CN116741392A - 一种临床科研数据生成路径与导出方法和装置 - Google Patents

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刘莉
肖芦山
李芮宁
洪畅
伍成凯
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Abstract

本发明公开一种临床科研数据生成路径与导出方法和装置,包括:步骤S1、对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;步骤S2、将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;步骤S3、接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;步骤S4、反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;步骤S5、根据设定的筛选条件和基线时间将步骤S4中反馈的数据标准化;步骤S6、对反馈的数据进行导出下载;步骤S7、对数据导出下载进行审核。采用本发明的技术方案,解决如何对医疗数据进行数据处理及标准化,提高数据导出效率与科研数据的可用性,实现多平台的数据共享。

Description

一种临床科研数据生成路径与导出方法和装置
技术领域
本发明属于数据处理技术领域,尤其涉及一种临床科研数据生成路径与导出方法和装置。
背景技术
大数据改变了人们生活,也引领了人们生活。对于医学领域的信息化增长,产生了健康医疗大数据。打造当地医疗健康大数据治理系统,为医学数据分析、民生医疗档案、疾病检测等方面提供数据基础。对于健康医疗大数据进行整理并加以利用可增强医疗资源分配管理能力,方便民生就诊体验,也提高当地医疗服务水平,降低医疗成本。健康医疗信息化技术人员通过采集与处理这些大数据,可实现真正精准医疗和“治未病”理念。目前健康医疗大数据已经应用于数据驱动型临床和手术决策、支持精准医疗以及降低护理成本等方面。目前,医疗大数据技术体系已经日益成熟,包括数据计算技术、数据管理技术、数据分析技术和数据安全流通技术。然而,市场上现在尚没有一款可实现医疗数据导出与共享的成熟标准化数据办公工具。数据导出后仍需大量人工整理工作,劳动强度大,数据灵活性差,信息存管效率低,给工作人员带来了巨大的工作量。因此必须对这些积累数据进行抽取和导出、临床数据才能得以有效利用,以更好地服务于患者。如何对大数据量的数据进行数据处理,提高数据导出效率,是需要解决的技术问题。
发明内容
本发明要解决的技术问题是,提供一种临床科研数据生成路径与导出方法和装置,解决如何对医疗数据进行数据处理及标准化,提高数据导出效率与科研数据的可用性,实现多平台的数据共享。
为实现上述目的,本发明采用如下的技术方案:
一种临床科研数据生成路径与导出方法,包括:
步骤S1、对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;
步骤S2、将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;
步骤S3、接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;
步骤S4、反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;
步骤S5、根据设定的筛选条件和基线时间将步骤S4中反馈的数据标准化;
步骤S6、对反馈的数据进行导出下载;
步骤S7、对数据导出下载进行审核。
作为优选,步骤S1包括:
对所述临床数据中的标准化信息进行提取,得到第一标准化数据;
对所述临床数据中的非标准化信息采用自然语言识别技术进行识别提取,得到第二标准化数据;
将所述第一标准化数据和所述第二标准化数据视为标准化数据。
作为优选,步骤S2中,将同一病例的所述临床数据形成的所述标准化数据建立关联关系;将所述关联关系存储至所述临床科研数据库。
作为优选,步骤S3中,所述对特定字段进行筛选,所述特定字段包括就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息。
作为优选,步骤S4中,对所反馈的数据进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载。
本发明还提供一种临床科研数据生成路径与导出装置,包括:
第一标准化模块,用于对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;
存储模块,用于将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;
检索模块,用于接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;
反馈模块,用于反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;
第二标准化模块,用于根据设定的筛选条件和基线时间将反馈的数据标准化;
导出模块,用于对反馈的数据进行导出下载;
审核模块,用于对数据导出下载进行审核。
作为优选,第一标准化模块包括:
第一提取单元,用于对所述临床数据中的标准化信息进行提取,得到第一标准化数据;
第二提取单元,用于对所述临床数据中的非标准化信息采用自然语言识别技术进行识别提取,得到第二标准化数据;
处理单元,用于将所述第一标准化数据和所述第二标准化数据视为标准化数据。
作为优选,存储模块还用于将同一病例的所述临床数据形成的所述标准化数据建立关联关系,将所述关联关系存储至所述临床科研数据库。
作为优选,所述检索模块对特定字段进行筛选,所述特定字段包括就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息。
作为优选,所述导出模块对所反馈的数据进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:
本发明按科研方向需求对病人临床资料进行快速筛选、检索和导出,实现了对整个医疗机构临床数据的高效利用,从而有利于满足科研数据需求,减少了科研人员的工作量,提高了科研人员的工作效率。该系统可支持的数据导出需求全面,包括病人的就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息,有利于提高科研工作的可控性,使科研人员得以拓展科研对象的可选择性,进而有利于为科研人员的研究课题提供针对化数据支持。
附图说明
为了更清楚地说明本发明的技术方案,下面对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动性的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本发明实施例临床科研数据生成路径与导出方法的流程图;
图2为为本发明实施例临床科研数据生成路径与导出装置的结构示意图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
为使本发明的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂,下面结合附图和具体实施方式对本发明作进一步详细的说明。
实施例1:
如图1所示,本发明实施例提供一种临床科研数据生成路径与导出方法,包括:
步骤S1、对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;
步骤S2、将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;
步骤S3、接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;
步骤S4、反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;
步骤S5、根据用户设定的筛选条件和基线时间将步骤S4中反馈的数据标准化;
步骤S6、对反馈的数据进行导出下载;
步骤S7、对数据导出下载进行审核。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S1中,对所述临床数据中的标准化信息进行提取,得到第一标准化数据;对所述临床数据中的非标准化信息采用自然语言识别技术进行识别提取,得到第二标准化数据;将所述第一标准化数据和所述第二标准化数据视为标准化数据。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S2中,在得到标准化数据之后,将同一病例的所述临床数据形成的所述标准化数据建立关联关系;将所述关联关系存储至所述临床科研数据库。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S3中,根据科研需要对特定字段进行筛选,以筛选出符合要求的患者,包括根据入选标准筛选和根据排除标准筛选。可筛选的字段包括就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息。可对筛选字段进行添加,并用与、或、非进行字段间的连接。此外,用户可根据需要将多个字段作为一个字段集合进行创建,并以此字段集合进行筛选。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S4中,根据数据筛选标准对符合要求的患者及其信息进行检索并展示。科研人员可浏览所检索出全部患者的人群分布统计,并可阅读其中每位患者的具体信息。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S5中,根据用户设定的筛选条件及所设定基线时间将步骤S4中反馈数据再次标准化,实现了数据的精准定位,使得导出的数据可直接应用于科研。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S6中,对所反馈的数据进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载,适用于多种数据处理软件,实现了多平台数据共享。其中,在下载时,科研人员可自由选择导出的数据字段和导出的时间范围,进行数据预览,并提交导出申请,申请经由系统管理者审核通过后可进行下载。
作为本发明实施例的一种实施方式,步骤S7中,对用户的数据导出申请做出审核,对敏感数据进行脱敏处理,以保护患者隐私;并校验数据导出范围符合要求,做到导出留痕,以便后续流程监管与审核。
本发明实施例的工作原理及使用流程:该发明实施例基于临床病例数据导出系统,在使用前,需要对数据进行标准化预处理,并标准化的病例数据进行横向关联并存储;此时,系统管理者或科研人员可以通过填写个人信息的方式进行系统账号注册和登录,当系统管理者登录后,其可以对用户的数据导出申请进行审核;而科研人员登录后,其可以对符合需求的患者进行筛选,随后检索并浏览所筛选出的患者的信息,系统对所筛选出的数据进行再次标准化后,科研人员可选择上述患者的特定字段及时间范围,提交数据导出申请,审核通过后对所查询到科研课题病例档案进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载。本发明系统按科研方向需求对病人临床资料进行快速筛选、检索和导出,实现了对整个医疗机构临床数据的高效利用,从而有利于满足科研数据需求,减少了科研人员的工作量,提高了科研人员的工作效率。该系统临床数据全面,包括病人的就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息,有利于提高科研工作的可控性,使科研人员得以拓展科研对象的可选择性,进而有利于为科研人员的研究课题提供针对化数据支持。
实施例2:
如图2所示,本发明实施例还提供一种临床科研数据生成路径与导出装置,包括:
第一标准化模块,用于对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;
存储模块,用于将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;
检索模块,用于接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;
反馈模块,用于反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;
第二标准化模块,用于根据用户设定的筛选条件和基线时间将反馈的数据标准化;
导出模块,用于对反馈的数据进行导出下载;
审核模块,用于对数据导出下载进行审核。
作为本发明实施例的一种实施方式,第一标准化模块包括:
第一提取单元,用于对所述临床数据中的标准化信息进行提取,得到第一标准化数据;
第二提取单元,用于对所述临床数据中的非标准化信息采用自然语言识别技术进行识别提取,得到第二标准化数据;
处理单元,用于将所述第一标准化数据和所述第二标准化数据视为标准化数据。
作为本发明实施例的一种实施方式,存储模块还用于将同一病例的所述临床数据形成的所述标准化数据建立关联关系,将所述关联关系存储至所述临床科研数据库。
作为本发明实施例的一种实施方式,所述检索模块对特定字段进行筛选,所述特定字段包括就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息。
作为本发明实施例的一种实施方式,所述导出模块对所反馈的数据进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载。
作为本发明实施例的一种实施方式,还包括:注册登录模块,用于用户通过填写个人信息的方式进行系统账号注册和登录;所述用于包括系统管理者和科研人员;所述个人信息包括姓名、性别、年龄、联系电话、电子邮件和所属科室。
以上所述的实施例仅是对本发明优选方式进行的描述,并非对本发明的范围进行限定,在不脱离本发明设计精神的前提下,本领域普通技术人员对本发明的技术方案做出的各种变形和改进,均应落入本发明权利要求书确定的保护范围内。

Claims (10)

1.一种临床科研数据生成路径与导出方法,其特征在于,包括:
步骤S1、对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;
步骤S2、将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;
步骤S3、接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;
步骤S4、反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;
步骤S5、根据设定的筛选条件和基线时间将步骤S4中反馈的数据标准化;
步骤S6、对反馈的数据进行导出下载;
步骤S7、对数据导出下载进行审核。
2.如权利要求1所述的临床科研数据生成路径与导出方法,其特征在于,步骤S1包括:
对所述临床数据中的标准化信息进行提取,得到第一标准化数据;
对所述临床数据中的非标准化信息采用自然语言识别技术进行识别提取,得到第二标准化数据;
将所述第一标准化数据和所述第二标准化数据视为标准化数据。
3.权利要求2所述的临床科研数据生成路径与导出方法,其特征在于,步骤S2中,将同一病例的所述临床数据形成的所述标准化数据建立关联关系;将所述关联关系存储至所述临床科研数据库。
4.如权利要求3所述的临床科研数据生成路径与导出方法,其特征在于,步骤S3中,对特定字段进行筛选,所述特定字段包括就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息。
5.如权利要求4所述的临床科研数据生成路径与导出方法,其特征在于,步骤S4中,对所反馈的数据进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载。
6.一种临床科研数据生成路径与导出装置,其特征在于,包括:
第一标准化模块,用于对获取病例的临床数据预处理,得到标准化数据;
存储模块,用于将所述标准化数据存储到临床科研数据库中;
检索模块,用于接收对临床科研数据库的检索请求,检索临床科研数据库中符合筛选条件的目标标准化数据;
反馈模块,用于反馈与目标标准化数据对应的病例的所有临床数据;
第二标准化模块,用于根据设定的筛选条件和基线时间将反馈的数据标准化;
导出模块,用于对反馈的数据进行导出下载;
审核模块,用于对数据导出下载进行审核。
7.如权利要求6所述的临床科研数据生成路径与导出装置,其特征在于,第一标准化模块包括:
第一提取单元,用于对所述临床数据中的标准化信息进行提取,得到第一标准化数据;
第二提取单元,用于对所述临床数据中的非标准化信息采用自然语言识别技术进行识别提取,得到第二标准化数据;
处理单元,用于将所述第一标准化数据和所述第二标准化数据视为标准化数据。
8.权利要求7所述的临床科研数据生成路径与导出装置,其特征在于,存储模块还用于将同一病例的所述临床数据形成的所述标准化数据建立关联关系,将所述关联关系存储至所述临床科研数据库。
9.如权利要求8所述的临床科研数据生成路径与导出装置,其特征在于,所述检索模块对特定字段进行筛选,所述特定字段包括就诊记录、临床诊断、人口学信息、病史、实验室检验信息、影像学检查信息、治疗信息和病理结果信息。
10.如权利要求9所述的临床科研数据生成路径与导出装置,其特征在于,所述导出模块对所反馈的数据进行CSV、Excel和SPSS格式的导出下载。
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