CN116987696A - 用于抑制angptl3基因表达的双链核糖核酸及其修饰物、缀合物和用途 - Google Patents
用于抑制angptl3基因表达的双链核糖核酸及其修饰物、缀合物和用途 Download PDFInfo
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Abstract
本公开涉及用于抑制ANGPTL3基因表达的双链核糖核酸及其修饰物、缀合物和用途。具体来说,本公开涉及一种用于抑制ANGPTL3基因表达的双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物、药物组合物和用途,以及用于抑制细胞内ANGPTL3基因表达的方法。本公开提供的双链核糖核酸,能够在细胞内结合形成RNA诱导沉默复合物(RISC),切割ANGPTL3基因转录的mRNA,高效、特异地抑制ANGPTL3基因的表达,用于治疗ANGPTL3基因介导的代谢异常相关疾病,在临床疾病治疗中具有重要应用前景。
Description
技术领域
本公开属于生物医药领域,具体来说,本公开涉及一种用于抑制ANGTPL3基因表达的双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物、药物组合物和用途,以及用于抑制细胞内ANGTPL3基因表达的方法。
背景技术
血管生成素-样蛋白3(ANGPTL3),亦称为ANGPL3或ANG3,是一种分泌型糖蛋白,属于分泌调控脂质代谢的因子的类血管生成素家族的成员。它主要在肝脏中合成,并且随后分泌到循环中,最终主要在肝脏中表达。ANGPTL3通过与脂肪组织结合,抑制脂蛋白脂肪酶的活性来调节脂质代谢,具体表现为抑制脂蛋白脂肪酶和内皮脂肪酶的催化活性。而这两类酶的抑制可导致甘油三酯、高密度脂蛋白(HDL)和磷脂的血浆水平增加,因此,ANGPTL3的低表达可以减缓血脂异常的各类疾病,包括乳糜微粒血症综合征、2型糖尿病、家族性部分脂肪营养不良、高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、高甘油三酯血症、非酒精性脂肪肝、动脉粥样硬化、高甘油三酯血症、膝盖损伤及骨关节炎、血脂异常及相关代谢疾病。
血脂异常,又名高脂血症,是脂肪代谢或运转异常,使血浆脂质高于正常值的一种全身性疾病,脂质代谢障碍可导致血清脂质,诸如三酸甘油酯和/或胆固醇的水平升高。血清脂质升高与高血压、心血管疾病、糖尿病及其他病理状况强烈相关。高三酸甘油酯血症为脂质代谢障碍的实例,其特征为三酸甘油酯的高血液水平,这些已经不再罕见,正严重威胁着全球患者的健康。目前脂质代谢障碍的现有治疗包括节食、运动、或使用他汀类(statins)及其他药物治疗,但并不能满足大多数患者的健康需求。因此,开发新型的ANGPTL3基因的表达抑制剂,是目前亟需解决的重要问题。
发明内容
发明要解决的问题
鉴于现有技术中存在的问题,例如,需要开发更多ANGPTL3抑制剂,用于治疗包括脂质代谢异常在内的ANGPTL3相关疾病。本公开旨在提供一系列用于抑制ANGPTL3基因表达的双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物及药物组合物,能够抑制ANGPTL3基因表达,在临床疾病治疗中具有重要应用前景。
用于解决问题的方案
[1].一种双链核糖核酸,所述双链核糖核酸包括正义链和反义链,所述正义链与所述反义链互补和/或基本上反向互补形成所述双链核糖核酸的双链区;
其中,所述正义链包含与靶标序列中至少15个连续核苷酸的差异不超过3个核苷酸的序列A,所述反义链包含与靶标序列中至少15个连续核苷酸的反向互补序列的差异不超过3个核苷酸的序列B;
所述靶标序列选自如SEQ ID NO:1-7任一项所示的核苷酸序列。
[2].根据[1]所述的双链核糖核酸,其中,所述靶标序列选自如SEQ ID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列,所述正义链包含与SEQ ID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列中至少15个连续核苷酸组成的序列相比差异不超过1个核苷酸的序列A,所述反义链包含与SEQID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列中至少15个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比差异不超过1个核苷酸的序列B;
可选地,所述差异的核苷酸位于所述序列A的3’末端;和/或,所述差异的核苷酸位于所述序列B的3’末端。
[3].根据[1]或[2]所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链由15-28个核苷酸组成,优选19-25个核苷酸,更优选19-23个核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
[4].根据[3]所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链的核苷酸序列为与SEQ IDNO:8-25任一项所示的核苷酸序列中的15-28个连续核苷酸组成的序列相比差异不超过1个核苷酸的序列A,优选19-25个连续核苷酸,更优选19-23个连续核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
[5].根据[1]-[4]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述反义链由15-28个核苷酸组成,优选19-25个核苷酸,更优选19-23个核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
[6].根据[5]所述的双链核糖核酸,其中,所述反义链的核苷酸序列是与SEQ IDNO:8-25任一项所示的核苷酸序列中的15-28个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比差异不超过1个核苷酸的序列B,优选19-25个连续核苷酸,更优选19-23个连续核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
[7].根据[1]-[6]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述双链区的长度为15-25个核苷酸,优选19-23个核苷酸,更优选19-21个核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
[8].根据[1]-[7]任一项所述的双链核糖核酸,其中,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,所述反义链的3’末端形成平末端;或者,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述反义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,所述正义链的3’末端形成平末端;或者,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链与所述反义链的3’末端均具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸;或者,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
[9].根据[1]-[8]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链与所述反义链选自如下组合:
1)所述正义链包含如SEQ ID NO:26所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:121所示的核苷酸序列;
2)所述正义链包含如SEQ ID NO:27所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:122所示的核苷酸序列;
3)所述正义链包含如SEQ ID NO:28所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:123所示的核苷酸序列;
4)所述正义链包含如SEQ ID NO:29所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:124所示的核苷酸序列;
5)所述正义链包含如SEQ ID NO:30所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:125所示的核苷酸序列;
6)所述正义链包含如SEQ ID NO:31所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:126所示的核苷酸序列;
7)所述正义链包含如SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:127所示的核苷酸序列;
8)所述正义链包含如SEQ ID NO:33所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:128所示的核苷酸序列;
9)所述正义链包含如SEQ ID NO:34所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:129所示的核苷酸序列;
10)所述正义链包含如SEQ ID NO:35所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQIDNO:130所示的核苷酸序列;
11)所述正义链包含如SEQ ID NO:36所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:131所示的核苷酸序列;
12)所述正义链包含如SEQ ID NO:37所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:132所示的核苷酸序列;
13)所述正义链包含如SEQ ID NO:38所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:133所示的核苷酸序列;
14)所述正义链包含如SEQ ID NO:39所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:134所示的核苷酸序列;
15)所述正义链包含如SEQ ID NO:40所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:135所示的核苷酸序列;
16)所述正义链包含如SEQ ID NO:41所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:136所示的核苷酸序列;
17)所述正义链包含如SEQ ID NO:42所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:137所示的核苷酸序列;
18)所述正义链包含如SEQ ID NO:43所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:138所示的核苷酸序列;
19)所述正义链包含如SEQ ID NO:44所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:139所示的核苷酸序列;
20)所述正义链包含如SEQ ID NO:45所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:140所示的核苷酸序列;
21)所述正义链包含如SEQ ID NO:46所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:141所示的核苷酸序列;
22)所述正义链包含如SEQ ID NO:47所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:142所示的核苷酸序列;
23)所述正义链包含如SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:143所示的核苷酸序列;
24)所述正义链包含如SEQ ID NO:49所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:144所示的核苷酸序列;
25)所述正义链包含如SEQ ID NO:50所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:145所示的核苷酸序列;
26)所述正义链包含如SEQ ID NO:51所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:146所示的核苷酸序列;
27)所述正义链包含如SEQ ID NO:52所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:147所示的核苷酸序列;
28)所述正义链包含如SEQ ID NO:53所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:148所示的核苷酸序列;
29)所述正义链包含如SEQ ID NO:54所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:149所示的核苷酸序列;
30)所述正义链包含如SEQ ID NO:55所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:150所示的核苷酸序列;
31)所述正义链包含如SEQ ID NO:56所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:151所示的核苷酸序列;
32)所述正义链包含如SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:152所示的核苷酸序列;
33)所述正义链包含如SEQ ID NO:58所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:153所示的核苷酸序列;
34)所述正义链包含如SEQ ID NO:59所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:154所示的核苷酸序列;
35)所述正义链包含如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:155所示的核苷酸序列;
36)所述正义链包含如SEQ ID NO:61所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:156所示的核苷酸序列;
37)所述正义链包含如SEQ ID NO:62所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:157所示的核苷酸序列;
38)所述正义链包含如SEQ ID NO:63所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:158所示的核苷酸序列;
39)所述正义链包含如SEQ ID NO:64所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:159所示的核苷酸序列;
40)所述正义链包含如SEQ ID NO:65所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:160所示的核苷酸序列;
41)所述正义链包含如SEQ ID NO:66所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:161所示的核苷酸序列;
42)所述正义链包含如SEQ ID NO:67所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:162所示的核苷酸序列;
43)所述正义链包含如SEQ ID NO:68所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:163所示的核苷酸序列;
44)所述正义链包含如SEQ ID NO:69所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:164所示的核苷酸序列;
45)所述正义链包含如SEQ ID NO:70所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:165所示的核苷酸序列;
46)所述正义链包含如SEQ ID NO:71所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:166所示的核苷酸序列;
47)所述正义链包含如SEQ ID NO:72所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:167所示的核苷酸序列;
48)所述正义链包含如SEQ ID NO:73所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:168所示的核苷酸序列;
49)所述正义链包含如SEQ ID NO:74所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:169所示的核苷酸序列;
50)所述正义链包含如SEQ ID NO:75所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:170所示的核苷酸序列;
51)所述正义链包含如SEQ ID NO:76所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:171所示的核苷酸序列;
52)所述正义链包含如SEQ ID NO:77所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:172所示的核苷酸序列;
53)所述正义链包含如SEQ ID NO:78所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:173所示的核苷酸序列;
54)所述正义链包含如SEQ ID NO:79所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:174所示的核苷酸序列;
55)所述正义链包含如SEQ ID NO:80所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQIDNO:175所示的核苷酸序列;
56)所述正义链包含如SEQ ID NO:81所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:176所示的核苷酸序列;
57)所述正义链包含如SEQ ID NO:82所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:177所示的核苷酸序列;
58)所述正义链包含如SEQ ID NO:83所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:178所示的核苷酸序列;
59)所述正义链包含如SEQ ID NO:84所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:179所示的核苷酸序列;
60)所述正义链包含如SEQ ID NO:85所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:180所示的核苷酸序列;
61)所述正义链包含如SEQ ID NO:86所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:181所示的核苷酸序列;
62)所述正义链包含如SEQ ID NO:87所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:182所示的核苷酸序列;
63)所述正义链包含如SEQ ID NO:88所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:183所示的核苷酸序列;
64)所述正义链包含如SEQ ID NO:89所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:184所示的核苷酸序列;
65)所述正义链包含如SEQ ID NO:90所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:185所示的核苷酸序列;
66)所述正义链包含如SEQ ID NO:91所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:186所示的核苷酸序列;
67)所述正义链包含如SEQ ID NO:92所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:187所示的核苷酸序列;
68)所述正义链包含如SEQ ID NO:93所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:188所示的核苷酸序列;
69)所述正义链包含如SEQ ID NO:94所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:189所示的核苷酸序列;
70)所述正义链包含如SEQ ID NO:95所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:190所示的核苷酸序列;
71)所述正义链包含如SEQ ID NO:96所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:191所示的核苷酸序列;
72)所述正义链包含如SEQ ID NO:97所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:192所示的核苷酸序列;
73)所述正义链包含如SEQ ID NO:98所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:193所示的核苷酸序列;
74)所述正义链包含如SEQ ID NO:99所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:194所示的核苷酸序列;
75)所述正义链包含如SEQ ID NO:100所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:195所示的核苷酸序列;
76)所述正义链包含如SEQ ID NO:101所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:196所示的核苷酸序列;
77)所述正义链包含如SEQ ID NO:102所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:197所示的核苷酸序列;
78)所述正义链包含如SEQ ID NO:103所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:198所示的核苷酸序列;
79)所述正义链包含如SEQ ID NO:104所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:199所示的核苷酸序列;
80)所述正义链包含如SEQ ID NO:105所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:200所示的核苷酸序列;
81)所述正义链包含如SEQ ID NO:106所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:201所示的核苷酸序列;
82)所述正义链包含如SEQ ID NO:107所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:202所示的核苷酸序列;
83)所述正义链包含如SEQ ID NO:108所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:203所示的核苷酸序列;
84)所述正义链包含如SEQ ID NO:109所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:204所示的核苷酸序列;
85)所述正义链包含如SEQ ID NO:110所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:205所示的核苷酸序列;
86)所述正义链包含如SEQ ID NO:111所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:206所示的核苷酸序列;
87)所述正义链包含如SEQ ID NO:112所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:207所示的核苷酸序列;
88)所述正义链包含如SEQ ID NO:113所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:208所示的核苷酸序列;
89)所述正义链包含如SEQ ID NO:114所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:209所示的核苷酸序列;
90)所述正义链包含如SEQ ID NO:115所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:210所示的核苷酸序列;
91)所述正义链包含如SEQ ID NO:116所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:211所示的核苷酸序列;
92)所述正义链包含如SEQ ID NO:117所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:212所示的核苷酸序列;
93)所述正义链包含如SEQ ID NO:118所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:213所示的核苷酸序列;
94)所述正义链包含如SEQ ID NO:119所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:214所示的核苷酸序列;
95)所述正义链包含如SEQ ID NO:120所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:215所示的核苷酸序列;
96)所述正义链包含如SEQ ID NO:258所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:268所示的核苷酸序列;
97)所述正义链包含如SEQ ID NO:259所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:269所示的核苷酸序列;
98)所述正义链包含如SEQ ID NO:260所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:270所示的核苷酸序列;
99)所述正义链包含如SEQ ID NO:261所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:271所示的核苷酸序列;
100)所述正义链包含如SEQ ID NO:262所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQIDNO:272所示的核苷酸序列;
101)所述正义链包含如SEQ ID NO:263所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:273所示的核苷酸序列;
102)所述正义链包含如SEQ ID NO:264所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:274所示的核苷酸序列;
103)所述正义链包含如SEQ ID NO:265所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:275所示的核苷酸序列;
104)所述正义链包含如SEQ ID NO:266所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:276所示的核苷酸序列;
105)所述正义链包含如SEQ ID NO:267所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:277所示的核苷酸序列;
137)所述正义链包含如SEQ ID NO:298所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:321所示的核苷酸序列;
138)所述正义链包含如SEQ ID NO:299所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:322所示的核苷酸序列;
139)所述正义链包含如SEQ ID NO:300所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:323所示的核苷酸序列;
140)所述正义链包含如SEQ ID NO:301所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:324所示的核苷酸序列;
141)所述正义链包含如SEQ ID NO:302所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:325所示的核苷酸序列;
142)所述正义链包含如SEQ ID NO:303所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:326所示的核苷酸序列;
143)所述正义链包含如SEQ ID NO:304所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:327所示的核苷酸序列;
144)所述正义链包含如SEQ ID NO:305所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:328所示的核苷酸序列;
145)所述正义链包含如SEQ ID NO:306所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:329所示的核苷酸序列;
146)所述正义链包含如SEQ ID NO:307所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:330所示的核苷酸序列;
147)所述正义链包含如SEQ ID NO:308所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:331所示的核苷酸序列;
148)所述正义链包含如SEQ ID NO:309所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:332所示的核苷酸序列;
149)所述正义链包含如SEQ ID NO:310所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:333所示的核苷酸序列;
150)所述正义链包含如SEQ ID NO:311所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:334所示的核苷酸序列;
151)所述正义链包含如SEQ ID NO:312所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:335所示的核苷酸序列;
152)所述正义链包含如SEQ ID NO:313所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:336所示的核苷酸序列;
153)所述正义链包含如SEQ ID NO:314所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:337所示的核苷酸序列;
154)所述正义链包含如SEQ ID NO:315所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:338所示的核苷酸序列;
155)所述正义链包含如SEQ ID NO:316所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:339所示的核苷酸序列;
156)所述正义链包含如SEQ ID NO:317所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:340所示的核苷酸序列;
157)所述正义链包含如SEQ ID NO:318所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:341所示的核苷酸序列;
158)所述正义链包含如SEQ ID NO:319所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:342所示的核苷酸序列;
159)所述正义链包含如SEQ ID NO:320所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:343所示的核苷酸序列;
201)所述正义链包含如SEQ ID NO:385所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:387所示的核苷酸序列;
202)所述正义链包含如SEQ ID NO:386所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:388所示的核苷酸序列。
[10].根据[1]-[9]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链中每个核苷酸彼此独立地为修饰的核苷酸或未修饰的核苷酸,和/或,所述反义链中每个核苷酸彼此独立地为修饰的核苷酸或未修饰的核苷酸。
[11].根据[1]-[10]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链中任意相连的两个核苷酸由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接,和/或,所述反义链中任意相连的两个核苷酸由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接。
[12].根据[1]-[11]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团,和/或,所述反义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。
[13].根据[1]-[12]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述双链核糖核酸为siRNA。
[14].根据[1]-[13]任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述双链核糖核酸为用于抑制ANGPTL3基因表达的siRNA。
[15].一种双链核糖核酸修饰物,其为如[1]-[14]任一项所述的双链核糖核酸的修饰物,所述双链核糖核酸修饰物包含如下至少一种的化学修饰:
(1)正义链中至少一个核苷酸的修饰,
(2)正义链中至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰,
(3)反义链中至少一个核苷酸的修饰,
(4)反义链中至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰;
任选地,所述双链核糖核酸的正义链中序列A的3’末端连接由1-2个核苷酸组成的序列D,优选由1-2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸组成的序列D;和/或,所述双链核糖核酸的反义链中序列B的3’末端连接由1-2个核苷酸组成的序列E,优选由1-2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸组成的序列E;和/或,所述双链核糖核酸的正义链中序列A的3’末端排除1-2个核苷酸后形成序列A’;
可选地,所述双链核糖核酸修饰物的正义链和反义链选自如下的序列组合:
所述正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A连接序列D所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A连接序列D所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。
[16].根据[15]所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述核苷酸的修饰选自2’-氟代修饰,2’-烷氧基修饰,2’-取代的烷氧基修饰,2’-烷基修饰,2’-取代的烷基修饰,2’-脱氧修饰,核苷酸衍生物修饰或其中任意两种以上的组合。
[17].根据[15]或[16]所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述核苷酸的修饰选自2’-F修饰、2’-O-CH3修饰、2’-O-CH2-CH2-O-CH3修饰、2’-O-CH2-CH=CH2修饰、2’-CH2-CH2-CH=CH2修饰、2’-脱氧修饰,核苷酸衍生物修饰或其中任意两种以上的组合。
[18].根据[16]或[17]所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述核苷酸衍生物修饰中的核苷酸衍生物选自异核苷酸、LNA、ENA、cET、UNA或GNA。
[19].根据[15]-[18]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述正义链中第7位、第9位、第10位和第11位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述正义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
[20].根据[15]-[19]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述正义链包含位于如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:
所述正义链5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述正义链5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间;
所述正义链3’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述正义链3’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间;
或者,
所述正义链包含位于如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:
所述正义链5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述正义链5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
[21].根据[15]-[20]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中任意奇数位置处的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,所述反义链中任意偶数位置处的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第6位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第6位、第8位、第9位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中第6位的核糖核苷酸为核苷酸衍生物GNA修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第6位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中第7位的核糖核苷酸为核苷酸衍生物GNA修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
[22].根据[15]-[21]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链的5’末端的核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。
[23].根据[15]-[22]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述反义链包含位于如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:
所述反义链5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述反义链5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间;
所述反义链3’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述反义链3’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
[24].根据[15]-[23]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物的正义链具有如(a1)-(a5)任一项所示的结构:
(a1)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(a2)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(a3)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(a4)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-3’,
(a5)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,
大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,
小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,
小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,
-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接。
[25].根据[15]-[24]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物的反义链具有如(b1)-(b15)任一项所示的结构:
(b1)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b2)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-N20f-(s)-mN21-3’,
(b3)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-N20f-mN21-(s)-N22f-(s)-mN23-3’,
(b4)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b5)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b6)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b7)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b8)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b9)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b10)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b11)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b12)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b13)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b14)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b15)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,
大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,
小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,
小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,
P1表示该字母右侧相邻的一个核苷酸为5’-磷酸核苷酸,
-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接,
[GNA]表示其右侧相邻的一个核糖核苷酸为存在GNA修饰的核糖核苷酸。
[26].根据[15]-[25]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物为siRNA修饰物。
[27].根据[15]-[26]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物为用于抑制ANGPTL3基因表达的siRNA修饰物。
[28].根据[15]-[27]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述正义链与所述反义链选自如下组合:
106)所述正义链包含如SEQ ID NO:216所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:237所示的核苷酸序列;
107)所述正义链包含如SEQ ID NO:217所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:238所示的核苷酸序列;
108)所述正义链包含如SEQ ID NO:218所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:239所示的核苷酸序列;
109)所述正义链包含如SEQ ID NO:219所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:240所示的核苷酸序列;
110)所述正义链包含如SEQ ID NO:220所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:241所示的核苷酸序列;
111)所述正义链包含如SEQ ID NO:221所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:242所示的核苷酸序列;
112)所述正义链包含如SEQ ID NO:222所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:243所示的核苷酸序列;
113)所述正义链包含如SEQ ID NO:223所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:244所示的核苷酸序列;
114)所述正义链包含如SEQ ID NO:224所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:245所示的核苷酸序列;
115)所述正义链包含如SEQ ID NO:225所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:246所示的核苷酸序列;
116)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:247所示的核苷酸序列;
117)所述正义链包含如SEQ ID NO:227所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:248所示的核苷酸序列;
118)所述正义链包含如SEQ ID NO:228所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:249所示的核苷酸序列;
119)所述正义链包含如SEQ ID NO:229所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:250所示的核苷酸序列;
120)所述正义链包含如SEQ ID NO:230所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:251所示的核苷酸序列;
121)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:252所示的核苷酸序列;
122)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:253所示的核苷酸序列;
123)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:254所示的核苷酸序列;
124)所述正义链包含如SEQ ID NO:234所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:241所示的核苷酸序列;
125)所述正义链包含如SEQ ID NO:235所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:247所示的核苷酸序列;
126)所述正义链包含如SEQ ID NO:236所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:253所示的核苷酸序列;
127)所述正义链包含如SEQ ID NO:278所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:288所示的核苷酸序列;
128)所述正义链包含如SEQ ID NO:279所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:289所示的核苷酸序列;
129)所述正义链包含如SEQ ID NO:280所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:290所示的核苷酸序列;
130)所述正义链包含如SEQ ID NO:281所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:291所示的核苷酸序列;
131)所述正义链包含如SEQ ID NO:282所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:292所示的核苷酸序列;
132)所述正义链包含如SEQ ID NO:283所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:293所示的核苷酸序列;
133)所述正义链包含如SEQ ID NO:284所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:294所示的核苷酸序列;
134)所述正义链包含如SEQ ID NO:285所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:295所示的核苷酸序列;
135)所述正义链包含如SEQ ID NO:286所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:296所示的核苷酸序列;
136)所述正义链包含如SEQ ID NO:287所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:297所示的核苷酸序列;
160)所述正义链包含如SEQ ID NO:344所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:354所示的核苷酸序列;
161)所述正义链包含如SEQ ID NO:345所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:355所示的核苷酸序列;
162)所述正义链包含如SEQ ID NO:346所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQIDNO:356所示的核苷酸序列;
163)所述正义链包含如SEQ ID NO:347所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:357所示的核苷酸序列;
164)所述正义链包含如SEQ ID NO:348所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:358所示的核苷酸序列;
165)所述正义链包含如SEQ ID NO:349所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:359所示的核苷酸序列;
166)所述正义链包含如SEQ ID NO:350所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:360所示的核苷酸序列;
167)所述正义链包含如SEQ ID NO:351所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:361所示的核苷酸序列;
168)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:362所示的核苷酸序列;
169)所述正义链包含如SEQ ID NO:352所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:362所示的核苷酸序列;
170)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:363所示的核苷酸序列;
171)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:364所示的核苷酸序列;
172)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:365所示的核苷酸序列;
173)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:366所示的核苷酸序列;
174)所述正义链包含如SEQ ID NO:236所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:366所示的核苷酸序列;
175)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:367所示的核苷酸序列;
176)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:368所示的核苷酸序列;
177)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:369所示的核苷酸序列;
178)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:370所示的核苷酸序列;
179)所述正义链包含如SEQ ID NO:353所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:370所示的核苷酸序列;
180)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:371所示的核苷酸序列;
181)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:372所示的核苷酸序列;
182)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:373所示的核苷酸序列;
183)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:381所示的核苷酸序列;
184)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:382所示的核苷酸序列;
185)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:383所示的核苷酸序列;
186)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:384所示的核苷酸序列;
187)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:394所示的核苷酸序列;
188)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:395所示的核苷酸序列;
189)所述正义链包含如SEQ ID NO:391所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:395所示的核苷酸序列;
190)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:396所示的核苷酸序列;
191)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:397所示的核苷酸序列;
192)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:398所示的核苷酸序列;
193)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:399所示的核苷酸序列;
194)所述正义链包含如SEQ ID NO:393所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:399所示的核苷酸序列;
195)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:400所示的核苷酸序列;
196)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:401所示的核苷酸序列;
197)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:377所示的核苷酸序列;
198)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:378所示的核苷酸序列;
199)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:402所示的核苷酸序列;
200)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQID NO:403所示的核苷酸序列。
[29].一种双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物包括如[1]-[14]任一项所述的双链核糖核酸,或如[15]-[28]任一项所述的双链核糖核酸修饰物;以及,缀合连接于所述双链核糖核酸或所述双链核糖核酸修饰物的缀合基团。
[30].根据[29]所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述缀合基团具有如下所示结构:
[31].根据[29]或[30]所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述缀合基团连接于正义链的3’末端。
[32].根据[31]所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述缀合基团通过磷酸二酯键与正义链的3’末端缀合连接;
优选地,所述双链核糖核酸缀合物的正义链与反义链互补形成所述双链核糖核酸缀合物的双链区,且所述正义链的3’末端形成平末端,所述反义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸;
或者,
所述双链核糖核酸缀合物的正义链与反义链互补形成所述双链核糖核酸缀合物的双链区,且所述正义链的3’末端形成平末端,所述反义链的3’末端形成平末端。
[33].根据[29]-[32]任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物具有如下所示结构:
其中,双螺旋结构为双链核糖核酸或双链核糖核酸修饰物。
[34].根据[29]-[33]任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物为siRNA缀合物。
[35].根据[29]-[34]任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物是用于抑制ANGPTL3基因表达的siRNA缀合物。
[36].根据[29]-[35]任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物由表1所示的任意一种siRNA与缀合基团连接形成,或者,所述双链核糖核酸缀合物由表1-1所示的任意一种siRNA与缀合基团连接形成,或者,所述双链核糖核酸缀合物由表2所示的任意一种siRNA修饰物与缀合基团连接形成;
优选地,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ IDNO:255所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:241所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:247所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:253所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:377所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:378所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:379所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:380所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:366所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:367所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:368所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:369所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:362所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:363所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:364所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:365所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:370所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:371所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:372所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:373所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:381所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:382所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:383所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:384所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:252所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:254所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:394所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:395所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:396所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:397所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:398所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:399所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:400所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:401所示的核苷酸序列。
[37].一种药物组合物,其中,所述药物组合物包括如下至少一项:如[1]-[14]任一项所述的双链核糖核酸,如[15]-[28]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,如[29]-[36]任一项所述的双链核糖核酸缀合物。
[38].根据[37]所述的药物组合物,其中,所述药物组合物还包括一种或多种药学上可接收的载体。
[39].根据[1]-[14]任一项所述的双链核糖核酸,根据[15]-[28]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,根据[29]-[36]任一项所述的双链核糖核酸缀合物,或根据[37]-[38]任一项所述的药物组合物在如下至少一项中的用途:
(1)抑制ANGPTL3基因表达,或制备用于抑制ANGPTL3基因表达的药物;
(2)用于预防或治疗与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病,或制备用于预防或治疗与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病的药物;
(3)用于治疗患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病的受试者,或制备用于治疗患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病的受试者的药物。
[40].根据[39]所述的用途,其中,所述与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病选自与脂代谢相关的疾病;
可选地,所述与脂代谢相关的疾病选自如下疾病组成的组:
乳糜微粒血症综合征、2型糖尿病、家族性部分脂肪营养不良、高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、高甘油三酯血症、非酒精性脂肪肝、动脉粥样硬化、高甘油三酯血症、膝盖损伤及骨关节炎、血脂异常。
[41].一种用于抑制细胞内ANGPTL3基因表达的方法,其中,所述方法包括将所述细胞与根据[1]-[14]任一项所述的双链核糖核酸,根据[15]-[28]任一项所述的双链核糖核酸修饰物,根据[29]-[36]任一项所述的双链核糖核酸缀合物,或根据[37]-[38]任一项所述的药物组合物接触。
[42].根据[41]所述的方法,其中,所述细胞为体内细胞或体外细胞。
[43].根据[41]或[42]所述的方法,其中,所述细胞在受试者体内。
[44].根据[43]所述的方法,其中,所述受试者为哺乳动物,优选为人。
[45].根据[43]或[44]所述的方法,其中,所述受试者具有如下至少一种特性:
体内ANGPTL3基因异常表达,更具体地为ANGPTL3基因异常高表达;
患有与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病;
患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病。
发明的效果
在一些实施方案中,本公开提供的双链核糖核酸,能够在细胞内结合形成RNA诱导沉默复合物(RISC),切割ANGPTL3基因转录的mRNA,高效、特异地抑制ANGPTL3基因的表达,用于治疗包括脂质代谢异常在内的ANGPTL3相关疾病。
进一步的,本公开中双链核糖核酸为siRNA,siRNA靶向结合并降解ANGPTL3基因的转录产物mRNA,发挥RNA干扰的作用,抑制ANGPTL3基因的蛋白表达,是一种抑制率高且特异性好的ANGPTL3抑制剂。
在一些实施方案中,本公开对双链核糖核酸进行修饰,得到双链核糖核酸修饰物,双链核糖核酸修饰物的稳定性高,适合体内疾病治疗中的应用。
进一步的,双链核糖核酸修饰物为siRNA修饰物,具有高的稳定性和较好的抑制活性。
在一些实施方案中,本公开在双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物上连接缀合基团得到双链核糖核酸或双链核糖核酸修饰物的缀合物,能够用于向组织、细胞中高效靶向递送,降低双链核糖核酸或双链核糖核酸修饰物对非靶向的正常组织、细胞的影响,提高其在临床疾病治疗中的安全性。
进一步的,双链核糖核酸缀合物为siRNA缀合物,在保持siRNA抑制活性、稳定性的同时,兼具器官或组织靶向性,可降低对其他组织或器官的影响以及减少siRNA分子使用量,可达到减轻毒性和降低成本的目的。
进一步的,本公开中的缀合基团为式I所示结构的基团(GalNAc),GalNAc可用于向肝脏细胞、组织内的靶向递送,用于高效抑制肝脏内ANGPTL3基因的表达。
具体实施方式
定义
除非有相反陈述,否则在本发明中所使用的术语具有下述含义。
在本发明的权利要求和/或说明书中,词语“一(a)”或“一(an)”或“一(the)”可以指“一个”,但也可以指“一个或多个”、“至少一个”以及“一个或多于一个”。
如在权利要求和说明书中所使用的,词语“包含”、“具有”、“包括”或“含有”是指包括在内的或开放式的,并不排除额外的、未引述的元件或方法步骤。
在整个申请文件中,术语“约”表示:一个值包括测定该值所使用的装置或方法的误差的标准偏差。用以界定本发明的数值范围与参数皆是约略的数值,此处已尽可能精确地呈现具体实施例中的相关数值。然而,任何数值本质上不可避免地含有因前述测试方法或装置所致的标准偏差。因此,除非另有明确的说明,应当理解本公开所用的所有范围、数量、数值与百分比均经过“约”的修饰。在此处,“约”通常是指实际数值在一特定数值或范围的正负10%、5%、1%或0.5%之内。
本公开上下文中使用的术语“ANGPTL3”、“ANL3”、“angiopoietin like 3”,是指熟知的基因和多肽,也在本领域已知为:ANG-5、FHBL2、ANGPT5。ANGPTL3基因、ANGPTL3 mRNA序列是例如使用以下容易获得的:基因库(GenBank)、数据库(UniProt)、人类孟德尔遗传在线(OMIM)等。
术语“ANGPTL3基因”,可以是野生型ANGPTL3基因,或存在序列变异的ANGPTL3基因突变体。在ANGPTL3基因中的许多序列变异已经被鉴别并且可以发现在例如NCBIdbSNP和UniProt(参见,例如,ncbi.nlm.nih.gov/snp)中。
术语“多肽”、“蛋白”可互换地指通过共价键(例如肽键)相互连接的一串至少两个氨基酸残基,可以是重组多肽、天然多肽或合成多肽。多肽可以是线形或分支的,它可以包含修饰的氨基酸,并且它可以由非氨基酸隔断。该术语也包括已经被修饰(例如,二硫键形成、糖基化、脂质化、乙酰化、磷酸化或任何其他操作,如以标记组分缀合)的氨基酸聚合物。
本公开上下文中使用的术语“靶标序列”是指在靶基因转录期间形成的mRNA分子的核苷酸序列的连续部分,包括作为对初级转录产物进行RNA加工的产物的mRNA。
在一些实施方案中,靶标序列是不少于16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、50、80、100、150、200、300、400、500、600或700个连续连接核苷组成的核苷酸序列。示例性的,靶标序列是19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、38、53、54、65、125、69、97、80、128、164或190个连续连接核苷组成的核苷酸序列。在一些可选的实施方案中,靶标序列中可以包含另一段较短的靶标序列。在一些实施方案中,靶标序列中可以包含一个或多个较短的靶标序列。应当认为,被包含于同一段靶标序列中的两个以上的较短靶标序列之间具有相同的特征。
在一些实施方案中,靶基因为ANGPTL3基因。在一些实施方案中,序列的靶部分将会是至少足够地长,以在ANGPTL3基因的转录期间形成的mRNA分子的核苷酸序列部分处或其附近充当iRNA指导的切割的底物。
在本技术领域中,“G”、“C”、“A”、“T”和“U”通常分别代表鸟嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶的碱基,但本领域中也通常知晓,“G”、“C”、“A”、“T”和“U”每个通常也代表分别含有鸟嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶作为碱基的核苷酸,这在表示脱氧核糖核酸序列和/或核糖核酸序列中是常见的方式,因此在本公开的上下文中,“G”、“C”、“A”、“T”、“U”表示的含义包括上述各种可能的情形。然而,应理解术语“核糖核苷酸”或“核苷酸”还可以指一种经修饰的核苷酸(如以下进一步详述)或一种替代性的置换部分。本领域人员可以意识到,鸟嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤以及尿嘧啶可以被其他部分置换而基本上不改变一种寡核苷酸(包括一种具有这种置换部分的核苷酸)的碱基配对特性。例如非限制性地,包括肌苷作为其碱基的核苷酸可以与包括腺嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶的核苷酸进行碱基配对。因此,含有尿嘧啶、鸟嘌呤或腺嘌呤的核苷酸可以在本发明表征的dsRNA的核苷酸序列中由含有例如肌苷的核苷酸替换。在另一个实例中,寡核苷酸中任何地方的腺嘌呤和胞嘧啶可以分别地替换为鸟嘌呤和尿嘧啶,以形成与靶mRNA的G-U摇摆碱基配对。含有这类替换部分的序列适用于本发明表征的组合物和方法。
本公开上下文使用的术语“iRNA”、“RNAi试剂”、“iRNA试剂”、“RNA干扰剂”在此可互换使用,是指在此所定义的术语包含siRNA,并且介导通过RNA诱导沉默复合物(RISC)途径的RNA转录物靶向切割。iRNA通过已知为RNA干扰(RNAi)的过程指导mRNA的序列特异性降解。iRNA调节,例如抑制,靶基因在细胞(如受试者(如哺乳动物受试者)的细胞)中的表达。
本公开上下文使用的术语“双链核糖核酸”、“双链RNA(dsRNA)分子”、“dsRNA”可以互换地使用。术语“dsRNA”,是指核糖核酸分子的复合体,其具有双链结构,包含两条反向平行的和基本上互补的核酸链,被称为相对于靶基因,例如ANGPTL3基因,具有“正义”和“反义”定向。在一些实施例中,双链核糖核酸(dsRNA)通过转录后基因沉默机制(在此称为RNA干扰或RNAi)触发靶RNA例如mRNA的降解。
通常,dsRNA分子的每条链的大部分的核苷酸是核糖核苷酸,但是如在此详述的,两条链的每一者或两者还可以包括一个或多个非核糖核苷酸,例如,脱氧核糖核苷酸和/或修饰的核苷酸。另外,如本公开中所用,“双链核糖核酸”可以包括具有化学修饰的核糖核苷酸、磷酸骨架等等。这些修饰可以包括在此披露的或在本领域中已知的所有类型的修饰。
本公开上下文使用的术语“异核苷酸”是指核苷酸中碱基在核糖环上的位置发生改变而形成的化合物,例如,碱基不与核糖环的1’-位相连,而是与核糖环的2’-位或3’-位相连而形成的化合物。
在一些实施方案中,本公开的双链核糖核酸是siRNA,其与靶基因转录的mRNA序列(例如C基因转录的mRNA序列)相互作用以指导靶RNA的切割。不希望受理论约束,引入细胞中的长双链RNA被称作Dicer的III型核酸内切酶分解成siRNA(夏普(Sharp)等人,《基因与发育》(Genes Dev.)2001,15:485)。Dicer(核糖核酸酶III样酶)将dsRNA加工成至具有特征性双碱基3'突出端的19-23碱基对短干扰性RNA(Bernstein等人,(2001)自然(Nature)409:363)。这些siRNA随后掺入RNA诱导性沉默复合物(RISC)中,在其中一种或多种解旋酶解开siRNA双链体,这使得互补性反义链指导靶识别成为可能(Nykanen等人,(2001)细胞(Cell)107:309)。一旦与适宜的靶mRNA结合,RISC内部的一种或多种核酸内切酶切割靶以诱导沉默(巴希尔(Elbashir)等人,(2001)《基因与发育》(Genes Dev.)15:188)。
本公开上下文使用的术语“突出的核苷酸”是指当双链核糖核酸的一条链的一个3’端延伸超出另一条链的5’端时从该dsRNA的双链体结构突出的一个或多个不成对的核苷酸,或反之亦然。“平端”或“平末端”意指在该双链核糖核酸的那端处不存在不成对的核苷酸,即无核苷酸突出端。一种“平末端的”双链核糖核酸是一种在其整个长度上都是双链、即在该分子的任一端处都无核苷酸突出端的dsRNA。
术语“反义链”是指双链核糖核酸中与靶标序列(例如,来源于人类ANGPTL3 mRNA)基本上互补的一个区域的链。在该互补性区域不与该靶标序列完全互补的情况下,错配在末端区域是最为可容忍的,并且如果出现错配,它们通常在末端的一个或多个区域,例如5’和/或3’末端的5、4、3、2或1个核苷酸之内。
术语“正义链”指的双链核糖核酸中含有与反义链区域基本上互补的区域的核酸链。
术语“互补”或“反向互补”一词可互相替代使用,并具有本领域技术人员周知的含义,即,在双链核酸分子中,一条链的碱基与另一条链上的碱基以互补的方式相配对。在DNA中,嘌呤碱基腺嘌呤(A)始终与嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)(或者在RNA中为尿嘧啶(U))相配对;嘌呤碱基鸟嘌呤(C)始终与嘧啶碱基胞嘧啶(G)相配对。每个碱基对都包括一个嘌呤和一个嘧啶。当一条链上的腺嘌呤始终与另一条链上的胸腺嘧啶(或尿嘧啶)配对,以及鸟嘌呤始终与胞嘧啶配对时,两条链被认为是彼此相互补的,以及从其互补链的序列中可以推断出该链的序列。与此相应地,“错配”在本领域中意指在双链核酸中,对应位置上的碱基并未以互补的形式配对存在。
术语“基本上反向互补”是指所涉及的两段核苷酸序列之间存在不多于3个的碱基错配,即所涉及的两段核苷酸序列之间存在1个、2个或3个的碱基错配;“完全互补”是指两段核苷酸序列之间不存在碱基错配。
术语“互补”、“完全互补”和“基本上互补”可相对于在dsRNA的正义链与反义链之间,或dsRNA的反义链与靶标序列之间的碱基配对使用,如将从其使用的上下文理解。
术语“抑制”,可以与“减少”、“沉默”、“下调”、“压制”和其他类似术语交替使用,并且包括任何水平的抑制。
术语“抑制ANGPTL3基因的表达”包括抑制任何ANGPTL3基因(如例如小鼠ANGPTL3基因、大鼠ANGPTL3基因、猴ANGPTL3基因、或人类ANGPTL3基因)以及ANGPTL3基因的变体(例如天然存在的变体)或突变体的表达。因此,该ANGPTL3基因可以是野生型ANGPTL3基因、突变ANGPTL3基因、或在遗传操作的细胞、细胞群组或生物体的情形下的转基因ANGPTL3基因。
“抑制ANGPTL3基因表达”包括任何水平的ANGPTL3基因的抑制,例如至少部分抑制ANGPTL3基因的表达,如抑制至少约5%、至少约10%、至少约15%、至少约20%、至少约25%、至少约30%、至少约35%、至少约40%、至少约45%、至少约50%、至少约55%、至少约60%、至少约65%、至少约70%、至少约75%、至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、或至少约99%。
术语“各自独立地”是指结构中存在的取值范围相同或相近的至少两个基团(或环系)可以在特定情形下具有相同或不同的含义。例如,取代基X和取代基Y各自独立地为氢、羟基、烷基或芳基,则当取代基X为氢时,取代基Y既可以为氢,也可以为羟基、烷基或芳基;同理,当取代基Y为氢时,取代基X既可以为氢,也可以为羟基、烷基或芳基。
术语“烷基”包括直链、支链或环状的饱和烷基。例如,烷基包括但不限于甲基、乙基、丙基、环丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、环丁基、正戊基、环已基等类似基团。示例性的,“C1-6烷基”中的“C1-6”是指包含有1、2、3、4、5或6个碳原子的直链、支链或环状形式排列的基团。
术语“烷氧基”在本文中是指烷基基团通过氧原子与分子其余部分相连(-O-烷基),其中所述烷基如本文中所定义。烷氧基的非限制性实例包括甲氧基、乙氧基、三氟甲氧基、二氟甲氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、叔丁氧基、正戊氧基等。
术语“治疗”是指:在罹患疾病之后,使受试者接触(例如给药)双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物、药物组合物,从而与不接触时相比使该疾病的症状减轻,并不意味着必需完全抑制疾病的症状。罹患疾病是指:身体出现了疾病症状。
术语“预防”是指:在罹患疾病之前,通过使受试者接触(例如给药)本公开的双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物、药物组合物,从而与不接触时相比减轻罹患疾病后的症状,并不意味着必需完全抑制患病。
术语“有效量”指本发明的双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物或药物组合物的这样的量或剂量,其以单一或多次剂量施用患者后,在需要治疗或预防的患者中产生预期效果。有效量可以由作为本领域技术人员的主治医师通过考虑以下多种因素来容易地确定:诸如哺乳动物的物种;它的大小、年龄和一般健康;涉及的具体疾病;疾病的程度或严重性;个体患者的应答;施用的具体抗体;施用模式;施用制剂的生物利用率特征;选择的给药方案;和任何伴随疗法的使用。
术语“与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病”是与代谢紊乱相关联的疾病或障碍。术语“与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病”包括将从减少ANGPTL3(即“ANGPTL3-相关性疾病”)表达受益的疾病、障碍或病症。此类疾病典型地与血浆甘油三酯(triglyceride,TG)、高密度脂蛋白(high-density lipoprotein,HDL)、低密度脂蛋白(low-densitylipoprotein,LDL)以及总胆固醇水平(total cholesterol,TC)变化密切相关。ANGPTL3基因异常表达相关的疾病的非限制性实例包括乳糜微粒血症综合征、2型糖尿病、家族性部分脂肪营养不良、高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、高甘油三酯血症、非酒精性脂肪肝、动脉粥样硬化、高甘油三酯血症、膝盖损伤及骨关节炎、血脂异常及相关代谢疾病、家族性低β脂蛋白血症、高脂血症、肥胖症、原发性肾病综合征、冠心病、恶性肿瘤等(参见,例如,Minicocci等,Mutations in the ANGPTL3 gene and familial combinedhypolipidemia:a clinical and biochemical characterization.J Clin EndocrinolMetab,2012,97(7):E1266-1275;Kaplan等,Regulation of the angiopoietin-likeprotein 3gene by LXR.JLipid Res,2003,44(1):136-143;成海鹏等,脂蛋白脂酶降解与代谢异常性疾病,中国动脉硬化杂志,2017,25(05):513-518;饶佳等,儿童原发性肾病综合征中血管生成素样蛋白3的表达,中华肾脏病杂志,2006,22(05):286-290;Stitziel等,ANGPTL3 deficiency and protection against coronary artery disease.J Am CollCardiol,2017,69(16):2054-2063;Wang PF等,Clinical significance ofangiopoietin-like protein 3expression in patients withglioblastoma.Neoplasma,2016,63(1):93-98)。
术语“药学上可接受的辅料”或“药学上可接受的载体”是指在药物生产领域中广泛采用的辅助物料。使用辅料的主要目的在于提供一种使用安全、性质稳定和/或具有特定功能性的药物组合物,还在于提供一种方法,以便在为受试者施用药物之后,活性成分能够以所期望的速率溶出,或者促进活性成分在接受给药的受试者体内得到有效吸收。药学上可接受的辅料可以是具有惰性的填充剂,也可以是为药用组合物提供某种功能(例如稳定组合物的整体pH值或防止组合物中活性成分的降解)的功效成分。药学上可接受的辅料的非限制性实例包括但不限于粘合剂、助悬剂、乳化剂、稀释剂(或填充剂)、成粒剂、胶粘剂、崩解剂、润滑剂、抗粘着剂、助流剂、润湿剂、胶凝剂、吸收延迟剂、溶解抑制剂、增强剂、吸附剂、缓冲剂、螯合剂、防腐剂、着色剂、矫味剂、甜味剂等。
本公开中的药物组合物可以使用本领域技术人员已知的任何方法来制备。例如,常规混合、溶解、造粒、乳化、磨细、包封、包埋和/或冻干工艺。
在本公开中,施用途经能够以任何适用的方式进行变化或调整,以满足药物的性质、患者和医务人员的便利以及其它相关因素的需求。
本公开上下文中使用的术语“个体”、“患者”或“受试者”包括哺乳动物。哺乳动物包括但不限于,家养动物(例如,牛,羊,猫,狗和马),灵长类动物(例如,人和非人灵长类动物如猴),兔,以及啮齿类动物(例如,小鼠和大鼠)。
除非另外定义或由背景清楚指示,否则在本公开中的全部技术与科学术语具有如本公开所属领域的普通技术人员通常理解的相同含义。
双链核糖核酸
本公开的第一方面提供一种双链核糖核酸(dsRNA),用于抑制ANGPTL3基因的表达。双链核糖核酸的一条链为反义链,反义链与靶基因(也即,ANGPTL3基因)在表达过程中形成的mRNA序列互补配对,用于指导靶mRNA(也即,ANGPTL3基因的转录产物)的切割。双链核糖核酸中另一条正义链包括与反义链部分互补和完全互补形成双链核糖核酸的双链区。
在一些实施方案中,双链核糖核酸作为核酸内切酶(Dicer)的底物,被切割为小片段的dsRNA,也即siRNA。在一些实施方案中,双链核糖核酸为siRNA。siRNA通过装配形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-induced silencing complex,RISC)RISC复合体,切割靶mRNA,抑制ANGPTL3基因的表达。
根据来源于人ANGPTL3 mRNA(NM_014495.4)中的靶标序列,设计与靶mRNA结合的siRNA。在一些实施方案中,靶标序列选自如SEQ ID NO:1-7任一项所示的核苷酸序列。在一些更为具体的实施方案中,靶标序列选自如SEQ ID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:8~10所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:11~12所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:13~14所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:15~16所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:17~19所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:20~22所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列包含SEQ ID NO:23~25所示的核苷酸序列。
在一些实施方案中,反义链包含与靶标序列中至少15个连续核苷酸的反向互补序列的差异不超过3个核苷酸的序列B。具体地,沿5’末端向3’末端的方向,在靶标序列中选择起始核苷酸,以包含起始核苷酸在内的向3’方向延伸的至少15个核苷酸作为siRNA的结合区域。反义链包含结合区域对应的核苷酸序列的反向互补序列。需要说明的是,起始核苷酸可以是靶标序列任意位置处的核苷酸,只要基于该起始核苷酸向靶标序列3’方向延伸,可以得到至少15个连续核苷酸(包含起始位置处的核苷酸)即可。
在本公开中,反义链的核苷酸序列与靶标序列可以是完全互补或基本上互补。当反义链的核苷酸序列与靶标序列基本上互补时,反义链的核苷酸序列中存在与靶标序列存在不超过3个的错配碱基。例如,错配碱基为1个、2个或3个。当反义链的核苷酸序列与靶标序列完全互补时,反义链的核苷酸序列与靶标序列不存在错配碱基。
进一步地,反义链由至少15个核苷酸组成。在一些实施方案中,反义链由15-28个核苷酸组成。例如,反义链的长度为15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28个核苷酸。
作为优选,反义链由19-25个核苷酸组成,更优选19-23个核苷酸,最优选19、21或23个核苷酸。
在一些可选的实施方案中,反义链包含的序列B与靶标序列上至少15个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列完全相同。
在一些具体的实施方案中,反义链包含的序列B与靶标序列上15-28个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列完全相同。优选靶标序列上19-25个连续核苷酸,更优选靶标序列上19-23个连续核苷酸,最优选19、21或23个连续核苷酸。
在一些可选的实施方案中,反义链包含的序列B与靶标序列上至少15个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列存在1个核苷酸的差异。
在一些具体的实施方案中,反义链包含的序列B与靶标序列上15-28个核苷酸组成的序列的反向互补序列存在1个核苷酸的差异。优选靶标序列上19-25个连续核苷酸,更优选靶标序列上19-23个连续核苷酸,最优选19、21或23个连续核苷酸。
在一些具体的实施方案中,差异的核苷酸位于序列B的3’末端。
在一些实施方案中,所述正义链包含与靶标序列中至少15个连续核苷酸的差异不超过3个核苷酸的序列A。正义链中包括与反义链互补的区域,正义链的核苷酸序列与反义链在靶标序列上结合区域的序列完全相同或基本完全相同。因此,正义链的核苷酸序列为靶标序列中结合反义链的至少15个连续核苷酸;或者,正义链的核苷酸序列与靶标序列中结合反义链的至少15个连续核苷酸相比,存在1个、2个或3个碱基不同的差异核苷酸。
进一步地,正义链由至少15个核苷酸组成。在一些实施方案中,正义链由15-28个核苷酸组成。例如,正义链的长度为15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28个核苷酸。
作为优选,正义链由19-25个核苷酸组成,更优选19-23个核苷酸,最优选19、21或23个核苷酸。
在一些可选的实施方案中,正义链包含的序列A与靶标序列上至少15个连续核苷酸组成的序列完全相同。
在一些具体的实施方案中,正义链包含的序列A与靶标序列上15-28个连续核苷酸组成的序列完全相同。优选靶标序列上19-25个连续核苷酸,更优选靶标序列上19-23个连续核苷酸,最优选靶标序列上19、21或23个连续核苷酸。
在一些可选的实施方案中,正义链包含的序列A与靶标序列上至少15个连续核苷酸组成的序列存在1个核苷酸的差异。
在一些具体的实施方案中,正义链包含的序列A与靶标序列上15-28个连续核苷酸组成的序列存在1个核苷酸的差异。优选靶标序列上19-25个连续核苷酸,更优选靶标序列上19-23个连续核苷酸,最优选靶标序列上19、21或23个连续核苷酸。
在一些具体的实施方案中,差异的核苷酸位于序列A的3’末端。
在本公开中,正义链的长度与反义链长度可以相同或不同。
在一些实施方式中,正义链与反义链的长度相同,具体地,正义链/反义链的长度比为15/15、16/16、17/17、18/18、19/19、20/20、21/21、22/22、23/23、24/24、25/25、26/26、27/27或28/28。作为优选,正义链/反义链的长度比为19/19、20/20、21/21、22/22、23/23、24/24或25/25,更优选19/19、20/20、21/21、22/22或23/23,最优选19/19、21/21或23/23;在一些优选的实施方式中,正义链/反义链的长度比为19/21或21/23。
在一些实施方式中,正义链与反义链的长度不同。例如,正义链/反义链的长度比为19/20、19/21、19/22、19/23、19/24、19/25、19/26、20/19、20/21、20/22、20/23、20/24、20/25、20/26、21/19、21/20、21/22、21/23、21/24、21/25、21/26、22/19、22/20、22/21、22/23、22/24、22/25、22/26、23/19、23/20、23/21、23/22、23/24、23/25或23/26等等。
在本公开中,正义链与反义链可以是完全互补或基本上互补,当两者基本上互补时,正义链与反义链形成的双链区内存在不超过3个错配碱基。
在一些实施方案中,正义链与反义链互补形成双链区后,正义链、反义链或其组合具有延伸出所述双链区的突出的核苷酸。突出的核苷酸的数量可以是1个或多个,例如,1个或2个。另外,突出1-2个核苷酸可以位于任意反义链或正义链的5’末端、3’末端或两端,并且,每一个突出的核苷酸可以是任意类型的核苷酸。
在一些实施方案中,所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,所述反义链的3’末端形成平末端。
在一些实施方案中,所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述反义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,所述正义链的3’末端形成平末端。
在一些实施方案中,所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链与所述反义链的3’末端均具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些实施方案中,所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在本公开中,如上所述,反义链的核苷酸序列与靶标序列可以是完全互补或基本上互补;正义链与反义链可以是完全互补或基本上互补。因此,以下对于靶标序列SEQ IDNO:8~SEQ ID NO:25以及能够与这些靶标序列互补的siRNA的描述,对于每个siRNA的反义链,均包括与其互补的靶标序列(例如,SEQ ID NO:8~SEQ ID NO:25中的任一者)基本上互补的情况,也即,每个siRNA的反义链的核苷酸序列中可以存在与相应的靶标序列存在碱基错配的情况;对于每个siRNA的正义链,均包括与其互补的靶标序列(例如,SEQ ID NO:8~SEQ ID NO:25中的任一者)基本上互补的情况,也即,每个siRNA的正义链的核苷酸序列中可以存在与相应的靶标序列存在碱基错配的情况。在一些实施方案中,所述碱基错配可以是与靶标序列的差异不超过3个碱基的错配,例如,错配碱基为1个、2个或3个。需要说明的是,对于靶标序列SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:7中的任一者,其也适用上述对于靶标序列SEQID NO:8~SEQ ID NO:25和与之互补的siRNA的碱基错配的情况的描述;也即,每个siRNA的反义链的核苷酸序列中可以存在与相应的靶标序列存在碱基错配的情况,每个siRNA的正义链的核苷酸序列中可以存在与相应的靶标序列存在碱基错配的情况。在一些实施方案中,所述碱基错配可以是与靶标序列的差异不超过3个碱基的错配,例如,错配碱基为1个、2个或3个。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示序列中23个连续核苷酸组成的序列B组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA1~siRNA3、siRNA87~siRNA88中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:9所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:9所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA4、siRNA89中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:10所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:10所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA5。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:11所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:11所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:11所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:11所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA6~siRNA7中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:12所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:12所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA8、siRNA120~siRNA121中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA9~siRNA15、siRNA90~siRNA91中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA16~siRNA25、siRNA122~siRNA 124中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:15所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:15所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:15所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:15所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA26~siRNA30中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA31~siRNA40中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:17所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:17所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:17所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:17所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:17所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:17所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA41~siRNA55、siRNA92、siRNA125中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:18所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:18所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA56。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:19所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:19所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为与SEQ ID NO:19所示序列中19个连续核苷酸组成的序列相比存在一个差异的核苷酸的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQID NO:19所示序列中19个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比存在一个差异的核苷酸的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA57~siRNA58中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA59~siRNA63中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:21所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:21所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA64、siRNA126中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为与SEQ ID NO:22所示序列中19个连续核苷酸组成的序列相比存在一个差异的核苷酸的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQID NO:22所示序列中19个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比存在一个差异的核苷酸的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A或与序列A存在一个核苷酸差异的序列,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B或与序列B存在一个核苷酸差异的序列。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A或与序列A存在一个核苷酸差异的序列,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B或与序列B存在一个核苷酸差异的序列。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA65~siRNA73、siRNA93、siRNA127~siRNA128中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:23所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:23所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1中示出的siRNA74~siRNA76中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为与SEQ ID NO:24所示序列中19个连续核苷酸组成的序列相比存在一个差异的核苷酸的序列A,反义链的核苷酸序列为与SEQ ID NO:24所示序列中19个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比存在一个差异的核苷酸的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示序列中21个连续核苷酸组成的序列A或与序列A存在一个核苷酸差异的序列,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示序列中21个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B或与序列B存在一个核苷酸差异的序列。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示序列中23个连续核苷酸组成的序列A或与序列A存在一个核苷酸差异的序列,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示序列中23个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B或与序列B存在一个核苷酸差异的序列。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均具有2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
示例性的,双链核糖核酸为表1或表1-1中示出的siRNA77~siRNA86、siRNA94~siRNA95、siRNA140~siRNA162、siRNA206~siRNA207中的任一siRNA。
在一些具体的实施方式中,正义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:25所示序列中19个连续核苷酸组成的序列A,反义链的核苷酸序列为SEQ ID NO:25所示序列中19个连续核苷酸组成的序列反向互补的序列B。并且,所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
示例性的,双链核糖核酸为表1-1中示出的siRNA129。
在一些具体的实施方式中,所述正义链包含如SEQ ID NO:26~120、SEQ ID NO:258~267、SEQ ID NO:298~320、SEQ ID NO:385~386任一项所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:121~215、SEQ ID NO:268~277、SEQ ID NO:321~343、SEQ ID NO:387~388任一项所示的核苷酸序列。
在一些具体的实施方案中,双链核糖核酸选自如表1或表1-1中所示的任一siRNA。本公开提供的siRNA,其与靶mRNA(ANGPTL3 mRNA)结合的特异性高,具有较好的靶mRNA的沉默活性,可以显著抑制ANGPTL3基因表达,用于治疗包括脂质代谢异常在内的ANGPTL3相关的疾病。
在一些实施方案中,本公开提供了一种siRNA组合物,其包含表1或表1-1中所示siRNA中的任意一种或两种以上的组合。
在一些实施方案中,正义链的每个核苷酸彼此独立地为修饰的核苷酸或未修饰的核苷酸。在一些实施方案中,反义链的每个核苷酸彼此独立地为修饰的核苷酸或未修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,正义链中任意相连的两个核苷酸由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接。在一些实施方案中,反义链中任意相连的两个核苷酸由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接。
在一些实施方式中,正义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。在一些实施方式中,所述反义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。
示例性的,5’磷酸基团的结构为:5’磷酸衍生基团的结构包括但不限于:等。
位于正义链或反义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团后,形成如下所示结构:
其中,Base表示碱基,例如A、U、G、C或T。R’为羟基或被本领域技术人员所知晓的各类基团所取代,例如,2’-氟代(2’-F)修饰的核苷酸,2’-烷氧基修饰的核苷酸,2’-取代的烷氧基修饰的核苷酸,2’-烷基修饰的核苷酸,2’-取代的烷基修饰的核苷酸,2’-脱氧核糖核苷酸。
双链核糖核酸修饰物
本公开的第二方面提供一种双链核糖核酸修饰物。进一步地,双链核糖核酸修饰物为siRNA修饰物。siRNA修饰物在保持较高ANGPTL3 mRNA抑制活性的同时,可提高siRNA的稳定性。
在一些实施方案中,双链核糖核酸修饰物包含至少一个核苷酸的修饰。核苷酸的修饰选自核糖基团的修饰和碱基的修饰中的至少一种。在一些实施方案中,“核苷酸的修饰”是指核苷酸的核糖基团2’位羟基被其他基团取代形成的核苷酸或核苷酸衍生物,或者核苷酸上的碱基是经修饰的碱基的核苷酸。所述核苷酸的修饰不会导致siRNA抑制基因表达的功能明显削弱或丧失。例如,可以选择J.K.Watts,G.F.Deleavey,and M.J.Damha,Chemically modified siRNA:tools and applications.Drug Discov Today,2008,13(19-20):842-55中公开的修饰的核苷酸。通过核苷酸的修饰可以提高siRNA的稳定性,并保持其对ANGPTL3基因的高抑制效率。
示例性的,修饰的核苷酸具有如下所示结构:
其中,Base表示碱基,例如A、U、G、C或T。核糖基团2’位的羟基被R取代。这些核糖基2’位的羟基可以为本领域技术人员所知晓的各类基团所取代,例如,2’-氟代(2’-F)修饰的核苷酸,2’-烷氧基修饰的核苷酸,2’-取代的烷氧基修饰的核苷酸,2’-烷基修饰的核苷酸,2’-取代的烷基修饰的核苷酸,2’-脱氧核糖核苷酸。
在一些实施方案中,2’-烷氧基修饰的核苷酸为2’-甲氧基(2’-OMe,2’-O-CH3)修饰的核苷酸等等。
在一些实施方案中,2’-取代的烷氧基修饰的核苷酸为2’-甲氧基乙氧基(2’-O-CH2-CH2-O-CH3)修饰的核苷酸,2’-O-CH2-CH=CH2修饰的核苷酸等。
在一些实施方案中,2’-取代的烷基修饰的核苷酸为2’-CH2-CH2-CH=CH2修饰的核苷酸等等。
在一些实施方案中,核苷酸的修饰是碱基的修饰。碱基的修饰可以是本领域技术人员所知晓的各类型修饰。示例性的,碱基的修饰包括但不限于m6A、Ψ、m1A、m5A、ms2i6A、i6A、m3C、m5C、ac4C、m7G、m2,2G、m2G、m1G、Q、m5U、mcm5U、ncm5U、ncm5Um、D、mcm5s2U、Inosine(I)、hm5C、s4U、s2U、偶氮苯、Cm、Um、Gm、t6A、yW、ms2t6A或其衍生物。
在一些实施方案中,核苷酸衍生物是指能够在核酸中代替核苷酸,但结构不同于腺嘌呤核糖核苷酸、鸟嘌呤核糖核苷酸、胞嘧啶核糖核苷酸、尿嘧啶核糖核苷酸或胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸的化合物。在一些实施方案中,核苷酸衍生物可以是异核苷酸、桥联的核苷酸(bridged nucleic acid,简称BNA)或无环核苷酸。BNA是指受约束的或不能接近的核苷酸。BNA可以含有五元环、六元环、或七元环的具有“固定的”C3’-内切糖缩拢的桥联结构。通常将该桥掺入到该核糖的2’-、4’-位处以提供一个2’,4’-BNA核苷酸,如LNA、ENA、cET等。
LNA如式(1)所示,ENA如式(2)所示,cET如式(3)所示:
无环核苷酸是核苷酸的糖环被打开形成的一类核苷酸,如解锁核酸(UNA)或甘油核酸(GNA),其中,UNA如式(4)所示,GNA如式(5)所示:
上述式(4)和式(5)中,R选自H、OH或烷氧基(O-烷基)。
在一些实施方案中,核苷酸衍生物修饰是指核酸中的核苷酸被替代为核苷酸衍生物。示例性的,核苷酸衍生物选自异核苷酸、LNA、ENA、cET、UNA或GNA。
在一些实施方案中,核酸中的核苷酸被替代为异核苷酸,在本公开的上下文中,也称之为异核苷修饰。在一些实施方案中,异核苷修饰包括在欲修饰的siRNA的正义链和/或反义链的一个或多个位点掺入异核苷,以代替天然核苷在相应位置进行偶联。
在一些实施方案中,异核苷修饰采用D-异核苷修饰。在另一些实施方案中,异核苷修饰采用L-异核苷修饰。在又一些实施方案中,异核苷修饰采用D-异核苷修饰和L-异核苷修饰。
在一些实施方案中,双链核糖核酸修饰物包含至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰。在一些实施方式中,磷酸二酯键的修饰是指磷酸二酯键中至少一个氧原子被硫原子取代形成硫代磷酸二酯键。硫代磷酸二酯键可以稳定siRNA的双链结构,保持碱基配对的特异性。示例性的,硫代磷酸二酯键结构如下所示:
在一些实施方案中,双链核糖核酸修饰物包含如下至少一种的化学修饰:
(1)正义链中至少一个核苷酸的修饰,
(2)正义链中至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰,
(3)反义链中至少一个核苷酸的修饰,
(4)反义链中至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰。
进一步地,双链核糖核酸修饰物是包含(1)-(4)中至少一种化学修饰的siRNA修饰物。
在本公开中,正义链中的序列A与反义链中的序列B互补形成双链区后,序列A与序列B的3’末端可以为如下任意一种所示:
(1)序列A与序列B的3’末端均形成平末端;
(2)序列A的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,且序列B的3’末端形成平末端;
(3)序列B的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,且序列A的3’末端形成平末端;
(4)序列A的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,且序列B的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。
在一些实施方案中,正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列。
在一些实施方案中,当正义链与反义链的核苷酸序列互补形成双链区后,正义链与反义链的3’末端不存在突出的核苷酸时,在正义链和反义链中至少一条链的3’末端添加1-2个核苷酸,作为突出的核苷酸。其中,连接于正义链的3’末端的1-2个核苷酸组成序列D,连接于反义链的3’末端的1-2个核苷酸组成序列E。相应地,正义链的核苷酸序列为序列A连接序列D所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。或者,正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。或者,正义链的核苷酸序列为序列A连接序列D所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列。
示例性的,在正义链的3’末端添加2个脱氧核糖核苷酸(TT)作为序列D,在反义链的3’末端添加2个脱氧核糖核苷酸(TT)作为序列E。或者,仅在反义链的3’末端添加2个脱氧核糖核苷酸(TT)作为序列E。或者,仅在正义链的3’末端添加2个脱氧核糖核苷酸(TT)作为序列D。
在一些实施方案中,当正义链与反义链的核苷酸序列互补形成双链区后,正义链的3’末端不存在突出的核苷酸时,在正义链的3’末端添加由1-2个核苷酸组成的序列D,作为突出的核苷酸。然后,当序列A连接序列D形成的核苷酸序列在完成化学修饰后,排除由1-2个核苷酸组成的序列D。相应地,在双链核糖核酸修饰物中,正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列。或者,在双链核糖核酸修饰物中,正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。
在一些实施方案中,当序列A在与序列B互补形成双链区后,序列A的3’末端具有延伸出双链区的突出的1-2个核苷酸时,将序列A中位于3’末端的突出的核苷酸排除后作为正义链的核苷酸序列。排除掉3’末端的突出的核苷酸的序列称为序列A’。相应地,双链核糖核酸修饰物的正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,双链核糖核酸修饰物的反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列。或者,双链核糖核酸修饰物的正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,双链核糖核酸修饰物的反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的正义链包括如下修饰:正义链中第7位、第9位、第10位和第11位的核糖核苷酸为2’-氟代修饰的核糖核苷酸;正义链中其他位置的核糖核苷酸为2’-甲氧基修饰的核糖核苷酸。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的正义链包括如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间,5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间,3’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间,以及3’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的正义链包括如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间、5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
在一些具体的实施方案中,siRNA修饰物正义链具有如(a1)-(a3)任一项所示的结构:
(a1)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(a2)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(a3)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接。
在另外一些具体的实施方案中,siRNA修饰物正义链具有如(a4)-(a5)任一项所示的结构:
(a4)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-3’,
(a5)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的反义链包括如下修饰:所述反义链中任意奇数位置处的核糖核苷酸为2’-甲氧基修饰的核糖核苷酸,所述反义链中任意偶数位置处的核糖核苷酸为2’-氟代修饰的核糖核苷酸。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的反义链包括如下修饰:所述反义链中第2位、第6位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的反义链包括如下修饰:所述反义链中第2位、第6位、第8位、第9位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中第6位的核糖核苷酸为核苷酸衍生物GNA修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的反义链包括如下修饰:所述反义链中第2位、第6位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中第7位的核糖核苷酸为核苷酸衍生物GNA修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,siRNA修饰物的反义链包括如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间,5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间,3’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间,以及3’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
在一些实施方案中,沿5’末端向3’末端方向,反义链的5’末端的核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。示例性的,5’磷酸基团的结构为:5’磷酸衍生基团的结构包括但不限于:/>(EVP),/>等。
在一些具体的实施方案中,siRNA修饰物反义链具有如下(b1)-(b15)任一项所示的结构:
(b1)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b2)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-N20f-(s)-mN21-3’,
(b3)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-N20f-mN21-(s)-N22f-(s)-mN23-3’;
(b4)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b5)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b6)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b7)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b8)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b9)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b10)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b11)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b12)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b13)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b14)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b15)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,P1表示该字母右侧相邻的一个核苷酸为5’-磷酸核苷酸,-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接,[GNA]表示其右侧相邻的一个核糖核苷酸为存在GNA修饰的核糖核苷酸。
在一些可选的实施方式中,所述正义链包含如SEQ ID NO:216~236、SEQ ID NO:278~287、SEQ ID NO:344~353、SEQ ID NO:389~393任一项所示的核苷酸序列,并且所述反义链包含如SEQ ID NO:237~254、SEQ ID NO:288~297、SEQ ID NO:354~373、SEQ IDNO:377~378、SEQ ID NO:381~384、SEQ ID NO:394~403任一项所示的核苷酸序列。
在一些实施方案中,双链核糖核酸修饰物包括但不限于如表2中所示的siRNA修饰物。
双链核糖核酸缀合物
本公开的第三方面提供一种双链核糖核酸缀合物,是本公开第一方面提供的双链核糖核酸或第二方面提供的双链核糖核酸修饰物与缀合基团缀合连接得到。
在本公开中,双链核糖核酸缀合物的正义链与反义链形成双链核糖核酸缀合物的双链区,并且,在双链核糖核酸缀合物的正义链的3’末端形成平末端。在一些实施方案中,双链核糖核酸缀合物的正义链的3’末端形成平末端,双链核糖核酸缀合物的反义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸。在另外一些实施方案中,双链核糖核酸缀合物的正义链的3’末端形成平末端,双链核糖核酸缀合物的反义链的3’末端形成平末端。
在一些优选地实施方案中,双链核糖核酸缀合物由双链核糖核酸修饰物与缀合基团缀合连接得到。其中,双链核糖核酸修饰物的正义链与反义链互补形成双链核糖核酸修饰物的双链区,并且,双链核糖核酸修饰物的正义链的3’末端形成平末端,缀合基团与具有平末端的正义链的3’末端缀合连接,形成双链核糖核酸缀合物。
示例性地,双链核糖核酸修饰物的正义链为序列A所示的序列,反义链为序列B连接序列E所示的序列。并且,双链核糖核酸修饰物的正义链的3’末端形成平末端,双链核糖核酸修饰物的正义链的3’末端连接缀合基团,形成双链核糖核酸缀合物。
示例性地,双链核糖核酸修饰物的正义链为序列A所示的序列,反义链为序列B所示的序列。并且,双链核糖核酸修饰物的正义链的3’末端形成平末端,双链核糖核酸修饰物的正义链3’末端连接缀合基团,形成双链核糖核酸缀合物。
示例性地,双链核糖核酸修饰物的正义链为序列A连接序列D所示的序列,反义链为序列B连接序列E所示的序列。并且,双链核糖核酸修饰物的正义链的3’末端具有突出的1-2个核苷酸组成的序列D,将双链核糖核酸修饰物中正义链的3’末端的序列D排除后,在序列A的3’末端连接缀合基团,形成双链核糖核酸缀合物。
示例性地,双链核糖核酸修饰物的正义链为序列A连接序列D所示的序列,反义链为序列B所示的序列。并且,双链核糖核酸修饰物的正义链的3’末端具有突出的1-2个核苷酸组成的序列D,将双链核糖核酸修饰物中正义链的3’末端的序列D排除后,在序列A的3’末端连接缀合基团,形成双链核糖核酸缀合物。
示例性地,双链核糖核酸修饰物的正义链为序列A所示的序列,反义链为序列B连接序列E所示的序列。其中,序列A的3’末端具有延伸出双链区的突出的核苷酸,将位于序列A中3’末端的突出的核苷酸排除后的序列(又称,序列A’)作为用于连接缀合基团的核苷酸序列。因此,双链核糖核酸缀合物的正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。
示例性地,双链核糖核酸修饰物的正义链为序列A所示的序列,反义链为序列B所示的序列。其中,序列A的3’末端具有延伸出双链区的突出的核苷酸,将位于序列A中3’末端的突出的核苷酸排除后的序列(又称,序列A’)作为用于连接缀合基团的核苷酸序列。因此,双链核糖核酸缀合物的正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列。
在一些可选地实施方案中,双链核糖核酸缀合物的正义链具有如(d1)-(d2)任一项所示的结构:
(d1)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-L96-3’,
(d2)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-L96-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接。L96也即式I所示的缀合物基团GalNAc。
在一些可选地实施方案中,双链核糖核酸缀合物的反义链具有如(b1)-(b15)任一项所示的结构:
(b1)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b2)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-N20f-(s)-mN21-3’,
(b3)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-N20f-mN21-(s)-N22f-(s)-mN23-3’,
(b4)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b5)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b6)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b7)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b8)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b9)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b10)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b11)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b12)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b13)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b14)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b15)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,P1表示该字母右侧相邻的一个核苷酸为5’-磷酸核苷酸,-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接,[GNA]表示其右侧相邻的一个核糖核苷酸为存在GNA修饰的核糖核苷酸。
进一步地,双链核糖核酸缀合物为siRNA缀合物,其中siRNA缀合物中与缀合基团连接的siRNA分子可以是未修饰的siRNA,或siRNA修饰物。缀合基团修饰的siRNA分子在保持了较高的抑制活性和稳定性的同时,还具有较好的组织、器官靶向性和促进细胞内吞的能力,可降低对其他组织或器官的影响以及减少siRNA分子使用量,可达到减轻毒性和降低成本的目的。可选地,选择表1或表1-1或表2示出的任意一种siRNA分子与缀合基团连接,得到双链核糖核酸缀合物。
siRNA与缀合基团的缀合位点可以在siRNA正义链的3’末端或5’末端,也可在反义链的5’端,还可以在siRNA的内部序列中。在一些实施方案中,所述siRNA与缀合基团的缀合位点在siRNA正义链的3’末端。
在一些实施方式中,所述缀合基团可以连接在核苷酸的磷酸基团、2’-位羟基或者碱基上。在一些实施方式中,所述缀合基团还可以连接在3’-位羟基上,此时核苷酸之间采用2’,5’-磷酸二酯键连接。当缀合基团连接在siRNA链的末端时,所述缀合基团通常连接在核苷酸的磷酸基团上;当缀合基团连接在siRNA的内部序列时,所述缀合基团通常连接在核糖糖环或者碱基上。各种连接方式可以参考文献:Muthiah Manoharan et.al.siRNAconjugates carrying sequentially assembled trivalent N-acetylgalactosaminelinked through nucleosides elicit robust gene silencing in vivo inhepatocytes.ACS Chemical biology,2015,10(5):1181-7。
在本公开中,缀合基团可以是siRNA给药领域常规使用的配体。在一些实施方式中,所述缀合基团可以选自以下靶向分子或其衍生物形成的配体中的一种或多种:亲脂分子,例如胆固醇、胆汁酸、维生素(例如维生素E)、不同链长的脂质分子;聚合物,例如聚乙二醇;多肽,例如透膜肽;适配体;抗体;量子点;糖类,例如乳糖、聚乳糖、甘露糖、半乳糖、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc);叶酸(folate);肝实质细胞表达的受体配体,例如去唾液酸糖蛋白、去唾液酸糖残基、脂蛋白(如高密度脂蛋白、低密度脂蛋白等)、胰高血糖素、神经递质(如肾上腺素)、生长因子、转铁蛋白等。
在一些具体的实施方案中,所述缀合基团具有如下所示结构:
式I所示的缀合基团为GalNAc,GalNAc具有肝脏靶向性,可以将siRNA分子高特异性地递送于肝脏组织中,特异性抑制肝脏内ANGPTL3基因的高表达。
在一些具体的实施方案中,GalNAc通过磷酸二酯键与正义链的3’末端缀合连接,得到如下所示结构的siRNA缀合物:
其中,双螺旋结构为未修饰的siRNA或siRNA修饰物。
在一些实施方案中,双链核糖核酸缀合物包括但不限于如表3中所示的siRNA缀合物。
药物组合物
本公开的第四方面提供一种药物组合物,包括第一方面所述的双链核糖核酸、第二方面所述的双链核糖核酸修饰物,以及第三方面所述的双链核糖核酸缀合物中的一种或多种。
在一些实施方案中,所述药物组合物含有如上所述的siRNA作为活性成分和药学上可接受的载体。在本公开中,使用药物组合物的目的在于促进针对生物体的给药,有利于活性成分的吸收,进而发挥生物活性。本公开的药物组合物可以通过任何形式给药,包括注射(动脉内、静脉内、肌肉内、腹膜内、皮下)、粘膜、口服(口服固体制剂、口服液体制剂)、直肠、吸入、植入、局部(例如眼部)给药等。口服固体制剂的非限制性实例包括但不限于散剂、胶囊剂、锭剂、颗粒剂、片剂等。口服或粘膜给药的液体制剂的非限制性实例包括但不限于混悬剂、酊剂、酏剂、溶液剂等。局部给药制剂的非限制性实例包括但不限于乳剂、凝胶剂、软膏剂、乳膏剂、贴剂、糊剂、泡沫剂、洗剂、滴剂或血清制剂。胃肠外给药制剂的非限制性实例包括但不限于注射用溶液剂、注射用干粉剂、注射用悬浮液、注射用乳剂等。本公开的药物组合物还可以制成控制释放或延迟释放剂型(例如脂质体或微球)。
在本公开中,施用途经能够以任何适用的方式进行变化或调整,以满足药物的性质、患者和医务人员的便利以及其它相关因素的需求。
医药用途
本公开的第五方面提供双链核糖核酸,双链核糖核酸修饰物或双链核糖核酸缀合物的如下至少一种用途:
(1)抑制ANGPTL3基因表达,或制备用于抑制ANGPTL3基因表达的药物;
(2)用于预防或治疗与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病,或制备用于预防或治疗与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病的药物;
(3)用于治疗患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病的受试者,或制备用于治疗患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病的受试者的药物。
本公开进一步提供了siRNA分子(包括未修饰的siRNA、siRNA修饰物、siRNA缀合物)或药物组合物在上述(1)-(3)至少一种中的用途。
在本公开中,ANGPTL3基因异常表达,引发如下一种或多种ANGPTL3基因异常表达相关疾病:乳糜微粒血症综合征、2型糖尿病、家族性部分脂肪营养不良、高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、高甘油三酯血症、非酒精性脂肪肝、动脉粥样硬化、高甘油三酯血症、膝盖损伤及骨关节炎、血脂异常及相关代谢疾病。
siRNA分子致使ANGPTL3基因的表达被抑制至少约5%、至少约10%、至少约15%、至少约20%、至少约25%、至少约30%、至少约35%、至少约40%、至少约45%、至少约50%、至少约55%、至少约60%、至少约65%、至少约70%、至少约75%、至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%,实现对ANGPTL3基因异常表达相关疾病的治疗。
在一些实施方案中,本公开提供一种抑制细胞内ANGPTL3基因表达的方法,包括将双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物或药物组合物与细胞接触。
进一步地,抑制细胞内ANGPTL3基因表达的方法,是将siRNA分子(包括未修饰的siRNA、siRNA修饰物、siRNA缀合物)或药物组合物引入细胞内。
在一些实施方案中,所述细胞为体内细胞或体外细胞。在一些具体的实施方案中,所述细胞在受试者体内。
在一些实施方案中,本公开提供预防或治疗疾病的方法,包括向受试者施用双链核糖核酸、双链核糖核酸修饰物、双链核糖核酸缀合物或药物组合物。
进一步地,预防或治疗疾病的方法是向受试者施用siRNA分子(包括未修饰的siRNA、siRNA修饰物、siRNA缀合物)或药物组合物。
在本公开中,“受试者”包括或者人或者非人类动物,优选脊椎动物,并且更优选哺乳动物。受试者可以包括转基因生物体。最优选地,受试者是人。进一步地,受试者具有如下至少一种特性:
(1)体内ANGPTL3基因异常表达,更具体地为ANGPTL3基因异常高表达;
(2)患有与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病;
(3)患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病。如罹患或倾向于患上与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病的人。
表1 siRNA序列信息
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表1-1siRNA序列信息
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表2 siRNA修饰物
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上述表格中大写字母“G”、“C”、“A”、“T”和“U”每个通常代表分别含有鸟嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶作为碱基的核苷酸;mA、mU、mC、mG:表示2’-甲氧基修饰的核苷酸;Af、Gf、Cf、Uf:表示2’-氟代修饰的核苷酸;小写字母s表示与该字母s左右相邻的两个核苷酸之间为硫代磷酸酯基连接;P1:表示该P1右侧相邻的一个核苷酸为5’-磷酸核苷酸,[GNA]表示其右侧相邻的一个核糖核苷酸为存在GNA修饰的核糖核苷酸。
表3 siRNA缀合物
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上述表格中大写字母“G”、“C”、“A”、“T”和“U”每个通常代表分别含有鸟嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶作为碱基的核苷酸”;mA、mU、mC、mG:表示2’-甲氧基修饰的核苷酸;Af、Gf、Cf、Uf:表示2’-氟代修饰的核苷酸;小写字母s表示与该字母s左右相邻的两个核苷酸之间为硫代磷酸酯基连接;P1:表示该P1右侧相邻的一个核苷酸为5’-磷酸核苷酸,[GNA]表示其右侧相邻的一个核糖核苷酸为存在GNA修饰的核糖核苷酸;L96也即式I所示的缀合物基团GalNAc。
实施例
本公开的其他目的、特征和优点将从以下详细描述中变得明显。但是,应当理解的是,详细描述和具体实施例(虽然表示本公开的具体实施方式)仅为解释性目的而给出,因为在阅读该详细说明后,在本公开的精神和范围内所作出的各种改变和修饰,对于本领域技术人员来说将变得显而易见。
本实施例中所用到的实验技术与实验方法,如无特殊说明均为常规技术方法,例如下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。实施例中所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可通过正规商业渠道获得。
下述实施例涉及的siRNA、siRNA修饰物、siRNA缀合物由天霖生物科技(上海)有限公司合成,实施例中使用的细胞、试剂如表4所示:
表4
实施例1:siRNA的合成
1.1siRNA序列设计
根据人ANGPTL3基因mRNA序列,选择不同位点设计多对ANGPTL3 siRNAs,设计的所有单个siRNA均能靶向靶基因的所有转录本(如表5),这些多对siRNA经序列相似性软件比对与其他所有非靶标基因序列有最低同源性。
表5
靶基因 | 物种 | Gene ID | NM_ID |
ANGPTL3 | Homo sapiens | 27329 | NM_014495.4 |
用于设计siRNA的靶标序列如下所示,靶标序列来源于ANGPTL3的基因mRNA序列(参见NM_014495.4)。
靶标序列I:
tccagaattgatcaagacaattcatcatttgattctctatctccagagccaaaatcaagatttgctatgttagacgatgtaaaaattttagccaatggcctccttcagttgggacatggtcttaa(SEQ ID NO:1)
靶标序列I-1:
tccagaattgatcaagacaattcatcat(SEQ ID NO:8)
靶标序列I-2:
caagatttgctatgttagacgatgta(SEQ ID NO:9)
靶标序列I-3:
agttgggacatggtcttaa(SEQ ID NO:10)
靶标序列II:
agagcaactaactaacttaattcaaaatcaacctgaaactccagaacacccagaagtaacttcacttaa(SEQ ID NO:2)
靶标序列II-1:
agagcaactaactaacttaattcaaa(SEQ ID NO:11)
靶标序列II-2:
gaacacccagaagtaacttcacttaa(SEQ ID NO:12)
靶标序列III:
ctccagaccgtggaagaccaatataaacaattaaaccaacagcatagtcaaataaaagaaatagaaaatcagctcagaaggactagtattcaagaac(SEQ ID NO:3)
靶标序列III-1:
ctccagaccgtggaagaccaatataaac(SEQ ID NO:13)
靶标序列III-2:
atcagctcagaaggactagtattcaagaac(SEQ ID NO:14)
靶标序列IV:
ctactccctttcttcagttgaatgaaataagaaatgtaaaacatgatggcattcctgctgaatgtaccaccatttataac(SEQ ID NO:4)
靶标序列IV-1:
ctactccctttcttcagttgaatga(SEQ ID NO:15)
靶标序列IV-2:
cctgctgaatgtaccaccatttataac(SEQ ID NO:16)
靶标序列V:
gacccagcaactctcaagtttttcatgtctactgtgatgttatatcaggtagtccatggacattaattcaacatcgaatagatggatcacaaaacttcaatgaaacgtgggagaactacaaatatggt(SEQ ID NO:5)
靶标序列V-1:
gacccagcaactctcaagtttttcatgtctactgtgatgttatatcaggtagtccatggacatta(SEQID NO:17)
靶标序列V-2:
gatggatcacaaaacttca(SEQ ID NO:18)
靶标序列V-3:
gtgggagaactacaaatatggt(SEQ ID NO:19)
靶标序列VI:
gttgggcctagagaagatatactccatagtgaagcaatctaattatgttttacgaattgagttggaagactggaaagacaacaaacattatattgaatattctttttacttgggaaatcacgaaaccaactatacgctacatctagttgcgattactggcaatg(SEQ ID NO:6)
靶标序列VI-1:
gttgggcctagagaagatatactccatagtga(SEQ ID NO:20)
靶标序列VI-2:
gaagactggaaagacaacaaacatta(SEQ ID NO:21)
靶标序列VI-3:
tgggaaatcacgaaaccaactatacgctacatctagttgcgattactggcaatg(SEQ ID NO:22)
靶标序列VII:
caactgtccagagggttattcaggaggctggtggtggcatgatgagtgtggagaaaacaacctaaatggtaaatataacaaaccaagagcaaaatctaagccagagaggagaagaggattatcttggaagtctcaaaatggaaggttatactctataaaatcaaccaaaatgttgatccatccaacagat(SEQ ID NO:7)
靶标序列VII-1:
caactgtccagagggttattca(SEQ ID NO:23)
靶标序列VII-2:
aggagaagaggattatcttggaagtctcaaaatggaaggttatactctataaa(SEQ ID NO:24)
靶标序列VII-3:
gttgatccatccaacagat(SEQ ID NO:25)
1.2合成方法描述:
通过固相亚磷酰胺法,按照核苷酸排布顺序自3'-5'方向逐一连接核苷单体。每连接一个核苷单体都包括脱保护、偶联、盖帽、氧化或硫化四步反应。其中,两个核苷酸之间采用磷酸酯连接时,连接后一个核苷单体时,包括脱保护、偶联、盖帽、氧化四步反应。两个核苷酸之间采用硫代磷酸酯连接时,连接后一个核苷单体时,包括保护、偶联、盖帽、硫化四步反应。
1.3合成条件给定如下:
核苷单体以0.1M浓度的乙腈溶液提供,每一步的脱保护反应的条件相同,即温度为25℃,反应时间为70秒,脱保护试剂为二氯乙酸的二氯甲烷溶液(3% V/V),二氯乙酸与固相载体上4,4’-二甲氧基三苯甲基保护基的摩尔比为5:1。
每一步偶联反应条件均相同,包括温度为25℃,固相载体上连接的核酸序列与核苷单体的摩尔比为1:10,固相载体上连接的核酸序列和偶联试剂的摩尔比为1:65,反应时间为600秒,偶联试剂为5-乙硫基-1H-四氮唑的0.5M乙腈溶液。
每一步盖帽条件均相同,包括温度为25℃,反应时间为15秒。盖帽试剂溶液为摩尔比为1:1的CapA和CapB的混合溶液,盖帽试剂与固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为乙酸酐:N-甲基咪唑:固相载体上连接的核酸序列=1:1:1。
每一步氧化反应条件相同,包括温度为25℃,反应时间为15秒,氧化试剂为浓度为0.05M的碘水。碘与偶联步骤中固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为30:1。反应在四氢呋喃:水:吡啶=3:1:1的混合溶剂中进行。
每一步硫化反应的条件相同,包括温度为2 5℃,反应时间为300秒,硫化试剂为氢化黄原素。硫化试剂与偶联步骤中固相载体上连接的核酸序列的摩尔比为120:1。反应在乙腈:吡啶=1:1的混合溶剂中进行。
待最后一个核苷单体连接完成后,依次对固相载体上连接的核酸序列进行切割、脱保护、纯化、脱盐,随后冻干得到正义链和反义链;最后将两条链进行加热退火得到产品,冻干,得到冻干粉。
实施例2:siRNA缀合物(GalNAc-siRNA)的合成
2.1siRNA缀合物具有如下式II所示的结构:
2.2 siRNA缀合物的合成过程
第一步,通过将DMTr-L96和丁二酸酐反应,得到化合物L96-A:
制备过程:将DMTr-L96、丁二酸酐、4-二甲基氨基吡啶和二异丙基乙胺加入二氯甲烷中,25℃下搅拌反应24小时,然后用0.5M三乙胺磷酸盐洗涤反应液,水相以二氯甲烷洗涤三次,合并有机相减压蒸干得粗品。然后柱层析纯化得到得到纯品L96-A。
第二步,将L96-A与NH2-SPS反应得到L96-B:
制备过程:将L96-A、O-苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸酯(HBTU)和二异丙基乙胺混合溶于乙腈中,室温搅拌5分钟得到均一溶液,加入氨甲基树脂(NH2-SPS,100-200目)至反应液体中,25℃下开始摇床反应,反应18小时后过滤,滤饼依次用二氯甲烷和乙腈洗涤,得滤饼。所得滤饼用CapA/CapB混合溶液进行盖帽反应得到L96-B,即为含有缀合分子的固相载体,然后在偶联反应下将核苷单体连接至缀合分子,随后按照前文所述的siRNA分子合成方法合成连接至缀合物分子的siRNA正义链,采用前文所述的siRNA分子合成方法合成siRNA反义链,退火生成本申请的siRNA缀合物。
实施例3:siRNA、siRNA修饰物抑制ANGPTL3基因表达
3.1实验材料:
Huh7细胞,JCRB cell bank,货号JCRB0403;
RNA提取试剂盒,96Kit,货号QIAGEN-74182;
RNAiMAX转染试剂,购自Invitrogen,货号13778-150;
Opti-medium:减血清培养基,购自Gibco,货号31985-070;
Fastking RT Kit(with gDNase),购自TianGen,货号KR116-02;
3.2实验方法:
3.2.1取Huh7细胞,先用PBS洗涤后,加入胰蛋白酶进行消化,调整细胞密度至5.5×105细胞/ml,然后以每孔20,000个细胞的密度接种到96孔板中,每孔培养液为100μl。将Huh7细胞置于5% CO2、37℃孵箱中培养过夜。
3.2.2将待测siRNA及siRNA修饰物(为便于描述,本实施例实验过程描述中统称为siRNA)的干粉以低温高速离心,然后用超纯蒸馏水(ULtraPure Distilled Water)溶解,配制成100μM的siRNA母液。
3.2.3配制2nM的siRNA稀释液Z和0.2nM的siRNA稀释液W
(1)0.1μM siRNA贮备液X和0.01μM siRNA贮备液Y的制备:
a)取上述步骤3.2.2中制得的100μM siRNA母液2μl,加入18μl超纯蒸馏水,得到终浓度为10μM的siRNA稀释液;
b)取步骤a)中制得的10μM的siRNA稀释液2μl,加入18μl超纯蒸馏水,得到终浓度为1μM的siRNA稀释液;
c)取步骤b)中制得的1μM的siRNA稀释液2μl,加入18μl超纯蒸馏水,得到终浓度为0.1μM的siRNA贮备液X;
d)取步骤c)中制得的0.1μM的siRNA贮备液X 2μl,加入18μl超纯蒸馏水,得到终浓度为0.01μM的siRNA贮备液Y;
(2)取上述配置好的siRNA贮备液X和siRNA贮备液Y各2μl,分别加入98μlOpti-medium,分别得到2nM的siRNA稀释液Z和0.2nM的siRNA稀释液W。
3.2.4转染Huh7细胞
(1)取RNAiMAX转染试剂3μl,加入97μl Opti-medium,得到/>RNAiMAX转染试剂稀释液;将/>RNAiMAX转染试剂稀释液与步骤3.2.3中制得的2nM siRNA稀释液Z以1:1体积比混合制备成转染混合物,静置5分钟,取10μl转染混合物加入到96孔板中转染步骤3.2.1中培养的Huh7细胞(终体积100μl,该体系中siRNA的浓度为0.1nM);
(2)取RNAiMAX转染试剂3μl,加入97μl Opti-medium,得到/>RNAiMAX转染试剂稀释液;将/>RNAiMAX转染试剂稀释液与步骤3.2.3中制得的0.2nM siRNA稀释液W以1:1体积比混合制备成转染混合物,静置5分钟,取10μl转染混合物加入到96孔板中转染步骤3.2.1中培养的Huh7细胞(终体积100μl,该体系中siRNA的浓度为0.01nM)。
上述转染后培养24小时;每个浓度(0.1nM和0.01nM)设置2个重复。
3.2.5根据96Kit试剂盒产品说明书,提取步骤3.2.4中获得的Huh7细胞的总RNA。
3.2.6对提取的总RNA使用Fastking RT Kit(with gDNase)进行逆转录至cDNA,按照以下步骤进行:
a)按照下表用gDNA酶除去gDNA;
表6
体积/μl | |
5×gDNA Buffer | 2 |
Sample(RNA) | 8 |
42℃,3min;4℃,静置。
b)如下所述进行逆转录程序
表7
体积/μl | |
FastKing RT Enzyme Mix | 1 |
FQ-RT Primer Mix | 2 |
10×King RT Buffer | 2 |
RNase-Free ddH2O | 5 |
42℃,15min;95℃,3min。
c)将逆转录产物储存在-20℃以进行实时PCR分析。
3.2.7使用FastStart universal probe master(ROX)进行实时PCR分析
a)如下表所示制备qPCR反应混合物,在整个操作过程中,所有试剂都放置在冰上;
表8
b)如下所述进行qPCR程序
95℃,10分钟;
95℃,15秒;60℃,1分钟(40个循环)。
3.2.8结果分析
a)使用Quant Studio 7软件采用默认设置,自动计算Ct值;
b)使用以下公式计算基因的相对表达量:
ΔCt=Ct(ANGPTL3基因)–Ct(GAPDH)
ΔΔCt=ΔCt(检测样品组)-ΔCt(Mock组)
相对于Mock组的mRNA表达=2-ΔΔCt,
其中Mock组表示和检测样品组相比,未加入siRNA的组。
抑制率(%)=(Mock组mRNA相对表达量–检测样品组mRNA相对表达量)/Mock组mRNA相对表达量×100%。
3.3沉默实验结果
选取浓度0.1nM和0.01nM进行测试。
3.3.1设计序列结果
表9
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/>
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从表9中可以看出,本公开提供的siRNA、siRNA修饰物显示出对ANGPTL3基因的优异的抑制效果。在0.01nM的浓度下,抑制率高达70.49%;在0.1nM的浓度下,抑制率高达86.25%。
3.3.2 IC50实验结果
下述待测siRNA测定浓度范围设置(nM):10、2.5、0.625、0.156、0.039、0.0098、0.0024、0.0006,再按照与3.2相似的方法进行IC50测定。
结果分析:
a)使用Quant Studio 7软件采用默认设置,自动计算Ct值;
b)使用以下公式计算基因的相对表达量:
ΔCt=Ct(ANGPTL3基因)–Ct(GAPDH)
ΔΔCt=ΔCt(检测样品组)–ΔCt(Mock组);
相对于Mock组的mRNA表达=2-ΔΔCt
抑制率(%)=(Mock组mRNA相对表达量–检测样品组mRNA相对表达量)/Mock组mRNA相对表达量×100%;
其中,Mock组表示和检测样品组相比,未加入siRNA的组。
以siRNA浓度的log值作为X轴,百分比抑制率为Y轴,采用分析软件GraphPadPrism 8的“log(抑制剂)vs.响应–变量斜率”功能模块,来拟合量效曲线,从而得出各个siRNA的IC50值。
拟合公式为:Y=Bottom+(Top–Bottom)/(1+10^((LogIC50–X)×HillSlope))
其中:Top表示顶部平台处的百分比抑制率,曲线的Top标准一般在80%至120%;Bottom表示底部平台处的百分比抑制率,曲线的Bottom一般在–20%至20%之间;HillSlope表示百分比抑制率曲线的斜率。
表10
siRNA ID | IC50(nM) |
N-ER-FY013001M1 | 0.229 |
N-ER-FY013003M1 | 0.168 |
N-ER-FY013004M1 | 0.040 |
N-ER-FY013010M1 | 0.093 |
N-ER-FY013018M1 | 0.083 |
N-ER-FY013024M1 | 0.143 |
N-ER-FY013030M1 | 0.090 |
N-ER-FY013058M1 | 0.114 |
N-ER-FY013060M1 | 0.031 |
N-ER-FY013062M1 | 0.047 |
从表10中可以看出,本公开提供的siRNA修饰物具有优异的ANGPTL3基因抑制活性,可以在低至0.031nM的IC50时依然具有良好的ANGPTL3基因抑制活性。
实施例4:递送系统验证
4.1实验材料:
人原代肝细胞PHH细胞,由药明康德提供;
PHH培养基:invitroGRO CP Meduim serum free BIOVIT,货号:S03316
RNAiMAX转染试剂,购自Invitrogen,货号:13778-150;
RNA提取试剂盒96Kit,购自QIAGEN,货号:QIAGEN-74182;
逆转录试剂盒FastKing RT Kit(With gDNase),购自TianGen,货号:KR116-02;
FastStart Universal Probe master(ROX),购自Roche,货号:04914058001;
ANGPTL3及GAPDH引物由药明康德提供。
4.2实验方法:
siRNA缀合物(siRNA缀合物终浓度为10nM、2.5nM、0.63nM、0.16nM、0.04nM、0.01nM、0.0024nM和0.0006nM,复孔)通过转染进入PHH细胞,过程如下所述:取冻存的PHH细胞,复苏,计数,调整细胞到6×105细胞/ml,同时应用RNAiMax转染试剂将siRNA缀合物转入细胞,以每孔54,000个细胞的密度接种到96孔板中,每孔加入PPH培养基100μL。细胞置于5% CO2、37℃孵箱中培养。48小时后,去除培养基并收集细胞用于总RNA提取。根据试剂盒产品说明书使用/>96Kit提取总RNA。
siRNA缀合物(siRNA缀合物终浓度为500nM、125nM、31.25nM、7.81nM、1.95nM、0.49nM、0.12nM和0.03nM,复孔)通过自由摄取进入PHH细胞,过程如下所述:取冻存的PHH细胞,复苏,计数,调整细胞到6×105细胞/ml,同时加入siRNA缀合物,以每孔54,000个细胞的密度接种到96孔板中,每孔培养液为100μl。细胞置于5% CO2、37℃孵箱中培养。48小时后,去除培养基并收集细胞用于总RNA提取。根据试剂盒产品说明书使用96Kit提取总RNA。
采用与实施例3中相似的方法,通过逆转录反应将提取的总RNA逆转录为cDNA,以及通过qPCR对逆转录得到的ANGPTL3 cDNA进行定量扩增。GAPDH cDNA将作为内部对照进行平行扩增。PCR反应程序为:95℃10分钟,然后进入循环模式,95℃15秒,随后60℃,60秒,共40个循环。
4.3结果分析
a)使用Quant Studio 7软件采用默认设置,自动计算Ct值;
b)使用以下公式计算基因的相对表达量:
ΔCt=Ct(ANGPTL3基因)–Ct(GAPDH)
ΔΔCt=ΔCt(检测样品组)-ΔCt(Mock组)
相对于Mock的mRNA表达=2-ΔΔCt,
抑制率(%)=(Mock组mRNA相对表达量–检测样品组mRNA相对表达量)/Mock组mRNA相对表达量×100%,
其中Mock组表示和检测样品组相比,未加入siRNA缀合物的组。
以siRNA缀合物浓度的log值作为X轴,百分比抑制率为Y轴,采用分析软件GraphPad Prism 8的“log(抑制剂)vs.响应–变量斜率”功能模块,来拟合量效曲线,从而得出各个siRNA缀合物的IC50值。
拟合公式为:Y=Bottom+(Top–Bottom)/(1+10^((LogIC50–X)×HillSlope))
其中:Top表示顶部平台处的百分比抑制率,曲线的Top标准一般在80%至120%;Bottom表示底部平台处的百分比抑制率,曲线的Bottom一般在–20%至20%之间;HillSlope表示百分比抑制率曲线的斜率。
表11
上表中的L96也即式I所示的缀合物基团GalNAc。
实施例5:siRNA、siRNA修饰物抑制ANGPTL3基因表达
本实施例中使用的实验材料、实验方法与实施例3中的实验材料、实验方法相同。基因表达沉默实验结果如下表12所示。
表12
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实施例6:递送系统验证
本实施例中使用的实验材料、实验方法与实施例4中的实验材料、实验方法相同。IC50实验结果如下表14所示。
表14
上表中的L96也即式I所示的缀合物基团GalNAc。
实施例7:siRNA缀合物抑制ANGPTL3基因表达的抑制率测定
7.1实验材料:
人原代肝细胞PHH细胞,由药明康德提供;
PHH培养基:invitroGRO CP Meduim serum free BIOVIT,货号:S03316
RNAiMAX转染试剂,购自Invitrogen,货号:13778-150;
RNA提取试剂盒96Kit,购自QIAGEN,货号:QIAGEN-74182;
逆转录试剂盒FastKing RT Kit(With gDNase),购自TianGen,货号:KR116-02;
FastStart Universal Probe master(ROX),购自Roche,货号:04914058001;
ANGPTL3及GAPDH引物由药明康德提供。
7.2实验方法:
siRNA缀合物(siRNA缀合物终浓度分别为5nM和0.5nM,复孔)通过转染进入PHH细胞,过程如下所述:取冻存的PHH细胞,复苏,计数,调整细胞到6×105细胞/ml,同时应用RNAiMAX转染试剂将siRNA缀合物转入细胞,以每孔54,000个细胞的密度接种到96孔板中,每孔培养液100μL。细胞置于5% CO2、37℃孵箱中培养。48小时后,去除培养基并收集细胞用于总RNA提取。根据试剂盒产品说明书使用/>96Kit提取总RNA。
siRNA缀合物(siRNA缀合物终浓度分别为100nM和10nM,复孔)通过自由摄取进入PHH细胞,过程如下所述:取冻存的PHH细胞,复苏,计数,调整细胞到6×105细胞/ml,同时加入siRNA缀合物,以每孔54,000个细胞的密度接种到96孔板中,每孔培养液为100μl。细胞置于5% CO2、37℃孵箱中培养。48小时后,去除培养基并收集细胞用于总RNA提取。根据试剂盒产品说明书使用96Kit提取总RNA。
采用与实施例3中相似的方法,通过逆转录反应将提取的总RNA逆转录为cDNA。ANGPTL3 cDNA将通过qPCR进行检测。GAPDH cDNA将作为内部对照进行平行检测。PCR反应程序为:95℃10分钟,然后进入循环模式,95℃15秒,随后60℃,60秒,共40个循环。
结果分析:
a)使用Quant Studio 7软件采用默认设置,自动计算Ct值;
b)使用以下公式计算基因的相对表达量:
ΔCt=Ct(ANGPTL3基因)–Ct(GAPDH)
ΔΔCt=ΔCt(检测样品组)–ΔCt(Mock组),其中Mock组表示和检测样品组相比,未加入siRNA缀合物的组;
相对于Mock组的mRNA表达=2-ΔΔCt
抑制率(%)=(Mock组mRNA相对表达量–检测样品组mRNA相对表达量)/Mock组mRNA相对表达量×100%
表15
/>
/>
从表15中可以看出,本公开提供的siRNA修饰物显示出对ANGPTL3基因的优异的抑制效果。在自由摄取条件下,在100nM浓度的抑制率高达89.37%,在10nM浓度的抑制率高达87.84%;在转染条件下,在5nM浓度的抑制率高达90.94%,在0.5nM浓度的抑制率高达84.78%。
实施例8:siRNA缀合物在人源化小鼠中对人ANGPTL3基因表达的抑制作用
6-8周龄的C57BL/6-hANGPTL3小鼠(由上海南方模式生物科技股份有限公司提供)进入饲养设施,适应性喂养7天后,以3mg/kg的单一剂量对小鼠分别皮下给药N-ER-FY013058M2L96、N-ER-FY013060M2L96、N-ER-FY013062M2L96L96和N-ER-FY013109M2L96(每组6只小鼠)。给药后第8日、第15日、第22日、第29日、第36日、第43日、第50日、第57日和第64日检测血清hANGPTL3蛋白表达量,由此得出siRNA缀合物对hANGPTL3蛋白表达的抑制率。
表16 siRNA缀合物对hANGPTL3蛋白抑制率
从表16中可以看出,对于ANGPTL3基因的抑制率,本公开提供的siRNA缀合物中,N-ER-FY013058M2L96、N-ER-FY013060M2L96和N-ER-FY013062M2L96在第8天至第43天的试验测定期间显示出抑制率高于88%的优异抑制效果,其中在第15天至第36天的抑制率均在90%以上,在第50天至第64天的试验测定期间,抑制率仍然保持在70%以上;对于N-ER-FY013109M2L96,在第8天至第43天中的抑制率均在75%以上,在第50天至第64天中的抑制率均高于50%。
实施例9 siRNA缀合物在CD-1小鼠血浆动力学研究
动物:CD-1小鼠,SPF级,雄性,30g左右,购买于斯贝福(北京)生物技术有限公司。
给药剂量和方式:3mg/kg(10mL/kg),随机分组后单次皮下注射给药,6只小鼠每组。
样品采集:采集给药后0.0833、0.25、0.5、1、2、4、8、24、36、48h全血样品,共10个点。每组前3只采集0.0833、0.5、2、8、36h,后3只采集0.25、1、4、24、48h,采集全血后离心分离血浆进行检测分析。
样品检测与分析:采用LC-MS/MS方法检测各时间点血浆样品中原形药物的浓度,使用WinNonlin软件计算PK参数:Cmax、Tmax、AUC、MRT、t1/2。
从该实验中可以得出,本公开的siRNA缀合物在血浆中半衰期较短,清除较快。
实施例10 siRNA缀合物在CD-1小鼠组织分布试验
动物:CD-1小鼠,SPF级,雄性,30g左右,购买于斯贝福(北京)生物技术有限公司。
给药剂量和方式:3mg/kg(10mL/kg),随机分组后单次皮下注射给药,每个时间点3只动物,共24只小鼠。
样品采集:
给药后24h:采集血浆、肝、肾、脾;给药后72h:采集血浆、肝、肾、脾;
给药后168h(1周):采集血浆、肝、肾、脾、脑、心、肺、胃、小肠、肌肉、睾丸;给药后336h(2周):采集血浆、肝、肾、脾;
给药后672h(4周):采集血浆、肝、肾、脾、脑、心、肺、胃、小肠、肌肉、睾丸;给药后1008h(6周):采集血浆、肝、肾、脾;
给药后1344h(8周):采集血浆、肝、肾、脾;
给药后1680h(10周):采集血浆、肝、肾、脾、脑、心、肺、胃、小肠、肌肉、睾丸。
样品检测与分析:采用LC-MS/MS方法检测各时间点血浆和组织样品中原形药物的浓度,采用梯形面积法计算血浆及组织中的AUC。
从该实验中可以得出,本公开的siRNA缀合物主要富集于肝脏,在组织中保留时间较长,具有很好的稳定性。
实施例11 siRNA缀合物单次皮下注射C57B/L小鼠给予MTD试验
C57B/L小鼠,SPF级,雄性,25g左右,购买于斯贝福(北京)生物技术有限公司。动物根据适应期最后1天的体重,采用体重随机区组的方法,具体剂量设计和分组具体如下表17所示:
表17
检测指标:
(1)临床观察:给药日连续观察4小时,恢复期每天至少进行一次临床观察
(2)体重:对所有存活动物每周进行2次体重称量。
(3)免疫毒性:MTD剂量组动物于D1给药后1h±2min,4h±5min,8h±10min,24h±20min交替采血,每个时间点采集3只/性别/组动物,检测细胞因子(IFN-γ、TNF-α、IL-2/6/8)。
(4)毒代动力学:MTD剂量组动物于D1给药前、给药后30min±2min,1h±2min,4h±5min,8h±10min,24h±20min交替采血,每个时间点采集3只/性别/组动物,检测血药浓度。
(5)血液生化学:主试验组动物于R28剖检,卫星组动物于R7、R14、R21、R28分批次剖检,检测血液生化学。
(6)组织分布:主试验组动物于R28剖检,卫星组动物于R7、R14、R21、R28分批次剖检,采集血、肝,检测组织药物浓度。
(7)组织病理学检查:主试验组动物于R28剖检,采集主要脏器(心、肝、脾、肺、肾、脑、肾上腺、胸腺、胃、子宫/睾丸、卵巢/附睾)以及发现异常的组织或脏器,取材并固定,进行组织病理学检查。
从该实验中可以得出,本公开的siRNA缀合物毒性较低,具有优异的用药安全窗口。
本公开的上述实施例仅是为清楚地说明本公开所作的举例,而并非是对本公开的实施方式的限定。对于所属领域的普通技术人员来说,在上述说明的基础上还可以做出其它不同形式的变化或变动。这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。凡在本公开的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本公开权利要求的保护范围之内。
Claims (45)
1.一种双链核糖核酸,所述双链核糖核酸包括正义链和反义链,所述正义链与所述反义链互补和/或基本上反向互补形成所述双链核糖核酸的双链区;
其中,所述正义链包含与靶标序列中至少15个连续核苷酸的差异不超过3个核苷酸的序列A,所述反义链包含与靶标序列中至少15个连续核苷酸的反向互补序列的差异不超过3个核苷酸的序列B;
所述靶标序列选自如SEQ ID NO:1-7任一项所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的双链核糖核酸,其中,所述靶标序列选自如SEQ ID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列,所述正义链包含与SEQ ID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列中至少15个连续核苷酸组成的序列相比差异不超过1个核苷酸的序列A,所述反义链包含与SEQID NO:8-25任一项所示的核苷酸序列中至少15个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比差异不超过1个核苷酸的序列B;
可选地,所述差异的核苷酸位于所述序列A的3’末端;和/或,所述差异的核苷酸位于所述序列B的3’末端。
3.根据权利要求1或2所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链由15-28个核苷酸组成,优选19-25个核苷酸,更优选19-23个核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
4.根据权利要求3所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链的核苷酸序列为与SEQ IDNO:8-25任一项所示的核苷酸序列中的15-28个连续核苷酸组成的序列相比差异不超过1个核苷酸的序列A,优选19-25个连续核苷酸,更优选19-23个连续核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
5.根据权利要求1-4任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述反义链由15-28个核苷酸组成,优选19-25个核苷酸,更优选19-23个核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
6.根据权利要求5所述的双链核糖核酸,其中,所述反义链的核苷酸序列是与SEQ IDNO:8-25任一项所示的核苷酸序列中的15-28个连续核苷酸组成的序列的反向互补序列相比差异不超过1个核苷酸的序列B,优选19-25个连续核苷酸,更优选19-23个连续核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
7.根据权利要求1-6任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述双链区的长度为15-25个核苷酸,优选19-23个核苷酸,更优选19-21个核苷酸,更优选19、21或23个核苷酸。
8.根据权利要求1-7任一项所述的双链核糖核酸,其中,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,所述反义链的3’末端形成平末端;或者,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述反义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸,所述正义链的3’末端形成平末端;或者,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链与所述反义链的3’末端均具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸;或者,
所述正义链与所述反义链互补形成所述双链区,且所述正义链与所述反义链的3’末端均形成平末端。
9.根据权利要求1-8任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链与所述反义链选自如下组合:
82)所述正义链包含如SEQ ID NO:107所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:202所示的核苷酸序列;
1)所述正义链包含如SEQ ID NO:26所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:121所示的核苷酸序列;
2)所述正义链包含如SEQ ID NO:27所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:122所示的核苷酸序列;
3)所述正义链包含如SEQ ID NO:28所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:123所示的核苷酸序列;
4)所述正义链包含如SEQ ID NO:29所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:124所示的核苷酸序列;
5)所述正义链包含如SEQ ID NO:30所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:125所示的核苷酸序列;
6)所述正义链包含如SEQ ID NO:31所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:126所示的核苷酸序列;
7)所述正义链包含如SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:127所示的核苷酸序列;
8)所述正义链包含如SEQ ID NO:33所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:128所示的核苷酸序列;
9)所述正义链包含如SEQ ID NO:34所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:129所示的核苷酸序列;
10)所述正义链包含如SEQ ID NO:35所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:130所示的核苷酸序列;
11)所述正义链包含如SEQ ID NO:36所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:131所示的核苷酸序列;
12)所述正义链包含如SEQ ID NO:37所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:132所示的核苷酸序列;
13)所述正义链包含如SEQ ID NO:38所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:133所示的核苷酸序列;
14)所述正义链包含如SEQ ID NO:39所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:134所示的核苷酸序列;
15)所述正义链包含如SEQ ID NO:40所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:135所示的核苷酸序列;
16)所述正义链包含如SEQ ID NO:41所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:136所示的核苷酸序列;
17)所述正义链包含如SEQ ID NO:42所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:137所示的核苷酸序列;
18)所述正义链包含如SEQ ID NO:43所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:138所示的核苷酸序列;
19)所述正义链包含如SEQ ID NO:44所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:139所示的核苷酸序列;
20)所述正义链包含如SEQ ID NO:45所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:140所示的核苷酸序列;
21)所述正义链包含如SEQ ID NO:46所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:141所示的核苷酸序列;
22)所述正义链包含如SEQ ID NO:47所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:142所示的核苷酸序列;
23)所述正义链包含如SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:143所示的核苷酸序列;
24)所述正义链包含如SEQ ID NO:49所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:144所示的核苷酸序列;
25)所述正义链包含如SEQ ID NO:50所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:145所示的核苷酸序列;
26)所述正义链包含如SEQ ID NO:51所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:146所示的核苷酸序列;
27)所述正义链包含如SEQ ID NO:52所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:147所示的核苷酸序列;
28)所述正义链包含如SEQ ID NO:53所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:148所示的核苷酸序列;
29)所述正义链包含如SEQ ID NO:54所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:149所示的核苷酸序列;
30)所述正义链包含如SEQ ID NO:55所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:150所示的核苷酸序列;
31)所述正义链包含如SEQ ID NO:56所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:151所示的核苷酸序列;
32)所述正义链包含如SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:152所示的核苷酸序列;
33)所述正义链包含如SEQ ID NO:58所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:153所示的核苷酸序列;
34)所述正义链包含如SEQ ID NO:59所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:154所示的核苷酸序列;
35)所述正义链包含如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:155所示的核苷酸序列;
36)所述正义链包含如SEQ ID NO:61所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:156所示的核苷酸序列;
37)所述正义链包含如SEQ ID NO:62所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:157所示的核苷酸序列;
38)所述正义链包含如SEQ ID NO:63所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:158所示的核苷酸序列;
39)所述正义链包含如SEQ ID NO:64所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:159所示的核苷酸序列;
40)所述正义链包含如SEQ ID NO:65所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:160所示的核苷酸序列;
41)所述正义链包含如SEQ ID NO:66所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:161所示的核苷酸序列;
42)所述正义链包含如SEQ ID NO:67所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:162所示的核苷酸序列;
43)所述正义链包含如SEQ ID NO:68所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:163所示的核苷酸序列;
44)所述正义链包含如SEQ ID NO:69所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:164所示的核苷酸序列;
45)所述正义链包含如SEQ ID NO:70所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:165所示的核苷酸序列;
46)所述正义链包含如SEQ ID NO:71所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:166所示的核苷酸序列;
47)所述正义链包含如SEQ ID NO:72所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:167所示的核苷酸序列;
48)所述正义链包含如SEQ ID NO:73所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:168所示的核苷酸序列;
49)所述正义链包含如SEQ ID NO:74所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:169所示的核苷酸序列;
50)所述正义链包含如SEQ ID NO:75所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:170所示的核苷酸序列;
51)所述正义链包含如SEQ ID NO:76所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:171所示的核苷酸序列;
52)所述正义链包含如SEQ ID NO:77所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:172所示的核苷酸序列;
53)所述正义链包含如SEQ ID NO:78所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:173所示的核苷酸序列;
54)所述正义链包含如SEQ ID NO:79所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:174所示的核苷酸序列;
55)所述正义链包含如SEQ ID NO:80所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:175所示的核苷酸序列;
56)所述正义链包含如SEQ ID NO:81所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:176所示的核苷酸序列;
57)所述正义链包含如SEQ ID NO:82所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:177所示的核苷酸序列;
58)所述正义链包含如SEQ ID NO:83所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:178所示的核苷酸序列;
59)所述正义链包含如SEQ ID NO:84所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:179所示的核苷酸序列;
60)所述正义链包含如SEQ ID NO:85所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:180所示的核苷酸序列;
61)所述正义链包含如SEQ ID NO:86所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:181所示的核苷酸序列;
62)所述正义链包含如SEQ ID NO:87所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:182所示的核苷酸序列;
63)所述正义链包含如SEQ ID NO:88所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:183所示的核苷酸序列;
64)所述正义链包含如SEQ ID NO:89所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:184所示的核苷酸序列;
65)所述正义链包含如SEQ ID NO:90所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:185所示的核苷酸序列;
66)所述正义链包含如SEQ ID NO:91所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:186所示的核苷酸序列;
67)所述正义链包含如SEQ ID NO:92所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:187所示的核苷酸序列;
68)所述正义链包含如SEQ ID NO:93所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:188所示的核苷酸序列;
69)所述正义链包含如SEQ ID NO:94所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:189所示的核苷酸序列;
70)所述正义链包含如SEQ ID NO:95所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:190所示的核苷酸序列;
71)所述正义链包含如SEQ ID NO:96所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:191所示的核苷酸序列;
72)所述正义链包含如SEQ ID NO:97所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:192所示的核苷酸序列;
73)所述正义链包含如SEQ ID NO:98所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:193所示的核苷酸序列;
74)所述正义链包含如SEQ ID NO:99所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:194所示的核苷酸序列;
75)所述正义链包含如SEQ ID NO:100所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:195所示的核苷酸序列;
76)所述正义链包含如SEQ ID NO:101所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:196所示的核苷酸序列;
77)所述正义链包含如SEQ ID NO:102所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:197所示的核苷酸序列;
78)所述正义链包含如SEQ ID NO:103所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:198所示的核苷酸序列;
79)所述正义链包含如SEQ ID NO:104所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:199所示的核苷酸序列;
80)所述正义链包含如SEQ ID NO:105所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:200所示的核苷酸序列;
81)所述正义链包含如SEQ ID NO:106所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:201所示的核苷酸序列;
83)所述正义链包含如SEQ ID NO:108所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:203所示的核苷酸序列;
84)所述正义链包含如SEQ ID NO:109所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:204所示的核苷酸序列;
85)所述正义链包含如SEQ ID NO:110所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:205所示的核苷酸序列;
86)所述正义链包含如SEQ ID NO:111所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:206所示的核苷酸序列;
87)所述正义链包含如SEQ ID NO:112所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:207所示的核苷酸序列;
88)所述正义链包含如SEQ ID NO:113所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:208所示的核苷酸序列;
89)所述正义链包含如SEQ ID NO:114所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:209所示的核苷酸序列;
90)所述正义链包含如SEQ ID NO:115所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:210所示的核苷酸序列;
91)所述正义链包含如SEQ ID NO:116所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:211所示的核苷酸序列;
92)所述正义链包含如SEQ ID NO:117所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:212所示的核苷酸序列;
93)所述正义链包含如SEQ ID NO:118所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:213所示的核苷酸序列;
94)所述正义链包含如SEQ ID NO:119所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:214所示的核苷酸序列;
95)所述正义链包含如SEQ ID NO:120所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:215所示的核苷酸序列;
96)所述正义链包含如SEQ ID NO:258所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:268所示的核苷酸序列;
97)所述正义链包含如SEQ ID NO:259所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:269所示的核苷酸序列;
98)所述正义链包含如SEQ ID NO:260所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:270所示的核苷酸序列;
99)所述正义链包含如SEQ ID NO:261所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:271所示的核苷酸序列;
100)所述正义链包含如SEQ ID NO:262所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:272所示的核苷酸序列;
101)所述正义链包含如SEQ ID NO:263所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:273所示的核苷酸序列;
102)所述正义链包含如SEQ ID NO:264所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:274所示的核苷酸序列;
103)所述正义链包含如SEQ ID NO:265所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:275所示的核苷酸序列;
104)所述正义链包含如SEQ ID NO:266所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:276所示的核苷酸序列;
105)所述正义链包含如SEQ ID NO:267所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:277所示的核苷酸序列;
137)所述正义链包含如SEQ ID NO:298所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:321所示的核苷酸序列;
138)所述正义链包含如SEQ ID NO:299所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:322所示的核苷酸序列;
139)所述正义链包含如SEQ ID NO:300所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:323所示的核苷酸序列;
140)所述正义链包含如SEQ ID NO:301所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:324所示的核苷酸序列;
141)所述正义链包含如SEQ ID NO:302所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:325所示的核苷酸序列;
142)所述正义链包含如SEQ ID NO:303所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:326所示的核苷酸序列;
143)所述正义链包含如SEQ ID NO:304所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:327所示的核苷酸序列;
144)所述正义链包含如SEQ ID NO:305所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:328所示的核苷酸序列;
145)所述正义链包含如SEQ ID NO:306所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:329所示的核苷酸序列;
146)所述正义链包含如SEQ ID NO:307所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:330所示的核苷酸序列;
147)所述正义链包含如SEQ ID NO:308所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:331所示的核苷酸序列;
148)所述正义链包含如SEQ ID NO:309所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:332所示的核苷酸序列;
149)所述正义链包含如SEQ ID NO:310所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:333所示的核苷酸序列;
150)所述正义链包含如SEQ ID NO:311所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:334所示的核苷酸序列;
151)所述正义链包含如SEQ ID NO:312所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:335所示的核苷酸序列;
152)所述正义链包含如SEQ ID NO:313所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:336所示的核苷酸序列;
153)所述正义链包含如SEQ ID NO:314所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:337所示的核苷酸序列;
154)所述正义链包含如SEQ ID NO:315所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:338所示的核苷酸序列;
155)所述正义链包含如SEQ ID NO:316所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:339所示的核苷酸序列;
156)所述正义链包含如SEQ ID NO:317所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:340所示的核苷酸序列;
157)所述正义链包含如SEQ ID NO:318所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:341所示的核苷酸序列;
158)所述正义链包含如SEQ ID NO:319所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:342所示的核苷酸序列;
159)所述正义链包含如SEQ ID NO:320所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:343所示的核苷酸序列;
201)所述正义链包含如SEQ ID NO:385所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:387所示的核苷酸序列;
202)所述正义链包含如SEQ ID NO:386所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:388所示的核苷酸序列。
10.根据权利要求1-9任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链中每个核苷酸彼此独立地为修饰的核苷酸或未修饰的核苷酸,和/或,所述反义链中每个核苷酸彼此独立地为修饰的核苷酸或未修饰的核苷酸。
11.根据权利要求1-10任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链中任意相连的两个核苷酸由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接,和/或,所述反义链中任意相连的两个核苷酸由磷酸二酯键或硫代磷酸二酯键连接。
12.根据权利要求1-11任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述正义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团,和/或,所述反义链的5’末端核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。
13.根据权利要求1-12任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述双链核糖核酸为siRNA。
14.根据权利要求1-13任一项所述的双链核糖核酸,其中,所述双链核糖核酸为用于抑制ANGPTL3基因表达的siRNA。
15.一种双链核糖核酸修饰物,其为如权利要求1-14任一项所述的双链核糖核酸的修饰物,所述双链核糖核酸修饰物包含如下至少一种的化学修饰:
(1)正义链中至少一个核苷酸的修饰,
(2)正义链中至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰,
(3)反义链中至少一个核苷酸的修饰,
(4)反义链中至少一个位置处的磷酸二酯键的修饰;
任选地,所述双链核糖核酸的正义链中序列A的3’末端连接由1-2个核苷酸组成的序列D,优选由1-2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸组成的序列D;和/或,所述双链核糖核酸的反义链中序列B的3’末端连接由1-2个核苷酸组成的序列E,优选由1-2个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸组成的序列E;和/或,所述双链核糖核酸的正义链中序列A的3’末端排除1-2个核苷酸后形成序列A’;
可选地,所述双链核糖核酸修饰物的正义链和反义链选自如下的序列组合:
所述正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A连接序列D所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A连接序列D所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B所示的序列;
或者,所述正义链的核苷酸序列为序列A’所示的序列,所述反义链的核苷酸序列为序列B连接序列E所示的序列。
16.根据权利要求15所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述核苷酸的修饰选自2’-氟代修饰,2’-烷氧基修饰,2’-取代的烷氧基修饰,2’-烷基修饰,2’-取代的烷基修饰,2’-脱氧修饰,核苷酸衍生物修饰或其中任意两种以上的组合。
17.根据权利要求15或16所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述核苷酸的修饰选自2’-F修饰、2’-O-CH3修饰、2’-O-CH2-CH2-O-CH3修饰、2’-O-CH2-CH=CH2修饰、2’-CH2-CH2-CH=CH2修饰、2’-脱氧修饰,核苷酸衍生物修饰或其中任意两种以上的组合。
18.根据权利要求16或17所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述核苷酸衍生物修饰中的核苷酸衍生物选自异核苷酸、LNA、ENA、cET、UNA或GNA。
19.根据权利要求15-18任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述正义链中第7位、第9位、第10位和第11位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述正义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
20.根据权利要求15-19任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述正义链包含位于如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:
所述正义链5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述正义链5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间;
所述正义链3’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述正义链3’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间;
或者,
所述正义链包含位于如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:
所述正义链5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述正义链5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
21.根据权利要求15-20任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中任意奇数位置处的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,所述反义链中任意偶数位置处的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第6位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第6位、第8位、第9位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中第6位的核糖核苷酸为核苷酸衍生物GNA修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸;
或者,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链中第2位、第6位、第14位和第16位的核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,所述反义链中第7位的核糖核苷酸为核苷酸衍生物GNA修饰的核糖核苷酸,所述反义链中其余位置的核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸。
22.根据权利要求15-21任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,沿5’末端向3’末端方向,所述反义链的5’末端的核苷酸连接5’磷酸基团或5’磷酸衍生基团。
23.根据权利要求15-22任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述反义链包含位于如下所示位置处的硫代磷酸二酯键:
所述反义链5’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述反义链5’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间;
所述反义链3’末端起始的第1个核苷酸与第2个核苷酸之间;
所述反义链3’末端起始的第2个核苷酸与第3个核苷酸之间。
24.根据权利要求15-23任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物的正义链具有如(a1)-(a5)任一项所示的结构:
(a1)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(a2)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(a3)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(a4)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-3’,
(a5)5’-mN1-(s)-mN2-(s)-mN3-mN4-mN5-mN6-N7f-mN8-N9f-N10f-N11f-mN12-mN13-mN14-mN15-mN16-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-3’;
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,
大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,
小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,
小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,
-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接。
25.根据权利要求15-24任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物的反义链具有如(b1)-(b15)任一项所示的结构:
(b1)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b2)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-(s)-N20f-(s)-mN21-3’,
(b3)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-N4f-mN5-N6f-mN7-N8f-mN9-N10f-mN11-N12f-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-N18f-mN19-N20f-mN21-(s)-N22f-(s)-mN23-3’,
(b4)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b5)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b6)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b7)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b8)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b9)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-mN7-N8f-N9f-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b10)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b11)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b12)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-[GNA]N6-mN7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
(b13)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-T-(s)-T-3’,
(b14)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-(s)-mN20-(s)-mN21-3’,
(b15)5’-P1mN1-(s)-N2f-(s)-mN3-mN4-mN5-N6f-[GNA]N7-mN8-mN9-mN10-mN11-mN12-mN13-N14f-mN15-N16f-mN17-mN18-mN19-mN20-mN21-(s)-mN22-(s)-mN23-3’,
其中,N1-N23彼此独立地选自碱基为A、U、C或G的核糖核苷酸,
大写字母T表示碱基为胸腺嘧啶的脱氧核糖核苷酸,
小写字母m表示该字母m右侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-O-CH3修饰的核糖核苷酸,
小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核糖核苷酸为2’-F修饰的核糖核苷酸,
P1表示该字母右侧相邻的一个核苷酸为5’-磷酸核苷酸,
-(s)-表示前后相邻的两个核苷酸以硫代磷酸二酯键连接,
[GNA]表示其右侧相邻的一个核糖核苷酸为存在GNA修饰的核糖核苷酸。
26.根据权利要求15-25任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物为siRNA修饰物。
27.根据权利要求15-26任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述双链核糖核酸修饰物为用于抑制ANGPTL3基因表达的siRNA修饰物。
28.根据权利要求15-27任一项所述的双链核糖核酸修饰物,其中,所述正义链与所述反义链选自如下组合:
106)所述正义链包含如SEQ ID NO:216所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:237所示的核苷酸序列;
107)所述正义链包含如SEQ ID NO:217所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:238所示的核苷酸序列;
108)所述正义链包含如SEQ ID NO:218所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:239所示的核苷酸序列;
109)所述正义链包含如SEQ ID NO:219所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:240所示的核苷酸序列;
110)所述正义链包含如SEQ ID NO:220所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:241所示的核苷酸序列;
111)所述正义链包含如SEQ ID NO:221所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:242所示的核苷酸序列;
112)所述正义链包含如SEQ ID NO:222所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:243所示的核苷酸序列;
113)所述正义链包含如SEQ ID NO:223所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:244所示的核苷酸序列;
114)所述正义链包含如SEQ ID NO:224所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:245所示的核苷酸序列;
115)所述正义链包含如SEQ ID NO:225所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:246所示的核苷酸序列;
116)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:247所示的核苷酸序列;
117)所述正义链包含如SEQ ID NO:227所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:248所示的核苷酸序列;
118)所述正义链包含如SEQ ID NO:228所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:249所示的核苷酸序列;
119)所述正义链包含如SEQ ID NO:229所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:250所示的核苷酸序列;
120)所述正义链包含如SEQ ID NO:230所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:251所示的核苷酸序列;
121)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:252所示的核苷酸序列;
122)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:253所示的核苷酸序列;
123)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:254所示的核苷酸序列;
124)所述正义链包含如SEQ ID NO:234所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:241所示的核苷酸序列;
125)所述正义链包含如SEQ ID NO:235所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:247所示的核苷酸序列;
126)所述正义链包含如SEQ ID NO:236所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:253所示的核苷酸序列;
127)所述正义链包含如SEQ ID NO:278所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:288所示的核苷酸序列;
128)所述正义链包含如SEQ ID NO:279所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:289所示的核苷酸序列;
129)所述正义链包含如SEQ ID NO:280所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:290所示的核苷酸序列;
130)所述正义链包含如SEQ ID NO:281所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:291所示的核苷酸序列;
131)所述正义链包含如SEQ ID NO:282所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:292所示的核苷酸序列;
132)所述正义链包含如SEQ ID NO:283所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:293所示的核苷酸序列;
133)所述正义链包含如SEQ ID NO:284所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:294所示的核苷酸序列;
134)所述正义链包含如SEQ ID NO:285所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:295所示的核苷酸序列;
135)所述正义链包含如SEQ ID NO:286所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:296所示的核苷酸序列;
136)所述正义链包含如SEQ ID NO:287所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:297所示的核苷酸序列;
160)所述正义链包含如SEQ ID NO:344所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:354所示的核苷酸序列;
161)所述正义链包含如SEQ ID NO:345所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:355所示的核苷酸序列;
162)所述正义链包含如SEQ ID NO:346所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:356所示的核苷酸序列;
163)所述正义链包含如SEQ ID NO:347所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:357所示的核苷酸序列;
164)所述正义链包含如SEQ ID NO:348所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:358所示的核苷酸序列;
165)所述正义链包含如SEQ ID NO:349所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:359所示的核苷酸序列;
166)所述正义链包含如SEQ ID NO:350所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:360所示的核苷酸序列;
167)所述正义链包含如SEQ ID NO:351所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:361所示的核苷酸序列;
168)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:362所示的核苷酸序列;
169)所述正义链包含如SEQ ID NO:352所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:362所示的核苷酸序列;
170)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:363所示的核苷酸序列;
171)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:364所示的核苷酸序列;
172)所述正义链包含如SEQ ID NO:231所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:365所示的核苷酸序列;
173)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:366所示的核苷酸序列;
174)所述正义链包含如SEQ ID NO:236所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:366所示的核苷酸序列;
175)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:367所示的核苷酸序列;
176)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:368所示的核苷酸序列;
177)所述正义链包含如SEQ ID NO:232所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:369所示的核苷酸序列;
178)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:370所示的核苷酸序列;
179)所述正义链包含如SEQ ID NO:353所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:370所示的核苷酸序列;
180)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:371所示的核苷酸序列;
181)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:372所示的核苷酸序列;
182)所述正义链包含如SEQ ID NO:233所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:373所示的核苷酸序列;
183)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:381所示的核苷酸序列;
184)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:382所示的核苷酸序列;
185)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:383所示的核苷酸序列;
186)所述正义链包含如SEQ ID NO:389所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:384所示的核苷酸序列;
187)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:394所示的核苷酸序列;
188)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:395所示的核苷酸序列;
189)所述正义链包含如SEQ ID NO:391所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:395所示的核苷酸序列;
190)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:396所示的核苷酸序列;
191)所述正义链包含如SEQ ID NO:390所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:397所示的核苷酸序列;
192)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:398所示的核苷酸序列;
193)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:399所示的核苷酸序列;
194)所述正义链包含如SEQ ID NO:393所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:399所示的核苷酸序列;
195)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:400所示的核苷酸序列;
196)所述正义链包含如SEQ ID NO:392所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:401所示的核苷酸序列;
197)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:377所示的核苷酸序列;
198)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:378所示的核苷酸序列;
199)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:402所示的核苷酸序列;
200)所述正义链包含如SEQ ID NO:226所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ IDNO:403所示的核苷酸序列。
29.一种双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物包括如权利要求1-14任一项所述的双链核糖核酸,或如权利要求15-28任一项所述的双链核糖核酸修饰物;以及,缀合连接于所述双链核糖核酸或所述双链核糖核酸修饰物的缀合基团。
30.根据权利要求29所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述缀合基团具有如下所示结构:
31.根据权利要求29或30所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述缀合基团连接于正义链的3’末端。
32.根据权利要求31所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述缀合基团通过磷酸二酯键与正义链的3’末端缀合连接;
优选地,所述双链核糖核酸缀合物的正义链与反义链互补形成所述双链核糖核酸缀合物的双链区,且所述正义链的3’末端形成平末端,所述反义链的3’末端具有1-2个延伸出所述双链区的突出的核苷酸;
或者,
所述双链核糖核酸缀合物的正义链与反义链互补形成所述双链核糖核酸缀合物的双链区,且所述正义链的3’末端形成平末端,所述反义链的3’末端形成平末端。
33.根据权利要求29-32任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物具有如下所示结构:
其中,双螺旋结构为双链核糖核酸或双链核糖核酸修饰物。
34.根据权利要求29-33任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物为siRNA缀合物。
35.根据权利要求29-34任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物是用于抑制ANGPTL3基因表达的siRNA缀合物。
36.根据权利要求29-35任一项所述的双链核糖核酸缀合物,其中,所述双链核糖核酸缀合物由表1所示的任意一种siRNA与缀合基团连接形成,或者,所述双链核糖核酸缀合物由表1-1所示的任意一种siRNA与缀合基团连接形成,或者,所述双链核糖核酸缀合物由表2所示的任意一种siRNA修饰物与缀合基团连接形成;
优选地,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ IDNO:255所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:241所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:247所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:253所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:377所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:378所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:379所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:256所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:380所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:366所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:367所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:368所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:257所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:369所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:362所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:363所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:364所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:365所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:370所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:371所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:372所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:373所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:381所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:382所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:383所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:376所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:384所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:374所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:252所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:375所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:254所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:394所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:395所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:396所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:404所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:397所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:398所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:399所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:400所示的核苷酸序列;
或者,所述双链核糖核酸缀合物中,连接缀合物基团的正义链包含如SEQ ID NO:405所示的核苷酸序列,所述反义链包含如SEQ ID NO:401所示的核苷酸序列。
37.一种药物组合物,其中,所述药物组合物包括如下至少一项:如权利要求1-14任一项所述的双链核糖核酸,如权利要求15-28任一项所述的双链核糖核酸修饰物,如权利要求29-36任一项所述的双链核糖核酸缀合物。
38.根据权利要求37所述的药物组合物,其中,所述药物组合物还包括一种或多种药学上可接收的载体。
39.根据权利要求1-14任一项所述的双链核糖核酸,根据权利要求15-28任一项所述的双链核糖核酸修饰物,根据权利要求29-36任一项所述的双链核糖核酸缀合物,或根据权利要求37-38任一项所述的药物组合物在如下至少一项中的用途:
(1)抑制ANGPTL3基因表达,或制备用于抑制ANGPTL3基因表达的药物;
(2)用于预防或治疗与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病,或制备用于预防或治疗与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病的药物;
(3)用于治疗患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病的受试者,或制备用于治疗患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病的受试者的药物。
40.根据权利要求39所述的用途,其中,所述与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病选自与脂代谢相关的疾病;
可选地,所述与脂代谢相关的疾病选自如下疾病组成的组:
乳糜微粒血症综合征、2型糖尿病、家族性部分脂肪营养不良、高胆固醇血症、家族性高胆固醇血症、高甘油三酯血症、非酒精性脂肪肝、动脉粥样硬化、高甘油三酯血症、膝盖损伤及骨关节炎、血脂异常。
41.一种用于抑制细胞内ANGPTL3基因表达的方法,其中,所述方法包括将所述细胞与根据权利要求1-14任一项所述的双链核糖核酸,根据权利要求15-28任一项所述的双链核糖核酸修饰物,根据权利要求29-36任一项所述的双链核糖核酸缀合物,或根据权利要求37-38任一项所述的药物组合物接触。
42.根据权利要求41所述的方法,其中,所述细胞为体内细胞或体外细胞。
43.根据权利要求41或42所述的方法,其中,所述细胞在受试者体内。
44.根据权利要求43所述的方法,其中,所述受试者为哺乳动物,优选为人。
45.根据权利要求43或44所述的方法,其中,所述受试者具有如下至少一种特性:
体内ANGPTL3基因异常表达,更具体地为ANGPTL3基因异常高表达;
患有与ANGPTL3基因异常表达相关的疾病;
患有将受益于ANGPTL3基因表达降低的疾病。
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