CN117500926A - 产品和组合物 - Google Patents
产品和组合物 Download PDFInfo
- Publication number
- CN117500926A CN117500926A CN202280040778.8A CN202280040778A CN117500926A CN 117500926 A CN117500926 A CN 117500926A CN 202280040778 A CN202280040778 A CN 202280040778A CN 117500926 A CN117500926 A CN 117500926A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- oligomeric compound
- region
- nucleoside
- compound according
- modified
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 12
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 365
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims abstract description 283
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 claims abstract description 209
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract description 62
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 25
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 15
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 claims description 118
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 79
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 79
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 claims description 72
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 59
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 59
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 47
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 41
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims description 37
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 claims description 33
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 30
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 27
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 20
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 20
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 17
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 claims description 17
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 claims description 17
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 claims description 15
- NAGJZTKCGNOGPW-UHFFFAOYSA-K dioxido-sulfanylidene-sulfido-$l^{5}-phosphane Chemical compound [O-]P([O-])([S-])=S NAGJZTKCGNOGPW-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 15
- -1 nucleoside saccharides Chemical class 0.000 claims description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 13
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 claims description 13
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 claims description 13
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 claims description 11
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 10
- 206010047249 Venous thrombosis Diseases 0.000 claims description 9
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 claims description 9
- 230000009424 thromboembolic effect Effects 0.000 claims description 9
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 claims description 8
- 208000020832 chronic kidney disease Diseases 0.000 claims description 7
- 206010051055 Deep vein thrombosis Diseases 0.000 claims description 6
- 208000010378 Pulmonary Embolism Diseases 0.000 claims description 6
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 claims description 5
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 claims description 5
- 201000000523 end stage renal failure Diseases 0.000 claims description 5
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 5
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims description 5
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 claims description 5
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 5
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 5
- 150000004044 tetrasaccharides Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 claims description 5
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 4
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 claims description 4
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 claims description 4
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 claims description 4
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 4
- 208000010125 myocardial infarction Diseases 0.000 claims description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 4
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 claims description 4
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 claims description 4
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 claims description 4
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 claims description 4
- 206010003178 Arterial thrombosis Diseases 0.000 claims description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 claims description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 claims description 3
- 208000028208 end stage renal disease Diseases 0.000 claims description 3
- 239000008101 lactose Substances 0.000 claims description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 3
- 239000000539 dimer Substances 0.000 claims description 2
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 claims description 2
- 125000000311 mannosyl group Chemical group C1([C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 claims description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims description 2
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 claims description 2
- 108010074864 Factor XI Proteins 0.000 abstract description 38
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 abstract description 21
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 abstract description 21
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 abstract description 17
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 38
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 37
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 29
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 28
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 25
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 25
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 24
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 21
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 20
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 16
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 14
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 14
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 14
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 13
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 12
- 230000006870 function Effects 0.000 description 12
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 11
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 9
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 9
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 9
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 9
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 9
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- YCKRFDGAMUMZLT-UHFFFAOYSA-N Fluorine atom Chemical compound [F] YCKRFDGAMUMZLT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N N-acetyl-D-galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N 0.000 description 8
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 8
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 8
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 8
- 125000003843 furanosyl group Chemical group 0.000 description 8
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 8
- 108010094028 Prothrombin Proteins 0.000 description 7
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 7
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 7
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical class [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 7
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 7
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 7
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 7
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 7
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010000499 Thromboplastin Proteins 0.000 description 6
- 102000002262 Thromboplastin Human genes 0.000 description 6
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 6
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 6
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 6
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 6
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 6
- 150000002611 lead compounds Chemical class 0.000 description 6
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 6
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 6
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 6
- 230000003285 pharmacodynamic effect Effects 0.000 description 6
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 6
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 6
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 6
- 229960005080 warfarin Drugs 0.000 description 6
- PJVWKTKQMONHTI-UHFFFAOYSA-N warfarin Chemical compound OC=1C2=CC=CC=C2OC(=O)C=1C(CC(=O)C)C1=CC=CC=C1 PJVWKTKQMONHTI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 208000032843 Hemorrhage Diseases 0.000 description 5
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 5
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 description 5
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 5
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 208000034158 bleeding Diseases 0.000 description 5
- 230000000740 bleeding effect Effects 0.000 description 5
- 230000008859 change Effects 0.000 description 5
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 5
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 5
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 5
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 5
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 4
- 102100027378 Prothrombin Human genes 0.000 description 4
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 4
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 4
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 4
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 4
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 4
- 238000011577 humanized mouse model Methods 0.000 description 4
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 4
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 4
- 229940039716 prothrombin Drugs 0.000 description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 4
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 4
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 4
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 3
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 3
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 3
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 3
- 206010062506 Heparin-induced thrombocytopenia Diseases 0.000 description 3
- 101800004937 Protein C Proteins 0.000 description 3
- 102000017975 Protein C Human genes 0.000 description 3
- 102000000574 RNA-Induced Silencing Complex Human genes 0.000 description 3
- 108010016790 RNA-Induced Silencing Complex Proteins 0.000 description 3
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 3
- 101800001700 Saposin-D Proteins 0.000 description 3
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 3
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 3
- 108091027967 Small hairpin RNA Proteins 0.000 description 3
- 230000009471 action Effects 0.000 description 3
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004019 antithrombin Substances 0.000 description 3
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 3
- AGVAZMGAQJOSFJ-WZHZPDAFSA-M cobalt(2+);[(2r,3s,4r,5s)-5-(5,6-dimethylbenzimidazol-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2r)-1-[3-[(1r,2r,3r,4z,7s,9z,12s,13s,14z,17s,18s,19r)-2,13,18-tris(2-amino-2-oxoethyl)-7,12,17-tris(3-amino-3-oxopropyl)-3,5,8,8,13,15,18,19-octamethyl-2 Chemical compound [Co+2].N#[C-].[N-]([C@@H]1[C@H](CC(N)=O)[C@@]2(C)CCC(=O)NC[C@@H](C)OP(O)(=O)O[C@H]3[C@H]([C@H](O[C@@H]3CO)N3C4=CC(C)=C(C)C=C4N=C3)O)\C2=C(C)/C([C@H](C\2(C)C)CCC(N)=O)=N/C/2=C\C([C@H]([C@@]/2(CC(N)=O)C)CCC(N)=O)=N\C\2=C(C)/C2=N[C@]1(C)[C@@](C)(CC(N)=O)[C@@H]2CCC(N)=O AGVAZMGAQJOSFJ-WZHZPDAFSA-M 0.000 description 3
- HGCIXCUEYOPUTN-UHFFFAOYSA-N cyclohexene Chemical compound C1CCC=CC1 HGCIXCUEYOPUTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 3
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 3
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 3
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 description 3
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 description 3
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 3
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 3
- 239000003055 low molecular weight heparin Substances 0.000 description 3
- 229940127215 low-molecular weight heparin Drugs 0.000 description 3
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 3
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 3
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 3
- 229960000856 protein c Drugs 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 235000021092 sugar substitutes Nutrition 0.000 description 3
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 3
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010003658 Atrial Fibrillation Diseases 0.000 description 2
- BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N Bilirubin Chemical compound N1C(=O)C(C)=C(C=C)\C1=C\C1=C(C)C(CCC(O)=O)=C(CC2=C(C(C)=C(\C=C/3C(=C(C=C)C(=O)N\3)C)N2)CCC(O)=O)N1 BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N 0.000 description 2
- 102000003847 Carboxypeptidase B2 Human genes 0.000 description 2
- 108090000201 Carboxypeptidase B2 Proteins 0.000 description 2
- 206010053567 Coagulopathies Diseases 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 2
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 2
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 2
- 238000001061 Dunnett's test Methods 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- HGVDHZBSSITLCT-JLJPHGGASA-N Edoxaban Chemical compound N([C@H]1CC[C@@H](C[C@H]1NC(=O)C=1SC=2CN(C)CCC=2N=1)C(=O)N(C)C)C(=O)C(=O)NC1=CC=C(Cl)C=N1 HGVDHZBSSITLCT-JLJPHGGASA-N 0.000 description 2
- 241001379910 Ephemera danica Species 0.000 description 2
- 108010074105 Factor Va Proteins 0.000 description 2
- 108010014173 Factor X Proteins 0.000 description 2
- 108091093094 Glycol nucleic acid Proteins 0.000 description 2
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 2
- 101710203526 Integrase Proteins 0.000 description 2
- 238000012313 Kruskal-Wallis test Methods 0.000 description 2
- 241000282567 Macaca fascicularis Species 0.000 description 2
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N Morpholine Chemical compound C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 2
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000000540 analysis of variance Methods 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 150000001719 carbohydrate derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 2
- 238000010523 cascade reaction Methods 0.000 description 2
- 229960003850 dabigatran Drugs 0.000 description 2
- YBSJFWOBGCMAKL-UHFFFAOYSA-N dabigatran Chemical compound N=1C2=CC(C(=O)N(CCC(O)=O)C=3N=CC=CC=3)=CC=C2N(C)C=1CNC1=CC=C(C(N)=N)C=C1 YBSJFWOBGCMAKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 2
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 2
- 229960000622 edoxaban Drugs 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- BNKAXGCRDYRABM-UHFFFAOYSA-N ethenyl dihydrogen phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OC=C BNKAXGCRDYRABM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000020764 fibrinolysis Effects 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 238000012226 gene silencing method Methods 0.000 description 2
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 2
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 2
- 229940127066 new oral anticoagluant drug Drugs 0.000 description 2
- 230000009437 off-target effect Effects 0.000 description 2
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical compound [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 2
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 230000001124 posttranscriptional effect Effects 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000001223 reverse osmosis Methods 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- 125000000548 ribosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 2
- 229960001148 rivaroxaban Drugs 0.000 description 2
- KGFYHTZWPPHNLQ-AWEZNQCLSA-N rivaroxaban Chemical compound S1C(Cl)=CC=C1C(=O)NC[C@@H]1OC(=O)N(C=2C=CC(=CC=2)N2C(COCC2)=O)C1 KGFYHTZWPPHNLQ-AWEZNQCLSA-N 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 239000003001 serine protease inhibitor Substances 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000035657 Abasia Diseases 0.000 description 1
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 208000003343 Antiphospholipid Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- QNZCBYKSOIHPEH-UHFFFAOYSA-N Apixaban Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1N1C(C(=O)N(CC2)C=3C=CC(=CC=3)N3C(CCCC3)=O)=C2C(C(N)=O)=N1 QNZCBYKSOIHPEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004215 Carbon black (E152) Substances 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000017667 Chronic Disease Diseases 0.000 description 1
- 102000012422 Collagen Type I Human genes 0.000 description 1
- 108010022452 Collagen Type I Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 229940123900 Direct thrombin inhibitor Drugs 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006145 Eagle's minimal essential medium Substances 0.000 description 1
- 208000005189 Embolism Diseases 0.000 description 1
- 108010062466 Enzyme Precursors Proteins 0.000 description 1
- 102000010911 Enzyme Precursors Human genes 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 1
- 206010015548 Euthanasia Diseases 0.000 description 1
- 108010054265 Factor VIIa Proteins 0.000 description 1
- 230000026769 Factor XII activation Effects 0.000 description 1
- 108010071289 Factor XIII Proteins 0.000 description 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 description 1
- 229940123583 Factor Xa inhibitor Drugs 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000976075 Homo sapiens Insulin Proteins 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012098 Lipofectamine RNAiMAX Substances 0.000 description 1
- 238000000585 Mann–Whitney U test Methods 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000001132 Osteoporosis Diseases 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 229940096437 Protein S Drugs 0.000 description 1
- 102000029301 Protein S Human genes 0.000 description 1
- 108010066124 Protein S Proteins 0.000 description 1
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000044126 RNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108700020471 RNA-Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- 229940122055 Serine protease inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101710102218 Serine protease inhibitor Proteins 0.000 description 1
- 108050000761 Serpin Proteins 0.000 description 1
- 102000008847 Serpin Human genes 0.000 description 1
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000001435 Thromboembolism Diseases 0.000 description 1
- 108010079274 Thrombomodulin Proteins 0.000 description 1
- 102100026966 Thrombomodulin Human genes 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 229930003448 Vitamin K Natural products 0.000 description 1
- 230000009102 absorption Effects 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000230 acceptable toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 125000002015 acyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical class C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 125000004183 alkoxy alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N alpha-acetylene Natural products C#C HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- IYIKLHRQXLHMJQ-UHFFFAOYSA-N amiodarone Chemical compound CCCCC=1OC2=CC=CC=C2C=1C(=O)C1=CC(I)=C(OCCN(CC)CC)C(I)=C1 IYIKLHRQXLHMJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005260 amiodarone Drugs 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 239000002506 anticoagulant protein Substances 0.000 description 1
- 230000010100 anticoagulation Effects 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 229960003886 apixaban Drugs 0.000 description 1
- 238000013475 authorization Methods 0.000 description 1
- 208000021018 autosomal dominant inheritance Diseases 0.000 description 1
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000023555 blood coagulation Effects 0.000 description 1
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 description 1
- 210000004413 cardiac myocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004700 cellular uptake Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000000038 chest Anatomy 0.000 description 1
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 1
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007820 coagulation assay Methods 0.000 description 1
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 235000021310 complex sugar Nutrition 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 1
- HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N cyclohexanol Chemical compound OC1CCCCC1 HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000593 degrading effect Effects 0.000 description 1
- 238000003936 denaturing gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000005549 deoxyribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N dexamethasone Chemical compound C1CC2=CC(=O)C=C[C@]2(C)[C@]2(F)[C@@H]1[C@@H]1C[C@@H](C)[C@@](C(=O)CO)(O)[C@@]1(C)C[C@@H]2O UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N 0.000 description 1
- 229960003957 dexamethasone Drugs 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 239000003651 drinking water Substances 0.000 description 1
- 235000020188 drinking water Nutrition 0.000 description 1
- 230000002526 effect on cardiovascular system Effects 0.000 description 1
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- XHDNNRGTROLZCF-UHFFFAOYSA-N ethenyl(methoxy)phosphinic acid Chemical compound COP(O)(=O)C=C XHDNNRGTROLZCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 108010091897 factor V Leiden Proteins 0.000 description 1
- 229940012414 factor viia Drugs 0.000 description 1
- 229940012444 factor xiii Drugs 0.000 description 1
- 238000004858 feed analysis Methods 0.000 description 1
- 235000012631 food intake Nutrition 0.000 description 1
- 125000002541 furyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000003209 gene knockout Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000003862 health status Effects 0.000 description 1
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 150000002402 hexoses Chemical group 0.000 description 1
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N insulin (human) Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H]2C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3NC=NC=3)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC1=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=O)CSSC[C@@H](C(N2)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C1=CN=CN1 PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 230000006623 intrinsic pathway Effects 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000002510 keratinocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000003908 liver function Effects 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000013160 medical therapy Methods 0.000 description 1
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 1
- XJRBAMWJDBPFIM-UHFFFAOYSA-N methyl vinyl ether Chemical group COC=C XJRBAMWJDBPFIM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000325 methylidene group Chemical group [H]C([H])=* 0.000 description 1
- YACKEPLHDIMKIO-UHFFFAOYSA-N methylphosphonic acid Chemical compound CP(O)(O)=O YACKEPLHDIMKIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 description 1
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 125000004573 morpholin-4-yl group Chemical group N1(CCOCC1)* 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 210000003668 pericyte Anatomy 0.000 description 1
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-L phosphoramidate Chemical compound NP([O-])([O-])=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N phosphoramidic acid Chemical compound NP(O)(O)=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000004437 phosphorous atom Chemical group 0.000 description 1
- SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N phylloquinone Natural products CC(C)CCCCC(C)CCC(C)CCCC(=CCC1=C(C)C(=O)c2ccccc2C1=O)C SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007747 plating Methods 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 239000003805 procoagulant Substances 0.000 description 1
- 125000004368 propenyl group Chemical group C(=CC)* 0.000 description 1
- 108010014806 prothrombinase complex Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000029058 respiratory gaseous exchange Effects 0.000 description 1
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 230000002000 scavenging effect Effects 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 125000000467 secondary amino group Chemical group [H]N([*:1])[*:2] 0.000 description 1
- 239000002924 silencing RNA Substances 0.000 description 1
- 238000011120 smear test Methods 0.000 description 1
- 210000000329 smooth muscle myocyte Anatomy 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000012533 structure-function relationship study Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 125000004213 tert-butoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C(O*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001302 tertiary amino group Chemical group 0.000 description 1
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 1
- 210000000115 thoracic cavity Anatomy 0.000 description 1
- 239000003868 thrombin inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000001732 thrombotic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 1
- 238000009423 ventilation Methods 0.000 description 1
- 235000019168 vitamin K Nutrition 0.000 description 1
- 239000011712 vitamin K Substances 0.000 description 1
- 150000003721 vitamin K derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000003722 vitamin derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 229940046010 vitamin k Drugs 0.000 description 1
- 238000004457 water analysis Methods 0.000 description 1
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
本发明提供了产品、组合物及其用途，特别是提供了调节，尤其是干扰或抑制因子XI(FXI)基因表达的核酸产品。这些产品可以是寡聚化合物，包含至少一个连接核苷的第一区域，所述第一区域至少具有与从FXI基因转录的RNA的至少一部分互补的第一核苷碱基序列，所述第一核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：序列号1至250。
Description
技术领域
本发明一方面，提供能调节、干扰或抑制XI因子(FXI)基因表达的核酸产品。本发明另一方面，还提供用于减少动物中FXI mRNA和蛋白质表达的方法、化合物和组合物。所述方法、化合物和组合物可用于治疗、预防或改善血栓栓塞性疾病，包括与透析或其他促凝血病症相关的血栓形成，如深静脉血栓、静脉或动脉血栓、肺栓塞、心肌梗塞、中风、或与慢性疾病或终末期肾病(ESRD)相关的血栓形成。
背景
循环系统具有防止失血以及抵消不适当的血管内阻塞的机制。一般而言，凝血包括一系列反应，最终将可溶性纤维蛋白原转化为不溶性纤维蛋白凝胶。级联反应的步骤包括将非活性酶原转化为活性酶，随后活性酶催化级联反应的下一步。
凝血级联反应
凝血级联可通过两个分支启动，即作为主要途径的组织因子途径(也称“外源性凝血途径”)和接触激活途径(也称“内源性凝血途径”)。
组织因子途径由细胞表面受体组织因子(TF，也称为因子III)启动，其由血管外细胞(周细胞、心肌细胞、平滑肌细胞和角质形成细胞)组成性表达，并在炎性细胞因子或内毒素的诱导下由血管单核细胞和内皮细胞表达(Drake等人，Am J Pathol1989，134：1087-1097)。TF是凝血因子VIIa(一种丝氨酸蛋白酶)的高亲和力细胞受体。在没有TF的情况下，VIIa具有非常低的催化活性，其必须与TF结合才能通过异构机制发挥功能(Drake等人，AmJ Pathol 1989，134:1087-1097)。TF-VIIa复合物将因子X激活为Xa，Xa又与其辅助因子因子Va结合成凝血酶原酶复合物，后者又将凝血酶原(又称因子II或因子2)活化为凝血酶(又称因子Ila或因子2a)。
凝血酶可激活血小板，将纤维蛋白原转化为纤维蛋白，并通过激活因子XIII促进纤维蛋白交联，从而在TF暴露于血管外细胞的部位形成稳定的堵塞物。此外，凝血酶还能激活因子V和VIII，从而加强凝血级联反应。
接触激活是由因子XII活化为Xlla触发的。因子Xlla将XI转化为XIa，XIa将IX转化为IXa。IXa与其辅助因子VIIIa结合，将X转化为Xa。当因子Xa与因子Va结合将凝血酶原(因子II)活化为凝血酶(因子Ila)时，这两条途径在这一点汇合。因子XI可增强体外凝块的形成和稳定性，但并不被认为与凝血的启动有关，相反，其在血块生长的扩增阶段非常重要(von de Borne等人，《血液凝固与纤维蛋白溶解》，2006年，17:251-257)。此外，因子XI依赖性放大凝血酶的形成，导致TAFI(凝血酶可激活的纤维蛋白溶解抑制剂)被激活，从而降低血凝块对纤维蛋白溶解的敏感性(Bouma等人，J Thromb Haemost 1999；82:1703-1708)。
凝血抑制
至少有三种机制可以控制凝血级联反应，即活化蛋白C、抗凝血酶和组织因子途径抑制剂的作用。活化蛋白C是一种丝氨酸蛋白酶，可降解辅助因子Va和VIIIa。蛋白C由凝血酶和血栓调节蛋白激活，并需要辅酶蛋白S才能发挥作用。抗凝血酶是一种丝氨酸蛋白酶抑制剂(serpin)，可抑制丝氨酸蛋白酶：凝血酶、Xa、Xlla、XIa和IXa。组织因子途径抑制剂可抑制Xa和TF-VIIa复合物的作用(Schwartz AL等人，《心血管医学趋势》，1997年；7:234-239)。
疾病
血栓形成是血凝块的病理发展，而当血凝块迁移到身体的另一部分并干扰器官功能时，就会发生栓塞。血栓栓塞可能导致深静脉血栓、肺栓塞、心肌梗塞和中风等病症。虽然大多数血栓形成病例是由于手术、癌症、不活动等后天外在因素造成的，但也有一些病例是由于遗传因素造成的，如抗磷脂综合征和因子V Leiden常染色体显性遗传(Bertina RM等人，《自然》，1994年；369:64-67)。
治疗
最常用的抗凝剂、华法林、肝素、低分子量肝素(LMWH)和新型的直接口服抗凝剂(DOAC)都有明显的缺点。华法林通常用于治疗心房颤动患者，这种药物会与依赖维生素K的凝血因子(包括因子II、VII、IX和X)发生相互作用。抗凝血蛋白C和S也会受到华法林的抑制。由于华法林与其他药物(包括用于治疗心房颤动的药物，如胺碘酮)相互作用，使得用华法林进行药物治疗变得更加复杂。由于很难预测华法林的治疗效果，因此必须对患者进行仔细监测，以发现任何异常出血的迹象。
肝素通过激活能抑制凝血酶和因子X的抗凝血酶而起作用(Bjork I,LindahlU.Mol Cell Biochem.1982 48:161-182)。肝素治疗可能会引起免疫反应，使血小板在血管内聚集，从而导致血栓形成。这种副作用被称为肝素诱导的血小板减少症(HIT)，会导致出血增加，需要对患者进行监测。长期使用肝素治疗还可能导致骨质疏松。LMWH也能抑制因子II，但抑制程度低于未分级肝素(UFH)，其与HIT的发生有关。
FDA已批准多种直接口服抗凝剂用于治疗血栓性疾病，其中包括贝曲沙班、阿哌沙班、利伐沙班和埃多沙班四种Xa因子抑制剂，以及一种直接凝血酶抑制剂达比加群(Smith,M.,Surg Clin N Am 2018 98:219-238)。与华法林相比，利伐沙班、达比加群和埃多沙班都会增加出血，尤其是增加消化道出血风险。
因此，我们仍然需要治疗血栓栓塞性疾病而不会增加出血风险的疗法。本发明旨在提供治疗此类疾病的化合物、方法和药物组合物。
能够与表达的mRNA互补结合的双链RNA(dsRNA)已被证明能够阻断基因表达(Fireet a.l，1998年，《自然》，1998年2月19日；391(6669):806-11和Elbashir等人，2001年，《自然》。2001年5月24日；41 1(6836)：494-8)，其机制被称为RNA干扰(RNAi)。在包括脊椎动物在内的许多生物体中，短dsRNA直接引导基因特异性转录后沉默，现在已经成为研究基因功能的有用工具。RNAi由RNA诱导的沉默复合体(RISC)介导，RISC是一种序列特异的多组分核酸酶，可破坏与加载到RISC复合物中的触发沉默的同源信使RNA。干扰RNA(iRNA)，如siRNA、反义RNA和micro-RNA，是一种寡核苷酸，通过基因沉默，即通过降解mRNA分子抑制基因翻译蛋白质，从而阻止蛋白质的形成。基因沉默剂在医学治疗中的应用正变得越来越重要。
Watts和Corey在《病理学杂志》(2012年；第226卷，第365-379页)上指出，有一些算法可用于设计核酸沉默触发器，但所有这些算法都有严重的局限性。由于算法没有考虑目标mRNA的三级结构或RNA结合蛋白的参与等因素，因此可能需要多种实验方法才能确定有效的siRNA。因此，发现脱靶效应最小的强效核酸沉默触发器是一个复杂的过程。要开发这些高电荷分子的药物就必须要以经济的方式合成这些分子，将其分布到目标组织，进入细胞，并在可接受的毒性范围内发挥作用。因此，我们的目标是提供本文所述的用于治疗血栓栓塞性疾病的化合物、方法和药物组合物，其中包括通过RNAi调节和抑制基因表达的寡聚化合物。
总结
本发明提供了调节、干扰或抑制因子XI(FXI)基因表达的核酸产品及相关治疗用途，描述了特定的寡聚化合物和序列。该总结并不旨在识别本文所述主题的关键特征或基本特征，也不旨在用于确定该主题的范围。
具体实施方式
下面描述的实施例是示例性的，但熟练的技术人员会认识到还可以实现更多的实施例。
应当理解，本文所述的益处和优点可涉及一个实施例或多个实施例。这些实施例并不局限于那些能解决任何或所有所述问题的实施例，或那些具有任何或所有所述益处和优点的实施例。
不同方面和不同实施方式的特征可酌情组合，这对技术人员来说显而易见，不同方面和不同实施方式的特征亦可与本文所述的任何方面相结合。
附图简要说明
下面描述的实施例仅以举例的方式并参考以下非限制性附图，其中：
图1展示了实施例2中表2的双链体的稳定性。
图2展示了实施例2中所述的两次独立的F11 qPCR检测的线性剂量响应。
图3至12显示了对于包括实施例1的表1a/1b的寡核苷酸的寡聚化合物的FXI基因表达的筛选结果，以未处理细胞中基因表达作为对照的相对百分比表示。
图13提供了实施例2中确定的26种FXI先导化合物的剂量反应曲线。
图14提供了根据图13的结果进一步确定的5种FXI先导化合物的剂量反应曲线。
图15至17显示了寡聚化合物F11-91、F11-46和F11-152的全部序列。
图18展示了已被选中用于后续药物化学研究的化合物。
图19展示了图18所示化合物的性能。
图20显示了基于图19所示结果设计的化合物。
图21显示了图20所示化合物的数据。
图22显示了在人源化小鼠中测试的化合物的结构。
图23显示了在人源化小鼠中进行测试所获得的数据。
图24显示了化合物91-Conv-31的体内研究的设计方案。
图25显示了在体内研究中化合物在因子XI活性敲低方面的性能。
图26显示了在体内研究过程中进行的靶向特异性测试的分子机制。
图27显示了图26所示测试的读数。
图28提供了证明没有副作用的数据。
定义
除非提供具体定义，本文所述分析化学、有机合成化学、药物和医药化学的术语、程序和技术均为本领域众所周知和常用的术语。标准技术可用于化学合成和化学分析。某些此类技术和程序可参见《反义研究中的碳水化合物修饰》由Sangvi和Cook编著，美国化学学会，华盛顿特区，1994年；《雷明顿制药科学》(Mack PublishingCo.,Easton,Pa.,第21版,2005年)以及由Stanley T.Crooke编著的《反义药物技术、原理、策略和应用》，CRC Press，佛罗里达州博卡拉顿；以及Sambrook等编著的《分子克隆，实验室手册》第2版，冷泉港实验室出版社，1989年，特此引用。在允许的情况下，本公开内容中提及的所有专利、申请、公开的申请和其它出版物以及其它数据均通过引用并入本文。
除非另有说明，下列术语具有如下含义：
如本文所用，“赋形剂(辅料)”是指添加到本文所提供的组合物中的适用于递送寡聚化合物的任何化合物或化合物混合物。
如本文所用，“核苷”是指由核苷碱基和糖基组成的化合物。核苷包括但不限于天然的核苷(如DNA和RNA中的核苷)和修饰的核苷。核苷可与磷酸基团相连，与磷酸相连的核苷也被称为“核苷酸”。
如本文所用，“化学修饰”或“化学性修饰”是指与天然存在的对应物相比，化合物的化学性质不同。寡核苷酸的化学修饰包括核苷修饰(包括糖基修饰和核苷碱基修饰)和核苷连接修饰。就寡核苷酸而言，化学修饰不仅仅包括核苷碱基序列上的差异。
如本文所用，“呋喃糖基”是指由四个碳原子和一个氧原子组成的五元环结构。
如本文所用，“天然糖基”指天然RNA中的核呋喃糖基或天然DNA中的脱氧核呋喃糖基。所述“天然糖基”也被称为“未修饰的糖基”。特别是，所述“天然糖基”或“未修饰的糖基”在糖基的2'-位上有一个-H(DNA糖基)或-OH(RNA糖基)，尤其是在糖基的2'-位上有一个-H(DNA糖基)。
如本文所用，“糖基”是指天然存在的糖基或核苷修饰的糖基。本文所用的“修饰的糖基”是指取代的糖基或糖代物。
如本文所用，“取代的糖基”是指被取代的呋喃糖基。取代的糖基包括但不限于在2'-位、3'-位、5'-位和/或4'-位上含有取代基的呋喃糖基，在一些实施例中，取代的糖基是双环糖基。
如本文所用，“2'-取代糖基”是指在2'-位上含有除H或OH以外的取代基的呋喃糖基。除非另有说明，2'-取代的糖基不是双环糖基(即2'-取代糖基的2'-取代基不与呋喃糖基环的另一个原子形成桥)。
如本文所用，“MOE”是指-OCH2CH2OCH3。
如本文所用，“2’-F核苷”是指由在2’位置含氟的糖组成的核苷。除非另有说明，2’-F核苷中的氟位于核糖位(取代天然核糖的OH位)。与RNA链杂交的经统一修饰的2’-氟化(ribo)寡核苷酸双链不是RNase H底物，而ara类似物则保留了RNase H的活性。
如本文所用，术语“糖代物”指一种不包含呋喃糖基的结构，它能够取代核苷中天然存在的糖基，从而使由此产生的核苷亚单位能够连接在一起，和/或，与其他核苷连接，形成一种寡聚化合物，这种寡聚化合物能够与互补的寡聚化合物杂交。这种结构包含与呋喃基不同原子数的环(如4、6或7元环)；用非氧原子(如碳、硫或氮)取代呋喃糖基的氧；或原子数量的变化和氧的替换。此类结构还可包括与所述取代糖基相应的取代物(例如，任选地包含另外的取代基的6元碳环双环糖替代物)。糖替代物还包括更复杂的糖替代物(如肽核酸的非环系统)。糖替代物包括但不限于吗啉、环己烯和环己醇。
如本文所用，“双环糖基”是指一种包含4至7元环(包括但不限于呋喃糖基)的修饰的糖基，其包含连接4至7元环的两个原子以形成第二个环的桥，从而产生双环结构。在一些实施方案中，4至7元环是糖环。在一些实施方案中，4至7元环是呋喃糖基。在某些此类实施方案中，桥连接呋喃糖基的2’-碳和4’-碳。
如本文所用，“核苷酸”是指进一步包含磷酸连接基团的核苷。如本文所用，“连接的核苷”可以通过或不通过磷酸键连接，因此包括但不限于“连接的核苷”。如本文所用，“连接的核苷”是指以连续序列连接的核苷(即在连接的核苷之间不存在其他核苷)。
如本文所用，“核苷碱基”是指一组可以连接到糖基以产生能够掺入寡核苷酸的核苷的原子，并且其中该原子能够与另一种寡核苷酸或核酸的互补的天然存在的核苷碱基结合。核苷碱基可以是天然存在的，也可以是经过修饰的。
如本文所用，术语“未修饰的核苷碱基”或“天然存在的核苷碱基”是指RNA或DNA中天然存在的杂环核苷碱基：嘌呤碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)，以及嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)(包括5-甲基C)和尿嘧啶(U)。
如本文所用，“修饰的核苷碱基”是指任何非天然核苷碱基的核苷碱基。
如本文所用，“修饰的核苷”是指与天然RNA或DNA核苷相比，至少包含一种化学修饰的核苷。修饰的核苷可包括修饰的糖基和/或修饰的核苷碱基。
如本文所用，“双环核苷”或“BNA”是指包含双环糖分子的核苷。
如本文所用，“锁核酸核苷”或“LNA”指包含4'-CH2-O-2'桥的双环糖分子的核苷。
如本文所用，“2'-取代核苷”是指在糖基的2'-位上含有除H或OH以外的取代基的核苷。除非另有说明，否则2'-取代核苷不是双环核苷。
如本文所用，“脱氧核苷”是指由2'-H呋喃糖基糖分子组成的核苷，如天然脱氧核苷(DNA)中的核苷。在一些实施方案中，2'-脱氧核苷可包括修饰的核苷碱基或RNA核苷碱基(如尿嘧啶)。
如本文所用，“寡核苷酸”是指由多个相连核苷组成的化合物。在一些实施方案中，寡核苷酸包括一种或多种未修饰的核糖核苷(RNA)，和/或，未修饰的脱氧核糖核苷(DNA)，和/或，一种或多种修饰的核苷。
如本文所用，“修饰的寡核苷酸”是指包含至少一种修饰的核苷，和/或，至少一种修饰的核苷间连接的寡核苷酸。
如本文所用，“连接”或“连接基团”是指将两个或多个其他原子团连接在一起的原子基团。
如本文所用，“核苷间连接”是指寡核苷酸中相邻核苷酸之间的共价连接。
如本文所用，“天然核苷连接”是指3'至5'磷酸二酯连接。本文所用的“修饰的核苷连接”是指除天然核苷连接以外的任何核苷连接。特别地，本文所指的“修饰的核苷连接”可包括修饰的磷连接基团，如硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷连接。
如本文所用，“末端核苷连接”是指寡核苷酸或其定义区域的最后两个核苷酸之间的连接。
如本文所用，“磷连接基团”是指包含一个磷原子的连接基团，可包括存在于天然RNA或DNA中的天然磷连接基团，如磷酸二酯连接基团，或不存在于天然RNA或DNA中的改性磷连接基团，如硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯连接基团。因此，磷连接基团可包括但不限于磷酸二酯、硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、膦酸酯、甲基膦酸酯、磷酰胺酯、硫代烷基膦酸酯、磷酸三酯、硫代烷基磷酸三酯和硼磷酯。
如本文所用，“核苷间磷连接基团”是指直接连接两个核苷的磷连接基团。
如本文所用，“寡聚化合物”是指由两个或两个以上亚结构组成的聚合物结构。在一些实施方案中，寡聚化合物包括寡核苷酸，如修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，寡聚化合物还包括一个或多个共轭基团，和/或，末端基团，和/或，配体。在一些实施方案中，寡聚化合物由寡核苷酸组成。在一些实施方案中，寡聚化合物包括一个或多个连接的单糖基的骨架，其中每个连接的单糖基直接或间接地连接到杂环基上。在一些实施方案中，寡聚化合物还可包括不与杂环基连接的单糖基，从而提供脱碱基位点。低聚物可以仅根据核苷碱基序列来定义，即指定A、G、C、U(或T)的序列。在这种情况下，糖-磷酸盐骨架的结构没有特定限制，可以包含或不包含修饰的糖，和/或，修饰的磷酸盐。另一方面，寡聚化合物的定义可以更全面，即不仅要指定核苷碱基序列，还要指定主链结构，特别是糖的修饰状态(未修饰、2'-OMe修饰、2'-F修饰等)，和/或，磷酸盐的修饰状态。
如本文所用，“末端基团”是指连接到寡核苷酸3'端或5'端的一个或多个原子。在一些实施方案中，末端基团包括一个或多个末端基团核苷。
如本文所用，“共轭物”或“共轭基团”是指与寡核苷酸或寡聚化合物结合的原子或原子团。在一些实施方案中，共轭基团将配体与修饰的寡核苷酸或寡聚化合物连接起来。一般来说，共轭基团可以改变所连接化合物的一种或多种性质，包括但不限于药效学、药代动力学、结合、吸收、细胞分布、细胞摄取、电荷和/或清除等性质。
如本文所用，“共轭连接体”或“连接体”在共轭基团的上下文中指包括任何原子或原子团的共轭基团的一部分，其将寡核苷酸与共轭基团的另一部分共价连接。在一些实施方案中，寡聚化合物上的连接点是寡核苷酸3'末端核苷酸的3'-羟基的3'-氧原子。在一些实施方案中，寡聚化合物上的连接点是寡核苷酸5'末端核苷的5'-羟基的5'-氧原子。在一些实施方案中，与寡聚化合物形成连接的键是可裂解键。在一些所述的实施方案中，这种可裂解键构成可裂解分子的全部或部分。
在一些实施方案中，共轭基团包括可裂解部分(如可裂解键或可裂解核苷)和配体部分，配体部分可包括一个或多个配体，如碳水化合物簇部分，如N-乙酰-半乳糖胺(也称"GalNAc")簇部分。在一些实施方案中，碳水化合物簇部分是通过配体的数量和特性来识别的。例如，在一些实施方案中，碳水化合物簇部分包括2个GalNAc基团。例如，优选地，在一些实施方案中，碳水化合物簇部分包括3个GalNAc基团。在一些实施方案中，碳水化合物簇部分包括4个GalNAc基团。这些配体部分通过可裂解部分(如可裂解键或可裂解核苷)连接到寡聚化合物上。配体可以以线性或支化构型排列，如双三元或三元构型。
如本文所用，“可裂解部分”是指在生理条件下能够被裂解的键或基团。在一些实施方案中，可裂解分子在细胞或亚细胞区室(如内质体或溶酶体)内被裂解。在一些实施方案中，可裂解部分是由核酸酶等内源酶裂解的。在一些实施方案中，可裂解部分包括具有一个、两个、三个、四个或四个以上可裂解键的原子团。在一些实施方案中，可裂解部分是磷酸二酯连接。
如本文所用，“可裂解键”是指任何能够被破坏的化学键。
如本文所用，“碳水化合物簇”是指具有一个或多个连接到连接基上的碳水化合物残基的化合物。
如本文所用，“修饰的碳水化合物”是指相对于天然碳水化合物具有一种或多种化学修饰的任何碳水化合物。
如本文所用，“碳水化合物衍生物”是指以碳水化合物为起始原料或中间体合成的任何化合物。
如本文所用，“碳水化合物”是指天然存在的碳水化合物、改性碳水化合物或碳水化合物衍生物。碳水化合物是一种包括碳(C)、氢(H)和氧(O)原子的生物大分子。碳水化合物可包括单糖、二糖、三糖、四糖、低聚糖或多糖，如一个或多个半乳糖分子、一个或多个乳糖分子、一个或多个N-乙酰-半乳糖胺分子，和/或，一个或多个甘露糖分子。特别优选地，碳水化合物是N-乙酰半乳糖胺分子。
如本文所用，“链”是指由连接的核苷组成的寡聚化合物。连接体没有特别限制，但包括本文所公开的磷酸二酯及其变体。核苷酸链也可以看作是多个连接的核苷酸，在这种情况下，连接体就是共价键。
术语“构建体”是指根据核苷碱基序列和糖修饰定义的连接核苷的区域。构建体可以与链或化合物重合，也可以是其一部分。
如本文所用，“单链”或“单链的”指的是一种寡聚化合物，由以连续序列连接的核苷组成，中间没有断裂。这种单链可包括具有足够自互补性的区域，以便能够在发夹结构中形成稳定的自身双链体。
如本文所用，“发夹”是指单链寡聚化合物，其包括由链中自我互补且方向相反的序列之间的碱基配对形成的双链体。
如本文所用，“发夹环”是指发夹中连接核苷的非配对环，它是自身互补序列杂交的结果。由此产生的结构看起来像一个环或U形。
特别是短发夹RNA，也称为shRNA，包括一个双链区和一个连接形成双链区的环。双链区中不带环的一端可以是平端，或带有(a)3'和/或(a)5'悬垂。优选地，构建体是平端。这种分子也被称为“mxRNA”。如本文所用，术语“mxRNA”可参见WO 2020/044186A2中所定义的，其全文并入本文作为参考。根据本发明，特别优选的，发夹型RNA如表6和表7以及图15至图18、图20和图22所示。
如本文所用，“方向性”是指寡核苷酸的端对端化学取向，其依据是糖基中碳原子编号的化学惯例，即由糖基的5’碳定义的5’端和由糖基的3'碳定义的3’端。在双链或双股寡核苷酸中，各自的链以相反的5'至3'方向运行，以允许它们之间进行碱基配对。
如本文所用，“双链”(也缩写为“dup”)是指寡核苷酸或寡核苷酸的两个或多个互补链区或链，通过其间的非共价、序列特异性相互作用杂交在一起。最常见的情况是，双链体中的杂交发生在核苷碱基腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)之间，和/或，
(A)腺嘌呤和尿嘧啶(U)之间，和/或，鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)之间。
如本文所用，“双链”或“双链”是指一对相互杂交的寡聚化合物。在一些实施方案中，双链寡聚物化合物包括第一和第二寡聚物化合物。
如本文所用，“表达”是指基因最终形成蛋白质的过程。表达包括但不限于转录、转录后修饰(如剪接、多腺苷酸化、添加5'-cap)和翻译。
如本文所用，“转录”或“转录的”是指基于DNA的基因表达的几个步骤中的第一个步骤，在该步骤中，DNA的目标序列被RNA聚合酶复制成RNA(尤其是mRNA)。在转录过程中，RNA聚合酶读取DNA序列，产生互补的、反平行的RNA序列，称为主转录本。
如本文所用，“靶标序列”是指与寡聚物化合物旨杂交结合，从而形成影响因子XI表达活性的序列。寡核苷酸与其靶序列有足够的互补性，可以在生理条件下进行杂交。
如本文所用，核苷碱基的“核苷碱基互补性”或“互补性”是指一个核苷碱基能够与另一个核苷碱基进行碱基配对。例如，在DNA中，腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)互补。例如，在RNA中，腺嘌呤(A)与尿嘧啶(U)互补。在DNA和RNA中，鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)互补。在一些实施方案中，互补核苷碱基是指寡聚物化合物中能与其靶序列核苷碱基配对的核苷碱基。例如，如果寡聚化合物某一位置上的核苷碱基能与目标序列某一位置上的核苷碱基发生氢键结合，那么寡聚化合物与目标序列之间的氢键结合位置就被认为是该核苷碱基对的互补位置。经过某些修饰的核苷碱基可保持与对应核苷碱基配对的能力，因此仍具有核苷碱基互补性。
如本文所用，核苷碱基的“非互补”是指一对核苷碱基之间不形成氢键。
如本文所用，“互补性”是指寡聚化合物(如连接核苷酸、寡核苷酸)通过核苷碱基互补性与目标序列或寡聚化合物本身的某个区域杂交的能力。
互补寡聚化合物不一定每个核苷都具有核苷碱基互补性。相反，可以容忍一些错配。在一些实施方案中，互补寡聚化合物或区域在70％的核苷碱基上互补(70％互补)。在一些实施例中，互补寡聚物化合物或区域的互补性为80％以上是互补的。在一些实施例中，互补寡聚物化合物或区域90％以上是互补的。在一些实施例中，互补寡聚物化合物或区域是95％互补的。在一些实施例中，互补寡聚物化合物或区域是100％互补的。
如本文所用，寡聚化合物的“自互补性”是指一种化合物，可以自身折叠，通过内部互补链区的核苷碱基杂交形成双链。根据链区的紧密程度和/或长度，化合物可形成发夹环、连接点、隆起或内环。
如本文所用，“错配”是指当寡聚化合物与目标序列和/或寡聚化合物的自互补区配对时，寡聚化合物的核苷碱基不能与目标序列相应位置的核苷碱基配对，或当寡聚化合物由于自身互补而杂交时，不能与寡聚化合物本身相应位置的核苷碱基配对。
如本文所用，“杂交”是指互补寡聚化合物(如寡聚化合物及其目标序列)的配对。虽然不限于特定的机制，但最常见的配对机制涉及互补核苷碱基之间的氢键，可以是沃森-克里克氢键、霍格斯坦氢键或反向霍格斯坦氢键。
如本文所用，“特异性杂交”是指寡聚化合物与一个核酸位点杂交的亲和力大于与另一个核酸位点杂交的亲和力。
如本文所用，“完全互补”指的是寡聚化合物或其区域的每个核苷碱基都能与互补核酸靶序列的核苷碱基或寡聚化合物的自互补区域配对。因此，完全互补的寡聚化合物或其区域相对于其目标序列或寡聚化合物的自互补区域不包含错配或未杂交的核苷碱基。
如本文所用，“互补性百分比”是指寡聚化合物中与目标核酸等长部分互补的核苷碱基的百分比。互补性百分比的计算方法是：将寡聚化合物中与目标核酸中相应位置的核苷碱基互补的核苷碱基数目除以寡聚化合物的总长度。
如本文所用，“同一性百分数”是指第一核酸中与第二核酸中相应位置的核苷碱基具有相同类型(与化学修饰无关)的核苷碱基的数量除以第一核酸中核苷碱基的总数。
如本文所用，“调节”是指与调节前的分子、功能或活性的量或质相比，分子、功能或活性的量或质的变化。例如，调节包括基因表达的增加(刺激或诱导)或减少(抑制或降低)。
如本文所用，核苷的“修饰类型”或核苷的“类型”是指核苷的化学修饰，包括修饰和未修饰的核苷。因此，除非另有说明，“具有第一类修饰的核苷”可以是未经修饰的核苷。
如本文所用，“不同修饰”是指不同的化学修饰或化学取代基，包括没有修饰。因此，例如，MOE核苷和未修饰的天然存在的RNA核苷是“不同修饰的”，即使天然核苷未经修饰。同样，DNA和RNA寡核苷酸也是“不同的修饰”，尽管两者都是天然存在的未修饰核苷。由不同核苷碱基组成的相同核苷不属于不同修饰的核苷。例如，由2'-OMe修饰的糖基和未修饰的腺嘌呤核苷碱基组成的核苷，和由2'-OMe修饰的糖基和未修饰的胸腺嘧啶核苷碱基组成的核苷就不是不同修饰的核苷。
如本文所用，“同类修饰”是指彼此相同的修饰，包括没有修饰。因此，举例来说，两个未经修饰的RNA核苷具有“相同类型的修饰”，即使RNA核苷未经修饰。具有相同修饰类型的核苷可以包含不同的核苷碱基。
如本文所用，“区域”或“区域”，或“部分”或“部分”，是指具有本文所定义的功能或特征的多个连接的核苷，特别是参照本文所述的主题和定义。通常，这些区域或部分包括至少10个、至少11个、至少12个或至少13个连接的核苷。例如，这些区域可包括13至20个连接的核苷，如13至16个或18至20个连接的核苷。通常，本文定义的第一区域基本上由18至20个核苷组成，而本文定义的第二区域基本上由13至16个连接的核苷组成。
如本文所用，“药学上可接受的载体或稀释剂”是指适用于给动物用药的任何物质。在某些实施例中，药学上可接受的载体或稀释剂是无菌生理盐水。在某些实施例中，这种无菌生理盐水是药用级生理盐水。
如本文所用，“取代基”和“取代基团”是指取代已命名母体化合物的原子或基团的原子或基团。例如，修饰核苷的取代基是与天然核苷中的原子或基团不同的任何原子或基团(例如，修饰的2'-取代基是核苷2'-位上除H或OH以外的任何原子或基团)。取代基可以是受保护的，也可以是未受保护的。在某些实施方案中，本公开的化合物在母体化合物的一个或多个位置上具有取代基。取代基还可进一步被其他取代基取代，并可直接或通过连接基(如氧或烷基或烃基)连接到母体化合物上。
这些取代基可以作为糖基上的修饰，特别是糖基2'-位上的取代基。除非另有说明，可用作取代基的基团包括但不限于卤代、羟基、烷基、烯基、炔基、酰基、羧基、烷氧基、烷氧基亚烷基和氨基中的一个或多个取代基。本文所述的某些取代基可以代表直接连接到糖分子环上的修饰(例如直接连接到糖环上的卤素，如氟)，或通过本身直接与糖基相连的氧连接原子间接与糖基环相连的修饰(如与氧原子相连的烷氧基亚烷基，如甲氧基乙烯，整体上提供了本文所述的连接到糖基2'-位的MOE取代基)。
如本文所用，“烷基”是指饱和的直链或支链C1-6单价烃基，甲基是糖分子2'-位上最优选的取代基。烷基通常附着在糖2'位的氧连接原子上，因此在本文所述的寡聚化合物的糖分子上总体上提供了-O-烷基取代基，如-OCH3取代基，这一点对本领域的技术人员来说再清楚不过了。
如本文所用，“烯基”是指通式为-CnH2n-的饱和直链或支链二价烃基，其中n为1-6。亚甲基或亚乙基是优选的亚烷基。
如本文所用，“烯基”是指直链或支链的不饱和一价C2-6烃基，其中乙烯基或丙烯基作为糖分子2'-位上的取代基最为理想。正如本领域所熟知的，烯基中存在的不饱和程度是指至少存在一个碳碳双键。烯基通常连接到糖2'-位上的氧连接原子上，因此在本文所述的寡聚化合物的糖分子上总体上提供了一个-O稀基取代基，如-OCH2CH＝CH2取代基。这一点对本领域的技术人员来说再清楚不过了。
如本文所用，“炔基”是指直链或支链的不饱和C2-6烃基，其中乙炔基是糖基2'-位上最优选的取代基。正如本领域所熟知的，炔基中存在的不饱和程度是指至少存在一个碳对碳的三键。炔基通常连接到糖2'-位上的氧连接原子上，因此在本文所述的寡聚化合物的糖分子上总体上提供了一个-炔基取代基。本领域的技术人员对此会有很好的理解。
如本文所用，“羧基”是具有通式-CO2H的基团。
如本文所用，“酰基”是指从本文定义的羧基中去除一个羟基而形成的基团，通式为-C(O)-X，其中X通常为C1-6烷基。
如本文所用，“烷氧基”是指烷基(如C1-6烷基)与氧原子之间形成的基团，其中氧原子用于将烷氧基连接到母体分子(如糖分子的2'-位)或另一个基团(如本文定义的亚烷基)上。烷氧基的例子包括但不限于甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基和叔丁氧基。本文所用的烷氧基基团可任选包括其他取代基团。
如本文所用，烷氧基烷基是指与同样如本文所定义的亚烷基相连的如本文所定义的烷氧基，其中烷氧基的氧原子与亚烷基相连，亚烷基与母体分子相连。亚烷基通常连接到糖2'-位上的氧连接原子上，因此在本文所述的寡聚化合物的糖分子上总体上提供了一个-O亚烷基烷氧基取代基，如-OCH2CH2OCH3取代基。本领域的技术人员对此充分理解，并且通常被称为如本文所定义和本领域已知的MOE取代基。
如本文所用，“氨基”包括伯氨基、仲氨基和叔氨基。
如本文所用，“卤”和“卤素”指选自氟、氯、溴和碘中的原子。
还可以理解的是，本文所述的寡聚化合物可以在一条或两条链的一端或两端具有一个或多个非杂交核苷(悬垂)，以及/或一个或多个内部非杂交核苷(错配)，只要有足够的互补性就能在生理相关条件下维持杂交。另外，本文所述的寡聚化合物至少一端可以是平端。
如本文所用，术语“包括”是指包括所确定的方法步骤或要素，但这些步骤或要素并不包括排他性列表，因此可能存在其他步骤或要素。
此外，就详细描述或权利要求中使用的术语“包括”而言，该术语旨在以类似于术语“包含”在权利要求中用作过渡词时所解释的方式来包含。
本发明的每种构建体的5'末端基团可以有磷酸修饰，也可以没有。此外，上述每种构建质粒的3'末端基团可以有也可以没有“3x GalNAc”。更有利的是，构建质粒带有3xGalNAc配体，如本文公开的“牙刷”分子。特别优选的是还具有5'磷酸的构建体，尽管这并不是严格的要求，因为如果没有5’磷酸，哺乳动物细胞将添加这种磷酸，以防其在施用的分子中缺乏。
以下为本发明实施例的方面
方面1.一种选择性调节或抑制FXI表达的寡聚化合物，化合物包含至少第一区域的连接核苷，该核苷至少具有与至少一部分从FXI基因转录的RNA互补的第一核苷碱基序列，所述序列选自以下序列或其部分，SEQ ID NO(序列号)1至250，或序列号1251至1500。
方面2.根据方面1所述的寡聚化合物，进一步包含至少一个连接核苷的第二个区域，所述第二区域至少具有与所述第一核苷碱基序列至少部分互补的第二核苷碱基序列，该序列选自以下序列或其部分，序列号251至500,或序列号1501至1750。
方面3.根据方面1或方面2所述的寡聚化合物，其中第一核苷碱基序列选自下列序列或其部分，序列号8、13、27、39、46、91、98、103、105、109、120、140、146、151、152、163、182、183、199、207、210、218、220、223、224、238，或序列号1258、1263、1277、1289、1296、1341、1348、1353、1355、1359、1370、1390、1396、1401、1402、1413、1432、1433、1449、1457、1460、1468、1470、1473、1474、1488。
方面4.根据实施例3所述的寡聚化合物，其中第二核苷碱基序列选自下列序列或其部分，序列号258、263、277、289、296、341、348、353、355、359、370、390、396、401、402、413、432、433、449、457、460、468、470、473、474、488，或序列号1508、1513、1527、1539、1546、1591、1598、1603、1605、1609、1620、1640、1646、1651、1652、1663、1682、1683、1699、1707、1710、1718、1720、1723、1724、1738。
方面5：根据方面到方面四中任一项所述的寡聚化合物，其中第一核苷碱基序列选自下列序列或其部分，序列号8、46、91、146、152、207，或1258、1296、1341、1396、1402、1457。
方面6：根据方面5所述的寡聚化合物，其第二核苷碱基序列选自下列序列或其部分：序列号258、296、341、396、402、457，或序列号1508、1546、1591、1646、1652、1707。
方面7：根据方面1到方面6中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷酸序列选自下列序列或其部分：序列号46、91、152，或序列号1296、1341、1402。
方面8：根据方面7所述的寡聚化合物，其第二核苷酸序列选自下列序列或其部分：序列号296、341、402或序列号1546、1591、1652。
方面9：根据方面1到方面8中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列至少与下列任一序列或其部分互补：序列号1001至1250。
方面10：根据方面3和/或方面四所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列至少部分互补于以下任一序列或其一部分：序列号1008、1013、1027、1039、1046、1091、1098、1103、1105、1109、1120、1140、1146、1151、1152、1163、1182、1183、1199、1207、1210、1218、1220、1223、1224、1238。
方面11：根据方面5和/或方面6所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列至少与下列序列中的任一序列或其部分互补：序列号1008、1046、1091、1146、1152、1207。
方面12：根据方面7和/或方面8所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列至少部分与下列任何序列或其部分互补：序列号1046、1091、1152。
方面13：一种选择性调节或抑制FXI表达的寡聚化合物，该化合物至少一个连接核苷的第一区域，所述第一区域至少具有与从FXI基因转录的RNA至少一部分互补的第一核苷碱基序列，所述RNA选自以下序列或其一部分：序列号1001至1250。
方面14：根据方面13所述的寡聚化合物，其RNA选自以下序列或其一部分：序列号1008、1013、1027、1039、1046、1091、1098、1103、1105、1109、1120、1140、1146、1151、1152、1163、1182、1183、1199、1207、1210、1218、1220、1223、1224、1238。
方面15：根据方面10或方面14所述的寡聚化合物，其RNA选自以下序列或其一部分：序列号1008、1046、1091、1146、1152、1207。
方面16：根据方面13到方面15中任一项所述的寡聚化合物，其RNA选自以下序列或其一部分：序列号1046、1091、1152。
方面17：根据方面1到方面16中任一项所述的寡聚化合物，其连接核苷的第一区域由18至20个连接核苷组成。
方面18：根据方面2到方面17中任一项所述的寡聚化合物，其连接核苷的第二区域由11至16、12至15或13至16个连接核苷组成。
方面19：根据方面2到方面18中任一项所述的寡聚化合物，其包括至少一个互补双链区，所述互补双链区包括与所述第二核苷区的至少一部分直接或间接连接的所述第一核苷区的至少一部分。
方面20：根据方面19所述的寡聚化合物，其每个所述第一核苷区和第二核苷区具有5'至3'方向性，从而分别定义其5'和3'区域。
方面21：根据方面20所述的寡聚化合物，第一核苷区的5'区与所述第二核苷区的3'区直接或间接连接，如通过互补碱基配对，和/或，所述第一核苷区的3'区与所述第二核苷区的5'区直接或间接连接。
方面22：根据方面1到方面21中任一项所述的寡聚化合物，其进一步包含一个或多个配体。
方面23：根据方面21所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体与所述的第二核苷区域共轭。
方面24：根据方面20和方面23所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体与所述第二核苷区的3'区共轭。
方面25：根据方面22到方面24中任一项所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体是任何细胞引导分子，如结合细胞膜或细胞表面上特定靶点的脂质、碳水化合物、适配体、维生素和/或肽。
方面26：根据方面25所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体包括一个或多个碳水化合物。
方面27：根据方面26所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个碳水化合物可以是单糖、二糖、三糖、四糖、寡聚糖或多糖。
方面28：根据方面27所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个碳水化合物包括一种或多种半乳糖分子、一种或多种乳糖分子、一种或多种N-乙酰-半乳糖胺分子，和/或，一种或多种甘露糖分子。
方面29：根据方面28所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个碳水化合物包括一个或多个N-乙酰基-半乳糖胺分子。
方面30：根据方面29所述的寡聚化合物，其包括两个或三个N-乙酰基-半乳糖胺基，优选为三个。
方面31：根据方面22到方面30中任一项所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体以线性构型或支链构型连接到所述寡聚化合物，优选连接到其第二核苷区域。
优选的配体具有以下结构，在本专利中也称为“牙刷”：
上图结构为本专利中称为GalNAc的其中一个特别优选地实施方案。
方面32：根据方面31所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体以二端构型或三端构型连接到所述寡聚化合物上。
方面33：根据方面19所述的寡聚化合物，其包含一条单链结构，该结构包含所述第一核苷区和第二核苷区的二聚体，所述第一核苷区的至少一部分直接或间接连接到所述第二核苷区的至少一部分，从而形成所述至少部分互补的双链区。
方面34：根据方面33所述的寡聚化合物，其第一核苷区与第二核苷区相比具有更多数量的连接核苷酸，由此第一核苷区额外数量的连接核苷酸形成连接第一核苷区和第二核苷区的发夹环。
方面35：根据方面20和方面34所述的寡聚化合物，其发夹环存在于所述第一核苷区的3'区域。
方面36：根据方面34或方面35所述的寡聚化合物，其发夹环包括4或5个连接的核苷。
方面37：根据方面8到方面36中任一项所述的寡聚化合物，其包括核苷间连接，其中至少一个核苷间连接是修饰的核苷间连接。
实施例38：根据方面37所述的寡聚化合物，其含有的修饰的核苷间连接是硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
方面39：根据方面38所述的寡聚化合物，其包括1至15个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
方面40：根据方面39所述的寡聚化合物，其包括7、8、9或10个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
方面41：根据方面38到方面40中任一项所述的寡聚化合物，其在第一个核苷区的5'区包括一个或多个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
方面42：根据方面20及方面38到方面41中任一项所述的寡聚化合物，其在第二核苷区的5'区包括一个或多个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
方面43：根据方面34及方面38到方面42中任一项所述的寡聚化合物，其包括发夹环的至少两个、优选至少三个、优选至少四个、优选至少五个相邻核苷之间的硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接，取决于发夹环中存在的核苷酸数目。
方面44：根据方面43所述的寡聚化合物，其包括存在于所述发夹环中的每个相邻核苷之间的硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
方面45：根据方面4到方面44中任一项所述的寡聚化合物，其中至少一个核苷包含修饰的糖。
方面46：根据方面45所述的寡聚化合物，其修饰的糖类选自2'位糖修饰；构象限制的核糖(CRN)，例如锁核酸(LNA)，(S)限制性乙基双环核酸，限制性乙基(cEt)，三环DNA；吗啉基，非锁核酸(UNA)，乙二醇核酸(GNA)，D-己醇核酸(HNA)和环己烯核酸(CeNA)，优选2'-O-甲基修饰糖。
进一步的2'糖修饰包括2'-O-烷基修饰糖、2'-O-甲氧基乙基修饰糖、2'-O-烯丙基修饰糖、2'-C-烯丙基修饰糖、2'-脱氧修饰糖，例如2'-脱氧核糖、2'-氟修饰糖、2'-阿拉伯-氟修饰糖、2'-O-苄基修饰糖、2'-氨基修饰糖和2'-O-甲基-4-吡啶修饰糖。
方面47：根据方面45或方面46所述的寡聚化合物，其中所述修饰糖为2'-氟修饰糖。
方面48：根据方面20和方面45到方面47中任一项所述的寡聚化合物，其在第一核苷区5'区的第一核苷酸下游的第2和14位上的核苷的糖不包含2'-O-甲基修饰。
方面49：根据方面20和方面45到方面48中任一项所述的寡聚化合物，其中第二核苷区的核苷的糖，在位置上对应于第一核苷区的5'区的第一核苷酸下游的位置9至11的任一位置上的第一核苷区的核苷的糖，不包含2'-O-甲基修饰。
方面50：根据方面48或方面49所述的寡聚化合物，其在第一核苷区5'区的第一核苷酸下游的第2和14位上的核苷的糖含有2'-O-甲基修饰。
方面51：根据方面48到方面50中任一项所述的寡聚化合物，其第二核苷区的核苷的糖，在位置上对应于第一核苷区的5'区的第一核苷酸下游的位置9至11的任一位置上的第一核苷区的核苷的糖包含2'-氟修饰。
方面52：根据方面20和方面45到方面51中任一项所述的寡聚化合物，其从第一核苷区的5'区开始的奇数核苷酸中的一个或多个被修饰，和/或，所述化合物中从第一核苷区的5'区开始的偶数核苷酸中的一个或多个被修饰，其中典型的偶数核苷酸的修饰是与奇数核苷酸的修饰不同的第二修饰。
方面53：根据方面52所述的寡聚化合物，其从第二核苷区的3'区开始的一个或多个奇数核苷酸被不同于第一核苷区奇数核苷酸的修饰所修饰。
方面54：根据方面52或方面53所述的寡聚化合物，其从第二核苷区的3'区开始的一个或多个偶数核苷酸被修饰，该修饰不同于权利要求53所述的第一核苷区偶数核苷酸的修饰。
方面55：根据方面52到方面54中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷区的至少一个或多个经修饰的偶数核苷酸与第一核苷区的至少一个或多个经不同修饰的奇数核苷酸相邻。
方面56：根据方面52到方面55中任一项所述的寡聚化合物，其第二核苷区的至少一个或多个经修饰的偶数核苷与第二核苷区的至少一个或多个经不同修饰的奇数核苷相邻。
方面57：根据方面52到方面56中任一项所述的寡聚化合物，其从第一个核苷区的5'区开始的一个或多个奇数核苷酸的糖是2'-O-甲基修饰糖。
方面58：根据方面52到方面57中任一项所述的寡聚化合物，其从第一核苷区的5'区开始的一个或多个偶数核苷的糖是2'-F修饰的糖。
方面59：根据方面52到方面58中任一项所述的寡聚化合物，其从第二核苷区的3'区开始的一个或多个奇数核苷的糖是2'-F修饰的糖。
方面60：根据方面52到方面59中任一项所述的寡聚化合物，其从第二核苷区的3'区开始的一个或多个偶数核苷的糖是2'-O-甲基修饰的糖。
方面61：根据方面45到方面60中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷区多个相邻核苷的糖被共同修饰。
方面62：根据方面45到方面61中任一项所述的寡聚化合物，其第二核苷区的多个相邻核苷的糖被共同修饰。
方面63：根据方面34及方面52到方面62中任一项所述的寡聚化合物，其发夹环的多个相邻核苷的糖被共同修饰。
方面64：根据方面61到方面63中任一项所述的寡聚化合物，其中所述的共同修饰是2'-F修饰糖。
方面65：根据方面61到方面63中任一项所述的寡聚化合物，其中所述的共同修饰是2'-O-甲基修饰糖。
方面66：根据方面65所述的寡聚化合物，其多个相邻的2'-O-甲基修饰糖存在于所述第一和/或第二核苷区的至少八个相邻核苷中。
方面67：根据方面65所述的寡聚化合物，其多个相邻的2'-O-甲基修饰糖存在于所述发夹环的三个或四个相邻的核苷中。
方面68：根据方面34和方面45所述的寡聚化合物，其发夹环包括至少一个具有修饰糖的核苷。
方面69：根据方面68所述的寡聚化合物，其中至少一个核苷与具有不同修饰糖的核苷相邻。
方面70：根据方面69所述的寡聚化合物，其中所述的修饰糖是2'-O-甲基修饰糖，所述的不同修饰糖是2'-F修饰糖。
方面71：根据方面1到方面70中任一项所述的寡聚化合物，其包含一个或多个未修饰糖的核苷。
方面72：根据方面71所述的寡聚化合物，其中所述的未修饰的糖存在于第二核苷区的5'区域。
方面73：根据方面34及方面71到方面72中任一项所述的寡聚化合物，其中所述的未修饰的糖存在于发夹环中。
方面74：根据方面1到方面73中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷区和/或第二核苷区的一个或多个核苷是倒置核苷，并通过其糖的3'碳和相邻核苷的糖的3'碳连接到相邻核苷，和/或，第一核苷区和/或第二核苷区中的一个或多个核苷是倒置核苷，并通过其糖的5'碳和相邻核苷的糖的5'碳连接到相邻核苷上。
方面75：根据方面1到方面74中任一项所述的寡聚化合物，其为钝性末端。
方面76：根据方面1到方面74中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷区或第二核苷区域具有悬垂。
方面77：一种选择性调节或抑制FXI表达的寡聚化合物，该化合物包含至少第一核苷连接区，所述核苷连接区至少具有与从FXI基因转录的RNA的至少一部分互补的第一核苷碱基序列，所述第一核苷碱基序列是经修饰的序列，且选自以下序列或其一部分：构建体序列号501至750，或构建体序列号1751至2000。
方面78：根据方面77所述的寡聚化合物，其进一步包含至少一个连接核苷的第二区域，所述第二区域至少具有与所述第一核苷碱基序列至少部分互补的第二核苷碱基序列，其中所述第二核苷碱基序列是经修饰的序列，且选自下列序列或其一部分：构建体序列号751至1000，或构建体序列号2001至2250。
方面79：根据方面77或方面78所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列选自下列序列或其一部分：构建体序列号508、513、527、539、546、591、598、603、605、609、620、640、646、651、652、663、682、683、699、707、710、718、720、723、724、738，或构建体序列号1758、1763、1777、1789、1796、1841、1848、1853、1855、1859、1870、1890、1896、1901、1902、1913、1932、1933、1949、1957、1960、1968、1970、1973、1974、1988。
方面80：根据方面79所述的寡聚化合物，其第二核苷碱基序列选自下列序列或其一部分：构建体序列号758、763、777、789、796、841、848、853、855、859、870、890、896、901、902、913、932、933、949、957、960、968、970、973、974、988，或构建体序列号2008、2013、2027、2039、2046、2091、2098、2103、2105、2109、2120、2140、2146、2151、2152、2163、2182、2183、2199、2207、2210、2218、2220、2223、2224、2238。
方面81：根据方面77到方面80中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：构建体序列号508、546、591、646、652、707，或构建体序列号1758、1796、1841、1896、1902、1957。
方面82：根据方面81所述的寡聚化合物，其第二核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：构建体序列号758、796、841、896、902、957，或构建体序列号2008、2046、2091、2146、2152、2207。
方面83：根据方面77到方面82中任一项所述的寡聚化合物，其第一核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：构建体序列号546、591、652或构建体序列号1796、1841、1902。
方面84：根据方面83所述的寡聚化合物，其第二核苷碱基序列选自下列序列或其一部分：构建体序列号796、841、902，或构建体序列号2046、2091、2152。
方面85：根据方面77到方面84中任一项所述的寡聚化合物，其特征进一步根据方面17到方面44，或方面74到方面76中任一项所述。
方面86：一种选择性调节或抑制FXI表达的寡聚化合物，选自以下序列：序列号2251至2253，或序列号2284至2288，优选序列号2287。
方面87：一种选择性调节或抑制FXI表达的寡聚化合物，选自以下序列：构建体序列号2254至2283。
方面88：根据方面86或方面87所述的寡聚化合物，其进一步包含一个或多个配体。
方面89：根据方面88所述的寡聚化合物，其一个或多个配体与所述序列的3'区共轭，优选共轭在3'末端核苷上。
方面90：根据方面88所述的寡聚化合物，其一个或多个配体与非末端位置共轭。
方面91：根据方面88到方面90中任一项所述的寡聚化合物，其一个或多个配体是任何细胞的引导分子，如结合细胞膜或细胞表面上特定靶点的脂质、碳水化合物、适配体、维生素和/或肽。
方面92：根据方面91所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体含有一个或多个碳水化合物。
方面93：根据方面92所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个碳水化合物可以是单糖、二糖、三糖、四糖、寡聚糖或多糖。
优选的单糖是己糖。
方面94：根据方面93所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个碳水化合物含有一个或多个半乳糖结构、一个或多个乳糖结构、一个或多个N-乙酰半乳糖胺结构、和/或一个或多个甘露糖结构。
方面95：根据方面94所述的寡聚化合物，其包含的一种或多种碳水化合物包括一个或多个N-乙酰-半乳糖胺分子。
方面96：根据方面95所述的寡聚化合物，其包含包括两个或三个N-乙酰基-半乳糖胺分子，优选为三个。
方面97：根据方面88到方面96中任一项所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体以线性构型或支链构型连接到所述寡聚化合物上。
方面98：根据方面97所述的寡聚化合物，其包含的一个或多个配体以二端构型或三端构型连接到所述寡聚化合物上。
方面99：根据方面86到方面98中任一项所述的寡聚化合物，其核苷酸序列自二聚化以形成至少部分互补的双链区。
方面100：根据方面99所述的寡聚化合物，其具有如图15至17或图18和图20中任一个所示的核苷碱基序列和结构，优选为构建体NO:2290至2292，特别优选为构建体NO:2290。
方面101：一种组合物包含了方面1到方面100中任一项所述的寡聚化合物和一种生物相容性辅料。
方面102：方面1到方面100中任一项所述的寡聚化合物在治疗中的应用。
方面103：方面1到方面100中任一项所述的寡聚化合物在治疗疾病或机体功能紊乱的应用。
方面104：一种用于治疗疾病或机体功能紊乱的方法，包括向需要治疗的个体施用方面1至100中任一项所述的寡聚化合物。
方面105：根据方面104所述的方法，将所述的寡聚化合物采用皮下注射或静脉注射方式给到患者个体。
方面106：方面1至100中任一项所述的寡聚化合物在研究中用作基因功能分析工具的用途。
方面107：根据方面103所述的用途，或方面104所述的方法，所述的疾病或机体功能紊乱为血栓栓塞性疾病。
方面108：根据方面107所述的用途或方法，血栓栓塞类疾病选自深静脉血栓，静脉或动脉血栓，肺栓塞，心肌梗死，中风，血栓相关的慢性肾脏疾病或终末期肾衰竭(ESRD)，包括透析相关血栓或其它凝血症状。
方面109-：根据方面108所述的用途或方法，血栓栓塞类疾病为深静脉血栓，肺栓塞或其综合症。
方面110：根据方面1到方面100中任一项所述的寡聚化合物在治疗疾病或机体功能紊乱药物的生产中的用途。所述疾病和病症与上文所述相同。
本专利公开的分子，包括但不限于表6、表7、图15到图18、图20及图22所展示的发夹结构的RNA，其特征是具有非常良好的效果，包括在体内环境中，证据可参见图24和25展示的数据。这些数据表明XI因子的长期下调与本专利所述的复合物的作用相对应。在实施例中提供的体外数据中可以看到多种构建体具有良好效果的更多证据，包括图19展示的数据。
本专利提供的附图阐明了代表性的方法和数据。尽管这些方法是以一系列的实施例和特定的顺序展示和描述的，但不局限于仅对操作的顺序的理解和认识。例如，一些操作可以以不同于所描述的另一种顺序执行。此外，一种操作可以和另一种操作同时进行。并且在某些情况下，在所描述的方法中并非所有的操作都是必须执行的。
本专利所描述的这些方法的操作顺序是具有代表性的，但这些步骤可能以任何合适的顺序进行，或以合适的方式同时进行。此外，在不偏离本专利所述主题的情况下，可以添加、替换或个别删除任何方法中的步骤。前面所述的任一项实施例都可能与其它任一项所述实施例组合形成进一步的实施例。
为便于理解，以上对优选实施例的描述仅通过示例的方式给出，本领域技术人员可能进行各种修改。以上描述包括一个或多个实施例的示例。当然，不可能尽述上述复合物、组成或方式的所有可能的修饰和改变，但是本领域的普通技术人员可以认识到，很多实施例的进一步改变和排列是可能的。因此，所述实施例旨在包含所有这些在权利要求范围内的改变、修改及差异。
实施例
以下实施例说明了本公开的某些实施方案，并不具有限制性。此外，在提供具体实施例的地方，发明人已经考虑到这些具体实施例的通用性。例如，对具有特定图案或修饰模式的寡核苷酸的公开为具有相同或相似图案或修饰模式的其它寡核苷酸提供了合理的支持。
本文公开的RNAi构建体的合成可采用本领域技术人员已知的合成方法，如https://en.wikipedia.org/wiki/Oligonucleotide_synthesis(检索日期：2022年2月16日)中公开的合成方法，其中本网站公开的方法全文并入本文作为参考。与该参考文献中公开的合成方法唯一不同的是，该合成方法在第一合成步骤中使用了固定在载体上的GalNAc磷酰胺。
术语“构建体编号”和“SEQ ID NO(序列号)”在本文中等效使用，尤其是对于67个核苷碱基序列而言。核苷碱基序列通常不携带有关糖-磷酸主链修饰的信息。
实施例1：
使用下表1a和1b中列出的寡核苷酸合成寡聚化合物。
表1a：活性核苷碱基序列的汇总序列表：
/>
/>
/>
/>
/>
/>
上表1a中：
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤。
表1b：具有化学修饰的活性核苷碱基序列的汇总序列表：
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
上表1b中：
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤；
P表示末端磷酸基；
m代表在基础核苷糖2'位的甲基修饰；
f代表在基础核苷糖2'位的氟修饰。
因子XI基因中与表1a/1b的反义(引导)序列相互作用的靶序列见下表1c。
表1c：靶基因核苷碱基序列汇总表：
/>
/>
/>
/>
/>
/>
在上表1c中：
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤。
还应当注意的是，本发明实施例的范围扩展至与表1a或表1b中的序列相对应的序列，其中反义(引导)链(如本文定义的第一区域)的5'核苷可包括可以存在于RNA分子中的任何核苷碱基，换言之，可以是腺嘌呤(A)、尿嘧啶(U)、鸟嘌呤或胞嘧啶(C)中的任何一种。另外，本发明实施例的范围扩展至与表1a或表1b中的序列相对应的序列，其中有义(乘客)链(如本文定义的第二区域)的3'核苷可以包括可以存在于RNA分子中的任何核苷碱基，换言之，可以是腺嘌呤(A)、尿嘧啶(U)、鸟嘌呤或胞嘧啶(C)中的任何一种，但优选的是与反义(引导)链(如本文定义的第一区域)的5'核苷碱基互补的核苷碱基。这些进一步的序列如表1d(未修饰)和1e(化学修饰)所示，其中N和N'分别代表可出现在反义(引导)链(本文定义的第一区域)5'末端位置和有义(乘客)链(本文定义的第二区域)3'末端位置的任何RNA核苷碱基。
表1d：活性核苷碱基序列的汇总序列表：
/>
/>
/>
/>
/>
在上表1d中：
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤。
N代表任何RNA核苷碱基；
N’代表任何RNA核苷碱基，且优选与N互补。
表1e：具有化学修饰的活性核苷碱基序列的汇总序列表：
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤；
P表示末端磷酸基；
m代表在基础核苷糖2'位的甲基修饰；f代表在基础核苷糖2'位的氟修饰；
N代表任何RNA核苷碱基；
N'代表任何RNA核苷碱基，且优选与N互补。
实施例2：
上文表1a/1b中列出的以人肝癌细胞中FXI mRNA为靶标的寡核苷酸筛选方法如下。
随机的FXI寡聚化合物的非变性凝胶电泳：将包括上表1a/1b中列出的寡聚化合物(包括寡核苷酸)溶解在无菌的无RNA酶、无DNA酶的水中至终浓度100μM。根据下表2，随机选择10种寡聚化合物进行验证。
表2：
对表2的上述寡聚化合物进行20％TBE凝胶电泳，10pm寡核苷酸/泳道，染色：SybrGold。图1显示了所得双链体的稳定性。根据该QC数据，我们在接下来的筛选中使用了所有的寡聚化合物。
两次独立的qPCR分析验证针对F11筛选的构建体。两种测定均产生如图2所示的线性剂量响应，具有高灵敏度和效率。由于siRNA与qPCR探针区域重叠会造成已知的qPCR伪影，因此使用了来自不同靶基因区域的两种探针。
在肝癌细胞系中筛选F11寡聚化合物：
方案详细信息：
细胞接种：10,000个HepG2细胞/孔。
Lipofectamine RNAiMax介导的转染。
转染：20nM化合物，不含抗生素的EMEM培养基，10％FBS，孵育72小时。
通过qPCR(Taqman化学)测量基因表达，根据标准曲线进行调整，采用内参基因GAPDH进行归一化。
数据以未处理细胞(NT)中基因表达的百分比表示。
筛选结果如图3至图12所示。
选择了26种具有80％基因敲除率的寡聚化合物用于剂量反应曲线。选择依据如下表3所示。
表3：
实施例3：
实施例2中确定的26种FXI先导化合物的剂量响应曲线如图13所示。
5种FXI先导化合物的剂量响应曲线见图14。
实施例4：
实施例2中确定的26种FXI先导化合物的IC50值如下表4所示。
表4：
| siRNA(nM) | 50 | 25 | 12.5 | 5 | 2 | 0.8 | 0.32 |
| F11-140 | 10.84824 | 27.26815 | 52.49094 | 74.79465 | 86.01931 | 92.5617 | 108.1231 |
| F11-91 | 11.21R62 | 17.5123 | 30.79378 | 52.89924 | 71.85335 | 76.62539 | 86.24001 |
| F11-46 | 11.31857 | 19.1463 | 34.94334 | 58.3431 | 72.36898 | 79.03502 | 87.90456 |
| F11-27 | 12.00189 | 19.71206 | 36.34996 | 58.61257 | 73.49525 | 80.52213 | 95.02346 |
| F11-08 | 12.88477 | 23.17136 | 38.502 | 60.95352 | 75.64406 | 85.64819 | 94.30091 |
| F11-207 | 13.33847 | 28.59863 | 48.07128 | 70.58417 | 80.28337 | 83.17787 | 97.52694 |
| F11-146 | 13.38071 | 23.04423 | 40.71772 | 67.32095 | 87.86172 | 94.18917 | 112.7978 |
| F11-152 | 14.24965 | 24.9051 | 51.57466 | 70.85458 | 81.53343 | 88.18263 | 105.3212 |
| F11-13 | 16.1023 | 30.30924 | 48.19031 | 63.18166 | 75.90383 | 80.13827 | 91.06444 |
| F11-220 | 16.95432 | 25.76435 | 52.68453 | 80.69079 | 87.87234 | 98.52989 | 105.8545 |
| F11-218 | 17.20341 | 31.58884 | 61.17974 | 77.06415 | 101.7601 | 105.0303 | 109.3946 |
| F11-109 | 17.57553 | 29.90478 | 47.49863 | 67.90813 | 83.63117 | 99.25234 | 104.6814 |
| F11-105 | 17.62636 | 27.2131 | 48.11403 | 75.61487 | 91.99868 | 99.3779 | 113.5676 |
| F11-103 | 19.05623 | 31.3836 | 53.66986 | 70.21575 | 87.15926 | 94.18358 | 109.3758 |
| F11-98 | 19.08747 | 25.21664 | 40.70468 | 62.53904 | 90.33434 | 92.00181 | 109.9554 |
| F11-39 | 20.76369 | 36.33147 | 56.83281 | 71.87339 | 85.66001 | 88.7146 | 89.9771 |
| F11-183 | 22.96668 | 40.72956 | 62.72405 | 82.71394 | 91.62041 | 102.8007 | 117.0328 |
| F11-163 | 23.72934 | 27.92605 | 45.96363 | 70.65669 | 90.44246 | 95.26864 | 111.0215 |
| F11-223 | 25.55254 | 50.53311 | 79.41138 | 88.2778 | 102.639 | 100.4705 | 109.0358 |
| F11-151 | 25.79851 | 29.31085 | 43.72483 | 64.81009 | 83.78671 | 85.73753 | 101.2187 |
| F11-120 | 26.54193 | 37.32053 | 44.77477 | 68.73705 | 81.41065 | 91.22496 | 92.68608 |
| F11-199 | 28.11948 | 37.72515 | 63.274 | 74.59009 | 89.97225 | 96.10097 | 97.29022 |
| F11-224 | 28.19833 | 42.50665 | 62.41726 | 82.4676 | 85.58443 | 92.77884 | 100.0632 |
| F11-210 | 29.66767 | 37.73558 | 58.54817 | 67.94156 | 78.98299 | 88.30405 | 103.0938 |
| F11-182 | 32.95932 | 52.5532 | 72.82952 | 81.79542 | 88.47215 | 101.748 | 104.4618 |
| F11-238 | 73.20162 | 93.24065 | 91.91126 | 90.37185 | 88.5052 | 87.39394 | 99.47702 |
实施例5：
实施例2中确定的26种FXI先导化合物的物种交叉反应性如下表5所示。
表5：
实施例6：
根据实施例3至5中提供的数据，寡核苷酸F11-46/序列号46、F11-91/序列号91和F11-152/序列号52已被确定为特别优选的反义寡核苷酸序列，可用于本文所述的低聚物中。在此基础上，这些序列已被纳入本文所述序列号2251至2253的总体寡聚化合物中，如下表6所列。此外，还对序列号2251至2253进行了选定的修饰，如下表6中序列号2254至2286所示。表6中提供的所有序列方向均为5'至3'。
表6：
/>
/>
/>
/>
在上表6中：
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤；
m代表在基础核苷糖2'位的甲基修饰；
f代表在基础核苷糖2'位的氟修饰；
N/N”/N”'代表任何RNA核苷碱基；
N'代表任何RNA核苷碱基，且优选与N互补；
(ps)代表硫代磷酸酯核苷间连接；
i代表核苷间的反向连接，可以是3'-3'或5'-5'；
vp代表磷酸乙烯酯；
mvp代表乙烯基膦酸甲酯。
对于表6中的每个上述构建体，配体(如半乳糖配体)优选连接在序列的3'端。具体地，对于序列号2251、2252、2253，可分别说明如下，其中Galnac可以表示Galnac连接的任何排列，优选三价galnac连接：
UUGGUGUGAGCAUUGCUUGCAAUGCUCACACCAA-Galnac
UUAUAAGAAAAUCAUCCUGAUGAUUUUCUUAUAA-Galnac
UGGUUUCCAAUGAUGGAGCCAUCAUUGGAAACCA–Galnac.
另外，对于上表6所示的SEQ ID NOs 2272至2273，配体(优选Galnac)可以连接在内部非末端核苷上，例如连接在上述序列中的没有修饰的核苷上。
实施例7：
本实施例描述了包含序列号91的核苷碱基序列的构建体的结构-功能关系研究。
图18显示了经过测试的包含序列号91的核苷碱基序列的构建体。
测试在原代肝细胞中进行。
将来自供体5的人可铺板的肝细胞(Sekisui XenoTech，HPCH05+)在45mL人OptiThaw肝细胞培养基(Sekisui Xenotech，K8000)中解冻，在200g下离心5分钟，并重悬于2x WEM完全溶液中(5％FBS、2uM地塞米松、Pen/Strep、8ug/mL人胰岛素、4mM GlutaMAX，30mM HEPES pH 7.4)。2x WEM完全溶液由WEM(Gibco，A1217601)和2x原代肝细胞解冻和铺板添加剂(Gibco,CM3000)组成，仅含1x FBS。然后将肝细胞以每孔50uL、25,000个细胞/孔铺在6孔胶原蛋白I包被板(Gibco，A1142803)上，并使其在37℃恢复并粘附4小时。
4小时后，GalNac缀合复合物在基础WEM中稀释至2uM，并进行2x、7步、5倍稀释系列。将50uL每种稀释液添加到铺板肝细胞的相应孔中，以在1x WEM完全溶液中形成1-0.000064uM的最终稀释系列。
细胞在不被破坏的情况下37度培养72小时，然后按照生产商的方案，使用PureLink Pro 96总RNA纯化试剂盒(Invitrogen，12173011A)进行收获和分离RNA。
结果如图19所示。
基于这些结果设计了7种分子，并将对其进行进一步分析(参见以下实施例)。这些分子如图20所示，其在原代肝细胞中的性能数据如图21所示。
基于这些数据，已在人源化小鼠中测试了三种分子，参见下面的示例8。
实施例8：
本实施例描述了在人源化小鼠中对实施例7中确定的三个分子进行的测试。
下表7列出了这三个分子的核苷碱基序列(序列号)和完整的修饰信息(构建体编号)。
在上表7中
A代表腺嘌呤；
U代表尿嘧啶；
C代表胞嘧啶；
G代表鸟嘌呤；
m代表在基础核苷糖2'位的甲基修饰；
f代表在基础核苷糖的2'位的氟修饰；
*代表硫代磷酸酯核苷间连接；
vp代表磷酸乙烯酯；
phos代表膦酸盐；和
3galnac代表上文定义的牙刷配体。
图22还显示了这些分子的结构。图23显示了这些分子在用药5天后的性能。
基于这些结果，选择了名为“91-Conv-31”的构建体(结构如图22所示)在非人类灵长类动物中进行测试；见下面的实施例9。值得注意的是，该分子特别短，总共只有31个核苷酸。
实施例9：
本实施例描述了对食蟹猴进行单次/重复皮下注射后，对名为“91-Conv-31”的构建体(结构如图22所示)进行的药效学研究。
材料和方法
研究方案的概述见图24，更详细的说明如下。
研究方案
表8.研究设计
/>
1研究信息
1.1研究目标
本研究的目的是确定所选择化合物的药效动力学(PD)，通过在雄性食蟹猴单次皮下注射(SC)研究展开。
1.2遵从法规
本研究是根据机构动物护理和使用委员会(IACUC)的标准动物程序进行的，同时符合IACUC的动物福利法和实验室动物护理和使用的指南。
本研究将根据本方案和方案修订(如适用)及相关的研究特定程序、以及适用的标准操作程序(SOP)和通常的良好实验室操作来开展。但本研究将不会被考虑在良好实验室规范(GLP)规定的范围内。
2待检测物和载体信息
2.1待检测物
如上文所述的进一步规定的化合物。
3测试系统标识
3.1动物规范
3.2动物护理
3.2.1环境条件
房间将控制和监测相对湿度(目标平均范围40％至70％，该范围超过3小时将记录为偏差)和温度(目标平均范围18℃至26℃，该范围的任何偏差将记录为偏差)，10-20换气/小时。除非研究活动需要中断外，房间的光/暗周期为12小时。
3.2.2分笼饲养
在适应期内，动物将被配对关在符合适用的动物福利法律和法规的笼子里。在实验期间，这些猴子将被单独关在笼子里。
饮食和喂养
动物将每天被喂食两次。猴子每天喂食大约120克合格的猴子食物。这些量可以根据群体的食物消耗量或单只动物体重的变化和/或经证明的饮食的变化进行调整。
在采集用于血清化学分析的血液前，动物禁食过夜。
饮用水
反渗透(RO)水自由提供给所有动物。
3.2.3饲料与水的分析
反渗透水每三个月分析一次，每批进料在使用前进行分析。饲料和水分析将保存在设施记录中。
3.2.4环境富集
提供环境富集用具。
4制剂与给药
给药途径：经动物胸部背侧区域进行皮下注射。
剂量水平选择理由：根据表征试验物品在猴子体内的剂量范围和给药频率的要求，选择合适的剂量水平。
给药途径选择理由：所选的给药途径与最初提出的人类给药途径相一致。
给药剂量：剂量配方将按设施的标准操作规程执行。
皮下注射：皮下注射部位将沿着动物胸廓区域的背侧区域。对于多剂量或大剂量，将使用不同的注射部位。当注射部位被改变时，该位置必须被记录在记录中。
4.1观察和检查
4.1.1临床观察
每天两次(大约上午9：30和下午4点)，将进行一般健康和外观观察。在研究开始前，所有动物将接受体检，以确认动物的健康状况。在给药日，将在给药后2、4和6小时观察动物。一般情况、注射部位、行为、活动、排泄、呼吸或其他异常观察结果将记录在原始数据中。必要时，将进行额外的临床观察并进行记录。如果临床观察结果显示动物状况下降，将由兽医或兽医技术员对每只动物进行评估，并通知研究主任。如果有评估需要，研究主任或被指定人将通知研究发起方。
4.1.2体重
所有的动物都将每周称重一次。在给药日，动物在给药前称重以确定给药的体积。
4.1.3用于临床病理学分析的血液收集
所有的血液样本都将从受限制的、未服用镇静剂的动物的外周血管中采集。
表10临床病理学分析安排表
a可以从接受计划外安乐死的动物身上采集血液样本。在这种情况下，动物不能禁食。
(1)血液学采集：在室温下将动物的全血(至少1.0mL)收集到室温(RT)的含钾(K2)EDTA的试管中。血液样本将送至临床病理实验室，所需检测的血液学参数见表9。
将对每个血液学样本进行血液涂片检查。血液涂片将被标记、染色和储存。血液涂片可以用来调查血液学分析的结果。如果认为有必要进行血液涂片检查，可以随后对涂片进行评估，该评估将在研究计划修订中进行描述。
(2)凝血试验分析的采血：采集约1.7mL的血液放入含柠檬酸钠的抗凝管(室温)，送临床病理实验室，采用表9所列参数检测凝血功能。
(3)临床化学采血：采集不含抗凝剂的全血样本(约1.2mL)，在室温下保存至少30分钟，并送往临床病理实验室。样品将被处理成血清，并将根据表9中列出的参数进行检查。
4.1.4用于药效动力学(PD)的血液采集
血液：所有的血液样本都将从受限制的、未服用镇静剂的动物的外周血管中采集。
动物：所有组皆适用
给药后
血液体积：大约5.6mL
抗凝剂：柠檬酸钠
频率：请参见表9。实际的样本采集时间将在研究记录中进行详细记录。对于给药第一小时内采集的样本，可接受±1分钟之内。对于剩余的时间点，在计划时间的5％范围内采集的样本是可接受的，不视为偏差。
样品处理：对于FXI ELISA(酶联免疫吸附试验)：2mL的血液将被收集到一个冰浴的含柠檬酸钠的离心管中(从研究发起者要求的公司购买)。然后所有的血液将被颠倒混合4次。样品将离心(1000g离心20分钟)，大约1mL血浆将快速转移到两个离心管中(每管约0.50mL)。一管(标记为冷冻血浆)应立即在液氮中冷冻，然后在-80℃下保存。
FXI活性测定：3mL的血液将被收集到一个冰浴的含柠檬酸钠的离心管中(从赞助商要求的公司购买)中。然后所有的血液将被颠倒混合4次。样品将离心(1660g，4℃下离心10分钟)，大约1.5mL血浆将快速转移到两个标记的聚丙烯微离心管中(每管约0.70mL)。一管(标记为冷冻血浆)应立即在液氮中冷冻，然后在-80℃下保存。另一管应该在一个冷却装置中保持2-6℃，并在2-4小时内转移到4℃保存，用于分析因子XI蛋白的活性测定。
血清：收集不含抗凝血的全血样本(约0.6mL)，在室温下朝上放置至少30分钟，然后离心(3200g离心10分钟)，并将约0.3mL血清快速转移到离心管中。离心管应立即在液氮中冷冻，然后转移到-80℃保存直到分析。
5协议的修订和偏差
对已获批准方案的修改将采用研究主任和研究发起方批准的修订形式。修订版将清楚地描述协议的变更，并将包括变更的生效日期和变更的理由。如果研究主任和研究代表在需要紧急或关键变更时不在场，他/她可通过电话或电子方式授权方案变更。对上述变更的任何授权必须适当地形成文件，并遵循准备合理的书面修订方案。研究主任必须在生效日期后45天内签署并注明日期。
所有偏离方案和标准操作程序的偏差以及偏差的原因将由研究主任记录并确认。如果发生可能影响研究结果的任何偏差，以及所采取的任何纠正措施，将立即通知研究发起方代表。可能影响数据解释的方案和SOP偏差将被纳入最终报告。
6Archiving of Materials材料归档
供试品准备、供试品跟踪、有效期数据、方案、方案修订(如适用)以及本研究结果产生的原始最终报告将被存档。
7STATISTICAL ANALYSIS统计分析
以下部分不适用于在意外场合记录的数据，这些数据将根据个别情况进行报告。
除非下文另有说明，所有数字数据将使用微软Excel软件计算各组的均值和标准差。为每个感兴趣的数据集进行描述性统计，包括确定分析变量和数据集分类变量(例如：性别、测量场合和可以用来指定细分必须报告描述性统计的任何其他相关变量)。
如果一个数据集在每一组中的非缺失值少于三个，则将不进行以下推理数据分析。不对毒物动力学参数和半定量数据进行推断数据分析，如：尿蛋白、尿pH、尿胆红素、尿隐血、尿葡萄糖和尿酮。
当有超过两个组时，将在0.05显著性水平上使用Levene检验评估组间的同质性。如果组间方差差异不显著(p>0.05)，则进行参数单因素方差分析(ANOVA)。当方差分析检验(p≤0.05)、有显著差异时，采用Dunnett检验对对照组与各治疗组进行组间比较。
如果Levene检验表明存在异质组方差(p≤0.05)，且数据集仅包含正值，则将进行对数转换。如果转换后的数据仍然不能通过方差同质性检验(p≤0.05)或数据包含零和/或负值，则将使用非参数Kruskal-Wallis检验来比较所有考虑的组。当克鲁斯卡尔-沃利斯(Kruskal-Wallis)检验具有显著性(p≤0.05)时，将使用Dunnett的秩次检验来对感兴趣的组进行两两比较。
当只有两个组需要比较时，依然采用前述的Levene检验进行分析，但需要以双样本t检验取代单因素方差分析，Wilcoxon秩和检验将进行Kruskal-Wallis检验，不进行Dunnett检验或Dunnett秩检验。
组与组之间的两两比较比较将通过在5％显著性水平上的双侧检验进行。显著性结果将被报告为p≤0.001、p≤0.01或p≤0.05，其中p表示观察到的概率。
结果
图25、27和28描述了研究的结果。
图25显示了体内研究中FXI活性被敲低的名为“91-Conv-31”的结构(结构如图22所示)，图中显示了不同剂量(以mg/kg表示)和实验开始时单次或多次给药的效果，并与阴性对照(生理盐水)进行了比较。
有效的、超预期的长期敲低效果非常明显。
图26显示了体内研究中靶向特异性检测的分子机制。
APTT代表活化的部分凝血溶酶时间，它测量受FXI等因素影响的凝血内在途径的活性。PT代表凝血酶原时间，反应外部凝血途径的完整性，该途径侧重分析VII、V、X等因子，以及凝血酶原和纤维蛋白原等因素的影响。
图27显示了图26所测试项目的读出结果。
％FXI血浆活性(图25)、以及APTT和PT数据(图27)表明，该分子特异性地靶向FXI，而对外部凝血途径没有任何脱靶效应。
图28中，未显示任何毒副作用数据。对一系列肝功能和血液学参数进行了检测，结果表明，肝脏酶水平没有升高，血液学参数也未发现变化。
Claims (109)
1.一种选择性调节或抑制FXI表达的寡聚化合物，化合物包含至少第一区域的连接核苷，该核苷至少具有与至少一部分从FXI基因转录的RNA互补的第一核苷碱基序列，所述序列选自以下序列或其部分，SEQ ID NO(序列号)1至250，或序列号1251至1500。
2.根据权利要求1所述的寡聚化合物，其特征在于，进一步包含至少一个连接核苷的第二个区域，所述第二区域至少具有与所述第一核苷碱基序列至少部分互补的第二核苷碱基序列，该序列选自以下序列或其部分，序列号251至500,或序列号1501至1750。
3.根据权利要求1或2所述的寡聚化合物，其特征在于，第一核苷碱基序列选自下列序列或其部分，序列号8、13、27、39、46、91、98、103、105、109、120、140、146、151、152、163、182、183、199、207、210、218、220、223、224、238，或序列号1258、1263、1277、1289、1296、1341、1348、1353、1355、1359、1370、1390、1396、1401、1402、1413、1432、1433、1449、1457、1460、1468、1470、1473、1474、1488。
4.根据权利要求3的寡聚化合物，其特征在于，所述第二核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：SEQ ID NOs 258,263,277,289,296,341,348,353,355,359,370,390,396,401,402,413,432,433,449,457,460,468,470,473,474,488,或SEQ ID NOs 1508、1513,1527,1539,1546,1591,1598,1603,1605,1609,1620,1640,1646,1651,1652,1663,1682,1683,1699,1707,1710,1718,1720,1723,1724,1738。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列选自下列序列或其部分，序列号8、46、91、146、152、207，或1258、1296、1341、1396、1402、1457。
6.根据权利要求5所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第二核苷碱基序列选自下列序列或其部分：序列号258、296、341、396、402、457，或序列号1508、1546、1591、1646、1652、1707。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷酸序列选自下列序列或其部分：序列号46、91、152，或序列号1296、1341、1402。
8.根据权利要求7的寡聚化合物，其特征在于，所述第二核苷酸序列选自下列序列或其部分：序列号296、341、402或序列号1546、1591、1652。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列至少与下列任一序列或其部分互补：序列号1001至1250。
10.根据权利要求3和/或4的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列至少部分互补于以下任一序列或其一部分：序列号1008、1013、1027、1039、1046、1091、1098、1103、1105、1109、1120、1140、1146、1151、1152、1163、1182、1183、1199、1207、1210、1218、1220、1223、1224、1238。
11.根据权利要求5和/或6的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列至少与下列序列中的任一序列或其部分互补：序列号1008、1046、1091、1146、1152、1207。
12.根据权利要求7和/或8的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列至少部分与下列任何序列或其部分互补：序列号1046、1091、1152。
13.一种抑制FXI表达的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包含至少一个连接核苷的第一区域，所述第一区域至少具有与从FXI基因转录的RNA至少一部分互补的第一核苷碱基序列，所述RNA选自以下序列或其一部分：序列号1001至1250。
14.根据权利要求13的寡聚化合物，其特征在于，所述RNA选自以下序列或其一部分：序列号1008、1013、1027、1039、1046、1091、1098、1103、1105、1109、1120、1140、1146、1151、1152、1163、1182、1183、1199、1207、1210、1218、1220、1223、1224、1238。
15.根据权利要求13或14所述的寡聚化合物，其特征在于，所述RNA选自以下序列或其一部分：序列号1008、1046、1091、1146、1152、1207。
16.根据权利要求13至15中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述RNA选自以下序列或其一部分：序列号1046、1091、1152。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述连接核苷的第一区域由18至20个连接核苷组成。
18.根据权利要求2至17中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述连接核苷的第二区域由11至16、12至15或13至16个连接核苷组成。
19.根据权利要求2至18中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括至少一个互补双链区，所述互补双链区包括与所述第二核苷区的至少一部分直接或间接连接的所述第一核苷区的至少一部分。
20.根据权利要求19所述的寡聚化合物，其特征在于，每个所述第一核苷区和第二核苷区具有5'至3'方向性，从而分别定义其5'和3'区域。
21.根据权利要求20所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷区的5'区与所述第二核苷区的3'区直接或间接连接，如通过互补碱基配对，和/或，所述第一核苷区的3'区与所述第二核苷区的5'区直接或间接连接。
22.根据权利要求1至21中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物进一步包含一个或多个配体。
23.根据权利要求21所述的寡聚化合物，其中所述的一个或多个配体与所述的第二核苷区域共轭。
24.根据权利要求所述23的寡聚化合物，如权利要求20所述，其特征在于，所述一个或多个配体与所述第二核苷区的3'区共轭。
25.根据权利要求22至24中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体是任何细胞引导分子，如结合细胞膜或细胞表面上特定靶点的脂质、碳水化合物、适配体、维生素和/或肽。
26.根据权利要求25所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体包括一个或多个碳水化合物。
27.根据权利要求26所述的寡聚化合物，其特征在于，所述的一种或多种碳水化合物是单糖、二糖、三糖、四糖、寡聚糖或多糖。
28.根据权利要求27的寡聚化合物，其特征在于，所述一种或多种碳水化合物包括一种或多种半乳糖分子、一种或多种乳糖分子、一种或多种N-乙酰-半乳糖胺分子，和/或，一种或多种甘露糖分子。
29.根据权利要求28所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一种或多种碳水化合物包括一个或多个N-乙酰基-半乳糖胺分子。
30.根据权利要求29所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括两个或三个N-乙酰基-半乳糖胺基，优选为三个。
31.根据权利要求22至30中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体以线性构型或支链构型连接到所述寡聚化合物，优选连接到其第二核苷区域。
32.根据权利要求31所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体以二端构型或三端构型连接到所述寡聚化合物上。
33.根据权利要求19所述的寡聚化合物，其特征在于，所述寡聚化合物包含所述第一核苷区和第二核苷区的二聚体，所述第一核苷区的至少一部分直接或间接连接到所述第二核苷区的至少一部分，从而形成所述至少部分互补的双链区。
34.根据权利要求33所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷区与第二核苷区相比具有更多数量的连接核苷酸，由此第一核苷区额外数量的连接核苷酸形成连接第一核苷区和第二核苷区的发夹环。
35.根据权利要求34所述的寡聚化合物，如权利要求20所述，其特征在于，所述发夹环存在于所述第一核苷区的3'区域。
36.根据权利要求34或35所述的寡聚化合物，其特征在于，所述发夹环包括4或5个连接的核苷。
37.根据权利要求1至36中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括核苷间连接，其中至少一个核苷间连接是修饰的核苷间连接。
38.根据权利要求37的寡聚化合物，其特征在于，所述修饰的核苷间连接是硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
39.根据权利要求38的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括1至15个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
40.根据权利要求39的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括7、8、9或10个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
41.根据权利要求38至40中任一项所述的寡聚化合物，如权利要求20所述，其特征在于，所述化合物在第一个核苷区的5'区包括一个或多个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
42.根据权利要求38至41中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物在第二核苷区的5'区包括一个或多个硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
43.根据权利要求38至42中任一项的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括发夹环的至少两个、优选至少三个、优选至少四个、优选至少五个相邻核苷之间的硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接，取决于发夹环中存在的核苷酸数目。
44.根据权利要求43所述的低聚物化合物，其特征在于，所述化合物包括存在于所述发夹环中的每个相邻核苷之间的硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯核苷间连接。
45.根据权利要求1至44中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中至少一个核苷包含修饰的糖。
46.根据权利要求45所述的寡聚化合物，其特征在于，所述修饰的糖基是2'-O-甲基修饰糖。
47.根据权利要求45或46的寡聚化合物，其特征在于，所述修饰的糖基是2'-F修饰糖。
48.根据权利要求45至47中任一项所述的一种寡聚化合物，其特征在于，其所述化合物中在第一核苷区5'区的第一核苷酸下游的第2和14位上的核苷的糖不包含2'-O-甲基修饰。
49.根据权利要求45至48中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，其所述化合物中第二核苷区的核苷的糖，在位置上对应于第一核苷区的5'区的第一核苷酸下游的位置9至11的任一位置上的第一核苷区的核苷的糖，不包含2'-O-甲基修饰。
50.根据权利要求48或49所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中在第一核苷区5'区的第一核苷酸下游的第2和14位上的核苷的糖含有2'-O-甲基修饰。
51.根据权利要求48至50中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中第二核苷区的核苷的糖，在位置上对应于第一核苷区的5'区的第一核苷酸下游的位置9至11的任一位置上的第一核苷区的核苷的糖含有2'-O-甲基修饰。
52.根据权利要求45至51中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第一核苷区的5'区开始的奇数核苷酸中的一个或多个被修饰，和/或，所述化合物中从第一核苷区的5'区开始的偶数核苷酸中的一个或多个被修饰，其中典型的偶数核苷酸的修饰是与奇数核苷酸的修饰不同的第二修饰。
53.根据权利要求52所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第二核苷区的3'区开始的一个或多个奇数核苷酸被不同于第一核苷区奇数核苷酸的修饰所修饰。
54.根据权利要求52或53所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第二核苷区的3'区开始的一个或多个偶数核苷酸被修饰，该修饰不同于权利要求53所述的第一核苷区偶数核苷酸的修饰。
55.根据权利要求52至54中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中第一核苷区的至少一个或多个经修饰的偶数核苷酸与第一核苷区的至少一个或多个经不同修饰的奇数核苷酸相邻。
56.根据权利要求52至55中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中第二核苷区的至少一个或多个经修饰的偶数核苷与第二核苷区的至少一个或多个经不同修饰的奇数核苷相邻。
57.根据权利要求52至56中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第一个核苷区的5'区开始的一个或多个奇数核苷酸的糖是2'-O-甲基修饰糖。
58.根据权利要求52至57中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第一核苷区的5'区开始的一个或多个偶数核苷的糖是2'-F修饰的糖。
59.根据权利要求52至58中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第二核苷区的3'区开始的一个或多个奇数核苷的糖是2'-F修饰的糖。
60.根据权利要求52至59中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中从第二核苷区的3'区开始的一个或多个偶数核苷的糖是2'-O-甲基修饰的糖。
61.根据权利要求45至60中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中第一核苷区多个相邻核苷的糖被共同修饰。
62.根据权利要求45至61中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中第二核苷区的多个相邻核苷的糖被共同修饰。
63.根据权利要求52至62中任一项所述的一种低聚物化合物，其特征在于，所述化合物中发夹环的多个相邻核苷的糖被共同修饰。
64.根据权利要求61至63中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述共同修饰是2'-F修饰糖。
65.根据权利要求61至63中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述共同修饰是2'-O-甲基修饰糖。
66.根据权利要求65所述的寡聚化合物，其特征在于，所述多个相邻的2'-O-甲基修饰糖存在于所述第一和/或第二核苷区的至少八个相邻核苷中。
67.根据权利要求65所述的寡聚化合物，其特征在于，所述多个相邻的2'-O-甲基修饰糖存在于所述发夹环的三个或四个相邻的核苷中。
68.根据权利要求45的寡聚化合物，如权利要求34所述，其特征在于，所述发夹环包括至少一个具有修饰糖的核苷。
69.根据权利要求68的寡聚化合物，其特征在于，所述至少一个核苷与具有不同修饰糖的核苷相邻。
70.根据权利要求69所述的寡聚化合物，其特征在于，所述修饰糖是2'-O-甲基修饰糖，所述不同修饰糖是2'-F修饰糖。
71.根据权利要求1至70中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包含一个或多个具有未修饰糖的核苷。
72.根据权利要求71所述的寡聚化合物，其特征在于，所述未修饰的糖存在于第二核苷区的5'区域。
73.根据权利要求34所述的权利要求71或72的寡聚化合物，其特征在于，所述未修饰的糖存在于发夹环中。
74.根据权利要求1至73中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物中第一核苷区和/或第二核苷区的一个或多个核苷是倒置核苷，并通过其糖的3'碳和相邻核苷的糖的3'碳连接到相邻核苷，和/或，第一核苷区和/或第二核苷区中的一个或多个核苷是倒置核苷，并通过其糖的5'碳和相邻核苷的糖的5'碳连接到相邻核苷上。
75.根据权利要求1至74中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物是钝末端。
76.根据权利要求1至74中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物的第一核苷区或第二核苷区域具有悬垂。
77.一种抑制FXI表达的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包含至少第一核苷连接区，所述核苷连接区至少具有与从FXI基因转录的RNA的至少一部分互补的第一核苷碱基序列，所述第一核苷碱基序列是经修饰的序列，且选自以下序列或其一部分：构建体NOs 501至750，或构建体NOs 1751至2000。
78.根据权利要求77所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物进一步包含至少一个连接核苷的第二区域，所述第二区域至少具有与所述第一核苷碱基序列至少部分互补的第二核苷碱基序列，其中所述第二核苷碱基序列是经修饰的序列，且选自下列序列或其一部分：构建体NOs 751至1000，或构建体NOs 2001至2250。
79.根据权利要求77或78的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列选自下列序列或其一部分：构建体序列号508、513、527、539、546、591、598、603、605、609、620、640、646、651、652、663、682、683、699、707、710、718、720、723、724、738，或构建体序列号1758、1763、1777、1789、1796、1841、1848、1853、1855、1859、1870、1890、1896、1901、1902、1913、1932、1933、1949、1957、1960、1968、1970、1973、1974、1988。
80.根据权利要求79所述的低聚物化合物，其特征在于，所述第二核苷碱基序列选自下列序列或其一部分：构建体序列号758、763、777、789、796、841、848、853、855、859、870、890、896、901、902、913、932、933、949、957、960、968、970、973、974、988，或构建体序列号2008、2013、2027、2039、2046、2091、2098、2103、2105、2109、2120、2140、2146、2151、2152、2163、2182、2183、2199、2207、2210、2218、2220、2223、2224、2238。
81.根据权利要求77至80中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：构建体序列号508、546、591、646、652、707，或构建体序列号1758、1796、1841、1896、1902、1957。
82.根据权利要求81所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第二核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：构建体序列号758、796、841、896、902、957，或构建体序列号2008、2046、2091、2146、2152、2207。
83.根据权利要求77至82中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第一核苷碱基序列选自以下序列或其一部分：构建体序列号546、591、652或构建体序列号1796、1841、1902。
84.根据权利要求83所述的寡聚化合物，其特征在于，所述第二核苷碱基序列选自下列序列或其一部分：构建体序列号796、841、902，或构建体序列号2046、2091、2152。
85.根据权利要求77至84中任一项所述的寡聚化合物，其特征进一步根据权利要求17至44，或74至76中任一项所述。
86.一种抑制FXI表达的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物选自以下序列：序列号2251至2253，或序列号2284至2288，优选序列号2287。
87.一种抑制FXI表达的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物选自以下序列：构建体序列号2254至2283。
88.根据权利要求86或87所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物进一步包含一个或多个配体。
89.根据权利要求88所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体与所述序列的3'区共轭，优选共轭在3'末端核苷上。
90.根据权利要求88所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体与非末端位置共轭。
91.根据权利要求88至90中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述的一个或多个配体是任何细胞的引导分子，如结合细胞膜或细胞表面上特定靶点的脂质、碳水化合物、适配体、维生素和/或肽。
92.根据权利要求91所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体包括一个或多个碳水化合物。
93.根据权利要求92所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一种或多种碳水化合物是单糖、二糖、三糖、四糖、寡聚糖或多糖。
94.根据权利要求93所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个碳水化合物含有一个或多个半乳糖结构、一个或多个乳糖结构、一个或多个N-乙酰半乳糖胺结构、和/或一个或多个甘露糖结构。
95.根据权利要求94所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一种或多种碳水化合物包括一个或多个N-乙酰-半乳糖胺分子。
96.根据权利要求95所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物包括两个或三个N-乙酰基-半乳糖胺分子，优选为三个。
97.根据权利要求88至96中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体以线性构型或支链构型连接到所述寡聚化合物上。
98.根据权利要求97所述的寡聚化合物，其特征在于，所述一个或多个配体以二端构型或三端构型连接到所述寡聚化合物上。
99.根据权利要求86至权利要求98中任一项所述的寡聚化合物，其特征在于，所述序列自二聚化以形成至少部分互补的双链区。
100.根据权利要求99所述的寡聚化合物，其特征在于，所述化合物具有如图15至17或图18和图20中任一个所示的核苷碱基序列和结构，优选为构建体NO:2290至2292，特别优选为构建体NO:2290。
101.一种组合物，包含权利要求1至100中任一项所述的寡聚化合物和一种生物相容性的赋形剂。
102.权利要求1至100中任一项所述的寡聚化合物在治疗中的应用。
103.权利要求1至100中任一项所述的寡聚化合物在治疗疾病或机体功能紊乱的应用。
104.一种治疗疾病或机体功能紊乱的方法，包括向需要治疗的个体施用权利要求1至100中任一项所述的寡聚化合物。
105.根据权利要求104所述的方法，其特征在于，所述寡聚化合物采用皮下注射或静脉注射方式给到患者个体。
106.权利要求1至100中任一项所述的寡聚化合物在研究中用作基因功能分析工具的用途。
107.根据权利要求103所述的用途，或根据权利要求104所述的方法，其特征在于，所述疾病或机体功能紊乱为血栓栓塞性疾病。
108.根据权利要求107所述的用途或方法，其特征在于，所述血栓栓塞性疾病选自深静脉血栓，静脉或动脉血栓，肺栓塞，心肌梗死，中风，血栓相关的慢性肾脏疾病或终末期肾衰竭(ESRD)，包括透析相关血栓或其它凝血症状。
109.根据权利要求108所述的用途或方法，其特征在于，所述血栓栓塞性疾病是深静脉血栓，肺栓塞或其综合症。
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US63/174,533 | 2021-04-13 | ||
| US202163253040P | 2021-10-06 | 2021-10-06 | |
| US63/253,040 | 2021-10-06 | ||
| PCT/US2022/024672 WO2022221441A2 (en) | 2021-04-13 | 2022-04-13 | Products and compositions |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN117500926A true CN117500926A (zh) | 2024-02-02 |
Family
ID=89678684
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202280040778.8A Pending CN117500926A (zh) | 2021-04-13 | 2022-04-13 | 产品和组合物 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN117500926A (zh) |
-
2022
- 2022-04-13 CN CN202280040778.8A patent/CN117500926A/zh active Pending
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP2070939B1 (en) | Modulators of pharmacological agents | |
| AU2001296305B2 (en) | RNA aptamers and methods for identifying the same | |
| AU2005238490B2 (en) | Improved modulators of coagulation factors | |
| EP2379084B1 (en) | Modulation of factor 11 expression | |
| CN110234326A (zh) | 用于抑制因子xii基因表达的组合物和方法 | |
| AU2001296305A1 (en) | RNA aptamers and methods for identifying the same | |
| CN107257858A (zh) | 乳酸脱氢酶的治疗性抑制及其试剂 | |
| JP2015507924A (ja) | 第ｖｉｉ因子の発現を調節するための方法と組成物 | |
| WO2023169548A1 (zh) | Lpa抑制剂及其用途 | |
| US20230135763A1 (en) | Products and compositions | |
| CN117500926A (zh) | 产品和组合物 | |
| AU2022258464A1 (en) | Products and compositions | |
| KR20210116509A (ko) | Serpinc1 irna 조성물 및 그의 이용 방법 | |
| CN118043460A (zh) | 产品和组合物 | |
| CN117795072A (zh) | 产品和组合物 | |
| WO2023240190A2 (en) | Products and compositions | |
| WO2023069707A2 (en) | Products and compositions | |
| WO2023245126A2 (en) | Products and compositions | |
| AU2012244176B8 (en) | Modulators of pharmacological agents | |
| AU2012244176B2 (en) | Modulators of pharmacological agents |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination |