGC CAT TTC GCC TTT TCA-3′SEQ ID 35)或RB 1-2(5’-CAA CTTAAT CGC CTT GCA GCA CA-3’;SEQ ID NO:36)进行第一轮,LB2(5′-CAG AAA TGG ATAAAT AGC CTT GCT TCC-3′;SEQ ID NO:37)或RB4-2(5′-AGC TGG CGT AAT AGC GAA GAG-3′;SEQ ID NO:38)进行第二轮PCR。另外进行了TAIL-PCR(Liu Y-G,Mitsukawa N,OosumiT和Whittier RF,1995,Plant J.8,457-463)。这种情况下作为T-DNA特异性引物分别用于左或右边界的是第一轮PCR的LB1(5′-TGA CGC CATTTC GCC TTT TCA-3′;SEQ ID 35)或RB1-2(5′-CAA CTT AAT CGCCTT GCA GCA CA-3′;SEQ ID 36)、第二轮的LB2(5′-CAGAAA TGGATA AAT AGC CTT GCT TCC-3′;SEQ ID 37)或RB4-2(5′-AGC TGGCGT AAT AGC GAA GAG-3′;SEQ ID 38)以及最后一轮PCR的LB3(5′-CCA ATA CAT TAC ACT AGC ATC TG-3′SEQ ID 39)或RB5(5′-AAT GCT AGA GCA GCT TGA-3′SEQ ID 40)。
在琼脂糖凝胶上鉴定正确的PCR产物并使用柱和标准程序纯化(Qiagen,Hilden,德国)。PCR产物用位于靠近扩增使用的引物相应边界的另外的T-DNA特异性引物进行测序。测序反应中对于含有左边界序列的接头PCR产物使用引物LBseq(5′-CAA TAC ATT ACA CTA GCATCTG-3′;SEQ ID 41),含有右边界序列的序列使用引物RBseq(5′-AGAGGC CCG CAC CGATCG-3;SEQ ID 42)。测序反应中对于含有左边界序列的TAIL PCR产物使用引物Lbseq2(5’-CTA GCA TCT GAA TTTCAT AAC C-3’;SEQ ID NO:43),含有右边界序列的序列使用引物Rbseq2(5’-GCT TGA GCT TGG ATC AGA TTG-3’;SEQ ID NO:44)。使用blast算法将得到的序列与Genbank提供的拟南芥基因组序列进行比较(Altschul等,1990.J Mol Biol,215:403-410)。
表3给出了用于鉴定基因组位点的PCR产物的详细情况。标明的是拟南芥基因组中鉴定出的经注释的开放读码框、得到的PCR产物的预计大小(碱基对)、实现扩增的T-DNA边界(LB:左边界、RB:右边界)、得到标明的PCR产物的方法(解释见上文)、衔接头PCR中各自的限制性酶以及TAIL PCR中的简并引物。通常使用简并引物ADP2(5’-NGTCGA SWG ANA WGAA-3’;SEQ ID NO:45),ADP3(5’-WGTGNAGWANCANAGA-3’;SEQ ID NO:46),ADP5(5’-STT GNT AST NCT NTG C-3’;SEQ ID NO:47),ADP6(5’-AGWGNAGWANCANAGA-3’;SEQ ID NO:48),ADP8(5’-NTGCGASWGANWAGAA-3’;SEQ ID NO:49),ADP9(5’-NTG CGA SWG ANT AGA A-3’;SEQ ID NO:50)和ADP11(5’-SST GGS TAN ATW ATW CT-3’;SEQ ID NO:51)。
在每种情况下使用上述T-DNA特异性引物之一和从鉴定的接近插入侧的基因组位点推出的引物进行对照PCR以确认鉴定出的插入位点。插入株系中使用这两种引物的预期大小PCR产物的扩增证明通过T-DNA整合破坏了鉴定出的位点。
表3:用于鉴定显示甲硫氨酸提高的株系中下调的基因组位点的PCR产物详表
表3:PCR产物
 SEQID     ORF PCR产物 边界 方法 限制性酶或简并引物
 1  at2g25320  1000  RB 接头 MunI
 7  at3g07610  820  LB 接头 SpeI
 17  at3g15600  750  LB 接头 Psp1406l/Bsp119l
 64  At1g14490  550  LB 接头 SpeI
 151  At1g30570  250  LB 接头 Psp1406/Bsp119l
 228  At2g21290  350  LB 接头 SpeI
 282  At3g14230  300  LB 接头 BgIII
第1列显示被敲除基因的seqID,第2列显示基因的Genebank登录号。第3列给出扩增的PCR产物的大约长度,第4列给出PCR产物用以扩增的T-DNA边界,第5列指出扩增用的PCR方法,第6列给出PCR方法中使用的简并引物的限制性酶(第5和第6列的详细解释见上文)。
实施例13:构建用于阻抑本发明基因的反义构建体
PCR扩增SEQ ID NO:7的片段。可添加限制性位点至用于扩增的引物以能够克隆PCR产物。可选的,可添加重组位点至引物以能够进行重组反应。将PCR片段克隆或重组进二元载体,优选以下述方式位于强组成型、组织或发育特异的启动子控制下:启动子方向与该基因在其最初基因组的位置相反。
使用从下述基因序列中推出的寡核苷酸进行SEQ ID NO:7片段的扩增:
a3g07610fw:5’-atattaattaaggtaattaggtatcatatct-3’(SEQ IDNO:52)
a3g07610rev:5’-ataccatggggatctacgtaattcgccag-3’(SEQ ID NO:53)
寡核苷酸溶于水中得到20μM的浓度。PCR反应含有5μl Herculase缓冲液(Stratagene)、0.4μl dNTP(各25mM)(Amersham)、0.5μl引物a07610fw、0.5μl引物a07610rev、0.5μl Herculase(Stratagene)、0.5μlgDNA和42.6μl水。使用以下程序在MJ-Cycler Tetrad(BioZym)上进行PCR:
94℃4分钟,随后94℃1分钟、50℃1分钟、72℃2分钟30个循环,随后72℃10分钟并冷却至25℃。
使用Qiagen的试剂盒纯化PCR产物。然后用NcoI/PacI在37℃过夜消化DNA。然后将片段克隆进已用NcoI/PacI消化的载体1bxPcUbicolic中。产生的构建体命名为1bxPcUbianti3g07610。
实施例14:构建用于阻抑本发明基因的RNAi构建体
PCR扩增SEQ ID NO:7的片段。可添加限制性位点至用于扩增的引物以能够克隆PCR产物。可选的,可添加重组位点至引物以能够进行重组反应。将PCR片段克隆或重组进二元载体,优选以下述方式位于强组成型、组织或发育特异的启动子控制下:启动子方向与该基因在其最初基因组的位置相反。
使用从下述基因序列中推出的寡核苷酸进行SEQ ID NO:7片段的扩增:
ri3g07610fw:5’-ataggtaccggtaattaggtatcatatct-3’(SEQ IDNO:54)
ri3g07610rev:5’-atagtcgacggatctacgtaattcgccag-3’(SEQ ID NO:55)
寡核苷酸溶于水中得到20μM的浓度。PCR反应含有5μl Herculase缓冲液(Stratagene)、0.4μl dNTP(各25mM)(Amersham)、0.5μl引物a07610fw、0.5μl引物a07610rev、0.5μl Herculase(Stratagene)、0.5μlgDNA和42.6μl水。使用以下程序在MJ-Cycler Tetrad(BioZym)上进行PCR:
94℃ 4分钟,随后94℃ 1分钟、50℃ 1分钟、72℃ 2分钟30个循环,随后72℃ 10分钟并冷却至25℃。
使用Qiagen的试剂盒纯化PCR产物。然后用Asp718/SaII在37℃过夜消化DNA。然后将片段克隆进已用Asp718/SaII消化的载体10xPcUbispacer中。产生的构建体用XhoI/BsrGI消化并将相同的Asp718/SaII消化的PCR片段连接进该载体。随后将引起BASTA抗性的表达盒作为XbaI片段连接进之前用XbaI切开并去磷酸化的该载体中。产生的构建体命名为1bxPcUbiri3g07610。
实施例15:构建用于阻抑本发明基因的共抑制构建体
PCR扩增SEQ ID NO:7的片段。可添加限制性位点至用于扩增的引物以能够克隆PCR产物。可选的,可添加重组位点至引物以能够进行重组反应。将PCR片段克隆或重组进二元载体,优选以下述方式位于强组成型、组织或发育特异的启动子控制下:启动子方向与该基因在其最初基因组的位置相反。
使用从下述基因序列中推出的寡核苷酸进行SEQ ID NO:7片段的扩增:
c3g07610fw:5’-ataccatggggtaattaggtatcatatct-3’(SEQ ID NO:56)
c3g07610rev:5’-atattaattaaggatctacgtaattcgccag-3’(SEQ ID NO:57)
寡核苷酸溶于水中得到20μM的浓度。PCR反应含有5μl Herculase缓冲液(Stratagene)、0.4μl dNTP(各25mM)(Amersham)、0.5μl引物a07610fw、0.5μl引物a07610rev、0.5μl Herculase(Stratagene)、0.5μlgDNA和42.6μl水。使用以下程序在MJ-Cycler Tetrad(BioZym)上进行PCR:
94℃ 4分钟,随后94℃ 1分钟、50℃ 1分钟、72℃ 2分钟30个循环,随后72℃ 10分钟并冷却至25℃。
使用Qiagen的试剂盒纯化PCR产物。然后用NcoI/PacI在37℃过夜消化DNA。然后将片段克隆进已用NcoI/PacI消化的载体1bxPcUbicolic中。产生的构建体命名为1bxPcUbicos3g07610。
实施例16:通过人造转录因子减少本发明基因表达
也可通过引入合成的特异阻抑物下调本发明基因和它们在其他物种中的同源ORF。为该目的构建嵌合的锌指蛋白基因,所述锌指蛋白与目的基因或其在其他物种中的同源物的调节或编码区的特异区结合。人造锌指蛋白包含特异的DNA结合结构域,其由例如锌指和任选的阻抑(例如EAR)结构域组成(Hiratsu等,2003.Plant J.34(5),733-739 Dominant repressionof target genes by chimeric repressors that include the EAR motif,arepression domain,in Arabidopsis.)。
该嵌合阻抑物在例如植物中的表达引起特异阻抑靶基因或其在其他植物物种中的同源物的特异阻抑,从而导致提高的代谢物生产。特别是关于设计和构建特异锌指结构域的实验细节可按照如WO 01/52620或OrdizMI,(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2002,Vol. 99,Issue 20,13290)或Guan,(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2002,Vol.99,Issue 20,13296)所述完成。
实施例17:通过在黑麦草中抑制本发明核酸序列同源物改造黑麦草植物
可以使用若干不同黑麦草变种的种子作为用于转化的外植体源,包括可从Svalof Weibull种子公司得到的商品变种Gunne或变种Affinity。种子依次用1%Tween20 1分钟,100%漂白剂60分钟表面消毒,漂洗三次,每次都用去离子水和蒸馏水进行5分钟,然后在潮湿的无菌滤纸上在黑暗中萌发3-4天。然后再用1%Tween20 1分钟,75%漂白剂5分钟消毒,用ddH2O洗涤三次,每次5分钟。
将表面消毒的种子置于含有Murashige和Skoog基础盐分和维生素、20g/l蔗糖、150mg/l天冬酰胺、500mg/l酪蛋白水解物、3g/l Phytagel、10mg/l BAP和5mg/l二氯甲氧苯酸的愈伤组织诱导培养基上。在黑暗中于25℃孵育培养皿4周,以使种子萌发并诱导胚胎发生的愈伤组织。
在愈伤组织诱导培养基上四周后,剪掉苗的嫩枝和根,将愈伤组织移至新鲜培养基上,再持续培养四周,然后转移至MSO培养基在光下两周。将数片愈伤组织(11-17周龄)用10目网筛损伤,然后置于愈伤组织诱导培养基上,或者在250mL三角瓶里于100mL液体黑麦草愈伤组织诱导培养基(与用于愈伤组织诱导的含琼脂的培养基相同)中培养。三角瓶用膜包好并于暗处在23℃以175rpm摇一周。用40目的网筛筛分液体培养物并收集细胞。筛网上收集的成分铺于固体黑麦草愈伤组织诱导培养基上,并在黑暗中于25℃培养一周。然后将愈伤组织转移至含有1%蔗糖的MS培养基上并培养2周。
可通过农杆菌或粒子轰击法完成转化。制备的表达载体包含pUC载体中的组成型植物启动子和基因cDNA。根据生产商的说明书使用Qiagen试剂盒从大肠杆菌细胞中制备质粒DNA。在培养皿中无菌滤纸的中央涂布大约2g胚胎发生的愈伤组织。在滤纸上加入含有10g/l蔗糖的液体MSO的等分试样。根据Sanford等,1993的方法用质粒DNA包裹金颗粒(1.0μm大小)并按如下参数将其递送给胚胎发生的愈伤组织:每次轰击500μg颗粒和2μgDNA、1300psi、从停止盘到愈伤组织盘的靶距离为8.5cm、每盘愈伤组织轰击一次。
轰击后将愈伤组织转移回新鲜的愈伤组织发育培养基,并在黑暗中室温保持1周时间。然后将愈伤组织转移至光下25℃的生长条件,以在合适选择剂(如250nM Arsenal,5mg/l PPT或50mg/L卡那霉素)下起始胚胎分化。出现对选择剂具有抗性的枝,一旦生根便转移到土壤中。
通过PCR分析原始转基因植物(T0)的样品以确认T-DNA的存在。这些结果通过Southern杂交确认,其中DNA在1%琼脂糖凝胶中电泳并转移至带正电荷的尼龙膜(Roche Diagnostics)上。按照生产商的推荐使用PCR DIG探针合成试剂盒(Roche Diagnostics)通过PCR制备地高辛(digoxigenin)标记探针。
转基因T0黑麦草植物通过切除分蘖进行营养繁殖。移植的分蘖在温室中维持两个月直至良好建立。除去嫩枝并使其生长两周。
实施例18:通过在大豆中抑制本发明核酸序列同源物改造大豆植物
根据下文Texas A&M专利US 5,164,310中所述方法的修改转化大豆。若干商品大豆变种可以通过该方法转化。通常用栽培种Jack(可从Illinois Seed Foundation获得)进行转化。种子通过在70%(v/v)乙醇中浸泡六分钟并在添加了1%(v/v)Tween的25%商品漂白剂(NaOCL)中浸泡20分钟来消毒,然后用无菌双蒸馏水漂洗四次。通过从每个苗上取下胚根、胚轴和一个子叶来繁殖七天苗。然后,将带有一片子叶的上胚轴转移至培养皿中新鲜的萌发培养基上,并在25℃ 16小时光周期(大约100FE-m-2s-1)下孵育三周。从3-4周龄植物上切下叶腋节(长度约4mm)。切除叶腋节并在农杆菌LBA4404培养物中孵育。
已经描述了许多不同的用于植物转化的二元载体系统(例如An,G.inAgrobacterium Protocols.Methods in Molecular Biology 44卷,47-62页,Garland KMA和MR Davey编,Humana Press,Totowa,New Jersey)。很多是基于Bevan(Nucleic Acid Research.1984.12:8711-8721)所述的pBIN19载体,它包括两侧与来源于根瘤农杆菌Ti质粒的左侧和右侧边界序列相连的植物基因表达盒。植物基因表达盒由至少两个基因组成——选择标记基因和调节性状基因的阻抑盒转录的植物启动子。可使用多种选择标记基因,包括编码突变型乙酰羟酸合酶(AHAS)酶(US专利57673666和6225105)的拟南芥基因。类似地,多种启动子可用于调节阻抑盒以提供组成型、发育、组织或环境调节的基因转录。在本实施例中,使用34S启动子(GenBank登录号M59930和X16673)以提供阻抑盒的组成型阻抑。
共同培养处理后,洗涤外植体并转移至添加了500mg/L特美汀的选择培养基。切除嫩枝并置于枝伸长培养基(shoot elongation medium)上。长于1cm的枝在移植进土壤前置于生根培养基上2到4周。
原始转基因植物(T0)通过PCR分析以确认T-DNA的存在。这些结果通过Southern杂交确认,其中DNA在1%琼脂糖凝胶中电泳并转移至带正电荷的尼龙膜(Roche Diagnostics)上。依照生产商的推荐使用PCRDIG探针合成试剂盒(Roche Diagnostics)通过PCR制备地高辛(digoxigenin)标记的探针。
实施例19:通过在玉米中抑制本发明核酸序列同源物改造玉米植物
使用Ishida等(1996.Nature Biotech14745-50)所述方法的修改来转化玉蜀黍。在玉米中,转化是基因型依赖性的且只有特殊的基因型才可用于转化和再生。自交系A188(明尼苏达大学)或以A188作为亲本的杂种是转化供体材料的优良来源(Fromm等,1990 Biotech8:833-839),但是其他基因型也可成功地使用。授粉后大约11天(DAP),当未成熟胚大约1到1.2mm时,从玉米植物采集穗。将未成熟胚与携带“超级二元”载体的根瘤农杆菌共同培养,并通过器官发生来再生转基因植物。Japan Tobacco的超级二元载体系统在WO专利WO 94/00977和WO 95/06722中有所描述。按所描述的构建载体。可使用包括编码突变型乙酰羟酸合酶(AHAS)酶(US专利6025541)的玉米基因在内的多种选择标记基因。类似地,可使用多种启动子调节阻抑盒以提供组成型、发育、组织或环境阻抑的基因转录。在本实施例中,使用34S启动子(GenBank登录号M59930和X16673)提供阻抑盒的组成型表达。
在愈伤组织诱导培养基上培养离体胚,然后在含有作为选择剂的咪唑啉酮的玉米再生培养基上培养。培养皿在25℃光下孵育2-3周,或直到枝发育。将绿色的枝从每个胚移至玉米生根培养基并在25℃培养2-3周直到根发育。将生根的枝移植到温室土壤中。从对咪唑啉酮除草剂显示耐性以及转基因PCR检测为阳性的植物中产生T1种子。
单一位点插入T-DNA的T1世代以3∶1的比例分离转基因。包含一个或两个转基因拷贝的后代对咪唑啉酮除草剂耐受。纯合的T2植物表现出与T1植物相似的表型。纯合转基因植物和非转基因植物的杂交植物(F1后代)也显示出提高的相似表型。
实施例20:通过在小麦中抑制本发明核酸序列同源物改造小麦植物
通过如Ishida等(1996 Nature Biotech.14745-50)所述的方法进行小麦转化。通常使用栽培种Bobwhite(可从CYMMIT,Mexico获得)进行转化。将未成熟胚与载有“超级二元”载体的根瘤农杆菌共同培养并通过器官发生再生转基因植物。Japan Tobacco的超级二元载体系统在WO专利WO94/00977和WO 95/06722中有所描述。按所描述的构建载体。可使用包括编码突变型乙酰羟酸合酶(AHAS)酶(US专利6025541)的玉米基因在内的多种选择标记基因。类似地,可使用多种启动子调节阻抑盒以提供组成型、发育、组织或环境调节的基因阻抑。在本实施例中,使用34S启动子(GenBank登录号M59930和X16673)以提供阻抑盒的组成型表达。
与农杆菌一起孵育后,胚在愈伤组织诱导培养基上培养,然后在含有作为选择剂的咪唑啉酮的再生培养基上培养。培养皿在25℃光下培养2-3周,或直到枝发育。将绿色的枝从每个胚移至生根培养基并在25℃培养2-3周直到根发育。将生根的枝移植到温室土壤中。从对咪唑啉酮除草剂显示耐性以及转基因PCR检测为阳性的植物中产生T1种子。
单一位点插入T-DNA的T1世代以3∶1的比例分离转基因。包含一个或两个转基因拷贝的后代对咪唑啉酮除草剂耐受。纯合的T2植物表现出相似的表型。
实施例21:通过在油菜籽/芸苔中抑制本发明核酸序列同源物改造油菜籽/芸苔植物
使用5-6天龄幼苗的子叶叶柄和下胚轴作为进行组织培养的外植体并根据Babic等(1998,Plant Cell Rep 17:183-188)进行转化。商品栽培种Westar(Agriculture Canada)是用于转化的标准变种,但可使用其他变种。
使用含有二元载体的根瘤农杆菌LBA4404转化芸苔。已经描述了许多不同的用于植物转化的二元载体系统(例如An,G.in AgrobacteriumProtocols.Methods in Molecular Biology 44卷,47-62页,Garland KMA和MR Davey编,Humana Press,Totowa,New Jersey)。很多是基于Bevan(Nucleic Acid Research.1984.12:8711-8721)所述的pBIN19载体,它包括两侧与来源于根瘤农杆菌Ti质粒的左侧和右侧边界序列相连的植物基因表达盒。植物基因表达盒由至少两个基因组成——选择标记基因和调节性状基因的阻抑盒转录的植物启动子。可使用多种选择标记基因,包括编码突变型乙酰羟酸合酶(AHAS)酶(US专利57673666和6225105)的拟南芥基因。类似地,多种启动子可用于调节阻抑盒以提供组成型、发育、组织或环境调节的基因阻抑。在本实施例中,使用34S启动子(GenBank登录号M59930和X16673)以提供阻抑盒的组成型表达。
通过在70%乙醇中浸泡两分钟,然后在含有一滴Tween20的30%Clorox中浸泡10分钟来表面消毒芸苔种子,随后用无菌的蒸馏水漂洗三次。然后使种子在不含激素含1%蔗糖、0.7%Phytagar的半强度MS培养基中于23℃ 16小时光照下体外萌发5天。从体外苗上切下带有子叶的子叶柄外植体,并通过将柄外植体的切除端浸入细菌悬液来接种农杆菌。然后将外植体在含有3mg/l BAP、3%蔗糖、0.7% Phytagar的MSBAP-3培养基上于23℃ 16小时光照下培养两天。与农杆菌共同培养两天后,将叶柄外植体移至含有3mg/l BAP、头孢噻肟、羧苄青霉素或特美汀(300mg/l)的MSBAP-3培养基上培养7天,然后在含有头孢噻肟、羧苄青霉素或特美汀以及选择剂的MSBAP-3培养基上培养直到枝再生。当枝长5-10mm时将其切下并移至枝伸长培养基(含有0.5mg/l BAP的MSBAP-0.5)上。将长约2cm的枝移至生根培养基(MSO)上进行根诱导。
原始转基因植物(T0)的样品通过PCR分析确认T-DNA的存在。这些结果通过Southern杂交确认,其中DNA在1%琼脂糖凝胶中电泳并转移至带正电荷的尼龙膜(Roche Diagnostics)上。依照生产商的推荐使用PCR DIG探针合成试剂盒(Roche Diagnostics)通过PCR制备地高辛(digoxigenin)标记的探针。
实施例22:通过在苜蓿中抑制本发明核酸序列同源物改造苜蓿植物
使用(McKersie等,1999 Plant Physiol 119:839-847)的方法转化苜蓿(紫苜蓿)的再生克隆。苜蓿的再生和转化是基因型依赖性的,因此需要再生植物。获得再生植物的方法已有描述。例如,它们可以选自Rangelander(Agriculture Canada)栽培种或如Brown DCW和AAtanassov(1985.Plant Cell Tissue Organ Culture 4:111-112)所述的任何其他商品苜蓿变种。另外,选择RA3变种(成斯康辛大学)用于组织培养(Walker等,1978 Am J Bot 65:654-659)。
将叶柄外植体与根瘤农杆菌C58C1 pMP90(McKersie等,1999 PlantPhysiol 119:839-847)或含有二元载体的LBA4404的过夜培养物共同培养。已经描述了许多不同的用于植物转化的二元载体系统(例如An,G.inAgrobacterium Protocols.《Methods in Molecular Biology》第44卷,47-62页,Garland KMA和MR Davey编,Humana Press,Totowa,New Jersey)。很多是基于Bevan(Nucleic Acid Research.1984.12:8711-8721)所述的pBIN19载体,它包括两侧与来源于根瘤农杆菌Ti质粒的左侧和右侧边界序列相连的植物基因表达盒。植物基因表达盒由至少两个基因组成——选择标记基因和调节性状基因的阻抑盒转录的植物启动子。可使用多种选择标记基因,包括编码突变的乙酰羟酸合酶(AHAS)酶(US专利57673666和6225105)的拟南芥基因。类似地,多种启动子可用于调节阻抑盒以提供组成型、发育、组织或环境调节的基因阻抑。在本实施例中,使用34S启动子(GenBank登录号M59930和X16673)以提供阻抑盒的组成型表达。
外植体在含有288mg/L脯氨酸,53mg/L硫代脯氨酸,4.35g/L K2SO4,以及100μM乙酰丁香酮的SH诱导培养基上在暗处共同培养三天。在半强度Murashige-Skoog培养基(Murashige和Skoog,1962)中洗涤外植体并铺在不含有乙酰丁香酮而含有合适的选择剂及抑制农杆菌生长的合适抗生素的相同SH诱导培养基上。数周后,将体细胞胚移至不合有生长调节物质和抗生素的50g/L蔗糖的BOi2Y发育培养基中。随后体细胞胚在半强度Murashige-Skoog培养基上发育。将生根的苗移植到盆中并在温室中培养。
通过结节切除并在Turface生长培养基中生根来繁殖T0转基因植物。除去植物的叶子并培养至大约10cm的高度(除叶后约两周)。
实施例23:通过同源重组敲除本发明基因
在随机突变种群中鉴定本发明基因中的突变
a)在化学或辐射突变种群中
制备化学和辐射突变种群是常规技术且为技术人员所掌握。方法由Koorneef等1982及其中的引文以及和Lightner和Caspar在《Methods inMolecular Biology》82卷中描述。这些技术通常诱导可使用如TILLING(Colbert等2001)方法在任一已知基因中鉴定的点突变。
b)通过反向遗传学在T-DNA或转座子突变种群中
多个案例中已描述了鉴定目的基因的插入突变体的反向遗传策略,例如Krysan等,1999(Plant Cell 1999,11,2283-2290);Sessions等,2002(PlantCell 2002,14,2985-2994);Young等,2001,(Plant Physiol.2001,125,513-518);Koprek等,2000(Plant J.2000,24,253-263);Jeon等,2000(Plant J.2000,22,561-570);Tissier等,1999(Plant Cell 1999,11,1841-1852);Speulmann等1999(Plant Cell 1999,11,1853-1866)。简要地,从大的T-DNA或转座子诱变植物群的所有植物中收集材料并制备基因组DNA。然后依照如Krysan等,1999(Plant Cell 1999,11,2283-2290)中所述特殊工艺合并基因组DNA。然后通过特定的多重PCR反应检测插入的诱变剂(例如T-DNA或转座子)和目的基因的组合来筛选基因组DNA库。因此使用T-DNA或转座子边界引物和基因特异引物的特定组合在DNA库中进行PCR反应。引物设计的一般原则可见Krysan等1999(Plant Cell1999,11,2283-2290)。较低水平DNA库的再筛选导致鉴定出其中目的基因被插入的诱变剂破坏的植物个体。
等同物
本领域普通技术人员只使用例行实验将识别或将能够确定本发明文中所述特定实施方案的许多等同物。这些等价物旨在包含于权利要求书中。

Claims (34)

1.产生甲硫氨酸的方法,其包括下面步骤:
a)在非人生物中减少或缺失如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:8、SEQID NO:20、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:229或SEQ ID NO:283所述蛋白质所表现出的生物活性;和
b)在允许所述生物中产生甲硫氨酸的条件下生长该生物。
2.如权利要求1的方法,其中回收由该生物合成的甲硫氨酸。
3.如权利要求1或2方法,其中通过减少或缺失至少一个核酸分子的表达来减少或缺失如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性,其中该核酸分子选自:
a)编码SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQID NO:28、SEQ ID NO:30,SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽的核酸分子;
b)含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQID NO:27、SEQ ID NO:29,SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271、、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所示核酸分子的核酸分子;
c)有下述核酸序列的核酸分子,所述核酸序列由于遗传密码子的简并性可来自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述多肽序列;
d)编码多肽的核酸分子,所述多肽与下面多肽的氨基酸序列有至少50%的同一性,所述多肽由(a)到(c)的核酸分子编码并具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
e)编码多肽的核酸分子,所述多肽用抗以下多肽的单克隆或多克隆抗体分离,所述多肽由(a)到(d)核酸分子之一编码并具有SEQ ID NO:2、SEQID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现的生物活性;
f)编码多肽的核酸分子,所述多肽含有SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150、SEQ ID NO:223、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:225、SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:246、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:273、SEQ ID NO:274、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277、SEQ ID NO:278、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:281、SEQ ID NO:438、SEQ ID NO:439或SEQ ID NO:442所示共有序列并具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
g)编码多肽的核酸分子,所述多肽具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性;
h)核酸分子,其可通过用含有(a)或(b)核酸分子序列之一的探针或具有在(a)到(c)表征核酸分子的至少15nt,优选20nt、30nt、50nt、100nt、200nt或500nt的片段在严格杂交条件下筛选适当的核酸文库获得,并编码具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性的多肽;
或含有与上述核酸分子互补的序列的核酸分子。
4.权利要求1到3中任一项的方法,其中通过含有选自如下步骤的方法减少或缺失如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性:
(a)引入编码核糖核酸序列的核酸分子,所述核糖核酸序列能够形成双链核糖核酸分子,其中所述双链核糖核酸分子的正义链与下述核酸分子有至少30%的同源性,该核酸分子赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达或编码具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质,或含有与赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子有至少50%同源性的核酸分子的至少17、18、19、20、21、22、23、24或25个碱基对的片段;
(b)引入反义核酸分子,其中该反义核酸分子与以下核酸分子的反义核酸分子具有至少30%的同源性,所述核酸分子编码具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质或赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达,或引入反义核酸分子,所述反义核酸分子含有以下核酸分子的至少15个碱基对的片段,该核酸分子与赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子的反义核酸分子有至少50%同源性的核酸分子;
(c)引入核酶,所述核酶特异切割赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子;
(d)引入(b)表征的反义核酸分子和(c)表征的核酶;
(e)引入赋予如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ IDNO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:118、SEQ IDNO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ IDNO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ IDNO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ IDNO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ IDNO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ IDNO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ IDNO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271、、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ IDNO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ IDNO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ ID NO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ IDNO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ IDNO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ IDNO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ ID NO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ IDNO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ ID NO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ IDNO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ ID NO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述核酸分子表达的有义核酸分子或编码与由权利要求3(a)到(c)核酸分子编码并具有如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的多肽的氨基酸序列有至少50%同一性的多肽的核酸分子,以诱导具有如权利要求1的蛋白质生物活性的内源蛋白质的共抑制;
(f)引入核酸分子,其赋予表达具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质的显性失活突变体;
(g)引入编码因子的核酸分子,所述因子与赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子结合;
(h)引入赋予RNA分子降低的病毒核酸分子,所述RNA分子赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达;
(i)引入核酸构建体,所述构建体能够与赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的内源基因重组;
(j)向内源基因中引入非沉默突变,所述基因赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达;
(k)引入表达构建体,所述构建体赋予(a)到(i)任一项表征的核酸分子表达。
5.如权利要求4所述的方法,其中使用少于1000bp的如权利要求3序列的5’或3’核酸序列,用于如权利要求4(a)、(b)、(e)、(f)到(g)所述减少或缺失如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性。
6.如权利要求1到5中任一项的方法,其中由化学化合物引起减少或缺失如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性。
7.如权利要求1到6任一项的方法,其中生物为选自微生物、非人动物和植物的转基因生物。
8.如权利要求7的方法,其中植物选自漆树科、紫菀科、伞形科、桦木科、紫草科、芸苔科、凤梨科、番木瓜科、大麻科、旋花科、藜科、葫芦科、茱萸科、杜鹃花科、大戟科、蝶形花科、牛儿苗科、禾本科、胡桃科、樟科、豆科、亚麻科、多年生草本、饲料作物、蔬菜和观赏植物。
9.如权利要求7的方法,其中微生物选自放线菌科、芽胞杆菌科、短杆菌科、棒杆菌科、肠杆菌科、Gordoniaceae、微球菌科、分枝杆菌科、诺卡氏菌科、假单胞菌科、根瘤菌科、链霉菌科、毛壳菌科、笄霉科、隐球酵母科、小克银汉霉科、Demetiaceae、从梗孢科、Mortierellaceae、毛霉科、腐霉科、酵母科,水霉科、裂殖酵母属、Sodariaceae、掷孢酵母科、瘤座孢科、Adelotheciaceae、甲藻纲、牛毛藓科和绿枝藻纲。
10.分离的核酸分子,其含有选自以下的核酸分子:
a)编码含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ IDNO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ IDNO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ IDNO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ IDNO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ IDNO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ IDNO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ IDNO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ IDNO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ IDNO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ IDNO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ IDNO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ IDNO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ IDNO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ IDNO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ IDNO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ IDNO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ IDNO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ IDNO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ IDNO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ IDNO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ IDNO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多肽的多肽的核酸分子;
b)含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ IDNO:137、SEQ IDNO:139、SEQ IDNO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ IDNO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ IDNO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ IDNO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ IDNO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ IDNO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所示多核苷酸的核酸分子;
c)含有以下核酸序列的核酸分子,所述序列由于遗传密码子的简并性可来自在(b)中描述并具有如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的多肽序列;
d)编码与以下多肽的氨基酸序列有至少50%同一性的多肽的核酸分子,所述多肽由(a)或(c)的核酸分子编码并具有如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性;
e)编码多肽的核酸分子,所述多肽用抗由(a)到(c)核酸分子之一编码并具有如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的多肽的单克隆或多克隆抗体分离;
f)核酸分子,其编码含有SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ IDNO:146、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150、SEQ ID NO:223、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:225、SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:246、SEQ IDNO:247、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:273、SEQ ID NO:274、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277、SEQ ID NO:278、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:281、SEQ IDNO:438、SEQ ID NO:439或SEQ ID NO:442所示共有序列并具有如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的多肽;
g)编码具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ IDNO:111、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ IDNO:133、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ IDNO:162、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ IDNO:206、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ IDNO:235、SEQ ID NO:237、SEQ IDNO:239、SEQ IDNO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ IDNO:262、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ IDNO:293、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ IDNO:315、SEQ ID NO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ IDNO:337、SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ IDNO:359、SEQ ID NO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ IDNO:381、SEQ ID NO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ IDNO:403、SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ IDNO:425、SEQ ID NO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质所表现出的生物活性的多肽的核酸分子;
h)核酸分子,其可通过用含有(a)到(c)核酸分子序列之一的探针或具有在(a)到(i)中表征并编码具有如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的多肽的核酸分子的至少15nt,优选20nt、30nt、50nt、100nt、200nt或500nt的片段在严格杂交条件下筛选适当的核酸文库获得,
或其含有上述核酸分子互补的序列的核酸分子;其中根据(a)到(h)的核酸分子与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQID NO:7、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:23、SEQ IDNO:25、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ IDNO:64、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:70、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:78、SEQ IDNO:80、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ IDNO:88、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:94、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102、SEQ IDNO:104、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:11 6、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:122、SEQ ID NO:124、SEQ IDNO:126、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:130、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:134、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:、SEQ ID NO:142、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:153、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:159、SEQ IDNO:161、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:165、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:173、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:177、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:181、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:185、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:193、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:197、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:201、SEQ ID NO:203、SEQ IDNO:205、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:209、SEQ IDNO:211、SEQ ID NO:213、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:217、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:230、SEQ ID NO:232、SEQ IDNO:234、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:238、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:253、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:257、SEQ ID NO:259、SEQ IDNO:261、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:265、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:271、、SEQ ID NO:282、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:290、SEQ IDNO:292、SEQ ID NO:294、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:298、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:302、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:308、SEQ ID NO:310、SEQ ID NO:312、SEQ IDNO:314、SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:318、SEQ ID NO:320、SEQ ID NO:322、SEQ ID NO:324、SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:328、SEQ ID NO:330、SEQ ID NO:332、SEQ ID NO:334、SEQ IDNO:336、SEQ ID NO:338、SEQ ID NO:340、SEQ ID NO:342、SEQ ID NO:344、SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:348、SEQ ID NO:350、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:354、SEQ ID NO:356、SEQ IDNO:358、SEQ ID NO:360、SEQ ID NO:362、SEQ ID NO:364、SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:368、SEQ ID NO:370、SEQ ID NO:372、SEQ ID NO:374、SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:378、SEQ IDNO:380、SEQ ID NO:382、SEQ ID NO:384、SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:388、SEQ ID NO:390、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:398、SEQ ID NO:400、SEQ IDNO:402、SEQ ID NO:404、SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:410、SEQ ID NO:412、SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:418、SEQ ID NO:420、SEQ ID NO:422、SEQ IDNO:424、SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:428、SEQ ID NO:430、SEQ ID NO:432、SEQ ID NO:434或SEQ ID NO:440所述序列和编码与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:111、SEQ IDNO:113、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:117、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:129、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:133、SEQ IDNO:135、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:154、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:162、SEQ IDNO:164、SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:170、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:174、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:178、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:186、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:190、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:194、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:198、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:202、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:206、SEQ IDNO:208、SEQ ID NO:210、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:214、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:218、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:233、SEQ ID NO:235、SEQ IDNO:237、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:250、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:254、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:258、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:262、SEQ IDNO:264、SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:270、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:285、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:293、SEQ IDNO:295、SEQ ID NO:297、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:301、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:305、SEQ ID NO:307、SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:311、SEQ ID NO:313、SEQ ID NO:315、SEQ IDNO:317、SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:321、SEQ ID NO:323、SEQ ID NO:325、SEQ ID NO:327、SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:331、SEQ ID NO:333、SEQ ID NO:335、SEQ ID NO:337、SEQ IDNO:339、SEQ ID NO:341、SEQ ID NO:343、SEQ ID NO:345、SEQ ID NO:347、SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:351、SEQ ID NO:353、SEQ ID NO:355、SEQ ID NO:357、SEQ ID NO:359、SEQ IDNO:361、SEQ ID NO:363、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:367、SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:371、SEQ ID NO:373、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:377、SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:381、SEQ IDNO:383、SEQ ID NO:385、SEQ ID NO:387、SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:391、SEQ ID NO:393、SEQ ID NO:395、SEQ ID NO:397、SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:401、SEQ ID NO:403、SEQ IDNO:405、SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:411、SEQ ID NO:413、SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:417、SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:421、SEQ ID NO:423、SEQ ID NO:425、SEQ IDNO:427、SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:431、SEQ ID NO:433、SEQ ID NO:435或SEQ ID NO:441所述蛋白质序列有至少一个或多个氨基酸差异的蛋白质的核酸序列有至少一个或多个核苷酸差异。
11.双链RNA分子(dsRNA),其中所述双链RNA核酸分子的有义链与以下核酸分子有至少30%的同源性:权利要求10的核酸分子,或者编码赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的蛋白质的核酸分子,或者含有与赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子或权利要求10的核酸分子或编码权利要求16蛋白质的核酸有至少50%同源性的核酸分子的至少17个碱基对的片段的核酸分子。
12.权利要求11的dsRNA分子,其中有义链和反义链彼此共价结合且反义链基本上是“有义”RNA链的互补物。
13.反义核酸分子,其中该反义核酸分子与下述核酸分子有至少30%的同源性:与编码由权利要求10的核酸分子编码的蛋白质的核酸分子反义的核酸分子;或本发明的核酸分子;或编码赋予具有下述蛋白质生物活性的蛋白质表达,所述蛋白质具有如权利要求1的蛋白质的生物活性;或引入含有下述核酸分子至少15个碱基对的片段的反义核酸分子,该核酸分子与以下核酸分子的反义核酸分子有至少50%的同源性,这样的核酸分子为赋予具有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子或权利要求10的核酸分子或编码权利要求26的蛋白质的核酸分子。
14.核酶,其特异切割赋予有如权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的核酸分子,或编码由权利要求10核酸分子编码的蛋白质的核酸分子,或权利要求10的核酸分子。
15.病毒核酸分子,所述病毒核酸分子使赋予具有根据权利要求1的蛋白质生物活性的蛋白质表达的RNA分子或编码由权利要求10核酸分子编码的蛋白质的核酸分子,或权利要求10的核酸分子降低。
16.权利要求24的蛋白质的显性失活突变体。
17.编码权利要求16显性失活突变体的核酸分子。
18.核酸构建体,其赋予权利要求11或12的dsRNA分子、权利要求13的反义核酸分子、权利要求14的核酶、权利要求15的病毒核酸分子或权利要求17的核酸分子表达。
19.含有如权利要求10的分离的核酸分子的核酸构建体,其中核酸与一个或多个调节信号功能性连接。
20.合有如权利要求10的核酸分子或如权利要求18或19的核酸构建体的载体。
21.如权利要求20的载体,其中核酸分子与用于在原核或真核,或原核和真核宿主中表达的调节序列有效连接。
22.转基因宿主细胞,其被如权利要求20或21的载体或如权利要求10的核酸分子或如权利要求18或19的核酸构建体稳定或瞬时转化。
23.如权利要求22的转基因宿主细胞,其中该宿主细胞为微生物、非人动物或植物细胞。
24.用于产生由如权利要求10的核酸序列编码的多肽的方法,所述多肽在如权利要求22或23的宿主细胞中表达。
25.如权利要求24的方法,其中宿主细胞为选自漆树科、紫菀科、伞形科、桦木科、紫草科、芸苔科、凤梨科、番木瓜科、大麻科、旋花科、藜科、葫芦科、茱萸科、杜鹃花科、大戟科、蝶形花科、牛儿苗科、禾本科、胡桃科、樟科、豆科、亚麻科、多年生草本、饲料作物、蔬菜和观赏植物的植物细胞。
26.由如权利要求10的核酸分子编码的分离的多肽。
27.抗体,其与如权利要求26的多肽特异结合。
28.含有如权利要求22或23的植物细胞的植物组织、植物、收获的植物材料或植物的繁殖材料。
29.用于筛选如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的拮抗剂的方法,包括:
a.在允许减少或缺失编码如权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的核酸分子表达或允许减少或缺失权利要求1的蛋白质所表现出的生物活性的条件下,将表达权利要求26多肽的生物、其细胞、组织或局部与化合物或含有大量化合物的样品接触;
b.测定生物、其细胞、组织或局部中,或生物、其细胞、组织或局部的培养基中如权利要求1的蛋白质的生物活性水平或多肽表达水平,其中生物、其细胞、组织或局部在所述培养基中培养或保持在其中;和
c.通过将测量的如权利要求1的蛋白质的生物活性水平或多肽表达水平与没有所述化合物或含有所述大量化合物的样品时测量的标准的如权利要求1的蛋白质的生物活性水平或多肽表达水平比较鉴定拮抗剂,其中与标准相比降低的水平指出该化合物或该含有所述大量化合物的样品为拮抗剂。
30.鉴定在植物、非人动物或微生物中赋予提高的甲硫氨酸产生的化合物的方法,包括步骤:
a.培养或维持表达权利要求26的多肽或编码所述多肽的多核苷酸的
植物或动物细胞或其组织或微生物以及读出系统,所述读出系统能够与多肽在适当条件下相互作用,该条件允许存在化合物或含有大量化合物的样品时多肽与该读出系统的相互作用,并能够产生响应化合物与所述多肽在允许抑制所述读出系统和如权利要求1的蛋白质的条件下结合的可检测信号;和
b.通过检测由所述读出系统产生的信号的存在或缺失或降低或提高鉴定该化合物是否为有效的拮抗剂。
31.用于产生农业组合物的方法,包括权利要求29或30的方法的步骤并以可应用于农业的形式配制所述权利要求中鉴定的化合物。
32.组合物,其含有如权利要求1的蛋白质、权利要求10的核酸分子、权利要求26的多肽、权利要求18或19的核酸构建体、权利要求20或21的载体、如权利要求29鉴定的拮抗剂、权利要求27的抗体和任选的可农业用的载体。
33.食品或饲料组合物,其含有权利要求10的核酸分子、权利要求26的多肽、权利要求18或19的核酸构建体、权利要求20或21的载体、如权利要求29鉴定的拮抗剂、权利要求27的抗体、权利要求28的植物、植物组织、植物的收获的材料或繁殖材料。
34.用于鉴定赋予生物中甲硫氨酸产生提高的基因产物的方法,包括以下步骤:
(a)鉴定生物的核酸分子,例如通过在数据库中进行同源性搜索;所述核酸分子可包含编码表达减少或缺失后赋予甲硫氨酸提高的基因产物的候选基因,其与本发明核酸分子为至少30%同源;
(b)向适于产生甲硫氨酸的宿主细胞中中引入候选核酸分子,优选植物细胞或微生物;
(c)减少或缺失鉴定的核酸分子在宿主细胞中的表达;
(d)测定宿主细胞中的甲硫氨酸水平;和
(e)鉴定核酸分子及其基因产物,其表达的减少或缺失赋予表达后的
宿主细胞中甲硫氨酸水平与野生型相比的提高。
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