CN116887859A - Ccr6抗体 - Google Patents

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CN116887859A CN202180093475.8A CN202180093475A CN116887859A CN 116887859 A CN116887859 A CN 116887859A CN 202180093475 A CN202180093475 A CN 202180093475A CN 116887859 A CN116887859 A CN 116887859A
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Abstract

本发明涉及CCR6、用于结合所述受体的抗体及其相关片段、所述抗体和片段的产生以及所述抗体和片段用于检测和治疗各种病况,特别是自身免疫疾病、炎症、感染、肿瘤和纤维化的用途。

Description

CCR6抗体
技术领域
本发明涉及CCR6、用于结合所述受体的抗体及其相关片段、所述抗体和片段的生产以及所述抗体和片段用于检测和治疗各种病症(特别是炎症、自身免疫、感染和肿瘤)的用途。
相关申请
本申请要求澳大利亚临时申请AU 2020904653的优先权,所述申请的内容据此通过引用以其整体并入。
背景技术
趋化因子是具有多种功能的胞外信号传导分子。它们可以启动和/或维持许多细胞过程,包括趋化性、细胞生长以及在某些情况下肿瘤生长、恶性细胞的归巢和转移。
趋化因子还密切参与免疫系统细胞的运输,并与许多自身免疫性疾病、炎症以及对病毒、细菌和其它感染的反应有关。趋化因子可通过结合、激活或抑制被称为趋化因子受体的受体来发挥作用,所述趋化因子受体是一类G蛋白偶联受体(GPCR),其为多跨膜蛋白,其中该蛋白具有一个或多个跨细胞膜的区域。
趋化因子受体6(CCR 6;CD196)在未成熟树突细胞、B细胞亚群(成熟、初始和记忆)和T细胞亚群(皮肤和肠道归巢效应T细胞/记忆T细胞和Th17细胞)中表达。其参与Th17细胞向炎症组织的迁移,并与淋巴细胞活化和运输有关。通过CCR6受体与其主要配体MIP-3α(CCL20;CKb4;LARC;MIP-3a;MIP3A;SCYA20;ST38)的结合诱导的细胞趋化性在粘膜表面、皮肤、大脑和眼睛的稳态和炎症过程中起重要作用。
在炎症和特别是自身免疫性疾病中,可涉及部分基于经由CCR6-MIP-3α轴的信号传导的自分泌和旁分泌机制。
需要用于结合CCR6(特别是需要能够结合CCR6并抑制MIP-3α介导的活性的新抗体及其片段),用于检测和治疗各种疾患,特别是炎症、感染、肿瘤和纤维化的改进试剂。
本说明书中对任何现有技术的引用并不是承认或暗示该现有技术形成任何管辖权中的公知常识的一部分,或者该现有技术可以合理地预期被本领域技术人员理解、认为是相关的和/或与其它现有技术组合。
发明内容
本发明提供了用于治疗与CCR6表达相关的疾病的抗原结合蛋白。优选地,所述抗原结合蛋白抑制MIP-3α与CCR6的结合。
本发明提供了用于结合肽的抗原结合蛋白,其中所述肽:
-由SEQ ID NO:2的序列组成;或
-由SEQ ID NO:2的序列内的序列组成,所述肽可作为免疫原产生能够与CCR6结合的抗体。
本发明提供了肽,其中所述肽:
-由SEQ ID NO:2的序列组成;
-由SEQ ID NO:2的序列内的序列组成,所述肽可作为免疫原产生能够与CCR6结合的抗体。
本发明还提供了抗原结合蛋白,其结合:
-由CCR6的氨基酸1至28组成的肽,和
-由CCR6的氨基酸18至46组成的肽。优选地,所述CCR6是人CCR6。
本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,所述抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,以及
FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a,
其中:
FR1、FR2、FR3和FR4各自是框架区;
CDR1、CDR2和CDR3各自是互补决定区;
FR1a、FR2a、FR3a和FR4a各自是框架区;
CDR1a、CDR2a和CDR3a各自是互补决定区;
其中任何框架区或互补决定区的序列如本文所述。
本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,所述抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,以及
FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a,
其中:
FR1、FR2、FR3和FR4各自是框架区;
CDR1、CDR2和CDR3各自是互补决定区;
FR1a、FR2a、FR3a和FR4a各自是框架区;
CDR1a、CDR2a和CDR3a各自是互补决定区;
其中任何所述互补决定区的序列具有如下表1或2中所述的氨基酸序列。优选地,所述框架区具有也如下表3或4中所述的氨基酸序列,包括特定残基处的氨基酸变异,这可以通过比对源自每种抗体的各种框架区来确定。本发明还包括其中CDR1、CDR2和CDR3是来自抗体的可变重链(VH)的序列,CDR1a、CDR2a和CDR3a是来自抗体的可变轻链(VL)的序列,或者其中CDR1、CDR2和CDR3是来自VL的序列,CDR1a、CDR2a和CDR3a是来自VH的序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变重链的CDR1,所述CDR1包含SEQ ID NO:3、6、11、14、102或103中的任一个中所示的氨基酸序列,优选其中可变重链的CDR1的序列包含SEQ ID NO:11中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变重链的CDR2,所述CDR2包含SEQ ID NO:4、7、9、12、15或104中的任一个中所示的氨基酸序列,优选其中可变重链的CDR2的序列包含SEQ ID NO:12中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变重链的CDR3,所述CDR3包含SEQ ID NO:5、8、10、13、16、106或107中的任一个中所示的氨基酸序列,优选其中可变重链的CDR3的序列包含SEQ ID NO:5中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变轻链的CDR1,所述CDR1包含SEQ ID NO:17、20、21、94、108或109中的任一个中所示的氨基酸序列,优选其中可变轻链的CDR1的序列包含SEQ ID NO:17或94中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变轻链的CDR2,所述CDR2包含如SEQ ID NO:18、22或110中的任一个中所示的氨基酸序列,优选其中可变轻链的CDR2的序列包含如SEQ ID NO:18中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变轻链的CDR3,所述CDR3包含SEQ ID NO:19、23或111中的任一个中所示的氨基酸序列,优选其中可变轻链的CDR3的序列包含SEQ ID NO:19中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变重链,所述可变重链包含CDR1、CDR2和CDR3,其中CDR1包含氨基酸序列SEQ ID NO:11,CDR2包含如SEQ ID NO:12中所示的氨基酸序列,CDR3包含如SEQ ID NO:5中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含可变轻链,所述可变轻链包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含氨基酸序列SEQ ID NO:17或94,所述CDR2包含如SEQ ID NO:18中所示的氨基酸序列,所述CDR3包含如SEQ ID NO:19中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了用于结合CCR6的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白竞争性抑制抗体与CCR6的结合,所述抗体:
-包含含有SEQ ID NO:88中所示的序列的VH和含有SEQ ID NO:89中所示的序列的VL;
-包含含有SEQ ID NO:96中所示的序列的VH和含有SEQ ID NO:98中所示的序列的VL;
-包含含有SEQ ID NO:97中所示的序列的VH和含有SEQ ID NO:98的序列组成;或
-包含含有SEQ ID NO:88中所示的序列的VH和含有SEQ ID NO:98中所示的氨基酸序列。
在任何实施方案中,本发明提供了具有抗体的CDRH1、CDRH2和/或CDRH3的抗原结合蛋白,所述抗体具有如SEQ ID NO:88、96或97中的任一个中定义的可变重链。
在任何实施方案中,本发明提供了具有抗体的CDRL1、CDRL2和/或CDRL3的抗原结合蛋白,所述抗体具有如SEQ ID NO:89或98中的任一个中定义的可变轻链。
在任何实施方案中,本发明提供了具有抗体的CDR1、CDR2和/或CDR3的抗原结合蛋白,所述抗体具有如SEQ ID NO:88、96或97中的任一个中定义的可变重链和如SEQ ID NO:89或98中的任一个中定义的可变轻链。
在任何实施方案中,本文描述的抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-连接子-FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a。
如本文中所定义的,连接子可以是化学物质、一个或多个氨基酸或两个半胱氨酸残基之间形成的二硫键。
本发明提供了用于结合CCR6受体的抗原结合蛋白,所述抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,以及
FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a,
其中:
FR1、FR2、FR3和FR4各自是框架区;
CDR1、CDR2和CDR3各自是互补决定区;
FR1a、FR2a、FR3a和FR4a各自是框架区;
CDR1a、CDR2a和CDR3a各自是互补决定区;
其中:
CDR1具有选自由以下组成的组的序列:(G/E)(F/Y)(T/S/P)F(S/K)(D/S)(Y/F)(Y/G)(SEQ ID NO:102)、GF(S/T/P)FSDYY(SEQ ID NO:103)、GFTFSDYY(SEQ ID NO:3)、GFSFSDYY(SEQ ID NO:6)、GFPFSDYY(SEQ ID NO:11)和EYTFKSFG(SEQ ID NO:14);
CDR2具有选自由以下组成的组的序列:I(T/Y)(N/P)(G/R)(D/G/A/V/S)G(R/N)T(SEQ ID NO:104)、ITNG(D/G/A/V)GRT(SEQ ID NO:105)、ITNGDGRT(SEQ ID NO:4)、ITNGGGRT(SEQ ID NO:7)、ITNGAGRT(SEQ ID NO:9)、ITNGVGRT(SEQ ID NO:12)和IYPRSGNT(SEQ ID NO:15);
CDR3具有选自由以下组成的组的序列:(T/A)(S/R)(P/S)P(L/Y)(G/D)G(A/-)(W/Y)F(G/A/D)Y(SEQ ID NO:106)、(A/T)SPPLGGAWF(G/A)Y(SEQ ID NO:107)、TSPPLGGAWFGY(SEQ ID NO:5)、ASPPLGGAWFGY(SEQ ID NO:8)、ASPPLGGAWFAY(SEQ ID NO:10)、TSPPLGGAWFAY(SEQ ID NO:13)和ARSPYDGYFDY(SEQ ID NO:16);
CDR1a具有选自由以下组成的组的序列:QS(I/L)(V/L)H(S/I)NGNTY(SEQ ID NO:108)、QS(I/L)VHSNGNTY(SEQ ID NO:109)、QSIVHSNGNTY(SEQ ID NO:17)、QSLVHSNGNTY(SEQID NO:20)和QSLLHINGNTY(SEQ ID NO:21);
CDR2a具有选自由以下组成的组的序列:(K/R)VS(SEQ ID NO:110)、RVS(SEQ IDNO:22)和KVS(SEQ ID NO:18);和
CDR3a具有选自由以下组成的组的序列:(F/S)Q(G/S)(S/T)HVP(L/R)T(SEQ IDNO:111)、FQGSHVPLT(SEQ ID NO:19)和SQSTHVPRT(SEQ ID NO:23);
其中优选地:
FR1具有选自由以下组成的组的序列:EVNLVESGGGLVQPGGSLKLSCAAS(SEQ ID NO:24)、EVNLVESGGGLVQPGGSLKLSCEAS(SEQ ID NO:25)、EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAAS(SEQ IDNO:26)、QDQLQQSGVALARPGASVKLSCKAS(SEQ ID NO:27)、EVNLVESGGGLVQPGGSLILSCEAS(SEQID NO:90)和EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:80);
FR2具有选自由以下组成的组的序列:MYWVRQTPEKRLEWVTY(SEQ ID NO:28)、LYWVRQTPEKRLEWVTY(SEQ ID NO:29)、LYWVRQTPEKRLEWVAY(SEQ ID NO:30)、LGWVKQRPGQGLEWIGE(SEQ ID NO:31)和LYWVRQAPGKGLEWVAY(SEQ ID NO:81);
FR3具有选自由以下组成的组的序列:YYSDTVRGRFTISRDNAKNTLYLQMSRLKSEDTAMYYC(SEQ ID NO:32)、YYSDTIRGRFTISRDNARNTLYLQMSRLKSEDTAMYYC(SEQ ID NO:33)、YYSDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSRLKSEDTSMYYC(SEQ ID NO:34)、YYNEKVKGKVRLTADKSSNSVYMEFRSLTSEDSAVYFC(SEQ IDNO:35)、YYSDAIRGRFTISRDNARNTLYLQMSRLKSEDTAMYYC(SEQ ID NO:91)和YYSDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRDEDTAVYYC(SEQ ID NO:82);
FR4具有序列:WGQGTLVTVS(SEQ ID NO:36)或WGQGTTLTVS(SEQ ID NO:37);
FR1a具有选自由以下组成的组的序列:DVLMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSS(SEQ IDNO:38)、DVSMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSS(SEQ ID NO:39)、DVVMTHSPLSLPVSLGDQASISCRSS(SEQ ID NO:40)和DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSS(SEQ ID NO:84);
FR2a具有序列:LEWYLQKPGQSPKLLIY(SEQ ID NO:41)、LHWYLQKPGQSPKLLIY(SEQ IDNO:42)或LEWYLQKPGQSPRLLIY(SEQ ID NO:85);
FR3a具有选自由以下组成的组的序列:KRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYC(SEQ ID NO:43)、KRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVGAEDLGVYYC(SEQ ID NO:44)、NRLSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYFC(SEQ ID NO:45)和KRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC(SEQ ID NO:86);和
FR4a具有序列:FGAGTKLELKR(SEQ ID NO:46)、FGGGTKLEIKR(SEQ ID NO:47)或FGQGTKLEIR(SEQ ID NO:87)。
本发明提供了抗原结合蛋白,其包括SEQ ID NO:48至59、88、89、92、93和96至98中的任一个的氨基酸序列,基本上由其组成或由其组成。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:4中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:48中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:55中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:4中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:48中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:55中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:4中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:48中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:55中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:24中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:28中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:32中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:38中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:24中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:24中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:6中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:49中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:56中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:49中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:56中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:49中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:56中所示的序列。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:25中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:28中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:33中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:39中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:25中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:33中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:39中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:25中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:33中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:39中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:8中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:50中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:57中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:50中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:57中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示的序列;和VL,其CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:50中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:57中所示的序列。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:24中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:29中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:32中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:38中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:24中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:24中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:8中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:51中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:58中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:51中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:58中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:51中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:58中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:24中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:28中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:32中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:38中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:44中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:24中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:44中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:24中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:44中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:9中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:10中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:52中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:56中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:9中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:10中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:52中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:56中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:9中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:10中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ IDNO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:52中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:56中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:25中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:28中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:32中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:39中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:25中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:39中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:25中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:32中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:39中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:13中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:53中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:55中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:53中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:55中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ IDNO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:53中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:55中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:26中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:30中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:34中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:38中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:26中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:30中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:34中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:26中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:30中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:34中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:80中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:81中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:82中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:83中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:84中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:85中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:86中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:87中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:80中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:81中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:82中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:80中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:81中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:82中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:14中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:15中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:16中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:54中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:21中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:22中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:23中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:59中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:14中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:15中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:16中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:54中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:21中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:22中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:23中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:59中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:14中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:15中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:16中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:21中所示的序列,所述CDR2包含SEQ IDNO:22中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:23中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:54中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:59中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:27中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:31中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:35中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:37中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:40中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:42中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:45中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:47中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:27中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:31中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:35中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:37中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:40中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:42中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:45中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:47中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:27中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:31中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:35中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:37中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:40中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:42中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:45中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:47中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:6中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:92中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:93中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:92中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:93中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:92中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:93中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(I)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:90中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:28中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:91中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:39中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:90中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:91中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:39中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:90中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:28中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:91中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:39中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:96或97中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:89中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:96或97中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:89中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示的序列,所述CDR2包含SEQ IDNO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:96或97中所示序列的VH和包含SEQ ID NO:89中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:80或95中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:81中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:34中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:83中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:84中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:85中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:86中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:87中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:80或95中所示的序列,FR2包含SEQ ID NO:81中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:34中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:80或95中所示的序列,FR2包含SEQ ID NO:81中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:34中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示的序列。
本发明还提供了包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:13中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:88中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含与SEQ ID NO:94中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示的序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:98中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示的序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:88中所示的序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:94中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:98中所示的序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示的序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,所述CDR1包含SEQ ID NO:94中所示的序列,所述CDR2包含SEQ IDNO:18中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示的序列;或
(x)包含SEQ ID NO:88中所示的序列的VH和包含SEQ ID NO:98中所示的序列的VL。
在本发明的任何方面,所述抗原结合结构域还包含以下至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:80中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:30中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:82中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:83中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含与SEQ ID NO:84中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:85中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:86中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR4包含与SEQ ID NO:87中所示的序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:80中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:30中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:82中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示的序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示的序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:80中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:30中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:82中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示的序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示的序列,所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列,所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示的序列,所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示的序列。
如本文中所述,抗原结合蛋白可呈以下形式:
(i)单链Fv片段(scFv);
(ii)二聚scFv(di-scFv);
(iii)与抗体的恒定区、Fc或重链恒定结构域(CH)2和/或CH3连接的(i)或(ii)之一;或
(iv)与结合免疫效应细胞的蛋白质连接的(i)或(ii)之一。
另外,如本文中所述,抗原结合蛋白可呈以下形式:
(v)双抗体;
(vi)三抗体;
(vii)四抗体;
(viii)Fab;
(ix)F(ab')2;
(x)Fv;
(xi)与抗体的恒定区、Fc或重链恒定区(CH)2和/或CH3连接的(v)至(x)之一;或
(xii)与结合免疫效应细胞的蛋白质连接的(v)至(x)之一。
前述抗原结合蛋白也可称为抗体的抗原结合结构域。
优选地,本文所述的抗原结合蛋白是抗体或其抗原结合片段。典型地,抗原结合蛋白是抗体,例如单克隆抗体。
如本文中所用,抗原结合蛋白可以是可变结构域。
本发明提供了抗原结合蛋白,其包含以下氨基酸序列(按N至C末端或C至N末端的顺序)、基本上由其组成或由其组成:
-SEQ ID NO:48和55;
-SEQ ID NO:49和56;
-SEQ ID NO:50和57;
-SEQ ID NO:51和58;
-SEQ ID NO:52和56;
-SEQ ID NO:53和55;
-SEQ ID NO:54和59;
-SEQ ID NO:88和89;
-SEQ ID NO:92和93;
-SEQ ID NO:96和98;
-SEQ ID NO:97和98。
-SEQ ID NO:88和98;
-SEQ ID NO:96和89;或
-SEQ ID NO:97和89。
在本发明的任何方面和本文所述的任何抗原结合蛋白中,还包含经改造以具有降低的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力的Fc区。优选地,通过与Fc受体相互作用的Fc区中的氨基酸的突变、缺失或修饰来赋予降低的诱导ADCC的能力。优选地,被突变、缺失或修饰的氨基酸在根据SEQ ID NO:60的位置234、235和331处(其中丙氨酸为位置118)或在234、235和331的等效位置处。优选地,氨基酸突变为L234F、L235E和P331S。通常,Fc包括SEQ ID NO:61中所示的氨基酸序列、基本上由所述氨基酸序列组成或由所述氨基酸序列组成。
如本文中所用,本发明的抗原结合蛋白的互补决定区序列(CDR)根据IMGT编码系统定义。
本发明提供了本文所述的抗原结合蛋白,其中形成FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4中的一者或多者的氨基酸序列是人序列。
本发明提供了抗CCR6受体抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体,其包含具有本文所述序列的抗原结合蛋白,或包括本文所述的CDR和/或FR序列。
本发明提供了包含抗原结合蛋白的双抗体或三抗体,所述抗原结合蛋白具有如本文所述的序列,或包含如本文所述的CDR和/或FR序列。
本发明提供了融合蛋白,其包含本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体。
本发明提供了呈与标记物或细胞毒性剂缀合的本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体或融合蛋白的形式的缀合物。
本发明提供了用于结合本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物的抗体。
在涉及形成抗原结合蛋白的多个多肽链的本发明的方面,表达构建体包含与启动子可操作地连接的编码包含例如VH的多肽的核酸和与启动子可操作地连接的编码包含例如VL的多肽的核酸。
在另一个实例中,表达构建体是例如以5’至3’顺序包含下列可操作地连接的组件的双顺反子表达构建体:
(i)启动子
(ii)编码第一多肽的核酸;
(iii)内部核糖体进入位点;和
(iv)编码第二多肽的核酸,
其中第一多肽包含VH,第二多肽包含VL,反之亦然。
本发明还设想了单独的表达构建体,其中一个表达构建体编码包含VH的第一多肽,另一个编码包含VL的第二多肽。例如,本发明还提供了组合物,其包含:
(i)第一表达构建体,其包含与启动子可操作地连接的编码包含VH的多肽的核酸;和
(ii)第二表达构建体,其包含与启动子可操作地连接的编码包含VL的多肽的核酸。
本发明提供了包含本文所述载体或核酸的细胞。优选地,所述细胞是分离的、基本纯化的或重组的。在一个实例中,所述细胞包含本发明的表达构建体或:
(i)第一表达构建体,其包含与启动子可操作地连接的编码包含VH的多肽的核酸;和
(ii)第二表达构建体,其包含与启动子可操作地连接的编码包含VL的多肽的核酸,
其中第一和第二多肽缔合形成本发明的抗原结合蛋白。
本发明的细胞的实例包括细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。
本发明提供了编码本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物的核酸。优选地,所述核酸具有编码对应于SEQ ID NO:3至62和80至98的氨基酸序列中的任一个或多个的核苷酸序列。优选地,所述核酸具有对应于SEQ IDNO:63至79、99或100中的任一个或多个的核苷酸序列。
本发明提供了包含本文所述核酸的载体。优选地,所述核酸具有编码对应于SEQID NO:3至62和80至98的氨基酸序列中的任一个或多个的核苷酸序列。优选地,所述核酸具有对应于SEQ ID NO:63至79、或99或100中的任一个或多个的核苷酸序列。
本发明提供了包含本文所述载体或核酸的细胞。
在另一个实施方案中,提供了包含本文所述细胞的动物或源自其的组织。
本发明提供了药物组合物,其包含抗原结合蛋白,或包含如本文所述的CDR和/或FR序列,或如本文所述的免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物,以及药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。
本发明提供了诊断组合物,其包含抗原结合蛋白,或包含本文所述的CDR和/或FR序列,或本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物、稀释剂和任选地标记物。
本发明提供了试剂盒或制品,其包含抗原结合蛋白、或包含如本文所述的CDR和/或FR序列、或如本文所述的免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子、或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物。
本发明提供了根据本文所述的CDR1、CDR2、FR1、FR2、FR3和FR4中的一者或多者的序列用于产生用于结合CCR6受体的抗原结合蛋白的用途。
本发明提供了如本文所述的抗原结合蛋白或CDR和/或FR序列用于产生对CCR6具有增强的亲和力的抗CCR6受体抗原结合蛋白的用途。
本发明提供了由本文所述的抗原结合蛋白或CDR和/或FR序列的突变产生的核酸分子的文库,其中所述文库中的至少一种核酸分子编码与CCR6结合的抗原结合蛋白。
本发明提供了生产用于结合本文所述CCR6受体的抗原结合蛋白的方法,其包括在本文所述的细胞或动物中表达本文所述的核酸。
本发明提供了用于预防或治疗个体中与CCR6表达相关的病况或疾病的方法,其包括向需要治疗所述病况或疾病的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。与CCR6表达相关的疾患或病症可以是自身免疫疾患或炎性疾患,诸如银屑病、感染、纤维化或癌症,尤其是本文所述的上皮癌,或肺病,诸如慢性阻塞性肺病(COPD)、哮喘和呼吸道合胞病毒(RSV)。
本发明提供了用于延迟个体中与CCR6表达相关的病况或疾病的发作或降低其严重性的方法,其包括向需要治疗癌症或所述病况或疾病的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,所述疾病是多发性硬化或银屑病。
本发明提供了预防个体中银屑病或关节炎的方法,其包括向有发展银屑病或关节炎的风险的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,银屑病是斑块型银屑病。
在本发明的任何方面,抗原结合蛋白包含Fc区,所述Fc区经工程化以具有增强的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力。优选地,通过Fc区中与Fc受体相互作用的氨基酸的突变、缺失或修饰赋予增强的诱导ADCC的能力。优选地,被突变、缺失或修饰的氨基酸在SEQ ID NO:60(其中丙氨酸是位置118)的位置239、330和/或332处或在239、330和/或332的等效位置处。优选地,所述氨基酸被突变为S239D、A330L和I332E。通常,Fc包含SEQ ID NO:62中所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
在本发明的任何方面,抗原结合蛋白包含Fc区,所述Fc区未经改造以具有降低的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力。优选地,根据SEQ ID NO:60(其中丙氨酸是位置118)的位置234、235和/或331处或与234、235和/或331等效的位置处的氨基酸分别不是F、E和/或S。换句话说,位置234处的氨基酸不是F,位置235的氨基酸不是E和/或位置331处的氨基酸不是S。
本发明提供了预防或治疗个体中银屑病的方法,其包括向有发展银屑病的风险或需要治疗银屑病的个体提供抑制CCR6活性的抗原结合蛋白的步骤,其中所述抗原结合蛋白包含Fc区,所述Fc区经改造以具有降低的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力。优选地,通过与Fc受体相互作用的Fc区中的氨基酸的突变、缺失或修饰来赋予降低的诱导ADCC的能力。优选地,被突变、缺失或修饰的氨基酸在根据SEQ ID NO:60的位置234、235和331处(其中丙氨酸为位置118)或在234、235和331的等效位置处。优选地,氨基酸突变为L234F、L235E和P331S。通常,Fc包括SEQ ID NO:61中所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。优选地,银屑病是斑块型银屑病。
本发明提供了治疗个体的银屑病的方法,其包括向需要治疗银屑病的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,银屑病是斑块型银屑病。
本发明提供了减缓个体的银屑病或关节炎进展的方法,其包括向需要减缓银屑病进展的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,银屑病是斑块型银屑病。
本发明提供了稳定或逆转个体的与CCR6表达相关的病况或疾病的临床症状的方法,其包括向需要治疗所述病况或疾病的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,所述疾病是多发性硬化或银屑病。
本发明提供了治疗被鉴定为具有与CCR6表达相关的病况或疾病的症状的受试者的方法,其包括施用本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物,从而治疗受试者。
本发明提供了本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物在制备用于治疗与CCR6表达相关的癌症或病况或疾病的药物方面的用途。
本发明提供了用于诊断与CCR6表达相关的疾病或疾患的方法,其包括将待确定是否存在癌症的组织或细胞与呈本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或诊断组合物的形式的试剂接触,并检测所述试剂与所述组织或细胞的结合。可在体内或体外操作该方法。该方法还可包括治疗被鉴定为患有疾病或疾患的受试者的步骤。本文描述了与CCR6表达相关的疾病或疾患的实例。
在本发明的任何方面,与CCR6表达相关的疾病或病症是关节炎。关节炎可以是任何类型,例如本文所述的任何类型,包括骨关节炎、类风湿性关节炎和银屑病性关节炎。
本发明提供了根据本发明的抗原结合蛋白,其以0.1至5nM范围内的亲和力结合活细胞上的CCR6。
本文所述的抗原结合蛋白、蛋白或抗体可包含人恒定区,例如IgG恒定区,诸如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4恒定区或其混合物。在包含VH和VL的抗体或蛋白质的情况下,VH可与重链恒定区连接,而VL可与轻链恒定区连接。
本发明的抗原结合蛋白的功能特征将加以必要的变更适用于本发明的抗体。
本文所述的抗原结合蛋白可以是纯化的、基本上纯化的、分离的和/或重组的。
本发明的抗原结合蛋白可以是取自其中生长了表达本发明的抗原结合蛋白的杂交瘤的培养基的上清液的一部分。
本发明提供了包含用于结合CCR6的抗原结合蛋白的单结构域抗体。
如本文中所用,除非上下文另有要求,否则术语“包含”和该术语的变形诸如“包括”、“含有”和“具有”,不旨在排除另外的添加剂、组分、整体或步骤。术语“包含”和“包括”可互换使用。
本发明的其它方面和在前面段落中描述的方面的其它实施方案将从下面的描述中变得显而易见,下面的描述通过实例并参考附图给出。
序列简述
SEQ ID NO:1-人CCR6的氨基酸序列。
SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:1的1至28的氨基酸序列。
SEQ ID NO:3至62和80至98-下表1至7中描述的氨基酸序列,对应于本发明的CDR、FR和抗原结合结构域的序列。
SEQ ID NO:63至79、99和100-各种VH、VL和Fc区的核苷酸序列,如表8所示。
附图说明
图1和图2:如本文所述,最初使用竞争性配体结合和趋化性测定对有前景的抗CCR6 mAb进行分级。
图3和图4:hCXCR1、hCXCR2、hCXCR3转染子未被抗CCR6杂交瘤培养物上清液染色。
图5:比较了在低IgG血清中生长并被部分纯化的抗CCR6 mAb防止125I-MIP3α与L1.2/hCCR6转染子结合的能力。53103是R&D的抗hCCR6 mAb。
图6:比较了在低IgG血清中生长并被部分纯化的抗CCR6 mAb防止MIP3α诱导的L1.2/hCCR6转染子迁移的能力。53103是R&D的抗hCCR6 mAb。
图7:纯化的抗CCR6 mAb抑制MIP-3α诱导的L1.2/hCCR6转染子的迁移。
图8:如本文所述通过ELISA绘制抗hCCR6 mAb的表位图谱。
图9:用AB6和AB7抗CCR6克隆对人PBMC进行染色。针对淋巴细胞群体门控新鲜人PBMC,并用抗CD3-FITC抗体和抗CCR6-APC抗体(克隆AB6(a)和克隆AB7(b))染色。
图10:通过CDR移植对抗CCR6(AB6)mAb进行人源化。
图11:通过流式细胞术表征小鼠AB6 mAb(mAB6)和人源化AB6mAb(hAB6)。mAB6 mAb和hAB6 mAb识别用hCCR6转染的L1.2细胞(绿线),但不识别未转染的L1.2细胞(黑线)。
图12:用纯化的人NK细胞进行ADCC测定:L1.2 hCCR6对比Fc经工程化的hAB6。将标记的靶细胞(hCCR6 L1.2-PK26)与纯化的人NK细胞(效应细胞)和1ug/ml的同种型对照、非耗竭人源化AB6(3SFc hAB6)或人源化耗竭抗体(3MFc hAB6)一起孵育。用TO-PRO-3碘化物监测细胞死亡。
图13和图14:产生人CCR6敲入小鼠(hCCR6+/mCCR6-/-)。hCCR6+/mCCR6-/-来源的脾细胞的染色。脾细胞用抗B220 APC mAb和hAB6 FITC(绿色)、抗-mCCR6(R&D;蓝线)或同种型对照(黑线)进行染色。
图15:使用hCCR6+敲入小鼠对EAE进行抗人CCR6 mAb治疗。给8-12周龄的雌性hCCR6 Tg小鼠(每组5只)皮下注射100μg完全弗氏佐剂中的rMOG 1-117。免疫后和48小时后,小鼠接受200ng百日咳毒素的静脉内注射。每天观察单个动物,并如下评估临床评分:0=无临床疾病,1=仅丧失尾部张力,2=轻度单肢轻瘫或下肢瘫痪,3=重度下肢瘫痪,4=截瘫和/或四肢瘫(quadraparesis),5=濒死或死亡。在第8天(黑色箭头),小鼠接受人源化非耗竭抗hCCR6抗体(hAB6)(2mg/kg)或同种型对照(人源化抗hCXCR3)抗体的IV注射。*P<.005,**P<.001-ANOVA检验。
图16:mCCR6+/+/hCCR6+小鼠中的CCR6耗竭。在淋巴细胞群(脾细胞)中记录了350000个事件。用hAB6 3MFc(d和f);hAB6 3SFc(b和g)或同种型控制(c和e)注射mCCR6+/+/hCCR6+小鼠。#a)是用FITC同种型对照抗体染色。
图17:来自用同种型或抗ccr6 mAb治疗的免疫动物的脊髓的代表性染色的组织切片(预防性研究)。连续切片用苏木精和伊红(H&E)染色以确定炎性细胞浸润的程度,用luxol固蓝(LFB:箭头)染色以确定髓磷脂完整性,用Bielschowski银染色以确定轴突损失和损伤(箭头)。
图18:给8-12周龄的雌性hCCR6 Tg小鼠皮下注射100μg的于完全弗氏佐剂中的rMOG 1-117。免疫后和48小时后,小鼠接受200ng百日咳毒素的静脉内注射。当平均临床评分达到2时(第15天),用2mg/kg人源化抗hCCR6或人源化抗hCXCR3 mAb(同种型组)治疗动物。动物在第19天接受第二次注射。*P<.005,**P<.001-ANOVA检验。
图19:预防性银屑病研究。小鼠中IMQ诱导的皮肤炎症在表型上类似于银屑病(咪喹莫特(IMIQUIMOD)诱导的银屑病模型(The Journal of Immunology 2009第182卷第9期5836-5845))。在预防性研究中,每天在剃光的背部皮肤上用IMQ乳膏或对照乳膏(凡士林)治疗hCCR6 Tg小鼠。(A)处理7天后小鼠背部皮肤的表型表现。从第一次施用IMQ乳膏的当天开始,每天用同种型对照抗体(5mg/kg)或人源化抗hCCR6 mab、hAB6(5mg/kg的3Mfc或3SFc)治疗小鼠。(B)IMQ处理改变了角质形成细胞的增殖和分化。用IMQ或凡士林霜处理小鼠7天。小鼠背部皮肤的H&E染色(凡士林对照;IMQ+同种型或IMQ+hAB6 3MFc)。(C)IMQ诱导的背部皮肤增厚。抗hCCR6显著减少背部皮肤增厚。
图20:治疗性银屑病研究。使用图19的实验中所用的相同IMQ模型,然而在第一次施用IMQ乳膏后第6天开始,每天用同种型对照抗体(5mg/kg)或人源化抗hCCR6 mab、hAB6(5mg/kg的3Mfc或3SFc)治疗小鼠。该治疗研究测量了IMQ诱导的背部皮肤增厚,其中与对照组相比,两种抗hCCR6抗体均显著减少了背部皮肤增厚。
图21:体外ADCC测定。将hAB6耗竭抗体(IgG1和IgG1 Fc优化)的溶细胞能力与非耗竭hAB6(Fc KO)和同种型对照进行比较。与非耗竭或对照相比,hAb6耗竭抗体显示具有显著增加的细胞杀伤能力。
图22:治疗性关节炎研究。上图:在第0天和第1天给人CCR6转基因小鼠注射(i.p.)200μL K/BXN血清。通过每天测量踝关节厚度和临床指数评分来评估关节炎的发展,直至实验终点。当小鼠表现出关节炎症状并且累积临床评分达到4(在第4天)时,将小鼠分成两组:注射同种型对照mAb抗体的那些小鼠;注射抗hCCR6-FcRK抗体的那些小鼠(蓝色);和以20mg/kg体重,然后每隔一天以5mg/kg注射抗hCCR6耗竭抗体(绿色)1周的那些小鼠。作为对照,在第0天和第1天给不表达人CCR6(WT)的小鼠腹膜内注射200μL K/BXN血清,并用抗hCCR6耗竭抗体(红色)处理。下图:实验终点时小鼠脚踝的代表性图像。
图23:hAB6突变体(黑色曲线)和hAB6突变体(WT/3-3;蓝色曲线;1-21/WT,绿色曲线;1-23/WT,红色曲线;1-21/3-3,橙色曲线;1-23/3-3,粉红色曲线)与hCCR6 L1.2细胞的FACS结合分析。对每个数据点减去背景荧光值并作图。使用GraphPad Prism软件计算EC50。
图24:(a)将6周龄的人CCR6转基因小鼠在动物房中适应7天。将博来霉素(BLM)(Sigma)用PBS稀释至200μg/ml。将博来霉素或PBS(100μl)皮下注射到小鼠剃光的背部的单一位置,每天一次,持续28天。随后,从第8天直至第27天,通过以5mg/kg i.p.注射抗人CCR6mAb治疗小鼠。通过IP注射同种型对照或PBS来治疗对照小鼠。(b)真皮厚度显示BLM治疗后厚度增加,而当小鼠进一步用抗人CCR6抗体处理时厚度减少。
图25:组织学评估。将来自PBS治疗的、同种型抗体治疗的和抗人CCR6治疗的小鼠的皮肤(a)和肺组织(b)用福尔马林固定并包埋在石蜡中。然后将切片用H&E、马松三色法(Masson’s trichrome)和天狼猩红(picrosirius red)染色用于显微镜评估。
具体实施方式
应当理解,本说明书中公开和限定的本发明扩展到文本或附图中提到或显而易见的两个或点位多个单独特征的所有可选组合。所有这些不同的组合构成了本发明的各种可选方面。
本发明的其它方面和在前面段落中描述的方面的其它实施方案将从下面的描述中变得显而易见,下面的描述通过例子并参考附图给出。
现将详细参考本发明的某些实施方案。虽然将结合实施方案描述本发明,但是应该理解的是,目的不是将本发明限制于这些实施方案。相反,本发明旨在覆盖所有的替换、修改和等同物,它们可以包括在由权利要求限定的本发明的范围内。
本发明人已经开发了结合并抑制或降低CCR6的活性的抗原结合蛋白,例如抗体。本文所述的抗原结合蛋白具有抑制或减少CCR6介导的炎症、肿瘤生长和转移活性的一个或多个方面的能力。
概述
在整个说明书中,除非另有具体说明或上下文另有要求,否则对单个步骤、物质组合、步骤的组或物质组合的组的引用应被理解为包括一个和多个(即一个或多个)这些步骤、物质组合、步骤的组或物质组合的组。因此,如本文中所使用,除非上下文清楚地另外指示,否则单数形式“一个/种”、“所述”和“该”包括复数方面,反之亦然。例如,对“一个/种(a)”的引用包括单个/种以及两个/种或更多个/种;对“一个/种(an)”的引用包括单个/种以及两个/种或更多个/种;对“所述”或“该)”的引用包括单个以及两个或更多个等等。
本领域的技术人员将会理解,除了那些具体描述的之外,本发明易于进行变化和修改。应当理解,本发明包括所有此类变化和修改。本发明还包括本说明书中单独或共同提及或指出的所有步骤、特征、组合物和化合物,以及所述步骤或特征的任意两个或更多个的任何和所有组合。
本领域技术人员将认识到许多与本文所述的方法和材料相似或等同的方法和材料,它们可用于本发明的实施。本发明决不限于所描述的方法和材料。
本文提及的所有专利和出版物均通过引用以其整体并入。
本发明的范围不受本文描述的具体实例的限制,所述实例仅用于举例说明的目的。功能等同的产品、组合物和方法显然在本发明的范围内。
除非另有具体说明,否则本文中本发明的任何实例或实施方案应视为经必要变更适用于本发明的任何其它实例或实施方案。
除非另有明确定义,否则本文使用的所有技术和科学术语应被视为具有与本领域(例如,在细胞培养、分子遗传学、免疫学、免疫组织化学、蛋白质化学和生物化学中)普通技术人员通常理解的相同含义。
除非另有说明,本公开中使用的重组蛋白、细胞培养和免疫学技术是本领域技术人员熟知的标准程序。这些技术在话题如以下文献中进行了描述和解释:J.Perbal,APractical Guide to Molecular Cloning,John Wiley和Sons(1984),J.Sambrook等人Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbour Laboratory Press(1989),T.A.Brown(编辑),Essential Molecular Biology:A Practical Approach,第1卷和第2卷,IRL Press(1991),D.M.Glover和B.D.Hames(编辑),DNA Cloning:A PracticalApproach,第1-4卷,IRL Press(1995t 1996),以及F.M.Ausubel等人(编辑),CurrentProtocols in Molecular Biology,Greene Pub.Associates and Wiley-Interscience(1988,包括到目前为止的所有更新),Ed Harlow和David Lane(编辑)Antibodies:ALaboratory Manual,Cold Spring Harbour Laboratory,(1988),和J.E.Coligan等人.(编辑)Current Protocols in Immunology,John Wiley&Sons(包括到目前为止的所有更新)。
本文中可变区及其部分、免疫球蛋白、抗体及其片段的描述和定义可通过以下文献中的论述进一步阐明:Kabat Sequences of Proteins of Immunological Interest,National Institutes of Health,Bethesda,Md.,1987and 1991,Bork等人,JMol.Biol.242,309-320,1994,Chothia和Lesk J.Mol Biol.196:901 -917,1987,Chothia等人Nature342,877-883,1989和/或Al-Lazikani等人,J Mol Biol 273,927-948,1997。
术语“和/或”,例如“X和/或Y”应被理解为表示“X和Y”或“X或Y”,其明确支持这两种含义或其中任一含义。
如本文中所用,术语“源自”应被理解为表示可从特定来源获得指定整数,尽管不一定直接从该来源获得。
本文提及的例如残基的范围将被理解为包括在内的。例如,提及“包含氨基酸56至65的区域”将被理解为包含在内的,即该区域包含指定序列中编号为56、57、58、59、60、61、62、63、64和65的氨基酸的序列。
选定的定义
CCR6也被称为C-X-C基序趋化因子受体6((CD196;BN-1、C-CCKR-6、CC-CKR-6、CCR-6、CD196、CKR-L3、CKRL3、CMKBR6、DCR2、DRY6、GPR29、GPRCY4、STRL22、C-C基序趋化因子受体6)。CCR61是G蛋白偶联受体(GPCR),其在许多不同的细胞和组织(包括淋巴和非淋巴组织诸如脾、淋巴结、胰腺、结肠、阑尾、小肠)上表达。CCR6在B细胞、未成熟树突细胞(DC)、T细胞(Th1、Th2、Th17、Treg)、天然杀伤细胞(NKT细胞)和中性粒细胞上表达。
CCR6以高亲和力结合CCL20(也称为巨噬细胞蛋白3α(MIP 3α))。与其它趋化因子受体不同,CCR6不以高度特异性与其它趋化因子配体结合。
白细胞介素4(IL-4)和干扰素γ(IFNγ)抑制朗格汉斯细胞发育中CCR6的表达,白细胞介素10(IL-10)诱导其表达。促炎Th17细胞表达CCR6及其配体CCL20(MIP-3),CCR6影响促炎性细胞向炎症部位的迁移。一些Th17细胞通过CCL20(MIP-3)的趋化因子梯度迁移到炎症部位。在一些模型中,缺乏CCR6导致不太严重的自身免疫性脑脊髓炎。
CCR6也被认为在胃肠道恶性肿瘤的发展和转移扩散中起作用。发现CCR6的表达在结直肠癌中被上调。CCR6也与克罗恩病相关。
本文提供的术语“CCR6”包括保持CCR6活性(例如,与天然蛋白质相比,活性在至少50%、80%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%内)的C-X-C基序趋化因子受体6(CCR6)蛋白天然存在的形式、同源物或变体中的任一者。在一些实施方案中,与天然存在的形式相比,变体或同源物在整个序列或序列的一部分(例如50个、100个、150个或200个连续氨基酸的部分)上具有至少90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的氨基酸序列同一性。在一些实施方案中,CCR6蛋白是通过UniProt序列参考P15684、其同源物或功能片段鉴定的蛋白。
仅为了命名的目的而非限制,人CCR6的示例性氨基酸序列是SEQ ID NO:1。
如本文中所用,提及CCR6是指具有CCR6的至少一种生物化学或生物物理活性的分子。CCR6生物化学或生物物理活性包括对抗原性刺激细胞表面受体信号传导途径的急性炎症反应、细胞防御反应、趋化性、树突细胞趋化性、炎症反应、后肾小管形态发生、中脑发育、中性粒细胞凋亡过程的负调节、中性粒细胞活化、中性粒细胞趋化性、磷脂酶C-活化G-蛋白偶联受体信号传导途径、血管生成的正调节、心肌细胞凋亡过程的正调节、细胞增殖的正调节、胞质钙离子浓度的正调节、中性粒细胞趋化性的正调节、血管通透性的正调节、受体内化和信号转导。
短语“抑制CCR6活性”应理解为意指本发明的抗原结合蛋白抑制或降低CCR6的任一种或多种活性,包括但不限于与CCR6的配体结合;配体诱导的CCR6构象变化;CCR6激活;G蛋白激活;CCR6介导的细胞信号传导;体外或体内CCR6介导的细胞迁移、炎症、肿瘤生长、血管生成或转移反应;CCR6介导的肿瘤细胞生长;和/或CCR6介导的白细胞(例如中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、肥大细胞或T细胞)迁移。“抑制MIP-3介导的CCR6活性”应理解为意指本发明的抗原结合蛋白抑制或降低一种或多种上述由MIP-3介导或诱导的活性。另外,使用合适的体外细胞测定或体内测定来测量活性,并且与在相同条件下但无抗原结合蛋白的相同测定中的CCR6活性相比,活性被阻断或降低至少1%、5%、10%、25%、50%、60%、70%、80%或90%或更多。优选地,CCR6活性由MIP3介导或诱导。
SEQ ID NO:1:
MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
术语“分离的蛋白质”或“分离的多肽”是由于其来源或衍生来源而不与在其天然状态下伴随其的天然相关组分缔合,基本上不含来自相同来源的其它蛋白质的蛋白质或多肽。使用本领域已知的蛋白质纯化技术,可以使蛋白质基本上不含天然相关组分或通过分离基本上纯化。“基本上纯化的”意指蛋白质基本上不含污染剂,例如,至少约70%或75%或80%或85%或90%或95%或96%或97%或98%或99%不含污染物质。
术语“重组体”应理解为人工基因重组的产物。因此,在包含抗体抗原结合结构域的重组蛋白的上下文中,该术语不涵盖受试者体内天然存在的抗体,所述抗体是B细胞成熟过程中发生的自然重组的产物。然而,如果这种抗体是分离的,则其被认为是包含抗体抗原结合结构域的分离的蛋白质。类似地,如果使用重组手段分离和表达编码蛋白质的核酸,则所得蛋白质是包含抗体抗原结合结构域的重组蛋白质。当重组蛋白质在例如表达其的细胞、组织或受试者中时,其还涵盖通过人工重组手段表达的蛋白质。
术语“蛋白质”应理解为包括单个多肽链,即一系列由肽键连接的连续氨基酸,或一系列彼此共价或非共价连接的多肽链(即多肽复合物)。例如,可使用合适的化学物质或二硫键共价连接一系列多肽链。非共价键的实例包括氢键、离子键、范德华力和疏水相互作用。
根据前面的段落,术语“多肽”或“多肽链”应理解为一系列由肽键连接的连续氨基酸。
如本文中所用,术语“抗原结合蛋白”可与“抗原结合结构域”互换使用,应理解为指能够特异性结合抗原的抗体区域,即VH或VL或包含VH和VL的Fv。抗原结合结构域不必在完整抗体的背景中,例如,其可以是分离的(例如,结构域抗体)或呈另一种形式(例如,如本文所述),诸如scFv。
出于本公开的目的,术语“抗体”包括能够通过包含在Fv内的抗原结合结构域特异性结合一种或几种密切相关的抗原(例如CCR6)的蛋白质。该术语包括四链抗体(例如,两条轻链和两条重链)、重组或修饰抗体(例如嵌,合抗体、人源化抗体、人抗体、CDR移植抗体、灵长类化抗体、去免疫抗体(de-immunized antibody)、同源人源化抗体、半抗体、双特异性抗体)。抗体通常包含恒定结构域,其可排列成恒定区或恒定片段或可结晶片段(Fc)。抗体的示例性形式包括作为其基本单位的四链结构。全长抗体包含两条共价连接的重链(~50至70kD)和两条轻链(~23kDa)。轻链通常包含可变区(如果存在的话)和恒定区,在哺乳动物中为κ轻链或λ轻链。重链通常包含可变区和一个或两个通过铰链区与另外的一个或多个恒定结构域连接的恒定结构域。哺乳动物的重链属于下列类型之一:α、δ、ε、γ或μ。每条轻链也与一条重链共价连接。例如,两条重链以及重链和轻链通过链间二硫键和非共价相互作用结合在一起。在不同类型的抗体中,链间二硫键的数量可以不同。每条链都有N-末端可变区(VH或VL,其中每个的长度约为110个氨基酸)和一个或多个位于C-末端的恒定区。轻链的恒定结构域(长度约为110个氨基酸的CL)与重链的第一个恒定结构域(长度为330至440个氨基酸的CH1)对齐并二硫键连接。轻链可变区与重链的可变区对齐。抗体重链可包含2个或更多个额外的CH结构域(例如CH2、CH3等),并且可在CH1与CH2恒定结构域之间包含铰链区。抗体可以是任何类型(例如,IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、类别(例如,IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或亚类。在一个实例中,抗体是鼠(小鼠或大鼠)抗体或灵长类(诸如,人)抗体。在一个实例中,抗体重链缺失了C端赖氨酸残基。在一个实例中,抗体是人源化的、同源人源化的、嵌合的、CDR移植的或去免疫的。
术语“全长抗体”、“完整抗体”或“完全抗体”可互换使用,指以其基本上完整的形式存在的抗体,与抗体的抗原结合片段相对。具体而言,完全抗体包括那些具有包括Fc区的重链和轻链的抗体。恒定结构域可以是野生型序列恒定结构域(例如,人野生型序列恒定结构域)或其氨基酸序列变体。
如本文中所用,“可变区”是指本文所定义的能够特异性结合抗原的抗体的轻链和/或重链的部分,包括互补决定区(CDR)(即CDR1、CDR2和CDR3)和框架区(FR)的的氨基酸序列。例如,可变区包含三个或四个FR(例如,FR1、FR2、FR3和任选的FR4)以及三个CDR。VH指重链的可变区。VL指的是轻链的可变区。
如本文中所用,术语“表位”(同义词“抗原决定簇”)应理解为意指包含抗体的抗原结合结构域的抗原结合蛋白与之结合的CXCR6的区域。除非另有定义,否则该术语不必限于抗原结合蛋白所接触的特定残基或结构。例如,该术语包括跨越抗原结合蛋白所接触的氨基酸的区域和该区域外的5-10个(或更多个)或2-5个或1-3个氨基酸。在一些实例中,表位包含一系列不连续的氨基酸,当抗原结合蛋白折叠时,所述氨基酸彼此靠近,即“构象表位”。熟练的技术人员也将意识到术语“表位”不限于肽或多肽。例如,术语“表位”包括分子的化学活性表面基团,诸如糖侧链、磷酰基侧链或磺酰基侧链,并且在某些实例中,可以具有特定的三维结构特征和/或特定的电荷特征。
如本文中所用,术语“受试者”是指包括人在内的任何动物,例如哺乳动物。示例性受试者包括但不限于人类和非人灵长类动物。例如,受试者是人。
本发明人开发了结合CCR6并抑制其功能的抗体。所述抗体对CCR6具有高亲和力,并抑制配体(MIP-3α)介导的趋化性。由于CCR6天然存在于免疫细胞表面,这些抗体经显示结合CCR6。鉴于本文(包括实施例)描述了抗体的性质,这些抗体可用于延迟与MIP-3α活性或CCR6表达相关的疾病的发作或降低其严重性。另外,这些抗体已被证明稳定和逆转与MIP-3α活性或CCR6表达相关的既定疾病的临床可观察症状。
“抗体”或“免疫球蛋白”或“Ig”是在脊椎动物的血液或其它体液中发现的γ球蛋白,其在免疫系统中发挥结合抗原,从而识别和中和外来物体的功能。
抗体通常是异四聚糖蛋白,由两条相同的轻(L)链和两条相同的重(H)链组成。每个L链通过一个共价二硫键与H链相连。根据H链同种型,两条H链通过一个或多个二硫键相互连接。每个H和L链也有规则间隔的链内二硫桥。
H链和L链定义了特定的Ig结构域。更具体地说,每个H链在N-末端具有可变结构域(VH),其后是α和γ链的每一种的三个恒定结构域(CH)以及μ和ε同种型的四个CH结构域。每条L链在N末端具有可变结构域,随后在其另一端具有恒定结构域(CL)。VL与VH对齐,并且CL与重链的第一个恒定区(CH1)对齐。
抗体可被分配到不同的类别或同种型。有五类免疫球蛋白:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,具有分别命名为α、δ、ε、γ和μ的重链。基于CH序列和功能上相对较小的差异,将γ类和α类进一步分为亚类,例如,人表达以下亚类:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2。来自任何脊椎动物物种的L链可以根据它们的恒定区的氨基酸序列,被指定为两种明显不同的类型(称为κ和λ)之一。
恒定区包含Fc部分,所述Fc部分包含由二硫化物结合在一起的两条H链的羧基末端部分。抗体的效应子功能诸如ADCC由Fc区的序列决定,所述区域也是被存在于某些类型细胞上的Fc受体(FcR)识别的部分。
VH和VL的配对一起形成“可变区”或“可变结构域”,包括抗体重链或轻链的氨基末端结构域。重链的可变结构域可称为“VH”。轻链的可变结构域可称为“VL”。V结构域包含抗原结合蛋白,其影响抗原结合并定义特定抗体对其特定抗原的特异性。V R&D区跨越约110个氨基酸残基,由被称为框架区(FR)(通常约4个)的15-30个氨基酸的相对不变的区段组成,其被称为“高变区”(通常约3个)的具有极端可变性的较短区域(各自长度为9-12个氨基酸)隔开。FR主要采用β-折叠构型,高变区形成环,其连接β-折叠结构,在某些情况下形成β-折叠结构的一部分。
“高变区”、“HVR”或“HV”是指抗体可变结构域的序列高变和/或形成结构确定的环的区域。通常,抗体包含六个高变区;三个在VH中(H1、H2、H3),三个在VL中(L1、L2、L3)。许多高变区的描述正在使用中,并且涵盖于本文中。
如本文中所用,术语“互补决定区”(同义词CDR;即,CDR1、CDR2和CDR3)是指抗体可变区的氨基酸残基,其存在是对特异性抗原结合的主要贡献者。每个可变区结构域(VH或VL)通常具有三个CDR,分别被鉴定为CDR1、CDR2和CDR3。VH的CDR在本文中也分别称为CDRH1、CDR H2和CDR H3,其中CDR H1对应于VH的CDR 1,CDR H2对应于VH的CDR 2,CDR H3对应于VH的CDR 3。同样,VL的CDR在本文中分别称为CDR L1、CDR L2和CDR L3,其中CDR L1对应于VL的CDR 1,CDR L2对应于VL的CDR 2,CDR L3对应于VL的CDR 3。在一个实例中,根据美国国家卫生研究院,Bethesda,Md,1987年和1991年的免疫目的蛋白质的卡巴特序列(本文也称为“Kabat编号系统”)来定义分配给CDR和FR的氨基酸位置。在另一个实例中,根据增强的Chothia编号方案(http://www.bioinfo.org.uk/mdex.html)定义分配给CDR和FR的氨基酸位置。本发明不限于由Kabat编号系统定义的FR和CDR,而是包括所有的编号系统,包括Chothia和Lesk J.Mol.MolBiol.196:901-917,1987;Chothia等人,Nature 342:877-883,1989;和/或Al-Lazikani等人,J.Mol.Biol.273:927-948,1997的规范编号系统、Honnegher和Plükthun J.Mol.Biol.309:657-670,2001的编号系统或Giudicelli等人,NucleicAcids Res.25:206-211 1997中论述的IMGT系统。在一个实例中,CDR根据Kabat编号系统来定义。任选地,根据Kabat编号系统的重链CDR2不包含本文列出的五个C-末端氨基酸,或者这些氨基酸中的任一个或多个被另一种天然存在的氨基酸取代。在这方面,Padlan等人,FASEB J.,9:133-139,1995确定了重链CDR2的五个C端氨基酸通常不参与抗原结合。
“框架”或“FR”残基是除本文定义的高变区或CDR残基外的那些可变结构域残基。VH的FR在本文中也分别称为FR H1、FR H2、FR H3和FR H4,其中FR H1对应于VH的FR 1,FRH2对应于VH的FR 2,FR H3对应于VH的FR 3,FR H4对应于VH的FR 4。同样,VL的FR在本文中分别称为FR L1、FR L2、FR L3和FR L4,其中FR L1对应于VL的FR 1,FR L2对应于VL的FR 2,FR L3对应于VL的FR 3,FR L4对应于VL的FR 4。
“用于形成抗原结合蛋白的肽”通常指可以形成赋予抗体对抗原的特异性的构象的肽。实例包括完全抗体或完全抗体相关结构、包括可变结构域在内的完全抗体片段、可变结构域及其片段,包括轻链和重链,或包括一些但非全部高变区或恒定区的轻链和重链的片段。
“完整”或“完全”抗体是包含抗原结合蛋白以及CL和至少重链恒定结构域CH1、CH2和CH3的抗体。恒定结构域可以是天然序列恒定结构域(例如人天然序列恒定结构域)或其氨基酸序列变体。
“完全抗体相关结构”包括完全抗体的多聚化形式。
“包含可变结构域的完全抗体片段”包括Fab、Fab’、F(ab’)2和Fv片段;双抗体;线性抗体、单链抗体分子;和由抗体片段形成的多特异性抗体。
Fab片段由完整的L链与H链的可变区结构域(VH)以及一条重链的第一恒定结构域(CHI)一起组成。就抗原结合而言,每个Fab片段都是单价的,即其具有单一抗原结合蛋白。
Fab’片段与Fab片段的不同之处在于在CHI结构域的羧基末端具有额外的少量残基,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。Fab'-SH是本文中对于Fab'的名称,其中恒定区的一个或多个半胱氨酸残基带有游离巯基。
F(ab’)2片段大致相当于两个具有二价抗原结合活性的二硫键连接的Fab片段,并且仍然能够交联抗原。
“Fv”是包含完整抗原识别和结合位点的抗体片段。该片段由一个重链可变区结构域与一个轻链可变区结构域紧密非共价缔合的二聚体组成。
在单链Fv(scFv)种类中,一个重链可变结构域和一个轻链可变结构域可通过柔性肽连接子共价连接,使得轻链和重链可以以类似于两链Fv种类中的“二聚体”结构的“二聚体”结构缔合。从这两个结构域的折叠产生出六个高变环(H链和L链各3个环),它们为抗原结合提供氨基酸残基,并赋予抗体抗原结合特异性。
“单链Fv”也缩写为“sFv”或“scFv”,是包含连接形成单个多肽链的VH和VL抗体结构域的抗体片段。优选地,scFv多肽还包含位于VH与VL结构域之间的多肽连接子,所述连接子使scFv能够形成抗原结合所需的结构。
“单一可变结构域”是Fv的一半(仅包含三个对抗原特异的CDR),其具有识别和结合抗原的能力,尽管亲和力低于整个结合部位。
“双抗体”指具有两个抗原结合部位的抗体片段,所述片段包含与同一多肽链(VH-VL)中的轻链可变结构域(VL)连接的重链可变结构域(VH)。通过在VH与VL结构域之间用短连接子(约5-10个残基)构建sFv片段(见前一段)来制备小抗体片段,从而实现V结构域的链间配对而非链内配对,产生二价片段,即具有两个抗原结合部位的片段。
双抗体可以是二价的或双特异性的。双特异性双抗体是两个“交叉”sFv片段的异二聚体,其中两种抗体的VH和VL结构域存在于不同的多肽链上。三抗体和四抗体也是本领域公知的。
“分离的抗体”是已经从其预先存在的环境的组分中鉴定并分离和/或回收的抗体。污染组分是会干扰抗体治疗用途的物质,可包括酶、激素和其它蛋白质性质或非蛋白质性质的溶质。
“人抗体”指具有与人产生的抗体的氨基酸序列相对应的氨基酸序列的抗体,和/或使用本文公开的任何制备人抗体的技术制备的抗体。人抗体的这一定义明确排除了包含非人抗原结合残基的人源化抗体。可使用本领域已知的各种技术(包括噬菌体展示文库)产生人抗体。人抗体可通过向转基因动物施用抗原来制备,所述转基因动物已被修饰成响应抗原攻击而产生此类抗体,但是其内源基因座已被失活。
非人(例如啮齿类动物)抗体的“人源化”形式是嵌合抗体,其包含源自非人抗体的最小序列。大多数情况下,人源化抗体是人免疫球蛋白(受体抗体),其中来自受体的高变区的残基被来自非人物种(供体抗体)的高变区的残基取代,所述非人物种是诸如小鼠、大鼠、兔或非人类灵长类动物,其具有所需的抗体特异性、亲和力和能力。在某些情况下,人免疫球蛋白的框架区(FR)残基被相应的非人残基取代。此外,人源化抗体可包含不存在于受体抗体或供体抗体中的残基。进行这些修饰以进一步完善抗体的性能。一般而言,人源化抗体将包含基本上所有的至少一个、通常两个可变结构域,其中所有或基本上所有的高变环对应于非人类免疫球蛋白的高变环,并且所有或基本上所有的FR是人类免疫球蛋白序列的FR。人源化抗体任选还包含免疫球蛋白恒定区(Fc)(通常为人免疫球蛋白的恒定区)的至少一部分。
“单克隆抗体”是指从基本上同质的抗体群中获得的抗体,即,除了可能以少量存在的可能的天然发生的突变外,构成该群体的单个抗体都是相同的。单克隆抗体是高度特异的,是针对抗原上的单一抗原位点或决定簇的。除了它们的特异性之外,单克隆抗体的有利方面在于它们可以在不被其它抗体污染的情况下合成。单克隆抗体可通过杂交瘤方法制备,或者可在细菌、真核动物或植物细胞中使用重组DNA方法制备。“单克隆抗体”也可以从噬菌体抗体库中分离。
本文中的单克隆抗体包括“嵌合”抗体,其中重链和/或轻链的一部分与源自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,而一条或多条链的剩余部分与源自另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体以及此类抗体的片段中的相应序列相同或同源,只要它们表现出所需的生物活性。本文中的目标嵌合抗体包括“灵长类化”抗体,其包含源自非人灵长类动物(例如,旧大陆猴、猿等)的可变结构域抗原结合序列和人恒定区序列。
术语“抗CCR6抗体”或“结合CCR6的抗体”是指这样的抗体,所述抗体能够以足够的亲和力结合CCR6,使得该抗体可用作靶向CCR6的诊断剂和/或治疗剂。优选地,CCR6抗体与无关受体蛋白的结合程度小于抗体与CCR6结合的约10%,如通过例如放射免疫测定法(RIA)所测量的。在某些实施方案中,结合CCR6的抗体具有<1μM、<100nM、<10nM、<1nM或<0.1nM的解离常数(Kd)。
“结合亲和力”通常指分子(例如抗体)的单个结合部位与其结合配偶体(例如抗原)之间的非共价相互作用的总和。通常,“结合亲和力”是指固有的结合亲和力,其反映结合对(例如,抗体和抗原)成员之间的1:1相互作用。分子X对其配偶体Y的亲和力通常可用离解常数(Kd)来表示。亲和力可通过本领域已知的常用方法(包括本文所述的方法)来测量。低亲和力抗体通常与抗原缓慢结合,往往易于解离,而高亲和力抗体通常与抗原较快结合,往往结合时间较长。本领域已知多种测量结合亲和力的方法,其中任一种都可以用于本发明的目的。
如本文中所用,关于抗原结合蛋白或其抗原结合结构域与抗原的相互作用,术语“结合”意指该相互作用依赖于抗原上特定结构(例如,抗原决定簇或表位)的存在。例如,抗体识别并结合特定的蛋白质结构而不是一般的蛋白质。如果抗体与表位“A”结合,则在含有标记的“A”和蛋白质的反应中,含有表位“A”(或游离的、未标记的“A”)的分子的存在将减少与抗体结合的标记的“A”的量。
如本文中所用,术语“特异性结合”或“特异性地结合”被用来意指本发明的抗原结合蛋白与特定抗原或表达该抗原的细胞的反应或缔合比其与替代抗原或细胞的反应或缔合更频繁、更迅速、持续时间更长和/或亲和力更高。例如,抗原结合蛋白与CCR6(例如,hCCR6)的结合亲和力比其与其它CCR的结合亲和力大得多(例如,为1.5倍或2倍或5倍或10倍或20倍或40倍或60倍或80倍至100倍或150倍或200倍)。在本发明的实例中,抗原结合蛋白与CCR6(优选人)特异性结合,其亲和力为其与另一种趋化因子受体(诸如CXCR1、CXCR2、CXCR3或CXCR7)的亲和力的至少1.5倍或2倍或更多倍(例如,5倍或10倍或20倍或50倍或100倍或200倍)。通常,但不是必须的,提及结合意味着特定的结合,并且每个术语应该被理解为对另一个术语提供明确的支持。
如本文中所用,术语“不发生可检测地结合”应理解为意指抗原结合蛋白(例如抗体)结合候选抗原的水平低于背景之上10%、或8%、或6%、或5%。背景可以是在所述蛋白质不存在的情况下和/或在阴性对照蛋白质(例如,同种型对照抗体)存在的情况下检测到的结合信号水平和/或在阴性对照抗原存在的情况下检测到的结合水平。使用其中抗原结合蛋白被固定并与抗原接触的生物传感器分析(例如Biacore)检测结合水平。
如本文中所用,术语“不发生显著地结合”应理解为意指本发明的抗原结合蛋白与多肽的结合水平不会在统计学上显著高于背景水平,例如在抗原结合蛋白不存在的情况下和/或在阴性对照蛋白(例如,同种型对照抗体)存在的情况下检测到的结合信号水平和/或在阴性对照多肽存在的情况下检测到的结合水平。使用其中抗原结合蛋白被固定并与抗原接触的生物传感器分析(例如Biacore)检测结合水平。
“亲和力成熟的”抗体是在其一个或多个HVR中具有一个或多个改变的抗体,与不具有这些改变的亲本抗体相比,所述改变导致抗体对抗原的亲和力提高。优选的亲和力成熟的抗体对靶抗原具有纳摩尔浓度或甚至皮摩尔浓度的亲和力。亲和力成熟的抗体通过本领域已知的方法产生。
“ADCC”是指称为抗体依赖性细胞毒性的过程,其为人中主要由天然杀伤(NK)细胞介导的免疫反应。在ADCC中,NK细胞表面上的FcyRIII识别抗体的Fe区,所述Fe区与展示在靶细胞表面上的抗原结合。这活化了NK细胞,NK细胞释放穿孔素和颗粒酶,导致靶细胞裂解和凋亡。
“CDC”是指称为补体依赖性细胞毒性的复杂过程,其可通过蛋白质级联的作用导致细胞杀伤,所述蛋白质级联可通过两种主要途径中的任一种起作用。
“ADCP”是指称为抗体依赖性细胞介导的吞噬作用的过程。在这种Fe受体介导的过程中,抗体结合的靶细胞被吞噬细胞诸如巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞和树突细胞吞噬。多个Fc受体参与这一过程。
“封闭”抗体或“拮抗性”抗体是抑制或降低其结合的抗原的生物活性的抗体。优选的封闭抗体或拮抗性抗体基本上或完全抑制抗原的生物活性。
如本文中所用,“激动性抗体”是模拟目标多肽的至少一种功能活性的抗体。
如本文中所指,“Fc区”是由通过一个或多个二硫键连接的两条多肽链组成的二聚体,每条链包含部分或全部铰链结构域加上CH2和CH3结构域。每条多肽链被称为“Fc多肽链”。为了区分两条Fe多肽链,一条在本文中称为“A链”,另一条称为“B链”。更具体地,预期用于本发明的Fc区是lgG Fc区,其可以是哺乳动物或人的lgG1、lgG2、lgG3或lgG4 Fc区。在人lgG1 Fc区中,已知至少两种等位基因类型。
本文所指的“含Fc的蛋白质”是包含本文所述的Fc区和结合靶分子的结合区的蛋白质。术语“含Fc的蛋白质”包括含有Fc区的抗体或Fc融合蛋白。
“与CCR6表达相关的疾病或疾患”包括但不限于本文所述的炎性疾患、本文所述的自身免疫疾病、感染、纤维化或癌症,尤其是本文所述的上皮癌,或肺病,诸如慢性阻塞性肺病(COPD)、哮喘和呼吸道合胞病毒(RSV)。本文进一步描述了其它疾病或疾患。
短语“治疗有效量”通常是指(i)治疗特定疾病、疾患或病症,(ii)减弱、改善或消除特定疾病、疾患或病症的一种或多种症状,或(iii)延迟本文所述特定疾病、疾患或病症的一种或多种症状的发作的本发明抗原结合蛋白的量。
词语“治疗(treat)”或“处理(treatment)”是指治疗性治疗,其中目的是减缓(减轻)不希望的生理变化或紊乱。出于本发明的目的,有益的或期望的临床结果包括但不限于症状的减轻、疾病程度的减轻、疾病状态的稳定(即,不恶化)、疾病进展的延迟或减缓、疾病状态的改善或减轻、以及缓解(无论是部分的还是全部的),无论是可检测的还是不可检测的。治疗还可以指与未接受治疗的预期存活相比延长存活。治疗不一定导致疾病或病症的完全清除,但可以减少或最小化并发症和感染的副作用以及疾病或病症的进展。治疗的成功与否尤其可通过对个体的身体检查、细胞病理学、血清DNA或mRNA检测技术来监测。
银屑病的治疗可通过银屑病的任一种或多种临床或生物化学可观察或可测量的特征的严重程度的降低或所述特征的逆转来观察或测量,所述特征包括斑块、过度增生的角质形成细胞、通常通过角质层中核的保留所展示的表皮分化紊乱(角化不全)、颗粒层的缺乏、外皮蛋白(involucrin)表达模式的改变、表皮增厚、红斑、脱屑(scaling)或本文所述的任何其它特征。
词语“预防(prevent)”和“预防(prevention)”通常指用于保护或阻止未患有给定疾病或病症的个体进展成该疾病或病症的预防性或防治性措施。
执业医师可以根据已知的生物化学和临床易感性指标来鉴定有患银屑病风险的个体。
短语“药学上可接受的”表示物质或组合物必须在化学上和/或毒理学上与组成制剂的另外成分和/或用其治疗的哺乳动物相容。
本发明人已经确定了他们已发现与CCR6结合的许多可变结构域克隆的CDR序列。这些CDR序列如下表1所示。
在一个实施方案中,提供了具有表1和表2所示序列的肽。这些肽特别适用于构建抗原结合蛋白、可变结构域、抗体和相关片段。
表1:VH CDR序列
表2:VLCDR序列
本发明人已经确定了他们已发现与CCR6结合的许多可变结构域克隆的FR序列。这些FR序列如下表3和表4所示。其它已知的FR序列可以与上述CDR一起使用,以形成用于与CCR6结合的抗原结合蛋白。
表3:VH框架区
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表4:VL框架区
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在某些实施方案中,提供了具有下表5或表6所示序列的抗原结合蛋白:
表5:VH结构域
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表6:VL结构域
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表7:hIgG1、3SFc和3MFc的Fc区
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表8:编码本发明的一个或多个氨基酸序列的核酸序列
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在某些实施方案中,抗原结合蛋白结合CCR6的表位,其中该表位包括CCR6的氨基酸1至28。优选地,CCR6是人CCR6。通常,该表位包括SEQ ID NO:1的1至28的氨基酸序列。
蛋白质突变
本发明还提供了与本文公开的序列具有至少80%同一性的抗原结合蛋白或编码该蛋白的核酸。在一个实例中,本发明的抗原结合蛋白或核酸包含与本文公开的序列至少约85%或90%或95%或97%或98%或99%相同的序列。
备选地或另外地,抗原结合蛋白包含与本文根据任何实例描述的VH或VL的一个或多个CDR至少约80%或85%或90%或95%或97%或98%或99%相同的CDR(例如,三个CDR)。
在另一个实例中,本发明的核酸包含与编码抗原结合蛋白的序列至少约80%或85%或90%或95%或97%或98%或99%相同的序列,所述抗原结合蛋白具有根据任何实例所述的功能。本发明还涵盖了编码本发明抗原结合蛋白的核酸,由于遗传密码的简并性,所述核酸不同于本文举例说明的序列。
核酸或多肽的同一性百分比通过GAP(Needleman和Wunsch Mol.Biol.48,443-453,1970)分析(GCG程序)(其中缺口产生罚分=5,缺口延伸罚分=0.3)来确定。查询序列的长度至少为50个残基,GAP分析在至少50个残基的区域内比对两个序列。例如,查询序列的长度至少为100个残基,GAP分析在至少100个残基的区域内比对两个序列。例如,将两个序列在其整个长度上进行比对。
本发明还设想了在严格杂交条件下与编码本文所述的抗原结合蛋白的核酸杂交的核酸。“中等严格性”在本文中定义为在45℃至65℃范围内的温度下在2×SSC缓冲液、0.1%(w/v)SDS中或在等同条件中进行的杂交和/或洗涤。“高严格性”在本文中定义为在至少65℃的温度下在0.1×SSC缓冲液、0.1%(w/v)SDS或更低的盐浓度下,或在等同条件下进行的杂交和/或洗涤。本文提及特定的严格性水平涵盖使用除本领域技术人员已知的SSC外的洗涤/杂交溶液的等同条件。例如,计算双链核酸链解离时的温度(也称为解链温度或Tm)的方法是本领域已知的。与核酸的Tm相似(例如,相差在5℃或10℃内)或等同的温度被认为是高严格性的。中等严格性被认为是在核酸的计算Tm的10℃至20℃或10℃至15℃之内。
本发明还设想了本发明的抗原结合蛋白的突变体形式,其与本文所述序列相比包含一个或多个保守氨基酸取代。在一些实例中,抗原结合蛋白包含10个或更少,例如9个或8个或7个或6个或5个或4个或3个或2个或1个保守氨基酸取代。“保守氨基酸取代”是其中氨基酸残基被具有相似侧链和/或亲水性(hydropathicity)和/或亲水性(hydrophilicity)的氨基酸残基替代。
本领域已经定义了具有相似侧链的氨基酸残基家族,包括碱性侧链(例如,赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(例如,天冬氨酸、谷氨酸)、不带电荷的极性侧链(例如,甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极性侧链(例如,丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β-支链侧链(例如,苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香族侧链(例如,酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。亲水指数描述于例如Kyte和Doolittle J.Mol.Biol.,157:105-132,1982中,亲水指数描述于例如US4554101中。
本发明还设想了非保守氨基酸变化。例如,特别感兴趣的是用另一种带电荷的氨基酸和中性或带正电荷的氨基酸取代带电荷的氨基酸。在一些实例中,抗原结合蛋白包含10个或更少,例如9个或8个或7个或6个或5个或4个或3个或2个或1个非保守氨基酸取代。
在一个实例中,一个或多个突变发生在本发明抗原结合蛋白的抗原结合结构域的FR内。在另一个例子中,所述一个或多个突变发生在本发明的抗原结合蛋白的CDR内。
产生抗原结合蛋白突变形式的示例性方法包括:
·DNA的诱变(Thie等人,Methods Mol.Biol.525:309-322,2009)或RNA(Kopsidas等人,Immunol.Lett.107:163-168,2006;Kopsidas等人BMC Biotechnology,7:18,2007;和WO1999/058661);
·将编码多肽的核酸导入突变细胞,例如XL-1Red、XL-mutS和XL-mutS-Kanr细菌细胞(Stratagene);
·DNA改组,例如如Stemmer,Nature 370:389-91,1994中所公开的;和
·定点诱变,例如如在Dieffenbach(编辑)和Dveksler(编辑)(在:PCR Primer:ALaboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratories,NY,1995中)中描述的。
用于确定本发明突变抗原结合蛋白的生物活性的示例性方法对技术人员来说是显而易见的和/或描述于本文中,例如抗原结合。例如,本文描述了用于确定抗原结合、结合的竞争性抑制、亲和力、缔合、解离和治疗功效的方法。
如本文中所用,在下表中定义了氨基酸的性质:
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恒定区
本发明涵盖本文所述的包含抗体恒定区的抗原结合蛋白和/或抗体。这包括与Fc融合的抗体的抗原结合片段。
可用于生产本发明的蛋白质的恒定区序列可获自许多不同来源。在一些实例中,蛋白质的恒定区或其部分源自人抗体。恒定区或其部分可源自任何抗体类别,包括IgM、IgG、IgD、IgA和IgE,以及任何抗体同种型,包括IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。在一个实例中,恒定区是人同种型IgG4或稳定化的IgG4恒定区。
在一个实例中,例如,与天然或野生型人IgG1或IgG3 Fc区相比,恒定区的Fc区具有降低的诱导效应子功能的能力。在一个实例中,效应子功能是抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)和/或抗体依赖性细胞介导的吞噬作用(ADCP)和/或补体依赖性细胞毒性(CDC)。评估含Fc区的蛋白质的效应子功能水平的方法是本领域已知的和/或描述于本文中。
在一个实例中,Fc区是IgG4 Fc区(即,来自IgG4恒定区),例如人IgG4 Fc区。合适的IgG4 Fc区的序列对技术人员来说是显而易见的和/或可从公开可得的数据库中获得(例如,可从国家生物技术信息中心获得)。
在一个实例中,恒定区是稳定化的IgG4恒定区。术语“稳定化的IgG4恒定区”将被理解为意指已被修饰以减少Fab臂交换或经历Fab臂交换或半抗体形成的倾向或形成半抗体的倾向的IgG4恒定区。“Fab臂交换”是指一种类型的针对人IgG4的蛋白质修饰,其中IgG4重链和附接的轻链(半分子)被交换为来自另一IgG4分子的重-轻链对。因此,IgG4分子可获得识别两种不同抗原的两种不同Fab臂(产生双特异性分子)。Fab臂交换在体内天然发生,并且可以通过纯化的血细胞或还原剂诸如还原型谷胱甘肽在体外诱导。当IgG4抗体解离形成两个分子,每个分子包含一条重链和一条轻链时,就形成了“半抗体”。
在一个实例中,根据Kabat的系统(Kabat等人,Sequences of Proteins ofImmunological Interest Washington DC United States Department of Health andHuman Services,1987年和/或1991年),稳定化的IgG4恒定区包含铰链区的位置241处的脯氨酸。根据EU编号系统(Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological InterestWashington DC United States Department of Health and Human Services,2001和Edelman等人,Proc.,Natl.Acad.USA,63,78-85,1969),该位置对应于铰链区的位置228。在人IgG4中,该残基通常是丝氨酸。在丝氨酸取代脯氨酸后,IgG4铰链区包含序列CPPC。在这点上,技术人员将意识到“铰链区”是连接Fc区和Fab区的抗体重链恒定区的富含脯氨酸的部分,其赋予抗体的两个Fab臂流动性。铰链区包括参与重链间二硫键的半胱氨酸残基。根据Kabat的编号系统,其通常被定义为从人IgG1的Glu226延伸到Pro243。通过将形成重链间二硫键(S-S)的第一个和最后一个半胱氨酸残基放置在相同的位置,可以将其它IgG同种型的铰链区与IgG1序列进行比对(参见例如WO2010/080538)。
稳定化的IgG4抗体的其它实例是其中人IgG4重链恒定区中位置409(根据EU编号系统)处的精氨酸被赖氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸或亮氨酸取代的抗体(例如,如WO2006/033386中所述)。恒定区的Fc区在对应于405(根据EU编号系统)的位置处可以另外或可选择地包含选自由以下组成的组的残基:丙氨酸、缬氨酸、甘氨酸、异亮氨酸和亮氨酸。任选地,铰链区包含位置241处的脯氨酸(即,CPPC序列)(如上所述)。
在另一个实例中,Fc区是经修饰以具有降低的效应子功能的区域,即“非免疫刺激性Fc区”。例如,Fc区是在选自由268、309、330和331组成的组的一个或多个位置处包含取代的IgG1 Fc区。在另一个实例中,Fc区是IgG1 Fc区,其包含一种或多种以下变化:E233P、L234V、L235A和G236的缺失和/或一种或多种以下变化:A327G、A330S和P331S(Armour等人,Eur J Immunol.29:2613-2624,1999;Shields等人,J Biol Chem.276(9):6591-604,2001)。非免疫刺激性Fc区的其它实例描述于例如Dall'Acqua等人,J Immunol.177:1129-11382006;和/或Hezareh J Virol;75:12161-12168,2001)。
在另一个实例中,Fc区是嵌合Fc区,例如,包含至少一个来自IgG4抗体的CH2结构域和至少一个来自IgG1抗体的CH3结构域,其中Fc区在选自由240、262、264、266、297、299、307、309、323、399、409和427(EU编号)组成的组的一个或多个氨基酸位置处包含取代(例如,如WO2010/085682中所描述的)。示例性取代包括240F、262L、264T、266F、297Q、299A、299K、307P、309K、309M、309P、323F、399S和427F。
如本文中所用,等效于例如SEQ ID NO:60中的位置234、235或331的位置处的氨基酸残基可以通过本领域技术人员已知的任何方法来确定。例如,一个或多个序列与SEQ IDNO:60的氨基酸序列的比对将允许本领域技术人员确定与SEQ ID NO:60中的位置234、235或331等效的位置处的氨基酸。本领域技术人员可将蛋白质的三维结构与具有SEQ ID NO:60的氨基酸序列的蛋白质的三维结构进行比较,并确定位于与SEQ ID NO:60中的位置234、235或331等效的位置处的氨基酸残基。
含抗体结合结构域的蛋白质
在另一个实施方案中,提供了如上所述的抗原结合蛋白,其中形成FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4中的一者或多者的氨基酸序列源自人序列或呈人序列的形式。
所述抗原结合蛋白可以以包含非人(例如,鼠)和人免疫球蛋白序列的人源化形式存在。典型地,抗原结合蛋白中除了CDR序列之外,其余序列都来自非人物种诸如小鼠、大鼠或兔。在某些情况下,抗原结合蛋白的框架残基也可以是非人的。当抗原结合蛋白以完全抗体的形式提供时,通常免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分是人的,从而允许各种人效应子功能。
用于将非人抗原结合蛋白人源化的方法是本领域公知的,合适方法的实例包括Jones等人,(1986)Nature,321:522;Riechmann等人,(1988)Nature,332:323;Verhoeyen等人,(1988)Science,239:1534中的那些方法。
本文描述的使用衍生自人免疫球蛋白序列的抗体文库的噬菌体展示方法可用于产生人抗原结合蛋白和人抗体。
此外,可使用不能表达功能性内源性免疫球蛋白但能表达人免疫球蛋白基因的转基因哺乳动物。这些小鼠可通过将人重链和轻链免疫球蛋白基因随机或靶向插入胚胎干细胞而产生。可通过插入或一些其它重组事件,例如通过宿主JH区的纯合缺失而使得宿主重链和轻链免疫球蛋白基因无功能。将转染的胚胎干细胞扩增并显微注射到囊胚中,以产生嵌合小鼠,然后培育嵌合小鼠以产生表达人抗原结合蛋白的纯合后代。用CCR6表位免疫后,可以获得人单克隆抗体。转基因动物体系的一个益处是有可能产生治疗上有用的同种型,因为人免疫球蛋白转基因在B细胞分化期间重排,随后在转基因小鼠中经历类别转换和体细胞突变。
通过替换表面暴露的残基以便使抗体对于免疫系统表现得如同自身的一样,可以使包含本发明的CDR和FR的可变结构域的免疫原性更低。Padlan,E.A.,1991,MoI.Immunol.28,489提供了示例性方法。通常,亲和力得以保持,因为抗原结合蛋白附近的氨基酸残基的内部堆积保持不变,并且通常影响结合特征的CDR残基或相邻残基在这些过程中不会被取代。
在另一个实施方案中,提供了本文所述的抗CCR6抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体,优选地它们具有表1至6中任一中所示的序列。
与完全抗体相比,较低分子量的抗体片段对实体瘤的接近可能已得到改善并被更快速地清除,这在治疗和体内诊断应用方面可以特别有用。
在某些实施方案中,抗原结合蛋白以单链Fv片段(scFv)的形式提供。Fv和scFv适合于在体内使用期间减少非特异性结合,因为它们具有完整的组合部位,没有恒定区。可以构建包含scFv的融合蛋白,以在scFv的氨基或羧基末端产生效应蛋白的融合。
在另一个实施方案中,提供了包含上述抗原结合蛋白的双抗体或三抗体或其它多特异性抗体。多特异性抗体可使用允许多聚化的多肽结构域来组装。实例包括Fc的CH2和CH3区域以及CH1和Cκ/λ区域。可使用其它天然存在的蛋白质多聚化结构域,包括亮氨酸拉链结构域(bZIP)、螺旋-环-螺旋基序、Src同源结构域(SH2、SH3)、EF手、磷酸酪氨酸结合(PTB)结构域或本领域已知的其它结构域。
在另一个实施方案中,提供了融合结构域或异源蛋白,包括本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体。
异源多肽可以与本发明的抗原结合蛋白或含有该蛋白的分子的N-末端或C-末端重组融合或与其化学缀合。
与抗体或抗原结合蛋白融合的异源多肽可用于靶向表达CCR6的细胞,或用于一些其它功能,诸如纯化,或增加多肽的体内半衰期,或用于使用本领域已知方法的免疫测定。
在优选实施方案中,标记氨基酸序列诸如六组氨酸肽可用于融合蛋白的方便纯化。其它包括但不限于“HA”标签(其对应于源自流感血凝素蛋白的表位)和“flag”标签。
另外,本发明的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体可以通过糖基化、乙酰化、聚乙二醇化、磷酸化、酰胺化、已知的保护/封闭基团的衍生化、蛋白水解切割、与细胞配体或其它蛋白质的键联等进行修饰。
本发明的抗原结合蛋白可由通过肽键或经修饰的肽键(即肽电子等排体(peptideisosteres))彼此连接的氨基酸组成,并且可包含除了20个基因编码的氨基酸外的氨基酸。本发明的抗原结合蛋白可通过天然过程,诸如翻译后加工,或通过本领域公知的化学修饰技术进行修饰。此类修饰在基础教科书以及研究文献中有很好的描述。修饰可以发生在抗原结合蛋白的任何地方,包括肽主链、氨基酸侧链和氨基或羧基末端,或者发生在诸如碳水化合物的部分上。应当理解,相同类型的修饰可以以相同或不同的程度存在于给定抗原结合蛋白的几个蛋白中。此外,给定的抗原结合蛋白可以包含许多类型的修饰。抗原结合蛋白可以是分支的,例如,作为遍在化的结果,并且它们可以是环状的,有或没有分支。环状、分支和分支环状抗原结合蛋白可以由翻译后天然过程产生,或者可以通过合成方法制备。修饰包括乙酰化、酰化、ADP-核糖基化、酰胺化、黄素的共价连接、血红素部分的共价连接、核苷酸或核苷酸衍生物的共价连接、脂质或脂质衍生物的共价连接、磷脂酰肌醇的共价附接、交联、环化、二硫键形成、脱甲基化、共价交联的形成、半胱氨酸的形成、焦谷氨酸的形成、甲酰化、γ-羧基化、糖基化、GPI锚形成、羟基化、碘化、甲基化、肉豆蔻酰化、氧化、聚乙二醇化、蛋白质水解加工、磷酸化、异戊二烯化、外消旋化、硒酰化、硫酸化、转移RNA介导的向蛋白质添加氨基酸,诸如精氨酰化和遍在蛋白化。
在另一个实施方案中,提供了呈与细胞毒性剂诸如化学治疗剂、药物、生长抑制剂、毒素(例如,细菌、真菌、植物或动物来源的酶促活性毒素或其片段)或标记物诸如放射性同位素(即,放射性缀合物)缀合的如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、Fab、dab、scFv、双抗体、三抗体或融合蛋白的形式的缀合物。另一方面,本发明还提供了使用免疫缀合物的方法。一方面,免疫缀合物包含与细胞毒性剂或可检测剂共价附接的任何上述可变结构域。
在另一个实施方案中,提供了用于结合如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物的抗体。
在另一个实施方案中,提供了编码如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物的核酸。
编码根据上述通式中任一个的CDR或FR、或由其组成的抗原结合蛋白的多核苷酸,可以由任何来源的核酸产生,例如通过化学合成或从cDNA或基因组文库中分离来产生。例如,可从产生抗体的细胞诸如B细胞、浆细胞或杂交瘤细胞中产生cDNA文库,并通过使用针对特定的目的克隆的寡核苷酸进行PCR扩增来分离相关核酸。然后可使用本领域已知的任何方法将分离的核酸克隆到载体中。然后可使用本领域已知的方法诱变相关核苷酸序列以产生具有不同氨基酸序列的抗原结合蛋白,例如以产生氨基酸取代、缺失和/或插入,所述方法是例如重组DNA技术、定点诱变、PCR等(参见,例如,Sambrook等人,1990,MolecularCloning,A Laboratory Manual,第2版,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold SpringHarbor,N.Y.和Ausubel等人,编辑,1998,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons,NY中描述的技术)。
蛋白质的生产
在另一个实施方案中,提供了用于生产如上所述的抗CCR6抗原结合蛋白的方法,其包括在如上所述的细胞或非人类动物中表达如上所述的核酸。
本发明抗原结合蛋白的产生通常需要含有编码本发明的抗原结合蛋白的多核苷酸的表达载体。可以获得编码本发明的抗原结合蛋白的多核苷酸,并将其亚克隆到载体中,用于通过重组DNA技术,使用本领域公知的技术(包括本文所述的技术)生产抗原结合蛋白。设想了许多不同的表达系统,包括使用哺乳动物细胞(包括人类细胞)来生产和分泌抗原结合蛋白。细胞的实例包括293F、CHO和NSO细胞系。
可使用本领域已知的方法构建含有蛋白质编码序列以及适当的转录和翻译控制信号的表达载体。这些技术包括体外重组DNA技术、合成技术和体内基因重组。在某些实施方案中,提供了可复制载体,其具有与启动子可操作地连接的编码抗原结合蛋白的核酸。
可通过常规技术培养用表达载体转染的细胞以产生抗原结合蛋白。因此,在某些实施方案中,提供了宿主细胞或细胞转染子,其含有与启动子可操作地连接的编码本发明的抗原结合蛋白的多核苷酸。启动子可以是异源的。可以利用多种宿主表达载体系统,在某些系统中,载体系统的转录机制与宿主细胞特别匹配。例如,哺乳动物细胞诸如中国仓鼠卵巢细胞(CHO)可以用包含来自人巨细胞病毒的主要立即早期基因启动子元件的载体转染。另外或可选地,可以使用调节插入序列的表达或根据需要修饰和加工(包括各种形式的翻译后修饰)基因产物的宿主细胞。具有特定翻译后修饰过程的哺乳动物宿主细胞的实例包括CHO、VERY、BHK、HeIa、COS、MDCK、293、3T3、W138、BT483、Hs578T、HTB2、BT2O和T47D、NSO、CRL7O3O和HsS78Bst细胞。
根据用于蛋白质分子的期望用途,可以有利地选择许多细菌表达载体。在一个实例中,当要产生大量抗原结合蛋白时,可以使用导致高水平表达易于纯化的融合蛋白产物的载体,诸如大肠杆菌表达载体pUR278。表达产物可以以与lacZ的融合蛋白的形式产生。其它细菌载体包括pIN载体等。pGEX载体也可用于表达作为与谷胱甘肽-S-转移酶(GST)的融合蛋白的外源多肽。这些融合蛋白通常是可溶的,并且可以通过吸附和结合谷胱甘肽-琼脂糖亲和基质,然后在游离谷胱甘肽存在下洗脱而容易地从裂解的细胞中纯化。可以在表达的多肽中提供凝血酶和/或因子Xa蛋白酶切割位点,以便克隆的靶基因产物可以从GST部分释放。
苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(AcNPV)可用作载体,以在包括草地贪夜蛾细胞的昆虫体系中表达外源基因。所用的特定启动子可以取决于蛋白质编码插入序列的位置。例如,可将该序列单独克隆到多角体蛋白基因中,并置于多角体蛋白启动子的控制之下。
基于病毒的表达系统可用于诸如腺病毒等哺乳动物细胞,由此可将目的编码序列与腺病毒晚期启动子和三联前导序列连接。然后可使用体外或体内重组将该嵌合基因插入腺病毒基因组。向区域E1或E3中的插入将产生能够在受感染的宿主细胞中表达抗原结合蛋白的有活力的重组病毒。插入的抗原结合蛋白编码序列的高效翻译可能需要特定的起始信号,包括ATG起始密码子和邻近序列。起始和翻译控制信号和密码子可获自多种来源,包括天然的和合成的来源。转录增强子元件和转录终止子可用于增强基于病毒的系统的表达效率。
当需要重组蛋白的长期高产率生产时,稳定表达是优选的。通常使用选择标记基因,由此在转染后,将细胞在富集培养基中生长1-2天,然后转移到含有选择培养基的培养基中,在所述选择培养基中可以筛选出含有相应选择标记例如抗生素抗性的细胞。结果是,已将质粒稳定整合到其染色体中的细胞生长并形成灶,所述灶又可被克隆并扩增成细胞系。单纯疱疹病毒胸苷激酶、次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶和腺嘌呤磷酸核糖基转移酶基因分别是可用于tk-、hgprt-或aprT-细胞,从而提供了合适的选择系统的基因实例。以下基因是可用于抗代谢物选择系统的基因实例:dhfr,其赋予对甲氨蝶呤的抗性;gpt,其赋予对麦考酚酸的抗性;neo,其赋予对氨基糖苷G-418的抗性;和hygro,其赋予对潮霉素抗性。
可通过重组表达系统,利用已知的方法(包括离子交换色谱、亲和色谱(特别是对特异性抗原蛋白A或蛋白G的亲和力)和凝胶过滤柱色谱、离心、差别溶解法)或利用任何其它用于蛋白质纯化的标准技术纯化本发明的抗原结合蛋白。通过提供呈融合蛋白形式的抗原结合蛋白可以促进或帮助纯化。
本发明的大量抗原结合蛋白可以通过在研究实验室中以中试表达系统开始的可扩展方法来生产,所述中试表达系统被放大至分析规模的生物反应器(通常5L至约50L的生物反应器)或生产规模的生物反应器(例如,但不限于75L、100L、150L、300L或500L)。理想的可扩展方法包括其中存在低至不可检测水平(如通过HPSEC或rCGE所测量的)的聚集,通常不超过5%(按蛋白质的重量计)的聚集,低至不超过0.5%(按蛋白质的重量计)的聚集的那些方法。另外或可选地,在可扩展方法中,可能需要根据代表完整抗原结合蛋白的总峰面积测量的不可检测的片段化水平,使得总峰面积的至少80%和多达99.5%或更高代表完整抗原结合蛋白。在其它实施方案中,本发明的可扩展方法以约10mg/L至约300mg/L或更高的生产效率生产抗原结合蛋白。
各种技术已被开发来生产抗体片段,包括完整抗体的蛋白水解消化和在宿主细胞中的重组表达。关于后者,如下所述,Fab、Fv和scFv抗体片段都可以在大肠杆菌中表达并从其中分泌,抗体片段可分离自抗体噬菌体文库,可以直接从大肠杆菌中回收Fab’-SH片段并将其化学偶联以形成F(ab’)2片段。在另一种方法中,直接从重组宿主细胞培养物中分离F(ab’)2片段。
在另一个实施方案中,提供了包含上述核酸的载体。例如,载体可呈质粒、粘粒、病毒颗粒或噬菌体形式。可通过多种方法将合适的核酸序列插入载体。通常,使用本领域已知的技术将DNA插入合适的一个或多个限制性内切酶位点。载体组成部分通常包括但不限于信号序列、复制起点、一个或多个标记基因、增强子元件、启动子和转录终止序列中的一者或多者。含有这些组件中的一者或多者的合适载体的构建采用技术人员已知的标准连接技术。
抗原结合位点不仅可以直接重组产生,还可以作为与异源多肽的融合多肽产生,所述异源多肽可以是信号序列或在成熟蛋白质或多肽的N-末端处具有特异性切割位点的其它多肽。通常,信号序列可以是载体的组成部分,或者可以是插入载体的编码抗原结合位点的DNA的一部分。信号序列可以是例如选自碱性磷酸酶、青霉素酶、lpp或热稳定性肠毒素II前导序列的组的原核信号序列。对于酵母分泌,信号序列可以是例如酵母转化酶前导序列、α因子前导序列或酸性磷酸酶前导序列或白色念珠菌(C.albicans)葡糖淀粉酶前导序列。在哺乳动物细胞表达中,哺乳动物信号序列可用于指导蛋白质的分泌,诸如来自相同或相关物种的分泌多肽的信号序列,以及病毒分泌前导序列。
编码本发明的抗原结合蛋白的多肽组分的多核苷酸序列可使用上述标准重组技术获得。可使用核苷酸合成仪或PCR技术合成多核苷酸。一旦获得,就可将编码多肽的序列插入到能够在原核宿主中复制和表达异源多核苷酸的重组载体中。本领域可获得和已知的许多载体可用于本发明的目的。合适载体的选择将主要取决于要插入载体的核酸的大小和要用载体转化的特定宿主细胞。每种载体含有多种组成部分,这取决于其功能(异源多核苷酸的扩增或表达,或两者)及其与其所在的特定宿主细胞的相容性。
通常,将含有复制子和控制序列的质粒载体与这些宿主结合使用,所述复制子和控制序列源自与宿主细胞相容的物种。表达和克隆载体都含有能使载体在一种或多种选择的宿主细胞中复制的核酸序列,以及能在转化细胞中提供表型选择的标记序列。对于多种细菌、酵母和病毒,这样的序列是公知的。质粒pBR322的复制起点适用于大多数革兰阴性菌,2μm质粒起点适用于酵母,各种病毒起点(SV40病毒、多瘤病毒、腺病毒、VSV或BPV)可用于在哺乳动物细胞中克隆载体,质粒pBR322含有编码氨苄青霉素(Amp)和四环素(Tet)抗性的基因,因此提供了鉴定转化细胞的简便方法。pBR322、其衍生物或其它微生物质粒或噬菌体也可含有或经修饰含有可被微生物用于表达内源蛋白质的启动子。
另外,含有与宿主微生物相容的复制子和控制序列的噬菌体载体可用作与这些宿主结合的转化载体。例如,噬菌体诸如λGEM.TM.-11可用于制备重组载体,该载体可用于转化易感宿主细胞诸如大肠杆菌LE392(E.coli LE392)。
本发明的表达载体可以包含两个或更多个启动子-顺反子(顺反子是包含产生单个多肽的所有信息的DNA区段)对。启动子是位于调节其表达的顺反子上游(5’)的非翻译调节序列。原核启动子通常分为两类:诱导型和组成型。诱导型启动子是响应培养条件的变化(例如营养物的存在或不存在或温度的变化),启动在其控制下的顺反子的转录水平升高的启动子。
许多被多种潜在的宿主细胞识别的启动子是公知的。通过限制性酶消化从源DNA中除去启动子,并将分离的启动子序列插入本发明的载体中,可以将选择的启动子与编码轻链或重链的顺反子DNA可操作地连接。天然启动子序列和许多异源启动子都可用于指导靶基因的扩增和/或表达。在一些实施方案中,使用异源启动子,因为与天然靶多肽启动子相比,它们通常允许更大的转录和更高的表达的靶基因产量。
被多种潜在宿主细胞识别的启动子是公知的。适用于原核宿主的启动子包括PhoA启动子、β-半乳糖苷酶和乳糖启动子系统、碱性磷酸酶、色氨酸(trp)启动子系统和杂合启动子诸如tac或trc启动子。用于细菌系统中的启动子也将包含Shine-Dalgarno(S.D.)序列,该序列与编码本发明抗原结合蛋白的DNA可操作地连接。然而,在细菌中有功能的其它启动子(诸如其它已知的细菌或噬菌体启动子)也是合适的。它们的核苷酸序列已经公布,从而使得技术人员能够使用连接子或衔接子将它们与编码靶轻链和重链的顺反子可操作地连接,以提供任何所需的限制性位点。
在本发明的一个方面,重组载体中的每个顺反子包含指导表达的多肽跨膜转运的分泌信号序列组分。通常,信号序列可以是载体的组成部分,或者可以是插入到载体中的靶多肽DNA的一部分。为了本发明的目的而选择的信号序列应该是被宿主细胞识别和加工(即被信号肽酶切割)的序列。对于不识别和加工异源多肽的天然信号序列的原核宿主细胞,信号序列被选自例如由以下组成的组的原核信号序列取代:碱性磷酸酶、青霉素酶、Ipp或热稳定性肠毒素II(STII)前导序列、LamB、PhoE、PeIB、OmpA和MBP。在本发明的一个实施方案中,表达系统的两个顺反子中使用的信号序列是STII信号序列或其变体。
在另一方面,根据本发明的免疫球蛋白的产生可以发生在宿主细胞的细胞质中,因此不需要在每个顺反子中存在分泌信号序列。在这方面,免疫球蛋白轻链和重链被表达、折叠和装配,在细胞质内形成功能性免疫球蛋白。某些宿主菌株(例如大肠杆菌trxB菌株)提供了有利于二硫键形成,从而允许表达的蛋白质亚单位正确折叠和装配的细胞质条件。
本发明提供了表达系统,在所述表达系统中可以调节表达的多肽组分的定量比例,以最大化分泌并正确装配的本发明抗原结合蛋白的产量。这种调节至少部分通过同时调节多肽组分的翻译强度来实现。
就在真核宿主细胞中的表达而言,载体组成部分通常包括但不限于以下的一种或多种:信号序列、复制起点、一种或多种标记基因、增强子元件、启动子和转录终止序列。
用于真核宿主细胞的载体也可包含信号序列或其它多肽,所述其它多肽在目的成熟蛋白质或多肽的N-末端具有特异性切割位点。所选择的异源信号序列优选是被宿主细胞识别并加工(即被信号肽酶切割)的序列。在哺乳动物细胞表达中,哺乳动物信号序列以及病毒分泌前导序列,例如单纯疱疹病毒gD信号是可用的。
将这种前体区域的DNA在读框内与编码抗体的DNA连接。
通常,哺乳动物表达载体不需要复制起点组件。例如,通常可使用SV40来源仅仅是因为其含有早期启动子。
表达和克隆载体通常含有选择基因,也称为选择标记。典型的选择基因编码蛋白质,所述蛋白质(a)赋予对抗生素或其它毒素(例如氨苄青霉素、新霉素、甲氨蝶呤或四环素)的抗性,(b)补充营养缺陷型缺陷,或(c)提供不能从复杂培养基中获得的关键营养,例如编码杆菌(Bacilli)的D-丙氨酸消旋酶的基因。
选择方案的一个实例利用药物来阻止宿主细胞的生长。用异源基因成功转化的那些细胞产生赋予药物抗性的蛋白质,并因此在选择方案中存活。这种显性选择的实例使用药物新霉素、霉酚酸和潮霉素。
用于哺乳动物细胞的合适的选择标记的实例是那些使得能够鉴定有能力摄取抗原结合蛋白编码核酸的细胞的选择标记,诸如DHFR或胸苷激酶、金属硫蛋白-I和-II,优选灵长类动物金属硫蛋白基因、腺苷脱氨酶、鸟氨酸脱羧酶等。当使用野生型DHFR时,合适的宿主细胞是DHFR活性有缺陷的CHO细胞系(例如,ATCC CRL-9096),制备和繁殖所述宿主细胞。例如,首先通过在含有甲氨蝶呤(Mtx)(一种DHFR的竞争性拮抗剂)的培养基中培养所有转化体来鉴定用DHFR选择基因转化的细胞。或者,用编码抗体、野生型DHFR蛋白和另一种选择标记诸如氨基糖苷3’-磷酸转移酶(APH)的DNA序列转化或共转化的宿主细胞(特别是含有内源性DHFR的野生型宿主)可以通过在含有选择标记的选择剂(诸如氨基糖苷类抗生素,例如卡那霉素、新霉素或G418)的培养基中细胞生长来选择。
表达和克隆载体通常含有与抗原结合蛋白编码核酸序列可操作地连接的启动子,以指导mRNA合成。被多种潜在宿主细胞识别的启动子是公知的。
真核基因通常具有富含AT的区域,其位于转录起始位点上游大约25-30个碱基处。在许多基因转录起点上游70-80个碱基处发现的另一个序列是CNCAAT区,其中N可以是任意核苷酸。在大多数真核基因的3’末端是AATAAA序列,其可以是用于在编码序列的3’末端添加poly A尾的信号。所有这些序列都被适当地插入到真核表达载体中。
用于酵母宿主的合适启动子序列的实例包括3-磷酸甘油酸激酶或其它糖酵解酶(包括烯醇酶、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、己糖激酶、丙酮酸脱羧酶、磷酸果糖激酶、葡萄糖-6-磷酸异构酶、3-磷酸甘油酸变位酶、丙酮酸激酶、丙糖磷酸异构酶、磷酸葡糖异构酶和葡糖激酶)的启动子。
其它酵母启动子(其具有由生长条件控制转录的额外有利方面的诱导型启动子)是乙醇脱氢酶2、异细胞色素C、酸性磷酸酶、与氮代谢相关的降解酶、金属硫蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶和负责麦芽糖和半乳糖利用的酶的启动子区域。
抗原结合蛋白在哺乳动物宿主细胞中从载体的转录受到例如启动子的控制,所述启子获自病毒诸如多瘤病毒、禽痘病毒、腺病毒(诸如腺病毒2)、牛乳头瘤病毒、禽肉瘤病毒、巨细胞病毒、逆转录病毒、乙型肝炎病毒和猿猴病毒40(SV40)的基因组,获自异源哺乳动物启动子,例如肌动蛋白启动子或免疫球蛋白启动子,以及获自热休克启动子,条件是此类启动子与宿主细胞系统相容。
通过在载体中插入增强子序列,可以增加高等真核生物对编码抗原结合蛋白的DNA的转录。增强子序列包括那些已知来自哺乳动物基因(球蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、甲胎蛋白和胰岛素)的增强子序列。然而,典型地,人们将使用来自真核细胞病毒的增强子。实例包括复制起点(bp 100-270)晚期侧上的SV40增强子、巨细胞病毒早期启动子增强子、复制起点晚期侧上的多瘤增强子和腺病毒增强子。
用于真核宿主细胞(酵母、真菌、昆虫、植物、动物、人或来自其它多细胞生物的有核细胞)的表达载体也将包含终止转录和稳定mRNA所必需的序列。此类序列通常可从真核或病毒DNA或cDNA的5’和偶尔3’非翻译区获得。这些区域包含在编码抗原结合蛋白的mRNA的非翻译部分转录为多聚腺苷酸化片段的核苷酸区段。
在另一个实施方案中,提供了包含上述载体或核酸的细胞。核酸分子或载体可以作为基因组外的独立分子,优选作为能够复制的分子存在于经遗传修饰的宿主细胞或宿主中,或者其可被稳定地整合到宿主细胞或宿主的基因组中。
本发明的宿主细胞可以是任何原核或真核细胞。
原核细胞的实例是那些通常用于克隆的细胞,如大肠杆菌或枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。此外,真核细胞包括例如真菌或动物细胞。
合适的真菌细胞的实例是酵母细胞,优选酵母属的酵母细胞,最优选酿酒酵母种的酵母细胞。
动物细胞的实例是例如昆虫细胞、脊椎动物细胞,优选为哺乳动物细胞,例如HEK293、NSO、CHO、MDCK、U2-OS、Hela、NIH3T3、MOLT-4、Jurkat、PC-12、PC-3、IMR、NT2N、Sk-n-sh、CaSki、C33A。这些宿主细胞,例如CHO细胞,可以为本发明的抗体分子提供翻译后修饰,包括前导肽的去除、H(重)链和L(轻)链的折叠和装配、分子在正确侧的糖基化以及功能分子的分泌。
本领域已知的其它合适的细胞系可从细胞系保藏中心如美国典型培养物保藏中心(ATCC)获得。
在另一个实施方案中,提供了包含上述细胞的动物。在某些实施方案中,含有转基因的动物及其组织可用于生产本发明的抗原结合蛋白。将核酸分子作为转基因引入非人宿主以及其随后的表达可用于生产抗原结合蛋白,例如,这种转基因在转基因动物乳汁中的表达提供了获得定量抗原结合蛋白的手段。在这方面,有用的转基因包含与来自乳腺特异性基因(如酪蛋白或β-乳球蛋白)的启动子和/或增强子结构可操作地连接的本发明的核酸分子(例如,本文所述的抗原结合蛋白的编码序列)。动物可以是非人类哺乳动物,最优选为小鼠、大鼠、绵羊、小牛、狗、猴子或猿。
组合物
在一些实例中,本文所述的抗原结合蛋白可以口服施用、肠胃外施用、通过吸入喷雾施用、吸附施用、吸收施用、局部施用、直肠施用、经鼻施用、口腔施用、阴道施用、心室内施用、通过含有常规无毒药学上可接受的载体的剂型中的植入贮库施用或通过任何其它方便的剂型来施用。本文使用的术语“肠胃外”包括皮下、静脉内、肌内、腹膜内、硬膜内、心室内、胸骨内和颅内注射或输注技术。
将抗原结合蛋白制备成用于向受试者施用的合适形式(例如药物组合物)的方法是本领域已知的,包括例如在Remington’sPharmaceutical Sciences(第18版,MackPublishing Co.,Easton,Pa.,1990)和美国药典:国家处方集(Mack Publishing Company,Easton,Pa.,1984)中描述的方法。
本发明的药物组合物特别适用于肠胃外施用,诸如静脉内施用或至体腔或器官或关节的管腔内施用。用于施用的组合物通常包含溶解在药学上可接受的载体(例如水性载体)中的抗原结合蛋白的溶液。可使用各种水性载体,例如缓冲盐水等。所述组合物可包含接近生理条件所需的药学上可接受的辅助物质,诸如pH调节剂和缓冲剂、毒性调节剂等,例如乙酸钠、氯化钠、氯化钾、氯化钙、乳酸钠等。本发明的抗原结合蛋白在这些制剂中的浓度可以广泛变化,并且将根据所选择的特定施用方式和患者的需要,主要基于液体体积、粘度、体重等进行选择。示例性载体包括水、盐水、林格氏溶液、葡萄糖溶液和5%人血清白蛋白。也可以使用非水性媒介物诸如混合油和油酸乙酯。脂质体也可以用作载体。媒介物可含有少量的增强等渗性和化学稳定性的添加剂,例如缓冲剂和防腐剂。
配制后,将以与剂型相容的方式和以治疗/预防有效的量施用本发明的抗原结合蛋白。制剂易于以各种剂型给药,诸如上述类型的可注射溶液,但也设想了其它药学上可接受的形式,例如用于口服施用的片剂、丸剂、胶囊或其它固体、栓剂、子宫托(pessaries)、鼻腔溶液或喷雾剂、气雾剂、吸入剂、脂质体形式等。也可以使用药物“缓释”胶囊或组合物。缓释制剂通常被设计成在延长的时期内提供恒定的药物水平,并可用于递送本发明的抗原结合蛋白。
WO2002/080967描述了组合物和用于施用包含用于治疗例如哮喘的抗体的雾化组合物和方法,所述方法也适用于施用本发明的抗原结合蛋白。
在另一个实施方案中,提供了药物组合物,其包含如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白或缀合物,以及药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。
尽管本发明可用于人,但本发明也可用于诊断或治疗性兽医学目的。本发明可用于家畜或农场动物,诸如牛、绵羊、马和家禽;用于诸如猫、狗等伴侣动物;用于动物园动物。
制备其抗原结合蛋白并向有需要的受试者施用其的方法是本领域技术人员公知的或容易确定的。抗原结合蛋白的施用途径可以是口服、肠胃外、通过吸入或局部施用。
虽然所有这些施用形式都清楚地被认为在本发明的范围内,但用于施用的形式可以是注射溶液,特别是静脉内或动脉内注射液或滴注液。通常,用于注射的合适药物组合物可包含缓冲剂(例如,乙酸盐、磷酸盐或柠檬酸盐缓冲剂)、表面活性剂(例如,聚山梨醇酯)、任选的稳定剂(例如,人白蛋白)等。
用于肠胃外施用的制剂包括无菌水溶液或非水溶液、悬浮液和乳液。非水溶剂的实例是丙二醇、聚乙二醇、植物油诸如橄榄油和可注射的有机酯诸如油酸乙酯。水性载体包括水、醇/水溶液、乳液或悬浮液,包括盐水和缓冲介质。在本发明中,药学上可接受的载体包括,但不限于,0.01-0.1M,优选0.05M的磷酸盐缓冲液或0.8%盐水。其它常见的肠胃外媒介物包括磷酸钠溶液、林格氏葡萄糖、葡萄糖和氯化钠、乳酸林格氏液或不挥发油。静脉内媒介物包括液体和营养补充剂、电解质补充剂,诸如基于林格氏葡萄糖的补充剂等。也可存在防腐剂和其它添加剂,例如抗菌剂、抗氧化剂、螯合剂和惰性气体等。
更具体地说,适于注射使用的药物组合物包含无菌水溶液(水溶性的)或分散体和用于临时制备无菌注射溶液或分散体的无菌粉末,在这种情况下,组合物必须是无菌的,并且应当是达到容易注射的程度的流体。其在生产和储存条件下应该是稳定的,并且优选能防止微生物诸如细菌和真菌的污染作用。载体可以是包含例如水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等)及其合适的混合物的溶剂或分散介质。适当的流动性可以例如通过使用包衣诸如卵磷脂,在分散体的情况下通过保持所需的粒度,以及通过使用表面活性剂来保持。用于本文公开的治疗方法的合适制剂描述于Remington's PharmaceuticalSciences,Mack Publishing Co.,第16版(1980)中。
通过各种抗细菌和抗真菌剂,例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗坏血酸、硫柳汞等,可以防止微生物的作用。在许多情况下,优选在组合物中包含等渗剂,例如糖、多元醇,诸如甘露醇、山梨醇或氯化钠。可注射组合物的延长吸收可通过在组合物中包含延迟吸收的剂(例如,单硬脂酸铝和明胶)来实现。
无菌可注射液可通过将所需量的活性化合物(例如抗原结合蛋白)与本文列举的成分之一或其组合(根据需要)一起掺入适当的溶剂中,接着进行过滤灭菌来制备。通常,通过将活性化合物掺入无菌媒介物中来制备分散体,所述媒介物包含基本分散介质和来自上述列举的所需其它成分。在用于制备无菌注射液的无菌粉末的情况下,优选的制备方法是真空干燥和冷冻干燥,其从活性成分的先前无菌过滤的溶液中产生活性成分加上任何附加的所需成分的粉末。根据本领域已知的方法,将注射制剂加工、填充到容器诸如安瓿、袋、瓶、注射器或小瓶中,并在无菌条件下密封。另外,可以以试剂盒的形式包装和销售所述制剂。此类制品优选具有标签或包装插页,表明相关组合物可用于治疗患有疾病或易患疾病的受试者。
施用的剂量和时间安排
本发明的抗原结合蛋白的合适剂量将根据具体的抗原结合蛋白、待治疗的疾患和/或正在治疗的受试者而变化。有经验的医生有能力确定合适的剂量,例如,通过从次优剂量开始,逐步修改剂量来确定最佳或有用剂量。或者,为了确定用于治疗/预防的合适剂量,使用来自细胞培养测定或动物研究的数据,其中合适的剂量在循环浓度的范围内,该范围包括几乎没有毒性或无毒性的活性化合物的ED50。剂量可在此范围内变化,这取决于所用的剂型和所用的施用途径。治疗/预防有效剂量可以从细胞培养测定中初步估算。可以在动物模型中配制剂量,以达到包括在细胞培养中测定的IC50(即,实现症状的半最大抑制的化合物的浓度或量)的循环血浆浓度范围。这种信息可用于更准确地确定人中的有效剂量。血浆中的水平可以例如通过高效液相色谱法来测量。
在一些实例中,本发明的方法包括施用预防或治疗有效量的本文所述的蛋白质。
术语“治疗有效量”是当向需要治疗的受试者施用时,改善受试者的预后和/或状态和/或将本文所述临床疾患的一种或多种症状减少或抑制至低于观察到并被接受为该疾患的临床诊断或临床特征的水平的量。待向受试者施用的剂量将取决于待治疗疾患的具体特征、正在治疗的疾患的类型和分期、施用方式以及受试者的特征,诸如总体健康状况、其它疾病、年龄、性别、基因型和体重。本领域技术人员将能够根据这些和其它因素确定合适的剂量。因此,该术语不应被解释为将本发明限制于特定的量,例如一种或多种蛋白质的重量或量,相反,本发明涵盖任何足以在受试者中实现所述结果的一种或多种抗原结合蛋白的量。
如本文中所用,术语“预防有效量”应被理解为意指足以预防或抑制或延迟临床疾患的一种或多种可检测症状的发作的蛋白质的量。本领域技术人员将会意识到,这样的量将根据例如施用的一种或多种特异性抗原结合蛋白和/或特定受试者和/或疾患的类型或严重程度或水平和/或对该疾患的易患病体质(遗传的或其它的)而变化。因此,该术语不应被解释为将本发明限制于特定的量,例如一种或多种抗原结合蛋白的重量或量,相反,本发明包括任何足以在受试者中实现所述结果的量的一种或多种抗原结合蛋白的量。
用于治疗本文所述病症的本发明组合物的有效剂量根据许多不同的因素而变化,所述因素包括施用方式、靶位点、患者的生理状态、患者是人还是动物、施用的其它药物以及治疗是预防性还是治疗性的。通常,患者是人,但也可以治疗包括转基因哺乳动物在内的非人哺乳动物。可使用本领域技术人员已知的常规方法来滴定治疗剂量,以优化安全性和有效性。
对于用抗原结合蛋白治疗某些病症,剂量可以在例如约0.0001至100mg/kg的宿主体重的范围内,更通常为0.01至5mg/kg(例如,0.02mg/kg、0.25mg/kg、0.5mg/kg、0.75mg/kg、1mg/kg、2mg/kg等)的宿主体重。例如,剂量可以是1mg/kg体重或10mg/kg体重或在1-10mg/kg的范围内,优选为至少1mg/kg。上述范围内的中间剂量也旨在本发明的范围内。可以每天、隔天、每周或按照根据经验分析确定的任何其它时间表向受试者施用此类剂量。示例性治疗需要在例如至少6个月的延长的时期内以多个剂量进行的施用。另外的示例性治疗方案需要每两周一次或每月一次或每3至6个月一次的施用。示例性剂量方案包括连续几天1-10mg/kg或15mg/kg,隔天30mg/kg或每周60mg/kg。在一些方法中,同时施用两种或更多种具有不同结合特异性的抗原结合蛋白,在这种情况下,施用的每种抗原结合蛋白的剂量都在指定的范围内。
本文公开的抗原结合蛋白可在多个场合施用。单次剂量之间的间隔可以是每周、每月或每年。如通过测量患者体内靶多肽或靶分子的血液水平所表明的,间隔也可以是无规律的。在一些方法中,调整剂量以获得1-1000μg/ml的血浆多肽浓度,以及在一些方法中获得25-300μg/ml的血浆多肽浓度。或者,抗原结合蛋白可以作为缓释制剂施用,在这种情况下,需要以较低频率施用。剂量和频率根据抗原结合蛋白在患者体内的半衰期而变化。抗原结合蛋白的半衰期也可以通过与稳定的多肽或部分(例如白蛋白或PEG)的融合而得到延长。一般来说,人源化抗体显示出最长的半衰期,其次为嵌合抗体和非人抗体。在一个实施方案中,本发明的抗原结合蛋白可以以非缀合形式施用。在另一个实施方案中,用于本文公开的方法中的抗原结合蛋白可以以缀合形式施用多次。在另一个实施方案中,本发明的抗原结合蛋白可以以非缀合形式施用,然后以缀合形式施用,反之亦然。
施用的剂量和频率可以根据治疗是预防性的还是治疗性的而变化。在预防性应用中,将包含抗体或其混合物的组合物向尚未处于疾病状态或疾病前状态的患者施用,以增强患者的抵抗力。这样的量被定义为“预防有效剂量”。在该应用中,精确的剂量也取决于患者的健康状况和一般免疫力,但通常范围为每剂量0.1至25mg,尤其是每剂量0.5至2.5mg。在长时期内以相对不频繁的间隔施用相对低的剂量。一些患者在其余生继续接受治疗。
在治疗性应用中,有时需要以相对短的时间间隔施用相对高的剂量(例如,每剂量约1至400mg/kg的结合分子(例如抗原结合蛋白),对于放射性免疫缀合物更常用5至25mg的剂量,对于细胞毒素-药物缀合分子更常用较高的剂量),直至疾病的进展减轻或终止,优选直至患者表现出疾病症状的部分或完全改善。此后,可向患者施用预防性方案。
在一个实施方案中,可用编码抗原结合蛋白的核酸分子(例如,在载体中)治疗受试者。编码多肽的核酸的剂量范围为每位患者约10ng至1g DNA、100ng至100mg DNA、1μg至10mg DNA或30-300μgDNA。感染性病毒载体的剂量在每剂量10-100个或更多个病毒体之间变化。
治疗剂可通过肠胃外、局部、静脉内、口服、皮下、动脉内、颅内、腹膜内、鼻内或肌内方式施用,用于预防性和/或治疗性治疗。在一些方法中,将药剂直接注射到CCR6细胞已在其中积聚的特定组织中,例如颅内注射。肌内注射或静脉内输注对于抗体施用是优选的,在一些方法中,将特定的治疗性抗体直接注射到颅内,在一些方法中,将抗体作为缓释组合物或装置来施用。
可将本发明的抗原结合蛋白任选地与有效治疗需要治疗(例如,预防性的或治疗性的)的病症或疾患的其它药物联合施用。
在另一个实施方案中,提供了药物组合物,其包含如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、Fab、dab、scFv、双抗体、三抗体、融合蛋白或缀合物、稀释剂和任选的标记物。为了治疗或预防银屑病,所述药物组合物优选适于局部施用。
在某些实施方案中,可检测地标记抗原结合蛋白或包括其的分子。可使用许多不同的标记物,包括酶、放射性同位素、胶体金属、荧光化合物、化学发光化合物和生物发光化合物。可使用荧光染料(荧光素、罗丹明、德克萨斯红等)、酶(辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、碱性磷酸酶等)、放射性同位素(32P或125I)、生物素、地高辛、胶体金属、化学或生物发光化合物(二氧杂环丁烷、鲁米诺或吖啶鎓)。
检测方法取决于所用标记物的类型,包括放射自显影、荧光显微镜检查、直接和间接酶促反应。实例包括蛋白质印迹、重叠测定(overlay-assay)、RIA(放射免疫测定)和IRMA(免疫放射免疫测定)、EIA(酶免疫测定)、ELISA(酶联免疫吸附测定)、FIA(荧光免疫测定)和CLIA(化学发光免疫测定)。
试剂盒
在另一个实施方案中,提供了试剂盒或制品,其包含如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物。
在其它实施方案中,提供了用于上述治疗性应用的试剂盒,该试剂盒包括:
-容纳治疗组合物的容器,所述治疗组合物呈抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物中的一种或多种的形式;
-附有使用说明的标签或包装插页。
在某些实施方案中,所述试剂盒可包含用于治疗癌症或预防上述癌症相关并发症,或与CCR6表达相关的病况或疾病的一种或多种其它活性要素或成分。
试剂盒或“制品”可包括容器和容器上或与容器相关联的标签或包装插页。合适的容器包括例如瓶子、小瓶、注射器、泡罩包装等。容器可由多种材料诸如玻璃或塑料形成。容器装有对治疗疾病有效的治疗性组合物,并可具有无菌入口(例如,该容器可以是静脉内注射液袋或具有可被皮下注射针头刺穿的塞子的小瓶)。标签或包装说明书表明该治疗组合物用于治疗所选择的疾患。在一个实施方案中,标签或包装插页包括使用说明,并表明治疗性组合物可用于治疗、预防或检测以CCR6表达为特征的疾病或疾患。
试剂盒可包含(a)治疗性组合物;和(b)其中含有第二种活性要素或成分的第二容器。本发明的该实施方案中的试剂盒还可包括包装插页,该包装插页表明所述活性要素和其它活性要素可用于治疗疾病或预防由癌症引起的并发症。可选地或另外地,试剂盒还可包括第二(或第三)容器,所述容器包含药学上可接受的缓冲液,诸如抑菌注射用水(BWFI)、磷酸盐缓冲盐水、林格氏溶液和葡萄糖溶液。其还可包括从商业和用户角度来看所希望的其它材料,包括其它缓冲剂、稀释剂、过滤器、针头和注射器。
在某些实施方案中,治疗性组合物可以以一次性或可重复使用的装置的形式提供,包括用于容纳治疗性组合物的容器。在一个实施方案中,所述装置是注射器。所述装置可以容纳1-2mL治疗性组合物。可将治疗性组合物以即时可用的状态或需要混合或添加其它组分的状态提供在装置中。
在其它实施方案中,提供了用于上述诊断应用的试剂盒,该试剂盒包括:
-容纳诊断组合物的容器,所述诊断组合物呈抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、Fab、dab、scFv、双抗体、三抗体、融合蛋白或缀合物中的一种或多种的形式;
-附有使用说明的标签或包装插页。
所述试剂盒可包含(a)诊断组合物;和(b)其中含有第二诊断剂或第二标记物的第二容器。其还可包括从商业和用户角度来看所希望的其它材料,包括其它缓冲剂、稀释剂、过滤器等。
需要治疗或诊断的疾病
在另一个实施方案中,提供了治疗个体的以CCR6表达为特征的疾病或疾患的方法,其包括向需要治疗所述疾患的个体提供如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、Fab、dab、scFv、双抗体、三抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。典型地,所述疾患是炎性疾患、感染、纤维化或癌症,尤其是本文所述的上皮癌,或肺病,诸如慢性阻塞性肺病(COPD)、哮喘和呼吸道合胞病毒(RSV)。
其它疾病和疾患包括各种炎性疾患。实例可包括增殖性组分。具体的实例包括痤疮、心绞痛、关节炎、吸入性肺炎、疾病、脓胸、胃肠炎、炎症、肠流感、坏死性小肠结肠炎、结肠炎、盆腔炎、咽炎、胸膜炎、嗓子发炎疼痛(raw throat)、发红(redness)、皮肤发红(rubor)、嗓子痛、肠胃型流感(stomach flu)和尿路感染、慢性炎性脱髓鞘性多神经病、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经根神经病、慢性炎性脱髓鞘性多神经病或慢性炎性脱髓鞘性多发性神经根神经病。
在另一个实施方案中,提供了如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物在制备用于治疗癌症、慢性炎症、自身免疫疾病、感染或纤维化的药物方面的用途。
本发明可用于诊断或治疗各种自身免疫疾病和炎性疾病。炎性病症可以是急性的或慢性的。炎性疾病包括心血管炎症(例如,动脉粥样硬化、中风)、胃肠炎症、肝脏炎性病症、肺部炎症(例如,哮喘、呼吸机诱导的肺损伤)、肾脏炎症、眼部炎症(例如,葡萄膜炎)、胰腺炎症、泌尿生殖系统炎症、神经炎症性病症(例如,多发性硬化、阿尔茨海默病)、过敏(例如,过敏性鼻炎/鼻窦炎)、皮肤过敏和病症(例如,风疹/荨麻疹、血管性水肿、特应性皮炎、接触性皮炎、银屑病)、食物过敏、药物过敏、昆虫过敏、肥大细胞增多症)、骨骼炎症(例如,关节炎、骨关节炎、类风湿性关节炎、脊椎关节病)、感染(例如,细菌或病毒感染;口腔炎症性病症(即,牙周炎、牙龈炎或口腔炎);和移植(例如,同种异体移植或异种移植排斥或母胎耐受)。
自身免疫疾病包括,例如,获得性免疫缺陷综合征(AIDS,其为具有自身免疫组分的病毒性疾病)、斑秃、强直性脊柱炎、抗磷脂综合征、自身免疫性阿狄森氏病、自身免疫性溶血性贫血、自身免疫性肝炎、自身免疫性内耳疾病(AIED)、自身免疫性淋巴增生综合征(ALPS)、自身免疫性血小板减少性紫癜(ATP)、白塞氏病、心肌病、乳糜泻-疱疹样皮炎;慢性疲劳免疫功能障碍综合征(CFIDS)、慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病(CIPD)、瘢痕性类天疱疮、冷凝集素病、肢端硬皮综合征、克罗恩病、德戈斯病、幼年型皮肌炎、盘状狼疮、原发性混合型冷球蛋白血症、纤维肌痛性肌炎(fibromyalgiafibromyositis)、格雷夫斯病、格林-巴利综合征、桥本甲状腺炎、特发性肺纤维化、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、lgA肾病、胰岛素依赖性糖尿病、幼年型慢性关节炎(斯蒂尔病)、幼年型类风湿性关节炎、梅尼埃病、混合结缔组织病、多发性硬化、重症肌无力、恶性贫血、结节性多动脉炎、多软骨炎、多腺体综合征、风湿性多肌痛、多肌炎和皮肌炎、原发性无丙种球蛋白血症、原发性胆汁性肝硬化、银屑病、银屑病性关节炎、雷诺现象、瑞特综合征、风湿热、类风湿性关节炎、肉状瘤病、硬皮病(进行性系统性硬化(PSS),也称为系统性硬化(SS))、干燥综合征、僵人综合征、系统性红斑狼疮、多发性大动脉炎、颞动脉炎/巨细胞动脉炎、溃疡性结肠炎、葡萄膜炎、白癜风和韦格纳肉芽肿病。
优选地,自身免疫性或炎性疾患是多发性硬化、类风湿性关节炎、皮肤过敏诸如特应性皮炎、接触性皮炎、银屑病、炎性肠病、葡萄膜炎、干眼症、系统性硬化(硬皮病)、牙周病、白癜风、系统性红斑狼疮/盘状狼疮/格雷夫斯病、动脉粥样硬化、哮喘或迟发型超敏反应。
多发性硬化(MS)是涉及脑和脊髓轴突周围髓鞘的脱髓鞘的炎症性疾病。MS症状包括但不限于大脑和/或脊髓中的白质疤痕和各种神经症状,包括但不限于感觉变化,诸如敏感性或麻刺感、刺痛感或麻木感的丧失(感觉减退和感觉异常)、肌肉无力、阵挛、肌肉痉挛或运动困难;协调和平衡困难(共济失调);言语问题(构音障碍)或吞咽问题(吞咽困难)、视觉问题(眼球震颤、视神经炎等)、疲劳、急性/慢性疼痛以及膀胱和肠道困难。不同程度的认知障碍和抑郁症也很常见。MS的症状通常出现在神经功能逐渐进行性恶化的发作急性恶化期,或两者的组合。
类风湿性关节炎是慢性全身性炎性病症,其可影响许多组织和器官,但主要攻击滑膜关节。该过程涉及继发于滑膜细胞增生的关节周围滑膜囊的炎症反应、过多的滑液和滑膜中纤维组织的发育。疾病过程的病理学经常导致关节软骨的破坏和关节的关节强直。类风湿性关节炎也可在肺、心包、肺胸膜、巩膜和结节性病变中产生弥漫性炎症,这在皮下组织中最常见。
如本文中所用,纤维化包括以下疾患中的任一种或多种:肺纤维化、特发性肺纤维化、囊性纤维化、肝硬化、心内膜心肌纤维化、陈旧性心肌梗塞、心房纤维化、纵隔纤维化、骨髓纤维化、腹膜后纤维化、进行性大量纤维化、肾源性系统性纤维化、克罗恩病、瘢痕疙瘩、硬皮病/系统性硬化、关节纤维化、佩罗尼氏病、杜普伊特伦挛缩、某些形式的粘连性关节囊炎。
前肿瘤性和肿瘤性疾病是可对其应用本发明方法的具体实例。广泛的实例包括乳腺肿瘤、结直肠肿瘤、腺癌、间皮瘤、膀胱瘤、前列腺瘤、生殖细胞瘤、肝细胞瘤/睾丸癌、神经内分泌瘤、垂体瘤、小20圆细胞瘤、鳞状细胞癌、黑色素瘤、非典型纤维黄瘤、精原细胞瘤、非精原细胞瘤、基质间质细胞瘤(stromal leydig cell tumor)、支持细胞瘤、皮肤瘤、肾肿瘤、睾丸瘤、脑肿瘤、卵巢瘤、胃肿瘤、口腔肿瘤、膀胱瘤、骨肿瘤、子宫颈瘤、食道肿瘤、喉肿瘤、肝肿瘤、肺肿瘤、阴道瘤和维耳姆斯氏瘤。
特定癌症的实例包括但不限于腺癌、腺瘤、腺纤维瘤、腺淋巴瘤、adontoma、AID相关癌症、听神经瘤、急性淋巴细胞性白血病、急性髓细胞性白血病(acute myeloidleukemia)、腺囊性癌、肾上腺皮质癌、原因不明的髓细胞化生(agnogenic myeloidmetaplasia)、脱发、腺泡状软组织肉瘤、成釉细胞瘤、血管角化瘤、血管淋巴样增生伴嗜酸性白细胞增多、血管瘤硬化、血管瘤病、APUD瘤(apudoma)、肛门癌、血管肉瘤、再生障碍性贫血、星形细胞瘤、共济失调-毛细血管扩张症、基底细胞癌(皮肤)、膀胱癌、骨癌、肠癌、脑干神经胶质瘤、脑和CNS肿瘤、乳腺癌、鳃原瘤、CNS肿瘤、类癌瘤、宫颈癌、儿童脑肿瘤、儿童癌症、儿童白血病、儿童软组织肉瘤、软骨肉瘤、绒毛膜癌、慢性淋巴细胞白血病、慢性髓细胞样白血病、结直肠癌、皮肤T细胞淋巴瘤、癌(例如,Walker癌、基底细胞癌、基底鳞状细胞、Brown-Pearce瘤、导管瘤、Ehrlich瘤、Krebs 2癌、默克尔细胞癌、粘液癌、非小细胞肺癌、燕麦细胞癌、乳头状癌、硬癌、细支气管癌、支气管源细胞癌、鳞状细胞和移行细胞癌)、癌肉瘤、宫颈发育不良、叶状囊肉瘤、牙骨质瘤、脊索瘤、迷芽瘤、软骨肉瘤、软骨母细胞瘤、颅咽管瘤、胆管癌、胆脂瘤、圆柱瘤、囊腺癌(cystadenocarcinoma)、囊腺瘤(cystadenoma)、隆突性皮肤纤维肉瘤、促结缔组织增生性小圆细胞瘤、导管癌、无性细胞瘤、内分泌癌、子宫内膜癌、室管膜瘤、食道癌、尤因肉瘤、肝外胆管癌、眼癌、眼:黑色素瘤、视网膜母细胞瘤、输卵管癌、范科尼贫血、纤维瘤、纤维肉瘤、胆囊癌、胃癌、胃肠癌、胃肠类癌、泌尿生殖系统癌、生殖细胞瘤、妊娠滋养细胞疾病、神经胶质瘤、妇科癌症、巨细胞瘤、神经节神经瘤、神经胶质瘤、血管球瘤、颗粒细胞瘤、雌雄细胞瘤(gynandroblastoma)、血液学恶性肿瘤、毛细胞白血病、头颈癌、肝细胞癌、遗传性乳腺癌、组织细胞增生症、霍奇金病、人乳头瘤病毒、葡萄胎、高钙血症、下咽癌、错构瘤、血管内皮瘤、血管瘤、血管外皮细胞瘤、血管肉瘤、血管肉瘤、组织细胞病、恶性组织细胞增多症、组织细胞瘤、肝细胞瘤、汗腺腺瘤、软骨肉瘤、免疫增生性小opoma、ontraocular黑色素瘤、胰岛细胞癌、卡波济氏肉瘤、肾癌、朗格罕氏细胞组织细胞增多症、喉癌、平滑肌肉瘤、白血病、李-佛美尼综合征(li-fraumeni syndrome)、唇癌、脂肪肉瘤、肝癌、肺癌、淋巴水肿、淋巴瘤、霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、平滑肌肉瘤、白血病(例如b细胞、混合细胞、空细胞、t细胞、慢性t细胞、淋巴管肉瘤、急性淋巴细胞、慢性淋巴细胞、肥大细胞和髓细胞样)、白血病性肉瘤、莱迪希细胞瘤、脂肪肉瘤、平滑肌瘤、平滑肌肉瘤、淋巴管瘤、淋巴管细胞瘤(lymphangiocytoma)、淋巴管瘤、淋巴管肌瘤(lymphagiomyoma)、淋巴管肉瘤、男性乳腺癌、肾恶性横纹肌样瘤、髓母细胞瘤、黑色素瘤、默克尔细胞癌、间皮瘤、转移癌、口腔癌、多发性内分泌瘤、蕈样霉菌病、骨髓增生异常综合征、骨髓瘤、骨髓增生性病、恶性类癌综合征、类癌性心脏病、髓母细胞瘤、脑膜瘤、黑色素瘤、间叶瘤、中肾瘤、间皮瘤、肌母细胞瘤、肌瘤、肌肉瘤、粘液瘤、粘液肉瘤、鼻癌、鼻咽癌、肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、神经纤维瘤病、Nijmegen断裂综合征、非黑色素瘤皮肤癌、非小细胞肺癌(nsclc)、神经鞘瘤、神经母细胞瘤、神经上皮瘤、神经纤维瘤病、神经纤维瘤、神经瘤、肿瘤(例如骨、乳腺、消化系统、结直肠、肝脏)、眼癌、食道癌、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤、造口卵巢癌(ostomy ovarian cancer)、胰腺癌、鼻旁癌、甲状旁腺癌、腮腺癌、阴茎癌、外周神经外胚层肿瘤、垂体癌、真性红细胞增多症、前列腺癌、骨瘤、骨肉瘤、卵巢癌、乳头状瘤、副神经节瘤、非嗜铬性副神经节瘤、松果体瘤、浆细胞瘤、原癌基因、罕见癌症和相关病症、肾细胞癌、视网膜母细胞瘤、横纹肌肉瘤、Rothmund-Thomson综合征、网状内皮组织增生症、横纹肌瘤、唾液腺癌、肉瘤、许旺细胞瘤、塞扎里综合征(Sezary syndrome)、皮肤癌、小细胞肺癌(sclc)、小肠癌、软组织肉瘤、脊髓肿瘤、鳞状细胞癌-(皮肤)、胃癌、滑膜肉瘤、肉瘤(例如,尤因氏实验性肉瘤、卡波济氏肉瘤和肥大细胞肉瘤)、支持细胞瘤、滑膜瘤、睾丸癌、胸腺癌、甲状腺癌、移行细胞癌-(膀胱)、移行细胞癌-(肾盂-/-输尿管)、滋养细胞癌(trophoblastic cancer)、畸胎瘤、卵泡膜细胞瘤、胸腺瘤、滋养细胞瘤、尿道癌、泌尿系统癌、uroplakins、子宫肉瘤、子宫癌、阴道癌、外阴癌、Waldenstrom巨球蛋白血症和维尔姆斯瘤。
本发明提供了预防个体中银屑病的方法,其包括向有发展银屑病的风险的个体提供如本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,银屑病是斑块型银屑病。银屑病的预防可通过皮肤的红斑、脱屑或增厚的消失来衡量。
本发明提供了治疗个体的银屑病或关节炎的方法,其包括向需要治疗银屑病的个体提供本文所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或药物组合物的步骤。优选地,银屑病是斑块型银屑病。
银屑病的治疗可由任何临床或生物化学上可观察或可测量的性状决定。优选地,银屑病的治疗通过皮肤的红斑、脱屑或增厚的减少来确定。
关节炎的成功治疗可由任何临床或生物化学上可观察或可测量的性状来决定。例如,类风湿性关节炎的治疗可通过观察受试者在类风湿性关节炎相关症状持续时间的严重程度方面的改善来评估。例如,鉴定改善包括使用RA或炎症的分数、测试或指标,包括确定受试者是否在一个或多个类风湿性关节炎指标上具有改善的分数。分数、测试或指标可选自由以下的一项或多项组成的组:美国风湿病学会缓解率(American College ofRheumatology Response Rate)(ACR,例如ACR20、ACR50和ACR70)、实现低疾病活动性(LDA)的受试者比例、疾病活动性评分28分(DAS28;例如,基于C反应蛋白)、关节肿胀、压痛关节患者的疼痛评估、总体疾病活动和身体功能、医生对疾病活动和急性期反应物水平的总体评估以及达到ACR70缓解状态的受试者比例。另外,类风湿性关节炎指标优选选自由以下组成的组:医生对疾病活动的总体评估;患者报告的结果;健康评估问卷(HAQ-DI);患者对疾病活动的总体评估(VAS));抗药物抗体(ADA)的测量或存在;压痛关节计数(tender jointcount)(TJC);肿胀关节计数(SJC);患者对疼痛的评估;类风湿性关节炎工作不稳定性量表(Work Instability Scale for Rheumatoid Arthritis);健康调查简表(SF-36);美国风湿病学会,ACR,(例如,ACR20、ACR50和ACR 70);实现低疾病活动性(LDA)的受试者比例;疾病活动性评分28分(DAS28;例如,基于C反应蛋白的DAS28临床疾病活动指数(CDAI);简单疾病活动指数(SDAI);和临床缓解标准。本领域技术人员将熟悉用于评估类风湿性关节炎指标评分的标准方法。
在一个实施方案中,本发明的方法将RA指标降低至少约1%、3%、5%、7%10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%或更多。
骨关节炎的治疗是否成功也为本领域技术人员所熟知。例如,治疗可通过观察选自由以下组成的组的一个或多个指标的改善来评估:西安大略和麦克马斯特大学关节炎指数(WOMAC)、全器官磁成像评分(WORMS)、间歇性和持续性骨关节炎疼痛(ICOAP)评分、11点数字评级分数(NRS)分数、医生对疾病活动的总体评估、患者报告的结果、健康评估问卷(HAQ-DI)、使用患者对疾病活动的总体评估(VAS)的疼痛水平、抗药物抗体(ADA)的测量或存在、压痛关节计数(TJC)、肿胀关节计数(SJC)、患者对疼痛的评估、类风湿性关节炎的工作不稳定性量表、简式健康调查(SF-36)、美国风湿病学会,ACR(例如,ACR20、ACR50和ACR70)、实现低疾病活动性(LDA)的受试者比例、疾病活动性评分28分(DAS28;例如,基于C反应蛋白的DAS28)、临床疾病活动指数(CDAI)、简单疾病活动指数(SDAI)、临床缓解标准和个体评估(例如问卷或患者的总体评估),在根据本发明治疗的受试者中观察上述指标。
此外,可通过观察个体的与骨关节炎(例如,中度至重度膝骨关节炎和/或中度至重度侵蚀性手骨关节炎)相关的疼痛的减轻来评估骨关节炎的治疗。疼痛状况可选自由以下组成的组:异常性疼痛、痛觉过敏以及异常性疼痛与痛觉过敏的组合。另外,可通过确定膝关节滑膜炎/渗出量、膝关节骨髓病变和由磁共振成像指示的骨关节炎程度来评估治疗。
银屑病性关节炎(PsA)是指与银屑病相关的慢性炎性关节炎,银屑病是一种会导致身体上出现红色斑块的常见慢性皮肤病。大约1/20的患有银屑病的个体会随着皮肤状况发展成关节炎,并且在大约75%的病例中,银屑病先于关节炎。PsA以多种方式表现其自身,从轻度到严重的关节炎,其中关节炎通常影响手指和脊柱。PsA有时与残毁性关节炎相关。残毁性关节炎是指以导致使关节致残的严重侵蚀性畸形的过度骨侵蚀为特征的疾病。
当脊柱受到影响时,PsA的症状与强直性脊柱炎的症状类似。强直性脊柱炎(AS)是涉及一个或多个椎骨炎症的炎性病症。AS是慢性炎性疾病,其影响中轴骨骼和/或外周关节,包括脊柱椎骨与骶髂关节之间的关节以及脊柱与骨盆之间的关节。AS最终可使受影响的椎骨融合或生长在一起。僵直性脊椎关节炎,包括AS,可与银屑病性关节炎(PsA)和/或炎性肠病(IBD)(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病)相关。
AS的早期表现可通过放射线照相检测(radiographic test)(包括CT扫描和MRI扫描)来确定。AS的早期表现通常包括骶髂关节炎和骶髂关节的改变(如通过软骨下骨的皮质边缘的模糊所证明的),随后是侵蚀和硬化。疲劳也被认为是AS的常见症状。
PsA的特征性放射线照相特征包括关节侵蚀、关节间隙变窄、骨增生(包括关节周围和骨干骨膜炎(shaft periostitis))、骨质溶解(包括“杯中铅笔”畸形和肢端骨质溶解)、关节强直、骨刺形成和脊椎炎(Wassenberg等人(2001)Z Rheumatol 60:156)。与类风湿性关节炎(RA)不同,PsA的关节受累通常是不对称的,可能是少关节的;骨质疏松症是非典型的。虽然早期PsA的侵蚀性改变与RA一样微不足道,但是由于与侵蚀相邻的骨膜骨形成,它们变得不规则并且随着疾病进展而定义不良。在严重的情况下,侵蚀性变化可进展至杯中铅笔畸形或严重骨质溶解的发展(Gold等人(1988)Radiol Clin North Am26:1195;Resnick等人(1977))J Can Assoc Radiol 28:187)。在手的腕骨、掌指关节(MCP)、近端指间关节(PIP)和远端指间(DIP)关节中,通过放射性照相可见不对称侵蚀,但DIP关节通常最先受到影响。在指骨簇中和在腱和韧带与骨的连接部位处可见到异常。DIP侵蚀性变化的存在可以提供灵敏的和特异性的放射线照相结果以支持PsA的诊断。此外,手倾向于远比脚更容易受伤,比例接近2:1。
因此,PsA的成功治疗包括任何一种或多种与PsA相关的症状的改善或消除(包括与关节炎、银屑病和强直性脊柱炎相关的症状或指标的改善)。
剂量量、给药频率、施用途径等已在上文详细描述。
在另一个实施方案中,提供了用于诊断癌症或炎性病症的方法,其包括将待确定是否存在癌症或炎性病症的组织或细胞与呈如上所述的抗原结合蛋白、免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体、融合蛋白、缀合物或诊断组合物的形式的试剂接触,并检测所述试剂与组织或细胞的结合。该方法可在体内或体外操作。
对于原位诊断,可通过静脉内、鼻内、腹膜内、脑内、动脉内注射或其它途径向待诊断的生物体施用抗原结合蛋白,使得根据本发明的抗原结合蛋白与CCR6上的表位区域(eptitopic region)之间可以发生特异性结合。抗体/抗原复合物可以方便地通过附接于抗原结合蛋白或其功能片段的标记物或任何其它本领域已知的检测方法来检测。
根据本发明和本文所述的用于诊断应用的免疫测定通常依赖于标记的抗原、抗体或用于检测的第二试剂。这些蛋白质或试剂可用本领域普通技术人员通常已知的化合物标记,所述化合物包括酶、放射性同位素以及荧光物质、发光物质和生色物质,包括但不限于有色颗粒,诸如胶体金和乳胶珠。其中,放射性标记可用于几乎所有类型的测定,并且具有大多数变化。当必须避免放射性或需要快速结果时,缀合有酶的标记物特别有用。尽管使用荧光染料需要昂贵的设备,但其提供了非常灵敏的检测方法。在这些测定中有用的抗体包括单克隆抗体、多克隆抗体和亲和纯化的多克隆抗体。
或者,抗原结合蛋白可通过与对免疫球蛋白具有亲和力的标记的物质(诸如蛋白A或G或第二抗体)反应而被间接标记。可将抗原结合蛋白与第二物质缀合,并用对与抗原结合蛋白缀合的第二物质具有亲和力的标记的第三物质进行检测。例如,抗原结合蛋白可以与生物素缀合,抗原结合蛋白-生物素缀合物可用标记的抗生物素蛋白或链霉抗生物素蛋白来检测。类似地,可将抗原结合蛋白与半抗原缀合,抗原结合蛋白-半抗原结合物可用标记的抗半抗原抗体检测。
在某些实施方案中,免疫测定利用双抗体方法来检测分析物的存在,其中,抗原结合蛋白通过与已用可检测标记物标记的第二抗体反应而被间接标记。第二抗体优选是与抗原结合蛋白所源自的动物的抗体结合的抗体。换句话说,如果抗原结合蛋白是小鼠抗体,则标记的第二抗体是抗小鼠抗体。对于本文所述测定中使用的抗原结合蛋白,该标记物优选是抗体包被的珠粒,特别是磁珠。对于本文所述免疫测定中使用的抗原结合蛋白,标记物优选是可检测的分子诸如放射性物质、荧光物质或电化学发光物质。
在本发明的范围内,也可以使用一种替代的双抗体系统,因为它们适于快速测定分析物的存在,所以通常称为快速形式系统。该系统需要抗原结合蛋白与分析物之间的高亲和力。根据本发明的一个实施方案,使用一对抗原结合蛋白(每一种抗原结合蛋白对CCR6蛋白具有特异性)来确定CCR6的存在。所述抗原结合蛋白对中的一种抗原结合蛋白在本文中被称为“检测抗原结合蛋白”,而所述抗原结合蛋白对中的另一抗原结合蛋白在本文中被称为“捕获抗原结合蛋白”。本发明的抗原结合蛋白可以用作捕获抗原结合蛋白或检测抗原结合蛋白。本发明的抗原结合蛋白也可以在单次检测中同时用作捕获和检测抗原结合蛋白。因此,本发明的一个实施方案使用双抗原结合蛋白夹心法来检测生物流体样品中的CCR6。在该方法中,将分析物(CCR6蛋白)夹在检测抗原结合蛋白与捕获抗原结合蛋白之间,捕获抗原结合蛋白被不可逆地固定在固体支持物上。检测抗原结合蛋白将包含可检测标记物,以鉴定抗原结合蛋白-分析物夹层的存在,从而鉴定分析物的存在。
示例性固相物质包括但不限于微量滴定板、聚苯乙烯试管、磁性珠粒、塑料珠粒或玻璃珠粒和载玻片,它们在放射免疫测定和酶免疫测定领域是公知的。将抗原结合蛋白偶联到固相上的方法也为本领域普通技术人员所熟知。最近,许多多孔材料诸如尼龙、硝化纤维素、醋酸纤维素、玻璃纤维和其它多孔聚合物已被用作固体支持物。
应当理解,本说明书中公开和限定的本发明扩展到文本或附图中提到或显而易见的两个或点位多个单独特征的所有可选组合。所有这些不同的组合构成了本发明的各种可选方面。
下面的实施例旨在说明而绝不是限制本发明。
实施例
实施例1-抗人CCR6单克隆抗体的产生
通过用2x 107L1.2/hCCR6转染的细胞免疫C57BL/6小鼠产生与人CCR6(hCCR6)反应的单克隆抗体,所述细胞在收获前20小时用5mM丁酸刺激,并在完全弗氏佐剂(第一次腹膜内免疫)或不完全弗氏佐剂(第二至第六次腹膜内免疫)中乳化,以2周的间隔总共进行5至6次。最后一次免疫是于PBS中静脉内注射。四天后,取出脾脏,使用标准方法将细胞与SP2/0细胞系融合。将杂交瘤在含有10% Fetalclone(HyClone)、1x HAT补充剂(SigmaAldrich)加上小鼠IL-6的DMEM(Gibco/lnvitrogen)中生长。10-14天后,取生长培养物上清液进行初步筛选。
使用免疫荧光染色,利用人CCR6转染的L1.2细胞和未转染的L1.2细胞、或用无关或密切相关的受体诸如hCXCR1、hCXCR2或hCXCR3转染的L1.2细胞鉴定与CCR6反应的单克隆抗体,并使用FACSCalibur(BD Biosciences)对其进行分析。使用如前所述的标准程序对细胞进行单克隆抗体染色(Lee等人,2006,Nat.Biotech.24:1279-1284)。
抗体的生产包括在组织培养瓶中培养杂交瘤以及收获培养基。对于一些实验,培养物上清液中的抗体浓度足以继续进行而无需进一步纯化。放大所选抗体的产量,通过蛋白G色谱纯化单克隆抗体,浓缩单克隆抗体,将缓冲液换成PBS。使用总IgG ELISA测定单克隆抗体浓度。
将表达高水平hCCR6的L1.2转染子用于免疫小鼠,最初通过流式细胞术鉴定了约40种与hCCR6转染的L1.2细胞反应的单克隆抗体,其中约10种与L1.2/hCCR6转染子特异性反应,但不与未转染的L1.2细胞或用密切相关的受体hCXCR1、hCXCR2或hCXCR3转染的L1.2细胞反应(图3)。
为了确保克隆性,使用稀释铺板法(dilution plating)将选择的杂交瘤亚克隆到384孔板中(如下表7所示)。用L1.2/hCCR6转染子和未转染的L1.2细胞通过流式细胞术证实了亚克隆的特异性和交叉反应性。
**所有亚克隆在人淋巴细胞上呈阴性
实施例2-抗人CCR6可变区基因的测序
将来自抗hCCR6杂交瘤的总RNA用于合成cDNA以用于测序分析。使用与小鼠轻链(mIgCk)和重链(mIgG2a)恒定区退火的引物,通过RT-PCR扩增可变区基因,并对可变重链(VH)和可变轻链(VL)基因进行测序。
实施例3-单克隆抗体对配体与CCR6结合的竞争性抑制
对于配体结合分析,重组人CCL20(MIP3α)(“配体”)获自Peprotech(New Jersey,USA)。125l-Bolton-Hunter标记的MIP3α购自Perkin-Elmer(Boston,MA,USA),其中比活度为2200Ci/mM。将细胞在结合缓冲液(50mM Hepes,pH 7.5,1mM CaCl,5mM MgCb,0.5% BSA)中洗涤一次,并以2.5x 106个细胞/ml的浓度重悬于结合缓冲液中。将冷的纯化的单克隆抗体或稀释的杂交瘤培养基(冷竞争剂)加入到96孔板中,然后加入含有1x 105个细胞的等体积(40μl)结合缓冲液。将细胞和竞争剂在室温下预孵育15min。然后将放射性标记的配体(终浓度为0.5-2nM)加入每个孔中,得到120μl的终反应体积。在室温下孵育60分钟后,用含150mM NaCl的1ml结合缓冲液洗涤细胞三次。在TopCount液体闪烁计数器(Packard)中计数细胞沉淀中的放射性(结合的标记物的量)。通过孵育不含放射性标记配体的细胞来计算非特异性背景结合。将样品以一式两份进行测定。
最初,筛选一小组被鉴定为与人CCCR6转染子结合的抗CCR6单克隆抗体竞争性地抑制125I-标记的配体与hCCR6/L1.2转染子结合的能力,所述hCCR6/L1.2转染子在测定前用5mM丁酸处理20小时。孵育和洗涤后,测量与细胞结合的标记物的量,并通过与没有加入抗体的对照反应进行比较来确定抑制百分比(图1和图5)。
实施例4-转染子趋化性测定
将人CCR6转染的L1.2细胞离心,在迁移培养基(MM=RPMI 1640,0.5% BSA)中洗涤,并以107个细胞/ml重悬。将组织培养插入物(Becton Dickinson&Co.,Mountain View,Calif.)置于24孔组织培养板的每个孔中,形成由带有3mm直径孔的聚对苯二甲酸乙二醇酯(polyethylene terepthalate)膜分隔的上下室。将趋化性MIP3α(于测定培养基中稀释的)加入24孔组织培养板中的600μl测定培养基中。将100μl中的100万个细胞与抗体预孵育30min。将纯化的mAb加入孔中的上室,并使细胞在5% CO2、37℃的培养箱中迁移至下室,持续18小时。迁移后取出插入物,用LSRII血细胞计数器(BD Biosciences)对细胞进行计数。通过在设定的30秒时间内获取事件来获得相对细胞计数。发现该方法具有高度的可重复性,并且使得能够对活细胞进行门控并排除碎片(图2、图6和图7)。
实施例5-表位作图
进行表位作图研究以确定CCR6内被抗CCR6 mAb识别的区域。最初,在ELISA中使用对应于人CCR6的N-末端区域和第一、第二和第三细胞外环的生物素化的肽。该初步作图研究的结果表明,所有抗人CCR6 mAb都识别CCR6的N-末端区域。
然后合成跨越人CCR6的整个N-末端区域的两个重叠的生物素化的肽,并将其用于更明确的抗CCR6 mAb表位作图研究。肽1(MSGESMNFSDVFDSSEDYFASVNTSYYT,SEQ ID NO:2)对应于人CCR6的氨基酸位置1-28,肽2(YFASVNTSYYTVDSEMLLCTLHEVRQFSR,SEQ ID NO:101)对应于人CCR6的氨基酸位置18-46。简言之,用链霉抗生物素蛋白包被多孔板并洗涤,然后将生物素化的肽添加到单独的孔中并孵育以促进肽与板的结合。然后通过向板的孔中加入相应的抗体并孵育板来测试不同的抗人CCR6抗体。将同种型对照和仅有缓冲液作为阴性对照。洗涤后,加入适当的缀合的抗体并孵育平板。再次洗涤平板,并使抗体与固定化肽的结合可视化(图8和图9)。
结果:大多数抗hCCR6抗体识别人CCR6的N-末端区域。更准确地说,大多数抗体与涉及前28个氨基酸的区域反应。只有克隆AB7识别涉及AA 18至46的表位。
实施例6-人源化AB6 mAb的产生
通过使用标准分子技术将AB6 mAb的CDR(CDR-H1;CDR-H2;CDR-H3;CDR-L1;CDR-L2;和CDR-L3)转移到人框架区上来产生人源化AB6 mAb(图10和图11)。将IMGT/V-QUEST和IMGT/Junctions分析工具用于鉴定人种系基因,其中将来自重链和轻链两者的可变区的序列与鼠抗体的所述可变区紧密比对。这些选择的人种系基因的框架序列被用作小鼠AB6CDR的受体序列(根据IMGT数据库的IGHV3-48*02和IGKV2-28*01人基因)。然而,在关键的“游标(Vernier)”区保留鼠残基。通过Genescript合成人源化VH和VL基因,为了在CHO细胞中表达也对所述基因进行了密码子优化。
通过标准定点诱变技术产生人源化AB6抗体的Fc变体,以增强或降低抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)。将称为“3M”的三重突变S239D/A330L/I332E(Eu编号系统)引入Fc区以增强ADCC,从而产生人源化AB6-3MFc抗体。还将三重突变L234F/L235E/P331S(Eu编号系统)引入Fc区以减小ADCC,产生人源化AB6-Fc-KO抗体(3SFC)。
实施例7-通过流式细胞术进行的抗体依赖性细胞毒性ADCC分析
通过流式细胞术评估了hAB6(3MFc和3SFc)诱导L1.2 hCCR6转染的细胞的效应细胞依赖性裂解的能力。简言之,用膜染料PKH26标记L1.2 hCCR6转染的细胞,以允许在与效应细胞和抗体孵育时进行区分。用培养基洗涤标记的靶细胞3次,并以1×106/ml的浓度重悬于培养基中。将标记的靶细胞分散在圆底96孔板中(100μl/孔中有1×105个),并与20μg/ml的hAB6或人IgG1同种型对照(Sigma)在37℃预孵育30分钟。通过在Ficoll上离心,从肝素化的血液(从健康个体获得)中制备PBMC。此后,以1:50的效应细胞:靶细胞(E:T)的比例将PBMC(效应细胞)加入到含有靶细胞的96孔板中,并在37℃孵育3小时。就在LSRII血细胞计数器(BD Biosciences)上分析之前,加入TO-PRO 3碘化物以检测细胞死亡。
结果:人源化抗hCCR6抗体效应子功能可被改造用于耗竭(3MFc)或阻断(3SFc)人CCR6阳性细胞(图12和图16)。
实施例8-人源化hCCR6转基因小鼠的产生
使用含有人CCR6基因的BAC克隆RP11-319P19产生人CCR6转基因小鼠。通过限制性核酸内切酶将BAC线性化。纯化人CCR6基因片段并通过原核显微注射将其注射到一日龄的C57BL/6胚胎中。然后将胚胎植入ICR代孕雌鼠体内,通过PCR筛选所得后代中是否存在人CCR6转基因。将hCCR6+小鼠与mCCR6-/-小鼠杂交,产生hCCR6+/mCCR6-/-品系(图13)。
结果:为了在抗人CCR6抗体抗炎活性的背景下研究人CCR6,我们在小鼠中表达了hCCR6-由其内源性启动子驱动,以再现hCCR6的特征性体内表达模式。将编码hCCR6基因及其调控区的人细菌人工染色体(BAC)克隆作为转基因引入小鼠。转基因小鼠在外周血和脾脏中的淋巴细胞上表现出这种人趋化因子受体的表面表达,类似于CCR6的人表达模式(图14)。
实施例9-人源化AB6 mAb对实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的体内作用
几项研究表明,CCR6(一种由CD4+Th17细胞优先表达的受体)以及其相应的配体(CCL20,MIP-3α)与多发性硬化有关。因此,进行实验以确定使用人源化AB6 mAb阻断CCR6+细胞是否会在EAE小鼠模型中导致免疫抑制和疾病结果的改善。
为了诱导EAE,给8-12周龄的雌性hCCR6 Tg C57BL/6小鼠皮下注射100μg的于完全弗氏佐剂(DIFCO Laboratories,Detroit,MI)中的重组小鼠MOG 1-117(Clements Cs等人Proc Natl Acad Sci U S A2003;100:11059-11064)。免疫后和48小时后,小鼠接受200ng百日咳毒素的静脉内注射。每天观察单个动物,并如下评估临床评分:0=无临床疾病,1=仅丧失尾部张力,2=轻度单肢轻瘫或下肢瘫痪,3=重度下肢瘫痪,4=截瘫和/或四肢瘫(quadraparesis),5=濒死或死亡。抗体施用的时间安排在临床上可观察到的疾病发作之前,因此提供了测试抗CCR6抗体是否能够延迟发作或降低疾病严重性的机会。
在免疫后第8天进行一次PBS、纯化的人源化抗CCR6 mab或同种型对照(5mg/kg)的注射。
结果:用单次注射人源化抗hCCR6抗体(hAB6-3SFc)治疗hCCR6转基因小鼠显著降低了EAE的发展(图15)。
实施例10-来自上述实施例9中描述的EAE研究的动物的组织学分析。
来自用同种型或抗ccr6 mAb治疗的免疫动物的脊髓的代表性染色组织切片(预防性研究)。连续切片用苏木精和伊红(H&E)染色以确定炎性细胞浸润的程度,用luxol固蓝(LFB:箭头)染色以确定髓磷脂的完整性,用Bielschowski银染色以确定轴突损失和损伤(箭头)(见图17)。施用hAB6抗体导致阻断炎性细胞诸如T细胞、B细胞和巨噬细胞的浸润。所述抗体还减少了髓磷脂的降解,防止了轴突的丢失和损伤。
实施例11-人源化AB6 mAb对实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的体内作用
给8-12周龄的雌性hCCR6 Tg小鼠皮下注射100μg的于完全弗氏佐剂中的rMOG 1-117。免疫后和48小时后,小鼠接受200ng百日咳毒素的静脉内注射。当平均临床评分达到2时(第15天),用2mg/kg人源化抗hCCR6或人源化抗hCXCR3 mAb(同种型组)治疗动物。动物在第19天接受第二次注射。结果如图18所示。
结果:在第15天施用人源化AB6 mAb导致临床疾病的稳定,随后在第19天施用导致可观察到的单肢轻瘫或下肢瘫痪的改善,这表明靶向CCR6不仅可以稳定疾病,而且还可以逆转以脱髓鞘和/或单核细胞浸润入CNS为特征的疾病(诸如多发性硬化)的症状。
实施例12-人源化AB6 mAb对咪喹莫特(IMQ)诱导的银屑病模型的体内作用
小鼠的IMQ诱导的皮肤炎症在表型上类似于银屑病(咪喹莫特诱导的银屑病模型(van der Fits等人The Journal of Immunology 2009第182卷第9期5836-5845))。在皮肤上施用IMQ后,施用部位,通常是背部,将显示出红斑、脱屑和增厚的体征。经IMQ治疗的皮肤也显示出增加的表皮增厚,这是由角质形成细胞的过度增殖引起的(van der Fits等人2009)。小鼠模型中的IMQ治疗导致过度增殖的角质形成细胞和紊乱的表皮分化(角化不全),其通常表现为角质层中核的保留、颗粒层的缺乏和外皮蛋白表达模式的改变(van derFits等人2009)。这些可观察和可测量的性状与斑块型银屑病的特征性组织学图像相匹配。
预防性研究
每天在剃光的背部皮肤上用IMQ乳膏或对照乳膏(凡士林)处理hCCR6 Tg小鼠。图19显示了在第一次施用IMQ乳膏的同一天(即第0天)开始治疗7天后小鼠背部皮肤的表型表现。每天用同种型对照抗体(5mg/kg)治疗小鼠,显示表皮增厚、红斑和脱屑(最右边),然而用人源化抗hCCR6 mab、hAB6(5mg/kg的3Mfc或3SFc)治疗防止了表皮增厚、红斑和脱屑的形成。(B)IMQ治疗改变了角质形成细胞的增殖和分化。用IMQ或凡士林霜治疗小鼠7天。小鼠背部皮肤的H&E染色(凡士林对照;IMQ+同种型或IMQ+hAB6 3MFc)表明,IMQ导致角质形成细胞的过度增殖,并改变分化,这被hAB6 3MFc所阻止。(C)IMQ诱导的背部皮肤增厚。与同种型对照相比,具有3Mfc或3SFc的抗hCCR6显著减少背部皮肤增厚。结果表明,抗CCR6抗体防止银屑病形成,并且这种作用不依赖于Fc功能。
治疗性研究
在剃光的背部皮肤上每天用IMQ乳膏或对照乳膏(凡士林)治疗hCCR6 Tg小鼠,并在第一次施用IMQ乳膏后的第6天开始每天用同种型对照抗体(5mg/kg)或人源化抗hCCR6mab(5mg/kg的3Mfc或3SFc)治疗。这项治疗性研究测量了IMQ诱导的背部皮肤增厚,与同种型对照相比,两种抗hCCR6抗体hAB6 3Mfc或Fc KO(3SFc)均显著减少了背部皮肤增厚。这些结果表明,本发明的抗CCR6抗体可以治疗银屑病并减缓其进展(图20)。
实施例13-体外ADCC分析。
将hAB6耗竭抗体(经优化的IgG1和IgG1 Fc)的溶细胞能力与非耗竭hAB6(Fc KO)和同种型对照进行比较。与非耗竭或对照相比,hAb6耗竭抗体经显示具有显著增强的细胞杀伤能力(图21)。
实施例14-治疗性关节炎研究
在第0天和第1天给人CCR6转基因小鼠注射(i.p.)200μL K/BXN血清。通过每天测量踝关节厚度和临床指数评分来评估关节炎的发展,直至实验终点。当小鼠表现出关节炎症状并且累积临床评分达到4(在第4天)时,将小鼠分成两组:注射同种型对照mAb抗体的那些小鼠;注射抗hCCR6-FcKO抗体的那些小鼠(蓝色);和以20mg/kg体重,然后每隔一天以5mg/kg注射抗hCCR6耗竭抗体(绿色)1周的那些小鼠。作为对照,在第0天和第1天给不表达人CCR6(WT)的小鼠腹膜内注射200μL K/BXN血清,并用抗hCCR6耗竭抗体(红色)处理。
实验终点时小鼠踝的代表性图像。
结果如图22所示,表明抗CCR6耗竭抗体显著减轻小鼠关节炎的症状和体征。
实施例15-h6H12的亲和力成熟
hAB6的VH和VK核酸序列发生突变,以产生VK序列1-21、1-23和VH序列3-3。使这些序列产生具有野生型hAB6 VH和VL,和/或突变的1-21、1-23VH或3-3VL的各种组合的各种突变抗体(图23)。本文所述的抗体显示为VH/VL:WT/3-3、1-21/WT、1-23/WT、1-21/3-3和1-23/3-3。通过对人CCR6 L1.2细胞进行流式细胞术细胞结合测定来测试这些所得抗体的亲和力。
使用表达人CCR6的细胞系(L1.2人CCR6),使用FACS结合分析来进行hAB6和突变型hAB6-IgG1与人CCR6的结合特征。用FACS结合缓冲液(FBB)(PBS,0.5% BSA,0.1% NaN3(pH7.4))洗涤约2.5x105个hCCR6 L1.2细胞/测试,并用hAB6或hAB6突变体(4.4μg/ml)和系列3倍稀释的抗体染色。在冰上进行1小时后,用FBB(pH 7.4)和缀合有PE的抗人Fc抗体(Jackson ImmunoResearch)洗涤细胞。在冰上进行30min后,用FBB(pH 7.4)洗涤细胞3次,重悬于1%甲醛中,并用FACS LSR流式细胞仪(BD Immunocytometry Systems)进行分析。使用GraphPad Prism计算EC50值。EC50值(以nM为单位)为3.4(hAB6)、3.2(WT/3.3)、0.46(1-21/WT)、0.39(1-23/WT)、0.41(1-21/3-3)和1.2(1-23/3.3)。
实施例16-治疗性硬皮病研究
在博莱霉素诱导的硬皮病模型中评估了抗CCR6耗竭抗体的治疗效果。简言之,使6周龄的C57/BL6小鼠在动物房中适应环境7天。
将博来霉素(BLM)(Sigma)用PBS稀释至200μg/ml。将100μl博来霉素或PBS(媒介物)皮下注射到小鼠剃光的背部的单一位置中,每天一次,持续28天。随后从第8天到第27天,每周3次以5mg/kg的剂量腹膜内注射抗人CCR6 mAb(hAB6,如本文所述)来治疗小鼠。通过i.p.注射同种型对照或PBS来治疗对照小鼠。实验方案的示意图如图24a)所示。
在用博来霉素处理后通常观察到增加的厚度,指示硬皮病。当施用同种型对照抗体时,该厚度增加并持续。然而,如图24b)所示,在注射博莱霉素后接受抗人CCR6抗体的小鼠中,背部皮肤厚度显著减小。
图25显示了小鼠的组织学评估结果。图25a)显示了皮肤组织的H&E、马松三色法和天狼猩红染色,图25b)显示了肺组织的相同染色。
这些结果表明,本发明的抗CCR6耗竭抗体可用于治疗和减轻硬皮病(包括系统性硬皮病)的症状。
序列表
<110> Monash University
<120> CCR6抗体
<130> 53158223AZD
<160> 111
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 374
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 1
Met Ser Gly Glu Ser Met Asn Phe Ser Asp Val Phe Asp Ser Ser Glu
1 5 10 15
Asp Tyr Phe Val Ser Val Asn Thr Ser Tyr Tyr Ser Val Asp Ser Glu
20 25 30
Met Leu Leu Cys Ser Leu Gln Glu Val Arg Gln Phe Ser Arg Leu Phe
35 40 45
Val Pro Ile Ala Tyr Ser Leu Ile Cys Val Phe Gly Leu Leu Gly Asn
50 55 60
Ile Leu Val Val Ile Thr Phe Ala Phe Tyr Lys Lys Ala Arg Ser Met
65 70 75 80
Thr Asp Val Tyr Leu Leu Asn Met Ala Ile Ala Asp Ile Leu Phe Val
85 90 95
Leu Thr Leu Pro Phe Trp Ala Val Ser His Ala Thr Gly Ala Trp Val
100 105 110
Phe Ser Asn Ala Thr Cys Lys Leu Leu Lys Gly Ile Tyr Ala Ile Asn
115 120 125
Phe Asn Cys Gly Met Leu Leu Leu Thr Cys Ile Ser Met Asp Arg Tyr
130 135 140
Ile Ala Ile Val Gln Ala Thr Lys Ser Phe Arg Leu Arg Ser Arg Thr
145 150 155 160
Leu Pro Arg Ser Lys Ile Ile Cys Leu Val Val Trp Gly Leu Ser Val
165 170 175
Ile Ile Ser Ser Ser Thr Phe Val Phe Asn Gln Lys Tyr Asn Thr Gln
180 185 190
Gly Ser Asp Val Cys Glu Pro Lys Tyr Gln Thr Val Ser Glu Pro Ile
195 200 205
Arg Trp Lys Leu Leu Met Leu Gly Leu Glu Leu Leu Phe Gly Phe Phe
210 215 220
Ile Pro Leu Met Phe Met Ile Phe Cys Tyr Thr Phe Ile Val Lys Thr
225 230 235 240
Leu Val Gln Ala Gln Asn Ser Lys Arg His Lys Ala Ile Arg Val Ile
245 250 255
Ile Ala Val Val Leu Val Phe Leu Ala Cys Gln Ile Pro His Asn Met
260 265 270
Val Leu Leu Val Thr Ala Ala Asn Leu Gly Lys Met Asn Arg Ser Cys
275 280 285
Gln Ser Glu Lys Leu Ile Gly Tyr Thr Lys Thr Val Thr Glu Val Leu
290 295 300
Ala Phe Leu His Cys Cys Leu Asn Pro Val Leu Tyr Ala Phe Ile Gly
305 310 315 320
Gln Lys Phe Arg Asn Tyr Phe Leu Lys Ile Leu Lys Asp Leu Trp Cys
325 330 335
Val Arg Arg Lys Tyr Lys Ser Ser Gly Phe Ser Cys Ala Gly Arg Tyr
340 345 350
Ser Glu Asn Ile Ser Arg Gln Thr Ser Glu Thr Ala Asp Asn Asp Asn
355 360 365
Ala Ser Ser Phe Thr Met
370
<210> 2
<211> 28
<212> PRT
<213> 智人
<400> 2
Met Ser Gly Glu Ser Met Asn Phe Ser Asp Val Phe Asp Ser Ser Glu
1 5 10 15
Asp Tyr Phe Ala Ser Val Asn Thr Ser Tyr Tyr Thr
20 25
<210> 3
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠(Mus musculus)
<400> 3
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1 5
<210> 4
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 4
Ile Thr Asn Gly Asp Gly Arg Thr
1 5
<210> 5
<211> 12
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 5
Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr
1 5 10
<210> 6
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 6
Gly Phe Ser Phe Ser Asp Tyr Tyr
1 5
<210> 7
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 7
Ile Thr Asn Gly Gly Gly Arg Thr
1 5
<210> 8
<211> 8
<212> PRT
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Ile Thr Asn Gly Ala Gly Arg Thr
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
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1 5
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<212> PRT
<213> 小鼠
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<210> 11
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
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Gly Phe Pro Phe Ser Asp Tyr Tyr
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<212> PRT
<213> 小鼠
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Ile Thr Asn Gly Val Gly Arg Thr
1 5
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<212> PRT
<213> 小鼠
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Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Ala Tyr
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<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 14
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1 5
<210> 15
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 15
Ile Tyr Pro Arg Ser Gly Asn Thr
1 5
<210> 16
<211> 11
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 16
Ala Arg Ser Pro Tyr Asp Gly Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10
<210> 17
<211> 11
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 17
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<211> 3
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 18
Lys Val Ser
1
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<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 19
Phe Gln Gly Ser His Val Pro Leu Thr
1 5
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<211> 11
<212> PRT
<213> 小鼠
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Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
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<213> 小鼠
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Gln Ser Leu Leu His Ile Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 22
<211> 3
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 22
Arg Val Ser
1
<210> 23
<211> 9
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 23
Ser Gln Ser Thr His Val Pro Arg Thr
1 5
<210> 24
<211> 25
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 24
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser
20 25
<210> 25
<211> 25
<212> PRT
<213> 小鼠
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Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Glu Ala Ser
20 25
<210> 26
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<212> PRT
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Glu Val Lys Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser
20 25
<210> 27
<211> 25
<212> PRT
<213> 小鼠
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Gln Asp Gln Leu Gln Gln Ser Gly Val Ala Leu Ala Arg Pro Gly Ala
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Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser
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<211> 17
<212> PRT
<213> 小鼠
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Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val Thr
1 5 10 15
Tyr
<210> 29
<211> 17
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 29
Leu Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val Thr
1 5 10 15
Tyr
<210> 30
<211> 17
<212> PRT
<213> 小鼠
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Leu Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val Ala
1 5 10 15
Tyr
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<211> 17
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 31
Leu Gly Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile Gly
1 5 10 15
Glu
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<212> PRT
<213> 小鼠
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Tyr Tyr Ser Asp Thr Val Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
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Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Ser Arg Leu Lys Ser Glu Asp
20 25 30
Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
35
<210> 33
<211> 38
<212> PRT
<213> 小鼠
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Tyr Tyr Ser Asp Thr Ile Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
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Ala Arg Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Ser Arg Leu Lys Ser Glu Asp
20 25 30
Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
35
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<213> 小鼠
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Tyr Tyr Ser Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
1 5 10 15
Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Ser Arg Leu Lys Ser Glu Asp
20 25 30
Thr Ser Met Tyr Tyr Cys
35
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<213> 小鼠
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Tyr Tyr Asn Glu Lys Val Lys Gly Lys Val Arg Leu Thr Ala Asp Lys
1 5 10 15
Ser Ser Asn Ser Val Tyr Met Glu Phe Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp
20 25 30
Ser Ala Val Tyr Phe Cys
35
<210> 36
<211> 10
<212> PRT
<213> 小鼠
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Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
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<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 37
Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr Val Ser
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<212> PRT
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Asp Val Leu Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
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Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser
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<210> 39
<211> 26
<212> PRT
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Asp Val Ser Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
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Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser
20 25
<210> 40
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<212> PRT
<213> 小鼠
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Asp Val Val Met Thr His Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser
20 25
<210> 41
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<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 41
Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
1 5 10 15
Tyr
<210> 42
<211> 17
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 42
Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
1 5 10 15
Tyr
<210> 43
<211> 36
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 43
Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
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Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly
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35
<210> 44
<211> 36
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<213> 小鼠
<400> 44
Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
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Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Gly Ala Glu Asp Leu Gly
20 25 30
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35
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<212> PRT
<213> 小鼠
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Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly
20 25 30
Val Tyr Phe Cys
35
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<213> 小鼠
<400> 46
Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg
1 5 10
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<212> PRT
<213> 小鼠
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Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
1 5 10
<210> 48
<211> 118
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 48
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
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<210> 49
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<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 49
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Lys Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly Phe Ser Phe Ser Asp Tyr
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Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
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Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
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115
<210> 50
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<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 50
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Leu Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Thr Tyr Ile Thr Asn Gly Gly Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Thr Val
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Ala Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
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<210> 51
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<213> 小鼠
<400> 51
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
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Thr Tyr Ile Thr Asn Gly Gly Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Thr Val
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Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
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85 90 95
Ala Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
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115
<210> 52
<211> 118
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 52
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
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Thr Tyr Ile Thr Asn Gly Ala Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Thr Val
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<213> 小鼠
<400> 53
Glu Val Lys Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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115
<210> 54
<211> 117
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<213> 小鼠
<400> 54
Gln Asp Gln Leu Gln Gln Ser Gly Val Ala Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Glu Tyr Thr Phe Lys Ser Phe
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Gly Leu Gly Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
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100 105 110
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115
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<211> 113
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 55
Asp Val Leu Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
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Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
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Arg
<210> 56
<211> 113
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 56
Asp Val Ser Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
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Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
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Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
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85 90 95
Ser His Val Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105 110
Arg
<210> 57
<211> 113
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 57
Asp Val Leu Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Ile Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
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85 90 95
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100 105 110
Arg
<210> 58
<211> 113
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 58
Asp Val Leu Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
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Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Gly Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly
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Arg
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<213> 小鼠
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35 40 45
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<213> 小鼠
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gaagtgaacc tggtggagtc tgggggaggc ttagtgcagc ctggagggtc cctgaaactc 60
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gatgttttga tgacccaaac tccactctcc ctgcctgtca gtcttggaga tcaagcctcc 60
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<213> 小鼠
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gatgtttcga tgacccaaac tccactctcc ctgcctgtca gtcttggaga tcaagcctcc 60
atctcttgca gatctagtca gagccttgta catagtaatg gaaacaccta tttagaatgg 120
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<211> 339
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<400> 73
gatgttttga tgacccaaac tccactctcc ctgcctgtca gtcttggaga tcaagcctcc 60
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<400> 75
gatgtttcga tgacccaaac tccactctcc ctgcctgtca gtcttggaga tcaagcctcc 60
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<400> 76
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<212> DNA
<213> 智人
<400> 77
gctagcacca agggcccatc ggtcttcccc ctggcaccct cctccaagag cacctctggg 60
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aaatcttgtg acaaaactca cacatgccca ccgtgcccag cacctgaatt cgagggggga 360
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gaggtcacat gcgtggtggt ggacgtgagc cacgaagacc ctgaggtcaa gttcaactgg 480
tacgtggacg gcgtggaggt gcataatgcc aagacaaagc cgcgggagga gcagtacaac 540
agcacgtacc gtgtggtcag cgtcctcacc gtcctgcacc aggactggct gaatggcaag 600
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ctgaccaaga accaggtcag cctgacctgc ctggtcaaag gcttctatcc cagcgacatc 780
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cagaagagtc tctccctgtc tccgggtaaa 990
<210> 78
<211> 990
<212> DNA
<213> 智人
<400> 78
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<212> DNA
<213> 智人
<400> 79
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<213> 智人
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<211> 17
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<213> 智人
<400> 81
Leu Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala
1 5 10 15
Tyr
<210> 82
<211> 38
<212> PRT
<213> 智人
<400> 82
Tyr Tyr Ser Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
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<400> 84
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser
20 25
<210> 85
<211> 17
<212> PRT
<213> 智人
<400> 85
Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Arg Leu Leu Ile
1 5 10 15
Tyr
<210> 86
<211> 36
<212> PRT
<213> 智人
<400> 86
Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
1 5 10 15
Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly
20 25 30
Val Tyr Tyr Cys
35
<210> 87
<211> 11
<212> PRT
<213> 智人
<400> 87
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
1 5 10
<210> 88
<211> 118
<212> PRT
<213> 智人
<400> 88
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Pro Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Leu Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Tyr Ile Thr Asn Gly Val Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Asp Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
115
<210> 89
<211> 113
<212> PRT
<213> 智人
<400> 89
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Ile Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly
85 90 95
Ser His Val Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
Arg
<210> 90
<211> 25
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 90
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Ile Leu Ser Cys Glu Ala Ser
20 25
<210> 91
<211> 38
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 91
Tyr Tyr Ser Asp Ala Ile Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
1 5 10 15
Ala Arg Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Ser Arg Leu Lys Ser Glu Asp
20 25 30
Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
35
<210> 92
<211> 118
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 92
Glu Val Asn Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Ile Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly Phe Ser Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Thr Tyr Ile Thr Asn Gly Gly Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Ala Ile
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Arg Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Ser Arg Leu Lys Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
115
<210> 93
<211> 113
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 93
Asp Val Ser Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly
85 90 95
Ser His Val Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105 110
Arg
<210> 94
<211> 11
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 94
Arg Ser Ile Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 95
<211> 25
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 95
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser
20 25
<210> 96
<211> 118
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 96
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Pro Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Leu Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Tyr Ile Thr Asn Gly Val Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Asp Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
115
<210> 97
<211> 118
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 97
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Pro Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Leu Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Tyr Ile Thr Asn Gly Val Gly Arg Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Asp Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
115
<210> 98
<211> 113
<212> PRT
<213> 小鼠
<400> 98
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Arg Ser Ile Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Glu Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Lys Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly
85 90 95
Ser His Val Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
Arg
<210> 99
<211> 354
<212> DNA
<213> 智人
<400> 99
gaggtgcagc tggtggaatc cggcggagga ctggtgcagc ctggcggctc cctgagactg 60
tcttgcgccg cctccggctt ccccttctcc gactactacc tgtactgggt ccgacaggcc 120
ccaggcaagg gcctggaatg ggtggcctac atcaccaacg gcgtgggccg gacctactac 180
tccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa caccctgtac 240
ctgcagatga actccctgcg ggacgaggac accgccgtgt actactgcac ctccccaccc 300
ctgggcggag cttggtttgc ttactggggc cagggcaccc tggtcaccgt gtcc 354
<210> 100
<211> 336
<212> DNA
<213> 智人
<400> 100
gacatcgtga tgacccagtc ccccctgtcc ctgcctgtga cacctggcga gcccgcctcc 60
atctcctgcc ggtcctccca gtccatcgtg cactccaacg gcaacaccta cctggaatgg 120
tatctgcaga agcccggcca gtcccctcgg ctgctgatct acaaggtgtc caagcggttc 180
tccggcgtgc ccgacagatt ctccggctct ggctccggca ccgacttcac cctgaagatc 240
tcccgggtgg aagccgagga cgtgggcgtg tactactgtt ttcaaggctc ccacgtgccc 300
ctgaccttcg gccagggcac caagctggaa atcaag 336
<210> 101
<211> 29
<212> PRT
<213> 智人
<400> 101
Tyr Phe Ala Ser Val Asn Thr Ser Tyr Tyr Thr Val Asp Ser Glu Met
1 5 10 15
Leu Leu Cys Thr Leu His Glu Val Arg Gln Phe Ser Arg
20 25
<210> 102
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(1)
<223> X等于G或E
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> X等于F或Y
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于T或S或P
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> X等于S或K
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> X等于D或S
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> X等于Y或F
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> X等于Y或G
<400> 102
Xaa Xaa Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5
<210> 103
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于S或T或P
<400> 103
Gly Phe Xaa Phe Ser Asp Tyr Tyr
1 5
<210> 104
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> X等于T或Y
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于N或P
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> X等于G或R
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> X等于D或G或A或V或S
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> X等于R或N
<400> 104
Ile Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Thr
1 5
<210> 105
<211> 8
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> X等于D或G或A或V
<400> 105
Ile Thr Asn Gly Xaa Gly Arg Thr
1 5
<210> 106
<211> 12
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(1)
<223> X等于T或A
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> X等于S或R
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于P或S
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> X等于L或Y
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> X等于G或D
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> X等于A或者无残基
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (9)..(9)
<223> X等于W或Y
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (11)..(11)
<223> X等于G或A或D
<400> 106
Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Phe Xaa Tyr
1 5 10
<210> 107
<211> 12
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(1)
<223> X等于A或T
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (11)..(11)
<223> X等于G或A
<400> 107
Xaa Ser Pro Pro Leu Gly Gly Ala Trp Phe Xaa Tyr
1 5 10
<210> 108
<211> 11
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于I或L
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> X等于V或L
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> X等于S或I
<400> 108
Gln Ser Xaa Xaa His Xaa Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 109
<211> 11
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于I或L
<400> 109
Gln Ser Xaa Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 110
<211> 3
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(1)
<223> X等于K或R
<400> 110
Xaa Val Ser
1
<210> 111
<211> 9
<212> PRT
<213> 小鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(1)
<223> X等于F或S
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> X等于G或S
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> X等于S或T
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> X等于L或R
<400> 111
Xaa Gln Xaa Xaa His Val Pro Xaa Thr
1 5

Claims (57)

1.一种抗原结合蛋白,其包含结合CCR6的抗原结合结构域,其中优选地所述抗原结合蛋白抑制MIP-3α与CCR6结合。
2.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合肽,其中该肽:
-由SEQ ID NO:2的序列组成;或
-由SEQ ID NO:2序列内的序列组成,所述肽可作为免疫原用于产生能够与CCR6结合的抗体。
3.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合:
-由CCR6的氨基酸1-28组成的肽,和/或
-由CCR6的氨基酸18-46组成的肽。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述CCR6是人CCR6。
5.根据权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,以及
FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a,
其中:
FR1、FR2、FR3和FR4各自是框架区;
CDR1、CDR2和CDR3各自是互补决定区;
FR1a、FR2a、FR3a和FR4a各自是框架区;
CDR1a、CDR2a和CDR3a各自是互补决定区;
其中任何所述框架区或互补决定区的序列如本文所述。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,以及
FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a,
其中:
FR1、FR2、FR3和FR4各自是框架区;
CDR1、CDR2和CDR3各自是互补决定区;
FR1a、FR2a、FR3a和FR4a各自是框架区;
CDR1a、CDR2a和CDR3a各自是互补决定区;
其中任何所述互补决定区的序列具有如本文表1或2中所述的氨基酸序列,并且其中优选地所述框架区具有如表3或4中所述的氨基酸序列。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含:
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-连接子-FR1a-CDR1a-FR2a-CDR2a-FR3a-CDR3a-FR4a。
8.根据权利要求7所述的抗原结合蛋白,其中所述连接子是一种化学物质,一个或多个氨基酸或者两个半胱氨酸残基之间形成的二硫键。
9.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3的VH,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:13中所示的序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:88中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:89中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:88中所示序列;
(vii)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17所示序列,所述CDR 2包含SEQ ID NO:18所示序列,并且所述CDR3包含SEQ ID NO:19所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:89中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示序列;以及VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR 2包含SEQ IDNO:18所示序列,并且所述CDR3包含SEQ ID NO:19所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:88中所示序列,和VL,其包含SEQ ID NO:89中所示序列。
10.根据权利要求9所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白进一步包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含与SEQ ID NO:80中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:81中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:82中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,和所述FR4包含与SEQ ID NO:83中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含与SEQ ID NO:84中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:85中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:86中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述FR4包含与SEQ ID NO:87中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ ID NO:80中所示序列,所述FR2包含SEQ ID NO:81中所示序列,所述FR3包含SEQ ID NO:82中所示序列和所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ ID NO:84中所示序列、所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示序列、所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示序列和所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ ID NO:80中所示序列、所述FR2包含SEQ ID NO:81中所示序列,所述FR3包含SEQ ID NO:82中所示的序列以及所述FR4包含SEQ ID NO:83中所示序列;以及VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQID NO:84中所示序列、所述FR2包含SEQ ID NO:85中所示的序列、所述FR3包含SEQ ID NO:86中所示序列和所述FR4包含SEQ ID NO:87中所示序列。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含SEQID NO:88和89中所示氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
12.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:15中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:96或97中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示的序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:89中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1含有SEQ ID NO:11中所示序列、所述CDR2含有SEQ ID NO:12中所示的序列和所述CDR3含有SEQ ID NO:5中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:96或97中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR 2包含SEQ ID NO:18中所示序列,并且所述CDR3包含SEQ ID NO.19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:89中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;以及VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR 2包含SEQ IDNO:18中所示序列,并且所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:96或97中所示序列;和VL,其包含SEQ ID NO:89中所示序列。
13.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一个:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:13中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:88中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:94中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:98中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:88中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:94中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:98中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:94中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:88中所示序列;和VL,其包含SEQ ID NO:98中所示序列。
14.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一项:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,和所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:96或97中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:94中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:98中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:96或97中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:94中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:98中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示的序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:94中所示序列,所述CDR2包含SEQ IDNO:18中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:96或97中所示序列;和VL,其包含SEQ ID NO:98中所示序列。
15.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中
CDR1具有选自由以下组成的组的序列:(G/E)(F/Y)(T/S/P)F(S/K)(D/S)(Y/F)(Y/G),GF(S/T/P)FSDYY,GFTFSDYY(SEQ ID NO:3),GFSFSDYY(SEQ ID NO:6),GFPFSDYY(SEQ IDNO:11)和EYTFKSFG(SEQ ID NO:14);
CDR2具有选自由以下组成的组的序列:I(T/Y)(N/P)(G/R)(D/G/A/V/S)G(R/N)T,ITNG(D/G/A/V)GRT,ITNGDGRT(SEQ ID NO:4),ITNGGGRT(SEQ ID NO:7),ITNGAGRT(SEQ ID NO:9),ITNGVGRT(SEQ ID NO:12)和IYPRSGNT(SEQ ID NO:15);
CDR3具有选自由以下组成的组的序列:(T/A)(S/R)(P/S)P(L/Y)(G/D)G(A/-)(W/Y)F(G/A/D)Y,(A/T)SPPLGGAWF(G/A)Y,TSPPLGGAWFGY(SEQ ID NO:5),ASPPLGGAWFGY(SEQ IDNO:8),ASPPLGGAWFAY(SEQ ID NO:10),TSPPLGGAWFAY(SEQ ID NO:13)和ARSPYDGYFDY(SEQID NO:16);
CDR1a具有选自由以下组成的组的序列:QS(I/L)(V/L)H(S/I)NGNTY,QS(I/L)VHSNGNTY,QSIVHSNGNTY(SEQ ID NO:17),QSLVHSNGNTY(SEQ ID NO:20)和QSLLHINGNTY(SEQID NO:21);
CDR2a具有选自(K/R)VS、RVS(SEQ ID NO:22)和KVS(SEQ ID NO:18)的序列;和
CDR3a具有选自(F/S)Q(G/S)(S/T)HVP(L/R)T、FQGSHVPLT(SEQ ID NO:19)和SQSTHVPRT(SEQ ID NO:23)的序列。
16.根据权利要求15所述的抗原结合蛋白,其中:
FR1具有选自由以下组成的组的序列:
EVNLVESGGGLVQPGGSLKLSCAAS(SEQ ID NO:24),
EVNLVESGGGLVQPGGSLKLSCEAS(SEQ ID NO:25),
EVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCAAS(SEQ ID NO:26),
QDQLQQSGVALARPGASVKLSCKAS(SEQ ID NO:27),
EVNLVESGGGLVQPGGSLILSCEAS(SEQ ID NO:90),和
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:80);
FR2具有选自由以下组成的组的序列:
MYWVRQTPEKRLEWVTY(SEQ ID NO:28),
LYWVRQTPEKRLEWVTY(SEQ ID NO:29),
LYWVRQTPEKRLEWVAY(SEQ ID NO:30),
LGWVKQRPGQGLEWIGE(SEQ ID NO:31),和
LYWVRQAPGKGLEWVAY(SEQ ID NO:81);
FR3具有选自由以下组成的组的序列:
YYSDTVRGRFTISRDNAKNTLYLQMSRLKSEDTAMYYC(SEQ ID NO:32),
YYSDTIRGRFTISRDNARNTLYLQMSRLKSEDTAMYYC(SEQ ID NO:33),
YYSDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSRLKSEDTSMYYC(SEQ ID NO:34),
YYNEKVKGKVRLTADKSSNSVYMEFRSLTSEDSAVYFC(SEQ ID NO:35),
YYSDAIRGRFTISRDNARNTLYLQMSRLKSEDTAMYYC(SEQ ID NO:91),和
YYSDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRDEDTAVYYC(SEQ ID NO:82);
FR4具有序列:WGQGTLVTVS(SEQ ID NO:36)或WGQGTTLTVS(SEQ ID NO:37);
FR1a具有选自由以下组成的组的序列:
DVLMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSS(SEQ ID NO:38),
DVSMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSS(SEQ ID NO:39),
DVVMTHSPLSLPVSLGDQASISCRSS(SEQ ID NO:40),和
DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSS(SEQ ID NO:84);
FR2a具有序列:LEWYLQKPGQSPKLLIY(SEQ ID NO:41),LHWYLQKPGQSPKLLIY(SEQ ID NO:42)或LEWYLQKPGQSPRLLIY(SEQ ID NO:85);
FR3a具有选自由以下组成的组的序列:
KRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYC(SEQ ID NO:43),
KRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVGAEDLGVYYC(SEQ ID NO:44),
NRLSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYFC(SEQ ID NO:45),和
KRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC(SEQ ID NO:86);和
FR4a具有序列:FGAGTKLELKR(SEQ ID NO:46),FGGGTKLEIKR(SEQ ID NO:47)或FGQGTKLEIR(SEQ ID NO:87)。
17.根据权利要求1至5中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包含SEQID NO:48至59、88、89、92、93和96至98中任一所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
18.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:4中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:48中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:55中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:4中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:48中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:55中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列、所述CDR2包含SEQ ID NO:4中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列、所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:48中所示序列,和VL,其包含SEQ ID NO:55中所示序列。
19.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:6中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:49中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,和所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:56中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示序列、所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:49中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:56中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:49中所示序列,和VL,其包含SEQ ID NO:56中所示序列。
20.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:8中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:50中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:57中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:50中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR 2包含SEQ ID NO:18中所示序列,并且所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:57中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR 2包含SEQ IDNO:18所示序列,并且所述CDR3包含SEQ ID NO:19所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:50中所示序列,和VL,其包含SEQ ID NO:57中所示序列。
21.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:8中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:51中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,和所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:58中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:8中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:51中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO.19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:58中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO.8中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO.19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:51中所示序列,和VL,其包含SEQ ID NO:58中所示序列。
22.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:3中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:9中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:10中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:52中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:56中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列、所述CDR2包含SEQ ID NO:9中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:10中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:52中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:56中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:3中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:9中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:10中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO.19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:52中所示序列,和VL,其包含SEQ ID NO:56中所示序列。
23.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:11中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:12中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,和所述CDR3包含与SEQ ID NO:13中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:53中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:17中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:18中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:55中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:53中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR 2包含SEQ ID NO:18所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO.19所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:55中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:11中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:12中所示序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:13中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:17中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:53中所示序列;和VL,其包含SEQ ID NO:55中所示序列。
24.根据权利要求23所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白进一步包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含框架区(FR)1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含与SEQ ID NO:26中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:30中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:34中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列和所述FR4包含与SEQ ID NO:36中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含与SEQ ID NO:38中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR2包含与SEQ ID NO:41中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述FR3包含与SEQ ID NO:43中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述FR4包含与SEQ ID NO:46中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iii)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ ID NO:26中所示序列,所述FR2包含SEQ ID NO:30中所示序列,所述FR3包含SEQ ID NO:34中所示序列,所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示序列;
(iv)VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ ID NO:38中所示序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示序列,和所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示序列;或
(v)VH,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ ID NO:26中所示序列,所述FR2包含SEQ ID NO:30中所示序列,所述FR3包含SEQ ID NO:34中所示序列,以及所述FR4包含SEQ ID NO:36中所示序列;和VL,其包含FR1、FR2、FR3和FR4,其中所述FR1包含SEQ IDNO:38中所示序列,所述FR2包含SEQ ID NO:41中所示序列,所述FR3包含SEQ ID NO:43中所示序列,和所述FR4包含SEQ ID NO:46中所示序列。
25.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:14中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:15中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,以及所述CDR3包含与SEQ ID NO:16中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:54中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:21中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:22中所示序列至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,和所述CDR3包含与SEQ ID NO:23中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:59中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:14中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:15中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:16中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:54中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:21中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:22中所示的序列,所述CDR3包含SEQ ID NO:23中所示的序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:59中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:14中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:15中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:16中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:21中所示序列,所述CDR 2包含SEQ IDNO:22中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:23中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:54中所示序列;和VL,其包含SEQ ID NO:59中所示序列。
26.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合结构域结合或特异性结合CCR6,并且其中所述抗原结合结构域包含以下中的至少一种:
(i)VH,其包含互补决定区(CDR)1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:6中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2包含与SEQ ID NO:7中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列和所述CDR3包含与SEQ ID NO:5中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(ii)VH,其包含与SEQ ID NO:92中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(iii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含与SEQ ID NO:20中所示序列至少约60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列,所述CDR2与SEQ ID NO:18中所示序列包含至少约65%、至少约66%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列和所述CDR3包含与SEQ ID NO:19中所示序列至少约60%、至少约70%、至少约75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少97%、至少99%相同的序列;
(iv)VL,其包含与SEQ ID NO:93中所示序列至少约80%、至少85%、至少90%、至少92%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%相同的序列;
(v)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;
(vi)VH,其包含SEQ ID NO:92中所示序列;
(vii)VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:19中所示序列;
(viii)VL,其包含SEQ ID NO:93中所示序列;
(ix)VH,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:6中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:7中所示序列和所述CDR3包含SEQ ID NO:5中所示序列;和VL,其包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含SEQ ID NO:20中所示序列,所述CDR2包含SEQ ID NO:18中所示序列,和所述CDR3包含SEQ ID NO.19中所示序列;或
(x)VH,其包含SEQ ID NO:92中所示序列;和VL,其包含SEQ ID NO:93中所示序列。
27.权利要求1-26中任一项的抗原结合蛋白,其中所述蛋白为以下形式:
(i)单链Fv片段(scFv);
(ii)二聚scFv(di-scFv);
(iii)(i)或(ii)之一与抗体的恒定区、Fc或重链恒定域(CH)2和/或CH3连接;或
(iv)(i)或(ii)之一与结合免疫效应细胞的蛋白质连接;
(v)双抗体;
(vi)三抗体;
(vii)四抗体;
(viii)Fab;
(ix)F(ab')2;
(x)Fv;
(xi)(v)至(x)之一与抗体的恒定区、Fc或重链恒定域(CH)2和/或CH3相连;或
(xii)(v)至(x)之一与结合免疫效应细胞的蛋白质连接。
28.权利要求1-26中任一项的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白是抗体或其抗原结合片段。
29.根据权利要求28所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白是单克隆抗体或其片段,任选地是可变结构域。
30.根据权利要求5至8中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述蛋白包含以下氨基酸序列(按N至C末端或C至N末端)、基本上由其组成或由其组成:
-SEQ ID NO:88和89;
-SEQ ID NO:96和98;
-SEQ ID NO:97和98;
-SEQ ID NO:88和98;
-SEQ ID NO:96和89;
-SEQ ID NO:97和89;
-SEQ ID NO:48和55;
-SEQ ID NO:49和56;
-SEQ ID NO:50和57;
-SEQ ID NO:51和58;
-SEQ ID NO:52和56;
-SEQ ID NO:53和55;
-SEQ ID NO:54和59;或
-SEQ ID NO:92和93。
31.根据权利要求1至30中任一项所述的抗原结合蛋白,其进一步包含Fc区,其中所述Fc区经改造以具有降低的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力。
32.根据权利要求31所述的抗原结合蛋白,其中所述经改造以具有降低的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力的Fc区在根据SEQ ID NO:60的位置234、235和331处(其中丙氨酸为位置118)或者在234、235和331的等效位置处被突变、缺失或修饰。
33.根据权利要求32所述的抗原结合蛋白,其中所述突变为L234F、L235E和P331S。
34.根据权利要求32所述的抗原结合蛋白,其中所述Fc区包含SEQ ID NO:61中所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
35.根据权利要求1至30中任一项所述的抗原结合蛋白,其进一步包含Fc区,其中所述Fc区经改造以具有增强的诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的能力。
36.根据权利要求35所述的抗原结合蛋白,其中所述增强的诱导ADCC的能力是通过对Fc区中与Fc受体相互作用的氨基酸进行的突变、缺失或修饰赋予的。
37.根据权利要求36所述的抗原结合蛋白,其中被突变、缺失或修饰的氨基酸位于按照SEQ ID NO:60中的239、330和/或332位(其中丙氨酸为118位)或者239、330和/或332的等效位置,其中优选地,所述氨基酸被突变为S239D、A330L和I332E。
38.根据权利要求37所述的抗原结合蛋白,其中所述Fc包含SEQ ID NO:62中所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
39.根据权利要求9或10所述的抗原结合蛋白,其中所述Fc包含SEQ ID NO:62中所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
40.根据权利要求11至14中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述Fc包含SEQ ID NO:62中所示的氨基酸序列、基本上由其组成或由其组成。
41.根据权利要求1至40中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白为免疫球蛋白可变结构域、抗体、dab、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、双抗体、三抗体、线性抗体、单链抗体分子或多特异性抗体的形式。
42.一种核酸,其编码根据权利要求1至41中任一项的抗原结合蛋白。
43.一种载体,其中包含根据权利要求42所述的核酸。
44.一种细胞,其中包含根据权利要求43所述的载体或根据权利要求36所述的核酸。
45.一种药物组合物,其中包含根据权利要求1至41中任一项所述的抗原结合蛋白和药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。
46.一种用于治疗或预防与CCR6表达相关的病况或疾病的方法,其中包括向有此需要的受试者施用根据权利要求1至41中任一项所述的抗原结合蛋白或根据权利要求45所述的药物组合物,从而治疗或预防受试者中与所述CCR6的表达相关的所述病况或疾病。
47.根据权利要求46所述的方法,其中与CCR6的表达相关的疾病或病况是炎性病况、自身免疫疾病、感染、纤维化或癌症或肺病症。
48.根据权利要求47所述的方法,其中所述炎性病况是心血管炎症、胃肠炎症、肝脏炎性病症、肺部炎症、肾脏炎症、眼部炎症、胰腺炎症、泌尿生殖系统炎症、神经炎性病症、过敏、骨骼炎症、由感染引起的炎症、由移植引起的或响应于移植的炎症。
49.根据权利要求47所述的方法,其中所述自身免疫性疾病是获得性免疫缺陷综合征、斑秃、强直、脊柱炎、抗磷脂综合征、自身免疫性艾迪生病、自身免疫性溶血性贫血、自身免疫肝炎、自身免疫内耳病(AIED)、自身免疫淋巴增生综合征(ALPS)、自身免疫血小板缺少性紫癜(ATP)、白塞氏病、心肌病、庚型乳糜泻皮炎;慢性疲劳免疫、功能障碍综合征(CFIDS)、慢性炎症性脱髓鞘多发性神经病(CIPD)、瘢痕性类天疱疮、冷凝集素病、crest综合征、克罗恩病、Degos病、青少年皮肌炎、盘状狼疮、原发性混合冷球蛋白血症、纤维肌痛性纤维肌炎、Graves病、格林-巴利综合征、桥本甲状腺炎、特发性肺纤维化、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、lgA肾病、胰岛素依赖性糖尿病、青少年慢性关节炎(Still’s disease)、青少年类风湿性关节炎、梅尼埃病、混合结缔组织病、多发性硬化症、重症肌无力、顽固性贫血、结节性多动脉炎、多软骨炎、多腺体综合征(polyglandular syndromes)、风湿病多肌痛(polymyalgia rheumatica)、多肌炎(polymyositis)和皮肌炎(dermatomyositis)、原发性无丙种球蛋白血症、原发胆汁性肝硬化、牛皮癣、银屑病性关节炎、雷诺现象(Raynaud'sphenomena)、雷特综合征(Reiter's syndrome)、风湿热、类风湿性关节炎、结节病、硬皮病(进行性系统性硬化症(PSS),也称为系统性硬化(SS))、干燥综合征、僵硬综合征、系统性红斑狼疮、大动脉炎、颞动脉炎/巨细胞动脉炎、溃疡性结肠炎、葡萄膜炎、白癜风或韦格纳肉芽肿病。
50.根据权利要求47所述的方法,其中所述自身免疫性疾病是银屑病。
51.根据权利要求47所述的方法,其中所述自身免疫性疾病是多发性硬化症。
52.根据权利要求47所述的方法,其中所述纤维化为肺纤维化、特发性肺纤维化、囊性纤维化、肝硬化、心肌内纤维化、陈旧性心肌梗死、心房纤维化、纵隔纤维化、骨髓纤维化、腹膜后纤维化、进行性大面积纤维化、肾原性系统性纤维化、克罗恩病、瘢痕瘤(Keloid)、硬皮病/系统性硬化(Scleroderma/systemic sclerosis)、关节纤维化(Arthrofibrosis)、佩罗尼氏病(Peyronie's disease)、掌腱膜挛缩症(Dupuytren's contracture)或粘连性囊炎(adhesive capsulitis)。
53.一种试剂盒或制品,其中包含根据权利要求1至41中任一项所述的抗原结合蛋白或根据权利要求45所述的药物组合物。
54.根据权利要求1到41中任一项所述的抗原结合蛋白用于制备药物的用途,其中所述药物用于治疗炎性病症、自身免疫疾病、感染、纤维化或癌症、肺疾病或与CCR6的表达相关的病况或疾病,优选地,其中所述疾病是炎性疾病或自身免疫疾病。
55.根据权利要求1到41中任一项所述的抗原结合蛋白,用于治疗炎性病况、自身免疫疾病、感染、纤维化或癌症、肺部病症或者与CCR6的表达相关的病况或疾病。
56.根据权利要求54所述的用途或用于权利要求55的用途的抗原结合蛋白,其中所述自身免疫性疾病是银屑病。
57.根据权利要求54所述的用途或用于权利要求55的用途的抗原结合蛋白,其中所述自身免疫疾病是多发性硬化症。
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