CN114026094A - Prmt5抑制剂 - Google Patents

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V·P·帕勒
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Abstract

本发明涉及式(I)的取代核苷类似物、其药学上可接受的盐和用于治疗与PRMT5酶过表达相关的疾病、病症或病症的药物组合物。本发明还涉及治疗与PRMT5酶过表达相关的疾病、病症或疾患的方法。

Description

PRMT5抑制剂
技术领域
本发明涉及式(I)的取代核苷类似物、其药学上可接受的盐和用于治疗与PRMT5酶过表达相关的疾病、病症或疾患的药物组合物。本发明还涉及治疗与PRMT5酶过表达相关的疾病、病症或疾患的方法。
相关申请的交叉引用
本申请要求在2019年6月10日提交的印度临时专利申请IN201921022971和在2019年6月10日提交的IN201921022972的权益,出于所有目的将其公开内容通过引用整体并入本文。
技术背景
蛋白质甲基化是一种常见的翻译后修饰,其影响蛋白质的活性及其与其他生物分子的相互作用。N-甲基化通常发生在精氨酸、赖氨酸和组氨酸残基的氮原子上,并且催化甲基化反应的酶有不同的家族,每个酶对将被甲基化的氨基酸残基是特异性的。
一个家族的9种酶,称为蛋白质精氨酸N-甲基转移酶(PRMTs),负责精氨酸的胍基的甲基化。精氨酸的胍基带有2个末端氮原子,可进行单甲基化或二甲基化。根据二甲基化的类型,酶进一步分为I型或II型。I型PRMTs催化单甲基化或不对称二甲基化,而II型酶催化对称二甲基化。一些进行甲基化的底物是组蛋白、Sm、核糖核蛋白、MRE11和p53结合蛋白1。
精氨酸侧链的甲基化在多种细胞功能中起重要作用,所述细胞功能包括转录激活以及转录抑制、mRNA翻译、前mRNA剪接、蛋白质运输和信号转导。它也发生在无数的基底上。因此,PRMTs的酶活性影响细胞过程,如细胞增殖、受损DNA的修复以及细胞周期和细胞死亡。已有研究表明PRMT酶介导的超甲基化导致某些疾病,如癌症(Nature Reviews Cancer2013,13,p37;Cell and Molecular Life Sciences 2015,72,p2041;Trends inBiochemical Sciences 2011,36,p633)。
目前,研究最多的II型酶是PRMT5,其在真核生物中是保守的。PRMT5的过表达与致癌作用有关,并且在几种人类恶性肿瘤中会降低患者的存活率(Cell Mol Life Sci.,2015,72,p2041)。PRMT5与癌症中经常失调或突变的蛋白直接相互作用,因此成为一种推定的致癌基因(Mol Cell Biol,2008,28,p6262)。PRMT5介导的肿瘤抑制基因如p53、RB-1、ST7的转录抑制,或细胞周期蛋白D1、CDK4、CDK6、eLF4E、MITF、FGFR3的上调与实体瘤和血液恶性肿瘤中的肿瘤发生相关。PRMT5位于细胞核以及细胞质中,并且其过表达与多种癌症相关,所述癌症包括但不限于多形性胶质母细胞瘤(Oncogene,2017,36,p263)、前列腺癌(Oncogene,2017,36,p1223)和胰腺癌(Science,2016,351,p1214)、套细胞淋巴瘤(NatureChemical Biology,2015,11,p432)、非霍奇金淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤(Journal ofBiological Chemistry,2013,288,p35534)、急性骨髓性白血病(Leukemia,2018,32,p499)、急性淋巴细胞白血病(AACR;Cancer Research 2017;77(13Suppl):Abstract nr1128)、多发性骨髓瘤(Leukemia,2018,32,p996)、非小细胞肺癌(The BiochemicalJournal,2012,446,p235)、小细胞肺癌(AACR;Cancer Research 2017;77(13Suppl):Abstract nr DDT02-04),乳腺癌(Cell Reports,2017,21,p3498)、三阴性乳腺癌(AACR;Cancer Res 2015;75(15Suppl):Abstract nr 4786)、胃癌(International Journal ofOncology,2016,49,p1195),结直肠癌(Oncotarget,2015,6,p22799)、卵巢癌(J HistochemCytochem 2013,61,p206)、膀胱癌(Clinical Cancer Research,2018,CCR-18-1270)、肝细胞癌(Oncology Reports,2018,,p536)、黑色素瘤(PLoS One,2013,8,e74710;J ClinInvest.2018,128,p517)、肉瘤(Oncology Letters,2018,16,p2161)、口咽鳞状细胞癌(Oncotarget,2017,8,p14847)、慢性粒细胞白血病(J Clin Invest,2016,126,p3961)、表皮鳞状细胞癌(Carcinogenesis,2017,38,p827),鼻咽癌(Oncology Reports,2016,35,p1703)、神经母细胞瘤(Molecular Oncology,2015,9,p617)、子宫内膜癌(GynecolOncol.,2016,140,p145)、宫颈癌(Pharmazie,2018,73,p269)。这些发现导致了进一步研究,表明抑制PRMT5会降低细胞增殖(Molecular and Cellular Biology 2008,28,p6262,The Journal of Biological Chemistry 2013,288,p35534)。
精氨酸甲基转移酶的抑制剂在2004年首次由Cheng等人在Journal ofBiological Chemistry-Vol.279(23),p.23892中公开。从那时起,已经公开了对I型或II型精氨酸甲基转移酶具有更高选择性的各种其它化合物和物质。公开了作为PRMT5抑制剂的小分子的其它出版物是:WO2011077133,WO2011079236,WO2014100695,WO2014100716,WO2014100719,WO2014100730,WO2014100734,WO2014128465,WO2014145214,WO2015200677,WO2015200680,WO2015198229,WO2016022605,WO2016034671,WO2016034673,WO2016034675,WO2016038550,WO2016135582,WO2016145150,WO2016178870,WO2017032840,WO2018160824,WO2018152501,WO2018085818,WO2018065365and ACS Medicinal Chemistry Letters 2015,6,p408。
发明内容
根据一个方面,本发明提供通式(I)的化合物,其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003402377930000031
其中,
L1选自键,-CRaRb-,-NRa-,S,and O;
Ra和Rb在每次出现时独立地选自氢、取代或未取代的烷基、和取代或未取代的环烷基;
环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure BDA0003402377930000032
Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure BDA0003402377930000033
R选自-NR4R5、氢、取代或未取代的烷基和环烷基;
Z选自CR10和N;
R1和R2与它们所连接的碳原子一起形成键以形成-C=C-;或R1和R2与它们所连接的碳原子一起形成环丙烷环;
R2'和R2a可以相同或不同,独立选自氢和取代或未取代的烷基;
R3每次出现时独立选自卤素、氰基、硝基、取代或未取代的烷基、-OR6、-NR7R8、取代或未取代的环烷基、-C(O)OH、-C(O)O-烷基、-C(O)R9、-C(O)NR7R8、-NR7C(O)R9、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基和取代或未取代的杂环基;
R4和R5独立选自氢、取代或未取代的烷基、和取代或未取代的环烷基;
R6选自氢、取代或未取代的烷基、和取代或未取代的环烷基;
R7和R8独立选自氢、取代或未取代的烷基、和取代或未取代的环烷基;
R9选自取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R10选自氢、卤素、取代或未取代的烷基;
“n”是0-4的整数,包括两个端点;
“m”是0-1的整数,包括两个端点;
当烷基被取代时,其被1至4个独立选自以下的取代基取代:-氧代(=O)、卤素、氰基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、-OR7a、-C(=O)OH、-C(=O)O(烷基)、-NR8aR8b、-NR8aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b
当杂芳基被取代时,其被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当杂环基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当芳基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当环烷基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
R7a选自氢、烷基、卤代烷基和环烷基;
R8a和R8b各自独立选自氢、烷基和环烷基;以及
R9a选自烷基和环烷基。
下面阐述的本发明的一个或多个实施例的细节本质上仅是说明性的,而不是要限制本发明的范围。本发明的其它特征、目的和优点将从说明书和权利要求书中显而易见。
根据一种实施方式,本发明提供具有式(II)结构的化合物,其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003402377930000051
其中,
环A、Hy、L1、R2a、R2'、Ra、Rb、R3和n如上文所定义。
根据一个实施方式,本发明提供具有式(IIa)结构的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003402377930000052
其中,L1、R2a、R2'、Ra、Rb、R3、R10和n如上文所定义。
根据另一个实施方式,本发明提供了具有式(III)结构的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003402377930000053
其中,
环A、Hy、L1、R2a、R2'、Ra、Rb、R3和n如上文所定义。
在本发明上述任一实施方式中,R3每次出现时独立选自卤素、取代或未取代的烷基和-NR7R8
在某些实施方式中,R3独立地选自F、Cl、Br、-NH2、-CH3和-CH(F)2
在本发明上述任一实施方式中,L1选自-CH2-或-NH-。
在本发明上述任一实施方式中,Ra、Rb、R2'和R2a独立为氢或甲基。
在某些实施方式中,Ra、Rb、R2'和R2a为氢。
根据本发明的一个实施方式,环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure BDA0003402377930000061
根据本发明的一个实施方式,Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure BDA0003402377930000062
根据本发明的一个实施方式,R10选自氢、-F和甲基。
在本发明的某些实施方式中,Hy选自,
Figure BDA0003402377930000063
在本发明的上述任一实施方式中,Ra、Rb、R2'和R2a独立地为氢或甲基;L1选自-CH2-或-NH-;环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure BDA0003402377930000071
R3在每次出现时独立地选自卤素、取代或未取代的烷基和-NR7R8;Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy选自式(A-1)至(h-1)时,条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure BDA0003402377930000072
其中R选自-NR4R5、氢和取代或未取代的烷基;Z选自CR10和N;R10选自氢、卤素、取代或未取代的烷基;R4和R5独立选自氢和取代或未取代的烷基;R6选自氢和取代或未取代的烷基;“n”是0-4的整数,包括两个端点;“m”是0-1的整数,包括两个端点。
本文给出的实施例1-30是代表性的化合物,其本质上仅是说明性的,而不是要限制本发明的范围。
应当理解,式(I)、(II)、(IIa)和(III)在结构上包括所有适用的立体异构体和同位素以及可从本文一般描述的化学结构预期的药学上可接受的盐。
根据一个实施方式,提供了式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体,其中所述化合物为游离碱的形式或是其药学上可接受的盐。
在本发明的另一个方面,提供了用于治疗与PRMT5酶相关的疾病、病症、综合征或疾患的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐。
在本发明的一个实施方式中,提供了式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐,其用于通过抑制PRMT5酶来治疗疾病、病症、综合征或疾患。
在本发明的另一个方面,提供了用作药物的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体、或其药学上可接受的盐。
在本发明的另一个方面,提供了式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体、或其药学上可接受的盐,其用于治疗与PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患。
在本发明的一个实施方式中,提供了式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学可接受的盐,其用于通过抑制PRMT5治疗疾病、病症、综合征或疾患。
在本发明的另一个方面,提供了通过使用选自式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐来抑制PRMT5的方法。
在本发明的另一个方面,提供通过使用选自式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物治疗PRMT5相关的疾病、病症或疾患的方法。
在本发明的另一个方面,治疗与PRMT5相关的疾病、病症或疾患的方法,与PRMT5相关的疾病、病症或疾患选自多形性胶质母细胞瘤、前列腺癌和胰腺癌、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤、急性髓性白血病、急性淋巴母细胞性白血病、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、乳腺癌、三阴性乳腺癌、胃癌、结肠直肠癌、卵巢癌、膀胱癌、肝细胞癌、黑素瘤、肉瘤、口咽鳞状细胞癌、慢性髓性白血病、表皮鳞状细胞癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、子宫内膜癌和宫颈癌。
在本发明的另一个方面,提供选自式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学可接受的盐在用于制备治疗PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患的药物的用途。
在另一方面,本发明提供一种药物组合物,其包含至少一种式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐和至少一种药学上可接受的赋形剂。
在另一个方面,本发明提供一种药物组合物,其包含治疗有效量的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐,用于通过给予有需要的受试者来治疗与PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患。
在本发明的另一方面,与PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患选自多形性胶质母细胞瘤、前列腺癌和胰腺癌、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤、急性髓性白血病、急性淋巴母细胞性白血病、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、乳腺癌、三阴性乳腺癌、胃癌、结肠直肠癌、卵巢癌、膀胱癌、肝细胞癌、黑素瘤、肉瘤、口咽鳞状细胞癌、慢性髓性白血病、表皮鳞状细胞癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、子宫内膜癌和宫颈癌。
在本发明的另一个实施方式中,所述化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐是:
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物1);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-氨基-7-氯-1,5-萘啶-3-基)乙基)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物2);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(3-氨基喹喔啉-6-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物3);
(1R,2R,3S,4R,5S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-1-(2-(3-氨基喹喔啉-6-基)乙基)二环[3.1.0]己烷-2,3-二醇(化合物4);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物5);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-氨基-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物6);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(((6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)氧基)甲基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物7);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物8);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物9);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物10);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(5-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物11);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(((6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)氧基)甲基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物12);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物13);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物14);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物15);
4-氨基-1-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)嘧啶-2(1H)-酮(化合物16);
6-氨基-3-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)嘧啶-4(3H)-酮(化合物17);
3-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)-6-甲基嘧啶-4(3H)-酮(化合物18);
6-氨基-3-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)-5-氟嘧啶-4(3H)-酮(化合物19);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-氯-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物20);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(5,6-二氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物21);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-4-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物22A和B);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-3-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物23A和B);
(1R,2R,3S,4R,5S)-1-(2-(6-氨基-7-氯-1,5-萘啶-3-基)乙基)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)二环[3.1.0]己烷-2,3-二醇(化合物24);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物25);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-溴喹啉-7-基)乙基)-5-(7H-咪唑并[1,2-c]吡咯并[3,2-e]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物26);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(7H-咪唑并[1,2-c]吡咯并[3,2-e]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物27);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯喹啉-7-基)乙基)-5-(8H-咪唑并[1,2-a]吡咯并[2,3-d]嘧啶-8-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物28);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(7H-咪唑并[1,2-c]吡唑并[4,3-e]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物29);以及
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-(甲氧基氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物30)。
在本发明的另一个实施方式中,所述化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐是:
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物1);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物5);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-氨基-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物6);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物10);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物13);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物14);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物15);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-4-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物22A和B);以及
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-3-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物23A和B)。
本发明具体实施方式:
除非另有说明,否则说明书和权利要求书中使用的以下术语具有以下给出的含义。
为了解释说明书,将应用以下定义,并且在任何适当的时候,以单数使用的术语也将包括复数,反之亦然。
术语“卤素”或“卤代”是指氟、氯、溴或碘。
术语“烷基”是指烷烃衍生的烃基,其在主链中仅包括碳和氢原子,不含不饱和度,具有1至6个碳原子,并且通过单键与分子的其余部分连接,例如(C1-C6)烷基或(C1-C4)烷基,代表性基团包括例如甲基、乙基、正丙基、1-甲基乙基(异丙基)、正丁基、正戊基等。除非相反地陈述或叙述,本文描述或要求保护的所有烷基可以是直链或支链的。
术语“卤代烷基”是指被一个或多个如上定义的卤素原子取代的如上定义的烷基。例如(C1-C6)卤代烷基或(C1-C4)卤代烷基。合适地,卤代烷基可以是单卤代烷基、二卤代烷基或多卤代烷基,包括全卤代烷基。单卤代烷基可以具有一个碘、溴、氯或氟原子。二卤代烷基和多卤代烷基可以被两个或多个相同的卤素原子或不同卤素原子的组合取代。合适地,多卤代烷基被至多12个卤原子取代。卤代烷基的非限制性实例包括氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氯甲基、二氯甲基、三氯甲基、五氟乙基、七氟丙基、二氟氯甲基、二氯氟甲基、二氟乙基、二氟丙基、二氯乙基、二氯丙基等。全卤代烷基是指所有氢原子被卤原子取代的烷基。除非相反地提出或叙述,本文描述或要求保护的所有卤代烷基可以是直链或支链的。
术语“环烷基”是指具有3-12个碳原子的非芳族单环或多环环系,例如(C3-C10)环烷基、(C3-C6)环烷基、环丙基、环丁基、环戊基、环己基等。多环环烷基的实例包括但不限于全氢萘基、金刚烷基和降冰片基、桥环基或螺二环基,例如螺(4,4)壬-2-基(spiro(4,4)non-2-yl)等。
术语“芳基”是指具有6-14个碳原子的芳族基团,包括单环、双环和三环芳族体系,例如苯基、萘基、四氢萘基、茚满基和联苯基等。
除非另有说明,术语“杂环”或“杂环基环”或“杂环基”是指取代或未取代的非芳香族3至15元环,其由碳原子组成并且具有一个或多个独立地选自N、O或S的杂原子。杂环可以是单环、双环或三环环系,其可以包括稠合的、桥接的或螺环系,并且杂环中的氮、碳、氧或硫原子可以任选地被氧化成各种氧化态。此外,氮原子可任选被季铵化,杂环或杂环基可任选含有一个或多个烯键,并且杂环或杂环基中的一个或两个碳原子可被-CF2-、-C(O)-、-S(O)-、S(O)2等间隔。另外,杂环也可以与芳环稠合。杂环的非限制性实例包括氮杂环丁烷基、苯并吡喃基、色满基、十氢异喹啉、二氢吲哚基、异二氢吲哚基、异色满基、异噻唑烷基、异恶唑烷基、吗啉基、恶唑啉基、恶唑烷基、2-氧代哌嗪基、2-氧代哌啶基、2-氧代吡咯烷基、2-氧氮杂基(2-oxoazepinyl)、八氢吲哚基、八氢异吲哚基、全氢氮杂基(perhydroazepinyl)、哌嗪基、4-哌啶基酮基、吡咯烷基、哌啶基、吩噻嗪基、吩恶嗪基、奎宁环基、四氢庚烯醇基、四氢呋喃基、四氢吡喃基、噻唑啉基、噻唑烷基、噻吗啉基、硫胺啉基亚砜(thiamorpholinylsulfoxide)、硫胺啉基硫吲哚(thiamorpholinylsulfoneindoline)、苯并二恶唑、四氢喹啉、四氢苯并吡喃等。杂环可以连接杂环的任何原子,从而产生稳定的结构。
除非另有说明,术语“杂芳基”是指具有一个或多个独立地选自N、O或S的杂原子的取代或未取代的5元至14元芳族杂环。杂芳基可以是单、双或三环系统。杂芳基环可以连接杂芳基环的任何原子,从而产生稳定结构。杂芳基环的非限制性实例包括噁唑基、异噁唑基、咪唑基、呋喃基、吲哚基、异吲哚基、吡咯基、三唑基、三嗪基、四唑基、噻吩基、噻唑基、异噻唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、苯并呋喃基、苯并噻唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、苯并噻吩基、咔唑基、喹啉基、异喹啉基、喹唑啉基、噌啉基、萘啶基、蝶啶基、嘌呤基、喹喔啉基、喹啉基、异喹啉基、噻二唑基、中氮茚基、吖啶基、吩嗪基、酞嗪基等。
本发明的化合物可以具有一个或多个手性中心。每个手性中心的绝对立体化学可以是‘R’或‘S’。本发明的化合物包括所有非对映体和对映体及其混合物。除非另有具体说明,提及一种立体异构体适用于任何可能的立体异构体。无论何时未指明立体异构组成,应理解包括所有可能的立体异构体。
术语“立体异构体”是指由相同原子通过相同的键连接而组成的化合物,但具有不可互换的不同的三维结构。三维结构被称为构型。本文所用的术语“对映体”是指分子彼此不能重叠镜像的两种立体异构体。术语“手性中心”是指连接四个不同基团的碳原子。本文所用的术语“非对映异构体”是指不是对映体的立体异构体。术语“外消旋体”或“外消旋混合物”是指等份对映体的混合物。
术语“治疗”或“医治”一种状态、病症或病状包括:(a)预防或延迟可能患有或易患所述状态、病症或病况但尚未经历或显示所述状态、病症或病况的临床或亚临床症状的受试者中发展的所述状态、病症或病况的临床症状的出现;(b)抑制所述状态、病症或病况,即阻止或减少所述疾病或其至少一种临床或亚临床症状的发展;c)减轻疾病、病症或症状或至少一种其临床或亚临床症状,或(d)缓解疾病,即,使状态、病症或症状或至少一种其临床或亚临床症状消退。
术语“抑制剂”是指与酶结合以部分或完全抑制所述酶的活性的分子。
术语“受试者”包括哺乳动物(尤其是人)和其它动物,例如家畜(例如,家庭宠物,包括猫和狗)和非家畜(例如野生动物)。
“治疗有效量”是指当给予受试者用于治疗疾病、病症或疾患时足以在受试者中引起效果的化合物的量,这是给药的目的。“治疗有效量”将根据化合物、疾病及其严重性和待治疗受试者的年龄、体重、身体状况和反应性而变化。
药学上可接受的盐
本发明的化合物可以与酸或碱形成盐。本发明的化合物可以是足够碱性或酸性的,以形成稳定的无毒酸或碱盐,以药学上可接受的盐形式给予该化合物可能是合适的。药学上可接受的盐的非限制性实例是通过加入酸形成的无机、有机酸加成盐,包括盐酸盐。药学上可接受的盐的非限制性实例是通过加入碱形成的无机、有机碱加成盐。本发明的化合物还可以与氨基酸形成盐。药学上可接受的盐可以使用本领域熟知的标准方法获得,例如通过使足够碱性的化合物如胺与合适的酸反应。
通过使用本文下文提及的各种体外和体内方案或本领域已知的方法,可以实现本发明化合物对PRMT5抑制活性的筛选。
药物组合物
本发明涉及含有本文公开的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物。尤其是,药物组合物含有治疗有效量的至少一种本文所述的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物和至少一种药学上可接受的赋形剂(例如载体或稀释剂)。优选地,所考虑的药物组合物包括本文所述的化合物,当给予受试者时,其量足以抑制PRMT5以治疗本文所述的疾病。
所考虑的受试者包括例如活细胞和哺乳动物,包括人。本发明的化合物可以与药学上可接受的赋形剂(例如载体或稀释剂)结合,或被载体稀释,或被包封在载体内,所述载体可以是胶囊、小袋、纸或其它容器的形式。药学上可接受的赋形剂包括本身不诱导产生对接受组合物的个体有害的抗体的药剂,并且其可以在没有过度毒性的情况下施用。
合适的载体或赋形剂的实例包括但不限于水、盐溶液、醇、聚乙二醇、聚羟基乙氧基化蓖麻油、花生油、橄榄油、明胶、乳糖、石膏粉、蔗糖、糊精、碳酸镁、糖、环糊精、直链淀粉、硬脂酸镁、滑石、明胶、琼脂、果胶、阿拉伯胶、硬脂酸或纤维素的低级烷基醚、水杨酸、脂肪酸、脂肪酸胺、脂肪酸单甘油酯和二甘油酯、季戊四醇脂肪酸酯、聚氧乙烯、羟甲基纤维素和聚乙烯吡咯烷酮。
药物组合物还可以包括一种或多种药学上可接受的助剂、润湿剂、乳化剂、悬浮剂、防腐剂、用于影响渗透压的盐、缓冲剂、甜味剂、调味剂、着色剂或前述的任意组合。本发明的药物组合物可以通过使用本领域已知的方法配制以便在向受试者施用后提供活性成分的快速、持续或延迟释放。
本文所述的药物组合物可以通过本领域已知的常规技术制备。例如,活性化合物可以与载体混合,或被载体稀释,或包封在载体中,其可以是安瓿、胶囊、小药囊、纸或其它容器的形式。当载体用作稀释剂时,其可以是固体、半固体或液体材料,其充当活性化合物的媒介物、赋形剂或介质。活性化合物可以吸附在颗粒状固体容器上,例如在小药囊中。
药物组合物可以是常规形式,例如胶囊、片剂、囊片、口腔崩解片、气雾剂、溶液、悬浮液或局部施用的产品。
给药途径可以是将本发明的活性化合物有效转运至适当或所需作用位点的任何途径。合适的给药途径包括但不限于口服、经口吸入、经鼻、经肺、经颊、皮下、皮内、经皮、肠胃外、经直肠、经储库、经皮下、经静脉内、经尿道内、经肌内、经鼻、经眼(例如用眼用溶液)或局部(例如用局部软膏)。
固体口服制剂包括但不限于片剂、囊片、胶囊(软或硬明胶)、口腔崩解片剂、糖衣丸(含有粉末或丸剂形式的活性成分)、片剂和锭剂(lozenges)。具有滑石和/或碳水化合物载体或粘合剂等的片剂、糖衣丸或胶囊特别适合于口服应用。液体制剂包括但不限于糖浆、乳剂、混悬液、溶液、软明胶和无菌可注射液体,例如水性或非水性液体混悬液或溶液。对于肠胃外应用,特别合适的是注射溶液或悬浮液,优选活性化合物溶解在多羟基化蓖麻油中的水溶液。
药物制剂优选是单位剂型。在这种形式中,制剂被细分成含有适量活性组分的单位剂量。单位剂型可以是包装的制剂,该包装含有离散量的制剂,例如袋装片剂、胶囊和小瓶或安瓿中的粉末。此外,单位剂型可以是胶囊、片剂、囊片、扁囊剂或锭剂本身,或者其可以是适当数量的任何这些包装形式。
对于向受试患者给药,本发明化合物的总日剂量当然取决于给药方式。例如,口服给药可能需要比静脉内(直接进入血液)更高的总日剂量。根据活性成分的效力或给药方式,单位剂量制剂中活性成分的量可以在口服给药0.1mg至1000mg和吸入给药1μg至5000μg之间变化或调整。
相关领域的技术人员可以确定用于治疗本文所述的疾病和病症的化合物的合适剂量。治疗剂量通常是基于源自动物研究的初步证据通过受试者的剂量范围研究来确定的。剂量必须足以产生所需的治疗效果而不引起对患者的不期望的副作用。例如,PRMT5抑制剂口服给药的日剂量可为约0.1至约30.0mg/kg。给药方式、剂型、合适的药物赋形剂、稀释剂或载体也可以被本领域技术人员充分使用和调整。所预想的所有变化和修改都在本发明的范围内。
治疗方法
本发明提供了作为蛋白精氨酸甲基转移酶-5(PRMT5)抑制剂的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物及其药物组合物,用于治疗与PRMT5过表达相关的疾病、病症或疾患。本发明还提供通过给予有需要的受试者治疗有效量的本发明化合物或药物组合物,在受试者中治疗与PRMT5过表达相关的疾病、病症或疾患的方法。
在另一个方面,本发明涉及治疗与PRMT5过表达相关的疾病、病症或疾患的方法。在该方法中,向需要这种治疗的受试者施用治疗有效量的如本文所述的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物或其药学上可接受的盐。
在本发明的一个实施方案中,与PRMT5过表达相关的疾病、病症或疾患是癌症。
在另一个实施方案中,本发明提供了治疗癌症的方法,特别是多形性胶质母细胞瘤、前列腺癌、胰腺癌、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤、急性髓性白血病、急性淋巴母细胞性白血病、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、乳腺癌、三阴性乳腺癌、胃癌、结肠直肠癌、卵巢癌、膀胱癌、肝细胞癌、黑素瘤、肉瘤、口咽鳞状细胞癌、慢性髓性白血病、表皮鳞状细胞癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、子宫内膜癌和宫颈癌。
应当理解,本发明包括用于治疗本文提及的疾病或病症的式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物或其药学上可接受的盐。
应当理解,本发明包括式(I)、(II)、(IIa)和(III)的化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗本文提及的疾病或病症的药物中的用途。
一般制备方法
本文所述式的化合物可以通过本领域已知的技术制备。此外,本文所述的式的化合物可以通过按照下面提供的方案中描述的反应顺序制备。此外,在下列方案中,其中提及了具体的碱、酸、试剂、溶剂、偶联剂等,应理解,也可使用本领域已知的其它碱、酸、试剂、溶剂、偶联剂等,因此包括在本发明的范围内。如本领域已知的,可以使用的反应条件例如温度和/或反应持续时间的变化也在本发明的范围内。除非另有说明,否则这些流程中描述的式的化合物的所有异构体也包括在本发明的范围内。
方案1:
Figure BDA0003402377930000161
方案1说明了式9化合物的合成。按照Purinetrg Signalling(2015)11:371-387中描述的方法,在膦如但不限于PPh3(三苯基膦)存在下,用各种偶氮二羧酸酯试剂如但不限于DEAD(偶氮二羧酸二乙酯)或DIAD(偶氮二羧酸二异丙酯)使式1化合物与式2化合物进行光延反应,得到式3化合物。通常这些反应在醚溶剂如THF(四氢呋喃)、MeTHF(甲基四氢呋喃)、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用氟离子如但不限于氟化铵、TBAF(四正丁基氟化铵)处理式3化合物,生成式4化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-40℃的温度下进行。在膦如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂如但不限于DEAD或DIAD,使式4化合物与式5化合物(PG1是保护基如但不限于对甲氧基苄基)进行光延反应,得到式6化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。将式6化合物的苯甲酰基去保护,可以用试剂如但不限于NH3(氨)进行,得到式7化合物。通常这些反应可以在醇溶剂如MeOH(甲醇)、EtOH(乙醇)或类似溶剂中,在0-25℃的温度下。在碱例如但不限于DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、DIPEA(N,N-二异丙基乙胺)、NEt3(三乙胺)的存在下,用各种芳基磺酰卤如但不限于2,4,6-三异丙基苯磺酰氯活化式7化合物,随后用NH3取代可以形成式8的化合物。用酸例如但不限于HCl或TFA(三氟乙酸)使式8化合物脱保护得到式9化合物。通常,这些反应在25-50℃的温度下进行。每个步骤的化合物都可以通过标准技术纯化,例如柱色谱、结晶、反相HPLC(高效液相色谱)或SFC(超临界流体色谱)。
方案2:
Figure BDA0003402377930000171
方案2说明了式14化合物的合成。在膦例如但不限于PPh3的存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式1化合物与式10化合物进行光延反应,得到式11化合物。这些反应通常在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用氟离子例如但不限于氟化铵、TBAF处理式11化合物,生成式12化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-40℃的温度下进行。在膦如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂如但不限于DEAD或DIAD,使式12化合物与式5化合物进行光延反应,得到式13化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用酸如但不限于HCl或TFA使式13化合物脱保护,得到式14化合物。通常,这些反应在25-50℃的温度下进行。每个步骤的化合物都可以用标准技术纯化,如柱层析、结晶、反相高效液相色谱或SFC。
方案3:
Figure BDA0003402377930000181
方案-3说明了式21化合物的合成。在膦例如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式1化合物与式15化合物进行光延反应,得到式16化合物。通常这些反应在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用氟离子例如但不限于氟化铵、TBAF处理式16化合物,生成式17化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-40℃的温度下进行。在膦如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂如但不限于DEAD或DIAD,使式17化合物与式5化合物进行光延反应,通常得到式18化合物。这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0℃-25℃的温度下进行。用aq.NH3处理式18化合物可得到式20化合物。通常,这些反应在醚溶剂如二噁烷中在120-170℃的温度下在钢制反应釜中进行。用酸例如但不限于HCl或TFA将式20化合物脱保护,得到式21化合物。通常,这些反应在25-50℃的温度下进行,每一步骤的化合物可通过标准技术例如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案4:
Figure BDA0003402377930000191
方案4说明了式30化合物的合成。在膦例如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式1化合物与式22化合物(X=-Cl,-Br)进行光延反应,得到式23化合物。通常这些反应在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用氟离子例如但不限于TBAF处理式23化合物,生成式24化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-40℃温度下进行。用各种氧化剂如但不限于戴斯-马丁试剂氧化式24化合物可得到式25化合物。通常这些反应可在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃至40℃温度下进行。在碱如但不限于KOtBu、NaOtBu、LiHMDS、NaHMDS或KHMDS存在下,当用试剂如但不限于甲基三苯基溴化鏻处理式25化合物时,得到式26化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-25℃温度下进行。式28的化合物可通过式26的化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式27化合物(Y=-Br,-I)的存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成,其通过遵循WO2012002577 A1中报道的方法合成,然后形成N-氧化物,用磷酰氯氯化,然后用PMB-NH2或J.Med.Chem,2017,60(9),3958-3978)进行亲核取代。通常,这些反应在醚类溶剂(如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂)中进行,并在25-70℃的温度下进行。式28化合物(其中R4和R5如上文所定义)在用式19化合物处理后得到式29化合物。通常,这些反应在醚类溶剂例如二恶烷中在120-170℃的温度下在钢制反应釜中进行。用酸例如但不限于HCl或TFA,使式29化合物的丙酮化物脱保护,得到式30化合物。通常,这些反应在25-50℃的温度下进行。每个步骤的化合物都可以通过标准技术纯化,例如柱色谱、结晶、反相HPLC或SFC。
方案5:
Figure BDA0003402377930000201
方案5说明了式39化合物的合成。式1化合物可以在碱例如但不限于NEt3、DIPEA等存在下,用各种磺酰氯例如但不限于MsCl、TsCl等处理,得到式31化合物。这些反应通常在卤化溶剂例如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。式33化合物可以通过在碱例如但不限于NaH、LiH等存在下,用式32化合物亲核取代式31化合物来合成。通常这些反应在溶剂例如DMF、DMAc、NMP或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。式34化合物在碱例如但不限于NEt3、DIPEA、DMAP等存在下,在0-25℃的温度下用酸酐例如但不限于(Boc)2O处理来制备。通常,这些反应在醚类溶剂中进行,例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂。式35化合物是在用氟离子例如但不限于TBAF处理式34化合物后形成的。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-25℃温度下进行。用各种氧化剂如但不限于戴斯-马丁试剂氧化式35化合物可得到式36化合物。通常,这些反应在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-25℃温度下进行。在碱如但不限于KOtBu、NaOtBu、LiHMDS、NaHMDS或KHMDS存在下,当用试剂如但不限于甲基三苯基溴化鏻处理式36化合物时,得到式37化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0-25℃温度下进行。式38的化合物可以通过用合适的硼烷例如但不限于9-BBN处理式37的化合物,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式27化合物(Y=-Br,-I)的存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3,其通过遵循WO2012002577 A1中报道的方法合成,然后形成N-氧化物,用磷酰氯氯化,然后用PMB-NH2或J.Med.Chem,2017,60(9),3958-3978)进行亲核取代。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在25-70℃的温度下进行。用酸如但不限于HCl/MeOH或TFA,使式38化合物的丙酮化物脱保护,得到式39化合物。通常这些反应在25-50℃的温度下进行,每一步化合物可通过标准技术如柱色谱、结晶、反相HPLC或手性HPLC或SFC纯化。
方案6:
Figure BDA0003402377930000211
方案6说明了式48化合物的合成。式1化合物(其中PG=保护基如TBDPS)按照Purinetrig Signalling(2015)11:371-387中所描述的方法制备。在膦例如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式1化合物与式40化合物(X=-Cl,-Br)进行光延反应,得到式41化合物。通常,这些反应在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用氟离子例如但不限于TBAF、氟化铵处理式41化合物,生成式42化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-40℃温度下进行。用各种氧化剂如但不限于戴斯-马丁试剂氧化式42化合物可得到式43化合物。通常这些反应可在卤化溶剂如CH2Cl2 CHCl3或类似溶剂中在0℃-40℃温度下进行。在碱如但不限于KOtBu、NaOtBu、LiHMDS、NaHMDS或KHMDS存在下,当用试剂如但不限于甲基三苯基溴化鏻处理式43化合物时,得到式44化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-25℃温度下进行。式45的化合物可以通过式44的化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化,然后在Pd催化剂例如但不限于但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式27化合物(Y=-Br,-I)的存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成,其通过遵循WO2012002577 A1中报道的方法合成,然后形成N-氧化物,用磷酰氯氯化,然后用PMB-NH2或J.Med.Chem,2017,60(9),3958-3978)进行亲核取代。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在25-70℃的温度下进行。用式46化合物(其中R4为氢)处理式45化合物,得到式47化合物。这些反应通常在醚类溶剂如二恶烷中,在120-170℃的温度下,在钢制反应釜中进行。用酸例如但不限于HCl或TFA使式47化合物的丙酮化合物脱保护,得到式48化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术例如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案7:
Figure BDA0003402377930000221
方案7说明了式52化合物的合成。式50化合物可以通过式44化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化,在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式49化合物(Y=-Br,-I)存在下,接着加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在25-70℃的温度下进行。用式19化合物处理后式50化合物,得到式51化合物。这些反应通常在醚类溶剂如二恶烷中,在120-170℃的温度下,在钢制反应釜中进行。式51化合物的丙酮化合物用酸如但不限于HCl(盐酸)或TFA脱保护,得到式52化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案8:
Figure BDA0003402377930000222
方案8说明了式60化合物的合成。式53化合物(其中PG=保护基,例如但不限于TBDPS)通过按照Purinetrici Signalling(2015)11:371-387中报道的方法制备。在膦例如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式53化合物与式40化合物(X=-Cl,-Br)进行光延反应,得到式54化合物。式55化合物是在用氟离子例如但不限于TBAF处理式54化合物后形成的。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。用各种氧化剂如但不限于戴斯-马丁试剂氧化式55化合物,得到式56化合物。在碱如但不限于KOtBu、NaOtBu、LiHMDS、NaHMDS或KHMDS存在下,当用试剂如但不限于甲基三苯基溴化鏻处理式56化合物时,得到式57化合物。式57化合物用式19化合物(其中R4和R5是氢)处理,得到式58化合物。这些反应通常在醚溶剂如二恶烷中,在120-170℃的温度下,在钢制反应釜中进行。式59化合物可以通过式58化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化,在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式49化合物(Y=-Br,-I)存在下,接着加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或碳酸铯来合成。用酸如但不限于HCl或TFA使式59化合物的丙酮化合物脱保护,得到式60化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案9:
Figure BDA0003402377930000231
方案9说明了式68化合物的合成。式62化合物可通过在碱例如但不限于NaH、LiH等存在下用式61化合物亲核取代式31化合物来合成。通常这些反应在溶剂如DMF、DMAc、NMP或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。式63化合物通过在碱如但不限于NEt3、DIPEA、DMAP等存在下,在0℃-25℃的温度下,用酸酐如但不限于(Boc)2O处理式62化合物来制备。通常,这些反应在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中进行。式64化合物是在用氟离子例如但不限于TBAF处理式63化合物后形成的。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0-25℃温度下进行。用各种氧化剂如但不限于戴斯-马丁试剂氧化式64化合物可得到式65化合物。通常这些反应在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃温度下进行。在碱如但不限于KOtBu、NaOtBu、LiHMDS、NaHMDS或KHMDS存在下,当用试剂如但不限于甲基三苯基溴化鏻处理式65化合物时,得到式66化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0-25℃温度下进行。式67的化合物可以通过用合适的硼烷例如但不限于9-BBN处理式66的化合物,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式27化合物(Y=-Br,-I),加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成,其按照WO2012002577 A1中报道的方法合成,然后形成N-氧化物,用磷酰氯氯化,然后用PMB-NH2或J.Med.Chem,2017,60(9),3958-3978)进行亲核取代。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在25-70℃的温度下进行。用酸如但不限于HCl/MeOH或TFA将式67化合物脱保护,得到式68化合物。通常,这些反应在25-50℃的温度下进行。每一步化合物可通过标准技术如柱色谱、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案10:
Figure BDA0003402377930000241
方案10说明了式73化合物的合成。式70化合物可以通过式44化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN硼氢化,接着在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式69化合物(Y=-Br,-I)存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3合成,其通过按照Journal of the American Chemical Society,1949,vol.71,p.6-10.报道的类似方法合成。通常,这些反应在醚类溶剂(例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂)中在25-70℃的温度下进行。式70化合物在用aq.NH3处理后得到式71化合物。通常,这些反应在醚溶剂例如二恶烷中进行,并在钢制反应釜中在120℃-170℃的温度下进行。在碱例如但不限于NaHCO3存在下,用2-卤代乙醛例如但不限于氯乙醛环化式71化合物,得到式72化合物。这些反应通常在质子溶剂例如EtOH、MeOH、H2O中,在50-80℃下进行。用酸例如但不限于HCl或TFA将式72化合物的丙酮化合物脱保护,得到式73化合物。这些反应通常在25-50℃下进行。在每一步骤中,化合物可通过标准技术例如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案11:
Figure BDA0003402377930000251
方案11说明了式78化合物的合成。式75化合物可以通过式37化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化,接着在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式74化合物(Y=Br,-I;PG1是保护基例如对甲氧基苄基)的存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3合成。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中进行,并在25-70℃的温度下进行。用aq NH3处理式75化合物,可得到式76化合物。通常,这些反应在醚性溶剂如二恶烷中在120℃-170℃的温度下在钢制反应釜中进行。式76化合物与2-卤代乙醛例如但不限于氯乙醛的环化可以得到式77化合物。这些反应通常在质子溶剂例如EtOH、MeOH、H2O中进行,在50℃-80℃的温度下进行。用酸例如但不限于HCl或TFA使式77化合物的丙酮化合物脱保护,得到式78化合物。通常,这些反应在25-50℃的温度下进行。每一步的化合物都可以用标准技术纯化,如柱层析、结晶、反相高效液相色谱或SFC。
方案12:
Figure BDA0003402377930000261
方案12说明了式88和89的化合物的合成。在膦例如但不限于PPh3存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式1化合物与式79化合物进行光延反应,得到式80化合物。这些反应通常在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用氟离子例如但不限于TBAF处理式80化合物,生成式81化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-40℃温度下进行。用各种氧化剂如但不限于戴斯-马丁试剂氧化式81化合物,可得到式82化合物。通常这些反应可在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-40℃温度下进行。在碱如但不限于KOtBu、NaOtBu、LiHMDS、NaHMDS或KHMDS存在下,当用试剂如但不限于甲基三苯基溴化鏻处理式82化合物时,可得到式83化合物。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在0℃-25℃温度下进行。式84的化合物可以通过式83的化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化,然后在Pd催化剂但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式74化合物(Y=Br,-I;PG1是保护基团,例如对甲氧基苄基)的存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,并在25-70℃的温度下进行。用aq.NH3处理式84化合物,可得到式85的化合物。通常,这些反应在醚性溶剂如二恶烷中在120℃-170℃的温度下在钢制反应釜中进行。式85化合物与2-卤代乙醛例如但不限于氯乙醛的环化可以得到式86化合物和式87化合物的混合物。通常这些反应在质子溶剂例如EtOH、MeOH、H2O中,并在50℃-80℃的温度下进行。用酸例如但不限于HCl或TFA将式86化合物脱保护,得到式88化合物。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式87化合物脱保护,得到式89化合物。通常这些反应在25℃-50℃的温度下进行。每一步化合物可以通过标准技术例如柱色谱、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案13:
Figure BDA0003402377930000271
方案13说明了式94化合物的合成。在膦例如但不限于PPh3存在下,式42化合物与碱例如但不限于咪唑碘化得到式90化合物。通常这些反应可在卤化溶剂例如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。在碱例如但不限于Cs2CO3或K2CO3存在下,用式91化合物亲核取代式90化合物得到式92化合物。通常这些反应可在极性非质子溶剂例如DMF、DMAc或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。式92化合物用式19化合物处理后可得到式93化合物。通常这些反应在醚性溶剂例如二氧六环中在120℃-170℃的温度下在钢制反应釜中进行。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式93化合物脱保护,得到式94化合物。通常这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术例如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案14:
Figure BDA0003402377930000272
方案14说明了式94化合物的合成。在膦例如但不限于PPh3的存在下,使用各种偶氮二羧酸酯试剂例如但不限于DEAD或DIAD,使式42化合物与式91化合物进行光延反应,得到式92化合物。这些反应通常在醚溶剂例如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-25℃的温度下进行。用式19化合物处理后式92化合物,得到式93化合物。这些反应通常在醚溶剂例如二恶烷中,在120-170℃的温度下,在钢制反应釜中进行。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式93化合物脱保护,得到式94化合物。通常这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术例如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案15:
Figure BDA0003402377930000281
方案15说明了式100化合物的合成。式97化合物可以通过式95化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN的硼氢化作用,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式96化合物(Y=Br,-I)的存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中进行,在25-70℃的温度下进行。用式19化合物处理式97化合物后,可得到式98化合物。这些反应通常在醚类溶剂如二恶烷中在120-170℃下在钢制反应釜中进行。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式97的化合物脱保护,得到式99的化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。用酸例如但不限于HCl或TFA将式98的化合物脱保护,得到式100的化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案16:
Figure BDA0003402377930000282
方案16说明了式100化合物的合成。式102化合物可通过将式44化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN硼氢化,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式101化合物(Y=Br,-I)存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中进行,并在25-70℃的温度下进行。式102化合物在用式19化合物处理后可得到式103化合物。通常,这些反应在醚溶剂如二噁烷中在120℃至170℃的温度下在钢制反应釜中进行。式103化合物经还原剂例如但不限于NaBH4处理,得到式104化合物。通常,这些反应在酸性溶剂例如乙酸中在0℃至25℃的温度下进行。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式104化合物脱保护,得到式100化合物。通常这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案17:
Figure BDA0003402377930000291
方案17说明了式109化合物的合成。式106化合物可以通过将式44化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN硼氢化,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式105化合物(Y=Br,-I)存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中进行,在25-70℃的温度下进行。式106化合物用式19化合物处理后可得到式107化合物。通常,这些反应在醚溶剂如二噁烷中在120℃至170℃的温度下在钢制反应釜中进行。式107的化合物在用还原剂例如但不限于NaBH4处理后得到式108的化合物。通常,这些反应在酸性溶剂例如乙酸中在0℃至25℃的温度下进行。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式108化合物脱保护,得到式109化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案18:
Figure BDA0003402377930000301
方案18说明了式114化合物的合成。式111化合物可通过将式44化合物与合适的硼烷例如但不限于9-BBN硼氢化,然后在Pd催化剂例如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd-118和式110化合物(Y=Br,-I)存在下,加入无机碱例如但不限于磷酸三钾或Cs2CO3来合成。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中进行,在25-70℃的温度下进行。式111化合物用式19化合物处理后可得到式112化合物。通常,这些反应在醚溶剂如二噁烷中在120℃至170℃的温度下在钢制反应釜中进行。式112化合物用还原剂例如但不限于NaBH4处理,得到式113化合物。通常,这些反应在酸性溶剂例如乙酸中在0℃至25℃的温度下进行。另外,用酸例如但不限于HCl或TFA将式113化合物脱保护,得到式114化合物。通常,这些反应在25℃至50℃的温度下进行。每一步骤的化合物可通过标准技术如柱色谱法、结晶、反相HPLC或SFC纯化。
方案19:
Figure BDA0003402377930000302
方案19说明了式117化合物的合成。在受阻碱例如但不限于LDA存在下,式115化合物与甲酰化剂例如但不限于DMF的甲酰化反应得到式116化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在-78℃至0℃的温度下进行。式116化合物用亲核氟化剂如但不限于DAST处理,可得到式117化合物。通常这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。
方案20:
Figure BDA0003402377930000311
方案20说明了式124化合物的合成。在碱例如但不限于KOtBu或NaOtBu存在下,式118化合物用试剂例如但不限于TosMIC处理后,可以得到式119化合物。通常这些反应可在溶剂混合物中,例如但不限于tBuOH和DME或类似溶剂,在0℃至25℃的温度下进行。通过使用硼烷试剂例如但不限于BH3.DMS或BH3.THF,式119化合物可转化为式120化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,在0-70℃的温度下进行。式120化合物与试剂如但不限于甲酸乙酯反应,得到式121化合物。通常,这些反应在0℃至60℃的温度下进行。在路易斯酸例如但不限于FeCl3存在下,用试剂例如但不限于草酰氯处理式121的化合物,可以得到式122的化合物。通常,这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。随后在酸性条件下在0-65℃的温度下反应,得到式123化合物。通常,这些反应可以在质子溶剂如甲醇、乙醇或类似溶剂中进行。式123化合物在用试剂例如但不限于MnO2处理后可得到式124化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在25-100℃的温度下进行。
方案21:
Figure BDA0003402377930000312
方案21说明了式126的化合物的合成。在受阻碱例如但不限于LDA存在下,式125化合物与氯化剂例如但不限于全氯乙烷的氯化反应得到式126化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在-78℃至0℃的温度下进行。
方案22:
Figure BDA0003402377930000321
方案22说明了式135化合物的合成。用氨基醛二甲基乙缩醛处理式127化合物,得到式128化合物。通常,这些反应可以在烃溶剂如甲苯或二甲苯或类似溶剂中在25℃至130℃的温度下进行。用还原剂如但不限于NaBH4还原式128的亚胺,得到式129的化合物。通常,这些反应可以在质子溶剂如甲醇、乙醇或类似溶剂中,在0℃至25℃的温度下进行。在碱如但不限于吡啶存在下,用试剂如但不限于甲苯磺酰氯对式129化合物进行甲苯磺酰化,得到式130化合物。通常这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。用路易斯酸如但不限于AlCl3环化式130化合物,得到式131化合物。通常这些反应可在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。用氧化剂如但不限于SeO2氧化式131的化合物,得到式132的化合物。通常这些反应可在烃溶剂如邻二氯苯或二甲苯或类似溶剂中在150℃-180℃的温度下进行。式132化合物在用亲核氟化剂如但不限于DAST处理后可得到式133化合物。通常,这些反应可在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。式133的化合物用还原剂如但不限于NaBH4处理,得到式134的化合物。通常这些反应在酸性溶剂如乙酸中在0℃-25℃的温度下进行。式135化合物通过在碱如但不限于NEt3、DIPEA、DMAP等存在下在0℃-25℃的温度下用酸酐如但不限于(Boc)2O处理式134化合物来制备。
方案23:
Figure BDA0003402377930000322
方案23说明了式138化合物的合成。式136化合物可通过用合适的硼烷如但不限于双频哪醇合二硼处理式135化合物,然后在Pd催化剂如但不限于Pd(dppf)Cl2或Pd(PPh3)2Cl2存在下,加入无机碱如但不限于乙酸钾,来合成。通常这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中,并在25-100℃的温度下进行。通过使用氧化剂如但不限于高碘酸钠,可将式136化合物转化成式137化合物。通常,这些反应可以在溶剂如丙酮或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。通过用试剂如但不限于H2O2/AcOH、H2O2/柠檬酸处理,可以将式137化合物转化成式138化合物。通常这些反应可以在0℃至25℃的温度下进行。
方案24:
Figure BDA0003402377930000331
方案24说明了式144化合物的合成。可通过使用氧化剂例如但不限于PCC将式139化合物转化为式140化合物。通常,这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。用试剂如但不限于氨基醛二甲基乙缩醛处理式140的化合物得到式141的化合物。通常,这些反应可以在烃溶剂如甲苯或二甲苯或类似溶剂中在25℃至130℃的温度下进行。用还原剂如但不限于NaBH4还原式141的亚胺,得到式142的化合物。通常,这些反应可以在质子溶剂例如甲醇、乙醇或类似溶剂中,在0℃至25℃的温度下进行。在碱例如但不限于吡啶的存在下,用试剂例如但不限于甲苯磺酰氯对式142化合物进行甲苯磺酰化,得到式143化合物。通常,这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。用路易斯酸如但不限于AlCl3环化式143化合物得到式144化合物。通常,这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。
方案25:
Figure BDA0003402377930000332
方案25说明了式150化合物的合成。用试剂例如但不限于1,1-二甲氧基丙-2-酮处理式145化合物,得到式146化合物。通常,这些反应可以在烃类溶剂如甲苯或二甲苯或卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中进行。用还原剂例如但不限于NaBH4还原式146的化合物,得到式147的化合物。通常,这些反应可以在质子溶剂例如甲醇、乙醇或类似溶剂中,在0℃至25℃的温度下进行。在碱例如但不限于吡啶存在下,用试剂例如但不限于甲苯磺酰氯对式147化合物进行甲苯磺酰化,得到式148化合物。通常,这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0-25℃的温度下进行。用路易斯酸如但不限于AlCl3环化式148化合物,得到式149化合物。通常,这些反应可以在卤化溶剂如CH2Cl2、CHCl3或类似溶剂中在0℃-25℃的温度下进行。式149的化合物在用试剂如但不限于MnO2处理后可以得到式150的化合物。通常,这些反应在醚类溶剂如THF、MeTHF、二恶烷或类似溶剂中在25-100℃的温度下进行。
提供以下实施例以进一步说明本发明,因此不应以任何方式解释为限制本发明的范围。
缩写词
本文可以使用以下缩写:
AcOH=乙酸
Aq=水溶液
AlCl3=氯化铝
ca=大约或近似
NH4Cl=氯化铵
BH3.DMS=硼烷二甲硫醚络合物
BH3.THF=硼烷四氢呋喃络合物
9-BBN=9-硼双环壬烷
BINAP=2,2'-双(二苯基膦基)-1,1'-联萘
Boc=叔丁氧基羰基
(Boc)2O=二碳酸二叔丁酯
t-Bu或tBu=叔丁基
t-BuOH=叔丁醇
Cs2CO3=碳酸铯
CHCl3=氯仿
CDCl3=氘代氯仿
DAST=二乙基氨基三氟化硫
dba=亚苄基丙酮
DBU=1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯
CH2Cl2或DCM=二氯甲烷
DMP=戴斯马丁氧化剂(Dess Martin Periodinane)
DEAD=偶氮二甲酸二乙酯
DIAD=偶氮二甲酸二异丙酯
DIPEA=二异丙基乙胺
DMAP=4-二甲氨基吡啶
DMF=N,N-二甲基甲酰胺
DMAc=N,N-二甲基乙酰胺
DME=1,2-二甲氧基乙烷
DMS=二甲硫醚
DMSO=二甲亚砜
DMSO-d6=氘代二甲亚砜
Et=乙基
EtOH=乙醇
EtOAc=乙酸乙酯
FeCl3=氯化铁(III)
GCMS=气相色谱-质谱
g=克
HPLC=高效液相色谱
HCl=盐酸
H2O=水
H2O2=过氧化氢
H2SO4=硫酸
K2CO3=碳酸钾
KOH=氢氧化钾
KOtBu=叔丁醇钾
K3PO4=磷酸钾
KHMDS=二(三甲基甲硅烷基)氨基钾
LiH=氢化锂
LDA=二异丙基氨基锂
LHMDS=二(三甲基甲硅烷基)氨基化锂
LCMS=液相色谱质谱分析
m-CPBA=间氯过氧苯甲酸
mg=毫克
Me=甲基
MeOH=甲醇
MeOD=氘代甲醇
MeTHF=2-甲基四氢呋喃
MS=分子筛
MsCl=甲磺酰氯
MgSO4=硫酸镁
MnO2=氧化锰(IV)
m/z=质荷比
NaH=氢化钠
NaBH4=硼氢化钠
NaOtBu=叔丁醇钠
NaHCO3=碳酸氢钠
Na2S2O3=硫代硫酸钠
Na2SO3=亚硫酸钠
NaHMDS=双(三甲基甲硅烷基)氨基钠
NMP=N-甲基-2-吡咯烷酮
NBS=N-溴代琥珀酰亚胺
NCS=N-氯代琥珀酰亚胺
NIS=N-碘代琥珀酰亚胺
NMO=N-甲基吗啉-N-氧化物
NMR=核磁共振
N2=氮气
Ph=苯基
PPh3=三苯基膦
PDC=二氯铬酸吡啶
Pd(OAc)2=乙酸钯
Pd/C=钯/碳
Pd-118=[1,1'-双(二叔丁基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)
Pd(PPh3)4=四(三苯基膦)钯(0)
POCl3=三氯氧磷
PdCl2(dppf)=[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)
Pd(PPh3)2Cl2=双(三苯基膦)二氯化钯(II)
PCC=氯铬酸吡啶
PMB=对甲氧基苄基
PTSA=对甲苯磺酸
Rt=保留时间
rt=室温
Sat.=饱和
SFC=超临界流体色谱法
SeO2=二氧化硒
TLC=薄层色谱法
TBAF=四丁基氟化铵
TsCl=对甲苯磺酰氯
TBDMS=叔丁基二甲基甲硅烷基
TBDPS=叔丁基二苯基甲硅烷基
Et3N或NEt3或TEA=三乙胺
TFA=三氟乙酸
p-TsOH=对甲苯磺酸
实施例
中间体
6-氯嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000381
按照与US2009/149466A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
4,6-二氯-5-氟嘧啶
Figure BDA0003402377930000382
按照与WO 2012/40279A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
6-氯-5-氟嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000383
将4,6-二氯-5-氟嘧啶(3.20g,19.17mmol)、HCl(14.31ml,165mmol)、水(15ml)在二恶烷(15ml)中的混合物在70℃加热6小时。使反应混合物冷却至室温,并在减压下蒸发溶剂,得到1.5g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000386
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到(1.2g,42.2%)标题化合物。GCMS M/z=148.11(M+,70%)。
3-苄基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
Figure BDA0003402377930000384
按照ACS Med.Chem.Lett.2015,6,1150-1155.中描述的相同反应方案制备标题化合物。
2-氨基-4-溴-6-氟苯甲醛
Figure BDA0003402377930000385
在0℃下向4-溴-2-氟-6-硝基苯甲醛(按照WO 2015/054572A1中描述的相同反应方案制备;4.15g,16.73mmol)在乙醇(20ml)和乙酸(20ml)中的搅拌溶液中加入铁粉(2.80g,50.2mmol),并搅拌反应混合物1小时。将反应混合物用乙酸乙酯(70mL)稀释,并用饱和的NaHCO3水溶液(碳酸氢钠,100ml)中和。将所得乳液通过硅藻土过滤。分离各层,有机层用盐水(100ml)洗涤,并在无水Na2SO4(硫酸钠)上干燥。将有机层过滤并真空浓缩,得到标题化合物(3.36g,92%),为浅绿色固体,其不经纯化即用于下一步骤。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.10(s,1H),7.78–7.54(m,2H),6.84(t,J=1.5Hz,1H),6.64(dd,J=11.1,1.8Hz,1H)。
7-溴-3-氯-5-氟喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000391
在0℃下向搅拌的2-氨基-4-溴-6-氟苯甲醛(9.48g,43.5mmol)的无水乙腈(150ml)溶液中加入DBU(1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯)(19.66ml,130mmol)和氯化锂(3.69g,87mmol),然后在相同温度下逐滴加入(氯(氰基)甲基)膦酸二乙酯(9.2g,43.5mmol)的50ml乙腈溶液。将反应混合物在25℃搅拌16小时。将反应混合物用乙酸乙酯(150ml)稀释,并用水(200ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(100ml)洗涤,并在无水Na2SO4(硫酸钠)上干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到11.2g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在Redisep
Figure BDA0003402377930000392
柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到标题化合物(9.48g,%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.23(s,1H),7.51(d,J=1.9Hz,1H),7.32(dd,J=9.5,1.9Hz,1H),7.25(s,2H);LCMS m/z=275(M+1;100%)。
3-溴-7-碘-N-(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000393
按照WO2012/037108A1中所述的类似反应方案制备标题化合物。
7-溴-3-氯-5-氟-N-(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000394
使用适当的起始原料,通过按照WO2012/037108A1中所述的类似反应方案制备标题化合物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.22(d,J=0.8Hz,1H),7.96(t,J=6.1Hz,1H),7.58(dd,J=1.8,1.0Hz,1H),7.39–7.28(m,3H),6.91–6.82(m,2H),4.62(d,J=6.1Hz,2H),3.71(s,3H);LCMS m/z=397(M+1;100%)。
7-溴-3-氯-5-氟-N,N-二(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000401
在0℃下,向搅拌的7-溴-3-氯-5-氟喹啉-2-胺(1.5g,5.44mmol)在DMF(二甲基甲酰胺,25ml)中的悬浮液中加入NaH(氢化钠,0.544g,13.61mmol)。将得到的混合物在0℃搅拌15分钟。在N2气氛下滴加4-甲氧基苄基氯(1.854ml,13.61mmol)。然后将反应混合物在25℃搅拌3小时,将反应混合物倒入冰水(150mL)中,用乙酸乙酯(200mL)萃取。分离各层,有机层用盐水(100ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到2.7g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000404
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至20%),得到标题化合物(2.2g,78%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.39(d,J=0.9Hz,1H),7.76(t,J=1.3Hz,1H),7.52(dd,J=9.4,1.7Hz,1H),7.29–7.23(m,4H),6.91–6.84(m,4H),4.60(s,4H),3.71(s,6H);LCMS m/z=515.68,517.68(M+,M+2;100%)。
3-氯-5-氟-N,N-双(4-甲氧基苄基)-7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000402
将7-溴-3-氯-5-氟-N,N-双(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺(2.5g,4.85mmol)、双频哪醇二硼(1.477g,5.82mmol)、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II)与二氯甲烷的复合物(0.396g,0.485mmol))、乙酸钾(0.809g,8.24mmol)在DMSO(35ml)中的混合物在预热油浴中在80℃下加热30分钟。将反应混合物冷却至室温。将反应混合物倒入冰水(50mL)中,用乙酸乙酯(100mL)萃取。分离各层,有机层用盐水(30ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到2.3g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000403
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到标题化合物(1.5g,55%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.44(d,J=0.8Hz,1H),7.81(d,J=1.0Hz,1H),7.35–7.17(m,5H),6.95–6.79(m,4H),4.58(s,4H),3.70(s,6H),1.33(s,12H);LCMS m/z=563.2(M+,100%)。
2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯-5-氟喹啉-7-醇
Figure BDA0003402377930000411
在0℃下向搅拌的3-氯-5-氟-N,N-双(4-甲氧基苄基)-7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)喹啉-2-胺(3g,5.33mmol)的THF(四氢呋喃,40ml)溶液中滴加冰乙酸(0.610ml,10.66mmol),并搅拌1小时。在0℃缓慢加入过氧化氢水溶液(3.27ml,32.0mmol)。将反应混合物搅拌16小时。将混合物用EtOAc(乙酸乙酯,25ml)和水(25ml)稀释。分离各层,有机层与水溶液一起搅拌。亚硫酸钠(25ml)在25℃下15分钟。分离各层,有机层用盐水(30ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。减压蒸发溶剂,得到2.1g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000412
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至25%),得到标题化合物(1.6g,66.3%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.46(s,1H),8.21(s,1H),7.25(d,J=8.0Hz,4H),6.86(d,J=8.1Hz,4H),6.83–6.72(m,2H),4.51(s,4H),3.71(d,J=3.0Hz,6H);LCMS m/z=453.1(M+,100%)。
3-氨基-5-溴甲基吡啶醛
Figure BDA0003402377930000413
在0℃下向搅拌的5-溴-3-硝基吡啶甲醛(通过按照如US2010/125089中所述的相同反应方案制备;1g,4.33mmol)的乙醇(5ml)和乙酸(5ml)的溶液中加入铁粉(0.725g,12.99mmol)并搅拌反应混合物30分钟。将反应混合物在25℃搅拌30分钟。将反应混合物用乙酸乙酯(20mL)稀释,并用饱和的NaHCO3(30ml)中和。将所得乳液通过硅藻土过滤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥,过滤有机层并真空浓缩,得到浅绿色固体(0.21g,24.13%),其不经纯化即用于下一步骤。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.86(s,1H),8.03(d,J=2.0Hz,1H),7.50(d,J=1.9Hz,1H),7.30(s,2H);LCMS m/z=201.39,203.39(M+,M+2;100%)。
7-溴-3-氯-1,5-萘啶-2-胺
Figure BDA0003402377930000414
在0℃下,向3-氨基-5-溴甲基吡啶醛(0.185g,0.922mmol)在乙腈(5ml)中的搅拌溶液中加入DBU(0.096ml,0.638mmol)和氯化锂(0.060g,1.418mmol),随后逐滴加入(氯(氰基)甲基)膦酸二乙酯(0.150g,0.709mmol)的乙腈(3ml)溶液。在25℃下搅拌反应混合物16小时。将反应混合物用乙酸乙酯(10ml)稀释,并用水(10ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.2g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在Redisep
Figure BDA0003402377930000421
柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-50%),得到标题化合物(0.13g,70.9%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.96–7.88(m,2H),7.34(d,J=2.1Hz,1H),6.34(s,2H);LCMS m/z=257.02,259.52,261.90(M-1,M+,M+2;100%)。
7-溴喹喔啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000422
按照Wolf等人,JACS,1949,71,6-10中所述的类似反应方案制备标题化合物。
4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000423
按照与WO2008/75110A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003402377930000424
按照与WO2017/46737A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003402377930000425
按照与US2015/225407A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
6-(二氟甲基)-5-氟-8-羟基-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000426
按照与US2019/0111060A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
6-(二氟甲基)-5-氟-8-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000431
在0℃下,向搅拌的6-(二氟甲基)-5-氟-8-羟基-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯(1g,3.15mmol)的DCM(40ml)溶液中加入Et3N(0.879ml,6.30mmol)和三氟甲磺酸酐(0.586ml,3.47mmol),将反应混合物搅拌1小时。将反应混合物用二氯甲烷(10ml)稀释,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(10ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1.2g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000432
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至5%),得到(1.079g,76%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.42(d,J=5.5Hz,1H),6.89(t,J=56Hz,1H),4.69(s,2H),3.72(t,J=6.0Hz,2H),2.94–2.82(m,2H),1.51(s,9H)。
6-(二氟甲基)-5-氟-8-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000433
将6-(二氟甲基)-5-氟-8-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯(1g,2.225mmol)、双频哪醇二硼(1.695g,6.68mmol)和Et3N(1.861ml,13.35mmol)的二恶烷(10ml)混合物在密封管中用氮气脱气5分钟。加入PdCl2(dppf)(0.163g,0.223mmol),并在130℃搅拌反应混合物16小时。将反应混合物用乙酸乙酯(10ml)稀释,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(10ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1.3g粗化合物。该残余物在酸性条件下经反相制备型HPLC纯化,得到(0.32g,33.7%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.92(d,J=7.8Hz,1H),6.80(t,J=52Hz,1H),4.90(s,2H),3.67(t,J=5.9Hz,2H),2.96–2.73(m,2H),1.52(s,9H),1.37(s,12H)。
8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000434
在室温下,向搅拌的6-(二氟甲基)-5-氟-8-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯(0.32g,0.749mmol)的甲醇(1ml)溶液中加入溴化铜(II)(0.502g,2.247mmol)的水(1ml)溶液。将所得混合物在70℃搅拌10小时。将反应混合物用乙酸乙酯(10ml)稀释,并用水(10ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(10ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.25g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在Redisep
Figure BDA0003402377930000441
柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至5%),得到(0.18g,63.2%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.66(d,J=6.4Hz,1H),6.86(t,J=54.8Hz,1H),4.56(s,2H),3.67(t,J=5.9Hz,2H),2.85(t,J=6.0Hz,2H),1.53(s,9H)。
8-溴-5-氟异喹啉
Figure BDA0003402377930000442
按照与WO2018/167800A1中所述相同的反应方案制备标题化合物。
8-溴-5-氟异喹啉-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000443
在-78℃下,向搅拌的8-溴-5-氟异喹啉(1.7g,7.52mmol)的THF(15ml)溶液中加入LDA(2M的THF/庚烷/乙苯溶液)(5.64ml,11.28mmol),搅拌1小时。在-78℃加入DMF(1.747ml,22.56mmol)并搅拌30分钟。将所得混合物用冰水淬灭,并使其温热至室温。将反应混合物用乙酸乙酯(20ml)稀释,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000444
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到(0.467g,24.44%)标题化合物。LCMS m/z=254.14(M+;90%)。
8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟异喹啉
Figure BDA0003402377930000445
在0℃下,向搅拌的8-溴-5-氟异喹啉-6-甲醛(233mg,0.917mmol)的DCM(6ml)溶液中加入DAST(0.606ml,4.59mmol),并将反应混合物搅拌15分钟。将所得混合物温热至室温并搅拌16小时。将所得混合物用二氯甲烷(10mL)稀释,并用冷饱和NaHCO3水溶液(20ml)淬灭。将反应混合物在室温下搅拌20分钟。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.8g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000451
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到(0.166g,65.6%)标题化合物。LCMS m/z=276.02(M+;100%)。
8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉
Figure BDA0003402377930000452
在室温下,向搅拌的8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟异喹啉(200mg,0.724mmol)的乙酸(4.6ml)溶液中分批加入NaBH4(96mg,2.54mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时。在40℃真空除去溶剂,反应混合物用二氯甲烷(20ml)稀释,并用饱和碳酸氢钠溶液(20ml)碱化。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到(0.2g,99%)足够纯的化合物,其不经进一步纯化直接用于下一步。LCMS m/z=280.0(M+;100%)。
8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000453
在0℃下,向搅拌的8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉(200mg,0.714mmol)的DCM(3ml)溶液中加入Et3N(0.199ml,1.428mmol)和BOC-酸酐(0.199ml,0.857mmol),将所得混合物在室温下搅拌2小时。用DCM(20ml)稀释反应混合物,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.32g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000454
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至9%),得到(0.215g,79%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.66(d,J=6.4Hz,1H),6.86(t,J=54Hz,1H),4.56(s,2H),3.67(t,J=5.9Hz,2H),2.85(t,J=5.8Hz,2H),1.53(s,9H)。
(E)-1-(2-溴-4-甲基苯基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)甲亚胺
Figure BDA0003402377930000461
将搅拌的2-溴-4-甲基苯甲醛(73g,367mmol)和2,2-二甲氧基乙-1-胺(47.9ml,440mmol)在甲苯(450ml)中的混合物用Dean-Stark分水器在125℃下加热4小时。使混合物冷却至室温并浓缩,得到粗制化合物(105g,100%),为淡黄色油状物。该粗化合物不经进一步纯化直接用于下一步骤。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.64(m,1H),7.93(d,J=8.0Hz,1H),7.41(dd,J=1.7,0.8Hz,1H),7.20-7.13(m,1H),4.71(t,J=5.3Hz,1H),3.83(dd,J=5.3,1.4Hz,2H),3.45(s,6H),2.37(s,3H)。
N-(2-溴-4-甲基苄基)-2,2-二甲氧基乙-1-胺
Figure BDA0003402377930000462
向(E)-1-(2-溴-4-甲基苯基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)甲亚胺(105g,367mmol)的乙醇(820ml)溶液中,在10℃下分批加入硼氢化钠(20.82g,550mmol)。将得到的混合物在室温搅拌2小时。通过缓慢加入100ml丙酮猝灭所得混合物。真空除去挥发物,得到102g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000463
Rf柱上纯化,用甲醇/二氯甲烷梯度洗脱(0至5%),得到(83g,78%)标题化合物。LCMS m/z=288.27(M+)。
N-(2-溴-4-甲基苄基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)-4-甲基苯磺酰胺
Figure BDA0003402377930000464
在室温下向N-(2-溴-4-甲基苄基)-2,2-二甲氧基乙烷-1-胺(83g,288mmol)的DCM(1000ml)溶液中加入吡啶(116ml,1440mmol)。将对甲苯磺酰氯(93g,490mmol)的DCM(300ml)溶液滴加到上述溶液中。将所得混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物用水(1000mL)稀释,用二氯甲烷(500mL×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(500ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到135g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000465
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯/二氯甲烷梯度洗脱(0至25%),得到标题化合物(120g,94%),为无色油状物。LCMS m/z=444.17(M+2)。
8-溴-6-甲基异喹啉
Figure BDA0003402377930000471
在0℃向搅拌的氯化铝(217g,1628mmol)在DCM(1400ml)中的悬浮液中滴加N-(2-溴-4-甲基苄基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)-4-甲基苯磺酰胺(120g,271mmol)的DCM(600ml)溶液。使所得混合物升温至rt并搅拌16小时。将反应混合物倒入冰冷水(2升)和DCM(500ml)中并搅拌1小时。分离各层,有机层用盐水(500ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到150g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000472
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至50%),得到(50g,83%)标题化合物。LCMS m/z=224.0(M+2,100%)。
8-溴异喹啉-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000473
将二氧化硒(28.0g,252mmol)和8-溴-6-甲基异喹啉(20g,90mmol)在1,2-二氯苯(120ml)中的悬浮液加热至180℃保持7小时。将反应混合物用25%MeOH的DCM溶液(500ml)稀释,并通过硅藻土床过滤,用25%MeOH的DCM溶液(500ml)洗涤。在减压下浓缩滤液,该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000474
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至70%),得到(5.1g,23.99%)标题化合物。GCMS m/z=235.08(M+1)。
8-溴-6-(二氟甲基)异喹啉
Figure BDA0003402377930000475
在0℃下,向搅拌的8-溴异喹啉-6-甲醛(5g,21.18mmol)的DCM(120ml)溶液中滴加DAST(28.0ml,212mmol),搅拌15分钟。将所得混合物在室温搅拌16小时。用DCM(50ml)稀释反应混合物并用冷的饱和NaHCO3水溶液淬灭,并搅拌20分钟。分离各层,有机层用盐水(100ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到4.6g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000476
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到(3.3g,60.4%)标题化合物。GCMS m/z=257.08-259.08(M+,100%)
8-溴-6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉
Figure BDA0003402377930000481
在室温下,向搅拌的8-溴-6-(二氟甲基)异喹啉(3g,11.62mmol)的乙酸(65ml)溶液中分批加入NaBH4(1.539g,40.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时。在40℃真空除去溶剂,反应混合物用二氯甲烷(50ml)稀释,并用饱和碳酸氢钠溶液(50ml)碱化。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到(3.05g,100%)足够纯的化合物,其不经进一步纯化直接用于下一步。GCMS m/z=262.08(M+,100%)。
8-溴-6-(二氟甲基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000482
在0℃下,向搅拌的8-溴-6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉(3g,11.45mmol)的DCM(70ml)溶液中加入Et3N(3.19ml,22.89mmol)和BOC-酸酐(3.19ml,13.74mmol)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。用DCM(20ml)稀释反应混合物,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到3.2g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000483
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到(2.9g,69.9%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.59(s,1H),7.26(s,1H),6.59(t,J=56.3Hz,1H),4.58(s,2H),3.67(t,J=5.8Hz,2H),2.90(t,J=5.9Hz,2H),1.53(s,9H)。
6-(二氟甲基)-8-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000484
在室温下将PdCl2(dppf)(0.586g,0.801mmol)一次性加入到8-溴-6-(二氟甲基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯(5.8g,16.01mmol)、双频哪醇二硼(8.13g,32.0mmol)和乙酸钾(6.29g,64.1mmol)在二恶烷(60ml)中的脱气混合物中,在100℃下搅拌2小时。然后将混合物冷却至室温,通过硅藻土过滤,用乙酸乙酯(50ml)洗涤。将滤液真空浓缩,得到7.2g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000491
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-5%),得到(6.5g,99%)标题化合物。LCMS m/z=410.23(M+1,100%)。
(2-(叔丁氧基羰基)-6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)硼酸
Figure BDA0003402377930000492
在室温下,将高碘酸钠(10.19g,47.6mmol)加到6-(二氟甲基)-8-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯(6.50g,15.88mmol)在溶剂(即水(11.5ml,比例:1.000)与丙酮(57.5ml,比例:5))的混合物中的溶液中。将所得混合物在室温搅拌1小时。在室温下加入1N HCl水溶液(15.88ml,15.88mmol),并将反应混合物再搅拌4小时。反应混合物用水(100mL)猝灭,用乙酸乙酯(100mL×2)萃取。分离各层,合并的有机层用盐水(50mL)洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到4g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000493
Rf柱上纯化,用甲醇/二氯甲烷梯度洗脱(0至10%),得到(2.3g,44.3%)标题化合物。LCMS m/z=328.34(M+)。
6-(二氟甲基)-8-羟基-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000494
将(2-(叔丁氧基羰基)-6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)硼酸(0.1g,0.306mmol)、过氧化氢(0.031ml,0.306mmol)和5%柠檬酸溶液(2.4ml,0.031mmol)的混合物在室温下搅拌2小时。将反应混合物用乙酸乙酯(20ml)稀释,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.12g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000495
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到(0.083g,91%)标题化合物。LCMS m/z=300.40(M+)。
8-溴-5-(二氟甲基)异喹啉
Figure BDA0003402377930000501
在0℃下,向搅拌的5-溴异喹啉-8-甲醛和8-溴异喹啉-5-甲醛(88:12)的混合物(985mg,2.086mmol)中加入在DCM(20ml)中的DAST(2.76ml,20.86mmol),所述混合物按照WO2007/79162,2007,A1中报道的相同方法合成;搅拌15分钟。将反应混合物温热至室温并搅拌16小时。反应混合物用DCM(50ml)稀释并用饱和NaHCO3水溶液(50ml)碱化。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1.1g粗化合物。将该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000502
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至11%),得到0.717g的5-溴-8-(二氟甲基)异喹啉和8-溴-5-(二氟甲基)异喹啉的混合物。将该混合物通过手性制备型HPLC(Chiralpak IG,流速:1.00ml/min,流动相A:HEX_0.1%DEA,流动相B:IPA-MEOH_0.1%DEA,A_B_80_20@276nm)纯化,得到次要异构体8-溴-5-(二氟甲基)异喹啉(0.101g,Rt=7.14min)和主要异构体5-溴-8-(二氟甲基)异喹啉(0.502g,Rt=7.98min)。结构的说明是基于WO2007/079162中报道的信息进行的。次要异构体:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.61(d,J=0.9Hz,1H),8.79(d,J=6.0Hz,1H),8.16(d,J=7.7Hz,1H),8.10–8.05(m,1H),7.98(dd,J=7.8,1.4Hz,1H),7.63(t,J=54.0Hz,1H);LCMS m/z=258.14,259.96(M+,M+2,100%).主要异构体:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.62(q,J=1.4Hz,1H),8.81(d,J=5.9Hz,1H),8.29(d,J=7.8Hz,1H),8.10(dd,J=5.9,0.9Hz,1H),7.93–7.62(m,2H);LCMS m/z=257.06,259.77(100%)。
2-(5-溴-2-氟苯基)丙腈
Figure BDA0003402377930000503
在0℃下向搅拌的1-(5-溴-2-氟苯基)乙烷-1-酮(20g,92mmol)和1-(异氰基甲基磺酰基)-4-甲苯(21.59g,111mmol)在DME(94ml)中的悬浮液中加入KOtBu(20.68g,184mmol),并在N2气氛下搅拌1小时。使反应混合物升温至室温并搅拌1小时。将反应混合物用水(200mL)猝灭,用乙酸乙酯(200mL×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(200ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到26g粗化合物。将该残余物通过硅胶柱色谱(100目-200)纯化,用10%乙酸乙酯的石油醚溶液等度洗脱,得到标题化合物(18g,86%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.70(dd,J=6.7,2.6Hz,1H),7.65-7.61(m,1H),7.31(dd,J=10.2,8.8Hz,1H),4.47(q,J=7.2Hz,1H),1.57(d,J=7.2Hz,3H)。
2-(5-溴-2-氟苯基)丙-1-胺
Figure BDA0003402377930000511
在室温下,向搅拌的2-(5-溴-2-氟苯基)丙腈(18g,79mmol)的四氢呋喃(225ml)溶液中加入硼烷-甲基硫醚络合物(22.48ml,237mmol)。在N2气氛下将所得混合物在65℃搅拌16小时。用6M HCl(~50mL)猝灭反应混合物,并回流2小时。将反应混合物冷却至rt,用6MNaOH(~70mL)使pH为碱性,并用DCM(500mL×3)萃取。合并的萃取物用硫酸钠干燥,真空浓缩,得到18.2g粗化合物。将该残余物通过硅胶柱色谱(100目-200)纯化,用10%(7N氨甲醇溶液)在二氯甲烷中的等度洗脱,得到(16.3g,89%)标题化合物。LCMS:m/z=232.0(M+,100%)。
N-(2-(5-溴-2-氟苯基)丙基)甲酰胺
Figure BDA0003402377930000512
将搅拌的2-(5-溴-2-氟苯基)丙-1-胺(14g,60.3mmol)的甲酸乙酯(24.55ml,302mmol)溶液在N2气氛下搅拌至55℃保持18小时。在减压下蒸发挥发物,得到(15.5g,99%)油状的粗化合物,其不经进一步纯化即用于下一步骤。LCMS:m/z=262.02(M+2)。
10-溴-7-氟-6-甲基-6,10b-二氢-5H-恶唑并[2,3-a]异喹啉-2,3-二酮
Figure BDA0003402377930000513
在室温和氮气氛下,向搅拌的N-(2-(5-溴-2-氟苯基)丙基)甲酰胺(13.6g,52.3mmol)的DCM(460ml)溶液中加入草酰氯(5.03ml,57.5mmol),并搅拌30分钟。然后将反应混合物冷却至-10℃,分批加入氯化铁(III)(10.18g,62.7mmol)。使反应混合物升温至室温并搅拌16小时。将反应混合物用二氯甲烷(100mL)稀释并用饱和碳酸氢钠水溶液(150ml)碱化。分离各层,有机层用盐水(100ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到(13.9g,85%)粗化合物,其不经进一步纯化用于下一步骤。LCMS:m/z=244.27(M+2,100%)。
8-溴-5-氟-4-甲基-3,4-二氢异喹啉
Figure BDA0003402377930000521
在室温下,向搅拌的10-溴-7-氟-6-甲基-6,10b-二氢-5H-恶唑并[2,3-a]异喹啉-2,3-二酮(8.6g,27.4mmol)的甲醇(310ml)溶液中加入H2SO4(16ml,300mmol)。在N2气氛下将所得混合物在65℃搅拌16小时。真空除去溶剂,所得残余物用饱和碳酸氢钠水溶液碱化,用乙酸乙酯(100ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(100ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到(6.63g,100%)粗化合物,其不经进一步纯化用于下一步骤。LCMS:m/z=242.33(M+,100%)。
8-溴-5-氟-4-甲基异喹啉
Figure BDA0003402377930000522
在室温下,向搅拌的8-溴-5-氟-4-甲基-3,4-二氢异喹啉(8g,33.0mmol)的二噁烷(240ml)溶液中加入二氧化锰(43.1g,496mmol)。在N2气氛下将所得混合物在101℃搅拌48小时。将反应混合物通过硅藻土过滤,并将滤液真空浓缩,得到3.7g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000523
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至25%),得到标题化合物(3g,37.8%),为浅黄色固体。LCMS:m/z=242.27(M+2,100%)。
8-溴-5-氟-4-甲基异喹啉-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000524
在-78℃下,向搅拌的8-溴-5-氟-4-甲基异喹啉(4g,16.66mmol)的THF(70ml)溶液中加入LDA(2M在THF/庚烷/乙苯中)(2.7ml,24.99mmol),并搅拌1小时。加入DMF(3.87ml,50.0mmol),并在-78℃下搅拌反应混合物1小时。将反应混合物用冰水(50ml)猝灭,用乙酸乙酯(50ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到3.5g粗化合物。将该残余物用正戊烷研磨,得到(3.5g,78%)标题化合物。LCMS:m/z=270.08(M+2,100%)。
8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟-4-甲基异喹啉
Figure BDA0003402377930000531
在0℃下,向搅拌的8-溴-5-氟-4-甲基异喹啉-6-甲醛(3.5g,13.06mmol)的DCM(100ml)溶液中滴加DAST(8.62ml,65.3mmol),搅拌15分钟。将所得混合物在室温搅拌16小时。用DCM(50ml)稀释反应混合物并用冷NaHCO3水溶液(50ml)淬灭,并搅拌20分钟。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到3.6g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000532
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至20%),得到(2.8g,73.9%)标题化合物。LCMS:m/z=291.77(M+1,100%)。
8-溴-6-氯-5-氟异喹啉
Figure BDA0003402377930000533
在-78℃下,向搅拌的8-溴-5-氟异喹啉(2g,8.85mmol)的THF(40ml)溶液中加入LDA(2M的THF/庚烷/乙苯溶液)(8.52ml,13.27mmol),搅拌1小时。加入全氯乙烷(2.51g,10.62mmol),并在-78℃下搅拌反应混合物30分钟。将反应混合物用冰水(50ml)猝灭,用乙酸乙酯(50ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.22g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000534
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到(0.160g,7%)标题化合物。LCMS:m/z=262.0(M+2,100%)。
2-溴-4,5-二氟苯甲醛
Figure BDA0003402377930000535
将(2-溴-4,5-二氟苯基)甲醇(15g,67.3mmol)、PCC(17.40g,81mmol)在DCM(350ml)中的混合物在室温下搅拌2小时。在35℃真空蒸发溶剂,并将所得残余物通过硅胶柱色谱(100目-200)纯化,用10%乙酸乙酯的石油醚溶液等度洗脱,得到标题化合物(10g,67%),为白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ10.25(d,J=3.0Hz,1H),7.79(dd,J=10.0,8.3Hz,1H),7.54(dd,J=9.1,6.7Hz,1H)。
(E)-1-(2-溴-4,5-二氟苯基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)甲亚胺
Figure BDA0003402377930000541
将搅拌的2-溴-4,5-二氟苯甲醛(10g,45.2mmol)和2,2-二甲氧基乙烷-1-胺(5.71g,54.3mmol)在甲苯(100ml)中的混合物用Dean-Stark分水器在130℃下加热4小时。将所得混合物冷却至室温并真空浓缩,得到粗制化合物(13.94g,100%),为淡黄色油状物。该粗化合物不经进一步纯化直接用于下一步骤。LCMS:m/z=331.40(M+23)。
N-(2-溴-4,5-二氟苄基)-2,2-二甲氧基乙-1-胺
Figure BDA0003402377930000542
在室温下,向搅拌(E)-1-(2-溴-4,5-二氟苯基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)甲亚胺(13.94g,45.2mmol)的乙醇(150ml)溶液中,分批加入硼氢化钠(2.57g,67.9mmol),并搅拌2小时。在0℃下向反应混合物中缓慢加入丙酮(30ml)。在真空中除去挥发物,并通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000543
Rf柱上纯化挥发物,用甲醇的二氯甲烷溶液梯度洗脱(0至5%),得到(14g,99%)标题化合物。LCMS:m/z=310.28(M+,10%)。
N-(2-溴-4,5-二氟苄基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)-4-甲基苯磺酰胺
Figure BDA0003402377930000544
在室温下,向搅拌的N-(2-溴-4,5-二氟苄基)-2,2-二甲氧基乙烷-1-胺(14g,45.1mmol)的DCM(180ml)溶液中加入吡啶(18.26ml,226mmol)。将对甲苯磺酰氯(14.63g,77mmol)的DCM(71ml)溶液滴加到上述溶液中。将所得混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物用水(500mL)稀释,用二氯甲烷(200mL×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(200ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到20.5g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000545
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到(18g,86%)标题化合物。LCMS:m/z=488.0(M+23,100%)。
8-溴-5,6-二氟异喹啉
Figure BDA0003402377930000551
在0℃下向搅拌的氯化铝(17.23g,129mmol)在DCM(110ml)中的悬浮液中滴加N-(2-溴-4,5-二氟苄基)-N-(2,2-二甲氧基乙基)-4-甲基苯磺酰胺(10g,21.54mmol)的DCM(40ml)溶液,使所得混合物升温至rt并搅拌16小时。将反应混合物倒入冰冷水(500ml)和DCM(250ml)中并搅拌1小时。分离各层,有机层用盐水(500ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到4g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000552
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至40%),得到标题化合物(1.5g,28.5%),为灰白色固体。LCMS:m/z=244.14(M+,100%)。
(2-溴-5-氟苯基)甲胺
Figure BDA0003402377930000553
按照与Organic Letters,2018,vol,20,#2,p.441-444中所述相同的反应方案制备标题化合物。
(E)-N-(2-溴-5-氟苄基)-1,1-二甲氧基丙-2-亚胺
Figure BDA0003402377930000554
在室温下,将(2-溴-5-氟苯基)甲胺(29g,142mmol)、1,1-二甲氧基丙-2-酮(19.78ml,163mmol)和硫酸镁(17.11g,142mmol)在DCM(150ml)中的混合物搅拌15小时。将所得混合物通过硅藻土过滤,并将滤液真空蒸发,得到标题化合物(41g,95%),其不经进一步纯化直接用于下一步骤。
N-(2-溴-5-氟苄基)-1,1-二甲氧基丙-2-胺
Figure BDA0003402377930000555
在0℃下,向(E)-N-(2-溴-5-氟苄基)-1,1-二甲氧基丙-2-亚胺(41g,135mmol)在甲醇(700ml)中的搅拌溶液中分批加入NaBH4(6.12g,162mmol)。并将反应混合物搅拌20分钟。将所得混合物温热至室温并搅拌2小时。将丙酮(250mL)缓慢加入烧瓶中以在0℃猝灭反应,真空蒸发溶剂,得到43g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000565
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到标题化合物(39g,94%),为淡黄色油状物。LCMS:m/z=306.28(M+,15%)。
8-溴-5-氟-3-甲基-3,4-二氢异喹啉
Figure BDA0003402377930000561
在-10℃下,将氯磺酸(43.5ml,653mmol)缓慢加入到N-(2-溴-5-氟苄基)-1,1-二甲氧基丙-2-胺(20g,65.3mmol)中,并将反应混合物在室温搅拌15小时。用冷的饱和NaHCO3水溶液碱化所得混合物,并用乙酸乙酯(200ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(200ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到11.3g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000562
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到(9g,56.9%)标题化合物。LCMS:m/z=242.02(M+,100%)。
8-溴-5-氟-3-甲基异喹啉
Figure BDA0003402377930000563
于室温下,向搅拌的密封试管中的8-溴-5-氟-3-甲基-3,4-二氢异喹啉(9g,37.2mmol)的二氧杂环己烷(350ml)的溶液中加入二氧化锰(48.5g,558mmol)。在N2气氛下将所得混合物在101℃搅拌12小时。将反应混合物通过硅藻土过滤,并将滤液真空浓缩,得到4.1g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000564
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到(3.6g,40.3%)标题化合物。LCMS:m/z=240.02(M+,100%)。
8-溴-5-氟-3-甲基异喹啉-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000571
在-78℃下,向搅拌8-溴-5-氟-3-甲基异喹啉(3.60g,15mmol)的THF(80ml)溶液中加入LDA(11.25ml,22.49mmol),并搅拌1小时。缓慢加入DMF(3.48ml,45.0mmol),并将反应混合物搅拌1小时。将所得混合物用饱和NH4Cl水溶液(100ml)淬灭,并用乙酸乙酯(50ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1.7g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000572
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到(1.3g,32.3%)标题化合物。LCMS:m/z=268.08(M+,100%)。
8-溴-6-(二氟甲基)-5-氟-3-甲基异喹啉
Figure BDA0003402377930000573
在0℃下,向搅拌的8-溴-5-氟-3-甲基异喹啉-6-甲醛(0.800g,2.98mmol)的DCM(50ml)溶液中加入DAST(1.971ml,14.92mmol),并将反应混合物搅拌15分钟。将所得混合物温热至室温并搅拌3小时。将所得混合物用二氯甲烷(20mL)稀释,并用冷的饱和NaHCO3水溶液(20ml)淬灭。将反应混合物在室温下搅拌20分钟。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.82g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000574
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到(0.65g,75%)标题化合物。LCMS:m/z=290.14(M+,100%)。
((3aR,6R,6aS)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-6,6a-二氢-3aH-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)甲醇
Figure BDA0003402377930000575
按照Kenneth A Jacobson et.al;Purinetrig Signalling(2015)11:371-387中描述的相同反应方案制备标题化合物。
4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-6-(碘甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000581
在0℃下,向搅拌的咪唑(0.931g,13.67mmol)和三苯基膦(2.119g,8.08mmol)的DCM(40ml)溶液中缓慢加入碘(2.051g,8.08mmol)。加入((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇(2g,6.22mmol)的DCM(40ml)溶液,并搅拌10分钟。将反应混合物温热至室温并搅拌3小时。将反应混合物用水(20ml)猝灭,用乙酸乙酯(20ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到2.3g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000582
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至7%),得到(1.91g,71.2%)标题化合物。LCMS m/z=432.04(M+)
(3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000583
在0℃下,向搅拌((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇(2.50g,7.77mmol)的CH2Cl2(40ml)溶液中,分批加入戴斯马丁氧化剂(3.95g,9.32mmol),并搅拌1h。将反应混合物用二氯甲烷(50ml)稀释,并用水(50ml)洗涤。分离有机层,用MgSO4干燥,过滤并真空浓缩,得到2.71g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000584
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-30%),得到标题化合物(2.32g,93%),为无色油状物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ10.00(s,1H),8.67(s,1H),7.12(d,J=3.6Hz,1H),6.78(dd,J=2.6,0.9Hz,1H),6.69(d,J=3.7Hz,1H),5.97(dt,J=2.8,1.4Hz,1H),5.76(dd,J=5.9,1.5Hz,1H),4.88(dt,J=5.9,1.1Hz,1H),1.54(s,3H),1.40(s,3H);LCMS m/z=320.2(M+1,100%)。
4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000591
在0℃下,向甲基(三苯基)溴化鏻(5.03g,14.07mmol)的THF(30mL)的冷却悬浮液中缓慢加入1M KHMDS的THF(14.07mL,14.07mmol)溶液并搅拌5分钟。使反应混合物升温至25℃并搅拌10分钟。将反应混合物冷却至0℃,缓慢加入(3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛(1.8g,5.63mmol)的THF(1ml)溶液。在25℃搅拌反应混合物10分钟。用饱和NH4Cl水溶液(50ml)淬灭反应混合物,并用乙酸乙酯(50ml)萃取。分离有机层,用Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到2.1g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000592
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-7%),得到标题化合物(0.81g,45.3%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.72(s,1H),7.11(d,J=3.6Hz,1H),6.66–6.57(m,2H),5.94(d,J=2.6Hz,1H),5.81–5.75(m,2H),5.57(dd,J=6.0,1.5Hz,1H),5.49(d,J=10.9Hz,1H),4.66(dt,J=6.0,1.0Hz,1H),1.52(s,3H),1.40(s,3H);LCMSm/z=318.09(M+1,100%)。
7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(A)。
7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(B)。
Figure BDA0003402377930000593
在25℃下,向7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(5g,8.93mmol)在二恶烷(80ml)和水(10ml)中的脱气溶液中,加入磷酸三钾(4.66g,26.8mmol)、二氯[1,1'-双(二叔丁基膦基)二茂铁]钯(II)(0.582g,0.893mmol)和2,4,6-三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼烷(12.48ml,89mmol)。将反应混合物在80℃下加热8小时。将反应混合物用乙酸乙酯(50ml)稀释,并用水(50ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水硫酸钠干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到4.3g粗化合物。将该粗残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000594
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至20%),得到标题化合物A(3.2g,66%)和B(0.75g,15.98%),为灰白色固体。A的1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.83(s,1H),7.71(tt,J=6.6,1.5Hz,4H),7.48–7.37(m,6H),6.91(d,J=3.6Hz,1H),6.57(d,J=3.6Hz,1H),5.88(s,2H),5.25(d,J=5.7Hz,1H),4.60(d,J=5.7Hz,1H),4.55–4.45(m,2H),2.77(s,3H),1.45(s,3H),1.32(s,3H),1.11(s,9H);LCMS m/z=540.4(M+1;100%);B的1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.71(tt,J=6.6,1.5Hz,4H),7.53–7.35(m,6H),6.98(d,J=3.6Hz,1H),6.57(d,J=3.6Hz,1H),5.90(d,J=14.5Hz,2H),5.26(d,J=5.7Hz,1H),4.61(d,J=5.7Hz,1H),4.51(d,J=9.3Hz,2H),1.46(s,3H),1.33(s,3H),1.28(s,2H),1.11(s,9H);LCMS m/z=526.44(M+1;100%)。
((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-4-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇
Figure BDA0003402377930000601
在25℃下,向搅拌的7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(3.20g,5.93mmol)的THF(20ml)溶液中,缓慢加入TBAF(8.89ml,8.89mmol),并在25℃搅拌反应混合物15小时。在真空中除去挥发物,并通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000602
Rf柱上纯化粗残余物,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至100%),得到标题化合物(1.5g,84%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.81(s,1H),7.06(d,J=3.6Hz,1H),6.55(d,J=3.6Hz,1H),5.90–5.78(m,2H),5.41(ddd,J=5.8,1.7,0.9Hz,1H),4.65(dt,J=5.8,0.9Hz,1H),4.56–4.42(m,2H),3.35(d,J=8.2Hz,1H),2.74(s,3H),1.53(s,3H),1.37(s,3H);LCMS m/z=302.21(M+1;100%)。
(3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-4-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛。
Figure BDA0003402377930000603
在0℃下,向搅拌的7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(1.50g,4.98mmol)的二氯甲烷(100ml)溶液中,分批加入戴斯马丁氧化剂(2.53g,5.97mmol),并搅拌1h。反应混合物用二氯甲烷(50ml)稀释,并用水(50ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水硫酸钠干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到粗制化合物,该粗制残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000611
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯的石油醚溶液梯度洗脱(0至30%),得到标题化合物(0.95g,63.8%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ10.00(s,1H),8.80(s,1H),7.02(d,J=3.6Hz,1H),6.82–6.76(m,1H),6.63(d,J=3.6Hz,1H),6.00(dt,J=2.7,1.4Hz,1H),5.76(dd,J=5.9,1.5Hz,1H),4.87(dt,J=5.9,1.1Hz,1H),2.77(s,3H),1.53(s,3H),1.38(s,3H);LCMS m/z=300.15(M+1;100%)
7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶。
Figure BDA0003402377930000612
按照与制备4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶中所述类似的反应方案,合成标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.83(s,1H),7.01(d,J=3.6Hz,1H),6.68–6.53(m,2H),5.95(d,J=2.5Hz,1H),5.80–5.71(m,2H),5.56(dd,J=6.0,1.4Hz,1H),5.47(d,J=10.8Hz,1H),4.65(d,J=5.8Hz,1H),2.75(s,3H),1.52(s,3H),1.40(s,3H);LCMS m/z=298.5(M+1;100%)。
7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-4,6a-二氢-3aH-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000613
在0℃下,向搅拌着的(3aS,4S,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-醇(按照Tetrahedron,2007,vol.63,#39,p.9836-9841,1.2g,2.83mmol)的THF(15ml)溶液中缓慢地加入2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(0.738g,4.80mmol)、三苯基膦(2.59g,9.89mmol)和DIAD(1.923ml,9.89mmol),并搅拌5分钟。将反应混合物加热至25℃并搅拌1小时。真空除去挥发物,粗残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000614
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到标题化合物(1.1g,69.5%),为灰白色固体。1HNMR(400MHz,氯仿-d)δ8.84(s,1H),7.70(ddt,J=6.6,5.0,1.5Hz,4H),7.50–7.34(m,6H),6.94(d,J=3.6Hz,1H),6.59(d,J=3.6Hz,1H),5.84(dt,J=19.8,2.2Hz,2H),5.30(d,J=5.7Hz,1H),4.63(d,J=5.6Hz,1H),4.57–4.42(m,2H),1.43(s,3H),1.33(s,3H),1.10(s,9H);LCMS m/z=560.3(M+;100%)。
(3aR,6R,6aS)-6-(2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-6,6a-二氢-3aH-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)甲醇
Figure BDA0003402377930000621
在0℃下,向搅拌的7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(500mg,0.893mmol)的THF(5ml)溶液中,缓慢加入TBAF(1.250ml,1.250mmol),并将反应混合物在相同温度下搅拌10分钟。将反应混合物加热至25℃并搅拌30分钟。真空除去挥发物,粗残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000622
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至40%),得到标题化合物(0.27g,94%),为无色油状物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.81(s,1H),7.28(s,1H),7.08(d,J=3.7Hz,1H),6.57(d,J=3.7Hz,1H),5.92–5.62(m,2H),5.47(d,J=5.7Hz,1H),4.69(dt,J=5.6,0.9Hz,1H),4.59–4.37(m,2H),1.52(s,3H),1.38(s,3H);LCMS m/z=321.09(M+;100%)。
(3aR,6R,6aS)-6-(2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-6,6a-二氢-3aH-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-甲醛
Figure BDA0003402377930000623
按照与制备(3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-4-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛中所述类似的反应方案,合成标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ9.99(s,1H),8.86(s,1H),7.04(d,J=3.7Hz,1H),6.75(dd,J=2.6,0.9Hz,1H),6.65(d,J=3.7Hz,1H),6.00(dt,J=2.7,1.4Hz,1H),5.77(dd,J=5.9,1.5Hz,1H),4.88(dd,J=5.9,1.2Hz,1H),1.53(s,3H),1.40(s,3H);LCMS m/z=319.90(M+;100)。
2-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-4,6a-二氢-3aH-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000631
按照与制备4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶中所述类似的反应方案,合成标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.82(s,1H),7.03(d,J=3.6Hz,1H),6.64–6.53(m,2H),5.93(d,J=2.6Hz,1H),5.81–5.69(m,2H),5.60(dd,J=5.8,1.4Hz,1H),5.53–5.44(m,1H),4.68(dd,J=5.8,1.1Hz,1H),1.45(s,6H);LCMS m/z=318.15(M+;100)。
7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000632
在0℃下,向搅拌的(3aS,4S,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-醇(5.0g,11.78mmol)的THF(5ml)溶液中加入三苯基膦(9.27g,35.3mmol),随后缓慢加入DIAD(6.87ml,35.3mmol),并搅拌30分钟。将反应物温热至室温并搅拌16小时。用MTBE(300mL)稀释反应混合物并过滤。将滤液真空蒸发,得到4.6g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000633
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至5%),得到标题化合物(4g,59.2%),为无色油状物。LCMS:m/z=374.17(M+,100%)。
((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇
Figure BDA0003402377930000634
在0℃下,向搅拌的7-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(4g,6.97mmol)的THF(50ml)溶液中缓慢加入TBAF(8.36ml,8.36mmol),并将反应混合物搅拌30分钟。将反应物温热至室温并搅拌16小时。真空蒸发挥发物,得到2.7g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000641
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至70%),得到标题化合物(2.1g,90%),为无色油状物。LCMS:m/z=336.1(M+1,100%)。
(3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000642
在室温下,向搅拌的((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇(2.1g,6.25mmol)的DCM(30ml)溶液中,分批加入戴斯马丁氧化剂(3.18g,7.50mmol),并搅拌2h。用DCM(50mL)稀释反应混合物并通过硅藻土过滤。滤液用NaHCO3和硫代硫酸钠的1:1饱和混合物(100mL×2)洗涤。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1.8g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000643
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至40%),得到标题化合物(1.5g,71.9%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.91(s,1H),8.61(s,1H),7.45(d,J=1.3Hz,1H),7.11–7.02(m,1H),5.97-5.96(m,1H),5.59(dd,J=6.0,1.4Hz,1H),4.77-4.75(m,1H),2.41(d,J=1.2Hz,3H),1.40(s,3H),1.29(s,3H)。
4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶
Figure BDA0003402377930000644
在0℃下,向搅拌的甲基三苯基溴化鏻(1.712g,4.79mmol)的THF(50ml)悬浮液中分批加入KHMDS(4.79ml,4.79mmol),并将反应混合物搅拌10分钟。缓慢加入(3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛(1.0g,3.00mmol)的THF(10ml)溶液,并在0℃搅拌10分钟。用饱和NH4Cl水溶液(50ml)淬灭反应混合物,并用乙酸乙酯(20ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到1.3g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000651
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到标题化合物(0.7g,70.4%),为灰白色固体。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.59(s,1H),7.31(d,J=1.3Hz,1H),6.60(dd,J=17.6,10.8Hz,1H),5.87(d,J=2.7Hz,1H),5.77(d,J=2.7Hz,1H),5.66–5.55(m,2H),5.42(dd,J=10.8,1.6Hz,1H),4.65(d,J=5.9Hz,1H),2.40(d,J=1.2Hz,3H),1.39(s,3H),1.31(s,3H)
(3aR,4S,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基甲磺酸酯
Figure BDA0003402377930000652
按照与Heterocycles,2017,vol.95,#1,p.445–461.中所述相同的反应方案制备标题化合物。
1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003402377930000653
在0℃下,向搅拌的1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺(1.785g,13.21mmol)在DMF(50ml)中的悬浮液中加入NaH(0.581g,14.53mmol),并将反应混合物搅拌30分钟。在0℃缓慢加入(3aR,4S,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基甲磺酸酯(5.00g,13.21mmol)的DMF(25mL)溶液,搅拌5分钟。将反应混合物加热至25℃并搅拌16小时。用饱和NH4Cl水溶液(50ml)淬灭反应混合物,并用乙基CH2Cl2(50ml)萃取。分离有机层,用Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到3.5g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000654
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-60%),得到标题化合物(2.1g,38.1%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.40(s,1H),7.99(d,J=3.4Hz,1H),5.96(s,1H),5.74(d,J=2.4Hz,1H),5.38(d,J=5.8Hz,1H),4.-91-4.89(m,1H),4.43(d,J=2.3Hz,2H),1.51(s,3H),1.38(s,3H),0.92(s,9H),0.10(d,J=3.6Hz,6H);LCMS m/z=417.23(M+;100%)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000661
在25℃下,向搅拌的1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺(2.1g,5.03mmol)的THF(30ml)溶液中加入三乙胺(2.103ml,15.09mmol)、DMAP(0.061g,0.503mmol),并将反应混合物搅拌10分钟。加入BOC-酸酐(2.452ml,10.56mmol),在25℃下搅拌反应混合物16小时。真空除去挥发物,粗残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000662
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到标题化合物(1.85g,59.5%),为无色油状物。LCMS m/z=618.32(M+;100%)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-(羟基甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000663
按照制备((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇中描述的类似反应方案,合成标题化合物。LCMS m/z=504.2(M+;100)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-甲酰基-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000664
按照制备例(3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛中所述的类似反应方案,合成标题化合物。LCMS m/z=502.44(M+;20%)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000671
按照制备例4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶中所述的类似反应方案,合成标题化合物。LCMS m/z=500.49(M+;20%)。
1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003402377930000672
在0℃下,向搅拌的6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺(0.788g,5.28mmol)的DMF(20ml)溶液中加入NaH(0.317g,7.92mmol)并搅拌15分钟。缓慢加入(3aR,4S,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基甲磺酸酯(2.00g,5.28mmol)的DMF(5mL)溶液,室温下搅拌15小时。将反应混合物用乙醚(50ml×2)稀释,并用水(25ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(50ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到(1.6g,70.2%)粗化合物,其不经纯化直接用于下一步骤。LCMS m/z=432.30(M+1)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000673
在室温下,向搅拌的1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺(1.60g,3.71mmol)的THF(20ml)溶液中加入TEA(2.067ml,14.83mmol)、DMAP(0.045g,0.371mmol),并搅拌10分钟。加入BOC-酸酐(3.44ml,14.83mmol),搅拌15小时。真空蒸发挥发物,得到2g粗化合物,其不经任何纯化直接用于下一步骤。LCMS m/z=632.09(M+)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-(羟基甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000681
向搅拌的(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.0g)的THF(20ml)溶液中缓慢加入TBAF(4.43ml,4.43mmol),并在室温搅拌15小时。真空蒸发挥发物,得到1.5g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000682
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到标题化合物(1.1g,67.1%),为无色油状物。LCMS m/z=518.07(M+1)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-甲酰基-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000683
在室温下向搅拌的(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-(羟基甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.10g)的DCM(25ml)溶液中逐份加入戴斯马丁氧化剂(3.61g,8.50mmol),并搅拌10分钟。将反应混合物温热至室温并搅拌3小时。真空蒸发挥发物,得到1.2g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000684
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到标题化合物(0.9g,82%),为无色油。LCMS m/z=515.57(M+)。
(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000685
在0℃下,向搅拌的甲基三苯基溴化鏻(1.039g,2.91mmol)的THF溶液(3ml)中缓慢加入KHMDS(2.91ml,2.91mmol),并搅拌3分钟。在0℃下,缓慢加入(叔丁氧基羰基)(1-((3aS,4R,6aR)-6-甲酰基-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基甲酸叔丁酯(0.75g)的THF(3ml)溶液,将反应混合物搅拌5分钟。将反应混合物用水(20ml)猝灭,用乙酸乙酯(20ml×2)萃取。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.6g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000691
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至10%),得到标题化合物(0.47g,62.9%),为无色油状物。LCMS m/z=514.30(M+1)。
((3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)甲醇
Figure BDA0003402377930000692
按照与Journal of Medicinal Chemistry,1992,vol.35,#2,p.324-331.中描述的相同的反应方案制备标题化合物。
(3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛
Figure BDA0003402377930000693
在0℃下,向搅拌的((3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲醇(2.1g,6.51mmol)的CH2Cl2溶液(5ml)中,分批加入戴斯马丁氧化剂(3.31g,7.81mmol),并搅拌16小时。将反应混合物用二氯甲烷(50mL)、水(50mL)稀释,并通过硅藻土过滤。分离有机层,用MgSO4干燥,过滤并真空浓缩,得到1.93g粗化合物。将该残余物通过Combiflash纯化,用乙酸乙酯的石油醚梯度洗脱(0-70%),得到标题化合物(1.79g,86%),为无色油状物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ10.00(s,1H),8.76(s,1H),8.11(s,1H),6.83–6.52(m,1H),5.84-5.82(m,2H),5.13–4.86(m,1H),1.54(s,3H),1.42(s,3H);LCMS m/z=320.47(M+,100%)。
6-氯-9-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)-9H-嘌呤
Figure BDA0003402377930000701
在0℃下,向搅拌的甲基三苯基溴化鏻(0.278g,0.779mmol)的THF(3mL)悬浮液中滴加1M KHMDS(0.779mL,0.779mmol),并在25℃搅拌反应混合物20分钟。将反应混合物冷却至-10℃至-15℃,缓慢加入(3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛(0.1g,0.312mmol)的THF(3ml)溶液。在-10℃下搅拌反应混合物10分钟。用饱和NH4Cl水溶液(10ml)淬灭反应混合物,并用乙酸乙酯(10ml)萃取。分离有机层,用Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到0.31g粗化合物。将该残余物通过Combiflash纯化,用乙酸乙酯的石油醚梯度洗脱(0-15%),得到标题化合物(0.021g,21.13%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.81(s,1H),8.03(s,1H),6.62(dd,J=17.6,10.8Hz,1H),5.82(dd,J=17.5,1.1Hz,1H),5.78(d,J=2.7Hz,1H),5.75(s,1H),5.65–5.62(m,1H),5.54(d,J=10.9Hz,1H),4.78(dd,J=5.9,1.1Hz,1H),1.52(s,3H),1.42(s,3H);LCMS m/z=319.4(M+1,20%)
3-苯甲酰基-1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
Figure BDA0003402377930000702
在0℃和氮气气氛下,向搅拌的(3aS,4S,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-醇(1g,2.355mmol)、三苯基膦(1.544g,5.89mmol)和3-苯甲酰基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.018g,4.71mmol)在无水THF(20ml)中的悬浮液中加入DEAD(0.932ml,5.89mmol)的THF(5ml)溶液。将所得混合物在25℃下搅拌16小时,然后在真空下除去溶剂。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000703
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-40%),得到标题化合物(0.6g,40.9%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.05(dd,J=8.4,1.3Hz,2H),7.84–7.77(m,1H),7.73–7.57(m,6H),7.56–7.38(m,7H),5.88(d,J=8.0Hz,1H),5.83–5.73(m,1H),5.30(d,J=2.6Hz,1H),5.18(d,J=5.8Hz,1H),4.81–4.72(m,1H),4.49-4.43(m,1H),4.34-4.29(m,1H),1.27(s,3H),1.23(s,3H),1.04(s,9H).LCMSm/z=623.09(M+1;50%)。
3-苯甲酰基-1-((3aS,4R,6aR)-6-(羟甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
Figure BDA0003402377930000711
向搅拌的3-苯甲酰基-1-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.250g,0.401mmol)的甲醇(3ml)溶液中加入氟化铵(0.074g,2.007mmol)。将所得混合物在室温搅拌16小时。反应完成后,减压蒸发甲醇。将残余物用乙酸乙酯(100ml)稀释,并用水(50ml)洗涤。分离有机层,用Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000712
Rf柱上纯化,用甲醇的DCM溶液梯度洗脱(0-2%),得到标题化合物(0.13g,84%),为浅黄色油状物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.08–8.00(m,2H),7.85–7.76(m,1H),7.70–7.58(m,2H),7.53(t,J=7.8Hz,1H),5.86(d,J=8.1Hz,1H),5.63–5.56(m,1H),5.26(d,J=2.9Hz,1H),5.20(d,J=5.8Hz,1H),5.11(t,J=5.5Hz,1H),4.73(d,J=5.8Hz,1H),4.13(dd,J=5.1,2.5Hz,2H),1.33(s,3H),1.27(s,3H).LCMS m/z=385.2(M+1;70%)。
3-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-氯嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000713
在0℃氮气氛下,向搅拌的(3aS,4S,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊烷并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-醇(5.0g,11.78mmol)、三苯基膦(9.27g,35.3mmol)和6-氯嘧啶-4(3H)-酮(2.61g,20.02mmol)在无水THF(180ml)中的悬浮液中,加入DIAD(6.87ml,35.3mmol。将所得混合物在室温下搅拌4小时,然后真空除去溶剂。通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000714
Rf柱上用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0-20%)来纯化该残余物,得到(5.22g,83%)标题化合物。LCMS m/z=539.20(M+2)。
6-氯-3-((3aS,4R,6aR)-6-(羟基甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000721
在0℃下,向3-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-氯嘧啶-4(3H)-酮(5.2g,9.68mmol)的THF(50ml)溶液中,缓慢加入TBAF(13.55ml,13.55mmol),并在室温下搅拌30分钟。蒸发溶剂后,通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器将粗产物在
Figure BDA0003402377930000722
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至55%),得到(2.3g,80%)标题化合物。LCMS m/z=299.27(M+1)。
3-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000723
在0℃下,向搅拌的(3aS,4S,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-醇(2.00g,4.71mmol)的甲苯(50ml)溶液中加入6-甲基嘧啶-4(3H)-酮(0.545g,4.95mmol)、三苯基膦(3.09g,11.78mmol),并缓慢加入DEAD(1.864ml,11.78mmol),搅拌15分钟。将反应物温热至室温并搅拌4小时。真空除去挥发物,粗残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000724
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至30%),得到标题化合物(1.48g,60.8%)。LCMS 517.2(M+)
3-((3aS,4R,6aR)-6-(羟基甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000725
向搅拌的3-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-甲基嘧啶-4(3H)-酮(1.42g,2.75mmol)的THF(15ml)溶液中缓慢加入TBAF(4.40ml,4.40mmol),并在室温搅拌3小时。真空除去挥发物,得到0.82g粗化合物。将该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000731
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到标题化合物(0.61g,80%),为灰白色固体。LCMS m/z=279.27M+1。
3-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-氯-5-氟嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000732
在0℃下,向搅拌的(3aS,4S,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-醇(2.00g,4.71mmol)的甲苯(50ml)溶液中加入6-氯-5-氟嘧啶-4(3H)-酮(0.735g,4.95mmol)、三苯基膦(3.09g,11.78mmol),然后缓慢加入DEAD(1.864ml,11.78mmol),搅拌30分钟。将所得混合物温热至室温并搅拌2.5小时。真空除去挥发物,得到2.5g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000733
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到(2.1g,80%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.43(s,1H),7.72–7.66(m,4H),7.44–7.36(m,6H),6.04–5.97(m,2H),5.16(dd,J=5.8,1.4Hz,1H),4.80–4.73(m,1H),4.48–4.35(m,2H),1.37(d,J=15.4Hz,6H),1.10(s,9H)。
6-氯-5-氟-3-((3aS,4R,6aR)-6-(羟基甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-4(3H)-酮
Figure BDA0003402377930000734
向搅拌的3-((3aS,4R,6aR)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-6-氯-5-氟嘧啶-4(3H)-酮(2.10g,3.78mmol)的THF(15ml)溶液中缓慢加入TBAF(6.05ml,6.05mmol),反应混合物在室温搅拌3小时。真空除去挥发物,得到1.2g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000735
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至15%),得到(1g,83%)标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.42(s,1H),6.00(dd,J=2.5,1.3Hz,1H),5.97-5.93(m,1H),5.32–5.29(m,1H),4.83–4.80(m,1H),4.49–4.36(m,3H),1.48(s,3H),1.41–1.40(m,3H)。
((3aR,3bR,4aS,5R,5aS)-5-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基六氢环丙烷并[3,4]环戊二烯并[1,2-d][1,3]二氧杂环戊烯-3b-基)甲醇
Figure BDA0003402377930000741
按照WO2006/091905A1中所述的类似反应方案制备标题化合物。
(3aR,3bS,4aS,5R,5aS)-5-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基六氢环丙烷并[3,4]环戊二烯并[1,2-d][1,3]间二氧杂环戊烯-3b-甲醛
Figure BDA0003402377930000742
按照与制备(3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-4-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-甲醛中所述类似的反应方案,合成标题化合物。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ9.34(s,1H),8.63(s,1H),7.18(d,J=3.6Hz,1H),6.66(d,J=3.6Hz,1H),5.91(dd,J=7.1,1.2Hz,1H),5.11(s,1H),4.82(dd,J=7.1,1.6Hz,1H),2.34(ddd,J=9.4,6.1,1.6Hz,1H),1.89–1.77(m,2H),1.58(s,3H),1.30(s,3H);LCMS m/z=333.9(M+,100%)。
4-氯-7-((3aR,3bS,4aS,5R,5aS)-2,2-二甲基-3b-乙烯基六氢环丙烷并[3,4]环戊[1,2-d][1,3]二氧杂环戊烯-5-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶。
Figure BDA0003402377930000743
在25℃下,向搅拌的甲基三苯基溴化鏻(24.62g,68.9mmol)的THF悬浮液(200ml)中加入1M KHMDS的THF(68.9ml,68.9mmol)溶液,并搅拌10分钟。将所得黄色悬浮液冷却至0℃,缓慢加入(3aR,3bS,4aS,5R,5aS)-5-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基六氢环丙烷并[3,4]环戊[1,2-d][1,3]间二氧杂环戊烯-3b-甲醛(9.2g,27.6mmol)的THF(80ml)溶液。将反应混合物在相同温度下搅拌1小时。用饱和NH4Cl水溶液(200ml)淬灭反应混合物,并用乙酸乙酯(200ml)萃取。分离各层,有机层用盐水(250ml)洗涤并用无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到11g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000751
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至20%),得到标题化合物(7g,77%),为白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.68(s,1H),7.23(d,J=3.7Hz,1H),6.67(d,J=3.6Hz,1H),5.86(dd,J=17.3,10.6Hz,1H),5.39–5.32(m,2H),5.29(s,1H),5.18(dd,J=10.6,0.9Hz,1H),4.59(dd,J=7.1,1.6Hz,1H),1.77(ddd,J=9.3,4.9,1.6Hz,1H),1.63(s,3H),1.49(t,J=5.3Hz,1H),1.27(s,3H),1.18(ddd,J=9.3,5.6,1.6Hz,1H);LCMS m/z=332.28(M+,50%)。
7-((3aR,3bS,4aS,5R,5aS)-2,2-二甲基-3b-乙烯基六氢环丙烷并[3,4]环戊二烯并[1,2-d][1,3]间二氧杂环戊烯-5-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺。
Figure BDA0003402377930000752
4-氯-7-((3aR,3bS,4aS,5R,5aS)-2,2-二甲基-3b-乙烯基六氢环丙烷并[3,4]环戊[1,2-d][1,3]二氧杂环戊烯-5-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(3g,9.04mmol)和氨的水溶液(19.57mL,904mmol)在二恶烷(6mL)中的混合物,在钢制反应釜中于130℃搅拌16小时。用乙酸乙酯(20mL)稀释反应混合物,并用水(20mL)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到4.1g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000753
Rf柱上纯化,用甲醇的二氯甲烷溶液梯度洗脱(0至3%),得到标题化合物(2.45g,87%),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.07(s,1H),7.02(s,2H),6.96(d,J=3.5Hz,1H),6.62(d,J=3.5Hz,1H),5.86(dd,J=17.4,10.7Hz,1H),5.33(dd,J=7.2,1.3Hz,1H),5.23(dd,J=17.4,1.3Hz,1H),5.10–5.01(m,2H),4.50(dd,J=7.1,1.6Hz,1H),1.70(ddd,J=9.3,4.8,1.6Hz,1H),1.46(s,3H),1.29–1.22(m,1H),1.19(s,3H),1.10(ddd,J=9.1,5.1,1.5Hz,1H);LCMS m/z=313(M+1,100%)。
3-氯-7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-5-氟喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000754
在N2气氛下,6-氯-9-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)-9H-嘌呤(0.11g,0.345mmol)在9-BBN(0.5摩尔,3.45ml,1.725mmol)中,于60℃下加热2小时。将反应混合物冷却至25℃,然后加入在水(0.5ml)中的三钾磷酸盐(0.366g,1.725mmol),并搅拌20分钟。加入7-溴-3-氯-5-氟喹啉-2-胺(0.086g,0.311mmol)的THF(1ml)溶液,然后加入PdCl2(dppf)(0.025g,0.035mmol)。将所得混合物在55℃搅拌2小时。将反应混合物用乙酸乙酯(10ml)稀释,并用水(10ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(10ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.15g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000761
Rf柱上纯化,用甲醇/二氯甲烷梯度洗脱(0至2.7%),得到标题化合物(0.077g),为无色半固体。LCMS m/z=514.8(M+,100%)。
表1中的中间体通过类似于用于制备3-氯-7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-5-氟喹啉-2-胺的反应方案,使用合适的原料并在合适的温度下合成。
表1:
Figure BDA0003402377930000762
Figure BDA0003402377930000771
Figure BDA0003402377930000781
Figure BDA0003402377930000791
Figure BDA0003402377930000801
3-氯-7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-5-氟喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000811
在N2气氛下,4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-2,2-二甲基-6-乙烯基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(0.242g,0.762mmol)在9-BBN(0.5摩尔,4.36ml,2.178mmol)中,于50℃下加热1小时。将反应混合物冷却至25℃,然后加入在水(0.5mL)中的三钾磷酸盐(0.578g,2.72mmol)并搅拌20分钟。加入7-溴-3-氯-5-氟喹啉-2-胺(0.150g,0.544mmol)的THF(0.5ml)溶液,然后加入二氯[1,1'-双(二叔丁基膦基)二茂铁]钯(II)(0.035g,0.054mmol)。将所得混合物在50℃下搅拌6小时。将反应混合物用水(10ml)稀释,用乙酸乙酯(10ml)萃取。分离各层,有机层用盐水(10ml)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.345g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000812
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至35%),得到标题化合物(0.16g,57.5%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.64(s,1H),8.18(s,1H),7.25(s,1H),7.09–6.96(m,4H),6.44(d,J=3.6Hz,1H),5.67(s,1H),5.56–5.51(m,1H),5.35(d,J=5.7Hz,1H),4.52(d,J=5.7Hz,1H),3.05–2.98(m,2H),2.74–2.56(m,2H),1.38(s,3H),1.28(s,3H);LCMS m/z=514.2(M+,100%)。
表-2中的中间体,通过类似于用于制备3-氯-7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-5-氟喹啉-2-胺的反应方案,使用合适的原料并在合适的温度下合成。
表2:
Figure BDA0003402377930000813
Figure BDA0003402377930000821
Figure BDA0003402377930000831
3-苯甲酰基-1-(6-(((2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯喹啉-7-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
Figure BDA0003402377930000841
在0℃下,向搅拌的3-苯甲酰基-1-((3aS,4R,6aR)-6-(羟甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.080g,0.208mmol)、2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯-5-氟喹啉-7-醇(0.151g,0.333mmol)和三苯基膦(0.164g,0.624mmol)的THF(2.5ml)溶液中逐滴加入DIAD(0.121ml,0.624mmol)。将所得混合物在室温搅拌14小时。减压蒸发溶剂,得到0.21g粗化合物。该残余物通过Combi-Flash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000842
Rf柱上纯化,用甲醇/二氯甲烷梯度洗脱(0至1%),得到(0.14g,82%)标题化合物。LCMS m/z=819.05(M+;100%)。
表4中的中间体,通过类似于制备3-苯甲酰基-1-(6-(((2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯喹啉-7-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮所用的反应方案,使用合适的原料合成。在一些实例中,代替DIAD,DEAD也可以使用。
表4:
Figure BDA0003402377930000843
Figure BDA0003402377930000851
8-(((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-6-基)甲氧基)-6-(二氟甲基)-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003402377930000861
向搅拌的6-(二氟甲基)-8-羟基-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-甲酸叔丁酯(250mg,0.834mmol)的DMF(体积:5ml)溶液中加入Cs2CO3(306mg,0.938mmol),在室温搅拌30分钟。然后将反应混合物冷却至0℃,加入在DMF(1ml)中的4-氯-7-((3aS,4R,6aR)-6-(碘甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(450mg,1.042mmol),并搅拌3小时。将反应混合物用乙酸乙酯(20ml)稀释,并用水(20ml)洗涤。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.52g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000862
Rf柱上纯化,用乙酸乙酯在石油醚中的梯度洗脱(0至20%),得到标题化合物(0.4g,63.6%),为灰白色固体。LCMS m/z=603.4(M+)。
7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-3-氯-5-氟喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000863
3-氯-7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-5-氟喹啉-2-胺(0.300g,0.473mmol)、25%氨(4.09ml,47.3mmol)的水溶液和二恶烷(4ml)的混合物,在120℃下,在钢制反应釜中加热18小时。真空蒸发溶剂,残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000864
Rf柱上纯化,用甲醇的二氯甲烷溶液梯度洗脱(0至5%),得到标题化合物(0.24g,83%),为灰白色固体。LCMS m/z=496.42(M+,20%)。
表5中的中间体,通过类似于用于制备7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-3-氯-5-氟喹啉-2-胺的反应方案,使用合适的原料合成。在一些实例中,反应在80℃或100℃下进行。
表5:
Figure BDA0003402377930000865
Figure BDA0003402377930000871
Figure BDA0003402377930000881
Figure BDA0003402377930000891
Figure BDA0003402377930000901
Figure BDA0003402377930000911
Figure BDA0003402377930000921
1-((3aS,4R,6aR)-6-(((2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
Figure BDA0003402377930000931
将3-苯甲酰基-1-((3aS,4R,6aR)-6-(((2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1g,1.221mmol)溶于7N甲醇氨(52.3ml,366mmol)中。将所得混合物在25℃搅拌3小时。真空蒸发溶剂,得到0.85g粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000932
Rf柱上纯化,用甲醇的DCM溶液梯度洗脱(0-12%),得到标题化合物(0.5g,57.3%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.34(d,J=2.3Hz,1H),8.29(s,1H),7.65(d,J=1.3Hz,2H),7.28–7.23(m,4H),7.07-7.05(m,1H),6.89–6.83(m,4H),5.71(s,1H),5.45(dd,J=8.0,2.3Hz,1H),5.34–5.25(m,2H),4.99–4.83(m,2H),4.65(d,J=5.8Hz,1H),4.55(s,4H),3.71(s,6H),1.38(s,3H),1.30(s,3H).LCMS m/z=715.21(M+;100%)。
4-氨基-1-((3aS,4R,6aR)-6-(((2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2(1H)-酮
Figure BDA0003402377930000933
将1-((3aS,4R,6aR)-6-(((2-(双(4-甲氧基苄基)氨基)-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.500g,0.699mmol)、DMAP(0.171g,1.398mmol)、三乙胺(0.195ml,1.398mmol)和2,4,6-三异丙基苯磺酰氯(0.423g,1.398mmol)在无水乙腈(50ml)中的混合物在25℃搅拌20小时,然后在80℃搅拌2小时。加入30%的氨(12.10ml,559mmol)水溶液后,将混合物进一步搅拌5小时。加入二氯甲烷(200mL)和水(100mL),滤出沉淀的固体,真空干燥,得到标题化合物(0.25g,50.1%),为浅黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.29(s,1H),7.38–7.18(m,5H),7.19–6.97(m,4H),6.86(d,J=8.5Hz,4H),5.68(s,1H),5.60(d,J=7.3Hz,1H),5.31(d,J=4.4Hz,2H),5.01–4.81(m,2H),4.55(s,5H),3.71(s,6H),1.38(s,3H),1.29(s,3H).LCMS m/z=714.2(M+;100%)。
7-((3aS,4R,6aR)-6-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺
Figure BDA0003402377930000941
在室温下,向搅拌的7-((3aS,4R,6aR)-6-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟异喹啉-8-基)乙基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(1.33g,2.68mmol)的乙酸(28ml)溶液中分批加入NaBH4(0.355g,9.39mmol),并搅拌1.5小时。在40℃真空蒸发溶剂,将该残余物用DCM(30ml)稀释,用饱和NaHCO3水溶液(50ml)碱化。分离各层。有机层用盐水洗涤,用硫酸钠干燥并浓缩,得到1.23g粗化合物,其不经进一步纯化直接用于下一步骤。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.07(s,1H),7.35–7.26(m,1H),7.14(d,J=3.7Hz,1H),7.03–6.95(m,2H),6.73(d,J=3.5Hz,1H),6.53(d,J=3.5Hz,1H),5.58(d,J=11.6Hz,2H),5.33(t,J=6.3Hz,1H),4.42(d,J=5.7Hz,1H),3.89(s,2H),2.93(t,J=5.9Hz,2H),2.89–2.74(m,3H),2.65(d,J=5.4Hz,2H),1.39(s,3H),1.29(s,4H);LCMS:m/z=499.54(M+)。
表6中的中间体通过类似于用于制备7-((3aS,4R,6aR)-6-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺的反应方案,使用适当的起始原料合成。
表6
Figure BDA0003402377930000942
Figure BDA0003402377930000951
Figure BDA0003402377930000961
Figure BDA0003402377930000971
7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(7H-咪唑并[1,2-c]吡咯并[3,2-e]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-3-溴-N-(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺
Figure BDA0003402377930000972
将7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-3-溴-N-(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺(0.050g,0.078mmol)、2-氯乙醛(0.033ml,0.234mmol)、EtOH(0.5ml,比例:1.000)和水(0.500ml,比例:1.000))的混合物在60℃下加热6小时。将水和饱和的NaHCO3水溶液加入反应混合物中,用EtOAc(50ml×2)萃取。合并的有机萃取物用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到0.065g粗化合物。通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000973
Rf柱上纯化获得的残余物,用二氯甲烷中的甲醇梯度洗脱(0至3%),得到标题化合物(0.038g,73.3%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.10(s,1H),8.37(s,1H),7.95(d,J=1.6Hz,1H),7.61(d,J=8.2Hz,1H),7.46(dd,J=5.5,1.5Hz,2H),7.35–7.31(m,2H),7.23–7.17(m,2H),6.86–6.77(m,2H),6.60(d,J=3.4Hz,1H),6.45(d,J=3.3Hz,1H),5.67(s,1H),5.54(s,1H),5.34(d,J=5.6Hz,1H),4.64(d,J=6.0Hz,2H),4.43(d,J=5.6Hz,1H),3.66(s,3H),3.03(tq,J=14.3,7.4Hz,2H),2.77–2.59(m,2H),1.40(s,3H),1.29(s,3H);LCMS m/z=665.3(M+;60%)。
表7中的中间体通过类似于用于制备7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(7H-咪唑并[1,2-c]吡咯并[3,2-e]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-3-溴-N-(4-甲氧基苄基)喹啉-2-胺的反应方案,使用适当的起始原料合成。
表7
Figure BDA0003402377930000981
Figure BDA0003402377930000991
实施例
实施例1:(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(6-氨基- 9H-嘌呤-9-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物1)
Figure BDA0003402377930000992
将7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-3-氯-5-氟喹啉-2-胺(0.05g,0.101mmol)在TFA(1.5ml)中的混合物在0℃和N2气氛下搅拌2小时。用冰冷的饱和NaHCO3水溶(20ml)液碱化反应混合物,并用乙酸乙酯(20ml)萃取。分离各层,有机层用盐水(20ml)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤有机层并真空浓缩,得到0.12g粗化合物。将该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930000993
Rf柱上纯化,用甲醇在二氯甲烷中的梯度洗脱(0至15%)得到标题化合物(19mg,41.3%),为黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.17(d,J=7.8Hz,2H),7.91(s,1H),7.47(s,2H),7.23(s,1H),7.09–6.92(m,3H),5.62–5.58(m,3H),5.36–5.31(m,1H),4.47(d,J=5.6Hz,1H),4.24(t,J=5.3Hz,1H),3.04–2.85(m,2H),2.64–2.53(m,2H);LCMS m/z=456.23(M+,50%)。
表8中的实例通过按照类似于用于制备(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)环戊-3-烯-1,2-二醇的反应方案,使用合适的原料合成。(代替TFA;TFA/50℃,HCl/MeOH,TFA水溶液或FeCl3·DCM,也可在适当的温度下使用)。在用7N氨甲醇碱化反应混合物后。通过反相制备HPLC直接纯化一些下述化合物。在通过反相制备HPLC纯化的化合物中,仅实施例21在酸性条件下纯化,而其它化合物在碱性条件下纯化。反相制备型HPLC的条件的细节如下:
酸性条件:YMC ODS-A,50x250mm,10μ;流速:117ml/min,梯度:从水相到有机相的线性梯度;水溶液:0.1%甲酸水溶液:CH3CN(95:5),有机相:0.1%甲酸水溶液:CH3CN(5:95)@220nm,
碱性条件:YMC Triart,50x250mm,10μ;流速:117ml/min,梯度:从水相到有机相的线性梯度;水溶液:0.1%氨水:CH3CN(95:5),有机相:0.1%氨水:CH3CN(5:95)@220nm。
表8:
Figure BDA0003402377930001001
Figure BDA0003402377930001011
Figure BDA0003402377930001021
Figure BDA0003402377930001031
Figure BDA0003402377930001041
Figure BDA0003402377930001051
Figure BDA0003402377930001061
Figure BDA0003402377930001071
Figure BDA0003402377930001081
Figure BDA0003402377930001091
Figure BDA0003402377930001101
实施例30:(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-(甲氧基氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇
Figure BDA0003402377930001102
在50℃下,将3-氯-7-(2-((3aS,4R,6aR)-4-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-3a,6a-二氢-4H-环戊二烯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-6-基)乙基)-5-氟喹啉-2-胺(100mg,0.194mmol)和N-甲基羟胺盐酸盐(130mg,1.555mmol)在叔丁醇(4ml)中的混合物在密封管中加热12小时。真空蒸发挥发物,得到135mg粗化合物。该残余物通过Combiflash(Rf200,Teledyne/Isco)仪器在
Figure BDA0003402377930001103
Rf柱上纯化,用甲醇的二氯甲烷溶液梯度洗脱(0至20%),得到标题化合物(35mg,37.1%),为灰白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.55(s,1H),8.31(s,1H),7.39(s,1H),7.27(d,J=10.7Hz,1H),7.15(d,J=3.6Hz,1H),6.78(d,J=3.5Hz,1H),5.58(d,J=4.6Hz,1H),5.48(d,J=1.8Hz,1H),4.46(d,J=5.6Hz,1H),4.06(t,J=5.3Hz,1H),3.87(s,3H),3.12–2.93(m,2H),2.57(d,J=6.7Hz,2H);LCMS m/z=485.05(M+,50%)。
生物学实施例
生化分析方案1
在生物化学试验中使用HTRF检测技术评估化合物对PRMT5的抑制作用。生物素化的H4R3(残基1-21)用作底物。在室温下,将化合物与384孔板的每孔15-25ng PRMT5:MEP50在含有20mM Bicine、pH 7.6、25mM NaCl、2mM DTT、0.01%鸡白蛋白和0.01%吐温-20的测定缓冲液中预孵育30分钟。通过加入1μM SAM和50nM生物素化H4R3引发反应。总测定体积为15μL。在室温下继续反应120分钟。然后加入含有链霉亲和素-Eu穴状化合物、抗兔IgG-XL-665、Histone H4R3二甲基对称性(H4R3me2s)多克隆抗体的检测溶液,均在HTRF检测缓冲液中制备,并在室温下进一步温育30分钟。HTRF信号记录在PHERASTAR微量培养板读数器中。在665nm和620nm处获得的信号比率用于计算化合物的抑制百分比,如下所示:
抑制百分比=100-((测试比率-阴性对照比率)/(阳性对照比率-阴性对照比率)×100),其中
阳性对照=PRMT5+SAM+H4R3
阴性对照=PRMT5+H4R3
生化分析方案2
在生物化学试验中使用HTRF检测技术评估化合物对PRMT5的抑制作用。生物素化的H4R3(残基1-21)用作底物。在室温下,将化合物与384孔板的每孔2.5ng PRMT5:MEP50在含有20mM Bicine、pH 7.6、25mM NaCl、2mM DTT、0.01%鸡白蛋白和0.01%吐温-20的测定缓冲液中预孵育30分钟。通过加入1μM SAM和50nM生物素化H4R3引发反应。总测定体积为15μL。在室温下继续反应4小时。然后加入含有链霉亲和素-Eu穴状化合物、抗兔IgG-XL-665、Histone H4R3二甲基对称性(H4R3me2s)多克隆抗体的检测溶液,所有都在HTRF检测缓冲液中制备,并在室温下进一步温育30分钟。HTRF信号记录在PHERASTAR微量培养板读数器中。在665nm和620nm处获得的信号比率用于计算化合物的抑制百分比,如下所示:
抑制百分比=100-((测试比率-阴性对照比率)/(阳性对照比率-阴性对照比率)×100),其中
阳性对照=PRMT5+SAM+H4R3
阴性对照=PRMT5+H4R3
Figure BDA0003402377930001111
Figure BDA0003402377930001121
SDMA抑制试验
方案(Protocol)
将Z-138细胞(ATCC,CRL-3001TM)以1百万细胞/孔的密度接种在透明平底组织培养48孔板中。用各种浓度的测试化合物处理细胞48小时。用1X CST裂解缓冲液(CellSignaling Technology,USA)制备细胞裂解物,将500ng/孔/50μL的裂解物在pH 9.6的碳酸盐缓冲液中的溶液涂布在96孔Maxisorb平板上,并在4℃下孵育过夜。将平板在含有0.05%Tween 20的1x PBS中洗涤两次,并在环境温度下在1%BSA中封闭1小时。此外,首先将平板与一抗(抗-SDMA抗体;CST#13222s)在环境温度温育2小时,然后与HRP偶联的二抗在环境温度温育1小时,其间进行2个间歇洗涤步骤。
对于基于发光的检测,加入HRP底物(底物A+底物B的比例为1:1),30分钟后在SynergyTM 2阅读器(Biotek,USA)中进行发光读取。
对于基于吸光度的检测,加入TMB底物,随后在显色后加入STOP溶液(2N H2SO4),并在SynergyTM 2阅读器(Biotek,USA)中测量吸光度(激发450nm和发射540nm)。
按照下式计算相对于仅含有0.1%DMSO的介质的媒介物对照样品的SDMA抑制百分比。
(未处理对照的平均-测试的平均)×100
未处理对照的平均
使用Graph Pad Prism(Graph Pad Software,Inc,USA)通过非线性回归分析计算各个化合物的IC50值。
Figure BDA0003402377930001122
抗癌活性测定
将Z-138细胞以2000-3000细胞/孔的密度接种在培养基(IMDM+10%FBS)中。将PANC-1(ATCC,CRL-1469TM)和MIA PaCa-2(ATCC,CRL-1420TM)细胞以每孔200-300个细胞的密度接种在培养基(DMEM+10%FBS)中。将细胞接种在不透明的平底组织培养级96孔板中,接种Z-138细胞(悬浮液),并在同一天用不同浓度的试验化合物处理。将贴壁的PANC-1和MIA PaCa-2细胞在标准细胞培养条件(37℃,5%CO2)下保持过夜沉降。第二天,用各种浓度的测试化合物处理细胞。对于Z-138细胞、PANC-1细胞和MIA PaCa-2细胞,分别用测试化合物处理细胞96小时、7天和10天。按照制造商的说明书,使用CellTiterGloTM(Promega,USA)评估细胞活力。在SynergyTM 2阅读器(Biotek,USA)中读取相对光单位(RLU)。该测定测量细胞ATP作为细胞生存力的指示。RLU与相应孔中的活细胞的数量成比例。按照下式计算相对于仅含有0.1%DMSO的培养基的媒介物对照样品的细胞生存力抑制百分数。
(未处理对照的平均-测试的平均)×100
未处理对照的平均数
使用Graph Pad Prism(Graph Pad Software,Inc,USA)通过非线性回归分析计算各个化合物的IC50值。
抗癌分析(Z-138)
活动范围 化合物编号
IC<sub>50</sub>0.1pM-100pM 1,22B,23A,30
IC<sub>50</sub>101pM-1nM 5,6,10,13,14,15,21
IC<sub>50</sub>>1nM 2,3,4,7,8,9,11,12,17,18,19,20,22A,23B,24,25,26,27,28.
抗癌分析(MiaPaCa-2)
活动范围 化合物编号
IC<sub>50</sub> 1pM-40nM 1,2,5,6,13,22B,23A,27,30
体内功效实验
套细胞淋巴瘤的肿瘤异种移植通过将细胞注射到购自美国杰克逊实验室的7-11周龄的雌性NOD.CB17-Prkdc<scid>/J小鼠的右侧胁腹而建立。在实验开始之前,所有的动物研究建议都由实验动物协会(IAEC)评审和批准。
Z-138异种移植
对于Z-138异种移植小鼠模型,使Z-138细胞(
Figure BDA0003402377930001131
CRL-3001TM)在补充有10%FBS的IMDM培养基中生长。在标准条件下,在370℃和5%CO2孵育细胞。为了产生肿瘤,将IMDM培养基中的Z-138细胞与基质胶(
Figure BDA0003402377930001132
Basement Membrane Matrix)以1:1的比例混合。10×106个细胞)以200μL的体积注射到每只小鼠的皮下以建立肿瘤。一旦肿瘤的平均体积达到100至120mm3之间,将小鼠随机分成8-10只小鼠的治疗组。在随机化当天开始治疗,并持续至研究结束。使用管饲管,以每只小鼠每天两次10mL/kg的施用体积,分别口服施用载体和测试化合物治疗组。
将小鼠圈养在单独通风的笼(IVC)中,室温为22±30℃,湿度为50±20%,并且光/暗循环12/12小时。所有实验活动均在生物安全柜内进行以确保无菌。
当肿瘤变得可触知时,用Digimatic游标卡尺(Mitutoyo,日本)测量肿瘤尺寸。肿瘤体积通过使用下式计算:
肿瘤体积(mm3)=(L×W2)/2
其中,L:肿瘤长度,W:肿瘤毫米宽度
使用以下公式计算肿瘤生长抑制百分比(%TGI):
%TGI=[1-(Tf-Ti)/(Cf-Ci)]×100
其中Tf和Ti是最终和初始肿瘤体积(测试化合物),Cf和Ci分别是最终和初始平均肿瘤体积(载体组)。
肿瘤消退百分比计算如下:
%TR:(Ti-Tf)/(Ti)×100
其中Tf和Ti分别是最终和初始肿瘤体积。
体内功效实验
用于胰腺癌的肿瘤碎片异种移植是通过将30-45mm 3的肿瘤碎片皮下植入年龄在10-11周之间的雌性无胸腺裸FOXn1/J/Mus musculus小鼠的右侧腹壁建立的,该小鼠购自Jackson Laboratory,USA。在实验开始之前,所有的动物研究建议都由实验动物协会(IAEC)评审和批准。

Claims (18)

1.通式(I)的化合物,其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure FDA0003402377920000011
其中,
L1选自键、-CRaRb-、-NRa-、S、和O;
Ra和Rb在每次出现时独立地选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure FDA0003402377920000012
Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure FDA0003402377920000013
R选自-NR4R5、氢、取代或未取代的烷基和环烷基;
Z选自CR10和N;
R1和R2与它们所连接的碳原子一起形成键以形成-C=C-;或R1和R2与它们所连接的碳原子一起形成环丙烷环;
R2'和R2a可以相同或不同,独立选自氢和取代或未取代的烷基;
R3每次出现时独立选自卤素、氰基、硝基、取代或未取代的烷基、-OR6、-NR7R8、取代或未取代的环烷基、-C(O)OH、-C(O)O-烷基、-C(O)R9、-C(O)NR7R8、-NR7C(O)R9、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基和取代或未取代的杂环基;
R4和R5独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R6选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R7和R8独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R9选自取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R10选自氢、卤素和取代或未取代的烷基;
“n”是0-4的整数,包括两个端点;
“m”是0-1的整数,包括两个端点;
当烷基被取代时,其被1至4个独立选自以下的取代基取代:-氧代(=O)、卤素、氰基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、-OR7a、-C(=O)OH、-C(=O)O(烷基)、-NR8aR8b、-NR8aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b
当杂芳基被取代时,其被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当杂环基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当芳基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当环烷基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
R7a选自氢、烷基、卤代烷基和环烷基;
R8a和R8b各自独立选自氢、烷基和环烷基;以及
R9a选自烷基和环烷基。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中,所述化合物具有式(II)的结构,其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure FDA0003402377920000031
其中,
L1选自键、-CRaRb-、-NRa-、S和O;
Ra和Rb在每次出现时独立地选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure FDA0003402377920000032
Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure FDA0003402377920000033
R选自-NR4R5、氢、取代或未取代的烷基和环烷基;
Z选自CR10和N;
R2'和R2a可以相同或不同,独立选自氢和取代或未取代的烷基;
R3每次出现时独立选自卤素、氰基、硝基、取代或未取代的烷基、-OR6、-NR7R8、取代或未取代的环烷基、-C(O)OH、-C(O)O-烷基、-C(O)R9、-C(O)NR7R8、-NR7C(O)R9、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基和取代或未取代的杂环基;
R4和R5独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R6选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R7和R8独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R9选自取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R10选自氢、卤素和取代或未取代的烷基;
“n”是0-4的整数,包括两个端点;
“m”是0-1的整数,包括两个端点;
当烷基被取代时,其被1至4个独立选自以下的取代基取代:-氧代(=O)、卤素、氰基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、-OR7a、-C(=O)OH、-C(=O)O(烷基)、-NR8aR8b、-NR8aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b
当杂芳基被取代时,其被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当杂环基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当芳基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当环烷基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
R7a选自氢、烷基、卤代烷基和环烷基;
R8a和R8b各自独立选自氢、烷基和环烷基;以及
R9a选自烷基和环烷基。
3.根据权利要求1所述的化合物,其中,所述化合物具有式(IIa)的结构,其立体异构体或其药学可接受的盐,
Figure FDA0003402377920000041
其中,
L1选自键、-CRaRb-、-NRa-、S和O;
Ra和Rb在每次出现时独立地选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R选自-NR4R5、氢、取代或未取代的烷基和环烷基;
R2'和R2a可以相同或不同,独立选自氢和取代或未取代的烷基;
R3每次出现时独立选自卤素、氰基、硝基、取代或未取代的烷基、-OR6、-NR7R8、取代或未取代的环烷基、-C(O)OH、-C(O)O-烷基、-C(O)R9、-C(O)NR7R8、-NR7C(O)R9、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基和取代或未取代的杂环基;
R4和R5独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R6选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R7和R8独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R9选自取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R10选自氢、卤素、取代或未取代的烷基;
“n”是0-4的整数,包括两个端点;
当烷基被取代时,其被1至4个独立选自以下的取代基取代:-氧代(=O)、卤素、氰基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、-OR7a、-C(=O)OH、-C(=O)O(烷基)、-NR8aR8b、-NR8aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b
当杂芳基被取代时,其被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当杂环基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当芳基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当环烷基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
R7a选自氢、烷基、卤代烷基和环烷基;
R8a和R8b各自独立选自氢、烷基和环烷基;以及
R9a选自烷基和环烷基。
4.根据权利要求1所述的化合物,其中,所述化合物具有式(III)的结构,其立体异构体或其药学上可接受的盐,
Figure FDA0003402377920000061
其中,
L1选自键、-CRaRb-、-NRa-、S和O;
Ra和Rb在每次出现时独立地选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure FDA0003402377920000062
Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure FDA0003402377920000063
R选自-NR4R5、氢、取代或未取代的烷基和环烷基;
Z选自CR10和N;
R2'和R2a可以相同或不同,独立选自氢和取代或未取代的烷基;
R3每次出现时独立选自卤素、氰基、硝基、取代或未取代的烷基、-OR6、-NR7R8、取代或未取代的环烷基、-C(O)OH、-C(O)O-烷基、-C(O)R9、-C(O)NR7R8、-NR7C(O)R9、取代或未取代的芳基、取代或未取代的杂芳基和取代或未取代的杂环基;
R4和R5独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R6选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R7和R8独立选自氢、取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R9选自取代或未取代的烷基和取代或未取代的环烷基;
R10选自氢、卤素、取代或未取代的烷基;
“n”是0-4的整数,包括两个端点;
“m”是0-1的整数,包括两个端点;
当烷基被取代时,其被1至4个独立选自以下的取代基取代:-氧代(=O)、卤素、氰基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、-OR7a、-C(=O)OH、-C(=O)O(烷基)、-NR8aR8b、-NR8aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b
当杂芳基被取代时,其被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当杂环基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当芳基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、环烷基、杂环基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
当环烷基被取代时,它被1-4个独立选自卤素、氰基、烷基、卤代烷基、-OR7a、-NR8aR8b、-NR7aC(=O)R9a和-C(=O)NR8aR8b的取代基取代;
R7a选自氢、烷基、卤代烷基和环烷基;
R8a和R8b各自独立选自氢、烷基和环烷基;以及
R9a选自烷基和环烷基。
5.根据权利要求1-4中任意一项所述的化合物,其中,L1选自-CH2-和-NH-。
6.根据权利要求1-4中任意一项所述的化合物,其中,R3独立地选自卤素、取代或未取代的烷基和-NR7R8
7.根据权利要求6所述的化合物,其中,R3独立地选自F、Cl、Br、-NH2、-CH3和-CH(F)2
8.根据权利要求1-4中任意一项所述的化合物,其中,Ra、Rb、R2'和R2a独立地选自氢和甲基。
9.根据权利要求1所述的化合物,其中,Ra、Rb、R2'和R2a独立地为氢或甲基;L1选自-CH2-和-NH-;环A选自式(i)、(ii)、(iii)和(iv),其中环A上的取代基R3可在任何环碳原子上被取代,
Figure FDA0003402377920000081
R3每次出现时独立地选自卤素、取代或未取代的烷基和-NR7R8,其中R7和R8独立地选自氢和取代或未取代的烷基;Hy选自式(a-1)至(h-1),条件是当Hy为(h-1)时,则环A不能为式(i),
Figure FDA0003402377920000082
其中,R选自-NR4R5、氢、取代或未取代的烷基;Z选自CR10和N;R10选自氢、卤素和取代或未取代的烷基;R4和R5独立选自氢和取代或未取代的烷基;R6选自氢和取代或未取代的烷基;n'是0-4的整数,包括两个端点;m是0-1的整数,包括两个端点。
10.根据权利要求1所述的式(I)的化合物,其立体异构体或其药学上可接受的盐,其中,所述化合物选自:
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物1);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-氨基-7-氯-1,5-萘啶-3-基)乙基)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物2);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(3-氨基喹喔啉-6-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物3);
(1R,2R,3S,4R,5S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-1-(2-(3-氨基喹喔啉-6-基)乙基)二环[3.1.0]己烷-2,3-二醇(化合物4);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物5);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-氨基-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物6);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(((6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)氧基)甲基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物7);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物8);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物9);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物10);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(5-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物11);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(((6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)氧基)甲基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物12);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物13);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物14);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物15);
4-氨基-1-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)嘧啶-2(1H)-酮(化合物16);
6-氨基-3-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)嘧啶-4(3H)-酮(化合物17);
3-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)-6-甲基嘧啶-4(3H)-酮(化合物18);
6-氨基-3-((1R,4R,5S)-3-(((2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)氧基)甲基)-4,5-二羟基环戊-2-烯-1-基)-5-氟嘧啶-4(3H)-酮(化合物19);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-氯-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物20);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(5,6-二氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物21);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-4-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物22A和B);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-3-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物23A和B);
(1R,2R,3S,4R,5S)-1-(2-(6-氨基-7-氯-1,5-萘啶-3-基)乙基)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)二环[3.1.0]己烷-2,3-二醇(化合物24);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-5-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物25);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-溴喹啉-7-基)乙基)-5-(7H-咪唑并[1,2-c]吡咯并[3,2-e]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物26);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(7H-咪唑并[1,2-c]吡咯并[3,2-e]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物27);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯喹啉-7-基)乙基)-5-(8H-咪唑并[1,2-a]吡咯并[2,3-d]嘧啶-8-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物28);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(7H-咪唑并[1,2-c]吡唑并[4,3-e]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物29);以及
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-(甲氧基氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物30)。
11.根据权利要求1所述的式(I)的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐,其中,所述化合物选自:
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物1);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物5);
(1S,2R,5R)-3-(2-(2-氨基-3-氯-5-氟喹啉-7-基)乙基)-5-(4-氨基-6-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物6);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物10);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物13);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物14);
(1S,2R,5R)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物15);
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-4-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物22A和B);以及
(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3-(2-(6-(二氟甲基)-5-氟-3-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉-8-基)乙基)环戊-3-烯-1,2-二醇(化合物23A和B)。
12.一种药物组合物,其包含至少一种权利要求1-11中任意一项所述的化合物、其立体异构体或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载体。
13.一种治疗与PRMT5酶相关的疾病、病症、综合征或疾患的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用有效量的如权利要求1-11中任意一项所述的化合物。
14.根据权利要求13所述的方法,其中,所述与PRMT5酶相关的疾病、病症、综合征或疾患是多形性胶质母细胞瘤、前列腺癌、胰腺癌、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤、急性髓性白血病、急性成淋巴细胞性白血病、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、乳腺癌、三阴性乳腺癌、胃癌、结肠直肠癌、卵巢癌、膀胱癌、肝细胞癌、黑素瘤、肉瘤、口咽鳞状细胞癌、慢性髓性白血病、表皮鳞状细胞癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、子宫内膜癌和宫颈癌。
15.根据权利要求13所述的方法,其中,所述与PRMT5酶相关的疾病、病症、综合征或疾患是癌症。
16.权利要求1-11中任意一项的化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗与PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患的药物中的用途。
17.根据权利要求16所述的用途,其中,所述与PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患选自多形性胶质母细胞瘤、前列腺癌、胰腺癌、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤、急性髓性白血病、急性淋巴细胞白血病、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、乳腺癌、三阴性乳腺癌、胃癌、结肠直肠癌、卵巢癌、膀胱癌、肝细胞癌、黑素瘤、肉瘤、口咽鳞状细胞癌、慢性髓性白血病、表皮鳞状细胞癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、子宫内膜癌和宫颈癌。
18.根据权利要求16所述的用途,其中,所述与PRMT5相关的疾病、病症、综合征或疾患是癌症。
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