CN115989226A - 制备jak抑制剂的方法和中间体 - Google Patents

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M·卡拉
董勇
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Abstract

披露了用于制备鲁索替尼、鲁索替尼的氘代类似物和其他JAK抑制剂的改进的方法和中间体。

Description

制备JAK抑制剂的方法和中间体
相关申请的交叉引用
本申请要求于2020年6月29日提交的美国临时专利申请号63/045,627的权益。以上申请的全部传授内容通过引用并入本文。
背景技术
磷酸鲁索替尼是杂芳基取代的吡咯并[2,3-d]嘧啶,也称为3(R)-环戊基-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈磷酸盐并且称为(R)-3-(4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基)-3-环戊基丙腈磷酸盐,其抑制Janus相关激酶(JAK)JAK1和JAK2。这些激酶介导对造血功能和免疫功能重要的许多细胞因子和生长因子的信号传导。JAK信号传导涉及将STAT(信号转导和转录激活因子)募集到细胞因子受体、激活并且随后将STAT定位到细胞核,从而导致基因表达的调节。
磷酸鲁索替尼已经在美国和欧洲被批准用于治疗骨髓纤维化和用于治疗真性红细胞增多症。鲁索替尼目前处于治疗移植物抗宿主病和其他病症的临床试验中。
磷酸鲁索替尼的氘代类似物(在本文中称为CTP-543或化合物(I))目前处于治疗斑秃的临床试验中。
由于鲁索替尼和氘代鲁索替尼类似物的有益活性,因此持续需要用于合成鲁索替尼及其氘代形式的改进的方法。
发明内容
本发明提供了用于合成可用于制备鲁索替尼、鲁索替尼的氘代形式和其他JAK抑制剂的中间体的改进的化合物和方法。在一个方面,本发明提供了用于制备具有式5的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000021
该方法包括使具有式1的化合物:
Figure BDA0004097454550000022
与化合物4
Figure BDA0004097454550000023
和碱(例如,选自六甲基二硅氮化锂(LiHMDS)和六甲基二硅氮化钠(NaHMDS)的碱)反应的步骤;其中R1选自H或保护基(PG),并且其中R2是C1-C4烷基。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式7的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000024
该方法包括使具有式5的化合物:
Figure BDA0004097454550000025
与甲脒或其盐反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式7的化合物的方法,该方法包括使具有式5的化合物与甲脒或其盐反应;或与铵源和原甲酸三烷基酯反应的步骤;其中R1选自H或保护基(PG)。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式6a的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000031
该方法包括使具有式5的化合物:
Figure BDA0004097454550000032
与铵盐反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式6a的化合物的方法,该方法包括使具有式5的化合物与铵源(如铵盐或氨)反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。在某些实施例中,铵源是铵盐。在某些实施例中,铵盐是甲酸铵、氯化铵或乙酸铵。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式7的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000033
该方法包括使具有式6a的化合物:
Figure BDA0004097454550000041
与甲脒或其盐反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。
本发明的其他方面和实施例将从本文中的具体实施方式和权利要求中显而易见。
具体实施方式
定义
术语“烷基”是指一价饱和烃基。C1-C6烷基是具有从1至6个碳原子的烷基;C1-C4烷基是具有从1至4个碳原子的烷基。在一些实施例中,烷基可以是直链或支链的。在一些实施例中,烷基可以是伯、仲或叔烷基。烷基的非限制性实例包括甲基;乙基;丙基,包括正丙基和异丙基;丁基,包括正丁基、异丁基、仲丁基、和叔丁基;戊基,包括例如正戊基、异戊基、和新戊基;和己基,包括例如正己基和2-甲基戊基。伯烷基的非限制性实例包括甲基、乙基、正丙基、正丁基、正戊基、和正己基。仲烷基的非限制性实例包括异丙基、仲丁基、和2-甲基戊基。叔烷基的非限制性实例包括叔丁基。
术语“烯基”是指一价不饱和烃基,其中不饱和度由双键表示。C2-C6烯基是具有从2至6个碳原子的烯基。烯基可以是直链或支链的。烯基的实例包括CH2=CH-(乙烯基)、CH2=C(CH3)-、CH2=CH-CH2-(烯丙基)、CH3-CH=CH-CH2-(巴豆基)、CH3-CH=C(CH3)-和CH3-CH=CH-CH(CH3)-CH2-。在可能存在双键立体异构的情况下,烯基的立体化学可以是(E)、(Z)、或其混合物。
“芳基”本身或作为另一个取代基的一部分是指具有所陈述的碳原子数目的单环或多环一价芳族烃基(即,C5-C14意指从5至14个碳原子)。典型的芳基包括但不限于衍生自以下的基团:醋蒽烯、苊烯、醋菲烯、蒽、薁、苯、屈、蔻、荧蒽、芴、并六苯、己芬、己烯、不对称引达省(as-indacene)、对称引达省(s-indacene)、茚满、茚、萘、并八苯、辛芬、辛搭烯、卵烯、戊-2,4-二烯、并五苯、戊搭烯、戊芬、苝、非那烯、菲、苉、七曜烯、芘、吡蒽、玉红省、苯并菲、联三萘等。在具体的实施例中,芳基是环戊二烯基、苯基或萘基。在更具体的实施例中,芳基是苯基或萘基。
术语“杂环”是指单环或双环一价饱和或非芳族不饱和环体系,其中从1至4个环原子是独立地选自由O、N和S组成的组的杂原子。术语“3至10元杂环烷基”是指其中环原子数是从3至10的杂环烷基。3至10元杂环烷基的实例包括3至6元杂环烷基。双环体系包括稠合的、桥接的和螺环的环体系。杂环烷基的更具体实例包括氮杂环庚烷基、氮杂环丁烷基、氮丙啶基、咪唑烷基、吗啉基、噁唑烷基、噁唑烷基、哌嗪基、哌啶基、吡唑烷基、吡咯烷基、奎宁环基、和硫代吗啉基。
在上述杂环取代基中,氮、磷、碳或硫原子可以任选地被氧化成各种氧化态。在具体的实例中,基团-S(O)0-2-分别是指-S-(硫化物)、-S(O)-(亚砜)、和-SO2-(砜)。为了方便起见,氮,特别地但不排他地,意在包括它们相应的N-氧化物形式,尽管在特定的实例中没有明确地这样定义。因此,对于具有例如吡啶基环的本发明化合物;相应的吡啶基-N-氧化物意在作为本发明的另一种化合物包括在内。此外,环状氮原子可以任选地季铵化;并且环取代基可以是部分或完全饱和的或芳族的。
“CTP-543”是鲁索替尼的氘代类似物,已知化学名称为(R)-3-(4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基)-3-(环戊基-2,2,3,3,4,4,5,5-d8)丙腈。化合物(I)在本文中也可称为D8-鲁索替尼。化合物(I)由以下结构式表示:
Figure BDA0004097454550000051
Figure BDA0004097454550000061
如本文所用,术语“接触”和“反应”如在本领域中已知的使用并且通常是指以一种方式将化学试剂集合在一起,该方式允许它们在分子水平上相互作用以实现化学或物理转化。在一些实施例中,接触或反应涉及两种(或更多种)试剂,其中相对于第一试剂使用一个或多个当量的第二试剂。本文所述的方法的反应步骤可以在适于制备所鉴定的产物的时间和条件下进行。
化合物的制备可以涉及不同化学基团的保护和脱保护。保护和脱保护的需要以及适当保护基的选择可以由本领域技术人员容易地确定。保护基的化学可以例如在Greene等人,Protective Groups in Organic Synthesis[有机合成中的保护基],第4d版,威利父子出版社(Wiley&Sons),2007中找到,将其通过引用以其整体并入本文。因此,例如,氮原子可以用保护基(如叔丁氧基羰基(Boc))保护为氨基甲酸酯;例如用保护基,如三氟甲磺酰基(Tf,SO2-CF3),保护为磺酰胺;例如用保护基,如乙酰基、苯甲酰基或三氟乙酰基(F3-Ac),保护为酰胺;例如用保护基,如苄基或三苯甲基(Tr,-CPh3),保护为胺;或保护为甲硅烷基胺(例如,用保护基如SiPh2But)。可以根据各种取代基按需要调整本文所述的保护基以及形成和裂解方法。
本文所述的方法的反应可以在有机合成领域的技术人员可以容易地选择的合适溶剂中进行。在进行反应的温度下,例如可以在从溶剂的冻结温度至溶剂的沸腾温度的范围的温度,合适的溶剂可以基本上不与起始材料(反应物)、中间体或产物反应。给定的反应可以在一种溶剂或多于一种溶剂的混合物中进行。取决于具体的反应步骤,可以针对具体的反应步骤选择合适的溶剂。在一些实施例中,反应可以在不存在溶剂的情况下进行,例如当至少一种试剂是液体或气体时。
合适的溶剂可以包括卤化溶剂,如四氯化碳、溴二氯甲烷、二溴氯甲烷、溴仿、氯仿、溴氯甲烷、二溴甲烷、丁基氯、二氯甲烷(DCM)、四氯乙烯、三氯乙烯、1,1,1-三氯乙烷、1,1,2-三氯乙烷、1,1-二氯乙烷、2-氯丙烷、α,α,α-三氟甲苯、1,2-二氯乙烷、1,2-二溴乙烷、六氟苯、1,2,4-三氯苯、1,2-二氯苯、氯苯、氟苯、三氟甲苯(TFT)、及其混合物。
合适的醚溶剂包括:二甲氧基甲烷、四氢呋喃(THF)、1,3-二噁烷、1,4-二噁烷、呋喃、二乙醚、乙二醇二甲醚、乙二醇二乙醚、二甘醇二甲醚、二甘醇二乙醚、三甘醇二甲醚、苯甲醚、叔丁基甲醚、其混合物。另外的醚溶剂包括2-甲基四氢呋喃和环戊基甲基醚(及其混合物,包括与本文所述的其他醚溶剂的混合物)。
合适的质子溶剂可以包括,例如但不限于,水、甲醇(MeOH)、乙醇(EtOH)、异丙醇(iPrOH)、2-硝基乙醇、2-氟乙醇、2,2,2-三氟乙醇(TFE)、乙二醇、1-丙醇、2-丙醇、2-甲氧基乙醇、1-丁醇、2-丁醇、异丁醇、叔丁醇、2-乙氧基乙醇、二甘醇、1-、2-或3-戊醇、新戊醇、叔戊醇、二甘醇单甲醚、二甘醇单乙醚、环己醇、苄醇、苯酚、甘油、六氟异丙醇(HFIP)、乙酸(AcOH)、及其混合物。
合适的非质子溶剂可以包括,例如但不限于,四氢呋喃(THF)、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)、N,N-二甲基乙酰胺(DMA)、1,3-二甲基-3,4,5,6-四氢-2(1H)-嘧啶酮(DMPU)、1,3-二甲基-2-咪唑啉酮(DMI)、N-甲基吡咯烷酮(NMP)、甲酰胺、N-甲基乙酰胺、N-甲基甲酰胺、乙腈、二甲亚砜(DMSO)、丙腈、甲酸乙酯、乙酸甲酯、六氯丙酮、丙酮、乙基甲基酮、乙酸乙酯(EtOAc)、环丁砜、N,N-二甲基丙酰胺、四甲基脲、硝基甲烷、硝基苯、六甲基磷酰胺、及其混合物。
合适的烃溶剂包括苯、环己烷、戊烷、己烷、甲苯、环庚烷、甲基环己烷、庚烷、乙苯、间、邻或对二甲苯、辛烷、茚满、壬烷、萘、及其混合物。
本文所述的方法的反应可以在由技术人员可以容易确定的适当温度下进行。反应温度将取决于例如试剂和溶剂(如果存在的话)的熔点和沸点;反应的热力学(例如,剧烈放热的反应可能需要在降低的温度下进行);和反应的动力学(例如,高活化能垒可能需要升高的温度)。“升高的温度”是指高于室温(约22℃)的温度。
本文所述的方法的反应可以在空气中或在惰性气氛下进行。典型地,可以使用技术人员熟知的空气敏感合成技术进行包含基本上与空气反应的试剂或产物的反应。
酸的实例可以是无机酸或有机酸。无机酸的非限制性实例包括盐酸、氢溴酸、硫酸、磷酸、和硝酸。有机酸的非限制性实例包括甲酸、乙酸、丙酸、丁酸、苯甲酸、4-硝基苯甲酸、甲磺酸、对甲苯磺酸、苯磺酸、酒石酸、三氟乙酸、丙炔酸、丁酸、2-丁炔酸、乙烯基乙酸、戊酸、己酸、庚酸、辛酸、壬酸和癸酸。
碱的非限制性实例包括氢氧化锂、氢氧化钠、氢氧化钾、碳酸锂、碳酸钠、和碳酸钾。一些示例性强碱包括但不限于氢氧化物、醇盐、氨基金属、金属氢化物、二烷基氨基金属和甲硅烷基氨基金属(包括例如六甲基二硅氮化锂(LiHMDS)和六甲基二硅氮化钠(NaHMDS))和芳基胺,其中;醇盐包括甲基、乙基和叔丁基氧化物的锂盐、钠盐和钾盐;氨基金属包括氨基钠、氨基钾和氨基锂;金属氢化物包括氢化钠、氢化钾和氢化锂;以及二烷基氨基金属包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、叔丁基、三甲基甲硅烷基和环己基取代的氨基化物的锂盐、钠盐和钾盐。
在根据本文所述的方法进行化合物的制备时,通常的分离和纯化操作(如浓缩、过滤、萃取、固相萃取、重结晶、色谱法等)可以用于分离所希望的产物。
在一些实施例中,本发明的化合物及其盐是基本上分离的。“基本上分离的”意指化合物至少部分地或基本上与形成或检测其的环境分离。部分分离可以包括例如富含本发明的化合物的组合物。基本上分离可以包括含有按重量计至少约50%、至少约60%、至少约70%、至少约80%、至少约90%、至少约95%、至少约97%、或至少约99%的本发明的化合物或其盐的组合物。用于分离化合物及其盐的方法在本领域中是常规的。
本发明还包括本文所述的化合物的盐形式。本发明的化合物的盐在酸与化合物的碱性基团(如氨基官能团)或碱与化合物的酸性基团(如羧基官能团)之间形成。根据一个实施例,该化合物是药学上可接受的酸加成盐。在一个实施例中,该酸加成盐可以是氘代酸加成盐。
如本文所用,术语“药学上可接受的”是指在合理的医学判断范围内适合与人和其他哺乳动物的组织接触使用而没有过度毒性、刺激、过敏反应等并且与合理的利益/风险比相称的组分。“药学上可接受的盐”意指在向接受者施用时能够直接或间接提供本发明的化合物的任何无毒的盐。“药学上可接受的抗衡离子”是盐的离子部分,其在施用于接受者时从盐中释放时是无毒的。
通常用于形成药学上可接受的盐的酸包括无机酸,如盐酸、氢溴酸、氢碘酸、硫酸和磷酸;以及有机酸,如对甲苯磺酸、水杨酸、酒石酸、氢酒石酸、抗坏血酸、马来酸、苯磺酸(besylic acid)、富马酸、葡萄糖酸、葡萄糖醛酸、甲酸、谷氨酸、甲磺酸、乙磺酸、苯磺酸(benzenesulfonic acid)、乳酸、草酸、对溴苯磺酸、碳酸、琥珀酸、柠檬酸、苯甲酸和乙酸,以及相关的无机酸和有机酸。因此,此类药学上可接受的盐包括硫酸盐、焦硫酸盐、硫酸氢盐、亚硫酸盐、亚硫酸氢盐、磷酸盐、磷酸一氢盐、磷酸二氢盐、偏磷酸盐、焦磷酸盐、氯化物、溴化物、碘化物、乙酸盐、丙酸盐、癸酸盐、辛酸盐、丙烯酸盐、甲酸盐、异丁酸盐、癸酸盐、庚酸盐、丙炔酸盐、草酸盐、丙二酸盐、琥珀酸盐、辛二酸盐、癸二酸盐、富马酸盐、马来酸盐、丁炔-1,4-二酸盐、己炔-l,6-二酸盐、苯甲酸盐、氯苯甲酸盐、甲基苯甲酸盐、二硝基苯甲酸盐、羟基苯甲酸盐、甲氧基苯甲酸盐、邻苯二甲酸盐、对苯二甲酸盐、磺酸盐、二甲苯磺酸盐、苯基乙酸盐、苯基丙酸盐、苯基丁酸盐、柠檬酸盐、乳酸盐、β-羟基丁酸盐、乙醇酸盐、马来酸盐、酒石酸盐、甲烷磺酸盐、丙烷磺酸盐、萘-1-磺酸盐、萘-2-磺酸盐、扁桃酸盐和其他盐。在一个实施例中,药学上可接受的酸加成盐包括与无机酸(如盐酸和氢溴酸)形成的那些,并且尤其是与有机酸(如马来酸)形成的那些。在一个实施例中,通常用于形成药学上可接受的盐的酸包括以上所列的无机酸,其中至少一种氢被氘替代。
如本文所用,术语“稳定的化合物”是指具有足以允许化合物制造的稳定性并且在足够长的时间内保持化合物的完整性以用于本文详述的目的的化合物(例如,配制成治疗性产物、用于生产治疗性化合物的中间体、可分离或可储存的中间体化合物、治疗响应于治疗剂的疾病或病症)。
“D”和“d”均是指氘。“立体异构体”是指对映异构体和非对映异构体两者。“Tert”和“t-”各自是指叔。“Sec”或“s-”各自是指仲。“n-”是指正。“i-”是指异。“US”是指美国。贯穿本说明书,变量可以被泛指(例如,“每个R”)或可以被特指(例如,R1、R2、R3等)。除非另有指示,否则当变量被泛指时,它意味着包括该特定变量的所有具体实施例。
方法
在一个方面,本发明提供了用于制备具有式A的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000101
该方法包括使具有式1的化合物:
Figure BDA0004097454550000102
与具有式D的化合物:
Figure BDA0004097454550000103
和碱(例如,选自六甲基二硅氮化锂(LiHMDS)和六甲基二硅氮化钠(NaHMDS)的碱)反应的步骤;其中R1选自H和保护基(PG),其中R2选自C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基、和杂环基,并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基(-CH2-苯基)。在某些实施例中,R2是甲基。在某些实施例中,R2是乙基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,R3是乙基。在某些实施例中,反应步骤在非质子溶剂(如四氢呋喃(THF))中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在-20℃与20℃之间、例如在-20℃与10℃之间、在-15℃与0℃之间、或在-10℃与0℃之间的温度下进行。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式E的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000111
该方法包括使具有式A的化合物:
Figure BDA0004097454550000112
与甲脒或其盐反应的步骤;
其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,每个R3是乙基,并且R1是保护基。在某些实施例中,如果每个R3是乙基,则R1不是H。在某些实施例中,反应步骤在非质子溶剂(如双(2-甲氧基乙基)醚(二甘醇二甲醚))中进行。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如甲醇)中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在20℃与180℃之间、例如在50℃与165℃之间的温度下进行。在某些实施例中,甲脒是乙酸甲脒。在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式E的化合物的方法,该方法包括使具有式A的化合物与甲脒或其盐反应;或与铵源和原甲酸三烷基酯反应的步骤;或与铵源和二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应的步骤;其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,R3是乙基。在某些实施例中,R3是乙基,并且R1是保护基。在某些实施例中,如果R3是乙基,则R1不是H。在某些实施例中,反应步骤在非质子溶剂(如双(2-甲氧基乙基)醚(二甘醇二甲醚))中进行。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如甲醇)中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在20℃与180℃之间、例如在50℃与165℃之间的温度下进行。在某些实施例中,该方法包括使具有式A的化合物与铵源和原甲酸三烷基酯反应的步骤。在某些实施例中,原甲酸三烷基酯是原甲酸三甲酯。在某些实施例中,铵源是氨。在某些实施例中,铵源是铵盐。在某些实施例中,铵盐是乙酸铵。在某些实施例中,原甲酸三烷基酯选自原甲酸三甲酯和原甲酸三乙酯。在某些实施例中,该方法包括使具有式A的化合物与乙酸铵和原甲酸三甲酯反应的步骤。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式B的化合物:
Figure BDA0004097454550000131
具有式C的化合物:
Figure BDA0004097454550000132
或其混合物的方法,该方法包括使具有式A的化合物:
Figure BDA0004097454550000133
与铵盐反应的步骤;其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,R3是乙基。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如乙醇,例如,无水乙醇)、非质子溶剂(如双(2-甲氧基乙基)醚(二甘醇二甲醚))中进行。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如甲醇、乙醇、或正丁醇,例如,无水甲醇、乙醇、或正丁醇)中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在20℃与120℃之间、例如在20℃与100℃之间的温度下进行。在某些实施例中,铵盐是甲酸铵。在某些实施例中,该方法产生具有式B的化合物。在某些实施例中,该方法产生具有式C的化合物。在某些实施例中,该方法产生具有式B的化合物和具有式C的化合物的混合物。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式B的化合物、具有式C的化合物或其混合物的方法,该方法包括使具有式A的化合物与氨源(如氨或铵盐)反应的步骤;其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,R3是乙基。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如甲醇、乙醇、正丁醇,例如,无水甲醇、乙醇、或正丁醇)或非质子溶剂(如双(2-甲氧基乙基)醚(二甘醇二甲醚))中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在20℃与120℃之间、例如在20℃与100℃之间的温度下进行。在某些实施例中,该方法包括使具有式A的化合物与甲酸铵反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式A的化合物与乙酸铵反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式A的化合物与氨反应的步骤。在某些实施例中,该方法产生具有式B的化合物。在某些实施例中,该方法产生具有式C的化合物。在某些实施例中,该方法产生具有式B的化合物和具有式C的化合物的混合物。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式E的化合物的方法:
Figure BDA0004097454550000151
该方法包括使具有式B的化合物:
Figure BDA0004097454550000152
具有式C的化合物:
Figure BDA0004097454550000153
或其混合物
与甲脒或其盐反应的步骤;
其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,R3是乙基。在某些实施例中,R3是乙基,并且R1是保护基。在某些实施例中,R3是乙基,并且R1不是H。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如正丁醇)中进行。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如甲醇、NH3/甲醇或正丁醇)中进行。在某些实施例中,反应步骤在非质子溶剂(如甲苯)中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在20℃与150℃之间、例如在50℃与140℃之间的温度下进行。在某些实施例中,甲脒是乙酸甲脒。在某些实施例中,该方法包括使具有式B的化合物与甲脒或其盐反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式C的化合物与甲脒或其盐反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式B的化合物和具有式C的化合物的混合物与甲脒或其盐反应的步骤。
在另一个方面,本发明提供了用于制备具有式E的化合物的方法,该方法包括使具有式B的化合物、或具有式C的化合物与甲脒或其盐反应;或与原甲酸三烷基酯(如原甲酸三甲酯或原甲酸三乙酯)和铵源反应,或与二甲基甲酰胺二甲基缩醛和铵源反应的步骤;其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,R1是保护基。在某些实施例中,R1是保护基,其是苄基。在某些实施例中,R3是甲基。在某些实施例中,R3是乙基。在某些实施例中,R3是乙基,并且R1是保护基。在某些实施例中,R3是乙基,并且R1不是H。在某些实施例中,反应步骤在质子溶剂(如甲醇、NH3/甲醇或正丁醇)中进行。在某些实施例中,反应步骤在非质子溶剂(如甲苯)中进行。在某些实施例中,反应步骤在惰性气氛(例如,氮气气氛)下进行。在某些实施例中,反应步骤在20℃与150℃之间、例如在50℃与140℃之间的温度下进行。在某些实施例中,该方法包括使具有式B的化合物与原甲酸三甲酯反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式C的化合物与原甲酸三甲酯反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式B的化合物和具有式C的化合物与原甲酸三甲酯反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式B的化合物与二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式C的化合物与二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应的步骤。在某些实施例中,该方法包括使具有式B的化合物和具有式C的化合物与二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应的步骤。
在某些实施例中,铵源是氨或铵盐。在某些实施例中,铵盐是甲酸铵、氯化铵或乙酸铵。
在一个方面,本发明提供了用于制备具有式7的化合物的方法,该化合物是可用于合成鲁索替尼、CTP-543和其他JAK抑制剂的中间体。在某些实施例中,这些方法包括以下方案1中所示的步骤:
方案1
Figure BDA0004097454550000171
在某些实施例中,用于制备具有式7的化合物的方法包括使具有式6a的化合物与甲脒或其盐反应;或与原甲酸三甲酯反应,或与二甲基甲酰胺二甲基乙缩醛反应的步骤。
在其他实施例中,这些方法包括以下方案2中所示的步骤:
方案2
Figure BDA0004097454550000181
在某些实施例中,用于制备具有式7的化合物的方法包括使具有式6b的化合物与甲脒或其盐反应;或与原甲酸三甲酯反应,或与二甲基甲酰胺二甲基乙缩醛反应的步骤。
在某些实施例中,这些方法包括以下方案3中所示的步骤:
方案3
Figure BDA0004097454550000182
在一个方面,化合物8(即,其中R1是H的具有式7的化合物)可以用作用于制备鲁索替尼的方法中的中间体,例如,如以下方案4中所示:
方案4
Figure BDA0004097454550000191
用磷酸(H3PO4)处理由上述方法产生的鲁索替尼,产生鲁索替尼的磷酸盐。
在另一个方面,化合物8(即,其中R1是H的具有式7的化合物)可以用作用于制备CTP-543的方法中的中间体,如以下方案5中所示:
方案5
Figure BDA0004097454550000192
用磷酸(H3PO4)处理由上述方法产生的CTP-543,产生CTP-543的磷酸盐。
中间体
在一个方面,本发明提供了可用于制备鲁索替尼、鲁索替尼的氘代类似物和其他JAK抑制剂的化合物和中间体。参见例如PCT公开WO 2020/163653。
在某些实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000201
或其盐,其中R1是H或保护基,并且每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,如果每个R3是乙基,则R1不是H。在某些实施例中,R1是苄基。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,每个R3是甲基。
在一个实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000202
或其盐。
在另一个实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000203
或其盐。
在某些实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000204
或其盐,其中R1是H或保护基,并且每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是苄基。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,每个R3是甲基。在某些实施例中,每个R3是乙基。在某些实施例中,如果每个R3是乙基,则R1不是H。
在另一个实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000211
或其盐。
在另一个实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000212
或其盐。
在某些实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000213
或其盐,其中R1是H或保护基,并且每个R3是C1-C10烷基(例如,甲基或乙基)、C2-C10烯基(例如,烯丙基)、芳基,或两个R3’与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环(例如,1,3-二氧戊环-2-基环、或1,3-二噁烷-2-基环、或1,3-苯并二氧戊环-2-基环,各自任选地被一个或多个甲基取代)。在某些实施例中,R1是苄基。在某些实施例中,R1是H。在某些实施例中,每个R3是甲基。在某些实施例中,每个R3是乙基。在某些实施例中,如果每个R3是乙基,则R1不是H。
在另一个实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000221
或其盐。
在另一个实施例中,本发明提供了由以下结构表示的化合物:
Figure BDA0004097454550000222
或其盐。
实例
Figure BDA0004097454550000223
实例1:1-苄基-1H-吡唑-4-甲酸甲酯(16)的制备
Figure BDA0004097454550000224
向带有搅拌棒、热电偶和正氮气流的250ml夹套烧瓶中添加1H-吡唑-4-甲酸甲酯15a(10g,77.7mmol,1.0当量)和K2CO3(21.9g,158mmol,2.04当量),随后添加二甲基甲酰胺(DMF)(80ml)。将混合物冷却至0℃。在10分钟内装入苄基溴(11.3ml,93.3mmol,1.2当量)。使反应混合物达到室温并搅拌18小时。添加水(50ml),并且将混合物转移至500ml分液漏斗中。将混合物用乙酸乙酯(150ml)萃取两次。将合并的有机萃取物用盐水(30ml)洗涤,经Na2SO4干燥,并在真空中浓缩,得到无色残余物,将其静置结晶,提供1-苄基-1H-吡唑-4-甲酸甲酯16a(14.1g,85%产率)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.85(s,1H),7.75(s,1H),7.31-7.22(m,3H),7.187.13(m,2H),5.21(s,2H),3.71(s,3H)。
实例2:2-(1-苄基-1H-吡唑-4-羰基)-4,4-二甲氧基丁腈(17)的制备
Figure BDA0004097454550000231
向带有热电偶、搅拌棒和正氮气流的125ml夹套烧瓶中添加双(三甲基甲硅烷基)氨基钠(44ml,87.5mmol,2.2当量,在四氢呋喃(THF)中2M)和10ml无水THF。将混合物冷却至-14℃。在40分钟内将化合物1-苄基-1H-吡唑-4-甲酸酯16a(8.6g,39.8mmol,1.0当量)和4,4-二甲氧基丁腈4(6.2ml,47.7mmol,1.2当量)在15ml THF中的溶液装入混合物中。添加后,将混合物在-10℃下搅拌1小时,然后在0℃下搅拌过夜。使用盐酸(0.5N)将反应混合物酸化至pH=2,然后用乙酸乙酯(150ml)萃取两次。将合并的有机萃取物用水(20ml)、盐水(20ml)洗涤,然后经Na2SO4干燥并在真空中浓缩,得到无色油状残余物。将残余物通过快速色谱法(使用乙酸乙酯/庚烷(1:1))纯化,得到呈无色油状物的产物2-(1-苄基-1H-吡唑-4-羰基)-4,4-二甲氧基丁腈17(10.9g,87%产率)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.05(s,1H),7.99(s,1H),7.42-7.34(m,3H),7.30-7.25(m,2H),5.37-5.28(m,2H),4.52(dd,1H),4.05(m,1H),3.39(s,3H),3.30(s,3H),2.30(m,1H),2.18(m,1H)。
实例3:2-(氨基(1-苄基-1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈(18)的制备
Figure BDA0004097454550000232
向带有搅拌棒、热电偶和正氮气流的125ml夹套烧瓶中添加化合物2-(1-苄基-1H-吡唑-4-羰基)-4,4-二甲氧基丁腈17(2.66g,8.49mmol,1.0当量)和甲酸铵(3.0g,42.4mmol,5当量),随后添加无水乙醇(25ml)和0.6g的
Figure BDA0004097454550000241
分子筛。将混合物加热回流18小时。将反应混合物通过短二氧化硅塞过滤,随后用乙醇(5mL)洗涤。将所得滤液在真空中浓缩,得到浅棕色残余物,将其通过柱色谱法(使用二氯甲烷/甲醇(10:1))纯化,提供呈黄色油状物的2-(氨基(1-苄基-1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈18(1.82g,69%产率,E:Z=9:1)。通过NOESY数据证实了主要烯胺异构体的E-几何构型。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.99(s,1H),7.80(s,1H),7.38-7.30(m,3H),7.277.22(m,2H),5.31(s,2H),4.83(bs,2H),4.45(t,1H),3.43(s,6H),2.51(d,2H)。
实例4:6-(1-苄基-1H-吡唑-4-基)-5-(2,2-二甲氧基乙基)嘧啶-4-胺(19)的制备
Figure BDA0004097454550000242
向带有冷凝器、搅拌棒、热电偶和正氮气流的25ml双颈烧瓶中添加化合物(E)-2-(氨基(1-苄基-1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈18(0.40g,1.28mmol,1.0当量)和乙酸甲脒(0.40g,3.84mmol,3当量),随后添加正丁醇(8ml)和100mg的
Figure BDA0004097454550000243
分子筛。将所得混合物加热回流18小时。装入另外的乙酸甲脒(0.27g,2.0当量)并继续回流36小时。在3天内添加另外的乙酸甲脒(810mg,5.0当量),同时保持回流温度。总共6天后,反应混合物的等分试样分析指示以>80%的转化率转化成6-(1-苄基-1H-吡唑-4-基)-5-(2,2-二甲氧基乙基)嘧啶-4-胺19,将其通过HPLC-MS通过与参考标记物比较来鉴定。
UV max:240和290;LCMS(ESI,正模式):预期值:340.2(M+H);发现值:340.1(M+H)。
实例5a:4,4-二甲氧基-2-(1H-吡唑-4-羰基)丁腈(20)的制备
Figure BDA0004097454550000251
向带有热电偶、搅拌棒和缓慢氮气流的250ml夹套烧瓶中添加双(三甲基甲硅烷基)氨基钠(NaHMDS)(67.5ml,135mmol,3.4当量,在THF中2M),并且将其冷却至-14℃。在3小时内将吡唑-4-甲酸甲酯15a(5g,39.6mmol,1.0当量)和4,4-二甲氧基丁腈4(7.3ml,55.5mmol,1.4当量)在15ml THF中的溶液添加到双(三甲基甲硅烷基)氨基钠的溶液中。将混合物在-10℃下搅拌1小时,然后在0℃下搅拌过夜。将反应混合物冷却至-10℃,并且使用盐酸(0.5N)酸化至pH=2。然后将溶液转移到500ml分液漏斗中,并且用乙酸乙酯(100ml)萃取两次。将合并的有机层用水(20ml)、盐水(20ml)洗涤,经Na2SO4干燥,并在真空中浓缩以提供无色油状物。将残余物通过快速色谱法(使用乙酸乙酯/庚烷(8:2))纯化,提供呈无色油状物的4,4-二甲氧基-2-(1H-吡唑-4-羰基)丁腈20(6.0g,61%产率)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.24(s,2H),4.55(dd,1H),4.17(dd,1H),3.41(s,3H),3.34(s,3H),2.35(m,1H),2.24(m,1H)。
实例5b:4,4-二甲氧基-2-(1H-吡唑-4-羰基)丁腈(20)的制备
Figure BDA0004097454550000252
向NaHMDS在THF中的2M溶液(375mL,749mmol,3.5当量)中添加THF(53.5mL,1.8体积),并且将溶液冷却至-5℃。然后添加4-吡唑甲酸乙酯15b(30.0g,214mmol,1.0当量)在THF(33mL,1.1体积)中的溶液,用另外的THF(5.0mL,0.2体积)冲洗。在6小时的时间段内,在-5℃至0℃的温度下,向所得橙色悬浮液中添加3-氰基丙醛二甲基缩醛4(36.0g,278mmol,1.3当量)在THF(72mL,2.4体积)中的溶液。然后将反应混合物在此温度下保持另外15小时,然后添加水(180mL,6.0体积),同时保持温度≤5℃。停止搅拌,并且去除上层有机层。将水相用6N HCl(92mL,3.0体积)调节至pH为约11,然后用2-MeTHF(2×120mL,2×4体积)洗涤。弃去有机相,并且将正丁醇(150mL,5体积)添加到剩余的水溶液中。将所得混合物用85%磷酸(约8mL)调节至pH 5,然后停止搅拌并分离各层。收集有机层,并且将剩余的水溶液进一步用正丁醇(150mL,5体积)萃取。将有机层合并,用水(100mL,3.3体积)洗涤,然后在真空中浓缩至120mL(4体积)的目标体积以提供二甲基缩醛20,其为在正丁醇中的红色/橙色透明溶液(135.6g,28.2%w/w,通过QNMR(定量1H-NMR)测定:38.2g的20,80%产率)。
实例6a:5-(2,2-二甲氧基乙基)-6-(1H-吡唑-4-基)嘧啶-4-胺(8)的制备
Figure BDA0004097454550000261
向带有搅拌棒的4mL玻璃小瓶中添加4,4-二甲氧基-2-(1H-吡唑-4-羰基)丁腈20(45.9mg)、甲脒乙酸盐(300mg,14当量)和双(2-甲氧基乙基)醚(0.500mL)。将小瓶在保持在150℃的加热器小瓶保持器中加热1.5小时,同时搅拌,然后冷却至室温。将氢氧化钠溶液(在水中15wt%,1.0mL)装入小瓶中。将小瓶轻轻摇动5分钟。将磷酸盐缓冲液(3M磷酸盐,pH7,1mL)、双(2-甲氧基乙基)醚(0.500mL)和活性炭(DARCO KB-G)装入小瓶中。将小瓶轻轻摇动5分钟,然后在聚丙烯过滤器上过滤,以提供澄清的暗红色有机层和澄清的淡黄色水层。将有机层通过柱色谱法(在二氯甲烷中的0%至10%甲醇)纯化。用氮气流干燥含产物的部分,并且将残余物溶解在正丁醇(1.0mL)中,并且用磷酸三钾溶液(1.0mL,1mol)洗涤。浓缩有机物,以提供5-(2,2-二甲氧基乙基)-6-(1H-吡唑-4-基)嘧啶-4-胺8(13.2mg,25.7%产率)。
1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δ13.10(s,1H),8.24(s,1H),8.07(br s,1H),7.95(br s,1H),6.57(s,2H),4.63(t,J=5.5Hz,1H),3.28(s,6H),2.93(d,J=5.5Hz,2H)。
13C-NMR(101MHz,DMSO)δ163.44,156.03,155.75,139.38(br),129.28(br),119.81,107.80,103.49,53.88,31.36。
LCMS(ESI,正模式):预期值:250.1(M+H);发现值:250.1(M+H)。
实例6b:5-(2,2-二甲氧基乙基)-6-(1H-吡唑-4-基)嘧啶-4-胺(8)的制备
Figure BDA0004097454550000271
向含有4,4-二甲氧基-2-(1H-吡唑-4-羰基)丁腈20(5g)的烧瓶中添加在甲醇(6体积)中的NH4OAc(6.7当量)。将混合物在68℃下搅拌过夜,然后通过蒸馏除去甲醇并且用原甲酸三甲酯替代。将混合物加热至92℃并搅拌4小时,然后冷却至约0℃并搅拌2小时,随后过滤以除去固体。将滤饼用乙腈(2×5mL)洗涤,并且将所得滤液在真空中浓缩。添加乙腈(15mL),并且将所得混合物在环境温度下搅拌1.5小时,随后过滤以除去固体。将滤饼用乙腈(5mL)洗涤,并且将所得滤液在真空在浓缩成棕色液体。将粗产物通过硅胶色谱法(使用0%-70%甲醇/CH2Cl2作为洗脱剂)纯化,得到呈浅棕色固体的8。QNMR(CD3OD)表明摩尔产率为65%。
实例7a:(E)-2-(氨基(1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈(22)的制备
Figure BDA0004097454550000281
向4mL玻璃小瓶中添加4,4-二甲氧基-2-(1H-吡唑-4-羰基)丁腈20(161mg)、乙酸铵(65mg,1.2当量)和双(2-甲氧基乙基)醚(2.0mL)。将混合物温热至100℃持续18小时,然后冷却至室温并转移到20mL闪烁瓶中。装入甲基叔丁基醚(3.0mL)和磷酸三钾溶液(3.0mL,0.5M),并且将混合物老化1小时。添加固体磷酸钾(0.40g)和活性炭(DARCO KB-G,0.115g),并轻轻摇动小瓶。过滤混合物以提供三相混合物。将顶层移至另一小瓶中。将剩余的两层用5mL甲基叔丁基醚萃取两次,并且将三个甲基叔丁基醚层合并。将合并的甲基叔丁基醚萃取物用氮气流干燥,以提供呈黄色油状物的(E)-2-(氨基(1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈22,其含有21.7wt%双(2-甲氧基乙基)醚(0.119g,58.5%产率)。
1H-NMR(400MHz,氯仿-d)δ10.88(s,1H),7.87(s,2H),5.12(s,2H),4.40(t,J=5.1Hz,1H),3.34(s,6H),2.42(d,J=5.1Hz,2H)。
13C-NMR(101MHz,CDCl3)δ151.55,133.83,124.62,116.99,105.51,70.75,54.74,33.58。
LCMS(ESI,正模式):预期值:223.1(M+H);发现值:223.1(M+H)。
实例7b:(E)-2-(氨基(1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈(22)的制备
Figure BDA0004097454550000282
向20(38.2g,171mmol)在正丁醇(191mL,5体积)中的搅拌溶液中添加乙酸铵(66.0g,856mmol,5.0当量)。将所得混合物在60℃下搅拌15小时,然后冷却至20℃。添加0.5M磷酸氢二钾溶液(191mL,5体积),随后添加正丁醇(76.4mL,2体积)。然后停止搅拌并且除去水层。然后将有机层用0.5M磷酸氢二钾溶液(3×135mL,3×3.5体积)洗涤,然后用0.05M磷酸氢二钾(153mL,3.5体积)洗涤。向剩余的有机溶液中添加碳(Darco KB-G,1.91g),并且将所得悬浮液在20℃下搅拌1小时,然后通过硅藻土过滤,用正丁醇(76.4mL,2体积)冲洗。将合并的滤液浓缩至约2体积的目标体积,并且将所得棕色悬浮液加热至60℃。在60℃下在2小时的时间段内添加庚烷(131mL,3.4体积),然后将所得浆液在此温度下保持另外一小时。冷却至20℃后,将浆液在真空下过滤,并且用25%正丁醇/庚烷(67mL,1.75体积)冲洗。将滤饼在50℃下在真空下干燥,以提供呈棕褐色粉末的22(32.1g,84%产率)。
实例7c:(E)-2-(氨基(1H-吡唑-4-基)亚甲基)-4,4-二甲氧基丁腈(22)的制备
Figure BDA0004097454550000291
向20(37.2g,167mmol,1.0当量)在MeTHF(45.7%w/w溶液)中的搅拌溶液中添加乙酸铵(64.3g,5.0当量)和甲醇(186mL,5体积)。将所得混合物在60℃下搅拌22小时,然后冷却至20℃。向混合物中添加碳(Darco KB-G,1.86g),并且将所得悬浮液在20℃下搅拌1小时,然后通过硅藻土过滤,用甲醇(112mL,3体积)冲洗。将合并的滤液浓缩至干,得到琥珀色澄清油状物,在搅拌下将其冷却至20℃-25℃,得到浆液。添加水(223mL,6体积),并且在20℃-25℃下搅拌批料5分钟。在冷却至0℃-5℃后,将混合物在此温度下搅拌2小时。将滤液在真空下过滤,并且将滤饼用水(112mL,3体积)冲洗。将滤饼在50℃-60℃下在真空下干燥,提供呈米色固体的22(37.9g,100%产率-98.6%w/w,QNMR)。
实例8:6-(1-苄基-1H-吡唑-4-基)-5-(2,2-二甲氧基乙基)嘧啶-4-胺(8)的制备
Figure BDA0004097454550000301
实例8a:
Figure BDA0004097454550000302
向22(5.0g,1.0当量)在二甲基乙酰胺(DMAc)(20mL)中的溶液中添加乙酸甲脒(11.8g,5.2当量),并且将所得悬浮液加热至115℃。在115℃下搅拌36小时后,将反应物冷却至90℃并添加水(10mL)。在90℃下搅拌一小时后,将反应物冷却至20℃,并添加另外的DMAc(10mL)。将所得深色溶液通过硅藻土垫过滤,随后用3:1DMAc/水(15mL)冲洗。将滤液合并,用水(28mL)稀释并添加碳(1.5g)。将所得悬浮液在20℃下搅拌一小时,然后过滤,用1:1DMAc/水(7.5mL)冲洗。向合并的滤液中添加在水中的25%w/w NaCl(4mL),并且将所得混合物用17%正丁醇/CH2Cl2(4×24mL)萃取。将有机层合并,用在水(15mL)中的15%w/wK3PO4洗涤,然后在真空下浓缩至约10mL。添加DMAc(4mL),使总DMAc含量为10mL,然后将所得溶液添加到预冷却至-20℃的甲基叔丁基醚(MTBE)(25mL)中。添加中间体8晶种,并且将所得浆液在-20℃下搅拌4小时,然后添加另外的MTBE(5mL)。在-20℃下搅拌另外4小时后,过滤浆液,并且将所得滤饼用3:1MTBE/DMAc(7.5mL)洗涤。在真空烘箱中干燥后,获得呈灰白色固体的5-(2,2-二甲氧基乙基)-6-(1H-吡唑-4-基)嘧啶-4-胺8(2.91g,54%产率)。
实例8b:
Figure BDA0004097454550000311
向带有螺旋盖和磁力搅拌器的100-mL半夹套玻璃反应器中添加固体吡唑-烯胺22(5.56g,25mmol,1.0当量)和NH4OAc(11.56g,150mmol,6.0当量),随后添加原甲酸三甲酯(TMOF)(50mL,9V)。将反应器用氮气冲洗并紧密密封。搅拌所得浆液,同时使夹套温度升高至88℃。使浆液溶解,得到棕色溶液。将溶液搅拌过夜(约20小时),同时将夹套温度保持在88℃。将混合物冷却至20℃,然后转移到圆底烧瓶中,并在真空中浓缩成棕色液体残余物(17.9g)。
向一部分这种棕色液体(10.6g,约为初始进料的61%)中添加TMOF(9.0mL)和NH4OAc(7.04g,91.3mmol)。将混合物在密封小瓶中在92℃下加热4小时,然后冷却至约0℃并搅拌2小时,随后过滤以除去固体。将湿滤饼用乙腈(2×5mL)洗涤,将所得滤液在真空中浓缩,向浓缩物中添加乙腈(15mL),将混合物在环境温度下搅拌1.5小时,随后过滤以除去固体。将滤饼用乙腈(5mL)洗涤,并且将所得滤液在真空中浓缩成棕色液体残余物。将粗产物通过硅胶色谱法(使用0%-70%甲醇/CH2Cl2作为洗脱剂)纯化,得到2.1g浅棕色固体。1H-NMR(DMSO-d6)证实了存在产物8和约8w%乙酸。定量1H-NMR(CD3OD)指示1.85g产物8,摩尔产率为49%。
实例8c:
Figure BDA0004097454550000312
将吡唑-烯胺22(5g)与乙酸甲脒(14g,6.0当量)和在甲醇(5mL)中的7N NH3混合。将混合物在密封反应器中搅拌并加热过夜,其中夹套温度设定为120℃。将另外的乙酸甲脒(7g,3当量)和在甲醇(5mL)中的7N NH3添加到所得反应混合物中,并且继续搅拌过夜,其中夹套温度设定为120℃。将反应混合物在真空中浓缩,并且将所得残余物通过硅胶塞(使用在乙腈中的10%-100%甲醇作为洗脱剂)纯化,得到2.7g呈浅米色固体的8(摩尔产率48%)。
实例8d:
Figure BDA0004097454550000321
向带有顶部搅拌的100mL反应器中装入22(5.0g)、甲苯(20mL)、TMOF(6mL)和乙酸酐(6mL)。将混合物加热至100℃并且在氮气下搅拌大约16小时。将夹套温度升至145℃,并且蒸馏出大约15mL溶液。向所得混合物中添加甲苯(15mL),并且将批料温度调节至60℃。将乙酸铵(8.8g)装入溶液中,并且将混合物在氮气下搅拌5小时。将批料温度调节至20℃,并且装入水(10mL)。将批料冷却至20℃,并且弃去澄清的有机层。将磷酸钾溶液(0.5M,80mL)添加到反应器中。将反应器夹套加热至145℃并且通过蒸馏除去5mL溶液。将批料冷却至60℃,并且添加大约2mg晶种中间体8。将混合物冷却至-2℃,并且添加另外2mg晶种。将混合物在此温度下搅拌14小时。将所得悬浮液在聚丙烯过滤漏斗上过滤,然后用冷水(10mL×2)洗涤两次。将棕褐色的沙状固体抽吸干燥45分钟,得到3.9g固体,KF滴定显示33%的水。测定纯度确定为61%,校正产率为41%。通过HPLC、1H NMR和质谱(ESI+M+H:预期值:250.1,发现值:250.1)与真实样品比较,来确认样品的身份。
实例8e:
Figure BDA0004097454550000331
程序A:向配备有搅拌棒的20mL闪烁瓶中装入22(0.281g)、甲醇(1.4mL)和二甲基甲酰胺二甲基缩醛(2.8当量)。将小瓶盖上盖子,并且在温热至60℃的小瓶保持器中将混合物搅拌4小时。将甲酸铵(0.420g)装入小瓶,重新盖上小瓶并在60℃下搅拌23小时。使用氮气流以从混合物中除去大部分甲醇。将混合物冷却,并且将磷酸钾溶液(0.5M,2mL)装入残余油状物中。将所得混合物短暂搅拌,添加另外的磷酸钾溶液(1M,1mL),并且立即形成白色悬浮液。将此悬浮液搅拌5分钟,然后过滤。将小瓶和滤饼用水(1mL)洗涤两次,然后将滤饼用1mL甲基叔丁基醚洗涤三次以促进除去水。在5分钟的抽吸干燥后,将固体转移到温热(60℃)小瓶中,并且用氮气流进一步干燥5分钟,得到0.132g棕褐色固体。第一批产物是72.1%w/w产物(定量NMR)和大约22%水(KF滴定)。将水溶液合并并且冷却至0℃持续24小时。将第二批较少的产物通过过滤分离并抽吸干燥20分钟,得到0.018g的第二批产物,为91%w/w(定量NMR)。沉淀的固体的合并分离产率为35%。
程序B:向烯胺22(2.0g,1.0当量)中添加2-丙醇(10mL,5体积)和二甲基甲酰胺二甲基乙缩醛(1.2mL,1.1当量)。将混合物在80℃-85℃下搅拌2小时,然后部分冷却。将甲酸铵(1.75g,3.0当量)添加到混合物中,并且将所得混合物在80℃-85℃下搅拌20小时。将磷酸钾溶液(0.5M,10mL,5体积)添加到混合物中,并且将所得混合物在85℃下浓缩至约5体积,然后添加水(10mL,5体积),并且再次在85℃下浓缩至约5体积。将混合物冷却至50℃,然后添加晶种8(约5mg)。将混合物冷却至20℃,搅拌1小时,然后过滤。将滤饼用水(5mL,2.5体积)洗涤,然后用MBTE(5mL,2.5体积)洗涤,然后真空干燥1小时,得到1.373g呈灰白色固体的8(93.0wt%,确定测定纯度,校正产率57%)。
无需进一步描述,认为本领域普通技术人员可以使用前面的描述和说明性实例制造和利用本发明的化合物并且实践所要求保护的方法。应理解,前述讨论和实例仅呈现某些优选的实施例的详细描述。对于本领域普通技术人员将显而易见的是,可以在不脱离本发明的精神和范围的情况下作出各种修改和等效方案。

Claims (52)

1.一种用于制备具有式E的化合物的方法:
Figure FDA0004097454540000011
该方法包括使具有式B的化合物:
Figure FDA0004097454540000012
具有式C的化合物:
Figure FDA0004097454540000013
或其混合物
与甲脒或其盐反应,或与原甲酸三烷基酯和铵源反应,或与二甲基甲酰胺二甲基缩醛和铵源反应的步骤;
其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基、C2-C10烯基、芳基,或两个R3与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环。
2.如权利要求1所述的方法,其中,R1是H。
3.如权利要求1所述的方法,其中,R1是保护基。
4.如权利要求3所述的方法,其中,R1是保护基,其是苄基。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法,其中,R3是甲基。
6.如权利要求1-4中任一项所述的方法,其中,R3是乙基。
7.如权利要求1-6中任一项所述的方法,其中,该方法包括使具有式B的化合物与甲脒或其盐反应,或与原甲酸三烷基酯反应,或与二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应。
8.如权利要求1-6中任一项所述的方法,其中,该方法包括使具有式C的化合物与甲脒或其盐反应,或与原甲酸三烷基酯反应,或与二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应。
9.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中,该反应步骤在质子溶剂中进行。
10.如权利要求9所述的方法,其中,该质子溶剂是甲醇或正丁醇。
11.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中,该反应步骤在非质子溶剂中进行。
12.如权利要求11所述的方法,其中,该非质子溶剂是甲苯。
13.如权利要求1-12中任一项所述的方法,其中,该方法包括使具有式B的化合物与甲脒或其盐反应的步骤。
14.如权利要求13所述的方法,其中,该甲脒或其盐是乙酸甲脒。
15.如权利要求1-7和9-12中任一项所述的方法,其中,该方法包括使具有式B的化合物与乙酸铵和原甲酸三甲酯反应的步骤。
16.一种用于制备具有式E的化合物的方法:
Figure FDA0004097454540000031
该方法包括使具有式A的化合物:
Figure FDA0004097454540000032
与甲脒或其盐反应,或与铵源和原甲酸三烷基酯反应的步骤;
其中R1选自H和保护基(PG),并且其中每个R3是C1-C10烷基、C2-C10烯基、芳基,或两个R3与它们所附接的氧原子一起形成可以任选地被取代的5-7元杂环;并且
该铵源是氨或铵盐;条件是如果每个R3是乙基,则R1不是H。
17.如权利要求16所述的方法,其中,R1是H。
18.如权利要求16所述的方法,其中,R1是保护基。
19.如权利要求18所述的方法,其中,R1是保护基,其是苄基。
20.如权利要求16-19中任一项所述的方法,其中,R3是甲基。
21.如权利要求16-19中任一项所述的方法,其中,R3是乙基。
22.如权利要求16所述的方法,其中,该铵源是铵盐。
23.如权利要求22所述的方法,其中,该铵盐是乙酸铵。
24.如权利要求16-23中任一项所述的方法,其中,该反应步骤在非质子溶剂中进行。
25.如权利要求24所述的方法,其中,该非质子溶剂是双(2-甲氧基乙基)醚。
26.如权利要求16-23中任一项所述的方法,其中,该反应步骤在质子溶剂中进行。
27.如权利要求26所述的方法,其中,该质子溶剂是甲醇。
28.如权利要求16-27中任一项所述的方法,其中,该方法包括使具有式A的化合物与甲脒或其盐反应的步骤。
29.如权利要求28所述的方法,其中,甲脒或其盐是乙酸甲脒。
30.如权利要求16-28中任一项所述的方法,其中,该方法包括使具有式A的化合物与乙酸铵和原甲酸三烷基酯反应的步骤。
31.一种用于制备具有式7的化合物的方法:
Figure FDA0004097454540000051
该方法包括使具有式6a的化合物:
Figure FDA0004097454540000052
与甲脒或其盐反应;或与原甲酸三甲酯反应,或与二甲基甲酰胺二甲基乙缩醛反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。
32.如权利要求31所述的方法,其中,R1是H。
33.如权利要求31所述的方法,其中,R1是保护基,其是苄基(Bn)。
34.一种用于制备具有式7的化合物的方法:
Figure FDA0004097454540000053
该方法包括使具有式5的化合物:
Figure FDA0004097454540000054
与甲脒或其盐反应;或与铵源和原甲酸三烷基酯反应;或与铵源和二甲基甲酰胺二甲基缩醛反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。
35.如权利要求34所述的方法,其中,R1是H。
36.如权利要求34所述的方法,其中,R1是保护基,其是苄基(Bn)。
37.一种由以下结构表示的化合物:
Figure FDA0004097454540000061
或其盐
其中Bn是苄基。
38.一种用于制备具有式5的化合物的方法:
Figure FDA0004097454540000062
该方法包括使具有式1的化合物:
Figure FDA0004097454540000063
与化合物4
Figure FDA0004097454540000064
和碱反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG),并且其中R2是C1-C4烷基。
39.如权利要求38所述的方法,其中,R1是H。
40.如权利要求38所述的方法,其中,R1是保护基,其是苄基(Bn)。
41.如权利要求38-40中任一项所述的方法,其中,R2是甲基。
42.如权利要求38-40中任一项所述的方法,其中,R2是乙基。
43.如权利要求38-42中任一项所述的方法,其中,该碱是NaHMDS。
44.一种用于制备具有式6a的化合物的方法:
Figure FDA0004097454540000071
该方法包括使具有式5的化合物:
Figure FDA0004097454540000072
与铵源反应的步骤;
其中R1选自H或保护基(PG)。
45.如权利要求44所述的方法,其中,R1是H。
46.如权利要求44所述的方法,其中,R1是保护基,其是苄基(Bn)。
47.如权利要求44-46中任一项所述的方法,其中,该铵源选自甲酸铵、氯化铵和乙酸铵。
48.一种由以下结构表示的化合物:
Figure FDA0004097454540000081
或其盐
其中Bn是苄基。
49.一种由以下结构表示的化合物:
Figure FDA0004097454540000082
或其盐。
50.一种由以下结构表示的化合物:
Figure FDA0004097454540000083
或其盐。
51.一种由以下结构表示的化合物:
Figure FDA0004097454540000084
或其盐
其中Bn是苄基。
52.一种由以下结构表示的化合物:
Figure FDA0004097454540000091
或其盐。
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