CN117222751A - 用于判断肤色的基因多态性标记及其用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及包含对与肤色程度有关联显著性的基因多态性标记能够进行检测的探针或能够进行扩增的制剂的用于判断肤色的组合物、包含上述组合物的试剂盒或微阵列及利用上述基因多态性标记或标记的组合提供关于肤色的信息的方法。本发明的单核苷酸多态性标记针对每个人的皮肤类型提供准确的信息,因此能够开发个人定制型化妆品及定制型有效成分。
Description
技术领域
本发明涉及与肤色有关联显著性的基因多态性标记、包含能够检测出该基因多态性标记的探针或能够扩增该基因多态性标记的制剂的用于判断肤色的组合物、包含上述组合物的用于判断肤色的试剂盒或微阵列、以及利用了上述基因多态性标记或标记的组合的提供关于肤色的信息的方法。
背景技术
肤色在人种或个人之间存在较大差异,并会受到环境要素和年龄、性别及基因变异这样的要素的影响。基于对肤色差异的深层的遗传学和生物学差异的理解,能够根据肤色特点,针对每个人的皮肤烦恼提供适当的解决方案。根据对肤色的以往的全基因组关联研究(GWAS,Genome-wide association study)表明,与相关于肤色的生物学路径在功能上关联的基因内的基因变异与肤色之间存在显著的关联。但是,以往的GWAS研究大部分是以欧洲人和非洲人种为对象而进行的,对亚洲人种的大规模研究几乎不存在,因此对亚洲人种的肤色关联遗传性变异的理解非常少。
与皮肤关联的遗传变异及基因的发掘会对生物学机制的理解和个人的皮肤特征的理解及预测提供重要的信息。基因分析研究从发掘与疾病或表型具有关联性的遗传指标的研究转移到利用发掘的遗传指标而预测未来的疾病或表型的研究。特别地,还进行着通过对脸部形态或皮肤特性的基因分析研究而预测脸部形态变形或皮肤老化的研究(Kempet al.,Molecules.2017Feb 26;22(3),2017)。但是,目前为止,对包括韩国人在内的东亚人的大规模的关于肤色的GWAS研究非常不足。
发明内容
技术课题
本发明的发明人想要通过构建遗传信息和皮肤类型信息的大数据而构建韩国人的皮肤特性分类体系,通过掌握决定个体皮肤特性的遗传特征,构建科学的皮肤分类标准,并以此为依据开发个人定制型有效成分,通过各种产品的细分化,为开发不同皮肤特性的定制型化妆品做出贡献,经过不懈努力,筛选与肤色有显著相关关系的特定单核苷酸多态性(SNP)标记并确认基于遗传信息而提供对肤色的信息的方法,从而完成了本发明。
课题解决手段
本发明的一个目的在于提供用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记。
本发明的另一个目的在于提供一种用于判断肤色的组合物,其包含能够检测出用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记的探针或能够扩增用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记的制剂。
本发明的另一个目的在于提供一种包含上述组合物的用于判断肤色的试剂盒或微阵列。
本发明的另一个目的在于提供一种提供关于肤色的信息的方法,包括确认上述单核苷酸多态性标记的多态性位点的步骤。
发明效果
通过本发明的与肤色有关联显著性的基因多态性标记而能够提供关于个人的肤色的信息,进而,根据在个人观察到的基因多态性标记的信息而能够开发对个人最有效的定制型成分或产品。
附图说明
图1是用于说明利用本发明的预测的固有肤色特性的信息提供系统的概略性框图。
图2是用于说明本发明的利用预测的固有肤色特性提供信息的方法的顺序图。
图3是用于说明本发明的另一个实施例的利用预测的固有肤色特性提供信息的方法的顺序图。
具体实施方式
本发明所公开的各个说明及实施方式也可以适用于各个其他说明及实施方式。即,本发明所公开的各种要素的所有组合属于本发明的范畴。另外,本发明的范畴不限于下面所述的具体叙述。
本发明的一个方式提供一种用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记。
本发明的另一个方式提供一种用于判断肤色的组合物,其包含能够检测出用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记的探针或能够扩增用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记的制剂。
根据上述肤色程度,可以区分个体的皮肤类型。
在本发明中,术语“多态性(polymorphism)”是指在一个基因座(locus)上存在两种以上的等位基因(allele)的情况,并且在多态性位点中,根据人的不同,仅单个碱基不同的称为单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。优选的多态性标记具有在选定的群体中显示出1%以上、更具体地10%或20%以上的发生频率的两种以上的等位基因。“基因多态性标记”通常是指在同一基因位点(碱基)观察到两种以上的等位基因(allele)的情况,通常根据不同的个体而存在主要等位基因(major allele)/主要等位基因(major allele)、主要等位基因(major allele)/次要等位基因(minor allele)、次要等位基因(minor allele)/次要等位基因(minor allele)的情况。在本发明中,可以与“多态性标记”混用,并且是指次要等位基因的碱基和碱基位点,或者可以与染色体的数目(number)和碱基位置(base position)一起定义,但不限于此。
在本发明中,术语“等位基因(allele)”是指存在于同源染色体的同一基因座的一个基因的多种类型。等位基因也用于表达多态性,例如,SNP具有两种类型的双等位基因(biallele)。另外,是指染色体的数目和碱基位置相同的两种以上的碱基的组合,上述碱基包括在特定群体的个体中发生频率高的主要等位基因(major allele)和发生频率低于上述主要等位基因的次要等位基因(minor allele)。
具体地,本发明的基因多态性标记与肤色有关联显著性,在两种等位基因(allele)中具有一个以上的次要等位基因(minor allele)时,可以说肤色与具有主要等位基因(major allele)/主要等位基因(major allele)的个体相比具有显著性。即,可以看出在主要等位基因(major allele)/次要等位基因(minor allele)、次要等位基因(minorallele)/次要等位基因(minor allele)的情况下,与具有主要等位基因(major allele)/主要等位基因(major allele)的情况相比,与肤色程度相比,具有高于或低于其程度的皮肤特性。
通过本发明的单核苷酸多态性标记,能够预测个人的固有肤色特性,因此还能够提供关于对肤色变化起到有效作用的有效成分的信息,由此可提供个人的定制型化妆品等,但不限于此。
在本发明中,术语“rs_id”是指对从1998年开始积累SNP信息的NCBI初期登记的所有SNP赋予的独立标识符rs-ID。这种表中记载的rs_id是指本发明的多态性标记即SNP标记。
另外,作为本发明的目的,上述术语‘肤色'是指个人皮肤的整体颜色,是指对两侧脸部位等能够代表面部整体颜色的部位进行检测的结果。具体地,在本发明中,关于肤色,一般的个人(具有主要等位基因/主要等位基因(major allele/major allele))的肤色是指以在相同的基因位点(碱基)上观察到两种等位基因的48,433名分析对象为对象检测的面部平均肤色,其值在分析区域内可用亮度(CIE L*)、红的程度(CIE a*)、黄的程度(CIEb*)各自的连续的数值而导出,但不限于此。
作为本发明的目的,将肤色分为亮度(皮肤明亮度)、红的程度、黄的程度而分类,在分类时可包括本领域技术人员通常可想到的与肤色相关的各种标准。作为一例,上述肤色可考虑皮肤明亮度及/或红色、黄色等整体肤色等而分类,但不限于此。
上述单核苷酸多态性标记可以是选自表1至表3所示的单核苷酸多态性标记的一种以上的单核苷酸多态性标记。上述表1至表3所示的单核苷酸多态性标记可以判断是否与肤色程度有关联性。
具体地,上述单核苷酸多态性标记可以是选自与皮肤的明亮度相关的表1的一个以上的单核苷酸多态性标记或选自与皮肤的红的程度相关的表2的一个以上的单核苷酸多态性标记或选自与皮肤的黄的程度相关的表3的一个以上的单核苷酸多态性标记。
本发明的单核苷酸多态性标记的与肤色的关联显著性是通过根据代表肤色的亮度、红的程度、黄的程度分别观察的基因多态性标记的频率之差而导出的。这样的显著性的特征在于但不限于p-值,例如小于0.05、小于0.01、小于0.001、小于0.0001、小于0.00001、小于0.000001、小于0.0000001、小于0.00000001、或小于0.000000001的p-值(p-value)。具体地,p-值可以小于0.01,更具体地,p-值可以小于0.001,更具体地可以小于0.0001,但不限于此。
本发明的单核苷酸多态性(SNP)标记可以是选自表1至表3所示的标记中的任一个以上,但不限于此。上述单核苷酸多态性(SNP)标记可以是一个以上,并且可以两个以上、三个以上、四个以上等能够判断肤色的个数的组合使用,但不限于此。
上述标记可以是SNP其本身,或由包括上述SNP位点的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,或由其互补序列构成的多核苷酸,但不限于此。
作为一个具体例,单核苷酸多态性标记可以是选自与皮肤的明亮度相关的表1所示的标记的任一个以上,但不限于此。
对选自表1所示的标记中的标记说明如下。
作为一例,当SNP ID为rs730502时,Chr.Position(GRCh ver.37)记载为“15:28234410”,如果等位基因(Allele)公开为T>G,则这表示人类的15号染色体的第28234410个碱基是T或G,并且位于等位基因(Allele)的“>”左侧的碱基可表示主要等位基因(majorallele),位于右侧的碱基可表示次要等位基因(minor allele)。
在一个具体例中,选自表1的标记可以由选自由以下多核苷酸及其互补多核苷酸组成的组的一个以上的多核苷酸组成,但不限于此:由包含上述第110677712个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的1号染色体的第110677712个碱基为A或G(rs7518585);由包含上述第58828927个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的2号染色体的第58828927个碱基为C或T(rs7589338);由包含上述第98749778个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的3号染色体的第98749778个碱基为T或G(rs774535);由包含上述第90868849个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的4号染色体的第90868849个碱基为T或C(rs16996201);由包含上述第88761655个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的5号染色体的第88761655个碱基为G或T(rs117007154);由包含上述第85574085个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的6号染色体的第85574085个碱基为A或G(rs6913995);由包含上述第96414506个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的7号染色体的第96414506个碱基为A或G(rs7786855);由包含上述第78062096个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的8号染色体的第78062096个碱基为T或A(rs10097260);由包含上述第5953024个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的9号染色体的第5953024个碱基为T或C(rs10815321);由包含上述第88442143个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的10号染色体的第88442143个碱基为T或C(rs10749541);由包含上述第78243134个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的11号染色体的第78243134个碱基为A或C(rs4285892);由包含上述第89373308个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的12号染色体的第89373308个碱基为A或C(rs7969593);由包含上述第27559971个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的13号染色体的第27559971个碱基为T或C(rs12429976);由包含上述第92578273个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的14号染色体的第92578273个碱基为C或G(rs10146051);由包含上述第28234410个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的15号染色体的第28234410个碱基为T或G(rs730502);由包含上述第90067310个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的16号染色体的第90067310个碱基为A或G(rs62054574);由包含上述第80988582个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的17号染色体的第80988582个碱基为C或T(rs12453146);由包含上述第69562234个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的18号染色体的第69562234个碱基为T或C(rs7242728);由包含上述第18398628个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的19号染色体的第18398628个碱基为C或G(rs11086102);由包含上述第32891200个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的20号染色体的第32891200个碱基为T或G(rs819146);由包含上述第50164613个碱基的5-100个连续的DNA序列构成的多核苷酸,其中人类的22号染色体的第50164613个碱基为G或C(rs6009872)。上述记载的标记在表1中仅例示了一部分,在其他位置的染色体中也可以通过与上述相同的方法来选择。
作为另一个实施例,可以选择与表1同样地示于表2的单核苷酸多态性(SNP)标记中的任一个以上,但不限于此。
作为另一个实施例,可以选择与表1同样地示于表3的单核苷酸多态性(SNP)标记中的任一个以上,但不限于此。
关于表2或表3中所示的单核苷酸多态性标记,可进行如上述说明的解释及选择,但不限于此。
关于本发明的上述等位基因,在每个个体中染色体的数目(number)相同,其中存在SNP的主要等位基因(major allele)和次要等位基因(minor allele),并且随着多态性标记的多态性位点的碱基逐一增加为次要等位基因,主要等位基因可逐一减少,并且随着碱基逐一增加为主要等位基因,次要等位基因可逐一减少。但是,次要等位基因和主要等位基因可增减的范围可以在i)主要等位基因(major allele)/主要等位基因(majorallele)、ii)主要等位基因(major allele)/次要等位基因(minor allele)、iii)次要等位基因(minor allele)/次要等位基因(minor allele)的三种类型内,并且在上述三种类型的范围内等位基因可减少或增加,但不限于此。
另外,在本发明中上述标记是个体的多态性标记的多态性位点的碱基随着逐一增加为次要等位基因(minor allele)而能够判断肤色的标记。具体地,能够判断为在两种等位基因(allele)中具有一个以上的次要等位基因(minor allele)((1)主要等位基因(major allele)/次要等位基因(minor allele)、(2)次要等位基因(minor allele)/次要等位基因(minor allele)的情况)的个人与一般的个人即具有主要等位基因(majorallele)/主要等位基因(major allele)的人相比具备肤色程度高或低的皮肤特性。
更具体地,表1所示的标记中随着次要等位基因(minor allele)逐一增加,能够判断肤色的明亮度即亮度的增减变化程度。作为一例,表1所示的标记中个体的9号染色体的第5953024个碱基中主要等位基因为T,次要等位基因为C的情况下(rs10815321),与具有T/T的人相比,在具有T/C或C/C的情况下,效应量(effect size)为正(+),因此能够判断为皮肤明亮度增加,个体的7号染色体的第96403238个碱基中主要等位基因为A,次要等位基因为G的情况下(rs1839358),与具有A/A的人相比,在具有A/G或G/G的情况下,效应量(effectsize)为负(-),因此能够判断为皮肤明亮度减少,但不限于此。
表2所示的标记中随着次要等位基因(minor allele)逐一增加,能够判断肤色的红的程度的增减变化程度。作为一例,表2所示的标记中个体的4号染色体的第166643609个碱基中主要等位基因为A,次要等位基因为T的情况下(rs7667134),与具有A/A的人相比,在具有A/T或T/T的情况下,效应量(effect size)为正(+),因此能够判断为皮肤的红的程度增加,个体的12号染色体的第125308682个碱基中主要等位基因为G,次要等位基因为A的情况下(rs10846742),与具有G/G的人相比,在具有G/A或A/A的情况下,效应量(effect size)为负(-),因此能够判断为皮肤的红的程度减少,但不限于此。
表3所示的标记中随着次要等位基因(minor allele)逐一增加,能够判断肤色的黄的程度的增减变化程度。作为一例,表3所示的标记中个体的15号染色体的第28233905个碱基中主要等位基因为C,次要等位基因为T的情况下(rs10775262),与具有C/C的人相比,在具有C/T或T/T的情况下,效应量(effect size)为正(+),因此能够判断为皮肤的黄的程度增加,在个体的12号染色体的第125315647个碱基中主要等位基因为G,次要等位基因为A的情况下(rs7485656),与具有G/G的人相比,在具有G/A或A/A的情况下,效应量(effectsize)为负(-),因此能够判断为皮肤的黄的程度减少,但不限于此。
关于上述碱基,仅将表1至表3作为一例进行了记载,虽然未具体地记载,但也可以如上所述地进行解释及导出。
另外,在从上述表1至表3的用于判断肤色的单核苷酸多态性标记中选择的单核苷酸多态性标记中,可额外地包含与韩国人的肤色关联性高的多态性标记。具体地,从表4至表6中选择的任一个以上的用于判断肤色的单核苷酸多态性标记可以是与韩国人的肤色关联性高的标记,但不限于此。
具体地,与韩国人的肤色的明亮度(亮度)相关的单核苷酸多态性标记可以是选自表4所示的标记中的任一个以上的标记,与韩国人的肤色的红的程度相关的单核苷酸多态性标记可以是选自表5所示的标记中的任一个以上的标记,与韩国人的肤色的黄的程度相关的单核苷酸多态性标记可以是选自表6所示的标记中的任一个以上的标记,但不限于此。
作为一个具体例,确认了与其他人种相比其频率高或低的单核苷酸多态性标记,其结果与韩国人的肤色的亮度相关的代表性的单核苷酸多态性标记可以是如表4所示的rs730502、rs10775262、rs10775263、rs7173419及rs12915041,与韩国人的肤色的红的程度相关的单核苷酸多态性标记可以是如表5所示的rs7667134、rs999318、rs17688866、rs57940970及rs17632434,与韩国人的肤色的黄的程度相关的单核苷酸多态性标记可以是如表6所示的rs10775262、rs10775263、rs730502、rs7485656及rs10846742,上述单核苷酸多态性标记仅为代表性的例子,并不限于此。
本发明中的术语“能够检测出用于判断肤色的标记的探针”是指通过与上述基因的多态性位点的特异性杂交反应确认而能够判断肤色的组合物,并且对这种基因分析的具体方法不作特别限定,可以根据本发明所属的技术领域中已知的所有基因检测方法进行。另外,上述术语可与‘用于判断肤色'的术语混用。
在本发明中,术语“能够扩增用于判断肤色的标记的制剂”是指通过扩增确认上述基因的多态性位点而能够诊断肤色程度的组合物,具体地,是指能够特异性扩增上述用于判断肤色的标记的多核苷酸的引物。另外,上述术语可与‘用于诊断肤色'、‘用于判断肤色程度'及‘用于诊断肤色程度'的术语混用。
用于扩增上述多态性标记的引物是指在适当的缓冲液中在适当的条件(例如,4个不同的核苷三磷酸及DNA、RNA聚合酶或逆转录酶等聚合酶)以及适当的温度下可作为模板-指导DNA合成的起始点发挥作用的单链寡核苷酸。上述引物的适当长度可根据使用目的而有所不同,但通常为15至30个核苷酸。短引物分子通常需要更低的温度以与模板形成稳定的杂交体。引物序列不必与模板完全互补,但必须充分互补至与模板杂交的程度。
在本发明中,术语“引物”作为具有短游离3′末端羟基(游离3′羟基,free 3′hydroxyl group)的碱基序列,是指可以与互补模板(template)形成碱基对(base pair)并充当用于模板链复制的起始点的短序列。引物可以在适当的缓冲溶液和温度下在用于聚合反应(即DNA聚合酶或逆转录酶)的试剂以及四种不同的核苷三磷酸的存在下引发DNA合成。可以通过实施PCR扩增而通过所需的产物的产生程度来预测皮肤类型。PCR条件、正义和反义引物的长度可以以本领域公知的为基础进行变形。
本发明的探针或引物可以使用亚磷酰胺(phosphoramidite)固体支持体方法或其他广泛公知的方法化学合成。此类核酸序列还可以利用本领域公知的许多手段来修饰。作为此类修饰的非限制性实例,有甲基化、“加帽(capping)”、用天然核苷酸的一种以上的同系物进行的置换,以及核苷酸之间的修饰,例如,对不带电荷的连接体(例如,磷酸甲酯(methyl phosphonate)、磷酸三酯、氨基磷酸酯(phosphoroamidate)、氨基甲酸酯等)或带电荷的连接体(例如,硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯等)的修饰。
在另一个方式中,本发明提供一种用于判断肤色的试剂盒,其包含上述用于判断肤色的组合物。上述试剂盒可以是RT-PCR试剂盒或DNA芯片试剂盒,但不限于此。
本发明的试剂盒通过扩增确认用于判断皮肤类型的标记即SNP多态性标记,或者确认SNP多态性标记的表达水平和mRNA的表达水平,从而能够诊断皮肤类型。作为一个具体例,在本发明中,用于测量皮肤类型判断用标记的mRNA表达水平的试剂盒可以是包含进行RT-PCR所必需的必要要素的试剂盒。除了对皮肤类型判断用标记的基因特异的各自的引物对之外,RT-PCR试剂盒还可以包括试管或其他适当的容器、反应缓冲液(pH和镁浓度多样)、脱氧核苷酸(dNTPs)、Taq-聚合酶和逆转录酶等酶、DNA酶、RNA酶抑制剂、DEPC-水(DEPC-water)、无菌水等。另外,可以包括对用作定量对照群的基因特异的引物对。另外,具体地,本发明的试剂盒可以是包含进行DNA芯片所必需的必要要素的用于判断皮肤类型的试剂盒。DNA芯片试剂盒通常是将核酸物种以格子型阵列(gridded array)附着于平坦固体支撑板、典型地不大于显微镜用载玻片的玻璃表面的DNA芯片试剂盒,并且是核酸均匀排列在芯片表面上以能够在DNA芯片上的核酸和芯片表面上处理的溶液中包含的互补核酸之间发生多次杂交(hybridization)反应,从而进行大量并行分析的工具。
本发明的另一个方式提供一种包含上述用于判断肤色的组合物的用于判断肤色的微阵列。
上述微阵列可以包含DNA或RNA多核苷酸。除了在探针多核苷酸中包含本发明的多核苷酸之外,上述微阵列由常规微阵列组成。
通过将探针多核苷酸固定在基底上来制备微阵列的方法是本领域中公知的。上述探针多核苷酸是指可杂交的多核苷酸,是指能够与核酸的互补链以序列特异性结合的寡核苷酸。本发明的探针是等位基因特异性探针,多态性位点存在于衍生自相同物种的两个成员的核酸片段中,与衍生自一个成员的DNA片段杂交,但不与衍生自另一个成员的片段杂交。在这种情况下,杂交条件在等位基因之间的杂交强度上显示显著差异,因此必须足够严格以仅与等位基因之一杂交。通过这样做,可诱发不同等位基因形式之间的良好杂交差异。本发明的上述探针可以用于通过检测等位基因来诊断皮肤类型的方法等中。上述诊断方法包括基于核酸杂交的检测方法,例如Southern印迹杂交(Southern blot)等,并且在利用DNA芯片的方法中可以提供为预先结合在DNA芯片的基底上的形式。上述杂交通常可以在严格的条件,例如1M以下的盐浓度和25℃以上的温度下进行。例如,5x SSPE(750mM NaCl,50mM磷酸钠,5mM EDTA,pH 7.4)和25~30℃的条件可适合于等位基因特异性探针杂交。
将本发明的与皮肤诊断相关的探针多核苷酸固定在基底上的过程也可以使用这种现有技术而容易地制备。另外,核酸在微阵列上的杂交和杂交结果的检测是本领域中公知的。上述检测可以通过以下过程检测杂交结果:例如,用能够产生可检测信号的标记材料(包括荧光材料,例如Cy3和Cy5等材料)标记核酸试料,然后在微阵列上杂交并检测由上述标记材料产生的信号。
在另一个方式中,本发明提供一种提供关于肤色的信息的方法,其包括:(a)在从分离自个体的试料中获得的DNA中将上述单核苷酸多态性标记的多态性位点扩增或与探针杂交的步骤;以及(b)确认上述(a)步骤的扩增或杂交的多态性位点的碱基的步骤。
本发明的术语“个体”是指用于诊断肤色的受试者。在上述检测样本中,可以从头发、尿、血液、各种体液、分离的组织、分离的细胞或唾液等试料等中获得DNA,但不限于此。
上述(a)步骤的基因组(genome)DNA获取方法可以使用本领域技术人员已知的任何方法。
从上述(a)步骤获得的DNA中扩增上述单核苷酸多态性标记的多态性位点或将其与探针杂交的步骤可以使用本领域技术人员已知的任何方法。例如,可以通过PCR扩增靶核酸并将其纯化来获得。此外,可以使用连接酶链反应(LCR)(Wu和Wallace,Genomics 4,560(1989),Landegren等,Science 241,1077(1988))、转录扩增(transcription amplification)(Kwoh等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA86,1173(1989))以及自我维持序列复制(Guatelli等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA87,1874(1990))以及基于核酸的序列扩增(NASBA)。
在上述方法中,(b)步骤的多态性位点的碱基的确定包括测序分析、通过微阵列(microarray)的杂交、等位基因特异性PCR(allele specific PCR)、动态等位基因杂交技术(动态等位基因特异性杂交,dynamic allele-specific hybridization,DASH)、PCR延伸分析、SSCP、PCR-RFLP分析或TaqMan技术、SNPlex平台(Applied Biosystems)、质谱(例如Sequenom的MassARRAY系统)、微测序(mini-sequencing)方法、Bio-Plex系统(BioRad)、CEQ和SNPstream系统(Beckman)、分子倒置探针(Molecular Inversion Probe)阵列技术(例如Affymetrix基因Chip)和BeadArray Technologies(例如Illumina GoldenGate和Infinium分析法),但不限于此。通过上述方法或本发明所属技术领域的技术人员可利用的其他方法,可以确认包括微卫星标记(microsatellite)、SNP或其他类型的多态性标记在内的多态性标记中的一个以上的等位基因。这种多态性位点的碱基的确定具体地可以通过SNP芯片进行。
在上述方法中,追加地(c)扩增或杂交的多态性位点的碱基包含一个以上的根据上述单核苷酸多态性标记的作为次要等位基因(minor allele)的碱基时,可以判断肤色程度高或低,但不限于此。另外,追加地(c)扩增或杂交的多态性位点的碱基包含一个以上的根据上述单核苷酸多态性标记的作为主要等位基因(major allele)的碱基时,可以判断为肤色的明亮度增加或减少或肤色的红的程度增加或减少或肤色的黄的程度增加或减少,但不限于此。
在本发明中,术语“SNP芯片”是指可以一次性确认数十万个SNP的各碱基的DNA微阵列之一。
TaqMan方法包括:(1)设计和制造引物和TaqMan探针以使得能够扩增所需DNA片段的步骤;(2)用FAM染料和VIC染料(Applied Biosystems)标记不同等位基因的探针的步骤;(3)以上述DNA为模板,利用上述引物和探针进行PCR的步骤;(4)上述PCR反应完成后,用核酸分析仪对TaqMan分析板进行分析和确认的步骤;以及(5)根据上述分析结果确定步骤(1)的多核苷酸的基因型的步骤。
在上述中,测序分析可以使用用于确定碱基序列的常规方法,并且可以利用自动化基因分析仪进行。另外,等位基因特异性PCR是指,使用包括以SNP所在的碱基为3′末端设计的引物的引物组扩增上述SNP所在的DNA片段的PCR方法。上述方法的原理利用了如下这一点:例如,当特定碱基由A被G取代时,通过设计包含上述A作为3′末端碱基的引物和能够扩增适当大小的DNA片段的反向引物来进行PCR反应时,如果上述SNP位点的碱基是A,则由于扩增反应正常进行而观察到期望位置的条带,如果上述碱基被G取代,则引物可以与模板DNA互补地结合,但由于3′末端不进行互补结合,因此扩增反应无法正常进行。DASH可以通过常规方法进行,具体地可以通过Prince等人的方法进行。
同时,PCR延伸分析通过以下过程实现:首先用引物对扩增包含单核苷酸多态性所在的碱基的DNA片段,然后通过去磷酸化使添加到反应中的所有核苷酸失活,并向其中添加SNP特异性延伸引物、dNTP混合物、双脱氧核苷酸、反应缓冲液和DNA聚合酶来进行引物延伸反应。此时,延伸引物以SNP所在的碱基的5'方向的直接邻接的碱基为3′末端,dNTP混合物中不包含具有与双脱氧核苷酸相同碱基的核酸,并且上述双脱氧核苷酸选自显示SNP的碱基类型之一。例如,在用G取代A的情况下,当将dGTP、dCTP以及TTP混合物和ddATP添加到反应中时,在发生上述取代的碱基中,引物由DNA聚合酶延伸,并且在经过几个碱基后,在A碱基首次出现的位置通过ddATP终止引物延伸反应。如果不发生上述取代,则延伸反应在该位置终止,因此可以通过比较上述延伸的引物的长度来判断显示SNP的碱基类型。
此时,作为检测方法,当延伸引物或双脱氧核苷酸被荧光标记时,可以通过使用用于确定碱基序列的常规基因分析仪(例如,ABI公司的Model 3700等)检测荧光来检测上述SNP,并且当使用未标记的延伸引物和双脱氧核苷酸时,可以通过利用MALDI-TOF(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱,matrix assisted laser desorption ionization-time offlight)技术测量分子量来检测上述SNP。
本发明的另一个方式提供一种利用预测的固有肤色特性的信息提供方法。具体地,提供一种包括如下步骤的利用预测的固有肤色特性的信息提供方法:a)基于特定个体的SNPs数据计算表示皮肤明亮度的第一值;(b)基于特定个体的SNPs数据计算表示皮肤泛红色的程度的第二值;(c)基于特定个体的SNPs数据计算表示皮肤泛黄色的程度的第三值;(d)计算基于多个个体的各个个体计算的第一值的第一参考值、基于上述多个个体的各个个体计算的第二值的第二参考值及基于上述多个个体的各个个体计算的第三值的第三参考值;(e)基于受检者的SNPs数据计算第一值、第二值及第三值,将计算的受检者的第一值、第二值及第三值分别与在上述(d)步骤中计算的第一参考值、第二参考值及第三参考值进行比较及(f)将与通过上述(e)步骤中的比较而生成的第一比较结果数据匹配的固有肤色特性预测为受检者的固有肤色特性。
表1至3中示出多个单核苷酸多态性标记,具体地,表1中示出对皮肤明亮度产生影响的多个单核苷酸多态性标记,表2中示出对皮肤泛红色的程度产生影响的多个单核苷酸多态性标记,表3中示出对皮肤泛黄色的程度产生影响的多个单核苷酸多态性标记。
即便是包括在相同的组的单核苷酸多态性标记,根据标记的不同的种类,对皮肤明亮度、皮肤泛红色的程度、皮肤泛黄色的程度产生影响的程度会有所不同。即,每个单核苷酸多态性标记对皮肤的明亮度、泛红色的程度、泛黄色的程度产生的加权值会彼此不同。
在本发明中,通过线性回归分析等统计学方法而决定各个单核苷酸多态性标记对皮肤的明亮度、泛红色的程度、泛黄色的程度产生的加权值,并利用所决定的加权值并按照下面的数学式而导出了能够预测固有肤色特性的数学式。
[数学式1]
第一值=(SNP11 x效应量11)+(SNP12 x效应量12)+(SNP13 x效应量13)+…+(SNP1nx效应量1n)
在此,n为自然数,SNP11至SNP1n是选自表1的单核苷酸多态性标记,效应量表示将各个单核苷酸多态性标记对皮肤的明亮度产生的影响数值化的加权值。
[数学式2]
第二值=(SNP21 x效应量21)+(SNP22 x效应量22)+(SNP23 x效应量23)+…+(SNP2nx效应量2n)
在此,n为自然数,SNP21至SNP2n是选自表2的单核苷酸多态性标记,效应量表示将各个单核苷酸多态性标记对皮肤泛红色的程度产生的影响数值化的加权值。
[数学式3]
第三值=(SNP31 x效应量31)+(SNP32 x效应量32)+(SNP33 x效应量33)+…+(SNP3nx效应量3n)
在此,n为自然数,SNP11至SNP1n是选自表3的单核苷酸多态性标记,效应量表示将各个单核苷酸多态性标记对皮肤泛黄色的程度产生的影响数值化的加权值。
在本发明中,通过数学式1至3并利用第一值、第二值及第三值而预测该个体的固有肤色特性。
首先,基于特定个体的SNPs数据通过上述数学式1至3而计算第一值、第二值及第三值。基于多个个体可分别计算第一值、第二值及第三值,基于多个个体可分别计算第一值、第二值及第三值,由此生成第一参考值、第二参考值及第三参考值。在此,作为一例,参考值可以是多个第一至第三值的各个平均值,但不限于此,可包括通过中间值等统计学分析法而可表示多个第一至第三值的标准的所有值。另外,多个个体可均为韩国人,但对此不作特别限定。
然后,通过上述数学式1至3并基于受检者的SNPs数据来计算第一值、第二值及第三值。
然后,将计算的受检者的第一值与第一参考值进行比较,将受检者的第二值与第二参考值进行比较,将受检者的第三值与第三参考值进行比较。通过上述比较,生成比较结果数据(例如,包括第一值与第一参考值之间的差异值、第二值与第二参考值之间的差异值、第三值与第三参考值之间的差异值)。
在本发明中,可以预先存储与上述比较结果数据分别匹配的固有肤色特性。因此,能够将与所生成的比较结果数据匹配并预先存储的固有肤色特性预测为受检者的固有肤色特性。
在本发明中,可利用预测的固有肤色特性而将各种信息提供给受检者。在本发明中,可预先存储有多个皮肤管理产品信息和对肤色产生影响的多个生活模式信息。进而皮肤管理产品信息和生活模式信息分别匹配于多个比较结果数据和多个固有肤色特性的组合。例如,将比较结果数据1和固有肤色特性1与皮肤管理产品1和生活模式信息3匹配地存储,将比较结果数据2和固有肤色特性2与皮肤管理产品2和生活模式信息1匹配地存储(参照图1)。
在本发明中,根据所预测的固有肤色特性和所生成的比较结果数据的组合,选定与此匹配的皮肤管理产品信息和生活模式信息而进行推荐。选定的推荐信息通过显示器等另设的输出装置而输出。因此,能够推荐符合受检者皮肤特性的最佳的皮肤管理产品信息及生活模式信息。另外,在本发明中,也可以检测受检者的肤色并通过检测的肤色(实际肤色)与目标肤色之间的比较而生成另外的比较结果数据。为了便于说明,将通过对第一值至第三值与第一参考值至第三参考值进行比较而生成的比较结果数据假设为第一比较结果数据,将通过对受检者的检测的肤色与目标肤色之间的比较而生成的比较结果数据假设为第二比较结果数据。
另外,在本发明中,也可以根据受检者的固有肤色特性、检测肤色、第一比较结果数据及第二比较结果数据的组合而选定与此匹配的皮肤管理产品信息和生活模式信息来进行推荐。与仅利用固有肤色特性和第一比较结果数据而推荐的情况相比,还使用实际受检者的肤色及当前肤色与目标肤色之间的比较结果数据即第二比较结果数据而选定皮肤管理产品信息和生活模式信息来进行推荐,因此能够具备提高推荐的准确性和使用者的满意度的效果。
在本发明中,术语“皮肤管理产品”例如是指,随着适用(例如,涂敷)到身体部位而能够改变肤色特性的所有产品,关于术语“皮肤管理产品信息”应该理解为对特定皮肤管理产品的产品名、成分名等能够特定皮肤管理产品的所有信息的统称。上述皮肤管理产品还可以适用于脸部及/或身体的其他部分的皮肤,作为一例,在固有肤色的亮度低的情况下,可提供能够提高肤色的亮度的美白产品的信息,但不限于此。关于本发明中的术语“生活模式信息”应该理解为对能够改变肤色特性的同时与日常生活相关的所有信息的统称,例如受检者通过进行规定期间以上的该生活模式而能够改变肤色特性的的信息例如饮食习惯信息、运动信息、紫外线暴露时间信息、体重变化信息等。
上述说明的本发明的一个实施例的方法可体现为通过各种计算机单元而可执行的计算机程序命令形态来记录到计算机可读介质。上述计算机可读介质可单独地或以组合的方式包括程序命令、数据文件、数据结构等。记录于上述介质的程序命令可以是为了本发明而特别设计并构成的命令或计算机软件领域的技术人员公知而使用的命令。作为计算机可读记录介质的例子,包括硬盘、软盘及磁带这样的磁性介质(magnetic media)、CD-ROM、DVD这样的光记录介质(optical media)、光磁软盘(floptical disk)这样的磁性-光介质(magneto-optical media)及只读存储器(ROM)、随机存取存储器(RAM)、闪存存储器等这样的以存储程序命令并执行的方式特别构成的硬件装置。作为程序命令的例子,不仅包括通过编译器制作的机器语言代码,而且还包括使用解释程序等而通过计算机可执行的高级语言代码。上述的硬件装置可构成为用作一个以上的软件模块来进行操作,以执行本发明的动作,也可以是其相反的情况。
本发明的另一个方式提供利用预测的固有肤色特性提供信息的系统。具体地,包括:存储装置10,其存储多个个体各自的SNPs数据,并存储与多个比较结果数据分别匹配的固有肤色特性、通过参考值计算装置21而计算的参考值、通过肤色特性值计算装置22而计算的肤色特性值;参考值计算装置21,其利用存储于上述存储装置10的SNPs数据而计算多个个体各自的第一值、第二值及第三值,并计算所计算的第一值的第一参考值(例如,第一值的平均值即第一平均值)、所计算的第二值的第二参考值(例如,第二值的平均值即第二平均值)及所计算的第三值的第三参考值(例如,第三值的平均值即第三平均值);肤色特性值计算装置22,其利用受检者的SNPs数据而计算受检者的第一值、第二值及第三值;比较结果生成装置23,其将上述第一参考值与上述受检者的第一值进行比较,将上述第二参考值与上述受检者的第二值进行比较,将上述第三参考值与上述受检者的第三值进行比较,从而生成比较结果数据;及预测装置24,其将与上述比较结果生成装置23中生成的比较结果数据匹配的固有肤色特性预测为上述受检者的固有肤色特性,其中,上述第一值是利用选自表1的一个以上的单核苷酸多态性标记和所选择的单核苷酸多态性标记对皮肤明亮度产生影响的程度即加权值而计算的,上述第二值是利用选自表2的一个以上的单核苷酸多态性标记和所选择的单核苷酸多态性标记对皮肤泛红色的程度产生影响的程度即加权值而计算的,上述第三值是利用选自表3的一个以上的单核苷酸多态性标记和所选择的单核苷酸多态性标记对泛黄色的程度产生影响的程度即加权值而计算的。
存储装置10可形成为能够存储规定的数据的存储器形态,存储有多个个体各自的SNPs数据和受检者的SNPs数据。另外,存储装置10中存储有与多个比较结果数据一对一地匹配的多个固有肤色特性、通过参考值计算装置21而计算的参考值、通过肤色特性值计算装置22而计算的肤色特性值。另外,存储装置10上存储有构成推荐的对象的多个皮肤管理产品信息和多个生活模式信息,根据多个比较结果数据(比较结果数据1至比较结果数据N(N为2以上的自然数))和多个皮肤管理产品信息(皮肤管理产品信息1至皮肤管理产品信息N(N为2以上的自然数))组合的情况的数量而分别匹配彼此不同的皮肤管理产品信息和生活模式信息来进行存储。
在本发明的另一个实施例中,将受检者的固有肤色特性、根据第一比较结果数据及第二比较结果数据的组合的情况的数量而产生的皮肤管理产品信息及生活模式信息分别匹配地存储到存储装置10。
计算装置20可以形成为具备运算功能的CPU这样的微控制器单元(MCU)的形态,参照图1,计算装置20包括参考值计算装置21、肤色特性值计算装置22、比较结果生成装置23、预测装置24及信息选定装置25。
参考值计算装置21利用存储于存储装置10的SNPs数据并通过数学式1至3而计算特定SNPs数据的第一值、第二值及第三值。另外,参考值计算装置21计算从多个个体计算的第一值的第一参考值(例如,第一值的平均值即第一平均值),计算第二值的第二参考值(例如,第二值的平均值即第二平均值),并计算第三值的第三参考值(例如,第三值的平均值即第三平均值)。计算的第1至第三参考值重新存储到存储装置10。
肤色特性值计算装置22利用存储于存储装置10的受检者的SNPs数据并通过数学式1至3而计算受检者的SNPs数据的第一值、第二值及第三值。
比较结果生成装置23将受检者的计算的第一值与第一参考值进行比较,将第二值与第二参考值进行比较,将第三值与第三参考值进行比较,从而生成比较结果数据(第一比较结果数据)。所生成的比较结果数据例如包括第一值和第一参考值的差异值、第二值和第二参考值的差异值、第三值和第三参考值的差异值,但并非特别限定于此,而是包括根据比较结果而可生成的所有数据的范畴。
另外,比较结果生成装置23通过由肤色检测装置40检测的受检者的检测肤色(实际肤色)与受检者的目标肤色之间的比较而生成另外的比较结果数据(第二结果比较数据)。在此,关于肤色检测装置40,只要是能够检测受检者的实际肤色的结构,则可任意适用,作为一例,可以是照相机等。
预测装置24预先存储于存储装置10,将与通过比较结果生成装置23而生成的比较结果数据(第一比较结果数据)匹配的固有肤色特性预测为受检者的固有肤色特性。通过以显示器、监视器等形态设置的输出装置30而输出通过预测装置24而预测的固有肤色特性。
另外,本发明还包括信息选定装置25,该信息选定装置25选定通过比较结果生成装置23而生成的比较结果数据(第一比较结果数据)、与通过预测装置24而预测的固有肤色特性匹配的皮肤管理产品信息及生活模式信息。通过输出装置30而输出通过信息选定装置25而选定的皮肤管理产品信息及生活模式信息。由此,能够提供受检者皮肤特性定制型皮肤管理产品信息和生活模式信息。
另外,信息选定装置25可选定通过预测装置24而预测的固有肤色特性、与第一比较结果数据及第二比较结果数据匹配的皮肤管理产品信息及生活模式信息。由此,可提供考虑到受检者的皮肤特性的同时使受检者达到所希望的目标肤色的皮肤管理产品信息和生活模式信息。
实施例
下面,通过实施例更详细地说明本发明。这些实施例仅用于对本发明进行例示,并且本发明的范围不限于这些实施例。
实施例1:肤色评价及基因采集
为了导出能够说明一般肤色的基因多态性标记,招募了20~70多岁的健康韩国女性。另外,为了测量皮肤,所有分析对象都用洗面奶或香皂洗脸,并在不涂抹任何产品的情况下等待30分钟使得皮肤能够适应测量环境,然后评价肤色,在评价中使用了基于图像的皮肤诊断专业仪器(PIE公司Janus3)(测量和分析根据仪器制造公司的手册进行)。具体地,分析受试者在佩戴头绳并将黑布盖在衣服上,然后将脸部固定在内置于设备的额头支承台和下巴支承台,在闭眼的状态下保持用于进行检测的姿势,并通过内置于Janus3设备的照相机而拍摄了关于分析受试者的面部的高分辨率图像。从Janus3本身提供的程序对两腮区域进行定义,将该区域内的CIE L*a*b*值作为肤色数值而使用(CIE L*:亮度,CIE a*:红的程度,CIE b*:黄的程度)。
一般的个人(具有主要等位基因(major allele)/主要等位基因(major allele))的肤色是指以48,433名在同一基因位点(碱基)观察到两种等位基因的分析对象为对象检测的面部平均肤色,其值是用在分析区域内的亮度(CIE L*)、红的程度(CIE a*)、黄的程度(CIE b*)各自的连续的数值导出的。
基因采集是通过唾液收集实现的,为了有效的基因采集,所有分析对象从采集前30分钟开始禁止摄取包括水在内的任何食物。
上述分析受试者中①妊娠、哺乳期或计划在6个月内怀孕的情况、②为了治疗皮肤疾病而使用1个月以上的含有类固醇的皮肤外用剂的情况、③参加相同试验后未经过6个月的情况、④具有敏感性、过敏性皮肤的情况、⑤试验部位有痣、痤疮、红斑、毛细血管扩张等皮肤异常的情况、⑥试验开始3个月内在试验部位使用相同或相似的化妆品或医药品的情况、⑦在试验部位接受或计划在6个月内进行手术(皮肤剥皮术、肉毒杆菌毒素(Botox)、其他皮肤护理)的情况、⑧患有慢性消耗性疾病的情况(哮喘、糖尿、高血压等)、⑨患有特应性皮炎的情况、⑩此外根据主试验者的判断,判断为难以试验的情况被排除在受试者之外。
实施例2:根据肤色进行的基因型分析
对于从唾液中提取基因进行基因分析,利用QIAmp mini prep kit(QIAGEN)提取人类基因组DNA(human genomic DNA),其质量通过吸光度(OD 260/280)或1.7、浓度50ng/ul,1x TAE 1%琼脂糖凝胶(agarose gel)的条带(band)检验确认,并且仅对通过质量的基因进行基因分析。
利用Illumina公司的微阵列基因分型芯片进行基因分析,具体地,利用同一公司的全球筛选阵列(global screening array)产品对分析受试者的基因进行分析。
Illumina公司的微阵列基因分型芯片基因分析实验根据提供的手册进行,使用提供的试剂,进行基因组DNA扩增(amplification)、DNA片段化(fragmentation)、沉淀(precipitation)、杂交(hybridization)、染色(staining)、洗涤(washing)、包被(coating)、扫描(scanning)的过程。
完成实验的微阵列基因分型芯片利用iScan Control Software(Illumina)进行扫描,扫描完成后,自动生成idat文件并利用GenomeStudio(Illumina)程序进行数据质量管理(样品检出率(sample call rate)98%,标记检出率(marker call rate)98%)以及基因信息确认。
在本实验中,仅使用了基因分析后通过数据质量管理的数据。
实施例3:肤色关联显著性基因多态性标记导出
为了导出与肤色有关联显著性的基因多态性标记,利用分析对象的基因多态性标记进行了线性回归分析,并且为了分析,使用了BOLT-LMM程序。
为了使用通过实验确认的基因多态性标记来确保有关附加基因多态性标记的信息,使用Minimac4程序进行了Imputation分析,并且为了进行相关分析,作为标准的参考数据,使用了在国际公开基因组数据数据库(database)Haplotype ReferenceConsortium中登记的信息。
Imputation是一种根据通过实验确保的基因多态性标记信息推断未分析的基因多态性标记信息的统计学技术。
为了分析对象基因多态性标记的质量管理,各基因多态性标记仅限于使用超过次要等位基因频率(minor allele frequency)或0.005以及哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinbergequilibrium)或0.000001标准的标记。
与肤色有关联性的基因多态性标记的显著性通过线性回归分析F-statistics进行了评价,其标准设定为P-值(P-value)<0.0001。
为了使可能影响肤色的外部效果最小化并导出根据遗传信息的效果,可以用年龄或BMI信息或生活习惯(饮酒、吸烟、饮食习惯、睡眠习惯等)的信息校正肤色数值,并用于分析(例如,进行线性回归分析)。
导出了很多肤色关联显著性基因多态性标记,并且确认了相关基因多态性标记主要位于人类基因组中的1号、2号、3号、4号、6号、11号、12号、16号染色体上。
将与肤色显著地关联的SNP标记列表示于下述表1至表3。具体地,表1涉及肤色(亮度)关联基因多态性标记,显著水平(P)小于0.0001,表2涉及肤色(红的程度)关联基因多态性标记,显著水平(P)小于0.0001,表3涉及肤色(黄的程度)关联基因多态性标记,显著水平(P)小于0.0001。
【表1】
肤色(亮度)关联基因多态性标记(P<0.0001)
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1)美国国立保健院(NIH)ID,可以在相关网站上确认序列
2)(主要等位基因,major allele)>(次要等位基因,minor allele)含义
3)次要等位基因频率(minor allele frequency)=(2mm+Mm)/2(MM+Mm+mm)
4)三种基因型(M/M、M/m、m/m)的表型差异的统计显著性(M:主要等位基因,m:次要等位基因)
5)随着次要等位基因逐一增加,表型(肤色:亮度)的增减变化程度(-:皮肤亮度减少,+:皮肤亮度增加),肤色=两腮区域的CIE L*a*b*各自的值(CIE L*:亮度,CIE a*:红的程度,CIE b*:黄的程度),利用市售仪器(Janus3,PIE公司,韩国)
6)使用BOLT-LMM分析
【表2】
肤色(红的程度)关联基因多态性标记(P<0.0001)
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1)美国国立保健院(NIH)ID,可以在相关网站上确认序列
2)(主要等位基因,major allele)>(次要等位基因,minor allele)含义
3)次要等位基因频率(minor allele frequency)=(2mm+Mm)/2(MM+Mm+mm)
4)三种基因型(M/M、M/m、m/m)的表型差异的统计显著性(M:主要等位基因,m:次要等位基因)
5)随着次要等位基因逐一增加,表型(肤色:红的程度)的增减变化程度(-:皮肤红的程度减少,+:皮肤红的程度增加),肤色=两腮区域的CIE L*a*b*各自的值(CIE L*:亮度,CIE a*:红的程度,CIE b*:黄的程度),利用市售仪器(Janus3,PIE公司,韩国)
6)使用BOLT-LMM分析
【表3】
肤色(黄的程度)关联基因多态性标记(P<0.0001)
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1)美国国立保健院(NIH)ID,可以在相关网站上确认序列
2)(主要等位基因,major allele)>(次要等位基因,minor allele)含义
3)次要等位基因频率(minor allele frequency)=(2mm+Mm)/2(MM+Mm+mm)
4)三种基因型(M/M、M/m、m/m)的表型差异的统计显著性(M:主要等位基因,m:次要等位基因)
5)随着次要等位基因逐一增加,表型(肤色:黄的程度)的增减变化程度(-:皮肤黄的程度减少,+:皮肤黄的程度增加)、肤色=两腮区域的CIE L*a*b*各自的值(CIE L*:亮度,CIE a*:红的程度,CIE b*:黄的程度),利用市售仪器(Janus3,PIE公司,韩国)
6)使用BOLT-LMM分析
其结果,在共计8个基因组位点(1号、2号、3号、4号、6号、11号、12号、16号染色体)确定了主要显示与肤色的关联性的基因变异。
实施例4:韩国人的肤色关联显著性基因多态性标记查明
为了查明通过实施例3而导出的在韩国人当中与肤色关联高的基因多态性标记为韩国人特异性标记,仅在代表标记的范围内将其频率与其他人种(非洲、东亚、欧洲、西亚、美国)进行了比较。
其结果,如表4至表6所示,确认到根据肤色的亮度、红的程度、黄的程度,肤色关联基因多态性标记的等位基因频率在不同人种之间存在差异。
【表4】
肤色(亮度)关联基因多态性代表标记的人种之间的等位基因频率比较
【表5】
肤色(红的程度)关联基因多态性代表标记的人种之间的等位基因频率比较
【表6】
肤色(黄的程度)关联基因多态性代表标记的人种之间的等位基因频率比较
1)美国国立保健院(NIH)ID,可以在相关网站上确认序列
2)韩国人研究中的(主要等位基因,major allele)>(次要等位基因,minorallele)含义
3)韩国人的次要等位基因频率(minor allele frequency);次要等位基因频率(minor allele frequency)=(2mm+Mm)/2(MM+Mm+mm)
4)韩国人研究中的的次要等位基因(minor allele)(2)的其他人种中的频率
具体地确认到:如表4所示,与韩国人的肤色的亮度相关的代表性的单核苷酸多态性(SNP)标记为rs730502、rs10775262、rs10775263、rs7173419及rs12915041,如表5所示,与韩国人的肤色的红的程度相关的单核苷酸多态性(SNP)标记为rs7667134、rs999318、rs17688866、rs57940970及rs17632434,如表6所示,与韩国人的肤色的黄的程度相关的单核苷酸多态性(SNP)标记为rs10775262、rs10775263、rs730502、rs7485656及rs10846742。由此可知,上述相应标记为韩国人独特的肤色关联基因多态性标记,但上述标记仅为与韩国人的肤色相关的代表性的单核苷酸多态性(SNP)标记,不限于上述标记。
实施例5:适用肤色关联显著性基因多态性标记的定制型皮肤管理产品信息及生活模式信息提供系统
适用受检者的肤色检测及个人的肤色关联显著性基因多态性标记或与肤色有关联显著性的基因多态性标记中的一个以上的标记的定制型皮肤管理产品信息及生活模式信息提供系统是基于包括皮肤明亮度(亮度)、红的程度、黄的程度等的整体肤色而以下述的方式进行的。
(1)作为将受检者的肤色定量化的步骤,为了进行皮肤检测,所有受检者均利用洗面奶或香皂而清洗脸部,并在不涂抹任何产品的情况下等待30分钟使得皮肤能够适应测量环境,然后评价肤色,在评价中使用了基于图像的皮肤诊断专业仪器(PIE公司Janus3)(测量和分析根据仪器制造公司的手册进行)。通过本身提供程序而对两腮区域进行定义,并将相应区域内CIE L*a*b*值用作肤色数值(CIE L*:亮度,CIE a*:红的程度,CIE b*:黄的程度)。可以适用韩国人肤色数据的分布而进行受检者的当前肤色各个指标的韩国人群体中的位置的表现。
(2)通过利用实施例2及实施例3的方式而进行的受检者的基因分析,导出了包含对CIE L*,a*,b*各个值产生影响的1个以上的关联显著性基因多态性标记或与CIE L*,a*,b*各个值有关联显著性的基因多态性标记中的一个以上的标记的肤色信息提供用标记组合。通过标记组合而构建的肤色预测模型的公式可以是如下述的形式。该公式可以用作个人的固有肤色特性预测及分类、提供定制型皮肤管理产品并推荐及提供生活模式信息的根据。
例如)肤色预测模型的公式=SNP1 X效应量1+…+(SNPn:特定SNP中特定等位基因(allele)的数量,效应量:通过线性回归分析等而求出的对SNPn的效果值)
例如,基于多个个体而计算亮度、红的程度、黄的程度各自的预测模型的公式,并利用其值而构成参考数据库。作为具体例,在参考数据库中可求出平均值,通过与受检者的计算值之间的比较而生成比较数据。这可以用作推荐并提供定制型皮肤管理产品信息及生活模式信息的根据。
(3)可基于(1)中检测的肤色而特定受检者对所希望的肤色的目标皮肤明亮度(亮度)、红的程度、黄的程度值(CIE L*a*b*),能够生成肤色检测比较结果数据。这可以用作推荐并提供定制型皮肤管理产品信息及生活模式信息的根据。
(4)为了改善受检者的本质的肤色烦恼,例如皮肤明亮度(亮度),可基于(2)中记载的预测式和比较数据而推荐包含对个人最有效的美白功能性、防紫外线等功能性原料的配方或包含该配方的皮肤管理产品。另外,为了从当前受检者的状态表现为所希望的肤色,可基于(3)中记载的受检者的肤色检测值、目标肤色数值及比较数据而推荐包含彩妆配方的定制型皮肤管理产品。在推荐符合受检者个人特性的配方或产品的同时,还可以对户外活动的种类、活动时间等生活习惯管理项目提出追加方案并提供服务。
基于以上的说明,本发明所属技术领域的技术人员可以理解,在不改变本发明的技术思想或必要特征的情况下可以以其他具体形式实施本发明。关于此,应当理解,上述实施例在所有方面均为示例性的而非限制性的。本发明的范围应被解释为包括所附的权利要求书的意思以及范围和从与其等同的概念导出的所有的变更或变形,不应被理解为仅包括上述详细的说明。
Claims (10)
1.一种用于判断肤色的组合物,其包含能够检测出选自表1至表3的任一个以上的用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记的探针或能够扩增选自表1至表3的任一个以上的用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记的制剂。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中,上述组合物包含对选自与皮肤的明亮度相关的表1的一个以上的单核苷酸多态性标记、选自与皮肤的红的程度相关的表2的一个以上的单核苷酸多态性标记、及选自与皮肤的黄的程度相关的表3的一个以上的单核苷酸多态性标记能够进行检测的探针或能够进行扩增的制剂。
3.根据权利要求1所述的组合物,其中,上述用于判断肤色的单核苷酸多态性标记还包括选自由与选自表1至表3中的任一个表的一种以上的单核苷酸多态性标记对应的多核苷酸;以及其互补多核苷酸组成的组的一种以上的多核苷酸。
4.根据权利要求1所述的组合物,其中,从选自上述表1至表3的用于判断肤色的单核苷酸多态性标记的单核苷酸多态性标记到选自表4至表6的任一个以上的用于判断肤色的单核苷酸多态性标记与韩国人的肤色关联性高。
5.一种用于判断肤色的试剂盒,其包含根据权利要求1至4中任一项所述的组合物。
6.根据权利要求5所述的用于判断肤色的试剂盒,其中,上述试剂盒为RT-PCR试剂盒或DNA芯片试剂盒。
7.一种用于判断肤色的微阵列,其包含根据权利要求1所述的用于判断肤色的单核苷酸多态性(SNP)标记。
8.一种提供关于肤色的信息的方法,包括如下步骤:
(a)在从分离自个体的试料中获得的DNA中将权利要求1所述的用于判断肤色的单核苷酸多态性标记的多态性位点扩增或与探针杂交;及
(b)确认上述(a)步骤的扩增或杂交的多态性位点的碱基。
9.根据权利要求8所述的提供关于肤色的信息的方法,其中,所述试料是头发、尿、血液、各种体液、分离的组织、分离的细胞或唾液。
10.根据权利要求8所述的提供关于肤色的信息的方法,其中,上述多态性位点的扩增和确认利用SNP芯片。
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