CN115100308A - 用于去除ct伪影的神经网络训练方法及系统 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种用于去除CT伪影的神经网络训练方法及系统,神经网络训练方法包括以下步骤:获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img;合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1;合成第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2;以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对神经网络进行训练。采用上述技术方案后,利用已有设备的数据模拟欠采样的情况,从而为去除伪影的神经网络提供训练数据对。
Description
技术领域
本发明涉及医学影像处理领域,尤其涉及一种用于去除CT伪影的神经网络训练方法及系统。
背景技术
在CT螺旋扫描过程中,探测器每排的像素对应的层厚不同会造成Z轴方向不同程度的欠采样。由于Z向的欠采样,沿被扫描物体在Z向明显变化的边缘就会产生风车伪影,表现为放射状,亮暗相间。
在硬件方面,为了减少风车伪影可以采取较小的像素增加Z向采样,但这样会带来成本的增加。目前市场上存在大量的层厚较厚的CT机型,如何减少这些机型上风车伪影成为一个问题。另外一种方法可以通过Z向飞焦点技术得到改善,通过交替切换焦点在Z方向的位置,增加采样率来减少风车伪影。但市场上已经存在的层厚较厚的CT机型由于历史原因和成本考虑不可能使用Z向飞焦点技术的球管。
在软件处理方面,一般通过Z向自适应低通滤波,或者低通滤波与其他技术相结合的方法,以保持图像的边缘和噪声,但这些技术都会对Z向分辨率造成一定的损失,并且人工修正滤波器参数和条件带来了很大的工作量。
近年来神经网络在图像处理中得到了广泛应用。神经网络的学习分为有监督的学习和无监督的学习,对医学图像的处理一般采用有监督的学习,但有监督的学习经常面临的问题就是不易获得可用且高质的数据对。一种去除风车伪影的想法是采用有监督学习,采集到同一患者有风车伪影的图像和无风车伪影的图像,利用此图像对进行神经网络的学习后应用此神经网络在图像重建过程中以去除风车伪影。
因此,需要一种新型的获取上述具有对比性的图像的方法,并输入至神经网络内对神经网络进行训练和学习。
发明内容
为了克服上述技术缺陷,本发明的目的在于提供一种用于去除CT伪影的神经网络训练方法及系统,利用已有设备的数据模拟欠采样的情况,从而为去除伪影的神经网络提供训练数据对。
本发明公开了一种用于去除CT伪影的神经网络训练方法,包括以下步骤:
获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且薄层图像Img内不具有风车伪影;
合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1;
合成第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;
基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,其中第二厚层图像Img2内具有风车伪影;
以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对神经网络进行训练。
优选地,获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且薄层图像Img内不具有风车伪影的步骤中,
宽度阈值为0.625mm;
预处理包括对扫描数据去除探测器偏移量、射束硬化;
合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1的步骤包括:
基于以下算法合成薄层图像Img:
其中i=1,2…N,j=1,2,…N,分别表示每一薄层图像Img内的像素的行坐标和列坐标,N薄层图像Img的图像宽度,k=1,2,…M为每一薄层图像Img的顺序编号,M为薄层图像Img的图像张数,W为滤波参数。
优选地,合成第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2的步骤包括:
基于以下算法合成第一投影数据Proj1:
其中,ch、row分别为第一投影数据Proj1在各角度投影内的通道方向坐标和排方向坐标,view为第一投影数据Proj1的投影角度编号。
优选地,当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度为薄层图像Img的探测器模块宽度的2倍时,W取2,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍时,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍,且薄层图像Img的探测器模块的排数为P,而第一厚层图像Img1的探测器模块的排数为Q时,对第一投影数据Proj1傅里叶变换以得到P排第一投影数据Proj1;
对位于P排第一投影数据Proj1中最外部的两边各(P-Q)/2排数据作截取,并对截取后数据作反傅里叶变换后得到第二投影数据Proj2。
优选地,合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1的步骤包括:
本发明还公开了一种用于去除CT伪影的神经网络训练系统,包括:
重建模块,获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且薄层图像Img内不具有风车伪影;
合成模块,合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1,合成第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;
重建模块基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,其中第二厚层图像Img2内具有风车伪影;
以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对神经网络进行训练。
优选地,宽度阈值为0.625mm;
预处理包括对扫描数据去除探测器偏移量、射束硬化;
合成模块基于以下算法合成薄层图像Img:
其中i=1,2…N,j=1,2,…N,分别表示每一薄层图像Img内的像素的行坐标和列坐标,N薄层图像Img的图像宽度,k=1,2,…M为每一薄层图像Img的顺序编号,M为薄层图像Img的图像张数,W为滤波参数。
优选地,合成模块基于以下算法合成第一投影数据Proj1:
其中,ch、row分别为第一投影数据Proj1在各角度投影内的通道方向坐标和排方向坐标,view为第一投影数据Proj1的投影角度编号。
优选地,当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度为薄层图像Img的探测器模块宽度的2倍时,W取2,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍时,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍,且薄层图像Img的探测器模块的排数为P,而第一厚层图像Img1的探测器模块的排数为Q时,重建模块对第一投影数据Proj1傅里叶变换以得到P排第一投影数据Proj1;
重建模块对位于P排第一投影数据Proj1中最外部的两边各(P-Q)/2排数据作截取,并对截取后数据作反傅里叶变换后得到第二投影数据Proj2。
优选地,当薄层图像Img的张数为M时,合成模块对每一薄层图像Img沿着层厚方向快速傅里叶变换,并取每一经快速傅里叶变换后的薄层图像Img位于中间部分的数据沿着层厚方向反傅里叶变换以得到第一厚层图像Img1。
采用了上述技术方案后,与现有技术相比,具有以下有益效果:
利用已有小层厚的CT设备,可以很容易获取到大量数据,并且风车伪影的形成主要是由于Z向欠采样造成的而对CT设备的机型依赖不大,因此由小层厚机器上采集的数据进行处理得到大层厚的数据能够模拟实际欠采样的情况,进而更加真实地模拟欠采样导致的重建伪影。
附图说明
图1为符合本发明一优选实施例中神经网络训练方法的流程示意图;
图2a为符合本发明一优选实施例中具有风车伪影的图像示意图;
图2b为符合本发明一优选实施例中不具有风车伪影的图像示意图;
图3为符合本发明一优选实施例中线性滤波的滤波核示意图。
具体实施方式
以下结合附图与具体实施例进一步阐述本发明的优点。
这里将详细地对示例性实施例进行说明,其示例表示在附图中。下面的描述涉及附图时,除非另有表示,不同附图中的相同数字表示相同或相似的要素。以下示例性实施例中所描述的实施方式并不代表与本公开相一致的所有实施方式。相反,它们仅是与如所附权利要求书中所详述的、本公开的一些方面相一致的装置和方法的例子。
在本公开使用的术语是仅仅出于描述特定实施例的目的,而非旨在限制本公开。在本公开和所附权利要求书中所使用的单数形式的“一种”、“所述”和“该”也旨在包括多数形式,除非上下文清楚地表示其他含义。还应当理解,本文中使用的术语“和/或”是指并包含一个或多个相关联的列出项目的任何或所有可能组合。
应当理解,尽管在本公开可能采用术语第一、第二、第三等来描述各种信息,但这些信息不应限于这些术语。这些术语仅用来将同一类型的信息彼此区分开。例如,在不脱离本公开范围的情况下,第一信息也可以被称为第二信息,类似地,第二信息也可以被称为第一信息。取决于语境,如在此所使用的词语“如果”可以被解释成为“在……时”或“当……时”或“响应于确定”。
在本发明的描述中,需要理解的是,术语“纵向”、“横向”、“上”、“下”、“前”、“后”、“左”、“右”、“竖直”、“水平”、“顶”、“底”“内”、“外”等指示的方位或位置关系为基于附图所示的方位或位置关系,仅是为了便于描述本发明和简化描述,而不是指示或暗示所指的装置或元件必须具有特定的方位、以特定的方位构造和操作,因此不能理解为对本发明的限制。
在本发明的描述中,除非另有规定和限定,需要说明的是,术语“安装”、“相连”、“连接”应做广义理解,例如,可以是机械连接或电连接,也可以是两个元件内部的连通,可以是直接相连,也可以通过中间媒介间接相连,对于本领域的普通技术人员而言,可以根据具体情况理解上述术语的具体含义。
在后续的描述中,使用用于表示元件的诸如“模块”、“部件”或“单元”的后缀仅为了有利于本发明的说明,其本身并没有特定的意义。因此,“模块”与“部件”可以混合地使用。
参阅图1,为符合本发明一优选实施例中神经网络训练方法的流程示意图,在该实施例中,使用小层厚的CT设备扫描获取在Z向采样足够的投影数据后重建出第一类图像,利用小层厚的CT设备的扫描投影数据合成大层厚投影数据并重建出第二类图像。第二类图像作为神经网络的输入,第一类图像作为神经网络的输出进行训练,为校正风车伪影的神经网络的训练生成可用数据对。具体地,包括以下步骤:
S100:获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且薄层图像Img内不具有风车伪影;
采集CT设备(小层厚型,例如每排探测器模块的宽度为0.625mm)的探测器模块在Z轴方向上的扫描数据,并利用滤波反投影技术重建为薄层图像Img。
S200:合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1;
对薄层图像Im进行Z轴方向的线性或非线性插值,从而生成该第一厚层图像Img1,可以理解的是,由于薄层图像Img的扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,属于小层厚,因此,第一厚层图像Img1上无风车伪影或风车伪影得到极大的抑制(如图2b所示)
S300:合成第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;
在探测器模块的排方向上对第一投影数据Proj1作线性或非线性插值合成,从而生成较厚的层厚对应的投影数据为第二投影数据Proj2。
需要注意的是,无论采用何种方式,步骤S200和步骤S300中所用的合成方法需完全一致。
S400:基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,其中第二厚层图像Img2内具有风车伪影;
利用滤波反投影技术,将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,由于用于模拟大层厚的数据,因此可进一步模拟实际大层厚的欠采样的情况,从而该第二厚层图像Img2内具有风车伪影(如图2a所示)。
S500:以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对神经网络进行训练,从而实现了为校正风车伪影的神经网络的训练生成可用数据对。
一优选实施例中,步骤S100中,宽度阈值为0.625mm(归于小层厚的标准),预处理包括对扫描数据去除探测器偏移量、射束硬化(CT球管产生的x射线具有一定频谱宽度,由于连续能谱的x射线穿过人体后,低能量射线易被吸收,高能量射线较易穿过,在射线传播过程中,平均能量会变高,射线逐渐变硬,称之为射束硬化效应)等。步骤S200包括:
S210:基于以下算法合成薄层图像Img:
其中i=1,2…N,j=1,2,…N,分别表示每一薄层图像Img内的像素的行坐标和列坐标,N薄层图像Img的图像宽度,k=1,2,…M为每一薄层图像Img的顺序编号,M为薄层图像Img的图像张数,W为对薄层图像Img作线性或非线性的滤波时的滤波参数。
进一步地,步骤S300包括:
S310:基于以下算法合成第一投影数据Proj1:
其中,ch、row分别为第一投影数据Proj1在各角度投影内的通道方向坐标和排方向坐标,view为第一投影数据Proj1的投影角度编号,W为对第一投影数据Proj1作线性或非线性的滤波时的滤波参数,可与上述W一致。
一优选实施例中,当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度为薄层图像Img的探测器模块宽度的2倍时,W取2,例如第一投影数据Proj1在0.625mm的层厚的探测器模块上采集,则为了得到层厚如1.25mm的探测器模块的数据,W可以取为两个相邻排的平均滤波器,即
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍时,例如第一投影数据Proj1在0.625mm的层厚的探测器模块上采集,则为了得到层厚如1mm的探测器模块的数据,W可以取为相邻3排的加权平均值,则
或,
W也可根据sinc插值及采样得到(如图3所示)。当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍,且薄层图像Img的探测器模块的排数为P,而第一厚层图像Img1的探测器模块的排数为Q时,对第一投影数据Proj1傅里叶变换以得到P排第一投影数据Proj1,例如第一投影数据Proj1在0.625mm的层厚的16排探测器模块上采集,则为了得到层厚如1mm的10排探测器模块的数据,对位于P排第一投影数据Proj1中最外部的两边各(P-Q)/2(本实施例中为3)排数据作截取,并对截取后数据作反傅里叶变换后得到第二投影数据Proj2。
进一步地,而对合成所述薄层图像Img为第一厚层图像Img1时,当薄层图像Img的张数为M时,对每一沿着层厚方向快速傅里叶变换,并取每一经快速傅里叶变换后的薄层图像Img位于中间(本实施例中为)部分的数据沿着层厚方向反傅里叶变换以得到第一厚层图像Img1(该第一厚层图像Img1的所有层厚均为1mm)。
本发明还公开了一种用于去除CT伪影的神经网络训练系统,包括:重建模块,获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且薄层图像Img内不具有风车伪影;合成模块,合成薄层图像Img为第一厚层图像Img1,合成第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;重建模块基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,其中第二厚层图像Img2内具有风车伪影;以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对神经网络进行训练。
优选地,宽度阈值为0.625mm;预处理包括对扫描数据去除探测器偏移量、射束硬化;合成模块基于以下算法合成薄层图像Img:其中i=1,2…N,j=1,2,…N,分别表示每一薄层图像Img内的像素的行坐标和列坐标,N薄层图像Img的图像宽度,k=1,2,…M为每一薄层图像Img的顺序编号,M为薄层图像Img的图像张数,W为滤波参数。
或,当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍,且薄层图像Img的探测器模块的排数为P,而第一厚层图像Img1的探测器模块的排数为Q时,重建模块对第一投影数据Proj1傅里叶变换以得到P排第一投影数据Proj1;重建模块对位于P排第一投影数据Proj1中最外部的两边各(P-Q)/2排数据作截取,并对截取后数据作反傅里叶变换后得到第二投影数据Proj2。
优选地,当薄层图像Img的张数为M时,合成模块对每一薄层图像Img沿着层厚方向快速傅里叶变换,并取每一经快速傅里叶变换后的薄层图像Img位于中间部分的数据沿着层厚方向反傅里叶变换以得到第一厚层图像Img1。
应当注意的是,本发明的实施例有较佳的实施性,且并非对本发明作任何形式的限制,任何熟悉该领域的技术人员可能利用上述揭示的技术内容变更或修饰为等同的有效实施例,但凡未脱离本发明技术方案的内容,依据本发明的技术实质对以上实施例所作的任何修改或等同变化及修饰,均仍属于本发明技术方案的范围内。
Claims (10)
1.一种用于去除CT伪影的神经网络训练方法,其特征在于,包括以下步骤:
获取CT设备的扫描数据,对所述扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中所述扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且所述薄层图像Img内不具有风车伪影;
合成所述薄层图像Img为第一厚层图像Img1;
合成所述第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;
基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,其中所述第二厚层图像Img2内具有风车伪影;
以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对所述神经网络进行训练。
2.如权利要求1所述的神经网络训练方法,其特征在于,获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对所述扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中所述扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且所述薄层图像Img内不具有风车伪影的步骤中,
所述宽度阈值为0.625mm;
所述预处理包括对所述扫描数据去除探测器偏移量、射束硬化;
合成所述薄层图像Img为第一厚层图像Img1的步骤包括:
基于以下算法合成薄层图像Img:
其中i=1,2…N,j=1,2,…N,分别表示每一薄层图像Img内的像素的行坐标和列坐标,N薄层图像Img的图像宽度,k=1,2,…M为每一薄层图像Img的顺序编号,M为薄层图像Img的图像张数,W为滤波参数。
4.如权利要求3所述的神经网络训练方法,其特征在于,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度为薄层图像Img的探测器模块宽度的2倍时,W取2,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍时,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍,且薄层图像Img的探测器模块的排数为P,而第一厚层图像Img1的探测器模块的排数为Q时,对第一投影数据Proj1傅里叶变换以得到P排第一投影数据Proj1;
对位于P排第一投影数据Proj1中最外部的两边各(P-Q)/2排数据作截取,并对截取后数据作反傅里叶变换后得到第二投影数据Proj2。
6.一种用于去除CT伪影的神经网络训练系统,其特征在于,包括:
重建模块,获取CT设备的探测器模块于Z轴方向的扫描数据,对所述扫描数据预处理后形成第一投影数据Proj1,并基于滤波反投影将第一投影数据Proj1重建为薄层图像Img,其中所述扫描数据采集于Z轴方向内小于一宽度阈值的探测器模块,且所述薄层图像Img内不具有风车伪影;
合成模块,合成所述薄层图像Img为第一厚层图像Img1,合成所述第一投影数据Proj1为第二投影数据Proj2;
重建模块基于滤波反投影将第二投影数据Proj2重建为第二厚层图像Img2,其中所述第二厚层图像Img2内具有风车伪影;
以第二厚层图像Img2作为神经网络的输入,第一厚层图像Img1作为神经网络的输出对所述神经网络进行训练。
9.如权利要求8所述的神经网络训练系统,其特征在于,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度为薄层图像Img的探测器模块宽度的2倍时,W取2,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍时,则
或,
当第一厚层图像Img1的探测器模块宽度不为薄层图像Img的探测器模块宽度的整数倍,且薄层图像Img的探测器模块的排数为P,而第一厚层图像Img1的探测器模块的排数为Q时,重建模块对第一投影数据Proj1傅里叶变换以得到P排第一投影数据Proj1;
重建模块对位于P排第一投影数据Proj1中最外部的两边各(P-Q)/2排数据作截取,并对截取后数据作反傅里叶变换后得到第二投影数据Proj2。
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