CN117881791A - 用于进行测定的物品和方法 - Google Patents
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Abstract
本发明总的来说提供了仪器、其部件、其耗材以及相关方法。有利的是,本文描述的某些仪器可能能够进行测定和/或被配置成进行测定,其比通过其他方法进行测定的速率更快和/或需要的操作者输入更少。某些方法可以包括以这种更快的速率和/或涉及这种更少的输入进行测定。
Description
相关申请
本申请要求2021年7月14日提交的题为“用于进行测定的物品和方法”(Articlesand Methods for Performing Assays)的美国临时申请第63/221,690号的优先权,所述临时申请为所有目的整体通过引用并入本文。
技术领域
本公开总的来说描述了用于进行测定的仪器和相关方法。
背景技术
测定通常需要执行多个顺序步骤,并且通常在多孔板中进行。在位于多孔板中的孔中进行这样的步骤可能需要相当大的工作量和/或时间。许多工作和/或时间可能需要操作者的体力劳动,这可能导致延迟、操作者引起的可变性和/或操作者引起的失败。
一种可能需要操作者投入特别大的工作量和/或时间才能在多孔板中进行的测定是ELISA测定。在此类测定中,操作者可能需要执行一些或全部下述步骤:(1)制备将要在其中进行测定的多孔板,这可以包括用捕获抗体包被多孔板,将多孔板温育过夜,清洗多孔板,封闭多孔板,和/或去除在前述步骤之一中积聚的任何过量液体;(2)将样品和/或标准品与制备的多孔板反应,这可以包括将样品和/或者标准品移液到多孔板的板中,温育多孔板,清洗多孔板,和/或去除在前述步骤之一中积聚的任何过量液体;(3)将其他试剂与样品和/或标准品反应以产生可检测信号,这可以包括将检测抗体溶液添加到多孔板的孔中,温育多孔板,将酶联溶液添加到多孔板的孔中,温育多孔板,清洗多孔板,将产色底物添加到多孔板的每个孔中,和/或将终止溶液添加到多孔板的每个孔中;和/或(4)测量来自多孔板的光学信号。
因此,需要用于进行测定的新仪器和方法。
发明内容
本公开总的来说描述了用于进行测定的物品和方法。在某些情况下,本文描述的主题内容涉及相关产品、特定问题的替代解决方案和/或一种或多种系统和/或物品的多种不同用途。
在某些实施方式中,提供了一种用于进行测定的仪器。所述用于进行测定的仪器包含探针、被放置在所述探针附近的支撑结构和被配置用于检测光学信号的光学检测器。试剂被固定在所述探针上。所述探针被配置成由所述仪器在放置有多种流体的多个位置之间平移。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含探针、被放置在所述探针附近的支撑结构和被配置用于检测光学信号的光学检测器。所述探针被配置用于传输光。试剂被固定在所述探针上。所述探针被配置成由所述仪器在放置有多种流体的多个位置之间平移。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含外壳、光缆和被配置用于检测光学信号的光学检测器。所述外壳包含被配置用于接收探针的部件。所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近。所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器。所述仪器被配置成将所述探针在靠近所述容器中的多个位置的多个位置之间平移。所述光缆将光传输到所述光学检测器。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含外壳、探针和被配置用于检测光学信号的光学检测器。所述外壳包含被配置用于接收探针的部件。所述探针被配置用于传输光。试剂被固定在所述探针上。所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近。所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器。所述仪器被配置成将所述探针在靠近所述容器中的多个位置的多个位置之间平移。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含探针、被放置在所述探针附近的支撑结构和被配置用于检测光学信号的光学检测器。试剂被固定在所述探针上。所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得所述支撑结构的多个部分被顺序地放置在所述探针附近。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含探针、被放置在所述探针附近的支撑结构和被配置用于检测光学信号的光学检测器。所述探针被配置用于传输光。试剂被固定在所述探针上。所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得所述支撑结构的多个部分被顺序地放置在所述探针附近。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含外壳、探针和被配置用于检测光学信号的光学检测器。所述外壳包含被配置用于接收探针的部件。所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近。所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器。所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得当所述探针位于所述部件中时所述容器中的多个位置被顺序地放置在所述探针附近。所述光缆将光传输到所述光学检测器。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种用于进行测定的仪器包含外壳、探针和被配置用于检测光学信号的光学检测器。试剂被固定在所述探针上。所述外壳包含被配置用于接收探针的部件。所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近。所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器。所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得当所述探针位于所述部件中时所述容器中的多个位置被顺序地放置在所述探针附近。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,提供了一种进行测定的方法。所述方法包括将探针与多种流体顺序接触,和检测光学信号。试剂被固定在所述探针上。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
在某些实施方式中,一种方法包括提供探针,提供用于一种或多种流体的容器,和检测光学信号。试剂被固定在所述探针上。光通过所述探针上的一个或多个孔传输。所述光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
当结合附图考虑时,本发明的其他优点和新颖特征将从下面对本发明的各种非限制性实施方式的详细描述中变得显而易见。在本说明书和通过引用并入的文件包括冲突和/或不一致的公开内容的情况下,以本说明书为准。如果通过引用并入的两个或更多个文件包含相互冲突和/或不一致的公开内容,则以生效日期较晚的文件为准。
附图说明
参考附图以示例的方式描述本发明的非限制性实施方式,所述附图是示意性的,并不旨在按比例绘制。在附图中,所示的每个相同或几乎相同的部件通常由单个数字表示。为清楚起见,在图示对使本领域普通技术人员理解本发明来说不是必需的情况下,不是每个部件在每个图中都被标记,也不是本发明的每个实施方式的每个部件都被示出。在所述附图中:
图1A是根据某些实施方式的仪器的示意图;
图1B是根据某些实施方式的支撑多孔板的支撑结构的示意图;
图2和3是根据某些实施方式的包含光缆的仪器的示意图;
图4是根据某些实施方式的包含光源的仪器的示意图;
图5是根据某些实施方式的包含光源、探针、光缆的仪器的示意图;
图6是根据某些实施方式的包含外壳的仪器的示意图;并且
图7是一种方法的示意图。
具体实施方式
本公开总的来说提供了仪器、其部件、其耗材以及相关方法。有利的是,本文描述的某些仪器可能能够进行测定和/或被配置成进行测定,其比通过其他方法进行测定的速率更快、需要的操作者输入更少和/或使用的样品体积更小。某些方法可以包括以这种更快的速率、涉及这种更少的输入和/或使用这种更小的样品体积进行测定。
本文描述的某些仪器可以包含探针和/或被配置成接收探针。有利的是,所述探针可能能够和/或被配置成在多个位置、例如流体所在的位置之间平移。所述流体可以是适合于进行测定的流体。相关地,在某些实施方式中,可以使用探针,通过顺序地接触包含样品的多种流体、包含试剂的一种或多种流体和任选的一种或多种清洗流体来进行测定。所述探针可能能够以相对快速的方式(例如与由操作者进行的接触流体的方法相比和/或与具有不同于本文描述的设计的仪器相比)接触这些流体。例如,所述流体最初可以被放置在由支撑结构支撑的一个或多个容器(例如多孔板的孔)中,并且可以将探针与每种这样的流体顺序地温育。将探针在多种环境中顺序温育可能相对高效,因为它可以允许缩短温育时间和/或消除对进行手动清洗步骤的需要。
在某些实施方式中,适合与本文描述的仪器一起使用的探针被官能化。所述官能化可以包括将试剂例如在测定中使用的试剂固定在其上。有利的是,使用官能化探针可以消除与在进行测定之前对将要在其上进行测定的基材进行官能化相关的时间和/或劳力。当使用时,此类官能化探针也可以相对容易地附着到仪器和/或从仪器脱离。这可以允许快速和/或自动的探针更换,这可以进一步促进需要减少的操作者输入的高效测定的进行。
本文描述的某些仪器适合于进行机械地终止一个或多个反应的测定。类似地,本文描述的某些方法包括进行机械地终止一个或多个反应的测定。这可以通过例如移除其上固定有试剂的探针使其不与包含与其反应的试剂的流体接触来实现。机械地停止反应可以有利地消除对终止试剂和/或终止溶液的需要。不使用终止试剂和终止溶液(或使用较少的终止试剂和终止溶液)进行测定可以有利地减少进行测定所需的流体和试剂的数量,和/或允许更精确地控制何时终止反应。
本文描述的某些仪器能够以增强的可重复性进行测定。类似地,本文描述的某些方法包括以增强的可重复性进行测定。增强的可重复性可以由自动化程度提高和/或由操作者进行的步骤数量减少引起。有利的是,增强的可重复性可以减少运行间变化和/或故障。
本文描述的某些仪器能够执行包括进行搅拌步骤和/或混合步骤的测定。类似地,本文描述的某些方法包括执行包括进行搅拌步骤和/或混合步骤的测定。此类步骤可以包括搅拌和/或混合正与探针接触的流体、将要与探针接触的流体和/或已与探针接触过的流体。在某些实施方式中,搅拌步骤和/或混合步骤包括使用探针搅动正与其接触的流体,从而搅拌和/或混合所述流体。搅拌步骤和混合步骤可以特别良好地适合于提高流体中的物质与固定在探针上的物质的接触速率和/或适合于使正与探针接触的流体均匀。有利的是,此类方法可以由此提高在测定进行期间发生的一个或多个反应的速率。
在某些实施方式中,本文描述的仪器适合于进行产生光学信号的测定和/或本文描述的方法包括产生光学信号。在此类实施方式中,所述仪器可以被配置成检测所述光学信号和/或所述方法可以包括产生和/或检测所述光学信号。所述光学信号可以指示样品的特征和/或测定的结果。例如,在某些实施方式中,光学信号包括指示样品特征和/或测定结果的被发射、透射、反射、散射、偏振和/或吸收的光。在某些实施方式中,所述光学信号由与探针结合的物质产生。例如,所述光学信号可以包括由固定在探针上的物质发射、透射、反射、散射、偏振和/或吸收的光。作为另一个实例,所述光学信号可以包括由固定在探针上的物质产生的物质发射、透射、反射、散射、偏振和/或吸收的光。例如,固定在所述探针上的物质可以与存在于与其接触的流体中的物质反应以产生发射和/或吸收光的物质,并且所述光学信号可以包括被物质发射、透射、反射、散射、偏振和/或吸收的光。
在某些实施方式中,当探针与流体(例如固定在所述探针上的物质最初存在于其中的流体、在其中产生由固定在所述探针上的物质产生的物质的流体、产生光学信号的流体、所述探针在其中温育的流体)接触时检测到和/或产生光学信号。当探针与流体接触时检测到和/或产生的某些光学信号可以良好地适合用于动力学测量(例如在反应期间的两个或更多个时间进行的一系列测量)和/或脉冲测量(例如在闪速发光和/或闪速反应期间进行的测量)。在某些实施方式中,在探针首次与流体接触的时间点读取光学信号。
检测由各个位置(例如探针附近、从与探针正在其中温育和/或已在其中温育过的流体)产生的光学信号的能力可以允许检测以各种方式产生的光学信号。这可以允许本文描述的仪器适合于进行各种测定。例如,如上所述,仪器可以适合于检测由探针和/或由流体和/或其中的物质产生的光学信号。理想情况下,这可以允许从其中产生信号的物质被固定在探针上(例如通过与最初固定在探针上和/或最初存在于样品中的物质反应)的测定和/或从其中产生信号的物质在与探针接触的流体中形成(例如所述物质可以从固定在探针上的物质产生)的测定检测光学信号。后一种情形对于其中使用催化生成产生光学信号的物质的反应的酶的测定来说是特别有用的。
本文描述的某些仪器适合于进行包含结合反应的测定。类似地,本文描述的某些方法包括进行包含结合反应的测定。某些此类结合反应可以具有非常高的灵敏度,这可以有利地允许对具有较小体积和/或包含相对低浓度的分析物的样品进行测定。通过混合和/或搅拌在其中发生结合反应的流体(例如与探针接触的流体),可以促进结合反应的灵敏度。在某些情况下,通过将结合反应定位到可能具有相对小的反应表面的探针,来促进结合反应的灵敏度。
在某些实施方式中,本文描述的仪器适合于进行多路分析。类似地,本文描述的某些方法包括进行多路分析。多路分析可以采取对单个样品进行两种或更多种不同测定和/或检测单个样品中存在的两种或更多种不同分析物的形式。这可以通过使用其上固定有不同试剂的不同探针来促进。在某些实施方式中,测定和/或分析物检测的结果可以是定量的。多路分析可以有利地允许使用相对小体积的样品进行多个测定和/或检测多种物质。
在某些实施方式中,系统能够进行测定和/或方法包括进行测定,其中将具有相同表面化学(例如其上固定有相同物质)的两种或更多种不同探针与共同样品接触。所述测定可以包括使用两种探针进行相同的步骤和/或检测来自两种探针的相同类型的光学信号。此类测定可以有利地包括使用不同探针对共同样品进行多次平行试验。
可以包括在本文描述的系统中的各种部件及其布置的概述如下所示。关于特定部件的适合设计的更多细节将在该概述后示出。图1A中示出了仪器的一个实例。如图中所示,仪器100包含探针200、支撑结构300和光学检测器400。
如本文中别处所述,图1A和本申请中的其他图不旨在按比例绘制。因此,仪器可以包含具有与图1A中示出的探针的形状不同的形状的探针、具有与图1A中示出的支撑结构不同的形状的支撑结构和/或具有与图1A中示出的光学检测器不同的形状的光学检测器。此外,仪器可以包含探针、支撑结构和光学检测器,它们相对于彼此的尺寸不同于图1A中描绘的探针、支撑结构和光学检测器的相对尺寸。还应该理解,本申请设想了具有与本文中的任何图中所描绘的仪器和/或其部件不同的形状和/或相对尺寸的仪器和/或其部件。
如图1A中所示,支撑结构可以在探针附近。在某些实施方式中,所述支撑结构被放置在探针下方。仪器也可以包含被放置在探针附近但不在探针下方的支撑结构。例如,在某些实施方式中,仪器包含被放置在与探针相同高度处和/或探针上方的支撑结构。仪器也可以包含被放置在探针旁边(例如在与探针相同的高度处、与探针不同的高度处)的支撑结构。
支撑结构可以是支撑将要在仪器使用期间使用的物品的结构。例如,在某些实施方式中,支撑结构支撑在测定期间使用的用于一种或多种流体的容器。这种容器的非限制性实例包括多孔板、微量滴定板、载玻片、液滴阵列、小瓶、微流体装置、微流体阵列、微阵列和数字微流体芯片。支撑结构可以以各种方式支撑此类物品。作为一个实例,在某些实施方式中,仪器包含被放置和/或被配置成放置在一个或多个此类物品下方的支撑结构。支撑结构也可以通过将此类物品夹持在位、在侧向上部分或完全包围它们和/或悬挂它们来支撑此类物品。图1B示出了支撑结构的一个非限制性实例,其通过被放置在多孔板下方来支撑多孔板。在图1B中,多孔板390被放置在图1A中示出的仪器中的支撑结构的顶上。图1B还示出了包含探针200、支撑结构300和光学检测器400的仪器100。
正如将在下文进一步详细描述的,在某些实施方式中,仪器包含被配置成由仪器平移的探针和/或被配置成由仪器平移的支撑结构。在此类实施方式中,探针相对于支撑结构的定位可以随时间变化。例如,仪器可以具有静息状态或储存状态,在该状态下,探针和支撑结构被定位在一对第一位置中;以及激活状态,在该状态下,支撑结构和/或探针被定位在与静息状态或储存状态下不同的位置中。作为另一个实例,在某些实施方式中,仪器可以被配置成在使用期间平移支撑结构和/或探针。在此类实施方式中,支撑结构和/或探针可以被放置在多个位置中和/或在位置之间移动。
如上所述,仪器也可以包含静止探针和静止支撑结构两者。
也如图1A和1B中所示,仪器可以包含光学检测器,例如被配置用于检测光学信号的光学检测器。光学检测器的定位通常可以根据需要来选择。在某些实施方式中,类似于图1A和1B中示出的实施方式,光学检测器被放置在支撑结构和/或探针附近(例如在支撑结构的与探针相对的一侧上,支撑结构的与探针相同的一侧上)。光学检测器也可以被放置成远离支撑结构和/或探针。在此类实施方式中,光学检测器可以被光学偶联到产生光学信号的位置。例如,在某些实施方式中,光缆可以将光(例如作为光学信号的光、指示光学信号缺失的光)从产生光学信号的位置附近的位置传输到光学检测器。某些仪器可以包含两个或更多个光学检测器(例如放置在支撑结构附近的一个光学检测器和放置在探针附近的一个光学检测器,放置在两个不同探针附近的两个光学检测器)。
不希望受任何特定理论限制,据信被放置在支撑结构的与探针相对的一侧上和/或光学偶联到这种位置的光学检测器可以特别适合用于检测包含光的缺失(例如由于吸收、反射和/或散射引起的)的光学信号。类似地,并且也不希望受任何特定理论限制,据信被放置在此类位置处的光学检测器也可以特别适合用于检测包含透射光的光学信号。作为第三个实例并且也不希望受任何特定理论限制,据信被放置在支撑结构的与探针相对的一侧上的光学检测器、被放置在支撑结构的与探针相同的一侧上的光学检测器和/或光学偶联到任一此类位置的光学检测器适合于检测包含发射光、反射光、散射光和/或偏振光的光学信号。
图2和3示出了包含光缆的仪器的两个实例,所述光缆被配置用于将光从产生光学信号的位置附近的位置传输到光学检测器。在图2中,光缆502被配置用于将光传输到光学检测器402。类似地,在图3中,光缆504被配置用于将光从探针204传输到光学检测器404。图2进一步描绘了包含光缆502的仪器102。仪器102进一步包含探针202、支撑结构302和光学检测器402。图3进一步描绘了包含光缆504的仪器104。仪器104进一步包含探针204、支撑结构304和光学检测器404。
类似于图2中所示的实施方式可以适合于进行其中产生光学信号的物质存在于探针可能接触的流体中的测定。在图2中,光缆将光从支撑结构附近的位置传输到光学检测器。所述支撑结构可以充当光学信号在其中产生的流体的容器的支撑物。此外,在某些此类实施方式中,探针不通过光缆偶联到检测器。
类似于图3中所示的实施方式可以适合于进行其中产生光学信号的物质被固定在探针上的测定,因为所述光缆被配置用于将光从探针传输到光学检测器。在某些此类实施方式中,所述探针接触的任何流体均不通过光缆偶联到光学检测器。探针及其接触的任何流体也可以均不通过光缆偶联到光学检测器。例如,实施方式可以包括这样的光学检测器,其放置成使得它可以直接接收来自探针和/或流体的光学信号,而不需在其之间放置光缆。仪器也可以包含辅助光学检测器收集光的其他光学器件。例如,仪器可以包含被配置用于此目的的一个或多个透镜。
某些包含两个或更多个光学检测器的仪器可以包含一个被配置用于以与图2中示出的方式相似的方式传输光的光缆和一个被配置用于以与图3中示出的方式相似的方式传输光的光缆。仪器也可以包含不与光缆光学联通的光学检测器。例如,光学检测器可以被放置在距光源一定距离和/或与其呈一定角度处,使得它不需光缆的帮助就能够收集足够强度的光学信号用于测定。
在某些实施方式中,仪器包含光源。图4示出了一个此类实施方式的示意图。在图4中,仪器106包含探针206、支撑结构306、光学检测器406和光源606。所述光源可以为仪器提供光。在某些实施方式中,所述光可以是在光学信号的形成中使用的光。例如,在其中光学信号是荧光的实施方式中,由光源提供的光可以是激发荧光的发射的光。作为另一个实例,在其中光学信号是被散射(例如拉曼散射)的光的实施方式中,所述光可以是产生所述散射(例如拉曼散射)的光。作为第三个实例,在其中光学信号是被透射的光的实施方式中,所述光可以是通过所述测定中存在的一种或多种流体透射的光。作为第四个实例,在其中光学信号是被反射的光的实施方式中,所述光是被所述测定中存在的一种或多种流体反射的光。作为第五个实例,在其中光学信号是由于吸收引起的光缺失的实施方式中,所述光可以是被所述测定中存在的物质吸收的光。作为第六个实施方式,在其中光学信号是被偏振的光的实施方式中,所述光可以是未被偏振的光或受到所述测定中存在的物质影响而具有偏振的光。
在某些实施方式中,仪器包含光源,并包含被配置用于将光从光源传输到探针的光缆。在此类实施方式中,所述探针可以照射仪器的一个或多个部分和/或由所述仪器进行的测定中存在的一种或多种流体。图5示出了这种仪器的示意图。在图5中,仪器108包含探针208、支撑结构308、光学检测器408、光源608和光缆708。图5中的光缆708被配置用于将光从光源608传输到探针208。
应该理解,某些仪器可以具有包括本文中示出的两个或更多个不同图中所示的某些特征的设计。例如,在某些实施方式中,仪器包含被配置用于将光传输到光学检测器的光缆(例如在图2和/或图3中所示),并进一步包含光源和/或被配置用于将光从光源传输到探针的第二光缆(例如图4和/或图5中所示)。仪器也可以具有如图1-5中的一者或多者中示出的设计,但缺少探针。在此类实施方式中,所述仪器可以被配置成接收探针。例如,在某些实施方式中,仪器包含外壳,所述外壳包含被配置用于接收探针的部件。图6示出了具有这种设计的仪器的一个非限制性实例。在图6中,仪器110包含支撑结构310、光学检测器410和外壳810。外壳810包含被配置用于接收探针的部件910。在这种仪器中,探针可以在仪器使用期间被放置在外壳中。
探针可以以各种适合的方式接收在外壳的部件中。在某些实施方式中,被配置用于接收探针的部件可以是开口,并且探针可以被插入到所述开口中。此外或可选地,探针也可以被机械偶联到部件(例如使用夹子)。
本文描述的装置也可以包含两套或更多套某些部件。例如,在某些实施方式中,仪器包含两个或更多个探针(例如放置在彼此不同的位置中)。在某些此类实施方式中,仪器中存在的两个或更多个探针可以被配置成平移。所述仪器可以被配置成将所述两个或更多个探针彼此独立地平移和/或一起平移。作为后一种类型的平移的一个实例,两个或更多个光学探针可以被放置成彼此相距恒定的距离,并且两者或全部以某种方式平移,使得当探针移动时这些恒定的距离得以维持。作为前一种平移的一个实例,两个或更多个光学探针可以相对于彼此平移,使得一个光学探针的移动不影响独立于其平移的任何其他光学探针的移动。
此外,当存在时,两个或更多个探针可以在不同的位置和/或彼此不同的位置组之间平移。这可以有利地允许不同的光学探针执行不同的测定和/或执行单个测定的不同部分,这与仅包含单个探针或包含在共同位置或位置组之间平移的多个探针的仪器相比可以有益地增加通量。然而,仪器也可以包含在共同位置或位置组之间平移的两个或更多个探针。例如,在某些实施方式中,具有相同表面化学(例如其上固定有相同试剂)的两个或更多个探针可以在样品和/或共同的位置组(其中至少一个位置是与样品接触的位置)之间平移。这可以有利地允许多同一分析物进行多次测量和/或对共同样品进行相同测定的多个平行试验。
如上所述,包含两个或更多个探针的仪器可以特别适合进行两个或更多个测定(例如顺序地、同时地、在交叠的时间段内、在不交叠的时间段内)。在此类实施方式中,每个探针可以被配置成独立于另一个探针进行测定。所述测定可以是相同类型(例如在不同样品上进行)或不同类型的(例如为了确定单个样品的两种或更多种不同性质而进行)。在某些此类实施方式中,将两个或更多个探针与共同的样品接触,以对该样品进行多路测定和/或检测该样品中的两种或更多种不同分析物。
此类仪器还可以用于进行单个测定。在此类实施方式中,不同的探针可用于进行所述测定的不同方面。例如,一个探针可用于对样品进行测定,一个或多个另外的探针可用于对一种或多种标准品进行测定。在某些实施方式中,两个探针和/或两个被配置用于接收探针的部件的存在可以允许快速更换探针和/或使用一个探针进行测定并同时装载和/或制备另一个探针。在某些实施方式中,不同的探针可用于进行同一测定的平行试验。
仪器也可以包含两套或更多套除探针之外的部件。例如,仪器可以包含外壳中的两个或更多个被配置用于接收探针的位置、两个或更多个支撑结构、两个或更多个光源和/或两个或更多个光学检测器。作为另一个实例,在某些实施方式中,仪器包含两个或更多个图1-6中示出的仪器。当仪器包含两个或更多个探针和/或外壳中的两个或更多个被配置用于接收探针的位置时,所述仪器进一步包含两个或更多个光学检测器可能是有益的。每个光学检测器可以被配置用于检测由与不同探针缔合的物质(例如固定在探针上的物质、由固定在探针上的物质产生的物质)引起的光学信号。在某些此类实施方式中,可以使用共同的光源,其被配置用于向所有探针提供光。这可以特别适合于在其中立即进行单个测定和/或在其中立即进行多个单一类型的测定的仪器。包含两个或更多个探针和/或外壳中的两个或更多个被配置用于接收探针的位置的仪器也可以包含两个或更多个光源(例如与每个探针相关联的光源)。此类仪器可以特别适合于其中仪器被配置用于同时进行两种或更多种不同类型的测定的实施方式。
如上所述,在某些实施方式中,仪器包含探针和/或包含被配置用于接收探针的外壳。所述探针可以充当可以在其上进行测定的基材,和/或可以帮助检测在测定期间产生的一种或多种光学信号。
在某些实施方式中,仪器包含作为光学探针的探针。例如,所述仪器可以包含作为其中的一个或多个光路的一部分和/或被配置用于传输光的探针。仪器也可以包含不是光学探针的探针。不是光学探针的探针可以被放置在仪器中存在的任何光路之外,和/或可以传输非常少量(或者零)的光。例如,仪器可以包含第一光缆,其将光从支撑结构附近的位置传输到光学检测器,并包含第二光缆,其将光从光源传输到支撑结构附近的位置。作为另一个实例,仪器可以包含将光从支撑结构附近的位置传输到光学检测器的光缆,并且可以缺少光源。换句话说,在某些实施方式中,探针不是光学探针,并且光从支撑结构附近的位置的传入和传出不被进行和/或由不通过所述探针的路径来实现。正如在本文别处进一步详细描述的,某些仪器可以包含两个或更多个探针。在此类实施方式中,所述仪器可以包含一个或多个光学探针和/或一个或多个不是光学探针的探针。类似地,仪器可以只包含光学探针、只包含不是光学探针的探针或光学探针和非光学探针两者。
如上所述,在某些实施方式中,探针被配置用于传输光。在此类实施方式中,所述探针可以以促进测定的分析的方式传输光。例如,某些探针可以将光从光源传输到探针附近的位置例如固定在所述探针上的物质所在的位置和/或位于所述探针附近的流体。在此类实施方式中,所述光可以是从光源传输到探针(例如通过光缆)的光。所述光可以是促进光学信号的形成的光。例如,所述光可以是将被吸收、透射、反射、散射(例如通过拉曼散射)、偏振和/或激发荧光以产生可以被光学检测器检测的光学信号的光。
在某些实施方式中,探针将光从探针附近的位置传输到光缆。在此类实施方式中,所述光可以由所述光缆传输到光学检测器。作为一个实例,所述光可以是由探针附近的物质(例如固定在探针上、存在于接触探针的流体中)产生的光。作为另一个实例,所述光可以是从位于所述探针附近的流体传输到检测器的光。在此类实施方式中,所述光可以是形成光学信号的光。例如,所述光可以是未被吸收的光、已被透射的光、已被反射的光、已被散射(例如通过拉曼散射)的光、已通过荧光产生的光和/或已通过发光(例如化学发光)产生的光。
探针可以具有各种适合的设计。在某些实施方式中,所述探针是光纤探针和/或包含光纤。探针也可以包含两个或更多个光纤。例如,探针可以包含光纤束。在某些实施方式中,所述探针包含一个或多个孔,光可以通过所述孔传输。例如,探针可以包含多个光纤,并且每个光纤的末端可以充当光可以通过其传输的孔。当存在时,所述孔可以位于所述探针的与任何光缆所在的一侧相对的一侧上。在此类实施方式中,所述探针可用于将光从光缆传输到孔和/或将光从孔传输到光缆。
探针也可以包含帮助光的传输的其他光学器件(例如除了光纤之外)。例如,探针可以包含透镜和/或针孔。当存在时,这些部件可以帮助进行近场成像。在某些实施方式中,探针包括被配置用于收集光并将光传输到探针和/或其部件的透镜。例如,透镜可以被配置用于收集光并将光传输到沿着探针的中心和/或光轴、沿着探针中存在的光纤的中心和/或光轴、和/或沿着探针中存在的光纤束的中心和/或光轴的轴。
在某些实施方式中,探针是透明的和/或可以透过多种波长(例如可见波长、红外波长)的光。
如上所述,本文描述的某些探针可以是适合用于执行测定的基材。此类探针可以被配置成放置在支撑结构的多个部分和/或由支撑结构支撑的物体(例如流体、含有流体的物体)附近。这可以通过平移探针(例如竖直地,在第一水平方向上,在垂直于第一水平方向的第二水平方向上,前述方向中的两者或三者的组合)和/或通过平移支撑结构(例如竖直地,在第一水平方向上,在第二水平方向上,前述方向中的两者或三者的组合)来实现。在某些实施方式中,仪器可以被配置成使得它通过预设程序平移探针,其中所述探针被多次放置在多个位置处。仪器也可以被配置成使得操作者可以随意平移所述探针(例如操作者可能能够输入所述探针被平移到的所需位置和/或通过使用控制器实时移动所述探针)。此外,某些仪器可以被配置成使得它们不被配置用于平移探针。在此类实施方式中,在不被操作者手动移动的情况下,探针可以是静止或不可移动的。
预设程序可以包括下述顺序步骤中的一些或全部:水平平移所述探针(例如在第一水平方向上、在垂直于第一水平方向的第二水平方向上、在两个方向的组合上)直至它被定位到容器和/或其一部分(例如多孔板中的孔)上方,暂停限定量的时间(在此期间容器可以被升高,以使容器的所述部分例如其中的孔中的任何流体接触所述探针)或者降低所述探针直至它接触容器的所述部分(例如孔)中的任何流体,将所述探针保持在位以使其接触容器的所述部分(例如孔)中的任何流体限定量的时间,并暂停限定量的时间(在此期间容器可以被降低,以使容器的所述部分例如孔中的任何流体不再接触所述探针)或升高所述探针直至它不再接触容器的所述部分(例如孔)中的任何流体。预设程序可以重复上述这些顺序步骤中的一些或全部,使得所述探针顺序接触包含在多个容器或其部分(例如多孔板中的多个孔)中的多种流体。预设程序可以包含的步骤的其他实例包括预润湿(例如涂层溶解)、起始、校准、参比和/或关闭步骤。
在某些实施方式中,探针包含被官能化和/或具有有助于进行测定的表面化学的表面。所述表面官能化和/或化学可以促进通常在测定期间在其上产生的反应产物的形成。例如,所述表面官能化和/或化学可以促进在测定期间产生的一种或多种物质与其键合。在某些实施方式中,探针包含其上固定有一种或多种试剂的表面。所述试剂可以以各种适合的方式固定在所述探针上。例如,可以将所述试剂键合到所述探针。所述键合可以包括共价键合、离子键合、极性键合、范德华键合、疏水键合和/或氢键键合。
在某些实施方式中,可以将一种或多种试剂以某种方式固定在探针上,使得它们在测定进行期间不经历与探针的显著(和/或任何)脱离。例如,可以将试剂以对水、水溶液、缓冲液、酸、碱和/或体液稳定的方式固定在探针上。然而,一种或多种试剂也可以最初被固定在探针表面上,然后在测定进行期间从探针的表面释放。例如,最初固定在探针表面上的试剂可以被配置成在暴露于特定刺激后从探针释放。所述刺激可以存在于流体中。
此外或可选地,可以将一种或多种试剂以某种方式固定在探针上,使得所述探针可以再生。一种方法也可以包括使探针再生。再生可以包括从所述探针移除一种或多种试剂。例如,在某些实施方式中,再生包括将其上固定有一种或多种试剂的探针暴露于导致这些试剂中的一者或多者从探针脱离的流体(例如缓冲液,例如酸性缓冲液)。然后,可以将所述探针暴露于包含将要固定在探针上的一种或多种新试剂的流体。使探针再生可以有利地允许探针在超过一次测定期间使用(例如作为非消耗品)。例如,在进行第一测定之前可以将第一试剂和/或试剂组固定在探针上。这些试剂可以被配置成与在测定过程中可能存在的一种或多种物质发生化学反应。如果这种化学反应确实发生,则所述探针可能不适合进行另一个测定,除非它被再生,因为所述化学反应可能使所述试剂不适合进行进一步化学反应。因此,在进行测定之后,可以将探针再生以产生新的试剂和/或试剂组可以被固定在其上的探针,从而允许在进行进一步测定期间使用所述探针。所述试剂和/或试剂组可以与最初固定在探针上的试剂和/或试剂组相同,或者可以在一种或多种方式上不同(例如,如果操作者希望使用所述探针进行不同测定的话)。
某些探针也可以不被再生和/或不能再生。此类探针可以用作耗材。
可以将各种适合的试剂固定到本文描述的探针的表面上。某些试剂可以是能够参与一个或多个化学反应(例如在使用探针促进的测定过程中可能发生的一个或多个化学反应)的物质。例如,探针可以包含能够与另一物质键合(例如共价地、离子地、通过极性相互作用、通过范德华相互作用、疏水地、通过氢键键合、通过络合)、吸收另一物质、吸附另一物质、催化另一物质和/或两个或更多个物质之间的反应、分解(例如在暴露于另一物质后)、经历构象转变和/或催化反应的试剂。在某些实施方式中,一个或多个上述化学反应可导致与试剂反应的物质变得固定在其上。所选的适合试剂的非限制性实例包括生物分子(例如蛋白质、糖蛋白、肽、核酸(例如DNA)、抗体、抗原、多糖、碳水化合物、激素)、配体、小分子、病毒、细胞、无机化合物、螯合化合物、衣壳和细菌。
在某些实施方式中,固定在探针表面上的试剂适合于参与包括结合的化学和/或生物学反应。探针也可能适合于参与不包括结合的化学和/或生物学反应。当存在时,结合可以包括靶与特异性结合靶的结合配偶体(例如特异性结合靶的试剂或分子)之间的反应。结合还可以包括将靶固定在结合配偶体上。在某些实施方式中,所述结合配偶体可以特异性结合靶分子上的表位。特定的成对结合配偶体和靶的非限制性实例包括抗体和抗原、抗体片段和抗原、抗体和半抗原、抗体和肽、抗体和小分子、抗原和融合蛋白、抗体片段和半抗原、酶和酶底物、酶和抑制剂、酶和辅因子,结合蛋白和底物、载体蛋白和底物、蛋白质和小分子、卵磷脂和碳水化合物、受体和激素、受体和效应物、互补的核酸链、蛋白质与核酸阻遏物和诱导物的组合、配体和细胞表面受体、病毒和配体以及受体和配体。
可以作为结合配偶体或抗体的抗体的非限制性实例包括完整的(即全长)多克隆和单克隆抗体、多克隆和单克隆抗体的抗原结合片段(例如Fab、Fab'、F(ab')2或Fv)、单链(scFv)、单链的突变体、包含抗体部分的融合蛋白、人源化抗体、嵌合抗体、双体抗体、线性抗体、单链抗体、多特异性抗体(例如双特异性抗体),以及包含具体所需特异性的抗原识别位点的免疫球蛋白分子的修饰构型。属于最后一类的抗体的非限制性实例包括抗体的糖基化变体、抗体的氨基酸序列变体和共价修饰的抗体。此外,结合配偶体可以是任何类别的抗体,例如IgD、IgE、IgG、IgA或IgM(或其亚类,例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和/或IgA2)。
抗原可以是分子或分子的一部分,可以产生针对它的抗体。抗原可以是肽、多糖和/或脂质。某些抗原可能源自体内(“自身抗原”),某些抗原可能源自外部环境(“非自身抗原”)。
在某些实施方式中,适合于进行化学和/或生物学反应的抗体特异性结合它们的靶分子上的表位。表位(可以被称为抗原决定簇)可以是抗原的被抗体识别(或结合)的部分。例如,表位可以是抗原的与抗体结合的特定片段。抗体的与表位结合的部分可以被称为互补位。表位可以是构象表位(由抗原的不连续氨基酸或区段组成)或线性表位(由连续的氨基酸组成)。某些蛋白质可能共享具有高序列同源性和/或结构相似性的区段。这些相似的蛋白质可能具有共同的表位(换句话说,不同抗原上的表位可能被同一抗体结合)。此外,经过不同加工的蛋白质(例如经过进一步酶促加工的蛋白质)可能与其加工前的形式共享一些但不是所有的表位。可以在加工过程中添加或移除的不同表位的非限制性实例包括N-端信号肽(如在前肽原上所看到的)和当非活性蛋白(如前肽)通过翻译后修饰转变成活性形式时所看到的变化。
当抗体与表位特异性结合时,它可以参与能够区分靶分子和非靶分子的结合反应。例如,结合配偶体可以与靶分子特异性结合,其亲和性比与非靶分子结合的亲和性高大于或等于2倍,比与非靶分子结合的亲和性高大于或等于4倍、大于或等于5倍、大于或等于6倍、大于或等于7倍、大于或等于8倍、大于或等于9倍、大于或等于10倍、大于或等于20倍、大于或等于25倍、大于或等于50倍或大于或等于100倍。
抗体的结合亲和性可以通过其表观结合常数或KA来参数化。KA是解离常数(KD)的倒数。在某些实施方式中,本文描述的结合配偶体具有大于或等于10-5M、大于或等于10-6M、大于或等于10-7M、大于或等于10-8M、大于或等于10-9M或大于或等于10-10M的解离常数(KD)。结合亲和性(KA)的提高对应于解离常数(KD)的降低。结合配偶体(例如抗体)与第一分子的更高亲和性的结合(相对于第二分子),可以通过与第一靶的结合的KA高于(或数值KD小于)与第二靶的结合的KA(或数值KD)来指示。在这些情况下,所述抗体对第一分子(例如采取第一构象的蛋白质或其模拟物)相对于第二分子(例如采取第二构象的同一蛋白质或其模拟物,或第二蛋白质)具有特异性。结合亲和性(例如特异性)的差异可以大于或等于1.5倍、大于或等于2倍、大于或等于3倍、大于或等于4倍、大于或等于5倍、大于或等于10倍、大于或等于15倍、大于或等于20倍、大于或等于37.5倍、大于或等于50倍、大于或等于70倍、大于或等于80倍、大于或等于90倍、大于或等于100倍、大于或等于500倍、大于或等于1000倍、大于或等于10,000倍、大于或等于105倍。
在某些实施方式中,试剂可以通过共价键固定在探针的表面上。在这样的固定化之前,可以将探针的表面官能化,使得它包含适合于形成此类共价键的多个官能团。例如,探针的表面可以通过与双官能试剂反应而被官能化,所述双官能试剂包含有助于附着到探针的硅氧烷基团和有助于与将要固定在探针上的试剂形成共价键的官能团。作为另一个实例,可以将探针的表面暴露于等离子体或原位产生有助于与将要固定在探针上的试剂形成共价键的官能团的其他处理。有助于与将要固定在探针上的试剂形成共价键的适合类型的官能团的非限制性实例包括羟基、胺和羧基。
本文描述的探针可以由各种适合的材料形成。在某些实施方式中,探针包含玻璃和/或聚合物。适合的玻璃的非限制性实例包括SiO2和Ta2O5。适合的聚合物的非限制性实例包括聚苯乙烯和聚乙烯。
如上所述,在某些实施方式中,仪器包含支撑结构。所述支撑结构可以被配置用于支撑在测定中使用的一种或多种流体和/或固体,和/或可以被配置用于支撑用于在测定中使用的一种或多种流体和/或固体的容器。例如,在某些实施方式中,支撑结构被配置用于支撑和/或接收多孔板。作为进一步的实例,支撑结构可以被配置用于支撑微量滴定板、载玻片、液滴阵列、小瓶、微流体装置、微流体阵列、微阵列和/或数字微流体芯片。在某些实施方式中,用于流体和/或固体的容器被放置在所述支撑结构上。
在某些实施方式中,支撑结构被配置成由它构成其一部分的仪器平移(例如竖直地,在第一水平方向上,在第二水平方向上,上述方向中的两者或三者的组合)。在某些实施方式中,仪器可以被配置成使得它通过预设程序平移支撑结构,其中所述支撑结构被多次放置在多个位置处。仪器也可以被配置成使得操作者可以随意平移所述支撑结构(例如操作者可能能够输入所述探针被平移到的所需位置和/或通过使用控制器实时移动所述探针)。此外,某些仪器可以被配置成使得它们不被配置用于平移支撑结构。在此类实施方式中,在不被操作者手动移动的情况下,支撑结构可以是静止或不可移动的。
如上所述,在某些实施方式中,仪器包含光学检测器。所述光学检测器可以被配置用于检测光学信号,和/或一种方法可以包括检测光学信号。光学信号可以指示正在测定的样品的特征(例如其中一种或多种组分的存在、浓度或不存在),指示测定中存在的标准品的特征(例如其中一种或多种组分的存在、浓度或不存在),是参比信号、背景信号和/或基线信号。
光学信号可以包括光或光的缺失。作为前者的实例,光的存在、强度和/或偏振可以传达关于正在进行的测定的信息。例如,某些测定可能导致产生特定波长、特定波长范围内、特定波长组合和/或具有特定偏振的光。这种光的检测可以指示所述测定被正确地进行,正在测定的样品具有特定特征,和/或样品包含特定量的特定组分。这种光的缺失可以指示所述测定进行得不正确,正在测定的样品缺少特定特征,和/或样品缺少特定组分。
存在于光学信号中的光可以包括通过荧光、发光(例如化学发光)和/或散射(例如拉曼散射)发射的光。存在于光学信号中的光也可以包括被反射或透射的光。在某些实施方式中,存在于光学信号中的光包括被偏振的光。
光学信号可以从流体或固体中的各个位置产生。例如,某些光学信号可以从流体或固体的表面(例如上表面、下表面、侧表面)产生。作为另一个实例,某些光学信号可以从流体或固体的内部产生。在某些实施方式中,光学信号从流体或固体的整体产生。
在某些实施方式中,光的缺失可以传达关于正在进行的测定的信息。所述测定可以导致产生吸收特定波长、特定波长范围内和/或特定波长组合的光的物质。这种光的缺失可以指示所述测定被正确地进行,正在测定的样品具有特定特征,和/或样品包含特定量的特定组分。这种光的存在可以指示所述测定进行得不正确,正在测定的样品缺少特定特征,和/或样品缺少特定组分。
缺失并且形成光学信号的光可以包括被吸收或反射的光。它可以被感知为入射到相关流体上的光的颜色变化。
光学信号可以包括各种波长和/或偏振的光的存在或缺失。在某些实施方式中,所述光可以包括可见光。所述光也可以包括红外光。此外,所述光可以是偏振光或非偏振光。
光学信号的检测可以包括检测和/或确定其各种适合的特征。在某些实施方式中,检测光学信号包括检测如上所述的光的存在或缺失。检测光学信号还可以包括检测如上所述的光的强度和/或偏振。这种检测可以在一个或多个离散的时间点或在一段时间内进行。此外,这种检测可以以产生单个数据点(例如端点,在一段时间内测量的特定波长的光的平均强度,通过对多个光强度测量值进行平均而计算的特定波长的光的平均强度,从单个测量值确定的特定波长的光的强度)、多个数据点的方式进行。所述多个数据点可以描述光学信号随时间的变化(例如在动力学测量中)、光学信号随位置的变化(例如在单个流体例如单个样品或单个标准品中的多个位置之间)和/或光学信号随波长的变化。
在某些实施方式中,一种方法包括检测两个或更多个光学信号。这些光学信号可以包括相同类型的光学信号(例如它们可以包含以相同方式检测的同一类型的光)和/或可以包括在一种或多种方式上不同的光学信号。所述两个或更多个光学信号可以从单个流体或固体产生,可以从超过一种流体或固体产生,和/或可以包括不从任何流体或固体产生的光学信号(例如作为参比信号、背景信号和/或基线信号的光学信号)。在某些实施方式中,所述两个或更多个光学信号与同一样品相关和/或与对同一样品进行的测定相关(但在某些实施方式中,与不同的探针和/或流体和/或固体相关和/或从其产生)。
当存在时,所述两个或更多个光学信号可以包含通过放置在不同位置处和/或光学偶联到不同位置(例如由支撑结构支撑的容器中的不同位置例如多孔板中的不同孔附近,不同容器附近)的光学检测器检测的至少两个光学信号(相同类型和/或不同类型的)。所述两个或更多个光学信号也可以包含通过单个光学检测器检测的至少两个光学信号(相同类型和/或不同类型的)。类似地,所述两个或更多个光学信号可以包含在不同时间点(例如在测定期间的离散时间点,在容器中发生的反应的过程中)检测的至少两个光学信号(相同类型和/或不同类型的)和/或包含在单个时间点检测的至少两个光学信号。
当方法包括检测两种或更多种不同类型的光学信号时,所述光学信号可以以各种方式不同。这些差异的非限制性实例包括所检测的光的产生方式(例如一个光学信号可以包括由荧光发射的光,另一个可以包括由发光发射的光)、所检测的光的波长(或波长范围)(例如一个光学信号可以包括以第一波长发射的光,另一个可以包括以第二波长发射的光)和所吸收的光的波长(或波长范围)(例如一个光学信号可以包括在第一波长处吸收的光,另一个可以包括在第二波长处吸收的光)。方法也可以包括检测包含不同类型的光的光学信号(例如一个光学信号包括发射的光,另一个光学信号包括散射的光),和/或方法可以包括既检测包含光(例如被发射、透射、反射、散射和/或偏振的光)的光学信号又检测包含光的缺失(例如被吸收或反射的光)的光学信号。包括检测两种不同类型的光学信号的方法的另一个特定实例是下述方法,其包括检测两个包含具有不同波长的光的光学信号,并进一步包括确定这两种波长彼此的比例。
包括检测两个光学信号(相同或不同类型的)的方法的一个实例是包括检测下述两者的方法:(1)指示第一样品的特征的第一光学信号;和(2)第二光学信号。所述第二光学信号可以是任何适合类型的光学信号。例如,在某些实施方式中,所述第二光学信号指示第二样品。所述第二光学信号也可以指示不同类型的流体和/或固体的特征、不从任何流体或固体产生(例如在光学信号是参比信号、背景信号和/或基线信号的情况下)、指示第一样品的不同特征和/或指示第一样品的同一特征。作为一个实例,在某些实施方式中,第二光学信号指示标准品的特征(例如它可以是由参比标准品产生的参比信号)。此类光学信号可以帮助校准仪器和/或检测仪器功能是否正常。方法也可以包括将指示样品特征的信号与指示标准品特征的信号进行比较。这种比较可用于减除背景噪声和/或提高测量的可重复性。
包括检测两个光学信号(相同或不同类型的)的方法的其他实例包括其中光学信号不从任何样品产生的方法。此类方法可以是专门检测参比、背景和/或基线光学信号的方法。在此类实施方式中,方法可以包括校准仪器、评估仪器功能和/或产生可用于标准化和/或校准从样品获得的数据的数据集。
如上所述,在某些实施方式中,光学信号的检测包括检测所述光学信号产生的位置。这可以通过检测将光学信号传输到检测器的探针的位置和/或通过检测用于检测光学信号的检测器的位置来实现。
在本文描述的仪器中可以使用各种适合的光学检测器。例如,适合的检测器类型的非限制性实例包括光子计数装置、分光光度计、拉曼光谱仪、红外光谱仪、偏振检测器、光电二极管、CCD/CMOS传感器和成像传感器。
如上所述,在某些实施方式中,仪器包含光源。所述光源可以充当刺激光学信号发射的光源。
在某些实施方式中,光源提供多种波长的光。例如,仪器可以包含包括白炽灯泡的光源。作为其他实例,仪器可以包含包括氙灯、汞灯和/或弧光灯的光源。当仪器包含提供多种波长的光的光源时,所述仪器还可以包含一个或多个滤光器和/或单色器。此类滤光器和/或单色器可以被放置在光源与产生光学信号的物质的位置之间、光源与检测器之间、检测器与产生光学信号的物质的位置之间、光学检测器与探针之间、光源与探针之间和/或光学检测器与光缆之间。如果由光源发射的光包括至少一个将与光学信号的波长重叠的波长和/或如果由光源发射的光包括至少一个将刺激光学信号的产生的波长,则不论所述测定产生阳性还是阴性结果,前者都可能是有益的(例如在相关波长的光将刺激从各种物质、包括总是固定在探针上和/或存在于接触探针的流体中的物质的发射的情况下)。
在某些实施方式中,仪器包含在相对窄的波段内发射光的光源。例如,仪器可以包含激光光源和/或LED光源。
本文描述的光源也可以提供单次偏振和/多次偏振的光。当光源提供多次偏振的光时,所述仪器可以进一步包含一个或多个偏振滤光器。此类偏振滤光器可以被放置在光源与产生光学信号的物质的位置之间、光源与检测器之间和/或光学检测器与光缆之间。如果由光源发射的光包括将以与光学信号的波长重叠的偏振的光和/或如果由光源发射的光包括至少一个将刺激光学信号的产生的偏振,则不论所述测定产生阳性还是阴性结果,前者都可能是有益的(例如在相关偏振的光将刺激从各种物质、包括总是固定在探针上和/或存在于接触探针的流体中的物质的发射的情况下)。如果所述光学信号包括由固定在探针上的物质和/或固定在探针上的物质产生的物质偏振的光,则前者也可能是有益的。
如本文中别处所述,某些仪器可以适合于进行测定,并且某些方法可以包括进行测定(例如利用本文描述的仪器)。在某些实施方式中,一种进行测定的方法包括提供其上固定有试剂并且光通过其上的一个或多个孔传输的探针,提供用于一种或多种流体的容器,以及检测光学信号。所述光学信号可以包括由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光、由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失和/或由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。这种方法示出在图7中的流程图中。在图7中,方法1012包括提供探针的步骤1112、提供用于一种或多种流体的容器的步骤1212和检测光学信号的步骤1312。在某些实施方式中,测定的进行包括进行图7中所示的步骤之外的更多步骤,并且在某些实施方式中测定可以在缺少图7中所示的一个或多个步骤的情况下进行。可以进行的其他步骤的非限制性实例在下文进一步详细描述。
在某些实施方式中,测定包括将探针与一种或多种流体接触(并且在某些实施方式中,随后移除探针以脱离接触)。可以移除探针以脱离与多种流体中其正在接触的每种流体的接触,然后再与所述多种流体中的下一种流体接触。在某些实施方式中,移除探针以脱离与流体的接触终止了正在发生的反应(例如固定在探针上的物质与从其移除探针的流体中存在的物质之间的反应)。通过移除探针以脱离与流体的接触来终止反应,可以对光学信号(例如指示所述流体和/或在接触所述流体之前与探针接触的样品的光学信号)做出响应来进行。反应也可以通过在经过预设的时间间隔后移除探针以脱离与流体的接触和/或通过操作者的手动操作来终止。
在某些实施方式中,测定的进行包括将探针与多种流体顺序接触并检测光学信号。所述顺序接触可以通过平移探针和/或支撑结构来实现。在测定进行期间,光学信号可以与固定在所述探针上的物质相关。正如本文中别处所述,所述光学信号可以包括由固定在探针上的物质发射、透射、反射、散射、偏振和/或吸收的光,和/或可以包括由固定在探针上的物质产生的物质发射、透射、反射、散射、偏振和/或吸收的光。在某些实施方式中,当探针与所述多种流体中的流体接触时检测光学信号。光学信号也可以在探针与所述多种流体中的流体之间的初始接触后产生。
也如本文中别处所述,某些方法可以包括使用两个探针进行共同测定和/或使用两个探针进行两个不同测定(其可以是相同类型的和/或对同一样品进行)。在此类实施方式中,也可以将第二探针与第二多种流体顺序接触,并且可以检测第二光学信号(例如包括被发射、透射、反射、偏振和/或散射的光和/或被吸收和/或反射的光的缺失)。可以移除探针以脱离与所述第二多种流体中其正在接触的每种流体的接触,然后再与所述第二多种流体中的下一种流体接触。在某些实施方式中,当探针与所述第二多种流体中的流体接触时检测第二光学信号。所述第二探针可用于对所述第一探针进行测定的同一样品进行第二测定,可用于对所述第一探针进行测定的同一样品进行相同的测定,和/或可用于对不同样品进行测定(例如由所述第一探针进行的同一测定,不同测定)。
某些测定包括检测样品的一种或多种定性特征(例如感兴趣的物质如蛋白质的存在或不存在)。某些测定包括检测样品的一种或多种定量特征(例如样品中存在的感兴趣的物质的量,例如样品中存在的蛋白质的量)。在某些实施方式中,测定包括进行动力学测量(例如流体如样品中的物质与固定在探针上的试剂的结合速率)和/或脉冲测量。在某些实施方式中,测定包括进行脉冲测量,例如在闪速发光反应和/或闪速反应期间进行的测量。某些适合的闪速发光反应和闪速反应包括将探针与固定在其上的作为反应催化剂的物质接触,然后测量与该反应产生的物质相关的光学信号。
可以进行各种适合的测定,其非限制性实例包括ELISA测定(例如直接ELISA测定、间接ELISA测定、夹心ELISA测定)、全细胞测定和生物分子相互作用测定。某些测定可以包括检测细胞表面蛋白、空衣壳和/或含有核酸的衣壳。
在某些实施方式中,测定在样品上进行。在此类实施方式中,在测定期间使用的至少一个多种流体可以包含作为样品的流体。所述样品可以是多种流体中与探针接触的一种流体,和/或可以存在于多种流体中与探针接触的一种流体中(例如悬浮在其中、溶解在其中)。在测定中使用的两个或更多个(或每个)多种流体也可以包含作为样品的流体(例如在其中进行测定包括使用两个或更多个探针来各自接触其自己的多个样品的情况下)。在某些实施方式中,进行测定包括将至少一个探针与缺少作为样品的任何流体的至少一个多种流体接触。
某些样品可以包含体液和/或生物材料。例如,在某些实施方式中,样品包含细胞(例如活细胞)和/或试剂(例如生物分子)。样品可以包含本文中别处针对可以固定在探针表面上的试剂所描述的一些或所有试剂,和/或可以包含除如此描述的试剂之外的试剂。可以包括在适合于通过测定进行分析的样品中的某些试剂的非限制性实例包括蛋白质、糖蛋白、肽、配体、抗体、抗原、激素、核酸(例如DNA)、多糖、碳水化合物、小分子、无机化合物、螯合化合物、病毒、衣壳、细胞和细菌。
在某些实施方式中,样品包含在测定进行期间变得固定在探针上和/或被配置成在测定进行期间变得固定在探针上的组分。例如,在某些实施方式中,样品包含与探针结合和/或被配置成与探针结合的组分。测定的进行也可以确定样品是否包含此类组分。例如,在某些实施方式中,样品可以包含固定在探针上的抗体的抗原。进行测定可以鉴定所述样品是否确实包含抗原和/或所述样品中这种抗原的浓度。作为进一步的实例,如上所述,可以将适合于参与包括结合的化学和/或生物学反应的试剂固定在探针表面上,并且样品可以包含该试剂的结合配偶体和/或靶。例如,可以将抗原固定在探针表面上,并且样品可以包含针对该抗原的抗体(例如针对该抗原的酶联抗体)。
测定也可以在标准品上进行。例如,在某些实施方式中,测定在阳性标准品和/或阴性标准品上进行。阳性标准品可以被配置成在测定正确进行的情况下总是产生光学信号和/或总是产生强度和/或偏振已知的光学信号。某些阳性标准品包含已知浓度的将要通过所述测定检测的试剂。阴性标准品可以被配置成在测定正确进行的情况下总是不产生光学信号。某些阳性标准品缺少将要通过所述测定检测的试剂。对阳性标准品和/或阴性标准品进行测定可用于校准从对样品进行的测定获得的结果和/或确认仪器的性能正常。某些实施方式可以包括将第一探针与包含样品(并任选地缺少标准品)的多种流体接触,并将第二探针与包含标准品(并任选地缺少样品)的多种流体接触。实施方式还可以包括接触两种或更多种标准品(例如与两个或更多个探针,以使得每个探针接触单个标准品的方式),例如阳性标准品和阴性标准两者,和/或两个或更多个阳性标准品,其包含不同浓度的将要通过所述测定检测的试剂。
可以在进行测定期间存在的除了样品和标准品之外的流体包括包含帮助进行测定的物质的流体。例如,可以存在包含一种或多种试剂(例如本文中别处针对可以固定在探针上的试剂类型所描述的类型的一种或多种试剂)的流体。此类流体可以与任何样品和/或标准品分开提供(例如在多孔板中的单独的孔中)。此外,此类流体可以包含被配置用于固定在探针上所固定的物质上的试剂。作为一个实例,此类流体可以包含被配置用于固定在探针上最初固定的物质上的试剂。所述流体中存在的试剂可以是被配置成与可能存在于样品中的物质经历反应的试剂。所述反应可以包括将样品中存在的试剂固定在其上(即最初存在于所述流体中的物质上)。作为另一个实例,流体可以包含被配置用于固定在最初存在于样品中的试剂上的试剂。此类试剂可以通过最初存在于所述样品中的试剂而固定在探针上。这种试剂可以被配置成产生光学信号和/或与其他试剂反应以产生光学信号。
可以存在于本文描述的流体中和/或被配置用于固定在探针上所固定的物质上的试剂的非限制性实例包括配体(例如样品中存在的分析物的配体)、样品中存在的分析物的结合配偶体和/或靶、抗体(例如针对样品中存在的抗原的抗体、酶联抗体、第一酶联抗体、第二酶联抗体、针对样品中存在的抗原的酶联抗体、包含荧光团的抗体)、蛋白质、糖蛋白、肽、核酸、抗原、多糖、碳水化合物、激素、小分子、病毒、细胞、无机化合物、螯合化合物、衣壳和细菌。在某些实施方式中,试剂包含酶和/或被键合到酶。适合的酶的非限制性实例包括辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶。
在某些实施方式中,在测定进行期间存在包含一种或多种被配置用于产生光学信号的试剂的流体。这种流体可以与任何样品、标准品和/或包含帮助进行测定的物质的流体、一种或多种试剂和/或包含帮助进行测定的物质的流体分开地提供(例如在多孔板中的单独的孔中)。这种流体的一个实例是包含被配置成与固定在探针上的试剂反应的试剂(例如最初存在于样品中的试剂、固定在最初存在于样品中的试剂上的试剂)的流体。被配置成与固定在探针上的试剂反应的试剂可以在经历这种反应后产生光学信号。例如,流体可以包含被配置成与固定在探针上的物质经历反应的试剂,其产生吸收光、透射光、反射光、发射荧光、经历散射(例如拉曼散射)、被偏振和/或经历发光(例如化学发光)的物质。在某些实施方式中,在探针与包含一种或多种被配置成产生光学信号的试剂的流体接触时和/或在与这种流体初始接触后,检测光学信号。
可以被配置成产生光学信号的试剂的非限制性实例包括酶底物(例如用于酶联抗体)。某些方法包括将酶底物与酶(例如酶联抗体)反应。这种反应可以导致产生酶反应的产物,一种或多种所述产物可能能够和/或被配置成产生光学信号。
在某些实施方式中,在测定进行期间存在一种或多种清洗流体。清洗流体可以与任何样品、标准品、包含帮助进行测定的物质的流体和/或包含被配置用于产生光学信号的试剂的流体、一种或多种标准品、一种或多种试剂、包含帮助进行测定的物质的流体和/或包含被配置用于产生光学信号的试剂的流体分开地提供(例如在多孔板中的单独的孔中)。清洗流体可以是被配置用于移除微弱地附着到探针的物质的流体。从探针移除此类物质可以通过消除来自未固定在其上的物质的信号来提高所述测定的可重复性。此外,从探针移除此类物质可以降低测定期间存在的不同流体之间的交叉污染。适合的清洗流体的一个实例是清洗缓冲液(例如甘氨酸缓冲液、磷酸缓冲液)。
在某些实施方式中,测定通过将其上固定有试剂的探针与下述流体顺序接触来进行:包含被配置用于固定在所述探针上的第一试剂的样品,包含被配置成变得固定在所述第一试剂上的第二试剂的流体,和包含被配置成与所述第二试剂反应以产生生成光学信号的物质的第三试剂的流体。作为另一个实例,测定可以包括将其上固定有试剂的探针与下述流体顺序接触:包含被配置用于固定在所述探针上的第一试剂的样品,包含被配置成变得固定在所述第一试剂上的第二试剂的流体,包含被配置成变得固定在所述第二试剂上的第三试剂的流体,和包含被配置成与所述第三试剂反应以产生生成光学信号的物质的第四试剂的流体。也可以进行一种方法,其中标准品是所述探针所接触的第一流体,但其他步骤与前两句之一中的步骤相同。此外,某些方法可以包括在两对或更多对上述步骤之间将探针与清洗流体(例如清洗缓冲液)接触。
在本文描述的测定期间使用的流体可以被包含在各种适合的容器中。在某些实施方式中,一些或所有此类流体被包含在一个或多个多孔板中。在此类实施方式中,所述流体可以被包含在独立的孔中。所述孔可以在同一个单行、同一组行、同一个单列或同一组列中。在其中将两个或更多个多种流体与两个或更多个探针接触的实施方式中,每个多种流体可以如上所述放置(例如每个多种流体可以被放置在同一个单行、同一组行、同一个单列或同一组列中)。在某些实施方式中,一种方法包括将第一探针与放置在单个列或行中的第一多种流体接触,并将第二探针与放置在不同行或列中的第二多种流体接触。方法也可以包括将探针与放置在两个或更多个列或两个或更多个行中的多种流体接触。流体也可以被包含在本文别处所述的其他类型的物品中。在进行测定期间,可以将探针在含有多种流体的一个或多个容器之间平移,和/或可以将支撑一个或多个此类容器的支撑结构相对于探针平移。例如,在多孔板的情况下,可以将探针在所述多孔板的多个孔之间平移。一些或所有那些孔可以含有用于进行测定的流体。作为另一个实例,可以将支撑多孔板的支撑结构平移,使得多个孔(其中的一些或所有孔含有适用于进行测定的流体)被顺序放置在探针附近。
测定的进行也可以包括一个或多个步骤和/或时间段,中支撑结构和探针两者都是静止的,其中仪器的所有部分都是静止的,其中仪器的两个或更多个部分相对于彼此是静止的,和/或其中仪器的两个或更多个部分(尽管相对于彼此不是静止的)彼此不经历可观的净位移。例如,在某些实施方式中,方法包括将探针与流体温育的一个或多个时间段。所述温育可以在探针和流体两者(以及可能情况下,含有所述流体的容器和/或支撑这种容器的支撑结构)静止时进行。所述温育也可以在流体(以及可能情况下,含有所述流体的容器和/或支撑这种容器的支撑结构)和/或探针中的任一者振摇时进行。在某些实施方式中,流体(以及可能情况下,含有所述流体的容器和/或支撑这种容器的支撑结构)和探针两者一起振摇。在某些实施方式中,温育包括搅拌所述流体(例如样品)和/或混合所述流体。所述搅拌和/或混合可以通过搅动所述流体(例如使用探针)来实现。
温育也可以包括调整和/或维持流体的温度。例如,温育可以包括加热流体和/或冷却流体。
在某些实施方式中,可以在一个或多个步骤和/或时间段中产生和/或检测光学信号,其中支撑结构和探针两者都是静止的,其中仪器的所有部分都是静止的,其中仪器的两个或更多个部分相对于彼此是静止的,和/或其中仪器的两个或更多个部分(尽管相对于彼此不是静止的)彼此不经历可观的净位移。检测可以在温育期间和/或不存在温育的情况下进行。
尽管本文已经描述和说明了本发明的几个实施方式,但本领域普通技术人员将容易地设想用于执行本文所述的功能和/或获得本文所述的结果和/或一个或多个优点的各种其他手段和/或结构,并且这些变化和/或修改中的每一者都被认为在本发明的范围之内。更一般地,本领域技术人员将容易理解,本文描述的所有参数、尺寸、材料和配置都是示例性的,并且实际的参数、尺寸、材料和/或配置将取决于使用本发明的教导的一个或多个具体应用。本领域技术人员将认识到或能够使用不超过常规的实验来确定本文描述的本发明的具体实施方式的许多等效物。因此应当理解,上述实施方式仅通过示例的方式呈现,并且在权利要求书及其等效物的范围之内,本发明可以以不同于具体描述和要求保护的方式来实践。本发明涉及本文描述的每个单独的特征、系统、物品、材料、试剂盒和/或方法。此外,如果此类特征、系统、物品、材料、试剂盒和/或方法不是相互矛盾的,则两个或更多个此类特征、系统、物品、材料、试剂盒和/或方法的任何组合都被包括在本发明的范围之内。
本文中所定义和使用的所有定义都应被理解为优先于字典定义、通过引用并入的文件中的定义和/或所定义的术语的普通含义。
本文中在说明书和权利要求书中使用的没有具体数目的指称应该被理解为意味着“至少一个”,除非清楚地指明不是如此。
本文中在说明书和权利要求书中使用的短语“和/或”应该被理解为意味着如此连结的要素中的“任一者或两者”,即在某些情况下连带地存在而在其他情况下分别地存在的要素。用“和/或”列出的多个要素应以相同的方式进行解释,即如此连结的要素中的“一者或多者”。除了由“和/或”子句具体标识的要素之外,可以任选地存在其他要素,无论与具体标识的那些要素相关还是无关。因此,作为非限制性实例,当与诸如“包含”的开放式语言相结合使用时,对“A和/或B”的指称在一个实施方式中可以是指仅仅A(任选地包括B以外的要素),在另一个实施方式中是指仅仅B(任选地包括除A以外的要素),在又一个实施方式中是指A和B两者(任选地包括其他要素);等等。
当在本文中在说明书和权利要求书中使用时,“或”应该被理解为具有与上文定义的“和/或”相同的含义。例如,当分隔列表中的项目时,“或”或“和/或”应该被解释为是包含性的,即包括多个要素或要素列表中的至少一者,但也包括超过一者,以及任选的其他未列出的项目。只有明确表示相反的术语如“仅仅一者”或“恰好一者”或在权利要求书中使用时的“由……组成”,才是指包含多个要素或要素列表中的恰好一个要素。通常,本文中使用的术语“或”仅应在前面加上排他性术语例如“任一者”、“之一”、“仅仅一者”或“恰好一者”时才被解释为表示排他性可选方案(即“一者或另一者但不是两者”)。当在权利要求书中使用时,“基本上由……组成”应具有它在专利法领域中使用的普通含义。
当在本文中在说明书和权利要求书中使用时,短语“至少一者”在指称一个或多个要素的列表时,应该被理解为意味着选自所述要素列表中的任一个或多个要素的至少一个要素,但不一定包括所述要素列表内具体列出的每个要素中的至少一者,并且不排除所述要素列表中的要素的任何组合。该定义还允许可以任选地存在由短语“至少一者”指称的要素列表内具体标识的要素之外的要素,不论与具体标识的那些要素相关还是无关。因此,作为非限制性实例,“A和B中的至少一者”(或等效地“A或B中的至少一者”或等效地“A和/或B中的至少一者”)在一个实施方式中可以是指至少一个、任选地包括超过一个A并且不存在B(并任选地包括B之外的要素),在另一个实施方式中是指至少一个、任选地包括超过一个B并且不存在A(并任选地包括A之外的要素),在又一个实施方式中是指至少一个、任选地包括超过一个A和至少一个、任选地包括超过一个B(并任选地包括其他要素);等等。
还应该理解,除非明确指出相反,否则在本文中要求保护的包括超过一个步骤或动作的任何方法中,所述方法的步骤或动作的顺序不一定限于所述方法的步骤或动作被叙述的顺序。
在权利要求书以及上述说明书中,所有过渡性短语例如“包含”、“包括”、“带有”、“具有”、“含有”、“涉及”、“持有”、“由……组成”等均应被理解为开放式的,即意味着包括但不限于。如美国专利局专利审查程序手册第2111.03节中所述,只有过渡性短语“由……组成”和“基本上由……组成”才分别是封闭或半封闭式过渡性术语。
Claims (135)
1.一种用于进行测定的仪器,其包含:
探针;
支撑结构,其被放置在所述探针附近;和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,
所述探针被配置成由所述仪器在放置有多种流体的多个位置之间平移,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
2.一种用于进行测定的仪器,其包含:
外壳;
光缆,和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
所述外壳包含被配置用于接收探针的部件,
所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近,
所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器,
所述仪器被配置成将所述探针在靠近所述容器中的多个位置的多个位置之间平移,
所述光缆将光传输到所述光学检测器,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
3.一种用于进行测定的仪器,其包含:
探针;
支撑结构,其被放置在所述探针附近;和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,
所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得所述支撑结构的多个部分被顺序地放置在所述探针附近,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
4.一种用于进行测定的仪器,其包含:
外壳;
探针,和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
所述外壳包含被配置用于接收探针的部件,
所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近,
所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器,
所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得当所述探针位于所述部件中时所述容器中的多个位置被顺序地放置在所述探针附近,
所述光缆将光传输到所述光学检测器,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
5.一种进行测定的方法,所述方法包括:
将探针与多种流体顺序接触;和
检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
6.一种用于进行测定的仪器,其包含:
探针,其中所述探针被配置用于传输光;
支撑结构,其被放置在所述探针附近;和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,
所述探针被配置成由所述仪器在放置有多种流体的多个位置之间平移,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
7.一种用于进行测定的仪器,其包含:
外壳;
探针,其中所述探针被配置用于传输光;和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
所述外壳包含被配置用于接收探针的部件,
试剂被固定在所述探针上,
所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近,
所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器,
所述仪器被配置成将所述探针在靠近所述容器中的多个位置的多个位置之间平移,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
8.一种用于进行测定的仪器,其包含:
探针,其中所述探针被配置用于传输光;
支撑结构,其被放置在所述探针附近;和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,
所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得所述支撑结构的多个部分被顺序地放置在所述探针附近,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
9.一种用于进行测定的仪器,其包含:
外壳;
探针,其中所述探针被配置用于传输光;和
光学检测器,其被配置用于检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,
所述外壳包含被配置用于接收探针的部件,
所述外壳包含支撑结构,其被放置在所述被配置用于接收探针的部件附近,
所述支撑结构被配置成接收用于一种或多种流体的容器,
所述支撑结构被配置成由所述仪器平移,使得当所述探针位于所述部件中时所述容器中的多个位置被顺序地放置在所述探针附近,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、透射、反射和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
10.一种进行测定的方法,所述方法包括:
提供探针;
提供用于一种或多种流体的容器;和
检测光学信号,其中:
试剂被固定在所述探针上,
光通过所述探针上的一个或多个孔传输,并且
所述光学信号包括:
由固定在所述探针上的物质发射、偏振和/或散射的光,
由固定在所述探针上的物质产生的物质发射、偏振和/或散射的光,
由于固定在所述探针上的物质的光吸收导致的光缺失,和/或
由于固定在所述探针上的物质产生的物质的光吸收导致的光缺失。
11.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述探针是光学探针。
12.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述探针是光纤探针。
13.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述探针包括光纤束。
14.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述探针通过一个或多个孔传输光。
15.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述一个或多个孔位于所述探针的与所述光缆相对的一侧上。
16.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述探针包括透镜。
17.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述透镜被配置用于收集光并将光传输到所述探针的光轴。
18.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述平移包括水平平移。
19.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述平移包括垂直平移。
20.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光缆将光从光源传输到所述探针。
21.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光源提供多种波长的光。
22.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中将滤光器放置在所述光源与探针之间。
23.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中将滤光器放置在所述光学检测器与探针之间。
24.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中将单色器放置在所述光源与探针之间。
25.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光是激光。
26.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光是LED光。
27.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光缆将光从所述探针传输到检测器。
28.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述检测器是光子计数装置。
29.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述检测器是分光光度计。
30.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述检测器是拉曼光谱仪。
31.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述检测器不通过所述光缆偶联到所述探针。
32.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中光缆将光从位于所述探针附近的流体传输到所述检测器。
33.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述检测器被放置在所述支撑结构的与所述探针相对的一侧上。
34.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中用于一种或多种流体的容器被放置在所述支撑结构上。
35.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述用于一种或多种流体的容器包括多孔板。
36.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述仪器包含光缆。
37.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光缆被配置用于将光传输到所述探针。
38.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光缆被配置用于传输来自所述探针的光。
39.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光缆被配置用于传输来自所述光源的光。
40.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光缆被配置用于将光传输到所述检测器。
41.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述仪器还包含第二探针。
42.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二探针被配置成独立于所述探针进行平移。
43.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述仪器还包含第二光学检测器。
44.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将所述探针与流体接触。
45.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中在所述探针与所述流体接触时检测所述光学信号。
46.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将所述探针从与所述流体的接触中移除。
47.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中检测所述光学信号包括检测和/或确定所述光学信号的特征。
48.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将第二探针与第二多种流体顺序接触并检测第二光学信号,其中所述第二光学信号包括由固定在所述探针上的物质发射的光、由固定在所述探针上的物质产生的物质发射的光、被固定在所述探针上的物质吸收的光的缺失和/或被固定在所述探针上的物质产生的物质吸收的光的缺失。
49.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述探针与多种流体以及所述第二探针与第二多种流体的顺序接触在交叠的时间段内发生。
50.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述测定是ELISA测定。
51.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述测定是全细胞测定。
52.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述测定是生物分子相互作用测定。
53.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是蛋白质。
54.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是肽。
55.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是抗体。
56.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是抗原。
57.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是小分子。
58.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是病毒。
59.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是细胞。
60.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是多糖。
61.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是细菌。
62.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述试剂是核酸。
63.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述核酸是DNA。
64.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述流体中的至少一者是样品。
65.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光学信号指示所述样品的特征。
66.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含体液。
67.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含细胞。
68.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述细胞包括活细胞。
69.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含蛋白质。
70.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含配体。
71.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含抗体。
72.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含抗原。
73.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含核酸。
74.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述核酸是DNA。
75.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含病毒。
76.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品包含衣壳。
77.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述流体中的至少一者包含针对所述样品中存在的分析物的配体。
78.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述流体中的至少一种包含针对所述样品中存在的抗原的抗体。
79.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述抗体是酶联抗体。
80.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述抗体是第一酶联抗体。
81.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述抗体是第二酶联抗体。
82.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述流体中的至少一者包含所述酶联抗体的底物。
83.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述酶联抗体是针对所述样品中存在的抗原的抗体。
84.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述抗体包含荧光团。
85.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述流体中的至少一者是清洗缓冲液。
86.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述多种流体被包含在多孔板中的多个孔中。
87.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述多种流体被包含在位于多孔板的单行中的多个孔中。
88.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述多种流体被包含在位于多孔板的两行或更多行中的多个孔中。
89.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述多种流体被包含在位于多孔板的单列中的多个孔中。
90.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述多种流体被包含在位于多孔板的两列或更多列中的多个孔中。
91.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光学信号是光。
92.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光是由固定在所述探针上的物质发射的光。
93.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述固定在光学探针上的物质是最初存在于在测定期间与所述探针接触的流体中的试剂。
94.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述流体是样品。
95.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光是由固定在所述探针上的物质产生的物质发射的光。
96.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光由荧光产生。
97.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光由发光产生。
98.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光由散射产生。
99.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述散射是拉曼散射。
100.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光学信号是光的缺失。
101.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光的缺失是因为它被固定在所述探针上的物质吸收。
102.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述光的缺失是因为它被固定在所述探针上的物质产生的物质吸收。
103.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中将所述探针与多种流体顺序接触包括将所述探针在含有所述多种流体的多个孔上平移。
104.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中将所述探针与多种流体顺序接触包括将含有所述多种流体的多个孔平移到所述探针附近。
105.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品的组分与所述探针结合。
106.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将所述探针与所述流体中的一者或多者温育。
107.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述温育在所述探针和与其温育的流体静止时进行。
108.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述温育在与所述探针温育的流体振摇时进行。
109.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述温育在所述探针和与其温育的流体一起振摇时进行。
110.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述温育包括加热所述流体。
111.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述温育包括冷却所述流体。
112.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述样品的与所述探针结合的组分是固定在所述探针上的抗体的抗原。
113.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述酶联抗体与所述抗原结合。
114.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将所述底物与连接到所述抗体的酶反应。
115.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述检测包括测量所述光学信号随时间的变化。
116.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将所述探针与第二多种流体顺序接触。
117.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体被包含在容器中。
118.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述容器是多孔板。
119.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体被包含在所述多孔板中的多个孔中。
120.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体被包含在位于多孔板的单列中的多个孔中。
121.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述列是与含有所述多种流体的孔所在的列不同的列。
122.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体被包含在位于多孔板的单行中的多个孔中。
123.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述行是与含有所述多种流体的孔所在的行不同的行。
124.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体中的至少一种流体是第二样品。
125.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体中的所有流体均不是第二样品。
126.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二多种流体中的至少一种流体是标准品。
127.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括检测第二光学信号。
128.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第二光学信号指示所述标准品的特征。
129.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述标准品是阳性标准品。
130.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述标准品是阴性标准品。
131.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其还包括将所述第二光学信号与指示所述样品的特征的光学信号进行比较。
132.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述方法包括检测细胞表面蛋白。
133.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述方法包括检测空衣壳和/或检测含有核酸的衣壳。
134.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述方法包括:
将所述探针暴露于第一流体,从而使所述试剂从所述探针脱离;和
随后将所述探针暴露于包含新试剂的第二流体,从而使所述新试剂被固定到所述探针上。
135.根据前述权利要求中任一项所述的仪器或方法,其中所述第一流体是缓冲液。
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