CN115831304A - 一种生物样本检测管理系统及异常样本追溯方法 - Google Patents

Abstract

本发明提供一种生物样本检测管理系统及异常样本追溯方法，包括:样本录入、结果获取和报告生成。首先对样本来源、数量等基础采集信息进行录入，利用扫码器扫描样本号录入至管架号中完成样本采集录入；其次对样本检测的结果进行获取，检测结果的获取有简易模式和追溯模式，通常情况采用一般简易模式，样本录入完成进入实验区后直接生成检测结果，需人工点击虚拟样本板，进行结果确认；最后报告生成，可以单个生成，也可以批量生成，将生成的报告上传完成整个样本管理流程。如异常样本出现，采用追溯模式对异常样本进行复测，追溯模式下，需要通过移动设备对样本号进行扫码加样、提取、转板和检测后再生成检测结果。

Description

一种生物样本检测管理系统及异常样本追溯方法

技术领域

本发明涉及医疗检测技术领域，具体为一种生物样本检测管理系统及异常样本追溯方法。

背景技术

现如今对冠状病毒的检测是人们关注的重点，冠状病毒检测是及早发现新冠感染的有效手段。

核酸检测时实验室检测人员要对收集的样本试剂进行采集、扫描、检测等工作，完成对样本的核酸检测工作时，还需要按条码对核酸检测结果进行逐个录入，再发布与核酸检测结果对应的核酸检测报告。在核酸检测时样本的数量有时非常庞大，逐个录入核酸检测结果并发布核酸检测报告的方式，效率较低，无法满足快速出报告的需求。

发明内容

针对现有技术的不足，本申请提供一种生物样本检测管理系统及异常样本追溯方法，以解决逐个录入核酸检测结果和发布核酸检测报告的过程中效率较低的技术问题。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：

一种生物样本检测管理系统，包括待检测样本、样本扫描模块、样本报告生成模块以及上传统计模块，一个样本孔板对应多个待检测样本，所述样本孔板具有专属的管架号，通过管家号可以查询到该样本孔板所对应的多个样本的样本信息；

所述样本扫描模块，通过扫码枪对所述样本孔板进行扫码，能够在选择了管架号后使得当前扫描样本号默认绑定管架号；

所述样本报告生成模块，在将待检测样本送入试验区完成实验检测后生成检测结果数据；

所述上传统计模块，根据地区自动统计接收样本数量、已扫描数量、检测完成率、未完成率的统计信息。

进一步的，包括简易模式，能够对样本检测信息进行批量录入，一个样本信息还包括送检单位、送检地区、单管、5混1、10混1、20混1、送样人、和接收人；一个样本信息对应多个样本号数据，通过界面查看所述样本信息中已扫描的所有样本号；

利用扫码枪扫描样本号可选择正常扫码或者加急扫码，还可以选择扫描样本号为条码不清，如果当前需要手动输入样本号的场景，也可点击手动输入样本号按钮进行操作；

检测结果在检测结果详请界面中按照参数配置中的样本位总数、横向孔数、竖向孔数的排布的方式进行排布；

根据检测结果中的异常样本异常标记生成审核数据，其中，审核数据中存在已审核和未审核，已审核数据如是操作保存，可点击退回返回未审核。

进一步的，还包括追溯模式，在系统参数配置追溯模式，通过PDA扫码设备对样本进行扫码加样，提取，转板和检测操作；

基于一个管架号对一个检测孔板对应的多个样本的样本检测结果进行批量标注和显示；

还包括在样本号不清晰、需要手动输入样本号、赝本漏液的情况下对应的方法操作以完成整个录入流程。

进一步的，还包括异常样本追溯和实时监测模块，使用PAD设备对异常样本的管架对应的样本号进行扫码加样、提取、转板和检测后再生成检测结果，完成异常样本的复测；

在加样、提取、转板的流程中，录入每个流程的操作记录人员、流程的开始时间、完成时间和附加信息；如果样本扫描八小时以后还未出检测报告，则系统进行提示；还包括板架号履历查询模块，查看每个板架的履历、时间、操作人和仪器信息，为加样、提取、转板的流程设置标准时间，当某个流程的运转超时，会进行系统提示；当异常数据进行复测时，记录复测原因，所述复测原因包括N异常、O异常、NO异常、无IC，根据复测的轮次设置提示颜色；

通过流程监测、问题跟踪、结果反馈的方式来进行操作信息记录、系统提示、信息通知，保证核酸检测的时效性和准确性；

还包括监测数据可视化模块，在地图类统计方式中以省、市、区的方式统计各区域的采样数、阴性样本数量、异常样本数量；在图表类统计方式中，以柱形图方式统计每日、周、月的采样数量、样本条码不清晰数量，以折线图的方式统计一段时间类的采样数量、阴性样本数量、异常样本数量的增减趋势，以饼图的方式统计阴性样本数量、异常样本数量的比例信息，以路径图的方式统计异常样本的行程轨迹。

进一步的，还包括实验室操作步骤追踪日志文件，所述日志文件对样本的加样、提取、转板操作人和操作时间进行实时记录，便于追溯样本检测过程中的流转过程和记录；

当异常样本确定需要复测时，设定不同颜色进行提醒，黄色代表尚未进行复测，蓝色代表已经进入实验室流程，绿色代表复测后正常，红色代表复测后还是异常，进一步加强管控异常样本的管理。

一种生物样本检测及异常样本追溯方法，采用以上的生物样本检测管理系统，包括以下步骤：

步骤a，通过扫码枪获取样本号，将虚拟样本列表的第i+1的位置作为录入位置；

步骤b，判断待录入位置是否为质检位，如果所述判断的结果为是，将当前虚拟样本列表序号+1并记录，重复步骤b；如果所述判断的结果为否，进入步骤c；

步骤c，记录当前虚拟样本列表需要，在虚拟样本列表最后的位置添加记录的列表序列号和样本号；

步骤d，结束本次样本号的扫码录入。

进一步的，扫码样本号录入后，将样本送入实验区，生成检测结果和虚拟样本板，其中所述进入实验区后包括简易模式和PAD模式；

所述简易模式中，样本进入实验区检测后生成检测结果，需要根据实验结果点击虚拟样板中孔位来标记样本号是否异常，异常为黄色填充；

所述PAD模式中，进入实验区后需要工作人员使用PDA扫码设备对样本号进行扫码加样、提取、转板和检测操作，同样会生成虚拟样板，不需要点击标记异常，系统自动带出异常样本号。

与现有技术相比，本发明提供了一种生物样本检测管理系统及异常样本追溯方法，具备以下有益效果：

一、样本录入和数据统计的快速响应

1.样本信息录入

在该技术方案中，可以基于一个管架号实现了对一个管架号对应多个样本，利用扫码枪扫描当前管架号，即可将管架信息（包括但不限于所属地理位置、采样时间、送检时间等信息）和该管架包含的多个样本信息（受检人身份信息）录入系统，在进入实验区完成实验检测后生成检测结果数据，根据样本的样本信息生成一个数据结果检测孔板，实现了对一个管架号对应多个样本的样本检测结果的批量生成；同时方便检测人员对同一批次进行检测的样本检测结果进行核查和标记；也可以通过批量导入功能将记录了送检样本信息的文件导入系统，完成样本信息的快速录入。

2.异常样本追溯

针对异常样本，基于一个管架号实现了对一个管架号对应多个样本，使用PAD设备对该管架对应的样本号进行扫码加样，提取，转板和检测后再生成检测结果，完成异常样本的复测。

3.检测结果统计

在系统进行检测结果查询时，可通过样本所属管架对应的位置信息使用数据库分组查询功能将检测结果按照不同统计粒度统计出接收样本数量、已扫描数量、检测完成率、未完成率等不同的统计量数据，帮助用户掌握检测样本汇总信息。

二、样本检测流程的实时监测

样本录入系统之后需要按照检测顺序进行检测，然后输出检测报告，但在实际检测中，可能会出现样本检测未按照既定流程运转、有样本需要加急检测、有异常样本需要追溯等情况，有鉴于此，对受检样本的全流程进行实时、动态的监测、提示、防控和异常情况的应急处理十分必要。系统设置了两种完备而灵活的监测模式，一是在追溯模式中，从异常样本加样到输出检测报告对整个流程进行监测；二是在使用批量导入采样信息后，即对该批次样本进行全流程监测。

在这些流程中，当某一环节未正常进行或处理时，系统会通过信息通知、系统提示等方式通知操作人员处理相关事宜，确保流程的正常运转和异常情况的即时响应。例如：在加样、提取、转板等流程中，录入每个流程的操作记录人员、流程的开始时间、完成时间和附加信息（如加样环节中的仪器信息）；样本管子扫描八小时以后还未出检测报告，系统会进行提示；建立板架号履历查询通道，查看每个板架的履历、时间、操作人和仪器等信息；为加样、提取、转板等流程设置标准时间，当某个流程的运转超时，会进行系统提示；当异常数据进行复测时，记录复测原因（N异常，O异常，NO异常，无IC），根据复测的轮次，设置提示颜色等等。

当系统反馈问题之后，问题的处理进度也是监测的对象，防止处理进度超时。同时，当问题处理完成之后，对后续结果进行跟进监测可以更进一步的预防异常情况出现。

通过流程监测、问题跟踪、结果反馈等维度，记录操作信息、系统提示、信息通知等方式，极大的保证了核酸检测的时效性和准确性。

三、检测数据的可视化分析

数据可视化可以帮助人更好的分析数据，信息的质量很大程度上依赖于其表达方式。在一般生产环境里，报表是经常使用到的数据统计汇总的呈现方式，在一定程度上方便了管理人员的查看阅读，但是在信息数据量呈指数级增长的互联网时代，数据展示需要更加直观。在该技术方案中，检测结果可以根据样本的位置信息，在地图上进行展示，也可以按照不同分类组合以图表（饼图、折线图、柱形图等）的形式呈现，如下所示，极大的方便了管理人员快速获取统计结果。

在地图类统计方式中，统计不同位置来源的采样数、阴性样本数量、异常样本数量等信息；在图表类统计方式中，以柱形图方式统计不同时间的采样数量、样本条码不清晰数量等信息，以在折线图方式统计一段时间类的采样数量、阴性样本数量、异常样本数量的增减趋势，以饼图方式统计阴性样本数量、异常样本数量的比例信息，以路径图方式统计异常样本的行程轨迹。

同时，增加从样本录入到进入实验室、异常样本追溯、输出检测报告、上传统计等各环节的合规统计，直观的展示出核酸检测的检测质量。

附图说明

图1为本发明的生物样本检测管理系统的流程模块示意图；

图2为本发明的样本录入的流程图；

图3为本发明的样本录入的软件界面图；

图4为本发明的数据结果虚拟样本板和报告生成的界面图；

图5为本发明的报告生成的界面图；

图6为本发明的样本信息录入到生成结果的流程图；

图7为本发明的另一种生成检测结果的流程图；

实施方式

下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本发明保护的范围。

1.样本录入

工作人员对送到录入地点的样本进行系统录入，根据来源单位，地区，样本数量，单管、5混1、10混1、20混1数量和送样人，送样人电话，接收人来录入；其中，样本来源单位和样本录入时间与样本扫描中样本单位相关联。也可批量导入录入信息；下载模板获取数据格式；导出所选数据；删除有异数据。

工作人员填写设备编号，选择送检单位，使用扫码枪扫描管架号，在用扫码枪将样本号扫入样本号列表中，加急样本号点击加急样本后扫描样本号；如样本号不清，可点击条码不清按钮进行操作；如需手动输入样本号进行流程，可点击手动输入样本号进行样本号输入；最后确定本次管架号所需检测的所有样本已扫描完成，点击进入实验区。

2.检测结果

实现1：简易模式

简易模式下样本进入实验区检测后生成检测结果，会更具系统参数配置生成页面样本孔板，自动生成样本扫描数量的有效孔位，同时会标记处加急样本、复测样本或者质控位，工作人员根据实验结果点击样板中孔位来控制样本号是否异常，异常为黄色填充。接着填写其他数据，保存后进入审核数据，审核通过后，如是操作有误，可以点击退回为未审核状态。

实现2：追溯模式

追溯模式下进入实验区后需要工作人员使用PDA扫码设备对样本号进行扫码加样，提取，转板和检测操作后，记录检测结果；然后再进行保存审核数据操作，同简易模式一样，审核通过后，如是操作有误，可以点击退回为未审核状态。

3.报告生成

在检测结果已审核数据页面中可以进行检测结果下载，会根据选择的管架号数据下载excel数据表格，表格的数据为选择的管架号中所有样本号，同时也支持多选批量下载数据。并且会根据所选择的数据的模板生成不同模板的excel数据表格。

有鉴于此，本申请通过预先将管架号中所有样本号与检测孔板上的样本的样本信息相关联，在获得检测孔板上的样本的检测结果，获取与管架号对应的多个样本信息，提高了检测的效率；能够便于检测人员对同一批次进行检测的样本检测结果进行核查与标记，给样本检测的核查工作带来极大的方便。

以下具体介绍本申请的技术方案。

图2为样本录入的流程图,图3为样本扫描界面截图，每条数据所对应的是相应管架号中数据，已进入试验区数据只能查看，未进入实验区数据可以进入扫描详情。

进入实验区则进入下一步流程。

扫描样本号后系统会自动检测当前样本信息已录入样本次数。

会自动检测当前列表序号是否为质检位，是则序号+1；

实现了可以进行加急，条码不清场景的样本号录入。

修改管架号，设备编号数据，还可删除样本号，扫描新样本号，可以用扫码枪新增样本号，点击移除删除样本号，重复样本号无法录入；点击加急样本后，所扫描的样本号为加急样本。

样本扫描时需要先选择送检单位，送检单位则为样本信息界面添加的数据，及样本信息送检单位+样本信息保存时间，当前选择的送检单位可扫描的总样本号数量为样本信息界面单管、5混1、10混1、20混1数量合，如果当前扫描的样本号已经超出了送检单位所选择的样本信息所填的的总样本数量，则无法录入。

图4为本申请实例提供的一种数据结果虚拟样本板和报告生成的示意图，样本扫描进入实验区后，此处会新增实验检测数据，如图2-B所示，此处为实验结果详情页面，如样本号有异常，可点击中间样本孔板对应孔位，颜色填充为黄色，则当前孔位为阳性异常。如图5所示，选择数据点击下载生成报告文件，可支持多选批量生成。图6为本申请实例提供的从样本信息录入到生成结果的完整示意图，样本信息录入：样本送至实验室后，根据送检单位为组将送检单位，送检人，样本数量等数据保存至系统。

扫描样本号录入：扫描管架号，选择样本信息录入中的送检单位后扫描样本号录入样本号。

进入实验区，生成检测结果和虚拟样本板：进入实验区后，会根据简易模式和追溯模式来自动生成结果和样本板。

生成报告、打印或下载：生成了结果报告后，可在系统中进行打印或者下载。

图7为生成检测结果中的不同方法的示意图。

简易模式：样本进入实验区检测后生成检测结果，需要根据实验结果点击虚拟样板中孔位来标记样本号是否异常，异常为黄色填充。

追溯模式：下进入实验区后需要工作人员使用PDA扫码设备对样本号进行扫码加样，提取，转板和检测操作，同样会生成虚拟样板，追溯模式则不需要点击标记异常，系统会自动带出异常样本号。

尽管已经示出和描述了本发明的实施例，对于本领域的普通技术人员而言，可以理解在不脱离本发明的原理和精神的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型，本发明的范围由所附权利要求及其等同物限定。

Claims (7)

1.一种生物样本检测管理系统，包括待检测样本、样本扫描模块、样本报告生成模块以及上传统计模块，其特征在于：

一个样本孔板对应多个待检测样本，所述样本孔板具有专属的管架号，通过管家号可以查询到该样本孔板所对应的多个样本的样本信息；

所述样本扫描模块，通过扫码枪对所述样本孔板进行扫码，能够在选择了管架号后使得当前扫描样本号默认绑定管架号；

所述样本报告生成模块，在将待检测样本送入试验区完成实验检测后生成检测结果数据；

所述上传统计模块，根据地区自动统计接收样本数量、已扫描数量、检测完成率、未完成率的统计信息。

2.根据权利要求1所述的生物样本检测管理系统，其特征在于：

包括简易模式，能够对样本检测信息进行批量录入，一个样本信息还包括送检单位、送检地区、单管、5混1、10混1、20混1、送样人、和接收人；一个样本信息对应多个样本号数据，通过界面查看所述样本信息中已扫描的所有样本号；

利用扫码枪扫描样本号可选择正常扫码或者加急扫码，还可以选择扫描样本号为条码不清，如果当前需要手动输入样本号的场景，也可点击手动输入样本号按钮进行操作；

检测结果在检测结果详请界面中按照参数配置中的样本位总数、横向孔数、竖向孔数的排布的方式进行排布；

根据检测结果中的异常样本异常标记生成审核数据，其中，审核数据中存在已审核和未审核，已审核数据如是操作保存，可点击退回返回未审核。

3.根据权利要求2所述的生物样本检测管理系统，其特征在于：

还包括追溯模式，在系统参数配置追溯模式，通过PDA扫码设备对样本进行扫码加样，提取，转板和检测操作；

基于一个管架号对一个检测孔板对应的多个样本的样本检测结果进行批量标注和显示；

还包括在样本号不清晰、需要手动输入样本号、赝本漏液的情况下对应的方法操作以完成整个录入流程。

4.根据权利要求3所述的生物样本检测管理系统，其特征在于：

还包括异常样本追溯和实时监测模块，使用PAD设备对异常样本的管架对应的样本号进行扫码加样、提取、转板和检测后再生成检测结果，完成异常样本的复测；

在加样、提取、转板的流程中，录入每个流程的操作记录人员、流程的开始时间、完成时间和附加信息；如果样本扫描八小时以后还未出检测报告，则系统进行提示；还包括板架号履历查询模块，查看每个板架的履历、时间、操作人和仪器信息，为加样、提取、转板的流程设置标准时间，当某个流程的运转超时，会进行系统提示；当异常数据进行复测时，记录复测原因，所述复测原因包括N异常、O异常、NO异常、无IC，根据复测的轮次设置提示颜色；

通过流程监测、问题跟踪、结果反馈的方式来进行操作信息记录、系统提示、信息通知，保证核酸检测的时效性和准确性；

还包括监测数据可视化模块，在地图类统计方式中以省、市、区的方式统计各区域的采样数、阴性样本数量、异常样本数量；在图表类统计方式中，以柱形图方式统计每日、周、月的采样数量、样本条码不清晰数量，以折线图的方式统计一段时间类的采样数量、阴性样本数量、异常样本数量的增减趋势，以饼图的方式统计阴性样本数量、异常样本数量的比例信息，以路径图的方式统计异常样本的行程轨迹，异常样本数量可以点击查看具体样本信息，包括样本在哪个管架以及履历详情。

5.根据权利要求4所述的生物样本检测管理系统，其特征在于：

还包括实验室操作步骤追踪日志文件，所述日志文件对样本的加样、提取、转板操作人和操作时间进行实时记录，便于追溯样本检测过程中的流转过程和记录；

当异常样本确定需要复测时，设定不同颜色进行提醒，黄色代表尚未进行复测，蓝色代表已经进入实验室流程，绿色代表复测后正常，红色代表复测后还是异常，进一步加强管控异常样本的管理。

6.一种生物样本检测及异常样本追溯方法，采用权利要求1-5任意一项所述的生物样本检测管理系统，其特征在于：

步骤a，通过扫码枪获取样本号，将虚拟样本列表的第i+1的位置作为录入位置；

步骤b，判断待录入位置是否为质检位，如果所述判断的结果为是，将当前虚拟样本列表序号+1并记录，重复步骤b；如果所述判断的结果为否，进入步骤c；

步骤c，记录当前虚拟样本列表需要，在虚拟样本列表最后的位置添加记录的列表序列号和样本号；

步骤d，结束本次样本号的扫码录入。

7.根据权利要求6所述的生物样本检测及异常样本追溯方法，其特征在于，扫码样本号录入后，将样本送入实验区，生成检测结果和虚拟样本板，其中所述进入实验区后包括简易模式和PAD模式；

所述简易模式中，样本进入实验区检测后生成检测结果，需要根据实验结果点击虚拟样板中孔位来标记样本号是否异常，异常为黄色填充；

所述PAD模式中，进入实验区后需要工作人员使用PDA扫码设备对样本号进行扫码加样、提取、转板和检测操作，同样会生成虚拟样板，不需要点击标记异常，系统自动带出异常样本号。

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