CN115210778A - 具有工作列表的微生物检测系统 - Google Patents
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Abstract
本公开的方面涉及一种方法,该方法包括从计算设备的显示装置上的用户界面接收稀释配置文件,稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段。该方法包括将稀释配置文件存储在计算设备的存储器中。该方法包括接收形成用于读取培养装置的工作列表的请求。工作列表包括多个工作列表字段,工作列表字段对应于稀释配置文件中的多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段。该方法包括确定稀释配置文件适用于工作列表,以及响应于确定稀释配置文件适用并且通过计算设备,用来自存储器的稀释配置文件中的多个配置文件字段填充多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段。
Description
背景技术
食品工业常规监测微生物的指标组的水平。这些微生物被认为是质量和卫生指标,并且可能对人类造成健康危害。量化指标微生物的常用方法是对菌落形成单位进行计数。可以通过首先在培养装置(例如,干膜或琼脂板)上培养目标微生物,然后对菌落形成单位进行计数来执行计数。菌落计数可以在多个阶段进行,包括对进料、加工产品、成品和从食品加工环境内取得的环境样品进行计数。
菌落计数数据可以用于许多用途,诸如符合法规要求、保质期要求、减少变质、确保工艺和设施的卫生、确保工艺步骤(烹饪、巴氏杀菌、去污等)的有效性,或确保最终产品不含可能导致疾病的污染。
对生长培养基上的菌落进行计数和解释这些计数可能是非常复杂的,并且可以极大地受益于菌落计数装置和软件的改进。使得此工作变得复杂的此领域中的独特挑战和要求包括A)培养基解释挑战和准确性要求、B)培养基的物理因素和C)数据的复杂性。
实验室(特别是利用大量生长培养基来监测微生物指标组水平的实验室)目前有各种手动方法,用于组织和传达哪些样品/测试需要在给定时间框架(诸如但不限于工作班次、一天、一周或一个月等)内处理。手动方法的示例包括使用纸质列表、打印的电子表格、公告板、电子邮件或来自数据管理系统的输出。
发明内容
本公开的方面涉及一种方法,所述方法包括从计算设备的显示装置上的用户界面接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段。所述方法包括将所述稀释配置文件存储在计算设备的存储器中。所述方法包括接收形成用于读取所述培养装置的工作列表的请求。所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子。所述工作列表包括多个工作列表字段,所述工作列表字段对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段。所述方法包括确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表,以及响应于确定所述稀释配置文件适用并且通过所述计算设备,用来自所述存储器的所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段。
本公开的额外方面还可涉及一种计算设备。所述计算设备可以包括:显示装置,所述显示装置被配置用于显示用户界面;和输入装置,所述输入装置通信地耦合到所述用户界面,以允许用户与所述用户界面交互。所述计算设备可以包括处理器和存储指令的存储器,所述指令在由所述处理器执行时将所述计算设备配置为用于:从所述用户界面接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段。所述处理器可以进一步将所述稀释配置文件存储在所述存储器中。
所述存储器可以存储指令,所述指令将所述计算设备配置为经由用户界面接收用于读取所述多个培养装置的工作列表的请求。所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子。所述工作列表可以包括多个工作列表字段,所述多个工作列表字段对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段。
所述存储器可以存储指令,所述指令将所述计算设备配置为确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表,并且响应于确定所述稀释配置文件适用,用所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段。所述计算设备可以被配置为响应于所述填充而执行至少一个动作。
本公开的额外方面可以涉及一种具有图像处理电路的读板器。所述计算设备可以通过以下操作执行所述至少一个动作:使用所述工作列表将指令传输到所述读板器,使所述读板器的所述图像处理电路捕获在所述工作列表中识别出的培养装置的图像。
本公开的以上发明内容并不旨在描述本发明的每个公开实施方案或每种实施方式。以下描述更具体地举例说明了例示性实施方案。在本申请全文的若干处,通过实施例列表提供了指导,这些实施例能够以各种组合使用。在每种情况下,所引用的列表都只用作代表性的组,并且不应被理解为排他性列表。
这些及其它实施方案的附加细节在下文附图和描述中示出。通过具体实施方式、附图和权利要求书,其他特征、目标和优点将变得显而易见。
附图说明
为了容易地识别对任何特定元件或动作的讨论,参考标号中的一个或多个最高有效数位是指首先引入该元件的附图标号。
图1示出了根据一个实施方案的方法100。
图2示出了根据一个实施方案的用户界面200。
图3示出了根据一个实施方案的用户界面300。
图4示出了根据一个实施方案的方法400。
图5示出了根据一个实施方案的用户界面500。
图6示出了根据一个实施方案的用户界面600。
图7示出了根据一个实施方案的方法700。
图8示出了根据一个实施方案的数据方案800。
图9示出了根据一个实施方案的用户界面元件900。
图10示出了根据一个实施方案的方法1000。
图11示出了根据一个实施方案的方法1000。
图12示出了根据一个实施方案的数据结构1200。
图13示出了简化的微生物检测系统1300,其中服务器1304和客户端装置1306经由网络1302通信地耦合。
图14是可以结合本发明的实施方案的计算设备1400的示例性框图。
具体实施方式
菌落计数的手动方法可能难以跟踪和监测、容易错误和/或容易忽略(导致记录保存和可追溯性的低效率、错误和故障)。
本公开的各方面可以允许用户经由用户界面建立、安排、跟踪和维护同一微生物检测系统中的工作列表的记录。因此,用于处理多个培养装置的读板器可以通信地耦合到计算设备上的用户界面上的工作列表。本公开的方面可以改进用户工作流、提高实验室和工作人员的效率并有助于给定实验室的记录的更好可追溯性。
本公开的另一方面可以允许用户使用稀释配置文件来填充工作列表的至少一些数据字段。稀释配置文件还可以包括读板器中的微生物样品类型的产品规格。通过链接稀释配置文件、工作列表和读板器,可以通过使用户输入最小化(这使得减少对用户的等待)来改进微生物检测系统的整体性能。
本公开的另一方面是利用培养装置标识(例如,具有编码元数据的条形码)来创建工作列表而无需手动数据输入的能力,以及更容易地跟踪给定培养装置是否已被馈送到装置中的能力。
本公开的其他方面还可以允许用户安排提醒,其可以在需要完成特定批次的培养装置时警告用户。在至少一个实施方案中,工作列表可以跨用户配置文件可见。因此,如果实验室在计算机和/或计算设备上使用多个配置文件,则提醒、工作列表和结果库可用于每个用户。
如本文进一步所描述,工作列表是实验室借助于在计算设备上运行的读板器和相关实验室信息管理系统(LIMS)来简化日常微生物测试工作流的方式,特别是在计划、运行和管理微生物测试中。计算设备可以使用帮助用户构建工作列表的多个数据结构。这些数据结构可以用作可以用于定义工作列表的模板。这节省了时间,减少了错误的可能性,并在实验室环境内产生效率。
此外,计算设备可以根据用户选择的模板组件自动生成测试的每次运行的规格。一旦构建了工作列表,实验室技术人员和由计算设备控制的仪器就可以使用工作列表作为指令来编排培养装置序列的运行。
在至少一个实施方案中,工作列表可由计算设备建立,所述计算设备可以由读板器使用,有效地使用测试实例的数据字段来分析与测试实例相关的样品数据。
图1示出了使用稀释配置文件形成工作列表的计算机实施的方法100。工作列表可以由计算设备用于从读板器分析培养装置。在至少一个实施方案中,图像处理电路(例如,相机、条形码读取器等)和读板器的照明电路可受工作列表影响。例如,工作列表可以确定何时传输来自读板器的数据,或者工作列表可以确定何时激活相机。用户可以经由计算设备的用户界面与工作列表交互。
在框102中,计算设备从计算设备的显示装置上的用户界面接收稀释配置文件。稀释配置文件可以包括多个配置文件字段。每个配置文件字段是与由读板器处理的培养装置的性质相关的数据字段。稀释配置文件可以表示培养装置的一系列测试实例或单个测试实例。例如,稀释配置文件可以是结构化数据(例如,存储在关系数据存储库中),并且可以具有表示例如培养装置标识、板类型、稀释、产品规格和它们的组合的多个列。测试实例的配置文件字段可以与多个列中的任一个列相关联。测试实例可以对应于结构化数据中的行。
在至少一个实施方案中,由用户经由用户界面创建稀释配置文件。例如,用户可以填充一系列测试实例的多个配置文件字段以创建稀释配置文件。在至少一个实施方案中,所述一系列测试实例可以由读板器以特定顺序执行。在其他实施方案中,所述一系列测试实例可以是不确定的。
在至少一个实施方案中,可以由计算设备从数据存储库接收稀释配置文件。例如,稀释配置文件可以存在于数据存储库中并且由计算设备经由网络获取。
在框104中,计算设备任选地将稀释配置文件存储在存储器中。存储器可以指用于临时存储数据(诸如RAM、高速缓存)或永久存储数据(诸如硬盘、固态驱动器、磁带驱动器)的各种硬件实施方式或它们的组合。
在框106中,计算设备接收形成用于读取培养装置的工作列表的请求。可以由读板器执行读取。例如,读板器的图像处理电路和照明电路可以捕获培养装置的图像。培养装置还可以包括营养培养基和微生物样品。例如,来自食物产品的微生物样品可以应用于多个培养装置,所述多个培养装置各自形成要由读板器读取的测试实例。根据工作列表读取所述一系列测试实例。
在至少一个实施方案中,工作列表可以具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子。例如,第一测试实例可具有1:100稀释因子的全计数板类型,并且第二测试实例可具有1:10稀释因子的大肠菌计数板类型。在至少一个实施方案中,工作列表可以包括多个工作列表字段,所述多个工作列表字段对应于稀释配置文件中的多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段。例如,工作列表可以具有比稀释配置文件具有的配置文件字段更多的工作列表字段,或反之亦然。
在子例程框108中,计算设备可以确定稀释配置文件是否适用于工作列表(或确定稀释配置文件适用于工作列表)。计算设备可以确定工作列表的任何部分是否可以用如本文进一步描述的稀释配置文件自动填充(例如,响应于填充的数据字段,以诸如表单完成或下拉选项的自动方式应用)。在至少一个实施方案中,当创建工作列表时,计算设备可经由用户界面从用户接收稀释配置文件适用于工作列表的指示。例如,在框106中创建工作列表期间,可以向用户呈现应用稀释配置文件的选项。如果选择,则可以满足子例程框108。
在框110中,计算设备可以响应于确定稀释配置文件适用,用稀释配置文件中的多个配置文件字段填充多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段。例如,如果存在比配置文件测试实例(具有多个配置文件字段)更多的工作列表测试实例(具有多个工作列表字段),则计算设备可以用对应于工作列表测试实例的配置文件字段填充工作列表字段,并且请求关于不对应于配置文件测试实例的工作列表测试实例的更多信息。
相反,如果存在比工作列表测试实例更多的配置文件测试实例,则方法100可以停止,并且计算设备可以提供稀释配置文件不适用的提示,或者计算设备可以呈现稀释配置文件(例如,所有配置文件测试实例)并允许用户选择适用于工作列表的一系列测试实例。计算设备可以使用由用户选择的所述一系列测试实例来填充工作列表数据字段中的至少一些工作列表数据字段。
在框112中,计算设备响应于填充而执行动作。在至少一个实施方案中,计算设备可以使读板器装载培养装置(例如,通过引导用户或自动装载器附件),读取培养装置(例如,用读板器的图像处理电路),并将样品数据(包括图像)从读板器传输到计算设备。
在至少一个实施方案中,计算设备可以进一步经由用户界面从用户接收时间条件以开始读取培养装置。一旦满足时间条件,读板器就可以引起或允许读取培养装置。例如,时间条件可以指培养装置将被运行的特定日期和时间。一旦时间条件临近,读板器就可以经由自动装载器附件自动装载培养装置,以由读板器读取或以其他方式从读板器接收样品数据。在至少一个实施方案中,读板器可以允许在任何时间读取培养装置并且仅在满足时间条件之后传输样品数据。在至少一个实施方案中,计算设备可以在时间条件下在用户界面内产生警报以允许用户启动培养装置的装载。
所述动作还可以包括计算设备经由用户界面通知用户对应于工作列表测试实例的培养装置正被读取或被安排读取。例如,计算设备可以通知用户在工作列表的进度。
在至少一个实施方案中,动作可以包括验证培养装置的身份的计算设备或读板器,以确保培养装置对应于特定工作列表测试实例。例如,计算设备包括通过确定来自培养装置的板类型来确定或验证培养装置的板类型是否对应于来自工作列表测试实例的板类型或以其他方式与所述板类型匹配。这可以经由对来自培养装置的元素的光学识别(诸如读取标签)进行,或者可以通过扫描具有内置标识的标识元素(诸如条形码或RFID)来进行。
在计算设备确定培养装置的板类型(从读板器接收)对应于工作列表测试实例之后,读板器可以读取培养装置。在至少一个实施方案中,读取培养装置可以包括读取各自与测试实例相关联的多个培养装置。例如,如果没有匹配,则读板器可以排除或忽略来自培养装置的样品数据。
在至少一个实施方案中,至少一个动作可以读取培养装置以产生样品数据。样品数据可以对应于至少一个工作列表测试实例。
在至少一个实施方案中,框114到框120可以是任选的,并且涉及确定结果(例如,来自在框112中读取培养装置的读板器)是否符合产品规格。
例如,在框114中,计算设备可以将阈值与工作列表测试实例相关联。阈值可以是食物产品的产品规格。产品规格可以与工作列表测试实例相关联。
在框116中,计算设备可以基于读取和多个工作列表字段来确定结果。结果可以基于样品数据,所述样品数据可以从在框112中读取培养装置的读板器获得。可以根据测试实例的多个工作列表字段分析样品数据。例如,稀释因子和板类型可以修改来自样品数据的原始菌落计数,以进一步确定微生物的类型和微生物的菌落计数(其可以是其中的结果)。
在框118中,计算设备可以确定结果是否符合阈值。如本文所讨论,阈值可以与给定食物产品样品的产品规格相关。如果结果符合阈值,则在框120中,计算设备可以经由用户界面显示工作列表测试实例的通过指示。例如,巴氏杀菌牛奶的产品规格取决于等级。USDA等级A牛奶的标准小于每毫升750000个体细胞。在此实例中,阈值基于体细胞浓度。如果体细胞计数为每毫升400000个细胞,则结果符合等级A牛奶的阈值。如果体细胞计数为800000个细胞,则结果将不符合阈值,但仍然可能作为较低等级牛奶而符合阈值。在至少一个实施方案中,计算设备可以确定满足哪个产品规格并将其呈现给用户。例如,计算设备可以确定牛奶样品虽然不是等级A,但有资格作为可以减少食物浪费的较低等级的牛奶。
图2示出了用户界面200的示例性视图。用户界面200可以包括带状标签208、带状内容区域206、图像部分202(示出可以作为样本数据的一部分的图像204)和主内容区域212。图像204可以属于培养装置,并且包括在其上突出显示的菌落形成单元240。在主内容区域212内,可以在工作列表部分210中创建工作列表。
工作列表部分210示出单个工作列表的创建。工作列表部分210可以包括工作列表的名称和工作列表的时间条件214。时间条件214可以与通知指示216相关联。
工作列表可以包括多个样品(例如,样品232和样品236)。例如,样品可以指来自单一来源(例如,一批食物产品)的微生物样品或可以指食品基质(其是根据协议收集的样品(不一定来自相同来源,但可以是相同类型))。微生物样品可以应用于多个培养装置,并且被读取为一系列测试实例218。因此,样品232可以与一系列测试实例218相关联。如图所示,给定样品232的单独测试实例通过在主标题下方稀释而嵌套和分组,以便于查看和计划与给定微生物样品相关的所有测试实例。
在工作列表部分210中,针对样品232示出了多个工作列表字段230。如图所示,多个列228对于主标题与子标题是不同的。例如,主标题被示出为表示样品232的样品标识(ID)、稀释配置文件220和产品规格,而子标题被示出为板类型224、稀释因子222和数量。单个测试实例可以具有测试实例标识符234。在至少一个实施方案中,测试实例识别符234可以被编号或简单地用测试实例之间的视觉间隔指示,如图所示。多个配置文件字段226可以与多个工作列表字段230中的至少一些工作列表字段匹配。
在工作列表部分210中,示出样品236具有使用与样品232相同的稀释配置文件220的所创建未扩展部分。例如,样品232和样品236都可以使用相同的稀释配置文件220。工作列表部分210还可以具有使用不同稀释配置文件的样品。例如,样品238可以对莴苣使用与稀释配置文件220不同的稀释配置文件。因此,工作列表可以包括具有在同一工作列表中存在的不同稀释配置文件的多个稀释配置文件。
在至少一个实施方案中,工作列表可以设置读板器读取多个培养装置的板类型和稀释因子。在根据工作列表由读板器读取每个培养装置之后,可以在图像部分202中显示培养装置的结果(包括图像204)。此外,工作列表可以链接到读板器的自动装载器附件从而以自动化方式执行分析。
图3示出了用户界面300。除了用户界面300可以包括请求菜单308之外,用户界面300可以像图2中的用户界面200。在至少一个实施方案中,请求菜单308可以是弹出菜单,其在编辑现有工作列表的任何部分时或在创建新工作列表(例如,图1中的框106)时被触发。
用户界面300可以示出用于将多个配置文件字段304(例如,包括新样品ID)添加到工作列表的示例性过程。在用户界面300中,用户可以选择手动添加测试、稀释配置文件或它们的组合。
例如,请求菜单308可以包括可以经由文本字段手动输入的样品数据字段306。用户可以选择产品规格数据字段310和稀释配置文件数据字段302(例如,通过下拉菜单)。在选择时,计算设备可以将多个配置文件字段304加载到工作列表上。尽管示出了稀释配置文件数据字段302和产品规格数据字段310被独立地选择,但是稀释配置文件数据字段302和产品规格数据字段310可以被链接。例如,在稀释配置文件数据字段302中选择新鲜水果可以限制在产品规格数据字段310中呈现给用户的选项(其示出为限制为新鲜橙汁)。
可以基于所选择的稀释配置文件数据字段302填充板类型数据字段312。对于给定大肠菌计数板类型,可以对两个培养装置进行两次稀释。在至少一个实施方案中,计算设备可以使自动装载器附件在由读板器读取之前自动执行稀释。
图4示出了用于跟踪工作列表中的工作列表测试实例的方法400。方法400可为框112的实施方案。在框402中,计算设备可以使读板器读取/捕获与工作列表测试实例相关联的培养装置。例如,计算设备可以触发读板器装载培养装置、捕获培养装置的图像和/或将图像/样品数据传输到计算设备。样品数据可以进一步包括培养装置的任何标识(例如,使用培养装置的内置标识)。
在决策框404中,计算设备可以确定先前是否读取了工作列表测试实例。例如,如果培养装置的标识指示培养装置读取在先前已被读取,则计算设备在框406中确定使用哪个样本数据(即,第一样本数据或第二样本数据)。
在至少一个实施方案中,框406可以包括验证培养装置是可接受的以产生读数。例如,计算设备可以分析培养装置的孵育时间以确定培养装置是否符合孵育时间的产品规格。替代地,计算设备可以提示用户选择要使用的样品数据。
如果未在先前读取工作列表测试实例,则计算设备可以在框408中响应于读取而将对工作列表测试实例的指示标记为已读取。
在框410中,计算设备可以使用多个工作列表字段来分析来自培养装置的样品数据以产生本文所描述的结果。
在框412中,计算设备可以任选地将结果保存到要访问的存储器或数据存储库中(例如,在决策框404中的确定中使用)。
图5示出了示出来自方法400的概念的示例性用户界面500。例如,用户界面500示出工作列表进度部分510的示例性视图。工作列表进度部分510可以示出所述一系列测试实例502相对于整个工作列表完成的进度。如图所示,所述一系列测试实例502均使用相同的产品规格。在至少一个实施方案中,所述一系列测试实例502还可以使用相同的稀释配置文件。工作列表进度部分510可以显示每个完成的工作列表测试实例的进度标记508(例如,检查和点图标)。一旦培养装置的测试实例由进度标记508标记为完成,则测试实例不能在后续实例中被读取(即,如果将同一培养装置放置在读板器中)。在至少一个实施方案中,工作列表进度部分510可以显示进行中的工作列表测试实例的进度标记506。在至少一个实施方案中,未读取的测试实例504可以是未标记的。
用户可以暂停工作列表内的所述一系列测试实例中的任一个测试实例。每个测试实例被示出为占据工作列表进度部分510中的一行,而不是如本文的用户界面200中那样嵌套在主标题下方。此布置可以进一步帮助馈送和跟踪,并且还减少可能的错误。
图6示出了示例性用户界面600。用户界面600可以具有工作列表安排窗口604。在至少一个实施方案中,工作列表安排窗口604可以基于主内容区域212内的选择在开放窗口和关闭窗口之间转换,并且允许用户切换工作列表以在查阅图像部分202上的图像204的同时创建和管理工作列表过程。
工作列表安排窗口604可以允许用户安排多个工作列表。例如,用户可以指定当将由读板器读取对应于工作列表的培养装置时的时间条件602。工作列表安排窗口604示出尚未开始的多个工作列表606和进行中的多个工作列表608。
图7示出了确定稀释配置文件是否适用于工作列表的方法700的实施方案。在至少一个实施方案中,方法700可以是图1中的子例程框108的实施方案。将参考图8中的数据方案800解释方法700的方面。在至少一个实施方案中,方法700还可以包括基于进入工作列表的输入自动填充工作列表。
在框702中,计算设备可以接收部分填充的工作列表802。部分填充的工作列表802可以包括工作列表测试实例808和与工作列表测试实例相关联的工作列表字段。在至少一个实施方案中,部分填充的工作列表802可以包括多个工作列表测试实例和多个工作列表字段。工作列表测试实例的数目可以对应于部分填充的工作列表802,并且可以由来自输入装置的文本输入生成。例如,用户可以通过键入测试实例的前几个字段的准则来创建工作列表的一部分。
部分填充的工作列表802或稀释配置文件804可以包括可以与数据类型的多个列相关联的多个配置文件字段812或多个工作列表字段810。例如,多个工作列表字段810可以按多个列816分类。多个配置文件字段812可以按多个列814分类。在另一实例中,多个工作列表字段810中的至少一个工作列表字段是元数据。
如图所示,多个列814包括任选的测试实例标识符,以及每个测试实例标识符的板类型和稀释物。来自多个列816的列可以包括表示培养装置的读取顺序的工作列表序列828。
在框704中,计算设备确定工作列表测试实例是否对应于稀释配置文件中的配置文件测试实例。当配置文件测试实例的多个配置文件字段中的至少一个配置文件字段与工作列表测试实例的多个工作列表字段中的至少一个工作列表字段匹配时,工作列表测试实例可以对应于配置文件测试实例。在至少一个实施方案中,如果配置文件测试实例的多个配置文件字段中的大部分配置文件字段与一个或多个工作列表测试实例的多个工作列表字段中的大部分工作列表字段匹配,则工作列表测试实例可以对应于配置文件测试实例。在至少一个实施方案中,工作列表测试实例可以确定所有(填充的)多个工作列表字段是否与单个测试实例的所有(填充的)多个配置文件字段匹配。
例如,配置文件测试实例806可以对应于工作列表测试实例808,因为所有多个工作列表字段810与每个实例的多个配置文件字段812匹配。工作列表测试实例820可以对应于配置文件测试实例822。然而,工作列表测试实例818不对应于配置文件测试实例824,因为在工作列表字段与配置文件字段之间仅有样品ID数据字段匹配。如图所示,其他配置文件字段中没有一个配置文件字段与工作列表字段匹配。
在至少一个实施方案中,所选列可以相对于其他列具有更高权重。例如,板类型列可以具有比板数目列更高的权重。因此,由于板类型列中的数据字段在工作列表测试实例818与配置文件测试实例824之间不匹配,因此两个测试实例彼此不对应。
在框706中,计算设备可以基于与配置文件测试实例匹配的工作列表测试实例的阈值来确定稀释配置文件适用于工作列表。例如,确定稀释配置文件是否适用于工作列表可以基于与工作列表测试实例匹配的配置文件测试实例的数目,或反之亦然。例如,在数据方案800中,如果阈值是三个工作列表测试实例,则因为仅两个工作列表测试实例与两个配置文件测试实例匹配,所以计算设备可以确定稀释配置文件804不适用于部分填充的工作列表802。然而,如果阈值是两个工作列表测试实例,则稀释配置文件804将适用于部分填充的工作列表802。
在框708中,计算设备可以用对应于每个测试实例的配置文件字段填充工作列表字段。例如,配置文件测试实例806和配置文件测试实例822的配置文件字段可以分别用于填充工作列表测试实例808和工作列表测试实例820的工作列表字段。在至少一个实施方案中,填充可以响应于计算设备在框706中确定稀释配置文件适用于工作列表。例如,如果没有匹配,则没有填充。在至少一个实施方案中,阈值可以是在框706中匹配的一个测试实例,其可以使得在工作列表测试实例基础上填充每个配置文件测试实例。例如,在输入工作列表测试实例808的工作列表字段之后,接着计算设备可以填充工作列表测试实例808的剩余工作列表字段。在另一实例中,在输入工作列表测试实例808并且配置文件测试实例806对应于工作列表测试实例808之后,接着工作列表测试实例820可以基于配置文件测试实例822的配置文件字段自动填充。
在框710中,计算设备可以任选地对于部分填充的工作列表的任何缺失的工作列表字段,经由用户界面从用户请求与培养装置相关的任何工作列表字段。例如,如果非对应配置文件测试实例(例如,配置文件测试实例824)与部分填充的工作列表802(例如,工作列表测试实例818)不匹配,则计算设备可以提示用户填充工作列表测试实例818和工作列表测试实例826。即使所有配置文件测试实例都对应于工作列表测试实例中的一些工作列表测试实例,剩余工作列表测试实例也可以由用户填充或基于另一稀释配置文件填充。
图9示出了作为框110的变型的用户界面元素900的实施方案。用户界面元素900可以是本文所描述的用户界面的一部分。如图所示,在给定特定用户或实验室中的所有用户的输入历史的情况下,用户可以选择将使计算设备预测新培养装置的元数据信息的自动化数据输入。计算设备可以学习适应随时间变化的用户输入行为(例如,通过考虑最频繁使用的、最近使用的或“动态输入的”(例如,一旦用户选择板类型,所述方法就将为用户预测和选择稀释),或自定义的元数据。
自动化数据输入可以基于上述方法700或另一机器学习模式。当用户键入工作列表字段并且工作列表字段对应于至少一个配置文件字段时,接着计算设备可提供下一配置文件字段作为下一工作列表字段。下一配置文件字段的选项可以呈现为可供用户选择的下拉菜单。
图10和图11示出了与用户界面交互的示例性方法1000。例如,经由用户界面和输入装置,用户可以在框1002中打开工作列表抽屉。用户可在框1004中创建新工作列表或在框1006中选择现有工作列表。
如果创建新工作列表,则用户可以创建新工作列表,用于从读板器接收样品数据或使用现有工作列表。新工作列表可以依赖于将具有预先填充的元数据的培养装置分批馈送到计算设备中。计算设备可以使用帮助用户构建工作列表的多个数据结构。这些数据结构可以用作可以用于定义工作列表的模板。一旦构建了工作列表,用户和由系统控制的仪器就使用工作列表作为指令来编排一系列测试的运行。
用户可以指定每次运行所需的所有信息。还可以从外部数据源(诸如客户的LIMS)导入元数据列表。在框1008中,用户可以在框1012中选择“保存并退出”或在框1010中单击“现在开始”按钮。如果用户选择保存并退出,则用户还具有在稍后安排工作列表并设置提醒的选项。用户可以在指定时间从计算设备接收通知。
如果用户在框1010中选择“现在开始”,则计算设备可以支持用于馈送生长培养基的三个不同工作流。例如,用户或读板器可以在框1014中以任何顺序馈送具有条形码的生长培养基,在框1018中以工作列表的顺序馈送培养装置或板,或在框1016中点击工作列表中的项目并馈送对应培养装置。
在根据工作流中的一个工作流馈送培养装置之后,读板器可以处理培养装置并显示每个培养装置的信息,而无需用户再次输入元数据。在框1102中,当培养装置计数完成时,仪器提示用户下一培养装置的信息。用户可以选择关闭工作列表面板并在框1104中查阅生长培养基结果。一旦在框1106中完成工作列表,计算设备就可以将完成状态传达给用户。在至少一个实施方案中,计算设备可以另外告知用户进行中的每个工作列表的状态并允许暂停和重启工作列表。
图12示出了与工作列表一起使用的数据结构1200。用户界面1208可用于创建形成工作列表1210的一部分的用户定义的产品规格和稀释配置文件(例如,与配置文件字段相关的元数据)。多个工作列表1212可以存储在数据存储库1206中,所述数据存储库可以在计算设备内部或者由计算设备经由网络访问。
在至少一个实施方案中,计算设备可以访问数据存储库1204,所述数据存储库可以基于外部方法和标准存储用户定义的产品规格。例如,产品规格中的一个产品规格可以链接到美国农业部标准,当美国农业部标准更新时,将自动更新数据存储库1204和相关联工作列表。类似地,计算设备可以访问可以存储用户定义的稀释方案模板的数据存储库1202。数据存储库1202和数据存储库1204可以与多个工作列表1212链接。
图13示出了微生物检测系统1300,其中服务器1304和客户端装置1306连接到网络1302。
在各种实施方案中,网络1302可包括互联网、局域网(“LAN”)、广域网(“WAN”)和/或其他数据网络。除了传统的数据联网协议之外,在一些实施方案中,数据可以根据包括近场通信(“NFC”)、蓝牙、电力线通信(“PLC”)等的协议和/或标准而被传达。在一些实施方案中,网络1302还可以包括语音网络,所述语音网络不仅传送语音通信,而且还传送诸如短消息服务(“SMS”)消息之类的非语音数据,以及经由各种蜂窝数据通信协议传达的数据等。
在各种实施方案中,客户端装置1306可包括台式PC、移动电话、膝上型计算机、平板计算机、可穿戴计算机或能够连接到网络1302并与服务器1304通信的其他计算装置,诸如本文所描述的。
在各种实施方案中,可存在附加基础设施(例如,短消息服务中心、小区站点、路由器、网关、防火墙等)以及附加装置。此外,在一些实施方案中,描述为由服务器1304和客户端装置1306中的一些或全部者提供的功能可经由物理和/或逻辑装置的各种组合来实施。然而,不必在图13中示出此类基础结构和实施细节,以便描述例示性实施方案。在至少一个实施方案中,服务器1304可以通信地耦合到数据存储库1324,使得来自客户端装置1306的数据可以通过服务器1304传输到数据存储库1324。
在至少一个实施方案中,微生物检测系统1300可以包括通信地耦合到客户端装置1306的读板器1308。读板器1308可以被配置为读取培养装置1316。读板器(也称为菌落计数器)的示例可从3M(圣保罗(Saint Paul),明尼苏达州)、合成生物(Synbiosis)(英国)或跨科学(Interscience)(法国)商购获得。在至少一个实施方案中,读板器1308可以在不使用网络1302的情况下直接连接到客户端装置1306。用户界面的方面可以集成到读板器1308自身上。
读板器1308可以具有多个子系统以帮助读取培养装置1316。例如,读板器1308可以包括用以捕获培养装置1316的图像的图像处理电路1310、用以孵育培养装置1316的任选加热器电路1314,以及用以在没有用户干预的情况下自动馈送多个培养装置1314的任选自动装载器附件1318。图像处理电路1310可以被配置为向客户端装置1306提供用于分析的图像。图像处理电路1310可以与照明电路1312结合工作。照明电路1312可以包括各种灯和控制器,以照射要由图像处理电路1310捕获的培养装置。
培养装置1316可以具有在其中含有营养培养基1320的生长室。微生物样品1322可以从所关注的样品(诸如食物样品)获得。微生物样品1322可以应用于营养培养基1320,使得微生物可以增殖。
图14是可以结合本发明的实施方案的计算设备1400的示例性框图。图14仅示出用以执行本文所描述的技术过程的方面的机器系统,并且不限制权利要求的范围。本领域普通技术人员将认识到其他变型、修改和替代方案。在一个实施方案中,计算设备1400通常包括图形用户界面1402、数据处理系统1420、通信网络接口1412、输入装置1408、输出装置1406等。
如图14中所描绘,数据处理系统1420可以包括经由总线子系统1418与数个外围装置通信的一个或多个处理器1404。这些外围装置可以包括输入装置1408、输出装置1406、通信网络接口1412和存储子系统,诸如存储器(例如,易失性存储器1410和非易失性存储器1414)。
易失性存储器1410和/或非易失性存储器1414可以存储计算机可执行指令,并且因此形成逻辑1422,所述逻辑在应用于处理器1404并由所述处理器执行时实施本文所公开的过程的实施方案。
输入装置1408包括用于将信息输入到数据处理系统1420的装置和机制。这些装置和机制可以包括键盘、小键盘、结合到图形用户界面1402中的触摸屏、诸如语音辨识系统、麦克风的音频输入装置,以及其他类型的输入装置。在各种实施方案中,输入装置1408可以体现为计算机鼠标、跟踪球、跟踪板、操纵杆、无线遥控器、绘图板、语音命令系统、眼睛跟踪系统等。输入装置1408通常允许用户经由诸如按钮等的命令来选择出现在图形用户界面1402上的对象、图标、控制区域、文本等。
输出装置1406包括用于从数据处理系统1420输出信息的装置和机制。这些装置和机制可以包括被配置为显示/投影/呈现图形用户界面1402的显示装置1424、扬声器、打印机、红外LED等,如本领域所公知的。
通信网络接口1412提供到通信网络(例如,通信网络1416)和数据处理系统1420外部的装置的接口。通信网络接口1412可以用作用于接收来自其他系统的数据并将数据发送到其他系统的接口。通信网络接口1412的实施方案可以包括以太网接口、调制解调器(电话、卫星、电缆、ISDN)、(异步)数字订户线(DSL)、火线、USB、诸如蓝牙或WiFi的无线通信接口、近场通信无线接口、蜂窝接口等。
通信网络接口1412可以经由天线、电缆等耦合到通信网络1416。在一些实施方案中,通信网络接口1412可以物理集成在数据处理系统1420的电路板上,或者在一些情况下可以在软件或固件(诸如“软调制解调器”等)中实施。通信网络1416可以进一步通信地耦合到如本文所描述的读板器。
计算设备1400可以包括使得能够使用诸如HTTP、TCP/IP、RTP/RTSP、IPX、UDP等的协议通过网络进行通信的逻辑。
易失性存储器1410和非易失性存储器1414是被配置为存储计算机可读数据和指令以实施本文所描述的过程的各种实施方案的有形介质的示例。其他类型的有形介质包括可移除存储器(例如,可插拔USB存储器装置、移动装置SIM卡)、光学存储介质(诸如CD-ROMS、DVD)、半导体存储器(诸如闪存)、非暂时性只读存储器(ROMS)、电池支持的易失性存储器、联网存储装置等。易失性存储器1410和非易失性存储器1414可以被配置为存储提供所公开的过程的功能和其落入本发明范围内的其他实施方案的基本编程和数据构建体。
实施本发明实施方案的逻辑1422可以存储在易失性存储器1410和/或非易失性存储器1414中。所述逻辑1422可以从易失性存储器1410和/或非易失性存储器1414读取并由处理器1404执行。易失性存储器1410和非易失性存储器1414还可以提供用于存储由逻辑1422使用的数据的储存库。
易失性存储器1410和非易失性存储器1414可以包括数个存储器,所述数个存储器包括用于在程序执行期间存储指令和数据的主随机存取存储器(RAM)和存储只读非暂时性指令的只读存储器(ROM)。易失性存储器1410和非易失性存储器1414可以包括为程序和数据文件提供持久(非易失性)存储的文件存储子系统。易失性存储器1410和非易失性存储器1414可以包括可移除存储系统,诸如可移除闪存。
总线子系统1418提供用于使数据处理系统1420的各种组件和子系统能够按需彼此通信的机制。尽管通信网络接口1412被示意性地描绘为单个总线,但是总线子系统1418的一些实施方案可以利用多个不同的总线。
对于本领域普通技术人员将显而易见的是,计算设备1400可以是诸如智能手机、台式计算机、膝上型计算机、机架安装的计算机系统、计算机服务器或平板计算机装置的装置。如本领域中通常已知的,计算设备1400可以被实施为多个联网计算装置的集合。此外,计算设备1400将通常包括操作系统逻辑(未示出),所述操作系统逻辑的类型和性质在本领域中是众所周知的。
“自动装载器附件”是指便于将培养装置转移到读板器中以便读板器可以捕获培养装置的图像的附件。自动装载器附件可以包括一个或多个伺服器和控制器,以装载培养装置。在至少一个实施方案中,自动装载器附件可以在没有用户干预的情况下依次装载培养装置序列。
“电路”是指具有至少一个离散电路的电路,具有至少一个集成电路的电路,具有至少一个专用集成电路的电路,形成由计算机程序配置的通用计算装置的电路(例如,由至少部分地执行本文描述的过程或装置的计算机程序配置的通用计算机,或由至少部分地执行本文描述的过程或装置的计算机程序配置的微处理器),形成存储器装置(例如,随机存取存储器的形式)的电路,或形成通信装置的电路(例如,调制解调器,通信开关或光电装备)。
“培养装置”是指适于容纳促进微生物生长的营养培养基的制品。任选地,培养装置可以包括封盖或顶盖,以便使营养培养基对外部污染的暴露最小化和/或以便减少水分在孵育和/或存储期间从培养基中的损失。培养装置可以具有生长室和含于培养装置内的营养培养基。可以在生长室中接收微生物样品。培养装置的非限制性例子包括烧瓶、烧杯、管、培养皿、多孔板、PETRIFILM板、COMPACT DRY培养基片、SANITA-KUN测试片等。培养装置可以是琼脂板或一体化接种系统,诸如3M Petrifilm。本发明的制品包括薄膜培养装置,诸如美国专利第4,476,226号、第5,089,413号和第5,232,838号中所公开的薄膜培养装置;所述专利全文以引用方式并入本文中。
“培养装置标识”是指由工作列表定义的培养装置。
“数据字段”是指你可以存储数据的位置。例如,呈数据输入形式或网络形式的字段。数据字段可以包括要输入的数据以及要显示的数据。
“数据类型”是指由列表示的数据的类型。
“不同微生物”是指微生物的第二属或种。
“稀释因子”是指原液被稀释的因子。可以由1:n+1表示,其中第二个数字(n+1)表示溶质+溶剂的总体积。
“稀释配置文件”是指给定微生物样品的测试实例的集合。稀释配置文件可以包括各种板类型的稀释因子、稀释因子运行的次数和产品规格。每个配置文件字段可以对应于单个配置文件测试实例。稀释配置文件可以与多个配置文件字段和多个配置文件测试实例相关联。
“固件”是指体现为存储在只读存储器或介质中的处理器可执行指令的软件逻辑。
“生长室”是指微生物生长的空间。生长室可以包括营养培养基、微生物样品和它们周围的空气体积。
“硬件”是指体现为模拟或数字电路的逻辑。
“图像”是指培养装置的图像。可以包括微生物样品或可以是参考。
“图像部分”是指显示图像和任何注释的页面的部分。用户可以与图像部分交互以创建注释或修改现有注释。
“逻辑”是指机器存储器电路、非暂时性机器可读介质,和/或通过其材料和/或材料-能量配置包括控制和/或程序信号和/或设置和值(诸如电阻、阻抗、电容、电感、电流/电压额定值等)的电路,其可以被应用以影响装置的操作。磁性介质、电子电路、电气和光学存储器(易失性和非易失性两者)以及固件是逻辑的示例。逻辑特别排除纯信号或软件本身(然而不排除包括软件并由此形成物质配置的机器存储器)。
“主内容区域”是指页面的为所述页面所独有的部分(不与其他页面共享的部分)。
“微生物样品”是指具有微生物的样品。可以分析可源自任何来源的微生物样品中的所关注的菌种,所述任何来源诸如:生理流体(例如血液、唾液、晶状体液、滑膜液、脑脊液、脓液、汗液、渗出液、尿液、粘液)、黏膜组织(例如口腔黏膜、齿龈黏膜、鼻黏膜、眼黏膜、气管黏膜、支气管黏膜、胃肠黏膜、直肠黏膜、尿道黏膜、输尿管黏膜、阴道黏膜、子宫颈黏膜和子宫粘膜)、泌乳期乳汁、粪便等。另外,样品可源自身体部位,例如伤口、皮肤、前鼻孔、鼻咽腔、鼻腔、鼻前庭、头皮、指甲、外耳、中耳、口、直肠、阴道、腋窝、会阴、肛门,或其他类似的部位。
除了生理流体外,其他微生物样品可包括其他液体以及溶解或悬浮于液体介质中的固体。所关注的样品可包括工艺物料流、水、食品、食品成分、饮料、土壤、植株或其他植被、空气、表面(如制造工厂、医院、诊所或住宅里的墙壁、地板、设备、用具),等等。优选地,可以经由食物基质收集微生物样品。
“微生物”是指微观生物体,诸如细菌、病毒或真菌。术语微生物还可以指要分析的目标微生物,诸如引起疾病的微生物细菌,优选地通常与食物污染相关联的微生物细菌,包括例如需氧细菌、大肠杆菌、大肠菌、肠杆菌、酵母、霉菌、金黄色葡萄球菌、李斯特菌、弯曲杆菌、志贺氏菌、沙门氏菌等。
“导航元素”是指在不同培养装置或培养装置的读数之间导航的图形用户界面元素。
“营养培养基”是指设计成支持微生物或细胞的生长的固体、液体或半固体。营养培养基通常包含至少一种营养物质,其选自肉蛋白胨、酪蛋白胨、明胶蛋白胨、大豆蛋白胨、牛肉提取物、酵母提取物、乳糖、葡萄糖、右旋糖、胰蛋白、半乳糖、胰蛋白胨、脂肪、矿物质或维生素。
“读板器”是指用于检测培养装置上的样品的生物事件的仪器。读板器的示例可包括诸如3M Petrifilm读板器的薄膜读板器,或其他基于琼脂的读板器。
“板类型”是指允许培养装置增殖所选微生物的培养装置的性质。一些板类型对种具有非特异性。其他者(如乳酸板)对属而非种具有特异性。
“多个配置文件字段”是指稀释配置文件中的多个数据字段。可与单个测试实例或多个测试实例相关。
“多个工作列表字段”是指工作列表中的多个数据字段。可与单个测试实例或多个测试实例相关。
“读取”是指捕获与培养装置相关的样品数据。这可以通过光学装置(例如,图像处理电路)来执行。术语“读取”可以用于指代获得读数的动作。读取可以由读板器在计算设备的指导下执行。术语“读取”可以与术语“捕获”相关联。“捕获”可以指读板器的动作。术语“读取”还可以包括对样品数据执行的分析,无论所述分析是在读板器还是在计算设备上执行的。
“带状标签”是指呈一组工具栏形式的图形控制元素。每个工具栏可具有控制不同功能性的多个图形按钮(例如,锁定按钮、导航元素),以及数据字段。可以组合多个带状标签以形成带状物。
“样品数据”是指来自由读板器对培养装置的读取的数据。样品数据可以包括来自培养装置的图像或关于培养装置的读取的其他数据。
“培养装置序列”是指读板器对培养装置的处理顺序。
“系列测试实例”是指多个测试实例的特定顺序。
“软件”是指实施为机器存储器(例如,读/写易失性或非易失性存储器或介质)中的处理器可执行指令的逻辑。
“测试实例”是指读取培养装置的单次发生。
“工作列表”是指由读板器和/或计算设备对一个或多个微生物样品执行的操作的列表。工作列表可以包括多个测试实例。
工作列表可以包括由读取器读取的培养装置标识,并且包括每个培养装置标识的多个字段。工作列表可以与多个稀释配置文件相关联(所述多个稀释配置文件可以属于相同或不同类型)。工作列表也可以与多个微生物样品相关联(所述多个微生物样品可以是不同类型的样品)。
“工作列表字段”是指工作列表内的字段。
“工作列表序列”是指处理工作列表内的培养装置的顺序。
“工作列表测试实例”是指工作列表内的测试实例。工作列表测试实例可以与多个工作列表字段相关联。可以根据工作列表测试实例准备培养装置。
短语“在一个实施方案中”、“在各种实施方案中”、“在一些实施方案中”等重复使用。此类短语不一定是指相同的实施方案。除非上下文另外指出,否则术语“包含”、“具有”和“包括”是同义的。术语“包括”及其变型在说明书和权利要求书中出现这些术语的地方不具有限制的含义。
词语“优选的”和“优选地”是指在某些情况下可提供某些有益效果的本发明实施方案。然而,在相同的情况或其他情况下,其他实施方案也可以是优选的。此外,对一个或多个优选实施方案的表述并不暗示其它实施方案是不可用的,并且并非旨在将其它实施方案排除在本发明范围之外。
如本文所用,“一个/一种”、“该”、“所述”、“至少一个/至少一种”和“一个或多个/一种或多种”可互换使用。因此,例如,营养素可被理解为“一种或多种”营养素。
术语“和/或”意指所列要素中的一个或全部,或者所列要素中的任何两个或更多个的组合。
另外,在本文中,通过端点表述的数值范围包含该范围内所含的所有数值(例如,1至5包含1、1.5、2、2.75、3、3.80、4、5等)。
现在详细参考如图所示的实施方案的描述。虽然结合附图和相关描述描述了实施方案,但是无意将范围限制于本文公开的实施方案。相反,意图是涵盖所有替代物、修改物和等同物。在替代实施方案中,可添加或组合附加装置或所示装置的组合,而不将范围限于本文所公开的实施方案。
例示性实施方案的列表:
1.一种方法,所述方法包括:
从计算设备的显示装置上的用户界面接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段;
将所述稀释配置文件存储在计算设备的存储器中;
接收形成用于读取所述培养装置的工作列表的请求,所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子,其中所述工作列表包括对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段的多个工作列表字段;
确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
响应于确定所述稀释配置文件适用,使用所述计算设备用来自所述存储器的所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段;并且
响应于所述填充而执行至少一个动作。
2.根据实施方案1所述的方法,其中所述多个配置文件字段或所述多个工作列表字段与数据类型的多个列相关联。
3.根据实施方案2所述的方法,其中所述多个列包括测试实例标识符,以及每个测试实例标识符的板类型和稀释因子。
4.根据实施方案2或3所述的方法,其中来自所述多个列的列包括工作列表序列,所述工作列表序列是读取所述培养装置的顺序。
5.根据前述实施方案中任一项所述的方法,其中确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表进一步包括:
接收包括工作列表测试实例和与所述工作列表测试实例相关联的工作列表字段的部分填充的工作列表;
确定所述工作列表测试实例是否对应于所述稀释配置文件中的配置文件测试实例;
基于与所述配置文件测试实例匹配的工作列表测试实例的阈值来确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
其中填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段包括用对应于每个测试实例的配置文件字段填充工作列表字段。
6.根据实施方案5所述的方法,其中确定所述工作列表测试实例是否对应于所述配置文件测试实例包括确定所述多个工作列表字段是否与单个测试实例的所述多个配置文件字段匹配。
7.根据实施方案6所述的方法,其中所述多个工作列表字段中的至少一个工作列表字段是元数据。
8.根据实施方案5所述的方法,所述方法进一步包括:对于所述部分填充的工作列表的任何缺失的工作列表字段,经由用户界面从用户请求与所述培养装置相关的工作列表字段。
9.根据前述实施方案中任一项所述的方法,其中确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表进一步包括在创建所述工作列表时,经由所述用户界面从用户接收所述稀释配置文件适用于所述工作列表的指示。
10.根据前述实施方案中任一项所述的方法,其中执行所述至少一个动作包括使用所述工作列表将指令传输到读板器,使所述读板器的图像处理电路捕获在所述工作列表中描述的培养装置的图像。
11.根据前述实施方案中任一项所述的方法,所述方法进一步包括:
由所述计算设备接收所述图像作为样品数据;
由所述计算设备使用所述多个工作列表字段中的至少一个工作列表字段来分析所述样品数据,以确定结果;
将所述结果呈现给显示装置的用户界面;以及
选择所述工作列表的不同测试实例。
12.根据实施方案11所述的方法,其中所述结果是所述培养装置中的菌落形成单位的计数。
13.根据前述实施方案中任一项所述的方法,其中执行至少一个动作包括由读板器读取与工作列表测试实例相关联的培养装置以获得样品数据,以及用所述计算设备或所述读板器使用所述多个工作列表字段来分析所述样品数据,以确定结果。
14.根据实施方案13所述的方法,其中执行至少一个动作包括:
接收开始读取所述培养装置的时间条件;并且
在所述时间条件下读取所述培养装置。
15.根据实施方案14所述的方法,所述方法进一步包括经由所述用户界面通知所述用户对应于所述工作列表测试实例的所述培养装置正被读取。
16.根据实施方案13所述的方法,其中执行至少一个动作进一步包括:
确定所述培养装置的板类型是否与来自所述工作列表测试实例的板类型匹配;
响应于所述培养装置的板类型与所述工作列表测试实例匹配而读取所述培养装置。
17.根据实施方案16所述的方法,其中确定所述培养装置的板类型是否与来自所述工作列表测试实例的所述板类型匹配包括使用所述培养装置的光谱学、存在于所述培养装置上的文本的文本辨识、存在于所述培养装置上的点码、存在于所述培养装置上的印刷码或它们的组合。
18.根据实施方案10所述的方法,其中所述工作列表中的所述工作列表测试实例被布置在工作列表序列。
19.根据实施方案18所述的方法,其中培养装置序列与所述工作列表序列呈不同的顺序。
20.根据实施方案19所述的方法,其中执行至少一个动作进一步包括:
确定工作列表序列中的工作列表测试实例是否已完成;
基于所述确定,从所述读板器接收所述多个培养装置中的对应于所述工作列表测试实例的培养装置的样品数据;
响应于所述读取而标记所述工作列表测试实例完成的指示;
使用所述多个工作列表字段分析所述样品数据以产生结果;以及将所述结果保存到数据存储库中。
21.根据实施方案20所述的方法,其中所述培养装置在被标记为完成时不在后续实例中被读取。
22.根据前述实施方案中任一项所述的方法,其中所述一系列测试实例包括每个测试实例的板类型、板类型的稀释因子,或它们的组合。
23.根据前述实施方案中任一项所述的方法,其中所述培养装置包括从食物产品获得的微生物样品。
24.根据前述实施方案中任一项所述的方法,还包括:
将阈值与工作列表测试实例相关联,所述阈值是所述工作列表测试实例的产品规格;
基于从所述读板器接收到的样品数据和所述多个工作列表字段来确定结果;
确定所述结果是否符合所述阈值;并且
基于所述结果符合所述阈值,经由所述用户界面显示所述工作列表测试实例的通过指示。
25.一种非暂态计算机可读存储介质,该非暂态计算机可读存储介质包括如下指令,该指令在由计算机处理时将该计算机配置为执行根据前述实施方案中任一项所述的方法。
26.一种计算设备,所述计算设备包括:
显示装置,所述显示装置被配置用于显示用户界面;
输入装置,所述输入装置通信地耦合到所述用户界面以允许用户与所述用户界面交互;
处理器;并且
存储器,所述存储器存储指令,所述指令在由所述处理器执行时将所述计算设备配置为用于:
从所述用户界面接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段;
将所述稀释配置文件存储在所述存储器中;
经由所述用户界面接收形成用于读取所述多个培养装置的工作列表的请求,所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子,其中所述工作列表包括对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段的多个工作列表字段;
确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
响应于确定所述稀释配置文件适用,用所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段;并且
响应于所述填充而执行至少一个动作。
27.根据实施方案26所述的计算设备,其中所述多个配置文件字段或所述多个工作列表字段与数据类型的多个列相关联。
28.根据实施方案27所述的计算设备,其中所述多个列包括测试实例标识符,以及每个测试实例标识符的板类型和稀释因子。
29.根据实施方案28所述的计算设备,其中来自所述多个列的列包括作为培养装置的读取顺序的工作列表序列。
30.根据前述实施方案中任一项所述的计算设备,其中确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表进一步包括:
接收包括工作列表测试实例和与所述工作列表测试实例相关联的工作列表字段的部分填充的工作列表;
确定所述工作列表测试实例是否对应于所述稀释配置文件中的配置文件测试实例;
基于与所述配置文件测试实例匹配的工作列表测试实例的阈值来确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
其中填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段包括用对应于每个测试实例的配置文件字段填充工作列表字段。
31.根据实施方案30所述的计算设备,其中确定所述工作列表测试实例是否对应于所述配置文件测试实例包括确定所述多个工作列表字段是否与单个测试实例的所述多个配置文件字段匹配。
32.根据实施方案31所述的计算设备,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为:对于所述部分填充的工作列表的任何缺失的工作列表字段,经由所述用户界面从用户请求与所述培养装置相关的工作列表字段,并且经由所述用户界面从所述输入装置接收工作列表字段。
33.根据前述实施方案中任一项所述的计算设备,其中确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表进一步包括在创建所述工作列表时,经由所述用户界面从用户接收所述稀释配置文件适用于所述工作列表的指示。
实施方案A1.一种方法,所述方法包括:
接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段;
将所述稀释配置文件存储在计算设备的存储器中;
接收形成用于读取所述培养装置的工作列表的请求,所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子,其中所述工作列表包括对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段的多个工作列表字段;
确定所述稀释配置文件不适用于所述工作列表;
响应于确定而执行至少一个动作。
实施方案A2.根据实施方案A1所述的方法,其中所述至少一个动作是经由用户界面提供所述稀释配置文件不适用的提示。
实施方案A3.根据实施方案A1或A2所述的方法,其中所述执行至少一个动作包括:
经由用户界面呈现包括多个配置文件测试实例的所述稀释配置文件;
接收对适用所述工作列表的所述多个配置文件测试实例中的至少一些配置文件测试实例的选择;并且
响应于所述接收和使用所述计算设备,用来自所述存储器的所述选择填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段。
实施方案A4.根据实施方案A1至A3中任一项所述的方法,所述方法与从属实施方案2至25中任一项组合。
实施方案B.一种计算设备,所述计算设备包括:
显示装置,所述显示装置被配置用于显示用户界面;
输入装置,所述输入装置通信地耦合到所述用户界面以允许用户与所述用户界面交互;
处理器;并且
存储器,所述存储器存储指令,所述指令在由所述处理器执行时将所述计算设备配置为:
执行根据实施方案A1至A4中任一项所述的方法。
34.一种系统,所述系统包括根据前述实施方案26至33中任一项所述的计算设备,所述系统进一步包括:
读板器,所述读板器包括图像处理电路;
其中执行所述至少一个动作包括使用所述工作列表将指令传输到所述读板器,使所述读板器的所述图像处理电路捕获在所述工作列表中描述的培养装置的图像。
35.根据实施方案34所述的系统,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为用于:
接收所述图像作为样品数据;
使用所述多个工作列表字段中的至少一个工作列表字段来分析所述样品数据,以确定结果;
将所述结果呈现给所述显示装置的用户界面;并且
选择所述工作列表的不同测试实例。
36.根据前述实施方案中任一项所述的系统,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为通过以下操作执行至少一个动作:
确定培养装置的板类型是否与来自工作列表测试实例的板类型匹配;
响应于所述培养装置的板类型与所述工作列表测试实例匹配而读取所述培养装置。
37.根据实施方案36所述的系统,其中确定所述培养装置的板类型是否与来自所述工作列表测试实例的所述板类型匹配包括使用所述培养装置的光谱学、存在于所述培养装置上的文本的文本辨识、存在于所述培养装置上的点码、存在于所述培养装置上的印刷码或它们的组合。
38.根据前述实施方案中任一项所述的系统,其中所述读板器包括自动装载器附件,所述自动装载器附件包括装载在其中的培养装置序列。
39.根据实施方案38所述的系统,其中工作列表中的工作列表测试实例被布置在工作列表序列中,所述工作列表序列与所述培养装置序列呈不同的顺序。
40.根据实施方案39所述的系统,其中所述工作列表序列与所述培养装置序列相同,其中所述自动装载器附件被配置用于根据所述工作列表序列装载要由所述板读取器的图像处理电路读取的培养装置。
41.根据前述实施方案中任一项所述的系统,所述系统进一步包括数据存储库;
其中执行至少一个动作进一步包括:
确定工作列表序列中的所述工作列表测试实例是否已完成;
基于所述确定,从所述读板器接收对应于所述工作列表测试实例的培养装置的样品数据;
响应于所述读取而标记所述工作列表测试实例完成的指示;
使用所述多个工作列表字段分析所述样品数据以产生结果;并且
将所述结果保存到所述数据存储库中。
42.根据前述实施方案中任一项所述的系统,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为:
将阈值与工作列表测试实例相关联,所述阈值是所述工作列表测试实例的产品规格;
基于从所述读板器接收到的样品数据来确定结果;
确定所述结果是否符合所述阈值;并且
基于符合所述阈值的所述结果,经由所述用户界面显示所述工作列表测试实例的通过指示。
Claims (20)
1.一种方法,所述方法包括:
接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段;
将所述稀释配置文件存储在计算设备的存储器中;
接收形成用于读取所述培养装置的工作列表的请求,所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子,其中所述工作列表包括对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段的多个工作列表字段;
确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
响应于确定所述稀释配置文件适用,使用所述计算设备用来自所述存储器的所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段;以及
响应于所述填充而执行至少一个动作。
2.根据权利要求1所述的方法,其中确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表进一步包括:
接收包括工作列表测试实例和与所述工作列表测试实例相关联的工作列表字段的部分填充的工作列表;
确定所述工作列表测试实例是否对应于所述稀释配置文件中的配置文件测试实例;
基于与所述配置文件测试实例匹配的工作列表测试实例的阈值来确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
其中填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段包括用对应于每个测试实例的配置文件字段填充工作列表字段。
3.根据权利要求2所述的方法,其中确定所述工作列表测试实例是否对应于所述配置文件测试实例包括确定所述多个工作列表字段是否与单个测试实例的所述多个配置文件字段匹配。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,所述方法进一步包括:对于所述部分填充的工作列表的任何缺失的工作列表字段,经由用户界面从用户请求与所述培养装置相关的工作列表字段。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中执行所述至少一个动作包括使用所述工作列表将指令传输到读板器,使所述读板器的图像处理电路捕获在所述工作列表中描述的培养装置的图像。
6.根据权利要求5所述的方法,所述方法进一步包括:
由所述计算设备接收所述图像作为样品数据;
由所述计算设备使用所述多个工作列表字段中的至少一个工作列表字段来分析所述样品数据,以确定结果;
将所述结果呈现给显示装置的用户界面;以及
选择所述工作列表的不同测试实例。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中执行至少一个动作包括由读板器读取与工作列表测试实例相关联的培养装置以获得样品数据,以及用所述计算设备或所述读板器使用所述多个工作列表字段来分析所述样品数据,以确定结果。
8.根据权利要求7所述的方法,其中执行至少一个动作包括:
接收开始读取所述培养装置的时间条件;以及
在所述时间条件下读取所述培养装置。
9.根据权利要求7所述的方法,其中执行至少一个动作包括:
确定所述培养装置的板类型是否与来自所述工作列表测试实例的板类型匹配;
响应于所述培养装置的板类型与所述工作列表测试实例匹配而读取所述培养装置。
10.根据权利要求7所述的方法,其中执行至少一个动作包括:
确定工作列表序列中的工作列表测试实例是否已完成;
基于所述确定,从所述读板器接收所述多个培养装置中的对应于所述工作列表测试实例的培养装置的样品数据;
响应于所述读取而标记所述工作列表测试实例完成的指示;
使用所述多个工作列表字段分析所述样品数据以产生结果;以及
将所述结果保存到数据存储库中。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的方法,所述方法进一步包括:
将阈值与工作列表测试实例相关联,所述阈值是所述工作列表测试实例的产品规格;
基于从所述读板器接收到的样品数据和所述多个工作列表字段来确定结果;
确定所述结果是否符合所述阈值;以及
基于所述结果符合所述阈值,经由所述用户界面显示所述工作列表测试实例的通过指示。
12.一种计算设备,所述计算设备包括:
显示装置,所述显示装置被配置用于显示用户界面;
输入装置,所述输入装置通信地耦合到所述用户界面,以允许用户与所述用户界面交互;
处理器;和
存储器,所述存储器存储指令,所述指令在由所述处理器执行时将所述计算设备配置为用于:
从所述用户界面接收稀释配置文件,所述稀释配置文件包括与多个培养装置的一系列测试实例相关的多个配置文件字段;
将所述稀释配置文件存储在所述存储器中;
经由所述用户界面接收形成用于读取所述多个培养装置的工作列表的请求,所述工作列表具有第一测试实例,所述第一测试实例具有与第二测试实例不同的板类型和稀释因子,其中所述工作列表包括对应于所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段中的至少一些配置文件字段的多个工作列表字段;
确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
响应于确定所述稀释配置文件适用,用所述稀释配置文件中的所述多个配置文件字段填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段;以及
响应于所述填充而执行至少一个动作。
13.根据权利要求12所述的计算设备,其中确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表进一步包括:
接收包括工作列表测试实例和与所述工作列表测试实例相关联的工作列表字段的部分填充的工作列表;
确定所述工作列表测试实例是否对应于所述稀释配置文件中的配置文件测试实例;
基于与所述配置文件测试实例匹配的工作列表测试实例的阈值来确定所述稀释配置文件适用于所述工作列表;
其中填充所述多个工作列表字段中的至少一些工作列表字段包括用对应于每个测试实例的配置文件字段填充工作列表字段。
14.根据权利要求12或13所述的计算设备,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为用于:对于所述部分填充的工作列表的任何缺失的工作列表字段,经由所述用户界面从用户请求与所述培养装置相关的工作列表字段,并且经由所述用户界面从所述输入装置接收工作列表字段。
15.一种系统,所述系统包括根据前述权利要求中任一项所述的计算设备,所述系统进一步包括:
读板器,所述读板器包括图像处理电路;
其中执行所述至少一个动作包括使用所述工作列表将指令传输到所述读板器,使所述读板器的所述图像处理电路捕获在所述工作列表中描述的培养装置的图像。
16.根据权利要求15所述的系统,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为用于:
接收所述图像作为样品数据;
使用所述多个工作列表字段中的至少一个工作列表字段来分析所述样品数据,以确定结果;
将所述结果呈现给所述显示装置的用户界面;以及
选择所述工作列表的不同测试实例。
17.根据权利要求15所述的系统,其中所述指令进一步将所述计算设备配置为通过以下操作执行至少一个动作:
确定培养装置的板类型是否与来自工作列表测试实例的板类型匹配;
响应于所述培养装置的板类型与所述工作列表测试实例匹配而读取所述培养装置。
18.根据权利要求15至17所述的系统,其中所述读板器包括自动装载器附件,所述自动装载器附件包括装载在其中的培养装置序列。
19.根据权利要求18所述的系统,其中工作列表序列与所述培养装置序列相同,其中所述自动装载器附件被配置用于根据所述工作列表序列装载要由所述板读取器的图像处理电路读取的培养装置。
20.根据权利要求15至19中任一项所述的系统,所述系统进一步包括数据存储库;
其中执行至少一个动作进一步包括:
确定工作列表序列中的所述工作列表测试实例是否已完成;
基于所述确定,从所述读板器接收对应于所述工作列表测试实例的培养装置的样品数据;
响应于所述读取而标记所述工作列表测试实例完成的指示;
使用所述多个工作列表字段分析所述样品数据以产生结果;以及
将所述结果保存到所述数据存储库中。
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