CN113505270A - 将后处理isp生成的数据与结构化报告整合的方法及系统 - Google Patents

将后处理isp生成的数据与结构化报告整合的方法及系统 Download PDF

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Abstract

本发明提供了一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法，包括接收影像后处理ISP生成的格式化XML数据；基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；当医生编辑结构化报告时，提取患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据。本发明还公开了一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统。本发明能将后处理ISP生成的处理结果直接发送到结构化报告，便于撰写报告以及后期的数据分析和科研教学。

Description

将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法及系统
技术领域
本发明涉及医疗信息领域，更具体地，涉及一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法及系统。
背景技术
对于影像的高级后处理ISP软件，可在该影像后处理软件中调用不同的Appliaction，对检查的医学影像进行自动或者手工测量分析，测量分析结果并生成测量值表格数据及关键图像。该影像后处理软件目前基本具备这些功能：可将测量数据和关键图像生成一份PDF报告；可将测量数据和关键图像生成格式化XML数据，通过Webservice协议发送给其他系统。
但医疗机构使用该影像后处理软件面临的问题为：生成的PDF格式报告不适合报告排版要求，不能直接发布给临床和患者；生成的测量数据没有设置标签和编码，不便于后期做数据分析和科研。
发明内容
有鉴于此，本发明的主要目的在于提供一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法及系统，能够解决现有技术中存在的不能将后处理软件ISP生成的处理结果直接发送到临床、生成的文档不利于报告的排班、后期的数据分析和科研教学的问题。
为达到上述目的，本发明的技术方案是这样实现的：
一方面，本发明提供了一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法，包括通过相关协议接口接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，调用相关函数，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；其中，结构化数据分为患者基本信息结构化数据和病灶结构化数据；对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；当医生编辑结构化报告时，自动提取患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据。
优选地，该方法还包括：预设的解析规则是基于不同的所述影像后处理软件ISP以及不同的模板类型来设置；其中，预设的解析规则包含的要素为：先按照影像检查部位进行数据分段，对每个数据段的不同行、不同列的数据设置读取规则、对关键图像设置读取规则。
优选地，该方法还包括：预设的配置规则是基于结构化报告类型来设置。
优选地，该方法还包括：对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储。
另一方面，本发明还提供了一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统，包括：接收模块、解析模块、数据转换模块、设置模块和提取模块，其中，接收模块，与解析模块相连，用于通过相关协议接口接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；解析模块，分别与接收模块和数据转换模块相连，用于基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；数据转换模块，分别与解析模块和设置模块相连，用于根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，调用相关函数，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；其中，结构化数据分为患者基本信息结构化数据和病灶结构化数据；设置模块，分别与数据转换模块和提取模块相连，用于对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；提取模块，与设置模块相连，用于当医生编辑结构化报告时，自动提取患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据。
优选地，该系统还包括：第一定义模块，与解析模块相连，用于基于不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置预设的解析规则；其中，预设的解析规则包含的要素为：先按照影像检查部位进行数据分段，对每个数据段的不同行、不同列的数据设置读取规则、对关键图像设置读取规则。
优选地，该系统还包括：第二定义模块，与数据转换模块相连，用于基于结构化报告类型设置预设的配置规则。
优选地，设置模块还包括存储单元，用于对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储。
本发明的技术效果：
本发明的方法可以接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析；根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；当医生编辑结构化报告时，可以自动提取该影像后处理软件生成的测量值等数据；本发明的方法可以将影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据整合到结构化报告系统中，可以将测量数据直接发布到临床，满足报告的排版要求，由于转换后的数据已经设置标签和编码，便于后期的统计分析和临床科研的使用；本发明还可以对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储，便于不同的第三方系统对数据的提取和使用，支持HIS/EMR系统将该后处理软件生成的数据发布的临床。
附图说明
此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解，构成本申请的一部分，本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明，并不构成对本发明的不当限定。在附图中：
图1示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法流程图；
图2示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中接收到后处理软件生成的格式化XML数据界面示意图；
图3示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中根据不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置预设的解析规则界面示意图；
图4示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中格式化XML数据转换为患者基本信息结构化数据界面示意图；
图5示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中标签化和编码化的病灶结构化数据界面示意图；
图6示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中标签化和编码化的病灶结构化数据一一填入到结构化报告界面示意图；
图7示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图；
图8示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中接收到后处理软件生成的格式化XML数据界面示意图；
图9示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中格式化XML数据转换为患者基本信息结构化数据界面示意图；
图10示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中标签化和编码化的病灶结构化数据界面示意图；
图11示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中标签化和编码化的病灶结构化数据一一填入到结构化报告界面示意图；
图12示出了根据本发明实施例三的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图；
图13示出了根据本发明实施例三的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中根据不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置预设的解析规则界面示意图；
图14示出了根据本发明实施例四的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图；
图15示出了根据本发明实施例五的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图。
具体实施方式
下面将参考附图并结合实施例，来详细说明本发明。
实施例一
图1示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法流程图，该方法包括以下步骤：
本发明主要构建一种将医学影像处理软件ISP生成的测量值和关键图像格式化数据整合到结构化报告系统中的方法，该方法主要对数据进行分析解析、对转换后的结构化数据进行标签化、编码化，整合到结构化报告系统中，结构化报告系统可以完成报告的书写、发布，对标签化、编码化的数据，后期可用于统计分析和临床科研。
步骤S101，通过相关协议接口接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；
其中相关协议接口为Webservice。
图2示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中接收到后处理软件生成的格式化XML数据界面示意图；如图2所示，为后处理ISP生成的格式化XML数据，包含患者基本信息和病灶数据(测量值和关键图像)，后处理软件ISP的数据一般包含如下内容：后处理软件模板基础数据，包括病人检查基本数据、病灶测量表格数据、病灶关键图像数据，其他关键图像数据等。
步骤S102，基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；
其中，预设的解析规则是基于不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型来设置；其中，预设的解析规则包含的要素为：先按照影像检查部位进行数据分段，对每个数据段的不同行、不同列的数据设置读取规则、对关键图像设置读取规则。
图3示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中根据不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置预设的解析规则界面示意图；如图3所示，后处理软件ISP对肺结节的诊断输出，根据影像检查部位，肺部分为左主支气管、右主支气管、左肺上支气管等数据段。
步骤S103，根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，调用相关函数(dll函数)，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据(中间变量)，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；
其中，结构化数据分为患者基本信息结构化数据和病灶结构化数据；
步骤S104，对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；
图4示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中格式化XML数据转换为患者基本信息结构化数据界面示意图；如图4所示，例如患者姓名、性别、年龄、检查号、检查日期、检查部位等。
图5示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中标签化和编码化的病灶结构化数据界面示意图；如图5所示，设置编码使用radlex编码。
步骤S105，当医生编辑结构化报告时，自动提取患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据。
图6示出了根据本发明实施例一的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法中标签化和编码化的病灶结构化数据一一填入到结构化报告界面示意图；如图6所示，将后处理生成的数据与结构化报告的标签一一对应填写到报告中，包括病灶的测量值和关键图像。
其中，该方法还包括：预设的配置规则是基于结构化报告类型来设置。
根据结构化报告的类型，比如肺结节的报告，每个控件标签与格式化XML标签的一一对应。
其中，该方法还包括：对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储。
其中，患者基本信息结构化数据存储于RIS系统，标签化和编码化的病灶结构化数据存储到结构化报告系统中，以便后期单独调用。
本发明实施例可以接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析；根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；当医生编辑结构化报告时，可以自动提取该影像后处理软件生成的测量值等数据；本发明的实施例可以将影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据整合到结构化报告系统中，可以将测量数据直接发布到临床，满足报告的排版要求，由于转换后的数据已经设置标签和编码，便于后期的统计分析和临床科研的使用；本发明的实施例还可以对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储，便于不同的第三方系统对数据的提取和使用，支持HIS/EMR系统将该后处理软件生成的数据发布的临床。
实施例二
图7示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图，如图7所示，该系统包括：接收模块10、解析模块20、数据转换模块30、设置模块40和提取模块50，其中，
接收模块10，与解析模块20相连，用于通过相关协议接口接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；
其中相关协议接口为Webservice。
图8示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中接收到后处理软件生成的格式化XML数据界面示意图；如图8所示，
为后处理ISP生成的格式化XML数据，包含患者基本信息和病灶数据(测量值和关键图像)，后处理软件ISP的数据一般包含如下内容：后处理软件模板基础数据，包括病人检查基本数据、病灶测量表格数据、病灶关键图像数据，其他关键图像数据等。
解析模块20，分别与接收模块10和数据转换模块30相连，用于基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；
数据转换模块30，分别与解析模块20和设置模块40相连，用于根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，调用相关函数(dll函数)，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据(中间变量)，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；
其中，结构化数据分为患者基本信息结构化数据和病灶结构化数据；
设置模块40，分别与数据转换模块30和提取模块50相连，用于对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；
图9示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中格式化XML数据转换为患者基本信息结构化数据界面示意图；如图9所示，例如患者姓名、性别、年龄、检查号、检查日期、检查部位等。
图10示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中标签化和编码化的病灶结构化数据界面示意图；如图10所示，设置编码使用radlex编码。
提取模块50，与设置模块40相连，用于当医生编辑结构化报告时，自动提取患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据。
图11示出了根据本发明实施例二的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中标签化和编码化的病灶结构化数据一一填入到结构化报告界面示意图；如图11所示，将后处理生成的数据与结构化报告的标签一一对应填写到报告中，包括病灶的测量值和关键图像。
本发明实施例设置了接收模块、解析模块、数据转换模块、设置模块和提取模块，可以接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析；根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；当医生编辑结构化报告时，可以自动提取该影像后处理软件生成的测量值等数据；本发明的实施例可以将影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据整合到结构化报告系统中，可以将测量数据直接发布到临床，满足报告的排版要求，由于转换后的数据已经设置标签和编码，便于后期的统计分析和临床科研的使用。
实施例三
图12示出了根据本发明实施例三的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图；如图12所示，该系统还包括：第一定义模块60，与解析模块20相连，用于基于不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置预设的解析规则；其中，预设的解析规则包含的要素为：先按照影像检查部位进行数据分段，对每个数据段的不同行、不同列的数据设置读取规则、对关键图像设置读取规则。
图13示出了根据本发明实施例三的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统中根据不同的影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置预设的解析规则界面示意图；如图13所示，后处理软件ISP对肺结节的诊断输出，根据影像检查部位，肺部分为左主支气管、右主支气管、左肺上支气管等数据段。
实施例四
图14示出了根据本发明实施例四的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图；如图14所示，该系统还包括：第二定义模块70，与数据转换模块30相连，用于基于结构化报告类型设置预设的配置规则。
根据结构化报告的类型，比如肺结节的报告，每个控件标签与格式化XML标签的一一对应。
实施例五
图15示出了根据本发明实施例五的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统结构示意图；如图15所示，设置模块40还包括存储单元402，用于对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储。
其中，患者基本信息结构化数据存储于RIS系统，标签化和编码化的病灶结构化数据存储到结构化报告系统中，以便后期单独调用。
本发明实施例中的存储单元，可以对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储，便于不同的第三方系统对数据的提取和使用，支持HIS/EMR系统将该后处理软件生成的数据发布的临床。
从以上描述中，可以看出，本发明的上述实施例实现了如下技术效果：本发明可以接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；基于预设的解析规则，将格式化XML数据进行解析；根据预设的配置规则，提取患者基本信息和病灶数据中的关键字，基于关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；对每个病灶结构化数据进行标签化和编码化；当医生编辑结构化报告时，可以自动提取该影像后处理软件生成的测量值等数据；本发明的实施例可以将影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据整合到结构化报告系统中，可以将测量数据直接发布到临床，满足报告的排版要求，由于转换后的数据已经设置标签和编码，便于后期的统计分析和临床科研的使用；本发明的实施例还可以对患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储，便于不同的第三方系统对数据的提取和使用，支持HIS/EMR系统将该后处理软件生成的数据发布的临床。
显然，本领域的技术人员应该明白，上述的本发明的各模块或各步骤可以用通用的计算装置来实现，它们可以集中在单个的计算装置上，或者分布在多个计算装置所组成的网络上，可选地，它们可以用计算装置可执行的程序代码来实现，从而，可以将它们存储在存储装置中由计算装置来执行，或者将它们分别制作成各个集成电路模块，或者将它们中的多个模块或步骤制作成单个集成电路模块来实现。这样，本发明不限制于任何特定的硬件和软件结合。
以上所述仅为本发明的优选实施例而已，并不用于限制本发明，对于本领域的技术人员来说，本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (8)

1.一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法，其特征在于，包括：
通过相关协议接口接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；
基于预设的解析规则，将所述格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；
根据预设的配置规则，提取所述患者基本信息和所述病灶数据中的关键字，调用相关函数，基于所述关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将所述与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；其中，所述结构化数据分为患者基本信息结构化数据和病灶结构化数据；
对每个所述病灶结构化数据进行标签化和编码化；
当医生编辑所述结构化报告时，自动提取所述患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的所述病灶结构化数据。
2.根据权利要求1所述的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法，其特征在于，该方法还包括：所述预设的解析规则是基于不同的所述影像后处理软件ISP以及不同的模板类型来设置；其中，所述预设的解析规则包含的要素为：先按照影像检查部位进行数据分段，对每个数据段的不同行、不同列的数据设置读取规则、对关键图像设置读取规则。
3.根据权利要求1所述的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法，其特征在于，该方法还包括：所述预设的配置规则是基于所述结构化报告类型来设置。
4.根据权利要求1所述的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的方法，其特征在于，该方法还包括：对所述患者基本信息结构化数据、所述标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储。
5.一种将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统，其特征在于，该系统包括：接收模块、解析模块、数据转换模块、设置模块和提取模块，其中，
所述接收模块，与所述解析模块相连，用于通过相关协议接口接收影像后处理软件ISP生成的格式化XML数据；
所述解析模块，分别与所述接收模块和所述数据转换模块相连，用于基于预设的解析规则，将所述格式化XML数据进行解析，将解析后的XML数据分成两类：患者基本信息和病灶数据；
所述数据转换模块，分别与所述解析模块和所述设置模块相连，用于根据预设的配置规则，提取所述患者基本信息和所述病灶数据中的关键字，调用相关函数，基于所述关键字生成与结构化报告格式相匹配的数据，将所述与结构化报告格式相匹配的数据定义为结构化数据；其中，所述结构化数据分为患者基本信息结构化数据和病灶结构化数据；
所述设置模块，分别与所述数据转换模块和所述提取模块相连，用于对每个所述病灶结构化数据进行标签化和编码化；
所述提取模块，与所述设置模块相连，用于当医生编辑所述结构化报告时，自动提取所述患者基本信息结构化数据、标签化和编码化的所述病灶结构化数据。
6.根据权利要求5所述的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统，其特征在于，该系统还包括：第一定义模块，与所述解析模块相连，用于基于不同的所述影像后处理软件ISP以及不同的模板类型设置所述预设的解析规则；其中，所述预设的解析规则包含的要素为：先按照影像检查部位进行数据分段，对每个数据段的不同行、不同列的数据设置读取规则、对关键图像设置读取规则。
7.根据权利要求5所述的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统，其特征在于，该系统还包括：第二定义模块，与所述数据转换模块相连，用于基于所述结构化报告类型设置所述预设的配置规则。
8.根据权利要求5所述的将后处理ISP生成的数据与结构化报告整合的系统，其特征在于，所述设置模块还包括存储单元，用于对所述患者基本信息结构化数据、所述标签化和编码化的病灶结构化数据进行单独存储。
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