CN117098846A - 诺如病毒来源的肽、多核苷酸、抗体、组合物、鉴定诺如病毒的中和表位的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明提供一种肽,其能够用于诱导针对属于GII的基因型的诺如病毒的保护性免疫。一种肽,其含有诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分,该诺如病毒属于基因组II(GII)中的除基因型4以外的任意基因型。

Description

诺如病毒来源的肽、多核苷酸、抗体、组合物、鉴定诺如病毒的 中和表位的方法
技术领域
本申请涉及诺如病毒疫苗领域。尤其涉及含有诺如病毒的中和表位的肽、识别该肽的抗体、编码该肽的多核苷酸、用于处置诺如病毒的组合物及鉴定中和表位的方法。
背景技术
已知诺如病毒感染症一年四季都会发生,尤其冬季容易流行。作为其症状,是腹痛、腹泻、想吐、呕吐、发热等。感染途径为:摄入被诺如病毒污染的食品、水等;接触携带诺如病毒的人、物品;诺如病毒感染者的飞沫等。诺如病毒通常对消毒、热具有抵抗性且感染力强,因此容易引起二次感染。
对于细菌感染,抗生素是有效的治疗手段。但是,对于诺如病毒感染而言,与细菌感染情况不同,不存在特异性的药剂。因此,感染了诺如病毒的情况下,只能等待病毒排出到体外、自然康复。
在这样的背景下,为了防患诺如病毒感染于未然,正在进行疫苗的开发。专利文献1公开了一种方法,其将疫苗组合物非经口给药于人,诱导针对诺如病毒的保护性免疫。在此,该疫苗组合物包含诺如病毒的基因组(基因群(Genogroup))I的基因型(Genotype)1(GI.1)和/或基因组II的基因型4(GII.4)的病毒样蛋白(virus-like protein、有时也称为“VLP”)。
诺如病毒目前基于基因组序列及衣壳蛋白序列而分为10种基因组(非专利文献1)。并且,各基因组存在1种以上的基因型。例如,基因组II(GII)存在27种基因型(GII.1、GII.2、···、GII.27)。对此,非专利文献2公开了:针对GII.4,鉴定了阻断表位(blockadeepitope)(也称为抑制表位)。但是,已知诺如病毒即使基因组相同,不同基因型之间彼此的抗原性也不同。对于诺如病毒的研究大多是针对诺如病毒感染症的主流即GII.4的。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:日本特开2017-214357号公报
非专利文献
非专利文献1:Chhabra et al.,Journal of General Virology 2019;100:1393-1406
非专利文献2:Lindesmith LC,Baric RS:Immunity 50,1530,2019
发明内容
发明要解决的问题
GII的基因型是多种多样的。因此,在诱导针对属于GII的诺如病毒的保护性免疫方面,现有技术的疫苗组合物可能是无效的。本发明提供一种肽,其可以用于针对属于GII的基因型的诺如病毒来诱导保护性免疫。
用于解决问题的方案
鉴于以上,本申请的发明人着眼于诺如病毒的VP1(viral protein 1,病毒蛋白1)蛋白的P(protruding,突出)结构域,从立体结构方面进行了广泛研究。其结果是,实现了多个潜在的表位区域的确定。基于这样的见解,本申请的发明人完成了本发明。
本发明非限定性地提供以下方案。
(1)一种肽,其含有诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分,
该诺如病毒属于基因组II(GII)中的除基因型4以外的任意基因型。
(2)根据(1)所述的肽,其中,上述诺如病毒属于选自由GII中的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型。
(3)根据(1)或(2)所述的肽,其中,上述P结构域的氨基酸序列的一部分包含选自由表位A、表位D、表位E、表位F及这些的组合组成的组中的中和表位的氨基酸序列整体或其一部分。
(4)根据(1)~(3)中任一项所述的肽,其中,上述表位A具有选自由序列号1~267组成的组中的氨基酸序列,
上述表位D具有选自由序列号268~351组成的组中的氨基酸序列,
上述表位E具有选自由序列号352~390组成的组中的氨基酸序列,并且,
上述表位F具有选自由序列号391~425组成的组中的氨基酸序列。
(5)根据(1)~(4)中任一项所述的肽,其还包含属于GII中的除基因型4以外的任意基因型且天然存在的诺如病毒的VP1蛋白的P结构域中不存在的氨基酸序列。
(6)根据(1)~(5)中任一项所述的肽,其还包含属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型且天然存在的诺如病毒的VP1蛋白的P结构域中不存在的氨基酸序列。
(7)一种多核苷酸,其编码(1)~(6)中任一项所述的肽。
(8)根据(7)所述的多核苷酸,其整合到了表达载体中。
(9)根据(7)或(8)所述的多核苷酸,其已被导入到宿主细胞中。
(10)一种抗体,其识别(1)~(6)中任一项所述的肽
(11)根据(10)所述的抗体,其识别上述诺如病毒的VP1蛋白的P结构域。
(12)一种组合物,其包含(1)~(6)中任一项所述的肽。
(13)一种组合物,其包含(7)~(9)中任一项所述的多核苷酸。
(14)根据(12)或(13)所述的组合物,其为疫苗。
(15)根据(12)~(14)中任一项所述的组合物,其用于诱导针对属于GII中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒的保护性免疫。
(16)根据(12)~(15)中任一项所述的组合物,其用于诱导针对属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒的保护性免疫。
(17)一种组合物,其包含(10)或(11)所述的抗体。
(18)根据(12)~(17)中任一项所述的组合物,其用于处置属于GII中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒的感染症。
(19)根据(12)~(18)中任一项所述的组合物,其用于处置属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒的感染症。
(20)一种鉴定诺如病毒的中和表位的方法,其包括下述步骤:
采集属于特定基因型的1个以上诺如病毒株的基因组序列,从该基因组序列中提取VP1蛋白的基因序列,
对该VP1蛋白的氨基酸序列进行比对,基于该氨基酸序列的类似性、这些氨基酸序列所来源的病毒株的系统树的远近、或其组合将该诺如病毒株分类到1个以上群组中,
对于代表该群组的诺如病毒株,通过同源建模来预测该株的VP1蛋白的P结构域的立体结构,
将该预测而得的P结构域的立体结构与诺如病毒的参照株的VP1蛋白的P结构域的立体结构进行比较,将结构上与该参照株的P结构域的中和表位对应的、该预测而得的P结构域的部分及位于该部分的附近的氨基酸序列且在该基因型间突变剧烈的区域确定为中和表位,并且,
将该确定了中和表位的VP1的P结构域的氨基酸序列与和该氨基酸序列所来源的病毒株属于相同的基因型且上述中未进行过立体结构的比较的其它株的VP1的P结构域的氨基酸序列进行比较,确定与该中和表位的氨基酸序列对应的、该其它株的VP1的P结构域的氨基酸序列中的部分,将该部分鉴定为其它株的VP1的P结构域的中和表位,
在此,该诺如病毒的参照株与该属于特定基因型的1个以上诺如病毒株属于不同的基因型,并且,
该参照株的VP1蛋白的P结构域的中和表位是已知的。
(21)根据(20)所述的方法,其中,上述属于特定基因型的诺如病毒为属于基因组II(GII)中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒。
(22)根据(20)或(21)所述的方法,其中,上述属于特定基因型的诺如病毒为属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒。
(23)根据(20)~(22)中任一项所述的方法,其中,上述诺如病毒的参照株选自属于GII.4的诺如病毒株。
附图说明
图1:左图为GII.4诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的立体结构(PDB ID:4oov)与GII.6诺如病毒(AB078337)的立体结构模型的结构比对。右图为GII.4诺如病毒的已知的中和表位(D)和根据与其的结构类似性鉴定出的GII.6诺如病毒的表位(序列号310)。
图2为PGM结合抑制活性的结果。(A)从用GII.6表位A免疫的兔子采集的血清、(B)从用GII.6表位D免疫的兔子采集的血清、(C)从用GII.6表位E免疫的兔子采集的血清、(D)从用GII.17表位A免疫的兔子采集的血清、(E)从用GII.17表位D免疫的兔子采集的血清、(F)从用GII.17表位E免疫的兔子采集的血清。
图3为PGM结合抑制活性的结果。(A)从用GII.2表位A免疫的兔子采集的血清、(B)从用GII.2表位D免疫的兔子采集的血清。
具体实施方式
<肽>
本发明提供包含特定氨基酸序列的肽。该特定氨基酸序列包含诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分或源自该P结构域的氨基酸序列。但是,该特定的氨基酸序列不包括诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的整体。
诺如病毒为属于杯状病毒科的病毒。已知诺如病毒存在10种基因组(GI、GII、GIII、GIV、GV、GVI、GVII、GVIII、GIX、GX)。属于GI、GII、GIV、GVIII及GIX的诺如病毒感染人,属于GIII的诺如病毒感染牛,属于GV的诺如病毒感染小鼠,属于GVI的诺如病毒感染猫,属于GVII的诺如病毒感染狗,属于GX的诺如病毒感染蝙蝠。各基因组中,存在基于诺如病毒的基因序列而分类或聚类的基因型。例如,对于GI及GII而言,已知存在各种基因型。目前,GI中存在9种基因型(GI.1~9),而GII中存在27种基因型(GII.1~27)。
构成本发明所提供的肽的特定氨基酸序列包含属于GII中的任意基因型的诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分。在此,从该GII中的任意基因型中排除基因型4。该GII中的任意基因型没有限定,例如可选自由1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组。
并且,该VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分包含:与选自由表位A、表位D、表位E、表位F及这些的组合组成的组中的中和表位相当的氨基酸序列整体或其一部分。在此,表位A、表位D、表位E及表位F的该组合可以为这些表位中的多个的组合,例如可以为2个、3个、4个及4个以上的组合。并且,该组合可以为相同表位的组合,也可以为不同表位的组合。这些表位中的多个的组合可以是将表位直接连接而成的,也可以是借助任意氨基酸序列将表位连接而成的。用于连接多个肽或表位的方法及任意氨基酸序列的设计是公知的,本领域技术人员可以适当地进行。
表位A含有选自天然存在的诺如病毒GII中的任意基因型(不包括GII.4)的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列中的A1区域、A2区域、A3区域及这些的组合中的氨基酸序列。在此,该组合即为A1区域与A2区域的组合、A1区域与A3区域的组合、A2区域与A3区域的组合、或A1区域、A2区域及A3区域的组合。例如,A1区域、A2区域及A3区域在VP1蛋白的氨基酸序列中可存在于从N末端数起的以下位置。
(1)GII.1
A1区域第288~305位,优选第293~300位
A2区域第350~363位,优选第355~360位
A3区域第366~382位,优选第369~376位
(2)GII.2
A1区域第284~305位,优选第289~300位
A2区域第355~369位,优选第360~365位
A3区域第372~393位,优选第375~388位或375~388位
(3)GII.3
A1区域第284~318位,优选第289~313位或289~312位
A2区域第361~376位,优选第366~373位或365~372位
A3区域第378~397位,优选第380~392位或381~393位
(4)GII.5
A1区域第282~303位,优选第287~298位或289~300位
A2区域第351~364位,优选第356~361位或358~363位
A3区域第366~380位,优选第370~375位或372~377位
(5)GII.6
A1区域第285~316位,优选第290~311位
A2区域第364~380位,优选第369~374位或372~377位
A3区域第381~397位,优选第382~392位或385~395位
(6)GII.7
A1区域第290~306位,优选第295~301位
A2区域第354~367位,优选第359~364位
A3区域第369~386位,优选第373~381位
(7)GII.12
A1区域第285~305位,优选第290~300位
A2区域第350~363位,优选第355~360位
A3区域第365~379位,优选第369~374位
(8)GII.13
A1区域第284~305位,优选第289~300位、291~301位或291~302位
A2区域第352~366位,优选第357~362位、358~363位或359~364位A3区域第369~384位,优选第371~379位、372~380位或373~381位
(9)GII.14
A1区域第288~304位,优选第293~299位或293~301位
A2区域第349~366位,优选第354~359位、355~360位或357~362位
A3区域第367~378位,优选第368~373位、369~374位或371~376位
(10)GII.17
A1区域第282~305位,优选第287~297位、289~299位或289~301位
A2区域第349~367位,优选第354~362位、356~364位、357~365位或358~366位
A3区域第368~385位,优选第369~380位、369~381位、371~382位、371~383位、372~384位、373~385位或370~384位
(11)GII.21
A1区域第283~304位,优选第288~299位或289~300位
A2区域第352~365位,优选第357~362位或358~363位
A3区域第368~382位,优选第371~377位或372~378位。
表位A的氨基酸序列可以针对对应的天然的氨基酸序列导入了置换、缺失、削除、插入、修饰等突变,也可以未导入这样的突变。表位A的氨基酸序列具有这样的突变时,优选对立体结构无实质性影响的突变,例如,可列举保守性置换。本领域技术人员熟知保守性置换且可以适当地进行。另外,表位A的氨基酸序列相对于对应的天然的氨基酸序列可以具有70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、98%以上、或99%以上的同源性。对表位A的氨基酸序列导入突变和/或序列同源性变异在能够诱导针对诺如病毒的免疫应答的范围内则是可接受的。并非进行限定,但是表位A例如可以具有选自由序列号1~267(表1)组成的组中的氨基酸序列、对该氨基酸序列导入上述突变而成的氨基酸序列、或对该氨基酸序列具有上述序列同源性的氨基酸序列。
作为构成表位A的氨基酸序列的更具体的例子,并非进行限定,但是可以列举以下例子:
·作为A1区域的、选自由序列号1~113组成的组中的氨基酸序列、
·作为A2区域的、选自由序列号114~160组成的组中的氨基酸序列、
·作为A3区域的、选自由序列号161~267及428组成的组中的氨基酸序列、
·具有该A1区域及该A2区域的氨基酸序列、
·具有该A1区域及该A3区域的氨基酸序列、
·具有该A2区域及该A3区域的氨基酸序列、
·具有该A1区域、该A2区域及该A3区域的氨基酸序列、
·在该A1区域、该A2区域和/或该A3区域中的任意者中导入氨基酸残基的置换、缺失、削除、插入、修饰等而成的、上述氨基酸序列、
·相对于该A1区域、该A2区域、或该A3区域中的任意氨基酸序列具有70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、98%以上、或99%以上的同源性的氨基酸序列。
在将A1区域、A2区域及A3区域中的2个或3个组合时,在表位A内可以相邻地存在,也可以被任意氨基酸序列隔开而存在。
表位D含有天然存在的诺如病毒GII中的任意基因型(不包括GII.4)的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分。例如,表位D在VP1蛋白的氨基酸序列中可存在于从N末端数起的以下位置。
(1)GII.1第385~395位,优选第390~394位
(2)GII.2第394~405位、394~403位,优选第396~403位、395~405位
(3)GII.3第398~410位,优选第403~409位或404~410位
(4)GII.5第387~399位,优选第392~397位或394~399位
(5)GII.6第399~411位,优选第404~408位或407~411位、401~410位
(6)GII.7第390~400位,优选第395~399位
(7)GII.12第386~396位,优选第391~396位
(8)GII.13第387~401位,优选第392~399位、393~400位或394~401位
(9)GII.14第385~399位,优选第390~396位、391~397位或393~399位
(10)GII.17第386~403位、386~402位,优选第387~397位、388~399位、389~399位、390~400位、390~401位、390~402位、391~401位、392~402位或388~403位
(11)GII.21第388~400位,优选第393~399位或394~400位
表位D的氨基酸序列可以针对对应的天然的氨基酸序列导入了置换、缺失、削除、插入、修饰等突变,也可以未导入这样的突变。表位D的氨基酸序列具有这样的突变时,优选对立体结构无实质性影响的突变,例如,可列举保守性置换。本领域技术人员熟知保守性置换且可以适当地进行。另外,表位D的氨基酸序列相对于对应的天然的氨基酸序列可以具有70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、98%以上、或99%以上的同源性。对表位D的氨基酸序列导入突变和/或序列同源性变异在能够诱导针对诺如病毒的免疫应答的范围内则是可接受的。并非进行限定,但是表位D例如可以具有选自由序列号268~351(表1)、426、429及431组成的组中的氨基酸序列、对该氨基酸序列导入上述突变而成的氨基酸序列、或对该氨基酸序列具有上述序列同源性的氨基酸序列。
表位E含有天然存在的诺如病毒GII中的任意基因型(不包括GII.4)的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分。例如,表位E在VP1蛋白的氨基酸序列中可存在于从N末端数起的以下位置。
(1)GII.1第401~413位,优选第402~408位
(2)GII.2第408~420位,优选第409~415位
(3)GII.3第415~427位,优选第415~421位或416~422位
(4)GII.5第405~418位,优选第405~411位或407~413位
(5)GII.6第413~428位、414~428位,优选第414~420位、417~423位、413~423位
(6)GII.7第407~418位,优选第407~413位
(7)GII.12第402~413位,优选第402~408位
(8)GII.13第405~418位,优选第405~411位、406~412位或407~413位
(9)GII.14第402~416位,优选第402~408位、403~409位或405~411位
(10)GII.17第403~420位,优选第403~410位、405~412位、406~413位、407~414位、408~415位或406~415位
(11)GII.21第405~417位,优选第405~411位或406~412位
表位E的氨基酸序列可以针对对应的天然的氨基酸序列导入了置换、缺失、削除、插入、修饰等突变,也可以未导入这样的突变。表位E的氨基酸序列具有这样的突变时,优选对立体结构无实质性影响的突变,例如,可列举保守性置换。本领域技术人员熟知保守性置换且可以适当地进行。另外,表位E的氨基酸序列相对于对应的天然的氨基酸序列可以具有70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、98%以上、或99%以上的同源性。对表位E的氨基酸序列导入突变和/或序列同源性变异在能够诱导针对诺如病毒的免疫应答的范围内则是可接受的。并非进行限定,但是表位E例如可以具有选自由序列号352~390(表1)、427及430组成的组中的氨基酸序列、对该氨基酸序列导入上述突变而成的氨基酸序列、或对该氨基酸序列具有上述序列同源性的氨基酸序列。
表位F含有选自天然存在的诺如病毒GII中的任意基因型(不包括GII.4)的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列中的F1区域、F2区域及这些的组合中的氨基酸序列。例如,F1区域及F2区域在VP1蛋白的氨基酸序列中可存在于从N末端数起的以下位置。
(1)GII.1
F1区域第322~337位,优选第327~332位
F2区域第396~400位,优选第397~400位
(2)GII.2
F1区域第322~337位,优选第327~332位
F2区域第404~407位
(3)GII.3
F1区域第334~350位,优选第339~344位或340~345位
F2区域第410~414位,优选第410~413位或411~414位
(4)GII.5
F1区域第320~337位,优选第325~330位或327~332位
F2区域第400~405位,优选第400~403位或402~405位
(5)GII.6
F1区域第332~347位,优选第337~342位
F2区域第409~415位,优选第409~412位或412~415位
(6)GII.7
F1区域第323~338位,优选第328~333位
F2区域第401~406位,优选第402~405位
(7)GII.12
F1区域第322~337位,优选第327~332位
F2区域第397~401位,优选第397~400位
(8)GII.13
F1区域第320~337位,优选第325~330位、326~331位或327~332位
F2区域第400~405位,优选第400~403位、401~404位或402~405位
(9)GII.14
F1区域第321~338位,优选第326~331位或328~333位
F2区域第397~403位,优选第397~400位、398~401位或400~403位
(10)GII.17
F1区域第319~338位,优选第324~329位、326~331位或328~333位
F2区域第398~406位,优选第398~401位、400~403位、401~404位、402~405位或403~406位
(11)GII.21
F1区域第321~337位,优选第326~331位或327~332位
F2区域第400~404位,优选第400~403位或401~404位。
表位F的氨基酸残序列可以针对对应的天然的氨基酸序列导入了置换、缺失、削除、插入、修饰等突变,也可以未导入这样的突变。表位F的氨基酸序列具有这样的突变时,优选对立体结构无实质性影响的突变,例如,可列举保守性置换。本领域技术人员熟知保守性置换且可以适当地进行。另外,表位F的氨基酸序列相对于对应的天然的氨基酸序列可以具有70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、98%以上、或99%以上的同源性。对表位F的氨基酸序列导入突变和/或序列同源性变异在能够诱导针对诺如病毒的免疫应答的范围内则是可接受的。并非进行限定,但是表位F例如可以具有选自由序列号391~425(表1)组成的组中的氨基酸序列、对该氨基酸序列导入上述突变而成的氨基酸序列、或对该氨基酸序列具有上述序列同源性的氨基酸序列。
作为构成表位F的氨基酸序列的更具体的例子,并非进行限定,但是可以列举以下例子:
·作为F1区域的、选自由序列号391~415组成的组中的氨基酸序列、
·作为F2区域的、选自由序列号416~425组成的组中的氨基酸序列、
·具有该F1区域及该F2区域的氨基酸序列、
·在该F1区域和/或该F2区域中的任意者中导入氨基酸残基的置换、缺失、削除、插入、修饰等而成的、上述氨基酸序列、
·相对于该F1区域或该F2区域中的任意氨基酸序列具有70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、98%以上、或99%以上的同源性的氨基酸序列。
F1区域及F2区域的组合在表位F内可以相邻地存在,也可以被任意氨基酸序列隔开而存在。
关于本发明的肽,除了针对表位A~F在上述中说明的氨基酸序列以外,还可以在该表位A~F的内部或者其N末端侧或C末端侧具有任意氨基酸序列。例如,可以具有源自天然存在的诺如病毒(属于GII中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒,例如,属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的的诺如病毒)的VP1蛋白的P结构域以外的氨基酸序列、并非源自天然存在的诺如病毒(属于GII中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒,例如,属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒)的氨基酸序列、或非天然的氨基酸序列。该任意氨基酸序列的使用在本发明的肽能够诱导针对诺如病毒的免疫应答的限度内是可接受的。因此,作为整体来看,本发明的肽的氨基酸序列可以具有非天然存在的氨基酸序列。
本发明的肽可以通过化学合成来得到。肽的合成可自己进行,另外也可以委托给外部机构。肽可以通过公知的任意的方法来合成。例如,液相肽合成法或固相肽合成法是众所周知的。作为固相肽合成法,可列举Boc固相法或Fmoc固相法。本领域技术人员熟知肽的合成方法及其条件。
或者,可以使用编码本发明的肽的多核苷酸通过生物学手段制造本发明的肽。将这样的多核苷酸导入合适的宿主细胞,培养该宿主细胞,由此也可以制造本发明的肽。关于编码本发明的肽的多核苷酸(核酸序列)、含有该多核苷酸的表达载体及导入了该多核苷酸的宿主细胞,将在本说明书的其它部分进行说明。
另外,得到的肽可以根据需要纯化。纯化可以基于肽的尺寸、电荷、疏水性等物理化学特性来进行。例如可列举尺寸排阻层析、离子交换色谱、分配色谱及高效液相(正相或反相)色谱等。本领域技术人员熟知关于肽的纯化的方法及其条件。
<抗体>
本发明提供识别至少1种本发明的肽的抗体。在此,“识别”是指抗体与靶肽选择性地进行相互作用(结合),与非选择性相互作用不同。抗体与靶肽间的相互作用可以通过公知的手段评价。例如,可列举ELISA、免疫印迹法及免疫沉淀法等。本领域技术人员可以适当地利用这些手段。
抗体可以为多克隆抗体,也可以为单克隆抗体。并且,抗体可以为人源化抗体之类的嵌合抗体。嵌合抗体可以通过本领域技术人员已知的任意方法制造。抗体可以为选自由IgG、IgA、IgY、IgD、IgM、IgE及其片段组成的组中的至少1种,但是不限于此。该片段可以包括例如重链、轻链、Fc、或F(ab)等。另外,抗体可以由单个抗体或其片段构成,也可以由2个以上抗体或其片段构成。
本发明的抗体可以识别属于GII中的任意基因型的诺如病毒中的至少1种(其中,不包括GII.4)。例如,本发明的抗体可以识别属于GII中的特定的基因型的诺如病毒中的至少1种。例如,抗体可以识别属于选自由GII.1、GII.2、GII.3、GII.5、GII.6、GII.7、GII.12、GII.13、GII.14、GII.17及GII.21组成的组中的至少1种的诺如病毒。
预测抗体将结合于诺如病毒的VP1蛋白的P结构域。例如,抗体可结合于诺如病毒的VP1蛋白的P结构域中的表位A、表位D、表位E及表位F中的至少1个。
本发明的抗体可以使用本发明的肽制造。使用肽制造抗体的方法对于本领域技术人员而言是众所周知的。虽然并非进行限定,但是提供包括下述工序的抗体的制造方法。
抗体的制造方法包括将本发明的肽给予对象的工序。通过该工序来免疫对象,可以产生针对肽的抗体。在此,对象只要可用于临床和/或实验、并且具有抗体产生能力即可。例如,对象为人、猪、牛、啮齿类(小鼠、大鼠、豚鼠等)、狗、猫、绵羊、兔子、禽类(鸡、鸵鸟等)等,但是不限于此。需要说明的是,免疫的条件(抗原肽的给药量、给药次数、给药时期、给药部位等)对于本领域技术人员而言是众所周知的,无需说明,可以适当地设定。
抗体的制造方法还包括回收上述对象中产生的抗体的工序。回收工序中,通过从经免疫的对象中回收体液(例如血液、血清、血浆、腹水等),可以得到目标抗体。或者,在回收工序中,也可以通过从经免疫的对象中回收抗体产生细胞来得到目标抗体。这种情况下,根据需要,可以通过使该抗体产生细胞与其它细胞融合等来建立具有增殖能力的杂交瘤株。杂交瘤细胞的制作方法是本领域技术人员公知的,无需特别说明。
抗体的制造方法中,如有需要,则可以还包括:对所回收的抗体进行纯化的工序;和/或对所回收的抗体与靶肽间的相互作用进行评价的工序。抗体的纯化和/或抗体-靶肽间的相互作用的评价可以通过公知的手段进行。
<多核苷酸、表达载体、宿主细胞>
本发明提供编码本发明的肽的多核苷酸。由于已经确定了氨基酸残基与基因密码子的对应关系,因此容易将肽序列变换成与其对应的多核苷酸序列。该多核苷酸可以为RNA及DNA中任意者,从处理、保存方面来看,DNA更方便。
本发明的多核苷酸可以通过化学合成得到。多核苷酸的合成可以自己进行,另外也可以委托给外部机构。多核苷酸可以通过公知的任意的方法合成。例如,固相合成法是众所周知的。本领域技术人员熟知关于多核苷酸合成的方法及其条件。
或者,本发明的多核苷酸可通过生物学方法得到。例如,将编码诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的RNA逆转录为cDNA,以该cDNA为模板进行基因扩增反应(逆转录PCR),由此可以扩增编码本发明的肽的氨基酸序列的核酸序列。用于PCR的引物以可扩增包含编码本发明的肽的氨基酸序列的核酸序列的区域的方式来设计。即,可以设计与存在于编码本发明的肽的氨基酸序列的核酸序列的上游和/或下游的核酸序列进行退火的引物。例如,编码序列号1~425(表1)中任意者所示的氨基酸序列的多核苷酸均存在于诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的基因中,可以基于其上游和/或下游的核酸序列制作引物。
上述含有编码诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的基因的基因序列的信息可以由互联网等中公开的数据库(并非进行限定,有GenBank、EMBL、DDBJ(日本DNA数据库)等)获得。
上述多核苷酸可在获得其的任意时期根据需要供于提取和/或纯化的操作。关于多核苷酸的提取和/或纯化,本领域技术人员可以适当选择公知的方法。
本发明的多核苷酸可以整合在表达载体中。因此,本发明还提供这样的表达载体。作为表达载体,可列举例如大肠杆菌表达用的pET、酵母表达用的pAUR、昆虫细胞表达用的pIEx-1、动物细胞表达用的pBApo-CMV,也可以利用其它公知载体。需要说明的是,多核苷酸向表达载体中的整合可以通过公知的方法进行。
本发明的表达载体可导入到合适的宿主细胞。因此,本发明提供导入有该表达载体的宿主细胞。宿主细胞只要能够生产本发明的肽则没有特别限制。例如,可以将昆虫来源(例如Sf9、Hi5细胞等)、大肠杆菌、酵母(例如酿酒酵母、粟酒裂殖酵母、毕赤酵母等)、哺乳动物细胞(CHO、HEK等)及其它任意细胞作为宿主细胞。通过培养本发明的宿主细胞,可以生产本发明的肽。需要说明的是,表达载体向宿主细胞中的导入及宿主细胞的培养可以通过公知的方法进行。
<组合物>
本发明提供包含至少1种上述的本发明的肽的组合物。并且,本发明提供包含至少1种上述的多核苷酸的组合物。进而,本发明提供包含至少1种上述的本发明的抗体的组合物。以下的说明中简称为“本发明的组合物”时,意图对这3种组合物一起进行说明。
本发明的组合物只要可发挥发明的效果则任选包含附加的成分。该附加的成分包括赋形剂、稀释剂、pH调节剂、保存剂、载体、悬浮化剂、增溶剂、增稠剂、稳定剂、防腐剂、渗透剂、佐剂等,但是不限于此。附加的成分可以从公知物质中适当选择。
本发明的组合物可以为经口用及非经口用中的任一者,并且可以制剂成适合于期望给药途径的形状。非经口的组合物可以通过静脉、动脉、肌肉、腹膜、鼻腔、经皮、皮下、颊侧、舌下、直肠、口腔、眼、阴道及肺等任意途径来给药。
本发明的组合物的形状没有限定,例如可以制成片剂、胶囊、丸剂、糖浆、酏剂、乳液、气雾剂、水性或非水性的注射溶液、或者注射溶液用的粉末、颗粒或片剂(添加水性或非水性的液体赋形剂而制备注射溶液)。
本发明的组合物可预防、治疗、减轻或改善诺如病毒感染症、由诺如病毒导致的疾病、或与该感染症和/或疾病有关的至少1种症状。在此,诺如病毒感染症、由诺如病毒导致的疾病、或与该感染症和/或疾病有关的至少1种症状可列举急性胃肠炎及相关症状(恶心、腹泻、软便、呕吐、想吐、发热、倦怠感、疲劳、胃痉挛、畏寒、肌肉痛、头痛中的至少一种)。应理解的是,诺如病毒感染、或由其引起的疾病或症状是本领域技术人员已知的,有时不限于这里所列举的。上述的预防、治疗、减轻或改善可通过中和感染因子、抑制感染因子侵入细胞、抑制感染因子的复制、抵抗对宿主细胞的感染或破坏、或刺激抗体的产生来实现,但是不限于此。因此,本发明的组合物可以作为用于在诺如病毒的处置中使用的药物组合物。
可应用本发明的组合物的诺如病毒可以为属于GII的诺如病毒,但是可排除GII.4。例如,可列举属于选自由GII.1、GII.2、GII.3、GII.5、GII.6、GII.7、GII.12、GII.13、GII.14、GII.17及GII.21组成的组中的至少1种的诺如病毒。
本发明的组合物可以以有效的量给药于对象,所述有效的量是对于预防、治疗、减轻或改善诺如病毒感染症、由诺如病毒引起的疾病、或与该感染症和/或疾病相关的至少1种症状有效的量。该对象只要是可能感染诺如病毒的对象即可,可以是例如哺乳类(人、猪、牛、啮齿类、狗、猫等)。该有效的量可考虑要应用组合物的对象、给药途径、给药方式等而适当设定。
本发明的组合物也可以与其它蛋白质和/或肽等组合给药。该其它蛋白质或肽可以作为配合于本发明的组合物的附加的成分来给药。或者,该其它蛋白质或肽可以作为配合在其它组合物中的成分与本发明的组合物同时或不同时地进行给药。并且,该其它蛋白质或肽可以为了预防、治疗、减轻或改善诺如病毒感染症而给药,也可以为了预防、治疗、减轻或改善其它疾病而给药。
另外,本发明的组合物中的、含有本发明的肽或编码该肽的多核苷酸的组合物例如可作为疫苗用组合物。疫苗用组合物可用于:诱导针对诺如病毒的保护性免疫,由此预防、治疗、减轻或改善诺如病毒感染症、由诺如病毒导致的疾病、或与该感染症和/或疾病相关的至少1种症状。
作为这里所称的诺如病毒,可以为属于GII中的任意基因型的诺如病毒,可排除GII.4。例如,可列举属于选自由GII.1、GII.2、GII.3、GII.5、GII.6、GII.7、GII.12、GII.13、GII.14、GII.17及GII.21组成的组中的至少1种的诺如病毒。
并且,诱导针对诺如病毒的“保护性免疫”是指:诱发针对感染因子(诺如病毒、源自其的物质、或由此而生产的物质)的免疫或免疫应答。保护性免疫应答可以是起因于体液免疫应答和细胞介导性免疫应答中任意免疫应答。如果诱导了针对诺如病毒的保护性免疫,则与进行该诱导前相比对象中针对诺如病毒的抗体效价可变高。抗体效价的测定可以通过公知的方法进行。例如,可列举实施例中说明的中和活性试验。
疫苗用组合物可以以对于诱导针对诺如病毒的保护性免疫而言有效的量给药于对象。该对象为可感染诺如病毒的对象即可,可以为例如哺乳类(人、猪、牛、啮齿类、狗、猫等)。用于诱导保护性免疫的有效量可以考虑要应用疫苗用组合物的对象、给药途径、给药方式等适当设定。
疫苗用组合物可以为包含本发明的肽的肽疫苗。该肽疫苗可以包含单个表位或包含2个以上的不同表位。另外,该肽疫苗中的表位可以分别以游离状态存在,也可以以2个以上连接在一起的状态(多表位肽)存在。
或者,疫苗用组合物可以为病毒样颗粒(VLP)疫苗。例如,可列举在VLP中表达本发明的肽的VLP疫苗。例如,作为VLP,可利用人乳头瘤病毒、人乙型肝炎病毒(HBV)、诺如病毒等的VLP,但是不限于此。VLP疫苗的制备方法是公知的,本领域技术人员可以适当选择VLP、其表达中使用的载体、表达载体及宿主等必要材料。
或者,疫苗用组合物可以是包含编码本发明的肽的多核苷酸的基因疫苗。例如,可列举包含整合有该多核苷酸的载体的重组载体疫苗。
或者,疫苗用组合物可以包含具有本发明的肽或编码该肽的多核苷酸的颗粒。本发明的肽或编码该肽的多核苷酸可以存在于该颗粒的表面,也可以存在于该颗粒的内部。另外,本发明的肽或编码该肽的多核苷酸可以与该颗粒共价结合或非共价结合,还可以借助接头与该颗粒结合。
<中和表位的鉴定方法>
本发明提供鉴定诺如病毒的中和表位的方法。
本发明的中和表位鉴定方法包括采集属于特定的基因型的1种以上诺如病毒株的基因组序列、并且从该基因组序列中提取衣壳蛋白的VP1(VP1蛋白)的基因序列的工序。该特定的基因型可以属于GI、GII、GIII、GIV、GV、GVI、GVII、GVIII、GIX及GX中的任意者,优选属于GII。例如,可以从属于选自由GII.2、GII.3、GII.5、GII.6、GII.7、GII.12、GII.13、GII.14、GII.17及GII.21组成的组中的基因组中的1种以上诺如病毒株中采集基因组序列,提取VP1蛋白的基因序列。该工序中,优选从尽量多的诺如病毒株采集基因组序列而提取更多种VP1蛋白的基因序列。诺如病毒株的基因组序列及VP1蛋白的基因序列的相关信息可以由互联网等中公开的数据库(并非进行限定,但是有GenBank、EMBL、DDBJ(日本DNA数据库)等)获得。
然后,包括对提取的VP1蛋白的基因序列进行比对,基于这些基因序列的类似性、这些基因序列所来源的病毒株的系统树的远近、或其组合将诺如病毒株分类到1个以上的群组中的工序。例如,该基因序列具有类似性时和/或该基因序列所来源的病毒株在系统树中较近时,可将基因序列分类到同一群组中。然后,从分类后的群组中选择任意诺如病毒株,通过同源建模预测该株的VP1蛋白的P结构域的立体结构。并非必需对分类到群组中的全部诺如病毒株进行该操作。这是因为,对诺如病毒株中的几个、例如3~5株左右预测中和表位的情况下,则可以通过氨基酸序列的比较来预期属于同一群组的其它诺如病毒株的中和表位。用于预测立体结构的软件通常是可获得或可利用的。例如,可列举Swiss-model。
然后,根据VP1蛋白的P结构域的预测而得的立体结构来确定中和表位。中和表位的确定可通过将该预测而得的立体结构与诺如病毒的参照株的VP1蛋白的P结构域的立体结构进行比较来进行。将与该参照株的P结构域的中和表位在结构上对应的、该预测而得的立体结构中的部分确定为中和表位。在此,诺如病毒的参照株是指:与中和表位的鉴定所涉及的对象株属于相同基因组的诺如病毒株。例如,中和表位的鉴定所涉及的对象株为属于GII的诺如病毒株时,参照株可以为属于GII的诺如病毒株(但是与对象株不同)。如果更具体地进行例示,在对象株为属于GII.1、GII.2、GII.3、GII.5、GII.6、GII.7、GII.12、GII.13、GII.14、GII.17、或GII.21的诺如病毒株时,参照株可以为属于GII.4的诺如病毒株。并且,对于参照株,需要已知VP1蛋白的P结构域上存在中和表位(此前已经确认)。中和表位的鉴定可以通过利用X射线分析抗原-抗体结合物的晶体的方法、表位作图、或其它公知的方法来进行。或者,也可以使用已有报道指出VP1蛋白的P结构域上存在中和表位的诺如病毒株作为参照株。例如,可以使用VP1蛋白的P结构域上的表位已被鉴定的GII.4的诺如病毒株(非专利文献2(Lindesmith LC,Baric RS:Immunity 50,1530,2019))作为参照株。
然后,将通过上述而确定了中和表位的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列与和该氨基酸序列所来源的病毒株属于相同基因型且上述中未进行过立体结构的比较的其它株的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列进行比较,确定与该中和表位的氨基酸序列对应的、该其它株的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列中的部分,将该部分鉴定为其它株的VP1蛋白的P结构域的中和表位。
实施例
通过以下的实施例更详细地说明发明。该实施例是为了进一步理解发明而提供的,并非意图对发明的范围进行限定。
[实施例1]GII.6基因型的诺如病毒的中和表位的鉴定
如以下那样鉴定GII.6的诺如病毒的中和表位。从NCBI(美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information):www.ncbi.nlm.nih.gov)的数据库中,采集了根据注释信息可确认是属于GII.6的诺如病毒的VP1蛋白的基因序列的数据(99个),翻译成氨基酸序列。基于序列同源性对这些氨基酸序列进行聚类,结果获知可分类为3个主要的群组。从这3个群组中选择作为各自的代表的3个株。这3个株的基因信息的NCBI登录号分别为AB078337、MH279838及JX989075。
通过同源建模基于氨基酸序列来预测这些代表株的VP1蛋白的P结构域的立体结构。将预测而得的GII.6的代表株的VP1蛋白的P结构域的立体结构与中和表位已知的GII.4(参照株)(具体可参照参考文献:Lindesmith LC,Baric RS:Immunity 50,1530,2019(非专利文献2))的VP1蛋白的P结构域的立体结构,通过立体结构比对来进行比较。作为一例,示出AB078337的表位D的鉴定(图1)。由此鉴定出与该参照株的P结构域的中和表位在结构上对应的、该GII.6的代表株的预测而得的P结构域的部分。
另外,将上述中获得的全部的GII.6的VP1蛋白的基因序列变换为氨基酸序列,将该氨基酸序列通过多序列比对来进行比较。由此计算GII.6之间(同一基因型之间)的VP1蛋白的各氨基酸残基的保守度,对VP1蛋白的P结构域的氨基酸残基的保守度低(突变剧烈)的区域进行鉴定。
将包括上述鉴定出的、GII.6代表株的预测而得的P结构域的部分及该部分的附近的氨基酸的保守度低(突变剧烈)的区域部分在内的氨基酸序列,鉴定为GII.6代表株的中和表位(认为GII.6的中和表位与GII.4的中和表位在立体结构上类似,另外通常中和表位为了规避宿主的免疫而容易发生氨基酸突变,因此可以将与这些条件相符的部分推断为中和表位。)。GII.4的已知的中和表位中存在A(分为3处,因此为了方便而记作A1区域、A2区域、A3区域)、D、E及F(分为2处,因此为了方便而记作F1区域、F2区域)。可以确认,与这些对应的、GII.6代表株中鉴定出的中和表位在VP1蛋白的氨基酸序列中对应于从N末端数起的以下的氨基酸位置。
·AB078337
中和表位A:第290~311位(A1区域)(序列号51)、第372~377位(A2区域)(序列号135)、第385~395位(A3区域)(序列号218);
中和表位D:第407~411位(序列号310);
中和表位E:第417~423位(序列号371);
中和表位F:第337~342位(F1区域)(序列号403)、第412~415位(F2区域)(序列号424)。
·MH279838
中和表位A:第290~311位(A1区域)(序列号54)、第369~374位(A2区域)(序列号136)、第382~392位(A3区域)(序列号217);
中和表位D:第404~408位(序列号312);
中和表位E:第414~420位(序列号372);
中和表位F:第337~342位(F1区域)(序列号403)、第409~412位(F2区域)(序列号424)。
·JX989075
中和表位A:第290~311位(A1区域)(序列号54)、第369~374位(A2区域)(序列号136)、第382~392位(A3区域)(序列号221);
中和表位D:第404~408位(序列号312);
中和表位E:第414~420位(序列号372);
中和表位F:第337~342位(F1区域)(序列号403)、第409~412位(F2区域)(序列号424)。
进而,基于通过上述中进行的GII.6的VP1蛋白的氨基酸序列的多序列比对而得的比较结果,鉴定了与GII.6代表株(AB078337、MH279838及JX989075)的鉴定出的中和表位对应的、该代表株以外的GII.6的氨基酸序列(即,中和表位)(表1)。
[实施例2]诺如病毒的中和表位的进一步鉴定
按照实施例1中记载的方法,鉴定了GII.1、GII.2、GII.3、GII.5、GII.7、GII.12、GII.13、GII.14、GII.17及GII.21的诺如病毒的中和表位(表1)。
[表1-1]
[表1-2]
[表1-3]
[表1-4]
[表1-5]
[表1-6]
[表1-7]
[表1-8]
[表1-9]
[表1-10]
[表1-11]
[表1-12]
[表1-13]
[表1-14]
[表1-15]
[表1-16]
[表1-17]
[表1-18]
[表1-19]
[表1-20]
[表1-21]
[表1-22]
[表1-23]
[表1-24]
[表1-25]
[表1-26]
[表1-27]
[表1-28]
[表1-29]
[表1-30]
[表1-31]
[表1-32]
[表1-33]
[表1-34]
[表1-35]
[表1-36]
[表1-37]
[表1-38]
[表1-39]
[表1-40]
[表1-41]
[表1-42]
[表1-43]
[表1-44]
[表1-45]
[表1-46]
[表1-47]
[表1-48]
[表1-49]
[表1-50]
[表1-51]
[表1-52]
[表1-53]
[表1-54]
[表1-55]
[表1-56]
[表1-57]
[表1-58]
[表1-59]
[表1-60]
[表1-61]
[表1-62]
[表1-63]
[表1-64]
[表1-65]
[表1-66]
[表1-67]
[表1-68]
[表1-69]
[表1-70]
[表1-71]
[表1-72]
[表1-73]
[表1-74]
[表1-75]
[表1-76]
[表1-77]
[表1-78]
[表1-79]
[表1-80]
[表1-81]
[表1-82]
[实施例3]VLP的制备
GII.2VLP、GII.6VLP及GII.17VLP如以下那样制备。
使用下述诺如病毒株来源的VP1基因:
(1)诺如病毒Hu/GII.2/MK04/2004/JP(登录号:DQ456824)来源的VP1基因(序列号432)。
(2)诺如病毒Hu/GII.6/GZ2010-L96/Guangzhou/CHN/2011(登录号:JX989075)来源的VP1基因(序列号433)。
(3)诺如病毒Hu/GII/JP/2015/GII.P17_GII.17/Kawasaki308(登录号:LC037415)来源的VP1基因(序列号434)。
将这些VP1基因整合到杆状病毒基因组DNA中,导入Sf9细胞,回收重组杆状病毒。将重组杆状病毒以合适的MOI(Multiplicity of Infection:感染复数)接种于High Five细胞。感染起4~7天后回收培养液,以10000×g离心分离60分钟,将培养上清供于利用氯化铯的密度梯度离心分离,得到VLP。将得到的VLP用于以下所示的中和活性评价。
[实施例4]鉴定出的表位的中和活性评价
通过Fmoc固相合成法合成了基于实施例1或2中鉴定出的GII.6表位A、GII.6表位D、GII.6表位E、GII.17表位A、GII.17表位D及GII.17表位E的氨基酸序列的肽。
作为合成的肽,例示出以下肽。需要说明的是,针对各表位而规定的氨基酸位置对应于从VP1蛋白的氨基酸序列的N末端数起的氨基酸位置。
·GII.6(GZ2010(JX989075))
表位A:第290~311位(序列号54)
表位D:第401~410位(序列号426)(第404~408位(序列号312)的序列的N末端及C末端分别添加有Gly-Met-Gly及Gln-Trp的肽。Gly-Met-Gly及Gln-Trp可能为保守性区域。);
表位E:第413~423位(序列号427(414~420位(序列号372)的序列的N末端及C末端分别添加有Pro及Leu-Asn-Met的肽。Pro及Leu-Asn-Met可能为保守性区域。)
·GII.17(Kawasaki308(LC037415))
表位A:第370~384位(序列号428)(第371~383位(序列号253)的序列的N末端及C末端分别添加有Asn及Thr的肽。Asn及Thr可能为保守性区域。)
表位D:第388~403位(序列号429)(第390~401位(序列号334)的序列的N末端及C末端分别添加有Pro-Val及Gln-Trp的肽。Pro-Val及Gln-Trp可能为保守性区域。);
表位E:第406~415位(序列号430)(第407~414位(序列号384)的序列的N末端及C末端分别添加有Pro及Asn的肽。Pro及Asn可能为保守性区域。)
以下说明使用上述例示的合成肽的试验。
分别使用合成的肽,通过皮内给药对兔子进行4次免疫,首次免疫起第49天采集血清。另外,免疫前也采集了血清。
使用采集的血清,进行了中和活性试验。参照Haynes,J et al.,Viruses2019;11(5):392,在以下那样的条件下进行了中和活性试验。
制备猪胃黏蛋白(PGM)溶液(1.0μg/mL,PBS),向各孔中各添加100μL后,在25℃下静置2小时。之后,除去液体并分别添加清洗缓冲液(加入了0.05%吐温20的PBS)300μL而清洗孔(该清洗操作之后重复实施了3次)。向各孔中分别添加5%脱脂乳-PBS溶液200μL后,在4℃下静置一晩。分别混合各50μL的GII.6或GII.17VLP溶液及1倍至128倍稀释的上述所采集的兔子血清而制作混合液(有血清),在25℃下静置一小时。清洗孔后,向孔中添加上述混合液100μL,在25℃下静置一小时。清洗孔后,向各孔中各添加100μL一抗溶液(加入了0.05%吐温20、5%脱脂乳的PBS中的小鼠抗-NoV VLP抗体),在25℃下静置一小时。清洗后,向各孔中各添加100μL二抗溶液(加入了0.05%吐温20、5%脱脂乳的PBS中的抗小鼠IgG抗体,缀合有HRP),在25℃下静置一小时。清洗后,向各孔中各添加100μL TMB(3,3’,5,5’-四甲基联苯胺)溶液,在遮光、25℃下静置30分钟。添加100μL终止液而使反应停止,测定波长450nm的吸光度。
仅将加入了0.05%吐温20、5%脱脂乳的PBS与VLP混合,制备混合液(无血清)。使用该混合液(无血清)代替上述混合液(有血清),进行与上述同样的操作。另外,作为空白,使用加入了0.05%吐温20、5%脱脂乳的PBS(不具有VLP也不具有兔子血清)代替上述混合液(有血清),进行与上述同样的操作。
将使用具有血清的混合液得到的OD[有血清]、使用不具有血清的混合液得到的OD[无血清]及使用空白得到的OD[空白]代入下式,计算结合抑制活性(图2)。
结合抑制活性=100(%)-〔(OD[有血清]-OD[空白])(OD[无血清]-OD[空白])〕×100(%)
有无中和活性是基于封闭滴度(BT)50值。BT50是结合抑制活性超过50%的最大血清稀释倍率的值。本试验的BT50值如表2所示,将免疫后的血清的BT50值为免疫前的血清的BT50值的2倍以上的情况作为有中和活性。其中,免疫前的血清的BT50值在检测限外时,如果免疫后的血清的BT50值能检测到则作为有中和活性。如表2所示,可以确认从用表位肽免疫的兔子采集的血清均具有中和活性。表明免疫了GII.6的表位肽则诱导对GII.6具有中和活性的抗体,免疫了GII.17的表位肽则诱导对GII.17具有中和活性的抗体。
[表2]
表2:兔抗血清的BT50值
[实施例5]鉴定出的表位的中和活性评价
通过Fmoc固相合成法合成了实施例1或2中鉴定出的GII.2表位A及GII.2表位D的氨基酸序列的肽。
作为合成的肽,例示出以下肽。需要说明的是,针对各表位而规定的氨基酸位置对应于从VP1蛋白的氨基酸序列的N末端数起的氨基酸位置。
·GII.2(MK04(DQ456824))
表位A:第375~388位(序列号167)
表位D:第395~405位(序列号431)(第396~403位(序列号273)的序列的N末端及C末端分别添加有Gly及Gln-Trp的肽。Gly及Gln-Trp可能为保守性区域。)
以下说明使用上述例示的合成肽的试验。
分别使用合成的肽,通过皮内给药对兔子进行4次免疫,首次免疫起第49天采集血清。另外,免疫前也采集了血清。
使用采集的血清,进行了中和活性试验。参照Haynes,J et al.,Viruses2019;11(5):392,在以下那样的条件下进行了中和活性试验。
制备猪胃黏蛋白(PGM)溶液(1.0μg/mL,PBS),向各孔中各添加100μL后,在25℃下静置2小时。之后,除去液体并分别添加清洗缓冲液(加入了0.05%吐温20的PBS)300μL而清洗孔(该清洗操作之后重复实施了3次)。向各孔中分别添加5%脱脂乳-PBS溶液200μL后,在4℃下静置一晩。清洗后,向各孔中各添加100μL糖基转移酶反应溶液(0.25μg/mL B型糖基转移酶、50mM HEPES,pH6.5、1.5mM UDP-半乳糖、5mM MnCl 2),在37℃下静置两小时。在实施糖基转移反应的期间,分别混合各50μL的GII.2VLP溶液及1倍至128倍稀释的上述所采集的兔子血清而制作混合液(有血清),在25℃下静置一小时。清洗孔后,向孔中添加上述混合液100μL,在25℃下静置一小时。清洗孔后,向各孔中各添加100μL一抗溶液(包含0.05%吐温20的PBS中的小鼠抗-NoV VLP抗体),在25℃下静置一小时。清洗后,向各孔中各添加100μL二抗溶液(包含0.05%吐温20的PBS中的抗小鼠IgG抗体,缀合有HRP),在25℃下静置一小时。清洗后,向各孔中各添加100μL TMB(3,3’,5,5’-四甲基联苯胺)溶液,在遮光、25℃下静置30分钟。添加终止液100μL而使反应停止,测定波长450nm的吸光度。
仅将加入了0.05%吐温20、5%脱脂乳的PBS与VLP混合,制备混合液(无血清)。使用该混合液(无血清)代替上述混合液(有血清),进行与上述同样的操作。另外,作为空白,使用加入了0.05%吐温20、5%脱脂乳的PBS(不具有VLP也不具有兔子血清)代替上述混合液(有血清),进行与上述同样的操作。
将使用具有血清的混合液得到的OD[有血清]、使用不具有血清的混合液得到的OD[无血清]及使用空白得到的OD[空白]代入下式,计算结合抑制活性(图3)。
结合抑制活性=100(%)-〔(OD[有血清]-OD[空白])(OD[无血清]-OD[空白])〕×100(%)
有无中和活性是基于封闭滴度(BT)50值。BT50是结合抑制活性超过50%的最大血清稀释倍率的值。本试验的BT50值如表3所示,将免疫后的血清的BT50值为免疫前的血清的BT50值的2倍以上的情况作为有中和活性。其中,免疫前的血清的BT50值在检测限外时,如果免疫后的血清的BT50值能检测到则作为有中和活性。如表3所示,可以确认从用表位肽免疫的兔子采集的血清均具有中和活性。表明免疫了GII.2的表位肽则诱导对GII.2具有中和活性的抗体。
[表3]
表3:兔抗血清的BT50值
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序列表
<110> 电化株式会社(Denka Company Limited)
<120> 诺如病毒来源的肽、多核苷酸、抗体、组合物、鉴定诺如病毒的中和表位的方法
<130> PU006649
<150> JP2021-055049
<151> 2021-03-29
<160> 434
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 20
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 21
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 21
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Thr Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 22
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 22
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Val
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 23
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 23
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Ala Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 24
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 24
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asp Tyr Tyr
20
<210> 25
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 25
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp His Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 26
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 26
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Ala Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 27
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 27
Val Met Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Ile Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 28
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 28
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr His
20
<210> 29
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 29
Met Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 30
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 30
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Ile Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 31
<211> 25
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 31
Val Leu Thr Gln Arg Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Val Thr Pro Arg Ala Phe Asp His Arg
20 25
<210> 32
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 32
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Ala Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr His
20
<210> 33
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 33
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ser Glu Thr Thr
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 34
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 34
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Thr
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 35
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 35
Val Leu Ile Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 36
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 36
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Ala Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn His Tyr
20
<210> 37
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 37
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Ile Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 38
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 38
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Val
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn His Tyr
20
<210> 39
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 39
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Asn Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Phe Phe Asp His Ser
20
<210> 40
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 40
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Asn Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg His Phe Asp Leu Ser
20
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<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 41
Val Leu Ile Gly Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Ser Phe Asn Tyr Tyr
20
<210> 42
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 42
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Thr Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg His Phe Asp His Ser
20
<210> 43
<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 43
Val Leu Thr Gly Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
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<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 44
Val Leu Ile Gly Ser Thr Ser Arg Ala Ser Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg Leu Phe Asn Tyr Tyr
20
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<211> 24
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 45
Val Leu Thr Arg Ser Thr Ser Arg Ala Asn Asp Gln Ala Asp Thr Ala
1 5 10 15
Thr Pro Arg His Phe Gly Leu Ser
20
<210> 46
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 46
Lys Val Thr Gly Gln Val Pro Asn Glu Gln His Met
1 5 10
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<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 47
Arg Ile Thr Gly Gln Val Pro Asn Glu Gln His Met
1 5 10
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<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 48
Ile Gly Gln Thr Ser Arg Ser Ser Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Arg Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 49
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 49
Ile Ser Gln Thr Ala Arg Ala Ala Asp Ser Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 50
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 50
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Glu Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 51
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 51
Ile Ser Gln Thr Ala Arg Ala Ala Asp Ser Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 52
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 52
Ile Ser Gln Thr Ala Arg Ala Thr Asp Ser Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 53
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 53
Ile Ser Gln Thr Ala Arg Ala Ala Asp Ser Val Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 54
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 54
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 55
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 55
Val Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 56
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 56
Ile Ser Gln Ala Ala Arg Ala Ala Asp Ser Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 57
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 57
Ile Ser Gln Thr Ala Arg Ala Val Asp Ser Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 58
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 58
Ile Gly Gln Ile Ser Arg Ser Ser Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Arg Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 59
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 59
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Pro
20
<210> 60
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 60
Ile Ser Gln Asn Ala Arg Ala Ala Asp Ser Pro Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 61
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 61
Ile Ser Gln Asn Ala Arg Ala Ala Asp Leu Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 62
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 62
Ile Ser Gln Asn Ala Arg Ala Ala Asp Ser Thr Asp Ser Pro Gln Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 63
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 63
Ile Gly Gln Thr Ser Arg Ser Pro Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Arg Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 64
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 64
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Ile Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 65
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 65
Ile Ser Gln Ala Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 66
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 66
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 67
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 67
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Val Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Ala Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 68
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 68
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Gln Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 69
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 69
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Gln Arg
1 5 10 15
Val Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 70
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 70
Val Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Ser Arg
1 5 10 15
Val Arg Asn His Pro Leu
20
<210> 71
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 71
Ile Gly Gln Thr Ser Arg Thr Ser Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Arg Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 72
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 72
Val Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ala Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Val Arg Ser His Pro Leu
20
<210> 73
<211> 22
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 73
Ile Ser Gln Thr Ser Arg Ser Ser Asp Ser Thr Asp Ser Ala Pro Arg
1 5 10 15
Arg Arg Asp His Pro Leu
20
<210> 74
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 74
Gly Asp Val Arg Ser Tyr Arg
1 5
<210> 75
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 75
Arg Asp Asp Arg Ser Tyr Arg
1 5
<210> 76
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 76
Ile Asn Gln Lys Val Ser Gly Glu Asn His Val
1 5 10
<210> 77
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 77
Val Asn Gln Lys Val Ser Gly Glu Asn His Val
1 5 10
<210> 78
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 78
Ile Asn Gln Lys Val Ser Gly Asp Asn His Val
1 5 10
<210> 79
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 79
Ile Asn Gln Lys Val Asn Gly Glu Asn His Val
1 5 10
<210> 80
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 80
Val Ala Asn Asn Gly Asp Asn Trp Asp Gln Asn Leu
1 5 10
<210> 81
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 81
Leu Ala Asn Asn Asp Ser Trp Asp Gln Asn Leu
1 5 10
<210> 82
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 82
Val Ala Asn Ser Gly Asp Asn Trp Asp Gln Asn Leu
1 5 10
<210> 83
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 83
Val Ala Asn Ser Gly Asp Asn Trp Asp Gln Asn Val
1 5 10
<210> 84
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 84
Val Ala Asn Arg Gly Asp Asn Trp Asp Gln Asn Leu
1 5 10
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<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 85
Val Ala Asn His Gly Asp Asn Trp Asp Gln Asn Leu
1 5 10
<210> 86
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 86
Glu Leu Ser Asp Gln Pro Arg Tyr Gln
1 5
<210> 87
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 87
Lys Leu Asn Glu Glu Pro Arg
1 5
<210> 88
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 88
Lys Leu Ser Glu Glu Pro Arg
1 5
<210> 89
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 89
Lys Leu Thr Ala Asp Val His Gln Ser His Asp Asp Arg
1 5 10
<210> 90
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 90
Arg Leu Thr Ala Asp Val Asp Gly Ser His Asp Asp Arg
1 5 10
<210> 91
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 91
Lys Ile Ser Ala Asp Val Gln Asn Ser His Gln Asp Arg
1 5 10
<210> 92
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 92
Arg Val Thr Ala Gln Ile Asn Gln Arg Asp Arg
1 5 10
<210> 93
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 93
Arg Val Thr Ala Glu Thr Asp His Arg Asp Lys
1 5 10
<210> 94
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 94
Arg Val Thr Ala Lys Thr Asp His Arg Asp Lys
1 5 10
<210> 95
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 95
Arg Val Thr Thr Glu Thr Asp His Arg Asp Lys
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<210> 96
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 96
Arg Val Thr Ala Glu Thr Asp His His Asp Lys
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 97
Arg Val Thr Ala Lys Thr Asp His Ser Asp Lys
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 98
Arg Val Thr Ala Glu Thr Asp Asn Pro Asp Lys
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<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 99
Lys Ile Thr Ala Asp Val Arg Pro Ser His Asp Asp Arg
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<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 100
Lys Ile Thr Ala Asp Val Arg Pro Asn His Asp Asp Arg
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<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 101
Arg Val Thr Ala Glu Thr Asp His Arg Asp Arg
1 5 10
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 102
Arg Val Thr Ala Gln Ile Asn Gln Arg Asp Lys
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 103
Arg Val Thr Ala Gln Ile Asn Gln His Asp Arg
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 104
Arg Val Thr Ala Gln Ile Asn Gln Ser Asp Arg
1 5 10
<210> 105
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 105
Arg Val Thr Ala Glu Pro Ser Arg Ser Asp Arg
1 5 10
<210> 106
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 106
Arg Val Thr Ala Gln Ile Asn Gln Cys Asp Arg
1 5 10
<210> 107
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 107
Arg Val Thr Ala Glu Val Asp Gln Arg Asp Lys
1 5 10
<210> 108
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 108
Ile Thr Ser Asn Pro Thr Ser Asp Tyr Trp Asp Gly
1 5 10
<210> 109
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 109
Thr Thr Ser Asn Asp Thr Ser Asp Tyr Trp Asp Asp
1 5 10
<210> 110
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 110
Met Thr Ser Asn Pro Thr Ser Asp Tyr Trp Asp Gly
1 5 10
<210> 111
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 111
Met Thr Ser Asn Pro Thr Ser Asp Tyr Trp Asp Asp
1 5 10
<210> 112
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 112
Thr Thr Ser Asn Pro Thr Ser Asp Tyr Trp Asp Asp
1 5 10
<210> 113
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 113
Ser Thr Ser Asn Pro Thr Ser Asp Tyr Trp Asp Asp
1 5 10
<210> 114
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 114
Trp Ser Pro Lys Phe Thr
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 115
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
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<212> PRT
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<400> 117
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<211> 6
<212> PRT
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<400> 118
Pro Thr Tyr Thr Ala Lys
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 119
Pro Thr Tyr Thr Thr Gln
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 120
Pro Thr Tyr Ala Ala Gln
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 121
Pro Thr His Thr Ala Lys
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 122
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 123
Asp Thr Thr Ser Gly Arg Phe Thr
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 124
Asp Thr Thr Ala Gly Arg Phe Thr
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 125
Asp Thr Ala Ser Gly Arg Phe Thr
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 126
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 127
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 128
Asp Thr Ser Ser Pro Arg Phe Thr
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 129
Asp Thr Thr Ser Pro Arg Phe Thr
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 130
Asp Thr Lys Ser Gly Arg Phe Ala
1 5
<210> 131
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 131
Asn Thr Thr Ser Gly Arg Phe Thr
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 132
Asp Thr Thr Ala Gly His Phe Thr
1 5
<210> 133
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 133
Tyr Ser Asp Lys Tyr Thr
1 5
<210> 134
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 134
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 135
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 136
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 137
Thr Asn Pro Arg Tyr Ala
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 138
Lys Asn Pro Arg Tyr Thr
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 139
Thr Asn Ser Arg Tyr Thr
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 140
Thr Asp Pro Arg Tyr Ala
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 141
Gly Gly Asp Gln Tyr Ala
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 142
Gly Gly Asn Gln Tyr Ala
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 143
Asn Ser Ala Lys Phe Thr
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 144
Asn Ser Thr Lys Phe Thr
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 145
Asp Ser Ala Lys Phe Thr
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 146
Asp Ser Thr Lys Phe Thr
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 147
His Ser Thr Lys Phe Thr
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 148
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 149
Thr Ser Gly Arg Phe Thr
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 150
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1 5
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 151
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 152
Ala Thr Thr Ser Thr Gln Phe Val Pro
1 5
<210> 153
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 153
Ser Thr Tyr Ser Pro Gln Phe Val Pro
1 5
<210> 154
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 154
Ser Thr His Ser Pro Gln Phe Val Pro
1 5
<210> 155
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 155
Ser Thr Tyr Ser Pro Lys Phe Val Pro
1 5
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 156
Ser Thr Tyr Ile Pro Gln Phe Val Pro
1 5
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 157
Ser Pro Tyr Ser Pro Gln Phe Val Pro
1 5
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 158
Ser Thr Tyr Ser Pro Gln Phe Val Arg
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 159
Thr Ser Glu Lys Phe Thr
1 5
<210> 160
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 160
Thr Ser Asp Lys Phe Thr
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 161
Gly Thr Trp Glu Glu Ser Asp Leu
1 5
<210> 162
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 162
Gly Thr Trp Glu Glu His Asp Leu
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 163
Gly Ala Trp Glu Asp Arg Asp Phe
1 5
<210> 164
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 164
Gly Thr Trp Glu Glu Arg Asp Leu
1 5
<210> 165
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 165
Gly Thr Trp Glu Asp Arg Asp Phe
1 5
<210> 166
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 166
Gly Thr Trp Glu Glu Gln Asp Leu
1 5
<210> 167
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 167
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Val Asn Gln Pro
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<210> 168
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 168
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Lys Val Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 169
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 169
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Ile Thr Val Asp Gln Pro
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<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 170
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Gln Val Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 171
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 171
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Val Ser Gln Pro
1 5 10
<210> 172
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 172
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Asp Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 173
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 173
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Asn Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 174
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 174
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Ala Val Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 175
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 175
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Ile Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 176
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 176
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asn Asp Leu Leu Asp Asn Gln Pro
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<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 177
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Val Asn Gln Ser
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<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 178
Ile Gly Thr Trp Gln Ile Asp Asp Leu Thr Val Asn Gln Pro
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<210> 179
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 179
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Ile Val Asn Gln Pro
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 180
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Ile Thr Val Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 181
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 181
Ile Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Asn Val Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 182
<211> 14
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 182
Val Gly Thr Trp Gln Thr Asp Asp Leu Thr Val Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 183
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 183
Ile Ser Thr Glu Ser Ser Asp Phe Asp Ser Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 184
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 184
Ile Ser Thr Glu Ser Gly Asp Phe Asp Pro Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 185
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 185
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Pro Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 186
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 186
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Ser Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 187
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 187
Ile Thr Thr Glu Ser Asn Asp Phe Asp Ser Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 188
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 188
Ile Thr Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Pro Asn Gln Ser
1 5 10
<210> 189
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 189
Ile Ile Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Leu Asn Gln Ser
1 5 10
<210> 190
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 190
Ile Ser Thr Glu Thr Asp Asp Phe Asn Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 191
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 191
Ile Thr Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Thr Asn Gln Ser
1 5 10
<210> 192
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 192
Ile Thr Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asn Gln Asn Lys Pro
1 5 10
<210> 193
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 193
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 194
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 194
Ile Ser Thr Glu Ser Gly Asp Phe Asp Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 195
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 195
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe His Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 196
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 196
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Gln Asn Lys Pro
1 5 10
<210> 197
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 197
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Gln Asn Gln Ser
1 5 10
<210> 198
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 198
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Glu Asn Lys Pro
1 5 10
<210> 199
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 199
Met Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 200
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 200
Ile Ser Thr Glu Ser Ser Asp Phe Asp Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 201
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 201
Ile Ser Thr Glu Ser Gly Asp Phe Glu Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 202
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 202
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asp Glu Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 203
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 203
Met Ser Thr Glu Ser Ser Asp Phe Asp Gln Asn Gln Pro
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<210> 204
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 204
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Ala Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 205
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 205
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Glu His Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 206
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 206
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Glu Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 207
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 207
Ile Ser Thr Glu Ser Gly Asp Phe Asp Gln Asn Lys Pro
1 5 10
<210> 208
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 208
Ile Ser Thr Glu Ser His Asp Phe Asp Glu Asn Glu Pro
1 5 10
<210> 209
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 209
Ile Ser Thr Glu Ser Ser Asp Phe Asp Gln Ser Gln Pro
1 5 10
<210> 210
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 210
Ile Ser Thr Glu Ser His Asp Phe Asp Gln Asn Glu Pro
1 5 10
<210> 211
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 211
Ile Ser Thr Glu Ser Gly Asp Phe Asp Gln Asn Glu Pro
1 5 10
<210> 212
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 212
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Asn Gln Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 213
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 213
Ile Ser Thr Glu Ser Asp Asp Phe Glu Leu Asn Gln Pro
1 5 10
<210> 214
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 214
Gly Thr Trp Asn Thr Asn
1 5
<210> 215
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 215
Met His Ser Glu Ser Asp Asp Phe Val Thr Gly
1 5 10
<210> 216
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 216
Ile Lys Ser Glu Ser Asn Asp Phe Thr Thr Asn
1 5 10
<210> 217
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 217
Met Tyr Ser Glu Ser Thr Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 218
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 218
Ile Lys Ser Gly Ser Asp Asp Phe Asn Thr Asn
1 5 10
<210> 219
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 219
Ile Lys Ser Glu Ser Asn Asp Phe Ile Thr Asn
1 5 10
<210> 220
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 220
Ile Lys Ser Asp Ser Asn Asp Phe Asn Thr Asn
1 5 10
<210> 221
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 221
Met His Ser Glu Ser Ser Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 222
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 222
Met Asn Ser Glu Ser Ser Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 223
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 223
Met Tyr Ser Glu Ser Ser Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 224
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 224
Ile Lys Ser Glu Ser Thr Asp Phe Thr Thr Asn
1 5 10
<210> 225
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 225
Ile Lys Ser Glu Ser Pro Asp Phe Asn Thr Asn
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 226
Met Arg Ser Glu Ser Asp Asp Phe Val Thr Gly
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 227
Met His Ser Glu Ser Gly Asp Phe Val Thr Gly
1 5 10
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<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 228
Ile His Ser Glu Ser Asp Asp Phe Val Thr Gly
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 229
Met Tyr Ser Glu Ser Asp Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 230
Ile Lys Ser Glu Ser Thr Asp Phe Thr Thr Ser
1 5 10
<210> 231
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 231
Met Tyr Ser Glu Ser Asp Asp Phe Val Thr Gly
1 5 10
<210> 232
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 232
Met His Ser Glu Ser Thr Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 233
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 233
Met Tyr Ser Glu Ser Asn Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 234
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 234
Met Tyr Ser Glu Ser Asp Asp Phe Asp Asn Gly
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 235
Met Tyr Ser Glu Ser Gly Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
<210> 236
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 236
Met Tyr Ser Glu Ser Pro Asp Phe Asp Asp Gly
1 5 10
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<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 237
Met Tyr Ser Glu Ser Glu Asp Phe Val Thr Gly
1 5 10
<210> 238
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 238
Ile Lys Ser Glu Ser Pro Asp Phe Thr Thr Asn
1 5 10
<210> 239
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 239
Phe Ser Glu Ser Gln Asp Phe Glu Val
1 5
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 240
Phe Ser Glu Ser Asp Asp Phe Asp Glu
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 241
Gly Thr Trp Glu Glu Asp
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 242
Gly Thr Trp Glu Gln Asp
1 5
<210> 243
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 243
Gly Thr Trp Glu Glu Asn
1 5
<210> 244
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 244
His Ser Ile Thr Glu His Val His Pro
1 5
<210> 245
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 245
His Ser Ile Thr Gly Asp Val His His
1 5
<210> 246
<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 246
His Ser Ile Thr Glu Asn Val His Pro
1 5
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<211> 9
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 247
His Ser Ile Thr Glu Asp Val Arg Pro
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 248
Lys Ser Ser Ser Asn Asp
1 5
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<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 249
Lys Ser Ser Ser Ser Asp
1 5
<210> 250
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 250
Phe Gly Ser Thr Ser Asp Asp Phe Gln Leu Gln Gln Pro
1 5 10
<210> 251
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 251
Phe Gly Ser Thr Ser Thr Asp Phe Gln Leu Gln Gln Pro
1 5 10
<210> 252
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 252
Phe Gly Ser Glu Ser Glu Asp Phe Gln Val Gly Pro Pro
1 5 10
<210> 253
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 253
Leu Arg Ile Ser Asp Asn Asp Asp Phe Gln Phe Gln Pro
1 5 10
<210> 254
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 254
Phe Arg Ser Asn Asp Asn Asp Phe Gln Leu Gln Pro
1 5 10
<210> 255
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 255
Phe Arg Ser Asn Asp Asp Asp Phe Gln Leu Gln Pro
1 5 10
<210> 256
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 256
Phe Gly Ser Thr Ser Glu Asp Phe Ile Val Gly Gln Pro
1 5 10
<210> 257
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 257
Leu Arg Ile Ser Asp Asn Asp Asp Phe Gln Phe His Pro
1 5 10
<210> 258
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 258
Phe Arg Ser Asn Asp Asp Asp Phe Gln Trp Gln Pro
1 5 10
<210> 259
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 259
Leu Arg Ile Ser Asn Asn Asp Asp Phe Gln Phe Gln Pro
1 5 10
<210> 260
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 260
Phe Gly Ser Asn Asp Asn Asp Phe Gln Leu Gln Pro
1 5 10
<210> 261
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 261
Phe Arg Ile Ser Asp Asn Asp Asp Phe Gln Phe Gln Pro
1 5 10
<210> 262
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 262
Leu Arg Ile Ser Asp Asn Asp Asp Phe Gln Leu Gln Pro
1 5 10
<210> 263
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 263
Phe Lys Ile Ser Ser Asp Asp Asp Phe Gln Leu Gln Pro
1 5 10
<210> 264
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 264
Leu Arg Ile Ser Asp Asn Asn Asp Phe Gln Phe Gln Pro
1 5 10
<210> 265
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 265
Phe Arg Ile Ser Asn Asn Asp Asp Phe Gln Phe Gln Pro
1 5 10
<210> 266
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 266
His Gln Val Gln Gly Asp Ile
1 5
<210> 267
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 267
His Gln Val Gln Gly Asp Thr
1 5
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<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 268
Phe Asn Thr Asp His
1 5
<210> 269
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 269
Tyr Asp Thr Gly His
1 5
<210> 270
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 270
Tyr Asp Thr Asn His
1 5
<210> 271
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 271
Tyr Asp Thr Glu His
1 5
<210> 272
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 272
Leu Asn Asp Val Glu His Phe Asn
1 5
<210> 273
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 273
Leu Asn Asp Thr Glu His Phe Asn
1 5
<210> 274
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 274
Leu Asn Asp Thr Asp His Phe Asn
1 5
<210> 275
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 275
Leu Ser Asp Thr Asp His Ser Asn
1 5
<210> 276
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 276
Leu Ser Asp Thr Asp His Phe Asn
1 5
<210> 277
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 277
Leu Asn Asp Ile Glu His Phe Asn
1 5
<210> 278
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 278
Leu Asn Asp Thr Glu His Phe Asp
1 5
<210> 279
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 279
Leu Asn Asp Thr Asp His Phe Asp
1 5
<210> 280
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 280
Leu Asn Asp Thr Gly His Phe Asn
1 5
<210> 281
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 281
Leu Asn Asp Thr Glu Tyr Phe Asn
1 5
<210> 282
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 282
Leu Asn Asp Thr Glu His Leu Asn
1 5
<210> 283
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 283
Leu Asn Asp Asn Glu His Phe Asn
1 5
<210> 284
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 284
Phe Asn Asp Thr Glu His Phe Asn
1 5
<210> 285
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 285
Leu Asn Asp Ala Glu His Phe Asn
1 5
<210> 286
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 286
Asp Asn Glu Ala Asp Phe Gln
1 5
<210> 287
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 287
Asp Arg Glu Thr Asp Phe Gln
1 5
<210> 288
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 288
Asp Asn Glu Val Asp Phe Gln
1 5
<210> 289
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 289
Asp Asn Glu Ala Glu Phe Gln
1 5
<210> 290
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 290
Asp Arg Glu Ala Asp Phe Gln
1 5
<210> 291
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 291
Asp His Glu Ala Asp Phe Gln
1 5
<210> 292
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 292
Asp His Glu Glu Asp Phe Gln
1 5
<210> 293
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 293
Asp Arg Glu Val Asp Phe Gln
1 5
<210> 294
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 294
Asp His Glu Val Asp Phe Gln
1 5
<210> 295
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 295
Asp Gln Glu Ala Asp Phe Gln
1 5
<210> 296
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 296
Asp His Glu Thr Asp Phe Gln
1 5
<210> 297
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 297
Asp His Glu Ser Asp Phe Gln
1 5
<210> 298
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 298
Asp Asn Glu Arg Glu Phe Gln
1 5
<210> 299
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 299
Asp His Glu Pro Asp Phe Gln
1 5
<210> 300
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 300
Asp His Glu Glu His Phe Gln
1 5
<210> 301
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 301
Asp His Glu Glu Asp Phe Lys
1 5
<210> 302
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 302
Asp Arg Glu Ala Asp Phe Glu
1 5
<210> 303
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 303
Asp His Glu Glu Asp Phe Arg
1 5
<210> 304
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 304
Asp Asn Glu Ala His Phe Lys
1 5
<210> 305
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 305
Asp Ser Glu Ala Asp Phe Gln
1 5
<210> 306
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 306
Asp Gln Glu Ser Asp Phe Gln
1 5
<210> 307
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 307
Val Ala Asn Gly His Arg
1 5
<210> 308
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 308
Val Ser Asp Gly His Arg
1 5
<210> 309
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 309
Asp Asn Asp Trp His
1 5
<210> 310
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 310
Asp Asn Asn Trp Arg
1 5
<210> 311
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 311
Ala Asp Asp Trp Arg
1 5
<210> 312
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 312
Ala Asp Asp Trp His
1 5
<210> 313
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 313
Asp Asp Asp Trp His
1 5
<210> 314
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 314
Asp Asp Asp Trp Arg
1 5
<210> 315
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 315
Asp Thr Ser His Pro
1 5
<210> 316
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 316
Asp Asp Ser His Pro
1 5
<210> 317
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 317
Asp Ala Ser His Pro
1 5
<210> 318
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 318
Asp Pro Ser His Pro
1 5
<210> 319
<211> 5
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 319
Asp Asn Ser His Pro
1 5
<210> 320
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 320
Glu His Glu Asp Phe Ser
1 5
<210> 321
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 321
Glu Asn Glu Gly Phe Asn
1 5
<210> 322
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 322
Asp Thr Asp Asp Phe Asn
1 5
<210> 323
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 323
Glu Asp Glu Gly Phe Asn
1 5
<210> 324
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 324
Glu Ser Glu Gly Phe Asn
1 5
<210> 325
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 325
Glu Arg Glu Gly Phe Asn
1 5
<210> 326
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 326
Val Asn Glu Asn Thr Pro Phe Gln
1 5
<210> 327
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 327
Val Asn Glu Asn Thr Pro Phe Lys
1 5
<210> 328
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 328
Gln Asn Glu Asn Thr Pro Phe Gln
1 5
<210> 329
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 329
Asp Asp Gln His Pro Phe Arg
1 5
<210> 330
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 330
Asp Asp Gln His Pro Phe Lys
1 5
<210> 331
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 331
Gly Ile Lys Val Glu Ser Gly His Asp Phe Asp
1 5 10
<210> 332
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 332
Gly Ile Lys Ile Glu Ser Gly His Glu Phe Asp
1 5 10
<210> 333
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 333
Gly Ile Lys Ile Glu Thr Gly His Ser Phe Arg
1 5 10
<210> 334
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 334
Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 335
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 335
Gly Ile Asn Asp Asp Gly Asp His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 336
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 336
Gly Ile Asn Asp Asp Asp Asp His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 337
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 337
Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly His Thr Phe Arg
1 5 10
<210> 338
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 338
Cys Ile Asn Asp Asp Asp Asp His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 339
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 339
Gly Ile Asn Asp Asp Gly Asn His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 340
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 340
Gly Ile Lys Ile Glu Asp Gly His Ala Phe Asp
1 5 10
<210> 341
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 341
Gly Val Asn Asp Asp Asn Asp Gly Pro Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 342
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 342
Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly His Ser Phe Arg
1 5 10
<210> 343
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 343
Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly Asn Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 344
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 344
Gly Val Asn Asp Asp Asp Gly Gly His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 345
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 345
Gly Val Asn Asp Asp Asp Gly His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 346
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 346
Ala Ile Asn Glu Glu Asp Asp Asp His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 347
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 347
Ser Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 348
<211> 12
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 348
Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Asp His Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 349
<211> 13
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 349
Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly Gly Arg Pro Phe Arg
1 5 10
<210> 350
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 350
Asn Gly Asn Thr Pro Phe Arg
1 5
<210> 351
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 351
Asn Gln Asn Thr Pro Phe Lys
1 5
<210> 352
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 352
Ser Tyr Ser Gly Arg Leu Thr
1 5
<210> 353
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 353
Asn Tyr Ser Gly Arg Leu Thr
1 5
<210> 354
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 354
Arg Tyr Ala Gly Ala Leu Asn
1 5
<210> 355
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 355
Lys Tyr Ala Gly Ala Leu Asn
1 5
<210> 356
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 356
Arg Phe Ala Gly Ala Leu Asn
1 5
<210> 357
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 357
Gly Tyr Ala Gly Ala Leu Asn
1 5
<210> 358
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 358
Asp Tyr Ser Gly Gln Phe Thr
1 5
<210> 359
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 359
Glu Tyr Ser Gly Gln Phe Thr
1 5
<210> 360
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 360
Asp Tyr Ser Gly Gln Leu Thr
1 5
<210> 361
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 361
Asn Tyr Ser Gly Gln Phe Thr
1 5
<210> 362
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 362
Asp Tyr Ala Gly Gln Phe Thr
1 5
<210> 363
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 363
Asn Tyr Ala Gly Gln Phe Thr
1 5
<210> 364
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 364
Asp Tyr Ala Gly Gln Leu Thr
1 5
<210> 365
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 365
Asp Tyr Ala Gly Gln Ile Thr
1 5
<210> 366
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 366
Asn Tyr Ala Gly Gln Leu Thr
1 5
<210> 367
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 367
Asn Tyr Ala Gly Gln Ile Ser
1 5
<210> 368
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 368
Asn Tyr Ala Gly Gln Ile Thr
1 5
<210> 369
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 369
Arg Tyr Ser Gly Ala Leu Thr
1 5
<210> 370
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 370
Asp Tyr Ser Gly His Leu Thr
1 5
<210> 371
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 371
Asp Tyr Ser Gly Arg Leu Thr
1 5
<210> 372
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 372
Glu Tyr Ser Gly His Leu Thr
1 5
<210> 373
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 373
Asp Tyr Ser Gly Ser Leu Thr
1 5
<210> 374
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 374
Asp Tyr Pro Gly His Leu Thr
1 5
<210> 375
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 375
Arg Tyr Gly Gly His Leu Thr
1 5
<210> 376
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 376
Asn Tyr Ser Gly Ala Leu Thr
1 5
<210> 377
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 377
His Tyr Ala Gly Ser Leu Ala
1 5
<210> 378
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 378
His Tyr Ser Gly Ser Leu Ala
1 5
<210> 379
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 379
His Tyr Ala Gly Ala Leu Ala
1 5
<210> 380
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 380
His Tyr Ala Arg Ala Leu Ala
1 5
<210> 381
<211> 7
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 381
Asn Tyr Gly Gly His Leu Ala
1 5
<210> 382
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 382
Arg Tyr Ser Gly His Leu Thr Leu
1 5
<210> 383
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 383
Asn Tyr Ser Gly Ala Leu Thr Leu
1 5
<210> 384
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 384
Asn Tyr Ser Gly Glu Leu Thr Leu
1 5
<210> 385
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 385
Asp Tyr Ser Gly Leu Leu Thr Leu
1 5
<210> 386
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 386
Asp Tyr Ser Gly Pro Leu Thr Leu
1 5
<210> 387
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 387
Asp Tyr Ser Gly Val Leu Thr Leu
1 5
<210> 388
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 388
Asn Tyr Ser Gly Glu Leu Thr Ser
1 5
<210> 389
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 389
Asn Tyr Ser Gly Glu Phe Thr Leu
1 5
<210> 390
<211> 8
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 390
Ser Tyr Ser Gly Glu Leu Thr Leu
1 5
<210> 391
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 391
Asp Phe Leu Ala Asn Ile
1 5
<210> 392
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 392
Asp Phe Gln Gly Arg Val
1 5
<210> 393
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 393
Asp Phe Glu Gly Arg Val
1 5
<210> 394
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 394
Asp Phe Gln Gly Lys Val
1 5
<210> 395
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 395
Asp Phe Gln Gly Arg Ile
1 5
<210> 396
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 396
Asp Phe Gln Glu Arg Val
1 5
<210> 397
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 397
Asp Phe Arg Gly Lys Val
1 5
<210> 398
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 398
Asp Phe Arg Gly Lys Ile
1 5
<210> 399
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 399
Asp Phe Arg Gly Arg Val
1 5
<210> 400
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 400
Asp Phe His Gly Lys Val
1 5
<210> 401
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 401
Asp Phe Ala Gly Glu Val
1 5
<210> 402
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 402
Asp Phe Lys Gly Ala Val
1 5
<210> 403
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 403
Asp Phe Lys Gly Thr Val
1 5
<210> 404
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 404
Asp Phe Arg Gly Ile Leu
1 5
<210> 405
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 405
Asp Phe Gln Gly Ile Leu
1 5
<210> 406
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 406
Asp Phe Ser Gly Lys Leu
1 5
<210> 407
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 407
Asp Phe Ser Gly Arg Leu
1 5
<210> 408
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 408
Asp Phe Ser Gly Met Leu
1 5
<210> 409
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 409
Asp Phe Ser Gly Ile Leu
1 5
<210> 410
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 410
Asp Phe Ser Gly Leu Leu
1 5
<210> 411
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 411
Asp Phe Gln Ala Met Leu
1 5
<210> 412
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 412
Asp Phe Gln Ala Val Leu
1 5
<210> 413
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 413
Asp Phe Thr Gly Leu Leu
1 5
<210> 414
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 414
Asp Phe Lys Gly Val Val
1 5
<210> 415
<211> 6
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 415
Asp Phe Lys Gly Phe Val
1 5
<210> 416
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 416
Gln Trp Ala Leu
1
<210> 417
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 417
Gln Trp Val Leu
1
<210> 418
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 418
Gln Trp Ile Leu
1
<210> 419
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 419
Gln Trp Val Val
1
<210> 420
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 420
Gln Trp Met Val
1
<210> 421
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 421
Gln Trp Ala Val
1
<210> 422
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 422
Gln Trp Thr Leu
1
<210> 423
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 423
Gln Trp Ser Leu
1
<210> 424
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 424
Gln Trp Glu Leu
1
<210> 425
<211> 4
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 425
Gln Trp Asp Pro
1
<210> 426
<211> 10
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 426
Gly Met Gly Ala Asp Asp Trp His Gln Trp
1 5 10
<210> 427
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 427
Pro Glu Tyr Ser Gly His Leu Thr Leu Asn Met
1 5 10
<210> 428
<211> 15
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 428
Asn Leu Arg Ile Ser Asp Asn Asp Asp Phe Gln Phe Gln Pro Thr
1 5 10 15
<210> 429
<211> 16
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 429
Pro Val Gly Val Asn Asp Asp Asp Asp Gly His Pro Phe Arg Gln Trp
1 5 10 15
<210> 430
<211> 10
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 430
Pro Asn Tyr Ser Gly Glu Leu Thr Leu Asn
1 5 10
<210> 431
<211> 11
<212> PRT
<213> 诺如病毒基因组 II(Norovirus genogroup II)
<400> 431
Gly Leu Asn Asp Thr Glu His Phe Asn Gln Trp
1 5 10
<210> 432
<211> 1629
<212> DNA
<213> 诺如病毒 GII.2(Norovirus GII.2)
<400> 432
atgaagatgg cgtcgaatga cgccgctcca tctactgatg gtgcagccgg cctcgtgcca 60
gaaagtaata atgaggtcat ggctcttgaa cccgtggctg gcgccgcctt ggcagccccg 120
gtcaccggtc aaacaaatat tatagaccct tggattagag caaattttgt ccaggcccct 180
aatggtgaat ttacagtctc tccccgtaat gcccctggtg aagtgctatt gaatctagag 240
ttgggtccag aattaaatcc ttatctggca catttagcaa gaatgtacaa cgggtatgcc 300
ggtgggatgg aggtgcaggt catgttggct gggaacgcgt tcacagccgg caagttggtc 360
ttcgccgctg tgccacctca cttcccggtt gaaaacctta gtccacagca aattaccatg 420
ttccctcatg tgattataga tgtaaggact ttggaacctg ttttattacc actccctgat 480
gttagaaata atttcttcca ttataatcag aaagatgatc ccaagatgag aattgtggct 540
atgctttata ccccccttag gtctaatggt tcaggtgatg atgtgtttac agtctcctgc 600
agggtgttga ctagaccctc ccctgatttt gatttcacat atctggtgcc accaacagtg 660
gagtctaaaa caaaaccatt taccctccca atcctcacac ttggggaact ttccaattct 720
agattcccag tgtccataga ccagatgtac accagcccca atgaagttat atcagtgcag 780
tgtcaaaatg gtaggtgcac actggatggg gagctccaag gaacaacaca actccaagtc 840
agtggtattt gtgctttcaa gggagaagtg accgcccatt tgcatgacaa tgatcatcta 900
tataatgtca ccatcacaaa cttgaatggg tccccctttg acccctccga ggacatccct 960
gcccctctgg gcgtacctga ctttcaggga agggtctttg gtgtcatctc ccaaagagac 1020
aaacacaatt cccctggaca taatgaacca gcaaataggg ggcacgacgc tgtggtccct 1080
acttacacat cacagtacac tccaaaattg ggtcagattc aaattggcac atggcaaacc 1140
gatgatctta cagtcaacca accagtcaaa ttcaccccag ttggactcaa tgacactgaa 1200
cattttaacc aatgggtggt ccccagatat gctggtgctc taaaccttaa cacaaacctt 1260
gccccttctg ttgctccagt atttccaggg gagcgcctgc tctttttcag atcatacatc 1320
cccctcaagg gtggttatgg aaatccagcc attgattgcc tactaccaca agagtgggtg 1380
cagcatttct atcaggaagc agccccttca atgagtgagg tggcccttgt cagatacatc 1440
aacccggata ctggtcgggc actgtttgag gccaagctcc acagagctgg tttcatgaca 1500
gtctcaagca acaccagtgc cccggtggtt gtgcctgcca acggatactt cagatttgat 1560
tcttgggtga accaattcta ttctctcgcc cccatgggaa ctggaaatgg gcgtagaagg 1620
gttcaataa 1629
<210> 433
<211> 2476
<212> DNA
<213> 诺如病毒 GII.6(Norovirus GII.6)
<400> 433
gtgaatgaag atggcgtcga atgacgctgc tccatcgaat gatggtgctg ccaacctcgt 60
accagaggcc aacaatgagg ttatggcact tgaaccggtg gtgggagcct caattgcagc 120
tcctgtcgtc ggtcaacaga atataattga cccctggatt agagaaaatt ttgttcaggc 180
accacagggt gagtttactg tttcaccaag aaactcgcct ggtgagatgc ttttaaatct 240
tgaattaggc ccagagctca atccttactt gagtcatttg tcccgcatgt acaatggtta 300
tgctggtggc atgcaggttc aggtggtcct agctgggaat gcgttcacag ctggtaaaat 360
catctttgcc gccgttccac cacatttccc tgtagagaat attagtgcag ctcaaattac 420
aatgtgcccc catgtgattg ttgatgtgag acagcttgaa cctgtgcttt tgcccctccc 480
tgacataagg aacagattct ttcattacaa ccaggaagac accccccgga tgagacttgt 540
ggccatgttg tacacacctc ttagagcaaa ctctggtgag gacgtgttca ctgtgtcttg 600
cagagtcttg acccgcccag cccctgattt tgagttcaca ttcttagtgc caccaaccgt 660
ggaatcaaag actaagcctt ttacactccc tattttaacc ctaggggaac tatccaattc 720
cagattccct gctccaatag acatgctgta cacagatcct aatgagacaa ttgtggtaca 780
accacaaaat ggtagatgca ccctagatgg gacactccaa gggaccaccc agctggtgcc 840
cacccaaatt tgctctttta ggggcacgtt gatcagccaa acgtcgaggt cagcagattc 900
aacagactca gctccacggg tgaggaacca cccccttcac gttcagctga agaacctcga 960
cgggacacca tatgacccaa cagatgaggt gccggcagtt ctgggtgcca tagactttaa 1020
aggaactgtg tttggagtcg ctagccagag gaacactaca gggagctctg taggggcgac 1080
tcgtgcccat gaggtgcaca tagacaccac aaaccctaga tacaccccaa aacttggttc 1140
tgtgttgatg cattctgagt ctagtgattt tgatgatgga caaccaaccc gcttcacacc 1200
cattggcatg ggagcagatg attggcacca atgggaattg cccgaatatt caggtcacct 1260
tactctcaac atgaacctag cccctgcagt tgctcctgct ttccccggtg agcgcatcct 1320
cttctttagg tcagtggttc catctgctgg tggctacgga tcaggccaaa tagactgcct 1380
catcccacag gagtgggttc agcacttcta tcaggaggcc gccccttcac aatctgcggt 1440
ggctcttatt agatatgtta accctgacac tgggagaaac atctttgagg caaagctaca 1500
cagagaaggg ttcattactg tggcaaattc tggaaacaac cccatagttg tgcccccgaa 1560
tggctatttt aggtttgagg cctgggtcaa tcaattctac acactcaccc ccatgggaac 1620
tggacagggg cgcaggagag tccaataatg gcaggagctt tctttgcagg acttgcaggt 1680
gacgccataa cgaatggtgt cgggtccctg atcaacgctg gggccaatgc aatcaaccag 1740
aaggtggagt atgatttcaa caaacaactc caattggcat cttttaagca tgacaaggag 1800
atgctgcaat cacaagttct agccaccaaa caactccagc aggaaatgat gaacataagg 1860
caaggggtct tgaccgctgg cggcttttcc cctactgatg ccgcgagggg cgctgtaaac 1920
gcgccaatga caaagatcct ggattggaat ggtacaagat attttgcccc aaatagcatg 1980
aaaacaacca gttattcagg tcagttttcc agtaatcctg tgcataggca acccactttg 2040
tcccgtcctg attcccaaaa agtcaaaatt aatagtgatt ctgctagtat atatagttct 2100
atgtctactg ctccttcaca atcaacccat tcaatgattc tgacttcagg gtctggatcg 2160
tccaggacaa cctcctctcc cacagtgact tccaccctat ctaggaccag tgactgggtg 2220
agggggcaaa atgagaggct tagcccgttc atggatggtg ctctccaaac aacttttgtc 2280
acaccaccat cgagcagagc ttcatcaaat gggtcggtct cgaccgttcc caaagctgtt 2340
ttggactcct ggactcctat gttcaatacc cataggcagc ctctcttcgc tcacttgcgt 2400
aggcgagggg agtcacaaat ttagtgaaaa gattgatcag gttttcttct tccttctttc 2460
tccttttctt tctttt 2476
<210> 434
<211> 1620
<212> DNA
<213> 诺如病毒 GII.17(Norovirus GII.17)
<400> 434
atgaagatgg cgtcgaatga cgccgctcca tctaatgatg gtgctgctgg tctcgtacca 60
gagggcaaca acgagaccct tcccctagaa ccagttgcgg gcgcagctat agccgcaccc 120
gtcactggcc aaaataatat aattgacccc tggattagaa caaattttgt gcaagcacca 180
aatggagagt tcacagtgtc acccagaaac tctcctggag aaattttatt aaatttagag 240
ttgggccctg atttgaaccc ttatttggct catttgtcaa ggatgtacaa tgggtatgct 300
ggtggagtgg aagttcaggt tctcctggca gggaacgcgt tcactgccgg aaagatcctc 360
ttcgccgccg tcccgccaaa tttcccagtg gaattcttaa gcccggccca gatcacaatg 420
ctcccacatt taatagtaga tgttaggact cttgaaccaa ttatgatccc actccctgat 480
gttaggaata cattcttcca ttatagtaac cagcctaaca gccgcatgag attagtggct 540
atgctctata ccccactcag atctaatggc tcaggtgatg atgtctttac tgtctcttgc 600
agggttttga ctaggcctac tcctgatttt gagttcactt atttagtgcc accttctgtt 660
gaatctaaaa ctaagccttt ttccttacct attttaaccc tttctgagct cacaaattcg 720
aggtttccag tccccatcga ttcgcttttc accgcccaga ataatgtgtt gcaggtgcag 780
tgtcaaaatg gcaggtgtac acttgatggt gagttacaag gcacaaccca gttgctccca 840
actggcatct gtgcattcag aggacgggtg acagcacaaa ttaaccaacg tgacaggtgg 900
cacatgcaac tgcaaaacct caatggtaca acatatgacc caactgatga tgtgccagcc 960
ccgctgggta cacctgactt caagggcgtc gtgtttggga tggtaagcca aagaaatgtg 1020
ggtaatgatg cgcctggctc aaccagagcc caacaggcgt gggtttcaac ctatagcccc 1080
caatttgtcc ccaaattagg ttctgtcaat cttagaatta gtgataatga tgatttccaa 1140
ttccagccga caaaattcac accagtgggc gtcaatgatg acgatgatgg ccacccgttc 1200
agacaatggg aactaccaaa ctattcaggg gagcttacct tgaatatgaa tcttgccccc 1260
ccagttgctc caaattttcc tggtgaacaa ttgttattct tcagatcttt cgtgccatgc 1320
tcaggaggtt acaaccaagg tattatagat tgtcttattc cccaagaatg gatccaacac 1380
ttctatcagg aatcagcacc ctcccagtca gacgtggccc taatcaggta tgtcaacccc 1440
gatacgggac gtacactgtt tgaagcaaaa ttgcacagat ctggttacat tactgtggct 1500
cactctggag actatcctct tgttgttccg gctaatggac actttagatt tgattcttgg 1560
gtaaatcagt tttactcact cgccccaatg ggaactggga atgggcgaag gagggctcag 1620

Claims (23)

1.一种肽,其含有诺如病毒的VP1蛋白的P结构域的氨基酸序列的一部分,
该诺如病毒属于基因组II(GII)中的除基因型4以外的任意基因型。
2.根据权利要求1所述的肽,其中,所述诺如病毒属于选自由GII中的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型。
3.根据权利要求1或2所述的肽,其中,所述P结构域的氨基酸序列的一部分包含选自由表位A、表位D、表位E、表位F及这些的组合组成的组中的中和表位的氨基酸序列整体或其一部分。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的肽,其中,所述表位A具有选自由序列号1~267组成的组中的氨基酸序列,
所述表位D具有选自由序列号268~351组成的组中的氨基酸序列,
所述表位E具有选自由序列号352~390组成的组中的氨基酸序列,并且,
所述表位F具有选自由序列号391~425组成的组中的氨基酸序列。
5.根据权利要求1~4中任一项所述的肽,其还包含属于GII中的除基因型4以外的任意基因型且天然存在的诺如病毒的VP1蛋白的P结构域中不存在的氨基酸序列。
6.根据权利要求1~5中任一项所述的肽,其还包含属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型且天然存在的诺如病毒的VP1蛋白的P结构域中不存在的氨基酸序列。
7.一种多核苷酸,其编码权利要求1~6中任一项所述的肽。
8.根据权利要求7所述的多核苷酸,其整合到了表达载体中。
9.根据权利要求7或8所述的多核苷酸,其已被导入到宿主细胞中。
10.一种抗体,其识别权利要求1~6中任一项所述的肽。
11.根据权利要求10所述的抗体,其识别所述诺如病毒的VP1蛋白的P结构域。
12.一种组合物,其包含权利要求1~6中任一项所述的肽。
13.一种组合物,其包含权利要求7~9中任一项所述的多核苷酸。
14.根据权利要求12或13所述的组合物,其为疫苗。
15.根据权利要求12~14中任一项所述的组合物,其用于诱导针对属于GII中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒的保护性免疫。
16.根据权利要求12~15中任一项所述的组合物,其用于诱导针对属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒的保护性免疫。
17.一种组合物,其包含权利要求10或11所述的抗体。
18.根据权利要求12~17中任一项所述的组合物,其用于处置属于GII中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒的感染症。
19.根据权利要求12~18中任一项所述的组合物,其用于处置属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒的感染症。
20.一种鉴定诺如病毒的中和表位的方法,其包括下述步骤:
收集属于特定基因型的1个以上诺如病毒株的基因组序列,从该基因组序列中提取VP1蛋白的基因序列,
对该VP1蛋白的氨基酸序列进行比对,基于该氨基酸序列的类似性、这些氨基酸序列所来源的病毒株的系统树的远近、或其组合将该诺如病毒株分类到1个以上群组中,
对于代表该群组的诺如病毒株,通过同源建模来预测该株的VP1蛋白的P结构域的立体结构,
将该预测而得的P结构域的立体结构与诺如病毒的参照株的VP1蛋白的P结构域的立体结构进行比较,将结构上与该参照株的P结构域的中和表位对应的、该预测而得的P结构域的部分及位于该部分的附近的氨基酸序列且在该基因型间突变剧烈的区域确定为中和表位,并且,
将该确定了中和表位的VP1的P结构域的氨基酸序列与和该氨基酸序列所来源的病毒株属于相同的基因型且上述中未进行过立体结构的比较的其它株的VP1的P结构域的氨基酸序列进行比较,确定与该中和表位的氨基酸序列对应的、该其它株的VP1的P结构域的氨基酸序列中的部分,将该部分鉴定为其它株的VP1的P结构域的中和表位,
在此,该诺如病毒的参照株与该属于特定基因型的1个以上诺如病毒株属于不同的基因型,并且,
该参照株的VP1蛋白的P结构域的中和表位是已知的。
21.根据权利要求20所述的方法,其中,所述属于特定基因型的诺如病毒为属于基因组II(GII)中的除基因型4以外的任意基因型的诺如病毒。
22.根据权利要求20或21所述的方法,其中,所述属于特定基因型的诺如病毒为属于选自由GII的1、2、3、5、6、7、12、13、14、17及21组成的组中的基因型的诺如病毒。
23.根据权利要求20~22中任一项所述的方法,其中,所述诺如病毒的参照株选自属于GII.4的诺如病毒株。
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