CN115315527A

CN115315527A - 用于治疗il33中存在风险等位基因的受试者的治疗方法

Info

Publication number: CN115315527A
Application number: CN202180020852.5A
Authority: CN
Inventors: A·S·普拉特; H·D·穆萨斯; M·L·加瓦拉; 王婧雅; B·F·乔治; 丁梅
Original assignee: MedImmune Ltd
Current assignee: MedImmune Ltd
Priority date: 2020-03-13
Filing date: 2021-03-11
Publication date: 2022-11-08
Also published as: JP2023516497A; EP4118236A1; US20230110203A1; WO2021180858A1

Abstract

本披露涉及用于治疗患有白介素(IL)‑33介导的病症的患者的方法，以及用于确定患者是否面临增加的IL‑33介导的病症的风险、或用于确定患有病症的患者响应于抗IL‑33治疗的可能性是否增加的方法。

Description

用于治疗IL33中存在风险等位基因的受试者的治疗方法

本申请要求于2020年3月13日提交的美国临时专利申请号62/988,993的优先权。本申请的内容通过引用以其全文并入本文。

技术领域

本披露涉及用于治疗患有白介素(IL)-33介导的病症的患者的方法，以及用于确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症的风险、或用于确定患有病症的患者响应于抗IL-33治疗的可能性是否增加的方法。

背景技术

白介素-33(IL-33)是由IL33基因编码的白介素-1(IL-1)细胞因子家族的成员。IL33在包括结构细胞(如平滑肌细胞、上皮细胞和内皮细胞)的多种细胞类型中组成型表达。据报道，IL-33表达也可以在巨噬细胞和树状细胞中被炎症因子诱导。由环境诱发因素(如变应原、毒素和病原体)以及机械性损伤造成的细胞应激可以导致IL-33释放。游离IL-33与抑制致瘤性2(ST2)蛋白和白介素-1受体辅助蛋白(IL-1RAcP)组成的异二聚IL-33受体复合体缔合，以通过衔接子蛋白髓样分化初级反应蛋白88(MyD88)和可能通过MyD88-衔接子样(Mal)蛋白来激活AP-1途径和NF-κB途径。IL-33刺激众多细胞类型(包含天然淋巴II型细胞(ILC2)、肥大细胞、嗜碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞和树状细胞)，以促进免疫响应。

最近，发现IL-33以还原形式(red-IL-33)和氧化形式(ox-IL-33)存在。RedIL33存在于血清中，氧化前的半衰期约为4小时。游离red-IL-33经由ST2途径进行信号传导，但ox-IL33不能。与之相反地，ox-IL33与晚期糖基化终产物受体(RAGE)结合，但red-IL-33不能。ox-IL33依赖性RAGE信号传导已经被证明抑制上皮细胞增殖和迁移。抑制IL-33/RAGE介导的信号传导可以增强上皮迁移，这表明，例如，通过增强受损上皮屏障的修复抑制ox-IL33信号传导可能有益于促进组织修复和伤口愈合。

因此，鉴于red-IL-33和ox-IL-33的生物学作用以及异常IL-33信号传导的病理学后果，IL33是治疗多种疾病的有吸引力的靶标。特别令人感兴趣的是，全基因组关联研究(GWAS)已经鉴定出了在与包括哮喘、鼻息肉和过敏性鼻炎的性状相关的白介素-33(IL33)处的常见遗传变体和/或与哮喘和湿疹(例如特应性皮炎)相关的ILlRL1(编码ST2的基因)。

在许多与IL-33信号传导相关的疾病中，仍有大量未满足的临床需求。例如，皮质类固醇耐药性哮喘仍然很普遍，并且重度哮喘的生物疗法(如抗IL-5疗法)并非对所有患者都有效。现有证据表明，不同的哮喘内型是由不同的病理机制驱动的。IL-33信号传导可能在某些哮喘内型中特别重要，但在其他内型中则不然。同样，IL-33信号传导很可能在其他炎性疾病(如COPD、哮喘COPD重叠(ACO)和特应性皮炎)的特定内型中很重要。

因此，本领域仍然需要区分哪些疾病内型IL-33最有可能显著促成或驱动疾病病理学，以及更准确地鉴定具有IL33显性疾病表型的患者。有效的患者选择策略将实现有针对性的治疗策略，并可能改善患者的治疗效果。

发明内容

本披露涉及治疗患有白介素(IL)-33介导的病症的患者的方法和确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症风险的方法。

在一方面，提供了一种用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的方法，该方法包括向该受试者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了一种用于确定患有IL-33介导的病症的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类2多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在另一方面，提供了一种用于确定患者是否面临增加的L-33介导的病症风险的方法，该方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

在另一方面，提供了一种用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的方法，该方法包括向该受试者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了一种用于确定患有IL-33介导的病症的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类3多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在另一方面，提供了一种用于确定患者是否面临增加的L-33介导的病症风险的方法，该方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型，其中如果该患者的基因型包含如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

在另一方面，提供了一种用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的方法，该方法包括向该受试者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了一种用于确定患有IL-33介导的病症的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类1多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在另一方面，提供了一种用于确定患者是否面临增加的L-33介导的病症风险的方法，该方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

在另一方面，提供了一种组合物，该组合物包含用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定待治疗受试者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或在与表1中定义的聚类2多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的药剂中的用途，其中已经确定待治疗受试者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或在与表1中定义的聚类2多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了一种组合物，该组合物包含用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定待治疗受试者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或在与表2中定义的聚类3多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的药剂中的用途，其中已经确定待治疗受试者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或在与表2中定义的聚类3多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了一种组合物，该组合物包含用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定待治疗受试者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或在与表3中定义的聚类1多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

在另一方面，提供了IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的药剂中的用途，其中已经确定待治疗受试者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或在与表3中定义的聚类1多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

附图说明

将参考以下附图通过举例来描述本披露的实例，在附图中：

图1显示了英国生物样本库(UK Biobank)中受试者的分布作为IL33途径风险评分的函数(上图)和哮喘风险作为风险评分函数的逻辑回归的结果(下图)。

图2显示了基于IL33途径遗传评分的两个极端哮喘风险组中与IL33(rs146597587)中罕见的功能缺失(LoF)剪接变体相关的比值比(OR)的比较。

图3显示了基于一组替代哮喘风险基因(ORMDL3、ADAM33、TSLP)且基于遗传风险评分的两个极端哮喘风险组中与IL33(rs146597587)中罕见的功能缺失剪接变体相关的比值比(OR)的比较。

图4显示了罕见IL33 LoF变体rs146597587的携带者和非携带者之间哮喘发病年龄的密度图。阴影区域定义了发病年龄，低于该年龄被认为是早发性。

图5显示了英国生物样本库群体中被鉴定为哮喘风险变体的39个IL33常见变体的相关(即，常见变体的共同存在评分)的聚类。该图显示了三个聚类(聚类1、2和3)的鉴定，其中变体以高内部相关性共同存在。灰度条表示皮尔逊相关系数。仅显示正相关，阴影越深表示相关性越高。

图6显示了在具有已知转录因子结合位点的区域中发现了许多聚类1、2和3变体。

图7显示了39种常见变体及其与哮喘和发病年龄的关联。-log10(Bonferroni P值)表示关联的统计显著性，其中较大的-log10(P)意味着更高的显著性。红色虚线表示p值为0.05。

图8显示了rs928413等位基因评分的逻辑回归以及与哮喘风险的关联。译码的等位基因G正在增加GTEx数据集中的IL33表达。UKBB数据集中的基因型计数和频率显示在相应估计值旁边的框中。

图9显示了与区段11(rs1929995-C、rs1475658-T和rs13298116-T)内增加的哮喘比值比相关的SNP选择能够显著调节IL-33启动子驱动的表达水平。％活性相对于野生型区段11的表达水平进行了标准化。*表示p＜0.05，***表示p＜0.001，以及****表示p＜0.0001。

图10显示了与区段13(rs144829310-T、rs7046661-C和rs992969-A)内增加的哮喘比值比相关的SNP选择能够显著调节IL-33启动子驱动的表达水平。％活性相对于野生型区段13的表达水平进行了标准化。*表示p＜0.05，***表示p＜0.001，以及****表示p<0.0001。

图11显示了rs7038893-C显著调节IL-33启动子驱动的表达水平。％活性相对于来自包含rs7038893处的野生型等位基因的区段的表达水平进行标准化。*表示p<0.05。

图12显示了来自U-BIOPRED鼻刷样品的IL-33表达谱，用于具有(a)多态性rs7032572-G、(b)多态性rs10815363-T、(c)多态性rs552376976-T、(d)多态性rs62558407-T、(e)多态性rs13291323-C、(f)多态性rs1475658-T、(g)多态性rs13298116-T、(h)多态性rs10975481-G、(i)多态性rs144829310-T、(j)多态性rs7046661-C、(k)多态性rs992969-A、(l)多态性rs10975488-G、(m)多态性rs928413-G或(n)(m)多态性rs7038893-C的零(非风险)、一个(杂合)或两个(风险)活性诱导等位基因的受试者。使用年龄和性别作为协变量，通过线性回归测试了每种活性诱导等位基因与IL-33的关联。

具体实施方式

一般定义

如本文所用的“IL-33”蛋白是指白介素33，尤其是哺乳动物白介素-33蛋白，例如以UniProt编号095760保藏的人类蛋白。这种实体不是单一种类，而是以具有不同功能活性的几种形式存在，例如全长和蛋白水解加工形式或氧化和还原形式(Cohen等人，2015NatComm[自然通讯]6：8327；Scott等人，2018Sci Rep[科学报告]8：3363)。鉴于还原形式在体内和在体外快速氧化，通常现有技术对IL-33的提及可能与氧化形式的检测最相关。术语“IL-33”和“IL-33多肽”以及“IL-33蛋白”可互换使用。在某些实例中，IL-33是全长(FL)蛋白。在另一个实例中，IL-33是成熟的蛋白水解加工形式的IL-33。最近研究表明FL IL-33有一些活性(Cayrol和Girard，Proc Natl Acad Sci USA[美国国家科学院院刊]106(22)：9021-6(2009)；Hayakawa等人，Biochem Biophys Res Commun.[生物化学与生物物理学研究通讯]387(1)：218-22(2009)；Scott等人，2018Sci Rep[科学报告]8：3363；Talabot-Ayer等人，J Biol Chem.[生物化学杂志]284(29)：19420-6(2009))。然而，N-末端处理的IL-33(包括但不限于aa72-270、79-270、95-270、99-270、107-270、109-270、111-270、112-270)具有增强的活性(Lefrancais 2012、2014；Scott等人，2018Sci Rep[科学报告]8：3363)。在另一个实例中，IL-33可包括全长IL-33、其片段或IL-33突变体或变体多肽，其中IL-33的片段或IL-33变体多肽保留活性IL-33的一些或所有功能特性。

本文中互换使用的术语“白介素1受体样1(IL 1 RL 1)”和“ST2”指来自任何脊椎动物来源的任何天然ST2，该脊椎动物来源包括哺乳动物如灵长类动物(例如，人)和啮齿动物(例如，小鼠和大鼠)，除非另外指示。ST2在本领域中也称为DER4、T1和FIT-1。该术语涵盖“全长”未加工的ST2、以及由细胞中的加工产生的任何形式的ST2。ST2的至少四种同种型是本领域已知的，包括可溶性ST2(sST2，也称为IL 1 RL 1-a)和跨膜ST2(ST2L，也称为IL 1RL 1-b)，其由双启动子系统的差异mRNA表达产生；以及ST2V和ST2LV，其由可变剪接产生。ST2L的结构域结构包括三个细胞外免疫球蛋白样C2结构域、一个跨膜结构域和一个胞质Toll/白介素-1受体(TIR)结构域。sST2缺少ST2内部的跨膜结构域和胞质结构域，并且包括独特的9个氨基酸(a.a.)C末端序列(参见例如，Kakkar等人Nat.Rev.Drug Disc.[自然综述：药物发现]40 7：827-840，2008)。sST2可以用作诱饵受体以抑制可溶性IL-33。该术语还涵盖ST2的天然存在的变体，例如剪接变体(例如，缺少第三个免疫球蛋白基序并具有独特的疏水尾的ST2V和缺少ST2L的跨膜结构域的ST2LV)或等位基因变体(例如，如本文所述的防范哮喘风险或引起哮喘风险的变体)。示例性人ST2的氨基酸序列可以例如在UniProtKB登录号001638下找到。ST2与共受体蛋白IL-1RAcP一起是IL-33受体的一部分。IL-33与ST2和共受体白介素-1受体辅助蛋白(IL-1RAcP)的结合形成1∶1∶1三元信号传导复合物，以促进下游信号转导(Lingel等人Structure[结构]17(10)：1398-1410,2009；和Liu等人Proc.Nat.Acad.Sci.[美国国家科学院院刊]11 0(37)：14918-14924，2013)。

在一些实例中，IL-33介导的炎性疾病可以是哮喘、败血症、败血性休克、特应性皮炎、过敏性鼻炎、类风湿性关节炎、慢性阻塞性肺病(COPD)、哮喘-COPD重叠综合征(ACOS)、慢性支气管炎、肺气肿、伴有或不伴有鼻息肉的慢性鼻窦炎、血管炎、GvHD、葡萄膜炎、慢性特发性荨麻疹、窦炎或胰腺炎。

在一些实例中，IL-33介导的病症是哮喘。在一些实例中，IL-33介导的病症是成人哮喘。在一些实例中，IL-33介导的病症是早发性哮喘。如本文所定义，“早发性”哮喘是指受试者在25岁之前，优选在18岁之前被诊断患有哮喘。可以由临床医生进行诊断，例如，使用用于诊断哮喘的许多众所周知的方法中的任何一种。应当理解，本文披露的用于早发性哮喘患病者的方法不限于18岁以下的受试者。例如，该方法可用于成人(本文定义为18岁或以上)但自18岁之前就患有哮喘病的成人。

在一些实例中，哮喘可以是轻度哮喘、中度哮喘、重度哮喘、非嗜酸性哮喘、低嗜酸性哮喘和高嗜酸性哮喘。

如本文所用的术语“轻度哮喘”和“中度哮喘”是指全球哮喘防治倡议(GINA)等级为3或更低、适当地GINA等级为2或3的哮喘。GINA等级基于以下标准测量哮喘的严重程度(参见“哮喘管理和预防袖珍指南”，全球哮喘防治倡议；2019)。

如本文所用，术语“重度哮喘”是指需要高强度治疗(例如，GINA步骤4和步骤5)以维持良好控制的哮喘，或尽管接受高强度治疗仍未实现良好控制的哮喘(GINA，全球哮喘管理和预防战略(Global Strategy for Asthma Management and Prevention)，全球哮喘防治倡议(GINA)，2012年12月)。

在一些实例中，哮喘可以是高嗜酸性哮喘。如本文所用，术语“高嗜酸性哮喘”是指筛选血液嗜酸性粒细胞计数≥300个细胞/μL的哮喘患者。

在一些实例中，哮喘受试者的筛选血液嗜酸性粒细胞计数可能没有显著升高超过基线水平。基线水平可以是健康、非哮喘受试者预期的血液嗜酸性粒细胞计数。在一些实例中，基线水平可以≤200个细胞/μL。在一些实例中，基线水平可以≤150个细胞/μL。

术语“有效量”指有效治疗受试者或患者(如哺乳动物，例如，人类)中疾病或病症的药物的量。

术语“基因型”指对个体或样品中包含的基因的等位基因的描述。在本披露的上下文中，不区分个体的基因型和源自个体的样品的基因型。尽管基因型一般从二倍体细胞样品确定，但是基因型可以从单倍体细胞(如精子细胞)样品确定。

“IL-33轴”意指参与IL-33信号转导的核酸(例如，基因或从该基因转录mRNA)或多肽。例如，IL-33轴可以包括配体IL-33、受体(例如，ST2和/或IL-1RAcP)、衔接分子(例如，MyD88)、或与受体分子和/或衔接分子缔合的蛋白(例如，激酶，如白介素-1受体相关激酶1(IRAK1)和白介素-1受体相关激酶4(IRAK4)或E3泛素连接酶，如TNF受体相关因子6(TRAF6))。

术语“患者”是指需要对其进行诊断或治疗的人类受试者。术语“患者”和“受试者”在本文中可互换使用。患者可以是临床患者、临床试验志愿者、实验动物等。

术语“患有......的患者”指患者显示某种疾病(例如，IL-33介导的病症(例如，哮喘，如早发性哮喘)的临床体征。

基因组中在群体中可能存在多于一个序列的核苷酸位置在本文中被称为“多态性(polymorphism)”或“多态性位点(polymorphic site)”。例如，多态性位点可以是例如两个或更多个核苷酸的核苷酸序列、插入的核苷酸或核苷酸序列、缺失的核苷酸或核苷酸序列、或微卫星。具有两个或更多个核苷酸长度的多态性位点可以是3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15个或更多个、20个或更多个、30个或更多个、50个或更多个、75个或更多个、100个或更多个、500个或更多个或约1000个核苷酸长度，其中全部或某些核苷酸序列在该区域内部不同。如下文描述，单个核苷酸长度的多态性位点在本文中称作单核苷酸多态性(SNP)。当在多态性位点有两个、三个或四个替代核苷酸序列时，每个核苷酸序列称为“多态性变体”或“核酸变体”。DNA序列中每个可能的变体被称为“等位基因”。通常，第一个鉴定的等位基因形式被任意指定为参考形式，而其他等位基因形式被指定为替代或变异等位基因。“常见”等位基因是给定群体中占优势的等位基因，例如，该等位基因以普遍接受的大于约2％的频率存在于群体的多个成员中。在两个多态性变体存在的情况下，来自群体的大部分样品中所代表的多态性变体称作“优势等位基因”或“主要等位基因”，并且群体中较不占优势的多态性变体称作“不常见等位基因”或“次要等位基因”。就该多态性而言，携带两个主要等位基因或两个次要等位基因的个体为“纯合子”。就该多态性而言，携带一个主要等位基因和一个次要等位基因的个体为“杂合子”。在C/G或A/T SNP情况下，等位基因不确定并且取决于用来从基因分型平台提取数据的链。在这些C/G或A/T SNP情况下，C或G核苷酸或A或T核苷酸分别地可能是风险等位基因并且决定于等位基因频率的相关性。

与疾病或病症(例如，IL-33介导的病症，如哮喘)风险增加相关或与>1的比值比或相对风险相关的等位基因称作“风险等位基因”或“效应等位基因”。“风险等位基因”或“效应等位基因”可以是次要等位基因或主要等位基因。

如本文所用，“等效等位基因”或“代用等位基因”指预期与类似于风险等位基因的方式表现并基于等位基因频率和/或高r²值(大于或等于(≥)0.6)和/或高D’值(≥0.6)选择的等位基因，而风险等位基因和/或选择的SNP如本文定义。例如，高r²值≥0.6、≥0.7、≥0.8、≥0.9或1.0。在一个实例中，高D’值≥0.6、≥0.7、≥0.8、≥0.9或1.0。

在本文中使用时，“连锁不平衡”或“LD”指在不同基因座处不随机相关的等位基因，即，在不同基因座处，与它们的频率不成比例地相关的等位基因。如果等位基因处于正连锁不平衡，则该等位基因比预期推定的统计学独立性更经常地一起出现。相反地，如果等位基因处于负连锁不平衡，则该等位基因比预期推定的统计学独立性更不经常地一起出现。在一些实例中，连锁不平衡中的等效多态性对所述多态性具有0.6至(但不包括)0.8的D′值。在一些实例中，连锁不平衡中的等效多态性的D’值大于或等于0.8。

在本文中使用时，“比值比”或“OR”指具有标志物(等位基因或多态性)的个体的疾病的可能性相对于没有该标志物(等位基因或多态性)的个体的疾病的可能性的比值比。

在本文中使用时，“单倍型”指在单一染色体上充分密切连锁以通常作为一个单位遗传的一组等位基因。

治疗方法

已经观察到单核苷酸多态性(SNP)与IL33介导的早发性哮喘风险增加有关。据认为IL33的遗传变体以前与早发性哮喘无关。此外，据观察，携带这些风险等位基因负担更大的个体携带更高的疾病风险负担。例如，与非风险等位基因的纯合子携带者相比，聚类2风险等位基因rs928413杂合子的个体患哮喘的伴随风险更高(图8)。此外，与风险等位基因的杂合子携带者相比，风险等位基因rs928413纯合子的个体患哮喘的伴随风险更高。

令人惊讶的是，IL33的风险等位基因与早发性哮喘之间的相关性并不仅仅与血液嗜酸性粒细胞计数的临床显著增加相关(表8)。以前假设IL33通过放大2型(T2)炎症反应来驱动特应性哮喘模型中的病理学。T2反应的IL33激活的下游结果是局部募集和嗜酸性粒细胞激活的增加。这些实例表明，因果风险等位基因可能不会仅通过嗜酸性粒细胞激活来增强IL33介导的疾病风险。因此，据认为该数据首次表示，因果IL33 SNP可能不仅仅经由T2炎症机制驱动IL-33介导的疾病，特别是在患有早发性哮喘的受试者中(表8)。

该数据还表明，通过筛选受试者的基因型，有可能筛选和鉴定患有IL33介导的病症(包括炎症性病症，如哮喘，特别是早发性哮喘)的受试者。基于受试者的基因型鉴定患有IL33介导的疾病的受试者的能力将能够早期干预那些个体最有可能响应于IL33阻断疗法的受试者。特别地，本披露代表了具有IL33驱动表型的患者亚组的鉴定，该患者亚组可能受益于基于抗IL-33的疗法，之前可能未被选为所述疗法的最佳候选者，特别是如果他们以前曾被选择为使用更传统的基于IL33的生物标志物(如血液嗜酸性粒细胞水平)进行治疗的候选者。因此，本披露潜在地提供了一种基于精确度的方法，用于鉴定和传递抗IL33疗法至最有可能响应于该疗法的受试者。

因此，本披露提供了一种治疗患有IL-33介导的病症(例如炎性病症，如哮喘，例如早发性哮喘)的患者的方法。特别地，本文披露的治疗方法包括基于患者基因组内存在如表1、表2和表3中定义的聚类1、2或3多态性的至少一个等位基因治疗患者。

这些实例报道了聚类1、2和3多态性的各种等位基因可能是L-33介导的病症(如哮喘，例如早发性哮喘)的发病和/或正在持续的病理学的原因。基于高度等位基因相关性对风险等位基因多态性进行聚类(表明每个聚类内的多态性可能处于连锁不平衡状态)(参见图5)。换句话说，每个聚类(Cluster)代表一组“等效等位基因”。本披露的一个重要元素是鉴定潜在的因果等位基因，而不是那些仅与疾病相关的等位基因。例如，多个等位基因可能与哮喘风险增加相关，但不一定是潜在疾病的原因。这些实例肯定地鉴定了每个聚类中的至少一个SNP子集在各种条件下增加了IL-33的表达，包括在基础条件、低细胞因子条件、和高细胞因子条件下增加的表达。因此，本披露首次实际鉴定了遗传标记物，该遗传标记物不仅表示受试者易患某种疾病，而且该疾病可能由增加IL-33基因表达的多态性驱动。因此，本披露首次鉴定这些SNP在IL-33介导的驱动疾病(如哮喘，包括早发性哮喘)中是潜在的原因。

因此，本文提供了一种治疗患有IL-33介导的病症的患者的方法，该方法包括向该受试者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。在一些实例中，患者的基因型包含表1中描述的聚类2等位基因中的一个、两个、三个、四个、五个、六个或七个。

表1聚类2多态性(聚类2“风险等位基因”)

“聚类2”多态性定义了IL33基因组区域中染色体9的位置6193455-6213468之间的等位基因多态性。示例性聚类2多态性在表1中进行了描述。如实例中所述，聚类2多态性与哮喘风险增加(比值比(OR))相关。对于变体rs992969(OR＝1.13(CI1.12-1.15)，P＝2.32x10-73)观察到最强的关联(参见表7)。给定的OR是关于非风险等位基因的纯合子个体和杂合子个体的比较。有趣的是，每个聚类2多态性都与早发性哮喘的风险增加有关。rs992969与早发性的关联具有OR＝1.14(1.1-1.18)，P＝7.52x10-20。令人惊讶的是，与早发性疾病的关联与血液嗜酸性粒细胞计数无关(表8)，这表明IL33驱动的早发性哮喘并非完全由高嗜酸性粒细胞计数介导。

在IL33基因的蛋白质译码区域上游发现了聚类2多态性，这意味着它们不对IL33中的氨基酸变化进行编码。因此，聚类2SNP不对IL33的功能获得变体进行编码。因此，SNP的因果作用本质上可能是调节性的。例如，不希望受理论束缚，与具有非风险多态性的受试者相比，SNP可以增加野生型IL33的表达水平。非译码基因组区域包含诱导(或抑制)基因表达的重要顺式作用调节元件。例如，非译码区域包含可以募集转录抑制因子或激活因子的转录因子结合元件(TFBE)。TFBE内的突变可能会影响这些反式调节元件的结合强度，从而增加与TFBE相关的基因的表达水平。因此，聚类2多态性可能通过解除IL33表达的调节来驱动IL-33驱动的病理，从而导致更多的IL-33产生，这意味着更大浓度的存储IL33的释放所触发的病理性IL-33介导的信号传导的更大诱导。这可能与其中急性加重常见的IL-33介导的病症特别相关。可替代地或另外地，聚类2多态性可能导致IL-33的漏表达和释放，这可能与L-33介导的病症以IL33信号传导的慢性症状为特征的情况有关。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性的至少一个(例如，一个、二个、三个、四个、五个、六个或七个)等位基因：在多态性rs928413(SEQ IDNO：43)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs3939286(SEQID NO：46)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ IDNO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因、在多态性rs1888909(SEQID NO：44)处的两个T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的两个A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的至少一个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的至少一个G等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因。

已经确定基因型具有在多态性rs928413处的一个G等位基因的受试者使IL-33介导的病症哮喘的风险增加约14％(参见图8)。在UKB数据集中，在多态性rs928413处具有两个G等位基因的基因型使哮喘风险增加约28％。实例还显示，多态性rs928413处的G等位基因在低细胞因子条件下增加了IL-33启动子的表达。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的至少一个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。实例显示，多态性rs992969处的A等位基因在低细胞因子条件下增加了IL-33启动子的表达。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的至少一个A等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因。

与聚类2相关的几个额外的多态性，如在表1中描述的具有聚类2多态性的LD中，包括：

表A

SNP	基因型	LD(多态性)
			rs7046661	C	0.71(rs928412)
rs10815363	T	0.71(rs2381416)
			rs62558407	T	0.71(rs2381416)
rs1475658	T	0.72(rs928412)
			rs10975481	G	0.46(rs2381416)

实例显示，这些多态性在基础、低和/或高细胞因子条件下增加了IL-33启动子的表达，表明这些SNP是L-33介导的病症发展的原因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的至少一个等位基因：在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的G等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs10815363(SEQ IDNO：83)处的至少一个T等位基因。在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的两个T等位基因。实例显示，多态性rs10815363处的T等位基因在基础条件下增强了IL-33启动子的表达。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs1475658(SEQ IDNO：85)处的至少一个T等位基因。在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的两个T等位基因。实例显示，多态性rs1475658处的T等位基因在基础条件下增强了IL-33启动子的表达。

在另一方面，提供了一种用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的方法，该方法包括向该受试者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。在一些实例中，患者的基因型包含表2中描述的聚类3等位基因中的一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个等位基因。

表2聚类3多态性(聚类3“风险等位基因”)

SNP	基因型
		rs9775039	A
rs144829310	T
		rs72699186	T
rs10975479	G
		rs72699191	C
rs7032572	G
		rs1342326	C
rs2066362	T
		rs142807069	G
rs10975488	G

“聚类3”多态性定义了IL33基因组区域中染色体9的位置6172380-6219176之间的等位基因多态性。如实例中所述，聚类3多态性与哮喘风险增加(比值比(OR))相关(参见表7)。给定的OR是关于非风险等位基因的纯合子个体和杂合子个体的比较。有趣的是，每个聚类3多态性也与早发性哮喘的风险增加相关，其中早发性哮喘与血液嗜酸性粒细胞计数无关(表8)，这表明IL33驱动的早发性哮喘并非完全由高嗜酸性粒细胞计数介导。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的聚类3多态性的至少一个(例如，一个、二个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个)等位基因：在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个等位基因：在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因、在多态性rs7032572(SEQID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs142807069(SEQ IDNO：57)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因，在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因，在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：以及在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因。实例显示，在这些多态性处的这三个等位基因中的每一个等位基因在低和高细胞因子条件下显著增加了IL-33启动子的表达。

两个额外的聚类3多态性，或与表2中描述的至少一个聚类3多态性呈高度连锁不平衡的多态性包括：

表B

SNP	基因型	LD(多态性)
			rs552376976	T	0.87(rs9775039)
rs13298116	T	0.65(rs72699191)

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs552376976(SEQ IDNO：87)处的至少一个T等位基因。在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs552376976(SEQ ID NO：87)处的两个T等位基因。示例显示，多态性rs552376976处的T等位基因在低和高细胞因子条件下增强了IL-33启动子的表达。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs13298116(SEQ IDNO：88)处的至少一个T等位基因。在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含在多态性rs13298116(SEQ ID NO：88)处的两个T等位基因。实例显示，多态性rs13298116处的T等位基因在基础和高细胞因子条件下增强了IL-33启动子的表达。

在另一方面，提供了一种用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的方法，该方法包括向该受试者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。在一些实例中，患者的基因型包含表3中描述的聚类1等位基因中的一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个，11个、12个、13个、14个或15个等位基因。

表3聚类1多态性(聚类1“风险等位基因”)

SNP	基因型
		rs10975507	T
rs10975504	G
		rs10815393	C
rs12339348	T
		rs7035413	G
rs17498196	C
		rs17582919	C
rs10815391	G
		rs10815392	C
rs72689561	C
		rs7038893	C
rs112935616	T
		rs10815376	T
rs12551268	A
		rs2006682	G

“聚类1”多态性定义了IL-33基因组区域中染色体9的位置6222149-6243392之间的等位基因多态性。如实例中所述，聚类1多态性与哮喘风险增加(比值比(OR))相关。对于变体rs10975507(OR＝1.1(CI 1.09-1.12)，P＝1.54x10-40)观察到最强的关联(参见表7)。给定的OR是关于非风险等位基因的纯合子个体和杂合子个体的比较。有趣的是，每个聚类1多态性都与早发性的风险增加有关。rs10975507与早发性的关联具有OR＝1.11(CI 1.08-1.14)，P＝3.19x10-11。令人惊讶的是，与早发性疾病的关联与血液嗜酸性粒细胞计数无关(表8)，这表明IL33驱动的早发性哮喘并非完全由高嗜酸性粒细胞计数介导。

与聚类2和聚类3多态性一样，聚类1多态性不对IL-33基因的蛋白质译码区域的氨基酸变化进行编码。因此，聚类1多态性可能经由上述调节机制驱动IL-33介导的病理。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQID NO：67)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12551268(SEQ ID NO：73)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因、在多态性rs12551268(SEQ ID NO：73)处的A等位基因、以及在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ IDNO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因、在多态性rs12551268(SEQ ID NO：73)处的A等位基因、以及在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQID NO：67)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、以及在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQID NO：67)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，已经确定待治疗患者的基因型包含选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的两个C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的两个T等位基因、在多态性rs7035413(SEQID NO：64)处的两个G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的两个C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ IDNO：67)处的两个G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的两个C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因、以及在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的至少一个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的至少一个T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的至少一个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的至少一个C等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因。

在另一个实例中，这些实例还披露了一系列SNP，它们降低了患有或发展为IL-33介导的病症的伴随风险。这些实例显示，在表4中呈现的多态性处具有至少一个等位基因降低了与患有或发展为IL33介导的病症(哮喘)的风险相关的比值比。

表4与哮喘风险降低相关的等位基因

SNP	基因型
		rs370820588	C
rs143215670	C
		rs343478	A
rs10118776	G
		rs146597587	C
rs10975519	T
		rs10815381	G

因此，在任何上述方法中，可能已经进一步确定患者的基因型不包含选自以下的至少一个多态性：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、以及在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因。

在一个实例中，可能已经进一步确定患者的基因型不包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、以及在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因。

在一个实例中，可能已经进一步确定患者的基因型不包含选自以下的两个多态性：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ IDNO：80)处的两个T等位基因。

在一个实例中，可能已经进一步确定患者的基因型不包含以下的多态性：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因。

在某些实例中，确定患者的基因型包含上述聚类1、2和3多态性的组合。在上述已经确定患者的基因型包含聚类2多态性的实例中，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因和/或表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因。在已经确定患者的基因型包含聚类3多态性的实例中，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因和/或表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因。在已经确定患者的基因型包含聚类1多态性的实例中，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因和/或表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因。

诊断方法

本披露也提供了用于确定或鉴定患有IL-33介导的病症的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法。

在一些实例中，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类2多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

聚类2

在一些实例中，选自以下的至少一个(例如，一个、二个、三个、四个、五个、六个或七个)等位基因(在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，选自以下的在多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ IDNO：48)处的A等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，以下的多态性的每一个多态性中的至少一个(在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ IDNO：48)处的A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs928413(SEQID NO：43)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因：选自以下的聚类2多态性处的两个等位基因(在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的两个T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的两个A等位基因、以及在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的至少一个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的至少一个G等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的至少一个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的至少一个A等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs7046661(SEQID NO：82)处的两个C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的两个T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的两个T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ IDNO：85)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的两个G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的一个或两个T等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的一个或两个T等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

聚类3

在一些实例中，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类3多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个(例如，一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个)等位基因(在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因、在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，以下的多态性的每一个多态性中的至少一个(在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因、在多态性rs72699191(SEQID NO：53)处的C等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因、在多态性rs10975488(SEQ IDNO：58)处的G等位基因以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975479(SEQ IDNO：52)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、和在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs7032572(SEQID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs552376976(SEQ ID NO：87)处的一个或两个T等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs13298116(SEQ ID NO：88)处的一个或两个T等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

聚类1

在一些实例中，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类1多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个(例如，一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、11个、12个、13个、14个或15个)等位基因(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ IDNO：65)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12551268(SEQ IDNO：73)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因、在多态性rs12551268(SEQID NO：73)处的A等位基因、在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，以下的多态性的每一个多态性中的至少一个(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因、在多态性rs12551268(SEQID NO：73)处的A等位基因、在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ IDNO：65)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的至少一个等位基因(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ IDNO：68)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在选自以下的多态性处的两个等位基因(在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的两个C等位基因、在多态性rs12339348(SEQID NO：63)处的两个T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的两个G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ IDNO：66)处的两个C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的两个G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的两个C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因)的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的至少一个T等位基因或与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的至少一个T等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的一个或两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的一个或两个C等位基因的存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

聚类4

在一些实例中，本文披露的任何诊断方法进一步包括：(a)确定源自该患者的样品中如表4中定义的至少一个多态性的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中如表4中定义的多态性的至少一个等位基因的不存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一些实例中，选自以下的至少一个多态性(在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、以及在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因)的不存在表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一个实例中，已经确定患者的基因型不包含以下的多态性的每一个多态性中的至少一个(在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、以及在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因)表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一个实例中，已经确定患者的基因型不包含选自以下的两个多态性(在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、以及在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因)表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

在一个实例中，已经确定患者的基因型不包含以下的多态性(在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、以及在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因)表示患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

本披露还提供了用于确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症风险的方法。

在一些实例中，确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症风险的方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

聚类2

在一些实例中，该患者的基因型包含选自以下的聚类2多态性的至少一个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs992969(SEQID NO：45)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs928412(SEQID NO：48)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性的至少一个(例如，一个、二个、三个、四个、五个、六个或七个)等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的两个T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的两个A等位基因、以及在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs928412(SEQ IDNO：48)处的两个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的至少一个A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含选自以下的至少一个等位基因：在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ IDNO：85)处的T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的G等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的两个C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的两个T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的两个T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的两个G等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的一个或两个T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的一个或两个T等位基因。

聚类3

在一些实例中，确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症风险的方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型，其中如果该患者的基因型包含如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs72699186(SEQ IDNO：51)处的T等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因、在多态性rs2066362(SEQ IDNO：56)处的T等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个：在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs72699186(SEQ IDNO：51)处的T等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因、在多态性rs2066362(SEQ IDNO：56)处的T等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975479(SEQ ID NO：52)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72699191(SEQ ID NO：53)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs1342326(SEQ ID NO：55)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2066362(SEQ ID NO：56)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs142807069(SEQ ID NO：57)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs9775039(SEQ ID NO：59)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因，在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因，在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQID NO：50)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因、以及在多态性rs7032572(SEQ IDNO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ IDNO：50)处的T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的G等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：以及在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因。实例显示，在这些多态性处的这三个等位基因中的每一个等位基因在低和高细胞因子条件下显著增加了IL-33启动子的表达。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs552376976(SEQ ID NO：87)处的一个或两个T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs13298116(SEQ ID NO：88)处的一个或两个T等位基因。

聚类1

在一些实例中，确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症风险的方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

在一些实例中，患者的基因型包含选自以下的聚类1多态性的至少一个(例如，一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个，11个、12个、13个、14个或15个)等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ D NO：63)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQ IDNO：67)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12551268(SEQ ID NO：73)处的A等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ IDNO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQID NO：71)处的T等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因、在多态性rs12551268(SEQ ID NO：73)处的A等位基因、在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ IDNO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQID NO：71)处的T等位基因、在多态性rs10815376(SEQ ID NO：72)处的T等位基因、在多态性rs12551268(SEQ ID NO：73)处的A等位基因、在多态性rs2006682(SEQ ID NO：74)处的G等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ IDNO：70)处的C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的至少一个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ IDNO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、在多态性rs112935616(SEQID NO：71)处的T等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815393(SEQID NO：62)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的两个G等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因、以及在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的两个等效等位基因。

在一些实例中，该患者的基因型包含在选自以下的多态性处的两个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的两个C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的两个T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的两个G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的两个C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的两个G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的两个C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因、在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的一个或两个C等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的一个或两个等效等位基因。

在一些实例中，患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的一个或两个C等位基因。

聚类4

在一些实例中，该患者的基因型不包含选自以下的至少一个多态性：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs10118776(SEQID NO：78)处的G等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因、以及在多态性rs10815381(SEQ ID NO：81)处的G等位基因。

在一个实例中，患者的基因型部不包含以下的多态性中的每一个多态性中的至少一个：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs10118776(SEQ ID NO：78)处的G等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因、以及在多态性rs10815381(SEQ ID NO：81)处的G等位基因。

在一个实例中，该患者的基因型不包含选自以下的两个多态性：在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs10118776(SEQ ID NO：78)处的两个G等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10815381(SEQ ID NO：81)处的两个G等位基因。

在一个实例中，患者的基因型不包含以下的多态性：在多态性rs370820588(SEQID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs10118776(SEQ IDNO：78)处的两个G等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10815381(SEQ IDNO：81)处的两个G等位基因。

在一些实例中，本文披露的诊断方法以及不包括向患者施用IL-33轴结合拮抗剂的步骤。

SNP的组合

上述治疗和诊断方法设想了患者的基因型可以包含聚类1、2或3多态性的组合的实例。

适合地，在已经确定患者的基因型包含聚类2多态性的实例中，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或如上所述的与聚类3多态性有关的具体实例中所述。另外地或可替代地，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或如上所述的与聚类1多态性有关的具体实例中所述。

适合地，在已经确定患者的基因型包含聚类3多态性的实例中，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或如上所述的与聚类2多态性有关的具体实例中所述。另外地或可替代地，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或如上所述的与聚类1多态性有关的具体实例中所述。

在已经确定患者的基因型包含聚类1多态性的实例中，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或如上所述的与聚类2多态性有关的具体实例中所述。另外地或可替代地，可能已经进一步确定患者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或如上所述的与聚类3多态性有关的具体实例中所述。

SNP的检测

在几个实例中，本文披露的治疗和诊断方法涉及在一个或多个聚类1、2或3多态性处确定患者的基因型(例如，如表1-3中所述)。针对SNP的存在评价核酸的检测技术包括分子遗传学领域熟知的程序。许多方法但不是全部方法涉及核酸的扩增。本领域提供了执行扩增的充分指导。示例性参考文献包括手册，如Erlich编著的PCR Technology：Principlesand Applications for DNA Amplification[PCR技术：DNA扩增的原理和应用]，弗里曼出版社(Freeman Press)，1992；Innis等人编著的PCR Protocols：A Guide to Methods andApplications[PCR协议：方法和应用指南]，学术出版社，1990；Ausubel编著的CurrentProtocols in Molecular Biology[分子生物学中的当前协议]，1994-1999，包括更新至2004年4月的附录；和Sambrook等人编著的Molecular Cloning，A Laboratory Manual[分子克隆实验室手册]，2001。Kwok编著的Single Nucleotide Polymorphisms：Methods andProtocols[单核苷酸多态性：方法和协议]，胡马纳出版社(Humana Press)，2003中披露了检测单核苷酸多态性的一般方法。

尽管这些方法一般采用PCR步骤，但也可以使用其他扩增方案。合适的扩增方法包括连接酶链反应(参见，例如，Wu等人，Genomics[基因组学]4：560-569,1988)；链置换分析(参见，例如，Walker等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA[美国国家科学研究院学报]89：392-396，1992；美国专利号5,455,166)；和几种基于转录的扩增系统，包括美国专利号5,437,990；5,409,818和5,399,491中描述的方法；转录扩增系统(TAS)(Kwoh等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA[美国国家科学研究院学报]86：1173-1177，1989)；和自我维持序列复制(3SR)(Guatelli等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA[美国国家科学研究院学报]87：1874-1878,1990；WO 1992/08800)。可替代地，可以使用将探针扩增至可检测水平的方法，如Qβ-复制酶扩增法(Kramer等人，Nature[自然]339：401-402，1989；Lomeli等人，Clin.Chem.[临床化学]35：1826-1831，1989)。已知扩增方法的综述例如由Abramson等人，Curr.Opin.Biotech.[生物技术新观点]4：41-47，1993提供。

可以使用寡核苷酸引物和/或探针进行个体基因型、单倍型、SNP、微卫星或其他多态性的检测。寡核苷酸可以通过任何合适的方法、通常通过化学合成制备。寡核苷酸可以使用市售试剂和仪器合成。可替代地，它们可以通过商业来源买到。合成寡核苷酸的方法是本领域熟知的(参见，例如，Narang等人，Meth.Enzymol.[酶学方法]68：90-99，1979；Brown等人，Meth.Enzymol.[酶学方法]68：109-151，1979；Beaucage等人，Tetra.Lett.[四面体快报]22：1859-1862，1981；和美国专利号4,458,066的固相支持法)。此外，上述合成方法的改良可以用来相对于合成的寡核苷酸合乎需要地影响酶行为。例如，向寡核苷酸掺入修饰的磷酸二酯键(例如，硫代磷酸酯、甲基磷酸酯、磷酰胺化物或硼烷磷酸酯)或除磷酸衍生物之外的键可以用来防止在选择的位点处切割。此外，与还作为合成新核酸链的模板的核酸杂交时，使用2’-氨基修饰的糖往往有利于置换而非消化寡核苷酸。

可以使用本领域众所周知的许多检测方法确定个体(例如，患有IL-33介导的病症，例如，哮喘或肺纤维化(例如，特发性肺纤维化)或面临其风险的患者)的基因型。大部分测定法牵涉几种一般方案之一：使用等位基因特异性寡核苷酸的杂交、引物延长、等位基因特异性连接、测序或电泳分离技术，例如，单链构象多态性(SSCP)和异源双链体分析法。示例性测定法包括5’-核酸酶测定法、模板指导的染料-终止子掺入、分子信标等位基因特异性寡核苷酸测定法、单碱基延长测定法和依据实时焦磷酸序列的SNP评分。可以使用多种技术(如微芯片、荧光偏振测定法和MALDI-TOF(基质辅助激光解吸附电离-飞行时间))质谱法进行已扩增序列的分析。还可以使用的两种方法是基于Flap核酸酶侵入性切割的测定法和使用锁式探针的方法学。

通常通过分析从待分析个体获得的核酸样品，确定特定等位基因的存在或不存在。经常地，核酸样品包含基因组DNA。基因组DNA一般从血液样品获得但也可以从其他细胞或组织获得。

样品可以取自疑似患有或经诊断为患有IL-33介导的病症，并且因此或许需要治疗的患者或取自没有疑似患有任何病症的正常个体。为了确定基因型，可以在本文披露的方法中使用患者样品，如含有细胞或这些细胞产生的核酸的那些样品。可用作本披露中样品的体液或分泌物包括例如血尿、唾液、粪便、胸膜液、淋巴液、痰、腹水、前列腺液、脑脊液(CSF)或任何其他身体分泌物或其衍生物。措词“血液”意在包括全血、血浆、血清或任何血液衍生物。用于本文所述的方法中的样品核酸可以从受试者的任何细胞类型或组织获得。例如，可以通过已知技术获得受试者的体液(例如，血液)。可替代地，可以对干燥样品(例如，毛发或皮肤)进行核酸检验。

样品可以是冷冻的、新鲜的、固定的(例如，福尔马林固定)、离心的和/或包埋的(例如，石蜡包埋)等。当然在评估样品中的基因型之前，细胞样品可以经历多种众所周知的采集后制备技术和储存技术(例如，核酸和/或蛋白质提取、固定、储存、冷冻、超滤、浓缩、蒸发、离心等)。同样地，活检样品也可以经历采集后制备技术和储存技术，例如，固定。

下文简要描述了分析核酸样品以检测可用于本公开中的SNP的频繁使用的方法学。但是，本领域已知的任何方法可以用于本发明中以检测单核苷酸置换的存在。

等位基因特异性杂交

这项技术，通常也称作等位基因特异性寡核苷酸杂交(ASO)(例如，Stoneking等人，Am.J.Hum.Genet.[美国人类遗传学杂志]48：70-382,1991；Saiki等人，Nature[自然]324,163-166,1986；EP235,726；和WO 1989/11548)，依赖于通过针对变体之一特异的寡核苷酸探针与从扩增核酸样品所获得的扩增产物杂交，区分相差一个碱基的两个DNA分子。这种方法一般使用短的寡核苷酸，例如，长度15-20个碱基。探针设计成相对于另一个变体而言，与一个变体差异性地杂交。设计这种探针的原理和指导是本领域可获得的，例如，在本文援引的参考文献中可获得。杂交条件应当足够地严格，从而在等位基因之间存在杂交强度的显著差异，并产生基本上双元的反应，因而探针仅与等位基因之一杂交。一些探针设计成与靶向DNA的区段杂交，从而多态性位点与探针的中央位置(例如，在15碱基寡核苷酸中第7位置处；在16碱基寡核苷酸中第8或第9位置处)对齐，但是不要求这种设计。

可以通过测量与样品杂交的等位基因特异性寡核苷酸量，确定等位基因的量和/或存在。一般地，寡核苷酸用标记物(例如，荧光标记物)标记。例如，将等位基因特异性寡核苷酸施加至代表SNP序列的固定寡核苷酸。在严格杂交和洗涤条件后，测量每种SNP寡核苷酸的荧光强度。

可以通过在序列特异性杂交条件下与涵盖多态性位点的区域中与多态性等位基因之一正好互补的寡核苷酸探针或引物杂交，鉴定多态性位点处存在的核苷酸。选择探针或引物杂交序列和序列特异性杂交条件，从而多态性位点处的单个错配使杂交双链体足够地去稳定化，这样它实际上没有形成。因此，在序列特异性杂交条件下，仅在探针或引物和正好互补的等位序列之间形成稳定双链体。因此，约10至约35个核苷酸长度、通常约15至约35个核苷酸长度的与涵盖多态性位点的区域中的等位基因序列正好互补的寡核苷酸处于本发明的范围内。

在另一个实例中，通过在足够严格的杂交条件下在涵盖多态性位点和与多态性位点处等位基因正好互补的区域中与SNP等位基因之一基本上互补的寡核苷酸杂交，鉴定多态性位点处存在的核苷酸。因为非多态性位点处出现的错配是与两个等位基因序列的错配，所以与靶等位基因序列形成的双链体中和与相应的非靶等位基因序列形成的双链体中错配数目的差异在使用与靶等位基因序列正好互补的寡核苷酸时相同。在这个实例中，充分放松杂交条件以允许与靶序列形成稳定的双链体，同时维持足够的严格性以排除与非靶序列形成稳定的双链体。在这类足够严格的杂交条件下，仅在探针或引物和靶等位基因之间形成稳定双链体。因此可以检测到约10至约35个核苷酸长度、通常约15至约35个核苷酸长度的与涵盖多态性位点并与多态性位点处等位基因序列正好互补的区域中的等位基因序列基本上互补的寡核苷酸。

使用基本上而非正好互补的寡核苷酸可能在杂交条件优化有限的测试形式中是合乎需要的。例如，在常见的多靶固定化寡核苷酸测定形式中，每个靶的探针或引物固定在单一固相支持物上。通过使固相支持物与含有靶向DNA的溶液接触，同时实施杂交。由于全部杂交在相同的条件下实施，杂交条件不能分别针对每种探针或引物优化。当测定形式排斥调整杂交条件时，向探针或引物掺入错配可以用来调节双链体稳定性。众所周知引入的特定错配对双链体稳定性的影响，并且如上文所述，可以例行地估计及经验地确定双链体稳定性。可以使用本文提供的和本领域众所周知的指导，经验地选择取决于探针或引物的精确尺寸和序列的合适杂交条件。例如，Conner等人，Proc.Nat.Acad.Sci.USA[美国国家科学院院刊]80：278-282，1983和美国专利号20 5,468,613和5,604,099中描述了寡核苷酸探针或引物检测序列中单碱基对差异的用途。

完美匹配的杂交双链体和单碱基错配的杂交双链体之间稳定性的比例变化取决于杂交的寡核苷酸的长度。与较短探针序列形成的双链体因存在错配而更多地按比例去稳定化。约15和约35个核苷酸长度之间的寡核苷酸经常用于序列特异性检测。另外，因为杂交的寡核苷酸的末端因热能而经历持续的随机解离和再复性，在任一末端的错配比内部出现的错配使杂交双链体去稳定化更少。为了区分靶序列中的单碱基对变化，选择该探针序列，该探针序列与靶序列杂交，从而多态性位点出现在探针的内部区域。

选择与特定等位基因杂交的探针序列的上述标准适用于探针的杂交区域，即，涉及与靶序列杂交的探针部分。探针可以与额外的核酸序列结合，如用来固定探针的聚T尾，而不显著改变探针的杂交特征。本领域技术人员会认识到，为了用于本发明的方法中，与不互补于靶序列并且因此不涉及杂交的额外核酸序列结合的探针实质上等同于未结合的探针。

用于检测样品中探针和靶标核酸序列之间形成的杂交分子的合适测定形式是本领域已知的并且包括固定化靶(斑点印迹)形式和固定化探针(反向斑点印迹或线印迹)测定形式。美国专利号5,310,893；5,451,512；5,468,613；和5,604,099中描述了斑点印迹和反向斑点印迹测定形式。

在斑点印迹形式中，扩增的靶向DNA固定在固相支持物(例如，尼龙膜)上。将膜-靶复合物与标记探针在合适的杂交条件下孵育，通过在适当严格的条件下洗涤，移除未杂交的探针，并且对膜监测结合探针的存在。

在反向斑点印迹(或线印迹)形式中，探针固定在固相支持物(例如，尼龙膜或微量滴定板)上。将靶向DNA标记，一般在扩增期间通过掺入标记的引物进行标记。可以标记一条或两条引物。将膜-探针复合物与标记的扩增的靶向DNA在合适的杂交条件下孵育，通过在适当严格的条件下洗涤，移除未杂交的靶向DNA，并且对膜监测结合的靶向DNA的存在。

对一个多态性变体特异的等位基因特异性探针经常与针对另一个多态性变体的等位基因特异性探针联合使用。这些探针可以固定在固相支持物上并且同时使用两种探针分析个体中的靶序列。核酸阵列的实例由WO 95/11995描述。相同的阵列或不同的阵列可以用于分析表征的多态性。WO 95/11995还描述了为检测预表征的多态性的变体形式而优化的子阵列。这种子阵列可以用于检测本文所述的多态性的存在。

等位基因特异性引物

还常见地使用等位基因特异性扩增法或引物延长法检测多态性。这些反应一般涉及使用设计成借助引物3′-末端处的错配特异性地靶向多态性的引物。当聚合酶缺少纠错活性时，错配的存在影响聚合酶延长引物的能力。例如，为了使用基于等位基因特异性扩增或延长的方法检测等位基因序列，与一个等位基因多态性互补的引物如此设计，从而核苷酸的3′-端在多态性位置杂交。可以通过引物启动延长的能力确定特定等位基因的存在。如果3’-末端错配，则延长受阻。

在一些实例中，引物与第二引物在扩增反应中联合使用。第二引物在与多态性位置不相关的位点杂交。从这两个引物推进扩增，导致预示存在特定等位基因形式的可检测产物。例如，WO 93/22456；美国专利号5,137,806；5,595,890；5,639,611；和美国专利号4,851,331中描述了基于等位基因特异性扩增或延长的方法。

使用基于等位基因特异性扩增的基因分型，等位基因的鉴定仅需要检测已扩增的靶序列的存在或不存在。用于检测已扩增的靶序列的方法是本领域众所周知的。例如，描述的凝胶电泳分析和探针杂交分析经常用来检测核酸的存在。

在探针较少的备选方法中，通过监测反应混合物中双链DNA总量的增加检测扩增的核酸，这例如在美国专利号5,994,056；和欧洲专利公开号487,218和512,334中描述。对双链靶向DNA的检测依赖于多种DNA结合染料(例如，SYBR Green)与双链DNA结合时所显示的荧光增加。

如本领域技术人员领会的那样，可以在利用多重等位基因特异性引物靶向特定等位基因的反应中进行等位基因特异性扩增方法。用于这类多重应用的引物通常用可区分的标记物标记或选择，从而从等位基因产生的扩增产物按大小可区分。因此，例如，可以使用单一扩增，通过扩增产物的凝胶分析鉴定单一样品中的多个等位基因。

如在等位基因特异性探针的情况下，等位基因特异性寡核苷酸引物可以在杂交区域正好互补于一个多态性等位基因或可以在寡核苷酸3’-末端之外的位置具有某些错配，该错配在两个等位基因序列中均出现在非多态性位点处。

可检测探针

5′-核酸酶分析探针

也可以使用如美国专利号5,210,015；5,487,972；和5,804,375；和Holland等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA[美国国家科学院院刊]88：7276-7280，1988中所述的

或“5’-核酸酶测定法”进行基因型分型。在

测定法中，扩增反应期间添加在扩增区域内部杂交的标记的检测探针。这些探针如此修饰，从而防止探针作为DNA合成的引物发挥作用。使用具有5’-至3’-核酸外切酶活性的DNA聚合酶，进行扩增。在扩增的每种合成步骤期间，与正在被延长的引物下游的靶标核酸杂交的任何探针由DNA聚合酶的5’-至3’-核酸外切酶活性降解。因此，新靶向链的合成还导致探针降解，并且降解产物堆积提供对靶序列合成的测量。

杂交探针可以是区分SNP等位基因的等位基因特异性探针。可替代地，可以使用与扩增产物结合的等位基因特异性引物和标记探针进行该方法。

适于检测降解产物的任何方法可以用于5’-核酸酶分析中。经常地，检测探针用两种荧光染料标记，其中之一能够猝灭另一种染料的荧光。这些染料与探针连接，通常一种染料与5’末端连接并且另一种染料与内部位点连接，从而探针处于未杂交的状态时，出现猝灭，并且从而探针在两种染料之间受到DNA聚合酶的5’-至3’-核酸外切酶活性切割。扩增导致切割染料之间的探针，伴以猝灭的同步消除和从最初猝灭的染料可观察的荧光增加。通过测量反应荧光的增加，监测降解产物的堆积。美国专利号5,491,063和5,571,673描述了用于检测伴随扩增同时出现的探针降解的备选方法。

二级结构探针

当二级结构性变化时可检测的探针也适用于检测多态性，包括SNP。例举的二级结构或茎-环结构探针包括分子信标或

引物/探针。分子信标探针是可以形成发夹结构的单链寡核酸探针，在该发夹结构中，荧光团和猝灭剂通常位于寡核苷酸的对侧端。探针短互补序列的任一末端允许形成分子内茎部，后者使得荧光团和猝灭剂靠近成为可能。分子信标的环部分与感兴趣的靶标核酸互补。这种探针与其感兴趣的靶标核酸的结合形成迫使茎部分开的杂交分子。这造成使荧光团和猝灭剂彼此远离并导致更强烈荧光信号的构象变化。分子信标探针对探针靶中的微小序列变异高度敏感(参见，例如，Tyagi等人，Nature Biotech.[自然生物技术]14：303-308，1996；Tyagi等人，Nature Biotech.[自然生物技术]16：49-53，1998；Piatek等人，Nature Biotech.[自然生物技术]16：359-363，1998；Marras等人，Genetic Analysis：Biomolecular Engineering[遗传分析：生物分子工程]14：151-156，1999；Tapp等人，BioTechniques[生物技术]28：732-738，2000)。

引物/探针包含与引物共价连接的茎-环结构探针。

DNA测序和单碱基延长

也可以通过直接测序检测SNP。方法包括例如基于双脱氧测序的方法及其他方法例如Maxam和Gilbert测序(参见，例如Sambrook和Russell，见上文)。

其他检测方法包括寡核苷酸长度产物的焦磷酸测序法^TM。这类方法经常利用扩增技术，例如PCR。例如，在焦磷酸测序法中，测序引物与PCR扩增的单链DNA模板杂交并且与DNA聚合酶、腺苷三磷酸硫酸化酶、荧光素酶和腺苷三磷酸双磷酶和底物腺苷5’磷酸硫酸盐(APS)和荧光素孵育。向反应添加四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)的第一种。如果与模板链中的碱基互补，则DNA聚合酶催化脱氧核苷酸三磷酸掺入DNA链中。每个掺入事件伴随按照与所掺入核苷酸的量等摩尔的量释放焦磷酸盐(PPi)。在APS存在下，腺苷三磷酸硫酸化酶将PPi定量转化成ATP。这种ATP驱动荧光素酶介导的荧光素转化成氧代荧光素，该转化按照与ATP量成正比的量产生可见光。荧光素酶催化反应中产生的光由电荷耦合元件(CCD)照相机检测并且在PYROGRAM^TM视为一个峰。每个光信号与掺入的核苷酸的数目成正比。腺苷三磷酸双磷酶(核苷酸降解酶)连续地降解未掺入的dNTP和过量ATP。当降解完成时，添加另一种dNTP。

用于表征SNP的另一个相似方法不需要使用完整的PCR，但一般仅利用通过荧光标记的与待研究核苷酸互补的单个双脱氧核糖核酸分子(ddNTP)延长引物。可以通过检测已经被延长一个碱基并经荧光标记的引物，鉴定多态性位点处的核苷酸(例如，Kobayashi等人，Mol.Cell.Probes[分子细胞探针]，9：175-182，1995)。

电泳法

可以通过使用变性梯度凝胶电泳，分析使用聚合酶链反应所生成的扩增产物。可以基于不同的序列依赖性解链特性和DNA在溶液中的电泳迁移，鉴定不同等位基因(参见，例如，Erlich编著，PCR Technology，Principles and Applications for DNAAmplification[PCR技术：DNA扩增的原理和应用]，W.H.弗里曼出版社(W.H.Freeman andCo.)，1992)。

可以使用毛细管电泳法区分微卫星多态性。毛细管电泳法便利地允许鉴定特定微卫星等位基因中重复序列的数目。应用毛细管电泳法分析DNA多态性是本领域技术人员众所周知的(参见，例如，Szantai等人，J ChromatogrA.[色谱杂志A]1079(1-2)：41-9，2005；Bjorheim等人，Electrophoresis[电泳法]26(13)：2520-30，2005和Mitchelson，Mol.Biotechnol.[分子生物技术]24(1)：41-68，2003)。

也可以通过分析包含多态性区域的核酸在含有变性剂梯度的聚丙烯酰胺凝胶中的运动，获得等位变体的身份，所述核酸使用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析(参见，例如，Myers等人，Nature[自然]313：495-498,1985)。当使用DGGE作为分析方法时，修饰DNA以确保它并未彻底变性，例如，通过PCR添加大约40bp富含GC的高解链温度DNA的GC钳进行修饰。在一些实例中，可以使用温度梯度替代变性剂梯度以鉴定对照和样品DNA的迁移率差异(参见，例如，Rosenbaum等人，Biophys.Chem.[生物物理学和生物化学]265：1275，1987)。

单链构象多态性分析

可以使用单链构象多态性分析法区分靶序列的等位基因，该单链构象多态性分析法依据单链PCR产物的电泳迁移的改变鉴定碱基差异，例如，如Orita等人，Proc.Nat.Acad.Sci.[美国国家科学院院刊]86,2766-2770，1989；Cotton Mutat.Res.[棉花突变研究]285：125-144，1993；和Hayashi Genet.Anal.Tech.Appl.[肛门技术应用]9：73-79，1992中所述。可以如上文所述那样生成扩增的PCR产物并加热或变性，以形成单链扩增产物。单链核酸可以再折叠或形成部分地依赖于碱基序列的二级结构。单链扩增产物的不同电泳迁移率可能与靶等位基因之间的碱基序列差异相关，并且所产生的电泳迁移率改变能够甚至实现对单碱基变化的检测。DNA片段可以被标记或用标记探针检测。可以通过使用RNA(而非DNA)增强测定法的灵敏度，其中二级结构对序列中的变化更敏感。在另一个实例中，该方法利用异源双链体分析法基于电泳迁移率的变化，分离双链异源双链体分子(参见，例如，Keen等人，Trends Genet.[遗传学趋势]7：5-10，1991)。

SNP检测方法经常利用标记的寡核苷酸。可以通过掺入借助光谱、光化学、生物化学、免疫化学或化学手段可检测的标记物，标记寡核苷酸。有用的标记物包括荧光染料、放射性标记物，例如，³²P、电子致密试剂、酶(例如，过氧化物酶或碱性磷酸酶)、生物素或可获得其抗血清或单克隆抗体的半抗原和蛋白质。标记技术是本领域众所周知的(参见，例如Current Protocols in Molecular Biology[分子生物学实验指南]，见上文；Sambrook等人，见上文)。

IL-33轴结合拮抗剂

本文披露的治疗和诊断方法鉴定了可以优先用IL-33轴结合拮抗剂治疗的受试者。“IL-33轴结合拮抗剂”是指抑制IL-33轴结合配偶体与一种或多种其结合配偶体相互作用的分子。如本文所用，IL-33轴结合拮抗剂包括IL-33结合拮抗剂、ST2结合拮抗剂、和IL-1RAcP结合拮抗剂。

示例性的IL-33结合拮抗剂包含抗IL-33抗体或其抗原结合片段，包括33_640087-7B(如WO 2016/156440中所述)、称为艾托奇单抗(etokimab)的ANB020(如WO 2015/106080中所述)、9675P(如US 2014/0271658中所述)、A25-3H04(如US 2017/0283494中所述)、Ab43(如WO 2018/081075中所述)、IL33-158(如US 2018/0037644中所述)、10C12.38.H6.87Y.581 lgG4(如WO 2016/077381中所述)或其结合片段。其他示例性抗IL-33抗体或其抗原结合片段包括WO 2016/156440、WO 2015/106080、US 2014/0271658、US2017/0283494、WO 2018/081075、US 2018/0037644或WO 2016/077381中描述的任何其他抗IL-33抗体，将其全部通过引用并入本文。

其他示例性IL-33轴结合拮抗剂包括结合IL-33和/或其受体(ST-2)或共受体(IL1-RAcP)并阻断配体受体相互作用的多肽(例如，ST2-Fc蛋白，如WO 2013/173761、WO2013/165894或WO 2014/152195中描述的那些，将其各自通过引用以其整体并入本文；或可溶性ST2：或其衍生物)。

其他示例性IL-33轴结合拮抗剂还包括抗ST-2抗体或其抗原结合片段(例如，AMG-282(安进公司(Amgen))或STLM15(杨森公司(Janssen))或者WO 2013/173761或WO 2013/165894中描述的任何抗ST2抗体，将其各自通过引用以其整体并入本文)。

其他示例性IL-33轴结合拮抗剂包括基于IL-33受体的配体阱，如WO 2018/102597中描述的那些，将其通过引用并入本文。

在一个实例中，该IL-33轴结合拮抗剂是结合分子。适合地，该结合分子可以是抗体或其抗原结合片段。

适合地，该结合分子特异性结合IL33。这样一种结合分子也称为“IL-33结合分子”或“抗IL-33结合分子”。适合地，该结合分子与IL-33特异性结合并抑制或减弱IL-33活性。

适合地，该IL-33结合分子特异性结合还原型IL-33、氧化型IL-33或还原型IL-33和氧化型IL-33两者。

适合地，该结合分子可以通过结合处于还原或氧化形式的IL-33来减弱或抑制IL-33活性。适合地，其中该结合分子抑制或减弱还原型IL-33活性和氧化型IL-33活性，这通过结合处于还原形式的IL-33(即通过结合还原型IL-33)来实现。

适合地，该结合分子抑制或减弱redIL-33和oxIL-33两者的活性，由此抑制或减弱ST2信号传导和RAGE信号传导两者。

适合地，该结合分子可以特异性地以小于以下的结合亲和力(Kd)与redIL-33结合：小于5x10^-2M、10^-2M、5x10^-3M、10^-3M、5x10^-4M、10^-4M、5x10^-5M、10^-5M、5x10^-6M、10^-6M、5x10-⁷M、10-⁷M、5x10^-8M、10^-8M、5x10^-9M、10^-9M、5x10^-10M、10^-10M、5x10^-11M、10^-11M、5x10^-12M、10^-12M、5x10-¹³M、10^-13M、5x10^-14M、10^-14M、5x10-¹⁵M或10^-15M。适合地，与redIL-33的结合亲和力小于5x10^-14M(即，0.05pM)。适合地，使用动力学排阻测定(KinExA)或BIACORE^IM，适合地，使用KinExA、使用例如WO 2016/156440中描述的那些方案(参见例如，实例11，将该文献通过引用以其整体并入本文)来测量结合亲和力。已经发现，以这种结合亲和力与redIL-33结合的结合分子足够紧密地结合，以防止结合分子/redIL-33复合物在生物学相关时间尺度内解离。不希望被理论束缚，这种结合强度被认为在结合分子/抗原复合物在体内降解之前防止抗原的释放，从而使与IL-33从结合复合物中释放相关的任何IL-33依赖性活性最小化。

适合地，该结合分子可以按大于或等于10³M^-1sec^-1、5X10³M^-1sec^-1、10⁴M^-1sec^-1或5X10⁴M^-1sec^-1的缔合速率(k(on))与redIL-33特异性结合。例如，本披露的结合分子可以按大于或等于10⁵M^-1sec^-1、5X10⁵M^-1sec^-1、10⁶M^-1sec^-1或5X10⁶M^-1sec^-1或10⁷M^-1sec^-1的结合速率(k(on))结合redIL-33或其片段或变体。适合地，k(on)速率大于或等于10⁷M^-1sec^-1。适合地，该结合分子可以按小于或等于5X10^-1sec^-1、10^-1sec^-1、5X10^-2sec^-1、10^-2sec^-1、5X10^-3sec^-1或10^-3sec^-1的解离速率(k(off))与redIL-33特异性结合。例如，可以说，本披露的结合分子按小于或等于5X10^-4sec^-1、10^-4sec^-1、5X10^-5sec^-1或10^-5sec^-15X10^-6sec^-1、10^-6sec^-1、5X10^-7sec^-1或10^-7sec^-1的解离速率(k(off))结合redIL-33或其片段或变体。适合地，该k(off)速率小于或等于10^-3sec^-1。IL-33是响应于炎症刺激迅速且以高浓度释放的警报素蛋白细胞因子。redIL-33在释放到细胞外环境中后大约5-45分钟转化为氧化形式(Cohen等人Nat Commun[自然通讯]6，8327(2015))。不希望被理论束缚，以这些k(on)和/或k(off)速率与redIL-33结合可以在将还原形式转化为oxIL-33之前使对redIL-33的暴露最小化。此外，在复合物在体内降解之前，k(off)速率可以防止IL-33从结合分子/抗原复合物中释放。这些结合动力学还可以起到防止redIL-33转化为oxIL-33的作用，因此防止经由RAGE进行的氧化形式的IL-33的病理信号传导(描述于WO 2016/156440中，将其通过引用并入本文)。

适合地，IL-33结合分子可以竞争性抑制IL33与表6中引用的结合分子中的任一项结合：

表6：示例性抗IL-33抗体VH和VL配对

已经报道了所有这些结合分子均与IL-33结合，并且抑制或减弱ST-2信号传导。因此，与表6中描述的任何抗体竞争结合IL-33的结合分子或其结合片段可以抑制或减弱ST-2信号传导。

如果结合分子或其片段以在某种程度上阻断参考抗体与给定表位结合的程度与该表位结合，则称该结合分子或其片段竞争性抑制参考抗体与该表位的结合。竞争性抑制可通过本领域已知的任何方法确定，例如固相测定(诸如竞争ELISA测定)、解离增强镧系荧光免疫测定(

珀金埃尔默公司(Perkin Elmer))和放射性配体结合测定。例如，技术人员可以通过使用体外竞争结合测定如WO 2016/156440段落881-886中描述的HTRF测定来确定结合分子或其片段是否竞争与IL-33结合，将其通过引用并入本文。例如，技术人员可以用供体荧光团标记表6的重组抗体，并且将多个浓度的重组抗体与受体荧光团标记的redIL-33的固定浓度样品混合。随后，可以测量每个样品内供体与受体荧光团之间的荧光共振能量转移，以确定结合特征。为了阐明竞争性结合分子，技术人员可以首先将各种浓度的测试结合分子与固定浓度的表6的标记抗体混合。当将混合物与标记的IL-33一起孵育时，与仅标记抗体的阳性对照相比，FRET信号的减少表示竞争性结合IL-33。可以称结合分子或其片段将参考抗体与给定表位的结合竞争性抑制至少90％、至少80％、至少70％、至少60％或至少50％。

适合地，该IL-33结合分子可以是包含选自表6的可变重链结构域(VH)和可变轻链结构域(VL)对的互补决定区(CDR)的抗体或抗原结合片段。在其中，对(pair)1对应于WO2016/156440中描述的33_640087-7B的VH和VL结构域序列。对2-7对应于US 2014/0271658中所述的抗体的VH和VL结构域序列。对8-12对应于US 2017/0283494中所述的抗体的VH和VL结构域序列。对13对应于WO 2015/106080中所述的ANB020的VH和VL结构域序列。对14-16对应于WO 2018/081075中所述的抗体的VH和VL结构域序列。对17对应于US 2018/0037644中所述的IL33-158的VH和VL结构域序列。对18对应于WO 2016/077381中所述的10C12.38.H6.87Y.581lgG4的VH和VL结构域序列。

适合地，IL-33结合分子可以竞争性地抑制IL-33与结合分子33_640087-7B的结合(如WO 2016/156440中所述)。适合地，WO 2016/156440披露到33_640087-7B以特别高的亲和力与redIL-33结合并且减弱了ST-2和RAGE依赖性IL-33信号传导两者。

适合地，该IL-33结合分子是包含以下的抗IL-33抗体或其抗原结合片段：包含SEQID NO：1的序列的重链可变区(HCVR)的互补决定区(CDR)，和包含SEQ ID NO：19的序列的轻链可变区(LCVR)的互补决定区(CDR)。这些CDR对应于源自33_640087-7B的CDR(如WO 2016/156440中所述)，33_640087-7B结合还原型IL-33并抑制其转化为氧化型IL-33。在WO 2016/156440中充分描述了33_640087-7B，将其通过引用并入本文。因此，此抗体可以特别适用于本文所述的方法中以抑制或减弱ST-2和RAGE信号传导两者。

适合地，技术人员已知本领域中可用于鉴定抗体或其抗原结合片段的重链和轻链可变区内的CDR的方法。适合地，技术人员可以例如进行基于序列的注释。CDR之间的区域通常是高度保守的，并且因此，可以使用逻辑规则来确定CDR位置。技术人员可以使用用于常规抗体的一组基于序列的规则(Pantazes和Maranas，Protein Engineering，Design andSelection[蛋白质工程化、设计和选择]，2010)，可替代地或另外地，他还可以基于多序列比对来完善规则。可替代地，技术人员可以使用BLAST+的BLASTP指令将抗体序列与根据Kabat、Chothia或IMGT方法操作的公众可获得的数据库进行比较，以鉴定最类似的注释序列。这些方法中的每一种均设计了独特的残基编号方案，根据该编号方案对高变区残基进行编号，然后根据某些关键位置确定六个CDR中的每一个的起始和结束。在例如与最类似的注释序列比对后，可以将CDR从注释序列外推至非注释序列，从而鉴定CDR。合适的工具/数据库是：例如，Kabat数据库、Kabatman、Scalinger、IMGT、Abnum。

适合地，该结合分子是包含选自表6的可变重链结构域(VH)和可变轻链结构域(VL)对的IL-33抗体或抗原结合片段。

因此，适合地，IL33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：1的序列的VH结构域和SEQ ID NO：19的序列的VL结构域。

因此，适合地， L33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：7的序列的VH结构域和SEQ ID NO：25的序列的VL结构域。

因此，适合地，IL33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：11的序列的VH结构域和SEQ ID NO：29的序列的VL结构域。

因此，适合地，IL33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：13的序列的VH结构域和SEQ ID NO：31的序列的VL结构域。

因此，适合地，IL33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：16的序列的VH结构域和SEQ ID NO：34的序列的VL结构域。

因此，适合地，IL33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：17的序列的VH结构域和SEQ ID NO：35的序列的VL结构域。

因此，适合地，IL33抗体或抗原结合片段包含SEQ ID NO：18的序列的VH结构域和SEQ ID NO：36的序列的VL结构域。

适合地，该IL-33抗体或抗原结合片段包含可变重链，该可变重链包含源自独立地选自SEQ ID NO：1、7、11、13、16、17和18的重链可变区的3个CDR。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含重链可变区，该重链可变区包含根据SEQ ID NO：1的重链可变区的3个CDR。

适合地，该IL-33抗体或抗原结合片段包含轻链可变区，该轻链可变区包含独立地选自SEQ ID NO：19、25、29、31、34、35和36的轻链可变区中的3个CDR。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含轻链可变区，该轻链可变区包含根据SEQ ID NO：19的轻链可变区中的3个CDR。

适合地，因此，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含重链可变区并且包含轻链可变区，该重链可变区包含根据SEQ ID NO：1、7、11、13、16、17和18的重链可变区的3个CDR，该轻链可变区包含独立地选自SEQ ID NO：19、25、29、31、34、35和36的轻链可变区中的3个CDR。

适合地，因此，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含重链可变区并且包含轻链可变区，该重链可变区包含根据SEQ ID NO：1的重链可变区的3个CDR，该轻链可变区包含根据SEQ ID NO：19的轻链可变区中的3个CDR。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含具有VH CDR 1-3的可变重链结构域(VH)和可变轻链结构域(VL)，VH CDR 1-3分别具有SEQ ID NO：37、38和39的序列，其中一个或多个VHCDR具有3个或更少的单个氨基酸取代、插入和/或缺失。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH结构域，该VH结构域包含分别为SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38和SEQ ID NO：39的VHCDR 1-3。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH结构域，该VH结构域包含分别由SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：38和SEQ ID NO：39组成的VHCDR 1-3。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含具有VL CDR 1-3的可变重链结构域(VH)和可变轻链结构域(VL)，VL CDR 1-3分别具有SEQ ID NO：40、41和42的序列，其中一个或多个VLCDR具有3个或更少的单个氨基酸取代、插入和/或缺失。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VL结构域，该VL结构域包含分别为SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41和SEQ ID NO：42的VLCDR1-3。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VL结构域，该VL结构域包含分别由SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41和SEQ ID NO：42组成的VLCDR 1-3。

适合地，因此，该抗IL-33抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：37序列的VHCDR1、具有SEQ ID NO：38序列的VHCDR2、具有SEQ ID NO：39序列的VHCDR3、具有SEQ IDNO：40序列的VLCDR1、具有SEQ ID NO：41序列的VLCDR2、和具有SEQ ID NO：42序列的VLCDR3。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VH具有与根据SEQ IDNO：1、7、11、13、16、17和18的VH具有至少90％(例如91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的氨基酸序列。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VH具有与根据SEQ IDNO：1的VH具有至少90％(例如91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的氨基酸序列。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中上文披露的VH具有如下序列，其中框架中的1、2、3或4个氨基酸缺失、用不同氨基酸插入和/或独立地替换。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VL具有与根据SEQ IDNO：19、25、29、31、34、35和36的VL具有至少90％(例如91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的氨基酸序列。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VL具有与根据SEQ IDNO：19的VL具有至少90％(例如91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的氨基酸序列。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中上文披露的VL具有如下序列，其中框架中的1、2、3或4个氨基酸独立地缺失、用不同氨基酸插入和/或替换。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VH具有与根据SEQ IDNO：1、7、11、13、16、17和18的VH具有至少90％(例如91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的氨基酸序列，并且VL具有与根据SEQ ID NO：19、25、29、31、34、35和36的VL具有至少90％(例如91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的氨基酸序列。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VH具有由SEQ ID NO：1、7、11、13、16、17和18组成的氨基酸序列，并且该VL具有由SEQ ID NO：19、25、29、31、34、35和36组成的氨基酸序列。

适合地，该IL-33抗体或其抗原结合片段包含VH和VL，其中该VH具有由SEQ ID NO：1组成的氨基酸序列，并且该VL具有由SEQ ID NO：19组成的氨基酸序列。

试剂盒

在一些实例中，本文提供一种用于实施本披露方法(例如，确定在如本文所述的多态性处的基因型)的试剂盒。在一些实例中，本文提供一种确定患者是否面临增加的IL-33介导的病症风险的试剂盒。在一些实例中，本文提供一种确定患有IL-33介导的病症的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的试剂盒。例如，该试剂盒包含第一和第二寡核苷酸，该寡核苷酸对上面鉴定为属于聚类1、2、3或4的IL33的任何多态性区域特异的。该试剂盒可以包含对相应的多个聚类1、2、3或4多态性特异的多个第一和第二寡核苷酸。多个聚类1、2、3或4多态性可以是上述方法中指定的那些中的任何一个。

“对遗传基因座特异的”寡核苷酸结合至基因座的多态性区域或结合至毗邻于基因座的多态性区域。对于待作为扩增用引物使用的寡核苷酸，如果引物足够地接近以用来产生包含多态性区域的多核苷酸，则它们是毗邻的。在一个实施例中，如果寡核苷酸在距多态性约1-2kb(例如，小于1kb)范围内结合，则它们是毗邻的。特异性寡核苷酸能够与序列杂交，并且在合适的条件下将不与单核苷酸不同的序列结合。

试剂盒中所含的寡核苷酸，无论是否作为探针或引物使用，均可以按可检测方式标记。可以直接(例如，对于荧光标记物)或间接地检测标记物。间接检测可以包括本领域技术人员已知的任何检测方法，包括生物素-抗生物素蛋白相互作用、抗体结合等。荧光标记的寡核苷酸还可以含有猝灭分子。寡核苷酸可以与表面结合。在一些实施例中，表面是二氧化硅或玻璃。在一些实施例中，表面是金属电极。

其他试剂盒包含至少一种为进行测定法而必需的试剂。例如，试剂盒可以包含酶。可替代地，试剂盒可以包含缓冲剂或任何其他必需试剂。试剂盒可以包含用于确定患者基因型的所有或部分阳性对照、阴性对照、试剂、引物、测序标记和探针。

组合物

本文还提供了包含本文披露的任何IL33轴结合拮抗剂的组合物，用于本文披露的方法的任何实例。还提供了任何所述IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有IL-33介导的病症的受试者的药剂中的用途，其中已经确定受试者的基因型包含聚类1、2或3等位基因多态性中的任意一个，或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的任何等效等位基因，与患有待治疗的IL33介导的病症的风险增加有关。

据报道，IL33的遗传变体与哮喘和血液嗜酸性粒细胞水平有关。在本实例中，通过对大型基因组群的调查显示，无论嗜酸性粒细胞状态如何，IL33(和IL1RL1)变体也与发病年龄相关。研究了一种罕见的预测功能缺失蛋白截短变体(PTV)(IL33中的罕见剪接变体-rs146597587)以及几种更常见的风险变体的影响。数据还显示，基于常见IL33和IL1RL1变体的遗传风险评分，在具有较高IL33途径活性的受试者中，观察到的罕见IL33功能缺失变体的风险降低更大，这表示一子组哮喘患者患有的IL33-驱动的疾病可以通过阻断IL33活性来挽救。

人类遗传学数据是在英国生物样本库(UKB)项目和FinnGene组群中生成的。这项研究获得了来自20,479名哮喘患者和109,902名呼吸控制受试者，以及64,773名哮喘患者和353，516名在英国生物样本库内进行基因分型的对照受试者的全外显子组测序数据。通过结合自我报告的哮喘病例和具有哮喘住院记录的受试者来确定哮喘受试者。经由自我报告和医生诊断为哮喘的年龄来获取发病年龄。使用来自英国生物样本库的GWAS结果评估了IL33和IL1RL1基因座处常见变体的哮喘关联。

实例1

以下实例是通过说明的方式但不是通过限制的方式来提供的。

具有高IL33途径遗传风险评分的受试者显示出携带罕见的IL33功能缺失变异体的更大益处

为了定义IL-33驱动的哮喘的遗传风险评分，收集(检索自GTEx Portal 01/16/2020，Sun等人，Nature.[自然]2018年6月；558(7708)：73-79，Gotenboer等人，J AllergyClin Immunol.[临床免疫学杂志]2013年3月；131(3)：856-65，Ho等人，J Clin Invest.[临床研究杂志]2013年10月；123(10)：4208-18)IL33中据报道影响IL33的表达水平的222个常见变体(检索自GTEx Portal 01/16/2020)，以及据报道影响IL1RL1的mRNA或蛋白水平或导致IL1RL1氨基酸序列改变的774个变体。哮喘的弹性净回归模型用于拟合UKB数据。模型选择了996个变体中的43个作为信息，这意味着它们具有非零系数。然后，将IL33驱动的哮喘的常见遗传变体风险评分作为所有UKB受试者中这43种变体的基因型计数的加权和获得。评分的范围从零(即，最不常见的变体风险)到一(即，最高的常见变体风险)。

在比较受试者的最低(遗传评分＝0)和最高(遗传评分＝1)UKB以确定IL-33驱动的哮喘风险时，观察到哮喘风险的差异超过2倍(OR为2.19，CI为2.05-2.34，p：1.03*10-114)(图1)。当针对哮喘风险进行IL33功能缺失变体rs146597587的携带者状态的影响的逻辑回归时，鉴定与常见遗传变体风险评分的交互作用系数0.36(CI0.16-0.83，p＝0.016)具有统计学意义，这表明常见变体风险评分越高，功能缺失变体的保护作用越强。在常见变体评分的整体逻辑回归中发现的这种效应及其与功能缺失等位基因的相互作用，可以通过比较常见变体评分的极端十分位数内的功能缺失等位基因的影响来可视化(即，最低风险与最高风险亚组比较)(图2)。

作为阴性对照，我们在携带者状态和三个不相关的哮喘疾病基因(ORMDL3、ADAM33、TSLP)上产生的弹性净风险评分之间进行了类似的逻辑回归，其中没有发现统计学上显著的关系(p：0.263)(图3)。这表示观察到的应用于IL33风险评分的携带rs146597587的抢救效果通常与任何哮喘风险评分无关。

罕见的IL33功能缺失变体降低早发性哮喘的风险

为了发现IL33内的罕见变体与UKB组群中捕获的哮喘相关表型性状之间的关联，进行了外显子组关联研究(exWAS)。病例/对照关联测试是通过将自我报告的哮喘病例和患有哮喘住院发作的受试者结合起来，并将它们与一组群呼吸控制(没有报告任何呼吸系统疾病的受试者)进行对比。

观察到变体rs146597587对哮喘具有显著的保护作用(OR＝0.59，95％CI0.47-0.73，p 2.1*10^-7，MAF＝0.4％)(图4)。还发现该变体在早发性(<18岁)的哮喘患者中不太普遍，与晚发型(>＝18岁)的哮喘患者相比，OR为0.49(p＝0.015)。

这些发现表示，IL33是哮喘的一个重要因素，尤其是在具有早发性疾病的患者中。

IL33基因座中的一组常见变体与哮喘风险和哮喘发病较早有关

为了表征先前报道的IL33基因座处哮喘风险变体，在GWAS目录中进行了数据库搜索(Buniello等人，Nucleic Acids Res.[核酸研究]，2019年1月8日；47(D1)：D1005-D1012)。这鉴定了IL33基因座中与哮喘、其他呼吸系统病症或嗜酸性粒细胞水平相关的39种常见变体。我们在UKB组群中的分析证实了其中这32个SNP与哮喘风险呈正相关(表7)。然而，在UKB基因分型数据中，发现了与哮喘发病年龄关联的新发现(表8)(487,409名受试者，其中64,773名哮喘患者和353,516名呼吸控制患者)。

对39个变体的连锁不平衡(即，等位基因相关)的分析显示了四个主要聚类，并且聚类1、2和3中的变体显示出高度的内部相关性(图5)。虽然没有变体位于IL33蛋白译码区，但发现许多变体非常接近已知的转录因子结合位点，如通过ENCODE中的ChIPseq实验鉴定的(图6)。所有聚类1、2和3(图7)中的变体都显示出与哮喘以及哮喘发病年龄(图7)的强关联。我们还通过在线性回归中添加嗜酸性粒细胞计数作为协变量进行了针对嗜酸性粒细胞计数调整的发病分析。这允许分析对哮喘发病的变体影响，同时控制嗜酸性粒细胞的影响。即使考虑到嗜酸性粒细胞的影响，仍然与发病有显著关联，这表明IL33通过不依赖嗜酸性粒细胞的途径对哮喘发病起作用。

为了阐明哮喘关联的潜在功能机制，使用coloc(Plagnol等人，Biostatistics.[生物统计学]2009年4月；10(2)：327-34)在UKB中IL33基因座处的哮喘关联峰与从GTEx(v8)检索到的主动脉组织的IL33eQTL数据之间进行了共定位分析。比较同一基因座的两个关联峰(在这种情况下与哮喘和IL-33基因表达关联)时，一个普遍的问题是相关变体是否标记了相同或不同的因果变体。我们使用R包coloc进行了统计分析，以估计相同因果变体对两个信号负责的概率。我们发现P＝0.976的共定位(即，相同的潜在因果变体)的可能性很高(共享因果变体的coloc后验)(表7)。观察哮喘和IL-33表达中效应方向性的一致性，我们观察到针对候选集中的39个变体，增加哮喘风险的等位基因也总是增加IL-33表达，反之亦然(表8)。

为了进一步表征变体对IL33表达的影响和哮喘之间的相互作用，选择对GTEx(rs928413)中IL-33表达影响最大的eQTL变体进行进一步分析。在英国生物样本库组群中，rs928413(G)的风险等位基因与哮喘风险增加相关(OR 1.14，p值2.91*10-61)以及发病年龄降低(效应值β＝-1.22，p值9.7*10-24)(图8)。

综合我们对英国生物样本库中IL-33基因座常见变体的分析，确认IL33是哮喘易感基因。我们还显示IL33变体以独立于嗜酸性粒细胞的方式与哮喘发病相关，并将基因表达的变化鉴定为这些变体的可能功能机制。最后，我们显示数据支持IL33功能缺失变体在由于其通用的遗传变体背景而导致IL33途径的活性增加的受试者中增强的保护作用。

表7.IL33基因座中的39种常见变体及其与英国生物样本库内哮喘的关联。该表还给出了主动脉组织中的GTExv8 eQTL效应值。表达效果以标准化表达评分(NES)给出，没有直接的生理解释。哮喘风险和IL33表达变化的影响方向性始终是一致的，即，增加哮喘风险的等位基因也会增加IL33表达。

表8.IL33基因座中的39个常见变体及其与哮喘发病年龄的关联(负值表示发病较早)。该表还列出了针对嗜酸性粒细胞计数调整的关联。

方法

在IL33基因座和聚类分析中选择哮喘相关变体

在EBI GWAS目录(https://www.ebi.ac.uk/gwas/)中对哮喘的数据库搜索与在先前出版物中的搜索相结合，鉴定了与哮喘、其他呼吸系统病症或嗜酸性粒细胞水平相关的IL33基因座内的39个常见变体。

英国生物样本库中与哮喘的关联

在英国生物样本库组群中进行了统计分析。通过将受试者与自我报告的诊断或因哮喘住院的记录相结合，鉴定了64,773例哮喘病例。基于电子健康记录中没有任何肺部疾病/肺功能损伤，选择了353，516名对照。哮喘发病年龄被分析为数量性状或基于18岁截止的二元“早发性”/“晚发性”变量。基于哮喘受试者中每个SNP的风险等位基因数量的Pearson相关性对SNP进行聚类。使用逻辑回归进行与哮喘的关联，并且使用R(版本3.5.3)中的线性回归进行与哮喘发病年龄的关联。年龄、性别和英国生物样本库的前10个主要成分(人口分层控制)被调整为辅助因素。计算比值比。使用Bonferroni方法调整P值以进行多重比较。

哮喘与IL33 eQTL关联的共定位分析

使用R包coloc(版本3.2-1，https://cran.r-project.org/web/packages/coloc/index.html)对来自GTEx(v8)的主动脉组织中的哮喘关联峰和IL33 eQTL信号进行共定位分析。GTEx eQTL效应的概括统计量可从gtexportal.org公开获得。

IL-33驱动的哮喘的常见遗传变体风险

为了定义IL-33驱动的哮喘的常见遗传变体风险评分，我们在IL-33和IL1RL1基因座处鉴定了遗传变体，并具有与各自基因的功能相关性的先前证据。这包括在IL-33基因座上报告了对GTEx中IL-33表达有影响的222个变体和对IL1RL1表达(GTEx)、蛋白水平(Sun等人，Nature.[自然]2018年6月；558(7708)：73-79)或蛋白功能(Gotenboer等人，J AllergyClin Immunol.[变态反应与临床免疫学杂志]2013年3月；131(3)：856-65，Ho等人，J ClinInvest.[临床研究杂志]2013年10月；123(10)：4208-18)有影响的774个变体。为了确保常见变体评分和IL33功能缺失变体rs146597587之间的独立性，排除了显示具有rs146597587的任何LD(r2>0.01)的SNP。使用R包glmnet(版本3.0.2)，这996个变体作为预测因素且哮喘作为响应变量的弹性净回归模型拟合UKB数据。α超参数设置为0.5。使用10倍交叉验证拟合久超参数，并为最终模型选择最小化偏差的参数值。模型拟合产生了43个具有非零系数的变体。使用这些权重，将IL-33驱动的哮喘的常见遗传变体风险评分作为所有UKB受试者中这43种变体的基因型计数的加权和获得。评分的范围从零(即，最不常见的变体风险)到一(即，最高的常见变体风险)。为了测试常见遗传变体风险评分与罕见IL33功能缺失变体rs146597587的保护作用的相互作用，我们使用常见变体风险评分和rs146597587携带者状态作为预测因素和哮喘作为响应进行了逻辑回归。通过包含常见变体风险评分和rs146597587携带者状态的相互作用项，我们可以测试功能缺失变体相对于常见遗传变体背景的影响差异。

实例2

变体在驱动IL-33表型中的功能意义

使用双荧光素酶报告基因测定在体外评估哮喘相关IL33 SNP变体的功能意义，其中荧光素酶表达由IL33启动子驱动。将含有野生型(WT)序列或具有来自IL335′上游基因间或启动子区域的单个SNP变体的序列的3kb区段克隆到IL33-NanoLuc报告构建体中IL33启动子的上游。而包含WT序列或内含子SNP的1.5kb区段被克隆到IL33-NanoLuc报告构建体中NanoLuc基因的下游。然后使用这些构建体来确定变体如何在基础、低细胞因子和高细胞因子条件下影响IL33启动子活性。在各种条件下荧光素酶活性的增加与IL33启动子的增强相关。

简而言之，用WT构建体和含有SNP的构建体转染A549细胞，然后用低浓度的细胞因子混合物(2.5ng/mL TNF-α+12.5ng/mL IFN-γ)、高浓度的细胞因子混合物(10ng/mL TNF-α+50ng/mL IFN-γ)，或培养基对照(基础条件)处理。为了量化SNP对IL-33启动子活性的影响，将瞬时转染的A549细胞裂解，并在转染后26-27小时测量NanoLuc和萤火虫的荧光素酶活性。双荧光素酶测定用于筛选70个含有SNP的构建体。SNP与哮喘风险增加有关。每个板上都包含相应的WT序列构建体作为对照。与来自板上WT序列构建体对照的标准化NanoLuc荧光素酶活性相比，将SNP的影响标准化为活性百分比(设置为0％活性)。

从该筛选中，鉴定了IL335′上游基因间和启动子区域中的13个SNP和内含子-1中的一个SNP，导致在基础、低或高浓度细胞因子处理下NanoLuc荧光素酶活性显著增强(表9)。所有这些采样运行2-4次，每次n＝3。令人惊讶的是，结果显示区段11中的两个SNP(rs1475658_T和rs13298116_T)在基础条件下对IL33启动子活性显示出强烈的增强作用。该效果不一定是区段特异性的，因为区段11中的rs1929995_C在基础条件或细胞因子刺激条件下不会诱导NanoLuc荧光素酶活性的任何增加(图9)。

表9：IL33基因座中的14个常见变体在荧光素酶报告基因测定中显示出对IL33启动子的显著增强作用。

数据表示为来自6-12个生物重复样品的平均值±标准误差。*p＜0.05，**p＜0.01，***p＜0.001，****p＜0.0001

有趣的是，其他SNP采样在细胞因子刺激条件下显示出增强效果(表9)。例如，区段13中的三个SNP(rs144829310_T、rs7046661_C和rs992969_A)在高浓度细胞因子处理下显示出显著增强(图10)。这些SNP调节IL33启动子活性的机制尚不清楚，并且需要进一步研究。

从U-BIOPRED组群(N＝75)获得的鼻刷样品中的IL-33表达水平的体外分析证实了这些观察结果。使用线性回归测试表9中14个SNP的荧光素酶测定中的活性诱导等位基因与IL-33基因表达的关联。对于11/14SNP中的荧光素酶诱导等位基因，观察到表达的名义上显著增加(β>0.0，P＜0.05)(表9，图12)。该分析提供了其他证据，表明荧光素酶测定中鉴定出的SNP在IL-33调节中起着直接作用。

结果首次鉴定了哪些IL33 SNP可能是通过增加IL-33表达而导致IL-33介导的病症发展的原因。因此，具有这些SNP的受试者可能特别易于接受基于抗IL-33疗法的治疗。因此，在患有哮喘等病症的受试者中对这些SNP的鉴定提供了一种精准医学方法来鉴定最有可能响应于基于IL-33的疗法的受试者。

方法

细胞系

A549人腺癌肺泡基底上皮细胞系获取自美国典型培养物保藏中心(ATCC，Manassas，VA，USA)。细胞在补充有10％胎牛血清(10270106，赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific))、1mM丙酮酸钠(11360070，赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific))和2mM Glutamax-I(35050038，赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific))的无酚红DMEM培养基(31053028，赛默飞世尔科技公司，美国马塞诸塞州沃尔瑟姆，(ThermoFisher Scientific，Waltham，MA，USA)中培养。

荧光素酶报告构建体

使用从A549细胞中分离的基因组DNA，通过PCR扩增人IL33启动子区域。将IL33启动子克隆到pNL1.2[NlucP]荧光素酶报告载体(N1011，普洛麦格生物技术，瑞典纳卡[N1011，Promega Biotech，NACKA，Sweden])中以生成IL33-NanoLuc报告载体。使用从A549细胞中分离的基因组DNA对IL33启动子上游的14个滑动的3kb区段进行PCR扩增，并将该区段亚克隆到IL33-NanoLuc报告载体中，每个载体在IL33启动子上游有一个3kb区段。包含一个3kb区段的IL33-NanoLuc报告载体的大小约为8.8kb。3kb区段和IL33启动子中的SNP变体是通过基于PCR的定点突变产生的，并通过Sanger测序验证。将包含内含子SNP的区段合成为两个片段，在组装成一个1.5kb区段(使用NEBuilder HiFI DNA标准协议)后，两侧为750bp。在XbaI和FseI位点之间的IL33-NanoLuc报告载体中的NanoLuc基因下游克隆了1.5kb区段。

A549转染，和荧光素酶报告基因测定

使用Fugene HD转染试剂(普洛麦格生物技术[Promega Biotech])转染A549细胞，质粒DNA：转染试剂的比例为3。简而言之，在转染前24小时，将90μL中的每孔12000个细胞接种到96孔板中，并用98ng的测试IL33-NanoLuc报告质粒DNA和2ng的标准化萤火虫对照质粒

(E5011，普洛麦格生物技术[Promega Biotech])。3-4小时后，细胞用不同浓度的TNF-α(210-TA，美国安迪生物，美国明尼阿波利斯明尼苏达州[R&D Systems，Minneapolis，MN，MN，USA])和IFN-GAMMA(285-IF，美国安迪生物[R&D Systems])组合混合物刺激，并且培养基仅作为基础培养基对照。根据制造商协议，使用纳米GLO双荧光素酶报告基因检测试剂盒(N1630，普洛麦格生物技术[Promega Biotech])，转染后26-27小时测量纳米和萤火虫荧光素酶活性。将NanoLuc荧光素酶活性标准化为萤火虫荧光素酶的活性，以说明细胞转染和裂解效率的变化。

UBIOPRED IL-33表达分析

U-BIOPRED(呼吸疾病结果预测中的无偏生物标志物)组群包括来自75名受试者的鼻刷样本。通过RNA微阵列测量这些样品中的IL-33表达。从阿斯利康基因组学研究中心[AstraZeneca Centre for Genomics Research]进行的U-BIOPRED的全基因组测序中提取了待测试的14个变体的基因型(表9)。使用年龄和性别作为协变量，通过线性回归评估来自荧光素酶测定的活性诱导等位基因对IL-33表达的影响。

其他序列

SEQ ID NO37：SYAMS

SEQ ID NO38：GISAIDQSTYYADSVKG

SEQ ID NO 39：QKFMQLWGGGLRYPFGY

SEQ ID NO40：SGEGMGDKYAA

SEQ ID NO 41：RDTKRPS

SEQ ID NO 42：GVIQDNTGV

SEQ ID NO43：(其中n是g)

序列表

<110> 免疫医疗有限公司（MEDIMMUNE LIMITED）

<120> 用于治疗IL33中存在风险等位基因的受试者的治疗方法

<130> 201014-WO-PCT

<150> 62/988,993

<151> 2020-03-13

<160> 88

<170> PatentIn版本3.5

<210> 1

<211> 126

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 VH

<400> 1

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Gly Ile Ser Ala Ile Asp Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Gln Lys Phe Met Gln Leu Trp Gly Gly Gly Leu Arg Tyr Pro

100 105 110

Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser

115 120 125

<210> 2

<211> 122

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对2 VH

<400> 2

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Ser Phe

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Leu Val

35 40 45

Ser Asp Leu Arg Thr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Leu Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Lys Ser His Tyr Ser Thr Ser Trp Phe Gly Gly Phe Asp Tyr Trp

100 105 110

Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 3

<211> 121

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对3 VH

<400> 3

Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu

1 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Tyr

20 25 30

Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Leu Ile

35 40 45

Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu Lys

50 55 60

Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn His Phe Ser Leu

65 70 75 80

Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala

85 90 95

Arg Ser Gln Tyr Thr Ser Ser Trp Tyr Gly Ser Phe Asp Ile Trp Gly

100 105 110

Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 4

<211> 122

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对4 VH

<400> 4

Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala

1 5 10 15

Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Asn Ser Tyr

20 25 30

Gly Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met

35 40 45

Gly Trp Ile Ser Ser His Asn Gly Asn Ser His Tyr Val Gln Lys Phe

50 55 60

Gln Gly Arg Val Ser Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr

65 70 75 80

Met Glu Leu Arg Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg His Ser Tyr Thr Thr Ser Trp Tyr Gly Gly Phe Asp Tyr Trp

100 105 110

Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 5

<211> 122

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对5 VH

<400> 5

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

20 25 30

Ala Leu Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Phe Ile Ser Gly Ser Gly Gly Arg Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Met Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Lys Ser Leu Tyr Thr Thr Ser Trp Tyr Gly Gly Phe Asp Ser Trp

100 105 110

Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 6

<211> 122

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对6 VH

<400> 6

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr

20 25 30

Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Thr Ile Ser Gly Ser Gly Asp Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Gln Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Gly His Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Lys Pro Thr Tyr Ser Arg Ser Trp Tyr Gly Ala Phe Asp Phe Trp

100 105 110

Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 7

<211> 122

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对7 VH

<400> 7

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Asn Leu Glu Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Ser

20 25 30

Ala Met Asn Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Gly Ile Ser Gly Ser Gly Gly Arg Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Ser Ala Glu Asp Thr Ala Ala Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Lys Asp Ser Tyr Thr Thr Ser Trp Tyr Gly Gly Met Asp Val Trp

100 105 110

Gly His Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 8

<211> 116

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对8 VH

<400> 8

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr

20 25 30

Tyr Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ser Ile Ser Arg Tyr Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Asp Ile Gly Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val

100 105 110

Thr Val Ser Ser

115

<210> 9

<211> 119

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对9 VH

<400> 9

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr

20 25 30

Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ser Ile Ser Ala Arg Ser Arg Tyr His Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Leu Ala Thr Arg His Asn Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly

100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 10

<211> 119

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对10 VH

<400> 10

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr

20 25 30

Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ser Ile Ser Ala Arg Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Leu Ala Thr Arg Asn Asn Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly

100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 11

<211> 119

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对11 VH

<400> 11

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Tyr

20 25 30

Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ser Ile Ser Ala Gln Ser Ser His Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Leu Ala Thr Arg Gln Asn Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly

100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 12

<211> 119

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对12 VH

<400> 12

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr

20 25 30

Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ser Ile Ser Ala Arg Ser Ser Tyr Leu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Leu Ala Thr Arg His Val Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly

100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 13

<211> 139

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对13 VH

<400> 13

Met Arg Ala Trp Ile Phe Phe Leu Leu Cys Leu Ala Gly Arg Ala Leu

1 5 10 15

Ala Gln Val Gln Leu Met Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly

20 25 30

Ala Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser

35 40 45

Tyr Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp

50 55 60

Met Gly Thr Ile Tyr Pro Arg Asn Ser Asn Thr Asp Tyr Asn Gln Lys

65 70 75 80

Phe Lys Ala Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val

85 90 95

Tyr Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr

100 105 110

Cys Ala Arg Pro Leu Tyr Tyr Tyr Leu Thr Ser Pro Pro Thr Leu Phe

115 120 125

Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

130 135

<210> 14

<211> 123

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对14 VH

<400> 14

Glu Val Gln Leu Val Glu Thr Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Thr Leu His Gly Ile Arg Ala Ala Tyr Asp Ala Phe Ile Ile

100 105 110

Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 15

<211> 123

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对15 VH

<400> 15

Glu Val Gln Leu Val Glu Thr Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Phe Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Thr Leu His Gly Ile Arg Ala Ala Tyr Asp Ala Phe Ile Ile

100 105 110

Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 16

<211> 123

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对16 VH

<400> 16

Glu Val Gln Leu Val Glu Thr Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Phe Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Thr Ile His Gly Ile Arg Ala Ala Tyr Asp Ala Phe Ile Ile

100 105 110

Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 17

<211> 121

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对17 VH

<400> 17

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

20 25 30

Trp Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Ala Ile Thr Pro Asn Ala Gly Glu Asp Tyr Tyr Pro Glu Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Gly His Tyr Tyr Tyr Thr Ser Tyr Ser Leu Gly Tyr Trp Gly

100 105 110

Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 18

<211> 119

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对18 VH

<400> 18

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe

20 25 30

Ser Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Thr Ile Ser Gly Gly Lys Thr Phe Thr Asp Tyr Val Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Thr Arg Ala Asn Tyr Gly Asn Trp Phe Phe Glu Val Trp Gly Gln Gly

100 105 110

Thr Leu Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 19

<211> 106

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 VL

<400> 19

Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln

1 5 10 15

Thr Ala Ser Ile Thr Cys Ser Gly Glu Gly Met Gly Asp Lys Tyr Ala

20 25 30

Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Val Leu Val Ile Tyr

35 40 45

Arg Asp Thr Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser

50 55 60

Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Thr Gln Ala Met

65 70 75 80

Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gly Val Ile Gln Asp Asn Thr Gly Val

85 90 95

Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105

<210> 20

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对2 VL

<400> 20

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Phe Ser Ser Trp

20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Thr Asn Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Leu

85 90 95

Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 21

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对3 VL

<400> 21

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Thr Trp

20 25 30

Leu Ala Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Gly Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Pro Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Trp

85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 22

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对4 VL

<400> 22

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Phe Ser Ser Trp

20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Gln Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Ser Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Phe Pro Leu

85 90 95

Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 23

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对5 VL

<400> 23

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Val Val Ser Trp

20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn Ser Phe Pro Phe

85 90 95

Thr Leu Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys

100 105

<210> 24

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对6 VL

<400> 24

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp

20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Gln Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Arg Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Trp Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Asn Phe Pro Phe

85 90 95

Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys

100 105

<210> 25

<211> 107

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对7 VL

<400> 25

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Phe Ser Trp

20 25 30

Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Ile Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Asn Ser Val Pro Ile

85 90 95

Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys

100 105

<210> 26

<211> 109

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对8 VL

<400> 26

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Val

20 25 30

Tyr Asp Val His Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu

35 40 45

Leu Ile Tyr Arg Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe

50 55 60

Ser Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu

65 70 75 80

Arg Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Thr Tyr Asp Ser Ser

85 90 95

Arg Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105

<210> 27

<211> 110

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对9 VL

<400> 27

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Asn Asn

20 25 30

Ala Val Ser Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45

Ile Tyr Ala Ser Asn Met Arg Val Ile Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60

Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg

65 70 75 80

Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gly Ala Trp Asp Asp Ser Gln

85 90 95

Lys Ala Leu Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 110

<210> 28

<211> 110

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对10 VL

<400> 28

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Arg Asn

20 25 30

Ala Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45

Ile Tyr Ala Ser Asn Met Arg Val Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60

Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg

65 70 75 80

Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Trp Ala Trp Asp Asp Ser Gln

85 90 95

Lys Val Gly Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 110

<210> 29

<211> 110

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对11 VL

<400> 29

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Arg Asn

20 25 30

Ala Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45

Ile Tyr Ala Ser Asn Met Arg Arg Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60

Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg

65 70 75 80

Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ala Trp Asp Asp Ser Gln

85 90 95

Lys Val Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 110

<210> 30

<211> 110

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对12 VL

<400> 30

Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln

1 5 10 15

Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Asn Asn

20 25 30

Ala Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu

35 40 45

Ile Tyr Ala Ser Asn Met Arg Arg Pro Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60

Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg

65 70 75 80

Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Glu Ala Trp Asp Asp Ser Gln

85 90 95

Lys Ala Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu

100 105 110

<210> 31

<211> 125

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对13 VL

<400> 31

Met Arg Ala Trp Ile Phe Phe Leu Leu Cys Leu Ala Gly Arg Ala Leu

1 5 10 15

Ala Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val

20 25 30

Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asp Val Gly Thr

35 40 45

Ala Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu

50 55 60

Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser

65 70 75 80

Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln

85 90 95

Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Lys Thr Tyr Pro

100 105 110

Phe Thr Phe Gly Ser Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg

115 120 125

<210> 32

<211> 108

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对14 VL

<400> 32

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly

1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Gly Ile Asn

20 25 30

Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Gly Ala Ser His Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln Tyr Ser Gln Ser Pro Pro

85 90 95

Phe Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 33

<211> 108

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对15 VL

<400> 33

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly

1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Gly Ile Asn

20 25 30

Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Gly Ala Ser His Arg Leu Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln Tyr Ser Gln Pro Pro Pro

85 90 95

Phe Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 34

<211> 108

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对16 VL

<400> 34

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly

1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Gly Ile Asn

20 25 30

Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Gly Ala Ser His Arg Leu Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln Tyr Ser Gln Pro Pro Pro

85 90 95

Phe Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 35

<211> 106

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对17 VL

<400> 35

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asn Ile Asn Lys His

20 25 30

Leu Asp Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Phe Thr Asn Asn Leu Gln Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Phe Gln Tyr Asn Gln Gly Trp Thr

85 90 95

Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105

<210> 36

<211> 111

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对18 VL

<400> 36

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly

1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Glu Ser Val Ala Lys Tyr

20 25 30

Gly Leu Ser Leu Leu Asn Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro

35 40 45

Arg Leu Leu Ile Phe Ala Ala Ser Asn Arg Gly Ser Gly Ile Pro Ala

50 55 60

Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser

65 70 75 80

Ser Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Lys

85 90 95

Glu Val Pro Phe Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys

100 105 110

<210> 37

<211> 5

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 HCDR1

<400> 37

Ser Tyr Ala Met Ser

1 5

<210> 38

<211> 17

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 HCDR2

<400> 38

Gly Ile Ser Ala Ile Asp Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys

1 5 10 15

Gly

<210> 39

<211> 17

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 HCDR3

<400> 39

Gln Lys Phe Met Gln Leu Trp Gly Gly Gly Leu Arg Tyr Pro Phe Gly

1 5 10 15

Tyr

<210> 40

<211> 11

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 LCDR1

<400> 40

Ser Gly Glu Gly Met Gly Asp Lys Tyr Ala Ala

1 5 10

<210> 41

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 LCDR2

<400> 41

Arg Asp Thr Lys Arg Pro Ser

1 5

<210> 42

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列说明：合成

对1 LCDR3

<400> 42

Gly Val Ile Gln Asp Asn Thr Gly Val

1 5

<210> 43

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs928413处的G等位基因

<400> 43

tagttagcta ctttttaata gttacgagag cattggccaa ggcagggaat c 51

<210> 44

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs1888909处的T等位基因

<400> 44

atgcagaaca acaatgtgtt ttccatgtgc acttggtcaa cacctatatc t 51

<210> 45

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs992969处的A等位基因

<400> 45

ttcctcggac tggaccattt caattaacct atcactggtt cttgcttctg a 51

<210> 46

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs3939286处的T等位基因

<400> 46

tccacatccc catggtttgt tgttgttgct tgtagtgggt tgttgttatc t 51

<210> 47

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs2381416处的C等位基因

<400> 47

atggaggaaa gaaacaatgg acttacaagt caatagaaat tatctgattt g 51

<210> 48

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs928412处的A等位基因

<400> 48

tatgattcag ataacaaatt atacgattac tagaataaag tctgtatgac c 51

<210> 49

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs7848215处的T等位基因

<400> 49

aggagacaga gaaatcactg ttgattggtg ttgtgggaat gaagagacaa a 51

<210> 50

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs144829310处的T等位基因

<400> 50

attaaaatgt caggaaacaa cagattctgg agaggatgtg gagaaatagg a 51

<210> 51

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs72699186处的T等位基因

<400> 51

ggaagaagaa tgcatcaact gaaaatctat tcctttgaga ggaccaataa a 51

<210> 52

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10975479处的G等位基因

<400> 52

taattaaaat cactgatgca gaacagcaat gtgttttcca tgtgcacttg g 51

<210> 53

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs72699191处的C等位基因

<400> 53

ctctagagag acagaactaa tagaacagat atataaagga gtttagtagg t 51

<210> 54

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs7032572处的G等位基因

<400> 54

ccctataaga attctgcatc catccgtggt aaaaagtcac tctgcaggag c 51

<210> 55

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs1342326处的C等位基因

<400> 55

atataaataa gaataagagg tcatgctggt gtcttcatga gaaaagattg g 51

<210> 56

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs2066362处的T等位基因

<400> 56

aaactcctga aacagcagaa agaaatggac cttaattcta tcaacaacaa a 51

<210> 57

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs142807069处的G等位基因

<400> 57

tgtaatccca gcactttggg aggccgaggg gggcagatca cgaggtcagg a 51

<210> 58

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10975488处的G等位基因

<400> 58

agcactttgg gaggccaagg ggggcggatc acgaggtcag gagatcgaga c 51

<210> 59

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs9775039处的A等位基因

<400> 59

ttcccaccta tgagtgagaa tatgcagtgt ttggtttttt gttcttgcca t 51

<210> 60

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10975507处的T等位基因

<400> 60

gctcccacac gttctaatgc atttatgtag ctccatctgc attgcctcat a 51

<210> 61

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10975504处的G等位基因

<400> 61

gttgtggtat gtatttggaa ggaaagaaaa atcccaaatg tattcttttt t 51

<210> 62

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10815393处的C等位基因

<400> 62

atttggtcca gaaaggtggg ataacctgaa gcgtggggtg gaggggttca g 51

<210> 63

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs12339348处的T等位基因

<400> 63

gtggcattca cattgttgta caaccttaac cactctccat ctccagaaca t 51

<210> 64

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs7035413处的G等位基因

<400> 64

ctcccacaag gccccacctc caacagtggg gatcaaattt caacaggaga c 51

<210> 65

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs17498196处的C等位基因

<400> 65

caagtgcgtt ctctcaaact agtccctgag ggtgataaga cgggagaaaa a 51

<210> 66

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs17582919处的C等位基因

<400> 66

ctcattctct cactagttcc tcctccactg caggaagaag tgtgcctcct c 51

<210> 67

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10815391处的G等位基因

<400> 67

atgtgctcaa agtggttggt gtgcagtttg gttttatgca ttttagggag a 51

<210> 68

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10815392处的C等位基因

<400> 68

tgtgctcaaa gtggttggtg tgcatcttgg ttttatgcat tttagggaga c 51

<210> 69

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs72689561处的C等位基因

<400> 69

acaggaggcc atacttaaaa agaagcagca ataattattg atagaattgc a 51

<210> 70

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs7038893处的C等位基因

<400> 70

tttctgttga gacagtctca ctttgcctcc caggctgaag tgcagtggca c 51

<210> 71

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs112935616处的T等位基因

<400> 71

aggctgcagt gagctgagat cgtgctactg cactccagcc tgggcagcag a 51

<210> 72

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10815376处的T等位基因

<400> 72

ggaaatgaaa tatccagggt gcagattgtg gcttatttta ttcagataaa t 51

<210> 73

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs12551268处的A等位基因

<400> 73

accaagcttc tgtccccttc tctctacagc cccttcacat tatgctctcc c 51

<210> 74

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs2006682处的G等位基因

<400> 74

aagtagtttg atttcagact acaaagccat gtaggggctg acttgtcctg a 51

<210> 75

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs370820588处的C等位基因

<400> 75

gctctggttt ctccccatct ttgtgctttt atctaccttt ggtctttgat g 51

<210> 76

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs143215670处的C等位基因

<400> 76

gagtaggtca ttacctgata attttcgtta ttcaaaacta agtaatattt t 51

<210> 77

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs343478处的A等位基因

<400> 77

gggagaggat cagaaaaaat aactaatggg tactaggctt aatacctggg t 51

<210> 78

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10118776处的G等位基因

<400> 78

ttaaaaatac atcttgcagc attttggttg tttttatcag gagggctgtt c 51

<210> 79

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs146597587处的C等位基因

<400> 79

gattgctttc tctcttgttt cctcacctcc ataagtgtga aaaaccactg c 51

<210> 80

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10975519处的T等位基因

<400> 80

tttcagataa ggtgttactg agttattatg agtctcaaca cccctcaaat g 51

<210> 81

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10815381处的G等位基因

<400> 81

ctcagcttcc aaaagtgctg ggactgtaag gcttgagcca ccacccccag c 51

<210> 82

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs7046661处的C等位基因

<400> 82

ttaatttctt aatgtcttac ttactctctc atttttaaag aatagttttt c 51

<210> 83

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10815363处的T等位基因

<400> 83

aagctttttc aaagaaataa taacataaac cttccaaacc tggagaaaga t 51

<210> 84

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs62558407处的T等位基因

<400> 84

taaggtgtaa ggaagggatc cagtttcagc tttctacata tggctagcca g 51

<210> 85

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs1475658处的T等位基因

<400> 85

acaatagtta tttttccttt ttttttaaaa aaaaattaca tgcatcctag t 51

<210> 86

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs10975481处的G等位基因

<400> 86

cagaaataaa atcctttaca gacatgcaaa tgctgagcga ttttgtcacc t 51

<210> 87

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs552376976处的T等位基因

<400> 87

cttttggtgt tttagacatg aagtctttgc ccatgcctat gtcctgaatg g 51

<210> 88

<211> 51

<212> DNA

<213> 智人

<220>

<221> 尚未归类的特征

<222> (26)..(26)

<223> 在多态性rs13298116处的T等位基因

<400> 88

caatagttat ttttcctttt ttttttaaaa aaaattacat gcatcctagt g 51

Claims

1.一种用于治疗患有哮喘的患者的方法，该方法包括向该患者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

2.一种用于确定患有哮喘的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类2多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

3.一种用于确定患者是否面临增加的哮喘风险的方法，该方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表1中定义的至少一个聚类2多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

4.如权利要求2或3所述的方法，该方法进一步包括向该患者施用IL-33轴结合拮抗剂。

5.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该IL-33介导的病症是早发性哮喘。

6.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含选自以下的多态性的至少一个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ IDNO：47)处的C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的A等位基因、在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的T等位基因、在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ IDNO：84)处的T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的G等位基因。

7.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含选自以下的多态性的至少两个等位基因：在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因、在多态性rs1888909(SEQ ID NO：44)处的两个T等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因、在多态性rs3939286(SEQ ID NO：46)处的两个T等位基因、在多态性rs2381416(SEQ ID NO：47)处的两个C等位基因、在多态性rs928412(SEQ ID NO：48)处的两个A等位基因、以及在多态性rs7848215(SEQ ID NO：49)处的两个T等位基因、在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的两个C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的两个T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的两个T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的两个G等位基因。

8.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的至少一个G等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的至少一个A等位基因、在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的G等位基因。

9.如权利要求8所述的方法，其中该患者的基因型包含在多态性rs928413(SEQ ID NO：43)处的两个G等位基因、在多态性rs992969(SEQ ID NO：45)处的两个A等位基因、在多态性rs7046661(SEQ ID NO：82)处的两个C等位基因、在多态性rs10815363(SEQ ID NO：83)处的两个T等位基因、在多态性rs62558407(SEQ ID NO：84)处的两个T等位基因、在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的两个T等位基因、以及在多态性rs10975481(SEQ ID NO：86)处的两个G等位基因。

10.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含在多态性rs1475658(SEQ ID NO：85)处的一个或两个T等位基因。

11.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型进一步包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的至少一个多态性，和/或其中该基因型进一步包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的至少一个多态性。

12.一种用于治疗患有哮喘的患者的方法，该方法包括向该患者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

13.一种用于确定患有哮喘的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类3多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

14.一种用于确定患者是否面临增加的哮喘风险的方法，该方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表2中定义的至少一个聚类3多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

15.如权利要求13或14所述的方法，该方法进一步包括向该患者施用IL-33轴结合拮抗剂。

16.如权利要求12至15中任一项所述的方法，其中该哮喘是早发性哮喘。

17.如权利要求12至16中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含选自以下的多态性的至少一个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的T等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的T等位基因、在多态性rs10975488(SEQ IDNO：58)处的G等位基因、在多态性rs552376976(SEQ ID NO：87)处的T等位基因、以及在多态性rs13298116(SEQ ID NO：88)处的T等位基因。

18.如权利要求12至17中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含选自以下的多态性的至少两个等位基因：在多态性rs72699186(SEQ ID NO：51)处的两个T等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs7032572(SEQ ID NO：54)处的两个G等位基因、在多态性rs144829310(SEQ ID NO：50)处的两个T等位基因、在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因、在多态性rs10975488(SEQ ID NO：58)处的两个G等位基因、在多态性rs552376976(SEQ ID NO：87)处的两个T等位基因以及在多态性rs13298116(SEQ ID NO：88)处的两个T等位基因。

19.如权利要求12至18中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含在多态性rs13298116(SEQ ID NO：88)处的一个或两个T等位基因。

20.如权利要求12至19中任一项所述的方法，其中该患者的基因型进一步包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的至少一个多态性，和/或其中该基因型进一步包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的至少一个多态性。

21.一种用于治疗患有哮喘的患者的方法，该方法包括向该患者施用IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定该患者的基因型包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

22.一种用于确定患有哮喘的患者是否可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的方法，该方法包括：(a)确定源自该患者的样品中如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的基因型；(b)基于该基因型，鉴定该患者为可能响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗，其中聚类1多态性的至少一个等位基因或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的存在表示该患者响应于包含IL-33轴结合拮抗剂的治疗的可能性增加。

23.一种用于确定患者是否面临增加的哮喘风险的方法，该方法包括从该患者获得的样品中鉴定如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因的该基因型，其中如果该患者的基因型包含如表3中定义的至少一个聚类1多态性或在与该多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因，则该患者面临增加的IL-33介导的病症的风险。

24.如权利要求22或23所述的方法，该方法进一步包括向该患者施用IL-33轴结合拮抗剂。

25.如权利要求21至24中任一项所述的方法，其中该哮喘是早发性哮喘。

26.如权利要求21至25中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含选自以下的在多态性处的至少一个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的C等位基因、以及在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的T等位基因。

27.如权利要求21至26中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含选自以下的在多态性处的两个等位基因：在多态性rs10975507(SEQ ID NO：60)处的两个T等位基因、在多态性rs10975504(SEQ ID NO：61)处的两个G等位基因、在多态性rs10815393(SEQ ID NO：62)处的两个C等位基因、在多态性rs12339348(SEQ ID NO：63)处的两个T等位基因、在多态性rs7035413(SEQ ID NO：64)处的两个G等位基因、在多态性rs17498196(SEQ ID NO：65)处的两个C等位基因、在多态性rs17582919(SEQ ID NO：66)处的两个C等位基因、在多态性rs10815391(SEQ ID NO：67)处的两个G等位基因、在多态性rs10815392(SEQ ID NO：68)处的两个C等位基因、在多态性rs72689561(SEQ ID NO：69)处的两个C等位基因、在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的两个C等位基因、以及在多态性rs112935616(SEQ ID NO：71)处的两个T等位基因。

28.如权利要求21至27中任一项所述的方法，其中该患者的基因型包含在多态性rs7038893(SEQ ID NO：70)处的一个或两个C等位基因。

29.如权利要求21至28中任一项所述的方法，其中该患者的基因型进一步包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的至少一个多态性，和/或其中该基因型进一步包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或与该多态性呈连锁不平衡的至少一个多态性。

30.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中与所述聚类2、3或1多态性呈连锁不平衡的该多态性具有大于或等于0.4、任选0.6的D′值。

31.如权利要求30所述的方法，其中该D′值大于或等于0.8。

32.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型不包含在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs146597587(SEQID NO：79)处的C等位基因、和/或在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因。

33.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该患者的基因型不包含在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ ID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的两个C等位基因、和/或在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因。

34.一种组合物，该组合物包含用于治疗患有哮喘的患者的IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定待治疗患者的基因型为包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或与表1中定义的聚类2多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

35.IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有哮喘的患者的药剂中的用途，其中已经确定待治疗患者的基因型为包含如表1中定义的聚类2多态性的至少一个等位基因、或与表1中定义的聚类2多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

36.一种组合物，该组合物包含用于治疗患有哮喘的患者的IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定待治疗患者的基因型为包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或与表2中定义的聚类3多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

37.IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有哮喘的患者的药剂中的用途，其中已经确定待治疗患者的基因型为包含如表2中定义的聚类3多态性的至少一个等位基因、或与表2中定义的聚类3多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

38.一种组合物，该组合物包含用于治疗患有哮喘的患者的IL-33轴结合拮抗剂，其中已经确定待治疗患者的基因型为包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或与表3中定义的聚类1多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

39.IL-33轴结合拮抗剂在制造用于治疗患有哮喘的患者的药剂中的用途，其中已经确定待治疗患者的基因型为包含如表3中定义的聚类1多态性的至少一个等位基因、或与表3中定义的聚类1多态性呈连锁不平衡的多态性处的等效等位基因。

40.如权利要求34至39中任一项所述使用的组合物或用途，其中该哮喘是早发性哮喘。

41.如权利要求34至40中任一项所述使用的组合物或用途，其中该患者的基因型不包含在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的C等位基因、在多态性rs143215670(SEQ IDNO：76)处的C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的A等位基因、在多态性rs10118776(SEQ ID NO：78)处的G等位基因、在多态性rs146597587(SEQ ID NO：79)处的C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的T等位基因、和/或在多态性rs10815381(SEQ ID NO：81)处的G等位基因。

42.如权利要求34至41中任一项所述使用的组合物或用途，其中该患者的基因型不包含在多态性rs370820588(SEQ ID NO：75)处的两个C等位基因、在多态性rs143215670(SEQID NO：76)处的两个C等位基因、在多态性rs343478(SEQ ID NO：77)处的两个A等位基因、在多态性rs10118776(SEQ ID NO：78)处的两个G等位基因、在多态性rs146597587(SEQ IDNO：79)处的两个C等位基因、在多态性rs10975519(SEQ ID NO：80)处的两个T等位基因、和/或在多态性rs10815381(SEQ ID NO：81)处的两个G等位基因。

43.如前述权利要求中任一项所述的方法、使用的组合物或用途，其中该IL-33结合拮抗剂是IL-33结合拮抗剂、ST-2结合拮抗剂或IL-1RAcP结合拮抗剂。

44.如前述权利要求中任一项所述的方法、使用的组合物或用途，其中该IL-33结合拮抗剂是抗体或其抗原结合片段。

45.如前述权利要求中任一项所述的方法、使用的组合物或用途，其中该IL-33拮抗剂是抗IL-33抗体或其抗原结合片段。

46.如权利要求45所述的方法、使用的组合物或用途，其中该抗IL-33抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：37序列的VHCDR1、具有SEQ ID NO：38序列的VHCDR2、具有SEQID NO：39序列的VHCDR3、具有SEQ ID NO：40序列的VLCDR1、具有SEQ ID NO：41序列的VLCDR2、以及具有SEQ ID NO：42序列的VLCDR3。