CN116801897A - 包含嗜乳脂蛋白的同二聚体和异二聚体蛋白 - Google Patents
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Abstract
本公开尤其涉及组合物和方法,包括发现可用于治疗疾病如用于癌症和自身免疫的免疫疗法的异二聚体蛋白和嵌合蛋白,所述异二聚体蛋白和嵌合蛋白包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的部分。
Description
优先权
本申请要求2020年10月26日提交的美国申请第63/105,744号的权益和优先权,该申请通过引用以其整体并入本文。
技术领域
本公开涉及发现可用于治疗疾病如用于癌症和自身免疫的免疫疗法的异二聚体蛋白。
以电子方式提交的文本文件的说明
以电子方式提交的文本文件的内容通过引用以其整体并入本文:序列表的计算机可读格式副本(文件名:SHK-033PC_116981-5033_ST25;创建日期:2021年4月13日;文件大小:354,746字节)。
背景技术
γδT细胞占人体所有T细胞的多达5%,但它们在抗癌方面发挥着重要作用。最近的研究表明,浸润肿瘤的γδT细胞的数量是对患者有利结果的极好预测指标。此外,与CAR-T疗法中常用的αβT细胞不同,γδT细胞在先天免疫应答中发挥作用。γδT细胞在癌症中的预后意义促使人们努力操纵γδT细胞作为癌症的治疗策略。目前的方法仅限于离体策略,其中收获和修饰患者的γδT细胞以表达嵌合抗原受体,和/或将其在细胞培养中扩增到更多数量,然后将修饰的γδT细胞输注回癌症患者体内(Front Immunol.2018年6月26日;9:1409)。直接在癌症患者体内操纵γδT细胞的策略因无法最终鉴定由γδT细胞受体直接识别的分子实体而受阻(Nat Immunol.20(2):121-128(2019))。事实上,最广泛接受的γδT细胞活化剂主要包括细胞内分子,如热休克蛋白、焦磷酸异戊酯(IPP)生物合成的非甲羟戊酸途径的中间体(包括HMB-PP)、细胞内细菌(例如分枝杆菌和李斯特菌)、病毒(例如巨细胞病毒)和其他脂质抗原。
因此,仍然需要不需要使用上述分子的γ-δT细胞接合的新组合物和方法。
发明概述
因此,在一个方面,本公开提供了一种异二聚体蛋白,其包含:(a)包含BTN2A1和/或BTN3A1嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域并促进异二聚化的接头。
在一个方面,本公开涉及包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)包含BTN2A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)包含BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
在一个方面,本公开涉及包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段,和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。
在一个方面,本公开涉及异二聚体蛋白,其包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。在实施方案中,两个异二聚体蛋白缔合形成异二聚体。
在实施方案中,靶向结构域能够结合癌细胞表面上的CD19。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,抗体样分子是scFv。
在实施方案中,异二聚体蛋白能够接合γ-δT细胞。在实施方案中,γδT细胞是Vγ9δ2T细胞。
在实施方案中,该蛋白调节γδT细胞的功能。在实施方案中,γδT细胞是Vγ9δ2T细胞。
在实施方案中,α链和β链自缔合形成异二聚体。
在多个方面,本公开的异二聚体蛋白用于同时活化γδT细胞并将其靶向肿瘤细胞,调节患者的免疫应答,和/或在体内刺激γδT细胞的增殖。因此,在各个方面,本公开的异二聚体蛋白用于治疗癌症、感染性疾病或自身免疫性疾病的方法,包括向有需要的患者施用有效量的包含异二聚体蛋白的药物组合物。
在多个方面,本公开的异二聚体蛋白用于通过向有需要的受试者施用有效量的本公开的药物组合物从而引起γδT细胞的体内增殖和/或使有效量的本公开的药物组合物与来源于有需要的受试者的细胞接触从而引起γδT细胞的离体增殖来刺激γδT细胞的增殖。
在多个方面,本公开的异二聚体蛋白用于在不存在热休克蛋白、焦磷酸异戊酯(IPP)生物合成的非甲羟戊酸途径的中间体(包括HMB-PP)、细胞内细菌(例如分枝杆菌和李斯特菌)、病毒(例如巨细胞病毒)和其他脂质抗原的情况下刺激γδT细胞的增殖。
同样在多个方面,本发明的异二聚体蛋白用于治疗自身免疫性疾病的方法中,该方法包括向有需要的患者施用有效量的包含异二聚体蛋白的药物组合物。在又一些方面,本发明的异二聚体蛋白用于治疗感染的方法中,所述感染包括但不限于病毒或其他细胞内病原体感染。在另一些方面,本发明的异二聚体蛋白用于治疗癌症的方法中。
在多个方面还提供了药物组合物,其包含本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白、包含编码本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白的核酸的表达载体或包含表达载体的宿主细胞,所述表达载体包含编码本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白的核酸。本文公开的任何方面或实施方案可以与本文公开的任何其他方面或实施方案组合。
在一个方面,本公开提供了异二聚体蛋白:(a)第一结构域,其包含(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头,其中BTN2A1蛋白或其片段与BTN3A1蛋白或其片段通过第二接头连接。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。
在一个方面,本公开提供了包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)第一结构域,其包含(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)第一结构域(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。
在一个方面,本公开涉及具有以下通用结构的嵌合蛋白:N末端-(a)-(b)-(c)-C末端,其中:(a)是包含通用结构(a1)-SL-(a2)的第一结构域,其中(a1)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,(a2)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,并且SL是连接(a1)和(a2)的第二接头,其包含约4至约50个氨基酸长度的柔性氨基酸序列,并且(c)是包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)膜蛋白的胞外结构域。(b)是连接第一结构域和第二结构域的接头,其中接头包含至少一个能够形成二硫键的半胱氨酸残基。
在实施方案中,(a1)和(a2)是两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,(a1)和(a2)是不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,(a1)和/或(a2)是包含可变结构域的嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段。在实施方案中,(a1)和(a2)包含独立选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白独立地选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。
在实施方案中,靶向结构域能够结合癌细胞表面上的抗原。在实施方案中,靶向结构域包含选自LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19或PSMA的膜蛋白的胞外结构域。
在实施方案中,靶向结构域是抗体或其抗原结合片段。在实施方案中,结合片段包含Fv结构域。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,结合片段包含scFv结构域。
在实施方案中,靶向结构域特异性结合以下中的一种:CLEC12A、CD307、gpA33、间皮素(mesothelin)、CDH17、CDH3/P-钙黏着蛋白(cadherin)、CEACAM5/CEA、EPHA2、NY-eso-1、GP100、MAGE-A1、MAGE-A4、MSLN、CLDN18.2、Trop-2、ROR1、CD123、CD33、CD20、GPRC5D、GD2、CD276/B7-H3、DLL3、PSMA、CD19、cMet、HER2、A33、TAG72、5T4、CA9、CD70、MUC1、NKG2D、CD133、EpCam、MUC17、EGFRvIII、IL13R、CPC3、GPC3、FAP、BCMA、CD171、SSTR2、FOLR1、MUC16、CD274/PDL1、CD44、KDR/VEGFR2、PDCD1/PD1、TEM1/CD248、LeY、CD133、CELEC12A/CLL1、FLT3、IL1RAP、CD22、CD23、CD30/TNFRSF8、FCRH5、SLAMF7/CS1、CD38、CD4、PRAME、EGFR、PSCA、STEAP1、CD174/FUT3/LeY、L1CAM/CD171、CD22、CD5、LGR5、LGR5、CLL-1和GD3。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD19。在实施方案中,靶向结构域特异性结合PSMA。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD33。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CLL-1。
在实施方案中,接头包含铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在实施方案中,铰链-CH2-CH3Fc结构域来源于IgG1,任选地人IgG1。在实施方案中,铰链-CH2-CH3 Fc结构域来源于IgG4,任选地人IgG4。
在实施方案中,嵌合蛋白是同二聚体。
在一个方面,本公开涉及药物组合物,其包含本文公开的任何实施方案的嵌合蛋白。
在一个方面,本公开涉及表达载体,其包含编码本文公开的任何实施方案的嵌合蛋白的第一多肽链和/或第二多肽链的核酸。在实施方案中,表达载体是哺乳动物表达载体。在实施方案中,表达载体包含DNA或RNA。
在一个方面,本公开涉及宿主细胞,其包含本文公开的任何实施方案的表达载体。
在一个方面,本公开涉及同时活化γδT细胞并将其靶向肿瘤细胞的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物给有需要的受试者。
在一个方面,本公开涉及一种调节患者的免疫应答的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物。
在一个方面,本公开涉及一种刺激γδT细胞增殖的方法,包括:向有此需要的受试者施用有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物,从而引起γδT细胞的体内增殖和/或使有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物与来源于有需要的受试者的细胞接触,从而引起γδT细胞的离体增殖。
在实施方案中,受试者的T细胞被第一结构域活化。在实施方案中,受试者具有肿瘤并且γδT细胞调节肿瘤细胞。
在一个方面,本公开涉及一种治疗癌症的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物给有需要的受试者。在实施方案中,癌症是淋巴瘤。在实施方案中,癌症是白血病。
附图简要说明
图1A显示了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白的非限制性示意图,其包含以下的异二聚体:i)经由接头与人CD19特异性scFv连接的人嗜乳脂蛋白BTN2A1,和ii)与人CD19特异性scFv连接的人嗜乳脂蛋白BTN3A1。这种γδT细胞衔接物构建体在本文中也称为BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv“GADLEN”蛋白。图1B显示了使用FcXL色谱法的纯化的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的示例性色谱图。该蛋白是通过用BTN2A1-Fc-CD19scFv(“α”链)和BTN3A1-Fc-CD19scFv(“β”链)构建体双重转染ExpiCHO或Expi293细胞而产生的,其中所谓的α和β构建体包含带电荷的极化接头结构域,其促进所需的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白的异二聚化。
图2A至图2C显示了纯化的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的凝胶电泳和蛋白质印迹分析。图2A显示了用考马斯蓝染色的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的SDS-PAGE凝胶图像,表明>90%的纯度。图2B显示了纯化的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白的蛋白质印迹分析。在用抗人BTN2A1抗体、抗人BTN3A1抗体或抗小鼠Fc抗体检测后,使用非还原(泳道“NR”)、还原(泳道“R”)以及还原且去糖基化(泳道“DG”)条件,通过蛋白质印迹分析纯化的蛋白质。结果表明存在二硫键连接的蛋白,该蛋白还原为两个单独的蛋白(在用β-巯基乙醇破坏链间二硫键后),其分子量与预测的α和β链分子量一致。基于还原泳道与还原且去糖基化泳道之间的相似性,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN构建体似乎几乎没有糖基化。图2C显示纯化的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的双色蛋白质印迹分析。在用与Starbright Blue520缀合的抗人BTN2A1抗体和与Dylite800缀合的抗人BTN3A1抗体检测后,使用非还原(泳道“NR”)、还原(泳道“R”)以及还原且去糖基化(泳道“DG”)条件,通过蛋白质印迹分析纯化的蛋白。双色蛋白质印迹表明存在BTN2A1-α和BTN3A1-β链。
图3显示了使用Octet系统(ForteBio)测定的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与重组CD19-His蛋白的结合动力学。使用BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白固定和检测重组CD19-His蛋白。使用缺乏CD19scFv的异二聚体作为阴性对照。如所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白与CD19-His蛋白结合。
图4A和图4B显示了Meso Scale Discovery(MSD)ELISA测定的结果,说明BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白同时结合抗BTN2A1/3A1抗体和CD19。将重组CD19蛋白包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的异二聚体添加到板中以供板结合的重组CD19蛋白捕获。使用抗BTN2A1抗体(图4A)或抗BTN3A1抗体(图4B)使用电化学发光(ECL)读出来检测结合。
图5A至图5C显示了MSD ELISA测定的结果,说明BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与抗BTN2A1和抗BTN3A1抗体同时结合。图5A显示了图5B中使用的MSD ELISA测定的示意图。图5B显示了用抗BTN2A1抗体捕获和用抗BTN3A1抗体检测进行的测定。将抗BTN2A1抗体包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白添加到板中,以供板结合的抗BTN2A1抗体捕获。使用抗BTN3A1抗体检测结合。图5C显示用抗BTN3A1抗体捕获和用抗BTN2A1抗体检测进行的测定。将抗BTN3A1抗体包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白添加到板中,以被板结合的抗BTN3A1抗体捕获。使用抗BTN2A1抗体检测结合。
图6A和图6B显示了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以CD19依赖性方式结合细胞表面。图6A的图显示了通过流式细胞术测定的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与在表面上表达CD19的HEK293细胞(HEK293-CD19细胞)的结合百分比。使用缺乏CD19scFv的异二聚体作为结合的阴性对照。图6B的图显示了通过流式细胞术测定的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白与HEK293亲本细胞的结合百分比。使用缺乏CD19scFv的异二聚体作为结合的阴性对照。
图7A和图7B显示了本文公开的GADLEN蛋白以CD19scFv依赖性方式与Daudi细胞的结合。图7A显示了用同种型对照或抗CD19抗体染色的Daudi细胞的流式细胞术概况,说明Daudi细胞是CD19+。图7B的图显示了显示通过流式细胞术测定的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白或人IgG对照与Daudi细胞的结合百分比。
图8A至图8E展示了人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白特异性结合Vγ9+Vδ2+T细胞。图8A显示了人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与Vγ9+Vδ2+T细胞的细胞表面结合。从健康供体的外周血单核细胞(PBMC)中分离并扩增Vγ9+Vδ2+T细胞。将分离的Vγ9+Vδ2+T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白、缺乏BTN2A1的对照异二聚体蛋白或人IgG对照一起孵育。使用与异二聚体蛋白的Fc结构域结合的APC缀合的抗hFc抗体通过流式细胞术检测结合。图8B显示了人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白不结合Vγ9+Vδ1+T细胞。从健康供体的PBMC中分离和扩增Vγ9+Vδ1+T细胞。将分离的Vγ9+Vδ1+T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或人IgG对照一起孵育。使用与异二聚体蛋白的Fc结构域结合的APC缀合的抗hFc抗体,通过流式细胞术检测结合。图8C显示了人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv蛋白与人Vγ9+δ2+T细胞的结合。从健康供体的外周血单核细胞(PBMC)中分离并扩增Vγ9+Vδ2+T细胞。将分离的Vγ9+Vδ2+T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN或BTN3A1/3A2-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白一起孵育。图8D显示了人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白不结合Vγ9-T细胞。从健康供体的PBMC中分离并扩增Vγ9-T细胞。将分离的Vγ9-T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN或BTN3A1/3A2-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白一起孵育。使用与异二聚体蛋白的Fc结构域结合的APC缀合的抗hFc抗体,通过流式细胞术检测结合。图8E的图显示了与缺乏BTN2A1的异二聚体相比,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与表达Vγ9δ2T细胞受体(TCR)的人γδT细胞的结合。小图显示如通过流式细胞术所显示的,与未染色细胞相比,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白与表达Vγ9δ2TCR的人γδT细胞的结合。
图9A和图9B显示了BTN2A1蛋白与Vγ9+Vδ2+T细胞的细胞表面结合需要二聚化。图9A显示了作为单体存在于溶液中的BTN2A1-His蛋白、Vγ9+Vδ2+T的结合%。与细胞上的CD47结合的SIRPα-His用作阳性对照。使用基于His标签检测的流式细胞术检测结合。图9B显示了通过流式细胞术测量的BTN2A1-Fc、BTN2A1-Fc蛋白、人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白或人IgG对照与Vγ9+Vδ2+T细胞的结合%。BTN2A1-Fc蛋白在溶液中以二聚体形式存在。这些数据表明BTN2A1需要同源二聚化才能与Vγ9+Vδ2T细胞受体相互作用。
图10A至图10E说明用于生产BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体构建体的细胞系开发(CLD)。图10A显示了分别表达α链和β链的2个单基因载体(SGV)的共转染。图10B显示了使用双基因载体(DGV)的转染,该双基因载体在单个载体中在2个单独的启动子下表达α和β链。图10C显示了对于具有带电荷的极化接头的构建体在第14天通过基于MSD-ELISA的摇瓶培养滴度测定的SGV和DGV微型池中BTN2A1-α和BTN3A1-β链的比较。图10D显示了对于具有带电荷的极化接头的构建体通过qRT-PCR评估α和β链在细胞中的表达测定的SGV和DGV微型池中BTN2A1-α和BTN3A1-β链的比较。图10E显示了在Fc结构域中具有KIH突变(KIH-Fc)以及具有KIH突变和FcRn突变(KIH-FcRn)的构建体的DGV微型池中对BTN2A1-α和BTN3A1-β链的比较。
图11显示了GADLEN蛋白的第二种版本的示意图:同二聚体融合蛋白,没有限制,例如BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv同二聚体融合蛋白,其中使用不同种类的接头将BTN2A1和BTN3A1的可变结构域串联在一起,并通过IgG4 Fc序列与CD19scFv序列融合。两条这样的链将同二聚化以形成BTN2A和BTN3A1的功能性四聚体单元,用于Vγ9δ2TCR活化。
图12A和图12B显示了同二聚体GADLEN蛋白的蛋白质印迹分析。在用抗人BTN2A1抗体(图12A)或抗人BTN3A1抗体(图12B)检测后,使用非还原(泳道“NR”)、还原(泳道“R”)条件通过蛋白质印迹分析纯化的BTN2A1V/3A1V-Fc IgG4-CD19scFv(A);2,BTN2A1V/3A1V-FcIgG1-CD19scFv(A);和3,BTN2A1V/3A1V-Fc IgG4-CD19scFv(A2)蛋白。
图13展示了BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与CD19和抗BTN3A1抗体的同时结合,如使用MSD ELISA测定所测量的。将重组CD19蛋白包被在板上,并将所示的BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv GADLEN同二聚体蛋白添加到板上,以供板结合的CD19蛋白捕获。使用抗BTN3A1抗体检测结合。
图14A和图14B显示了通过流式细胞术测定的在存在抗NKG2D抗体(克隆#149810)的情况下,所示的BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv同二聚体蛋白(图14A)或BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv同二聚体蛋白(图14B)对γδT细胞的活化。在抗NKG2D抗体的存在下,使用IgG作为阴性对照。
图15A和图15B显示了使用两种单基因载体(SGV,图15A)和双基因载体(DGV,图15B)方法制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白的尺寸排阻色谱(SEC)概况。
图16显示了使用两种单基因载体(图15A)和双基因载体(图15B)方法制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白的蛋白质印迹分析。将纯化的蛋白在非还原(泳道“NR”)、还原(泳道“R”)以及还原且去糖基化(泳道“D”)条件下进行处理,使用SDS-PAGE分离并用抗人BTN2A1抗体(蓝色条带,三角形箭头)或抗人BTN3A1抗体(绿色条带,方形箭头)检测。
图17显示了比较使用两种单基因载体(SGV)和双基因载体(DGV)产生的BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白参考材料相比与在B细胞淋巴瘤细胞系(Daudi)上表达的CD19的结合的图。人IgG蛋白用作阴性对照,并在6.25μg/ml的最高浓度下进行测试。使用流式细胞术测量结合。
图18显示了比较在抗NKG2D抗体(克隆#149810)的存在下,与BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白参考材料相比,由6.25μg/ml的使用两个单基因载体(SGV)和双基因载体(DGV)产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白诱导的γδT细胞的活化程度的图。γδT细胞的活化以板结合形式测定并通过流式细胞术测定。在抗NKG2D抗体的存在下,IgG用作阴性对照。
图19显示了作为促进异二聚化且不利于同二聚化的结构域的带电荷的极化接头和杵臼(knob-in-hole,KIH)突变的示意图。
图20显示了使用ELISA测定在使用带电荷的极化接头(CPL)方法和KIH突变方法生成的微型池的培养物上清液中测定的BTN2A1-α和BTN3A1-β链的量的条形图。
图21A到图21C显示了使用带电荷的极化接头(CPL)方法(图21A)、KIH突变方法(图21B)和带有FcRn突变的KIH突变方法(KIH-FcRn;图21C)制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白的蛋白质印记分析。在用抗人BTN2A1抗体或抗人BTN3A1抗体检测后,使用非还原(泳道“NR”)、还原(泳道“R”)和还原且去糖基化(泳道“D”)条件通过蛋白质印记分析纯化的蛋白。
图22A到图22C显示与抗NKG2D抗体(克隆#149810)的存下相比,比较使用带电荷的极化接头(CPL)方法、KIH突变方法和带有FcRn突变的KIH突变方法产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白诱导的γδT细胞活化程度的图。基于通过流式细胞术测定的TNFα(图22A)、IFNγ(图22B)和CD107a(图22C)的表达,以板结合形式测量γδT细胞的活化。在抗NKG2D抗体的存在下,使用IgG作为阴性对照。
发明详述
本公开涉及新型嵌合蛋白,其具有尤其靶向γδT细胞并导致它们活化同时还与例如肿瘤细胞形成突触的能力。因此,本发明的多功能嵌合蛋白提供了独特的手段来调节受试者的免疫系统以进行治疗。
本公开的异二聚体蛋白
在一个方面,本公开涉及包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)包含BTN2A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)包含BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
在一个方面,本公开涉及包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。在实施方案中,α链和β链自缔合形成α链和β链的异二聚体,其包含BTN2A12-BTN3A12四聚体。
在一个方面,本公开涉及异二聚体蛋白,其包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。在实施方案中,两个异二聚体蛋白缔合形成两条链的异二聚体,其包含BTN2A12-BTN3A12四聚体。
在一个方面,本公开涉及包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一和第二结构域的α链接头;并且其中β链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的β链接头。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。在实施方案中,α链接头和β链接头自缔合。在实施方案中,α链和β链自缔合形成α和β链的异二聚体,其包含BTN2A12-BTN3A12四聚体。在实施方案中,α链接头和β链接头是带电荷的极化接头,其中α链接头和β链接头中的一个带正电荷,另一个带负电荷。在实施方案中,α链接头和β链接头包含Fc结构域,该Fc结构域包含杵臼(KIH)突变。在实施方案中,α链接头和β链接头包含Fc结构域,该Fc结构域包含KIH突变和FcRn突变。
在实施方案中,α链和β链自缔合形成异二聚体。
在实施方案中,α链的第一结构域包含BTN2A1蛋白的胞外结构域。在实施方案中,α链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:71的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:71的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,β链的第一结构域包含BTN3A1蛋白的胞外结构域。在实施方案中,β链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:19或SEQ ID NO:72的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,β链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:19或SEQ ID NO:72的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
在实施方案中,靶向结构域是抗体或其抗原结合片段。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,抗体样分子选自单结构域抗体、重组仅重链抗体(VHH)、单链抗体(scFv)、鲨鱼仅重链抗体(VNAR)、微蛋白(半胱氨酸结蛋白,打结素(knottin))、DARPin;四联凝素(Tetranectin);亲和体(Affibody);穿膜抗体(Transbody);Anticalin;AdNectin;Affilin;Affimer、微体(Microbody);适体;改变酶(alterase);塑料抗体(plastic antibody);phylomer;stradobody;巨型体(maxibody);evibody;fynomer、犰狳重复蛋白、Kunitz结构域、avimer、atrimer、probody、免疫体(immunobody)、triomab、troybody;肽体(pepbody);疫苗体(vaccibody);单特异性体(UniBody);双特异性体(DuoBody)、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2。
在实施方案中,接头包含(a)与嗜乳脂蛋白家族蛋白连接的第一电荷极化核心结构域,任选地在羧基末端,和(b)与嗜乳脂蛋白家族蛋白连接的第二电荷极化核心结构域,任选地在羧基末端。在实施方案中,接头通过第一和第二电荷极化核心结构域上带正电荷的氨基酸残基和带负电荷的氨基酸残基之间的静电相互作用形成异二聚体。在实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域包含多肽接头,任选地选自柔性氨基酸序列、IgG铰链区或抗体序列。在实施方案中,接头是合成接头,任选地是PEG。在实施方案中,接头包含源自IgG1、任选地人IgG1的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在实施方案中,接头包含源自IgG4、任选地人IgG4的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域还包含在电荷极化核心结构域的氨基和/或羧基末端具有带正电荷和/或带负电荷的氨基酸残基的肽。在实施方案中,带正电荷的氨基酸残基包括选自His、Lys和Arg的一种或多种氨基酸。在实施方案中,带正电荷的氨基酸残基存在于包含第一和/或第二电荷极化核心结构域中的带正电荷氨基酸残基的肽中。在实施方案中,包含带正电荷的氨基酸残基的肽包含选自以下的序列:YnXnYnXnYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ IDNO:1)、YYnXXnYYnXXnYYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:3),和YnXnCYnXnYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:5)。在实施方案中,包含带正电荷的氨基酸残基的肽包含序列RKGGKR(SEQ ID NO:11)或GSGSRKGGKRGS(SEQ IDNO:12)。在实施方案中,带负电荷的氨基酸残基可包括选自Asp和Glu的一种或多种氨基酸。在实施方案中,带负电荷的氨基酸残基存在于包含第一和/或第二电荷极化核心结构域中的带负电荷氨基酸残基的肽中。在实施方案中,包含带负电荷的氨基酸残基的肽包含选自以下的序列:YnZnYnZnYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:2)、YYnZZnYYnZZnYYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:4)和YnZnCYnZnYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:6)。
在实施方案中,α链和/或β链的接头包含具有与选自SEQ ID NO:15-17、28-32和52-55的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的接头包含具有与选自SEQ ID NO:15-17、28-32和52-55的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的接头包含具有与选自SEQ ID NO:15-17和28-32的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的接头包含具有与选自SEQ IDNO:15-17和28-32的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
在实施方案中,α链和/或β链的第二结构域包含具有与选自SEQ ID NO:20-23的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的第二结构域包含具有与选自SEQ ID NO:20-27和94-126的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
在实施方案中,α链包含具有与选自SEQ ID NO:37-39的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链包含具有与选自SEQ ID NO:37-39的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
在实施方案中,β链包含具有与选自SEQ ID NO:40-42的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,β链包含具有与选自SEQ ID NO:40-42的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,异二聚体嵌合蛋白包含与以下的氨基酸序列相同的氨基酸序列:(a)SEQ ID NO:37和SEQ ID NO:40;(b)SEQ ID NO:38和SEQID NO:41;或(c)SEQ IDNO:39和SEQ ID NO:42。
GADLEN融合蛋白的示例性实施方案的序列在下表中提供(前导序列由双下划线字体指出,人BTN2A1的胞外结构域以粗体-下划线-斜体字体显示,人BTN3A1的胞外结构域以粗体下划线字体显示,接头的核心结构域以单下划线字体显示,并且抗CD19 ScFv序列以粗体字体显示):
在一个方面,本公开涉及异二聚体蛋白,其包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含两条多肽链,其中第一多肽链和第二多肽链包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,异二聚体蛋白包含两条自缔合的单独的多肽链。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域是相同的。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含靶向结构域的第二结构域是相同的。在实施方案中,连接第一结构域和第二结构域的接头是相同的。
在实施方案中,第一结构域包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白选自BTN2A1、BTN3A1及其片段。在实施方案中,第一结构域包含:(i)BTN2A1、BTN3A1及其片段;和(i)BTN2A1、BTN3A1及其片段。
在实施方案中,第一结构域包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段,其中该片段能够结合γδT细胞受体并且任选地是胞外结构域,任选地包含一个或多个免疫球蛋白V(IgV)样和IgC样结构域。在实施方案中,第一结构域包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段,其中该片段能够结合Vγ9δ2γδT细胞受体。
在实施方案中,第一结构域和/或异二聚体蛋白调节或能够调节γδ(gammadelta)T细胞。在实施方案中,γδT细胞是Vγ9δ2T细胞。在实施方案中,γδT细胞的调节是γδT细胞的活化。在实施方案中,异二聚体蛋白能够在γδT细胞和肿瘤细胞之间形成突触和/或异二聚体蛋白能够同时活化γδT细胞并将其靶向肿瘤细胞。
在一个方面,本公开涉及异二聚体蛋白,其包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含两条多肽链,其中第一多肽链和第二多肽链包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,异二聚体蛋白包含两条自缔合的单独的多肽链。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域是相同的。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含靶向结构域的第二结构域是相同的。在实施方案中,连接第一结构域和第二结构域的接头是相同的。
在一个方面,本公开涉及包含α链和β链的异二聚体蛋白,其中α链包含:(a)第一结构域,其包含(i)BTN2A1、BTN3A1及其片段;和(ii)BTN2A1、BTN3A1及其片段;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)(i)包含BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,所述靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头连接(i)和(ii)。在实施方案中,第二接头是本文公开的任何实施方案的柔性氨基酸序列。
在一个方面,本公开涉及一种异二聚体蛋白,其包含:(a)第一结构域,其包含(i)BTN2A1、BTN3A1及其片段;和(ii)BTN2A1、BTN3A1及其片段;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。在实施方案中,两个异二聚体蛋白缔合形成两条链的异二聚体,其包含BTN2A12-BTN3A12四聚体。
在实施方案中,本发明的异二聚体缔合形成异四聚体。在实施方案中,本发明的分子是图11的形式。
在一个方面,本公开涉及包含本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白的两个异二聚体嵌合蛋白的四聚体嵌合蛋白,四聚体包含两条蛋白链,其均二聚化以形成包含BTN2A1和BTN3A1的四聚体单元。在实施方案中,四聚体单元是BTN2A12-BTN3A12四聚体单元。在实施方案中,四聚体嵌合蛋白包含具有与选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,四聚体嵌合蛋白包含具有氨基酸序列的多肽,该氨基酸序列与选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列具有至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%、或至少约99.2%、或至少约99.4%、或至少约99.6%、或至少约99.8%的序列同一性。在实施方案中,四聚体嵌合蛋白包含具有选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列的多肽。
在实施方案中,四聚体嵌合蛋白如图11所描绘,任选地包含具有与选自SEQ IDNO:43、44和56-70的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,四聚体嵌合蛋白如图11所描绘,任选地包含具有选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列的氨基酸序列的多肽。
第一结构域
在实施方案中,第一结构域包含两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,其中第一结构域包含两个不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白包含V型结构域。合适的嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段源自天然嗜乳脂蛋白家族蛋白,其在全长蛋白的胞质尾中包含B30.2结构域。
在实施方案中,第一结构域是嗜乳脂蛋白亚家族2成员A1(BTN2A1)的一部分。在实施方案中,第一结构域包含BTN2A1的基本上所有的胞外结构域。在实施方案中,第一结构域能够结合γδT细胞受体(例如Vγ9δ2)。BTN2A1也称为BT2.1、BTF1。在实施方案中,BTN2A1的部分是BTN2A1胞外结构域的一部分。在实施方案中,本发明的嵌合蛋白进一步包含结构域,例如胞外结构域BTN2A1。
适用于本公开的人BTN2A1的示例性氨基酸序列的人BTN2A1的胞外结构域的氨基酸序列如下:
QFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCA(SEQ ID NO:35)
在一些实施方案中,适用于本公开的人BTN2A1的示例性氨基酸序列的人BTN2A1胞外结构域的片段如下:
QFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLV(SEQ ID NO:71)
在实施方案中,本发明的嵌合蛋白包含人BTN2A1的胞外结构域,其具有SEQ IDNO:35或SEQ ID NO:71的氨基酸序列。在实施方案中,本发明的嵌合蛋白可包含如本文所述的BTN2A1的胞外结构域,或其变体或功能片段。例如,嵌合蛋白可包含如上文提供的BTN2A1的胞外结构域的序列,或其变体或功能片段,其具有与本文所述的BTN2A1的胞外结构域的氨基酸序列至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%)的序列同一性。
BTN2A1衍生物可以根据可用的结构数据构建,包括以下文献中描述的同源性模型:Karunakaran等人,Butyrophilin-2A1 Directly Binds Germline-Encoded Regionsof the Vγ9Vδ2TCRand Is Essential for Phosphoantigen Sensing,Immunity.52(3):487-498(2020)。此外,不希望受理论束缚,BTN2A1的蛋白结构同源性模型可在SWISS-MODEL库中获得。Bienert等人,“TheSWISS-MODEL Repository–new features andfunctionality.”Nucleic Acids Research,45(D1):D313–D319(2017)。另外的结构洞察力获自诱变。Rigau等人,Butyrophilin 2A1 is essential forphosphoantigen reactivitybyγδT cells.Science 367(6478):eaay5516(2020)。
在实施方案中,第一结构域是嗜乳脂蛋白亚家族3成员A1(BTN3A1)的一部分。在实施方案中,第一结构域包含BTN3A1的基本上所有的胞外结构域。在实施方案中,第一结构域能够结合γδT细胞受体(例如Vγ9δ2)。BTN3A1也称为BTF5。在实施方案中,BTN3A1的部分是BTN3A1胞外结构域的一部分。在实施方案中,本发明的嵌合蛋白进一步包含结构域,例如胞外结构域BTN3A1。
适用于本公开的人BTN3A1的示例性氨基酸序列的人BTN3A1胞外结构域的氨基酸序列如下:
QFSVLGPSGPILAMVGEDADLPCHLFPTMSAETMELKWVSSSLRQVVNVYADGKEVEDRQSAPYRGRTSILRDGITAGKAALRIHNVTASDSGKYLCYFQDGDFYEKALVELKVAALGSDLHVDVKGYKDGGIHLECRSTGWYPQPQIQWSNNKGENIPTVEAPVVADGVGLYAVAASVIMRGSSGEGVSCTIRSSLLGLEKTASISIADPFFRSAQRWIAALAG(SEQ ID NO:19)
在一些实施方案中,适用于本公开的人BTN2A1的示例性氨基酸序列的人BTN3A1的胞外结构域的片段如下:
AQFSVLGPSGPILAMVGEDADLPCHLFPTMSAETMELKWVSSSLRQVVNVYADGKEVEDRQSAPYRGRTSILRDGITAGKAALRIHNVTASDSGKYLCYFQDGDFYEKALVELKVA(SEQ ID NO:72)
在实施方案中,本发明的嵌合蛋白包含人BTN3A1的胞外结构域,其具有SEQ IDNO:19或SEQ ID NO:72的氨基酸序列。在实施方案中,本发明的嵌合蛋白可包含如本文所述的BTN3A1的胞外结构域,或其变体或功能片段。例如,嵌合蛋白可包含如上文提供的BTN3A1的胞外结构域的序列,或其变体或功能片段,其具有与本文所述的BTN3A1的胞外结构域的氨基酸序列至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%)的序列同一性。
BTN3A1衍生物可以根据可用的结构数据构建,所述结构数据包括以下:Palakodeti等人,Themolecular basis for modulation of human V(gamma)9V(delta)2Tcell responses byCD277/Butyrophilin-3(BTN3A)-specific antibodies,J Biol Chem287:32780-32790(2012);Vavassori等人,Butyrophilin 3A1 binds phosphorylatedantigens and stimulates human gamma delta T cells.NatImmunol 14:908-916(2013);Sandstrom等人,The Intracellular B30.2 Domain of Butyrophilin 3A1BindsPhosphoantigens to Mediate Activation of Human V gamma 9V delta 2TCells.Immunity 40:490-500(2014);Rhodes等人,Activation of Human Gammadelta TCells by Cytosolic Interactions ofBtn3A1 with Soluble Phosphoantigens and theCytoskeletal Adaptor Periplakin.J Immunol 194:2390(2015);Gu等人,Phosphoantigen-induced conformational change of butyrophilin 3A1(BTN3A1)anditsimplication on V gamma 9V delta 2T cell activation.Proc Natl Acad Sci U SA 114:E7311-E7320(2017);Salim等人,BTN3A1 Discriminates gamma delta T CellPhosphoantigens from NonantigenicSmall Molecules via a Conformational Sensorin Its B30.2 Domain.ACS Chem Biol 12:2631-2643(2017);Yang等人,A StructuralChange in Butyrophilin upon Phosphoantigen Binding UnderliesPhosphoantigen-Mediated V gamma 9V delta 2T Cell Activation.Immunity 50:1043(2019)。
在实施方案中,第一结构域包含BTN2A1的一部分。在实施方案中,BTN2A1的部分是BTN2A1的胞外结构域,或其γδT细胞受体(例如γ9δ2)结合片段。
在实施方案中,第一结构域包含BTN3A1的一部分。在实施方案中,BTN3A1的部分是BTN3A1的胞外结构域,或其γδT细胞受体(例如γ9δ2)结合片段。
在实施方案中,第一结构域包含BTN2A1的一部分和BTN3A1的一部分。在实施方案中,BTN2A1的部分是BTN2A1的胞外结构域,或其γδT细胞受体(例如γ9δ2)结合片段。在实施方案中,BTN3A1的部分是BTN3A1的胞外结构域,或其γδT细胞受体(例如γ952)结合片段。在实施方案中,第二接头连接(i)BTN2A1蛋白或其片段和(ii)BTN3A1蛋白或其片段。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。示例性的第二接头是G(G3S)m或GGGSn,其中m或n是2-6,例如,GGGGSGGGS(SEQ ID NO:73)、GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:74)、GGGGSGGGSGGGS(SEQ ID NO:75)、GGGSGGGSGGGSGGGS(SEQ ID NO:76)、GGGGSGGGSGGGSGGGS(SEQID NO:77)、GGGGSGGGGS(SEQ ID NO:78)和GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:79)。在实施方案中,两个异二聚体蛋白缔合形成两条链的异二聚体,其包含BTN2A12-BTN3A12四聚体。
包含靶向结构域的第二结构域
一方面,本公开涉及异二聚体蛋白,其第二结构域包含特异性结合CD19的靶向结构域。
本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白包含第二结构域,该第二结构域包含靶向结构域。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,抗体样分子选自单结构域抗体、重组仅重链抗体(VHH)、单链抗体(scFv)、鲨鱼仅重链抗体(VNAR)、微蛋白(半胱氨酸结蛋白,打结素(knottin))、DARPin;四联凝素;亲和体;穿膜抗体;Anticalin;AdNectin;Affilin;Affimer、微体;适体;改变酶;塑料抗体;phylomer;stradobody;巨型体;evibody;fynomer、犰狳重复蛋白、Kunitz结构域、avimer、atrimer、probody、免疫体、triomab、troybody;肽体;疫苗体;单特异性体;双特异性体、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2。在实施方案中,抗体样分子是scFv。在实施方案中,靶向结构域是胞外结构域。在实施方案中,靶向结构域能够结合癌细胞表面上的抗原。在实施方案中,靶向结构域特异性结合以下中的一种:CD19、PSMA、GD2、PSCA、BCMA、CD123、B7-H3、CD20、CD30、CD33、CD38、CEA、CLEC12A、DLL3、EGFRvIII、EpCAM、CD307、FLT3、GPC3、gpA33、HER2、MUC16、P-钙黏着蛋白、SSTR2和间皮素。在实施方案中,靶向结构域包含LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19或PSMA的胞外结构域的一部分。在实施方案中,靶向结构域特异性结合PSMA。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD19。
包含靶向结构域的第二结构域的示例性序列提供如下:
示例性靶向结构域是scFVh19,其是与人CD19具有特异性的scFV的重链可变结构域,具有以下序列:
DIQLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYLNWYQQIPGQPPKLLIYDASNLVSGIPPRFSGSGSGTDFTLNIHPVEKVDAATYHCQQSTEDPWTFGGGTKLEIK(SEQ ID NO:20)
示例性靶向结构域是scFVlh19,其是与人CD19具有特异性的scFV的轻链可变结构域,具有以下序列:
EVQLVESGGGLVQPGGSLTLSCAASRFMISEYHMHWVRQAPGKGLEWVSTINPAGTTDYAESVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCDSYGYRGQGTQVTV(SEQ ID NO:21)示例性靶向结构域是scFvCD19,其是与人CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
QVQLQQSGAELVRPGSSVKISCKASGYAFSSYWMNWVKQRPGQGLEWIGQIWPGDGDTNYNGKFKGKATLTADESSSTAYMQLSSLASEDSAVYFCARRETTTVGRYYYAMDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYLNWYQQIPGQPPKLLIYDASNLVSGIPPRFSGSGSGTDFTLNIHPVEKVDAATYHCQQSTEDPWTFGGGTKLEIK(SEQ IDNO:22)
示例性靶向结构域是19scFv3,其是与人CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGGGSGGGSGGGSEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSS(SEQ ID NO:23)
示例性靶向结构域是scFvCD19VHVL,其是与小鼠CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
EVQLQQSGAELVRPGTSVKLSCKVSGDTITFYYMHFVKQRPGQGLEWIGRIDPEDESTKYSEKFKNKATLTADTSSNTAYLKLSSLTSEDTATYFCIYGGYYFDYWGQGVMVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPASLSTSLGETVTIQCQASEDIYSGLAWYQQKPGKSPQLLIYGASDLQDGVPSRFSGSGSGTQYSLKITSMQTEDEGVYFCQQGLTYPRTFGGGTKLELK(SEQ ID NO:24)
示例性靶向结构域是scFvCD19VLVH,其是与小鼠CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
DIQMTQSPASLSTSLGETVTIQCQASEDIYSGLAWYQQKPGKSPQLLIYGASDLQDGVPSRFSGSGSGTQYSLKITSMQTEDEGVYFCQQGLTYPRTFGGGTKLELKGGGGSGGGGSGGGGSEVQLQQSGAELVRPGTSVKLSCKVSGDTITFYYMHFVKQRPGQGLEWIGRIDPEDESTKYSEKFKNKATLTADTSSNTAYLKLSSLTSEDTATYFCIYGGYYFDYWGQGVMVTVSS(SEQ ID NO:25)
示例性靶向结构域是scFVlPSMA,其是与人PSMA具有特异性的scFV的轻链可变结构域,具有以下序列:
RKGGKRGSGSGQTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCASSTGAVTSGNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTKFLVPGTPARFSGSLLGGKAALTLSGVQPEDEAEYYCTLWYSNRWVFGGGTKLTVL(SEQ IDNO:26)
示例性靶向结构域是GD2scFv3,其是与人GD2具有特异性的scFV,具有以下序列:
GTDFTLKISRVEAEDLGVYFCSQSTHVPPLTFGAGTKLELKGGGSGGGSGGGSEVQLLQSGPELEKPGASVMISCKASGSSFTGYNMNWVRQNIGKSLEWIGAIDPYYGGTSYNQKFKGRATLTVDKSSSTAYMHLKSLTSEDSAVYYCVSGMKYWGQGTSVTVSS(SEQ ID NO:27)
在实施方案中,α链和/或β链的第二结构域包含具有选自SEQ ID NO:20-23和94-126的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的第二结构域包含具有与选自SEQID NO:20-23和94-126的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的第二结构域包含具有氨基酸序列的多肽,所述氨基酸序列与选自SEQ ID NO:20-23和94-126的氨基酸序列的氨基酸序列具有至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%)的序列同一性。
连接第一结构域和第二结构域的接头结构域
在实施方案中,连接第一结构域和第二结构域的接头包含电荷极化核心结构域。在各种实施方案中,第一和第二电荷极化核心结构域中的每一个均包含在核心结构域的氨基和羧基末端具有带正电荷或带负电荷的氨基酸残基的蛋白。在示例性实施方案中,第一电荷极化核心结构域可包含在氨基末端具有带正电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带负电荷的氨基酸残基的蛋白连接。第二电荷极化核心结构域可包含在氨基末端具有带负电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带正电荷的氨基酸残基的蛋白连接。
在另一个示例性实施方案中,第一电荷极化核心结构域可以包含在氨基末端具有带负电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带正电荷的氨基酸残基的蛋白连接。第二电荷极化核心结构域可包含在氨基末端具有带正电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带负电荷的氨基酸残基的蛋白连接。
在各种实施方案中,异二聚体蛋白的形成由位于第一和第二电荷极化核心结构域的氨基和羧基末端的带正电荷和带负电荷的氨基酸残基之间的静电相互作用驱动。此外,通过位于第一和第二电荷极化核心结构域的氨基和羧基末端的带正电荷的氨基酸残基或带负电荷的氨基酸残基之间的排斥,阻止同二聚体蛋白的形成。
在各种实施方案中,在电荷极化核心结构域的氨基或羧基末端包含带正电荷和/或带负电荷的氨基酸残基的蛋白的长度为约2至约50个氨基酸。例如,在电荷极化核心结构域的任一末端包含带正电荷和/或带负电荷的氨基酸残基的蛋白可以是约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约19、约18、约17、约16、约15、约14、约13、约12、约11、约10、约9、约8、约7、约6、约5、约4、约3或约2个氨基酸长。
在各种实施方案中,包含带正电荷的氨基酸残基的蛋白可包含选自His、Lys和Arg的一种或多种氨基酸。在各种实施方案中,包含带负电荷的氨基酸残基的蛋白可包括选自Asp和Glu的一种或多种氨基酸。
在各种实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域中的每一个可包含蛋白,所述蛋白包含下表中提供的氨基酸序列或与其具有至少90%、或93%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列。
例如,在一个实施方案中,第一和第二电荷极化核心结构域中的每一个都可以包含肽,该肽包含序列YYnXXnYYnXXnYYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸;SEQ ID NO:3)。示例性肽序列包括但不限于RKGGKR(SEQ IDNO:11)或GSGSRKGGKRGS(SEQ ID NO:12)。
在另一个示例性实施方案中,第一和第二电荷极化核心结构域中的每一个可包含肽,所述肽包含序列YYnZZnYYnZZnYYn(其中Z是带负电荷的氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸)。示例性肽序列包括但不限于DEGGED(SEQ ID NO:13)或GSGSDEGGEDGS(SEQ ID NO:14)。
在一个方面,本公开提供了一种异二聚体蛋白,其包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,异二聚体蛋白包含两条自缔合的单独的多肽链。在实施方案中,接头促进异二聚化。在实施方案中,异二聚体蛋白包含两种相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白或两种不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白包含V型结构域和/或B30.2结构域。在实施方案中,第一结构域是嗜乳脂蛋白样(BTNL)家族蛋白,如BTN2A1、BTN3A1及其片段。
在实施方案中,第一多肽链和第二多肽链通过第一和第二电荷极化核心结构域上带正电荷的氨基酸残基和带负电荷的氨基酸残基之间的静电相互作用形成异二聚体。在实施方案中,带正电荷的氨基酸残基可包括选自His、Lys和Arg的一种或多种氨基酸。在实施方案中,带负电荷的氨基酸残基可包括选自Asp和Glu的一种或多种氨基酸。
因此,在实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域中的每一个均包含在核心结构域的氨基和羧基末端具有带正电荷或带负电荷的氨基酸残基的蛋白。在示例性实施方案中,第一电荷极化核心结构域可包含在氨基末端具有带正电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带负电荷的氨基酸残基的蛋白连接。在这样的实施方案中,第二电荷极化核心结构域可以包含在氨基末端具有带负电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带正电荷的氨基酸残基的蛋白连接。在另一个示例性实施方案中,第一电荷极化核心结构域可以包含在氨基末端具有带负电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带正电荷的氨基酸残基的蛋白连接。在这样的实施方案中,第二电荷极化核心结构域可以包含在氨基末端具有带正电荷的氨基酸的蛋白,其通过接头(例如,稳定结构域)与在羧基末端具有带负电荷的氨基酸残基的蛋白连接。
在各种实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域中的每一个均进一步包含接头(例如,稳定结构域),其连接具有带正电荷或带负电荷的氨基酸的蛋白。在实施方案中,接头(例如,稳定结构域)任选地选自柔性氨基酸序列、IgG铰链区或抗体序列。在一个实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含源自IgG1(任选地,人IgG1)的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在另一个实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含源自IgG4(任选地,人IgG4)的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。
下面提供了连接第一结构域和第二结构域(本文也称为核心结构域)的接头的示例性序列:
在实施方案中,核心结构域具有以下序列:
在实施方案中,核心结构域具有以下序列:
在实施方案中,核心结构域是具有以下序列的KIHT22Y蛋白:
EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVE VHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELT KNQVSLYCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNH YTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:29)
在实施方案中,核心结构域是具有以下序列的KIHY86T蛋白:
EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVE VHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELT KNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLTSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNH YTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:30)。
在实施方案中,核心结构域是具有以下序列的KIHY86T蛋白:
VPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGI(SEQ ID NO:31)。
下面提供了示例性电荷极化核心结构域(正-负)的序列:
下面提供了示例性电荷极化核心结构域(负-正)的序列:
下面提供了示例性电荷极化核心结构域(负-正)的序列:
下面提供了包含杵臼(KIH)突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:52)。
下面提供了包含杵臼(KIH)突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:53)。
下面提供了包含杵臼(KIH)突变和FcRn突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHSHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:54)。
下面提供了包含杵臼(KIH)突变和FcRn突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHSHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:55)。
在各种实施方案中,包含带电荷的氨基酸残基的蛋白可进一步包含一个或多个半胱氨酸残基以促进带静电电荷的核心结构域之间的二硫键作为额外的稳定异二聚体的方法。
在各种实施方案中,第一和第二电荷极化核心结构域中的每一个均包含可任选地充当稳定化结构域的接头序列。在各种实施方案中,接头可源自天然存在的多结构域蛋白或是如例如以下文献中所述的经验接头:Chichili等人,(2013),Protein Sci.22(2):153-167;Chen等人,(2013),Adv DrugDeliv Rev.65(10):1357-1369,其全部内容通过引用并入本文。在实施方案中,可以使用接头设计数据库和计算机程序来设计接头,例如以下文献中描述的那些:Chen等人,(2013),Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369和Crasto等人,(2000),Protein Eng.13(5):309-312,其全部内容通过引用并入本文。
在实施方案中,接头(例如,稳定结构域)是合成接头,如PEG。
在其他实施方案中,接头(例如,稳定结构域)是多肽。在实施方案中,接头(例如稳定结构域)为小于约500个氨基酸长、约450个氨基酸长、约400个氨基酸长、约350个氨基酸长、约300个氨基酸长、约250个氨基酸长、约200个氨基酸长、约150个氨基酸长或约100个氨基酸长。例如,接头(例如稳定结构域)可以为小于约100个、约95个、约90个、约85个、约80个、约75个、约70个、约65个、约60个、约55个、约50个、约45个、约40个、约35个、约30个、约25个、约20个、约19个、约18个、约17个、约16个、约15个、约14个、约13个、约12个、约11个、约10个、约9个、约8个、约7个、约6个、约5个、约4个、约3个或约2个氨基酸长。
在各种实施方案中,接头(例如,稳定结构域)基本上由甘氨酸和丝氨酸残基组成(例如,约30%、或约40%、或约50%、或约60%、或约70%、或约80%、或约90%、或约95%、或约97%的甘氨酸和丝氨酸)。
在各种实施方案中,接头(例如,稳定结构域)是抗体(例如,IgG、IgA、IgD和IgE,包括亚类(例如,IgG1、IgG2、IgG3和IgG4,以及IgA1和IgA2))的铰链区。在IgG、IgA、IgD和IgE类抗体中发现的铰链区充当柔性间隔子,允许Fab部分在空间中自由移动。与恒定区相反,铰链结构域在结构上是多样的,在免疫球蛋白类别和亚类之间的序列和长度上都不同。例如,铰链区的长度和柔性因IgG亚类而异。IgG1的铰链区包含氨基酸216-231,并且因为它是自由柔性的,Fab片段可以绕其对称轴旋转并在以两个重链间二硫桥中的第一个为中心的球体内移动。IgG2的铰链比IgG1短,具有12个氨基酸残基和四个二硫桥。IgG2的铰链区缺少甘氨酸残基,相对较短,并含有刚性聚脯氨酸双螺旋,由额外的重链间二硫桥稳定。这些性质限制了IgG2分子的柔性。IgG3与其他亚类的不同之处在于其独特的延伸铰链区(大约是IgG1铰链的四倍),含有62个氨基酸(包括21个脯氨酸和11个半胱氨酸),形成刚性聚脯氨酸双螺旋。在IgG3中,Fab片段距离Fc片段相对较远,使分子具有更大的柔性。与其他亚类相比,IgG3中的细长铰链也是其较高分子量的原因。IgG4的铰链区比IgG1短,其柔性介于IgG1和IgG2之间。据报道,铰链区的柔性按IgG3>IgG1>IgG4>IgG2的顺序降低。在其他实施方案中,接头可源自人IgG4并含有一个或多个突变以增强二聚化(包括S228P)或FcRn结合。
根据晶体学研究,免疫球蛋白铰链区在功能上可进一步细分为三个区域:上铰链区、核心区和下铰链区。参见Shin等人,1992Immunological Reviews 130:87。上铰链区包括从CH1的羧基端到限制运动的铰链中第一个残基(通常是在两条重链之间形成链间二硫键的第一个半胱氨酸残基)的氨基酸。上铰链区的长度与抗体的片段柔性相关。核心铰链区包含重链间二硫桥,下铰链区连接CH2结构域的氨基末端并包括CH2中的残基。同上。野生型人IgG1的核心铰链区含有序列Cys-Pro-Pro-Cys,其在通过形成二硫键而二聚化时得到环状八肽,该环状八肽被认为充当枢轴,从而赋予柔性。在各种实施方案中,本发明的接头(例如,稳定结构域)包含任何抗体(例如,IgG、IgA、IgD和IgE,包括亚类(例如,IgG1、IgG2、IgG3和IgG4,以及IgA1和IgA2))的上铰链区、核心区和下铰链区中的一个、或两个或三个。铰链区还可以含有一个或多个糖基化位点,其包括许多结构上不同的类型的碳水化合物连接位点。例如,IgA1在铰链区的17个氨基酸片段中含有五个糖基化位点,赋予铰链区多肽对肠蛋白酶的抗性,这被认为是分泌性免疫球蛋白的有利性质。在各种实施方法中,本公开的接头(例如,稳定结构域)包含一个或多个糖基化位点。
在各种实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含抗体(例如,IgG、IgA、IgD和IgE,包括亚类(例如,IgG1、IgG2、IgG3和IgG4以及IgA1和IgA2))的Fc结构域。在各种实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含源自人IgG4抗体的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在各种实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含源自人IgG1抗体的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在实施方案中,Fc结构域表现出增加的对新生儿Fc受体(FcRn)的亲和力和增强的结合。在实施方案中,Fc结构域包括增加亲和力并增强与FcRn的结合的一个或多个突变。不希望受理论束缚,据信增加的亲和力和增强的与FcRn的结合增加了本发明异二聚体蛋白的体内半衰期。
在实施方案中,Fc结构域在氨基酸残基250、252、254、256、308、309、311、428、433或434(根据Kabat编号)或其等同物处包含一个或多个氨基酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基250处的氨基酸取代是谷氨酰胺取代。在一个实施方案中,氨基酸残基252处的氨基酸取代为酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸或苏氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基254处的氨基酸取代为苏氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基256处的氨基酸取代为丝氨酸、精氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、天冬氨酸或苏氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基308处的氨基酸取代为苏氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基309处的氨基酸取代为脯氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基311处的氨基酸取代为丝氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基385处的氨基酸取代为精氨酸、天冬氨酸、丝氨酸、苏氨酸、组氨酸、赖氨酸、丙氨酸或甘氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基386处的氨基酸取代是苏氨酸、脯氨酸、天冬氨酸、丝氨酸、赖氨酸、精氨酸、异亮氨酸或甲硫氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基387处的氨基酸取代为精氨酸、脯氨酸、组氨酸、丝氨酸、苏氨酸或丙氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基389处的氨基酸取代为脯氨酸、丝氨酸或天冬酰胺取代。在一个实施方案中,氨基酸残基428处的氨基酸取代是亮氨酸取代。在一个实施方案中,氨基酸残基433处的氨基酸取代为精氨酸、丝氨酸、异亮氨酸、脯氨酸或谷氨酰胺取代。在一个实施方案中,氨基酸残基434处的氨基酸取代为组氨酸、苯丙氨酸或酪氨酸取代。
在实施方案中,Fc结构域(例如,包含IgG恒定区)包含一个或多个突变,例如氨基酸残基252、254、256、433、434或436(根据Kabat编号)处的取代。在一个实施方案中,IgG恒定区包括三重M252Y/S254T/T256E突变或YTE突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包括三重H433K/N434F/Y436H突变或KFH突变。在又一个实施方案中,IgG恒定区包括组合的YTE和KFH突变。
在实施方案中,本发明的修饰的人源化抗体包含IgG恒定区,其在氨基酸残基250、253、307、310、380、428、433、434和435处含有一个或多个突变。示例性突变包括T250Q、M428L、T307A、E380A、I253A、H310A、M428L、H433K、N434A、N434F、N434S和H435A。在一个实施方案中,IgG恒定区包含M428L/N434S突变或LS突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包含T250Q/M428L突变或QL突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包含N434A突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包含T307A/E380A/N434A突变或AAA突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包含I253A/H310A/H435A突变或IHH突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包含H433K/N434F突变。在另一个实施方案中,IgG恒定区包含组合的M252Y/S254T/T256E和H433K/N434F突变。
在各种实施方案中,引入突变以增加Fc结构域的稳定性和/或半衰期。示例性Fc稳定突变体是S228P。另外的示例性Fc半衰期延长突变体是T250Q、M428L、V308T、L309P和Q311S,并且本发明的接头(例如,稳定结构域)可以包含这些突变体中的1个、或2个、或3个、或4个、或5个。
IgG恒定区中的另外的示例性突变描述于例如Robbie等人,AntimicrobialAgents andChemotherapy(2013),57(12):6147-6153;Dall’Acqua等人,JBC(2006),281(33):23514-24;Dall’Acqua等人,Journal of Immunology(2002),169:5171-80;Ko等人,Nature(2014)514:642-645;Grevys等人,Journal of Immunology.(2015),194(11):5497-508;和美国专利号7,083,784,其全部内容通过引用并入本文。
在各种实施方案中,接头可以是柔性的,包括但不限于高度柔性。在各种实施方案中,接头可以是刚性的,包括但不限于刚性α螺旋。
在各种实施方案中,接头可以是功能性的。例如但不限于,接头可以起到改善本发明的异二聚体蛋白的折叠和/或稳定性、改善表达、改善药代动力学和/或改善生物活性的作用。在另一个实例中,接头可以起到将异二聚体蛋白靶向特定细胞类型或位置的作用。
异二聚体蛋白
在一个方面,本公开提供了一种异二聚体蛋白,其包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
在实施方案中,异二聚体蛋白是两条多肽链的复合物。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链和β链各自独立地包含(a)包含嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
在实施方案中,α链和β链自缔合形成异二聚体。
在实施方案中,第一结构域包含两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,其中第一结构域包含两个不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白包含V型结构域。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段源自在胞质尾中包含B30.2结构域的天然嗜乳脂蛋白家族蛋白。
在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白选自BTN2A1、BTN3A1及其片段。在实施方案中,第一结构域包含:(a)BTN2A1、BTN3A1及其片段;和(b)BTN2A1、BTN3A1及其片段。
在实施方案中,第一结构域包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段,其中该片段能够结合γδT细胞受体并且任选地是胞外结构域,任选地包含一个或多个免疫球蛋白V(IgV)-和IgC-样结构域。在实施方案中,第一结构域包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段,其中该片段能够结合Vγ9δ2γδT细胞受体。
在实施方案中,第一结构域包含具有以下氨基酸序列的多肽:(a)SEQ ID NO:19、35中的任一个或其片段;和(b)SEQ ID NO:19、35中的任一个或其片段。在实施方案中,第一结构域包含具有(a)与SEQ ID NO:19或SEQ ID NO:72具有至少90%、或95%、或97%、或98%或99%同一性的氨基酸序列以及与SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:71具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列的多肽。
另外地,或备选地,在本文公开的任何实施方案中,靶向结构域中是抗体或其抗原结合片段。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,抗体样分子选自单结构域抗体、重组仅重链抗体(VHH)、单链抗体(scFv)、鲨鱼仅重链抗体(VNAR)、微蛋白(半胱氨酸结蛋白,打结素(knottin))、DARPin;四联凝素;亲和体;穿膜抗体;Anticalin;AdNectin;Affilin;Affimer、微体;适体;改变酶;塑料抗体;phylomer;stradobody;巨型体;evibody;fynomer、犰狳重复蛋白、Kunitz结构域、avimer、atrimer、probody、免疫体、triomab、troybody;肽体;疫苗体;单特异性体;双特异性体、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2。在实施方案中,抗体样分子是scFv。在实施方案中,靶向结构域是胞外结构域。在实施方案中,靶向结构域能够结合癌细胞表面上的抗原。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD19、PSMA、GD2、PSCA、BCMA、CD123、B7-H3、CD20、CD30、CD33、CD38、CEA、CLEC12A、DLL3、EGFRvIII、EpCAM、CD307、FLT3、GPC3、gpA33、HER2、MUC16、P-钙黏着蛋白、SSTR2和间皮素之一。在实施方案中,靶向结构域包含LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19或PSMA的胞外结构域的一部分。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD19。在实施方案中,靶向结构域特异性结合PSMA。另外地或备选地,在实施方案中,靶向结构域是具有与选自SEQ ID NO:20-27和94-126的多肽具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,靶向结构域是具有选自SEQ ID NO:20-27和94-126的氨基酸序列的多肽。
另外地或可选地,在实施方案中,接头包含(a)任选地在羧基末端与嗜乳脂蛋白家族蛋白连接的第一电荷极化核心结构域,和(b)任选地在羧基末端与嗜乳脂蛋白家族蛋白连接的第二电荷极化核心结构域。在实施方案中,接头通过第一和第二电荷极化核心结构域上带正电荷的氨基酸残基和带负电荷的氨基酸残基之间的静电相互作用形成异二聚体。在实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域包含多肽接头,任选地选自柔性氨基酸序列、IgG铰链区或抗体序列。在实施方案中,接头是合成接头,任选地是PEG。在实施方案中,接头包含源自IgG1、任选地人IgG1的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在实施方案中,接头包含源自IgG4、任选地人IgG4的铰链-CH2-CH3Fc结构域。在实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域还包含在电荷极化核心结构域的氨基和/或羧基末端具有带正电荷和/或带负电荷的氨基酸残基的肽。在实施方案中,带正电荷的氨基酸残基包括选自His、Lys和Arg的一种或多种氨基酸。在实施方案中,带正电荷的氨基酸残基存在于包含第一和/或第二电荷极化核心结构域中的带正电荷的氨基酸残基的肽中。
在实施方案中,包含带正电荷的氨基酸残基的肽包含选自以下的序列:YnXnYnXnYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:1),YYnXXnYYnXXnYYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:3),和YnXnCYnXnYn(其中X是带正电荷的氨基酸,如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:5)。在实施方案中,包含带正电荷的氨基酸残基的肽包含序列RKGGKR(SEQ ID NO:11)或GSGSRKGGKRGS(SEQ ID NO:12)。在实施方案中,带负电荷的氨基酸残基可包括选自Asp和Glu的一个或多个氨基酸。在实施方案中,带负电荷的氨基酸残基存在于包含第一和/或第二电荷极化核心结构域中的带负电荷的氨基酸残基的肽中。在实施方案中,包含带负电荷的氨基酸残基的肽包含选自以下的序列:YnZnYnZnYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:2),YYnZZnYYnZZnYYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地为0至4的整数)(SEQ IDNO:4),和YnZnCYnZnYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,如丝氨酸或甘氨酸)(SEQ ID NO:6,并且其中每个n独立地是0至4的整数)。在实施方案中,包含带负电荷的氨基酸残基的肽包含序列DEGGED(SEQ ID NO:13)或GSGSDEGGEDGS(SEQ IDNO:14)。
另外地或备选地,在实施方案中,第一结构域和/或异二聚体蛋白调节或能够调节γδ(gammadelta)T细胞。在实施方案中,γδT细胞是Vγ9δ2γδT细胞。
另外地或备选地,在实施方案中,异二聚体蛋白能够在γδT细胞和肿瘤细胞之间形成突触。在实施方案中,异二聚体蛋白能够同时活化γδT细胞并将其靶向肿瘤细胞。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含与SEQ ID NO:19、35、71或72具有至少90%、或至少91%、或至少92%、或至少93%、或至少94%、或至少95%、或至少96%,或至少97%,或至少98%,或至少98%,或至少99%的序列同一性的氨基酸序列。
在实施方案中,第二结构域是LAG-3蛋白。
在实施方案中,第二结构域是PD-1蛋白。
在实施方案中,第二结构域是TIGIT蛋白。
在实施方案中,第二结构域是CD19蛋白结合结构域,如scFv、CDR3或Fab。在实施方案中,第二结构域是CD19蛋白,并且异二聚体蛋白还包含抗体或其片段(例如,包含抗体的抗原结合结构域的一部分)并且能够结合癌细胞表面上的抗原。
在实施方案中,第二结构域是PSMA蛋白结合结构域,如scFv、CDR3或Fab。在实施方案中,第二结构域是PSMA蛋白,并且异二聚体蛋白还包含抗体或其片段(例如,包含抗体的抗原结合结构域的一部分)并且能够结合癌细胞表面上的抗原。
在示例性实施方案中,第二结构域是EGP的受体,如EGFR(ErbB1)、ErbB2、ErbB3和ErbB4。
在示例性实施方案中,第二结构域是胰岛素或胰岛素类似物的受体,如胰岛素受体和/或IGF1或IGF2受体。
在示例性实施方案中,第二结构域是EPO的受体,如EPO受体(EPOR)受体和/或肝配蛋白受体(EphR)
在各种实施方案中,异二聚体蛋白可包含可溶性(例如,非膜相关)蛋白的结构域。在各种实施方案中,异二聚体蛋白可包含参与信号传导的可溶性蛋白的片段(例如,与受体相互作用的可溶性蛋白的一部分)。
在各种实施方案中,异二聚体蛋白可包含跨膜蛋白的胞外结构域。在各种实施方案中,胞外结构域之一转导免疫抑制信号,并且胞外结构域之一转导免疫刺激信号。
在实施方案中,胞外结构域是指能够与细胞外环境相互作用的跨膜蛋白的一部分。在各种实施方案中,胞外结构域是指足以结合配体或受体并有效地将信号传递至细胞的跨膜蛋白的一部分。在各种实施方案中,胞外结构域是细胞或细胞膜外部的跨膜蛋白的完整氨基酸序列。在各种实施方案中,胞外结构域是跨膜蛋白的氨基酸序列的一部分,其在细胞或细胞膜外部并且是信号转导和/或配体结合所需要的,如可以使用本领域已知的方法测定的那样(例如,体外配体结合和/或细胞活化测定)。
在各种实施方案中,异二聚体蛋白可包含抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)。在各种实施方案中,抗体结合结构域之一转导免疫抑制信号并且抗体结合结构域之一转导免疫刺激信号。
在实施方案中,免疫抑制信号是指减少或消除免疫应答的信号。例如,在肿瘤学的背景下,此类信号可能削弱或消除抗肿瘤免疫力。在正常生理条件下,抑制信号可用于维持自我耐受(例如,预防自身免疫),也可在免疫系统对病原体感染做出反应时保护组织免受损害。例如但不限于,可以通过检测当这种抑制信号被阻断时细胞增殖、细胞因子产生、细胞杀伤活性或吞噬活性的增加来确定免疫抑制信号。
在实施方案中,免疫刺激信号是指增强免疫应答的信号。例如,在肿瘤学的背景下,此类信号可能增强抗肿瘤免疫力。例如但不限于,可以通过直接刺激白细胞的增殖、细胞因子产生、杀伤活性或吞噬活性来确定免疫刺激信号。具体实例包括使用编码细胞因子受体的配体的融合蛋白(分别为IL-2、IL-7、IL-15、IL-17或IL-21)直接刺激此类受体如IL-2R、IL-7R、IL-15R、IL-17R或IL-21R)。来自这些受体中任何一种的刺激可以直接刺激个体T细胞亚群的增殖和细胞因子产生。
在实施方案中,胞外结构域或抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)可用于生产可溶性蛋白,以竞争性抑制该受体配体的信号传导。例如但不限于,PD-L1或PD-L2的竞争性抑制可以使用PD-1实现,或者PVR的竞争性抑制可以使用TIGIT实现。在实施方案中,胞外结构域或抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)可用于提供人工信号传导。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白递送或掩蔽免疫抑制信号。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白递送或掩蔽免疫刺激信号。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含两个独立的结合结构域,每个均来自异二聚体人蛋白的一个亚基。表1中提供了可作为本发明的异二聚体蛋白的一部分形成的示例性蛋白质。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白具有表1中提供的示例性蛋白质之一。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白具有表1中提供的两种示例性蛋白质。
表1
可以并入本发明的组合物和方法中的示例性嗜乳脂蛋白家族蛋白包括以下蛋白(如本文所用,“条目”是指Uniprot数据库中的蛋白条目,“条目名称”是指Uniprot数据库中的蛋白条目):
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可以被工程化以靶向存在于人白细胞上的一种或多种分子,其包括但不限于以下的胞外结构域(如果适用):SLAMF4、IL-2Rα、IL-2Rβ、ALCAM、B7-1、IL-4R、B7-H3、BLAME/SLAMFS、CEACAM1、IL-6R、IL-7Rα、IL-10Rα、IL-l 0Rβ、IL-12Rβ1、IL-12Rβ2、CD2、IL-13Rα1、IL-13、CD3、CD4、ILT2/CDS5j、ILT3/CDS5k、ILT4/CDS5d、ILT5/CDS5a、lutegrinα4/CD49d、CDS、整合素αE/CD103、CD6、整合素αM/CD 11b、CDS、整合素αX/CD11c、整合素β2/CDlS、KIR/CD15S、KIR2DL1、CD2S、KIR2DL3、KIR2DL4/CD15Sd、CD31/PECAM-1、KIR2DS4、LAG-3、CD43、LAIR1、CD45、LAIR2、CDS3、白三烯B4-R1、CDS4/SLAMF5、NCAM-L1、CD94、NKG2A、CD97、NKG2C、CD229/SLAMF3、NKG2D、CD2F-10/SLAMF9、NT-4、CD69、NTB-A/SLAMF6、共同γ链/IL-2Rγ、骨桥蛋白、CRACC/SLAMF7、PD-1、CRTAM、PSGL-1、CTLA-4、CX3CR1、CX3CL1、L-选择素、SIRPβ1、SLAM、TCCR/WSX-1、DNAM-1、胸腺生成素、EMMPRIN/CD147、TIM-1、EphB6、TIM-2、TIM-3、TIM-4、FcγRIII/CD16、TIM-6、颗粒溶素、ICAM-1/CD54、ICAM-2/CD102、IFN-γR1、IFN-γR2、TSLP、IL-1R1和TSLPR。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可以被工程化以靶向参与免疫抑制的一种或多种分子,包括例如:CTLA-4、PD-L1、PD-L2、PD-1、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA/VSIG8、KIR、2B4、TIGIT、CD160(也称为BY55)、CHK 1和CHK2激酶、A2aR、CEACAM(例如,CEACAM-1、CEACAM-3和/或CEACAM-5),以及各种B-7家族配体(包括但不限于B7-1、B7-2、B7-DC、B7-H1、B7-H2、B7-H3、B7-H4、B7-H5、B7-H6和B7-H7)。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含免疫抑制剂的胞外结构域。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含针对免疫抑制剂的抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含具有免疫抑制性质的可溶性或膜蛋白的胞外结构域。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含具有免疫抑制性质的抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白模拟抑制信号配体与其同源受体的结合,但抑制抑制信号传递至免疫细胞(例如,T细胞、巨噬细胞或其他白细胞)。
在各种实施方案中,异二聚体蛋白包含免疫抑制受体胞外结构域或抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)和免疫刺激配体胞外结构域或抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等),其可以但不限于向T细胞传递免疫刺激,同时掩盖肿瘤细胞的免疫抑制信号。在各种实施方案中,异二聚体蛋白递送具有T细胞活化的净结果的信号。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含具有免疫刺激性质的可溶性或膜蛋白的胞外结构域。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白包含具有免疫刺激性质的抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可包含任何已知细胞因子、生长因子和/或激素的变体。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可包含细胞因子、生长因子和/或激素的任何已知受体的变体。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可包含任何已知胞外结构域的变体,例如,与已知氨基酸或核酸序列具有至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%)的序列同一性。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可包含相对于任何已知蛋白序列具有一个或多个氨基酸突变的氨基酸序列。在实施方案中,一个或多个氨基酸突变可独立地选自取代、插入、缺失和截短。
在实施方案中,氨基酸突变是氨基酸取代,并且可以包括保守和/或非保守取代。
“保守取代”可以例如基于所涉及的氨基酸残基的极性、电荷、大小、溶解度、疏水性、亲水性和/或两亲性质来进行。20种天然存在的氨基酸可分为以下六个标准氨基酸组:(1)疏水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile;(2)中性亲水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)碱性:His、Lys、Arg;(5)影响链取向的残基:Gly、Pro;和(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
如本文所用,“保守取代”被定义为一个氨基酸被上面所示六个标准氨基酸组中的同一组中列出的另一个氨基酸交换。例如,Asp被Glu交换在这样修饰的多肽中保留一个负电荷。另外,甘氨酸和脯氨酸基于它们破坏α-螺旋的能力可以相互取代。
如本文所用,“非保守取代”被定义为一个氨基酸被上面所示六个标准氨基酸组(1)至(6)中的不同组中列出的另一个氨基酸交换。
如本文所用,“非保守取代”被定义为氨基酸被列在上面所示的六个标准氨基酸组(1)至(6)中的不同组中列出的另一个氨基酸交换。
在各种实施方案中,取代还可以包括非经典氨基酸(例如,硒代半胱氨酸、吡咯赖氨酸、N-甲酰甲硫氨酸、β-丙氨酸、GABA和δ-氨基乙酰丙酸、4-氨基苯甲酸(PABA)、常见氨基酸的D-异构体、2,4-二氨基丁酸、α-氨基异丁酸、4-氨基丁酸、Abu、2-氨基丁酸、γ-Abu、ε-Ahx、6-氨基己酸、Aib、2-氨基异丁酸、3-氨基丙酸、鸟氨酸、正亮氨酸、正缬氨酸、羟脯氨酸、肌氨酸、瓜氨酸、高瓜氨酸、磺基丙氨酸、叔丁基甘氨酸、叔丁基丙氨酸、苯基甘氨酸、环己基丙氨酸、β-丙氨酸、氟氨基酸、设计师氨基酸(designer amino acid)例如β甲基氨基酸、Cα-甲基氨基酸、Nα-甲基氨基酸和一般的氨基酸类似物)。
也可以参考遗传密码,包括考虑密码子简并性,对异二聚体蛋白的核苷酸序列进行突变。
在各种实施方案中,本发明的嵌合蛋白是或包含以下氨基酸序列,所述序列与SEQID NO:33、34和37至42中的一个多个具有至少90%、或至少91%、或至少92%、或至少93%、或至少94%、或至少95%、或至少96%、或至少97%、或至少98%、或至少98%、或至少99%(例如约90%、或约91%、或约92%、或约93%、或约94%、或约95%、或约96%、或约97%、或约98%、或约98%、或约99%)的序列同一性,SEQ ID NO:33、34和37至42各自任选地省略前导序列(如本文别处的双下划线所示,或在实施方案:MEFGLSWVFLVAIIKGVQC(SEQ ID NO:18)中)。在各种实施方案中,本发明的嵌合蛋白是或包含以下氨基酸序列,所述氨基酸序列与SEQ IDNO:43、44和56-70中的一个多个具有至少90%、或至少91%、或至少92%、或至少93%、或至少94%、或至少95%、或至少96%、或至少97%、或至少98%、或至少98%、或至少99%(例如约90%、或约91%、或约92%、或约93%、或约94%、或约95%、或约96%、或约97%、或约98%、或约98%、或约99%)的序列同一性,SEQ ID NO:43、44和56-70各自任选地省略前导序列(如本文别处的双下划线所示,或在实施方案:MEFGLSWVFLVAIIKGVQC(SEQ IDNO:18)中)。
在这些序列中的任何序列中,具有以下氨基酸序列的核心结构域是或包含与SEQID NO:16具有至少90%、或至少91%、或至少92%、或至少93%、或至少94%、或至少95%、或至少96%、或至少97%、或至少98%、或至少98%、或至少99%(例如约90%、或约91%、或约92%、或约93%、或约94%、或约95%、或约96%、或约97%、或约98%、或约98%、或约99%)的序列同一性的氨基酸序列。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够并且可以用于包括促进免疫活化(例如,针对肿瘤)的方法中。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够并且可以用于包括抑制免疫抑制(例如,允许肿瘤存活)的方法中。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白提供改善的免疫活化和/或改善的免疫抑制的阻抑。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够或可用于包括调节免疫应答幅度的方法,例如调节效应物输出的水平。在实施方案中,例如当用于治疗癌症时,与免疫抑制相比,本发明的异二聚体蛋白改变免疫刺激的程度以增加T细胞反应的幅度,包括但不限于刺激增加水平的细胞因子产生、增殖或靶标杀伤潜力。
在实施方案中,进一步向受试者施用离体扩增的自体或同种异体γδT细胞。
在实施方案中,进一步向受试者施用表达嵌合抗原受体的自体或同种异体T细胞(即,CAR-T细胞)。CAR-T细胞描述于例如Eshhar等人,PNAS USA.90(2):720-724,1993;Geiger等人,J Immunol.162(10):5931-5939,1999;Brentjens等人,Nat Med.9(3):279-286,2003;Cooper等人,Blood101(4):1637-1644,2003;Imai等人,Leukemia.18:676-684,2004;Pang等人Mol Cancer.2018;17:91;和Schmidts等人Front.Immunol 2018;9:2593;其全部内容通过引用并入本文。
在实施方案中,异二聚体蛋白当与嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法联合使用时协同作用。在示例性实施方案中,异二聚体蛋白当与CAR T细胞疗法联合用于治疗肿瘤或癌症时协同作用。在一个实施方案中,异二聚体蛋白当与CAR T细胞疗法联合用于治疗基于血液的肿瘤时协同作用。在一个实施方案中,异二聚体蛋白当与CAR T细胞疗法联合用于治疗实体肿瘤时协同作用。例如,异二聚体蛋白和CAR T细胞的使用可协同作用以减少或消除肿瘤或癌症,或减缓肿瘤或癌症的生长和/或进展和/或转移。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白诱导CAR T细胞分裂。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白诱导CAR T细胞增殖。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白防止CAR T细胞的无反应性。
在各种实施方案中,CAR T细胞疗法包括靶向抗原(例如,肿瘤抗原)的CAR T细胞,所述靶向抗原例如但不限于碳酸酐酶IX(CAIX)、5T4、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD38、CD47、CS1、CD138、Lewis-Y、L1-CAM、MET、MUC1、MUC16、ROR-1、IL13Rα2、gp100、前列腺干细胞抗原(PSCA)、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、B细胞成熟抗原(BCMA)、人乳头瘤病毒16型E6(HPV-16E6)、CD171、叶酸受体α(FR-α)、GD2、GPC3、人表皮生长因子受体2(HER2)、κ轻链、间皮素、EGFR、EGFRvIII、ErbB、成纤维细胞活化蛋白(FAP)、癌胚抗原(CEA)、PMSA、受体酪氨酸激酶样孤儿受体1(ROR1)、TAG72和血管内皮生长因子受体2(VEGF-R2),以及作为所属领域熟知的其他肿瘤抗原。其他说明性肿瘤抗原包括但不限于MART-1/Melan-A、gp100、二肽基肽酶IV(DPPIV)、腺苷脱氨酶结合蛋白(ADAbp)、亲环蛋白b、结肠直肠相关抗原(CRC)-0017-1A/GA733、癌胚抗原(CEA)及其免疫原性表位CAP-1和CAP-2、etv6、aml1、前列腺特异性抗原(PSA)及其免疫原性表位PSA-1、PSA-2和PSA-3、T细胞受体/CD3-ζ链、肿瘤抗原MAGE家族(例如,MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A5、MAGE-A6、MAGE-A7、MAGE-A8、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A11、MAGE-A12、MAGE-Xp2(MAGE-B2)、MAGE-Xp3(MAGE-B3)、MAGE-Xp4(MAGE-B4)、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-C4、MAGE-C5)、肿瘤抗原GAGE家族(例如,GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7、GAGE-8、GAGE-9)、BAGE、RAGE、LAGE-1、NAG、GnT-V、MUM-1、CDK4、酪氨酸酶、p53、MUC家族、HER2/neu、p21ras、RCAS1、甲胎蛋白、E-钙黏着蛋白、α-钙黏着蛋白、β-钙黏着蛋白和γ-钙黏着蛋白、p120ctn、gp100 Pmel117、PRAME、NY-ESO-1、cdc27、腺瘤状结肠息肉蛋白(APC)、胞衬蛋白(fodrin)、连接蛋白37、Ig独特型、p15、gp75、GM2和GD2神经节苷脂、病毒产品(例如人乳头瘤病毒蛋白)、肿瘤抗原Smad家族、lmp-1、NA、EBV编码的核抗原(EBNA)-1、脑糖原磷酸化酶、SSX-1、SSX-2(HOM-MEL-40)、SSX-1、SSX-4、SSX-5、SCP-1CT-7、c-erbB-2、CD19、CD37、CD56、CD70、CD74、CD138、AGS16、MUC1、GPNMB、Ep-CAM、PD-L1和PD-L2。
示例性CAR T细胞疗法包括但不限于JCAR014(Juno Therapeutics)、JCAR015(JunoTherapeutics)、JCAR017(Juno Therapeutics)、JCAR018(Juno Therapeutics)、JCAR020(JunoTherapeutics)、JCAR023(Juno Therapeutics)、JCAR024(JunoTherapeutics)、CTL019(Novartis)、KTE-C19(Kite Pharma)、BPX-401(BellicumPharmaceuticals)、BPX-501(Bellicum Pharmaceuticals)、BPX-601(BellicumPharmaceuticals)、bb2121(Bluebird Bio)、CD-19睡美人细胞(ZiopharmOncology)、UCART19(Cellectis)、UCART123(Cellectis)、UCART38(Cellectis)、UCARTCS1(Cellectis)、OXB-302(Oxford BioMedica,MB-101(Mustang Bio)和由InnovativeCellularTherapeutics研发的CAR T-细胞。
在实施方案中,CAR-T细胞是自体或同种异体的γδT细胞。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白在一些实施方案中能够或可用于涉及掩蔽肿瘤细胞表面上的抑制性配体并用免疫刺激性配体替换所述免疫抑制性配体的方法中。因此,在一些实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够或可用于涉及减少或消除抑制性免疫信号和/或增加或活化免疫刺激信号的方法中。例如,带有抑制信号(从而逃避免疫应答)的肿瘤细胞可以被取代为结合在T细胞上的阳性信号,所述阳性信号然后可以攻击肿瘤细胞。因此,在实施方案中,抑制性免疫信号被本发明的异二聚体蛋白掩蔽并且刺激性免疫信号被活化。这种有益特性通过本发明的异二聚体蛋白的单一构建方法来增强。例如,信号替换可以几乎同时进行,并且信号替换被定制为在具有临床重要性的部位(例如,肿瘤微环境)的局部。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够或可用于包括刺激或增强免疫刺激受体/配体对结合的方法中。
在其他实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够或可用于涉及增强、恢复、促进和/或刺激免疫调节的方法中。在实施方案中,本文所描述的本发明的异二聚体蛋白恢复、促进和/或刺激一种或多种针对肿瘤细胞的免疫细胞的活性或活化,所述免疫细胞包括但不限于:T细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T辅助细胞、天然杀伤(NK)细胞、天然杀伤T(NKT)细胞、抗肿瘤巨噬细胞(例如,M1巨噬细胞)、B细胞和树突细胞。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白增强、恢复、促进和/或刺激T细胞的活性和/或活化,包括(作为非限制性实例)活化和/或刺激一种或多种T细胞内在信号,包括促生存信号;自分泌或旁分泌生长信号;p38MAPK-、ERK-、STAT-、JAK-、AKT-或PI3K-介导的信号;抗凋亡信号;和/或促进以下一项或多项和/或以下一项或多项所必需的信号:促炎细胞因子产生或T细胞迁移或T细胞肿瘤浸润。
在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够或可用于涉及引起一种或多种T细胞(包括但不限于细胞毒性T淋巴细胞、T辅助细胞、天然杀伤T(NKT)细胞)、B细胞、天然杀伤(NK)细胞、天然杀伤T(NKT)细胞、树突细胞、单核细胞和巨噬细胞(例如,M1和M2中的一个或多个)增加进入肿瘤或肿瘤微环境中的方法中。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够或可用于涉及、抑制和/或引起免疫抑制细胞(例如,髓源性抑制细胞(MDSC)、调节性T细胞(Treg)、肿瘤相关中性粒细胞(TAN)、M2巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞(TAM))对肿瘤和/或肿瘤微环境(TME)的募集减少的方法中。在实施方案中,本疗法可改变肿瘤部位和/或TME中M1与M2巨噬细胞的比率以有利于M1巨噬细胞。
在实施方案中,异二聚体蛋白调节γδT细胞的功能。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够并且可用于包括抑制和/或降低T细胞失活和/或对肿瘤的免疫耐受的方法中,包含将有效量的本文所描述的异二聚体蛋白施用于受试者。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够增加多种细胞因子(包括但不限于IFNγ、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-9、IL-10、IL-13、IL-17A、IL-17F和IL-22中的一种或多种)的血清水平。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够增强所治疗受试者的血清中的IL-2、IL-4、IL-5、IL-10、IL-13、IL-17A、IL-22或IFNγ。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白抑制、阻断和/或减少抗肿瘤CD8+和/或CD4+T细胞的细胞死亡;或刺激、诱导和/或增加促肿瘤T细胞的细胞死亡。T细胞耗竭是一种T细胞功能障碍的状态,其特征是增殖和效应功能的逐渐丧失,最终导致克隆缺失。因此,促肿瘤T细胞是指在许多慢性感染和癌症期间出现的T细胞功能障碍的状态。这种功能障碍的定义是增殖和/或效应子功能差、抑制性受体的持续表达以及与功能性效应子或记忆T细胞不同的转录状态。耗竭会妨碍对感染和肿瘤的最佳控制。此外,抗肿瘤CD8+和/或CD4+T细胞是指可以对肿瘤产生免疫应答的T细胞。说明性的促肿瘤T细胞包括但不限于表达一种或多种检查点抑制受体的Treg、CD4+和/或CD8+T细胞、Th2细胞和Th17细胞。检查点抑制受体是指在免疫细胞上表达的受体(例如,CTLA-4、B7-H3、B7-H4、TIM-3),其防止或抑制不受控制的免疫应答。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够并且可用于包括增加效应T细胞与调节性T细胞的比率的方法中。说明性的效应T细胞包括ICOS+效应T细胞;细胞毒性T细胞(例如,αβTCR、CD3+、CD8+、CD45RO+);CD4+效应T细胞(例如,αβTCR、CD3+、CD4+、CCR7+、CD62Lhi、IL-7R/CD127+);CD8+效应T细胞(例如,αβTCR、CD3+、CD8+、CCR7+、CD62Lhi、IL-7R/CD127+);效应记忆T细胞(例如,CD62Llow、CD44+、TCR、CD3+、IL-7R/CD127+、IL-15R+、CCR7low);中央记忆T细胞(例如,CCR7+、CD62L+、CD27+;或CCR7hi、CD44+、CD62Lhi、TCR、CD3+、IL-7R/CD127+、IL-15R+);CD62L+效应T细胞;CD8+效应记忆T细胞(TEM),包括早期效应记忆T细胞(CD27+CD62L-)和晚期效应记忆T细胞(CD27-CD62L-)(分别为TemE和TemL);CD127(+)CD25(low/-)效应T细胞;CD127(-)CD25(-)效应T细胞;CD8+干细胞记忆效应细胞(TSCM)(例如,CD44(low)CD62L(high)CD122(high)sca(+));TH1效应T细胞(例如,CXCR3+、CXCR6+和CCR5+;或αβTCR、CD3+、CD4+、IL-12R+、IFNγR+、CXCR3+)、TH2效应T细胞(例如,CCR3+、CCR4+和CCR8+;或αβTCR、CD3+、CD4+、IL-4R+、IL-33R+、CCR4+、IL-17RB+、CRTH2+);TH9效应T细胞(例如,αβTCR、CD3+、CD4+);TH17效应T细胞(例如,αβTCR、CD3+、CD4+、IL-23R+、CCR6+、IL-1R+);CD4+CD45RO+CCR7+效应T细胞、CD4+CD45RO+CCR7(-)效应T细胞;和分泌IL-2、IL-4和/或IFN-γ的效应T细胞。说明性的调节性T细胞包括ICOS+调节性T细胞、CD4+CD25+FOXP3+调节性T细胞、CD4+CD25+调节性T细胞、CD4+CD25-调节性T细胞、CD4+CD25high调节性T细胞、TIM-3+PD-1+调节性T细胞、淋巴细胞活化基因-3(LAG-3)+调节性T细胞、CTLA-4/CD152+调节性T细胞、神经纤毛蛋白-1(Nrp-1)+调节性T细胞、CCR4+CCR8+调节性T细胞、CD62L(L-选择蛋白)+调节性T细胞、CD45RBlow调节性T细胞、CD127low调节性T细胞、LRRC32/GARP+调节性T细胞、CD39+调节性T细胞、GITR+调节性T细胞、LAP+调节性T细胞、1B11+调节性T细胞、BTLA+调节性T细胞、1型调节性T细胞(Tr1细胞)、T辅助3型(Th3)细胞、天然杀伤T细胞的调节性细胞(NKTreg)、CD8+调节性T细胞、CD8+CD28-调节性T细胞和/或分泌IL-10、IL-35、TGF-β、TNF-α、半乳凝素-1、IFN-γ和/或MCP1的调节性T细胞。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够并且可用于包括瞬时刺激效应T细胞不超过约12小时、约24小时、约48小时、约72小时或约96小时或约1周或约2周的方法中。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白能够并且可用于包括瞬时消耗或抑制调节性T细胞不超过约12小时、约24小时、约48小时、约72小时或约96小时或约1周或约2周的方法中。在各种实施方案中,效应T细胞的瞬时刺激和/或调节性T细胞的瞬时消耗或抑制基本上发生在患者的血流中或特定组织/位置中,包括淋巴组织,例如骨髓、淋巴结、脾脏、胸腺、粘膜相关淋巴组织(MALT)、非淋巴组织或肿瘤微环境中。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白提供了包括但不限于易于使用和易于生产的优点。这是因为两种不同的免疫治疗剂组合成一个单独的产品,这允许单一的制造过程而不是两个独立的制造过程。此外,施用单一的剂而不是两种分开的剂允许更容易施用和更大的患者依从性。此外,与例如单克隆抗体相比(单克隆抗体是包含大量二硫键和翻译后修饰(例如糖基化)的大多聚体蛋白质),本发明的异二聚体蛋白更容易制造且更具成本效益。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白提供协同治疗效果,因为其允许两种免疫治疗剂的改善的位点特异性相互作用。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白提供降低位点外和/或全身毒性的潜力。
在实施方案中,第一结构域和/或异二聚体蛋白调节或能够调节γδ(gammadelta)T细胞。在实施方案中,γδT细胞是Vγ9δ2T细胞。在实施方案中,γδT细胞的调节是γδT细胞的活化。在实施方案中,异二聚体蛋白能够在γδT细胞和肿瘤细胞之间形成突触和/或异二聚体蛋白能够同时活化γδT细胞并将其靶向肿瘤细胞。
本公开的嵌合蛋白
在一个方面,本公开涉及具有以下通用结构的嵌合蛋白:N末端-(a)–(b)–(c)–C末端,其中:(a)是包含通用结构(a1)–SL–(a2)的第一结构域,其中(a1)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,(a2)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,并且SL是连接(a1)和(a2)的第二接头,其包含约4至约50个氨基酸长度的柔性氨基酸序列,并且(c)是包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域是选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段和(ii)膜蛋白的胞外结构域,(b)是连接第一和第二结构域的接头,其中接头包含至少一个能够形成二硫键的半胱氨酸残基。
在实施方案中,嵌合蛋白如图11所示,任选地包含具有与选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,四聚体嵌合蛋白如图11所示,任选地包含具有选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列的氨基酸序列的多肽。
第一结构域
在实施方案中,第一结构域包括以下的通用结构:
(a1)–SL–(a2),其中
(a1)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,(a2)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,并且SL是连接(a1)和(a2)的第二接头,其包含约4至约50个氨基酸长度的柔性氨基酸序列。
在实施方案中,第一结构域包含两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,其中第一结构域包含两个不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白包含V型结构域。
在实施方案中,(a1)和(a2)是两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,(a1)和(a2)是不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,(a1)和/或(a2)是包含可变结构域的嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段。在实施方案中,(a1)和(a2)包含独立地选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白独立地选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。
在一些实施方案中,第一结构域包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段,其中该片段能够结合γδT细胞受体并且任选地是胞外结构域,任选地包含可变结构域。在一些实施方案中,第一结构域包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段,其中该片段能够结合任选地选自Vγ4和Vγ9δ2TCR的γδT细胞受体。
在一些实施方案中,第一结构域包含两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在一些实施方案中,其中第一结构域包含两个不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在一些实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白包含V型结构域。合适的嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段源自天然嗜乳脂蛋白家族蛋白,其在全长蛋白的胞质尾中包含B30.2结构域。
适用于本技术的人BTNL3的示例性氨基酸序列如下所示:
QWQVTGPGKFVQALVGEDAVFSCSLFPETSAEAMEVRFFRNQFHAVVHLYRDGEDWESKQMPQYRGRTEFVKDSIAGGRVSLRLKNITPSDIGLYGCWFSSQIYDEEATWELRVAALGSLPLISIVGYVDGGIQLLCLSSGWFPQPTAKWKGPQGQDLSSDSRANADGYSLYDVEISIIVQENAGSILCSIHLAEQSHEVESKVLIGETFFQPSPWRLAS(SEQ ID NO:80)
人BTN2A1的胞外结构域的氨基酸序列,其是适用于本公开的人BTN2A1的示例性氨基酸序列,如下所示:
QFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCA(SEQ ID NO:35)
在一些实施方案中,人BTN2A1的胞外结构域的片段,其是适用于本公开的人BTN2A1的可变结构域,如下所示:
QFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLV(SEQ ID NO:71)
人BTN3A1的胞外结构域的氨基酸序列,其是适用于本公开的人BTN3A1的示例性氨基酸序列,如下所示:
QFSVLGPSGPILAMVGEDADLPCHLFPTMSAETMELKWVSSSLRQVVNVYADGKEVEDRQSAPYRGRTSILRDGITAGKAALRIHNVTASDSGKYLCYFQDGDFYEKALVELKVAALGSDLHVDVKGYKDGGIHLECRSTGWYPQPQIQWSNNKGENIPTVEAPVVADGVGLYAVAASVIMRGSSGEGVSCTIRSSLLGLEKTASISIADPFFRSAQRWIAALAG(SEQ ID NO:19)
在一些实施方案中,人BTN3A1的胞外结构域的片段,其是适用于本公开的人BTN2A1的可变结构域,如下所示:
AQFSVLGPSGPILAMVGEDADLPCHLFPTMSAETMELKWVSSSLRQVVNVYADGKEVEDRQSAPYRGRTSILRDGITAGKAALRIHNVTASDSGKYLCYFQDGDFYEKALVELKVA(SEQ ID NO:72)适用于本技术的人BTN3A2的示例性氨基酸序列
QFSVLGPSGPILAMVGEDADLPCHLFPTMSAETMELKWVSSSLRQVVNVYADGKEVEDRQSAPYRGRTSILRDGITAGKAALRIHNVTASDSGKYLCYFQDGDFYEKALVELKVAALGSNLHVEVKGYEDGGIHLECRSTGWYPQPQIQWSNAKGENIPAVEAPVVADGVGLYEVAASVIMRGGSGEGVSCIIRNSLLGLEKTASISIADPFFRSAQPW(SEQ ID NO:81)
适用于本技术的人BTNL8的示例性氨基酸序列如下所示:
QWQVFGPDKPVQALVGEDAAFSCFLSPKTNAEAMEVRFFRGQFSSVVHLYRDGKDQPFMQMPQYQGRTKLVKDSIAEGRISLRLENITVLDAGLYGCRISSQSYYQKAIWELQVSALGSVPLISITGYVDRDIQLLCQSSGWFPRPTAKWKGPQGQDLSTDSRTNRDMHGLFDVEISLTVQENAGSISCSMRHAHLSREVESRVQIGDTFFEPISWHLATK(SEQ ID NO:82)
在各种实施方案中,本发明的嵌合蛋白包含两个独立的结合结构域,每个结合结构域均来自异二聚体人蛋白的一个亚基。表2中提供了可作为本发明的异二聚体蛋白的一部分形成的示例性蛋白。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白具有表2中提供的示例性蛋白之一。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白具有表2中提供的两种示例性蛋白。
表2
可以并入本发明的组合物和方法中的示例性嗜乳脂蛋白样(BTNL)家族蛋白包括以下蛋白(如本文所用,“条目”是指Uniprot数据库中的蛋白条目,“条目名称”是指Uniprot数据库中的蛋白条目):
在实施方案中,第一结构域包含多肽,该多肽具有(a1)与选自SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93的氨基酸序列具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列,和(a2)与选自SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93的氨基酸序列具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列。在实施方案中,第一结构域包含具有以下氨基酸序列的多肽:(a1)SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93中的任一个;和(a2)SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93中的任一个。在实施方案中,第一结构域包含以下的胞外结构域:(i)BTNL3和BTNL8;(ii)BTN2A1和BTN3A1;(iii)BTN3A1和BTN3A2;或(iv)BTN3A1和BTN3A3。在实施方案中,第一结构域包含以下的可变结构域:(i)BTNL3和BTNL8;(ii)BTN2A1和BTN3A1;(iii)BTN3A1和BTN3A2;或(iv)BTN3A1和BTN3A3。
在实施方案中,本发明的嵌合蛋白包含两个嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域,所述两个嗜乳脂蛋白家族蛋白独立地选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。在实施方案中,本发明的嵌合蛋白包含两个嗜乳脂蛋白家族蛋白的可变结构域,所述两个嗜乳脂蛋白家族蛋白独立地选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。例如,嵌合蛋白可包含两个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其变体、可变结构域或功能片段,它们与独立地选自SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93的两个氨基酸序列具有至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%)的序列同一性。
在实施方案中,第二接头包含通式G(G3S)m或GGGSn的氨基酸序列,其中m和n是1至16范围内的整数。在实施方案中,第二接头是柔性氨基酸序列。示例性第二接头是G(G3S)m或GGGSn,其中m或n是2-6,例如GGGGSGGGS(SEQ ID NO:73),GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:74),GGGGSGGGSGGGS(SEQ ID NO:75),GGGSGGGSGGGSGGGS(SEQ ID NO:76),GGGGSGGGSGGGSGGGS(SEQ ID NO:77),GGGGSGGGGS(SEQ ID NO:78),和GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:79)。
包含靶向结构域的第二结构域
本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白包含第二结构域,该第二结构域包含靶向结构域。在一些实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗体样分子选自单结构域抗体、重组仅重链抗体(VHH)、单链抗体(scFv)、鲨鱼仅重链抗体(VNAR)、微蛋白(半胱氨酸结蛋白,打结素(knottin))、DARPin;四联凝素;亲和体;穿膜抗体;Anticalin;AdNectin;Affilin;Affimer、微体;适体;改变酶;塑料抗体;phylomer;stradobody;巨型体;evibody;fynomer、犰狳重复蛋白、Kunitz结构域、avimer、atrimer、probody、免疫体、triomab、troybody;肽体;疫苗体;单特异性体;双特异性体、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2。在一些实施方案中,抗体样分子是scFv。在实施方案中,靶向结构域特异性结合以下中的一种:CLEC12A、CD307、gpA33、间皮素、CDH17、CDH3/P-钙黏着蛋白、CEACAM5/CEA、EPHA2、NY-eso-1、GP100、MAGE-A1、MAGE-A4、MSLN、CLDN18.2、Trop-2、ROR1、CD123、CD33、CD20、GPRC5D、GD2、CD276/B7-H3、DLL3、PSMA、CD19、cMet、HER2、A33、TAG72、5T4、CA9、CD70、MUC1、NKG2D、CD133、EpCam、MUC17、EGFRvIII、IL13R、CPC3、GPC3、FAP、BCMA、CD171、SSTR2、FOLR1、MUC16、CD274/PDL1、CD44、KDR/VEGFR2、PDCD1/PD1、TEM1/CD248、LeY、CD133、CELEC12A/CLL1、FLT3、IL1RAP、CD22、CD23、CD30/TNFRSF8、FCRH5、SLAMF7/CS1、CD38、CD4、PRAME、EGFR、PSCA、STEAP1、CD174/FUT3/LeY、L1CAM/CD171、CD22、CD5、LGR5、LGR5、CLL-1和GD3。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD19。在实施方案中,靶向结构域特异性结合PSMA。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD33。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CLL-1。
包含靶向结构域的第二结构域的示例性序列提供如下:
在一个方面,本公开涉及异二聚体蛋白,其第二结构域包含特异性结合CD19的靶向结构域。
本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白包含第二结构域,该第二结构域包含靶向结构域。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,抗体样分子选自单结构域抗体、重组仅重链抗体(VHH)、单链抗体(scFv)、鲨鱼仅重链抗体(VNAR)、微蛋白(半胱氨酸结蛋白,打结素(knottin))、DARPin;四联凝素;亲和体;穿膜抗体;Anticalin;AdNectin;Affilin;Affimer、微体;适体;改变酶;塑料抗体;phylomer;stradobody;巨型体;evibody;fynomer、犰狳重复蛋白、Kunitz结构域、avimer、atrimer、probody、免疫体、triomab、troybody;肽体;疫苗体;单特异性体;双特异性体、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2。在实施方案中,抗体样分子是scFv。在实施方案中,靶向结构域是胞外结构域。在实施方案中,靶向结构域能够结合癌细胞表面上的抗原。在实施方案中,靶向结构域特异性结合以下中的一种:CD19、PSMA、GD2、PSCA、BCMA、CD123、B7-H3、CD20、CD30、CD33、CD38、CEA、CLEC12A、DLL3、EGFRvIII、EpCAM、CD307、FLT3、GPC3、gpA33、HER2、MUC16、P-钙黏着蛋白、SSTR2和间皮素。在实施方案中,靶向结构域包含LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19或PSMA的胞外结构域的一部分。在实施方案中,靶向结构域特异性结合PSMA。在实施方案中,靶向结构域特异性结合CD19。
在实施方案中,靶向结构域是抗体或其抗原结合片段。在实施方案中,结合片段包含Fv结构域。在实施方案中,靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。在实施方案中,结合片段包含scFv结构域。
包含靶向结构域的第二结构域的示例性序列提供如下:
示例性靶向结构域是scFVh19,其是对人CD19具有特异性的scFV的重链可变结构域,具有以下序列:
DIQLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYLNWYQQIPGQPPKLLIYDASNLVSGIPPRFSGSGSGTDFTLNIHPVEKVDAATYHCQQSTEDPWTFGGGTKLEIK(SEQ ID NO:20)
示例性靶向结构域是scFVlh19,其是对人CD19具有特异性的scFV的轻链可变结构域,具有以下序列:
EVQLVESGGGLVQPGGSLTLSCAASRFMISEYHMHWVRQAPGKGLEWVSTINPAGTTDYAESVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCDSYGYRGQGTQVTV(SEQ ID NO:21)
示例性靶向结构域是scFvCD19,其是对人CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
QVQLQQSGAELVRPGSSVKISCKASGYAFSSYWMNWVKQRPGQGLEWIGQIWPGDGDTNYNGKFKGKATLTADESSSTAYMQLSSLASEDSAVYFCARRETTTVGRYYYAMDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYLNWYQQIPGQPPKLLIYDASNLVSGIPPRFSGSGSGTDFTLNIHPVEKVDAATYHCQQSTEDPWTFGGGTKLEIK(SEQ IDNO:22)
示例性靶向结构域是19scFv3,其是对人CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGGGSGGGSGGGSEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSS(SEQ ID NO:23)
示例性靶向结构域是scFvCD19VHVL,其是对小鼠CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
EVQLQQSGAELVRPGTSVKLSCKVSGDTITFYYMHFVKQRPGQGLEWIGRIDPEDESTKYSEKFKNKATLTADTSSNTAYLKLSSLTSEDTATYFCIYGGYYFDYWGQGVMVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPASLSTSLGETVTIQCQASEDIYSGLAWYQQKPGKSPQLLIYGASDLQDGVPSRFSGSGSGTQYSLKITSMQTEDEGVYFCQQGLTYPRTFGGGTKLELK(SEQ ID NO:24)
示例性靶向结构域是scFvCD19VLVH,其是对小鼠CD19具有特异性的scFV,具有以下序列:
DIQMTQSPASLSTSLGETVTIQCQASEDIYSGLAWYQQKPGKSPQLLIYGASDLQDGVPSRFSGSGSGTQYSLKITSMQTEDEGVYFCQQGLTYPRTFGGGTKLELKGGGGSGGGGSGGGGSEVQLQQSGAELVRPGTSVKLSCKVSGDTITFYYMHFVKQRPGQGLEWIGRIDPEDESTKYSEKFKNKATLTADTSSNTAYLKLSSLTSEDTATYFCIYGGYYFDYWGQGVMVTVSS(SEQ ID NO:25)
示例性靶向结构域是scFVlPSMA,其是对人PSMA具有特异性的scFV的轻链可变结构域,具有以下序列:
RKGGKRGSGSGQTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCASSTGAVTSGNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTKFLVPGTPARFSGSLLGGKAALTLSGVQPEDEAEYYCTLWYSNRWVFGGGTKLTVL(SEQ IDNO:26)
示例性靶向结构域是GD2scFv3,其是对人GD2具有特异性的scFV,具有以下序列
GTDFTLKISRVEAEDLGVYFCSQSTHVPPLTFGAGTKLELKGGGSGGGSGGGSEVQLLQSGPELEKPGASVMISCKASGSSFTGYNMNWVRQNIGKSLEWIGAIDPYYGGTSYNQKFKGRATLTVDKSSSTAYMHLKSLTSEDSAVYYCVSGMKYWGQGTSVTVSS(SEQ ID NO:27)
示例性靶向结构域是CD33scFv-3,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
QVQLVQSGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKEDTIRGPNYYYYGMDVWGQGTTVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSETTLTQSPSSVSASVGDRVSITCRASQDIDTWLAWYQLKPGKAPKLLMYAASNLQGGVPSRFSGSGSGTDFILTISSLQPEDFATYYCQQASIFPPTFGGGTKVDIK(SEQ ID NO:94)
示例性靶向结构域是CD33scFv-4,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
QVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTSYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSITTAYLQWSSLRASDSAMYYCARGGYSDYDYYFDFWGQGTLVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSEIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLLHSNGYNYLDWYLQKPGQSPQLLIYLGSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQALQTPFTFGGGTKVEIK(SEQ IDNO:95)
示例性靶向结构域是CD33scFv-5,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
QVQLVQSGGDLAQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLEWVAVIWPDGGQKYYGDSVKGRFTVSRDNPKNTLYLQMNSLRAEDTAIYYCVRHFNAWDYWGQGTLVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSAYVGGRVTITCQASQGISQFLNWFQQKPGKAPKLLISDASNLEPGVPSRFSGSGSGTDFTFTITNLQPEDIATYYCQQYDDLPLTFGGGTKVEIK(SEQ ID NO:96)
示例性靶向结构域是CD33scFv-6,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
QVQLVQSGGGVVQPGKSLRLSCAASGFTFSIFAMHWVRQAPGKGLEWVATISYDGSNAFYADSVEGRFTISRDNSKDSLYLQMDSLRPEDTAVYYCVKAGDGGYDVFDSWGQGTLVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSEIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLLHSNGYNYLDWYLQKPGQSPQLLIYLGSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQALQTPTFGPGTKVDIK(SEQ ID NO:97)
示例性靶向结构域是CD33scFv-7,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKETDYYGSGTFDYWGQGTLVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTISCRASQGIGIYLAWYQQRSGKPPQLLIHGASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFASYWCQQSNNFPPTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:98)
示例性靶向结构域是CD33scFv-9,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
QVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTNYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCARHGPSSWGEFDYWGQGTLVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSDIRLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGGGTKVDIK(SEQ ID NO:99)
示例性靶向结构域是CD33scFv-10,其是对人CD33具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链(VH)和轻链(VL)可变区的接头用下划线显示):
EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTITDSNIHWVRQAPGQSLEWIGYIYPYNGGTDYNQKFKNRATLTVDNPTNTAYMELSSLRSEDTAFYYCVNGNPWLAYWGQGTLVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSTLSASVGDRVTITCRASESLDNYGIRFLTWFQQKPGKAPKLLMYAASNQGSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQTKEVPWSFGQGTKVEVK(SEQ ID NO:100)
示例性靶向结构域是CD20scFv-1,其是对人CD20具有特异性的scFV,具有以下序列(重链可变区(VH)以粗体字体显示,轻链可变区(VL)以斜体字体表示,连接VH和VL的接头用下划线表示):
示例性靶向结构域是CD20scFv-2,其是对人CD20具有特异性的scFV,具有以下序列(重链可变区(VH)以粗体字体显示,轻链可变区(VL)以斜体字体表示,连接VH和VL的接头用下划线显示):
示例性靶向结构域是CD20scFv-3,其是对人CD20具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWMGAIYPGNGDTSYNQKFQGRVTITADKSISTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSTYYGGDWYFNVWGAGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASSSVSYIHWFQQKPGKSPKPLIYATSNLASGVPVRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYCQQWTSNPPTFGGGTKVEIK(SEQ ID NO:103)
示例性靶向结构域是CD20scFv-4,其是对人CD20具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
EVQLVESGGGLVQPDRSLRLSCAASGFTFHDYAMHWVRQAPGKGLEWVSTISWNSGTIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAKDIQYGNYYYGMDVWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPITFGQGTRLEIK(SEQ ID NO:104)
示例性靶向结构域是GPRC5DscFv-1,其是对人GPRC5D具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
SSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSRDSSGNPPVVFGGGTKLTVLGSRGGGGSGGGGSGGGGSLEMAQVQLVESGGGLVHPGGSLRLSCAASGFTFRSHSMNWVRQAPGKGLEWVSSISSDSTYTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSGGQWKYYDYWGQGTLVTVSS(SEQ IDNO:105)
示例性靶向结构域是GPRC5DscFv-2,其是对人GPRC5D具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QSVVTQPPSMSAAPGQQVTISCSGGNSNIERNYVSWYLQLPGTAPKLVIFDNDRRPSGIPDRFSGSKSGTSATLGITGLQTGDEADYYCGTWDSSLRGWVFGGGTKLTVLGSRGGGGSGGGGSGGGGSLEMAEVQLVESGGGLIQPGGSLRLSCAASGFTFSNYAMNWVRQAPGKGLEWVSTINGRGSSTIYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTATYYCARYISRGLGDSWGQGTLVTV(SEQ ID NO:106)
示例性靶向结构域是Trop2-1_vHvL,其是对人Trop2具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QVQLQQSGSELKKPGASVKVSCKASGYTFTNYGMNWVKQAPGQGLKWMGWINTYTGEPTYTDDFKGRFAFSLDTSVSTAYLQISSLKADDTAVYFCARGGFGSSYWYFDVWGQGSLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVSITCKASQDVSIAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQHYITPLTFGAGTKVEIKR(SEQ ID NO:107)
示例性靶向结构域是Trop2-1_vLvH,其是对人Trop2具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
DIQLTQSPSSLSASVGDRVSITCKASQDVSIAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQHYITPLTFGAGTKVEIKRGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQQSGSELKKPGASVKVSCKASGYTFTNYGMNWVKQAPGQGLKWMGWINTYTGEPTYTDDFKGRFAFSLDTSVSTAYLQISSLKADDTAVYFCARGGFGSSYWYFDVWGQGSLVTVSS(SEQ ID NO:108)
示例性靶向结构域是Trop2-2_vHvL,其是对人Trop2具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QIQLVQSGPELKKPGETVKISCKASGYTFTNYGMNWVKQAPGKGLKWMGWINTKTGEPTYAEEFKGRFAFSLETSASTAYLQINNLKKEDTATYFCGRGGYGSSYWYFDVWGAGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVMTQSHKFMSTSVGDRVSITCKASQDVSIAVAWYQQKPGQSPKVLIYSASYRYTGVPDRFTGSGSGTDFTFTISRVQAEDLAVYYCQQHYITPLTFGAGTKLELK(SEQ ID NO:109)
示例性靶向结构域是Trop2-2_vLvH,其是对人Trop2具有特异性的scFV,具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
DIVMTQSHKFMSTSVGDRVSITCKASQDVSIAVAWYQQKPGQSPKVLIYSASYRYTGVPDRFTGSGSGTDFTFTISRVQAEDLAVYYCQQHYITPLTFGAGTKLELKGGGGSGGGGSGGGGSQIQLVQSGPELKKPGETVKISCKASGYTFTNYGMNWVKQAPGKGLKWMGWINTKTGEPTYAEEFKGRFAFSLETSASTAYLQINNLKKEDTATYFCGRGGYGSSYWYFDVWGAGTTVTVSS(SEQ ID NO:110)
示例性靶向结构域是CEACAM5-1_vHvL,其是对人CEACAM5具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCSASGFDFTTYWMSWVRQAPGKGLEWIGEIHPDSSTINYAPSLKDRFTISRDNAKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCASLYFGFPWFAYWGQGTPVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTSVAWYQQKPGKAPKLLIYWTSTRHTGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYSLYRSFGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:111)
示例性靶向结构域是CEACAM5-1_vLvH,其是对人CEACAM5具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTSVAWYQQKPGKAPKLLIYWTSTRHTGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYSLYRSFGQGTKVEIKRGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCSASGFDFTTYWMSWVRQAPGKGLEWIGEIHPDSSTINYAPSLKDRFTISRDNAKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCASLYFGFPWFAYWGQGTPVTVSS(SEQ ID NO:112)
示例性靶向结构域是CEACAM5-2_vHvL,其是对人CEACAM5具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
EVQLQESGPGLVKPGGSLSLSCAASGFVFSSYDMSWVRQTPERRLEWVAYISSGGGITYFPSTVKGRFTVSRDNAKNTLYLQMNSLTSEDTAIYYCAAHYFGSSGPFAYWGQGTLVTVSAGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPASLSASVGDTVTITCRASENIFSYLAWYQQKPGKSPKLLVYNTKTLAEGVPSRFSGSGSGTQFSLTISSLQPEDFGSYYCQHHYGTPFTFGSGTKLEIK(SEQ ID NO:113)
示例性靶向结构域是CEACAM5-2_vLvH,其是对人CEACAM5具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
DIQMTQSPASLSASVGDTVTITCRASENIFSYLAWYQQKPGKSPKLLVYNTKTLAEGVPSRFSGSGSGTQFSLTISSLQPEDFGSYYCQHHYGTPFTFGSGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSVQLQESGPGLVKPGGSLSLSCAASGFVFSSYDMSWVRQTPERRLEWVAYISSGGGITYFPSTVKGRFTVSRDNAKNTLYLQMNSLTSEDTAIYYCAAHYFGSSGPFAYWGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:114)
示例性靶向结构域是CEACAM5-3_vHvL,其是对人CEACAM5具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVL(SEQ ID NO:115)
示例性靶向结构域是CEACAM5-3_vLvH,其是对人CEACAM5具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVLGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSS(SEQID NO:116)
示例性靶向结构域是CLL1-1_vHvL,其是对人CLL1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCVASGFTFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAAIWYNGRKQDYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCTRGTGYNWFDPWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPPTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:117)
示例性靶向结构域是CLL1-1_vLvH,其是对人CLL1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPPTFGQGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCVASGFTFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAAIWYNGRKQDYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCTRGTGYNWFDPWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:118)
示例性靶向结构域是CLL1-2_vHvL,其是对人CLL1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSYYWSWIRQPPGKGLEWIGYIYYSGSTNYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCVSLVYCGGDCYSGFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVSFTCQASQDINNFLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYGNLPFTFGGGTKVEIKR(SEQ ID NO:119)
示例性靶向结构域是CLL1-2_vLvH,其是对人CLL1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头用下划线显示):
DIQLTQSPSSLSASVGDRVSFTCQASQDINNFLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYGNLPFTFGGGTKVEIKRGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSYYWSWIRQPPGKGLEWIGYIYYSGSTNYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCVSLVYCGGDCYSGFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:120)
示例性靶向结构域是ROR1-vHvL-1,其是对人ROR1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头是下划线所示):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGIINPNGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARDSSYDAFDIWGQGTMVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSAIQLTQSPSTLSASVGDRVTItCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLINDASYLETGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDIATYYCQQYESLPYTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:121)
示例性靶向结构域是ROR1-vLvH-1,其是对人ROR1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头是下划线所示):
AIQLTQSPSTLSASVGDRVTItCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLINDASYLETGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDIATYYCQQYESLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGIINPNGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARDSSYDAFDIWGQGTMVTVSS(SEQ ID NO:122)
示例性靶向结构域是ROR1-vLvH-2,其是对人ROR1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头是下划线所示):
QVTLKESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNAWMSWVRQAPGKGLEWVGRIKSKTDGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCARDFGRWSYYFDYWSQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQSVLTQPSSVSGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNYVYWYQQLPGTAPKWYRNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLSGVVFGGGTKLTVL(SEQ ID NO:123)
示例性靶向结构域是ROR1-vHvL-2,其是对人ROR1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头是下划线所示):
QSVLTQPSSVSGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNYVYWYQQLPGTAPKWYRNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLSGVVFGGGTKLTVLGGGGSGGGGSGGGGSQVTLKESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNAWMSWVRQAPGKGLEWVGRIKSKTDGGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCARDFGRWSYYFDYWSQGTLVTVSS(SEQ ID NO:124)
示例性靶向结构域是ROR1-vHvL-3,其是对人ROR1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头是下划线所示):
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASGFTFGDYAMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGRSTDHADYVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNRLRAEDTAVYYCAKVSNYEYYFDYWAQGTLTVSSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPSVSVAPGQTARITCGGSNIGSESVNWYQWKSGQVPVLVVSDTTDPRSGIPGRFTGTRSGTTATLTISGVEAGDEADYHCQVWDDTGDHPVFGGGTKLTVL(SEQ ID NO:125)
示例性靶向结构域是ROR1-vLvH-3,其是对人ROR1具有特异性的scFV,并具有以下序列(连接重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的接头是下划线所示):
EIVLTQSPSVSVAPGQTARITCGGSNIGSESVNWYQWKSGQVPVLVVSDTTDPRSGIPGRFTGTRSGTTATLTISGVEAGDEADYHCQVWDDTGDHPVFGGGTKLTVLGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASGFTFGDYAMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGRSTDHADYVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNRLRAEDTAVYYCAKVSNYEYYFDYWAQGTLTVSS(SEQ ID NO:126)
在实施方案中,嵌合蛋白的第二结构域包含具有选自SEQ ID NO:20-27和94-126的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,嵌合蛋白的第二结构域包含具有与选自SEQ ID NO:20-23和94-126的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。在实施方案中,α链和/或β链的第二结构域包含具有氨基酸序列的多肽,所述氨基酸序列与选自SEQ IDNO:20-23和94-126的氨基酸序列具有至少约60%、或至少约61%、或至少约62%、或至少约63%、或至少约64%、或至少约65%、或至少约66%、或至少约67%、或至少约68%、或至少约69%、或至少约70%、或至少约71%、或至少约72%、或至少约73%、或至少约74%、或至少约75%、或至少约76%、或至少约77%、或至少约78%、或至少约79%、或至少约80%、或至少约81%、或至少约82%、或至少约83%、或至少约84%、或至少约85%、或至少约86%、或至少约87%、或至少约88%、或至少约89%、或至少约90%、或至少约91%、或至少约92%、或至少约93%、或至少约94%、或至少约95%、或至少约96%、或至少约97%、或至少约98%、或至少约99%)的序列同一性。
在实施方案中,除了嗜乳脂蛋白家族蛋白之外,嵌合蛋白还包含LAG-3、PD-1或TIGIT的胞外结构域的一部分,并且其能够结合其在癌细胞表面上的受体/配体。在实施方案中,除了嗜乳脂蛋白家族蛋白之外,嵌合蛋白还包含抗体或其片段(例如,包含抗体的抗原结合结构域的一部分和/或结合肿瘤表位的CDR3),并且其能够结合癌细胞表面上的抗原。
在实施方案中,除了嗜乳脂蛋白家族蛋白之外,嵌合蛋白还包含LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19、PSMA的胞外结构域的一部分或靶向肿瘤抗原(如CD19或PSMA)的抗体衍生结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等),并且其能够结合其在癌细胞表面上的受体/配体。在实施方案中,除了BTNL家族蛋白之外,嵌合蛋白还包含抗体或其片段(例如,包含抗体的抗原结合结构域的一部分)并且其能够结合癌细胞表面上的抗原。
在示例性实施方案中,第二结构域是EGP的受体,例如EGFR(ErbB1)、ErbB2、ErbB3和ErbB4。
在示例性实施方案中,第二结构域是胰岛素或胰岛素类似物的受体,例如胰岛素受体和/或IGF1或IGF2受体。
在示例性实施方案中,第二结构域是EPO受体,例如EPO受体(EPOR)受体和/或肝配蛋白受体(EphR)。
在各种实施方案中,嵌合蛋白可包含可溶性(例如,非膜相关)蛋白的结构域。在各种实施方案中,嵌合蛋白可包含参与信号传导的可溶性蛋白的片段(例如,与受体相互作用的可溶性蛋白的一部分)。
在各种实施方案中,嵌合蛋白可包含跨膜蛋白的胞外结构域。在各种实施方案中,胞外结构域之一转导免疫抑制信号,并且胞外结构域之一转导免疫刺激信号。
在一些实施方案中,胞外结构域是指能够与细胞外环境相互作用的跨膜蛋白的一部分。在各种实施方案中,胞外结构域是指足以结合配体或受体并有效地将信号传递至细胞的跨膜蛋白的一部分。在各种实施方案中,胞外结构域是细胞或细胞膜外部的跨膜蛋白的完整氨基酸序列。在各种实施方案中,胞外结构域是跨膜蛋白的氨基酸序列的一部分,该部分是细胞或细胞膜外部,并且是信号转导和/或配体结合所必需的,如可以使用本领域已知的方法测定的(例如,体外配体结合和/或细胞活化测定)。
在各种实施方案中,嵌合蛋白可包含抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)。在各种实施方案中,抗体结合结构域之一转导免疫抑制信号并且抗体结合结构域之一转导免疫刺激信号。
在一些实施方案中,免疫抑制信号是指减少或消除免疫应答的信号。例如,在肿瘤学的背景下,此类信号可能削弱或消除抗肿瘤免疫力。在正常生理条件下,抑制信号可用于维持自我耐受(例如,预防自身免疫),也可在免疫系统对病原体感染做出反应时保护组织免受损害。例如,但不限于,免疫抑制信号可以通过检测当这种抑制信号被阻断时细胞增殖、细胞因子产生、细胞杀伤活性或吞噬活性的增加来确定。
在一些实施方案中,免疫刺激信号是指增强免疫应答的信号。例如,在肿瘤学的背景下,此类信号可能增强抗肿瘤免疫力。例如但不限于,可以通过直接刺激白细胞的增殖、细胞因子产生、杀伤活性或吞噬活性来确定免疫刺激信号。具体实例包括使用编码细胞因子受体如IL-2R、IL-7R、IL-15R、IL-17R或IL-21R的配体(分别为IL-2、IL-7、IL-15、IL-17或IL-21)的融合蛋白直接刺激此类受体。来自这些受体中任何一种的刺激可以直接刺激个体T细胞亚群的增殖和细胞因子产生。
在一些实施方案中,胞外结构域或抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)可用于生产可溶性蛋白,以竞争性抑制该受体的配体的信号传导。例如,但不限于,PD-L1或PD-L2的竞争性抑制可以使用PD-1来实现,或者PVR的竞争性抑制可以使用TIGIT来实现。在一些实施方案中,胞外结构域或抗体结合结构域(例如CDR3、Fab、scFv结构域等)可用于提供人工信号传导。
在一些实施方案中,本发明的嵌合蛋白递送或掩蔽免疫抑制信号。在一些实施方案中,本发明的嵌合蛋白递送或掩蔽免疫刺激信号。
在实施方案中,靶向结构域能够结合癌细胞表面上的抗原。在实施方案中,靶向结构域包含选自LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19或PSMA的膜蛋白的胞外结构域。
在实施方案中,第二结构域包含LAG-3蛋白的胞外结构域。
在实施方案中,第二结构域包含PD-1蛋白的胞外结构域。
在实施方案中,第二结构域包含TIGIT蛋白的胞外结构域。
连接第一结构域和第二结构域的接头结构域
本文公开的任何实施方案的接头都是合适的。
在各种实施方案中,第一和/或第二电荷极化核心结构域中的每一个均进一步包含接头(例如,稳定结构域),其连接具有带正电荷或带负电荷的氨基酸的蛋白质。在实施方案中,接头(例如,稳定结构域)任选地选自柔性氨基酸序列、IgG铰链区或抗体序列。在一个实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含源自IgG1(任选地人IgG1)的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在另一个实施方案中,接头(例如,稳定结构域)包含源自IgG4(任选地人IgG4)的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。
下面提供了连接第一结构域和第二结构域(本文也称为核心结构域)的接头的示例性序列:
在实施方案中,核心结构域具有以下序列:
在实施方案中,核心结构域具有以下序列:
在实施方案中,核心结构域是具有以下序列的KIHT22Y蛋白:
EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVE VHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELT KNQVSLYCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNH YTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:29)。
在实施方案中,核心结构域是具有以下序列的KIHY86T蛋白:
EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVE VHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELT KNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLTSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNH YTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:30)。
在实施方案中,核心结构域是具有以下序列的KIHY86T蛋白:
VPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGI(SEQ ID NO:31)。
下面提供了示例性电荷极化核心结构域(正-负)的序列:
下面提供了示例性电荷极化核心结构域(负-正)的序列:
下面提供了示例性电荷极化核心结构域(负-正)的序列:
下面提供了包含杵臼(KIH)突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:52)。
下面提供了包含杵臼(KIH)突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:53)。
下面提供了包含杵臼(KIH)突变和FcRn突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHSHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:54)。
下面提供了包含杵臼(KIH)突变和FcRn突变的示例性Fc结构域的序列:
EPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHSHYTQKSLSLSPGKIEGRMD(SEQ ID NO:55)。
在实施方案中,接头包含铰链-CH2-CH3 Fc结构域。在实施方案中,铰链-CH2-CH3Fc结构域源自IgG1,任选地人IgG1。在实施方案中,铰链-CH2-CH3 Fc结构域源自IgG4,任选地人IgG4。在实施方案中,铰链-CH2-CH3 Fc结构域包含具有与选自SEQ ID NO:16-17、28-32和52-55的多肽具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列的多肽。
在实施方案中,第一结构域和/或嵌合蛋白调节或能够调节γδ(gamma delta)T细胞。在实施方案中,γδT细胞表达Vγ4或Vγ9δ2。在实施方案中,第一结构域包含BTNL3和BTNL8,并且它调节表达Vγ4的T细胞。在实施方案中,第一结构域调节表达Vγ9δ2的T细胞。在实施方案中,第一结构域包含:(a)BTN2A1和BTN3A1,(b)BTN3A1和BTN3A2,或(c)BTN3A1和BTN3A3。在实施方案中,γδT细胞的调节是γδT细胞的活化。在实施方案中,嵌合蛋白能够在γδT细胞和肿瘤细胞之间形成突触和/或嵌合蛋白能够同时活化γδT细胞并将其靶向肿瘤细胞。
在实施方案中,嵌合蛋白是同二聚体。
在一个方面,本公开涉及药物组合物,其包含本文公开的任何实施方案的嵌合蛋白。
在一个方面,本公开涉及表达载体,其包含编码本文公开的任何实施方案的嵌合蛋白的第一和/或第二多肽链的核酸。在实施方案中,表达载体是哺乳动物表达载体。在实施方案中,表达载体包含DNA或RNA。
在一个方面,本公开涉及宿主细胞,其包含本文公开的任何实施方案的表达载体。
疾病;治疗方法和患者选择
在一个方面,本公开提供了治疗癌症的方法,其包括向有需要的受试者施用有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物至有需要的受试者。在实施方案中,癌症是淋巴瘤。在实施方案中,癌症是白血病。在实施方案中,癌症是霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤、B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL(bulky disease NHL);套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(Waldenstrom’s Macroglobulinemia);慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;或慢性成髓细胞白血病。在实施方案中,癌症是基底细胞癌;胆道癌;膀胱癌;骨癌;脑和中枢神经系统癌症;乳腺癌;腹膜癌;宫颈癌;绒膜癌;结肠癌和直肠癌;结缔组织癌;消化系统癌症;子宫内膜癌;食道癌;眼癌;头颈癌;胃癌(包括胃肠道癌);胶质母细胞瘤;肝脏癌;肝细胞瘤;上皮内肿瘤;肾脏癌或肾癌;喉癌;白血病;肝癌;肺癌(例如,小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌);黑色素瘤;骨髓瘤;成神经细胞瘤;口腔癌(唇、舌、口和咽);卵巢癌;胰腺癌;前列腺癌;视网膜母细胞瘤;横纹肌肉瘤;直肠癌;呼吸系统癌症;唾液腺癌;肉瘤;皮肤癌;鳞状细胞癌;胃癌;睾丸癌;甲状腺癌;子宫或子宫内膜癌;泌尿系统癌症;外阴癌;淋巴瘤,包括霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤,以及B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;慢性成髓细胞白血病;以及其他癌和肉瘤;和移植后淋巴组织增生性疾病(PTLD),以及与瘢痣病、水肿(例如与脑肿瘤相关的水肿)和梅格斯氏综合征(Meigs’syndrome)相关的异常血管增殖。在实施方案中,癌症是前列腺癌。在实施方案中,癌症是上皮来源的癌。在实施方案中,已知癌症表达异二聚体蛋白的第二结构域的抗原性靶标。在实施方案中,已知癌症含有限制由αβT细胞识别的突变,包括但不限于MHC I、β2微球蛋白、TAP等中的突变。
在实施方案中,进一步向受试者施用离体扩增的自体或同种异体γδT细胞。在实施方案中,自体或同种异体γδT细胞表达嵌合抗原受体。在实施方案中,进一步向受试者施用表达嵌合抗原受体的自体或同种异体T细胞。
在一个方面,本公开提供一种治疗自身免疫疾病或病症的方法,其包括向有需要的受试者施用有效量的本文公开的任何实施方案的药物组合物,其中自身免疫疾病或病症任选地选自类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、糖尿病、强直性脊柱炎、干燥综合征(syndrome)、炎性肠病(例如,溃疡性结肠炎、克罗恩病(Crohn's disease))、多发性硬化症、结节病、银屑病、格雷夫斯病(Grave's disease)、桥本甲状腺(Hashimoto'sthyroiditis)、过敏反应、超敏反应(例如过敏、花粉热、哮喘和急性水肿引起I型超敏反应)和血管炎。
在各种实施方案中,本公开涉及异二聚体蛋白用于治疗一种或多种自身免疫疾病或病症的用途。在各种实施方案中,自身免疫疾病或病症的治疗可涉及用本发明的异二聚体蛋白调节免疫系统以有利于免疫抑制而非免疫刺激。可用本发明的异二聚体蛋白治疗的说明性自身免疫疾病或病症包括其中身体自身抗原成为免疫应答的靶标的那些自身免疫疾病或病症,例如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、糖尿病、强直性脊柱炎、干燥综合征、炎性肠病(例如,溃疡性结肠炎、克罗恩病)、多发性硬化症、结节病、银屑病、格雷夫斯病、桥本甲状腺、银屑病、超敏反应(例如,过敏、花粉热、哮喘和急性水肿引起I型超敏反应)和血管炎。
可以使用本发明的异二聚体蛋白治疗或预防的示例性自身免疫疾病或疾患包括但不限于多发性硬化症、糖尿病、狼疮、乳糜泻、克罗恩病、溃疡性结肠炎、格林-巴利综合征(Guillain-Barresyndrome)、硬皮病、古德帕斯丘综合征(Goodpasture's syndrome)、韦格纳肉芽肿(Wegener'sgranulomatosis)、自身免疫性癫痫、拉斯马森脑炎(Rasmussen'sencephalitis)、原发性胆管硬化、硬化性胆管炎、自身免疫性肝炎、艾迪生病(Addison'sdisease)、桥本甲状腺、纤维肌痛、美尼尔氏综合征(Menier's syndrome);移植排斥(例如,预防同种异体移植排斥)、恶性贫血、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、皮肌炎、干燥综合征、红斑狼疮、多发性硬化症、重症肌无力、莱特尔综合征(Reiter's syndrome)、格雷夫斯病和其他自身免疫性疾病。
在各种实施方案中,本公开涉及癌症和/或肿瘤;例如,治疗或预防癌症和/或肿瘤。如本文别处所描述,癌症的治疗可涉及在各种实施方案中,用本发明的异二聚体蛋白调节免疫系统以有利于免疫刺激而非免疫抑制。
癌症或肿瘤是指细胞不受控制的生长和/或异常增加的细胞存活和/或细胞凋亡的抑制,其干扰身体器官和系统的正常功能。包括良性和恶性癌症、息肉、增生,以及休眠肿瘤或微转移。此外,包括具有不受免疫系统阻碍的异常增殖的细胞(例如,病毒感染细胞)。癌症可以是原发性癌症或转移性癌症。原发性癌症可以是在临床可检测的起源部位处的癌细胞区域,并且可以是原发性肿瘤。相反,转移性癌症可能是疾病从一个器官或部分扩散到另一个非相邻器官或部分。转移性癌症可能由获得在局部区域穿透和浸润周围正常组织从而形成新的肿瘤的能力的癌细胞引起,这可能是局部转移。癌症也可能由获得穿透淋巴管和/或血管壁的能力的癌细胞引起,此后癌细胞能够通过血流循环(因此成为循环肿瘤细胞)到体内的其他部位和组织。癌症可能由如淋巴或血性扩散等过程引起。癌症也可能由在另一个部位静止、重新穿透血管或壁、继续增殖并最终形成另一个临床可检测肿瘤的肿瘤细胞引起。癌症可能是这种新肿瘤,也可能是转移性(或继发性)肿瘤。
癌症可能由已经转移的肿瘤细胞引起,其可能是继发性或转移性肿瘤。肿瘤的细胞可能与原始肿瘤中的细胞相似。例如,如果乳腺癌或结肠癌转移到肝脏,继发性肿瘤虽然存在于肝脏,但由异常的乳腺或结肠细胞组成,而不是由异常的肝细胞组成。因此,肝脏中的肿瘤可能是转移性乳腺癌或转移性结肠癌,而不是肝癌。
癌症可以起源于任何组织。癌症可能源自黑色素瘤、结肠、乳腺或前列腺,因此可能分别由最初分别是皮肤、结肠、乳腺或前列腺的细胞组成。癌症也可以是血液恶性肿瘤,其可以是白血病或淋巴瘤。癌症可能会侵入例如肝脏、肺、膀胱或肠道的组织。
本公开的代表性癌症和/或肿瘤包括但不限于基底细胞癌、胆道癌;膀胱癌;骨癌;脑和中枢神经系统癌症;乳腺癌;腹膜癌;宫颈癌;绒膜癌;结肠癌和直肠癌;结缔组织癌;消化系统癌症;子宫内膜癌;食道癌;眼癌;头颈癌;胃癌(包括胃肠道癌);胶质母细胞瘤;肝脏癌;肝细胞瘤;上皮内肿瘤;肾脏癌或肾癌;喉癌;白血病;肝癌;肺癌(例如,小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌);黑色素瘤;骨髓瘤;成神经细胞瘤;口腔癌(唇、舌、口和咽);卵巢癌;胰腺癌;前列腺癌;视网膜母细胞瘤;横纹肌肉瘤;直肠癌;呼吸系统癌症;唾液腺癌;肉瘤;皮肤癌;鳞状细胞癌;胃癌;睾丸癌;甲状腺癌;子宫或子宫内膜癌;泌尿系统癌症;外阴癌;淋巴瘤,包括霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤,以及B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;慢性成髓细胞白血病;以及其他癌和肉瘤;和移植后淋巴组织增生性疾病(PTLD),以及与瘢痣病、水肿(例如与脑肿瘤相关的水肿)和梅格斯氏综合征相关的异常血管增殖。
在实施方案中,癌症是上皮来源的癌。
在实施方案中,异二聚体蛋白用于治疗患有难治性癌症的受试者。在实施方案中,异二聚体蛋白用于治疗对一种或多种免疫调节剂难治的受试者。例如,在实施方案中,异二聚体蛋白用于治疗在治疗12周左右后对治疗没有反应或甚至进展的受试者。例如,在实施方案中,受试者对PD-1和/或PD-L1和/或PD-L2剂难治,包括例如纳武单抗(nivolumab)(ONO-4538/BMS-936558、MDX1106、OPDIVO、BRISTOL MYERS SQUIBB)、派姆单抗(pembrolizumab)(KEYTRUDA、MERCK)、匹地利珠单抗(pidilizumab)(CT-011、CURE TECH)、MK-3475(MERCK)、BMS 936559(BRISTOL MYERS SQUIBB)、依鲁替尼(Ibrutinib)(PHARMACYCLICS/ABBVIE)、阿特朱单抗(atezolizumab)(TECENTRIQ、GENENTECH),和/或MPDL328OA(ROCHE)难治性患者。例如,在实施方案中,受试者对抗CTLA-4剂难治,例如伊匹单抗(ipilimumab)(YERVOY)难治性患者(例如,黑色素瘤患者)。因此,在各种实施方案中,本公开提供拯救对各种疗法、包括一种或多种免疫调节剂的单一疗法无反应的患者的癌症治疗方法。
在各种实施方案中,本公开提供了靶向肿瘤微环境内的细胞或组织的异二聚体蛋白。在实施方案中,肿瘤微环境内的细胞或组织表达异二聚体蛋白的一种或多种靶标或结合配偶体。肿瘤微环境是指细胞环境,包括肿瘤所在的细胞、分泌蛋白、生理小分子和血管。在实施方案中,肿瘤微环境内的细胞或组织是以下中的一种或多种:肿瘤血管;肿瘤浸润淋巴细胞;成纤维细胞网状细胞;内皮祖细胞(EPC);癌症相关成纤维细胞;周细胞;其他基质细胞;胞外基质(ECM)的成分;树突状细胞;抗原呈递细胞;T细胞;调节性T细胞;巨噬细胞;中性粒细胞;和位于肿瘤附近的其他免疫细胞。在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白靶向癌细胞。在实施方案中,癌细胞表达异二聚体蛋白的一种或多种靶标或结合配偶体。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白可以靶向表达如本文所描述的任何受体的细胞(例如,癌细胞或免疫细胞)。例如,本发明的异二聚体蛋白可以靶向表达本文所描述的细胞因子、生长因子和/或激素的任何受体的细胞。
在实施方案中,本发明的方法为对另外的剂难治的患者提供异二聚体蛋白的治疗,这类“另外的剂”在本文别处描述,包括但不限于本文所描述的各种化疗剂。
在一些方面,本发明的嵌合剂用于消除细胞内病原体。在一些方面,本发明的嵌合剂用于治疗一种或多种感染。在实施方案中,本发明的异二聚体蛋白用于治疗病毒感染(包括例如,HIV和HCV)、寄生虫感染(包括例如,疟疾)和细菌感染的方法中。在各种实施方案中,感染诱导免疫抑制。例如,HIV感染通常会导致受感染受试者的免疫抑制。因此,如本文别处所描述,在各种实施方案中,这种感染的治疗可包括用本发明的异二聚体蛋白调节免疫系统以有利于免疫刺激而非免疫抑制。替代地,本公开提供用于治疗诱导免疫活化的感染的方法。例如,肠道蠕虫感染与慢性免疫活化有关。在这些实施方案中,这种感染的治疗可涉及用本发明的异二聚体蛋白调节免疫系统以有利于免疫抑制而非免疫刺激。
在各种实施方案中,本公开提供了治疗病毒感染的方法,所述病毒感染包括但不限于急性或慢性病毒感染,例如呼吸道、乳头瘤病毒感染、单纯疱疹病毒(HSV)感染、人免疫缺陷病毒(HIV)感染,以及内脏的病毒感染,例如肝炎病毒感染。在实施方案中,病毒感染由黄病毒科(Flaviviridae)病毒引起。在实施方案中,黄病毒科病毒选自黄热病病毒(YellowFever Virus)、西尼罗河病毒(WestNile virus)、登革病毒(Dengue virus)、日本脑炎病毒(Japanese Encephalitis Virus)、圣路易斯脑炎病毒(St.Louis Encephalitis Virus)和丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus)。在其他实施方案中,病毒感染由小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)病毒,例如脊髓灰质炎病毒、鼻病毒、柯萨奇病毒(coxsackievirus)引起。在其他实施方案中,病毒感染由正粘病毒科(Orthomyxoviridae)的成员,例如流感病毒引起。在其他实施方案中,病毒感染由逆转录病毒科(Retroviridae)的成员,例如慢病毒引起。在其他实施方案中,病毒感染由副粘病毒科(Paramyxoviridae)的成员,例如,呼吸道合胞病毒、人副流感病毒、风疹病毒(例如,腮腺炎病毒)、麻疹病毒和人偏肺病毒引起。在其他实施方案中,病毒感染由布尼亚病毒科(Bunyaviridae)的成员,例如汉坦病毒(hantavirus)引起。在其他实施方案中,病毒感染由呼肠孤病毒科(Reoviridae)的成员,例如轮状病毒引起。
在各种实施方案中,本公开提供治疗寄生虫感染,例如原生动物或蠕虫感染的方法。在实施方案中,寄生虫感染由原生动物寄生虫引起。在实施方案中,oritiziab寄生虫选自肠原生动物、组织原生动物或血液原生动物。说明性的原生动物寄生虫包括但不限于溶组织内阿米巴(Entamoebahystolytica)、兰伯氏贾第虫(Giardia lamblia)、鼠隐孢子虫(Cryptosporidium muris)、冈比亚锥虫(Trypanosomatida gambiense)、罗得西亚锥虫(Trypanosomatida rhodesiense)、克鲁斯锥虫(Trypanosomatida crusi)、墨西哥利什曼原虫(Leishmania mexicana)、巴西利什曼原虫(Leishmaniabraziliensis)、热带利什曼原虫(Leishmania tropica)、杜氏利什曼原虫(Leishmania donovani)、刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)、间日疟原虫(Plasmodium vivax)、卵形疟原虫(Plasmodiumovale)、三日疟原虫(Plasmodium malariae)、恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)、阴道毛滴虫(Trichomonasvaginalis),和组织滴虫(Histomonas meleagridis)。在实施方案中,寄生虫感染由蠕虫寄生虫,例如线虫(例如,腺毛虫)引起。在实施方案中,寄生虫选自侧尾腺口纲(Secementea)(例如,毛首鞭虫(Trichuris trichiura)、蛔虫(Ascarislumbricoides)、蛲虫(Enterobius vermicularis)、十二指肠钩虫(Ancylostomaduodenale)、美洲钩虫(Necator americanus)、粪类圆线虫(Strongyloidesstercoralis)、班氏线虫(Wuchereria bancrofti)、麦地那龙线虫(Dracunculus medinensis))。在实施方案中,寄生虫选自吸虫(例如,血吸虫、肝吸虫、肠吸虫和肺吸虫)。在实施方案中,寄生虫选自:曼氏裂体吸虫(Schistosoma mansoni)、埃及裂体吸虫(Schistosoma haematobium)、日本裂体吸虫(Schistosoma japonicum)、肝片吸虫(Fasciola hepatica)、大片吸虫(Fasciola gigantica)、异形吸虫(Heterophyes)、卫氏并殖吸虫(Paragonimuswestermani)。在实施方案中,寄生虫选自绦虫(例如,猪带绦虫(Taenia solium)、牛带绦虫(Taenia saginata)、短膜壳绦虫(Hymenolepis nana)、细粒棘球绦虫(Echinococcusgranulosus))。
在各种实施方案中,本公开提供治疗细菌感染的方法。在各种实施方案中,细菌感染由革兰氏阳性菌(gram-positive bacteria)、革兰氏阴性菌(gram-negativebacteria)、需氧菌和/或厌氧菌引起。在各种实施方案中,细菌选自但不限于葡萄球菌属(Staphylococcus)、乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、八叠球菌属(Sarcina)、埃希氏菌属(Escherichia)、肠杆菌属(Enterobacter)、克雷伯菌属(Klebsiella)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、变形杆菌属(Proteus)、弯曲杆菌属(Campylobacter)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、尼氏杆菌属(Nisseria)、芽孢杆菌属(Baccillus)、拟杆菌属(Bacteroides)、消化球菌属(Peptococcus)、梭状杆菌属(Clostridium)、沙门氏菌属(Salmonella)、志贺氏菌属(Shigella)、沙雷氏菌属(Serratia)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、布鲁氏菌属(Brucella)和其他生物体。在实施方案中,细菌选自但不限于铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)、食酸假单胞菌(Pseudomonas acidovorans)、产碱假单胞菌(Pseudomonas alcaligenes)、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonasmaltophilia)、洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia)、嗜水气单胞菌(Aeromonashydrophilia)、大肠杆菌(Escherichia coli)、弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)、鼠伤寒沙门菌(Salmonella typhimurium)、伤寒杆菌(Salmonella typhi)、副伤寒沙门菌(Salmonellaparatyphi)、肠炎沙门菌(Salmonella enteritidis)、痢疾志贺氏菌(Shigella dysenteriae)、福氏志贺氏菌(Shigella flexneri)、宋氏志贺氏菌(Shigellasonnei)、阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)、产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)、产酸克雷伯菌(Klebsiella oxytoca)、粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)、土拉热弗朗西丝菌(Francisellatularensis)、摩氏摩根菌(Morganella morganii)、奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)、普通变形杆菌(Proteusvulgaris)、产碱普罗威登斯菌(Providencia alcalifaciens)、雷氏普罗威登斯菌(Providenciarettgeri)、斯氏普罗威登斯菌(Providencia stuartii)、鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)、醋酸钙不动杆菌(Acinetobacter calcoaceticus)、溶血不动杆菌(Acinetobacter haemolyticus)、小肠结肠炎耶尔森氏菌(Yersiniaenterocolitica)、鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)、假结核耶尔森菌(Yersiniapseudotuberculosis)、中间耶尔森菌(Yersinia intermedia)、百日咳博代氏杆菌(Bordetella pertussis)、副百日咳博代氏杆菌(Bordetella parapertussis)、支气管炎博德特菌(Bordetella bronchiseptica)、流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)、副流感嗜血杆菌(Haemophilus parainfluenzae)、溶血嗜血杆菌(Haemophilushaemolyticus)、副溶血嗜血杆菌(Haemophilus parahaemolyticus)、杜克雷嗜血杆菌(Haemophilus ducreyi)、多杀性巴斯德氏菌(Pasteurella multocida)、溶血性巴斯德氏菌(Pasteurella haemolytica)、粘膜炎布兰汉球菌(Branhamella catarrhalis)、幽门螺杆菌(Helicobacterpylori)、胎儿弯曲杆菌(Campylobacter fetus)、空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni)、大肠弯曲杆菌(Campylobacter coli)、伯氏疏螺旋体(Borreliaburgdorferi)、霍乱弧菌(Vibrio cholerae)、副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)、单核细胞增多性李斯特氏菌(Listeriamonocytogenes)、淋病奈瑟球菌(Neisseria gonorrhoeae)、脑膜炎奈瑟球菌(Neisseriameningitidis)、金氏菌属(Kingella)、莫拉克斯氏菌属(Moraxella)、阴道加德菌(Gardnerella vaginalis)、脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)、狄氏拟杆菌(Bacteroides distasonis)、拟杆菌属3452A同族群、普通拟杆菌(Bacteroidesvulgatus)、卵形拟杆菌(Bacteroides ovalus)、多形拟杆菌(Bacteroidesthetaiotaomicron)、单形拟杆菌(Bacteroides uniformis)、埃氏拟杆菌(Bacteroideseggerthii)、内脏拟杆菌(Bacteroides splanchnicus)、艰难梭菌(Clostridiumdifficile)、结核分支杆菌(Mycobacterium tuberculosis)、鸟型结核分支杆菌(Mycobacterium avium)、细胞内分枝杆菌(Mycobacterium intracellulare)、麻风分枝杆菌(Mycobacterium leprae)、白喉杆菌(Corynebacterium diphtheriae)、溃疡棒杆菌(Corynebacterium ulcerans)、肺炎链球菌(Streptococcuspneumoniae)、无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)、酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)、粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)、腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus)、中间葡萄球菌(Staphylococcus intermedius)、猪葡萄球菌亚种(Staphylococcus hyicus subsp.hyicus)、溶血性葡萄球菌(Staphylococcushaemolyticus)、人葡萄球菌(Staphylococcus hominis),或解糖葡萄球菌(Staphylococcus saccharolyticus)。
在另一方面,本公开涉及治疗和预防T细胞介导的疾病和病症的方法,例如但不限于本文别处描述的疾病或病症以及炎性疾病或病症、移植物抗宿主病(GVHD)、移植排斥和T细胞增殖病症。
在一些方面,本发明的嵌合剂用于活化T细胞的方法中,例如,通过具有免疫刺激信号的胞外结构域或具有免疫刺激信号的抗体结合结构域(例如,CDR3、Fab、scFv结构域等)。
在一些方面,本发明的嵌合剂用于阻止免疫抑制信号的细胞传递的方法中。
组合疗法和缀合
在实施方案中,本发明提供异二聚体蛋白和方法,其还包括向受试者施用另外的剂。在实施方案中,本发明涉及共同施用和/或共同配制。可以共同配制和/或共同施用本文所描述的任何组合物。
在实施方案中,本文所描述的任何异二聚体蛋白在与另一种剂共同施用时协同作用并且以低于在此类剂用作单一疗法时通常采用的剂量的剂量施用。在各种实施方案中,本文提及的任何剂可与本文所描述的任何异二聚体蛋白组合使用。
在各种实施方案中,本文公开的任何异二聚体蛋白可以与本文公开的另一种异二聚体蛋白共同施用。不希望受理论束缚,据信涉及施用一种或多种诱导先天免疫应答的异二聚体蛋白和一种或多种诱导适应性免疫应答的异二聚体蛋白的组合方案可提供协同效应(例如,协同抗肿瘤效应)。
在各种实施方案中,在本公开中可以利用诱导先天免疫应答的任何异二聚体蛋白。在各种实施方案中,在本公开中可以利用诱导适应性免疫应答的任何异二聚体蛋白。
在一些实施方案中,包括但不限于癌症应用,本公开涉及作为另外的剂的化疗剂。化疗剂的实例包括但不限于烷化剂,例如噻替哌(thiotepa)和CYTOXAN环磷酰胺(cyclosphosphamide);烷基磺酸盐类,例如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)、哌泊舒凡(piposulfan);氮丙啶类,例如苯佐多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、美托多巴(meturedopa)、乌多巴(uredopa);乙烯亚胺和甲基三聚氰胺,包括六甲三聚氰胺、三亚乙基三聚氰胺、三亚乙基磷酰胺、三亚乙基硫代磷酰胺和三羟甲基三聚氰胺;己酸配质(acetogenins)(例如,布拉它辛(bullatacin)和布拉它辛酮(bullatacinone));喜树碱(camptothecin)(包括合成类似物拓扑替康(topotecan));苔藓抑素(bryostatin);卡莉他汀类药物(cally statin);CC-1065(包括其阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)合成类似物);隐藻素(cryptophycins)(例如,隐藻素1和隐藻素8);尾海兔素(dolastatin);多卡霉素(duocarmycin)(包括合成类似物KW-2189和CB 1-TM1);软珊瑚醇(eleutherobin);水鬼蕉碱(pancratistatin);匍枝珊瑚醇(sarcodictyin);海绵抑制素(spongistatin);氮芥类(nitrogen mustards),例如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷酰胺(cholophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、氮芥(mechlorethamine)、盐酸氧氮芥(mechlorethamine oxide hydrochloride)、美法仑(melphalan)、新恩比兴(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲洛磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard);硝基脲类,例如卡莫司汀(carmustine)、氯脲霉素(chlorozotocin)、福替莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)和雷尼司汀(ranimnustine);抗生素,例如烯二炔抗生素(例如,卡里奇霉素(calicheamicin),尤其是卡里奇霉素γll和卡里奇霉素Ωll(参见,例如,Agnew,Chem.Intl.Ed.Engl.,33:183-186(1994));达内霉素(dynemicin),包括达内霉素A;双膦酸盐类,例如氯膦酸盐;埃斯佩拉霉素(esperamicin);以及新制癌素发色团(neocarzinostatin chromophore)和相关的色蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素(aclacinomysin)、放线菌素(actinomycin)、安曲霉素(authramycin)、重氮丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycin)、放线菌素C(cactinomycin)、卡拉比星(carabicin)、卡米诺霉素(caminomycin)、嗜癌素(carzinophilin)、色霉素(chromomycini)、放线菌素D(dactinomycin)、道诺比星(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸、ADRIAMYCIN多柔比星(doxorubicin)(包括吗啉代多柔比星、氰基吗啉代多柔比星、2-吡咯啉多柔比星和脱氧多柔比星)、表柔比星(epirubicin)、依柔比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、丝裂霉素(mitomycin)(例如丝裂霉素C)、霉酚酸(mycophenolicacid)、诺加霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、泊非霉素(potfiromycin)、嘌呤霉素(puromycin)、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑菌素(streptonigrin)、链佐星(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、净司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin);抗代谢药,例如甲氨蝶呤(methotrexate)和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,例如二甲叶酸(denopterin)、甲氨蝶呤、蝶罗呤(pteropterin)、曲美沙特(trimetrexate);嘌呤类似物,例如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鸟嘌呤(thioguanine);嘧啶类似物,例如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-氮杂尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、双脱氧尿苷(dideoxyuridine)、多西氟尿苷(doxifluridine)、依西他滨(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine);雄激素,例如卡普睾酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolonepropionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾内酯(testolactone);抗肾上腺素,例如氨鲁米特(minoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane);叶酸补充剂,例如亚叶酸(frolinic acid);醋葡醛内酯(aceglatone);醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside);氨基酮戊酸(aminolevulinic acid);恩尿嘧啶(eniluracil)、安吖啶(amsacrine)、贝司他韦(bestrabucil);比生群(bisantrene);依达沙酯(edatraxate);地美可辛(demecolcine);地吖醌(diaziquone);依氟鸟氨酸(elformithine);依利醋铵(elliptinium acetate);埃博霉素(epothilone);依托格鲁(etoglucid);硝酸镓;羟基脲;香菇多糖(lentinan);洛尼达宁(lonidainine);美登素类(maytansinoids),例如美登素(maytansine)和安丝菌素(ansamitocin);米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌;莫哌达醇(mopidanmol);二胺硝吖啶(nitraerine);喷司他丁(pentostatin);蛋氨氮芥(phenamet);吡柔比星(pirarubicin);洛索蒽醌(losoxantrone);鬼臼酸(podophyllinic acid);2-乙基酰肼;甲基苄肼(procarbazine);PSK多糖复合物(JHS Natural Products,Eugene,Oreg.);雷佐生(razoxane);根瘤菌素(rhizoxin);西索菲兰(sizofuran);锗螺胺(spirogermanium);替奴佐酸(tenuazonicacid);三亚胺醌(triaziquone);2,2',2"-三氯三乙胺;单端孢霉烯(trichothecenes)(例如,T-2毒素、维拉库林A(verracurin A)、漆斑菌素A(roridin A)和蛇形菌素(anguidine));乌拉坦(urethan);长春地辛(vindesine);达卡巴嗪(dacarbazine);甘露莫司汀(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴卫矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);加胞嘧啶(gacytosine);阿拉伯糖苷(arabinoside)(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替哌;紫杉醇类(taxoids),例如,TAXOL紫杉醇(paclitaxel)(Bristol-MyersSquibbOncology,Princeton,N.J.)、不含克列莫佛的ABRAXANE、紫杉醇的白蛋白工程纳米粒制剂(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,111.)和TAXOTERE多西紫杉醇(doxetaxel)(Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);苯丁酸氮芥(chloranbucil);GEMZAR吉西他滨(gemcitabine);6-硫鸟嘌呤;巯嘌呤;甲氨蝶呤;铂类似物,例如顺铂(cisplatin)、奥沙利铂(oxaliplatin)和卡铂(carboplatin);长春碱(vinblastine);铂(platinum);依托泊苷(etoposide)(VP-16);异环磷酰胺;米托蒽醌;长春新碱(长春新碱);NAVELBINE长春瑞滨(vinorelbine);诺凡酮(novantrone);替尼泊苷(teniposide);依达曲沙(edatrexate);道诺霉素(daunomycin);氨基蝶呤(aminopterin);希罗达(xeloda);伊班膦酸盐(ibandronate);伊立替康(irinotecan)(Camptosar,CPT-11)(包括伊立替康与5-FU和亚叶酸(leucovorin)的治疗方案);拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);类视黄酸,例如视黄酸;卡培他滨(capecitabine);考布他汀(combretastatin);亚叶酸(LV);奥沙利铂,包括奥沙利铂治疗方案(FOLFOX);拉帕替尼(lapatinib)(TYKERB);减少细胞增殖的PKC-α、Raf、H-Ras、EGFR(例如,厄洛替尼(erlotinib)(Tarceva))和VEGF-A的抑制剂以及上述任一种的药学上可接受的盐、酸或衍生物。此外,治疗方法还可包括使用辐射。此外,治疗方法还可包括使用光动力疗法。
在包括但不限于癌症应用在内的各种实施方案中,本发明的另外的剂是一种或多种免疫调节剂,其选自阻断、降低和/或抑制PD-1和PD-L1或PD-L2和/或PD-1与PD-L1或PD-L2的结合的剂(作为非限制性实例,一种或多种纳武单抗(ONO-4538/BMS-936558、MDX1106、OPDIVO、BRISTOL MYERS SQUIBB)、派姆单抗(KEYTRUDA,Merck)、MK-3475(MERCK)、BMS936559(BRISTOL MYERS SQUIBB)、阿特朱单抗(TECENTRIQ、GENENTECH)、MPDL328OA(ROCHE);增加和/或刺激CD137(4-1BB)和/或CD137(4-1BB)与一种或多种4-1BB配体的结合的剂(作为非限制性实例,乌瑞芦单抗(urelumab)(BMS-663513和抗4-1BB抗体);以及阻断、减少和/或抑制CTLA-4的活性和/或CTLA-4与AP2M1、CD80、CD86、SHP-2和PPP2R5A中的一种或多种的结合和/或OX40与OX40L的结合的剂(作为非限制性实例GBR 830(GLENMARK)、MEDI6469(MEDIMMUNE)。
在包括但不限于传染病应用在内的实施方案中,本公开涉及作为另外的剂的抗感染剂。在一些实施方案中,抗感染剂是抗病毒剂,包括但不限于阿巴卡韦(Abacavir)、阿昔洛韦(Acyclovir)、阿德福韦(Adefovir)、安普那韦(Amprenavir)、阿扎那韦(Atazanavir)、西多福韦(Cidofovir)、地瑞那韦(Darunavir)、地拉夫定(Delavirdine)、地达诺新(Didanosine)、二十二烷醇(Docosanol)、依法韦仑(Efavirenz)、埃替格韦(Elvitegravir)、恩曲他滨(Emtricitabine)、恩夫韦地(Enfuvirtide)、依曲韦林(Etravirine)、泛昔洛韦(Famciclovir)和膦甲酸(Foscarnet)。在实施方案中,抗感染剂是抗菌剂,包括但不限于头孢菌素类抗生素(头孢氨苄(cephalexin)、头孢呋辛(cefuroxime)、头孢羟氨苄(cefadroxil)、头孢唑啉(cefazolin)、头孢噻吩(cephalothin)、头孢克洛(cefaclor)、头孢孟多(cefamandole)、头孢西丁(cefoxitin)、头孢罗齐(cefprozil)和头孢吡普(ceftobiprole));氟喹诺酮类抗生素(环丙沙星(cipro)、左氧氟沙星(Levaquin)、氧氟沙星(floxin)、加替沙星(tequin)、莫西沙星(avelox)和诺氟沙星(norflox));四环素类抗生素(四环素(tetracycline)、米诺环素(minocycline)、土霉素(oxytetracycline)和多西环素(doxycycline));青霉素类抗生素(阿莫西林(amoxicillin)、氨苄西林(ampicillin)、青霉素V、双氯西林(dicloxacilli)、羧苄青霉素(carbenicillin)、万古霉素(vancomycin)和甲氧西林(methicillin));单环内酰胺类抗生素(氨曲南(aztreonam));和碳青霉烯类抗生素(厄他培南(ertapenem)、多利培南(doripenem)、亚胺培南(imipenem)/西司他丁(cilastatin)和美罗培南(meropenem))。在实施方案中,抗感染剂包括抗疟疾剂(例如,氯喹(chloroquine)、奎宁(quinine)、甲氟喹(mefloquine)、伯氨喹(primaquine)、多西环素、蒿甲醚(artemether)/苯芴醇(lumefantrine)、阿托伐醌(atovaquone)/氯胍(proguanil)和磺胺多辛(sulfadoxine)/乙胺嘧啶(pyrimethamine))、甲硝唑(metronidazole)、替硝唑(tinidazole)、依维菌素(ivermectin)、双羟萘酸噻嘧啶(pyrantel pamoate)和阿苯达唑(albendazole)。
在包括但不限于自身免疫应用在内的实施方案中,另外的剂是免疫抑制剂。在实施方案中,免疫抑制剂是抗炎剂,例如甾体抗炎剂或非甾体抗炎剂(NSAID)。类固醇,特别是肾上腺皮质类固醇和其合成类似物,是所属领域熟知的。可用于本公开中的皮质类固醇的实例包括但不限于羟基曲安西龙(hydroxyltriamcinolone)、α-甲基地塞米松(alpha-methyl dexamethasone)、β-甲基倍他米松(beta-methyl betamethasone)、二丙酸倍氯米松(beclomethasone dipropionate)、苯甲酸倍他米松(betamethasone benzoate)、二丙酸倍他米松(betamethasone dipropionate)、戊酸倍他米松(betamethasone valerate)、戊酸氯倍他索(clobetasol valerate)、地奈德(desonide)、去羟米松(desoxymethasone)、地塞米松(dexamethasone)、双醋二氟拉松(diflorasone diacetate)、戊酸二氟米松(diflucortolone valerate)、氟氢缩松(fluadrenolone)、氟氯缩松(flucloroloneacetonide)、新戊酸氟米松(flumethasone pivalate)、氟新诺龙丙酮(fluosinoloneacetonide)、醋酸氟轻松(fluocinonide)、氟可丁酯(flucortine butylester)、氟可龙(fluocortolone)、醋酸氟泼尼定(fluprednidene/fluprednylidene)、氟雄诺龙(flurandrenolone)、哈西缩松(halcinonide)、醋酸氢化可的松(hydrocortisoneacetate)、丁酸氢化可的松(hydrocortisone butyrate)、甲泼尼龙(methylprednisolone)、曲安奈德(triamcinolone acetonide)、可的松(cortisone)、可托多松(cortodoxone)、氟西奈德(flucetonide)、氟可的松(fludrocortisone)、醋酸双氟拉松(difluorosonediacetate)、丙酮缩氟氢羟龙(fluradrenolone acetonide)、甲羟松(medrysone)、安西法尔(amcinafel)、安西非特(amcinafide)、倍他米松及其酯的其余部分、氯泼尼松(chloroprednisone)、氯可托龙(clocortelone)、地西龙(clescinolone)、二氯松(dichlorisone)、二氟泼尼酯(difluprednate)、氟氯奈德(flucloronide)、氟尼缩松(flunisolide)、氟米龙(fluoromethalone)、氟培龙(fluperolone)、氟泼尼龙(fluprednisolone)、氢化可的松(hydrocortisone)、甲泼尼松(meprednisone)、帕拉米松(paramethasone)、泼尼松龙(prednisolone)、泼尼松(prednisone)、二丙酸倍氯米松(beclomethasonedipropionate)。可用于本公开中的(NSAIDS)包括但不限于水杨酸、乙酰水杨酸、水杨酸甲酯、水杨酸乙二醇酯、水杨酰胺、苄基-2,5-二乙酰氧基苯甲酸、布洛芬(ibuprofen)、fulindac、萘普生(naproxen)、酮洛芬(ketoprofen)、依托芬那酯(etofenamate)、保泰松(phenylbutazone)和吲哚美辛(indomethacin)。在实施方案中,免疫抑制剂可以是细胞抑制剂,例如烷化剂、抗代谢物(例如,硫唑嘌呤(azathioprine)、甲氨蝶呤)、细胞毒性抗生素、抗体(例如,巴利昔单抗(basiliximab)、达利珠单抗(daclizumab)和莫罗单抗(muromonab))、抗亲免素(例如,环孢菌素(cyclosporine)、他克莫司(tacrolimus)、西罗莫司(sirolimus))、干扰素、阿片类药物、TNF结合蛋白、霉酚酸酯和小生物制剂(例如,芬戈莫德(fingolimod)、多球壳菌素(myriocin))。
在实施方案中,本文所描述的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)包括经修饰的衍生物,即通过将任何类型的分子共价连接至合成物,使得共价连接不会阻止所述合成物的活性。例如,但不作为限制,衍生物包括已经通过尤其是糖基化、脂化、乙酰化、聚乙二醇化、磷酸化、酰胺化、通过已知保护/封闭基团衍生化、蛋白水解裂解、与细胞配体或其他蛋白键联等进行修饰的合成物。许多化学修饰中的任何一种都可以通过已知技术进行,包括但不限于特定的化学裂解、乙酰化、甲酰化、衣霉素(turicamycin)的代谢合成等。此外,衍生物可含有一种或多种非经典氨基酸。在其他实施方案中,本文所描述的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)还包括细胞毒性剂,在说明性实施方案中,包括毒素、化疗剂、放射性同位素和引起细胞凋亡或细胞死亡的剂。此类剂可与本文所描述的合成物缀合。
因此,本文所描述的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以在翻译后修饰以添加效应部分(例如化学接头)、可检测部分(例如荧光染料、酶、底物、生物发光材料、放射性材料)和化学发光部分或功能部分(例如链霉亲和素、亲和素、生物素、细胞毒素、细胞毒性剂和放射性材料)。
制剂
在一个方面,本公开提供了一种药物组合物,其包含本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白。
本文所描述的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可具有足够碱性的官能团,其可与无机或有机酸反应,或羧基,其可与无机或有机碱反应,以形成药学上可接受的盐。药学上可接受的酸加成盐由药学上可接受的酸形成,如所属领域中熟知的。此类盐包括列于例如Journal of PharmaceuticalScience,66,2-19(1977)和The Handbook ofPharmaceutical Salts;Properties,Selection,and Use.P.H.Stahl和C.G.Wermuth(编),Verlag,Zurich(瑞士)2002中的药学上可接受的盐,其全部内容据此通过引用整体并入。
在实施方案中,本文所描述的组合物呈药学上可接受的盐形式。
此外,本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以作为包含药学上可接受的载体或媒介物的组合物的组分施用于受试者。此类组合物可任选地包含合适量的药学上可接受的赋形剂以便提供用于适当施用的形式。药用赋形剂可以是液体,例如水和油,包括石油、动物、植物或合成来源的那些,例如花生油、大豆油、矿物油、芝麻油等。药用赋形剂可以是例如盐水、阿拉伯树胶、明胶、淀粉糊、滑石、角蛋白、胶体二氧化硅、尿素等。另外,可使用辅助剂、稳定剂、增稠剂、润滑剂和着色剂。在一个实施方案中,药学上可接受的赋形剂在施用于受试者时是无菌的。当静脉内施用本文所描述的任何剂时,水是有用的赋形剂。盐水溶液和葡萄糖和甘油水溶液也可用作液体赋形剂,特别是可注射溶液。适合的药用赋形剂还包括淀粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明胶、麦芽、米、面粉、白垩、硅胶、硬脂酸钠、单硬脂酸甘油酯、滑石、氯化钠、脱脂奶粉、丙三醇、丙烯、乙二醇、水、乙醇等。如果需要,本文所描述的任何剂也可包含少量润湿剂或乳化剂,或pH缓冲剂。
在实施方案中,将本文所描述的组合物再悬浮于盐水缓冲液(包括但不限于TBS、PBS等)中。
在各种实施方案中,异二聚体蛋白可通过与另一种剂缀合和/或融合以延长半衰期或以其他方式改善药效学和药代动力学特性。在实施方案中,异二聚体蛋白可以与PEG、XTEN(例如,作为rPEG)、聚唾液酸(POLYXEN)、白蛋白(例如,人血清白蛋白或HAS)、弹性蛋白样蛋白(ELP)、PAS、HAP、GLK、CTP、转铁蛋白等中的一种或多种融合或缀合。在各种实施方案中,每种单独的异二聚体蛋白与描述于BioDrugs(2015)29:215–239(其全部内容据此通过引用并入)中的一种或多种剂融合。
施用、配量和治疗方案
本公开包括各种制剂中的所描述的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)。本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以采用溶液、悬浮液、乳液、滴剂、片剂、丸剂、小丸剂、胶囊、含有液体的胶囊、粉末、缓释制剂、栓剂、乳液、气雾剂、喷雾剂、悬浮液或任何其他适合使用的形式。也可以使用编码蛋白序列的DNA或RNA构建体。在一个实施方案中,组合物是胶囊形式(参见例如,美国专利号5,698,155)。合适的药物赋形剂的其他实例描述于通过引用并入的Remington’s Pharmaceutical Sciences 1447-1676(Alfonso R.Gennaroeds.,19th ed.1995)中。
必要时,包含异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的制剂还可包括增溶剂。此外,剂可以用所属领域已知的合适的媒介物或递送装置递送。本文概述的组合疗法可以在单个递送媒介物或递送装置中共同递送。用于施用的组合物可任选地包括局部麻醉剂,例如利多卡因(lignocaine),以减轻注射部位的疼痛。
包含本公开的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的制剂可以方便地以单位剂型存在并且可以通过药学领域中熟知的任何方法制备。此类方法通常包括将治疗剂与载体结合的步骤,所述载体构成一种或多种辅助成分。通常,制剂通过将治疗剂与液体载体、细碎的固体载体或两者均匀且紧密地结合,然后,如果需要,将产品成型为所需制剂的剂型(例如,湿法或干法制粒、粉末混合物等,然后使用所属领域中已知的常规方法压片)。
在一个实施方案中,本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)根据常规程序配制为适合本文所描述的施用模式的组合物。
施用途径包括例如:皮内、肌内、腹膜内、静脉内、皮下、鼻内、硬膜外、口服、舌下、鼻内、脑内、阴道内、透皮、直肠、吸入或局部,特别是耳、鼻、眼或皮肤。在实施方案中,施用通过口服或肠胃外注射实现。在大多数情况下,施用导致本文所描述的任何剂释放到血流中。
本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以口服施用。此类异二聚体蛋白(和/或另外的剂)也可以通过任何其他方便的途径施用,例如通过静脉输注或推注、通过上皮或粘膜皮肤内衬(例如,口腔粘膜、直肠和肠粘膜等)吸收,并且可与另一种生物活性剂一起施用。施用可以是全身的或局部的。各种递送系统是已知的,例如封装在脂质体、微粒、微胶囊、胶囊等中,并且可用于施用。
在特定的实施方案中,可能需要对需要治疗的区域进行局部施用。在一个实施方案中,例如在癌症的治疗中,将异二聚体蛋白(和/或另外的剂)施用在肿瘤微环境(例如,细胞、分子、胞外基质和/或围绕和/或饲喂肿瘤细胞的血管,包括例如肿瘤血管;肿瘤浸润淋巴细胞;成纤维细胞网状细胞;内皮祖细胞(EPC);癌症相关成纤维细胞;周细胞;其他基质细胞;胞外基质(ECM)的成分;树突状细胞;抗原呈递细胞;T细胞;调节性T细胞;巨噬细胞;中性粒细胞;和位于肿瘤附近的其他免疫细胞)或淋巴结中和/或靶向肿瘤微环境或淋巴结。在各种实施方案中,例如在癌症的治疗中,瘤内施用异二聚体蛋白(和/或另外的剂)。
在各种实施方案中,本发明的异二聚体蛋白允许提供比常规免疫疗法(例如,用OPDIVO、KEYTRUDA、YERVOY和TECENTRIQ中的一种或多种治疗)中所见更少副作用的双重作用。例如,本发明的异二聚体蛋白减少或预防常见的免疫相关不良事件,所述不良事件影响各种组织和器官,包括皮肤、胃肠道、肾脏、外周和中枢神经系统、肝脏、淋巴结、眼睛、胰腺和内分泌系统;例如垂体炎、结肠炎、肝炎、肺炎、皮疹和风湿病。此外,本发明的局部施用(例如瘤内)避免了标准全身施用(例如IV输注)所见的不良事件,如在与常规免疫疗法(例如,用OPDIVO、KEYTRUDA、YERVOY和TECENTRIQ中的一种或多种治疗)一起使用时。
适用于肠胃外施用(例如,静脉内、肌肉内、腹膜内、皮下和关节内注射和输注)的剂型包括例如溶液、悬浮液、分散液、乳液等。其也可以无菌固体组合物(例如,冻干组合物)的形式制造,其可以在使用前立即溶解或悬浮在无菌可注射介质中。其可以包含例如所属领域已知的悬浮剂或分散剂。
本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的剂量以及给药方案可取决于各种参数,包括但不限于所治疗的疾病、受试者的一般健康状况和给药医师的判断。本文所描述的任何异二聚体蛋白可以在施用另外的剂之前(例如,5分钟、15分钟、30分钟、45分钟、1小时、2小时、4小时、6小时、12小时、24小时、48小时、72小时、96小时、1周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周之前)、同时或之后(例如,5分钟、15分钟、30分钟、45分钟、1小时、2小时、4小时、6小时、12小时、24小时、48小时、72小时、96小时、1周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周之后)施用于有需要的受试者。在各种实施方案中,本文所描述的任何异二聚体蛋白和另外的剂相隔1分钟、相隔10分钟、相隔30分钟、相隔小于1小时、相隔1小时、相隔1小时至2小时、相隔2小时至3小时、相隔3小时至4小时、相隔4小时至5小时、相隔5小时至6小时、相隔6小时至7小时、相隔7小时至8小时、相隔8小时至9小时、相隔9小时至10小时、相隔10小时至11小时、相隔11小时至12小时、相隔1天、相隔2天、相隔3天、相隔4天、相隔5天、相隔6天、相隔1周、相隔2周、相隔3周或相隔4周施用。
在各种实施方案中,本公开涉及诱导先天免疫应答的异二聚体蛋白和诱导适应性免疫应答的另一种异二聚体蛋白的共同施用。在此类实施方案中,诱导先天免疫应答的异二聚体蛋白可以在诱导适应性免疫应答的异二聚体蛋白的施用之前、同时或之后施用。例如,异二聚体蛋白可以相隔1分钟、相隔10分钟、相隔30分钟、相隔小于1小时、相隔1小时、相隔1小时至2小时、相隔2小时至3小时、相隔3小时至4小时、相隔4小时至5小时、相隔5小时至6小时、相隔6小时至7小时、相隔7小时至8小时、相隔8小时至9小时、相隔9小时至10小时、相隔10小时至11小时、相隔11小时至12小时、相隔1天、相隔2天、相隔3天、相隔4天、相隔5天、相隔6天、相隔1周、相隔2周、相隔3周或相隔4周施用。在说明性的实施方案中,诱导先天免疫应答的异二聚体蛋白和诱导适应性反应的异二聚体蛋白相隔1周施用,或隔周施用(即,在施用诱导先天免疫应答的异二聚体蛋白的1周后施用诱导适应性免疫应答的异二聚体蛋白,等等)。
本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的剂量可取决于若干因素,包括疾患的严重程度、是否要治疗或预防疾患以及要治疗的受试者的年龄、体重和健康状况。此外,关于特定受试者的药物基因组学(基因型对治疗药物的药代动力学、药效学或疗效特征的影响)信息可能会影响使用的剂量。此外,确切的个体剂量可以根据多种因素进行某种程度的调整,包括施用的剂的特定组合、施用时间、施用途径、制剂的性质、排泄率、正在治疗的特定疾病、病症的严重程度以及病症的解剖学位置。可以预期剂量可能有一些变化。
对于通过肠胃外注射施用本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂),剂量可以是每天约0.1mg至约250mg、每天约1mg至约20mg或每天约3mg至约5mg。通常,当口服或肠胃外施用时,本文所描述的任何剂的剂量可为每天约0.1mg至约1500mg、或每天约0.5mg至约10mg、或每天约0.5mg至约5mg、或每天约200至约1,200mg(例如,每天约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg、约1,000mg、约1,100mg、约1,200mg)。
在实施方案中,本文所描述的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的施用是以每次治疗约0.1mg至约1500mg、或每次治疗约0.5mg至约10mg、或每次治疗约0.5mg至约5mg、或每次治疗约200至约1,200mg(例如,每次治疗约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg、约1,000mg、约1,100mg、约1,200mg)的剂量通过肠胃外注射进行。
在实施方案中,异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的合适剂量在受试者的约0.01mg/kg至约100mg/kg体重或约0.01mg/kg至约10mg/kg体重的范围内,例如约0.01mg/kg、约0.02mg/kg、约0.03mg/kg、约0.04mg/kg、约0.05mg/kg、约0.06mg/kg、约0.07mg/kg、约0.08mg/kg、约0.09mg/kg、约0.1mg/kg、约0.2mg/kg、约0.3mg/kg、约0.4mg/kg、约0.5mg/kg、约0.6mg/kg、约0.7mg/kg、约0.8mg/kg、约0.9mg/kg、约1mg/kg、约1.1mg/kg、约1.2mg/kg、约1.3mg/kg、约1.4mg/kg、约1.5mg/kg、约1.6mg/kg、约1.7mg/kg、约1.8mg/kg、1.9mg/kg、约2mg/kg、约3mg/kg、约4mg/kg、约5mg/kg、约6mg/kg、约7mg/kg、约8mg/kg、约9mg/kg、约10mg/kg体重,包括其间的所有值和范围。
在另一个实施方案中,递送可以在囊泡中,特别是脂质体中(参见Langer,1990,Science249:1527-1533;Treat等人.,在Liposomes in the Therapy of InfectiousDisease and Cancer中,Lopez-Berestein和Fidler(编),Liss,New York,pp.353-365(1989)。
本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以通过控释或缓释方式或通过所属领域普通技术人员公知的递送装置施用。实例包括但不限于美国专利号3,845,770;3,916,899;3,536,809;3,598,123;4,008,719;5,674,533;5,059,595;5,591,767;5,120,548;5,073,543;5,639,476;5,354,556;和5,733,556中描述的那些,每个都通过引用整体并入本文。此类剂型可用于使用例如羟丙基甲基纤维素、其他聚合物基质、凝胶、渗透膜、渗流系统、多层包衣、微粒、脂质体、微球或其组合提供一种或多种活性成分的控释或缓释,以提供不同比例的所需释放曲线。活性成分的控释或缓释可以通过各种条件刺激,所述条件包括但不限于pH值变化、温度变化、适当波长的光刺激、酶的浓度或可用性、水的浓度或可用性,或其他生理条件或化合物。
在另一个实施方案中,可以使用聚合物材料(参见Medical Applications ofControlled Release,Langer和Wise(编),CRC Pres.,Boca Raton,Florida(1974);Controlled Drug Bioavailability,DrugProduct Design and Performance,Smolen和Ball(编),Wiley,New York(1984);Ranger和Peppas,1983,J.Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.23:61;还参见Levy等人,1985,Science 228:190;During等人,1989,Ann.Neurol.25:351;Howard等人,1989,J.Neurosurg.71:105)。
在另一实施方案中,控释系统可以放置在待治疗的目标区域附近,因此仅需要全身剂量的一部分(参见例如Goodson,Medical Applications of Controlled Release,见前文,vol.2,pp.115-138(1984))。可以使用由Langer,1990,Science 249:1527-1533)的评述中讨论的其他控释系统。
本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的施用可以独立地为每天一至四次或每月一至四次或每年一至六次或每两年、三年、四年或五年一次。施用可以持续一天或一个月、两个月、三个月、六个月、一年、两年、三年,并且甚至可以持续受试者的一生。
可以根据多种因素来选择利用本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的给药方案,所述因素包括受试者的类型、物种、年龄、体重、性别和医学状况;待治疗疾患的严重程度;施用途径;受试者的肾或肝功能;个体的药物基因组构成;和所采用的本发明的特定化合物。本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以单次日剂量施用,或总日剂量可以每天两次、三次或四次的分剂量施用。此外,本文所描述的任何异二聚体蛋白(和/或另外的剂)可以在整个给药方案中连续而不是间歇地施用。
细胞和核酸
在一个方面,本公开提供了一种表达载体,其包含编码本文公开的任何实施方案的异二聚体蛋白的第一和/或第二多肽链的核酸。在实施方案中,表达载体是哺乳动物表达载体。在实施方案中,表达载体包含DNA或RNA。在实施方案中,在一个方面,本公开提供一种宿主细胞,其包含本文公开的任一实施方案的表达载体。
在各种实施方案中,本公开提供了表达载体,其包含编码本文所描述的异二聚体蛋白(例如,包含第一和第二多肽链的异二聚体蛋白)的核酸。在各种实施方案中,表达载体包含DNA或RNA。在各种实施方案中,表达载体是哺乳动物表达载体。
原核和真核载体均可用于表达异二聚体蛋白。原核载体包括基于大肠杆菌序列的构建体(参见,例如Makrides,Microbiol Rev 1996,60:512-538)。可以用于在大肠杆菌中表达的调控区的非限制性实例包括lac、trp、lpp、phoA、recA、tac、T3、T7和λPL。原核表达载体的非限制性实例可包括λgt载体系列,例如λgt11(Huynh等人,“DNA CloningTechniques,Vol.I:A Practical Approach,”1984,(D.Glover,ed.),pp.49-78,IRLPress,Oxford),和pET载体系列(Studier等人,Methods Enzymol1990,185:60-89)。然而,原核宿主-载体系统无法完成哺乳动物细胞的大部分翻译后加工。因此,真核宿主-载体系统可特别有用。多种调节区可用于在哺乳动物宿主细胞中表达异二聚体蛋白。例如,可以使用SV40早期和晚期启动子、巨细胞病毒(CMV)立即早期启动子和劳斯肉瘤病毒长末端重复(RSV-LTR)启动子。可适用于哺乳动物细胞中的诱导型启动子包括但不限于与金属硫蛋白II基因、小鼠乳腺肿瘤病毒糖皮质激素响应性长末端重复(MMTV-LTR)、β-干扰素基因和hsp70基因相关的启动子(参见,Williams等人,Cancer Res 1989,49:2735-42;和Taylor等人,MolCell Biol 1990,10:165-75)。热休克启动子或应激启动子也可有利于驱动融合蛋白在重组宿主细胞中的表达。
在实施方案中,本发明的表达载体包含至少编码异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的第一和/或第二多肽链或其互补序列的核酸,其有效地连接至在哺乳动物细胞中起作用的表达控制区或其互补序列。表达控制区能够驱动有效连接的阻断剂和/或刺激剂编码核酸的表达,使得阻断剂和/或刺激剂在用表达载体转化的人细胞中产生。
表达控制区是影响有效连接的核酸的表达的调节性多核苷酸(在本文中有时称为元件),例如启动子和增强子。本发明的表达载体的表达控制区能够在人细胞中表达有效连接的编码核酸。在一个实施方案中,细胞是肿瘤细胞。在另一个实施方案中,细胞是非肿瘤细胞。在一个实施方案中,表达控制区赋予有效连接的核酸可调节的表达。信号(有时称为刺激)可以增加或减少与这种表达控制区有效连接的核酸的表达。这种响应信号而增加表达的表达控制区通常被称为诱导型。这种响应信号而降低表达的表达控制区通常被称为抑制型。通常,这些元件赋予的增加或减少的量与存在的信号的量成正比;信号的量越大,表达的增加或减少就越大。
在一个实施方案中,本公开考虑使用能够瞬时响应于信号实现高水平表达的诱导型启动子。例如,当在肿瘤细胞附近时,用包含这种表达控制序列的异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的表达载体转化的细胞通过将转化的细胞暴露于适当的信号而被诱导瞬时产生高水平的剂。说明性诱导型表达控制区包括那些包含用信号(诸如小分子化合物)刺激的诱导型启动子的诱导型表达控制区。具体的实例可见于例如美国专利号5,989,910、5,935,934、6,015,709和6,004,941中,这些专利各自以引用的方式整体并入本文。
表达控制区和基因座控制区包括全长启动子序列,例如天然启动子和增强子元件,以及保留全部或部分全长或非变体功能的子序列或多核苷酸变体。如本文所用,当用于指核酸序列、子序列或片段时,术语“功能”和其语法变体是指所述序列具有天然核酸序列(例如,非变体或未修饰的序列)的一种或多种功能。
如本文所用,“有效的连接”是指如此描述的组分的物理并置,以允许其以其预期的方式起作用。在与核酸有效连接的表达控制元件的实例中,关系是这样的,即控制元件调节核酸的表达。通常,调节转录的表达控制区并置在转录核酸的5’端附近(即,上游)。表达控制区也可以位于转录序列的3’端(即,下游)或转录物内(例如,内含子中)。表达控制元件可位于距转录序列一定距离处(例如,距核酸100至500、500至1000、2000至5000或更多个核苷酸)。表达控制元件的一个具体实例是启动子,其通常位于转录序列的5'。表达控制元件的另一个实例是增强子,其可以位于转录序列的5'或3',或位于转录序列内。
在人细胞中起作用的表达系统是所属领域中熟知的,并且包括病毒系统。通常,在人细胞中起作用的启动子是能够结合哺乳动物RNA聚合酶并起始编码序列下游(3')转录为mRNA的任何DNA序列。启动子将具有转录起始区,其通常位于编码序列的5'端附近,并且通常为位于转录起始位点上游25-30个碱基对处的TATA框。TATA框被认为会引导RNA聚合酶II在正确的位点处开始RNA合成。启动子通常还包含上游启动子元件(增强子元件),通常位于TATA盒上游100至200个碱基对内。上游启动子元件决定了转录起始的速率,并且可以在任一方向上起作用。特别用作启动子的是来自哺乳动物病毒基因的启动子,因为病毒基因通常高度表达并且具有广泛的宿主范围。实例包括SV40早期启动子、小鼠乳腺肿瘤病毒LTR启动子、腺病毒主要晚期启动子、单纯疱疹病毒启动子和CMV启动子。
通常,哺乳动物细胞识别的转录终止和聚腺苷酸化序列是位于翻译终止密码子的3'端的调节区,并且因此与启动子元件一起位于编码序列的侧翼。成熟mRNA的3'末端由位点特异性翻译后切割和聚腺苷酸化形成。转录终止子和聚腺苷酸化信号的实例包括那些源自SV40的信号。内含子也可包括在表达构建体中。
存在多种可用于将核酸引入到活细胞中的技术。适用于体外将核酸转移至哺乳动物细胞中的技术包括使用脂质体、电穿孔、显微注射、细胞融合、聚合物基系统、DEAE-葡聚糖、病毒转导、磷酸钙沉淀法等。对于体内基因转移,还可以使用多种技术和试剂,包括脂质体;天然聚合物基媒介物,例如壳聚糖和明胶;病毒载体也适用于体内转导。在一些情况下,需要提供靶向剂,诸如对细胞表面膜蛋白具有特异性的抗体或配体。在使用脂质体的情况下,与细胞表面膜蛋白结合并与胞吞作用相关的蛋白可用于靶向和/或促进摄取,例如,对于特定细胞类型有趋向性的衣壳蛋白或其片段、针对在循环过程中发生内化的蛋白的抗体、靶向细胞内定位并延长细胞内半衰期的蛋白。受体介导的内吞作用技术描述于例如Wu等人,J.Biol.Chem.262,4429-4432(1987);和Wagner等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87,3410-3414(1990)中。
在适当情况下,也可以采用基因递送剂,例如整合序列。许多整合序列是所属领域中已知的(参见,例如,Nunes-Duby等人,Nucleic Acids Res.26:391-406,1998;Sadwoski,J.Bacteriol.,165:341-357,1986;Bestor,Cell,122(3):322-325,2005;Plasterk等人,TIG 15:326-332,1999;Kootstra等人,Ann.Rev.Pharm.Toxicol.,43:413-439,2003)。这些包括重组酶和转座酶。实例包括Cre(Sternberg和Hamilton,J.Mol.Biol.,150:467-486,1981)、lambda(Nash,Nature,247,543-545,1974)、FIp(Broach等人,Cell,29:227-234,1982)、R(Matsuzaki等人,J.Bacteriology,172:610-618,1990)、cpC31(参见,例如,Groth等人,J.Mol.Biol.335:667-678,2004)、睡美人(sleeping beauty),水手家族的转座酶(Plasterk等人,见前文),以及用于整合病毒,例如AAV、逆转录病毒的组分,以及具有提供病毒整合的组分,诸如逆转录病毒或慢病毒的LTR序列和AAV的ITR序列的抗病毒(Kootstra等人,Ann.Rev.Pharm.Toxicol.,43:413-439,2003)。此外,直接和靶向遗传整合策略可用于插入编码嵌合融合蛋白的核酸序列,包括CRISPR/CAS9、锌指、TALEN和大范围核酸酶基因编辑技术。
在一个方面,本发明提供了用于表达异二聚体蛋白(和/或另外的剂)的作为病毒载体的表达载体。许多可用于基因治疗的病毒载体是已知的(参见,例如,Lundstrom,Trends Biotechnol.,21:1 17,122,2003)。说明性病毒载体包括选自抗病毒(LV)、逆转录病毒(RV)、腺病毒(AV)、腺相关病毒(AAV)和α病毒的那些病毒载体,但也可以使用其他病毒载体。对于体内用途,不整合到宿主基因组中的病毒载体适合使用,例如α病毒和腺病毒。α病毒的说明性类型包括辛德毕斯病毒(Sindbis virus)、委内瑞拉马脑炎(Venezuelanequine encephalitis;VEE)病毒和塞姆利基森林病毒(Semliki Forest virus;SFV)。对于体外用途,整合到宿主基因组中的病毒载体是合适的,例如逆转录病毒、AAV和抗病毒。在一个实施方案中,本发明提供了体内转导人细胞的方法,包括使实体瘤在体内与本发明的病毒载体接触。
在各种实施方案中,本公开提供了一种宿主细胞,其包括包含本文所描述的异二聚体蛋白的表达载体。
可以将表达载体引入宿主细胞以产生本发明的异二聚体蛋白。例如,细胞可在体外培养或被基因工程改造。有用的哺乳动物宿主细胞包括但不限于源自人、猴子和啮齿动物的细胞(参见,例如,Kriegler,“Gene Transfer and Expression:A LaboratoryManual,”1990,New York,Freeman&Co.)。这些细胞包括被SV40转化的猴肾细胞系(例如,COS-7、ATCC CRL 1651);人胚胎肾细胞系(例如,293、293-EBNA或被亚克隆以便在悬浮培养物中生长的293细胞,Graham等人,J GenVirol 1977,36:59);幼仓鼠肾细胞(例如,BHK、ATCC CCL 10);中国仓鼠卵巢细胞-DHFR(例如,CHO、Urlaub和Chasin,Proc Natl Acad SciUSA 1980,77:4216);DG44 CHO细胞,CHO-K1细胞,小鼠支持细胞(Mather,Biol Reprod1980,23:243-251);小鼠成纤维细胞(例如,NIH-3T3);猴肾细胞(例如,CV1 ATCC CCL 70);非洲绿猴肾细胞(例如,VERO-76、ATCC CRL-1587);人宫颈癌细胞(例如,HELA、ATCC CCL2);犬肾细胞(例如,MDCK、ATCC CCL 34);水牛大鼠肝细胞(例如,BRL 3A、ATCC CRL 1442);人肺细胞(例如,W138、ATCC CCL 75);人肝细胞(例如,Hep G2、HB 8065);以及小鼠乳腺肿瘤细胞(例如,MMT 060562、ATCC CCL51)。用于表达本文所描述的融合蛋白的说明性癌细胞类型包括小鼠成纤维细胞系NIH3T3、小鼠刘易斯(Lewis)肺癌细胞系LLC、小鼠肥大细胞瘤细胞系P815、小鼠淋巴瘤细胞系EL4及其卵清蛋白转染子E.G7、小鼠黑色素瘤细胞系B16F10、小鼠纤维肉瘤细胞系MC57以及人小细胞肺癌细胞系SCLC#2和SCLC#7。
宿主细胞可以从正常受试者或受影响的受试者(包括健康人、癌症患者以及患有感染性疾病的患者)、私人实验室存储物、公共培养物保藏中心(例如美国典型培养物保藏中心(American TypeCulture Collection))或商业供应商处获得。
可用于体外、离体和/或体内产生本发明的异二聚体蛋白的细胞包括但不限于上皮细胞、内皮细胞、角质细胞、成纤维细胞、肌肉细胞、肝细胞;例如T淋巴细胞、B淋巴细胞、单核细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、巨核细胞、粒细胞的血细胞;各种干细胞或祖细胞,特别是造血干细胞或祖细胞(例如,如从骨髓中获得)、脐带血、外周血、胎肝等。细胞类型的选择取决于所治疗或预防的肿瘤或感染性疾病的类型,并且可由所属领域技术人员来确定。
含Fc大分子(例如Fc融合蛋白)的生产和纯化已成为标准化过程,产品之间只需稍作修改。例如,许多含Fc的大分子是由人胚胎肾(HEK)细胞(或其变体)或中国仓鼠卵巢(CHO)细胞(或其变体)或在某些情况下通过细菌或合成方法产生的。生产后,由HEK或CHO细胞分泌的含Fc的大分子通过与蛋白A柱结合进行纯化,然后使用各种方法进行“精制”。通常,将纯化的含Fc的大分子以液体形式储存一段时间,长时间冷冻或在某些情况下冻干。在各种实施方案中,与传统的含Fc的大分子相比,本文考虑的异二聚体蛋白的产生可具有独特的特征。在某些实例中,异二聚体蛋白可以使用特定层析树脂或使用不依赖于蛋白A捕获的层析方法来纯化。在其他实施方案中,异二聚体蛋白可以寡聚状态或以多种寡聚状态纯化,并且使用特定方法富集特定寡聚状态。不受理论束缚,这些方法可包括用特定缓冲液处理,包括特定盐浓度、pH和添加剂组合物。在其他实例中,此类方法可包括偏向于一种寡聚状态而不是另一种的处理。在此获得的异二聚体蛋白可以使用所属领域指定的方法另外“精制”。在实施方案中,异二聚体蛋白高度稳定并且能够耐受宽范围的pH暴露(pH 3-12之间),能够耐受大量冻/融应激(大于3个冻/融循环)并且能够耐受高温下的长时间孵育(40摄氏度下超过2周)。在其他实施方案中,异二聚体蛋白显示保持完整,在这类应激条件下没有降解、脱酰胺等的迹象。
受试者和/或动物
在实施方案中,受试者和/或动物是哺乳动物,例如,人、小鼠、大鼠、豚鼠、狗、猫、马、牛、猪、兔、羊或非人灵长类动物,例如猴子、黑猩猩或狒狒。在其他实施方案中,受试者和/或动物是非哺乳动物,例如斑马鱼。在实施方案中,受试者和/或动物可以包含荧光标记的细胞(具有例如,GFP)。在实施方案中,受试者和/或动物是包含荧光细胞的转基因动物。
在实施方案中,受试者和/或动物是人。在实施方案中,人是儿科人。在其他实施方案中,人是成年人。在其他实施方案中,人是老年人。在其他实施方案中,人可被称为患者。
在某些实施方案中,人的年龄范围为约0个月至约6个月、约6至约12个月、约6至约18个月、约18至约36个月、约1至约5岁、约5至约10岁、约10至约15岁、约15至约20岁、约20至约25岁、约25至约30岁,大约30岁至约35岁、约35岁至约40岁、约40岁至约45、约45岁至约50岁、约50岁至约55岁、约55至约60岁、约60至约65岁,约65至约70岁、约70至约75岁、约75至约80岁、约80至约85岁、约85至约90岁、约90至约95岁或约95至约100岁。
在其他实施方案中,受试者是非人动物,因此本发明涉及兽医用途。在一个具体实施方案中,非人动物是家庭宠物。在另一个具体实施方案中,非人动物是家畜动物。
制备本公开的异二聚体蛋白的方法
本文还公开了用于制备异二聚体蛋白的方法,所述异二聚体蛋白包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一和第二结构域并促进异二聚化的接头。在一些实施方案中,异二聚体蛋白包含两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白或两个不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在一些实施方案中,异二聚体蛋白包含两条自缔合的个体多肽链。此类异二聚体蛋白在WO 2020/146393中公开,其全部内容通过引用并入本文。
在实施方案中,第一结构域包含来自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL的嗜乳脂蛋白家族蛋白。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10,和人SKINTL。靶向结构域可以是本文公开的任何实施方案。接头可以是本文公开的任何实施方案。
通常,通过至少一个纯化步骤制备异二聚体蛋白。示例性纯化步骤包括色谱法(但不限于,例如亲和色谱法)。纯化方法是蛋白质纯化和抗体纯化领域众所周知的。纯化过程中的步骤公开于美国专利号5,429,746;9,708,365;10,570,434;10,533,045;9,631,007;7,691,980;9,938,317,其每篇的全部内容均通过引用并入本文。
在示例性实施方案中,本文提供的异二聚体蛋白包括两个变体Fc结构域序列。此类变体Fc结构域包括氨基酸修饰以促进异二聚体蛋白的自组装和/或纯化。促进异二聚体蛋白的产生和纯化的示例性氨基酸修饰包括“不对称”(skew)变体(例如本文所述的“杵臼”和“电荷对”变体)以及允许异二聚体蛋白的纯化的“pI变体”。如美国专利号US 9,605,084(其全部内容通过引用并入本文)中一般性描述的,可用于异二聚化的机制包括如美国专利号US 9,605,084中描述的“杵臼”(“KIH”),如美国专利号US 9,605,084(其全部内容通过引用并入本文)中所述的“静电转向”或“电荷对”,美国专利号US 9,605,084(其全部内容通过引用并入本文)中所述的pI变体,以及如美国专利号US 9,605,084(其全部内容通过引用并入本文)中概述的一般其他Fc变体。
使用单基因载体的方法
在一个方面,本公开提供了一种制备异二聚体蛋白的方法,该方法包括(i)提供包含编码α链的单基因载体和/或编码β链的单基因载体的细胞;(ii)培养细胞,和(ii)从细胞的培养物上清液和/或裂解物制备异二聚体蛋白。
在一个方面,本公开提供了一种用于制造异二聚体蛋白的方法,该方法包括:a)提供细胞群(但不限于,例如,ExpiCHO和Expi293细胞);b)用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)转导细胞群;c)培养转导的细胞群以增殖;和d)从转导的细胞群的培养物上清液和/或裂解物中提取和/或纯化异二聚体蛋白。
在实施方案中,这样的方法如图10A中所描绘。在实施方案中,细胞(但不限于,例如,ExpiCHO和Expi293细胞)用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)共转染。在实施方案中,用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)基本上同时转染细胞。在实施方案中,用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)依次转染细胞。在实施方案中,细胞在用表达β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的单基因载体(SGV)转染之前,首先用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)的单基因载体(SGV)转染。在实施方案中,细胞在首先用表达β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的单基因载体(SGV)转染之后,用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)的单基因载体(SGV)转染。在实施方案中,将用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)共转染的细胞分离、富集或纯化。在实施方案中,用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)共转染的细胞未经分离、富集或纯化。在实施方案中,在体外培养用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)共转染的细胞,其任选地经分离、富集或纯化。在实施方案中,用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)共转染的细胞经培养扩增。在实施方案中,从培养物上清液和/或细胞的裂解物中提取和/或纯化异二聚体蛋白,所述细胞用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的两个单基因载体(SGV)共转染。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链和β链包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域是相同的。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含靶向结构域的第二结构域是相同的。在实施方案中,连接第一结构域和第二结构域的接头是相同的。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链包含:(a)包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的第一结构域选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL,或其片段;(b)包含靶向结构域的第二结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的第一结构域选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL,或其片段;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。在实施方案中,靶向结构域是本文公开的任何实施方案的靶向结构域。在实施方案中,接头是本文公开的任何实施方案的接头。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链包含:(a)包含BTN2A1或其片段(但不限于,例如可变结构域)的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)包含BTN3A1或其片段(但不限于,例如可变结构域)的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
使用双基因载体的方法
在一个方面,本公开提供了一种制备异二聚体蛋白的方法,该方法包括(i)提供包含编码α链和β链的双基因载体的细胞;(ii)培养细胞,和(ii)从细胞的培养物上清液和/或裂解物制备异二聚体蛋白。
在一个方面,本公开提供了一种用于制造异二聚体蛋白的方法,该方法包括:a)提供细胞群(但不限于,例如,ExpiCHO和Expi293细胞);b)用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的双基因载体(DGV)转导细胞群;c)培养转导的细胞群以增殖;和d)从转导的细胞群的培养物上清液和/或裂解物中提取和/或纯化异二聚体蛋白。
在实施方案中,这样的方法如图10B中所描绘。在实施方案中,用表达α链(但不限于,例如BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如BTN3A1-Fc-CD19scFv)的双基因载体(DGV)转染细胞(但不限于,例如,ExpiCHO和Expi293细胞)。在实施方案中,将用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的双基因载体(DGV)转染的细胞进行分离、富集或纯化。在实施方案中,在体外培养用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的双基因载体(DGV)转染的细胞,其任选地经分离、富集或纯化。在实施方案中,用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如,BTN3A1-Fc-CD19scFv)的双基因载体(DGV)转染的细胞经培养扩增。在实施方案中,从细胞的培养物上清液和/或裂解物中提取和/或纯化异二聚体蛋白,所述细胞用表达α链(但不限于,例如,BTN2A1-Fc-CD19scFv)和β链(但不限于,例如BTN3A1-Fc-CD19scFv)的双基因载体(DGV)转染。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链和β链包含:(a)包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含一个或多个嗜乳脂蛋白家族蛋白或其片段的第一结构域是相同的。在实施方案中,第一和第二多肽链的包含靶向结构域的第二结构域是相同的。在实施方案中,连接第一结构域和第二结构域的接头是相同的。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链包含:(a)包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的第一结构域选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL,或其片段;(b)包含靶向结构域的第二结构域;和(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)包含嗜乳脂蛋白家族蛋白的第一结构域选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL,或其片段;(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。在实施方案中,嗜乳脂蛋白家族蛋白选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。在实施方案中,靶向结构域是本文公开的任何实施方案的靶向结构域。在实施方案中,接头是本文公开的任何实施方案的接头。
在实施方案中,异二聚体蛋白包含α链和β链,其中α链包含:(a)包含BTN2A1或其片段(但不限于,例如可变结构域)的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;并且其中β链包含:(a)包含BTN3A1或其片段(但不限于,例如可变结构域)的第一结构域;(b)包含靶向结构域的第二结构域,该靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)胞外结构域;以及(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
试剂盒
本发明提供可简化本文所描述的任何剂的施用的试剂盒。本发明的示例性试剂盒包含单位剂型的本文所描述的任何组合物。在一个实施方案中,单位剂型是容器,例如预装注射器,其可以是无菌的,含有本文所描述的任何剂和药学上可接受的载体、稀释剂、赋形剂或媒介物。试剂盒还可包括指示使用本文所描述的任何剂的标签或印刷说明书。试剂盒还可包括开睑器、局部麻醉剂和用于施用位置的清洁剂。试剂盒还可进一步包括一种或多种本文所描述的另外的剂。在一个实施方案中,试剂盒包括含有有效量的本发明组合物和有效量的另一种组合物例如本文所描述的那些组合物的容器。
实施例
提供本文的实施例是为了说明本技术的优点和益处,并进一步帮助本领域普通技术人员制备或使用本技术的嵌合蛋白。本文的实施例也被呈现以更充分地说明本技术的优选方面。这些实施例决不应被解释为限制如所附权利要求所定义的本技术的范围。这些实施例可以包括或并入上述的本技术的任何变体、方面或实施方案。上述变体、方面或实施方案还可以进一步各自包括或并入本技术的任何或所有其他变体、方面或实施方案的变体。
实施例1:示例性BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白的构建和表征
本技术的异二聚体蛋白包含两个嵌合蛋白的二聚体,每个嵌合蛋白包含嗜乳脂蛋白家族成员、核心结构域和抗原靶向结构域。“BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv”构建体包括包含经由铰链-CH2-CH3Fc结构域与CD19scFv融合的人BTN2A1的胞外结构域(ECD)的α链,以及包含经由铰链-CH2-CH3Fc结构域与CD19scFv融合的人BTN3A1的胞外结构域(ECD)的β链。参见图1A。生成了编码BTN2A1-Fc-CD19scFv蛋白(α链)和BTN3A1-Fc-CD19scFv蛋白(β链)的构建体。这种γδ(GammaDELta)T细胞衔接器(ENgager)构建体在本文中也称为BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv‘GADLEN’蛋白。
BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白,经由在Expi293细胞中瞬时共转染编码1)BTN2A1-α-CD19scFv蛋白和2)BTN3A1-β-CD19scFv蛋白的两种质粒而产生。α和β构建体编码BTN2A1-Fc-CD19scFv(‘α’链)和BTN3A1-Fc-CD19scFv(‘β’链)。α和β链包含带电荷的极化接头结构域,其有助于所需的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的异二聚化。转染后6天收获瞬时转染的细胞培养物上清液,并在FcXL层析树脂上纯化。如图1B所示,FcXL层析表明所得蛋白是基本上纯的。
使用非还原十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进一步评估蛋白的纯度。如图2A所示,考马斯蓝染色凝胶显示BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白具有>90%的纯度(也参见图2B和2C)。
在用抗人BTN2A1抗体、抗人BTN3A1抗体或抗小鼠Fc抗体检测后,使用非还原、还原以及还原且去糖基化条件通过蛋白质印迹进一步分析纯化的蛋白。非还原的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白作为单条带跑胶(参见图2B中的泳道“L”),表明在BTN2A1-α-CD19scFv和BTN3A1-β-CD19scFv链之间形成共价复合物。如图2B所示,用抗Fc抗体探测的印迹揭示了两个条带,其中蛋白是在还原但未去糖基化的条件下制备的(参见图2B中的泳道“R”)。用抗人BTN2A1和抗人BTN3A1抗体探测的凝胶表明带的迁移率对应于抗Fc探测印迹中显示的两条带。有趣的是,在还原且去糖基化(泳道“DG”)条件下制备的蛋白产生单条带,其可用抗人BTN2A1、抗人BTN3A1或抗小鼠Fc抗体中的任何一种检测。
为了促进同时检测BTN2A1-α-CD19scFv和BTN3A1-β-CD19scFv单体,在用与Starbright Blue520缀合的抗人BTN2A1抗体和与Dylite800缀合的抗人BTN3A1抗体检测后,使用非还原(泳道“NR”)、还原(泳道“R”)和还原且去糖基化(泳道“DG”)条件通过蛋白质印迹来分析纯化的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白。如图2C所示,双色蛋白质印迹分析表明在还原但非去糖基化条件下BTN2A1-α和BTN3A1-β链的存在。具体而言,蓝色BTN2A1-α-CD19scFv条带比绿色BTN3A1-β-CD19scFv单体迁移得更慢(参见图2C中的泳道“R”)。在非还原条件(图2C中的泳道“NR”)和还原且去糖基化条件(图2C中的泳道“DG”)下制备的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白以单个蓝绿色条带运行。
这些结果表明存在二硫键连接的二聚体蛋白,该蛋白还原成两个个体蛋白(在用β-巯基乙醇破坏链间二硫键之后)。这些数据进一步表明,基于还原泳道以及还原且去糖基化泳道之间的相似性,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN是糖基化的。这些数据进一步表明BTN2A1-Fc-CD19scFv的糖基化程度高于BTN3A1-Fc-CD19scFv。
实施例2:BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与CD19的结合
为了研究BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白中存在的CD19scFv的结合的结合动力学,使用Octet系统(ForteBio)进行结合测定。简而言之,将重组CD19-His蛋白固定在生物传感器上,并添加BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的对照异二聚体。BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与CD19-His蛋白的结合反应实时绘制在传感图迹线上。如图3所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与重组CD19-His蛋白以时间依赖性和饱和动力学结合。相比之下,缺乏CD19scFv的对照异二聚体仅显示背景信号。这些实验揭示了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与人CD19结合的以下结合参数:
异二聚体构建体 | 配体 | Kon(1/Ms) | Kdis(1/s) | KD(nM) | 全R2 |
BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv | 人CD19 | 4.86E+04 | 6.72E-04 | 13.8 | 0.992 |
这些结果证明,位于本文公开的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的C末端的CD19scFv特异性结合CD19。
实施例3:BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与CD19和BTN2A1/BTN3A1配体的同时结合
BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白含有BTN2A1和BTN3A1的胞外结构域(ECD)。接下来使用基于Meso Scale Discovery(MSD)ELISA的测定法来探索特有的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白中存在的BTN2A1和BTN3A1蛋白的ECD以及存在的CD19scFv是否可以同时与其配体结合。将重组CD19蛋白包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的异二聚体添加到板上,以供板结合的重组CD19蛋白捕获。使用抗BTN2A1抗体检测结合。如图4A所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白而非缺乏CD19scFv的异二聚体表现出剂量依赖性结合。由于该测定中信号的产生需要同时与重组CD19蛋白和抗BTN2A1抗体结合,这些数据证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白可以同时结合CD19蛋白和BTN2A1配体。
在另一个实验中,将重组CD19蛋白包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的异二聚体添加到板上,以供板结合的重组CD19蛋白捕获。使用抗BTN3A1抗体检测结合。如图4B所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白而非缺乏CD19scFv的异二聚体表现出剂量依赖性结合。由于该测定中信号的产生需要同时与重组CD19蛋白和抗BTN3A1抗体结合,因此这些数据证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白可以同时结合CD19蛋白和BTN3A1配体。
这些数据表明BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白可以同时结合CD19和嗜乳脂蛋白BTN2A1/3A1配体。总的来说,这些数据证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白可以使CD19scFv和嗜乳脂蛋白BTN2A1/3A1端可以同时结合它们的配体。
实施例4:BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与BTN2A1和BTN3A1配体的同时结合
接下来使用基于MSD ELISA的测定探索了特有的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白中存在的BTN2A1和BTN3A1蛋白的ECD以及存在的CD19scFv是否可以同时与其配体结合。图5A显示了MSD ELISA测定的示意图。将抗BTN2A1抗体包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白添加到板中,以供板结合的抗BTN2A1抗体捕获。使用抗BTN3A1抗体检测结合。如图5B所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白表现出剂量依赖性结合。由于该测定中信号的产生需要同时与板结合的抗BTN2A1抗体和抗BTN3A1抗体结合,这些数据证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白可以桥接板结合的抗BTN2A1抗体和抗BTN3A1抗体。
在另一个实验中,将抗BTN3A1抗体包被在板上,并将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白添加到板中,以供板结合的抗BTN3A1抗体捕获。使用抗BTN2A1抗体检测结合。如图5C所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白表现出剂量依赖性结合。由于该测定中信号的产生需要同时与板结合的抗BTN3A1抗体和抗BTN2A1抗体结合,这些数据证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白可以桥接板结合的抗BTN3A1抗体和抗BTN2A1抗体。
这些数据表明BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白可以同时结合抗BTN3A1抗体和抗BTN2A1抗体。总的来说,这些数据证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白可以同时与嗜乳脂蛋白BTN2A1配体/受体和BTN3A1配体/受体结合。
实施例5:BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白的CD19依赖性细胞表面结合
为了研究BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与CD19+细胞的结合,使用在表面表达CD19的HEK293细胞(HEK293-CD19细胞)和HEK293亲本细胞。将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的对照异二聚体(其用作结合的阴性对照)添加到HEK293-CD19细胞中。使用抗Fc抗体检测HEK293-CD19细胞结合的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白,并使用流式细胞术进行测定。如图6A所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白表现出与HEK293-CD19细胞的剂量依赖性和可饱和的结合。相比之下,缺乏CD19scFv的异二聚体仅显示背景水平的结合。数据显示BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白以0.89nM的EC50结合HEK293-CD19细胞。
在另一个实验中,将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的对照异二聚体添加到亲本HEK293细胞中。如图6A所示,使用流式细胞术测定结合BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白。如图6B所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白和缺乏CD19scFv的异二聚体都仅表现出背景水平的结合。
使用在表面表达CD19的Daudi细胞进一步研究了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白与CD19+细胞的结合。使用流式细胞术确认Daudi细胞表面上CD19的表达。如图7A所示,抗CD19抗体能够染色Daudi细胞,而同种型对照则不能染色Daudi细胞,证实Daudi细胞是CD19+。
将渐增量的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或缺乏CD19scFv的对照异二聚体添加到Daudi细胞中,并使用流式细胞术检测结合。如图7B所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以剂量依赖性和可饱和的方式结合Daudi细胞,但是缺乏CD19scFv的对照异二聚体则不能。这些数据再次显示BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以5nM的EC50结合Daudi细胞。
这些结果证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以剂量依赖性和可饱和的方式特异性结合CD19+细胞。
实施例6:BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与γδ细胞的结合
接下来,研究了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与γδ细胞的结合。从健康供体的外周血单核细胞(PBMC)中分离并扩增Vγ9+Vδ2+T细胞。将分离的Vγ9+Vδ2+T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白、缺乏BTN2A1的对照异二聚体蛋白或人IgG对照一起孵育。使用与异二聚体蛋白的Fc结构域结合的APC缀合的抗hFc抗体,通过流式细胞术检测结合。如图8A所示,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白特异性结合Vγ9+Vδ2+T细胞。相比之下,缺乏CD19scFv的对照异二聚体蛋白或人IgG对照不结合Vγ9+Vδ2+T细胞。
在另一项实验中,从健康供体的PBMC中分离并扩增Vγ9+Vδ1+T细胞。将分离的Vγ9+Vδ1+T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白或人IgG对照一起孵育。使用与异二聚体蛋白的Fc结构域结合的APC缀合的抗hFc抗体,通过流式细胞术检测结合。如图8B所示,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白和人IgG对照均未结合Vγ9+Vδ1+T细胞。
在又一项实验中,从健康供体的外周血单核细胞(PBMC)中分离并扩增Vγ9+Vδ2+T细胞。将分离的Vγ9+Vδ2+T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN或BTN3A1/3A2-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白一起孵育。通过流式细胞术检测结合。如图8C所示,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白与分离的人Vγ9+Vδ2+T细胞结合,而BTN3A1/3A2-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白则未与分离的人Vγ9+Vδ2+T细胞结合。
在又一项实验中,从健康供体的外周血单核细胞(PBMC)中分离并扩增Vγ9+Vδ2+T细胞。如图8E(小图)所示,如通过流式细胞术所示的,与未染色细胞相比,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白结合表达Vγ9δ2TCR的人γδT细胞。将渐增量的人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白或缺乏BTN2A1的异二聚体与分离的Vγ9+Vδ2+T细胞一起孵育,并使用流式细胞术检测结合。如图8E所示,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白表现出与表达Vγ9δ2TCR的人γδT细胞的剂量依赖性结合,EC50为43nM。相比之下,缺乏BTN2A1的异二聚体不与表达Vγ9δ2TCR的T细胞结合。
在另一项实验中,从健康供体的PBMC中分离并扩增Vγ9-T细胞。将分离的Vγ9-T细胞与人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN或BTN3A1/3A2-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白一起孵育。使用与异二聚体蛋白的Fc结构域结合的APC缀合的抗hFc抗体,通过流式细胞术检测结合。如图8D所示,人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN或BTN3A1/3A2-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白均不结合分离的Vγ9-T细胞。
这些结果证明了BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以剂量依赖性和可饱和的方式特异性结合CD19+细胞。
实施例7:BTN2A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白与γδ细胞的结合需要二聚化
接下来,研究了作为单体存在于溶液中的BTN2A1-His和SIRPα-His蛋白与Vγ9+Vδ2+T细胞的结合。将渐增量的BTN2A1-His和SIRPα-His蛋白添加到Vγ9+Vδ2+T细胞中。使用基于His标签检测的流式细胞术检测结合。如图9A所示,BTN2A1-His蛋白不结合Vγ9+Vδ2+T细胞。相比之下,SIRPα-His蛋白以剂量依赖性和可饱和的方式与细胞上的CD47结合。
为了进一步探索这一观察结果,使用了BTN2A1-Fc、BTN3A1-Fc、人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白和人IgG对照。BTN2A1-Fc和BTN3A1-Fc蛋白在溶液中以二聚体形式存在。Vγ9+Vδ2+T细胞与渐增量的BTN2A1-Fc、BTN3A1-Fc、人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白和人IgG对照一起孵育。使用流式细胞术检测结合。如图9B所示,BTN2A1-Fc和人BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以剂量依赖性和可饱和的方式结合Vγ9+Vδ2+T细胞。相比之下,BTN3A1-Fc蛋白和人IgG对照不与Vγ9+Vδ2+T细胞结合。这些数据表明BTN2A1需要同二聚化才能与Vγ9+Vδ2T细胞受体相互作用。
由于与Vγ9+Vδ2+T细胞结合的BTN2A1-Fc蛋白在溶液中以二聚体形式存在,而未与Vγ9+Vδ2+T细胞结合的BTN2A1-His蛋白在溶液中以单体形式存在,因此这些数据证明了BTN2A1的二聚化:与BTN2A1的同二聚化,或与例如BTN3A1的异二聚化,是结合Vγ9+Vδ2+T细胞所必需的。
实施例8:BTN2A1-Fc-CD19scFv GADLEN的细胞系开发和生产
生成了三个版本的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白,以比较促进异二聚化的带电荷的极化接头策略与杵臼(KIH)突变:带电荷的极化接头、Fc结构域中的KIH突变、KIH突变和FcRn突变(见图19)。不受理论的束缚,认为具有KIH突变和FcRn突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白增加了与新生儿Fc受体的结合。
进行BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体构建体的细胞系开发(CLD),以使用两种方法评估可制造性:分别表达α链和β链的两个单基因载体(SGV)的共转染(图10A),和使用在单个载体中两个独立启动子下表达α和β链的双基因载体(DGV)的转染(图10B)。
在所有BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白分子的CLD过程期间,经由MSDELISA在微型池中评价α和β链的表达并对微型池进行排序,以向下选择并能够选择可能会进入该过程的单细胞克隆阶段的排名居前的微型池。使具有带电荷的极化接头的BTN2A1-α链(BTN2A1-Fc-CD19scFv)和BTN3A1-β链(BTN3A1-Fc-CD19scFv)的微型池在摇瓶培养物中生长,所述微型池是通过两个单基因载体(SGV)的共转染或使用双基因载体(DGV)的转染产生的。在第14天使用基于MSD-ELISA的测定分析BTN2A1-α链和BTN3A1-β链的表达。蛋白滴度的比较显示在图10C中。在第14天使用定量RT-PCR分析BTN2A1-α链mRNA和BTN3A1-β链mRNA的表达。图10D显示了SGV和DGV微型池中BTN2A1-α链mRNA和BTN3A1-β链mRNA的比较。有趣的是,与BTN3A1-β-CD19scFv链相比,双基因载体(DGV)起源的微型池表达更多的BTN2A1-α-CD19scFv链,而SGV衍生的微型池在蛋白和RNA水平上似乎表达相对等量的两条链。
这些数据表明两个单基因载体(SGV)或单个双基因载体(DGV)均可用于生产GADLEN蛋白,包括BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白。如本文所示,两个单基因载体(SGV)的共转染产生基本上等量的两条链。单个双基因载体(DGV)可用于进一步优化BTN3A1-β-CD19scFv链的表达,例如在启动子强度和/或mRNA稳定性方面。
此外,仅使用双基因载体方法生成BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白构建体,其中带电荷的极化接头被其他二聚化基序替代,例如具有KIH突变的Fc结构域和另一个具有KIH突变和FcRn突变的Fc结构域。在第14天使用基于MSD-ELISA的测定法对在Fc结构域中具有KIH突变(KIH-Fc)和具有FcRn突变的KIH突变(KIH-FcRn)的构建体分析BTN2A1-α链和BTN3A1-β链的表达。滴度的比较如图10E所示。如图10E和图10C所示,与具有带电荷的极化接头的构建体相比,在Fc结构域中具有KIH突变(KIH-Fc)和具有FcRn突变的KIH突变(KIH-FcRn)微型库的构建体中观察到BTN3A1-β-CD19scFv表达的显著减少。
来自Fc结构域中具有KIH突变(KIH-Fc)以及具有FcRn突变的KIH突变(KIH-FcRn)的构建体的前12个微型池将被移至摇瓶阶段以进一步评估两条链的表达水平,这将确定电荷极化接头方法是否更适合KIH突变的异二聚化。
实施例9:使用用两个单基因载体或双基因载体转染的细胞生产GADLEN蛋白
进一步研究了制造BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白的两种方法。
使用以下两种方法制备BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白:分别表达α链和β链的两个单基因载体(SGV)的共转染(图10A),以及使用双基因载体(DGV)的转染,所述双基因载体在单个载体中两个独立启动子下表达α和β链(图10B)。对纯化的蛋白进行尺寸排阻层析(SEC)以评估其纯度。使用两个单基因载体制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白的大小排阻色谱(SEC)曲线显示在图15A中。使用双基因载体制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白的尺寸排阻色谱(SEC)曲线在图15B中示出。如图15A和图15B所示,从SGV或DGV形式产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv构建体获得了类似的SEC曲线。这些结果证明了GADLEN异二聚体可以由这些生产形式中的任一种产生。
为了进一步评价SGV或DGV生产形式,通过蛋白质印迹分析由SGV或DGV生产形式产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白,以确认BTN2A1-α-CD19scFv和BTN3A1-β-CD19scFv链在纯化物质中的存在。
简而言之,在不存在还原剂(非还原条件)、存在β-巯基乙醇(还原条件)或同时存在β-巯基乙醇和去糖基化剂(还原-去糖基化条件)的情况下,在变性后通过蛋白质印迹分析纯化的蛋白。用抗人BTN2A1抗体和抗人BTN3A1抗体检测BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白。为了促进同时检测BTN2A1-α-CD19scFv和BTN3A1-β-CD19scFv单体,使用结合BTN2A1和BTN3A1的抗体,其使用与两种IR染料荧光缀合的红外(IR)二抗。如图16所示,被抗BTN2A1抗体识别的蛋白条带以蓝色显示(三角箭头),被抗BTN3A1抗体识别的蛋白条带以绿色显示(方形箭头)。在非还原条件下制备的蛋白(“NR”泳道)产生单条带,其可用抗人BTN2A1和抗人BTN3A1抗体二者进行检测(图16,左图和右图)。在还原条件下制备的蛋白(泳道“R”)产生两条带,其各自可以用抗人BTN2A1和抗人BTN3A1抗体检测(图16,左图和右图)。有趣的是,在还原且去糖基化(条件泳道“D”)下制备的蛋白产生单条带,其可用抗人BTN2A1和抗人BTN3A1抗体检测(图16,左图和右图)。基于还原泳道与还原且去糖基化泳道之间的相似性,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN构建体似乎只有少量糖基化。这些数据进一步表明,基于还原泳道与还原且去糖基化泳道之间的相似性,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN是糖基化的。这些数据进一步表明BTN2A1-Fc-CD19scFv的糖基化程度高于BTN3A1-Fc-CD19scFv。
这些结果表明使用两个单基因载体(图16,左图)或双基因载体(图16,右图)制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白是二硫键连接的二聚体蛋白,其还原成两个单独的蛋白(在用β-巯基乙醇破坏链间二硫键后)。这些结果证明了,两种生产形式都产生了含有两条链的物质,如使用针对BTN2A1和BTN3A1的特异性抗体检测到的那样。
对由SGV或DGV生产形式产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN异二聚体蛋白测试了与B细胞淋巴瘤细胞系(Daudi)上表达的CD19的结合。简言之,将Daudi细胞与6.25μg、1.56μg或0μg由SGV或DGV生产形式产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN异二聚体蛋白或6.25μg用作阴性对照的人IgG一起孵育。使用流式细胞术检测结合。如图17所示,从SGV或DGV产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白能够结合Daudi细胞上的CD19以及BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv参考物质。
这些结果表明使用两个单基因载体或双基因载体方法制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白在结合CD19方面具有同等活性。
为了评价使用两个单基因载体和双基因载体方法制造的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白对γδT细胞的活化,使用了体外测定。简而言之,将板用以下包被:(1)抗NKG2D抗体(克隆#149810)和IgG(阴性对照),(2)抗NKG2D抗体和BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白(参考物质),(3)抗NKG2D抗体和使用SGV形式制备的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白,和(4)抗NKG2D抗体和使用DGV形式制备的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白。将1×105个人γδT细胞添加到板中以被板结合的剂刺激并在10%FBS+100U/mL重组人IL-2(rhIL-2)中在存在蛋白转运至高尔基复合体的抑制剂的情况下,在37℃下孵育4小时。4小时后,收获γδT细胞并用抗CD107a(活化的γδT细胞的脱颗粒标志物)染色,并通过流式细胞术进行分析。通过流式细胞术确定表达CD107a的Vγ9+T细胞的频率。如图18所示,BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白的每种制备物与抗NKG2D抗体的组合都能够刺激γδT细胞,如CD107a的表达所证明的。另一方面,IgG和抗NKG2D抗体的组合产生背景水平的活化(图18)。
这些结果表明,由SGV或DGV生产形式生产的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白在使γδT细胞脱粒的能力方面表现相似。
总的来说,这些结果表明异二聚体GADLEN蛋白可以使用单独表达α链和β链的两个单基因载体(SGV)的共转染(图10A)以及使用在单个载体中两个独立启动子下表达α和β链的双基因载体(DGV)的转染(图10B)来生产。
实施例10:每条链上均具有BTN2A1和BTN3A1串联的BTN2A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白
不受理论的束缚,据信两个嗜乳脂蛋白的四聚体可能参与与Vγ9δ2TCR的相互作用。因此,构建了在每条链上均具有BTN2A1和BTN3A1串联的BTN2A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白。如图11所示,生成了新版本的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv融合蛋白,其中BTN2A1和BTN3A1的可变结构域串联在一起,并通过生成IgG4 Fc序列与CD19scFv序列融合。两条这样的链将同二聚化以形成用于Vγ9δ2TCR活化的BTN2A1和BTN3A1的功能性四聚体单元(图11)。
因此,评价了使用仅包含在单个多肽链中串联排列的BTN2A1和BTN3A1蛋白的可变(V)结构域的同二聚体GADLEN构建体的可行性。生成并纯化了包含IgG1或IgG4来源的Fc接头的三种不同GADLEN构建体。对纯化的蛋白在非还原(在未添加还原剂的情况下变性)、还原(在存在β-巯基乙醇的情况下变性)条件下通过蛋白质印迹进行分析,并通过SDS-PAGE进行解析。用抗人BTN2A1抗体和抗人BTN3A1抗体探测印迹。通过使用红外(IR)二抗检测结合BTN2A1和BTN3A1的抗体来同时检测BTN2A1和BTN3A1,所述红外(IR)二抗使用两种IR染料进行荧光缀合,在图12A-12B中以蓝色(BTN2A1)或绿色(BTN3A1)表示。如图12A和图12B所示,结合BTN2A1和BTN3A1的抗体鉴定出相同的条带。非还原条件产生的条带与还原条件下看到的单体二聚体一致。
这些结果表明二硫键连接的二聚体蛋白的存在,该二聚体蛋白还原为单个单体(在用β-巯基乙醇破坏链间二硫键后)。此外,来自IgG1和两个版本IgG4的每一个Fc都显示出相似的曲线。
接下来,检查了BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv GADLEN同二聚体蛋白与两个配体的同时结合。使用基于MSD的ELISA方法来评估含有BTN2A1和BTN3A1的可变结构域的同二聚体GADLEN构建体是否能够结合重组CD19。简而言之,将板用重组CD19蛋白包被,并将渐增量的所示BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv GADLEN同二聚体蛋白添加至板,以供板结合的CD19蛋白捕获。使用抗BTN3A1抗体,然后使用硫标记的抗兔二抗检测结合。使用不能结合这两种蛋白的蛋白作为阴性对照。如图13所示,每种BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv GADLEN同二聚体蛋白都显示出剂量依赖性信号。另一方面,阴性对照仅显示背景信号。
这些结果证明了含有BTN2A1和BTN3A1的可变结构域的GADLEN构建体能够结合重组CD19蛋白并同时结合BTN3A1配体。
使用体外测定来研究BTN2A1V/3A1V-Fc-CD19scFv同二聚体蛋白对γδT细胞的活化。简而言之,将板用以下进行包被:(1)抗NKG2D抗体(克隆#149810)和IgG,(2)抗NKG2D抗体和BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白,(3)抗NKG2D抗体和BTN2A1V/3A1V-IgG1-CD19scFv同二聚体蛋白,以及(4)抗NKG2D抗体和BTN2A1V/3A1V-IgG1-CD19scFv同二聚体蛋白。使用IgG与抗NKG2D抗体的组合作为阴性对照。将1×105个人γδT细胞添加到板中供板结合的剂刺激并在10%FBS+100U/mL重组人IL-2(rhIL-2)中在蛋白转运至高尔基复合体的抑制剂的存在下在37℃下孵育4小时。4小时后,收获γδT细胞并用抗CD107a(活化的γδT细胞的脱颗粒标志物)染色,并通过流式细胞术进行分析。表达CD107a的Vγ9+T细胞的频率通过流式细胞术测定。如图14A所示,当用BTN2A1V/3A1V-IgG1-CD19scFv或BTN2A1V/3A1V-IgG1-CD19scFv同二聚体蛋白与抗NKG2D抗体的组合刺激时,约10%γδT细胞表现出CD107a的表达。这种活化水平高于在这一体外测定中由IgG和抗NKG2D抗体的组合产生的背景活化(图14B),但低于由BTN2A1/3A1-IgG1-CD19scFv异二聚体蛋白产生的活化程度(图14B)。
这些结果表明BTN2A1V/3A1V-IgG1-CD19scFv和BTN2A1V/3A1V-IgG1-CD19scFv同二聚体蛋白都能够活化γδT细胞。
实施例11:比较具有带电荷的极化接头和杵臼(KIH)突变的BTN2A1-Fc-CD19scFv异二聚体GADLEN蛋白促进异二聚化并且不利于同二聚化
生成了三个版本的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白以比较促进异二聚化的带电荷的极化接头策略与杵臼(KIH)突变:带电荷的极化接头(图19,左图)、Fc结构域中的KIH突变,以及Fc结构域中的KIH突变和FcRn突变(均为图19,右图)。不受理论的束缚,认为具有KIH突变和FcRn突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白增加了与新生儿Fc受体的结合。带电荷的极化接头(CPL)和Fc结构域中的KIH突变被设计用于通过促进α链和β链之间的缔合来促进异二聚化并且不利于同二聚化。KIH已成功用于生成双特异性抗体。参见,例如,Eldesouki等人,Identification and Targeting of Thomsen-Friedenreich andIL1RAP Antigens on Chronic MyeloidLeukemia Stem Cells Using Bi-SpecificAntibodies,Onco Targets Ther 14:609-621(2021)。
构建了具有带电荷的极化接头或杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白。通过转染表达BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv构建体的α和β链的载体生成微型池,所述构建体在个体α和β链中并入带电荷的极化接头(CPL)和KIH突变。通过使用重组CD19蛋白捕获异二聚体蛋白并使用BTN2A1或BTN3A1特异性抗体进行检测的ELISA方法对每个微型库中每个链(BTN2A1-α-CD19scFv和BTN3A1-β-CD19scFv)的表达水平进行定量。对微型池的培养物上清液中BTN2A1-α和BTN3A1-β链的量进行定量。如图20所示,使用CPL方法生成的微型池在培养物上清液中产生了等量的BTN2A1-α和BTN3A1-β链。另一方面,令人惊讶的是,KIH微型池在培养物上清液中产生较少量的BTN2A1-α链和极少量的BTN3A1-β链。
通过蛋白质印迹对具有带电荷的极化接头或杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白也进行了分析。简而言之,在不存在还原剂(非还原条件)、存在β-巯基乙醇(还原条件)或同时存在β-巯基乙醇和去糖基化剂(还原-去糖基化条件)的情况下对纯化的蛋白进行变性,并通过蛋白质印迹分析进行分析。用抗人BTN2A1抗体和抗人BTN3A1抗体来检测BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白。如图21A所示,具有带电荷的极化接头策略的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白中抗BTN2A1抗体和抗BTN3A1抗体识别的蛋白条带显示相似的含BTN3A1链和含BTN2A1链的水平。
另一方面,使用Fc结构域中的KIH突变(图21B)以及KIH突变和FcRn突变(图21C)产生的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv GADLEN蛋白显示较少的含BTN3A1链的表达以及增加的含BTN2A1链。这些数据与ELISA数据(图21A)和qPCR数据(图10C、图10D和图10E)一致。这表明电荷极化接头策略在异二聚体GADLEN蛋白的形成中优于KIH。
还通过体外测定对具有带电荷的极化接头或杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFvGADLEN蛋白分析了γδT细胞的刺激作用。简言之,将板用(1)抗NKG2D抗体(克隆#149810)和IgG(阴性对照),(2)抗NKG2D抗体和具有杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白,(3)抗NKG2D抗体和具有杵臼(KIH)和FcRn突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白,和(4)抗NKG2D抗体和具有带电荷的极化接头的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白包被。将1×105个人γδT细胞添加到板中以供板结合的剂刺激并在10%FBS+100U/mL重组人IL-2(rhIL-2)中在蛋白质转运到高尔基复合体的抑制剂的存在下在37℃孵育4小时。4小时后,收获γδT细胞并用抗TNFα、抗IFNγ或抗CD107a(活化的γδT细胞的脱颗粒标志物)染色,并通过流式细胞术进行分析。通过流式细胞术测定表达细胞毒性细胞因子TNFα、IFNγ或脱颗粒标志物CD107a的Vγ9+T细胞的频率。如图22A所示,具有带或不带FcRn突变的杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白诱导较少的γδT细胞表达TNFα。类似地,具有带或不带FcRn突变的杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白诱导较少的γδT细胞表达IFNγ(图22B)。类似地,具有带或不带FcRn突变的杵臼(KIH)突变的BTN2A1/3A1-Fc-CD19scFv异二聚体蛋白诱导较少的γδT细胞表达CD107a(图22C)。
总的来说,这些结果表明使用电荷极化接头更适合异二聚体形成以产生GADLEN。这些数据是令人惊讶的,尤其是因为杵臼Fc技术在设计具有工程化不对称CH3结构域的双特异性抗体方面取得了巨大进步,但它似乎不适用于异二聚体GADLEN蛋白。
通过引用并入
本文引用的所有专利和出版物据此通过引用整体并入本文。
本文所讨论的出版物仅为其在本申请的申请日之前的公开而提供。本文中的任何内容都不应被解释为承认本技术无权凭借先前的发明先于这种公开。
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等同方案
虽然已经结合本发明的具体实施方案公开了本发明,但是应当理解,本发明能够进一步修改,并且本申请旨在覆盖本发明的任何变化、使用或修改,所述变化、使用或修改通常遵循本发明的原理,并且包括在本发明所属领域的已知或习惯实践内的对本公开的偏离,并且可以应用于上文阐述的并且在所附权利要求的范围内的基本特征。
所属领域技术人员将认识到或能够仅使用常规实验来确定本文具体公开的具体实施方案的许多等效方案。此类等效方案旨在包含在以下权利要求的范围内。
序列表
<110> 沙塔克实验室有限公司(Shattuck Labs Inc.)
<120> 包含嗜乳脂蛋白的同二聚体和异二聚体蛋白
<130> SHK-033PC/116981-5033
<150> US 63/105,744
<151> 2020-10-26
<160> 126
<170> PatentIn version 3.5
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<222> (10)..(10)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<400> 3
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10
<210> 4
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(1)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (2)..(2)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> 带负电荷氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (4)..(4)
<223> 带负电荷氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (6)..(6)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> 带负电荷氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (8)..(8)
<223> 带负电荷氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (9)..(9)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (10)..(10)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<400> 4
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10
<210> 5
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (1)..(1)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (2)..(2)
<223> 带正电荷氨基酸如精氨酸、组氨酸或赖氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (4)..(4)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (5)..(5)
<223> 带正电荷氨基酸如精氨酸、组氨酸或赖氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (6)..(6)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<400> 5
Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa
1 5
<210> 6
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (1)..(1)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (2)..(2)
<223> 带负电荷氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (4)..(4)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (5)..(5)
<223> 带负电荷氨基酸如天冬氨酸或谷氨酸
<220>
<221> 重复(REPEAT)
<222> (6)..(6)
<223> 间隔氨基酸如丝氨酸或甘氨酸
<400> 6
Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa
1 5
<210> 7
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 7
Gly Ser Gly Ser Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser
1 5 10
<210> 8
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 8
Gly Ser Gly Ser Arg Lys Cys Gly Lys Arg Gly Ser
1 5 10
<210> 9
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 9
Gly Ser Gly Ser Asp Glu Gly Gly Glu Asp Gly Ser
1 5 10
<210> 10
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 10
Gly Ser Gly Ser Asp Glu Cys Gly Glu Asp Gly Ser
1 5 10
<210> 11
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 11
Arg Lys Gly Gly Lys Arg
1 5
<210> 12
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 12
Gly Ser Gly Ser Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser
1 5 10
<210> 13
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 13
Asp Glu Gly Gly Glu Asp
1 5
<210> 14
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 14
Gly Ser Gly Ser Asp Glu Gly Gly Glu Asp Gly Ser
1 5 10
<210> 15
<211> 234
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 15
Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu
1 5 10 15
Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu
20 25 30
Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser
35 40 45
Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu
50 55 60
Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr
65 70 75 80
Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser
85 90 95
Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser
100 105 110
Ile Glu Lys Thr Ile Ser Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln
115 120 125
Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val
130 135 140
Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val
145 150 155 160
Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro
165 170 175
Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr
180 185 190
Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val
195 200 205
Leu His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu
210 215 220
Ser Leu Gly Lys Ile Glu Gly Arg Met Asp
225 230
<210> 16
<211> 249
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 16
Gly Ser Gly Ser Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser Lys Tyr Gly Pro
1 5 10 15
Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val
20 25 30
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu Met Ile Ser Arg Thr
35 40 45
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu
50 55 60
Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
65 70 75 80
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
85 90 95
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser Gly Lys Glu Tyr Lys
100 105 110
Cys Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile
115 120 125
Ser Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
130 135 140
Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
145 150 155 160
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
165 170 175
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
180 185 190
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
195 200 205
Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu
210 215 220
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys Asp
225 230 235 240
Glu Gly Gly Glu Asp Gly Ser Gly Ser
245
<210> 17
<211> 249
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 17
Gly Ser Gly Ser Asp Glu Gly Gly Glu Asp Gly Ser Lys Tyr Gly Pro
1 5 10 15
Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val
20 25 30
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu Met Ile Ser Arg Thr
35 40 45
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu
50 55 60
Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
65 70 75 80
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
85 90 95
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser Gly Lys Glu Tyr Lys
100 105 110
Cys Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile
115 120 125
Ser Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
130 135 140
Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
145 150 155 160
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
165 170 175
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
180 185 190
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
195 200 205
Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu
210 215 220
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys Arg
225 230 235 240
Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser Gly Ser
245
<210> 18
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 18
Met Glu Phe Gly Leu Ser Trp Val Phe Leu Val Ala Ile Ile Lys Gly
1 5 10 15
Val Gln Cys
<210> 19
<211> 225
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 19
Gln Phe Ser Val Leu Gly Pro Ser Gly Pro Ile Leu Ala Met Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Asp Leu Pro Cys His Leu Phe Pro Thr Met Ser Ala Glu
20 25 30
Thr Met Glu Leu Lys Trp Val Ser Ser Ser Leu Arg Gln Val Val Asn
35 40 45
Val Tyr Ala Asp Gly Lys Glu Val Glu Asp Arg Gln Ser Ala Pro Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Ser Ile Leu Arg Asp Gly Ile Thr Ala Gly Lys Ala
65 70 75 80
Ala Leu Arg Ile His Asn Val Thr Ala Ser Asp Ser Gly Lys Tyr Leu
85 90 95
Cys Tyr Phe Gln Asp Gly Asp Phe Tyr Glu Lys Ala Leu Val Glu Leu
100 105 110
Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asp Leu His Val Asp Val Lys Gly Tyr
115 120 125
Lys Asp Gly Gly Ile His Leu Glu Cys Arg Ser Thr Gly Trp Tyr Pro
130 135 140
Gln Pro Gln Ile Gln Trp Ser Asn Asn Lys Gly Glu Asn Ile Pro Thr
145 150 155 160
Val Glu Ala Pro Val Val Ala Asp Gly Val Gly Leu Tyr Ala Val Ala
165 170 175
Ala Ser Val Ile Met Arg Gly Ser Ser Gly Glu Gly Val Ser Cys Thr
180 185 190
Ile Arg Ser Ser Leu Leu Gly Leu Glu Lys Thr Ala Ser Ile Ser Ile
195 200 205
Ala Asp Pro Phe Phe Arg Ser Ala Gln Arg Trp Ile Ala Ala Leu Ala
210 215 220
Gly
225
<210> 20
<211> 111
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 20
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Asp
20 25 30
Gly Asp Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Ile Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Val Ser Gly Ile Pro Pro
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His
65 70 75 80
Pro Val Glu Lys Val Asp Ala Ala Thr Tyr His Cys Gln Gln Ser Thr
85 90 95
Glu Asp Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 21
<211> 109
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 21
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Ala Ser Arg Phe Met Ile Ser Glu Tyr
20 25 30
His Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Thr Ile Asn Pro Ala Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Glu Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asp
85 90 95
Ser Tyr Gly Tyr Arg Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val
100 105
<210> 22
<211> 250
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 22
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Trp Met Asn Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Gln Ile Trp Pro Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Glu Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Ala Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Glu Thr Thr Thr Val Gly Arg Tyr Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly
115 120 125
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr
130 135 140
Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly Gln Arg Ala Thr Ile
145 150 155 160
Ser Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Asp Gly Asp Ser Tyr Leu
165 170 175
Asn Trp Tyr Gln Gln Ile Pro Gly Gln Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
180 185 190
Asp Ala Ser Asn Leu Val Ser Gly Ile Pro Pro Arg Phe Ser Gly Ser
195 200 205
Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His Pro Val Glu Lys Val
210 215 220
Asp Ala Ala Thr Tyr His Cys Gln Gln Ser Thr Glu Asp Pro Trp Thr
225 230 235 240
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
245 250
<210> 23
<211> 239
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 23
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Ser Gly
100 105 110
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro
115 120 125
Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser
130 135 140
Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro
145 150 155 160
Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr
165 170 175
Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn
180 185 190
Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp
195 200 205
Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr
210 215 220
Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
225 230 235
<210> 24
<211> 238
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 24
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Thr
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Val Ser Gly Asp Thr Ile Thr Phe Tyr
20 25 30
Tyr Met His Phe Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Arg Ile Asp Pro Glu Asp Glu Ser Thr Lys Tyr Ser Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Asn Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Lys Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
85 90 95
Ile Tyr Gly Gly Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Val Met Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125
Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Thr
130 135 140
Ser Leu Gly Glu Thr Val Thr Ile Gln Cys Gln Ala Ser Glu Asp Ile
145 150 155 160
Tyr Ser Gly Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Gln
165 170 175
Leu Leu Ile Tyr Gly Ala Ser Asp Leu Gln Asp Gly Val Pro Ser Arg
180 185 190
Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Gln Tyr Ser Leu Lys Ile Thr Ser
195 200 205
Met Gln Thr Glu Asp Glu Gly Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Leu Thr
210 215 220
Tyr Pro Arg Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
225 230 235
<210> 25
<211> 238
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 25
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Thr Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Thr Val Thr Ile Gln Cys Gln Ala Ser Glu Asp Ile Tyr Ser Gly
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Gln Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Asp Leu Gln Asp Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Gln Tyr Ser Leu Lys Ile Thr Ser Met Gln Thr
65 70 75 80
Glu Asp Glu Gly Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Leu Thr Tyr Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Gln Gln
115 120 125
Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Thr Ser Val Lys Leu Ser Cys
130 135 140
Lys Val Ser Gly Asp Thr Ile Thr Phe Tyr Tyr Met His Phe Val Lys
145 150 155 160
Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile Gly Arg Ile Asp Pro Glu
165 170 175
Asp Glu Ser Thr Lys Tyr Ser Glu Lys Phe Lys Asn Lys Ala Thr Leu
180 185 190
Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr Leu Lys Leu Ser Ser Leu
195 200 205
Thr Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys Ile Tyr Gly Gly Tyr Tyr
210 215 220
Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Val Met Val Thr Val Ser Ser
225 230 235
<210> 26
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 26
Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser Gly Ser Gly Gln Thr Val Val Thr
1 5 10 15
Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly Thr Val Thr Leu Thr
20 25 30
Cys Ala Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Ser Gly Asn Tyr Pro Asn Trp
35 40 45
Val Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Gly Leu Ile Gly Gly Thr
50 55 60
Lys Phe Leu Val Pro Gly Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Leu Leu
65 70 75 80
Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Leu Ser Gly Val Gln Pro Glu Asp Glu
85 90 95
Ala Glu Tyr Tyr Cys Thr Leu Trp Tyr Ser Asn Arg Trp Val Phe Gly
100 105 110
Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
115 120
<210> 27
<211> 166
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 27
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu
1 5 10 15
Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser Thr His Val Pro Pro Leu Thr Phe
20 25 30
Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
35 40 45
Ser Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Leu Gln Ser Gly Pro Glu Leu
50 55 60
Glu Lys Pro Gly Ala Ser Val Met Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Ser
65 70 75 80
Ser Phe Thr Gly Tyr Asn Met Asn Trp Val Arg Gln Asn Ile Gly Lys
85 90 95
Ser Leu Glu Trp Ile Gly Ala Ile Asp Pro Tyr Tyr Gly Gly Thr Ser
100 105 110
Tyr Asn Gln Lys Phe Lys Gly Arg Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser
115 120 125
Ser Ser Thr Ala Tyr Met His Leu Lys Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser
130 135 140
Ala Val Tyr Tyr Cys Val Ser Gly Met Lys Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
145 150 155 160
Ser Val Thr Val Ser Ser
165
<210> 28
<211> 222
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 28
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215 220
<210> 29
<211> 232
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 29
Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala
1 5 10 15
Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
35 40 45
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
50 55 60
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
65 70 75 80
Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
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Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala
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Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
115 120 125
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr
130 135 140
Lys Asn Gln Val Ser Leu Tyr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
145 150 155 160
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
165 170 175
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
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Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe
195 200 205
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
210 215 220
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
225 230
<210> 30
<211> 232
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 30
Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala
1 5 10 15
Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
35 40 45
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
50 55 60
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
65 70 75 80
Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
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Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala
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Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
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Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr
130 135 140
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
145 150 155 160
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
165 170 175
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Thr
180 185 190
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe
195 200 205
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
210 215 220
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 31
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Val Ser Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Val Leu Thr
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Asp Asp Pro Glu Val Gln Phe Ser Trp Phe Val Asp Asp Val Glu Val
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Ile Met Asp Thr Asp Gly Ser Tyr Phe Val Tyr Ser Lys Leu Asn Val
180 185 190
Gln Lys Ser Asn Trp Glu Ala Gly Asn Thr Phe Thr Cys Ser Val Leu
195 200 205
His Glu Gly Leu His Asn His His Thr Glu Lys Ser Leu Ser His Ser
210 215 220
Pro Gly Ile
225
<210> 32
<211> 222
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 32
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
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Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
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Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
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Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
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Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
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Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215 220
<210> 33
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 33
Met Glu Phe Gly Leu Ser Trp Val Phe Leu Val Ala Ile Ile Lys Gly
1 5 10 15
Val Gln Cys Gln Phe Ser Val Leu Gly Pro Ser Gly Pro Ile Leu Ala
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Met Val Gly Glu Asp Ala Asp Leu Pro Cys His Leu Phe Pro Thr Met
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Val Glu Leu Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asp Leu His Val Asp Val
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Lys Gly Tyr Lys Asp Gly Gly Ile His Leu Glu Cys Arg Ser Thr Gly
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Trp Tyr Pro Gln Pro Gln Ile Gln Trp Ser Asn Asn Lys Gly Glu Asn
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Ile Pro Thr Val Glu Ala Pro Val Val Ala Asp Gly Val Gly Leu Tyr
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195 200 205
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Ala Leu Ala Gly Gly Ser Gly Ser Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser
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Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
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Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val
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Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Leu
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His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
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Leu Gly Lys Asp Glu Gly Gly Glu Asp Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln
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Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe Lys Gly Lys Ala Thr
545 550 555 560
Leu Thr Ala Asp Glu Ser Ser Ser Thr Ala Tyr Met Gln Leu Ser Ser
565 570 575
Leu Ala Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys Ala Arg Arg Glu Thr
580 585 590
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595 600 605
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Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ser
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Leu Ala Val Ser Leu Gly Gln Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ala Ser
645 650 655
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660 665 670
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Val Ser Gly Ile Pro Pro Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
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Phe Thr Leu Asn Ile His Pro Val Glu Lys Val Asp Ala Ala Thr Tyr
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His Cys Gln Gln Ser Thr Glu Asp Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr
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Lys Leu Glu Ile Lys
740
<210> 34
<211> 730
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 34
Met Glu Phe Gly Leu Ser Trp Val Phe Leu Val Ala Ile Ile Lys Gly
1 5 10 15
Val Gln Cys Gln Phe Ser Val Leu Gly Pro Ser Gly Pro Ile Leu Ala
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Met Val Gly Glu Asp Ala Asp Leu Pro Cys His Leu Phe Pro Thr Met
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Ser Ala Glu Thr Met Glu Leu Lys Trp Val Ser Ser Ser Leu Arg Gln
50 55 60
Val Val Asn Val Tyr Ala Asp Gly Lys Glu Val Glu Asp Arg Gln Ser
65 70 75 80
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Lys Tyr Leu Cys Tyr Phe Gln Asp Gly Asp Phe Tyr Glu Lys Ala Leu
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Val Glu Leu Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asp Leu His Val Asp Val
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Lys Gly Tyr Lys Asp Gly Gly Ile His Leu Glu Cys Arg Ser Thr Gly
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Trp Tyr Pro Gln Pro Gln Ile Gln Trp Ser Asn Asn Lys Gly Glu Asn
165 170 175
Ile Pro Thr Val Glu Ala Pro Val Val Ala Asp Gly Val Gly Leu Tyr
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Ala Val Ala Ala Ser Val Ile Met Arg Gly Ser Ser Gly Glu Gly Val
195 200 205
Ser Cys Thr Ile Arg Ser Ser Leu Leu Gly Leu Glu Lys Thr Ala Ser
210 215 220
Ile Ser Ile Ala Asp Pro Phe Phe Arg Ser Ala Gln Arg Trp Ile Ala
225 230 235 240
Ala Leu Ala Gly Gly Ser Gly Ser Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser
245 250 255
Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly
260 265 270
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu Met
275 280 285
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln
290 295 300
Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
305 310 315 320
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr
325 330 335
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser Gly
340 345 350
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile
355 360 365
Glu Lys Thr Ile Ser Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
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Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
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Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val
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His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
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Leu Gly Lys Asp Glu Gly Gly Glu Asp Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr
485 490 495
Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile
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Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln
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Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg
530 535 540
Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr
545 550 555 560
Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr
565 570 575
Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly
580 585 590
Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly
595 600 605
Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro
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Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro
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Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu
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Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val
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Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp
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Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
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<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 35
Gln Phe Ile Val Val Gly Pro Thr Asp Pro Ile Leu Ala Thr Val Gly
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Glu Asn Thr Thr Leu Arg Cys His Leu Ser Pro Glu Lys Asn Ala Glu
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Pro Glu Ser Phe Met Pro Ser Val Ser Pro Cys Ala
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<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 36
Gln Phe Ile Val Val Gly Pro Thr Asp Pro Ile Leu Ala Thr Val Gly
1 5 10 15
Glu Asn Thr Thr Leu Arg Cys His Leu Ser Pro Glu Lys Asn Ala Glu
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Val Tyr Lys Gly Gly Arg Glu Arg Thr Glu Glu Gln Met Glu Glu Tyr
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210 215 220
<210> 37
<211> 725
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 37
Met Glu Phe Gly Leu Ser Trp Val Phe Leu Val Ala Ile Ile Lys Gly
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195 200 205
Ser Cys Ser Ile Asn Asn Thr Leu Leu Gly Gln Lys Lys Glu Ser Val
210 215 220
Ile Phe Ile Pro Glu Ser Phe Met Pro Ser Val Ser Pro Cys Ala Gly
225 230 235 240
Ser Gly Ser Arg Lys Gly Gly Lys Arg Gly Ser Lys Tyr Gly Pro Pro
245 250 255
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
260 265 270
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Gln Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
275 280 285
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val
290 295 300
Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
305 310 315 320
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
325 330 335
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Ser Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
340 345 350
Lys Val Ser Ser Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser
355 360 365
Asn Ala Thr Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
370 375 380
Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
385 390 395 400
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
405 410 415
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
420 425 430
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
435 440 445
Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His
450 455 460
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys Asp Glu
465 470 475 480
Gly Gly Glu Asp Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser
485 490 495
Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser
500 505 510
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515 520 525
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675 680 685
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725
<210> 38
<211> 716
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 38
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1 5 10 15
Val Gln Cys Gln Phe Ile Val Val Gly Pro Thr Asp Pro Ile Leu Ala
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Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Ala
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Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
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<223> 合成聚合物
<400> 44
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 47
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Thr Cys Thr Gly Gly Ala Gly Gly Ala Gly Gly Ala Thr Cys Thr
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Gly Ala Ala Gly Thr Thr Ala Ala Ala Cys Thr Gly Cys Ala Gly
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Gly Ala Ala Thr Cys Thr Gly Gly Ala Cys Cys Ala Gly Gly Ala
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Thr Thr Ala Gly Thr Gly Gly Cys Cys Cys Cys Ala Thr Cys Thr
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Gly Gly Ala Gly Thr Thr Thr Cys Thr Thr Thr Gly Cys Cys Thr
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Gly Ala Thr Thr Ala Cys Gly Gly Ala Gly Thr Gly Thr Cys Cys
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Gly Thr Gly Ala Cys Ala Gly Thr Gly Thr Cys Thr Thr Cys Thr
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 48
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
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<212> DNA
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
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<220>
<223> 合成聚合物
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<220>
<223> 合成聚合物
<400> 73
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
1 5
<210> 74
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 74
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
<210> 75
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 75
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
1 5 10
<210> 76
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 76
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
<210> 77
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 77
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
1 5 10 15
Ser
<210> 78
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 78
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10
<210> 79
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 79
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1 5 10 15
Gly Gly Gly Ser
20
<210> 80
<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 80
Gln Trp Gln Val Thr Gly Pro Gly Lys Phe Val Gln Ala Leu Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Val Phe Ser Cys Ser Leu Phe Pro Glu Thr Ser Ala Glu
20 25 30
Ala Met Glu Val Arg Phe Phe Arg Asn Gln Phe His Ala Val Val His
35 40 45
Leu Tyr Arg Asp Gly Glu Asp Trp Glu Ser Lys Gln Met Pro Gln Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Glu Phe Val Lys Asp Ser Ile Ala Gly Gly Arg Val
65 70 75 80
Ser Leu Arg Leu Lys Asn Ile Thr Pro Ser Asp Ile Gly Leu Tyr Gly
85 90 95
Cys Trp Phe Ser Ser Gln Ile Tyr Asp Glu Glu Ala Thr Trp Glu Leu
100 105 110
Arg Val Ala Ala Leu Gly Ser Leu Pro Leu Ile Ser Ile Val Gly Tyr
115 120 125
Val Asp Gly Gly Ile Gln Leu Leu Cys Leu Ser Ser Gly Trp Phe Pro
130 135 140
Gln Pro Thr Ala Lys Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Leu Ser Ser
145 150 155 160
Asp Ser Arg Ala Asn Ala Asp Gly Tyr Ser Leu Tyr Asp Val Glu Ile
165 170 175
Ser Ile Ile Val Gln Glu Asn Ala Gly Ser Ile Leu Cys Ser Ile His
180 185 190
Leu Ala Glu Gln Ser His Glu Val Glu Ser Lys Val Leu Ile Gly Glu
195 200 205
Thr Phe Phe Gln Pro Ser Pro Trp Arg Leu Ala Ser
210 215 220
<210> 81
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 81
Gln Phe Ser Val Leu Gly Pro Ser Gly Pro Ile Leu Ala Met Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Asp Leu Pro Cys His Leu Phe Pro Thr Met Ser Ala Glu
20 25 30
Thr Met Glu Leu Lys Trp Val Ser Ser Ser Leu Arg Gln Val Val Asn
35 40 45
Val Tyr Ala Asp Gly Lys Glu Val Glu Asp Arg Gln Ser Ala Pro Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Ser Ile Leu Arg Asp Gly Ile Thr Ala Gly Lys Ala
65 70 75 80
Ala Leu Arg Ile His Asn Val Thr Ala Ser Asp Ser Gly Lys Tyr Leu
85 90 95
Cys Tyr Phe Gln Asp Gly Asp Phe Tyr Glu Lys Ala Leu Val Glu Leu
100 105 110
Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asn Leu His Val Glu Val Lys Gly Tyr
115 120 125
Glu Asp Gly Gly Ile His Leu Glu Cys Arg Ser Thr Gly Trp Tyr Pro
130 135 140
Gln Pro Gln Ile Gln Trp Ser Asn Ala Lys Gly Glu Asn Ile Pro Ala
145 150 155 160
Val Glu Ala Pro Val Val Ala Asp Gly Val Gly Leu Tyr Glu Val Ala
165 170 175
Ala Ser Val Ile Met Arg Gly Gly Ser Gly Glu Gly Val Ser Cys Ile
180 185 190
Ile Arg Asn Ser Leu Leu Gly Leu Glu Lys Thr Ala Ser Ile Ser Ile
195 200 205
Ala Asp Pro Phe Phe Arg Ser Ala Gln Pro Trp
210 215
<210> 82
<211> 221
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 82
Gln Trp Gln Val Phe Gly Pro Asp Lys Pro Val Gln Ala Leu Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Ala Phe Ser Cys Phe Leu Ser Pro Lys Thr Asn Ala Glu
20 25 30
Ala Met Glu Val Arg Phe Phe Arg Gly Gln Phe Ser Ser Val Val His
35 40 45
Leu Tyr Arg Asp Gly Lys Asp Gln Pro Phe Met Gln Met Pro Gln Tyr
50 55 60
Gln Gly Arg Thr Lys Leu Val Lys Asp Ser Ile Ala Glu Gly Arg Ile
65 70 75 80
Ser Leu Arg Leu Glu Asn Ile Thr Val Leu Asp Ala Gly Leu Tyr Gly
85 90 95
Cys Arg Ile Ser Ser Gln Ser Tyr Tyr Gln Lys Ala Ile Trp Glu Leu
100 105 110
Gln Val Ser Ala Leu Gly Ser Val Pro Leu Ile Ser Ile Thr Gly Tyr
115 120 125
Val Asp Arg Asp Ile Gln Leu Leu Cys Gln Ser Ser Gly Trp Phe Pro
130 135 140
Arg Pro Thr Ala Lys Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Leu Ser Thr
145 150 155 160
Asp Ser Arg Thr Asn Arg Asp Met His Gly Leu Phe Asp Val Glu Ile
165 170 175
Ser Leu Thr Val Gln Glu Asn Ala Gly Ser Ile Ser Cys Ser Met Arg
180 185 190
His Ala His Leu Ser Arg Glu Val Glu Ser Arg Val Gln Ile Gly Asp
195 200 205
Thr Phe Phe Glu Pro Ile Ser Trp His Leu Ala Thr Lys
210 215 220
<210> 83
<211> 216
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 83
Ala Pro Phe Asp Val Ile Gly Pro Pro Glu Pro Ile Leu Ala Val Val
1 5 10 15
Gly Glu Asp Ala Glu Leu Pro Cys Arg Leu Ser Pro Asn Ala Ser Ala
20 25 30
Glu His Leu Glu Leu Arg Trp Phe Arg Lys Lys Val Ser Pro Ala Val
35 40 45
Leu Val His Arg Asp Gly Arg Glu Gln Glu Ala Glu Gln Met Pro Glu
50 55 60
Tyr Arg Gly Arg Ala Thr Leu Val Gln Asp Gly Ile Ala Lys Gly Arg
65 70 75 80
Val Ala Leu Arg Ile Arg Gly Val Arg Val Ser Asp Asp Gly Glu Tyr
85 90 95
Thr Cys Phe Phe Arg Glu Asp Gly Ser Tyr Glu Glu Ala Leu Val His
100 105 110
Leu Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asp Pro His Ile Ser Met Gln Val
115 120 125
Gln Glu Asn Gly Glu Ile Cys Leu Glu Cys Thr Ser Val Gly Trp Tyr
130 135 140
Pro Glu Pro Gln Val Gln Trp Arg Thr Ser Lys Gly Glu Lys Phe Pro
145 150 155 160
Ser Thr Ser Glu Ser Arg Asn Pro Asp Glu Glu Gly Leu Phe Thr Val
165 170 175
Ala Ala Ser Val Ile Ile Arg Asp Thr Ser Ala Lys Asn Val Ser Cys
180 185 190
Tyr Ile Gln Asn Leu Leu Leu Gly Gln Glu Lys Lys Val Glu Ile Ser
195 200 205
Ile Pro Ala Ser Ser Leu Pro Arg
210 215
<210> 84
<211> 215
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 84
Ala Pro Phe Asp Val Ile Gly Pro Pro Glu Pro Ile Leu Ala Val Val
1 5 10 15
Gly Glu Asp Ala Glu Leu Pro Cys Arg Leu Ser Pro Asn Ala Ser Ala
20 25 30
Glu His Leu Glu Leu Arg Trp Phe Arg Lys Lys Val Ser Pro Ala Val
35 40 45
Leu Val His Arg Asp Gly Arg Glu Gln Glu Ala Glu Gln Met Pro Glu
50 55 60
Tyr Arg Gly Arg Ala Thr Leu Val Gln Asp Gly Ile Ala Lys Gly Arg
65 70 75 80
Val Ala Leu Arg Ile Arg Gly Val Arg Val Ser Asp Asp Gly Glu Tyr
85 90 95
Thr Cys Phe Phe Arg Glu Asp Gly Ser Tyr Glu Glu Ala Leu Val His
100 105 110
Leu Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asp Pro His Ile Ser Met Gln Val
115 120 125
Gln Glu Asn Gly Glu Ile Cys Leu Glu Cys Thr Ser Val Gly Trp Tyr
130 135 140
Pro Glu Pro Gln Val Gln Trp Arg Thr Ser Lys Gly Glu Lys Phe Pro
145 150 155 160
Ser Thr Ser Glu Ser Arg Asn Pro Asp Glu Glu Gly Leu Phe Thr Val
165 170 175
Ala Ala Ser Val Ile Ile Arg Asp Thr Ser Ala Lys Asn Val Ser Cys
180 185 190
Tyr Ile Gln Asn Leu Leu Leu Gly Gln Glu Lys Lys Val Glu Ile Ser
195 200 205
Ile Pro Ala Ser Ser Leu Pro
210 215
<210> 85
<211> 432
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 85
Lys Gln Ser Glu Asp Phe Arg Val Ile Gly Pro Ala His Pro Ile Leu
1 5 10 15
Ala Gly Val Gly Glu Asp Ala Leu Leu Thr Cys Gln Leu Leu Pro Lys
20 25 30
Arg Thr Thr Met His Val Glu Val Arg Trp Tyr Arg Ser Glu Pro Ser
35 40 45
Thr Pro Val Phe Val His Arg Asp Gly Val Glu Val Thr Glu Met Gln
50 55 60
Met Glu Glu Tyr Arg Gly Trp Val Glu Trp Ile Glu Asn Gly Ile Ala
65 70 75 80
Lys Gly Asn Val Ala Leu Lys Ile His Asn Ile Gln Pro Ser Asp Asn
85 90 95
Gly Gln Tyr Trp Cys His Phe Gln Asp Gly Asn Tyr Cys Gly Glu Thr
100 105 110
Ser Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Leu Gly Ser Ala Pro Ser Ile His
115 120 125
Met Glu Gly Pro Gly Glu Ser Gly Val Gln Leu Val Cys Thr Ala Arg
130 135 140
Gly Trp Phe Pro Glu Pro Gln Val Tyr Trp Glu Asp Ile Arg Gly Glu
145 150 155 160
Lys Leu Leu Ala Val Ser Glu His Arg Ile Gln Asp Lys Asp Gly Leu
165 170 175
Phe Tyr Ala Glu Ala Thr Leu Val Val Arg Asn Ala Ser Ala Glu Ser
180 185 190
Val Ser Cys Leu Val His Asn Pro Val Leu Thr Glu Glu Lys Gly Ser
195 200 205
Val Ile Ser Leu Pro Glu Lys Leu Gln Thr Glu Leu Ala Ser Leu Lys
210 215 220
Val Asn Gly Pro Ser Gln Pro Ile Leu Val Arg Val Gly Glu Asp Ile
225 230 235 240
Gln Leu Thr Cys Tyr Leu Ser Pro Lys Ala Asn Ala Gln Ser Met Glu
245 250 255
Val Arg Trp Asp Arg Ser His Arg Tyr Pro Ala Val His Val Tyr Met
260 265 270
Asp Gly Asp His Val Ala Gly Glu Gln Met Ala Glu Tyr Arg Gly Arg
275 280 285
Thr Val Leu Val Ser Asp Ala Ile Asp Glu Gly Arg Leu Thr Leu Gln
290 295 300
Ile Leu Ser Ala Arg Pro Ser Asp Asp Gly Gln Tyr Arg Cys Leu Phe
305 310 315 320
Glu Lys Asp Asp Val Tyr Gln Glu Ala Ser Leu Asp Leu Lys Val Val
325 330 335
Ser Leu Gly Ser Ser Pro Leu Ile Thr Val Glu Gly Gln Glu Asp Gly
340 345 350
Glu Met Gln Pro Met Cys Ser Ser Asp Gly Trp Phe Pro Gln Pro His
355 360 365
Val Pro Trp Arg Asp Met Glu Gly Lys Thr Ile Pro Ser Ser Ser Gln
370 375 380
Ala Leu Thr Gln Gly Ser His Gly Leu Phe His Val Gln Thr Leu Leu
385 390 395 400
Arg Val Thr Asn Ile Ser Ala Val Asp Val Thr Cys Ser Ile Ser Ile
405 410 415
Pro Phe Leu Gly Glu Glu Lys Ile Ala Thr Phe Ser Leu Ser Gly Trp
420 425 430
<210> 86
<211> 233
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 86
Gln Phe Thr Val Val Gly Pro Ala Asn Pro Ile Leu Ala Met Val Gly
1 5 10 15
Glu Asn Thr Thr Leu Arg Cys His Leu Ser Pro Glu Lys Asn Ala Glu
20 25 30
Asp Met Glu Val Arg Trp Phe Arg Ser Gln Phe Ser Pro Ala Val Phe
35 40 45
Val Tyr Lys Gly Gly Arg Glu Arg Thr Glu Glu Gln Met Glu Glu Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Ile Thr Phe Val Ser Lys Asp Ile Asn Arg Gly Ser Val
65 70 75 80
Ala Leu Val Ile His Asn Val Thr Ala Gln Glu Asn Gly Ile Tyr Arg
85 90 95
Cys Tyr Phe Gln Glu Gly Arg Ser Tyr Asp Glu Ala Ile Leu Arg Leu
100 105 110
Val Val Ala Gly Leu Gly Ser Lys Pro Leu Ile Glu Ile Lys Ala Gln
115 120 125
Glu Asp Gly Ser Ile Trp Leu Glu Cys Ile Ser Gly Gly Trp Tyr Pro
130 135 140
Glu Pro Leu Thr Val Trp Arg Asp Pro Tyr Gly Glu Val Val Pro Ala
145 150 155 160
Leu Lys Glu Val Ser Ile Ala Asp Ala Asp Gly Leu Phe Met Val Thr
165 170 175
Thr Ala Val Ile Ile Arg Asp Lys Tyr Val Arg Asn Val Ser Cys Ser
180 185 190
Val Asn Asn Thr Leu Leu Gly Gln Glu Lys Glu Thr Val Ile Phe Ile
195 200 205
Pro Glu Ser Phe Met Pro Ser Ala Ser Pro Trp Met Val Ala Leu Ala
210 215 220
Val Ile Leu Thr Ala Ser Pro Trp Met
225 230
<210> 87
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 87
Gln Val Thr Val Val Gly Pro Thr Asp Pro Ile Leu Ala Met Val Gly
1 5 10 15
Glu Asn Thr Thr Leu Arg Cys Cys Leu Ser Pro Glu Glu Asn Ala Glu
20 25 30
Asp Met Glu Val Arg Trp Phe Gln Ser Gln Phe Ser Pro Ala Val Phe
35 40 45
Val Tyr Lys Gly Gly Arg Glu Arg Thr Glu Glu Gln Lys Glu Glu Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Thr Phe Val Ser Lys Asp Ser Arg Gly Ser Val Ala
65 70 75 80
Leu Ile Ile His Asn Val Thr Ala Glu Asp Asn Gly Ile Tyr Gln Cys
85 90 95
Tyr Phe Gln Glu Gly Arg Ser Cys Asn Glu Ala Ile Leu His Leu Val
100 105 110
Val Ala Gly Leu Asp Ser Glu Pro Val Ile Glu Met Arg Asp His Glu
115 120 125
Asp Gly Gly Ile Gln Leu Glu Cys Ile Ser Gly Gly Trp Tyr Pro Lys
130 135 140
Pro Leu Thr Val Trp Arg Asp Pro Tyr Gly Glu Val Val Pro Ala Leu
145 150 155 160
Lys Glu Val Ser Thr Pro Asp Ala Asp Ser Leu Phe Met Val Thr Thr
165 170 175
Ala Val Ile Ile Arg Asp Lys Ser Val Arg Asn Val Ser Cys Ser Ile
180 185 190
Asn Asp Thr Leu Leu Gly Gln Lys Lys Glu Ser Val Ile Phe Ile Pro
195 200 205
Glu Ser Phe Met Pro Ser Arg Ser Pro Cys Val
210 215
<210> 88
<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 88
Gln Trp Gln Val Thr Gly Pro Gly Lys Phe Val Gln Ala Leu Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Val Phe Ser Cys Ser Leu Phe Pro Glu Thr Ser Ala Glu
20 25 30
Ala Met Glu Val Arg Phe Phe Arg Asn Gln Phe His Ala Val Val His
35 40 45
Leu Tyr Arg Asp Gly Glu Asp Trp Glu Ser Lys Gln Met Pro Gln Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Glu Phe Val Lys Asp Ser Ile Ala Gly Gly Arg Val
65 70 75 80
Ser Leu Arg Leu Lys Asn Ile Thr Pro Ser Asp Ile Gly Leu Tyr Gly
85 90 95
Cys Trp Phe Ser Ser Gln Ile Tyr Asp Glu Glu Ala Thr Trp Glu Leu
100 105 110
Arg Val Ala Ala Leu Gly Ser Leu Pro Leu Ile Ser Ile Val Gly Tyr
115 120 125
Val Asp Gly Gly Ile Gln Leu Leu Cys Leu Ser Ser Gly Trp Phe Pro
130 135 140
Gln Pro Thr Ala Lys Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Leu Ser Ser
145 150 155 160
Asp Ser Arg Ala Asn Ala Asp Gly Tyr Ser Leu Tyr Asp Val Glu Ile
165 170 175
Ser Ile Ile Val Gln Glu Asn Ala Gly Ser Ile Leu Cys Ser Ile His
180 185 190
Leu Ala Glu Gln Ser His Glu Val Glu Ser Lys Val Leu Ile Gly Glu
195 200 205
Thr Phe Phe Gln Pro Ser Pro Trp Arg Leu Ala Ser
210 215 220
<210> 89
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 89
Gln Phe Ser Val Leu Gly Pro Ser Gly Pro Ile Leu Ala Met Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Asp Leu Pro Cys His Leu Phe Pro Thr Met Ser Ala Glu
20 25 30
Thr Met Glu Leu Lys Trp Val Ser Ser Ser Leu Arg Gln Val Val Asn
35 40 45
Val Tyr Ala Asp Gly Lys Glu Val Glu Asp Arg Gln Ser Ala Pro Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Ser Ile Leu Arg Asp Gly Ile Thr Ala Gly Lys Ala
65 70 75 80
Ala Leu Arg Ile His Asn Val Thr Ala Ser Asp Ser Gly Lys Tyr Leu
85 90 95
Cys Tyr Phe Gln Asp Gly Asp Phe Tyr Glu Lys Ala Leu Val Glu Leu
100 105 110
Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asn Leu His Val Glu Val Lys Gly Tyr
115 120 125
Glu Asp Gly Gly Ile His Leu Glu Cys Arg Ser Thr Gly Trp Tyr Pro
130 135 140
Gln Pro Gln Ile Gln Trp Ser Asn Ala Lys Gly Glu Asn Ile Pro Ala
145 150 155 160
Val Glu Ala Pro Val Val Ala Asp Gly Val Gly Leu Tyr Glu Val Ala
165 170 175
Ala Ser Val Ile Met Arg Gly Gly Ser Gly Glu Gly Val Ser Cys Ile
180 185 190
Ile Arg Asn Ser Leu Leu Gly Leu Glu Lys Thr Ala Ser Ile Ser Ile
195 200 205
Ala Asp Pro Phe Phe Arg Ser Ala Gln Pro Trp
210 215
<210> 90
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 90
Gln Phe Ser Val Leu Gly Pro Ser Gly Pro Ile Leu Ala Met Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Asp Leu Pro Cys His Leu Phe Pro Thr Met Ser Ala Glu
20 25 30
Thr Met Glu Leu Arg Trp Val Ser Ser Ser Leu Arg Gln Val Val Asn
35 40 45
Val Tyr Ala Asp Gly Lys Glu Val Glu Asp Arg Gln Ser Ala Pro Tyr
50 55 60
Arg Gly Arg Thr Ser Ile Leu Arg Asp Gly Ile Thr Ala Gly Lys Ala
65 70 75 80
Ala Leu Arg Ile His Asn Val Thr Ala Ser Asp Ser Gly Lys Tyr Leu
85 90 95
Cys Tyr Phe Gln Asp Gly Asp Phe Tyr Glu Lys Ala Leu Val Glu Leu
100 105 110
Lys Val Ala Ala Leu Gly Ser Asp Leu His Ile Glu Val Lys Gly Tyr
115 120 125
Glu Asp Gly Gly Ile His Leu Glu Cys Arg Ser Thr Gly Trp Tyr Pro
130 135 140
Gln Pro Gln Ile Lys Trp Ser Asp Thr Lys Gly Glu Asn Ile Pro Ala
145 150 155 160
Val Glu Ala Pro Val Val Ala Asp Gly Val Gly Leu Tyr Ala Val Ala
165 170 175
Ala Ser Val Ile Met Arg Gly Ser Ser Gly Gly Gly Val Ser Cys Ile
180 185 190
Ile Arg Asn Ser Leu Leu Gly Leu Glu Lys Thr Ala Ser Ile Ser Ile
195 200 205
Ala Asp Pro Phe Phe Arg Ser Ala Gln Pro Trp
210 215
<210> 91
<211> 221
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 91
Gln Trp Gln Val Phe Gly Pro Asp Lys Pro Val Gln Ala Leu Val Gly
1 5 10 15
Glu Asp Ala Ala Phe Ser Cys Phe Leu Ser Pro Lys Thr Asn Ala Glu
20 25 30
Ala Met Glu Val Arg Phe Phe Arg Gly Gln Phe Ser Ser Val Val His
35 40 45
Leu Tyr Arg Asp Gly Lys Asp Gln Pro Phe Met Gln Met Pro Gln Tyr
50 55 60
Gln Gly Arg Thr Lys Leu Val Lys Asp Ser Ile Ala Glu Gly Arg Ile
65 70 75 80
Ser Leu Arg Leu Glu Asn Ile Thr Val Leu Asp Ala Gly Leu Tyr Gly
85 90 95
Cys Arg Ile Ser Ser Gln Ser Tyr Tyr Gln Lys Ala Ile Trp Glu Leu
100 105 110
Gln Val Ser Ala Leu Gly Ser Val Pro Leu Ile Ser Ile Thr Gly Tyr
115 120 125
Val Asp Arg Asp Ile Gln Leu Leu Cys Gln Ser Ser Gly Trp Phe Pro
130 135 140
Arg Pro Thr Ala Lys Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Leu Ser Thr
145 150 155 160
Asp Ser Arg Thr Asn Arg Asp Met His Gly Leu Phe Asp Val Glu Ile
165 170 175
Ser Leu Thr Val Gln Glu Asn Ala Gly Ser Ile Ser Cys Ser Met Arg
180 185 190
His Ala His Leu Ser Arg Glu Val Glu Ser Arg Val Gln Ile Gly Asp
195 200 205
Thr Phe Phe Glu Pro Ile Ser Trp His Leu Ala Thr Lys
210 215 220
<210> 92
<211> 222
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 92
Ser Ser Glu Val Lys Val Leu Gly Pro Glu Tyr Pro Ile Leu Ala Leu
1 5 10 15
Val Gly Glu Glu Val Glu Phe Pro Cys His Leu Trp Pro Gln Leu Asp
20 25 30
Ala Gln Gln Met Glu Ile Arg Trp Phe Arg Ser Gln Thr Phe Asn Val
35 40 45
Val His Leu Tyr Gln Glu Gln Gln Glu Leu Pro Gly Arg Gln Met Pro
50 55 60
Ala Phe Arg Asn Arg Thr Lys Leu Val Lys Asp Asp Ile Ala Tyr Gly
65 70 75 80
Ser Val Val Leu Gln Leu His Ser Ile Ile Pro Ser Asp Lys Gly Thr
85 90 95
Tyr Gly Cys Arg Phe His Ser Asp Asn Phe Ser Gly Glu Ala Leu Trp
100 105 110
Glu Leu Glu Val Ala Gly Leu Gly Ser Asp Pro His Leu Ser Leu Glu
115 120 125
Gly Phe Lys Glu Gly Gly Ile Gln Leu Arg Leu Arg Ser Ser Gly Trp
130 135 140
Tyr Pro Lys Pro Lys Val Gln Trp Arg Asp His Gln Gly Gln Cys Leu
145 150 155 160
Pro Pro Glu Phe Glu Ala Ile Val Trp Asp Ala Gln Asp Leu Phe Ser
165 170 175
Leu Glu Thr Ser Val Val Val Arg Ala Gly Ala Leu Ser Asn Val Ser
180 185 190
Val Ser Ile Gln Asn Leu Leu Leu Ser Gln Lys Lys Glu Leu Val Val
195 200 205
Gln Ile Ala Asp Val Phe Val Pro Gly Ala Ser Ala Trp Lys
210 215 220
<210> 93
<211> 228
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 93
Ser Ile Trp Lys Ala Asp Phe Asp Val Thr Gly Pro His Ala Pro Ile
1 5 10 15
Leu Ala Met Ala Gly Gly His Val Glu Leu Gln Cys Gln Leu Phe Pro
20 25 30
Asn Ile Ser Ala Glu Asp Met Glu Leu Arg Trp Tyr Arg Cys Gln Pro
35 40 45
Ser Leu Ala Val His Met His Glu Arg Gly Met Asp Met Asp Gly Glu
50 55 60
Gln Lys Trp Gln Tyr Arg Gly Arg Thr Thr Phe Met Ser Asp His Val
65 70 75 80
Ala Arg Gly Lys Ala Met Val Arg Ser His Arg Val Thr Thr Phe Asp
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Asn Arg Thr Tyr Cys Cys Arg Phe Lys Asp Gly Val Lys Phe Gly Glu
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Ala Thr Val Gln Val Gln Val Ala Gly Leu Gly Arg Glu Pro Arg Ile
115 120 125
Gln Val Thr Asp Gln Gln Asp Gly Val Arg Ala Glu Cys Thr Ser Ala
130 135 140
Gly Cys Phe Pro Lys Ser Trp Val Glu Arg Arg Asp Phe Arg Gly Gln
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Ala Arg Pro Ala Val Thr Asn Leu Ser Ala Ser Ala Thr Thr Arg Leu
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Trp Ala Val Ala Ser Ser Leu Thr Leu Trp Asp Arg Ala Val Glu Gly
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Leu Ser Cys Ser Ile Ser Ser Pro Leu Leu Pro Glu Arg Arg Lys Val
195 200 205
Ala Glu Ser His Leu Pro Ala Thr Phe Ser Arg Ser Ser Gln Phe Thr
210 215 220
Ala Trp Lys Ala
225
<210> 94
<211> 249
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 94
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Glu Asp Thr Ile Arg Gly Pro Asn Tyr Tyr Tyr Tyr Gly Met
100 105 110
Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly
115 120 125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Thr
130 135 140
Thr Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg
145 150 155 160
Val Ser Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Asp Thr Trp Leu Ala
165 170 175
Trp Tyr Gln Leu Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Met Tyr Ala
180 185 190
Ala Ser Asn Leu Gln Gly Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly
195 200 205
Ser Gly Thr Asp Phe Ile Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp
210 215 220
Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Ser Ile Phe Pro Pro Thr Phe
225 230 235 240
Gly Gly Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
245
<210> 95
<211> 250
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 95
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Thr Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Arg Ala Ser Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Tyr Ser Asp Tyr Asp Tyr Tyr Phe Asp Phe Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln
130 135 140
Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser
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Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu
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Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr
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Leu Gly Ser Asn Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser
195 200 205
Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu
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Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Ala Leu Gln Thr Pro Phe Thr
225 230 235 240
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
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<211> 240
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 96
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Asp Leu Ala Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Pro Asp Gly Gly Gln Lys Tyr Tyr Gly Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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Val Arg His Phe Asn Ala Trp Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
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Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
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Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
130 135 140
Ser Ala Tyr Val Gly Gly Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln
145 150 155 160
Gly Ile Ser Gln Phe Leu Asn Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala
165 170 175
Pro Lys Leu Leu Ile Ser Asp Ala Ser Asn Leu Glu Pro Gly Val Pro
180 185 190
Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile
195 200 205
Thr Asn Leu Gln Pro Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr
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Asp Asp Leu Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
225 230 235 240
<210> 97
<211> 248
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 97
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Lys
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ile Phe
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Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Val Lys Ala Gly Asp Gly Gly Tyr Asp Val Phe Asp Ser Trp Gly Gln
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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
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Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser
130 135 140
Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys
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Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu Asp
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Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Leu
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Gly Ser Asn Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly
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Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp
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Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Ala Leu Gln Thr Pro Thr Phe Gly
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Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
245
<210> 98
<211> 245
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 98
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
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Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln
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Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser
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Trp Cys Gln Gln Ser Asn Asn Phe Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr
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Lys Val Glu Ile Lys
245
<210> 99
<211> 244
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 99
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Asn Tyr
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Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
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Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Arg Leu Thr Gln Ser
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Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
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Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys
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Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys
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Val Asp Ile Lys
<210> 100
<211> 244
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 100
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Ile Thr Asp Ser
20 25 30
Asn Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Tyr Pro Tyr Asn Gly Gly Thr Asp Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
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65 70 75 80
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Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu
130 135 140
Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Glu
145 150 155 160
Ser Leu Asp Asn Tyr Gly Ile Arg Phe Leu Thr Trp Phe Gln Gln Lys
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Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe
195 200 205
Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr
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Cys Gln Gln Thr Lys Glu Val Pro Trp Ser Phe Gly Gln Gly Thr Lys
225 230 235 240
Val Glu Val Lys
<210> 101
<211> 255
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 101
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Ser Trp Asn Ser Asp Ser Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val
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Leu Gln Met His Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
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Ala Lys Asp Asn His Tyr Gly Ser Gly Ser Tyr Tyr Tyr Tyr Gln Tyr
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Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly
115 120 125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
130 135 140
Gly Gly Ser Ala Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser
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Val Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser
165 170 175
Val Ser Ser Asn Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro
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Arg Leu Leu Ile Tyr Gly Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala
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210 215 220
Ser Leu Gln Ser Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His Tyr Ile
225 230 235 240
Asn Trp Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
245 250 255
<210> 102
<211> 247
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 102
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Arg Thr Phe Thr Ser Tyr
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Asn Met His Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Ala Ile Tyr Pro Leu Thr Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Ser
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Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
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Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val
130 135 140
Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala
145 150 155 160
Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Pro Tyr Ile His Trp Tyr
165 170 175
Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Ala Thr Ser
180 185 190
Ala Leu Ala Ser Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
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Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala
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Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Leu Ser His Pro Pro Thr Phe Gly Gln
225 230 235 240
Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
245
<210> 103
<211> 247
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 103
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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Asn Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Ala Ile Tyr Pro Gly Asn Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
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Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
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Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ile Val
130 135 140
Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
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Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Ile His Trp Phe
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Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Lys Pro Leu Ile Tyr Ala Thr Ser
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Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Val Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
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Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala
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Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Thr Ser Asn Pro Pro Thr Phe Gly Gly
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Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
245
<210> 104
<211> 249
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 104
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Asp Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Asp Tyr
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Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
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Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile
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Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg
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Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Ile Thr Phe
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Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys
245
<210> 105
<211> 250
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 105
Ser Ser Glu Leu Thr Gln Asp Pro Ala Val Ser Val Ala Leu Gly Gln
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Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu
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245 250
<210> 106
<211> 248
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 106
Gln Ser Val Val Thr Gln Pro Pro Ser Met Ser Ala Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
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Arg Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
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Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr
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245
<210> 107
<211> 244
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 107
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ser Glu Leu Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
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Glu Ile Lys Arg
<210> 108
<211> 244
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 108
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
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Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln
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Gln Ser Gly Ser Glu Leu Lys Lys Pro Gly Ala Ser Val Lys Val Ser
130 135 140
Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr Gly Met Asn Trp Val
145 150 155 160
Lys Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Lys Trp Met Gly Trp Ile Asn Thr
165 170 175
Tyr Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Thr Asp Asp Phe Lys Gly Arg Phe Ala
180 185 190
Phe Ser Leu Asp Thr Ser Val Ser Thr Ala Tyr Leu Gln Ile Ser Ser
195 200 205
Leu Lys Ala Asp Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys Ala Arg Gly Gly Phe
210 215 220
Gly Ser Ser Tyr Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
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Thr Val Ser Ser
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<220>
<223> 合成聚合物
<400> 109
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Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
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Gly Met Asn Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Lys Trp Met
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Gly Trp Ile Asn Thr Lys Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Ala Glu Glu Phe
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Lys Gly Arg Phe Ala Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
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Leu Gln Ile Asn Asn Leu Lys Lys Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
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Gly Arg Gly Gly Tyr Gly Ser Ser Tyr Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly
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Ala Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
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Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln Ser His
130 135 140
Lys Phe Met Ser Thr Ser Val Gly Asp Arg Val Ser Ile Thr Cys Lys
145 150 155 160
Ala Ser Gln Asp Val Ser Ile Ala Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro
165 170 175
Gly Gln Ser Pro Lys Val Leu Ile Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg Tyr Thr
180 185 190
Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
195 200 205
Phe Thr Ile Ser Arg Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys
210 215 220
Gln Gln His Tyr Ile Thr Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu
225 230 235 240
Glu Leu Lys
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<211> 243
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 110
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser His Lys Phe Met Ser Thr Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Ser Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asp Val Ser Ile Ala
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Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Val Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Arg Val Gln Ala
65 70 75 80
Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Ile Thr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ile Gln Leu Val Gln
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Ser Gly Pro Glu Leu Lys Lys Pro Gly Glu Thr Val Lys Ile Ser Cys
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Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr Gly Met Asn Trp Val Lys
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<223> 合成聚合物
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Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
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Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser
130 135 140
Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser
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Gln Asp Val Gly Thr Ser Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys
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Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Thr Ser Thr Arg His Thr Gly Val
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Tyr Ser Leu Tyr Arg Ser Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
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Arg
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asp Val Gly Thr Ser
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Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
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Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
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Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Val Glu
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Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys
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Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Glu Ile His Pro Asp
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Phe Pro Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Pro Val Thr Val Ser
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<220>
<223> 合成聚合物
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Glu Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
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Ser Leu Ser Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Val Phe Ser Ser Tyr
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Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Val Gln Leu Gln Glu Ser
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Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly Ser Leu Ser Leu Ser Cys Ala
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Ala Ser Gly Phe Val Phe Ser Ser Tyr Asp Met Ser Trp Val Arg Gln
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Thr Pro Glu Arg Arg Leu Glu Trp Val Ala Tyr Ile Ser Ser Gly Gly
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Ala
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
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Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Tyr
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Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Gly Phe Ile Arg Asn Lys Ala Asn Gly Gly Thr Thr Glu Tyr Ala Ala
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Tyr Cys Ala Arg Asp Arg Gly Leu Arg Phe Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 117
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
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Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ala Ala Ile Trp Tyr Asn Gly Arg Lys Gln Asp Tyr Ala Asp Ser Val
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Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
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Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln
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<223> 合成聚合物
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Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 119
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Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser
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<223> 合成聚合物
<400> 120
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 121
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 122
Ala Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly
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<210> 123
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 123
Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Ala
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Gly Arg Ile Lys Ser Lys Thr Asp Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala
50 55 60
Pro Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Ala Arg Asp Phe Gly Arg Trp Ser Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Ser Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120 125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro
130 135 140
Ser Ser Val Ser Gly Thr Pro Gly Gln Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser
145 150 155 160
Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln
165 170 175
Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Trp Tyr Arg Asn Asn Gln Arg Pro Ser
180 185 190
Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser
195 200 205
Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys
210 215 220
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Ser Gly Val Val Phe Gly Gly Gly Thr
225 230 235 240
Lys Leu Thr Val Leu
245
<210> 124
<211> 245
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 124
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Ser Ser Val Ser Gly Thr Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn
20 25 30
Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Trp Tyr
35 40 45
Arg Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg Ser Glu
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Ser Gly
85 90 95
Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly
100 105 110
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Thr Leu Lys
115 120 125
Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser
130 135 140
Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Ala Trp Met Ser Trp Val
145 150 155 160
Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Gly Arg Ile Lys Ser
165 170 175
Lys Thr Asp Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Ala Pro Val Lys Gly Arg
180 185 190
Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met
195 200 205
Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Asp
210 215 220
Phe Gly Arg Trp Ser Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp Ser Gln Gly Thr Leu
225 230 235 240
Val Thr Val Ser Ser
245
<210> 125
<211> 241
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 125
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asp Tyr
20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Ser Gly Ser Gly Arg Ser Thr Asp His Ala Asp Tyr Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Arg Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Ser Asn Tyr Glu Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp Ala Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ser Val Ser
130 135 140
Val Ala Pro Gly Gln Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Ser Asn Ile
145 150 155 160
Gly Ser Glu Ser Val Asn Trp Tyr Gln Trp Lys Ser Gly Gln Val Pro
165 170 175
Val Leu Val Val Ser Asp Thr Thr Asp Pro Arg Ser Gly Ile Pro Gly
180 185 190
Arg Phe Thr Gly Thr Arg Ser Gly Thr Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser
195 200 205
Gly Val Glu Ala Gly Asp Glu Ala Asp Tyr His Cys Gln Val Trp Asp
210 215 220
Asp Thr Gly Asp His Pro Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val
225 230 235 240
Leu
<210> 126
<211> 241
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 合成聚合物
<400> 126
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Ser Asn Ile Gly Ser Glu Ser Val
20 25 30
Asn Trp Tyr Gln Trp Lys Ser Gly Gln Val Pro Val Leu Val Val Ser
35 40 45
Asp Thr Thr Asp Pro Arg Ser Gly Ile Pro Gly Arg Phe Thr Gly Thr
50 55 60
Arg Ser Gly Thr Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Glu Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr His Cys Gln Val Trp Asp Asp Thr Gly Asp His
85 90 95
Pro Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly
100 105 110
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Val
115 120 125
Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser
130 135 140
Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asp Tyr Ala Met Ser Trp Val
145 150 155 160
Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Ser Ile Ser Gly
165 170 175
Ser Gly Arg Ser Thr Asp His Ala Asp Tyr Val Lys Gly Arg Phe Thr
180 185 190
Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Arg
195 200 205
Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys Val Ser Asn
210 215 220
Tyr Glu Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp Ala Gln Gly Thr Leu Thr Val Ser
225 230 235 240
Ser
Claims (118)
1.一种包含α链和β链的异二聚体蛋白,
其中α链包含:
(a)包含BTN2A1蛋白或其片段的第一结构域;
(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和
(c)连接第一结构域和第二结构域的接头;
并且其中β链包含:
(a)包含BTN3A1蛋白或其片段的第一结构域;
(b)包含特异性结合CD19的靶向结构域的第二结构域;和
(c)连接第一结构域和第二结构域的接头。
2.根据权利要求1所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述α链和β链自缔合形成异二聚体。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述α链的第一结构域包含BTN2A1蛋白的胞外结构域。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述α链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:71的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述α链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:71的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述β链的第一结构域包含BTN3A1蛋白的胞外结构域。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述β链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:19或SEQ ID NO:72的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
8.根据权利要求7所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述β链的第一结构域包含具有与SEQ ID NO:19或SEQ ID NO:72的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述靶向结构域是抗体或其抗原结合片段。
10.根据权利要求1至8中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。
11.根据权利要求10所述的异二聚体蛋白,其中所述抗体样分子选自单结构域抗体、重组仅重链抗体(VHH)、单链抗体(scFv)、鲨鱼仅重链抗体(VNAR)、微蛋白(半胱氨酸结蛋白,打结素)、DARPin;四联凝素;亲和体;穿膜抗体;Anticalin;AdNectin;Affilin;Affimer、微体;适体;改变酶;塑料抗体;phylomer;stradobody;巨型体;evibody;fynomer、犰狳重复蛋白、Kunitz结构域、avimer、atrimer、probody、免疫体、triomab、troybody;肽体;疫苗体;单特异性体;双特异性体、Fv、Fab、Fab′和F(ab′)2。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述接头包含(a)任选地在羧基末端与嗜乳脂蛋白家族蛋白连接的第一电荷极化核心结构域,和(b)任选地在羧基末端与嗜乳脂蛋白家族蛋白连接的第二电荷极化核心结构域。
13.根据权利要求12所述的异二聚体蛋白,其中所述接头通过第一电荷极化核心结构域和第二电荷极化核心结构域上带正电荷的氨基酸残基和带负电荷的氨基酸残基之间的静电相互作用形成异二聚体。
14.根据权利要求12或权利要求13所述的异二聚体蛋白,其中第一电荷极化核心结构域和/或第二电荷极化核心结构域包含多肽接头,任选地选自柔性氨基酸序列、IgG铰链区或抗体序列。
15.根据权利要求12至14中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述接头是合成接头,任选地是PEG。
16.根据权利要求12至15中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述接头包含源自IgG1、任选源自人IgG1的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。
17.根据权利要求12至16中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述接头包含源自IgG4、任选源自人IgG4的铰链-CH2-CH3 Fc结构域。
18.根据权利要求12至17中任一项所述的异二聚体蛋白,其中第一电荷极化核心结构域和/或第二电荷极化核心结构域还包含在电荷极化核心结构域的氨基末端和/或羧基末端具有带正电荷和/或带负电荷的氨基酸残基的肽。
19.根据权利要求13所述的异二聚体蛋白,其中所述带正电荷的氨基酸残基包括选自His、Lys和Arg的一种或多种氨基酸。
20.根据权利要求13或权利要求14所述的异二聚体蛋白,其中所述带正电荷的氨基酸残基存在于包含第一电荷极化核心结构域和/或第二电荷极化核心结构域中的带正电荷的氨基酸残基的肽中。
21.根据权利要求20所述的异二聚体蛋白,其中包含带正电荷的氨基酸残基的肽包含选自以下的序列:YnXnYnXnYn(其中X是带正电荷的氨基酸,例如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,例如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:1),YYnXXnYYnXXnYYn(其中X是带正电荷的氨基酸,例如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,例如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:3),和YnXnCYnXnYn(其中X是带正电荷的氨基酸,例如精氨酸、组氨酸或赖氨酸,Y是间隔氨基酸,例如丝氨酸或甘氨酸,其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:5)。
22.根据权利要求20或权利要求21所述的异二聚体蛋白,其中包含带正电荷的氨基酸残基的肽包含序列RKGGKR(SEQ ID NO:11)或GSGSRKGGKRGS(SEQ ID NO:12)。
23.根据权利要求13至22中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述带负电荷的氨基酸残基可以包括选自Asp和Glu的一种或多种氨基酸。
24.根据权利要求13至23中任一项所述的异二聚体蛋白,其中所述带负电荷的氨基酸残基存在于包含第一电荷极化核心结构域和/或第二电荷极化核心结构域中的带负电荷的氨基酸残基的肽中。
25.根据权利要求24所述的异二聚体蛋白,其中包含带负电荷的氨基酸残基的肽包含选自以下的序列:YnZnYnZnYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,例如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,例如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:2),YYnZZnYYnZZnYYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,例如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,例如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:4),和YnZnCYnZnYn(其中Z是带负电荷的氨基酸,例如天冬氨酸或谷氨酸,Y是间隔氨基酸,例如丝氨酸或甘氨酸,并且其中每个n独立地是0至4的整数)(SEQ ID NO:6)。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中α链和/或β链的第二结构域包含具有与选自SEQ ID NO:20-23的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
27.根据权利要求26所述的异二聚体嵌合蛋白,其中α链和/或β链的第二结构域包含具有与选自SEQ ID NO:20-23的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
28.根据权利要求1至17或19至27中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中α链和/或β链的接头包含具有与选自SEQ ID NO:15-17、28-32和52-55的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
29.根据权利要求28所述的异二聚体嵌合蛋白,其中α链和/或β链的接头包含具有与选自SEQ ID NO:15-17、28-32和52-55的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
30.根据权利要求1至29中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述α链包含具有与选自SEQ ID NO:37-39的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
31.根据权利要求30所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述α链包含具有与选自SEQ IDNO:37-39的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
32.根据权利要求1至31中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述β链包含具有与选自SEQ ID NO:40-42的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
33.根据权利要求32所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述β链包含具有与选自SEQ IDNO:40-42的氨基酸序列相同的氨基酸序列的多肽。
34.根据权利要求33所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述异二聚体嵌合蛋白包含与以下氨基酸序列相同的氨基酸序列:
(a)SEQ ID NO:37和SEQ ID NO:40;
(b)SEQ ID NO:38和SEQ ID NO:41;或
(c)SEQ ID NO:39和SEQ ID NO:42。
35.根据权利要求1至34中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述第一结构域和/或所述异二聚体蛋白调节或能够调节γδ(gamma delta)T细胞。
36.根据权利要求35所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述γδT细胞是Vγ9δ2T细胞。
37.根据权利要求35所述的异二聚体嵌合蛋白,其中γδT细胞的调节是γδT细胞的活化。
38.根据权利要求1至37中任一项所述的异二聚体嵌合蛋白,其中所述异二聚体蛋白能够在γδT细胞和肿瘤细胞之间形成突触和/或所述异二聚体蛋白能够同时活化γδT细胞并将其靶向至肿瘤细胞。
39.一种药物组合物,其包含权利要求1至38中任一项所述的异二聚体蛋白。
40.一种表达载体,其包含编码权利要求1至38中任一项所述的异二聚体蛋白的第一多肽链和/或第二多肽链的核酸。
41.根据权利要求40所述的表达载体,其中所述表达载体是哺乳动物表达载体。
42.根据权利要求40或权利要求41所述的表达载体,其中所述表达载体包含DNA或RNA。
43.一种宿主细胞,其包含权利要求40至42中任一项所述的表达载体。
44.一种同时活化γδT细胞并将其靶向至肿瘤细胞的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的权利要求39所述的药物组合物至有需要的受试者。
45.一种调节患者的免疫应答的方法,包括将有效量的权利要求39所述的药物组合物施用于有需要的受试者。
46.一种刺激γδT细胞的增殖的方法,包括:
向有需要的受试者施用有效量的权利要求39所述的药物组合物,从而引起γδT细胞的体内增殖,和/或
使有效量的权利要求39所述的药物组合物与来源于有需要的受试者的细胞接触,从而引起γδT细胞的离体增殖。
47.根据权利要求44-46中任一项所述的方法,其中受试者的T细胞被第一结构域活化。
48.根据权利要求44-47中任一项所述的方法,其中所述受试者患有肿瘤并且所述γδT细胞调节肿瘤的细胞。
49.一种治疗癌症的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的权利要求39所述的药物组合物至有需要的受试者。
50.根据权利要求49所述的方法,其中所述癌症是淋巴瘤。
51.根据权利要求49所述的方法,其中所述癌症是白血病。
52.根据权利要求49-51中任一项所述的方法,其中所述癌症是霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤,B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;或慢性成髓细胞白血病。
53.根据权利要求49所述的方法,其中,所述癌症为基底细胞癌、胆道癌;膀胱癌;骨癌;脑和中枢神经系统癌症;乳腺癌;腹膜癌;宫颈癌;绒膜癌;结直肠癌;结缔组织癌;消化系统癌症;子宫内膜癌;食道癌;眼癌;头颈癌;胃癌(包括胃肠道癌);胶质母细胞瘤;肝脏癌;肝细胞瘤;上皮内肿瘤;肾脏癌或肾癌;喉癌;白血病;肝癌;肺癌(例如,小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌);黑色素瘤;骨髓瘤;成神经细胞瘤;口腔癌(唇、舌、口和咽);卵巢癌;胰腺癌;前列腺癌;视网膜母细胞瘤;横纹肌肉瘤;直肠癌;呼吸系统癌症;唾液腺癌;肉瘤;皮肤癌;鳞状细胞癌;胃癌;睾丸癌;甲状腺癌;子宫或子宫内膜癌;泌尿系统癌症;外阴癌;淋巴瘤,包括霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤,以及B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;慢性成髓细胞白血病;以及其他癌和肉瘤;和移植后淋巴组织增生性疾病(PTLD),以及与瘢痣病、水肿(例如与脑肿瘤相关的水肿)和梅格斯氏综合征相关的异常血管增殖。
54.根据权利要求49或权利要求53所述的方法,其中所述癌症是前列腺癌。
55.根据权利要求49、53或54任一项所述的方法,其中所述癌症是上皮来源的癌。
56.根据权利要求49至55中任一项所述的方法,其中已知所述癌症表达所述异二聚体蛋白的第二结构域的抗原靶标。
57.根据权利要求49至56中任一项所述的方法,其中所述癌症具有限制αβT细胞识别的突变,任选地选自MHC I、β2微球蛋白和与抗原加工相关的转运蛋白(TAP)中的突变。
58.根据权利要求49至57中任一项所述的方法,其中进一步向受试者施用离体扩增的自体或同种异体γδT细胞。
59.根据权利要求58所述的方法,其中所述自体或同种异体γδT细胞表达嵌合抗原受体。
60.一种四聚体嵌合蛋白,其包含两个权利要求1至34中任一项所述的同二聚体嵌合蛋白,四聚体包含两条蛋白链,其同二聚化形成包含BTN2A1和BTN3A1的四聚体单元。
61.根据权利要求60所述的四聚体嵌合蛋白,其包含具有与选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
62.如图11所示的四聚体嵌合蛋白,其任选地包含具有与选自SEQ ID NO:43、44和56-70的氨基酸序列具有至少约95%同一性的氨基酸序列的多肽。
63.一种具有以下通式结构的嵌合蛋白:
N末端–(a)–(b)–(c)–C末端,
其中:
(a)是包含(a1)–SL–(a2)的通式结构的第一结构域,其中
(a1)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,
(a2)是嗜乳脂蛋白家族蛋白的胞外结构域(ECD)或其片段,并且
SL是连接(a1)和(a2)的第二接头,其包含约4至约50个氨基酸长度的柔性氨基酸序列,且
(c)是包含靶向结构域的第二结构域,所述靶向结构域选自(i)抗体、抗体样分子或其抗原结合片段,和(ii)膜蛋白的胞外结构域,且
(b)是连接第一结构域和第二结构域的接头,其中所述接头包含至少一个能够形成二硫键的半胱氨酸残基。
64.根据权利要求63所述的嵌合蛋白,其中(a1)和(a2)是两个相同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。
65.根据权利要求63所述的嵌合蛋白,其中(a1)和(a2)是不同的嗜乳脂蛋白家族蛋白。
66.根据权利要求63至65中任一项所述的嵌合蛋白,其中(a1)和/或(a2)是包含可变结构域的嗜乳脂蛋白家族蛋白的片段。
67.根据权利要求63至66中任一项所述的嵌合蛋白,其中(a1)和(a2)包含独立地选自BTN1A1、BTN2A1、BTN2A2、BTN2A3、BTN3A1、BTN3A2、BTN3A3、BTNL2、BTNL3、BTNL8、BTNL9、BTNL10和SKINTL的嗜乳脂蛋白家族蛋白。
68.根据权利要求67所述的嵌合蛋白,其中所述嗜乳脂蛋白家族蛋白独立地选自人BTN1A1、人BTN2A1、人BTN2A2、人BTN2A3、人BTN3A1、人BTN3A2、人BTN3A3、人BTNL2、人BTNL3、人BTNL8、人BTNL9、人BTNL10和人SKINTL。
69.根据权利要求63至66中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域包含具有以下氨基酸序列的多肽:
(a1)与SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列;和
(a2)与SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列。
70.根据权利要求69所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域包含具有以下氨基酸序列的多肽:
(a1)SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93中的任一个;和
(a2)SEQ ID NO:19、35-36、45、71-72、80-93中的任一个。
71.根据权利要求63至70中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域包含以下蛋白的胞外结构域:
(i)BTNL3和BTNL8;
(ii)BTN2A1和BTN3A1;
(iii)BTN3A1和BTN3A2;或
(iv)BTN3A1和BTN3A3。
72.根据权利要求63至68中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域包含以下蛋白的可变结构域:
(i)BTNL3和BTNL8;
(ii)BTN2A1和BTN3A1;
(iii)BTN3A1和BTN3A2;或
(iv)BTN3A1和BTN3A3。
73.根据权利要求63至72中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述第二接头包含通式G(G3S)m或GGGSn的氨基酸序列,其中m和n是1至16范围内的整数。
74.根据权利要求63至73中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域能够结合癌细胞表面上的抗原。
75.根据权利要求63至74中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域包含选自LAG-3、PD-1、TIGIT、CD19或PSMA的膜蛋白的胞外结构域。
76.根据权利要求63至74中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域是抗体或其抗原结合片段。
77.根据权利要求76所述的嵌合蛋白,其中所述结合片段包含Fv结构域。
78.根据权利要求63至74中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域是抗体样分子或其抗原结合片段。
79.根据权利要求78所述的嵌合蛋白,其中所述结合片段包含scFv结构域。
80.根据权利要求76至79中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域特异性结合以下中的一种:CLEC12A、CD307、gpA33、间皮素、CDH17、CDH3/P-钙黏着蛋白、CEACAM5/CEA、EPHA2、NY-eso-1、GP100、MAGE-A1、MAGE-A4、MSLN、CLDN18.2、Trop-2、ROR1、CD123、CD33、CD20、GPRC5D、GD2、CD276/B7-H3、DLL3、PSMA、CD19、cMet、HER2、A33、TAG72、5T4、CA9、CD70、MUC1、NKG2D、CD133、EpCam、MUC17、EGFRvIII、IL13R、CPC3、GPC3、FAP、BCMA、CD171、SSTR2、FOLR1、MUC16、CD274/PDL1、CD44、KDR/VEGFR2、PDCD1/PD1、TEM1/CD248、LeY、CD133、CELEC12A/CLL1、FLT3、IL1RAP、CD22、CD23、CD30/TNFRSF8、FCRH5、SLAMF7/CS1、CD38、CD4、PRAME、EGFR、PSCA、STEAP1、CD174/FUT3/LeY、L1CAM/CD171、CD22、CD5、LGR5、LGR5、CLL-1和GD3。
81.根据权利要求80所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域特异性结合CD19。
82.根据权利要求80所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域特异性结合PSMA。
83.根据权利要求80所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域特异性结合CD33。
84.根据权利要求80所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域特异性结合CLL-1。
85.根据权利要求80所述的嵌合蛋白,其中所述靶向结构域包含具有与选自SEQ IDNO:20-27和94-126的多肽具有至少90%、或95%、或97%、或98%、或99%同一性的氨基酸序列的多肽。
86.根据权利要求63-85中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述接头包含铰链-CH2-CH3Fc结构域。
87.根据权利要求86所述的嵌合蛋白,其中所述铰链-CH2-CH3 Fc结构域源自IgG1,任选地人IgG1。
88.根据权利要求86所述的嵌合蛋白,其中所述铰链-CH2-CH3 Fc结构域源自IgG4,任选地人IgG4。
89.根据权利要求86所述的嵌合蛋白,其中所述铰链-CH2-CH3 Fc结构域包含具有与选自SEQ ID NO:16-17、28-32和52-55的多肽具有至少90%、或95%、或97%、或98%或99%同一性的氨基酸序列的多肽。
90.根据权利要求63-89中任一项所述的嵌合蛋白,其中第一结构域和/或嵌合蛋白调节或能够调节γδ(gamma delta)T细胞。
91.根据权利要求90所述的嵌合蛋白,其中所述γδT细胞表达Vγ4或Vγ9δ2。
92.根据权利要求90或权利要求91所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域包含BTNL3和BTNL8,并且它调节表达Vγ4的T细胞。
93.根据权利要求90或权利要求91所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域调节表达Vγ9δ2的T细胞。
94.根据权利要求90、91和93中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述第一结构域包含:
(a)BTN2A1和BTN3A1,
(b)BTN3A1和BTN3A2,或
(c)BTN3A1和BTNA3。
95.根据权利要求90-94中任一项所述的嵌合蛋白,其中γδT细胞的调节是γδT细胞的活化。
96.根据权利要求63至95中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述嵌合蛋白能够在γδT细胞和肿瘤细胞之间形成突触和/或所述嵌合蛋白能够同时活化γδT细胞并将其靶向至肿瘤细胞。
97.根据权利要求63至96中任一项所述的嵌合蛋白,其中所述嵌合蛋白是同二聚体。
98.一种药物组合物,其包含权利要求63至97中任一项所述的嵌合蛋白。
99.一种表达载体,其包含编码权利要求63至97中任一项所述的嵌合蛋白的第一多肽链和/或第二多肽链的核酸。
100.根据权利要求99所述的表达载体,其中所述表达载体是哺乳动物表达载体。
101.根据权利要求99或权利要求100所述的表达载体,其中所述表达载体包含DNA或RNA。
102.一种宿主细胞,其包含权利要求99至101中任一项所述的表达载体。
103.一种同时活化γδT细胞并将其靶向至肿瘤细胞的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的权利要求98所述的药物组合物至有需要的受试者。
104.一种调节患者的免疫应答的方法,包括将有效量的权利要求98所述的药物组合物施用于有需要的受试者。
105.一种刺激γδT细胞的增殖的方法,包括:
向有需要的受试者施用有效量的权利要求98所述的药物组合物,从而引起γδT细胞的体内增殖,和/或
使有效量的权利要求98所述的药物组合物与来源于有需要的受试者的细胞接触,从而引起γδT细胞的离体增殖。
106.根据权利要求103-105中任一项所述的方法,其中受试者的T细胞被第一结构域活化。
107.根据权利要求103-106中任一项所述的方法,其中受试者患有肿瘤并且γδT细胞调节所述肿瘤的细胞。
108.一种治疗癌症的方法,包括向有需要的受试者施用有效量的权利要求98所述的药物组合物至有需要的受试者。
109.根据权利要求108所述的方法,其中所述癌症是淋巴瘤。
110.根据权利要求108所述的方法,其中所述癌症是白血病。
111.根据权利要求108-110中任一项所述的方法,其中所述癌症是霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤,B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;或慢性成髓细胞白血病。
112.根据权利要求111所述的方法,其中所述癌症为基底细胞癌、胆道癌;膀胱癌;骨癌;脑和中枢神经系统癌症;乳腺癌;腹膜癌;宫颈癌;绒膜癌;结直肠癌;结缔组织癌;消化系统癌症;子宫内膜癌;食道癌;眼癌;头颈癌;胃癌(包括胃肠道癌);胶质母细胞瘤;肝脏癌;肝细胞瘤;上皮内肿瘤;肾脏癌或肾癌;喉癌;白血病;肝癌;肺癌(例如,小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌);黑色素瘤;骨髓瘤;成神经细胞瘤;口腔癌(唇、舌、口和咽);卵巢癌;胰腺癌;前列腺癌;视网膜母细胞瘤;横纹肌肉瘤;直肠癌;呼吸系统癌症;唾液腺癌;肉瘤;皮肤癌;鳞状细胞癌;胃癌;睾丸癌;甲状腺癌;子宫或子宫内膜癌;泌尿系统癌症;外阴癌;淋巴瘤,包括霍奇金氏和非霍奇金氏淋巴瘤,以及B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非霍奇金氏淋巴瘤(NHL);小淋巴细胞(SL)NHL;中级/滤泡性NHL;中级弥漫性NHL;高级成免疫细胞NHL;高级成淋巴细胞NHL;高级小非裂解细胞NHL;巨大肿块疾病NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS相关淋巴瘤;和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症;慢性淋巴细胞白血病(CLL);急性成淋巴细胞白血病(ALL);毛细胞白血病;慢性成髓细胞白血病;以及其他癌和肉瘤;和移植后淋巴组织增生性疾病(PTLD),以及与瘢痣病、水肿(例如与脑肿瘤相关的水肿)和梅格斯氏综合征相关的异常血管增殖。
113.根据权利要求108或权利要求112所述的方法,其中所述癌症是前列腺癌。
114.根据权利要求108、112或113任一项所述的方法,其中所述癌症是上皮来源的癌。
115.根据权利要求108至114中任一项所述的方法,其中已知所述癌症表达所述嵌合蛋白的第二结构域的抗原靶标。
116.根据权利要求108至115中任一项所述的方法,其中所述癌症具有限制αβT细胞识别的突变,任选地选自MHC I、β2微球蛋白和与抗原加工相关的转运蛋白(TAP)中的突变。
117.根据权利要求108至116中任一项所述的方法,其中进一步向受试者施用离体扩增的自体或同种异体γδT细胞。
118.根据权利要求117所述的方法,其中所述自体或同种异体γδT细胞表达嵌合抗原受体。
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