CN113157654B - 数字切片图像存储的方法和装置 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种数字切片图像存储的方法和装置,方法包括以下步骤:步骤1,设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;步骤2,对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中。本发明设计了一种分块分段式存储数字切片瓦片金字塔模型的文件格式,能以二进制方式存储瓦片图、瓦片图的信息、数字切片的基本信息、扫描视野信息及标记信息;将数字切片分成金字塔多层并在每层按照256*256瓦片图的方式进行图像存储,满足了医学数字切片的存储要求,减少了无效部分的存储,保证了切片存取速度。
Description
技术领域
本发明涉及一种数字切片图像存储的方法和装置,属于数字切片图像处理技术领域。
背景技术
数字切片是利用数字切片扫描仪将传统的玻璃切片数字化后的切片,数字化后可以形成全视野数字病理切片(Whole slide images,WSIs)。一张全视野数字病理切片的分辨率可以达到几十万像素乘几十万像素,需要存储的数据量非常大。用户在查看数字切片时,需要从小的全景图逐步放大来进行查看。这样如果将整张数字切片作为一张图片存储,存放和读取都非常困难,效率非常低。通用的做法是将整张数字切片分割成256*256的瓦片图来进行存放和读取;同时为了方便用户查看,一般将数字切片进行分层处理,最底层是最大的图片,向上每一层逐渐缩小,上一层的长宽是下一层的1/2,每层由256*256的瓦片组成。整个切片的存储方式类似于金字塔结构。
现在存储全景数字切片的文件格式一般采用TIFF格式。TIFF能存储多层图片,并且在每一层可以按照指定大小的瓦片图进行存储。但是TIFF格式每层要求存储的大小为一个方形,这样数字切片的很多空白区域都需要存储,增大了文件的大小,对文件读取和传输造成影响。同时TIFF格式存在安全漏洞,容易遭受攻击。为了满足不同的扫描模式和存储要求大多数厂家都推出自己的数字切片文件格式,这些格式都是私有格式。
为了满足医学数字切片的存储要求,减少无效部分的存储,保证切片读取速度,本发明提出一种瓦片金字塔模型的数字切片图像存储方案。
发明内容
为了解决上述问题,本发明提出了一种数字切片图像存储的方法和装置。
本发明解决其技术问题采取的技术方案是:
第一方面,本发明实施例提供的一种数字切片图像存储的方法,包括以下步骤:
步骤1,设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;
步骤2,对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述图片与其相关信息存储到不同的存储区域中。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述存储区域包括:
存储区域一:存储数字切片瓦片图的二进制数据;
存储区域二:存储数字切片的基本信息;
存储区域三:存储数字切片瓦片图的信息;
存储区域四:存储图像视野的原始信息;
存储区域五:存储用户标记信息索引段;
存储区域六:存储存储区域二至存储区域五的各自信息索引段在文件中的起始位置。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述数字切片瓦片图按照jpg、png和tiff格式进行处理形成二进制数据;
所述数字切片的基本信息包括扫描设备类型、设备编号、扫描倍率、扫描开始时间、扫描结束时间;标签数据的存储位置和数据大小信息;
所述数字切片瓦片图的信息包括瓦片图在文件中的起始位置和瓦片图数据大小信息;
所谓图像视野的原始信息就是从摄像头中采集下来的图片信息,包括原始图片对应的扫描仪的位置信息、图片在整个切片中的虚拟坐标信息;
所述用户标记信息索引段为用户的在数字切片上所标注的信息,包含圆形图像信息和方形图像信息及其对应的描述信息。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述步骤2具体包括以下步骤:
(1)定义各存储区域AreaStructure的变量:存储区域二的信息变量slideBaseInfo;存储区域三的信息变量tilePictureInfo;存储区域四的信息变量viewInfo;存储区域五的信息变量userMarkInfo;
(2)获取传统切片的预览图片,建立GroupSectionStructure结构体的变量previewInfo,先将预览图片转成二进制数据,将二进制数据保存到文件存储区域一中,并记录保存的起始位置,将二进制数据大小信息存入变量previewInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将变量previewInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(3)拍摄传统切片的标签区域,获得数字切片的标签图,建立GroupSectionStructure的变量barCodeInfo,先将标签图转成二进制数据,将二进制数据保存到文件末尾,并记录保存的起始位置、二进制数据大小等信息,并存入变量barCodeInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将barCodeInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(4)记录扫描开始时间、设备型号、物镜类型等信息,加入slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(5)扫描传统切片,建立GroupSectionStructure结构体的变量viewDetailInfo,采集每一幅图像,记录每幅原始图的信息,包括对应设备的步进、相对坐标、是否为聚焦点信息,加入viewDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量viewDetailInfo加入到viewInfo变量的mapGroup中;
(6)对原始视野进行配准分割产生瓦片图,建立GroupSectionStructure结构体的变量tileDetailInfo,将瓦片图转为二进制数据,保存到文件末尾,并将存储的起始位置、二进制数据大小、瓦片图坐标信息存入tileDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量tileDetailInfo加入到tilePictureInfo变量的mapGroup中;
(7)完成扫描,记录扫描结束时间、总视野数扫描信息到slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中。
(8)存储存储区域二至存储区域五的数据;记录文件末尾位置longSlideInfo,存储slideBaseInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储每个详细信息;存储slideBaseInfo完成后,记录文件末尾位置longPictureInfo,存储tilePictureInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储tilePictureInfo完成后,记录文件末尾位置longViewInfo,存储viewInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储viewInfo完成后,记录文件末尾位置longUserMarkInfo,存储userMarkInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储用户标记信息;
(9)将存储区域二至存储区域五的起始位置longSlideInfo、longPictureInfo、longViewInfo和longUserMarkInfo存储到文件末尾,至此文件存储完成。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述的数字切片图像存储的方法还包括:
步骤3,读取数字切片图像数据,查询具体的信息或读取相应瓦片。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述步骤3具体包括以下步骤:
(1)读取存储区域二至存储区域五的起始位置,分别存放到变量longSlideInfo、变量longPictureInfo、变量longViewInfo、变量longUserMarkInfo中;
(2)从位置longSlideInfo开始,来读取切片基本信息到变量slideBaseInfo;从位置longPictureInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量tilePictureInfo;从位置longViewInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量viewInfo;从位置longUserMarkInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量userMarkInfo;
(3)从相应的变量中来查询具体的信息或读取相应瓦片。
第二方面,本发明实施例提供的一种数字切片图像存储的装置,其特征是,包括:
存储格式设置模块,用于设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;
图像存储模块,用于对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述存储区域包括:
存储区域一:存储数字切片瓦片图的二进制数据;
存储区域二:存储数字切片的基本信息;
存储区域三:存储数字切片瓦片图的信息;
存储区域四:存储图像视野的原始信息;
存储区域五:存储用户标记信息索引段;
存储区域六:存储存储区域二至存储区域五的各自信息索引段在文件中的起始位置。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述的数字切片图像存储的装置还包括:
图像读取模块,用于读取数字切片图像数据,查询具体的信息或读取相应瓦片。
本发明实施例的技术方案可以具有的有益效果如下:
本发明设计了一种分块分段式存储数字切片瓦片金字塔模型的文件格式,能以二进制方式存储瓦片图、瓦片图的信息、数字切片的基本信息、扫描视野信息及标记信息;将数字切片分成金字塔多层并在每层按照256*256瓦片图的方式进行图像存储,满足了医学数字切片的存储要求,减少了无效部分的存储,保证了切片存取速度。
附图说明:
图1是根据一示例性实施例示出的一种数字切片图像存储的方法流程图;
图2是根据一示例性实施例示出的一种数字切片图像存储的装置的结构图;
图3是根据一示例性实施例示出的一种数字切片图像文件的数据存储格式的结构图。
具体实施方式
下面结合附图与实施例对本发明做进一步说明:
为能清楚说明本方案的技术特点,下面通过具体实施方式,并结合其附图,对本发明进行详细阐述。下文的公开提供了许多不同的实施例或例子用来实现本发明的不同结构。为了简化本发明的公开,下文中对特定例子的部件和设置进行描述。此外,本发明可以在不同例子中重复参考数字和/或字母。这种重复是为了简化和清楚的目的,其本身不指示所讨论各种实施例和/或设置之间的关系。应当注意,在附图中所图示的部件不一定按比例绘制。本发明省略了对公知组件和处理技术及工艺的描述以避免不必要地限制本发明。
图1是根据一示例性实施例示出的一种数字切片图像存储的方法流程图。如图1所示,本发明实施例提供的一种数字切片图像存储的方法,包括以下步骤:
步骤1,设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;
步骤2,对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述图片与其相关信息存储到不同的存储区域中。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述存储区域包括:
存储区域一:存储数字切片瓦片图的二进制数据;
存储区域二:存储数字切片的基本信息;
存储区域三:存储数字切片瓦片图的信息;
存储区域四:存储图像视野的原始信息;
存储区域五:存储用户标记信息索引段;
存储区域六:存储存储区域二至存储区域五的各自信息索引段在文件中的起始位置。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述数字切片瓦片图按照jpg、png和tiff格式进行处理形成二进制数据;
所述数字切片的基本信息包括扫描设备类型、设备编号、扫描倍率、扫描开始时间、扫描结束时间;标签数据的存储位置和数据大小信息;
所述数字切片瓦片图的信息包括瓦片图在文件中的起始位置和瓦片图数据大小信息;
所谓图像视野的原始信息就是从摄像头中采集下来的图片信息,包括原始图片对应的扫描仪的位置信息、图片在整个切片中的虚拟坐标信息;
所述用户标记信息索引段为用户的在数字切片上所标注的信息,包含圆形图像信息和方形图像信息及其对应的描述信息。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述步骤2具体包括以下步骤:
(1)定义各存储区域AreaStructure的变量:存储区域二的信息变量slideBaseInfo;存储区域三的信息变量tilePictureInfo;存储区域四的信息变量viewInfo;存储区域五的信息变量userMarkInfo;
(2)获取传统切片的预览图片,建立GroupSectionStructure结构体的变量previewInfo,先将预览图片转成二进制数据,将二进制数据保存到文件存储区域一中,并记录保存的起始位置,将二进制数据大小信息存入变量previewInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将变量previewInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(3)拍摄传统切片的标签区域,获得数字切片的标签图,建立GroupSectionStructure的变量barCodeInfo,先将标签图转成二进制数据,将二进制数据保存到文件末尾,并记录保存的起始位置、二进制数据大小等信息,并存入变量barCodeInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将barCodeInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(4)记录扫描开始时间、设备型号、物镜类型等信息,加入slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(5)扫描传统切片,建立GroupSectionStructure结构体的变量viewDetailInfo,采集每一幅图像,记录每幅原始图的信息,包括对应设备的步进、相对坐标、是否为聚焦点信息,加入viewDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量viewDetailInfo加入到viewInfo变量的mapGroup中;
(6)对原始视野进行配准分割产生瓦片图,建立GroupSectionStructure结构体的变量tileDetailInfo,将瓦片图转为二进制数据,保存到文件末尾,并将存储的起始位置、二进制数据大小、瓦片图坐标信息存入tileDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量tileDetailInfo加入到tilePictureInfo变量的mapGroup中;
(7)完成扫描,记录扫描结束时间、总视野数扫描信息到slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中。
(8)存储存储区域二至存储区域五的数据;记录文件末尾位置longSlideInfo,存储slideBaseInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储每个详细信息;存储slideBaseInfo完成后,记录文件末尾位置longPictureInfo,存储tilePictureInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储tilePictureInfo完成后,记录文件末尾位置longViewInfo,存储viewInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储viewInfo完成后,记录文件末尾位置longUserMarkInfo,存储userMarkInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储用户标记信息;
(9)将存储区域二至存储区域五的起始位置longSlideInfo、longPictureInfo、longViewInfo和longUserMarkInfo存储到文件末尾,至此文件存储完成。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述的数字切片图像存储的方法还包括:
步骤3,读取数字切片图像数据,查询具体的信息或读取相应瓦片。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述步骤3具体包括以下步骤:
(1)读取存储区域二至存储区域五的起始位置,分别存放到变量longSlideInfo、变量longPictureInfo、变量longViewInfo、变量longUserMarkInfo中;
(2)从位置longSlideInfo开始,来读取切片基本信息到变量slideBaseInfo;从位置longPictureInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量tilePictureInfo;从位置longViewInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量viewInfo;从位置longUserMarkInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量userMarkInfo;
(3)从相应的变量中来查询具体的信息或读取相应瓦片。
图2是根据一示例性实施例示出的一种数字切片图像存储的装置的结构图。如图2所示,本发明实施例提供的一种数字切片图像存储的装置,包括:
存储格式设置模块,用于设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;
图像存储模块,用于对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中。
作为本实施例一种可能的实现方式,所述的数字切片图像存储的装置还包括:
图像读取模块,用于读取数字切片图像数据,查询具体的信息或读取相应瓦片。
利用本实施例所述的数字切片图像存储的装置进行数字切片图像存储的实现过程如下:
1、设置文件格式
本申请的文件格式如图1所示。整个文件格式被分成六个存储区域,每个区存储的信息如下:
存储区域一(简称一区):存储瓦片图的二进制数据;瓦片图按照jpg、png、tiff等格式进行处理,形成的二进制数据。
存储区域二(简称二区):存储数字切片的基本信息;包括扫描设备类型、设备编号、扫描倍率、扫描开始时间、扫描结束时间;标签数据的存储位置、数据大小等信息。
存储区域三(简称三区):存储瓦片图的信息;包括在文件中的起始位置、数据大小等;
存储区域四(简称四区):存储图像视野的原始信息;所谓图像视野的原始信息就是从摄像头中采集下来的图片信息,包括原始图片对应的扫描仪的位置信息、图片在整个切片中的虚拟坐标信息等。
存储区域五(简称五区):用户标记信息索引段;用于存储用户的在数字切片上所标注的信息,包含圆形、方形等图像信息及对应的描述信息等。
存储区域六(简称六区):二区到五区四个信息索引段在文件中的起始位置。
2、设计具体数据结构
3、数据存储过程
(1)定义各区AreaStructure的变量:二区信息变量slideBaseInfo;三区信息变量tilePictureInfo;四区信息变量viewInfo;五区信息变量userMarkInfo;
(2)传统切片进入到扫描装置,利用预览相机产生预览图片,建立GroupSectionStructure结构体的变量previewInfo,先将预览图片转成二进制数据,将二进制数据保存到文件中,并记录保存的起始位置、二进制数据大小等信息存入变量previewInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将previewInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中。
(3)利用预览相机拍摄传统切片的标签区域,获得数字切片的标签图,建立GroupSectionStructure的变量barCodeInfo,先将标签图转成二进制数据,将二进制数据保存到文件末尾,并记录保存的起始位置、二进制数据大小等信息,并存入变量barCodeInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将barCodeInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中。
(4)记录扫描开始时间、设备型号、物镜类型等信息,加入slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中。将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(5)开始扫描,建立GroupSectionStructure结构体的变量viewDetailInfo,采集每一幅图像,记录每幅原始图的信息,包括对应设备的步进、相对坐标、是否为聚焦点等信息,加入viewDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量viewDetailInfo加入到viewInfo变量的mapGroup中。
(6)对原始视野进行配准分割产生瓦片图,建立GroupSectionStructure结构体的变量tileDetailInfo,将瓦片图转为二进制数据,保存到文件末尾,并将存储的起始位置、二进制数据大小、瓦片图坐标等信息存入tileDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量tileDetailInfo加入到tilePictureInfo变量的mapGroup中。
(7)扫描完成,记录扫描结束时间、总视野数扫描信息到slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中。
(8)存储数据二区、三区、四区、五区这四个区数据;记录文件末尾位置longSlideInfo,存储slideBaseInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储每个详细信息;存储slideBaseInfo完成后,记录文件末尾位置longPictureInfo,存储tilePictureInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储tilePictureInfo完成后,记录文件末尾位置longViewInfo,存储viewInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储viewInfo完成后,记录文件末尾位置longUserMarkInfo,存储userMarkInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储用户标记信息。
(9)将二区至五区四个区的起始位置longSlideInfo、longPictureInfo、longViewInfo、longUserMarkInfo存储到文件末尾,至此文件存储完成。
4、数据读取过程
(1)读取二区至五区四个区的起始位置,分别存放到变量longSlideInfo、longPictureInfo、longViewInfo、longUserMarkInfo中。
(2)从位置longSlideInfo开始,来读取切片基本信息到变量slideBaseInfo;从位置longPictureInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量tilePictureInfo;从位置longViewInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量viewInfo;从位置longUserMarkInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量userMarkInfo;
(3)基本信息读取完毕后,即可从相应的变量中来查询具体的信息或读取相应瓦片。
最后应当说明的是:以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非对其限制,尽管参照上述实施例对本发明进行了详细的说明,所属领域的普通技术人员应当理解:依然可以对本发明的具体实施方式进行修改或者等同替换,而未脱离本发明精神和范围的任何修改或者等同替换,其均应涵盖在本发明的权利要求保护范围之内。
Claims (5)
1.一种数字切片图像存储的方法,其特征是,包括以下步骤:
步骤1,设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;
步骤2,对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中;
步骤3,读取数字切片图像数据,查询具体的信息或读取相应瓦片;
所述存储区域包括:
存储区域一:存储数字切片瓦片图的二进制数据;
存储区域二:存储数字切片的基本信息;
存储区域三:存储数字切片瓦片图的信息;
存储区域四:存储图像视野的原始信息;
存储区域五:存储用户标记信息索引段;
存储区域六:存储存储区域二至存储区域五的各自信息索引段在文件中的起始位置;
所述步骤3具体包括以下步骤:
(1)读取存储区域二至存储区域五的起始位置,分别存放到变量longSlideInfo、变量longPictureInfo、变量longViewInfo、变量longUserMarkInfo中;
(2)从位置longSlideInfo开始,来读取切片基本信息到变量slideBaseInfo;从位置longPictureInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量tilePictureInfo;从位置longViewInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量viewInfo;从位置longUserMarkInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量userMarkInfo;
(3)从相应的变量中来查询具体的信息或读取相应瓦片。
2.根据权利要求1所述的数字切片图像存储的方法,其特征是,所述图片与其相关信息存储到不同的存储区域中。
3.根据权利要求1所述的数字切片图像存储的方法,其特征是,
所述数字切片瓦片图按照jpg、png和tiff格式进行处理形成二进制数据;
所述数字切片的基本信息包括扫描设备类型、设备编号、扫描倍率、扫描开始时间、扫描结束时间;标签数据的存储位置和数据大小信息;
所述数字切片瓦片图的信息包括瓦片图在文件中的起始位置和瓦片图数据大小信息;
所谓图像视野的原始信息就是从摄像头中采集下来的图片信息,包括原始图片对应的扫描仪的位置信息、图片在整个切片中的虚拟坐标信息;
所述用户标记信息索引段为用户的在数字切片上所标注的信息,包含圆形图像信息和方形图像信息及其对应的描述信息。
4.根据权利要求1所述的数字切片图像存储的方法,其特征是,所述步骤2具体包括以下步骤:
(1)定义各存储区域AreaStructure的变量:存储区域二的信息变量slideBaseInfo;存储区域三的信息变量tilePictureInfo;存储区域四的信息变量viewInfo;存储区域五的信息变量userMarkInfo;
(2)获取传统切片的预览图片,建立GroupSectionStructure结构体的变量previewInfo,先将预览图片转成二进制数据,将二进制数据保存到文件存储区域一中,并记录保存的起始位置,将二进制数据大小信息存入变量previewInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将变量previewInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(3)拍摄传统切片的标签区域,获得数字切片的标签图,建立GroupSectionStructure的变量barCodeInfo,先将标签图转成二进制数据,将二进制数据保存到文件末尾,并记录保存的起始位置、二进制数据大小信息,并存入变量barCodeInfo的mapSectionDetailInfo变量中;将barCodeInfo加入到 slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(4)记录扫描开始时间、设备型号、物镜类型信息,加入slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(5)扫描传统切片,建立GroupSectionStructure结构体的变量viewDetailInfo,采集每一幅图像,记录每幅原始图的信息,包括对应设备的步进、相对坐标、是否为聚焦点信息,加入viewDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量viewDetailInfo加入到viewInfo变量的mapGroup中;
(6)对原始视野进行配准分割产生瓦片图,建立GroupSectionStructure结构体的变量tileDetailInfo,将瓦片图转为二进制数据,保存到文件末尾,并将存储的起始位置、二进制数据大小、瓦片图坐标信息存入tileDetailInfo的mapSectionDetailInfo中,将变量tileDetailInfo加入到tilePictureInfo变量的mapGroup中;
(7)完成扫描,记录扫描结束时间、总视野数扫描信息到slideDetailInfo变量的mapSectionDetailInfo中;将slideDetailInfo加入到 slideBaseInfo变量的mapGroup中;
(8)存储存储区域二至存储区域五的数据;记录文件末尾位置longSlideInfo,存储slideBaseInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储每个详细信息;存储slideBaseInfo完成后,记录文件末尾位置longPictureInfo,存储tilePictureInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储tilePictureInfo完成后,记录文件末尾位置longViewInfo,存储viewInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储瓦片图的每个详细信息;存储viewInfo完成后,记录文件末尾位置longUserMarkInfo,存储userMarkInfo的AreaStrectureId信息,mapGroup的数量,循环mapGroup来存储用户标记信息;
(9)将存储区域二至存储区域五的起始位置longSlideInfo、longPictureInfo、longViewInfo和longUserMarkInfo存储到文件末尾,至此文件存储完成。
5.一种数字切片图像存储的装置,其特征是,包括:
存储格式设置模块,用于设置数字切片图像文件的数据存储格式,所述数据存储格式包括多个存储区域;
图像存储模块,用于对切片进行扫描,将获得的图片及其相关信息存储到相应的存储区域中,并将存储相关信息存储区域的起始位置单独存储到一个存储区域中;
图像读取模块,用于读取数字切片图像数据,查询具体的信息或读取相应瓦片;
所述存储区域包括:
存储区域一:存储数字切片瓦片图的二进制数据;
存储区域二:存储数字切片的基本信息;
存储区域三:存储数字切片瓦片图的信息;
存储区域四:存储图像视野的原始信息;
存储区域五:存储用户标记信息索引段;
存储区域六:存储存储区域二至存储区域五的各自信息索引段在文件中的起始位置;
所述图像读取模块具体用于:
(1)读取存储区域二至存储区域五的起始位置,分别存放到变量longSlideInfo、变量longPictureInfo、变量longViewInfo、变量longUserMarkInfo中;
(2)从位置longSlideInfo开始,来读取切片基本信息到变量slideBaseInfo;从位置longPictureInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量tilePictureInfo;从位置longViewInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量viewInfo;从位置longUserMarkInfo开始,来读取切片的瓦片信息到变量userMarkInfo;
(3)从相应的变量中来查询具体的信息或读取相应瓦片。
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