CN116964061A - 作为细胞周期蛋白依赖性激酶7（cdk7）抑制剂的三环嘧啶 - Google Patents

作为细胞周期蛋白依赖性激酶7（cdk7）抑制剂的三环嘧啶 Download PDF

Info

Publication number
CN116964061A
CN116964061A CN202180094048.1A CN202180094048A CN116964061A CN 116964061 A CN116964061 A CN 116964061A CN 202180094048 A CN202180094048 A CN 202180094048A CN 116964061 A CN116964061 A CN 116964061A
Authority
CN
China
Prior art keywords
mmol
alkyl
independently
compound
mixture
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202180094048.1A
Other languages
English (en)
Inventor
I·斯坦斯菲尔德
Y·A·E·里戈尼
Y·R·F·西蒙尼特
N·C·I·安布拉德
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Janssen Pharmaceutica NV
Original Assignee
Janssen Pharmaceutica NV
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Janssen Pharmaceutica NV filed Critical Janssen Pharmaceutica NV
Publication of CN116964061A publication Critical patent/CN116964061A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D498/00—Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D498/02—Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D498/04—Ortho-condensed systems
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D498/00—Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D498/12—Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms in which the condensed system contains three hetero rings
    • C07D498/14—Ortho-condensed systems
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D519/00—Heterocyclic compounds containing more than one system of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring system not provided for in groups C07D453/00 or C07D455/00

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
  • Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)

Abstract

本发明涉及式(I)的药物化合物和包含所述化合物的药物组合物、用于制备所述化合物的方法和所述化合物作为细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)抑制剂的用途以及它们在治疗疾病例如癌症中的用途。

Description

作为细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)抑制剂的三环嘧啶
技术领域
本发明涉及药物化合物和包含所述化合物的药物组合物、用于制备所述化合物的方法和所述化合物作为细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)抑制剂的用途以及它们在治疗疾病例如癌症中的用途。
背景技术
细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)家族的成员在增殖中起关键的调节作用。CDK7在哺乳动物CDK中是独特的，具有整合的激酶活性，调节细胞周期和转录。在胞质溶胶中，CDK7作为异源三聚体复合物存在，并被认为起CDK1/2活化激酶(CAK)的作用，由此CDK7对CDK1/2中保守残基的磷酸化是完全催化CDK活性和细胞周期进程所必需的。在细胞核中，CDK7形成RNA聚合酶(RNAP)II通用转录因子复合物的激酶核，并负责磷酸化RNAP II的C-末端结构域(CTD)，这是基因转录起始的必要步骤。CDK7的两种功能，即CAK和CTD磷酸化，共同支持细胞增殖、细胞周期和转录的关键方面。
RNAP IICTD磷酸化的破坏已经显示优先影响具有短半衰期的蛋白质，包括抗细胞凋亡BCL-2家族的那些蛋白质。癌细胞已被证明能够通过上调BCL-2家族成员来规避促细胞死亡信号转导。因此，抑制人CDK7激酶活性可能导致抗增殖活性。
CDK家族成员的激酶结构域的高度序列和结构相似性阻碍了CDK7的选择性抑制剂的发现。因此，需要发现和开发选择性CDK7抑制剂。此类CKD7抑制剂有望作为治疗慢性淋巴细胞白血病和其他癌症的治疗剂。
发明内容
本发明涉及一种式(I)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X为4-7元非芳族杂环、4-10元非芳族桥接杂环、C3-7环烷基、C5-7环烯基；其中所述环中的每一者能够独立地任选地被-C1-3烷基取代；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代，并且其中所述4-7元非芳族杂环任选地被C1-3烷基、卤基或D取代；或者R1为被-NH-C(＝O)-CH＝CH-R6或-NH-C(＝O)-CH≡CH-R7取代的C1-3烷基；
A为CR2或N；
R2为H、C1-3烷基、氰基、卤基或C2-3炔基；
R3为C1-3烷基、H、卤素、C2-3烯基、C2-3炔基、氰基、C3-7环烷基；被一个、两个或三个卤基、羟基、羧基、氨基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基取代的C1-3烷基；1-咪唑基、2-咪唑基或4-咪唑基；
R4为C1-3烷基；被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选
地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基，或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
本发明还涉及一种式(I)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中，
X为4-7元非芳族杂环、4-10元非芳族桥接杂环、C4-7环烷基、C5-7环烯基；其中所述环中的每一者能够独立地任选地被-C1-3烷基取代；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代，并且其中所述4-7元非芳族杂环任选地被C1-3烷基、卤基或D取代；或者R1为被-NH-C(＝O)-CH＝CH-R6或-NH-C(＝O)-CH≡CH-R7取代的C1-3烷基；
A为CR2或N；
R2为H、C1-3烷基、或氰基；
R3为C1-3烷基、H、卤素、氰基、C3-7环烷基；或被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；
R4为甲基或H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
该化合物可以为式(II)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中X、R1、R2、R3、R4和R5中的每一者独立地如上文所定义。
该化合物可以为式(IIa)、(IIb)、(IIc)、(IId)、(IIe)或(IIf)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中在式(IIa)、(IIb)、(IIc)、(IId)、(IIe)或(IIf)的化合物中的每一者中，
每个Q独立地为CH或N；
每个Z独立地为CH或N；
R1、R2、R3、R4和R5中的每一者独立地如上文所定义；
每个R8独立地为H或-C1-3烷基；并且所述R8能够键合到所述环的任何碳或氮原子；并且
每个虚键独立地为任选的双键。
所述化合物可以为具有如上文所定义的取代基的式(I)、(II)、(IIa)、(IIb)、(IIc)、(IId)、(IIe)或(IIf)的化合物，其中
R1选自
其中
每个R9独立地为-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7；
每个R10独立地为H、-C1-3烷基、卤基或D；并且所述R10能够键合到所述环的任何碳原子；并且
R5选自
该化合物可以为式(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)或(IIIf)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中
每个R9独立地为-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7；
每个R10独立地为H、-C1-3烷基、卤基或D；并且所述R10能够键合到所述环的任何碳原子；并且
R2、R3、R4、R5、R6和R7中的每一者独立地如上文所定义。
该化合物可以为式(IVa)、(IVb)、(IVc)、(IVd)、(IVe)、(IVf)、(IVg)、(IVh)、(IVi)、(IVj)、(IVk)、(IVl)、(IVm)、(IVn)、(Ivo)、(IVp)或(IVq)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中
X、R1、R2、R3和R4中的每一者独立地如上文所定义。
该化合物可以为式(Va)或(Vb)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X、R1、R2、R3、R4和R5中的每一者独立地如上文所定义。
本发明还涉及一种式(VI)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中，
X为4-7元非芳族杂环、4-10元非芳族桥接杂环、C3-7环烷基、C5-7环烯基；其中所述环中的每一者能够独立地任选地被-C1-3烷基取代；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代，并且其中所述4-7元非芳族杂环任选地被C1-3烷基、卤基或D取代；或者R1为被-NH-C(＝O)-CH＝CH-R6或-NH-C(＝O)-CH≡CH-R7取代的C1-3烷基；
R3为C1-3烷基、H、卤素、C2-3烯基、C2-3炔基、氰基、C3-7环烷基；被一个、两个或三个卤基、羟基、羧基、氨基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基取代的C1-3烷基；1-咪唑基、2-咪唑基或4-咪唑基；
R4为C1-3烷基；被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选
地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基，或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
本发明还涉及一种式(VI)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中，
X为4-7元非芳族杂环、4-10元非芳族桥接杂环、C4-7环烷基、C5-7环烯基；其中所述环中的每一者能够独立地任选地被-C1-3烷基取代；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代，并且其中所述4-7元非芳族杂环任选地被C1-3烷基、卤基或D取代；或者R1为被-NH-C(＝O)-CH＝CH-R6或-NH-C(＝O)-CH≡CH-R7取代的C1-3烷基；
R3为C1-3烷基、H、卤素、氰基、C3-7环烷基；或被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；
R4为甲基或H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
本发明还涉及一种式(VI)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中，
X为4-7元非芳族杂环；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代；
R3为C1-3烷基、H、卤素、氰基、C3-7环烷基；或被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；
R4为甲基或H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
该化合物可以为式(VIIa)、(VIIb)、(VIIc)、(VIId)、(VIIe)或(VIIf)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
每个Q独立地为CH或N；
每个Z独立地为CH或N；
R1、R3、R4和R5中的每一者独立地如上文针对式(VI)的化合物所定义。
该化合物可以为式(VIIIa)、(VIIIb)、(VIIIc)、(VIIId)、(VIIIe)或(VIIIf)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中
R9为-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7；并且
X、R3、R4、R5、R6和R7中的每一者独立地如上文针对式(VI)的化合物所定义。
该化合物可以为式(IXa)、(IXb)、(IXc)、(IXd)、(IXe)、(IXf)、(IXg)、(IXh)、(IXi)、(IXj)、(IXk)、(IXl)、(IXm)、(IXn)、(IXo)、(IXp)或(IXq)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X、R1、R3和R4中的每一者独立地如上文针对式(VI)的化合物所定义。
在式(VI)、(VIIa)、(VIIb)、(VIIc)、(VIId)、(VIIe)、(VIIf)、(VIIIa)、(VIIIb)、(VIIIc)、(VIIId)、(VIIIe)、(VIIIf)、(IXa)、(IXb)、(IXc)、(IXd)、(IXe)、(IXf)、(IXg)、(IXh)、(IXi)、(IXj)、(IXk)、(IXl)、(IXm)、(IXn)、(IXo)、(IXp)或(IXq)的化合物中，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
R5为并且
X、R1、R3和R4中的每一者独立地如上文所定义。
该化合物可以为式(Xa)或(Xb)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X、R1、R3、R4和R5中的每一者独立地如上文所定义。
本发明特别涉及一种化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，其中所述化合物选自：
本发明进一步涉及包含本文所公开的化合物以及药学上可接受的载体的药物组合物。
本发明进一步涉及在治疗中使用的本文所公开的任何化合物。
本发明进一步涉及本文所公开的任何化合物，在预防和/或治疗由细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)介导的疾病状态或病状中使用。
本发明进一步涉及用于上文所公开的用途的任何化合物，其中由CDK7介导的疾病状态或病状为选自以下的增殖性疾病：癌症、白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)、淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、霍奇金淋巴瘤(Hodgkin’s lymphoma)、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、骨癌、骨肉瘤、尤因肉瘤(Ewing’s sarcoma)、乳腺癌、三阴性乳腺癌(TNBC)、脑癌、神经母细胞瘤、肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、大细胞肺癌、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、类风湿性关节炎、自身炎性疾病或自体免疫性疾病。
本发明还涉及本文所公开的任何化合物用于制备用于预防或治疗增殖性疾病的药物的用途。
增殖性疾病可以为癌症、白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)、淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、骨癌、骨肉瘤、尤因肉瘤、乳腺癌、三阴性乳腺癌(TNBC)、脑癌、神经母细胞瘤、肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、大细胞肺癌、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、类风湿性关节炎、自身炎性疾病或自体免疫性疾病。
本发明还涉及一种用于预防或治疗由CDK7介导的疾病状态或病状的方法，所述方法包括向对其有需要的受试者施用有效量的如本文所公开的化合物。
所述疾病或病状选自癌症、白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)、淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、骨癌、骨肉瘤、尤因肉瘤、乳腺癌、三阴性乳腺癌(TNBC)、脑癌、神经母细胞瘤、肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、大细胞肺癌、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、类风湿性关节炎、自身炎性疾病或自体免疫性疾病。
受试者可以为哺乳动物。
本发明还涉及一种调节CDK7活性的体外方法，包括使CDK7蛋白或其部分与如本文所公开的化合物接触。
以引用方式并入
本说明书中提及的所有出版物、专利、专利申请和公布的核苷酸和氨基酸序列(例如，可在GenBank或其他数据库中获得的序列)均以引用的方式并入本文，其程度如同每个单独的出版物、专利、专利申请或公布的核苷酸和氨基酸序列被具体地和单独地指示以引用的方式并入本文一样。
具体实施方式
定义
除非另有定义，否则本文所用的所有技术和科学术语具有与所要求保护的主题所属的通常理解相同的含义。在引用URL或其他此类标识符或地址的情况下，应当理解，此类标识符可以改变，并且因特网上的特定信息可以不断变化，但是通过搜索因特网可以找到等效信息。对其的引用证明了此类信息的可用性和公众传播。
应当理解，前述一般描述和以下详细描述仅为示例性和说明性的，并且不对所要求保护的任何主题构成限制。
在本申请中，除非另外特别说明，否则单数的使用包括复数。必须注意，除非上下文明确地指明，否则如本说明书和所附权利要求所用，单数形式“一个”、“一种”、“该”和“所述”包括复数指代物。在本申请中，除非另外说明，否则“或”的使用意指“和/或”。
当前面使用“约”将值表示为近似值时，应当理解，该具体值构成了另一个实施方案。如本文所用，“约X”(其中X为数值)优选地指所引用值±10％，包括端值在内。例如，术语“约8”是指7.2至8.8的值，包括端值在内；又如，术语“约8％”是指7.2％至8.8％的值，包括端值在内。在存在的情况下，所有范围均包括端值在内并且是可组合的。例如，当引用“1至5”的范围时，所引用的范围应当理解为包括“1至4”、“1至3”、“1至2”、“1至2和4至5”、“1至3和5”等范围。此外，当肯定地提供替代方案的列表时，此类列表也可包括其中可能排除替代方案中的任一个的实施方案。例如，当描述“1至5”的范围时，此类描述可涵盖其中排除1、2、3、4或5中的任一项的情形；因此，对“1至5”的引用可涵盖“1和3至5，但不包括2”，或者仅仅是“其中不包括2”。
本文给出的一些数量表述没有用术语“约”修饰。应当理解，无论是否明确地使用了术语“约”，本文所给出的每个量都意在指代实际的给定值，并且还意在指代由本领域的普通技术人员可合理推测出的这些给定值的近似值，包括这些给定值的由实验和/或测量条件和可接受的误差容限所引起的近似值。
如本文所用，表述“一个或多个”是指至少一个，例如一个、两个、三个、四个、五个或更多个，只要可能并且取决于上下文。
此外，使用的术语“包括”以及其它形式，如“包括”、“包含”和“含有”不是限制性的。
本文所用的章节标题仅用于组织目的，而不应被解释为限制所描述的主题。
标准化学术语的定义可以在参考文献中找到，包括但不限于Carey and Sundberg“Advanced Organic Chemistry 4th Ed.”A卷(2000)和B卷(2001),Plenum Press,NewYork。
除非提供具体定义，否则本文所述的分析化学、合成有机化学以及医学和药物化学所采用的命名法以及实验室程序和技术是本领域公认的那些。标准技术可以用于化学合成、化学分析、药物制备、配制和递送以及患者的治疗。标准技术可以用于重组DNA、寡核苷酸合成以及组织培养和转化(例如，电穿孔、脂质转染)。反应和纯化技术可以例如使用制造商说明书的试剂盒或如本领域通常完成的或如本文所述来进行。前述技术和程序通常可以按照常规方法进行，并且如在本说明书的全文中所引用和讨论的各种一般和更具体的参考文献中所述。
应当理解，本文所述的方法和组合物不限于本文所述的特定方法、方案、细胞系、构建体和试剂，并且因此可以变化。还应当了解，本文所用的术语只是为了描述具体实施方案的目的，并非旨在限制本文所述的方法、化合物、组合物的范围。
在上文和下文中，术语“式(I)的化合物”意指包括其加成盐、溶剂化物和立体异构体。
如本文所用，“Cx-y”(其中x和y为整数)是指构成其所指定的部分的碳原子数(不包括任选的取代基)。因此，C1-6烷基基团含有1至6个碳原子，C3-6环烷基基团含有3至6个碳原子，C1-4烷氧基基团含有1至4个碳原子等。
术语“卤基”或另选地“卤素”是指氟、氯、溴和碘。
“烷基”基团可以具有1至6个碳原子(在本文中出现时，诸如“1至6”的数值范围是指给定范围中的每个整数；例如，“1至6个碳原子”意指该烷基基团可以由1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子等组成，至多包含6个碳原子，但本发明的定义还涵盖在未指定数值范围的情况下出现的术语“烷基”)。本文所述的化合物的烷基基团可以指定为“C1-6烷基”或类似名称。
例如，在本文中作为基团或基团的一部分使用的术语“C1-4烷基”或“C1-6烷基”是指分别含有1至4个或1至6个碳原子的直链或支链饱和烃基团。此类基团的示例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、异戊基、新戊基、己基等。
术语“烯基”是指其中烷基基团的至少两个原子形成不是芳族基团的一部分的双键的烷基类型。烯基基团的非限制性示例包括-CH＝CH2、-C(CH3)＝CH2、-CH＝CHCH3、-CH＝C(CH3)2和-C(CH3)＝CHCH3。烯基部分可以为支链或直链。烯基基团可以具有2至6个碳。烯基基团可以为取代或未取代的。根据结构，烯基基团可以为单价基团或二价基团(即，亚烯基基团)。“烯基”的示例还包括“C2-4烯基”或“C2-6烯基”。
术语“炔基”是指其中烷基基团的至少两个原子形成三键的烷基基团的类型。炔基基团的非限制性示例包括-C≡CH、-C≡CCH3、-C≡CCH2CH3和-C≡CCH2CH2CH3。炔基部分可以为支链或直链。炔基基团可以具有2至6个碳。炔基基团可以为取代或未取代的。根据结构，炔基基团可以为单价基团或二价基团(即，亚炔基基团)。“炔基”的示例还包括“C2-4炔基”或“C2-6炔基”。
“烷氧基”是指“-O-烷基”基团，其中烷基如本文所定义。
在本文中作为基团或基团的一部分使用的术语“C1-4烷氧基”或“C1-6烷氧基”是指-O-C1-4烷基基团或-O-C1-6烷基基团，其中C1-4烷基和C1-6烷基如本文所定义。此类基团的示例包括甲氧基、乙氧基、丙氧基、丁氧基等。
在本文中作为基团或基团的一部分使用的术语“羟基C1-4烷基”或“羟基C1-6烷基”是指其中一个或多于一个氢原子被羟基基团替代的如本文所定义的C1-4烷基或C1-6烷基基团。因此，术语“羟基C1-4烷基”或“羟基C1-6烷基”包括单羟基C1-4烷基、单羟基C1-6烷基以及多羟基C1-4烷基和多羟基C1-6烷基。可以存在一个、两个、三个或更多个被羟基基团替代的氢原子，因此羟基C1-4烷基或羟基C1-6烷基可以具有一个、两个、三个或更多个羟基基团。此类基团的示例包括羟甲基、羟乙基、羟丙基等。
术语“卤代烷基”是指其中一个或多于一个氢原子被一个或多个卤素替代的如本文所定义的烷基基团。术语“卤代烷基”包括“卤代C1-4烷基”、“卤代C1-6烷基”、单卤代C1-4烷基、单卤代C1-6烷基、多卤代C1-4烷基和多卤代C1-6烷基。可以存在一个、两个、三个或更多个被卤素替代的氢原子，因此卤代C1-4烷基或卤代C1-6烷基可以具有一个、两个、三个或更多个卤素。卤素可以相同或者它们可以不同。卤代烷基的非限制性示例包括-CH2Cl、-CF3、-CHF2、-CH2CF3、-CF2CF3、-CF(CH3)2、氟乙基、氟甲基、三氟乙基等。
术语“杂烷基”是指其中一个或多个骨架链原子选自除碳以外的原子，例如氧、氮、硫、磷、硅或它们的组合的烷基。杂原子可以位于杂烷基基团的任何内部位置。示例包括但不限于-CH2-O-CH3、-CH2-CH2-O-CH3、-CH2-NH-CH3、-CH2-CH2-NH-CH3、-CH2-N(CH3)-CH3、-CH2-CH2-NH-CH3、-CH2-CH2-N(CH3)-CH3、-CH2-S-CH2-CH3、-CH2-CH2,-S(O)-CH3、-CH2-CH2-S(O)2-CH3、-CH2-NH-OCH3、-CH2-O-Si(CH3)3、-CH2-CH＝N-OCH3和-CH＝CH-N(CH3)-CH3。此外，最多两个杂原子可以为连续的，例如-CH2-NH-OCH3和-CH2-O-Si(CH3)3。除杂原子的数目外，“杂烷基”可以具有1至6个碳原子。
在本文中作为基团或基团的一部分使用的术语“卤代C1-4烷氧基”或“卤代C1-6烷氧基”是指其中一个或多于一个氢原子被卤素替代的如本文所定义的-O-C1-4烷基基团或-O-C1-6烷基基团。因此，术语“卤代C1-4烷氧基”或“卤代C1-6烷氧基”包括单卤代C1-4烷氧基、单卤代C1-6烷氧基以及多卤代C1-4烷氧基和多卤代C1-6烷氧基。可以存在一个、两个、三个或更多个被卤素替代的氢原子，因此卤代C1-4烷氧基或卤代C1-6烷氧基可以具有一个、两个、三个或更多个卤素。此类基团的示例包括氟乙氧基、二氟甲氧基或三氟甲氧基等。
术语“氟烷基”和“氟烷氧基”分别包括被一个或多个氟原子取代的烷基和烷氧基基团。氟烷基的非限制性示例包括-CF3、-CHF2、-CH2F、-CH2CF3、-CF2CF3、-CF2CF2CF3、-CF(CH3)3等。氟烷氧基基团的非限制性示例包括-OCF3、-OCHF2、-OCH2F、-OCH2CF3、-OCF2CF3、-OCF2CF2CF3、-OCF(CH3)2等。
如本文所用，术语“氰基C1-4烷基”或“氰基C1-6烷基”是指被一个或两个氰基基团、特别是被一个氰基基团取代的如本文所定义的C1-4烷基或C1-6烷基基团。
“氨基”是指-NH2基团。
术语“烷基胺”或“烷基氨基”是指-N(烷基)xHy基团，其中烷基如本文所定义并且x和y选自以下组：x＝1、y＝1和x＝2、y＝0。当x＝2时，烷基基团与它们所附接的氮合在一起可以任选地形成环状环系。“二烷基氨基”是指-N(烷基)2基团，其中烷基如本文所定义。
术语“羧基(carboxy)”或“羧基(carboxyl)”是指-CO2H。在一些实施方案中，羧基部分可以被“羧酸生物电子等排体”替代，该羧酸生物电子等排体是指表现出与羧酸部分类似的物理和/或化学性质的官能团或部分。羧酸生物电子等排体具有与羧酸基团类似的生物学性质。具有羧酸部分的化合物可以具有与羧酸生物电子等排体交换的羧酸部分，并且当与含羧酸的化合物相比时具有类似的物理和/或生物性质。例如，在一个实施方案中，羧酸生物电子等排体将在生理pH下离子化到与羧酸基团大致相同的程度。羧酸的生物电子等排体的示例包括但不限于：
等。
除非上下文另有说明，否则本文所用的术语“碳环基”包括芳族、非芳族、不饱和、部分饱和和完全饱和的碳环系。一般来讲，除非上下文另有说明，否则此类环系可以为单环或双环或桥接的，并且可以含有例如3至12个环成员，或4至10个环成员，或更通常5至10个环成员。提及3至6个环成员包括环中的3、4、5或6个原子，提及4至7个环成员包括环中的4、5、6或7个原子，并且提及4至6个环成员包括环中的4、5或6个原子。单环碳环基环系的示例为含有3、4、5、6、7和8个环成员，更通常3至7个环成员，并且优选地4、5、6或7个环成员，更优选地5或6个环成员的环系。双环碳环基环系的示例为含有8、9、10、11和12个环成员，并且更通常9或10个环成员的那些。在本文中提及碳环基环系的情况下，除非上下文另外指明，否则碳环基环可以任选地被一个或多个如本文所述的取代基取代(即未取代或取代)。3至12元碳环的具体示例包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基、苯基萘基、茚基、四氢萘基、薁基、降冰片烷(1,4-内-亚甲基-环己烷)、金刚烷环系。
术语“芳族”是指具有包含4n+2π电子的离域π电子体系的平面环，其中n为整数。芳族环可以由五个、六个、七个、八个、九个或多于九个原子形成。芳烃可以为任选取代的。术语“芳族”包括芳基基团(例如，苯基、萘基)和杂芳基基团(例如，吡啶基、喹啉基)。
除非上下文另有说明，术语“非芳族基团”包括没有芳族特征的不饱和环系、部分饱和和完全饱和的杂环基环系。
术语“不饱和”和“部分饱和”是指其中环结构含有共享多于一个价键的原子的环，即该环含有至少一个多重键，例如C＝C、C℃或N＝C键。
术语“完全饱和”是指其中环原子之间没有多重键的环。饱和杂环基基团包括哌啶、吗啉、硫代吗啉、哌嗪。部分饱和的杂环基基团包括吡唑啉类，例如2-吡唑啉和3-吡唑啉。
碳环基环系可以为芳基环系。
如本文所用，术语“芳基”是指碳环基芳族基团并且包括多环(例如双环)环系，其中一个或多个环为非芳族的，条件是至少一个环为芳族的。在此类多环体系中，环系可以通过芳族环或通过非芳族环附接到化合物的剩余部分。术语“芳基”包括苯基、萘基(naphthyl)或萘基(naphthalenyl)、茚基和四氢萘基。根据结构，芳基基团可以为单价基团或二价基团(即亚芳基基团)。
术语“环烷基”是指单环或多环非芳族基团，其中每一个成环原子(即，骨架原子)均为碳原子。环烷基可以为饱和的或部分不饱和的。“环烷基”的示例为“C3-6环烷基”。环烷基可以与芳族环稠合(在这种情况下，环烷基通过非芳族环碳原子键合)。环烷基基团包括具有3至10个环原子的基团。环烷基基团的例示性示例包括但不限于以下部分：
等。
术语“杂环基”、“杂环烷基”或“杂脂环”基团是指如本文所定义的碳环基，该碳环基含有至少一个通常选自氮、氧或硫的杂原子，特别是含有至多5个、至多4个、至多3个、至多2个或单个杂原子。在本文中提及杂环基环系的情况下，除非上下文另外说明，否则杂环基环可以任选地被一个或多个如本文所述的取代基取代(即未取代或取代)。该基团可以与芳基或杂芳基稠合。杂环烷基基团(也称为非芳族杂环)的例示性示例包括：
等。
术语杂脂环族还包括糖类的所有环形式，包括但不限于单糖、二糖和寡糖。除非另有说明，否则杂环烷基在环中具有2至10个碳。应当理解，当提及杂环烷基中的碳原子数时，杂环烷基中的碳原子数与构成杂环烷基的原子(包括杂原子)(即，杂环烷基环的骨架原子)的总数不同。
杂环基环系可以为具有5至12个环成员、更通常5至10个环成员的杂芳基环系。
术语“杂芳基”在本文中用于表示具有芳族特性的杂环基环系。术语“杂芳基”包括多环(例如双环)环系，其中一个或多个环为非芳族的，条件是至少一个环为芳族的。在此类多环体系中，环系可以通过芳族环或通过非芳族环附接到化合物的剩余部分。
杂芳基基团的示例为含有五至十二个环成员，并且更通常五至十个环成员的单环和双环基团。杂芳基基团可以为例如五元或六元单环或由稠合的五元环和六元环或两个稠合的六元环或两个稠合的五元环形成的双环结构。杂芳基环系可以含有至多约五个通常选自氮、氧和硫的杂原子。通常，杂芳基环将含有至多4个杂原子，更通常至多3个杂原子，更通常至多2个，例如单个杂原子。在一个实施方案中，杂芳基环含有至少一个环氮原子。杂芳基环中的氮原子可以是碱性的，如在咪唑或吡啶的情况下，或者基本上是非碱性的，如在吲哚或吡咯氮的情况下。一般来讲，杂芳基基团中存在的碱性氮原子(包括环的任何氨基基团取代基)的数目将小于五。
五元杂芳基基团的示例包括但不限于吡咯基、呋喃基、噻吩基、咪唑基、唑基、二唑基、三唑、异唑基、噻唑基、噻二唑基、异噻唑基、吡唑基、三唑基和四唑基基团。特别地，五元杂芳基基团的示例包括但不限于吡咯基、呋喃基、噻吩基、咪唑基、唑基、二唑基、异唑基、噻唑基、噻二唑基、异噻唑基、吡唑基和三唑基基团。
六元杂芳基基团的示例包括但不限于吡啶基、吡嗪基、哒嗪基、嘧啶基和三嗪基基团。
双环杂芳基基团可以为例如选自以下的基团：与含有1、2或3个环杂原子的5或6元环稠合的苯环；与含有0、1、2或3个环杂原子的5或6元环稠合的吡啶环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的嘧啶环；与含有0、1、2或3个环杂原子的5或6元环稠合的吡咯环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的吡唑环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的咪唑环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的唑环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的异唑环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的噻唑环；与含有0、1或2个环杂原子的5或6元环稠合的异噻唑环；与含有0、1、2或3个环杂原子的5或6元环稠合的噻吩环；与含有0、1、2或3个环杂原子的5或6元环稠合的呋喃环；与含有1、2或3个环杂原子的5或6元芳族环稠合的环己基环；和与含有1、2或3个环杂原子的5或6元芳族环稠合的环戊基环。
含有与另一个五元环稠合的五元环的双环杂芳基基团的具体示例包括但不限于咪唑并噻唑基(例如咪唑并[2,1-b]噻唑)和咪唑并咪唑基(例如咪唑并[1,2-a]咪唑)。
含有与五元环稠合的六元环的双环杂芳基基团的具体示例包括但不限于苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并咪唑基、苯并唑基、异苯并唑基、苯并异唑基、苯并噻唑基、苯并异噻唑基、异苯并呋喃基、吲哚基、异吲哚基、吲嗪基、二氢吲哚基、异二氢吲哚基、嘌呤基、吲唑基、吡唑并嘧啶基(例如吡唑并[1,5-a]嘧啶)、三唑并嘧啶基(例如[1,2,4]三唑并[1,5-a]嘧啶)、苯并二氧杂环戊烯基、咪唑并吡嗪基、咪唑并哒嗪基、咪唑并吡啶基和吡唑并吡啶基(例如吡唑并[1,5-a]吡啶)基团。
含有两个稠合的六元环的双环杂芳基基团的具体示例包括但不限于喹嗪基、喹啉基、异喹啉基、噌啉基、色满基、异色满基、硫代色满基、苯并吡喃基、苯并二烷基、苯并嗪基、吡啶并吡啶基、喹喔啉基、喹唑啉基、酞嗪基、萘啶基和蝶啶基基团。
含有两个稠合的六元环的双环杂芳基基团的具体示例包括但不限于喹嗪基、喹啉基、异喹啉基、苯并吡喃基、苯并二烷基、苯并嗪基、吡啶并吡啶基、喹喔啉基、喹唑啉基、酞嗪基、萘啶基和蝶啶基基团。
含有芳族环和非芳族环的多环杂芳基基团的示例包括四氢异喹啉基、四氢喹啉基、二氢苯并噻吩基、二氢苯并呋喃基、2,3-二氢-苯并[1,4]二英基、苯并[1,3]间二氧杂环戊烯基、4,5,6,7-四氢-苯并呋喃基、四氢三唑并吡嗪基(例如5,6,7,8-四氢-[1,2,4]三唑并[4,3-a]-吡嗪基)和二氢吲哚基。
含氮杂芳基环必须含有至少一个环氮原子。此外，每个环可以含有至多约四个通常选自氮、硫和氧的其他杂原子。通常，杂芳基环将含有至多3个杂原子，例如1、2或3个，更通常至多2个氮，例如单个氮。杂芳基环中的氮原子可以是碱性的，如在咪唑或吡啶的情况下，或者基本上是非碱性的，如在吲哚或吡咯氮的情况下。一般来讲，杂芳基基团中存在的碱性氮原子(包括环的任何氨基基团取代基)的数目将小于五。
含氮杂芳基基团的示例包括但不限于吡啶基、吡咯基、咪唑基、唑基、二唑基、噻二唑基、三唑基、异唑基、噻唑基、异噻唑基、吡唑基、吡嗪基、嘧啶基、哒嗪基、三嗪基、三唑基(例如，1,2,3-三唑基、1,2,4-三唑基)、四唑基、喹啉基、异喹啉基、苯并咪唑基、苯并唑基、苯并异唑基、苯并噻唑基和苯并异噻唑、吲哚基、3H-吲哚基、异吲哚基、吲嗪基、异二氢吲哚基、嘌呤基、吲唑基、喹嗪基、苯并嗪基、吡啶并吡啶基、喹喔啉基、喹唑啉基、噌啉基、酞嗪基、萘啶基和蝶啶基。
含有芳族环和非芳族环的含氮多环杂芳基基团的示例包括四氢异喹啉基、四氢喹啉基和二氢吲哚基。
非芳族杂环基基团的示例为具有3至12个环成员，更通常5至10个环成员的基团。例如，此类基团可以为单环或双环的，并且通常具有1至5个通常选自氮、氧和硫的杂原子环成员(更通常为1、2、3或4个杂原子环成员)。杂环基基团可以含有例如环醚部分(例如，如在四氢呋喃和二烷中)、环硫醚部分(例如，如在四氢噻吩和二噻烷中)、环胺部分(例如，如在吡咯烷中)以及它们的组合(例如，硫代吗啉)。
具体示例包括吗啉基、硫代吗啉基、哌啶基(例如1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基和4-哌啶基)、吡咯烷基(例如1-吡咯烷基、2-吡咯烷基和3-吡咯烷基)、氮杂环丁烷基、吡喃基(2H-吡喃基或4H-吡喃基)、二氢噻吩基、二氢吡喃基、二氢呋喃基、二氢噻唑基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、二烷基、二氧杂环戊烷基、四氢吡喃基、咪唑啉基、唑啉基、唑烷基、氧杂环丁烷基、噻唑啉基、2-吡唑啉基、吡唑烷基和哌嗪基。一般来讲，优选的非芳族杂环基基团包括饱和基团，诸如哌啶基、吡咯烷基、氮杂环丁烷基、吗啉基和哌嗪基。一般来讲，优选的非芳族杂环基基团包括饱和基团，诸如哌啶基、吡咯烷基、氮杂环丁烷基、吗啉基和哌嗪基。
在含氮非芳族杂环基环中，该环必须含有至少一个环氮原子。
含氮非芳族杂环基基团的具体示例包括氮丙啶基、吗啉基、硫代吗啉基、哌啶基(例如1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基和4-哌啶基)、吡咯烷基(例如1-吡咯烷基、2-吡咯烷基和3-吡咯烷基)、二氢噻唑基、咪唑啉基、唑啉基、噻唑啉基、2-吡唑啉基、3-吡唑啉基、吡唑烷基和哌嗪基。
3至6元单环饱和杂环基的具体示例包括吗啉基、硫代吗啉基、二烷基、哌啶基(例如1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基和4-哌啶基)、哌嗪基、吡咯烷基(例如1-吡咯烷基、2-吡咯烷基和3-吡咯烷基)、咪唑烷基、吡唑烷基、唑烷基、异唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、四氢吡喃基(例如4-四氢吡喃基)、二噻烷基、三烷基、三噻烷基、氮丙啶基、环氧乙烷基、硫杂环丙烷基、二氮丙啶基、二氧杂环己烷基(dioxarinyl)、氧杂环丁烷基、氮杂环丁烷基、硫杂环丁烷基、二氧杂环丁烷基环系。
3至6元单环杂环基的具体示例包括吗啉基、硫代吗啉基、哌啶基(例如1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基和4-哌啶基)、吡咯烷基(例如1-吡咯烷基、2-吡咯烷基和3-吡咯烷基)、咪唑烷基、吡唑烷基、唑烷基、异唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、哌嗪基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、二烷基、四氢吡喃基(例如4-四氢吡喃基)、二噻烷基、三烷基、三噻烷基、氮丙啶基、环氧乙烷基、硫杂环丙烷基、二氮丙啶基、二氧杂环己烷基、氧杂环丁烷基、氮杂环丁烷基、硫杂环丁烷基、二氧杂环丁烷基、吖丙啶基(azirinyl)、氮杂环丁二烯基(azetyl)、1,2-二硫杂环丁烯基(1,2-dithietyl)、吡咯基、呋喃基、噻吩基、咪唑基、吡唑基、唑基、噻唑基、异噻唑基、三唑基、二唑基、噻二唑基、二噻唑基、吡啶基、吡喃基、噻吡喃基、嘧啶基、噻嗪基、嗪基、三嗪基环系。
3至12元杂环的具体示例包括吗啉基、硫代吗啉基、哌啶基(例如1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基和4-哌啶基)、吡咯烷基(例如1-吡咯烷基、2-吡咯烷基和3-吡咯烷基)、咪唑烷基、吡唑烷基、唑烷基、异唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、哌嗪基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、二烷基、四氢吡喃基(例如4-四氢吡喃基)、二噻烷基、三烷基、三噻烷基、氮丙啶基、环氧乙烷基、硫杂环丙烷基、二氮丙啶基、二氧杂环己烷基、氧杂环丁烷基、氮杂环丁烷基、硫杂环丁烷基、二氧杂环丁烷基、吖丙啶基、氮杂环丁二烯基、1,2-二硫杂环丁烯基、吡咯基、呋喃基、苯硫基、咪唑基、吡唑基、唑基、噻唑基、异噻唑基、三唑基、二唑基、噻二唑基、二噻唑基、吡啶基、吡喃基、噻喃基、嘧啶基、噻嗪基、嗪基、三嗪基、氮杂环庚烷基、氧杂环庚烷基、硫杂环庚烷基(thiepanyl)、1,2-二氮杂环庚烷基、1,4-二氮杂环庚烷基、二氮杂卓基、硫氮杂卓基(thiazepinyl)、氮杂环辛烷基(azocanyl)、氮杂环辛四烯基(azocinyl)、咪唑并噻唑基(例如咪唑并-[2,1-b]噻唑基)、咪唑并-咪唑基(例如咪唑并-[1,2-a]咪唑基)、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并咪唑基、苯并唑基、异苯并唑基、苯并异唑基、苯并噻唑基、苯并异噻唑基、异苯并呋喃基、吲哚基、异吲哚基、吲嗪基、二氢吲哚基、异二氢吲哚基、嘌呤基、吲唑基、吡唑并嘧啶基(例如吡唑并[1,5-a]嘧啶基)、三唑并嘧啶基(例如[1,2,4]三唑并[1,5-a]嘧啶基)、苯并二氧杂环戊烯基、咪唑并吡啶基和吡唑并吡啶基(例如吡唑并[1,5-a]吡啶基)、喹啉基、异喹啉基、色满基、硫代色满基、异色满基、苯并二烷基、喹嗪基、苯并嗪基、吡啶并吡啶基、喹喔啉基、喹唑啉基、噌啉基、酞嗪基、萘啶基、蝶啶基、四氢异喹啉基、四氢喹啉基、二氢苯并噻吩基、二氢苯并呋喃基、2,3-二氢-苯并[1,4]二英基、苯并[1,3]间二氧杂环戊烯基、4,5,6,7-四氢苯并呋喃基、四氢三唑并吡嗪基(例如5,6,7,8-四氢-[1,2,4]三唑并[4,3-a]吡嗪基)、8-氧杂-3-氮杂双环-[3.2.1]辛烷基、2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷基、3-氧杂-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷基、3,6-二氮杂双环[3.1.1]庚烷基环系。
5至6元芳族杂环的具体示例包括但不限于吡咯基、呋喃基、苯硫基、咪唑基、呋咱基(furazanyl)、唑基、二唑基、三唑基、异唑基、噻唑基、噻二唑基、异噻唑基、吡唑基、三唑基、四唑基、吡啶基、吡嗪基、哒嗪基、嘧啶基和三嗪基环系。
杂环基和碳环基环还包括桥接环系，例如桥接环烷烃，例如降冰片烷(1,4-内-亚甲基-环己烷)、金刚烷、氧杂金刚烷；桥接吗啉环，例如8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷、2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷、3-氧杂-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷；桥接哌嗪环，例如3,6-二氮杂双环[3.1.1]庚烷；桥接哌啶环，例如1,4-亚乙基哌啶。对于稠合环系和桥接环系之间的区别的解释，参见Jerry March的Advanced Organic Chemistry，第4版，WileyInterscience，第131-133页，1992。
向环系中划的线指示该键可以附接到任何合适的且可用的环原子。
术语“任选的”或“任选地”意指随后描述的事件可能发生或可能不发生。该术语包括事件可能发生或可能不发生的情况。
在本公开的化合物中，在绘制的式中用“*”表示的碳原子为手性中心。当碳原子用“(R*)”表示时，它是指其为纯对映体，但不知道它是R对映体还是S对映体。类似地，当碳原子用“(S*)”表示时，它是指其为纯对映体，但不知道它是R对映体还是S对映体。
术语“键”或“单键”是指两个原子之间的化学键，或者当通过键接合的原子被认为是较大子结构的一部分时两个部分之间的化学键。
术语“部分”是指分子的特定链段或官能团。化学部分通常被认为是嵌入或附加到分子中的化学实体。
如本文所用，取代基“R”单独出现且没有指定数字，是指选自烷基、卤代烷基、杂烷基、烯基、环烷基、芳基、杂芳基(通过环碳键合)和杂环烷基的取代基。
如果没有明确定义，则术语“任选取代的”或“取代的”是指所提及的基团可以被一个或多个另外的基团取代，该另外的基团单独且独立地选自烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环烷基、-OH、烷氧基、芳氧基、烷硫基、芳硫基、烷基亚砜、芳基亚砜、烷基砜、芳基砜、-CN、炔基、C1-6烷基炔基、卤基、酰基、酰氧基、-CO2H、-CO2-烷基、硝基、卤代烷基、氟烷基和氨基，包括单取代和二取代的氨基基团(例如-NH2、-NHR、-N(R)2)以及它们的受保护的衍生物。在一些实施方案中，任选的取代基独立地选自卤素、-CN、-NH2、-NH(CH3)、-N(CH3)2、-OH、-CO2H、-CO2烷基，-C(＝O)NH2、-C(＝O)NH(烷基)、-C(＝O)N(烷基)2、-S(＝O)2NH2、-S(＝O)2NH(烷基)、-S(＝O)2N(烷基)2、烷基、环烷基、氟烷基、杂烷基、烷氧基、氟烷氧基、杂环烷基、芳基、杂芳基、芳氧基、烷硫基、芳硫基、烷基亚砜、芳基亚砜、烷基砜和芳基砜。在一些实施方案中，任选的取代基独立地选自卤素、–CN、-NH2、-OH、-NH(CH3)、-N(CH3)2、-CH3、-CH2CH3、-CF3、-OCH3和-OCF3。在一些实施方案中，取代的基团被一个或两个前述基团取代。在一些实施方案中，脂族碳原子(无环或环状、饱和或不饱和碳原子，不包括芳族碳原子)上的任选取代基包括氧代基(＝O)。
如本文所用，术语“治疗有效量”是指当施用于对其有需要的哺乳动物时，有效地至少部分改善或至少部分预防本文所述的疾病、病症或病状的活性化合物或药剂的量。
如本文所用，术语“组合物”旨在涵盖包含指定量的指定成分的产品，以及通过组合指定量的指定成分而直接或间接得到的任何产品。
如本文所用，术语“表达”包括将多核苷酸转录成mRNA并翻译成肽、多肽或蛋白质的过程。
术语“活化剂”在本说明书中用于表示导致指定受体活化的任何分子种类，而无论该种类本身是否与受体结合或该种类的代谢物是否与受体结合。因此，活化剂可以为受体的配体，或者它可以为代谢成受体的配体的活化剂，即在组织中形成并且为实际配体的代谢物。
如本文所用，术语“拮抗剂”是指与受体结合并随后降低激动剂诱导的受体转录活性的小分子试剂。
如本文所用，术语“激动剂”是指在不存在已知激动剂的情况下与受体结合并随后增加受体转录活性的小分子药剂。
如本文所用，术语“反向激动剂”是指与受体结合并随后降低在不存在已知激动剂的情况下存在的受体转录活性基础水平的小分子药剂。
如本文所用，术语“调节”是指与靶直接或间接相互作用以改变靶的活性，包括(仅举例而言)增强靶的活性、抑制靶的活性、限制靶的活性或延伸靶的活性。
术语“受试者”或“患者”包括哺乳动物。哺乳动物的示例包括但不限于哺乳动物类的任何成员：人、非人灵长类动物如黑猩猩、以及其他猿和猴物种：家畜，诸如牛、马、绵羊、山羊、猪；家畜，诸如兔、犬和猫；实验动物，包括啮齿动物，诸如大鼠、小鼠和豚鼠等。在一个方面，哺乳动物为人。本领域技术人员认识到，降低一种哺乳动物的病状严重程度的疗法可预测该疗法对另一种哺乳动物的效果。
如本文所用，术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”或“治疗(treatment)”包括缓解、减轻或改善疾病或病状的至少一种症状，预防另外的症状，抑制疾病或病状，例如阻止疾病或病状的发展、缓解疾病或病状、引起疾病或病状的消退、缓解由疾病或病状引起的病况、或预防性和/或治疗性地停止疾病或病状的症状。
“增殖性疾病”是指由于细胞的增殖引起的异常生长或扩展而发生的疾病。增殖性疾病可能与以下因素有关：1)正常静止细胞的病理性增殖；2)细胞从其正常位置的病理性迁移(例如，肿瘤细胞的转移)；3)蛋白水解酶如基质金属蛋白酶(例如，胶原酶、明胶酶和弹性蛋白酶)的病理性表达；或4)病理性血管生成，如增殖性视网膜病和肿瘤转移。示例性增殖性疾病包括癌症(即“恶性赘生物”)、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、自身炎性疾病和自体免疫性疾病。
术语“赘生物”和“肿瘤”在本文中可互换使用，并且是指异常的组织块，其中该组织块的生长超过正常组织的生长，并且与正常组织的生长不协调。赘生物或肿瘤可能是“良性的”或“恶性的”，这取决于以下特征：细胞分化程度(包括形态和功能性)、生长速率、局部侵袭和转移。“良性赘生物”通常是分化良好的，其特征性生长慢于恶性赘生物，并且仍局限于原发部位。此外，良性赘生物不具有浸润、侵袭或转移至远处部位的能力。示例性的良性赘生物包括但不限于脂肪瘤、软骨瘤、腺瘤、肢端血管瘤、老年性血管瘤、脂溢性角化病、雀斑样痣和皮脂腺增生。在某些情况下，某些“良性”肿瘤随后可能会发展成恶性赘生物，这可能是由肿瘤的赘生性细胞亚群中的额外遗传变化引起的，并且这些肿瘤被称为“恶变前赘生物”。示例性的恶变前赘生物为畸胎瘤。相比之下,“恶性赘生物”通常是分化不良的(发育不全)，并且其特征在于快速生长，伴有周围组织的进行性浸润、侵袭和破坏。此外，恶性赘生物通常具有转移至远端部位的能力。
如本文所用，术语“癌症”是指恶性赘生物。示例性癌症包括但不限于听神经瘤；腺癌；肾上腺癌；肛门癌；血管肉瘤(例如，淋巴管肉瘤、淋巴管内皮细胞肉瘤、血管肉瘤)；阑尾癌；良性单克隆丙球蛋白病；胆道癌(例如，胆管癌)；膀胱癌；乳腺癌(例如，乳腺腺癌、乳腺乳头状癌、乳腺癌、乳腺髓样癌)；脑癌(例如，脑膜瘤、胶质母细胞瘤、神经胶质瘤(例如，星形细胞瘤、少突神经胶质瘤)、髓母细胞瘤)；支气管癌；类癌瘤；宫颈癌(例如，宫颈腺癌)；绒毛膜癌；脊索瘤；颅咽管瘤；结肠直肠癌(例如，结肠癌、直肠癌、结肠直肠腺癌)；结缔组织癌；上皮癌；室管膜瘤；内皮肉瘤(例如，卡波西肉瘤(Kaposi’s sarcoma)、多发性特发性出血性肉瘤)；子宫内膜癌(例如子宫癌、子宫肉瘤)；食道癌(例如，食道腺癌、巴雷特腺癌(Barrett’s adenocarcinoma))；尤因肉瘤；眼癌(例如，眼内黑素瘤、成视网膜细胞瘤)；常见的高嗜酸性粒细胞增多症；胆囊癌；胃癌(例如，胃腺癌)；胃肠道间质瘤(GIST)；生殖细胞癌；头颈癌(例如，头颈部鳞状细胞癌、口腔癌(例如，口腔鳞状细胞癌)、咽喉癌(例如，喉癌、咽癌、鼻咽癌、口咽癌))；造血细胞癌(例如，白血病如急性淋巴细胞白血病(ALL)(例如，B细胞ALL、T细胞ALL)、急性骨髓性白血病(AML)(例如，B细胞AML、T细胞AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)(例如，B细胞CML、T细胞CML)和慢性淋巴细胞白血病(CLL)(例如，B细胞CLL、T细胞CLL))；淋巴瘤如霍奇金淋巴瘤(HL)(例如，B细胞HL、T细胞HL)和非霍奇金淋巴瘤(NHL)(例如，B细胞NHL，诸如弥散性大细胞淋巴瘤(DLCL)(例如，弥散性大B细胞淋巴瘤)、滤泡性淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、边缘区B细胞淋巴瘤(例如，粘膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤、淋巴节边缘区B细胞淋巴瘤、脾边缘区B细胞淋巴瘤)、原发纵隔B细胞淋巴瘤、柏基特淋巴瘤(Burkitt lymphoma)、淋巴浆细胞淋巴瘤(即，华氏巨球蛋白血症( macroglobulinemia))、毛细胞白血病(HCL)、成免疫细胞大细胞淋巴瘤、前体B淋巴母细胞性淋巴瘤和原发中枢神经系统(CNS)淋巴瘤；以及T细胞NHL，诸如前体T淋巴母细胞性淋巴瘤/白血病、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)(例如，皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)(例如，蕈样肉芽肿病、塞扎里综合征(Sezary syndrome))、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、结外自然杀伤T细胞淋巴瘤、肠病型T细胞淋巴瘤、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤和间变性大细胞淋巴瘤)；一种或多种如上所述的白血病/淋巴瘤的混合物；以及多发性骨髓瘤(MM)、重链病(例如，α链病、γ链病、μ链病)；血管母细胞瘤；下咽癌；炎性肌纤维母细胞肿瘤；免疫细胞性淀粉样变性；肾癌(例如，肾母细胞瘤，也称为维尔姆斯瘤(Wilms'tumor)、肾细胞癌)；肝癌(例如，肝细胞癌(HCC)、恶性肝细胞瘤)；肺癌(例如，支气管肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌)；平滑肌肉瘤(LMS)；肥大细胞增多症(例如，系统性肥大细胞增多症)；肌肉癌；骨髓增生异常综合征(MDS)；间皮瘤；骨髓增生性疾病(MPD)(例如，真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)、原因不明性髓样化生(AMM)(也称为骨髓纤维化(MF))、慢性特发性骨髓纤维化、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性中性粒细胞白血病(CNL)、高嗜酸性粒细胞增多综合征(HES))；神经母细胞瘤；神经纤维瘤(例如，神经纤维瘤(NF)1型或2型、施旺细胞瘤病(schwannomatosis))；神经内分泌癌(例如，胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NET)、类癌瘤)；骨肉瘤(例如，骨癌)；卵巢癌(例如，囊腺癌、卵巢胚胎癌、卵巢腺癌)；乳头状腺癌；胰腺癌(例如，胰腺腺癌、导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)、胰岛细胞瘤)；阴茎癌(例如，阴茎佩吉特病和阴囊佩吉特病(Paget'sdisease of the penis and scrotum))；松果体瘤；原始神经外胚叶肿瘤(PNT)；浆细胞瘤；副肿瘤综合征；上皮内肿瘤；前列腺癌(例如，前列腺腺癌)；直肠癌；横纹肌肉瘤；唾液腺癌；皮肤癌(例如，鳞状细胞癌(SCC)、角化棘皮瘤(KA)、黑素瘤、基底细胞癌(BCC))；小肠癌(例如，阑尾癌)；软组织肉瘤(例如，恶性纤维组织细胞瘤(MFH)、脂肪肉瘤、恶性外周神经鞘瘤(MPNST)、软骨肉瘤、纤维肉瘤、黏液肉瘤)；皮脂腺癌；小肠癌；汗腺癌；滑膜瘤；睾丸癌(例如，精原细胞瘤、睾丸胚胎性癌)；甲状腺癌(例如，甲状腺乳头状癌、乳头状甲状腺癌(PTC)、甲状腺髓样癌)；尿道癌；阴道癌；以及外阴癌(例如，外阴佩吉特病(Paget’s disease ofthe vulva))。
术语“血管生成”是指新血管的形成和生长。正常的血管生成发生在受试者的健康身体中，用于愈合伤口和在损伤后恢复流向组织的血流。健康身体通过多种方式控制血管生成，例如刺激血管生成的生长因子和血管生成抑制剂。许多疾病状态，诸如癌症、糖尿病性失明、年龄相关性黄斑变性、类风湿性关节炎和牛皮癣的特征在于异常(即，增加或过度)的血管生成。异常血管生成是指比正常身体内的血管生成大的血管生成，特别是与正常血管生成(例如，月经或伤口愈合)无关的成人体内的血管生成。异常血管生成可以提供新血管来滋养患病组织和/或破坏正常组织，并且在癌症的情况下，新血管可以允许肿瘤细胞逃逸到循环中并停留在其他器官中(肿瘤转移)。
如本文所用，“炎性疾病”是指由炎症引起、由炎症导致或导致炎症的疾病。术语“炎性疾病”还可以指失调的炎性反应，其引起巨噬细胞、粒细胞和/或T淋巴细胞的过度应答，导致异常组织损伤和/或细胞死亡。炎性疾病可以为急性或慢性炎性病状，并且可以由感染或非感染性原因引起。炎性疾病包括但不限于动脉粥样硬化、动脉硬化症、自体免疫性疾病、多发性硬化、系统性红斑狼疮、风湿性多肌痛(PMR)、痛风性关节炎、退行性关节炎、腱炎、滑囊炎、银屑病、囊性纤维化、关节骨炎、类风湿性关节炎、发炎性关节炎、舍格伦综合症(Sjogren's syndrome)、巨细胞性动脉炎、进行性全身性硬化(硬皮病)、强直性脊柱炎、多发性肌炎、皮肌炎、天疱疮、类天疱疮、糖尿病(例如，I型)、重症肌无力、桥本甲状腺炎(Hashimoto's thyroiditis)、格雷夫斯病(Graves'disease)、古德巴斯捷氏病(Goodpasture's disease)、混合性结缔组织病、硬化性胆管炎、炎性肠病、克罗恩病(Crohn's disease)、溃疡性结肠炎、恶性贫血、炎性皮肤病、普通型间质性肺炎(UIP)、石棉沉着病、硅沉着病、支气管扩张症、铍中毒、滑石沉着病、肺尘埃沉着病、结节病、脱屑性间质性肺炎、淋巴细胞性间质性肺炎、巨细胞间质性肺炎、细胞间质性肺炎、外源性变应性肺泡炎、韦格纳肉芽肿(Wegener's granulomatosis)和脉管炎的相关形式(颞动脉炎和结节性多动脉炎)、炎症性皮肤病、肝炎、迟发型过敏性反应(例如，毒叶藤皮炎)、肺炎、呼吸道炎症、成人型呼吸窘迫综合征(ARDS)、脑炎、立即性过敏反应、气喘、花粉症、过敏症、急性过敏反应、风湿热、肾小球肾炎、肾盂肾炎、蜂窝织炎、膀胱炎、慢性胆囊炎、局部缺血(缺血性损伤)、再灌注损伤、同种异体移植排斥、宿主抗移植物排斥、阑尾炎、动脉炎、睑炎、细支气管炎、支气管炎、子宫颈炎、胆管炎、绒膜羊膜炎、结膜炎、泪腺炎、皮肤肌炎、心内膜炎、子宫内膜炎、肠炎、小肠结肠炎、上髁炎、附睾炎、筋膜炎、纤维组织炎、胃炎、胃肠炎、龈炎、回肠炎、虹膜炎、喉炎、脊髓炎、心肌炎、肾炎、脐炎、卵巢炎、睾丸炎(orchitis)、骨炎、耳炎、胰腺炎、腮腺炎、心包炎、咽炎、胸膜炎、静脉炎、肺炎、直肠炎、前列腺炎、鼻炎、输卵管炎、窦炎、口炎、滑膜炎、睾丸炎(testitis)、扁桃体炎、尿道炎、膀胱炎、葡萄膜炎、阴道炎、脉管炎、外阴炎、外阴阴道炎、脉管炎、慢性支气管炎、骨髓炎、视神经炎、颞动脉炎、横贯性脊髓炎、坏死性筋膜炎和坏死性小肠结肠炎。
如本文所用，“自体免疫性疾病”是指由受试者身体针对体内正常存在的物质和组织的不适当免疫应答引起的疾病。换句话说，免疫系统将身体的某个部分误认为病原体并攻击其自身的细胞。这可能局限于某些器官(例如，在自体免疫性甲状腺炎中)或涉及不同部位的特定组织(例如，可能影响肺部和肾两者中的基底膜的古德巴斯捷氏病)。自体免疫性疾病的治疗通常使用免疫抑制，例如降低免疫应答的药物。示例性自体免疫性疾病包括但不限于肾小球肾炎、古德帕斯丘综合征(Goodpasture's syndrome)、坏死性血管炎、淋巴结炎、结节性多动脉炎、系统性红斑狼疮、类风湿、关节炎、牛皮癣性关节炎、系统性红斑狼疮、牛皮癣、溃疡性结肠炎、全身性硬化症、皮肌炎/多发性肌炎、抗磷脂抗体综合征、硬皮病、寻常型天疱疮、ANCA相关脉管炎(例如，韦格纳肉芽肿、显微镜下多脉管炎)、葡萄膜炎、舍格伦综合症、克罗恩病、莱特尔综合征(Reiter's syndrome)、强直性脊柱炎、莱姆关节炎(Lyme arthritis)、格-巴二氏综合征(Guillain-Barrésyndrome)、桥本甲状腺炎和心肌病。
术语“自身炎性疾病”是指与自体免疫性疾病类似但不同的一类疾病。自身炎性疾病和自体免疫性疾病共有的共同特征在于这两组病症都是由免疫系统攻击受试者自身组织引起的并导致炎症增加。在自身炎性疾病中，受试者的先天免疫系统由于未知原因导致炎症。先天免疫系统即使从未在受试者体内遇到自身抗体或抗原也会做出反应。自身炎性病症的特征在于炎症的剧烈发作，这导致诸如发烧、皮疹或关节肿胀的症状。这些疾病还带有淀粉样变性的风险，这是一种重要器官中血液蛋白的潜在致命积累。自身炎性疾病包括但不限于家族性地中海热(FMF)、新生儿发作的多系统性炎性疾病(NOMID)、肿瘤坏死因子(TNF)相关周期综合征(TRAPS)、白细胞介素-1受体拮抗剂缺乏症(DIRA)和贝赫切特氏病
术语“生物样品”是指任何样品，包括组织样品(诸如组织切片和组织的针刺活检)；细胞样品(例如，细胞涂片(诸如巴氏涂片或血液涂片)或通过显微解剖获得的细胞样品)；完整生物体的样品(诸如酵母或细菌的样品)；或细胞级分、碎片或细胞器(诸如通过裂解细胞并通过离心或其他方式分离其组分而获得的)。生物样品的其他示例包括血液、血清、尿液、精液、粪便物、脑脊液、间质液、黏液、泪液、汗液、脓液、活检组织(例如，通过手术活检或针刺活检获得的)、乳头抽吸物、乳汁、阴道液、唾液、拭子(诸如口腔拭子)或含有源自第一生物样品的生物分子的任何材料。生物样品还包括转基因的那些生物样品，诸如转基因卵母细胞、精细胞、胚泡、胚胎、胎儿、供体细胞或细胞核。
异构体、盐、N-氧化物、溶剂化物、多晶型物、前药、同位素标记的衍生物
在上文和下文中，术语“式(I)、(II)、(IIIa)、(IIIb)、(IVa)、(IVb)、(Va)、(Vb)的化合物”、“本公开或本发明的化合物”、“本文提供的化合物”或类似术语意在包括其加成盐、溶剂化物和立体异构体。
在某些实施方案中，本文提供的化合物具有一个或多个立构中心，并且每个中心独立地以R构型或S构型存在。本文提供的化合物包括所有的非对映体、对映体、阻转异构体和差向异构形式以及它们的适当混合物。如果需要，通过诸如立体选择性合成和/或通过手性色谱柱分离立体异构体的方法来获得立体异构体。在一些实施方案中，本公开的化合物作为单一对映体使用。在一些实施方案中，本公开的化合物作为外消旋混合物使用。在一些实施方案中，本公开的化合物具有围绕单键的受阻旋转，产生阻转异构体。
在一些情况下，化合物可以作为互变异构体存在。所有互变异构体都包括在本文所提供化合物的范围内。
为了避免疑问，当化合物可以以几种几何异构体或互变异构体形式中的一者存在并且仅具体描述或显示一种时，仍然包括所有其他形式。互变异构体形式的示例包括例如酮形式、烯醇形式和烯醇化物形式，如在例如以下互变异构体对中：酮/烯醇(如下所示)、亚胺/烯胺、酰胺/亚氨基醇、脒/烯二胺、亚硝基/肟、硫酮/烯硫醇和硝基/酸式硝基。
此类形式，只要它们可以存在，旨在被包括在本文提供的化合物的范围内。由此可见，单一化合物可以立体异构体和互变异构体的形式存在。
在本文所述的化合物含有一个或多个手性中心并且可以以两种或更多种旋光异构体的形式存在的情况下，除非上下文另外要求，否则提及本文所述的化合物包括其所有旋光异构体形式(例如，对映体、差向异构体和非对映体)，作为单独的旋光异构体，或者两种或更多种旋光异构体的混合物(例如，外消旋混合物)。当化合物具有多于一个手性中心并且一个手性中心被表示为具有绝对立体构型时，除非上下文另有要求，否则其他手性中心包括所有旋光异构体形式，作为单独的旋光异构体或，或者其两种或更多种旋光异构体的混合物(例如，外消旋混合物)。旋光异构体可以通过它们的旋光性来表征和鉴定(即，作为+异构体和-异构体，取决于它们旋转平面偏振光的方向，或d异构体和l异构体)，或者它们可以使用由Cahn、Ingold和Prelog开发的“R和S”命名法根据它们的绝对立体化学来表征，参见Jerry March的Advanced Organic Chemistry,第4版,John Wiley&Sons,NewYork,1992,第109-114页，并且还参见Cahn,Ingold&Prelog(1966)Angew.Chem.Int.Ed.Engl.,5,385-415。例如，绝对构型未知的拆分的对映体可以根据其旋转平面偏振光的方向由(+)或(–)指定。
旋光异构体可以通过多种技术分离，包括手性色谱法(在手性载体上的色谱法)，并且这些技术是本领域技术人员熟知的。作为手性色谱法的替代方法，旋光异构体可以通过与手性酸如(+)-酒石酸、(-)-焦谷氨酸、(-)-二-甲苯酰基-L-酒石酸、(+)-扁桃酸、(-)-苹果酸和(-)-樟脑磺酸形成非对映异构体盐，通过优先结晶分离非对映异构体，并然后解离盐得到游离碱的单个对映体来分离。
在化合物以两种或更多种异构体形式存在的情况下，一种异构体形式(例如一对对映体中的一种对映异构体)可以表现出优于另一种异构体形式(例如优于另一种对映体)，例如在生物活性方面。因此，在某些情况下，可能需要仅使用一对对映体中的一种对映体，或仅使用多种非对映异构体中的一种非对映异构体作为治疗剂。
当鉴定特定的立体异构体时，这意指所述立体异构体基本上不含其他立体异构体，即与小于50％，优选地小于20％，更优选地小于10％，甚至更优选地小于5％，特别地小于2％以及最优选地小于1％的其他立体异构体相关。因此，当本文所述的化合物例如被指定为(S)时，这意味着该化合物基本上不含(R)异构体；当本文所述的化合物例如被指定为E时，这意味着该化合物基本上不含Z异构体；当本文所述的化合物例如被指定为顺式时，这意味着该化合物基本上不含反式异构体。
如本文所用，具有仅显示为实线的键而不显示为实心楔形或散列楔形键或者以其他方式未指明为在一个或多个原子周围具有特定构型(例如，R、S)的任何化学式设想了每种可能的立体异构体，或者两种或更多种立体异构体的混合物。
术语“立体异构体”、“立体异构形式”或“立体化学异构形式”在上文或下文中可互换使用。
对映体是互为不可重叠镜像的立体异构体。一对对映体的1:1混合物是外消旋体或外消旋混合物。
阻转异构体(或阻转异构体(atropoisomers))是具有特定空间构型的立体异构体，由于大的空间位阻，其产生围绕单键的受限旋转。本文所述的化合物的所有阻转异构形式旨在包括在本发明的范围内。
非对映体(或非对映异构体)是不为对映体的立体异构体，即它们不与镜像相关。如果化合物含有双键，则取代基可以是E或Z构型。二价环状(部分)饱和基团上的取代基可以具有顺式或反式构型；例如，如果化合物含有二取代的环烷基基团，则取代基可以是顺式或反式构型。因此，只要化学上可能，本公开包括对映体、阻转异构体、非对映体、外消旋体、E异构体、Z异构体、顺式异构体、反式异构体以及它们的混合物。
所有那些术语，即对映体、阻转异构体、非对映体、外消旋体、E异构体、Z异构体、顺式异构体、反式异构体以及它们的混合物的含义是技术人员已知的。
本文所述的方法和制剂包括使用具有本文提供的结构的化合物的N-氧化物(如果合适)、结晶形式(也称为多晶型物)、溶剂化物和水合物(也称为假多晶型物)、药学上可接受的盐以及它们的组合，以及这些化合物的具有相同类型的活性的活性代谢物。
在一些实施方案中，本文所述的化合物为各种形式，包括但不限于无定形形式、研磨形式和纳米颗粒形式。此外，本文所述的化合物包括结晶形式，也称为多晶型物。多晶型物包括化合物的相同元素组成的不同晶体堆积排列。多晶型物通常具有不同的X射线衍射图、熔点、密度、硬度、晶体形状、光学性质、稳定性和溶解度。各种因素如重结晶溶剂、结晶速率和储存温度可能导致单一晶形形式占主导地位。
在具体实施方案中，本文所述的化合物与药学上可接受的溶剂如水、乙醇等以溶剂化形式存在。在其他实施方案中，本文所述的化合物以非溶剂化形式存在。
在一些实施方案中，本文所述的化合物包括其溶剂加成形式或晶体形式，特别是溶剂化物或多晶型物。如本文所用，术语“溶剂化物”意指本发明的化合物与一种或多种溶剂分子以及其药学上可接受的加成盐的物理缔合。该物理缔合涉及不同程度的离子键合和共价键合，包括氢键合。在某些情况下，溶剂化物将能够在例如一个或多个溶剂分子掺入在结晶固体的晶格中时分离出来。术语“溶剂化物”旨在既涵盖溶液相溶剂化物又涵盖可分离的溶剂化物。溶剂化物含有化学计量或非化学计量的溶剂，并且可用药学上可接受的溶剂如，水、乙醇、异丙醇、甲醇、DMSO、乙酸乙酯、乙酸、乙醇胺等在结晶的过程中形成。当溶剂为水时，形成水合物，或者当溶剂为醇时，形成醇化物。本文所述的化合物可以在它们处于溶液中时发挥它们的生物学效应。
本文所呈现的化合物的盐形式通常是药学上可接受的盐，并且药学上可接受的盐的示例在Berge等人(1977)“Pharmaceutically Acceptable Salts,”J.Pharm.Sci.，第66卷，第1-19页中讨论。然而，非药学上可接受的盐也可制备为中间体形式，然后可将中间体形式转化为药学上可接受的盐。可用于例如纯化或分离本发明的化合物的此类非药学上可接受的盐形式也构成本发明的一部分。
药学上可接受的盐包括药学上可接受的酸和碱加成盐，并且意在包括本文所述的化合物能够形成的治疗活性的无毒酸和碱加成盐形式。
本公开的盐可通过常规化学方法由含有碱性或酸性部分的母体化合物合成，这些常规化学方法诸如描述于“Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use”,P.Heinrich Stahl(编辑),Camille G.Wermuth(编辑),ISBN:3-90639-026-8，精装本，第388页,2002年8月中的方法。一般来讲，此类盐可通过以下过程制备：使这些化合物的游离酸或碱形式与适当碱或酸在水中或在有机溶剂中或者在这两者的混合物中反应；通常使用非水性介质，诸如乙醚、乙酸乙酯、乙醇、异丙醇或乙腈。本发明的化合物可作为单盐或二盐存在，这取决于形成盐的酸的pKa。
药学上可接受的酸加成盐可方便地通过用阴离子形式的此类适当的无机酸(诸如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等)或有机酸(诸如乙酸、甲磺酸、马来酸、酒石酸、柠檬酸等)处理碱形式来获得。
适当的阴离子包括例如乙酸盐、2,2-二氯乙酸盐、己二酸盐、藻酸盐、抗坏血酸盐(例如，L-抗坏血酸盐)、L-天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、4-乙酰氨基苯甲酸盐、丁酸盐、碳酸氢盐、酒石酸氢盐、溴化物、(+)樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、(+)-(1S)-樟脑-10-磺酸盐、依地酸钙、樟脑磺酸盐、癸酸盐、己酸盐、辛酸盐、碳酸盐、氯化物、肉桂酸盐、柠檬酸盐、环己基氨基磺酸盐(cyclamate)、二盐酸盐、十二烷基硫酸盐、依地酸盐、依托酸盐(estolate)、乙磺酸盐、乙烷-1,2-二磺酸盐、乙烷磺酸盐、甲酸盐、富马酸盐、半乳糖酸盐、龙胆酸盐、葡庚酸盐、葡庚糖酸盐、葡糖酸盐、D-葡糖酸盐、葡糖醛酸盐(例如，D-葡糖醛酸盐)、谷氨酸盐(例如，L-谷氨酸盐)、α-氧代戊二酸盐、乙醇酸盐、乙醇酰对氨基苯胂酸盐(glycollylarsanilate)、己基间苯二酚盐、马尿酸盐、海巴明盐(hydrabamine)、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-羟基乙烷磺酸盐、羟基萘甲酸盐、碘化物、羟乙基磺酸盐(isethionate)、乳酸盐(例如，(+)-L-乳酸盐、(±)-DL-乳酸盐)、乳糖醛酸盐(lactobionate)、苹果酸盐、(-)-L-苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、扁桃酸盐、(±)-DL扁桃酸盐、甲磺酸盐(mesylate)、甲磺酸盐(methansulfonate)、甲基溴化物、甲基硝酸盐、甲基硫酸盐、粘酸盐、萘磺酸盐(例如，萘-2-磺酸盐)、萘-1,5-二磺酸盐、1-羟基-2-萘甲酸盐、萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、乳清酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐(恩波酸盐(embonate))、泛酸盐、磷酸盐/二磷酸盐、丙酸盐、聚半乳糖醛酸盐、L-焦谷氨酸盐、丙酮酸盐、水杨酸盐、4-氨基-水杨酸盐、癸二酸盐、硬脂酸盐、碱式乙酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、鞣酸盐、酒石酸盐、(+)-L-酒石酸盐、茶氯酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐(toluenesulphonate)(例如，对甲苯磺酸盐)、甲苯磺酸盐(tosylate)、三乙基碘化物、十一碳烯酸盐、戊酸以及酰化氨基酸和阳离子交换树脂。相反地，所述盐形式可通过用适当的碱处理而转化成游离碱形式。
含有酸性质子的本公开化合物也可通过用适当的阳离子形式的有机碱和无机碱处理而转化成其无毒的金属或胺加成盐形式。适当的碱式盐包括与有机阳离子形成的那些盐，有机阳离子诸如精氨酸、苄星、苄胺、丁胺、氯普鲁卡因、胆碱、二乙醇胺、二普鲁卡因、胆碱、二乙醇胺、二环己胺、二乙醇胺、二乙胺、乙醇胺、乙胺、乙二胺、赖氨酸、葡甲胺、苯基苄胺、哌嗪、普鲁卡因、三乙胺、氨丁三醇等；与铵离子(即NH4 +)、季铵离子N(CH3)4 +和取代的铵离子(例如，NH3R+、NH2R2 +、NHR3 +、NR4 +)形成的那些盐；和与金属阳离子形成的那些盐，金属阳离子诸如铝、钙、锂、镁、钾、钠、锌等。当本文所述的化合物含有胺官能团时，这些可形成季铵盐，例如根据本领域技术人员众所周知的方法通过与烷基化剂反应。此类季铵化合物在本文所呈现的化合物的范围内。
相反地，所述盐形式可通过用适当的酸处理而转化成游离形式。
药学上可接受的盐、多晶型物和/或溶剂化物的筛选和表征可以使用多种技术来完成，包括但不限于热分析、X射线衍射、光谱学、蒸气吸附和显微术。热分析方法涉及热化学降解或热物理过程，包括但不限于多晶型转变，并且此类方法用于分析多晶型形式之间的关系、确定重量损失、发现玻璃化转变温度或用于赋形剂相容性研究。此类方法包括但不限于差示扫描量热法(DSC)、调制差示扫描量热法(MDCS)、热重分析(TGA)以及热重和红外分析(TG/IR)。X射线衍射方法包括但不限于单晶和粉末衍射仪以及同步加速器源。所使用的各种光谱技术包括但不限于拉曼光谱、FTIR、UV-VIS和NMR(液态和固态)。固态NMR(SS-NMR)也被称为魔角旋转NMR或MAS-NMR。各种显微技术包括但不限于偏振光显微术、具有能量分散X射线分析(EDX)的扫描电子显微术(SEM)、具有EDX的环境扫描电子显微术(在气体或水蒸气气氛中)、IR显微术和拉曼显微术。
在一些实施方案中，将本文所述的化合物制备为前药。“前药”是指在体内转化为母体药物的药剂。前药通常是有用的，因为在某些情况下，它们可能比母体药物更容易施用。例如，它们可以通过口服施用而被生物利用，而母体则不能。与母体药物相比，前药在药物组合物中还可以具有改善的溶解度。在一些实施方案中，前药的设计提高了有效的水溶性。在某些实施方案中，在体内施用后，前药被化学转化为该化合物的生物学、药学或治疗活性形式。在某些实施方案中，前药通过一个或多个步骤或过程被酶促代谢为该化合物的生物学、药学或治疗活性形式。
本文所述的化合物的前药包括但不限于酯、醚、碳酸酯、硫代碳酸酯、N-酰基衍生物、N-酰氧基烷基衍生物、叔胺的季衍生物、N-曼尼希碱、席夫碱(Schiff bases)、氨基酸缀合物、磷酸酯和磺酸酯。参见例如Vivekkumar K.和Bari S.“Prodrug Design”,AcademicPress,2016；Rautio,J.和Laine,K.“Textbook of Drug Design and Development”中的“Prodrugs in Drug Design and Development”,Krogsgaard-Larsen和Madsen编5,2017,第10章；以及Di和Kerns,“Drug-Like Properties”中的“Prodrugs”,2016,第2版，471-485，该参考文献中的每一者以引用方式并入本文。在一些实施方案中，本文公开的化合物中的羟基基团用于形成前药，其中羟基基团被掺入到酰氧基烷基酯、烷氧基羰基氧基烷基酯、烷基酯、芳基酯、磷酸酯、糖酯、醚等中。
本文所述的化合物的前药形式包括在权利要求的范围内，其中该前药在体内被代谢以产生如本文所述的本公开的化合物。在一些情况下，本文所述的一些化合物可以为另一种衍生物或活性化合物的前药。
在一些实施方案中，本文公开的化合物上的位点易受各种代谢反应的影响。因此，在代谢反应位置处掺入合适的取代基将减少、最小化或消除代谢途径。在具体实施方案中，降低或消除芳族环对代谢反应的敏感性的合适取代基为，仅作为示例，卤素、氘或烷基基团。
本公开的化合物包括同位素标记(即，具有一个或多个同位素取代)的化合物。这些化合物与本文所呈现的各种化学式和结构中列举的那些化合物相同，但是事实上一个或多个原子被原子质量或质量数不同于在自然界中通常发现的原子质量或质量数的原子替代。对特定元素的提及在其范围内包括该元素的所有同位素，无论是天然存在的还是合成产生的，无论是具有天然丰度还是以同位素富集形式。例如，对氢的提及在其范围内包括1H、2H(D)和3H(T)。类似地，对碳和氧提及在其范围内分别包括12C、13C和14C以及16O和18O。同位素可为放射性的或非放射性的。在本发明的一个实施方案中，化合物不含放射性同位素。在另一个实施方案中，化合物可以含有一种或多种放射性同位素。含有此类放射性同位素的化合物还可以用于诊断环境。本文所述的放射性标记化合物可以包括放射性同位素，该放射性同位素选自以下的组：2H、3H、11C、18F、122I、123I、125I、131I、75Br、76Br、77Br和82Br。优选地，放射性同位素选自2H、3H、11C和18F的组。更优选地，放射性同位素为2H。特别地，氘代化合物旨在包括在本发明的范围内。在一些实施方案中，本文所述的化合物上的代谢位点是氘代的。
在整个说明书中，可以选择它们的基团和取代基以提供稳定的部分和化合物。
化合物的合成
本文所述的化合物的合成，特别是在实施例部分中，是使用化学文献中所述的手段、使用本文所述的方法或它们的组合来完成的。此外，本文所呈现的溶剂、温度和其他反应条件可以变化。本领域公认的技术和材料描述于例如Fieser and Fieser’s Reagentsfor Organic Synthesis,第1-17卷(John Wiley and Sons,1991)；Rodd的Chemistry ofCarbon Compounds，第1-5卷和增刊(Elsevier Science Publishers,1989)；OrganicReactions,第1-40卷(John Wiley and Sons,1991),Larock’s Comprehensive OrganicTransformations(VCH Publishers Inc.,1989),March,Advanced Organic Chemistry第4版,(Wiley1992)；Carey和Sundberg,Advanced Organic Chemistry第4版,卷A和B(Plenum2000,2001)，和Green和Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis第3版,(Wiley1999)(所有这些文献以引用的方式并入本公开)。用于制备如本文公开的化合物的一般方法可以来源于反应，并且该反应可以使用合适的试剂和条件进行修饰，以引入如本文提供的式中所见的各种部分。
用于合成本文所述的化合物的起始材料和试剂可以合成或可购自商业来源，诸如但不限于Sigma-Aldrich、FischerScientific(Fischer Chemicals)和AcrosOrganics。
在本文所述的反应中，可能有必要保护反应性官能团，例如羟基、氨基、亚氨基、硫代基或羧基基团，其中这些是最终产物所需要的，以避免它们不必要地参与反应。保护基团用于封闭一些或所有的反应性部分，并防止此类基团参与化学反应，直到保护基团被去除。优选的是，每个保护基团可通过不同方式去除。在完全不同的反应条件下断裂的保护基团满足了差别去除的要求。
保护基团可以通过酸、碱、还原条件(例如，氢解)和/或氧化条件去除。基团如三苯甲基、二甲氧基三苯甲基、缩醛和叔丁基二甲基甲硅烷基是酸不稳定的，并且可以用于在用可以通过氢解去除的Cbz基团和碱不稳定的Fmoc基团保护的氨基基团的存在下保护羧基和羟基反应性部分。羧酸和羟基反应性部分可以用碱不稳定基团(诸如但不限于甲基、乙基和乙酰基)在用酸不稳定基团如氨基甲酸叔丁酯或用酸和碱稳定但可水解去除的氨基甲酸酯封端的胺的存在下封端。
羧酸和羟基反应性部分也可以用可水解去除的保护基团如苄基基团封端，而能够与酸形成氢键的胺基基团可以用碱不稳定基团如乙酰基、三氟乙酰基、叔丁氧基羰基(Boc)、苄氧基羰基(CBz)和9-芴基亚甲基氧基羰基(Fmoc)来封端。羧酸反应性部分可以通过转化成如本文举例说明的简单酯化合物来保护，其包括转化成烷基酯，或者它们可以用可氧化去除的保护基团如2,4-二甲氧基苄基封端，而共存的氨基基团可以用氟不稳定的氨基甲酸甲硅烷基酯封端。
烯丙基封端基团在酸保护基团和碱保护基团的存在下是有用的，因为前者是稳定的并且可以随后通过金属或π酸催化剂去除。例如，烯丙基封端的羧酸可以在酸不稳定的氨基甲酸叔丁酯或碱不稳定的乙酸胺保护基团的存在下用Pd0催化的反应去保护。另一种形式的保护基团是可以与化合物或中间体附接的树脂。只要残基附接到树脂，该官能团就被封端并且不能反应。一旦从树脂中释放，官能团就可以用于反应。
通常，封端/保护基团可以选自：
其他保护基团，加上适用于保护基团的产生和去除的技术的详细描述都描述于T.W.Greene和P.G.M.Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis,第4版,Wiley,Hoboken,New Jersey,2007中，该文献的公开内容以引用的方式并入本文。
技术人员将认识到，下文方案中所示的中间体和最终化合物可以根据本领域技术人员熟知的方法进一步官能化。
式(I)的化合物还可以经由本领域已知的反应或官能团转化而彼此转化。例如，取代基如-C(＝O)-O-C1-6烷基或C1-6烷基-O-C(＝O)-可以在氢氧化锂的存在下且在合适的溶剂如四氢呋喃或醇如甲醇的存在下转化成HOOC-C1-6烷基或羧基。
技术人员将认识到，在本文所述的反应中，在某些情况下，在惰性气氛下，例如在N2气体气氛下进行反应可能是可取的或必要的。
对于技术人员显而易见的是，可能需要在反应后处理之前冷却反应混合物，这意味着分离和纯化化学反应的产物所需的一系列操作，例如淬灭、柱色谱法或萃取。
技术人员将认识到，在搅拌下加热反应混合物可增强反应结果。在一些反应中，可使用微波加热代替常规加热来缩短总反应时间。
在本文所述的方法中制备的本发明化合物可以对映体的混合物，特别是对映体的外消旋混合物的形式合成，所述混合物可按照本领域已知的拆分方法彼此分离。含有碱性氮原子的式(I)的外消旋化合物可以通过与合适的手性酸反应转化成对应的非对映体盐形式。随后例如通过选择性或分级结晶分离所述非对映体盐形式，并且通过碱从其中释放对映体。分离式(I)的化合物和其药学上可接受的加成盐和溶剂化物的对映体形式的替代方式涉及使用手性固定相的液相色谱法，例如通过超临界流体色谱法。所述纯立体化学异构体形式还可衍生自适当起始物质的对应纯立体化学异构体形式，前提条件是反应立体特异性地发生。优选地，如果需要特定的立体异构体，则所述化合物将通过立体特异性制备方法合成。这些方法将有利地采用光学纯的起始物质。
在所有这些制备中，反应产物可以从反应介质中分离，并且如果需要，根据本领域通常已知的方法进一步纯化，例如萃取、结晶、研磨和色谱法。反应产物的纯度可以根据本领域通常已知的方法来测定，例如LC-MS、TLC、HPLC。
治疗方法和医疗用途、药物组合物和组合
本发明还提供了用于治疗或预防受试者的增殖性疾病(例如，癌症、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、自身炎性疾病或自体免疫性疾病)或感染性疾病(例如，病毒性疾病)的方法。此类方法包括向对其有需要的受试者施用有效量的本公开的化合物、或其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物、互变异构体、立体异构体、或同位素标记的衍生物、或其药物组合物的步骤。
被治疗的受试者为哺乳动物。受试者可以为人。受试者可以为家养动物，诸如犬、猫、牛、猪、马、绵羊或山羊。受试者可以为伴侣动物，诸如犬或猫。受试者可以为家畜动物，诸如牛、猪、马、绵羊或山羊。受试者可以为动物园动物。受试者可以为研究动物，诸如啮齿动物、犬或非人灵长类动物。受试者可以为非人转基因动物，诸如转基因小鼠或转基因猪。
使用式(I)或式(II)的化合物治疗或预防的增殖性疾病通常与CDK7的异常活性有关。CDK7的异常活性可以是升高的和/或不适当的(例如，异常的)CDK7活性。在某些实施方案中，CDK7不过表达，并且CDK7的活性升高和/或不适当。在某些其他实施方案中，CDK7过表达，并且CDK7的活性升高和/或不适当。本公开的化合物及其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物、互变异构体、立体异构体、同位素标记的衍生物和组合物可以抑制CDK7的活性并且可用于治疗和/或预防增殖性疾病。
增殖性疾病还可能与生物样品或受试者中细胞凋亡的抑制相关。本文所述的或本领域已知的所有类型的生物样品都被认为在本发明的范围内。预期CDK7的活性的抑制会经由诱导细胞凋亡而引起细胞毒性。本公开的化合物及其药学上可接受的盐、溶剂化物、水合物、互变异构体、立体异构体、同位素标记的衍生物和组合物可以诱导细胞凋亡，并因此可用于治疗和/或预防增殖性疾病。
可以受益于使用本发明的CDK7抑制剂治疗的癌症包括淋巴瘤、白血病、癌和恶性毒瘤，例如，非霍奇金淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、滤泡性淋巴瘤(FL)、粘膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤、边缘区淋巴瘤、T细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、淋巴细胞T细胞白血病、慢性髓细胞性白血病(CML)、毛细胞白血病、急性淋巴细胞T细胞白血病(T-ALL)、浆细胞瘤、免疫母细胞性大细胞白血病、巨核细胞白血病、急性巨核细胞白血病、急性骨髓性白血病(AML)、早幼粒细胞白血病、红白血病、脑(胶质瘤)、胶质母细胞瘤、乳腺癌、结直肠癌/结肠癌、前列腺癌、肺癌(包括小细胞肺癌和非小细胞肺癌)、胃癌、子宫内膜癌、黑素瘤、胰腺癌、肝癌、肾癌、鳞状细胞癌、卵巢癌、肉瘤、骨肉瘤、甲状腺癌、膀胱癌、头颈癌、睾丸癌、尤因肉瘤、横纹肌肉瘤、髓母细胞瘤、神经母细胞瘤、宫颈癌、肾癌、尿路上皮癌、外阴癌、食道癌、唾液腺癌、鼻咽癌、颊癌、口腔癌和GIST(胃肠道间质瘤)。
本领域技术人员将认识到，本发明化合物的治疗有效量是足以具有治疗活性的量，并且该量尤其根据疾病类型、治疗制剂中化合物的浓度和患者的病状而变化。通常，作为用于治疗本文所指的病症的治疗剂施用的本发明的化合物的量将由主治医师根据具体情况来确定。
治疗此类疾病的技术人员可以从下文给出的测试结果确定有效的治疗每日量。有效的治疗每日量可以为约0.005mg/kg体重至50mg/kg体重。实现治疗效果所需的根据本发明的化合物(在此也称为活性成分)的量可以根据具体情况而变化，例如根据具体化合物、施用途径、接受者的年龄和病状以及所治疗的具体病症或疾病。治疗方法还可以包括以每天一至四次摄入的方案施用活性成分。在这些治疗方法中，优选在施用之前配制根据本发明的化合物。如下文所述，合适的药物制剂是使用众所周知且容易获得的成分通过已知方法制备的。
虽然活性成分可以单独施用，但优选其以药物组合物的形式存在。因此，本发明还提供了一种药物组合物，所述药物组合物包含根据本发明的化合物以及药学上可接受的载体或稀释剂。载体或稀释剂在与组合物的其他成分相容的意义上必须是“可接受的”，并且对其接受者无害。
本发明的药物组合物可以通过药房领域熟知的任何方法制备，例如，使用诸如描述于Gennaro等人.Remington's Pharmaceutical Sciences(第18版,Mack PublishingCompany,1990，尤其参见Part 8:Pharmaceutical preparations and theirManufacture)中的那些的方法。将作为活性成分的治疗有效量的碱形式或加成盐形式的特定化合物与药学上可接受的载体以紧密混合物的形式组合，该载体可以根据施用所需的制剂形式而采用多种形式。这些药物组合物有利地为优选适于全身施用，诸如口服、经皮或肠胃外施用；或局部施用，诸如经由吸入或鼻喷雾剂的单位剂型。例如，在制备口服剂型的组合物时，在口服液体制剂如悬浮液、糖浆、酏剂和溶液的情况下，可以采用任何常用的药物介质，例如水、二醇、油、醇等；或者在粉剂、丸剂、胶囊和片剂的情况下，可以使用固体载体，诸如淀粉、糖、高岭土、润滑剂、粘结剂、崩解剂等。由于其在施用方面的方便性，片剂和胶囊剂代表了最有利的口服单位剂型，在这种情况下显然采用固体药用载体。对于肠胃外组合物，载体将通常至少大部分包括无菌水，但也可包括例如有助于溶解的其他成分。例如，可以制备可注射溶液，其中载体包括盐水溶液、葡萄糖溶液或盐水和葡萄糖溶液的混合物。还可以制备可注射混悬剂，在这种情况下，可以采用合适的液体载体、悬浮剂等。在适于经皮施用的组合物中，载体任选地包括渗透增强剂和/或合适的可润湿剂，任选地与小比例的任何性质的合适添加剂组合，该添加剂不对皮肤造成任何显著的有害作用。所述添加剂可促进对皮肤的施用和/或可有助于制备期望的组合物。这些组合物可以各种方式施用，例如作为透皮贴剂、滴剂(spot-on)或软膏剂。
尤其有利的是将上述药物组合物配制成便于施用和剂量均匀的单位剂型。如本说明书和本文的权利要求中所用的单位剂型是指适合作为单一剂量的物理离散单元，每个单元含有预定量的活性成分，其经计算为与所需的药物载体相结合产生期望的治疗效果。此类单位剂型的示例为片剂(包括刻痕片剂或包衣片剂)、胶囊剂、丸剂、粉包、干胶片、可注射溶液或混悬剂、一茶匙量、一汤匙量等、以及它们分开的多倍剂型。
正如本领域技术人员所熟知的，施用的确切剂量和频率取决于所用的具体化合物、所治疗的特定病状、所治疗的病状的严重程度、具体患者的年龄、体重、性别、病症程度和一般身体状况以及个体可能正在服用的其他药物。此外，显然所述有效每日量可以根据所治疗的受试者的反应和/或根据开具本发明的化合物的医师的评价而降低或增加。
本文所述的方法还可以包括将一种或多种另外的药剂与本发明的化合物、其药学上可接受的盐或包含此类化合物或其药学上可接受的盐的组合物组合施用的另外的步骤。此类另外的药剂包括但不限于抗增殖剂、抗癌剂、抗糖尿病剂、抗炎剂、免疫抑制剂和止痛剂。另外的药剂可以协同增强生物样品或受试者中由本发明化合物或本发明的组合物诱导的CDK7或CDK12和/或CDK13的抑制。因此，本发明化合物或组合物和另外的药剂的组合可以用于治疗对使用不含本发明化合物或组合物的另外的药剂的治疗有抗性的增殖性疾病。
本发明的化合物可单独施用或与一种或多种附加的治疗剂组合施用。组合疗法包括施用含有根据本发明的化合物和一种或多种附加的治疗剂的单一药物剂量制剂，以及施用在其各自单独的药物剂量制剂中的根据本发明的化合物和每种附加的治疗剂。例如，根据本发明的化合物和治疗剂可以在单一口服剂量组合物如片剂或胶囊中一起施用于患者，或者每种药剂可以在单独的口服剂量制剂中施用。
对于上述病状的治疗，本发明的化合物可以有利地与一种或多种其他药剂组合使用，更具体地，与其他抗癌剂或癌症治疗中的助剂组合使用。抗癌剂或助剂(治疗中的载剂)的示例包括但不限于：
-铂配位化合物，例如任选地与氨磷汀(amifostine)、卡铂(carboplatin)或奥沙利铂(oxaliplatin)组合的顺铂(cisplatin)；
-紫杉烷化合物，例如紫杉醇(paclitaxel)、紫杉醇蛋白结合颗粒(AbraxaneTM)或多西他赛(docetaxel)；
-拓扑异构酶I抑制剂，诸如喜树碱化合物，例如伊立替康(irinotecan)、SN-38、拓扑替康(topotecan)、盐酸拓扑替康(topotecan hcl)；
-拓扑异构酶II抑制剂，诸如抗肿瘤表鬼臼毒素或鬼臼毒素衍生物，例如依托泊苷(etoposide)、磷酸依托泊苷(etoposide phosphate)或替尼泊苷(teniposide)；
-抗肿瘤长春花生物碱，例如长春碱(vinblastine)、长春新碱(vincristine)或长春瑞滨(vinorelbine)；
-抗肿瘤核苷衍生物，例如5-氟尿嘧啶、甲酰四氢叶酸(leucovorin)、吉西他滨(gemcitabine)、盐酸吉西他滨(gemcitabine hcl)、卡培他滨(capecitabine)、克拉屈滨(cladribine)、氟达拉滨(fludarabine)、奈拉滨(nelarabine)；
-烷基化剂，诸如氮芥或亚硝基脲，例如环磷酰胺、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、卡莫司汀(carmustine)、噻替哌(thiotepa)、马法兰(mephalan)(美法仑(melphalan))、洛莫司汀(lomustine)、六甲蜜胺(altretamine)、白消安(busulfan)、达卡巴嗪(dacarbazine)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺，任选地与美司钠(mesna)、哌泊溴烷(pipobroman)、甲基苄肼(procarbazine)、链脲霉素(streptozocin)、替莫唑胺(temozolomide)、尿嘧啶组合；
-抗肿瘤蒽环霉素衍生物，例如柔红霉素(daunorubicin)、多柔比星(doxorubicin)，任选地与右雷佐生(dexrazoxane)、多喜(doxil)、伊达比星(idarubicin)、米托蒽醌(mitoxantrone)、表柔比星(epirubicin)、盐酸表柔比星(epirubicin hcl)、戊柔比星(valrubicin)组合；
-靶向IGF-1受体的分子，例如苦鬼臼毒素(picropodophilin)；
-氧化四膦(tetracarcin)衍生物，例如氧化四膦A；
-糖皮质激素，例如泼尼松(prednisone)或泼尼松龙(prednisolone)；
-抗体，例如曲妥珠单抗(trastuzumab)(HER2抗体)、利妥昔单抗(rituximab)(CD20抗体)、吉妥珠单抗(gemtuzumab)、吉妥珠单抗奥佐米星(gemtuzumab ozogamicin)、西妥昔单抗(cetuximab)、帕妥珠单抗(pertuzumab)、贝伐单抗(bevacizumab)、阿仑单抗(alemtuzumab)、依库丽单抗(eculizumab)、替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan)、若莫单抗(nofetumomab)、帕尼单抗(panitumumab)、托西莫单抗(tositumomab)、CNTO 328；
-雌激素受体拮抗剂或选择性雌激素受体调节剂或雌激素合成抑制剂，例如他莫昔芬(tamoxifen)、氟维司群(fulvestrant)、托瑞米芬(toremifene)、屈洛昔芬(droloxifene)、氟维司琼(faslodex)、雷洛昔芬(raloxifene)或来曲唑(letrozole)；
-芳香酶抑制剂，诸如依西美坦(exemestane)、阿那曲唑(anastrozole)、来曲唑、睾内酯(testolactone)和伏氯唑(vorozole)；
-分化剂，诸如类维生素A(retinoid)、维生素D或视黄酸和视黄酸代谢阻断剂(RAMBA)，例如异维A酸(accutane)；
-DNA甲基转移酶抑制剂，例如氮杂胞苷(azacytidine)或地西他滨(decitabine)；
-抗叶酸剂，例如培美曲塞二钠(premetrexed disodium)；
-抗菌素，例如放线菌素D(antinomycin D)、博莱霉素(bleomycin)、丝裂霉素C(mitomycin C)、放线菌素D(dactinomycin)、洋红霉素(carminomycin)、道诺霉素(daunomycin)、左旋咪唑(levamisole)、普卡霉素(plicamycin)、光神霉素(mithramycin)；
-抗代谢药，例如氯法拉滨(clofarabine)、氨基蝶呤(aminopterin)、阿糖胞苷(cytosine arabinoside)或甲氨蝶呤(methotrexate)、阿扎胞苷(azacitidine)、阿糖胞苷(cytarabine)、氟尿苷(floxuridine)、喷司他丁(pentostatin)、硫鸟嘌呤(thioguanine)；
-细胞凋亡诱导剂和抗血管生成剂，诸如Bcl-2抑制剂，例如YC 137、BH 312、维奈托克(venetoclax)、ABT 737、棉酚、HA 14-1、TW 37或癸酸；
-微管蛋白结合剂，例如康普瑞汀(combrestatin)、秋水仙碱(colchicines)或诺考达唑(nocodazole)；
-激酶抑制剂(例如EGFR(上皮生长因子受体)抑制剂、MTKI(多靶激酶抑制剂)、mTOR抑制剂)，例如弗拉平度(flavoperidol)、甲磺酸伊马替尼(imatinib mesylate)、埃罗替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、达沙替尼(dasatinib)、拉帕替尼(lapatinib)、二甲苯磺酸拉帕替尼(lapatinib ditosylate)、索拉非尼(sorafenib)、舒尼替尼(sunitinib)、马来酸舒尼替尼(sunitinib maleate)、西罗莫司(temsirolimus)；
-法呢基转移酶抑制剂，例如替吡法尼(tipifarnib)；
-组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂，例如丁酸钠、辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA)、缩酚酸肽(FR 901228)、NVP-LAQ824、R306465、奎西诺司他(quisinostat)、曲古抑菌素A(trichostatin A)、伏立诺他(vorinostat)；
-泛素-蛋白酶体路径的抑制剂，例如PS-341、万珂(Velcade)(MLN-341)或硼替佐米(bortezomib)；
-友待(Yondelis)；
-端粒酶抑制剂，例如替莫美他汀(telomestatin)；
-基质金属蛋白酶抑制剂，例如巴马司他(batimastat)、马立马司他(marimastat)、普立司他(prinostat)或美他司他(metastat)；
-重组白介素，例如阿地白介素(aldesleukin)、地尼白介素(denileukindiftitox)、干扰素α2a、干扰素α2b、聚乙二醇干扰素α2b；
-MAPK抑制剂；
-类维生素A，例如阿利维A酸(alitretinoin)、贝沙罗汀(bexarotene)、维甲酸(tretinoin)；
-三氧化二砷；
-天冬酰胺酶；
-类固醇，例如丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、醋酸甲地孕酮(megestrol acetate)、诺龙(nandrolone)(癸酸盐、苯丙酸盐)、地塞米松(dexamethasone)；
-促性腺激素释放激素激动剂或拮抗剂，例如阿巴瑞克(abarelix)、醋酸戈舍瑞林(goserelin acetate)、醋酸组氨瑞林(histrelin acetate)、醋酸亮丙瑞林(leuprolideacetate)；
-沙利度胺(Thalidomide)、来那度胺(lenalidomide)；
-巯嘌呤、米托坦(mitotane)、帕米磷酸二钠(pamidronate)、培加酶(pegademase)、培门冬酶(pegaspargase)、拉布立酶(rasburicase)；
-BH3模拟物，例如ABT-199；
-MEK抑制剂，例如PD98059、AZD6244、CI-1040；
-集落刺激因子类似物，例如非格司亭(filgrastim)、培非格司亭(pegfilgrastim)、沙莫司亭(sargramostim)；红细胞生成素或其类似物(例如达依泊汀α(darbepoetin alfa))；白介素11；奥普瑞白介素(oprelvekin)；唑来磷酸(zoledronate)、唑来膦酸(zoledronic acid)；芬太尼(fentanyl)；双膦酸酯；帕利夫明(palifermin)；
-类固醇细胞色素P450 17α-羟化酶-17,20-裂解酶抑制剂(CYP17)，例如阿比特龙(abiraterone)、醋酸阿比特龙(abiraterone acetate)；
-mTOR抑制剂，诸如雷帕霉素(rapamycins)和雷帕霉素类似物，以及mTOR激酶抑制剂；
-PI3K抑制剂和双重mTOR/PI3K抑制剂；PI3Kδ抑制剂，例如艾代拉里斯(idelalisib)和杜韦利西布(duvelisib)；
-BTK抑制剂，例如依鲁替尼(Ibrutinib)、ONO-4059、ACP-196；
-R-CHOP(向CHOP中添加美罗华(Rituxan)-环磷酰胺、多柔比星、长春新碱和泼尼松龙)；
-达雷木单抗(daratumumab)；
-BRD4抑制剂；
-CDK9抑制剂；
-SYK抑制剂；
-PKC抑制剂；
-JAK抑制剂；
-PIM激酶抑制剂；
-免疫细胞重定向剂(例如博纳吐单抗(Blinatumomab)或CAR T细胞)；和
-免疫调节剂(例如抗PD1抗体)。
因此，本发明的一个实施方案涉及一种产品，所述产品包含作为第一活性成分的根据本发明的化合物以及作为另外的活性成分的一种或多种抗癌剂，作为组合制剂用于在治疗患有癌症的患者中同时、单独或依序使用。
一种或多种其他药剂和根据本发明的化合物可以同时(例如，在单独或单一组合物中)或按任一顺序依序施用。在后一种情况下，两种或更多种化合物将在足以确保实现有利或协同作用的时间段内且以足以确保实现有利或协同作用的量和方式施用。应了解，组合的每种组分的优选施用方法和顺序以及相应的剂量和方案将取决于所施用的特定其他药剂和本发明的化合物、它们的施用途径、所治疗的特定肿瘤和所治疗的特定宿主。最佳施用方法和顺序以及剂量和方案可以由本领域技术人员使用常规方法并根据本文列出的信息容易地确定。
当以组合形式给药时，根据本发明的化合物与一种或多种其他抗癌剂的重量比可以由本领域技术人员确定。如本领域技术人员所熟知的，所述比率以及确切剂量和施用频率取决于根据本发明的具体化合物和所使用的其他抗癌剂、所治疗的特定病状、所治疗的病状的严重程度、具体患者的年龄、体重、性别、饮食、施用时间和一般身体状况、施用方式以及个体可能正在服用的其他药物。此外，显然有效每日量可以根据所治疗的受试者的反应和/或根据开具本发明的化合物的医师的评价而降低或增加。本发明的式(I)的化合物与另一种抗癌剂的具体重量比可以在1/10至10/1，更特别地1/5至5/1，甚至更特别地1/3至3/1的范围内。
实施例
以下实施例是为了说明的目的而提供的，并不旨在限制本文提供的权利要求的范围。在这些实施例和整个说明书中引用的所有文献以引用的方式并入本文，用于所有法律目的。用于合成本文所述的化合物的起始材料和试剂可以合成或可以购自商业来源，诸如但不限于Sigma-Aldrich、Acros Organics、Fluka和Fischer Scientific。
当立体中心用‘RS’表示时，这意味着获得了外消旋混合物。
对于可以作为粗产物或作为部分纯化的中间体用于下一反应步骤的中间体，理论摩尔量可以在下述反应方案中指出。
载下文中，术语：‘ACN’是指乙腈，‘AcOH’是指乙酸，‘Ar’是指氩气，‘BINAP’是指2,2'-双(二苯基膦基)-1,1'-联萘，‘BOC’是指叔丁氧基羰基，‘Boc2O’是指二碳酸二叔丁酯，是指硅藻土，‘DCM’是指二氯甲烷，‘DIPEA’是指二异丙基乙胺，‘h’是指小时，‘min’是指分钟，‘Int.’是指中间体；‘aq.’是指水溶液；‘DMAP’是指二甲基氨基吡啶，‘DMF’是指二甲基甲酰胺，‘Et2O’是指二乙醚，‘EtOAc’是指乙酸乙酯，‘HPLC’是指高效液相色谱法，‘iPrOH’是指异丙醇，‘HATU’是指1-[双(二甲基氨基)亚甲基]-1H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-1-3-氧化物六氟磷酸盐，‘LC/MS’是指液相色谱法/质谱法，‘Me-THF’是指甲基-四氢呋喃，‘MeOH’是指甲醇，‘EtOH’是指乙醇，‘NBS’是指N-溴琥珀酰亚胺，‘NCS’是指N-氯琥珀酰亚胺，‘NMR’是指核磁共振，‘Pd/C 10％’是指钯/碳负载量10％，‘Pd(OAc)2’是指乙酸钯(II)，‘Pd(PPh3)4’是指四(三苯基膦)钯(0)，‘rt’是指室温，‘SFC’是指超临界流体色谱法，‘ee’是指对映体过量，‘TBAF’是指氟化四丁基铵，‘TBDMS’或‘SMDBT’是指叔丁基二甲基甲硅烷基，‘TEA’是指三乙胺，‘TFA’是指三氟乙酸，‘THF’是指四氢呋喃，‘CV’是指柱体积，‘Quant.’是指定量，‘equiv.’是指当量，‘M.P.’或‘m.p.’是指熔点，‘OR’是指旋光度，‘DIPE’是指二异丙基乙醚，‘RaNi’是指雷尼镍(Raney Nickel)，‘NaHCO3’是指碳酸氢钠，‘BRETTPHOS’是指2-(二环己基膦基)-3,6-二甲氧基-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯，‘DMSO’是指二甲亚砜，‘NaBH3(OAc)3’是指三乙酰氧基硼氢化钠，‘DMA-DMF’是指N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛，‘v/v’是指体积/体积百分比，‘T’是指温度，‘iPrNH2’是指异丙胺。
A.中间体的制备
实施例A1
中间体1的制备：
在schlenk反应器中，将4-溴-2-氟苯酚(2.8mL，1.74g/mL，25.508mmol)、N-Boc-1,2,3,6-四氢吡啶-4-硼酸频哪醇酯(8.38g，27.101mmol)、磷酸三钾(10.9g，51.351mmol)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(0.468g，0.511mmol)、三环己基膦(0.286g，1.02mmol)在1,4-二烷(190mL，1.033g/mL，2227.65mmol)中的混合物和蒸馏水(25mL，0.998g/mL，1384.935mmol)在100℃处搅拌2小时。使反应物冷却至室温，然后倾注到水中，并用EtOAc萃取三次。倾析有机层，并将溶剂蒸发直至干燥，得到7.85g粗物质，将该粗物质通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm 120g流动相：90％庚烷，10％ EtOAc至60％庚烷，40％ EtOAc)纯化。收集含有纯化合物的级分，并将溶剂蒸发直至干燥，得到产物(5.34g；71％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A2
中间体3的制备：
将中间体1(5.3g，18.068mmol)在大气压下在EtOAc(100mL)和MeOH(75mL)中用Pd/C(10％)(1.2g，1.128mmol)作为催化剂氢化。在使反应过夜之后，通过将反应混合物通过垫过滤来去除催化剂，并将滤液蒸发直至干燥，得到产物(5.10g；96％)。产物原样用于下一步骤。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A3
中间体4的制备：
在0℃处，将硝酸(1.3mL，1.4g/mL，18.774mmol)和蒸馏水逐滴添加到中间体3(5.1g，17.267mmol)在AcOH(25mL)的搅拌溶液中，保持温度在10℃-15℃之间。使反应物温热至室温并在室温处搅拌3小时。将反应物倾注到水上，并将该混合物用EtOAc萃取两次。将合并的有机物蒸发直至干燥，得到粗产物。将该粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm 120g GraceResolv，流动相梯度：80％庚烷、20％ EtOAc至60％庚烷、40％ EtOAc)纯化。合并含有纯化合物的级分，并将溶剂蒸发直至干燥，得到产物(5.17g；88％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A4
中间体6的制备：
将四氢-4H-吡喃-4-酮(2g；19.98mmol)在MeOH(100mL)中的混合物在N2气氛下冷却至0℃。添加硼氢化钠(1.51g；39.95mmol)，并将所得溶液在室温处搅拌2小时。将反应混合物真空浓缩。将残余物用EtOAc溶解，用1M Na2CO3溶液和盐水(50ml)洗涤。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩至干。将残余物通过快速柱色谱法(SiO2，100％庚烷-0％EtOAc至0％庚烷-100％EtOAc)纯化。合并含有该化合物的级分，并在减压下浓缩，得到呈澄清油状物的产物(1.71g；83％)。
中间体7的制备：
在0℃处在N2气氛下，在30分钟内向中间体6(1.71g；16.69mmol)、咪唑(1.36g；20.03mmol)和PPh3(4.60g；17.53mmol)在THF(40mL)的溶液中逐滴添加I2(5.09g；20.03mmol)在THF(30mL)中的溶液。一旦添加完成，就使混合物升温至室温并搅拌过夜。将反应混合物用EtOAc稀释，并用饱和Na2S2O3水溶液和盐水洗涤。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；100％庚烷-0％ EtOAc至40％庚烷-60％ EtAOc)纯化。合并所需的级分并在减压下浓缩，得到呈澄清油状物的产物(2.12g；59％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体9的制备：
在N2气氛下将1,2-二溴乙烷(0.035mL；2.173g/mL；0.406mmol)添加到Zn(354mg；5.408mmol)在DMA(4mL)的悬浮液中。将混合物用热风枪短暂加热并使其冷却至室温(3次)。缓慢添加TMS-Cl(0.034mL；0.859g/mL；0.27mmol)，并将混合物在室温处搅拌30分钟。以温度不超过50℃的速率逐滴添加含中间体7的DMA(4mL)溶液(5分钟)，并保持搅拌30分钟。该溶液用于下一步骤(基于完全转化的摩尔浓度计算)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A5
中间体12的制备：
将N-溴-琥珀酰亚胺(163g，916mmol)添加到2-甲基-3-羟基吡啶(50g，458mmol)在乙腈(500mL)的溶液中。将所得混合物回流1.5h。真空去除挥发物。将如此获得的残余物用EtOAc稀释，并依次用水和盐水洗涤。然后将有机萃取物经MgSO4干燥，过滤并将滤液真空浓缩。将由此获得的粗产物在硅胶上纯化(用0至35％ EtOAc/己烷的溶剂梯度洗脱)。收集产物级分并真空浓缩，得到中间体12(64.1g，52％)。
中间体13的制备：
在-90℃处在氮气下，在10min内将2.5M nBuLi在己烷(211mL，528mmol)中的溶液逐滴添加到中间体12(64.1g，240mmol)在THF(550mL)的溶液中。将混合物在-90℃处搅拌30min，然后逐滴添加碘(73g，288mmol)在THF(180mL)中的溶液。将混合物搅拌30min，然后添加水(100ml)以淬灭混合物。将混合物用乙酸乙酯和饱和氯化铵水溶液稀释。添加亚硫酸氢钠饱和溶液(15mL)以去除过量的碘。通过缓慢添加3M HCl将混合物酸化至pH约为5。分离各层，并将有机层用盐水洗涤，然后干燥(MgSO4)并浓缩，得到中间体13(65.8g，87％)。
中间体14的制备：
在0℃处在氮气气氛下，将60％氢化钠分散体(7.9g，197.3mmol)添加到中间体13(51.6g，164.4mmol)在DMF(360mL)的溶液中。将混合物搅拌10min，然后逐滴添加氯甲基甲基醚(16.2mL，213.7mmol)并将混合物在室温处搅拌过夜。将反应物用水淬灭。添加盐水，并将混合物用乙酸乙酯萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并浓缩。将粗产物通过快速色谱法(二氧化硅；庚烷/EtOAc梯度)纯化。收集所需级分并浓缩，得到呈白色固体状的中间体14(48.8g，83％)。
中间体15的制备：
将中间体14(23.2g，64.81mmol)、4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基氧杂蒽(1.88g，3.24mmol)和碳酸铯(42.2g，129.62mmol)溶解在甲苯(200mL)中，并通过鼓泡氮气15min将混合物脱气。在氮气下添加乙酸钯(II)(0.73g，3.24mmol)，随后添加氨基甲酸叔丁酯(8.35g，71.29mmol)，并且将混合物在室温处搅拌15min，并然后在50℃处加热16h。然后使混合物冷却至室温，用水(100mL)稀释并用乙酸乙酯(2*150mL)萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并浓缩。将粗产物通过快速色谱法(二氧化硅；庚烷/EtOAc梯度)纯化。收集所需级分并浓缩，得到中间体15(10.6g，47％)。
中间体16的制备：
将37％ HCl水溶液(2.8mL，33.6mmol)添加到中间体15(10.6g，30.5mmol)在2-丙醇(250mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌72h。添加饱和NaHCO3水溶液直至pH＝7。将混合物用二氯甲烷萃取，经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到中间体16(9.3g，定量)。
实施例A6
中间体17的制备：
向2-甲基-3-羟基吡啶(20g；183.3mmol)在CH3CN(400mL)的溶液中添加NBS(65.2g；366.5mmol)。将所得混合物回流加热2小时。真空去除挥发物。将残余物用Et2O稀释并依次用水和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤并将滤液在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2，100％庚烷至65％庚烷-35％ EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的产物(23.2g；47％)。
中间体18的制备：
将中间体17(8.29g；31.06mmol)在THF(150mL)中的溶液冷却至-90℃。在15分钟内逐滴添加n-BuLi(27.33mL；2.5mol/L；68.33mmol)。将混合物搅拌30分钟，并然后用蒸馏水(10mL)淬灭。将混合物用EtOAc稀释，并添加饱和NH4Cl。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(SiO2，100/0至50/50的庚烷/EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的产物(5.09g；85％)。
中间体13的制备：
在-90℃处在氮气下，在10min内向中间体17(41g；153.6mmol)在THF(450mL)的溶液中逐滴添加n-BuLi(135.2mL；2.5mol/L；337.9mmol)。将混合物在-90℃处搅拌30min，然后逐滴添加碘(46.78g；184.33mmol)在THF(150mL)中的溶液。将混合物搅拌30分钟，然后添加水(100ml)以淬灭混合物。将混合物用乙酸乙酯和饱和氯化铵水溶液稀释。添加亚硫酸氢钠饱和溶液(5ml)以去除过量的碘。通过缓慢添加3N HCl(水溶液)使pH为酸性，达到约5的pH。分离各相，将有机层用盐水洗涤，然后干燥(MgSO4)，过滤并真空浓缩。所得产物(47g；97％)原样用于下一反应。
中间体19的制备：
将苄基溴(21.37mL；1.438g/mL；179.67mmol)添加到中间体13(47g；149.72mmol)和K2CO3(41.39g；299.44mmol)在DMF(200mL)的混合物中，并将混合物在室温处搅拌2小时。将反应混合物倾注到饱和NaCl水溶液上。将沉淀的固体过滤并用水洗涤两次。然后将固体用二氯甲烷萃取并用盐水洗涤。将有机层干燥(MgSO4)，过滤并真空浓缩。通过快速色谱法(二氧化硅；95/5至80/20的庚烷/EtOAc)纯化。收集所需级分并浓缩直至固体开始沉淀。通过过滤收集固体并用庚烷洗涤，然后干燥，得到产物(29.1g；48％)。还浓缩母液，并将残余物通过快速色谱法(二氧化硅；95/5至80/20的庚烷/EtOAc)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到另一批产物(8.4g；14％)。
中间体20的制备：
按照用于制备中间体40的方案并从中间体25开始，得到中间体20(23.4g；64％)。
中间体21的制备：
按照用于制备中间体43的方案并从中间体20开始，得到中间体21(20.3g；60％)。
中间体22的制备：
在0℃处，将NaH(6.02g；60％分散体，150.5mmol)分批添加到2-氯-5-羟基吡啶(16.3g；125.4mmol)在DMF(200mL)的溶液中并搅拌1小时，然后添加氯甲基甲基醚(19.1mL；1.06g/mL；250.9mmol)，并将混合物在室温处搅拌过夜。通过在冰浴中添加水将反应混合物淬灭，并用EtOAc萃取。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(15.2g；70％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A7
中间体24的制备：
在室温处在氮气气氛下，将中间体23(56.4g；243.025mmol)、Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2加合物(5.954g；7.291mmol)和CuI(4.628g；24.302mmol)添加到h59在DMA(702mL；0.45M；315.932mmol)的溶液中。将所得混合物在80℃处加热1小时。使混合物冷却至室温并真空去除溶剂。将深色残余物溶于乙酸乙酯(500ml)和水(500ml)中。添加25％NH4OH(50ml)和氰化钠(NaCN，1g)。通过硅藻土垫过滤出不溶物质，并分离有机层。将有机物用更多乙酸乙酯(2×200ml)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到呈粘稠褐色油状物的粗产物。进行硅胶色谱法(乙酸乙酯/庚烷的梯度为0至30％)，得到在静置时结晶的呈黄色油状物的产物(70.94g；90％)。
实施例A8
中间体25的制备：
在78℃处，将n-BuLi在己烷(38.5mL；2.5mol/L；96.3mmol)中的溶液逐滴添加到中间体22(15.2g；87.6mmol)在THF(40mL)的溶液中并在该温度处搅拌1小时。然后，添加I2(26.7g；105.1mmol)在THF(15mL)中的溶液，并将混合物在-78℃处搅拌1小时。将反应物用水淬灭，并用EtOAc萃取。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(15.5g；38％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A9
中间体27的制备：
将中间体25(15.5g；31.1mmol)、Cs2CO3(20.2g；62.1mmol)、Xantphos(1.80g；3.11mmol)和Pd2(dba)3(2.84g；3.11mmol)在N2气氛下在甲苯(250mL)中混合，并将混合物在室温处搅拌10min，然后添加氨基甲酸叔丁酯(4.08g；34.2mmol)并在100℃处搅拌3小时。将粗混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将另一批(规模：5.5g)与该批次合并以进行纯化。将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(14.5g；90％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A10
中间体31的制备：
在室温处，向2-溴-5-羟基苄腈(9.7g；48.99mmol)和H2SO4(137.4μL；1.84g/mL；2.45mmol)在乙酸(380mL)的溶液中逐滴添加HNO3在乙酸(100mL)中的溶液。将反应混合物在室温处搅拌20小时。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；100/0至0/100的庚烷/EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的产物(4.78g；39％)。
实施例A11
中间体32的制备：
在N2气氛下，向中间体27(7g；24.2mmol)、N-boc-1,2,3,6-四氢吡啶-4-硼酸频哪醇酯(12.2g；31.5mmol)和K3PO4(10.3g；48.5mmol)在1,4-二烷(180mL)和蒸馏水(30mL)的混合物的悬浮液中添加[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)(992mg；1.21mmol)，并将混合物在80℃处在氮气下搅拌过夜。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层浓缩并将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(7.34g；70％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A12
中间体36的制备：
将中间体29(7.62g；22.76mmol)、1-Boc-哌嗪(8.48g；45.52mmol)、Pd2(dab)3(1.04g；1.138mmol)、XPhos(1.09g；2.276mmol)和Cs2CO3(11.12g；34.14mmol)置于甲苯(100mL)中，同时鼓泡氮气。然后将混合物在氮气气氛下回流搅拌16小时。使反应混合物冷却至室温并用EtOAc稀释。将混合物通过硅藻土垫过滤，并将滤液用水洗涤。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；100/0至65/35的庚烷/EtOAc)纯化，得到呈米色固体状的产物(1.92g；15％)。
实施例A13
中间体37的制备：
在N2气氛下在0℃处，将10％ Pd/C(34.0mg)添加到中间体32(7.34g；16.9mmol)在MeOH(50mL)的溶液中。将所得悬浮液在大气压下在室温处氢化过夜。将混合物通过垫过滤。将滤液在减压下浓缩，得到产物(6.87g；93％)，该产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A14
中间体40的制备：
向中间体37(6.6g；15.1mmol)在混合物iPrOH:THF(1:1；450mL)的溶液中添加HCl(75.4mL；6mol/L；226.3mmol)，并将混合物在室温处搅拌24小时。将反应混合物用EtOAc稀释并用AcONa水溶液中和至pH 4-5。将有机层用盐水洗涤并在真空下浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2；DCM/MeOH)纯化，得到产物(2.19g；37％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A15
中间体42的制备：
向中间体39(1.95g；6.16mmol)、DMAP(38.0mg；0.308mmol)和TEA(1.29mL；0.726g/mL；9.24mmol)在DCM(40mL)的溶液中添加Boc2O(1.84g；8.00mmol)，并将混合物在室温处搅拌1小时。将反应混合物在DCM和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；100/0至50/50的庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(2.36g；70％)。
实施例A16
中间体43的制备：
向中间体34(343mg；0.929mmol)和K2CO3(154mg；1.115mmol)在丙酮(10mL)的溶液中添加苄基溴(166μL；1.438g/mL；1.393mmol)，并将混合物在50℃处搅拌15小时。将反应混合物冷却至室温，在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2，100％庚烷至80％庚烷-20％EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的产物(389mg；91％)。
实施例A17
中间体44的制备：
将中间体43(8.0g；17.4mmol)、Cs2CO3(11.3g；34.7mmol)、Xantphos(1.00g；1.74mmol)和Pd2(dba)3(1.59g；1.74mmol)在N2气氛下在甲苯(220mL)中混合，并将混合物在室温处搅拌10min，然后添加氨基甲酸叔丁酯(2.64g；22.6mmol)并在100℃处搅拌16小时。将粗混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(6.7g；78％)。
实施例A18
中间体45的制备：
在N2气氛下，将10％ Pd/C(560mg)添加到中间体44(6.69g；13.5mmol)在MeOH(350mL)的溶液中。将所得悬浮液在大气压下在室温处氢化过夜。将混合物通过垫过滤。将滤液在减压下浓缩，得到产物(5.4g；98％)，该产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A19
中间体49的制备：
制备2个批次。
在N2下在28℃处，向中间体11(理论摩尔浓度0.86M，500mL)的溶液中添加4-溴-2-甲基苯酚(37g，198mmol)、乙酸钯(II)(2.2g，9.9mmol)和CPhos(4.3g，9.9mmol)的混合物。将浅棕色悬浮液在28℃处搅拌16h。将混合物用乙酸乙酯(600mL)和H2O(0.8L)稀释并通过硅藻土垫过滤。将滤液的水层用乙酸乙酯(800mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3*0.8L)、盐水(0.5L)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩。将2个批次合并，用石油醚/甲基叔丁基醚(1/1)(80mL)稀释并在室温处搅拌10min。观察到浅棕色沉淀。将沉淀滤出，用石油醚(2*50mL)洗涤并干燥(高真空，50℃，30min)，得到黄色固体的中间体49(76.5g，73％)。
浓缩滤液，得到呈棕色油状物的粗产物(100g)，将该粗产物通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至25/75，梯度)纯化。收集产物级分并蒸发溶剂，得到25g呈棕色油状物的中间体49(纯度60％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体50的制备：
在28℃处，向中间体11(理论摩尔浓度0.86M，500mL)的溶液中添加4-溴苯酚(37g；213.864mmol)、Pd(OAc)2(2.401g；10.693)和CPhos(4.669；10.693mmol)的混合物。将所得浅棕色悬浮液在28℃处在N2下搅拌16h。观察到深色悬浮液。将混合物用乙酸乙酯(600mL)和H2O(0.8L)稀释。将混合物通过硅藻土垫过滤。将滤液的水层用乙酸乙酯(800mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3*0.8L)、盐水(0.8L)洗涤，然后经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到呈棕色油状物的在静置过夜之后固化的粗产物。将混合物用甲基叔丁基醚(50mL)稀释。将混合物在室温(25℃)处搅拌10min。将沉淀滤出，用甲基叔丁基醚(2*30mL)洗涤并干燥(高真空，50℃，30min)，得到一批呈黄色固体状的产物。浓缩滤液，得到呈棕色油状物的粗残余物(48g)，将该粗残余物通过330g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至25/75，梯度)纯化。收集含有纯产物的级分并蒸发溶剂，得到呈黄色固体状的产物。合并产物批次，得到呈黄色固体状的中间体46(45g；84％)。
实施例A20
中间体51的制备：
在40℃(内部温度30℃)处，向中间体46(45g；180.5mmol)在AcOH(700mL)的黄色悬浮液中逐滴添加硝酸(13.367mL；1.44g/mL；198.55mmol)，得到深棕色溶液。将混合物在40℃处搅拌20min。得到黑色溶液。将混合物用乙酸乙酯(1.5L)稀释。将混合物用饱和Na2CO3溶液(水溶液)(3*700mL)、H2O(1L)和盐水(0.8L)洗涤，然后干燥(MgSO4)，过滤并浓缩，得到呈棕色油状物的粗产物，将该粗产物在室温处静置16h后固化。将混合物用甲基叔丁基醚(50mL)稀释。将混合物搅拌5min并过滤。将滤饼用甲基叔丁基醚(2*30mL)冲洗并在高真空(50℃，0.5h)下干燥，得到一批呈黄色固体状的产物。在真空下浓缩滤液，得到呈棕色油状物的残余物(30g)，将该残余物通过330g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至18/82，梯度)纯化。收集含有纯产物的级分并蒸发溶剂，得到呈黄色固体状的产物。合并产物批次，得到呈黄色固体状的中间体51(39g；73％)。
中间体52的制备：
平行地进行2个反应(6g和34g规模)并合并用于纯化。该方案针对34g反应进行了描述。在-15℃处，将NBS(20.383g；114.522mmol)分批添加到中间体51(34g；114.522mmol)和二氧化硅(210g)在CH2Cl2(1100mL)的悬浮液中。将混合物在-15℃处搅拌30min。过滤混合物。将滤饼用DCM(3*800mL)冲洗。浓缩滤液，得到呈黄色胶状物的粗产物。纯化通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至18/82，梯度)进行。合并含有纯产物的级分并蒸发溶剂，得到呈黄色固体状的产物(35.45g；69％，基于两个批次)。
中间体53的制备：
在40℃处，向中间体4-(4-羟基-3-甲基苯基)哌啶-1-甲酸叔丁酯[1852496-93-5](100g，323mmol)在AcOH(1.1L)的黄色悬浮液中逐滴添加硝酸(密度约1.4g/mL)(23.9mL，355mmol)。观察到深棕色溶液。将混合物在40℃处搅拌20min。将混合物用乙酸乙酯(1500mL)稀释并缓慢倾注到饱和NaHCO3水溶液(1.3L)中。将分离的水层用乙酸乙酯(300mL)萃取。将合并的有机层用H2O/盐水(1/1)(2L)的溶液洗涤，干燥(MgSO4)，过滤并浓缩，得到棕色液体，将该液体通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至90/10，梯度，35min)纯化。收集所需的级分并将溶剂在真空下蒸发，得到呈浅黄色胶状物的中间体53(91.8g，84％)，该中间体在静置后固化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A21
中间体55的制备
方法A：向中间体2a(43.4g，135mmol)在DMF(218mL)的溶液中分批添加N-溴琥珀酰亚胺(28.8g，162mmol)。将混合物在室温处搅拌过夜。添加水(400mL)，并将混合物用乙酸乙酯(400mL*2)萃取。将有机层合并，用盐水(400mL)洗涤，经Na2SO4干燥，蒸发，得到黄色固体(60g)。将粗产物通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至70/30)纯化。收集所需级分并将溶剂真空浓缩至干燥，得到呈黄色固体状的中间体55(26.5g，47％，纯度96％)。
方法B：
在0℃处，将溴(2.8mL，3.119g/mL，54.6mmol)在AcOH(40ml)中的溶液逐滴添加到中间体2a(11.8g，36.6mmol)在AcOH(130mL)和MeOH(135mL)的溶液中。将反应物在室温处搅拌7小时。将反应混合物用水(2×200ml)稀释并用EtOAc萃取三次。将合并的有机层倾析并蒸发直至干燥。
将粗产物溶于DCM中，研磨并过滤。将溶剂蒸发至干燥，得到中间体55(9g，61％)。
中间体52的制备：
在-15℃处，将NBS(20.4g，115mmol)分批添加到中间体51(34g，115mmol)和硅胶(210g)在DCM(1.1L)的悬浮液中。将混合物在-15℃处搅拌30min。过滤混合物。将滤饼用DCM(3*800mL)冲洗。浓缩滤液，得到黄色凝胶(60g)。将粗产物通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至18/82，梯度)纯化。收集产物级分并蒸发溶剂，得到呈黄色固体状的中间体52(35.4g，69％，86％纯)。
实施例A22
中间体655的制备：
在-15℃处，将N-碘琥珀酰亚胺(3.49g，15.51mmol)分批添加到中间体5(5.0g，15.51mmol)和二氧化硅(30g)在DCM(180mL)的悬浮液中。将混合物在-15℃处搅拌15min并在25℃处搅拌2h。将混合物在真空下浓缩并通过40g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至25/75，梯度)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到呈浅黄色胶状物的中间体655(6.2g，89％)。
实施例A23
中间体656的制备：
将氯化镍(II)、乙二醇二甲醚络合物(16.6mg，0.075mmol)和[4,4'-双(1,1-二甲基乙基)-2,2'-联吡啶-N1,N1']双[3,5-二氟-2-[5-(三氟甲基)-2-吡啶基-N]苯基-C]六氟磷酸铱(III)(169mg，0.15mmol)添加到4-苄氧基溴苯(2.00g，7.53mmol)、中间体101(2.53g，8.28mmol)、三(三甲基甲硅烷基)硅烷(2.06g，8.28mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(24.3mg，0.09mmol)和碳酸钠(1.60g，15.06mmol)在DME(50mL)的悬浮液中。将溶液用氮气脱气并在40℃处在72W品蓝LED照射下搅拌48h。将混合物过滤，并将滤饼用乙酸乙酯(3*80mL)冲洗。将滤液在真空下浓缩。将粗物质通过40g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至50/50，梯度)纯化。收集所需级分并将溶剂在真空下蒸发，得到中间体656(960mg，31％)。
中间体657的制备：
将中间体656(960mg，2.31mmol)和10％ Pd/C(1.0g)在甲醇/乙酸乙酯1/1(50mL)中的混合物在室温(50psi)处氢化16h。滤出催化剂并浓缩滤液，得到中间体657(700mg，90％)。
中间体658的制备：
在40℃处，将硝酸(0.15mL，2.29mmol)逐滴添加到中间体657(700mg，2.09mmol)在乙酸的溶液中。将混合物在40℃处搅拌10min，然后倾注到冰水(15mL)和乙酸乙酯(15mL)的混合物中。将水层用乙酸乙酯(3*15mL)萃取。将合并的有机层用饱和Na2CO3水溶液(20mL)缓慢处理，用盐水(20mL)洗涤，经MgSO4干燥并浓缩。将粗物质通过12g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至90/10，梯度)纯化。收集产物级分并将溶剂在真空下蒸发，得到中间体658(220mg，28％)。
中间体659的制备：
在-15℃处，将N-碘琥珀酰亚胺(136mg，0.61mmol)分批添加到中间体658(220mg，0.61mmol)和二氧化硅(1.2g)在DCM(7mL)的悬浮液中。将混合物在-15℃处搅拌15min并在25℃处搅拌16h，然后在真空下浓缩。将粗产物通过4g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/石油醚，0/100至100/0，梯度)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到中间体659(90mg，27％)。
实施例A24
中间体56的制备：
将中间体54(31.5g，102mmol)溶解于DCM(350mL)中。在25℃处添加TFA(53mL，715mmol)。将橙色溶液在25℃处搅拌16h。将混合物在真空下浓缩，得到残余物，将该残余物与甲苯(2*200mL)共蒸发，得到呈橙色液体状的中间体56(45g，定量)，将该中间体静置后固化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A25
中间体59的制备：
将中间体56(3.9g，11.4mmol)、TEA(3.16g，22.8mmol)、中间体89(2.8g，13.7mmol)在DCE(40mL)中的溶液在室温处搅拌1小时。添加三乙酰氧基硼氢化钠(3.1g，14.8mmol)，并将反应物在室温处搅拌过夜。将反应混合物浓缩。将粗化合物溶解于CH2Cl2(300mL)中，用饱和NaHCO3(100mL)、盐水(50mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并真空蒸发，得到10g粗产物。将该粗产物通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：CH2Cl2/MeOH，100/0至80/20)纯化。收集所需级分，并将溶剂在真空下浓缩至干燥，得到中间体59(2.9g，63％)。
中间体60的制备：
将DIPEA(35.9mL，206mmol)添加到中间体56(45g，103mmol)在EtOH(500mL)的溶液中。在氮气下添加中间体90(24g，109mmol)和AcOH(10.2mL，186mmol)。将混合物在30℃处搅拌1h。分批缓慢添加氰基硼氢化钠(13g，206mmol)。将混合物在30℃处搅拌16小时。将混合物在减压下浓缩。将残余物用CH2Cl2(1L)稀释，用饱和NaHCO3水溶液(11*700mL)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩，得到橙色液体(50g)。将残余物溶解在CH2Cl2(30mL)中并通过330g硅胶柱色谱法(洗脱液：MeOH/CH2Cl2，0/100至1/99，梯度)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到呈橙色固体状的中间体60(32.7g，71％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A26
中间体62的制备：
将3-氨基-3-甲基氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(3.5g，19mmol)和K2CO3(260mg，1.88mmol)的EtOH溶液(51mL)在80℃处搅拌。添加1-乙基-1-甲基-4-氧代哌啶-1-碘化(中间体108)(10.1g，37.6mmol)的水溶液(23mL)，并将反应混合物回流搅拌18h。添加水、饱和NH4Cl水溶液和DCM。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并在减压下蒸发。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm 220g Buchi，流动相：100％ DCM至DCM:95，MeOH:5，NH4OH:0.5)纯化。将含有产物的级分在真空下蒸发，得到中间体62(4.51g，89％)。
实施例A27
中间体63的制备：
在室温处，经由滴液漏斗向托品酮(5.00g，35.9mmol)在丙酮(20mL)的溶液中添加碘甲烷(2.46mL，39.5mmol)在丙酮(20mL)中的溶液。将反应物在室温处搅拌4小时，然后在玻璃料上过滤。将固体用丙酮洗涤，然后用Et2O洗涤。将固体收集并真空干燥，得到中间体63(9.12g，90％)。
中间体63的制备：
在45min内，向托品酮(8.72g；62.6mmol)在丙酮(70mL)的溶液中逐滴添加CH3I(4.7mL；2.27g/mL；75.2mmol)。将所得悬浮液在室温处搅拌1小时。将沉淀滤出，用丙酮洗涤并用庚烷/EtOAc(6/4)的混合物洗涤。然后将所得固体在真空下干燥，得到呈浅棕色粉末状的产物(16.6g；94％)。
实施例A28
中间体64的制备：
将中间体63(4.9g；17.42mmol)和3-氨基-1-N-Boc-氮杂环丁烷(3g；17.42mmol)在EtOH(39mL)和蒸馏水(39mL)中的溶液加热至回流温度。在15分钟内分批添加K2CO3(7.2g；52.26mmol)，并然后将混合物回流14小时。将混合物冷却至室温并用DCM萃取。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥并在减压下浓缩。将残余物通过快速色谱法(SiO2，庚烷/EtOAc)纯化，得到产物(2.8g；58％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A29
中间体65的制备：
在-78℃处在N2下，将双(三甲基甲硅烷基)氨基锂溶液(7.033mL；1mol/L；7.033mmol)逐滴添加到2-甲基-4-氧代-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1g；4.689mmol)在THF(20mL)的溶液中。在-78℃处搅拌溶液20分钟后，添加N,N-双(三氟甲基磺酰基)苯胺(2.01g；5.627mmol)在THF(20mL)中的溶液，并使所得溶液温热至0℃并搅拌过夜。将反应混合物在真空下浓缩，并将残余物溶解在乙醚中，并用水、1M NaOH溶液和盐水洗涤。将有机相经MgSO4干燥，过滤，在减压下浓缩并通过快速色谱法(SiO2；己烷/EtOAc)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到产物(1.03g；32％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体67的制备：
在氮气下在60℃处，向中间体64(2.8g，10.1mmol)在THF(3ml)的溶液中添加1M双(三甲基甲硅烷基)-氨基锂的THF溶液(17.2mL，17.2mmol)，并将混合物在-60℃处搅拌15min。然后添加N-苯基-双(三氟-甲烷磺酰亚胺)(4.7g，13.1mmol)的THF溶液(2ml)，并将混合物在-60℃处搅拌30min，然后使其在2小时内温热至室温。将混合物倾注到NaHCO3饱和溶液上并用乙酸乙酯萃取。将有机层用盐水洗涤，用MgSO干燥并浓缩。将粗产物通过快速色谱法(SiO2，己烷/乙酸乙酯梯度)纯化，得到中间体67(3.43g，82％)。
实施例A30
中间体68的制备：
将双(频哪醇合)二硼(808.88mg；3.185mmol)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]-二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(94.59mg；0.116mmol)、乙酸钾(852.65mg；8.687mmol)和1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁(64.17mg；0.116mmol)添加到中间体65在1,4-二烷(37mL)的溶液中，同时鼓泡通入N2。将反应混合物在80℃处搅拌14小时。然后，将混合物用盐水稀释并用EtOAc(3×)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并将溶剂真空蒸发。将残余物通过快速色谱法(SiO2；0-10％ EtOAc/庚烷)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到呈白色固体状的产物(700mg；37％)。
实施例A31
中间体69的制备：
在0℃处，将NaBH4(134mg，3.55mmol)分批添加到4-(4-氧代环己基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(1g，3.55mmol)在无水MeOH(35mL)的溶液中，并将溶液搅拌至室温持续20h。在减压下去除大部分溶剂，并将残余物用EtOAc稀释，并然后添加1M HCl水溶液。分离各层，并将水层用EtOAc萃取(两次)。合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下去除溶剂，得到呈无色油状物的中间体69(944mg，94％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A32
中间体71的制备：
在室温处，将叔丁基氯二苯基硅烷(24.4mL；95.4mmol)逐滴添加到3-羟基环丁烷甲酸乙酯(12.5g；86.7mmol)、咪唑(6.49g；95.4mmol)和DMAP(1.06g；8.67mmol)在DCM(500mL)的溶液中，并将溶液在室温处搅拌20h。将反应混合物用DCM稀释并用饱和NaHCO3水溶液处理。分离各层，并将水层用DCM萃取(一次)。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下去除溶剂，得到34.7g。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，220g Buchi，液体注射(DCM)，流动相梯度：庚烷/EtOAc 100/0至50/50)纯化。合并含有纯产物的级分，得到无色油的中间体71(20.5g，62％)。
中间体72的制备：
在-78℃处，将DIBAL(1,2M在甲苯中)(45mL；54mmol)缓慢添加到中间体71(20.5g；53.6mmol)在无水DCM(587mL)的溶液中，并将溶液在-78℃处搅拌1h。添加MeOH(30mL)，将混合物在室温下搅拌5分钟并添加DCM。分离各层，并将水层用EtOAc萃取(两次)。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到呈无色油状物的中间体72(15.5g，86％)。
中间体73的制备：
将中间体72(15.5g，37.5mmol)、硝基甲烷(101mL)和TEA(26.1mL，188mmol)的溶液在室温处搅拌2h。向粗产物中添加水、盐水和EtOAc。分离各层并将水层用EtOAc萃取(两次)。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发，得到呈黄色油状物的中间体73(16.1g，定量)(定量，93％纯度)。
计算纯度以给出定量产率。
中间体74的制备：
将Pd/C(10％)(2.4g，2.27mmol，0.15当量)添加到中间体73(6.49g，15.1mmol)在EtOH(227mL)的溶液中，并将混合物在室温处氢化(1巴的H2)20h。将反应混合物用MeOH稀释，并然后在硅藻土垫上过滤。将硅藻土用MeOH洗涤，并在减压下浓缩滤液，得到中间体74(5.4g，97％)。
原样用于下一步骤中。
中间体75的制备：
在0℃处，向中间体74(6.08g，16.5mmol)和TEA(5.7mL，41.1mmol)在THF(260mL)的混合物中添加氯乙酰氯(1.31mL，16.5mmol)。使混合物在室温处搅拌1h 30。添加水和EtOAc。分离各层并将水层用EtOAc萃取(两次)。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空去除溶剂，得到呈黄色油状物的中间体75(7.3g，定量)。
中间体76的制备：
在0℃处，将叔丁醇钾(7.35g，65.5mmol)在iPrOH(200mL)中的溶液逐滴添加到中间体75(7.30g，16.4mmol)在DCM(200mL)的溶液中。将混合物搅拌至室温持续2h。添加NH4Cl的饱和水溶液。分离各层并将水层用EtOAc萃取(两次)。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空去除溶剂，得到呈黄色油状物的中间体76(6.28g，94％)。
中间体77的制备：
在N2下在0℃处，将LAH(1M在THF中)(30.5mL，30.5mmol)逐滴添加到中间体76(6.25g，15.2mmol)在无水THF(323mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌30min，并然后在50℃处搅拌30min。将所得反应物冷却至室温，并通过添加水(1.2mL)，然后添加3M NaOH水溶液(1.2mL)和水(3.6mL)来淬灭反应混合物(Fieser的方法)。添加EtOAc以及MgSO4。在玻璃料上过滤混合物，并蒸发滤液，得到5.35g黄色油。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，80g Buchi，液体加载(DCM)，流动相梯度：CH2Cl2/MeOH：97/3至80/20，15CV，收集全部)纯化。合并纯级分，得到呈淡黄色油状物的中间体77(2.87g，48％)。
中间体78的制备：
在0℃处，将氯甲酸苄酯(1.09mL，7.62mmol)逐滴添加到中间体77(2.87g，7.25mmol)、DIPEA(1.44mL，8.34mmol)和DMAP(27mg，0.22mmol)在无水DCM(34mL)的溶液中。然后将反应混合物搅拌至室温持续20小时。通过添加水来将反应混合物淬灭并在室温处搅拌5分钟。添加DCM和饱和NaHCO3水溶液。分离各层，并将水层用DCM萃取(一次)。将有机层合并，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到呈黄色油状物的中间体78(3.47g，90％)。
中间体79的制备：
将TBAF(1M在THF中)(7.9mL，7.9mmol)逐滴添加到中间体78(3.47g，6.55mmol)在THF(174mL)的溶液中。然后将反应混合物搅拌至室温持续20h。将反应混合物用EtOAc和水稀释。分离各层并将水层用EtOAc萃取(一次)。将有机层合并，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，40g Buchi，液体注射(CH2Cl2)，流动相梯度：庚烷/EtOAc 100/0至0/100，收集全部)纯化。蒸发含有产物的级分，得到呈无色油状物的中间体79(1.58g，83％)。
实施例A33
中间体80的制备：
在0℃处，向1,4-二氧杂螺[4.5]癸-8-醇(1.00g，1.174g/mL，6.32mmol)、三苯基膦(1.74g，6.64mmol)和咪唑(0.495g，7.27mmol)在无水DCM(15mL)的溶液中添加四溴化碳(2.20g，6.64mmol)。将反应混合物在室温处搅拌18h。将挥发物在减压下蒸发并且将残余物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，40g Buchi，液体加载(DCM)，流动相梯度：在10个柱体积中从庚烷/EtOAc 99/1至90/10)纯化，合并包含产物的级分并蒸发，得到呈无色液体状的产物(916mg；66％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体82的制备：
向中间体70(2.0g，7.4mmol)在THF(75mL)的溶液中添加三苯基膦(5.8g，22mmol)，然后逐滴添加四溴甲烷(7.4g，22mmol)在THF(11mL)中的溶液，并将混合物在室温处搅拌18小时。将混合物倾注到NaHCO3水溶液中，用DCM萃取两次，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，80g Buchi，液体加载(DCM)，流动相梯度：庚烷/EtOAc 99/1至1/1，10CV)纯化。将含有产物的级分蒸发，得到中间体82(2.05g，83％)。
中间体83的制备：
在0℃处，向中间体79(1.58g，5.42mmol)、三苯基膦(1.49g，5.69mmol)在无水DCM(9mL)的溶液中添加四溴化碳(1.89g，5.69mmol)。将反应混合物在室温处搅拌20h。将溶剂在减压下去除并通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，120g Buchi，干燥负载(硅藻土)，流动相梯度：庚烷/EtOAc 95/5至0/100，20CV)纯化。蒸发含有产物的级分，得到呈淡黄色油状物的中间体83(1.12g，46％)。
实施例A34
中间体84的制备：
将1-Boc-哌嗪(2.50g，13.4mmol)、2-丁炔酸(1.36g，16.2mmol)和二异丙基乙胺(11.5mL，0.75g/mL，66.5mmol)在DCM(45mL)中的混合物在0℃处搅拌。在0℃处缓慢添加1-丙烷膦酸酐(T3P)(20mL，1.069g/mL，33.7mmol)。将混合物在0℃处搅拌10min，然后在室温处搅拌1h。添加NaHCO3(水溶液)和EtOAc的饱和溶液。进行萃取。将有机层用1M HCl水性溶液(水溶液)洗涤，然后用盐水洗涤，之后干燥(MgSO4)并蒸发，得到呈淡黄色固体状的产物(3.54g；定量)。
中间体85的制备：
将TFA(1.5mL，1.49g/mL，19.6mmol)添加到中间体84(200mg，0.793mmol)在DCM(10mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌1h。将反应混合物在减压下蒸发，得到呈淡黄色油状物的产物(332mg；定量)。该产物无需进一步加工即用于后续步骤。
实施例A35
中间体86的制备：
将2-丁炔酸(4.3g；51.144mmol)和三乙胺(19.441mL；0.726g/mL；139.484mmol)溶解在DCM(250mL)中并在0℃处搅拌。将3-氮杂环丁酮盐酸盐(5g；46.495mmol)一次性添加到反应混合物中，然后缓慢添加1-丙烷膦酸酐(T3P-50重量％在EtOAc中)(34.113mL；1.301g/mL；69.742mmol)。将混合物在0℃处搅拌4小时。将H2O(100mL)缓慢添加到混合物中，并移除冷却浴。将混合物用溶剂混合物(CH2Cl2:MeOH＝10:1,3*100mL)萃取。将有机层干燥(MgSO4)并浓缩，得到呈红色油状物的粗产物。将残余物通过硅胶柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯＝100:0:-30:70)纯化。将所需级分真空蒸发，得到呈黄色固体状的产物(4.28g；48％)。
中间体87的制备：
将2-丁炔酸(7.608g；90.487mmol)和三乙胺(57.327mL；0.726g/mL；411.303mmol)溶解在DCM(200mL)中并在0℃处搅拌。将3-吡咯烷酮盐酸盐(10g；82.261mmol)一次性添加到反应混合物中，然后缓慢添加1-丙烷膦酸酐(T3P-50重量％在EtOAc中)(40.236mL；1.301g/mL；82.261mmol)。将混合物在35℃处搅拌过夜。将乙酸乙酯(100mL)添加到反应物中，搅拌30min，过滤并用乙酸乙酯(50mL*3)冲洗。真空蒸发滤液，得到呈油状物的粗产物。将粗产物通过硅胶柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯＝100:0-10:90)纯化。收集纯级分，并将溶剂真空去除，得到呈油状物的产物(2.3g；18％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A36
中间体89的制备：
将3-(甲磺酰基)丙酸(50g；329mmol)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(126g；657mmol)、1-苯并三唑(64.4g；476mmol)和三乙胺(100.8mL；0.726g/mL；723mmol)在DCM(1000mL)中的混合物在5℃处搅拌60min。然后添加3-氮杂环丁酮盐酸盐(35.3g；329mmol)，并将混合物在室温处搅拌12小时。将乙酸乙酯(1500mL)添加到反应物中，搅拌30min，过滤并用乙酸乙酯(100mL*3)冲洗。将滤液真空蒸发，得到131g粗产物。将该粗产物通过硅胶柱色谱法(洗脱液：乙酸乙酯/MeOH＝100/0～95/5)纯化。真空蒸发所需级分，得到40g白色固体。添加THF(50mL)并将混合物搅拌15min，并且将固体滤出并真空干燥，得到白色固体(32g；47.5％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A37
中间体92的制备：
将DL-泛酰内酯(8.00g，61.5mmol)、苯甲胺(8.07mL，73.8mmol)和PTSA(1.06g，6.15mmol)的混合物在235℃处使用功率输出在0W至400W范围内的单模微波(Biotageinitiator60)搅拌2h30[固定保持时间]。将反应混合物冷却并将混合物用乙酸乙酯稀释。将有机层用1N HCl水溶液洗涤三次，然后用NaHCO3饱和溶液洗涤，然后用盐水洗涤，干燥并真空浓缩，得到油，将该油通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，120g Buchi，干燥负载(硅藻土)，流动相梯度：庚烷/AcOEt 80/20至50/50，12CV)纯化。合并含有产物的级分并蒸发，得到中间体92(4.67g，35％)。
中间体93的制备：
在氮气下，将中间体92(3.5g，16.0mmol)在无水THF(17.5mL)中的溶液用1M LAH的THF溶(32.0mL，32.0mmol)逐滴处理，并在50℃处搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温，用Et2O稀释并通过缓慢添加水(1.20mL)、3M NaOH水溶液(1.20mL)和水(3.60mL)淬灭。将反应混合物在室温处搅拌5分钟。然后添加MgSO4，并将反应混合物在玻璃料上过滤。真空蒸发滤液，得到中间体93(3.08g，94％)。
中间体94的制备：
在催化量的氢氧化钯/碳(308mg，0.22mmol)的存在下，将中间体93(900mg，4.38mmol)在EtOH(10mL)中的溶液在氢气(8巴)下在室温处于高压瓶中氢化17小时。
将反应混合物在DCM中稀释，通过硅藻土垫过滤并蒸发，得到中间体94(500mg，定量)。
中间体95的制备：
将氯甲酸苄酯(2.12mL，14.8mmol)逐滴添加到中间体94(1.8g，15.6mmol)和NaOH(1M在H2O中)(16.4mL，16.4mmol)在DCM(35mL)的溶液中。然后将反应混合物在室温处搅拌20h。添加DCM并分离各层，并将水层用DCM萃取(一次)。将有机层合并，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到中间体95(3.1g，80％)。
中间体96的制备：
在室温处，向中间体95(3.1g，12.4mmol)和TEA(8.8mL，63.4mmol)在DMSO(11mL)和DCM(50mL)的混合物中添加吡啶三氧化硫(48％-50％)(7.9g，50mmol)，并将所得混合物在室温处搅拌20h。添加NaHCO3和DCM的饱和水溶液。分离各层，并将水层用DCM萃取(两次)。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空去除溶剂。将残余物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，80g Grace，液体加载(DCM)，流动相梯度：庚烷/EtOAc：100/0至20/80)纯化。合并含有产物的级分，得到中间体96(1.46g，47％)。
实施例38
中间体97的制备：
向1-Boc-4-溴哌啶(15g，57mmol)在DCM(15mL)的溶液中添加4N HCl的无水二烷溶液(35.5mL，142mmol)，并将混合物在室温处搅拌4小时。添加二乙醚，沉淀出固体。将混合物在室温处搅拌30min，然后过滤，用乙醚洗涤并干燥，得到中间体97(10.3g，91％，HCl盐)。
中间体98的制备：
将中间体97(10g，51.4mmol)、N-Boc-3-氧代氮杂环丁烷(11g，64.2mmol)和TEA(7.1mL，51.4mmol)在DCE(480mL)中的溶液在室温处搅拌30分钟。然后添加三乙酰氧基硼氢化钠(16.4，77mmol)并继续反应3小时。添加1M Na2CO3。分离各相。将水层用DCM萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发。将残余物通过快速柱色谱法(二氧化硅：AcOEt/庚烷0/100至100/0)纯化。收集所需级分并真空浓缩，得到中间体98(15.8g，96mmol)。
实施例A39
中间体99的制备：
向S-(-)-Boc-3-氨基吡咯烷(7.22g；38.75mmol)和Na2CO3(6.51g；77.49mmol)在MeCN(77.4mL)的混合物中添加表氯醇(5.08mL；1.18g/mL；46.50mmol)并将混合物在80℃处搅拌16小时。将反应混合物用NaHCO3碱化，并用EtOAc萃取。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在真空下蒸发。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；DCM/MeOH)纯化，得到产物(3.75g；40％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体101的制备：
向中间体99(3.62g；14.94mmol)在THF(75mL)的溶液中添加PPh3(11.76g；44.82mmol)，然后滴加CBr4(14.86g；44.82mmol)在THF(75mL)中的溶液，并将混合物在氮气下在室温处搅拌2小时。添加1M NaHCO3水溶液，并将混合物用EtOAc萃取。将有机层用水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在真空下蒸发。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；DCM/MeOH)纯化，得到产物(3.43g；75％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体99的制备：
将碳酸氢钠(135.3g，1610.7mmol)添加到(S)-(–)-1-Boc-3-氨基吡咯烷(100.0g，536.9mmol)在乙腈(1000mL)的溶液中。分批添加表氯醇(59.6g，644.3mmol)，并将混合物在90℃处搅拌过夜。过滤混合物并浓缩滤液，得到呈黄色油状物的中间体99(140.6g，定量)。
中间体101的制备：
将三苯基膦(197.8g，754.3mmol)和四溴甲烷(250.2g，754.3mmol)相继添加到中间体99(140.6g，580.2mmol)在THF(1500mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌2h，然后过滤并浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(梯度洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至70/30)纯化。收集纯级分并将溶剂在真空下蒸发，得到中间体101(53.1g，30％)。
中间体100的制备：
将碳酸氢钠(162.4g，1932.9mmol)添加到(R)-(+)-1-Boc-3-氨基吡咯烷(120.0g，644.3mmol)在乙腈(1000mL)的溶液中。分批添加表氯醇(71.5g，773.2mmol)，并将混合物在90℃处搅拌过夜。过滤混合物并浓缩滤液。将粗产物通过硅胶色谱法(洗脱液：DCM/MeOH，100/0至80/20)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到呈黄色油状物的中间体100(100.0g，64％)。
中间体102的制备：
将三苯基膦(142.9g，544.8mmol)和四溴甲烷(180.7g，544.8mmol)在THF(200mL)中的溶液相继添加到中间体100(66.0g，272.4mmol)在THF(1000mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌2h。将反应混合物用乙酸乙酯(500mL)稀释，并将有机层用饱和NaHCO3水溶液(400mL)、水(3*300mL)和盐水(500mL)洗涤。浓缩有机层，将粗产物通过硅胶色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至60/40)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到呈黄色油状物的中间体102(43.0g，52％)。
实施例A40
中间体103的制备：
在室温处，向4-羟基吡啶(1.0g，11mmol)在THF(35mL)的溶液中添加1-Boc-3-羟基氮杂环丁烷(2.28g，13.1mmol)和三苯基膦(3.45g，13.1mmol)。然后逐滴添加偶氮二甲酸二异丙酯(2.6mL，13.1mmol)并将混合物在55℃处加热16h。真空蒸发溶剂。将所得油用1M HCl水溶液吸收。将酸性混合物用DCM洗涤两次。将合并的DCM洗涤液用1M HCl水溶液和水再萃取。将水层合并，用1M NaOH水溶液碱化至pH约12，并用DCM萃取三次。将有机萃取物用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将粗物质通过制备型LC(不规则SiO2 40μm，40gBuchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：从DCM 99％、iPrOH 1％至DCM 85％、iPrOH 15％)纯化。合并含有产物的级分并在真空下蒸发，得到中间体103(2.25g，85％)。
中间体104的制备：
将中间体103(2.0g，8.0mmol)在无水乙醇(44mL)中的溶液用N2脱气。添加二氧化铂(IV)(454mg，2.00mmol)。将混合物再次脱气。然后添加对甲苯磺酸一水合物(1.52g，8.00mmol)。将所得混合物第三次脱气并在H2的大气压下在室温处氢化18h。将混合物倾注到50mL冰冷的1M NaOH水溶液中，用小体积的DCM洗涤，并通过垫过滤。将滤液真空浓缩以去除乙醇，并将剩余的水溶液用DCM萃取三次。将合并的有机萃取物用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将粗物质通过制备型LC(不规则SiO2 40μm，40g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：从DCM 90％，(MeOH/NH4OH：10/0.2)10％至DCM 50％，(MeOH/NH4OH：10/0.2)50％)纯化。合并含有产物的级分并在真空下蒸发，得到中间体104(1.65g，72％)。
实施例A41
中间体105的制备：
将1-叔丁氧基羰基-4-羟基哌啶(7.83g；38.89mmol)和TEA(8.11mL；0.728g/mL；58.34mmol)溶解在MeCN(300mL)中，并将混合物在室温处搅拌10分钟。然后将甲磺酰氯(3.31mL；1.48g/mL；42.78mmol)添加到水-冰浴中，并将反应物在0℃处搅拌1小时。添加哌嗪(13.4g；155.57mmol)和K2CO3(21.50g；155.57mmol)并将混合物在80℃处搅拌过夜。将反应混合物在EtOAc和饱和NaHCO3溶液之间分配。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶快速柱色谱法(SiO2；DCM/MeOH)纯化，得到产物(3.8g；36％)。
中间体105的制备：
将1-叔丁氧基羰基-4-羟基哌啶(7.83g，38.89mmol)和三乙胺(8.11mL，58.34mmol)溶解在乙腈(300mL)中，并将混合物在室温处搅拌10min，然后冷却至0℃。添加甲磺酰氯(3.31mL，42.78mmol)，并将反应物在0℃处搅拌1h。添加哌嗪(13.4g，155.57mmol)和碳酸钾(21.5g，155.57mmol)，并将混合物在80℃处搅拌两天。将反应混合物在EtOAc和饱和NaHCO3水溶液之间分配。将合并的有机层干燥(MgSO4)，过滤并浓缩。将产物通过快速色谱法(DCM-MeOH)纯化，合并纯级分并浓缩，得到中间体105(1.70g，16％)。
实施例A42
中间体106的制备：
将1-苄基-4-哌啶酮(7.1g，37.6mmol)添加到1-Boc-哌嗪(7.0g，37.6mmol)在THF(64mL)的溶液中。将混合物用乙酸(2.2mL，37.6mmol)酸化并将混合物在0℃处冷却。然后，分批添加三乙酰氧基硼氢化钠(8.0g，37.6mmol)，并将混合物在室温处搅拌16h。将混合物用碳酸钾水溶液调节至pH 8。将有机相分离，经MgSO4干燥并真空浓缩。将残余物通过快速色谱法(二氧化硅；DCM-DCM/MeOH)纯化，得到中间体106(9.4g，70％)。
中间体107的制备：
在N2下，将氢氧化钯/碳20％(2.0g，2.8mmol)添加到中间体106(9.4g，26.2mmol)在甲醇(90mL)的溶液中，然后用H2吹扫并将混合物在H2下在室温处搅拌72h。将混合物经硅藻土垫过滤，并在减压下去除溶剂，得到中间体107(7.2g，定量)。
实施例A43
中间体108的制备：
在N2气氛下，向1-甲基-4-哌啶酮(1.45g，12.82mmol)在丙酮(15mL)的溶液中逐滴添加乙基碘(2.4g，15.39mmol)，并将混合物在室温处搅拌18h。将混合物过滤，用丙酮洗涤，然后用Et2O洗涤并干燥，得到中间体108(2.41g，70％)。
中间体109的制备：
在80℃处，将中间体108(2.1g，7.80mmol)在水(5mL)中的溶液添加到3-氨基-3-甲基-吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(781mg，3.90mmol)和碳酸钾(54mg，0.39mmol)在乙醇(10mL)的溶液中。将混合物回流3h。添加水、NH4Cl和DCM。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将残余物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm 40g 流动相：100％ DCM至96％ DCM，4％ MeOH(2％ NH4OH))纯化，得到中间体109(600mg，54％)。
中间体110的制备：
在室温处，将硼氢化钠(161mg，4.25mmol)添加到中间体109(600mg，2.13mmol)在甲醇(7mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌3h。添加水、NH4Cl和DCM。将混合物在室温处搅拌1h，将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到中间体110(550mg，91％)。
中间体111的制备：
将三苯基膦(1.522g，5.80mmol)和四溴甲烷(1.924g，5.802mmol)在THF(4mL)中的溶液相继添加到中间体110(550mg，1.93mmol)在THF(20mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌4h，然后倾注到饱和NaHCO3水溶液上，用DCM萃取两次并经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiO2 40μm 24g，流动相：梯度为100％庚烷至50％庚烷，50％AcOEt)进行纯化，得到中间体111(238mg，35％)。
实施例A44
中间体112的制备：
将表氯醇(873μL，7.99mmol)添加到3-氨基-3-甲基-吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(800mg，3.99mmol)和碳酸氢钠(1.007g，11.98mmol)在乙腈(20mL)的混合物中，并将混合物在80℃处搅拌16h。添加表氯醇(437μL，3.99mmol)和碳酸氢钠(336mg，3.99mmol)，并将混合物在80℃处再搅拌16小时。添加Na2CO3水溶液直至pH 8-9，并将水层用乙酸乙酯萃取。将有机相用盐水洗涤，然后经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。将粗产物通过快速柱色谱法(用甲醇-二氯甲烷梯度洗脱)纯化，得到中间体112(499mg，49％)。
中间体113的制备：
将三苯基膦(1.29g，4.92mmol)添加到中间体112(420mg，1.64mmol)在THF(5mL)的溶液中。添加四溴甲烷(1.63g，4.92mmol)在THF(5mL)中的溶液，并将混合物在室温处搅拌过夜。添加NaHCO3水溶液，并用EtOAc萃取水层。将有机层用水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。将残余物通过快速色谱法(AcOEt/庚烷)纯化，得到中间体113(411mg，79％)。
实施例A45
中间体114的制备：
在80℃处，将中间体108(5.78g，21.48mmol)在水(13mL)中的溶液添加到3-氨基-3-甲基氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(2.00g，10.74mmol)和碳酸钾(148mg，1.07mmol)在乙醇(29mL)的溶液中。将混合物回流2h。添加水、NH4Cl和DCM。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将残余物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm 80g 流动相：100％ DCM至96％ DCM，4％ MeOH(2％ NH4OH))纯化，得到中间体114(910mg，32％)。
中间体115的制备：
在5℃处，将硼氢化钠(451mg，11.92mmol)分批添加到中间体114(1600mg，5.96mmol)在甲醇(20mL)的搅拌溶液中。将混合物在室温处搅拌3h。添加水、NH4Cl和DCM。将混合物在室温处搅拌1h，将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到中间体115(1.39g，86％)。
中间体116的制备：
将三苯基膦(4.05g，15.42mmol)和四溴甲烷(5.12g，15.42mmol)在THF(10mL)中的溶液相继添加到中间体115(1.39g，5.14mmol)在THF(50mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌4h，然后倾注到饱和NaHCO3水溶液上，用DCM萃取两次并经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiO2 40μm 120g，流动相：梯度为100％庚烷至50％庚烷，50％ EtOAc)进行纯化，得到中间体116(1.15g，67％)。
实施例A46
中间体117的制备：
在-78℃处，将n-BuLi(1.6M在己烷中)(14mL，22.4mmol)添加到四氢-2-(2-丙炔氧基)-2H-吡喃(3.0mL，21.3mmol)在THF(43mL)的溶液中。在搅拌10min后，将反应混合物温热至0℃并添加碘甲烷-D3(1.5mL，24mmol)。使反应混合物升温至室温过夜。然后通过添加饱和NH4Cl水溶液来淬灭反应物。分离各层，并将水层用DCM萃取三次。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤，在真空下浓缩。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，80g Buchi，液体负载(庚烷)，流动相梯度：从庚烷100％、EtOAc 0％至庚烷80％、EtOAc 20％)纯化。合并含有产物的级分并在真空下蒸发，得到中间体117(2.79g，83％)。
中间体118的制备：
向中间体117(2.79g，17.8mmol)在MeOH(17mL)的溶液中添加TPSA,H2O(338mg，1.8mmol)，并将反应混合物搅拌18h。添加K2CO3(245mg，1.8mmol)并将所得悬浮液在室温处搅拌30min，然后将 Celite过滤，浓缩。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，40g Buchi，干燥负载(硅藻土)，流动相梯度：从戊烷/Et2O 90/10至60/40)纯化。蒸发含有产物的级分，得到呈无色油状物的中间体118(717mg，55％)。
中间体119的制备：
向氯化亚铜(I)(15mg，0.15mmol)在ACN(6mL)和中间体118(220mg，3.01mmol)的溶液中缓慢添加70％叔丁基过氧化氢的水溶液(2.1mL，15mmol)。将所得混合物在室温处搅拌18h。添加水，将反应混合物的pH用饱和NaHCO3水溶液调节至8.0-8.5。然后将水层用Et2O萃取两次。使用1N HCl将水层酸化至pH 2.0，并用Et2O萃取4次。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩，得到中间体119(108mg，41％)。
实施例A47
中间体120的制备：
将1-二甲基氨基-2-丙炔(1.00g，12.0mmol)和n-BuLi(1.6M在己烷中)(8.3mL，13.2mmol)在THF(21mL)中的溶液保持在固体二氧化碳/丙酮浴中。在-78℃处1h后，将干燥的CO2*在反应混合物中鼓泡18h。将反应混合物用水稀释，然后用EtOAc洗涤。蒸发水层。将残余物溶解在MeOH中并经由过滤去除不溶性盐。蒸发滤液，得到中间体120(1.7g，定量)。
*在鼓泡进入反应混合物之前通过鼓泡通过H2SO4而获得干燥CO2。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A48
中间体123的制备：
在-78℃处，在30分钟内向4,6-二氯嘧啶-5-甲醛(80g；452mmol)在THF(100mL)的溶液中逐滴添加二异丁基氢化铝溶液(1.0M溶液在甲苯中；587.6mL；587.6mmol)。将混合物在-78℃处搅拌2小时。添加罗谢尔盐饱和水溶液(800mL)，并移除干冰/丙酮浴。使反应混合物升温至室温并搅拌过夜。将混合物用CH2Cl2(4×1000mL)萃取，将有机层合并，经Na2SO4干燥，过滤，并在减压下浓缩滤液，得到呈黄色固体状的产物(63.8g；79％)。将产物用于下一步骤而无需任何进一步纯化。
中间体124的制备：
在0℃处，将亚硫酰氯(7.62mL；105.02mmol)逐滴添加到中间体123(4.70g；26.25mmol)在DCM(130mL)的溶液中。将反应物温热至室温过夜。在减压下蒸发后，将固体残余物通过硅胶柱快速色谱法使用环己烷/EtOAc(7/3)的混合物作为洗脱液进行纯化，得到呈白色固体状的标题化合物(4.57g，87％)。
实施例A49
中间体125的制备：
在0℃处在氮气气氛下，将中间体123(20g；111.73mmol)添加到4-溴-2-硝基苯酚(24.35g；111.73mmol)在THF(400mL)的溶液中，然后向其中添加三苯基膦(35.16g；134.075mmol)。逐滴添加偶氮二甲酸二异丙酯(27.11g；134.08mmol)。使混合物升温至室温并搅拌过夜。蒸发混合物，得到呈黄色油状物的粗产物，将该粗产物通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至50/50)纯化。合并所需级分，并将溶剂真空浓缩至干燥，得到呈黄色固体状的中间体125(45g；>100％)。将产物用于下一步骤而无需任何进一步纯化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A50
中间体130的制备：
在N2下，向中间体123(17g；94.97mmol)在1,4-二烷(500mL)的溶液中添加Na2CO3(119mL；2mol/L；238mmol)和1-甲基吡唑-4-硼酸频哪醇酯(20.52g；98.60mmol)并在室温处搅拌10分钟。然后添加四(三苯基膦)钯(0)(7.86g；6.80mmol)，并将反应混合物加热至140℃并搅拌1小时。冷却后，将混合物在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；石油醚/EtOAc，100/0至40/60)纯化，得到呈白色固体状的产物(23g；定量)。
实施例A51
中间体131的制备：
将4,6-二氯嘧啶-5-甲醛(30g；169.50mmol)悬浮于DCM(250mL)中并添加TEA(24.74mL；0728g/mL；177.98mmol)。将溶解液在冰浴中冷却至0℃。逐滴添加溶解于DCM(50mL)中的吗啉(14.77g；169.51mmol)。将反应混合物升温至室温并然后搅拌20小时。添加1M Na2CO3并分离各相。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发。将残余物通过快速色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc，100/0至50/50)纯化，得到产物(19.8g；87％)。
实施例A52
中间体132的制备：
将4,6-二氯嘧啶-5-甲醛(30g；169.5mmol)溶解在THF(500mL)中，并将反应混合物在氮气下在0℃处冷却。在0℃处，逐滴添加溴化甲基镁(1.4M在THF/甲苯(1/3)中；145.3mL；203.4mmol)，并将反应混合物在0℃处搅拌10分钟，并然后在室温处搅拌30分钟。添加另外的(0.1当量)溴化甲基镁(1.4M在THF/甲苯(1/3)中；12.1mL；16.94mmol)并将混合物搅拌过夜。添加水和乙酸(220mmol)的混合物，并将混合物用乙酸乙酯萃取。将有机层用水和盐水洗涤，用MgSO4干燥，过滤并蒸发。将粗产物通过快速色谱法(SiO2，乙酸乙酯-庚烷梯度)纯化。合并含有纯产物的级分并蒸发真空，得到产物(21.0g；64％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体134的制备：
将4,6-二氯嘧啶-5-甲醛(2.5g；13.7mmol)溶解在THF(55mL)中，并将反应混合物在氮气下在-5℃处冷却。在-5℃处，逐滴添加环丙基溴化镁(0.5M在THF中；27.4mL；13.7mmol)并将反应混合物在-5℃处搅拌1小时，然后在1小时内使其达到室温。将反应混合物在EtOAc和饱和NH4Cl(水溶液)溶液之间分配。将合并的有机层干燥(MgSO4)，过滤并真空浓缩。将产物通过快速色谱法(二氧化硅；EtOAc/庚烷，梯度为0/100至70/30)纯化。合并所需级分并浓缩真空，得到呈透明油状物的产物(1.12g；36％)。
实施例A53
中间体135的制备：
向中间体132(42g，218mmol)在THF(800mL)和水(80mL)的溶液中添加1-甲基吡唑-4-硼酸频哪醇酯(45.3g，218mmol)和碳酸钠(27.7g，261mmol)。在N2气氛下添加双(三苯基膦)二氯化钯(II)。将混合物加热至60℃并搅拌过夜。将混合物通过硅藻土过滤，用乙酸乙酯(500mL)冲洗。
将滤液真空蒸发，得到黄色油状物(100g)。将粗化合物通过硅胶柱色谱法(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯＝100/0～0/100)纯化。真空蒸发所需级分，得到呈黄色固体状的中间体135(19g，37％)。
中间体136和中间体137的制备：
以3g规模进行手性分离：经由手性SFC(固定相：Chiralpak IG 5μm250*20mm，流动相：75％ CO2，25％ EtOH/DCM 80/20v/v的混合物)进行纯化，得到中间体136(1.5g)和中间体137(1.5g)。
实施例A54
中间体138的制备：
将中间体132(55.5g，287mmol)、硫代吗啉-1,1-二氧化物(38.9g，287.5mmol)和Et3N(120mL，863mmol)在Et2O(500mL)中的浅棕色悬浮液在50℃处搅拌16h。将混合物浓缩，得到黄色固体。添加水(400mL)和MTBE(300mL)。将混合物在室温处搅拌30min。滤出固体并干燥，得到浅黄色固体。将其与对2g规模的中间体132进行的测试反应合并，得到中间体138(58g；69％)。
中间体139和中间体140的制备：
经由手性SFC(固定相：CHIRALPAK AS-H 5μm 250*20mm，流动相：60％ CO2，40％EtOH)对中间体138进行分离(以6g规模)，得到中间体139(2.9g，48％)和中间体140(2.95g，49％)。
经由VCD光谱技术鉴定中间体139和中间体140的绝对构型：
-中间体139确定为R对映体，即中间体660(通过SFC检验EE纯度(RT：0.68、1.00，面积％：100.00、0.00，MW：291，BPM1：292，BPM2：290，方法：UPCC_AS3_ETOH_NEAT_30_6MIN))。
-中间体140确定为S对映体，即中间体661(检验EE纯度(RT：0.68、0.99，面积％：0.16、99.84，MW：291，BPM1：292，BPM2：290，方法：UPCC_AS3_ETOH_NEAT_30_6MIN))。
实施例A55
中间体662的制备：
中间体660(200mg；0.69mmol)、5-溴-2-氟-3-硝基甲苯(241mg；1.03mmol)和K2CO3(190mg；1.37mmol)的DMSO溶液(1mL)。将反应混合物在室温处搅拌18h。将混合物倾注到水和DCM上。将混合物用DCM(3×)萃取。合并有机层，经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到405mg橙色油状物。将残余物通过硅胶色谱法(SiO2，Buchi，24g，洗脱液：90％庚烷、10％EtOAc至30％庚烷、70％ EtOAc)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体662(195mg，45％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体664的制备：
将铁(86mg，1.54mmol)添加到中间体662(195mg；0.31mmol)和氯化铵(168mg；3.15mmol)在THF(1.3mL)、MeOH(1.3mL)和水(0.8mL)的混合物中。将反应混合物在90℃处搅拌12h。冷却至室温后，将混合物用DCM稀释，通过过滤并蒸发滤液，得到182mg黄色油状物。将残余物通过硅胶色谱法(SiO2，Buchi，4g，洗脱液：100％DCM至98％DCM，2％ MeOH，0.2％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体664(110mg，81％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A56
中间体667的制备：
在室温处，将620mg SiO2 35μm-70μm添加到中间体259(100mg；0.19mmol)在甲苯(7.9mL)的溶液中。将反应混合物回流(111℃)搅拌过夜。冷却至室温后，将SiO2滤出，用DCM/MeOH 50/50洗涤，并蒸发滤液，得到中间体667(81mg，定量)，该中间体显示与中间体664相同。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
分析数据
实施例A57
中间体141的制备：
将中间体123(30g，168mmol)、硫代吗啉1,1-二氧化物(23.3g，173mmol)和TEA(50.9g，503mmol)在THF(300mL)中的溶液在90℃处搅拌过夜。将粗化合物蒸发，吸收到EtOAc(300mL)中并搅拌1小时。将混合物过滤。将滤饼倾注到H2O(300mL)中并搅拌1小时。将混合物过滤并将滤饼干燥，得到呈白色固体状的中间体141(38.3g，79％，纯度96％)。
实施例A58
中间体142的制备：
在0℃处，将硼氢化钠(1.5g，40mmol)分批添加到4-氯-6-(吗啉-4-基)嘧啶-5-甲醛[54503-94-5](6.55g，29mmol)在MeOH(71mL)的溶液中，并将反应混合物在室温处搅拌2小时。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配。将合并的有机层用MgSO4干燥，过滤并浓缩。
将反应物的粗产物通过快速色谱法(庚烷/乙酸乙酯0-100％)纯化。收集所需级分并真空浓缩，得到中间体142(5.6g，84％)。
实施例A59
中间体143的制备：
将(二乙酰氧基碘)苯(57.3g，178mmol)添加到4-硫代吗啉甲酸,1,1-二甲基乙基酯,1-氧化物[278788-74-2](26g，119mmol)、三氟乙酰胺(20.1g，178mmol)、氧化镁(19.1g，474mmol)和乙酸铑(II)二聚体(2.62g，11.9mmol)在DCM(300mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土垫过滤。将滤液在真空下浓缩，得到粗产物。
将粗产物通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝100:0至石油醚/乙酸乙酯＝30:70)纯化。收集所需级分，并在真空下蒸发溶剂，得到呈白色固体状的中间体143(36g，92％)。
中间体144的制备：
将TFA(200mL)添加到中间体143(36g，109mmol)在DCM(300mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌过夜。将溶剂在真空下浓缩，得到呈黄色油状物的中间体144(38g，定量)。
中间体145的制备：
将TEA(48.7mL，351mmol)添加到中间体144(38g，110mmol)在DCM(400mL)的溶液中。将中间体123(18g，100mmol)添加到反应混合物中。将反应混合物在50℃处搅拌48h。
添加水(500mL)并将反应混合物用DCM(800mL*3)萃取。将合并的有机层经Mg2SO4干燥并真空浓缩，得到粗产物。将粗产物用CH2Cl2(100mL*2)洗涤，得到呈白色固体状的中间体145(22g，57％)。
实施例A60
中间体146的制备：
在氮气气氛下，将4-氯-6-(吗啉-4-基)嘧啶-5-甲醛(15g，65mmol)溶解在THF(200mL)中，然后冷却至-78℃，然后逐滴添加3.0M溴化甲基镁的乙醚溶液(43.5mL，130.5mmol)。将反应混合物在-78℃处搅拌1.5小时。将混合物用饱和NH4Cl(水溶液)溶液淬灭，并与另一批1.5g 4-氯-6-(吗啉-4-基)嘧啶-5-甲醛合并。将合并的实验用乙酸乙酯(300mL*2)萃取。将有机层用Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到15g白色固体。向残余物中添加甲基叔丁基醚(25mL)。将混合物在室温处搅拌20min，并且将不溶物滤出并在真空下干燥，得到呈白色固体状的中间体146(12.3g；70％)。
中间体147和中间体148的制备：
经由手性SFC(固定相：Lux Cellulose-2 5μm 250*30mm，流动相：85％ CO2，15％EtOH)进行中间体146的分离，得到中间体147(3g；25％)和中间体148(3.1g；26％)。
实施例A61
中间体149的制备：
在0℃处，将中间体142(560mg；2.44mmol)溶解于DCM(6mL)中，并缓慢加添加SOCl2(265μL；1.64g/mL；3.66mmol)。将反应混合物在室温处搅拌3小时。真空去除溶剂。将残余物在DCM和盐水之间分配。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到产物(605mg；定量)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A62
中间体151的制备：
将三乙胺(21.4mL，154.3mmol)添加到4,6-二氯嘧啶-5-甲醛(26.0g，146.9mmol)在DCM(390mL)的悬浮液中。将混合物冷却至0℃并分批添加硫代吗啉N,N-二氧化物(19.9g，146.9mmol)。将反应混合物温热至室温并然后搅拌5h。添加1M Na2CO3水溶液并分离各相。将水层用DCM萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发。将残余物通过快速色谱法(二氧化硅；DCM-DCM/MeOH)纯化，得到中间体151(18.0g，44％)。
中间体151a的制备：
在0℃处，将硼氢化钠(3.46g，91.4mmol)分批添加到中间体151(18.0g，65.29mmol)在甲醇(175mL)的溶液中，并将反应混合物在室温处搅拌16h。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配，并且将水层用DCM萃取。将合并的有机层干燥(MgSO4)，过滤并浓缩，得到中间体151a(14.4g，79％)。
中间体150的制备：
在0℃处，将亚硫酰氯缓慢添加到中间体151a(7.2g，25.9mmol)在DCM(70mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌过夜。添加庚烷并将混合物搅拌5min，然后将混合物过滤并在真空下干燥固体，得到中间体150(7.7g，定量)。
实施例A63
中间体152的制备：
在氮气气氛下，将中间体132(20.5g；106.2mmol)、三苯基膦(39g；148.7mmol)和4-溴-2-甲基-6-硝基苯酚(24.6g；106.2mmol)在THF(300mL)中混合。逐滴添加偶氮二甲酸二异丙酯(29.3mL；148.7mmol)并将反应混合物在室温处搅拌1小时。将混合物蒸发并将粗产物用二氧化硅干燥负载到柱上，用于通过快速色谱法(SiO2；40％ EtOAt/庚烷)纯化。合并所需级分并浓缩，得到产物(30.1g；69％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A64
中间体158的制备：
在0℃-5℃处在N2下，向中间体142(0.877g，3.82mmol)、中间体4(1.3g，3.82mmol)和PPh3(1.503g，5.729mmol)在THF(10.9mL)的溶液中逐滴添加DIAD(1.115mL，1.039g/mL，5.729mmol)。将所得溶液在0℃-5℃处搅拌30分钟。在减压下去除挥发物，并将残余物通过柱色谱法(SiO2；90％庚烷-10％ EtOAc至40％庚烷-60％ EtOAc)纯化，得到产物(1.89g；90％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体163的制备：
在0℃处，将偶氮二甲酸二异丙酯(86.2mL，435.19mmol)添加到中间体123(40.9g，228.47mmol)、中间体54(67.09g，217.59mmol)和三苯基膦(62.78g，239.35mmol)在THF(650mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌16h，然后浓缩，得到棕色油状物，将该油状物用石油醚/乙酸乙酯(2.5/1)(1190mL)稀释并搅拌0.5h。将黄色沉淀滤出并用石油醚/乙酸乙酯(2.5/1)(350mL)洗涤，然后用乙醇(100mL)处理并搅拌5min。过滤混合物。将固体用乙醇(30mL)洗涤并在高真空下干燥，得到呈浅黄色固体状的中间体163(97g，95％)。
中间体164的制备：
在室温处，将偶氮二甲酸二异丙酯(31mL，1.039g/mL，159mmol)逐滴添加到中间体53(35.8g，106.3mmol)、中间体151a(31g，111.6mmol)和三苯基膦(41.8g，159.5mmol)在THF(796mL)的搅拌溶液中。将反应物在室温处搅拌3h。将挥发物蒸发。经由制备型LC固体沉积物(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 2X 750g Grace，流动相：梯度为100％ DCM至95％DCM、5％ MeOH、0.5％ NH4OH)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到51g预期化合物。将该化合物从CH3CN中结晶，过滤，用二异丙醚冲洗并干燥，得到中间体164(27.9g，产率44％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体177和中间体178的制备：
得自中间体139：在室温处将偶氮二甲酸二异丙酯(0.46mL，2.34mmol)逐滴添加到中间体60(712mg，1.56mmol)、中间体139(500mg，1.71mmol)和三苯基膦(613mg，2.34mmol)在THF(11.7mL，143mmol)的搅拌溶液中。将反应物在室温处搅拌3h。添加DCM和水。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 120gGrace，流动相：梯度为100％DCM至90％ DCM、10％ MeOH(2％ NH4OH))进行纯化。合并最纯的级分并蒸发溶剂。经由反相(固体沉积物)(固定相：YMC-DispoPack AT ODS-25:40g，流动相：梯度为90％ HCCONH3 0.2％于水中，10％ ACN至50％ HCCONH3 0.2％于水中，50％ACN)进行纯化。合并纯级分并蒸发溶剂，得到中间体177和中间体178的混合物(总共550mg)。
经由制备型SFC(固定相：Chiralcel Diacel OJ 20×250mm，流动相：CO2，MeOH+0.4iPrNH2)进行手性纯化，得到中间体178(97mg；9％)和中间体177(280mg；26％)。
得自中间体140：在室温处将偶氮二甲酸二异丙酯(0.46mL，2.34mmol)逐滴添加到中间体60(712mg，1.56mmol)、中间体140(500mg，1.71mmol)和三苯基膦(613mg，2.34mmol)在THF(11.7mL，143mmol)的搅拌溶液中。将反应物在室温处搅拌3h。添加DCM和水。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 120gGrace，流动相：梯度为100％DCM至90％ DCM、10％ MeOH(2％ NH4OH))进行纯化。合并最纯的级分并蒸发溶剂。经由反相(固体沉积物)(固定相：YMC-DispoPack AT ODS-25:40g，流动相：梯度为90％ HCCONH3 0.2％于水中，10％ ACN至50％ HCCONH3 0.2％于水中，50％ACN)进行纯化。合并纯级分并蒸发溶剂，得到中间体177和中间体178的混合物(380mg)。经由制备型SFC(固定相：Chiralcel Diacel OJ 20×250mm，流动相：CO2，MeOH+0.4iPrNH2)进行手性纯化，得到中间体178(222mg；21％)和中间体177(80mg；7％)。
中间体179的制备
在室温处在氮气下，向中间体148(1.6g，6.566mmol)和5-溴-2-氟-3-硝基甲苯(2.31g，9.9mmol)在THF(19mL)的溶液中添加双(三甲基甲硅烷基)氨基锂(9.9mL，1M，9.9mmol)，并将混合物在回流下搅拌15小时。将反应混合物用NH4Cl溶液淬灭并用DCM稀释。分离各层，将有机层用盐水洗涤。用乙酸乙酯再萃取水层。将合并的有机层在真空下浓缩。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 80g，流动相：梯度为100％ DCM至97％DCM，3％ MeOH(2％NH4OH))进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体179(2.25g，产率75％)。
实施例A65
中间体180的制备：
向中间体52(2.1g；5.627mmol)在DMF(125mL)的悬浮液中添加K2CO3(1.56g；11.25mmol)。然后添加中间体150(2g；6.752mmol)，并将混合物在室温处搅拌过夜。将反应混合物用EtOAc稀释并用盐水洗涤。将有机层浓缩并在高真空下干燥，得到产物(3.56g；定量)，该产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
中间体181的制备：
将中间体150(3.6g，12.2mmol)添加到4-溴-2-甲基-6-硝基苯酚(2.4g，10.1mmol)和碳酸钾(2.8g，20.3mmol)在DMF(45mL)的悬浮液中。将混合物在室温处搅拌过夜，然后用乙酸乙酯稀释。将有机层用盐水洗涤(5次)。将有机层浓缩并在高真空下干燥，得到中间体181(4.3g，86％)。
实施例A66
中间体182的制备：
反应分四个批次(13.71mmol和3*17.14mmol)进行，将该批次合并用于纯化。
将偶氮二甲酸二异丙酯(4.5mL，22.85mmol)和三苯基膦(5.99g，22.85mmol)在THF(55mL)中在氮气下在0℃处混合。当固体沉淀时，添加中间体138(5.0g，17.14mmol)，并在5min后添加中间体16(3.46g，11.43mmol)。将反应混合物在室温处搅拌16h。添加饱和NaHCO3水溶液并将混合物用乙酸乙酯萃取。将有机层经MgSO4干燥，浓缩，与另外3个批次合并，并通过快速色谱法(己烷:DCM(9:1)-乙酸乙酯梯度)纯化，得到中间体182(18.69g，50％)。
实施例A67
中间体183的制备：
在氮气气氛下，将中间体45(1.4g；3.44mmol)、三苯基膦(1.80g；6.87mmol)和中间体151a(954mg；3.44mmol)在THF(50mL)中混合。逐滴添加偶氮二甲酸二异丙酯(1.38mL；1.027g/mL；6.87mmol)并将反应混合物在室温处搅拌20小时。将混合物蒸发，并将粗产物用二氧化硅干燥负载到柱上，用于通过快速色谱法(SiO2；己烷-DCM/EtOAc)纯化，得到产物(1.46g；57％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A68
中间体186的制备：
向中间体184(545mg；0.959mmol)在DCM(20mL)的溶液中添加TEA(0.2mL；0.728g/mL；1.44mmol)，随后添加吗啉(125mg；1.44mmol)。将混合物在室温处搅拌20小时。将混合物用DCM稀释并用盐水洗涤。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；95％庚烷-5％ EtOAc至10％庚烷-90％ EtOAc)纯化，得到产物(350mg；59％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A69
中间体188的制备：
向中间体149(605mg；2.44mmol)和中间体40(960mg；2.44mmol)在DMF(15mL)的溶液中添加K2CO3(674mg；88mmol)。将反应混合物在N2下在60℃处搅拌20小时。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到呈白色固体状的产物(880mg；58％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A70
中间体193的制备：
平行地进行2个等效的反应，并将其合并用于后处理和纯化。将中间体156(8.2g，18.318mmol)在MeOH(164mL)和THF(164mL)中的悬浮液用RaNi(8.2g，139.709mmol)作为催化剂在室温处在1巴的H2下氢化5小时。将两种反应物合并，并经过滤。将滤液蒸发直至干燥。将残余物用硅胶柱色谱法(SiO2；100％ DCM至98％ DCM，2％ MeOH，0.2％ NH4OH)纯化。合并所需级分并在减压下浓缩。将固体用MeCN洗涤，得到产物(13.6g；89％)。
实施例A71
中间体194的制备：
将中间体193(13.6g，32.562mmol)在叔戊醇(141.65mL，0.805g/mL，1293.574mmol)中的混合物在schlenk管中在140℃处搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温并添加蒸馏水。将混合物通过垫过滤，并将滤液用DCM萃取。将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发直至干燥。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；90％庚烷-10％ EtOAc至40％庚烷-60％ EtOAc)纯化，得到产物(6.6g；53％)。
实施例A72
中间体195的制备：
将中间体158(1.6g，2.899mmol)、Fe(0.486g，8.696mmol)和NH4Cl(0.775g，14.493mmol)在THF(10.6mL)、MeOH(10.6mL)和蒸馏水(5.2mL)中的溶液在80℃处搅拌3小时。将反应物冷却至室温，用DCM:MeOH(9:1)的混合物稀释并通过Chromabond PTS过滤。将滤液在减压下浓缩，得到产物(1.7g；定量)，该产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A73中间体201的制备：
将中间体195(1.7g，3.257mmol)的叔戊醇溶液(17.8mL)在140℃处搅拌4小时。在真空下去除挥发物，并将残余物通过柱色谱法(SiO2；100％ DCM-0％ MeOH至93％ DCM-7％MeOH)纯化，得到产物(1.43g；90％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A74
中间体204的制备：
在室温处，将铁(1.76g，31.5mmol)添加到中间体168在乙酸(3.6mL)和MeOH(30mL)的剧烈搅拌的溶液中。将反应物搅拌3小时。去除过量的铁(搅拌棒)。将混合物用1M Na2CO3(200ml)和DCM(200ml)稀释。分离有机层，并将水相用DCM(200ml)再萃取一次。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到中间体204的粗褐色残余物(2.36g，91％，纯度70％)。
实施例A75
中间体205的制备：
方法A：将中间体168(2g，3.26mmol)、铁(0.91g，16mmol)和氯化铵(1.76g，33mmol)在THF(13mL)、MeOH(13mL)和水(6.5mL)中的混合物在90℃处搅拌2小时。冷却至室温后，将反应混合物用DCM稀释并添加水。在上倾析有机层并蒸发溶剂。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm 80g流动相梯度为100％ DCM至95％DCM、5％ MeOH、0.5％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂直至干燥，得到中间体205(697mg，39％)以及中间体205'(595mg，31％)。
方法B：将TFA(434μL，5.7mmol)添加到中间体204在1,4-二烷(45mL)的溶液中并在120℃处加热2小时。将反应混合物冷却至室温并用DCM(150mL)稀释。将混合物用1MNa2CO3(50ml)洗涤。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并浓缩成粗产物。硅胶色谱法(EA/庚烷的梯度为o至100％)得到中间体205(1.34g，85％)。
实施例A76
中间体206的制备：
平行地进行2个等效的反应，并且将其合并用于后处理。将中间体152(57.9g；142.244mmol)溶解在THF(240mL)、MeOH(240mL)和H2O(120mL)中。添加NH4Cl(15.218g；284.488mmol)和铁粉(23.831g；426.732mmol)。将混合物加热并在90℃处回流2h。观察到黑色悬浮液。将混合物冷却至25℃，与来自平行反应的混合物合并，并经硅藻土垫过滤。将滤饼用乙酸乙酯/THF(1/1)(3*1L)冲洗。浓缩滤液，得到棕色固体残余物，将该残余物用乙醇/H2O(1/1)(150mL)处理。将混合物搅拌5min并过滤。将滤饼用乙醇/H2O(1/1)(2*100mL)冲洗并在高真空下干燥(50℃，2h)，得到呈棕色固体状的产物(84g；87％，基于两个批次)。
中间体206的替代制备：
向中间体152(3.2g；7.86mmol)和氯化铵(4.205g；78.6mmol)在甲醇/THF/水(2/2/1；55mL)的悬浮液中添加铁粉(2.195g；39.31mmol)并将混合物在搅拌下加热至70℃持续2小时。将混合物冷却至室温，用二氯甲烷:甲醇(9:1)稀释并用饱和NaHCO3(水溶液)洗涤。将有机层干燥(MgSO4)，过滤并真空浓缩。将所得粗产物在高真空下干燥，得到中间体206(1.19g；44％)。将产物用于下一步骤而无需任何进一步纯化。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体217的制备：
将氯化铵(2.11g，413.37mmol)和铁(4.63g，620.05mmol)添加到中间体163(97g，206.68mmol)在THF/MeOH/H2O(300mL/300mL/150mL)的溶液中。将混合物在95℃处加热16h，冷却至25℃并经硅藻土垫过滤。将滤饼用乙酸乙酯/DMF(1/1)(1500mL*3)洗涤。将浓缩滤液，得到黄色固体，将该固体用甲醇/H2O(1/1)(150mL)处理。将混合物搅拌5min并过滤。将固体用甲醇/H2O(1/1)(2*50mL)洗涤并在高真空下干燥(60℃，2h)，得到呈灰白色固体状的中间体217(63g，76％)。
实施例A77
中间体218的制备：
平行地进行三个反应(6.4g、11.5g和17g)并合并用于纯化。将中间体165(17g，19.568mmol)、铁(5.472g，97.977mmol)和氯化铵(10.687g，199.79mmol)在THF(83mL)、MeOH(83mL)和水(50mL)中的混合物在85℃处搅拌24h。将反应混合物在DCM中稀释并用饱和NaHCO3水溶液洗涤，然后在硅藻土上过滤。将有机层经MgSO4干燥并蒸发真空，得到粗产物，将该粗产物与来自其他两个反应的产物合并(合并32.3g)用于纯化。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 750g，流动相：梯度为100％ DCM至95％ DCM、5％ MeOH、0.5％NH4OH)进行纯化。合并纯级分并蒸发溶剂，得到呈外消旋混合物形式的产物(13.4g，产率58％合并产率)。
中间体218*R和中间体218*S的制备：
将中间体218通过手性SFC(固定相：CHIRALCEL OD-H 5μm250*30mm，流动相：60％CO2，40％ EtOH(0.3％iPrNH2))纯化，得到中间体218*R(5.01g)和中间体218*S(5.05g)。
中间体219的制备
将中间体164(27.9g，46.80mmol)、铁(13.1g，234mmol)和氯化铵(25.6g，478mmol)在THF(198mL)、MeOH(198mL)和水(119mL)中的混合物在90℃处搅拌15小时。冷却至室温后，将反应混合物用DCM稀释，经过滤，并将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到粗化合物(22.7g)。将化合物从CH3CN中结晶，滤出并用Et2O洗涤，得到最终化合物(17.2g，产率69％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A78
中间体232的制备
将中间体179(2.2g，4.8mmol)、铁(2684mg，48mmol)和AcOH(5.5mL，1.049g/mL，96mmol)的MeOH溶液(78mL)在室温处搅拌16h。添加水并将反应混合物用DCM稀释。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm80g，流动相：梯度为100％ DCM至95％DCM，5％ MeOH(2％NH4OH))进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体232(1.22g，产率65％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A79
中间体234的制备：
在密封管中，将中间体188(880mg；1.43mmol)和Cs2CO3(928.7mg；2.85mmol)在1,4-二烷(15mL)中的溶液在N2下脱气。然后添加Pd2(dba)3(130.5mg；143mmol)和Xantphos(164.9mg；0.285mmol)。将反应混合物在N2下再次脱气并在100℃处加热过夜。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化，得到呈黄色固体状的产物(555mg；88％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A80
中间体242的制备：
反应分两个批次(15.60mmol和16.64mmol)进行，将该批次合并用于纯化。
在氮气下，将2-二环己基膦基-2',6'-二甲氧基联苯(1025mg，2.50mmol)和乙酸钯(II)(560mg，2.50mmol)添加到中间体182(9.60g，16.64mmol)和碳酸铯(8.13g，24.96mmol)在甲苯(300mL)的溶液中。将反应混合物用氮气脱气并在100℃处加热15h。添加盐水，将水层用乙酸乙酯萃取，将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。将与另一批次合并的粗产物通过快速色谱法(用庚烷/乙酸乙酯梯度洗脱)纯化，得到呈白色固体状的中间体242(5.36g，31％)。
实施例A81
方法A
中间体243的制备：
向中间体206(14.29g；41.96mmol)、DMAP(1.025g；8.39mmol)和三乙胺(11.7mL；83.92mmol)在DCM(200mL)的溶液中添加二碳酸二叔丁酯(18.32g；83.92mmol)，并将混合物在室温处搅拌13小时。将反应混合物真空浓缩并用二氧化硅干燥负载到柱上以通过快速色谱法(SiO2；己烷/EtOAc)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到产物(11.2g；93％)。
中间体243的替代制备
方法B
中间体243的制备：
在25℃处，将二碳酸二叔丁酯(226.629g；986.486mmol)添加到中间体206(84g；246.621mmol)和Cs2CO3(136.602g；419.256mmol)在THF(1000mL)的悬浮液中。将混合物搅拌并在90℃处回流3h。将混合物冷却至20℃并过滤。将滤饼用THF(500mL)和乙酸乙酯(500mL)冲洗。将滤液在真空下浓缩，得到橙色油状物，将该油状物在玻璃过滤器上经硅胶(洗脱液：石油醚/乙酸乙酯，100/0至86/14)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到橙色胶状物，将该胶状物静置并固化过夜。将混合物用石油醚(50mL)处理并搅拌5min。过滤混合物。将滤饼用石油醚(10mL)洗涤并在高真空下干燥(50℃，0.5h)，得到呈浅黄色固体状的产物(94.5g；87％)。
下表中的中间体通过使用与方法A类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体250的制备：
在室温处，将二碳酸二叔丁酯(298mL，1295.7mmol)添加到中间体217(58g，144.0mmol)和碳酸铯(79.7g，244.7mmol)在THF(600mL)的悬浮液中。将混合物在90℃处搅拌16h，然后冷却至20℃，与较小批次(以5g中间体217运行)合并并过滤。将滤饼用THF(300mL)和乙酸乙酯(300mL)洗涤。将滤液在真空下浓缩，得到橙色油状物，将该油状物经硅胶(洗脱液:石油醚/乙酸乙酯，100/0至86/14)纯化。收集所需级分并蒸发溶剂，得到橙色胶状物，将该胶状物静置过夜。固体沉淀。将混合物用甲基叔丁基醚(50mL)处理并搅拌5min。过滤混合物。将滤饼用甲基叔丁基醚(10mL)洗涤并在高真空下干燥(50℃，0.5h)，得到中间体250(50g，63％，基于两个批次)。
中间体251的制备：
向中间体263(2.06g；5.18mmol)、DMAP(126.6mg；1.04mmol)和三乙胺(1.44mL；10.36mmol)在DCM(50mL)的溶液中添加二碳酸二叔丁酯(2.26g；10.36mmol)，并将混合物在室温处搅拌15小时。将反应混合物真空浓缩并用二氧化硅干燥负载到柱上以通过快速色谱法(SiO2；己烷/EtOAc)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到产物(2.05g；79％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体254的制备：
按照用于制备中间体243的方法A并使用中间体199(2.3g；4.06mmol)作为起始材料来获得中间体254(1.19g；44％)。
中间体255的制备：
按照用于制备中间体243的方法A并使用中间体200(2.0g；4.151mmol)作为起始材料来获得中间体255(1.75g；72％)。
中间体256的制备：
将中间体232(1.2g，3.1mmol)、BOC-酸酐(1.34g，6.1mmol)、DMAP(75mg，0.61mmol)和Et3N(0.85mL，0.728g/mL，6.1mmol)在DCM(12mL)中的混合物在室温处搅拌24h。将混合物用水稀释，并用DCM萃取。将有机层经MgSO4干燥。在真空下去除溶剂。将残余物真空蒸发并通过硅胶色谱法(SiO2，Grace，80g；洗脱液：90％庚烷、10％AcOEt至40％庚烷、60％ AcOEt)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体256(1.13g，78％，纯度90％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A82
中间体258的制备：
将中间体243(94.5g；214.422mmol)、硫代吗啉-1,1-二氧化物(28.987g；214.422mmol)和三乙胺(239.09mL；0.726g/mL；1715.379mmol)在t-BuOH(1000mL)中的浅黄色悬浮液在100℃处搅拌16h，得到黄色溶液。将反应混合物冷却至室温并在减压下浓缩。将残余物用乙酸乙酯(1L)稀释。将溶液用H2O(300mL)、盐水(300mL)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩，得到黄色液体，将该黄色液体溶解在CH2Cl2(100mL)中并通过硅胶快速柱色谱法(洗脱液：石油醚:乙酸乙酯，100:0至50:50，梯度)纯化。收集所需级分并将溶剂在减压下蒸发，得到呈浅黄色固体状的产物(100.37g；86％)。
中间体258的制备：
将中间体243(57.5g，129.9mmol)、硫代吗啉N,N-二氧化物(70.3g，519.7mmol)和三乙胺(144mL，1039.5mmol)在叔丁醇(600mL)中的悬浮液在100℃处搅拌64h。将反应溶液冷却至室温并在真空下浓缩。将残余物用乙酸乙酯(500mL)稀释。将溶液用H2O/盐水(1/1)(400mL)、盐水(600mL)洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将粗物质通过硅胶柱色谱法(洗脱液：石油/乙酸乙酯＝100:0-50:50)纯化。真空蒸发所需级分，得到呈白色固体状的外消旋产物。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A83
中间体259和中间体260的制备：
将中间体258(110g；203.91mmol)经由手性SFC(固定相：CHIRALPAK AD-H 5μm250*30mm，流动相：85％ CO2，15％ EtOH)纯化。收集纯级分并将溶剂蒸发直至干燥，得到中间体259(53.5g；45％)和中间体260(49.5g；41％)，以及富含中间体260的混合级分(8.28g)。将混合的级分经由手性SFC(固定相：CHIRALPAK AD-H5μm 250*30mm，流动相：85％CO2，15％ EtOH)纯化，得到另外的纯中间体260(7.18g；6％)。(中间体259脱保护得到中间体667以及与中间体664的关联证实了中间体259中的立体中心的绝对构型为R。)
中间体259和中间体260的制备：
经由手性SFC(固定相：CHIRALPAK AD-H 5μm 250*30mm，流动相：85％ CO2，15％EtOH)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体259(23.9g，34％)和中间体260(22.2g，32％)。(中间体259脱保护得到中间体667以及与中间体664的关联证实了中间体259中的立体中心的绝对构型为R。)
实施例A84
中间体261的制备：
在密封容器中，在室温处，将吗啉(6.9mL；79.99mmol)添加到中间体207(10g；32mmol)和二异丙基乙胺(14mL；79.99mmol)在MeCN(380mL)的溶液中。将反应混合物在100℃处搅拌过夜。然后，将混合物用水稀释并用EtOAc(3×)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到呈棕色固体状的无需进一步加工即使用的产物(11.77g；定量)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A85
中间体267的制备：
将中间体250(500mg，0.99mmol)、硫代吗啉-1,1-二氧化物(335mg，2.48mmol)和三乙胺(510μL，0.728g/mL，3.67mmol)在乙腈(12mL)中的混合物在密封管中加热，使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(Biotage Initiator EXP 60)在150℃处在密封管中搅拌10min[固定保持时间]。将混合物用水稀释，并用DCM萃取。将有机层经MgSO4干燥。在真空下去除溶剂。将残余物真空蒸发并通过硅胶色谱法(SiO2，Grace，40g；洗脱液：100％ DCM至95％ DCM、5％ MeOH、0.5％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体267(227mg，38％)。
中间体268的制备：
按照用于制备中间体261的方案并使用中间体255(1.75g；3.007mmol)和硫代吗啉1,1-二氧化物(0.813g；6.015mmol)作为起始材料来获得中间体268(1.26g；62％)。
中间体675的制备：
将中间体672(550mg，0.87mmol)、硫代吗啉1,1-二氧化物(702mg，5.19mmol)和DIPEA(0.6mL，3.46mmol)在DMF(2mL)中的悬浮液在100℃处搅拌16h。将混合物用水(6mL)稀释，然后用乙酸乙酯(3*6mL)萃取。将合并的有机层用H2O/盐水1/1(10mL)的溶液洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将粗物质通过12g硅胶快速柱色谱法(洗脱液：100/0至0/100的石油醚/乙酸乙酯，然后100/0至90/10的乙酸乙酯/甲醇，梯度)纯化。将残余物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝10:1)再纯化，得到呈浅黄色固体状的中间体675(284mg，47％)。
实施例A86
中间体269的制备：
将中间体244(1.2g；2.96mmol)、3,6-二氢-2H-吡喃-4-硼酸频哪醇酯(747mg；3.56mmol)和Na2CO3(5.9mL；1mol/L；5.93mmol)在1,4-二烷(40mL)中的溶液在N2下脱气15分钟。添加双(三苯基膦)二氯化钯(II)(104mg；0.15mmol)，并将反应混合物在80℃处加热1小时。将混合物冷却至室温，用EtOAc稀释并经过滤。将滤液用1M Na2CO3溶液洗涤，并将有机层经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将残余物通过快速柱色谱法(SiO2，100％庚烷-0％ EtOAc至50％庚烷-50％ EtOAc)纯化，得到呈黄色油状物的产物(881mg；62％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A87
中间体272的制备：
在N2气氛下，向中间体244(1.55g；3.756mmol)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)(153mg；0.188mmol)和CuI(71.5mg；0.376mmol)在DMA(8mL)的溶液中添加中间体9的溶液(0.56mol/L；4.507mmol)。将所得溶液在80℃处搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温，用EtOAc稀释并用饱和NH4Cl溶液和盐水洗涤。将有机层经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；100％庚烷-0％EtOAc至60％庚烷-40％ EtOAc)纯化。收集所需级分并在减压下蒸发，得到产物(706mg；33％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A88
中间体284的制备：
在密封容器中，将中间体261(11.68g；32.2mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)-3,6-二氢-2H-吡啶-1-甲酸叔丁酯(11.9g；38.6mmol)和K3PO4(13.65g；64.3mmol)在二烷(224mL)和水(32mL)中的溶液在N2下脱气。添加[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]-二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(2.63g；3.22mmol)，将反应混合物在N2下再次脱气并在80℃处加热4小时。将反应混合物冷却至室温，倾注到水中并用EtOAc萃取。将有机层倾析，用水洗涤，然后用盐水洗涤，经MgSO4干燥，经过滤并蒸发至干燥。将所得残余物从MeCN中结晶，过滤并干燥，得到产物(12.68g；85％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A89
中间体676的制备：
将中间体674(1100mg，1.46mmol)、(2-二环己基膦基-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯)[2-(2'-氨基-1,1'-联苯)]甲磺酸钯(II)(123mg，0.15mmol)和碳酸铯(1233mg，3.78mmol)在甲苯(15mL)中的混合物在氮气下在室温处搅拌1h。逐滴添加(三异丙基甲硅烷基)乙炔(0.65mL，2.91mmol)并将混合物在80℃处搅拌3h。添加水(20mL)，将水层用EtOAc(2*20mL)萃取，将有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质通过快速柱色谱法(洗脱液：石油醚:乙酸乙酯＝100:0～0:100)纯化，得到呈浅黄色固体状的中间体676(1120mg，95％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A90
中间体292的制备：
在N2气氛下，将[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]-二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(113mg；0.138mmol)添加到中间体261(1g；2.753mmol)、双(频哪醇合)二硼(839mg；3.304mmol)、乙酸钾(540mg；5.506mmol)在1,4-二烷(21mL)的溶液中。将反应混合物在80℃处搅拌过夜。将混合物在真空下浓缩并通过快速色谱法(SiO2；庚烷/EtOAc)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到产物(1.01g；89％)。
实施例A91
中间体293的制备：
在密封容器中，将中间体261(262.19mg；0.722mmol)、中间体68(700mg；1.083mmol)和Na2CO3(0.722mL；2mol/L；1.44mmol)在1,4-二烷(4mL)中的溶液在N2下脱气。添加[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]-二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(23.52mg；0.036mmol)，将反应混合物在N2下再次脱气并在90℃处加热16小时。将反应混合物冷却至室温，倾注到水中并用EtOAc萃取。将有机层倾析，用水洗涤，然后用盐水洗涤，经MgSO4干燥，经过滤并蒸发至干燥。将所得残余物通过柱色谱法(SiO2；EtOAc/庚烷)纯化。合并所需级分并真空浓缩，得到产物(430mg；62％)。
中间体294的制备：
将中间体293(856mg；0.892mmol)和Pd/C(10％)(0.6g)在MeOH(9mL)和THF(9mL)中的溶液在室温处在大气压下氢化12小时。将反应混合物通过垫过滤以去除催化剂并将滤液蒸发，得到产物(330mg；77％)。
实施例A92
中间体295的制备：
在室温处，将HCl在二烷(4M；7.9mL；31.45mmol)中的溶液添加到中间体287(0.73g；1.57mmol)在DCM(79mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌1小时。在减压下去除挥发物，得到产物(689mg；100％)，该产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
中间体296的制备：
将中间体295(689mg；1.57mmol)和Pd/C(10％)(79mg)在MeOH(31mL)和THF(31mL)中的溶液在室温处在大气压下氢化15小时。将反应混合物通过垫过滤以去除催化剂并将滤液蒸发。将残余物溶解在DCM和10％ NaHCO3水溶液中并萃取。将有机相经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩，得到呈游离碱形式的产物(402mg；70％)。
实施例A93
中间体297的制备：
在密封管中，将中间体292(600mg；1.448mmol)、中间体66(749.97mg；2.172mmol)和K3PO4(627.19mg，2.896mmol)在1,4-二烷(10.1mL)和蒸馏水(1.4mL)中的溶液在N2下脱气5分钟。添加[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(118.53mg，0.145mmol)，并将所得溶液在80℃处搅拌2小时。将所得混合物在EtOAc和盐水之间分配。将有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(SiO2，洗脱液：100％庚烷、0％ EtOAc至0％庚烷、100％ EtOAc)纯化。合并纯级分并浓缩，得到呈黄色固体状的产物(800mg；94％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A94
中间体299的制备：
将中间体284(2.5g；5.37mmol)和Pd/C(10％)(1g)在MeOH(90mL)和EtOAc(90mL)中的溶液在室温处在3巴的H2下氢化18小时。将反应混合物与类似反应物(以500mg规模平行运行)合并以进行后处理。将合并的反应物通过垫过滤以去除催化剂，并将滤液蒸发，得到呈棕色泡沫状的产物(2.89g；96％)。
中间体300和中间体301的制备：
将中间体298(1.03g；1.66mmol)和Pd/C(10％)(83mg)在MeOH(33mL)中的溶液在室温处在大气压下氢化4天。将反应混合物通过垫过滤以去除催化剂并将滤液蒸发。将残余物通过反相色谱法纯化，得到内型产物中间体300(76mg；8％)和外型产物中间体301(150mg；16％)。
中间体302的制备：
将中间体297(800mg；1.368mmol)和Pd/C(10％)(440mg)在MeOH(20mL)和THF(20mL)中的溶液在室温处在大气压下氢化4天。将反应混合物通过垫过滤以去除催化剂并将滤液蒸发。将残余物通过硅胶色谱法(SiO2，洗脱液：100％庚烷、0％ EtOAc至0％庚烷、100％EtOAc)纯化，得到呈棕色油状物的产物(414mg；47％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A95
中间体308的制备：
将中间体205(1.34g，2.45mmol)、环丙基硼酸(843mg，9.81mmol)、磷酸钾(2.08g，9.81mmol)和PdCl2(dppf)2.DCM(200.3mg，0.245mmol)的1,4-二烷溶液(20mL)和蒸馏水溶液(3mL)在密封管中在100℃处搅拌36小时。一旦反应完成，将反应混合物通过垫过滤，并将滤液用EtOAc萃取。将有机层合并，用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2，100％ DCM-0％ MeOH至95％ DCM-5％ MeOH)纯化，得到产物(450mg；35％)。
实施例A96
中间体309的制备：
在5℃处在氮气回流下，将NaH(60％分散体在矿物油中)(1.01g，25.252mmol)添加到中间体261(7.07g，19.465mmol)在DMF(90mL，0.944g/mL，1162.328mmol)的混合物中。将反应物在0℃处搅拌20分钟，然后添加2-(氯甲氧基)乙基三甲基硅烷(4.15mL，0.94g/mL，23.398mmol)，并将反应物在室温处搅拌1小时。添加水，并将混合物用EtOAc萃取三次。倾析有机层并蒸发溶剂直至干燥，得到粗产物。将该粗产物经由制备型LC(固定相：不规则SiOH15μm-40μm 120g 流动相：梯度为100％庚烷至70％庚烷、30％EtOAc)纯化。合并纯级分并真空蒸发溶剂，得到所需产物(3.11g；32％)。(将不纯的级分通过制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 120g Grace，流动相：梯度为100％庚烷至70％庚烷、30％EtOAc)再纯化，得到另外的1.81g(19％)产物)。
中间体310的制备：
将NaOtBu(2.272mL，1M，2.272mmol)添加到在密封管中的中间体309(0.701g，1.42mmol)、1-N-BOC-4-氮杂环丁烷-3-基-哌嗪(514mg，2.13mmol)、Ru-Phos(53.007mg，0.114mmol)和RuPhos预催化剂(46.393mg，0.0568mmol)在4-甲基四氢吡喃(10.621mL，0.857g/mL，90.873mmol)的悬浮液中。使用功率输出在0W至850W范围内的单模式微波(Anton Paar Monowave300)将反应混合物在140℃处搅拌10min(固定保持时间)。添加水和DCM，并将整体用蒸发，以进行固体沉淀纯化。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH15μm-40μm 80g Grace，流动相：梯度为80％庚烷、20％ EtOAc至40％庚烷、50％ EtOAc、10％ MeOH(5％NH4OH))进行纯化，得到产物(778mg；84％)。
中间体311的制备：
将NaOtBu(5.836mL，1M，5.836mmol)添加到Schlenk中的中间体309(1.8g，3.648mmol)、N-Boc-哌嗪(1.019g，5.471mmol)、Ru-Phos(136.17mg，0.292mmol)和RuPhos预催化剂(119.18mg，0.146mmol)在THF(19mL)的悬浮液中。将反应混合物在105℃处搅拌10min。添加水。将混合物用EtOAc萃取两次。将合并的有机层用蒸发以进行固体沉淀纯化。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 80g Grace，流动相：梯度为80％庚烷、20％ EtOAc至40％庚烷、60％ EtOAc)进行纯化，得到产物(1.66g，产率76％)。
中间体312的制备：
将中间体309(1231.915mg，2.496mmol)、3-(哌啶-4-基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(900mg，3.745mmol)、Ru-Phos(93.195mg，0.2mmol)、NaOtBu(3.994mL，1M，3.994mmol)和RuPhos预催化剂(81.567mg，0.0999mmol)的THF溶液(13.00mL，0.886g/mL，159.77mmol)使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(Biotage Initiator EXP 60)在密封管中在105℃处搅拌5min(固定保持时间)。添加水。将混合物用DCM萃取两次，并将添加到合并的有机层中。蒸发溶剂。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 40g GRACE，流动相：梯度为90％庚烷、10％ EtOAc至50％庚烷、50％ EtOAc)进行纯化(固体沉积物)，得到产物(900mg；55％)。
实施例A97
中间体313的制备
将中间体259(650mg，1.21mmol)、1-Boc-哌嗪(224mg，1.21mmol)、Cs2CO3(1.18g，3.62mmol)的混合物装入密封管中并用N2吹扫。添加1,4-二烷(13mL)，并将混合物用N2脱气，然后添加Pd2(dba)3(110mg，0.120mmol)和X-Phos(230mg，0.482mmol)。将反应混合物搅拌并在90℃处加热18h。将水和EtOAc添加到反应混合物中。分离各层。将水层用EtOAc萃取两次。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发，得到呈黄色油状物的粗产物。将粗物质与来自50mg规模的类似反应物合并，并通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，40g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：庚烷80％、EtOAc20％至庚烷0％、EtOAc 100％)纯化。合并含有产物的级分并在真空下蒸发，得到产物(707mg，84％合并产率)。
实施例A98
中间体314的制备：
将中间体207(5g，0.016mol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)-5-6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸叔丁酯(4.122g，13.331mmol)、K3PO4(5.659g，26.662mmol)和[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(0.871g，1.066mmol)的1,4-二烷溶液(80mL)、#F#蒸馏水溶液(12.5mL)和DMF溶液(10.3mL)在Schlenk中在140℃处搅拌40分钟。将反应混合物倾注到水上，用EtOAc萃取两次，并合并有机层。添加并蒸发溶剂。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2，Grace，120g；洗脱液：900％庚烷、10％EtOAc至40％庚烷、50％ EtOAc、10％MeOH(2％ NH4OH))纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到产物(2g；36％)。
实施例A99
中间体315的制备：
将中间体314(1g，2.41mmol)、1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2(1H)-酮(679.959mg，2.892mmol)、磷酸钾(1.023g，4.821mmol)和PdCl2(dppf)2.DCM(197.32mg，0.241mmol)的1,4-二烷溶液(16.8mL)和蒸馏水(2.5mL)使用功率输出在0W至850W范围内的单模式微波(Anton Paar)在密封管中在100℃处搅拌60min(固定保持时间)。一旦反应完成，添加并蒸发挥发物。将粗产物通过固体沉积色谱法纯化。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 80g Grace，流动相：梯度为100％DCM至95％ DCM，5％ MeOH(2％NH4OH))进行纯化，得到产物(730mg；62％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例100
中间体317的制备：
将中间体315(0.73g，1.497mmol)和Pd/C(10％)(0.297g，2.789mmol)在MeOH(25mL)和EtOAc(25mL)中的溶液在室温处在1巴的H2下氢化18小时。然后将反应混合物在室温处在2.2巴的H2下氢化5h。更换催化剂并将反应混合物在室温处在3巴的H2下氢化18小时。经滤出催化剂。蒸发滤液，得到固体残余物(520mg)。经由非手性SFC(固定相：NH2 5μm 150*30mm，流动相：88％ CO2，12％ MeOH(0.3％iPrNH2))进行纯化，得到产物(360mg；49％)。
实施例101
中间体318的制备：
将中间体205(690mg，1.26mmol)、氰化锌(683mg，5.8mmol，1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁(75mg，0.135mmol)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(69mg，0.0754mmol)在DMF(7mL)中的混合物在密封管中使用功率输出在0W至850W范围内的单模式微波(anton parr monowave)在140℃处搅拌30分钟。
将反应物冷却至室温。将该反应物倾注到水中，并将该混合物用EtOAc萃取。倾析有机层并蒸发溶剂直至干燥。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，80g流动相梯度为98％DCM、2％ MeOH、0.2％ NH4OH至95％ DCM、5％ MeOH、0.5％NH4OH)纯化(通过固体沉积在上)。收集纯级分并蒸发直至干燥，得到：
-120mg中间体318；
-325mg不纯的级分，将该级分通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，80g流动相梯度为70％庚烷、30％EtOAc至40％庚烷、60％ EtOAc)纯化，得到252mg中间体318。整体产率为约60％。
中间体319的制备：
在密封管中，将中间体233(399mg，0.77mmol)、六氰合铁(II)酸钾三水合物(0.165g，0.39mmol)、(43mg，0.44mmol)、XPhos Pd G3(70mg，0.083mmol)、tBu XPhos(38mg，0.09mmol)在1,4-二烷(3.6mL)和水(3.6mL)中的溶液用氮气流吹扫。然后将反应物在100℃处搅拌5小时。将反应物冷却至室温。将反应物倾注到NaCl和DCM的饱和溶液上。将有机层在上倾析，然后真空蒸发溶剂直至干燥。将该粗产物溶于ACN中，部分溶解并研磨。添加几滴Et2O，并滤出沉淀并干燥，得到中间体319(276mg，77％)。
中间体320的制备：
将氰化锌(0.84g，7.149mmol)、中间体203(0.8g，1.558mmol)、Pd2(dab)3(0.088g，0.0961mmol)、1,1'-二茂铁二基-双(二苯基膦)(0.088g，0.159mmol)在DMF(8.5mL)中的混合物使用功率输出在0W至850W范围内的单模式微波(anton parr monowave)在140℃处搅拌40分钟。将反应物冷却至室温。将该反应物与另一浴(规模200mg)合并。将反应混合物用DCM和水稀释并经过滤。将有机层在减压下浓缩并且将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；DCM/MeOH)纯化，得到产物(720mg；80％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A102
中间体322的制备：
将中间体254(987.2mg；1.481mmol)、环丙基硼酸(508.9mg；5.924mmol)和K3PO4(943.1mg；4.443mmol)在1,4-二烷(10.3mL)和蒸馏水(1.5mL)中的溶液在N2下脱气。然后添加二氯[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]钯(II)与二氯甲烷的复合物(1:1)(121.2mg；0.148mmol)。将反应混合物在N2下再次脱气并在100℃处加热16小时。将混合物与另一批次(0.735mmol规模)合并。将反应混合物在EtOAc和盐水之间分配。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(SiO2；DCM/MeOH)纯化，得到产物(1.05g；75％)。
中间体323的制备：
按照用于制备中间体322的方案并使用中间体268(1.26g；1.851mmol)作为起始材料来获得中间体323(1.09g；92％)。
实施例A103
中间体324和中间体325的制备：
对中间体323(1.09g；1.698mmol)进行手性分离(方法：Q-M5-Hep-0.1％ DEA-(9:1IPA+0.1％ DEA)300nm)，得到中间体324(123mg；11％)和中间体325(244mg；22％)。
实施例A104
中间体326的制备：
将中间体259(1.0g，1.9mmol)、双(频哪醇合)二硼(706mg，2.78mmol)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)二氯甲烷加合物(151mg，0.185mmol)和乙酸钾(546mg，5.56mmol)悬浮在1,4-二烷(12mL)中。将混合物通过鼓泡氮气脱气15分钟，并然后在80℃处加热18小时。使反应混合物冷却至室温。添加水和AcOEt。分离各层。将有机层用饱和NaHCO3洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，24g Buchi，液体加载(DCM)，流动相梯度：庚烷/AcOEt，80/20至40/60，10CV)纯化。合并含有产物的级分并蒸发，得到中间体326(1.09g，87％，纯度87％)。
实施例A105
中间体327的制备：
将中间体67(600mg，1.46mmol)、中间体326(938mg，1.46mmol)和磷酸钾(772mg，3.64mmol)在1,4-二烷(7.2mL)和水(3.6mL)中的溶液小心地用氮气吹扫。添加催化量的[1,1'-双(二叔丁基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)(95mg，0.145mmol)。将反应混合物用氮气再次吹扫，密封并在70℃处搅拌17小时。将反应混合物冷却至室温并与从220mg中间体67开始的另一批次合并。
在EtOAc中稀释后，将有机层用水洗涤，然后用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发，得到残余物，将该残余物通过制备型LC(固定相：不规则裸二氧化硅40g，流动相：梯度为5％庚烷、95％ AcOEt至0％庚烷、100％ AcOEt)纯化。合并含有所需产物的级分并真空蒸发，得到中间体327(930mg，66％)。
中间体328和中间体329的制备：
将中间体327(850mg，1.2mmol)在EtOH(10mL)中的溶液在55℃处温热。然后添加Pd/C(5％)(500mg，0.235mmol)，随后添加甲酸铵(741mg，11.8mmol，分2份添加，第二份在第一份后5分钟添加)。将烧瓶用普通塑料盖盖住，并将反应物在55℃处搅拌1h30。将反应混合物冷却至室温，并通过硅藻土塞过滤。将滤液真空蒸发，得到645mg灰色固体(76％)。将粗产物通过手性SFC(固定相：Whelk-O1(S,S)5μm250*21.2mm，流动相：50％ CO2、50％ MeOH(0.3％iPrNH2))纯化。合并含有所需产物的级分，得到中间体328(475mg，56％)和中间体329(74mg，9％)。
实施例A106
中间体330的制备：
将中间体256、1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁-二氯化钯(ii)二氯甲烷加合物(58.8mg，0.071mmol)和碘化亚铜(I)(27.1mg，0.14mmol)添加到密封管中。将混合物脱气3次。添加DMA(5.9mL)。将反应混合物脱气3次。添加中间体11的DMA溶液(10.175mL，0.35M，3.561mmol)并将混合物脱气3次。使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(BiotageInitiator EXP 60)将反应混合物在80℃处搅拌90min(固定保持时间)。将反应混合物倾注到水和NH4Cl上，用DCM萃取两次，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。
经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 40g，流动相：梯度为100％庚烷至40％庚烷，60％ AcOEt)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体330(439mg，产率54％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A107
中间体333的制备：
该反应以10.2g规模的中间体260平行进行两次。
将中间体260(10.211g，18.928mmol)、碘化镍(II)(670.765mg，2.146mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(536.604mg，1.999mmol)、锌粉(2.53g，38.686mmol)、1-BOC-4-溴哌啶(10g，37.855mmol)和氯化镁(1.802g，18.928mmol)置于密封管中。将混合物脱气3次。添加吡啶(1.533mL，0.982g/mL，19.033mmol)的DMA溶液(134mL)。将反应混合物脱气3次。将反应混合物在室温处搅拌5小时，然后倾注到水上，用DCM萃取两次并经过滤。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将残余物从MeCN中结晶，得到第一批次的产物(12.9g；53％)。
将母液真空蒸发。将残余物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm220g流动相：100％ DCM至95％ DCM，％MeOH(2％NH4OH))纯化。合并富含产物的级分并蒸发溶剂。将残余物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm 80g 流动相：90％庚烷、10％AcOEt至40％庚烷、60％ AcOEt)纯化，得到第二批次的产物(4.5g；18％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体343的制备：
在N2下，将吡啶(60.1μL，0.982g/mL，0.746mmol)在DMA(5mL)中的溶液添加到中间体259(400mg，0.741mmol)、中间体80(328mg，1.48mmol)、碘化镍(II)(26.3mg，0.0841mmol)、4,4'-二叔丁基-2,2'-联吡啶(21.0mg，0.0783mmol)、锌粉(99.1mg，1.52mmol)和氯化镁(70.6mg，0.741mmol)的混合物中。将反应混合物用N2吹扫(3次)，然后在室温处搅拌20h。将反应混合物用DCM稀释，然后添加水。将水层用DCM萃取。将合并的有机层用水、盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤，蒸发并通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，40gBuchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：庚烷/EtOAc：80/20至20/80，15柱体积)纯化，得到呈无色油状物的产物(423mg；80％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体346和中间体347的制备：
将中间体259(100mg，0.185mmol)、碘化镍(II)(6.6mg，0.021mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(5.3mg，0.020mmol)、锌粉(24.8mg，0.379mmol)和氯化镁(17.7mg，0.185mmol)的混合物在密封管中脱气3次。添加吡啶(15μL，0.186mmol)和中间体111(123mg，0.371mmol)的DMA溶液(1.3mL)。将混合物脱气3次并在室温处搅拌18h。将反应物冷却至室温。添加水和EtOAc，将混合物经过滤并分离有机层。将溶剂蒸发直至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiO240μm 40g，流动相：100％ DCM至93％ DCM、7％ MeOH(2％NH4OH))进行纯化，合并级分并蒸发溶剂，得到外消旋中间体。经由手性SFC(固定相：Whelk-O1(S,S)5μm 250*21.2mm，流动相：50％ CO2，50％iPrOH)进行纯化，得到中间体346(70mg，28％)和中间体347(65mg，26％)。
中间体348的制备：
反应分两个批次(分别为0.78mmol和0.26mmol规模)进行，将该批次合并用于纯化。
在氮气下，将中间体259(422mg，0.78mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(46mg，0.17mmol)、碘化镍(II)(98mg，0.31mmol)、锌粉(102mg，1.57mmol)和氯化镁(75mg，0.78mmol)引入烘箱干燥的管中。将中间体113(300mg，0.94mmol)和吡啶(63μL，0.78mmol)在DMA(3mL)中的溶液添加到混合物中，将该混合物在室温处搅拌2天。添加盐水，将水层用乙酸乙酯萃取，将有机层经MgSO4干燥并在减压下浓缩。将粗产物通过快速色谱法(用DCM-DCM/MeOH洗脱)纯化。收集纯级分并浓缩，得到中间体348(302mg，42％)。
中间体349的制备：
反应分两个批次(5.55mmol和15.73mmol)进行，将该批次合并用于纯化。
在氮气下，将中间体242(8.50g，15.73mmol)、中间体98(7.53g，23.59mmol)、4,4'-二-叔丁基-联吡啶(464mg，1.73mmol)、碘化镍(II)(980mg，3.15mmol)、锌粉(2.06g，31.46mmol)和氯化镁(1.50g，15.73mmol)引入到烘箱干燥的管中。添加吡啶(1.27mL，15.73mmol)在DMA(100mL)中的溶液，将管密封并将混合物在室温处搅拌16h。将混合物用乙酸乙酯稀释，用盐水洗涤(5次)并浓缩有机层。将粗产物与另一批次合并，并通过快速色谱法(SiO2，庚烷-乙酸乙酯)纯化，得到中间体349(6.82g，62％)。
中间体350的制备：
反应分两个批次(分别为18.54mmol和3.71mmol规模)进行，将该批次合并用于纯化。
将中间体259(10.00g，18.54mmol)、碘化镍(II)(657mg，2.10mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(526mg，1.96mmol)、锌粉(2.48g，37.89mmol)和氯化镁(1.77g，18.54mmol)引入密封管中，并将混合物用氮气脱气3次。添加吡啶(1.5mL，18.64mmol)和中间体102(11.32g，37.08mmol)的DMA溶液(130mL)。将混合物用氮气脱气3次并在室温处搅拌24h。将反应混合物冷却至室温并与第二批次合并。添加水和EtOAc，将混合物经硅藻土过滤，并倾析有机层。将溶剂蒸发直至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiO2 40μm 330g，流动相：100％DCM至88％ DCM、12％ MeOH(2％ NH4OH))进行纯化。经由制备型LC(固定相：不规则SiO2 40μm 330g，流动相：80％庚烷、20％ AcOEt至40％庚烷、50％ AcOEt、10％ MeOH(2％NH4OH))进行第二次纯化，得到中间体350(9.6g，63％)。
中间体351的制备：
将氯化镁(2.43g，25.56mmol)添加到密封管中的中间体259(13.8g，25.56mmol)、碘化镍(II)(918mg，2.94mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(686mg，2.56mmol)、锌粉(3.34g，51.11mmol)和中间体101(15.60g；51.11mmol)的混合物中。将混合物用氮气脱气3次，然后添加吡啶(2.06mL，25.56mmol)在DMA(185mL)中的溶液。将反应混合物用氮气脱气3次，并将混合物在室温处搅拌18h。将反应混合物倾注到水上并添加EtOAc。将混合物通过垫过滤，并将滤液用EtOAc萃取3次。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并将溶剂蒸发。将粗物质通过色谱法(不规则SiO2，330g；洗脱液：100％ DCM至96％DCM、4％ MeOH、0.4％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体351(13.56g，77％)。
中间体352的制备：
将中间体259(730mg，1.36mmol)、碘化镍(II)(48mg，0.15mmol)、4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(39mg，0.14mmol)、锌粉(182mg，2.78mmol)和氯化镁(130mg，1.36mmol)引入密封管中，并将混合物用氮气脱气3次。添加吡啶(110μL，1.37mmol)和中间体116(907mg，2.72mmol)的DMA溶液(10mL)。将混合物用氮气脱气3次，然后在室温处搅拌18h。添加水和EtOAc，将混合物经硅藻土过滤并倾析有机层。将溶剂蒸发直至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiO240μm 40g，流动相：100％ DCM至93％ DCM、7％ MeOH(2％NH4OH))进行纯化。合并级分并蒸发溶剂，得到中间体352(1060mg，定量)。
实施例A108
中间体353的制备：
将TFA(2.165mL；1.489g/mL；28.27mmol)添加到中间体284(329mg；0.707mmol)在DCM(10.6mL)的溶液中，在0℃处搅拌并在室温处搅拌16h。将反应混合物倾注到冰水中并用饱和NaHCO3(水溶液)碱化，并用DCM/MeOH 9:1萃取。将有机相经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩，得到产物(256mg；99％)，该产物用于下一步骤而无需进一步精制。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体355的制备：
将TFA(2.56mL；1.489g/mL；33.43mmol)添加到中间体302(414mg；0.636mmol)在DCM(3.8mL)的溶液中并在室温处搅拌6h。将反应混合物在真空下浓缩。将残余物在EtOAc和饱和Na2CO3溶液之间分配，并将有机层经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩，得到产物(240mg；79％)，该产物用于下一步骤而无需进一步纯化。
中间体356的制备：
将TFA(1.04mL；1.489g/mL；13.58mmol)添加到中间体294(327mg；0.679mmol)在DCM(7mL)的溶液中，并在0℃处搅拌并且在室温处搅拌2小时。将反应混合物倾注到冰水中并用饱和Na2CO3(水溶液)碱化，并用DCM/iPrOH 9:1萃取。将有机相经MgSO4干燥，过滤并在减压下浓缩，得到产物(200mg；77％)，该产物用于下一步骤而无需进一步精制。
中间体357的制备：
将中间体311(1600mg，2.672mmol)在TFA(35.059mL，1.49g/mL，458.126mmol)和DCM(67mL)中的溶液在室温处搅拌5h。将混合物倾注到冰上。添加水和NH4OH直至碱性pH。将混合物用DCM萃取两次，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到产物(1070mg，定量)，该产物无需进一步加工即使用。
中间体358的制备
在室温处，将TFA(18.7mL，244mmol)缓慢添加到中间体224(15g，34.8mmol)在DCM(200mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌12小时。将混合物在真空下浓缩，得到呈黄色固体状的粗化合物。
将甲基叔丁基醚(40mL)添加到粗化合物中，搅拌0.5小时，过滤。将滤饼真空干燥，得到呈白色固体状的中间体358(17g，73％)。
中间体359的制备：
将三氟乙酸(2.89mL，1.49g/mL，37.725mmol)添加到中间体267(227mg，0.377mmol)在DCM(7.5mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌12h。将溶剂蒸发直至干燥。将该粗产物倾注到冰上。添加水和NH4OH直至碱性pH。将混合物用DCM萃取两次。在上倾析有机层，并蒸发溶剂直至干燥，得到中间体359(144mg，95％)。
中间体360的制备
将中间体335(500mg，0.81mmol)溶解于DCM(16mL)中，并将混合物冷却至0℃，然后缓慢添加TFA(3.5mL，45mmol)。将该混合物在室温处搅拌2h，并将混合物在减压下浓缩，得到呈黄色油状物的中间体360(788mg，定量)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A109
中间体365的制备：
将中间体367(284mg，0.77mmol)和乙酸酐(0.13mL，1.36mmol)在DCM(5.6mL)中的溶液在室温处搅拌30分钟。添加水和DCM。将混合物用氨水调至碱性。倾析有机层并蒸发溶剂直至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 40g，流动相：梯度为100％DCM至91％DCM，9％ MeOH(2％NH4OH))进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体365(231mg，73％)。
中间体366的制备：
将中间体365(226mg，0.552mmol)和NaOH(1M在H2O中)(5.5mL，1M，5.5mmol)在EtOH(9.5mL)中的溶液在密封管中在140℃处使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(Biotage Initiator EXP 60)搅拌15min(固定保持时间)。将反应混合物倾注到水和NH4Cl上，用DCM萃取两次，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到中间体366(103mg，51％)。
中间体367的制备：
在室温处，将TFA(1.7mL，1.49g/mL，22.4mmol)逐滴添加到中间体330(0.439g，0.773mmol)在DCM(3.9mL)的溶液中。将反应混合物搅拌1h。将粗产物倾注到冰上。添加水和NH4OH直至碱性pH。将混合物用DCM萃取两次。在上倾析有机层，并蒸发溶剂直至干燥，得到中间体367(284mg，定量)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体373和中间体374的制备：
将三氟乙酸(85mL，1.49g/mL，1105.436mmol)添加到中间体218(5.7g，11.054mmol)在DCM(219mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌6h。将溶剂蒸发直至干燥。将该粗产物倾注到冰上。添加水和NH4OH直至碱性pH。将混合物用DCM萃取两次，将有机层在上倾析，并蒸发溶剂直至干燥，得到外消旋中间体。经由制备型LC(固定相：不规则SiO2 40μm 200g，流动相：0.8％ NH4OH、92％DCM、8％ MeOH)进行纯化。经由制备型手性SFC(固定相：Chiralpak IG，流动相：CO2/MeOH/DCM(+1％iPrNH2)50/25/25)进行纯化，得到中间体373(1.2g，26％)和中间体374(1.2g，26％)。
中间体375的制备：
在0℃处，将TFA(20.683mL，1.49g/mL，270.268mmol)的DCM溶液(87mL)逐滴添加到中间体333(5.8g，9.009mmol)在DCM(130mL)的溶液中。在搅拌下将反应混合物温热至室温，并在室温下搅拌48小时。将挥发物蒸发并将该粗产物吸收到DCM、水和NH4OH(水溶液)的溶液中。倾析有机层，并蒸发溶剂直至干燥，得到产物(4.8g，定量)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A110中间体415的制备：
在室温处，将HCl在二烷(4M；5.3mL；21.39mmol)中的溶液添加到中间体299(1g；2.14mmol)在DCM(11mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌一周。添加K2CO3和DCM的10％水溶液。将混合物在室温处搅拌1h，然后用DCM(3×)萃取。将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到680mg棕色泡沫。将该粗残余物通过硅胶色谱法(SiO2，Grace，24g；洗脱液：98％ DCM、2％ MeOH、0.2％ NH4OH至90％DCM、10％ MeOH、1％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到呈棕色泡沫状的产物(210mg；26％)。
中间体416的制备：
将HCl(4M在二烷中)(1.762mL，4M，7.047mmol)添加到中间体317(345mg，0.705mmol)在1,4-二烷(4.7mL)和MeOH(2.9mL)的溶液中，并将混合物在室温处搅拌12h。将挥发物蒸发，并将残余物吸收到DCM中并再次蒸发至干燥，得到产物(380mg；定量)，该产物随后无需进一步纯化即使用。
中间体417的制备：
在室温处，将HCl的二烷溶液(0.8mL，4M，3.2mmol)缓慢添加到中间体318(120mg，0.244mmol)在1,4-二烷(2mL)的混合物中。将反应混合物在室温处搅拌2小时，并添加MeOH(0.5mL，0.7g)，并将混合物在室温处再搅拌1小时。将该反应物与另一批次(从300mg中间体318开始)合并。将溶剂蒸发至干燥，得到中间体417(825mg，定量)。
中间体678的制备：
在0℃处，将HCl的1,4-二烷溶液(6.8mL，4M，27.16mmol)添加到中间体676(1100mg，1.36mmol)在DCM(5mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌3h并真空浓缩，得到呈HCl盐形式的中间体678(1100mg，55％)。
实施例A111
中间体418的制备：
将中间体343(423mg，0.591mmol)在甲酸(7.5mL)和水(497μL)中的溶液在50℃处搅拌2天。将反应混合物冷却至室温。将混合物用饱和NaHCO3溶液(水溶液)碱化，并用DCM萃取两次。将有机层合并，经MgSO4干燥，过滤，蒸发并通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，24g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：DCM/(MeOH/NH4OH:9/1):100/00至95/5，10CV)纯化。将含有产物的级分蒸发，得到呈黄色固体状的产物(265mg；98％)。
实施例A112
中间体419和中间体420的制备：
将中间体415(1g；2.72mmol)、N-Boc-3-吡咯烷酮(756mg；4.08mmol)和AcOH(281μL；4.90mmol)在二氯乙烷(10mL)中的溶液在室温处搅拌15min，添加三乙酰氧基硼氢化钠(1.15g；5.44mmol)，并将反应混合物在室温处搅拌过夜。将反应物用10％ K2CO3溶液(水溶液)淬灭，并用DCM萃取。将有机层用水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到1.51g棕色残余物。将粗产物通过硅胶色谱法(SiO2；40g；Grace；洗脱液：97％ DCM、3％ MeOH、0.3％NH4OH至90％ DCM、10％MeOH、1％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到2等份的外消旋产物，为淡棕色泡沫(613mg；42％)和灰白色泡沫(130mg；13％)。将淡棕色泡沫经由手性SFC(固定相：CHIRALCEL OJ-H 5μm 250x20mm，流动相：80％ CO2，20％ MeOH(0.3％iPrNH2))纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到呈淡棕色泡沫状的中间体419(287mg；20％)和中间体420(287mg；20％)。
中间体421的制备：
将中间体415(210mg；0.57mmol)、1-Boc-氮杂环丁酮(147mg；0.86mmol)和AcOH(59μL；1.03mmol)在二氯乙烷(2mL)中的溶液在室温处搅拌15min，添加三乙酰氧基硼氢化钠(242mg；1.14mmol)，并将反应混合物在室温处搅拌过夜。将反应物用10％ K2CO3溶液(水溶液)淬灭，并用EtOAc(3×)萃取。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到350mg呈淡棕色油状物的粗产物。将粗产物通过硅胶色谱法(SiO2，Grace，4g；洗脱液：100％DCM至97％ DCM、3％ MeOH、0.3％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到呈淡黄色油状物的产物(262mg；88％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体462的制备：
将中间体359(144mg，0.359mmol)、1-Boc-3-氮杂环丁酮(92mg，0.538mmol)、乙酸(37μL，1.048g/mL，0.646mmol)和三乙酰氧基硼氢化钠(152mg，0.717mmol)在DCM(1mL)中的溶液在室温处搅拌24h。将反应物用10％ K2CO3水溶液淬灭，并用DCM萃取。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并将溶剂蒸发。将残余物通过硅胶色谱法(SiO2，Grace 40g；洗脱液：100％ DCM至95％ DCM、5％ MeoH、0.5％NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体462(127mg，64％)。
中间体463的制备：
将叔丁氧基羰基哌啶-4-酮(420mg，2.11mmol)添加到中间体359(1146mg，1.06mmol)和三乙胺(0.88mL，6.33mmol)在1,2-二氯乙烷(15mL)的溶液中，并将混合物搅拌1h。添加三乙酰氧基硼氢化钠(340mg)，并将混合物在室温处搅拌48h。添加饱和NaHCO3水溶液，并将水层用DCM萃取。将有机相用盐水洗涤，然后经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。将粗产物通过快速柱色谱法(SiO2，用庚烷-乙酸乙酯50％至100％洗脱以去除一些杂质，然后用DCM-MeOH 0％至10％洗脱产物)纯化，得到中间体463(353mg，57％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体464的制备：
向中间体360(1.21g，1.06mmol)和TEA(881μL，6.34mmol)在DCE(21mL)的溶液中添加N-Boc-3-吡咯烷酮(391mg，2.11mmol)并将反应混合物搅拌4h。然后添加三乙酰氧基硼氢化钠(336mg，1.58mmol)，并将混合物在室温处搅拌18h。添加DCM和饱和NaHCO3水溶液，并分离各层。将水层用DCM萃取，并将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤，浓缩并通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，40g Buchi，液体注射(CH2Cl2)，流动相梯度：CH2Cl2/(MeOH+10％NH3水溶液):98/2至90/10，15CV)纯化。蒸发含有产物的级分，得到中间体464(471mg，66％，纯度86％)。
中间体465的制备：
将中间体96(189mg，0.765mmol)添加到中间体378*R(159mg，0.383mmol)在DCE(7.6mL)的溶液中，并将反应混合物在室温处搅拌1h。然后，添加三乙酰氧基硼氢化钠(122mg，0.574mmol)，并将混合物在室温处搅拌70h。真空去除溶剂。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 40μm，12g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：DCM/MeOH 100/0至90/10)纯化。蒸发含有产物的级分，得到159mg黄色残余物。将该残余物用饱和NaHCO3水溶液稀释并添加DCM。分离各层，并将水层用DCM萃取(两次)。将合并的有机层经MgSO4干燥，过滤并真空去除溶剂，得到中间体465(129mg，43％，纯度83％)。
实施例A113
中间体466的制备：
将中间体341(328mg，0.447mmol)溶解于DCM(9mL)中，并将混合物冷却至0℃，然后缓慢添加TFA(328mg，0.447mmol)。将该混合物在室温处搅拌4.5小时。将反应混合物浓缩，然后在0℃处冷却。添加水和10％ NH4OH水溶液直至pH＝10。将水层用DCM萃取两次，将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到呈淡黄色固体状的中间体466(311mg，定量，纯度91％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A114
中间体468的制备：
将中间体377(6g；14mmol)、中间体89(4.3g；21mmol)和AcOH(1.36mL；24mmol)在二氯甲烷(138mL)中的溶液在室温处搅拌10min，然后添加三乙酰氧基硼氢化钠(5.9g；28mmol)，并将反应混合物在室温处搅拌12h。将反应混合物与2种其他反应混合物(分别以2.3g和0.86g中间体377开始)合并。将反应物用10％ K2CO3溶液(水溶液)淬灭，并用DCM萃取。倾析有机层并蒸发溶剂，得到9.3g粗产物。将粗产物通过硅胶色谱法(SiO2，Grace，4g；洗脱液：100％ DCM至93％DCM、7％ MeOH、0.7％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到产物(6.2g；47％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体475的制备：
将中间体417(339mg，0.73mmol)、中间体89(0.224g，1.1mmol)、三乙酰氧基硼氢化钠(0.293g，1.38mmol)在AcOH(0.08mL，1.049g/mL，1.4mmol)和DCM(7mL)中的混合物在室温处搅拌过夜，然后添加中间体89(70mg，0.341mmol)和三乙酰氧基硼氢化钠(154mg，0.73mmol)，并将混合物在室温处再搅拌2天。添加水和10％K2CO3水溶液。将混合物用EtOAc萃取两次，并用DCM萃取一次。合并有机层并蒸发溶剂直至干燥。将粗产物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm 40g 流动相梯度为99％ DCM、1％ MeOH、0.1％NH4OH至88％ DCM、12％ MeOH、1.2％ NH4OH)纯化。收集纯级分并将溶剂蒸发直至干燥，得到中间体475(125mg，30％)。
中间体476和中间体477的制备：
在室温处，将三乙酰氧基硼氢化钠(4.386g，20.69mmol)添加到中间体373(4.3g，10.35mmol)、1-Z-3-吡咯烷酮(3.403g，15.52mmol)和HOAc(1.02mL，1.049g/mL，17.84mmol)在DCM(108mL)的搅拌溶液中。将反应混合物在室温处搅拌12h，在DCM中稀释并添加10％K2CO3水溶液。搅拌该混合物，然后用倾析有机层，并蒸发溶剂直至干燥。将该粗产物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm 120g 流动相梯度：100％DCM至94％ DCM、6％ MeOH(2％NH4OH))纯化。收集纯级分并蒸发溶剂直至干燥，得到外消旋产物(6000mg，94％)。经由手性SFC(固定相：CHIRALPAK AS-H 5μm250*20mm，流动相：55％CO2，45％ EtOH/iPrOH 50/50v/v+10％ACN(+0.3％iPrNH2)的混合物)进行纯化，得到中间体476(2.82g，44％)和中间体477(2.72g，42％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A115
中间体480的制备：
在室温处，中间体380(1.85g，1.71mmol)、中间体91(1.62g，6.93mmol)和AcOH(476μL，1.049g/mL，8.3mmol)的EtOH(59mL)溶液。将反应混合物搅拌10min，然后添加氰基硼氢化钠(785mg，9.2mmol)。将反应混合物在室温处搅拌12h。添加水并蒸发EtOH。
使用连续萃取将水层用DCM萃取，得到中间体480(215mg，20％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体483的制备：
在室温处，向中间体353(226mg；0.618mmol)在甲醇(5.3mL)的溶液中添加1-Boc-氮杂环丁酮(211.8mg；1.237mmol)、AcOH(42.4μl；1.05g/mL；0.742mmol)和氰基硼氢化钠(19.4mg；0.309mmol)。将混合物搅拌16h。向反应混合物中添加NaHCO3(水溶液)，并将混合物用乙酸乙酯萃取并用NaHCO3(水溶液)洗涤。将有机相经MgSO4干燥，过滤并蒸发至干燥。将粗产物通过快速柱色谱法用DCM/DCM:MeOH 9:1(40％)的混合物洗脱来纯化，得到产物(228mg；71％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A116
中间体490和中间体491的制备：
对中间体489(200mg；0.354mmol)进行手性分离(起始：59％[正庚烷+0,1％DEA]-41％[2-丙醇+0,1％DEA]-结束：17％[正庚烷+0,1％DEA]-83％[2-丙醇+0,1％DEA])，得到中间体490(80mg；0.148mmol)和中间体491(89mg；46％)。
中间体497和中间体498的制备：
将中间体496(559mg；1.01mmol)通过手性HPLC分离，得到纯的对映体中间体497(213mg；38％)和中间体498(189mg；34％)。
中间体501和中间体502的制备：
将中间体500(426mg；0.775mmol)通过手性HPLC分离，得到纯的对映体中间体501(194mg；46％)和中间体502(200mg；47％)。
中间体506和中间体507的制备：
将中间体505(249mg；0.463mmol)通过手性HPLC分离，得到纯的对映体中间体506(97mg；39％)和中间体507(93mg；37％)。
中间体512和中间体513的制备：
对中间体511(1107mg；2.01mmol)进行手性分离(方法：CELLULOSE-1Q_M5[HEPT-(2-PROP-EtOH 9:1)]+0.1％DEA)，得到中间体512(392mg；35％)和中间体513(445mg；40％)。
中间体516和中间体517的制备：
对中间体515(1783；2.978mmol)进行手性分离(方法CELULOSE-1,Q-MG3 iPrOH-MeOH 9:1+0.1％ DEA)，得到中间体516(656mg；37％)和中间体517(637mg；36％)。
中间体519和中间体520的制备：
对中间体518(332mg；0.554mmol)进行手性分离(方法：AMYLOSE_1Q_MS5[(HEPT_EtOH 9-1)-(ACN)]+0.1％DEA)，得到中间体519(133mg；40％)和中间体520(108mg；33％)。
中间体454和中间体455的制备：
对中间体453(680mg；1.14mmol)进行手性分离(方法：SFC CELULOSE-1ISO50MeOH，234nm)，得到中间体454(254mg；37％)和中间体455(154mg；23％)。
中间体457和中间体458的制备：
对中间体456(164mg；1.14mmol)进行手性分离(方法：固定相：CHIRALPAK AD-H 5μm 250*30mm，流动相：60％ CO2、40％iPOH(0.3％iPrNH2))，得到中间体457(62mg；38％)和中间体458(60mg；37％)。
实施例A117
中间体521和中间体522的制备：
将中间体460(2.41g，4.82mmol)、硫代吗啉-1,1-二氧化物(1.303g，9.639mmol)、乙酸钯(II)(108mg，0.482mmol)、2,2'-双(二苯基膦基)-1,1'-联萘基(600mg，0.964mmol)、碳酸铯(3.926g，12.049mmol)在1,4-二烷(35mL)中的混合物在密封管中在105℃处搅拌3h。将反应混合物用DCM稀释并用饱和NaHCO3溶液洗涤，然后在硅藻土上过滤。将有机层经MgSO4干燥并真空蒸发。将粗产物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm，40g GraceResolv，流动相梯度：100％ DCM至95％ DCM、5％ MeOH、NH4OH 0.5％)纯化。收集纯化的级分，并将溶剂蒸发至干。将残余物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm，80g GraceResolv，流动相梯度：80％庚烷、20％ AcOEt至40％庚烷、50％AcOEt、10％ MeOH、NH4OH 1％)再纯化。收集纯化的级分，并将溶剂蒸发至干。经由反相(固定相：120g，YMC-actus Triart C18 10μm30*150mm，流动相：梯度为65％ NH4HCO3 0.2％、35％ ACN至25％NH4HCO3 0.2％、75％ ACN)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到外消旋产物。经由手性SFC(固定相：CHIRALPAK AD-H5μm 250*30mm，流动相：50％ CO2、50％iPrOH(0.3％iPrNH2))进行纯化，得到中间体521(129mg，4％)和中间体522(134mg，5％)。
实施例A118
中间体523的制备：
将中间体481(250mg，0.48mmol)、3-羟甲基-氮杂环丁烷[95849-02-8](106mg，0.6mmol)和DIPEA(331μL，0.75g/mL，1.9mmol)在ACN(4.4mL)中的溶液在密封管中在110℃处使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(Biotage Initiator EXP 60)搅拌30min[固定保持时间]。将反应物倾注到盐水上，用DCM萃取。
将不溶物过滤并干燥，得到中间体523(45mg)。将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到177mg。将粗产物经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 24g，流动相：梯度为100％ DCM至97％ DCM、3％MeOH、0.3％ NH4OH)纯化。收集纯级分并将溶剂蒸发直至干燥，得到中间体523(95mg)。
总量和产率：140mg，50％
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A119
中间体525的制备：
在室温处，将Boc2O(32.33mL；0.95g/mL；140.74mmol)添加到中间体447(7.6g；15.64mmol)和Cs2CO3(5.61g；17.20mmol)在THF(80mL)的悬浮液中。将混合物在85℃处回流16小时。将混合物冷却至室温，过滤并用THF(100mL)和乙酸乙酯(100mL)洗涤。将滤液在真空下浓缩。将残余物通过硅胶快速色谱法(SiO2；石油醚/乙酸乙酯，100/0至40/60)纯化，得到呈浅橙色固体状的产物(7.6g；78％)。
中间体526的制备：
将中间体525(300mg，0.512mmol)、3-(甲磺酰基)吡咯烷(190.931mg，1.28mmol)和DIPEA(352.81μL，0.75g/mL，2.047mmol)在MeCN(5.347mL)中的溶液在密封管中在110℃处使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(Biotage Initiator EXP 60)搅拌5分钟。[固定保持时间]。将反应物倾注到水和NaCl上，用DCM萃取，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm24g，流动相：梯度为100％ DCM至93％ DCM、7％MeOH(2％NH4OH))进行纯化，得到产物(285mg；80％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A120
中间体532的制备：
将中间体525(500mg，0.853mmol)、1-甲基-1H-吡唑-5-硼酸频哪醇酯(204.117mg，0.981mmol)和K3PO4(271.611mg，1.28mmol)在1,4-二烷(4.765mL)和蒸馏水(2.383mL)中的搅拌溶液用N2吹扫，并添加[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(34.832mg，0.0427mmol)。将反应混合物用N2再次吹扫，并在80℃处搅拌4小时。将粗混合物用EtOAc和水稀释，并将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发。将残余物通过制备型LC(固定相：不规则SiOH 20μm-45μm 80g GRACE，流动相：99％ DCM、1％ MeOH、0.1％ NH4OH至90％DCM、10％ MeOH、1％ NH4OH)纯化，得到产物(378mg；78％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A121
中间体535的制备：
在氮气下，向中间体249(300mg；0.571mmol)、中间体105(308mg；1.142mmol)、Cs2CO3(372.1mg；1.142mmol)在THF(8mL)的溶液中添加DavePhos(44.94mg；0.114mmol)和Pd2(dba)3(52.29mg；0.057mmol)。将混合物在95℃处加热16小时。将混合物倾注到水/NaHCO3上并用EtOAc稀释。将有机层分离，用盐水洗涤并在减压下浓缩。将残余物通过硅胶快速柱色谱法(SiO2；庚烷//乙酸乙酯和二氯甲烷//甲醇)纯化，得到产物(204mg；50％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A122
中间体537的制备：
在氮气下，将2-二环己基膦基-2'-(N,N-二甲基氨基)联苯(105mg，0.27mmol)和三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(122mg，0.13mmol)添加到中间体249(700mg，1.33mmol)、中间体105(718mg，2.66mmol)和碳酸铯(868mg，2.66mmol)在THF(15mL)的溶液中。将混合物在95℃处加热16h，然后倾注到水/NaHCO3上并用乙酸乙酯稀释。将有机层分离并用盐水洗涤。将混合物通过快速柱色谱法(二氧化硅；庚烷/乙酸乙酯和二氯甲烷/甲醇)纯化。收集所需级分并浓缩，得到中间体537(171mg，18％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体539的制备：
将中间体259(400mg，0.741mmol)、中间体104(190mg，0.741mmol)和碳酸铯(725mg，2.22mmol)的混合物装入密封管中并用N2吹扫。添加1,4-二烷(8mL)，并将混合物用N2脱气，然后添加2-二环己基膦基-2',4',6'-三异丙基联苯(71mg，0.15mmol)和三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(136mg，0.148mmol)。将反应混合物搅拌并在100℃处加热18h。将水和EtOAc添加到反应混合物中。分离各层。将水层用EtOAc萃取两次。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发。将粗物质通过制备型LC(不规则SiO2 40μm，40g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：从DCM 99％、iPrOH 1％至DCM 90％、iPrOH 10％)纯化。合并含有产物的级分并在真空下蒸发，得到中间体539(320mg，60％)。
实施例A123
中间体540的制备：
在室温处，将HCl在二烷(4M；1.244mL；4.98mmol)中的溶液添加到中间体421(260mg；0.50mmol)在二烷(3.3mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌3h。添加K2CO3和DCM的10％水溶液。将混合物在室温处搅拌1h，将悬浮液过滤并干燥，得到167mg白色固体(79％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体570的制备：
在0℃处，将4M HCl的1,4-二烷溶液(594μL，2.376mmol)缓慢添加到中间体462(127mg，0.228mmol)在1,4-二烷(3mL)和MeOH(378μL)的溶液中。将该反应物在室温处搅拌12h。将溶剂蒸发直至干燥。添加DCM、水和NH4OH。将有机层用NaCl洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到中间体570(100mg，96％)。
实施例A124
中间体571的制备：
将中间体349(7.97g，11.39mmol)溶解于DCM(30mL)中，并添加三氟乙酸(20mL)。将反应混合物在室温处搅拌3h并蒸发。将所得粗产物在高真空下干燥，得到呈TFA盐形式的中间体571(5.69g，定量)。
实施例A125
中间体572的制备：
将碘三甲基硅烷(9.9mL，69.36mmol)添加到中间体350(9.5g，13.87mmol)在乙腈(180mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌2h。添加10％ NaHCO3水溶液和EtOAc。用EtOAc萃取混合物三次。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到中间体572(7.7g，定量)。
实施例A126
中间体573的制备：
在0℃处，将三氟乙酸(45mL，593.99mmol)在DCM(145mL)中的溶液逐滴添加到中间体351(13.56g，19.80mmol)在DCM(240mL)的溶液中。将反应混合物在室温处搅拌18h，然后用DCM、水和30％ NH4OH水溶液稀释。将混合物在室温处搅拌1h并用DCM萃取3次。将有机层倾析，经MgSO4干燥，过滤并将溶剂蒸发。将粗物质通过色谱法(SiO2，Buchi，220g，洗脱液：95％ DCM、5％ MeOH、0.5％ NH4OH至85％DCM、14％ MeOH、1.4％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到中间体573(8.1g，84％)。
中间体574的制备：
将中间体352(810mg，1.14mmol)溶解于DCM(22mL)中，并逐滴添加三氟乙酸(4.35mL，56.81mmol)。将混合物在室温处搅拌20h。将挥发物蒸发。将残余物溶于冰中。添加水和10％ NH4OH水溶液直至碱性pH。将水溶液用EtOAc萃取两次。将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂直至干燥，得到呈无色油状物的中间体574(536mg，92％)。
中间体575的制备：
将TFA(14.046mL，1.49g/mL，183.547mmol)逐滴添加到中间体310(700mg，1.071mmol)在DCM(27mL)的搅拌溶液中。将反应混合物在室温处搅拌5h。将混合物倾注到冰上。添加水和NH4OH直至碱性pH。将混合物用DCM萃取两次，并将合并的有机物经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发，得到无需进一步加工即使用的产物(455mg；定量)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体628的制备：
在0℃处，将TFA(3mL，39.4mmol)逐滴添加到中间体337(622mg，0.70mmol)在DCM(14mL)的搅拌溶液中。将反应混合物在室温处搅拌18h。将混合物倾注到冰上。添加水和NH4OH直至碱性pH。将水层用DCM萃取两次，并将合并的有机物用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发，得到呈白色固体状的中间体628(373mg，95％，纯度89％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
中间体632的制备：
在5℃处，将TFA(500μL；6.53mmol)逐滴添加到中间体423(117mg；0.23mmol)在DCM(2mL)的悬浮液中，并将反应混合物在室温处搅拌6h。将反应混合物用冰水、10％ K2CO3水溶液和DCM稀释。将反应混合物在室温处搅拌1h，然后将混合物用DCM(3×)萃取。将有机层经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到呈白色泡沫状的产物(100mg；定量)。
实施例A127
中间体644的制备
将中间体465(129mg，0.166mmol)在EtOH(5.4mL)中的溶液通过N2鼓泡脱气，并然后在55℃处温热(Findenser设备)。然后添加Pd/C(5％)(70mg，33μmol)，随后添加甲酸铵(104mg，1.66mmol)并将反应物在55℃处搅拌1h 30。将反应混合物冷却至室温，用EtOH稀释并将混合物在硅藻土垫上过滤。真空蒸发滤液，得到中间体644(85mg，定量)。
中间体645和中间体646的制备：
将中间体466(311mg，0.45mmol)在EtOH(4mL)中的溶液在55℃处温热。然后添加Pd/C(5％)(190mg，0.089mmol)，随后添加甲酸铵(282mg，4.5mmol)。将烧瓶用普通塑料盖盖住，并将反应物在55℃处搅拌1h 30。将反应混合物过滤，浓缩并通过制备型LC(球形C18，25μm，120g YMC-ODS-25，干燥负载，流动相梯度0.2％NH4+HCO3-水溶液/MeCN，65:35至25:75在10CV中)。蒸发含有纯产物的级分，得到113mg白色固体。将粗产物通过手性SFC(固定相：CHIRACEL OJ-H 5μm250*30mm，流动相：60％ CO2、40％ MeOH/ACN的混合物：80/20v/v(+0.3％iPrNH2))纯化。蒸发含有纯产物的级分，得到中间体645(54mg，24％)和中间体646(47mg，21％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A128
中间体649的制备：
将中间体477(2.7g，4.36mmol)在室温处在MeOH(50mL)和EtOAc(50mL)中用Pd/C(10％)(546mg，0.51mmol)作为催化剂在大气压下氢化5h。在垫上滤出催化剂。将用EtOAc/MeOH(80/20)的混合物洗涤两次。将溶剂蒸发至干燥，得到产物(1.72g，81％)。
中间体650的制备：
将中间体476(544mg，0.879mmol)在室温处在MeOH(10mL)和EtOAc(10mL)中用Pd/C(10％)(100mg，0.094mmol)作为催化剂在大气压下氢化5h。在垫上滤出催化剂。将用EtOAc/MeOH(80/20)的混合物洗涤两次。将溶剂蒸发至干燥，得到产物(395mg，93％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A129
中间体682的制备：
在0℃处，将丙烯酰氯(25μL，0.31mmol)添加到中间体680(200mg，0.29mmol)和三乙胺(0.2mL，1.43mmol)在DCM(2mL)的溶液中。将混合物在0℃处搅拌30min。添加水(10mL)，将水层用EtOAc(3*10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯，100/0至50/50)纯化。收集产物级分并蒸发溶剂，得到呈黄色油状物的中间体682(180mg，88％)。
下表中的中间体通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例A130
中间体684的制备：
在0℃处，将丙基膦酸酐(544mg，0.86mmol)添加到中间体680(400mg，0.57mmol)、2-丁炔酸(53mg，0.63mmol)和三乙胺(159μL，1.14mmol)在DMF(4mL)的溶液中。将混合物在室温处搅拌过夜。添加水(10mL)，将水层用EtOAc(3*10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯，100/0至50/50)纯化。收集产物级分并蒸发溶剂，得到中间体684(120mg，29％)。
实施例A131
中间体686的制备：
在0℃-5℃处在氮气下，将DIPEA(869.8μL，0.76g/mL，5.12mmol)添加到丁炔酸(103.2mg，1.23mmol)和O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(546mg，1.43mmol)在DCM(7.65mL)的悬浮液中。将反应混合物搅拌10分钟。在0℃-5℃处，将该悬浮液添加到中间体685(628mg，1.023mmol)在DCM(22.95mL)的溶液中，并将反应混合物在室温处搅拌3h。添加水、NH4Cl(水溶液)和DCM。倾析有机层并蒸发溶剂直至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm40g，流动相：梯度为100％ DCM至90％ DCM、10％ MeOH、0.1％NH4OH)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到产物(230mg；50％)。
B.最终化合物的制备
实施例B1
化合物1的制备：
将丙烯酸溶液(162μL；1.05g/mL；2.36mmol)在DMF(2mL)中的溶液逐滴添加到中间体540(166mg；0.39mmol)、EDCI.HCl(226mg；1.18mmol)和Et3N(0.75mL；0.73g/mL；5.41mmol)在DMF(5.5mL)的悬浮液中，并将反应混合物在室温处搅拌2h。将反应混合物用EtOAc稀释并倾注到水上。将混合物用EtOAc(3×)提取。将有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发溶剂，得到152mg黄色油状物。将该油状物通过硅胶色谱法(SiO2，Grace，4g；洗脱液：97％ DCM、3％ MeOH至95％DCM、5％ MeOH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到60mg淡黄色油状物。经由反相色谱法(固定相：YMC-actus Triart-C18 10μm 30*150mm，流动相：梯度为75％ NH4HCO3 0.2％、25％ ACN至35％ NH4HCO3 0.2％、65％ ACN)进行进一步纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到呈无色油状物的产物(36mg，19％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例B2
化合物32的制备：
将三乙胺(494.1μL；0.726g/mL；3.545mmol)添加到中间体614a(353.54mg；0.709mmol)在DCM(10mL)的溶液中。将混合物在冰浴中冷却。然后将丙烯酰氯(57.6μL；1.114g/mL；0.709mmol)的DCM溶液(2mL)逐滴添加到混合物中并在室温处搅拌3小时。将反应混合物通过添加饱和NaHCO3(水溶液)淬灭并用CH2Cl2萃取。将有机层在真空下浓缩，留下368mg粗残余物，将该粗残余物通过反相色谱法纯化，得到呈白色固体状的产物(193mg；49％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例B3
化合物100的制备：
将中间体469*S(340mg，0.537mmol)溶解于THF(13mL)中。将反应混合物在氮气下冷却至0℃。缓慢添加tBuONa溶液(402.968μL，2M，0.806mmol)。将反应混合物在0℃处搅拌20min，然后在室温处搅拌1h。添加水、NH4Cl和DCM。倾析有机层并蒸发溶剂直至干燥。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 40g，流动相：梯度为100％DCM至88％ DCM、12％MeOH、0.1％ NH4OH)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂。将所得残余物从MeCN中结晶，得到产物(148mg，产率50％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例B4
化合物123的制备：
将HBTU(5.689g；15mmol)添加到中间体654(4.986g；10mmol)、2-丁炔酸(1.261g；15mmol)和二异丙基乙胺(8.733mL；0.74g/mL；50mmol)在DCM(10mL)的溶液中，并将混合物在室温处搅拌2小时。通过添加饱和NaHCO3(水溶液)将反应混合物淬灭并用CH2Cl2萃取。将有机层在真空下浓缩。纯化通过快速色谱法(SiO2，甲醇-二氯甲烷梯度)进行，得到呈消旋混合物形式的产物(5.4g；96％)。
化合物124*R和化合物125*S的制备：
将化合物123(5.4g；9.563mmol)通过手性SFC色谱法(方法Lux Cellulose_1SFCisocratic 50％ MeOH+0.1DEA)分离成2个对映体化合物124*R和化合物125*S来纯化，得到分离的对映体。每种分离的异构体通过快速色谱法(SiO2，甲醇-二氯甲烷梯度)纯化，得到化合物124*R(2.485g；46％)和化合物125*S(2.260g；42％)。
化合物126的制备：
在0℃-5℃处在氮气下，将二异丙基乙胺(1.8mL，0.75g/mL，10.445mmol)添加到2-丁炔酸(0.203g，2.415mmol)和O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(1g，2.623mmol)在DCM(40mL)的悬浮液中。将反应物搅拌10分钟。在0℃-5℃处添加中间体620(0.99g，2.104mmol)在DCM(20mL)中的溶液，并将反应物在0℃处搅拌45min，然后在室温处搅拌30min。添加水、NH4Cl水溶液和DCM。将有机层在上倾析并将溶剂蒸发直至干燥。将粗物质经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 40g，流动相：梯度为98％ DCM、2％MeOH、0.2％NH4OH至90％DCM、10％MeOH、0.1％NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到残余物(632mg)，将该残余物溶于MeCN中并研磨，过滤并真空干燥，得到产物(588mg；52％)。
化合物127的制备：
在0℃-5℃处在氮气下，将二异丙基乙胺(1.66mL，0.75g/mL，9.635mmol)添加到O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(0.955g，2.505mmol)和2-丁炔酸(0.186g，2.216mmol)在DCM(10mL)的悬浮液中。将反应混合物搅拌10分钟。在0℃-5℃处添加中间体622(1.346g，1.927mmol)在DCM(55mL)中的溶液，并将反应混合物在0℃处搅拌45min，然后在室温处搅拌30min。添加水、NH4Cl(水溶液)和DCM。倾析有机层并蒸发溶剂直至干燥。将所得粗产物经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 40g，流动相：梯度为100％ DCM至90％ DCM、10％ MeOH、0.1％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到部分纯的产物(971mg)。经由反相(固体沉积物)(固定相：YMC-DispoPack AT ODS-25:40g，流动相：梯度为90％ HCCONH3 0.2％在水中，10％ MeCN至50％ HCCONH3 0.2％在水中，50％MeCN)进行纯化。将残余物用MeCN和水冷冻干燥，得到固体(666mg)。将该级分悬浮于Et2O中，过滤并在70℃处在真空下干燥24h，得到产物(586mg，57％)。
化合物128(对应于化合物142)的制备：
在0℃处，将二异丙基乙胺(3.08mL，0.74g/mL，17.63mmol)添加到2-丁炔酸(361mg，4.29mmol)、O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(2.323g，6.12mmol)在DCM(18mL)的混合物中。将该混合物在0℃处搅拌10min，然后添加中间体649(1.72g，3.55mmol)在DCM(80mL)中的溶液。将该反应物在0℃处搅拌45min，添加10％ NH4Cl水溶液，并该混合物用DCM萃取两次。将有机层在上倾析并将溶剂蒸发直至干燥。将该产物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm320g流动相梯度：100％ DCM至93％ DCM，7％ MeOH(2％ NH4OH))纯化。收集纯级分，并将溶剂蒸发直至干燥。将残余物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm 320g流动相梯度：100％DCM至94％ DCM，6％ MeOH(2％ NH4OH))纯化。收集纯级分，添加硅藻土并蒸发溶剂直至干燥。经由反相(固体沉淀物)(固定相：YMC ODS-25 120g，流动相：梯度为85％ NH4HCO30.2％、15％ ACN至45％ NH4HCO3 0.2％、55％ ACN)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂直至干燥，得到固体(1.6g)。将级分吸收到Et2O中，过滤并在65℃处在真空下干燥3h，然后在70℃处干燥16h，得到产物(1.406g，72％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
化合物139和化合物140的制备：
将O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(6.48g，17.08mmol)添加到中间体571(5.69g，11.39mmol)、2-丁炔酸(1.44g，17.08mmol)和二异丙基乙胺(9.94mL，56.94mmol)在DCM(40m)的溶液中。将混合物在室温处搅拌3h，然后倾注到饱和NaHCO3水溶液上并用二氯甲烷萃取。将有机层用NaHCO3和盐水洗涤，然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗产物通过快速色谱法(用DCM-DCM/MeOH洗脱)纯化。将纯级分收集并浓缩。经由手性SFC(固定相：CHIRACEL OJ-H 5μm250*30mm，流动相：70％ CO2、30％ MeOH(0.6％ TEA))进行纯化。将每种级分在Et2O中研磨，过滤并干燥。将所得固体分别溶解于DCM中，用10％K2CO3水溶液和水洗涤，经MgSO4干燥并浓缩，然后在Et2O中研磨，过滤并在70℃处干燥18h，得到化合物139(1210mg，19％)和140(1270mg，产率20％)。
化合物141(对应于化合物130)的制备：
在0℃处，将二异丙基乙胺(13.4mL，76.88mmol)添加到2-丁炔酸(1.57g，18.71mmol)和O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(10.13g，26.71mmol)在DCM(75mL)的混合物中。将该混合物在0℃处搅拌10min，然后添加中间体572(7.5g，15.48mmol)在DCM(345mL)中的溶液。将反应物在0℃处搅拌45min，添加10％ NH4Cl水溶液，并该混合物用DCM萃取两次。将有机层在上倾析并将溶剂蒸发直至干燥。将该产物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm 320g 流动相梯度：100％ DCM至88％ DCM、12％ MeOH(2％NH4OH))纯化。收集纯级分，并将溶剂蒸发直至干燥。将残余物通过制备型LC(不规则SiO2 15μm-40μm 320g 流动相梯度：60％庚烷、40％ AcOEt至55％庚烷、20％ AcOEt、25％ MeOH(2％ NH4OH))纯化。收集纯级分，添加硅藻土并蒸发溶剂直至干燥。经由反相(固体沉淀物，固定相：YMC ODS-25 300g，流动相：梯度为85％ NH4HCO30.2％、15％ ACN至45％ NH4HCO3 0.2％、55％ ACN)进行纯化。收集纯级分，并将溶剂蒸发直至干燥。经由非手性SFC(固定相：2-乙基吡啶5μm150*30mm，流动相：87％ CO2、13％ MeOH(0.9％iPrNH2))进行最终纯化，得到化合物141(2730mg，32％)。
化合物142(对应于化合物128)的制备：
在0℃处在氮气下，将二异丙基乙胺(13.9mL，81.71mmol)添加到2-丁炔酸(1.65g，19.61mmol)和O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(8.7g，22.88mmol)在DCM(100mL)的悬浮液中。将反应混合物搅拌10min。在0℃处添加中间体573(7.92g，16.34mmol)在DCM(350mL)中的溶液并将反应混合物在室温处搅拌45min。添加水、10％NH4Cl水溶液和DCM。将混合物用DCM萃取3次。将有机层倾析，经MgSO4干燥，过滤并将溶剂蒸发。将粗物质通过色谱法(SiO2，Buchi，220g，洗脱液：100％ DCM至93％ DCM、7％ MeOH、0.7％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂。将产物经由反相(YMC，固体沉积物300g；洗脱液：75％ NH4HCO3水溶液(0.2％)、25％ ACN至35％ NH4HCO3水溶液(0.2％)、65％ACN)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂。添加DCM和水，将混合物通过过滤并蒸发滤液，得到化合物142(5.15g，57％)。
化合物144的制备：
将中间体574(536mg，1.05mmol)和2-丁炔酸(105mg，1.26mmol)在DCM(23mL)和二异丙基乙胺(0.907mL，5.19mmol)中的溶液冷却至0℃，并用O-(1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(595mg，1.57mmol)处理。将反应混合物在0℃处搅拌1h，然后用饱和NaHCO3水溶液和DCM稀释。将有机层分离，经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发。将残余物通过制备型LC(不规则SiO2 40μm，80g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：DCM/MeOH 100/0至90/10，15CV)纯化。合并含有产物的级分并蒸发。将产物在Et2O中研磨，得到固体，将该固体真空干燥，得到呈白色粉末状的化合物144(158mg，26％)。
实施例B5
化合物150的制备：
将中间体375(3.992g，9mmol)、中间体86(2.461g，17.945mmol)、三乙酰氧基硼氢化钠(3.814g，17.997mmol)和AcOH(939.51μL，1.049g/mL，16.411mmol)的无水DCM溶液(113.741mL)在室温处搅拌12h。添加水并将反应混合物用DCM萃取两次。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将所得残余物经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 40g，流动相：梯度为100％ DCM至90％ DCM、10％ MeOH、0.1％ NH4OH)纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到固体(4.8g)，将该固体通过手性SFC(固定相：CHIRALCEL OD-H 5μm250*30mm，流动相：50％ CO2、50％ EtOH(0.3％iPrNH2))进一步纯化，得到3.9g产物。将该物质从MeCN中结晶，在70℃处在真空下干燥24h，得到最终化合物(3g，59％)。
化合物149的制备：
将中间体407(2.85g，6.425mmol)、中间体86(1.757g，12.811mmol)、三乙酰氧基硼氢化钠(2.723g，12.848mmol)和AcOH(0.671mL，1.049g/mL，11.716mmol)的无水DCM溶液(80mL)在室温处搅拌2h。添加水并将反应混合物用DCM萃取两次。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并蒸发，得到粗残余物。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 80g，流动相：梯度为100％ DCM至90％ DCM、10％ MeOH、0.1％ NH4OH)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂，得到呈外消旋物形式的产物(3.3g；91％)。
化合物148和150的制备：
经由手性SFC(固定相：CHIRALCEL OD-H 5μm 250*30mm，流动相：50％ CO2、50％EtOH(0.3％iPrNH2))进行手性分离，得到第一洗脱级分(1.5g；41％)和第二洗脱级分(1.5g；41％)。将第一洗脱级分从MeCN中结晶，并在70℃处在真空下干燥4h，得到化合物150(1.08g；30％)。将第二洗脱级分从MeCN中结晶，并在70℃处在真空下干燥4h，得到化合物148(1.11g；31％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例B6
化合物157(化合物148柠檬酸盐)的制备：
将化合物148(125mg，0.222mmol)和柠檬酸(42.6mg，0.222mmol)在MeOH(3mL)中的混合物在室温处搅拌1h。将反应混合物真空浓缩，得到161mg呈白色固体状的柠檬酸盐(96％)。
化合物158(化合物148HCl盐)的制备：
将化合物148(114mg，0.202mmol)和HCl溶液(4M在二烷中，101μL，0.404mmol)在MeOH(1.4mL)中的混合物在室温处搅拌1h。将反应混合物真空浓缩，得到112mg呈淡黄色固体状的HCl盐(87％)。
实施例B7
化合物159的制备：
将中间体376(260mg，0.626mmol)、中间体87(189.18mg，1.251mmol)、AcOH(60.9μL，1.049g/mL，1.064mmol)和氰基硼氚化钠(82.42mg，1.251mmol)一起在无水DCM(6.2mL)和MeOH(0.6mL)中在室温处搅拌。将反应混合物在室温处搅拌12h。将反应混合物用DCM稀释并用饱和NaHCO3溶液(水溶液)洗涤。将有机物经MgSO4干燥，过滤并真空蒸发，得到粗产物。经由制备型LC(固定相：不规则SiOH 15μm-40μm 40g Grace，流动相：梯度为100％ DCM至90％DCM、10％MeOH、0.5％NH4OH)进行纯化。合并纯级分并蒸发溶剂，得到呈非对映体混合物形式的产物(280mg；81％)。通过手性SFC(固定相：Whelk-O1(S,S)5μm 250*30mm，流动相：40％CO2、60％ MeOH/DCM 90/10v/v(+0.3％iPrNH2)的混合物)进行分离，得到168mg混合级分和化合物159的纯级分，将该纯级分用ACN/水冷冻干燥，得到产物(53mg，产率15％)。化合物128在分析手性sfc中的常见保留时间支持非对映体分配。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例B8
化合物161和162的制备：
化合物161和化合物162
将二异丙基乙胺(325μL，0.75g/mL，1.88mmol)和中间体418(215mg，0.471mmol)添加到中间体85(420mg，1.01mmol)在DCM(4.5mL)的混合物中。将混合物在室温处搅拌4h。添加三乙酰氧基硼氢化钠(250mg，1.18mmol)并将反应混合物在室温处搅拌18h。添加水和DCM。分离各层并将水层用DCM萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并浓缩，得到353mg粗产物。将粗物质通过反相(固定相：YMC-actus Triart C18 10μm 30*150mm，流动相梯度：0.2％ NH4HCO3水溶液/MeCN：65/35至15/85)纯化。将含有产物的级分蒸发，得到呈白色固体状的化合物161(63mg；18％)和呈白色固体状的化合物162(138mg；40％)。
实施例B9
化合物163的制备：
将中间体628(200mg，0.389mmol)、2-戊炔酸(45.8mg，0.467mmol)和二异丙基乙胺(332μL，0.75g/mL，1.93mmol)在DCM(4mL)中的混合物在0℃处搅拌。在0℃处缓慢添加1-丙烷膦酸酐(T3P)(582μL，1.069g/mL，0.977mmol)。将混合物在0℃处搅拌10min，并然后在室温处搅拌3h。添加饱和NaHCO3水性溶液(水溶液)和EtOAc。分离各层。将水层用EtOAc萃取。将合并的有机层用盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并真空浓缩。将所得残余物通过制备型LC(不规则SiOH 15μm-40μm，24g Buchi，液体负载(DCM)，流动相梯度：DCM/MeOH 99/1至95/5，10柱体积)纯化。合并含有纯产物的级分并蒸发，得到呈白色固体状的不够纯的产物(143mg)。将该物质通过制备型LC(球形C18，25μm，40g YMC-ODS-25，液体负载(MeOH)，流动相梯度0.2％NH4HCO3水溶液/MeCN，75:25至35:65在10柱体积中)进一步纯化。合并含有纯产物的级分并真空蒸发，得到呈白色固体状的所需产物(122mg，54％)。
下表中的化合物通过使用类似的方法由相应的起始材料开始制备。
实施例B10化合物189和化合物190
将氟化铯(76mg，0.50mmol)添加到中间体682(180mg，0.25mmol)在DMF(0.5mL)的溶液中。将混合物在70℃处搅拌2h，添加水(10mL)，将水层用二氯甲烷/MeOH 10/1(3*10mL)萃取。将合并的有机层真空浓缩。将粗物质通过反相(Xtimate C18 150*25mm*5μm，水(0.225％ HCOONH4)/MeCN 55/45至25/75)纯化，得到外消旋产物(76mg)。经由手性SFC(固定相：CHIRALCEL OD(250mm*30mm,10μm)，流动相：45％ CO2、55％ EtOH(0.05％DEA))分离对映体。将两种残余物悬浮于水(5mL)中并冻干，得到化合物189(19mg，14％)和化合物190(17mg，12％)。
实施例B11
化合物195的制备：
将中间体686(210mg，0.465mmol)、2,5-二氧杂-8-氮杂螺[3.5]壬烷TFA盐(282.5mg，1.16mmol)和DIPEA(400.4μL，0.75g/mL，2.32mmol)在ACN(4.85mL)中的溶液在密封管中在140℃处使用功率输出在0W至400W范围内的单模式微波(Biotage Initiator EXP60)搅拌40min[固定保持时间]。添加水，并将反应混合物用DCM萃取，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。经由制备型LC(固体沉积物)(固定相：不规则SiOH 35μm-70μm 40g，流动相：梯度为100％ DCM至88％ DCM、12％MeOH、0.1％ NH4OH)进行纯化。收集纯级分并蒸发溶剂。经由反相(固体沉积物)(固定相：YMC-DispoPack AT ODS-25:40g，流动相：梯度为90％ HCCONH30.2％在水中，10％ ACN至40％ HCCONH3 0.2％在水中，60％ ACN)进行第二次纯化。收集纯级分并蒸发溶剂。将残余物溶于DCM中，经MgSO4干燥，过滤并蒸发。将残余物用ACN和水冷冻干燥，得到产物(17mg，产率7％)。
分析部分
LCMS(液相色谱/质谱)
高效液相色谱(HPLC)测量使用LC泵、二极管阵列(DAD)或UV检测器和如相应方法中所规定的柱来进行。如果需要，包括另外的检测器(参见下表方法)。
将来自柱的流送入配置有大气压离子源的质谱仪(MS)。设置调整参数(例如，扫描范围、驻留时间……)以便获得允许识别化合物的标称单同位素分子量(MW)的离子在技术人员的知识范围内。用适当的软件进行数据采集。
通过实验保留时间(Rt)和离子来描述化合物。如果在数据表中没有不同地规定，则所报告的分子离子对应于[M+H]+(质子化分子)和/或[M-H]-(去质子化分子)。在化合物不可直接电离的情况下，指定加合物的类型(即[M+NH4]+、[M+HCOO]-等)。对于具有多同位素模式(Br、Cl)的分子，所报告的值是针对最低同位素质量获得的值。所有结果都是在具有通常与所用方法相关的实验不确定性的情况下获得的。
在下文中，“SQD”是指单四极检测器，“RT”是指室温，“BEH”是指桥接乙基硅氧烷/二氧化硅混合物，“HSS”是指高强度二氧化硅，“DAD”是指二极管阵列检测器，“MSD”是指质量选择检测器。
表：LCMS方法代码(流速以mL/min表示；柱温(T)以℃计；运行时间以分钟表示)。
熔点(DSC或K)
对于许多化合物，熔点(MP)通过DSC1(Mettler-Toledo)测定。熔点以10℃/分钟的温度梯度测量。最高温度为350℃。值为峰值。在表中表示为DSC。
对于许多化合物，熔点是通过Kofler热台(在分析表中用(K)表示)获得的，该热台由具有线性温度梯度的加热板、滑动指针和以摄氏度计的温标组成。
对于许多化合物，熔点是用自动熔点仪WRS-2A(在分析表中用WRS-2A表示)获得的。从室温开始到320℃的最大值以每分钟5℃的温度梯度测量熔点。
对于许多化合物，熔点是通过Mettler Toledo MP50仪器(在分析表中用MP50表示)获得的。从50℃开始(等待时间10秒)到300℃的最大值以每分钟10℃的温度梯度测量熔点。
对于许多化合物，熔点是用Mettler Toledo FP72仪器(在分析表中用FP72表示)获得的。从50℃开始(等待时间10秒)到300℃的最大值以每分钟10℃的温度梯度测量熔点。
在下表中，“N°”是指化合物编号。
NMR
NMR实验使用Bruker Avance 500III进行，该仪器使用内部氘锁并配备有反向三重共振(1H、13C、15N TXI)探头，或者在环境温度处使用Bruker Avance DRX 400光谱仪进行，该仪器使用内部氘锁并配备有反向双重共振(1H、13C、SEI)探头，该探头具有z梯度并对于质子在400MHz处且对于碳在100MHz处操作。化学位移(δ)以百万分率(ppm)报告。J值以Hz表示。
化合物1：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.55(s,1H),8.21(s,1H),7.13(d,J＝1.9Hz,1H),6.89(d,J＝8.2Hz,1H),6.73(dd,J＝8.2,2.2Hz,1H),6.31(dd,J＝16.9,10.2Hz,1H),6.10(dd,J＝17.0,2.2Hz,1H),5.67(dd,J＝10.4,2.2Hz,1H),4.90(s,2H),4.24(t,J＝8.0Hz,1H),4.03(dd,J＝8.8,5.0Hz,1H),3.94(dd,J＝10.2,7.4Hz,1H),3.74(dd,J＝10.4,5.0Hz,1H),3.69(t,J＝4.4Hz,4H),3.16(t,J＝4.4Hz,4H),3.14-3.10(m,1H),2.96-2.81(m,2H),2.44-2.38(m,1H),1.95-1.84(m,2H),1.78-1.69(m,2H),1.63-1.51(m,2H)
化合物32：
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δppm
8.25(s,1H),6.71(s,1H),6.53(s,1H),6.38–6.29(m,1H),6.19(dd,J＝16.9,10.2Hz,1H),5.71–5.56(m,2H),4.34–3.97(m,5H),3.97–3.74(m,5H),3.41–3.22(m,3H),3.22–2.91(m,5H),2.58–2.38(m,1H),2.22(s,3H),2.17–2.01(m,2H),1.93–1.79(m,2H),1.30(d,J＝6.7Hz,3H)。
化合物100：
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δppm
8.25(s,1H),7.29(s,1H),6.75(s,1H),6.64(s,1H),6.58(dd,J＝17.0,10.7Hz,1H),6.26(dd,J＝16.9,2.0Hz,1H),5.68(s,1H),5.64(q,J＝6.8Hz,1H),4.43–4.26(m,1H),4.00-3.86(m,3H),3.87–3.73(m,4H),3.71–3.59(m,1H),3.41–3.27(m,2H),3.27-2.98(m,6H),2.53–2.38(m,1H),2.24(s,3H),1.86–1.71(m,3H),1.47–1.34(m,3H),1.29(d,J＝6.8Hz,3H)。
化合物123：
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δppm
8.25(s,1H),7.41(s,1H),6.74(s,2H),5.63(q,J＝6.8Hz,1H),4.40(s,2H),4.12(s,2H),4.04-3.70(m,4H),3.57(s,1H),3.42–3.04(m,5H),2.91(s,2H),2.24(s,3H),2.01(s,3H),1.91(s,2H),1.73–1.41(m,4H),d 1.29(d,J＝6.7Hz,3H)。
化合物124：
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δppm
8.24(s,1H),7.48(s,1H),6.76(s,1H),6.66(t,J＝2.7Hz,1H),5.62(q,J＝6.8Hz,1H),4.32–4.10(m,2H),4.03–3.70(m,6H),3.63(q,J＝7.5Hz,1H),3.42–3.25(m,3H),3.24–2.94(m,5H),2.41(d,J＝10.0Hz,1H),2.23(s,3H),2.01(s,3H),1.84–1.62(m,2H),1.49–1.21(m,5H)。
化合物125：
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δppm
8.23(s,1H),7.72(s,1H),6.75(s,1H),6.68(s,1H),5.61(q,J＝6.8Hz,1H),4.19(dd,J＝13.4,5.7Hz,2H),4.01–3.68(m,6H),3.61(p,J＝7.4Hz,1H),3.32(tt,J＝9.4,3.9Hz,3H),3.11(dt,J＝23.2,8.3Hz,5H),2.45–2.32(m,1H),2.23(s,3H),2.00(s,3H),1.83–1.64(m,2H),1.47–1.15(m,5H)。
化合物126：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.59(d,J＝2.5Hz,1H),8.23(s,1H),7.05(s,1H),6.75(s,1H),4.96(s,2H),3.65-3.40(m,9H),3.30-3.12(m,6H),3.06-2.96(m,3H),2.21(s,3H),2.00(d,J＝1.6Hz,3H),1.90-1.64(m,2H)
化合物127：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.59(d,J＝2.8Hz,1H),8.23(s,1H),7.05(s,1H),6.75(s,1H),4.96(s,2H),3.62-3.32(m,10H,被溶剂峰部分遮蔽),3.27-3.11(m,5H),3.06-2.95(m,3H),2.21(s,3H),2.00(d,J＝2.2Hz,3H),1.88-1.65(m,2H)
化合物128：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.76(s,1H),8.27(s,1H),7.11(s,1H),6.74(s,1H),5.68(q,J＝6.7Hz,1H),3.68-3.53(m,7H),3.52-3.30(m,7H,被溶剂峰部分遮蔽),3.24-3.11(m,1H),3.08-2.97(m,3H),2.17(s,3H),2.00(d,J＝1.6Hz,3H),1.90-1.68(m,2H),1.18(d,J＝6.6Hz,3H)
化合物129：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm
9.80(s,1H),8.28(s,1H),7.11(s,1H),6.75(s,1H),5.68(q,J＝6.4Hz,1H),3.59(br s,7H),3.52-3.33(m,5H,被溶剂峰部分遮蔽),3.30-3.25(m,2H,被溶剂峰部分遮蔽),3.25-3.11(m,1H),3.01(br t,J＝6.8Hz,3H),2.17(s,3H),2.01(s,3H),1.91-1.65(m,2H),1.18(br d,J＝6.6Hz,3H)
化合物130：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.76(s,1H),8.27(s,1H),7.11(s,1H),6.74(br s,1H),5.68(q,J＝6.6Hz,1H),3.67-3.53(m,7H),3.52-3.30(m,7H,被溶剂峰部分遮蔽),3.24-3.12(m,1H),3.08-2.95(m,3H),2.17(s,3H),2.00(d,J＝1.3Hz,3H),1.90-1.66(m,2H),1.18(d,J＝6.6Hz,3H)
化合物131：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm
9.80(s,1H),8.28(s,1H),7.11(s,1H),6.74(s,1H),5.68(q,J＝6.3Hz,1H),3.68-3.54(m,7H),3.53-3.33(m,5H,被溶剂峰部分遮蔽),3.30-3.11(m,3H,被溶剂峰部分遮蔽),3.09-2.96(m,3H),2.17(s,3H),2.01(s,3H),1.66-1.66(m,2H),1.17(br d,J＝6.7Hz,3H)
化合物139：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
10.05(br s,1H),8.28(s,1H),6.90(s,1H),5.64(q,J＝6.4Hz,1H),4.08(br t,J＝7.7Hz,1H),3.90-3.82(m,2H),3.68-3.51(m,5H),3.35-3.24(m,5H,被溶剂峰部分遮蔽),3.12-3.06(m,1H),2.81(br d,J＝10.1Hz,2H),2.26(s,3H),1.93(s,3H),1.84(br t,J＝10.9Hz,2H),1.74(br d,J＝12.0Hz,2H),1.62-1.51(m,2H),1.14(br d,J＝6.3Hz,3H)
化合物140：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
10.19-9.89(m,1H),8.28(s,1H),6.90(s,1H),5.64(q,J＝6.4Hz,1H),4.12-4.03(m,1H),3.90-3.80(m,2H),3.68-3.50(m,6H),3.33-3.24(m,4H),3.09(quin,J＝6.0Hz,1H),2.81(br d,J＝10.4Hz,2H),2.26(s,3H),1.93(s,3H),1.84(br t,J＝11.3Hz,2H),1.74(br d,J＝11.0Hz,2H),1.62-1.52(m,2H),1.14(br d,J＝6.9Hz,3H)
化合物141(对应于化合物130)：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.76(s,1H),8.27(s,1H),7.11(br s,1H),6.75(br s,1H),5.68(q,J＝6.6Hz,1H),3.70-3.52(m,7H),3.52-3.29(m,7H,被溶剂峰部分遮蔽),3.25-3.12(m,1H),3.08-2.96(m,3H),2.17(s,3H),2.00(s,3H),1.91-1.66(m,2H),1.18(br d,J＝6.6Hz,3H)
化合物142(对应于化合物128)：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.81(d,J＝2.2Hz,1H),8.28(s,1H),7.13-7.10(m,1H),6.75(s,1H),5.68(q,J＝6.6Hz,1H),3.69-3.52(m,7H),3.52-3.33(m,5H,被溶剂峰部分遮蔽),3.32-3.25(m,2H,被溶剂峰部分遮蔽),3.24-3.11(m,1H),3.08-2.96(m,3H),2.17(s,3H),2.01(d,J＝1.9Hz,3H),1.90-1.66(m,2H),1.17(d,J＝6.6Hz,3H)
化合物144：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.76(s,1H),8.27(s,1H),7.00(s,1H),6.69(s,1H),5.67(q,J＝6.7Hz,1H),3.89(d,J＝8.7Hz,1H),3.76(d,J＝8.5Hz,1H),3.68–3.51(m,6H),3.39–3.24(m,4H),2.75–2.67(m,2H),2.39–2.29(m,1H),2.21–2.10(m,5H),2.00(s,3H),1.74(d,J＝11.4Hz,2H),1.63–1.49(m,2H),1.22(s,3H),1.17(d,J＝6.7Hz,3H)。
化合物148：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.77(s,1H),8.27(s,1H),7.00(s,1H),6.69(s,1H),5.67(q,J＝6.6Hz,1H),4.15(t,J＝8.0Hz,1H),3.98–3.87(m,2H),3.70(dd,J＝10.2,5.2Hz,1H),3.65–3.53(m,4H),3.39–3.25(m,4H),3.24–3.11(m,1H),2.91–2.84(m,2H),2.41–2.31(m,1H),2.16(s,3H),2.00(s,3H),1.94–1.84(m,2H),1.79–1.69(m,2H),1.64–1.52(m,2H),1.18(d,J＝6.9Hz,3H)。
化合物150：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ
9.77(s,1H),8.27(s,1H),7.00(s,1H),6.69(s,1H),5.67(q,J＝6.6Hz,1H),4.15(t,J＝8.0Hz,1H),4.00–3.84(m,2H),3.70(dd,J＝10.1,4.8Hz,1H),3.66–3.51(m,4H),3.42-3.24(m,4H),3.21–3.09(m,1H),2.94–2.82(m,2H),2.41–2.29(m,1H),2.16(s,3H),2.00(s,3H),1.94–1.79(m,2H),1.79–1.66(m,2H),1.66–1.48(m,2H),1.18(d,J＝6.6Hz,3H)。
化合物159：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.81(br d,J＝1.3Hz,1H),8.28(s,1H),7.12(s,1H),6.75(s,1H),5.68(q,J＝6.5Hz,1H),3.69-3.52(m,7H),3.51-3.36(m,3H,被溶剂峰部分遮蔽),3.31-3.24(m,2H,被溶剂峰部分遮蔽),3.24-3.11(m,1H),3.09-2.97(m,2H),2.17(s,3H),2.01(d,J＝1.6Hz,3H),1.89-1.65(m,2H),1.18(br d,J＝6.6Hz,3H)
化合物161：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.44(s,1H),8.26(s,1H),7.00(d,J＝2.0Hz,1H),6.67(d,J＝1.8Hz,1H),5.67(q,J＝6.7Hz,1H),3.67-3.55(m,6H),3.47(br s,2H),3.33-3.21(m,4H),2.55(br s,2H),2.40-2.28(m,2H),2.16(s,3H),2.00(s,3H),1.92-1.83(m,4H),1.47-1.30(m,4H),1.20(d,J＝6.7Hz,3H)
化合物162：
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δδppm
9.80(s,1H),8.27(s,1H),7.05(d,J＝1.8Hz,1H),6.66(d,J＝1.6Hz,1H),5.67(q,J＝6.9Hz,1H),3.73-3.46(m,8H),3.36(br s,1H),3.27(br s,1H),2.44(br s,2H),2.38(br s,2H),2.22(br s,1H),2.16(s,3H),2.02(s,3H),1.98-1.87(m,2H),1.86-1.74(m,2H),1.57-1.43(m,4H),1.18(d,J＝6.7Hz,3H)
化合物163：
1H NMR(xxx MHz,氯仿-d)δδppm
9.78(s,1H),8.27(s,1H),7.00(d,J＝0.7Hz,1H),6.69(s,1H),5.67(q,J＝6.7Hz,1H),4.15(t,J＝8.3Hz,1H),3.98-3.86(m,2H),3.76-3.66(m,1H),3.66-3.53(m,4H),3.38–3.25(m,4H),3.19-3.09(m,1H),2.93-2.81(m,2H),2.37(q,J＝7.3Hz,3H),2.16(s,3H),1.95-1.84(m,2H),1.79-1.68(m,2H),1.66-1.50(m,2H),1.18(d,J＝6.6Hz,3H),1.12(t,J＝7.5Hz,3H)。
化合物189：
1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ
8.25(s,1H),7.05(d,J＝2.0Hz,1H),6.98(d,J＝2.2Hz,1H),6.43-6.21(m,2H),5.81-5.73(m,2H),4.37(t,J＝8.2Hz,1H),4.20-4.10(m,2H),3.93(dd,J＝5.4,10.8Hz,1H),3.85-3.67(m,4H),3.64(s,1H),3.41-3.33(m,2H),3.28-3.20(m,1H),3.28-3.20(m,2H),3.01(br t,J＝12.2Hz,2H),2.57-2.48(m,1H),2.04(br t,J＝11.6Hz,2H),1.88(brd,J＝13.7Hz,2H),1.79-1.69(m,2H),1.30(d,J＝6.8Hz,3H)
化合物190：
1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ
8.26(s,1H),7.05(d,J＝2.0Hz,1H),7.00-6.97(m,1H),6.99(d,J＝2.0Hz,1H),6.42-6.20(m,2H),5.81-5.73(m,2H),4.38(t,J＝8.1Hz,1H),4.20-4.10(m,2H),3.94(dd,J＝5.0,10.4Hz,1H),3.87-3.70(m,4H),3.63(s,1H),3.36(br s,3H),3.28-3.20(m,2H),3.02(br t,J＝12.7Hz,2H),2.54(br t,J＝12.1Hz,1H),2.05(br t,J＝11.4Hz,2H),1.89(br d,J＝10.3Hz,2H),1.81-1.70(m,2H),1.31(d,J＝6.8Hz,3H)
化合物195：
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm
9.49(s,1H),8.22(s,1H),6.94(d,J＝1.9Hz,1H),6.68(d,J＝1.6Hz,1H),4.94(s,2H),4.45(d,J＝6.9Hz,1H),4.43(d,J＝6.9Hz,1H),4.18-4.11(m,1H),3.96-3.86(m,2H),3.74-3.66(m,3H),3.40(s,2H),3.17-3.12(m,1H),3.05-3.01(m,2H),2.88(br d,J＝11.0Hz,2H),2.41-2.31(m,2H),2.20(s,3H),2.00(s,3H),1.94-1.85(m,2H),1.72(br d,J＝11.0Hz,2H),1.63-1.51(m,2H)
OR
旋光度用旋光计341Perkin Elmer测量。偏振光以1分米的路径长度和每100毫升0.2克至0.4克的样品浓度通过样品。称量小瓶中的2mg至4mg产物，然后用1ml至1.2ml光谱溶剂(例如DMF)溶解。在20℃的温度处用该溶液填充该单元并将其放入旋光计中。以0.004°的精度读取OR。
浓度的计算：重量(克)×100/体积(ml)
[α]d 20：(读数旋转×100)/(1.000dm×浓度)。
d为钠D线(589纳米)。
表：Co.No.是指化合物编号；保留时间(Rt)以min计；MP是指熔点(℃)；dec是指分解；n.d.是指未测定。
OR数据：溶剂：DMF；温度：20℃；波长：589nm；‘N°’是指化合物编号
SFC-MS方法
SFC测量使用分析超临界流体色谱(SFC)系统进行，该系统由用于递送二氧化碳(CO2)和改性剂的二元泵、自动进样器、柱箱、配备有静置时高达400巴的高压流通池的二极管阵列检测器组成。如果配置有质谱仪(MS)，则将来自柱的流送入MS。设置调整参数(例如，扫描范围、驻留时间……)以便获得允许识别化合物的标称单同位素分子量(MW)的离子在技术人员的知识范围内。用适当的软件进行数据采集。
表：分析SFC-MS方法(流速以mL/min表示；柱温(T)以℃表示；运行时间以分钟表示，背压(BPR)以巴表示)。
表：分析型SFC数据(Rt意指保留时间(以分钟为单位)，[M+H]+意指化合物的质子化质量，方法是指用于光学纯化合物的SFC-MS分析的方法)。
实施例C：药理学测定
CDK7、细胞周期蛋白H和MAT1的三聚体复合物的表达和纯化：
在杆状病毒-SF9昆虫细胞表达系统中共表达含有N-末端His6-标签，随后是烟草蚀纹病毒(TEV)蛋白酶切割位点的人CDK7(氨基酸1-346)、人MAT1(氨基酸1-309)和人细胞周期蛋白H(氨基酸1-323)以产生三聚体复合物。在感染后72h收集细胞沉淀，并根据制造商的说明，通过在20mMHepes-NaOH(pH 8.0)、300mM NaCl、10％甘油、2mM二硫苏糖醇DTT)以及补充有cOmpleteTM蛋白酶抑制剂混合物(Roche)和25U/mL核酸酶HC的20mM咪唑中的Dounce均质化来再悬浮。通过在600kPa处通过Microfluidics M110Y微流化器3次，随后在4℃处以38,000×g离心1小时来裂解细胞。将上清液加载到预平衡的HisTrap HP柱上，并在20mM Hepes-NaOH(pH 8.0)、50mM NaCl、10％甘油、2mM DTT和400mM咪唑中洗脱。将洗脱液通过在Superdex S200 16/60柱上凝胶过滤来进一步纯化，并用20mM Hepes-NaOH(pH 7.5)、50mM NaCl、10％甘油、2mM DTT洗脱。将含有比例为1:1:1的CDK7、细胞周期蛋白H和MAT1的三聚体复合物的级分合并，并在10kDa MWCO浓缩器中浓缩至3mg/mL，并在11.1mMHepes-NaOH(pH 8.0)、27.8mM NaCl、1.1mM DTT和50％甘油中稀释至1.6mg/mL的最终浓度。
材料
ATP、磷酸烯醇丙酮酸(PEP)、NADH、MgCl2、Triton X-100(10％溶液)、丙酮酸、激酶/乳酸脱氢酶、384孔测定板(Greiner UV-Star Clear)和384孔化合物稀释板(Greinerbio-one)购自Sigma-Aldrich(St.Louis,MO)。1M Tris-HCl(pH 7.4)和CDK7/9肽分别购自Teknova(Hillister,CA)和Anaspec(Freemont,CA)。
体外CDK7测定和不可逆共价抑制剂效力的测定：
通过跟踪由CDK7对源自RNA Pol II(CDK7/9肽)的肽底物进行ATP依赖性磷酸化而产生的ADP的产生来测量CDK7的活性。丙酮酸激酶将ADP和磷酸烯醇丙酮酸(PEP)转化为ATP和丙酮酸。乳糖酶脱氢酶催化丙酮酸转化为乳酸，同时NADH转化成氧化形式的NAD+，其在340nm处通过分光光度计测量。在最终体积为100μL的384孔微孔板中进行CDK7测定。通过分别使用来自PerkinElmer(Downers Grove,IL)的Janus和来自Formulatrix(Bedford,MA)的Tempest进行用于测定的抑制剂系列稀释和液体处理。为了测定不可逆共价抑制剂的抑制剂效力(k无效/KI比率)，使用来自Labcyte(San Jose,CA)的Echo 555将500nL抑制剂的DMSO溶液(或DMSO作为对照)添加到测定板中，随后添加50μL的由600μM肽底物(CDK7/9肽，YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSKKKK)、1mM ATP，1mM PEP、200μM NADH、1.2个-2个单位的PK、1.8个-2.8个单位的LDH、20mM Tris-HCl(pH 7.4)、10mM MgCl2和0.004％ Triton X-100组成的测定混合物。通过在20mM Tri-HCl(pH 7.4)、10mM MgCl2和0.004％Triton X-100中添加50μL的40nM CDK7/细胞周期蛋白H/MAT1三聚体复合物来引发反应。使用来自Eppendorf(Hauppauge,NY)的Centrifuge 5810将测定板以3220g离心5min，并然后使用来自Tecan(Switzerland)的Infinite M1000在室温处于340nm读取吸光度变化，每2min读取一次，持续8小时。
为了进行数据分析以确定效力(k无效/KI比率)，将对应于DMSO对照的线性范围的反应进程曲线拟合到等式1，其中Vo为以Abs/秒计的初始速率并且t为以秒计的时间，从而产生在每个抑制剂浓度处的酶灭活的一级速率常数(kobs)。然后将kobs值对抑制剂浓度([I])作图并拟合到等式2，其中k无效为在无限浓度的抑制剂处实现的最大失活速率，并且KI为产生最大失活速率一半的抑制剂浓度。当[I]<<KI时，等式2被简化为等式3。因此，在远低于KI的抑制剂浓度处，kobs对抑制剂浓度([I])的图是线性的，并且该线的斜率等于k无效/KI。
基于成像的细胞RNA PolII Ser5磷酸化测定：
为了评估对CDK7激酶活性的抑制，使用了384孔自动成像测定。该测定检测RNA聚合酶II(CDK7的下游底物)的Rpb1亚单位的C-末端结构域中独特的七肽序列上的丝氨酸5磷酸化。该七肽序列在Rpb1的CTD中重复多达52次。
材料
A549腺癌人肺泡基底上皮细胞(ATCC、CCL-185)、兔Phospho-Rpb1 CTD(Ser5)抗体(D9N51(Cell Signaling Technology))、DMEM(Sigma)、胎牛血清(Biowest)、L-谷氨酰胺(Sigma)、青霉素/链霉素(Life Technologies)、丙酮酸钠(Sigma)、Hepes(Sigma)、聚-D-赖氨酸包被的μclear 384黑色培养板(Greiner)、甲醛(PolySciences)、D-PBS(Sigma)、甲醇(Sigma)、Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG二抗(Life Technologies)、HCS CellMaskTM深红色染色剂(Life Technologies)、Hoechst 33258(Invitrogen)。
使用特异性兔Phospho-Rpb1 CTD(Ser5)抗体检测RNA聚合酶II丝氨酸5磷酸化。将A549腺癌人肺泡基底上皮细胞以1000个细胞/孔接种在20μl培养基(补充有1％胎牛血清(热灭活30’56℃)、2mM L-谷氨酰胺、50U/ml青霉素、50μg/ml链霉素、1mM丙酮酸钠和50mMhepes的DMEM)中，并在37℃和5％ CO2处在聚-D-赖氨酸包被的μclear 384黑色培养板中培养20小时。
温育后，在37℃和5％ CO2处用化合物刺激细胞3小时。使用DMSO作为高对照，并使用10μM以下参照化合物作为低对照：
使用Echo Liquid Handler(Echo 550,Labcyte)将40nl测试化合物和对照点样在细胞板中。温育后在室温处用20μl 10％甲醛固定20分钟。去除培养基/甲醛溶液，将培养板用30μl D-PBS(不含Ca2+和Ma2+)洗涤3次，并通过添加20μl冰冷甲醇20分钟进行透化。将细胞用30μl D-PBS再次洗涤3次，并添加20μl封闭缓冲液(含25ml胎牛血清的500ml D-PBS)1小时。
去除封闭缓冲液后，添加20μl 1/1000一抗兔Phospho-Rpb1 CTD(Ser5)抗体，该抗体与Rpb1的CTD中七肽序列的磷酸化丝氨酸5结合。去除一抗，将培养板用30μl D-PBS洗涤3次，随后添加20μl 1/2000Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG二抗，用于最终检测Phospho-Rpb1CTD(Ser5)，以及添加1/5000HCS CellMaskTM深红色染色剂用于膜染色并添加1/5000Hoechst 33258用于核染色。最后，将培养板用30μl D-PBS洗涤2次，并将孔用40μL D-PBS填充，将培养板密封(热电偶套管密封带)并在4℃处储存直至读数。用具有10x空气物镜的Opera Phenix(Perkin Elmer)读取培养板。在Phaedra中对数据进行计算和分析。
使用下式计算IC50值：
LC＝低对照值的平均值
＝用10μM LDC4297处理的细胞
HC＝高对照值的平均值
＝用0.2％ DMSO处理的细胞
所有HC和所有LC的平均值用于归一化。
％效应＝100-(样品-LC)/(HC-LC)×100
％对照＝(样品/HC)×100
通过最小平方和方法将最佳拟合曲线拟合到％对照与化合物浓度的曲线图。由此可以获得IC50值。还获得了根据希尔系数估计的曲线的斜率。
平行地，在过表达CDK7-突变体(C312S)的A549细胞中进行该测定，以评估共价键对效力的影响并筛选潜在的脱靶效应。半胱氨酸突变为丝氨酸(C312S)，一种亲核性较低的氨基酸，防止CDK7抑制剂以不可逆方式与CDK7共价结合并抑制CDK7活性。产生了稳定转导的A549细胞库，其过表达CDK7突变体(C312S)，但也表达内源性CDK7-WT。在过表达突变体C312S CDK7的A549细胞中，靶向312位处的半胱氨酸的共价结合剂将显示出效力的改变。
使用过表达WT或C312S突变体CDK7的OCI-AML3细胞的增殖测定：
材料
OCI-AML-3急性骨髓性白血病细胞(DSMZ ACC 582)、α-MEM(Sigma M4526)、胎牛血清(BioWest S1810-500)、L-谷氨酰胺(Sigma G7513)、庆大霉素(Gentamycin)(LifeTechnologies 15750-037)、96孔板(Costar，目录号3904)、CellTiterGLO试剂(PromegaG7573)。
为了评估抗增殖效果，使用两种不同的AML细胞系在4天增殖测定中测试CDK7抑制剂测试化合物。亲代OCI-AML-3细胞系用于产生过表达CDK7 WT或CDK7 C312S突变体的两种OCI-AML-3细胞系。半胱氨酸突变为丝氨酸(C312S)，一种亲核性较低的氨基酸，防止CDK7抑制剂以不可逆方式与CDK7共价结合并抑制CDK7活性。
OCI-AML-3细胞在补充有20％热灭活的胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺和50μg/ml庆大霉素的α-MEM中增殖。在培养期间，将细胞保持在50万个细胞/mL-250万个细胞/mL之间。细胞代数不超过30。为了评估抗增殖效果，将3000个细胞接种在96孔板的每孔135μL培养基中。将化合物在DMSO中稀释至所需最终浓度的500倍。在培养基中制备化合物的1/50预稀释物。向96孔板的每个孔中添加15μL的这些预稀释的化合物。将细胞在37℃和5％ CO2处温育4天。基于生长曲线选择细胞涂布数量以确保线性细胞生长。温育4天后，向每个孔中添加75μL CellTiterGLO试剂。在室温处以500rpm振荡温育10min后，在Envision多模式读板机(Perkin Elmer)上测量发光。在过表达突变体C312S CDK7的OCI-AML3细胞中，靶向312位处的半胱氨酸的共价结合剂将显示出效力的改变。
使用下式计算IC50值(Z prime应>0.5)：
LC＝低对照值的中值
＝低对照：无细胞的反应
HC＝高对照值的中值
＝高对照：在没有化合物的情况下与细胞的反应
％效应＝100-(样品-LC)/(HC-LC)×100
％对照＝(样品/HC)×100
％对照min＝(样品-LC)/(HC-LC)×100
通过最小平方和方法将最佳拟合曲线拟合到％对照与化合物浓度的曲线图。由此可以获得IC50值(引起50％细胞毒性的抑制浓度)。还获得了根据希尔系数估计的曲线的斜率。
表A、B和C中提供了本发明的化合物在上述测定中的数据(表中的值为所有批次的化合物的所有测量值的平均值；‘n.c.’是指未计算)。
表A：使用本公开的化合物的细胞测定结果
表B：使用本公开的化合物的生化和酶测定结果
表C：使用本公开的化合物的生化和酶测定结果
实施例D：假想制剂
贯穿这些实施例使用的“活性成分”(a.i.)涉及式(I)的化合物，包括其任何互变异构体或立体异构体形式，或其药学上可接受的加成盐，或溶剂化物；特别是例示的化合物中的任一者。
用于本发明的制剂的配方的典型示例如下：
1.片剂
2.悬浮液
制备用于口服施用的水性悬浮液，使得每毫升含有1mg至5mg活性成分、50mg羧甲基纤维素钠、
1mg苯甲酸钠、500mg山梨醇和加至1ml的水。
3.注射物
通过将1.5％(重量/体积)活性成分在0.9％ NaCl溶液中或在10％体积丙二醇水溶液中搅拌来制备肠胃外组合物。
4.膏剂
在该实施例中，活性成分可以用相同量的任何根据本发明的化合物代替，特别是用相同量的任何例示性化合物代替。

Claims (26)

1.一种式(I)的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X为4-7元非芳族杂环、4-10元非芳族桥接杂环、C3-7环烷基、C5-7环烯基；其中所述环中的每一者能够独立地任选地被-C1-3烷基取代；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代，并且其中所述4-7元非芳族杂环任选地被C1-3烷基、卤基或D取代；或者
R1为被-NH-C(＝O)-CH＝CH-R6或-NH-C(＝O)-CH≡CH-R7取代的C1-3烷基；
A为CR2或N；
R2为H、C1-3烷基、氰基、卤基或C2-3炔基；
R3为C1-3烷基、H、卤素、C2-3烯基、C2-3炔基、氰基、C3-7环烷基；被一个、两个或三个卤基、羟基、羧基、氨基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基取代的C1-3烷基；1-咪唑基、2-咪唑基或4-咪唑基；
R4为C1-3烷基；被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基，或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
2.根据权利要求1所述的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，其中，
X为4-7元非芳族杂环、4-10元非芳族桥接杂环、C4-7环烷基、C5-7环烯基；其中所述环中的每一者能够独立地任选地被-C1-3烷基取代；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代，并且其中所述4-7元非芳族杂环任选地被C1-3烷基、卤基或D取代；或者R1为被-NH-C(＝O)-CH＝CH-R6或-NH-C(＝O)-CH≡CH-R7取代的C1-3烷基；
A为CR2或N；
R2为H、C1-3烷基、或氰基；
R3为C1-3烷基、H、卤素、氰基、C3-7环烷基；或被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；
R4为甲基或H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
3.根据权利要求1或2所述的化合物，其中所述化合物具有式(II)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中X、R1、R2、R3、R4和R5中的每一者独立地如权利要求1或2中所定义。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(IIa)、(IIb)、(IIc)、(IId)、(IIe)或(IIf)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中在式(IIa)、(IIb)、(IIc)、(IId)、(IIe)或(IIf)的化合物中的每一者中，
每个Q独立地为CH或N；
每个Z独立地为CH或N；
R1、R2、R3、R4和R5中的每一者独立地如权利要求1或2中所定义；
每个R8独立地为H或-C1-3烷基；并且所述R8能够键合到所述环的任何碳或氮原子；并且
每个虚键独立地为任选的双键。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物，其中
R1选自
其中
每个R9独立地为-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7；
每个R10独立地为H、-C1-3烷基、卤基或D；并且所述R10能够键合到所述环的任何碳原子；并且
R5选自
6.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)或(IIIf)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中
每个R9独立地为-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7；
每个R10独立地为H、-C1-3烷基、卤基或D；并且所述R10能够键合到所述环的任何碳原子；并且
R2、R3、R4、R5、R6和R7中的每一者独立地如权利要求1或2中所定义。
7.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(IVa)、(IVb)、(IVc)、(IVd)、(IVe)、(IVf)、(IVg)、(IVh)、(IVi)、(IVj)、(IVk)、(IVl)、(IVm)、(IVn)、(Ivo)、(IVp)或(IVq)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中
X、R1、R2、R3和R4中的每一者独立地如权利要求1、2或5中所定义。
8.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(Va)或(Vb)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X、R1、R2、R3、R4和R5中的每一者独立地如权利要求1、2或5中任一项所定义。
9.根据权利要求1或2所述的化合物，其中所述化合物具有式(VI)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，
其中X、R1、R3、R4和R5中的每一者独立地如权利要求1、2或5中所定义。
10.根据权利要求9所述的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，其中，
X为4-7元非芳族杂环；
R1为具有至少一个氮原子的4-7元非芳族杂环，其中所述至少一个氮原子被-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7取代；
R3为C1-3烷基、H、卤素、氰基、C3-7环烷基；或被一个、两个或三个卤基取代的C1-3烷基；
R4为甲基或H；
R5为4-7元饱和或部分不饱和杂环、5-6元杂芳基或6-12元螺双环杂环；其中所述环中的每一者具有一个、两个或三个选自硫、氮和氧的杂原子；并且其中，
所述硫，如果存在的话，被二氧代基、或被氧代基和亚氨基取代；
所述一个、两个或三个氮，如果存在的话，能够各自独立地任选地被C1-3烷基取代；
所述环的碳原子中的任一者能够任选地被C1-3烷基、羟基C1-3烷基、C1-3烷氧基、氧代基、C1-3烷基磺酰基、氰基、羟基、卤基、羧基、单(C1-6烷基)氨基或二(C1-6烷基)氨基、多卤代C1-3烷基、多卤代C1-3烷氧基、C2-3烯基和C2-3炔基取代；
R6为H；任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环；并且
R7为任选地被一个、两个或三个选自卤基、D和-NR7aR7b的取代基取代的-C1-3烷基；其中R7a和R7b中的每一者独立地为C1-3烷基；或者R7a和R7b合在一起形成杂环。
11.根据权利要求9至10中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(VIIa)、(VIIb)、(VIIc)、(VIId)、(VIIe)或(VIIf)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
每个Q独立地为CH或N；
每个Z独立地为CH或N；
R1、R3、R4和R5中的每一者独立地如权利要求9或10中所定义。
12.根据权利要求9至10中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(VIIIa)、(VIIIb)、(VIIIc)、(VIIId)、(VIIIe)或(VIIIf)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中
R9为-C(＝O)-CH＝CH-R6或-C(＝O)-CH≡CH-R7；并且
X、R3、R4、R5、R6和R7中的每一者独立地如权利要求1或2中所定义。
13.根据权利要求9至10中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(IXa)、(IXb)、(IXc)、(IXd)、(IXe)、(IXf)、(IXg)、(IXh)、(IXi)、(IXj)、(IXk)、(IXl)、(IXm)、(IXn)、(IXo)、(IXp)或(IXq)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X、R1、R3和R4中的每一者独立地如权利要求1或2中所定义。
14.根据权利要求9至10中任一项所述的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
R5为
X、R1、R3和R4中的每一者独立地如权利要求1或2中所定义。
15.根据权利要求9至14中任一项所述的化合物，其中所述化合物具有式(Xa)或(Xb)，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物：
其中，
X、R1、R3、R4和R5中的每一者独立地如权利要求1至2和9至14中任一项所定义。
16.根据权利要求1所述的化合物，包括任何互变异构和立体化学异构形式、同位素标记的衍生物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物，其中所述化合物选自：
17.一种药物组合物，包含根据权利要求1至16中任一项所述的化合物以及药学上可接受的载体。
18.根据权利要求1至16中任一项所述的化合物，在治疗中使用。
19.根据权利要求1至16中任一项所述的化合物，在预防和/或治疗由细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)介导的疾病状态或病状中使用。
20.根据权利要求19所述使用的化合物，其中所述疾病状态或病状为选自以下的增殖性疾病：癌症、白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)、淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、骨癌、骨肉瘤、尤因肉瘤、乳腺癌、三阴性乳腺癌(TNBC)、脑癌、神经母细胞瘤、肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、大细胞肺癌、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、类风湿性关节炎、自身炎性疾病或自体免疫性疾病。
21.根据权利要求1至16中任一项所述的化合物用于制造用于预防或治疗增殖性疾病的药物的用途。
22.根据权利要求21所述的化合物的用途，其中所述增殖性疾病为癌症、白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)、淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、骨癌、骨肉瘤、尤因肉瘤、乳腺癌、三阴性乳腺癌(TNBC)、脑癌、神经母细胞瘤、肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、大细胞肺癌、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、类风湿性关节炎、自身炎性疾病或自体免疫性疾病。
23.一种用于预防或治疗由CDK7介导的疾病状态或病状的方法，所述方法包括向对其有需要的受试者施用有效量的根据权利要求1至16中任一项所述的化合物。
24.根据权利要求22所述的方法，其中所述疾病或病状选自增殖性疾病、癌症、白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性髓细胞性白血病(CML)、淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、T细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、骨癌、骨肉瘤、尤因肉瘤、乳腺癌、三阴性乳腺癌(TNBC)、脑癌、神经母细胞瘤、肺癌、小细胞肺癌(SCLC)、大细胞肺癌、良性赘生物、血管生成、炎性疾病、类风湿性关节炎、自身炎性疾病或自体免疫性疾病。
25.根据权利要求23或24所述的方法，其中所述受试者为哺乳动物。
26.一种调节CDK7活性的体外方法，包括使CDK7蛋白或其部分与根据权利要求1至16中任一项所述的化合物接触。
CN202180094048.1A 2020-12-21 2021-12-17 作为细胞周期蛋白依赖性激酶7（cdk7）抑制剂的三环嘧啶 Pending CN116964061A (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP20216100 2020-12-21
EP20216100.6 2020-12-21
PCT/EP2021/086552 WO2022136174A1 (en) 2020-12-21 2021-12-17 Tricyclic pyrimidines as cyclin-dependent kinase 7 (cdk7) inhibitors

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN116964061A true CN116964061A (zh) 2023-10-27

Family

ID=74068220

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202180094048.1A Pending CN116964061A (zh) 2020-12-21 2021-12-17 作为细胞周期蛋白依赖性激酶7（cdk7）抑制剂的三环嘧啶

Country Status (5)

Country Link
US (1) US20240109912A1 (zh)
EP (1) EP4263554A1 (zh)
JP (1) JP2023554673A (zh)
CN (1) CN116964061A (zh)
WO (1) WO2022136174A1 (zh)

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2634190A1 (en) * 2012-03-01 2013-09-04 Lead Discovery Center GmbH Pyrazolo-triazine derivatives as selective cyclin-dependent kinase inhinitors

Also Published As

Publication number Publication date
US20240109912A1 (en) 2024-04-04
EP4263554A1 (en) 2023-10-25
JP2023554673A (ja) 2023-12-28
WO2022136174A1 (en) 2022-06-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2949538T3 (es) Piridazinonas como inhibidores de PARP7
JP7073359B2 (ja) ユビキチン特異的プロテアーゼ７の阻害剤としてのピペリジン誘導体
CN112778276B (zh) 作为shp2抑制剂的化合物及其应用
EP3277689B1 (en) Heterocyclic compounds as lsd1 inhibitors
CN109311843B (zh) 作为PI3Kβ抑制剂的氮杂苯并咪唑衍生物
EP2694486B1 (en) Substituted n-(3-(pyrimidin-4-yl)phenyl)acrylamide analogs as tyrosine receptor kinase btk inhibitors
US10954240B2 (en) Compounds inhibiting leucine-rich repeat kinase enzyme activity
EP3596073B1 (en) Tricyclic compounds for use in treatment of proliferative disorders.
EP3405196B1 (en) New substituted cyanoindoline derivatives as nik inhibitors
EP2943485B1 (en) Bicyclic aromatic carboxamide compounds useful as pim kinase inhibitors
EP3478675B1 (en) Heteroaromatic derivatives as nik inhibitors
CA3147902A1 (en) Heterobicyclic amides as inhibitors of cd38
CA2887435A1 (en) Substituted n-(3-(pyrimidin-4-yl)phenyl)acrylamide analogs as tyrosine receptor kinase btk inhibitors
US20240101554A1 (en) Cyclin-dependent kinase 7 (cdk7) non-covalent inhibitors
CN116964061A (zh) 作为细胞周期蛋白依赖性激酶7（cdk7）抑制剂的三环嘧啶
AU2019413504A1 (en) Thienopyridinone compounds
CN116940577A (zh) 作为细胞周期蛋白依赖性激酶7（cdk7）抑制剂的三环吡啶
US20240132464A1 (en) Heterocyclic compounds as e3 ligase inhibitors

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination