CN117716033A - 工程化指导rna和多核苷酸 - Google Patents
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Abstract
本文公开了用于治疗受试者的疾病或疾患的工程化指导RNA和包含其的组合物。本文还公开了通过施用本文所述的工程化指导RNA或药物组合物来治疗受试者的疾病或疾患的方法。
Description
交叉引用
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背景技术
介导RNA编辑的有效载荷可为遗传疾病的可行疗法。然而，需要可最大化中靶RNA编辑，同时最小化脱靶RNA编辑的高效有效载荷。此外，还需要能够促进RNA编辑以敲低蛋白质的有效负载。
发明内容
本文公开了包含工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸的组合物。在一些实施方案中，在与DUX4靶RNA的序列杂交后，工程化指导RNA可与DUX4靶RNA的序列形成指导-靶RNA支架；指导-靶RNA支架的形成基本上形成选自由以下组成的组的一种或多种结构特征：凸起、内部环、发夹，以及由工程化指导RNA中的碱基与DUX4靶RNA中的G、C或U形成的错配；并且在工程化指导RNA与DUX4靶RNA杂交之前，结构特征可能不存在于工程化指导RNA内；并且当工程化指导RNA与DUX4靶RNA的序列杂交后，工程化指导RNA可促进RNA编辑实体对DUX4靶RNA的序列中的一个或多个靶腺苷进行RNA编辑。在一些实施方案中，DUX4靶RNA的序列可包含翻译起始位点、polyA信号序列、剪接位点或其任何组合。在一些实施方案中，DUX4靶RNA的序列可包含polyA信号序列。在一些实施方案中，一种或多种特征还可包括由工程化指导RNA中的碱基与DUX4靶RNA中的A形成的错配。在一些实施方案中，DUX4可以是DUX4-FL。在一些实施方案中，DUX4靶RNA的序列可包含polyA信号序列。在一些实施方案中，polyA信号序列可在DUX4-FL中。在一些实施方案中，polyA信号序列可包含ATTAAA。在一些实施方案中，ATTAAA polyA信号序列的任何A可以是靶腺苷。在一些实施方案中，ATTAAA的位置0可以是靶腺苷，其中位置0是ATTAAA在5'端的第一个A。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-10和-11。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环可在相对于位置0的位置-5处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1054。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:977具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:977。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:934具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:934。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ IDNO:1575。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1573。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1569。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ IDNO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1567。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1588。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ IDNO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:593。在一些实施方案中，ATTAAA的位置3是靶腺苷，其中位置3是ATTAAA从5'端起的第二个A。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：22、21、20、-2、-4、-5、-6、-7、-8、-9和-10。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置20处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括在相对于位置0的位置3处的A/C错配。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:8具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQID NO:8。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ IDNO:1054。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:977具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:977。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1569。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1567。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1573。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1588。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ IDNO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1575。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:593。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一2/2对称凸起：-3、-5和-7。在一些实施方案中，第一2/2对称凸起在相对于位置0的位置-5处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置26处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置42处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置58处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置74处的2/2对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1545具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1545。在一些实施方案中，ATTAAA的位置4是靶腺苷，其中位置4是ATTAAA从5'端起的第三个A。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：33、-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-11和-12。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-1处。
在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1463具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1463。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-3处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1294具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1294。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1054。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:934具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ IDNO:934。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1573。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1575。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1567。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1569。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1588。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:593。在一些实施方案中，ATTAAA的位置5是靶腺苷，其中位置5是ATTAAA从5'端起的第四个A。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：33、23、-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-10和-12。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-1处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1463具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1463。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1054。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1575。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ IDNO:1567。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1573。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1569。在一些实施方案中，一种或多种结构特征还可包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:1588。在一些实施方案中，方法还可包括在ATTAAA的任何A处进行编辑。在一些实施方案中，一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:8的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:593的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:934的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:977的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1054的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1294的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1463的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1545的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1567的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1569的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1573的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ ID NO:1575的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与包含SEQ IDNO:1588的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括：第一6/6对称内部环，以及至少一种选自由以下组成的组的其他结构特征：第二6/6对称内部环、5/5对称内部环、4/4对称凸起、3/3对称凸起和2/2对称凸起。在一些实施方案中，指导-靶RNA支架还可包含A/C错配，其中A/C错配的胞嘧啶存在于工程化指导RNA中与一个或多个靶腺苷相对；并且其中一种或多种结构特征包括：相对于A/C错配位于位置-4至-8的第一6/6对称内部环；相对于A/C错配位于位置+31至+35的第二6/6对称内部环。
在一些实施方案中，指导-靶RNA支架还可包含A/C错配，其中A/C错配的胞嘧啶存在于工程化指导RNA中与一个或多个靶腺苷相对；并且其中一种或多种结构特征包括：相对于A/C错配在位置-6处的第一6/6对称内部环；相对于A/C错配在位置+33处的第二6/6对称内部环。在一些实施方案中，第一6/6对称内部环可在工程化指导RNA侧包含序列GGAACU，并且在靶RNA侧包含序列UUCAGA。在一些实施方案中，第二6/6对称内部环可在工程化指导RNA侧包含序列CUGACC，并且在靶RNA侧包含序列AGAUUU。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括第一6/6对称内部环和第二6/6对称内部环，并且其中靶RNA中的每个A与工程化指导RNA中的U碱基配对。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括凸起。在一些实施方案中，凸起可以是对称凸起。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括凸起。在一些实施方案中，凸起可以是不对称凸起。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括内部环，其中内部环是对称内部环。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括内部环。在一些实施方案中，内部环可以是不对称内部环。在一些实施方案中，一种或多种结构特征可包括由工程化指导RNA中的碱基与DUX4靶RNA中的G、C或U形成的错配。在一些实施方案中，RNA编辑实体可包括ADAR1、ADAR2、ADAR3或其任何组合。在一些实施方案中，一个或多个靶腺苷的RNA编辑可包括超编辑。在一些实施方案中，超编辑可包括编辑DUX4靶RNA的polyA信号序列中的多于一个A。在一些实施方案中，工程化指导RNA的内部环可包含任何位置顺序的任何核苷酸。在一些实施方案中，任何位置顺序的核苷酸都不与其在DUX 4靶RNA中的位置对应物互补。在一些实施方案中，工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸可以是环状的。在一些实施方案中，工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸可包含U7发夹序列、SmOPT序列或其组合，并且任选地其中U7发夹序列可包含SEQ IDNO 1591或1593并且其中SmOPT序列可包含SEQ ID NO:1595。在一些实施方案中，DUX4靶RNA可包含DUX4的前mRNA转录本。在一些实施方案中，至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4的前mRNA转录本可在polyA信号序列中具有至少一个编辑。在一些实施方案中，至少80％的DUX4的前mRNA转录本可在polyA信号序列中具有至少一个编辑。在一些实施方案中，一个或多个腺苷的编辑可促进mRNA敲低。在一些实施方案中，mRNA敲低可包括DUX4 mRNA的敲低。在一些实施方案中，mRNA敲低可包括与RNA编辑之前的mRNA水平相比，RNA编辑之后的mRNA水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。在一些实施方案中，与RNA编辑之前的mRNA水平相比，mRNA敲低可以是mRNA水平的至少50％。在一些实施方案中，与RNA编辑之前的mRNA水平相比，mRNA敲低可以是mRNA水平的至少70％。在一些实施方案中，一个或多个腺苷的编辑可促进蛋白质敲低。在一些实施方案中，蛋白质敲低可包括DUX4的敲低。在一些实施方案中，蛋白质敲低可包括DUX4下游的蛋白质的敲低。在一些实施方案中，DUX4下游的蛋白质可包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2或其任何组合。在一些实施方案中，蛋白质敲低可包括与RNA编辑之前的蛋白质水平相比，RNA编辑之后的蛋白质水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。在一些实施方案中，蛋白质敲低可包括与包含非功能性ADAR基因的细胞相比，ADAR表达细胞中的蛋白质水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。在一些实施方案中，蛋白质敲低可包括ADAR依赖性蛋白质敲低。在一些实施方案中，ADAR依赖性蛋白质敲低可包括与RNA编辑之前的蛋白质水平相比，蛋白质水平降低至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。在一些实施方案中，工程化指导RNA是体外转录(IVT)工程化指导RNA。在一些实施方案中，组合物可包含工程化多核苷酸。在一些实施方案中，工程化多核苷酸可包含在载体中或载体上。在一些实施方案中，载体可以是病毒载体。在一些实施方案中，工程化多核苷酸可被衣壳化在病毒载体中。在一些实施方案中，病毒载体可以是腺相关病毒(AAV)载体或其衍生物。在一些实施方案中，载体可以是非病毒载体。在一些实施方案中，非病毒载体可以是脂质纳米颗粒(LNP)、脂质体或聚合物纳米颗粒。在一些实施方案中，工程化多核苷酸可以是编码工程化指导RNA的DNA多核苷酸。在一些实施方案中，工程化指导RNA可与SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中的任一个具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。在一些实施方案中，工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中任一个的序列。
本文还描述了药物组合物，其包含：a)上述任何组合物；和b)药学上可接受的赋形剂、载剂或稀释剂。
本文还描述了治疗有需要的受试者的疾病或疾患的方法，所述方法包括向受试者施用治疗有效量的上述任何组合物或上述药物组合物。
在一些实施方案中，疾病或疾患可包括面肩肱型肌营养不良症(FSHD)。在一些实施方案中，FSHD可包括I型FSHD。在一些实施方案中，FSHD可包括II型FSHD。在一些实施方案中，施用可包括肠胃外施用、静脉内施用、皮下施用、鞘内施用、腹膜内施用、肌内施用、血管内施用、输注施用、局部施用、口服施用、吸入施用、十二指肠内施用、直肠施用或其组合。在一些实施方案中，施用可以是口服施用。在一些实施方案中，施用可包括全身施用。
本文还描述了编辑DUX4 RNA的方法。在一些实施方案中，所述方法可包括使DUX4RNA与上述组合物中的任一种和RNA编辑实体接触，从而编辑DUX4 RNA。在一些实施方案中，编辑可包括在DUX4 RNA的polyA尾的任何A位置处进行编辑。在一些实施方案中，DUX4 RNA可包含DUX4的前mRNA转录本。在一些实施方案中，至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。在一些实施方案中，DUX4RNA的编辑可促进蛋白质敲低。在一些实施方案中，蛋白质敲低可包括DUX4的敲低。
本文还描述了用作药物的上述组合物和上述药物组合物。在一些实施方案中，上述组合物或上述药物组合物可用于治疗面肩肱型肌营养不良症(FSHD)。在一些实施方案中，FSHD可包括I型FSHD。在一些实施方案中，FSHD可包括II型FSHD。
通过引用并入
本说明书中提及的所有出版物、专利和专利申请通过引用并入本文，就如每个单独的出版物、专利或专利申请被具体地和单独地指出通过引用并入的程度一样。
附图说明
本公开的新颖特征在所附权利要求中具体阐述。通过参考阐述利用本公开示例性原理的说明性实施方案的以下详细描述和附图将获得对本公开的特征和优点的更好理解，在附图中：
图1示出了双同源盒4(DUX4)靶标的示意图，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。
图2示出了DMPK靶标的示意图，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。
图3示出了PMP22靶标的示意图，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。
图4示出了SOD1靶标的示意图，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。
图5示出了在本公开的潜在指导RNA与靶RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架中存在的各种示例性结构特征的图例。所示的示例性结构特征包括8/7不对称环(靶RNA侧8个核苷酸和指导RNA侧7个核苷酸)、2/2对称凸起(靶RNA侧2个核苷酸和指导RNA侧2个核苷酸)、1/1错配(靶RNA侧1个核苷酸和指导RNA侧1个核苷酸)、5/5对称内部环(靶RNA侧5个核苷酸和指导RNA侧5个核苷酸)、24bp区域(靶RNA侧24个核苷酸与指导RNA侧24个核苷酸碱基配对)和2/3不对称凸起(靶RNA侧2个核苷酸和指导RNA侧3个核苷酸)。此图分别按出现顺序公开了SEQ ID NO:1602和1603。
图6是在x轴上示出本公开的DUX4靶向工程化指导RNA序列与规范指导RNA设计的序列相似性，以及在y轴上示出ADAR2酶的编辑分数的图。这些数据突出了本公开的DUX4靶向工程化指导RNA序列所代表的多样化序列空间，其具有驱动序列多样性的一系列不同的结构特征并且表现出高中靶编辑效率。
图7示出了设计以确定与突变的DUX4-FL polyA位点腺苷融合的报告基因的表达变化的荧光素酶和GFP报告基因构建体的示意图。
图8A示出了用荧光素酶报告基因转染之后LHCN细胞的活力和转染效率。
图8B示出了荧光素酶报告基因转染的LHCN细胞的mCherry中值荧光强度(MFI)。
图8C示出了归一化为携带突变型或野生型DUX4-FL polyA位点腺苷的荧光素酶构建体的mCherry MFI的荧光素酶信号。
图9A示出了用GFP报告基因转染之后LHCN细胞的活力和转染效率。
图9B示出了GFP报告基因转染的LHCN细胞的mCherry中值荧光强度(MFI)。
图9C示出了归一化为携带突变型或野生型DUX4-FL polyA位点腺苷的GFP构建体的mCherry MFI的GFP MFI信号。
图10示出了用不同指导RNA在HEK细胞中对整合的DUX4-荧光素酶报告基因的编辑。
图11示出了用不同指导RNA在ADAR 1/2(1和2)敲除HEK细胞中对整合的DUX4-荧光素酶报告基因的编辑。
具体实施方式
RNA编辑
RNA编辑可指RNA可在特定核苷处进行合成后酶促修饰的过程。RNA编辑可包括核苷酸的插入、缺失或取代中的任一种。RNA编辑的实例包括化学修饰，诸如假尿苷化(尿苷残基的异构化)和脱氨基(从胞苷中去除胺基以得到尿苷，或C到U编辑或从腺苷到肌苷，或A到I编辑)。RNA编辑可用于引入突变、纠正错义突变或编辑RNA的编码区域或非编码区域以抑制RNA翻译并实现蛋白质敲低。
本文描述了促进RNA编辑实体(例如，作用于RNA的腺苷脱氨酶(ADAR))或其生物活性片段进行RNA编辑的工程化指导RNA。在一些情况下，ADAR可以是催化RNA中腺苷化学转化为肌苷的酶。因为肌苷的性质类似于鸟苷的性质(例如，肌苷将与胞嘧啶形成两个氢键)，所以肌苷可被翻译细胞机器识别为鸟苷。因此，“腺苷到肌苷(A到I)RNA编辑”有效地改变了RNA靶标的一级序列。一般来说，ADAR酶具有共同的结构域构造，其包含数量可变的氨基端dsRNA结合结构域(dsRBD)和单个羧基端催化脱氨酶结构域。人ADAR具有两个或三个dsRBD。有证据表明，当与双链RNA结合时，ADAR可与其他ADAR形成同二聚体以及异二聚体，但目前尚无定论是否需要二聚化来进行编辑。本文公开的工程化指导RNA可促进已鉴定的三种人ADAR基因(ADAR 1-3)中的任一种或任何组合的RNA编辑。ADAR具有在ADAR的N端区域中包含至少两个dsRNA结合结构域(dsRBD；ADAR1具有三个dsRBD；ADAR2和ADAR3各具有两个dsRBD)拷贝的典型模块化结构域组织，随后是C端脱氨酶结构域。本公开的工程化指导RNA促进内源ADAR酶进行RNA编辑。在一些实施方案中，外源ADAR可与本文公开的工程化指导RNA一起递送。
在一些实施方案中，本公开提供了促进靶RNA(例如，mRNA或前mRNA)中特定区域处的编辑的工程化指导RNA。例如，本文公开的工程化指导RNA可靶向RNA的编码序列。RNA的编码序列中的靶区域可以是翻译起始位点(TIS)。本文公开的工程化指导RNA可靶向RNA的非编码序列，例如，3'UTR中的聚腺苷酸化(polyA)信号序列。本文公开的工程化指导RNA可靶向剪接位点。在一些情况下，剪接位点可存在于前mRNA(在加工去除内含子之前)。
在一些实施方案中，本公开提供了促进多个腺苷处的编辑的工程化指导RNA。RNA中多个腺苷的水解脱氨可称为超编辑。在一些情况下，超编辑可以顺式(例如，在Alu元件中)或反式(例如，在工程化指导RNA的靶RNA中)发生。在一些情况下，超编辑可包括在DUX4-FL靶RNA的polyA信号序列中的编辑。在一些情况下，超编辑可在主题靶RNA的至少2个或更多个核苷酸中引入编辑。在一些情况下，超编辑可在靶RNA区域中引入至少或至多约2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98个或至少或至多约100个编辑。在一个实施方案中，超编辑可发生在非翻译区、翻译区、3'UTR、5'UTR或其任何组合中。
TIS。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向翻译起始位点(TIS)处的腺苷。工程化指导RNA促进ADAR介导的TIS(AUG)到GUG的RNA编辑。这会导致RNA翻译的抑制，从而导致蛋白质敲低。
剪接位点。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向剪接位点处的腺苷。工程化指导RNA促进ADAR介导的剪接位点处的A的RNA编辑。这可导致前mRNA分子编码的蛋白质的误译和/或截短，从而导致蛋白质敲低。
PolyA信号序列。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向polyA信号序列中的一个或多个腺苷。在一些实施方案中，工程化指导RNA促进ADAR介导的polyA信号序列中的一个或多个腺苷的RNA编辑，从而导致RNA加工的破坏和靶mRNA的降解，从而导致蛋白质敲低。在一些实施方案中，靶标可具有一个或多个polyA信号序列。在这些情况下，本公开的一个或多个工程化指导RNA(其各自的序列不同)可多路复用以靶向一个或多个polyA信号序列中的腺苷。在这两种情况下，本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的polyA信号序列中的腺苷至肌苷的RNA编辑(通过细胞机器读取为鸟苷)，从而导致蛋白质敲低。
工程化指导RNA
本文公开了工程化指导RNA和编码其的工程化多核苷酸，用于经由RNA编辑实体或其生物活性片段对靶RNA进行位点特异性、选择性编辑。本公开的工程化指导RNA可包含潜在结构，使得当工程化指导RNA与靶RNA杂交以形成指导-靶RNA支架时，潜在结构的至少一部分表现为如本文所述的结构特征的至少一部分。
如本文所述的工程化指导RNA包含与本文所述的靶RNA具有互补性的靶向结构域。因此，指导RNA可被工程化以位点特异性/选择性地靶向特定靶RNA并与特定靶RNA杂交，从而促进经由RNA编辑实体或其生物活性片段编辑靶RNA中的特定核苷酸。靶向结构域可包括定位的核苷酸，使得当指导RNA与靶RNA杂交时，所述核苷酸与将被RNA编辑实体或其生物活性片段编辑的碱基相对并且不碱基配对，或者不完全碱基配对，所述碱基将要进行编辑。这种错配可有助于将RNA编辑实体的编辑定位到靶RNA的所需碱基。然而，在一些情况下，除了所需的编辑之外，还可存在一些(并且在一些情况下是重要的)脱靶编辑。
靶RNA和指导RNA的靶向结构域的杂交在指导-靶RNA支架中产生在杂交后表现的特定二级结构，其在本文中被称为“潜在结构”。潜在结构在表现时变成本文所述的结构特征，包括错配、凸起、内部环和发夹。不受理论的束缚，本文所述的在指导RNA与靶RNA杂交后产生的结构特征的存在配置指导RNA以促进经由RNA编辑实体或其生物活性片段的靶RNA的特异性或选择性靶向编辑。此外，与单独包含错配的构建体或与靶RNA具有完美互补性的构建体相比，与上述错配组合的结构特征通常促进靶腺苷的编辑量增加、脱靶编辑减少或两者。因此，合理设计本公开的工程化指导RNA中的潜在结构以在指导-靶RNA支架中产生特定结构特征可以是促进具有高特异性、选择性和稳健活性的靶RNA的编辑的有力工具。图5示出了具有示例性结构特征的靶RNA支架。
本文提供了工程化指导物和编码其的多核苷酸；以及包含所述工程化指导RNA或所述多核苷酸的组合物。如本文所用，关于指导RNA或编码其的多核苷酸的术语“工程化的”是指非天然存在的指导RNA或编码其的多核苷酸。例如，本公开提供了编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸。在一些实施方案中，工程化指导物包含RNA。在一些实施方案中，工程化指导物包含DNA。在一些实例中，工程化指导物包含修饰的RNA碱基或未修饰的RNA碱基。在一些实施方案中，工程化指导物包含修饰的DNA碱基或未修饰的DNA碱基。在一些实例中，工程化指导物包含DNA碱基和RNA碱基两者。
在一些实例中，本文提供的工程化指导物包含可被配置(与靶RNA分子杂交后)以至少部分地与靶RNA分子的至少一部分形成指导-靶RNA支架的工程化指导物，其中指导-靶RNA支架包含至少一个结构特征，并且其中指导-靶RNA支架募集RNA编辑实体并促进RNA编辑实体对靶RNA分子中核苷酸的碱基的化学修饰。
在一些实例中，本公开的工程化指导RNA的靶RNA可以是前mRNA或mRNA。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA与靶RNA的序列杂交。在一些实施方案中，工程化指导RNA的部分(例如，靶向结构域)与靶RNA的序列杂交。与靶RNA杂交的工程化指导RNA的部分与靶RNA的序列具有足够的互补性以发生杂交。
A.靶向结构域
本文公开的工程化指导RNA可以任何适合于RNA编辑的方式进行工程化。在一些实例中，工程化指导RNA通常至少包含允许其与靶RNA分子的区域杂交的靶向序列。靶向序列也可称为“靶向结构域”或“靶向区域”。
在一些情况下，工程化指导物的靶向结构域允许工程化指导物通过碱基配对(诸如Watson Crick碱基配对)来靶向RNA序列。在一些实例中，靶向序列可位于工程化指导物的N端或C端。在一些情况下，靶向序列可位于两端。靶向序列可以是任何长度。在一些情况下，靶向序列的长度可以是至少约：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150个或多至约200个核苷酸。在一些情况下，靶向序列的长度可以是不超过约：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150个或200个核苷酸。在一些实例中，工程化指导物包含长度可为约60至约500、约60至约200、约75至约100、约80至约200、约90至约120或约95至约115个核苷酸的靶向序列。在一些实例中，工程化指导RNA包含长度可为约100个核苷酸的靶向序列。
在一些情况下，靶向结构域与靶RNA具有95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列互补性。在一些情况下，靶向序列与靶RNA序列具有小于100％的互补性。例如，靶向序列和可被所述靶向序列结合的靶RNA的区域可具有单个碱基错配。
B.具有募集结构域的工程化指导RNA
在一些实例中，主题工程化指导RNA包含募集RNA编辑实体(例如，ADAR)的募集结构域，其中在一些情况下，募集结构域在不存在与靶RNA结合的情况下形成和存在。“募集结构域”在本文中可称为“募集序列”或“募集区域”。在一些实例中，主题工程化指导物可被配置以促进主题靶RNA区域的多核苷酸的核苷酸碱基的编辑、调节由主题靶RNA编码的多肽的表达或两者。在一些情况下，工程化指导物可被配置以促进主题RNA编辑实体对RNA区域的核苷酸或多核苷酸的碱基进行编辑。为促进编辑，本公开的工程化指导RNA可募集RNA编辑实体。可利用各种RNA编辑实体募集结构域。在一些实例中，募集结构域包含：谷氨酸离子型受体AMPA型亚基2(GluR2)、APOBEC或Alu。
在一些实例中，多于一个募集结构域可被包含在本公开的工程化指导物中。在可存在募集结构域的实例中，募集结构域可用于定位RNA编辑实体，以在靶向序列(例如反义序列)与靶RNA杂交之后与主题靶RNA有效地反应。在一些情况下，募集结构域可允许RNA编辑实体与工程化指导物的短暂结合。在一些实例中，募集结构域允许RNA编辑实体与工程化指导物的永久结合。募集结构域可以是任何长度。在一些情况下，募集结构域的长度可以是约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、多至约80个核苷酸。在一些情况下，募集结构域的长度可以是不超过约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75或80个核苷酸。在一些情况下，募集结构域的长度可以是约45个核苷酸。在一些情况下，募集结构域的至少一部分包含至少1至约75个核苷酸。在一些情况下，募集结构域的至少一部分包含约45个核苷酸至约60个核苷酸。
在一个实施方案中，募集结构域包含GluR2序列或其功能片段。在一些情况下，GluR2序列可被RNA编辑实体(诸如ADAR或其生物活性片段)识别。在一些实施方案中，GluR2序列可以是非天然存在的序列。在一些情况下，GluR2序列可被修饰，例如用于增强募集。在一些实施方案中，GluR2序列可包含天然存在的GluR2序列和合成序列的一部分。
在一些实例中，募集结构域包含GluR2序列，或与GUGGAAUAGUAUAACAAAUUGCUAAAAUGUUGUUAUAGUUA UCCCAC(SEQ ID NO:1)具有至少约70％、80％、85％、90％、95％、98％、99％或100％同一性和/或长度的序列。在一些情况下，募集结构域可与SEQ ID NO:1的至少约10、15、20、25或30个核苷酸具有至少约80％的序列同源性。在一些实例中，募集结构域可与SEQ ID NO:1具有至少约90％、95％、96％、97％、98％或99％的序列同源性和/或长度。
另外，还考虑了RNA编辑实体募集结构域。在一个实施方案中，募集结构域包含载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样(APOBEC)结构域。在一些情况下，APOBEC结构域可包含非天然存在的序列或天然存在的序列。在一些实施方案中，APOBEC结构域编码序列可包含修饰的部分。在一些情况下，APOBEC结构域编码序列可包含天然存在的APOBEC结构域编码序列的一部分。在另一个实施方案中，募集结构域可来自Alu结构域。
在本公开的工程化指导物中可发现任何数量的募集结构域。在一些实例中，至少约1、2、3、4、5、6、7、8、9或多至约10个募集结构域可包含在工程化指导物中。募集结构域可位于主题指导物的任何位置。在一些情况下，募集结构域可位于多核苷酸的N端、中间或C端。募集结构域可位于靶向序列的上游或下游。在一些情况下，募集结构域在主题指导物的靶向序列的侧翼。募集序列可包含所有核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸，尽管在一些情况下不能排除包含核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸的募集结构域。
C.具有潜在结构的工程化指导RNA
在一些实例中，本文公开的用于促进RNA编辑实体编辑靶RNA的工程化指导物可以是工程化潜在指导RNA。“工程化潜在指导RNA”是指包含潜在结构的工程化指导RNA。“潜在结构”是指指导RNA与靶RNA杂交后基本上形成的结构特征。例如，指导RNA的序列提供一种或多种结构特征，但这些结构特征仅在与靶RNA杂交后基本上形成，因此一种或多种潜在结构特征在与靶RNA杂交后表现为结构特征。在指导RNA与靶RNA杂交后形成结构特征，并且指导RNA中提供的潜在结构因此被揭示。
双链RNA(dsRNA)底物在本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成。所得dsRNA底物在本文中也称为“指导-靶RNA支架”。
图5示出了在本公开的潜在指导RNA与靶RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架中存在的各种示例性结构特征的图例。所示的示例性结构特征包括8/7不对称环(靶RNA侧8个核苷酸和指导RNA侧7个核苷酸)、2/2对称凸起(靶RNA侧2个核苷酸和指导RNA侧2个核苷酸)、1/1错配(靶RNA侧1个核苷酸和指导RNA侧1个核苷酸)、5/5对称内部环(靶RNA侧5个核苷酸和指导RNA侧5个核苷酸)、24bp区域(靶RNA侧24个核苷酸与指导RNA侧24个核苷酸碱基配对)和2/3不对称凸起(靶RNA侧2个核苷酸和指导RNA侧3个核苷酸)。除非另有说明，否则给定结构特征中参与核苷酸的数量表示为靶RNA侧的核苷酸比指导RNA侧的核苷酸。此图例中还示出了每个图形位置注释的关键。例如，将待编辑的靶核苷酸指定为0位置。在待编辑的靶核苷酸的下游(3')，每个核苷酸以+1的增量进行计数。在待编辑的靶核苷酸的上游(5')，每个核苷酸以-1的增量进行计数。因此，此图例中的实例2/2对称凸起在指导-靶RNA支架中的+12至+13位置。类似地，此图例中的2/3不对称凸起在指导-靶RNA支架中的-36至-37位置。如本文所用，相对于待编辑的且位于指导-靶RNA支架的靶RNA侧的靶核苷酸提供位置注释。如本文所用，如果注释单个位置，则结构特征从所述位置延伸远离位置0(待编辑的靶核苷酸)。例如，如果潜在指导RNA在本文中注释为在位置-36处形成2/3不对称凸起，则在指导-靶RNA支架的靶RNA侧相对于待编辑的靶核苷酸(位置0)从-36位置到-37位置形成2/3不对称凸起。作为另一个实例，如果潜在指导RNA在本文中注释为在位置+12处形成2/2对称凸起，则在指导-靶RNA支架的靶RNA侧相对于待编辑的靶核苷酸(位置0)从+12到+13位置形成2/2对称凸起。
在一些实例中，本文公开的工程化指导物缺乏募集区域，并且RNA编辑实体的募集可通过工程化指导RNA与靶RNA杂交形成的指导-靶RNA支架的结构特征来实现。在一些实例中，当存在于水性溶液中并且不与靶RNA分子结合时，工程化指导物不包含募集RNA编辑实体(例如，ADAR)的结构特征。工程化指导RNA在与靶RNA杂交后，与靶RNA分子形成募集RNA编辑实体(例如，ADAR)的一种或多种结构特征。
在募集序列可不存在的情况下，工程化指导RNA仍能够与主题RNA编辑实体(例如，ADAR)缔合以促进靶RNA的编辑和/或调节主题靶RNA编码的多肽的表达。这可通过在工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架中形成的结构特征来实现。结构特征可包括以下任一种：错配、对称凸起、不对称凸起、对称内部环、不对称内部环、发夹、摆动碱基对或其任何组合。
本文描述了可存在于本公开的指导-靶RNA支架中的结构特征。特征的实例包括错配、凸起(对称凸起或不对称凸起)、内部环(对称内部环或不对称内部环)或发夹(募集发夹或非募集发夹)。本公开的工程化指导RNA可具有1至50个特征。本公开的工程化指导RNA可具有1至5、5至10、10至15、15至20、20至25、25至30、30至35、35至40、40至45、45至50、5至20、1至3、4至5、2至10、20至40、10至40、20至50、30至50、4至7，或8至10个特征。在一些实施方案中，在工程化潜在指导RNA与靶RNA杂交后，可由工程化潜在指导RNA中的潜在结构形成结构特征(例如，错配、凸起、内部环)，并因此形成指导-靶RNA支架。在一些实施方案中，结构特征不是由潜在结构形成的，而是预先形成的结构(例如，GluR2募集发夹或来自U7 snRNA的发夹)。
指导-靶RNA支架在本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成。如本文所公开的，错配是指指导RNA中的单核苷酸与指导-靶RNA支架内的靶RNA中的相对单核苷酸不配对。错配可包含不碱基配对的任何两个单核苷酸。在指导RNA侧和靶RNA侧的参与核苷酸数量超过1的情况下，所得结构不再被认为是错配，而是被认为是凸起或内部环，取决于结构特征的大小。在一些实施方案中，指导RNA中的错配是与DUX4靶RNA中的G、C或U的错配。例如，DUX4靶RNA中的G可与指导RNA中的G、A或U错配。在另一个实例中，DUX4靶RNA中的C可与指导RNA中的C、A或U错配。在另一个实例中，DUX4靶RNA中的U可与指导RNA中的U、G或C错配。在一些实施方案中，指导RNA中的错配是与DUX4靶RNA中的A错配。例如，DUX4靶RNA中的A可与指导RNA中的A、G或C错配。在一些实施方案中，错配是A/C错配。A/C错配可包括本公开的工程化指导RNA中的C与靶RNA中的A相对。A/C错配可包括本公开的工程化指导RNA中的A与靶RNA中的C相对。G/C错配可包括本公开的工程化指导RNA中的G与靶RNA中的G相对。在一些实施方案中，本公开的指导RNA可不具有A/C错配，并且靶RNA的每个A与工程化指导RNA中的U碱基配对。
在一些实施方案中，位于编辑位点5'的错配可促进待编辑的靶A的碱基翻转。错配也可有助于赋予序列特异性。因此，错配可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
在另一方面，结构特征包括摆动碱基。摆动碱基对是指弱碱基配对的两个碱基。例如，本公开的摆动碱基对可指与U配对的G。因此，摆动碱基对可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
在一些情况下，结构特征可以是发夹。如本文所公开的，发夹包含RNA双链体，其中单RNA链的一部分自身折叠以形成RNA双链体。单RNA链的部分由于具有彼此碱基配对的核苷酸序列而自身折叠，其中核苷酸序列被不与自身碱基配对的间插序列分开，从而形成碱基配对的部分和非碱基配对的间插环部分。发夹的整个双链体结构的长度可以是10至500个核苷酸。发夹的环部分可以是3至15个核苷酸长。发夹可存在于本文公开的任何工程化指导RNA中。本文公开的工程化指导RNA可具有1至10个发夹。在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA具有1个发夹。在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA具有2个发夹。如本文所公开的，发夹可包括募集发夹或非募集发夹。发夹可位于本公开的工程化指导RNA内的任何位置。在一些实施方案中，一个或多个发夹邻近或存在于本公开的工程化指导RNA的3'端、邻近或存在于本公开的工程化指导RNA的5'端、邻近本公开的工程化指导RNA的靶向结构域或存在于其内，或其任何组合。
在一些方面，结构特征包括非募集发夹。如本文所公开的，非募集发夹不具有募集RNA编辑实体的主要功能。在一些情况下，非募集发夹不募集RNA编辑实体。在一些情况下，非募集发夹具有在生理条件下不足以结合的与RNA编辑实体结合的解离常数。例如，非募集发夹具有在25℃下结合大于约1mM、10mM、100mM或1M的RNA编辑实体的解离常数，如在体外测定中确定的。非募集发夹可表现出改善将工程化指导RNA定位至靶RNA的功能。在一些实施方案中，非募集发夹改善核保留。在一些实施方案中，非募集发夹包括来自U7 snRNA的发夹。因此，非募集发夹(诸如来自U7 snRNA的发夹)是可存在于包括工程化指导RNA构建体的构建体中的预形成的结构特征，而不是由工程化潜在指导RNA中提供的潜在结构形成的结构特征。
本公开的发夹可具有任何长度。在一个方面，发夹可以是约10-500个或更多个核苷酸。在一些情况下，发夹可包含约10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、500个或更多个核苷酸。在其他情况下，发夹还可包含10至20、10至30、10至40、10至50、10至60、10至70、10至80、10至90、10至100、10至110、10至120、10至130、10至140、10至150、10至160、10至170、10至180、10至190、10至200、10至210、10至220、10至230、10至240、10至250、10至260、10至270、10至280、10至290、10至300、10至310、10至320、10至330、10至340、10至350、10至360、10至370、10至380、10至390、10至400、10至410、10至420、10至430、10至440、10至450、10至460、10至470、10至480、10至490或10至500个核苷酸。
指导-靶RNA支架在本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成。如本文所公开的，凸起是指仅在指导-靶RNA支架形成后基本上形成的结构，其中工程化指导RNA或靶RNA中的连续核苷酸不与其在相反链上的位置对应物互补。指导RNA的凸起中的核苷酸可以任何顺序包含任何核苷酸，只要它们不与其在靶RNA上的位置对应物互补。凸起可改变指导-靶RNA支架的二级或三级结构。凸起可独立地具有指导-靶RNA支架的指导RNA侧的0至4个连续核苷酸，以及指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1至4个连续核苷酸，或者凸起可独立地具有指导-靶RNA支架的靶RNA侧的0至4个核苷酸，以及指导-靶RNA支架的指导RNA侧的1至4个连续核苷酸。然而，如本文所用，凸起并不是指工程化指导RNA的单个参与核苷酸和靶RNA的单个参与核苷酸不碱基配对的结构，不碱基配对的工程化指导RNA的单个参与核苷酸和靶RNA的单个参与核苷酸在本文中被称为错配。此外，在指导RNA侧或靶RNA侧的参与核苷酸数量超过4的情况下，所得结构不再被认为是凸起，而是被认为是内部环。在一些实施方案中，本公开的引指导-靶RNA支架具有2个凸起。在一些实施方案中，本公开的引指导-靶RNA支架具有3个凸起。在一些实施方案中，本公开的引指导-靶RNA支架具有4个凸起。因此，凸起可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
在一些实施方案中，指导-靶RNA支架中存在凸起可定位或可帮助定位ADAR以选择性编辑靶RNA中的靶A并减少对靶RNA中的非靶A的脱靶编辑。在一些实施方案中，指导-靶RNA支架中存在凸起可募集或帮助募集额外量的ADAR。本文公开的指导-靶RNA支架中的凸起可募集其他蛋白质，诸如其他RNA编辑实体。在一些实施方案中，位于编辑位点5'的凸起可促进待编辑的靶A的碱基翻转。相对于靶RNA中存在的其他A，凸起还可帮助赋予待编辑的靶RNA的A序列特异性。例如，凸起可通过将ADAR限制在产生靶A的选择性编辑的方向来帮助引导ADAR编辑。
指导-靶RNA支架在本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成。凸起可以是对称凸起或不对称凸起。当凸起的每一侧存在相同数量的核苷酸时，形成对称凸起。例如，本公开的指导-靶RNA支架中的对称凸起可在指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧和靶RNA侧具有相同数量的核苷酸。本公开的对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的2个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的2个核苷酸形成。本公开的对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的3个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的4个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的4个核苷酸形成。因此，对称凸起可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
指导-靶RNA支架在本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成。凸起可以是对称凸起或不对称凸起。当凸起的每一侧存在不同数量的核苷酸时，形成不对称凸起。例如，本公开的指导-靶RNA支架中的不对称凸起可在指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧和靶RNA侧具有不同数量的核苷酸。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的2个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的2个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的0个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的2个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的2个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的2个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的2个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的3个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的2个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的2个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的3个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的4个核苷酸形成。本公开的不对称凸起可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的3个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的4个核苷酸形成。因此，不对称凸起可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
在一些情况下，结构特征可以是内部环。如本文所公开的，内部环是指仅在指导-靶RNA支架形成后基本上形成的结构，其中工程化指导RNA或靶RNA中的核苷酸不与其相对链上的位置对应物互补，并且其中内部环的一侧(指导-靶RNA支架的靶RNA侧或工程化指导RNA侧)具有5个核苷酸或更多。指导RNA的内部环中的核苷酸可以任何顺序包含任何核苷酸，只要它们不与其在靶RNA上的位置对应物互补。在指导RNA侧和靶RNA侧的参与核苷酸数量低于5的情况下，所得结构不再被认为是内部环，而是被认为是凸起或错配，取决于结构特征的大小。内部环可以是对称内部环或不对称内部环。存在于编辑位点附近的内部环可帮助待编辑的靶RNA中靶A的碱基翻转。
内部环的一侧(无论是在指导-靶RNA支架的靶RNA侧还是工程化指导RNA侧)可由5至150个核苷酸形成。内部环的一侧可由5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、120、135、140、145、150、200、250、300、350、400、450、500、600、700、800、900或1000个核苷酸，或其间的任何数量的核苷酸形成。内部环的一侧可由5个核苷酸形成。内部环的一侧可由10个核苷酸形成。内部环的一侧可由15个核苷酸形成。内部环的一侧可由20个核苷酸形成。内部环的一侧可由25个核苷酸形成。内部环的一侧可由30个核苷酸形成。内部环的一侧可由35个核苷酸形成。内部环的一侧可由40个核苷酸形成。内部环的一侧可由45个核苷酸形成。内部环的一侧可由50个核苷酸形成。内部环的一侧可由55个核苷酸形成。内部环的一侧可由60个核苷酸形成。内部环的一侧可由65个核苷酸形成。内部环的一侧可由70个核苷酸形成。内部环的一侧可由75个核苷酸形成。内部环的一侧可由80个核苷酸形成。内部环的一侧可由85个核苷酸形成。内部环的一侧可由90个核苷酸形成。内部环的一侧可由95个核苷酸形成。内部环的一侧可由100个核苷酸形成。内部环的一侧可由110个核苷酸形成。内部环的一侧可由120个核苷酸形成。内部环的一侧可由130个核苷酸形成。内部环的一侧可由140个核苷酸形成。内部环的一侧可由150个核苷酸形成。内部环的一侧可由200个核苷酸形成。内部环的一侧可由250个核苷酸形成。内部环的一侧可由300个核苷酸形成。内部环的一侧可由350个核苷酸形成。内部环的一侧可由400个核苷酸形成。内部环的一侧可由450个核苷酸形成。内部环的一侧可由500个核苷酸形成。内部环的一侧可由600个核苷酸形成。内部环的一侧可由700个核苷酸形成。内部环的一侧可由800个核苷酸形成。内部环的一侧可由900个核苷酸形成。内部环的一侧可由1000个核苷酸形成。因此，内部环可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
内部环可以是对称内部环或不对称内部环。当内部环的每一侧存在相同数量的核苷酸时，形成对称内部环。例如，本公开的指导-靶RNA支架中的对称内部环可在指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧和靶RNA侧具有相同数量的核苷酸。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的7个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的8个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的9个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的10个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的11个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的11个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的12个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的12个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的13个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的13个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的14个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的14个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的15个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的15个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的20个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的20个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的30个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的30个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的40个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的40个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的60个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的60个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的70个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的70个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的80个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的80个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的90个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的90个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的110个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的110个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的120个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的120个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的130个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的130个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的140个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的140个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的250个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的250个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的350个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的350个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的450个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的450个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的600个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的600个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的700个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的700个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的800个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的800个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的900个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的900个核苷酸形成。本公开的对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸形成。因此，对称内部环可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
在一些实施方案中，对称内部环可位于靶A(0位置)上游(5')、靶A下游(3')或两者。在一些实施方案中，当提及结构特征的位置时，“-”或负整数表示靶A上游(5')或指定位置(例如，位置0ATTAAA)的核苷酸，而正整数表示靶A下游(3')或指定位置的核苷酸。在一些情况下，第一对称内部环可在靶A的下游，并且第二对称内部环可在靶A的上游。在一些情况下，对称内部环可从以下位置开始：相对于靶A的-1至-25、-2至-10、-4至-8、-5至-7、-2至-15、-4至-20、-8至-15或-10至-22。在一些情况下，对称内部环可位于以下位置：相对于靶A的-25、-24、-23、-22、-21、-20、-19、-18、-17、-16、-15、-14、-13、-12、-11、-10、-9、-8、-7、-6、-5、-4、-3、-2或-1。在一些情况下，对称内部环可从以下位置开始：相对于靶A的+1至+60、+10至+50、+10至+40、+20至+50、+20至+40、+25至+45、+31至+35、+10至+20、+15至+30、+25至+45或+45至+60。在一些情况下，对称内部环可位于以下位置：相对于靶A的1、+2、+3、+4、+5、+6、+7、+8、+9、+10、+11、+12、+13、+14、+15、+16、+17、+18、+19、+20、+21、+22、+23、+24、+25、+26、+27、+28、+29、+30、+31、+32、+33、+34、+35、+36、+37、+38、+39、+40、+41、+42、+43、+44、+45、+46、+47、+48、+49、+50、+51、+52、+53、+54、+55、+56、+57、+58、+59或+60。在一些情况下，第一对称内部环与指导RNA的5'端的距离在约以下内：80bp、70bp、60bp、50bp、40bp、30bp、25bp、20bp、15bp、10bp或5bp，并且第二对称内部环与指导RNA的3'端的距离在约以下内：80bp、70bp、60bp、50bp、40bp、30bp、25bp、20bp、15bp、10bp或5bp。
当内部环的每一侧存在不同数量的核苷酸时，形成不对称内部环。例如，本公开的指导-靶RNA支架中的不对称内部环可在指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧和靶RNA侧具有不同数量的核苷酸。
本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5至150个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5至150个核苷酸形成，其中指导-靶RNA支架的工程化侧的核苷酸数量与指导-靶RNA支架的靶RNA侧的核苷酸数量不同。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5至1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5至1000个核苷酸形成，其中指导-靶RNA支架的工程化侧的核苷酸数量与指导-靶RNA支架的靶RNA侧的核苷酸数量不同。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的7个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的7个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的7个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的7个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的8个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的7个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的8个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的8个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的9个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的8个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的8个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的9个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的9个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的10个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的5个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的50个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的50个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的100个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的100个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的150个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的5个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的150个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的200个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的200个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的300个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的300个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的400个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的400个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的500个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1000个核苷酸形成。本公开的不对称内部环可由指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1000个核苷酸和指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的500个核苷酸形成。因此，不对称内部环可以是由工程化潜在指导RNA提供的潜在结构形成的结构特征。
如本文所公开的，“碱基配对(bp)区域”是指指导-靶RNA支架的区域，其中指导RNA中的碱基与靶RNA中的相对碱基配对。碱基配对区域可从指导-靶RNA支架的一端或邻近指导-靶RNA支架的一端延伸至指导-靶RNA支架的另一端或邻近指导-靶RNA支架的另一端。碱基配对区域可在两个结构特征之间延伸。碱基配对区域可从指导-靶RNA支架的一端或邻近指导-靶RNA支架的一端延伸至结构特征或邻近结构特征。碱基配对区域可从结构特征延伸至指导-靶RNA支架的另一端。在一些实施方案中，碱基配对区域具有1bp至100bp、1bp至90bp、1bp至80bp、1bp至70bp、1bp至60bp、1bp至50bp、1bp至45bp、1bp至40bp、1bp至35bp、1bp至30bp、1bp至25bp、1bp至20bp、1bp至15bp、1bp至10bp、1bp至5bp、5bp至10bp、5bp至20bp、10bp至20bp、10bp至50bp、5bp至50bp、至少1bp、至少2bp、至少3bp、至少4bp、至少5bp、至少6bp、至少7bp、至少8bp、至少9bp、至少10bp、至少12bp、至少14bp、至少16bp、至少18bp、至少20bp、至少25bp、至少30bp、至少35bp、至少40bp、至少45bp、至少50bp、至少60bp、至少70bp、至少80bp、至少90bp、至少100bp。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQID NO:8的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:8的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQID NO:10的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:10的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQID NO:14的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:14的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:15的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:15的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(5')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQID NO:17的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:17的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQID NO:24的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:24的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(5')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQID NO:72的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:72的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A下游(5')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')12个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:195的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')12个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:195的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')12个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:252的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:252的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')28个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:291的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')28个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:291的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')28个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')41个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:352的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')41个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:352的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')41个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:356的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:356的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:358的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:358的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:365的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:365的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:375的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:375的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:392的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:392的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')11个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:394的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:394的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')27个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:408的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')27个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:408的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')27个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:482的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:482的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:486的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:486的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')43个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:487的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')43个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:487的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')43个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:494的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:494的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')10个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:502的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:502的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:505的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:505的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:512的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:512的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:566的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:566的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:593的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:593的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:594的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:594的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:606的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:606的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')9个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:625的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:625的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:635的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:635的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:642的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:642的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:679的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:679的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:680的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:680的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')35个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:694的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')35个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:694的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')35个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:727的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:727的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:737的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:737的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')8个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:747的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:747的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:748的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:748的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:757的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:757的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')25个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:769的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')25个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:769的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')25个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:806的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:806的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:810的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:810的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:815的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:815的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:851的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:851的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:871的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:871的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:873的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:873的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:874的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:874的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:880的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:880的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')21个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:884的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:884的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:892的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:892的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')27个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:906的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')27个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:906的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')27个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:930的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:930的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:934的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:934的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:935的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:935的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:937的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:937的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')35个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:944的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')35个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:944的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')35个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:967的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:967的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')40个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:976的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:976的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:977的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:977的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:985的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:985的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1002的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1002的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1008的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1008的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1051的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1051的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1054的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1054的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1058的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1058的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1059的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1059的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')34个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1066的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1066的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')43个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1098的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')43个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1098的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')43个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1103的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1103的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1104的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1104的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')44个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1116的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1116的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')22个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1117的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1117的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')23个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1163的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1163的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1168的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1168的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1183的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1183的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1185的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1185的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')38个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1193的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')38个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1193的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')38个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1211的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1211的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1212的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1212的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')4个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1236的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1236的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')24个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1293的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1293的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1294的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1294的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1296的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1296的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')36个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1374的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1374的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')37个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1391的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')37个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1391的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')37个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1411的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1411的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')2个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')5个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')42个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')1个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1463的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')1个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1463的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')1个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')4个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')32个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')7个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')6个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')20个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')34个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')48个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')62个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')76个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1538的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')6个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')20个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')34个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')48个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')62个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')76个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1538的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')7个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')6个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')20个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')34个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')48个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')62个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')76个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')7个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')22个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')37个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')52个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1539的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')7个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')22个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')37个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')52个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1539的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')7个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')22个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')37个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')52个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')5个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')10个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')26个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')42个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')58个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')74个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1545的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')10个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')26个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')42个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')58个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')74个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1545的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')5个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')10个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')26个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')42个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')58个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')74个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')3个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')14个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')32个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')50个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')68个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1552的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')14个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')32个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')50个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')68个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1552的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')3个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')14个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')32个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')50个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')68个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')61个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')69个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')77个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1566的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')61个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')69个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')77个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1566的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')61个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')69个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')77个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')54个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')63个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')72个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1567的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')54个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')63个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')72个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1567的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')54个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')63个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')72个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')65个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1568的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')65个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1568的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')65个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环、靶A下游(3')56个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1569的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环、靶A下游(3')56个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1569的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')45个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环、靶A下游(3')56个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')57个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')67个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')77个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1570的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')57个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')67个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')77个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1570的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')57个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')67个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')77个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')58个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')69个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1571的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')58个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')69个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1571的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')58个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')69个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')59个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')71个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1572的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')59个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')71个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1572的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起、靶A下游(3')59个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')71个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环、靶A下游(3')60个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1573的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环、靶A下游(3')60个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1573的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')47个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环、靶A下游(3')60个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')61个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1574的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')61个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1574的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起、靶A下游(3')61个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')62个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1575的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')62个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1575的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起、靶A下游(3')62个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')63个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1576的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')63个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1576的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')63个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')64个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1577的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')64个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1577的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')49个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')64个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')65个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1578的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')65个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1578的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')65个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')66个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1579的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')66个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1579的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')66个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1580的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1580的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')67个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')68个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1581的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')68个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1581的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')51个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')68个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')69个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1582的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')69个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1582的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')69个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')70个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1583的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')70个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1583的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')70个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')71个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1584的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')71个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1584的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')71个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')72个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1585的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')72个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1585的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')53个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')72个核苷酸处形成的5核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1586的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1586的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')73个核苷酸处形成的2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')74个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1587的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')74个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1587的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')74个核苷酸处形成的3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1588的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。在一些情况下，针对靶DUX4 RNA的本公开的工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1588的序列，并且所述工程化指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后形成的指导-靶RNA支架包含靶A上游(5')6个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')33个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')55个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起，以及靶A下游(3')75个核苷酸处形成的4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环和靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A下游(3')形成的1核苷酸错配和靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')形成的一个6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')形成的两个6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')形成的三个6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')形成的四个6核苷酸内部对称环。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的两个2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的三个2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的四个2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的五个2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的两个3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的三个3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的四个3核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的两个4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的三个4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的四个4核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的两个5核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')形成的6核苷酸内部对称环、靶A下游(3')形成的1核苷酸错配、靶A下游(3')形成的6核苷酸内部对称环，以及靶A下游(3')形成的三个5核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')的2核苷酸对称凸起和靶A下游(3')的四个2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')的2核苷酸对称凸起和靶A下游(3')的五个2核苷酸对称凸起。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA与靶RNA杂交后形成的结构特征包括靶A上游(5')的2核苷酸对称凸起和靶A下游(3')的六个2核苷酸对称凸起。
D.其他工程化指导RNA组分
本公开提供了具有其他结构特征和组分的工程化指导RNA。例如，本文所述的工程化指导RNA可以是环状的。在另一个实例中，本文所述的工程化指导RNA可包含U7、SmOPT序列或两者的组合。
在一些情况下，工程化指导RNA可以是环化的。在一些情况下，本文提供的工程化指导RNA可以是环化的或呈环状构型。在一些方面，至少部分环状的指导RNA缺乏5'羟基或3'羟基。在一些实施方案中，环状工程化指导RNA可包含SEQ ID NO:2-1589中的任一个的指导RNA。
在一些实例中，工程化指导RNA可包含主链，其包含共价连接在一起的多个糖和磷酸部分。在一些实例中，工程化指导RNA的主链可包含DNA中脱氧核糖或RNA中核糖的5'碳上的磷酸基团中的第一羟基与DNA中脱氧核糖或RNA中核糖的3'碳上的第二羟基之间的磷酸二酯键键联。
在一些实施方案中，工程化指导RNA的主链可缺少能够暴露于溶剂的5'还原性羟基、3'还原性羟基或两者。在一些实施方案中，工程化指导物的主链可缺少能够暴露于核酸酶的5'还原性羟基、3'还原性羟基或两者。在一些实施方案中，工程化指导物的主链可缺少能够暴露于水解酶的5'还原性羟基、3'还原性羟基或两者。在一些情况下，工程化指导物的主链可表示为其中一个核苷酸接着另一个的环状二维格式的多核苷酸序列。在一些情况下，工程化指导物的主链可表示为其中一个核苷酸接着另一个的环形二维格式的多核苷酸序列。在一些情况下，5'羟基、3'羟基或两者可通过磷-氧键接合。在一些情况下，5'羟基、3'羟基或两者可被修饰成具有含磷部分的磷酸酯。
如本文所述，工程化指导物可包含环状结构。工程化多核苷酸可由前体工程化多核苷酸环化。此种前体工程化多核苷酸可以是前体工程化线性多核苷酸。在一些情况下，前体工程化线性多核苷酸可以是环状工程化指导RNA的前体。例如，前体工程化线性多核苷酸可以是从质粒转录的线性mRNA，其可使用本文所述的技术配置以在细胞内环化。前体工程化线性多核苷酸可用在插入细胞中时允许环化的结构域(诸如核酶结构域和连结结构域)构建。核酶结构域可包括能够在特定位点(例如，邻近连结结构域)切割线性前体RNA的结构域。前体工程化线性多核苷酸从5'到3'可包含：5'核酶结构域、5'连结结构域、环化区域、3'连结结构域和3'核酶结构域。在一些情况下，环化区域可包含本文所述的指导RNA。在一些情况下，前体多核苷酸可在两个位点处分别被5'核酶和3'核酶特异性加工以释放5'连结结构域和3'连结结构域上的暴露末端。游离的暴露末端可以是连结胜任的，使得末端可连接以形成成熟的环化结构。例如，游离末端可包含5'-OH和2',3'-环状磷酸盐，它们经由细胞中的RNA结接而连结。具有连结结构域和核酶结构域的线性多核苷酸可转染到细胞中，在细胞中其可经由内源细胞酶环化。在一些情况下，多核苷酸可编码包含本文所述的核酶结构域和连结结构域的工程化指导RNA，其可在细胞内环化。环状指导RNA描述于PCT/US2021/034301中，其通过引用整体并入。
如本文所述的工程化多核苷酸(例如，环化指导RNA)可包含间隔结构域。如本文所述，间隔结构域可指在其他结构域之间提供空间的结构域。间隔结构域可用于待环化区域和侧翼连结序列之间，以增加成熟环化指导RNA的整体大小。当待环化的区域包含如本文所述的被配置以与靶序列缔合的靶向结构域时，相对于缺乏间隔结构域的可比工程化多核苷酸，间隔区的添加可针对靶多核苷酸为工程化多核苷酸提供改进(例如增加的特异性、增强的编辑效率等)。在一些情况下，间隔结构域被配置以不与靶RNA杂交。在一些实施方案中，前体工程化多核苷酸或环状工程化指导物可按5'到3'的顺序包含：第一核酶结构域；第一连结结构域；第一间隔结构域；可与靶RNA至少部分互补的靶向结构域、第二间隔结构域、第二连结结构域和第二核酶结构域。在一些情况下，第一间隔结构域、第二间隔结构域或两者被配置以不结合至靶RNA(当靶向结构域结合至靶RNA时)。
本公开的组合物和方法提供了编码指导RNA的工程化多核苷酸，所述工程化多核苷酸可操作地连接至小核核糖核酸(snRNA)序列的一部分。工程化多核苷酸可包含小核核糖核酸(snRNA)序列的至少一部分。U7和U1小核RNA的天然作用是在前mRNA的剪接体加工中发挥作用，几十年来，它们已经被重新工程化以改变所需疾病靶标的剪接。用疾病基因的短靶向(或反义)序列替换U7 snRNA(自然地与组蛋白前mRNA的间隔区元件杂交)的前18nt重定向剪接机制以改变所述靶位点周围的剪接。此外，将野生型U7 Sm结构域结合位点转化为优化的共有Sm结合序列(SmOPT)可增加人工反义工程化U7 snRNA的表达水平、活性和亚细胞定位。许多后续小组使这种修饰的U7 SmOPT snRNA底架与其他基因的反义序列相适应以募集剪接体元件并针对其他疾病靶标修饰RNA剪接。
snRNA是真核细胞核内发现的一类小RNA分子。它们参与多种重要过程，诸如RNA剪接(从前mRNA中去除内含子)、转录因子(7SK RNA)或RNA聚合酶II(B2 RNA)的调节以及维持端粒。它们总是与特定蛋白质相关，并且所得RNA-蛋白质复合物被称为小核核糖核蛋白(snRNP)或有时也被称为snurps。有很多种snRNA，其命名为U1、U2、U3、U4、U5、U6、U7、U8、U9和U10。
U7型snRNA通常参与组蛋白mRNA的成熟。此snRNA已在大量真核物种(迄今为止56个)中得到鉴定，并且这些物种中的每一个的U7 snRNA都应被视为同样便于本公开。
野生型U7 snRNA包含茎环结构、U7特异性Sm序列和与组蛋白前mRNA 3'端反义的序列。
除了SmOPT结构域之外，U7还包含与组蛋白前mRNA 3'端反义的序列。当此序列被与另一个靶前mRNA反义的靶向序列替换时，U7被重定向到新的靶前mRNA。因此，含有SmOPT结构域和靶向反义序列的修饰U7 snRNA的稳定表达导致mRNA剪接的特定改变。虽然表达适当修饰的鼠U7基因以及其天然启动子和3'元件的基于AAV-2/1的载体能够通过覆盖和跳过小鼠Dmd外显子23将基因高效转移到骨骼肌中并完成抗肌营养不良蛋白救援，但如本文所述的工程化多核苷酸(无论是直接施用还是经由例如AAV载体施用)可促进脱氨酶对靶RNA的编辑。
工程化多核苷酸可至少部分地包含snRNA序列。snRNA序列可以是U1、U2、U3、U4、U5、U6、U7、U8、U9或U10 snRNA序列。
在一些情况下，相对于缺乏此类特征的可比多核苷酸，包含snRNA序列(例如snRNA启动子、snRNA发夹等)的至少一部分的工程化多核苷酸可具有用于治疗或预防疾病或疾患的优异特性。例如，如本文所述，包含snRNA序列的至少一部分的工程化多核苷酸可以比缺乏此类特征的可比多核苷酸更高的效率促进外显子的外显子跳跃。此外，如本文所述，包含snRNA序列的至少一部分的工程化多核苷酸可以比缺乏此类特征的可比多核苷酸更高的效率促进靶RNA(例如前mRNA或成熟RNA)中核苷酸碱基的编辑。启动子和snRNA组分描述于PCT/US2021/028618中，其通过引用整体并入。
本文公开了工程化RNA，其包含(a)如本文所述的工程化指导RNA，和(b)U7 snRNA发夹序列、SmOPT序列或其组合。在一些实施方案中，U7发夹包括人U7发夹序列或小鼠U7发夹序列。在一些情况下，人U7发夹序列包含TAGGCTTTCTGGCTTTTTACCGGAAAGCCCCT(SEQ IDNO:1590)或RNA：UAGGCUUUCUGGCUUUUUACCGGAAAGCCCCU(SEQ ID NO:1591)。在一些情况下，小鼠U7发夹序列包含CAGGTTTTCTGACTTCGGTCGGAAAACCCCT(SEQ ID NO:1592)或RNA：CAGGUUUUCUGACUUCGGUCGGAAAACCCCU(SEQ ID NO:1593)。在一些实施方案中，SmOPT序列具有AATTTTTGGAG(SEQ ID NO:1594)或RNA：AAUUUUUGGAG(SEQ ID NO:1595)的序列。在一些实施方案中，SEQ ID NO:2-1589中任一个的指导RNA可包括包含U7发夹序列(例如，人或小鼠U7发夹序列)、SmOPT序列或其组合的指导RNA。在一些情况下，U7发夹序列和SmOPT序列的组合可包括SmOPT U7发夹序列，其中SmOPT序列与U7序列连接。在一些情况下，U7发夹序列、SmOPT序列或其组合在本文公开的工程化指导RNA的下游(例如，3')。
本文还公开了用于驱动本文公开的指导RNA表达的启动子。在一些情况下，用于驱动表达的启动子可在本文公开的指导RNA序列的5'。在一些情况下，启动子可包括U1启动子、U7启动子、U6启动子或其任何组合。在一些情况下，启动子可包括CMV启动子。在一些情况下，U7启动子或U6启动子可以是小鼠U7启动子或小鼠U6启动子。在一些情况下，U1启动子、U7启动子或U6启动子可以是人U1启动子、人U7启动子或人U6启动子。在一些情况下，人U6启动子可包含与以下具有至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的序列：GAGGGCCTATTTCCCATGATTCCT TCATATTTGCATATACGATACAAGGCTGTTAGAGAGATAATTAGAATTAATTTGACTGTAAACACAAAGATATTAGTACAAAATACGTGACGTAGAAAGTAATAATTTCTTGGGTAGTTTGCAGTTTTAAAATTATGTTTTAAAATGGACTATCATATGCTTACCGTAACTTGAAAGTATTTCGATTTCTTGGCTTTATATATCTTGTGGAAAGGACGAAACACC(SEQ ID NO:1596)。在一些情况下，小鼠U6启动子可包含与以下具有至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的序列：GTACTGAGTCGCCCAGTCTCAGATAGATCC GACGCCGCCATCTCTAGGCCCGCGCCGGCCCCCTCGCACAGACTTGTGGGAGAAGCTCGGCTACTCCCCTGCCCCGGTTAATTTGCATATAATATTTCCTAGTAACTATAGAGGCTTAATGTGCGATAAAAGACAGATAATCTGTTCTTTTTAATACTAGCTACATTTTACATGATAGGCTTGGATTTCTATAAGAGATACAAATACTAAATTATTATTTTAAAAAACAGCACAAAAGGAAACTCACCCTAACTGTAAAGTAATTGTGTGTTTTGAGACTATAAATATCCCTTGGAGAAAAGCCTTGTTTG(SEQ ID NO:1597)。在一些情况下，人U7启动子可包含与以下具有至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的序列：TTAACAACAACGAAGGGGCTGTGACTGGCT GCTTTCTCAACCAATCAGCACCGAACTCATTTGCATGGGCTGAGAACAAATGTTCGCGAACTCTAGAAATGAATGACTTAAGTAAGTTCCTTAGAATATTATTTTTCCTACTGAAAGTTACCACATGCGTCGTTGTTTATACAGTAATAGGAACAAGAAAAAAGTCACCTAAGCTCACCCTCATCAATTGTGGAGTTCCTTTATATCCCATCTTCTCTCCAAACACATACGCA(SEQ ID NO:1598)。在一些情况下，小鼠U7启动子可包含与以下具有至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的序列：TTAACAACATAGGAGCTGTGATT GGCTGTTTTCAGCCAATCAGCACTGACTCATTTGCATAGCCTTTACAAGCGGTCACAAACTCAAGAAACGAGCGGTTTTAATAGTCTTTTAGAATATTGTTTATCGAACCGAATAAGGAACTGTGCTTTGTGATTCACATATCAGTGGAGGGGTGTGGAAATGGCACCTTGATCTCACCCTCATCGAAAGTGGAGTTGATGTCCTTCCCTGGCTCGCTACAGACGCACTTCCGC(SEQ ID NO:1599)。在一些情况下，人U1启动子可包含与以下具有至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的序列：TAAGGACCAGCTTCTTTGGGAGAG AACAGACGCAGGGGCGGGAGGGAAAAAGGGAGAGGCAGACGTCACTTCCTCTTGGCGACTCTGGCAGCAGATTGGTCGGTTGAGTGGCAGAAAGGCAGACGGGGACTGGGCAAGGCACTGTCGGTGACATCACGGACAGGGCGACTTCTATGTAGATGAGGCAGCGCAGAGGCTGCTGCTTCGCCACTTGCTGCTTCGCCACGAAGGGAGTTCCCGTGCCCTGGGAGCGGGTTCAGGACCGCTGATCGGAAGTGAGAATCCCAGCTGTGTGTCAGGGCTGGAAAGGGCTCGGGAGTGCGCGGGGCAAGTGACCGTGTGTGTAAAGAGTGAGGCGTATGAGGCTGTGTCGGGGCAGAGCCCGAAGATCTC(SEQ ID NO:1600)。在一些情况下，CMV启动子可包含与以下具有至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％序列同一性的序列：ATACGCGTTGA CATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCGTTTAGTGAACCGTCAGATCGCCTGGAGACGCCATCCACGCTGTTTTGACCTCCATAGAAGACACCGGGACCGATCCAGCCTCCGGACTCTAGAGGATCGAACC(SEQ IDNO:1601)。
靶标和治疗方法
本公开提供了工程化指导RNA或编码指导RNA的工程化多核苷酸的组合物及其使用方法，诸如治疗方法。在一些实施方案中，本公开的工程化多核苷酸编码靶向RNA的编码序列(例如，TIS)或RNA的非编码序列(例如，polyA信号序列)的指导RNA。在一些实施方案中，本公开提供了编码多于一种靶向TIS和polyA序列的工程化指导RNA的组合物或多于一种工程化多核苷酸。本文公开的工程化指导RNA促进TIS、polyA序列或两者中腺苷的ADAR介导的RNA编辑。在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA可通过体外和体内方法进行筛选，以确定它们促进靶RNA中腺苷的ADAR介导的RNA编辑的能力。在一些情况下，筛选方法可包括如本文所述的基于细胞的报告基因测定。
DUX4。本公开提供了工程化指导RNA，其促进DUX4-FL的RNA编辑以敲低DUX4-FLmRNA和DUX4激活基因的表达，并因此敲低DUX4活性。面肩肱型肌营养不良症(FSHD)是一种罕见的神经肌肉疾病，其特征是进行性骨骼肌无力和萎缩，表型严重程度和发病年龄具有显著异质性。FSHD主要影响身体的脸部(面部)、肩带(肩胛)和上臂(肱骨)区域。随着疾病进展，上臂肌肉、腿部肌肉和背部姿势肌肉的质量和力量会降低。患者通常首先出现面部和肩胛周围肌肉无力，最终导致无法将手臂举至肩高以上、无法做出面部表情，甚至无法闭上眼睛。在约20％的FSHD患者中，椎旁肌无力足以导致患者衰弱到只能坐在轮椅上。FSHD是最常见的成人肌营养不良症之一，由染色体4q上的亚端粒D4Z4微卫星阵列的表观遗传去抑制引起。此类表观遗传去抑制导致最远端D4Z4单元的低甲基化和骨骼肌中DUX4基因的错误表达。FSHD有两种亚型——FSHD1和FSHD2。FSHD1占FSHD病例的95％，并且与D4Z4微卫星重复序列的致病性收缩相关，而FSHD2占FSHD病例的5％，并且与收缩无关，但与染色质调节基因SMCHD1的突变相关。FSHD1和FSHD2的突变都会导致D4Z4阵列去抑制和DUX4 mRNA错误表达。所述DUX4突变在2/3的FSHD1患者中是常染色体显性突变，并且流行率为1:8,000-12,000(美国约16,000-38,000名患者)。DUX4(双同源盒4)是种系转录因子，并且其在肌肉中的错误表达会激活一系列基因(DUX4激活基因)的表达，其中许多基因与干细胞和生殖细胞生物学有关。一些已知的DUX4激活基因包括MBD3L2、TRIM43、PRAMEF12、ZSCAN和LEUTX。尽管物理治疗、疼痛管理和手术可减轻与FSHD相关的一些残疾，但这些治疗并不是治愈性的，并且都不能解决疾病病理学的根本原因。虽然健康受试者生成无毒剪接形式的缺乏DUX4 C端反式激活结构域的DUX4 mRNA(简称为DUX4-S)，但受影响的受试者产生毒性剪接形式的DUX4mRNA(全长称为DUX4-FL)，导致毒性形式的DUX4蛋白在肌肉中表达。尽管正在探索各种药物和基于细胞的干预方法来治疗FSHD，但根据临床试验的结果，这些方法通常几乎不能提供治疗益处。为了开发更有针对性的治疗形式，减少肌肉特异性DUX4-FL表达和DUX4介导的毒性的方法已成为FSHD治疗的有吸引力的目标。事实上，针对疾病根本原因(例如，DUX4)的基因治疗有望得到更有效或更深层的治疗效果。有效治疗所需的DUX4抑制的确切量目前尚不清楚，但来自临床受影响和无症状FSHD患者的数据支持这样的观点，即DUX4-FL mRNA表达的任何减少都将具有治疗益处。在一些实施方案中，本公开提供了工程化指导RNA的组合物，其靶向DUX4并促进ADAR介导的DUX4(特别是DUX4-FL)的RNA编辑以介导DUX4-FL敲低。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向DUX4-FL中的编码序列。例如，编码序列可以是DUX4的翻译起始位点(TIS)(AUG)，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的AUG到GUG的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向DUX4前mRNA中的剪接位点。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向DUX4中的非编码序列。非编码序列可以是pLAM区域中的polyA信号序列(ATTAAA)，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的DUX4的polyA信号序列中一个或多个腺苷的RNA编辑。此polyA信号序列的RNA编辑减少了DUX4-FL polyA序列的多腺苷酸化和基因切除，导致DUX4-FL mRNA敲低和DUX4-FL蛋白质敲低。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向DUX4中的多于一个polyA信号序列。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向DUX4中的TIS和一个或多个polyA信号序列。
在一些实施方案中，靶向DUX4的指导RNA的靶组织可包括肌肉。在一些情况下，肌肉可包括面部肌肉、手臂肌肉、颈部肌肉、肩部肌肉、大腿肌肉、臀部肌肉、腹部肌肉、背部肌肉、足部肌肉、手部肌肉或其任何组合。在一些情况下，肌肉可包括眼轮匝肌、口轮匝肌、笑肌、颧大肌和颧小肌、肱二头肌、肱三头肌、斜方肌、菱形肌、肩胛提肌、背阔肌、胸大肌、骨盆带肌肉、腹部肌肉、胫骨前肌或其任何组合。在一些情况下，面部肌肉可包括枕额肌、眼轮匝肌、颞肌、颊肌、咬肌、颏肌、降下唇肌、口轮匝肌、提口角肌、提上唇肌、降口角肌、提上唇鼻翼肌、颧大肌和颧小肌、眼轮匝肌、皱眉肌或笑肌。在一些情况下，颈部肌肉可包括肩胛舌骨肌、颈阔肌、胸骨舌骨肌、胸锁乳突肌、肩胛提肌、斜角肌、斜方肌、头半棘肌、后上锯肌或其任何组合。在一些情况下，肩部肌肉可包括三角肌、冈上肌、菱形肌、冈下肌、小圆肌、大圆肌、胸大肌、胸小肌、前锯肌或其任何组合。在一些情况下，手臂肌肉可包括肱三头肌、肱二头肌、肱肌、肱桡肌、腕肌、指伸肌、示指伸肌、小指伸肌、指浅屈肌、指深屈肌、拇长屈肌、拇长伸肌、拇短伸肌、拇长展肌、鱼际肌、拇收肌、小鱼际肌、蚓状肌、背侧骨间肌、掌侧骨间肌或其任何组合。在一些情况下，臀部肌肉可包括筋膜张肌、臀小肌、臀大肌、臀中肌、梨状肌、闭孔内肌或其任何组合。在一些情况下，腹部肌肉可包括锥体肌、腹直肌、外斜肌、内斜肌、腹横肌或其任何组合。在一些情况下，背部肌肉可包括斜方肌、菱形肌、背阔肌、竖脊肌、多裂肌、腰方肌或其任何组合。在一些情况下，腿部肌肉可包括股外侧肌、股内侧肌、股中间肌、股直肌、股二头肌、半膜肌、半腱肌、腓肠肌、比目鱼肌、跖肌或其任何组合。在一些情况下，足部肌肉可包括拇展肌、胫骨前肌、趾长伸肌、趾长屈肌、腓骨长肌、第三腓骨肌、腓骨短肌或其任何组合。
在一些实施方案中，靶向DUX4的指导RNA的靶细胞可包括体细胞(例如，肌肉细胞)或配子细胞。例如，体细胞可包括内脏器官、皮肤、肌肉、骨骼、血细胞、结缔组织细胞或其任何组合的细胞。在一些情况下，体细胞可包括肌肉细胞。在一些情况下，肌肉细胞可包括骨骼肌细胞、心肌细胞、平滑肌细胞或其组合。在一些情况下，肌肉细胞可包括肌丝细胞(myocyte)、肌原纤维、成肌细胞、心肌细胞或其任何组合。
本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的DUX4的RNA编辑，从而影响报告蛋白敲低。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的1％至100％的靶腺苷RNA编辑。本公开的工程化指导RNA可促进40％至90％的靶腺苷编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可促进至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、100％、5％至20％、20％至40％、40％至60％、60％至80％、80％至100％、60％至80％、70％至90％或多至90％或更多的靶腺苷的RNA编辑。任选地，此外，本公开的工程化指导RNA可促进这些水平的中靶RNA编辑，同时维持低于10％的脱靶腺苷编辑。任选地，此外，本公开的工程化指导RNA可促进这些水平的中靶RNA编辑，同时维持小于30％、小于25％、小于20％、小于15％、小于10％、小于9％、小于8％、小于7％、小于6％、小于5％、小于4％、小于3％、小于2％、小于1％或0％的脱靶腺苷的编辑。
在一些实施方案中，DUX4 RNA包含DUX4的前mRNA转录本。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可促进对DUX4的前mRNA转录本的polyA信号序列中的至少一个编辑进行编辑。在一些情况下，至少40％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。在一些情况下，至少80％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。在一些情况下，1％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％、20％至40％、30％至50％、40％至60％、50％至70％、60％至80％、20％至50％或30％至60％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。
在一些实施方案中，DUX4-FL的pLAM区域中的polyA信号序列(ATTAAA)中的突变导致DUX4 mRNA敲低、DUX4蛋白敲低或两者。作为RNA，polyA信号序列对应于序列AUUAAA。在一些情况下，polyA信号序列(AUUAAA)可突变为AUUAAG；AUUAGA；AUUGAA；GUUAAA；或GUUGGG。在一些情况下，本文公开的工程化指导RNA可促进ADAR介导的将未修饰的polyA信号序列(AUUAAA)RNA编辑为AUUAAG；AUUAGA；AUUGAA；GUUAAA；或GUUGGG。在一些情况下，ADAR介导的RNA编辑未修饰的polyA信号序列为AUUAAG；AUUAGA；AUUGAA；GUUAAA；或GUUGGG导致DUX4mRNA敲低、DUX4蛋白敲低或两者。
在一些实施方案中，本文公开的工程化指导物可促进ADAR介导的DUX4的pLAM区域中非编码polyA信号序列(ATTAAA)中的一个或多个腺苷的RNA编辑。在一些情况下，编辑DUX4 RNA的方法可包括使DUX4 RNA与本文公开的工程化指导物和RNA编辑实体接触。在一些情况下，所述方法可包括编辑非编码polyA信号序列。作为RNA，polyA信号序列对应于序列AUUAAA。polyA信号位点序列(AUUAAA)中每个“A”的对应位置从左到右表示为0、3、4和5。在一些情况下，编辑polyA信号位点序列可包括编辑任何A处的polyA信号位点。在一些情况下，编辑可包括编辑约20％至约95％、30％至约95％、40％至约95％、44％至约91％、60％至约95％，或80％至约91％的polyA尾中的任何A位置。在一些情况下，用于靶向位置“0”处的DUX4 polyA信号位点序列的工程化指导RNA可包含与SEQ ID NO:1575、593、1573、934、1569、1567、851、1211、1571、937、1574、1570、1566、1117、906、1572、1104、352、512、1587、375、1588、977、642、1236、1584、252、394、482、1585、291、356、1054、1581、1103、502、769、408、1586、1008、737、985、679、727、1578、365、1580、487、1098或976具有至少70％、80％、85％、90％、95％、98％、99％或100％同一性和/或长度的序列。在一些情况下，编辑可包括约20％至约85％、30％至约85％、40％至约85％、50％至约66％、40％至约70％，或60％至约66％的polyA尾中的位置“0”处的A的编辑。在一些情况下，用于靶向位置“3”处的DUX4polyA信号位点序列的工程化指导RNA可包含与SEQ ID NO:1573、1588、1545、1575、1569、1584、1572、1567、1570、1587、1574、625、1571、874、17、1585、757、1581、1538、8、1002、1566、486、1552、505、635、606、884、1054、880、1411、1568、871、1580、1539、14、892、1116、15、1586、593、10、977、1578、1579、747、1577、748、873或494具有至少70％、80％、85％、90％、95％、98％、99％或100％同一性和/或长度的序列。在一些情况下，编辑可包括约20％至约95％、30％至约95％、40％至约95％、76％至约91％、60％至约80％，或80％至约91％的polyA尾中的位置“3”处的A的编辑。在一些情况下，用于靶向位置“4”处的DUX4 polyA信号位点序列的工程化指导RNA可包含与SEQ ID NO:1575、1573、1567、1569、1570、1566、1572、1587、1571、1574、1584、1588、1054、1586、1585、1581、1578、1580、934、72、1582、1066、1183、1577、967、1568、930、566、1463、1294、1293、1391、1579、1583、944、815、1168、593、594、694、1576、1193、1051、1212、806、1059、1374、195、358或1296具有至少70％、80％、85％、90％、95％、98％、99％或100％同一性和/或长度的序列。在一些情况下，编辑可包括约20％至约85％、30％至约85％、40％至约85％、54％至约77％、50％至约60％，或60％至约77％的polyA尾中的位置“4”处的A的编辑。在一些情况下，用于靶向位置“5”处的DUX4 polyA信号位点序列的工程化指导RNA可包含与SEQ ID NO:1575、1573、1569、1574、1570、1572、1567、1587、1566、1571、1588、72、1586、1584、1581、1578、1585、1582、1580、1183、1568、1066、1391、1168、1293、1577、1054、566、1579、930、694、944、195、1583、815、1576、1051、1411、24、1163、935、680、1212、594、1185、1463、1058、810、392或1104具有至少70％、80％、85％、90％、95％、98％、99％或100％同一性和/或长度的序列。在一些情况下，编辑可包括约20％至约85％、30％至约85％、40％至约85％、44％至约70％、50％至约60％，或60％至约70％的polyA尾中的位置“5”处的A的编辑。
在一些实施方案中，本文公开的用于靶向DUX4的工程化指导RNA可包含在指导-靶RNA支架中形成的结构特征。在一些情况下，结构特征包括由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的6个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的6个核苷酸形成的对称内部环。在一些情况下，内部环可在靶RNA序列的靶A(0位置)上游(5')6个核苷酸处开始。在一些情况下，工程化指导RNA可包含两个或更多个6核苷酸对称内部环。在一些情况下，一个对称内部环可在靶A(0位置)上游(5')并且一个对称内部环可在靶A下游(3')。在一些情况下，结构特征包括由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的1个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1个核苷酸形成的错配。在一些情况下，错配是A/C错配。在一些情况下，A/C错配包含与靶RNA中的A相对的本公开的工程化指导RNA中的C。在一些情况下，错配可位于靶A(0位置)或靶A下游(3')3或5个核苷酸处。在一些情况下，结构特征包括由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的4个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的4个核苷酸形成的对称凸起。在一些情况下，结构特征包括由指导-靶RNA支架的工程化指导RNA侧的2个核苷酸和指导-靶RNA支架的靶RNA侧的2个核苷酸形成的对称凸起。在一些情况下，对称凸起在靶A下游(3')。
用于测量靶向DUX4的有效工程化gRNA的测定
在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的DUX4的RNA编辑。在一些实施方案中，ADAR介导的DUX4的RNA编辑可导致蛋白质水平的敲低(例如，降低)、mRNA水平的敲低或两者。在一些情况下，蛋白质水平的敲低可以是DUX4或DUX4下游蛋白质的敲低。在一些情况下，mRNA水平的敲低可以是DUX4或DUX4下游蛋白质的敲低。在一些情况下，蛋白质水平和/或mRNA水平的敲低是ADAR依赖性敲低。
在一些实施方案中，使用测定来确定本文公开的指导RNA的功效。在一些情况下，测定可包括测量细胞中的RNA编辑、mRNA水平或蛋白质水平。在一些情况下，测定可包括在用本文公开的指导RNA处理之前和之后测量细胞中的RNA编辑、mRNA水平或蛋白质水平。在一些情况下，可在时程测定中对细胞进行取样。在一些情况下，细胞可包括具有功能性ADAR基因的细胞。在一些情况下，细胞可包括具有非功能性ADAR基因的细胞。例如，细胞可包含截短的或突变的ADAR基因或细胞可包含缺失的ADAR基因。在一些情况下，测定可用于比较具有ADAR基因功能性拷贝的细胞和不具有功能性ADAR基因的细胞中的编辑水平、mRNA水平或蛋白质水平。在一些情况下，细胞中mRNA或蛋白质水平的降低可被鉴定为mRNA或蛋白质水平ADAR依赖性降低。细胞中的蛋白质水平可通过任何标准技术来测量，例如蛋白质印迹。细胞中的mRNA水平可通过任何标准技术来测量，例如通过实时定量逆转录PCR或微滴数字PCR。在一些情况下，可通过对感兴趣的蛋白质具有特异性的功能测定来确定蛋白质水平。例如，测定可用于通过测量蛋白质的酶动力学的酶测定来确定蛋白质的量。
在一些实施方案中，本文公开的指导RNA可促进1％至100％的mRNA水平或蛋白质水平的ADAR依赖性敲低。在一些情况下，与用指导RNA处理之前的细胞相比，本文公开的指导RNA可促进mRNA水平或蛋白质水平ADAR依赖性敲低1％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％、20％至40％、30％至50％、40％至60％、50％至70％、60％至80％、20％至50％、30％至60％、至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。在一些情况下，可在包含ADAR的功能性拷贝的细胞与包含ADAR的非功能性拷贝的细胞之间比较mRNA水平或蛋白质水平的ADAR依赖性敲低。
在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的DUX4-FL的RNA编辑，这导致蛋白质水平的敲低。蛋白质水平的敲低被定量为DUX4-FL蛋白质表达的减少。本公开的工程化指导RNA可促进1％至100％的DUX4-FL蛋白质敲低。本公开的工程化指导RNA可促进1％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％、20％至40％、30％至50％、40％至60％、50％至70％、60％至80％、20％至50％、30％至60％、至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4-FL蛋白质敲低。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进30％至60％的DUX4-FL蛋白质敲低。蛋白质敲低(例如，DUX4-FL敲低)可通过将用工程化指导RNA处理的样品或治疗的受试者与未用工程化指导RNA处理的对照样品或治疗的对照受试者进行比较的测定来测量。在一些情况下，可通过比较用本文公开的指导RNA治疗之前样品或受试者中存在的蛋白质的量并与治疗之后蛋白质的量比较来测量蛋白质敲低。
在一些实施方案中，ADAR介导的DUX4-FL的RNA编辑导致DUX4下游的一种或多种蛋白质的下游蛋白质水平的敲低。在一些情况下，DUX4下游蛋白质的敲低可用于确定DUX-4蛋白质水平的减少。在一些情况下，DUX4的下游蛋白质包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2。DUX4下游蛋白质的蛋白质水平的敲低可被定量为SLC34A2蛋白、LEUTX蛋白、ZSCAN4蛋白、PRAMEF12蛋白、TRIM43蛋白、DEFB103蛋白或MBD3L2蛋白表达的减少。本公开的工程化指导RNA可促进1％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％、20％至40％、30％至50％、40％至60％、50％至70％、60％至80％、20％至50％、30％至60％、至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4下游的SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103、MBD3L2或另一种蛋白质的蛋白质敲低。在一些实施方案中，在测定中测量指导RNA对DUX4 RNA的增加的编辑。在一些情况下，增加的编辑包括DUX4和/或DUX4下游蛋白质的蛋白质敲低的增加。在一些情况下，测定可包括测量用本文所述的指导RNA处理之前和之后样品中的蛋白质水平。在一些情况下，测定可包括测量未用指导RNA处理的样品中的蛋白质水平和测量用本文所述的指导RNA处理的样品中的蛋白质。
在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的DUX4的RNA编辑，这导致mRNA水平的敲低。mRNA水平的敲低被定量为DUX4 mRNA转录蛋白表达的减少。本公开的工程化指导RNA可促进1％至100％的DUX4 mRNA减少。本公开的工程化指导RNA可促进减少：1％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％、20％至40％、30％至50％、40％至60％、50％至70％、60％至80％、20％至50％或30％至60％的DUX4 mRNA。本公开的工程化指导RNA可促进减少：至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4 mRNA。本公开的工程化指导RNA可促进DUX4mRNA减少至少50％或至少70％。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进DUX4mRNA减少50％至75％。DUX4(例如，DUX4-FL)mRNA水平可通过将用工程化指导RNA处理的样品或治疗的受试者与未用工程化指导RNA处理的对照样品或治疗的对照受试者进行比较的测定来测量。
在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的DUX4的RNA编辑，这导致DUX4下游蛋白质的mRNA水平的敲低。在一些情况下，DUX4下游的蛋白质可包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2。在一些情况下，SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2的mRNA表达的降低可表示DUX4表达的降低。本公开的工程化指导RNA可促进SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2 mRNA减少1％至100％。本公开的工程化指导RNA可促进减少：1％至10％、10％至20％、20％至30％、30％至40％、40％至50％、50％至60％、60％至70％、70％至80％、80％至90％、90％至100％、20％至40％、30％至50％、40％至60％、50％至70％、60％至80％、20％至50％或30％至60％的SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2mRNA。本公开的工程化指导RNA可促进减少：至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少25％、至少30％、至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2 mRNA。SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2 mRNA水平可通过将用工程化指导RNA处理的样品或治疗的受试者与未用工程化指导RNA处理的对照样品或治疗的对照受试者进行比较的测定来测量。
DMPK。本公开提供了工程化指导RNA，其促进RNA编辑DMPK以敲低强直性肌营养不良蛋白激酶的表达。强直性肌营养不良(DM1)是一种罕见的神经肌肉疾病，其特征是进行性肌肉无力和无法放松肌肉(肌强直)(主要是远端骨骼肌)。DM1的遗传原因包括DMPK基因3'UTR中CTG重复的扩增，导致蛋白质聚集和后续的肌肉萎缩。严重程度与发病年龄和CTG重复区域的大小有关。所述DMPK突变是常染色体显性突变，并且流行率为1:2,300(美国约140,000名患者)。靶细胞类型是骨骼肌细胞和心肌细胞。在一些实施方案中，本公开提供了靶向DMPK并促进ADAR介导的DMPK的RNA编辑的工程化指导RNA的组合物。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向DMPK中的编码序列。例如，编码序列可以是DMPK的翻译起始位点(TIS)(AUG)，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的AUG到GUG的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向DMPK前mRNA中的剪接位点。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向DMPK中的非编码序列。非编码序列可以是polyA信号序列，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的DMPK的polyA信号序列中一个或多个腺苷的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向DMPK中的多于一个polyA信号序列。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向DMPK中的TIS和一个或多个polyA信号序列。本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的DMPK的RNA编辑，从而实现蛋白质敲低。
PMP22。本公开提供了工程化指导RNA，其促进RNA编辑PMP22以敲低外周髓鞘蛋白-22(PMP22)的表达。腓骨肌萎缩综合征(Charcot-Marie-Tooth Syndrome)(CMT1A)是最常见的遗传驱动的外周神经病变，其特征是进行性远端肌肉萎缩、感觉丧失和足/手畸形。CMT1A的遗传原因包括PMP22基因重复，其导致外周神经髓鞘形成障碍和神经传导不良。所述PMP22突变是常染色体显性突变，并且流行率为1:7,500(美国约42,000名患者)。靶细胞类型是施万细胞(Schwann cell)。在一些实施方案中，本公开提供了靶向PMP22并促进ADAR介导的PMP22的RNA编辑的工程化指导RNA的组合物。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向PMP22中的编码序列。例如，编码序列可以是PMP22的翻译起始位点(TIS)(AUG)，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的AUG到GUG的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向PMP22前mRNA中的剪接位点。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向PMP22中的非编码序列。非编码序列可以是polyA信号序列，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的PMP22的polyA信号序列中一个或多个腺苷的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向PMP22中的多于一个polyA信号序列。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向PMP22中的TIS和一个或多个polyA信号序列。本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的PMP22的RNA编辑，从而实现蛋白质敲低。
SOD1。本公开提供了工程化指导RNA，其促进RNA编辑SOD1以敲低超氧化物歧化酶的表达。肌萎缩侧索硬化症(ALS)是一种快速进展的神经退行性疾病，其特征是运动神经元死亡和自主肌肉运动丧失。虽然ALS的确切原因尚不清楚，但SOD1中功能获得性突变占常见ALS的约20％和自发性ALS的2％。所述SOD1突变是常染色体显性突变，并且流行率为2:100,000(美国<1,000名患者)。靶细胞类型是运动神经元。在一些实施方案中，本公开提供了靶向SOD1并促进ADAR介导的SOD1的RNA编辑的工程化指导RNA的组合物。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向SOD1中的编码序列。例如，编码序列可以是SOD1的翻译起始位点(TIS)(AUG)，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的AUG到GUG的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向SOD1前mRNA中的剪接位点。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA靶向SOD1中的非编码序列。非编码序列可以是polyA信号序列，并且工程化指导RNA可促进ADAR介导的SOD1的polyA信号序列中一个或多个腺苷的RNA编辑。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向SOD1中的多于一个polyA信号序列。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可多路复用以靶向SOD1中的TIS和一个或多个polyA信号序列。本公开的工程化指导RNA促进ADAR介导的SOD1的RNA编辑，从而实现蛋白质敲低。
本公开的工程化指导RNA可用在治疗有需要的受试者的病症的方法中。例如，本文公开的工程化指导RNA可用于治疗面肩肱型肌营养不良症和/或强直性肌营养不良症。病症可以是疾病、疾患、基因型、表型或与副作用相关的任何状态。在一些实施方案中，治疗病症可包括预防病症、减缓病症的进展、逆转或减轻病症的症状。治疗病症的方法可包括将编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸递送至有需要的受试者的细胞以及在细胞中表达工程化指导RNA。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可用于治疗遗传性病症(例如，FSHD、DM1、CMT1A或ALS)。在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA可用于治疗FSHD。在一些情况下，FSHD可包括FSHD I或FSHD II。在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA可用于治疗FSHD I。在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA可用于治疗FSHD II。在一些实施方案中，本公开的工程化指导RNA可用于治疗与一种或多种突变相关的疾患。例如，本文公开了用靶向DUX4的工程化指导RNA治疗FSHD的方法。本文还公开了用靶向DMPK的工程化指导RNA治疗DM1的方法。本文还公开了用靶向PMP22的工程化指导RNA治疗CMT1A的方法。本文还公开了用靶向SOD1的工程化指导RNA治疗ALS的方法。
在一些实施方案中，治疗FSHD包括治疗与FSHD相关的症状。FSHD的症状可包括肌肉无力或萎缩，所述肌肉诸如面部肌肉、手臂肌肉、颈部肌肉、肩部肌肉、大腿肌肉、臀部肌肉、腹部肌肉、背部肌肉、足部肌肉、手部肌肉或其任何组合。在一些情况下，FSHD的症状可包括视力丧失、呼吸功能不全、吞咽困难、脊柱前凸、脊柱侧弯、听力丧失、疼痛、炎症(例如，肌肉炎症)、肩部无力、身体不对等(不对称)衰弱，或其任何组合。
药物组合物
本文所述的组合物(例如，包含工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸的组合物)可与药学上可接受的载剂一起配制以施用至受试者(例如，人或非人动物)。本文所述的组合物(例如，包含工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸的组合物)可与药学上可接受的赋形剂、载剂、稀释剂或其任何组合一起配制以施用至受试者(例如，人或非人动物)。药学上可接受的载剂和/或稀释剂可包括但不限于磷酸盐缓冲盐水溶液、水、乳液(例如，油/水乳液或水/油乳液)、甘油、液体聚乙二醇、非质子溶剂(例如，二甲基亚砜、N-甲基吡咯烷酮或其混合物)，以及各种类型的润湿剂、增溶剂、抗氧化剂、填充剂、蛋白质载剂(诸如白蛋白)、任何和所有溶剂、分散介质、包衣、十二烷基硫酸钠、等渗剂和吸收延迟剂、崩解剂(例如，马铃薯淀粉或羟基乙酸淀粉钠)等。组合物还可包含稳定剂和防腐剂。与本公开的组合物一致的载剂、稳定剂和佐剂的其他实例可在例如Remington's Pharmaceutical Sciences,第21版,Mack Publ.Co.,Easton,Pa.(2005)中找到，其全部内容通过引用并入本文。
递送
本公开的工程化指导RNA或本公开的工程化多核苷酸(例如，编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸)可经由递送媒介物递送。在一些实施方案中，递送媒介物是载体。载体可促进将工程化指导RNA或工程化多核苷酸递送至细胞中以对细胞进行遗传修饰。靶组织和细胞包括但不限于面部、肩部和上肢的卫星细胞、成肌细胞、肌丝细胞和肌管。在一些实例中，载体包含DNA，诸如双链或单链DNA。在一些实例中，递送载体可以是真核载体、原核载体(例如，细菌载体或质粒)、病毒载体或其任何组合。在一些情况下，递送媒介物可包括非病毒递送媒介物。在一些实施方案中，载体是表达盒。在一些实施方案中，病毒载体包含病毒衣壳、反向末端重复序列，并且工程化多核苷酸可用于将工程化指导RNA递送至细胞。
在一些情况下，本公开的工程化指导RNA可以是体外转录(IVT)RNA。在一些情况下，工程化指导RNA可作为包含工程化指导RNA的制剂来递送。在一些情况下，工程化指导RNA可不包含在载体中。在一些实例中，工程化指导RNA(例如，作为寡核苷酸)可配制用于通过直接注射递送。在一些实例中，工程化指导RNA(作为寡核苷酸)可配制用于通过静脉内施用或口服施用来递送。
在一些实施方案中，病毒载体可以是逆转录病毒载体、腺病毒载体、腺相关病毒(AAV)载体、甲病毒载体、慢病毒载体(例如，人或猪)、疱疹病毒载体、EB病毒(Epstein-Barrvirus)载体、SV40病毒载体、痘病毒载体或其组合。在一些实施方案中，病毒载体可以是重组载体、杂交载体、嵌合载体、自身互补载体、单链载体或其任何组合。
在一些实施方案中，病毒载体可以是腺相关病毒(AAV)。在一些实施方案中，AAV可以是本领域已知的任何AAV。在一些实施方案中，AAV可包括AAV5血清型、AAV6血清型、AAV8血清型或AAV9血清型。在一些实施方案中，病毒载体可以是特定血清型。在一些实施方案中，病毒载体可以是AAV1血清型、AAV2血清型、AAV3血清型、AAV4血清型、AAV5血清型、AAV6血清型、AAV7血清型、AAV8血清型、AAV9血清型、AAV10血清型、AAV11血清型、AAV12血清型、AAV13血清型、AAV14血清型、AAV15血清型、AAV16血清型、AAV.rh8血清型、AAV.rh10血清型、AAV.rh20血清型、AAV.rh39血清型、AAV.Rh74血清型、AAV.RHM4-1血清型、AAV.hu37血清型、AAV.Anc80血清型、AAV.Anc80L65血清型、AAV.7m8血清型、AAV.PHP.B血清型、AAV2.5血清型、AAV2tYF血清型、AAV3B血清型、AAV.LK03血清型、AAV.HSC1血清型、AAV.HSC2血清型、AAV.HSC3血清型、AAV.HSC4血清型、AAV.HSC5血清型、AAV.HSC6血清型、AAV.HSC7血清型、AAV.HSC8血清型、AAV.HSC9血清型、AAV.HSC10血清型、AAV.HSC11血清型、AAV.HSC12血清型、AAV.HSC13血清型、AAV.HSC14血清型、AAV.HSC15血清型、AAV.HSC16血清型和AAVhu68血清型、任何这些血清型的衍生物、任何这些血清型的嵌合体、任何这些血清型的变体或其任何组合。
在一些实施方案中，AAV载体可以是重组载体、杂交AAV载体、嵌合AAV载体、自身互补AAV(scAAV)载体、单链AAV或其任何组合。
在一些实施方案中，AAV载体可以是重组AAV(rAAV)载体。产生重组AAV载体的方法可以是本领域已知的，并且在一些情况下通常涉及将以下引入到生产细胞系中：(1)AAV复制和合成AAV衣壳所需的DNA，(b)一种或多种包含由AAV载体缺失的病毒功能的辅助构建体，(c)辅助病毒，和(d)含有AAV载体基因组(例如，ITR、启动子和工程化指导RNA序列等)的质粒构建体。在一些实例中，本文所述的病毒载体可参考公开的序列(诸如可在文献中获得的序列)通过合成或其他合适的方式进行工程化。例如，AAV的各种血清型的基因组和蛋白质序列，以及天然末端重复序列(TR)、Rep蛋白质和衣壳亚基的序列可以是本领域已知的，并且可在文献或公开数据库(诸如GenBank或蛋白质数据库(PDB))中找到。
在一些实例中，产生本文递送载体的方法包括将本公开的工程化多核苷酸(例如，编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸)包装在AAV载体中。在一些实例中，产生本文所述的递送载体的方法包括，(a)将以下引入细胞：(i)包含启动子和本文公开的工程化指导RNA有效载荷的多核苷酸；和(ii)包含复制(Rep)基因和编码野生型AAV衣壳蛋白或其修饰型式的衣壳(Cap)基因的病毒基因组；(b)在细胞中表达野生型AAV衣壳蛋白或其修饰型式；(c)组装AAV颗粒；以及(d)将本文公开的有效载荷包装在AAV颗粒中，从而生成AAV递送载体。在一些实例中，重组载体包含一个或多个反向末端重复序列，并且所述反向末端重复序列包括5'反向末端重复序列、3'反向末端重复序列和突变的反向末端重复序列。在一些实例中，突变的末端重复序列缺乏末端解析位点，从而能够形成自身互补的AAV。
在一些实例中，杂交AAV载体可通过转衣壳作用产生，例如将来自第一血清型的反向末端重复序列(ITR)包装至第二血清型的衣壳中，其中第一和第二血清型可不相同。在一些实例中，来自第一AAV血清型(例如，AAV2)的Rep基因和ITR可用在来自第二AAV血清型(例如，AAV5或AAV9)的衣壳中，其中第一和第二AAV血清型可不相同。作为非限制性实例，包含AAV2 ITR和AAV9衣壳蛋白的杂交AAV血清型可表示为AAV2/9。在一些实例中，杂交AAV递送载体包括AAV2/1、AAV2/2、AAV2/4、AAV2/5、AAV2/8或AAV2/9载体。
在一些实例中，AAV载体可以是嵌合AAV载体。在一些实例中，嵌合AAV载体包含外源氨基酸或氨基酸取代，或来自两种或更多种血清型的衣壳蛋白。在一些实例中，可对嵌合AAV载体进行遗传工程化以增加转导效率、选择性或其组合。
在一些实例中，AAV载体包含自身互补的AAV基因组。自身互补的AAV基因组通常可以是本领域已知的，并且含有可一起退火形成双链DNA的两条DNA链。
在一些实例中，递送载体可以是逆转录病毒载体。在一些实例中，逆转录病毒载体可以是莫洛尼鼠(Moloney Murine)白血病病毒载体、脾坏死病毒载体，或源自劳斯肉瘤病毒(Rous Sarcoma Virus)、哈维肉瘤病毒(Harvey Sarcoma Virus)、禽白血病病毒、人免疫缺陷病毒、骨髓增殖性肉瘤病毒或乳腺肿瘤病毒的载体或其组合。在一些实例中，可转染逆转录病毒载体，使得编码病毒结构基因(例如，gag、pol和env)的大部分序列可缺失并被感兴趣的基因替换。
在一些实例中，递送媒介物可以是非病毒载体。在一些情况下，递送媒介物可以是编码工程化指导RNA的DNA。在一些实例中，递送媒介物可以是质粒。在一些实施方案中，质粒包含DNA。在一些实例中，质粒包含环状双链DNA。在一些实例中，质粒可以是线性的。在一些实例中，质粒包含一种或多种感兴趣的基因和一种或多种调控元件。在一些实例中，质粒包含含有复制起点的细菌主链和抗生素抗性基因或用于细菌中质粒扩增的其他可选标志物。在一些实例中，质粒可以是小环质粒。在一些实例中，质粒含有一种或多种提供选择性标志物以诱导靶细胞保留质粒的基因。在一些实例中，可将质粒配制用于通过携带针的注射器注射来递送。在一些实例中，可配制质粒用于经由电穿孔递送。在一些实例中，可通过合成或本领域已知的其他合适的方式工程化质粒。例如，在一些情况下，可通过限制性消化来自供体质粒或生物体的所需遗传序列来组装遗传元件以产生DNA末端，然后其可容易地连结至另一遗传序列。
在一些实施方案中，含有工程化指导RNA或工程化多核苷酸的载体是非病毒载体系统。在一些实施方案中，非病毒载体系统包含阳离子脂质或聚合物。例如，非病毒载体系统可以是脂质体或聚合物纳米颗粒。在一些情况下，非病毒载体系统可以是脂质纳米颗粒(LNP)或聚合物纳米颗粒。在一些实施方案中，通过流体动力学注射或超声将工程化多核苷酸或包含工程化指导RNA或工程化多核苷酸的非病毒载体递送至细胞。
施用
施用可指可用于能够将本文所述的组合物(例如包含工程化指导RNA或编码其的工程化多核苷酸)递送至期望的生物作用位点的方法。例如，工程化指导RNA可包含在DNA构建体、病毒载体或两者中，并通过静脉内施用来施用。本文公开的向需要治疗或疗法的区域的施用可通过例如但不限于口服施用、局部施用、静脉内施用、吸入施用或其任何组合来实现。在一些情况下，本文公开的施用可以是全身施用。在一些情况下，施用可以是通过注射全身施用(例如，静脉内施用或通过注射的任何施用)或口服递送。在一些实施方案中，递送可包括吸入、经耳、经颊、结膜、经牙、宫颈内、窦内、气管内、肠内、硬膜外、羊膜外、体外、血液透析、浸润、间质、腹内、羊膜内、动脉内、关节内、胆道内、支气管内、法氏囊内、心内、软骨内、尾内、阴茎海绵体内(intracavernous)、腔内、脑室内、脑池内、角膜内、冠内、冠状动脉内、阴茎海绵体内(intracorpous cavernaosum)、皮内、椎间盘内、导管内、十二指肠内、硬膜内、表皮内、食道内、胃内、龈内、海马内、回肠内、病灶内、管腔内、淋巴管内、髓内、脑膜内、肌内、眼内、静脉内、心包内、腹膜内、胸膜内、前列腺内、肺内、窦内(intrasinal)、椎管内、滑膜内、腱内、睾丸内、胸腔内、小管内、瘤内、鼓室内、子宫内、血管内、静脉内、静脉推注、静脉滴注、膀胱内、玻璃体内、离子电渗、冲洗、经喉、鼻腔、鼻饲、经眼、口服、口咽、肠胃外、经皮、关节周围、硬膜外、神经周围、牙周、直肠、球后、蛛网膜下腔、结膜下、皮下、舌下、黏膜下、局部、透皮、透粘膜、经胎盘、经气管、经鼓室、输尿管、尿道、阴道、眶下、实质内、鞘内、脑室内、立体定向或其任何组合。递送可包括肠胃外施用(包括静脉内、皮下、鞘内、腹膜内、肌内、血管内或输注)、口服施用、吸入施用、十二指肠内施用、直肠施用或其组合。递送可包括直接应用于受影响的组织或身体区域。在一些情况下，局部施用可包括将以下施用至表面(诸如皮肤)的外表面：洗剂、溶液、乳液、乳霜、香膏、油、糊剂、固体剂(stick)、气雾剂、泡沫、胶浆(jelly)、泡沫、面膜、垫、粉末、固体、酊剂、油剂(butter)、贴剂、凝胶、喷雾剂、滴剂、液体制剂、软膏。递送可包括实质注射、鞘内注射、心室内注射或脑池内注射。本文提供的组合物可通过任何方法施用。施用方法可以是通过动脉内注射、脑池内注射、肌内注射、实质内注射、腹膜内注射、椎管内注射、鞘内注射、静脉内注射、心室内注射、立体定向注射、皮下注射、硬膜外注射或其任何组合。递送可包括肠胃外施用(包括静脉内、皮下、鞘内、腹膜内、肌内、血管内或输注施用)。在一些实施方案中，递送可包括纳米颗粒、脂质体、外来体、细胞外囊泡、植入物或其组合。在一些情况下，可从设备进行递送。在一些情况下，递送可通过泵、输注泵或其组合来施用。在一些实施方案中，递送可通过灌肠剂、滴眼剂、鼻喷剂或其任何组合来进行。在一些情况下，受试者可在没有监督的情况下施用组合物。在一些情况下，受试者可在医疗专业人员(例如，医师、护士、医师助理、护工、临终关怀工作者等)的监督下施用组合物。在一些实施方案中，医疗专业人员可施用组合物。
在一些情况下，施用可以是口服摄取。在一些情况下，递送可以是胶囊或片剂。口服摄取递送可包括茶、酏剂、食物、饮品、饮料、糖浆、液体、凝胶、胶囊、片剂、油、酊剂或其任何组合。在一些实施方案中，食物可以是医疗食物。在一些情况下，胶囊可包含羟甲基纤维素。在一些实施方案中，胶囊可包含明胶、羟丙基甲基纤维素、普鲁兰或其任何组合。在一些情况下，胶囊可包含包衣，例如肠溶包衣。在一些实施方案中，胶囊可包含素食产品或纯素食产品，诸如羟丙甲纤维素胶囊。在一些实施方案中，递送可包括通过吸入器、扩散器、喷雾器、蒸发器或其组合的吸入。
在一些实施方案中，本文公开的工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的多核苷酸可与第二治疗剂一起施用。在一些情况下，第二治疗剂可以足以治疗疾病或疾患的量施用。在一些情况下，施用第二治疗剂可与本文公开的工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的多核苷酸的施用同时施用或连续施用。在一些情况下，第二治疗剂可包含洛吡莫德(losmapimod)或其盐。在一些情况下，洛吡莫德或其盐可以约0.0001克至约100克或约1mg至约100mg的量施用。
在一些实施方案中，本文公开的可以是一种方法，其包括向有需要的受试者(例如，人)施用本文公开的组合物。在一些情况下，所述方法可治疗或预防受试者的疾病。
定义
除非另有定义，否则本文所用的所有领域术语、表示和其它技术和科学术语旨在具有与要求保护的主题所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。在一些情况下，为了清楚和/或便于参考，本文定义了具有通常所理解的含义的术语，并且将此类定义并入本文不应必然理解为代表与本领域通常所理解的含义具有实质性区别。
贯穿本申请，各种实施方案以范围格式呈现。应当理解，范围格式的描述仅仅是为了方便和简洁，而不应当被理解为对本公开范围的硬性限制。因此，范围的描述应当被认为已经具体公开了所有可能的子范围以及此范围内的各个数值。例如，诸如1至6的范围的描述应当被认为具有具体公开的子范围，诸如1至3、1至4、1至5、2至4、2至6、3至6等，以及此范围内的单个数字，例如1、2、3、4、5和6。无论范围有多大，这都适用。
如本文所用，术语“约”一个数字可指此数字加或减此数字的10％。
如本文所公开的，“凸起”是指仅在指导-靶RNA支架形成后基本上形成的结构，其中工程化指导RNA或靶RNA中的连续核苷酸不与其在相反链上的位置对应物互补。凸起可独立地具有指导-靶RNA支架的指导RNA侧的0至4个连续核苷酸，以及指导-靶RNA支架的靶RNA侧的1至4个连续核苷酸，或者凸起可独立地具有指导-靶RNA支架的靶RNA侧的0至4个核苷酸，以及指导-靶RNA支架的指导RNA侧的1至4个连续核苷酸。然而，如本文所用，凸起并不是指工程化指导RNA的单个参与核苷酸和靶RNA的单个参与核苷酸不碱基配对的结构，不碱基配对的工程化指导RNA的单个参与核苷酸和靶RNA的单个参与核苷酸在本文中被称为“错配”。此外，在指导RNA侧或靶RNA侧的参与核苷酸数量超过4的情况下，所得结构不再被认为是凸起，而是被认为是“内部环”。“对称凸起”是指凸起的每一侧存在相同数量的核苷酸的凸起。“不对称凸起”是指凸起的每一侧存在不同数量的核苷酸的凸起。
术语“互补”或“互补性”是指核酸通过例如氢键(例如，传统的沃森-克里克(Watson-Crick))、共价键或其他类似方法与对应核酸序列形成一个或多个键的能力。在沃森-克里克碱基配对中，核碱基T与A之间形成双氢键，而核碱基C与G之间形成三氢键。例如，序列A-G-T可与序列T-C-A互补。互补性百分比表示核酸分子中可与第二核酸序列形成氢键(例如，沃森-克里克碱基配对)的残基的百分比(例如，10个中的5、6、7、8、9、10个分别为50％、60％、70％、80％、90％和100％互补)。“完全互补”可意指核酸序列的所有连续残基将与第二核酸序列中相同数量的连续残基形成氢键。如本文所用的“基本上互补”可指在10、15、20、25、30、35、40、45、50或更多个核苷酸的区域上可以是至少60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、97％、98％、99％或100％的互补程度，或者可指在严格条件(即，严格的杂交条件)下杂交的两个核酸。核酸可包含非特异性序列。如本文所用，术语“非特异性序列”或“非特异性”可指含有一系列残基的核酸序列，所述残基可不被设计为与任何其他核酸序列互补或可与任何其他核酸序列仅部分互补。
术语“确定”、“测量”、“评价”、“评估”、“测定”和“分析”在本文中可互换使用以指测量的形式。这些术语包括确定元件是否存在(例如，检测)。这些术语可包括定量、定性或定量和定性确定。评估可以是相对的或绝对的。“检测……的存在”除了根据上下文确定某物是否存在之外还可包括确定某物存在的量。
如本文所用，术语“编码”是指多核苷酸提供足以产生对应基因表达产物的信息或指令序列的能力。在非限制性实例中，mRNA可在翻译期间编码多肽，而DNA可在转录期间编码mRNA分子。
“工程化潜在指导RNA”是指一种工程化指导RNA，其包含在与靶RNA杂交后或仅在与靶RNA杂交后在待编辑的靶腺苷处基本上形成除单个A/C错配特征之外的结构特征的至少一部分的序列的一部分。
如本文所用，术语工程化指导RNA“促进RNA编辑”是指工程化指导RNA在与RNA编辑实体和靶RNA缔合时提供RNA编辑实体对靶RNA进行靶向编辑的能力。在一些情况下，工程化指导RNA可直接将RNA编辑实体募集或定位/定向到适当的位置以编辑靶RNA。在其他情况下，工程化指导RNA在与靶RNA杂交后形成具有如本文所述的一种或多种结构特征的指导-靶RNA支架，其中具有结构特征的指导-靶RNA支架将RNA编辑实体募集或定位/定向到适当的位置以编辑靶RNA。
如本文所公开的，“指导-靶RNA支架”是在具有潜在结构的指导RNA与靶RNA杂交后形成的所得双链RNA。指导-靶RNA支架具有在杂交后在双链RNA双链体内形成的一种或多种结构特征。例如，指导-靶RNA支架可具有选自凸起、错配、内部环、发夹或摆动碱基对的一种或多种结构特征。
如本文所公开的，“发夹”包含RNA双链体，其中单RNA链的一部分自身折叠以形成RNA双链体。单RNA链的部分由于具有彼此碱基配对的核苷酸序列而自身折叠，其中核苷酸序列被不与自身碱基配对的间插序列分开，从而形成碱基配对的部分和非碱基配对的间插环部分。
如本文所用，术语百分比“同一性”在两个或更多个核酸或多肽序列的上下文中可指当比较和比对以获得最大对应性时，两个或更多个序列或子序列具有指定百分比的相同核苷酸或氨基酸残基，如使用下述序列比较算法(例如，BLASTP和BLASTN或技术人员可用的其他算法)之一或通过目视检查来测量。取决于应用，百分比“同一性”可相对于所比较的序列的区域存在，例如，相对于功能性结构域，或者可选地，相对于待比较的两个序列的全长存在。
对于序列比较，通常一个序列充当与测试序列进行比较的参考序列。当使用序列比较算法时，将测试序列和参考序列输入计算机中，指定子序列坐标(如果必要的话)，并且指定序列算法程序参数。然后序列比较算法基于指定的程序参数计算测试序列相对于参考序列的百分比序列同一性。
出于本文的目的，百分比同一性和序列类似性可使用BLAST算法来执行，所述算法在Altschul等人(J.Mol.Biol.215:403-410(1990))中描述。用于执行BLAST分析的软件可通过国家生物技术信息中心公开获取。
如本文所公开的，“内部环”是指仅在指导-靶RNA支架形成后基本上形成的结构，其中工程化指导RNA或靶RNA中的核苷酸不与其相对链上的位置对应物互补，并且其中内部环的一侧(指导-靶RNA支架的靶RNA侧或工程化指导RNA侧)具有5个核苷酸或更多。在指导RNA侧和靶RNA侧的参与核苷酸数量低于5的情况下，所得结构不再被认为是内部环，而是被认为是“凸起”或“错配”，取决于结构特征的大小。当内部环的每一侧存在相同数量的核苷酸时，形成“对称内部环”。当内部环的每一侧存在不同数量的核苷酸时，形成“不对称内部环”。
“潜在结构”是指仅在指导RNA与靶RNA杂交后基本上形成的结构特征。例如，指导RNA的序列提供一种或多种结构特征，但这些结构特征仅在与靶RNA杂交后基本上形成，因此一种或多种潜在结构特征在与靶RNA杂交后表现为结构特征。在指导RNA与靶RNA杂交后形成结构特征，并且指导RNA中提供的潜在结构因此被揭示。
“信使RNA”或“mRNA”是包含编码多肽或蛋白质的序列的RNA分子。一般来说，RNA可从DNA转录。在一些情况下，序列中含有非蛋白质编码区域的前体mRNA可从DNA转录，然后进行处理以去除全部或部分非编码区域(内含子)以产生成熟的mRNA。如本文所用，术语“前mRNA”可指在进行去除非蛋白质编码区域的加工之前从DNA转录的RNA分子。
如本文所公开的，“错配”是指指导RNA中的单核苷酸与指导-靶RNA支架内的靶RNA中的相对单核苷酸不配对。错配可包含不碱基配对的任何两个单核苷酸。在指导RNA侧和靶RNA侧的参与核苷酸数量超过1的情况下，所得结构不再被认为是错配，而是被认为是“凸起”或“内部环”，取决于结构特征的大小。
如本文所用，术语“多核苷酸”可指从5'端到3'端读取的脱氧核糖核苷酸(DNA)或核糖核苷酸(RNA)碱基的单链或双链聚合物。术语“RNA”包括dsRNA(双链RNA)、snRNA(小核RNA)、lncRNA(长非编码RNA)、mRNA(信使RNA)、miRNA(微小RNA)、RNAi(抑制性RNA)、siRNA(小干扰RNA)、shRNA(短发夹RNA)、tRNA(转移RNA)、rRNA(核糖体RNA)、snoRNA(小核仁RNA)和cRNA(互补RNA)。术语DNA包括cDNA、基因组DNA和DNA-RNA杂交体。
术语“蛋白质”、“肽”和“多肽”可互换使用，并且在其最广泛的意义下，可指具有两个或更多个亚单位氨基酸、氨基酸类似物或肽模拟物的化合物。亚单位可通过肽键连接。在另一实施方案中，亚单位可通过其他键连接，例如酯、醚等。蛋白质或肽可含有至少两种氨基酸并且对于可构成蛋白质或肽序列的氨基酸的最大数量没有设限。如本文所用，术语“氨基酸”可指天然氨基酸、非天然氨基酸或合成氨基酸，包括甘氨酸及D和L光学异构体、氨基酸类似物和肽模拟物。如本文所用，术语“融合蛋白”可指由来自多于一种天然存在或重组产生的蛋白质的结构域组成的蛋白质，其中通常每个结构域发挥不同的功能。在这方面，术语“接头”可指可用于将这些结构域连接在一起以任选地保留融合蛋白结构域的构象、防止融合蛋白结构域之间的可能损害其各自功能的不利相互作用或达成两者的蛋白质片段。
术语“结构化基序”是指指导-靶RNA支架中两个或更多个结构特征的组合。
术语“受试者”、“个体”或“患者”在本文中可互换使用。“受试者”是指含有表达的遗传物质的生物实体。生物实体可以是植物、动物或微生物，包括例如细菌、病毒、真菌和原生动物。受试者可以是体内获得或体外培养的生物实体的组织、细胞及其后代。受试者可以是哺乳动物。哺乳动物可以是人。受试者可被诊断为处于或怀疑处于疾病的高风险中。在一些情况下，受试者不一定被诊断为处于或怀疑处于疾病的高风险中。
术语“体内”是指在受试者体内发生的事件。
术语“离体”是指在受试者体外发生的事件。不得对受试者进行离体测定。相反，离体测定可对从受试者分离的样品进行。对样品进行的离体测定的一个实例可以是“体外”测定。
术语“体外”是指发生在用于容纳实验室试剂的容器中的事件，使得其可与可获得材料的生物来源分离。体外测定可涵盖基于细胞的测定，其中可应用活细胞或死细胞。体外测定还可涵盖其中不可使用完整细胞的无细胞测定。
术语“摆动碱基对”是指弱配对的两个碱基。例如，摆动碱基对可指与U配对的G。
如本文所述的术语“基本上形成”在涉及特定二级结构时是指在生理条件(例如生理pH、生理温度、生理盐浓度等)下形成至少80％的结构。
如本文所用，术语“治疗(treatment)”或“治疗(treating)”可用于指用于在接受者中获得有益的或期望的结果的药物或其他干预方案。有益的或期望的结果包括但不限于治疗益处和/或预防益处。治疗益处可指正在治疗的潜在病症的一种或多种症状的根除或改善。而且，可用根除或改善与潜在病症相关的一种或多种生理症状来实现治疗益处，使得可在受试者中观察到改善，尽管受试者仍可能患有潜在病症。预防效果包括延迟、预防或消除疾病或疾患的出现，延迟或消除疾病或疾患的一种或多种症状的发作，减缓、停止或逆转疾病或疾患的进展，或其任何组合。为得到预防益处，处于患上特定疾病风险的受试者或报告疾病的一种或多种生理症状的受试者可接受治疗，即使可能尚未做出此疾病的诊断。
编号的实施方案
本文公开了多种组合物和方法。这些组合物和方法的特定示例性实施方案公开如下。以下实施方案叙述了本文公开的特征组合的非限制性排列。还设想了特征组合的其他排列。特别地，这些编号的实施方案中的每一个均被设想为依赖于每个先前或后续编号的实施方案或与其相关，而与它们所列出的顺序无关。
实施方案第1部分：
实施方案1.一种包含工程化指导RNA的组合物，其中：
a)在与靶RNA的序列杂交后，工程化指导RNA与靶RNA的序列形成指导-靶RNA支架；
b)指导-靶RNA支架的形成基本上形成选自由以下组成的组的一种或多种结构特征：凸起、内部环和发夹；并且
c)靶RNA的序列是选自由以下组成的组的靶RNA的序列：翻译起始位点、polyA信号序列及其任何组合。
实施方案2.如实施方案1所述的组合物，其中靶RNA的序列包含翻译起始位点。
实施方案3.如实施方案1所述的组合物，其中靶RNA的序列包含polyA信号位点。
实施方案4.如实施方案1-2中任一项所述的组合物，其中在工程化指导RNA与靶RNA的序列杂交后，工程化指导RNA促进RNA编辑实体对靶RNA的序列中的一个或多个腺苷进行RNA编辑。
实施例5.如实施方案1-4中任一项所述的组合物，其中靶RNA选自由DUX4、DMPK、PMP22和SOD1组成的组。
实施例6.如实施方案1-4中任一项所述的组合物，其中靶RNA包含DUX4-FL。
实施例7.如实施方案6所述的组合物，其中靶RNA的序列包含polyA信号序列，其中polyA信号序列在DUX4-FL中。
实施方案8.如实施方案7所述的组合物，其中polyA信号序列包含ATTAAA。
实施方案9.如实施方案8所述的组合物，其中ATTAAA的polyA信号序列中的一个或多个腺苷由RNA编辑实体编辑。
实施方案10.如实施方案1-9中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括凸起，其中凸起是对称凸起。
实施方案11.如实施方案1-9中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括凸起，其中凸起是不对称凸起。
实施方案12.如实施方案1-11中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括内部环，其中内部环是对称内部环。
实施方案13.如实施方案1-11中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括内部环，其中内部环是不对称内部环。
实施方案14.如实施方案1-13中任一项所述的组合物，其中指导-靶RNA支架包含摆动碱基对。
实施方案15.如实施方案1-14中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括发夹，其中发夹是募集发夹或非募集发夹。
实施方案16.如实施方案4所述的组合物，其中RNA编辑实体包括ADAR1、ADAR2、ADAR3或其任何组合。
实施方案17.如实施方案1-16中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA由工程化多核苷酸编码。
实施方案18.如实施方案17所述的组合物，其中工程化多核苷酸包含在载体中或载体上。
实施方案19.如实施方案18所述的组合物，其中载体是病毒载体，并且其中工程化多核苷酸被衣壳化在病毒载体中。
实施方案20.如实施方案19所述的组合物，其中病毒载体是腺相关病毒(AAV)载体或其衍生物。
实施方案21.如实施方案20所述的组合物，其中AAV载体是AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11或其衍生物、嵌合体或变体。
实施方案22.如实施方案20-21中任一项所述的组合物，其中AAV载体是重组AAV(rAAV)载体、杂交AAV载体、嵌合AAV载体、自身互补AAV(scAAV)载体或其任何组合。
实施方案23.如实施方案1-22中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQID NO:2-SEQ ID NO:1589中的任一个具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
实施方案24.如实施方案1-22中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中任一个的序列。
实施方案25.一种药物组合物，其包含：
(a)如实施方案1-24中任一项所述的组合物；和
(b)药学上可接受的赋形剂、载剂或稀释剂。
实施方案26.一种治疗有需要的受试者的疾病或疾患的方法，所述方法包括向受试者施用治疗有效量的如实施方案1-24中任一项所述的组合物或如实施方案25所述的药物组合物。
实施方案27.如实施方案26所述的方法，其中疾病或疾患包括面肩肱型肌营养不良症，并且靶RNA是DUX4。
实施方案28.如实施方案26所述的方法，其中疾病或疾患包括强直性肌营养不良，并且靶RNA是DMPK。
实施方案29.如实施方案26所述的方法，其中疾病或疾患包括腓骨肌萎缩综合征，并且靶RNA是PMP22。
实施方案30.如实施方案26所述的方法，其中疾病或疾患包括肌萎缩侧索硬化症，并且靶RNA是SOD1。
实施方案第2部分：
1.一种组合物，其包含工程化指导RNA或编码所述工程化指导RNA的工程化多核苷酸，其中：a)在与DUX4靶RNA的序列杂交后，工程化指导RNA与DUX4靶RNA的序列形成指导-靶RNA支架；b)指导-靶RNA支架的形成基本上形成选自由以下组成的组的一种或多种结构特征：凸起、内部环、发夹，以及由工程化指导RNA中的碱基与DUX4靶RNA中的G、C或U形成的错配；并且c)在工程化指导RNA与DUX4靶RNA杂交之前，结构特征不存在于工程化指导RNA内；并且d)在工程化指导RNA与DUX4靶RNA的序列杂交后，工程化指导RNA促进RNA编辑实体对DUX4靶RNA的序列中的一个或多个靶腺苷进行RNA编辑。2.如实施方案1所述的组合物，其中DUX4靶RNA的序列包含翻译起始位点、polyA信号序列、剪接位点或其任何组合。3.如实施方案2所述的组合物，其中DUX4靶RNA的序列包含翻译起始位点。4.如实施方案2所述的组合物，其中DUX4靶RNA的序列包含polyA信号序列。5.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种特征还包括由工程化指导RNA中的碱基与DUX4靶RNA中的A形成的错配。6.如实施方案1所述的组合物，其中DUX4是DUX4-FL。7.如实施方案6所述的组合物，其中DUX4靶RNA的序列包含polyA信号序列，其中polyA信号序列在DUX4-FL中。8.如实施方案7所述的组合物，其中polyA信号序列包含ATTAAA。9.如实施方案8所述的组合物，其中ATTAAA polyA信号序列的任何A是靶腺苷。10.如实施方案6-9中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置0是靶腺苷，其中位置0是ATTAAA在5'端的第一个A。11.如实施方案10所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-10和-11。12.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-3处。13.如实施方案12所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置24处的第二6/6对称内部环及其组合。14.如实施方案13所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1236具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。15.如实施方案14所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1236。16.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-4处。17.如实施方案16所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。18.如实施方案17所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1211具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。19.如实施方案18所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1211。20.如实施方案16所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置23处的第二6/6对称内部环及其组合。21.如实施方案20所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1117具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。22.如实施方案21所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1117。23.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。24.如实施方案23所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置24处的第二6/6对称内部环及其组合。25.如实施方案24所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1008具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。26.如实施方案25所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1008。27.如实施方案23所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。28.如实施方案27所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。29.如实施方案28所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1054。30.如实施方案23所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。31.如实施方案30所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1103具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。32.如实施方案31所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1103。33.如实施方案23所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置43处的第二6/6对称内部环及其组合。34.如实施方案33所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1098具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。35.如实施方案34所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1098。36.如实施方案23所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。37.如实施方案36所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1104具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。38.如实施方案37所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1104。39.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。40.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。41.如实施方案40所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:977具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。42.如实施方案41所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:977。43.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置27处的第二6/6对称内部环及其组合。44.如实施方案43所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:906具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。45.如实施方案44所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:906。46.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。47.如实施方案46所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:937具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。48.如实施方案47所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:937。49.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。50.如实施方案49所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:934具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。51.如实施方案50所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:934。52.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。53.如实施方案52所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQID NO:1584具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。54.如实施方案53所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1584。55.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的5/5内部环、在相对于位置0的位置72处的5/5内部环及其任何组合。56.如实施方案55所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1585具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。57.如实施方案56所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1585。58.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的5/5内部环、在相对于位置0的位置68处的5/5内部环及其任何组合。59.如实施方案58所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1581具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。60.如实施方案59所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1581。61.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置65处的2/2对称凸起及其任何组合。62.如实施方案61所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1578具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。63.如实施方案62所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1578。64.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。65.如实施方案64所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。66.如实施方案65所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。67.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5内部环及其任何组合。68.如实施方案67所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。69.如实施方案68所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1573。70.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5内部环及其任何组合。71.如实施方案70所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。72.如实施方案71所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。73.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。74.如实施方案73所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。75.如实施方案74所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。76.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置58处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置69处的3/3对称凸起及其任何组合。77.如实施方案76所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1571具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。78.如实施方案77所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1571。79.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。80.如实施方案79所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1574具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。81.如实施方案80所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1574。82.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置57处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置67处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。83.如实施方案82所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1570具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。84.如实施方案83所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1570。85.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置53处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置69处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。86.如实施方案85所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1566具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。87.如实施方案86所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1566。88.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置59处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。89.如实施方案88所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1572具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。90.如实施方案89所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1572。91.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置74处的3/3对称凸起及其任何组合。92.如实施方案91所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1587具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。93.如实施方案92所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1587。94.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。95.如实施方案94所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。96.如实施方案95所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1588。97.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。98.如实施方案97所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1586具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。99.如实施方案98所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1586。100.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置67处的4/4对称凸起及其任何组合。101.如实施方案100所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1580具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。102.如实施方案101所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1580。103.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。104.如实施方案103所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:985具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。105.如实施方案104所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:985。106.如实施方案39所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。107.如实施方案106所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:976具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。108.如实施方案107所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:976。109.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-7处。110.如实施方案109所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置25处的第二6/6对称内部环及其组合。111.如实施方案110所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:769具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。112.如实施方案111所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:769。113.如实施方案109所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。114.如实施方案113所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:851具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。115.如实施方案114所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:851。116.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-8处。117.如实施方案116所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。118.如实施方案117所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:679具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。119.如实施方案118所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:679。120.如实施方案116所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。121.如实施方案120所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:727具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。122.如实施方案121所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:727。123.如实施方案116所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置24处的第二6/6对称内部环及其组合。124.如实施方案123所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:642具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。125.如实施方案124所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:642。126.如实施方案116所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。127.如实施方案126所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:737具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。128.如实施方案127所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:737。129.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。130.如实施方案129所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置22处的第二6/6对称内部环及其组合。131.如实施方案130所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:512具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。132.如实施方案131所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:512。133.如实施方案129所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。134.如实施方案133所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。135.如实施方案134所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:593。136.如实施方案129所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。137.如实施方案136所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:502具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。138.如实施方案137所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:502。139.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-10处。140.如实施方案139所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置43处的第二6/6对称内部环及其组合。141.如实施方案140所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:487具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。142.如实施方案141所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:487。143.如实施方案139所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置27处的第二6/6对称内部环及其组合。144.如实施方案143所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:408具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。145.如实施方案144所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:408。146.如实施方案139所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置24处的第二6/6对称内部环及其组合。147.如实施方案146所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:394具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。148.如实施方案147所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:394。149.如实施方案139所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。150.如实施方案146所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:482具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。151.如实施方案147所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:482。152.如实施方案139所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。153.如实施方案152所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:375具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。154.如实施方案153所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:375。155.如实施方案11所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-11处。156.如实施方案155所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。157.如实施方案156所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:365具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。158.如实施方案157所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:365。159.如实施方案155所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。160.如实施方案159所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:356具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。161.如实施方案160所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:356。162.如实施方案155所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置41处的第二6/6对称内部环及其组合。163.如实施方案162所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:352具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。164.如实施方案163所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:352。165.如实施方案155所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。166.如实施方案165所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:252具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。167.如实施方案166所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:252。168.如实施方案155所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置28处的第二6/6对称内部环及其组合。169.如实施方案168所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:291具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。170.如实施方案169所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:291。171.如实施方案6-9中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置3是靶腺苷，其中位置3是ATTAAA从5'端起的第二个A。172.如实施方案171所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：22、21、20、-2、-4、-5、-6、-7、-8、-9和-10。173.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置22处。174.如实施方案173所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置3处的A/C错配。175.如实施方案174所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:17具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。176.如实施方案175所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:17。177.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置21处。178.如实施方案177所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:15具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。179.如实施方案178所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:15。180.如实施方案177所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置5处的A/C错配。181.如实施方案180所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:14具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。182.如实施方案181所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:14。183.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置20处。184.如实施方案183所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置5处的A/C错配。185.如实施方案184所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:10具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。186.如实施方案185所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:10。187.如实施方案183所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置3处的A/C错配。188.如实施方案187所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:8具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。189.如实施方案188所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:8。190.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-2处。191.如实施方案190所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。192.如实施方案191所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1411具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。193.如实施方案192所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1411。194.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-4处。195.如实施方案194所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置22处的第二6/6对称内部环。196.如实施方案195所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1116具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。197.如实施方案196所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1116。198.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。199.如实施方案198所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置22处的第二6/6对称内部环及其组合。200.如实施方案199所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1002具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。201.如实施方案200所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1002。202.如实施方案198所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。203.如实施方案202所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。204.如实施方案203所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1054。205.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。206.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置24处的第二6/6对称内部环及其组合。207.如实施方案206所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:892具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。208.如实施方案207所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:892。209.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置21处的第二6/6对称内部环。210.如实施方案209所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:880具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。211.如实施方案210所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:880。212.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。213.如实施方案212所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:977具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。214.如实施方案213所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:977。215.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。216.如实施方案215所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:874具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。217.如实施方案216所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:874。218.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。219.如实施方案218所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:873具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。220.如实施方案219所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:873。221.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。222.如实施方案221所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。223.如实施方案222所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。224.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。225.如实施方案224所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。226.如实施方案225所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。227.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置74处的3/3对称凸起及其任何组合。228.如实施方案227所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1587具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。229.如实施方案228所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1587。230.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置58处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置69处的3/3对称凸起及其任何组合。231.如实施方案230所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1571具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。232.如实施方案231所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1571。233.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置72处的5/5对称内部环及其任何组合。234.如实施方案233所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1585具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。235.如实施方案234所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1585。236.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。237.如实施方案236所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。238.如实施方案237所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573。239.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。240.如实施方案239所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。241.如实施方案240所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588。242.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。243.如实施方案242所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。244.如实施方案243所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。245.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。246.如实施方案245所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1584具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。247.如实施方案246所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1584。248.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置59处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。249.如实施方案248所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1572具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。250.如实施方案249所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1572。251.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置57处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置67处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。252.如实施方案251所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1570具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。253.如实施方案252所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1570。254.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。255.如实施方案254所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1574具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。256.如实施方案255所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1574。257.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置68处的5/5对称内部环及其任何组合。258.如实施方案257所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1581具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。259.如实施方案258所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1581。260.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置53处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置69处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。261.如实施方案260所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1566具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。262.如实施方案261所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1566。263.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置65处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。264.如实施方案263所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1568具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。265.如实施方案264所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1568。266.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置67处的4/4对称凸起及其任何组合。267.如实施方案266所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1580具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。268.如实施方案267所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1580。269.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。270.如实施方案269所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:1586具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。271.如实施方案270所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1586。272.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置65处的2/2对称凸起及其任何组合。273.如实施方案272所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1578具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。274.如实施方案273所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1578。275.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置66处的3/3对称凸起及其任何组合。276.如实施方案275所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1579具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。277.如实施方案276所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1579。278.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置64处的5/5对称内部环及其任何组合。279.如实施方案278所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1577具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。280.如实施方案279所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1577。281.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置22处的第二6/6对称内部环及其组合。282.如实施方案281所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:884具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。283.如实施方案282所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:884。284.如实施方案205所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。285.如实施方案284所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:871具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。286.如实施方案285所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:871。287.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-7处。288.如实施方案287所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。289.如实施方案288所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:747具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。290.如实施方案289所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:747。291.如实施方案287所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置22处的第二6/6对称内部环及其组合。292.如实施方案291所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:757具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。293.如实施方案292所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:757。294.如实施方案287所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。295.如实施方案294所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:748具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。296.如实施方案295所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:748。297.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-8处。298.如实施方案297所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。299.如实施方案298所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:625具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。300.如实施方案299所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:625。301.如实施方案297所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置22处的第二6/6对称内部环及其组合。302.如实施方案301所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:635具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。303.如实施方案302所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:635。304.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。305.如实施方案304所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置20处的第二6/6对称内部环及其组合。306.如实施方案305所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:505具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。307.如实施方案306所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:505。308.如实施方案304所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环。309.如实施方案308所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:606具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。310.如实施方案309所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:606。311.如实施方案304所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。312.如实施方案311所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。313.如实施方案312所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:593。314.如实施方案172所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-10处。315.如实施方案314所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环。316.如实施方案315所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:486具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。317.如实施方案316所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:486。318.如实施方案314所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。319.如实施方案318所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:494具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。320.如实施方案319所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:494。321.如实施方案171所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一2/2对称凸起：-3、-5和-7。322.如实施方案321所述的组合物，其中第一2/2对称凸起在相对于位置0的位置-3处。323.如实施方案322所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置14处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置32处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置50处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置68处的2/2对称凸起及其任何组合。324.如实施方案323所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1552具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。325.如实施方案324所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1552。326.如实施方案321所述的组合物，其中第一2/2对称凸起在相对于位置0的位置-5处。327.如实施方案326所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置26处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置42处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置58处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置74处的2/2对称凸起及其任何组合。328.如实施方案327所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1545具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。329.如实施方案328所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1545。330.如实施方案321所述的组合物，其中第一2/2对称凸起在相对于位置0的位置-7处。331.如实施方案330所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置6处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置20处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置34处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置48处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置62处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置76处的2/2对称凸起及其任何组合。332.如实施方案331所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1538具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。333.如实施方案332所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1538。334.如实施方案171所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：在相对于ATTAAA的位置0的位置-6处的第一3/3对称凸起。335.如实施方案334所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置7处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置22处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置37处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置52处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置67处的3/3对称凸起及其任何组合。336.如实施方案335所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1539具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。337.如实施方案336所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1539。338.如实施方案6-9中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置4是靶腺苷，其中位置4是ATTAAA从5'端起的第三个A。339.如实施方案338所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：33、-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-11和-12。340.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置33处。341.如实施方案340所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置3处的A/C错配。342.如实施方案341所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:72具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。343.如实施方案342所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:72。344.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-1处。345.如实施方案344所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。346.如实施方案345所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1463具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。347.如实施方案346所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1463。348.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-2处。349.如实施方案348所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环。350.如实施方案349所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQID NO:1374具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。351.如实施方案350所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1374。352.如实施方案348所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置37处的第二6/6对称内部环及其组合。353.如实施方案352所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1391具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。354.如实施方案353所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1391。355.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-3处。356.如实施方案355所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。357.如实施方案356所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1293具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。358.如实施方案357所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1293。359.如实施方案355所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。360.如实施方案359所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1294具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。361.如实施方案360所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1294。362.如实施方案355所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环。363.如实施方案362所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1296具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。364.如实施方案363所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1296。365.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-4处。366.如实施方案365所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。367.如实施方案366所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1183具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。368.如实施方案367所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1183。369.如实施方案365所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置38处的第二6/6对称内部环及其组合。370.如实施方案369所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1193具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。371.如实施方案370所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1193。372.如实施方案365所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。373.如实施方案372所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1212具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。374.如实施方案373所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1212。375.如实施方案365所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。376.如实施方案375所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1168具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。377.如实施方案376所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1168。378.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。379.如实施方案378所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。380.如实施方案379所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1066具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。381.如实施方案380所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1066。382.如实施方案378所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。383.如实施方案382所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1051具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。384.如实施方案383所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1051。385.如实施方案378所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置34处的第二6/6对称内部环。386.如实施方案385所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1059具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。387.如实施方案386所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1059。388.如实施方案378所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。389.如实施方案388所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。390.如实施方案389所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1054。391.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。392.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。393.如实施方案392所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:967具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。394.如实施方案393所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:967。395.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。396.如实施方案395所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:930具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。397.如实施方案396所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:930。398.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。399.如实施方案398所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:934具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。400.如实施方案399所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:934。401.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置35处的第二6/6对称内部环及其组合。402.如实施方案401所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:944具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。403.如实施方案402所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:944。404.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。405.如实施方案404所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。406.如实施方案405所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573。407.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。408.如实施方案407所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。409.如实施方案408所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。410.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。411.如实施方案410所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。412.如实施方案411所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。413.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。414.如实施方案413所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。415.如实施方案414所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。416.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置57处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置67处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。417.如实施方案416所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1570具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。418.如实施方案417所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1570。419.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置53处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置69处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。420.如实施方案419所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQID NO:1566具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。421.如实施方案420所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1566。422.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置59处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。423.如实施方案422所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1572具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。424.如实施方案423所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1572。425.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置74处的3/3对称凸起及其任何组合。426.如实施方案425所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1587具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。427.如实施方案426所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1587。428.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置58处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置69处的3/3对称凸起及其任何组合。429.如实施方案428所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1571具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。430.如实施方案429所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1571。431.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。432.如实施方案431所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1574具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。433.如实施方案432所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1574。434.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。435.如实施方案434所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1584具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。436.如实施方案435所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1584。437.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。438.如实施方案437所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。439.如实施方案438所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1588。440.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。441.如实施方案440所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1586具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。442.如实施方案441所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1586。443.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置72处的5/5对称内部环及其任何组合。444.如实施方案443所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQID NO:1585具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。445.如实施方案444所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1585。446.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置68处的5/5对称内部环及其任何组合。447.如实施方案446所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1581具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。448.如实施方案447所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1581。449.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置65处的2/2对称凸起及其任何组合。450.如实施方案449所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1578具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。451.如实施方案450所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1578。452.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置69处的2/2对称凸起及其任何组合。453.如实施方案452所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1582具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。454.如实施方案453所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1582。455.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置67处的4/4对称凸起及其任何组合。456.如实施方案455所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1580具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。457.如实施方案456所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1580。458.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置64处的5/5对称内部环及其任何组合。459.如实施方案458所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQID NO:1577具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。460.如实施方案459所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1577。461.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置65处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。462.如实施方案461所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1568具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。463.如实施方案462所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1568。464.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置66处的3/3对称凸起及其任何组合。465.如实施方案464所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1579具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。466.如实施方案465所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1579。467.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置70处的3/3对称凸起及其任何组合。468.如实施方案467所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1583具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。469.如实施方案468所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1583。470.如实施方案391所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置63处的4/4对称凸起及其任何组合。471.如实施方案470所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1576具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。472.如实施方案471所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1576。473.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-7处。474.如实施方案473所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置34处的第二6/6对称内部环及其组合。475.如实施方案474所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:815具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。476.如实施方案475所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:815。477.如实施方案473所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。478.如实施方案477所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:806具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。479.如实施方案478所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:806。480.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-8处。481.如实施方案480所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置35处的第二6/6对称内部环及其组合。482.如实施方案481所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:694具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。483.如实施方案482所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:694。484.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。485.如实施方案484所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。486.如实施方案485所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。487.如实施方案486所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:593。488.如实施方案484所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置34处的第二6/6对称内部环及其组合。489.如实施方案488所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:566具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。490.如实施方案489所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:566。491.如实施方案484所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。492.如实施方案491所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:594具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。493.如实施方案492所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:594。494.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-11处。495.如实施方案494所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。496.如实施方案495所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:358具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。497.如实施方案496所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:358。498.如实施方案339所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-12处。499.如实施方案498所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。500.如实施方案499所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:195具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。501.如实施方案500所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:195。502.如实施方案6-9中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置5是靶腺苷，其中位置5是ATTAAA从5'端起的第四个A。503.如实施方案340所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：33、23、-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-10和-12。504.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置33处。505.如实施方案504所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置3处的A/C错配。506.如实施方案505所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:72具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。507.如实施方案506所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:72。508.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置23处。509.如实施方案508所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置5处的A/C错配。510.如实施方案509所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:24具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。511.如实施方案510所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:24。512.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-1处。513.如实施方案512所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。514.如实施方案513所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1463具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。515.如实施方案514所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1463。516.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-2处。517.如实施方案516所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。518.如实施方案517所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1411具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。519.如实施方案518所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1411。520.如实施方案516所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置37处的第二6/6对称内部环及其组合。521.如实施方案520所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1391具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。522.如实施方案521所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1391。523.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-3处。524.如实施方案523所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。525.如实施方案524所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1293具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。526.如实施方案525所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1293。527.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-4处。528.如实施方案527所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。529.如实施方案528所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1185具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。530.如实施方案529所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1185。531.如实施方案527所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。532.如实施方案531所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1163具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。533.如实施方案532所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1163。534.如实施方案527所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。535.如实施方案534所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1183具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。536.如实施方案535所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1183。537.如实施方案527所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。538.如实施方案537所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1212具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。539.如实施方案538所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1212。540.如实施方案527所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。541.如实施方案540所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1168具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。542.如实施方案541所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1168。543.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。544.如实施方案543所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。545.如实施方案544所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1066具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。546.如实施方案545所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1066。547.如实施方案543所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置34处的第二6/6对称内部环及其组合。548.如实施方案547所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1058具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。549.如实施方案548所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1058。550.如实施方案543所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。551.如实施方案550所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1051具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。552.如实施方案551所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1051。553.如实施方案543所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。554.如实施方案553所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。555.如实施方案554所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1054。556.如实施方案543所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置44处的第二6/6对称内部环及其组合。557.如实施方案556所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1104具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。558.如实施方案557所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1104。559.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。560.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。561.如实施方案560所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:930具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。562.如实施方案561所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:930。563.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置35处的第二6/6对称内部环及其组合。564.如实施方案563所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:944具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。565.如实施方案564所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:944。566.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。567.如实施方案566所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:935具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。568.如实施方案567所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:935。569.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。570.如实施方案569所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。571.如实施方案570所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1575。572.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。573.如实施方案572所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。574.如实施方案573所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。575.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置58处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置69处的3/3对称凸起及其任何组合。576.如实施方案575所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1571具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。577.如实施方案576所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1571。578.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置74处的3/3对称凸起及其任何组合。579.如实施方案578所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1587具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。580.如实施方案579所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1587。581.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置57处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置67处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。582.如实施方案581所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:1570具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。583.如实施方案582所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1570。584.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置53处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置69处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置77处的2/2对称凸起及其任何组合。585.如实施方案584所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1566具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。586.如实施方案585所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1566。587.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置61处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。588.如实施方案587所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1574具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。589.如实施方案588所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1574。590.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置65处的2/2对称凸起及其任何组合。591.如实施方案590所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1578具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。592.如实施方案591所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1578。593.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置73处的2/2对称凸起及其任何组合。594.如实施方案593所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1586具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。595.如实施方案594所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1586。596.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置69处的2/2对称凸起及其任何组合。597.如实施方案596所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:1582具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。598.如实施方案597所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1582。599.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。600.如实施方案599所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。601.如实施方案600所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1573。602.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置68处的5/5对称内部环及其任何组合。603.如实施方案602所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1581具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。604.如实施方案603所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1581。605.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。606.如实施方案605所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。607.如实施方案606所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。608.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置72处的5/5对称内部环及其任何组合。609.如实施方案608所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1585具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。610.如实施方案609所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1585。611.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置67处的4/4对称凸起及其任何组合。612.如实施方案611所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1580具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。613.如实施方案612所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1580。614.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。615.如实施方案614所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。616.如实施方案615所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588。617.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。618.如实施方案617所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1584具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。619.如实施方案618所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1584。620.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置63处的4/4对称凸起及其任何组合。621.如实施方案620所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1576具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。622.如实施方案621所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1576。623.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置59处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置71处的4/4对称凸起及其任何组合。624.如实施方案623所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ IDNO:1572具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。625.如实施方案624所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1572。626.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置65处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。627.如实施方案626所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1568具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。628.如实施方案627所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1568。629.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置64处的5/5对称内部环及其任何组合。630.如实施方案629所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1577具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。631.如实施方案630所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1577。632.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置51处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置66处的3/3对称凸起及其任何组合。633.如实施方案632所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1579具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。634.如实施方案633所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1579。635.如实施方案559所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置53处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置70处的3/3对称凸起及其任何组合。636.如实施方案635所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:1583具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。637.如实施方案636所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1583。638.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-7处。639.如实施方案638所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。640.如实施方案639所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:810具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。641.如实施方案640所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:810。642.如实施方案638所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置34处的第二6/6对称内部环及其组合。643.如实施方案642所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:815具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。644.如实施方案643所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:815。645.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-8处。646.如实施方案645所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。647.如实施方案646所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:680具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。648.如实施方案647所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:680。649.如实施方案645所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置35处的第二6/6对称内部环及其组合。650.如实施方案649所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:694具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。651.如实施方案650所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:694。652.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。653.如实施方案652所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置34处的第二6/6对称内部环及其组合。654.如实施方案653所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:566具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。655.如实施方案654所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:566。656.如实施方案652所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。657.如实施方案656所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:594具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。658.如实施方案657所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:594。659.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-10处。660.如实施方案659所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置23处的第二6/6对称内部环及其组合。661.如实施方案660所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:392具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。662.如实施方案661所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:392。663.如实施方案503所述的组合物，其中第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-12处。664.如实施方案663所述的组合物，其中一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置5处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。665.如实施方案664所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:195具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。666.如实施方案665所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:195。667.如实施方案10-666中任一项所述的组合物，其还包含ATTAAA的任何A处的编辑。668.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。669.如实施方案668所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:8的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。670.如实施方案668-669中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:8的序列。671.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。672.如实施方案671所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:10的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。673.如实施方案671-672中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:10的序列。674.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。675.如实施方案674所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:14的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。676.如实施方案674-675中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:14的序列。677.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。678.如实施方案677所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:15的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。679.如实施方案677-678中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:15的序列。680.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。681.如实施方案680所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:17的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。682.如实施方案680-681中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:17的序列。683.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。684.如实施方案683所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:24的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。685.如实施方案683-684中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:24的序列。686.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。687.如实施方案686所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:72的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。688.如实施方案686-687中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:72的序列。689.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。690.如实施方案689所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:195的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。691.如实施方案689-690中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:195的序列。692.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。693.如实施方案692所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:252的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。694.如实施方案692-693中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:252的序列。695.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。696.如实施方案695所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:291的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。697.如实施方案695-696中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:291的序列。698.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。699.如实施方案698所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:352的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。700.如实施方案698-699中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:352的序列。701.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。702.如实施方案701所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:356的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。703.如实施方案701-702中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:356的序列。704.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。705.如实施方案704所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:358的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。706.如实施方案704-705中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:358的序列。707.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。708.如实施方案707所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:365的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。709.如实施方案707-708中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:365的序列。710.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。711.如实施方案710所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQID NO:375的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。712.如实施方案710-711中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:375的序列。713.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。714.如实施方案713所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:392的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。715.如实施方案713-714中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:392的序列。716.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。717.如实施方案716所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:394的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。718.如实施方案716-717中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:394的序列。719.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。720.如实施方案719所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:408的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。721.如实施方案719-720中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:408的序列。722.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。723.如实施方案722所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:482的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。724.如实施方案722-723中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:482的序列。725.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。726.如实施方案725所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:486的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。727.如实施方案725-726中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:486的序列。728.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。729.如实施方案728所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:487的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。730.如实施方案728-729中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:487的序列。731.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。732.如实施方案731所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:494的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。733.如实施方案731-732中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:494的序列。734.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。735.如实施方案734所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:502的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。736.如实施方案734-735中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:502的序列。737.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。738.如实施方案737所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:505的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。739.如实施方案737-738中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:505的序列。740.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。741.如实施方案740所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQID NO:512的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。742.如实施方案740-741中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:512的序列。743.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。744.如实施方案743所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:566的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。745.如实施方案743-744中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:566的序列。746.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。747.如实施方案746所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:593的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。748.如实施方案746-747中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:593的序列。749.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。750.如实施方案749所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:594的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。751.如实施方案749-750中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:594的序列。752.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。753.如实施方案752所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:606的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。754.如实施方案752-753中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:606的序列。755.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。756.如实施方案755所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:625的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。757.如实施方案755-756中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:625的序列。758.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。759.如实施方案758所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:635的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。760.如实施方案758-759中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:635的序列。761.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。762.如实施方案761所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:642的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。763.如实施方案761-762中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:642的序列。764.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。765.如实施方案764所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:679的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。766.如实施方案764-765中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:679的序列。767.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。768.如实施方案767所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:680的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。769.如实施方案767-768中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:680的序列。770.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。771.如实施方案770所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQID NO:694的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。772.如实施方案770-771中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:694的序列。773.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。774.如实施方案773所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:727的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。775.如实施方案773-774中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:727的序列。776.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。777.如实施方案776所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:737的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。778.如实施方案776-777中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:737的序列。779.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。780.如实施方案779所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:747的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。781.如实施方案779-780中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:747的序列。782.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。783.如实施方案782所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:748的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。784.如实施方案782-783中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:748的序列。785.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。786.如实施方案785所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:757的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。787.如实施方案785-786中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:757的序列。788.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。789.如实施方案788所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:769的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。790.如实施方案788-789中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:769的序列。791.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。792.如实施方案791所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:806的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。793.如实施方案791-792中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:806的序列。794.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。795.如实施方案794所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:810的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。796.如实施方案794-795中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:810的序列。797.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。798.如实施方案797所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:815的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。799.如实施方案797-798中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:815的序列。800.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。801.如实施方案800所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQID NO:851的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。802.如实施方案800-801中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:851的序列。803.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。804.如实施方案803所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:871的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。805.如实施方案803-804中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:871的序列。806.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。807.如实施方案806所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:873的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。808.如实施方案806-807中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:873的序列。809.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。810.如实施方案809所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:874的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。811.如实施方案809-810中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:874的序列。812.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。813.如实施方案812所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:880的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。814.如实施方案812-813中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:880的序列。815.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。816.如实施方案815所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:884的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。817.如实施方案815-816中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:884的序列。818.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。819.如实施方案818所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:892的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。820.如实施方案818-819中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:892的序列。821.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。822.如实施方案821所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:906的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。823.如实施方案821-822中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:906的序列。824.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。825.如实施方案824所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:930的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。826.如实施方案824-825中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:930的序列。827.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。828.如实施方案827所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:934的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。829.如实施方案827-828中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:934的序列。830.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。831.如实施方案830所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQID NO:935的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。832.如实施方案830-831中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:935的序列。833.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。834.如实施方案833所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:937的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。835.如实施方案833-834中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:937的序列。836.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。837.如实施方案836所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:944的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。838.如实施方案836-837中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:944的序列。839.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。840.如实施方案839所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:967的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。841.如实施方案839-840中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:967的序列。842.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。843.如实施方案842所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:976的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。844.如实施方案842-843中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:976的序列。845.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。846.如实施方案845所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:977的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。847.如实施方案845-846中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:977的序列。848.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。849.如实施方案848所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:985的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。850.如实施方案848-849中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:985的序列。851.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。852.如实施方案851所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1002的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。853.如实施方案851-852中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1002的序列。854.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。855.如实施方案854所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1008的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。856.如实施方案854-855中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1008的序列。857.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。858.如实施方案857所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1051的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。859.如实施方案857-858中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1051的序列。860.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。861.如实施方案860所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1054的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。862.如实施方案860-861中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1054的序列。863.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。864.如实施方案863所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1058的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。865.如实施方案863-864中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1058的序列。866.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。867.如实施方案866所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1059的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。868.如实施方案866-867中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1059的序列。869.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。870.如实施方案869所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1066的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。871.如实施方案869-870中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1066的序列。872.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。873.如实施方案872所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1098的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。874.如实施方案872-873中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1098的序列。875.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。876.如实施方案875所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1103的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。877.如实施方案875-876中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1103的序列。878.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。879.如实施方案878所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1104的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。880.如实施方案878-879中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1104的序列。881.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。882.如实施方案881所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1116的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。883.如实施方案881-882中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1116的序列。884.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。885.如实施方案884所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1117的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。886.如实施方案884-885中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1117的序列。887.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。888.如实施方案887所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1163的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。889.如实施方案887-888中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1163的序列。890.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。891.如实施方案890所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1168的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。892.如实施方案890-891中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1168的序列。893.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。894.如实施方案893所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1183的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。895.如实施方案893-894中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1183的序列。896.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。897.如实施方案896所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1185的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。898.如实施方案896-897中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1185的序列。899.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。900.如实施方案899所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1193的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。901.如实施方案899-900中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1193的序列。902.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。903.如实施方案902所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1211的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。904.如实施方案902-903中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1211的序列。905.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。906.如实施方案905所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1212的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。907.如实施方案905-906中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1212的序列。908.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。909.如实施方案908所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1236的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。910.如实施方案908-909中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1236的序列。911.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。912.如实施方案911所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1293的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。913.如实施方案911-912中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1293的序列。914.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。915.如实施方案914所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1294的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。916.如实施方案914-915中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1294的序列。917.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。918.如实施方案917所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1296的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。919.如实施方案917-918中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1296的序列。920.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。921.如实施方案920所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1374的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。922.如实施方案920-921中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1374的序列。923.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。924.如实施方案923所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1391的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。925.如实施方案923-924中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1391的序列。926.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。927.如实施方案926所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1411的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。928.如实施方案926-927中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1411的序列。929.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。930.如实施方案929所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1463的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。931.如实施方案929-930中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1463的序列。932.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。933.如实施方案932所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1538的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。934.如实施方案932-933中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1538的序列。935.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。936.如实施方案935所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1539的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。937.如实施方案935-936中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1539的序列。938.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。939.如实施方案938所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1545的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。940.如实施方案938-939中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1545的序列。941.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。942.如实施方案941所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1552的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。943.如实施方案941-942中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1552的序列。944.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。945.如实施方案944所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1566的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。946.如实施方案944-945中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1566的序列。947.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。948.如实施方案947所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1567的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。949.如实施方案947-948中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1567的序列。950.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。951.如实施方案950所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1568的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。952.如实施方案950-951中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1568的序列。953.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。954.如实施方案953所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1569的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。955.如实施方案953-954中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1569的序列。956.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。957.如实施方案956所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1570的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。958.如实施方案956-957中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1570的序列。959.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。960.如实施方案959所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1571的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。961.如实施方案959-960中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1571的序列。962.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。963.如实施方案962所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1572的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。964.如实施方案962-963中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1572的序列。965.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。966.如实施方案965所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1573的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。967.如实施方案965-966中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1573的序列。968.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。969.如实施方案968所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1574的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。970.如实施方案968-969中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1574的序列。971.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。972.如实施方案971所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1575的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。973.如实施方案971-972中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1575的序列。974.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。975.如实施方案974所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1576的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。976.如实施方案974-975中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1576的序列。977.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。978.如实施方案977所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1577的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。979.如实施方案977-978中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1577的序列。980.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。981.如实施方案980所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1578的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。982.如实施方案980-981中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1578的序列。983.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。984.如实施方案983所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1579的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。985.如实施方案983-984中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1579的序列。986.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。987.如实施方案986所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1580的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。988.如实施方案986-987中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1580的序列。989.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。990.如实施方案989所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1581的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。991.如实施方案989-990中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1581的序列。992.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。993.如实施方案992所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1582的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。994.如实施方案992-993中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ IDNO:1582的序列。995.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。996.如实施方案995所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1583的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。997.如实施方案995-996中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1583的序列。998.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。999.如实施方案998所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1584的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。1000.如实施方案998-999中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1584的序列。1001.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。1002.如实施方案1001所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1585的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。1003.如实施方案1001-1002中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1585的序列。1004.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。1005.如实施方案1004所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1586的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。1006.如实施方案1004-1005中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1586的序列。1007.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。1008.如实施方案1007所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ IDNO:1587的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。1009.如实施方案1007-1008中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1587的序列。1010.如实施方案7所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。1011.如实施方案1010所述的组合物，其中工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1588的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。1012.如实施方案1010-1011中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA具有SEQ ID NO:1588的序列。1013.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括：a)第一6/6对称内部环，以及b)至少一种选自由以下组成的组的其他结构特征：第二6/6对称内部环、5/5对称内部环、4/4对称凸起、3/3对称凸起和2/2对称凸起。1014.如实施方案1013所述的组合物，其中指导-靶RNA支架还包含A/C错配，其中A/C错配的胞嘧啶存在于工程化指导RNA中与一个或多个靶腺苷相对；并且其中一种或多种结构特征包括：a)相对于A/C错配位于位置-4至-8的第一6/6对称内部环；b)相对于A/C错配位于位置+31至+35的第二6/6对称内部环。1015.如实施方案1014所述的组合物，其中指导-靶RNA支架还包含A/C错配，其中A/C错配的胞嘧啶存在于工程化指导RNA中与一个或多个靶腺苷相对；并且其中一种或多种结构特征包括：a)相对于A/C错配在位置-6处的第一6/6对称内部环；b)相对于A/C错配在位置+33处的第二6/6对称内部环。1016.如实施方案1014或1015所述的组合物，其中第一6/6对称内部环包含工程化指导RNA侧的序列GGAACU和靶RNA侧的序列UUCAGA。1017.如实施方案1014或1015所述的组合物，其中第二6/6对称内部环包含工程化指导RNA侧的序列CUGACC和靶RNA侧的序列AGAUUU。1018.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括第一6/6对称内部环和第二6/6对称内部环，并且其中靶RNA中的每个A与工程化指导RNA中的U碱基配对。1019.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA包含以下中的任一个的序列：SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:1575、SEQ ID NO:1577、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:1587或SEQ ID NO:1588。1020.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA包含以下中的任一个的序列：SEQ IDNO:1575、SEQ ID NO:593、SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:934、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:851、SEQ ID NO:1211、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:937、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:1117、SEQ ID NO:906、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1104、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:512、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:977、SEQ ID NO:642、SEQ ID NO:1236、SEQ ID NO:1584、SEQID NO:252、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:482、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1103、SEQ ID NO:502、SEQ ID NO:769、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:1008、SEQ ID NO:737、SEQ ID NO:985、SEQID NO:679、SEQ ID NO:727、SEQ ID NO:1578、SEQ ID NO:365、SEQ ID NO:1580、SEQ IDNO:487、SEQ ID NO:1098或SEQ ID NO:976。1021.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575的序列。1022.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:593的序列。1023.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573的序列。1024.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:934的序列。1025.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569的序列。1026.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1567的序列。1027.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:851的序列。1028.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1211的序列。1029.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1571的序列。1030.如实施方案1020所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:937的序列。1031.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA包含以下中的任一个的序列：SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:1545、SEQ ID NO:1575、SEQ IDNO:1569、SEQ ID NO:1584、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1570、SEQ IDNO:1587、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:625、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:874、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:757、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1538、SEQ ID NO:8、SEQID NO:1002、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:486、SEQ ID NO:1552、SEQ ID NO:505、SEQ IDNO:635、SEQ ID NO:606、SEQ ID NO:884、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:880、SEQ ID NO:1411、SEQ ID NO:1568、SEQ ID NO:871、SEQ ID NO:1580、SEQ ID NO:1539、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:892、SEQ ID NO:1116、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:593、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:977、SEQ ID NO:1578、SEQ ID NO:1579、SEQ ID NO:747、SEQ ID NO:1577、748、SEQ ID NO:873或SEQ ID NO:494。1032.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573的序列。1033.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588的序列。1034.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1545的序列。1035.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575的序列。1036.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569的序列。1037.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1584的序列。1038.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1572的序列。1039.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567的序列。1040.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:1570的序列。1041.如实施方案1031所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ IDNO:1587的序列。1042.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA包含以下中的任一个的序列：SEQ ID NO:1575、SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:1584、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1578、SEQ ID NO:1580、SEQ ID NO:934、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:1582、SEQ ID NO:1066、SEQ ID NO:1183、SEQ ID NO:1577、SEQ ID NO:967、SEQ ID NO:1568、SEQ ID NO:930、SEQ ID NO:566、SEQ ID NO:1463、SEQID NO:1294、SEQ ID NO:1293、SEQ ID NO:1391、SEQ ID NO:1579、SEQ ID NO:1583、SEQ IDNO:944、SEQ ID NO:815、SEQ ID NO:1168、SEQ ID NO:593、SEQ ID NO:594、SEQ ID NO:694、SEQ ID NO:1576、SEQ ID NO:1193、SEQ ID NO:1051、SEQ ID NO:1212、SEQ ID NO:806、SEQ ID NO:1059、SEQ ID NO:1374、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:或SEQID NO:1296。1043.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575的序列。1044.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573的序列。1045.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567的序列。1046.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569的序列。1047.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1570的序列。1048.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1566的序列。1049.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1572的序列。1050.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1587的序列。1051.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1571的序列。1052.如实施方案1042所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1574的序列。1053.如实施方案6-8中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA包含以下中的任一个的序列：SEQ ID NO:1575、SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:1584、SEQID NO:1581、SEQ ID NO:1578、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:1582、SEQ ID NO:1580、SEQ IDNO:1183、SEQ ID NO:1568、SEQ ID NO:1066、SEQ ID NO:1391、SEQ ID NO:1168、SEQ IDNO:1293、SEQ ID NO:1577、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:566、SEQ ID NO:1579、SEQ ID NO:930、SEQ ID NO:694、SEQ ID NO:944、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:1583、SEQ ID NO:815、SEQ ID NO:1576、SEQ ID NO:1051、SEQ ID NO:1411、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:1163、SEQID NO:935、SEQ ID NO:680、SEQ ID NO:1212、SEQ ID NO:594、SEQ ID NO:1185、SEQ IDNO:1463、SEQ ID NO:1058、SEQ ID NO:810、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:或SEQ ID NO:1104。1054.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575的序列。1055.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573的序列。1056.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569的序列。1057.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1574的序列。1058.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1570的序列。1059.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1572的序列。1060.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567的序列。1061.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1587的序列。1062.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1566的序列。1063.如实施方案1053所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1571的序列。1064.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括凸起，其中凸起是对称凸起。1065.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括凸起，其中凸起是不对称凸起。1066.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括内部环，其中内部环是对称内部环。1067.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括内部环，其中内部环是不对称内部环。1068.如实施方案1所述的组合物，其中指导-靶RNA支架还包含摆动碱基对。1069.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括发夹，其中发夹是募集发夹或非募集发夹。1070.如实施方案1所述的组合物，其中一种或多种结构特征包括由工程化指导RNA中的碱基与DUX4靶RNA中的G、C或U形成的错配。1071.如实施方案1所述的组合物，其中RNA编辑实体包括ADAR1、ADAR2、ADAR3或其任何组合。1072.如实施方案1所述的组合物，其中一个或多个靶腺苷的RNA编辑包括超编辑。1073.如实施方案1072所述的组合物，其中超编辑包括编辑DUX4靶RNA的polyA信号序列中的多于一个A。1074.如实施方案1所述的组合物，其中工程化指导RNA的内部环包含任何位置顺序的任何核苷酸，其中任何位置顺序的核苷酸都不与其在DUX 4靶RNA中的位置对应物互补。1075.如实施方案1-1074中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸是环状的。1076.如实施方案1-1075中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA或编码工程化指导RNA的工程化多核苷酸包含U7发夹序列、SmOPT序列或其组合，并且任选地其中U7发夹序列包含SEQ ID NO 1591或1593并且其中SmOPT序列包含SEQ ID NO:1595。1077.如实施方案1所述的组合物，其中DUX4靶RNA包含DUX4的前mRNA转录本。1078.如实施方案1077所述的组合物，其中至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。1079.如实施方案1078所述的组合物，其中至少80％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。1080.如实施方案1-1079中任一项所述的组合物，其中一个或多个腺苷的编辑促进mRNA敲低。1081.如实施方案1080所述的组合物，其中mRNA敲低包括DUX4mRNA的敲低。1082.如实施方案1080或1081所述的组合物，其中mRNA敲低包括DUX4下游的蛋白质的mRNA敲低，其中DUX4下游的蛋白质包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2或其任何组合。1083.如实施方案1080-1082中任一项所述的方法，其中mRNA敲低包括与RNA编辑之前的mRNA水平相比，RNA编辑之后的mRNA水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。1084.如实施方案1083所述的组合物，其中与RNA编辑之前的mRNA水平相比，mRNA敲低是所述mRNA水平的至少50％。1085.如实施方案1083所述的组合物，其中与RNA编辑之前的mRNA水平相比，mRNA敲低是所述mRNA水平的至少70％。1086.如实施方案1-1085中任一项所述的组合物，其中一个或多个腺苷的编辑促进蛋白质敲低。1087.如实施方案1086所述的组合物，其中蛋白质敲低包括DUX4的敲低。1088.如实施方案1086或1087所述的组合物，其中蛋白质敲低包括DUX4下游的蛋白质的敲低，其中DUX4下游的蛋白质包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2或其任何组合。1089.如实施方案1086-1088中任一项所述的组合物，其中蛋白质敲低包括与RNA编辑之前的蛋白质水平相比，RNA编辑之后的蛋白质水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。1090.如实施方案1086-1088中任一项所述的组合物，其中蛋白质敲低包括与包含非功能性ADAR基因的细胞相比，ADAR表达细胞中的蛋白质水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。1091.如实施方案1086-1090中任一项所述的组合物，其中蛋白质敲低包括ADAR依赖性蛋白质敲低。1092.如实施方案1091所述的组合物，其中ADAR依赖性蛋白质敲低包括与RNA编辑之前的蛋白质水平相比，蛋白质水平降低至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。1093.如实施方案1-1092中任一项所述的组合物，其中工程化指导RNA是体外转录(IVT)工程化指导RNA。1094.如实施方案1-1092中任一项所述的组合物，其包含工程化多核苷酸。1095.如实施方案1094所述的组合物，其中工程化多核苷酸包含在载体中或载体上。1096.如实施方案1095所述的组合物，其中载体是病毒载体，并且其中工程化多核苷酸被衣壳化在病毒载体中。1097.如实施方案1096所述的组合物，其中病毒载体是腺相关病毒(AAV)载体或其衍生物。1098.如实施方案1097所述的组合物，其中AAV载体是AAV1血清型、AAV2血清型、AAV3血清型、AAV4血清型、AAV5血清型、AAV6血清型、AAV7血清型、AAV8血清型、AAV9血清型、AAV10血清型、AAV11血清型、AAV12血清型、AAV13血清型、AAV14血清型、AAV15血清型、AAV16血清型、AAV.rh8血清型、AAV.rh10血清型、AAV.rh20血清型、AAV.rh39血清型、AAV.Rh74血清型、AAV.RHM4-1血清型、AAV.hu37血清型、AAV.Anc80血清型、AAV.Anc80L65血清型、AAV.7m8血清型、AAV.PHP.B血清型、AAV2.5血清型、AAV2tYF血清型、AAV3B血清型、AAV.LK03血清型、AAV.HSC1血清型、AAV.HSC2血清型、AAV.HSC3血清型、AAV.HSC4血清型、AAV.HSC5血清型、AAV.HSC6血清型、AAV.HSC7血清型、AAV.HSC8血清型、AAV.HSC9血清型、AAV.HSC10血清型、AAV.HSC11血清型、AAV.HSC12血清型、AAV.HSC13血清型、AAV.HSC14血清型、AAV.HSC15血清型、AAV.HSC16血清型和AAVhu68血清型、任何这些血清型的衍生物或其任何组合。1099.如实施方案1098所述的组合物，其中AAV载体是AAV5血清型、AAV6血清型、AAV8血清型或AAV9血清型。1100.如实施方案1097-1099中任一项所述的组合物，其中AAV载体是重组AAV(rAAV)载体、杂交AAV载体、嵌合AAV载体、自身互补AAV(scAAV)载体或其任何组合。1101.如实施方案1095所述的组合物，其中载体是非病毒载体。1102.如实施方案1101所述的组合物，其中非病毒载体是脂质纳米颗粒(LNP)、脂质体或聚合物纳米颗粒。1103.如实施方案1094所述的组合物，其中工程化多核苷酸是编码工程化指导RNA的DNA多核苷酸。1104.如实施方案1所述的组合物，其中工程化指导RNA与SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中的任一个具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。1105.如实施方案1所述的组合物，其中工程化指导RNA包含SEQID NO:2-SEQ ID NO:1589中任一个的序列。1106.一种药物组合物，其包含：a)如实施方案1-1105中任一项所述的组合物；和b)药学上可接受的赋形剂、载剂或稀释剂。1107.一种治疗有需要的受试者的疾病或疾患的方法，所述方法包括向受试者施用治疗有效量的如实施方案1-1105中任一项所述的组合物或如实施方案1106所述的药物组合物。1108.如实施方案1107所述的方法，其中疾病或疾患包括面肩肱型肌营养不良症。1109.如实施方案1108所述的方法，其中FSHD包括I型FSHD。1110.如实施方案1108所述的方法，其中FSHD包括II型FSHD。1111.如实施方案1107-1110中任一项所述的方法，其中施用包括肠胃外施用、静脉内施用、皮下施用、鞘内施用、腹膜内施用、肌内施用、血管内施用、输注施用、局部施用、口服施用、吸入施用、十二指肠内施用、直肠施用或其组合。1112.如实施方案1111所述的方法，其包括施用，其中施用是口服施用。1113.如实施方案1111所述的方法，其包括施用，其中施用是注射形式。1114.如实施方案1107-1113中任一项所述的方法，其中施用包括全身施用。1115.一种编辑DUX4 RNA的方法，所述方法包括使DUX4 RNA与如实施方案1-1105所述的组合物中的任一种和RNA编辑实体接触，从而编辑DUX4 RNA。1116.如实施方案1115所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的任何A位置处进行编辑。1117.如实施方案1116所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的任何A位置处约44％至约91％的编辑，如在体外测定中所测量的。1118.如实施方案1116所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置0处进行编辑。1119.如实施方案1118所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置0处的A的约50％至约66％的编辑，如在体外测定中所测量的。1120.如实施方案1118或1119所述的方法，其中组合物中的工程化指导RNA包含选自由以下组成的组的序列：SEQ ID NO:1575、SEQ ID NO:593、SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:934、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:851、SEQ ID NO:1211、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:937、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:1117、SEQ ID NO:906、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1104、SEQ ID NO:352、SEQ ID NO:512、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:375、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:977、SEQ ID NO:642、SEQ ID NO:1236、SEQID NO:1584、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:394、SEQ ID NO:482、SEQ ID NO:1585、SEQ IDNO:291、SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1103、SEQ ID NO:502、SEQ ID NO:769、SEQ ID NO:408、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:1008、SEQ ID NO:737、SEQ ID NO:985、SEQ ID NO:679、SEQ ID NO:727、SEQ ID NO:1578、SEQ ID NO:365、SEQ IDNO:1580、SEQ ID NO:487、SEQ ID NO:1098和SEQ ID NO:976。1121.如实施方案1116所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置3处进行编辑。1122.如实施方案1121所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置3处的A的约76％至约91％的编辑，如在体外测定中所测量的。1123.如实施方案1121或1122所述的方法，其中组合物中的工程化指导RNA包含选自由以下组成的组的序列：SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:1545、SEQ ID NO:1575、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1584、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:625、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:874、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:757、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1538、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:1002、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:486、SEQ IDNO:1552、SEQ ID NO:505、SEQ ID NO:635、SEQ ID NO:606、SEQ ID NO:884、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:880、SEQ ID NO:1411、SEQ ID NO:1568、SEQ ID NO:871、SEQ ID NO:1580、SEQ ID NO:1539、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:892、SEQ ID NO:1116、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:593、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:977、SEQ ID NO:1578、SEQ IDNO:1579、SEQ ID NO:747、SEQ ID NO:1577、748、SEQ ID NO:873和SEQ ID NO:494。1124.如实施方案1116所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置4处进行编辑。1125.如实施方案1124所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置4处的A的约54％至约77％的编辑，如在体外测定中所测量的。1126.如实施方案1124或1125所述的方法，其中组合物中的工程化指导RNA包含选自由以下组成的组的序列：SEQ ID NO:1575、SEQ IDNO:1573、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1566、SEQ IDNO:1572、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:1584、SEQ IDNO:1588、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:1581、SEQ IDNO:1578、SEQ ID NO:1580、SEQ ID NO:934、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:1582、SEQ ID NO:1066、SEQ ID NO:1183、SEQ ID NO:1577、SEQ ID NO:967、SEQ ID NO:1568、SEQ ID NO:930、SEQ ID NO:566、SEQ ID NO:1463、SEQ ID NO:1294、SEQ ID NO:1293、SEQ ID NO:1391、SEQ ID NO:1579、SEQ ID NO:1583、SEQ ID NO:944、SEQ ID NO:815、SEQ ID NO:1168、SEQ ID NO:593、SEQ ID NO:594、SEQ ID NO:694、SEQ ID NO:1576、SEQ ID NO:1193、SEQ ID NO:1051、SEQ ID NO:1212、SEQ ID NO:806、SEQ ID NO:1059、SEQ ID NO:1374、SEQID NO:195、SEQ ID NO:358、SEQ ID NO:和SEQ ID NO:1296。1127.如实施方案1116所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置5处进行编辑。1128.如实施方案1127所述的方法，其中编辑包括在DUX4 RNA的polyA尾的位置4处的A的约44％至约70％的编辑，如在体外测定中所测量的。1129.如实施方案1127或1128所述的方法，其中组合物中的工程化指导RNA包含选自由以下组成的组的序列：SEQ ID NO:1575、SEQ ID NO:1573、SEQ ID NO:1569、SEQ ID NO:1574、SEQ ID NO:1570、SEQ ID NO:1572、SEQ ID NO:1567、SEQ ID NO:1587、SEQ ID NO:1566、SEQ ID NO:1571、SEQ ID NO:1588、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:1586、SEQ ID NO:1584、SEQ ID NO:1581、SEQ ID NO:1578、SEQ ID NO:1585、SEQ ID NO:1582、SEQ ID NO:1580、SEQ ID NO:1183、SEQ ID NO:1568、SEQ ID NO:1066、SEQ ID NO:1391、SEQ ID NO:1168、SEQ ID NO:1293、SEQ ID NO:1577、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:566、SEQ ID NO:1579、SEQ ID NO:930、SEQ ID NO:694、SEQ ID NO:944、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:1583、SEQ ID NO:815、SEQ ID NO:1576、SEQ ID NO:1051、SEQ ID NO:1411、SEQID NO:24、SEQ ID NO:1163、SEQ ID NO:935、SEQ ID NO:680、SEQ ID NO:1212、SEQ ID NO:594、SEQ ID NO:1185、SEQ ID NO:1463、SEQ ID NO:1058、SEQ ID NO:810、SEQ ID NO:392、SEQ ID NO:和SEQ ID NO:1104。1130.如实施方案1115所述的方法，其中DUX4 RNA包含DUX4的前mRNA转录本。1131.如实施方案1130所述的方法，其中至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的DUX4的前mRNA转录本在polyA信号序列中具有至少一个编辑。1132.如实施方案1115所述的方法，其中DUX4 RNA的编辑促进蛋白质敲低。1133.如实施方案1132所述的方法，其中蛋白质敲低包括DUX4的敲低。1134.如实施方案1132或1133所述的方法，其中蛋白质敲低包括DUX4下游的蛋白质的敲低，其中DUX4下游的蛋白质包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2或其任何组合。1135.如实施方案1132-1134中任一项所述的组合物，其中蛋白质敲低包括与RNA编辑之前的蛋白质水平相比，蛋白质降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。1136.如实施方案1132-1135中任一项所述的方法，其中在测定中测量了指导RNA增加的DUX4 RNA的编辑，其中增加的编辑包括蛋白质敲低增加。1137.如实施方案1-1105中任一项所述的组合物或如实施方案1106所述的药物组合物，其用作药物。1138.如实施方案1-1105中任一项所述的组合物或如实施方案1106所述的药物组合物，其用于治疗面肩肱型肌营养不良症(FSHD)。1139.如实施方案1138所述的组合物，其中FSHD包括I型FSHD。1140.如实施方案1138所述的组合物，其中FSHD包括II型FSHD。
实施例
以下示例性实施例代表本文所述的刺激、系统和方法的实施方案，并且不意在以任何方式进行限制。
实施例1
用于编辑DUX4 TIS的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑DUX4 RNA以敲低DUX4蛋白表达的工程化指导RNA。DUX4靶标的示意图示于图1中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的工程化指导RNA被设计以靶向DUX4 RNA的单个翻译起始位点(TIS)并促进ADAR介导的AUG(所述TIS)到GUG的RNA编辑，从而抑制DUX4翻译。鉴于附近没有其他蛋氨酸残基可用于替代翻译起始，编辑导致DUX4蛋白的敲低。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑DUX4 TIS，从而使DUX4靶基因的表达正常化。在施用于患有面肩肱型肌营养不良症(FSHD)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并恢复适当的肌肉功能。
实施例2
用于编辑DUX4 polyA信号位点的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑DUX4(DUX4-FL)RNA以敲低对应DUX4蛋白表达的工程化指导RNA。DUX4靶标的示意图示于图1中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的工程化指导RNA被设计以靶向DUX4-FL RNA的单个polyA信号序列(ATTAAA)中的一个或多个腺苷并且促进ADAR介导的所述一个或多个腺苷的RNA编辑，从而导致破坏RNA加工以及诱导mRNA降解。这反过来又导致毒性DUX4-FL蛋白的敲低。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑DUX4 polyA信号序列，从而使DUX4靶基因的表达正常化。在施用于患有面肩肱型肌营养不良症(FSHD)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并恢复适当的肌肉功能。
实施例3
用于编辑DMPK polyA信号位点的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑DMPK RNA以敲低强直性肌营养不良蛋白激酶表达的工程化指导RNA。DMPK靶标的示意图示于图2中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的工程化指导RNA被设计以靶向DMPK RNA的polyA信号区域中的一个或多个腺苷并且促进ADAR介导的所述一个或多个腺苷的RNA编辑，从而导致破坏RNA加工以及诱导毒性mRNA降解。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑DMPK polyA信号区域。在施用于患有强直性肌营养不良(DM1)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并可预防肌强直和肌肉萎缩。
实施例4
用于编辑DMPK TIS的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑DMPK RNA以敲低强直性肌营养不良蛋白激酶表达的工程化指导RNA。DMPK靶标的示意图示于图2中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的工程化指导RNA被设计以靶向DMPK RNA的单个翻译起始位点(TIS)并促进ADAR介导的AUG(所述TIS)到GUG的RNA编辑，从而抑制DMPK翻译。鉴于附近没有其他蛋氨酸残基可用于替代翻译起始，编辑导致强直性肌营养不良蛋白激酶的敲低。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑DMPK TIS。在施用于患有强直性肌营养不良(DM1)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并可预防肌强直和肌肉萎缩。
实施例5
用于编辑PMP22 TIS的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑PMP22 RNA以敲低外周髓鞘蛋白-22(PMP22)表达的工程化指导RNA。PMP22靶标的示意图示于图3中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的工程化指导RNA被设计以靶向PMP22 RNA的单个翻译起始位点(TIS)并促进ADAR介导的AUG(所述TIS)到GUG的RNA编辑，从而抑制PMP22翻译。鉴于附近没有其他蛋氨酸残基可用于替代翻译起始，编辑导致PMP22蛋白的敲低。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑PMP22 TIS。在施用于患有腓骨肌萎缩综合征(CMT1A)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并可恢复适当的周围神经髓鞘形成和传导，并改善肌肉力量和感觉功能。
实施例6
用于编辑PMP22 polyA信号位点的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑PMP22 RNA以敲低外周髓鞘蛋白-22(PMP22)表达的工程化指导RNA。PMP22靶标的示意图示于图3中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的一种或多种不同的工程化指导RNA被设计以靶向PMP22 RNA的三个可供选择的polyA信号位点中的一个或多个中的腺苷并且促进ADAR介导的所述三个可供选择的polyA信号位点中的一个或多个中的所述腺苷的RNA编辑。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑三个可供选择的polyA信号位点中的一个或多个。在施用于患有腓骨肌萎缩综合征(CMT1A)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并可恢复适当的周围神经髓鞘形成和传导，并改善肌肉力量和感觉功能。
实施例7
用于编辑SOD1 TIS的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑SOD1 RNA以敲低超氧化物歧化酶表达的工程化指导RNA。SOD1靶标的示意图示于图4中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的工程化指导RNA被设计以靶向SOD1 RNA的单个翻译起始位点(TIS)并促进ADAR介导的AUG(所述TIS)到GUG的RNA编辑，从而抑制SOD1翻译和毒性蛋白功能。鉴于附近没有其他蛋氨酸残基可用于替代翻译起始，编辑导致超氧化物歧化酶的敲低。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑SOD1 TIS。在施用于患有强直性肌营养不良(ALS)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并可预防运动神经元变性和疾病进展。
实施例8
用于编辑SOD1 polyA信号位点的工程化指导RNA
此实施例描述了用于编辑SOD1 RNA以敲低超氧化物歧化酶表达的工程化指导RNA。SOD1靶标的示意图示于图4中，突出了可被本公开的工程化指导RNA靶向的位点。本公开的一种或多种不同的工程化指导RNA被设计以靶向SOD1 RNA的三个可供选择的polyA信号位点中的一个或多个中的腺苷并且促进ADAR介导的所述三个可供选择的polyA信号位点中的一个或多个中的所述腺苷的RNA编辑。在体外或体内施用工程化指导RNA后，工程化指导RNA编辑三个可供选择的polyA信号位点中的一个或多个。在施用于患有强直性肌营养不良(ALS)的受试者后，工程化指导RNA具有治疗效果并可预防运动神经元变性和疾病进展。
实施例9
靶向DUX4的工程化指导RNA组合物
此实施例描述了靶向DUX4 mRNA的“pLAM”区域中聚腺苷酸化(polyA)信号位点(ATTAAA)的工程化指导RNA。使用表1的工程化指导RNA序列来靶向polyA信号位点序列(ATTAAA)中三个末端A中的一个或多个来进行编辑。DUX4 polyA信号位点编辑的结果(指定A的编辑百分比)示于表2。表2示出了ADAR1(A1)、ADAR2(A2)或ADAR1和ADAR2(A1+2)与表1中描述的指导RNA对DUX4mRNA的ATTAAA中A的编辑百分比。位置0(ATTAAA的第一个A)表示为“P0”，位置3(ATTAAA的第三个A)表示为“P3”，位置4(ATTAAA的第四个A)表示为“P4”，位置5(ATTAAA的第五个A)表示为“P5”，并且在表2中的任何位置处的编辑表示为“任何”。使自退火RNA结构与RNA编辑实体(例如，重组ADAR1和/或ADAR2)在允许编辑的条件下接触30分钟，所述自退火RNA结构包含(i)示于表1的工程化指导RNA和(ii)工程化指导RNA靶向的DUX4区域的RNA序列。随后使用下一代测序(NGS)评估工程化指导RNA靶向的区域以进行编辑。对ADAR1和/或ADAR2表现出有利的DUX4的中靶编辑的工程化指导RNA示于表1。本文还涵盖了编码表1的工程化指导RNA的所有多核苷酸序列，其由表1中所示的每个序列代表，其中每个U被T取代。对于每个序列，在指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后在双链RNA基质中形成的结构特征示于表1的第二列。作为参考，指导-靶RNA支架(与工程化指导RNA杂交的靶RNA序列)内形成的每个结构特征如下注释：
a.结构特征相对于靶RNA序列的靶A(位置0)的位置，负值表示靶A的上游(5')，并且正值表示靶A的下游(3')；
b.共同形成结构特征的靶RNA序列中的碱基数量和工程化指导RNA中的碱基数量——例如，6/6表示靶RNA序列中的六个连续碱基和工程化指导RNA中的六个连续碱基形成结构特征；
c.结构特征的名称(例如，对称凸起、对称内部环、不对称凸起、不对称内部环、错配或摆动碱基对)，以及
d.参与形成结构特征的靶RNA侧和工程化指导RNA侧的碱基序列。
例如，参考SEQ ID NO:7，“20_6-6_内部_环-对称_UGGAUC-UACAUU”被解读为在指导-靶RNA支架(与SEQ ID NO:7的工程化指导RNA杂交的靶DUX4 RNA序列)中形成的结构特征，其中
a.结构特征从靶RNA序列的靶A(0位置)下游(3')20个核苷酸(+20位置)开始
b.来自靶RNA序列中的六个连续碱基和来自工程化指导RNA中的六个连续碱基形成结构特征
c.结构特征是内部对称环
d.来自靶RNA侧的UGGAUC序列和来自工程化指导RNA侧的UACAUU序列参与形成内部对称环。
作为参考，图5可用作使本文公开的结构特征和命名法可视化的辅助。图6是在x轴上示出本公开的DUX4靶向工程化指导RNA序列与规范指导RNA设计的序列相似性，以及在y轴上示出ADAR2酶的编辑分数的图。这些数据突出了本公开的DUX4靶向工程化指导RNA序列所代表的多样化序列空间，其具有驱动序列多样性的一系列不同的结构特征并且表现出高中靶编辑效率。
表1-靶向DUX4的工程化指导RNA
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表2-ADAR1、ADAR2或ADAR1和ADAR2对DUX4 mRNA的ATTAAA中的A的编辑百分比
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实施例10
选择的靶向DUX4的工程化指导RNA组合物
此实施例描述了靶向DUX4 mRNA的“pLAM”区域中聚腺苷酸化(polyA)信号位点(ATTAAA)的前50个工程化指导RNA。polyA信号位点序列(ATTAAA)中每个“A”的对应位置表示为0、3、4和5。使用不同的工程化指导RNA序列靶向这些位置中的每一个以进行编辑，并且已鉴定用于编辑的前50个工程化指导RNA。polyA信号位点的RNA序列是(AUUAAA)。使自退火RNA结构与ADAR1在允许编辑的条件下接触30分钟，所述自退火RNA结构包含(i)示于表3的工程化指导RNA和(ii)工程化指导RNA靶向的DUX4区域的RNA序列。随后使用下一代测序(NGS)评估工程化指导RNA靶向的区域以进行编辑。本文涵盖了编码表3的工程化指导RNA的所有多核苷酸序列，其由表3中所示的每个SEQ ID NO代表，其中每个U被T取代。对于每个序列，在指导RNA与靶DUX4 RNA杂交后在双链RNA基质中形成的结构特征示于表3的第二列。作为参考，指导-靶RNA支架(与工程化指导RNA杂交的靶RNA序列)内形成的每个结构特征如下注释：
a.结构特征相对于靶RNA序列的靶A(位置0)的位置，负值表示靶A的上游(5')，并且正值表示靶A的下游(3')；
b.共同形成结构特征的靶RNA序列中的碱基数量和工程化指导RNA中的碱基数量——例如，6/6表示靶RNA序列中的六个连续碱基和工程化指导RNA中的六个连续碱基形成结构特征；
c.结构特征的名称(例如，对称凸起、对称内部环、不对称凸起、不对称内部环、错配或摆动碱基对)，以及
d.参与形成结构特征的靶RNA侧和工程化指导RNA侧的碱基序列。
例如，参考SEQ ID NO:8，“20_6-6_内部_环-对称_UGGAUC-ACAGGU”被解读为在指导-靶RNA支架(与SEQ ID NO:8的工程化指导RNA杂交的靶DUX4 RNA序列)中形成的结构特征，其中
a.结构特征从靶RNA序列的靶A(0位置)下游(3')20个核苷酸(+20位置)开始
b.来自靶RNA序列中的六个连续碱基和来自工程化指导RNA中的六个连续碱基形成结构特征
c.结构特征是内部对称环
d.来自靶RNA侧的UGGAUC序列和来自工程化指导RNA侧的ACAGGU序列参与形成内部对称环。
表3：靶向DUX4的“pLAM”区域中的聚腺苷酸化(polyA)信号位点(ATTAAA)的前50个工程化指导RNA。
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实施例11
靶向细胞中的DUX4 polyA位点
此实施例描述了与突变的DUX4-FL polyA位点腺苷融合的报告基因的表达变化。为了测试细胞中DUX4-FL polyA位点的表达，设计并生成了两个DUX4-FL荧光报告基因。在永生化成肌细胞(LHCN-M2细胞，也称为LHCN)中测试了GFP报告基因构建体(EF1a-GFP-DUX4flwt3'UTR)和荧光素酶报告基因构建体(EF1a-荧光素酶-DUX4flwt3'UTR)。荧光素酶和GFP构建体的示意图示于图7。两种报告基因均被工程化以包含替代型式，其中polyA位点处的特定腺苷突变为G，以测试它们在mRNA和蛋白质水平中的作用。除了未改变的型式(或野生型型式)ATTAAA之外，替代型式还包括ATTAAG；ATTAGA；ATTGAA；GTTAAA；和GTTGGG。为了确定这些polyA位点的RNA序列，所有T碱基均被U碱基取代。考虑到如果所述突变导致较低的mRNA/蛋白质水平，则表达突变构建体的细胞中的GFP/荧光素酶mRNA和蛋白质将会较少。
为了确定LHCN-M2细胞中DUX4-FL polyA位点的突变是否改变了报告基因的表达，用荧光素酶构建体转染细胞。将永生化LHCN肌肉细胞以10K个细胞/孔进一步铺板，并在第二天用500ng DNA质粒(Lipofectamine 2000，DNA:试剂比率为1:3)转染。对细胞的活力进行处理并经由mCherry流式分析进行分析。转染后48小时通过荧光素酶测定检查上清液。荧光素酶实验的结果示于图8A至8C。如图8A所示，转染后细胞的存活率约为80％-90％，并且转染效率约为7-40％(mCherry阳性)。不同的转染效率可能是由与转染肌肉细胞相关的困难造成的。将荧光素酶表达归一化为mCherry中值荧光强度(MFI)(示于图8B)。如图8C所示，归一化之后，构建体STX994(ATTAGA)、STX995(ATTGAA)和STX997(GTTGGG)导致WT DUX4-3'UTR荧光素酶信号STX992(ATTAAA)的显著下调。STX993(ATTAAG)导致荧光素酶信号显著增加，而STX996(GTTAAA)未显示出变化。“Un”是未转染的对照，并且“Exb296”是阳性对照。这些结果表明，DUX4可通过使DUX4-FL polyA位点突变在肌肉细胞中下调。
为了确定LHCN-M2细胞中DUX4-FL polyA位点的突变是否改变了报告基因的表达，用GFP构建体转染细胞。将永生化LHCN肌肉细胞以10K个细胞/孔进一步铺板，并在第二天用250ng DNA质粒(Lipofectamine 2000，DNA:试剂比率为1:3)转染。转染后48小时，对细胞的活力进行处理并经由mCherry/GFP流式分析进行分析。GFP实验的结果示于图9A至9C。转染后细胞的存活率大于90％，并且转染效率约为10-40％(mCherry阳性)，如图9A所示。不同的转染效率可能是由与转染肌肉细胞相关的困难造成的。将GFP MFI归一化为mCherry MFI(示于图9B)。如图9C所示，归一化之后，所有构建体STX999(ATTAAG)、STX1000(ATTAGA)、STX1001(ATTGAA)、STX1002(GTTAAA)和STX1003(GTTGGG)导致WT DUX4-3'UTR GFP信号STX998(ATTAAA)的显著下调。“Un”是未转染的对照。这些结果表明，DUX4可通过使DUX4-FLpolyA位点突变在细胞中下调。这些构建体(荧光素酶和GFP)还可与本文所述的指导RNA一起使用，以测试DUX4 polyA位点的RNA编辑导致的表达变化。
实施例12
靶向细胞中的DUX4 polyA信号序列
用DUX4-荧光素酶报告基因转染HEK细胞，所述报告基因经由Piggybac系统稳定整合。ADAR 1/2敲除(KO)细胞使用相同的DUX4-荧光素酶报告基因。为了测试DUX4 polyA位点的编辑，测试了七种gRNA，并且测试了无转染对照。测试的七种gRNA是SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:593、SEQ ID NO:934、SEQ ID NO:977、SEQ ID NO:1054、SEQ ID NO:1294和SEQ ID NO:1463。用分别编码七种gRNA中每一种的质粒转染细胞。转染后48小时收集细胞，并且收集RNA，通过逆转录酶将其转化为DNA，并经由Sanger测序进行测序。图11示出了使用测试的7种指导物的ADAR 1/2敲除细胞中的有限编辑至无编辑。图10示出了包含功能性ADAR 1的HEK细胞中的编辑。例如，SEQ ID NO:8指导物促进了在DUX 4poly A尾的位置3(自ATTAAA的5'端起的第三个A)处的高水平编辑(约60％)。使用SEQ ID NO:593指导物的编辑在位置0(ATTAAA的第一个A)和DUX 4poly A尾的位置3处具有高水平编辑(约70％)。在具有SEQ IDNO:593的poly A尾的位置4和5(分别是自ATTAAA的5'端起的第三个A和第四个A)处也观察到大于40％的编辑。使用SEQ ID NO:934指导物的编辑在DUX 4poly A尾的位置0处具有高水平编辑(约78％)，在位置3处具有约75％的编辑，并且在位置4处具有约60％的编辑。使用SEQ ID NO:977指导物的编辑在位置3处具有高水平编辑(约75％)，并且在位置4和5处具有约60％的编辑。使用SEQ ID NO:1054指导物的编辑在位置0和3处具有高水平编辑(大于约70％)，并且在位置4处具有约40％的编辑。使用SEQ ID NO:1294指导物的编辑在位置3和4处具有高水平编辑(约70％至75％)，并且在位置0处具有约40％的编辑。使用SEQ ID NO:1463指导物的编辑在位置3和4处具有高水平编辑(约80％)。这些结果表明DUX-4mRNA可在细胞中被高效编辑。
mRNA敲低。还通过mRNA敲低的qPCR分析了用于量化上述编辑水平的细胞的RNA制备物(2个生物重复份)的mRNA敲低。将qPCR数据归一化为GAPDH mRNA，并且两个生物重复份的平均倍数变化呈现于下表4，其中无转染对照设置为1。在WT细胞背景中测试的所有工程化指导RNA均观察到敲低，而ADAR 1/2KO细胞大部分没有显示出敲低。
表4-DUX4 mRNA敲低(倍数变化归一化为GAPDH n＝2)
实施例13
DUX4 mRNA转录本的减少
此实施例描述了细胞中DUX4 mRNA水平的降低。用本文所述的任何工程化指导RNA(例如，SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中的任一个)转染人FSHD衍生的成肌细胞。细胞是转染后0、12、24和48小时的样品。对细胞取样之后，裂解细胞并纯化RNA。用逆转录酶将RNA转化为DNA，并通过定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)确定RNA水平。确定DUX4 mRNA水平的相对和绝对表达水平。用工程化指导RNA转染之后，DUX4 mRNA水平减少。
实施例14
DUX4下游蛋白质水平的降低
此实施例描述了DUX4下游蛋白质的减少。用本文所述的任何工程化指导RNA(例如，SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中的任一个)转染人FSHD衍生的成肌细胞。细胞是转染后0、12、24和48小时的样品。对细胞取样之后，裂解细胞并制备裂解细胞的蛋白质样品。蛋白质样品在SDS-PAGE凝胶上运行并转移至硝化纤维印迹。使用针对SLC34A2的一抗通过蛋白质印迹确定蛋白质水平。密度测定法用于确定SLC34A2的蛋白质水平。用工程化指导RNA转染之后，SLC34A2蛋白水平减少。
实施例15
用于治疗面肩肱型肌营养不良症(FSHD)的组合物
本实施例描述了用于治疗FSHD的载体。受试者被诊断患有FSHD，这是由DUX4基因的错误表达引起的。给受试者开具药物组合物的给药方案。所述药物组合物包含有包含本文所述的工程化指导RNA(例如，SEQ ID NO:2-1589)的载体，其涉及使DUX4-FL的polyA信号序列(ATTAAA)中的区域突变。通过静脉内施用将药物组合物以有效量全身施用至受试者以治疗FSHD疾病。
虽然本公开的优选实施方案已在本文中示出和描述，但对于本领域技术人员来说将显而易见的是，此类实施方案仅以举例的方式提供。在不偏离本公开的情况下，本领域技术人员现在将进行各种变型、变化和替换。应当理解，可将本文描述公开的实施方案的各种替代方案应用于实施本公开。这意味着以下权利要求书限定本公开的范围并且这些权利要求及其等同物范围内的方法和结构因此被涵盖。
序列表
<110> 塑造治疗公司(SHAPE THERAPEUTICS INC.)
<120> 工程化指导RNA和多核苷酸
<130> 199235-733601
<140>
<141>
<150> 63/303,662
<151> 2022-01-27
<150> 63/277,665
<151> 2021-11-10
<150> 63/216,175
<151> 2021-06-29
<150> 63/192,818
<151> 2021-05-25
<160> 1603
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 45
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1
guggaauagu auaacaauau gcuaaauguu guuauaguau cccac 45
<210> 2
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca ccgacaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 32
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 32
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc cauuuaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 33
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 33
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc cuuuaaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 34
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca ucguuaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 35
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca agaaaaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 52
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugaccc cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 55
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 56
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaagagag auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 57
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 58
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
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<400> 62
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<220>
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<220>
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<400> 66
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 72
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 73
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 74
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccugcacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 75
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccgcgggucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<220>
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 77
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 78
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 79
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 81
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 82
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc uuaggcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 83
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 83
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua agugccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 84
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 84
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc uuccacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 85
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 85
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaca acuuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 86
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 86
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 87
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 87
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaac gguuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 88
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 88
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<210> 89
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 89
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 90
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcga uccaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 91
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 91
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcac gucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 92
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcua guuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 93
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcgu uuuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 94
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 94
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagucu gauaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 95
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 95
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacuua uuaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 96
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 96
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaauuua ucaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 97
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaauuaa acaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 98
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaauuac guaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 99
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 100
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauacgg aaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 101
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaacucca gaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 102
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaucaac aaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 103
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaacauac gaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 104
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaauaucgu caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 105
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaauccgca caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 106
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacuugac caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 107
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaucuuuc caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 108
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 109
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 110
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 111
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acauguaucg caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 112
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 113
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 114
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 115
gauauuguga cauaucucug cacucaucac accugcucug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 116
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 117
gauauuguga cauaucucug cacucaucac accuauauug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 118
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aguuguaaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 119
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aaccugaaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 120
gauauuguga cauaucucug cacucaucac agcugucaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 121
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 122
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uaccucgaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 123
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 123
gauauuguga cauaucucug cacucaucac cuuuccgaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 124
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 125
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uguuucgaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 126
gauauuguga cauaucucug cacucaucac cuugccgaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 127
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 127
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 128
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agaagagauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 129
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga agcacgaauc 100
<210> 130
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 130
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aagauaaauc 100
<210> 131
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 131
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aacgccaauc 100
<210> 132
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 132
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagcaggau 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga aaaaccgauc 100
<210> 133
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 133
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagccuaau 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aagcgggauc 100
<210> 134
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 134
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagcacagu 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga agccuaaauc 100
<210> 135
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 135
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga agccauaauc 100
<210> 136
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 136
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagccgugu 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aggccaaauc 100
<210> 137
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 137
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auauaccgaa 60
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<210> 138
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 138
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auacacgcaa 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aauuuagauc 100
<210> 139
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 139
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<210> 140
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 140
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaaacgaga 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aggguaaauc 100
<210> 141
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 141
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 142
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aucgcuggca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aggugggauc 100
<210> 143
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 143
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auccagcaca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aggcacaauc 100
<210> 144
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 144
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aucuuguaca 60
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<210> 145
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 145
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auccagaaca 60
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<210> 146
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 146
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga aagggggauc 100
<210> 147
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 147
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acuccugcca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agcacggauc 100
<210> 148
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 148
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu accuaaccca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aaccguaauc 100
<210> 149
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 149
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aaagcagauc 100
<210> 150
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 150
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agaguggauc 100
<210> 151
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 151
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ucuacuucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga aaucuggauc 100
<210> 152
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 152
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugccuuucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agguacaauc 100
<210> 153
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 153
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uaccauucca 60
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<210> 154
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 154
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ucaccuucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aggccggauc 100
<210> 155
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 155
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ucacccucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aggcagaauc 100
<210> 156
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 156
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg aaaccaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agacagaauc 100
<210> 157
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 157
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca caaauaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aagcgagauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 158
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc cccuuaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aggguggauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 159
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca ccccuaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga agacgcgauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 160
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg caccaaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agagccgauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 161
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuau cgacgaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga aacaugaauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 163
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc ucgugaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aagcaagauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 164
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg ugaagaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga agccagaauc 100
<210> 165
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc ggucgaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agaccggauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugac cucggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aaucuggauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 167
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugau ucuggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga agguuaaauc 100
<210> 168
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 168
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugcc uuuggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aaggccgauc 100
<210> 169
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 169
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuggc cucggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agcgugaauc 100
<210> 170
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 170
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucguag uaaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agaauagauc 100
<210> 171
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 171
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgaca cgaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agcauggauc 100
<210> 172
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 172
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgggc gcaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga agaacgaauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 173
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<210> 174
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 174
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucguga gcaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aaacgggauc 100
<210> 175
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 175
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugcagg uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agccucgauc 100
<210> 176
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 176
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauagcgu cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agggacaauc 100
<210> 177
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 177
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauagcac cuaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aacuccaauc 100
<210> 178
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 178
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaagau uuaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aggagcaauc 100
<210> 179
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 179
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugacag cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agacccgauc 100
<210> 180
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 180
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaagaggc auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 181
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaguaugg auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agccuggauc 100
<210> 182
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 182
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaagagcg auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aauucggauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 183
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaaguaag auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aauucggauc 100
<210> 184
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 184
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaaaccaa auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aagggcgauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 185
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caauaaauau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agguuggauc 100
<210> 186
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 186
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacaugaau auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aggcgagauc 100
<210> 187
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 187
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caucaagacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agccgcgauc 100
<210> 188
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 188
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacaggaccu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agccuaaauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 189
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 190
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacaauaacu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aacccgaauc 100
<210> 191
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 191
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacugauacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agcauagauc 100
<210> 192
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 192
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<210> 193
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 193
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<210> 194
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 194
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 195
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cucgggaucu auaggaucca 60
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 196
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccccuacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agacaaaauc 100
<210> 197
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 197
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug agucgauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agccacaauc 100
<210> 198
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 198
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug agggaguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aacuccaauc 100
<210> 199
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 199
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<210> 200
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 200
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gcuccguucu auaggaucca 60
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<210> 201
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 201
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug aaugcguucu auaggaucca 60
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<210> 202
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 202
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc ugucgcuucu auaggaucca 60
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<210> 203
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 203
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu accgacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aaacccaauc 100
<210> 204
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 204
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua acuagcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aagugcaauc 100
<210> 205
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 205
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua accgacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga agggaggauc 100
<210> 206
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 206
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu acgcccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aagcgagauc 100
<210> 207
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 207
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaau uuccucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga aggcgaaauc 100
<210> 208
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 208
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaac uacuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aauuuaaauc 100
<210> 209
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 209
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagagg agcuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aaaggggauc 100
<210> 210
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 210
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagacc auauucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aaauaggauc 100
<210> 211
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 211
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaau uccuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga agauuagauc 100
<210> 212
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 212
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcuu aauaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga aaauuggauc 100
<210> 213
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 213
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagucu auuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aggagggauc 100
<210> 214
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 214
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcaa uuuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga agcccgaauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 215
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguac ucuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga aggugcgauc 100
<210> 216
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 216
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacuca guaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga agguggaauc 100
<210> 217
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 217
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaauuuu uuaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga agggcagauc 100
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 218
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaaaca guaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaacga acaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aggacggauc 100
<210> 220
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaaucu uuaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaacucua gaaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauucgu aaaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacauuaa caaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 225
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaauccccc caaaucuucu auaggaucca 60
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaauacgcc caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 227
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacuacau caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aaagugaauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuga aacguagauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 232
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acauuccaag caaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaucauuag caaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 234
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 235
gauauuguga cauaucucug cacucaucac accuggccug caaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 236
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acuaacguug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aacgcagauc 100
<210> 237
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 237
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acugugcuug caaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 240
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aauguacaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga aggacagauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 242
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uauguugaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 244
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uuuagugaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga aauccaaauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 245
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uauaucgaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 246
gauauuguga cauaucucug cacucaucac cuguacgaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 247
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uaaccgcauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 248
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga ccagggcauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 249
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uuguagcauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 250
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga caauaccauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 251
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uucgugcauc 100
<210> 252
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 252
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagagcggu 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uaaucccauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 253
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagucaggu 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 254
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagacgggu 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uccucgcauc 100
<210> 255
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 255
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagacaaau 60
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<210> 256
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 256
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagacgggu 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga cagcaacauc 100
<210> 257
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 257
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auacacuaga 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 258
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaauuacaa 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 259
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaccuuaga 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga cgguuccauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 260
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auauaugaga 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga ccccaccauc 100
<210> 261
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 261
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaaccaaga 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uccuugcauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 262
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuuucggca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ugacaacauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 263
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuuagaaca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga cauuugcauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 264
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aucaccggca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga caggugcauc 100
<210> 265
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 265
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuuacagca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga caucugcauc 100
<210> 266
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 266
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuuaugaca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uccuuccauc 100
<210> 267
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 267
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 268
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acgaaaccca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga cggugccauc 100
<210> 269
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 269
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acgcacgcca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uggugccauc 100
<210> 270
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 270
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu agucacccca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uaccaccauc 100
<210> 271
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 271
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aaugucgcca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga caacggcauc 100
<210> 272
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 272
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu caaugcucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ugaaggcauc 100
<210> 273
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 273
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu caucauucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga caguaccauc 100
<210> 274
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 274
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cgaaguucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uguucgcauc 100
<210> 275
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 275
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cgccauucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uagccacauc 100
<210> 276
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 276
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugaauuucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga cgaccgcauc 100
<210> 277
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 277
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg ccgaaaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uaaaaacauc 100
<210> 278
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 278
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg uguccaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga ccaugccauc 100
<210> 279
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 279
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc ccgccaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga ucaacccauc 100
<210> 280
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 280
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg uucccaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uagucccauc 100
<210> 281
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 281
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuag aacagaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ucccgacauc 100
<210> 282
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 282
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuag cgucgaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uguccccauc 100
<210> 283
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 283
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc aacagaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uuucaacauc 100
<210> 284
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 284
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg acacgaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uggccgcauc 100
<210> 285
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 285
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuau cauagaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga ccagcgcauc 100
<210> 286
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 286
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuggg aauggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uaccgccauc 100
<210> 287
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 287
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuaug gauggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uaguugcauc 100
<210> 288
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 288
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucac gauggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga caucggcauc 100
<210> 289
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 289
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuggg uuuggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uucccgcauc 100
<210> 290
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 290
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucaa uccggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga cgauuacauc 100
<210> 291
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 291
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucccuc caaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ugagcacauc 100
<210> 292
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 292
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccugg ugaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uucgagcauc 100
<210> 293
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 293
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccaac gcaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga ccaagacauc 100
<210> 294
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 294
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucaaaa aaaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uuaccccauc 100
<210> 295
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 295
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucagua gcaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uccucacauc 100
<210> 296
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 296
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaagua cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uggaggcauc 100
<210> 297
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 297
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugcgaa uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga cagcaccauc 100
<210> 298
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 298
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugaaca uuaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uugucgcauc 100
<210> 299
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 299
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaucaa uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uguccacauc 100
<210> 300
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 300
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaauauag auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uaggcccauc 100
<210> 301
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 301
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaguacca auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uguucgcauc 100
<210> 302
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 302
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacguaaa auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga cauucccauc 100
<210> 303
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 303
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacaagaa auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga ugucaccauc 100
<210> 304
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 304
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaaggggg auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uccaggcauc 100
<210> 305
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 305
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacagcgau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ucccggcauc 100
<210> 306
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 306
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacuacagu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga cagcagcauc 100
<210> 307
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 307
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaugagagu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga cgaaaacauc 100
<210> 308
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 308
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaccgcagu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga caguuccauc 100
<210> 309
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 309
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaugugagu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga cagucccauc 100
<210> 310
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 310
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacgcaagcu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ugacagcauc 100
<210> 311
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 311
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caucagugcu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uucggacauc 100
<210> 312
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 312
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caucuaugcu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uuaaagcauc 100
<210> 313
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 313
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caccaggccu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uagcgccauc 100
<210> 314
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 314
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacuauaccu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uagucccauc 100
<210> 315
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 315
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccuagacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga cgguaccauc 100
<210> 316
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 316
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cugcgacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uacacgcauc 100
<210> 317
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 317
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccuugacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uuaugccauc 100
<210> 318
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 318
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccccaagucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga cgaggacauc 100
<210> 319
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 319
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccguauaucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga ugcauccauc 100
<210> 320
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 320
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gucgaauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga cagcgacauc 100
<210> 321
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 321
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gccccguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uuauuacauc 100
<210> 322
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 322
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug agugaguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga ugccuccauc 100
<210> 323
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 323
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gcccgguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga cggcgacauc 100
<210> 324
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 324
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc ucugacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga cgguuacauc 100
<210> 325
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 325
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua uuccacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uugcgccauc 100
<210> 326
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 326
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc uguuccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uuacaccauc 100
<210> 327
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 327
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua auugccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga caacgacauc 100
<210> 328
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 328
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaac uuucucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga uguucccauc 100
<210> 329
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 329
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagagu ccucucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uagcaacauc 100
<210> 330
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 330
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaca guguucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga uaaucccauc 100
<210> 331
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 331
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaga gguuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga uauccacauc 100
<210> 332
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 332
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagucu aacaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ugcauccauc 100
<210> 333
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 333
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagccu uuuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuga cgguuacauc 100
<210> 334
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 334
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguca aucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuga uucuuccauc 100
<210> 335
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 335
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguua acuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuga cauucccauc 100
<210> 336
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 336
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcac ccuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuga caagggcauc 100
<210> 337
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 337
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaccaa guaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga uccauacauc 100
<210> 338
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 338
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacuac ucaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 340
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaauuua ucaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 346
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaucagu aaaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 349
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 356
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 357
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<400> 358
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 361
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuga ugcauacauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 362
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 363
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 364
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 365
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 366
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 367
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 368
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 369
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 370
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 371
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 372
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 373
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 374
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 375
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 376
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 377
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagucauau 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 378
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 379
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 380
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 382
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 383
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 385
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 386
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 387
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 388
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 390
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 391
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 392
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 394
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<210> 395
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 395
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccguuuucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 396
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 397
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uccaauucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugc gauccucauc 100
<210> 398
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 398
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cauuuuucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu gucguucauc 100
<210> 399
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 399
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg ccgcaaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu cggacucauc 100
<210> 400
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 400
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca gcuauaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugc caaauucauc 100
<210> 401
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 401
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg aaacuaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc ugguuucauc 100
<210> 402
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 402
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc gauucaucca 60
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<210> 403
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 403
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc cucagaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 404
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuaa agcugaucca 60
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 405
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuac cgaagaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 406
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuau ccucgaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 407
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuag ugcagaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 408
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 409
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<210> 410
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 410
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucac gauggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu gagccucauc 100
<210> 411
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 411
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucau ccuggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 412
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucaaua caaggaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 413
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucggag agaggaucca 60
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<210> 414
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 414
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccggc gcaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc agauuucauc 100
<210> 415
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 415
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgcgc aaaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu aaagcucauc 100
<210> 416
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 416
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgugg ugaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc cgagcucauc 100
<210> 417
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 417
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<210> 418
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 418
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugggaa uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu gaaccucauc 100
<210> 419
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 419
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugcuaa uuaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu cacccucauc 100
<210> 420
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 420
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaugga uuaggaucca 60
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<210> 421
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 421
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaauac cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu uuaucucauc 100
<210> 422
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 422
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacagcac auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugc uggauucauc 100
<210> 423
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 423
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaacaaac auaggaucca 60
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 424
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaagaggc auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc uugccucauc 100
<210> 425
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 425
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacacggc auaggaucca 60
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<210> 426
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 426
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaauuaga auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu ugcauucauc 100
<210> 427
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 427
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caauaagcgu auaggaucca 60
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<210> 428
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 428
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacauacau auaggaucca 60
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 429
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<210> 430
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 430
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacuaaagu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu aaagcucauc 100
<210> 431
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 431
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caauugcuau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu uuaccucauc 100
<210> 432
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 432
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 433
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 434
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cagggagggg gcauucuaau auaucucugc cccauucauc 100
<210> 435
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 435
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacgaaaccu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu uggccucauc 100
<210> 436
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 436
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc uggauucauc 100
<210> 437
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 437
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<210> 438
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 438
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cagggagggg gcauuucaau auaucucugc gggucucauc 100
<210> 439
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 439
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cccacugucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc ugguuucauc 100
<210> 440
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 440
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cuuaacgucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu cagucucauc 100
<210> 441
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 441
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cccacagucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc gaauuucauc 100
<210> 442
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 442
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug guuguauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu uucucucauc 100
<210> 443
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 443
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug acugcguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu uacacucauc 100
<210> 444
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 444
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gccagguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu gauccucauc 100
<210> 445
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 445
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug agucaauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugc uuaucucauc 100
<210> 446
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 446
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gcgcaguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu ccaucucauc 100
<210> 447
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 447
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu agucacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu ugguuucauc 100
<210> 448
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 448
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua uguuccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu caaauucauc 100
<210> 449
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 449
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu aacggcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc ggaucucauc 100
<210> 450
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 450
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu uucaccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu aagguucauc 100
<210> 451
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 451
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua aauagcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu uuauuucauc 100
<210> 452
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 452
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaau uuauucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugc ccaccucauc 100
<210> 453
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 453
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagagu ccgcucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu uggucucauc 100
<210> 454
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 454
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaac auguucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu auaucucauc 100
<210> 455
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 455
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagacc ccuuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugc gaaguucauc 100
<210> 456
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 456
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaaa gucuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu agggcucauc 100
<210> 457
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 457
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguau aguaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu ugcccucauc 100
<210> 458
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 458
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguac uacaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu guguuucauc 100
<210> 459
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 459
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcga uucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc ccccuucauc 100
<210> 460
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 460
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcaa aucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugc caaacucauc 100
<210> 461
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 461
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguaa aauaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu uauccucauc 100
<210> 462
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 462
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacucc acaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu aucucucauc 100
<210> 463
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 463
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacuaa cuaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu ugcauucauc 100
<210> 464
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 464
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaccac uuaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc caguuucauc 100
<210> 465
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 465
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaauacu auaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu ugucuucauc 100
<210> 466
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 466
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaauca acaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu cuuccucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 467
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaacuagu aaaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 468
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaacuuca gaaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 469
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauuugg aaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc uuaguucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 470
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaacacca aaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu uugucucauc 100
<210> 471
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 471
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauucuu aaaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc cagucucauc 100
<210> 472
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 472
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaccuaca caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu ugcacucauc 100
<210> 473
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 473
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacgaaau caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugc caccuucauc 100
<210> 474
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 474
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaauacacu caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc caaucucauc 100
<210> 475
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 475
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaauuuagc caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugc aggacucauc 100
<210> 476
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 476
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacgaaac caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu uuaccucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 477
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acauuuccag caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugc uuauuucauc 100
<210> 478
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 478
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acacacgugg caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugc gggguucauc 100
<210> 479
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 479
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaccacacg caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu uuuccucauc 100
<210> 480
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 480
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaccuuucg caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu caucuucauc 100
<210> 481
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 481
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaucgccgg caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc cccccucauc 100
<210> 482
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 482
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acuacgccug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugu uacauucauc 100
<210> 483
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 483
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acccugucug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugu ccacuucauc 100
<210> 484
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 484
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acuccauuug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu cucgcucauc 100
<210> 485
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 485
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acuccaucug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu guauuucauc 100
<210> 486
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 486
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acugucccug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc cagucucauc 100
<210> 487
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 487
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aaucgcuaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugc cucacucauc 100
<210> 488
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 488
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aagccaaaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugc cguccucauc 100
<210> 489
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 489
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aguucucaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugu uucuuucauc 100
<210> 490
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 490
gauauuguga cauaucucug cacucaucac agcucauaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucugc uucucucauc 100
<210> 491
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 491
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aaaguuuaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugu cgaguucauc 100
<210> 492
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 492
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uggcaugaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucugc gagguucauc 100
<210> 493
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 493
gauauuguga cauaucucug cacucaucac ugucuugaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucugc cucuuucauc 100
<210> 494
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 494
gauauuguga cauaucucug cacucaucac cccuccgaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucugc guaccucauc 100
<210> 495
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 495
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucugu ugguuucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 496
gauauuguga cauaucucug cacucaucac cuugccgaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucugc ggaucucauc 100
<210> 497
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 497
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuau uuauaucauc 100
<210> 498
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 498
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuuu guacaucauc 100
<210> 499
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 499
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuca uuuuaucauc 100
<210> 500
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 500
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucucu ccacaucauc 100
<210> 501
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 501
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuuc aaauaucauc 100
<210> 502
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 502
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagacuauu 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuuu uugcaucauc 100
<210> 503
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 503
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagcgcuuu 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuuc cgauaucauc 100
<210> 504
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 504
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagaaggau 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuau guauaucauc 100
<210> 505
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 505
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auagucgggu 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuac guccaucauc 100
<210> 506
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 506
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaguacuuu 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuuu caccaucauc 100
<210> 507
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 507
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auauagaaaa 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuua ugguaucauc 100
<210> 508
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 508
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaucuacaa 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuuu uuccaucauc 100
<210> 509
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 509
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaaccuaaa 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuuu ccgcaucauc 100
<210> 510
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 510
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaacgcaga 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuuc ccgcaucauc 100
<210> 511
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 511
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auacuuagaa 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuag ugauaucauc 100
<210> 512
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 512
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auucuccgca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuau cauuaucauc 100
<210> 513
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 513
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aucuaccaca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuua ugauaucauc 100
<210> 514
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 514
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuaauuaca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuuc cuccaucauc 100
<210> 515
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 515
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuauguaca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuau ggguaucauc 100
<210> 516
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 516
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuucgcgca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuca guccaucauc 100
<210> 517
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 517
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aauugcacca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucucu ccauaucauc 100
<210> 518
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 518
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu agauuaacca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuca ugccaucauc 100
<210> 519
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 519
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aguccuacca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuuc cuccaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 520
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu agacaaacca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuac agguaucauc 100
<210> 521
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 521
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aggcuggcca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuac cguuaucauc 100
<210> 522
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 522
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugauucucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuca ccgcaucauc 100
<210> 523
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 523
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uuacauucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 524
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uucaucucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 525
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccaauuucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uuaaucucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuuu ccgcaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 531
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuga caccgaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucuac caauaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 532
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuag uuacaucauc 100
<210> 533
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucucu ugguaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 536
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuuu ugccaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<210> 539
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 539
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuguc ccuggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuug uaguaucauc 100
<210> 540
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 540
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuau cccuaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 541
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 542
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuuu caguaucauc 100
<210> 543
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 543
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucaagc ccaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuau caauaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 544
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucuau uuauaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 545
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucuuc auauaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 546
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cagggagggg gcauuucaau auaucucuuu uuccaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 547
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 548
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 550
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 552
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaagccga auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 553
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacaacgau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucuau guucaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 554
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cagggagggg gcauuucaau auaucucucc cuucaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 555
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 556
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucucg ccgcaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 557
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauucuaau auaucucucc aaguaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 560
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucuag ugauaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 561
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 562
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 563
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 570
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 577
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cagggagggg gcauucuaau auaucucucc uuauaucauc 100
<210> 578
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 578
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaga guccucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucuau cuccaucauc 100
<210> 579
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 579
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcuu gauaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 580
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcga acuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucucc cuccaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 581
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcua uccaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucuuc uugcaucauc 100
<210> 582
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 582
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguca guuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucucg caguaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 583
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguuu gacaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucuau uauuaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 584
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacuau cuaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucucc uuccaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauaaau aaaaucuucu auaggaucca 60
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucucc ggguaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 600
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuca ccgcaucauc 100
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 601
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acacuucaag caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucucc ccgcaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 603
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 604
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acugucucug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucucc uugcaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 605
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acccaguuug caaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 606
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acccucacug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 607
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 608
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 609
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 610
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<211> 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 611
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 612
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 613
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cagggagggg gcauuucaau auaucucucu ccgcaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 614
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cagggagggg gcauucuaau auaucucuuc ccacaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 615
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 616
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 618
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 620
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 621
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucccc uggaaucauc 100
<210> 622
<211> 100
<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 622
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucauu ucgaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 623
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 624
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 625
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 626
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cagggagggg gcauuuuaau auaucuccuc uggaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 627
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 628
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 629
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaaagugga 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 630
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auauuuauaa 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 631
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 632
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 633
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 634
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cagggagggg gcauucuaau auaucucggu uucaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 636
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cagggagggg gcauuuuaau auaucucauu uagaaucauc 100
<210> 637
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 638
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cagggagggg gcauuucaau auaucucccg cccaaucauc 100
<210> 639
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 639
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<210> 640
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 640
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aaugcaccca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucguu uuaaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 641
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acauucccca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucaua ccgaaucauc 100
<210> 642
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 642
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccuuuuucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucauu guaaaucauc 100
<210> 643
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 643
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugcauuucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucuccua uggaaucauc 100
<210> 644
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 644
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccuccuucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucgcg uugaaucauc 100
<210> 645
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 645
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cucuacucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucgac gaaaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 646
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cccuuuucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuccua uggaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 647
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca aucuuaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucccg ucgaaucauc 100
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 648
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc uccgcaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 649
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 650
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg ucgcuaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuccuu ucgaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 651
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc gcaucaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucacu guaaaucauc 100
<210> 652
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 652
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuac cugcgaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucauu uaaaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 653
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuac ggccgaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucauu cccaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 654
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg uaucgaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucguc gggaaucauc 100
<210> 655
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 655
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 656
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucacg uugaaucauc 100
<210> 657
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 657
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuaua agcggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucauu uucaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 658
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucccg uagaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 659
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuaau uacggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuccau cgaaaucauc 100
<210> 660
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 660
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cagggagggg gcauuuuaac auaucucauc ccaaaucauc 100
<210> 661
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 661
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucccgc gcaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucgcu cgaaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 662
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccugg agaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuccuu uuaaaucauc 100
<210> 663
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 663
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucccag ucaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuccuu gggaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 664
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucggga acaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucaac ccgaaucauc 100
<210> 665
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 665
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaccuu uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucacu cagaaucauc 100
<210> 666
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 666
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaguau uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucaag uaaaaucauc 100
<210> 667
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 667
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauggaca cuaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucaau cgaaaucauc 100
<210> 668
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 668
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaagau uuaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucucaag uucaaucauc 100
<210> 669
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 669
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauauagu uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucgau gucaaucauc 100
<210> 670
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 670
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacaggac auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucucccc ucgaaucauc 100
<210> 671
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 671
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacaggug auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucucggu uucaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 672
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 673
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 674
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaugugagu auaggaucca 60
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 675
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 676
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 677
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaccuaagu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 678
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<210> 679
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 679
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 682
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacuaagacu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 683
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 684
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 685
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 698
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 701
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagagu cuucucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 702
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaac ucuuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucucauu ccgaaucauc 100
<210> 703
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 703
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguaa gacaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuccca uagaaucauc 100
<210> 704
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 704
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcga uucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucucgac cccaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 705
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 706
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 707
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 708
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 711
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 712
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauauca gaaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 716
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaccuac aaaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 717
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 718
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 720
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 723
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<220>
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<400> 724
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<220>
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<400> 725
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
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<400> 726
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acauuaccgg caaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 727
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 728
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 730
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 731
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 732
gauauuguga cauaucucug cacucaucac aacgcuaaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuccac caaaaucauc 100
<210> 733
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 733
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 734
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 735
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 736
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 740
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cagggagggg gcaucuuaau auaucucgau ucgaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 742
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 743
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 744
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 745
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 746
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuggcc cguaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 747
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 748
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 749
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 750
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 751
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 752
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 753
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cagggagggg gcauuuuaau auaucuauuc cauaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 754
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cagggagggg gcauuuuaac auaucuaacc uguaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 755
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 756
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aucuagcaca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucugcuu gauaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 757
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cagggagggg gcaucuuaau auaucuaagc aauaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 758
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cagggagggg gcauuuuaau auaucuaauu cguaaucauc 100
<210> 759
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 759
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 760
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cagggagggg gcauuucaau auaucugacc cauaaucauc 100
<210> 761
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 761
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cagggagggg gcauucuaau auaucuggcu uauaaucauc 100
<210> 762
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 762
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 763
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu agccacccca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuauca cguaaucauc 100
<210> 764
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 764
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cucgucucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucugcuc cguaaucauc 100
<210> 765
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 765
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccaucuucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucugguc cauaaucauc 100
<210> 766
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 766
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cacaauucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuggcg uguaaucauc 100
<210> 767
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 767
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uaacguucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuacuu gauaaucauc 100
<210> 768
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 768
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uguauuucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuaagc cauaaucauc 100
<210> 769
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 769
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg acuccaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuaaaa uauaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 770
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg aagaaaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucugccg cauaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 771
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca ucaccaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 772
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca cguuuaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuacua uguaaucauc 100
<210> 773
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 773
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc ccuuuaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuauuu uguaaucauc 100
<210> 774
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 774
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg aauagaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuacuu gauaaucauc 100
<210> 775
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 775
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuga acgcgaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucugcac uguaaucauc 100
<210> 776
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 776
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuga uaucgaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuaguu aauaaucauc 100
<210> 777
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 777
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuau accugaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuauag uguaaucauc 100
<210> 778
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 778
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuag gcucgaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuaaca cauaaucauc 100
<210> 779
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 779
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuagg cguggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuaacu cguaaucauc 100
<210> 780
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 780
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugug uuuggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucuaguu aauaaucauc 100
<210> 781
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 781
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucau cauggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuaccu cauaaucauc 100
<210> 782
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 782
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuagc aguggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuggcc uauaaucauc 100
<210> 783
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 783
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucca cucggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugacc uauaaucauc 100
<210> 784
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 784
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccagu ucaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuaccu uguaaucauc 100
<210> 785
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 785
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucggau cgaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucuaguu uguaaucauc 100
<210> 786
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 786
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucguga ugaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuggcg cguaaucauc 100
<210> 787
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 787
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgacc ucaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucugcgc gauaaucauc 100
<210> 788
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 788
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccgag caaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugcag uguaaucauc 100
<210> 789
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 789
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaugau cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuagua uauaaucauc 100
<210> 790
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 790
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauggugc cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucugaug uauaaucauc 100
<210> 791
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 791
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauacagg uuaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuaacg gauaaucauc 100
<210> 792
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 792
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugacgu uuaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuacgu uguaaucauc 100
<210> 793
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 793
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaucaa uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugacc uauaaucauc 100
<210> 794
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 794
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaagaacg auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuacca uguaaucauc 100
<210> 795
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 795
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaagggugg auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucuagcu cauaaucauc 100
<210> 796
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 796
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaagagccg auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuggcc uauaaucauc 100
<210> 797
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 797
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaaugggg auaggaucca 60
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<210> 798
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 798
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaauacac auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugacu cauaaucauc 100
<210> 799
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 799
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacggaaau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuaauu uauaaucauc 100
<210> 800
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 800
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacagguau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucuggcg gauaaucauc 100
<210> 801
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 801
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cagggagggg gcauucuaau auaucuaacu cguaaucauc 100
<210> 802
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 802
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caauugccau auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuauuu uguaaucauc 100
<210> 803
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 803
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacguacau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugauu gauaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 804
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cauaagcacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucugaaa uauaaucauc 100
<210> 805
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 805
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cagggagggg gcauuucaau auaucugcag uguaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 806
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caccugcccu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuggcu aauaaucauc 100
<210> 807
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 807
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cauacgcgcu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuaccc cguaaucauc 100
<210> 808
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 808
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cauccacacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuaacg cauaaucauc 100
<210> 809
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 809
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<210> 810
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 810
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cagggagggg gcauuucaau auaucuaguu uauaaucauc 100
<210> 811
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 811
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccccgacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuagcc uauaaucauc 100
<210> 812
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 812
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccaugacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucuaacc uguaaucauc 100
<210> 813
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 813
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccuuuaaucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucuaacg cguaaucauc 100
<210> 814
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 814
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug agcgcauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucugcgc uguaaucauc 100
<210> 815
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 815
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gccugguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucugccc cguaaucauc 100
<210> 816
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 816
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug aauaaguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuagau uguaaucauc 100
<210> 817
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 817
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug acucgauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucugacu cguaaucauc 100
<210> 818
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 818
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug gucugguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugguc uguaaucauc 100
<210> 819
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 819
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua ggucgcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucugaca uguaaucauc 100
<210> 820
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 820
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua acugccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucuaauc cguaaucauc 100
<210> 821
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 821
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua uucuacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucuaccu cguaaucauc 100
<210> 822
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 822
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu augggcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucugccc cguaaucauc 100
<210> 823
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 823
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaaa guguucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucuauuc cguaaucauc 100
<210> 824
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauucuaau auaucuagug uguaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 826
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<400> 846
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 885
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auccaacgca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucggaac ccuaaucauc 100
<210> 886
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 886
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aguccagcca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucaggcu ccuaaucauc 100
<210> 887
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 887
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aaauuuccca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggccc ucuaaucauc 100
<210> 888
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 888
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aguaucccca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucaggcc ucuaaucauc 100
<210> 889
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 889
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aaaaauacca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucggccu ccuaaucauc 100
<210> 890
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 890
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aaguaaacca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucagacc ccuaaucauc 100
<210> 891
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 891
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cuuuuuucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucauacu ccuaaucauc 100
<210> 892
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 892
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugaccuucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucaaucg ccuaaucauc 100
<210> 893
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 893
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccguacucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucaauac ucuaaucauc 100
<210> 894
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 894
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccuuucucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucaagcu ccuaaucauc 100
<210> 895
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 895
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cgacgcucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucgacuu ccuaaucauc 100
<210> 896
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 896
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca acgccaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauccaaag ucuaaucauc 100
<210> 897
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 897
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc aacgcaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucaccuu ucuaaucauc 100
<210> 898
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 898
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca gcgcaaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucagcau ccuaaucauc 100
<210> 899
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 899
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg ugucaaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auauccaaau ucuaaucauc 100
<210> 900
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 900
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg aauaaaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucagcuu ucuaaucauc 100
<210> 901
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 901
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuac gaaagaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucggaau ccuaaucauc 100
<210> 902
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 902
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg uccugaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucguaau ucuaaucauc 100
<210> 903
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 903
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc accugaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucgacac ccuaaucauc 100
<210> 904
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 904
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuag gaaagaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucaggua ucuaaucauc 100
<210> 905
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 905
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuac gacagaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucguaca ccuaaucauc 100
<210> 906
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 906
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugug ggcggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucagcuc ccuaaucauc 100
<210> 907
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 907
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucau cgcggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucgguac ccuaaucauc 100
<210> 908
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 908
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuagc cuuggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucgggcu ccuaaucauc 100
<210> 909
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 909
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugaa cacggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucaagcu ucuaaucauc 100
<210> 910
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 910
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugcg cguggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucgccuu ccuaaucauc 100
<210> 911
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 911
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccugg agaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucaauuc ucuaaucauc 100
<210> 912
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 912
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgcaa acaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucguauc ucuaaucauc 100
<210> 913
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 913
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucggug cgaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucaaacu ucuaaucauc 100
<210> 914
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 914
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgagg aaaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucaggcc ucuaaucauc 100
<210> 915
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 915
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccgga agaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucaaacc ccuaaucauc 100
<210> 916
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 916
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauagcgc cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucggcuu ucuaaucauc 100
<210> 917
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 917
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaagua uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucaacau ucuaaucauc 100
<210> 918
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 918
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauagaau uuaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucagcuu ucuaaucauc 100
<210> 919
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 919
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaguag uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucagauc ucuaaucauc 100
<210> 920
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 920
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaggccac auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucaaguc ccuaaucauc 100
<210> 921
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 921
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaauagug auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auauccaccg ccuaaucauc 100
<210> 922
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 922
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaagaggac auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucgguca ucuaaucauc 100
<210> 923
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 923
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaagggcaa auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucaggca ucuaaucauc 100
<210> 924
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 924
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacgaccau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauccaaau ccuaaucauc 100
<210> 925
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 925
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaccauaau auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucagucg ucuaaucauc 100
<210> 926
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 926
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacgaauau auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucgauac ccuaaucauc 100
<210> 927
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 927
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caauuagcau auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucgccau ucuaaucauc 100
<210> 928
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 928
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacgacggu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucguguu ucuaaucauc 100
<210> 929
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 929
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caccuagacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucggaau ucuaaucauc 100
<210> 930
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 930
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cauuggcccu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auauccaaca ccuaaucauc 100
<210> 931
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 931
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacggacacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucagauu ucuaaucauc 100
<210> 932
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 932
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cauccauacu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auauccaacu ucuaaucauc 100
<210> 933
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 933
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cauucgggcu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucagguu ccuaaucauc 100
<210> 934
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 934
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cucccuaucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauccaccu ccuaaucauc 100
<210> 935
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 935
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 936
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 936
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cucgcugucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucguacu ccuaaucauc 100
<210> 937
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 937
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cuugcacucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucggcuu ucuaaucauc 100
<210> 938
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 938
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cccagaaucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucaguaa ucuaaucauc 100
<210> 939
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 939
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug aauuuauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucgauac ucuaaucauc 100
<210> 940
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 940
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug guugcguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucacaua ccuaaucauc 100
<210> 941
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 941
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug accgcauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucaggug ccuaaucauc 100
<210> 942
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 942
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug aacgcauucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucgcccc ccuaaucauc 100
<210> 943
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 943
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaua ccacccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucauaag ccuaaucauc 100
<210> 944
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 944
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu augcccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucgaauu ccuaaucauc 100
<210> 945
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 945
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu gaccacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucagcau ccuaaucauc 100
<210> 946
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 946
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu agugccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucagguc ccuaaucauc 100
<210> 947
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 947
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu uuauacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucggguu ccuaaucauc 100
<210> 948
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 948
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagacu uaccucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaucggaua ucuaaucauc 100
<210> 949
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 949
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagacu aguuucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 950
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaca accuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaucgagac ccuaaucauc 100
<210> 951
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 951
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaaa ucgcucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 952
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaac auuuucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 953
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 964
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauaaau aaaaucuucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 965
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaauauuu aaaaucuucu auaggaucca 60
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 966
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 967
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 968
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacuuuuu caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucauauu ucuaaucauc 100
<210> 969
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 969
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 970
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaacuacac caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaucaaaau ucuaaucauc 100
<210> 971
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 971
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acacaaaucg caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauccauuu ucuaaucauc 100
<210> 972
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 972
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 974
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cagggagggg gcaucuuaau auaucguauu ccuaaucauc 100
<210> 975
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 975
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cagggagggg gcauuuuaau auaucgaucu ucuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 976
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cagggagggg gcauuuuaac auaucguguu ucuaaucauc 100
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<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 977
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 978
gauauuguga cauaucucug cacucaucac accgcuucug caaaucuucu auaggaucca 60
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<210> 979
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 979
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cagggagggg gcaucuuaau auaucaacuc ccuaaucauc 100
<210> 980
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 980
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acuuuacuug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaucgugcu ucuaaucauc 100
<210> 981
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 981
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 982
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 984
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cagggagggg gcauuuuaau auaucaacac ccuaaucauc 100
<210> 985
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 985
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 986
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 987
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 988
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<210> 989
<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 989
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<220>
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<400> 990
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<220>
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<400> 991
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<220>
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<400> 992
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cagggagggg gcauucuaau auauagggcu acuaaucauc 100
<210> 993
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 993
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
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<400> 994
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 995
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 996
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cagggagggg gcauuucaau auaugagaau acuaaucauc 100
<210> 997
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 997
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 998
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<210> 999
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 999
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<210> 1000
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1000
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<210> 1001
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1001
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cagggagggg gcauucuaau auauggaaau acuaaucauc 100
<210> 1002
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1002
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cagggagggg gcaucuuaau auauaaggcu acuaaucauc 100
<210> 1003
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1004
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cagggagggg gcauuucaau auaugcauuu acuaaucauc 100
<210> 1005
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1005
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acuucgccca 60
cagggagggg gcauucuaau auaugcauac acuaaucauc 100
<210> 1006
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1006
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aguuaagcca 60
cagggagggg gcaucuuaau auauauaguc acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1007
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aauuaagcca 60
cagggagggg gcauuuuaau auauagauac acuaaucauc 100
<210> 1008
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1008
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uuuucuucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaugagagu acuaaucauc 100
<210> 1009
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1009
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uauuguucca 60
cagggagggg gcauuucaau auauauaacu acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1010
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugacacucca 60
cagggagggg gcauucuaau auauaaaccc acuaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1011
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cuuaucucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaugaaccu acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1012
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uguaccucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auauaaccac acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca cuucaaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauauuacc acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuucaau auaugauacc acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1016
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg acuccaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaugcaucc acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca ccgaaaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaugcauau acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuag ucucgaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaugaaccc acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauucuaau auauaacaac acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1020
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg caccgaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auauagaguu acuaaucauc 100
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaau auauagacgu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1022
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugac aauggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauaaccau acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuucaau auauaacauu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucucac gacggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaugcaguu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1025
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuguu uccggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auauggagcc acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1026
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuggc uuuggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<210> 1028
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1028
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccuag agaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auauauaaau acuaaucauc 100
<210> 1029
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1029
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccugc ggaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auauaagacu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1030
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauccgau cgaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaugguuau acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1031
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucaagu ucaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auauagagcu acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1032
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cagggagggg gcauuuuaac auauacguac acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1033
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cagggagggg gcauuucaau auauaaaccu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1034
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugaaug cuaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1035
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauggcuu uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auauaaacgc acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaac auaugauauc acuaaucauc 100
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<220>
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<400> 1037
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<400> 1039
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1040
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1041
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cagggagggg gcauuuuaac auaugaacac acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcaucuuaau auaugcaacu acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1047
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cagggagggg gcauuucaau auauauaguc acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1048
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug cacuaggacu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auauaccauu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
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<220>
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<400> 1053
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1057
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1058
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1067
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaga gacuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auauacguuu acuaaucauc 100
<210> 1068
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1068
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagacc ucguucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaugcaccc acuaaucauc 100
<210> 1069
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1069
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaga uuucucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auauacgguu acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguca gguaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auauaggacc acuaaucauc 100
<210> 1071
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcga uucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auauaagguu acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1089
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1091
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1100
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cagggagggg gcauucuaau auaugcguuu acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1101
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1105
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1107
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1108
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auagcccaua acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1109
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auaggaucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1110
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1111
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1113
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auuuuugaca 60
cagggagggg gcauuucaau auaagagcca acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1115
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cagggagggg gcaucuuaau auaagcagca acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1116
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu auccccagca 60
cagggagggg gcauuuuaau auacgaaaca acuaaucauc 100
<210> 1117
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1117
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu accuuuccca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaguaauca acuaaucauc 100
<210> 1118
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1118
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acgaaaccca 60
cagggagggg gcauuucaau auacagagaa acuaaucauc 100
<210> 1119
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1119
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cagggagggg gcauucuaau auaaacggaa acuaaucauc 100
<210> 1120
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1120
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu aacaacacca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaagcagua acuaaucauc 100
<210> 1121
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1121
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu acucucgcca 60
cagggagggg gcauuuuaau auagagguaa acuaaucauc 100
<210> 1122
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1122
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cagggagggg gcauuuuaac auagagguaa acuaaucauc 100
<210> 1123
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1123
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cagggagggg gcauuucaau auagcaggaa acuaaucauc 100
<210> 1124
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<212> RNA
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1124
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cagaauucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaaacguca acuaaucauc 100
<210> 1125
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1125
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ccguucucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaggcguua acuaaucauc 100
<210> 1126
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1126
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu cccucuucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaaggagua acuaaucauc 100
<210> 1127
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1127
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca gauucaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auacggacaa acuaaucauc 100
<210> 1128
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1128
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca cuccuaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaaggaaua acuaaucauc 100
<210> 1129
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1129
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucg ucgauaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaguacgca acuaaucauc 100
<210> 1130
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1130
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca cgucaaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaaggagua acuaaucauc 100
<210> 1131
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1131
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc cacucaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auagacagca acuaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1132
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc uccugaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auagaaaaaa acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1133
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuaa ucgagaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1134
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugc gguugaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaggugcaa acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuaa aauagaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaaagggca acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1136
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuugg ccucgaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaagaagaa acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuaua acuggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuucaau auacgccaca acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugac ggcggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auacacauaa acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1140
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuagc gauggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaguagaca acuaaucauc 100
<210> 1141
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1141
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucugag uccggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaaugggua acuaaucauc 100
<210> 1142
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1142
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgcga cgaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaggaguca acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1143
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucccag ggaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaagcacca acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1144
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucaaca agaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaaugacca acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1145
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucguac cgaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auagaguaua acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1146
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucgguc agaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaggccgca acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1147
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugcauc cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auacggguca acuaaucauc 100
<210> 1148
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1148
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauagauu cuaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaaaaagua acuaaucauc 100
<210> 1149
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1149
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugaggc cuaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auacggaaua acuaaucauc 100
<210> 1150
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1150
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaauaaaag uuaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auagggagca acuaaucauc 100
<210> 1151
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1151
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaugacag uuaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auagacguca acuaaucauc 100
<210> 1152
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1152
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaacaacgg auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaaugggaa acuaaucauc 100
<210> 1153
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1153
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaaaccga auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaccaggua acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1154
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaaacgac auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auagaaacca acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1155
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cagggagggg gcaucuuaau auaauauaaa acuaaucauc 100
<210> 1156
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1156
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaggccgg auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaagcagaa acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1157
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caacgaaagu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1158
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1159
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cagggagggg gcauucuaau auaagcaaua acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1160
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caauugcuau auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auagaagaca acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1161
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1163
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cagggagggg gcauuucaau auaaugagaa acuaaucauc 100
<210> 1164
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1164
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cagggagggg gcauucuaau auaggugcaa acuaaucauc 100
<210> 1165
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1165
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1166
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1167
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1168
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cagggagggg gcauuucaau auaguaguca acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1169
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccuggcgucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auacgaaaua acuaaucauc 100
<210> 1170
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1170
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccugcggucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaagggaaa acuaaucauc 100
<210> 1171
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1171
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug ccccgaaucu auaggaucca 60
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1172
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<210> 1173
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1173
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cagggagggg gcauuucaau auaagcguua acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1174
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug guucaguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auaaugggaa acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1175
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1176
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug guugaguucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auagacggca acuaaucauc 100
<210> 1177
<211> 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1177
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cagggagggg gcauuuuaac auagaguaua acuaaucauc 100
<210> 1178
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1178
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu gaccacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaaaccgca acuaaucauc 100
<210> 1179
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1179
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc uuacgcuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auacgcacaa acuaaucauc 100
<210> 1180
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1180
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauu uaccacuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auacggacaa acuaaucauc 100
<210> 1181
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1181
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagauc uccaccuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auaaacacca acuaaucauc 100
<210> 1182
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1182
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaga ggcuucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auacaggaca acuaaucauc 100
<210> 1183
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1183
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cagggagggg gcauuucaau auaauggcca acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1184
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<210> 1185
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1185
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaga ccucucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaaagguca acuaaucauc 100
<210> 1186
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1186
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcaa uacaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auagcgguca acuaaucauc 100
<210> 1187
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1187
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcau aucaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaaacagaa acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1188
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcua gauaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auacacccaa acuaaucauc 100
<210> 1189
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1189
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguca guuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau auaauagaua acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcua gguaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaau auacgagcca acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1191
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaucca auaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auaguauuca acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaac auagaaguua acuaaucauc 100
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1228
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1229
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1230
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<220>
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<220>
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<400> 1233
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<220>
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1237
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uauaccucca 60
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1238
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu uuuauuucca 60
cagggagggg gcauucuaau aucauggaga acuaaucauc 100
<210> 1239
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1239
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucu ugcaauucca 60
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1240
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuucc gagucaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac auugagggga acuaaucauc 100
<210> 1241
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1241
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cagggagggg gcauuucaau aucggaagga acuaaucauc 100
<210> 1242
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1242
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuca caaauaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auuuggaaga acuaaucauc 100
<210> 1243
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1243
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<210> 1244
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1244
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cagggagggg gcauuuuaau auuaaguaga acuaaucauc 100
<210> 1245
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1245
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<210> 1246
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1246
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagaug caaaucuuaa ggcagaucca 60
cagggagggg gcauucuaau auuaguacga acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1425
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1426
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuucaau ugcagacuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1488
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaagcuu ucuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauucuaau cgacggcuga acuaaucauc 100
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<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1489
gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaaguca ucuaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcaucuuaau uauaggcuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaaacaga auaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac ucuaagcuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1492
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1493
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuuuaac acaggacuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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gauauuguga cauaucucug cacucaucac acaaugcagc caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau cagguacuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcaucuuaau cuccgacuga acuaaucauc 100
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1509
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cagggagggg gcauuuuaau cgaguacuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1511
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1512
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1513
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1514
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1515
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cagggagggg gcauuuuaac acgcggcuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1516
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1517
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1518
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cagggagggg gcaucuuaau ugaaaccuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1520
gauauuguga cauaucucug cacucaucac uuuacugaug caaaucuucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuuuaac ucuuaacuga acuaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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cagggagggg gcauuucaau ugcguacuga acuaaucauc 100
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1522
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<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1524
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acgggagggg agauuuuaau ccaucucuga uguaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1526
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caggccuugg gcauuucuuc auaucucucu uguaaucauc 100
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1527
gauauugugc gaauucucug cagauuccac acaaacaagc caaaucuuga uucggaucca 60
ccacaugggg gcauacuucu auaucucauu cguaaucauc 100
<210> 1528
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1528
gaccugggga cauaucgaga gucucaucac cucuaugaug caaaacacgg auaggaucau 60
cucagagggg gcuuuaacau auaucuauaa uguaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1529
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gugggagggg auaauacaau auaucgguca uguaaucauc 100
<210> 1530
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1530
gauacuauua auuaucucug guggauggac acaaaaacuc cgucucuucu aucuaauagu 60
cagggaggcg auuuaguaau auaugcgucc aauaaucauc 100
<210> 1531
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1531
gauacgguga cauauccgug cacucaucca acaaaagaug guaaucuucu auucgaucca 60
cagguugggg gcauuuguau auaucucuac acuaaucauc 100
<210> 1532
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1532
gauauugugu guuaucucug cagaaaucac acaaaccuug caaaucuuag cuaggaucca 60
cuaugagggg gcauaccaau auaucucaau acuaaucauc 100
<210> 1533
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1533
gaguacguga cauauccacc cacucaucac cuccaagaug caaaguaacu auaggaucau 60
cugggagggg gcugaauaau auaucugauc acuaaucauc 100
<210> 1534
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1534
gauauuguga guacacucug cacucccaaa acaaaagaug gucaccuucu auaggcuagu 60
cagggagggg uaaaauuaau auaucaaccu acuaaucauc 100
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1535
gauacuuuau cauaucucug guuggcucac acaaaauaca guaaucuucu auccuacgca 60
cagggaggcc uaccuuuaau auauaagcac acuaaucauc 100
<210> 1536
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1536
gauauuguga cauaugcaua aucucaucac acuucauucg caaaucuucg cgaugcucca 60
cagggauuuc ccuuuuuaau auacaccccc acuaaucauc 100
<210> 1537
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1537
gauauuguga gcugcaaaug cacucaucug ugacccgaug caaauccuac acaagaucca 60
caggcauugc ugauuuuaau auuugggcgu acuaaucauc 100
<210> 1538
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1538
gaccuuguga cauaucgaug cacucaucac cgaaaagaug caaacauucu auaggaucau 60
cagggagggg gcucuuuaau auaucugaga acuaaucauc 100
<210> 1539
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1539
gauauuguga accaucucug cacuccggac acaaaagaug guuaucuucu auagguagca 60
cagggagggg aacuuuuaau auauccagga acuaaucauc 100
<210> 1540
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1540
gauaacaaga cauaucucug guagcaucac acaaaacucc caaaucuucu aucccuucca 60
cagggaggcu cgauuuuaau auauauaaga acuaaucauc 100
<210> 1541
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1541
gauauuguga cauaugaauu cacucaucac acuuuaaaug caaaucuuca cucugaucca 60
cagggaucac ucauuuuaau auacaggcga acuaaucauc 100
<210> 1542
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1542
gauauuguga guuccgucug cacucaucug aaauaagaug caaaucgcag agaggaucca 60
caggcccaca gcauuuuaau aucagcccga acuaaucauc 100
<210> 1543
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1543
gauauccgaa guuaucucug cacuaccccc ucaaaagaug caacaaaugg auaggaucca 60
caccucgacg gcauuuuaau aaaggccgga acuaaucauc 100
<210> 1544
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1544
gauauuguga cauaucucug aaggguagac acaaaagaug accuguaccu auaggaucca 60
guauacaagg gcauuuuaau ugugauaaga acuaaucauc 100
<210> 1545
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1545
gauaagguga cauaucucug gucucaucac acaaaaccug caaaucuucu auuugaucca 60
cagggaggau gcauuuuaau auaugccuga acuaaucauc 100
<210> 1546
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1546
gauauuguga cauauauaug cacucaucac accuuagaug caaaucuucc caaggaucca 60
cagggauaag gcauuuuaau auaggacuga acuaaucauc 100
<210> 1547
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<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1547
gauauuguga gccuucucug cacucaucug ugaaaagaug caaauccggc auaggaucca 60
caggcaccgg gcauuuuaau auuaggcuga acuaaucauc 100
<210> 1548
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1548
gauaugcuuc cauaucucug cacuauaguc acaaaagaug caauaauccu auaggaucca 60
cauuaccggg gcauuuuaau aaugaccuga acuaaucauc 100
<210> 1549
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1549
gauauuguga cauaucucug auguguucac acaaaagaug aacucguucu auaggaucca 60
auuacugggg gcauuuuaau uaagaccuga acuaaucauc 100
<210> 1550
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1550
gauauuguga cauaucgguc gaaucaucac acaaaagcga guuuucuucu auaggaucau 60
uaaaaagggg gcauuuuaag auuuaccuga acuaaucauc 100
<210> 1551
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1551
gauauuguga caaccacgac cacucaucac acaauaaaaa cuaaucuucu auaggaaagu 60
aucagagggg gcauuuuaug cgcuugcuga acuaaucauc 100
<210> 1552
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1552
gauauuguga gcuaucucug cacucauccg acaaaagaug caaaucggcu auaggaucca 60
cagguugggg gcauuuuaau aucacucuga acuaaucauc 100
<210> 1553
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1553
gauauccgga cauaucucug cacugugcac acaaaagaug caaugguucu auaggaucca 60
caaccagggg gcauuuuaau agcccucuga acuaaucauc 100
<210> 1554
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1554
gauauuguga cauaucucug guaacaucac acaaaagaug auucucuucu auaggaucca 60
aaucgagggg gcauuuuaau ccaacucuga acuaaucauc 100
<210> 1555
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1555
gauauuguga cauaucgacc aacucaucac acaaaagucc guaaucuucu auaggaucgu 60
ccuggagggg gcauuuuaac ugaacucuga acuaaucauc 100
<210> 1556
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1556
gauauuguga cagugaagug cacucaucac acaauuaaau caaaucuucu auaggaaaga 60
augggagggg gcauuuuaua agaccucuga acuaaucauc 100
<210> 1557
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1557
gauauuguuu uucaccucug cacucaucac aguucaacug caaaucuucu auagcagaaa 60
aagggagggg gcauuuucua uuuacucuga acuaaucauc 100
<210> 1558
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1558
gauacgagaa guuaucucug cacucauccu ugauccgaug caaaucuucu auccguuagu 60
cagggagggg gcauuugccu aaaacucuga acuaaucauc 100
<210> 1559
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1559
gauauuguga cagcucucug cacucaucac acaaucgaug caaaucuucu auaggauaca 60
cagggagggg gcauuuuaug auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1560
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1560
gauauugucc gauaucucug cacucaucac aaacaagaug caaaucuucu auaguuccca 60
cagggagggg gcauuuuucg auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1561
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1561
gauaggccga cauaucucug cacucaucug ugaaaagaug caaaucuucu aucuacucca 60
cagggagggg gcauuuguag auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1562
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1562
gauauuguga cauaucucug cacucccgug acaaaagaug caaaucuucu uucauaucca 60
cagggagggg gcauucguuc auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1563
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1563
gauauuguga cauaucucug cagcgcuaac acaaaagaug caaaucuugg agccgaucca 60
cagggagggg gcaucgucac auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1564
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1564
gauauuguga cauaucucua aagaauucac acaaaagaug caaaucauau uuuggaucca 60
cagggagggg gcagauucua auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1565
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1565
gauauuguga cauaucgaga gugacaucac acaaaagaug caaacgguau uaaggaucca 60
cagggagggg gccuauaacc auaucucuga acuaaucauc 100
<210> 1566
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1566
gccauugugu gauaucugag cacuccgcac acaccagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1567
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1567
gauaugcaga cauagaccug caccuuucac acuauagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1568
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1568
guucguguga ccaaacucug ccaagaucac aguauagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1569
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1569
gauauugucc aaaaucucuc uuuccaucac uguucagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1570
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1570
gugauuguga cuaaucucug ccgucaucac aauaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1571
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1571
gauauugucc aauaucucua aucucaucac uguaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1572
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1572
gauaucuuua cauaucuggu gacucaucaa ccuaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1573
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1573
gaaagucuga cauaugcacc cacucaucug aauaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1574
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1574
gauauacuga cauaucuaag cacucaucag ccaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1575
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1575
gaguguguga cauaugagug cacucauccu ucaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1576
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1576
gauauuguga cauuggccug cacucaugua ucaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1577
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1577
gauauuguga ccuuaaucug cacucagccu ucaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1578
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1578
gauauuguga cauugcucug cacucaugcc acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1579
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1579
gauauuguga cuacucucug cacucaagcc acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1580
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1580
gauauugugu gucaucucug cacuccuacc acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1581
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1581
gauauuggca guuaucucug cacuguaguc acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1582
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1582
gauauugugu aauaucucug cacucuacac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1583
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1583
gauauugauu cauaucucug cacugcgcac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1584
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1584
gauauauaaa cauaucucug cacagcccac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1585
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1585
gauucaagga cauaucucug cagaaaacac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1586
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1586
gauauccuga cauaucucug cacaaaucac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1587
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1587
gauucaguga cauaucucug cagcgaucac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1588
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1588
gcgcguguga cauaucucug ccaaaaucac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1589
<211> 100
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1589
gauauuguga cauaucucug augggaucac acaaaagaug ccugaccucu auaggaucca 60
cagggagggg gcauuucaau auaucggaac ucuaaucauc 100
<210> 1590
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1590
taggctttct ggctttttac cggaaagccc ct 32
<210> 1591
<211> 32
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1591
uaggcuuucu ggcuuuuuac cggaaagccc cu 32
<210> 1592
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1592
caggttttct gacttcggtc ggaaaacccc t 31
<210> 1593
<211> 31
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1593
cagguuuucu gacuucgguc ggaaaacccc u 31
<210> 1594
<211> 11
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1594
aatttttgga g 11
<210> 1595
<211> 11
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成寡核苷酸
<400> 1595
aauuuuugga g 11
<210> 1596
<211> 249
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1596
gagggcctat ttcccatgat tccttcatat ttgcatatac gatacaaggc tgttagagag 60
ataattagaa ttaatttgac tgtaaacaca aagatattag tacaaaatac gtgacgtaga 120
aagtaataat ttcttgggta gtttgcagtt ttaaaattat gttttaaaat ggactatcat 180
atgcttaccg taacttgaaa gtatttcgat ttcttggctt tatatatctt gtggaaagga 240
cgaaacacc 249
<210> 1597
<211> 341
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1597
gtactgagtc gcccagtctc agatagatcc gacgccgcca tctctaggcc cgcgccggcc 60
ccctcgcaca gacttgtggg agaagctcgg ctactcccct gccccggtta atttgcatat 120
aatatttcct agtaactata gaggcttaat gtgcgataaa agacagataa tctgttcttt 180
ttaatactag ctacatttta catgataggc ttggatttct ataagagata caaatactaa 240
attattattt taaaaaacag cacaaaagga aactcaccct aactgtaaag taattgtgtg 300
ttttgagact ataaatatcc cttggagaaa agccttgttt g 341
<210> 1598
<211> 263
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1598
ttaacaacaa cgaaggggct gtgactggct gctttctcaa ccaatcagca ccgaactcat 60
ttgcatgggc tgagaacaaa tgttcgcgaa ctctagaaat gaatgactta agtaagttcc 120
ttagaatatt atttttccta ctgaaagtta ccacatgcgt cgttgtttat acagtaatag 180
gaacaagaaa aaagtcacct aagctcaccc tcatcaattg tggagttcct ttatatccca 240
tcttctctcc aaacacatac gca 263
<210> 1599
<211> 257
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1599
ttaacaacat aggagctgtg attggctgtt ttcagccaat cagcactgac tcatttgcat 60
agcctttaca agcggtcaca aactcaagaa acgagcggtt ttaatagtct tttagaatat 120
tgtttatcga accgaataag gaactgtgct ttgtgattca catatcagtg gaggggtgtg 180
gaaatggcac cttgatctca ccctcatcga aagtggagtt gatgtccttc cctggctcgc 240
tacagacgca cttccgc 257
<210> 1600
<211> 393
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1600
taaggaccag cttctttggg agagaacaga cgcaggggcg ggagggaaaa agggagaggc 60
agacgtcact tcctcttggc gactctggca gcagattggt cggttgagtg gcagaaaggc 120
agacggggac tgggcaaggc actgtcggtg acatcacgga cagggcgact tctatgtaga 180
tgaggcagcg cagaggctgc tgcttcgcca cttgctgctt cgccacgaag ggagttcccg 240
tgccctggga gcgggttcag gaccgctgat cggaagtgag aatcccagct gtgtgtcagg 300
gctggaaagg gctcgggagt gcgcggggca agtgaccgtg tgtgtaaaga gtgaggcgta 360
tgaggctgtg tcggggcaga gcccgaagat ctc 393
<210> 1601
<211> 698
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<400> 1601
atacgcgttg acattgatta ttgactagtt attaatagta atcaattacg gggtcattag 60
ttcatagccc atatatggag ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc ccgcctggct 120
gaccgcccaa cgacccccgc ccattgacgt caataatgac gtatgttccc atagtaacgc 180
caatagggac tttccattga cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact gcccacttgg 240
cagtacatca agtgtatcat atgccaagta cgccccctat tgacgtcaat gacggtaaat 300
ggcccgcctg gcattatgcc cagtacatga ccttatggga ctttcctact tggcagtaca 360
tctacgtatt agtcatcgct attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac atcaatgggc 420
gtggatagcg gtttgactca cggggatttc caagtctcca ccccattgac gtcaatggga 480
gtttgttttg gcaccaaaat caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac tccgccccat 540
tgacgcaaat gggcggtagg cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga gctcgtttag 600
tgaaccgtca gatcgcctgg agacgccatc cacgctgttt tgacctccat agaagacacc 660
gggaccgatc cagcctccgg actctagagg atcgaacc 698
<210> 1602
<211> 105
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<220>
<221> 经修饰的_碱基
<222> (1)..(1)
<223> a、c、t、g、未知的或其他
<400> 1602
nactgggagt ggccattcga cgacagtgtg gtgtaaagga attcattagc catggatgta 60
ttcatgaaag gactttcaaa ggccaaggag ggagttgtgg ctgct 105
<210> 1603
<211> 105
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述：合成多核苷酸
<220>
<221> 经修饰的_碱基
<222> (105)..(105)
<223> a、c、t、g、未知的或其他
<400> 1603
agcagccaca actccgggaa cccctttgaa agtcctttcc cgaatacatc cacggctaaa 60
cttctccttt acaccacact gtcgtcgatt aggccactcc cagtn 105
Claims (228)
1.一种包含工程化指导RNA或编码所述工程化指导RNA的工程化多核苷酸的组合物，其中：
a)在与DUX4靶RNA的序列杂交后，所述工程化指导RNA与所述DUX4靶RNA的序列形成指导-靶RNA支架；
b)所述指导-靶RNA支架的形成基本上形成了一种或多种选自由以下组成的组的结构特征：凸起、内部环、发夹，以及由所述工程化指导RNA中的碱基与所述DUX4靶RNA中的G、C或U形成的错配；并且
c)在所述工程化指导RNA与所述DUX4靶RNA杂交之前，所述结构特征不存在于所述工程化指导RNA内；并且
d)当所述工程化指导RNA与所述DUX4靶RNA的序列杂交后，所述工程化指导RNA促进RNA编辑实体对所述DUX4靶RNA的序列中的一个或多个靶腺苷进行RNA编辑。
2.如权利要求1所述的组合物，其中所述DUX4靶RNA的序列包含翻译起始位点、polyA信号序列、剪接位点或其任何组合。
3.如权利要求2所述的组合物，其中所述DUX4靶RNA的序列包含所述polyA信号序列。
4.如权利要求1所述的组合物，其中所述一种或多种特征还包括由所述工程化指导RNA中的碱基与所述DUX4靶RNA中的A形成的错配。
5.如权利要求1所述的组合物，其中所述DUX4是DUX4-FL。
6.如权利要求5所述的组合物，其中所述DUX4靶RNA的序列包含所述polyA信号序列，其中所述polyA信号序列在DUX4-FL中。
7.如权利要求6所述的组合物，其中所述polyA信号序列包含ATTAAA。
8.如权利要求7所述的组合物，其中所述ATTAAA polyA信号序列的任何A是所述靶腺苷。
9.如权利要求5-8中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置0是所述靶腺苷，其中位置0是ATTAAA在5'端的第一个A。
10.如权利要求9所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括：
在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-10和-11。
11.如权利要求10所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。
12.如权利要求11所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。
13.如权利要求12所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
14.如权利要求13所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1054。
15.如权利要求10所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。
16.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。
17.如权利要求16所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:977具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
18.如权利要求17所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:977。
19.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。
20.如权利要求19所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:934具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
21.如权利要求20所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:934。
22.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。
23.如权利要求22所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
24.如权利要求23所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。
25.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5内部环及其任何组合。
26.如权利要求25所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
27.如权利要求26所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573。
28.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5内部环及其任何组合。
29.如权利要求28所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
30.如权利要求29所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。
31.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。
32.如权利要求31所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
33.如权利要求32所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。
34.如权利要求15所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。
35.如权利要求34所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
36.如权利要求35所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588。
37.如权利要求10所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。
38.如权利要求37所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。
39.如权利要求38所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
40.如权利要求39所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:593。
41.如权利要求5-8中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置3是所述靶腺苷，其中位置3是ATTAAA从5'端起的第二个A。
42.如权利要求41所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括：
在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：22、21、20、-2、-4、-5、-6、-7、-8、-9和-10。
43.如权利要求42所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置20处。
44.如权利要求43所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置3处的A/C错配。
45.如权利要求44所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:8具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
46.如权利要求45所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:8。
47.如权利要求42所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。
48.如权利要求47所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。
49.如权利要求48所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
50.如权利要求49所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1054。
51.如权利要求42所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。
52.如权利要求51所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置42处的第二6/6对称内部环及其组合。
53.如权利要求52所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:977具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
54.如权利要求53所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:977。
55.如权利要求51所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。
56.如权利要求55所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
57.如权利要求56所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。
58.如权利要求51所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。
59.如权利要求58所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
60.如权利要求59所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。
61.如权利要求51所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。
62.如权利要求61所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
63.如权利要求62所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573。
64.如权利要求51所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。
65.如权利要求64所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
66.如权利要求65所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588。
67.如权利要求51所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。
68.如权利要求67所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
69.如权利要求68所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。
70.如权利要求42所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。
71.如权利要求70所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。
72.如权利要求71所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
73.如权利要求72所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:593。
74.如权利要求41所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括：在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一2/2对称凸起：-3、-5和-7。
75.如权利要求74所述的组合物，其中所述第一2/2对称凸起在相对于位置0的位置-5处。
76.如权利要求75所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置26处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置42处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置58处的2/2对称凸起、在相对于位置0的位置74处的2/2对称凸起及其任何组合。
77.如权利要求76所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1545具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
78.如权利要求77所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1545。
79.如权利要求5-8中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置4是所述靶腺苷，其中位置4是ATTAAA从5'端起的第三个A。
80.如权利要求79所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括：
在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：33、-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-11和-12。
81.如权利要求80所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-1处。
82.如权利要求81所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。
83.如权利要求82所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1463具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
84.如权利要求83所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1463。
85.如权利要求80所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-3处。
86.如权利要求85所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置36处的第二6/6对称内部环及其组合。
87.如权利要求86所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1294具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
88.如权利要求87所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1294。
89.如权利要求80所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。
90.如权利要求89所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。
91.如权利要求90所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
92.如权利要求91所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1054。
93.如权利要求80所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。
94.如权利要求93所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环及其组合。
95.如权利要求94所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:934具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
96.如权利要求95所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:934。
97.如权利要求93所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。
98.如权利要求97所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
99.如权利要求98所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573。
100.如权利要求93所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。
101.如权利要求100所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
102.如权利要求101所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。
103.如权利要求93所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。
104.如权利要求103所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
105.如权利要求104所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。
106.如权利要求93所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。
107.如权利要求106所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
108.如权利要求107所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。
109.如权利要求93所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。
110.如权利要求109所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
111.如权利要求110所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588。
112.如权利要求80所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-9处。
113.如权利要求112所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在位置0处的A/C错配、在相对于位置0的位置40处的第二6/6对称内部环及其组合。
114.如权利要求113所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:593具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
115.如权利要求114所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:593。
116.如权利要求5-8中任一项所述的组合物，其中ATTAAA的位置5是所述靶腺苷，其中位置5是ATTAAA从5'端起的第四个A。
117.如权利要求81所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括：
在选自由以下组成的组的相对于ATTAAA的位置0的位置处的第一6/6对称内部环：33、23、-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、-10和-12。
118.如权利要求117所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-1处。
119.如权利要求118所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置4处的A/C错配、在相对于位置0的位置32处的第二6/6对称内部环及其组合。
120.如权利要求119所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1463具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
121.如权利要求120所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1463。
122.如权利要求117所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-5处。
123.如权利要求122所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环。
124.如权利要求123所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1054具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
125.如权利要求124所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1054。
126.如权利要求117所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环在相对于位置0的位置-6处。
127.如权利要求126所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置49处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置62处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置75处的3/3对称凸起及其任何组合。
128.如权利要求127所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1575具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
129.如权利要求128所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1575。
130.如权利要求126所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置54处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置63处的3/3对称凸起、在相对于位置0的位置72处的3/3对称凸起及其任何组合。
131.如权利要求130所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1567具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
132.如权利要求131所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1567。
133.如权利要求126所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置47处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置60处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置73处的5/5对称内部环及其任何组合。
134.如权利要求133所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1573具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
135.如权利要求134所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1573。
136.如权利要求126所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置45处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置56处的5/5对称内部环、在相对于位置0的位置67处的5/5对称内部环及其任何组合。
137.如权利要求136所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1569具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
138.如权利要求137所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1569。
139.如权利要求126所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征还包括选自由以下组成的组的至少一种结构特征：在相对于位置0的位置3处的A/C错配、在相对于位置0的位置33处的第二6/6对称内部环、在相对于位置0的位置55处的4/4对称凸起、在相对于位置0的位置75处的4/4对称凸起及其任何组合。
140.如权利要求139所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:1588具有至少约80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
141.如权利要求140所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:1588。
142.如权利要求9-141中任一项所述的组合物，其还包含ATTAAA的任何A处的编辑。
143.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
144.如权利要求143所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:8的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
145.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
146.如权利要求145所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:593的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
147.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
148.如权利要求147所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:934的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
149.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
150.如权利要求149所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:977的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
151.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
152.如权利要求151所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1054的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
153.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
154.如权利要求153所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1294的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
155.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
156.如权利要求155所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1463的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
157.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
158.如权利要求157所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1545的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
159.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
160.如权利要求159所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1567的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
161.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
162.如权利要求161所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1569的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
163.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
164.如权利要求163所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1573的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
165.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
166.如权利要求165所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1575的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
167.如权利要求6所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述靶A下游(3')3个核苷酸处形成的1核苷酸错配，以及所述靶A下游(3')20个核苷酸处形成的6核苷酸内部对称环。
168.如权利要求167所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与包含SEQ ID NO:1588的指导RNA具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
169.如权利要求5-7中任一项所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括：
a)第一6/6对称内部环，和
b)至少一种选自由以下组成的组的其他结构特征：第二6/6对称内部环、5/5对称内部环、4/4对称凸起、3/3对称凸起和2/2对称凸起。
170.如权利要求169所述的组合物，其中所述指导-靶RNA支架还包含A/C错配，其中所述A/C错配的胞嘧啶存在于所述工程化指导RNA中与所述一个或多个靶腺苷相对；并且其中所述一种或多种结构特征包括：
a)相对于所述A/C错配位于位置-4至-8的所述第一6/6对称内部环；
b)相对于所述A/C错配位于位置+31至+35的所述第二6/6对称内部环。
171.如权利要求170所述的组合物，其中所述指导-靶RNA支架还包含A/C错配，其中所述A/C错配的胞嘧啶存在于所述工程化指导RNA中与所述一个或多个靶腺苷相对；并且其中所述一种或多种结构特征包括：
a)相对于所述A/C错配在位置-6处的所述第一6/6对称内部环；
b)相对于所述A/C错配在位置+33处的所述第二6/6对称内部环。
172.如权利要求170或171所述的组合物，其中所述第一6/6对称内部环包含所述工程化指导RNA侧的序列GGAACU和所述靶RNA侧的序列UUCAGA。
173.如权利要求170或171所述的组合物，其中所述第二6/6对称内部环包含所述工程化指导RNA侧的序列CUGACC和所述靶RNA侧的序列AGAUUU。
174.如权利要求5-7中任一项所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括第一6/6对称内部环和第二6/6对称内部环，并且其中所述靶RNA中的每个A与所述工程化指导RNA中的U碱基配对。
175.如权利要求1所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述凸起，其中所述凸起是对称凸起。
176.如权利要求1所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述凸起，其中所述凸起是不对称凸起。
177.如权利要求1所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述内部环，其中所述内部环是对称内部环。
178.如权利要求1所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括所述内部环，其中所述内部环是不对称内部环。
179.如权利要求1所述的组合物，其中所述一种或多种结构特征包括由所述工程化指导RNA中的碱基与所述DUX4靶RNA中的G、C或U形成的所述错配。
180.如权利要求1所述的组合物，其中所述RNA编辑实体包括ADAR1、ADAR2、ADAR3或其任何组合。
181.如权利要求1所述的组合物，其中所述一个或多个靶腺苷的RNA编辑包括超编辑。
182.如权利要求181所述的组合物，其中所述超编辑包括编辑所述DUX4靶RNA的polyA信号序列中的多于一个A。
183.如权利要求1所述的组合物，其中所述工程化指导RNA的内部环包含任何位置顺序的任何核苷酸，其中所述任何位置顺序的核苷酸都不与其在所述DUX 4靶RNA中的位置对应物互补。
184.如权利要求1-183中任一项所述的组合物，其中所述工程化指导RNA或所述编码所述工程化指导RNA的工程化多核苷酸是环状的。
185.如权利要求1-184中任一项所述的组合物，其中所述工程化指导RNA或所述编码所述工程化指导RNA的工程化多核苷酸包含U7发夹序列、SmOPT序列或其组合，并且任选地其中所述U7发夹序列包含SEQ ID NO 1591或1593并且其中所述SmOPT序列包含SEQ ID NO:1595。
186.如权利要求1所述的组合物，其中所述DUX4靶RNA包含DUX4的前mRNA转录本。
187.如权利要求186所述的组合物，其中至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的所述DUX4的前mRNA转录本在所述polyA信号序列中具有至少一个编辑。
188.如权利要求187所述的组合物，其中至少80％的所述DUX4的前mRNA转录本在所述polyA信号序列中具有至少一个编辑。
189.如权利要求1-188中任一项所述的组合物，其中一个或多个腺苷的编辑促进mRNA敲低。
190.如权利要求189所述的组合物，其中所述mRNA敲低包括DUX4 mRNA的敲低。
191.如权利要求189或190中任一项所述的组合物，其中所述mRNA敲低包括与RNA编辑之前的mRNA水平相比，RNA编辑之后的mRNA水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。
192.如权利要求191所述的组合物，其中与所述RNA编辑之前的mRNA水平相比，所述mRNA敲低是所述mRNA水平的至少50％。
193.如权利要求191所述的组合物，其中与所述RNA编辑之前的mRNA水平相比，所述mRNA敲低是所述mRNA水平的至少70％。
194.如权利要求1-193中任一项所述的组合物，其中所述一个或多个腺苷的编辑促进蛋白质敲低。
195.如权利要求194所述的组合物，其中所述蛋白质敲低包括DUX4的敲低。
196.如权利要求194或195所述的组合物，其中所述蛋白质敲低包括DUX4下游的蛋白质的敲低，其中所述DUX4下游的蛋白质包括SLC34A2、LEUTX、ZSCAN4、PRAMEF12、TRIM43、DEFB103或MBD3L2或其任何组合。
197.如权利要求194-196中任一项所述的组合物，其中所述蛋白质敲低包括与所述RNA编辑之前的蛋白质水平相比，所述RNA编辑之后的蛋白质水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。
198.如权利要求194-196中任一项所述的组合物，其中所述蛋白质敲低包括与包含非功能性ADAR基因的细胞相比，ADAR表达细胞中的蛋白质水平降低至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。
199.如权利要求194-198中任一项所述的组合物，其中所述蛋白质敲低包括ADAR依赖性蛋白质敲低。
200.如权利要求199所述的组合物，其中所述ADAR依赖性蛋白质敲低包括与所述RNA编辑之前的蛋白质水平相比，所述蛋白质水平降低至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％。
201.如权利要求1-200中任一项所述的组合物，其中所述工程化指导RNA是体外转录(IVT)的工程化指导RNA。
202.如权利要求1-200中任一项所述的组合物，其包含所述工程化多核苷酸。
203.如权利要求202所述的组合物，其中所述工程化多核苷酸包含在载体中或载体上。
204.如权利要求203所述的组合物，其中所述载体是病毒载体，并且其中所述工程化多核苷酸被衣壳化在所述病毒载体中。
205.如权利要求204所述的组合物，其中所述病毒载体是腺相关病毒(AAV)载体或其衍生物。
206.如权利要求203所述的组合物，其中所述载体是非病毒载体。
207.如权利要求206所述的组合物，其中所述非病毒载体是脂质纳米颗粒(LNP)、脂质体或聚合物纳米颗粒。
208.如权利要求202所述的组合物，其中所述工程化多核苷酸是编码所述工程化指导RNA的DNA多核苷酸。
209.如权利要求1所述的组合物，其中所述工程化指导RNA与SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1589中的任一个具有至少80％、85％、90％、92％、95％、97％或99％的序列同一性。
210.如权利要求1所述的组合物，其中所述工程化指导RNA包含SEQ ID NO:2-SEQ IDNO:1589中任一个的序列。
211.一种药物组合物，所述药物组合物包含：
a)如权利要求1-210中任一项所述的组合物；和
b)药学上可接受的赋形剂、载剂或稀释剂。
212.一种治疗有需要的受试者的疾病或疾患的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的如权利要求1-210中任一项所述的组合物或如权利要求211所述的药物组合物。
213.如权利要求212所述的方法，其中所述疾病或疾患包括面肩肱型肌营养不良症(FSHD)。
214.如权利要求213所述的方法，其中FSHD包括I型FSHD。
215.如权利要求213所述的方法，其中FSHD包括II型FSHD。
216.如权利要求212-215中任一项所述的方法，其中所述施用包括肠胃外施用、静脉内施用、皮下施用、鞘内施用、腹膜内施用、肌内施用、血管内施用、输注施用、局部施用、口服施用、吸入施用、十二指肠内施用、直肠施用或其组合。
217.如权利要求216所述的方法，其包括所述施用，其中所述施用是口服施用。
218.如权利要求212-217中任一项所述的方法，其中所述施用包括全身施用。
219.一种编辑DUX4 RNA的方法，所述方法包括使所述DUX4RNA与如权利要求1-210所述的组合物中的任一种和RNA编辑实体接触，从而编辑所述DUX4 RNA。
220.如权利要求219所述的方法，其中所述编辑包括在所述DUX4 RNA的polyA尾的任何A位置处进行编辑。
221.如权利要求219所述的方法，其中所述DUX4 RNA包含DUX4的前mRNA转录本。
222.如权利要求221所述的方法，其中至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％的所述DUX4的前mRNA转录本在所述polyA信号序列中具有至少一个编辑。
223.如权利要求219所述的方法，其中所述DUX4 RNA的编辑促进蛋白质敲低。
224.如权利要求223所述的方法，其中所述蛋白质敲低包括DUX4的敲低。
225.如权利要求1-210中任一项所述的组合物或如权利要求211所述的药物组合物，其用作药物。
226.如权利要求1-210中任一项所述的组合物或如权利要求211所述的药物组合物，其用于治疗面肩肱型肌营养不良症(FSHD)。
227.如权利要求226所述的组合物，其中FSHD包括I型FSHD。
228.如权利要求226所述的组合物，其中FSHD包括II型FSHD。
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